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Reference ( gi|1 ) : TGCCCCACTGTGAACGAGATATTGC-ATCTGCGA---TG--GAATTGTCCTTAGTGGGGATATAAGAGGCATTAATGCTGATATTA-GACCTGAGACAAGCTAAC---ACAAGTTTACG-ATGAGATTCATGAC----C-CTAA-GATTTGGATGTGAATTTATTGATGACATGAATAACTGCCATGTTGTCAATGAGAAACAAAA---GCTTGCAATTTGTGAAATGACTT-TG-----CCATAGTGATAAAGAGGCGAC---CACTGGAAAGAGTTC-AAGGAAGACAATGTCCTTAATGACAC----CCTCCT-TAAACCAAAATTTTGGC--AAGGACCC---AT----AA---GCCCAAAT-TCCGTTGAAATAGATGCCGAACCCTCCCTTTTCA-CCCCCTGCAC---TGTCGGTG---AATAAT-----T-GA--A---CCGTTTCATTATG-TAACCA-TGGTTGTAAAGAAATTACGGAT---ATGCCATTATAGGATTTT--AGAA--ATTCTAGCCAGGTAACA-----AGGTCGGCTTTGATATTTT--TTGTT-AGCCTAATTTTGTAATGAGGTTTGGTAA-TGCCAATTGTTGCATT--GATGAGGCGCCGGCAA-AAGGCT-CTGCCAGGGG-AAATGACCCTATATACGAAGTTCAATAGGCCAA-TGATGGATTGCAT-----TTA---GGAAGT----CTTTTGACTTTTAAAAAA---------A--ATTGTATTG--TA-AGGTGA----AGCAGGTCCAACTT---GTC-TGAG----------GG--GAGCTTCATGGTCAT--G-TTGATGG-AG--TCAAATTCAATGCCCAAGA---A---------A-------------------------G----------------------TT--T-TG----------------T---CCTGC-G-C-GAT-GGGGACGCCTATGTCCCCGCAGATG---GATT---TG---AAAAC-C-TCTAAG-GTAT-G-ATA--ACA-AGT-T-TGA---GA---ATTTG-GT--TGTCCGCAGAA-AAGGAAA-TCATCTAAGTAATGAATGATAAAACGGTT-------T-----------A-T---T-T-T---TC-T--G---T-G--C---CCA-GTGTAAGAAT-AC--AGC-GA--AGCAAA-TTGT--T--C--A-A--ATAA--T--A-C-A-----GC-TGATT-TGAGG-AA----C-CA-AA--AG--AA--CA-TTTTAT-CG--AAGTA-AA--AT--TT--TTGT-----TGAAA-T---TGGAA-G--CC--AAG-TA-ATTCAAAATC------G----CT----TGGC-----G----C--GA--CAGGAA-G-TAAT---------CGG--AATGCCGATTTGA-TATCA-G-CTTT-TGCCAGG-AAA----GCC---------GCAC------------TAGCTATCATTCCAGCT---GCTTGATCTATGCT------ACTATA-ATGTA-CTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGATG-CGAGAG-GTGGTGAATGAGTCG-CAT-CTGT--CCATCTTTCTTGGGCACTAGGCCT--AGTTG--AGA---G-ACTTGAAGA--T-TA-GGAAAAGG-TGGGGAG---T-C-G-AAAGG---GCCT-GCCACC--CGTCAGAGCATTAACTCCTT---CTGAATT-TTG-CTTTTTGC-TATTTGAGAACTAGTCTT-TACACTGG-ATTAAT-TATCAAA------CGAGGAAG--TC--GGG--CCA--------TAT-TATTAGCT-T---AAAAC-CGTTAGAAAAA---CCCTGCCG-A-T-AA----AGTA--CCCCTGATA--CCC--TGAGGTGTTTGGTTAGTTGCTG---CAAA-TAATTGGTGT---------TACACCAAAG--A-A-AATAGAG-AC---C-CCTTATTT-T--GAA-AT----CTGGT--CT--GGGTGA---TG------TCTC-ACATTT--GC-----TGC-ATGC-TGCTTGTACTTGCACCTTGGGGAAAA-A--TTACAA--------CT--T--TG-T-TATAAA--AA--CGAC--AATACA------TA---TTAGCGTGATG-ACTGGC-TTAA--TTG-C-T-GAATG----TATAA-TTA-GAGC--GCT-GATTTG-ACT-GTGTGTT-CTTTTGT--GGCTGCGCTTGGTTTG----AAACA-T-ACAGTA-GCC--AAAATTCCT--GATTG-A-TCTGA--C-CCCAAGAT-GCTAGTG--AGTG-ACTAGATATCCTCAGCCT---AAATT-TTTCAT-CAT-ACTTAGGCCAGAAATTAG--ACTTAGTAGCT-GCAATTCGAATGTCC-CTTAAA-TACTTAAGCAGTTCTTGGGCTTTACCTGGAAAT-TTTTCGATCATGA-CACTGATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTA--TCAATGCT-AAGAATTGGATTGGGTTT-GGATTT--TGCAATACACATTGACAAA-CGGCCCTC---CATA-ATTCGAATGTCTCCCA-----CA-----GA-CTCTTG---GTCCTG-----------GATTTCGCATGCCGACTTGGTCATGATCAGCAACGACAAATCAATAAATTGGCCTTCCCATATTTTTTGTTTTGATTGATAGGGGAACGTTG-GATCCC---------AAGGAG-------------TCG---TAACAACTTATTTGCTGATAAGAGTGAGACGCAATAACATTAACAAAATCACCCCTTCCAAACTCGACTCAGACATCCGAGGAACC-GTTGGTTCCCT--CGTAGATTCTG-CTGCCGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGCGCGGTGACAATTCTGGGGTCCTGTTGGAATTAGATGGCTGTTGGTTAAGGGTATTTTGGC-----TACA-----CTGCTTAGGTC-GGCCTTT--CCCTCGACTTGGG-ATGCTCATCGTCTGTAAACGA-CGCCGAGATGCCCTGGAATTTGTTTTGGTTCGTACAGGTGGCATTTTTGGCCTCCGAT--G-GTGTCGATTGCAATGGATTGTTTATGGTCGAAAAAACAGTC---GT-CTGGCTT-GTAA-CCGAG-A-TGGCTTGGA--AAAGGATGATGC---TAAA-T-----CGTTCTA-GGTGAGGTTTATTTTTATAGTACAATCGTACCATGGCTAACTCGT-TTTACGAAAAG--TT-AGATTGGGACAA-ACTAA-ACAAGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATAAAGCTGGAC-TATTTGTTA-TAAAATCAGA--TAATTTTTAT
gi|19 : TGGCCCACTGTAAATGA--TATCTA-AT--ACGA---TG--GAATTGGTTTGAGTAGGAATGTGTGAAACCCTAATGAGTATATTGTGACGTATG----GCTAATAGAATAAGTTT
gi|5 : aaactggtctgcatcttgtgccaactgtcaatatcCCACTGTGAACGAGA-AATGCAATCTGCAATTTTGTTGAG-TGTC----GTGGGAATGTATTGTGCTTTAACAGTGATGTTG-TACTTGAGAGTAATCAAA---ACAATCTTGCGAACAAGCTGCATTACATGTT-TT---GATTTTGATGTCGAGTTATTGAGTATGTGCACGACTGTCATATTGTCTATGTGGATTAAAATTCGCTT---ATCTGCTAAG-GATTTGGG-----CCATAAGCACA---AGGCAACATACACGGGGATCAACTCTAAGAAAGTC-ATGTCCCTAATGATATGGGACCTCGTCCAGGCCAA-----TGGC-----CACCTTGAAT----AG---GCCCAGCTACCCG-CAAAGTAGATGCCAAAGCC-CCAAGTGGG-CCCCCTGCAC---TGTCTGTG---ACAAGT-----TAGAG-A---C--TTGTATC-TGCTACCCAGCAGTTAT-TTGAAATGACTGTA---ACCCCATTATAGTCTTCG--AGAA--ATGATAACC-----ACACCTGTAGGTCGGCCTTGAT-CTCC--ATGTTGACCCTGACTTTGTtctaacaacacgcattactcttggggat
gi|20 : tttgcgagttatttcccccactcgcaggaggccgaaataagctaaacagaaagcagatttgaaaagtttcatttcgtagtgggatgacgagatatgagggagtgcgtggaccaccttttgcaggatatggatggtaatgggacgacgggtatcaggttttttgccgtgagtgcgtttaaggccttggattgatttaaatacatgtactaggattgacttggttggatctggcaatagtcgtattttgtggaagtacgacagggcttgcacataacgctgaatagtgttggttgagagattttgaattgacagatatgctataaaatgtagtgtggtttttgttggtatggccaagagttaggcagcttgtaagcaagcagaaatcctggtatctgcggacagacatgtatgctttagttttgtagatatcgcagcattaataagacgggctgatcggattctagatcctccaaatgtggcttggtagaggcataggtttgcggtctgctgagggggccaggtggtgaaatttggtCCACTGTGAACGAGATTTTGg
gi|2 : gtggtgaaatttggtCATGAC----TGCTGGTGATTTGGATGTTGATGAGTTAAGTATCTGAACCACTGCCATATTGTCAATGTGAAACAGGA----TTCGCA---TGTTCAA-GAGTC-TGTCTCACCACAATG--AAAG-TGCTACATACACTGGGAAAAGTTC-CAAAAATGTCATGCCTCTGACCACCC----CCTGCT-GGACCCA-------GGCCTGAGG--CC---ATCTCGAATGTGCCCAGCT-GCCCGCGAAATAGATACCAAATCC-CCCTTTTGATCCCCCTGCGC---TATCTGTA---AAGAATTGCAGT-GA--A-----GTGTCA-GAGG-T--CCA-CAG--ACCAAG-AGTTATAAGTGTAATGCCATTAAA--ATCTTGCAGGA--ACTGTTGCCAGACATGA-----AGGTCAGATTTCATGTCTT--GTGTG-ATTCTGACCATGTGATGTTGTTTTTTGA-TGCCGACTGTTGCATC--GATCAATCGCGTGCAA-AATGCA-CGACCAGGGG-CAACAGTTTTGCACGCAAAGTTCAGTAAGCCAA-TGAGTGATTGCATGTC--TTT---GAGAGTTAC-CTTTT---TCCTAAGAAGAAAGAAGTCA--ATTGT-TTGTTTT-AGATTA----------TCTAGCTT---ATC-TTGG----------GG--GAGACGCATAACCAT--G-TTAATCG-TG--TAAAATTCAATGCCCCAAA---A---------GGTGATGACAGTGTTGGGTTCAGT--G----------------------TT--T-TT----------------T---TCTACGG-C-TAG-TGGTACACCTATTTTTT----GACA---AATT---TGCTTAAAAA-T-TGTAAGTGTGG-A-ATG--ACATTGT-TGTGA---G------TTG-CCCATGCCAGC-GAA-AAGGAAA-TCATCT-AGTAATGCAGAATATAAGGATTGCGA---G-----------A-T---T-GAT---TT-T--GAA-T-A--A---TCC-GTGTAGG---------GCTGT--AGCAAA-CTTT--TCCC--A-C--GTTG--C--A-C-A-----GC-TTA-T-TGATG-CT----C-CA-AAT-GG--CATTCA-TCTTGT-CA--AAATA-TA------TT--TTGA-----TTAAA-T---T-GAA-T--CC---AG-TA-GTCAAAAATCTGA---G----TC----TGCC-----A----CTGGG--CAGAAC-G-AAA-----------GG--GCGACGGATTTGA-CGTCA-G-ATTT-AGCCA-A-ACA----G-C---------GTACCTGGACCCAAGGTAGCCACTAT---GGATGGAGCCTCATCAA--CTGA----AGTGTA-ATGAA-CTGAAGCAA------GC-GTC-GAGTCAATATCAATGATTT-ATGGA---ATTAAATTCAGGGTA--AATAA-ATGATGTATGAGACG--AT-A-GTTACCATCTTT-TTAGGGACCAGACCCAAAGATG--GGAGAGG-ATTTGTA-A--T-AAGGGGAAAGG-TGGAGGGTGAT-C-A-AAAGG---GGCC-CCCAAC----TCAGAttgagtttcgtgggaatgtattgtactttaacaatcaattatgatgttgtacttgagggtgatcaagacaaacttgcaaacaagctgca
gi|8 : ttcgcctactctgagcaacgcaaaatatgctaagcaaaaggcacatgtaaaaagtttgacctcataagtagaagcacataagagtggcaatgatgccaccattttttccagaataggaaaagtgataggacaacgcaagtcctctcccatacccctggtgcgcttgagacctaataatgctttgccaatgagaaagtgatttgttgggtcctcaagccctctaagtttatggtagaaagctaatgcgcttacgtacaaatgcacagtgcgaggggaatattggtgaattgacaagtctgcaataaatttagcaacactgaaactggtataggccaagttactgccgcttgattgtactggactctaaagaaaattaaaaaaaattttaagggcagtttcgtatgtcttgtgtgtactgggagctagagcgttgtaaatgaggcttctggattcagcccttagatctgctcgagttgggaattgggggttggccaaacgtctgcgtcgggcgccagcttcctgaatttctcccactgcgaacgagaaagactgtcagcaagaattgaagttttgatggaatgtgctgagctttaagtgatgttgtattgtaacgttacaaggactatatttctaacaatttgCTTGCACACATGTCGGGGGGTATTAAT-----T-GATCATCCCCGTTT-ATTGTG-TA-CCA-TGGTTGTAAAGAAAG-AAGGAT---ATGC-ATTATAGGATTTTT-AAAATGATTCT-GCCAAGTA-CA-----AGGTCGGCTTTGATATTTTTTTTGTT-AGCGACATTTTGTAGTGAGGTTTGGTAATTGCTCATTGTGTCATTGGGATG-TGCGTCGGCAACAAGGCTCCTGCCAGGGGAAAATGA-CCTACATG-GAAGTTCAATAGAACAA-TGAGGGATTGCATTTGTCTTA---AGAAAC----TTTTTGGCTTTTCAGAAA---------ATTTTTGTATTG--TA-AGGTG-----AGCAGGGCCAACTTTAGGTCAT--G----------GG--GAGCCTCAT-GTCAA--G-TTAATGGAAG--TCAATATC-ATGCCCAAGAAGTA---------A-------------------------GGATATATGGGTTGGCTCTACTGTT--TATG----------------G---TCTGC-G-C--AT-GGGAA---CTATGTCCCCACAGATGA--GCTT---TG---AAAACAC-TCTAAG-GTAT-G-ATATGACA-AAT-T-TGA---GA---ATTTGCGT--TGGCCGCAAAA-AAAG-AA-TCATCTAAGTAATGAATGAT-AAATGGTT-------TTGTG-------ATT---T-T-T---TC-TTAG---TGG--C---CCA-GTGT-AGAACGAT--AGC-AT--AAC--A-TTGTTCT--C--A-ACTATAA--T--G-CAA-----GC-TGATTGTGA---CA----CATA-TA--AGGCAA--CATTTTTATGAG--AAGTA-AA--AT--TT--TTGT-----TGAAA-T---TGGAAGG--AC--AAG-T
gi|10 : tGTGGCGTC--GATAAGCCTTTG-CAG-AAGGCT-CGGCCTGGGG-CTATGACC-TACAAGCAAAATTGAGCAGTCCAAATGAGAGACTGCAG-----TGACCTGAGAGTGACCTTTTTTACTGGCACAAAAT--------G--ATTGGATTG--TA---------------GATTTGATTT---TTAATGAGTTTCTCCCTTGG--CAGTCTCATAACCATTAGCTTGA--G-TG--TCAAATTCAATACC-AAGA---A---------AAAATGAT------------------G----------------------TTAGT-TGATGGGGCTGTGGTCTTT---TCTCT-G-C-AAT-TGGGACCCCGATATCTGAGCATACT---GATC---TA---AATAC-T-GACGAA-GTATCA-ATA---CA-CAT-C-TGT---GA---GTTTG-GG--GGTCCGGCGAA-TAGGAAA-TCATCTAAATAGTG--TAGTA----GGTT-------TGGGTTGCAACGA-TCGGT-T-T---TG-A--G---T-GA-T---CCA-ATGGAGGG----C--AGT-G----GCAAA-TTTT--T--CCCA-G--ATGG--C--G-C-A-----GC-TAAT-----GG-AAGCT-C-CG-AA--AGGGAG--CA-TTTTAT-CA--A---A-AA--GT--AT--TTGTTC---TGAAA-C---CTAAA-A--CCT-AAG--A-GTTCAAAATCTGTAG-G----AT----TCAT-----G----G--GA--CAAG--------T---------CTG--AAGGCTGGATTAATTGTCA-G-ATTT-GGCAAG
gi|9 : A-GAGGCT-CGGCCTGGGG-CTATGACCCTACAAGCAAAATTGAGCAGTCCAA-TGAGAGACTGCAG-----TGACCTGAGAGTGAC-TTTTTTACTGGCACAAAAT--------G--ATTGGATTG--TAGATTTGATTTTAATGAGT-----TT---CTC-CCTT----------GG--CAGTCTCATAACCATTAG-CTGA--G-TG--TCAAATTCAATACC-AAGA---A---------AAATGATGTTAGTTGATGGGGCTGTGG----------------------TC--T-TT----------------T---CTTCT-G-C-AAT-TGGGAC-CCGATATCTGAGCATACT---GATC---TA---AATAC-T-GACGAA-GTATCA-ATA---CA-CAT-C-TGT---GA---GTTTG-GG--GGTCCGGCGAA-TAGGAAA-TCATCTAAATAGTG--TAGTA----GGTT-------TGGGTTGCACG-A-TCGGT-T-T---TG-A--G---T-GA-T---CCA-ATGGAGGG----C--AGT-G----GCAAA-TTTT--T--CCCA-G--ATGG--C--G-C-A-----GC-TAAT-----GG-AAGCT-C-CG-AA--AGGGAG--CA-TTTTAT-CA--AA--A-AA--GT--AT--TTGTTC---TGAAA-C---CTAAA-A--CCT-AAG--A-GTTCAAAATC------T----GT----AGGA-----T----T--CA--CTGGGA-C-AAGT---------CTG--AAGGCTGACTTAA-TGTCA-G-ATTT-GGCAAGc
gi|23 : tgtttttaacacctgaagtggcgtcgataagcctttgcTTAAAAAA---------A--ATTGTATTG--TA-AGGTGA----AGCAGATCCAACTT---GTc
gi|7 : AACTT---GTC-TGAT----------GGCAAAGC--CATAGCCAT--A-AT-AT-G-AGTATCAAATCTAATA-CCGAGA---AATGTTCAACA-------------------------G----------------------TC--T-TG----------------T---CCTCT-A-CAGAT--GGTACTCCTAAATCTTGGCAGA-----GA-T---TG---AACAT-TGTCTGTG-GTGT-G-TTG--ACA-AAC-T-GGGGACGA---ATTTG------GACCACAAAA-GAGAAAA-TCATTT--------AATGGTA----TGTT-------C-----------A-T---TGC-C---TG-T--G---T-G--CTGTCGA-GT-TAACCAA-ACTAAAT-AAATAGCAAA-CTTC--T--C--C-C--ATAAGTT--G-T-A-----GC-TTATT-----A-AG----C-CA-AA--GG--GAACCA-TTTTGT-----AATCATAA--AT--TT--ATCT-----TCAAACT---TTAAA-GAACC--AAG-GA-GGTCAAAATC------G----GA----TGGG-----GATATC--GG--TAGGAG-A-CAA---------------AAGGCAGACTTGA-TGTCA-G-AATT-----AGGCAAAGGGTGCCTCCACCAA-GCA-------------TAGCAATCATGTCAGCT---GCCTCATCAGTGGTTGAATAATTATA-GTGGG-ATC-AACATCTAAAAGC-AATTAACTCAAT--C-GTC-TTG-A-----------------GGATG-TAAAAG-ATGGTGTATGAGCCT-CATGCTG---CCATCCTTTTTGGGGACAAAGCTC--AGTGGGAAAA---A-ACTTTAATG--TCTA-TAAAAGGGATATGGA----------AAAGG---G
gi|4 : tggataggtttgcagaaggtacatccaagtgagacaaccttgcaggcaaaatataatgactgcaattaccaaaggatgatcatttgggcaacaaaatagaatttataacttgccttaccttaccgTAGCTAT--C-TTG--GG-AG--TCAGATTCAA--CCCAAGG---A---------AT------------------------T----------------------TT--T-TGGC--------------T---CCTGggc
gi|12 : ccaagtaattcaaaatcacttggcgcgacaggaagtaatcgggatgccgatttgatatcagcttttgccaggaaagccccttgacctgcactagctatcatttcagctgcttgatctatgctactatagtgtactgagcatgcattggggtcaatgaagtcattgatggatgcattttctggatgcgagaggtggtgaaagagtcgcatgtctccattttccttgggcactaggcccagtggagagacttgcagattaggaagaggtggggagtcgaaagggcctgccatccgtcctagcactaactcattctgaattttgcttttggctatttgagaattagtctttacactggataaattatcagaatatcgaggaagtctggggcccatatatcttagcttaaaaccgtagaaaaacccctgccgaataaaagtaaccccttgataccccctgaggggtttggttagttgctgccaattaattggtatggtattaaatacccaaagatataatagagcacacaccgttatttataagaacattgtactggtgcttggagtgaatctgtcctcccacattttatctgcaatgcatgcttgtacttgcatcctggggaaaatattacaatcatatccctaattgtatataaaagaacggtcgaatacagtaaattatgagcgttgtgcttggcattgacttgctggaatgttaatttagagctgactgattagaactggtgtgctgcttttgttggactgcgcttggtttgaggaaaacatga---------A-------------------------G----------------------TT--T-TG----------------T---CTT-C-GTC-TAT-GGGGACCTCCAGGTCAGTGTACA-A---CATTC--TG---AATAT-T-TGCAAG-GTGT-T--TG--TCC-ATTGT-TGA---GA-----TTG-G----------AAAATAAAACAA-CCATCTAAATACTGGATAATGAAATTGTTTTGGAGGT-----------G-T---T-T-T---TC-A--G---TAA--T---TCA-ATGTAAGAA------AGT-T----GCAAATTTGTC-C--C--ACA--GTGA-----A-C-A-----AC-TGA-T-GGAGG-AT----C-CA-AATTGA--AG--TA-GCTTGT-TA--AAGTA-GA--AA--AG--CCCT-----TGGAA-T---TTAAA-A--CT--CGA-TT-ATTGAAAGTTTTCAAGG----TT----T-----------------A--TAGGAATG-GGA----------CAG--AAAGCTGA-TTGA-TATCA-GACTTgtggaagtattagacattcttagcctaaattggctcatcgtcacttaggccacaaattagacctagtagctcccactcgaatgttccttaaatacttaagcaattcttgggctttacctggagacttttcgatcatgatactaataaagatgataaatgctgaggtccagctagcaatgctaagaattggattggttttggattttgcaatacacaagcggcccaccattattcggatgtctcccatagactcttggtcctggattttgcatgccgacttgg
gi|11 : ttagttggttccac---------A-------------------------G----------------------TC--T-TT----------------T---CATAA-G-C-AAT-GGGG-CACCGACACCTTGACA-ATT---TGCT---TG---AAAAC-G-TTAAGG-GTAG-C-TTG--ACA-----C-TGATCCGG---ATTTG-GA--GGACC-CAGGA-AGAGAGATTCGTCAAGGTAGTGCATGATGTTGGGATTGCG----TG----------A-T---C-T-A---TCTT--GAATT-A--T---CCA-ATGTAAG---------GCTGT--CGCACA-TTTT--T--C--C-C--GTGT--TGCA-C-A-----GC-TTAT----AG---ACTCTC-CA-AAT-GG--AAG-CA-TTTTGT-CA--AAATA-GT--AT--TTG-CCGT-----TG-AA-T---TTGAA-A--CC--TAG-AAGATTGAAGATT------GAAATCTGATATG-------G----C--TA--CGGGTA-T-TAAG---------CGG--TAGGCAGATTTAA-AATTT-G-ATTT-TGCTAgcaa
gi|6 : ggtttgtcacggggaggcctcattaccatggttactgtgtctatttcatcacctaggaaaagtaaggttgtggttgggtttgt-------------------------G----------------------TT--TATG----------------TTCACCTGC-G-C-GATTGGGGACACCTATGTCCCCACAGATGCTTTATTGTATG---AACCT-C-TCTAAG---AT-G-TCA--ACA-AAT-T-TGtataggtccccggccgcaaagcggctataatggctg
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gi|6 : taatggtacagatgtagtgatactatgagcatcaaatccaagacaaataaatatgagagtttttgttggtcaaacaatcttgtcctctcatattgttactctgtattcttgtcaaagagacctacGATC-------T-----------A-T---T-T-TAACTT-A--G---T-GAAC---CCACGTGTAACAA------AGT-----AGCAAA-TTGC--T--C--A-A--A-AA--T--A-C-ACACAGACATGATT-GGATGCAA----C-CA-CA--GC--AA--CA-TTTTAT-CGAAAAGTA-GATCAT--ATAATTGTATATCTTAAA-TACGCGGAA-G--CCTAAAGAAA-ATTTAGAATA------AGT--CT----TCGCCTCCAG----A--GATCTAAGAA-GATAATATACTCGCGCAGATAATGCCGATTTGA-TATCACG-CTTTATGCCAtagaa
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Reference ( family-881 ) : TGGCCCACTGTGAACGAGA-----TATC-GNAATCTGCGATTTTGTTGA-GTTGNCTTGAGTGGGAATGTGTNGNGCCCTAACGGNNA-------TGTTGTNACNTGNGAGTAGCCAANAGAACAANCTTGCGAACAAGCTGCATNACATGTTGCTGGTGATTTNGATGTCGANNNGTTGAGTATNTGNACNACTGCCATATTGTCNATGTGGANCAGGATTCGCTCGCAATCTGCTNAG-GANTCGNGTCTCACCACAANNACAAAGANGCNACATACACNGGGANNAGCTCTNAGAAANNCCATGCCCCTGACGACNCGGGACCTNNTCCGGNCCAA-----TGGCCTGAGNACCCTGAATCTCGAGTGTGCCCAGCTANCCNGCGAAGTAGATGCCAAANCCCCNNNTNGGTCCCCCTGCGCTGTCTGTGACGAATT-G-----A-AC-GTTTCA-----TCGTG-TA-CC--ACG-GTTATAA-GAAAT-ANNGNTACGCCATTATAG-A--TTTT--AGAA--ATT-NT-GCCAGGCA-C-A-----AGGTCGGCTTTGATG--TTTCGTGTT-ANCCTGAC--TTTGTGGTGNNGTTTNNTGATTGCCGACTGTGGCGTC--GATNANNCGTCG-GCAA-AAGGCT-CGGCCNGGGG-CNACGACCCTACANGCAAAGTTNAGCAGNCC-AATGAGAGACTGCANTTNACCTGAGAGTGA-CTTTTTTACTNNT-AAAAAA-----TAATTGTATTG--TAAGGTGA---AGCGGGTCCAACTT---GTCATNAG----------GGNA--GCCTCATAGCCAT--G-TTGAT-G--N-GT--CAAATTCAATACCCAAGA---AA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---CCTNC-G-C-GAT-GGGGACNCCNATGTC--TNNGCAGACG---GATT---TG---AANAC-T-TNTAAG-GTATG--ATGACANAT--TTG--A---GA------ATTTG---GNGGNCCG---C---A--G-AANAGGA-AATCAT-CT--AAGTAGT---GAATGATA--A---GG---------TT----------T-----------AT---T-TT---TC--------------------NGT-G--C---C-----------CA-GTGTAA-------GAA--CAGCGA-GCA-AAT----TTTT--C--A--NA-TG--A--CGC-AG-C-TNATT-GA--GGAAC---C--AAA--GG--AG-CA-TT----TTGT-CG--AAGTA-GA--ATNT--TTGT-----TGAAA-T---TTGAAG--C-C--AAG-NAG-TTCAAAATC------G---NTTGGC---G----C-----GA----CAGGAA-G-NAAT---------CGG--AAGGCNGATTTGA-TGTCA-G-ATTT-NGCCA---GGAAAGC--CCC-C------GCAC------TAG-CNATCAT-T-C-------GGCT---GCCTNA-----TCNA-TG--------CTTG----AC----------TATAGTG-NACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGAT-GCGAGAG-GTGGTGNATGAGTC-GCAT-G-TGTCCATCTTTCTTGGGNACTAGGCCCA---GT-GG--AGA-G-ACTTGCAGA--TTA-GGGAAAGGTGGGGAG---T-CG-AAAGG---GCCT-GCCANC--CGTCCTAGCACTAACTCATT---CTGAATT-TTG-CTTTTGGC-TATTTGAGAATTAGTCTT-TACACTGG-ATAAAT-TATCAGAATNNTTCGAGGAAGGTTCTGGGGGCCCACAATCTAATACATNTTAGCTATGAAAAAACACGTTAGAAAAGNACCCCTGCCGAAATAAAGAACAGTAACNCCCTNGTACCCCCCCTGAGGGGTTTGGTTAGTTGCTGAGCCNANTTAATTNGTGTGGTATTAAATACACCAAAGTGATATAATAGAGCACACACGCNTTATTTATAAGAACNTNGTACTGGTGCCTTGGGGTGAATCTGNCCGGTTCCCCANATTTTANCGGCATTGCAATGCATGCTTGTACTTGCACCCGGNGGAAAGTAATTTACAANCATATCCCTAATCCTGCTATATAAANGAAGTCGGCCGAATACAGTAAATTGGGTTNAGCNTTGTGGNCTGGCATTGACCTTGGCATGGGATGGTAGTATAATTTAAGAGCTGGCTTGATTNGAACTGGTGTGCNGCTTTTGTTGNGCTGCGCTTGNNTTGAGGAAAGCACTGACAGGAAGCCAAAANATTCCTTGGGTTGAACTCTGGATCTCCCAAGATAGCTNGTNGAGGTGGATTAGACNTCCTTANCCCGTGAAATTGGCTCATTCGTC--ACTTAGGCCACAAATTAGGGACCTAGTAGCTCNCNNNTCGAATGTTCTCTTAAAATACTTAAGCAATTCTTGGGCTTTACCTGGAGACCTTTTCGATCATGAATACTAATAAAGATGCATAAATGCTGAGTGTCCAGCTAGCNCAATGCTTAAGAATTGGATTGGTTTTTGGATTTATTGCAATNCACA---ACAAGGCGGCCCNCAACCATTTATTCGGNNGTCTNCCAATCCTCATTATGGATCTCNTGTCCGTCCCGCCCCCCCCCCGGATTTTGCATGCCGACTTGG---TGGTCAGCGA----AAATCAATAAA-TGGCCGTTCCATA-TTTTTG-CTTAATTGATAGGGGAACGTTGAGAGCCCCCCCAAACAAAGGGGGACATTTCAATAATCGAAGTAACAACTGATTGGCTGAT-AGAGTGAGACGCGATAGCA-TAACAAACTCACCCCGTCCAAACTCGACTC-GACATCCGAGGAACCCATTGGTTCTCTTTCGTAGATTCTGGCTG-CGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGGGC-GTGACAATTCCGGGGTTTTGTTGGAATTAGGTGGCTG-TGGTTAAGGGTGCTTTNGCATTAGCACAAACCCCNGCTTAGGTTAGGCCCTTGGCCCTCGACTTGGGCGTGCCCNTCGTCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTCATTTTGGTTCGTACTGGTGGCANTTTTGGCCGCCGATTTGCGTGTCAATTGCAATGGATTGTTGTTGATCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTC-TAA-CCGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGATGATGC---TAAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACAGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAG--TT-AGATCGGGACAA-ATTGACACACGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATTGATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTTTAT
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gi|10 : GTGGCGTC--GATAAGCCTTTG--CAG-AAGGCT-CGGCCTGGGG-CTATGA-CCTACAAGCAAAATTGAGCAGTCCAAATGAGAGACTGCAG-TGACCTGAGAGTGACCTTTTTTACTGGC-ACAAAA-----TGATTGGATTG--TA-------------GATTTGATTT---TTAATGAGTTTCTCCCTTGGCA--GTCTCATAACCATTAGCTTGA--G--T-GT--CAAATTCAATA-CCAAGA---AAAAATGAT------------------G-----------------------TTAGT-TGATGGGGCTGTGGTCTTT---TCTCT-G-C-AAT-TGGGACCCCGATATC--TGAGCATACT---GATC---TA---AATAC-T-GACGAA-GTATC--AATACACAT--CTG--T---GA------GTTTG---GGGGTCCG---G---C--G-AATAGGA-AATCAT-CT--AAATAGT---G--TAGT---A---GG---------TT----------TGGGTTGCAACGATCGGT-TT---TG--------------------AGT-GA-T---C-----------CA-ATG-GA-------GGG--CAGTG--GCA-AAT----TTTTCCC--A--GA-TG--G--CGC-AG-C-TAATG-GA--AGCTC---CGAAAG--GG--AG-CA-TT----TTAT-CA--A---A-AA--GTAT--TTGTTC---TGAAA-C---CTAAAA--C-C--TAA-GAG-TTCAAAATCTGTAG-G---ATTCAT---G----G-----GA----CAAG--------T---------CTG--AAGGCTGGATTAATTGTCA-G-ATTT-GGCAA---G
gi|11 : TT---GTCACG-G----------GGAG--GCCTCATTACCAT--GGTTACT-G--T-GT--CTATTTCATCACCTAGGA---AAAGTAAGGTTGTGGTTGGGTTTGTA-G-----------------------TC--T-TT----------------T---CATAA-G-C-AAT-GGGG-CACCGACACC--TTGACA-ATT---TGCT---TG---AAAAC-G-TTAAGG-GTAGC--TTGACAC-----TG--ATCCGG------ATTTG---GAGGACC----C---A--GGAAGAGAG-ATTCGT-CA--AGGTAGT---GCATGATGTTG---GGATTGCGTGATC----------T-----------AT---C-TT---GA--------------------ATT-A--T---C-----------CA-ATGTAA-------GGC--TGTCG---CA-CAT----TTTT--C--C--CG-TGTTG--CAC-AG-C-TTATA-GA--CTCTC---C--AAATGGA--AG-CA-TT----TTGT-CA--AAATA-GT--ATTTG-CCGT-----TG-AA-T---TTGAAA--C-C--TAG-AAGATTGAAGATT------GAAATCTGATATGG----C-----TA----CGGGTA-T-TAAG---------CGG--TAGGCAGATTTAA-AATTT-G-ATTT-TGCTA---TATAGGT--CCC-C------Gc
gi|12 : ggtA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T----CTTC-GTC-TAT-GGGGACCTCCAGGTCAGTGTACA-AC-----ATTC--TG---AATAT-T-TGCAAG-GTGTT---TGTC-CATTGTTG--A---GA--------TTG---G--------------A--A-AATAAAACAACCAT-CT--AAATACT---GGATAATG--A---AA---------TTGTTTTGGAGGT-----------GT---T-TT---TC--------------------AGTAA--T---T-----------CA-ATGTAA-------GAA---AGTT--GCA-AAT----TTGTCCC--A--CAGTG--A---AC-AA-C-TGATG-GA--GGATC---C--AAATTGA--AG-TA-GC----TTGT-TA--AAGTA-GA--AAAG--CCCT-----TGGAA-T---TTAAAA--CTC--GAT-TA--TTGAAAGTTTTCAAGG---TTT------------------A----TAGGAATG-GGA----------CAG--AAAGCTGA-TTGA-TATCA-G-ACTT-gccgcaaagcggctataatggctg
gi|13 : ttagttggttccacTC--TTGTCAAAGA---GACC---TA---CAAAT-G-TCTATA-GTACGT-ACGACAGAA--TAG--A---GACAA---ATTTG---GA---CCA---C---A--T-AATAGAA-AATCGT-CT--GAATAAT---GAGGGATA--T---AT---------TC----------T-----------AT---G-GT---TG--------------------TGT-G--A---TATTGAGTTAGGCA-ATGCTA-------AAA--TAAGTA-GCA-ACT----TTTCTCC--A--CA-AA--G--CGC-AG-C-TTATT-GA--GG-----------A--GG--AACCA-TT----TTAT-TG--AAAT--GA--Agcaa
gi|16 : taatggtacagatgtagtgatactatgagcatcaaatccaagacaaataaatatgagagtttttgttggtcaaacaatcttgtcctctcatattgttactctgtatCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTCATTTTGGTTCGTACTGGTGGCATTTTTGGCCGCCGAT--G-GTGTCAATTGCAATGGATTGTTGTTGATCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTC-TAA-CCGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGATGATGC---TAAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACAATCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAG--TT-AGAACGGGACAA-ATTGACACA--TA-GAAACC---TGT--CCTAAATTGATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTTTgataggcttcaaaatctagaa
gi|17 : GTTGG--GGAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTTGTAATCCGA-GAATGGCGTGGATAGAAGGATGATGTGCGTAAGCT-----CGTTCTATGGTTAGGTTTATTTTTATGGTACGGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAGTATT-AGATCGAGACAA-ATTGACACTCGTATTAAACC---TGTCCCCTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATAGTAAAATCAAAATTAATTTGTAT
gi|18 : AAACAGTCTTTG-TCTGGCATC-TAT-CTGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGAATATGC---TAAA-TTAATTCGTTCTA-GATTAGGTTTATTT--ATAGTACAGTCGTACCATGGCTAACTAATA-TTAC-AAAAT--TT-ACATTGGAACAA-ATTAA-ACACGTA-GACACC---TGT--CTTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTCTATtaa
gi|19 : ggTGGCCCACTGTAAATGA-------TATC--TAAT--ACGAT---G--GA-ATTGGTTTGAGTAGGAATGTGTGAAACCCTAATGAGTA-------TATTGTGACGTATG----GCTAATAGAATAAGTTTTCTAACAACACGCATTACta
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gi|20 : ttcgcctactctgagcaacgcaaaatatgctaagcaaaaggcacatgtaaaaagtttgacctcataagtagaagcacataagagtggcaatgatgccaccattttttccagaataggaaaagtgataggacaacgcaagtcctctcccatacccctggtgcgcttgagacctaataatgctttgccaatgagaaagtgatttgttgggtcctcaagccctctaagtttatggtagaaagctaatgcgcttacgtacaaatgcacagtgcgaggggaatattggtgaattgacaagtctgcaataaatttagcaacactgaaactggtataggccaagttactgccgcttgattgtactggactctaaagaaaattaaaaaaaattttaagggcagtttcgtatgtcttgtgtgtactgggagctagagcgttgtaaatgaggcttctggattcagcccttagatctgctcgagttgggaattgggggttggccaaacgtctgcgtcgggcgccagcttcctgaatttctTGGTCCACTGTGAACGAGA-----T----------------TTTGTTGA-GTT-TC----GTGGGAATGTATTGTACTTTAACAATCAATTATGATGTTGT-ACTTGAGGGTGATCAAGA---CAAACTTGCAAACAAGCTGCAtcaga
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Reference ( family-881 ) : TGGCCCACTGTGAACGAGA-----TATC-GCAATCTGCGATTTTGTTGAGTTGTCTTGAGTGGGAATGTATTGNGCTTTAACG-------GTGATGTTGTGACTTGAGANTAGTTAANAGAACAANCTTNCGAACAAGNTGCATNAC-T-C-TGGTGATTTGGATGTCGATTTATTGAGTACGTGAACGACTGCCATATTGTCAATGTGAAACAAAATTCGCTT---ATCTGTTAAA-GANTC-GTC--GCCATAATGACAAAGAGGCGACATACACTGGGAANAGTTCCAAGAAAGNCCATGTCCCTAACGACAC----CCTCCT-CGGACCAA-----TGGCC-GAGGAC----CC--AATAGGCCCAGCT-CCCGC-GAAATAGATGCCGAANCC-CCCNTTTGN-CCCCCTGCGCTGTCTGTGAANAATT-G-----A-AC-GTTTCA-----TC-GCGTA-CC--ACG-GTTGTAAAGAAAT-ACNGNNATGCCATTATAG-A--TCTT--AGAA--ATT-CT-GCCAGGCA-C-A-----AGGTCGGCTTTGATATTTTNT--GTT-ANCCTGAC--TTTGTGATGAGGTTTGGTAATTGCCGATTGTGGCGTCG--ATGAGNCGTCG-GCAG-AAGGCTCG-GCCAGGGGNNA-CGACCCTACANGCGAAGTTCAGTAGNCCAA-TGAGGGACTGCANTTGAC-CTGAGAGTGACCTTTTN-ACTNN-CAAAAAA-----TAATTGTATTG--TAAGGTGA---AGCAGATCCGACTT---GTCATGAG----------GGNA--GCCTCATAGCCAT--G-T-TGAT-GT--GTCAAATTCAATGCCCAAGA---AA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---CCTNC-G-C-GAT-GGGGACNCCTATGTC--TCCGCAGACG-G---ATT---TG----AANAC-T-TCTAAG-GTATN-AT--GACANAT--TTG--A---GA------ATTTG----GA--GN-CCG---CA---G-AANAGGA-AATCAT-CTA-----AGTAGT---GAAT--GATA------A---G---GT-----------T---T----G----------A----T---T-T---T---TGAGT---G--C---CCA-GTG-TAA--GAA--C--AGTGA---GCA-AA-T----TT-T-TC-------C-AC-AT--G--GCGC-AGCTNATT-G-AGGC---T-CC--AAA--GG--AG-CA-TT----TTAT-CGAA--GTA-GA--ATNT--TTGT-----TGAAA-T---TTGAAG--C-CNAGN---AG-TTCAAAATC------G---NTTGGC---G----C-------GAC--AGGAA-GN-AAT---------CGGA--AGGCCGATTTGA-TGTCA-G-ATTTN-GCCAGG---AANGCCCCC------GCAC------TAGCN-ATCATTCC------GGCT---GCCTCAT-----CAA-TG--------CTTG----AC----------TATA-GTGNACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGATG-CGAGAG-GTGGTGAATGAGTCG-CAT-GTNTCCATCTTTCTTGGGCACTAGGCCCA---GT-GG--AGA-G-ACTTGCAGA--TTA-GGGAAAGGTGGGGAG---T-C-G-AAAGG---GCCT-GCCANC--CGTCCTAGCACTAACTCNTT---CTGAATT-TTG-CTTTTGGC-TATTTGAGAATTAGTCTT-TACACTGG-ATAAAT-TATCAGAAT---TCGAGGAAG--TCTGGGGCC-----C--ATAT-TATTAGCT-T---AAAAC-CGTTAGAAAAGA-CCCCTGCCGAATAAAGACAGTAACCCC-TGATACCCCCTGAGGGGTTTGGTTAGTTGCT-GCAAATTAATTGGT---GTAT---ACACCAAAG-GA-A-AATAGAG---ACACCCTTATTT-T--GAACAT--TACTGGTGCT--GG-GTGA---T--GTCCCCCCACATTTCG-CTGCAATGC-TGCTT-GTACTTGCACCTTGGGGAAAGAATT-ACAA----ATCCCT--TCTGCTATATAAANGAA--CGGC--AATACA------TATGTT-AGCGTTATG-ACTGGC-TTGACCTTGGCCGGAATG-T-GTATAA-TTA-GAGC--GCT-GATTTGAACTGGTGTGCTGCTTTTGTTGGGCTGCGCTTGGTTT---GAAAACACTACAGGA-GCC--AAAATTCCT--GGTTG-A-TCTG-ACCCCCAAGAT-GCTAGTG--AGTG-ATTAGACATCCTTAGCCT---AAATT-GCTCATTCGTCACTTAGGCCACAAATTAG--ACCTAGTAGCTCGCAANTCGAATGTTCCCTT-AAATACTTAAGCAATTCTTGGGCTTTACCTGGAGA-CTTTTCGATCATG-ATACTAATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTAG-CCAATGC-TAAGAATTGGATTGG-TTTTGGATT--TTGCAATACACA---ACAA-GCGGCCCC--ACCA-TTATTCGGATGTCT-------CCCACAATGGA-CTCTTG---GT-----------CCCGGATTTCGCATGCCGACTTGG---TGGTCAGCGACGACAAATCAATAAATTGGCCNTCCCATATTTTTTGTCTTGATTGATAGGGGAACGTTGAGANCCCCCCCAAACAAAGGGGGACATTTCAATAATCGAAGTAACAACTNATTNGCTGATAAGAGTGAGACGCGATAGCATTAACAAANTCACCCCNTCCAAACTCGACTCAGACATCCGAGGAACCCGTTGGTTCCCTTTCGTAGATTCTGGCTGCCGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGNGCGGTGACAATTCCGGGGTCCTGTTGGAATTAGGTGGCTGTTGGTTAAGGGTGCTTTGGC-----TAC--ACC---GCTTAGGTC-GGCCTTT--CCCTCGACTTGGG-GTGCCCATCGTCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTCGTTTTGGTTCGTACTGGTGGCATTTTTGGCCGCCGA-TTG-GTGTCGATTGCAATGGATTGTTGTTGGTCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTC-TAA-CCGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGATGATGC---TAAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACAGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAG--TT-AGATCGGGACAA-ATTGACACACGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTTTAT
gi|1 : TGCCCCACTGTGAACGAGA-----TATT-GCA-TCTGCGAT---G--GAATTGTCCTTAGTGGGGATATAAGAGGCATTAATG-------CTGATATTA-GACCTGAGACAAGCTAACA---CAAGTTTACGA-TGAGATTCATGAC-C-C-TAA-GATTTGGATGTGAATTTATTGATGACATGAATAACTGCCATGTTGTCAATGAGAAACAAAA---GCTTGCAATTTGTGAAATGACT---TT--GCCATAGTGATAAAGAGGCGAC---CACTGGAAAGAGTTC-AAGGAAGACAATGTCCTTAATGACAC----CCTCCT-TAAACCAAAATTTTGGC--AAGGAC----CC--A-TAAGCCCAAAT-TCCGTTGAAATAGATGCCGAACCCTCCCTTTTCA-CCCCCTGCACTGTCGGTGAATAATT-G-----A-ACCGTTTCA-----TT-ATGTAACC--ATG-GTTGTAAAGAAATTACGGATATGCCATTATAGGA--TTTT--AGAA--ATT-CTAGCCAGGTAAC-A-----AGGTCGGCTTTGATATTTTTT--GTT-AGCCTAAT--TTTGTAATGAGGTTTGGTAAT-GCCAATTGTTGCATTG--ATGAGGCGCCG-GCAA-AAGGCTCT-GCCAGGGGAAA-TGACCCTATATACGAAGTTCAATAGGCCAA-TGATGGATTGCATTTA-----GGAAGT---CTTTTG-ACTTT-TAAAAAA------AATTGTATTG--TAAGGTGA---AGCAGGTCCAACTT---GTC-TGAG----------GGGA--GCTTCATGGTCAT--G-T-TGAT-GGA-GTCAAATTCAATGCCCAAGA---AA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---CCTGC-G-C-GAT-GGGGACGCCTATGTC--CCCGCAGATG-G---ATT---TG----AAAAC-C-TCTAAG-GTATG-AT--AACAAGT--TTG--A---GA------ATTTG----GTT-GT-CCG---CA---G-AAAAGGA-AATCAT-CTA-----AGTAAT---GAAT--GATA------AAACG---GT-----------T---T---------------A----T---T-T---T---TCTGT---G--C---CCA-GTG-TAA--GAATAC--AGCGAA--GCA-AA-T----TG-T-TC-------A-A--AT--A--ATAC-AGCTGATTTG-AGGA---A-CC--AAA--AG--AA-CA-TT----TTAT-CGAA--GTA-AA--ATTT--TTGT-----TGAAA-T---TGGAAG--C-CAAGT---AA-TTCAAAATC------G---CTTGGC---G----C-------GAC--AGGAA-GT-AAT---------CGGA--ATGCCGATTTGA-TATCA-G-CTTTT-GCCAGG---AAAGCC---------GCAC------TAGCT-ATCATTCC------AGCT---GCTTGAT-----CTA-TG--------CT------AC----------TATA-ATGTACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGATG-CGAGAG-GTGGTGAATGAGTCG-CAT-CTGTCCATCTTTCTTGGGCACTAGGCCTA---GT-TG--AGA-G-ACTTGAAGA--TTA-GGAAAAGGTGGGGAG---T-C-G-AAAGG---GCCT-GCCACC--CGTCAGAGCATTAACTCCTT---CTGAATT-TTG-CTTTTTGC-TATTTGAGAACTAGTCTT-TACACTGG-ATTAAT-TATCAAA------CGAGGAAG--TC-GGG--C-----C--ATAT-TATTAGCT-T---AAAAC-CGTTAGAAAAA---CCCTGCCG-ATAA----AGT-ACCCC-TGATA--CCCTGAGGTGTTTGGTTAGTTGCT-GCAAA-TAATTGGT---GT-T---ACACCAAA--GA-A-AATAGAG---AC-CCCTTATTT-T--GAA-AT----CTGGT-CT--GG-GTGA---T--GT---CTCACATTT-G-CTGC-ATGC-TGCTT-GTACTTGCACCTTGGGGAAA-AATT-ACAA--------CT--T-TGTTATA-AA---AA--CGAC--AATACA------TA--TT-AGCGTGATG-ACTGGC-TTAA--TTG--CTGAA---T-GTATAA-TTA-GAGC--GCT-GATTTG-ACT-GTGTGTT-CTTTTGT--GGCTGCGCTTGGTTT---G-AAACA-TACAGTA-GCC--AAAATTCCT--GATTG-A-TCTG-A-CCCCAAGAT-GCTAGTG--AGTG-ACTAGATATCCTCAGCCT---AAATT-TTTCA-TCAT-ACTTAGGCCAGAAATTAG--ACTTAGTAGCT-GCAATTCGAATG-TCCCTT-AAATACTTAAGCAGTTCTTGGGCTTTACCTGGAAA-TTTTTCGATCATG-ACACTGATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTA--TCAATGC-TAAGAATTGGATTGG-GTTTGGATT--TTGCAATACACATTGACAA-ACGGCCCT---CCA-TAATTCGAATGTCT-------CCCACA---GA-CTCTTG---GT-----------CCTGGATTTCGCATGCCGACTTGGTCATGATCAGCAACGACAAATCAATAAATTGGCCTTCCCATATTTTTTGTTTTGATTGATAGGGGAACGTTG-GATCCC---------AAGGAG------TC----------GTAACAACTTATTTGCTGATAAGAGTGAGACGCAATAACATTAACAAAATCACCCCTTCCAAACTCGACTCAGACATCCGAGGAA-CCGTTGGTTCCC--TCGTAGATTCT-GCTGCCGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGCGCGGTGACAATTCTGGGGTCCTGTTGGAATTAGATGGCTGTTGGTTAAGGGTATTTTGGC-----TAC--ACT---GCTTAGGTC-GGCCTTT--CCCTCGACTTGGG-ATGCTCATCGTCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTTGTTTTGGTTCGTACAGGTGGCATTTTTGGCCTCCGA--TG-GTGTCGATTGCAATGGATTGTTTATGGTCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTG-TAA-CCGA-GA-TGGCTTGGA--AAAGGATGATGC---TAAA-T-----CGTTCTA-GGTGAGGTTTATTTTTATAGTACAATCGTACCATGGCTAACTCGTT-TTACGAAAAG--TT-AGATTGGGACAA-ACTAA-ACAAGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATAAAGCTGGAC-TATTTGTTA-TAAAATCAGA--TAATTTTTAT
gi|10 : GTGGCGTCG--ATAAGCCTTTG--CAG-AAGGCTCG-GCCTGGGGCTA-TGACC-TACAAGCAAAATTGAGCAGTCCAAATGAGAGACTGCAGT-GAC-CTGAGAGTGACCTTTTTTACTGG-CACAAAA-----TGATTGGATTG--TA-------------GATTTGATTT---TTAATGAGTTTCTCCCTTGGCA--GTCTCATAACCATTAGCT-TGA--GT--GTCAAATTCAATACC-AAGA---AAAAATGAT------------------G-----------------------TTAGT-TGATGGGGCTGTGGTCTTT---TCTCT-G-C-AAT-TGGGACCCCGATATC--TGAGCATACT-G---ATC---TA----AATAC-T-GACGAA-GTATC-AA--TACACAT--CTG--T---GA------GTTTG----GG--GGTCCG---GC---G-AATAGGA-AATCAT-CTA-----AATAGT---G--T--AGTA----------G---GT-----------T---T----GGGTTGCAACGA----TCGGT-T---T---TGAGT---GA-T---CCA-ATG--GA--GGG--C--AGTG----GCA-AA-T----TT-T-TC-------CCAG-AT--G--GCGC-AGCTAATG-G-AAGC---T-CCGAAAG--GG--AG-CA-TT----TTAT-CAA-----A-AA--GTAT--TTGTTC---TGAAA-C---CTAAAA--C-CTAAG---AG-TTCAAAATCTGTAG-G---ATTCAT---G----G-------GAC--AAG--------T---------CTGA--AGGCTGGATTAATTGTCA-G-ATTTG-GCAAG
gi|11 : TT---GTCACG-G----------GGAG--GCCTCATTACCAT--GGT-TACT-GT--GTCTATTTCATCACCTAGGA---AAAGTAAGGTTGTGGTTGGGTTTGTA-G-----------------------TC--T-TT----------------T---CATAA-G-C-AAT-GGGG-CACCGACACC--TT----GACA-----ATT---TGCTTGAAAAC-G-TTAAGG-GTAGC-TT--GACAC-----TG--ATCCGG------ATTTG----GA--GG-ACC---CA---GGAAGAGAG-ATTCGT-CAA-----GGTAGT---GCAT--GATGTTG---G---G---AT-----------TGCGT----G----------A----T---C-TATCT---TGAATT--A--T---CCA-ATG-TAA--GG---C--TGTC----GCA-CA-T----TT-T-TC-------C--C-GT--GTTGCAC-AGCTTATA-G-ACTC---T-CC--AAATGGA--AG-CA-TT----TTGT-CAAA--ATA-GT--ATTTG-CCGT-----TG-AA-T---TTGAAA--C-CTAGA---AGATTGAAGATT------GAAATCTGATATGG----C-------TAC--GGGTA-TT-AAG---------CGGT--AGGCAGATTTAA-AATTT-G-ATTTT-GCTATA---TAGGTCCCC------Gc
gi|12 : ggtA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T----CTTC-GTC-TAT-GGGGACCTCCAGGTCAGTGTACA-AC------ATTC--TG----AATAT-T-TGCAAG-GTGTT--T--GTC-CATTGTTG--A---GA--------TTG----G-------------A---A-AATAAAACAACCAT-CTA-----AATACT---GGAT--AATG------A---AATTGT-----------T---TTG--G----------AGGTGT---T-T---T---TCAGTA--A--T---TCA-ATG-TAA--GAA-----AGTT----GCA-AA-T----TTGT-CC-------C-AC-AG--T--GAAC-AACTGATG-G-AGGA---T-CC--AAATTGA--AG-TA-GC----TTGT-TAAA--GTA-GA--AAAG--CCCT-----TGGAA-T---TTAAAA--CTCGATT---A--TTGAAAGTTTTCAAGG---TTT--------------------AT--AGGAATGG-GA----------CAGA--AAGCTGA-TTGA-TATCA-G-ACTTgccgcaaagcggctataatggctg
gi|13 : ttagttggttccac-TCTATA-GTACGTAC--GACAGAA--TAG--A---GACAA---ATTTG----GA-----CCA---CA---T-AATAGAA-AATCGT-CTG-----AATAAT---GAGG--GATATATTCTAT--G---GT-----------TGTGT----G----------A----T---A-T---T----GAGTTAGG--C-----A-ATGCTAA--AAT--A--AGT-A---GCA-AC-T----TT-TCTC-------C-AC-AA--A--GCGC-AGCTTATT-G-AGG------------A--GG--AACCA-TT----TTAT-TGAA--AT--GA--Agcaa
gi|16 : taatggtacagatgtagtgatactatgagcatcaaatccaagacaaataaatatgagagtttttgttggtcaaacaatcttgtcctctcatattgttactctgtattcttgtcaaagagacctacaaatgCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTCATTTTGGTTCGTACTGGTGGCATTTTTGGCCGCCGA-T-G-GTGTCAATTGCAATGGATTGTTGTTGATCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTC-TAA-CCGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGATGATGC---TAAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACAATCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAG--TT-AGAACGGGACAA-ATTGACACA--TA-GAAACC---TGT--CCTAAATTGATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTTTgataggcttcaaaatctagaa
gi|17 : GTTGG--GGAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTTGTAATCCGA-GAATGGCGTGGATAGAAGGATGATGTGCGTAAGCT-----CGTTCTATGGTTAGGTTTATTTTTATGGTACGGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAGTATT-AGATCGAGACAA-ATTGACACTCGTATTAAACC---TGTCCCCTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATAGTAAAATCAAAATTAATTTGTAT
gi|18 : AAACAGTCTTTG-TCTGGCATC-TAT-CTGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGAATATGC---TAAA-TTAATTCGTTCTA-GATTAGGTTTATTT--ATAGTACAGTCGTACCATGGCTAACTAATA-TTAC-AAAAT--TT-ACATTGGAACAA-ATTAA-ACACGTA-GACACC---TGT--CTTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTCTATtaa
gi|19 : ggTGGCCCACTGTAAATGA-------TATC--TAAT--ACGAT---G--GAATTGGTTTGAGTAGGAATGTGTGAAACCCTAATGA------GT-ATATTGTGACGT----ATGGCTAATAGAATAAGTTTTCTAACAACACGCATTAC-T-CTTGGGGATta
gi|2 : aaactggtctgcatcttgtgccaactgtcaatatcCCCACTGCGAACGAGAAAGACTGTCAGCAA-----GA----ATTGAA--GTTTTGA-TGG-AATGTGCTGAGCTTTAA---------GTGATGTTGTA--TTGTAAC--GTTACAAGGACTATATTTCTAACAATTTGCATGAC-TGC-TGGTGATTTGGATGTTGATGAGTTAAGTATCTGAACCACTGCCATATTGTCAATGTGAAACAGGATTCGC-----AT--GTTCAA-GAGTCTGTCTCACCACAATGA--AAG-TGCTACATACACTGGGAAAAGTTCCAA-AAATGTCATGCCTCTGACCACCC----CCTGCT--GGACCCA------GGCCTGAGGCCATCTCG--AATGTGCCCAGCTGCCCGC-GAAATAGATACCAAATCC-CCCTTTTGATCCCCCTGCGCTATCTGTAAAGAATT-GCAGTGA-A--GTGTCAGAGGTCC-ACAGA-CC--AAGAGTTATAAG--------TGTAATGCCATTA-AA-A--TCTTGCAGGA--ACTGTT-GCCAGACA-TGA-----AGGTCAGATTTCATGTCTTGT--GTG-ATTCTGAC--CATGTGATGTTGTTTTTTGAT-GCCGACTGTTGCATCG--ATCAATCG-CGTGCAA-AATGCACG-ACCAGGGGCAA-CAGTTTTGCACGCAAAGTTCAGTAAGCCAA-TGAGTGATTGCA--TGTCTTTGAGAGTTACCTTTTT-CCTAA-GAAGAAAGAAGTCAATTGT-TTGTTTTAGAT---------TATCTAGCTT---ATCTTG-G----------GGGA--GACGCATAACCAT--G-T-TAATCGT--GTAAAATTCAATGCCCCAAA---AG-------------------------GTGATGACAGTGTTGGGTTCAGTGTT--T-TT----------------T---TCTACGG-C-TAG-TGGTACACCTATTTT--TT----GACA-A---ATT---TGCTT-AAAAA-T-TGTAAGTGTGGA-AT--GACATTG--TTG--T---GA------GTT----------GC-CCATGCCAGC-G-AAAAGGA-AATCAT-CT------AGTAATGCAGAAT---ATA------A---G---GA-----------T---TGCGAG----------A----TTGAT-T---T---TGAAT---A--A---TCC-GTG-T-A--GGG--C--TGT-A---GCA-AACT----TT-T-CC-------C-AC-GT--T--GCAC-AGCTTATT-G-ATGC---T-CC--AAA--TG---G-CA-TTCATCTTGT-CAAA--ATA-TA----TT--TTGA-----TTAAA-----TTGAAT--C-C-AGT---AG-TCAAAAATCTGA---G---TCTGCC---A----CTG-----GGC--AGAAC-GA-AA-----------GGG--CGACGGATTTGA-CGTCA-G-ATTTA-GCCAAAC--AGCGTACCT------GGACCCAAGGTAGCC-ACTAT---------GGATGGAGCCTCAT-----CAA-----------CTGA----AG----------TGTA-ATGAACTGAAGCAA------GC-GTC-GAGTCAATATCAATGATTT-ATGGA---ATTAAATTCAGGGTA--AATAA-ATGATGTATGAGACG--ATAGTTACCATCTTT-TTAGGGACCAGACCCAAAGATGGG--AGAGG-ATTTGTA-A--TAAGGGGAAAGGTGGAGGGTGAT-C-A-AAAGG---GGCC-CCCAAC--
gi|20 : ttcgcctactctgagcaacgcaaaatatgctaagcaaaaggcacatgtaaaaagtttgacctcataagtagaagcacataagagtggcaatgatgccaccattttttccagaataggaaaagtgataggacaacgcaagtcctctcccatacccctggtgcgcttgagacctaataatgctttgccaatgagaaagtgatttgttgggtcctcaagccctctaagtttatggtagaaagctaatgcgcttacgtacaaatgcacagtgcgaggggaatattggtgaattgacaagtctgcaataaatttagcaacactgaaactggtataggccaagttactgccgcttgattgtactggactctaaagaaaattaaaaaaaattttaagggcagtttcgtatgtcttgtgtgtactgggagctagagcgttgtaaatgaggcttctggattcagcccttagatctgctcgagttgggaattgggggttggccaaacgtctgcgtcgggcgccagcttcctgaatttctTGGTCCACTGTGAACGAGA-----T----------------TTTGTTGAGTT-TC----GTGGGAATGTATTGTACTTTAACAATCAATTATGATGTTGT-ACTTGAGGGTGATCAAG---ACAAACTTGCAAACAAGCTGCAtcaga
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Reference ( family-881 ) : TGGCCCACTGTGAACGAGA-----TATC-GCAATCTGCGATTTTGTTGAATTGTCTTGAGTGGGAATGTATTGNGCTTTAACGA------GTGATGTTGTGACTTGAGANTGGTTAANAGAACAANCTTNCGAACAAGNTGCATNAC-T-C-TGGTGATTTGGATGTCGATTTATTGAGTACGTGAACGACTGCCATATTGTCAATGTGAAACAAAATTCGCTT---ATCTGTTAAA-GANTC-GTC--GCCATAATGACAAAGAGGCGACATACACTGGGAANAGTTCCAAGAAAGNCCATGTCCCTAACGACAC----CCTCCT-CGGACCAA-----TGGCC-GAGGAC----C--NAATANGCCCAGCTGCCCGCGAAATAGATGCCGAANCC-CCCTTTTGA-CCCCCTGCGCTGTCTGTGAANAATT-G-----A-AC-GTTTCA-----TC-GCGTA-CC--ACG-GTTGTAAAGAAAT-ACNGNNATGCCATTATAG-A--TCTT--AGAA--ATT-CT-GCCAGGCA-C-A-----AGGTCGGCTTTGATA--TTTTNTGTT-ANCCTGAC--TTTGTGATGAGGTTTGGTAA-TGCCGATTGTGGCGTC--GATGAGCCGTCG-GCAG-AAGGCT-CGGCCAGGGG-NNACGACCCTACANGCGAAGTTCAGTAGNCCAA-TGAGGGACTGCANTTGAC-CTGAGAGTGACCTTTTN-AC-TNNCAAAAAA-----TAATTGTATTG--TAAGGTGA---AGCAGATCCGACTT---GTCATGAG----------GGNA--GCCTCATAGCCAT--G-T-TGAT-GT--GTCAAATTCAATGCCCAAGA---AA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---CCTNC-G-C-GAT-GGGGACNCCTATGTC--TNCGCAGACG-G---ATT---TG----AANAC-T-TCTAAG-GTAT--N-ATGACANATT--TG--A---GA------ATTTG----GG--GG-CC-------GCA---G-AANAGGA-AATCAT-CTA-----AGTAGT---GAAT--GATA------A---G---GT-----------T---T----G----------A----T---T-T---T---TGAGT---G--C---CCA-GTG-TAA--GAA--C------AGT--AGCA-AA-T----TT-T-TC-------C-AC-AT--G--GCGC-AGCTNATT-G-AGGC---T-CC--AAA--GG--AG-CA-TT----TTAT-CG--AAGTA-GA--ATNT--TTGT-----TGAAA-T---TTGAAG--C-CNA---GNAG-TTCAAAATC------G---NTTGGC---G----C-----GA----CAGGAA-G-NAAT---------CGG--AAGGCCGATTTGA-TGTCA-G-ATTT-NGCCA---GG-AANGCCCC-C------GCAC------TAGCT-ATCATTCC------GGCT---GCCTCA-----TCAA-TG--------CTTG----AC----------TATAGTG-NACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGAT-GCGAGAG-GTGGTGAATGAGTC-GCAT-GTTTCCATCTTTCTTGGGCACTAGGCCCA---GT-GG--AGA-G-ACTTGCAGA--TTA-GGGAAAGGTGGGGAG---T-CG-AAAGG---GCCT-GCCANC--CGTCCTAGCACTAACTCNTT---CTGAATT-TTG-CTTTTGGC-TATTTGAGAATTAGTCTT-TACACTGG-ATAAAT-TATCAGAAT---TCGAGGAAG--TCTGGGGCC-----C--ATAT-TATTAGCT-T---AAAAC-CGTTAGAAAAGA-CCCCTGCCGAATAAGA---GTAACCCC-TGATACCCCCTGAGGGGTTTGGTTAGTTGCT-GCCAATTAATTGGT---GTAT---ATACCAAAG-GA-A-AATAGAG-AC---C-CCTTATTT-T--GAACAT--TACTGGTGCTTGGG-GTGA---T--GTCCTCCCACATTT--GCTGCAATGCATGCTT-GTACTTGCACCTTGGGGAAAGAATT-ACAA----ATCCCT--TTGCTATAT-AAAGAA---CGGC--AATACA-T-AG--TT---AGCGTTATG-ACTGGC-TTGACCTTGGCNTGAATG-T-GTATAA-TTA-GAGC--GCT-GATTTGAACTGGTGTGCTGCTTTTGTTGGGCTGCGCTTGGTTT---GAAAACACTACAGGA-GCC--AAAATTCCT--GGTTG-A-TCTG-ACCCCCAAGAT-GCTAGTG--AGTG-ATTAGACATCCTTAGCCT---AAATT-GTTCAT-CGT-ACTTAGGCCACAAATTAG--ACCTAGTAGCTCGCAANTCGAATGTTCCCTT-AAATACTTAAGCAATTCTTGGGCTTTACCTGGAGA-CTTTTCGATCATG-ATACTGATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTAG-CCAATGC-TAAGAATTGGATTGG-TTTTGGATT--TTGCAATACAC----ACAA-GCGGCCCC--ACCA-TTATTCGGATGTCT-------CCCA-CATGGA-CTCTTG---GT-----------CCCGGATTTCGCATGCCGACTTGG---TGGTCAGCGACGACAAATCAATAAATTGGCCNTCCCATATTTTTTGTCTTGATTGATAGGGGAACGTTGAGANCCCCCCCAAACAAAGGGGGACATTTCAATAATCGAAGTAACAACTNATTNGCTGATAAGAGTGAGACGCGATAGCATTAACAAANTCACCCCNTCCAAACTCGACTCAGACATCCGAGGAACCCGTTGGTTCCCTTTCGTAGATTCTGGCTGCCGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGNGCGGTGACAATTCCGGGGTCCTGTTGGAATTAGGTGGCTGTTGGTTAAGGGTGCTTTGGC-----TAC--ACC---GCTTAGGTC-GGCCTTT--CCCTCGACTTGGG-GTGCCCATCGTCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTCGTTTTGGTTCGTACTGGTGGCATTTTTGGCCGCCGA-TTG-GTGTCGATTGCAATGGATTGTTGTTGGTCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTC-TAA-CCGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGATGATGC---TAAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACAGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAG--TT-AGATCGGGACAA-ATTGACACACGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTTTAT
gi|1 : TGCCCCACTGTGAACGAGA-----TATT-GCA-TCTGCGAT---G--GAATTGTCCTTAGTGGGGATATAAGAGGCATTAATGC-------TGATATTA-GACCTGAGACAAGCTAACA---CAAGTTTACGA-TGAGATTCATGAC-C-C-TAA-GATTTGGATGTGAATTTATTGATGACATGAATAACTGCCATGTTGTCAATGAGAAACAAAA---GCTTGCAATTTGTGAAATGACT---TT--GCCATAGTGATAAAGAGGCGAC---CACTGGAAAGAGTTC-AAGGAAGACAATGTCCTTAATGACAC----CCTCCT-TAAACCAAAATTTTGGC--AAGGAC----C--CA-TAAGCCCAAATTCCGTTGAAATAGATGCCGAACCCTCCCTTTTCA-CCCCCTGCACTGTCGGTGAATAATT-G-----A-ACCGTTTCA-----TT-ATGTAACC--ATG-GTTGTAAAGAAATTACGGATATGCCATTATAGGA--TTTT--AGAA--ATT-CTAGCCAGGTAAC-A-----AGGTCGGCTTTGATA--TTTTTTGTT-AGCCTAAT--TTTGTAATGAGGTTTGGTAA-TGCCAATTGTTGCATT--GATGAGGCGCCG-GCAA-AAGGCT-CTGCCAGGGG-AAATGACCCTATATACGAAGTTCAATAGGCCAA-TGATGGATTGCATTTA-----GGAAGT---CTTTTG-AC-TTTTAAAAAA------AATTGTATTG--TAAGGTGA---AGCAGGTCCAACTT---GTC-TGAG----------GGGA--GCTTCATGGTCAT--G-T-TGAT-GGA-GTCAAATTCAATGCCCAAGA---AA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---CCTGC-G-C-GAT-GGGGACGCCTATGTC--CCCGCAGATG-G---ATT---TG----AAAAC-C-TCTAAG-GTAT--G-ATAACAAGTT--TG--A---GA------ATTTG----GT--TGTCC-------GCA---G-AAAAGGA-AATCAT-CTA-----AGTAAT---GAAT--GATA------AAACG---GT-----------T---T---------------A----T---T-T---T---TCTGT---G--C---CCA-GTG-TAA--GAATAC------AGCGAAGCA-AA-T----TG-T-TC-------A-A--AT--A--ATAC-AGCTGATTTG-AGGA---A-CC--AAA--AG--AA-CA-TT----TTAT-CG--AAGTA-AA--ATTT--TTGT-----TGAAA-T---TGGAAG--C-CAA---GTAA-TTCAAAATC------G---CTTGGC---G----C-----GA----CAGGAA-G-TAAT---------CGG--AATGCCGATTTGA-TATCA-G-CTTT-TGCCA---GG-AAAGCC----------GCAC------TAGCT-ATCATTCC------AGCT---GCTTGA-----TCTA-TG--------CT------AC----------TATAATG-TACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGAT-GCGAGAG-GTGGTGAATGAGTC-GCAT-CTGTCCATCTTTCTTGGGCACTAGGCCTA---GT-TG--AGA-G-ACTTGAAGA--TTA-GGAAAAGGTGGGGAG---T-CG-AAAGG---GCCT-GCCACC--CGTCAGAGCATTAACTCCTT---CTGAATT-TTG-CTTTTTGC-TATTTGAGAACTAGTCTT-TACACTGG-ATTAAT-TATCAAA------CGAGGAAG--TC-GGG--C-----C--ATAT-TATTAGCT-T---AAAAC-CGTTAGAAAAA---CCCTGCCG-ATAA-A---GT-ACCCC-TGATA--CCCTGAGGTGTTTGGTTAGTTGCT-GCAAA-TAATTGGT---GT-T---ACACCAAA--GA-A-AATAGAG-AC---C-CCTTATTT-T--GAA-AT----CTGGT-CT--GG-GTGA---T--G---TCTCACATTT--GCTGC-ATGC-TGCTT-GTACTTGCACCTTGGGGAAA-AATT-ACAA--------CT--TTGTTAT----AAAAA---CGAC--AATACA-T-A---TT---AGCGTGATG-ACTGGC-TTAA--TTG--CTGAA---T-GTATAA-TTA-GAGC--GCT-GATTTG-ACT-GTGTGTT-CTTTTGT--GGCTGCGCTTGGTTT---G-AAACA-TACAGTA-GCC--AAAATTCCT--GATTG-A-TCTG-A-CCCCAAGAT-GCTAGTG--AGTG-ACTAGATATCCTCAGCCT---AAATT-TTTCAT-CAT-ACTTAGGCCAGAAATTAG--ACTTAGTAGCT-GCAATTCGAATG-TCCCTT-AAATACTTAAGCAGTTCTTGGGCTTTACCTGGAAA-TTTTTCGATCATG-ACACTGATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTA--TCAATGC-TAAGAATTGGATTGG-GTTTGGATT--TTGCAATACACATTGACAA-ACGGCCCT---CCA-TAATTCGAATGTCT-------CCCA-CA--GA-CTCTTG---GT-----------CCTGGATTTCGCATGCCGACTTGGTCATGATCAGCAACGACAAATCAATAAATTGGCCTTCCCATATTTTTTGTTTTGATTGATAGGGGAACGTTG-GATCCC---------AAGGAG------TC----------GTAACAACTTATTTGCTGATAAGAGTGAGACGCAATAACATTAACAAAATCACCCCTTCCAAACTCGACTCAGACATCCGAGGAA-CCGTTGGTTCCC--TCGTAGATTCT-GCTGCCGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGCGCGGTGACAATTCTGGGGTCCTGTTGGAATTAGATGGCTGTTGGTTAAGGGTATTTTGGC-----TAC--ACT---GCTTAGGTC-GGCCTTT--CCCTCGACTTGGG-ATGCTCATCGTCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTTGTTTTGGTTCGTACAGGTGGCATTTTTGGCCTCCGA--TG-GTGTCGATTGCAATGGATTGTTTATGGTCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTG-TAA-CCGA-GA-TGGCTTGGA--AAAGGATGATGC---TAAA-T-----CGTTCTA-GGTGAGGTTTATTTTTATAGTACAATCGTACCATGGCTAACTCGTT-TTACGAAAAG--TT-AGATTGGGACAA-ACTAA-ACAAGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATAAAGCTGGAC-TATTTGTTA-TAAAATCAGA--TAATTTTTAT
gi|10 : GTGGCGTC--GATAAGCCTTTG--CAG-AAGGCT-CGGCCTGGGG-CTATGACC-TACAAGCAAAATTGAGCAGTCCAAATGAGAGACTGCAGT-GAC-CTGAGAGTGACCTTTTTTAC-TGGCACAAAA-----TGATTGGATTG--TA-------------GATTTGATTT---TTAATGAGTTTCTCCCTTGGCA--GTCTCATAACCATTAGCT-TGA--GT--GTCAAATTCAATACC-AAGA---AAAAATGAT------------------G-----------------------TTAGT-TGATGGGGCTGTGGTCTTT---TCTCT-G-C-AAT-TGGGACCCCGATATC--TGAGCATACT-G---ATC---TA----AATAC-T-GACGAA-GTAT--C-AATACACATC--TG--T---GA------GTTTG----GG--GGTCC-------GGC---G-AATAGGA-AATCAT-CTA-----AATAGT---G--T--AGTA----------G---GT-----------T---T----GGGTTGCAACGA----TCGGT-T---T---TGAGT---GA-T---CCA-ATG--GA--GGG--C------AGT--GGCA-AA-T----TT-T-TC-------CCAG-AT--G--GCGC-AGCTAATG-G-AAGC---T-CCGAAAG--GG--AG-CA-TT----TTAT-CA--A---A-AA--GTAT--TTGTTC---TGAAA-C---CTAAAA--C-CTA---AGAG-TTCAAAATCTGTAG-G---ATTCAT---G----G-----GA----CAAG--------T---------CTG--AAGGCTGGATTAATTGTCA-G-ATTT-GGCAA---G
gi|11 : TT---GTCACG-G----------GGAG--GCCTCATTACCAT--GGT-TACT-GT--GTCTATTTCATCACCTAGGA---AAAGTAAGGTTGTGGTTGGGTTTGTA-G-----------------------TC--T-TT----------------T---CATAA-G-C-AAT-GGGG-CACCGACACC--TT----GACA-----ATT---TGCTTGAAAAC-G-TTAAGG-GTAG--C-TTGACAC-----TG--ATCCGG------ATTTG----GA--GG-AC-------CCA---GGAAGAGAG-ATTCGT-CAA-----GGTAGT---GCAT--GATGTTG---G---G---AT-----------TGCGT----G----------A----T---C-TATCT---TGAATT--A--T---CCA-ATG-TAA--GG---C------TGT--CGCA-CA-T----TT-T-TC-------C--C-GT--GTTGCAC-AGCTTATA-G-ACTC---T-CC--AAATGGA--AG-CA-TT----TTGT-CA--AAATA-GT--ATTTG-CCGT-----TG-AA-T---TTGAAA--C-CTA---GAAGATTGAAGATT------GAAATCTGATATGG----C-----TA----CGGGTA-T-TAAG---------CGG--TAGGCAGATTTAA-AATTT-G-ATTT-TGCTA---TA-TAGGTCCC-C------Gc
gi|12 : ggtA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---C-TTC-GTC-TAT-GGGGACCTCCAGGTCAGTGTACA-AC------ATTC--TG----AATAT-T-TGCAAG-GTGT--T--TGTC-CATTGTTG--A---GA--------TTG----G-----------------A---A-AATAAAACAACCAT-CTA-----AATACT---GGAT--AATG------A---AATTGT-----------T---TTG--G----------AGGTGT---T-T---T---TCAGT---AA-T---TCA-ATG-TAA--GAA---------AGT--TGCA-AA-T----TTGT-CC-------C-AC-AG--T--GAAC-AACTGATG-G-AGGA---T-CC--AAATTGA--AG-TA-GC----TTGT-TA--AAGTA-GA--AAAG--CCCT-----TGGAA-T---TTAAAA--CTCGA---TTA--TTGAAAGTTTTCAAGG---TTT------------------A----TAGGAATG-GGA----------CAG--AAAGCTGA-TTGA-TATCA-G-ACTT-gccgcaaagcggctataatggctg
gi|13 : ttagttggttccac-TCTATA-GTAC--GTACGACAGAAT--AG--A---GACAA---ATTTG----GA-----CC-------ACA---T-AATAGAA-AATCGT-CTG-----AATAAT---GAGG--GATATATTCTAT--G---GT-----------TGTGT----G----------A----T---A-T---T----GAGTTAGG--C-----A-ATGCTAA--AAT--A------AGT--AGCA-AC-T----TT-TCTC-------C-AC-AA--A--GCGC-AGCTTATT-G-AGG------------A--GG--AACCA-TT----TTAT-TG--AAAT--GA--Agcaa
gi|16 : taatggtacagatgtagtgatactatgagcatcaaatccaagacaaataaatatgagagtttttgttggtcaaacaatcttgtcctctcatattgttactctgtattcttgtcaaagagacctacaaatgCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTCATTTTGGTTCGTACTGGTGGCATTTTTGGCCGCCGA-T-G-GTGTCAATTGCAATGGATTGTTGTTGATCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTC-TAA-CCGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGATGATGC---TAAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACAATCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAG--TT-AGAACGGGACAA-ATTGACACA--TA-GAAACC---TGT--CCTAAATTGATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTTTgataggcttcaaaatctagaa
gi|17 : GTTGG--GGAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTTGTAATCCGA-GAATGGCGTGGATAGAAGGATGATGTGCGTAAGCT-----CGTTCTATGGTTAGGTTTATTTTTATGGTACGGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAGTATT-AGATCGAGACAA-ATTGACACTCGTATTAAACC---TGTCCCCTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATAGTAAAATCAAAATTAATTTGTAT
gi|18 : AAACAGTCTTTG-TCTGGCATC-TAT-CTGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGAATATGC---TAAA-TTAATTCGTTCTA-GATTAGGTTTATTT--ATAGTACAGTCGTACCATGGCTAACTAATA-TTAC-AAAAT--TT-ACATTGGAACAA-ATTAA-ACACGTA-GACACC---TGT--CTTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTCTATtaa
gi|19 : ggTGGCCCACTGTAAATGA-------TATC--TAAT--ACGAT---G--GAATTGGTTTGAGTAGGAATGTGTGAAACCCTAATGA------GT-ATATTGTGACGT----ATGGCTAATAGAATAAGTTTTCTAACAACACGCATTAC-T-CTTGGGGATta
gi|2 : aaactggtctgcatcttgtgccaactgtcaatatcCCCACTGCGAACGAGAAAGACTGTCAGCAA-----GA----ATTGAA--GTTTTGA-TGG-AATGTGCTGAGCTTTAA---------GTGATGTTGTA--TTGTAAC--GTTACAAGGACTATATTTCTAACAATTTGCATGAC-TGC-TGGTGATTTGGATGTTGATGAGTTAAGTATCTGAACCACTGCCATATTGTCAATGTGAAACAGGATTCGC-----AT--GTTCAA-GAGTCTGTCTCACCACAATGA--AAG-TGCTACATACACTGGGAAAAGTTCCAA-AAATGTCATGCCTCTGACCACCC----CCTGCT--GGACCCA------GGCCTGAGGCCATCTC--GAATGTGCCCAGCTGCCCGCGAAATAGATACCAAATCC-CCCTTTTGATCCCCCTGCGCTATCTGTAAAGAATT-GCAGTGA-A--GTGTCAGAGGTCC-ACAGA-CC--AAGAGTTATAAG--------TGTAATGCCATTA-AA-A--TCTTGCAGGA--ACTGTT-GCCAGACA-TGA-----AGGTCAGATTTCATG--TCTTGTGTG-ATTCTGAC--CATGTGATGTTGTTTTTTGA-TGCCGACTGTTGCATC--GATCAATCG-CGTGCAA-AATGCA-CGACCAGGGG-CAACAGTTTTGCACGCAAAGTTCAGTAAGCCAA-TGAGTGATTGCA--TGTCTTTGAGAGTTACCTTTTT-CC-TAAGAAGAAAGAAGTCAATTGT-TTGTTTTAGAT---------TATCTAGCTT---ATCTTG-G----------GGGA--GACGCATAACCAT--G-T-TAATCGT--GTAAAATTCAATGCCCCAAA---AG-------------------------GTGATGACAGTGTTGGGTTCAGTGTT--T-TT----------------T---TCTACGG-C-TAG-TGGTACACCTATTTT--TT----GACA-A---ATT---TGCTT-AAAAA-T-TGTAAGTGTGG--A-ATGACATTGT--TG--T---GA------GTT-----------G-CCCATGCCAGC----G-AAAAGGA-AATCAT-CT------AGTAATGCAGAAT---ATA------A---G---GA-----------T---TGCGAG----------A----TTGAT-T---T---TGAAT---A--A---TCC-GTG-T-A--GGG--C------TGT--AGCA-AACT----TT-T-CC-------C-AC-GT--T--GCAC-AGCTTATT-G-ATGC---T-CC--AAA--TG---G-CA-TTCATCTTGT-CA--AAATA-TA----TT--TTGA-----TTAAA-----TTGAAT--C-C-A---GTAG-TCAAAAATCTGA---G---TCTGCC---A----CTG---GG----CAGAAC-G-AAA-----------GG--GCGACGGATTTGA-CGTCA-G-ATTT-AGCCA---AACAGCGTACC-T------GGACCCAAGGTAGCC-ACTAT---------GGATGGAGCCTCA-----TCAA-----------CTGA----AG----------TGTAATG-AACTGAAGCAA------GC-GTC-GAGTCAATATCAATGATTT-ATGGA---ATTAAATTCAGGGT-A-AATAA-ATGATGTATGAGAC-G-ATAGTTACCATCTTT-TTAGGGACCAGACCCAAAGATGGG--AGAGG-ATTTGTA-A--TAAGGGGAAAGGTGGAGGGTGAT-CA-AAAGG---GGCC-CCCAAC--
gi|20 : ttcgcctactctgagcaacgcaaaatatgctaagcaaaaggcacatgtaaaaagtttgacctcataagtagaagcacataagagtggcaatgatgccaccattttttccagaataggaaaagtgataggacaacgcaagtcctctcccatacccctggtgcgcttgagacctaataatgctttgccaatgagaaagtgatttgttgggtcctcaagccctctaagtttatggtagaaagctaatgcgcttacgtacaaatgcacagtgcgaggggaatattggtgaattgacaagtctgcaataaatttagcaacactgaaactggtataggccaagttactgccgcttgattgtactggactctaaagaaaattaaaaaaaattttaagggcagtttcgtatgtcttgtgtgtactgggagctagagcgttgtaaatgaggcttctggattcagcccttagatctgctcgagttgggaattgggggttggccaaacgtctgcgtcgggcgccagcttcctgaatttctTGGTCCACTGTGAACGAGA-----T----------------TTTGTTGAGTT-TC----GTGGGAATGTATTGTACTTTAACAATCAATTATGATGTTGT-ACTTGAGGGTGATCAAG---ACAAACTTGCAAACAAGCTGCAtcaga
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Reference ( family-881 ) : TGGCCCACTGTGAACGAGA-----TATC-GCAATCTGCGATTTTGTTGAATTGTCTTGAGTGGGAATGTATTGNGCTTTAACGA------GTGATGTTGTGACTTGAGANTGGTTAANAGAACAANCTTNCGAACAAGNTGCATNAC-T-C-TGGTGATTTGGATGTCGATTTATTGAGTACGTGAACGACTGCCATATTGTCAATGTGAAACAAAATTCGCTT---ATCTGTTAAA-GANTC-G--TCGCCATAATGACAAAGAGGCGACATACACTGGGAANAGTTCCAAGAAAGNCCATGTCCCTAACGACAC----CCTCCT-CGGACCAA-----TGGCC-GAGGAC----C--GAATANGCCCAGCTNCCCGCGAAATAGATGCCGAANCC-CCCTTTTGA-CCCCCTGCGCTGTCTGTGAANAATT-G----A-AC-GTTTCA-----TC-GCGTA-CC--ACG-GTTGTAAAGAAAT-ACNGNNATGCCATTATAG-A--TCTT--AGAA--ATT-CT-GCCAGGCA-C-A-----AGGTCGGCTTTGATA--TTTTNTGTT-ANCCTGAC--TTTGTGATGAGGTTTGGTAA-TGCCGATTGTGGCGTC--GATGAGCCGTCG-GCAG-AAGGCT-CGGCCAGGGG-NNACGACCCTACANGCGAAGTTCAGTAGNCCAA-TGAGGGACTGCANTTGAC-CTGAGAGTGACCTTTTN-AC-TNNCAAAAAA-----TAATTGTATTGTAAGGTG----A-GCAGATCCGACTT---GTCATGAG----------GGNA--GCCTCATAGCCAT--G-T-TGAT-GT--GTCAAATTCAATGCCCAAGA---AA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---CCTNC-G-C-GAT-GGGGACNCCTATGTC--TNCGCAGACG-G---ATT---TG----AANAC-T-TCTAAG-GTAT--N-ATGACANATT--TG--A---GA------ATTTG----GG--GG-CC-------GCA---G-AANAGGA-AATCAT-CTA-----AGTAGT---GAAT--GATA------A---G---GT-----------T---T----G----------A----T---TT---T---TGAGTGA-CCCA-GTG-TAAGAA--CAGT--AGCA-AA-T----TT-T-TC-------C-AC-AT--G--GCGC-AGCTNATT-GAGGC---TCC--AAA--GG--AG-CA-TT----TTAT-CG--AAGTA-GA--ATNT--TTGT-----TGAAA-T---TTGAAG--C-CNA---GNAG-TTCAAAATC------G---NTTGGC---G----C-----GA----CAGGAA-G-NAAT---------CGG--AAGGCCGATTTGA-TGTCA-G-ATTT-NGCCA---GG-AANGCCCC-C------GCAC------TAGCT-ATCATTCC------GGCT---GCCTCA-----TCAA-TG--------CTTG----AC----------TATAGTG-NACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGAT-GCGAGAG-GTGGTGAATGAGTC-GCAT-GTTTCCATCTTTCTTGGGCACTAGGCCCA---GT-GG--AGA-G-ACTTGCAGA--TTA-GGGAAAGGTGGGGAG---T-CG-AAAGG---GCCT-GCCANC--CGTCCTAGCACTAACTCNTT---CTGAATT-TTG-CTTTTGGC-TATTTGAGAATTAGTCTT-TACACTGG-ATAAAT-TATCAGAAT---TCGAGGAAG--TCTGGGGCC-----C--ATAT-TATTAGCT-T---AAAAC-CGTTAGAAAAGA-CCCCTGCCGAATAAGA---GTAACCCC-TGATACCCCCTGAGGGGTTTGGTTAGTTGCT-GCCAATTAATTGGT---GTAT---ATACCAAAG-GA-A-AATAGAG-AC---C-CCTTATTT-T--GAACAT--TACTGGTGCTTGGG-GTGA---T--GTCCTCCCACATTT--GCTGCAATGCATGCTT-GTACTTGCACCTTGGGGAAAGAATT-ACAA----ATCCCT--TTGCTATAT-AAANAA---CGGC--AATACA-T-AG--TT---AGCGTTATG-ACTGGC-TTGACCTTGGCNTGAATG-T-GTATAA-TTA-GAGC--GCT-GATTTGAACTGGTGTGCTGCTTTTGTTGGGCTGCGCTTGGTTT---GAAAACACTACAGGA-GCC--AAAATTCCT--GGTTG-A-TCTG-ACCCCCAAGAT-GCTAGTG--AGTG-ATTAGACATCCTTAGCCT---AAATT-GTTCAT-CGT-ACTTAGGCCACAAATTAG--ACCTAGTAGCTCGCAANTCGAATGTTCCCTT-AAATACTTAAGCAATTCTTGGGCTTTACCTGGAGA-CTTTTCGATCATG-ATACTGATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTAG-CCAATGC-TAAGAATTGGATTGG-TTTTGGATT--TTGCAAT-CAC----ACAA-GCGGCCCC--ACCA-TTATTCGGATGTCT-------CCCA-CATGGA-CTCTTG---GT-----------CCCGGATTTCGCATGCCGACTTGG---TGGTCAGCGACGACAAATCAATAAATTGGCCNTCCCATATTTTTTGTCTTGATTGATAGGGGAACGTTGAGANCCCCCCCAAACAAAGGGGGACATTTCAATAATCGAAGTAACAACTNATTNGCTGATAAGAGTGAGACGCGATAGCATTAACAAANTCACCCCNTCCAAACTCGACTCAGACATCCGAGGAACCCGTTGGTTCCCTTTCGTAGATTCTGGCTGCCGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGNGCGGTGACAATTCCGGGGTCCTGTTGGAATTAGGTGGCTGTTGGTTAAGGGTGCTTTGGC-----TAC--ACC---GCTTAGGTC-GGCCTTT--CCCTCGACTTGGG-GTGCCCATCGTCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTCGTTTTGGTTCGTACTGGTGGCATTTTTGGCCGCCGA-TTG-GTGTCGATTGCAATGGATTGTTGTTGGTCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTC-TAA-CCGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGATGATGC---TAAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACAGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAG--TT-AGATCGGGACAA-ATTGACACACGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTTTAT
gi|1 : TGCCCCACTGTGAACGAGA-----TATT-GCA-TCTGCGAT---G--GAATTGTCCTTAGTGGGGATATAAGAGGCATTAATGC-------TGATATTA-GACCTGAGACAAGCTAACA---CAAGTTTACGA-TGAGATTCATGAC-C-C-TAA-GATTTGGATGTGAATTTATTGATGACATGAATAACTGCCATGTTGTCAATGAGAAACAAAA---GCTTGCAATTTGTGAAATGACT-----TTGCCATAGTGATAAAGAGGCGAC---CACTGGAAAGAGTTC-AAGGAAGACAATGTCCTTAATGACAC----CCTCCT-TAAACCAAAATTTTGGC--AAGGAC----C--CA-TAAGCCCAAATTCCGTTGAAATAGATGCCGAACCCTCCCTTTTCA-CCCCCTGCACTGTCGGTGAATAATT-G----A-ACCGTTTCA-----TT-ATGTAACC--ATG-GTTGTAAAGAAATTACGGATATGCCATTATAGGA--TTTT--AGAA--ATT-CTAGCCAGGTAAC-A-----AGGTCGGCTTTGATA--TTTTTTGTT-AGCCTAAT--TTTGTAATGAGGTTTGGTAA-TGCCAATTGTTGCATT--GATGAGGCGCCG-GCAA-AAGGCT-CTGCCAGGGG-AAATGACCCTATATACGAAGTTCAATAGGCCAA-TGATGGATTGCATTTA-----GGAAGT---CTTTTG-AC-TTTTAAAAAA------AATTGTATTGTAAGGTG----AAGCAGGTCCAACTT---GTC-TGAG----------GGGA--GCTTCATGGTCAT--G-T-TGAT-GGA-GTCAAATTCAATGCCCAAGA---AA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---CCTGC-G-C-GAT-GGGGACGCCTATGTC--CCCGCAGATG-G---ATT---TG----AAAAC-C-TCTAAG-GTAT--G-ATAACAAGTT--TG--A---GA------ATTTG----GT--TGTCC-------GCA---G-AAAAGGA-AATCAT-CTA-----AGTAAT---GAAT--GATA------AAACG---GT-----------T---T---------------A----T---TT---T---TCTGTG--CCCA-GTG-TAAGAATACAGCGAAGCA-AA-T----TG-T-TC-------A-A--AT--A--ATAC-AGCTGATTTGAGGA---ACC--AAA--AG--AA-CA-TT----TTAT-CG--AAGTA-AA--ATTT--TTGT-----TGAAA-T---TGGAAG--C-CAA---GTAA-TTCAAAATC------G---CTTGGC---G----C-----GA----CAGGAA-G-TAAT---------CGG--AATGCCGATTTGA-TATCA-G-CTTT-TGCCA---GG-AAAGCC----------GCAC------TAGCT-ATCATTCC------AGCT---GCTTGA-----TCTA-TG--------CT------AC----------TATAATG-TACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGAT-GCGAGAG-GTGGTGAATGAGTC-GCAT-CTGTCCATCTTTCTTGGGCACTAGGCCTA---GT-TG--AGA-G-ACTTGAAGA--TTA-GGAAAAGGTGGGGAG---T-CG-AAAGG---GCCT-GCCACC--CGTCAGAGCATTAACTCCTT---CTGAATT-TTG-CTTTTTGC-TATTTGAGAACTAGTCTT-TACACTGG-ATTAAT-TATCAAA------CGAGGAAG--TC-GGG--C-----C--ATAT-TATTAGCT-T---AAAAC-CGTTAGAAAAA---CCCTGCCG-ATAA-A---GT-ACCCC-TGATA--CCCTGAGGTGTTTGGTTAGTTGCT-GCAAA-TAATTGGT---GT-T---ACACCAAA--GA-A-AATAGAG-AC---C-CCTTATTT-T--GAA-AT----CTGGT-CT--GG-GTGA---T--G---TCTCACATTT--GCTGC-ATGC-TGCTT-GTACTTGCACCTTGGGGAAA-AATT-ACAA--------CT--TTGTTAT----AAAAA---CGAC--AATACA-T-A---TT---AGCGTGATG-ACTGGC-TTAA--TTG--CTGAA---T-GTATAA-TTA-GAGC--GCT-GATTTG-ACT-GTGTGTT-CTTTTGT--GGCTGCGCTTGGTTT---G-AAACA-TACAGTA-GCC--AAAATTCCT--GATTG-A-TCTG-A-CCCCAAGAT-GCTAGTG--AGTG-ACTAGATATCCTCAGCCT---AAATT-TTTCAT-CAT-ACTTAGGCCAGAAATTAG--ACTTAGTAGCT-GCAATTCGAATG-TCCCTT-AAATACTTAAGCAGTTCTTGGGCTTTACCTGGAAA-TTTTTCGATCATG-ACACTGATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTA--TCAATGC-TAAGAATTGGATTGG-GTTTGGATT--TTGCAATACACATTGACAA-ACGGCCCT---CCA-TAATTCGAATGTCT-------CCCA-CA--GA-CTCTTG---GT-----------CCTGGATTTCGCATGCCGACTTGGTCATGATCAGCAACGACAAATCAATAAATTGGCCTTCCCATATTTTTTGTTTTGATTGATAGGGGAACGTTG-GATCCC---------AAGGAG------TC----------GTAACAACTTATTTGCTGATAAGAGTGAGACGCAATAACATTAACAAAATCACCCCTTCCAAACTCGACTCAGACATCCGAGGAA-CCGTTGGTTCCC--TCGTAGATTCT-GCTGCCGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGCGCGGTGACAATTCTGGGGTCCTGTTGGAATTAGATGGCTGTTGGTTAAGGGTATTTTGGC-----TAC--ACT---GCTTAGGTC-GGCCTTT--CCCTCGACTTGGG-ATGCTCATCGTCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTTGTTTTGGTTCGTACAGGTGGCATTTTTGGCCTCCGA--TG-GTGTCGATTGCAATGGATTGTTTATGGTCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTG-TAA-CCGA-GA-TGGCTTGGA--AAAGGATGATGC---TAAA-T-----CGTTCTA-GGTGAGGTTTATTTTTATAGTACAATCGTACCATGGCTAACTCGTT-TTACGAAAAG--TT-AGATTGGGACAA-ACTAA-ACAAGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATAAAGCTGGAC-TATTTGTTA-TAAAATCAGA--TAATTTTTAT
gi|10 : GTGGCGTC--GATAAGCCTTTG--CAG-AAGGCT-CGGCCTGGGG-CTATGACC-TACAAGCAAAATTGAGCAGTCCAAATGAGAGACTGCAGT-GAC-CTGAGAGTGACCTTTTTTAC-TGGCACAAAA-----TGATTGGATTGTA--------------GATTTGATTT---TTAATGAGTTTCTCCCTTGGCA--GTCTCATAACCATTAGCT-TGA--GT--GTCAAATTCAATACC-AAGA---AAAAATGAT------------------G-----------------------TTAGT-TGATGGGGCTGTGGTCTTT---TCTCT-G-C-AAT-TGGGACCCCGATATC--TGAGCATACT-G---ATC---TA----AATAC-T-GACGAA-GTAT--C-AATACACATC--TG--T---GA------GTTTG----GG--GGTCC-------GGC---G-AATAGGA-AATCAT-CTA-----AATAGT---G--T--AGTA----------G---GT-----------T---T----GGGTTGCAACGA----TCGGTT---T---TGAGTGA-TCCA-ATG--GAGGG--CAGT--GGCA-AA-T----TT-T-TC-------CCAG-AT--G--GCGC-AGCTAATG-GAAGC---TCCGAAAG--GG--AG-CA-TT----TTAT-CA--A---A-AA--GTAT--TTGTTC---TGAAA-C---CTAAAA--C-CTA---AGAG-TTCAAAATCTGTAG-G---ATTCAT---G----G-----GA----CAAG--------T---------CTG--AAGGCTGGATTAATTGTCA-G-ATTT-GGCAA---G
gi|11 : TT---GTCACG-G----------GGAG--GCCTCATTACCAT--GGT-TACT-GT--GTCTATTTCATCACCTAGGA---AAAGTAAGGTTGTGGTTGGGTTTGTA-G-----------------------TC--T-TT----------------T---CATAA-G-C-AAT-GGGG-CACCGACACC--TT----GACA-----ATT---TGCTTGAAAAC-G-TTAAGG-GTAG--C-TTGACAC-----TG--ATCCGG------ATTTG----GA--GG-AC-------CCA---GGAAGAGAG-ATTCGT-CAA-----GGTAGT---GCAT--GATGTTG---G---G---AT-----------TGCGT----G----------A----T---CTATCT---TGAATTA-TCCA-ATG-TAAGG---CTGT--CGCA-CA-T----TT-T-TC-------C--C-GT--GTTGCAC-AGCTTATA-GACTC---TCC--AAATGGA--AG-CA-TT----TTGT-CA--AAATA-GT--ATTTG-CCGT-----TG-AA-T---TTGAAA--C-CTA---GAAGATTGAAGATT------GAAATCTGATATGG----C-----TA----CGGGTA-T-TAAG---------CGG--TAGGCAGATTTAA-AATTT-G-ATTT-TGCTA---TA-TAGGTCCC-C------Gc
gi|12 : ggtA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---C-TTC-GTC-TAT-GGGGACCTCCAGGTCAGTGTACA-AC------ATTC--TG----AATAT-T-TGCAAG-GTGT--T--TGTC-CATTGTTG--A---GA--------TTG----G-----------------A---A-AATAAAACAACCAT-CTA-----AATACT---GGAT--AATG------A---AATTGT-----------T---TTG--G----------AGGTGT---TT---T---TCAGTAA-TTCA-ATG-TAAGAA---AGT--TGCA-AA-T----TTGT-CC-------C-AC-AG--T--GAAC-AACTGATG-GAGGA---TCC--AAATTGA--AG-TA-GC----TTGT-TA--AAGTA-GA--AAAG--CCCT-----TGGAA-T---TTAAAA--CTCGA---TTA--TTGAAAGTTTTCAAGG---TTT------------------A----TAGGAATG-GGA----------CAG--AAAGCTGA-TTGA-TATCA-G-ACTT-gccgcaaagcggctataatggctg
gi|13 : ttagttggttccac-TCTATA-GTAC--GTACGACAGAAT--AG--A---GACAA---ATTTG----GA-----CC-------ACA---T-AATAGAA-AATCGT-CTG-----AATAAT---GAGG--GATATATTCTAT--G---GT-----------TGTGT----G----------A----T---AT---T----GAGTTA-GGCA-ATGCTAAAAT--AAGT--AGCA-AC-T----TT-TCTC-------C-AC-AA--A--GCGC-AGCTTATT-GAGG-----------A--GG--AACCA-TT----TTAT-TG--AAAT--GA--Agcaa
gi|16 : taatggtacagatgtagtgatactatgagcatcaaatccaagacaaataaatatgagagtttttgttggtcaaacaatcttgtcctctcatattgttactctgtattcttgtcaaagagacctacaaatgCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTCATTTTGGTTCGTACTGGTGGCATTTTTGGCCGCCGA-T-G-GTGTCAATTGCAATGGATTGTTGTTGATCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTC-TAA-CCGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGATGATGC---TAAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACAATCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAG--TT-AGAACGGGACAA-ATTGACACA--TA-GAAACC---TGT--CCTAAATTGATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTTTgataggcttcaaaatctagaa
gi|17 : GTTGG--GGAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTTGTAATCCGA-GAATGGCGTGGATAGAAGGATGATGTGCGTAAGCT-----CGTTCTATGGTTAGGTTTATTTTTATGGTACGGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAGTATT-AGATCGAGACAA-ATTGACACTCGTATTAAACC---TGTCCCCTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATAGTAAAATCAAAATTAATTTGTAT
gi|18 : AAACAGTCTTTG-TCTGGCATC-TAT-CTGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGAATATGC---TAAA-TTAATTCGTTCTA-GATTAGGTTTATTT--ATAGTACAGTCGTACCATGGCTAACTAATA-TTAC-AAAAT--TT-ACATTGGAACAA-ATTAA-ACACGTA-GACACC---TGT--CTTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTCTATtaa
gi|19 : ggTGGCCCACTGTAAATGA-------TATC--TAAT--ACGAT---G--GAATTGGTTTGAGTAGGAATGTGTGAAACCCTAATGA------GT-ATATTGTGACGT----ATGGCTAATAGAATAAGTTTTCTAACAACACGCATTAC-T-CTTGGGGATta
gi|2 : aaactggtctgcatcttgtgccaactgtcaatatcCCCACTGCGAACGAGAAAGACTGTCAGCAA-----GA----ATTGAA--GTTTTGA-TGG-AATGTGCTGAGCTTTAA---------GTGATGTTGTA--TTGTAAC--GTTACAAGGACTATATTTCTAACAATTTGCATGAC-TGC-TGGTGATTTGGATGTTGATGAGTTAAGTATCTGAACCACTGCCATATTGTCAATGTGAAACAGGATTCGC-----A--TGTTCAA-GAGTCTGTCTCACCACAATG--AAAG-TGCTACATACACTGGGAAAAGTTCCAA-AAATGTCATGCCTCTGACCACCC----CCTGCT--GGACCCA------GGCCTGAGGCCATCTC--GAATGTGCCCAGCTGCCCGCGAAATAGATACCAAATCC-CCCTTTTGATCCCCCTGCGCTATCTGTAAAGAATT-GCAGTG-AA-GTGTCAGAGGTCC-ACAGA-CC--AAGAGTTATAAG--------TGTAATGCCATTA-AA-A--TCTTGCAGGA--ACTGTT-GCCAGACA-TGA-----AGGTCAGATTTCATG--TCTTGTGTG-ATTCTGAC--CATGTGATGTTGTTTTTTGA-TGCCGACTGTTGCATC--GATCAATCG-CGTGCAA-AATGCA-CGACCAGGGG-CAACAGTTTTGCACGCAAAGTTCAGTAAGCCAA-TGAGTGATTGCA--TGTCTTTGAGAGTTACCTTTTT-CC-TAAGAAGAAAGAAGTCAATTGT-TTGT---TTT----A-GATTATCTAGCTT---ATCTTG-G----------GGGA--GACGCATAACCAT--G-T-TAATCGT--GTAAAATTCAATGCCCCAAA---AG-------------------------GTGATGACAGTGTTGGGTTCAGTGTT--T-TT----------------T---TCTACGG-C-TAG-TGGTACACCTATTTT--TT----GACA-A---ATT---TGCTT-AAAAA-T-TGTAAGTGTGG--A-ATGACATTGT--TG--T---GA------GTT-----------G-CCCATGCCAGC----G-AAAAGGA-AATCAT-CT------AGTAATGCAGAAT---ATA------A---G---GA-----------T---TGCGAG----------A----TTGATT---T---TGAATAA-TCC--GTG-T-AGGG--CTGT--AGCA-AACT----TT-T-CC-------C-AC-GT--T--GCAC-AGCTTATT-GATGC---TCC--AAA--TG---G-CA-TTCATCTTGT-CA--AAATA-TA----TT--TTGA-----TTAAA-----TTGAAT--C-C-A---GTAG-TCAAAAATCTGA---G---TCTGCC---A----CTG---GG----CAGAAC-G-AAA-----------GG--GCGACGGATTTGA-CGTCA-G-ATTT-AGCCA---AACAGCGTACC-T------GGACCCAAGGTAGCC-ACTAT---------GGATGGAGCCTCA-----TCAA-----------CTGA----AG----------TGTAATG-AACTGAAGCAA------GC-GTC-GAGTCAATATCAATGATTT-ATGGA---ATTAAATTCAGGGT-A-AATAA-ATGATGTATGAGAC-G-ATAGTTACCATCTTT-TTAGGGACCAGACCCAAAGATGGG--AGAGG-ATTTGTA-A--TAAGGGGAAAGGTGGAGGGTGAT-CA-AAAGG---GGCC-CCCAAC--
gi|20 : ttcgcctactctgagcaacgcaaaatatgctaagcaaaaggcacatgtaaaaagtttgacctcataagtagaagcacataagagtggcaatgatgccaccattttttccagaataggaaaagtgataggacaacgcaagtcctctcccatacccctggtgcgcttgagacctaataatgctttgccaatgagaaagtgatttgttgggtcctcaagccctctaagtttatggtagaaagctaatgcgcttacgtacaaatgcacagtgcgaggggaatattggtgaattgacaagtctgcaataaatttagcaacactgaaactggtataggccaagttactgccgcttgattgtactggactctaaagaaaattaaaaaaaattttaagggcagtttcgtatgtcttgtgtgtactgggagctagagcgttgtaaatgaggcttctggattcagcccttagatctgctcgagttgggaattgggggttggccaaacgtctgcgtcgggcgccagcttcctgaatttctTGGTCCACTGTGAACGAGA-----T----------------TTTGTTGAGTT-TC----GTGGGAATGTATTGTACTTTAACAATCAATTATGATGTTGT-ACTTGAGGGTGATCAAG---ACAAACTTGCAAACAAGCTGCAtcaga
gi|22 : gtggtgaaattGGGTGCTTTTGC-----TAC--ACC---GCTTAGGTT-GGCCCTT--CCCTCGACTTGGG-GTACCCATCGTTTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCC
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Reference ( family-881 ) : TGGCCCACTGTGAACGAGA-----TATC-GCAATCTGCGATTTTGTTGAATTGTCTTGAGTGGGAATGTATTGNGCTTTAACGA------GTGATGTTGTGACTTGAGANTGGTTAANAGAACAANCTTNCGAACAAGNTGCATNAC-T-C-TGGTGATTTGGATGTCGATTTATTGAGTACGTGAACGACTGCCATATTGTCAATGTGAAACAAAATTCGCTT---ATCTGTTAAA-GANTC-G--TCGCCATAATGACAAAGAGGCGACATACACTGGGAANAGTTCCAAGAAAGNCCATGTCCCTAACGACAC----CCTCCT-CGGACCAA-----TGGCC-GAGGAC----C--GAATANGCCCAGCTNCCCGCGAAATAGATGCCGAANCC-CCCTTTTGA-CCCCCTGCGCTGTCTGTGAANAATT-G----A-AC-GTTTCA-----TC-GCGTA-CC--ACG-GTTGTAAAGAAAT-ACNGNNATGCCATTATAG-A--TCTT--AGAA--ATT-CT-GCCAGGCA-C-A-----AGGTCGGCTTTGATA--TTTTNTGTT-ANCCTGAC--TTTGTGATGAGGTTTGGTAA-TGCCGATTGTGGCGTC--GATGAGCCGTCG-GCAG-AAGGCT-CGGCCAGGGG-NNACGACCCTACANGCGAAGTTCAGTAGNCCAA-TGAGGGACTGCANTTGAC-CTGAGAGTGACCTTTTN-AC-TNNCAAAAAA-----TAATTGTATTGTAAGGTG----A-GCAGATCCGACTT---GTCATGAG----------GGNA--GCCTCATAGCCAT--G-T-TGAT-GT--GTCAAATTCAATGCCCAAGA---AA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---CCTNC-G-C-GAT-GGGGACNCCTATGTC--TNCGCAGACG-G---ATT---TG----AANAC-T-TCTAAG-GTAT--N-ATGACANATT--TG--A---GA------ATTTG----GG--GG-CC-------GCA---G-AANAGGA-AATCAT-CTA-----AGTAGT---GAAT--GATA------A---G---GT-----------T---T----G----------A----T---TT---T---TGAGTGATCCAA--TG-TAAGGA--CAGT--AGCA-AA-T----TT-T-T-C-------C-AC-AT--G--GCGC-AGCTNATT-G-AGGC---T-CC--AAA--GG--AG-CA-TT----TTAT-CGAA--GTA-GA--ATNT--TTGT-----TGAAA-T---TTGAAG--C-CNAGN---AG-TTCAAAATC------G---NTTGGC---G----C-------GAC--AGGAA-GN-AAT---------CGGA--AGGCCGATTTGA-TGTCA-G-ATTTN-GCCAGG---AANGCCCCC------GCAC------TAGCT-ATCATTCC------GGCT---GCCTCAT-----CAA-TG--------CTTG----AC----------TATA-GTGNACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGATG-CGAGAG-GTGGTGAATGAGTCG-CAT-GTTTCCATCTTTCTTGGGCACTAGGCCCA---GT-GG--AGA-G-ACTTGCAGA--TTA-GGGAAAGGTGGGGAG---T-C-G-AAAGG---GCCT-GCCANC--CGTCCTAGCACTAACTCNTT---CTGAATT-TTG-CTTTTGGC-TATTTGAGAATTAGTCTT-TACACTGG-ATAAAT-TATCAGAAT---TCGAGGAAG--TCTGGGGCC-----C--ATAT-TATTAGCT-T---AAAAC-CGTTAGAAAAGA-CCCCTGCCGAATAAGA---GTAACCCC-TGATACCCCCTGAGGGGTTTGGTTAGTTGCT-GCCAATTAATTGGT---GTAT---ATACCAAAG-GA-A-AATAGAG-AC---C-CCTTATTT-T--GAACAT--TACTGGTGCTTGGG-GTGA---T--GTCCTCCCACATTT--GCTGCAATGCATGCTT-GTACTTGCACCTTGGGGAAAGAATT-ACAA----ATCCCT--TTGCTATAT-AAANAA---CGGC--AATACA-T-AG--TT---AGCGTTATG-ACTGGC-TTGACCTTGGCNTGAATG-T-GTATAA-TTA-GAGC--GCT-GATTTGAACTGGTGTGCTGCTTTTGTTGGGCTGCGCTTGGTTT---GAAAACACTACAGGA-GCC--AAAATTCCT--GGTTG-A-TCTG-ACCCCCAAGAT-GCTAGTG--AGTG-ATTAGACATCCTTAGCCT---AAATT-GTTCAT-CGT-ACTTAGGCCACAAATTAG--ACCTAGTAGCTCGCAANTCGAATGTTCCCTT-AAATACTTAAGCAATTCTTGGGCTTTACCTGGAGA-CTTTTCGATCATG-ATACTGATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTAG-CCAATGC-TAAGAATTGGATTGG-TTTTGGATT--TTGCAAT-CAC----ACAA-GCGGCCCC--ACCA-TTATTCGGATGTCT-------CCCA-CATGGA-CTCTTG---GT-----------CCCGGATTTCGCATGCCGACTTGG---TGGTCAGCGACGACAAATCAATAAATTGGCCNTCCCATATTTTTTGTCTTGATTGATAGGGGAACGTTGAGANCCCCCCCAAACAAAGGGGGACATTTCAATAATCGAAGTAACAACTNATTNGCTGATAAGAGTGAGACGCGATAGCATTAACAAANTCACCCCNTCCAAACTCGACTCAGACATCCGAGGAACCCGTTGGTTCCCTTTCGTAGATTCTGGCTGCCGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGNGCGGTGACAATTCCGGGGTCCTGTTGGAATTAGGTGGCTGTTGGTTAAGGGTGCTTTGGC-----TAC--ACC---GCTTAGGTC-GGCCTTT--CCCTCGACTTGGG-GTGCCCATCGTCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTCGTTTTGGTTCGTACTGGTGGCATTTTTGGCCGCCGA-TTG-GTGTCGATTGCAATGGATTGTTGTTGGTCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTC-TAA-CCGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGATGATGC---TAAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACAGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAG--TT-AGATCGGGACAA-ATTGACACACGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTTTAT
gi|1 : TGCCCCACTGTGAACGAGA-----TATT-GCA-TCTGCGAT---G--GAATTGTCCTTAGTGGGGATATAAGAGGCATTAATGC-------TGATATTA-GACCTGAGACAAGCTAACA---CAAGTTTACGA-TGAGATTCATGAC-C-C-TAA-GATTTGGATGTGAATTTATTGATGACATGAATAACTGCCATGTTGTCAATGAGAAACAAAA---GCTTGCAATTTGTGAAATGACT-----TTGCCATAGTGATAAAGAGGCGAC---CACTGGAAAGAGTTC-AAGGAAGACAATGTCCTTAATGACAC----CCTCCT-TAAACCAAAATTTTGGC--AAGGAC----C--CA-TAAGCCCAAATTCCGTTGAAATAGATGCCGAACCCTCCCTTTTCA-CCCCCTGCACTGTCGGTGAATAATT-G----A-ACCGTTTCA-----TT-ATGTAACC--ATG-GTTGTAAAGAAATTACGGATATGCCATTATAGGA--TTTT--AGAA--ATT-CTAGCCAGGTAAC-A-----AGGTCGGCTTTGATA--TTTTTTGTT-AGCCTAAT--TTTGTAATGAGGTTTGGTAA-TGCCAATTGTTGCATT--GATGAGGCGCCG-GCAA-AAGGCT-CTGCCAGGGG-AAATGACCCTATATACGAAGTTCAATAGGCCAA-TGATGGATTGCATTTA-----GGAAGT---CTTTTG-AC-TTTTAAAAAA------AATTGTATTGTAAGGTG----AAGCAGGTCCAACTT---GTC-TGAG----------GGGA--GCTTCATGGTCAT--G-T-TGAT-GGA-GTCAAATTCAATGCCCAAGA---AA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---CCTGC-G-C-GAT-GGGGACGCCTATGTC--CCCGCAGATG-G---ATT---TG----AAAAC-C-TCTAAG-GTAT--G-ATAACAAGTT--TG--A---GA------ATTTG----GT--TGTCC-------GCA---G-AAAAGGA-AATCAT-CTA-----AGTAAT---GAAT--GATA------AAACG---GT-----------T---T---------------A----T---TT---T---TCTGTG-CCCAG--TG-TAAGAATACAGCGAAGCA-AA-T----TG-T-T-C-------A-A--AT--A--ATAC-AGCTGATTTG-AGGA---A-CC--AAA--AG--AA-CA-TT----TTAT-CGAA--GTA-AA--ATTT--TTGT-----TGAAA-T---TGGAAG--C-CAAGT---AA-TTCAAAATC------G---CTTGGC---G----C-------GAC--AGGAA-GT-AAT---------CGGA--ATGCCGATTTGA-TATCA-G-CTTTT-GCCAGG---AAAGCC---------GCAC------TAGCT-ATCATTCC------AGCT---GCTTGAT-----CTA-TG--------CT------AC----------TATA-ATGTACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGATG-CGAGAG-GTGGTGAATGAGTCG-CAT-CTGTCCATCTTTCTTGGGCACTAGGCCTA---GT-TG--AGA-G-ACTTGAAGA--TTA-GGAAAAGGTGGGGAG---T-C-G-AAAGG---GCCT-GCCACC--CGTCAGAGCATTAACTCCTT---CTGAATT-TTG-CTTTTTGC-TATTTGAGAACTAGTCTT-TACACTGG-ATTAAT-TATCAAA------CGAGGAAG--TC-GGG--C-----C--ATAT-TATTAGCT-T---AAAAC-CGTTAGAAAAA---CCCTGCCG-ATAA-A---GT-ACCCC-TGATA--CCCTGAGGTGTTTGGTTAGTTGCT-GCAAA-TAATTGGT---GT-T---ACACCAAA--GA-A-AATAGAG-AC---C-CCTTATTT-T--GAA-AT----CTGGT-CT--GG-GTGA---T--G---TCTCACATTT--GCTGC-ATGC-TGCTT-GTACTTGCACCTTGGGGAAA-AATT-ACAA--------CT--TTGTTAT----AAAAA---CGAC--AATACA-T-A---TT---AGCGTGATG-ACTGGC-TTAA--TTG--CTGAA---T-GTATAA-TTA-GAGC--GCT-GATTTG-ACT-GTGTGTT-CTTTTGT--GGCTGCGCTTGGTTT---G-AAACA-TACAGTA-GCC--AAAATTCCT--GATTG-A-TCTG-A-CCCCAAGAT-GCTAGTG--AGTG-ACTAGATATCCTCAGCCT---AAATT-TTTCAT-CAT-ACTTAGGCCAGAAATTAG--ACTTAGTAGCT-GCAATTCGAATG-TCCCTT-AAATACTTAAGCAGTTCTTGGGCTTTACCTGGAAA-TTTTTCGATCATG-ACACTGATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTA--TCAATGC-TAAGAATTGGATTGG-GTTTGGATT--TTGCAATACACATTGACAA-ACGGCCCT---CCA-TAATTCGAATGTCT-------CCCA-CA--GA-CTCTTG---GT-----------CCTGGATTTCGCATGCCGACTTGGTCATGATCAGCAACGACAAATCAATAAATTGGCCTTCCCATATTTTTTGTTTTGATTGATAGGGGAACGTTG-GATCCC---------AAGGAG------TC----------GTAACAACTTATTTGCTGATAAGAGTGAGACGCAATAACATTAACAAAATCACCCCTTCCAAACTCGACTCAGACATCCGAGGAA-CCGTTGGTTCCC--TCGTAGATTCT-GCTGCCGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGCGCGGTGACAATTCTGGGGTCCTGTTGGAATTAGATGGCTGTTGGTTAAGGGTATTTTGGC-----TAC--ACT---GCTTAGGTC-GGCCTTT--CCCTCGACTTGGG-ATGCTCATCGTCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTTGTTTTGGTTCGTACAGGTGGCATTTTTGGCCTCCGA--TG-GTGTCGATTGCAATGGATTGTTTATGGTCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTG-TAA-CCGA-GA-TGGCTTGGA--AAAGGATGATGC---TAAA-T-----CGTTCTA-GGTGAGGTTTATTTTTATAGTACAATCGTACCATGGCTAACTCGTT-TTACGAAAAG--TT-AGATTGGGACAA-ACTAA-ACAAGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATAAAGCTGGAC-TATTTGTTA-TAAAATCAGA--TAATTTTTAT
gi|10 : GTGGCGTC--GATAAGCCTTTG--CAG-AAGGCT-CGGCCTGGGG-CTATGACC-TACAAGCAAAATTGAGCAGTCCAAATGAGAGACTGCAGT-GAC-CTGAGAGTGACCTTTTTTAC-TGGCACAAAA-----TGATTGGATTGTA--------------GATTTGATTT---TTAATGAGTTTCTCCCTTGGCA--GTCTCATAACCATTAGCT-TGA--GT--GTCAAATTCAATACC-AAGA---AAAAATGAT------------------G-----------------------TTAGT-TGATGGGGCTGTGGTCTTT---TCTCT-G-C-AAT-TGGGACCCCGATATC--TGAGCATACT-G---ATC---TA----AATAC-T-GACGAA-GTAT--C-AATACACATC--TG--T---GA------GTTTG----GG--GGTCC-------GGC---G-AATAGGA-AATCAT-CTA-----AATAGT---G--T--AGTA----------G---GT-----------T---T----GGGTTGCAACGA----TCGGTT---T---TGAGTGATCCAA--TG--GAGGG--CAGT--GGCA-AA-T----TT-T-TCC-------C-AG-AT--G--GCGC-AGCTAATG-G-AAGC---T-CCGAAAG--GG--AG-CA-TT----TTAT-CAA-----A-AA--GTAT--TTGTTC---TGAAA-C---CTAAAA--C-CTAAG---AG-TTCAAAATCTGTAG-G---ATTCAT---G----G-------GAC--AAG--------T---------CTGA--AGGCTGGATTAATTGTCA-G-ATTTG-GCAAG
gi|11 : TT---GTCACG-G----------GGAG--GCCTCATTACCAT--GGT-TACT-GT--GTCTATTTCATCACCTAGGA---AAAGTAAGGTTGTGGTTGGGTTTGTA-G-----------------------TC--T-TT----------------T---CATAA-G-C-AAT-GGGG-CACCGACACC--TT----GACA-----ATT---TGCTTGAAAAC-G-TTAAGG-GTAG--C-TTGACAC-----TG--ATCCGG------ATTTG----GA--GG-AC-------CCA---GGAAGAGAG-ATTCGT-CAA-----GGTAGT---GCAT--GATGTTG---G---G---AT-----------TGCGT----G----------A----T---CTATCT---TGAATTATCCAA--TG-TAAGG---CTGT--CGCA-CA-T----TT-T-T-C-------C--C-GT--GTTGCAC-AGCTTATA-G-ACTC---T-CC--AAATGGA--AG-CA-TT----TTGT-CAAA--ATA-GT--ATTTG-CCGT-----TG-AA-T---TTGAAA--C-CTAGA---AGATTGAAGATT------GAAATCTGATATGG----C-------TAC--GGGTA-TT-AAG---------CGGT--AGGCAGATTTAA-AATTT-G-ATTTT-GCTATA---TAGGTCCCC------Gc
gi|12 : ggtA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---C-TTC-GTC-TAT-GGGGACCTCCAGGTCAGTGTACA-AC------ATTC--TG----AATAT-T-TGCAAG-GTGT--T--TGTC-CATTGTTG--A---GA--------TTG----G-----------------A---A-AATAAAACAACCAT-CTA-----AATACT---GGAT--AATG------A---AATTGT-----------T---TTG--G----------AGGTGT---TT---T---TCAGTAATTCAA--TG-TAAGAA---AGT--TGCA-AA-T----TTGT-C-C-------C-AC-AG--T--GAAC-AACTGATG-G-AGGA---T-CC--AAATTGA--AG-TA-GC----TTGT-TAAA--GTA-GA--AAAG--CCCT-----TGGAA-T---TTAAAA--CTCGATT---A--TTGAAAGTTTTCAAGG---TTT--------------------AT--AGGAATGG-GA----------CAGA--AAGCTGA-TTGA-TATCA-G-ACTTgccgcaaagcggctataatggctg
gi|13 : ttagttggttccac-TCTATA-GTAC--GTACGACAGAAT--AG--A---GACAA---ATTTG----GA-----CC-------ACA---T-AATAGAA-AATCGT-CTG-----AATAAT---GAGG--GATATATTCTAT--G---GT-----------TGTGT----G----------A----T---AT---T----GAGTTAGGCAA--TGCTAAAAT--AAGT--AGCA-AC-T----TT-TCT-C-------C-AC-AA--A--GCGC-AGCTTATT-G-AGG------------A--GG--AACCA-TT----TTAT-TGAA--AT--GA--Agcaa
gi|16 : taatggtacagatgtagtgatactatgagcatcaaatccaagacaaataaatatgagagtttttgttggtcaaacaatcttgtcctctcatattgttactctgtattcttgtcaaagagacctacaaatgCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTCATTTTGGTTCGTACTGGTGGCATTTTTGGCCGCCGA-T-G-GTGTCAATTGCAATGGATTGTTGTTGATCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTC-TAA-CCGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGATGATGC---TAAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACAATCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAG--TT-AGAACGGGACAA-ATTGACACA--TA-GAAACC---TGT--CCTAAATTGATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTTTgataggcttcaaaatctagaa
gi|17 : GTTGG--GGAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTTGTAATCCGA-GAATGGCGTGGATAGAAGGATGATGTGCGTAAGCT-----CGTTCTATGGTTAGGTTTATTTTTATGGTACGGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAGTATT-AGATCGAGACAA-ATTGACACTCGTATTAAACC---TGTCCCCTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATAGTAAAATCAAAATTAATTTGTAT
gi|18 : AAACAGTCTTTG-TCTGGCATC-TAT-CTGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGAATATGC---TAAA-TTAATTCGTTCTA-GATTAGGTTTATTT--ATAGTACAGTCGTACCATGGCTAACTAATA-TTAC-AAAAT--TT-ACATTGGAACAA-ATTAA-ACACGTA-GACACC---TGT--CTTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTCTATtaa
gi|19 : ggTGGCCCACTGTAAATGA-------TATC--TAAT--ACGAT---G--GAATTGGTTTGAGTAGGAATGTGTGAAACCCTAATGA------GT-ATATTGTGACGT----ATGGCTAATAGAATAAGTTTTCTAACAACACGCATTAC-T-CTTGGGGATta
gi|2 : aaactggtctgcatcttgtgccaactgtcaatatcCCCACTGCGAACGAGAAAGACTGTCAGCAA-----GA----ATTGAA--GTTTTGA-TGG-AATGTGCTGAGCTTTAA---------GTGATGTTGTA--TTGTAAC--GTTACAAGGACTATATTTCTAACAATTTGCATGAC-TGC-TGGTGATTTGGATGTTGATGAGTTAAGTATCTGAACCACTGCCATATTGTCAATGTGAAACAGGATTCGC-----A--TGTTCAA-GAGTCTGTCTCACCACAATG--AAAG-TGCTACATACACTGGGAAAAGTTCCAA-AAATGTCATGCCTCTGACCACCC----CCTGCT--GGACCCA------GGCCTGAGGCCATCTC--GAATGTGCCCAGCTGCCCGCGAAATAGATACCAAATCC-CCCTTTTGATCCCCCTGCGCTATCTGTAAAGAATT-GCAGTG-AA-GTGTCAGAGGTCC-ACAGA-CC--AAGAGTTATAAG--------TGTAATGCCATTA-AA-A--TCTTGCAGGA--ACTGTT-GCCAGACA-TGA-----AGGTCAGATTTCATG--TCTTGTGTG-ATTCTGAC--CATGTGATGTTGTTTTTTGA-TGCCGACTGTTGCATC--GATCAATCG-CGTGCAA-AATGCA-CGACCAGGGG-CAACAGTTTTGCACGCAAAGTTCAGTAAGCCAA-TGAGTGATTGCA--TGTCTTTGAGAGTTACCTTTTT-CC-TAAGAAGAAAGAAGTCAATTGT-TTGT---TTT----A-GATTATCTAGCTT---ATCTTG-G----------GGGA--GACGCATAACCAT--G-T-TAATCGT--GTAAAATTCAATGCCCCAAA---AG-------------------------GTGATGACAGTGTTGGGTTCAGTGTT--T-TT----------------T---TCTACGG-C-TAG-TGGTACACCTATTTT--TT----GACA-A---ATT---TGCTT-AAAAA-T-TGTAAGTGTGG--A-ATGACATTGT--TG--T---GA------GTT-----------G-CCCATGCCAGC----G-AAAAGGA-AATCAT-CT------AGTAATGCAGAAT---ATA------A---G---GA-----------T---TGCGAG----------A----TTGATT---T---TGAATAATCC-G--TG-T-AGGG--CTGT--AGCA-AACT----TT-T-C-C-------C-AC-GT--T--GCAC-AGCTTATT-G-ATGC---T-CC--AAA--TG---G-CA-TTCATCTTGT-CAAA--ATA-TA----TT--TTGA-----TTAAA-----TTGAAT--C-C-AGT---AG-TCAAAAATCTGA---G---TCTGCC---A----CTG-----GGC--AGAAC-GA-AA-----------GGG--CGACGGATTTGA-CGTCA-G-ATTTA-GCCAAAC--AGCGTACCT------GGACCCAAGGTAGCC-ACTAT---------GGATGGAGCCTCAT-----CAA-----------CTGA----AG----------TGTA-ATGAACTGAAGCAA------GC-GTC-GAGTCAATATCAATGATTT-ATGGA---ATTAAATTCAGGGTA--AATAA-ATGATGTATGAGACG--ATAGTTACCATCTTT-TTAGGGACCAGACCCAAAGATGGG--AGAGG-ATTTGTA-A--TAAGGGGAAAGGTGGAGGGTGAT-C-A-AAAGG---GGCC-CCCAAC--
gi|20 : ttcgcctactctgagcaacgcaaaatatgctaagcaaaaggcacatgtaaaaagtttgacctcataagtagaagcacataagagtggcaatgatgccaccattttttccagaataggaaaagtgataggacaacgcaagtcctctcccatacccctggtgcgcttgagacctaataatgctttgccaatgagaaagtgatttgttgggtcctcaagccctctaagtttatggtagaaagctaatgcgcttacgtacaaatgcacagtgcgaggggaatattggtgaattgacaagtctgcaataaatttagcaacactgaaactggtataggccaagttactgccgcttgattgtactggactctaaagaaaattaaaaaaaattttaagggcagtttcgtatgtcttgtgtgtactgggagctagagcgttgtaaatgaggcttctggattcagcccttagatctgctcgagttgggaattgggggttggccaaacgtctgcgtcgggcgccagcttcctgaatttctTGGTCCACTGTGAACGAGA-----T----------------TTTGTTGAGTT-TC----GTGGGAATGTATTGTACTTTAACAATCAATTATGATGTTGT-ACTTGAGGGTGATCAAG---ACAAACTTGCAAACAAGCTGCAtcaga
gi|22 : gtggtgaaattGGGTGCTTTTGC-----TAC--ACC---GCTTAGGTT-GGCCCTT--CCCTCGACTTGGG-GTACCCATCGTTTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCC
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Reference ( family-881 ) : TGGCCCACTGTGAACGAGA-----TATC-GCAATCTGCGATTTTGTTGAATTGTCTTGAGTGGGAATGTATTGNGCTTTAACGA------GTGATGTTGTGACTTGAGANTGGTTAANAGAACAANCTTNCGAACAAGNTGCATNAC-T-C-TGGTGATTTGGATGTCGATTTATTGAGTACGTGAACGACTGCCATATTGTCAATGTGAAACAAAATTCGCTT---ATCTGTTAAA-GANTC-G--TCGCCATAATGACAAAGAGGCGACATACACTGGGAANAGTTCCAAGAAAGNCCATGTCCCTAACGACAC----CCTCCT-CGGACCAA-----TGGCC-GAGGAC----C--GAATANGCCCAGCTNCCCGCGAAATAGATGCCGAANCC-CCCTTTTGA-CCCCCTGCGCTGTCTGTGAANAATT-G----A-AC-GTTTCA-----TC-GCGTA-CC--ACG-GTTGTAAAGAAAT-ACNGNNATGCCATTATAG-A--TCTT--AGAA--ATT-CT-GCCAGGCA-C-A-----AGGTCGGCTTTGATA--TTTTNTGTT-ANCCTGAC--TTTGTGATGAGGTTTGGTAA-TGCCGATTGTGGCGTC--GATGAGCCGTCG-GCAG-AAGGCT-CGGCCAGGGG-NNACGACCCTACANGCGAAGTTCAGTAGNCCAA-TGAGGGACTGCANTTGAC-CTGAGAGTGACCTTTTN-AC-TNNCAAAAAA-----TAATTGTATTGTAAGGTG----A-GCAGATCCGACTT---GTCATGAG----------GGNA--GCCTCATAGCCAT--G-T-TGAT-GT--GTCAAATTCAATGCCCAAGA---AA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---CCTNC-G-C-GAT-GGGGACNCCTATGTC--TNCGCAGACG-G---ATT---TG----AANAC-T-TCTAAG-GTAT--N-ATGACANATT--TG--A---GA------ATTTG----GG--GG-CC-------GCA---G-AANAGGA-AATCAT-CTA-----AGTAGT---GAAT--GATA------A---G---GT-----------T---T----G----------A----T---TT---T---TGAGTGANCCAA--TG-TAAGGA--CAGT--AGCA-AA-T----TT-T-TC-------C-AC-AT--G--GCGC-AGCTNATT-G-AGGC---T-CC--AAA--GG--AG-CA-TT----TTAT-CG--AAGTA-GA--ATNT--TTGT-----TGAAA-T---TTGAAG--C-CNA---GNAG-TTCAAAATC------G---NTTGGC---G----C-----GA----CAGGAA-G-NAAT---------CGG--AAGGCCGATTTGA-TGTCA-G-ATTT-NGCCA---GG-AANGCCCC-C------GCAC------TAGCT-ATCATTCC------GGCT---GCCTCA-----TCAA-TG--------CTTG----AC----------TATAGTG-NACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGAT-GCGAGAG-GTGGTGAATGAGTC-GCAT-GTTTCCATCTTTCTTGGGCACTAGGCCCA---GT-GG--AGA-G-ACTTGCAGA--TTA-GGGAAAGGTGGGGAG---T-CG-AAAGG---GCCT-GCCANC--CGTCCTAGCACTAACTCNTT---CTGAATT-TTG-CTTTTGGC-TATTTGAGAATTAGTCTT-TACACTGG-ATAAAT-TATCAGAAT---TCGAGGAAG--TCTGGGGCC-----C--ATAT-TATTAGCT-T---AAAAC-CGTTAGAAAAGA-CCCCTGCCGAATAAGA---GTAACCCC-TGATACCCCCTGAGGGGTTTGGTTAGTTGCT-GCCAATTAATTGGT---GTAT---ATACCAAAG-GA-A-AATAGAG-AC---C-CCTTATTT-T--GAACAT--TACTGGTGCTTGGG-GTGA---T--GTCCTCCCACATTT--GCTGCAATGCATGCTT-GTACTTGCACCTTGGGGAAAGAATT-ACAA----ATCCCT--TTGCTATAT-AAANAA---CGGC--AATACA-T-AG--TT---AGCGTTATG-ACTGGC-TTGACCTTGGCNTGAATG-T-GTATAA-TTA-GAGC--GCT-GATTTGAACTGGTGTGCTGCTTTTGTTGGGCTGCGCTTGGTTT---GAAAACACTACAGGA-GCC--AAAATTCCT--GGTTG-A-TCTG-ACCCCCAAGAT-GCTAGTG--AGTG-ATTAGACATCCTTAGCCT---AAATT-GTTCAT-CGT-ACTTAGGCCACAAATTAG--ACCTAGTAGCTCGCAANTCGAATGTTCCCTT-AAATACTTAAGCAATTCTTGGGCTTTACCTGGAGA-CTTTTCGATCATG-ATACTGATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTAG-CCAATGC-TAAGAATTGGATTGG-TTTTGGATT--TTGCAAT-CAC----ACAA-GCGGCCCC--ACCA-TTATTCGGATGTCT-------CCCA-CATGGA-CTCTTG---GT-----------CCCGGATTTCGCATGCCGACTTGG---TGGTCAGCGACGACAAATCAATAAATTGGCCNTCCCATATTTTTTGTCTTGATTGATAGGGGAACGTTGAGANCCCCCCCAAACAAAGGGGGACATTTCAATAATCGAAGTAACAACTNATTNGCTGATAAGAGTGAGACGCGATAGCATTAACAAANTCACCCCNTCCAAACTCGACTCAGACATCCGAGGAACCCGTTGGTTCCCTTTCGTAGATTCTGGCTGCCGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGNGCGGTGACAATTCCGGGGTCCTGTTGGAATTAGGTGGCTGTTGGTTAAGGGTGCTTTGGC-----TAC--ACC---GCTTAGGTC-GGCCTTT--CCCTCGACTTGGG-GTGCCCATCGTCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTCGTTTTGGTTCGTACTGGTGGCATTTTTGGCCGCCGA-TTG-GTGTCGATTGCAATGGATTGTTGTTGGTCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTC-TAA-CCGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGATGATGC---TAAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACAGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAG--TT-AGATCGGGACAA-ATTGACACACGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTTTAT
gi|1 : TGCCCCACTGTGAACGAGA-----TATT-GCA-TCTGCGAT---G--GAATTGTCCTTAGTGGGGATATAAGAGGCATTAATGC-------TGATATTA-GACCTGAGACAAGCTAACA---CAAGTTTACGA-TGAGATTCATGAC-C-C-TAA-GATTTGGATGTGAATTTATTGATGACATGAATAACTGCCATGTTGTCAATGAGAAACAAAA---GCTTGCAATTTGTGAAATGACT-----TTGCCATAGTGATAAAGAGGCGAC---CACTGGAAAGAGTTC-AAGGAAGACAATGTCCTTAATGACAC----CCTCCT-TAAACCAAAATTTTGGC--AAGGAC----C--CA-TAAGCCCAAATTCCGTTGAAATAGATGCCGAACCCTCCCTTTTCA-CCCCCTGCACTGTCGGTGAATAATT-G----A-ACCGTTTCA-----TT-ATGTAACC--ATG-GTTGTAAAGAAATTACGGATATGCCATTATAGGA--TTTT--AGAA--ATT-CTAGCCAGGTAAC-A-----AGGTCGGCTTTGATA--TTTTTTGTT-AGCCTAAT--TTTGTAATGAGGTTTGGTAA-TGCCAATTGTTGCATT--GATGAGGCGCCG-GCAA-AAGGCT-CTGCCAGGGG-AAATGACCCTATATACGAAGTTCAATAGGCCAA-TGATGGATTGCATTTA-----GGAAGT---CTTTTG-AC-TTTTAAAAAA------AATTGTATTGTAAGGTG----AAGCAGGTCCAACTT---GTC-TGAG----------GGGA--GCTTCATGGTCAT--G-T-TGAT-GGA-GTCAAATTCAATGCCCAAGA---AA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---CCTGC-G-C-GAT-GGGGACGCCTATGTC--CCCGCAGATG-G---ATT---TG----AAAAC-C-TCTAAG-GTAT--G-ATAACAAGTT--TG--A---GA------ATTTG----GT--TGTCC-------GCA---G-AAAAGGA-AATCAT-CTA-----AGTAAT---GAAT--GATA------AAACG---GT-----------T---T---------------A----T---TT---T---TCTGTG-CCCAG--TG-TAAGAATACAGCGAAGCA-AA-T----TG-T-TC-------A-A--AT--A--ATAC-AGCTGATTTG-AGGA---A-CC--AAA--AG--AA-CA-TT----TTAT-CG--AAGTA-AA--ATTT--TTGT-----TGAAA-T---TGGAAG--C-CAA---GTAA-TTCAAAATC------G---CTTGGC---G----C-----GA----CAGGAA-G-TAAT---------CGG--AATGCCGATTTGA-TATCA-G-CTTT-TGCCA---GG-AAAGCC----------GCAC------TAGCT-ATCATTCC------AGCT---GCTTGA-----TCTA-TG--------CT------AC----------TATAATG-TACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGAT-GCGAGAG-GTGGTGAATGAGTC-GCAT-CTGTCCATCTTTCTTGGGCACTAGGCCTA---GT-TG--AGA-G-ACTTGAAGA--TTA-GGAAAAGGTGGGGAG---T-CG-AAAGG---GCCT-GCCACC--CGTCAGAGCATTAACTCCTT---CTGAATT-TTG-CTTTTTGC-TATTTGAGAACTAGTCTT-TACACTGG-ATTAAT-TATCAAA------CGAGGAAG--TC-GGG--C-----C--ATAT-TATTAGCT-T---AAAAC-CGTTAGAAAAA---CCCTGCCG-ATAA-A---GT-ACCCC-TGATA--CCCTGAGGTGTTTGGTTAGTTGCT-GCAAA-TAATTGGT---GT-T---ACACCAAA--GA-A-AATAGAG-AC---C-CCTTATTT-T--GAA-AT----CTGGT-CT--GG-GTGA---T--G---TCTCACATTT--GCTGC-ATGC-TGCTT-GTACTTGCACCTTGGGGAAA-AATT-ACAA--------CT--TTGTTAT----AAAAA---CGAC--AATACA-T-A---TT---AGCGTGATG-ACTGGC-TTAA--TTG--CTGAA---T-GTATAA-TTA-GAGC--GCT-GATTTG-ACT-GTGTGTT-CTTTTGT--GGCTGCGCTTGGTTT---G-AAACA-TACAGTA-GCC--AAAATTCCT--GATTG-A-TCTG-A-CCCCAAGAT-GCTAGTG--AGTG-ACTAGATATCCTCAGCCT---AAATT-TTTCAT-CAT-ACTTAGGCCAGAAATTAG--ACTTAGTAGCT-GCAATTCGAATG-TCCCTT-AAATACTTAAGCAGTTCTTGGGCTTTACCTGGAAA-TTTTTCGATCATG-ACACTGATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTA--TCAATGC-TAAGAATTGGATTGG-GTTTGGATT--TTGCAATACACATTGACAA-ACGGCCCT---CCA-TAATTCGAATGTCT-------CCCA-CA--GA-CTCTTG---GT-----------CCTGGATTTCGCATGCCGACTTGGTCATGATCAGCAACGACAAATCAATAAATTGGCCTTCCCATATTTTTTGTTTTGATTGATAGGGGAACGTTG-GATCCC---------AAGGAG------TC----------GTAACAACTTATTTGCTGATAAGAGTGAGACGCAATAACATTAACAAAATCACCCCTTCCAAACTCGACTCAGACATCCGAGGAA-CCGTTGGTTCCC--TCGTAGATTCT-GCTGCCGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGCGCGGTGACAATTCTGGGGTCCTGTTGGAATTAGATGGCTGTTGGTTAAGGGTATTTTGGC-----TAC--ACT---GCTTAGGTC-GGCCTTT--CCCTCGACTTGGG-ATGCTCATCGTCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTTGTTTTGGTTCGTACAGGTGGCATTTTTGGCCTCCGA--TG-GTGTCGATTGCAATGGATTGTTTATGGTCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTG-TAA-CCGA-GA-TGGCTTGGA--AAAGGATGATGC---TAAA-T-----CGTTCTA-GGTGAGGTTTATTTTTATAGTACAATCGTACCATGGCTAACTCGTT-TTACGAAAAG--TT-AGATTGGGACAA-ACTAA-ACAAGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATAAAGCTGGAC-TATTTGTTA-TAAAATCAGA--TAATTTTTAT
gi|10 : GTGGCGTC--GATAAGCCTTTG--CAG-AAGGCT-CGGCCTGGGG-CTATGACC-TACAAGCAAAATTGAGCAGTCCAAATGAGAGACTGCAGT-GAC-CTGAGAGTGACCTTTTTTAC-TGGCACAAAA-----TGATTGGATTGTA--------------GATTTGATTT---TTAATGAGTTTCTCCCTTGGCA--GTCTCATAACCATTAGCT-TGA--GT--GTCAAATTCAATACC-AAGA---AAAAATGAT------------------G-----------------------TTAGT-TGATGGGGCTGTGGTCTTT---TCTCT-G-C-AAT-TGGGACCCCGATATC--TGAGCATACT-G---ATC---TA----AATAC-T-GACGAA-GTAT--C-AATACACATC--TG--T---GA------GTTTG----GG--GGTCC-------GGC---G-AATAGGA-AATCAT-CTA-----AATAGT---G--T--AGTA----------G---GT-----------T---T----GGGTTGCAACGA----TCGGTT---T---TGAGTGATCCAA--TG--GAGGG--CAGT--GGCA-AA-T----TT-T-TC-------CCAG-AT--G--GCGC-AGCTAATG-G-AAGC---T-CCGAAAG--GG--AG-CA-TT----TTAT-CA--A---A-AA--GTAT--TTGTTC---TGAAA-C---CTAAAA--C-CTA---AGAG-TTCAAAATCTGTAG-G---ATTCAT---G----G-----GA----CAAG--------T---------CTG--AAGGCTGGATTAATTGTCA-G-ATTT-GGCAA---G
gi|11 : TT---GTCACG-G----------GGAG--GCCTCATTACCAT--GGT-TACT-GT--GTCTATTTCATCACCTAGGA---AAAGTAAGGTTGTGGTTGGGTTTGTA-G-----------------------TC--T-TT----------------T---CATAA-G-C-AAT-GGGG-CACCGACACC--TT----GACA-----ATT---TGCTTGAAAAC-G-TTAAGG-GTAG--C-TTGACAC-----TG--ATCCGG------ATTTG----GA--GG-AC-------CCA---GGAAGAGAG-ATTCGT-CAA-----GGTAGT---GCAT--GATGTTG---G---G---AT-----------TGCGT----G----------A----T---CTATCT---TGAATTATCCAA--TG-TAAGG---CTGT--CGCA-CA-T----TT-T-TC-------C--C-GT--GTTGCAC-AGCTTATA-G-ACTC---T-CC--AAATGGA--AG-CA-TT----TTGT-CA--AAATA-GT--ATTTG-CCGT-----TG-AA-T---TTGAAA--C-CTA---GAAGATTGAAGATT------GAAATCTGATATGG----C-----TA----CGGGTA-T-TAAG---------CGG--TAGGCAGATTTAA-AATTT-G-ATTT-TGCTA---TA-TAGGTCCC-C------Gc
gi|12 : ggtA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---C-TTC-GTC-TAT-GGGGACCTCCAGGTCAGTGTACA-AC------ATTC--TG----AATAT-T-TGCAAG-GTGT--T--TGTC-CATTGTTG--A---GA--------TTG----G-----------------A---A-AATAAAACAACCAT-CTA-----AATACT---GGAT--AATG------A---AATTGT-----------T---TTG--G----------AGGTGT---TT---T---TCAGTAATTCAA--TG-TAAGAA---AGT--TGCA-AA-T----TTGT-CC-------C-AC-AG--T--GAAC-AACTGATG-G-AGGA---T-CC--AAATTGA--AG-TA-GC----TTGT-TA--AAGTA-GA--AAAG--CCCT-----TGGAA-T---TTAAAA--CTCGA---TTA--TTGAAAGTTTTCAAGG---TTT------------------A----TAGGAATG-GGA----------CAG--AAAGCTGA-TTGA-TATCA-G-ACTT-gccgcaaagcggctataatggctg
gi|13 : ttagttggttccac-TCTATA-GTAC--GTACGACAGAAT--AG--A---GACAA---ATTTG----GA-----CC-------ACA---T-AATAGAA-AATCGT-CTG-----AATAAT---GAGG--GATATATTCTAT--G---GT-----------TGTGT----G----------A----T---AT---T----GAGTTAGGCAA--TGCTAAAAT--AAGT--AGCA-AC-T----TT-TCTC-------C-AC-AA--A--GCGC-AGCTTATT-G-AGG------------A--GG--AACCA-TT----TTAT-TG--AAAT--GA--Agcaa
gi|16 : taatggtacagatgtagtgatactatgagcatcaaatccaagacaaataaatatgagagtttttgttggtcaaacaatcttgtcctctcatattgttactctgtattcttgtcaaagagacctacaaatgCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTCATTTTGGTTCGTACTGGTGGCATTTTTGGCCGCCGA-T-G-GTGTCAATTGCAATGGATTGTTGTTGATCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTC-TAA-CCGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGATGATGC---TAAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACAATCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAG--TT-AGAACGGGACAA-ATTGACACA--TA-GAAACC---TGT--CCTAAATTGATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTTTgataggcttcaaaatctagaa
gi|17 : GTTGG--GGAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTTGTAATCCGA-GAATGGCGTGGATAGAAGGATGATGTGCGTAAGCT-----CGTTCTATGGTTAGGTTTATTTTTATGGTACGGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAGTATT-AGATCGAGACAA-ATTGACACTCGTATTAAACC---TGTCCCCTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATAGTAAAATCAAAATTAATTTGTAT
gi|18 : AAACAGTCTTTG-TCTGGCATC-TAT-CTGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGAATATGC---TAAA-TTAATTCGTTCTA-GATTAGGTTTATTT--ATAGTACAGTCGTACCATGGCTAACTAATA-TTAC-AAAAT--TT-ACATTGGAACAA-ATTAA-ACACGTA-GACACC---TGT--CTTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTCTATtaa
gi|19 : ggTGGCCCACTGTAAATGA-------TATC--TAAT--ACGAT---G--GAATTGGTTTGAGTAGGAATGTGTGAAACCCTAATGA------GT-ATATTGTGACGT----ATGGCTAATAGAATAAGTTTTCTAACAACACGCATTAC-T-CTTGGGGATta
gi|2 : aaactggtctgcatcttgtgccaactgtcaatatcCCCACTGCGAACGAGAAAGACTGTCAGCAA-----GA----ATTGAA--GTTTTGA-TGG-AATGTGCTGAGCTTTAA---------GTGATGTTGTA--TTGTAAC--GTTACAAGGACTATATTTCTAACAATTTGCATGAC-TGC-TGGTGATTTGGATGTTGATGAGTTAAGTATCTGAACCACTGCCATATTGTCAATGTGAAACAGGATTCGC-----A--TGTTCAA-GAGTCTGTCTCACCACAATG--AAAG-TGCTACATACACTGGGAAAAGTTCCAA-AAATGTCATGCCTCTGACCACCC----CCTGCT--GGACCCA------GGCCTGAGGCCATCTC--GAATGTGCCCAGCTGCCCGCGAAATAGATACCAAATCC-CCCTTTTGATCCCCCTGCGCTATCTGTAAAGAATT-GCAGTG-AA-GTGTCAGAGGTCC-ACAGA-CC--AAGAGTTATAAG--------TGTAATGCCATTA-AA-A--TCTTGCAGGA--ACTGTT-GCCAGACA-TGA-----AGGTCAGATTTCATG--TCTTGTGTG-ATTCTGAC--CATGTGATGTTGTTTTTTGA-TGCCGACTGTTGCATC--GATCAATCG-CGTGCAA-AATGCA-CGACCAGGGG-CAACAGTTTTGCACGCAAAGTTCAGTAAGCCAA-TGAGTGATTGCA--TGTCTTTGAGAGTTACCTTTTT-CC-TAAGAAGAAAGAAGTCAATTGT-TTGT---TTT----A-GATTATCTAGCTT---ATCTTG-G----------GGGA--GACGCATAACCAT--G-T-TAATCGT--GTAAAATTCAATGCCCCAAA---AG-------------------------GTGATGACAGTGTTGGGTTCAGTGTT--T-TT----------------T---TCTACGG-C-TAG-TGGTACACCTATTTT--TT----GACA-A---ATT---TGCTT-AAAAA-T-TGTAAGTGTGG--A-ATGACATTGT--TG--T---GA------GTT-----------G-CCCATGCCAGC----G-AAAAGGA-AATCAT-CT------AGTAATGCAGAAT---ATA------A---G---GA-----------T---TGCGAG----------A----TTGATT---T---TGAATAATCC-G--TG-T-AGGG--CTGT--AGCA-AACT----TT-T-CC-------C-AC-GT--T--GCAC-AGCTTATT-G-ATGC---T-CC--AAA--TG---G-CA-TTCATCTTGT-CA--AAATA-TA----TT--TTGA-----TTAAA-----TTGAAT--C-C-A---GTAG-TCAAAAATCTGA---G---TCTGCC---A----CTG---GG----CAGAAC-G-AAA-----------GG--GCGACGGATTTGA-CGTCA-G-ATTT-AGCCA---AACAGCGTACC-T------GGACCCAAGGTAGCC-ACTAT---------GGATGGAGCCTCA-----TCAA-----------CTGA----AG----------TGTAATG-AACTGAAGCAA------GC-GTC-GAGTCAATATCAATGATTT-ATGGA---ATTAAATTCAGGGT-A-AATAA-ATGATGTATGAGAC-G-ATAGTTACCATCTTT-TTAGGGACCAGACCCAAAGATGGG--AGAGG-ATTTGTA-A--TAAGGGGAAAGGTGGAGGGTGAT-CA-AAAGG---GGCC-CCCAAC--
gi|20 : ttcgcctactctgagcaacgcaaaatatgctaagcaaaaggcacatgtaaaaagtttgacctcataagtagaagcacataagagtggcaatgatgccaccattttttccagaataggaaaagtgataggacaacgcaagtcctctcccatacccctggtgcgcttgagacctaataatgctttgccaatgagaaagtgatttgttgggtcctcaagccctctaagtttatggtagaaagctaatgcgcttacgtacaaatgcacagtgcgaggggaatattggtgaattgacaagtctgcaataaatttagcaacactgaaactggtataggccaagttactgccgcttgattgtactggactctaaagaaaattaaaaaaaattttaagggcagtttcgtatgtcttgtgtgtactgggagctagagcgttgtaaatgaggcttctggattcagcccttagatctgctcgagttgggaattgggggttggccaaacgtctgcgtcgggcgccagcttcctgaatttctTGGTCCACTGTGAACGAGA-----T----------------TTTGTTGAGTT-TC----GTGGGAATGTATTGTACTTTAACAATCAATTATGATGTTGT-ACTTGAGGGTGATCAAG---ACAAACTTGCAAACAAGCTGCAtcaga
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Reference ( family-881 ) : TGGCCCACTGTGAACGAGA-----TATC-GCAATCTGCGATTTTGTTGAATTGTCTTGAGTGGGAATGTATTGNGCTTTAACGA------GTGATGTTGTGACTTGAGANTGGTTAANAGAACAANCTTNCGAACAAGNTGCATNAC-T-C-TGGTGATTTGGATGTCGATTTATTGAGTACGTGAACGACTGCCATATTGTCAATGTGAAACAAAATTCGCTT---ATCTGTTAAA-GANTC-G--TCGCCATAATGACAAAGAGGCGACATACACTGGGAANAGTTCCAAGAAAGNCCATGTCCCTAACGACAC----CCTCCT-CGGACCAA-----TGGCC-GAGGAC----C--GAATANGCCCAGCTNCCCGCGAAATAGATGCCGAANCC-CCCTTTTGA-CCCCCTGCGCTGTCTGTGAANAATT-G----A-AC-GTTTCA-----TC-GCGTA-CC--ACG-GTTGTAAAGAAAT-ACNGNNATGCCATTATAG-A--TCTT--AGAA--ATT-CT-GCCAGGCA-C-A-----AGGTCGGCTTTGATA--TTTTNTGTT-ANCCTGAC--TTTGTGATGAGGTTTGGTAA-TGCCGATTGTGGCGTC--GATGAGCCGTCG-GCAG-AAGGCT-CGGCCAGGGG-NNACGACCCTACANGCGAAGTTCAGTAGNCCAA-TGAGGGACTGCANTTGAC-CTGAGAGTGACCTTTTN-AC-TNNCAAAAAA-----TAATTGTATTGTAAGGTG----A-GCAGATCCGACTT---GTCATGAG----------GGNA--GCCTCATAGCCAT--G-T-TGAT-GT--GTCAAATTCAATGCCCAAGA---AA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---CCTNC-G-C-GAT-GGGGACNCCTATGTC--TNCGCAGACG-G---ATT---TG----AANAC-T-TCTAAG-GTAT--N-ATGACANATT--TG--A---GA------ATTTG----GG--GG-CC-------GCA---G-AANAGGA-AATCAT-CTA-----AGTAGT---GAAT--GATA------A---G---GT-----------T---T----G----------A----T---TT---T---TGAGTGANCCAA--TG-TAAGGA--CAGT--AGCA-AA-T----TT-T-TC-------C-AC-AT--G--GCGC-AGCTNATT-G-AGGC---T-CC--AAA--GG--AG-CA-TT----TTAT-CG--AAGTA-GA--ATNT--TTGT-----TGAAA-T---TTGAAG--C-CNA---GNAG-TTCAAAATC------G---NTTGGC---G----C-----GA----CAGGAA-G-NAAT---------CGG--AAGGCCGATTTGA-TGTCA-G-ATTT-NGCCA---GG-AANGCCCC-C------GCAC------TAGCT-ATCATTCC------GGCT---GCCTCA-----TCAA-TG--------CTTG----AC----------TATAGTG-NACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGAT-GCGAGAG-GTGGTGAATGAGTC-GCAT-GTTTCCATCTTTCTTGGGCACTAGGCCCA---GT-GG--AGA-G-ACTTGCAGA--TTA-GGGAAAGGTGGGGAG---T-CG-AAAGG---GCCT-GCCANC--CGTCCTAGCACTAACTCNTT---CTGAATT-TTG-CTTTTGGC-TATTTGAGAATTAGTCTT-TACACTGG-ATAAAT-TATCAGAAT---TCGAGGAAG--TCTGGGGCC-----C--ATAT-TATTAGCT-T---AAAAC-CGTTAGAAAAGA-CCCCTGCCGAATAAGA---GTAACCCC-TGATACCCCCTGAGGGGTTTGGTTAGTTGCT-GCCAATTAATTGGT---GTAT---ATACCAAAG-GA-A-AATAGAG-AC---C-CCTTATTT-T--GAACAT--TACTGGTGCTTGGG-GTGA---T--GTCCTCCCACATTT--GCTGCAATGCATGCTT-GTACTTGCACCTTGGGGAAAGAATT-ACAA----ATCCCT--TTGCTATAT-AAANAA---CGGC--AATACA-T-AG--TT---AGCGTTATG-ACTGGC-TTGACCTTGGCNTGAATG-T-GTATAA-TTA-GAGC--GCT-GATTTGAACTGGTGTGCTGCTTTTGTTGGGCTGCGCTTGGTTT---GAAAACACTACAGGA-GCC--AAAATTCCT--GGTTG-A-TCTG-ACCCCCAAGAT-GCTAGTG--AGTG-ATTAGACATCCTTAGCCT---AAATT-GTTCAT-CGT-ACTTAGGCCACAAATTAG--ACCTAGTAGCTCGCAANTCGAATGTTCCCTT-AAATACTTAAGCAATTCTTGGGCTTTACCTGGAGA-CTTTTCGATCATG-ATACTGATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTAG-CCAATGC-TAAGAATTGGATTGG-TTTTGGATT--TTGCAAT-CAC----ACAA-GCGGCCCC--ACCA-TTATTCGGATGTCT-------CCCA-CATGGA-CTCTTG---GT-----------CCCGGATTTCGCATGCCGACTTGG---TGGTCAGCGACGACAAATCAATAAATTGGCCNTCCCATATTTTTTGTCTTGATTGATAGGGGAACGTTGAGANCCCCCCCAAACAAAGGGGGACATTTCAATAATCGAAGTAACAACTNATTNGCTGATAAGAGTGAGACGCGATAGCATTAACAAANTCACCCCNTCCAAACTCGACTCAGACATCCGAGGAACCCGTTGGTTCCCTTTCGTAGATTCTGGCTGCCGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGNGCGGTGACAATTCCGGGGTCCTGTTGGAATTAGGTGGCTGTTGGTTAAGGGTGCTTTGGC-----TAC--ACC---GCTTAGGTC-GGCCTTT--CCCTCGACTTGGG-GTGCCCATCGTCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTCGTTTTGGTTCGTACTGGTGGCATTTTTGGCCGCCGA-TTG-GTGTCGATTGCAATGGATTGTTGTTGGTCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTC-TAA-CCGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGATGATGC---TAAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACAGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAG--TT-AGATCGGGACAA-ATTGACACACGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTTTAT
gi|1 : TGCCCCACTGTGAACGAGA-----TATT-GCA-TCTGCGAT---G--GAATTGTCCTTAGTGGGGATATAAGAGGCATTAATGC-------TGATATTA-GACCTGAGACAAGCTAACA---CAAGTTTACGA-TGAGATTCATGAC-C-C-TAA-GATTTGGATGTGAATTTATTGATGACATGAATAACTGCCATGTTGTCAATGAGAAACAAAA---GCTTGCAATTTGTGAAATGACT-----TTGCCATAGTGATAAAGAGGCGAC---CACTGGAAAGAGTTC-AAGGAAGACAATGTCCTTAATGACAC----CCTCCT-TAAACCAAAATTTTGGC--AAGGAC----C--CA-TAAGCCCAAATTCCGTTGAAATAGATGCCGAACCCTCCCTTTTCA-CCCCCTGCACTGTCGGTGAATAATT-G----A-ACCGTTTCA-----TT-ATGTAACC--ATG-GTTGTAAAGAAATTACGGATATGCCATTATAGGA--TTTT--AGAA--ATT-CTAGCCAGGTAAC-A-----AGGTCGGCTTTGATA--TTTTTTGTT-AGCCTAAT--TTTGTAATGAGGTTTGGTAA-TGCCAATTGTTGCATT--GATGAGGCGCCG-GCAA-AAGGCT-CTGCCAGGGG-AAATGACCCTATATACGAAGTTCAATAGGCCAA-TGATGGATTGCATTTA-----GGAAGT---CTTTTG-AC-TTTTAAAAAA------AATTGTATTGTAAGGTG----AAGCAGGTCCAACTT---GTC-TGAG----------GGGA--GCTTCATGGTCAT--G-T-TGAT-GGA-GTCAAATTCAATGCCCAAGA---AA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---CCTGC-G-C-GAT-GGGGACGCCTATGTC--CCCGCAGATG-G---ATT---TG----AAAAC-C-TCTAAG-GTAT--G-ATAACAAGTT--TG--A---GA------ATTTG----GT--TGTCC-------GCA---G-AAAAGGA-AATCAT-CTA-----AGTAAT---GAAT--GATA------AAACG---GT-----------T---T---------------A----T---TT---T---TCTGTG-CCCAG--TG-TAAGAATACAGCGAAGCA-AA-T----TG-T-TC-------A-A--AT--A--ATAC-AGCTGATTTG-AGGA---A-CC--AAA--AG--AA-CA-TT----TTAT-CG--AAGTA-AA--ATTT--TTGT-----TGAAA-T---TGGAAG--C-CAA---GTAA-TTCAAAATC------G---CTTGGC---G----C-----GA----CAGGAA-G-TAAT---------CGG--AATGCCGATTTGA-TATCA-G-CTTT-TGCCA---GG-AAAGCC----------GCAC------TAGCT-ATCATTCC------AGCT---GCTTGA-----TCTA-TG--------CT------AC----------TATAATG-TACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGAT-GCGAGAG-GTGGTGAATGAGTC-GCAT-CTGTCCATCTTTCTTGGGCACTAGGCCTA---GT-TG--AGA-G-ACTTGAAGA--TTA-GGAAAAGGTGGGGAG---T-CG-AAAGG---GCCT-GCCACC--CGTCAGAGCATTAACTCCTT---CTGAATT-TTG-CTTTTTGC-TATTTGAGAACTAGTCTT-TACACTGG-ATTAAT-TATCAAA------CGAGGAAG--TC-GGG--C-----C--ATAT-TATTAGCT-T---AAAAC-CGTTAGAAAAA---CCCTGCCG-ATAA-A---GT-ACCCC-TGATA--CCCTGAGGTGTTTGGTTAGTTGCT-GCAAA-TAATTGGT---GT-T---ACACCAAA--GA-A-AATAGAG-AC---C-CCTTATTT-T--GAA-AT----CTGGT-CT--GG-GTGA---T--G---TCTCACATTT--GCTGC-ATGC-TGCTT-GTACTTGCACCTTGGGGAAA-AATT-ACAA--------CT--TTGTTAT----AAAAA---CGAC--AATACA-T-A---TT---AGCGTGATG-ACTGGC-TTAA--TTG--CTGAA---T-GTATAA-TTA-GAGC--GCT-GATTTG-ACT-GTGTGTT-CTTTTGT--GGCTGCGCTTGGTTT---G-AAACA-TACAGTA-GCC--AAAATTCCT--GATTG-A-TCTG-A-CCCCAAGAT-GCTAGTG--AGTG-ACTAGATATCCTCAGCCT---AAATT-TTTCAT-CAT-ACTTAGGCCAGAAATTAG--ACTTAGTAGCT-GCAATTCGAATG-TCCCTT-AAATACTTAAGCAGTTCTTGGGCTTTACCTGGAAA-TTTTTCGATCATG-ACACTGATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTA--TCAATGC-TAAGAATTGGATTGG-GTTTGGATT--TTGCAATACACATTGACAA-ACGGCCCT---CCA-TAATTCGAATGTCT-------CCCA-CA--GA-CTCTTG---GT-----------CCTGGATTTCGCATGCCGACTTGGTCATGATCAGCAACGACAAATCAATAAATTGGCCTTCCCATATTTTTTGTTTTGATTGATAGGGGAACGTTG-GATCCC---------AAGGAG------TC----------GTAACAACTTATTTGCTGATAAGAGTGAGACGCAATAACATTAACAAAATCACCCCTTCCAAACTCGACTCAGACATCCGAGGAA-CCGTTGGTTCCC--TCGTAGATTCT-GCTGCCGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGCGCGGTGACAATTCTGGGGTCCTGTTGGAATTAGATGGCTGTTGGTTAAGGGTATTTTGGC-----TAC--ACT---GCTTAGGTC-GGCCTTT--CCCTCGACTTGGG-ATGCTCATCGTCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTTGTTTTGGTTCGTACAGGTGGCATTTTTGGCCTCCGA--TG-GTGTCGATTGCAATGGATTGTTTATGGTCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTG-TAA-CCGA-GA-TGGCTTGGA--AAAGGATGATGC---TAAA-T-----CGTTCTA-GGTGAGGTTTATTTTTATAGTACAATCGTACCATGGCTAACTCGTT-TTACGAAAAG--TT-AGATTGGGACAA-ACTAA-ACAAGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATAAAGCTGGAC-TATTTGTTA-TAAAATCAGA--TAATTTTTAT
gi|10 : GTGGCGTC--GATAAGCCTTTG--CAG-AAGGCT-CGGCCTGGGG-CTATGACC-TACAAGCAAAATTGAGCAGTCCAAATGAGAGACTGCAGT-GAC-CTGAGAGTGACCTTTTTTAC-TGGCACAAAA-----TGATTGGATTGTA--------------GATTTGATTT---TTAATGAGTTTCTCCCTTGGCA--GTCTCATAACCATTAGCT-TGA--GT--GTCAAATTCAATACC-AAGA---AAAAATGAT------------------G-----------------------TTAGT-TGATGGGGCTGTGGTCTTT---TCTCT-G-C-AAT-TGGGACCCCGATATC--TGAGCATACT-G---ATC---TA----AATAC-T-GACGAA-GTAT--C-AATACACATC--TG--T---GA------GTTTG----GG--GGTCC-------GGC---G-AATAGGA-AATCAT-CTA-----AATAGT---G--T--AGTA----------G---GT-----------T---T----GGGTTGCAACGA----TCGGTT---T---TGAGTGATCCAA--TG--GAGGG--CAGT--GGCA-AA-T----TT-T-TC-------CCAG-AT--G--GCGC-AGCTAATG-G-AAGC---T-CCGAAAG--GG--AG-CA-TT----TTAT-CA--A---A-AA--GTAT--TTGTTC---TGAAA-C---CTAAAA--C-CTA---AGAG-TTCAAAATCTGTAG-G---ATTCAT---G----G-----GA----CAAG--------T---------CTG--AAGGCTGGATTAATTGTCA-G-ATTT-GGCAA---G
gi|11 : TT---GTCACG-G----------GGAG--GCCTCATTACCAT--GGT-TACT-GT--GTCTATTTCATCACCTAGGA---AAAGTAAGGTTGTGGTTGGGTTTGTA-G-----------------------TC--T-TT----------------T---CATAA-G-C-AAT-GGGG-CACCGACACC--TT----GACA-----ATT---TGCTTGAAAAC-G-TTAAGG-GTAG--C-TTGACAC-----TG--ATCCGG------ATTTG----GA--GG-AC-------CCA---GGAAGAGAG-ATTCGT-CAA-----GGTAGT---GCAT--GATGTTG---G---G---AT-----------TGCGT----G----------A----T---CTATCT---TGAATTATCCAA--TG-TAAGG---CTGT--CGCA-CA-T----TT-T-TC-------C--C-GT--GTTGCAC-AGCTTATA-G-ACTC---T-CC--AAATGGA--AG-CA-TT----TTGT-CA--AAATA-GT--ATTTG-CCGT-----TG-AA-T---TTGAAA--C-CTA---GAAGATTGAAGATT------GAAATCTGATATGG----C-----TA----CGGGTA-T-TAAG---------CGG--TAGGCAGATTTAA-AATTT-G-ATTT-TGCTA---TA-TAGGTCCC-C------Gc
gi|12 : ggtA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---C-TTC-GTC-TAT-GGGGACCTCCAGGTCAGTGTACA-AC------ATTC--TG----AATAT-T-TGCAAG-GTGT--T--TGTC-CATTGTTG--A---GA--------TTG----G-----------------A---A-AATAAAACAACCAT-CTA-----AATACT---GGAT--AATG------A---AATTGT-----------T---TTG--G----------AGGTGT---TT---T---TCAGTAATTCAA--TG-TAAGAA---AGT--TGCA-AA-T----TTGT-CC-------C-AC-AG--T--GAAC-AACTGATG-G-AGGA---T-CC--AAATTGA--AG-TA-GC----TTGT-TA--AAGTA-GA--AAAG--CCCT-----TGGAA-T---TTAAAA--CTCGA---TTA--TTGAAAGTTTTCAAGG---TTT------------------A----TAGGAATG-GGA----------CAG--AAAGCTGA-TTGA-TATCA-G-ACTT-gccgcaaagcggctataatggctg
gi|13 : ttagttggttccac-TCTATA-GTAC--GTACGACAGAAT--AG--A---GACAA---ATTTG----GA-----CC-------ACA---T-AATAGAA-AATCGT-CTG-----AATAAT---GAGG--GATATATTCTAT--G---GT-----------TGTGT----G----------A----T---AT---T----GAGTTAGGCAA--TGCTAAAAT--AAGT--AGCA-AC-T----TT-TCTC-------C-AC-AA--A--GCGC-AGCTTATT-G-AGG------------A--GG--AACCA-TT----TTAT-TG--AAAT--GA--Agcaa
gi|16 : taatggtacagatgtagtgatactatgagcatcaaatccaagacaaataaatatgagagtttttgttggtcaaacaatcttgtcctctcatattgttactctgtattcttgtcaaagagacctacaaatgCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTCATTTTGGTTCGTACTGGTGGCATTTTTGGCCGCCGA-T-G-GTGTCAATTGCAATGGATTGTTGTTGATCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTC-TAA-CCGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGATGATGC---TAAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACAATCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAG--TT-AGAACGGGACAA-ATTGACACA--TA-GAAACC---TGT--CCTAAATTGATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTTTgataggcttcaaaatctagaa
gi|17 : GTTGG--GGAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTTGTAATCCGA-GAATGGCGTGGATAGAAGGATGATGTGCGTAAGCT-----CGTTCTATGGTTAGGTTTATTTTTATGGTACGGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAGTATT-AGATCGAGACAA-ATTGACACTCGTATTAAACC---TGTCCCCTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATAGTAAAATCAAAATTAATTTGTAT
gi|18 : AAACAGTCTTTG-TCTGGCATC-TAT-CTGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGAATATGC---TAAA-TTAATTCGTTCTA-GATTAGGTTTATTT--ATAGTACAGTCGTACCATGGCTAACTAATA-TTAC-AAAAT--TT-ACATTGGAACAA-ATTAA-ACACGTA-GACACC---TGT--CTTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTCTATtaa
gi|19 : ggTGGCCCACTGTAAATGA-------TATC--TAAT--ACGAT---G--GAATTGGTTTGAGTAGGAATGTGTGAAACCCTAATGA------GT-ATATTGTGACGT----ATGGCTAATAGAATAAGTTTTCTAACAACACGCATTAC-T-CTTGGGGATta
gi|2 : aaactggtctgcatcttgtgccaactgtcaatatcCCCACTGCGAACGAGAAAGACTGTCAGCAA-----GA----ATTGAA--GTTTTGA-TGG-AATGTGCTGAGCTTTAA---------GTGATGTTGTA--TTGTAAC--GTTACAAGGACTATATTTCTAACAATTTGCATGAC-TGC-TGGTGATTTGGATGTTGATGAGTTAAGTATCTGAACCACTGCCATATTGTCAATGTGAAACAGGATTCGC-----A--TGTTCAA-GAGTCTGTCTCACCACAATG--AAAG-TGCTACATACACTGGGAAAAGTTCCAA-AAATGTCATGCCTCTGACCACCC----CCTGCT--GGACCCA------GGCCTGAGGCCATCTC--GAATGTGCCCAGCTGCCCGCGAAATAGATACCAAATCC-CCCTTTTGATCCCCCTGCGCTATCTGTAAAGAATT-GCAGTG-AA-GTGTCAGAGGTCC-ACAGA-CC--AAGAGTTATAAG--------TGTAATGCCATTA-AA-A--TCTTGCAGGA--ACTGTT-GCCAGACA-TGA-----AGGTCAGATTTCATG--TCTTGTGTG-ATTCTGAC--CATGTGATGTTGTTTTTTGA-TGCCGACTGTTGCATC--GATCAATCG-CGTGCAA-AATGCA-CGACCAGGGG-CAACAGTTTTGCACGCAAAGTTCAGTAAGCCAA-TGAGTGATTGCA--TGTCTTTGAGAGTTACCTTTTT-CC-TAAGAAGAAAGAAGTCAATTGT-TTGT---TTT----A-GATTATCTAGCTT---ATCTTG-G----------GGGA--GACGCATAACCAT--G-T-TAATCGT--GTAAAATTCAATGCCCCAAA---AG-------------------------GTGATGACAGTGTTGGGTTCAGTGTT--T-TT----------------T---TCTACGG-C-TAG-TGGTACACCTATTTT--TT----GACA-A---ATT---TGCTT-AAAAA-T-TGTAAGTGTGG--A-ATGACATTGT--TG--T---GA------GTT-----------G-CCCATGCCAGC----G-AAAAGGA-AATCAT-CT------AGTAATGCAGAAT---ATA------A---G---GA-----------T---TGCGAG----------A----TTGATT---T---TGAATAATCC-G--TG-T-AGGG--CTGT--AGCA-AACT----TT-T-CC-------C-AC-GT--T--GCAC-AGCTTATT-G-ATGC---T-CC--AAA--TG---G-CA-TTCATCTTGT-CA--AAATA-TA----TT--TTGA-----TTAAA-----TTGAAT--C-C-A---GTAG-TCAAAAATCTGA---G---TCTGCC---A----CTG---GG----CAGAAC-G-AAA-----------GG--GCGACGGATTTGA-CGTCA-G-ATTT-AGCCA---AACAGCGTACC-T------GGACCCAAGGTAGCC-ACTAT---------GGATGGAGCCTCA-----TCAA-----------CTGA----AG----------TGTAATG-AACTGAAGCAA------GC-GTC-GAGTCAATATCAATGATTT-ATGGA---ATTAAATTCAGGGT-A-AATAA-ATGATGTATGAGAC-G-ATAGTTACCATCTTT-TTAGGGACCAGACCCAAAGATGGG--AGAGG-ATTTGTA-A--TAAGGGGAAAGGTGGAGGGTGAT-CA-AAAGG---GGCC-CCCAAC--
gi|20 : ttcgcctactctgagcaacgcaaaatatgctaagcaaaaggcacatgtaaaaagtttgacctcataagtagaagcacataagagtggcaatgatgccaccattttttccagaataggaaaagtgataggacaacgcaagtcctctcccatacccctggtgcgcttgagacctaataatgctttgccaatgagaaagtgatttgttgggtcctcaagccctctaagtttatggtagaaagctaatgcgcttacgtacaaatgcacagtgcgaggggaatattggtgaattgacaagtctgcaataaatttagcaacactgaaactggtataggccaagttactgccgcttgattgtactggactctaaagaaaattaaaaaaaattttaagggcagtttcgtatgtcttgtgtgtactgggagctagagcgttgtaaatgaggcttctggattcagcccttagatctgctcgagttgggaattgggggttggccaaacgtctgcgtcgggcgccagcttcctgaatttctTGGTCCACTGTGAACGAGA-----T----------------TTTGTTGAGTT-TC----GTGGGAATGTATTGTACTTTAACAATCAATTATGATGTTGT-ACTTGAGGGTGATCAAG---ACAAACTTGCAAACAAGCTGCAtcaga
gi|22 : gtggtgaaattGGGTGCTTTTGC-----TAC--ACC---GCTTAGGTT-GGCCCTT--CCCTCGACTTGGG-GTACCCATCGTTTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCC
gi|23 : AAAAAA------AATTGTATTGTAAGGTGA---A-GCAGATCCAACTT---GT
gi|3 : ttAAAGTGGGGAG---TACGCAAAGGTGAGCCTTGCCAGTTGCGTGCTAGCACTAACTCATTGTTCTGACTTATTGACTTTTGGCATATTTGAGAATTAGTCTCGTACACTGTTATAAATCTATCAGAATCATTCGAGGAAGGTTCTGGGGCCACAATCTAATAC-TAT-AGCTATGAAAAAACACGT-AGAAAAGAACCCCTGCCGAATAAGAACAGTAACCCT-TG-TACCCCCTGAGGG-TTTGGTTAGT-GCGAGCCAATTAATTTGT---GTAT---ATACCAAAGTGA-A-AATAGAG-AC---CGCCTTATTT-T--GAAC----TACTGGTGCTTGGGTGTGA---TTGGTTCTCCAA-ATTT--GTGGCATTGCATGCTTTGTATTT--ACCTGGTGGAAAGAATTTACAA----ATCTTC--CTGCT-TAT-AAATAAAGTTGGC--AATACA-T-GGGTTT---AGCCTTATGGACTG-C-TTGACCTTGGCATGGATGGTAGTATAA-TTAAGAGC--GCTTGATTTGA-CTG-TGTGC-GCTTTTGTTG---TGCGCTTGTGTT---GAAG-TACTACAGGAAGCC--AACATTCCT--GGTTG-ACTCTGGATCCCCAAGAT-GCTCGTC--GGTGGATTA-ACCTCCTTATTCCGTGAAATT-GTTCATTCAT-ACTTAGGCCACAA-TTAGGGACCTAGTAGCTCGCACGTCGAATGTTCTCTTAAAATACTT-AGCAATTCTT-GGCTTTACCTGGAGATCTTTTCGAT-ATGAATACT-ATAAAGATGCATAAATGCTGAGTGTCCAGCTAGCCCAATGCTTAAGAATTGGATTGGTTTTTGGATTTATTGCATC-CAC----ACAAGGCGGCCCCCAACCATTTATTCGGTGGTCTACTAATCCTCATTATGGATCTCGTGTCCGTCCCGCCCCCCCCCCGGATTTTGCATGCCGACTT-----TGGTCAGCGA----AAATCAATAAA-TGGCCGTTCCATA-TTTTTG-CTTAATTGATAGGGGAACGTTGAGAGCCCCCCCAAACAAAGGGGGACATTTCAATAATCGAAGTAACAACTGATTGGCTGAT-AGAGTGAGACGCGATAGCA-TAACAAACTCACCCCGTCCAAACTCGACTC-GACATCCGAGGAACCCATTGGTTCTCTTTCGTAGATTCTGGCTG-CGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGGGC-GTGACAATTCCGGGGTTTTGTTGGAATTAGGTGGCTG-TGGTTAAGGGTGCTTTGGCATTAGCACAAACCCCGGCTTAGGTTAGGCCTTTGGTCCTCGA-TTGGGCGTGTCCCTCGTCTGTTAACGAACG-CGAGATGCCCTGGAATTCA-TTTGGTTCGTACTGGTGGCAGTTTTGGCCGCCGATTTGCGTGTCAATTGCAATGGATTGTTGTTGATCGAAAAAACAGTC---GTTCTGGCTTC--AA-CCGAGGA-TGGCGTTGA--AAAGGATGTTGC---CTAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACATTCGTACC-TGGCGAACTCGTATTTACG-AAAG--TTGAGAC--GGACAATATTGACACATGAC-GAAACCTGTTGT--CCTAAATTGATT--GACTTATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATATT
gi|4 : --C-CAA---GTAA-TTCAAAATC------A---CTTGGC---G----C-----GA----CAGGAA-G-TAAT---------CGG--GATGCCGATTTGA-TATCA-G-CTTT-TGCCA---GG-AAAGCCCC-TTGACCTGCAC------TAGCT-ATCATTTC------AGCT---GCTTGA-----TCTA-TG--------CT------AC----------TATAGTG-TACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAA-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGAT-GCGAGAG-GTGGTGAAAGAGTC-GCAT-GTCTCCATTTTCCTTGGGCACTAGGCCCA---GT-GG--AGA-G-ACTTGCAGA--TTA-GGAAGAGGTGGGGAG---T-CG-AAAGG---GCCT-GCCATC--CGTCCTAGCACTAACTCATT---CTGAATT-TTG-CTTTTGGC-TATTTGAGAATTAGTCTT-TACACTGG-ATAAAT-TATCAGAATA--TCGAGGAAG--TCTGGGGCC-----C--ATATATCTTAGCT-T---AAAAC-CG-TAGAAAA-A-CCCCTGCCGAATAAAA---GTAACCCCTTGATACCCCCTGAGGGGTTTGGTTAGTTGCT-GCCAATTAATTGGTATGGTATTAAATACCCAAA-GATATAATAGAGCACACAC-CGTTATTTATAAGAACATTGTACTGGTGCTTGGA-GTGAATCT--GTCCTCCCACATTTTATCTGCAATGCATGCTT-GTACTTGCATCCTGGGGAAAATATT-ACAATCATATCCCTAATTG-TATATAAAAGAA---CGGTCGAATACAGTAAA--TTATGAGCGTTGTG-CTTGGCATTGACTT--GCTGGAATG-T----TAATTTA-GAGCTGACT-GATTAGAACTGGTGTGCTGCTTTTGTTGGACTGCGCTTGGTTTGAGGAAAACATGACAGGA-GCCAAAAAATTCCTTGGGTTGAA-TCTG-ACTCCCAAGATAGCTAGTGGAAGT--ATTAGACATTCTTAGCCT---AAATTGGCTCAT-CGTCACTTAGGCCACAAATTAG--ACCTAGTAGCTC-CCACTCGAATGTT-CCTT-AAATACTTAAGCAATTCTTGGGCTTTACCTGGAGA-CTTTTCGATCATG-ATACTAATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTAG--CAATGC-TAAGAATTGGATTGG-TTTTGGATT--TTGCAAT--AC----ACAA-GCGG-CCC--ACCA-TTATTCGGATGTCT-------CC---CATAGA-CTCTTG---GT-----------CCTGGATTTTGCATGCCGACTTGG---atta
gi|5 : TGGTCCACTGTGAACGAGA-----AAT--GCAATCTGCAATTTTGTTGAGT-GTC----GTGGGAATGTATTGTGCTTTAAC-A------GTGATGTTGT-ACTTGAGAGTAATCAA---AACAATCTTGCGAACAAGCTGCATTACAT-G-TTTTGATTTTGATGTCGAGTTATTGAGTATGTGCACGACTGTCATATTGTCTATGTGGATTAAAATTCGCTT---ATCTGCTAAG-GATTT-G---GGCCATAAGCACA---AGGCAACATACACGGGGATCAACTCTAAGAAAGT-CATGTCCCTAATGATATGGGACCTCGTCCAGGCCAA-----TGGCC-----AC----CTTGAATAGGCCCAGCTACCCGCAAAGTAGATGCCAAAGCC-CCAAGTGGG-CCCCCTGCACTGTCTGTGACAAGTTAG----AGAC--TTGTA-----TCTGC-TA-CCCAGCA-GTTAT-TTGAAATGACTGTAACCCCATTATAG----TCTTCGAGAA--A----T-GATAACCA-C-ACCTGTAGGTCGGCCTTGAT---CTCCATGTTGACCCTGAC--TTTGTG
gi|6 : tttgcgagttatttcccccactcgcaggaggccgaaataagctaaacagaaagcagatttgaaaagtttcatttcgtagtgggatgacgagatatgagggagtgcgtggaccaccttttgcaggatatggatggtaatgggacgacgggtatcaggttttttgccgtgagtgcgtttaaggccttggattgatttaaatacatgtactaggattgacttggttggatctggcaatagtcgtattttgtggaagtacgacagggcttgcacataacgctgaatagtgttggttgagagattttgaattgacagatatgctataaaatgtagtgtggtttttgttggtatggccaagagttaggcagcttgtaagcaagcagaaatcctggtatctgcggacagacatgtatgctttagttttgtagatatcgcagcattaataagacgggctgatcggattctagatcctccaaatgtggcttggtagaggcataggtttgcggtctgctgagggggccaggtggtgaaatt-------------------------G-----------------------TT--TATG----------------TTCACCTGC-G-C-GATTGGGGACACCTATGTC--CCCACAGATG-CTTTATTGTATG----AACCT-C-TCTAAG-ATGT--C-A--ACAAATT--TGCTA---GACATTATATTCGTCAGAA--GG-CT-------GCAATAG-AATATAA-CATCATACTACAAACATTA-T---GACTAGGATT------A---G---TTACAAATCTTTCT---T----GTAGATCT---A----T---TT---TAACTTAGTGAACCCACGTG-TAACAA---AGT--AGCA-AA-T----TG-C-TCAAAAATAC-AC-AC--A--G-AC-A--TGATT-GGATGC---AACC--ACA--GC--AA-CA-TT----TTAT-CGAAAAGTA-GATCATATAATTGTATATCTTAAA-TACGCGGAAG--C-CTAAAGAAAA-TTTAGAATA------A---GTCTTC---G----CCTCCAGAGATCTAAGAA-GATAATATACTCGCGCAGATAATGCCGATTTGA-TATCACG-CTTTATGCCATGCGC-AACACCTCAA------GGAC------CAATTGATCCTTCCCACCTAGACT---GACTCATTTTCTCAACTGATCTTAGACTTG----ACCTAGCTTACATATA-TGTAACTG-AGCAT------GCGATTGGGG-CAATGAA-GTCATTGCATGGATGCGTT---GTCTGGATGGCG-GAGAGTGGTGAATGAGTCGGCAT-GTTT-CATCTTTCTT-GGCACTAGGCCCA---GT-GG--AGA-GCAC-TGCAGAACTTA-GGGAAA-GTTGGGAG---TCCG-AAGAG---GCCT-GCCACC--CGTCCTCGCACTAACTCCT-----TGAATT-TTG-CTTTTGGC--ATTTGAGAATTAGTCTT-TACACTGG-ATAAAT-TA
gi|7 : -GCAG-AAGGTA-CATCCAAGTG-AGACAACCTTGCAGGCAAAAT-----A---TAA-TGA----CTGCAATT-AC-CAAAGGATGATCATTTG-GG-CAACAAAATA-----GAATT----TATAACTTGCCTTA-CCTTACCGAACTT---GTC-TGAT----------GGCAAAGCC--ATAGCCAT--AATATGA--GT--ATCAAATCTAATACC-GAGA---AATGTTCAACA----------------G-----------------------TC--T-TG----------------T---CCTCT-A-CAGAT-GGT-ACTCCTAAATC--TTGGCAGA---G---ATT----G----AACAT-TGTCTGTG-GTGT--G-TTGACAAACT--GG--G---GACGA---ATTTG----GA-----CC-------ACA---A-AAGAGAA-AATCAT-TTA-----A-TGGT-----AT--GTTC------ATT-GCCTGT-----------G---T----G---------------C---TG---T---CGAGTTAACCAA--AC-TAAATA---AAT--AGCA-AA-C----TT-C-TC-------C--C-ATAAG--TTGT-AGCTTATT-A-AG-------CC--AAA--GGGAAC-CA-TT----TTGT-----AATCATAA--ATTT--ATCT-----TCAAACT---TTAAAGAAC-CAA---GGAG-GTCAAAATC------G---GATGGG---GATATC-----GG----TAGGAG-A-CAA---------------AAGGCAGACTTGA-TGTCA-GAATTA-GGCAA---AG-GGTGCCTC-CACCAA-GCA-------TAGCA-ATCATGTC------AGCT---GCCTCA-----TCAG-TG--------GTTGAATAAT----------TATAGTG-GGATC-AACATCTAAAAGC-AATTAACTCAAT--C-GTC-TTG-A-----------------GGAT-GTAAAAG-ATGGTGTATGAGCC-TCAT-GCTGCCATCCTTTTTGGGGACAAAGCTCA---GT-GGGAAAA-A-ACTT
gi|8 : tggataggtttC-GTTT-A-----TT-GTGTA-CC--ATG-GTTGTAAAGAAAG-AAGGATATGC-ATTATAG-GATTTTT--AAAATGATT-CT-GCCAAGTA-C-A-----AGGTCGGCTTTGATATTTTTTTTGTT-AGC--GACATTTTGTAGTGAGGTTTGGTAATTGCTCATTGTGTCATTGGGATGTG-CGTCG-GCAACAAGGCTCCTGCCAGGGGAAAATGA-CCTACATG-GAAGTTCAATAGAACAA-TGAGGGATTGCATTTGTC-TTAAGA--AACTTTTTG-GCTTTTCAGAAAA-----TTTTTGTATTGTAAGGTG----A-GCAGGGCCAACTTTAGGTCAT--G----------GGGA--GCCTCAT-GTCAA--G-T-TAAT-GGAAGTCAATATC-ATGCCCAAGAAGTAA-------------------------GGATATATGGGTTGGCTCTACTG-TT--TATG----------------G---TCTGC-G-C--AT-GGGAA---CTATGTC--CCCACAGATGAG---CTT---TG----AAAACAC-TCTAAG-GTATGAT-ATGACAAATT--TG--A---GA------ATTTG----CGTTGG-CC-------GCA---A-AAAAAG--AATCAT-CTA-----AGTAAT---GAAT--GATA------AAT-G---GT-----------TTTGT----G----------A----T---TT---TTTCTTAGTGGCCCAG--TG-T-AGAA--CGAT--AGCATAA-CATTGTT-C-TC-------A-ACTAT--A--ATGCAAGCTGATT-G-TGACACAT-AT--AAG--GC--AA-CATTT----TTATGAG--AAGTA-AA--ATTT--TTGT-----TGAAA-T---TGGAAG--taatgtctataaaagggatatggaaaagggggc
gi|9 : tcttgcacacatgtcggggggtattaattgatcatcccGTGGCGTC--GATAAGCCTTTG--CAG-A-GGCT-CGGCCTGGGG-CTATGACCCTACAAGCAAAATTGAGCAGTCCAA-TGAGAGACTGCAGT-GAC-CTGAGAGTGACTTTTTT-AC-TGGCACAAAA-----TGATTGGATTGTA--------------GATTTGATTT----TAATGAGTTTCTCCCTTGGCA--GTCTCATAACCATTAG-C-TGA--GT--GTCAAATTCAATACC-AAGA---AAAATGATGTTAGTTGATGGGGCTGTGG-----------------------TC--T-TT----------------T---CTTCT-G-C-AAT-TGGGAC-CCGATATC--TGAGCATACT-G---ATC---TA----AATAC-T-GACGAA-GTAT--C-AATACACATC--TG--T---GA------GTTTG----GG--GGTCC-------GGC---G-AATAGGA-AATCAT-CTA-----AATAGT---G--T--AGTA----------G---GT-----------T---T----GGGTTGCACG-A----TCGGTT---T---TGAGTGATCCAA--TG--GAGGG--CAGT--GGCA-AA-T----TT-T-TC-------CCAG-AT--G--GCGC-AGCTAATG-G-AAGC---T-CC--GAAAGGG--AG-CA-TT----TTAT-CA--AA--A-AA--GTAT--TTGTTC---TGAAA-C---CTAAAA--C-CTA---AGAG-TTCAAAATC------T---GTAGGA---T----T-----CA----CTGGGA-C-AAGT---------CTG--AAGGCTGACTTAA-TGTCA-G-ATTT-GGCAA---Ggacaagt
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blockSeqs : AAGACTGTCAGCAAGAATT TT TTGA A TGAG TA A GTG AAGG TA T T T G TGCTGGT C TG G T A . T TGG ACAA A A C T . T . G TGGCCACCTT A G A G . . A AGAGACTTGTATCTGC . AAGA AAG GAAG TA C T A CG ACTGTT TGA G A . C C . . C . C T T G . . G CT T T C C AG . GT GTGAC G T GGCT AA T TA AGGTGAAGCA TA T A AGTTTCTCCCTT A . T T GTTAATGGAA C . AATGATGTTAGTTGATGGGGCTGTGGTCTTTT A . . A . A TGAG G TGAG TGCTT A AC T . GTAC C . CTA ATTTGCGTTGGCCGCAA G . . . G G GC . GGTTTGGGTTGCAACGATCGGTTT T . TA ATA . . . . . . CCAGATG C . T A . CAA . TT . . . . GAG G A . T G TC CT . . T . A G GAAATCTGATATGGCTACGGGTATTAAG G . A T . . . G T AAC C C TTGACCTGCAC . TTC . . T TGGTTGAATAAT G A . . . G GAA . T T T . C . A . . T C G . . . GC G . . A TA . . . G . A T . . T . . . ATA . T G C . . T . T A A AA A . . C . . . T GTAT A A . CG T CT G T . TTGGTT . . A A . . A . ATCTTC CTTAT G . . TGGGTTT . . . CTTG T TGT . . . . A G G TG . A . T . . . AA AC . . . . . . . . . . C C T . . . . . . . . . . G . . . AC . . A . CC TA . GT . . . . T . . . . C A TG T . . T . . . . . . . . G . . . C . C C . . . . . .
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blockSeqs : TTTTGTT . . T G TA . C A TC G G C . A . . . . . T AG C C T G GT . GA ATTAC G A GGG TT T GA TTTAGAT GA A A G C . T A GTTAATCGT . . GTGATGACAGTGTTGGGTTCAGTGTTTTTT A . . T . A TTGG G CAA CTG A G C . CTT G . A ATTTGGAGGACCCAGG T . . . A A GA . TATTCTATGGTTGTGTGATATT G . TA AAC . . . . . . CCATAAG C . T T . CT . . . . . . CA A G . T . . T . . A . T A GGATGGGGATATCGGTAGGAGACAA G . G T . . . A C GG C T AAGGAC . . . . A TGCTAC . G . . . . C . . . . . . . T . . G . . . . . A . T . . . C . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G CT . . A . . . . GTGAC . G TAC GG T T . CA G A G G . T A AATATGAGT . . GGATATATGGGTTGGCTCTACTGTTTATGG G . . T . A CCCA G CTG TA C T G . AAT T . A CAAATTTGGACCACAT A . . . G A GA . TTGGGATTGCGTGATCTATCT T . TA GGC . . . . . . AACTATA C . T T . AT . . . . . . TA G G . A . . T . . T . T A TTCAAGGTTTATAGGAATGGGA G . C T . . . T C AG T T
blockSeqs : . . . TG G . G C . . . TAGCTGAGT . . TGTTCAACAGTCTTGT C . . G . T TGAG G CA TG C T C . GTT A . T GTTGCCCATGCCAGCG T . . . T G GA . AAATTGTTTTGGAGGTGTTTT A . G GC . . . . . . CCAGATG T . G T . CT . . . . . . TG T T . T . . T . . A . A G ACTTGGCGCGACAGGAAGTAAT A . C C . . . G A
blockSeqs : . GTTTATGTTCA G . . A . . TT T C TA A C C . CAA A . G CGAATTTGGACCACAA G . . . G A G . AATGGTTTTGTGATTTTTTC A . T AA . . . . . . CACAGT T . T T . CT . . . . . . CA G G . T . . C . . T . G G TGTAGGATTCACTGGGACAAGT T . A C . . . G A
blockSeqs : GTTTTGT C . . . . . TT . G G T T C . TT A . A GTTTGGGGGTCCGGCG A . . . A G G . AGGATTGCGAGATTGATTT C . T AA . . . . . . CACAAA C . G T . . . . . . . . CA . A . A . . . . . . . G . TGTAGGATTCATGGGACAAGT . . T . . . .
blockSeqs : A . CA C . T TTGGAA T . . . . . . . ATTGCCTGTGTGCTGT T . G TA . . . . . . CACGTT . . A G . . . . . . . . . . A . .
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Reference ( family-881 ) : TGGCCCACTGTGAACGAGA------A----C--G---T--GCGAT---G--TTGAATT-GTC----GTGGGAATGTATTGNGCTTTAACGA------GTGATGTTGTGACTTGAGANTGGTTA-A---A--ACAANCTTNCGAACAAGNTGCATNAC-T-C-TGGTGATTTGGATGTCGATTTATTGAGTACGTGAACGACTGCCATATTGTCAATGTGAAACAAAATTCGCTT---ATCTGTTAAA-GANTC-GTC--GCCATAATGACAAAGAGGCGACATACACTGGGAANAGTTCCAAGAAAGNCCATGTCCCTAACGACAC----CCTCCT-CGGACCAA-----TGGCC-GAGGAC----C--GAATANGCCCAGCTNCCCGCGAAATAGATGCCGAANCC-CCCTTTTGA-CCCCCTGCGCTGTCTGTGAANAATT-G----A-AC-GTTTCA-----TC-GCGTA-CC--ACG-GTTGTAAAGAAAT-ACNGNNATGCCATTATAG-A--TCTT--AGAA--ATT-CT-GCCAGGCA-C-A-----AGGTCGGCTTTGATA--TTTTNTGTT-ANCCTGAC--TTTGTGATGAGGTTTGGTAA-TGCCGATTGTGGCGTC--GATGAGCCGTCG-GCAG-AAGGCT-CGGCCAGGGG-NNACGACCCTACANGCGAAGTTCAGTAGNCCAA-TGAGGGACTGCA-GTNACCTGAGAGTGACCTTTTN-AC-TNNCAAAAAATAATT-GTA--TTG---TAA-G-T----GA--C-GATCCGA-CTT---GTCATGG----------TGGNA--GCCTCATAGCCAT--G-T-TGAT-GT--GTCAAATTCAATGCCCAAGA---AA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---CCTNC-G-C-GAT-GGGGACNCCTATGTC--TNCGCAGACG-G---ATT---TG----AANAC-T-TCTAAG-GTAT--N-ATGACANAT--TTG--A---GA------ATTTG----GG--GG-CC-------GCA---G-AANAGGA-AATCAT-CTA-----AGTAGT---GAAT--GATA------A---G---GT-----------T---T----G----------A----T---TT---T---TGAGTGANCCAA--TG-TAAGGG--CAGT--AGCA-A--ATTTTTCCCA--TATG-GCGC-AG-C-TNATT-G-AGGC---T-CC--AAA--GG--AG-CA-TT----TTAT-CG--AAGTA-GA--ATNT--TTGT-----TGAAA-T---TTGAAG--C-CNA---GNAG-TTCAAAATC------G---NTTGGC---G----C-----GA----CAGGAA-G-NAAT---------CGG--AAGGCCGATTTGA-TGTCA-G-ATTT-NGCCAGG-AANGC--CCC----C--CCG--AG--NTAGCT-ATCATTCC------GGCT---GCCTCA-----TCAA-TG--------CTTG----AC----------TATAGTG-NACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGAT-GCGAGAG-GTGGTGAATGAGTC-GCAT-GTTTCCATCTTTCTTGGGCACTAGGCCCA---GT-GG--AGA-G-ACTTGCAGA--TTA-GGGAAAGGTGGGGAG---T-CG-AAAGG---GCCT-GCCANC--CGTCCTAGCACTAACTCNTT---CTGAATT-TTG-CTTTTGGC-TATTTGAGAATTAGTCTT-TACACTGG-ATAAAT-TATCAGAAT---TCGAGGAAG--TCTGGGGCC-----C--ATAT-TATTAGCT-T---AAAAC-CGTTAGAAAAGA-CCCCTGCCGAATAAGA---GTAACCCC-TGATACCCCCTGAGGGGTTTGGTTAGTTGCT-GCCAATTAATTGGT---GTAT---ATACCAAAG-GA-A-AATAGAG-AC---C-CCTTATTT-T--GAACAT--TACTGGTGCTTGGG-GTGA---T--GTCCTCCCACATTT--GCTGCAATGCATGCTT-GTACTTGCACCTTGGGGAAAGAATT-ACAA----ATCCCT--TTGCTATAT-AAANAA---CGGC--AATACA-T-AG--TT---AGCGTTATG-ACTGGC-TTGACCTTGGCNTGAATG-T-GTATAA-TTA-GAGC--GCT-GATTTGAACTGGTGTGCTGCTTTTGTTGGGCTGCGCTTGGTTT---GAAAACACTACAGGA-GCC--AAAATTCCT--GGTTG-A-TCTG-ACCCCCAAGAT-GCTAGTG--AGTG-ATTAGACATCCTTAGCCT---AAATT-GTTCAT-CGT-ACTTAGGCCACAAATTAG--ACCTAGTAGCTCGCAANTCGAATGTTCCCTT-AAATACTTAAGCAATTCTTGGGCTTTACCTGGAGA-CTTTTCGATCATG-ATACTGATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTAG-CCAATGC-TAAGAATTGGATTGG-TTTTGGATT--TTGCAAT-CAC----ACAA-GCGGCCCC--ACCA-TTATTCGGATGTCT-------CCCA-CATGGA-CTCTTG---GT-----------CCCGGATTTCGCATGCCGACTTGG---TGGTCAGCGACGACAAATCAATAAATTGGCCNTCCCATATTTTTTGTCTTGATTGATAGGGGAACGTTGAGANCCCCCCCAAACAAAGGGGGACATTTCAATAATCGAAGTAACAACTNATTNGCTGATAAGAGTGAGACGCGATAGCATTAACAAANTCACCCCNTCCAAACTCGACTCAGACATCCGAGGAACCCGTTGGTTCCCTTTCGTAGATTCTGGCTGCCGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGNGCGGTGACAATTCCGGGGTCCTGTTGGAATTAGGTGGCTGTTGGTTAAGGGTGCTTTGGC-----TAC--ACC---GCTTAGGTC-GGCCTTT--CCCTCGACTTGGG-GTGCCCATCGTCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTCGTTTTGGTTCGTACTGGTGGCATTTTTGGCCGCCGA-TTG-GTGTCGATTGCAATGGATTGTTGTTGGTCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTC-TAA-CCGA-GA-TGGCGTGGA--AAAGGATGATGC---TAAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACAGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAG--TT-AGATCGGGACAA-ATTGACACACGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATTTTTAT
gi|1 : TGCCCCACTGTGAACGAGATATTGCA----T--C---T--GCGAT---G----GAATT-GTCCTTAGTGGGGATATAAGAGGCATTAATGC-------TGATATTA-GACCTGAGACAAGCTA-A---C--ACAAGTTTACGA-TGAGATTCATGAC-C-C-TAA-GATTTGGATGTGAATTTATTGATGACATGAATAACTGCCATGTTGTCAATGAGAAACAAAA---GCTTGCAATTTGTGAAATGACT---TT--GCCATAGTGATAAAGAGGCGAC---CACTGGAAAGAGTTC-AAGGAAGACAATGTCCTTAATGACAC----CCTCCT-TAAACCAAAATTTTGGC--AAGGAC----C--CA-TAAGCCCAAATTCCGTTGAAATAGATGCCGAACCCTCCCTTTTCA-CCCCCTGCACTGTCGGTGAATAATT-G----A-ACCGTTTCA-----TT-ATGTAACC--ATG-GTTGTAAAGAAATTACGGATATGCCATTATAGGA--TTTT--AGAA--ATT-CTAGCCAGGTAAC-A-----AGGTCGGCTTTGATA--TTTTTTGTT-AGCCTAAT--TTTGTAATGAGGTTTGGTAA-TGCCAATTGTTGCATT--GATGAGGCGCCG-GCAA-AAGGCT-CTGCCAGGGG-AAATGACCCTATATACGAAGTTCAATAGGCCAA-TGATGGATTGCA-TTTA---GGAAGT---CTTTTG-AC-TTTTAAAAAA-AATT-GTA--TTG---TAA-GGT----GAAGCAGGTCCAA-CTT---GTC-TGA----------GGGGA--GCTTCATGGTCAT--G-T-TGAT-GGA-GTCAAATTCAATGCCCAAGA---AA-------------------------G-----------------------TT--T-TG----------------T---CCTGC-G-C-GAT-GGGGACGCCTATGTC--CCCGCAGATG-G---ATT---TG----AAAAC-C-TCTAAG-GTAT--G-ATAACAAGT--TTG--A---GA------ATTTG----GT--TGTCC-------GCA---G-AAAAGGA-AATCAT-CTA-----AGTAAT---GAAT--GATA------AAACG---GT-----------T---T---------------A----T---TT---T---TCTGTG-CCCAG--TG-TAAGAATACAGCGAAGCA-A--ATTGTTC--A--AATA-ATAC-AG-C-TGATTTG-AGGA---A-CC--AAA--AG--AA-CA-TT----TTAT-CG--AAGTA-AA--ATTT--TTGT-----TGAAA-T---TGGAAG--C-CAA---GTAA-TTCAAAATC------G---CTTGGC---G----C-----GA----CAGGAA-G-TAAT---------CGG--AATGCCGATTTGA-TATCA-G-CTTT-TGCCAGG-AAAGC--CGC----A--C---------TAGCT-ATCATTCC------AGCT---GCTTGA-----TCTA-TG--------CT------AC----------TATAATG-TACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAC-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGAT-GCGAGAG-GTGGTGAATGAGTC-GCAT-CTGTCCATCTTTCTTGGGCACTAGGCCTA---GT-TG--AGA-G-ACTTGAAGA--TTA-GGAAAAGGTGGGGAG---T-CG-AAAGG---GCCT-GCCACC--CGTCAGAGCATTAACTCCTT---CTGAATT-TTG-CTTTTTGC-TATTTGAGAACTAGTCTT-TACACTGG-ATTAAT-TATCAAA------CGAGGAAG--TC-GGG--C-----C--ATAT-TATTAGCT-T---AAAAC-CGTTAGAAAAA---CCCTGCCG-ATAA-A---GT-ACCCC-TGATA--CCCTGAGGTGTTTGGTTAGTTGCT-GCAAA-TAATTGGT---GT-T---ACACCAAA--GA-A-AATAGAG-AC---C-CCTTATTT-T--GAA-AT----CTGGT-CT--GG-GTGA---T--G---TCTCACATTT--GCTGC-ATGC-TGCTT-GTACTTGCACCTTGGGGAAA-AATT-ACAA--------CT--TTGTTAT----AAAAA---CGAC--AATACA-T-A---TT---AGCGTGATG-ACTGGC-TTAA--TTG--CTGAA---T-GTATAA-TTA-GAGC--GCT-GATTTG-ACT-GTGTGTT-CTTTTGT--GGCTGCGCTTGGTTT---G-AAACA-TACAGTA-GCC--AAAATTCCT--GATTG-A-TCTG-A-CCCCAAGAT-GCTAGTG--AGTG-ACTAGATATCCTCAGCCT---AAATT-TTTCAT-CAT-ACTTAGGCCAGAAATTAG--ACTTAGTAGCT-GCAATTCGAATG-TCCCTT-AAATACTTAAGCAGTTCTTGGGCTTTACCTGGAAA-TTTTTCGATCATG-ACACTGATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTA--TCAATGC-TAAGAATTGGATTGG-GTTTGGATT--TTGCAATACACATTGACAA-ACGGCCCT---CCA-TAATTCGAATGTCT-------CCCA-CA--GA-CTCTTG---GT-----------CCTGGATTTCGCATGCCGACTTGGTCATGATCAGCAACGACAAATCAATAAATTGGCCTTCCCATATTTTTTGTTTTGATTGATAGGGGAACGTTG-GATCCC---------AAGGAG------TC----------GTAACAACTTATTTGCTGATAAGAGTGAGACGCAATAACATTAACAAAATCACCCCTTCCAAACTCGACTCAGACATCCGAGGAA-CCGTTGGTTCCC--TCGTAGATTCT-GCTGCCGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGCGCGGTGACAATTCTGGGGTCCTGTTGGAATTAGATGGCTGTTGGTTAAGGGTATTTTGGC-----TAC--ACT---GCTTAGGTC-GGCCTTT--CCCTCGACTTGGG-ATGCTCATCGTCTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCCTGGAATTTGTTTTGGTTCGTACAGGTGGCATTTTTGGCCTCCGA--TG-GTGTCGATTGCAATGGATTGTTTATGGTCGAAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTG-TAA-CCGA-GA-TGGCTTGGA--AAAGGATGATGC---TAAA-T-----CGTTCTA-GGTGAGGTTTATTTTTATAGTACAATCGTACCATGGCTAACTCGTT-TTACGAAAAG--TT-AGATTGGGACAA-ACTAA-ACAAGTA-GAAACC---TGT--CCTAAATAAAGCTGGAC-TATTTGTTA-TAAAATCAGA--TAATTTTTAT
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gi|17 : GTTGG--GGAAAAACAGTC---G-TCTGGCTTTGTAATCCGA-GAATGGCGTGGATAGAAGGATGATGTGCGTAAGCT-----CGTTCTATGGTTAGGTTTATTTTTATGGTACGGTCGTACCATGGCGAACTCGTA-TTACGAAAAGTATT-AGATCGAGACAA-ATTGACACTCGTATTAAACC---TGTCCCCTAAATTAATCTGGAC-TATTTGATAGTAAAATCAAAATTAATTTGTAT
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gi|20 : ttcgcctactctgagcaacgcaaaatatgctaagcaaaaggcacatgtaaaaagtttgacctcataagtagaagcacataagagtggcaatgatgccaccattttttccagaataggaaaagtgataggacaacgcaagtcctctcccatacccctggtgcgcttgagacctaataatgctttgccaatgagaaagtgatttgttgggtcctcaagccctctaagtttatggtagaaagctaatgcgcttacgtacaaatgcacagtgcgaggggaatattggtgaattgacaagtctgcaataaatttagcaacactgaaactggtataggccaagttactgccgcttgattgtactggactctaaagaaaattaaaaaaaattttaagggcagtttcgtatgtcttgtgtgtactgggagctagagcgttgtaaatgaggcttctggattcagcccttagatctgctcgagttgggaattgggggttggccaaacgtctgcgtcgggcgccagcttcctgaatttctTGGTCCACTGTGAACGAGA------------------T--TT--T---G--TTGAGTT--TC----GTGGGAATGTATTGTACTTTAACAATCAATTATGATGTTGT-ACTTGAGGGTGATCA-A---G--ACAAACTTGCAAACAAGCTGCAtcaga
gi|22 : gtggtgaaattGGGTGCTTTTGC-----TAC--ACC---GCTTAGGTT-GGCCCTT--CCCTCGACTTGGG-GTACCCATCGTTTGTAAACG-ACGCCGAGATGCCC
gi|23 : AAAAAA-AATT-GTA--TTG---TAAGG-T----GAAGCAGATCCAA-CTT---GT
gi|3 : ttAAAGTGGGGAG---TACGCAAAGGTGAGCCTTGCCAGTTGCGTGCTAGCACTAACTCATTGTTCTGACTTATTGACTTTTGGCATATTTGAGAATTAGTCTCGTACACTGTTATAAATCTATCAGAATCATTCGAGGAAGGTTCTGGGGCCACAATCTAATAC-TAT-AGCTATGAAAAAACACGT-AGAAAAGAACCCCTGCCGAATAAGAACAGTAACCCT-TG-TACCCCCTGAGGG-TTTGGTTAGT-GCGAGCCAATTAATTTGT---GTAT---ATACCAAAGTGA-A-AATAGAG-AC---CGCCTTATTT-T--GAAC----TACTGGTGCTTGGGTGTGA---TTGGTTCTCCAA-ATTT--GTGGCATTGCATGCTTTGTATTT--ACCTGGTGGAAAGAATTTACAA----ATCTTC--CTGCT-TAT-AAATAAAGTTGGC--AATACA-T-GGGTTT---AGCCTTATGGACTG-C-TTGACCTTGGCATGGATGGTAGTATAA-TTAAGAGC--GCTTGATTTGA-CTG-TGTGC-GCTTTTGTTG---TGCGCTTGTGTT---GAAG-TACTACAGGAAGCC--AACATTCCT--GGTTG-ACTCTGGATCCCCAAGAT-GCTCGTC--GGTGGATTA-ACCTCCTTATTCCGTGAAATT-GTTCATTCAT-ACTTAGGCCACAA-TTAGGGACCTAGTAGCTCGCACGTCGAATGTTCTCTTAAAATACTT-AGCAATTCTT-GGCTTTACCTGGAGATCTTTTCGAT-ATGAATACT-ATAAAGATGCATAAATGCTGAGTGTCCAGCTAGCCCAATGCTTAAGAATTGGATTGGTTTTTGGATTTATTGCATC-CAC----ACAAGGCGGCCCCCAACCATTTATTCGGTGGTCTACTAATCCTCATTATGGATCTCGTGTCCGTCCCGCCCCCCCCCCGGATTTTGCATGCCGACTT-----TGGTCAGCGA----AAATCAATAAA-TGGCCGTTCCATA-TTTTTG-CTTAATTGATAGGGGAACGTTGAGAGCCCCCCCAAACAAAGGGGGACATTTCAATAATCGAAGTAACAACTGATTGGCTGAT-AGAGTGAGACGCGATAGCA-TAACAAACTCACCCCGTCCAAACTCGACTC-GACATCCGAGGAACCCATTGGTTCTCTTTCGTAGATTCTGGCTG-CGCTTGTACCATATCAGGCTGATCCGGTAAGGGC-GTGACAATTCCGGGGTTTTGTTGGAATTAGGTGGCTG-TGGTTAAGGGTGCTTTGGCATTAGCACAAACCCCGGCTTAGGTTAGGCCTTTGGTCCTCGA-TTGGGCGTGTCCCTCGTCTGTTAACGAACG-CGAGATGCCCTGGAATTCA-TTTGGTTCGTACTGGTGGCAGTTTTGGCCGCCGATTTGCGTGTCAATTGCAATGGATTGTTGTTGATCGAAAAAACAGTC---GTTCTGGCTTC--AA-CCGAGGA-TGGCGTTGA--AAAGGATGTTGC---CTAG-T-----CGTTCTA-GGTTAGGTTTATTTTTATGGTACATTCGTACC-TGGCGAACTCGTATTTACG-AAAG--TTGAGAC--GGACAATATTGACACATGAC-GAAACCTGTTGT--CCTAAATTGATT--GACTTATTTGATA-TAAAATCAAA--TAATATT
gi|4 : --C-CAA---GTAA-TTCAAAATC------A---CTTGGC---G----C-----GA----CAGGAA-G-TAAT---------CGG--GATGCCGATTTGA-TATCA-G-CTTT-TGCCAGG-AAAGC--CCCTTGAC--CTG--CA--CTAGCT-ATCATTTC------AGCT---GCTTGA-----TCTA-TG--------CT------AC----------TATAGTG-TACTG-AGCAT------GC-ATTGGGGTCAATGAA-GTCATTG-ATGGATGCATT---TTCTGGAT-GCGAGAG-GTGGTGAAAGAGTC-GCAT-GTCTCCATTTTCCTTGGGCACTAGGCCCA---GT-GG--AGA-G-ACTTGCAGA--TTA-GGAAGAGGTGGGGAG---T-CG-AAAGG---GCCT-GCCATC--CGTCCTAGCACTAACTCATT---CTGAATT-TTG-CTTTTGGC-TATTTGAGAATTAGTCTT-TACACTGG-ATAAAT-TATCAGAATA--TCGAGGAAG--TCTGGGGCC-----C--ATATATCTTAGCT-T---AAAAC-CG-TAGAAAA-A-CCCCTGCCGAATAAAA---GTAACCCCTTGATACCCCCTGAGGGGTTTGGTTAGTTGCT-GCCAATTAATTGGTATGGTATTAAATACCCAAA-GATATAATAGAGCACACAC-CGTTATTTATAAGAACATTGTACTGGTGCTTGGA-GTGAATCT--GTCCTCCCACATTTTATCTGCAATGCATGCTT-GTACTTGCATCCTGGGGAAAATATT-ACAATCATATCCCTAATTG-TATATAAAAGAA---CGGTCGAATACAGTAAA--TTATGAGCGTTGTG-CTTGGCATTGACTT--GCTGGAATG-T----TAATTTA-GAGCTGACT-GATTAGAACTGGTGTGCTGCTTTTGTTGGACTGCGCTTGGTTTGAGGAAAACATGACAGGA-GCCAAAAAATTCCTTGGGTTGAA-TCTG-ACTCCCAAGATAGCTAGTGGAAGT--ATTAGACATTCTTAGCCT---AAATTGGCTCAT-CGTCACTTAGGCCACAAATTAG--ACCTAGTAGCTC-CCACTCGAATGTT-CCTT-AAATACTTAAGCAATTCTTGGGCTTTACCTGGAGA-CTTTTCGATCATG-ATACTAATAAAGATG-ATAAATGCTGAG-GTCCAGCTAG--CAATGC-TAAGAATTGGATTGG-TTTTGGATT--TTGCAAT--AC----ACAA-GCGG-CCC--ACCA-TTATTCGGATGTCT-------CC---CATAGA-CTCTTG---GT-----------CCTGGATTTTGCATGCCGACTTGG---atta
gi|5 : TGGTCCACTGTGAACGAGA------AATG-C--AATCT--GCAATTTTG--TTGAGT--GTC----GTGGGAATGTATTGTGCTTTAAC-A------GTGATGTTGT-ACTTGAGAGTAATCA-A---A--ACAATCTTGCGAACAAGCTGCATTACAT-G-TTTTGATTTTGATGTCGAGTTATTGAGTATGTGCACGACTGTCATATTGTCTATGTGGATTAAAATTCGCTT---ATCTGCTAAG-GATTT-G-G--GCCATAAGCACA---AGGCAACATACACGGGGATCAACTCTAAGAAAGT-CATGTCCCTAATGATATGGGACCTCGTCCAGGCCAA-----TGGCC-----AC----CTTGAATAGGCCCAGCTACCCGCAAAGTAGATGCCAAAGCC-CCAAGTGGG-CCCCCTGCACTGTCTGTGACAAGTTAG----AGAC--TTGTA-----TCTGC-TA-CCCAGCA-GTTAT-TTGAAATGACTGTAACCCCATTATAG----TCTTCGAGAA--A----T-GATAACCA-C-ACCTGTAGGTCGGCCTTGAT---CTCCATGTTGACCCTGAC--TTTGTG
gi|6 : tttgcgagttatttcccccactcgcaggaggccgaaataagctaaacagaaagcagatttgaaaagtttcatttcgtagtgggatgacgagatatgagggagtgcgtggaccaccttttgcaggatatggatggtaatgggacgacgggtatcaggttttttgccgtgagtgcgtttaaggccttggattgatttaaatacatgtactaggattgacttggttggatctggcaatagtcgtattttgtggaagtacgacagggcttgcacataacgctgaatagtgttggttgagagattttgaattgacagatatgctataaaatgtagtgtggtttttgttggtatggccaagagttaggcagcttgtaagcaagcagaaatcctggtatctgcggacagacatgtatgctttagttttgtagatatcgcagcattaataagacgggctgatcggattctagatcctccaaatgtggcttggtagaggcataggtttgcggtctgctgagggggccaggtggtgaaatt-------------------------G-----------------------TT--TATG----------------TTCACCTGC-G-C-GATTGGGGACACCTATGTC--CCCACAGATG-CTTTATTGTATG----AACCT-C-TCTAAG-ATGT--C-A--ACAAAT--TTGCTA---GACATTATATTCGTCAGAA--GG-CT-------GCAATAG-AATATAA-CATCATACTACAAACATTA-T---GACTAGGATT------A---G---TTACAAATCTTTCT---T----GTAGATCT---A----T---TT---TAACTTAGTGAACCCACGTG-TAACAA---AGT--AGCA-A--ATTGCTCAAA--AATACACAC-AGACATGATT-GGATGC---AACC--ACA--GC--AA-CA-TT----TTAT-CGAAAAGTA-GATCATATAATTGTATATCTTAAA-TACGCGGAAG--C-CTAAAGAAAA-TTTAGAATA------A---GTCTTC---G----CCTCCAGAGATCTAAGAA-GATAATATACTCGCGCAGATAATGCCGATTTGA-TATCACG-CTTTATGCCATG---CGCAACAC----C--TCA--AGGACCAATTGATCCTTCCCACCTAGACT---GACTCATTTTCTCAACTGATCTTAGACTTG----ACCTAGCTTACATATA-TGTAACTG-AGCAT------GCGATTGGGG-CAATGAA-GTCATTGCATGGATGCGTT---GTCTGGATGGCG-GAGAGTGGTGAATGAGTCGGCAT-GTTT-CATCTTTCTT-GGCACTAGGCCCA---GT-GG--AGA-GCAC-TGCAGAACTTA-GGGAAA-GTTGGGAG---TCCG-AAGAG---GCCT-GCCACC--CGTCCTCGCACTAACTCCT-----TGAATT-TTG-CTTTTGGC--ATTTGAGAATTAGTCTT-TACACTGG-ATAAAT-TA
gi|7 : -GCAG-AAGGTA-CATCCAAGTG-AGACAACCTTGCAGGCAAAAT-----A---TAA-TGA----CTGCA-ATTACCAAAGGATGATCATTTG-GG-CAACAAAATAGAATTTATAACTTGCCTTAC-C-T----TA--C-----CGAACTT---GTC-TGA----------TGGCAAAGCC--ATAGCCAT--AATATGA--GT--ATCAAATCTAATACC-GAGA---AATGTTCAACA----------------G-----------------------TC--T-TG----------------T---CCTCT-A-CAGAT-GGT-ACTCCTAAATC--TTGGCAGA---G---ATT----G----AACAT-TGTCTGTG-GTGT--G-TTGACAAAC--TGG--G---GACGA---ATTTG----GA-----CC-------ACA---A-AAGAGAA-AATCAT-TTA-----A-TGGT-----AT--GTTC------ATT-GCCTGT-----------G---T----G---------------C---TG---T---CGAGTTAACCAA--AC-TAAATA---AAT--AGCA-A--ACTTCTCCCA--TAAG-TTGT-AG-C-TTATT-A-AG-------CC--AAA--GGGAAC-CA-TT----TTGT-----AATCATAA--ATTT--ATCT-----TCAAACT---TTAAAGAAC-CAA---GGAG-GTCAAAATC------G---GATGGG---GATATC-----GG----TAGGAG-A-CAA---------------AAGGCAGACTTGA-TGTCA-GAATTA-GGCAAAG-GGTGC--CTC----CA-CCA--AGC-ATAGCA-ATCATGTC------AGCT---GCCTCA-----TCAG-TG--------GTTGAATAAT----------TATAGTG-GGATC-AACATCTAAAAGC-AATTAACTCAAT--C-GTC-TTG-A-----------------GGAT-GTAAAAG-ATGGTGTATGAGCC-TCAT-GCTGCCATCCTTTTTGGGGACAAAGCTCA---GT-GGGAAAA-A-ACTT
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gi|9 : tcttgcacacatgtcggggggtattaattgatcatcccGTGGCGTC--GATAAGCCTTTG--CAG-A-GGCT-CGGCCTGGGG-CTATGACCCTACAAGCAAAATTGAGCAGTCCAA-TGAGAGACTGCA-GTGACCTGAGAGTGACTTTTTT-AC-TGGCACAAAATGATT-GGA--TTG---TA---------------GATTTGA-TTT----TAATGAGTTTCTCCCTTGGCA--GTCTCATAACCATTAG-C-TGA--GT--GTCAAATTCAATACC-AAGA---AAAATGATGTTAGTTGATGGGGCTGTGG-----------------------TC--T-TT----------------T---CTTCT-G-C-AAT-TGGGAC-CCGATATC--TGAGCATACT-G---ATC---TA----AATAC-T-GACGAA-GTAT--C-AATACACAT--CTG--T---GA------GTTTG----GG--GGTCC-------GGC---G-AATAGGA-AATCAT-CTA-----AATAGT---G--T--AGTA----------G---GT-----------T---T----GGGTTGCACG-A----TCGGTT---T---TGAGTGATCCAA--TG--GAGGG--CAGT--GGCA-A--ATTTTTCCCA--GATG-GCGC-AG-C-TAATG-G-AAGC---T-CC--GAAAGGG--AG-CA-TT----TTAT-CA--AA--A-AA--GTAT--TTGTTC---TGAAA-C---CTAAAA--C-CTA---AGAG-TTCAAAATC------T---GTAGGA---T----T-----CA----CTGGGA-C-AAGT---------CTG--AAGGCTGACTTAA-TGTCA-G-ATTT-GGCAAGgacaagt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): TCGCGAGTAAATTCGCCCACTCGTAATAAGCAGAAGTATGCTAGAGTAAACACGCTTGCAAATAGTTTGGCTTCGTATGGGATGTGCAGACCGAGGGTAAAGCGACTTAGCAATTTTTTCTAAGATTGAGATGGTGATGGGGTGACGTGTGTCTGGTGCTTTATTGTAGCGCGTTATGCCTTGCAAGGGTTTGAAACTAGGAAAGATGTGGTTGGGTCAGATACTTGCCTTAATTTGTGGAAAAAGGACAATGGCTAATGTATAGCCGAACTGTGTTTGGGGATAGATTAAGGAGGGACATATGTGCTATAAAGTT
Unaligned ( gi|15 ): CGAAAGGCCTGCACAATAAAGCTAATAGTGTTGGTTGAAAGATTTTAATTGACAGATATCTATAAAAATGTAGTGGTGGTTTTAGTTGGTATAGGGCAAGAGTGGCAGTTGTAGCCAGCAAATCTGGTAATCTGCGTAGGACTGACATGTAAATCTTTTTTTTAAGTGTTTGTAGATATGCAGCATTAAATAGACGGGCTTGATTTCGGATCCTAATCCTCCAAATGTGGCTTGGTAGAGGCATAGGTTTTGCGGTCTGGCTGCGGGGGCCAGGTGGTGAAATTTGGTCACTGGTGAAGAGAAATGCAATCGC
Unaligned ( gi|21 ): GATGGTAATAGGACGACGGGTATCAGGTTTTTTGCCGTTAGTGCGTTTAAGGCCTTGGATTGATTTAATTACTAGGATTGACTTGGTTGGATCTGGCAATAGTCGTATCTTGTGGAGG