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lowQualScore : . . . . . . .... ... . .. . . . . .. . . ... ... .. . . . . . . .. ... ... ... .. . . . ..
lowQualScore : 1 0 0 9 9 8 4444 222 5 55 7 7 7 7 00 7 7 333 888 00 7 7 7 5 7 5 55 666 333 333 55 9 9 7 22
consensus : GCGAGCG-CCG-T-GG-TTA-TCG-TGC--G-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-CC--ATT--NT---CGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAA
Reference ( gi|19 ) : GCGAGCG-CCG-T-GG-TTA-TCG-TGC--G-A--TA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-CC--ATT--AT---CGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAA
gi|6 : GCGAGCG-CCG-T-GG-TTA-TCG-TGC--C-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-G-CGT---G---T--C-CC-A-AA-T-CGCCC--ATT--CT---CGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAA
gi|11 : GCGACCG-CCG-T-GA-TTA-TCG-TGC--A-A--CA-ATGG--A-TA-TTT-GA-A--TA-T-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-CC--ATT--AT---CGT---GT--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTATGACTAAgg
gi|8 : GCGACCG-CCG-T-GA-TTA-TCG-TGC--A-A--CA-ATGG--A-TA-TTT-GA-A--TA-T-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-CC--ATT--AT---CGT---GT--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTATGACTAAgg
gi|9 : GCGAGCG-CCG-T-GT-TTA-TTG-TAC--C-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-G--TT-T-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-CC--ATT--CT---CGT---GC--AGGAG-TG-G-CCCA--TTTGTGACTAAggc
gi|10 : GCGGGTG-CCG-T-GT-TTA-TCG-TGC--C-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-TA-A--TT-T-TGC---G---C--C-CC-A-AA-T-CG-CC--ATT--CT---TGT---GT--GGGAG-TT-G-TCCA--TTTGTGACCAAgg
gi|43 : GCGAGCG-CCG-T-GC-TTA-TCG-TGC--C-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-TGC---G---T--C-C----------------------T---CGT---GC--GGGAG-TC-G-GCCA--TTTGTGACTAAgg
gi|4 : GCGATCG-CCG---GG-TTA-TCG-TGC----A--CA-ATGGGGA-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGC---G---T--C-CC-A-AACT-CG-CCCGA-T--AT---CGT---GC--GGGAG-TC-gg
gi|34 : GCAGACG-CCG-T-GT-TTA-TCG--GC--C-A--TA-ATGG--A-GA-TTT--A-A--TT-C-CGT---G---C--T-CC-A-AA-T-CG-CT--ATT--CT---CGT---GT--GGGAGTTT-G-CCCA--TTTGTattttacgggcactagggc
gi|3 : GCG-GCG-CCG---GG-TTA-T-G-TGC--C-A--CATATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-GGCGT---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-CCC-ATTCAGT---CGT---ATCTGGGAG-TC-G-CCAA--TTTGTGACTAAac
gi|5 : cGCGAGTG-CTG-T-GG-T-A-TCG-TGC----A--CA-ATGGA-A-GA-TTT-GAGA--TT-T-CGA---G---T--A-CC-A-AATT-CG-CCA-ATT--AT---CAT---GC---GGAG-T--G-CCCA--TGAGTGACTTAAgg
gi|2 : ggGCGAGCG-CCG-A-GT-TTA-TCGTTGC--C-GCCCA-ATGG--A-GA-ATT-GA-ATTTT-T-CGC---G------C-CC-A-AA-T-CG-CC--A-T--ATTGACGT---GCT-GGGAG-TC-GCCCCA--TTT-TAACTAAg
gi|37 : GCGAGCGGCCT-T-GG-TTAATCG-TGC--GGA--CA-AGGGG-A-GA-TTTAGA-A--TT-T-CAC-------T--C-CC-A-A--T-CG-C----TT--AT---CGT---GC----GAG-TC-G-CC-----TTGTGACg
gi|14 : CGAACG-CCG-T-GG-TTA-TCG-TGC--G-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGC---G---T--C-CC-A-AG-T-CG-CC--ATT--AT---CGT---GC--GGGAG-TC-G-CCTA--TTTGTGACTAA
gi|16 : CGAGCG-CCG-T-GG-TTA-TCG-TGC--G-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-A-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-CC--ATT--AT---CTT---GC--GCGAT-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAgg
gi|40 : CGAGCG-CCG-T-GG-TTA-TCG-TGC--G-A--CA-ATGG--A-AA-TTT-GA-A--TT-T-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-CC--ATT--AT---CTT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGgg
gi|28 : CGATCG-TCG-T-AG-TTA-TCG-TGC--G-A--CA-GTTG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CT-CC--ATT--AT---CGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAA
gi|23 : CGAGCG-TCG-T-TT-TTA-TCG-TGC--C-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-TC--ATT--GT---CGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAA
gi|15 : CGATCG-TCG-T-AG-TTA-TCG-TGC--G-A--CA-GTTG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CT-CC--ATT--AT---CGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAg
gi|12 : CGAGTG-CCG-T-GG-TAA-TCG-TGC--C-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GG-A--TT-T-TGT---G---T--C-TC-A-AA-T-CG-CC--ATT--AT---CGT---GC--GGGAA-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAgg
gi|38 : CGATCA-CCA-T-GG-TTA-TCG-TGC--G-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-GC--ATT--AT---CGT---GC--GGGAG-TC-G-CCTA--TTTGgg
gi|17 : CGAGCG-CCG-T-GG-TTT-TCG-TGC--C-A--CA-ATGG--A-TA-TTT-GA-A--TT-C-CAT---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-CA--ATT--CT---TGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAA
gi|27 : aCGAGCG-CCG-T-GG-TTA-TCG-TAC--C-G--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CAC---G---T--C-GC-A-AA-T-TG-CC--ATT--GT---CGT---GC--GGTAG-TC-G-CCAA--TTGGTAACTg
gi|18 : CGGGCA-CTG-T-GT-TTA-TCA-TGC--C-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-TC-A--TT-C-TGA---G---T--C-TC-A-AA-T-CG-TC--ATT--CT---TGT---GC--AGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTta
gi|20 : CGAGTA-CCG-T-TG-TTA-TCG-TGT--C-A--CA-ACAG--G-GA-TTT-GG-A--TT-T-CGT---G---T--T-AC-A-AA-T-CG-CC--ATT--CT---CAT---GC--GGTAG-TC-G-CCCT--TTTGTGACTgtag
gi|25 : GATCG-CCG-T-GG-TTA-TCG-TGC--G-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-CC--ATT--AT---CGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAcagg
gi|21 : GAGTG-CCG-T-GG-TTA-TCG-TGC--A-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGC---G---T--C-CT-A-AA-T-CG-CC--ATT--AT---CGT---GC--TGGAG-TC-A-TCCA--TTTGTGACTAAgg
gi|22 : GAGCG-CCG-T-GG-TTA-TCG-TGC--C-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGT---G---T--T-CA-A-AA-T-CG-CC--ATT--GT---CGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGAC-AAAgg
gi|26 : tGGGTG-CCG-T-GT-TTA-TCG-TTC--C-A--CA-ATCG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-CC--ATT--CT---CGT---GC--GGGAG-TC-A-GCCA--TTTGTGACTAAg
gi|32 : GAGCG-CCG-C-CT-TTA-TTG-TGC--C-A--CA-ATGG--A-G--CTT-GA-A--TT-T--GC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-CC--ATT--CT---CAT---GC--GGGAG-TC-G-CCC---TTTGTGACTAAg
gi|24 : GAGCG-CCG-T-GG-TTA--CA-TGC--G-A--CA-ATGG--A--A-TTG-AA-A--TTCT-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-CC--TTT--AT---CGT---GC---GGAG-TCGG-CCTATTTTTGTGATTAAg
gi|7 : gGGGTG-CCG-T-GT-TTA-TCA-TGT--C-A--CA-ATGA--G-GA-TT--GT-A--TT-T-CGC---G---C--T-CC-A-AA-T-CG-CC--ATT--GT---TGT---GC--GGGAG-GC-G-TCCA--TTTGTGACTAA
gi|30 : gggaGAGTA-CCG-T-TG-TTA-TCG-TGT--C-A--CA-ACAG--G-GA-TTT-GG-A--TT-T-CGT---G---T--T-AC-A-AA-T-CG-CC--ATT--CT---CAT---GC--GGTAG-TC-G-CCCT--TTTGTGACTgg
gi|33 : GGGCA-CCG-A-GT-TTA-TTG-TGT--C-A--TA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGC---G------G-CC-A-AA-T-CG-CT--ATT--TT---TGT---GC--AGAAG-TC-G-GCAA--TTTGTGACTAca
gi|13 : GGGCA-CTG-T-GT-TTA-TCA-TGC--C-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-TC-A--TT-C-TGA---G---T--C-TC-A-AA-T-CG-TC--ATT--CT---CGG---GC--AGGAG-TC-G-CCCA--TTTATGACTA
gi|31 : CG-CCG-T-GG-TTA-TCG-TGC--G-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-TGC---G---T--C-CG-A-AA-T-CG-CC--ATT--AT---CGT---GC--GAGAG-TC-T-CCCA--TTCGTGACTGAtagg
gi|1 : tCG-CCG-TTGGCTTA-TCG-T-C--G-A--CACATGG--AAGA-TTT-GA-A--TT-T-CGC---G---T--CGCCGA-AA-TCCGCCC--ATT---T---CGTGGAGC--TGGAG-TC-GTCCCA--TTTGTGACTAg
gi|29 : cgattG-CCG-T-AG-TTA-TCG-TGC--G-A--CA-ATGT--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-TC--ATT--AT---CGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTGAgg
gi|35 : attG-CCGGC-GT-TTA-TCG-TGC--G----CA-ATGG--A-GA-TT--GA-A--TT-T-CGC---G---C--C-CC-A-AA-T-CG-CC--ATA--TT---CGT---GC--GGGAG-TC-G--CCA--TTT-TAACTAAt
gi|36 : CG-T-GG-TTA-TCG-TGT--G-A--CA-ATGG--A-TA-TTT-GA-A--CT-T-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-CC--AAT--AT---CGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAgg
gi|41 : CG-T-GG-TTA-TCG--GT--G-A--CA-ATGG--A-TATTTT-GA-A--CT-T-CGC---G---T--C-CC-A-AA-T-CG-CC--AAT--AT---CGT---GC--GGGAG-TC-G--CCA---TTGTGACTAAg
gi|42 : CG-T-GT-TTA-TGG-TGC--C-A--CA-ATGA--A-GA-TTT-AA-A--TT-T-TTC---G---C--C-CC-A-AA-T-CG-CT--ATT--CT---CGT---AC--GGGAG-TC-G-CCCA--TATGTGAg
gi|39 : g-T-GT-TTT-TCG-TGT--C-A--CA-ATGA--G-GA-TTT-GA-A--TT-G-TGA---G------C-CC-ATAA-T-CG-TC--ATT--TT---AGT---ACG-GGGAG-TT-G-CTTA--TTTGTGACTAAt
gi|45 : G-TTA-TCG-TAC--C-G--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CAC---G---T--C-GC-A-AA-T-TG-CC--ATT--GT---CGT---GC--GGTAG-TC-G-CCAA--TTGGTAACTTAAg
gi|44 : -TTT-TCG-TGT--C-A--CA-ATGA--G-GA-TTT-GA-A--TT-G-TGA---G---A--C-CC-A-AA-T-CG-TC--ATT--TT---AGT---GC--GGGAG-TT-G-CTTA--TTTGTGAC-AAA
gi|16 : gtA-TCG-CGCAAG-A--TA-ATGG--C-GA-TTTGGG-A-------CGC---G---TAAT-TC-A-AA-T-CT-CC--ATT--GT---CGC---AC--G
gi|46 : cgagcgccgtggttatA-TCG-TGC--C-A--CA-ATGG--A-GA-TTT--A-A--TT-T--GC---G---C--C-CC-A-AA-T-CG-CC--ATT--CT---CGT-------GGGAG-TT-G-TCCA--TTTGTGACTAAtcgcccatttgtgactaagg
gi|31 : ta-TCG-CAC--G-A--TA-ATGG--C-GA-TTTCGG-A-------CGCAAAA---T----TC-A-AA-T-CT-CC--ATT--GT---CGC---AC--Ggg
gi|25 : tcgccgtggttatCG-CAC--G-A--TA-ATGG--C-GA-TTTGGG-A-------CGC---GAAAT----TC-A-AA-T-CT-CC--ATT--GT---CGC---AC--Ggagtctcccattcgtgactgag
gi|14 : gatcgccgtggttatCG-CAC--G-A--TA-ATGG--C-GA-CTTGGG-A-------CGC---GAAAT----TC-A-AA-T-CT-CC--ATT--GT---CGC---AC--Gggagtcgcccatttgtgactaagg
gi|28 : cgaacgccgtggttatCG-CAC--G-A--TA-ATGG--A-GA-TTTGGG-A-------CGC---GAAAT----TC-A-AA-T-CT-CA--ACT--GT---CGC---AC--Gggagtcgcctatttgtgactaagg
gi|15 : cgatcgtcgtagttatCG-CAC--G-A--TA-ATGG--A-GA-TTTGGG-A-------CGC---GAAAT----TC-A-AA-T-CT-CA--ACT--GT---CGC---AC--Gggagtcgcccatttgtgactaa
gi|38 : cgatcgtcgtagttatCG-CAC--G-A--TA-ATGC--C-GA-TTTGGG-A-------CGC---GAAAT----TC-A-AA-T-CT-CC--ATT--GT---CGC---AC--Gggagtcgcccatttgtgactaagg
gi|21 : cgatcaccatggttatC--G-A--TA-ATGG--C-GA-TTTAGG-A-------CGC---GAAAT----TC-A-AA-T-CT-CC--ATT--GT---TGC---AC--Gggagtcgcctatttg
gi|47 : gagtgccgtggttatG--A-GA-TAT-AA-G--TT-T-CGT---G---T--C-CC-A-CA-T-CG-CC--ATT--CT---CAT---GC--GGGAG-TC-A-TCCA--TTTGTGACTAAtgctggagtcatccatttgtgactaagg
gi|48 : -CC-A-AG-T-CG-CC--ATT--CT---CGT---GC--GGGAG-TC-G-CCAA--TTTGTGACTAAg
Alignments
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lowQualScore : . . . . . .. .. . .. . . . . .. . . . . . . . . .. ... ... .. . . . ..
lowQualScore : 0 9 9 9 9 77 22 7 99 9 9 9 9 22 9 9 8 8 8 7 8 7 00 222 555 88 8 8 7 22
consensus : GCGAGCG-CCGT-GG-TTA-TCG-TGCC-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTN--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAA
Reference ( family-8702 ) : GCGAGCG-CCGT-GG-TTA-TCG-TGCG-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTN--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAA
gi|1 : CG-CCGTTGGCTTA-TCG-T-CG-A--CACATGG--AAGA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTCGCCGA-AA-TCCGCCC--ATT---TCGTGGAGC--TGGAG-TC-GTCCCA--TTTGTGACTA
gi|10 : cgattGCGGGTG-CCGT-GT-TTA-TCG-TGCC-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-TA-A--TT-T-TGCGCC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTC--TTGT---GT--GGGAG-TT-G-TCCA--TTTGTGACCAAgg
gi|11 : GCGACCG-CCGT-GA-TTA-TCG-TGCA-A--CA-ATGG--A-TA-TTT-GA-A--TA-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTA--TCGT---GT--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTATGACTAAgg
gi|12 : CGAGTG-CCGT-GG-TAA-TCG-TGCC-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GG-A--TT-T-TGTGTC-TC-A-AA-T-CG-CC--ATTA--TCGT---GC--GGGAA-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAgg
gi|13 : GGGCA-CTGT-GT-TTA-TCA-TGCC-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-TC-A--TT-C-TGAGTC-TC-A-AA-T-CG-TC--ATTC--TCGG---GC--AGGAG-TC-G-CCCA--TTTATGACTAgg
gi|14 : CGAACG-CCGT-GG-TTA-TCG-TGCG-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AG-T-CG-CC--ATTA--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCTA--TTTGTGACTAAtagg
gi|15 : CGATCG-TCGT-AG-TTA-TCG-TGCG-A--CA-GTTG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CT-CC--ATTA--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAgg
gi|16 : CGAGCG-CCGT-GG-TTA-TCG-TGCG-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-A-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTA--TCTT---GC--GCGAT-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAgg
gi|17 : CGAGCG-CCGT-GG-TTT-TCG-TGCC-A--CA-ATGG--A-TA-TTT-GA-A--TT-C-CATGTC-CC-A-AA-T-CG-CA--ATTC--TTGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAgg
gi|18 : aCGGGCA-CTGT-GT-TTA-TCA-TGCC-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-TC-A--TT-C-TGAGTC-TC-A-AA-T-CG-TC--ATTC--TTGT---GC--AGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTg
gi|19 : GCGAGCG-CCGT-GG-TTA-TCG-TGCG-A--TA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTA--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAAgtag
gi|2 : GCGAGCG-CCGA-GT-TTA-TCGTTGCC-GCCCA-ATGG--A-GA-ATT-GA-ATTTT-T-CGCG-C-CC-A-AA-T-CG-CCATATTG--ACGT---GCT-GGGAG-TC-GCCCCA--TTT-TAACTAA
gi|20 : CGAGTA-CCGT-TG-TTA-TCG-TGTC-A--CA-ACAG--G-GA-TTT-GG-A--TT-T-CGTGTT-AC-A-AA-T-CG-CC--ATTC--TCAT---GC--GGTAG-TC-G-CCCT--TTTGTGACTg
gi|21 : GAGTG-CCGT-GG-TTA-TCG-TGCA-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CT-A-AA-T-CG-CC--ATTA--TCGT---GC--TGGAG-TC-A-TCCA--TTTGTGACTAAcagg
gi|22 : GAGCG-CCGT-GG-TTA-TCG-TGCC-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGTGTT-CA-A-AA-T-CG-CC--ATTG--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGAC-AAAgg
gi|23 : tCGAGCG-TCGT-TT-TTA-TCG-TGCC-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-TC--ATTG--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAg
gi|24 : GAGCG-CCGT-GG-TTA--CA-TGCG-A--CA-ATGG--A--A-TTG-AA-A--TTCT-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--TTTA--TCGT---GC---GGAG-TCGG-CCTATTTTTGTGATTAAg
gi|25 : gGATCG-CCGT-GG-TTA-TCG-TGCG-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTA--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAA
gi|26 : GGGTG-CCGT-GT-TTA-TCG-TTCC-A--CA-ATCG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTC--TCGT---GC--GGGAG-TC-A-GCCA--TTTGTGACTAAgg
gi|27 : CGAGCG-CCGT-GG-TTA-TCG-TACC-G--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CACGTC-GC-A-AA-T-TG-CC--ATTG--TCGT---GC--GGTAG-TC-G-CCAA--TTGGTAACTg
gi|28 : CGATCG-TCGT-AG-TTA-TCG-TGCG-A--CA-GTTG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CT-CC--ATTA--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAta
gi|29 : G-CCGT-AG-TTA-TCG-TGCG-A--CA-ATGT--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-TC--ATTA--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTGA
gi|3 : attGCG-GCG-CCG--GG-TTA-T-G-TGCC-A--CATATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-GGCGTGTC-CC-A-AA-T-CG-CCC-ATTCAGTCGT---ATCTGGGAG-TC-G-CCAA--TTTGTGACTAAt
gi|30 : cGAGTA-CCGT-TG-TTA-TCG-TGTC-A--CA-ACAG--G-GA-TTT-GG-A--TT-T-CGTGTT-AC-A-AA-T-CG-CC--ATTC--TCAT---GC--GGTAG-TC-G-CCCT--TTTGTGACTgg
gi|31 : CG-CCGT-GG-TTA-TCG-TGCG-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-TGCGTC-CG-A-AA-T-CG-CC--ATTA--TCGT---GC--GAGAG-TC-T-CCCA--TTCGTGACTGAca
gi|32 : tGAGCG-CCGC-CT-TTA-TTG-TGCC-A--CA-ATGG--A-G--CTT-GA-A--TT-T--GCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTC--TCAT---GC--GGGAG-TC-G-CCC---TTTGTGACTAAg
gi|33 : GGGCA-CCGA-GT-TTA-TTG-TGTC-A--TA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCG-G-CC-A-AA-T-CG-CT--ATTT--TTGT---GC--AGAAG-TC-G-GCAA--TTTGTGACTAg
gi|34 : GCAGACG-CCGT-GT-TTA-TCG--GCC-A--TA-ATGG--A-GA-TTT--A-A--TT-C-CGTGCT-CC-A-AA-T-CG-CT--ATTC--TCGT---GT--GGGAGTTT-G-CCCA--TTTGT
gi|35 : CG-GCGT----TTA-TCG-TGCG----CA-ATGG--A-GA-TT--GA-A--TT-T-CGCGCC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATAT--TCGT---GC--GGGAG-TC-G--CCA--TTT-TAACTAAac
gi|36 : gcCGT-GG-TTA-TCG-TGTG-A--CA-ATGG--A-TA-TTT-GA-A--CT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--AATA--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAgg
gi|37 : GCGAGCGGCCTT-GG-TTAATCG-TGCGGA--CA-AGGGG-A-GA-TTTAGA-A--TT-T-CAC-TC-CC---AA-T-CG-C----TTA--TCGT---GC----GAG-TC-G-CC-----TTGTGACg
gi|38 : CGATCA-CCAT-GG-TTA-TCG-TGCG-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-GC--ATTA--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCTA--TTTG
gi|39 : T-GT-TTT-TCG-TGTC-A--CA-ATGA--G-GA-TTT-GA-A--TT-G-TGAG-C-CC-ATAA-T-CG-TC--ATTT--TAGT---ACG-GGGAG-TT-G-CTTA--TTTGTGACTAA
gi|4 : GCGATCG-CCG--GG-TTA-TCG-TGC--A--CA-ATGGGGA-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AACT-CG-CCCGA-TA--TCGT---GC--GGGAG-TC-g
gi|40 : CGAGCG-CCGT-GG-TTA-TCG-TGCG-A--CA-ATGG--A-AA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTA--TCTT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGattttacgggcactagggc
gi|41 : CGT-GG-TTA-TCG--GTG-A--CA-ATGG--A-TATTTT-GA-A--CT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--AATA--TCGT---GC--GGGAG-TC-G--CCA---TTGTGACTAA
gi|42 : CGT-GT-TTA-TGG-TGCC-A--CA-ATGA--A-GA-TTT-AA-A--TT-T-TTCGCC-CC-A-AA-T-CG-CT--ATTC--TCGT---AC--GGGAG-TC-G-CCCA--TATGTGAg
gi|43 : gGCGAGCG-CCGT-GC-TTA-TCG-TGCC-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-TGCGTC-C----------------------TCGT---GC--GGGAG-TC-G-GCCA--TTTGTGACTAAt
gi|44 : -TTT-TCG-TGTC-A--CA-ATGA--G-GA-TTT-GA-A--TT-G-TGAGAC-CC-A-AA-T-CG-TC--ATTT--TAGT---GC--GGGAG-TT-G-CTTA--TTTGTGAC-AAAgg
gi|45 : gtG-TTA-TCG-TACC-G--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CACGTC-GC-A-AA-T-TG-CC--ATTG--TCGT---GC--GGTAG-TC-G-CCAA--TTGGTAACTTAA
gi|46 : A-TCG-TGCC-A--CA-ATGG--A-GA-TTT--A-A--TT-T--GCGCC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTC--TCGT-------GGGAG-TT-G-TCCA--TTTGTGACTAA
gi|47 : taG--A-GA-TAT-AA-G--TT-T-CGTGTC-CC-A-CA-T-CG-CC--ATTC--TCAT---GC--GGGAG-TC-A-TCCA--TTTGTGACTAAgg
gi|48 : -CC-A-AG-T-CG-CC--ATTC--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCAA--TTTGTGACTAAg
gi|5 : GCGAGTG-CTGT-GG-T-A-TCG-TGC--A--CA-ATGGA-A-GA-TTT-GAGA--TT-T-CGAGTA-CC-A-AATT-CG-CCA-ATTA--TCAT---GC---GGAG-T--G-CCCA--TGAGTGACTTAAg
gi|6 : ggGCGAGCG-CCGT-GG-TTA-TCG-TGCC-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-G-CGTGTC-CC-A-AA-T-CGCCC--ATTC--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAg
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Alignments
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lowQualScore : . . . . . . .. .. . .. . . . . .. . . . . . . . . .. ... ... .. . . . ..
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consensus : GCGAGCG-CCGT-GG-TTA-TCG-T-GCC-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTN--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAA
Reference ( family-8702 ) : GCGAGCG-CCGT-GG-TTA-TCG-T-GCC-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTN--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAA
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gi|34 : GCAGACG-CCGT-GT-TTA-TCG---GCC-A--TA-ATGG--A-GA-TTT--A-A--TT-C-CGTGCT-CC-A-AA-T-CG-CT--ATTC--TCGT---GT--GGGAGTTT-G-CCCA--TTTGT
gi|35 : CG-GCGT----TTA-TCG-T-GC--G--CA-ATGG--A-GA-TT--GA-A--TT-T-CGCGCC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATAT--TCGT---GC--GGGAG-TC-G--CCA--TTT-TAACTAAac
gi|36 : gcCGT-GG-TTA-TCG-T-GTG-A--CA-ATGG--A-TA-TTT-GA-A--CT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--AATA--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAgg
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gi|42 : CGT-GT-TTA-TGG-T-GCC-A--CA-ATGA--A-GA-TTT-AA-A--TT-T-TTCGCC-CC-A-AA-T-CG-CT--ATTC--TCGT---AC--GGGAG-TC-G-CCCA--TATGTGAg
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Alignments
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Reference ( family-8702 ) : GCGAGCG-CCGT-GG-TTA-TCG-T-GCC-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTN--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAA
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gi|30 : cGAGTA-CCGT-TG-TTA-TCG-T-GTC-A--CA-ACAG--G-GA-TTT-GG-A--TT-T-CGTGTT-AC-A-AA-T-CG-CC--ATTC--TCAT---GC--GGTAG-TC-G-CCCT--TTTGTGACTgg
gi|31 : CG-CCGT-GG-TTA-TCG-T-GCG-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-TGCGTC-CG-A-AA-T-CG-CC--ATTA--TCGT---GC--GAGAG-TC-T-CCCA--TTCGTGACTGAca
gi|32 : tGAGCG-CCGC-CT-TTA-TTG-T-GCC-A--CA-ATGG--A-G--CTT-GA-A--TT-T--GCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTC--TCAT---GC--GGGAG-TC-G-CCC---TTTGTGACTAAg
gi|33 : GGGCA-CCGA-GT-TTA-TTG-T-GTC-A--TA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCG-G-CC-A-AA-T-CG-CT--ATTT--TTGT---GC--AGAAG-TC-G-GCAA--TTTGTGACTAg
gi|34 : GCAGACG-CCGT-GT-TTA-TCG---GCC-A--TA-ATGG--A-GA-TTT--A-A--TT-C-CGTGCT-CC-A-AA-T-CG-CT--ATTC--TCGT---GT--GGGAGTTT-G-CCCA--TTTGT
gi|35 : CG-GCGT----TTA-TCG-T-GC--G--CA-ATGG--A-GA-TT--GA-A--TT-T-CGCGCC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATAT--TCGT---GC--GGGAG-TC-G--CCA--TTT-TAACTAAac
gi|36 : gcCGT-GG-TTA-TCG-T-GTG-A--CA-ATGG--A-TA-TTT-GA-A--CT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--AATA--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAgg
gi|37 : GCGAGCGGCCTT-GG-TTAATCG-T-GCGGA--CA-AGGGG-A-GA-TTTAGA-A--TT-T-CAC-TC-CC---AA-T-CG-C----TTA--TCGT---GC----GAG-TC-G-CC-----TTGTGACg
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gi|44 : -TTT-TCG-T-GTC-A--CA-ATGA--G-GA-TTT-GA-A--TT-G-TGAGAC-CC-A-AA-T-CG-TC--ATTT--TAGT---GC--GGGAG-TT-G-CTTA--TTTGTGAC-AAAgg
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Alignments
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Reference ( family-8702 ) : GCGAGCG-CCGT-GG-TTA-TCG-T-GCC-A--CA-ATGG--A-GA-TTT-GA-A--TT-T-CGCGTC-CC-A-AA-T-CG-CC--ATTN--TCGT---GC--GGGAG-TC-G-CCCA--TTTGTGACTAAA
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