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consensus : CGTTTGA-TTAAG--ACGAC------------------T--CT--AG----T--GA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGCG-CA----TG-TG---C---A------ATAG---A--T-GAA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C-AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAGT--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ANTTTTT--TC--CT-TG-TG--C-T-C-CT--G-CC--A-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT-G-AC----T--CG-AG-T--T-C-A-A-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACGG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-AA--TA-C--TC--G-T-AACA-CG-AGTA-ACAC--GTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACGTA
Reference ( gi|12 ) : CGTTTGA-TTAAG--ACGAC------------------G--CT--GG----T--GA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGCG-CA----TG-CG---C---A------ATAG---A--T-GAA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C-AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAGT--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTT--TC--CT-TG-TG--C-T-C-CT--G-TC--A-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT-G-AA----T--CG-AG-T--T-C-A-A-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACGG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-AA--TA-T--TC--G-T-AACA-CG-AGTA-ACAC--GTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACGTA
gi|11 : CGTTTGA-TTAAG--ACGAC------------------T--CT--AG----T--GA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-TGCA-CA----TG-TG---C---A------ATAG---A--T-GAA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C-AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAGT--GTT---G-T-TTGTA-C--A--AT-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTT--TC--CT-TG-TG--T-T-C-CT--G-CC--A-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT-G-AC----T--CC-AG-T--T-C-A-A-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-CACGG---T-T-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-AA--TA-C--TC--G-T-AACT-CG-AGTA-ACAC--GTGT-T--G-TT----T-A-ATCA-AACGTA
gi|7 : aCGTTTGA-TTAAG--ACGAC------------------T--CT--AGATAGT--GA-TA---TT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGCG-CA----TG-TG---C---A------ATAG---A--T-GAA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C-AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAGT--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTTCCCC--CT-TG-TG--C-T-C-CT--G-CC--A-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT-G-AC----T--CG-AT-T--T-C-A-A-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACCG---T-GTTTAAT----T-T--G-A-TT----AA-C-AA--TA-C--TC--G-T-AACA-CG-AGTA-ACAC--GTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACGTA
gi|7 : CGTTTGA-TT-AG--ACAAC------------------A--C----G----T--GT-TA---CT-CG--------TG-T---T--
gi|9 : cgtttgattaagacgactctagatagtgatattagtgtttgatacgcgcatgtgcaatagatgaatacaacactagcaaataaaacgtggagtgttgtttacaacatggctaccattttttcccccttgtgctcctgccaatttggggagtatactcgtgttgactcgatttcaacactagtgtgggataaccgtgtttaatttgattaacaatactcgtCATTTGA-TTAAG--AAGAC------------------T--CT--AG----T--GA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGCG-CA----TG-TG---C---A------ATAG---A--T-GAA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-A---C-AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAGT--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-AATTTCT--TC--CT-TG-TG--C-T-C-CT--G-CC--A-AT--T-A--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT-G-AC----T--CG-AG-T--T-T-A-A-CA-C--T-A-G--C--G-TGC---G--AT-AACGG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-AA--TA-C--TC--G-T-AACA-CA-AGTG-ACAC--GTGT-T--G-TCTGGGT-A-ATCA-AACGTAta
gi|16 : CGTTTGA-TTAAG--ACGAC------------------T--CT--AG----T--GA-TA---CC-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGCG-CA----TG-TG---C---A------ATAG---A--T-AAA-----T---A-CA-A-CG-CT-A-G---C-AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAGT--TTT---G-T-TC--A-C--A--AC-------------------TTTT--TC--CT-TG-TG--C-T-C-CT--G-CC--A-AT--C-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT-G-AC----T--CG-AG-T--T-C-A-A-CA-A--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACGG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-AA--TA-C--TC--C-T-AACA-CA-AGTA-ACAC--GTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACGTc
gi|16 : aCGTTTGA-TT-AG--ACAAC------------------A--C----G----T--GT-TA---CT-TG--------TG-T---T--
gi|8 : acgtttgattaagacgactctagtgataccagtgtttgatacgcgcatgtgcaatagataaatacaacgctagcaaataaaacgtggagttttgttcacaactttttccttgtgctcctgccaatctggggagtatactcgtgttgactcgagttcaacaatagtgtgggataacggtgtttggttaacaatactcctCGTTTGA-TTAAG--ACGAC------------------T--CT--AG----T--GA-TATACCT-AG--------TG-T---TGTT----GATA-CGCG-CA----TG-TA---C---A-------TAG---A--T-GAA-----T---A-CA-A-TA-C--A-G---C-AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAGT--GTT---G-T-TTA-A-C--A--TT-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTC--TC--CT-TG-TG--C-T-C-CT--G-CCA-A-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-ACG-T----G--TT-G--C----T--CG-AGTT--T-C-A-A-CATC--T-A-G--T--G-TGG---A--AT-AACGG---T-G-----T----T-T--G-G-TTA---AA-C-AA--TA-C--TC--G-C-AACACCG-AGTA-ACAC--GTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AAt
gi|2 : CGTTTGA-TTAAGTAACGAC------------------T--CT--AG----T--GA-TA---TT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGCGGCA----TG--G---C---A------ATAG---A--T-GAAAA---T---A-CACA-CA-CT-A-GATTC-AAAAA-----T-AAA-ATGT-G--GAGTT-GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-GTGG-C--TA--CC-AATTTTT--TT--CC-TG-TG--C-T-CTCTGCG-CC--A-AT--T-TGAGGG---G--AT-TCATAC-TCG-T----GTTTT-G-AA----T--CG-AG-T--T-C-A-A-CA-CTTT-A-T--T--G-GGGTTAG--AT-AACAGC--T-G-----T----T-TGAG-G-TT----AA-C-AA--TA-C--TC--GCT-AACA-CG-AGTA-ACAC--GTGT-T--GATC----TAA-ATCA-AACGac
gi|6 : aCGTTTGA-TGATG--ACGAC------------------T--CT--AG----T--GA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CG
gi|20 : CGTTTGA-TTAAG--ACGACTATATAGTGATATAAAATG--CTCTAG----T--GA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GACA-CGCG-CA----TT-TG---C---A------ATAG---A--T-GAA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C-AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAGT--GTT---GTT-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-AATTTTT--TC--CT-TG-TG---------------------------------------------AC-TCG-A----G--TT-----------------------C-A-A-CA-A--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACGG---T-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgataccgcatgtgcatctatagagattacaacactagcaaaataaaacgtgagtgttgtttacacacatggctccaattttttccttgtgtctgcaatttggggatatacgcgtgttgactcgagttccaacacatagtgttgataacggtagattgttagaacaatatcgcacactgtgttgtctaatcaaac
gi|1 : aCGTTTGA-TTAAG--ACGAC------------------T--CT--------T---A-TA---TT-AGCTATTGGTTG-T---T--T----GATACCGCG-CA----TG-TG---TCTAA------ATAGTGCA--TAGAA-----T---G-CA-A-CATCT-A-G---C-AAATT-----T-AAATACGT-G--GAGT--GTT---T-TGTT--A-CAGA--AC-ATGG-C--TACGCC-GAATATT--TC--CT-TG--G--C-C-T-CT--G-CC--A-AT--TAT--GGG---G--AACT-ATAC-TCG-T----G--TT-C-GACACTC--CG-AG-T--C-T-C-A-CATC--T-A-GACTCAGCTCG---T--ATAAACGGATTC-G-----T----T-TC-A-G-TTTCACGA-C-AA--TA-TACTCCGG-T-AA-A-CG-AATA-TCAC---TGT-T--G-TC----T-A-ATCG-AACGTA
gi|13 : GTTTGA-TTAAG--ACGAC------------------T--CT--TG----T--GA-TA---TT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGCG-CA----TG-TG---C---A------ATAG---A--T-GAA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C-AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAGT--GTT---G-T-TT--A-C--T--AC-AAGG-C--TA--CC-AATTTTT--TC--CT-TG-TG--C-T-C-CT--G-CC--A-AT--T-T--GGA---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT-G-AC----T--CG-AG-T--T-C-A-A-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---A--AT-AATGG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-T-AA--TA-C--TC--G-T-AACA-CG-AGTA-ACAC--GTGT-T--G-TC----G-A-ATCA-AACGTA
gi|15 : GTTTGA-TTGAG--ACGAC------------------T--CT--AG----T--GA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGCA-CA----TG-TG---T---A------ATAG---A--T-GAA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-C---C-AAA-------T-AAA-ACGT-G--AAGT--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTT--TC--CT-TG-CT--A-T-C-CT--G-CC--A-AT--G-T--GGT---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT-G-AC----T--CG-AG-T--T-C-A-A-CA-A--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACAG---T-G-----T----T-A--G-C-TT----AA-C-AA--TA-C--TC--G-T-AACA-CG-AGTA-ACTC--GTGT-T--A-TC----T-A-ATCA-
gi|14 : GTTTGA-TTGAG--GCGAC------------------T--CT--AG----T--GA-TA---CA-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGCA-CA----TG-TA---C---A------ATAG---A--T-GAA-----T---A-CA-A-CA-TT-A-G---C-AAA-------T-AAA-ACGT-G--AAGT--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTT--TC--CT-TG-GT--A-T-C-CT--G-CC--A-AT--G-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT-G-AT----T--CG-AG-T--T-C-A-A-CA-A--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACGG---T-G-----T----T-A--G-A-TT----AA-C-TA--TA-C--TC--G-T-AACA-CT-AGTA-ACTC--GTGT-T--A-TC----T-A-ATCA-AATGT
gi|26 : GTTTGA-TTAAG--ACGAC------------------T--CT--AG----T--GA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGCG-CA----TG-TG---C---A------ATAG---G--T-GAA-----T---A-CA-A-CA-CT-T-G---C-AGA-------T-AAA-ACGG-G--GAGT--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CT-A
gi|10 : TTTGA-T-AAG--ACGAC------------------T--CT--AG----T--AAGTA---CTTAG--------TGAT---T--T----GATA-CGCG-CAA---TGATG---C---A------ATAG---A--T-GAA-----T---AACA-AACA-CT-A-C---C-AAA-------TTAAA-ACGT-G--GAGT--GTT---T-G-TT--A-CC-A--AC-ATGG-C--TA--CC-AATTTTT--TC--CT-TG-TG--C-TCC-CT--G-ACCAA-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCGTT----G--TT-G-AC----T--CA-AG-TGGT-C-A-A-CA-A--T-A-G--T--G-TGG-------T--ACGG---T-G-----T----T-T--G-GTTT----AA-CAAA--TACT--TC--G-T-TA--------TA-ACAC--GTGT-T--G-TG----T-A-ATCA-AACGat
gi|5 : TTTGA-TTAA---ACGAC------------------T--TTT-GG----TTGAA-TA---TT-AGA-------TG-T---T--TTGGAAATA-CGCG-CAATGGTG-C----C---A------ATAG---AATT-GAA-----T---A-CA-A-CA-TC-A-G---C-AAA-------T-ACG--TGT-G--GAGTTGGTTTTGG-T-TT--AAC--A--AC-ATGGGC--TA--CC-ATTTTTT--TTTTCT-TG-TGGAC-T-C--T--G-GC--C-AT--T-T--GGA---GT-AT-T-AT-C-TCG-TT---G--TTTG-AAC---T--CG-AG-T--T-G-AGA-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---GGGAT-AACGG---T-G-----TGGTTT-T--G-A-TT----AA-C-A---TA-C--TC--G-T-AA------------CAC--GTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACGTA
gi|3 : gttTTTGACTTAAG--GCGAC------------------TTTCT--AG----T--GA--A---AT-CG--------TG-TGCTC--T----GATA-GGC--CAAC--TG-CGTTGC---A------A--A---A--T-GAAATTGGT---A-CA-A-CA-CTCA-G---C-ACA-------A-AAA-ACGTTGT-GAGTT-GTT---G-T-TT--A-C--ATTAC-ATG--C--TA--CC-A-TTTTT--TC--CT-TG-TGT-C-T-C-CT--G-CC--A-AT--T-T--GGG---GACAG-T-AT-C-TCG-TTGTGA--TT-G-AC----T--CGCAG-T--T-C-A-ATCG-C--T-ATG--T----TGG---G--AT-AATGG---C-G----------T-T--G-T-TT----AATC-AAAGTAGC--TC--G-T--ACA-CGTAGT--ACAC--TTGT-T--G-TC----T-ATATCA-GAAGT
gi|18 : TTGA-TTAAG--A--AC------------------G--CTCTGG----T--GA-TC---AT-AG--------TG-T---T--T----AATA-CGCG-CA----TG-TG---C---AC-----ATAG---A--T-GAA-----T---A-TA-A-CAGCT-A-G---C-AAA-------T-AAA-AC-T-G--GAGT--GTT---G-T-GT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTT--TC--CT-TG-TG--CTT-C-CT--G-CC--A-AT--T-G--GGGTGAG--AG-T-A-AC-TCG-T----GA-TT-G-AA----CTGCG-AG-T--T-C-A-A-CA----T-A-G--T----TGG---G--AT-AATGG---T-------T----T-G--G-G-TT----AAGC-AA--TA-C--GC--G-T-AAC----------ACAC--GTGT-
gi|17 : gA-TTAAG--ACGAC------------------T--CT--AG----C--GA-TA---CT-AG--------TG-C---T--T----GATA-CGCG-CA----TG-TG---C---A------ATCG---A--T-GAA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C-AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAGT--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-AAATTTT------------------C-C-CT--G-CC--A-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-CCG-T----C--TT-G-AC----T--CG-AA-T--T-C-A-A-CA-A--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACAG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-AT--TA-C--TC--G-T-AACA-CG-AGTA-ATAC--GTGT-T--G-TC----T-A-A
gi|19 : A-TTAAG--ACGAC------------------T--CT---------------------------------------T--T----AATA-CGCG-CA----TG-TG---C---A------ATAA---A--T-GAA-----T---G-CA-A-CA-CT-A-G---C-AAA-------T-AAA-ACGT-A--GAGT--G-T---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CCAATTTTTT--TC--TT-TG-TG--C-T-C-CT--GCCC--ACAT--T-T--GGG---G--AG-T-ATACTTCG-T-------TT-G-AC----T--CG-AG-TTCT-C-A-A-TA----T-A-G--T--G-TGGT--GT-AT-AACGG---T-G-----T----T-T--G-ATTT----AG-C-AA--TACT--CC--G-TAAACA-C----------C--GTGT-TCCG-TC----T-A-Acggcgagcgcac
gi|28 : -TTAAG--ACGAC------------------T--CT--AG----T--GA--A---CT-TG--------TG-T---T--T----G-TA-CGCG-CA----TG-TG---C---ATGTGCAATAG---A----GAA-----T---C-TA-A-CA-CT-AAG---C-AA--------T-AAA--CGT-G--GAGT--GTT-----T-TT--A-CA-A--AC-ATGG-C--TA--
gi|21 : AAG--ACGAC------------------T--CT--AG----T--GA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGCG-CA----TG-TG---C---A------ATAG---A--T-GGA-----T---A-CA-A-CA--T-A-G---C-AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAGT--GGT---G---TT--A-C--A--ACGATGG-C--TA--CC-AATTTTT--TC--TT----TG--C-T-C-CT--G-CC--A-AT--T-T--GGA---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT-A-AC----T--CA-AT-T--T-C-C-A-CA-C--T-A-G--T--G-Tacc
gi|4 : --------TG-T---T--T----GATA-CGCT-CA----TG-TG---C---A------ATAG---A--T-GAA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C-AAATACAATGT-AAA-ACGT-GATGAGT--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-CTATA--CC-AATTTTC--TT--CC-TG-TG--C-T-C-CT--G-TC--A-AC--T-TG-GGG---G--AGTT-ATAC-TCG-T----G--TT-G-AC----T--CG-AG-T--T-CAA-A-AA-C--TAA-G--T--G-TGA---G--AT-AAC-G---T-G-----T----T-T--G-T-TT-----A-C-AA--GA-C--TC--G-T-AACA-CG-AATA-ACAC--G-GT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACGTAtga
gi|6 : cattagattaataccgaccatattggcccacccgggggggtt-T---T--T----GATA-C-CG-CA----TG-TG---C---ATCT---ATAG---A----GAT-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---CAAAA-------T-AAA-ACGT----GAGT--GTT---G-T-TT--A-C--AC-AC-ATGG-C--T---CC-AATTTTT--TC--CT-TG-TG------T-CT--G--C--A-AT--T-T--GGG---G--A--T-ATAC-GCG-T----G--TT-G-AC----T--CG-AG-T--TCC-A-A-CA-CA-T-A-G--T--G-T-T---G--AT-AACGG---TAG-----A----T-T----G-TTAG--AA-C-AA--TA----TC--G-C--ACA-C----------T--GTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AAC
gi|24 : cgtttgatgatgacgactctagtgatactagtgtttgatacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaA----TG-TG---C---A------ATAG---A--T-GAA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C-AAA-------T-ATA-ACGT-G--GAGT--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTT--GC--CT-TG-TT--C-T-C-CT--G-CC--C-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT-G-AC----T--CG-AG-T--T-C-A-A-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-
gi|23 : caa------ATAG---A--T-GAA-----TTGTA-CA-A-CA-CT-A-G---C-AAA-------T-AAA-ACGT-
gi|22 : TGG-A--TA--CCCAATTTTT--TC--CTGTGCTA--C-T-C-TT--G-CC--A-AT--T-T--GGG---G-----T-ATAC-TCG-T----G--TT-G-AC----T--CG-AG-T--T-C-A-A-CA-C--T-AAG--T--G-TGG---G--AT-AACGG---T-G-----T----T-T--GTG-TT----GA-C-AA--TA-C--TC--G-TGAAC--CG-AGTAGACAC--GTGTCT--GCTC----T---ATC---ACGTAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcttacatggaatagttccatcacaataacggcgtttggttaaaaagactcgtaacacgagttacacgtgttgtctaatcaaacgta
gi|27 : atataagcatgaaaagttT--TC--CT-TG-CG--C-T-C-CT--G-CT--G-AT--T-T--CGG---G--AG-T-ATAC-TGC-T----G--CT-G-AC----T--CG-AG-C--T-C-T-A-CA-A--T-T-G--T--G-TGG---G--AA-AATGG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-------------------AACA-CG-A------------GT-T--G-TC----T-A-ATTA-AATGTAcc
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gi|27 : T--TC--CT-TG-CG--C-T-C-CT--G-CT-G-AT--T-T--CGG---G--AG-T-ATAC-TGC-T----G--CT--G-AC---T-CG-AG-C--T-C-T-A-CA-A--T-T-G--T--G-TGG---G--AA-AATGG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-A--A------------------CA-CG-A----------GT-T--G-TC----T-A-ATTA-AATGTA
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gi|23 : --AT-AACGG---C-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-A-A--A--GA-C-T-C--G-T-AACA-CG-AGTT-ACACGTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACGTAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcttacatggaatagttccatcacaataacggcgtttggttaaaaagactcgtaacacgagttacacgtgttgtctaatcaaacgta
gi|24 : atagatgaattgtacaacactagcaaataaaacgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcttacatggaatagttccatcacaA-TG-TGC---A------ATAG---A--T-G--AA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C--AAA-------T-ATA-ACGT-G--GAG-T--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTT--GC--CT-TG-TT--C-T-C-CT--G-CC-C-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT--G-AC---T-CG-AG-T--T-C-A-A-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-
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blockSeqs : . . . . . GT A . . . . . . . . G A G . TCT . . . . . . . . . . . . . A . . . . T . T . . . A . A C . . . . C T . . . . T . . . . C A . . . G . T . T . . T A . . . . . . TC . . . . CA . . . . . T T . . . . . . T . T A T . . . . . . . . G . G G A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . G G A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T G A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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consensus : CGTTTGA-TTAAG--A-CGA--------------------CT--CTAG----TGA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGC-----GCA-TG-TGC---A------ATAG---A--T-G--AA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C--AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAG-T--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ANTTTTT--TC--CT-TG-TG--C-T-C-CT--G-CC-A-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT--G-AC---T-CG-AG-T--T-C-A-A-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACGG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-A--A--TA-C-T-C--G-T-AACA-CG-AGTA-ACACGTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACGTA
Reference ( family-8787 ) : CGTTTGA-TTAAG--A-CGA--------------------CT--CTAG----TGA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGC-----GCA-TG-TGC---A------ATAG---A--T-G--AA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C--AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAG-T--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ANTTTTT--TC--CT-TG-TG--C-T-C-CT--G-CC-A-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT--G-AC---T-CG-AG-T--T-C-A-A-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACGG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-A--A--TA-C-T-C--G-T-AACA-CG-AGTA-ACACGTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACGTA
gi|1 : CGTTTGA-TTAAG--A-CGA--------------------CT--CT------T-A-TA---TT-AGCTATTGGTTG-T---T--T----GATACCGC-----GCA-TG-TGTCTAA------ATAGTGCA--TAG--AA-----T---G-CA-A-CATCT-A-G---C--AAATT-----T-AAATACGT-G--GAG-T--GTT---T-TGTT--A-CAGA--AC-ATGG-C--TACGCC-GAATATT--TC--CT-TG--G--C-C-T-CT--G-CC-A-AT--TAT--GGG---G--AACT-ATAC-TCG-T----G--TTC-G-ACACTC-CG-AG-T--C-T-C-A-CATC--T-A-GACTCAGCTCG---T--ATAAACGGATTC-G-----T----T-TC-A-G-TTTCACGA-C-AATA--TA-C-T-CCGG-T-AA-A-CG-AATA-TCAC-TGT-T--G-TC----T-A-ATCG-AACGTA
gi|10 : TTTGA-T-AAG--A-CGA--------------------CT--CTAG----TAAGTA---CTTAG--------TGAT---T--T----GATA-CGC-----GCAATGATGC---A------ATAG---A--T-G--AA-----T---AACA-AACA-CT-A-C---C--AAA-------TTAAA-ACGT-G--GAG-T--GTT---T-G-TT--A-CC-A--AC-ATGG-C--TA--CC-AATTTTT--TC--CT-TG-TG--C-TCC-CT--GACCAA-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCGTT----G--TT--G-AC---T-CA-AG-TGGT-C-A-A-CA-A--T-A-G--T--G-TGG-------T--ACGG---T-G-----T----T-T--G-GTTT----AA-CAA--A--TA-CTT-C--G-T-TA--------TA-ACACGTGT-T--G-TG----T-A-ATCA-AACG
gi|11 : CGTTTGA-TTAAG--A-CGA--------------------CT--CTAG----TGA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-TGC-----ACA-TG-TGC---A------ATAG---A--T-G--AA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C--AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAG-T--GTT---G-T-TTGTA-C--A--AT-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTT--TC--CT-TG-TG--T-T-C-CT--G-CC-A-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT--G-AC---T-CC-AG-T--T-C-A-A-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-CACGG---T-T-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-A--A--TA-C-T-C--G-T-AACT-CG-AGTA-ACACGTGT-T--G-TT----T-A-ATCA-AACGTA
gi|12 : aCGTTTGA-TTAAG--A-CGA--------------------CG--CTGG----TGA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGC-----GCA-TG-CGC---A------ATAG---A--T-G--AA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C--AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAG-T--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTT--TC--CT-TG-TG--C-T-C-CT--G-TC-A-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT--G-AA---T-CG-AG-T--T-C-A-A-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACGG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-A--A--TA-T-T-C--G-T-AACA-CG-AGTA-ACACGTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACGTA
gi|13 : GTTTGA-TTAAG--A-CGA--------------------CT--CTTG----TGA-TA---TT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGC-----GCA-TG-TGC---A------ATAG---A--T-G--AA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C--AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAG-T--GTT---G-T-TT--A-C--T--AC-AAGG-C--TA--CC-AATTTTT--TC--CT-TG-TG--C-T-C-CT--G-CC-A-AT--T-T--GGA---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT--G-AC---T-CG-AG-T--T-C-A-A-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---A--AT-AATGG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-T-A--A--TA-C-T-C--G-T-AACA-CG-AGTA-ACACGTGT-T--G-TC----G-A-ATCA-AACGTA
gi|14 : GTTTGA-TTGAG--G-CGA--------------------CT--CTAG----TGA-TA---CA-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGC-----ACA-TG-TAC---A------ATAG---A--T-G--AA-----T---A-CA-A-CA-TT-A-G---C--AAA-------T-AAA-ACGT-G--AAG-T--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTT--TC--CT-TG-GT--A-T-C-CT--G-CC-A-AT--G-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT--G-AT---T-CG-AG-T--T-C-A-A-CA-A--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACGG---T-G-----T----T-A--G-A-TT----AA-C-T--A--TA-C-T-C--G-T-AACA-CT-AGTA-ACTCGTGT-T--A-TC----T-A-ATCA-AATGT
gi|15 : GTTTGA-TTGAG--A-CGA--------------------CT--CTAG----TGA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGC-----ACA-TG-TGT---A------ATAG---A--T-G--AA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-C---C--AAA-------T-AAA-ACGT-G--AAG-T--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTT--TC--CT-TG-CT--A-T-C-CT--G-CC-A-AT--G-T--GGT---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT--G-AC---T-CG-AG-T--T-C-A-A-CA-A--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACAG---T-G-----T----T-A--G-C-TT----AA-C-A--A--TA-C-T-C--G-T-AACA-CG-AGTA-ACTCGTGT-T--A-TC----T-A-ATCA-
gi|16 : CGTTTGA-TTAAG--A-CGA--------------------CT--CTAG----TGA-TA---CC-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGC-----GCA-TG-TGC---A------ATAG---A--T-A--AA-----T---A-CA-A-CG-CT-A-G---C--AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAG-T--TTT---G-T-TC--A-C--A--AC-------------------TTTT--TC--CT-TG-TG--C-T-C-CT--G-CC-A-AT--C-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT--G-AC---T-CG-AG-T--T-C-A-A-CA-A--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACGG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-A--A--TA-C-T-C--C-T-AACA-CA-AGTA-ACACGTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACGT
gi|17 : aA-TTAAG--A-CGA--------------------CT--CTAG----CGA-TA---CT-AG--------TG-C---T--T----GATA-CGC-----GCA-TG-TGC---A------ATCG---A--T-G--AA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C--AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAG-T--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-AAATTTT------------------C-C-CT--G-CC-A-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-CCG-T----C--TT--G-AC---T-CG-AA-T--T-C-A-A-CA-A--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACAG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-A--T--TA-C-T-C--G-T-AACA-CG-AGTA-ATACGTGT-T--G-TC----T-A-A
gi|18 : TTGA-TTAAG--AACG---------------------CT--CTGG----TGA-TC---AT-AG--------TG-T---T--T----AATA-CGC-----GCA-TG-TGC---AC-----ATAG---A--T-G--AA-----T---A-TA-A-CAGCT-A-G---C--AAA-------T-AAA-AC-T-G--GAG-T--GTT---G-T-GT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTT--TC--CT-TG-TG--CTT-C-CT--G-CC-A-AT--T-G--GGGTGAG--AG-T-A-AC-TCG-T----GA-TT--GAAC---TGCG-AG-T--T-C-A-A-CA----T-A-G--T----TGG---G--AT-AATGG---T-------T----T-G--G-G-TT----AAGC-A--A--TA-C-G-C--G-T-AAC----------ACACGTGT-cggcgagcgcac
gi|19 : gA-TTAAG--A-CGA--------------------CT--CT-----------------------------------T--T----AATA-CGC-----GCA-TG-TGC---A------ATAA---A--T-G--AA-----T---G-CA-A-CA-CT-A-G---C--AAA-------T-AAA-ACGT-A--GAG-T--G-T---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CCAATTTTTT--TC--TT-TG-TG--C-T-C-CT--GCCC-ACAT--T-T--GGG---G--AG-T-ATACTTCG-T-------TT--G-AC---T-CG-AG-TTCT-C-A-A-TA----T-A-G--T--G-TGGT--GT-AT-AACGG---T-G-----T----T-T--G-ATTT----AG-C-A--A--TA-C-TCC--G-TAAACA-C----------CGTGT-TCCG-TC----T-A-A
gi|2 : CGTTTGA-TTAAGTAA-CGA--------------------CT--CTAG----TGA-TA---TT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGCG----GCA-TG--GC---A------ATAG---A--T-GAAAA-----T---A-CACA-CA-CT-A-GATTCAAAAA-------T-AAA-ATGT-G--GAGTT--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-GTGG-C--TA--CC-AATTTTT--TT--CC-TG-TG--C-T-CTCTGCG-CC-A-AT--T-TGAGGG---G--AT-TCATAC-TCG-T----GTTTT--G-AA---T-CG-AG-T--T-C-A-A-CA-CTTT-A-T--T--G-GGGTTAG--AT-AACAGC--T-G-----T----T-TGAG-G-TT----AA-C-A--A--TA-C-T-C--GCT-AACA-CG-AGTA-ACACGTGT-T--GATC----TAA-ATCA-AACG
gi|20 : aCGTTTGA-TTAAG--A-CGACTATATAGTGATATAAAATGCT--CTAG----TGA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GACA-CGC-----GCA-TT-TGC---A------ATAG---A--T-G--AA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C--AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAG-T--GTT---GTT-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-AATTTTT--TC--CT-TG-TG--------------------------------------------AC-TCG-A----G--TT----------------------C-A-A-CA-A--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACGG---T-
gi|21 : aAAG--A-CGA--------------------CT--CTAG----TGA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGC-----GCA-TG-TGC---A------ATAG---A--T-G--GA-----T---A-CA-A-CA--T-A-G---C--AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAG-T--GGT---G---TT--A-C--A--ACGATGG-C--TA--CC-AATTTTT--TC--TT----TG--C-T-C-CT--G-CC-A-AT--T-T--GGA---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT--A-AC---T-CA-AT-T--T-C-C-A-CA-C--T-A-G--T--G-T
gi|22 : TGG-A--TA--CCCAATTTTT--TC--CTGTGCTA--C-T-C-TT--G-CC-A-AT--T-T--GGG---G-----T-ATAC-TCG-T----G--TT--G-AC---T-CG-AG-T--T-C-A-A-CA-C--T-AAG--T--G-TGG---G--AT-AACGG---T-G-----T----T-T--GTG-TT----GA-C-A--A--TA-C-T-C--G-TGAAC--CG-AGTAGACACGTGTCT--GCTC----T---ATC---ACGTAtga
gi|23 : atataagcatgaaaagtt------ATAG---A--T-G--AA-----TTGTA-CA-A-CA-CT-A-G---C--AAA-------T-AAA-ACGT-cc
gi|23 : --AT-AACGG---C-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-A-A--A--GA-C-T-C--G-T-AACA-CG-AGTT-ACACGTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACGTAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcttacatggaatagttccatcacaataacggcgtttggttaaaaagactcgtaacacgagttacacgtgttgtctaatcaaacgta
gi|24 : atagatgaattgtacaacactagcaaataaaacgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctcttacatggaatagttccatcacaA-TG-TGC---A------ATAG---A--T-G--AA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C--AAA-------T-ATA-ACGT-G--GAG-T--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTT--GC--CT-TG-TT--C-T-C-CT--G-CC-C-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT--G-AC---T-CG-AG-T--T-C-A-A-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-
gi|25 : caa-TG--C-T-C-CT--G-CC-A-ATCGT-T--GGG---G--A--T-ATAC-TCG-T----T--GT--G-AC---T-CG-AG-C--T-T-C-A-CA-C--T-A-G--T--G-TTG---G--AT-AACGG---T-G-----T----TCT--G-G-TTA---AA-C-A--A--TA-C-T-C--G---AACA-CG-A----------GT-T--G-TC----T-A-ATCACAACGT
gi|26 : GTTTGA-TTAAG--A-CGA--------------------CT--CTAG----TGA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGC-----GCA-TG-TGC---A------ATAG---G--T-G--AA-----T---A-CA-A-CA-CT-T-G---C--AGA-------T-AAA-ACGG-G--GAG-T--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CT-AATtac
gi|27 : T--TC--CT-TG-CG--C-T-C-CT--G-CT-G-AT--T-T--CGG---G--AG-T-ATAC-TGC-T----G--CT--G-AC---T-CG-AG-C--T-C-T-A-CA-A--T-T-G--T--G-TGG---G--AA-AATGG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-A--A------------------CA-CG-A----------GT-T--G-TC----T-A-ATTA-AATGTA
gi|28 : -TTAAG--A-CGA--------------------CT--CTAG----TGA--A---CT-TG--------TG-T---T--T----G-TA-CGC-----GCA-TG-TGC---ATGTGCAATAG---A----G--AA-----T---C-TA-A-CA-CT-AAG---C--AA--------T-AAA--CGT-G--GAG-T--GTT-----T-TT--A-CA-A--AC-ATGG-C--TA--c
gi|29 : --T-T--CGG---G--AG-TTATAC-T-G-C----T--CT--G-AC---T-CG-AG-C--T-C-T-A-CA-T--T---G--T--G-TGG---G--AA-AATGG---T-G-----T----T-TT-G-G-TT----AA-C-A--A------------------CA-CG-A----------GT-T--G-TC----T-A-ATTA-AATGTAacc
gi|3 : TTTGACTTAAG--G-CGA--------------------CTTTCTAG----TGA--A---AT-CG--------TG-TGCTC--T----GATA-GGCCAACTGCG-T--TGC---A------A--A---A--T-G--AAATTGGT---A-CA-A-CA-CTCA-G---C--ACA-------A-AAA-ACGTTGT-GAG-TT-GTT---G-T-TT--A-C--ATTAC-ATG--C--TA--CC-A-TTTTT--TC--CT-TG-TGT-C-T-C-CT--G-CC-A-AT--T-T--GGG---GACAG-T-AT-C-TCG-TTGTGA--TT--G-AC---T-CGCAG-T--T-C-A-ATCG-C--T-A----T--GTTGG---G--AT-AATGG---C-G----------T-T--G-T-TT----AATC-A--AAGTAGC-T-C--G-T--ACA-CGTAGT--ACACTTGT-T--G-TC----T-ATATCA-GAAGTcc
gi|30 : -T-GTAC-TCG-T----G--TT--G-AC---T-CG-AG-T--T-C---A-CA-C--T-A-G--T--G-T-G---G--AT-AA-GG---T-G-----T----T-TG-G-G-TT----AA-C-A--A--TA-C-T----------------AGTA-ACACATGT-T--G-T-----T-A-ATCA-AACG
gi|31 : ac-T--G-G-TT----AA-C-A--A--TA-C-T-C---------------GTA-ACACGTGT-T--G-TG----T-A-ATCA-AACATAa
gi|4 : gtgggaacatcatagn--------TG-T---T--T----GATA-CGC-----TCA-TG-TGC---A------ATAG---A--T-G--AA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C--AAATACAATGT-AAA-ACGT-GATGAG-T--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-CTATA--CC-AATTTTC--TT--CC-TG-TG--C-T-C-CT--G-TC-A-AC--T-TG-GGG---G--AGTT-ATAC-TCG-T----G--TT--G-AC---T-CG-AG-T--T-CAA-A-AA-C--TAA-G--T--G-TGA---G--AT-AAC-G---T-G-----T----T-T--G-T-TT-----A-C-A--A--GA-C-T-C--G-T-AACA-CG-AATA-ACACG-GT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACGTAc
gi|5 : cattagattaataccgaccatattggcccacccgggggggttTTTGA-TTAA---A-CGA--------------------CT--TTTGGT--TGAATA---TT-AGA-------TG-T---T--TTGGAAATA-CGC-----GCAATGGTGCC--A------ATAG---AATT-G--AA-----T---A-CA-A-CA-TC-A-G---C--AAA-------T-ACG--TGT-G--GAG-TTGGTTTTGG-T-TT--AAC--A--AC-ATGGGC--TA--CC-ATTTTTT--TTTTCT-TG-TGGAC-T-C-TG--G-CC-A--T--T-T--GGA---GT-AT-T-AT-C-TCG-TT---G--TTTGA-AC---T-CG-AG-T--T-G-AGA-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---GGGAT-AACGG---T-G-----TGGTTT-T--G-A-TT----AA-C-A-----TA-C-T-C--G-T-AA------------CACGTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACGTA
gi|6 : gttCGTTTGA-TGATG--A-CGA--------------------CT--CTAG----TGA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CG
gi|6 : -T---T--T----GATA-C-C-----GCA-TG-TGC---ATCT---ATAG---A----G--AT-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---CA-AAA-------T-AAA-ACGT----GAG-T--GTT---G-T-TT--A-C--AC-AC-ATGG-C--T---CC-AATTTTT--TC--CT-TG-TG------T-CT--G--C-A-AT--T-T--GGG---G--A--T-ATAC-GCG-T----G--TT--G-AC---T-CG-AG-T--TCC-A-A-CA-CA-T-A-G--T--G-T-T---G--AT-AACGG---TAG-----A----T-T----G-TTAG--AA-C-A--A--TA---T-C--G-C--ACA-C----------TGTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgataccgcatgtgcatctatagagattacaacactagcaaaataaaacgtgagtgttgtttacacacatggctccaattttttccttgtgtctgcaatttggggatatacgcgtgttgactcgagttccaacacatagtgttgataacggtagattgttagaacaatatcgcacactgtgttgtctaatcaaac
gi|7 : cgtttgatgatgacgactctagtgatactagtgtttgatacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCGTTTGA-TTAAG--A-CGA--------------------CT--CTAGATAGTGA-TA---TT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGC-----GCA-TG-TGC---A------ATAG---A--T-G--AA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-G---C--AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAG-T--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTTCCCC--CT-TG-TG--C-T-C-CT--G-CC-A-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT--G-AC---T-CG-AT-T--T-C-A-A-CA-C--T-A-G--T--G-TGG---G--AT-AACCG---T-GTTTAAT----T-T--G-A-TT----AA-C-A--A--TA-C-T-C--G-T-AACA-CG-AGTA-ACACGTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AACGTA
gi|8 : CGTTTGA-TTAAG--A-CGA--------------------CT--CTAG----TGA-TATACCT-AG--------TG-T---TGTT----GATA-CGC-----GCA-TG-TAC---A-------TAG---A--T-G--AA-----T---A-CA-A-TA-C--A-G---C--AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAG-T--GTT---G-T-TTA-A-C--A--TT-ATGG-C--TA--CC-ATTTTTC--TC--CT-TG-TG--C-T-C-CT--G-CCAA-AT--T-T--GGG---G--AG-T-ATAC-ACG-T----G--TT--G--C---T-CG-AGTT--T-C-A-A-CATC--T-A-G--T--G-TGG---A--AT-AACGG---T-G-----T----T-T--G-G-TTA---AA-C-A--A--TA-C-T-C--G-C-AACACCG-AGTA-ACACGTGT-T--G-TC----T-A-ATCA-AA
gi|9 : CATTTGA-TTAAG--A-AGA--------------------CT--CTAG----TGA-TA---CT-AG--------TG-T---T--T----GATA-CGC-----GCA-TG-TGC---A------ATAG---A--T-G--AA-----T---A-CA-A-CA-CT-A-A---C--AAA-------T-AAA-ACGT-G--GAG-T--GTT---G-T-TT--A-C--A--AC-ATGG-C--TA--CC-AATTTCT--TC--CT-TG-TG--C-T-C-CT--G-CC-A-AT--T-A--GGG---G--AG-T-ATAC-TCG-T----G--TT--G-AC---T-CG-AG-T--T-T-A-A-CA-C--T-A-G--C--G-TGC---G--AT-AACGG---T-G-----T----T-T--G-G-TT----AA-C-A--A--TA-C-T-C--G-T-AACA-CA-AGTG-ACACGTGT-T--G-TCTGGGT-A-ATCA-AACGTAac
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Unaligned ( gi|32 ): TGCTGTAAAACTACTGATGTAGTACAGTCAAACCTTTACA