lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 999999999999999999999999999999 11 1111111 11 111 111111 2222 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 1 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111111 1 1 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111 11 11111 444444444444444444 1 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 111 11 11 2222222222222222 00000000000000000000000000000000000 33333333333333333333333 11111111 1 11111 2222222222222 111111 22222222 11 222222222222 1 666666666666666666666666666666666666666 1111
lowQualScore : 5 66 33 2 2 2 4 666666 9 22 6 666666 888888888888888888888888888888 2 77 66 2 33 2 33 9999999 33 5 22 5 5 2 2 66 2 33 777 55 33 2 444 2 555 111 4444 4 555 4 4 55 4 888 111111 8888 55 7 7777 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2222 0 2 8 55 55 4 4 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777777777 99 4 4 1 5 9 6 6 5 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 666666 11 00000 999999999999999999 5 1 66 5 2 5 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 33 5 000 5 8 4 6 11 6666 4 00 2 3 3 555 3 7777 1111111111111111 3 3 33333333333333333333333333333333333 3 3 3 55 3 55 44 77777777777777777777777 33333333 7 7 0 3 666 99999 3 88888 3 3 0000000000000 4 333333 6 3 3 3 11111111 1 66 66 1 3 333 66 1 1 77777 1 1 555555555555 4 22 1 3 1 1 444 0 55555 0 1 1 555555555555555555555555555555555555555 2 0000 4 88888 66 88 1 6666 22 7777 22 1 1 55 77777 22 2 22 333 2 4 2
lowQualScore : . .. .. . . . . ...... . .. . ...... .............................. . .. .. . .. . .. ....... .. . .. . . . . .. . .. ... .. .. . ... . ... ... .... . ... . . .. . ... ...... .... .. . .... .......................................................................................................................................... .... . . . .. .. . . ............................................................................................................................................................................................ .......... .. . . . . . . . . ............................................................................................................................................ ...... .. ..... .................. . . .. . . . .................................................................................. .. . ... . . . . .. .... . .. . . . ... . .... ................ . . ................................... . . . .. . .. .. ....................... ........ . . . . ... ..... . ..... . . ............. . ...... . . . . ........ . .. .. . . ... .. . . ..... . . ............ . .. . . . . ... . ..... . . . ....................................... . .... . ..... .. .. . .... .. .... .. . . .. ..... .. . .. ... . . .
lowQualScore : 7 88 99 5 5 4 4 444444 2 99 3 444444 999999999999999999999999999999 2 99 33 9 88 9 99 0000000 99 7 77 3 6 7 7 33 7 77 333 55 77 7 777 9 000 333 8888 0 999 0 0 55 0 333 555555 9999 11 6 7777 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0000 4 3 9 77 55 0 0 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555555555 55 4 4 7 3 2 0 0 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 444444 77 44444 444444444444444444 7 4 66 0 1 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 66 7 000 0 9 4 0 22 3333 0 77 4 6 6 555 6 7777 5555555555555555 6 6 77777777777777777777777777777777777 6 6 6 00 6 00 88 55555555555555555555555 22222222 3 3 9 6 222 11111 6 22222 6 6 7777777777777 6 333333 7 6 6 6 33333333 4 33 44 9 8 222 11 8 9 77777 8 8 000000000000 1 55 8 6 8 8 777 2 55555 2 3 8 999999999999999999999999999999999999999 1 0000 2 33333 88 88 9 0000 66 0000 00 9 9 77 00000 88 0 88 555 0 2 1
consensus : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTT------GATCTT--AGC-TGTA------CTT----T-----------AAAT--GAC----AACGG-TTG--GCAGAATT--CC-AAC-CG-TA--CAATA--AC-TTCT--A-GG-GG-CGG-AGCT-T--A-G--CTG---TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-TACTATA-AC-TTCCAGC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGC--AACGA------TT--TTG-AAACATTTATT----CA-----GT-GA-----TGA-AAA--C----NTA--A--N----AA---------------AT-GC------AG-C-----------------ATA----------------A------CT-------------T----ATG---TTTCAATTAACACG-CGGAG--TTTAGC-A-CACTT--------------TTAA-------------AGGG-AG-------CCC-CC-C---C----C--------CC----AATA-ATT-------TC------T-----T--------AAG-A-TAAATCATAA---T-N-----TTTTGTT--------C---------------A-------------TAA----------AAGA--AGC-AA-TAATTCTTCCGCTCTTAGAGAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCTAACGCCAAGACCCACTG-G---GGGCCTT-GA----GGCGGCC-TCCAG-ACCCC-C-TACC-TCACGAA--NC-TCA-CCCC-----C-----TC-CC---CC-----T-----------TC-----------CA-----GT---A----A-----AT------GCATG-CA-A---TGA--------------A---G-TA-CTTACC-GTGCCCAAT-CCCG-TTATG-TTCAA-TCC---G-TTA---C--T-CNCAG--G--G---GTTTTT--TTTA-CACA-TCC--T--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAAT-NA-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-AAGTTA-A------ATA---GTC-CN--AT----C------T-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGAT-T-GT--T-TCCA--ACTT--------TT-GA-CA-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA---------T--TTAGCAATGCTG-T---T-ATGAAT-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-GT---A--CTG-T-CTT-----TC-GT-TT----------GTATGGA--A-T-T-TATT-G--TACAGA----GGGGC-GTG-A----CAGTC----T-CGT--C-GCTGCGCGACT-C-GAC-TG--C-CAC-GCCCCTC----TGTA--CAATA-A-A----T--TC---CAT-ACAA-A-C-GAAAG-----A-CA-G--T---A-CTG-T-AAATATAAA
Reference ( gi|3 ) : TCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTT------GATCCT--AGC-TGTA------CTT----T-----------AAA-----------ACGG-TTG--GCAGAATT--CC-AAT-CG-TA--CAACA--AG-TTCT--A-GG-AG-CAG-AGCT-T--A-G--CTG---TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-TACTATA-AC-TTCCAAC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGC--GACGA------TT--ACG-AAACATTCATT----CT-----GT-AG-----TGA-AAA--C----ACA--A--G----AT---------------AT-GC------AG-C-----------------ATA----------------A------CT-------------T----ATG---TTTCAATTAAAACG-CATAG--TTTAGC-A-CAC----------------TTAA-------------AGGG-A--------CCC-CC-T---C----C--------CC----AATA-ATT-------T-------T-----T--------AAG-A-TAAATCATAA---T-A-----TTTTATT--------C---------------A-------------TAA----------AAGA--AGC-AA-TAATTATTCCAATCTTAGAGAAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTCCGGGATCCAACACCAAGACCCACTG-A---GAACCTT-GACCTAGGCGGCC-TCCAT-ACCCC-T-TACC-TCACGAA--GC-TCA-CCCC-----C-----TC-CC---CC-----T-----------TC-----------CA-----GT---A----A-----AT------GCATA-CA-A---TGA--------------A---G-TA-TTTACT-GTGCTCAAT-CCCA-T-ATG-TCCAA-TCC---G-TTA---C--T-CGCAG--G--G---GCTTTT--TTTA-CACA-TCC--CA-T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGGAAT-TA-C-GT-AATGACAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-AAGTTA-A------ATA--AGTC-CT--AC----C------T-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GAGAT-T-GT--T-TCCG--ACTT--------TT-GA-CA-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA---------C--TTAGCAATGCTA-T---T-ATGAAT-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-AT---A--CTG-T-CTT-----TC-GT-TT----------AAATTGA--A-T-T-TATT-G--TACAGA----GGGGC-GTG-A----CAGTC----T-CGT--C-GCTGCGCTACT-C-GAC-TG--T-CAC-GCCCCTT----TGTA--CAATG-A-A----T--TC---TAT-ACAA-A-C-AAAAG-----A-CA-G--T---A-CTG-T-AAATATAAA
gi|27 : CATTGAGT-CA--T--GGTGCTGC-A-C-TT---------------AATC----AGC-AATG------CTT----T-----------AAATCAGACGGAAAATGG-TTA--ACAGAATT--CT-AA--CT-TA--CAAAA--AACTTCT--A-GA-GGACGG-AGCT-TTCA-GTGCTG---TAC-ATT--A-AT---TTC-TAGGG---AAACG-TATTA
gi|6 : tgATTGTGT-CA--T--GATGCGGT-A-CTTTTT-TCCCTT------GATCTT--AGC--GTA------CTT----TAAATCAACAGAAAA-----------GCGG-TTG--GCAGATTC--CC-AATCCG-TA--CAA-A--AC-TTCT--A-GG-GG-CGGCAG-T-T--A-G--CTG---TACTTAT--A-AC---TTCTCAGGG---AACTG-TACTATA-AC-TTCCAGCACCT-AAA-ATC--A-GATAGGC--AACGA------TT--TTG--AACATTTA-T----CA-----GT-GA-----TAA-AAA--CTT--TCA--A--A----ATGCAGTGAGTTAACAAAT-TA------AG-C-----------------ATA----------------A------AT-------------T----A-GCATTTTCAATTAACACGACGGAG--TTTAGCAA-CACTTAATTCAGGCAGA--TTAA-------------AGGG-AGT------CCC-CC-C---C----CCCCCCCCACC----AATA-ATCTTTCCAAT-------T-----T--------AAGAA-TAAATCATAA---TCC-----TTTTGTT--------C---------------G-------------TAA----------AAAATTAGCGGA-TAAggcctat
gi|37 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTT------GATCTT--AGC-TGTA------C-A----G-----------AAA-----------ACGG-TTG--GCAGAATT--CC-AAC-CG-TA--aagtatgcaatcattcttcccgctcaaagagaaattcaatgacaaggtctatgatttattgtttttattgggagcaattccgattttcattttaataagaaactttaaaagattaagtgttatcgtttaatttta
gi|1 : aTTGTGTACA--CTAGATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTT-------GATCTT--AGCCTGTG------CTT----T-----------AAATCAGACAGAAAACGG-TTGA-GCAGGATCA-CC-AAC-GA-TA--CA-CATTAA-CTCT--A-GGCGG-CGG-AGCT-T--A-C--CCGC--TAC-A-T--A-AC---TTC-CAGGG---AACTGTTACTATA-CT-TCCCAGT-CATAAAA-ATC--AGGAAAGGC--AGCGA------TT---TG-AAACATTTATT----CA-----GTGAT-----TCA-AAA--CGTTAATA--A--T----A----------------AT-GC------AG-TG----------------ATA----------------AACAATTCTAAGCTTAAACATCT----ATG---TTAC-ATTAACACGCCGGAGTTTTTAGC-A-CACTTAGATTGGCAAGAATTTAA-------------AGGG-AGCGCCCCCCCC-CC-C---C----C--------CC----AATAGATT-------TCTCAAC-T-----T--------AA--A-TAAATCATAAATCT-------TTTTGTTTCGTAAAAC---------------AATAGCAT------TAA----------AAGA--AGC-AATTCATTCTTCCGCTC-TACAGAA
gi|5 : cTTGTTT-CA--T--TGTACGAT-A-C-ATTT-TCCTTT------GATTTT--AGC-TGTA------CTTAAAATCAGACAG----AAA-----------ATGC-TAG--GCAGAATT--CT-AAC-CG-TA--CAATA--TG-TACT--A-TG-TG-CGG-AGCT-T--A-G--CTG---TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGGTAAAAC----ACTATA-AC-TTCCAA--CAC-AAA-ATC--A-GAAAGGG--GACGC------TT--TTG-TAACACTTATTTACCCA-----GT-GA-----TGA-AAA--C----ATA--A--C----AA---------------AT-AC------AGACTATAA------------ACA----------------A------CG-------------T----ATG----TTCAAATAACATG-CATAT--TTTAGC-A-CAC----------------TTAACAGATTAAG----AGGG-ATTG-----CCCACCAT---C----C--------AC----AAT---TT-------TCAA----T-----T--------AAG-A-T-AATCATAA-----A-----TATTGTT--------CCTGT-----------A-------------TAACTGGCGATATAAGA--AGA-AA-TAATTCTTCCA--TTTAAAGAAtccaatttgacaagatctaaaattgacatttattgtgtttttattgggtaattcatataatttttaattataagaaacttagatttgtatgttattttaatttatttcagtcagttaaaaatgaccaaaatagtaaacagctttagggttggggttacaagacccactggggccttgaggtagcctccatgactccctacctcacgactcttcacccccctcttccctcccctcactgccaaagcttacttgatcccacccctcagcttaaaatgcatgcaaacttcaaccagctacttactcgtgcccaatgcccgtatggttcaactcctaagcttaccgtcccaggttgtttattttttttaacacaatcctagtgcccaccttgcactatttgaaatatactaatggcattccaattcacttttaaaacacactaaactaagagagtataataccaccaccgattccattgactgaatgttatgcgattatttccaactttttgatcaccccagactttctacgtcacgtcgcgtcgcaatctcacgatcttagcaatactgttatgaattattcactgaatcaagacaatttacaatactgtctttcgtcttgtatggaatcttatggtacagagtgagtgacccagtctcgtcggctgcgcgactccgactgcacactgccccctcacctgtacgcaaaaagttccataacaaactcgaagaccagtttactgtaaaatta
gi|15 : TTGTGT-CA--C--GATGCGGT-A-G-TTAT-TGCTTT------GATCTT--AGC-TGTA------CCT----T-----------AAATCAGACAGAAAACGG-TTG--GCAGATTT--CC-AAC-CG-TA--CAATA--AC-TTCT--A-GG-GG-CGG-AGAT-T--A-G--CTG---TAC-TAT--A-AC---TTC-CAGGG---GTCTG-GATTATA-AC-TTCGAGC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGC--AACGA------TT--TTT-AAGCATTTATT----CA-----GT-GA-----TAA-AAATTT----TTA--A--A----A----------------AT-GC------AG-CTTATAAACAGATTAAGTATA----------------A------AT-------------TAAGCATG----TTCAATTAACACG-CGGAG--TTTAGC-A-CAC----------------TTAagcaatggacaagatctattgaattattttcttgtatttgggaaatcgtattttcattttgaaaaaaaaaccatgtaagattgtattaatttgatattcgcgtcattaaaatacactaaatagtaagagtttcatgggggcaaccaacacccatgggggggtcttgaggctgctccagagccctacctcacgaagatccgtcttcaactcattgatccgccatatacatgctaaatgacgtact
gi|29 : atTTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTCT------GATCTT--AGC-TGTG------CTT----T-----------AAATGAGACAGAAAACGG-TTG--GCAGATTC--CC-AAT-CG-TA--CAATA--AC-TTTT--A-GG-GA-CGG-AGCT-T--A-G--CTG---TAC-AAT--A-AC---T
gi|31 : atTTGTGT-TA--T--GGTATGAT-A-C-ATTT-TCCTTT------GATTTT--ATC-TGTA------C-T----T-----------AAA-----------AT---------CAG-----------------A--CAAAA--AA-TGCT--T-G----------GCT-C--A-G--CTG---TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---
gi|39 : cTTGTGT-CG--T--GGTGCGGT-A-C-ATTT-CCCTTC------GATCTT--AGG-CATA------CTT----T-----------A
gi|38 : taaagTTGTGTTCA--T--GATGCGGTTA-C-TTTTTTCCTTT------GATCTT--AGC-T
gi|23 : TGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTT------GATCTT--AGC-TGTA------CTT----TAAATCAGACAGAAA-----------ACGG-TTG--GCA-AATT--CC------------CAAC------TTCT--A-GG-GG-CGG-AGTT-T--A-G--CTG---TAC-TAT--A-AC---TTC-CAG----------------------------C-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGT--AACGA------TT--TTG-AAACATTTATT----CA-----GT-GA-----TCA-AAA--C----TTA--A--T----AA---------------AT-GC------AG-C-----------------GTA----------------taattaattcaga
gi|36 : TGTGT-CA--T--GATGCAGC-A-C-TTTT-TCATTT------GATCTT--AGC-TGTA------CTT----TAAATCAGACAGAAA-----------ACGG-TTG--GTAGAATT--Ctaaaaaacttaa
gi|35 : TGTGT-CAA-T--GATGTGCA-A-C-TTTT-TC-TTT------GATCTT--AGC-TGTG------CTT----T-----------AAA-----------TCAG---G--ACAGAA
gi|19 : cGTGT-CAAAT--GGCGTGGC-AAC-CTTT-CCCTTTTATGAAAATCAG--AGC-AG----------------------------AA-----------ATAG-TTG--GCAGAATT--TA-AAA-CG-TA--CAAT---AC-TTCT--AGGG-GG-TGG-AGCT-T--A-G--CTG---TAC-AATCAA-ACCTTTTC-CAGGG---AACTGTTACTATACACATTTTAAC-AAA-AAACAT---A-GAAAGG---AACAAAATATTTT--TTG-TAACATT-ATT----C-------A-AG-----TGATAAA--G----A-A--A--G----------------------T-GC------AG-T-----------------ATA----------------acacggttgggcagactttccca
gi|30 : tgATTCGGC-A-C-TTTT-CCCTTT------GAT-TT--AA--TGTA------ATT----T-------------G-----------ACGG-TTcaaacaaa
gi|2 : atTGCG-C-A-C-TTCTATTTTCT------GGTGCTTAAGCATGTAACGTATCTT----T-----------AAATCAGACTGGTAACGGGTTGCGGCAGAATTGCCCGAACACG-TAAACAATA--AC-TTTTGTA-GG-GG-CGG-GGTTGT--ATG--CTTATTTAC-AAT--ATAC---TTC-CAGGG---attctttgatccacgttctcgacgtgtcattgcattcgtacaacagattccatacaaacgaaggacagtctgctaatata
gi|40 : -TTTT-TCCTT-------GATCTT--AGCCTGTG------CTT----T-----------AAATCAGACAGAAAACGG-TTGA-GCAggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|11 : T-TCCTTT------CATC-T--AGC-TGTG------TTTAAA-TAAGACAG----AAA-----------ACGG-TTG--ACAGAATT--CC-AAA-CGAAA--CAATA--AC-TTCT--A-GG--G-CGG-AGCT-T--A-G--CCG---TAC------A-AC---TTC-CA-GG---AACC--TAATCTA-AC-TTCCAAC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAAACAAAACAT------TT--TTGAAAACATTTATT----CA-----GT-GA-----TGG-AAA--C----ATA--A--AGAACAA---------------AT-AC-------G-C-----------------AAA----------------A------CT-------------T----ATG---TTT-AA-TAAA--G-CATAG--TTTAGC-ACCAC----------------TTGGTAGATTT------AAGG-A--------CCC-CC-T---C----C--------CCCT--AATA-ACT-------T-------T-----TTTAATTTCAAG-A--AAATCATAACC-T-------TTTTATT--------T---------------A-------------TAA----------AAGA--AGC-AA-TCATTCTTCCACTCTTAGATAAAT
gi|33 : CTT--AGC-TATA------TTT----T-----------AAATCGGACATTAAACGG-TTG--GCAGAATT--CC-AAT-CG-TA--CTATA--AC-TTCT--AGGG-GG-CGG-AACT-T------------------------AC---TTC-CAGGG---AACcaatgtcaagatataactgtgtcttttattgggtattttcat
gi|9 : -----------AAA-----------ACGG-TTG--GCAGAATT--CC-AAC-CG-TA--CAATA--AC-TTCT--A-GG-GG-TGG-AGCT-T--A-G--CTG---TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AAACG-TACTATA-AC-TTCCCAC-CAT-ACA-ATC--A-GAAAGGC--GACGA------TT--TTG-AAACATTTATT----C---------AG-----TGATGAA--C----AAA--A--G----AA---------------AT-AC------AG-C-----------------TTATCAACAAATTAAGCATA------CT-------------T----ATG---TCTCAATTAACACG-CATAG--TTTAGC-A-CACTTCGCAGAT-------TTAA-------------AGAG-A--------GCC-CC-C---C----C--------C-----------TT-------T-------T------------------A-T-AATCATAA---T-AT----TTTTGTT--------CATAAAACAAATAGCGA-------------TAA----------AAGA--AGC-AA-TCATTCTTCCACTCTTAGAGAAAT
gi|20 : tatactttaaatcagacag-TTCT--A-GG-GGGCGG-AGCT-T--A-G--CTG---TAC-AAT--A-AC---TTC-CATGG---AACCG-TACT----------------AT-AAA-ATC--A-GAAAGGC--AACGA------T-----G-AAACATTTATT----CA-----AT-GA-----TAA-AAA--T----GCA--ACTT----AT---------------AA-ACAAATTAAG-C-----------------AAA----------------A------GT-------------T----ATG---TATCAATTAACACG-CATAG--TTTAGC-A-CAC----------------TTTA-------------AAGC-C--------CCC-CC-C---CCCTTC--------CC----AATA-ATTTTTAA--T-------T-----T--------AAG-A-TAAATCATcaatgacaagatctattggttaattgtttttttttattgggagatctcgtatttcatttttataagaaacttttaagatttgtgtta
gi|33 : gacG-CAG-AATT-CC-A-A--TCG---TAC-TAT--A-AC---TTC-TAGGG---GGCGG-AACT-T--AC-TTCCA
gi|2 : cttagctatattttaaatcggacattaaacggttg-AAA-ATCGCA-GAAAGGC--AACGA------TTTGATG-AAAC---CATT----CTAATGCGTCAGGCCGATGA-AAA--C----ACAGGA--G----AA---------------ATGGC------AG-C-----------------CTA----------------A------TC-------------T----Agggaac
gi|4 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagACATGTATT----CA-----GT-GA-----TCA-AAA--C----TTA--A--A----AG---------------AT-GC------AG-CGTCTAAAGAAAATAACCATA----------------A------CA-------------T----ATG---TT-CAATTAACACA-CCGAG--TTTAGC-A-CACTTAATTGGAAGAT---TTAA-------------AGGGAA--------CCC-CC-C---C----CG-------CCTCTTACTA-TTTTCCAA--T-------T-----T--------AA--A-TAAATCATAA---T-CCTTGTTTTTGTT--------C---------------A--------------AT----------AAGA--ACC-AA-TAaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|18 : CAATTAACACG-CCGAG--TTTAGC-A-CAC----------------TTAAGTGGCAGATTTAAAGAG-AG-------CCC-CC-TGCAC----C--------CC----AATA-ATT-------TCCAAT--T-----T--------AAG-A-TAAATCATAA---TCA-----TTTTGTT--------CATAAAAAAATAGCG-A-------------TAA----------AAGA--AGC-AA-TCATTCTTCCGCTCTTAGAGAAgcgatgaagaagcttcataattcttccgctcgttagatgaaagcaatgacaaagatctattgatctattgtgtcttttgaattgctattcgtaatttcatattgttaataagaaactttgaagaatctgtgttatttcattaatttttaacgcgtacaaaaaatgaccaattaatagtaaccacggcttcgggtgggggacgaagaccaatgtgggccttgagcggactccagacccccttaccgtcacgcccacctcgacatttcaacattcattgatctacccaagtacaatgcatgcaatgagtacttaccatgaccaatcccgttatgttcagtccgttactctcaggtgggttttttctacactactctagtgcaatgcatattttgaaataacgtgaaggatccaattattttaaccacaaaactaaagaagttaatacaccgatctccaatgtttgaatgctgcgttatgtttcaacttttgaccaccccagacttctacgtgcacgtgcatgcgacctttatcaatgctcttcctacgtcacgtcgcatgcaacttagcaatgctgttctgaacatttatgacataagacatttacaatgctgctcgactcgactgccacgcccctctgtaccaaacattccatacaaacgaaagacagtactgtaaatataa
gi|13 : AG--ATTAGC-G-GAT----------------TTAA-------------AGGG-AGTGCA---CCC-CC-T---C----CTTCT----CC----CTGA-ATT-------T-------TCAATTT--------AAG-G-TGAATCATGG---T-G-----TTTTGGT--------C---------------A-------------TAA----------ACAAT-AGC-AG-TAAaacaatgacaagatatattgatttattgtcttttattgggtaattcgtatttcatatttaataagaaactttaagat
gi|28 : --------CCC-CC-C---C----C--------CC----CATT-TTT-------TCTCCAAAT-----T--------AAA-AGTAAATCATGA---T-A-----TTTTGTT--------C---------------AG------------TAA----------AAGA--Aaagatacaataatcctttcacttttcgtgaaatatttctattcattgtatttttttttttttttggattggtataacttaatatttgtgatatcctatcaatctcacgtcattaaaaatgaccaacactagtaaagattttccaggggccccataccaagaccccactgggggccttaacactccctttaaatccctcgaacccccccccctctt
gi|26 : atgtaaatatac-ATA-------T-------T-----T--------AGA-A-TAAATCATGG---T-C-----CCTTGTT--------T---------------AAAAAAAATAACGATAA----------AAGA--AGC-AA-TAATTTTTCCACTTTTAGAGAAttagatacacgataaaagaagcaatcgttgatttaaataataagatttttgatatattggtacttttat
gi|2 : tcATCTAACGC-AAGAACCACTGTATGTGCGCCTTTGA---GGGCGACGATCCAG-ACCCC-TATCCA-TCACGAAAAG----A-CCTT-----C-----TGATC---CC-----G-----------CC-----------CA----------A----A-----AT------GCATGGCA-T---TGA--------------AAA-G-TAGTTTACT-A-----AGT-ACCG-C-ATG-CTCA----------TTA---C--TTCGCAC--A--G------------TT-------TCCGGCT-T------A-GTGT-CC-A---TGTA-TAGT-TTGAAAT-AA-C-GT-A------------TTCT-TTCT--A-A----AAC-----T-----TA---A-A-AAGTTA-A-------TA-------CT--AC----------------A-T--G-TACCGA--TGT-T-GCGAT-TTAT--C-TCCA--ACT--------------------------CCTC--CTA-----CAT-CACGTCG-----C-GT-GCAA---------T--TTAGCAATGC-------------AT-ATT-CA-TGACA----C-------------------AT---A--CTG-T-CTT-----TC-GT-TT----------GAATGG-----------TC-GC-TA------------C-GCG-A--------C----T-CG-----ACT--GCCACT-C-----------------CCCTC----TGTA--CAATA-A-A----T--TC---CAT-ACAA-A-C-AAagaaatcaagatattttatttgttgggggaacttgtactctatccaaaaaataatctgaattaaaatttgcg
gi|4 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaACGAAGACCAA-TG-T---GGGCCTT-GA-----GCGGAC-TCCAG-ACCCCCT-TACCGTCACG-----C-CCA-CCTCGACATT-----TC-AA---CA-----T-----------TCATTGATCTACCCAA----GT---AC---A-----AT------GCATG-CA-A---TGA------------------G-TA-CTTACC-ATGACCAAT-CCCG-TTATG-TTCAG-TCC---G-TTA---C--T-CTCAGGTG--G---GTTTTT--TCTA-CAC--TAC--TC-T------A-GTG--CA-A---TGCA-TATT-TTGAAAT-AA-C-GT-GAAGG-AT-CCAATT-A-TTTT--A-ACCACAAAA----C-----TA---A-AGAAGTTA-AT-----ACA-----C-CG--AT----C------T-CCAA-T--GTT--TGAA-TGC-T-GCGTTAT-GT--T-T-CA--ACTT--------TT-GACCA-CCC-CAGACTT---CTA-----CGTGCACGT-G-----C-AT-GCGA---------CCTTTATCAATGCTC-TTCCT-ACG------T-CA-CGTCG----C--ATG-CAACTTAG-C-A-AT---G--CTG-T-------------T-CT----------GAAC-----A-T-T-TA-T-G---ACATA----A-------G-A----CATTT----A-CAA--T-GCTGCTCGACT-C-GAC-TG--C-CAC-GCCCCTC----TGTA--CCAAA-C-A----T--TC---CAT-ACAA-A-C-GAAAG-----A-CA-G--T---A-CTG-T-AAATATAA
gi|12 : acatgtattcagtgatcaaaacttaaaagatgcagcgtctaaagaaaataaccataacatatgttcaattaacacaccgagtttagcacacttaattggaagatttaaagggaaccccccccgcctcttactattttccaatttaaataaatcataatccttgtttttgttcaataagaaccaatagcgatgaagaagcttcataattcttccgctcgttagatgaaagcaatgacaaagatctattgatctattgtgtcttttgaattgctattcgtaatttcatattgttaataagaaactttgaagaatctgtgttatttcattaatttttaacgcgtacaaaaaatgaccaattaatagtaaccacggcttcgggtgggggACCAG--CCCACTG-G---GG-CCTT-G--C--AGCGGCC---CAG-ACCCC-C-TAC--TCACGAA--CT-CCC-CCCC-----C-----TC-CCTTTCC-----TGAATTCATTGATC-----------CACCCGGGT---A----AATTTTAT------GCATG-CA-A---TGA--------------A---G-TA-T----G-GTAC-CAAT-CCCGTT-ATG-TTCAA-TAC---T-TTCCTTC--T-CGT-G--G--T---GTTTTT--TTT
gi|8 : attcacgtcattaaaaatgactcaaaaatagtaaagagctttaagggggaggtgtttaCAAGACCCACTG-G---GGACCTT-GA----GGCAGCC-TCCAG-ATCCC-C-TACC-ATATGAA--GC-TCC-CCCC-----C-----CC-CC---CCACCTCT-----------TCTT---------CA-----AT---TCCTTG-----AT------GCATG-CA-A---TGATTCTCAGTTGCAAAA---G-TA-CTTACT-GTGCCCAAT-ACCA-TTATG-CCCAA-TCA---G-TTA---C--T-C--AG-----------TTTT--ATTA-CA---TCC--TAGT------ATGTA--CT-A---TGCA-TA-T-TTGAGAT-AA-C-GT-AACGGCAT-CCAATTCA-TTTC--A-A----AACA----C-----CA---A-A-AAGTTA-A-------T----GCC-ATTGAT----A------T-CC-A-T--G-A--TGGA-TGT-A-GCGAT-T-TTAGT-TCCT--ACTTCCAAATTTTT-TA-CAACCC-CAGACTCC--CTA-----CAT-CACGTCA-----C-GT-CCAA---------A--TATGCAATGTTA-T---T-ATGAAT-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-GT---A--CTT-T-CTT-----TT-GT-TC----------AAATGTA--A-T-T-TATT-G----------------------------------------T--C-ACTGTGCGACT-A-AAC-TG--C-CAT-GCCCCTC----TGTA--CAATA-A-A----T--TC---TAT-ACAA-A-C-GAAAG-----A-AA-G--T---A-CTG-T-AAATATgttttctgttttttttttttttgctttacaaatcctagtggctcatgcatatattgaaattaacagtatgacatccaattcattttaaaaaacataagccaataaagttaatacactcaaatctgccatgttga
gi|1 : CAAGACCCACTG-G---GG-CCTT-GA----GGTAGCC-TCCATGACTCC-C-TACC-TCACGAC--TCTTCACCCCC-----C-----TC-TT---CC-----C-----------TC-----------C
gi|7 : cttgtgtacactagatgcggcactttttccttgatcttagcctgtgctttaaatcagacagaaaacggttgagcaggatcaccaacgatacacattaactctaggcggcggagcttacccgctacataacttccagggaactgttactatacttcccagtcataaaaatcaggaaaggcagcgatttgaaacatttattcagtgattcaaaacgttaataataatgcagtgataaacaattctaagcttaaacatctatgttacattaacacgccggagtttttagcacacttagattggcaagaatttaaagggagcgcccccccccccccccaatagatttctcaacttaaataaatcataaatctttttgtttcgtaaaacaatagcattaaaagaagcaattcattcttccgctctacagaatccaatttgacaagatctaaaattgacatttattgtgtttttattgggtaattcatataatttttaattataagaaacttagatttgtatgttattttaatttatttcagtcagttaaaaatgaccaaaatagtaaacagctttagggttggggttaAAGACCCACT--------ACCTC-A-------CGACC-TCC----CCCC-C-CCCC-TCA---A--CT-TCA-CATT-----CATTGATC-CA---CC------------------C-----------GA-----GT---A----A-----ATATTTATGCATG-CAGA---TGA--------------A---G-TA-CTTACC-GTGCCCAAT-CCCG-TTATG-TTCAA-TCC---T-TTA---C--T-CTTGG--G--T---GTTTTTGTTTTA-CAAA-TCC--T-----------GTG--CC-A---TGCA-TA-T-T-GAAAA-TA-C-GTTAAAGGCAT-CCAAT-CA-TTTT--AGA----AACA----CTAAGCCA---A-A-AAGTTATACCC---ACA--AG-------AT----C------T-CC-A-T--G-T--TGAACTGT-T-GCGAT-T-GT--T-TCTA--ACTT--------TT-GA-CA-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----A-AT-GCAA---------C--TTAGCAATGCTGTT---T-ATGAAT-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-GT---A--CTG-T-CTT-----TTGGT-TTGTTTATGGGAAAATT------T-T-TATTGG--TACAGA----GGGGC-GTG-G----CAGTC----G-AGT--C-GCCTCGCGACT-C-GAC-TG--C-CAC-GCCCC-C----TGTAC-CAAAA-C-A----T--TC---CAT-ACAA-A-C-GAAAG-----A-CA-G--T---A-CTG-T--AATATAcctcactgccaaagcttacttgatcccacccctcagcttaaaatgcatgcaaacttcaaccagctacttactcgtgcccaatgcccgtatggttcaactcctaagcttaccgtcccaggttgtttattttttttaacacaatcctagtgcccaccttgcactatttgaaatatactaatggcattccaattcacttttaaaacacactaaactaagagagtataataccaccaccgattccattgactgaatgttatgcgattatttccaactttttgatcaccccagactttctacgtcacgtcgcgtcgcaatctcacgatcttagcaatactgttatgaattattcactgaatcaagacaatttacaatactgtctttcgtcttgtatggaatcttatggtacagagtgagtgacccagtctcgtcggctgcgcgactccgactgcacactgccccctcacctgtacgcaaaaagttccataacaaactcgaagaccagtttactgtaaaatta
gi|1 : CT-TCCCT--CCCC-T-CACT-GC-CAAA--GC-TTA-CTTG-----A-----TC-CCA--CC-----C-----------CT-----------CA-----GCTTAA----A-----AT------GCATG-CA-AACTTCA--------------ACCAGCTA-CTTACTCGTGCCCAATGCCCG-T-ATGGTTCAACTCCTAAGCTTA---CCGT-CCCAG--GTTGTTTATTTTT--TTTAACACAATCC-----T------A-GTG--CCCACCTTGCACTA-T-TTGAAATATA-C--T-AATGGCATTCCAATTCACTTTT--A-A----AACA----CA----CT---A-A-A--CTA-AGAGAGTATA--A-TA-CC--AC----CACCGATT-CC-A-TTGA-C--TGAA-TGTTATGCGAT-T-AT--T-TCCA--ACTT--------TTTGATCA-CCC-CAGACTTT--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GTCGCAATCTCACGATC--TTAGCAATACTG-T---T-ATGAATTATT-CACTGAAT----C--AAGACAATTTA--C-A-AT---A--CTG-T-CTT-----TC-GTCTT----------GTATGGA--A-TCT-TATG-G--TACAGA----GTGA--GTG-ACC--CAGTC----T-CGT--CGGCTGCGCGACTCC-GAC-TG--CACACTGCCCCCTCACCTGTACGCAAAA-A-G----T--TC---CATAACAA-A-CTCGAAG-----ACCA-GTTT---A-CTG-T-AAA
gi|10 : cttgtgtacactagatgcggcactttttccttgatcttagcctgtgctttaaatcagacagaaaacggttgagcaggatcaccaacgatacacattaactctaggcggcggagcttacccgctacataacttccagggaactgttactatacttcccagtcataaaaatcaggaaaggcagcgatttgaaacatttattcagtgattcaaaacgttaataataatgcagtgataaacaattctaagcttaaacatctatgttacattaacacgccggagtttttagcacacttagattggcaagaatttaaagggagcgcccccccccccccccaatagatttctcaacttaaataaatcataaatctttttgtttcgtaaaacaatagcattaaaagaagcaattcattcttccgctctacagaatccaatttgacaagatctaaaattgacatttattgtgtttttattgggtaattcatataatttttaattataagaaacttagatttgtatgttattttaatttatttcagtcagttaaaaatgaccaaaatagtaaacagctttagggttggggttacaagacccactggggccttgaggtagcctccatgactccctacctcacgactcttcacccccct---A----A-----AT------GCATG-CA-A---TGA--------------A---G-TACTTTGCC-G-GCCCAAT-CCCA-T--------------------TA---C--T-CGCTG--G--GTTAATTTAT--TTCA-C-CA-TCC--TA-TGTAGCTA-GTG--CC-A---TACA-TA-T-TTGAAAT--A-T-GT-AATGAGAT-CCAATACA-TTTC--A-A----A-CA----C------A---A-G-AAGTTA-A-------TA--CCAC-CG--AT----C------T-CT-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGAT---GT--TATCCATAACTT--------TTTGA-TA-CCC-GAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTTG-----CGGT-GCAA---------T--TTAGCAAT-CT--T---T-ATGAAT-ATTAGA-TGACA----TTAAAGACA--TTA--CAA-AT---AC-CTG-T-C-------TA-GT-TT-----------GATGGAGGA-T-T-TATT-G--TACAGA----GGGGC-GTG-A--------C----T-CG-------------------GAC-TG--C-CAC-GCCCCCT----T-TA--CAATACA-A----T--TC---CAT-ACAA-A-C-AAAAG-----A-CA-G--TTAAA-CTG-TAAAATATAAatta
gi|12 : TTTTGCTTTA-CAAA-TCC-----T------A-GTGGCTC-A---TGCA-TA-TATTGAAAT-TAACAGT-A-TGACAT-CCAATTCA-TTTTAAA-A----AACATAAGC-----CA---ATA-AAGTT--A------ATAC-ACTC-AA--AT----C------TGCC-A-T--G-T--TGA
gi|16 : attcacgtcattaaaaatgactcaaaaatagtaaagagctttaagggggaggtgtttaaccagcccactggggccttgcagcggcccagaccccctactcacgaactcccccccctccctttcctgaattcattgatccacccgggtaaattttatgcatgcaatgaagtatggtaccaatcccgttatgttcaatactttccttctcgtggtgttttttttgttttctgttttttttttA-TA-T-TTTAAGC-CA-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTT---A-A----AACA----CA----CG---A-A-AAGTTA-G-------T----GCCACT--AT----C------T-CC-A-T--G-T--TGAA---------------------------A-TT--------TT-GA-CAACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT---------T--TT-GCAATGCTA-T---TTGTGAAT-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-AT---A--CTT-C-CTT-----TC-GT-TT----------GAATGGA--A-T-T-TATT-G--CACAGA----GGAAC-GTG-ACATGCAGTC----T-C
gi|17 : aaA-T-TTGAA---TA-A-GT-AATGACCC-CAAAGTCA-TTTT--T-A----A-CT----C-----TA---A-A---GTTA-GT-----ATA--CG-------AT----C------T-CA-AAT--G-T--TGAA-TGT-A-C-GAT-G-TT--T-TTCA--ACTT--------TG-AA-AA-CCC-CAA---TCAACTA-----CGT-AAAATCG-----C-GA-GCA----------T--TTAGCAATGCTG-T---T-ATGAacaaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataac
gi|14 : T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTTA--A-A----AACA----C-----TG---A-A-AAGTTA--------------GTG-CC--ACTGATC------T-CC-A-T--G-T--TGAA---------------------------A-TT--------TT-GA-CAACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT---------T--TT-GCAATGCTA-T---TTGTGAAT-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-AT---A--CTT-C-CTT-----TC-GT-TT----------GAATGGA--A-T-T-TATT-G--CACAGA----GGAAC-GTG-ACATGCAGTC----T-Ccttatttttacatatattgtacagaagggcatgacaatctccgtcactgcgctactcgacagcacgccctcttaaaataaatttccataacaaaaatatagtactgttgaatataaa
gi|34 : tgttttctgtaacttttataaatatatttaagccat-CCAATTCA-TTTT--C-A----GACT----T-----TATACA-A-AAGTCA-A-------TGCCAGTG-----AT----C------C-CC-G-T--G-T--CGAA-TGT-A-GTGAT-T-GTCGT-TCCacaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataa
gi|22 : agAT-T-GT--T-TCCA--ACTT--------TT-GA-CA-CCC-CAGATTTC--CTATGTCACGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA---------C--TTAGCAATGCTG-T---T-ATGAAT-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-AT---A--CTG-T-CTT-----TC-GT-TT----------GTATAGA--A-T-T-GAAT-G--C-----------TGC-GCA-A--------C----T-CG--------------------AC-TG--C-CAC-GCCCCTC----TGTA--CCAAA-A-A----T--TC---CAT-ACAA-A-C-GAAAG-----A-CA-G--T---A-CTG-C-AAATATAAcaattataaa
gi|24 : --ACTT--------TT-GA-CA-ACAGCTGGCTTA--TGA-----CGC-TATATCA-----C-GT-GCAA---------T--TTTGCAATGATG-TTAAT-ATGAAT-ATC-CA-TGGCATAGTT--AAGGC-ATTTA--C-AGAT---AT-CTG-c
gi|32 : aaCCA-T---T-ACGAAT-GTT-AA-TGACA--------AGTCG-TTCAAAC-ATAT---A--CTT-T-CTT-----TC-GT-TT----------ATGTGGA--A-T-T-AAGT-T--CACAGA----GGGGC-GTG-A----CAGTC----T-CGatacctttttttcactgcaactcccttctgtataataaacccaatacaaaagaaacaaagtactatatataa
gi|8 : ATTTA--C-A-GT---A--CTT-T-CTT-----TC-GT-TT----------GTATAGA--A-T-T-TATT-G--TACAGA----GGGGC-ATG-G----CAGTT----T-AGT--C-GC------AC-----AG-TG----------------------A--CAATA-A-A----T--TA---CAT-TTGA-A-C-AAAAG-----A-AA-G--T---A-CTG-T-AAATGTctg
gi|4 : caagacccactggggaccttgaggcagcctccagatcccctaccatatgaagctcccccccccccccacctcttcttcaattccttgatgcatgcaatgattctcagttgcaaaagtacttactgtgcccaataccattatgcccaatcagttactcagttttattacatcctagtatgtactatgcatatttgagataacgtaacggcatccaattcatttcaaaacaccaaaaagttaatgccattgatatccatgatggatgtagcgattttagttcctacttccaaattttttacaaccccagactccctacatcacgtcacgtccaaatatgcaatgttattatgaatattcatgacacaagATTTA--C-A-GT---A--CTG-T-CTT-----TC-GT-TT----------GTATGGA--A-T-G-TTTG-G--TACAGA----GGGGC-GTG-G----CAGTC----G-AGT--C-Gat
gi|22 : acatgtattcagtgatcaaaacttaaaagatgcagcgtctaaagaaaataaccataacatatgttcaattaacacaccgagtttagcacacttaattggaagatttaaagggaaccccccccgcctcttactattttccaatttaaataaatcataatccttgtttttgttcaataagaaccaatagcgatgaagaagcttcataattcttccgctcgttagatgaaagcaatgacaaagatctattgatctattgtgtcttttgaattgctattcgtaatttcatattgttaataagaaactttgaagaatctgtgttatttcattaatttttaacgcgtacaaaaaatgaccaattaatagtaaccacggcttcgggtgggggacgaagaccaatgtgggccttgagcggactccagacccccttaccgtcacgcccacctcgacatttcaacattcattgatctacccaagtacaatgcatgcaatgagtacttaccatgaccaatcccgttatgttcagtccgttactctcaggtgggttttttctacactactctagtgcaatgcatattttgaaataacgtgaaggatccaattattttaaccacaaaactaaagaagttaatacaccgatctccaatgtttgaatgctgcgttatgtttcaacttttgaccaccccagacttctacgtgcacgtgcatgcgacctttatcaatgctcttcctacgtcacgtcgcatgcaacttagcaatgctgttctgaacatttatgacataagacatttacaatgctgctATTTG--C-A-GT---A--CTG-T-CTT-----TC-GT-TT----------GTATGGA--A-T-T-TTTG-G--TACAGA----GGGGC-GTG-G----CAGTC----G-AGT------TGCGCAGC-----AT-T--------------------------CAA----------T--TC---TAT-ACAA-A-C-GAAAG-----A-CA-G--T---A-TTG-T-AAATGTataa
gi|14 : attgtttccaacttttgacaccccagatttcctatgtcacgtcacgtcgcgtgcaacttagcaatgctgttatgaatattcatgacacaagATTTT--C-A-AT---A--CTT-T-CTT-----TC-AT-TT----------GTGTGGA--A-T-T-TATT--------------------GTG-A----GA-----------------CTGCA------------TG--T-CAC-GTTCCTC----TGTG--CAATA-A-A----T--TC---CAT-TCAA-A-C-GAAAG-----G-AA-G--T---A-TTA-T-AAATGTataac
gi|16 : tgttttctgtaacttttataaatatatttaagccattaaggcatctgattcatttaaaaacactgaaaagttagtgccactgatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagATTTT--C-A-AT---A--CTT-T-CTT-----TC-AT-TT----------GTGTGGA--A-T-T-TATT------------------T-GTG-A----GA-----------------CTGCA------------TG--T-CAC-GTTCCTC----TGTG--CAATA-A-A----T--TC---CAT-TCAA-A-C-GAAAG-----G-AA-G--T---A-TTA-T-AAATGTataa
gi|17 : aaatattttaagccattaaggcatctgattcatttaaaacacacgaaaagttagtgccactatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagATTTAG-C-A-AT---G--CTG-T-TATGAC--TT-AT-TT-------------TTAC--A-T-A-TATT-G--TACAGA----AGGGC-ATG-A----CAATC----TCCGT--C-ACTGCGCTACT-C-GAC-AG----CAC-GCCCTCT------TA--AAATA-A-AT---T--TC---CAT----A-A-C-AAAAAT----A-TA-G--T---A-CTGTT-GAATATAAAataac
gi|10 : atttgaataagtaatgaccccaaagtcatttttaactctaaagttagtatacgatctcaaatgttgaatgtacgatgtttttcaactttgaaaaccccaatcaactacgtaaaatcgcgagcTTTA--C-A-GTTTAA--CTG-T-CTT-----TT-GT-TT----------GTATGGA--A-T-TGTATT-G--TAAAG-----GGGGC-GTG-G----CAGTC-------------------------C-GA---G--T-CAC-GCCCCTC----TGTA--CAATA-A-A----TCCTC---CAT--CAA-A-C---TAG-----A-CAGG--T---ATTTG-T-AA
gi|1 : aaatgcatgcaatgaagtactttgccggcccaatcccattactcgctgggttaatttatttcaccatcctatgtagctagtgccatacatatttgaaatatgtaatgagatccaatacatttcaaacacaagaagttaataccaccgatctctatgttgaatgtagcgatgttatccataactttttgatacccgagacttcctacgtcacgttgcggtgcaatttagcaatctttatgaatattagatgacattaaagacaTTTA--C-A-GT---AAACTGGT-CTTCGAGTTT-GT-T-------------ATGGA--A-C-T-TTTT-GCGTACAGGTGAGGGGGCAGTGTG----CAGTCGGAGT-CG---C-GCAGC-CGACG-A-GAC-TGGGT-CAC--TCACTC----TGTA--CCATA-AGA----T--TC---CAT-ACAAGA-C-GAAAG-----A-CA-G--T---A-TTG-T-AAATatataa
gi|7 : cttgtgtacactagatgcggcactttttccttgatcttagcctgtgctttaaatcagacagaaaacggttgagcaggatcaccaacgatacacattaactctaggcggcggagcttacccgctacataacttccagggaactgttactatacttcccagtcataaaaatcaggaaaggcagcgatttgaaacatttattcagtgattcaaaacgttaataataatgcagtgataaacaattctaagcttaaacatctatgttacattaacacgccggagtttttagcacacttagattggcaagaatttaaagggagcgcccccccccccccccaatagatttctcaacttaaataaatcataaatctttttgtttcgtaaaacaatagcattaaaagaagcaattcattcttccgctctacagaatccaatttgacaagatctaaaattgacatttattgtgtttttattgggtaattcatataatttttaattataagaaacttagatttgtatgttattttaatttatttcagtcagttaaaaatgaccaaaatagtaaacagctttagggttggggttacaagacccactggggccttgaggtagcctccatgactccctacctcacgactcttcacccccctcttccctcccctcactgccaaagcttacttgatcccacccctcagcttaaaatgcatgcaaacttcaaccagctacttactcgtgcccaatgcccgtatggttcaactcctaagcttaccgtcccaggttgtttattttttttaacacaatcctagtgcccaccttgcactatttgaaatatactaatggcattccaattcacttttaaaacacactaaactaagagagtataataccaccaccgattccattgactgaatgttatgcgattatttccaactttttgatcaccccagactttctacgtcacgtcgcgtcgcaatctcacgatcttagcaatactgttatgaattattcactgaatcaagacaTTA--C-A-GT---A--CTG-T-CTT-----TC-GT-TT----------GTATGGA--A-TGT-TTTG-G--TACAG-----GGGGC-GTG-G----CAGTC----G-AGT--C-GCGAGGCGACT-C-GAC-TG--C-CAC-GCCCCTC----TGTAC-CAATA-A-AAATTT--TCCCATAA-ACAA-ACC-AAAAG-----A-CA-G--T---A-CTG-T-AAATGTatta
gi|17 : aagacccactacctcacgacctccccccccccctcaacttcacattcattgatccacccgagtaaatatttatgcatgcagatgaagtacttaccgtgcccaatcccgttatgttcaatcctttactcttgggtgtttttgttttacaaatcctgtgccatgcatattgaaaatacgttaaaggcatccaatcattttagaaacactaagccaaaaagttatacccacaagatctccatgttgaactgttgcgattgtttctaacttttgacaccccagacttcctacgtcacgtcgaatgcaacttagcaatgctgtttatgaatattcatgacacaagA--C-A-GT---A--CTA-TATTT-----TT-GT-T-------------ATGGA--AAT-T-TATT-T--TA-AGA----GGG-C-GTG------CTGTC----G-AGTAGC-GCAGTG--ACG-GAGAT-TG--T-CAT-GCCCTTC----TGTA--CAATA----------------TAT-GTAA-A-A-ATAAGTCATAA-CA-G--C---A-TTGCT-AAATtata
gi|30 : atttgaataagtaatgaccccaaagtcatttttaactctaaagttagtatacgatctcaaatgttgaatgtacgatgtttttcaactttgaaaaccccaatcaactacgtaaaatcgcgagc---A--CTG-T-CCT-----TC-GT-TT----------GTATGGA--A-T-C-TGTT-G--TAC-GA----ATGCA-ATG-A----CA---------CGT--C-Gtgaatataaa
gi|2 : atattcggcacttttccctttgatttaatgtaatttgacggttattctttgatccacgttct-----TT-GT-TT----------GTATGGA--A-T-T-TATT-G--TACAGA----GGGGA-GTG-G----CAGTC----G-AGT--C-GCctgctaatata
gi|30 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacCT-C-GACGTG--T-CATTGCA--TT----CGTA--CAACA-G-A----T--TC---CAT-ACAA-A-C-GAAGG-----A-CA-G--T-----CTG-C-TAATATA
gi|32 : atattcggcacttttccctttgatttaatgtaatttgacggttattctttgatccacgtt-GAC-TG--T-CAC-GCCCCTC----TGTG--AACTT-A-A----T--TC---CAC-ATAA-A-C-GAAAG-----A-AA-G--T---A-
gi|24 : ccattacgaatgttaatgacaagtcgttcaaacataAC-TG--C-AAC-TCCCTTC----TGTA--TAATA-A-A----C--CC---AAT-ACAA-A-A-GAAAC-----A-AA-G--T---A-CTA-T---ATATAAtcgctg
gi|14 : aaacttttgacaacagctggcttatgacgctatatcacgtgcaattttgcaatgatgttaatatgaatatccatggcatagttaaggcatttacagatatctgatacctttttttcA--CAATA-A-A----T--TC---CAC-ACAA-A-T-GAAAG-----A-AA-G--T---A-TTG-A-AAATATAA
gi|16 : tgttttctgtaacttttataaatatatttaagccattaaggcatctgattcatttaaaaacactgaaaagttagtgccactgatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagacatttataatacttcctttcgtttgaatggaatttattgcacagaggaacgtgacatgcagtctcAATA-A-A----T--TC---CAC-ACAA-A-T-GAAAG-----A-AA-G--T---A-TTG-A-AAATATAA
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): ATCATACATATTTTTGTCTCATAATTACAAAGGGGTGGCGAATAAAAGAAGCGGAAACATGGTCTTCCAGCTCTTAGAGAGAATTCAATGACAAATGGATCTATTGGATCTATTGTTTAAAAACTTTTACTTAAAGGCTAGGACTTCCAATAGCTTGCATTTTTTATCCACAAACCAAAAAAAACACTTTAAGATTTGGATTATTTCA
Unaligned ( gi|25 ): GATTTAAGGTGGATGCATCTGTAGGCACCCCTAAAATTTTCAAATGGTAGATTATGATCTTTTGTATCAAAAATAGAATGATAAAAAAGCAATCATTTTTCCACTATCAGCACAGAGAAATATTACTTTGATACATTGTTACTTTTATTAGAAGA
Unaligned ( gi|41 ): ATGACGTCATTTTATGGAGGAATCCATGATAAGTA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 99999999999999999999 111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444 555555555555555555555555555555555555555555 111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 1111 11 11111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 333333333333333333 11111 1111111111 6666666666666666666666666666666 33333333333333333333333333333 11 11111 111111111111 777777777777777777777777777 1111111111111 11111 111111111111 111 1111111 11 444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 5 66 33 2 2 4 2 666666 2 2 2 3 555555 22222222222222222222 2 2 2 77 55 2 333 66 2 2 2 33 5 2 5 2 2 33 2 33 555 2 44 33 2 555 3 555 2 7 4 4 0 4 3 3 55 3 55 000000 55 0 6 44 555 7777 3 44 3 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222 44 3 77 777777777777777777777777777777777777777777 7777 7777 4 3 55 7 000 44 88888 44 3 3 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 6666 5555 5 0 6666 999999999 3 3 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 555 88 3 5 44 3 3 3 77777 3 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5 888 000 5 0000 5 0 5 4 888 99 8888 6666 22 00000 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 66 4 777 999999999999999999 4 0 00000 5 9 5 9999999999 66 5555555555555555555555555555555 66 33333333333333333333333333333 5 11 5 888 4 7 3 88 33333 8 3 3 44 3 7777 777777777777 3 3 000000000000000000000000000 999999 3 3 3 44 3 44 3 999 3 9999999999999 3 3 44 0 6 6 3 6 3 444 88888 3 66666 3 3 444444444444 3 66 000 6 3 3 3 6666666 0 66 99 2 66 2 0 555 2 2 999 66 77777 2 555555555555555555555555555555555555555555555555 3 33 3 0 6666 77 0 3 3 6 44 44 555 3 55
lowQualScore : . .. .. . . . . ...... . . . . ...... .................... . . . .. .. . ... .. . . . .. . . . . . .. . .. ... . .. .. . ... . ... . . . . . . . . .. . .. ...... .. . . .. ... .... . .. . . ................................................... .. . .. .......................................... .... .... . . .. . ... .. ..... .. . . ................................................................................................................................... .... .... . . .... ......... . . ........................................................................................ . ... .. . . .. . . . ..... . ................................................................................................................................... . ... ... . .... . . . . ... .. .... .... .. ..... ........................................................................... . .. . ... .................. . . ..... . . . .......... .. ............................... .. ............................. . .. . ... . . . .. ..... . . . .. . .... ............ . . ........................... ...... . . . .. . .. . ... . ............. . . .. . . . . . . ... ..... . ..... . . ............ . .. ... . . . . ....... . .. .. . .. . . ... . . ... .. ..... . ................................................ . .. . . .... .. . . . . .. .. ... . ..
lowQualScore : 3 33 77 4 4 2 1 111111 0 0 0 8 888888 77777777777777777777 2 2 2 55 66 5 555 33 9 9 7 77 3 7 7 9 9 99 9 99 000 9 55 99 9 000 1 444 6 3 0 0 5 0 6 6 00 6 00 555555 00 2 7 66 888 1111 3 66 3 6 222222222222222222222222222222222222222222222222222 22 1 33 888888888888888888888888888888888888888888 7777 8888 0 6 00 3 222 66 33333 66 3 3 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 6666 7 8 5555 222222222 1 1 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 9 444 55 1 8 22 1 1 1 77777 1 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 888 222 0 6666 0 2 0 4 000 55 5555 2222 00 00000 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 11 4 888 111111111111111111 4 1 55555 0 4 0 0000000000 99 2222222222222222222222222222222 99 22222222222222222222222222222 0 99 0 888 0 3 6 22 55555 2 3 3 66 3 1111 111111111111 3 3 111111111111111111111111111 666666 3 3 3 66 3 66 6 777 3 6666666666666 3 1 22 2 7 7 3 7 3 888 33333 3 77777 3 3 888888888888 5 77 888 2 3 3 3 8888888 5 22 00 7 11 9 7 000 9 9 444 88 11111 9 222222222222222222222222222222222222222222222222 1 88 1 2 5555 33 2 1 1 2 22 66 888 3 99
consensus : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-CTTTT-T-CCTTT------GAT-CTTA-G-C-TGTA------CTTTAAATCA---GA--C----AGAAA-A-CGG-TT-G--GCAGAATT--CC-AA-C-CGTA--CA-AT-AA-CTTCT--A-GG-GG-CGG-AGCT-T--A-G--C---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-TACTATA-AC-TTCCAGC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGCAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TGAA------------AA-----C-T-T-----------------A---AN----A--AAT-GCAG--C-----------------ATAA------CT-------------T----ATG---TT-TC-AATTAACA--CG-CGT-AG--TTTA-----G--C-AC-ACT--------------T------------TTAA-AG------GGA--G-------CCCCCC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------A----A--G-A-TAAATCATA----A--T-----NTTTT-GT-T--------------------C---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TCAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TAGA-GAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTCCGGGATCCAACGCCAAGACCC-ACTG---GGG-G-CCTT-GA----GG-CGGCC-TCCA-GACCCCCT-ACC--TCAC----GAANC-TCA-CCCC-----CTC--C---C---CC-----T------------------TC-----------CA-----GT---A----AAT------GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T---CNCGG--G--GT----------------GTTTT--TTTT-----------A-CACATCCTA------TA-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-G-TAATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA-----C-CA---A-A-AAGTTAA------ATA-GC----C--C----GATC------T-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTG-T---T-ATGAA-TATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTT---TC-GT-TTG--TATGGA--A-----T-TTATT-G-TACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
Reference ( family-888 ) : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-CTTTT-T-CCTTT------GAT-CTTA-G-C-TGTA------CTTTAAAT-----GA--C----A-----A-CGG-TT-G--GCAGAATT--CC-AA-C-CGTA--CA-AT-AA-CTTCT--A-GG-GG-CGG-AGCT-T--A-G--C---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-TACTATA-AC-TTCCAGC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGCAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TGAA------------AA-----C-N-T-----------------A---AN----A--AAT-GCAG--C-----------------ATAA------CT-------------T----ATG---TT-TC-AATTAACA--CG-CGG-AG--TTTA-----G--C-AC-ACT--------------T------------TTAA-AG------GGA--G-------CCCCCC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------A----A--G-A-TAAATCATA----A--T-----NTTTT-GT-T--------------------C---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TAAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TAGA-GAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCTAACGCCAAGACCC-ACTG---GGG-G-CCTT-GA----GG-CGGCC-TCCA-GACCCCCT-ACC--TCAC----GAANC-TCA-CCCC-----CTC--C---C---CC-----T------------------TC-----------CA-----GT---A----AAT------GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T---CNCAG--G--G-----------------GTTTT--TTTT-----------A-CACATCCT-------TA-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-G-TAATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA-----C-CA---A-A-AAGTTAA------ATA-GT----C--C----NATC------T-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTG-T---T-ATGAA-TATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-GTA-CTGTCTT---TC-GT-TTG--TATGGA--A-----T-TTATT-G-TACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
gi|1 : TTGTGTACA--CTAGATGCGGC-A-CTTTT-T-CCTT-------GAT-CTTA-G-CCTGTG------CTTTAAATCA---GA--C----AGAAA-A-CGG-TT-GA-GCAGGATCA-CC-AA-C-GATA--CACATTAA-CT-CT--A-GGCGG-CGG-AGCT-T--A-C--C---CGCTAC--AT--A-AC---TTC-CAGGG---AACTGTTACTATA-CT-TCCCAGT-CATAAAA-ATC--AGGAAAGGCAG--CGA-------TT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATTCAA------------AA-----CGT-T-----------------A---AT----AATAAT-GCAG--TG----------------ATAAACAATTCTAAGCTTAAACATCT----ATG---TT-AC--ATTAACA--CGCCGG-AGTTTTTA-----G--C-AC-ACTTAGATTGGCAAGAAT------------TTAA-AG------GGA--GCGCCCCCCCCCCC---C------C---------CC------------AATAGA--TTT-------C----T------C-------AACTTA--A-A-TAAATCATA----AATC-----TTTTT-GT-TTCGTAAAA------------C---------------AATAGCAT--------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AATTCAT--TCTT-CC-GCTC-------TACA-GAA
gi|1 : cCAAGACCC-ACT----GGG-G-CCTT-GA----GG-TAGCC-TCCATGACTCCCT-ACC--TCAC----GACTCTTCACCCCC-----CTC--T---T---CC-----C------------------TC-----------Ctccaatttgacaagatctaaaattgacatttattgtgtttttattgggtaattcatataatttttaattataagaaacttagatttgtatgttattttaatttatttcagtcagttaaaaatgaccaaaatagtaaacagctttagggttggggttacaagacccactggggccttgaggtagcctccatgactccctacctcacgactcttcacccccctcttccctcccctcactgccaaagcttacttgatcccacccctcagcttaaaatgcatgcaaacttcaaccagctacttactcgtgcccaatgcccgtatggttcaactcctaagcttaccgtcccaggttgtttattttttttaacacaatcctagtgcccaccttgcactatttgaaatatactaatggcattccaattcacttttaaaacacactaaactaagagagtataataccaccaccgattccattgactgaatgttatgcgattatttccaactttttgatcaccccagactttctacgtcacgtcgcgtcgcaatctcacgatcttagcaatactgttatgaattattcactgaatcaagacaatttacaatactgtctttcgtcttgtatggaatcttatggtacagagtgagtgacccagtctcgtcggctgcgcgactccgactgcacactgccccctcacctgtacgcaaaaagttccataacaaactcgaagaccagtttactgtaaaatta
gi|1 : cttgtgtacactagatgcggcactttttccttgatcttagcctgtgctttaaatcagacagaaaacggttgagcaggatcaccaacgatacacattaactctaggcggcggagcttacccgctacataacttccagggaactgttactatacttcccagtcataaaaatcaggaaaggcagcgatttgaaacatttattcagtgattcaaaacgttaataataatgcagtgataaacaattctaagcttaaacatctatgttacattaacacgccggagtttttagcacacttagattggcaagaatttaaagggagcgcccccccccccccccaatagatttctcaacttaaataaatcataaatctttttgtttcgtaaaacaatagcattaaaagaagcaattcattcttccgctctacagaatccaatttgacaagatctaaaattgacatttattgtgtttttattgggtaattcatataatttttaattataagaaacttagatttgtatgttattttaatttatttcagtcagttaaaaatgaccaaaatagtaaacagctttagggttggggttaCCTCC---CC--TCACTGCCAAAGC-TTA-CTTG-----ATC--C---CA--CC-----C------------------CT-----------CA-----GCTTAA----AAT------GCATG-C--A-AACTTCA--------------ACCAGCTACTT-ACTCGTGCCCAATGCCCGT-ATGGTTCAACTCCTAAGCTTACCGT---CCCAG--GTTGTTT--------------ATTTT--TTTT-----------AACACAATCC-------TA-GTG--CCCACCTTGCACTA-T-TTGAAATATA-C---TAATGGCATTCCAATTCACTTTT--A-A----AACA-----CACT---A-A-A--CTAAGAGAGTATA-AT----A--C----CACCACCGATT-CC-A-TTGA-C--TGAA-TGTTATGCGA-T-T---AT------T-TCC-A--ACTTTTTGATC-A-CCC-CAGACTTT--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GTCGCAA--TCTCACGATCTTAGCAATACTG-T---T-ATGAATTATT-CACTGAAT----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTT---TC-GTCTTG--TATGGA--A-----TCTTATG-G-TACAGAGTGA-GTGACC--CAGTCT-CGTCGGCTGCGCGACTCCGAC-TGCACACTGCCCCCTCACCTGTACGCAAAA-AG-TTCCATAACAAACTCGAAGACCAGTTT---ACTG-T-AAAcctcactgccaaagcttacttgatcccacccctcagcttaaaatgcatgcaaacttcaaccagctacttactcgtgcccaatgcccgtatggttcaactcctaagcttaccgtcccaggttgtttattttttttaacacaatcctagtgcccaccttgcactatttgaaatatactaatggcattccaattcacttttaaaacacactaaactaagagagtataataccaccaccgattccattgactgaatgttatgcgattatttccaactttttgatcaccccagactttctacgtcacgtcgcgtcgcaatctcacgatcttagcaatactgttatgaattattcactgaatcaagacaatttacaatactgtctttcgtcttgtatggaatcttatggtacagagtgagtgacccagtctcgtcggctgcgcgactccgactgcacactgccccctcacctgtacgcaaaaagttccataacaaactcgaagaccagtttactgtaaaatta
gi|10 : cttgtgtacactagatgcggcactttttccttgatcttagcctgtgctttaaatcagacagaaaacggttgagcaggatcaccaacgatacacattaactctaggcggcggagcttacccgctacataacttccagggaactgttactatacttcccagtcataaaaatcaggaaaggcagcgatttgaaacatttattcagtgattcaaaacgttaataataatgcagtgataaacaattctaagcttaaacatctatgttacattaacacgccggagtttttagcacacttagattggcaagaatttaaagggagcgcccccccccccccccaatagatttctcaacttaaataaatcataaatctttttgtttcgtaaaacaatagcattaaaagaagcaattcattcttccgctctacagaatccaatttgacaagatctaaaattgacatttattgtgtttttattgggtaattcatataatttttaattataagaaacttagatttgtatgttattttaatttatttcagtcagttaaaaatgaccaaaatagtaaacagctttagggttggggttacaagacccactggggccttgaggtagcctccatgactccctacctcacgactcttcacccccctcttc---A----AAT------GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TACTTTGC-CG-GCCCAAT-CCCATTA--------------------C--T---CGCTG--G--GTTA--------------ATTTA--TTTC-----------A-C-CATCCTATGTAGCTA-GTG--CC-A---TACA-TA-T-TTGAAAT--A-T-G-TAATGAGAT-CCAATACA-TTTC--A-A----A-CA-----C--A---A-G-AAGTTAA-------TA-CCA---C--C----GATC------T-CT-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-----GT------TATCC-ATAACTTTTTGA-T-A-CCC-GAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTTG-----CGGT-GCAA--T---------TTAGCAAT-CT--T---T-ATGAA-TATTAGA-TGACA----TTAAAGACA--TTA--CAA-ATACCTGTC-----TA-GT-TTG---ATGGAGGA-----T-TTATT-G-TACAGAGGGGCGTGA--------CT-CG----------------GAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTTTA--CAATACAA-TTCCAT-ACAAA--CAAAAGACAG--TTAAACTG-TAAAATATAAatta
gi|11 : T-T-CCTTT------CAT-CT-A-G-C-TGTG-------TTTAAATAA---GA--C----AGAAA-A-CGG-TT-G--ACAGAATT--CC-AA-A-CGAAA-CA-AT-AA-CTTCT--A-GG-G--CGG-AGCT-T--A-G--C---CG-TAC-AA------C---TTC-CAGG----AACC--TAATCTA-AC-TTCCAAC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAAACAAAACAT------TTT--TGAAAACATTT--AT---T----C-AG--TGA-TGGA------------AA-----C-A-T-----------------A---AAGAACA--AAT-AC-G--C-----------------AAAA------CT-------------T----ATG---TT-T--AATAAA-----G-CAT-AG--TTTA-----G--C-ACCACT--------------TGGTAGAT-----TTAA---------GGA--C-------CCCCTC---C------C---------CCT-----------AATA-A--CTT-------T----T------TTAATTTCA----A--G-A--AAATCATA----A--C-----CTTTTTAT-T--------------------T---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TCAT--TCTT-CC-ACTC-T-----TAGA-TAAAT
gi|12 : CCC-ACTG---GGG---CCTT-GC----AG-CGGCC---CA-GACCCCCT-AC---TCAC----GAACT-CCC-CCCC-----CTC--C---CTTTCC-----TGAATTCATTGA-------TC-----------CACCCGGGT---A----AATTTTAT-GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TA--T-G---GTACC-AAT-CCCGTTATG-TTCAA-TAC---T-TTCC--TT--CTCGT--G--GTGTTTTTTTTGTTTTCTGTTTT--TTTTTTTTTTGCTTTA-CAAATCCT--------A-GTGGCTC-A---TGCA-TA-TATTGAAATT-AACAG-TA-TGACAT-CCAATTCA-TTTTAAA-A----AACATAAG-C-CA---ATA-AAGTTAAT-----ACA-CT----C--A----AATC------TGCC-A-T--G-T--TGAcaatgtcaagatataactgtgtcttttattgggtattttcat
gi|13 : attcacgtcattaaaaatgactcaaaaatagtaaagagctttaagggggaggtgtttaaccag-AG--ATTA-----G--C-GG-A----------------T------------TTAA-AG------GGA--GTGCAC--CCCCTC---CTTCT--C---------CCTG----------AAT-----TTT-------CAAT-T------T-------A----A--G-G-TGAATCATG----G--T-----GTTTT-GG-T--------------------C---------------A---------------TA-------A---------------ACAATAGCAGTAA-AAGATAC--AA-TAAT--CCTT-TC-ACTT-T-----TCGT-GAAAT
gi|13 : CCAAGACCCCACTG---GGG-G-CCTT-AA----CA-CTCCC-TTTA-AATCCCT----------C----GAACC-CCC-CCCC-----CTC--atttctattcattgtatttttttttttttttggattggtataacttaatatttgtgatatcctatcaatctcacgtcattaaaaatgaccaacactagtaaagattttccaggggccccataccaagaccccactgggggccttaacactccctttaaatccctcgaacccccccccctctt
gi|14 : agattagcggatttaaagggagtgcaccccctccttctccctgaattttcaatttaaggtgaatcatggtgttttggtcataaacaatagcagtaaaagatacaataatcctttcacttttcgtgaaatatttctattcattgtatttttttttttttttggattggtataacttaatatttgtgatatcctatcaatctcacgtcattaaaaatgaccaacactagtaaagattttccaggggccccataA-TA-T-TT-AAGCC-A-T---TAA-GGCAT-CTGATTCA-TTTA--A-A----AACA-----C-TG---A-A-AAGTTA-----------GTGCCAC--T----GATC------T-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTA-T---TTGTGAA-TATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTT---TC-GT-TTG--AATGGA--A-----T-TTATT-G-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-Ctt
gi|14 : tgttttctgtaacttttataaatATTTT--C-A-ATA-CTTTCTT---TC-AT-TTG--TGTGGA--A-----T-TTATT--------------GTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataa
gi|15 : tgttttctgtaacttttataaatatatttaagccattaaggcatctgattcatttaaaaacactgaaaagttagtgccactgatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagTTGTGT-CA--C--GATGCGGT-A-GTTAT-T-GCTTT------GAT-CTTA-G-C-TGTA------CCTTAAATCA---GA--C----AGAAA-A-CGG-TT-G--GCAGATTT--CC-AA-C-CGTA--CA-AT-AA-CTTCT--A-GG-GG-CGG-AGAT-T--A-G--C---TG-TAC-TAT--A-AC---TTC-CAGGG---GTCTG-GATTATA-AC-TTCGAGC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGCAA--CGA------TTT--TTAAG-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TAAA------------AAT----T-T-T-----------------T---AA----A--AAT-GCAG--CTTATAAACAGATTAAGTATAA------AT-------------TAAGCATG----T-TC-AATTAACA--CG-CGG-AG--TTTA-----G--C-AC-ACT--------------T------------ataa
gi|16 : atA-TA-T-TTTAAGCC-A-T---TAA-GGCAT-CTGATTCA-TTT---A-A----AACA-----CACG---A-A-AAGTTAG-------T--GC----CA-C----TATC------T-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTA-T---TTGTGAA-TATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTT---TC-GT-TTG--AATGGA--A-----T-TTATT-G-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-Ca
gi|16 : aaATTTT--C-A-ATA-CTTTCTT---TC-AT-TTG--TGTGGA--A-----T-TTATT-------------TGTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataac
gi|17 : aaatattttaagccattaaggcatctgattcatttaaaacacacgaaaagttagtgccactatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagA-T-TTGAA-TA-A---G-TAATGACCC-CAAAGTCA-TTTT--T-A----A-CT-----C-TA---A-A---GTTAGT-----ATA----------C----GATC------T-CA-AAT--G-T--TGAA-TGT-A--CGA-T-G---TT------T-TTC-A--ACTTTG-AA-A-A-CCC-CAA---TCAACTA-----CGT-AAAATCG-----C-GA-GCA---T---------TTAGCAATGCTG-T---T-ATGAataac
gi|17 : ATTTAG-C-A-ATG-CTGTTATGACTT-AT-TTT--TAC-----A-----T-ATATT-G-TACAGAAGGGCATGA----CAATCTCCGTC-ACTGCGCTACT-CGAC-AG--CAC-G-CCC----TCT-TA--AAATA-AATTTCCATAACAA-----AAATATAG--T---ACTGTT-GAATATAAActtatttttacatatattgtacagaagggcatgacaatctccgtcactgcgctactcgacagcacgccctcttaaaataaatttccataacaaaaatatagtactgttgaatataaa
gi|18 : atttgaataagtaatgaccccaaagtcatttttaactctaaagttagtatacgatctcaaatgttgaatgtacgatgtttttcaactttgaaaaccccaatcaactacgtaaaatcgcgagcC-AATTAACA--CG-CCG-AG--TTTA-----G--C-AC-ACTTAAGTGGCAGA---T------------TTAA-AG------AGA--G-------CCCCCTGCAC------C---------CC------------AATA-A--TTT-------CCAATT------T-------A----A--G-A-TAAATCATA----A--TC----ATTTT-GT-T--------------------C---------------ATAAAAAAATAGCGA-TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TCAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TAGA-GAAA
gi|19 : GTGT-CAAAT--GGCGTGGC-AACCTTT-C-CCTTTTATGAAAAT-CAGA-G-C-AG------------AAAT-----A------------------G-TT-G--GCAGAATT--TA-AA-A-CGTA--CA-AT--A-CTTCT--AGGG-GG-TGG-AGCT-T--A-G--C---TG-TAC-AATCAA-ACCTTTTC-CAGGG---AACTGTTACTATACACATTTTAAC-AAA-AAACAT---A-GAAAGG-AA--CAAAATATTTTT--TGTAA-CA-TT--AT---T----CAAG--TGA-TAAA------------GA-------------------------------------A--AGT-GCAG--T-----------------ATAacaatgacaagatatattgatttattgtcttttattgggtaattcgtatttcatatttaataagaaactttaagat
gi|2 : tgTGCG-C-A-CTTCTAT-TTTCT------GGTGCTTAAG-CATGTAACGTATCTTTAAATCA---GA--CTGGTA-----A-CGGGTT-GCGGCAGAATTGCCCGAA-CACGTAAACA-AT-AA-CTTTTGTA-GG-GG-CGG-GGTTGT--ATG--CTTATT-TAC-AAT--ATAC---TTC-CAGGG---caaacaaa
gi|2 : -AAA-ATCGCA-GAAAGGCAA--CGA------TTTGATGAAACCATTCTAATGCGT----C-AGGCCGA-TGAA------------AA-----C-A-C-----------------AGG-AG----A--AATGGCAG--C-----------------CTAA------TC-------------T----Aggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|2 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagA------------AA-----C-AGT-----------------A---AG----A--ACT-GTAGAGC-----------------ATAA------CA-------------T----ATG---TTGTCTAATTAACAACCG-CATTAG--TTAACGTCCGTCC-AC-ACT--------------T------------TCAC--GTACCTTGGA--G-------CCCCCC---C------C---------CCCCGCCCCCCCTAAGTA-A--TTTGCAAAAAT----T------G-------A----A--G-AATCAATCATACATTA--T-----TTTTC-GT-CATGAATGCACAAATGGCGAGC---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-ACAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TTTA-GAAaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|2 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctATCTAACGC-AAGAACC-ACTGTATGTGCG-CCTTTGA----GGGCGACGATCCA-GACCCC-T-ATCCATCAC----GAAA----A-GACC-----TTC--TGATC---CC-----G------------------CC-----------CA----------A----AAT------GCATGGC--A-T---TGA--------------AAA-G-TAGTT------TACTAAGT-ACCGC-ATG-CTCA----------TTAC--TTCGCACAG-------------------------------TTT-----------C-CGG---CT-------TA-GTGT-CC-A---TGTA-TAGT-TTGAAATA-A-C-G-T------------ATTCT-TTCT--A-A----AAC------T-TA---A-A-AAGTT-A------ATA------------------C------T-AC-A-T--G-TACCG-A-TGT-T-GCGATT-T---AT------C-TCC-A--ACT-------------------CCTC--CTA-----CAT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGC-------------A-TATT-CA-TGACA----C--A-----------------TA-CTGTCTT---TC-GT-TTG--AATGG--------------TC-GCTA--------CGCGA--------CT-CG---ACTGC-C-ACT-C--------------CCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CAAtaattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|20 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaA-CTTCT--A-GG-GGGCGG-AGCT-T--A-G--C---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CATGG---AACCG-TACTATA-A----------------A-ATC--A-GAAAGGCAA--CGA------T-----GAAA-CATTT--AT---T----C-AA--TGA-TAAA------------AATGCAAC-T-T-----------------ATAAAC----A--AAT-TAAG--C-----------------AAAA------GT-------------T----ATG---TA-TC-AATTAACA--CG-CAT-AG--TTTA-----G--C-AC-AC---------------T------------TTAA-----------A--G-------CCCCCC---CCCCCTTC---------CC------------AATA-A--TTTTTAA---T----T------T-------A----A--G-A-TAAATCAT
gi|21 : g---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---CGGAA-ACATGGTCTT-CCAGCTC-T-----TAGA-GAGA
gi|22 : atcatacatatttttgtctcataattacaaaggggtggcgaA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGATTTC--CTATGTCACGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTG-T---T-ATGAA-TATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-ATA-CTGTCTT---TC-GT-TTG--TATAGA--A-----T-TGAAT-G-C-------TGCGCAA--------CT-CG-----------------AC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-C-AAATATAAattcaatgacaaatggatctattggatctattgtttaaaaacttttacttaaaggctaggacttccaatagcttgcattttttatccacaaaccaaaaaaaacactttaagatttggattatttca
gi|23 : TGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-CTTTT-T-CCTTT------GAT-CTTA-G-C-TGTA------CTTTAAATCA---GA--CAGAAA-----A-CGG-TT-G--GCA-AATT--CC----------------C-AA-CTTCT--A-GG-GG-CGG-AGTT-T--A-G--C---T----------------------------------G-TACTATA-AC-TTCCAGC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGTAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TCAA------------AA-----C-T-T-----------------A---AT----A--AAT-GCAG--C-----------------GTAc
gi|24 : -A--ACTTTT-GA-C-A-ACAGCTGGCTTA--TGA-----CGC-TATATCA-----C-GT-GCAA--T---------TTTGCAATGATG-TTAAT-ATGAA-TATC-CA-TGGCATAGTT--AAGGC-ATTTA--C-A-Gtaaaaaacttaa
gi|24 : aAC-TGC-AAC-TCCCT----TCTGTA--TAATA-AA-CCCAAT-ACAAA--AGAAACAAAG--T---ACTA-T---ATATAAatatctgatacctttttttcactgcaactcccttctgtataataaacccaatacaaaagaaacaaagtactatatataa
gi|25 : aaacttttgacaacagctggcttatgacgctatatcacgtgcaattttgcaatgatgttaatatgaatatccatggcatagttaaggcatttacagatatctgatacctttttttcC---C------C---------CT------------AA-A-A--TTT------------T------C-------A----AATG-G-TAGATTATG----A--T-----CTTTT-GTAT--------------------CAAAA-----------A---------------TAGAATGATA---------------A----------AA-AAG---C--AA-TCAT--TTTT-CC-ACTA-TCAGCACAGA-GAAAT
gi|26 : gatttaaggtggatgcatctgtaggca----T------T-------A----G--A-A-TAAATCATG----G--T-----CCCTT-GT-T--------------------T---------------AAAAAAAATAACGA--TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TAAT--TTTT-CC-ACTT-T-----TAGA-GAAAattactttgatacattgttacttttattagaaga
gi|27 : tcatatCATTGAGT-CA--T--GGTGCTGC-A-CTT----------------AAT-C--A-G-C-AATG------CTTTAAATCA---GA--CGGAAA-----A-TGG-TT-A--ACAGAATT--CT-AA-C-T-TA--CA-AA-AAACTTCT--A-GA-GGACGG-AGCT-TTCA-GTGC---TG-TAC-ATT--A-AT---TTC-TAGGG---AAACG-TATTAgaaatcaagatattttatttgttgggggaacttgtactctatccaaaaaataatctgaattaaaatttgcg
gi|28 : tg-------CCCCCC---C------C---------CC------------CATT-T--TTT-------C----TCCAAATT-------A----A--A-AGTAAATCATG----A--T-----ATTTT-GT-T--------------------C---------------AG--------------TA-------A---------------A----------AG-AAggcctat
gi|29 : atgtaaatatacTTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-CTTTT-T-CCTCT------GAT-CTTA-G-C-TGTG------CTTTAAAT-----GAGAC----AGAAA-A-CGG-TT-G--GCAGATTC--CC-AA-T-CGTA--CA-AT-AA-CTTTT--A-GG-GA-CGG-AGCT-T--A-G--C---TG-TAC-AAT--A-AC---Tttagatacacgataaaagaagcaatcgttgatttaaataataagatttttgatatattggtacttttat
gi|3 : atCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-CTTTT-T-CCTTT------GAT-CCTA-G-C-TGTA------CTTTAAA---------------------A-CGG-TT-G--GCAGAATT--CC-AA-T-CGTA--CA-AC-AA-GTTCT--A-GG-AG-CAG-AGCT-T--A-G--C---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-TACTATA-AC-TTCCAAC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGCGA--CGA------TTA--CGAAA-CATTC--AT---T----C-TG--TAG-TGAA------------AA-----C-A-C-----------------A---AG----A--TAT-GCAG--C-----------------ATAA------CT-------------T----ATG---TT-TC-AATTAAAA--CG-CAT-AG--TTTA-----G--C-AC-ACT--------------T--------------AA-AG------GGA----------CCCCCT---C------C---------CC------------AATA-A--TTT------------T------T-------A----A--G-A-TAAATCATA----A--T-----ATTTT-AT-T--------------------C---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TAAT--TATT-CC-AATC-T-----TAGA-GAAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTCCGGGATCCAACACCAAGACCC-ACTG---AGA-A-CCTT-GACCTAGG-CGGCC-TCCA-TACCCCTT-ACC--TCAC----GAAGC-TCA-CCCC-----CTC--C---C---CC-----T------------------TC-----------CA-----GT---A----AAT------GCATA-C--A-A---TGA--------------A---G-TATTT-AC-TGTGCTCAAT-CCCAT-ATG-TCCAA-TCC---G-TTAC--T---CGCAG--G--G-----------------GCTTT--TTTT-----------A-CACATCCCA------TA-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGGAATT-A-C-G-TAATGACAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA-----C-CA---A-A-AAGTTAA------ATAAGT----C--C----TACC------T-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GAGA-T-T---GT------T-TCC-G--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTA-T---T-ATGAA-TATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTT---TC-GT-TTA--AATTGA--A-----T-TTATT-G-TACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCTACT-CGAC-TGT-CAC-GCCCC----TTTGTA--CAATG-AA-TTCTAT-ACAAA--CAAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
gi|30 : tATTCGGC-A-CTTTT-C-CCTTT------GAT--TTA-A---TGTA------ATTTGA
gi|30 : atCT-CGACGTGT-CAT-TGCAT----TC-GTA--CAACA-GA-TTCCAT-ACAAA--CGAAGGACAG--T----CTG-C-TAATATAcggttattctttgatccacgttctcgacgtgtcattgcattcgtacaacagattccatacaaacgaaggacagtctgctaatata
gi|31 : atattcggcacttttccctttgatttaatgtaatttgacggttattctttgatccacgttTTGTGT-TA--T--GGTATGAT-A-CATTT-T-CCTTT------GAT-TTTA-T-C-TGTA------CTTAAAATCA---GA--CAAAAA-----A-TGC-TT-G--GC--------TC-AG-C-TGTA--CA-AT-AA-CTTCC--A-GG-G
gi|32 : c-T---T-ACGAA-TGTT-AA-TGACA--------AGTCG-TTCAAAC-ATATA-CTTTCTT---TC-GT-TTA--TGTGGA--A-----T-TAAGT-T-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CG
gi|33 : cca-CTTA-G-C-TATA------TTTTAAATCG---GA--C----ATTAA-A-CGG-TT-G--GCAGAATT--CC-AA-T-CGTA--CT-AT-AA-CTTCT--AGGG-GG-CGG-AACT-T-------------------------AC---TTC-CAGGG---AACctg
gi|34 : -CCAATTCA-TTTT--C-A----GACT-----T-TATACA-A-AAGTCAATG----CCA-GT------------GATC------C-CC-G-T--G-T--CGAA-TGT-A-GTGA-T-TGTCGT------T-CCC-A--ATT
gi|35 : agTGTGT-CAA-T--GATGTGCA-A-CTTTT-T-C-TTT------GAT-CTTA-G-C-TGTG------CTTTAAATCAG--GA--C----AGAAACA-CGG-TTGG--GCAGACTT--TC-ataaa
gi|36 : cTGTGT-CA--T--GATGCAGC-A-CTTTT-T-CATTT------GAT-CTTA-G-C-TGTA------CTTTAAATCA---GA--CAGAAA-----A-CGG-TT-G--GTAGAATT--Ccca
gi|37 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-CTTTT-T-CCTTT------GAT-CTTA-G-C-TGTA------C---A--------GA--A----A-----A-CGG-TT-G--GCAGAATT--CC-AA-C-CGTA--
gi|38 : aTTGTGTTCA--T--GATGCGGTTA-CTTTTTT-CCTTT------GAT-CTTA-G-C-T
gi|39 : TTGTGT-CG--T--GGTGCGGT-A-CATTT-C-CCTTC------GAT-CTTA-G-G-CATA------CTTTAtaattaattcaga
gi|4 : taaagA-CATGT--AT---T----C-AG--TGA-TCAA------------AA-----C-T-T-----------------A---AA----A--GAT-GCAG--CGTCTAAAGAAAATAACCATAA------CA-------------T----ATG---TT--C-AATTAACA--CA-CCG-AG--TTTA-----G--C-AC-ACTTAATTGGAAGA---T------------TTAA-AG------GGA--A-------CCCCCC---C------CG--------CCTCTT--------ACTA-T--TTT-------CCAATT------T-------A----A----A-TAAATCATA----A--TCCTTGTTTTT-GT-T--------------------CA--------------A---------------TA-------AGAACCAATAGCGATGA----------AG-AAG---CTTCA-TAAT--TCTT-CC-GCTCGT-----TAGATGAAA
gi|4 : AAGACCA-A-TG---TGG-G-CCTT-GA----G--CGGAC-TCCA-GACCCCCTTACCG-TCAC----G---C-CCA-CCTCGACATTTC--A---A---CA-----T------------------TCATTGATCTACCCAA----GT---AC---AAT------GCATG-C--A-A---TGA------------------G-TACTT-AC-CATGACCAAT-CCCGTTATG-TTCAG-TCC---G-TTAC--T---CTCAGGTG--G-----------------GTTTT--TTCT-----------A-CACTACTC-------TA-GTG--CA-A---TGCA-TATT-TTGAAATA-A-C-G-TGAAGG-AT-CCAATT-A-TTTT--A-ACCACAAAA-----C-TA---A-AGAAGTT-A------ATA-CA----C--C----GATC------T-CCAA-T--GTT--TGAA-TGC-T-GCGT-TAT---GT------T-T-C-A--ACTTTT-GACC-A-CCC-CAGACTT---CTA-----CGTGCACGT-G-----C-AT-GCGACCT---------TTATCAATGCTC-TTCCT-ACG------T-CA-CGTCG----C--ATG-CAACTTAG-C-A-ATG-CTG---T---TC-----------TGAAC-A-----T-TTA-T-G--ACATAA------GA----CATTTA-CAAT-GCTGCTCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAgcaatgacaaagatctattgatctattgtgtcttttgaattgctattcgtaatttcatattgttaataagaaactttgaagaatctgtgttatttcattaatttttaacgcgtacaaaaaatgaccaattaatagtaaccacggcttcgggtgggggacgaagaccaatgtgggccttgagcggactccagacccccttaccgtcacgcccacctcgacatttcaacattcattgatctacccaagtacaatgcatgcaatgagtacttaccatgaccaatcccgttatgttcagtccgttactctcaggtgggttttttctacactactctagtgcaatgcatattttgaaataacgtgaaggatccaattattttaaccacaaaactaaagaagttaatacaccgatctccaatgtttgaatgctgcgttatgtttcaacttttgaccaccccagacttctacgtgcacgtgcatgcgacctttatcaatgctcttcctacgtcacgtcgcatgcaacttagcaatgctgttctgaacatttatgacataagacatttacaatgctgctcgactcgactgccacgcccctctgtaccaaacattccatacaaacgaaagacagtactgtaaatataa
gi|40 : acatgtattcagtgatcaaaacttaaaagatgcagcgtctaaagaaaataaccataacatatgttcaattaacacaccgagtttagcacacttaattggaagatttaaagggaaccccccccgcctcttactattttccaatttaaataaatcataatccttgtttttgttcaataagaaccaatagcgatgaagaagcttcataattcttccgctcgttagatgaaagcaatgacaaagatctattgatctattgtgtcttttgaattgctattcgtaatttcatattgttaataagaaactttgaagaatctgtgttatttcattaatttttaacgcgtacaaaaaatgaccaattaatagtaaccacggcttcgggtgggggacgTTTT-T-CCTT-------GAT-CTTA-GCC-TGTG------CTTTAAATCA---GA--CAGAAA-----A-CGG-TT-GA-GCA
gi|5 : TTGTTT-CA--T--TGTACGAT-A-CATTT-T-CCTTT------GAT-TTTA-G-C-TGTA------CTTAAAATCA---GA--C----AGAAA-A-TGC-TA-G--GCAGAATT--CT-AA-C-CGTA--CA-AT-AT-GTACT--A-TG-TG-CGG-AGCT-T--A-G--C---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGGTAAAAC----ACTATA-AC-TTCCAA--CAC-AAA-ATC--A-GAAAGGGGA--CGC------TTT--TGTAA-CACTT--AT---TTACCC-AG--TGA-TGAA------------AA-----C-A-T-----------------A---AC----A--AAT-ACAGA-CTATAA------------ACAA------CG-------------T----ATG----T-TC-AAATAACA--TG-CAT-AT--TTTA-----G--C-AC-ACT--------------TAACAGA------TTAAGAG------GGATTG-------CCCACCAT-C------C---------AC------------AAT-----TTT-------CAA--T------T-------A----A--G-A-T-AATCATA----A--------ATATT-GT-T--------------------CCTGT-----------A---------------TA-------ACTGGCGATAT-----A----------AG-AAG---A--AA-TAAT--TCTT-CC-A--T-T-----TAAA-GAAA
gi|5 : CCAACACCC-ATGG---GGG-GGTCTT-GA----GG-CTGC--TCCA-GAGCCC-T-ACC--TCAC----GAAGA-TC--CGTC-----TTCAAC---T---CA-----TTGA---------------TC-----------CG-----CC---A----TAT------ACATG-CTAA-A---TGA--------------C---G-TACTgcaatggacaagatctattgaattattttcttgtatttgggaaatcgtattttcattttgaaaaaaaaaccatgtaagattgtattaatttgatattcgcgtcattaaaatacactaaatagtaagagtttcatgggggcaaccaacacccatgggggggtcttgaggctgctccagagccctacctcacgaagatccgtcttcaactcattgatccgccatatacatgctaaatgacgtact
gi|6 : ttgtttcattgtacgatacattttcctttgattttagctgtacttaaaatcagacagaaaatgctaggcagaattctaaccgtacaatatgtactatgtgcggagcttagctgtacaataacttccagggtaaaacactataacttccaacacaaaatcagaaaggggacgcttttgtaacacttatttacccagtgatgaaaacataacaaatacagactataaacaacgtatgttcaaataacatgcatattttagcacacttaacagattaagagggattgcccaccatccacaattttcaattaagataatcataaatattgttcctgtataactggcgatataagaagaaataattcttccatttaaagaaagcaatggacaagatctattgaattattttcttgtatttgggaaatcgtattttcattttgaaaaaaaaaccatgtaagattgtattaatttgatattcgcgtcattaaaatacactaaatagtaagagtttcatgggggcaaATTGTGT-CA--T--GATGCGGT-A-CTTTT-TTCCCTT------GAT-CTTA-G-C--GTA------CTTTAAATCAACAGA--A----A-----AGCGG-TT-G--GCAGATTC--CC-AATC-CGTA--CA-A--AA-CTTCT--A-GG-GG-CGGCAG-T-T--A-G--C---TG-TACTTAT--A-AC---TTCTCAGGG---AACTG-TACTATA-AC-TTCCAGCACCT-AAA-ATC--A-GATAGGCAA--CGA------TTT--TG-AA-CATTT--A----T----C-AG--TGA-TAAA------------AA-----C-T-TTCAAAATGCAGTGAGTTA---AC----A--AAT-TAAG--C-----------------ATAA------AT-------------T----A-GCATTT-TC-AATTAACA--CGACGG-AG--TTTA-----G--CAAC-ACT--------------TAATTCAGGCAGATTAA-AG------GGA--G-------TCCCCC---C------CCCCCCCCCACC------------AATA-ATCTTT-------CCAATT------T-------A----A--GAA-TAAATCATA----A--TC----CTTTT-GT-T--------------------CGTAAAAAATTAGCGGA---------------TA-------A---------------A----------AGTATG---C--AA-TCAT--TCTTCCC-GCTC-A-----AAGA-GAAAT
gi|7 : A-GACCCACT-ACC--TCAC----GA-CC-TC---CCC-----CCC--C---C---CC-----TCAACTTCACATTCATTGATC-----------CACCCGAGT---A----AATATTTATGCATG-C--AGA---TGA--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---T-TTAC--T---CTTGG--G--T-----------------GTTTTTGTTTT-----------A-CAAATCCT----------GTG--CC-A---TGCA-TA---TTGAAAAT-A-C-GTTAAAGGCAT-CCAA-TCA-TTTT--AGA----AACACTAAGC-CA---A-A-AAGTT--------ATA--C----C--CACAAGATC------T-CC-A-T--G-T--TGAACTGT-T-GCGA-T-T---GT------T-TCT-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----A-AT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGTT---T-ATGAA-TATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-GTA-CTGTCTT---TTGGT-TTGTTTATGGG--AAAATTT-TTATTGG-TACAGAGGGGCGTGG----CAGTCG-AGTC-GCCTCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTGTAC-CAAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T--AATATAtcaatgacaaggtctatgatttattgtttttattgggagcaattccgattttcattttaataagaaactttaaaagattaagtgttatcgtttaatttta
gi|8 : aCAAGACCC-ACTG---GGG-A-CCTT-GA----GG-CAGCC-TCCA-GATCCCCT-ACC--ATAT----GAAGC-TCC-CCCC-----CCC--C---C---CCACCTCT------------------TCTT---------CA-----AT---TCCTTGAT------GCATG-C--A-A---TGATTCTCAGTTGCAAAA---G-TACTT-AC-TGTGCCCAAT-ACCATTATG-CCCAA-TCA---G-TTAC--T---CA--------------------------GTTTT--ATT---------------ACATCCTAG-----TATGTA--CT-A---TGCA-TA-T-TTGAGATA-A-C-G-TAACGGCAT-CCAATTCA-TTTC--A-A----AACA-----C-CA---A-A-AAGTT-A------AT--GC----CATT----GATA------T-CC-A-T--G-A--TGGA-TGT-A-GCGA-T-TTTAGTTCCTACT-TCCAA--ATTTTT-TA-CAA-CCC-CAGACTCC--CTA-----CAT-CACGTCA-----C-GT-CCAA--A---------TATGCAATGTTA-T---T-ATGAA-TATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-GTA-CTTTCTT---TT-GT-TCA--AATGTA--A-----T-TTATT------------------------------GTC-ACTGTGCGACT-AAAC-TGC-CAT-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCTAT-ACAAA--CGAAAGAAAG--T---ACTG-T-AAATAT
gi|9 : -TATA------CTTTAAATCA---GA--C----AGAAA-A-CGG-TT-G--GCAGAATT--CC-AA-C-CGTA--CA-AT-AA-CTTCT--A-GG-GG-TGG-AGCT-T--A-G--C---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AAACG-TACTATA-AC-TTCCCAC-CAT-ACA-ATC--A-GAAAGGCGA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TGAACAAAAGAAATACAG-----C-T-TATC--------------A---AC----A--AAT-TAAG--C-----------------AT-A------CT-------------T----ATG---TC-TC-AATTAACA--CG-CAT-AG--TTTA-----G--C-AC-ACTTCGCAGA-------T------------TTAA-AG------AGA--G-------CCCCCC---C------C---------T---------------------TTT-------------------------------------A-T-AATCATA----A--TA----TTTTT-GT-T--------------------C---------------ATAAAACAAATAGCGATA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TCAT--TCTT-CC-ACTC-T-----TAGA-GAAAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): ATGACGTCATTTTATGGAGGAATCCATGATAAGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 44444444444444444444444444444444444444444444 555555555555555555555555555555555555555555 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 111 1111 11 11111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 333333333333333333 11111 1111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 1111111111 1111111 555555555555555555555 1111111111111 11111 111111111111 11111 22222222222222 55555555555555555555555555555555555555555555555
lowQualScore : 5 66 33 2 2 2 4 2 2 2 3 555555 2 2 2 2 2 55 4 4 33 333 2 33 2 2 2 33 2 2 2 5 2 2 33 66 555 2 88 33 2 555 3 555 2 7 4 4 0 4 3 3 55 3 55 000000 55 33 3 44 555 7777 3 44 3 1 66666666666666666666666666666666666666666666 2 44 3 77 888888888888888888888888888888888888888888 7777 7777 4 3 55 7 888 44 88888 44 3 3 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 555 88 3 44 3 3 3 77777 3 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 0 5 888 000 5 0000 5 0 5 4 888 99 8888 6666 22 00000 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 66 4 777 999999999999999999 4 0 00000 5 9 5 9999999999 66 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 00 4 777 4 7 3 88 9999 3 8 3 3 44 3 7777 7777 7777777777 3 3 0000000 999999999999999999999 3 3 3 44 3 44 3 999 3 9999999999999 3 3 44 0 6 6 3 6 3 444 88888 3 66666 3 3 444444444444 3 3 22222 3 3 3 3 22222222222222 66 2 8 5 1 2 2 999 66 77777 2 88888888888888888888888888888888888888888888888 3 33 3 0 6666 77 0 3 3 6 44 44 555 3 55
lowQualScore : . .. .. . . . . . . . . ...... . . . . . .. . . .. ... . .. . . . .. . . . . . . .. .. ... . .. .. . ... . ... . . . . . . . . .. . .. ...... .. .. . .. ... .... . .. . . ............................................ . .. . .. .......................................... .... .... . . .. . ... .. ..... .. . . ....................................................................................................................................................................................................................................................................... . ... .. . .. . . . ..... . .......................................................................................................................... . . . ... ... . .... . . . . ... .. .... .... .. ..... ........................................................................... . .. . ... .................. . . ..... . . . .......... .. ............................................................................. .. . ... . . . .. .... . . . . .. . .... .... .......... . . ....... ..................... . . . .. . .. . ... . ............. . . .. . . . . . . ... ..... . ..... . . ............ . . ..... . . . . .............. .. . . . . . . ... .. ..... . ............................................... . .. . . .... .. . . . . .. .. ... . ..
lowQualScore : 3 33 77 4 4 2 2 0 0 0 8 555555 1 1 2 2 2 33 4 7 44 555 7 77 9 9 9 77 7 7 7 7 9 9 99 88 000 9 00 99 9 000 1 444 6 3 0 0 5 0 6 6 00 6 00 555555 00 88 3 66 888 1111 3 66 3 6 88888888888888888888888888888888888888888888 1 22 1 33 555555555555555555555555555555555555555555 7777 8888 0 6 00 3 555 66 33333 66 3 3 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 9 444 55 1 22 1 1 1 77777 1 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 7 0 888 222 0 6666 0 2 0 4 000 55 5555 2222 00 00000 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 11 4 888 111111111111111111 4 1 55555 0 4 0 0000000000 99 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 66 4 888 0 3 6 22 8888 6 2 3 3 66 3 1111 1111 3333333333 3 3 8888888 888888888888888888888 3 3 3 66 3 66 6 777 3 6666666666666 3 1 22 2 7 7 3 7 3 888 33333 3 77777 3 3 888888888888 5 7 88888 1 1 1 1 55555555555555 33 7 0 3 7 9 9 444 88 11111 9 11111111111111111111111111111111111111111111111 1 88 1 2 5555 33 2 1 1 2 22 66 888 3 99
consensus : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-G-C-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-A-TAACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-TACTATA-AC-TTCCAGC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGC--AACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TGAA------------AA-----C-TT-----------------A---ANA--AAT-GCAG--C-----------------ATAA------CT-------------T----ATG---TT-TC-AATTAACA--CG-CGT-AG--TTTA-----G--C-A-CACTT-------------T------------TTAA-AG------GGA--G-------CCCC-CC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------A----A--G-A-TAAATCATA----A--T-----NTTTTGT-T--------------------C---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TCAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TAGA-GAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTCCAGGGATCCAACGCCAAGACCC-ACTG---GGG-G-CCTT-GA----GG-CGGCC-TCCA-GACCCCCT-ACC--TCAC----GAANC-TCA-CCCC-----CTC--C---C---CC-----T------------------TC-----------CA-----GT---A----AAT------GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATA-GC----C--C----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
Reference ( family-888 ) : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-G-C-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-A-TAACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-TACTATA-AC-TTCCAGC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGC--AACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TGAA------------AA-----C-TT-----------------A---ANA--AAT-GCAG--C-----------------ATAA------CT-------------T----ATG---TT-TC-AATTAACA--CG-CGT-AG--TTTA-----G--C-A-CACT--------------T------------TTAA-AG------GGA--G-------CCCC-CC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------A----A--G-A-TAAATCATA----A--T-----NTTTTGT-T--------------------C---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TCAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TAGA-GAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTCC-GGGATCCAACGCCAAGACCC-ACTG---GGG-G-CCTT-GA----GG-CGGCC-TCCA-GACCCCCT-ACC--TCAC----GAANC-TCA-CCCC-----CTC--C---C---CC-----T------------------TC-----------CA-----GT---A----AAT------GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATA-GC----C--C----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTG-TACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
gi|1 : TTGTGTACA--CTAGATGCGGC-A-C-TTTT-TCC-TTGAT-CTTA-GCC-TGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCAGGATCACC--AA-C-GA-T--AC-ACATTAAC-TC--TA-G-GCGG-CGG-AGCT-T--A--CC---CGCTAC--AT--A-AC---TTC-CAGGG---AACTGTTACTATA-CT-TCCCAGT-CATAAAA-ATC--AGGAAAGGC--AGCGA-------TT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATTCAA------------AA-----CGTT-----------------A---ATAATAAT-GCAG--TG----------------ATAAACAATTCTAAGCTTAAACATCT----ATG---TT-AC--ATTAACA--CGCCGG-AGTTTTTA-----G--C-A-CACTTAGATTGGCAAGAAT------------TTAA-AG------GGA--GCGCCCCCCCCC-CC---C------C---------CC------------AATAGA--TTT-------C----T------C-------AACTTA--A-A-TAAATCATA----AATC-----TTTTTGT-TTCGTAAAA------------C---------------AATAGCAT--------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AATTCAT--TCTT-CC-GCTC-------TACA-GAA
gi|1 : cCAAGACCC-ACT----GGG-G-CCTT-GA----GG-TAGCC-TCCATGACTCCCT-ACC--TCAC----GACTCTTCACCCCC-----CTC--T---T---CC-----C------------------TC-----------Ctccaatttgacaagatctaaaattgacatttattgtgtttttattgggtaattcatataatttttaattataagaaacttagatttgtatgttattttaatttatttcagtcagttaaaaatgaccaaaatagtaaacagctttagggttggggttacaagacccactggggccttgaggtagcctccatgactccctacctcacgactcttcacccccctcttccctcccctcactgccaaagcttacttgatcccacccctcagcttaaaatgcatgcaaacttcaaccagctacttactcgtgcccaatgcccgtatggttcaactcctaagcttaccgtcccaggttgtttattttttttaacacaatcctagtgcccaccttgcactatttgaaatatactaatggcattccaattcacttttaaaacacactaaactaagagagtataataccaccaccgattccattgactgaatgttatgcgattatttccaactttttgatcaccccagactttctacgtcacgtcgcgtcgcaatctcacgatcttagcaatactgttatgaattattcactgaatcaagacaatttacaatactgtctttcgtcttgtatggaatcttatggtacagagtgagtgacccagtctcgtcggctgcgcgactccgactgcacactgccccctcacctgtacgcaaaaagttccataacaaactcgaagaccagtttactgtaaaatta
gi|1 : cttgtgtacactagatgcggcactttttccttgatcttagcctgtgctttaaatcagacagaaaacggttgagcaggatcaccaacgatacacattaactctaggcggcggagcttacccgctacataacttccagggaactgttactatacttcccagtcataaaaatcaggaaaggcagcgatttgaaacatttattcagtgattcaaaacgttaataataatgcagtgataaacaattctaagcttaaacatctatgttacattaacacgccggagtttttagcacacttagattggcaagaatttaaagggagcgcccccccccccccccaatagatttctcaacttaaataaatcataaatctttttgtttcgtaaaacaatagcattaaaagaagcaattcattcttccgctctacagaatccaatttgacaagatctaaaattgacatttattgtgtttttattgggtaattcatataatttttaattataagaaacttagatttgtatgttattttaatttatttcagtcagttaaaaatgaccaaaatagtaaacagctttagggttggggttaCCTCC---CC--TCACTGCCAAAGC-TTA-CTTG-----ATC--C---CA--CC-----C------------------CT-----------CA-----GCTTAA----AAT------GCATG-C--A-AACTTCA--------------ACCAGCTACTT-ACTCGTGCCCAATGCCCGT-ATGGTTCAACTCCTAAGCTTACCGT-CCCAGG-TT--G-------------------------TTTATTTTT--TTTAACACAA--TCCTA-----------GTG--CCCACCTTGCACTA-T-TTGAAATATA-C--T-AATGGCATTCCAATTCACTTTT--A-A----AACA----CA----CT---A-A-ACTAAGAGAGTATA-ATA-CCACCAC--C----GAT-T-CC-A-TTGA-C--TGAA-TGTTATGCGA-T-T---AT------T-TCC-A--ACTTTTTGATC-A-CCC-CAGACTTT--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GTCGCAA--TCTCACGATCTTAGCAATACTGT---T-ATGAA-TTATT-CACTGAAT----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-TCTTGT--ATGGA--A-----TCTTATGG-TACAGAGTGA-GTGACC--CAGTCT-CGTCGGCTGCGCGACTCCGAC-TGCACACTGCCCCCTCACCTGTACGCAAAA-AG-TTCCATAACAAACTCGAAGACCAGTTT---ACTG-T-AAAcctcactgccaaagcttacttgatcccacccctcagcttaaaatgcatgcaaacttcaaccagctacttactcgtgcccaatgcccgtatggttcaactcctaagcttaccgtcccaggttgtttattttttttaacacaatcctagtgcccaccttgcactatttgaaatatactaatggcattccaattcacttttaaaacacactaaactaagagagtataataccaccaccgattccattgactgaatgttatgcgattatttccaactttttgatcaccccagactttctacgtcacgtcgcgtcgcaatctcacgatcttagcaatactgttatgaattattcactgaatcaagacaatttacaatactgtctttcgtcttgtatggaatcttatggtacagagtgagtgacccagtctcgtcggctgcgcgactccgactgcacactgccccctcacctgtacgcaaaaagttccataacaaactcgaagaccagtttactgtaaaatta
gi|10 : cttgtgtacactagatgcggcactttttccttgatcttagcctgtgctttaaatcagacagaaaacggttgagcaggatcaccaacgatacacattaactctaggcggcggagcttacccgctacataacttccagggaactgttactatacttcccagtcataaaaatcaggaaaggcagcgatttgaaacatttattcagtgattcaaaacgttaataataatgcagtgataaacaattctaagcttaaacatctatgttacattaacacgccggagtttttagcacacttagattggcaagaatttaaagggagcgcccccccccccccccaatagatttctcaacttaaataaatcataaatctttttgtttcgtaaaacaatagcattaaaagaagcaattcattcttccgctctacagaatccaatttgacaagatctaaaattgacatttattgtgtttttattgggtaattcatataatttttaattataagaaacttagatttgtatgttattttaatttatttcagtcagttaaaaatgaccaaaatagtaaacagctttagggttggggttacaagacccactggggccttgaggtagcctccatgactccctacctcacgactcttcacccccctcttc---A----AAT------GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TACTTTGC-CG-GCCCAAT-CCCATTA--------------------C--T-CGCTGG-GTTAA-------------------------TTT----AT--TTCA-C-CA---TCCTA--TGTAGCTA-GTG--CC-A---TACA-TA-T-TTGAAAT--A-T-GT-AATGAGAT-CCAATACA-TTTC--A-A----A-CA----C------A---A-G-A-------AGTTAA--TA-CCA---C--C----GATCT-CT-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-----GT------TATCC-ATAACTTTTTGA-T-A-CCC-GAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTTG-----CGGT-GCAA--T---------TTAGCAAT-CT-T---T-ATGAA-T-ATTAGA-TGACA----TTAAAGACA--TTA--CAA-ATACCTGTC--TAG-T-TTG---ATGGAGGA-----T-TTATTG-TACAGAGGGGCGTGA--------CT-CG----------------GAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTTTA--CAATACAA-TTCCAT-ACAAA--CAAAAGACAG--TTAAACTG-TAAAATATAAatta
gi|11 : T-TCCTTTCAT-CT-A-G-C-TGTG-------TTTAAATAA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-ACAGAATT-CC--AA-A-CGAA--AC-A-A-TAACTTC--TA---G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---CG-TAC------A-AC---TTC-CA-GG---AACC--TAATCTA-AC-TTCCAAC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAAACAAAACAT------TTT--TGAAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TGGA------------AA-----C-ATAAAG-------------A---ACA--AAT-AC-G--C-----------------AAAA------CT-------------T----ATG---TT-T--AATAAA-----G-CAT-AG--TTTA-----G--C-ACCACTTGGTAGA-------T------------TTAA---------GGA--C-------CCCCTCC---C------C---------CT------------AATA-A--CTT-------T----T------TTAATTTCA----A--G-A--AAATCATA----AC-C-----TTTTTAT-T--------------------T---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TCAT--TCTT-CC-ACTC-T-----TAGA-TAAAT
gi|12 : CCC-ACTG---GGG---CCTT-GC----AG-CGGCC---CA-GACCCCCT-AC---TCAC----GAACT-CCC-CCCC-----CTC--C---CTTTCC-----TGAATTCATTGA-------TC-----------CACCCGGGT---A----AATTTTAT-GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TA--T-G---GTACC-AAT-CCCGTTATG-TTCAA-TAC---T-TTCC--TTCTCGTG-GT--GTTTTTTTTGTTTTCTGTTTTTTTTTTTT----TTGCTTTA-CAAA---TCCTA-----------GTGGCTC-A---TGCA-TA-TATTGAAATT-AACAGT-A-TGACAT-CCAATTCA-TTTTAAA-A----AACATAAGC-----CA---ATA-A-------AGTTAATACA-CT----C--A----AATCTGCC-A-T--G-T--TGAcaatgtcaagatataactgtgtcttttattgggtattttcat
gi|13 : attcacgtcattaaaaatgactcaaaaatagtaaagagctttaagggggaggtgtttaaccag-AG--ATTA-----G--C-G-GA----------------T------------TTAA-AG------GGA--GTGCAC--CCCC-TC---CTTCT--C---------CCTG----------AAT-----TTT-------CAAT-T------T-------A----A--G-G-TGAATCATG----G--T-----GTTTTGG-T--------------------C---------------A---------------TA-------A---------------ACAATAGCAGTAA-AAGATAC--AA-TAAT--CCTT-TC-ACTT-T-----TCGT-GAAAT
gi|13 : TTCCAGGGGCCCCATACCAAGACCCCACTG---GGG-G-CCTT-AA----CA-CTCCC-TTTA-AATCCCT----------C----GAACC-CCC-CCCC-----CTC--atttctattcattgtatttttttttttttttggattggtataacttaatatttgtgatatcctatcaatctcacgtcattaaaaatgaccaacactagtaaagattttccaggggccccataccaagaccccactgggggccttaacactccctttaaatccctcgaacccccccccctctt
gi|14 : agattagcggatttaaagggagtgcaccccctccttctccctgaattttcaatttaaggtgaatcatggtgttttggtcataaacaatagcagtaaaagatacaataatcctttcacttttcgtgaaatatttctattcattgtatttttttttttttttggattggtataacttaatatttgtgatatcctatcaatctcacgtcattaaaaatgaccaacactagtaaagattT--G-------------------------TTT----TC--TGTA--AC----TTTTA--T------A-A-------A---T--A-TA-T-TT-AAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTTA--A-A----AACA----C-----TG---A-A-A-------AGTTAG--T--GC----CACT----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTAT---TTGTGAA-T-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTCG-T-TTGA--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-Ctt
gi|14 : ATTTT--C-A-ATA-CTTTCTTTCA-T-TTGT--GTGGA--A-----T-TTATT-------------GTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataa
gi|15 : tgttttctgtaacttttataaatatatttaagccattaaggcatctgattcatttaaaaacactgaaaagttagtgccactgatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagTTGTGT-CA--C--GATGCGGT-A-G-TTAT-TGCTTTGAT-CTTA-G-C-TGTA------CCTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-A-TAACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGAT-T--A--GC---TG-TAC-TAT--A-AC---TTC-CAGGG---GTCTG-GATTATA-AC-TTCGAGC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGC--AACGA------TTT--TT-AAG-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TAAA------------AAT----T-TT-----------------T---AAA--AAT-GCAG--CTTATAAACAGATTAAGTATAA------AT-------------TAAGCATG----T-TC-AATTAACA--CG-CGG-AG--TTTA-----G--C-A-CACT--------------T------------ataa
gi|16 : atA-TA-T-TTTAAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTT---A-A----AACA----CA----CG---A-A-A-------AGTTAG--T--GC----CA-C----TATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTAT---TTGTGAA-T-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTCG-T-TTGA--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-Ca
gi|16 : aaATTTT--C-A-ATA-CTTTCTTTCA-T-TTGT--GTGGA--A-----T-TTATT------------TGTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataac
gi|17 : aaatattttaagccattaaggcatctgattcatttaaaacacacgaaaagttagtgccactatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagA-T-TTGAA-TA-A---GT-AATGACCC-CAAAGTCA-TTTT--T-A----A-CT----C-----TA---A-A----------GTTAGTATA----------C----GATCT-CA-AAT--G-T--TGAA-TGT-A--CGA-T-G---TT------T-TTC-A--ACTTTG-AA-A-A-CCC-CAA---TCAACTA-----CGT-AAAATCG-----C-GA-GCA---T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGACTT-ATT-----------------------TTTA--C-ATATA--------------TTGT--ACAGA--A---------------------GGGCATGA----CAATCTCCGTC-ACTGCGCTACT-CGAC-AG--CAC-G-CCC----TCT-TA--AAATA-AATTTCCATAACAA-----AAATATAG--T---ACTGTT-GAATATAAAataac
gi|18 : C-AATTAACA--CG-CCG-AG--TTTA-----G--C-A-CACTTAAGTGGCAGA---T------------TTAA-AG------AGA--G-------CCCC-CTGCAC------C---------CC------------AATA-A--TTT-------CCAATT------T-------A----A--G-A-TAAATCATA----A--TC----ATTTTGT-T--------------------C---------------ATAAAAAAATAGCGA-TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TCAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TAGA-GAAA
gi|19 : GTGT-CAAAT--GGCGTGGC-AAC-CTTT-CCCTTT------TA-----TG-A----------AAATCA-GAGCAGAAA---T-AGTT--G-GCAGAATT-TA--AA-A-CG-T--AC-A-A-TA-CTTC--TA-G-G-GGGTGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AATCAA-ACCTTTTC-CAGGG---AACTGTTACTATACACATTTTAAC-AAA-AAACAT---A-GAAAGG---AACAAAATATTTTT--TG-TAA-CA-TT--AT---T----CAAG--TGA-TAAA------------GA--------------------------------A--AGT-GCAG--T-----------------ATAacaatgacaagatatattgatttattgtcttttattgggtaattcgtatttcatatttaataagaaactttaagat
gi|2 : tgTGCG-C-A-C-TTCTATTTTCTGGTGCTTAAG-CATGTAACGTATCTTTAAATCA-GA-CTGGTA-A-CGGGTTGCG-GCAGAATTGCCCGAA-CACG-TAAAC-A-A-TAACTTTTGTA-G-G-GG-CGG-GGTTGT--AT-GCTTATT-TAC-AAT--ATAC---TTC-CAGGG---caaacaaa
gi|2 : -AAA-ATCGCA-GAAAGGC--AACGA------TTTGATG-AAACCATTCTAATGCGT----C-AGGCCGA-TGAA------------AA-----C-AC-----------------AGG-AGA--AATGGCAG--C-----------------CTAA------TC-------------T----Aggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|2 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagT-----------------A---AGA--ACT-GTAGAGC-----------------ATAA------CA-------------T----ATG---TTGTCTAATTAACAACCG-CATTAG--TTAACGTCCGTCC-A-CACT--------------T------------TCAC--GTACCTTGGA--G-------CCCC-CC---C------C---------CCCCGCCCCCCCTAAGTA-A--TTTGCAAAAAT----T------G-------A----A--G-AATCAATCATACATTA--T-----TTTTCGT-CATGAATGCACAAATGGCGAGC---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-ACAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TTTA-GAAaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|2 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagATCTAACGC-AAGAACC-ACTGTATGTGCG-CCTTTGA----GGGCGACGATCCA-GACCCC-T-ATCCATCAC----GAAA----A-GACC-----TTC--TGATC---CC-----G------------------CC-----------CA----------A----AAT------GCATGGC--A-T---TGA--------------AAA-G-TAGTT------TACTAAGT-ACCGC-ATG-CTCA----------TTAC--T--TCG-------------------------------------------------CACAGTTTCCGGCTT------A-GTGT-CC-A---TGTA-TAGT-TTGAAATA-A-C-GT-------------ATTCT-TTCT--A-A----AAC-----T-----TA---A-A-A-------AGTT-A-ATA------------------CT-AC-A-T--G-TACCG-A-TGT-T-GCGATT-T---AT------C-TCC-A--ACT-------------------CCTC--CTA-----CAT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGC------------A-T-ATT-CA-TGACA----C-------------------ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGA--ATGG--------------TCGCTA--------CGCGA--------CT-CG---ACTGC-C-ACT-C--------------CCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CAAtaattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|20 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaACTTC--TA-G-G-GGGCGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CATGG---AACCG-TACTATA-A----------------A-ATC--A-GAAAGGC--AACGA------T-----G-AAA-CATTT--AT---T----C-AA--TGA-TAAA------------AATGCAAC-TT-----------------ATAAACA--AAT-TAAG--C-----------------AAAA------GT-------------T----ATG---TA-TC-AATTAACA--CG-CAT-AG--TTTA-----G--C-A-CAC---------------T------------TTAA-----------A--G-------CCCC-CC---CCCCCTTC---------CC------------AATA-A--TTTTTAA---T----T------T-------A----A--G-A-TAAATCAT
gi|21 : g---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---CGGAA-ACATGGTCTT-CCAGCTC-T-----TAGA-GAGA
gi|22 : atcatacatatttttgtctcataattacaaaggggtggcgaA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGATTTC--CTATGTCACGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATAGA--A-----T-TGAATG-C-------TGCGCAA--------CT-CG-----------------AC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-C-AAATATAAattcaatgacaaatggatctattggatctattgtttaaaaacttttacttaaaggctaggacttccaatagcttgcattttttatccacaaaccaaaaaaaacactttaagatttggattatttca
gi|23 : TGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-G-C-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCA-AATT-CC--------------------CAACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGTT-T--A--GC---T----------------------------------G-TACTATA-AC-TTCCAGC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGT--AACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TCAA------------AA-----C-TT-----------------A---ATA--AAT-GCAG--C-----------------GTAc
gi|24 : -A--ACTTTT-GA-C-A-ACAGCTGGCTTA--TGA-----CGC-TATATCA-----C-GT-GCAA--T---------TTTGCAATGATGTTAAT-ATGAA-T-ATC-CA-TGGCATAGTT--AAGGC-ATTTA--C-AGATATCTGtaaaaaacttaa
gi|24 : aAC-TGC-AAC-TCCCT----TCTGTA--TAATA-AA-CCCAAT-ACAAA--AGAAACAAAG--T---ACTA-T---ATATAAatacctttttttcactgcaactcccttctgtataataaacccaatacaaaagaaacaaagtactatatataa
gi|25 : aaacttttgacaacagctggcttatgacgctatatcacgtgcaattttgcaatgatgttaatatgaatatccatggcatagttaaggcatttacagatatctgatacctttttttcC---C------C---------CT------------AA-A-A--TTT------------T------C-------A----AATG-G-TAGATTATG----A--T-----CTTTTGTAT--------------------C---------------AAAAA-----------TAGAATGATA---------------A----------AA-AAG---C--AA-TCAT--TTTT-CC-ACTA-TCAGCACAGA-GAAAT
gi|26 : gatttaaggtggatgcatctgtaggca----T------T-------A----G--A-A-TAAATCATG----G--T-----CCCTTGT-T--------------------T---------------AAAAAAAATAACGA--TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TAAT--TTTT-CC-ACTT-T-----TAGA-GAAAattactttgatacattgttacttttattagaaga
gi|27 : tcatatCATTGAGT-CA--T--GGTGCTGC-A-C-TT---------AAT-C--A-G-C-AATG------CTTTAAATCA-GA-CGGAAA-A-T-GGTT--A-ACAGAATT-CT--AA-C-T--T--ACAA-A-AAACTTC--TA-GAG-GA-CGG-AGCT-TTCAGTGC---TG-TAC-ATT--A-AT---TTC-TAGGG---AAACG-TATTAgaaatcaagatattttatttgttgggggaacttgtactctatccaaaaaataatctgaattaaaatttgcg
gi|28 : tg-------CCCC-CC---C------C---------CC------------CATT-T--TTT-------C----TCCAAATT-------A----A--A-AGTAAATCATG----A--T-----ATTTTGT-T--------------------C---------------AG--------------TA-------A---------------A----------AG-AAggcctat
gi|29 : atgtaaatatacTTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTCTGAT-CTTA-G-C-TGTG------CTTTAAATGA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AA-T-CG-T--AC-A-A-TAACTTT--TA-G-G-GA-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---Tttagatacacgataaaagaagcaatcgttgatttaaataataagatttttgatatattggtacttttat
gi|3 : atCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CCTA-G-C-TGTA------CTTTAAA--------------A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CG-T--AC-A-A-CAAGTTC--TA-G-G-AG-CAG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-TACTATA-AC-TTCCAAC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGC--GACGA------TTA--CG-AAA-CATTC--AT---T----C-TG--TAG-TGAA------------AA-----C-AC-----------------A---AGA--TAT-GCAG--C-----------------ATAA------CT-------------T----ATG---TT-TC-AATTAAAA--CG-CAT-AG--TTTA-----G--C-A-CACT--------------T--------------AA-AG------GGA----------CCCC-CT---C------C---------CC------------AATA-A--TTT------------T------T-------A----A--G-A-TAAATCATA----A--T-----ATTTTAT-T--------------------C---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TAAT--TATT-CC-AATC-T-----TAGA-GAAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTCC-GGGATCCAACACCAAGACCC-ACTG---AGA-A-CCTT-GACCTAGG-CGGCC-TCCA-TACCCCTT-ACC--TCAC----GAAGC-TCA-CCCC-----CTC--C---C---CC-----T------------------TC-----------CA-----GT---A----AAT------GCATA-C--A-A---TGA--------------A---G-TATTT-AC-TGTGCTCAAT-CCCAT-ATG-TCCAA-TCC---G-TTAC--T-CGCAGG-G---G-------------------------CTT----TT--TTTA-CACA---TCCCA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGGAATT-A-C-GT-AATGACAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATAAGT----C--C----TACCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GAGA-T-T---GT------T-TCC-G--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTAT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTAA--ATTGA--A-----T-TTATTG-TACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCTACT-CGAC-TGT-CAC-GCCCC----TTTGTA--CAATG-AA-TTCTAT-ACAAA--CAAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
gi|30 : tATTCGGC-A-C-TTTT-CCCTTTGAT--TTA-A---TGTA------ATTTGA
gi|30 : atCT-CGACGTGT-CAT-TGCAT----TC-GTA--CAACA-GA-TTCCAT-ACAAA--CGAAGGACAG--T----CTG-C-TAATATAcggttattctttgatccacgttctcgacgtgtcattgcattcgtacaacagattccatacaaacgaaggacagtctgctaatata
gi|31 : atattcggcacttttccctttgatttaatgtaatttgacggttattctttgatccacgttTTGTGT-TA--T--GGTATGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-T-C-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAAAAA-A-T-GCTT--G-GC-------TC--AG-C-TG-T--AC-A-A-TAACTTC--CA-G-G-G
gi|32 : cT---T-ACGAA-T-GTT-AA-TGACA--------AGTCG-TTCAAAC-ATATA-CTTTCTTTCG-T-TTAT--GTGGA--A-----T-TAAGTT-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CG
gi|33 : cca-CTTA-G-C-TATA------TTTTAAATCG-GA-CATTAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CG-T--AC-T-A-TAACTTC--TAGG-G-GG-CGG-AACT-T------------------------AC---TTC-CAGGG---AACctg
gi|34 : -CCAATTCA-TTTT--C-A----GACT----T-----TATACA-A-A-------AGTCAA--T--GC----CAGT----GATCC-CC-G-T--G-T--CGAA-TGT-A-GTGA-T-TGTCGT------T-CCC-A--ATT
gi|35 : agTGTGT-CAA-T--GATGTGCA-A-C-TTTT-TC-TTTGAT-CTTA-G-C-TGTG------CTTTAAATCAGGA-CAGAAACA-C-GGTTG-G-GCAGACTT-TC--ataaa
gi|36 : cTGTGT-CA--T--GATGCAGC-A-C-TTTT-TCATTTGAT-CTTA-G-C-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GTAGAATT-Ccca
gi|37 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-G-C-TGT-------------------A-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--A
gi|38 : aTTGTGTTCA--T--GATGCGGTTA-C-TTTTTTCCTTTGAT-CTTA-G-C-T-TA------A-TTAATTCA-GA-
gi|39 : TTGTGT-CG--T--GGTGCGGT-A-C-ATTT-CCCTTCGAT-CTTA-G-G-CATA------CTTTA
gi|4 : taaagA-CATGT--AT---T----C-AG--TGA-TCAA------------AA-----C-TT-----------------A---AAA--GAT-GCAG--CGTCTAAAGAAAATAACCATAA------CA-------------T----ATG---TT--C-AATTAACA--CA-CCG-AG--TTTA-----G--C-A-CACTTAATTGGAAGA---T------------TTAA-AG------GGA--A-------CCCC-CC---C------CG--------CCTCTT--------ACTA-T--TTT-------CCAATT------T-------A----A----A-TAAATCATA----A--TCCTTGTTTTTGT-T--------------------CA--------------A---------------TA-------AGAACCAATAGCGATGA----------AG-AAG---CTTCA-TAAT--TCTT-CC-GCTCGT-----TAGATGAAA
gi|4 : AAGACCA-A-TG---TGG-G-CCTT-GA----G--CGGAC-TCCA-GACCCCCTTACCG-TCAC----G---C-CCA-CCTCGACATTTC--A---A---CA-----T------------------TCATTGATCTACCCAA----GT---AC---AAT------GCATG-C--A-A---TGA------------------G-TACTT-AC-CATGACCAAT-CCCGTTATG-TTCAG-TCC---G-TTAC--T-CTCAGGTGG--G-------------------------TTT----TT--TCTA-CAC----TACTC--T------A-GTG--CA-A---TGCA-TATT-TTGAAATA-A-C-GT-GAAGG-AT-CCAATT-A-TTTT--A-ACCACAAAA----C-----TA---A-AGA-------AGTT-A-ATA-CA----C--C----GATCT-CCAA-T--GTT--TGAA-TGC-T-GCGT-TAT---GT------T-T-C-A--ACTTTT-GACC-A-CCC-CAGACTT---CTA-----CGTGCACGT-G-----C-AT-GCGACCT---------TTATCAATGCTCTTCCT-ACG-------T-CA-CGTCG----C--ATG-CAACTTAG-C-A-ATG-CTG---TTC-----------TGAAC-A-----T-TTA-TG--ACATAA------GA----CATTTA-CAAT-GCTGCTCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAgcaatgacaaagatctattgatctattgtgtcttttgaattgctattcgtaatttcatattgttaataagaaactttgaagaatctgtgttatttcattaatttttaacgcgtacaaaaaatgaccaattaatagtaaccacggcttcgggtgggggacgaagaccaatgtgggccttgagcggactccagacccccttaccgtcacgcccacctcgacatttcaacattcattgatctacccaagtacaatgcatgcaatgagtacttaccatgaccaatcccgttatgttcagtccgttactctcaggtgggttttttctacactactctagtgcaatgcatattttgaaataacgtgaaggatccaattattttaaccacaaaactaaagaagttaatacaccgatctccaatgtttgaatgctgcgttatgtttcaacttttgaccaccccagacttctacgtgcacgtgcatgcgacctttatcaatgctcttcctacgtcacgtcgcatgcaacttagcaatgctgttctgaacatttatgacataagacatttacaatgctgctcgactcgactgccacgcccctctgtaccaaacattccatacaaacgaaagacagtactgtaaatataa
gi|40 : acatgtattcagtgatcaaaacttaaaagatgcagcgtctaaagaaaataaccataacatatgttcaattaacacaccgagtttagcacacttaattggaagatttaaagggaaccccccccgcctcttactattttccaatttaaataaatcataatccttgtttttgttcaataagaaccaatagcgatgaagaagcttcataattcttccgctcgttagatgaaagcaatgacaaagatctattgatctattgtgtcttttgaattgctattcgtaatttcatattgttaataagaaactttgaagaatctgtgttatttcattaatttttaacgcgtacaaaaaatgaccaattaatagtaaccacggcttcgggtgggggacg-TTTT-TCCTT-GAT-CTTA-G-CCTGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCA
gi|5 : TTGTTT-CA--T--TGTACGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-G-C-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAGAAA-A-T-GCTA--G-GCAGAATT-CT--AA-C-CG-T--AC-A-A-TATGTAC--TA-T-G-TG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGGTAAAAC----ACTATA-AC-TTCCAA--CAC-AAA-ATC--A-GAAAGGG--GACGC------TTT--TG-TAA-CACTT--AT---TTACCC-AG--TGA-TGAA------------AA-----C-AT-----------------A---ACA--AAT-ACAGA-CTATAA------------ACAA------CG-------------T----ATG----T-TC-AAATAACA--TG-CAT-AT--TTTA-----G--C-A-CACT--------------TAACAGA------TTAAGAG------GGATTG-------CCCA-CCAT-C------C---------AC------------AAT-----TTT-------CAA--T------T-------A----A--G-A-T-AATCATA----A--------ATATTGT-T--------------------CCTGT-----------A---------------TA-------ACTGGCGATAT-----A----------AG-AAG---A--AA-TAAT--TCTT-CC-A--T-T-----TAAA-GAAA
gi|5 : CCAACACCC-ATGG---GGG-GGTCTT-GA----GG-CTGC--TCCA-GAGCCC-T-ACC--TCAC----GAAGA-TC--CGTC-----TTCAAC---T---CA-----TTGA---------------TC-----------CG-----CC---A----TAT------ACATG-CTAA-A---TGA--------------C---G-TACTgcaatggacaagatctattgaattattttcttgtatttgggaaatcgtattttcattttgaaaaaaaaaccatgtaagattgtattaatttgatattcgcgtcattaaaatacactaaatagtaagagtttcatgggggcaaccaacacccatgggggggtcttgaggctgctccagagccctacctcacgaagatccgtcttcaactcattgatccgccatatacatgctaaatgacgtact
gi|6 : ttgtttcattgtacgatacattttcctttgattttagctgtacttaaaatcagacagaaaatgctaggcagaattctaaccgtacaatatgtactatgtgcggagcttagctgtacaataacttccagggtaaaacactataacttccaacacaaaatcagaaaggggacgcttttgtaacacttatttacccagtgatgaaaacataacaaatacagactataaacaacgtatgttcaaataacatgcatattttagcacacttaacagattaagagggattgcccaccatccacaattttcaattaagataatcataaatattgttcctgtataactggcgatataagaagaaataattcttccatttaaagaaagcaatggacaagatctattgaattattttcttgtatttgggaaatcgtattttcattttgaaaaaaaaaccatgtaagattgtattaatttgatattcgcgtcattaaaatacactaaatagtaagagtttcatgggggcaaATTGTGT-CA--T--GATGCGGT-A-CTTTTT-TCCCTTGAT-CTTA-G-C--GTA------CTTTAAATCA--A-CAGAAA-AGC-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AATC-CG-T--AC-A-A--AACTTC--TA-G-G-GG-CGGCAG-T-T--A--GC---TG-TACTTAT--A-AC---TTCTCAGGG---AACTG-TACTATA-AC-TTCCAGCACCT-AAA-ATC--A-GATAGGC--AACGA------TTT--TG--AA-CATTT--A----T----C-AG--TGA-TAAA------------AA-----C-TTTCAAAATGCAGTGAGTTA---ACA--AAT-TAAG--C-----------------ATAA------AT-------------T----A-GCATTT-TC-AATTAACA--CGACGG-AG--TTTA-----G--CAA-CACT--------------TAATTCAGGCAGATTAA-AG------GGA--G-------TCCC-CC---C------CCCCCCCCCACC------------AATA-ATCTTT-------CCAATT------T-------A----A--GAA-TAAATCATA----A--TC----CTTTTGT-T--------------------CGTAAAAAATTAGCGGA---------------TA-------A---------------A----------AGTATG---C--AA-TCAT--TCTTCCC-GCTC-A-----AAGA-GAAAT
gi|7 : A-GACCCACT-ACC--TCAC----GA-CC-TC---CCC-----CCC--C---C---CC-----TCAACTTCACATTCATTGATC-----------CACCCGAGT---A----AATATTTATGCATG-C--AGA---TGA--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---T-TTAC--T-CTTGGG--T--G-------------------------TTT----TTGTTTTA-CAAA---TCCT------------GTG--CC-A---TGCA-TA-T-T-GAAAAT-A-C-GTTAAAGGCAT-CCAAT-CA-TTTT--AGA----AACA----CTAAGCCA---A-A-A-------AGTTA---TA--C----C--CACAAGATCT-CC-A-T--G-T--TGAACTGT-T-GCGA-T-T---GT------T-TCT-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----A-AT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGT---TTATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACA-TTTA--C-A-GTA-CTGTCTTTTGGT-TTGTTTATGGG--AAAATTT-TTATTGGTACAGAGGGGCGTGG----CAGTCG-AGTC-GCCTCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTGTAC-CAAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T--AATATAtcaatgacaaggtctatgatttattgtttttattgggagcaattccgattttcattttaataagaaactttaaaagattaagtgttatcgtttaatttta
gi|8 : aCAAGACCC-ACTG---GGG-A-CCTT-GA----GG-CAGCC-TCCA-GATCCCCT-ACC--ATAT----GAAGC-TCC-CCCC-----CCC--C---C---CCACCTCT------------------TCTT---------CA-----AT---TCCTTGAT------GCATG-C--A-A---TGATTCTCAGTTGCAAAA---G-TACTT-AC-TGTGCCCAAT-ACCATTATG-CCCAA-TCA---G-TTAC--T-CA---------G-------------------------TTT----TA--TT----ACA---TCCTAG-T------ATGTA--CT-A---TGCA-TA-T-TTGAGATA-A-C-GT-AACGGCAT-CCAATTCA-TTTC--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTT-A-AT--GC----CATT----GATAT-CC-A-T--G-A--TGGA-TGT-A-GCGA-T-TTTAGTTCCTACT-TCCAA--ATTTTT-TA-CAA-CCC-CAGACTCC--CTA-----CAT-CACGTCA-----C-GT-CCAA--A---------TATGCAATGTTAT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-GTA-CTTTCTTTTG-T-TCAA--ATGTA--A-----T-TTATT-----------------------------GTC-ACTGTGCGACT-AAAC-TGC-CAT-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCTAT-ACAAA--CGAAAGAAAG--T---ACTG-T-AAATAT
gi|9 : -TATA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-A-TAACTTC--TA-G-G-GG-TGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AAACG-TACTATA-AC-TTCCCAC-CAT-ACA-ATC--A-GAAAGGC--GACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TGAACAAAAGAAATACAG-----C-TT-----------------ATCAACA--AAT-TAAG--C-----------------ATA-------CT-------------T----ATG---TC-TC-AATTAACA--CG-CAT-AG--TTTA-----G--C-A-CACTTCGCAGA-------T------------TTAA-AG------AGA--G-------CCCC-CC---C------C---------T---------------------TTT-------------------------------------A-T-AATCATA----A--TA----TTTTTGT-T--------------------C---------------ATAAAACAAATAGCGATA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TCAT--TCTT-CC-ACTC-T-----TAGA-GAAAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): ATGACGTCATTTTATGGAGGAATCCATGATAAGTA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 44444444444444444444444444444444444444444444 555555555555555555555555555555555555555555 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 222 1 111 1111 11 11111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 333333333333333333 11111 1111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 1111111111 1111111 555555555555555555555 1111111111111 11111 111111111111 11111 22222222222222 6666666666666666666666666666666666 11111111
lowQualScore : 5 66 33 2 2 2 4 2 2 2 3 555555 2 2 2 2 2 55 4 4 33 333 2 33 2 2 2 33 2 2 2 5 2 2 33 66 555 2 88 33 2 555 3 555 2 7 4 4 0 4 3 3 55 3 55 000000 55 33 3 44 555 7777 3 44 3 1 66666666666666666666666666666666666666666666 2 44 3 77 888888888888888888888888888888888888888888 7777 777 77 3 55 7 888 44 88888 44 3 3 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 555 88 3 44 3 3 9999999 3 6666 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111 7 0 5 888 000 5 0000 5 0 5 4 888 99 8888 6666 22 00000 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 66 4 777 999999999999999999 4 0 00000 5 9 5 9999999999 66 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 00 4 777 4 7 3 88 9999 3 8 3 3 44 3 7777 7777 7777777777 3 3 0000000 999999999999999999999 3 3 3 44 3 44 3 999 3 9999999999999 3 3 44 0 6 6 3 6 3 444 88888 3 66666 3 3 444444444444 3 3 22222 3 3 3 3 22222222222222 66 2 8 5 1 2 2 999 66 77777 2 5555555555555555555555555555555555 11111111 3 33 3 6666 77 0 3 3 6 44 44 555 3 55
lowQualScore : . .. .. . . . . . . . . ...... . . . . . .. . . .. ... . .. . . . .. . . . . . . .. .. ... . .. .. . ... . ... . . . . . . . . .. . .. ...... .. .. . .. ... .... . .. . . ............................................ . .. . .. .......................................... .... ... .. . .. . ... .. ..... .. . . .................................................................................................................................................................................................................................................................. . ... .. . .. . . ....... . .... .......................................................................................................................... ... . . . ... ... . .... . . . . ... .. .... .... .. ..... ........................................................................... . .. . ... .................. . . ..... . . . .......... .. ............................................................................. .. . ... . . . .. .... . . . . .. . .... .... .......... . . ....... ..................... . . . .. . .. . ... . ............. . . .. . . . . . . ... ..... . ..... . . ............ . . ..... . . . . .............. .. . . . . . . ... .. ..... . .................................. ........ . .. . .... .. . . . . .. .. ... . ..
lowQualScore : 3 33 77 4 4 2 2 0 0 0 8 555555 1 1 2 2 2 33 4 7 44 555 7 77 9 9 9 77 7 7 7 7 9 9 99 88 000 9 00 99 9 000 1 444 6 3 0 0 5 0 6 6 00 6 00 555555 00 88 3 66 888 1111 3 66 3 6 88888888888888888888888888888888888888888888 1 22 1 33 555555555555555555555555555555555555555555 7777 000 44 6 00 3 555 66 33333 66 3 3 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 9 444 55 1 22 1 1 4444444 1 5555 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 000 0 5 0 888 222 0 6666 0 2 0 4 000 55 5555 2222 00 00000 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 11 4 888 111111111111111111 4 1 55555 0 4 0 0000000000 99 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 66 4 888 0 3 6 22 8888 6 2 3 3 66 3 1111 1111 3333333333 3 3 8888888 888888888888888888888 3 3 3 66 3 66 6 777 3 6666666666666 3 1 22 2 7 7 3 7 3 888 33333 3 77777 3 3 888888888888 5 7 88888 1 1 1 1 55555555555555 33 7 0 3 7 9 9 444 88 11111 9 4444444444444444444444444444444444 55555555 1 88 1 5555 33 2 1 1 2 22 66 888 3 99
consensus : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-G-C-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-A-TAACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-TACTATA-AC-TTCCAGC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGC--AACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TGAA------------AA-----C-TT-----------------A---ANA--AAT-GCAG--C-----------------ATAA------CT-------------T----ATG---TT-TC-AATTAACA--CG-CGT-AG--TTTA-----G--C-A-CACTTAG--GG-------T---------TTAAAG------GGA--G-------CCCC-CC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------A----A--G-A-TAAATCATA----A--T-----NTTTTGT-T--------------------C---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TCAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TAGA-GA----AATGGACAAGATCTATTGAATTATTTTCTTGTATTTGGGAAATCGTATTTTCATTTTGAAAAAAAAACCATGTAAGATTGTATTAATTTGATATTCGCGTCATTAAAATACACTAAATAGTAAGAGCTTC-CGGGGGTCCAACGCCAAGACCC-ACTG---GGG-G-CCTT-GA----GG-CGGCC-TCCA-GACCCCCT-ACC--TCAC----GAANC-TCA-CCCC-----CTC--C---C---CC-----T------------------TC-----------CA-----GT---A----AAT------GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATA-GC----C--C----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
Reference ( family-888 ) : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-G-C-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-A-TAACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-TACTATA-AC-TTCCAGC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGC--AACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TGAA------------AA-----C-TT-----------------A---ANA--AAT-GCAG--C-----------------ATAA------CT-------------T----ATG---TT-TC-AATTAACA--CG-CGT-AG--TTTA-----G--C-A-CACTT-------------T---------TTAAAG------GGA--G-------CCCC-CC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------A----A--G-A-TAAATCATA----A--T-----NTTTTGT-T--------------------C---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TCAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TAGA-GA----AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTC-CAGGGATCCAACGCCAAGACCC-ACTG---GGG-G-CCTT-GA----GG-CGGCC-TCCA-GACCCCCT-ACC--TCAC----GAANC-TCA-CCCC-----CTC--C---C---CC-----T------------------TC-----------CA-----GT---A----AAT------GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATA-GC----C--C----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
gi|1 : TTGTGTACA--CTAGATGCGGC-A-C-TTTT-TCC-TTGAT-CTTA-GCC-TGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCAGGATCACC--AA-C-GA-T--AC-ACATTAAC-TC--TA-G-GCGG-CGG-AGCT-T--A--CC---CGCTAC--AT--A-AC---TTC-CAGGG---AACTGTTACTATA-CT-TCCCAGT-CATAAAA-ATC--AGGAAAGGC--AGCGA-------TT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATTCAA------------AA-----CGTT-----------------A---ATAATAAT-GCAG--TG----------------ATAAACAATTCTAAGCTTAAACATCT----ATG---TT-AC--ATTAACA--CGCCGG-AGTTTTTA-----G--C-A-CACTTAGATTGGCAAGAAT---------TTAAAG------GGA--GCGCCCCCCCCC-CC---C------C---------CC------------AATAGA--TTT-------C----T------C-------AACTTA--A-A-TAAATCATA----AATC-----TTTTTGT-TTCGTAAAA------------C---------------AATAGCAT--------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AATTCAT--TCTT-CC-GCTC-------TACA-GA----A
gi|1 : cCAAGACCC-ACT----GGG-G-CCTT-GA----GG-TAGCC-TCCATGACTCCCT-ACC--TCAC----GACTCTTCACCCCC-----CTC--T---T---CC-----C------------------TC-----------Ctccaatttgacaagatctaaaattgacatttattgtgtttttattgggtaattcatataatttttaattataagaaacttagatttgtatgttattttaatttatttcagtcagttaaaaatgaccaaaatagtaaacagctttagggttggggttacaagacccactggggccttgaggtagcctccatgactccctacctcacgactcttcacccccctcttccctcccctcactgccaaagcttacttgatcccacccctcagcttaaaatgcatgcaaacttcaaccagctacttactcgtgcccaatgcccgtatggttcaactcctaagcttaccgtcccaggttgtttattttttttaacacaatcctagtgcccaccttgcactatttgaaatatactaatggcattccaattcacttttaaaacacactaaactaagagagtataataccaccaccgattccattgactgaatgttatgcgattatttccaactttttgatcaccccagactttctacgtcacgtcgcgtcgcaatctcacgatcttagcaatactgttatgaattattcactgaatcaagacaatttacaatactgtctttcgtcttgtatggaatcttatggtacagagtgagtgacccagtctcgtcggctgcgcgactccgactgcacactgccccctcacctgtacgcaaaaagttccataacaaactcgaagaccagtttactgtaaaatta
gi|1 : cttgtgtacactagatgcggcactttttccttgatcttagcctgtgctttaaatcagacagaaaacggttgagcaggatcaccaacgatacacattaactctaggcggcggagcttacccgctacataacttccagggaactgttactatacttcccagtcataaaaatcaggaaaggcagcgatttgaaacatttattcagtgattcaaaacgttaataataatgcagtgataaacaattctaagcttaaacatctatgttacattaacacgccggagtttttagcacacttagattggcaagaatttaaagggagcgcccccccccccccccaatagatttctcaacttaaataaatcataaatctttttgtttcgtaaaacaatagcattaaaagaagcaattcattcttccgctctacagaatccaatttgacaagatctaaaattgacatttattgtgtttttattgggtaattcatataatttttaattataagaaacttagatttgtatgttattttaatttatttcagtcagttaaaaatgaccaaaatagtaaacagctttagggttggggttaCCTCC---CC--TCACTGCCAAAGC-TTA-CTTG-----ATC--C---CA--CC-----C------------------CT-----------CA-----GCTTAA----AAT------GCATG-C--A-AACTTCA--------------ACCAGCTACTT-ACTCGTGCCCAATGCCCGT-ATGGTTCAACTCCTAAGCTTACCGT-CCCAGG-TT--G-------------------------TTTATTTTT--TTTAACACAA--TCCTA-----------GTG--CCCACCTTGCACTA-T-TTGAAATATA-C--T-AATGGCATTCCAATTCACTTTT--A-A----AACA----CA----CT---A-A-ACTAAGAGAGTATA-ATA-CCACCAC--C----GAT-T-CC-A-TTGA-C--TGAA-TGTTATGCGA-T-T---AT------T-TCC-A--ACTTTTTGATC-A-CCC-CAGACTTT--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GTCGCAA--TCTCACGATCTTAGCAATACTGT---T-ATGAA-TTATT-CACTGAAT----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-TCTTGT--ATGGA--A-----TCTTATGG-TACAGAGTGA-GTGACC--CAGTCT-CGTCGGCTGCGCGACTCCGAC-TGCACACTGCCCCCTCACCTGTACGCAAAA-AG-TTCCATAACAAACTCGAAGACCAGTTT---ACTG-T-AAAcctcactgccaaagcttacttgatcccacccctcagcttaaaatgcatgcaaacttcaaccagctacttactcgtgcccaatgcccgtatggttcaactcctaagcttaccgtcccaggttgtttattttttttaacacaatcctagtgcccaccttgcactatttgaaatatactaatggcattccaattcacttttaaaacacactaaactaagagagtataataccaccaccgattccattgactgaatgttatgcgattatttccaactttttgatcaccccagactttctacgtcacgtcgcgtcgcaatctcacgatcttagcaatactgttatgaattattcactgaatcaagacaatttacaatactgtctttcgtcttgtatggaatcttatggtacagagtgagtgacccagtctcgtcggctgcgcgactccgactgcacactgccccctcacctgtacgcaaaaagttccataacaaactcgaagaccagtttactgtaaaatta
gi|10 : cttgtgtacactagatgcggcactttttccttgatcttagcctgtgctttaaatcagacagaaaacggttgagcaggatcaccaacgatacacattaactctaggcggcggagcttacccgctacataacttccagggaactgttactatacttcccagtcataaaaatcaggaaaggcagcgatttgaaacatttattcagtgattcaaaacgttaataataatgcagtgataaacaattctaagcttaaacatctatgttacattaacacgccggagtttttagcacacttagattggcaagaatttaaagggagcgcccccccccccccccaatagatttctcaacttaaataaatcataaatctttttgtttcgtaaaacaatagcattaaaagaagcaattcattcttccgctctacagaatccaatttgacaagatctaaaattgacatttattgtgtttttattgggtaattcatataatttttaattataagaaacttagatttgtatgttattttaatttatttcagtcagttaaaaatgaccaaaatagtaaacagctttagggttggggttacaagacccactggggccttgaggtagcctccatgactccctacctcacgactcttcacccccctcttc---A----AAT------GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TACTTTGC-CG-GCCCAAT-CCCATTA--------------------C--T-CGCTGG-GTTAA-------------------------TTT----AT--TTCA-C-CA---TCCTA--TGTAGCTA-GTG--CC-A---TACA-TA-T-TTGAAAT--A-T-GT-AATGAGAT-CCAATACA-TTTC--A-A----A-CA----C------A---A-G-A-------AGTTAA--TA-CCA---C--C----GATCT-CT-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-----GT------TATCC-ATAACTTTTTGA-T-A-CCC-GAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTTG-----CGGT-GCAA--T---------TTAGCAAT-CT-T---T-ATGAA-T-ATTAGA-TGACA----TTAAAGACA--TTA--CAA-ATACCTGTC--TAG-T-TTG---ATGGAGGA-----T-TTATTG-TACAGAGGGGCGTGA--------CT-CG----------------GAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTTTA--CAATACAA-TTCCAT-ACAAA--CAAAAGACAG--TTAAACTG-TAAAATATAAatta
gi|11 : T-TCCTTTCAT-CT-A-G-C-TGTG-------TTTAAATAA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-ACAGAATT-CC--AA-A-CGAA--AC-A-A-TAACTTC--TA---G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---CG-TAC------A-AC---TTC-CA-GG---AACC--TAATCTA-AC-TTCCAAC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAAACAAAACAT------TTT--TGAAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TGGA------------AA-----C-ATAAAG-------------A---ACA--AAT-AC-G--C-----------------AAAA------CT-------------T----ATG---TT-T--AATAAA-----G-CAT-AG--TTTA-----G--C-ACCACTTGGTAGA-------T---------TTAA--------GGA--C-------CCCCTCC---C------C---------CT------------AATA-A--CTT-------T----T------TTAATTTCA----A--G-A--AAATCATA----AC-C-----TTTTTAT-T--------------------T---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TCAT--TCTT-CC-ACTC-T-----TAGA-TA----AAT
gi|12 : CCC-ACTG---GGG---CCTT-GC----AG-CGGCC---CA-GACCCCCT-AC---TCAC----GAACT-CCC-CCCC-----CTC--C---CTTTCC-----TGAATTCATTGA-------TC-----------CACCCGGGT---A----AATTTTAT-GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TA--T-G---GTACC-AAT-CCCGTTATG-TTCAA-TAC---T-TTCC--TTCTCGTG-GT--GTTTTTTTTGTTTTCTGTTTTTTTTTTTT----TTGCTTTA-CAAA---TCCTA-----------GTGGCTC-A---TGCA-TA-TATTGAAATT-AACAGT-A-TGACAT-CCAATTCA-TTTTAAA-A----AACATAAGC-----CA---ATA-A-------AGTTAATACA-CT----C--A----AATCTGCC-A-T--G-T--TGAcaatgtcaagatataactgtgtcttttattgggtattttcat
gi|13 : attcacgtcattaaaaatgactcaaaaatagtaaagagctttaagggggaggtgtttaaccag-AG--ATTA-----G--C-G-GA----------------T---------TTAAAG------GGA--GTGCAC--CCCC-TC---CTTCT--C---------CCTG----------AAT-----TTT-------CAAT-T------T-------A----A--G-G-TGAATCATG----G--T-----GTTTTGG-T--------------------C---------------A---------------TA-------A---------------ACAATAGCAGTAA-AAGATAC--AA-TAAT--CCTT-TC-ACTT-T-----TCGT-GA----AAT
gi|13 : TTC-CAGGGGCCCCATACCAAGACCCCACTG---GGG-G-CCTT-AA----CA-CTCCC-TTTA-AATCCCT----------C----GAACC-CCC-CCCC-----CTC--atttctattcattgtatttttttttttttttggattggtataacttaatatttgtgatatcctatcaatctcacgtcattaaaaatgaccaacactagtaaagattttccaggggccccataccaagaccccactgggggccttaacactccctttaaatccctcgaacccccccccctctt
gi|14 : agattagcggatttaaagggagtgcaccccctccttctccctgaattttcaatttaaggtgaatcatggtgttttggtcataaacaatagcagtaaaagatacaataatcctttcacttttcgtgaaatatttctattcattgtatttttttttttttttggattggtataacttaatatttgtgatatcctatcaatctcacgtcattaaaaatgaccaacactagtaaagattT--G-------------------------TTT----TC--TGTA--AC----TTTTA--T------A-A-------A---T--A-TA-T-TT-AAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTTA--A-A----AACA----C-----TG---A-A-A-------AGTTAG--T--GC----CACT----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTAT---TTGTGAA-T-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTCG-T-TTGA--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-Ctt
gi|14 : ATTTT--C-A-ATA-CTTTCTTTCA-T-TTGT--GTGGA--A-----T-TTATT-------------GTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataa
gi|15 : tgttttctgtaacttttataaatatatttaagccattaaggcatctgattcatttaaaaacactgaaaagttagtgccactgatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagTTGTGT-CA--C--GATGCGGT-A-G-TTAT-TGCTTTGAT-CTTA-G-C-TGTA------CCTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-A-TAACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGAT-T--A--GC---TG-TAC-TAT--A-AC---TTC-CAGGG---GTCTG-GATTATA-AC-TTCGAGC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGC--AACGA------TTT--TT-AAG-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TAAA------------AAT----T-TT-----------------T---AAA--AAT-GCAG--CTTATAAACAGATTAAGTATAA------AT-------------TAAGCATG----T-TC-AATTAACA--CG-CGG-AG--TTTA-----G--C-A-CACTT-------------ataa
gi|16 : atA-TA-T-TTTAAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTT---A-A----AACA----CA----CG---A-A-A-------AGTTAG--T--GC----CA-C----TATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTAT---TTGTGAA-T-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTCG-T-TTGA--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-Ca
gi|16 : aaATTTT--C-A-ATA-CTTTCTTTCA-T-TTGT--GTGGA--A-----T-TTATT------------TGTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataac
gi|17 : aaatattttaagccattaaggcatctgattcatttaaaacacacgaaaagttagtgccactatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagA-T-TTGAA-TA-A---GT-AATGACCC-CAAAGTCA-TTTT--T-A----A-CT----C-----TA---A-A----------GTTAGTATA----------C----GATCT-CA-AAT--G-T--TGAA-TGT-A--CGA-T-G---TT------T-TTC-A--ACTTTG-AA-A-A-CCC-CAA---TCAACTA-----CGT-AAAATCG-----C-GA-GCA---T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGACTT-ATT-----------------------TTTA--C-ATATA--------------TTGT--ACAGA--A---------------------GGGCATGA----CAATCTCCGTC-ACTGCGCTACT-CGAC-AG--CAC-G-CCC----TCT-TA--AAATA-AATTTCCATAACAA-----AAATATAG--T---ACTGTT-GAATATAAAataac
gi|18 : C-AATTAACA--CG-CCG-AG--TTTA-----G--C-A-CACTTAAGTGGCAGA---T---------TTAAAG------AGA--G-------CCCC-CTGCAC------C---------CC------------AATA-A--TTT-------CCAATT------T-------A----A--G-A-TAAATCATA----A--TC----ATTTTGT-T--------------------C---------------ATAAAAAAATAGCGA-TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TCAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TAGA-GA----AA
gi|19 : GTGT-CAAAT--GGCGTGGC-AAC-CTTT-CCCTTT------TA-----TG-A----------AAATCA-GAGCAGAAA---T-AGTT--G-GCAGAATT-TA--AA-A-CG-T--AC-A-A-TA-CTTC--TA-G-G-GGGTGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AATCAA-ACCTTTTC-CAGGG---AACTGTTACTATACACATTTTAAC-AAA-AAACAT---A-GAAAGG---AACAAAATATTTTT--TG-TAA-CA-TT--AT---T----CAAG--TGA-TAAA------------GA--------------------------------A--AGT-GCAG--T-----------------ATAacaatgacaagatatattgatttattgtcttttattgggtaattcgtatttcatatttaataagaaactttaagat
gi|2 : tgTGCG-C-A-C-TTCTATTTTCTGGTGCTTAAG-CATGTAACGTATCTTTAAATCA-GA-CTGGTA-A-CGGGTTGCG-GCAGAATTGCCCGAA-CACG-TAAAC-A-A-TAACTTTTGTA-G-G-GG-CGG-GGTTGT--AT-GCTTATT-TAC-AAT--ATAC---TTC-CAGGG---caaacaaa
gi|2 : -AAA-ATCGCA-GAAAGGC--AACGA------TTTGATG-AAACCATTCTAATGCGT----C-AGGCCGA-TGAA------------AA-----C-AC-----------------AGG-AGA--AATGGCAG--C-----------------CTAA------TC-------------T----Aggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|2 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagT-----------------A---AGA--ACT-GTAGAGC-----------------ATAA------CA-------------T----ATG---TTGTCTAATTAACAACCG-CATTAG--TTAACGTCCGTCC-A-CACTT-------------T---------C--ACGTACCTTGGA--G-------CCCC-CC---C------C---------CCCCGCCCCCCCTAAGTA-A--TTTGCAAAAAT----T------G-------A----A--G-AATCAATCATACATTA--T-----TTTTCGT-CATGAATGCACAAATGGCGAGC---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-ACAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TTTA-GA----Aaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|2 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagATCTAACGC-AAGAACC-ACTGTATGTGCG-CCTTTGA----GGGCGACGATCCA-GACCCC-T-ATCCATCAC----GAAA----A-GACC-----TTC--TGATC---CC-----G------------------CC-----------CA----------A----AAT------GCATGGC--A-T---TGA--------------AAA-G-TAGTT------TACTAAGT-ACCGC-ATG-CTCA----------TTAC--T--TCG-------------------------------------------------CACAGTTTCCGGCTT------A-GTGT-CC-A---TGTA-TAGT-TTGAAATA-A-C-GT-------------ATTCT-TTCT--A-A----AAC-----T-----TA---A-A-A-------AGTT-A-ATA------------------CT-AC-A-T--G-TACCG-A-TGT-T-GCGATT-T---AT------C-TCC-A--ACT-------------------CCTC--CTA-----CAT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGC------------A-T-ATT-CA-TGACA----C-------------------ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGA--ATGG--------------TCG-C-TA------CGCGA--------CT-CG---ACTGC----------------CAC-TCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CAAtaattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|20 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaACTTC--TA-G-G-GGGCGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CATGG---AACCG-TACTATA-A----------------A-ATC--A-GAAAGGC--AACGA------T-----G-AAA-CATTT--AT---T----C-AA--TGA-TAAA------------AATGCAAC-TT-----------------ATAAACA--AAT-TAAG--C-----------------AAAA------GT-------------T----ATG---TA-TC-AATTAACA--CG-CAT-AG--TTTA-----G--C-A-CAC---------------T---------TTAA----------A--G-------CCCC-CC---CCCCCTTC---------CC------------AATA-A--TTTTTAA---T----T------T-------A----A--G-A-TAAATCAT
gi|21 : g---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---CGGAA-ACATGGTCTT-CCAGCTC-T-----TAGA-GA----GA
gi|22 : atcatacatatttttgtctcataattacaaaggggtggcgaA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGATTTC--CTATGTCACGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATAGA--A-----T-TGAATG-C--------------------------------TGCGCAACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-C-AAATATAAattcaatgacaaatggatctattggatctattgtttaaaaacttttacttaaaggctaggacttccaatagcttgcattttttatccacaaaccaaaaaaaacactttaagatttggattatttca
gi|23 : TGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-G-C-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCA-AATT-CC--------------------CAACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGTT-T--A--GC---T----------------------------------G-TACTATA-AC-TTCCAGC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGT--AACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TCAA------------AA-----C-TT-----------------A---ATA--AAT-GCAG--C-----------------GTAc
gi|24 : -A--ACTTTT-GA-C-A-ACAGCTGGCTTA--TGA-----CGC-TATATCA-----C-GT-GCAA--T---------TTTGCAATGATGTTAAT-ATGAA-T-ATC-CA-TGGCATAGTT--AAGGC-ATTTA--C-AGATATCTGtaaaaaacttaa
gi|24 : aAC-TGC-AAC-TCCCT----TCTGTA--TAATA-AA-CCCAAT-ACAAA--AGAAACAAAG--T---ACTA-T---ATATAAatacctttttttcactgcaactcccttctgtataataaacccaatacaaaagaaacaaagtactatatataa
gi|25 : aaacttttgacaacagctggcttatgacgctatatcacgtgcaattttgcaatgatgttaatatgaatatccatggcatagttaaggcatttacagatatctgatacctttttttcC---C------C---------CT------------AA-A-A--TTT------------T------C-------A----AATG-G-TAGATTATG----A--T-----CTTTTGTAT--------------------C---------------AAAAA-----------TAGAATGATA---------------A----------AA-AAG---C--AA-TCAT--TTTT-CC-ACTA-TCAGCACAGA-GA----AAT
gi|26 : gatttaaggtggatgcatctgtaggca----T------T-------A----G--A-A-TAAATCATG----G--T-----CCCTTGT-T--------------------T---------------AAAAAAAATAACGA--TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TAAT--TTTT-CC-ACTT-T-----TAGA-GA----AAattactttgatacattgttacttttattagaaga
gi|27 : tcatatCATTGAGT-CA--T--GGTGCTGC-A-C-TT---------AAT-C--A-G-C-AATG------CTTTAAATCA-GA-CGGAAA-A-T-GGTT--A-ACAGAATT-CT--AA-C-T--T--ACAA-A-AAACTTC--TA-GAG-GA-CGG-AGCT-TTCAGTGC---TG-TAC-ATT--A-AT---TTC-TAGGG---AAACG-TATTAgaaatcaagatattttatttgttgggggaacttgtactctatccaaaaaataatctgaattaaaatttgcg
gi|28 : tg-------CCCC-CC---C------C---------CC------------CATT-T--TTT-------C----TCCAAATT-------A----A--A-AGTAAATCATG----A--T-----ATTTTGT-T--------------------C---------------AG--------------TA-------A---------------A----------AG-AAggcctat
gi|29 : atgtaaatatacTTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTCTGAT-CTTA-G-C-TGTG------CTTTAAATGA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AA-T-CG-T--AC-A-A-TAACTTT--TA-G-G-GA-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---Tttagatacacgataaaagaagcaatcgttgatttaaataataagatttttgatatattggtacttttat
gi|3 : atCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CCTA-G-C-TGTA------CTTTAAA--------------A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CG-T--AC-A-A-CAAGTTC--TA-G-G-AG-CAG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-TACTATA-AC-TTCCAAC-CAT-AAA-ATC--A-GAAAGGC--GACGA------TTA--CG-AAA-CATTC--AT---T----C-TG--TAG-TGAA------------AA-----C-AC-----------------A---AGA--TAT-GCAG--C-----------------ATAA------CT-------------T----ATG---TT-TC-AATTAAAA--CG-CAT-AG--TTTA-----G--C-A-CACTT-------------------------AAAG------GGA----------CCCC-CT---C------C---------CC------------AATA-A--TTT------------T------T-------A----A--G-A-TAAATCATA----A--T-----ATTTTAT-T--------------------C---------------A---------------TA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TAAT--TATT-CC-AATC-T-----TAGA-GA----AGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTC-C-GGGATCCAACACCAAGACCC-ACTG---AGA-A-CCTT-GACCTAGG-CGGCC-TCCA-TACCCCTT-ACC--TCAC----GAAGC-TCA-CCCC-----CTC--C---C---CC-----T------------------TC-----------CA-----GT---A----AAT------GCATA-C--A-A---TGA--------------A---G-TATTT-AC-TGTGCTCAAT-CCCAT-ATG-TCCAA-TCC---G-TTAC--T-CGCAGG-G---G-------------------------CTT----TT--TTTA-CACA---TCCCA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGGAATT-A-C-GT-AATGACAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATAAGT----C--C----TACCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GAGA-T-T---GT------T-TCC-G--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTAT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTAA--ATTGA--A-----T-TTATTG-TACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCTACT-CGAC-TGT-CAC-GCCCC----TTTGTA--CAATG-AA-TTCTAT-ACAAA--CAAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
gi|30 : tATTCGGC-A-C-TTTT-CCCTTTGAT--TTA-A---TGTA------ATTTGA
gi|30 : atCT-CGACGTGT-CAT-TGCAT----TC-GTA--CAACA-GA-TTCCAT-ACAAA--CGAAGGACAG--T----CTG-C-TAATATAcggttattctttgatccacgttctcgacgtgtcattgcattcgtacaacagattccatacaaacgaaggacagtctgctaatata
gi|31 : atattcggcacttttccctttgatttaatgtaatttgacggttattctttgatccacgttTTGTGT-TA--T--GGTATGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-T-C-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAAAAA-A-T-GCTT--G-GC-------TC--AG-C-TG-T--AC-A-A-TAACTTC--CA-G-G-G
gi|32 : cT---T-ACGAA-T-GTT-AA-TGACA--------AGTCG-TTCAAAC-ATATA-CTTTCTTTCG-T-TTAT--GTGGA--A-----T-TAAGTT-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CG
gi|33 : cca-CTTA-G-C-TATA------TTTTAAATCG-GA-CATTAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CG-T--AC-T-A-TAACTTC--TAGG-G-GG-CGG-AACT-T------------------------AC---TTC-CAGGG---AACctg
gi|34 : -CCAATTCA-TTTT--C-A----GACT----T-----TATACA-A-A-------AGTCAA--T--GC----CAGT----GATCC-CC-G-T--G-T--CGAA-TGT-A-GTGA-T-TGTCGT------T-CCC-A--ATT
gi|35 : agTGTGT-CAA-T--GATGTGCA-A-C-TTTT-TC-TTTGAT-CTTA-G-C-TGTG------CTTTAAATCAGGA-CAGAAACA-C-GGTTG-G-GCAGACTT-TC--ataaa
gi|36 : cTGTGT-CA--T--GATGCAGC-A-C-TTTT-TCATTTGAT-CTTA-G-C-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GTAGAATT-Ccca
gi|37 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-G-C-TGT-------------------A-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--A
gi|38 : aTTGTGTTCA--T--GATGCGGTTA-C-TTTTTTCCTTTGAT-CTTA-G-C-T-TA------A-TTAATTCA-GA-
gi|39 : TTGTGT-CG--T--GGTGCGGT-A-C-ATTT-CCCTTCGAT-CTTA-G-G-CATA------CTTTA
gi|4 : taaagA-CATGT--AT---T----C-AG--TGA-TCAA------------AA-----C-TT-----------------A---AAA--GAT-GCAG--CGTCTAAAGAAAATAACCATAA------CA-------------T----ATG---TT--C-AATTAACA--CA-CCG-AG--TTTA-----G--C-A-CACTTAATTGGAAGA---T---------TTAAAG------GGA--A-------CCCC-CC---C------CG--------CCTCTT--------ACTA-T--TTT-------CCAATT------T-------A----A----A-TAAATCATA----A--TCCTTGTTTTTGT-T--------------------CA--------------A---------------TA-------AGAACCAATAGCGATGA----------AG-AAG---CTTCA-TAAT--TCTT-CC-GCTCGT-----TAGATGA----AA
gi|4 : AAGACCA-A-TG---TGG-G-CCTT-GA----G--CGGAC-TCCA-GACCCCCTTACCG-TCAC----G---C-CCA-CCTCGACATTTC--A---A---CA-----T------------------TCATTGATCTACCCAA----GT---AC---AAT------GCATG-C--A-A---TGA------------------G-TACTT-AC-CATGACCAAT-CCCGTTATG-TTCAG-TCC---G-TTAC--T-CTCAGGTGG--G-------------------------TTT----TT--TCTA-CAC----TACTC--T------A-GTG--CA-A---TGCA-TATT-TTGAAATA-A-C-GT-GAAGG-AT-CCAATT-A-TTTT--A-ACCACAAAA----C-----TA---A-AGA-------AGTT-A-ATA-CA----C--C----GATCT-CCAA-T--GTT--TGAA-TGC-T-GCGT-TAT---GT------T-T-C-A--ACTTTT-GACC-A-CCC-CAGACTT---CTA-----CGTGCACGT-G-----C-AT-GCGACCT---------TTATCAATGCTCTTCCT-ACG-------T-CA-CGTCG----C--ATG-CAACTTAG-C-A-ATG-CTG---TTC-----------TGAAC-A-----T-TTATGA-CATAA--------GA----CATTTA-CAAT-GCTGCTCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAgcaatgacaaagatctattgatctattgtgtcttttgaattgctattcgtaatttcatattgttaataagaaactttgaagaatctgtgttatttcattaatttttaacgcgtacaaaaaatgaccaattaatagtaaccacggcttcgggtgggggacgaagaccaatgtgggccttgagcggactccagacccccttaccgtcacgcccacctcgacatttcaacattcattgatctacccaagtacaatgcatgcaatgagtacttaccatgaccaatcccgttatgttcagtccgttactctcaggtgggttttttctacactactctagtgcaatgcatattttgaaataacgtgaaggatccaattattttaaccacaaaactaaagaagttaatacaccgatctccaatgtttgaatgctgcgttatgtttcaacttttgaccaccccagacttctacgtgcacgtgcatgcgacctttatcaatgctcttcctacgtcacgtcgcatgcaacttagcaatgctgttctgaacatttatgacataagacatttacaatgctgctcgactcgactgccacgcccctctgtaccaaacattccatacaaacgaaagacagtactgtaaatataa
gi|40 : acatgtattcagtgatcaaaacttaaaagatgcagcgtctaaagaaaataaccataacatatgttcaattaacacaccgagtttagcacacttaattggaagatttaaagggaaccccccccgcctcttactattttccaatttaaataaatcataatccttgtttttgttcaataagaaccaatagcgatgaagaagcttcataattcttccgctcgttagatgaaagcaatgacaaagatctattgatctattgtgtcttttgaattgctattcgtaatttcatattgttaataagaaactttgaagaatctgtgttatttcattaatttttaacgcgtacaaaaaatgaccaattaatagtaaccacggcttcgggtgggggacg-TTTT-TCCTT-GAT-CTTA-G-CCTGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCA
gi|5 : TTGTTT-CA--T--TGTACGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-G-C-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAGAAA-A-T-GCTA--G-GCAGAATT-CT--AA-C-CG-T--AC-A-A-TATGTAC--TA-T-G-TG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGGTAAAAC----ACTATA-AC-TTCCAAC--AC-AAA-ATC--A-GAAAGGG--GACGC------TTT--TG-TAA-CACTT--AT---TTACCC-AG--TGA-TGAA------------AA-----C-AT-----------------A---ACA--AAT-ACAGA-CTATAA------------ACAA------CG-------------T----ATG---TT--C-AAATAACA--TG-CAT-AT--TTTA-----G--C-A-CACTTAACAGA-------T---------TAAGAG------GGATTG-------CCCA-CCAT-C------C---------AC------------AAT-----TTT-------CAA--T------T-------A----A--G-A-TAA-TCATA----A--------ATATTGT-T--------------------CCTGT-----------A---------------TA-------ACTGGCGATAT-----A----------AG-AAG---A--AA-TAAT--TCTT-CC-ATT--------TAAA-GAAAGCAATGGACAAGATCTATTGAATTATTTTCTTGTATTTGGGAAATCGTATTTTCATTTTGAAAAAAAAACCATGTAAGATTGTATTAATTTGATATTCGCGTCATTAAAATACACTAAATAGTAAGAGTTTCATGGGGG--CAAC--CAACACCC-ATGG---GGG-GGTCTT-GA----GG-CTGC--TCCA-GAGCCC-T-ACC--TCAC----GAAGA-TC--CGTC-----TTCAAC---T---CA-----TTGA---------------TC-----------CG-----CC---A----TAT------ACATG-CTAA-A---TGA--------------C---G-TACT
gi|6 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGT-A-CTTTTT-TCCCTTGAT-CTTA-G-C--GTA------CTTTAAATCA--A-CAGAAA-AGC-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AATC-CG-T--AC-A-A--AACTTC--TA-G-G-GG-CGGCAG-T-T--A--GC---TG-TACTTAT--A-AC---TTCTCAGGG---AACTG-TACTATA-AC-TTCCAGCACCT-AAA-ATC--A-GATAGGC--AACGA------TTT--TG--AA-CATTT--A----T----C-AG--TGA-TAAA------------AA-----C-TTTCAAAATGCAGTGAGTTA---ACA--AAT-TAAG--C-----------------ATAA------AT-------------T----A-GCATTT-TC-AATTAACA--CGACGG-AG--TTTA-----G--CAA-CACTTAA-----------TTCAGGCAGATTAAAG------GGA--G-------TCCC-CC---C------CCCCCCCCCACC------------AATA-ATCTTT-------CCAATT------T-------A----A--GAA-TAAATCATA----A--TC----CTTTTGT-T--------------------CGTAAAAAATTAGCGGA---------------TA-------A---------------A----------AGTATG---C--AA-TCAT--TCTTCCC-GCTC-A-----AAGA-GA----AAT
gi|7 : A-GACCCACT-ACC--TCAC----GA-CC-TC---CCC-----CCC--C---C---CC-----TCAACTTCACATTCATTGATC-----------CACCCGAGT---A----AATATTTATGCATG-C--AGA---TGA--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---T-TTAC--T-CTTGGG--T--G-------------------------TTT----TTGTTTTA-CAAA---TCCT------------GTG--CC-A---TGCA-TA-T-T-GAAAAT-A-C-GTTAAAGGCAT-CCAAT-CA-TTTT--AGA----AACA----CTAAGCCA---A-A-A-------AGTTA---TA--C----C--CACAAGATCT-CC-A-T--G-T--TGAACTGT-T-GCGA-T-T---GT------T-TCT-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----A-AT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGT---TTATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACA-TTTA--C-A-GTA-CTGTCTTTTGGT-TTGTTTATGGG--AAAATTT-TTATTGGTACAGAGGGGCGTGG----CAGTCG-AGTC-GCCTCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTGTAC-CAAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T--AATATAtcaatgacaaggtctatgatttattgtttttattgggagcaattccgattttcattttaataagaaactttaaaagattaagtgttatcgtttaatttta
gi|8 : aCAAGACCC-ACTG---GGG-A-CCTT-GA----GG-CAGCC-TCCA-GATCCCCT-ACC--ATAT----GAAGC-TCC-CCCC-----CCC--C---C---CCACCTCT------------------TCTT---------CA-----AT---TCCTTGAT------GCATG-C--A-A---TGATTCTCAGTTGCAAAA---G-TACTT-AC-TGTGCCCAAT-ACCATTATG-CCCAA-TCA---G-TTAC--T-CA---------G-------------------------TTT----TA--TT----ACA---TCCTAG-T------ATGTA--CT-A---TGCA-TA-T-TTGAGATA-A-C-GT-AACGGCAT-CCAATTCA-TTTC--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTT-A-AT--GC----CATT----GATAT-CC-A-T--G-A--TGGA-TGT-A-GCGA-T-TTTAGTTCCTACT-TCCAA--ATTTTT-TA-CAA-CCC-CAGACTCC--CTA-----CAT-CACGTCA-----C-GT-CCAA--A---------TATGCAATGTTAT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-GTA-CTTTCTTTTG-T-TCAA--ATGTA--A-----T-TTATT-----------------------------GTC-ACTGTGCGACT-AAAC-TGC-CAT-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCTAT-ACAAA--CGAAAGAAAG--T---ACTG-T-AAATAT
gi|9 : -TATA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-A-TAACTTC--TA-G-G-GG-TGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AAACG-TACTATA-AC-TTCCCAC-CAT-ACA-ATC--A-GAAAGGC--GACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGA-TGAACAAAAGAAATACAG-----C-TT-----------------ATCAACA--AAT-TAAG--C-----------------ATA-------CT-------------T----ATG---TC-TC-AATTAACA--CG-CAT-AG--TTTA-----G--C-A-CACTTCGCAGA-------T---------TTAAAG------AGA--G-------CCCC-CC---C------C---------T---------------------TTT-------------------------------------A-T-AATCATA----A--TA----TTTTTGT-T--------------------C---------------ATAAAACAAATAGCGATA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AA-TCAT--TCTT-CC-ACTC-T-----TAGA-GA----AAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): ATGACGTCATTTTATGGAGGAATCCATGATAAGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 44444444444444444444444444444444444444444444 55555555555555555 111111111111111111111111111 1111 77777777777777777777777777777 1111111111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 2222222222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111 44444444444444444444444444 111 1111111111 2222222222222222222 1111 444444444444444444444444444444444 111 111 2222222222222 555555555555555555 2222 2222 666666666666666666666 22222222 111 22222222222 11111111 22222222222222 11111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 333333333333333333 11111 1111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 1111111111 1111111 555555555555555555555 1111111111111 11111 111111111111 11111 22222222222222 6666666666666666666666666666666666 11111111
lowQualScore : 5 66 33 2 2 2 4 2 2 5 555555 2 2 2 2 2 55 4 4 33 333 2 33 2 2 2 33 2 2 2 5 2 2 33 66 555 2 666666 2 555 3 555 2 3 3 4 4 0 4 3 3 55 3 55 000000 55 33 3 44 555 7777 3 44 44 66666666666666666666666666666666666666666666 2 44 3 77 33333333333333333 777777777777777777777777777 7777 4 3 55 3 2222 55 99999 55 3 3 55555555555555555555555555555 2 3333333333333333 3 999 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111 5 0 6666 2222222222 3 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 555 88 3 44 3 3 3 00000 3 555 99999999999999999999999999 000 999 3 555 8888888888 3 3 2 3 1111111111111111111 55 3 5555 1 3 999999999999999999999999999999999 99 888 66 222 4444444444444 5 5 5 3 666666666666666666 5 5 3333 5 3333 000000000000000000000 5 33333333 888 222 5 44444444444 1 5 66666666 00000000000000 9999 22 9 11111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 66 4 777 999999999999999999 4 0 00000 5 9 5 9999999999 66 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 00 4 777 4 7 3 88 9999 3 8 3 3 44 3 7777 7777 7777777777 3 3 0000000 999999999999999999999 3 3 3 44 3 44 3 999 3 9999999999999 3 3 44 0 6 6 3 6 3 444 88888 3 66666 3 3 444444444444 3 3 22222 3 3 3 3 22222222222222 66 2 8 5 1 2 2 999 66 77777 2 5555555555555555555555555555555555 11111111 3 33 3 6666 77 0 3 3 6 44 44 555 3 55
lowQualScore : . .. .. . . . . . . . ...... . . . . . .. . . .. ... . .. . . . .. . . . . . . .. .. ... . ...... . ... . ... . . . . . . . . . .. . .. ...... .. .. . .. ... .... . .. .. ............................................ . .. . .. ................. ........................... .... . . .. . .... .. ..... .. . . ............................. . ................ . ... .................................................................... ...... . . .... .......... . ......................................................................................... . ... .. . .. . . . ..... . ... .......................... ... ... . ... .......... . . . . ................... .. . .... . . ................................. .. ... .. ... ............. . . . . .................. . . .... . .... ..................... . ........ ... ... . ........... . . ........ .............. .... .. . ..... ........................................................................... . .. . ... .................. . . ..... . . . .......... .. ............................................................................. .. . ... . . . .. .... . . . . .. . .... .... .......... . . ....... ..................... . . . .. . .. . ... . ............. . . .. . . . . . . ... ..... . ..... . . ............ . . ..... . . . . .............. .. . . . . . . ... .. ..... . .................................. ........ . .. . .... .. . . . . .. .. ... . ..
lowQualScore : 3 33 77 4 4 2 2 0 0 7 555555 1 1 2 2 2 33 4 7 44 555 7 77 9 9 9 77 7 7 7 7 9 9 99 88 000 9 111111 9 000 1 444 6 6 6 0 0 5 0 6 6 00 6 00 555555 00 88 3 66 888 1111 3 66 99 88888888888888888888888888888888888888888888 1 22 1 33 88888888888888888 777777777777777777777777777 8888 0 6 00 6 5555 00 11111 00 6 6 88888888888888888888888888888 1 8888888888888888 3 666 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 666666 7 8 5555 3333333333 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 444 55 1 22 1 1 1 88888 1 444 66666666666666666666666666 444 222 3 888 2222222222 3 3 0 6 2222222222222222222 00 6 9999 5 9 111111111111111111111111111111111 55 333 99 222 1111111111111 7 7 7 1 444444444444444444 7 7 6666 7 1111 999999999999999999999 0 11111111 888 111 0 66666666666 4 0 11111111 33333333333333 4444 77 9 11111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 11 4 888 111111111111111111 4 1 55555 0 4 0 0000000000 99 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 66 4 888 0 3 6 22 8888 6 2 3 3 66 3 1111 1111 3333333333 3 3 8888888 888888888888888888888 3 3 3 66 3 66 6 777 3 6666666666666 3 1 22 2 7 7 3 7 3 888 33333 3 77777 3 3 888888888888 5 7 88888 1 1 1 1 55555555555555 33 7 0 3 7 9 9 444 88 11111 9 4444444444444444444444444444444444 55555555 1 88 1 5555 33 2 1 1 2 22 66 888 3 99
consensus : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGC--AACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AA------------AA-----C-TT-----------------A---ANAA--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAACA--CG-C-GT-AGTTT--A-----G--C-A-CACTT-----A------G------G--A------TTTAAAGGGA--G-----C-------CCC-CC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-N-----TTTTGT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TAGA-G---A------A--------AT----C----GA---CAA---GATCT-A---TTG---A---AT-T-AT-TNT-TTTTTATTTGGG---A--AN--T--CG-TAT---TTTCATNTT------AANAAG---------AAACCTTG---TAAGA--TT---GTGT--TA--ATTTNAT--ATT-----CG-CGT-CA-TTAAAAA----T-G--CAC-T---AA-A-TAGTAA----G-AGCTTC---CGGG----GG------TCCAACGCCAAGA-CCCAC--------TG---GGG--GCCTT-GA----GG-----CGGCC-TCCAGAC--------CCCCT-A--------CC--TCAC----GAAGCTCACCCC-----CTC--C---C---CC-----T--A---------------TC-----------CA-----GT---A----AAT------GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATA-GC----C--C----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
Reference ( family-888 ) : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGC--AACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AA------------AA-----C-TT-----------------A---ANAA--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAACA--CG-C-GT-AGTTT--A-----G--C-A-CACTT-----A------G------G--G------TTTAAAGGGA--G-----C-------CCC-CC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-N-----TTTTGT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TAGA-G---A------A--------AT----G----GA---CAA---GATCT-A---TTG---A---AT-T-AT-TTT-CTTGTATTTGGG---A--AA--T--CG-TAT---TTTCATTTT---G--AAAAAA---------AAACCATG---TAAGA--TT---GTAT--TA--ATTTGAT--ATT-----CG-CGT-CA-TTAAAA-----T-A--CAC-T---AA-A-TAGTAA----G-AGCTTC---CGGG----GG------TCCAACGCCAAGA-CCCAC--------TG---GGG--GCCTT-GA----GG-----CGGCC-TCCAGAC--------CCCCT-A--------CC--TCAC----GAANCTCACCCC-----CTC--C---C---CC-----T------------------TC-----------CA-----GT---A----AAT------GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATA-GC----C--C----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
gi|1 : TTGTGTACA--CTAGATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTT-GAT-CTTA-GCCTGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCAGGATCACC--AA-C-GA-T--AC-ACATTAACT-C--TA-G-GCGG-CGG-AGCT-T--A--CC---CGCTAC-A-T--A-AC---TTC-CAGGG---AACTG-TTACTATA-CT-TCCCAGT-CATAAA-AATC--AGGAAAGGC--AGCGA------TTT---G-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATTCAA------------AA-----CGTT-----------------A---ATAATAAT-GCAG--TG----------------ATAAACAATTCTAAGCTT----AAACATCTATG---TT-AC-A-TTAACA--CG-CCGG-AGTTTTTA-----G--C-A-CACTT-----A------GATT---G--GCAAGAATTTAAAGGGA--G-----CGCCCCCCCCC-CC---C------C---------CC------------AATAGA--TTT-------C----T------C-------AACTTAA-A-TAAATCATA----AATC-T-----TTTTGT-TTCGTAAAACAATAG------C---------------A---------------TTA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AATTCAT--TCTT-CC-GCTC-TA----CAGA-ATCCA------A--------TT----T----GA---CAA---GATCT-AAAATTG---AC--AT-TTAT-TGTGTTTTTATTGGGT---A--AT--T--CA-TATAATTTTTAATT--------ATAAG---------AAAC-------TTAGA--TTT--GTATGTTA--TTTTAATTTATT-----TC-AGT-CAGTTAAAAA----TGA--C-C-A---AA-A-TAGTAA----ACAGCTTT---AGGGTTGGGG------TT--AC---AAGA-CCCACTGGGGCCTTG---AGGTAGCCTC-CA----TGACTCCCTACC-TCACGACTCTTCACCCCCCT-CTTCCCTCCCC--TCACTGCCAAAGCTTACTTG-----ATC--C---CA--CC-----C------------------CT-----------CA-----GCTTAA----AAT------GCATG-C--A-AACTTCA--------------ACCAGCTACTT-ACTCGTGCCCAATGCCCGT-ATGGTTCAACTCCTAAGCTTACCGT-CCCAGG-TT--G-------------------------TTTATTTTT--TTTAACACAA--TCCTA-----------GTG--CCCACCTTGCACTA-T-TTGAAATATA-C--T-AATGGCATTCCAATTCACTTTT--A-A----AACA----CA----CT---A-A-ACTAAGAGAGTATA-ATA-CCACCAC--C----GAT-T-CC-A-TTGA-C--TGAA-TGTTATGCGA-T-T---AT------T-TCC-A--ACTTTTTGATC-A-CCC-CAGACTTT--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GTCGCAA--TCTCACGATCTTAGCAATACTGT---T-ATGAA-TTATT-CACTGAAT----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-TCTTGT--ATGGA--A-----TCTTATGG-TACAGAGTGA-GTGACC--CAGTCT-CGTCGGCTGCGCGACTCCGAC-TGCACACTGCCCCCTCACCTGTACGCAAAA-AG-TTCCATAACAAACTCGAAGACCAGTTT---ACTG-T-AAA
gi|10 : c---A----AAT------GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TACTTTGC-CG-GCCCAAT-CCCATTA--------------------C--T-CGCTGG-GTTAA-------------------------TTT----AT--TTCA-C-CA---TCCTA--TGTAGCTA-GTG--CC-A---TACA-TA-T-TTGAAAT--A-T-GT-AATGAGAT-CCAATACA-TTTC--A-A----A-CA----C------A---A-G-A-------AGTTAA--TA-CCA---C--C----GATCT-CT-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-----GT------TATCC-ATAACTTTTTGA-T-A-CCC-GAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTTG-----CGGT-GCAA--T---------TTAGCAAT-CT-T---T-ATGAA-T-ATTAGA-TGACA----TTAAAGACA--TTA--CAA-ATACCTGTC--TAG-T-TTG---ATGGAGGA-----T-TTATTG-TACAGAGGGGCGTGA--------CT-CG----------------GAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTTTA--CAATACAA-TTCCAT-ACAAA--CAAAAGACAG--TTAAACTG-TAAAATATAAatta
gi|11 : T-TCCTTTCAT-CT-A-GC-TGTG-------TTTAAATAA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-ACAGAATT-CC--AA-A-CGAA--AC-A-AT-AACTTC--TA---G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---CG-TAC------A-AC---TTC-CA-GG---AACC--T-AATCTA-AC-TTCCAAC-CATAAA-A-TC--AG-AAAAACAAAACAT------TTT--TGAAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-GA------------AA-----C-ATAAAG-------------A---ACAA--AT-AC-G--C-----------------AAAA-----------CTT----A--------TG---TT-T--AATAAA-----G-C-AT-AGTTT--A-----G--C-ACCACTT-----G------GTA----G--A------TTTAA--GGA--C-----C-------CCCTCC---C------C---------CT------------AATA-A--CTT-------T----T------TTAATTTCAA----G-A--AAATCATA----AC-C-T-----TTTTAT-T--------------------T---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-ACTC-T-----TAGA-T---A------A--------AT----C----AATGTCAA---GA--T-A---T-----A---AC-T-G--TGT-CTTTTA-TTGG---------------G-TAT---TTTCAT
gi|12 : --ATT-----CA-CGT-CA-TTAAAAA----T-G---AC-TCAAAA-A-TAGTAAA---G-AGCTTT---AAGG----GGGAGGTGTTTAAC--CAG---CCCAC--------TG---GGG---CCTT-GC----AG-----CGGCC---CAGAC--------CCCCT-A--------C---TCAC----GAACTCCCCCCC-----CTC--C---CTTTCC-----TGAATTCATTGA-------TC-----------CACCCGGGT---A----AATTTTAT-GCATG-C--A-A---TGA--------------A---G-TA--T-G---GTACC-AAT-CCCGTTATG-TTCAA-TAC---T-TTCC--TTCTCGTG-GT--GTTTTTTTTGTTTTCTGTTTTTTTTTTTT----TTGCTTTA-CAAA---TCCTA-----------GTGGCTC-A---TGCA-TA-TATTGAAATT-AACAGT-A-TGACAT-CCAATTCA-TTTTAAA-A----AACATAAGC-----CA---ATA-A-------AGTTAATACA-CT----C--A----AATCTGCC-A-T--G-T--TGA
gi|13 : ------G------G--A------TTTAAAGGGA--GTGCACC-------CCC-TC---CTTCT--C---------CCTG----------AAT-----TTT-------CAAT-T------T-------AA----G-G-TGAATCATG----G--T-G-----TTTTGG-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------ACAATAGCAGTAA-AAGATAC--AAT-AAT--CCTT-TC-ACTT-T-----TCGT-G---A------A--------AT----------------A---TTTCT-A---TTC---A---TTGT-AT-TTT-TTTTTTTTTTTG---G--AT--T--GG-TATAA-CTTAATATT---------------------------TG---TGATA--TC---CTAT--CA--ATCT-------------CA-CGT-CA-TTAAAAA----T-G---AC-C---AACACTAGTAAA---G-ATTTTC---CAGG----GG------CCCCATACCAAGACCCCAC--------TG---GGG--GCCTT-AA----CA-----CTCCC-TTTAAAT--------CCCT------------------C----GAACCCCCCCCC-----CTC--
gi|14 : agattagcT--G-------------------------TTT----TC--TGTA--AC----TTTTA--T------A-A-------A---T--A-TA-T-TT-AAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTTA--A-A----AACA----C-----TG---A-A-A-------AGTTAG--T--GC----CACT----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTAT---TTGTGAA-T-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTCG-T-TTGA--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-Ctt
gi|14 : ATTTT--C-A-ATA-CTTTCTTTCA-T-TTGT--GTGGA--A-----T-TTATT-------------GTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataa
gi|15 : tgttttctgtaacttttataaatatatttaagccattaaggcatctgattcatttaaaaacactgaaaagttagtgccactgatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagTTGTGT-CA--C--GATGCGGT-A-G-TTAT-TGCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CCTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGAT-T--A--GC---TG-TAC-TAT--A-AC---TTC-CAGGG---GTCTG-G-ATTATA-AC-TTCGAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGC--AACGA------TTT--TT-AAG-CATTT--AT---T----C-AG--TGATA-AA------------AAT----T-TT-----------------T---AAAA--AT-GCAG--CTTATAAACAGATTAAGTATAA-----------ATTAAGCA--------TG----T-TC-AATTAACA--CG-C-GG-AGTTT--A-----G--C-A-CACTT-----A------ataa
gi|16 : atA-TA-T-TTTAAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTT---A-A----AACA----CA----CG---A-A-A-------AGTTAG--T--GC----CA-C----TATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTAT---TTGTGAA-T-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTCG-T-TTGA--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-C
gi|16 : aaATTTT--C-A-ATA-CTTTCTTTCA-T-TTGT--GTGGA--A-----T-TTATT------------TGTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataac
gi|17 : aaatattttaagccattaaggcatctgattcatttaaaacacacgaaaagttagtgccactatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagA-T-TTGAA-TA-A---GT-AATGACCC-CAAAGTCA-TTTT--T-A----A-CT----C-----TA---A-A----------GTTAGTATA----------C----GATCT-CA-AAT--G-T--TGAA-TGT-A--CGA-T-G---TT------T-TTC-A--ACTTTG-AA-A-A-CCC-CAA---TCAACTA-----CGT-AAAATCG-----C-GA-GCA---T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGACTT-ATT-----------------------TTTA--C-ATATA--------------TTGT--ACAGA--A---------------------GGGCATGA----CAATCTCCGTC-ACTGCGCTACT-CGAC-AG--CAC-G-CCC----TCT-TA--AAATA-AATTTCCATAACAA-----AAATATAG--T---ACTGTT-GAATATAAAataac
gi|18 : C-AATTAACA--CG-C-CG-AGTTT--A-----G--C-A-CACTT-----AAGTGGCA------G--A------TTTAAAGAGA--G-----C-------CCC-CTGCAC------C---------CC------------AATA-A--TTT-------CCAATT------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--TCA-----TTTTGT-T--------------------C---------------ATAAAAAAATAGCGA-T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TAGA-G---AAAAC--A--------AT---------GA---CAA---GATAT-A---TTG---A---TT-T-AT-TGT-CTTTTATTGGGT---A--AT--T--CG-TA----TTTCATATT---T--AATAAG---------AAAC--TT---TAAGA--T
gi|19 : GTGT-CAAAT--GGCGTGGC-AAC-CTTT-CCCTTT------TA----TG-A----------AAATCA-GAGCAGAAA---T-AGTT--G-GCAGAATT-TA--AA-A-CG-T--AC-A-AT-A-CTTC--TA-G-G-GGGTGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AATCAA-ACCTTTTC-CAGGG---AACTGTT-ACTATACACATTTTAAC-AAAAAACA-T---AG-AAAGG---AACAAAATATTTTT--TG-TAA-CA-TT--AT---T----CAAG--TGATA-AA------------GA--------------------------------AA--GT-GCAG--T-----------------ATA
gi|2 : tgTGCG-C-A-C-TTCTATTTTCTGGTGCTTAAGCATGTAACGTATCTTTAAATCA-GA-CTGGTA-A-CGGGTTGCG-GCAGAATTGCCCGAA-CACG-TAAAC-A-AT-AACTTTTGTA-G-G-GG-CGG-GGTTGT--AT-GCTTATT-TAC-AAT--ATAC---TTC-CAGGG---caaacaaa
gi|2 : AAA-A-TCGCAG-AAAGGC--AACGA------TTTGATG-AAACCATTCTAATGCGT----C-AGGCCGATG-AA------------AA-----C-AC-----------------AGG-AGAA--ATGGCAG--C-----------------CTAA-----------TCT----A--------ggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|2 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagT-----------------A---AGAA--CT-GTAGAGC-----------------ATAA-----------CAT----A--------TG---TTGTCTAATTAACAACCG-C-ATTAGTTA--ACGTCCGTCC-A-CACTTTC---A------C------G--TAC----CTT----GGA--G-----C-------CCC-CC---C------C---------CCCCGCCCCCCCTAAGTA-A--TTTGCAAAAAT----T------G-------AA----G-AATCAATCATACATTA--T-T-----TTTCGT-CATGAATGCACAAATGGCGAGC---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAA-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TTTA-G---A------ATAATTCATAT----T----GA---CAA---GATCTCA---TTG----------------TT-CTTTTACTTTGGCTTA--AC--T--CGGTAT---TTCAATATTATAG--CAAAAAGTTTTTATTAGATTTTG---TGTGA--TTCTCATAT--TA--ATTTTCT--AAT-----CGTCGT-TA-TAAAAAATGACC-A--AACGT---AG-A-TAGAAA----G-AGCTTTT--CGGATA--GGCAA---TCTAACGC-AAGA-ACCAC--------TGTATGTGC-GCCTTTGA----GGG----CGACGATCCAGAC--------CCC-T-A--------TCCATCAC----GAAA---AGACC-----TTC--TGATC---CC-----G------------------CC-----------CA----------A----AAT------GCATGGC--A-T---TGA--------------AAA-G-TAGTT------TACTAAGT-ACCGC-ATG-CTCA----------TTAC--T--TCG-------------------------------------------------CACAGTTTCCGGCTT------A-GTGT-CC-A---TGTA-TAGT-TTGAAATA-A-C-GT-------------ATTCT-TTCT--A-A----AAC-----T-----TA---A-A-A-------AGTT-A-ATA------------------CT-AC-A-T--G-TACCG-A-TGT-T-GCGATT-T---AT------C-TCC-A--ACT-------------------CCTC--CTA-----CAT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGC------------A-T-ATT-CA-TGACA----C-------------------ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGA--ATGG--------------TCG-C-TA------CGCGA--------CT-CG---ACTGC----------------CAC-TCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CAAaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|20 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagACTTC--TA-G-G-GGGCGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CATGG---AACCG-T-ACTATA-A---------------A-A-TC--AG-AAAGGC--AACGA------T-----G-AAA-CATTT--AT---T----C-AA--TGATA-AA------------AATGCAAC-TT-----------------ATAAACAA--AT-TAAG--C-----------------AAAA-----------GTT----A--------TG---TA-TC-AATTAACA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-A-CAC-------------------------------TTTAA----A--G-----C-------CCC-CC---CCCCCTTC---------CC------------AATA-A--TTTTTAA---T----T------T-------AA----G-A-TAAATCAT
gi|21 : g---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---CGGAAA-CATGGTCTT-CCAGCTC-T-----TAGA-G---AGAATTCA--------AT---------GA---CAAATGGATCT-A---TTG---G---ATCT-AT-T
gi|22 : atcatacatatttttgtctcataattacaaaggggtggcgaA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGATTTC--CTATGTCACGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATAGA--A-----T-TGAATG-C--------------------------------TGCGCAACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-C-AAATATAAgtttaaaaacttttacttaaaggctaggacttccaatagcttgcattttttatccacaaaccaaaaaaaacactttaagatttggattatttca
gi|23 : TGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCA-AATT-CC-------------------C-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGTT-T--A--GC---T----------------------------------G-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGT--AACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATC-AA------------AA-----C-TT-----------------A---ATAA--AT-GCAG--C-----------------GTAc
gi|24 : -A--ACTTTT-GA-C-A-ACAGCTGGCTTA--TGA-----CGC-TATATCA-----C-GT-GCAA--T---------TTTGCAATGATGTTAAT-ATGAA-T-ATC-CA-TGGCATAGTT--AAGGC-ATTTA--C-AGATATCTGtaaaaaacttaa
gi|24 : aAC-TGC-AAC-TCCCT----TCTGTA--TAATA-AA-CCCAAT-ACAAA--AGAAACAAAG--T---ACTA-T---ATATAAatacctttttttcactgcaactcccttctgtataataaacccaatacaaaagaaacaaagtactatatataa
gi|25 : aaacttttgacaacagctggcttatgacgctatatcacgtgcaattttgcaatgatgttaatatgaatatccatggcatagttaaggcatttacagatatctgatacctttttttcC---C------C---------CT------------AA-A-A--TTT------------T------C-------AAAT--G-G-TAGATTATG----A--T-C-----TTTTGTAT--------------------CAAAA-----------A---------------T-AGAATGATA---------------A----------AA-AAG---C--AAT-CAT--TTTT-CC-ACTA-TCAGCACAGA-G---A------A--------AT----
gi|26 : gatttaaggtggatgcatctgtaggca----T------T-------AG----A-A-TAAATCATG----G--T-C-----CCTTGT-T--------------------T---------------AAAAAAAATAACGA--T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-AAT--TTTT-CC-ACTT-T-----TAGA-G---A------A--------A-----G----AAAT-CAA---GA--T-A---TT---------T-T-AT-TTG-TTGG-----GGG---A--AC--T--TG-TAC---TCT-ATCC-------AAAAAA---------TAATC-TGAATTAAAA--TT---attactttgatacattgttacttttattagaaga
gi|27 : tcatatCATTGAGT-CA--T--GGTGCTGC-A-C-TT---------AAT-C--A-GC-AATG------CTTTAAATCA-GA-CGGAAA-A-T-GGTT--A-ACAGAATT-CT--AA-C-T--T--ACAA-AA-AACTTC--TA-GAG-GA-CGG-AGCT-TTCAGTGC---TG-TAC-ATT--A-AT---TTC-TAGGG---AAACG-T-ATTAtgcg
gi|28 : tg-----C-------CCC-CC---C------C---------CC------------CATT-T--TTT-------C----TCCAAATT-------AA----A-AGTAAATCATG----A--T-A-----TTTTGT-T--------------------C---------------AG--------------T-A-------A---------------A----------AG-AAggcctat
gi|29 : atgtaaatatacTTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTCTGAT-CTTA-GC-TGTG------CTTTAAATGA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AA-T-CG-T--AC-A-AT-AACTTT--TA-G-G-GA-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---Tttagatacacgataaaagaagcaatcgttgatttaaataataagatttttgatatattggtacttttat
gi|3 : atCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CCTA-GC-TGTA------CTTTAAA--------------A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CG-T--AC-A-AC-AAGTTC--TA-G-G-AG-CAG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAAC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGC--GACGA------TTA--CG-AAA-CATTC--AT---T----C-TG--TAGTG-AA------------AA-----C-AC-----------------A---AGAT--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAAAA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-A-CACTT-----A---------------------------AAGGGA--------C-------CCC-CT---C------C---------CC------------AATA-A--TTT------------T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-A-----TTTTAT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-AAT--TATT-CC-AATC-T-----TAGA-G---A------A--------GT----N----NN---NNN---NNNNN-N---NNN---N---NN-N-NN-NNN-NNNNNNNNNNNN---N--NN--N--NN-NNN---NNNNNNNNN---N--NNNNNN---------NNNNNNNN---NNNNN--NN---NNNN--NN--NNNNNNN--NNN-----NN-NNN-NN-NNNNNN-----N-N--NNN-N---NN-N-NNNNNN----N-NGCTTC---CGGG----A-------TCCAACACCAAGA-CCCAC--------TG---AGA--ACCTT-GACCTAGG-----CGGCC-TCCATAC--------CCCTT-A--------CC--TCAC----GAAGCTCACCCC-----CTC--C---C---CC-----T------------------TC-----------CA-----GT---A----AAT------GCATA-C--A-A---TGA--------------A---G-TATTT-AC-TGTGCTCAAT-CCCAT-ATG-TCCAA-TCC---G-TTAC--T-CGCAGG-G---G-------------------------CTT----TT--TTTA-CACA---TCCCA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGGAATT-A-C-GT-AATGACAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATAAGT----C--C----TACCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GAGA-T-T---GT------T-TCC-G--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTAT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTAA--ATTGA--A-----T-TTATTG-TACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCTACT-CGAC-TGT-CAC-GCCCC----TTTGTA--CAATG-AA-TTCTAT-ACAAA--CAAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
gi|30 : tATTCGGC-A-C-TTTT-CCCTTTGAT--TTA-A--TGTA------ATTTGA
gi|30 : atCT-CGACGTGT-CAT-TGCAT----TC-GTA--CAACA-GA-TTCCAT-ACAAA--CGAAGGACAG--T----CTG-C-TAATATAcggttattctttgatccacgttctcgacgtgtcattgcattcgtacaacagattccatacaaacgaaggacagtctgctaatata
gi|31 : atattcggcacttttccctttgatttaatgtaatttgacggttattctttgatccacgttTTGTGT-TA--T--GGTATGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-TC-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAAAAA-A-T-GCTT--G-GC-------TC--AG-C-TG-T--AC-A-AT-AACTTC--CA-G-G-G
gi|32 : cT---T-ACGAA-T-GTT-AA-TGACA--------AGTCG-TTCAAAC-ATATA-CTTTCTTTCG-T-TTAT--GTGGA--A-----T-TAAGTT-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CG
gi|33 : cca-CTTA-GC-TATA------TTTTAAATCG-GA-CATTAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CG-T--AC-T-AT-AACTTC--TAGG-G-GG-CGG-AACT-T------------------------AC---TTC-CAGGG---AACctg
gi|34 : -CCAATTCA-TTTT--C-A----GACT----T-----TATACA-A-A-------AGTCAA--T--GC----CAGT----GATCC-CC-G-T--G-T--CGAA-TGT-A-GTGA-T-TGTCGT------T-CCC-A--ATT
gi|35 : agTGTGT-CAA-T--GATGTGCA-A-C-TTTT-TC-TTTGAT-CTTA-GC-TGTG------CTTTAAATCAGGA-CAGAAACA-C-GGTTG-G-GCAGACTT-TC--ataaa
gi|36 : cTGTGT-CA--T--GATGCAGC-A-C-TTTT-TCATTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GTAGAATT-Ccca
gi|37 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGT-------------------A-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--A
gi|38 : aTTGTGTTCA--T--GATGCGGTTA-C-TTTTTTCCTTTGAT-CTTA-GC-T-TA------A-TTAATTCA-GA-
gi|39 : TTGTGT-CG--T--GGTGCGGT-A-C-ATTT-CCCTTCGAT-CTTA-GG-CATA------CTTTA
gi|4 : taaagA-CATGT--AT---T----C-AG--TGATC-AA------------AA-----C-TT-----------------A---AAAG--AT-GCAG--CGTCTAAAGAAAATAACCATAA-----------CAT----A--------TG---TT--C-AATTAACA--CA-C-CG-AGTTT--A-----G--C-A-CACTT-----A------ATTGGAAG--A------TTTAAAGGGA--A-----C-------CCC-CC---C------CG--------CCTCTT--------ACTA-T--TTT-------CCAATT------T-------AA------A-TAAATCATA----A--T-CCTTGTTTTTGT-T--------------------C---------------AA--------------T-A-------AGAACCAATAGCGATGA----------AG-AAG---CTTCAT-AAT--TCTT-CC-GCTCGT-----TAGATG---A------A--------A-----GCAATGA---CAAA--GATCT-A---TTG---ATCTAT-T-GTGTCT-TTTGAATT--GC---T--AT--T--CG-TAA---TTTCATATT---GTTAATAAG---------AAACTTTG----AAGAATCT---GTGT--TA---TTTCATTAATTTTTAACG-CGTACA-A-AAAA-----T-GACCAA-T---TA-A-TAGTAACCACG--GCTTCGGGTGGG----GG----------ACG--AAGA-CCAA---------TG---TGG--GCCTT-GA----G------CGGAC-TCCAGAC--------CCCCTTA--------CCG-TCAC----G---CCCACCTCGACATTTC--A---A---CA-----T------------------TCATTGATCTACCCAA----GT---AC---AAT------GCATG-C--A-A---TGA------------------G-TACTT-AC-CATGACCAAT-CCCGTTATG-TTCAG-TCC---G-TTAC--T-CTCAGGTGG--G-------------------------TTT----TT--TCTA-CAC----TACTC--T------A-GTG--CA-A---TGCA-TATT-TTGAAATA-A-C-GT-GAAGG-AT-CCAATT-A-TTTT--A-ACCACAAAA----C-----TA---A-AGA-------AGTT-A-ATA-CA----C--C----GATCT-CCAA-T--GTT--TGAA-TGC-T-GCGT-TAT---GT------T-T-C-A--ACTTTT-GACC-A-CCC-CAGACTT---CTA-----CGTGCACGT-G-----C-AT-GCGACCT---------TTATCAATGCTCTTCCT-ACG-------T-CA-CGTCG----C--ATG-CAACTTAG-C-A-ATG-CTG---TTC-----------TGAAC-A-----T-TTATGA-CATAA--------GA----CATTTA-CAAT-GCTGCTCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAA
gi|40 : -TTTT-TCCTT-GAT-CTTA-GCCTGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCA
gi|5 : TTGTTT-CA--T--TGTACGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-GC-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAGAAA-A-T-GCTA--G-GCAGAATT-CT--AA-C-CG-T--AC-A-AT-ATGTAC--TA-T-G-TG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGGTAAAAC-----ACTATA-AC-TTCCAA--CACAAA-A-TC--AG-AAAGGG--GACGC------TTT--TG-TAA-CACTT--AT---TTACCC-AG--TGATG-AA------------AA-----C-AT-----------------A---ACAA--AT-ACAGA-CTATAA------------ACAA-----------CGT----A--------TG----T-TC-AAATAACA--TG-C-AT-ATTTT--A-----G--C-A-CACTT-----AAC----A------G--A------TTAAGAGGGATTG-----C-------CCA-CCAT-C------C---------AC------------AAT-----TTT-------CAA--T------T-------AA----G-A-T-AATCATA----A----A-----TATTGT-T--------------------CCTGT-----------A---------------T-A-------ACTGGCGATAT-----A----------AG-AAG---A--AAT-AAT--TCTT-CC-A--T-T-----TAAA-G---AAAGC--A--------AT----G----GA---CAA---GATCT-A---TTG---A---AT-T-AT-TTT-CTTGTATTTGGG---A--AA--T--CG-TAT---TTTCATTTT---G--AAAAAA---------AAACCATG---TAAGA--TT---GTAT--TA--ATTTGAT--ATT-----CG-CGT-CA-TTAAAA-----T-A--CAC-T---AA-A-TAGTAA----G-AGTTTCA--TGGG----GG--------CAA--CCAACA-CCCATG-------GG---GGG--GTCTT-GA----GG-----CTG-C-TCCAGA---------GCCCT-A--------CC--TCAC----GAAGATC-CGTC-----TTCAAC---T---CA-----TTGA---------------TC-----------CG-----CC---A----TAT------ACATG-CTAA-A---TGA--------------C---G-TACT
gi|6 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGT-A-CTTTTT-TCCCTTGAT-CTTA-GC--GTA------CTTTAAATCA--A-CAGAAA-AGC-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AATC-CG-T--AC-A-A--AACTTC--TA-G-G-GG-CGGCAG-T-T--A--GC---TG-TACTTAT--A-AC---TTCTCAGGG---AACTG-T-ACTATA-AC-TTCCAGCACCTAAA-A-TC--AG-ATAGGC--AACGA------TTT--TG--AA-CATTT--A----T----C-AG--TGATA-AA------------AA-----C-TTTCAAAATGCAGTGAGTTA---ACAA--AT-TAAG--C-----------------ATAA-----------ATT----A---------GCATTT-TC-AATTAACA--CGAC-GG-AGTTT--A-----G--CAA-CACTTAATTCA------G------GCAG------ATTAAAGGGA--G-----T-------CCC-CC---C------CCCCCCCCCACC------------AATA-ATCTTT-------CCAATT------T-------AA----GAA-TAAATCATA----A--TCC-----TTTTGT-T--------------------CGTAAAAAATTAGCGGA---------------T-A-------A---------------A----------AGTATG---C--AAT-CAT--TCTTCCC-GCTC-A-----AAGA-G---A------A--------ATTCAAT----GA---CAA---GGTCT-A----TG---A---TT-T-AT-TGT-TTT-TA-TTGGG---AGCAA--TTCCG--AT---TTTCATTTT------AATAAG---------AAACTTTA---AAAGA--TTAA-GTGT--TATCGTTTAAT--TTT-----
gi|7 : AGAC--------CCACT-A--------CC--TCAC----GA-CCTC--CCC-----CCC--C---C---CC-----TCAACTTCACATTCATTGATC-----------CACCCGAGT---A----AATATTTATGCATG-C--AGA---TGA--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---T-TTAC--T-CTTGGG--T--G-------------------------TTT----TTGTTTTA-CAAA---TCCT------------GTG--CC-A---TGCA-TA-T-T-GAAAAT-A-C-GTTAAAGGCAT-CCAAT-CA-TTTT--AGA----AACA----CTAAGCCA---A-A-A-------AGTTA---TA--C----C--CACAAGATCT-CC-A-T--G-T--TGAACTGT-T-GCGA-T-T---GT------T-TCT-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----A-AT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGT---TTATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACA-TTTA--C-A-GTA-CTGTCTTTTGGT-TTGTTTATGGG--AAAATTT-TTATTGGTACAGAGGGGCGTGG----CAGTCG-AGTC-GCCTCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTGTAC-CAAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T--AATATAa
gi|8 : aCAAGA-CCCAC--------TG---GGG--ACCTT-GA----GG-----CAGCC-TCCAGAT--------CCCCT-A--------CC--ATAT----GAAGCTCCCCCC-----CCC--C---C---CCACCTCT------------------TCTT---------CA-----AT---TCCTTGAT------GCATG-C--A-A---TGATTCTCAGTTGCAAAA---G-TACTT-AC-TGTGCCCAAT-ACCATTATG-CCCAA-TCA---G-TTAC--T-CA---------G-------------------------TTT----TA--TT----ACA---TCCTAG-T------ATGTA--CT-A---TGCA-TA-T-TTGAGATA-A-C-GT-AACGGCAT-CCAATTCA-TTTC--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTT-A-AT--GC----CATT----GATAT-CC-A-T--G-A--TGGA-TGT-A-GCGA-T-TTTAGTTCCTACT-TCCAA--ATTTTT-TA-CAA-CCC-CAGACTCC--CTA-----CAT-CACGTCA-----C-GT-CCAA--A---------TATGCAATGTTAT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-GTA-CTTTCTTTTG-T-TCAA--ATGTA--A-----T-TTATT-----------------------------GTC-ACTGTGCGACT-AAAC-TGC-CAT-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCTAT-ACAAA--CGAAAGAAAG--T---ACTG-T-AAATAT
gi|9 : -TATA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-TGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AAACG-T-ACTATA-AC-TTCCCAC-CATACA-A-TC--AG-AAAGGC--GACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AACAAAAGAAATACAG-----C-TT-----------------ATCAACAA--AT-TAAG--C-----------------ATA------------CTT----A--------TG---TC-TC-AATTAACA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-A-CACTT-----C------GCA----G--A------TTTAAAGAGA--G-----C-------CCC-CC---C------C---------T---------------------TTT-----------------------------------A-T-AATCATA----A--TAT-----TTTTGT-T--------------------C---------------ATAAAACAAATAGCGAT-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-ACTC-T-----TAGA-G---A------A--------ATCAA-T----GA---CAA---GATCT-A---TTGGTTA---AT-T-GT-TTT-TTTTTA-TTGGG---A--GATCT--CG-TA----TTTCATTTT---T--ATAAGA---------AA--CTTT---TAAGAT-TT---GTGT--TA--
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): ATGACGTCATTTTATGGAGGAATCCATGATAAGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 44444444444444444444444444444444444444444444 55555555555555555 111111111111111111111111111 1111 6666666666666666666666666666 1111111111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 2222222222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111 55555555555555555555555555 11111111 11111 1111 22222 11111111 111 11 222 111 2222222222222 444444444444444 2222 55555555555555555555555555555555 22222222 11111 22222222222 222222222 22222222222222 11111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 333333333333333333 11111 1111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 1111111111 1111111 555555555555555555555 1111111111111 11111 111111111111 11111 22222222222222 6666666666666666666666666666666666 11111111
lowQualScore : 5 66 33 2 2 2 4 2 2 5 555555 2 2 2 2 2 55 4 4 33 333 2 33 2 2 2 33 2 2 2 5 2 2 33 66 555 2 666666 2 555 3 555 2 3 3 4 4 0 4 3 3 55 3 55 000000 55 33 3 44 555 7777 3 44 44 66666666666666666666666666666666666666666666 2 44 3 77 33333333333333333 777777777777777777777777777 7777 4 3 55 3 2222 55 99999 55 3 3 7777777777777777777777777777 2 3333333333333333 3 999 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111 5 0 6666 2222222222 3 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 555 88 3 44 3 3 3 00000 3 555 00000000000000000000000000 888 44 3 555 88888888 3 1 999999 7 0 88888 33 3 0000 1 44 11111 1 44444444 3 000 00 444 222 1 2222222222222 5 5 000000000000000 5 5 3333 5 5 99999999999999999999999999999999 5 33333333 00000 777 5 44444444444 1 5 000000000 00000000000000 9999 777777777 777 11111 66 888 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 66 4 777 66 333333333333333333 4 0 00000 5 5 5 9999999999 66 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 00 4 777 4 7 3 88 9999 3 8 3 3 44 3 7777 7777 7777777777 3 3 0000000 999999999999999999999 3 3 3 44 3 44 3 999 3 9999999999999 3 3 44 0 6 6 3 6 3 444 88888 3 66666 3 3 444444444444 3 3 22222 3 3 3 3 22222222222222 66 2 8 5 1 2 2 999 66 77777 2 5555555555555555555555555555555555 11111111 3 33 3 6666 77 0 3 3 6 44 44 555 3 55
lowQualScore : . .. .. . . . . . . . ...... . . . . . .. . . .. ... . .. . . . .. . . . . . . .. .. ... . ...... . ... . ... . . . . . . . . . .. . .. ...... .. .. . .. ... .... . .. .. ............................................ . .. . .. ................. ........................... .... . . .. . .... .. ..... .. . . ............................ . ................ . ... .................................................................... ...... . . .... .......... . ......................................................................................... . ... .. . .. . . . ..... . ... .......................... ... .. . ... ........ . . ...... . . ..... .. . .... . .. ..... . ........ . ... .. ... ... . ............. . . ............... . . .... . . ................................ . ........ ..... ... . ........... . . ......... .............. .... ......... ... ..... .. ... ................................................................ . .. . ... .. .................. . . ..... . . . .......... .. ............................................................................. .. . ... . . . .. .... . . . . .. . .... .... .......... . . ....... ..................... . . . .. . .. . ... . ............. . . .. . . . . . . ... ..... . ..... . . ............ . . ..... . . . . .............. .. . . . . . . ... .. ..... . .................................. ........ . .. . .... .. . . . . .. .. ... . ..
lowQualScore : 3 33 77 4 4 2 2 0 0 7 555555 1 1 2 2 2 33 4 7 44 555 7 77 9 9 9 77 7 7 7 7 9 9 99 88 000 9 111111 9 000 1 444 6 6 6 0 0 5 0 6 6 00 6 00 555555 00 88 3 66 888 1111 3 66 99 88888888888888888888888888888888888888888888 1 22 1 33 88888888888888888 777777777777777777777777777 8888 0 6 00 6 5555 00 11111 00 6 6 5555555555555555555555555555 1 8888888888888888 3 666 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 666666 7 8 5555 3333333333 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 444 55 1 22 1 1 1 88888 1 444 99999999999999999999999999 555 22 1 444 44444444 1 0 111111 5 6 77777 22 6 9999 5 66 00000 0 55555555 7 222 66 444 222 0 6666666666666 7 7 111111111111111 7 7 6666 7 7 99999999999999999999999999999999 0 11111111 99999 111 0 66666666666 4 0 888888888 33333333333333 4444 999999999 888 11111 11 888 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 11 4 888 11 000000000000000000 4 1 55555 0 1 0 0000000000 99 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 66 4 888 0 3 6 22 8888 6 2 3 3 66 3 1111 1111 3333333333 3 3 8888888 888888888888888888888 3 3 3 66 3 66 6 777 3 6666666666666 3 1 22 2 7 7 3 7 3 888 33333 3 77777 3 3 888888888888 5 7 88888 1 1 1 1 55555555555555 33 7 0 3 7 9 9 444 88 11111 9 4444444444444444444444444444444444 55555555 1 88 1 5555 33 2 1 1 2 22 66 888 3 99
consensus : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGC--AACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AA------------AA-----C-TT-----------------A---ANAA--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAACA--CG-C-GT-AGTTT--A-----G--C-A-CACTT--A--------G------G---------ATTTAAAGGGA--G-----C-------CCC-CC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-N-----TTTTGT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TAGA-G---AA--------A--T----CAAT-GA---CAA---GAT--CT-A---TTG---A-NT-T-ATTGT---T--TTTTATTTGG-G---AATTC-GTAT---TTTCAT-NTT-----AATAAG--------AAACTTTGTAAGA--TT---GTGTTA--ATTTNAT--ATT-----CG-CGT-CA-TTAAAAATG--CAC------T---AA-A-TAGTAA----G-AGC-TTC---CGG---G----G--G------TCCAACGCCAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTGA----GG-----CGGC-CTCCAGAC--------CCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAGCCCNCCC---C-----CTC--CC---C----------C------T-----------------ATCCA-----GT---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATA-GC----C--C----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
Reference ( family-888 ) : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGC--AACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AA------------AA-----C-TT-----------------A---ANAA--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAACA--CG-C-GT-AGTTT--A-----G--C-A-CACTT--A--------G------G---------ATTTAAAGGGA--G-----C-------CCC-CC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-N-----TTTTGT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TAGA-G---AA--------A--T----C----GA---CAA---GAT--CT-A---TTG---A-AT-T-ATTNT---T--TTTTATTTGG-G---AANTC-GTAT---TTTCAT-NTT-----AANAAG--------AAACCTTGTAAGA--TT---GTGTTA--ATTTNAT--ATT-----CG-CGT-CA-TTAAAAATG--CAC------T---AA-A-TAGTAA----G-AGC-TTC---CGG---G----G--G------TCCAACGCCAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTGA----GG-----CGGC-CTCCAGAC--------CCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAGCTCACCC---C-----CTC--CC---C----------C------T-----------------ATCCA-----GT---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATA-GC----C--C----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
gi|1 : TTGTGTACA--CTAGATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTT-GAT-CTTA-GCCTGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCAGGATCACC--AA-C-GA-T--AC-ACATTAACT-C--TA-G-GCGG-CGG-AGCT-T--A--CC---CGCTAC-A-T--A-AC---TTC-CAGGG---AACTG-TTACTATA-CT-TCCCAGT-CATAAA-AATC--AGGAAAGGC--AGCGA------TTT---G-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATTCAA------------AA-----CGTT-----------------A---ATAATAAT-GCAG--TG----------------ATAAACAATTCTAAGCTT----AAACATCTATG---TT-AC-A-TTAACA--CG-CCGG-AGTTTTTA-----G--C-A-CACTT--A--------G------ATTGGCAAGAATTTAAAGGGA--G-----CGCCCCCCCCC-CC---C------C---------CC------------AATAGA--TTT-------C----T------C-------AACTTAA-A-TAAATCATA----AATC-T-----TTTTGT-TTCGTAAAACAATAG------C---------------A---------------TTA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AATTCAT--TCTT-CC-GCTC-TA----CAGA-ATCCAA--------T--T----T----GA---CAA---GAT--CT-AAAATTG---ACAT-TTATTGTG--T--TTTTATTGGG-T---AATTC-ATATAATTTTTA--ATT-----A-TAAG--------AAACTT----AGA--TTTGTATGTTA--TTTTAATTTATT-----TC-AGT-CAGTTAAAAATG--ACC------A---AA-A-TAGTAA----ACAGC-TTT---AGG---GTTGGG--G------TT--AC---AAGA-CCCACTGGGGCCTTG---A-GGTAGCC-TCCA----TGACTCCCTAC-CTCACGACTCTTCACCCCCCT-CTTCCCTCCCC--TCACTGCCA--AAGCTTACTTGATC-----CCA--CC---C----------C------T--------------------CA-----GCTTAA----AAT------GCAT-GC--A-AACTTC--A--------------ACCAGCTACTT-ACTCGTGCCCAATGCCCGT-ATGGTTCAACTCCTAAGCTTACCGT-CCCAGG-TT--G-------------------------TTTATTTTT--TTTAACACAA--TCCTA-----------GTG--CCCACCTTGCACTA-T-TTGAAATATA-C--T-AATGGCATTCCAATTCACTTTT--A-A----AACA----CA----CT---A-A-ACTAAGAGAGTATA-ATA-CCACCAC--C----GAT-T-CC-A-TTGA-C--TGAA-TGTTATGCGA-T-T---AT------T-TCC-A--ACTTTTTGATC-A-CCC-CAGACTTT--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GTCGCAA--TCTCACGATCTTAGCAATACTGT---T-ATGAA-TTATT-CACTGAAT----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-TCTTGT--ATGGA--A-----TCTTATGG-TACAGAGTGA-GTGACC--CAGTCT-CGTCGGCTGCGCGACTCCGAC-TGCACACTGCCCCCTCACCTGTACGCAAAA-AG-TTCCATAACAAACTCGAAGACCAGTTT---ACTG-T-AAA
gi|10 : c---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTTTGC-CG-GCCCAAT-CCCATTA--------------------C--T-CGCTGG-GTTAA-------------------------TTT----AT--TTCA-C-CA---TCCTA--TGTAGCTA-GTG--CC-A---TACA-TA-T-TTGAAAT--A-T-GT-AATGAGAT-CCAATACA-TTTC--A-A----A-CA----C------A---A-G-A-------AGTTAA--TA-CCA---C--C----GATCT-CT-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-----GT------TATCC-ATAACTTTTTGA-T-A-CCC-GAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTTG-----CGGT-GCAA--T---------TTAGCAAT-CT-T---T-ATGAA-T-ATTAGA-TGACA----TTAAAGACA--TTA--CAA-ATACCTGTC--TAG-T-TTG---ATGGAGGA-----T-TTATTG-TACAGAGGGGCGTGA--------CT-CG----------------GAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTTTA--CAATACAA-TTCCAT-ACAAA--CAAAAGACAG--TTAAACTG-TAAAATATAAatta
gi|11 : T-TCCTTTCAT-CT-A-GC-TGTG-------TTTAAATAA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-ACAGAATT-CC--AA-A-CGAA--AC-A-AT-AACTTC--TA---G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---CG-TAC------A-AC---TTC-CA-GG---AACC--T-AATCTA-AC-TTCCAAC-CATAAA-A-TC--AG-AAAAACAAAACAT------TTT--TGAAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-GA------------AA-----C-ATAAAG-------------A---ACAA--AT-AC-G--C-----------------AAAA-----------CTT----A--------TG---TT-T--AATAAA-----G-C-AT-AGTTT--A-----G--C-ACCACTT--G--------GTA----G---------ATTTAA--GGA--C-----C-------CCCTCC---C------C---------CT------------AATA-A--CTT-------T----T------TTAATTTCAA----G-A--AAATCATA----AC-C-T-----TTTTAT-T--------------------T---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-ACTC-T-----TAGA-T---AA--------A--T----C----AATGTCAA---GA----T-A---T-----A-AC-T-G-TGT---C--TTTTA-TTGG-----------GTAT---TTTCAT-
gi|12 : --ATT-----CA-CGT-CA-TTAAAAATG---AC------TCAAAA-A-TAGTAAA---G-AGC-TTT---AAG---G----G--GGAGGTGTTTAAC--CAG---CCCAC--------TG---G-GG---CC-TTGC----AG-----CGGC-C--CAGAC--------CCCCT-A--------C---TCAC----G--AACTCCCCCC---C-----CTC--CCTTTC----------C------TGAATTCATTG-------ATCCACCCGGGT---A----AATTTTAT-GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TA--T-G---GTACC-AAT-CCCGTTATG-TTCAA-TAC---T-TTCC--TTCTCGTG-GT--GTTTTTTTTGTTTTCTGTTTTTTTTTTTT----TTGCTTTA-CAAA---TCCTA-----------GTGGCTC-A---TGCA-TA-TATTGAAATT-AACAGT-A-TGACAT-CCAATTCA-TTTTAAA-A----AACATAAGC-----CA---ATA-A-------AGTTAATACA-CT----C--A----AATCTGCC-A-T--G-T--TGA
gi|13 : --------G------G---------ATTTAAAGGGA--GTGCACC-------CCC-TC---CTTCT--C---------CCTG----------AAT-----TTT-------CAAT-T------T-------AA----G-G-TGAATCATG----G--T-G-----TTTTGG-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------ACAATAGCAGTAA-AAGATAC--AAT-AAT--CCTT-TC-ACTT-T-----TCGT-G---AA--------A--T----------------A---TTT--CT-A---TTC---A-TTGT-ATTTT---T--TTTTTTTTTT-G---GATTG-GTAT-------AA-CTT-----AATA--------------TTTGTGATA--TC---CTATCA--ATCTCA--------------CGT-CA-TTAAAAATG---AC------C---AACACTAGTAAA---G-ATT-TTC---CAG---G----G--G------CCCCATACCAAGACCCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTAA----CA-----CTCC-CTTTAAAT--------CCCT------------------C----G--AACCCCCCCC---C-----CTC--
gi|14 : agattagcT--G-------------------------TTT----TC--TGTA--AC----TTTTA--T------A-A-------A---T--A-TA-T-TT-AAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTTA--A-A----AACA----C-----TG---A-A-A-------AGTTAG--T--GC----CACT----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTAT---TTGTGAA-T-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTCG-T-TTGA--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-Ctt
gi|14 : ATTTT--C-A-ATA-CTTTCTTTCA-T-TTGT--GTGGA--A-----T-TTATT-------------GTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataa
gi|15 : tgttttctgtaacttttataaatatatttaagccattaaggcatctgattcatttaaaaacactgaaaagttagtgccactgatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagTTGTGT-CA--C--GATGCGGT-A-G-TTAT-TGCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CCTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGAT-T--A--GC---TG-TAC-TAT--A-AC---TTC-CAGGG---GTCTG-G-ATTATA-AC-TTCGAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGC--AACGA------TTT--TT-AAG-CATTT--AT---T----C-AG--TGATA-AA------------AAT----T-TT-----------------T---AAAA--AT-GCAG--CTTATAAACAGATTAAGTATAA-----------ATTAAGCA--------TG----T-TC-AATTAACA--CG-C-GG-AGTTT--A-----G--C-A-CACTT--A--------ataa
gi|16 : atA-TA-T-TTTAAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTT---A-A----AACA----CA----CG---A-A-A-------AGTTAG--T--GC----CA-C----TATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTAT---TTGTGAA-T-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTCG-T-TTGA--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-C
gi|16 : aaATTTT--C-A-ATA-CTTTCTTTCA-T-TTGT--GTGGA--A-----T-TTATT------------TGTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataac
gi|17 : aaatattttaagccattaaggcatctgattcatttaaaacacacgaaaagttagtgccactatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagA-T-TTGAA-TA-A---GT-AATGACCC-CAAAGTCA-TTTT--T-A----A-CT----C-----TA---A-A----------GTTAGTATA----------C----GATCT-CA-AAT--G-T--TGAA-TGT-A--CGA-T-G---TT------T-TTC-A--ACTTTG-AA-A-A-CCC-CAA---TCAACTA-----CGT-AAAATCG-----C-GA-GCA---T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGACTT-ATT-----------------------TTTA--C-ATATA--------------TTGT--ACAGA--A---------------------GGGCATGA----CAATCTCCGTC-ACTGCGCTACT-CGAC-AG--CAC-G-CCC----TCT-TA--AAATA-AATTTCCATAACAA-----AAATATAG--T---ACTGTT-GAATATAAAataac
gi|18 : C-AATTAACA--CG-C-CG-AGTTT--A-----G--C-A-CACTT--AAGTGGC--A------G---------ATTTAAAGAGA--G-----C-------CCC-CTGCAC------C---------CC------------AATA-A--TTT-------CCAATT------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--TCA-----TTTTGT-T--------------------C---------------ATAAAAAAATAGCGA-T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TAGA-G---AA--------A--A----CAAT-GA---CAA---GAT--AT-A---TTG---A-TT-T-ATTGT---C--TTTTATTGGG-T---AATTC-GTA----TTTCATATTT-----AATAAG--------AAACTT--TAAGA--T
gi|19 : GTGT-CAAAT--GGCGTGGC-AAC-CTTT-CCCTTT------TA----TG-A----------AAATCA-GAGCAGAAA---T-AGTT--G-GCAGAATT-TA--AA-A-CG-T--AC-A-AT-A-CTTC--TA-G-G-GGGTGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AATCAA-ACCTTTTC-CAGGG---AACTGTT-ACTATACACATTTTAAC-AAAAAACA-T---AG-AAAGG---AACAAAATATTTTT--TG-TAA-CA-TT--AT---T----CAAG--TGATA-AA------------GA--------------------------------AA--GT-GCAG--T-----------------ATA
gi|2 : tgTGCG-C-A-C-TTCTATTTTCTGGTGCTTAAGCATGTAACGTATCTTTAAATCA-GA-CTGGTA-A-CGGGTTGCG-GCAGAATTGCCCGAA-CACG-TAAAC-A-AT-AACTTTTGTA-G-G-GG-CGG-GGTTGT--AT-GCTTATT-TAC-AAT--ATAC---TTC-CAGGG---caaacaaa
gi|2 : AAA-A-TCGCAG-AAAGGC--AACGA------TTTGATG-AAACCATTCTAATGCGT----C-AGGCCGATG-AA------------AA-----C-AC-----------------AGG-AGAA--ATGGCAG--C-----------------CTAA-----------TCT----A--------ggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|2 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagT-----------------A---AGAA--CT-GTAGAGC-----------------ATAA-----------CAT----A--------TG---TTGTCTAATTAACAACCG-C-ATTAGTTA--ACGTCCGTCC-A-CACTTTCA--------C------GT--------ACCT---TGGA--G-----C-------CCC-CC---C------C---------CCCCGCCCCCCCTAAGTA-A--TTTGCAAAAAT----T------G-------AA----G-AATCAATCATACATTA--T-T-----TTTCGT-CATGAATGCACAAATGGCGAGC---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAA-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TTTA-G---AATAATTCATA--T----T----GA---CAA---GAT--CTCA---TTG-------------TT---C--TTTTACTTTG-GCTTAACTCGGTAT---TTCAAT-ATTATAGCAAAAAGTTTTTATTAGATTTTGTGTGA--TTCTCATATTA--ATTTTCT--AAT-----CGTCGT-TA-TAAAAAATG---ACCAAACGT---AG-A-TAGAAA----G-AGCTTTT---CGGATAG----GCAA------TCTAACG-CAAGA-ACCAC--------TGTATGTGC--GCCTTTGAG---GG-----CGACGATCCAGA---------CCCCT-A--------TCCATCAC----GAAAAG---ACCT---T-----CTG--AT---C----------C------C-----------------GCCCA----------A----AAT------GCATGGC--A-T---TGAAA--------------A---G-TAGTT------TACTAAGT-ACCG-CATG-CTCA----------TTAC--T--TCG-------------------------------------------------CACAGTTTCCGGCTT------A-GTGT-CC-A---TGTA-TAGT-TTGAAATA-A-C-GT-------------ATTCT-TTCT--A-A----AAC-----T-----TA---A-A-A-------AGTT-A-ATA------------------CT-AC-A-T--G-TACCG-A-TGT-T-GCGATT-T---AT------C-TCC-A--ACT-------------------CCTC--CTA-----CAT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGC------------A-T-ATT-CA-TGACA----C-------------------ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGA--ATGG--------------TCG-C-TA------CGCGA--------CT-CG---ACTGC----------------CAC-TCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CAAaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|20 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagACTTC--TA-G-G-GGGCGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CATGG---AACCG-T-ACTATA-A---------------A-A-TC--AG-AAAGGC--AACGA------T-----G-AAA-CATTT--AT---T----C-AA--TGATA-AA------------AATGCAAC-TT-----------------ATAAACAA--AT-TAAG--C-----------------AAAA-----------GTT----A--------TG---TA-TC-AATTAACA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-A-CAC-------------------------------TTTAA----A--G-----C-------CCC-CC---CCCCCTTC---------CC------------AATA-A--TTTTTAA---T----T------T-------AA----G-A-TAAATCAT
gi|21 : g---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---CGGAAA-CATGGTCTT-CCAGCTC-T-----TAGA-G---AG--------AATT----CAAT-GA---CAAATGGAT--CT-A---TTG---G-ATCT-ATTGT---T--T
gi|22 : atcatacatatttttgtctcataattacaaaggggtggcgaA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGATTTC--CTATGTCACGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATAGA--A-----T-TGAATG-C--------------------------------TGCGCAACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-C-AAATATAAaaaaacttttacttaaaggctaggacttccaatagcttgcattttttatccacaaaccaaaaaaaacactttaagatttggattatttca
gi|23 : TGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCA-AATT-CC-------------------C-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGTT-T--A--GC---T----------------------------------G-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGT--AACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATC-AA------------AA-----C-TT-----------------A---ATAA--AT-GCAG--C-----------------GTAc
gi|24 : -A--ACTTTT-GA-C-A-ACAGCTGGCTTA--TGA-----CGC-TATATCA-----C-GT-GCAA--T---------TTTGCAATGATGTTAAT-ATGAA-T-ATC-CA-TGGCATAGTT--AAGGC-ATTTA--C-AGATATCTGtaaaaaacttaa
gi|24 : aAC-TGC-AAC-TCCCT----TCTGTA--TAATA-AA-CCCAAT-ACAAA--AGAAACAAAG--T---ACTA-T---ATATAAatacctttttttcactgcaactcccttctgtataataaacccaatacaaaagaaacaaagtactatatataa
gi|25 : aaacttttgacaacagctggcttatgacgctatatcacgtgcaattttgcaatgatgttaatatgaatatccatggcatagttaaggcatttacagatatctgatacctttttttcC---C------C---------CT------------AA-A-A--TTT------------T------C-------AAAT--G-G-TAGATTATG----A--T-C-----TTTTGTAT--------------------CAAAA-----------A---------------T-AGAATGATA---------------A----------AA-AAG---C--AAT-CAT--TTTT-CC-ACTA-TCAGCACAGA-G---AA--------A--T---------------------ATTACT-----TTG---A-TA-C-ATTGT---TACTTTTATT
gi|26 : gatttaaggtggatgcatctgtaggca----T------T-------AG----A-A-TAAATCATG----G--T-C-----CCTTGT-T--------------------T---------------AAAAAAAATAACGA--T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-AAT--TTTT-CC-ACTT-T-----TAGA-G---AA--------A------------GAAATCAA---GA----T-A---TT------------TTAT---T--TGTTG--GGG-G---AACTT-GTAC---TCT-AT-CCA-----AAAAAT--------AAagaaga
gi|27 : tcatatCATTGAGT-CA--T--GGTGCTGC-A-C-TT---------AAT-C--A-GC-AATG------CTTTAAATCA-GA-CGGAAA-A-T-GGTT--A-ACAGAATT-CT--AA-C-T--T--ACAA-AA-AACTTC--TA-GAG-GA-CGG-AGCT-TTCAGTGC---TG-TAC-ATT--A-AT---TTC-TAGGG---AAACG-T-ATTAtctgaattaaaatttgcg
gi|28 : tg-----C-------CCC-CC---C------C---------CC------------CATT-T--TTT-------C----TCCAAATT-------AA----A-AGTAAATCATG----A--T-A-----TTTTGT-T--------------------C---------------AG--------------T-A-------A---------------A----------AG-AAggcctat
gi|29 : atgtaaatatacTTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTCTGAT-CTTA-GC-TGTG------CTTTAAATGA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AA-T-CG-T--AC-A-AT-AACTTT--TA-G-G-GA-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---Tttagatacacgataaaagaagcaatcgttgatttaaataataagatttttgatatattggtacttttat
gi|3 : atCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CCTA-GC-TGTA------CTTTAAA--------------A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CG-T--AC-A-AC-AAGTTC--TA-G-G-AG-CAG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAAC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGC--GACGA------TTA--CG-AAA-CATTC--AT---T----C-TG--TAGTG-AA------------AA-----C-AC-----------------A---AGAT--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAAAA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-A-CACTT--A------------------------------AAGGGA--------C-------CCC-CT---C------C---------CC------------AATA-A--TTT------------T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-A-----TTTTAT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-AAT--TATT-CC-AATC-T-----TAGA-G---AA--------G--T----N----NN---NNN---NNN--NN-N---NNN---N-NN-N-NNNNN---N--NNNNNNNNNN-N---NNNNN-NNNN---NNNNNN-NNN-----NNNNNN--------NNNNNNNNNNNNN--NN---NNNNNN--NNNNNNN--NNN-----NN-NNN-NN-NNNNNNNNN--NNN------N---NN-N-NNNNNN----N-NGC-TTC---CGG---G----A---------TCCAACACCAAGA-CCCAC--------TG---A-GA--ACC-TTGACCTAGG-----CGGC-CTCCATAC--------CCCTT-A--------CC--TCAC----G--AAGCTCACCC---C-----CTC--CC---C----------C------T------------------TCCA-----GT---A----AAT------GCAT-AC--A-A---TG--A--------------A---G-TATTT-AC-TGTGCTCAAT-CCCAT-ATG-TCCAA-TCC---G-TTAC--T-CGCAGG-G---G-------------------------CTT----TT--TTTA-CACA---TCCCA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGGAATT-A-C-GT-AATGACAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATAAGT----C--C----TACCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GAGA-T-T---GT------T-TCC-G--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTAT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTAA--ATTGA--A-----T-TTATTG-TACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCTACT-CGAC-TGT-CAC-GCCCC----TTTGTA--CAATG-AA-TTCTAT-ACAAA--CAAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
gi|30 : tATTCGGC-A-C-TTTT-CCCTTTGAT--TTA-A--TGTA------ATTTGA
gi|30 : atCT-CGACGTGT-CAT-TGCAT----TC-GTA--CAACA-GA-TTCCAT-ACAAA--CGAAGGACAG--T----CTG-C-TAATATAcggttattctttgatccacgttctcgacgtgtcattgcattcgtacaacagattccatacaaacgaaggacagtctgctaatata
gi|31 : atattcggcacttttccctttgatttaatgtaatttgacggttattctttgatccacgttTTGTGT-TA--T--GGTATGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-TC-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAAAAA-A-T-GCTT--G-GC-------TC--AG-C-TG-T--AC-A-AT-AACTTC--CA-G-G-G
gi|32 : cT---T-ACGAA-T-GTT-AA-TGACA--------AGTCG-TTCAAAC-ATATA-CTTTCTTTCG-T-TTAT--GTGGA--A-----T-TAAGTT-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CG
gi|33 : cca-CTTA-GC-TATA------TTTTAAATCG-GA-CATTAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CG-T--AC-T-AT-AACTTC--TAGG-G-GG-CGG-AACT-T------------------------AC---TTC-CAGGG---AACctg
gi|34 : -CCAATTCA-TTTT--C-A----GACT----T-----TATACA-A-A-------AGTCAA--T--GC----CAGT----GATCC-CC-G-T--G-T--CGAA-TGT-A-GTGA-T-TGTCGT------T-CCC-A--ATT
gi|35 : agTGTGT-CAA-T--GATGTGCA-A-C-TTTT-TC-TTTGAT-CTTA-GC-TGTG------CTTTAAATCAGGA-CAGAAACA-C-GGTTG-G-GCAGACTT-TC--ataaa
gi|36 : cTGTGT-CA--T--GATGCAGC-A-C-TTTT-TCATTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GTAGAATT-Ccca
gi|37 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGT-------------------A-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--A
gi|38 : aTTGTGTTCA--T--GATGCGGTTA-C-TTTTTTCCTTTGAT-CTTA-GC-T-TA------A-TTAATTCA-GA-
gi|39 : TTGTGT-CG--T--GGTGCGGT-A-C-ATTT-CCCTTCGAT-CTTA-GG-CATA------CTTTA
gi|4 : taaagA-CATGT--AT---T----C-AG--TGATC-AA------------AA-----C-TT-----------------A---AAAG--AT-GCAG--CGTCTAAAGAAAATAACCATAA-----------CAT----A--------TG---TT--C-AATTAACA--CA-C-CG-AGTTT--A-----G--C-A-CACTT--A--------ATTGGAAG---------ATTTAAAGGGA--A-----C-------CCC-CC---C------CG--------CCTCTT--------ACTA-T--TTT-------CCAATT------T-------AA------A-TAAATCATA----A--T-CCTTGTTTTTGT-T--------------------C---------------AA--------------T-A-------AGAACCAATAGCGATGA----------AG-AAG---CTTCAT-AAT--TCTT-CC-GCTCGT-----TAGATG---AA--------A--G----CAAT-GA---CAAA--GAT--CT-A---TTG---A-TC-T-ATTGTGTCT--TTTGAATTGC-T---A-TTC-GTAA---TTTCAT-ATTGTT--AATAAG--------AAACTTTG-AAGAATCT---GTGTTA---TTTCATTAATTTTTAACG-CGTACA---AAAAATGACCAA------T---TA-A-TAGTAACCACG--GC-TTCGGGTGG---G----G--G----------ACG--AAGA-CCAA---------TG---T-GG--GCC-TTGA----G------CGGA-CTCCAGAC--------CCCCTTA--------CCG-TCAC----G-----CCCACCT---CGACATTTC--AA---CATTCATTGATC------T-----------------ACCCAA----GT---AC---AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A------------------G-TACTT-AC-CATGACCAAT-CCCGTTATG-TTCAG-TCC---G-TTAC--T-CTCAGGTGG--G-------------------------TTT----TT--TCTA-CAC----TACTC--T------A-GTG--CA-A---TGCA-TATT-TTGAAATA-A-C-GT-GAAGG-AT-CCAATT-A-TTTT--A-ACCACAAAA----C-----TA---A-AGA-------AGTT-A-ATA-CA----C--C----GATCT-CCAA-T--GTT--TGAA-TGC-T-GCGT-TAT---GT------T-T-C-A--ACTTTT-GACC-A-CCC-CAGACTT---CTA-----CGTGCACGT-G-----C-AT-GCGACCT---------TTATCAATGCTCTTCCT-ACG-------T-CA-CGTCG----C--ATG-CAACTTAG-C-A-ATG-CTG---TTC-----------TGAAC-A-----T-TTATGA-CATAA--------GA----CATTTA-CAAT-GCTGCTCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAA
gi|40 : -TTTT-TCCTT-GAT-CTTA-GCCTGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCA
gi|5 : TTGTTT-CA--T--TGTACGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-GC-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAGAAA-A-T-GCTA--G-GCAGAATT-CT--AA-C-CG-T--AC-A-AT-ATGTAC--TA-T-G-TG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGGTAAAAC-----ACTATA-AC-TTCCAA--CACAAA-A-TC--AG-AAAGGG--GACGC------TTT--TG-TAA-CACTT--AT---TTACCC-AG--TGATG-AA------------AA-----C-AT-----------------A---ACAA--AT-ACAGA-CTATAA------------ACAA-----------CGT----A--------TG----T-TC-AAATAACA--TG-C-AT-ATTTT--A-----G--C-A-CACTT--AAC------A------G---------ATTAAGAGGGATTG-----C-------CCA-CCAT-C------C---------AC------------AAT-----TTT-------CAA--T------T-------AA----G-A-T-AATCATA----A----A-----TATTGT-T--------------------CCTGT-----------A---------------T-A-------ACTGGCGATAT-----A----------AG-AAG---A--AAT-AAT--TCTT-CC-A--T-T-----TAAA-G---AA--------A--G----CAATGGA---CAA---GAT--CT-A---TTG---A-AT-T-ATTTT---C--TTGTATTTGG-G---AAATC-GTAT---TTTCAT-TTTG----AAAAAA--------AAACCATGTAAGA--TT---GTATTA--ATTTGAT--ATT-----CG-CGT-CA-TT-AAAATA--CAC------T---AA-A-TAGTAA----G-AGT-TTCA--TGG---G----G--G--------CAA--CCAACA-CCCATG-------GG---G-GG--GTC-TTGA----GG-----CTG--CTCCAGA---------GCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAGATC-CGT---C-----TTCAACT---C----------A------TTG---------------ATCCG-----CC---A----TAT------ACAT-GCTAA-A---TG--A--------------C---G-TACT
gi|6 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGT-A-CTTTTT-TCCCTTGAT-CTTA-GC--GTA------CTTTAAATCA--A-CAGAAA-AGC-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AATC-CG-T--AC-A-A--AACTTC--TA-G-G-GG-CGGCAG-T-T--A--GC---TG-TACTTAT--A-AC---TTCTCAGGG---AACTG-T-ACTATA-AC-TTCCAGCACCTAAA-A-TC--AG-ATAGGC--AACGA------TTT--TG--AA-CATTT--A----T----C-AG--TGATA-AA------------AA-----C-TTTCAAAATGCAGTGAGTTA---ACAA--AT-TAAG--C-----------------ATAA-----------ATT----A---------GCATTT-TC-AATTAACA--CGAC-GG-AGTTT--A-----G--CAA-CACTT--AATTCAGGCA------G---------A-TTAAAGGGA--G-----T-------CCC-CC---C------CCCCCCCCCACC------------AATA-ATCTTT-------CCAATT------T-------AA----GAA-TAAATCATA----A--TCC-----TTTTGT-T--------------------CGTAAAAAATTAGCGGA---------------T-A-------A---------------A----------AGTATG---C--AAT-CAT--TCTTCCC-GCTC-A-----AAGA-G---AA--------A--TTCAAT----GA---CAA---GGT--CT-A----TG---A-TT-T-ATTG----T--TTTTA-TTGG-GAGCAATTC-CGAT---TTTCAT-TTT-----AATAAG--------AAACTTTAAAAGA--TTAA-GTGTTATCGTTTAAT--TTT-----
gi|7 : AGAC--------CCACT-A--------CC--TCAC----G--A---CCTCCC---C-----CCC--CC---C----------C------TCAACTTCACATTCATTGATCCACCCGAGT---A----AATATTTATGCAT-GC--AGA---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---T-TTAC--T-CTTGGG--T--G-------------------------TTT----TTGTTTTA-CAAA---TCCT------------GTG--CC-A---TGCA-TA-T-T-GAAAAT-A-C-GTTAAAGGCAT-CCAAT-CA-TTTT--AGA----AACA----CTAAGCCA---A-A-A-------AGTTA---TA--C----C--CACAAGATCT-CC-A-T--G-T--TGAACTGT-T-GCGA-T-T---GT------T-TCT-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----A-AT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGT---TTATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACA-TTTA--C-A-GTA-CTGTCTTTTGGT-TTGTTTATGGG--AAAATTT-TTATTGGTACAGAGGGGCGTGG----CAGTCG-AGTC-GCCTCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTGTAC-CAAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T--AATATAa
gi|8 : aCAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--ACC-TTGA----GG-----CAGC-CTCCAGAT--------CCCCT-A--------CC--ATAT----G--AAGCTCCCCC---C-----CCC--CC---C----------CACCTCTT-----------------CTTCA-----AT---TCCTTGAT------GCAT-GC--A-A---TG--ATTCTCAGTTGCAAAA---G-TACTT-AC-TGTGCCCAAT-ACCATTATG-CCCAA-TCA---G-TTAC--T-CA---------G-------------------------TTT----TA--TT----ACA---TCCTAG-T------ATGTA--CT-A---TGCA-TA-T-TTGAGATA-A-C-GT-AACGGCAT-CCAATTCA-TTTC--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTT-A-AT--GC----CATT----GATAT-CC-A-T--G-A--TGGA-TGT-A-GCGA-T-TTTAGTTCCTACT-TCCAA--ATTTTT-TA-CAA-CCC-CAGACTCC--CTA-----CAT-CACGTCA-----C-GT-CCAA--A---------TATGCAATGTTAT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-GTA-CTTTCTTTTG-T-TCAA--ATGTA--A-----T-TTATT-----------------------------GTC-ACTGTGCGACT-AAAC-TGC-CAT-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCTAT-ACAAA--CGAAAGAAAG--T---ACTG-T-AAATAT
gi|9 : -TATA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CG-T--AC-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-TGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AAACG-T-ACTATA-AC-TTCCCAC-CATACA-A-TC--AG-AAAGGC--GACGA------TTT--TG-AAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AACAAAAGAAATACAG-----C-TT-----------------ATCAACAA--AT-TAAG--C-----------------ATA------------CTT----A--------TG---TC-TC-AATTAACA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-A-CACTT--C--------GCA----G---------ATTTAAAGAGA--G-----C-------CCC-CC---C------C---------T---------------------TTT-----------------------------------A-T-AATCATA----A--TAT-----TTTTGT-T--------------------C---------------ATAAAACAAATAGCGAT-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-ACTC-T-----TAGA-G---AA--------A--T----CAAT-GA---CAA---GAT--CT-A---TTGGTTA-AT-T-GTTTT---T--TTTTATTGGGAG---ATCTC-GTA----TTTCAT-TTT-----TATAAG--------AAACTTT-TAAGAT-TT---GTGTTA--
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): ATGACGTCATTTTATGGAGGAATCCATGATAAGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444 55555555555555555 111111111111111111111111111 1111 6666666666666666666666666666 1111111111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 1111111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 11111 11111 111111 111 222222222 1111 111 111111 11 3333333333333333 111 2222222222222 444444444444 2222 55555555555555555555555555555555 22222222 11111 22222222222 222222222 22222222222222 111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 333333333333333333 11111 1111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 1111111111 1111111 555555555555555555555 1111111111111 11111 111111111111 11111 22222222222222 6666666666666666666666666666666666 11111111
lowQualScore : 5 66 33 2 2 2 4 2 2 5 555555 2 2 2 2 2 55 4 4 33 333 33 2 2 2 2 33 2 2 2 5 2 2 33 66 555 2 2 33 2 555 3 555 2 3 3 4 4 0 4 3 3 55 3 55 000000 55 0 6 44 555 7777 3 44 44 11111111111111111111111111111111111111111111111111 44 3 77 33333333333333333 777777777777777777777777777 7777 4 3 55 3 2222 55 99999 55 3 3 7777777777777777777777777777 2 3333333333333333 999 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111111 5 0 6666 9999999999 3 3 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 555 88 3 44 3 3 3 99999999 3 8888 333 999 0 00000 3 00000 333333 000 111111111 4 2222 55 333 3 66 777777 11 4444444444444444 333 1 5555555555555 6 6 333333333333 6 6 6 0000 6 5 99999999999999999999999999999999 5 33333333 00000 777 5 44444444444 1 5 000000000 00000000000000 9999 777777 1 333333333 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 66 4 777 66 333333333333333333 4 0 00000 5 5 5 9999999999 66 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 00 4 777 4 7 3 88 9999 3 8 3 3 44 3 7777 7777 7777777777 3 3 0000000 999999999999999999999 3 3 3 44 3 44 3 999 3 9999999999999 3 3 44 0 6 6 3 6 3 444 88888 3 66666 3 3 444444444444 3 3 22222 3 3 3 3 22222222222222 66 2 8 5 1 2 2 999 66 77777 2 5555555555555555555555555555555555 11111111 3 33 3 6666 77 0 3 3 6 44 44 555 3 55
lowQualScore : . .. .. . . . . . . . ...... . . . . . .. . . .. ... .. . . . . .. . . . . . . .. .. ... . . .. . ... . ... . . . . . . . . . .. . .. ...... .. . . .. ... .... . .. .. .................................................. .. . .. ................. ........................... .... . . .. . .... .. ..... .. . . ............................ . ................ ... .................................................................... ...... . . .... .......... . . ......................................................................................... . ... .. . .. . . . ........ . .... ... ... . ..... . ..... ...... ... ......... . .... .. ... . .. ...... .. ................ ... . ............. . . ............ . . . .... . . ................................ . ........ ..... ... . ........... . . ......... .............. .... ...... . ......... .................................................................... . .. . ... .. .................. . . ..... . . . .......... .. ............................................................................. .. . ... . . . .. .... . . . . .. . .... .... .......... . . ....... ..................... . . . .. . .. . ... . ............. . . .. . . . . . . ... ..... . ..... . . ............ . . ..... . . . . .............. .. . . . . . . ... .. ..... . .................................. ........ . .. . .... .. . . . . .. .. ... . ..
lowQualScore : 3 33 77 4 4 2 2 0 0 7 555555 1 1 2 2 2 33 4 7 44 555 77 7 9 9 9 77 7 7 7 7 9 9 99 88 000 9 9 99 9 000 1 444 6 6 6 0 0 5 0 6 6 00 6 00 555555 00 2 7 66 888 1111 3 66 99 88888888888888888888888888888888888888888888888888 22 1 33 88888888888888888 777777777777777777777777777 8888 0 6 00 6 5555 00 11111 00 6 6 4444444444444444444444444444 1 8888888888888888 666 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 666666 7 8 5555 2222222222 1 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 444 55 1 22 1 1 1 88888888 1 8888 888 222 4 33333 3 99999 777777 444 000000000 4 6666 44 888 2 99 000000 99 3333333333333333 999 0 2222222222222 7 7 777777777777 7 7 7 8888 7 7 99999999999999999999999999999999 0 11111111 99999 111 0 66666666666 4 0 888888888 33333333333333 4444 222222 0 444444444 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 11 4 888 11 000000000000000000 4 1 55555 0 1 0 0000000000 99 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 66 4 888 0 3 6 22 8888 6 2 3 3 66 3 1111 1111 3333333333 3 3 8888888 888888888888888888888 3 3 3 66 3 66 6 777 3 6666666666666 3 1 22 2 7 7 3 7 3 888 33333 3 77777 3 3 888888888888 5 7 88888 1 1 1 1 55555555555555 33 7 0 3 7 9 9 444 88 11111 9 4444444444444444444444444444444444 55555555 1 88 1 5555 33 2 1 1 2 22 66 888 3 99
consensus : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AA------------AA-----C-TT-----------------A---AN----AA--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAACA--CG-C-GT-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--A--------G------G---------ATTTAAAGGGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-N-----TTTT-GT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----T--AGA-GAAA--TCAAT---GACAA---GATCT-A---TT-GAT--T-TATTGT---T--TTTTAT--TTGGG---A-AT-TCG-TAT---TTTCAT-NTT---AATA--AGAAACTTTGTA--AGA--TT----GTG---------TTA--ATTTNAT--ATT-----CG-CGT-CA-TTAAAAATG--CA--C-T---AA-A-TAGT-AA----G-AGC-TTC---CGG---G----G--G------TCCAACGCCAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTGA----GG-----CGGC-CTCCAGAC--------CCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAG-CCCNCCC---C-----CTCCC---C----------C------T-----------------ATCCA-----GT---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATA-GC----C--C----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
Reference ( family-888 ) : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AA------------AA-----C-TT-----------------A---AN----AA--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAACA--CG-C-GT-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--A--------G------G---------ATTTAAAGGGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-N-----TTTT-GT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----T--AGA-GAAA--TCAAT---GACAA---GATCT-A---TT-GAN--T-TATTGT---T--TTTTAT--TTGGG---A-AT-TCG-TAT---TTTCAT-NTT---AATA--AGAAACTTTGTA--AGA--TT----GTG---------TTA--ATTTNAT--ATT-----CG-CGT-CA-TTAAAAATG--CA--C-T---AA-A-TAGT-AA----G-AGC-TTC---CGG---G----G--G------TCCAACGCCAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTGA----GG-----CGGC-CTCCAGAC--------CCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAG-CCCNCCC---C-----CTCCC---C----------C------T-----------------ATCCA-----GT---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATA-GC----C--C----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
gi|1 : TTGTGTACA--CTAGATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTT-GAT-CTTA-GCCTGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCAGGATCACC--AA-C-GAT--A-C-ACATTAACT-C--TA-G-GCGG-CGG-AGCT-T--A--CC---CGCTAC-A-T--A-AC---TTC-CAGGG---AACTG-TTACTATA-CT-TCCCAGT-CATAAA-AATC--AGGAAAGGCAG--CGA------TTT---GAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATTCAA------------AA-----CGTT-----------------A---AT----AATAAT-GCAG--TG----------------ATAAACAATTCTAAGCTT----AAACATCTATG---TT-AC-A-TTAACA--CG-CCGG-AGTTTTTA-----G--C-AC-ACTT--A--------G------ATTGGCAAGAATTTAAAGGGA--G-----CGCCCCCCCCCCC---C------C---------CC------------AATAGA--TTT-------C----T------C-------AACTTAA-A-TAAATCATA----AATC-T-----TTTT-GT-TTCGTAAAACAATAG------C---------------A---------------TTA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AATTCAT--TCTT-CC-GCTC-T--------ACA-GAAT--CCAATTT-GACAA---GATCT-AAAATT-GACATT-TATTGTG--T--TTTTAT--TGGGT---A-AT-TCA-TATAATTTTTA--ATT---A-TA--AGAAACTT------AGA--TTTGT-ATG---------TTA--TTTTAATTTATT-----TC-AGT-CAGTTAAAAATG--AC--C-A---AA-A-TAGT-AA----ACAGC-TTT---AGG---GTTGGG--G------TT--AC---AAGA-CCCACTGGGGCCTTG---A-GGTAGCC-TCCA----TGACTCCCTAC-CTCACGACTCTTCACCCCCCT-CTTCCCTCCCC--TCACTGCCA--AAG-CTTACTTGATC-----CCACC---C----------C------T--------------------CA-----GCTTAA----AAT------GCAT-GC--A-AACTTC--A--------------ACCAGCTACTT-ACTCGTGCCCAATGCCCGT-ATGGTTCAACTCCTAAGCTTACCGT-CCCAGG-TT--G-------------------------TTTATTTTT--TTTAACACAA--TCCTA-----------GTG--CCCACCTTGCACTA-T-TTGAAATATA-C--T-AATGGCATTCCAATTCACTTTT--A-A----AACA----CA----CT---A-A-ACTAAGAGAGTATA-ATA-CCACCAC--C----GAT-T-CC-A-TTGA-C--TGAA-TGTTATGCGA-T-T---AT------T-TCC-A--ACTTTTTGATC-A-CCC-CAGACTTT--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GTCGCAA--TCTCACGATCTTAGCAATACTGT---T-ATGAA-TTATT-CACTGAAT----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-TCTTGT--ATGGA--A-----TCTTATGG-TACAGAGTGA-GTGACC--CAGTCT-CGTCGGCTGCGCGACTCCGAC-TGCACACTGCCCCCTCACCTGTACGCAAAA-AG-TTCCATAACAAACTCGAAGACCAGTTT---ACTG-T-AAA
gi|10 : c---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTTTGC-CG-GCCCAAT-CCCATTA--------------------C--T-CGCTGG-GTTAA-------------------------TTT----AT--TTCA-C-CA---TCCTA--TGTAGCTA-GTG--CC-A---TACA-TA-T-TTGAAAT--A-T-GT-AATGAGAT-CCAATACA-TTTC--A-A----A-CA----C------A---A-G-A-------AGTTAA--TA-CCA---C--C----GATCT-CT-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-----GT------TATCC-ATAACTTTTTGA-T-A-CCC-GAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTTG-----CGGT-GCAA--T---------TTAGCAAT-CT-T---T-ATGAA-T-ATTAGA-TGACA----TTAAAGACA--TTA--CAA-ATACCTGTC--TAG-T-TTG---ATGGAGGA-----T-TTATTG-TACAGAGGGGCGTGA--------CT-CG----------------GAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTTTA--CAATACAA-TTCCAT-ACAAA--CAAAAGACAG--TTAAACTG-TAAAATATAAatta
gi|11 : T-TCCTTTCAT-CT-A-GC-TGTG-------TTTAAATAA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-ACAGAATT-CC--AA-A-CGA--AAC-A-AT-AACTTC--TA-G-G-G--CGG-AGCT-T--A--GC---CG-TAC-AA------C---TTC-CAGG----AACC--T-AATCTA-AC-TTCCAAC-CATAAA-A-TC--AG-AAAAACAAAACAT------TTT--TGAAAACATTT--AT---T----C-AG--TGATG-GA------------AA-----C-AT-----------------A---AAGAACAA--AT-AC-G--C-----------------AAAA-----------CTT----A--------TG---TT-T--AATAAA-----G-C-AT-AGTTT--A-----G--C-ACCACTT--G--------GTA----G---------ATTTAA--GGA--C-----C-------CCCTC---C------C---------CCT-----------AATA-A--CTT-------T----T------TTAATTTCAA----G-A--AAATCATA----A--C-C-----TTTTTAT-T--------------------T---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-ACTC-T-----T--AGA-TAAA--TCAAT---GTCAA---GATATAA---CT-G---------TGT---C--TTTTA---TTGG-----------G-TAT---TTTCAT-
gi|12 : --ATT-----CA-CGT-CA-TTAAAAATG---A--C-TCAAAA-A-TAGT-AAA---G-AGC-TTT---AAG---G----G--GGAGGTGTTTAAC--CAG---CCCAC--------TG---G-GG---CC-TTGC----AG-----CGGC-C--CAGAC--------CCCCT-A--------C---TCAC----G--AAC-TCCCCCC---C-----CTCCCTTTC----------C------TGAATTCATTG-------ATCCACCCGGGT---A----AATTTTAT-GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TA--T-G---GTACC-AAT-CCCGTTATG-TTCAA-TAC---T-TTCC--TTCTCGTG-GT--GTTTTTTTTGTTTTCTGTTTTTTTTTTTT----TTGCTTTA-CAAA---TCCTA-----------GTGGCTC-A---TGCA-TA-TATTGAAATT-AACAGT-A-TGACAT-CCAATTCA-TTTTAAA-A----AACATAAGC-----CA---ATA-A-------AGTTAATACA-CT----C--A----AATCTGCC-A-T--G-T--TGA
gi|13 : --------G------G---------ATTTAAAGGGA--GTGCACC-------CCCTC---CTTCT--C---------CCTG----------AAT-----TTT-------CAAT-T------T-------AA----G-G-TGAATCATG----G--T-G-----TTTT-GG-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------ACAATAGCAGTAA-AAGATAC--AAT-AAT--CCTT-TC-ACTT-T-----T--CGT-GAAA--T--AT---T---------TCT-A---TT-CAT--TGTATTTT---T--TTTTTT--TTTTG---G-AT-TGG-TAT-------AA-CTT---AATA--------TTTGTG--ATA--TC----CTA---------TCA--ATCTCA--------------CGT-CA-TTAAAAATG---A--C-C---AACACTAGTAAA----G-ATT-TTC---CAG---G----G--G------CCCCATACCAAGACCCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTAA----CA-----CTCC-CTTTAAAT--------CCCT------------------C----G--AAC-CCCCCCC---C-----CTC
gi|14 : agattagcT--G-------------------------TTT----TC--TGTA--AC----TTTTA--T------A-A-------A---T--A-TA-T-TT-AAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTTA--A-A----AACA----C-----TG---A-A-A-------AGTTAG--T--GC----CACT----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTAT---TTGTGAA-T-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTCG-T-TTGA--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-Ctt
gi|14 : ATTTT--C-A-ATA-CTTTCTTTCA-T-TTGT--GTGGA--A-----T-TTATT-------------GTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataa
gi|15 : tgttttctgtaacttttataaatatatttaagccattaaggcatctgattcatttaaaaacactgaaaagttagtgccactgatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagTTGTGT-CA--C--GATGCGGT-A-G-TTAT-TGCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CCTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGAT-T--A--GC---TG-TAC-TAT--A-AC---TTC-CAGGG---GTCTG-G-ATTATA-AC-TTCGAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------TTT--TTAAG-CATTT--AT---T----C-AG--TGATA-AA------------AAT----T-TT-----------------T---AA----AA--AT-GCAG--CTTATAAACAGATTAAGTATAA-----------ATTAAGCA--------TG----T-TC-AATTAACA--CG-C-GG-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--A--------ataa
gi|16 : atA-TA-T-TTTAAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTT---A-A----AACA----CA----CG---A-A-A-------AGTTAG--T--GC----CA-C----TATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTAT---TTGTGAA-T-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTCG-T-TTGA--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-C
gi|16 : aaATTTT--C-A-ATA-CTTTCTTTCA-T-TTGT--GTGGA--A-----T-TTATT------------TGTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataac
gi|17 : aaatattttaagccattaaggcatctgattcatttaaaacacacgaaaagttagtgccactatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagA-T-TTGAA-TA-A---GT-AATGACCC-CAAAGTCA-TTTT--T-A----A-CT----C-----TA---A-A----------GTTAGTATA----------C----GATCT-CA-AAT--G-T--TGAA-TGT-A--CGA-T-G---TT------T-TTC-A--ACTTTG-AA-A-A-CCC-CAA---TCAACTA-----CGT-AAAATCG-----C-GA-GCA---T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGACTT-ATT-----------------------TTTA--C-ATATA--------------TTGT--ACAGA--A---------------------GGGCATGA----CAATCTCCGTC-ACTGCGCTACT-CGAC-AG--CAC-G-CCC----TCT-TA--AAATA-AATTTCCATAACAA-----AAATATAG--T---ACTGTT-GAATATAAAataac
gi|18 : C-AATTAACA--CG-C-CG-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--AAGTGGC--A------G---------ATTTAAAGAGA--G-----C-------CCCCTGCAC------C---------CC------------AATA-A--TTT-------CCAATT------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--TCA-----TTTT-GT-T--------------------C---------------ATAAAAAAATAGCGA-T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----T--AGA-GAAA--ACAAT---GACAA---GATAT-A---TT-GAT--T-TATTGT---C--TTTTAT--TGGGT---A-AT-TCG-TA----TTTCATATTT---AATA--AGAAACTT--TA--AGA--T
gi|19 : GTGT-CAAAT--GGCGTGGC-AAC-CTTT-CCCTTT------TA----TG-A----------AAATCA-GAGCAGAAA---T-AGTT--G-GCAGAATT-TA--AA-A-CGT--A-C-A-AT-A-CTTC--TA-G-G-GGGTGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AATCAA-ACCTTTTC-CAGGG---AACTGTT-ACTATACACATTTTAAC-AAAAAACA-T---AG-AAAGG-AA--CAAAATATTTTT--TGTAA-CA-TT--AT---T----CAAG--TGATA-AA------------GA------------------------------------AA--GT-GCAG--T-----------------ATA
gi|2 : tgTGCG-C-A-C-TTCTATTTTCTGGTGCTTAAGCATGTAACGTATCTTTAAATCA-GA-CTGGTA-A-CGGGTTGCG-GCAGAATTGCCCGAA-CACGTAAA-C-A-AT-AACTTTTGTA-G-G-GG-CGG-GGTTGT--AT-GCTTATT-TAC-AAT--ATAC---TTC-CAGGG---caaacaaa
gi|2 : AAA-A-TCGCAG-AAAGGCAA--CGA------TTTGATGAAACCATTCTAATGCGT----C-AGGCCGATG-AA------------AA-----C-AC-----------------AGG-AG----AA--ATGGCAG--C-----------------CTAA-----------TCT----A--------ggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|2 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagT-----------------A---AG----AA--CT-GTAGAGC-----------------ATAA-----------CAT----A--------TG---TTGTCTAATTAACAACCG-C-ATTAGTTA--ACGTCCGTCC-AC-ACTTTCA--------C------GT--------ACCT---TGGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------CCCCGCCCCCCCTAAGTA-A--TTTGCAAAAAT----T------G-------AA----G-AATCAATCATACATTA--T-T-----TTTC-GT-CATGAATGCACAAATGGCGAGC---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAA-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TTTAGA-ATAA--TTCATATTGACAA---GATCT---------------CATTGT---TC-TTTTAC--TTTGGCTTA-AC-TCGGTAT---TTCAAT-ATT---A-TAGCAAAAAGTTTTTATTAGA--TTTTGTGTGATTCTCATATTA--ATTTTCT--AAT-----CGTCGT-TA-TAAAAAATGACCAAACGT---AG-A-TAGA-AA----G-AGCTTTT---CGGATAG----GCAA------TCTAACG-CAAGA-ACCAC--------TGTATGTGC--GCCTTTGAG---GG-----CGACGATCCAGA---------CCCCT-A--------TCCATCAC----GAAAAG-ACCTTCT---G-----ATCCC---G----------C--------------------------CCA----------A----AAT------GCATGGC--A-T---TGAAA--------------A---G-TAGTT------TACTAAGT-ACCG-CATG-CTCA----------TTAC--T--TCG-------------------------------------------------CACAGTTTCCGGCTT------A-GTGT-CC-A---TGTA-TAGT-TTGAAATA-A-C-GT-------------ATTCT-TTCT--A-A----AAC-----T-----TA---A-A-A-------AGTT-A-ATA------------------CT-AC-A-T--G-TACCG-A-TGT-T-GCGATT-T---AT------C-TCC-A--ACT-------------------CCTC--CTA-----CAT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGC------------A-T-ATT-CA-TGACA----C-------------------ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGA--ATGG--------------TCG-C-TA------CGCGA--------CT-CG---ACTGC----------------CAC-TCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CAAaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|20 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagACTTC--TA-G-G-GGGCGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CATGG---AACCG-T-ACTATA-A---------------A-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------T-----GAAA-CATTT--AT---T----C-AA--TGATA-AA------------AATGCAAC-TT-----------------ATAAAC----AA--AT-TAAG--C-----------------AAAA-----------GTT----A--------TG---TA-TC-AATTAACA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-AC-AC-------------------------------TTTAA----A--G-----C-------CCCCC---CCCCCTTC---------CC------------AATA-A--TTTTTAA---T----T------T-------AA----G-A-TAAATCAT
gi|21 : g---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---CGGAAA-CATGGTCTT-CCAGCTC-T-----T--AGA-GAGAATTCAAT---GACAAATGGATCT-A---TTGGAT--C-TATTGT---T--T
gi|22 : atcatacatatttttgtctcataattacaaaggggtggcgaA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGATTTC--CTATGTCACGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATAGA--A-----T-TGAATG-C--------------------------------TGCGCAACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-C-AAATATAAaaaaacttttacttaaaggctaggacttccaatagcttgcattttttatccacaaaccaaaaaaaacactttaagatttggattatttca
gi|23 : TGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCA-AATT-CC-------------------C-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGTT-T--A--GC---T----------------------------------G-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGTAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATC-AA------------AA-----C-TT-----------------A---AT----AA--AT-GCAG--C-----------------GTAc
gi|24 : -A--ACTTTT-GA-C-A-ACAGCTGGCTTA--TGA-----CGC-TATATCA-----C-GT-GCAA--T---------TTTGCAATGATGTTAAT-ATGAA-T-ATC-CA-TGGCATAGTT--AAGGC-ATTTA--C-AGATATCTGtaaaaaacttaa
gi|24 : aAC-TGC-AAC-TCCCT----TCTGTA--TAATA-AA-CCCAAT-ACAAA--AGAAACAAAG--T---ACTA-T---ATATAAatacctttttttcactgcaactcccttctgtataataaacccaatacaaaagaaacaaagtactatatataa
gi|25 : aaacttttgacaacagctggcttatgacgctatatcacgtgcaattttgcaatgatgttaatatgaatatccatggcatagttaaggcatttacagatatctgatacctttttttcC---C------C---------CT------------AA-A-A--TTT------------T------C-------AAAT--G-G-TAGATTATG----A--T-C-----TTTT-GTAT--------------------C---------------AAAAA-----------T-AGAATGATA---------------A----------AA-AAG---C--AAT-CAT--TTTT-CC-ACTA-TCAGCAC--AGA-GAAA--T--AT---TAC-------T-------TT-GAT--A-CATTGT---TACTTTTAT--T
gi|26 : gatttaaggtggatgcatctgtaggca----T------T-------AG----A-A-TAAATCATG----G--T-C-----CCTT-GT-T--------------------T---------------AAAAAAAATAACGA--T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-AAT--TTTT-CC-ACTT-T-----T--AGA-GAAA--GAAAT-----CAA---GATAT-----TT-TAT--T-TGTTGagaaga
gi|27 : tcatatCATTGAGT-CA--T--GGTGCTGC-A-C-TT---------AAT-C--A-GC-AATG------CTTTAAATCA-GA-CGGAAA-A-T-GGTT--A-ACAGAATT-CT--AA-C-T-T--A-CAA-AA-AACTTC--TA-GAG-GA-CGG-AGCT-TTCAGTGC---TG-TAC-ATT--A-AT---TTC-TAGGG---AAACG-T-ATTAggggaacttgtactctatccaaaaaataatctgaattaaaatttgcg
gi|28 : tg-----C-------CCCCC---C------C---------CC------------CATT-T--TTT-------C----TCCAAATT-------AA----A-AGTAAATCATG----A--T-A-----TTTT-GT-T--------------------C---------------AG--------------T-A-------A---------------A----------AG-AAggcctat
gi|29 : atgtaaatatacTTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTCTGAT-CTTA-GC-TGTG------CTTTAAATGA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AA-T-CGT--A-C-A-AT-AACTTT--TA-G-G-GA-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---Tttagatacacgataaaagaagcaatcgttgatttaaataataagatttttgatatattggtacttttat
gi|3 : atCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CCTA-GC-TGTA------CTTTAAA--------------A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CGT--A-C-A-AC-AAGTTC--TA-G-G-AG-CAG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAAC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCGA--CGA------TTA--CGAAA-CATTC--AT---T----C-TG--TAGTG-AA------------AA-----C-AC-----------------A---AG----AT--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAAAA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-AC-AC--------------------------------TTAAAGGGA--------C-------CCCCT---C------C---------CC------------AATA-A--TTT------------T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-A-----TTTT-AT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-AAT--TATT-CC-AATC-T-----T--AGA-GAAG--T
gi|3 : tGC-TTC---CGG---G----A---------TCCAACACCAAGA-CCCAC--------TG---A-GA--ACC-TTGACCTAGG-----CGGC-CTCCATAC--------CCCTT-A--------CC--TCAC----G--AAG-CTCACCC---C-----CTCCC---C----------C------T------------------TCCA-----GT---A----AAT------GCAT-AC--A-A---TG--A--------------A---G-TATTT-AC-TGTGCTCAAT-CCCAT-ATG-TCCAA-TCC---G-TTAC--T-CGCAGG-G---G-------------------------CTT----TT--TTTA-CACA---TCCCA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGGAATT-A-C-GT-AATGACAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATAAGT----C--C----TACCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GAGA-T-T---GT------T-TCC-G--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTAT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTAA--ATTGA--A-----T-TTATTG-TACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCTACT-CGAC-TGT-CAC-GCCCC----TTTGTA--CAATG-AA-TTCTAT-ACAAA--CAAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcttccgggatccaacaccaagacccactgagaaccttgacctaggcggcctccataccccttacctcacgaagctcaccccctcccccttccagtaaatgcatacaatgaagtatttactgtgctcaatcccatatgtccaatccgttactcgcaggggctttttttacacatcccatagtgccatgcatatttggaattacgtaatgacatccaattcattttaaaacaccaaaaagttaaataagtcctacctccatgttgaatgtagagattgtttccgacttttgacaccccagacttcctacgtcacgtcgcgtgcaacttagcaatgctattatgaatattcatgacacaagacaatttacaatactgtctttcgtttaaattgaatttattgtacagaggggcgtgacagtctcgtcgctgcgctactcgactgtcacgcccctttgtacaatgaattctatacaaacaaaagacagtactgtaaatataaa
gi|30 : tcattgtgtcatgatgcggcactttttcctttgatcctagctgtactttaaaacggttggcagaattccaatcgtacaacaagttctaggagcagagcttagctgtacaataacttccagggaaccgtactataacttccaaccataaaatcagaaaggcgacgattacgaaacattcattctgtagtgaaaacacaagatatgcagcataacttatgtttcaattaaaacgcatagtttagcacacttaaagggaccccctccccaataatttttaagataaatcataatattttattcataaaagaagcaataattattccaatcttagagaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTCGGC-A-C-TTTT-CCCTTTGAT--TTA-A--TGTA------ATTTGA
gi|30 : atCT-CGACGTGT-CAT-TGCAT----TC-GTA--CAACA-GA-TTCCAT-ACAAA--CGAAGGACAG--T----CTG-C-TAATATAcggttattctttgatccacgttctcgacgtgtcattgcattcgtacaacagattccatacaaacgaaggacagtctgctaatata
gi|31 : atattcggcacttttccctttgatttaatgtaatttgacggttattctttgatccacgttTTGTGT-TA--T--GGTATGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-TC-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAAAAA-A-T-GCTT--G-GC-------TC--AG-C-TGT--A-C-A-AT-AACTTC--CA-G-G-G
gi|32 : cT---T-ACGAA-T-GTT-AA-TGACA--------AGTCG-TTCAAAC-ATATA-CTTTCTTTCG-T-TTAT--GTGGA--A-----T-TAAGTT-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CG
gi|33 : cca-CTTA-GC-TATA------TTTTAAATCG-GA-CATTAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CGT--A-C-T-AT-AACTTC--TAGG-G-GG-CGG-AACT-T------------------------AC---TTC-CAGGG---AACctg
gi|34 : -CCAATTCA-TTTT--C-A----GACT----T-----TATACA-A-A-------AGTCAA--T--GC----CAGT----GATCC-CC-G-T--G-T--CGAA-TGT-A-GTGA-T-TGTCGT------T-CCC-A--ATT
gi|35 : agTGTGT-CAA-T--GATGTGCA-A-C-TTTT-TC-TTTGAT-CTTA-GC-TGTG------CTTTAAATCAGGA-CAGAAACA-C-GGTTG-G-GCAGACTT-TC--ataaa
gi|36 : cTGTGT-CA--T--GATGCAGC-A-C-TTTT-TCATTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GTAGAATT-Ccca
gi|37 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGT-------------------A-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-
gi|38 : aTTGTGTTCA--T--GATGCGGTTA-C-TTTTTTCCTTTGAT-CTTA-GC-T-TA------A-TTAATTCA-GA-
gi|39 : TTGTGT-CG--T--GGTGCGGT-A-C-ATTT-CCCTTCGAT-CTTA-GG-CATA------CTTTA
gi|4 : taaagA-CATGT--AT---T----C-AG--TGATC-AA------------AA-----C-TT-----------------A---AA----AG--AT-GCAG--CGTCTAAAGAAAATAACCATAA-----------CAT----A--------TG---TT--C-AATTAACA--CA-C-CG-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--A--------ATTGGAAG---------ATTTAAAGGGA--A-----C-------CCCCC---C------CG--------CCTCTT--------ACTA-T--TTT-------CCAATT------T-------AA------A-TAAATCATA----A--T-CCTTGTTTTT-GT-T--------------------C---------------AA--------------T-A-------AGAACCAATAGCGATGA----------AG-AAG---CTTCAT-AAT--TCTT-CC-GCTCGT-----T--AGATGAAA--GCAAT---GACAAA--GATCT-A---TT-GAT--C-TATTGTGTCT--TTTGAA--TTGCT---A--T-TCG-TAA---TTTCAT-ATTGTTAATA--AGAAACTTTG-A--AGAATCT----GTG---------TTA---TTTCATTAATTTTTAACG-CGTACA---AAAAATGACCA--A-T---TA-A-TAGT-AACCACG--GC-TTCGGGTGG---G----G--G----------ACG--AAGA-CCAA---------TG---T-GG--GCC-TTGA----G------CGGA-CTCCAGAC--------CCCCTTA--------CCG-TCAC----G------CCCACCT---CGACATTTCAA---CATTCATTGATC------T-----------------ACCCAA----GT---AC---AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A------------------G-TACTT-AC-CATGACCAAT-CCCGTTATG-TTCAG-TCC---G-TTAC--T-CTCAGGTGG--G-------------------------TTT----TT--TCTA-CAC----TACTC--T------A-GTG--CA-A---TGCA-TATT-TTGAAATA-A-C-GT-GAAGG-AT-CCAATT-A-TTTT--A-ACCACAAAA----C-----TA---A-AGA-------AGTT-A-ATA-CA----C--C----GATCT-CCAA-T--GTT--TGAA-TGC-T-GCGT-TAT---GT------T-T-C-A--ACTTTT-GACC-A-CCC-CAGACTT---CTA-----CGTGCACGT-G-----C-AT-GCGACCT---------TTATCAATGCTCTTCCT-ACG-------T-CA-CGTCG----C--ATG-CAACTTAG-C-A-ATG-CTG---TTC-----------TGAAC-A-----T-TTATGA-CATAA--------GA----CATTTA-CAAT-GCTGCTCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAA
gi|40 : -TTTT-TCCTT-GAT-CTTA-GCCTGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCA
gi|5 : TTGTTT-CA--T--TGTACGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-GC-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAGAAA-A-T-GCTA--G-GCAGAATT-CT--AA-C-CGT--A-C-A-AT-ATGTAC--TA-T-G-TG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGGTAAAAC-----ACTATA-AC-TTCCAA--CACAAA-A-TC--AG-AAAGGGGA--CGC------TTT--TGTAA-CACTT--AT---TTACCC-AG--TGATG-AA------------AA-----C-AT-----------------A---AC----AA--AT-ACAGA-CTATAA------------ACAA-----------CGT----A--------TG----T-TC-AAATAACA--TG-C-AT-ATTTT--A-----G--C-AC-ACTT--AAC------A------G---------ATTAAGAGGGATTG-----C-------CCACCAT-C------C---------AC------------AAT-----TTT-------CAA--T------T-------AA----G-A-T-AATCATA----A----A-----TATT-GT-T--------------------CCTGT-----------A---------------T-A-------ACTGGCGATAT-----A----------AG-AAG---A--AAT-AAT--TCTT-CC-A--T-T-----T--AAA-GAAA--GCAATG--GACAA---GATCT-A---TT-GAA--T-TATTTT---C--TTGTAT--TTGGG---A-AA-TCG-TAT---TTTCAT-TTTG--AAAA--AAAAACCATGTA--AGA--TT----GTA---------TTA--ATTTGAT--ATT-----CG-CGT-CA-TT-AAAATA--CA--C-T---AA-A-TAGT-AA----G-AGT-TTCA--TGG---G----G--G--------CAA--CCAACA-CCCATG-------GG---G-GG--GTC-TTGA----GG-----CTG--CTCCAGA---------GCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAGATCCGTCT---T-----CAACT---C----------A------TTG---------------ATCCG-----CC---A----TAT------ACAT-GCTAA-A---TG--A--------------C---G-TACT
gi|6 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGT-A-CTTTTT-TCCCTTGAT-CTTA-GC--GTA------CTTTAAATCA--A-CAGAAA-AGC-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AATC-CGT--A-C-A-A--AACTTC--TA-G-G-GG-CGGCAG-T-T--A--GC---TG-TACTTAT--A-AC---TTCTCAGGG---AACTG-T-ACTATA-AC-TTCCAGCACCTAAA-A-TC--AG-ATAGGCAA--CGA------TTT--TG-AA-CATTT--A----T----C-AG--TGATA-AA------------AA-----C-TTTCAAAATGCAGTGAGTTA---AC----AA--AT-TAAG--C-----------------ATAA-----------ATT----A---------GCATTT-TC-AATTAACA--CGAC-GG-AGTTT--A-----G--CAAC-ACTT--AATTCAGGCA------G---------A-TTAAAGGGA--G-----T-------CCCCC---C------CCCCCCCCCACC------------AATA-ATCTTT-------CCAATT------T-------AA----GAA-TAAATCATA----A--TCC-----TTTT-GT-T--------------------CGTAAAAAATTAGCGGA---------------T-A-------A---------------A----------AGTATG---C--AAT-CAT--TCTTCCC-GCTC-A-----A--AGA-GAAAT-TCAAT---GACAA---GGTCT-A----T-GAT--T-TATTG----T--TTTTA---TTGGGAGCA-AT-TCC-GAT---TTTCAT-TTT---AATA--AGAAACTTTAAA--AGA--TTAA--GTG---------TTATCGTTTAAT--TTT-----
gi|7 : AGAC--------CCACT-A--------CC--TCAC----G--A----CCTCCC---C-----CCCCC---C----------C------TCAACTTCACATTCATTGATCCACCCGAGT---A----AATATTTATGCAT-GC--AGA---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---T-TTAC--T-CTTGGG--T--G-------------------------TTT----TTGTTTTA-CAAA---TCCT------------GTG--CC-A---TGCA-TA-T-T-GAAAAT-A-C-GTTAAAGGCAT-CCAAT-CA-TTTT--AGA----AACA----CTAAGCCA---A-A-A-------AGTTA---TA--C----C--CACAAGATCT-CC-A-T--G-T--TGAACTGT-T-GCGA-T-T---GT------T-TCT-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----A-AT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGT---TTATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACA-TTTA--C-A-GTA-CTGTCTTTTGGT-TTGTTTATGGG--AAAATTT-TTATTGGTACAGAGGGGCGTGG----CAGTCG-AGTC-GCCTCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTGTAC-CAAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T--AATATAa
gi|8 : aCAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--ACC-TTGA----GG-----CAGC-CTCCAGAT--------CCCCT-A--------CC--ATAT----G--AAG-CTCCCCC---C-----CCCCC---C----------CACCTCTT-----------------CTTCA-----AT---TCCTTGAT------GCAT-GC--A-A---TG--ATTCTCAGTTGCAAAA---G-TACTT-AC-TGTGCCCAAT-ACCATTATG-CCCAA-TCA---G-TTAC--T-CA---------G-------------------------TTT----TA--TT----ACA---TCCTAG-T------ATGTA--CT-A---TGCA-TA-T-TTGAGATA-A-C-GT-AACGGCAT-CCAATTCA-TTTC--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTT-A-AT--GC----CATT----GATAT-CC-A-T--G-A--TGGA-TGT-A-GCGA-T-TTTAGTTCCTACT-TCCAA--ATTTTT-TA-CAA-CCC-CAGACTCC--CTA-----CAT-CACGTCA-----C-GT-CCAA--A---------TATGCAATGTTAT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-GTA-CTTTCTTTTG-T-TCAA--ATGTA--A-----T-TTATT-----------------------------GTC-ACTGTGCGACT-AAAC-TGC-CAT-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCTAT-ACAAA--CGAAAGAAAG--T---ACTG-T-AAATAT
gi|9 : -TATA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-TGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AAACG-T-ACTATA-AC-TTCCCAC-CATACA-A-TC--AG-AAAGGCGA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AACAAAAGAAATACAG-----C-TT-----------------ATCAAC----AA--AT-TAAG--C-----------------ATA------------CTT----A--------TG---TC-TC-AATTAACA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--C--------GCA----G---------ATTTAAAGAGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------T---------------------TTT-----------------------------------A-T-AATCATA----A--TAT-----TTTT-GT-T--------------------C---------------ATAAAACAAATAGCGAT-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-ACTC-T-----T--AGA-GAAA--TCAAT---GACAA---GATCT-A---TT-GGT--T-AATTGT---T--TTTTTTTATTGGG---AGATCTCG-TA----TTTCAT-TTT---TATA--AGAAACTTT-TA--AGAT-TT----GTG---------TTA--
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): ATGACGTCATTTTATGGAGGAATCCATGATAAGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444 55555555555555555 111111111111111111111111111 1111 6666666666666666666666666666 1111111111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 1111111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 1111111111111 111 11111 111111 222222222 1111 111 111111 11 3333333333333333 111 2222222222222 444444444444 2222 55555555555555555555555555555555 22222222 11111 22222222222 222222222 22222222222222 111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 333333333333333333 11111 1111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 1111111111 1111111 555555555555555555555 1111111111111 11111 111111111111 11111 22222222222222 6666666666666666666666666666666666 11111111
lowQualScore : 5 66 33 2 2 2 4 2 2 5 555555 2 2 2 2 2 55 4 4 33 333 33 2 2 2 2 33 2 2 2 5 2 2 33 66 555 2 2 33 2 555 3 555 2 3 3 4 4 0 4 3 3 55 3 55 000000 55 0 6 44 555 7777 3 44 44 11111111111111111111111111111111111111111111111111 44 3 77 33333333333333333 777777777777777777777777777 7777 4 3 55 3 2222 55 99999 55 3 3 7777777777777777777777777777 2 3333333333333333 999 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111111 5 0 6666 9999999999 3 3 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 555 77 22 33 2 2 2 00000000 2 555 9999999999999 222 888 0 22222 3 55555 666666 888 111111111 4 2222 55 333 3 66 777777 11 4444444444444444 333 1 5555555555555 6 6 333333333333 6 6 6 0000 6 5 99999999999999999999999999999999 5 33333333 00000 777 5 44444444444 1 5 000000000 00000000000000 9999 777777 1 333333333 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 66 4 777 66 333333333333333333 4 0 00000 5 5 5 9999999999 66 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 00 4 777 4 7 3 88 9999 3 8 3 3 44 3 7777 7777 7777777777 3 3 0000000 999999999999999999999 3 3 3 44 3 44 3 999 3 9999999999999 3 3 44 0 6 6 3 6 3 444 88888 3 66666 3 3 444444444444 3 3 22222 3 3 3 3 22222222222222 66 2 8 5 1 2 2 999 66 77777 2 5555555555555555555555555555555555 11111111 3 33 3 6666 77 0 3 3 6 44 44 555 3 55
lowQualScore : . .. .. . . . . . . . ...... . . . . . .. . . .. ... .. . . . . .. . . . . . . .. .. ... . . .. . ... . ... . . . . . . . . . .. . .. ...... .. . . .. ... .... . .. .. .................................................. .. . .. ................. ........................... .... . . .. . .... .. ..... .. . . ............................ . ................ ... .................................................................... ...... . . .... .......... . . ......................................................................................... . ... .. .. .. . . . ........ . ... ............. ... ... . ..... . ..... ...... ... ......... . .... .. ... . .. ...... .. ................ ... . ............. . . ............ . . . .... . . ................................ . ........ ..... ... . ........... . . ......... .............. .... ...... . ......... .................................................................... . .. . ... .. .................. . . ..... . . . .......... .. ............................................................................. .. . ... . . . .. .... . . . . .. . .... .... .......... . . ....... ..................... . . . .. . .. . ... . ............. . . .. . . . . . . ... ..... . ..... . . ............ . . ..... . . . . .............. .. . . . . . . ... .. ..... . .................................. ........ . .. . .... .. . . . . .. .. ... . ..
lowQualScore : 3 33 77 4 4 2 2 0 0 7 555555 1 1 2 2 2 33 4 7 44 555 77 7 9 9 9 77 7 7 7 7 9 9 99 88 000 9 9 99 9 000 1 444 6 6 6 0 0 5 0 6 6 00 6 00 555555 00 2 7 66 888 1111 3 66 99 88888888888888888888888888888888888888888888888888 22 1 33 88888888888888888 777777777777777777777777777 8888 0 6 00 6 5555 00 11111 00 6 6 4444444444444444444444444444 1 8888888888888888 666 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 666666 7 8 5555 2222222222 1 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 000 99 99 99 9 9 9 44444444 9 000 0000000000000 777 555 8 66666 1 00000 444444 666 000000000 4 6666 44 888 2 99 000000 99 3333333333333333 999 0 2222222222222 7 7 777777777777 7 7 7 8888 7 7 99999999999999999999999999999999 0 11111111 99999 111 0 66666666666 4 0 888888888 33333333333333 4444 222222 0 444444444 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 11 4 888 11 000000000000000000 4 1 55555 0 1 0 0000000000 99 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 66 4 888 0 3 6 22 8888 6 2 3 3 66 3 1111 1111 3333333333 3 3 8888888 888888888888888888888 3 3 3 66 3 66 6 777 3 6666666666666 3 1 22 2 7 7 3 7 3 888 33333 3 77777 3 3 888888888888 5 7 88888 1 1 1 1 55555555555555 33 7 0 3 7 9 9 444 88 11111 9 4444444444444444444444444444444444 55555555 1 88 1 5555 33 2 1 1 2 22 66 888 3 99
consensus : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AA------------AA-----C-TT-----------------A---AN----AA--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAACA--CG-C-GT-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--A--------G------G---------ATTTAAAGGGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-N-----TTTT-GT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----T--AGA-GA---AA--TC---------AAT---GACAA---GATCT-A---TT-GA--TT-TATTGT---T--TTTTAT--TTGGG---A-AT-TCG-TAT---TTTCAT-NTT---AATA--AGAAACTTTGTA--AGA--TT----GTG---------TTA--ATTTNAT--ATT-----CG-CGT-CA-TTAAAAATG--CA--C-T---AA-A-TAGT-AA----G-AGC-TTC---CGG---G----G--G------TCCAACGCCAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTGA----GG-----CGGC-CTCCAGAC--------CCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAG-CCCNCCC---C-----CTCCC---C----------C------T-----------------ATCCA-----GT---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATA-GC----C--C----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
Reference ( family-888 ) : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AA------------AA-----C-TT-----------------A---AN----AA--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAACA--CG-C-GT-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--A--------G------G---------ATTTAAAGGGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-N-----TTTT-GT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----T--AGA-GA---AA--TC---------AAT---GACAA---GATCT-A---TT-GA--TT-TATTGT---T--TTTTAT--TTGGG---A-AT-TCG-TAT---TTTCAT-NTT---AATA--AGAAACTTTGTA--AGA--TT----GTG---------TTA--ATTTNAT--ATT-----CG-CGT-CA-TTAAAAATG--CA--C-T---AA-A-TAGT-AA----G-AGC-TTC---CGG---G----G--G------TCCAACGCCAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTGA----GG-----CGGC-CTCCAGAC--------CCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAG-CCCNCCC---C-----CTCCC---C----------C------T-----------------ATCCA-----GT---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATA-GC----C--C----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
gi|1 : TTGTGTACA--CTAGATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTT-GAT-CTTA-GCCTGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCAGGATCACC--AA-C-GAT--A-C-ACATTAACT-C--TA-G-GCGG-CGG-AGCT-T--A--CC---CGCTAC-A-T--A-AC---TTC-CAGGG---AACTG-TTACTATA-CT-TCCCAGT-CATAAA-AATC--AGGAAAGGCAG--CGA------TTT---GAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATTCAA------------AA-----CGTT-----------------A---AT----AATAAT-GCAG--TG----------------ATAAACAATTCTAAGCTT----AAACATCTATG---TT-AC-A-TTAACA--CG-CCGG-AGTTTTTA-----G--C-AC-ACTT--A--------G------ATTGGCAAGAATTTAAAGGGA--G-----CGCCCCCCCCCCC---C------C---------CC------------AATAGA--TTT-------C----T------C-------AACTTAA-A-TAAATCATA----AATC-T-----TTTT-GT-TTCGTAAAACAATAG------C---------------A---------------TTA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AATTCAT--TCTT-CC-GCTC-T--------ACA-GA---AT--CC---------AATTT-GACAA---GATCT-AAAATT-GACATT-TATTGTG--T--TTTTAT--TGGGT---A-AT-TCA-TATAATTTTTA--ATT---A-TA--AGAAACTT------AGA--TTTGT-ATG---------TTA--TTTTAATTTATT-----TC-AGT-CAGTTAAAAATG--AC--C-A---AA-A-TAGT-AA----ACAGC-TTT---AGG---GTTGGG--G------TT--AC---AAGA-CCCACTGGGGCCTTG---A-GGTAGCC-TCCA----TGACTCCCTAC-CTCACGACTCTTCACCCCCCT-CTTCCCTCCCC--TCACTGCCA--AAG-CTTACTTGATC-----CCACC---C----------C------T--------------------CA-----GCTTAA----AAT------GCAT-GC--A-AACTTC--A--------------ACCAGCTACTT-ACTCGTGCCCAATGCCCGT-ATGGTTCAACTCCTAAGCTTACCGT-CCCAGG-TT--G-------------------------TTTATTTTT--TTTAACACAA--TCCTA-----------GTG--CCCACCTTGCACTA-T-TTGAAATATA-C--T-AATGGCATTCCAATTCACTTTT--A-A----AACA----CA----CT---A-A-ACTAAGAGAGTATA-ATA-CCACCAC--C----GAT-T-CC-A-TTGA-C--TGAA-TGTTATGCGA-T-T---AT------T-TCC-A--ACTTTTTGATC-A-CCC-CAGACTTT--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GTCGCAA--TCTCACGATCTTAGCAATACTGT---T-ATGAA-TTATT-CACTGAAT----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-TCTTGT--ATGGA--A-----TCTTATGG-TACAGAGTGA-GTGACC--CAGTCT-CGTCGGCTGCGCGACTCCGAC-TGCACACTGCCCCCTCACCTGTACGCAAAA-AG-TTCCATAACAAACTCGAAGACCAGTTT---ACTG-T-AAA
gi|10 : c---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTTTGC-CG-GCCCAAT-CCCATTA--------------------C--T-CGCTGG-GTTAA-------------------------TTT----AT--TTCA-C-CA---TCCTA--TGTAGCTA-GTG--CC-A---TACA-TA-T-TTGAAAT--A-T-GT-AATGAGAT-CCAATACA-TTTC--A-A----A-CA----C------A---A-G-A-------AGTTAA--TA-CCA---C--C----GATCT-CT-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-----GT------TATCC-ATAACTTTTTGA-T-A-CCC-GAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTTG-----CGGT-GCAA--T---------TTAGCAAT-CT-T---T-ATGAA-T-ATTAGA-TGACA----TTAAAGACA--TTA--CAA-ATACCTGTC--TAG-T-TTG---ATGGAGGA-----T-TTATTG-TACAGAGGGGCGTGA--------CT-CG----------------GAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTTTA--CAATACAA-TTCCAT-ACAAA--CAAAAGACAG--TTAAACTG-TAAAATATAAatta
gi|11 : T-TCCTTTCAT-CT-A-GC-TGTG-------TTTAAATAA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-ACAGAATT-CC--AA-A-CGA--AAC-A-AT-AACTTC--TA-G-G-G--CGG-AGCT-T--A--GC---CG-TAC-AA------C---TTC-CAGG----AACC--T-AATCTA-AC-TTCCAAC-CATAAA-A-TC--AG-AAAAACAAAACAT------TTT--TGAAAACATTT--AT---T----C-AG--TGATG-GA------------AA-----C-AT-----------------A---AAGAACAA--AT-AC-G--C-----------------AAAA-----------CTT----A--------TG---TT-T--AATAAA-----G-C-AT-AGTTT--A-----G--C-ACCACTT--G--------GTA----G---------ATTTAA--GGA--C-----C-------CCCTC---C------C---------CCT-----------AATA-A--CTT-------T----T------TTAATTTCAA----G-A--AAATCATA----A--C-C-----TTTTTAT-T--------------------T---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-ACTC-T-----T--AGA-TA---AA--TC---------AAT---GTCAA---GATATAA---CT-G---------TGT---C--TTTTA---TTGG-----------G-TAT---TTTCAT-
gi|12 : --ATT-----CA-CGT-CA-TTAAAAATG---A--C-TCAAAA-A-TAGT-AAA---G-AGC-TTT---AAG---G----G--GGAGGTGTTTAAC--CAG---CCCAC--------TG---G-GG---CC-TTGC----AG-----CGGC-C--CAGAC--------CCCCT-A--------C---TCAC----G--AAC-TCCCCCC---C-----CTCCCTTTC----------C------TGAATTCATTG-------ATCCACCCGGGT---A----AATTTTAT-GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TA--T-G---GTACC-AAT-CCCGTTATG-TTCAA-TAC---T-TTCC--TTCTCGTG-GT--GTTTTTTTTGTTTTCTGTTTTTTTTTTTT----TTGCTTTA-CAAA---TCCTA-----------GTGGCTC-A---TGCA-TA-TATTGAAATT-AACAGT-A-TGACAT-CCAATTCA-TTTTAAA-A----AACATAAGC-----CA---ATA-A-------AGTTAATACA-CT----C--A----AATCTGCC-A-T--G-T--TGA
gi|13 : --------G------G---------ATTTAAAGGGA--GTGCACC-------CCCTC---CTTCT--C---------CCTG----------AAT-----TTT-------CAAT-T------T-------AA----G-G-TGAATCATG----G--T-G-----TTTT-GG-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------ACAATAGCAGTAA-AAGATAC--AAT-AAT--CCTT-TC-ACTT-T-----T--CGT-GA---AA--T-----------AT---T---------TCT-A---TT-CA--TTGTATTTT---T--TTTTTT--TTTTG---G-AT-TGG-TAT-------AA-CTT---AATA--------TTTGTG--ATA--TC----CTA---------TCA--ATCTCA--------------CGT-CA-TTAAAAATG---A--C-C---AACACTAGTAAA----G-ATT-TTC---CAG---G----G--G------CCCCATACCAAGACCCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTAA----CA-----CTCC-CTTTAAAT--------CCCT------------------C----G--AAC-CCCCCCC---C-----CTC
gi|14 : agattagcT--G-------------------------TTT----TC--TGTA--AC----TTTTA--T------A-A-------A---T--A-TA-T-TT-AAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTTA--A-A----AACA----C-----TG---A-A-A-------AGTTAG--T--GC----CACT----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTAT---TTGTGAA-T-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTCG-T-TTGA--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-Ctt
gi|14 : ATTTT--C-A-ATA-CTTTCTTTCA-T-TTGT--GTGGA--A-----T-TTATT-------------GTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataa
gi|15 : tgttttctgtaacttttataaatatatttaagccattaaggcatctgattcatttaaaaacactgaaaagttagtgccactgatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagTTGTGT-CA--C--GATGCGGT-A-G-TTAT-TGCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CCTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGAT-T--A--GC---TG-TAC-TAT--A-AC---TTC-CAGGG---GTCTG-G-ATTATA-AC-TTCGAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------TTT--TTAAG-CATTT--AT---T----C-AG--TGATA-AA------------AAT----T-TT-----------------T---AA----AA--AT-GCAG--CTTATAAACAGATTAAGTATAA-----------ATTAAGCA--------TG----T-TC-AATTAACA--CG-C-GG-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--A--------ataa
gi|16 : atA-TA-T-TTTAAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTT---A-A----AACA----CA----CG---A-A-A-------AGTTAG--T--GC----CA-C----TATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTAT---TTGTGAA-T-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTCG-T-TTGA--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-C
gi|16 : aaATTTT--C-A-ATA-CTTTCTTTCA-T-TTGT--GTGGA--A-----T-TTATT------------TGTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataac
gi|17 : aaatattttaagccattaaggcatctgattcatttaaaacacacgaaaagttagtgccactatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagA-T-TTGAA-TA-A---GT-AATGACCC-CAAAGTCA-TTTT--T-A----A-CT----C-----TA---A-A----------GTTAGTATA----------C----GATCT-CA-AAT--G-T--TGAA-TGT-A--CGA-T-G---TT------T-TTC-A--ACTTTG-AA-A-A-CCC-CAA---TCAACTA-----CGT-AAAATCG-----C-GA-GCA---T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGACTT-ATT-----------------------TTTA--C-ATATA--------------TTGT--ACAGA--A---------------------GGGCATGA----CAATCTCCGTC-ACTGCGCTACT-CGAC-AG--CAC-G-CCC----TCT-TA--AAATA-AATTTCCATAACAA-----AAATATAG--T---ACTGTT-GAATATAAAataac
gi|18 : C-AATTAACA--CG-C-CG-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--AAGTGGC--A------G---------ATTTAAAGAGA--G-----C-------CCCCTGCAC------C---------CC------------AATA-A--TTT-------CCAATT------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--TCA-----TTTT-GT-T--------------------C---------------ATAAAAAAATAGCGA-T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----T--AGA-GA---AA--AC---------AAT---GACAA---GATAT-A---TT-GA--TT-TATTGT---C--TTTTAT--TGGGT---A-AT-TCG-TA----TTTCATATTT---AATA--AGAAACTT--TA--AGA--T
gi|19 : GTGT-CAAAT--GGCGTGGC-AAC-CTTT-CCCTTT------TA----TG-A----------AAATCA-GAGCAGAAA---T-AGTT--G-GCAGAATT-TA--AA-A-CGT--A-C-A-AT-A-CTTC--TA-G-G-GGGTGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AATCAA-ACCTTTTC-CAGGG---AACTGTT-ACTATACACATTTTAAC-AAAAAACA-T---AG-AAAGG-AA--CAAAATATTTTT--TGTAA-CA-TT--AT---T----CAAG--TGATA-AA------------GA------------------------------------AA--GT-GCAG--T-----------------ATA
gi|2 : tgTGCG-C-A-C-TTCTATTTTCTGGTGCTTAAGCATGTAACGTATCTTTAAATCA-GA-CTGGTA-A-CGGGTTGCG-GCAGAATTGCCCGAA-CACGTAAA-C-A-AT-AACTTTTGTA-G-G-GG-CGG-GGTTGT--AT-GCTTATT-TAC-AAT--ATAC---TTC-CAGGG---caaacaaa
gi|2 : AAA-A-TCGCAG-AAAGGCAA--CGA------TTTGATGAAACCATTCTAATGCGT----C-AGGCCGATG-AA------------AA-----C-AC-----------------AGG-AG----AA--ATGGCAG--C-----------------CTAA-----------TCT----A--------ggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|2 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagT-----------------A---AG----AA--CT-GTAGAGC-----------------ATAA-----------CAT----A--------TG---TTGTCTAATTAACAACCG-C-ATTAGTTA--ACGTCCGTCC-AC-ACTTTCA--------C------GT--------ACCT---TGGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------CCCCGCCCCCCCTAAGTA-A--TTTGCAAAAAT----T------G-------AA----G-AATCAATCATACATTA--T-T-----TTTC-GT-CATGAATGCACAAATGGCGAGC---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAA-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TTTAGA-AT---AA--TT---------CATATTGACAA---GATCT---------------CATTGT---TC-TTTTAC--TTTGGCTTA-AC-TCGGTAT---TTCAAT-ATT---A-TAGCAAAAAGTTTTTATTAGA--TTTTGTGTGATTCTCATATTA--ATTTTCT--AAT-----CGTCGT-TA-TAAAAAATGACCAAACGT---AG-A-TAGA-AA----G-AGCTTTT---CGGATAG----GCAA------TCTAACG-CAAGA-ACCAC--------TGTATGTGC--GCCTTTGAG---GG-----CGACGATCCAGA---------CCCCT-A--------TCCATCAC----GAAAAG-ACCTTCT---G-----ATCCC---G----------C--------------------------CCA----------A----AAT------GCATGGC--A-T---TGAAA--------------A---G-TAGTT------TACTAAGT-ACCG-CATG-CTCA----------TTAC--T--TCG-------------------------------------------------CACAGTTTCCGGCTT------A-GTGT-CC-A---TGTA-TAGT-TTGAAATA-A-C-GT-------------ATTCT-TTCT--A-A----AAC-----T-----TA---A-A-A-------AGTT-A-ATA------------------CT-AC-A-T--G-TACCG-A-TGT-T-GCGATT-T---AT------C-TCC-A--ACT-------------------CCTC--CTA-----CAT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGC------------A-T-ATT-CA-TGACA----C-------------------ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGA--ATGG--------------TCG-C-TA------CGCGA--------CT-CG---ACTGC----------------CAC-TCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CAAaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|20 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagACTTC--TA-G-G-GGGCGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CATGG---AACCG-T-ACTATA-A---------------A-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------T-----GAAA-CATTT--AT---T----C-AA--TGATA-AA------------AATGCAAC-TT-----------------ATAAAC----AA--AT-TAAG--C-----------------AAAA-----------GTT----A--------TG---TA-TC-AATTAACA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-AC-AC-------------------------------TTTAA----A--G-----C-------CCCCC---CCCCCTTC---------CC------------AATA-A--TTTTTAA---T----T------T-------AA----G-A-TAAATCAT
gi|21 : g---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---CGGAAA-CATGGTCTT-CCAGCTC-T-----T--AGA-GA---GAATTC---------AAT---GACAAATGGATCT-A---TTGGA--TC-TATTGT---T--T
gi|22 : atcatacatatttttgtctcataattacaaaggggtggcgaA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGATTTC--CTATGTCACGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATAGA--A-----T-TGAATG-C--------------------------------TGCGCAACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-C-AAATATAAaaaaacttttacttaaaggctaggacttccaatagcttgcattttttatccacaaaccaaaaaaaacactttaagatttggattatttca
gi|23 : TGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCA-AATT-CC-------------------C-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGTT-T--A--GC---T----------------------------------G-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGTAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATC-AA------------AA-----C-TT-----------------A---AT----AA--AT-GCAG--C-----------------GTAc
gi|24 : -A--ACTTTT-GA-C-A-ACAGCTGGCTTA--TGA-----CGC-TATATCA-----C-GT-GCAA--T---------TTTGCAATGATGTTAAT-ATGAA-T-ATC-CA-TGGCATAGTT--AAGGC-ATTTA--C-AGATATCTGtaaaaaacttaa
gi|24 : aAC-TGC-AAC-TCCCT----TCTGTA--TAATA-AA-CCCAAT-ACAAA--AGAAACAAAG--T---ACTA-T---ATATAAatacctttttttcactgcaactcccttctgtataataaacccaatacaaaagaaacaaagtactatatataa
gi|25 : aaacttttgacaacagctggcttatgacgctatatcacgtgcaattttgcaatgatgttaatatgaatatccatggcatagttaaggcatttacagatatctgatacctttttttcC---C------C---------CT------------AA-A-A--TTT------------T------C-------AAAT--G-G-TAGATTATG----A--T-C-----TTTT-GTAT--------------------C---------------AAAAA-----------T-AGAATGATA---------------A----------AA-AAG---C--AAT-CAT--TTTT-CC-ACTA-TCAGCAC--AGA-GA---AA--T-----------AT---TAC-------T-------TT-GA--TA-CATTGT---TACTTTTAT--T
gi|26 : gatttaaggtggatgcatctgtaggca----T------T-------AG----A-A-TAAATCATG----G--T-C-----CCTT-GT-T--------------------T---------------AAAAAAAATAACGA--T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-AAT--TTTT-CC-ACTT-T-----T--AGA-GA---AA--GA---------AAT-----CAA---GATAT-----TT-TA--TT-TGTTGagaaga
gi|27 : tcatatCATTGAGT-CA--T--GGTGCTGC-A-C-TT---------AAT-C--A-GC-AATG------CTTTAAATCA-GA-CGGAAA-A-T-GGTT--A-ACAGAATT-CT--AA-C-T-T--A-CAA-AA-AACTTC--TA-GAG-GA-CGG-AGCT-TTCAGTGC---TG-TAC-ATT--A-AT---TTC-TAGGG---AAACG-T-ATTAggggaacttgtactctatccaaaaaataatctgaattaaaatttgcg
gi|28 : tg-----C-------CCCCC---C------C---------CC------------CATT-T--TTT-------C----TCCAAATT-------AA----A-AGTAAATCATG----A--T-A-----TTTT-GT-T--------------------C---------------AG--------------T-A-------A---------------A----------AG-AAT---T--AGA-TA---------C-ACGA-T-----A--AAA-GAAGCAA--TCGTTGATTTAAAT---AATAA---GATTT-----TT-GA--TA-TATTGG---TACTTTTAT--ggcctat
gi|29 : atgtaaatatacTTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTCTGAT-CTTA-GC-TGTG------CTTTAAATGA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AA-T-CGT--A-C-A-AT-AACTTT--TA-G-G-GA-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---T
gi|3 : atCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CCTA-GC-TGTA------CTTTAAA--------------A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CGT--A-C-A-AC-AAGTTC--TA-G-G-AG-CAG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAAC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCGA--CGA------TTA--CGAAA-CATTC--AT---T----C-TG--TAGTG-AA------------AA-----C-AC-----------------A---AG----AT--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAAAA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-AC-AC--------------------------------TTAAAGGGA--------C-------CCCCT---C------C---------CC------------AATA-A--TTT------------T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-A-----TTTT-AT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-AAT--TATT-CC-AATC-T-----T--AGA-GA---AG--T
gi|3 : tGC-TTC---CGG---G----A---------TCCAACACCAAGA-CCCAC--------TG---A-GA--ACC-TTGACCTAGG-----CGGC-CTCCATAC--------CCCTT-A--------CC--TCAC----G--AAG-CTCACCC---C-----CTCCC---C----------C------T------------------TCCA-----GT---A----AAT------GCAT-AC--A-A---TG--A--------------A---G-TATTT-AC-TGTGCTCAAT-CCCAT-ATG-TCCAA-TCC---G-TTAC--T-CGCAGG-G---G-------------------------CTT----TT--TTTA-CACA---TCCCA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGGAATT-A-C-GT-AATGACAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATAAGT----C--C----TACCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GAGA-T-T---GT------T-TCC-G--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTAT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTAA--ATTGA--A-----T-TTATTG-TACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCTACT-CGAC-TGT-CAC-GCCCC----TTTGTA--CAATG-AA-TTCTAT-ACAAA--CAAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcttccgggatccaacaccaagacccactgagaaccttgacctaggcggcctccataccccttacctcacgaagctcaccccctcccccttccagtaaatgcatacaatgaagtatttactgtgctcaatcccatatgtccaatccgttactcgcaggggctttttttacacatcccatagtgccatgcatatttggaattacgtaatgacatccaattcattttaaaacaccaaaaagttaaataagtcctacctccatgttgaatgtagagattgtttccgacttttgacaccccagacttcctacgtcacgtcgcgtgcaacttagcaatgctattatgaatattcatgacacaagacaatttacaatactgtctttcgtttaaattgaatttattgtacagaggggcgtgacagtctcgtcgctgcgctactcgactgtcacgcccctttgtacaatgaattctatacaaacaaaagacagtactgtaaatataaa
gi|30 : tcattgtgtcatgatgcggcactttttcctttgatcctagctgtactttaaaacggttggcagaattccaatcgtacaacaagttctaggagcagagcttagctgtacaataacttccagggaaccgtactataacttccaaccataaaatcagaaaggcgacgattacgaaacattcattctgtagtgaaaacacaagatatgcagcataacttatgtttcaattaaaacgcatagtttagcacacttaaagggaccccctccccaataatttttaagataaatcataatattttattcataaaagaagcaataattattccaatcttagagaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTCGGC-A-C-TTTT-CCCTTTGAT--TTA-A--TGTA------ATTTGA
gi|30 : atCT-CGACGTGT-CAT-TGCAT----TC-GTA--CAACA-GA-TTCCAT-ACAAA--CGAAGGACAG--T----CTG-C-TAATATAcggttattctttgatccacgttctcgacgtgtcattgcattcgtacaacagattccatacaaacgaaggacagtctgctaatata
gi|31 : atattcggcacttttccctttgatttaatgtaatttgacggttattctttgatccacgttTTGTGT-TA--T--GGTATGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-TC-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAAAAA-A-T-GCTT--G-GC-------TC--AG-C-TGT--A-C-A-AT-AACTTC--CA-G-G-G
gi|32 : cT---T-ACGAA-T-GTT-AA-TGACA--------AGTCG-TTCAAAC-ATATA-CTTTCTTTCG-T-TTAT--GTGGA--A-----T-TAAGTT-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CG
gi|33 : cca-CTTA-GC-TATA------TTTTAAATCG-GA-CATTAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CGT--A-C-T-AT-AACTTC--TAGG-G-GG-CGG-AACT-T------------------------AC---TTC-CAGGG---AACctg
gi|34 : -CCAATTCA-TTTT--C-A----GACT----T-----TATACA-A-A-------AGTCAA--T--GC----CAGT----GATCC-CC-G-T--G-T--CGAA-TGT-A-GTGA-T-TGTCGT------T-CCC-A--ATT
gi|35 : agTGTGT-CAA-T--GATGTGCA-A-C-TTTT-TC-TTTGAT-CTTA-GC-TGTG------CTTTAAATCAGGA-CAGAAACA-C-GGTTG-G-GCAGACTT-TC--ataaa
gi|36 : cTGTGT-CA--T--GATGCAGC-A-C-TTTT-TCATTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GTAGAATT-Ccca
gi|37 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGT-------------------A-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-
gi|38 : aTTGTGTTCA--T--GATGCGGTTA-C-TTTTTTCCTTTGAT-CTTA-GC-T-TA------A-TTAATTCA-GA-
gi|39 : TTGTGT-CG--T--GGTGCGGT-A-C-ATTT-CCCTTCGAT-CTTA-GG-CATA------CTTTA
gi|4 : taaagA-CATGT--AT---T----C-AG--TGATC-AA------------AA-----C-TT-----------------A---AA----AG--AT-GCAG--CGTCTAAAGAAAATAACCATAA-----------CAT----A--------TG---TT--C-AATTAACA--CA-C-CG-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--A--------ATTGGAAG---------ATTTAAAGGGA--A-----C-------CCCCC---C------CG--------CCTCTT--------ACTA-T--TTT-------CCAATT------T-------AA------A-TAAATCATA----A--T-CCTTGTTTTT-GT-T--------------------C---------------AA--------------T-A-------AGAACCAATAGCGATGA----------AG-AAG---CTTCAT-AAT--TCTT-CC-GCTCGT-----T--AGATGA---AA--GC---------AAT---GACAAA--GATCT-A---TT-GA--TC-TATTGTGTCT--TTTGAA--TTGCT---A--T-TCG-TAA---TTTCAT-ATTGTTAATA--AGAAACTTTG-A--AGAATCT----GTG---------TTA---TTTCATTAATTTTTAACG-CGTACA---AAAAATGACCA--A-T---TA-A-TAGT-AACCACG--GC-TTCGGGTGG---G----G--G----------ACG--AAGA-CCAA---------TG---T-GG--GCC-TTGA----G------CGGA-CTCCAGAC--------CCCCTTA--------CCG-TCAC----G------CCCACCT---CGACATTTCAA---CATTCATTGATC------T-----------------ACCCAA----GT---AC---AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A------------------G-TACTT-AC-CATGACCAAT-CCCGTTATG-TTCAG-TCC---G-TTAC--T-CTCAGGTGG--G-------------------------TTT----TT--TCTA-CAC----TACTC--T------A-GTG--CA-A---TGCA-TATT-TTGAAATA-A-C-GT-GAAGG-AT-CCAATT-A-TTTT--A-ACCACAAAA----C-----TA---A-AGA-------AGTT-A-ATA-CA----C--C----GATCT-CCAA-T--GTT--TGAA-TGC-T-GCGT-TAT---GT------T-T-C-A--ACTTTT-GACC-A-CCC-CAGACTT---CTA-----CGTGCACGT-G-----C-AT-GCGACCT---------TTATCAATGCTCTTCCT-ACG-------T-CA-CGTCG----C--ATG-CAACTTAG-C-A-ATG-CTG---TTC-----------TGAAC-A-----T-TTATGA-CATAA--------GA----CATTTA-CAAT-GCTGCTCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAA
gi|40 : -TTTT-TCCTT-GAT-CTTA-GCCTGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCA
gi|5 : TTGTTT-CA--T--TGTACGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-GC-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAGAAA-A-T-GCTA--G-GCAGAATT-CT--AA-C-CGT--A-C-A-AT-ATGTAC--TA-T-G-TG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGGTAAAAC-----ACTATA-AC-TTCCAA--CACAAA-A-TC--AG-AAAGGGGA--CGC------TTT--TGTAA-CACTT--AT---TTACCC-AG--TGATG-AA------------AA-----C-AT-----------------A---AC----AA--AT-ACAGA-CTATAA------------ACAA-----------CGT----A--------TG----T-TC-AAATAACA--TG-C-AT-ATTTT--A-----G--C-AC-ACTT--AAC------A------G---------ATTAAGAGGGATTG-----C-------CCACCAT-C------C---------AC------------AAT-----TTT-------CAA--T------T-------AA----G-A-T-AATCATA----A----A-----TATT-GT-T--------------------CCTGT-----------A---------------T-A-------ACTGGCGATAT-----A----------AG-AAG---A--AAT-AAT--TCTT-CC-A--T-T-----T--AAA-GA---AA--GC---------AATG--GACAA---GATCT-A---TT-GA--AT-TATTTT---C--TTGTAT--TTGGG---A-AA-TCG-TAT---TTTCAT-TTTG--AAAA--AAAAACCATGTA--AGA--TT----GTA---------TTA--ATTTGAT--ATT-----CG-CGT-CA-TT-AAAATA--CA--C-T---AA-A-TAGT-AA----G-AGT-TTCA--TGG---G----G--G--------CAA--CCAACA-CCCATG-------GG---G-GG--GTC-TTGA----GG-----CTG--CTCCAGA---------GCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAGATCCGTCT---T-----CAACT---C----------A------TTG---------------ATCCG-----CC---A----TAT------ACAT-GCTAA-A---TG--A--------------C---G-TACT
gi|6 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGT-A-CTTTTT-TCCCTTGAT-CTTA-GC--GTA------CTTTAAATCA--A-CAGAAA-AGC-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AATC-CGT--A-C-A-A--AACTTC--TA-G-G-GG-CGGCAG-T-T--A--GC---TG-TACTTAT--A-AC---TTCTCAGGG---AACTG-T-ACTATA-AC-TTCCAGCACCTAAA-A-TC--AG-ATAGGCAA--CGA------TTT--TG-AA-CATTT--A----T----C-AG--TGATA-AA------------AA-----C-TTTCAAAATGCAGTGAGTTA---AC----AA--AT-TAAG--C-----------------ATAA-----------ATT----A---------GCATTT-TC-AATTAACA--CGAC-GG-AGTTT--A-----G--CAAC-ACTT--AATTCAGGCA------G---------A-TTAAAGGGA--G-----T-------CCCCC---C------CCCCCCCCCACC------------AATA-ATCTTT-------CCAATT------T-------AA----GAA-TAAATCATA----A--TCC-----TTTT-GT-T--------------------CGTAAAAAATTAGCGGA---------------T-A-------A---------------A----------AGTATG---C--AAT-CAT--TCTTCCC-GCTC-A-----A--AGA-GA---AAT-TC---------AAT---GACAA---GGTCT-A----T-GA--TT-TATTG----T--TTTTA---TTGGGAGCA-AT-TCC-GAT---TTTCAT-TTT---AATA--AGAAACTTTAAA--AGA--TTAA--GTG---------TTATCGTTTAAT--TTT-----
gi|7 : AGAC--------CCACT-A--------CC--TCAC----G--A----CCTCCC---C-----CCCCC---C----------C------TCAACTTCACATTCATTGATCCACCCGAGT---A----AATATTTATGCAT-GC--AGA---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---T-TTAC--T-CTTGGG--T--G-------------------------TTT----TTGTTTTA-CAAA---TCCT------------GTG--CC-A---TGCA-TA-T-T-GAAAAT-A-C-GTTAAAGGCAT-CCAAT-CA-TTTT--AGA----AACA----CTAAGCCA---A-A-A-------AGTTA---TA--C----C--CACAAGATCT-CC-A-T--G-T--TGAACTGT-T-GCGA-T-T---GT------T-TCT-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----A-AT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGT---TTATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACA-TTTA--C-A-GTA-CTGTCTTTTGGT-TTGTTTATGGG--AAAATTT-TTATTGGTACAGAGGGGCGTGG----CAGTCG-AGTC-GCCTCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTGTAC-CAAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T--AATATAa
gi|8 : aCAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--ACC-TTGA----GG-----CAGC-CTCCAGAT--------CCCCT-A--------CC--ATAT----G--AAG-CTCCCCC---C-----CCCCC---C----------CACCTCTT-----------------CTTCA-----AT---TCCTTGAT------GCAT-GC--A-A---TG--ATTCTCAGTTGCAAAA---G-TACTT-AC-TGTGCCCAAT-ACCATTATG-CCCAA-TCA---G-TTAC--T-CA---------G-------------------------TTT----TA--TT----ACA---TCCTAG-T------ATGTA--CT-A---TGCA-TA-T-TTGAGATA-A-C-GT-AACGGCAT-CCAATTCA-TTTC--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTT-A-AT--GC----CATT----GATAT-CC-A-T--G-A--TGGA-TGT-A-GCGA-T-TTTAGTTCCTACT-TCCAA--ATTTTT-TA-CAA-CCC-CAGACTCC--CTA-----CAT-CACGTCA-----C-GT-CCAA--A---------TATGCAATGTTAT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-GTA-CTTTCTTTTG-T-TCAA--ATGTA--A-----T-TTATT-----------------------------GTC-ACTGTGCGACT-AAAC-TGC-CAT-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCTAT-ACAAA--CGAAAGAAAG--T---ACTG-T-AAATAT
gi|9 : -TATA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-TGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AAACG-T-ACTATA-AC-TTCCCAC-CATACA-A-TC--AG-AAAGGCGA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AACAAAAGAAATACAG-----C-TT-----------------ATCAAC----AA--AT-TAAG--C-----------------ATA------------CTT----A--------TG---TC-TC-AATTAACA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--C--------GCA----G---------ATTTAAAGAGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------T---------------------TTT-----------------------------------A-T-AATCATA----A--TAT-----TTTT-GT-T--------------------C---------------ATAAAACAAATAGCGAT-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-ACTC-T-----T--AGA-GA---AA--TC---------AAT---GACAA---GATCT-A---TT-GG--TT-AATTGT---T--TTTTTTTATTGGG---AGATCTCG-TA----TTTCAT-TTT---TATA--AGAAACTTT-TA--AGAT-TT----GTG---------TTA--
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): ATGACGTCATTTTATGGAGGAATCCATGATAAGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444 55555555555555555 111111111111111111111111111 1111 6666666666666666666666666666 1111111111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 1111111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 1111111111111 111 11111 111111 222222222 1111 111 111111 11 3333333333333333 111 2222222222222 444444444444 2222 55555555555555555555555555555555 22222222 11111 22222222222 222222222 22222222222222 111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 333333333333333333 11111 1111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 1111111111 1111111 555555555555555555555 1111111111111 11111 111111111111 11111 22222222222222 6666666666666666666666666666666666 11111111
lowQualScore : 5 66 33 2 2 2 4 2 2 5 555555 2 2 2 2 2 55 4 4 33 333 33 2 2 2 2 33 2 2 2 5 2 2 33 66 555 2 2 33 2 555 3 555 2 3 3 4 4 0 4 3 3 55 3 55 000000 55 0 6 44 555 7777 3 44 44 11111111111111111111111111111111111111111111111111 44 3 77 33333333333333333 777777777777777777777777777 7777 4 3 55 3 2222 55 99999 55 3 3 7777777777777777777777777777 2 3333333333333333 999 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111111 5 0 6666 9999999999 3 3 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 555 77 22 33 2 2 2 00000000 2 555 9999999999999 222 888 0 22222 3 55555 666666 888 111111111 4 2222 55 333 3 66 777777 11 4444444444444444 333 1 5555555555555 6 6 333333333333 6 6 6 0000 6 5 99999999999999999999999999999999 5 33333333 00000 777 5 44444444444 1 5 000000000 00000000000000 9999 777777 1 333333333 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 66 4 777 66 333333333333333333 4 0 00000 5 5 5 9999999999 66 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 00 4 777 4 7 3 88 9999 3 8 3 3 44 3 7777 7777 7777777777 3 3 0000000 999999999999999999999 3 3 3 44 3 44 3 999 3 9999999999999 3 3 44 0 6 6 3 6 3 444 88888 3 66666 3 3 444444444444 3 3 22222 3 3 3 3 22222222222222 66 2 8 5 1 2 2 999 66 77777 2 5555555555555555555555555555555555 11111111 3 33 3 6666 77 0 3 3 6 44 44 555 3 55
lowQualScore : . .. .. . . . . . . . ...... . . . . . .. . . .. ... .. . . . . .. . . . . . . .. .. ... . . .. . ... . ... . . . . . . . . . .. . .. ...... .. . . .. ... .... . .. .. .................................................. .. . .. ................. ........................... .... . . .. . .... .. ..... .. . . ............................ . ................ ... .................................................................... ...... . . .... .......... . . ......................................................................................... . ... .. .. .. . . . ........ . ... ............. ... ... . ..... . ..... ...... ... ......... . .... .. ... . .. ...... .. ................ ... . ............. . . ............ . . . .... . . ................................ . ........ ..... ... . ........... . . ......... .............. .... ...... . ......... .................................................................... . .. . ... .. .................. . . ..... . . . .......... .. ............................................................................. .. . ... . . . .. .... . . . . .. . .... .... .......... . . ....... ..................... . . . .. . .. . ... . ............. . . .. . . . . . . ... ..... . ..... . . ............ . . ..... . . . . .............. .. . . . . . . ... .. ..... . .................................. ........ . .. . .... .. . . . . .. .. ... . ..
lowQualScore : 3 33 77 4 4 2 2 0 0 7 555555 1 1 2 2 2 33 4 7 44 555 77 7 9 9 9 77 7 7 7 7 9 9 99 88 000 9 9 99 9 000 1 444 6 6 6 0 0 5 0 6 6 00 6 00 555555 00 2 7 66 888 1111 3 66 99 88888888888888888888888888888888888888888888888888 22 1 33 88888888888888888 777777777777777777777777777 8888 0 6 00 6 5555 00 11111 00 6 6 4444444444444444444444444444 1 8888888888888888 666 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 666666 7 8 5555 2222222222 1 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 000 99 99 99 9 9 9 44444444 9 000 0000000000000 777 555 8 66666 1 00000 444444 666 000000000 4 6666 44 888 2 99 000000 99 3333333333333333 999 0 2222222222222 7 7 777777777777 7 7 7 8888 7 7 99999999999999999999999999999999 0 11111111 99999 111 0 66666666666 4 0 888888888 33333333333333 4444 222222 0 444444444 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 11 4 888 11 000000000000000000 4 1 55555 0 1 0 0000000000 99 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 66 4 888 0 3 6 22 8888 6 2 3 3 66 3 1111 1111 3333333333 3 3 8888888 888888888888888888888 3 3 3 66 3 66 6 777 3 6666666666666 3 1 22 2 7 7 3 7 3 888 33333 3 77777 3 3 888888888888 5 7 88888 1 1 1 1 55555555555555 33 7 0 3 7 9 9 444 88 11111 9 4444444444444444444444444444444444 55555555 1 88 1 5555 33 2 1 1 2 22 66 888 3 99
consensus : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AA------------AA-----C-TT-----------------A---AN----AA--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAACA--CG-C-GT-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--A--------G------G---------ATTTAAAGGGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-N-----TTTT-GT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----T--AGA-GA---AA--TC---------AAT---GACAA---GATCT-A---TT-GA--TT-TATTGT---T--TTTTAT--TTGGG---A-AT-TCG-TAT---TTTCAT-NTT---AATA--AGAAACTTTGTA--AGA--TT----GTG---------TTA--ATTTNAT--ATT-----CG-CGT-CA-TTAAAAATG--CA--C-T---AA-A-TAGT-AA----G-AGC-TTC---CGG---G----G--G------TCCAACGCCAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTGA----GG-----CGGC-CTCCAGAC--------CCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAG-CCCNCCC---C-----CTCCC---C----------C------T-----------------ATCCA-----GT---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATA-GC----C--C----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
Reference ( family-888 ) : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AA------------AA-----C-TT-----------------A---AN----AA--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAACA--CG-C-GT-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--A--------G------G---------ATTTAAAGGGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-N-----TTTT-GT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----T--AGA-GA---AA--TC---------AAT---GACAA---GATCT-A---TT-GA--TT-TATTGT---T--TTTTAT--TTGGG---A-AT-TCG-TAT---TTTCAT-NTT---AATA--AGAAACTTTGTA--AGA--TT----GTG---------TTA--ATTTNAT--ATT-----CG-CGT-CA-TTAAAAATG--CA--C-T---AA-A-TAGT-AA----G-AGC-TTC---CGG---G----G--G------TCCAACGCCAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTGA----GG-----CGGC-CTCCAGAC--------CCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAG-CCCNCCC---C-----CTCCC---C----------C------T-----------------ATCCA-----GT---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATA-GC----C--C----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
gi|1 : TTGTGTACA--CTAGATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTT-GAT-CTTA-GCCTGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCAGGATCACC--AA-C-GAT--A-C-ACATTAACT-C--TA-G-GCGG-CGG-AGCT-T--A--CC---CGCTAC-A-T--A-AC---TTC-CAGGG---AACTG-TTACTATA-CT-TCCCAGT-CATAAA-AATC--AGGAAAGGCAG--CGA------TTT---GAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATTCAA------------AA-----CGTT-----------------A---AT----AATAAT-GCAG--TG----------------ATAAACAATTCTAAGCTT----AAACATCTATG---TT-AC-A-TTAACA--CG-CCGG-AGTTTTTA-----G--C-AC-ACTT--A--------G------ATTGGCAAGAATTTAAAGGGA--G-----CGCCCCCCCCCCC---C------C---------CC------------AATAGA--TTT-------C----T------C-------AACTTAA-A-TAAATCATA----AATC-T-----TTTT-GT-TTCGTAAAACAATAG------C---------------A---------------TTA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AATTCAT--TCTT-CC-GCTC-T--------ACA-GA---AT--CC---------AATTT-GACAA---GATCT-AAAATT-GACATT-TATTGTG--T--TTTTAT--TGGGT---A-AT-TCA-TATAATTTTTA--ATT---A-TA--AGAAACTT------AGA--TTTGT-ATG---------TTA--TTTTAATTTATT-----TC-AGT-CAGTTAAAAATG--AC--C-A---AA-A-TAGT-AA----ACAGC-TTT---AGG---GTTGGG--G------TT--AC---AAGA-CCCACTGGGGCCTTG---A-GGTAGCC-TCCA----TGACTCCCTAC-CTCACGACTCTTCACCCCCCT-CTTCCCTCCCC--TCACTGCCA--AAG-CTTACTTGATC-----CCACC---C----------C------T--------------------CA-----GCTTAA----AAT------GCAT-GC--A-AACTTC--A--------------ACCAGCTACTT-ACTCGTGCCCAATGCCCGT-ATGGTTCAACTCCTAAGCTTACCGT-CCCAGG-TT--G-------------------------TTTATTTTT--TTTAACACAA--TCCTA-----------GTG--CCCACCTTGCACTA-T-TTGAAATATA-C--T-AATGGCATTCCAATTCACTTTT--A-A----AACA----CA----CT---A-A-ACTAAGAGAGTATA-ATA-CCACCAC--C----GAT-T-CC-A-TTGA-C--TGAA-TGTTATGCGA-T-T---AT------T-TCC-A--ACTTTTTGATC-A-CCC-CAGACTTT--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GTCGCAA--TCTCACGATCTTAGCAATACTGT---T-ATGAA-TTATT-CACTGAAT----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-TCTTGT--ATGGA--A-----TCTTATGG-TACAGAGTGA-GTGACC--CAGTCT-CGTCGGCTGCGCGACTCCGAC-TGCACACTGCCCCCTCACCTGTACGCAAAA-AG-TTCCATAACAAACTCGAAGACCAGTTT---ACTG-T-AAA
gi|10 : c---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTTTGC-CG-GCCCAAT-CCCATTA--------------------C--T-CGCTGG-GTTAA-------------------------TTT----AT--TTCA-C-CA---TCCTA--TGTAGCTA-GTG--CC-A---TACA-TA-T-TTGAAAT--A-T-GT-AATGAGAT-CCAATACA-TTTC--A-A----A-CA----C------A---A-G-A-------AGTTAA--TA-CCA---C--C----GATCT-CT-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-----GT------TATCC-ATAACTTTTTGA-T-A-CCC-GAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTTG-----CGGT-GCAA--T---------TTAGCAAT-CT-T---T-ATGAA-T-ATTAGA-TGACA----TTAAAGACA--TTA--CAA-ATACCTGTC--TAG-T-TTG---ATGGAGGA-----T-TTATTG-TACAGAGGGGCGTGA--------CT-CG----------------GAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTTTA--CAATACAA-TTCCAT-ACAAA--CAAAAGACAG--TTAAACTG-TAAAATATAAatta
gi|11 : T-TCCTTTCAT-CT-A-GC-TGTG-------TTTAAATAA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-ACAGAATT-CC--AA-A-CGA--AAC-A-AT-AACTTC--TA-G-G-G--CGG-AGCT-T--A--GC---CG-TAC-AA------C---TTC-CAGG----AACC--T-AATCTA-AC-TTCCAAC-CATAAA-A-TC--AG-AAAAACAAAACAT------TTT--TGAAAACATTT--AT---T----C-AG--TGATG-GA------------AA-----C-AT-----------------A---AAGAACAA--AT-AC-G--C-----------------AAAA-----------CTT----A--------TG---TT-T--AATAAA-----G-C-AT-AGTTT--A-----G--C-ACCACTT--G--------GTA----G---------ATTTAA--GGA--C-----C-------CCCTC---C------C---------CCT-----------AATA-A--CTT-------T----T------TTAATTTCAA----G-A--AAATCATA----A--C-C-----TTTTTAT-T--------------------T---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-ACTC-T-----T--AGA-TA---AA--TC---------AAT---GTCAA---GATATAA---CT-G---------TGT---C--TTTTA---TTGG-----------G-TAT---TTTCAT-
gi|12 : --ATT-----CA-CGT-CA-TTAAAAATG---A--C-TCAAAA-A-TAGT-AAA---G-AGC-TTT---AAG---G----G--GGAGGTGTTTAAC--CAG---CCCAC--------TG---G-GG---CC-TTGC----AG-----CGGC-C--CAGAC--------CCCCT-A--------C---TCAC----G--AAC-TCCCCCC---C-----CTCCCTTTC----------C------TGAATTCATTG-------ATCCACCCGGGT---A----AATTTTAT-GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TA--T-G---GTACC-AAT-CCCGTTATG-TTCAA-TAC---T-TTCC--TTCTCGTG-GT--GTTTTTTTTGTTTTCTGTTTTTTTTTTTT----TTGCTTTA-CAAA---TCCTA-----------GTGGCTC-A---TGCA-TA-TATTGAAATT-AACAGT-A-TGACAT-CCAATTCA-TTTTAAA-A----AACATAAGC-----CA---ATA-A-------AGTTAATACA-CT----C--A----AATCTGCC-A-T--G-T--TGA
gi|13 : --------G------G---------ATTTAAAGGGA--GTGCACC-------CCCTC---CTTCT--C---------CCTG----------AAT-----TTT-------CAAT-T------T-------AA----G-G-TGAATCATG----G--T-G-----TTTT-GG-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------ACAATAGCAGTAA-AAGATAC--AAT-AAT--CCTT-TC-ACTT-T-----T--CGT-GA---AA--T-----------AT---T---------TCT-A---TT-CA--TTGTATTTT---T--TTTTTT--TTTTG---G-AT-TGG-TAT-------AA-CTT---AATA--------TTTGTG--ATA--TC----CTA---------TCA--ATCTCA--------------CGT-CA-TTAAAAATG---A--C-C---AACACTAGTAAA----G-ATT-TTC---CAG---G----G--G------CCCCATACCAAGACCCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTAA----CA-----CTCC-CTTTAAAT--------CCCT------------------C----G--AAC-CCCCCCC---C-----CTC
gi|14 : agattagcT--G-------------------------TTT----TC--TGTA--AC----TTTTA--T------A-A-------A---T--A-TA-T-TT-AAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTTA--A-A----AACA----C-----TG---A-A-A-------AGTTAG--T--GC----CACT----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTAT---TTGTGAA-T-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTCG-T-TTGA--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-Ctt
gi|14 : ATTTT--C-A-ATA-CTTTCTTTCA-T-TTGT--GTGGA--A-----T-TTATT-------------GTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataa
gi|15 : tgttttctgtaacttttataaatatatttaagccattaaggcatctgattcatttaaaaacactgaaaagttagtgccactgatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagTTGTGT-CA--C--GATGCGGT-A-G-TTAT-TGCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CCTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGAT-T--A--GC---TG-TAC-TAT--A-AC---TTC-CAGGG---GTCTG-G-ATTATA-AC-TTCGAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------TTT--TTAAG-CATTT--AT---T----C-AG--TGATA-AA------------AAT----T-TT-----------------T---AA----AA--AT-GCAG--CTTATAAACAGATTAAGTATAA-----------ATTAAGCA--------TG----T-TC-AATTAACA--CG-C-GG-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--A--------ataa
gi|16 : atA-TA-T-TTTAAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTT---A-A----AACA----CA----CG---A-A-A-------AGTTAG--T--GC----CA-C----TATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-----------------------------------A-TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTAT---TTGTGAA-T-ATT-CA-TGACA--------AGACA-TTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTCG-T-TTGA--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGAACGTGACATGCAGTCT-C
gi|16 : aaATTTT--C-A-ATA-CTTTCTTTCA-T-TTGT--GTGGA--A-----T-TTATT------------TGTGA----GA-----------CTGCA-----------TGT-CAC-GTTCC----TCTGTG--CAATA-AA-TTCCAT-TCAAA--CGAAAGGAAG--T---ATTA-T-AAATGTacaaataaattccacacaaatgaaagaaagtattgaaaatataac
gi|17 : aaatattttaagccattaaggcatctgattcatttaaaacacacgaaaagttagtgccactatctccatgttgaaattttgacaaccccatactttttatgtcacgtcaagtcacgtgcattttgcaatgctatttgtgaatattcatgacaagA-T-TTGAA-TA-A---GT-AATGACCC-CAAAGTCA-TTTT--T-A----A-CT----C-----TA---A-A----------GTTAGTATA----------C----GATCT-CA-AAT--G-T--TGAA-TGT-A--CGA-T-G---TT------T-TTC-A--ACTTTG-AA-A-A-CCC-CAA---TCAACTA-----CGT-AAAATCG-----C-GA-GCA---T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGACTT-ATT-----------------------TTTA--C-ATATA--------------TTGT--ACAGA--A---------------------GGGCATGA----CAATCTCCGTC-ACTGCGCTACT-CGAC-AG--CAC-G-CCC----TCT-TA--AAATA-AATTTCCATAACAA-----AAATATAG--T---ACTGTT-GAATATAAAataac
gi|18 : C-AATTAACA--CG-C-CG-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--AAGTGGC--A------G---------ATTTAAAGAGA--G-----C-------CCCCTGCAC------C---------CC------------AATA-A--TTT-------CCAATT------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--TCA-----TTTT-GT-T--------------------C---------------ATAAAAAAATAGCGA-T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----T--AGA-GA---AA--AC---------AAT---GACAA---GATAT-A---TT-GA--TT-TATTGT---C--TTTTAT--TGGGT---A-AT-TCG-TA----TTTCATATTT---AATA--AGAAACTT--TA--AGA--T
gi|19 : GTGT-CAAAT--GGCGTGGC-AAC-CTTT-CCCTTT------TA----TG-A----------AAATCA-GAGCAGAAA---T-AGTT--G-GCAGAATT-TA--AA-A-CGT--A-C-A-AT-A-CTTC--TA-G-G-GGGTGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AATCAA-ACCTTTTC-CAGGG---AACTGTT-ACTATACACATTTTAAC-AAAAAACA-T---AG-AAAGG-AA--CAAAATATTTTT--TGTAA-CA-TT--AT---T----CAAG--TGATA-AA------------GA------------------------------------AA--GT-GCAG--T-----------------ATA
gi|2 : tgTGCG-C-A-C-TTCTATTTTCTGGTGCTTAAGCATGTAACGTATCTTTAAATCA-GA-CTGGTA-A-CGGGTTGCG-GCAGAATTGCCCGAA-CACGTAAA-C-A-AT-AACTTTTGTA-G-G-GG-CGG-GGTTGT--AT-GCTTATT-TAC-AAT--ATAC---TTC-CAGGG---caaacaaa
gi|2 : AAA-A-TCGCAG-AAAGGCAA--CGA------TTTGATGAAACCATTCTAATGCGT----C-AGGCCGATG-AA------------AA-----C-AC-----------------AGG-AG----AA--ATGGCAG--C-----------------CTAA-----------TCT----A--------ggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|2 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagT-----------------A---AG----AA--CT-GTAGAGC-----------------ATAA-----------CAT----A--------TG---TTGTCTAATTAACAACCG-C-ATTAGTTA--ACGTCCGTCC-AC-ACTTTCA--------C------GT--------ACCT---TGGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------CCCCGCCCCCCCTAAGTA-A--TTTGCAAAAAT----T------G-------AA----G-AATCAATCATACATTA--T-T-----TTTC-GT-CATGAATGCACAAATGGCGAGC---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAA-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TTTAGA-AT---AA--TT---------CATATTGACAA---GATCT---------------CATTGT---TC-TTTTAC--TTTGGCTTA-AC-TCGGTAT---TTCAAT-ATT---A-TAGCAAAAAGTTTTTATTAGA--TTTTGTGTGATTCTCATATTA--ATTTTCT--AAT-----CGTCGT-TA-TAAAAAATGACCAAACGT---AG-A-TAGA-AA----G-AGCTTTT---CGGATAG----GCAA------TCTAACG-CAAGA-ACCAC--------TGTATGTGC--GCCTTTGAG---GG-----CGACGATCCAGA---------CCCCT-A--------TCCATCAC----GAAAAG-ACCTTCT---G-----ATCCC---G----------C--------------------------CCA----------A----AAT------GCATGGC--A-T---TGAAA--------------A---G-TAGTT------TACTAAGT-ACCG-CATG-CTCA----------TTAC--T--TCG-------------------------------------------------CACAGTTTCCGGCTT------A-GTGT-CC-A---TGTA-TAGT-TTGAAATA-A-C-GT-------------ATTCT-TTCT--A-A----AAC-----T-----TA---A-A-A-------AGTT-A-ATA------------------CT-AC-A-T--G-TACCG-A-TGT-T-GCGATT-T---AT------C-TCC-A--ACT-------------------CCTC--CTA-----CAT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGC------------A-T-ATT-CA-TGACA----C-------------------ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGA--ATGG--------------TCG-C-TA------CGCGA--------CT-CG---ACTGC----------------CAC-TCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CAAaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|20 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagACTTC--TA-G-G-GGGCGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CATGG---AACCG-T-ACTATA-A---------------A-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------T-----GAAA-CATTT--AT---T----C-AA--TGATA-AA------------AATGCAAC-TT-----------------ATAAAC----AA--AT-TAAG--C-----------------AAAA-----------GTT----A--------TG---TA-TC-AATTAACA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-AC-AC-------------------------------TTTAA----A--G-----C-------CCCCC---CCCCCTTC---------CC------------AATA-A--TTTTTAA---T----T------T-------AA----G-A-TAAATCAT
gi|21 : g---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---CGGAAA-CATGGTCTT-CCAGCTC-T-----T--AGA-GA---GAATTC---------AAT---GACAAATGGATCT-A---TTGGA--TC-TATTGT---T--T
gi|22 : atcatacatatttttgtctcataattacaaaggggtggcgaA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGATTTC--CTATGTCACGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATAGA--A-----T-TGAATG-C--------------------------------TGCGCAACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-C-AAATATAAaaaaacttttacttaaaggctaggacttccaatagcttgcattttttatccacaaaccaaaaaaaacactttaagatttggattatttca
gi|23 : TGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCA-AATT-CC-------------------C-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGTT-T--A--GC---T----------------------------------G-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGTAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATC-AA------------AA-----C-TT-----------------A---AT----AA--AT-GCAG--C-----------------GTAc
gi|24 : -A--ACTTTT-GA-C-A-ACAGCTGGCTTA--TGA-----CGC-TATATCA-----C-GT-GCAA--T---------TTTGCAATGATGTTAAT-ATGAA-T-ATC-CA-TGGCATAGTT--AAGGC-ATTTA--C-AGATATCTGtaaaaaacttaa
gi|24 : aAC-TGC-AAC-TCCCT----TCTGTA--TAATA-AA-CCCAAT-ACAAA--AGAAACAAAG--T---ACTA-T---ATATAAatacctttttttcactgcaactcccttctgtataataaacccaatacaaaagaaacaaagtactatatataa
gi|25 : aaacttttgacaacagctggcttatgacgctatatcacgtgcaattttgcaatgatgttaatatgaatatccatggcatagttaaggcatttacagatatctgatacctttttttcC---C------C---------CT------------AA-A-A--TTT------------T------C-------AAAT--G-G-TAGATTATG----A--T-C-----TTTT-GTAT--------------------C---------------AAAAA-----------T-AGAATGATA---------------A----------AA-AAG---C--AAT-CAT--TTTT-CC-ACTA-TCAGCAC--AGA-GA---AA--T-----------AT---TAC-------T-------TT-GA--TA-CATTGT---TACTTTTAT--T
gi|26 : gatttaaggtggatgcatctgtaggca----T------T-------AG----A-A-TAAATCATG----G--T-C-----CCTT-GT-T--------------------T---------------AAAAAAAATAACGA--T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-AAT--TTTT-CC-ACTT-T-----T--AGA-GA---AA--GA---------AAT-----CAA---GATAT-----TT-TA--TT-TGTTGagaaga
gi|27 : tcatatCATTGAGT-CA--T--GGTGCTGC-A-C-TT---------AAT-C--A-GC-AATG------CTTTAAATCA-GA-CGGAAA-A-T-GGTT--A-ACAGAATT-CT--AA-C-T-T--A-CAA-AA-AACTTC--TA-GAG-GA-CGG-AGCT-TTCAGTGC---TG-TAC-ATT--A-AT---TTC-TAGGG---AAACG-T-ATTAggggaacttgtactctatccaaaaaataatctgaattaaaatttgcg
gi|28 : tg-----C-------CCCCC---C------C---------CC------------CATT-T--TTT-------C----TCCAAATT-------AA----A-AGTAAATCATG----A--T-A-----TTTT-GT-T--------------------C---------------AG--------------T-A-------A---------------A----------AG-AAT---T--AGA-TA---------C-ACGA-T-----A--AAA-GAAGCAA--TCGTTGATTTAAAT---AATAA---GATTT-----TT-GA--TA-TATTGG---TACTTTTAT--ggcctat
gi|29 : atgtaaatatacTTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTCTGAT-CTTA-GC-TGTG------CTTTAAATGA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AA-T-CGT--A-C-A-AT-AACTTT--TA-G-G-GA-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---T
gi|3 : atCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CCTA-GC-TGTA------CTTTAAA--------------A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CGT--A-C-A-AC-AAGTTC--TA-G-G-AG-CAG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAAC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCGA--CGA------TTA--CGAAA-CATTC--AT---T----C-TG--TAGTG-AA------------AA-----C-AC-----------------A---AG----AT--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAAAA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-AC-AC--------------------------------TTAAAGGGA--------C-------CCCCT---C------C---------CC------------AATA-A--TTT------------T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-A-----TTTT-AT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-AAT--TATT-CC-AATC-T-----T--AGA-GA---AG--T
gi|3 : tGC-TTC---CGG---G----A---------TCCAACACCAAGA-CCCAC--------TG---A-GA--ACC-TTGACCTAGG-----CGGC-CTCCATAC--------CCCTT-A--------CC--TCAC----G--AAG-CTCACCC---C-----CTCCC---C----------C------T------------------TCCA-----GT---A----AAT------GCAT-AC--A-A---TG--A--------------A---G-TATTT-AC-TGTGCTCAAT-CCCAT-ATG-TCCAA-TCC---G-TTAC--T-CGCAGG-G---G-------------------------CTT----TT--TTTA-CACA---TCCCA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGGAATT-A-C-GT-AATGACAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATAAGT----C--C----TACCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GAGA-T-T---GT------T-TCC-G--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTAT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTAA--ATTGA--A-----T-TTATTG-TACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCTACT-CGAC-TGT-CAC-GCCCC----TTTGTA--CAATG-AA-TTCTAT-ACAAA--CAAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcttccgggatccaacaccaagacccactgagaaccttgacctaggcggcctccataccccttacctcacgaagctcaccccctcccccttccagtaaatgcatacaatgaagtatttactgtgctcaatcccatatgtccaatccgttactcgcaggggctttttttacacatcccatagtgccatgcatatttggaattacgtaatgacatccaattcattttaaaacaccaaaaagttaaataagtcctacctccatgttgaatgtagagattgtttccgacttttgacaccccagacttcctacgtcacgtcgcgtgcaacttagcaatgctattatgaatattcatgacacaagacaatttacaatactgtctttcgtttaaattgaatttattgtacagaggggcgtgacagtctcgtcgctgcgctactcgactgtcacgcccctttgtacaatgaattctatacaaacaaaagacagtactgtaaatataaa
gi|30 : tcattgtgtcatgatgcggcactttttcctttgatcctagctgtactttaaaacggttggcagaattccaatcgtacaacaagttctaggagcagagcttagctgtacaataacttccagggaaccgtactataacttccaaccataaaatcagaaaggcgacgattacgaaacattcattctgtagtgaaaacacaagatatgcagcataacttatgtttcaattaaaacgcatagtttagcacacttaaagggaccccctccccaataatttttaagataaatcataatattttattcataaaagaagcaataattattccaatcttagagaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTCGGC-A-C-TTTT-CCCTTTGAT--TTA-A--TGTA------ATTTGA
gi|30 : atCT-CGACGTGT-CAT-TGCAT----TC-GTA--CAACA-GA-TTCCAT-ACAAA--CGAAGGACAG--T----CTG-C-TAATATAcggttattctttgatccacgttctcgacgtgtcattgcattcgtacaacagattccatacaaacgaaggacagtctgctaatata
gi|31 : atattcggcacttttccctttgatttaatgtaatttgacggttattctttgatccacgttTTGTGT-TA--T--GGTATGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-TC-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAAAAA-A-T-GCTT--G-GC-------TC--AG-C-TGT--A-C-A-AT-AACTTC--CA-G-G-G
gi|32 : cT---T-ACGAA-T-GTT-AA-TGACA--------AGTCG-TTCAAAC-ATATA-CTTTCTTTCG-T-TTAT--GTGGA--A-----T-TAAGTT-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CG
gi|33 : cca-CTTA-GC-TATA------TTTTAAATCG-GA-CATTAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CGT--A-C-T-AT-AACTTC--TAGG-G-GG-CGG-AACT-T------------------------AC---TTC-CAGGG---AACctg
gi|34 : -CCAATTCA-TTTT--C-A----GACT----T-----TATACA-A-A-------AGTCAA--T--GC----CAGT----GATCC-CC-G-T--G-T--CGAA-TGT-A-GTGA-T-TGTCGT------T-CCC-A--ATT
gi|35 : agTGTGT-CAA-T--GATGTGCA-A-C-TTTT-TC-TTTGAT-CTTA-GC-TGTG------CTTTAAATCAGGA-CAGAAACA-C-GGTTG-G-GCAGACTT-TC--ataaa
gi|36 : cTGTGT-CA--T--GATGCAGC-A-C-TTTT-TCATTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GTAGAATT-Ccca
gi|37 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGT-------------------A-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-
gi|38 : aTTGTGTTCA--T--GATGCGGTTA-C-TTTTTTCCTTTGAT-CTTA-GC-T-TA------A-TTAATTCA-GA-
gi|39 : TTGTGT-CG--T--GGTGCGGT-A-C-ATTT-CCCTTCGAT-CTTA-GG-CATA------CTTTA
gi|4 : taaagA-CATGT--AT---T----C-AG--TGATC-AA------------AA-----C-TT-----------------A---AA----AG--AT-GCAG--CGTCTAAAGAAAATAACCATAA-----------CAT----A--------TG---TT--C-AATTAACA--CA-C-CG-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--A--------ATTGGAAG---------ATTTAAAGGGA--A-----C-------CCCCC---C------CG--------CCTCTT--------ACTA-T--TTT-------CCAATT------T-------AA------A-TAAATCATA----A--T-CCTTGTTTTT-GT-T--------------------C---------------AA--------------T-A-------AGAACCAATAGCGATGA----------AG-AAG---CTTCAT-AAT--TCTT-CC-GCTCGT-----T--AGATGA---AA--GC---------AAT---GACAAA--GATCT-A---TT-GA--TC-TATTGTGTCT--TTTGAA--TTGCT---A--T-TCG-TAA---TTTCAT-ATTGTTAATA--AGAAACTTTG-A--AGAATCT----GTG---------TTA---TTTCATTAATTTTTAACG-CGTACA---AAAAATGACCA--A-T---TA-A-TAGT-AACCACG--GC-TTCGGGTGG---G----G--G----------ACG--AAGA-CCAA---------TG---T-GG--GCC-TTGA----G------CGGA-CTCCAGAC--------CCCCTTA--------CCG-TCAC----G------CCCACCT---CGACATTTCAA---CATTCATTGATC------T-----------------ACCCAA----GT---AC---AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A------------------G-TACTT-AC-CATGACCAAT-CCCGTTATG-TTCAG-TCC---G-TTAC--T-CTCAGGTGG--G-------------------------TTT----TT--TCTA-CAC----TACTC--T------A-GTG--CA-A---TGCA-TATT-TTGAAATA-A-C-GT-GAAGG-AT-CCAATT-A-TTTT--A-ACCACAAAA----C-----TA---A-AGA-------AGTT-A-ATA-CA----C--C----GATCT-CCAA-T--GTT--TGAA-TGC-T-GCGT-TAT---GT------T-T-C-A--ACTTTT-GACC-A-CCC-CAGACTT---CTA-----CGTGCACGT-G-----C-AT-GCGACCT---------TTATCAATGCTCTTCCT-ACG-------T-CA-CGTCG----C--ATG-CAACTTAG-C-A-ATG-CTG---TTC-----------TGAAC-A-----T-TTATGA-CATAA--------GA----CATTTA-CAAT-GCTGCTCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAA
gi|40 : -TTTT-TCCTT-GAT-CTTA-GCCTGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCA
gi|5 : TTGTTT-CA--T--TGTACGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-GC-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAGAAA-A-T-GCTA--G-GCAGAATT-CT--AA-C-CGT--A-C-A-AT-ATGTAC--TA-T-G-TG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGGTAAAAC-----ACTATA-AC-TTCCAA--CACAAA-A-TC--AG-AAAGGGGA--CGC------TTT--TGTAA-CACTT--AT---TTACCC-AG--TGATG-AA------------AA-----C-AT-----------------A---AC----AA--AT-ACAGA-CTATAA------------ACAA-----------CGT----A--------TG----T-TC-AAATAACA--TG-C-AT-ATTTT--A-----G--C-AC-ACTT--AAC------A------G---------ATTAAGAGGGATTG-----C-------CCACCAT-C------C---------AC------------AAT-----TTT-------CAA--T------T-------AA----G-A-T-AATCATA----A----A-----TATT-GT-T--------------------CCTGT-----------A---------------T-A-------ACTGGCGATAT-----A----------AG-AAG---A--AAT-AAT--TCTT-CC-A--T-T-----T--AAA-GA---AA--GC---------AATG--GACAA---GATCT-A---TT-GA--AT-TATTTT---C--TTGTAT--TTGGG---A-AA-TCG-TAT---TTTCAT-TTTG--AAAA--AAAAACCATGTA--AGA--TT----GTA---------TTA--ATTTGAT--ATT-----CG-CGT-CA-TT-AAAATA--CA--C-T---AA-A-TAGT-AA----G-AGT-TTCA--TGG---G----G--G--------CAA--CCAACA-CCCATG-------GG---G-GG--GTC-TTGA----GG-----CTG--CTCCAGA---------GCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAGATCCGTCT---T-----CAACT---C----------A------TTG---------------ATCCG-----CC---A----TAT------ACAT-GCTAA-A---TG--A--------------C---G-TACT
gi|6 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGT-A-CTTTTT-TCCCTTGAT-CTTA-GC--GTA------CTTTAAATCA--A-CAGAAA-AGC-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AATC-CGT--A-C-A-A--AACTTC--TA-G-G-GG-CGGCAG-T-T--A--GC---TG-TACTTAT--A-AC---TTCTCAGGG---AACTG-T-ACTATA-AC-TTCCAGCACCTAAA-A-TC--AG-ATAGGCAA--CGA------TTT--TG-AA-CATTT--A----T----C-AG--TGATA-AA------------AA-----C-TTTCAAAATGCAGTGAGTTA---AC----AA--AT-TAAG--C-----------------ATAA-----------ATT----A---------GCATTT-TC-AATTAACA--CGAC-GG-AGTTT--A-----G--CAAC-ACTT--AATTCAGGCA------G---------A-TTAAAGGGA--G-----T-------CCCCC---C------CCCCCCCCCACC------------AATA-ATCTTT-------CCAATT------T-------AA----GAA-TAAATCATA----A--TCC-----TTTT-GT-T--------------------CGTAAAAAATTAGCGGA---------------T-A-------A---------------A----------AGTATG---C--AAT-CAT--TCTTCCC-GCTC-A-----A--AGA-GA---AAT-TC---------AAT---GACAA---GGTCT-A----T-GA--TT-TATTG----T--TTTTA---TTGGGAGCA-AT-TCC-GAT---TTTCAT-TTT---AATA--AGAAACTTTAAA--AGA--TTAA--GTG---------TTATCGTTTAAT--TTT-----
gi|7 : AGAC--------CCACT-A--------CC--TCAC----G--A----CCTCCC---C-----CCCCC---C----------C------TCAACTTCACATTCATTGATCCACCCGAGT---A----AATATTTATGCAT-GC--AGA---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---T-TTAC--T-CTTGGG--T--G-------------------------TTT----TTGTTTTA-CAAA---TCCT------------GTG--CC-A---TGCA-TA-T-T-GAAAAT-A-C-GTTAAAGGCAT-CCAAT-CA-TTTT--AGA----AACA----CTAAGCCA---A-A-A-------AGTTA---TA--C----C--CACAAGATCT-CC-A-T--G-T--TGAACTGT-T-GCGA-T-T---GT------T-TCT-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----A-AT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGT---TTATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACA-TTTA--C-A-GTA-CTGTCTTTTGGT-TTGTTTATGGG--AAAATTT-TTATTGGTACAGAGGGGCGTGG----CAGTCG-AGTC-GCCTCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTGTAC-CAAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T--AATATAa
gi|8 : aCAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--ACC-TTGA----GG-----CAGC-CTCCAGAT--------CCCCT-A--------CC--ATAT----G--AAG-CTCCCCC---C-----CCCCC---C----------CACCTCTT-----------------CTTCA-----AT---TCCTTGAT------GCAT-GC--A-A---TG--ATTCTCAGTTGCAAAA---G-TACTT-AC-TGTGCCCAAT-ACCATTATG-CCCAA-TCA---G-TTAC--T-CA---------G-------------------------TTT----TA--TT----ACA---TCCTAG-T------ATGTA--CT-A---TGCA-TA-T-TTGAGATA-A-C-GT-AACGGCAT-CCAATTCA-TTTC--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTT-A-AT--GC----CATT----GATAT-CC-A-T--G-A--TGGA-TGT-A-GCGA-T-TTTAGTTCCTACT-TCCAA--ATTTTT-TA-CAA-CCC-CAGACTCC--CTA-----CAT-CACGTCA-----C-GT-CCAA--A---------TATGCAATGTTAT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-GTA-CTTTCTTTTG-T-TCAA--ATGTA--A-----T-TTATT-----------------------------GTC-ACTGTGCGACT-AAAC-TGC-CAT-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCTAT-ACAAA--CGAAAGAAAG--T---ACTG-T-AAATAT
gi|9 : -TATA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-TGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AAACG-T-ACTATA-AC-TTCCCAC-CATACA-A-TC--AG-AAAGGCGA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AACAAAAGAAATACAG-----C-TT-----------------ATCAAC----AA--AT-TAAG--C-----------------ATA------------CTT----A--------TG---TC-TC-AATTAACA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--C--------GCA----G---------ATTTAAAGAGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------T---------------------TTT-----------------------------------A-T-AATCATA----A--TAT-----TTTT-GT-T--------------------C---------------ATAAAACAAATAGCGAT-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-ACTC-T-----T--AGA-GA---AA--TC---------AAT---GACAA---GATCT-A---TT-GG--TT-AATTGT---T--TTTTTTTATTGGG---AGATCTCG-TA----TTTCAT-TTT---TATA--AGAAACTTT-TA--AGAT-TT----GTG---------TTA--
blockSeqs : T AA . T A T A G A A ACGTAT G G C G G GC A G CG CA AA A A . . TG G A . G C G TC GT TTA . T CA T CTT T TAA C T . C A A C . GC . AA AATATT GA A TA GCG TACC A GC G AACTTTCAAAATGCAGTGAGTTAAC . G AG TTATAAACAGATTAAGT ATTAAGCA CATT G T AC A ATT . CGTCC TC A C AATTCAGGCAG A GTGCACC GCA CCCCCGCCCCCCCTAAGTAATTTGCAAAAATTG ATG A CATT TCCTTGT T A ATGAATGCACAAATGGCGAGCATAAA T ATA GG C GG C A G CAGCAC T AGC TCGTTGATTTA ATT ATG AA G TTG GTCT TTA GCTTAAC G T AT GTT A GC TTTATT AT TTGTGTGATTCTCATA TCG C TAATTTTTAACG A . ACCAAACGT C C A CCAC . T AAGGGGGAGGTGTTTAAC C G TATGT G T CCTAGG G G C ATCCA . AAAAG C CGACAT CCTCAACTTCACATTCATTGATCCACCCGAGTAAATATTTAT G TA G . AA TTCTCAGTTGCAAAA . TGCC . T . ATACT . TCTCGTGGTGTTTTTTTTGTTTTCTGTTTTTTTTTTTTTTGCTTTACAAATCCTA GC . . . G A T ACAG T T . . AA G CCAC TAAG TAAGCCA T G . AATACACTCA G A A . T AC C A T TTTAGTTCCTAC A A TA T C A A G CAA TGTCA G AGTCA G . CCT A A TAAT T . A . TAGTTAAGGCA AA A T C G G . TTT GG AAATT . GGTACAGAGGGGCGTGGCAGTCGAGTCG GCTACTC G C . . C C T A . . TAA T AA
blockSeqs : . A . . . . T . . C . . . . . . G . . . TC . . . . . . . . . G . . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . C . . . . . A CAAAAGAAATACAGCTTATCAAC . . A GTCTAAAGAAAATAACC CTTA T . . . . AT . . . . . AAGTGGCAG A TTGC AT CCCCCCCCCACCAATAATCTTTCCAATTT GA G . TCA . . CAATAAGAACCAATAGCGATGA . . TT A . . . . TTT . . ATTC G A A . TT TAC T GAGCAAT . T C G A . TGTG T AAGTG A T AATCGT . . ACTCAA . . . A . . CGGATAGGCAATCTAACG . . G G . GGG T . T TACCG . AAGA C C TTTCCTGAATTCATTGATCCACCCGGGTAAATTTTAT . . . . . A . ACT . T . ATCCG . CGCTGGGTTAATTTATTTCACCATCCTATGTAGCTA T . . . T . C TG . T . . . . . . TATAC . . . AAATAAGTCC . . . . . . . A . TGTCGT . . . . . . A . C . . AGTCA . . T A A TCCT . . . . TTAAAGACA G . G T T . . A C . . GTACAGAGGGGCGTGACAGTCTCGTCG GCAACTC . T . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . A AATGCAACTTATAAAC . . . TATAA TCTA T . . . . GG . . . . . AATTGGAAG A CC . CCCCTTCCCAATAATTTTTAATTT G . . TCC . . CGTAAAAAATTAGCGGATAAA . . . C . . . . T . . TTC . . A . TC TAC T GAGATC . T A . A . TGTA . CTA A C ATTCA . . ACCAAT . . . . . . CAGGGGCCCCATAC . . G A . AG G . C ACC . AAC T C CATTCATTGATCTACCCAAGTACAAT . . . . . A . ACC . C . GTCCG . CTCAGGTGGGTTTTTTCTACACTACTCTA . . . . . . C CG . T . . . . . . ACG . . . ATACCCACAA . . . . . . . T . ATGT . . . . . . . . T . . . . . T A G TT . . . . CAAGACAA . . T . T . . T . . . GTACAGAGGGGCGTGACTCG GCTACTC . T . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . G AACATAAAGAAC . . . . CATA T . . . . CG . . . . . TCACGT A GC . CGCCTCTTACTATTTTCCAATTT G . . TAT . . CATAAAACAAATAGCGATAAA . . . C . . . . T . . TC . . A . TA TC C GGAT . A A . A . TAAA . GTG A G ATTCG . . CACT . . . . . . CGGGATCCAACAC . . A G . CA G . C ACC . AAC A G CCACCTCTTCTTCAATTCCTTGAT . . . . . A . ACC . T . ATCCT . CGCAGGGGCTTTTTTTACACATCCCATA . . . . . . A CG . T . . . . . . CA . . . AATACCACC . . . . . . . A . GTT . . . . . . . . T . . . . . T A G TT . . . . CAAGACA . . . . T . . A . . . GGGCATGACAATCTCCGTCA TCGACTC . C . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . A AACACAGGAG . . . . GTTA T . . . . AT . . . . . GGTAG A GC . CCCTAATAACTTTTTTAATTTC G . . CC . . CATAAAAAAATAGCGATAAA . . . C . . . . T . . AC . . A . TT C T TAAT . T T . A . TGA . GTA . A . . . ACC . . . . . . GGGTGGGGGACG . . T G . GG G . C ACC . AAG A C CATTGATCCGCCATAT . . . . . A . ACT . T . ATCAG . CTTGGGTGTTTTTGTTTTACAAATCCT . . . . . . A CG . A . . . . . . TG . . . AGTGCCACT . . . . . . . A . TAT . . . . . . . . C . . . . . T T G TT . . . . CATGCAA . . . . T . . T . . . ACATAAGACATTTACAATG GCGACTC . C . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . C AATTTTTAA . . . . CTTA T . . . . AT . . . . . AACAG A GC . TTCTCCCTGAATTTTCAATTT G . . TG . . CCTGTATAACTGGCGATATA . . . C . . . . T . . TT . . A . TA T T GAAA . T T . A . TTA . GTG . ATGGGGGCAAC . . G A . GG T . T ACC . AAG G T CCTTCCAGTAAAT . . . . . C . G . T . . . CAGTTTTATTACATCCTAGTAT . . . . . . T CG . A . . . . . . TA . . . AATGCCAGT . . . . . . . T . TGT . . . . . . . . C . . . . . T A A T . . . . CAAGACA . . . . G . . T . . . GCTACGCGACTCGA GCGACTA . T . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . G AACTTAAT . . . . CATA T . . . . CG . . . . . CGCAG A AC . CCCCATTTTTTCTCCAAATT G . . TT . . TAAAAAAAATAACGATAAA . . . A . . . . T . . GA . . A . TC C A TAT . . T . . . TA . . . G . . G A . . AC . A T C GCCCAAAAT . . . . . A . . . . . . . TCGCACAGTTTCCGGCTTA . . . . . . A CG . C . . . . . . TA . . . AATGCCATT . . . . . . . T . TGT . . . . . . . . A . . . . . C A C T . . . . CAAGACA . . . . G . . A . . . TGTGAGA A . T . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . C AACACAAG . . . . CGTA . . . . . AT . . . . . . . GT . CCCAATAATTTCCAATTT A . . TC . . CAAAAATAGAATGATAA . . . T . . . . A . . GC . . A . AT T T . . . . . . . C C . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . CA . . . AGTGCCAC . . . . . . . A . TGT . . . . . . . . C . . . . . T A G T . . . . AGACA . . . . G . . T . . . GTGAGA A . C . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G AACTTAAA . . . . ATTA . . . . . GG . . . . . . . GC . CACAATTTTCAATT A . . TC . . CATAAACAATAGCAGT . . . A . . . . T . . GC . . . . TT C . . . . A T . . . . . . . . TA . . . AATACACC . . . . . . . . . GT . . . . . . . . C . . . . . C T A T . . . . AGACA . . . . G . . A . . . GTCA . . C . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A AACATAAC . . . . CTTA . . . AT . . . . . . C . CCCAATAATTTTT G . . TA . . CAGTAAA . . . A . . . . T . . TC . . . . TT T . . . . G . . . . . . . . CA . . . AGTATAC . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . T . . . . AGTCG . . . . T . . T . . . GC . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G GA . . . . . CCTAAAATTTTC G . . TA . . TATAAA . . . A . . . . T . . T . . . . . T . . . . . . A . . . AATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . C . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTTTT . . . A . . CATAAA . . . C . . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ** G* AACATAAC****************************************** ** ***************** CTTA*********************** AT** ** AACAG*********************** GC************** G***** TN******** C* T******* *** A**** TT*** C***** T*** TGTA** GTG************* ATTCG******** ACCAAT****** CGGGGGCAAC********************** ******** G** GG********* C******** ACC*********** **** C******** *** A***************** ACC** ATCCG***** ** *** N* CG** CA******** ******* AATACCACC************ ** A** T*********** CAAGACA******* GTACAGAGGTGACATCG***************** GCGACTC* C* **** ** ** **
originalCons : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AA------------AA-----C-TT-----------------A---AN----AA--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAACA--CG-C-GT-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT--A--------G------G---------ATTTAAAGGGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-N-----TTTT-GT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----T--AGA-GA---AA--TC---------AAT---GACAA---GATCT-A---TT-GA--TT-TATTGT---T--TTTTAT--TTGGG---A-AT-TCG-TAT---TTTCAT-NTT---AATA--AGAAACTTTGTA--AGA--TT----GTG---------TTA--ATTTNAT--ATT-----CG-CGT-CA-TTAAAAATG--CA--C-T---AA-A-TAGT-AA----G-AGC-TTC---CGG---G----G--G------TCCAACGCCAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTGA----GG-----CGGC-CTCCAGAC--------CCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAG-CCCNCCC---C-----CTCCC---C----------C------T-----------------ATCCA-----GT---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGTTAA-ATA-GC----C--C----GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTG-CACAGAGGGGCGTGA----CAGTCT-CGTC-GCTGCGCGACT-CGAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
finalCons : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AAAACATAAC------------------------------------------AA--AT-GCAG--C-----------------ATAACTTA-----------------------TG---TT-TC-AATTAACA--CG-CAT--AGTTT--A-----G--C-AC-ACTTAACAG-----------------------ATTTAAAGGGAGC--------------CCCCC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------AAG-----A-TAAATCATA----ATN--------TTTT-GT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AATC-AT--TCTT-CC-GCTC-TT-------AGA-GA---AA--TC---------AAT---GACAA---GATCTA----TT-GATT---TATTGTC-----TTTTAT--TTGGG---A-AT-TCG-TAT---TTTCAT-NTT---AATA--AGAAACTTTGTA--AGA--TTGTG-------------TTA--ATTTNATATTCG--------CGT-CA-TTAAAAATGACCAAT------AA-A-TAGT-AA----G-AGC-TTCCGGGGGCAAC----------------------CAAGA-CCCAC--------TG---G-GGG--CC-TTGAGG---------CGGC-CTCCAGAC--------CCCCTACC-----------TCAC----G--AAG-CCCNCCCC--------CTCCC---C----------C------T-----------------ATCCA-----GT---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--AA-----------------G-TACTTACC--GTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAATCCG-----TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TTGAAATN-ACG--T-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----CCA--------A-A-A-------AGTTAATACCACC------------GATCT-CC-A-T--G-T--TGAA-TGTA--GCGA-T-T---GT------T-TCC-A--ACTTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAAT-----------TTAGCAATGCTGT---T-ATGAA-T-ATT-CA-TGACACAAGACA-------TTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTCG-T-TTGT--ATGGA--A-----T-TTATTGTACAGAGGTGACATCG-----------------CTGCGCGACTC-GAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): ATGACGTCATTTTATGGAGGAATCCATGATAAGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 1111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111111111111111111111 333333333333333333 1111111111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 1111111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 1111111111111 111 11111 3333333 222222 1111 111 111111 11 3333333333333333 111 2222222222222 22222 2222 4444444444444444444444 111111 22222222 11111 22222222222 222222222 22222222222222 111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 333333333333333333 11111 1111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 1111111111 1111111 111111111 111111111111111 11111 111111111111 111 11111111 111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000
lowQualScore : 5 66 33 2 2 2 4 2 2 5 555555 2 2 2 2 2 55 4 4 33 333 33 2 2 2 2 33 2 2 2 5 2 2 33 66 555 2 2 33 2 555 3 555 2 3 3 4 4 0 4 3 3 55 3 55 000000 55 0 6 44 555 7777 3 44 44 0000000 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 777777777777777777777777777 7777 4 3 55 3 8888 55 99999 55 3 3 888888888888888888 2 3333333333333333 999 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111111 5 0 6666 9999999999 3 3 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 555 77 22 33 2 2 2 00000000 2 555 9999999999999 222 888 0 22222 3 55555 3 0000000 44 666 0 222222 4 4 2222 55 333 3 66 777777 11 4444444444444444 333 1 5555555555555 6 6 6 99999 6 0000 6 5 88 8888888888888888888888 444444 5 33333333 00000 777 5 44444444444 1 5 000000000 00000000000000 9999 777777 1 333333333 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 66 4 777 66 333333333333333333 4 0 00000 5 5 5 9999999999 66 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 00 4 777 4 3 3 3 88 9999 3 8 3 3 44 3 7777 7777 7777777777 3 3 0000000 3 3 666666666 3 6 44 44 3 3 999 777777777777777 3 77 33 3 3 6 6 3 44 88888 3 66666 3 3 444444444444 3 66 555 111 6 3 3 88888888 6 77 3 9 6 3 3 222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 3 3 3 333 99999 77 0 3 3 6 44 44 555 7777
lowQualScore : . .. .. . . . . . . . ...... . . . . . .. . . .. ... .. . . . . .. . . . . . . .. .. ... . . .. . ... . ... . . . . . . . . . .. . .. ...... .. . . .. ... .... . .. .. ....... .................................................................... ........................... .... . . .. . .... .. ..... .. . . .................. . ................ ... .................................................................... ...... . . .... .......... . . ......................................................................................... . ... .. .. .. . . . ........ . ... ............. ... ... . ..... . ..... . ....... .. ... . ...... . . .... .. ... . .. ...... .. ................ ... . ............. . . . ..... . .... . . .. ...................... ...... . ........ ..... ... . ........... . . ......... .............. .... ...... . ......... .................................................................... . .. . ... .. .................. . . ..... . . . .......... .. ............................................................................. .. . ... . . . . .. .... . . . . .. . .... .... .......... . . ....... . . ......... . . .. .. . . ... ............... . .. .. . . . . . .. ..... . ..... . . ............ . .. ... ... . . . ........ . .. . . . . . ... ........................................................ . . . . ... ..... .. . . . . .. .. ... ....
lowQualScore : 3 33 77 4 4 2 2 0 0 7 555555 1 1 2 2 2 33 4 7 44 555 77 7 9 9 9 77 7 7 7 7 9 9 99 88 000 9 9 99 9 000 1 444 6 6 6 0 0 5 0 6 6 00 6 00 555555 00 2 7 66 888 1111 3 66 99 0000000 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 777777777777777777777777777 8888 0 6 00 6 6666 00 11111 00 6 6 222222222222222222 1 8888888888888888 666 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 666666 7 8 5555 2222222222 1 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9 000 99 99 99 9 9 9 44444444 9 000 0000000000000 777 555 8 66666 1 00000 1 0000000 66 222 7 111111 4 4 6666 44 888 2 99 000000 99 3333333333333333 999 0 2222222222222 7 7 7 00000 7 8888 7 7 77 9999999999999999999999 444444 0 11111111 99999 111 0 66666666666 4 0 888888888 33333333333333 4444 222222 0 444444444 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 11 4 888 11 000000000000000000 4 1 55555 0 1 0 0000000000 99 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 66 4 888 0 6 6 6 22 8888 6 2 3 3 66 3 1111 1111 3333333333 3 3 8888888 3 3 222222222 3 7 66 66 3 6 777 999999999999999 3 33 22 3 3 7 7 3 66 33333 3 77777 3 3 888888888888 5 77 444 555 2 1 1 88888888 2 33 1 2 2 3 3 555 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 3 1 1 555 99999 33 2 1 1 2 22 66 888 1111
consensus : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-A-------AAA----C-------A-------------T-A--A----CAA--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAACA--CG-C-GT-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT-AG------C----AG--ATTTAAAGGGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-N-----TTTT-GT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----T--AGA-GA---AA--TC---------AAT---GACAA---GATCT-A---TT-GA--TT-TATT-GT-------CTTTT--AT--TTGGG---A-AT-TCG-TAT---TTTCAT-NTT---AATA--AGAAACTTTGTA--AGA--TT----GTG---------TTA--ATTTNAT--ATT-----CG-CGT-CA-TTAAAAATGAC-CAA---TAAATAGT-AA----G-AGC-TTC-CGG--G----GG--------C--A-AC------CAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTGA----GG-----CGGC-CTCCAGAC--------CCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAG-CCCNCCC---C-----CTCCC---C----------C------T-----------------ATCCA-----GT---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TT-GAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGT-TAA-TAC-C-ACC---GATCT-CCA-T--GT--T-GAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC--AAC-TTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTG-T---T---ATGAA-TATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTC-GT-TTG--NATGGA--A-----T-TTATT-GCACAGAGGGGCG----TGAC---A-------TC------GCTGCGCGACT-C-GAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
Reference ( family-888 ) : NCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-A-------AAA----C-------A-------------T-A--A----CAA--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAACA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT-AA------C----AG--ATTTAAAGGGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------CC------------AATA-A--TTT-------C----T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-N-----TTTT-GT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----T--AGA-GA---AA--TC---------AAT---GACAA---GATCT-A---TT-GA--TT-TATT-GT-------CTTTT--AT--TTGGG---A-AT-TCG-TAT---TTTCAT-NTT---AATA--AGAAACTTTGTA--AGA--TT----GTG---------TTA--ATTTNAT--ATT-----CG-CGT-CA-TTAAAAATGAC-CAA---TAAATAGT-AA----G-AGC-TTC-CGG--G----GG--------C--A-AC------CAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTGA----GG-----CGGC-CTCCAGAC--------CCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAG-CCCNCCC---C-----CTCCC---C----------C------T-----------------ATCCA-----GT---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---G-TTAC--T-CNCGGG-GT--G-------------------------TTT----TT--TTTA-CACA---TCCTA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TT-GAAATN-A-C-GT-AATGGCAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGT-TAA-TAC-C-ACC---GATCT-CCA-T--GT--T-GAA-TGT-A-GCGA-T-T---GT------T-TCC--AAC-TTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGCTG-T---T---ATGAA-TATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTC-GT-TTG--TATGGA--A-----T-TTATT-GTACAGAG----G----TGAC---A-------TC------GCTGCGCGACT-C-GAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAA
gi|1 : TTGTGTACA--CTAGATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTT-GAT-CTTA-GCCTGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCAGGATCACC--AA-C-GAT--A-C-ACATTAACT-C--TA-G-GCGG-CGG-AGCT-T--A--CC---CGCTAC-A-T--A-AC---TTC-CAGGG---AACTG-TTACTATA-CT-TCCCAGT-CATAAA-AATC--AGGAAAGGCAG--CGA------TTT---GAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATTCA-------AAA----C-------G-------------TTA--A----TAATAAT-GCAG--TG----------------ATAAACAATTCTAAGCTT----AAACATCTATG---TT-AC-A-TTAACA--CG-CCGG-AGTTTTTA-----G--C-AC-ACTT-AGATTGG-C----AAGAATTTAAAGGGA--G-----CGCCCCCCCCCCC---C------C---------CC------------AATAGA--TTT-------C----T------C-------AACTTAA-A-TAAATCATA----AATC-T-----TTTT-GT-TTCGTAAAACAATAG------C---------------A---------------TTA-------A---------------A----------AG-AAG---C--AATTCAT--TCTT-CC-GCTC-T--------ACA-GA---AT--CC---------AATTT-GACAA---GATCT-AAAATT-GACATT-TATT-GTG------TTTTT--AT--TGGGT---A-AT-TCA-TATAATTTTTA--ATT---A-TA--AGAAACTT------AGA--TTTGT-ATG---------TTA--TTTTAATTTATT-----TC-AGT-CAGTTAAAAATGAC-CAA-----AATAGT-AA----ACAGC-TTT-AGG--GTTGGGG--------T--T-AC-------AAGA-CCCACTGGGGCCTTG---A-GGTAGCC-TCCA----TGACTCCCTAC-CTCACGACTCTTCACCCCCCT-CTTCCCTCCCC--TCACTGCCA--AAG-CTTACTTGATC-----CCACC---C----------C------T--------------------CA-----GCTTAA----AAT------GCAT-GC--A-AACTTC--A--------------ACCAGCTACTT-ACTCGTGCCCAATGCCCGT-ATGGTTCAACTCCTAAGCTTACCGT-CCCAGG-TT--G-------------------------TTTATTTTT--TTTAACACAA--TCCTA-----------GTG--CCCACCTTGCACTA-T-TT-GAAATATA-C--T-AATGGCATTCCAATTCACTTTT--A-A----AACA----CA----CT---A-A-ACTAAGAGAGTATAA-TAC-C-ACCACCGAT-T-CCA-TTGAC--T-GAA-TGTTATGCGA-T-T---AT------T-TCC--AAC-TTTTTGATC-A-CCC-CAGACTTT--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GTCGCAA--TCTCACGATCTTAGCAATACTG-T---T---ATGAATTATT-CACTGAAT----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTC-GTCTTG--TATGGA--A-----TCTTATG-GTACAGAGTGA-G----TGACCCAG-------TCTCGTCGGCTGCGCGACTCC-GAC-TGCACACTGCCCCCTCACCTGTACGCAAAA-AG-TTCCATAACAAACTCGAAGACCAGTTT---ACTG-T-AAA
gi|10 : c---A----AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TACTTTGC-CG-GCCCAAT-CCCATTA--------------------C--T-CGCTGG-GTTAA-------------------------TTT----AT--TTCA-C-CA---TCCTA--TGTAGCTA-GTG--CC-A---TACA-TA-T-TT-GAAAT--A-T-GT-AATGAGAT-CCAATACA-TTTC--A-A----A-CA----C------A---A-G-A-------AGT-TAA-TAC-C-ACC---GATCT-CTA-T--GT--T-GAA-TGT-A-GCGA---T---GT------TATCCATAACTTTTT-GA-T-A-CCC-GAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTTG-----CGGT-GCAA--T---------TTAGCAAT-CT--T---T---ATGAA-TATTAGA-TGACA----TTAAAGAC-A-TTA--CAA-ATACCTGTC--TA-GT-TTG---ATGGAGGA-----T-TTATT-GTACAGAG----G-----G------------------------GCGTGACT-CGGAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTTTA--CAATACAA-TTCCAT-ACAAA--CAAAAGACAG--TTAAACTG-TAAAATATAAatta
gi|11 : T-TCCTTTCAT-CT-A-GC-TGTG-------TTTAAATAA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-ACAGAATT-CC--AA-A-CGA--AAC-A-AT-AACTTC--TA-G-G-G--CGG-AGCT-T--A--GC---CG-TAC-AA------C---TTC-CAGG----AACC--T-AATCTA-AC-TTCCAAC-CATAAA-A-TC--AG-AAAAACAAAACAT------TTT--TGAAAACATTT--AT---T----C-AG--TGATG-G-------AAA----C-------A-------------T-A--AAGAACAA--AT-AC-G--C-----------------AAAA-----------CTT----A--------TG---TT-T--AATAAA-----G-C-AT-AGTTT--A-----G--C-ACCACTT-GG------T----AG--ATTTAA--GGA--C-----C-------CCCTC---C------C---------CCT-----------AATA-A--CTT-------T----T------TTAATTTCAA----G-A--AAATCATA----A--C-C-----TTTTTAT-T--------------------T---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-ACTC-T-----T--AGA-TA---AA--TC---------AAT---GTCAA---GATATAA---CT-G---------T-GT-------CTTTT--A---TTGG-----------G-TAT---TTTCAT-
gi|12 : --ATT-----CA-CGT-CA-TTAAAAATGACTCAA----AAATAGT-AAA---G-AGC-TTT-AAG--G----GGGAGGTGTTT--A-AC------CAG---CCCAC--------TG---G-GG---CC-TTGC----AG-----CGGC-C--CAGAC--------CCCCT-A--------C---TCAC----G--AAC-TCCCCCC---C-----CTCCCTTTC----------C------TGAATTCATTG-------ATCCACCCGGGT---A----AATTTTAT-GCAT-GC--A-A---TG--A--------------A---G-TA--T-G---GTACC-AAT-CCCGTTATG-TTCAA-TAC---T-TTCC--TTCTCGTG-GT--GTTTTTTTTGTTTTCTGTTTTTTTTTTTT----TTGCTTTA-CAAA---TCCTA-----------GTGGCTC-A---TGCA-TA-TATT-GAAATT-AACAGT-A-TGACAT-CCAATTCA-TTTTAAA-A----AACATAAGC-----CA---ATA-A-------AGT-TAA-TACAC-TCA---AATCTGCCA-T--GT--T-GA
gi|13 : TT-AG------C----GG--ATTTAAAGGGA--GTGCACC-------CCCTC---CTTCT--C---------CCTG----------AAT-----TTT-------CAAT-T------T-------AA----G-G-TGAATCATG----G--T-G-----TTTT-GG-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------ACAATAGCAGTAA-AAGATAC--AAT-AAT--CCTT-TC-ACTT-T-----T--CGT-GA---AA--T-----------AT---T---------TCT-A---TT-CA--TTGTATT-TT-------TTTTT--TT--TTTTG---G-AT-TGG-TAT-------AA-CTT---AATA--------TTTGTG--ATA--TC----CTA---------TCA--ATCTCA--------------CGT-CA-TTAAAAATGAC-CAA---C-ACTAGTAAA----G-ATT-TTC-CAG--G----GGCCC-----C--ATAC------CAAGACCCCAC--------TG---G-GG--GCC-TTAA----CA-----CTCC-CTTTAAAT--------CCCT------------------C----G--AAC-CCCCCCC---C-----CTC
gi|14 : agaT--G-------------------------TTT----TC--TGTA--AC----TTTTA--T------A-A-------A---T--A-TA-T-TT--AAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTTA--A-A----AACA----C-----TG---A-A-A-------AGT-TAG-TGC-C-ACT---GATCT-CCA-T--GT--T-GAA----------------------------------A--TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTA-T---TT--GTGAA-TATT-CA-TGACA--------AGAC-ATTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTC-GT-TTG--AATGGA--A-----T-TTATT-GCACAGAGGAACG----TGAC---A-----------------TGCA-GTCT-C---------------------------A--CAATA-AA-TTCCAC-ACAAA--TGAAAGAAAG--T---ATTG-A-AAATATAAtt
gi|15 : TTGTGT-CA--C--GATGCGGT-A-G-TTAT-TGCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CCTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGAT-T--A--GC---TG-TAC-TAT--A-AC---TTC-CAGGG---GTCTG-G-ATTATA-AC-TTCGAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------TTT--TTAAG-CATTT--AT---T----C-AG--TGATA-A-------AAATT--T-------T-------------T-A--A-----AA--AT-GCAG--CTTATAAACAGATTAAGTATAA-----------ATTAAGCA--------TG----T-TC-AATTAACA--CG-C-GG-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT-A
gi|16 : atA-TA-T-TT-TAAGCC-A-T--T-AA-GGCAT-CTGATTCA-TTT---A-A----AACA----CA----CG---A-A-A-------AGT-TAG-TGC-C-ACT----ATCT-CCA-T--GT--T-GAA----------------------------------A--TTTT-GA-C-AACCC-CATACTTT--TTA-----TGT-CACGTCAAGTCAC-GT-GCAT--T---------TT-GCAATGCTA-T---TT--GTGAA-TATT-CA-TGACA--------AGAC-ATTTA--T-A-ATA-CTTCCTTTC-GT-TTG--AATGGA--A-----T-TTATT-GCACAGAGGAACG----TGAC---A-------T-------GC------AGT-C-------T-CAC-A-----------------AATA-AA-TTCCAC-ACAAA--TGAAAGAAAG--T---ATTG-A-AAATATAA
gi|17 : aaA-T-TT-GAA-TA-A---GT-AATGACCC-CAAAGTCA-TTTT--T-A----A-CT----C-----TA---A-A----------GT-TAG-TAT---AC----GATCT-CAAAT--GT--T-GAA-TGT-A--CGA-T-G---TT------T-TTC--AAC-TTTG-AA-A-A-CCC-CAA---TCAACTA-----CGT-AAAATCG-----C-GA-GCA---T---------TTAGCAATGCTG-T---T---ATGACTTATT-----------------------TTTA--C-ATATA--------------TTG--TACAGA--A-------------GGGCA------------TGAC---AATCTCCGTC------ACTGCGCTACT-C-GAC-AG--CAC-G-CCC----TCT-TA--AAATA-AATTTCCATAACAA-----AAATATAG--T---ACTGTT-GAATATAAAc
gi|18 : C-AATTAACA--CG-C-CG-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT-AAGTGG--C----AG--ATTTAAAGAGA--G-----C-------CCCCTGCAC------C---------CC------------AATA-A--TTT-------CCAATT------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--TCA-----TTTT-GT-T--------------------C---------------ATAAAAAAATAGCGA-T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----T--AGA-GA---AA--AC---------AAT---GACAA---GATAT-A---TT-GA--TT-TATT-GT-------CTTTT--AT--TGGGT---A-AT-TCG-TA----TTTCATATTT---AATA--AGAAACTT--TA--AGA--T
gi|19 : GTGT-CAAAT--GGCGTGGC-AAC-CTTT-CCCTTT------TA----TG-A----------AAATCA-GAGCAGAAA---T-AGTT--G-GCAGAATT-TA--AA-A-CGT--A-C-A-AT-A-CTTC--TA-G-G-GGGTGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AATCAA-ACCTTTTC-CAGGG---AACTGTT-ACTATACACATTTTAAC-AAAAAACA-T---AG-AAAGG-AA--CAAAATATTTTT--TGTAA-CA-TT--AT---T----CAAG--TGATA-A-------AGA-------------------------------------AA--GT-GCAG--T-----------------ATA
gi|2 : tgTGCG-C-A-C-TTCTATTTTCTGGTGCTTAAGCATGTAACGTATCTTTAAATCA-GA-CTGGTA-A-CGGGTTGCG-GCAGAATTGCCCGAA-CACGTAAA-C-A-AT-AACTTTTGTA-G-G-GG-CGG-GGTTGT--AT-GCTTATT-TAC-AAT--ATAC---TTC-CAGGG---caaacaaa
gi|2 : AAA-A-TCGCAG-AAAGGCAA--CGA------TTTGATGAAACCATTCTAATGCGT----C-AGGCCGATG-A-------AAA----C-------A-------------C-AGGA----GAA--ATGGCAG--C-----------------CTAA-----------TCT----A--------ggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctaaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|2 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaag-------AAA----C-------AG------------T-A--A----GAA--CT-GTAGAGC-----------------ATAA-----------CAT----A--------TG---TTGTCTAATTAACAACCG-C-ATTAGTTA--ACGTCCGTCC-AC-ACTTTCA------C----GT--ACCT---TGGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------CCCCGCCCCCCCTAAGTA-A--TTTGCAAAAAT----T------G-------AA----G-AATCAATCATACATTA--T-T-----TTTC-GT-CATGAATGCACAAATGGCGAGC---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAA-CAT--TCTT-CC-GCTC-T-----TTTAGA-AT---AA--TT---------CATATTGACAA---GATCT---------------CATT-GTT------CTTTT--AC--TTTGGCTTA-AC-TCGGTAT---TTCAAT-ATT---A-TAGCAAAAAGTTTTTATTAGA--TTTTGTGTGATTCTCATATTA--ATTTTCT--AAT-----CGTCGT-TA-TAAAAAATGAC-CAAACGTAGATAGA-AA----G-AGCTTTT-CGGATA----GG--------C--A-ATCTAACGCAAGA-ACCAC--------TGTATGTGC--GCCTTTGAG---GG-----CGACGATCCAGA---------CCCCT-A--------TCCATCAC----GAAAAG-ACCTTCT---G-----ATCCC---G----------C--------------------------CCA----------A----AAT------GCATGGC--A-T---TGAAA--------------A---G-TAGTT------TACTAAGT-ACCG-CATG-CTCA----------TTAC--T--TCG-------------------------------------------------CACAGTTTCCGGCTT------A-GTGT-CC-A---TGTA-TAGT-TT-GAAATA-A-C-GT-------------ATTCT-TTCT--A-A----AAC-----T-----TA---A-A-A-------AGT-TAA-TAC-T-A------------CA-T--GTACC-G-A-TGT-T-GCGATT-T---AT------C-TCC--AAC-T-------------------CCTC--CTA-----CAT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--T---------TTAGCAATGC---------------A-TATT-CA-TGACA----C-------------------ATA-CTGTCTTTC-GT-TTG--AATGG-------------------------------------------------TC------GCTACGCGACT-C-GAC-TGC-CAC-TCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCCAT-ACAAA--CAAaacagtaagaactgtagagcataacatatgttgtctaattaacaaccgcattagttaacgtccgtccacactttcacgtaccttggagccccccccccccgccccccctaagtaatttgcaaaaattgaagaatcaatcatacattatttttcgtcatgaatgcacaaatggcgagcataaaagaagcaaacattcttccgctcttttagaataattcatattgacaagatctcattgttcttttactttggcttaactcggtatttcaatattatagcaaaaagtttttattagattttgtgtgattctcatattaattttctaatcgtcgttataaaaaatgaccaaacgtagatagaaagagcttttcggataggcaatctaacgcaagaaccactgtatgtgcgcctttgagggcgacgatccagacccctatccatcacgaaaagaccttctgatcccgcccaaaatgcatggcattgaaaagtagtttactaagtaccgcatgctcattacttcgcacagtttccggcttagtgtccatgtatagtttgaaataacgtattctttctaaaacttaaaaagttaatactacatgtaccgatgttgcgatttatctccaactcctcctacatcacgtcgcgtgcaatttagcaatgcatattcatgacacatactgtctttcgtttgaatggtcgctacgcgactcgactgccactcccctctgtacaataaattccatacaaacaa
gi|20 : tgcgcacttctattttctggtgcttaagcatgtaacgtatctttaaatcagactggtaacgggttgcggcagaattgcccgaacacgtaaacaataacttttgtaggggcggggttgtatgcttatttacaatatacttccagggggaaaaacaaaccgcggtgtcccccccccccggtttttttgggttttttttatgccccgccccaaggcatcaagaaaatcgcagaaaggcaacgatttgatgaaaccattctaatgcgtcaggccgatgaaaacacaggagaaatggcagcctaatctACTTC--TA-G-G-GGGCGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CATGG---AACCG-T-ACTATA-A---------------A-A-TC--AG-AAAGGCAA--CGA------T-----GAAA-CATTT--AT---T----C-AA--TGATA-A-------AAA----TGCAACTTA-------------T-A--AA---CAA--AT-TAAG--C-----------------AAAA-----------GTT----A--------TG---TA-TC-AATTAACA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-AC-AC---------------------TTTAA----A--G-----C-------CCCCC---CCCCCTTC---------CC------------AATA-A--TTTTTAA---T----T------T-------AA----G-A-TAAATCAT
gi|21 : g---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---CGGAAA-CATGGTCTT-CCAGCTC-T-----T--AGA-GA---GAATTC---------AAT---GACAAATGGATCT-A---TTGGA--TC-TATT-GTTTAAAAACTTTT--AC--TT
gi|22 : atcatacatatttttgtctcataattacaaaggggtggcgaA-T-T---GT------T-TCC--AAC-TTTT-GA-C-A-CCC-CAGATTTC--CTATGTCACGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTG-T---T---ATGAA-TATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTC-GT-TTG--TATAGA--A-----T-T-----------------------GA----A-------T-------GCTGCGCAACT-C-GAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-AA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-C-AAATATAAaaaggctaggacttccaatagcttgcattttttatccacaaaccaaaaaaaacactttaagatttggattatttca
gi|23 : TGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCA-AATT-CC-------------------C-AACTTC--TA-G-G-GG-CGG-AGTT-T--A--GC---T----------------------------------G-T-ACTATA-AC-TTCCAGC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGTAA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATC-A-------AAA----C-------T-------------T-A--A----TAA--AT-GCAG--C-----------------GTAc
gi|24 : --AAC-TTTT-GA-C-A-ACAGCTGGCTTA--TGA-----CGC-TATATCA-----C-GT-GCAA--T---------TTTGCAATGATG-TTAAT---ATGAA-TATC-CA-TGGCATAGTT--AAGGC-ATTTA--C-AGATATCTGtaaaaaacttaa
gi|24 : aAC-TGC-AAC-TCCCT----TCTGTA--TAATA-AA-CCCAAT-ACAAA--AGAAACAAAG--T---ACTA-T---ATATAAatacctttttttcactgcaactcccttctgtataataaacccaatacaaaagaaacaaagtactatatataa
gi|25 : aaacttttgacaacagctggcttatgacgctatatcacgtgcaattttgcaatgatgttaatatgaatatccatggcatagttaaggcatttacagatatctgatacctttttttcC---C------C---------CT------------AA-A-A--TTT------------T------C-------AAAT--G-G-TAGATTATG----A--T-C-----TTTT-GTAT--------------------C---------------AAAAA-----------T-AGAATGATA---------------A----------AA-AAG---C--AAT-CAT--TTTT-CC-ACTA-TCAGCAC--AGA-GA---AA--T-----------AT---TAC-------T-------TT-GA--TA-CATT-GTTA-----CTTTT--AT--T
gi|26 : gatttaaggtggatgcatctgtaggca----T------T-------AG----A-A-TAAATCATG----G--T-C-----CCTT-GT-T--------------------T---------------AAAAAAAATAACGA--T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-AAT--TTTT-CC-ACTT-T-----T--AGA-GA---AA--GA---------AAT-----CAA---GATAT-----TT-TA--TT-TGTT-Gagaaga
gi|27 : tcatatCATTGAGT-CA--T--GGTGCTGC-A-C-TT---------AAT-C--A-GC-AATG------CTTTAAATCA-GA-CGGAAA-A-T-GGTT--A-ACAGAATT-CT--AA-C-T-T--A-CAA-AA-AACTTC--TA-GAG-GA-CGG-AGCT-TTCAGTGC---TG-TAC-ATT--A-AT---TTC-TAGGG---AAACG-T-ATTAggggaacttgtactctatccaaaaaataatctgaattaaaatttgcg
gi|28 : tg-----C-------CCCCC---C------C---------CC------------CATT-T--TTT-------C----TCCAAATT-------AA----A-AGTAAATCATG----A--T-A-----TTTT-GT-T--------------------C---------------AG--------------T-A-------A---------------A----------AG-AAT---T--AGA-TA---------C-ACGA-T-----A--AAA-GAAGCAA--TCGTTGATTTAAAT---AATAA---GATTT-----TT-GA--TA-TATTGGTA------CTTTT--AT--ggcctat
gi|29 : atgtaaatatacTTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTCTGAT-CTTA-GC-TGTG------CTTTAAATGA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AA-T-CGT--A-C-A-AT-AACTTT--TA-G-G-GA-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---T
gi|3 : atCATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CCTA-GC-TGTA------CTTTAAA--------------A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CGT--A-C-A-AC-AAGTTC--TA-G-G-AG-CAG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AACCG-T-ACTATA-AC-TTCCAAC-CATAAA-A-TC--AG-AAAGGCGA--CGA------TTA--CGAAA-CATTC--AT---T----C-TG--TAGTG-A-------AAA----C-------A-------------C-A--A----GAT--AT-GCAG--C-----------------ATAA-----------CTT----A--------TG---TT-TC-AATTAAAA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-AC-AC----------------------TTAAAGGGA--------C-------CCCCT---C------C---------CC------------AATA-A--TTT------------T------T-------AA----G-A-TAAATCATA----A--T-A-----TTTT-AT-T--------------------C---------------A---------------T-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-AAT--TATT-CC-AATC-T-----T--AGA-GA---AG--T
gi|3 : tGC-TTC-CGG--G----AT--------CCAACAC------CAAGA-CCCAC--------TG---A-GA--ACC-TTGACCTAGG-----CGGC-CTCCATAC--------CCCTT-A--------CC--TCAC----G--AAG-CTCACCC---C-----CTCCC---C----------C------T------------------TCCA-----GT---A----AAT------GCAT-AC--A-A---TG--A--------------A---G-TATTT-AC-TGTGCTCAAT-CCCAT-ATG-TCCAA-TCC---G-TTAC--T-CGCAGG-G---G-------------------------CTT----TT--TTTA-CACA---TCCCA--T------A-GTG--CC-A---TGCA-TA-T-TT-GGAATT-A-C-GT-AATGACAT-CCAATTCA-TTTT--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGT-TAAATAA-G-TCC---TACCT-CCA-T--GT--T-GAA-TGT-A-GAGA-T-T---GT------T-TCC--GAC-TTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----C-GT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTA-T---T---ATGAA-TATT-CA-TGACA----C--AAGACAATTTA--C-A-ATA-CTGTCTTTC-GT-TTA--AATTGA--A-----T-TTATT-GTACAGAGGGGCG----TGAC---AGTCTCG-TC------GCTGCGCTACT-C-GAC-TGT-CAC-GCCCC----TTTGTA--CAATG-AA-TTCTAT-ACAAA--CAAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcttccgggatccaacaccaagacccactgagaaccttgacctaggcggcctccataccccttacctcacgaagctcaccccctcccccttccagtaaatgcatacaatgaagtatttactgtgctcaatcccatatgtccaatccgttactcgcaggggctttttttacacatcccatagtgccatgcatatttggaattacgtaatgacatccaattcattttaaaacaccaaaaagttaaataagtcctacctccatgttgaatgtagagattgtttccgacttttgacaccccagacttcctacgtcacgtcgcgtgcaacttagcaatgctattatgaatattcatgacacaagacaatttacaatactgtctttcgtttaaattgaatttattgtacagaggggcgtgacagtctcgtcgctgcgctactcgactgtcacgcccctttgtacaatgaattctatacaaacaaaagacagtactgtaaatataaa
gi|30 : tcattgtgtcatgatgcggcactttttcctttgatcctagctgtactttaaaacggttggcagaattccaatcgtacaacaagttctaggagcagagcttagctgtacaataacttccagggaaccgtactataacttccaaccataaaatcagaaaggcgacgattacgaaacattcattctgtagtgaaaacacaagatatgcagcataacttatgtttcaattaaaacgcatagtttagcacacttaaagggaccccctccccaataatttttaagataaatcataatattttattcataaaagaagcaataattattccaatcttagagaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTCGGC-A-C-TTTT-CCCTTTGAT--TTA-A--TGTA------ATTTGA
gi|30 : atCT-C-GACGTGT-CAT-TGCAT----TC-GTA--CAACA-GA-TTCCAT-ACAAA--CGAAGGACAG--T----CTG-C-TAATATAcggttattctttgatccacgttctcgacgtgtcattgcattcgtacaacagattccatacaaacgaaggacagtctgctaatata
gi|31 : atattcggcacttttccctttgatttaatgtaatttgacggttattctttgatccacgttTTGTGT-TA--T--GGTATGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-TC-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAAAAA-A-T-GCTT--G-GC-------TC--AG-C-TGT--A-C-A-AT-AACTTC--CA-G-G-G
gi|32 : c-T---T---ACGAA-TGTT-AA-TGACA--------AGTC-GTTCAAAC-ATATA-CTTTCTTTC-GT-TTA--TGTGGA--A-----T-TAAGT-TCACAGAGGGGCG----TGAC---AGTC----TC------GCTG
gi|33 : cca-CTTA-GC-TATA------TTTTAAATCG-GA-CATTAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-T-CGT--A-C-T-AT-AACTTC--TAGG-G-GG-CGG-AACT-T------------------------AC---TTC-CAGGG---AAC
gi|34 : -CCAATTCA-TTTT--C-A----GACT----T-----TATACA-A-A-------AGT-CAA-TGC-C-AGT---GATCC-CCG-T--GT--C-GAA-TGT-A-GTGA-T-TGTCGT------T-CCC--AAT-T
gi|35 : agTGTGT-CAA-T--GATGTGCA-A-C-TTTT-TC-TTTGAT-CTTA-GC-TGTG------CTTTAAATCAGGA-CAGAAACA-C-GGTTG-G-GCAGACTT-TC--ataaa
gi|36 : cTGTGT-CA--T--GATGCAGC-A-C-TTTT-TCATTTGAT-CTTA-GC-TGTA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GTAGAATT-Ccca
gi|37 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGC-A-C-TTTT-TCCTTTGAT-CTTA-GC-TGT-------------------A-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-
gi|38 : aTTGTGTTCA--T--GATGCGGTTA-C-TTTTTTCCTTTGAT-CTTA-GC-T-TA------A-TTAATTCA-GA-
gi|39 : TTGTGT-CG--T--GGTGCGGT-A-C-ATTT-CCCTTCGAT-CTTA-GG-CATA------CTTTA
gi|4 : taaagA-CATGT--AT---T----C-AG--TGATC-A-------AAA----C-------T-------------T-A--A----AAG--AT-GCAG--CGTCTAAAGAAAATAACCATAA-----------CAT----A--------TG---TT--C-AATTAACA--CA-C-CG-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT-AA------TTGGAAG--ATTTAAAGGGA--A-----C-------CCCCC---C------CG--------CCTCTT--------ACTA-T--TTT-------CCAATT------T-------AA------A-TAAATCATA----A--T-CCTTGTTTTT-GT-T--------------------C---------------AA--------------T-A-------AGAACCAATAGCGATGA----------AG-AAG---CTTCAT-AAT--TCTT-CC-GCTCGT-----T--AGATGA---AA--GC---------AAT---GACAAA--GATCT-A---TT-GA--TC-TATT-GTGT-----CTTTTGAAT--T--GC---T-AT-TCG-TAA---TTTCAT-ATTGTTAATA--AGAAACTTTG-A--AGAATCT----GTG---------TTA---TTTCATTAATTTTTAACG-CGTACA---AAAAATGAC-CAA---TTAATAGT-AACCACG--GC-TTC-GGGT-G----GG--------G--G-AC------GAAGA-CCAA---------TG---T-GG--GCC-TTGA----G------CGGA-CTCCAGAC--------CCCCTTA--------CCG-TCAC----G------CCCACCT---CGACATTTCAA---CATTCATTGATC------T-----------------ACCCAA----GT---AC---AAT------GCAT-GC--A-A---TG--A------------------G-TACTT-AC-CATGACCAAT-CCCGTTATG-TTCAG-TCC---G-TTAC--T-CTCAGGTGG--G-------------------------TTT----TT--TCTA-CAC----TACTC--T------A-GTG--CA-A---TGCA-TA-T-TTTGAAATA-A-C-GT-GAAGG-AT-CCAATT-A-TTTT--A-ACCACAAAA----C-----TA---A-AGA-------AGT-TAA-TAC---ACC---GATCT-CCAAT--GT--TTGAA-TGC-T-GCGT-TAT---GT------T-TC---AAC-TTTT-GA-CCA-CCC-CAGACTTC---TA-----CGTGCACGT-G-----C-AT-GCGACCT---------TTATCAATGCTC-T---TCCTACG------T-CA-CGTCG----C--ATGCA-ACTTAG-C-A-ATG-CTGT---TC-----------TGAAC-A-----T-TTAT--G-ACATAA----GACATTTAC---A-------AT------GCTGCTCGACT-C-GAC-TGC-CAC-GCCCC----TCTGTA--CCAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T-AAATATAA
gi|40 : -TTTT-TCCTT-GAT-CTTA-GCCTGTG------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--GAGCA
gi|5 : TTGTTT-CA--T--TGTACGAT-A-C-ATTT-TCCTTTGAT-TTTA-GC-TGTA------CTTAAAATCA-GA-CAGAAA-A-T-GCTA--G-GCAGAATT-CT--AA-C-CGT--A-C-A-AT-ATGTAC--TA-T-G-TG-CGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGGTAAAAC-----ACTATA-AC-TTCCAA--CACAAA-A-TC--AG-AAAGGGGA--CGC------TTT--TGTAA-CACTT--AT---TTACCC-AG--TGATG-A-------AAA----C-------A-------------T-A--A----CAA--AT-ACAGA-CTATAA------------ACAA-----------CGT----A--------TG----T-TC-AAATAACA--TG-C-AT-ATTTT--A-----G--C-AC-ACTT-AA------C----AG--ATTAAGAGGGATTG-----C-------CCACCAT-C------C---------AC------------AAT-----TTT-------CAA--T------T-------AA----G-A-T-AATCATA----A----A-----TATT-GT-T--------------------CCTGT-----------A---------------T-A-------ACTGGCGATAT-----A----------AG-AAG---A--AAT-AAT--TCTT-CC-A--T-T-----T--AAA-GA---AA--GC---------AATG--GACAA---GATCT-A---TT-GA--AT-TATT-TT-------CTTGT--AT--TTGGG---A-AA-TCG-TAT---TTTCAT-TTTG--AAAA--AAAAACCATGTA--AGA--TT----GTA---------TTA--ATTTGAT--ATT-----CG-CGT-CA-TT-AAAATA---CAC---TAAATAGT-AA----G-AGT-TTCATGG--G----GG--------C--A-AC------CAACA-CCCATG-------GG---G-GG--GTC-TTGA----GG-----CTG--CTCCAGA---------GCCCT-A--------CC--TCAC----G--AAGATCCGTCT---T-----CAACT---C----------A------TTG---------------ATCCG-----CC---A----TAT------ACAT-GCTAA-A---TG--A--------------C---G-TACT
gi|6 : ATTGTGT-CA--T--GATGCGGT-A-CTTTTT-TCCCTTGAT-CTTA-GC--GTA------CTTTAAATCA--A-CAGAAA-AGC-GGTT--G-GCAGATTC-CC--AATC-CGT--A-C-A-A--AACTTC--TA-G-G-GG-CGGCAG-T-T--A--GC---TG-TACTTAT--A-AC---TTCTCAGGG---AACTG-T-ACTATA-AC-TTCCAGCACCTAAA-A-TC--AG-ATAGGCAA--CGA------TTT--TG-AA-CATTT--A----T----C-AG--TGATA-A-------AAACTTTC-------AAAATGCAGTGAGTT-A--A----CAA--AT-TAAG--C-----------------ATAA-----------ATT----A---------GCATTT-TC-AATTAACA--CGAC-GG-AGTTT--A-----G--CAAC-ACTT-AATTCAGGC----AG--A-TTAAAGGGA--G-----T-------CCCCC---C------CCCCCCCCCACC------------AATA-ATCTTT-------CCAATT------T-------AA----GAA-TAAATCATA----A--TCC-----TTTT-GT-T--------------------CGTAAAAAATTAGCGGA---------------T-A-------A---------------A----------AGTATG---C--AAT-CAT--TCTTCCC-GCTC-A-----A--AGA-GA---AAT-TC---------AAT---GACAA---GGTCT-A----T-GA--TT-TATT-GT--------TTTT--A---TTGGGAGCA-AT-TCC-GAT---TTTCAT-TTT---AATA--AGAAACTTTAAA--AGA--TTAA--GTG---------TTATCGTTTAAT--TTT-----
gi|7 : AGAC--------CCACT-A--------CC--TCAC----G--A----CCTCCC---C-----CCCCC---C----------C------TCAACTTCACATTCATTGATCCACCCGAGT---A----AATATTTATGCAT-GC--AGA---TG--A--------------A---G-TACTT-AC-CGTGCCCAAT-CCCGTTATG-TTCAA-TCC---T-TTAC--T-CTTGGG--T--G-------------------------TTT----TTGTTTTA-CAAA---TCCT------------GTG--CC-A---TGCA-TA-T-T--GAAAAT-A-C-GTTAAAGGCAT-CCAAT-CA-TTTT--AGA----AACA----CTAAGCCA---A-A-A-------AGT-TA--TAC-CCACAA--GATCT-CCA-T--GT--T-GAACTGT-T-GCGA-T-T---GT------T-TCT--AAC-TTTT-GA-C-A-CCC-CAGACTTC--CTA-----CGT-CACGTCG-----A-AT-GCAA--C---------TTAGCAATGCTGTT---T---ATGAA-TATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-GTA-CTGTCTTTTGGT-TTGTTTATGGG--AAAATTT-TTATTGGTACAGAGGGGCG----TGGC---AGTCGAG-TC------GCCTCGCGACT-C-GAC-TGC-CAC-GCCCC-----CTGTAC-CAAAA-CA-TTCCAT-ACAAA--CGAAAGACAG--T---ACTG-T--AATATAa
gi|8 : a------CAAGA-CCCAC--------TG---G-GG--ACC-TTGA----GG-----CAGC-CTCCAGAT--------CCCCT-A--------CC--ATAT----G--AAG-CTCCCCC---C-----CCCCC---C----------CACCTCTT-----------------CTTCA-----AT---TCCTTGAT------GCAT-GC--A-A---TG--ATTCTCAGTTGCAAAA---G-TACTT-AC-TGTGCCCAAT-ACCATTATG-CCCAA-TCA---G-TTAC--T-CA---------G-------------------------TTT----TA--TT----ACA---TCCTAG-T------ATGTA--CT-A---TGCA-TA-T-TT-GAGATA-A-C-GT-AACGGCAT-CCAATTCA-TTTC--A-A----AACA----C-----CA---A-A-A-------AGT-TAA-TGC-C-ATT---GATAT-CCA-T--GA--T-GGA-TGT-A-GCGA-T-TTTAGTTCCTACT-TCCA-AAT-TTTT-TA-CAA-CCC-CAGACTCC--CTA-----CAT-CACGTCA-----C-GT-CCAA--A---------TATGCAATGTTA-T---T---ATGAA-TATT-CA-TGACA----C--AAGAC-ATTTA--C-A-GTA-CTTTCTTTT-GT-TCA--AATGTA--A-----T-TTATT-G-------------------------------TC------ACTGTGCGACT-A-AAC-TGC-CAT-GCCCC----TCTGTA--CAATA-AA-TTCTAT-ACAAA--CGAAAGAAAG--T---ACTG-T-AAATAT
gi|9 : -TATA------CTTTAAATCA-GA-CAGAAA-A-C-GGTT--G-GCAGAATT-CC--AA-C-CGT--A-C-A-AT-AACTTC--TA-G-G-GG-TGG-AGCT-T--A--GC---TG-TAC-AAT--A-AC---TTC-CAGGG---AAACG-T-ACTATA-AC-TTCCCAC-CATACA-A-TC--AG-AAAGGCGA--CGA------TTT--TGAAA-CATTT--AT---T----C-AG--TGATG-AACAAAAGAAA----T-------ACAGCTTAT-----C-A--A----CAA--AT-TAAG--C-----------------AT-A-----------CTT----A--------TG---TC-TC-AATTAACA--CG-C-AT-AGTTT--A-----G--C-AC-ACTT-CG------C----AG--ATTTAAAGAGA--G-----C-------CCCCC---C------C---------T---------------------TTT-----------------------------------A-T-AATCATA----A--TAT-----TTTT-GT-T--------------------C---------------ATAAAACAAATAGCGAT-A-------A---------------A----------AG-AAG---C--AAT-CAT--TCTT-CC-ACTC-T-----T--AGA-GA---AA--TC---------AAT---GACAA---GATCT-A---TT-GG--TT-AATT-GT-------TTTTT--TTTATTGGG---AGATCTCG-TA----TTTCAT-TTT---TATA--AGAAACTTT-TA--AGAT-TT----GTG---------TTA--
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): ATGACGTCATTTTATGGAGGAATCCATGATAAGTA