lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                
lowQualScore                  :                 1                                                                                                           11111111                                                                        1111                                                    1111       111111111                                                                                 111111      11111111              11111    1111111  44444444444444444444444444                    111     22222222222222            11111             1111111    11     11111     1111111                        111111     222222222222                   22222222222222                222222222                                11        22222222     1   1111  22222222           1111            2222222        4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444     222222                4444444444444  1    1111   111 1     2222222222222222     2     33       44444      11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111            7777777777777777777777       11    3333333      33333333333      11   1    2   666666    2222  1    
lowQualScore                  :            4 0  3   8   2 33      2 33  2     66   2    2  2       2 2 2   2  5555     5 2    2  2 2 2 2    2    33         44444444       77777   2     2 5555     2  444 2  444     2 5      66  8888  2  3333 33 33  2        2  5  9999999 2    2  5 33  6666   0000   2 2 666666666    2  77777 6666   9999 3  3 44  888888 0  77  3 3     88 3 3   888 3 77777     111111  88  44444444 1 0 55 666 3 11111    6666666  22222222222222222222222222    3 3   666 88    444 4   77777777777777  4   4 777 11111  66 4  66 4 4444444 4  00     44444   4 3333333    66   66  66 9999  4 000000 4 4 444444444444   9999   777 4 4  22222222222222 66    4  777   555555555 2     4  9999  4  66   4 4   5 11    66  55555555 66  0   2222  66666666  77       2222   5   8 8  6666666   8  2 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555   3 888888  7 8     3     3333333333333  0  3 4444   777 0     9999999999999999     0     11     1 66666      33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333       7 3  4444444444444444444444       88    7777777    0 99999999999      88   5    0   111111    1111  5    
lowQualScore                  :            . .  .   .   . ..      . ..  .     ..   .    .  .       . . .   .  ....     . .    .  . . . .    .    ..         ........       .....   .     . ....     .  ... .  ...     . .      ..  ....  .  .... .. ..  .        .  .  ....... .    .  . ..  ....   ....   . . .........    .  ..... ....   .... .  . ..  ...... .  ..  . .     .. . .   ... . .....     ......  ..  ........ . . .. ... . .....    .......  ..........................    . .   ... ..    ... .   ..............  .   . ... .....  .. .  .. . ....... .  ..     .....   . .......    ..   ..  .. ....  . ...... . . ............   ....   ... . .  .............. ..    .  ...   ......... .     .  ....  .  ..   . .   . ..    ..  ........ ..  .   ....  ........  ..       ....   .   . .  .......   .  . ................................................................   . ......  . .     .     .............  .  . ....   ... .     ................     .     ..     . .....      ..................................................................................................       . .  ......................       ..    .......    . ...........      ..   .    .   ......    ....  .    
lowQualScore                  :            2 3  3   4   7 77      7 77  7     33   7    7  7       5 5 5   7  7777     3 7    5  5 5 5 5    5    77         44444444       99999   5     7 7777     7  777 7  777     7 7      88  1111  9  1111 99 99  9        9  7  3333333 9    9  7 99  1111   1111   9 9 444444444    9  11111 1111   6666 1  1 22  888888 2  33  1 1     55 1 1   555 1 77777     888888  66  55555555 2 2 00 444 6 00000    8888888  66666666666666666666666666    6 6   444 66    000 0   55555555555555  0   4 888 11111  11 4  11 4 4444444 4  66     99999   4 9999999    11   11  11 4444  4 333333 4 4 333333333333   4444   888 4 4  77777777777777 11    4  888   666666666 7     4  4444  4  11   4 4   0 99    99  44444444 99  0   1111  44444444  99       1111   7   0 0  0000000   0  5 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000   2 888888  0 8     2     0000000000000  0  2 8888   555 0     2222222222222222     0     77     0 77777      55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555       3 7  0000000000000000000000       33    7777777    7 00000000000      33   0    0   555555    0000  0    
consensus                     :        TAATAATAA-AATAATA-A--AATACA-C--TT-ATATA--GCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATT--------AATACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---T-AC---AAAAC-G-AAAATA--CC-T--TA-CA---CA--T--TT-AAAACATG-AA-TG-------C-AACA-TT-A--TG----TCA-T--AAT-A-G---------ATAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--TC------AAGA--CA-A-TTTAA--A-G-TAT---A-A-----AATAT----G-AT--GC-A------GGCAT--A---A-A-AC--GTCC-----T-AA-------T-AT---AT--------A-GAAA-A-ACA---A--TAAG---T-AAA--------------TC-TAA-A---A-----CA--C-AA--A-C-------G-TG--CCCAAAG---TTC-GG------TAAA--TTT--AA--C----AG-T----A-G-C-T-----A------TTT----AAT---G-G-TT---A----------T--AGGA-TT---TAC---------AGAAAAG-AT----GA-GT--TTT-T-AAA-A--GACG--TT------TAA--AA-CAT----TC--------AA--GATTTTT----GGC-GTT-T-CT-------GAG-CTNG-CT----AGGC-A--G-ATT-GT-TCTCAGAG----T-G-T-GGAT---G---C--AG-C-C-GTTGTC------GAATCTGCGTTCACCGT-AG-------G-TC-TTAG-T--TCT---G-ACTGA------TG-G-T--A-CAGTT-AGTAGA-TTCGCGGC----TTTCTGA-AA----CGCA-GG-G-----CTC-TT-----GT-C--GNGTT--GTATCGCGAATAATGAATGNGTNNNGTT---TA-G-ATA---TC-----C--TGGAGCAAGNTT----G--CGGAG---ACG----TTTTAAA--CACG-----T-ATAGAA--GAA------TTTTGT--ACTGGATATCGATTATACATCATACGGGCAAGC
Reference ( gi|3 )            :        TAATGATAA-AATGATA-A--AATACA-C--TT-ATATA--GCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATT--------AATACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---T-AC---AAAAC-G-AAAATA--CC-T--TA-CA---TA--T--TT-AAAACATG-AA-TG-------C-AACA-TT-A--TG----TCA-T--AAT-A-G---------ATAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--TC------AAGA--CA-A-TTTAA--A-G-TAT---A-A-----AATAT----G-AT--GC-A------GGCAT--A---A-A-AC--GTCC-----T-AA-------T-AT---AT--------A-GAAA-A-ACA---A--TAAG---T-AAA--------------TC-TAA-A---A-----CA--C-AA--A-C-------G-TG--CCCAATG---TTC-GG------TAAA--TTT--AA--C----AG-T----A-G-C-T-----A------TTT----AAT---G-G-TT---A----------T--AGGA-TT---TAC---------AAAAAAG-AT----GA-GT--TTT-T-AAA-A--GACG--TT------T-A--AA-CAT----TC--------AA--GATTTTT----GGC-GTT-T-CT-------GAG-CTGG-CT----AGGC-A--G-ATT-GT-TC-CAGAG----T-G-T-GGAT---G---C--AG-C-C--TTGTC------GAATCTGCGTTCACCGT-AG-------G-TC-TTAG-T--TCT---G-ACTGA------TG-G-T--A-CAGTT-AGTAG--TTTGCAG-----TTTCTG--AA----CGCA-GG-G-----CTC-TT-----GT-C--GGGTT--GTAT-G-GAATACTGAATGAGTTCCG-T---TA-G-ATA---TC-----C--TGGAGCAAGCTT----G--TGGAG---AC-----TTTTAAA--CACA-----T-ATAGGA--GAA------TTTTGT--ACTGGATA-CGA-TA---ATCA-AC-GGCAAGC
gi|6                          :        TAATAAATA-AATAATA-A--AATACA-C--TT-ATATA--GCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATT--------AATACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---T-AC---AAAAC-G-AAAATA--CC-T--TA-CA---CA--T--TT-AAAACATG-AA-TG-------C-AACA-TT-A--TG----TCA-T--AAT-A-G---------ATAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--TC------AAGA--CA-A-TTTAA--A-G-TAT---A-A-----AATAT----G-AT--GC-A------GGCAT--A---A-A-AC--GTCC-----TAAA-------T-AT---AT----------GAAA-A-ACA---A--TAAG---T-AAA--------------TC-TAA-A---A-----CA--C-AA--A-C-------G-TG--CCCAATG---TTC-GG------TAAA--TTT--AA--C----AG-T----A-G-C-T-----A------TTT----AAT---G-G-TT---A----------T--AGGA-TT---TAC---------AGAAAAG-AT----GA-GT--TTT-T-AAA-A--GACG--TT------TAA--AA-CAT----TC--------AA--GATTTTT----GGC-GTT-T-CT-------GAG-
gi|2                          :        TAATAATAATAA--ATA-A--AAT-CA-C--TTTATATA--GCGGCCTT-AT-CTAAAAAAT-A-CTA-TA----AAGCGGC-T-TAGCA-AGC-A-TACT-AAAT--TTTACAATTTTTTTTTTATTACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA-----ACTGAGAAAC-G-AAAATA--CC-TATTA-CAACATC--T--TT-AAAACATG-AA-T--------C-AACA-TT-A--TG----TCAAT--AAT-A-GCAT------ACAA-AA-----A----GTA----C-AA-AATTC------AAGA---A-A-TTAAA--ACG-TTG---A-A-----AATAT----GCAT--GC-A------GGCAT--A---ACA-AC--GTCC-----T-AA---------AT---AA--------T-GAAA-A-ACA---A---AAG---T-AAA--------------TC-TAAGA---A-----CA--A-AA--A-C-------GCTG--CGCAAAG---TTT-GC------TAAA--TTT--AAAGC----AG-T----A-G-C-T-----A------TTT----AAT---GCG-TTT--A----------T--AGGG-AT---TAG---------CAGAAAG-AT----GA-GT--TTT-TTAAA-A--GATG--TT------T-A--AAACAT----TCG-------AA--GATTGTT----GGC-GTT-TTCT-------GAG-CTGG-CTT---AGGCCA--G-ATT-GT-TT--GGAGAAAAT-G-TTGGAT---G---C--AGGC-C--TTGTC------GAATCTGCGTTCACCGT-AT-------G-TCTTTAGCT--TCT---G-ACTGA------TGCG-T--ACCAGTT-AGTAGATTTCGCGGT----TTTCTGAAAA----CGCA-GG-GCGCTACTT-TG-----GTGC--GGGTT--GTAT-GCGAAT----AATGAGTTAGGTT---TACG-ATA---TC-----CT-TGGAGCAAGCTT----GCTCGGAG---AC-----TTTTAAAGGCACA-----TAATAGGACGGAA------TTTTGCTAACTGGATA-CGA-T----ATCA-ACGGGCAAGC
gi|7                          :        TAATAAAAT-AATAATA-A--AATACG-C--TT-ATATA--GCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TAAT-AAAA--ATTACAATT--------AATACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---A-AC---AAAAC-GCAAAATA--CA-A--AA-CA---CG--T--TT-AAAACATA-GA-TG-------C-AAAA-GT-A--TG----ACA-T--AAT-A-G---------AGAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--TC------AAGA--CA-A-TTTAA--A-G-TAT---A-A-----AATAT----G-AT--GC-A------GGCAT--A---A-A-AC--GTCC-----TAAA-------T-AT---AT----------GAAA-A-ACA---A--TAAG---T-ACA--------------TC-TAA-A---A-----TA--C-AA--A-C-------G-TG--CCCAATG---TTC-GG------TAAA--TTT--AA--C----AG-T----A-G-C-T-----A------TTT----AAT---G-G-TT---A----------T--AGGA-TT---TAC---------AGAAAAT-AT----GA-GT--TTT-T-AAA-A--GACG--TT------TAA--AA-CAT----TC--------AA--GATTTTT----GGC-
gi|16                         :       aTAATAAAAA-AATTATA-A--ATTACA-C--TT-ATATA--GTG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATT--------AATACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---T-AC---AAAAC-G-AAAATA--CC-T--TA-CA---CA--T--TT-AAAACATG-AA-TG-------C-AACA-
gi|20                         :        TAATGACAAGAATTACACACCAGTACA-T--TT-ACATA--GCG-CCTT-AT-CTAGAAA-T-A-CTT-TA----CAG-----TATG-CT-A---A-TACC-AAA
gi|12                         : agtaggaaAATAATAATAATAATA-A--AATACA-C--TT-ATATA--GCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATT--------AAAACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---T-AC---AAAAC-A-AAAATA--CC-T--TA-CA---CA--T--TT-AAAACATG-AA-TG-------C-AACA-TT-A--TG----TTA-T--AAT-A-G---------ATAA-AA-----AAAAAGTA----T--A-A--TC------TATATGCG-C-TTTA--------AT---A-A-----TCTAT------AT--GC---------GCTT--T---A-A--------------T-AA---------AT---GT--------G-GCAATA-ACA---A--AAAGCGTT-AAA--------------TC-T
gi|14                         :          ATAATAA-AAATATA-A--AA-ACA-AAATT-ATA-A--GCG-CCTT-AT-C--AAAA-T-AGCTC-------AAGCG-C-TGTA-CAGA-C-A-TTAT-AAAA--TTTATAATT--------AATATTT-----AAA-GAAAA-C-----ATAG-AA---T-AC---AAA-C-G-AAAATA--CC-G--TA-CA---CA--T--TA-ATAACATA-AA-TG-------C-AACA-TT-A--AT----TCA-T--AATAA-G---------ATAA-AA-----A----ATA----C-AA-A--TC------A--A--CC-A-TTT-A--A-G-TAT---A-A-----
gi|18                         :          ATAATAATAATAATA-A--AATACT-C--TT-ATATA--GCG-CCTT-AT-CTAGAAA-T-A--------------------GTA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATTTTAA----AATACTT-G---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---T-AC---ACAAC-
gi|13                         :           TAATGA-AATAATA-A--AATACA-C--TT-ATATAA-GCG-CCTT-ATTCTAAAGA-TTA-C-C-TA----AAGCG-C-TGT--CA-A-C-ATTACT-AAAA--TTTACAATT--------AATACTT-CCAAAAA-AAAAA-CGCCTCATAGAAA---T-AC---AAAA--G-AAAATA--CCTT--TA-CA---CAGTT--TT-AAAACATGAAA-TG-------A-AACA-TTAA--TG----TCA----AAT-A-G---------ATAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--TC------AGGA--CAGA-TTTTACCA-G-TAT---A-A-----AATAa
gi|10                         :             ATAATAATAATA-A--AATACA-C--TT-ATGTA--GCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATT--------AATAC-------AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---T-AC---AAAAC-G-AAAATA--CC-T--TA-CA---CA--T--TT-AAAACATG-AA-TG-------C-AACA-TT-A--TG----TCA-T--AAT-A-G---------ATAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--TC------AAGA--CA-A-TTTAA--A-G-TAT---A-A-----AATAT----G-AT--GC-A------GGCTT--A---A-GCAC--ATCA-----T-AA-------G-A----AT--------A-TAAT-C-ATA---A--TAA
gi|17                         :             atAA-GATAATA-A--AATACA-T--TT-ATATG--GCG-CATT-AT-CTAAATA-T-G-CTT-TA----AAGCG-C-TTTA-CA-G-T-A-TACT-AAA-----CACAA----------AA-ACAT-C---AAA-tataagaatatgaccataagaacaaa
gi|5                          : acgataaagttttgga-AATAATG-A--AATACAGC--TT-ATATATTGCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CCCTTA----AAGTGCC-TGTA-CA-A-CGA-TACTCAACA--TTTAC-ATT--------AATACGCACA--AAA-GAAAACC----CATAG-TG---T-AC---ACAAC-GAAAAATA--CC-T--TA-CA---CA--T--TT-AAAA-GCG-AA-TG-------CGAATACCT-AGTTG----TCA----GAT---G---------AGAATAA-----A----GTA----CTAACA--TC------AAGA--CA-G-TTTAA--A-GCTAT---ACA-----AATAC----G-AT--GT-A------ATCAT--A---A-ATAA--GTCC-----TAAA-------T-ATATGAT--------A-AAAA-A-ACA---A--TAAG---TAAAA--------------TCTTAA-AACCA-----CA--C-AA--ACC-------G-TGGCCCCAA-G---TTC-GG------TAAACGTTT--AA--TCGAAAGAT----A-G-CTT-----A------TCA----TAT---G-GTTT---A----------T--AGAATTT---TACCAAGAGGAAAAAAAAT-AT----GA-GTAATTT-T--AA-A--GACG--TT------TAA--AA-CAT----GC---------A--GA-TGGT----GGC-GTTCT-TT-------GAG-CTGGTTT----AGGC-AAGA-ATT-GT-TC-CACGG----C-GTT-TGAT---G---C--AG-C-C--TTG-C------GAAT-TGGGTTCACCGTAAG-------G-TC-TTAG-T--TCT---GAACTGA------TG-GTT--A-CAGTTAAGTAGA-TTTGCGG-----TTTCTGA-AA----CGCA--G-A-----CTCTTT-----GT-C--GAGTT--ttttacaaaga
gi|15                         :             tatt-AATAATA-A--AATACA----TT-ATATA--GCG-CCTTTAT-CTAACAA-T-A-CTC-TA----A-GCG-CCTGTA-CA---C-A-TACT-AAAACATTTATAATT--------AAAACTT-C---AAA--AAAA-C----CATAG-AA---TTAC---AAAAC-A-AAAATA--CC-TC-TA-CAG--CA--T--TTAAAAACATG-AATTG-------C-AA-A-TTCA--TG----TTA-TC-AAT-A-A---------ATAA-AA-----A----tc
gi|19                         :          aatcaat-AATAATA-A--AATACA-C--TT-ATATA--GTG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TAAATTAAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TAAT-AAAA--TTTACAATT--------AATACT
gi|21                         :               at-AATAATA-A--AATTCA-C--TT-ATATA--GCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTg
gi|22                         :                                                          ataatagaat-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TACT-AA------TACAAC----------ATAC
gi|9                          :                                                                                              A-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATT--------AATACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-A----T-AC---ACAAC-G-AAAAAT--CC-T--TA-CA---CA--T--GT-AAAA--TG-AAATG-------C-AACA-TT-A--TG----TCA-T--AAT-A-A---------GTAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--T-------AGGA--CA-A-TTTAA--A-G-TAT---A-A-----AAT-T----G-TT--GC-G------GACAT--A---A-A--C--GTCC-----T-AA---------AT---AT--------ATGAAA-A-ACA---A--TAAG---T-AAA--------------TC-TAA-A---A-----CA--C-AATGA-T-------G-T-----CAAAG---TTC-GG------TAAA--TTT--AA--C----AG-T----A-G-C-T-----A------TTT----AAT---G-G-TT---A----------T--AGGA-TT---TAC---------AGAAAAG-AT----GA-TT--TTT-T-AA------ACG--TT------T-A--AA-aa
gi|8                          :                                                                                                                      TACAATT--------AATACTT-A---AAA-GAAAA-C----CAAAG-AA---T-AT---ACAAC---AAAATAT-CC-C--NN-NN---NN--N--NN-NNNNNNNN-NN-NN-------N-NNNN-NN-N--NN----NNN-N--NNN-N-N---------ATAA-AA-----A----TTA----C-AA-A--TC------AAGA--CA-A-TTTAA--A-G-TTT---A-C-----AATAT----T-AT--AC-A------AACAT--A---A-A-AT--GTCC-----T-AAA------T-AT---AT--------G-GAAA-A-AAA---AA-CAAG---T-AAAACTACTCAAAGGAATC-TAA-A---A-----AT--C-AA--A-T-------G-TG--CACAAAT---TTC-AT------TAAA--TTT--AA--C----AG-TGTATA-G-C-T-----ACATGTATAT----AAA---G-G-TT---A----------T--AGGA-TT---GAC---------GGAAATG-GA----GA-GT--TTT-T-AAA-AG-GACG--TT------TAA--AA-CAA----TC--------AA--CATTTTT----GGC-GT
gi|11                         :                                                                                                                                         gTT-C---AAAAGAAAA-C----CATAA-GA---T-AC---ACAAC-G-AAAAAT--CC-T--TA-CA---CA--T--GT--AAACATG-AA-TG-------C-AACA-TT-A--TG----TCA-T--AAA-ATG---------ATAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--TC------AGGA--CA-ATTTTAA--A-G-TAT---A-A-----AATAT----GTAT--GC-AGTGGTTGACACTAA---A-A-AC--GTCC-----TAAA-------T-AT---AT----------GACA-A-ACA---A--TAAG---T-AAA--------------TC-TAA-A---A-----CA--CAAA--A-T-------G-TG--TCCAAAG---TTC-GG------T-AA--TTT--AA--C----AG-T----A-GTC-T-----A------TTT----AAT---G-G-TT---A----------T--A-GA-TT---TAC---------AGAAAAGTAT----GA-GT--TTT-T-a
gi|1                          :                                                                                                                                              ---AAA-GAAAA-C----TA-AG-AAGATT-AC---AAAACCG-AAGATATACCAT--TAACA---GA--TAATA-GAAACATG-AA-AGAGACACAT-AACA-TT-A--TGGTAGTCA-GGAAAT-A-A---------CTAA-AACTCATA----ACATGAGC-AA-A--TG------ATCA--CA-A-TTTAA--A-G-TATG--A-A-----AATGTCACTG-ATT-GCTAT-----GGC-T--A---G-A-ATAAGCGC-----G-AAGAGGGAAT-AT---GT----------GAAG-A-ACACGAA--TAAAGTAT-AAC--------------TC-TTA-T---A-----CAAGC-AA--A-CAACACCGG-TGA-CCCAACACGTTTCTGGATGACATAAA--TTCTCAA--C----AG-T------G-C-T-----GGAG---TGT----AAT---G-G-TT---AGATAATCCGTTCAAGTA-TT---TAC---------AGACCAG-ATTGGTGATGT--TCT-C-AAA-AAAGACG--TTCTTCAGT-ACGAA-CGCACTGTC--------AATAGATTTTT----GACTGTG-T-CTCGGATGAGAG-CTTG-GT-----GGC-A--G-ATTTGT-TCTCAGAG----T-G-T-GGATTTGG---CTCAG-CACGATTGTC------GA-TATGCGT-CACCG--AG-------GCTC-TTAG-TCTTCT---G-ACTGA------TG-G-T--A-CAGTT-A
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                        -A--TG----TCA-T--AAC-A-GGCTTCGAGTATAA-AT-----A----GTAG---C-AA-A--TCTCTCTCAATAT-CA-G-TTTAAGCA-G-TTTCCAA-AGTCTGAACAT----G-ATATGC-A------G-CAT--ACTTA-A-GC--GTCCCCTTCT-AA-------TCATTGGATGAACTCTAA-GAAA-ATCCA---AATTAAT---T-ACAC-------------TC-TAA-A---AATACACA--C-AA--A-C-------G-TG--CCCAAAG---TTC-G-------TAAA--TTT--TA--C----CC-T----AAG-C-TCACTCA------TTTTTTTCATCGCG-A-TTGGAA----------T--AAGA-CTCTCTACCAG------AGAAAAG-AT----G--GT--TTTAC-AGACA--GACGATTT------T-A--AAACAC----TCTCCTGAAAAA--GATTCTTTTTCAGT-GTT-T-CT-------GAGGCTCG-CCGTGGAGCC-A--ATATT-CTCTCTCAGTG----TAG-T-GGAT---GAAGC--AG-C-TCGTTGTCTCGTGTAAGTCTGCGTTCATCGT-CGTAACACTA-TG-TT-G-T--TCTCCTG-ACTGAATGCTGTG-G-CTCA-CAGTTCAGTTG--ATTTCAGCGGTGTTTCTG--AAGGCACGCACGGTG-----CTC-TTTGTTAAT-CTTGTGTTTGGTATCG-GAATAATGA-TGTATACTG-TAAATA-GTATAGTCTC-----CACTGGAGCAAGGCT----A--TGGAGGAAACGTA--TCTTGAA--GACGACCATT-ATAGAA--GAAGACCCTTTTTGT--ACagctacatcggtgtccttgacagagtcttcaaacacgcaggggatccattgaatctggcgtatgattgggaattggaatcagcactccaaatttctgacctaatctgatatagatttcttcaactggagcagttttggggtggtaacaactattttaaacacatatagaaagattggctactgatatcgattatacatcatacggaag
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ---TA-G-ATT---TCTTCAAC--TGGAGCA-GTTTTGGGG--TGGTA---ACAACTATTTTAAA--CACA-----T-ATAGAA--AGA------TTGGCT--ACT-GATATCGATTATACATCATAC-GG-AAG

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         11111111                                                                                                                                         111111111                                                                                 111111        111111                                44444444444444444444444444                     111   22222222222222               11111             1111111                      111111                      1111      111111111111                       11111111111111                 222222222                                11        111111         1111  22222222           1111            2222222        22222222     1111         1     1111        1111111111   2222     222222                    222222222         11   111       222222    1111       1     11  111    33      222222     3333333333   1  22222  1 11     11    333        11111      222   1 1   1  44444 1             111    777777777777       11   22222222      11   222222      11        2   444444    2          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          7        777777      2 33  2     55   2    2  2       2 2 2   2  5555     5 2    2  2 2 2 2    2    33         33333333       66666   2     2 5555     2  444 2  444     2 5      66  7777  2  5  33 77  2        2  5  8888888 2    2  5 33  5555   8888   2 2 555555555    2  66666 5555   8888 2  2 33  888888    66  2 2     77 2 2   777 2 77777     000000  77  3 222222 0   44 555 3 88888    88888 6  11111111111111111111111111 3   3 3   555 44    222 3 11111111111111  3  3   4 777 00000  55 4  55 4 3333333 4 4 4     666    55  111111    55   55  55 8888  2222  4 4 666666666666 777   8888   777 4 4  99999999999999 55    4  777  4 333333333       4  8888  4  55   4 4   4 00    66  222222  4      0000  33333333  66       0000   5   6 6  1111111   6  1 66666666   8 5555   8  8  5     3333 8 8    9999999999   9999   0 333333  3 5     0     88  777777777  8  0 8 11   444 8     333333  8 3333 8     6     33  555    33      111111     1111111111   0  55555  0 33 1   33    666        77777  333 555   0 0   0  66666 0         1   888    000000000000       33   88888888      33   888888      33    6   3   222222    3  6       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .        ......      . ..  .     ..   .    .  .       . . .   .  ....     . .    .  . . . .    .    ..         ........       .....   .     . ....     .  ... .  ...     . .      ..  ....  .  .  .. ..  .        .  .  ....... .    .  . ..  ....   ....   . . .........    .  ..... ....   .... .  . ..  ......    ..  . .     .. . .   ... . .....     ......  ..  . ...... .   .. ... . .....    ..... .  .......................... .   . .   ... ..    ... . ..............  .  .   . ... .....  .. .  .. . ....... . . .     ...    ..  ......    ..   ..  .. ....  ....  . . ............ ...   ....   ... . .  .............. ..    .  ...  . .........       .  ....  .  ..   . .   . ..    ..  ......  .      ....  ........  ..       ....   .   . .  .......   .  . ........   . ....   .  .  .     .... . .    ..........   ....   . ......  . .     .     ..  .........  .  . . ..   ... .     ......  . .... .     .     ..  ...    ..      ......     ..........   .  .....  . .. .   ..    ...        .....  ... ...   . .   .  ..... .         .   ...    ............       ..   ........      ..   ......      ..    .   .   ......    .  .       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          5        222222      5 44  5     99   5    5  5       4 4 4   5  3333     0 5    4  4 4 4 4    4    44         55555555       88888   4     5 3333     5  444 5  444     5 3      33  0000  7  3  77 33  7        7  3  7777777 7    7  3 77  7777   8888   7 7 333333333    7  77777 7777   9999 9  9 99  222222    88  9 9     99 9 9   999 9 11111     000000  99  3 999999 2   66 888 3 55555    33333 7  22222222222222222222222222 3   3 3   888 66    777 6 44444444444444  6  6   0 000 00000  55 0  55 0 0000000 0 0 0     888    55  555555    55   55  55 5555  5555  0 0 555555555555 000   5555   000 0 0  55555555555555 55    0  000  0 000000000       0  5555  0  55   0 0   4 66    11  888888  4      6666  11111111  99       6666   0   7 7  7777777   7  0 00000000   0 4444   0  0  4     0000 0 0    0000000000   0000   8 000000  8 0     8     88  222222222  0  8 0 00   000 0     000000  0 0000 0     0     22  888    00      888888     5555555555   0  00000  0 88 0   88    777        77777  000 777   0 0   0  22222 0         0   000    000000000000       88   00000000      88   888888      88    7   7   777777    7  7       
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAATAATAA-AATAATAA------AATACA-C--TT-ATATA--GCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATT--------AATACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---T-AC---AAAAC-G-AAAATA--CC-T--TA-CA-CA--T--TT-AAAACATG-AA-TG-------C-AACA-TT-A--TG----TCA-T--AAT-A-G---------ATAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--TC------AAGA--CA-A-TTTAA--A-G-TAT---A-A-----AATAT----G-AT--GC-A------GGCAT--A---A-A-AC--GTCC-----T-AA-------T-AT---AT--------A-G-AAA-A-ACA---A--TAAG---T-A--------------AA-TC-TAA-A---A-----CA--C-AA--A-C-------G-T-G-CCCAA-A-GTTC--GG------TAAA--TTT--AA--C----AG----TA-G-C------T-----A---TTT----AAT---G-G-TT---A----------T--AGGA-TT---TA-C---------AGAAAAG-AT----GA-GT--TTT-T-AAA-A--GACG--TT------TA-AAACAT----TC--------AA--GATTTTT----GGC-GTT-T-CT-------GAG-CTGG-CT----AGGC-A--G-ATT-GT-TCTCAGAG--T-G-T-GGAT---G---C--AGC-CG-TTGTC------GAATCTGCGTTCACCGT-AG-------G-TC-TTAG-T--TCT---G-ACTGA------TG-G-T--A-CAGTT-AGTAGA-TTT--GCGGT-TTTCTG-AA---ACGCA-GG-G-----CTC-TT-----GT-C--GGGTT--GTAT-G-GAATAATGAATG-GTTCCGT--TTA-G-ATA-TCTCCA-C-TGGAGCAAGCTTG--CGGAGG-A---AC-G--TTTTAAA--CACA-----T-ATAGGA--GAA------TTTTGT--ACTGGATA-CGATTA---ATCA-ACGGGCAAGC
Reference ( family-83 )       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAATAATAA-AATAATAA------AATACA-C--TT-ATATA--GCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATT--------AATACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---T-AC---AAAAC-G-AAAATA--CC-T--TA-CA-CA--T--TT-AAAACATG-AA-TG-------C-AACA-TT-A--TG----TCA-T--AAT-A-G---------ATAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--TC------AAGA--CA-A-TTTAA--A-G-TAT---A-A-----AATAT----G-AT--GC-A------GGCAT--A---A-A-AC--GTCC-----T-AA-------T-AT---AT--------A-G-AAA-A-ACA---A--TAAG---T-A--------------AA-TC-TAA-A---A-----CA--C-AA--A-C-------G-T-G-CCCAA-A-GTTC--GG------TAAA--TTT--AA--C----AG----TA-G-C------T-----A---TTT----AAT---G-G-TT---A----------T--AGGA-TT---TA-C---------AGAAAAG-AT----GA-GT--TTT-T-AAA-A--GACG--TT------TA-AAACAT----TC--------AA--GATTTTT----GGC-GTT-T-CT-------GAG-CTNG-CT----AGGC-A--G-ATT-GT-TCTCAGAG--T-G-T-GGAT---G---C--AGC-CG-TTGTC------GAATCTGCGTTCACCGT-AG-------G-TC-TTAG-T--TCT---G-ACTGA------TG-G-T--A-CAGTT-AGTAGA-TTC--GCGGC-TTTCTG-AA---ACGCA-GG-G-----CTC-TT-----GT-C--GNGTT--GTATCGCGAATAATGAATGNGTNNNGT--TTA-G-ATA-TC-----C-TGGAGCAAGNTTG--CGGAG------AC-G--TTTTAAA--CACG-----T-ATAGAA--GAA------TTTTGT--ACTGGATATCGATTATACATCATACGGGCAAGC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---AAA-GAAAA-C----TA-AG-AAGATT-AC---AAAACCG-AAGATATACCAT--TAACA-GA--TAATA-GAAACATG-AA-AGAGACACAT-AACA-TT-A--TGGTAGTCA-GGAAAT-A-A---------CTAA-AACTCATA----ACATGAGC-AA-A--TG------ATCA--CA-A-TTTAA--A-G-TATG--A-A-----AATGTCACTG-ATT-GCTAT-----GGC-T--A---G-A-ATAAGCGC-----G-AAGAGGGAAT-AT---GT----------G-AAG-A-ACACGAA--TAAAGTAT-A--------------AC-TC-TTA-T---A-----CAAGC-AA--A-CAACACCGG-T-GACCCAACACGTTTCTGGATGACATAAA--TTCTCAA--C----AG----T--G-C------T-----GGAGTGT----AAT---G-G-TT---AGATAATCCGTTCAAGTA-TT---TA-C---------AGACCAG-ATTGGTGATGT--TCT-C-AAA-AAAGACG--TTCTTCAGTACGAACGCACTGTC--------AATAGATTTTT----GACTGTG-T-CTCGGATGAGAG-CTTG-GT-----GGC-A--G-ATTTGT-TCTCAGAG--T-G-T-GGATTTGG---CTCAGCACGATTGTC------GA-TATGCGT-CACCG--AG-------GCTC-TTAG-TCTTCT---G-ACTGA------TG-G-T--A-CAGTT-A
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TA-G-ATT-TCTTCAAC-TGGAGCAGTTTTG--GGGTGGTAACAACTA--TTTTAAA--CACA-----T-ATAGAA--AGA------TTGGCT--ACTG-ATATCGATTATACATCATACGagctacatcggtgtccttgacagagtcttcaaacacgcaggggatccattgaatctggcgtatgattgggaattggaatcagcactccaaatttctgacctaatctgatatagatttcttcaactggagcagttttggggtggtaacaactattttaaacacatatagaaagattggctactgatatcgattatacatcatacggaag
gi|10                         : aaagaaaactaagaagattacaaaaccgaagatataccattaacagataatagaaacatgaaagagacacataacattatggtagtcaggaaataactaaaactcataacatgagcaaatgatcacaatttaaagtatgaaaatgtcactgattgctatggctagaataagcgcgaagagggaatatgtgaagaacacgaataaagtataactcttatacaagcaaacaacaccggtgacccaacacgtttctggatgacataaattctcaacagtgctggagtgtaatggttagataatccgttcaagtatttacagaccagattggtgatgttctcaaaaaagacgttcttcagtacgaacgcactgtcaatagatttttgactgtgtctcggatgagagcttggtggcagatttgttctcagagtgtggatttggctcagcacgattgtcgatatgcgtcaccgaggctcttagtcttctgactgatggtacagttaagctacatcggtgtccttgacagagtcttcaaacacgcaggggatccattgaatctggcgtatgattgggaattggaatcagcactccaaatttctgacctaatctgataATAATAA---TAATAA------AATACA-C--TT-ATGTA--GCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATT--------AATAC-------AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---T-AC---AAAAC-G-AAAATA--CC-T--TA-CA-CA--T--TT-AAAACATG-AA-TG-------C-AACA-TT-A--TG----TCA-T--AAT-A-G---------ATAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--TC------AAGA--CA-A-TTTAA--A-G-TAT---A-A-----AATAT----G-AT--GC-A------GGCTT--A---A-GCAC--ATCA-----T-AA-------G-A----AT--------A-T-AAT-C-ATA---A--TAAaag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atTT-C---AAAAGAAAA-C----CATAA-GA---T-AC---ACAAC-G-AAAAAT--CC-T--TA-CA-CA--T--GT--AAACATG-AA-TG-------C-AACA-TT-A--TG----TCA-T--AAA-ATG---------ATAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--TC------AGGA--CA-ATTTTAA--A-G-TAT---A-A-----AATAT----GTAT--GC-AGTGGTTGACACTAA---A-A-AC--GTCC-----T-AA---------AT---AT--------ATG-ACA-A-ACA---A--TAAG---T-A--------------AA-TC-TAA-A---A-----CA--CAAA--A-T-------G-T-G-TCCAA-A-GTTC--GG------T-AA--TTT--AA--C----AG----TA-GTC------T-----A---TTT----AAT---G-G-TT---A----------T--A-GA-TT---TA-C---------AGAAAAGTAT----GA-GT--TTT-T-tataagaatatgaccataagaacaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AATAATAATAATAATAA------AATACA-C--TT-ATATA--GCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATT--------AAAACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---T-AC---AAAAC-A-AAAATA--CC-T--TA-CA-CA--T--TT-AAAACATG-AA-TG-------C-AACA-TT-A--TG----TTA-T--AAT-A-G---------ATAA-AA-----AAAAAGTA----T--A-A--TC------TATATGCG-C-TTTA--------AT---A-A-----TCTAT------AT--GC---------GCTT--T---A-A--------------T-AA---------AT---GT--------G-G-CAATA-ACA---A--AAAGCGTT-A--------------AA-TC-T
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAATGA-AATAATAA------AATACA-C--TT-ATATAA-GCG-CCTT-ATTCTAAAGA-TTA-C-C-TA----AAGCG-C-TGT--CA-A-C-ATTACT-AAAA--TTTACAATT--------AATACTT-CCAAAAA-AAAAA-CGCCTCATAGAAA---T-AC---AAAA--G-AAAATA--CCTT--TA-CA-CAGTT--TT-AAAACATGAAA-TG-------A-AACA-TTAA--TG----TCA----AAT-A-G---------ATAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--TC------AGGA--CAGA-TTTTACCA-G-TAT---A-A-----AATA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATAATAA-AAATATAA------AA-ACA-AAATT-ATA-A--GCG-CCTT-AT-C--AAAA-T-AGCTC-------AAGCG-C-TGTA-CAGA-C-A-TTAT-AAAA--TTTATAATT--------AATATTT-----AAA-GAAAA-C-----ATAG-AA---T-AC---AAA-C-G-AAAATA--CC-G--TA-CA-CA--T--TA-ATAACATA-AA-TG-------C-AACA-TT-A--AT----TCA-T--AATAA-G---------ATAA-AA-----A----ATA----C-AA-A--TC------A--A--CC-A-TTT-A--A-G-TAT---A-A-----
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -AATAATAA------AATACA----TT-ATATA--GCG-CCTTTAT-CTAACAA-T-A-CTC-TA----A-GCG-CCTGTA-CA---C-A-TACT-AAAACATTTATAATT--------AAAACTT-C---AAA--AAAA-C----CATAG-AA---TTAC---AAAAC-A-AAAATA--CC-TC-TA-CAGCA--T--TTAAAAACATG-AATTG-------C-AA-A-TTCA--TG----TTA-TC-AAT-A-A---------ATAA-AA-----A----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aatcaatTAATAAAAA-AATTATAA------ATTACA-C--TT-ATATA--GTG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATT--------AATACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---T-AC---AAAAC-G-AAAATA--CC-T--TA-CA-CA--T--TT-AAAACATG-AA-TG-------C-AACA-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AA-GATAATAA------AATACA-T--TT-ATATG--GCG-CATT-AT-CTAAATA-T-G-CTT-TA----AAGCG-C-TTTA-CA-G-T-A-TACT-AAA-----CACAA----------AA-ACAT-C---AAA-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acgataaagttttggaATAATAATAATAATAA------AATACT-C--TT-ATATA--GCG-CCTT-AT-CTAGAAA-T-A--------------------GTA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATTTTAA----AATACTT-G---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---T-AC---ACAAC-ttttacaaaga
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -AATAATAA------AATACA-C--TT-ATATA--GTG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TAAATTAAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TAAT-AAAA--TTTACAATT--------AATACTa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atTAATAATAA-TA-AATAA------AAT-CA-C--TTTATATA--GCGGCCTT-AT-CTAAAAAAT-A-CTA-TA----AAGCGGC-T-TAGCA-AGC-A-TACT-AAAT--TTTACAATTTTTTTTTTATTACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA-----ACTGAGAAAC-G-AAAATA--CC-TATTA-CAACA--TCTTT-AAAACATG-AA-T--------C-AACA-TT-A--TG----TCAAT--AAT-A-GCAT------ACAA-AA-----A----GTA----C-AA-AATTC------AAGA---A-A-TTAAA--ACG-TTG---A-A-----AATAT----GCAT--GC-A------GGCAT--A---ACA-AC--GTCC-----T-AA---------AT---AA--------T-G-AAA-A-ACA---A---AAG---T-A--------------AA-TC-TAAGA---A-----CA--A-AA--A-C-------GCT-G-CGCAA-A-GTTT--GC------TAAA--TTT--AAAGC----AG----TA-G-C------T-----A---TTT----AAT---GCG-TTT--A----------T--AGGG-AT---TAGC---------AGAAA-G-AT----GA-GT--TTT-TTAAA-A--GATG--TT------TA-AAACAT----TCG-------AA--GATTGTT----GGC-GTT-TTCT-------GAG-CTGG-CTT---AGGCCA--G-ATT-GT-TTGGAGAAAAT-G-TTGGAT---G---C--AGG-CC-TTGTC------GAATCTGCGTTCACCGT-AT-------G-TCTTTAGCT--TCT---G-ACTGA------TGCG-T--ACCAGTT-AGTAGATTTC--GCGGT-TTTCTGAAA---ACGCA-GG-GCGCTACTT-TG-----GTGC--GGGTT--GTAT-GCGAATAATGA----GTTAGGT--TTACG-ATA-TC-----CTTGGAGCAAGCTTGCTCGGAG------AC----TTTTAAAGGCACA-----TAATAGGACGGAA------TTTTGCTAACTGGATA-CGAT-----ATCA-ACGGGCAAGCg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AATAATGACAAGAATTACACACCAGTACA-T--TT-ACATA--GCG-CCTT-AT-CTAGAAA-T-A-CTT-TA----CAG-----TATG-CT-A---A-TACC-AAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agtaggTAATAGAAT-AATAATAA------AATTCA-C--TT-ATATA--GCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               a-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TACT-AA------TACAAC----------ATAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAATGATAA-AATGATAA------AATACA-C--TT-ATATA--GCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATT--------AATACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---T-AC---AAAAC-G-AAAATA--CC-T--TA-CA-TA--T--TT-AAAACATG-AA-TG-------C-AACA-TT-A--TG----TCA-T--AAT-A-G---------ATAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--TC------AAGA--CA-A-TTTAA--A-G-TAT---A-A-----AATAT----G-AT--GC-A------GGCAT--A---A-A-AC--GTCC-----T-AA-------T-AT---AT--------A-G-AAA-A-ACA---A--TAAG---T-A--------------AA-TC-TAA-A---A-----CA--C-AA--A-C-------G-T-G-CCCAA-T-GTTC--GG------TAAA--TTT--AA--C----AG----TA-G-C------T-----A---TTT----AAT---G-G-TT---A----------T--AGGA-TT---TA-C---------AAAAAAG-AT----GA-GT--TTT-T-AAA-A--GACG--TT------T--AAACAT----TC--------AA--GATTTTT----GGC-GTT-T-CT-------GAG-CTGG-CT----AGGC-A--G-ATT-GT-TC-CAGAG--T-G-T-GGAT---G---C--AGC-C--TTGTC------GAATCTGCGTTCACCGT-AG-------G-TC-TTAG-T--TCT---G-ACTGA------TG-G-T--A-CAGTT-AGTAG--TTT--GCAG--TTTCTG--A---ACGCA-GG-G-----CTC-TT-----GT-C--GGGTT--GTAT-G-GAATACTGAATGAGTTCCG---TTA-G-ATA-TC-----C-TGGAGCAAGCTTG--TGGAG------AC----TTTTAAA--CACA-----T-ATAGGA--GAA------TTTTGT--ACTGGATA-CGA-TA---ATCA-AC-GGCAAGCaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -A--TG----TCA-T--AAC-A-GGCTTCGAGTATAA-AT-----A----GTAG---C-AA-A--TCTCTCTCAATAT-CA-G-TTTAAGCA-G-TTTCCAA-AGTCTGAACAT----G-ATATGC-A------G-CAT--ACTTA-A-GC--GTCCCCTTCT-AA-------TCATTGGATGAACTCTAA-G-AAA-ATCCA---AATTAAT---T-A--------------CACTC-TAA-A---AATACACA--C-AA--A-C-------G-T-G-CCCAA-A-GTTC--G-------TAAA--TTT--TA--C----CC----TAAG-C------TCACTCA---TTTTTTTCATCGCG-A-TTGGAA----------T--AAGA-CTCTCTA-CCAG------AGAAAAG-AT----G--GT--TTTAC-AGACA--GACGATTT------TA-AAACAC----TCTCCTGAAAAA--GATTCTTTTTCAGT-GTT-T-CT-------GAGGCTCG-CCGTGGAGCC-A--ATATT-CTCTCTCAGTG--TAG-T-GGAT---GAAGC--AGCTCG-TTGTCTCGTGTAAGTCTGCGTTCATCGT-CGTAACACTA-TG-TT-G-T--TCTCCTG-ACTGAATGCTGTG-G-CTCA-CAGTTCAGTTGA-TTTCAGCGGTGTTTCTG-AAGGCACGCACGGTG-----CTC-TTTGTTAAT-CTTGTGTTTGGTATCG-GAATAATG-ATGTATACTGTAAATA-GTATAGTCTCCA-C-TGGAGCAAGGCTA--TGGAGGAA---AC-GTATCTTGAA--GACGACCATT-ATAGAA--GAAGACCCTTTTTGT--AC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -AATAATGA------AATACAGC--TT-ATATATTGCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CCCTTA----AAGTGCC-TGTA-CA-A-CGA-TACTCAACA--TTTAC-ATT--------AATACGCACA--AAA-GAAAACC----CATAG-TG---T-AC---ACAAC-GAAAAATA--CC-T--TA-CA-CA--T--TT-AAAA-GCG-AA-TG-------CGAATACCT-AGTTG----TCA----GAT---G---------AGAATAA-----A----GTA----CTAACA--TC------AAGA--CA-G-TTTAA--A-GCTAT---ACA-----AATAC----G-AT--GT-A------ATCAT--A---A-ATAA--GTCC-----TAAA-------T-ATATGAT--------A-A-AAA-A-ACA---A--TAAG---TAA--------------AA-TCTTAA-AACCA-----CA--C-AA--ACC-------G-TGG-CCCCA-A-GTTC--GG------TAAACGTTT--AA--TCGAAAGA---TA-G-CT-----T-----A---TCA----TAT---G-GTTT---A----------T--AGAATTT---TA-CCAAGAGGAAAAAAAAT-AT----GA-GTAATTT-T--AA-A--GACG--TT------TA-AAACAT----GC---------A--GA-TGGT----GGC-GTTCT-TT-------GAG-CTGGTTT----AGGC-AAGA-ATT-GT-TC-CACGG--C-GTT-TGAT---G---C--AGC-C--TTG-C------GAAT-TGGGTTCACCGTAAG-------G-TC-TTAG-T--TCT---GAACTGA------TG-GTT--A-CAGTTAAGTAGA-TTT--GCGG--TTTCTG-AA---ACGCA--G-A-----CTCTTT-----GT-C--GAGTT--
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tattTAATAAATA-AATAATAA------AATACA-C--TT-ATATA--GCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATT--------AATACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---T-AC---AAAAC-G-AAAATA--CC-T--TA-CA-CA--T--TT-AAAACATG-AA-TG-------C-AACA-TT-A--TG----TCA-T--AAT-A-G---------ATAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--TC------AAGA--CA-A-TTTAA--A-G-TAT---A-A-----AATAT----G-AT--GC-A------GGCAT--A---A-A-AC--GTCC-----T-AA---------AT---AT--------ATG-AAA-A-ACA---A--TAAG---T-A--------------AA-TC-TAA-A---A-----CA--C-AA--A-C-------G-T-G-CCCAA-T-GTTC--GG------TAAA--TTT--AA--C----AG----TA-G-C------T-----A---TTT----AAT---G-G-TT---A----------T--AGGA-TT---TA-C---------AGAAAAG-AT----GA-GT--TTT-T-AAA-A--GACG--TT------TA-AAACAT----TC--------AA--GATTTTT----GGC-GTT-T-CT-------GAG-tc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAATAAAAT-AATAATAA------AATACG-C--TT-ATATA--GCG-CCTT-AT-CTAAAAA-T-A-CTC-TA----AAGCG-C-TGTA-CA-A-C-A-TAAT-AAAA--ATTACAATT--------AATACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-AA---A-AC---AAAAC-GCAAAATA--CA-A--AA-CA-CG--T--TT-AAAACATA-GA-TG-------C-AAAA-GT-A--TG----ACA-T--AAT-A-G---------AGAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--TC------AAGA--CA-A-TTTAA--A-G-TAT---A-A-----AATAT----G-AT--GC-A------GGCAT--A---A-A-AC--GTCC-----T-AA---------AT---AT--------ATG-AAA-A-ACA---A--TAAG---T-A--------------CA-TC-TAA-A---A-----TA--C-AA--A-C-------G-T-G-CCCAA-T-GTTC--GG------TAAA--TTT--AA--C----AG----TA-G-C------T-----A---TTT----AAT---G-G-TT---A----------T--AGGA-TT---TA-C---------AGAAAAT-AT----GA-GT--TTT-T-AAA-A--GACG--TT------TA-AAACAT----TC--------AA--GATTTTT----GGC-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aTACAATT--------AATACTT-A---AAA-GAAAA-C----CAAAG-AA---T-AT---ACAAC---AAAATAT-CC-C--NN-NN-NN--N--NN-NNNNNNNN-NN-NN-------N-NNNN-NN-N--NN----NNN-N--NNN-N-N---------ATAA-AA-----A----TTA----C-AA-A--TC------AAGA--CA-A-TTTAA--A-G-TTT---A-C-----AATAT----T-AT--AC-A------AACAT--A---A-A-AT--GTCC-----TAAA-------T-AT---AT--------G-GAAAA-A-AAA---A--CAAG---T-AAAACTACTCAAAGGAA-TC-TAA-A---A-----AT--C-AA--A-T-------G-T-G-CACAA-A-TTTC--AT------TAAA--TTT--AA--C----AGTGTATA-G-CTACATGT-----A---TAT----AAA---G-G-TT---A----------T--AGGA-TT---GA-C---------GGAAATG-GA----GA-GT--TTT-T-AAA-AG-GACG--TT------TA-AAACAA----TC--------AA--CATTTTT----GGC-GT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gA-CA-A-C-A-TACT-AAAA--TTTACAATT--------AATACTT-C---AAA-GAAAA-C----CATAG-A----T-AC---ACAAC-G-AAAAAT--CC-T--TA-CA-CA--T--GT-AAAA--TG-AAATG-------C-AACA-TT-A--TG----TCA-T--AAT-A-A---------GTAA-AA-----A----GTA----C-AA-A--T-------AGGA--CA-A-TTTAA--A-G-TAT---A-A-----AAT-T----G-TT--GC-G------GACAT--A---A-A--C--GTCC-----T-AAA------T-AT---AT----------G-AAA-A-ACA---A--TAAG---T-A--------------AA-TC-TAA-A---A-----CA--C-AATGA-T-------G-T-----CAA-A-GTTC--GG------TAAA--TTT--AA--C----AG----TA-G-C------T-----A---TTT----AAT---G-G-TT---A----------T--AGGA-TT---TA-C---------AGAAAAG-AT----GA-TT--TTT-T-AA------ACG--TT------TA-AAa