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Reference ( gi|2 ) : GCTTTAAGATATATGCACGTGTCAGCTTTCCACTTTTCA-GAC-CCTGTGTCAGCGTGTGCATACACT--GTG--TAGATGGATGGTATATAATATATCACACAGAATTATAAC-TGAACTTAAATGATGAGCGATATTTCTACGCTTAAGTGTCAACGAAATTCGGTA-GCTTA-CACCCC-GTGCACA-ACA-----TGTAGCT-TAC-ACTC--CATG-CA-CAA-CATCGGTATTT---CGTT---------GATATCT-T-TCAA-TATGATTGGTTTT--ATTCACTGACAGAATA-T-GT--AT-AACC---TT-ATA--CAGA-T-A------G-CAC-GC-AAT-TAT--TGGT-A---ACG-T-AAAAG-TG-ACGAAAAAACACAG-CGCTGT-------T-CT--------------GA--------------CATA------CAGTTGTACCAAA-CTAGTCT---C-G-ATCGT-CAGCA-TTGTGTT-G--AGGTGTT-T-G-ATAAA-ACTAGAAAGT-G-TA-CAGTGCA-TGT-A--TT--T--T---TCC--T-TATATTCTTCAAAT-GT---TGC-TTTCTTCC-----------GTAGG-CGT-ACATTTTCC--T-GCAA--GATA---T---ATC-CAT-A-AAT--T-A-ACAT-TTTATGCAAAA-ACTA-AC-C-TCGA----CCACCTGAATC--GT-CGCTT--C--G----GT-----AGCC-TA-CACCCC----GGT---CACA-GC-A--T-A-GCCT--ACA---CCCCGCA-TGTTGGGGTATATACC
gi|4 : GCTTTAAGATCTATGCACGTGTCAGCTT-CCACTTTTCAAGAC-CCTGTGCCAGCGTGTGCATACAGT--GTG--TA-ATGGATGGTACATA-----TCACACAGCATTATCAC-TAAACTTAAATAATGAGTGATATT-CTACGCTTAAGTGTAAAAGAAATTCGGTA-GCTTA-CACCCC-GTGCACA-ACA-----TGTAGCC-TAC-ACCC--CATG-CA-CAATTATC-GT-TTT---CGTT---------GATATCT-T-TCAA-CACGATT-GTTTT--ATTCACTGACAGAATA-T-GT--AT-AA-C---TT-ATA--CAGA-T-A------G-CAC-GT-AAT-TAT--TGGT-C---ACG-T-AAAAG-TG-ACGATTAAA-ACAG-CGTTGT-------T-CTAATATTTGGTCATAAA--------------CATA------CGGTTGTACCAAA-CTAGTCC---C-G-ATCGT-CAGCA-TTGTGTT-G--AGGTG-T-T-G-ATAAA-ACGAAAAAGT-G-TA-CAGTGGA-TAT-A--TTTGT--T---TCC--A-TATATTCTTCAAAT-GT---TGT-TTTTCCTC-----------GTAGG-CAT-ACATTCTCC--T-GCA
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Reference ( family-879 ) : GCTTTAAGATCTATGCACGTGTCAGCTTTCCAC-TTTTCA-GAC-CCTGTNCCAGCGTGTGCATACACTGNGAGTAGATGGAT--GGTATATG--ATGTCA--CATAGAANTATCAC-TA--AACATAAAAAATAAATN--ATATTTCC-GCGCTTACGTGTAAAAG-AAATTCGGTA-GC-CTAC-ACCCCGTGCA-CAACATGTAGC-CTACACCCCGTG-CACAA-CATC-GGTTTTTCG---------TCGATATCT-T-TC-AACACGATTGGTTTT--ATTCACTGACAGA-ATA-TGT--AT-AACC---TT-ATA--CAGA-T-A------G-CACG-TAATTA--TTGGT-CA-CG-TAAAAG-TG-ACGATTAAACACAG-CGTTGT-------TCT-G--A--T--T-T-----G--------CATA------CGGTNGTACCAAA-CTAGTC---CCG-ATCGT-CAGAATT-GTGTT-G--AGGTGTT-T-G-ATAAA-ACTAGAAAGC-G-TAC-AGGGGA-TATA--TT--T--T---TCCA-TA-TATTCTTCAAAT-GTT---GC-TTTCTTCC-----------GTAAGCAT--ACGTTTTCC--T-GCAAA--ATA---T---ATC-CAT-A-AATTG-AGA--TNT-TGTGC-AAAA-ACTGAC-C-TCGA----CCACCTGAATC--GTC-GCTT--C--G----GT-----AGCC-TA-CACCCC----GGT---CACA-A-C-AT-A-GCCT--ACA---CCCCGCA-TGTTGGGGTATA
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Reference ( family-879 ) : GCTTTAAGATCTATGCACGTGTCAGCTTTCCAC-TTTTCA-GAC-CCTGTGCCAGCGTGTGCATACACTGCGAGTAGATGGAT--GGTATATG--ATGTCA--CACAGAANTATCAC-TA--AACATAAAAAATGAAC--GATATTTCC-GCGCTTACGTGTAAAAG-AAATTCGGTA-GC-CTAC-ACCCCGTGCA-CAACATGTAGC-CTACACCCCGTG-CACAA-CATC-GGTTTTTCG---------TCGATATCT-T-TC-AACACGATTGGTTTT--ATTCACTGACAGA-ATA-TGT--AT-AACC---TT-ATA--CAGA-T-A------G-CACG-TAATTA--TTGGT-CA-CG-TAAAAG-TG-A-CGATNAAACACAG-CGTTGTTCTG--A--T--TT-GA---T-CATAAAC--ATACGGTT---GT---ACCAA-A-CTAGTC------CCG-ATCG---T-CAGAATT-GTGTT-G--AGG---TGTT-T-G--ATAAA-ACTAG-A--AAGC-G-TAC-AGGGGA--TAT----------------------A--TT--T--T---TCCA-TA----TATT--CTTCAAAT-GTT---GC-TTTCTTCC-----------GTAAGCAT--ACGTTTTCC--T-GCAAA--ATA---T---ATC-CAT-A-AATTG-AGA--TNT-TGTGC-AAAA-ACTGAC-C-TCGA----CCACCTGAATC--GTC-GCTT--C--G----GT-----AGCC-TA-CACCCC----GGT---CACA-A-C-AT-A-GCCT--ACA---CCCCGCA-TGTTGGGGTATA
gi|1 : ACGTATAAGCGATCCACAGTTTCATG------GTGCC----TGTGCAAACGCTGCA--TAG---GATTTGGTGTA----ATGTTGATCATTTAATTATCAC-TATGAAC-CAGAAAATATATTTGATATTTTCTGCATTTACATCTTAAATTAAATCTGGTA-GC-CTACCACCCTGTGTAGCAACA----GC-GTAT----------------------TTTTCCG---------TCGATAGTT-T-TA-AACACCATTTGTTTTTTATTTATTGACAGATAT--TGTTGAC-AATCAAGTT-ATATCCAAA-TTA------G-TACG-TA-TTG--TTAGTGCA-TACTAAAAG-TGGA-CGATAAAACAAAGGCGTTGTCCTG--A--T--TTTGA---T-CATAAAC--A-GCGGTA---GT---AGCAC-ATCTGCTCTTT---CCGTATCG---TTCAGAATT-GTGTT-GGAAGC---TGTT-T-GG-ATAAATAC-AG-A--A-GC-G-TAC-AGGGGAA-TCT----------------------A--AT--T--TGTGTCCAATAA---TATT--TTTAATAA-ATT---GCCTTTCTTCC-----------GTAAGCAT--ATGTTTTCCCGT-GC-AA--TTA---G---ATCTCATAA-AATTG-ATA--TACATATGC-AAAA-AC--AC-CGTCGA----CTACC-----C--GTC--CTTTAC--G----GCTGAGAGGCCTTT-CACCCC----TGTTC-CACA-A-C-AT-ATGCCCTGACA---CCCCGCA-TGTTGGGGTGT
gi|10 : TA--CAGA-T-A------G-CACA-TACTTA--TTGGT-CG-CG-TAAAAG-TG-A-CGATTGAACACAG-CGTTGTTCTG--A--TATTT-GA---T-CATAAAC--ATGCGGTT---GT---ACCAA-A-CTAGCC------CCG-ATCG---T-CAGAATT-GTGTT-G--AGG---TGTT-T-G--ATAAA-ACTAG-A--AAGT-G-TAG-TGGGG---------------------------------------------A-TA----TATT--CTTCAAAT-GTA---AC-TTTCTTCC-----------GTAAGCAT--ACGTTTTCC--T-GCA----------------------A-AATTG-AGA--TTT-TGTGC-AAAA-ACTGAA-C-TCGA----CCACTTGAATC--TTC-GCTT--C--G----GT-----cc
gi|11 : TAATT------CCG-ATCG---T-CAGAATT-GTGTT-G--AAG---TGTT-T-G--ATAAA-ACTAG-A--AAGC-G-TAC-AGGGAA--TAT----------------------AACTG--T--G---TCCA-TA----TATT--CTTTAATA-GAT---GC-TTTCTCCC-----------GTAATCAT--ATGTTTTCC--T-GCAAA--TTA---T---ATC-CAT-A-AATTG-ATA--TAA-TATGC-AAAA-ACTTAC-C-TCGA----CTACCC--ATCCTTTC-GCTT--G--A----GT-----AGCT-TA-CACCCC----TGT---CACA-A-C-AT-A-GCCT--ACA---C----CA-TG-CGGGGT
gi|12 : tCG---T-CATAATT-GTGTT-G--AAG---CGTT-T-G--ATAAA-ACTAG-A--AAGC-G-TAC-AGGGGA--TAT----------------------AA-TT--G--TG--TCCA-TA----TATT--CTTTAACT-GAT---GC-TTTCTTCC-----------GCAAGCAT--ATGTTTTCC--T-GCAAA--TTA---T---ATC-CAT-A-AATTG-ATA--TAA-TACGC-AAAA-ACGTAC-C-TCGA----TTACCTGTACT--GTC-GCTT--C--A----GT-----AGCC-TA-CACCCC----TGT---CACA-A-C-AT-A-GCCT--ACA---CCCCGCA-TGTTGGGGTATAg
gi|13 : agGAAT--GGC-TATG---TGTCA--CATACAGCTATCACGTA--AACATAAAA--TAGAC--CCTATTTCC-ACGCTTATATGCAAAAG-AAA-TCGGTACGCTCAAC-ACCCCGTGAA-CAACATATAGCTCTACA-CCCATGATACAG-AATTAGG--TTTCG---------TCGATATCTATGTC-AACACGATTGcc
gi|14 : gagatgtataataaccgaagGT-G-TAC-AGTTGA--TAT----------------------A--TT--TGTT---TCCA-TA----CATT--CTTCAAAT-TTT---GC-TTTCTTCC-----------GTAGGCAT--ACATTTTCC--T-CCAAG--ATA---T---ATC-CAT-A-AATTG-AGA--TTT-TGTGC-AAAA-ACTGAC-C-TCGA----CCACCTGAATC--GTC-GCTT--C--G----GT-----AGCC-TA-CATCCC----ttagaattaatga
gi|14 : TTCGGTA-GC-CTAC-ATCCC--------ACATGTacatgttggggtgtacctg
gi|15 : gtgtacagttgatatatttgtttccatacattcttcaaattttgctttcttccgtaggcatacattttcctccaagatatatccataaattgagattttgtgcaaaaactgacctcgaccacctgaatcgtcgc--TTGGT-CAATG-TAAAAGGTG-A-CGATTAAACACAG-CGTTGTT--------T--CT------------ACC--ATACTGTT---GT---ACCAA-A-CTAG--------CCG-AT-G---T-CAGAATT-GTG-T-G--AAT---TG-T-T-A--ATAAA-ATTAG-A--AAGT-GATAC-AGGGGtggggtgtacctg
gi|16 : gacaaaagtgaataattggagtatatgaaacagaatcatac--TAC----------------------A--TT--TGTT---TCTA-TA----TATT--CTTTAATT-TTT---CC-TTTCTTCC-----------GTAACCAT--ACGCTTTCC--T-GCAAA--ATA---C---ATC-CAT-A-AATTG-AGA--ACC-AGTGC--AAA-ACTGAC-C-----------------------TC-GCTT--T--A----AT-----AGCT-TA-CACCGT----GAC---CACA-G-C-AT-A-ACCT--ACA---CACTATA-TGCTGGGGTATAgatcttt
gi|17 : C-TTTCTTCT-----------GTGACCAT--GTGCTTTCC--T-GTCAA--AGA---T---ATC-CAT-A-AATTT-AGA--TAT-TATAG-AAAA-A---AC-C-T------------TCAACT--GCT-GCTT--T--G----GT-----AGCC-TA-CACCCC----AGT---CACA-A-C-AT-A-ACCT--ACG---TCCTGCA-TGTTGGAATATActc
gi|18 : TCC--T-GCAAA--ATA---T---ATC-CAT-A-AAATG-AGA--AAT-TGTACAAAAA-ACATAC-T-GTGA----CCTCC---GTCCTGTC-GCTA--T--G----AC-----AGTC-TA-CACCCC----ACA---CACA-A-C----A-ACTT--GTATAGCCCCGCG-TGTTGGGc
gi|19 : ATTGGTTTT--AATCACTGACAGA-ATA-TGT--AT-AACC---TT-ACA--TAGA-T-G------G-CACG-TAATTA--TTGGT-CA-TG-T--ATG-TG-A-TGATTAAACACAG-CGTTGTTCCA--A--T------A---C-CATAAGC--ATACAGTA---GT---ACCAA-A-Ctgttttt
gi|2 : GCTTTAAGATATATGCACGTGTCAGCTTTCCAC-TTTTCA-GAC-CCTGTGTCAGCGTGTGCATACACTGT--GTAGATGGAT--GGTATATAATATATCA--CACAGAATTATAAC-TG--AACTTAAATGATGAGC--GATATTTCT-ACGCTTAAGTGTCAACG-AAATTCGGTA-GC-TTAC-ACCCCGTGCA-CAACATGTAGC-TTACACTCCATG-CACAA-CATC-GGTATTTCG---------TTGATATCT-T-TC-AATATGATTGGTTTT--ATTCACTGACAGA-ATA-TGT--AT-AACC---TT-ATA--CAGA-T-A------G-CACG-CAATTA--TTGGT-AA-CG-TAAAAG-TG-A-CGAAAAAACACAG-CGCTGTTCTG-----------------------AC--ATACAGTT---GT---ACCAA-A-CTAGTC------TCG-ATCG---T-CAGCATT-GTGTT-G--AGG---TGTT-T-G--ATAAA-ACTAG-A--AAGT-G-TAC-AGTGCA--TGT----------------------A--TT--T--T---TCCT-TA----TATT--CTTCAAAT-GTT---GC-TTTCTTCC-----------GTAGGCGT--ACATTTTCC--T-GCAAG--ATA---T---ATC-CAT-A-AATTA-ACA--TTT-TATGC-AAAA-ACTAAC-C-TCGA----CCACCTGAATC--GTC-GCTT--C--G----GT-----AGCC-TA-CACCCC----GGT---CACA-G-C-AT-A-GCCT--ACA---CCCCGCA-TGTTGGGGTATA
gi|20 : --ATATCA--CTCAGAAATATCAC-TA--AATATAAAAAA-GAAT--AGTATTTCC-GCACTTTCGTGTAAAAG-AAACTGGGTT-GC-ATAA-ACCCtacc
gi|21 : atgcaggatgtaggctacggcatTTACGATCTATGCATGTTGCAGCTTTCCAC-TTTTCA-GGTACCTATAT--ATATATGCATACACTGAGAGTAGATAGA---GGTA---A--ATGTCA--CA
gi|22 : tgc-AAAA-ACTGAC-C-TCGA----CCACCTGAATC--GTC-GCTT--C--G----GT-----AGCC-TA-CA-CCC----GGT---CACA-A-T-AT-A-GCCT--ACA---CCCCGCATTGTTAGGATGT
gi|23 : TTTAAGATCTATGCACGTGTCAGTTTTCCAC-TTTTCA-GAC-CCTGTTTCAGCGTGTGCATACACTGT--GTAGATGGAT--
gi|24 : tgaTCTTCC--T-GCAAA--ATA---T---ATC-CAT-A-AATTG-GGA--TTT-AGTGC-AAAA-ACTGAT-G-TCGA----CCACCTGAATC--TTC-GCTT--C--G----GT-----
gi|25 : ctt----GT-----AGCT-TA-CAACCC----GTT---C-CA-AGC-AT-A-GCCT--AAT---CCTTCCA-TGCTAGGTTATA
gi|26 : C-GCTT--C--G----GT-----ATCT-TA-CACCCC----AGT---CTCA-A-C-AT-A-GCCT--ACA---TTCTGCA-TGTTGGGcctg
gi|27 : GTTTTCC--T-GCAAA--ATA---T---ATC-CAT-A-AATTG-A-ATTTTT-TGTGC-AAAA-
gi|28 : ct---------TCGATATCT-T-AA-AACACCATTGTTTTT--ATTTACTGACAGT-AT
gi|29 : ACA-A-C-AT-A-GCCT--TCA---CCCCGCA-TGTTGAGGTATA
gi|3 : TTACGATCTATGTACGTTTTAGCTTTTCAC-TTTTCA-G------GTTCCAA----TGCATACACTGAGAGTAGATAGAT--GGTATATG-----TCA--CATAGAAATATCAC-TA--AACACAAAAAATAAAC--CACATGTCG-ACGCTTACATGCAAAAT-AAATTC-----------------------------TGTATC-CTACACCCCATG-CACAA-CATT-GGTTTTTCG---------TTGATATCT-T-TC-AACACGATTGGTTTT--ATTCACTGACAGA-GTA-TGT--AT-AACC---TT-ATA--CAGA-T-ACATGTAG-CACG-TAATTA--TTGGT-CA-CG-TAAAAG-TG-A-CGATTAAACACAG-CGTTGTTCTA--A--TATTT-GG---T-CATAAAC--ATACGGTT---GT---ACCAA-A-CTAGTC------CCG-ATCG---T-CAGCATT-GTGTT-G--AGG---TGTT-T-G--ATAAA-ACTAG-A--AAGT-G-TAC-AGTGGA--TAT----------------------A--TT--TATT---TCCA-TA----TATT--CTTCAAAT-GTT---GC-TTTCTTCA-----------GTAGGCAT--ACGTTTTCC--T-GCAAA--ATA---T---ATC-CAT-A-AATTG-AGA--TTT-TGTGC-AAAA-AATGAC-C-TCGA----CCACCTGAATC--GTC-GCTT--C--G----GT-----AGCC-TA-CACCCC----GGT---CACA-A-T-AT-A-GCCT--ACA---CCCCGCA-TGTTGGGGTGTAccc
gi|30 : c--GTT-GCTT--C--A----GT-----AGCC-TA-CACCCC----TGT---CACA-A-C-AT-cc
gi|4 : ctGCTTTAAGATCTATGCACGTGTCAGCTT-CCAC-TTTTCAAGAC-CCTGTGCCAGCGTGTGCATACAGTGTG--TA-ATGGAT--GGTACATA-----TCA--CACAGCATTATCAC-TA--AACTTAAATAATGAGT--GATATT-CT-ACGCTTAAGTGTAAAAG-AAATTCGGTA-GC-TTAC-ACCCCGTGCA-CAACATGTAGC-CTACACCCCATG-CACAATTATC-G--TTTTCG---------TTGATATCT-T-TC-AACACGATT-GTTTT--ATTCACTGACAGA-ATA-TGT--AT-AA-C---TT-ATA--CAGA-T-A------G-CACG-TAATTA--TTGGT-CA-CG-TAAAAG-TG-A-CGATTAAA-ACAG-CGTTGTTCTAATA--T--TT-GG---T-CATAAAC--ATACGGTT---GT---ACCAA-A-CTAGTC------CCG-ATCG---T-CAGCATT-GTGTT-G--AGG---TG-T-T-G--ATAAA-ACGAA-A--AAGT-G-TAC-AGTGGA--TAT----------------------A--TTTGT--T---TCCA-TA----TATT--CTTCAAAT-GTT---GT-TTTTCCTC-----------GTAGGCAT--ACATTCTCC--T-GCA
gi|5 : tgt-AAATCTGGTA-GC-CTAC-ACCCCATGCA-CAACAGGTAGC-CTACACCCCGTG-CACAA-CATT-GATTTTTCG---------TCGATATCT-T-TTAAACACCATTGTTTTT--ATTTATTGACAGT-ATA-TGT--ATCAAGT---AT-ATA--CAAATT-A------G-TACG-TAATTATGTTAGT-CA-CGTTAAAAG-TG-A-CGATAAAACAAAG-CGTTGTCCTG--ATCT--TT-GA---T-CATAAAC--ATGCGGTA---GT---AGCAC-A-TT-TTCTT----CCG-ATCG---T-CAGAATT-G-GTT-G--AAG---TGTTGT-G--ATAAA-ACTAG-A--AAGC-GTTAC-A-GGAA--TAA----------------------A--TTG-T--G---TCCA-TA----TATT--CTTTTAATAGAT---GC-TTTCTTCC-----------GTAAGCAT--ATGTTTT-C--T-GCAAA--TTA---T---ATC-CAT-A-AATTG-ATA--TAA-TATGC-AAAA-ACTTAC-C-TCGA----CTACC-----C--GTC-CTTT--C--GCTGAGT-----AGCT-TA-CACCCC----TGT---CACA-A-C-AT-A-ACCT--ACA-----CCGCA-TGTTGGGGTGTAg
gi|6 : AAG-TG-AACTGTAAAACACAG-CATTATTGTGG-A--T--TT-TAATAT-TATGAACCTATACTGTTTTTGTTAAAACAACA-TAAGCCAAACGGCCG-ATCACCCT-CAACATG-ATGCT-G--AATAACTGTT-T-GTGAGAAA-ACTAGTATCAAGCTG-TAG-ATGCGAGGTATTCAAGTTTTAGATCCGTGTGTAA--TT--T--A---TCCA-CAGTAATATCTACTATAAATTGTA---GC-TTTCTTCCTTTGTTTAGCAGTAAGCATT-ACGTTACGC--TCACAAA--AAA---TCAAATC-CAT-ACAATTATAGA--TTT-TCTAC-AAAATACTGACAC-TCGGTATTCGACTCGAATC--GTC-GCTT--CCAG----GT-----AGCC-TACCACCCCAAGTGGTCAACACA-T-C-ATGA-GCCT--ATA---CCCCcct
gi|7 : TA--CAAA-TTA------G-TACGCTAATTG--TTAGT-CA-CGGTAAAAG-TG-A-CGATAAAACAAAG-CGTTGTCGTA--A--TCTTT-GA---TTCATAAAC--ACGCGGTA---GT---AGCAC-A--TAGTC------C-G-ATCG---T-CGAAATTTGTGT--G--AAG---TGTT-T-GG-ATAAA-ACTA--A--AAGCAG-TACCAGGGGA--TAT----------------------AA-TTG-T--TG--TTCA-TA----TATT--CTTAAGTT-GTTTATGC-TTTCTTCC-----------GCAAGCAC--TTGTTTTCC--T-GCAAAGAATAAATT---ATC-CAT-A-AAT-G-ATA--GAA-TATGC-AAAA-ACTTAC-C-TCGA----CTAC-TGAATC--GTCCGCTT--C--A----GT-----AGCC-TA-CACCCC----TGT---CACATA-CTAT-A-GCCT--ACA---CCCCGCA-TGTTGGGGCAcgctttgtttgg
gi|8 : GACAGA-ATA-TGT--AT-AACC---TT--TA--CAGA-T-A------GGCACG-TAATTA--TTGGT-CA-TG-TAAAAG-TG-A-CAATTAAACTTGA-CTTTGTT--------T--TT-GA---T-CATAAAC--ATACAGTT---GT---ACAAA-A-ACAGCCT-----CCG-ATAG---T-CAAAATT-TTGTTCA--AGG---TGTT-TCG--ATAGA-ACTAG-A--AAGT-G-TAC-AGGGGA--TAT----------------------A--TT--TGTT---TCCA-TA----TATT--CTTGGAATTGTT---GC-TTTCTTCC-----------GTAAA-ATTTACAATTTCC--T-GCAAA--ACA---T---ATT-CAT-C-AATTG-AGA--TTT-TGTGC-AAAA-ACTTAC-C-TTGA----CCACCTGAATT--GTC-GCTT--C--G----ATA----AGCC-TA-CACCCC----c
gi|9 : ttgttaTTAAGATCAATGTACGTGTCAACTTTCCAC-TTTTCA-G------GTG-----ATATGTATACACTGCGAGTAGATGAAG--GGTATATG--TCG-CA--CATAGAACTATCAC-TA--AACA--AAAAATAAAT--AATATTTTC-GCACTTACATGTAAAAG-AATTTCGGTA-GC-ATAC-ATCCCGTGCA-CAACATGTAGC-ATACACCTCGTG-CACAA-CATT-GATTTTTCGTCATTTTTCTCGAT-TAT-T-TC-AACACGAAT--TTTT--AATCACTGACAGA-ATATTGT--AT-AACC---TTGATA--TACATT-A------G-CAaaatgttgggataatacctgg
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blockSeqs : . GACCCTGTGTCAGCG AGA T TGT . T . . TT G . . . C . G C . . A . . CGGT . . . . G . . . . . C . . . T TA . . . . . G . . . T . GTAATCTTTGATT . T . . . TT . . . . . . . . . G . . . A T . . AATTGTTG . . . T T . . . T . . . . . . . . . T . AA . . T . . . TGT CT . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . GACCCTGTTTCAGCG CGA T TG . A . . AT A . . . T . G C . . A . . TGGT . . . . G . . . . . C . . . . A . . . . . . . . . T . CTGATATTTGAT . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . AACTGTG . . . T T . . . . . . . . . . . . . T . AA . . T . . . TGA . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . GGTACCTATATATA TG T AA . A . . AC C . . . A . A C . . A . . TGAT . . . . G . . . . . G . . . . G . . . . . . . . . A . CTAATATTTGGT . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AATTGTG . . . C . . . . . . . . . . . . . . G . TT . . G . . . TCA . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . GGTTCCAA T T TG . T . . TT G . . . T . G C . . G . . TGAT . . . . G . . . . . C . . . . A . . . . . . . . . T . CTAATATTTGGT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTTGTT . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . CC . . G . . . TGA . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . GGTGA T G TA . C . . A A . . . C . . . . . G . . CG . . . . G . . . . . C . . . . A . . . . . . . . . T . CTGATCTTTGAT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTTGTT . . . C . . . . . . . . . . . . . . G . AT . . T . . . TGA . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . CCAATAC . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTTATT . . . C . . . . . . . . . . . . . . G . AT . . A . . . TGA . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . . . A . TTTGAT . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTTGTT . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . TT . . G . . . TGA . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . A . TCT . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTTGTT . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . TT . . G . . . CGA . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . CTG . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTGTG . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . TT . . G . . . TGA . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . ATTTT . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . TT . . T . . . TGA . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . G . AA . . G . . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . TT . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . AA . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . .
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originalCons : GCTTTAAGATCTATGCACGTGTCAGCTTTCCAC-TTTTCA-GAC-CCTGTGCCAGCGTGTGCATACACTGCGAGTAGATGGAT--GGTATATG--ATGTCA--CACAGAANTATCAC-TA--AACATAAAAAATGAAC--GATATTTCC-GCGCTTACGTGTAAAAG-AAATTCGGTA-GC-CTAC-ACCCCGTGCA-CAACATGTAGC-CTACACCCCGTG-CACAA-CATC-GGTTTTTCG---------TCGATATCT-T-TC-AACACGATTGGTTTT--ATTCACTGACAGA-ATA-TGT--AT-AACC---TT-ATA--CAGA-T-A------G-CACG-TAATTA--TTGGT-CA-CG-TAAAAG-TG-A-CGATNAAACACAG-CGTTGTTCTG--A--T--TT-GA---T-CATAAAC--ATACGGTT---GT---ACCAA-A-CTAGTC------CCG-ATCG---T-CAGAATT-GTGTT-G--AGG---TGTT-T-G--ATAAA-ACTAG-A--AAGC-G-TAC-AGGGGA--TAT----------------------A--TT--T--T---TCCA-TA----TATT--CTTCAAAT-GTT---GC-TTTCTTCC-----------GTAAGCAT--ACGTTTTCC--T-GCAAA--ATA---T---ATC-CAT-A-AATTG-AGA--TNT-TGTGC-AAAA-ACTGAC-C-TCGA----CCACCTGAATC--GTC-GCTT--C--G----GT-----AGCC-TA-CACCCC----GGT---CACA-A-C-AT-A-GCCT--ACA---CCCCGCA-TGTTGGGGTATA
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Reference ( family-879 ) : GCTTTAAGATCTATGCACGTGTCAGCTTTCCAC-TTTTCA-GAC-CCTGTNCCAGCATGTGCATACACTGTGAGTAGATGGAT--GGTATA-TG---TGTCA-CACAGAANTATCAC-TA--AACATAAAAAATGAACN--ATATTTCC-GCGCTTACGTGTAAAAG-AAATTCGGTA-GC-CTAC-ACCCCGTGCA-CAACATGTAGC-CTACACCCCGTG-CACAAC-ATT-GGTTTTTCG---------TCGATATCT-T-TC-AACACGATTGGTTTT--ATTCACTGACAGA-ATA-TGT--AT-AACC---TT-ATA--CAGA-T-A------G-CACG-TAATTA--TTGGT-CA-CG-TAAAAG-TG-A-CGATNAAACACAG-CGTTGTTCTG-AT-TTTGAT--CATAAAC--ATACGGTT---GT---ACCAA-A-CTAGTC------CCG-ATCG---TCAGAATT-GTGTT-G--AGG---TGTT-T-G--ATAAA-ACTAG-A--AAGC-G-TAC-AGGGGATAT---ATTT--GTT-T-----CC-AT-ATAT------------------TCTTC---AAAT-GTT---G-CTTTCTTCC-----------GTAAGCAT--ACGTTTTCC--T-GCAAA--ATA---T---ATC-CAT-A-AATTG-AGA--TNT-TGTGC-AAAA-ACTGAC-C-TCGA----CCACCTGAATC--GTC-GCTT--C--G----GT-----AGCC-TA-CACCCC----GGT---CACA-A-C-AT-A-GCCT--ACA---CCCCGCA-TGTTGGGGTATA
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