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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         catgtaatatatgaactGC-C-AAG-T-A-TA---G-A--C-CG---T--A-ATT-A-AG--A-AC--TT--CA-A--T--------ATG---GCG---G-AT---AAA--A----AG------------TACA-----------------A--TG---------T-T-GCC----A------A-----G----A-CT-----AG---TG-TT-C-TAGT-G---C-C---GT------ATA---T-----T-----T-ATC-----T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T------------A-TA--------T--AA---------AT-T-C--T--------G--C-ATG-GCA-A--AGTAAGT--C-A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----G---AA-AAG--AAA-GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--AG-C--A---T-AGA-TC---AG-AA-A--A-AT----TGT--C-TTA------AGGGG---A------A-G--TAA-T-T-CC-A-T-AAA-A-TA--C-A--A-----TGG-A--A-T-CG-C--T-TTC-CT--C-CT-AC--GACT---AAT----A-TAC-CGCTAGA-TG-----C---CAC-GTG-ACG-CAA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TTGGT-C-CACTT--TT--T-G--------CT-A-----CAA--C--G-T-A-C-ATTTG-C-C---AG--TAATAGT-----A-T--C-ATTTCTC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT--TGCA-C-GCTC-CAAA--------A--TA-C-A--GAA-GCGGCTTGGGT-CCTTT--A-C--TAGAGGGGTTAC-A---------G----------A------AC--------A-----------TT-----T--AA-G-TCA-TA--ATTCGTTC---T-TTCCC--A--TT--TTGATTG-GT-CTG-A-TATTG-G-A-TA-TTGGG-AAT-C-A---C-G--AATC-TTGG---attgtgaatcc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ccggccttcgaagtaacaaagcaataccgtttttaaattacttaatttcattcgagctctgatatgtatgcggtctcttaaattctatcattcacaatgatagctct-T-A-TAAT-G-A--C-CGA-AT--A---------------------------T--------ATA---A-A---A-GT---GAA--A----AA----GT-T-G-TTATT-T----A-T-T--T---A--TAG-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACG-GTG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG---T-----T-----T-ATC---C-T--A----------------GAT-TTTATATAAATGTGTA-A-----------A-------------T------------A-TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-ATG-A-C-G--A--AAAT-AC-A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----CC--AA-A-G--AAA-AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---G-A-A-TC---A--GA-A--A-AT----T-T--C-TTA------AGGGG---A------A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-CG-C--T-TTC-CT--C-AC-AA--TACTAA---T----G-TAC-C-C---A-TA-----T--GCAC-GTG-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----GCC-T------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TT-ATTTTACAA--C--T-G-A-C-ACTTT-C-C---AG--T-ATA-C-----A-T--C-ATT--TC-----CCC--T-----C-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT--T-CA-C-GC-G-CAAA--------A--T--C-A--CAA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T------------------------------------A------A---------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TC--G-AAT-C-ATTTC-G--AATatt
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  attgacataatattgtgttttgcagtttcacctccgccacttccaagtaacctatatttttaatattgcaatgatgaaagacgtcgtgattgtatc-T-A-TACT-G-A--C-CGA-ATT-A-AAT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------TTA---A-A---C-AT---AAA--A----AAAAA-GT-T-G-T---A-CTTTGA-T-T--T---A--TCA-T-C--A-G-T-ATA----A------A-----T----AACT-----ACG-GTG--C-C-TA-T-GG--C-T---TT--C-A-AT----T-----T-----T-ATC---C-TT-A----------------AAT-TTTATATTAAATGTGT-A-----------A-------------T------------A-TA--------TCAAA---------AT-T-C--T---G----T--C-ATT-G-C-ACCA--AAATCACCA-----------G-AAA-T--A-------TCT--C-ATTC---------AA-A-G--AAA-AA-GTG-TATT-TA-----T-TC-T-T--A--C--G-----A-A-TC---A--GA-A--A-A-------T--C-TTA------A---G---A------ATG--TAA-T-TCCC-ATTAATA-A-TA--C-A--AACC--CGG-A--A-T-CG-C--T-TTTCCT--C-AC-AATTTACT---AAT----C-TA--C-C---A-TA-----TG-GCAC-GTGAA-A-CCA--------CAG-AA--A---TT-----TCC-T------TTTAT-C-CAC-T--TT--T-T--------CT-A-----CAAT-C--ACC-A-C--CTTT-C-C---AGATT-ATA-T-----A-T--C-ATTA-TT-----CCCC-T-----A-C---AA-ACGATAT--A-------G-T---A-TC-TT--T-CG-C-GC-CGCAAA--------AGTT--C-A--CAAGGC-GCTTGGGCAT---T--A-A--C----------T-A---------C----------A------AG--------TAA---------TT-----T--AA-G-T-A-AA--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TAGATTGTG--CTA-A-T-TTG-GCA-TA-TT--G-AAT-T-C---T-GATAATC-TTGG---
gi|42                         : actaccataaaccctaagtacaggattatatcgacatacggcagatgctgagaagacgctcacattcccttgtaatttttctaattcctctgtcccaaatcaaaacgatctgattcttaaactcaagttatccgttatcgtctatgcagttgagcaatacctctagacgtcacctgagaccaacttgcatttgccacttatattctaaatttatgtgacaagatggcccaattttattgactccatggactgtgattgtccagactttcaagagtggaaagacttaactttatactgtaggactggaccagtttttagtcacatgaaaacggggggcgggggtcaatttcattgcaatttgtccattgactaaaaactcgttgacatttattcactgcatggcagcccacccaagaatttgtaactattgatatatcaatagataacttttttctttttgtttaaaagtaattatatctaactaactacttaactaaggttcgtaactagtgcttctgtttgataaacgacttgtcgtaccggacctaatattgacataaaatatattttgcatttaccgccgcctcttccaagtaccttataatttaagttgaaatgaactttgacgtcgtgtttgatat-T-A-TACT-G-A--C-CGA-AT--A-A----------------------------------ATA---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACT-T----A-T-T--T---A--attcga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cataatattgtcttcatattttcctccccctcttcccgtatcctacattgacaactgatgttgtgtttgtttcT-G-A--C-CAC-ATTCA-ATT-A-AA--A-AC--TTATTC-A--T--------CTA---A-A---A-AA---AAA--A----AAA---GT-T-GCTTACT-T----A-T-T--T---A--TAG-T-C--A-TCT-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACG-GTG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG---T-----T-----T-ATC---CGT--A----------------GAT-TTTATATTAAATATGTAA-----------A-------------T------------A-TA--------T--AA---------AT-T-C--G---T----G--CTATG-G-ACC--A--AAAT-GC-A-----------GCAAA-T--A-------TCT--T-AC-C-----C---AA-A-A--AAA-AATTTG-TATT-TA-----T-TTAT-T--A--C--A---G-A-A-TC------AG-A--A-AT----T-T--C-TTA------AGGGA---C------A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-CG-C--T-TTC-CT--G-AC-AA--TACT---ACT----GCTAC-C-C---A-TATT---C--GCAC-GTG-G-A---A---A-C-CAAG-GA--A---AC-----GCC-T------TT--T-C-C-CTT--TT--T-TTTC-----TT-A-----CAACTC--G---A-C-ACTGT-C-C---AG--T-ATA-TC----A-T--CAATT--TC-----CCCC-TTACCAA-C----A-AC--TATTCA-------G-T---ATT--TT--T-CA-C-GC-G-CAAA--------ATTC--A-A--CAA-GC-GCTCTGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AATG-T-ATTG--A---ATTC---T-T---G--A--TTA-TTGATTG-G--CTGCA-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTGG---c
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aggaaaaagaaggggcgggggtgatgtacatttgctgtaccaatctgactaaacaactcggcttggattgcccactggcccagccacagagaatttgtaatattctatcatagattaactcttgtgttttaaagaaattatatcctaacttaacttactgtaaacataaggttggcgttacctaagtgctgttcttcgataaacgatgtcgtaaccgggacgtaatattgaccatagtattgtgtttttgcagttttacaagtaggcctaatatttctaatttttaagaattacaatagacgtcgtgtttgtatctacacc-G-A--C-CGA-AT--A-AAT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATA---A-T---A-AT---AAA--AAAAAAA----GT-T-G-TTACT-T----A-T-T--T---A--TAG-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----Aattt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acatggaacgggggggggatgtacatttgtaccattgactaagactcggcttgacattattcactgtcactgaccagcccacagagaatttgtaatattctatcaatagataatctgtcttttaaaggaaattatatctaactaatttactgtaaacataaggttggcgtatctaggtgctgttttgaaaaacgatgtagtaccgggcctaattttgacataaaattgttttgcggttattcctccgcctcttccaagtatccgatattattaaatttgcaatgacaatagacgttgtgtttgtatggatgcc--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A--C--TT--TC-A--CTAACAACAATG---A-ATAAA-GT---AAA--C----AA----GG-T---TTGTA-C----C-T-TATT---A--TAG-T-C--A-T-T-ATA----A------ACCACAT----A-CTTTCG-GGC-GT--TC-C-TG-T-ATTAC-T---TT--T-C-AGG---T-----T-----TCATC---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------TAAATTATGTAAAA-TA--------T--AAT--------AT-T-C--T---T----G--C-CTC-A-G-C--A--AAAT-AC-A-----------G-AAA-T--C-------TTC--A-G--C-----C---AA-A-G--AAA-AATGTA-T-TG-TA-----T-T--T-TTAG--CCGA---T-A-G-TT---C--AG-A--C-ATACTCT-T--C-TTCCTCCTTAAGGG---ATTCCTCA-GTCTAA-T-T-CC-A-CAAAGTA-TA--C-ACCC-----CGG-A--A-T-CG-T--T-cgtacgtacggt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tggaactgggaggaaataagaagggagttacatttgcttaccattgactaaatgaactcggcttgacattattcactgccatggccagcctcacagaggaattgtatagattactatcacatagaatatatcctgttgtttttgttaaaggattacgattatagtctaaaaacctatacatactcgtaatcggtacagtggcgtacctaactgctgtcatatgcttcaagacggcaggtgttcggtttgaaccgcgagcgttatgtacttagaagcatatatggaattggtactttattaatccagttttactcaagtaccatatatgtctactcatgagcatcgtgtttggtatcctacctgagc-AA--A-AC--TT--CA-A--T--------ATA---A-A---A-AT---TAA--A----AA----GT-T-----ACA-T----A-T-T--T---A--TAG-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG---T-----T-----T-ACC---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------ATATAAATGAGTATT------------A-TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-ATG-G-C-A--A--AAGT-AC-A-----------G-AAA-T--A--------TT--C-A--CA----G---AA-A-G--AAA-AA--CG-TATT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---G--GA-A--A-AT----cggttttccttgacaacttactgtaatca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aatgaagctacaccgaagatttactctttatctaacatcgatttgtatctctctctaatcttctattcattcttctagtttattgccaagaaattttgtttacctcatgaacgTG-TC-C-T--T-G---C-T---CC--C-C-ATG---T-----T-----T-A-----C-T--A----------------GAT-TTGATTATA--------A-----------A-------------T------------G-TG--------T--AAGTAATATCGAT-T-C--T---TTGTAG--C-AT------A--A--CAAT-GC-A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----A---AA-A-G--AAA-AA--TG-TATT-TA-----T-T--T-A--A--C--A---GAA-A-TC---A--GA-A--A-TT----T-T--C-TTA------AGGGG---G------A-A--TA----T-TC-A-TAGA-----A--T-A--A-----CGG-A--A-T-CG-C--T-TC--CT--C-----A--CAT--A-TGT----G-TAC---------TA-----T--GCAC-GTG-G-G---A---A-C-CAAA-GA--A---CT------CT-C------TT--T-T-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C----T-A-C-ACTTC-C---------------T-----A-T--T-TTT--TC-----CTCC-T-----A-C---A------TAA--A----------------------T-CA-C-GC-G-T-AA--------A--C--T-A--C-A-GC-GATT-GGT-C----------------------------------------------------AC-------------------------------------------A---ATTC---T-T---G--A---T--TTGATTG-GAAATG---T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-GA-AATC-TTG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cag-TC-C-TA-T-A---C-T---TT--C-A-ATG---T-----T-------ATC---C-T--A----------------GAT-TT---------------ATATAAATGTGTA-------------T------------A-TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-ATG-A-C-A--A--AATT-AC-------------G-AAA-T--A-------TCCC-T-A--T-----C---AA-A-G--AAA-AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---G-A-A-TC---A--GA-A--A-AT----T-T--C-TTA------A-GGG---A------A-G--TAA-T-T-CC---TAAAA---TA--G-C--A-----TGA-A------CGAC--T-TTC-CT--C-AA-AA--CACTAA---T----G-TAC-C-C---A-TA-----T--ACAC-TTG-G-A-------A-G-CAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TTTTT-T--------CT-A-----CAA--C--T-T-A-C-ACTTT-C-C---AG--T-ATT-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT--T-CA-C-GC-G-CAAA--------A--T--C-A--CAA-GC-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTGG---actttcgaatggttgaaagtttgacatatttggaattttgaaattggactgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -A-----------G-AAA-T--AAACATATTTT--T-A--CACAGAG---AG-A-G--AAA-AA-ATG-TA-T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-CC---A--GA-A--A-AT----G-A--T-TTA------A-GGG---A------A-G--TTA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--A-----AGG-A--A-T-TG-C--T-TTC-CT--C-GT-AA--CATTAA---T----G-TAC-C-A---A-CA-----T--GCAC-GTA-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----ACC-T------TT--T-C-CACCT--TT--T-T--------CT-A-----CGA--C--G-T-A-C-ACTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ACG--TC-----ACCC-T-----G-C---AA-AC--TAT--A-------G-A---A-T--GT--T-CA-C-GC-C-GAAA--------A--T--C-A--CGA-AC------GAT-C---T--A-TAAT----------T-ACTCAG----G----------A------AA--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---T--A--TT--TTGATTG-G-------------------A-TN--N-NNN-N-N---N-N--NNNN-NNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCG----AA-T-GAGCCTTCTGGTCTTTCGatt
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cgaaaaacgaatatttggtttctttgtcaattgaaacctcattcgagaaattttaaatttaataaaatatctttggttttatccaatggggtccttGGG---A------A-G--TAA-T-G-CC-A-CACAATA-TA--C----------CGG-A--A-T-CG-C--T-TTC-CT--C-AT-AA--TACTAT---T----G-TAC-C-C---A-TA-----TATGCAA-GTG-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT------CC-A------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--G-T-A-C-ACTTTGC-C---AG--T-Ata
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gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -A---------A----------G------ACA-------T-----------TT-----G--AC-G-T-A-TGT-A---ATTCC--T-T---C--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TAGTT--GTAAT-C-A---C-G--AATC-TTacattcaaactacataatcattaattagcatggagtatatgaaacggcagattctgagaatgactctccattccctttgtaatttctaatttccttgtccataataagcttaaaatcattttccgcttcgttccgcatttagcaataccctcttatgacgtcacctgagacacttgcatttagccactatattaatttatgtgacaaatgaccaattttattggtgatgtccagactttcaggagtgaaaggacttaactttatatcagggactggaccagtttttaagt
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ctaggggtttgtacag--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---A--A--TT--TGGATTG-G--ATT-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---C-G--AATC-Taattttttgaatcgtttgaatttgaatcttgaatcgaaatactgat
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aacagaggaatcatt-T-A-TG--G---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-N-NN-NN--N-NNN-N-N---N-N--NNNN-NNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-N-GAGCCTTCTGGGCTTTCGc
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-T
12 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): ATGACGTCACCTGAGAATATTGCATACATTATGTCACTATATTATCGTTTTGATTTTCGTGACAAATGGCTAGTTTTATTGACTACGAGGAGAGTGACTGTGAAATATTGATGATTGACTCGGGTTTAAGGACTGAACTTTTATATATTACGTAGAGACTGGGCCAGTTTCTAAGTCACATGGAACTGGAGGAAAAATGGGGGTGGATTGGGCTATCTTCCGATGACTAGACATATATAATGACTCAGTTTGACATTATTCATCAGCAGCCCGCAAAGAATTCGTAATATTCTATCAAAAGATAACTTTTGTGTGTTAAAAGAAAATATATCGAACTGTACCACGGGACCAGTATATAGGTGAGCGTATCTA
Unaligned ( gi|29 ): AGTCACATGGAATGGGGGGGGAGAACGACTAAAAGGAGACTCGGCTTGACATATTACTGGCCGCCCCACAGAGTATCTTGCCTTTAGCATTCCACTGATGAAATCTTGTGTTTTACAGAAGATTTATATCGAACTCATTTACTGTAACTAAATCCGTATGTGGGCTATCTACTGTAAGGCTGTTTTAAAATCAATATAGTACCAGGGCGAGATTTTGAGAGGGGGG
Unaligned ( gi|30 ): AAGTCACATGGAACTGGGGTGGGGGGGGGGGCGACTAGACTCGGCTTGACATGATTTACTAGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATAATCTAAAGTATATCGAACTCTATTTTACTGTAAATAAATCCGTATGTGGGCGTATCTACTGTAGAGGGCTGTTTTCAAATTCAATATAGTACCCGTAGTGGCGGATTTAAAGGGGGACGGCCCCGCCCT
Unaligned ( gi|32 ): AGTCCGATGGAAACTGGGGGGGGGGGACTAAGACTCGGCTTGACATTATTTACTTGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATAATCTTTGTGTTTTAAAGAAATTGAATATCGAACTCATTTTACTGTTGATATCGTGTGGGCGTATCTTTTAAGAAATACGATATAGTACCGCAATGGCGGATTTAGA
Unaligned ( gi|37 ): ATTCATATCAAAATCATTACTGCCAGATTCCTGTATGCTTTCAGCAAGCTTACCCGGTAGATTTGATATAAATGAATGTTATTACATTTAAACCTTTCATTGTGGCAAGGTGGGCAATATTTACAGATA
Unaligned ( gi|40 ): ACGTCATTTTCAAAAGACTCTTGCATATATTTACACACAAAACACAACTATATTTTACGTTGTCATCTCTCTGACAAATGGTCAGTGTTATCAGCAGCACGGATAGTGACCGTGAAATAT
Unaligned ( gi|41 ): ACTTACTGTAATCATAAGGTTGGCGTACCTAACTGCTGTTTTGTTAAACGATGTCGTACCGGACGTTTTATTGACATATTATTGTATTTAACAGTTTTACAAGTAGCCTATATTTCTAA
Unaligned ( gi|43 ): TCATTGTACCGTCATTTACTGGTAAACAATAAATATCTGTATTGTGGGGCGATTCTAGCTGTCAGTGCTTGTTTTAAAATCAATATAGTACTCGAGTGGGCGATTTATGAGC
Unaligned ( gi|44 ): AGTCACATGGAACTGGGGGGCGACTAAGACTCGGCTTGACATTATTTATGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATTAATCTTTGTGTTTACAAGAAATTAT
Unaligned ( gi|46 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA
Unaligned ( gi|48 ): AACAATAAGTTTTTTAAATTCATTGTCTTTTTAAAAATAGTATCTTCTCCGTATCTCTCCGCCTCT
Unaligned ( gi|49 ): ATAACAACAAAGAACGAACTGGTGGGATTACTTTTTCTCAACTAAACGACTTACCAGCTT






Alignments
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ccttgtataacaaacaatacagttattgctaatgatttttttttacaacttattgacattatatattatcttctcct------T--C---C-CATG-T-TC----C-A--TG--T-A-CGC-----AT--T-T--AATCA-AGA--CTTGTCC-GGC---AAG-T-A-TAAT-G-A--CACGA-AT--A-ATT-A-AA--A--C--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACAAC----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TG-T-TA-TAG---C-C---GT----T-ATG-T-----T-----T-GA---T---C-T--A----------------GATATT---------------A-----------A-------------T--------A------------TT--------G--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTTACT-A--CC----G---AA-A-G--AAA-GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-T-AAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAATA-A-CA----A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA-------T--T---C--C-CACTA--T--G--AG--CAGTG-G-A-------A-C-CAAG-AA--A----T-----GTC-C------TT----C-CACTT--TT--T-TT-------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-TATC-TTT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA--C--TAT--A-------GAT---A-T--TTCT-CA--C-GC-C-CAAAAA-C------C--AC------AA-GC-GCTTGG-T-C---T--A-T--T----------TTA---------A----------A------AC--------T-----------TTTG---A--AA-G-TGA-T---A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-T-----------TGG---atttttt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aagttaatgttgcctaataattttttttaatttatgacttataatatatctctctatacaagatgtttaatgaattaaaatattatctctctctatatagcatgttctccacctg-------------TTTTCCATGT---TCC--GGT-A-A-C---T--TTAA--------TAC------T--C---C-C----T-TC-------------------C-----CC--T-T--AGAAA-AAAAACT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TAAT-G-A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A--T-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--GA---------TA-T-C--T---G----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--TAA--C-----G---AA-A-G--AAA-GA--TG-TACTATA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--T-A---------TT-T--C-TTAA-GGG-----A--A-G--TAA-T-T-TC-A-T-AAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTTCT-C-AT-AA--C--ACT---AAT-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-T-AG-AA--A---CT-----G-C-C------TC--T-C-CAC-T--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AGA-T-ATA-T-----A-G--C-ATT--CC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC---AT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ACT----T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-T-----------TGG----NN-NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCAGAACT-GAGCCTTCTGGGCTTTCGat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttttaattcattgacattaaatattatcttctccgtc-------------TCTTCCATGC---ATC--GAC-A-T-C---T--T--A---------AT------T--C---C-C----T-T--A--C-C--TG--C-A-CGT-----AT--TAC--TGTTA-AA---CT---C---GC-C-A-G-T---TAAT-CCA--C-CGA-GA--A-ATT-A-AA--A--C--TT-----A--T--------ATGCACA-A---A-TT---AAA--A----AA----GA-T-G-TTAAATC----A-T-A--TA--TA--G-T-C------T--TG----A------A-----T----A-T-------AC-ATGCTT-C-TA-T-T---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----C-AT---C---T-T--A----------------GAG-TT---------------A-----------A-------------T--------C------------TA--------TA-AA---------AT-T-CCAT---T----G--C--T-G-G-------CA--A--A---A-G-T--C--A-----------G-ACA-------------TC--T-AC-C-----G---AA-A-G--A----ATGT--TACT-TA-----TAT--TAT--A--C--A---T-A-A-TC---A-GATA--A-T---------TT-T--C-TTAAAGGG-----A--A-G--T-A-T-T-CCGA-TAAAA-ATTA--C-A--A-----TGG-A--A-T-C-----GAC-TGTTCCT-C-CT--------ACT---AATCA-T--A---A--C-CA-TACGT--G--CA--C-GTGTG-A-ACA---A-T-TAAG--A--A---CT-----GCC-C------TA--T-C-CATTT--TT--T-G--------CT-C-----AAA--C--GTGA-C-A---TT-T-C---AG--C-TTA-T-----A-T--C-ATT--T------CCCT-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------T-T---A----TT-T-CATCC-GC-T-CAAAA--T------T--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAC--------T-A---------G----------GGTTGT-ACGAGGACA-T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTCT--T-T---C--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A---TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-T-----------TGG---TTt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgggcccttgtttaacaaacaacataattttttttaaaatatcaccttgtcttaattggtagttcattctacctagatttctccgccATGTA--TGC--GGT-C-T-C---T--T--A--------AAT------T--CTATC-A----T-TC-A--C-A--------A-TG-------------------A-TAG--CT---CT-G-C-C-AAG-T-A-TA---G-A--C-CG---T--A-ATT-A-AG--A-AC--TT--CA-A--T--------ATG---GCG---G-AT---AAA--A----AG------------TACA--------------A--TG-----------T-T-GCC----A------A-----G----A-CT-----AG---TG-TT-C-TAGT-G---C-C---GT------ATA-T-----T-----T-AT---C-----T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T--------G--C-AT-G-G-------CA--A--AGTAA-G-T--C--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----G---AA-AAG--AAA-GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--AG-C--A---T-AGA-TC---A-GA-A--A-AA--------TTGT--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-T-AAA-A-TA--C-A--A-----TGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-CT-AC--G--ACT---AAT-A-T--A---CCGC-TA-GA--T--GC-CA--C-GTG-ACG-CAA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TTGGT-C-CACTT--TT--T-G--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-TTTG-C-C---AG--TAATAGT-----A-T--C-ATTTCTC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-TGCA--C-GCTC-CAAAA--TA-----C--AG------AA-GCGGCTTGGGT-CCTTT--A-C--TAGAGGGGTTAC-A---------G----------A------AC--------A-----------TT-----T--AA-G-TCA-TA--ATTCGTTC---T-TTCCC--A--TT--TTGATTG-GT-CTG-A-TATTG-G-A-TA-TTGGG-AAT-C-A---C-G--AATC-T-----------TGG---tt
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  attgacataatattgtgttttgcagtttcacctccgccacttccaagtaacctatatttttaatattgcaatgatgaaagacgtcgtgattgtatc-------------TCTTCCATGT---TCC--GGT-A-C-C---T--T--AAA------TAT------T--C---A-C----T-GC-G--C-A--TA--T-A-CGC-----CT--G-AAATGTTA-TAA---T---CC-GGC-C-AAG-T-A-TAAT-G-A--C-CGA-AT--A-ATTTA-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AAA---GT-T-G-TTACAAC----A-T-G--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-----GT--C-T-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------TT-------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TT------------------------------------------------------T-T--A--C--C---G-A-A-TC---A-AA-A--A------------T-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-C--A-TAAAA---TA--C-A--A-----CGG-A--AAT-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA---T-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CAC-T--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---GATA--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTA-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-GA-AATC-T-----------TGG---
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cAA--CT---CC-GGC-C-TAG-T-A-TCAT-G-A--C-CGA--T--A-ATT-A-AA--A-CT--CT--TC-AA-T--------ATG---T-A---A-AT---AAA--A----AAAG--GTCT-G-T-ACA-C----AAT-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----A-C--TG-TC-C-TA-T-G---CAC---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA----------T-C-T--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--------G-T-AC--A-----------G-AA--T--AAC-----TCT--T-A--CC----G---AA-A-G--AAA-GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-AC-TAA-T-T-CCCA-TAAA----TA--C-A--A-----CGG-A--AAT-C-----G-CCT-TTCCG-C-CTCAA--C--TCTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCA-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----C-A--T--GT---C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-TA--AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TG-T-CA--C-GC-C-C-AAA--T------C--AA------AA-GC-GCTT-GGT-C---T--A-T--T----------TAA---------A----------A------AC--------T-----------TT-----GACAA-G-T-A-TG--A---AATC---TCT---C--A--TTTCTTGATTG-G--CTG-A-A-TTG-G---TA-TT--G-AAT-CAA---C-GA-AATC-T-----------TGGA--TTGTGAATCatt
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aggaaaaagaaggggcgggggtgatgtacatttgctgtaccaatctgactaaacaactcggcttggattgcccactggcccagccacagagaatttgtaatattctatcatagattaactcttgtgttttaaagaaattatatcctaacttaacttactgtaaacataaggttggcgttacctaagtgctgttcttcgataaacgatgtcgtaaccgggacgtaatattgaccatagtattgtgtttttgcagttttacaagtaggcctaatatttctaatttttaagaattacaatagacgtcgtgtttgtatctacacc-AT---T---T-T--A----------------AAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A-------------------------AA---------ATAT-C--T---T----------T-G-GTTTTATCCA--ATGG---G-G-T-CCTTA-----------G-AAA-T--AAACATATTTT--T-A--CACAGAG---AG-A-G--AAA-AA-ATG-TA-T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-CC---A-GA-A--A-A---------TG-A--T-TTAAGGG------A--A-G--TTA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--A-----AGG-A--A-T-T-----G-C-T-TTCCT-C-GT-AA--C--ATTAA---T-G-T--A---C--C-AA-CA--T--G--CA--C-GTA-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----ACC-T------TT--T-C-CACCT--TT--T-T--------CT-A-----CGA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ACG--TC-----ACCC-T-----G-C---AA-AC--TAT--A-------G-A---A-T--GT-T-CA--C-GC-C-GAAAA--T------C--AC------GA-AC------GAT-C---T--A-TAAT----------T-ACTCAG----G----------A------AA--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---T--A--TT--TTGATTG-G--ATN-N-N-NNN-N-N-NN-NN--N-NNN-N-N---N-N--NNNN-N-----------NNN---NNN-NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNT--------------TC-GAA-T-GAGCCTTCTGGTCTTTCGattt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cgaaaaacgaatatttggtttctttgtcaattgaaacctcattcgagaa-TACCGGGCC-TGTTAAGTTA-TTGCCAATGA--TTGTTTTTAA--------------ta
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 g-------------TCTTCCAT------CC--GGT-ACT-C---TAAT--A--------TAT------T--C---T-C----C-TC-T--CGA--TG--T-AGCGC-----CT--T-C--GGTTA-ACGGCCA---CC-GGC-CCAAG-TCA-TAAT-G-A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-G----T--GC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G--GACA-C----A-T-T--TC--CAATG-T-A--A-C-T-ATG----AGAAATTG-----T----A-CC-----AAC-A---TT-C-TAGT-GA--C-CGGGGT--CGT-ATG-------T-----T-ATTTAC---C-T--ACAGATTTGGTTAGAGCGAT-TT---------------A-----------A-------------A--------A------------TAAAGGCCTCC--AA---------AT-T-C--TATAT----GACC-AT-GTG-------CC--A--A---A-G-TAAC--AGTAGACAGACCG-AAA-CTAA-------TTT--T-A--CCT---T---AA-A-GGAAAA-GATA-G-TACTCTA-----A-T--T-T--AC-C--A---T-A-A-TC---A-AA-A--A-A----------G-T--C-TTAAAAGGAGC--A--A-G--TAtttattgacataaattttgtctctctatacaggatgtctccgcctcttccatccggtactctaatatattctcctctcgatgtagcgccttcggttaacggccaccggcccaagtcataatgaccgaataattaaaagtgcatatgaaaataaaaaagttggacacatttccaatgtaactatgagaaattgtaccaacattctagtgaccggggtcgtatgttatttacctacagatttggttagagcgatttaaaataaaggcctccaaattctatatgaccatgtgccaaagtaacagtagacagaccgaaactaattttaccttaaaggaaaagatagtactctaatttaccataatcaaaaaagtcttaaaaggagcaagtataacttatcattccattttaatcaaa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gtaccgggcctgttaagttattgccaatgattgtttttaatttattgacataaattttgtctctctatacaggatgtctccgcc-G-A--C-CGA-AT--A-AAT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATA---A-T---A-AT---AAA--AAAAAAA----GT-T-G-TTACT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----Ataacttatcattccattttaatcaaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acatggaacgggggggggatgtacatttgtaccattgactaagactcggcttgacattattcactgtcactgaccagcccacagagaatttgtaatattctatcaatagataatctgtcttttaaaggaaattatatctaactaatttactgtaaacataaggttggcgtatctaggtgctgttttgaaaaacgatgtagtaccgggcctaattttgacataaaattgttttgcggttattcctccgcctcttccaagtatccgatattattaaatttgcaatgacaatagacgttgtgtttgtatggatgccTG-TC-C-T--T-G---C-T---CC--C-C-ATG-T-----T-----T-A--------C-T--A----------------GAT-TTGATTATA--------A-----------A-------------T--------G------------TG--------T--AAGTAATATCGAT-T-C--T---TTGTAG--C-AT-A-A-------CA--A----------T-GC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----A---AA-A-G--AAA-AA--TG-TATT-TA-----T-T--T-A--A--C--A---GAA-A-TC---A-GA-A--A-T---------TT-T--C-TTAAGGGG-----G--A-A--TA----T-TC-A-TAGA-----A--T-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C---TTCCT-C-----A--C--AT--A-TGT-G-T--A---C-------TA--T--G--CA--C-GTG-G-G---A---A-C-CAAA-GA--A---CT------CT-C------TT--T-T-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C---T-A-C-A-CTTC-C---------------T-----A-T--T-TTT--TC-----CTCC-T-----A-C---A------TAA--A---------------------T-CA--C-GC-G-TAAAC--T---------AC-------A-GC-GATT-GGT-C----------------------------------------------------AC-------------------------------------------A---ATTC---T-T---G--A---T--TTGATTG-GAAATG---T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-GA-AATC-TTGACTTTCGAATGG---TTG-AAAGTTTG-A-CAT----ATTTGGAATTTTGAAcgtacgtacggt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cag-TC-C-TA-T-A---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------ATATAAATGTGTA-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-A-------CA--A--A---A-T-T-AC--------------G-AAA-T--A-------TCCC-T-A--T-----C---AA-A-G--AAA-AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---G-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGG------A--A-G--TAA-T-T-CC---TAAAA---TA--G-C--A-----TGA-A------C-----GAC-T-TTCCT-C-AA-AA--C--ACTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--A--CA--C-TTG-G-A-------A-G-CAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TTTTT-T--------CT-A-----CAA--C--TT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATT-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-G-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-T-----------TGG---attggactgt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T------------------------------------A------A---------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AGTC-T-----------Tatt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -AA--A-AC--TT--CA-A--T--------ATA---A-A---A-AT---TAA--A----AA----GT-T-----ACA-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AC---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------ATATAAATGAGTATT--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A--------TT--C-A--CA----G---AA-A-G--AAA-AA--CG-TATT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---G-GA-A--A-A---------Tacattcaaactacataatcattaattagcatggagtatatgaaacggcagattctgagaatgactctccattccctttgtaatttctaatttccttgtccataataagcttaaaatcattttccgcttcgttccgcatttagcaataccctcttatgacgtcacctgagacacttgcatttagccactatattaatttatgtgacaaatgaccaattttattggtgatgtccagactttcaggagtgaaaggacttaactttatatcagggactggaccagtttttaagt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aatgaagctacaccgaagatttactctttatctaacatcgatttgtatctctctctaatcttctattcattcttctagtttattgccaagaaattttgtttacctcatgaacg-CG-TA--T--A--CA--C-GGG-G-A-TAAGGAA-C-CAAG-AATTA---CT-----GGC-CATTTTATT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TC-ATAC--CAA--C--TT-A-CTA-CTTT-------AG--T-ATA-T-----AGT--C-ATT--TCGGGCGCTCG-TGGAG-A-CGT-AACAC--TATA-A-------G-TTAAA-TCATT-T-CG--C-CC-G-CTAAA--TAGTAGGC--ACCAATCAAA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAC--------T-A---------A----------AAGG---AA--------T-----------TT-----G--AT-G-T-A-TG--A---ATTTCTAT-T---G--A--TT--TTG-TTG-G--CTG-A-A-TTG-G-A-TA-TT--G-ACT-T-----T-G--AATC-T-----------TGGAT-TTG-AA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acttcgctcaataatttaaatcaaatggtgttcgcaCCATGTCACTCC--GCT-A-T-CAGCC--T--A--------TATATAATAT--C---TGC----T-TC-GGTC-A--TAGTT-A-CGC------T--T-CGGCGTTA-AGG--AC---GC-GGCTC-AAG-T-AATAATAG-A--C-AGAGAT--ATATT-A-AATAA-GT--TT--TCTA--T--------ATG---A-A---ATAC---AAT--A----AA----GT-TTG-TTACAAC----A-T-T--TACGTA--G-T-C--AAT-T-A-G----A------A-----TTTTGA-CCGA---AACTATG-TCTC-TA-T-G---C-C---GTACC-T--TA-T-----TCTTCTT-AT---C---C-T--A----------------GAT-TTT--------------A-----------A-------------T--------AA-----------TA--------T--AA---------AT-TGCA-T---T----G--CCAT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--AATA--------G-AAACT--A-------TTTA-T-A--CC----G---AA-A-G--AAA-GATGT---ACT-TAATCTCTGT--C-T--A--C--AGGGT-A-A-TC---A-TATACCA-A---------TT-T--CCTTAAGG----------A-G--TAAAT-T-CC-A-TAAA----TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-------G-C-T-TTCCT-CTATCAA--C--AGTACTAAT-A-T--T---C--CACA-TAA-T--GACCAAAC-ATG-G-A-CCA---A-T-TAGC-A-------CT-----GCC-C------TT----C-CACTTATTT--T-TATATCATACT-A-----CAA--CACGT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATG-A-----A-T--C-AAT--TT-----CCCC-T-----ATC---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--G-GC-CGCAAAA------------AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---CTGA-T--T----------T-A---------A----------A------ACT-------T-----------TT-----G--AA-G-TCA-TGTAA---ATTC---T-C------A--TTG-TGGATTG-G---TG-A-A-TTG-G-A-TA-Tta
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gggccttgtatagggtatttgccaatgatttgtttttaatttattgacattggaatttaatatatgtcttctctatacatggggagtttaaaattgggtccgccctttcacttta-TTCCT-T-GT-GA--C----TTA-AAT-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-A-A-------A-C-CAAG-AA--G---CT-----GCT-A------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TT-T-----TA---C--GT-A-C-G-CTCT-C-C---AG--T-AGA-T-----T-T--C-ATT--TC-----CCT--T-----G-C---AA-AT--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CC--C-GC-G-GAAAA--T------C--AA------AA-GC-GTTTGAGT-T---T--A-T--TA---------T-A---------AGCTACAGGGGA------AA--------T-----------AC-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---T--A--TT--TTGATAG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-AT--G-GAT-C-
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ---A-T-TAGA-GA--A---CTTT---GCC-C------TT--T-C-CAA----TT--T-T--------CTGA-----TAACTC--AT-A-C-A-C-TT-C-C---AG--T-AT--T-----A-T-----TT--T-------CCC-T-----A-CAA-AA-AC--TAT------------C---A----TT-T-CT--C-GC-----AAATCT------C--AC------AA-GC-GCT--GGT-C---TTGA-A--C----------T-AGCAATGAGGA----------A------AA--------T-----------TT-----G--AA-GTT-A-TG--A---TTCT---T-T---G--ATTTT--TTGAGGG-G--CTG-A----TG-GCATTA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-T-----------Tt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cGACAAATCCTGGATCCTCCACTA-TACCGGGCCTTGT--GGTAACAAAACAATAATTT--TTTTTAA--------------AAT-------------TC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ccctttc-------------TCTTCCATGC---ATC--GAT-C-T-C---T--T--ACA------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TG--C-A-CGT-----TT--A-C--TGTTA-attgtctttaattagtttcttctccagatcttctccgcctcttccatgcatcgatctcttacatattcccttcgcatgcacgtttactgtta
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gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---A--A--TT--TGGATTG-G--ATT-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---C-G--AATC-T-----------cattttgaatc
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 g--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A--C--TT--TC-A--CTAACAACAATG---A-ATAAA-GT---AAA--C----AA----GG-T---TTGTA-C----C-T-TATTA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------ACCACAT----A-CTTTCG-GGC-GT--TC-C-TG-T-ATTAC-T---TT--T-C-AGG-T-----T-----TCAT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------AAATTATGTAAAATA--------T--AAT--------AT-T-C--T---T----G--C-CTCA-G-------CA--A--A---A---T-AC--A-----------G-AAA-T--C-------TTC--A-G--C-----C---AA-A-G--AAA-AATGTA-T-TG-TA-----T-T--T-TTAG--CCGA---T-A-GTTC---A-GA-C--ATACTCTTCTTCCT-C--C-TTAAGGGATTCCTC--A-GTCTAA-T-T-CC-A-CAAAGTA-TA--C-ACCC-----CGG-A--A-T-CGTTCGG-T-T-TTCCT-TGAC-AA--CTTACTGT-AAT-cctgcatagcgaattt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                             tggaactgggaggaaataagaagggagttacatttgcttaccattgactaaatgaactcggcttgacattattcactgccatggccagcctcacagaggaattgtatagattactatcacatagaatatatcctgttgtttttgttaaaggattacgattatagtctaaaaacctatacatactcgtaatcggtacagtggcgtacctaactgctgtcatatgcttcaagacggcaggtgttcggtttgaaccgcgagcgttatgtacttagaagcatatatggaattggtactttattaatccagttttactcaagtaccatatatgtctactcatgagcatcgtgtttggtatcctacctgagcGGCCTTGT--AGTAACAAAATAATAAG-T--TTTTTAAATTCATTGTCTTTAAATAGTATTTCTCGCCTCTTCCATGTA--TC----GT-C-T-C---T--T--AAA------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TA--TTA-CGCGAAAA---------TATTA-AAA--CT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TAAT---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------AT----A-A---A-ATTTTAAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C------T-T--TA--TA--G-TGC--A-T-T-ACG----A------A-----T----A-AT-----AAC-ATG-TT-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-------T-----T-AT---A---T-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T---A---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--C----C-----A---GA-A-G--AAA-GA--TG-TAC--TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--CTTTAAGGGG-----A--A-G--TAA-TAT-TC-A-T--CA-A-TA--CTA--A-----TGGAA--A-T-C-----G-C---TTCCT-C-CT-AA--C--AT----AAT-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TT--TGT--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTAT-C-C---AG--T-TTA-T-----A-T--C--TT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAG--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-T-CAAAA--TTA----C--AC------AG-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAAC-------T-A---------A----------GGGTTGTACAGAGGACAT-----------TT-----G--AA-G-T-A-GT--A---ATTC---T-T---C--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AA---N-----------NNN---NNN-NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGATGTC-G-A-T-GAGCCTTCTGGGCTTTCGca
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Unaligned ( gi|37 ): ATTCATATCAAAATCATTACTGCCAGATTCCTGTATGCTTTCAGCAAGCTTACCCGGTAGATTTGATATAAATGAATGTTATTACATTTAAACCTTTCATTGTGGCAAGGTGGGCAATATTTACAGATA
Unaligned ( gi|40 ): ACGTCATTTTCAAAAGACTCTTGCATATATTTACACACAAAACACAACTATATTTTACGTTGTCATCTCTCTGACAAATGGTCAGTGTTATCAGCAGCACGGATAGTGACCGTGAAATAT
Unaligned ( gi|41 ): ACTTACTGTAATCATAAGGTTGGCGTACCTAACTGCTGTTTTGTTAAACGATGTCGTACCGGACGTTTTATTGACATATTATTGTATTTAACAGTTTTACAAGTAGCCTATATTTCTAA
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Unaligned ( gi|46 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA
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Reference ( family-826 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GACAAATCCTGGATCCNCCACTG-TACCGGGCCTTGTT-AGTNACNNGACAATGA--T--TTT----TTAA--------------AAT-------------TCTTCCA--TGT---TCC--G-GT-A-T-C---T--T--A--------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TG----T-A-CGC-----CT--T-C--TGTTA-AAA--CT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--T-A--C-----G---AA-A-G--AAA-GATGTG-TACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA-AAT-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTGG---TTG-AAAT-CTTGNA-CGTTTNG-ATNTT--GAATTTTGAATGTTGNGATGTC-GAA-T-GAGCCTTCTGGGCTTTCG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -T-A-TA-CT-G---A--C-CGA-ATT-A-AAT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------TTA---A-A---C-AT---AAA--A----AAAAA-GT-T-G-T---A-CTTTGA-T-T--TA--TC--A-T-C--A-G-T-ATA----A------A-----T----AACT-----ACG-GTG--C-C-TA-T-GG--C-T---TT--C-A-AT--T-----T-----T-AT---C---C-TT-A----------------AAT-TTTATATTAAATGTGT-A-----------A-------------T--------A------------TA--------TCAAA---------AT-T-C--T---G----T--C-AT-T-G-------CACCA--A---A-A-TCACC-A-----------G-AAA-T--A-------TCT--C-ATTC---------AA-A-G--AAA-AA-GTG-TATT-TA-----T-TC-T-T--A--C--G-----A-A-TC---A-GA-A--A-A------------T--C-TTAA---G-----A--ATG--TAA-T-TCCC-ATTAATA-A-TA--C-A--AACC--CGG-A--A-T-C-----G-CTT-TTCCT-C-AC-AATTT--ACT---AAT-C-T--A------C-CA-TA--TG-G--CA--C-GTGAA-A-CCA--------CAG-AA--A---TT-----TCC-T------TTTAT-C-CAC-T--TT--T-T--------CT-A-----CAAT-C--AC---C-ACCTTT-C-C---AGATT-ATA-T-----A-T--C-ATTA-TT-----CCCC-T-----A-C---AA-ACGATAT--A-------G-T---A-TC-TT-T-CG--C-GC-CGCAAAAGTT------C--AC------AAGGC-GCTTGGGCAT---T--A-A--C----------T-A---------C----------A------AG--------TAA---------TT-----T--AA-G-T-A-AA--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TAGATTGTG--CTA-A-T-TTG-GCA-TA-TT--G-AAT-T-C---T-GATAATC-TTGG---
gi|10                         : actaccataaaccctaagtacaggattatatcgacatacggcagatgctgagaagacgctcacattcccttgtaatttttctaattcctctgtcccaaatcaaaacgatctgattcttaaactcaagttatccgttatcgtctatgcagttgagcaatacctctagacgtcacctgagaccaacttgcatttgccacttatattctaaatttatgtgacaagatggcccaattttattgactccatggactgtgattgtccagactttcaagagtggaaagacttaactttatactgtaggactggaccagtttttagtcacatgaaaacggggggcgggggtcaatttcattgcaatttgtccattgactaaaaactcgttgacatttattcactgcatggcagcccacccaagaatttgtaactattgatatatcaatagataacttttttctttttgtttaaaagtaattatatctaactaactacttaactaaggttcgtaactagtgcttctgtttgataaacgacttgtcgtaccggacctaatattgacataaaatatattttgcatttaccgccgcctcttccaagtaccttataatttaagttgaaatgaactttgacgtcgtgtttgatat-------------TCTTCCA--TGT---TTC--G-GT-A-T-C---T--TG-A--------TA-----------------------------------G----T-A-CGA-----GTAAT-C--T-TCG-AAA--CT---CC-GGC-C-TAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--C-AAT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---T-A---A-AT---AAA--A----AAAAA-GT-T-G-TTACA-C----AAT-T--TAATTA--G-T-C--A-T-T-ATGG---A------A-----T----A-CT-----AA---TG-TC---TA-T-G---TTC---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-A--A----------------GAT-TC---------------A-----------A-------------T--------AA-----------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A-----G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----G---AA-A-G--AAA-A---TG-TACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--C-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAA----TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-CT-AA--C--AC----AAT-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-TAAG-AA--A----T-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--T--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--CTATT--CT-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A----TT-T-CA--CTGC-C-C-AAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------------------TT-----G--AA-G-T-A-TGA-A---ATTC---T-T---C--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-A-TTGAG-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-GA-AATC-TTGG---NNN-NNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTC-GAA-T-GAGCCTTCTGGGCTTTCGattcga
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taccgaggccttgtttaacaaaaacaataaaactatcatctctccaagcaggttttcttcgccc-------------TCTTCCA--TGT---TTT--G-GT-A-T-C---T--T--A--------T-T------T--A---T-C----T-TC-A--C-A--TA----T-A-CGT-----CT--T-T--TGTTA-CAG--CG---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-----A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--GCT-C--A-T-T-ATG----A------AA----T----A-CTT----AAC-ATC-TC-CCTA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C----A----------------GAT-T----------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-GGT-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--T-A--C-----C---GA-A-A--AAA-GATGT---ACT-C------T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-AA-A--A-A---------TT-T--C-TTA--GGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--------CGG-A--AAT-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA---T-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-A-A-CCA---A-T-TA-G-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--A-TTA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-C---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-TAAAA---------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--ATT--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A---T--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TTG-G-AAT-C-A---CNN--NNNN-NNNN---NNN-NNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTC-GAA-T-GAGCCTTCTGGGCTTt
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgggcccttgtttaacaaacaacataattttttttaaaatatcaccttgtcttaattggtagttcattctacctagatttctccgccA--TGTA--TGC--G-GT-C-T-C---T--T--A--------AAT------T--CTATC-A----T-TC-A--C-A----------A-TG-------------------A-TAG--CT---CT-G-C-C-AAG-T-A-TA----G---A--C-CG---T--A-ATT-A-AG--A-AC--TT--CA-A--T--------ATG---GCG---G-AT---AAA--A----AG------------TACA--------------A--TG-----------T-T-GCC----A------A-----G----A-CT-----AG---TG-TT-C-TAGT-G---C-C---GT------ATA-T-----T-----T-AT---C-----T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T--------G--C-AT-G-G-------CA--A--AGTAA-G-T--C--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----G---AA-AAG--AAA-GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--AG-C--A---T-AGA-TC---A-GA-A--A-AA--------TTGT--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-T-AAA-A-TA--C-A--A-----TGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-CT-AC--G--ACT---AAT-A-T--A---CCGC-TA-GA--T--GC-CA--C-GTG-ACG-CAA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TTGGT-C-CACTT--TT--T-G--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-TTTG-C-C---AG--TAATAGT-----A-T--C-ATTTCTC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-TGCA--C-GCTC-CAAAA--TA-----C--AG------AA-GCGGCTTGGGT-CCTTT--A-C--TAGAGGGGTTAC-A---------G----------A------AC--------A-----------TT-----T--AA-G-TCA-TA--ATTCGTTC---T-TTCCC--A--TT--TTGATTG-GT-CTG-A-TATTG-G-A-TA-TTGGG-AAT-C-A---C-G--AATC-TTGG---tt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ccggccttcgaagtaacaaagcaataccgtttttaaattacttaatttcattcgagctctgat-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A---------------------------T--------ATA---A-A---A-GT---GAA--A----AA----GT-T-G-TTATT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACG-GTG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TTTATATAAATGTGTA-A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-A-------CG--A--A---A-A-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----CC--AA-A-G--AAA-AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---G-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AC-AA--T--ACTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----GCC-T------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TT-ATTTTACAA--C--TG-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-C-----A-T--C-ATT--TC-----CCC--T-----C-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-G-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TC--G-AAT-C-ATTTC-G--AATatt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  attgacataatattgtgttttgcagtttcacctccgccacttccaagtaacctatatttttaatattgcaatgatgaaagacgtcgtgattgtatc-------------TCTTCCA--TGT---TCC--G-GT-A-C-C---T--T--AAA------TAT------T--C---A-C----T-GC-G--C-A--TA----T-A-CGC-----CT--G-AAATGTTA-TAA---T---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATTTA-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AAA---GT-T-G-TTACAAC----A-T-G--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-----GT--C-T-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------TT-------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TT------------------------------------------------------T-T--A--C--C---G-A-A-TC---A-AA-A--A------------T-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-C--A-TAAAA---TA--C-A--A-----CGG-A--AAT-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA---T-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CAC-T--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---GATA--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTA-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-GA-AATC-TTGG---
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cAA--CT---CC-GGC-C-TAG-T-A-TC-AT-G---A--C-CGA--T--A-ATT-A-AA--A-CT--CT--TC-AA-T--------ATG---T-A---A-AT---AAA--A----AAAG--GTCT-G-T-ACA-C----AAT-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----A-C--TG-TC-C-TA-T-G---CAC---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA----------T-C-T--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--------G-T-AC--A-----------G-AA--T--AAC-----TCT--T-A--CC----G---AA-A-G--AAA-GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-AC-TAA-T-T-CCCA-TAAA----TA--C-A--A-----CGG-A--AAT-C-----G-CCT-TTCCG-C-CTCAA--C--TCTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCA-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----C-A--T--GT---C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-TA--AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TG-T-CA--C-GC-C-C-AAA--T------C--AA------AA-GC-GCTT-GGT-C---T--A-T--T----------TAA---------A----------A------AC--------T-----------TT-----GACAA-G-T-A-TG--A---AATC---TCT---C--A--TTTCTTGATTG-G--CTG-A-A-TTG-G---TA-TT--G-AAT-CAA---C-GA-AATC-TTGGA--TTGTGAAT-Catt
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aggaaaaagaaggggcgggggtgatgtacatttgctgtaccaatctgactaaacaactcggcttggattgcccactggcccagccacagagaatttgtaatattctatcatagattaactcttgtgttttaaagaaattatatcctaacttaacttactgtaaacataaggttggcgttacctaagtgctgttcttcgataaacgatgtcgtaaccgggacgtaatattgaccatagtattgtgtttttgcagttttacaagtaggcctaatatttctaatttttaagaattacaatagacgtcgtgtttgtatctacacc-AT---T---T-T--A----------------AAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A-------------------------AA---------ATAT-C--T---T----------T-G-GTTTTATCCA--ATGG---G-G-T-CCTTA-----------G-AAA-T--AAACATATTTT--T-A--CACAGAG---AG-A-G--AAA-AA-ATG-TA-T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-CC---A-GA-A--A-A---------TG-A--T-TTAAGGG------A--A-G--TTA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--A-----AGG-A--A-T-T-----G-C-T-TTCCT-C-GT-AA--C--ATTAA---T-G-T--A---C--C-AA-CA--T--G--CA--C-GTA-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----ACC-T------TT--T-C-CACCT--TT--T-T--------CT-A-----CGA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ACG--TC-----ACCC-T-----G-C---AA-AC--TAT--A-------G-A---A-T--GT-T-CA--C-GC-C-GAAAA--T------C--AC------GA-AC------GAT-C---T--A-TAAT----------T-ACTCAG----G----------A------AA--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---T--A--TT--TTGATTG-G--ATN-N-N-NNN-N-N-NN-NN--N-NNN-N-N---N-N--NNNN-NNNN---NNN-NNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNT--------------TC-GAA-T-GAGCCTTCTGGTCTTTCGattt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cgaaaaacgaatatttggtttctttgtcaattgaaacctcattcgagaaG-TACCGGGCC-TGTTAAGTTA-TTGCCAATGA--TTGTTT----TTAA--------------ta
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -------------TCTTCCA--T------CC--G-GT-ACT-C---TAAT--A--------TAT------T--C---T-C----C-TC-T--CGA--TG----T-AGCGC-----CT--T-C--GGTTA-ACGGCCA---CC-GGC-CCAAG-TCA-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-G----T--GC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G--GACA-C----A-T-T--TC--CAATG-T-A--A-C-T-ATG----AGAAATTG-----T----A-CC-----AAC-A---TT-C-TAGT-GA--C-CGGGGT--CGT-ATG-------T-----T-ATTTAC---C-T--ACAGATTTGGTTAGAGCGAT-TT---------------A-----------A-------------A--------A------------TAAAGGCCTCC--AA---------AT-T-C--TATAT----GACC-AT-GTG-------CC--A--A---A-G-TAAC--AGTAGACAGACCG-AAA-CTAA-------TTT--T-A--CCT---T---AA-A-GGAAAA-GATA-G-TACTCTA-----A-T--T-T--AC-C--A---T-A-A-TC---A-AA-A--A-A----------G-T--C-TTAAAAGGAGC--A--A-G--TAtttattgacataaattttgtctctctatacaggatgtctccgcctcttccatccggtactctaatatattctcctctcgatgtagcgccttcggttaacggccaccggcccaagtcataatgaccgaataattaaaagtgcatatgaaaataaaaaagttggacacatttccaatgtaactatgagaaattgtaccaacattctagtgaccggggtcgtatgttatttacctacagatttggttagagcgatttaaaataaaggcctccaaattctatatgaccatgtgccaaagtaacagtagacagaccgaaactaattttaccttaaaggaaaagatagtactctaatttaccataatcaaaaaagtcttaaaaggagcaagtataacttatcattccattttaatcaaa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtaccgggcctgttaagttattgccaatgattgtttttaatttattgacataaattttgtctctctatacaggatgtctccgccG-TACCGGGCCTAATT--TTGACATAA-AATTG--T--TTTGCGGTTA-----------------T-------------TCCTCCGCCTCT---TCC--AAGT-A-T-C---C--G--A--------TAT------T--A---T-TAAA-T-TT-G--C-AA-TGACAAT-A-GAC-----GT--T-G--TGTT--------T--------------G-T-A-TGGAT-GCCGA--C-CGA-AT--A-AAT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATA---A-T---A-AT---AAA--AAAAAAA----GT-T-G-TTACT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----Ataacttatcattccattttaatcaaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acatggaacgggggggggatgtacatttgtaccattgactaagactcggcttgacattattcactgtcactgaccagcccacagagaatttgtaatattctatcaatagataatctgtcttttaaaggaaattatatctaactaatttactgtaaacataaggttggcgtatctaggtgctgttttgaaaaacgatgtaTG-TC-C-T--T-G---C-T---CC--C-C-ATG-T-----T-----T-A--------C-T--A----------------GAT-TTGATTATA--------A-----------A-------------T--------G------------TG--------T--AAGTAATATCGAT-T-C--T---TTGTAG--C-AT-A-A-------CA--A----------T-GC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----A---AA-A-G--AAA-AA--TG-TATT-TA-----T-T--T-A--A--C--A---GAA-A-TC---A-GA-A--A-T---------TT-T--C-TTAAGGGG-----G--A-A--TA----T-TC-A-TAGA-----A--T-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C---TTCCT-C-----A--C--AT--A-TGT-G-T--A---C-------TA--T--G--CA--C-GTG-G-G---A---A-C-CAAA-GA--A---CT------CT-C------TT--T-T-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C---T-A-C-A-CTTC-C---------------T-----A-T--T-TTT--TC-----CTCC-T-----A-C---A------TAA--A---------------------T-CA--C-GC-G-TAAAC--T---------AC-------A-GC-GATT-GGT-C----------------------------------------------------AC-------------------------------------------A---ATTC---T-T---G--A---T--TTGATTG-GAAATG---T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-GA-AATC-TTGACT-TTC-GAATGGTTGAA-AGTTTGACATATTTGGAATTTTGAA-ATTGGACTGTcgtacgtacggt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cag-TC-C-TA-T-A---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------ATATAAATGTGTA-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-A-------CA--A--A---A-T-T-AC--------------G-AAA-T--A-------TCCC-T-A--T-----C---AA-A-G--AAA-AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---G-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGG------A--A-G--TAA-T-T-CC---TAAAA---TA--G-C--A-----TGA-A------C-----GAC-T-TTCCT-C-AA-AA--C--ACTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--A--CA--C-TTG-G-A-------A-G-CAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TTTTT-T--------CT-A-----CAA--C--TT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATT-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-G-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTGG---
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T------------------------------------A------A---------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AGTC-TTatt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -AA--A-AC--TT--CA-A--T--------ATA---A-A---A-AT---TAA--A----AA----GT-T-----ACA-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AC---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------ATATAAATGAGTATT--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A--------TT--C-A--CA----G---AA-A-G--AAA-AA--CG-TATT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---G-GA-A--A-A---------Tacattcaaactacataatcattaattagcatggagtatatgaaacggcagattctgagaatgactctccattccctttgtaatttctaatttccttgtccataataagcttaaaatcattttccgcttcgttccgcatttagcaataccctcttatgacgtcacctgagacacttgcatttagccactatattaatttatgtgacaaatgaccaattttattggtgatgtccagactttcaggagtgaaaggacttaactttatatcagggactggaccagtttttaagt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatgaagctacaccgaagatttactctttatctaacatcgatttgtatctctctctaatcttctattcattcttctagtttattgccaagaaattttgtttacctcatgaacg-CG-TA--T--A--CA--C-GGG-G-A-TAAGGAA-C-CAAG-AATTA---CT-----GGC-CATTTTATT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TC-ATAC--CAA--C--TT-A-CTA-CTTT-------AG--T-ATA-T-----AGT--C-ATT--TCGGGCGCTCG-TGGAG-A-CGT-AACAC--TATA-A-------G-TTAAA-TCATT-T-CG--C-CC-G-CTAAA--TAGTAGGC--ACCAATCAAA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAC--------T-A---------A----------AAGG---AA--------T-----------TT-----G--AT-G-T-A-TG--A---ATTTCTAT-T---G--A--TT--TTG-TTG-G--CTG-A-A-TTG-G-A-TA-TT--G-ACT-T-----T-G--AATC-TTGGAT-TTG-AA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acttcgctcaataatttaaatcaaatggtgttcgcaCCA--TGTCACTCC--G-CT-A-T-CAGCC--T--A--------TATATAATAT--C---TGC----T-TC-GGTC-A--TAGT--T-A-CGC------T--T-CGGCGTTA-AGG--AC---GC-GGCTC-AAG-T-AATA-ATAG---A--C-AGAGAT--ATATT-A-AATAA-GT--TT--TCTA--T--------ATG---A-A---ATAC---AAT--A----AA----GT-TTG-TTACAAC----A-T-T--TACGTA--G-T-C--AAT-T-A-G----A------A-----TTTTGA-CCGA---AACTATG-TCTC-TA-T-G---C-C---GTACC-T--TA-T-----TCTTCTT-AT---C---C-T--A----------------GAT-TTT--------------A-----------A-------------T--------AA-----------TA--------T--AA---------AT-TGCA-T---T----G--CCAT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--AATA--------G-AAACT--A-------TTTA-T-A--CC----G---AA-A-G--AAA-GATGT---ACT-TAATCTCTGT--C-T--A--C--AGGGT-A-A-TC---A-TATACCA-A---------TT-T--CCTTAAGG----------A-G--TAAAT-T-CC-A-TAAA----TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-------G-C-T-TTCCT-CTATCAA--C--AGTACTAAT-A-T--T---C--CACA-TAA-T--GACCAAAC-ATG-G-A-CCA---A-T-TAGC-A-------CT-----GCC-C------TT----C-CACTTATTT--T-TATATCATACT-A-----CAA--CACGT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATG-A-----A-T--C-AAT--TT-----CCCC-T-----ATC---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--G-GC-CGCAAAA------------AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---CTGA-T--T----------T-A---------A----------A------ACT-------T-----------TT-----G--AA-G-TCA-TGTAA---ATTC---T-C------A--TTG-TGGATTG-G---TG-A-A-TTG-G-A-TA-Tta
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gggccttgtatagggtatttgccaatgatttgtttttaatttattgacattggaatttaatatatgtcttctctatacatggggagtttaaaattgggtccgccctttcacttta-TTCCT-T-GT-GA--C----TTA-AAT-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-A-A-------A-C-CAAG-AA--G---CT-----GCT-A------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TT-T-----TA---C--GT-A-C-G-CTCT-C-C---AG--T-AGA-T-----T-T--C-ATT--TC-----CCT--T-----G-C---AA-AT--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CC--C-GC-G-GAAAA--T------C--AA------AA-GC-GTTTGAGT-T---T--A-T--TA---------T-A---------AGCTACAGGGGA------AA--------T-----------AC-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---T--A--TT--TTGATAG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-AT--G-GAT-C-
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ---A-T-TAGA-GA--A---CTTT---GCC-C------TT--T-C-CAA----TT--T-T--------CTGA-----TAACTC--AT-A-C-A-C-TT-C-C---AG--T-AT--T-----A-T-----TT--T-------CCC-T-----A-CAA-AA-AC--TAT------------C---A----TT-T-CT--C-GC-----AAATCT------C--AC------AA-GC-GCT--GGT-C---TTGA-A--C----------T-AGCAATGAGGA----------A------AA--------T-----------TT-----G--AA-GTT-A-TG--A---TTCT---T-T---G--ATTTT--TTGAGGG-G--CTG-A----TG-GCATTA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTt
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gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ccctttc-------------TCTTCCA--TGC---ATC--G-AT-C-T-C---T--T--ACA------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TG----C-A-CGT-----TT--A-C--TGTTA-attgtctttaattagtttcttctccagatcttctccgcctcttccatgcatcgatctcttacatattcccttcgcatgcacgtttactgtta
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccctttcgacaaatcctggatcctccactataccgggccttgtggtaacaaaacaataattttttttaaaattcattgtctttaattagtttcttctccagatcttctccgcc--T-ATA-T-----A-T--A-ATT--TC-----CCTT-T-----G-C---AA-AC--TAC--ACTGTACAG-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-A-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGTGT-T---T--A-T--TAAC-------T-ACAGAG----G----------A------AA--------T-----------AC-----G--AA-G-T-G-TG--A---ATCC---T-T---T--AT-TT--TTGATTC-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---C-G--AATC-TTGG---
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gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGG-----A--A-G--TAA-T-G-CC-A-CACAATA-TA--C----------CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--T--ACTAT---T-G-T--A---C--C-CA-TA--TATG--CA--A-GTG-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT------CC-A------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTTGC-C---AG--T-A
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taccgaggccttgtttaacaaaaacaataaaactatcatctctccaagcaggttttcttcgccc-------------TC---TTCC---A--TGT---TTT--G-GT-A-T-C---T--T--A--------T-T------T--A---T-C----T-TC-A--C-A--TA----T-A-CGT-----CT--T-T--TGTTA-CAG--CG---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-----A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--GCT-C--A-T-T-ATG----A------AA----T----A-CTT----AAC-ATC-TC-CCTA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C----A----------------GAT-T----------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-GGT-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--T-A--C-----C---GA-A-A--AAA-GATGT---ACT-C------T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-AA-A--A-A---------TT-T--C-TTA--GGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--------CGG-A--AAT-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA---T-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-A-A-CCA---A-T-TA-G-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--A-TTA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-C---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-TAAAA---------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--ATT--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A---T--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TTG-G-AAT-C-A---CNN--NNNN-NNN--N---NNN-NNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTC-GAA-T-GAGCCTTCTGGGCTTt
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ccttgtataacaaacaatacagttattgctaatgatttttttttacaac------T--C---C-CATG-T-TC----C-A--TG----T-A-CGC-----AT--T-T--AATCA-AGA--CTTGTCC-GGC---AAG-T-A-TA-AT-G---A--CACGA-AT--A-ATT-A-AA--A--C--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACAAC----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TG-T-TA-TAG---C-C---GT----T-ATG-T-----T-----T-GA---T---C-T--A----------------GATATT---------------A-----------A-------------T--------A------------TT--------G--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTTACT-A--CC----G---AA-A-G--AAA-GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-T-AAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAATA-A-CA----A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA-------T--T---C--C-CACTA--T--G--AG--CAGTG-G-A-------A-C-CAAG-AA--A----T-----GTC-C------TT----C-CACTT--TT--T-TT-------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-TATC-TTT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA--C--TAT--A-------GAT---A-T--TTCT-CA--C-GC-C-CAAAAA-C------C--AC------AA-GC-GCTTGG-T-C---T--A-T--T----------TTA---------A----------A------AC--------T-----------TTTG---A--AA-G-TGA-T---A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG--G---atttttt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aagttaatgttgcctaataattttttttaatttatgacttataatatatctctctatacaagatgtttaatgaattaaaatattatctctctctatatagcatgttctccacctg-------------TT---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-A-C---T--TTAA--------TAC------T--C---C-C----T-TC---------------------C-----CC--T-T--AGAAA-AAAAACT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A--T-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--GA---------TA-T-C--T---G----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--TAA--C-----G---AA-A-G--AAA-GA--TG-TACTATA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--T-A---------TT-T--C-TTAA-GGG-----A--A-G--TAA-T-T-TC-A-T-AAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTTCT-C-AT-AA--C--ACT---AAT-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-T-AG-AA--A---CT-----G-C-C------TC--T-C-CAC-T--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AGA-T-ATA-T-----A-G--C-ATT--CC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC---AT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ACT----T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG--G----NN-NNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCAGAACT-GAGCCTTCTGGGCTTTCGat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttttaattcattgacattaaatattatcttctccgtc-------------TC---TTCC---A--TGC---ATC--G-AC-A-T-C---T--T--A---------AT------T--C---C-C----T-T--A--C-C--TG----C-A-CGT-----AT--TAC--TGTTA-AA---CT---C---GC-C-A-G-T---TA-AT-CC--A--C-CGA-GA--A-ATT-A-AA--A--C--TT-----A--T--------ATGCACA-A---A-TT---AAA--A----AA----GA-T-G-TTAAATC----A-T-A--TA--TA--G-T-C------T--TG----A------A-----T----A-T-------AC-ATGCTT-C-TA-T-T---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----C-AT---C---T-T--A----------------GAG-TT---------------A-----------A-------------T--------C------------TA--------TA-AA---------AT-T-CCAT---T----G--C--T-G-G-------CA--A--A---A-G-T--C--A-----------G-ACA-------------TC--T-AC-C-----G---AA-A-G--A----ATGT--TACT-TA-----TAT--TAT--A--C--A---T-A-A-TC---A-GATA--A-T---------TT-T--C-TTAAAGGG-----A--A-G--T-A-T-T-CCGA-TAAAA-ATTA--C-A--A-----TGG-A--A-T-C-----GAC-TGTTCCT-C-CT--------ACT---AATCA-T--A---A--C-CA-TACGT--G--CA--C-GTGTG-A-ACA---A-T-TAAG--A--A---CT-----GCC-C------TA--T-C-CATTT--TT--T-G--------CT-C-----AAA--C--GTGA-C-A---TT-T-C---AG--C-TTA-T-----A-T--C-ATT--T------CCCT-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------T-T---A----TT-T-CATCC-GC-T-CAAAA--T------T--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAC--------T-A---------G----------GGTTGT-ACGAGGACA-T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTCT--T-T---C--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A---TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG--G---TTt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cgggcccttgtttaacaaacaacataattttttttaaaatatcaccttgtcttaattggtagttcattctacctagatttctccgccGGCCTTCGA-AGTAACAAAGCA-ATAC--CG-TTT----TTAA--------------ATTACTTAATTTCAT-------------TCGAGCTCTGATA--TGTA--TGC--G-GT-C-T-C---T--T--A--------AAT------T--CTATC-A----T-TC-A--C-A----------A-TG-------------------A-TAG--CT---CT-G-C-C-AAG-T-A-TA----G---A--C-CG---T--A-ATT-A-AG--A-AC--TT--CA-A--T--------ATG---GCG---G-AT---AAA--A----AG------------TACA--------------A--TG-----------T-T-GCC----A------A-----G----A-CT-----AG---TG-TT-C-TAGT-G---C-C---GT------ATA-T-----T-----T-AT---C-----T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T--------G--C-AT-G-G-------CA--A--AGTAA-G-T--C--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----G---AA-AAG--AAA-GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--AG-C--A---T-AGA-TC---A-GA-A--A-AA--------TTGT--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-T-AAA-A-TA--C-A--A-----TGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-CT-AC--G--ACT---AAT-A-T--A---CCGC-TA-GA--T--GC-CA--C-GTG-ACG-CAA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TTGGT-C-CACTT--TT--T-G--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-TTTG-C-C---AG--TAATAGT-----A-T--C-ATTTCTC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-TGCA--C-GCTC-CAAAA--TA-----C--AG------AA-GCGGCTTGGGT-CCTTT--A-C--TAGAGGGGTTAC-A---------G----------A------AC--------A-----------TT-----T--AA-G-TCA-TA--ATTCGTTC---T-TTCCC--A--TT--TTGATTG-GT-CTG-A-TATTG-G-A-TA-TTGGG-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG--G---tt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cc-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A---------------------------T--------ATA---A-A---A-GT---GAA--A----AA----GT-T-G-TTATT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACG-GTG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TTTATATAAATGTGTA-A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-A-------CG--A--A---A-A-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----CC--AA-A-G--AAA-AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---G-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AC-AA--T--ACTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----GCC-T------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TT-ATTTTACAA--C--TG-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-C-----A-T--C-ATT--TC-----CCC--T-----C-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-G-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TC--G-AAT-C-ATTTC-G--AATatt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  attgacataatattgtgttttgcagtttcacctccgccacttccaagtaacctatatttttaatattgcaatgatgaaagacgtcgtgattgtatc-------------TC---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-C-C---T--T--AAA------TAT------T--C---A-C----T-GC-G--C-A--TA----T-A-CGC-----CT--G-AAATGTTA-TAA---T---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATTTA-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AAA---GT-T-G-TTACAAC----A-T-G--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-----GT--C-T-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------TT-------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TT------------------------------------------------------T-T--A--C--C---G-A-A-TC---A-AA-A--A------------T-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-C--A-TAAAA---TA--C-A--A-----CGG-A--AAT-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA---T-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CAC-T--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---GATA--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTA-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-GA-AATC-TTG--G---
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cAA--CT---CC-GGC-C-TAG-T-A-TC-AT-G---A--C-CGA--T--A-ATT-A-AA--A-CT--CT--TC-AA-T--------ATG---T-A---A-AT---AAA--A----AAAG--GTCT-G-T-ACA-C----AAT-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----A-C--TG-TC-C-TA-T-G---CAC---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA----------T-C-T--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--------G-T-AC--A-----------G-AA--T--AAC-----TCT--T-A--CC----G---AA-A-G--AAA-GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-AC-TAA-T-T-CCCA-TAAA----TA--C-A--A-----CGG-A--AAT-C-----G-CCT-TTCCG-C-CTCAA--C--TCTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCA-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----C-A--T--GT---C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-TA--AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TG-T-CA--C-GC-C-C-AAA--T------C--AA------AA-GC-GCTT-GGT-C---T--A-T--T----------TAA---------A----------A------AC--------T-----------TT-----GACAA-G-T-A-TG--A---AATC---TCT---C--A--TTTCTTGATTG-G--CTG-A-A-TTG-G---TA-TT--G-AAT-CAA---C-GA-AATC-TTG--GA--TTGTGAAT-Catt
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aggaaaaagaaggggcgggggtgatgtacatttgctgtaccaatctgactaaacaactcggcttggattgcccactggcccagccacagagaatttgtaatattctatcatagattaactcttgtgttttaaagaaattatatcctaacttaacttactgtaaacataaggttggcgttacctaagtgctgttcttcgataaacgatgtcgtaaccgggacgtaatattgaccatagtattgtgtttttgcagttttacaagtaggcctaatatttctaatttttaagaattacaatagacgtcgtgtttgtatctacacc-AT---T---T-T--A----------------AAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A-------------------------AA---------ATAT-C--T---T----------T-G-GTTTTATCCA--ATGG---G-G-T-CCTTA-----------G-AAA-T--AAACATATTTT--T-A--CACAGAG---AG-A-G--AAA-AA-ATG-TA-T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-CC---A-GA-A--A-A---------TG-A--T-TTAAGGG------A--A-G--TTA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--A-----AGG-A--A-T-T-----G-C-T-TTCCT-C-GT-AA--C--ATTAA---T-G-T--A---C--C-AA-CA--T--G--CA--C-GTA-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----ACC-T------TT--T-C-CACCT--TT--T-T--------CT-A-----CGA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ACG--TC-----ACCC-T-----G-C---AA-AC--TAT--A-------G-A---A-T--GT-T-CA--C-GC-C-GAAAA--T------C--AC------GA-AC------GAT-C---T--A-TAAT----------T-ACTCAG----G----------A------AA--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---T--A--TT--TTGATTG-G--ATN-N-N-NNN-N-N-NN-NN--N-NNN-N-N---N-N--NNNN-NNN--N---NNN-NNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNT--------------TC-GAA-T-GAGCCTTCTGGTCTTTCGattt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgaaaaacgaatatttggtttctttgtcaattgaaacctcattcgagaaG-TACCGGGCC-TGTTAAGTTAT-TGCCA-ATGA--TTGTTT----TTAA--------------ta
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -------------TC---TTCC---A--T------CC--G-GT-ACT-C---TAAT--A--------TAT------T--C---T-C----C-TC-T--CGA--TG----T-AGCGC-----CT--T-C--GGTTA-ACGGCCA---CC-GGC-CCAAG-TCA-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-G----T--GC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G--GACA-C----A-T-T--TC--CAATG-T-A--A-C-T-ATG----AGAAATTG-----T----A-CC-----AAC-A---TT-C-TAGT-GA--C-CGGGGT--CGT-ATG-------T-----T-ATTTAC---C-T--ACAGATTTGGTTAGAGCGAT-TT---------------A-----------A-------------A--------A------------TAAAGGCCTCC--AA---------AT-T-C--TATAT----GACC-AT-GTG-------CC--A--A---A-G-TAAC--AGTAGACAGACCG-AAA-CTAA-------TTT--T-A--CCT---T---AA-A-GGAAAA-GATA-G-TACTCTA-----A-T--T-T--AC-C--A---T-A-A-TC---A-AA-A--A-A----------G-T--C-TTAAAAGGAGC--A--A-G--TAtttattgacataaattttgtctctctatacaggatgtctccgcctcttccatccggtactctaatatattctcctctcgatgtagcgccttcggttaacggccaccggcccaagtcataatgaccgaataattaaaagtgcatatgaaaataaaaaagttggacacatttccaatgtaactatgagaaattgtaccaacattctagtgaccggggtcgtatgttatttacctacagatttggttagagcgatttaaaataaaggcctccaaattctatatgaccatgtgccaaagtaacagtagacagaccgaaactaattttaccttaaaggaaaagatagtactctaatttaccataatcaaaaaagtcttaaaaggagcaagtataacttatcattccattttaatcaaa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtaccgggcctgttaagttattgccaatgattgtttttaatttattgacataaattttgtctctctatacaggatgtctccgccG-TACCGGGCCTAATT--TTGACATAA-A-ATTG--T--TTTGCGGTTA-----------------------------T-------------TC---CTCC---GCCTCT---TCC--AAGT-A-T-C---C--G--A--------TAT------T--A---T-TAAA-T-TT-G--C-AA-TGACAAT-A-GAC-----GT--T-G--TGTT--------T--------------G-T-A-TGGAT-GCCGA--C-CGA-AT--A-AAT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATA---A-T---A-AT---AAA--AAAAAAA----GT-T-G-TTACT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----Ataacttatcattccattttaatcaaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acatggaacgggggggggatgtacatttgtaccattgactaagactcggcttgacattattcactgtcactgaccagcccacagagaatttgtaatattctatcaatagataatctgtcttttaaaggaaattatatctaactaatttactgtaaacataaggttggcgtatctaggtgctgttttgaaaaacgatgtaTG-TC-C-T--T-G---C-T---CC--C-C-ATG-T-----T-----T-A--------C-T--A----------------GAT-TTGATTATA--------A-----------A-------------T--------G------------TG--------T--AAGTAATATCGAT-T-C--T---TTGTAG--C-AT-A-A-------CA--A----------T-GC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----A---AA-A-G--AAA-AA--TG-TATT-TA-----T-T--T-A--A--C--A---GAA-A-TC---A-GA-A--A-T---------TT-T--C-TTAAGGGG-----G--A-A--TA----T-TC-A-TAGA-----A--T-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C---TTCCT-C-----A--C--AT--A-TGT-G-T--A---C-------TA--T--G--CA--C-GTG-G-G---A---A-C-CAAA-GA--A---CT------CT-C------TT--T-T-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C---T-A-C-A-CTTC-C---------------T-----A-T--T-TTT--TC-----CTCC-T-----A-C---A------TAA--A---------------------T-CA--C-GC-G-TAAAC--T---------AC-------A-GC-GATT-GGT-C----------------------------------------------------AC-------------------------------------------A---ATTC---T-T---G--A---T--TTGATTG-GAAATG---T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-GA-AATC-TTG--ACT-TTC-GAATGGTTGAA-AGTTTGACATATTTGGAATTTTGAA-ATTGGACTGTcgtacgtacggt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cag-TC-C-TA-T-A---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------ATATAAATGTGTA-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-A-------CA--A--A---A-T-T-AC--------------G-AAA-T--A-------TCCC-T-A--T-----C---AA-A-G--AAA-AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---G-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGG------A--A-G--TAA-T-T-CC---TAAAA---TA--G-C--A-----TGA-A------C-----GAC-T-TTCCT-C-AA-AA--C--ACTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--A--CA--C-TTG-G-A-------A-G-CAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TTTTT-T--------CT-A-----CAA--C--TT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATT-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-G-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTG--G---
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T------------------------------------A------A---------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AGTC-TTatt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -AA--A-AC--TT--CA-A--T--------ATA---A-A---A-AT---TAA--A----AA----GT-T-----ACA-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AC---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------ATATAAATGAGTATT--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A--------TT--C-A--CA----G---AA-A-G--AAA-AA--CG-TATT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---G-GA-A--A-A---------Tacattcaaactacataatcattaattagcatggagtatatgaaacggcagattctgagaatgactctccattccctttgtaatttctaatttccttgtccataataagcttaaaatcattttccgcttcgttccgcatttagcaataccctcttatgacgtcacctgagacacttgcatttagccactatattaatttatgtgacaaatgaccaattttattggtgatgtccagactttcaggagtgaaaggacttaactttatatcagggactggaccagtttttaagt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatgaagctacaccgaagatttactctttatctaacatcgatttgtatctctctctaatcttctattcattcttctagtttattgccaagaaattttgtttacctcatgaacg-CG-TA--T--A--CA--C-GGG-G-A-TAAGGAA-C-CAAG-AATTA---CT-----GGC-CATTTTATT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TC-ATAC--CAA--C--TT-A-CTA-CTTT-------AG--T-ATA-T-----AGT--C-ATT--TCGGGCGCTCG-TGGAG-A-CGT-AACAC--TATA-A-------G-TTAAA-TCATT-T-CG--C-CC-G-CTAAA--TAGTAGGC--ACCAATCAAA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAC--------T-A---------A----------AAGG---AA--------T-----------TT-----G--AT-G-T-A-TG--A---ATTTCTAT-T---G--A--TT--TTG-TTG-G--CTG-A-A-TTG-G-A-TA-TT--G-ACT-T-----T-G--AATC-TTG--GA--TTT-GAAT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acttcgctcaataatttaaatcaaatggtgttcgcaCC---A--TGTCACTCC--G-CT-A-T-CAGCC--T--A--------TATATAATAT--C---TGC----T-TC-GGTC-A--TAGT--T-A-CGC------T--T-CGGCGTTA-AGG--AC---GC-GGCTC-AAG-T-AATA-ATAG---A--C-AGAGAT--ATATT-A-AATAA-GT--TT--TCTA--T--------ATG---A-A---ATAC---AAT--A----AA----GT-TTG-TTACAAC----A-T-T--TACGTA--G-T-C--AAT-T-A-G----A------A-----TTTTGA-CCGA---AACTATG-TCTC-TA-T-G---C-C---GTACC-T--TA-T-----TCTTCTT-AT---C---C-T--A----------------GAT-TTT--------------A-----------A-------------T--------AA-----------TA--------T--AA---------AT-TGCA-T---T----G--CCAT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--AATA--------G-AAACT--A-------TTTA-T-A--CC----G---AA-A-G--AAA-GATGT---ACT-TAATCTCTGT--C-T--A--C--AGGGT-A-A-TC---A-TATACCA-A---------TT-T--CCTTAAGG----------A-G--TAAAT-T-CC-A-TAAA----TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-------G-C-T-TTCCT-CTATCAA--C--AGTACTAAT-A-T--T---C--CACA-TAA-T--GACCAAAC-ATG-G-A-CCA---A-T-TAGC-A-------CT-----GCC-C------TT----C-CACTTATTT--T-TATATCATACT-A-----CAA--CACGT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATG-A-----A-T--C-AAT--TT-----CCCC-T-----ATC---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--G-GC-CGCAAAA------------AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---CTGA-T--T----------T-A---------A----------A------ACT-------T-----------TT-----G--AA-G-TCA-TGTAA---ATTC---T-C------A--TTG-TGGATTG-G---TG-A-A-TTG-G-A-TA-Ta
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gggccttgtatagggtatttgccaatgatttgtttttaatttattgacattggaatttaatatatgtcttctctatacatggggagtttaaaattgggtccgccctttcacttta-TTCCT-T-GT-GA--C----TTA-AAT-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-A-A-------A-C-CAAG-AA--G---CT-----GCT-A------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TT-T-----TA---C--GT-A-C-G-CTCT-C-C---AG--T-AGA-T-----T-T--C-ATT--TC-----CCT--T-----G-C---AA-AT--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CC--C-GC-G-GAAAA--T------C--AA------AA-GC-GTTTGAGT-T---T--A-T--TA---------T-A---------AGCTACAGGGGA------AA--------T-----------AC-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---T--A--TT--TTGATAG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-AT--G-GAT-C-
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---A-T-TAGA-GA--A---CTTT---GCC-C------TT--T-C-CAA----TT--T-T--------CTGA-----TAACTC--AT-A-C-A-C-TT-C-C---AG--T-AT--T-----A-T-----TT--T-------CCC-T-----A-CAA-AA-AC--TAT------------C---A----TT-T-CT--C-GC-----AAATCT------C--AC------AA-GC-GCT--GGT-C---TTGA-A--C----------T-AGCAATGAGGA----------A------AA--------T-----------TT-----G--AA-GTT-A-TG--A---TTCT---T-T---G--ATTTT--TTGAGGG-G--CTG-A----TG-GCATTA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cGACAAATCCTGGATCCTCCACTA-TACCGGGCCTTG-T-GGTAACAAAACA-ATAATTT--TTT----TTAA--------------A------------AT-------------TC---
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ccctttc-------------TC---TTCC---A--TGC---ATC--G-AT-C-T-C---T--T--ACA------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TG----C-A-CGT-----TT--A-C--TGTTA-attgtctttaattagtttcttctccagatcttctccgcctcttccatgcatcgatctcttacatattcccttcgcatgcacgtttactgtta
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               g--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A--C--TT--TC-A--CTAACAACAATG---A-ATAAA-GT---AAA--C----AA----GG-T---TTGTA-C----C-T-TATTA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------ACCACAT----A-CTTTCG-GGC-GT--TC-C-TG-T-ATTAC-T---TT--T-C-AGG-T-----T-----TCAT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------AAATTATGTAAAATA--------T--AAT--------AT-T-C--T---T----G--C-CTCA-G-------CA--A--A---A---T-AC--A-----------G-AAA-T--C-------TTC--A-G--C-----C---AA-A-G--AAA-AATGTA-T-TG-TA-----T-T--T-TTAG--CCGA---T-A-GTTC---A-GA-C--ATACTCTTCTTCCT-C--C-TTAAGGGATTCCTC--A-GTCTAA-T-T-CC-A-CAAAGTA-TA--C-ACCC-----CGG-A--A-T-CGTTCGG-T-T-TTCCT-TGAC-AA--CTTACTGT-AAT-cctgcatagcgaattt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                            tggaactgggaggaaataagaagggagttacatttgcttaccattgactaaatgaactcggcttgacattattcactgccatggccagcctcacagaggaattgtatagattactatcacatagaatatatcctgttgtttttgttaaaggattacgattatagtctaaaaacctatacatactcgtaatcggtacagtggcgtacctaactgctgtcatatgcttcaagacggcaggtgttcggtttgaaccgcgagcgttatgtacttagaagcatatatggaattggtactttattaatccagttttactcaagtaccatatatgtctactcatgagcatcgtgtttggtatcctacctgagcGGCCTTGT--AGTAACAAAATA-ATAAG-T--TTT----TTAAATTCATTGTCTTTAA------------ATAGTATTTCTCGCCTC---TTCC---A--TGTA--TC-----GT-C-T-C---T--T--AAA------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TA----TTA-CGCGAAAA---------TATTA-AAA--CT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-----A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------AT----A-A---A-ATTTTAAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C------T-T--TA--TA--G-TGC--A-T-T-ACG----A------A-----T----A-AT-----AAC-ATG-TT-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-------T-----T-AT---A---T-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T---A---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--C----C-----A---GA-A-G--AAA-GA--TG-TAC--TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--CTTTAAGGGG-----A--A-G--TAA-TAT-TC-A-T--CA-A-TA--CTA--A-----TGGAA--A-T-C-----G-C---TTCCT-C-CT-AA--C--AT----AAT-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TT--TGT--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTAT-C-C---AG--T-TTA-T-----A-T--C--TT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAG--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-T-CAAAA--TTA----C--AC------AG-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAAC-------T-A---------A----------GGGTTGTACAGAGGACAT-----------TT-----G--AA-G-T-A-GT--A---ATTC---T-T---C--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AA---NNN--N---NNN-NNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNAGATGTC-G-A-T-GAGCCTTCTGGGCTTTCGca
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Reference ( family-826 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GACAAATCCTGGATCCNCCACTG-TACCG-GGCCTTGTT-------AGTNACANAACA-ATNA--T-TTT----TTAA--------------A------------AT---------------TC---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-T-C---T--T--A--------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TG----T-A-CGC-----CT--T-C--TGTTA-AAA--CT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--T-A--C-----G---AA-A-G--AAA-GATGTG-TACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA-AAT-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG--G---TT-NGAAT-CTTGAA-CGTTTGA-ATATT--GAATTTTGAATGTCGNAATGTC-GAA-T-GAGCCTTCTGGGCTTTCG
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagttaatgttgcctaataattttttttaatttatgacttataatatatctctctatacaagatgtttaatgaattaaaatattatctctctctatatagcatgttctccacctg---------------TT---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-A-C---T--TTAA--------TAC------T--C---C-C----T-TC---------------------C-----CC--T-T--AGAAA-AAAAACT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A--T-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--GA---------TA-T-C--T---G----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--TAA--C-----G---AA-A-G--AAA-GA--TG-TACTATA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--T-A---------TT-T--C-TTAA-GGG-----A--A-G--TAA-T-T-TC-A-T-AAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTTCT-C-AT-AA--C--ACT---AAT-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-T-AG-AA--A---CT-----G-C-C------TC--T-C-CAC-T--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AGA-T-ATA-T-----A-G--C-ATT--CC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC---AT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ACT----T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG--G----N-NNNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCAGAACT-GAGCCTTCTGGGCTTTCGat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tttttaattcattgacattaaatattatcttctccgtc---------------TC---TTCC---A--TGC---ATC--G-AC-A-T-C---T--T--A---------AT------T--C---C-C----T-T--A--C-C--TG----C-A-CGT-----AT--TAC--TGTTA-AA---CT---C---GC-C-A-G-T---TA-AT-CC--A--C-CGA-GA--A-ATT-A-AA--A--C--TT-----A--T--------ATGCACA-A---A-TT---AAA--A----AA----GA-T-G-TTAAATC----A-T-A--TA--TA--G-T-C------T--TG----A------A-----T----A-T-------AC-ATGCTT-C-TA-T-T---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----C-AT---C---T-T--A----------------GAG-TT---------------A-----------A-------------T--------C------------TA--------TA-AA---------AT-T-CCAT---T----G--C--T-G-G-------CA--A--A---A-G-T--C--A-----------G-ACA-------------TC--T-AC-C-----G---AA-A-G--A----ATGT--TACT-TA-----TAT--TAT--A--C--A---T-A-A-TC---A-GATA--A-T---------TT-T--C-TTAAAGGG-----A--A-G--T-A-T-T-CCGA-TAAAA-ATTA--C-A--A-----TGG-A--A-T-C-----GAC-TGTTCCT-C-CT--------ACT---AATCA-T--A---A--C-CA-TACGT--G--CA--C-GTGTG-A-ACA---A-T-TAAG--A--A---CT-----GCC-C------TA--T-C-CATTT--TT--T-G--------CT-C-----AAA--C--GTGA-C-A---TT-T-C---AG--C-TTA-T-----A-T--C-ATT--T------CCCT-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------T-T---A----TT-T-CATCC-GC-T-CAAAA--T------T--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAC--------T-A---------G----------GGTTGT-ACGAGGACA-T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTCT--T-T---C--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A---TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG--G---TT-t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cgggcccttgtttaacaaacaacataattttttttaaaatatcaccttgtcttaattggtagttcattctacctagatttctccgcc-GGCCTTCGA-------AGTAACAAAGCA-ATAC--CGTTT----TTAA--------------ATTACTTAATTTCAT---------------TCGAGCTCTGATA--TGTA--TGC--G-GT-C-T-C---T--T--A--------AAT------T--CTATC-A----T-TC-A--C-A----------A-TG-------------------A-TAG--CT---CT-G-C-C-AAG-T-A-TA----G---A--C-CG---T--A-ATT-A-AG--A-AC--TT--CA-A--T--------ATG---GCG---G-AT---AAA--A----AG------------TACA--------------A--TG-----------T-T-GCC----A------A-----G----A-CT-----AG---TG-TT-C-TAGT-G---C-C---GT------ATA-T-----T-----T-AT---C-----T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T--------G--C-AT-G-G-------CA--A--AGTAA-G-T--C--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----G---AA-AAG--AAA-GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--AG-C--A---T-AGA-TC---A-GA-A--A-AA--------TTGT--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-T-AAA-A-TA--C-A--A-----TGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-CT-AC--G--ACT---AAT-A-T--A---CCGC-TA-GA--T--GC-CA--C-GTG-ACG-CAA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TTGGT-C-CACTT--TT--T-G--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-TTTG-C-C---AG--TAATAGT-----A-T--C-ATTTCTC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-TGCA--C-GCTC-CAAAA--TA-----C--AG------AA-GCGGCTTGGGT-CCTTT--A-C--TAGAGGGGTTAC-A---------G----------A------AC--------A-----------TT-----T--AA-G-TCA-TA--ATTCGTTC---T-TTCCC--A--TT--TTGATTG-GT-CTG-A-TATTG-G-A-TA-TTGGG-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG--G---tt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cc-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A---------------------------T--------ATA---A-A---A-GT---GAA--A----AA----GT-T-G-TTATT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACG-GTG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TTTATATAAATGTGTA-A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-A-------CG--A--A---A-A-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----CC--AA-A-G--AAA-AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---G-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AC-AA--T--ACTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----GCC-T------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TT-ATTTTACAA--C--TG-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-C-----A-T--C-ATT--TC-----CCC--T-----C-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-G-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TC--G-AAT-C-ATTTC-G--AATatt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attgacataatattgtgttttgcagtttcacctccgccacttccaagtaacctatatttttaatattgcaatgatgaaagacgtcgtgattgtatc---------------TC---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-C-C---T--T--AAA------TAT------T--C---A-C----T-GC-G--C-A--TA----T-A-CGC-----CT--G-AAATGTTA-TAA---T---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATTTA-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AAA---GT-T-G-TTACAAC----A-T-G--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-----GT--C-T-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------TT-------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TT------------------------------------------------------T-T--A--C--C---G-A-A-TC---A-AA-A--A------------T-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-C--A-TAAAA---TA--C-A--A-----CGG-A--AAT-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA---T-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CAC-T--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---GATA--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTA-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-GA-AATC-TTG--G---
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cAA--CT---CC-GGC-C-TAG-T-A-TC-AT-G---A--C-CGA--T--A-ATT-A-AA--A-CT--CT--TC-AA-T--------ATG---T-A---A-AT---AAA--A----AAAG--GTCT-G-T-ACA-C----AAT-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----A-C--TG-TC-C-TA-T-G---CAC---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA----------T-C-T--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--------G-T-AC--A-----------G-AA--T--AAC-----TCT--T-A--CC----G---AA-A-G--AAA-GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-AC-TAA-T-T-CCCA-TAAA----TA--C-A--A-----CGG-A--AAT-C-----G-CCT-TTCCG-C-CTCAA--C--TCTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCA-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----C-A--T--GT---C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-TA--AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TG-T-CA--C-GC-C-C-AAA--T------C--AA------AA-GC-GCTT-GGT-C---T--A-T--T----------TAA---------A----------A------AC--------T-----------TT-----GACAA-G-T-A-TG--A---AATC---TCT---C--A--TTTCTTGATTG-G--CTG-A-A-TTG-G---TA-TT--G-AAT-CAA---C-GA-AATC-TTG--GA--TTGTGAAT-Catt
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aggaaaaagaaggggcgggggtgatgtacatttgctgtaccaatctgactaaacaactcggcttggattgcccactggcccagccacagagaatttgtaatattctatcatagattaactcttgtgttttaaagaaattatatcctaacttaacttactgtaaacataaggttggcgttacctaagtgctgttcttcgataaacgatgtcgtaaccgggacgtaatattgaccatagtattgtgtttttgcagttttacaagtaggcctaatatttctaatttttaagaattacaatagacgtcgtgtttgtatctacacc-AT---T---T-T--A----------------AAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A-------------------------AA---------ATAT-C--T---T----------T-G-GTTTTATCCA--ATGG---G-G-T-CCTTA-----------G-AAA-T--AAACATATTTT--T-A--CACAGAG---AG-A-G--AAA-AA-ATG-TA-T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-CC---A-GA-A--A-A---------TG-A--T-TTAAGGG------A--A-G--TTA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--A-----AGG-A--A-T-T-----G-C-T-TTCCT-C-GT-AA--C--ATTAA---T-G-T--A---C--C-AA-CA--T--G--CA--C-GTA-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----ACC-T------TT--T-C-CACCT--TT--T-T--------CT-A-----CGA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ACG--TC-----ACCC-T-----G-C---AA-AC--TAT--A-------G-A---A-T--GT-T-CA--C-GC-C-GAAAA--T------C--AC------GA-AC------GAT-C---T--A-TAAT----------T-ACTCAG----G----------A------AA--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---T--A--TT--TTGATTG-G--ATN-N-N-NNN-N-N-NN-NN--N-NNN-N-N---N-N--NNNN-NNN--N---NN-NNNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNT--------------TC-GAA-T-GAGCCTTCTGGTCTTTCGattt
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acatggaacgggggggggatgtacatttgtaccattgactaagactcggcttgacattattcactgtcactgaccagcccacagagaatttgtaatattctatcaatagataatctgtcttttaaaggaaattatatctaactaatttactgtaaacataaggttggcgtatctaggtgctgttttgaaaaacgatgtaTG-TC-C-T--T-G---C-T---CC--C-C-ATG-T-----T-----T-A--------C-T--A----------------GAT-TTGATTATA--------A-----------A-------------T--------G------------TG--------T--AAGTAATATCGAT-T-C--T---TTGTAG--C-AT-A-A-------CA--A----------T-GC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----A---AA-A-G--AAA-AA--TG-TATT-TA-----T-T--T-A--A--C--A---GAA-A-TC---A-GA-A--A-T---------TT-T--C-TTAAGGGG-----G--A-A--TA----T-TC-A-TAGA-----A--T-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C---TTCCT-C-----A--C--AT--A-TGT-G-T--A---C-------TA--T--G--CA--C-GTG-G-G---A---A-C-CAAA-GA--A---CT------CT-C------TT--T-T-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C---T-A-C-A-CTTC-C---------------T-----A-T--T-TTT--TC-----CTCC-T-----A-C---A------TAA--A---------------------T-CA--C-GC-G-TAAAC--T---------AC-------A-GC-GATT-GGT-C----------------------------------------------------AC-------------------------------------------A---ATTC---T-T---G--A---T--TTGATTG-GAAATG---T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-GA-AATC-TTG--ACT-TT-CGAATGGTTGAA-AGTTTGACATATTTGGAATTTTGAA-ATTGGACTGTcgtacgtacggt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cag-TC-C-TA-T-A---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------ATATAAATGTGTA-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-A-------CA--A--A---A-T-T-AC--------------G-AAA-T--A-------TCCC-T-A--T-----C---AA-A-G--AAA-AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---G-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGG------A--A-G--TAA-T-T-CC---TAAAA---TA--G-C--A-----TGA-A------C-----GAC-T-TTCCT-C-AA-AA--C--ACTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--A--CA--C-TTG-G-A-------A-G-CAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TTTTT-T--------CT-A-----CAA--C--TT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATT-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-G-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTG--G---
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T------------------------------------A------A---------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AGTC-TTatt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -AA--A-AC--TT--CA-A--T--------ATA---A-A---A-AT---TAA--A----AA----GT-T-----ACA-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AC---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------ATATAAATGAGTATT--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A--------TT--C-A--CA----G---AA-A-G--AAA-AA--CG-TATT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---G-GA-A--A-A---------Tacattcaaactacataatcattaattagcatggagtatatgaaacggcagattctgagaatgactctccattccctttgtaatttctaatttccttgtccataataagcttaaaatcattttccgcttcgttccgcatttagcaataccctcttatgacgtcacctgagacacttgcatttagccactatattaatttatgtgacaaatgaccaattttattggtgatgtccagactttcaggagtgaaaggacttaactttatatcagggactggaccagtttttaagt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aatgaagctacaccgaagatttactctttatctaacatcgatttgtatctctctctaatcttctattcattcttctagtttattgccaagaaattttgtttacctcatgaacg-CG-TA--T--A--CA--C-GGG-G-A-TAAGGAA-C-CAAG-AATTA---CT-----GGC-CATTTTATT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TC-ATAC--CAA--C--TT-A-CTA-CTTT-------AG--T-ATA-T-----AGT--C-ATT--TCGGGCGCTCG-TGGAG-A-CGT-AACAC--TATA-A-------G-TTAAA-TCATT-T-CG--C-CC-G-CTAAA--TAGTAGGC--ACCAATCAAA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAC--------T-A---------A----------AAGG---AA--------T-----------TT-----G--AT-G-T-A-TG--A---ATTTCTAT-T---G--A--TT--TTG-TTG-G--CTG-A-A-TTG-G-A-TA-TT--G-ACT-T-----T-G--AATC-TTG--GA--TT-TGAAT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acttcgctcaataatttaaatcaaatggtgttcgcaCC---A--TGTCACTCC--G-CT-A-T-CAGCC--T--A--------TATATAATAT--C---TGC----T-TC-GGTC-A--TAGT--T-A-CGC------T--T-CGGCGTTA-AGG--AC---GC-GGCTC-AAG-T-AATA-ATAG---A--C-AGAGAT--ATATT-A-AATAA-GT--TT--TCTA--T--------ATG---A-A---ATAC---AAT--A----AA----GT-TTG-TTACAAC----A-T-T--TACGTA--G-T-C--AAT-T-A-G----A------A-----TTTTGA-CCGA---AACTATG-TCTC-TA-T-G---C-C---GTACC-T--TA-T-----TCTTCTT-AT---C---C-T--A----------------GAT-TTT--------------A-----------A-------------T--------AA-----------TA--------T--AA---------AT-TGCA-T---T----G--CCAT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--AATA--------G-AAACT--A-------TTTA-T-A--CC----G---AA-A-G--AAA-GATGT---ACT-TAATCTCTGT--C-T--A--C--AGGGT-A-A-TC---A-TATACCA-A---------TT-T--CCTTAAGG----------A-G--TAAAT-T-CC-A-TAAA----TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-------G-C-T-TTCCT-CTATCAA--C--AGTACTAAT-A-T--T---C--CACA-TAA-T--GACCAAAC-ATG-G-A-CCA---A-T-TAGC-A-------CT-----GCC-C------TT----C-CACTTATTT--T-TATATCATACT-A-----CAA--CACGT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATG-A-----A-T--C-AAT--TT-----CCCC-T-----ATC---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--G-GC-CGCAAAA------------AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---CTGA-T--T----------T-A---------A----------A------ACT-------T-----------TT-----G--AA-G-TCA-TGTAA---ATTC---T-C------A--TTG-TGGATTG-G---TG-A-A-TTG-G-A-TA-Ta
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gggccttgtatagggtatttgccaatgatttgtttttaatttattgacattggaatttaatatatgtcttctctatacatggggagtttaaaattgggtccgccctttcacttta-TTCCT-T-GT-GA--C----TTA-AAT-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-A-A-------A-C-CAAG-AA--G---CT-----GCT-A------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TT-T-----TA---C--GT-A-C-G-CTCT-C-C---AG--T-AGA-T-----T-T--C-ATT--TC-----CCT--T-----G-C---AA-AT--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CC--C-GC-G-GAAAA--T------C--AA------AA-GC-GTTTGAGT-T---T--A-T--TA---------T-A---------AGCTACAGGGGA------AA--------T-----------AC-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---T--A--TT--TTGATAG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-AT--G-GAT-C-
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---A-T-TAGA-GA--A---CTTT---GCC-C------TT--T-C-CAA----TT--T-T--------CTGA-----TAACTC--AT-A-C-A-C-TT-C-C---AG--T-AT--T-----A-T-----TT--T-------CCC-T-----A-CAA-AA-AC--TAT------------C---A----TT-T-CT--C-GC-----AAATCT------C--AC------AA-GC-GCT--GGT-C---TTGA-A--C----------T-AGCAATGAGGA----------A------AA--------T-----------TT-----G--AA-GTT-A-TG--A---TTCT---T-T---G--ATTTT--TTGAGGG-G--CTG-A----TG-GCATTA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cGACAAATCCTGGATCCTCCACTA-TACCG-GGCCTTG-T-------GGTAACAAAACA-ATAATTT-TTT----TTAA--------------A------------AT---------------TC---
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ccctttc---------------TC---TTCC---A--TGC---ATC--G-AT-C-T-C---T--T--ACA------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TG----C-A-CGT-----TT--A-C--TGTTA-attgtctttaattagtttcttctccagatcttctccgcctcttccatgcatcgatctcttacatattcccttcgcatgcacgtttactgtta
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ccctttcgacaaatcctggatcctccactataccgggccttgtggtaacaaaacaataattttttttaaaattcattgtctttaattagtttcttctccagatcttctccgcc--T-ATA-T-----A-T--A-ATT--TC-----CCTT-T-----G-C---AA-AC--TAC--ACTGTACAG-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-A-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGTGT-T---T--A-T--TAAC-------T-ACAGAG----G----------A------AA--------T-----------AC-----G--AA-G-T-G-TG--A---ATCC---T-T---T--AT-TT--TTGATTC-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---C-G--AATC-TTG--G---
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gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---A--A--TT--TGGATTG-G--ATT-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---C-G--AATC-T
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GACAAATCCTGGATCCGCCACTGCTACCG-GGCCTTGTT-------AGTTATTTGACT-ATGA--T-TTT----TTAA--------------A------------AT---------------TC---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-T-C---T--T--A--------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TA----T-A-CGC-----CT--T-T--TATTA-AGG--CG---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------AA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--T-A--C-----G---AA-A-G--AAA-GATGTG-TACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-AA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAAGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TCTCT-C-AT-AA--C--ACTAA-AAT-A-T--A---C--C-CA-TA--C--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG--G---NN-NNNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTC-GAA-T-GAGCCTTCTGGGCTTTCGta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ------------AT---------------TC---TT---------GT-----C--G-GT-A-T-C---T--T--AGTTTAGATTAT------T--C---C-CCGTTT-TCTG--C-G--TA----T-A-CGC-----TT--T-A--TGTTG-AAA--CT---CCTGGC-C-AAG-TTA-TA-AT-G---AGAC-CGA-AT--A-ATC-GTAA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AGTGGTGT-T-A-CTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------------T----A-CT-----AAC-ATG--C-C-TA-TTG---C-C---GT----T-ATG-T-----T-----T-A----C---C-TCAA----------------GAT-TTTT-------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A--------TT--T-ACTC-----G---AA-A-G--AAATGATGTACTGTT-TA-----T-T--T-T--A--C------T-A-A-TC---ATGA-AC-A-A---------AT-T--C-TTAAGGG---------A-A--TAA-T-T-CC-A-T-AAA-A-TA--C----A-----CGA-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACT---AAT-A-T--A---CT-C-CA-TA-----G--CA--C-GT--G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--AACGCT-----GCC-C------TTGCT-C-CACTT--TT--T-T--------CTAA-----CAA--C--GT-AGC-A-CTTT-C-C-------T-ATA-T-----A-T--C-ATT--T-------CCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---T-A--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC--CTTGGGC-C---T--A-T--TA---------G-A---------A----------A------AC--------T-----------TTGAACAG--AA-G-T---TG--A---ATTC---T-T---GA-A--TTG-TTGATTGTG--CTG---T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TT
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): ATGACGTCACCTGAGAATATTGCATACATTATGTCACTATATTATCGTTTTGATTTTCGTGACAAATGGCTAGTTTTATTGACTACGAGGAGAGTGACTGTGAAATATTGATGATTGACTCGGGTTTAAGGACTGAACTTTTATATATTACGTAGAGACTGGGCCAGTTTCTAAGTCACATGGAACTGGAGGAAAAATGGGGGTGGATTGGGCTATCTTCCGATGACTAGACATATATAATGACTCAGTTTGACATTATTCATCAGCAGCCCGCAAAGAATTCGTAATATTCTATCAAAAGATAACTTTTGTGTGTTAAAAGAAAATATATCGAACTGTACCACGGGACCAGTATATAGGTGAGCGTATCTA
Unaligned ( gi|29 ): AGTCACATGGAATGGGGGGGGAGAACGACTAAAAGGAGACTCGGCTTGACATATTACTGGCCGCCCCACAGAGTATCTTGCCTTTAGCATTCCACTGATGAAATCTTGTGTTTTACAGAAGATTTATATCGAACTCATTTACTGTAACTAAATCCGTATGTGGGCTATCTACTGTAAGGCTGTTTTAAAATCAATATAGTACCAGGGCGAGATTTTGAGAGGGGGG
Unaligned ( gi|30 ): AAGTCACATGGAACTGGGGTGGGGGGGGGGGCGACTAGACTCGGCTTGACATGATTTACTAGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATAATCTAAAGTATATCGAACTCTATTTTACTGTAAATAAATCCGTATGTGGGCGTATCTACTGTAGAGGGCTGTTTTCAAATTCAATATAGTACCCGTAGTGGCGGATTTAAAGGGGGACGGCCCCGCCCT
Unaligned ( gi|32 ): AGTCCGATGGAAACTGGGGGGGGGGGACTAAGACTCGGCTTGACATTATTTACTTGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATAATCTTTGTGTTTTAAAGAAATTGAATATCGAACTCATTTTACTGTTGATATCGTGTGGGCGTATCTTTTAAGAAATACGATATAGTACCGCAATGGCGGATTTAGA
Unaligned ( gi|37 ): ATTCATATCAAAATCATTACTGCCAGATTCCTGTATGCTTTCAGCAAGCTTACCCGGTAGATTTGATATAAATGAATGTTATTACATTTAAACCTTTCATTGTGGCAAGGTGGGCAATATTTACAGATA
Unaligned ( gi|40 ): ACGTCATTTTCAAAAGACTCTTGCATATATTTACACACAAAACACAACTATATTTTACGTTGTCATCTCTCTGACAAATGGTCAGTGTTATCAGCAGCACGGATAGTGACCGTGAAATAT
Unaligned ( gi|41 ): ACTTACTGTAATCATAAGGTTGGCGTACCTAACTGCTGTTTTGTTAAACGATGTCGTACCGGACGTTTTATTGACATATTATTGTATTTAACAGTTTTACAAGTAGCCTATATTTCTAA
Unaligned ( gi|43 ): TCATTGTACCGTCATTTACTGGTAAACAATAAATATCTGTATTGTGGGGCGATTCTAGCTGTCAGTGCTTGTTTTAAAATCAATATAGTACTCGAGTGGGCGATTTATGAGC
Unaligned ( gi|44 ): AGTCACATGGAACTGGGGGGCGACTAAGACTCGGCTTGACATTATTTATGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATTAATCTTTGTGTTTACAAGAAATTAT
Unaligned ( gi|46 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA
Unaligned ( gi|48 ): AACAATAAGTTTTTTAAATTCATTGTCTTTTTAAAAATAGTATCTTCTCCGTATCTCTCCGCCTCT
Unaligned ( gi|49 ): ATAACAACAAAGAACGAACTGGTGGGATTACTTTTTCTCAACTAAACGACTTACCAGCTT






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Reference ( family-826 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GACAAATCCTGGATCCNCCACTG-TACCG-GGCCTTGTT-------AGTAACANAACA-ATNA--T-TTT----TTAA--------------A------------AT---------------TC---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-T-C---T--T--A--------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TG----T-A-CGC-----CT--T-C--TGTTA-AAA--CT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--T-A--C-----G---AA-A-G--AAA-GATGTG-TACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA-AAT-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG-G--TT-C--GAAT-CTTGAA-CGTTTGA-ATATT--GAATTTTGAATGTCGNAATGTC-GAA-T-GAGCCTTCTGGGCTTTCG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttttttaatttattgacattgtatattgtctctctaaatagatgttctccgccTT-------ATTGACATTATATATTA--T-CTT----CTCCT-------------A------------GT---------------TC---TTCC---A--TGT---TCCACG-GT-A-A-C---T--T--AAA------TAT------T--C---CGC----T-TC-G--C-A--CA----TTA-CGC-----CT--T-C--CGTGA-AAA--CT---CC-GGC-C-AAGGT-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--TT-------ATG---A-A---A-AT---AAACAA----AA----GT---G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-TTATA----A------A-----T----A-CT-----AAC-A-G-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-TTACGGT-----T-----T-AT---CATCC-C--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA----------T-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-ATA-A--A-------TTT--T-A--C-----AGAAAA-A-A--AAA-GAT-CG-TACTATA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GG-A--ATA---------TTCT--C-TTAAGGGG-----A--A-T--AAA-T-T-CC-A-TAAAATA-TA--C-A--AA----CGG-G--A-T-C-----G-C-T-TTCCTTC-AT-A---C--ACTCT-AAT-A-T--A---C--C-CA-TA--TT-G--CA--C-GTG-GGA-CCA---A-T-AAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TTA-T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTC-T-C----G--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-G--TT-T-CAC-C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------TA----------TT-----G--AA-G-T-A-TG------ATTT---T-C---A--A--TG--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TT-TG--G-AATAA-A---C-G---ATCATTG-G--cgta
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagttaatgttgcctaataattttttttaatttatgacttataatatatctctctatacaagatgtttaatgaattaaaatattatctctctctatatagcatgttctccacctg---------------TT---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-A-C---T--TTAA--------TAC------T--C---C-C----T-TC---------------------C-----CC--T-T--AGAAA-AAAAACT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A--T-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--GA---------TA-T-C--T---G----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--TAA--C-----G---AA-A-G--AAA-GA--TG-TACTATA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--T-A---------TT-T--C-TTAA-GGG-----A--A-G--TAA-T-T-TC-A-T-AAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTTCT-C-AT-AA--C--ACT---AAT-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-T-AG-AA--A---CT-----G-C-C------TC--T-C-CAC-T--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AGA-T-ATA-T-----A-G--C-ATT--CC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC---AT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ACT----T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG-G---N-N--NNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCAGAACT-GAGCCTTCTGGGCTTTCGat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tttttaattcattgacattaaatattatcttctccgtc---------------TC---TTCC---A--TGC---ATC--G-AC-A-T-C---T--T--A---------AT------T--C---C-C----T-T--A--C-C--TG----C-A-CGT-----AT--TAC--TGTTA-AA---CT---C---GC-C-A-G-T---TA-AT-CC--A--C-CGA-GA--A-ATT-A-AA--A--C--TT-----A--T--------ATGCACA-A---A-TT---AAA--A----AA----GA-T-G-TTAAATC----A-T-A--TA--TA--G-T-C------T--TG----A------A-----T----A-T-------AC-ATGCTT-C-TA-T-T---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----C-AT---C---T-T--A----------------GAG-TT---------------A-----------A-------------T--------C------------TA--------TA-AA---------AT-T-CCAT---T----G--C--T-G-G-------CA--A--A---A-G-T--C--A-----------G-ACA-------------TC--T-AC-C-----G---AA-A-G--A----ATGT--TACT-TA-----TAT--TAT--A--C--A---T-A-A-TC---A-GATA--A-T---------TT-T--C-TTAAAGGG-----A--A-G--T-A-T-T-CCGA-TAAAA-ATTA--C-A--A-----TGG-A--A-T-C-----GAC-TGTTCCT-C-CT--------ACT---AATCA-T--A---A--C-CA-TACGT--G--CA--C-GTGTG-A-ACA---A-T-TAAG--A--A---CT-----GCC-C------TA--T-C-CATTT--TT--T-G--------CT-C-----AAA--C--GTGA-C-A---TT-T-C---AG--C-TTA-T-----A-T--C-ATT--T------CCCT-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------T-T---A----TT-T-CATCC-GC-T-CAAAA--T------T--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAC--------T-A---------G----------GGTTGT-ACGAGGACA-T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTCT--T-T---C--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A---TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG-G--TT-t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cgggcccttgtttaacaaacaacataattttttttaaaatatcaccttgtcttaattggtagttcattctacctagatttctccgcc-GGCCTTCGA-------AGTAACAAAGCA-ATAC--CGTTT----TTAA--------------ATTACTTAATTTCAT---------------TCGAGCTCTGATA--TGTA--TGC--G-GT-C-T-C---T--T--A--------AAT------T--CTATC-A----T-TC-A--C-A----------A-TG-------------------A-TAG--CT---CT-G-C-C-AAG-T-A-TA----G---A--C-CG---T--A-ATT-A-AG--A-AC--TT--CA-A--T--------ATG---GCG---G-AT---AAA--A----AG------------TACA--------------A--TG-----------T-T-GCC----A------A-----G----A-CT-----AG---TG-TT-C-TAGT-G---C-C---GT------ATA-T-----T-----T-AT---C-----T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T--------G--C-AT-G-G-------CA--A--AGTAA-G-T--C--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----G---AA-AAG--AAA-GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--AG-C--A---T-AGA-TC---A-GA-A--A-AA--------TTGT--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-T-AAA-A-TA--C-A--A-----TGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-CT-AC--G--ACT---AAT-A-T--A---CCGC-TA-GA--T--GC-CA--C-GTG-ACG-CAA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TTGGT-C-CACTT--TT--T-G--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-TTTG-C-C---AG--TAATAGT-----A-T--C-ATTTCTC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-TGCA--C-GCTC-CAAAA--TA-----C--AG------AA-GCGGCTTGGGT-CCTTT--A-C--TAGAGGGGTTAC-A---------G----------A------AC--------A-----------TT-----T--AA-G-TCA-TA--ATTCGTTC---T-TTCCC--A--TT--TTGATTG-GT-CTG-A-TATTG-G-A-TA-TTGGG-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG-G--tt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cc-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A---------------------------T--------ATA---A-A---A-GT---GAA--A----AA----GT-T-G-TTATT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACG-GTG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TTTATATAAATGTGTA-A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-A-------CG--A--A---A-A-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----CC--AA-A-G--AAA-AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---G-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AC-AA--T--ACTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----GCC-T------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TT-ATTTTACAA--C--TG-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-C-----A-T--C-ATT--TC-----CCC--T-----C-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-G-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TC--G-AAT-C-ATTTC-G--AATatt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attgacataatattgtgttttgcagtttcacctccgccacttccaagtaacctatatttttaatattgcaatgatgaaagacgtcgtgattgtatc---------------TC---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-C-C---T--T--AAA------TAT------T--C---A-C----T-GC-G--C-A--TA----T-A-CGC-----CT--G-AAATGTTA-TAA---T---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATTTA-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AAA---GT-T-G-TTACAAC----A-T-G--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-----GT--C-T-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------TT-------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TT------------------------------------------------------T-T--A--C--C---G-A-A-TC---A-AA-A--A------------T-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-C--A-TAAAA---TA--C-A--A-----CGG-A--AAT-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA---T-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CAC-T--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---GATA--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTA-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-GA-AATC-TTG-G--
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cAA--CT---CC-GGC-C-TAG-T-A-TC-AT-G---A--C-CGA--T--A-ATT-A-AA--A-CT--CT--TC-AA-T--------ATG---T-A---A-AT---AAA--A----AAAG--GTCT-G-T-ACA-C----AAT-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----A-C--TG-TC-C-TA-T-G---CAC---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA----------T-C-T--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--------G-T-AC--A-----------G-AA--T--AAC-----TCT--T-A--CC----G---AA-A-G--AAA-GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-AC-TAA-T-T-CCCA-TAAA----TA--C-A--A-----CGG-A--AAT-C-----G-CCT-TTCCG-C-CTCAA--C--TCTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCA-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----C-A--T--GT---C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-TA--AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TG-T-CA--C-GC-C-C-AAA--T------C--AA------AA-GC-GCTT-GGT-C---T--A-T--T----------TAA---------A----------A------AC--------T-----------TT-----GACAA-G-T-A-TG--A---AATC---TCT---C--A--TTTCTTGATTG-G--CTG-A-A-TTG-G---TA-TT--G-AAT-CAA---C-GA-AATC-TTG-GA-TTGT--GAAT-Catt
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aggaaaaagaaggggcgggggtgatgtacatttgctgtaccaatctgactaaacaactcggcttggattgcccactggcccagccacagagaatttgtaatattctatcatagattaactcttgtgttttaaagaaattatatcctaacttaacttactgtaaacataaggttggcgttacctaagtgctgttcttcgataaacgatgtcgtaaccgggacgtaatattgaccatagtattgtgtttttgcagttttacaagtaggcctaatatttctaatttttaagaattacaatagacgtcgtgtttgtatctacacc-AT---T---T-T--A----------------AAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A-------------------------AA---------ATAT-C--T---T----------T-G-GTTTTATCCA--ATGG---G-G-T-CCTTA-----------G-AAA-T--AAACATATTTT--T-A--CACAGAG---AG-A-G--AAA-AA-ATG-TA-T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-CC---A-GA-A--A-A---------TG-A--T-TTAAGGG------A--A-G--TTA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--A-----AGG-A--A-T-T-----G-C-T-TTCCT-C-GT-AA--C--ATTAA---T-G-T--A---C--C-AA-CA--T--G--CA--C-GTA-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----ACC-T------TT--T-C-CACCT--TT--T-T--------CT-A-----CGA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ACG--TC-----ACCC-T-----G-C---AA-AC--TAT--A-------G-A---A-T--GT-T-CA--C-GC-C-GAAAA--T------C--AC------GA-AC------GAT-C---T--A-TAAT----------T-ACTCAG----G----------A------AA--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---T--A--TT--TTGATTG-G--ATN-N-N-NNN-N-N-NN-NN--N-NNN-N-N---N-N--NNNN-NNN-N--NN-N--NNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNT--------------TC-GAA-T-GAGCCTTCTGGTCTTTCGattt
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acatggaacgggggggggatgtacatttgtaccattgactaagactcggcttgacattattcactgtcactgaccagcccacagagaatttgtaatattctatcaatagataatctgtcttttaaaggaaattatatctaactaatttactgtaaacataaggttggcgtatctaggtgctgttttgaaaaacgatgtaTG-TC-C-T--T-G---C-T---CC--C-C-ATG-T-----T-----T-A--------C-T--A----------------GAT-TTGATTATA--------A-----------A-------------T--------G------------TG--------T--AAGTAATATCGAT-T-C--T---TTGTAG--C-AT-A-A-------CA--A----------T-GC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----A---AA-A-G--AAA-AA--TG-TATT-TA-----T-T--T-A--A--C--A---GAA-A-TC---A-GA-A--A-T---------TT-T--C-TTAAGGGG-----G--A-A--TA----T-TC-A-TAGA-----A--T-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C---TTCCT-C-----A--C--AT--A-TGT-G-T--A---C-------TA--T--G--CA--C-GTG-G-G---A---A-C-CAAA-GA--A---CT------CT-C------TT--T-T-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C---T-A-C-A-CTTC-C---------------T-----A-T--T-TTT--TC-----CTCC-T-----A-C---A------TAA--A---------------------T-CA--C-GC-G-TAAAC--T---------AC-------A-GC-GATT-GGT-C----------------------------------------------------AC-------------------------------------------A---ATTC---T-T---G--A---T--TTGATTG-GAAATG---T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-GA-AATC-TTG-ACTTT-C--GAATGGTTGAA-AGTTTGACATATTTGGAATTTTGAA-ATTGGACTGTcgtacgtacggt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cag-TC-C-TA-T-A---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------ATATAAATGTGTA-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-A-------CA--A--A---A-T-T-AC--------------G-AAA-T--A-------TCCC-T-A--T-----C---AA-A-G--AAA-AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---G-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGG------A--A-G--TAA-T-T-CC---TAAAA---TA--G-C--A-----TGA-A------C-----GAC-T-TTCCT-C-AA-AA--C--ACTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--A--CA--C-TTG-G-A-------A-G-CAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TTTTT-T--------CT-A-----CAA--C--TT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATT-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-G-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTG-G--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T------------------------------------A------A---------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AGTC-TTatt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -AA--A-AC--TT--CA-A--T--------ATA---A-A---A-AT---TAA--A----AA----GT-T-----ACA-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AC---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------ATATAAATGAGTATT--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A--------TT--C-A--CA----G---AA-A-G--AAA-AA--CG-TATT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---G-GA-A--A-A---------Tacattcaaactacataatcattaattagcatggagtatatgaaacggcagattctgagaatgactctccattccctttgtaatttctaatttccttgtccataataagcttaaaatcattttccgcttcgttccgcatttagcaataccctcttatgacgtcacctgagacacttgcatttagccactatattaatttatgtgacaaatgaccaattttattggtgatgtccagactttcaggagtgaaaggacttaactttatatcagggactggaccagtttttaagt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aatgaagctacaccgaagatttactctttatctaacatcgatttgtatctctctctaatcttctattcattcttctagtttattgccaagaaattttgtttacctcatgaacg-CG-TA--T--A--CA--C-GGG-G-A-TAAGGAA-C-CAAG-AATTA---CT-----GGC-CATTTTATT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TC-ATAC--CAA--C--TT-A-CTA-CTTT-------AG--T-ATA-T-----AGT--C-ATT--TCGGGCGCTCG-TGGAG-A-CGT-AACAC--TATA-A-------G-TTAAA-TCATT-T-CG--C-CC-G-CTAAA--TAGTAGGC--ACCAATCAAA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAC--------T-A---------A----------AAGG---AA--------T-----------TT-----G--AT-G-T-A-TG--A---ATTTCTAT-T---G--A--TT--TTG-TTG-G--CTG-A-A-TTG-G-A-TA-TT--G-ACT-T-----T-G--AATC-TTG-GA-TT-T--GAAT-
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gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gggccttgtatagggtatttgccaatgatttgtttttaatttattgacattggaatttaatatatgtcttctctatacatggggagtttaaaattgggtccgccctttcacttta-TTCCT-T-GT-GA--C----TTA-AAT-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-A-A-------A-C-CAAG-AA--G---CT-----GCT-A------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TT-T-----TA---C--GT-A-C-G-CTCT-C-C---AG--T-AGA-T-----T-T--C-ATT--TC-----CCT--T-----G-C---AA-AT--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CC--C-GC-G-GAAAA--T------C--AA------AA-GC-GTTTGAGT-T---T--A-T--TA---------T-A---------AGCTACAGGGGA------AA--------T-----------AC-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---T--A--TT--TTGATAG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-AT--G-GAT-C-
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---A-T-TAGA-GA--A---CTTT---GCC-C------TT--T-C-CAA----TT--T-T--------CTGA-----TAACTC--AT-A-C-A-C-TT-C-C---AG--T-AT--T-----A-T-----TT--T-------CCC-T-----A-CAA-AA-AC--TAT------------C---A----TT-T-CT--C-GC-----AAATCT------C--AC------AA-GC-GCT--GGT-C---TTGA-A--C----------T-AGCAATGAGGA----------A------AA--------T-----------TT-----G--AA-GTT-A-TG--A---TTCT---T-T---G--ATTTT--TTGAGGG-G--CTG-A----TG-GCATTA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cGACAAATCCTGGATCCTCCACTA-TACCG-GGCCTTG-T-------GGTAACAAAACA-ATAATTT-TTT----TTAA--------------A------------AT---------------TC---
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ccctttc---------------TC---TTCC---A--TGC---ATC--G-AT-C-T-C---T--T--ACA------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TG----C-A-CGT-----TT--A-C--TGTTA-attgtctttaattagtttcttctccagatcttctccgcctcttccatgcatcgatctcttacatattcccttcgcatgcacgtttactgtta
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ccctttcgacaaatcctggatcctccactataccgggccttgtggtaacaaaacaataattttttttaaaattcattgtctttaattagtttcttctccagatcttctccgcc--T-ATA-T-----A-T--A-ATT--TC-----CCTT-T-----G-C---AA-AC--TAC--ACTGTACAG-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-A-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGTGT-T---T--A-T--TAAC-------T-ACAGAG----G----------A------AA--------T-----------AC-----G--AA-G-T-G-TG--A---ATCC---T-T---T--AT-TT--TTGATTC-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---C-G--AATC-TTG-G--
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gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---A--A--TT--TGGATTG-G--ATT-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---C-G--AATC-Ttc
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GACAAATCCTGGATCCGCCACTGCTACCG-GGCCTTGTT-------AGTTATTTGACT-ATGA--T-TTT----TTAA--------------A------------AT---------------TC---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-T-C---T--T--A--------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TA----T-A-CGC-----CT--T-T--TATTA-AGG--CG---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------AA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--T-A--C-----G---AA-A-G--AAA-GATGTG-TACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-AA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAAGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TCTCT-C-AT-AA--C--ACTAA-AAT-A-T--A---C--C-CA-TA--C--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG-G--NN-N--NNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTC-GAA-T-GAGCCTTCTGGGCTTTCGta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ------------AT---------------TC---TT---------GT-----C--G-GT-A-T-C---T--T--AGTTTAGATTAT------T--C---C-CCGTTT-TCTG--C-G--TA----T-A-CGC-----TT--T-A--TGTTG-AAA--CT---CCTGGC-C-AAG-TTA-TA-AT-G---AGAC-CGA-AT--A-ATC-GTAA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AGTGGTGT-T-A-CTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------------T----A-CT-----AAC-ATG--C-C-TA-TTG---C-C---GT----T-ATG-T-----T-----T-A----C---C-TCAA----------------GAT-TTTT-------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A--------TT--T-ACTC-----G---AA-A-G--AAATGATGTACTGTT-TA-----T-T--T-T--A--C------T-A-A-TC---ATGA-AC-A-A---------AT-T--C-TTAAGGG---------A-A--TAA-T-T-CC-A-T-AAA-A-TA--C----A-----CGA-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACT---AAT-A-T--A---CT-C-CA-TA-----G--CA--C-GT--G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--AACGCT-----GCC-C------TTGCT-C-CACTT--TT--T-T--------CTAA-----CAA--C--GT-AGC-A-CTTT-C-C-------T-ATA-T-----A-T--C-ATT--T-------CCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---T-A--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC--CTTGGGC-C---T--A-T--TA---------G-A---------A----------A------AC--------T-----------TTGAACAG--AA-G-T---TG--A---ATTC---T-T---GA-A--TTG-TTGATTGTG--CTG---T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TT
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): ATGACGTCACCTGAGAATATTGCATACATTATGTCACTATATTATCGTTTTGATTTTCGTGACAAATGGCTAGTTTTATTGACTACGAGGAGAGTGACTGTGAAATATTGATGATTGACTCGGGTTTAAGGACTGAACTTTTATATATTACGTAGAGACTGGGCCAGTTTCTAAGTCACATGGAACTGGAGGAAAAATGGGGGTGGATTGGGCTATCTTCCGATGACTAGACATATATAATGACTCAGTTTGACATTATTCATCAGCAGCCCGCAAAGAATTCGTAATATTCTATCAAAAGATAACTTTTGTGTGTTAAAAGAAAATATATCGAACTGTACCACGGGACCAGTATATAGGTGAGCGTATCTA
Unaligned ( gi|29 ): AGTCACATGGAATGGGGGGGGAGAACGACTAAAAGGAGACTCGGCTTGACATATTACTGGCCGCCCCACAGAGTATCTTGCCTTTAGCATTCCACTGATGAAATCTTGTGTTTTACAGAAGATTTATATCGAACTCATTTACTGTAACTAAATCCGTATGTGGGCTATCTACTGTAAGGCTGTTTTAAAATCAATATAGTACCAGGGCGAGATTTTGAGAGGGGGG
Unaligned ( gi|30 ): AAGTCACATGGAACTGGGGTGGGGGGGGGGGCGACTAGACTCGGCTTGACATGATTTACTAGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATAATCTAAAGTATATCGAACTCTATTTTACTGTAAATAAATCCGTATGTGGGCGTATCTACTGTAGAGGGCTGTTTTCAAATTCAATATAGTACCCGTAGTGGCGGATTTAAAGGGGGACGGCCCCGCCCT
Unaligned ( gi|32 ): AGTCCGATGGAAACTGGGGGGGGGGGACTAAGACTCGGCTTGACATTATTTACTTGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATAATCTTTGTGTTTTAAAGAAATTGAATATCGAACTCATTTTACTGTTGATATCGTGTGGGCGTATCTTTTAAGAAATACGATATAGTACCGCAATGGCGGATTTAGA
Unaligned ( gi|37 ): ATTCATATCAAAATCATTACTGCCAGATTCCTGTATGCTTTCAGCAAGCTTACCCGGTAGATTTGATATAAATGAATGTTATTACATTTAAACCTTTCATTGTGGCAAGGTGGGCAATATTTACAGATA
Unaligned ( gi|40 ): ACGTCATTTTCAAAAGACTCTTGCATATATTTACACACAAAACACAACTATATTTTACGTTGTCATCTCTCTGACAAATGGTCAGTGTTATCAGCAGCACGGATAGTGACCGTGAAATAT
Unaligned ( gi|41 ): ACTTACTGTAATCATAAGGTTGGCGTACCTAACTGCTGTTTTGTTAAACGATGTCGTACCGGACGTTTTATTGACATATTATTGTATTTAACAGTTTTACAAGTAGCCTATATTTCTAA
Unaligned ( gi|43 ): TCATTGTACCGTCATTTACTGGTAAACAATAAATATCTGTATTGTGGGGCGATTCTAGCTGTCAGTGCTTGTTTTAAAATCAATATAGTACTCGAGTGGGCGATTTATGAGC
Unaligned ( gi|44 ): AGTCACATGGAACTGGGGGGCGACTAAGACTCGGCTTGACATTATTTATGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATTAATCTTTGTGTTTACAAGAAATTAT
Unaligned ( gi|46 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA
Unaligned ( gi|48 ): AACAATAAGTTTTTTAAATTCATTGTCTTTTTAAAAATAGTATCTTCTCCGTATCTCTCCGCCTCT
Unaligned ( gi|49 ): ATAACAACAAAGAACGAACTGGTGGGATTACTTTTTCTCAACTAAACGACTTACCAGCTT






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Reference ( family-826 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GACAAATCCTGGATCCNCCACTG-TACCG-GGCCTTGTT-------AGTAACANAACA-ATNA--T-TTT----TTAA--------------A------------AT---------------TC---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-T-C---T--T--A--------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TG----T-A-CGC-----CT--T-C--TGTTA-AAA--CT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--T-A--C-----G---AA-A-G--AAA-GATGTG-TACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA-AAT-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG-G--TTC--GAAT-NTTGAA-CGTTTGA-ATATT--GAATTTTGAATGTCGNAATGTC-GAA-T-GAGCCTTCTGGGCTTTCG
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagttaatgttgcctaataattttttttaatttatgacttataatatatctctctatacaagatgtttaatgaattaaaatattatctctctctatatagcatgttctccacctg---------------TT---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-A-C---T--TTAA--------TAC------T--C---C-C----T-TC---------------------C-----CC--T-T--AGAAA-AAAAACT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A--T-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--GA---------TA-T-C--T---G----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--TAA--C-----G---AA-A-G--AAA-GA--TG-TACTATA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--T-A---------TT-T--C-TTAA-GGG-----A--A-G--TAA-T-T-TC-A-T-AAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTTCT-C-AT-AA--C--ACT---AAT-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-T-AG-AA--A---CT-----G-C-C------TC--T-C-CAC-T--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AGA-T-ATA-T-----A-G--C-ATT--CC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC---AT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ACT----T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG-G---NN--NNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCAGAACT-GAGCCTTCTGGGCTTTCGat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tttttaattcattgacattaaatattatcttctccgtc---------------TC---TTCC---A--TGC---ATC--G-AC-A-T-C---T--T--A---------AT------T--C---C-C----T-T--A--C-C--TG----C-A-CGT-----AT--TAC--TGTTA-AA---CT---C---GC-C-A-G-T---TA-AT-CC--A--C-CGA-GA--A-ATT-A-AA--A--C--TT-----A--T--------ATGCACA-A---A-TT---AAA--A----AA----GA-T-G-TTAAATC----A-T-A--TA--TA--G-T-C------T--TG----A------A-----T----A-T-------AC-ATGCTT-C-TA-T-T---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----C-AT---C---T-T--A----------------GAG-TT---------------A-----------A-------------T--------C------------TA--------TA-AA---------AT-T-CCAT---T----G--C--T-G-G-------CA--A--A---A-G-T--C--A-----------G-ACA-------------TC--T-AC-C-----G---AA-A-G--A----ATGT--TACT-TA-----TAT--TAT--A--C--A---T-A-A-TC---A-GATA--A-T---------TT-T--C-TTAAAGGG-----A--A-G--T-A-T-T-CCGA-TAAAA-ATTA--C-A--A-----TGG-A--A-T-C-----GAC-TGTTCCT-C-CT--------ACT---AATCA-T--A---A--C-CA-TACGT--G--CA--C-GTGTG-A-ACA---A-T-TAAG--A--A---CT-----GCC-C------TA--T-C-CATTT--TT--T-G--------CT-C-----AAA--C--GTGA-C-A---TT-T-C---AG--C-TTA-T-----A-T--C-ATT--T------CCCT-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------T-T---A----TT-T-CATCC-GC-T-CAAAA--T------T--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAC--------T-A---------G----------GGTTGT-ACGAGGACA-T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTCT--T-T---C--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A---TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG-G--TTt
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cc-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A---------------------------T--------ATA---A-A---A-GT---GAA--A----AA----GT-T-G-TTATT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACG-GTG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TTTATATAAATGTGTA-A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-A-------CG--A--A---A-A-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----CC--AA-A-G--AAA-AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---G-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AC-AA--T--ACTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----GCC-T------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TT-ATTTTACAA--C--TG-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-C-----A-T--C-ATT--TC-----CCC--T-----C-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-G-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TC--G-AAT-C-ATTTC-G--AATatt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attgacataatattgtgttttgcagtttcacctccgccacttccaagtaacctatatttttaatattgcaatgatgaaagacgtcgtgattgtatc---------------TC---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-C-C---T--T--AAA------TAT------T--C---A-C----T-GC-G--C-A--TA----T-A-CGC-----CT--G-AAATGTTA-TAA---T---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATTTA-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AAA---GT-T-G-TTACAAC----A-T-G--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-----GT--C-T-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------TT-------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TT------------------------------------------------------T-T--A--C--C---G-A-A-TC---A-AA-A--A------------T-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-C--A-TAAAA---TA--C-A--A-----CGG-A--AAT-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA---T-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CAC-T--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---GATA--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTA-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-GA-AATC-TTG-G--
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cAA--CT---CC-GGC-C-TAG-T-A-TC-AT-G---A--C-CGA--T--A-ATT-A-AA--A-CT--CT--TC-AA-T--------ATG---T-A---A-AT---AAA--A----AAAG--GTCT-G-T-ACA-C----AAT-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----A-C--TG-TC-C-TA-T-G---CAC---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA----------T-C-T--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--------G-T-AC--A-----------G-AA--T--AAC-----TCT--T-A--CC----G---AA-A-G--AAA-GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-AC-TAA-T-T-CCCA-TAAA----TA--C-A--A-----CGG-A--AAT-C-----G-CCT-TTCCG-C-CTCAA--C--TCTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCA-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----C-A--T--GT---C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-TA--AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TG-T-CA--C-GC-C-C-AAA--T------C--AA------AA-GC-GCTT-GGT-C---T--A-T--T----------TAA---------A----------A------AC--------T-----------TT-----GACAA-G-T-A-TG--A---AATC---TCT---C--A--TTTCTTGATTG-G--CTG-A-A-TTG-G---TA-TT--G-AAT-CAA---C-GA-AATC-TTG-G--att
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  catgtaatatatgT-G---A--C-CAC-ATTCA-ATT-A-AA--A-AC--TTATTC-A--T--------CTA---A-A---A-AA---AAA--A----AAA---GT-T-GCTTACT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-TCT-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACG-GTG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AT---C---CGT--A----------------GAT-TTTATATTAAATATGTAA-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--G---T----G--CTAT-G-GA------CC--A--A---A-A-T-GC--A-----------GCAAA-T--A-------TCT--T-AC-C-----C---AA-A-A--AAA-AATTTG-TATT-TA-----T-TTAT-T--A--C--A---G-A-A-TC---A-G--A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGA-----C--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-G-AC-AA--T--ACT---ACT-GCT--A---C--C-CA-TA--TTCG--CA--C-GTG-G-A---A---A-C-CAAG-GA--A---AC-----GCC-T------TT--T-C-C-CTT--TT--T-TTTC-----TT-A-----CAACTC--G--A-C-A-CTGT-C-C---AG--T-ATA-TC----A-T--CAATT--TC-----CCCC-TTACCAA-C----A-AC--TATTCA-------G-T---ATT--TT-T-CA--C-GC-G-CAAAA--T------TCAAC------AA-GC-GCTCTGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AATG-T-ATTG--A---ATTC---T-T---G--A--TTA-TTGATTG-G--CTGCA-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTG-G--attgtgaatcc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aggaaaaagaaggggcgggggtgatgtacatttgctgtaccaatctgactaaacaactcggcttggattgcccactggcccagccacagagaatttgtaatattctatcatagattaactcttgtgttttaaagaaattatatcctaacttaacttactgtaaacataaggttggcgttacctaagtgctgttcttcgataaacgatgtcgtaaccgggacgtaatattgaccatagtattgtgtttttgcagttttacaagtaggcctaatatttctaatttttaagaattacaatagacgtcgtgtttgtatctacacc-AT---T---T-T--A----------------AAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A-------------------------AA---------ATAT-C--T---T----------T-G-GTTTTATCCA--ATGG---G-G-T-CCTTA-----------G-AAA-T--AAACATATTTT--T-A--CACAGAG---AG-A-G--AAA-AA-ATG-TA-T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-CC---A-GA-A--A-A---------TG-A--T-TTAAGGG------A--A-G--TTA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--A-----AGG-A--A-T-T-----G-C-T-TTCCT-C-GT-AA--C--ATTAA---T-G-T--A---C--C-AA-CA--T--G--CA--C-GTA-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----ACC-T------TT--T-C-CACCT--TT--T-T--------CT-A-----CGA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ACG--TC-----ACCC-T-----G-C---AA-AC--TAT--A-------G-A---A-T--GT-T-CA--C-GC-C-GAAAA--T------C--AC------GA-AC------GAT-C---T--A-TAAT----------T-ACTCAG----G----------A------AA--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---T--A--TT--TTGATTG-G--ATN-N-N-NNN-N-N-NN-NN--N-NNN-N-N---N-N--NNNN-NNN-N--NNN--NNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNT--------------TC-GAA-T-GAGCCTTCTGGTCTTTCGattt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cgaaaaacgaatatttggtttctttgtcaattgaaacctcattcgagaa---------------TC---TTCC---A--T------CC--G-GT-ACT-C---TAAT--A--------TAT------T--C---T-C----C-TC-T--CGA--TG----T-AGCGC-----CT--T-C--GGTTA-ACGGCCA---CC-GGC-CCAAG-TCA-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-G----T--GC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G--GACA-C----A-T-T--TC--CAATG-T-A--A-C-T-ATG----AGAAATTG-----T----A-CC-----AAC-A---TT-C-TAGT-GA--C-CGGGGT--CGT-ATG-------T-----T-ATTTAC---C-T--ACAGATTTGGTTAGAGCGAT-TT---------------A-----------A-------------A--------A------------TAAAGGCCTCC--AA---------AT-T-C--TATAT----GACC-AT-GTG-------CC--A--A---A-G-TAAC--AGTAGACAGACCG-AAA-CTAA-------TTT--T-A--CCT---T---AA-A-GGAAAA-GATA-G-TACTCTA-----A-T--T-T--AC-C--A---T-A-A-TC---A-AA-A--A-A----------G-T--C-TTAAAAGGAGC--A--A-G--TAta
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtaccgggcctgttaagttattgccaatgattgtttttaatttattgacataaattttgtctctctatacaggatgtctccgccG-TACCG-GGCCTAATT--------TTGACATAA-A-ATTG--T-TTTGCGGTTA-----------------------------T---------------TC---CTCC---GCCTCT---TCC--AAGT-A-T-C---C--G--A--------TAT------T--A---T-TAAA-T-TT-G--C-AA-TGACAAT-A-GAC-----GT--T-G--TGTT--------T--------------G-T-A-TGGAT-GCCGA--C-CGA-AT--A-AAT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATA---A-T---A-AT---AAA--AAAAAAA----GT-T-G-TTACT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----Ataacttatcattccattttaatcaaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acatggaacgggggggggatgtacatttgtaccattgactaagactcggcttgacattattcactgtcactgaccagcccacagagaatttgtaatattctatcaatagataatctgtcttttaaaggaaattatatctaactaatttactgtaaacataaggttggcgtatctaggtgctgttttgaaaaacgatgtaTG-TC-C-T--T-G---C-T---CC--C-C-ATG-T-----T-----T-A--------C-T--A----------------GAT-TTGATTATA--------A-----------A-------------T--------G------------TG--------T--AAGTAATATCGAT-T-C--T---TTGTAG--C-AT-A-A-------CA--A----------T-GC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----A---AA-A-G--AAA-AA--TG-TATT-TA-----T-T--T-A--A--C--A---GAA-A-TC---A-GA-A--A-T---------TT-T--C-TTAAGGGG-----G--A-A--TA----T-TC-A-TAGA-----A--T-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C---TTCCT-C-----A--C--AT--A-TGT-G-T--A---C-------TA--T--G--CA--C-GTG-G-G---A---A-C-CAAA-GA--A---CT------CT-C------TT--T-T-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C---T-A-C-A-CTTC-C---------------T-----A-T--T-TTT--TC-----CTCC-T-----A-C---A------TAA--A---------------------T-CA--C-GC-G-TAAAC--T---------AC-------A-GC-GATT-GGT-C----------------------------------------------------AC-------------------------------------------A---ATTC---T-T---G--A---T--TTGATTG-GAAATG---T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-GA-AATC-TTG-ACTTTC--GAATGGTTGAA-AGTTTGACATATTTGGAATTTTGAA-ATTGGACTGTcgtacgtacggt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cag-TC-C-TA-T-A---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------ATATAAATGTGTA-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-A-------CA--A--A---A-T-T-AC--------------G-AAA-T--A-------TCCC-T-A--T-----C---AA-A-G--AAA-AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---G-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGG------A--A-G--TAA-T-T-CC---TAAAA---TA--G-C--A-----TGA-A------C-----GAC-T-TTCCT-C-AA-AA--C--ACTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--A--CA--C-TTG-G-A-------A-G-CAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TTTTT-T--------CT-A-----CAA--C--TT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATT-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-G-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTG-G--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T------------------------------------A------A---------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AGTC-TTatt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -AA--A-AC--TT--CA-A--T--------ATA---A-A---A-AT---TAA--A----AA----GT-T-----ACA-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AC---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------ATATAAATGAGTATT--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A--------TT--C-A--CA----G---AA-A-G--AAA-AA--CG-TATT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---G-GA-A--A-A---------Tacattcaaactacataatcattaattagcatggagtatatgaaacggcagattctgagaatgactctccattccctttgtaatttctaatttccttgtccataataagcttaaaatcattttccgcttcgttccgcatttagcaataccctcttatgacgtcacctgagacacttgcatttagccactatattaatttatgtgacaaatgaccaattttattggtgatgtccagactttcaggagtgaaaggacttaactttatatcagggactggaccagtttttaagt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aatgaagctacaccgaagatttactctttatctaacatcgatttgtatctctctctaatcttctattcattcttctagtttattgccaagaaattttgtttacctcatgaacg-CG-TA--T--A--CA--C-GGG-G-A-TAAGGAA-C-CAAG-AATTA---CT-----GGC-CATTTTATT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TC-ATAC--CAA--C--TT-A-CTA-CTTT-------AG--T-ATA-T-----AGT--C-ATT--TCGGGCGCTCG-TGGAG-A-CGT-AACAC--TATA-A-------G-TTAAA-TCATT-T-CG--C-CC-G-CTAAA--TAGTAGGC--ACCAATCAAA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAC--------T-A---------A----------AAGG---AA--------T-----------TT-----G--AT-G-T-A-TG--A---ATTTCTAT-T---G--A--TT--TTG-TTG-G--CTG-A-A-TTG-G-A-TA-TT--G-ACT-T-----T-G--AATC-TTG-GA-TTT--GAAT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acttcgctcaataatttaaatcaaatggtgttcgcaCC---A--TGTCACTCC--G-CT-A-T-CAGCC--T--A--------TATATAATAT--C---TGC----T-TC-GGTC-A--TAGT--T-A-CGC------T--T-CGGCGTTA-AGG--AC---GC-GGCTC-AAG-T-AATA-ATAG---A--C-AGAGAT--ATATT-A-AATAA-GT--TT--TCTA--T--------ATG---A-A---ATAC---AAT--A----AA----GT-TTG-TTACAAC----A-T-T--TACGTA--G-T-C--AAT-T-A-G----A------A-----TTTTGA-CCGA---AACTATG-TCTC-TA-T-G---C-C---GTACC-T--TA-T-----TCTTCTT-AT---C---C-T--A----------------GAT-TTT--------------A-----------A-------------T--------AA-----------TA--------T--AA---------AT-TGCA-T---T----G--CCAT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--AATA--------G-AAACT--A-------TTTA-T-A--CC----G---AA-A-G--AAA-GATGT---ACT-TAATCTCTGT--C-T--A--C--AGGGT-A-A-TC---A-TATACCA-A---------TT-T--CCTTAAGG----------A-G--TAAAT-T-CC-A-TAAA----TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-------G-C-T-TTCCT-CTATCAA--C--AGTACTAAT-A-T--T---C--CACA-TAA-T--GACCAAAC-ATG-G-A-CCA---A-T-TAGC-A-------CT-----GCC-C------TT----C-CACTTATTT--T-TATATCATACT-A-----CAA--CACGT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATG-A-----A-T--C-AAT--TT-----CCCC-T-----ATC---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--G-GC-CGCAAAA------------AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---CTGA-T--T----------T-A---------A----------A------ACT-------T-----------TT-----G--AA-G-TCA-TGTAA---ATTC---T-C------A--TTG-TGGATTG-G---TG-A-A-TTG-G-A-TA-Ta
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gggccttgtatagggtatttgccaatgatttgtttttaatttattgacattggaatttaatatatgtcttctctatacatggggagtttaaaattgggtccgccctttcacttta-TTCCT-T-GT-GA--C----TTA-AAT-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-A-A-------A-C-CAAG-AA--G---CT-----GCT-A------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TT-T-----TA---C--GT-A-C-G-CTCT-C-C---AG--T-AGA-T-----T-T--C-ATT--TC-----CCT--T-----G-C---AA-AT--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CC--C-GC-G-GAAAA--T------C--AA------AA-GC-GTTTGAGT-T---T--A-T--TA---------T-A---------AGCTACAGGGGA------AA--------T-----------AC-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---T--A--TT--TTGATAG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-AT--G-GAT-C-
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---A-T-TAGA-GA--A---CTTT---GCC-C------TT--T-C-CAA----TT--T-T--------CTGA-----TAACTC--AT-A-C-A-C-TT-C-C---AG--T-AT--T-----A-T-----TT--T-------CCC-T-----A-CAA-AA-AC--TAT------------C---A----TT-T-CT--C-GC-----AAATCT------C--AC------AA-GC-GCT--GGT-C---TTGA-A--C----------T-AGCAATGAGGA----------A------AA--------T-----------TT-----G--AA-GTT-A-TG--A---TTCT---T-T---G--ATTTT--TTGAGGG-G--CTG-A----TG-GCATTA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cGACAAATCCTGGATCCTCCACTA-TACCG-GGCCTTG-T-------GGTAACAAAACA-ATAATTT-TTT----TTAA--------------A------------AT---------------TC---
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ccctttc---------------TC---TTCC---A--TGC---ATC--G-AT-C-T-C---T--T--ACA------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TG----C-A-CGT-----TT--A-C--TGTTA-attgtctttaattagtttcttctccagatcttctccgcctcttccatgcatcgatctcttacatattcccttcgcatgcacgtttactgtta
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ccctttcgacaaatcctggatcctccactataccgggccttgtggtaacaaaacaataattttttttaaaattcattgtctttaattagtttcttctccagatcttctccgcc--T-ATA-T-----A-T--A-ATT--TC-----CCTT-T-----G-C---AA-AC--TAC--ACTGTACAG-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-A-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGTGT-T---T--A-T--TAAC-------T-ACAGAG----G----------A------AA--------T-----------AC-----G--AA-G-T-G-TG--A---ATCC---T-T---T--AT-TT--TTGATTC-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---C-G--AATC-TTG-G--
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gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---A--A--TT--TGGATTG-G--ATT-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---C-G--AATC-Ttc
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GACAAATCCTGGATCCGCCACTGCTACCG-GGCCTTGTT-------AGTTATTTGACT-ATGA--T-TTT----TTAA--------------A------------AT---------------TC---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-T-C---T--T--A--------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TA----T-A-CGC-----CT--T-T--TATTA-AGG--CG---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------AA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--T-A--C-----G---AA-A-G--AAA-GATGTG-TACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-AA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAAGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TCTCT-C-AT-AA--C--ACTAA-AAT-A-T--A---C--C-CA-TA--C--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG-G--NNN--NNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTC-GAA-T-GAGCCTTCTGGGCTTTCGta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ------------AT---------------TC---TT---------GT-----C--G-GT-A-T-C---T--T--AGTTTAGATTAT------T--C---C-CCGTTT-TCTG--C-G--TA----T-A-CGC-----TT--T-A--TGTTG-AAA--CT---CCTGGC-C-AAG-TTA-TA-AT-G---AGAC-CGA-AT--A-ATC-GTAA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AGTGGTGT-T-A-CTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------------T----A-CT-----AAC-ATG--C-C-TA-TTG---C-C---GT----T-ATG-T-----T-----T-A----C---C-TCAA----------------GAT-TTTT-------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A--------TT--T-ACTC-----G---AA-A-G--AAATGATGTACTGTT-TA-----T-T--T-T--A--C------T-A-A-TC---ATGA-AC-A-A---------AT-T--C-TTAAGGG---------A-A--TAA-T-T-CC-A-T-AAA-A-TA--C----A-----CGA-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACT---AAT-A-T--A---CT-C-CA-TA-----G--CA--C-GT--G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--AACGCT-----GCC-C------TTGCT-C-CACTT--TT--T-T--------CTAA-----CAA--C--GT-AGC-A-CTTT-C-C-------T-ATA-T-----A-T--C-ATT--T-------CCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---T-A--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC--CTTGGGC-C---T--A-T--TA---------G-A---------A----------A------AC--------T-----------TTGAACAG--AA-G-T---TG--A---ATTC---T-T---GA-A--TTG-TTGATTGTG--CTG---T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TT
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): ATGACGTCACCTGAGAATATTGCATACATTATGTCACTATATTATCGTTTTGATTTTCGTGACAAATGGCTAGTTTTATTGACTACGAGGAGAGTGACTGTGAAATATTGATGATTGACTCGGGTTTAAGGACTGAACTTTTATATATTACGTAGAGACTGGGCCAGTTTCTAAGTCACATGGAACTGGAGGAAAAATGGGGGTGGATTGGGCTATCTTCCGATGACTAGACATATATAATGACTCAGTTTGACATTATTCATCAGCAGCCCGCAAAGAATTCGTAATATTCTATCAAAAGATAACTTTTGTGTGTTAAAAGAAAATATATCGAACTGTACCACGGGACCAGTATATAGGTGAGCGTATCTA
Unaligned ( gi|29 ): AGTCACATGGAATGGGGGGGGAGAACGACTAAAAGGAGACTCGGCTTGACATATTACTGGCCGCCCCACAGAGTATCTTGCCTTTAGCATTCCACTGATGAAATCTTGTGTTTTACAGAAGATTTATATCGAACTCATTTACTGTAACTAAATCCGTATGTGGGCTATCTACTGTAAGGCTGTTTTAAAATCAATATAGTACCAGGGCGAGATTTTGAGAGGGGGG
Unaligned ( gi|30 ): AAGTCACATGGAACTGGGGTGGGGGGGGGGGCGACTAGACTCGGCTTGACATGATTTACTAGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATAATCTAAAGTATATCGAACTCTATTTTACTGTAAATAAATCCGTATGTGGGCGTATCTACTGTAGAGGGCTGTTTTCAAATTCAATATAGTACCCGTAGTGGCGGATTTAAAGGGGGACGGCCCCGCCCT
Unaligned ( gi|32 ): AGTCCGATGGAAACTGGGGGGGGGGGACTAAGACTCGGCTTGACATTATTTACTTGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATAATCTTTGTGTTTTAAAGAAATTGAATATCGAACTCATTTTACTGTTGATATCGTGTGGGCGTATCTTTTAAGAAATACGATATAGTACCGCAATGGCGGATTTAGA
Unaligned ( gi|37 ): ATTCATATCAAAATCATTACTGCCAGATTCCTGTATGCTTTCAGCAAGCTTACCCGGTAGATTTGATATAAATGAATGTTATTACATTTAAACCTTTCATTGTGGCAAGGTGGGCAATATTTACAGATA
Unaligned ( gi|40 ): ACGTCATTTTCAAAAGACTCTTGCATATATTTACACACAAAACACAACTATATTTTACGTTGTCATCTCTCTGACAAATGGTCAGTGTTATCAGCAGCACGGATAGTGACCGTGAAATAT
Unaligned ( gi|41 ): ACTTACTGTAATCATAAGGTTGGCGTACCTAACTGCTGTTTTGTTAAACGATGTCGTACCGGACGTTTTATTGACATATTATTGTATTTAACAGTTTTACAAGTAGCCTATATTTCTAA
Unaligned ( gi|43 ): TCATTGTACCGTCATTTACTGGTAAACAATAAATATCTGTATTGTGGGGCGATTCTAGCTGTCAGTGCTTGTTTTAAAATCAATATAGTACTCGAGTGGGCGATTTATGAGC
Unaligned ( gi|44 ): AGTCACATGGAACTGGGGGGCGACTAAGACTCGGCTTGACATTATTTATGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATTAATCTTTGTGTTTACAAGAAATTAT
Unaligned ( gi|46 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA
Unaligned ( gi|48 ): AACAATAAGTTTTTTAAATTCATTGTCTTTTTAAAAATAGTATCTTCTCCGTATCTCTCCGCCTCT
Unaligned ( gi|49 ): ATAACAACAAAGAACGAACTGGTGGGATTACTTTTTCTCAACTAAACGACTTACCAGCTT






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Reference ( family-826 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GACAAATCCTGGATCCNCCACTG-TACCG-GGCCTTGTT-------AGTAACANAACA-ATNA--T-TTT----TTAA--------------A------------AT---------------TC---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-T-C---T--T--A--------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TG----T-A-CGC-----CT--T-C--TGTTA-AAA--CT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--T-A--C-----G---AA-A-G--AAA-GATGTG-TACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA-AAT-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG-G--TTC--GAAT-NTTGAA-CGTTTGA-ATATT--GAATTTTGAATGTCGNAATGTC-GAA-T-GAGCCTTCTGGGCTTTCG
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagttaatgttgcctaataattttttttaatttatgacttataatatatctctctatacaagatgtttaatgaattaaaatattatctctctctatatagcatgttctccacctg---------------TT---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-A-C---T--TTAA--------TAC------T--C---C-C----T-TC---------------------C-----CC--T-T--AGAAA-AAAAACT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A--T-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--GA---------TA-T-C--T---G----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--TAA--C-----G---AA-A-G--AAA-GA--TG-TACTATA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--T-A---------TT-T--C-TTAA-GGG-----A--A-G--TAA-T-T-TC-A-T-AAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTTCT-C-AT-AA--C--ACT---AAT-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-T-AG-AA--A---CT-----G-C-C------TC--T-C-CAC-T--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AGA-T-ATA-T-----A-G--C-ATT--CC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC---AT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ACT----T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG-G---NN--NNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCAGAACT-GAGCCTTCTGGGCTTTCGat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tttttaattcattgacattaaatattatcttctccgtc---------------TC---TTCC---A--TGC---ATC--G-AC-A-T-C---T--T--A---------AT------T--C---C-C----T-T--A--C-C--TG----C-A-CGT-----AT--TAC--TGTTA-AA---CT---C---GC-C-A-G-T---TA-AT-CC--A--C-CGA-GA--A-ATT-A-AA--A--C--TT-----A--T--------ATGCACA-A---A-TT---AAA--A----AA----GA-T-G-TTAAATC----A-T-A--TA--TA--G-T-C------T--TG----A------A-----T----A-T-------AC-ATGCTT-C-TA-T-T---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----C-AT---C---T-T--A----------------GAG-TT---------------A-----------A-------------T--------C------------TA--------TA-AA---------AT-T-CCAT---T----G--C--T-G-G-------CA--A--A---A-G-T--C--A-----------G-ACA-------------TC--T-AC-C-----G---AA-A-G--A----ATGT--TACT-TA-----TAT--TAT--A--C--A---T-A-A-TC---A-GATA--A-T---------TT-T--C-TTAAAGGG-----A--A-G--T-A-T-T-CCGA-TAAAA-ATTA--C-A--A-----TGG-A--A-T-C-----GAC-TGTTCCT-C-CT--------ACT---AATCA-T--A---A--C-CA-TACGT--G--CA--C-GTGTG-A-ACA---A-T-TAAG--A--A---CT-----GCC-C------TA--T-C-CATTT--TT--T-G--------CT-C-----AAA--C--GTGA-C-A---TT-T-C---AG--C-TTA-T-----A-T--C-ATT--T------CCCT-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------T-T---A----TT-T-CATCC-GC-T-CAAAA--T------T--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAC--------T-A---------G----------GGTTGT-ACGAGGACA-T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTCT--T-T---C--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A---TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTG-G--TTt
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cc-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A---------------------------T--------ATA---A-A---A-GT---GAA--A----AA----GT-T-G-TTATT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACG-GTG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TTTATATAAATGTGTA-A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-A-------CG--A--A---A-A-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----CC--AA-A-G--AAA-AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---G-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-C-AC-AA--T--ACTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----GCC-T------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TT-ATTTTACAA--C--TG-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-C-----A-T--C-ATT--TC-----CCC--T-----C-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-G-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TC--G-AAT-C-ATTTC-G--AATatt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attgacataatattgtgttttgcagtttcacctccgccacttccaagtaacctatatttttaatattgcaatgatgaaagacgtcgtgattgtatc---------------TC---TTCC---A--TGT---TCC--G-GT-A-C-C---T--T--AAA------TAT------T--C---A-C----T-GC-G--C-A--TA----T-A-CGC-----CT--G-AAATGTTA-TAA---T---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATTTA-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AAA---GT-T-G-TTACAAC----A-T-G--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-----GT--C-T-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------TT-------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TT------------------------------------------------------T-T--A--C--C---G-A-A-TC---A-AA-A--A------------T-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-C--A-TAAAA---TA--C-A--A-----CGG-A--AAT-C-----G-C-T-TTCCT-C-AT-AA--C--ACTAA---T-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CAC-T--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-CAAAA--C------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---GATA--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTA-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-GA-AATC-TTG-G--
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cAA--CT---CC-GGC-C-TAG-T-A-TC-AT-G---A--C-CGA--T--A-ATT-A-AA--A-CT--CT--TC-AA-T--------ATG---T-A---A-AT---AAA--A----AAAG--GTCT-G-T-ACA-C----AAT-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----A-C--TG-TC-C-TA-T-G---CAC---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA----------T-C-T--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--------G-T-AC--A-----------G-AA--T--AAC-----TCT--T-A--CC----G---AA-A-G--AAA-GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-AC-TAA-T-T-CCCA-TAAA----TA--C-A--A-----CGG-A--AAT-C-----G-CCT-TTCCG-C-CTCAA--C--TCTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCA-C------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----C-A--T--GT---C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-TA--AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TG-T-CA--C-GC-C-C-AAA--T------C--AA------AA-GC-GCTT-GGT-C---T--A-T--T----------TAA---------A----------A------AC--------T-----------TT-----GACAA-G-T-A-TG--A---AATC---TCT---C--A--TTTCTTGATTG-G--CTG-A-A-TTG-G---TA-TT--G-AAT-CAA---C-GA-AATC-TTG-G--att
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  catgtaatatatgT-G---A--C-CAC-ATTCA-ATT-A-AA--A-AC--TTATTC-A--T--------CTA---A-A---A-AA---AAA--A----AAA---GT-T-GCTTACT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-TCT-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACG-GTG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AT---C---CGT--A----------------GAT-TTTATATTAAATATGTAA-----------A-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--G---T----G--CTAT-G-GA------CC--A--A---A-A-T-GC--A-----------GCAAA-T--A-------TCT--T-AC-C-----C---AA-A-A--AAA-AATTTG-TATT-TA-----T-TTAT-T--A--C--A---G-A-A-TC---A-G--A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGA-----C--A-G--TAA-T-T-CC-A-TAAAA-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TTCCT-G-AC-AA--T--ACT---ACT-GCT--A---C--C-CA-TA--TTCG--CA--C-GTG-G-A---A---A-C-CAAG-GA--A---AC-----GCC-T------TT--T-C-C-CTT--TT--T-TTTC-----TT-A-----CAACTC--G--A-C-A-CTGT-C-C---AG--T-ATA-TC----A-T--CAATT--TC-----CCCC-TTACCAA-C----A-AC--TATTCA-------G-T---ATT--TT-T-CA--C-GC-G-CAAAA--T------TCAAC------AA-GC-GCTCTGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AATG-T-ATTG--A---ATTC---T-T---G--A--TTA-TTGATTG-G--CTGCA-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTG-G--attgtgaatcc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aggaaaaagaaggggcgggggtgatgtacatttgctgtaccaatctgactaaacaactcggcttggattgcccactggcccagccacagagaatttgtaatattctatcatagattaactcttgtgttttaaagaaattatatcctaacttaacttactgtaaacataaggttggcgttacctaagtgctgttcttcgataaacgatgtcgtaaccgggacgtaatattgaccatagtattgtgtttttgcagttttacaagtaggcctaatatttctaatttttaagaattacaatagacgtcgtgtttgtatctacacc-AT---T---T-T--A----------------AAT-TT---------------A-----------A-------------T--------A-------------------------AA---------ATAT-C--T---T----------T-G-GTTTTATCCA--ATGG---G-G-T-CCTTA-----------G-AAA-T--AAACATATTTT--T-A--CACAGAG---AG-A-G--AAA-AA-ATG-TA-T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-CC---A-GA-A--A-A---------TG-A--T-TTAAGGG------A--A-G--TTA-T-T-CC-A-TAAAA---TA--C-A--A-----AGG-A--A-T-T-----G-C-T-TTCCT-C-GT-AA--C--ATTAA---T-G-T--A---C--C-AA-CA--T--G--CA--C-GTA-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----ACC-T------TT--T-C-CACCT--TT--T-T--------CT-A-----CGA--C--GT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-T--C-ACG--TC-----ACCC-T-----G-C---AA-AC--TAT--A-------G-A---A-T--GT-T-CA--C-GC-C-GAAAA--T------C--AC------GA-AC------GAT-C---T--A-TAAT----------T-ACTCAG----G----------A------AA--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---T--A--TT--TTGATTG-G--ATN-N-N-NNN-N-N-NN-NN--N-NNN-N-N---N-N--NNNN-NNN-N--NNN--NNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNT--------------TC-GAA-T-GAGCCTTCTGGTCTTTCGattt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cgaaaaacgaatatttggtttctttgtcaattgaaacctcattcgagaa---------------TC---TTCC---A--T------CC--G-GT-ACT-C---TAAT--A--------TAT------T--C---T-C----C-TC-T--CGA--TG----T-AGCGC-----CT--T-C--GGTTA-ACGGCCA---CC-GGC-CCAAG-TCA-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-G----T--GC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G--GACA-C----A-T-T--TC--CAATG-T-A--A-C-T-ATG----AGAAATTG-----T----A-CC-----AAC-A---TT-C-TAGT-GA--C-CGGGGT--CGT-ATG-------T-----T-ATTTAC---C-T--ACAGATTTGGTTAGAGCGAT-TT---------------A-----------A-------------A--------A------------TAAAGGCCTCC--AA---------AT-T-C--TATAT----GACC-AT-GTG-------CC--A--A---A-G-TAAC--AGTAGACAGACCG-AAA-CTAA-------TTT--T-A--CCT---T---AA-A-GGAAAA-GATA-G-TACTCTA-----A-T--T-T--AC-C--A---T-A-A-TC---A-AA-A--A-A----------G-T--C-TTAAAAGGAGC--A--A-G--TAta
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtaccgggcctgttaagttattgccaatgattgtttttaatttattgacataaattttgtctctctatacaggatgtctccgccG-TACCG-GGCCTAATT--------TTGACATAA-A-ATTG--T-TTTGCGGTTA-----------------------------T---------------TC---CTCC---GCCTCT---TCC--AAGT-A-T-C---C--G--A--------TAT------T--A---T-TAAA-T-TT-G--C-AA-TGACAAT-A-GAC-----GT--T-G--TGTT--------T--------------G-T-A-TGGAT-GCCGA--C-CGA-AT--A-AAT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATA---A-T---A-AT---AAA--AAAAAAA----GT-T-G-TTACT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----Ataacttatcattccattttaatcaaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acatggaacgggggggggatgtacatttgtaccattgactaagactcggcttgacattattcactgtcactgaccagcccacagagaatttgtaatattctatcaatagataatctgtcttttaaaggaaattatatctaactaatttactgtaaacataaggttggcgtatctaggtgctgttttgaaaaacgatgtaTG-TC-C-T--T-G---C-T---CC--C-C-ATG-T-----T-----T-A--------C-T--A----------------GAT-TTGATTATA--------A-----------A-------------T--------G------------TG--------T--AAGTAATATCGAT-T-C--T---TTGTAG--C-AT-A-A-------CA--A----------T-GC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--T-A--C-----A---AA-A-G--AAA-AA--TG-TATT-TA-----T-T--T-A--A--C--A---GAA-A-TC---A-GA-A--A-T---------TT-T--C-TTAAGGGG-----G--A-A--TA----T-TC-A-TAGA-----A--T-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C---TTCCT-C-----A--C--AT--A-TGT-G-T--A---C-------TA--T--G--CA--C-GTG-G-G---A---A-C-CAAA-GA--A---CT------CT-C------TT--T-T-CACTT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C---T-A-C-A-CTTC-C---------------T-----A-T--T-TTT--TC-----CTCC-T-----A-C---A------TAA--A---------------------T-CA--C-GC-G-TAAAC--T---------AC-------A-GC-GATT-GGT-C----------------------------------------------------AC-------------------------------------------A---ATTC---T-T---G--A---T--TTGATTG-GAAATG---T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-GA-AATC-TTG-ACTTTC--GAATGGTTGAA-AGTTTGACATATTTGGAATTTTGAA-ATTGGACTGTcgtacgtacggt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cag-TC-C-TA-T-A---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------ATATAAATGTGTA-------------T--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-A-------CA--A--A---A-T-T-AC--------------G-AAA-T--A-------TCCC-T-A--T-----C---AA-A-G--AAA-AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---G-A-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGG------A--A-G--TAA-T-T-CC---TAAAA---TA--G-C--A-----TGA-A------C-----GAC-T-TTCCT-C-AA-AA--C--ACTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--A--CA--C-TTG-G-A-------A-G-CAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T-C-CACTT--TTTTT-T--------CT-A-----CAA--C--TT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATT-T-----A-T--C-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-G-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTG-G--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ------AA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T------------------------------------A------A---------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AGTC-TTatt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -AA--A-AC--TT--CA-A--T--------ATA---A-A---A-AT---TAA--A----AA----GT-T-----ACA-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AC---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------ATATAAATGAGTATT--------A------------TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A--------TT--C-A--CA----G---AA-A-G--AAA-AA--CG-TATT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---T-A-A-TC---G-GA-A--A-A---------Tacattcaaactacataatcattaattagcatggagtatatgaaacggcagattctgagaatgactctccattccctttgtaatttctaatttccttgtccataataagcttaaaatcattttccgcttcgttccgcatttagcaataccctcttatgacgtcacctgagacacttgcatttagccactatattaatttatgtgacaaatgaccaattttattggtgatgtccagactttcaggagtgaaaggacttaactttatatcagggactggaccagtttttaagt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aatgaagctacaccgaagatttactctttatctaacatcgatttgtatctctctctaatcttctattcattcttctagtttattgccaagaaattttgtttacctcatgaacg-CG-TA--T--A--CA--C-GGG-G-A-TAAGGAA-C-CAAG-AATTA---CT-----GGC-CATTTTATT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TC-ATAC--CAA--C--TT-A-CTA-CTTT-------AG--T-ATA-T-----AGT--C-ATT--TCGGGCGCTCG-TGGAG-A-CGT-AACAC--TATA-A-------G-TTAAA-TCATT-T-CG--C-CC-G-CTAAA--TAGTAGGC--ACCAATCAAA-GC-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAC--------T-A---------A----------AAGG---AA--------T-----------TT-----G--AT-G-T-A-TG--A---ATTTCTAT-T---G--A--TT--TTG-TTG-G--CTG-A-A-TTG-G-A-TA-TT--G-ACT-T-----T-G--AATC-TTG-GA-TTT--GAAT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acttcgctcaataatttaaatcaaatggtgttcgcaCC---A--TGTCACTCC--G-CT-A-T-CAGCC--T--A--------TATATAATAT--C---TGC----T-TC-GGTC-A--TAGT--T-A-CGC------T--T-CGGCGTTA-AGG--AC---GC-GGCTC-AAG-T-AATA-ATAG---A--C-AGAGAT--ATATT-A-AATAA-GT--TT--TCTA--T--------ATG---A-A---ATAC---AAT--A----AA----GT-TTG-TTACAAC----A-T-T--TACGTA--G-T-C--AAT-T-A-G----A------A-----TTTTGA-CCGA---AACTATG-TCTC-TA-T-G---C-C---GTACC-T--TA-T-----TCTTCTT-AT---C---C-T--A----------------GAT-TTT--------------A-----------A-------------T--------AA-----------TA--------T--AA---------AT-TGCA-T---T----G--CCAT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--AATA--------G-AAACT--A-------TTTA-T-A--CC----G---AA-A-G--AAA-GATGT---ACT-TAATCTCTGT--C-T--A--C--AGGGT-A-A-TC---A-TATACCA-A---------TT-T--CCTTAAGG----------A-G--TAAAT-T-CC-A-TAAA----TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-------G-C-T-TTCCT-CTATCAA--C--AGTACTAAT-A-T--T---C--CACA-TAA-T--GACCAAAC-ATG-G-A-CCA---A-T-TAGC-A-------CT-----GCC-C------TT----C-CACTTATTT--T-TATATCATACT-A-----CAA--CACGT-A-C-A-CTTT-C-C---AG--T-ATG-A-----A-T--C-AAT--TT-----CCCC-T-----ATC---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--G-GC-CGCAAAA------------AC------AA-GC-GCTTGGGT-C---CTGA-T--T----------T-A---------A----------A------ACT-------T-----------TT-----G--AA-G-TCA-TGTAA---ATTC---T-C------A--TTG-TGGATTG-G---TG-A-A-TTG-G-A-TA-Ta
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gggccttgtatagggtatttgccaatgatttgtttttaatttattgacattggaatttaatatatgtcttctctatacatggggagtttaaaattgggtccgccctttcacttta-TTCCT-T-GT-GA--C----TTA-AAT-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-A-A-------A-C-CAAG-AA--G---CT-----GCT-A------TT--T-C-CACTT--TT--T-T--------TT-T-----TA---C--GT-A-C-G-CTCT-C-C---AG--T-AGA-T-----T-T--C-ATT--TC-----CCT--T-----G-C---AA-AT--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CC--C-GC-G-GAAAA--T------C--AA------AA-GC-GTTTGAGT-T---T--A-T--TA---------T-A---------AGCTACAGGGGA------AA--------T-----------AC-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---T--A--TT--TTGATAG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-AT--G-GAT-C-
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---A-T-TAGA-GA--A---CTTT---GCC-C------TT--T-C-CAA----TT--T-T--------CTGA-----TAACTC--AT-A-C-A-C-TT-C-C---AG--T-AT--T-----A-T-----TT--T-------CCC-T-----A-CAA-AA-AC--TAT------------C---A----TT-T-CT--C-GC-----AAATCT------C--AC------AA-GC-GCT--GGT-C---TTGA-A--C----------T-AGCAATGAGGA----------A------AA--------T-----------TT-----G--AA-GTT-A-TG--A---TTCT---T-T---G--ATTTT--TTGAGGG-G--CTG-A----TG-GCATTA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cGACAAATCCTGGATCCTCCACTA-TACCG-GGCCTTG-T-------GGTAACAAAACA-ATAATTT-TTT----TTAA--------------A------------AT---------------TC---
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ccctttc---------------TC---TTCC---A--TGC---ATC--G-AT-C-T-C---T--T--ACA------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TG----C-A-CGT-----TT--A-C--TGTTA-attgtctttaattagtttcttctccagatcttctccgcctcttccatgcatcgatctcttacatattcccttcgcatgcacgtttactgtta
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ccctttcgacaaatcctggatcctccactataccgggccttgtggtaacaaaacaataattttttttaaaattcattgtctttaattagtttcttctccagatcttctccgcc--T-ATA-T-----A-T--A-ATT--TC-----CCTT-T-----G-C---AA-AC--TAC--ACTGTACAG-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-A-CAAAA--T------C--AC------AA-GC-GCTTGTGT-T---T--A-T--TAAC-------T-ACAGAG----G----------A------AA--------T-----------AC-----G--AA-G-T-G-TG--A---ATCC---T-T---T--AT-TT--TTGATTC-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---C-G--AATC-TTG-G--
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gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --AA-G-T-A-TG--A---ATCC---T-T---A--A--TT--TGGATTG-G--ATT-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---C-G--AATC-Ttc
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12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): ATGACGTCACCTGAGAATATTGCATACATTATGTCACTATATTATCGTTTTGATTTTCGTGACAAATGGCTAGTTTTATTGACTACGAGGAGAGTGACTGTGAAATATTGATGATTGACTCGGGTTTAAGGACTGAACTTTTATATATTACGTAGAGACTGGGCCAGTTTCTAAGTCACATGGAACTGGAGGAAAAATGGGGGTGGATTGGGCTATCTTCCGATGACTAGACATATATAATGACTCAGTTTGACATTATTCATCAGCAGCCCGCAAAGAATTCGTAATATTCTATCAAAAGATAACTTTTGTGTGTTAAAAGAAAATATATCGAACTGTACCACGGGACCAGTATATAGGTGAGCGTATCTA
Unaligned ( gi|29 ): AGTCACATGGAATGGGGGGGGAGAACGACTAAAAGGAGACTCGGCTTGACATATTACTGGCCGCCCCACAGAGTATCTTGCCTTTAGCATTCCACTGATGAAATCTTGTGTTTTACAGAAGATTTATATCGAACTCATTTACTGTAACTAAATCCGTATGTGGGCTATCTACTGTAAGGCTGTTTTAAAATCAATATAGTACCAGGGCGAGATTTTGAGAGGGGGG
Unaligned ( gi|30 ): AAGTCACATGGAACTGGGGTGGGGGGGGGGGCGACTAGACTCGGCTTGACATGATTTACTAGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATAATCTAAAGTATATCGAACTCTATTTTACTGTAAATAAATCCGTATGTGGGCGTATCTACTGTAGAGGGCTGTTTTCAAATTCAATATAGTACCCGTAGTGGCGGATTTAAAGGGGGACGGCCCCGCCCT
Unaligned ( gi|32 ): AGTCCGATGGAAACTGGGGGGGGGGGACTAAGACTCGGCTTGACATTATTTACTTGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATAATCTTTGTGTTTTAAAGAAATTGAATATCGAACTCATTTTACTGTTGATATCGTGTGGGCGTATCTTTTAAGAAATACGATATAGTACCGCAATGGCGGATTTAGA
Unaligned ( gi|37 ): ATTCATATCAAAATCATTACTGCCAGATTCCTGTATGCTTTCAGCAAGCTTACCCGGTAGATTTGATATAAATGAATGTTATTACATTTAAACCTTTCATTGTGGCAAGGTGGGCAATATTTACAGATA
Unaligned ( gi|40 ): ACGTCATTTTCAAAAGACTCTTGCATATATTTACACACAAAACACAACTATATTTTACGTTGTCATCTCTCTGACAAATGGTCAGTGTTATCAGCAGCACGGATAGTGACCGTGAAATAT
Unaligned ( gi|41 ): ACTTACTGTAATCATAAGGTTGGCGTACCTAACTGCTGTTTTGTTAAACGATGTCGTACCGGACGTTTTATTGACATATTATTGTATTTAACAGTTTTACAAGTAGCCTATATTTCTAA
Unaligned ( gi|43 ): TCATTGTACCGTCATTTACTGGTAAACAATAAATATCTGTATTGTGGGGCGATTCTAGCTGTCAGTGCTTGTTTTAAAATCAATATAGTACTCGAGTGGGCGATTTATGAGC
Unaligned ( gi|44 ): AGTCACATGGAACTGGGGGGCGACTAAGACTCGGCTTGACATTATTTATGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATTAATCTTTGTGTTTACAAGAAATTAT
Unaligned ( gi|46 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA
Unaligned ( gi|48 ): AACAATAAGTTTTTTAAATTCATTGTCTTTTTAAAAATAGTATCTTCTCCGTATCTCTCCGCCTCT
Unaligned ( gi|49 ): ATAACAACAAAGAACGAACTGGTGGGATTACTTTTTCTCAACTAAACGACTTACCAGCTT






Alignments
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Reference ( family-826 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GACAAATCCTGGATCCNCCACTG-TACCG-GGCCTTGTT-------AGTAACANAACAATNA-T-TTTT---T---AAA------T------T-------TTT------T--A------TT--------C---TTC----------------------C---A--TGT---TCC--G-GT-A-T-C---T--T--A--------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TG----T-A-CGC-----CT--T-C--TGTTA-AAA--CT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T------------A-TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--TAC-C---GAA-AG--AAA--GATGTG-TACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---TA-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-ATAAA-A-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TT-CCT-C-AT-AAC--ACTAA-AAT-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T--C-CAC-TT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-ACTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-TC-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-C-AAAA--T------C--AC------AAG-C-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTGG---NNNGAAT-NTTGAA-CGTTTGA-ATATT--GAATTTTGAATGTCGNAATGTC-GAA-T-GAGCCTTCTGGGCTTTCG
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aagttaatgttgcctaataattttttttaatttatgacttataatatatctctctatacaagatgtttaatgaattaaaatattatctctctctatatagcatgttctccacctgT--------T---TTC----------------------C---A--TGT---TCC--G-GT-A-A-C---T--TTAA--------TAC------T--C---C-C----T-TC---------------------C-----CC--T-T--AGAAA-AAAAACT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A--T-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T------------A-TA--------T--GA---------TA-T-C--T---G----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--TAA-C---GAA-AG--AAA--GA--TG-TACTATA-----T-T--T-T--A--C--A---TA-A-TC---A-GA-A--T-A---------TT-T--C-TTAA-GGG-----A--A-G--TAA-T-T-TC-AT-AA-A-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TT-TCT-C-AT-AAC--ACT---AAT-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-T-AG-AA--A---CT-----G-C-C------TC--T--C-CAC--T--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-ACTTT-C-C---AGA-T-ATA-T-----A-GC-ATT--CC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC---AT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-C-AAAA--C------C--AC------AAG-C-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ACT----T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTGG----NNNNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCAGAACT-GAGCCTTCTGGGCTTTCGat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttttaattcattgacattaaatattatcttctccgtcT--------C---TTC----------------------C---A--TGC---ATC--G-AC-A-T-C---T--T--A---------AT------T--C---C-C----T-T--A--C-C--TG----C-A-CGT-----AT--TAC--TGTTA-AA---CT---C---GC-C-A-G-T---TA-AT-CC--A--C-CGA-GA--A-ATT-A-AA--A--C--TT-----A--T--------ATGCACA-A---A-TT---AAA--A----AA----GA-T-G-TTAAATC----A-T-A--TA--TA--G-T-C------T--TG----A------A-----T----A-T-------AC-ATGCTT-C-TA-T-T---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----C-AT---C---T-T--A----------------GAG-TT---------------A-----------A-------------T------------C-TA--------TA-AA---------AT-T-CCAT---T----G--C--T-G-G-------CA--A--A---A-G-T--C--A-----------G-ACA-------------TC--TAC-C---GAA-AG--A-----ATGT--TACT-TA-----TAT--TAT--A--C--A---TA-A-TC---A-GATA--A-T---------TT-T--C-TTAAAGGG-----A--A-G--T-A-T-T-CCGATAAA-A-ATTA--C-A--A-----TGG-A--A-T-C-----GAC-TGTT-CCT-C-CT------ACT---AATCA-T--A---A--C-CA-TACGT--G--CA--C-GTGTG-A-ACA---A-T-TAAG--A--A---CT-----GCC-C------TA--T--C-CAT-TT--TT--T-G--------CT-C-----AAA--C--GTGA-C-A--TT-T-C---AG--C-TTA-T-----A-TC-ATT--T------CCCT-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------T-T---A----TT-T-CATCC-GC-T-C-AAAA--T------T--AC------AAG-C-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAC--------T-A---------G----------GGTTGT-ACGAGGACA-T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTCT--T-T---C--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A---TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTGG---t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cgggcccttgtttaacaaacaacataattttttttaaaatatcaccttgtcttaattggtagttcattctacctagatttctccgcc-GGCCTTCGA-------AGTAACAAAGCAATAC-CGTTTT---T---AAA------T------TACTTAA-TTT------C--A------TT--------CGAGCTC----------------------TGATA--TGTA--TGC--G-GT-C-T-C---T--T--A--------AAT------T--CTATC-A----T-TC-A--C-A----------A-TG-------------------A-TAG--CT---CT-G-C-C-AAG-T-A-TA----G---A--C-CG---T--A-ATT-A-AG--A-AC--TT--CA-A--T--------ATG---GCG---G-AT---AAA--A----AG------------TACA--------------A--TG-----------T-T-GCC----A------A-----G----A-CT-----AG---TG-TT-C-TAGT-G---C-C---GT------ATA-T-----T-----T-AT---C-----T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T------------A-TA--------T--AA---------AT-T-C--T--------G--C-AT-G-G-------CA--A--AGTAA-G-T--C--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--TAC-G---AAA-AG--AAA--GATGT---ACT-TA-----T-T--T-T--AG-C--A---TAGA-TC---A-GA-A--A-AA--------TTGT--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-AT-AA-A-A-TA--C-A--A-----TGG-A--A-T-C-----G-C-T-TT-CCT-C-CT-ACG--ACT---AAT-A-T--A---CCGC-TA-GA--T--GC-CA--C-GTG-ACG-CAA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TTGGT--C-CAC-TT--TT--T-G--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-ATTTG-C-C---AG--TAATAGT-----A-TC-ATTTCTC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-TGCA--C-GCTC-C-AAAA--TA-----C--AG------AAG-CGGCTTGGGT-CCTTT--A-C--TAGAGGGGTTAC-A---------G----------A------AC--------A-----------TT-----T--AA-G-TCA-TA--ATTCGTTC---T-TTCCC--A--TT--TTGATTG-GT-CTG-A-TATTG-G-A-TA-TTGGG-AAT-C-A---C-G--AATC-TTGG---tttt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cc-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A---------------------------T--------ATA---A-A---A-GT---GAA--A----AA----GT-T-G-TTATT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACG-GTG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TTTATATAAATGTGTA-A-----------A-------------T------------A-TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-A-------CG--A--A---A-A-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--TAC-C---CAA-AG--AAA--AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---GA-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-ATAAA-A---TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TT-CCT-C-AC-AAT--ACTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-G-A-------A-C-CAAG-AA--A---CT-----GCC-T------TT--T--C-CAC-TT--TT--T-T--------TT-ATTTTACAA--C--TG-A-C-ACTTT-C-C---AG--T-ATA-C-----A-TC-ATT--TC-----CCC--T-----C-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-G-C-AAAA--T------C--AC------AAG-C-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TC--G-AAT-C-ATTTC-G--AATatt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   attgacataatattgtgttttgcagtttcacctccgccacttccaagtaacctatatttttaatattgcaatgatgaaagacgtcgtgattgtatcT--------C---TTC----------------------C---A--TGT---TCC--G-GT-A-C-C---T--T--AAA------TAT------T--C---A-C----T-GC-G--C-A--TA----T-A-CGC-----CT--G-AAATGTTA-TAA---T---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATTTA-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AAA---GT-T-G-TTACAAC----A-T-G--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-----GT--C-T-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------TT-----------A-TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-------------------------------------AAA--------------TA-----T-T--T-T--A--C--C---GA-A-TC---A-AA-A--A------------T-T--C-TTAAGGGG-----A--A-G--TAA-T-T-C--ATAAA-A---TA--C-A--A-----CGG-A--AAT-C-----G-C-T-TT-CCT-C-AT-AAC--ACTAA---T-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T--C-CAC--T--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-ACTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-TC-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-C-AAAA--C------C--AC------AAG-C-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---GATA--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTA-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-GA-AATC-TTGG---
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              catgtaatatatgT-G---A--C-CAC-ATTCA-ATT-A-AA--A-AC--TTATTC-A--T--------CTA---A-A---A-AA---AAA--A----AAA---GT-T-GCTTACT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-TCT-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACG-GTG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AT---C---CGT--A----------------GAT-TTTATATTAAATATGTAA-----------A-------------T------------A-TA--------T--AA---------AT-T-C--G---T----G--CTAT-G-GA------CC--A--A---A-A-T-GC--A-----------GCAAA-T--A-------TCT--TAC-C---CAA-AA--AAA--AATTTG-TATT-TA-----T-TTAT-T--A--C--A---GA-A-TC---A-G--A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGGA-----C--A-G--TAA-T-T-CC-ATAAA-A-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TT-CCT-G-AC-AAT--ACT---ACT-GCT--A---C--C-CA-TA--TTCG--CA--C-GTG-G-A---A---A-C-CAAG-GA--A---AC-----GCC-T------TT--T--C-C-C-TT--TT--T-TTTC-----TT-A-----CAACTC--G--A-C-ACTGT-C-C---AG--T-ATA-TC----A-TCAATT--TC-----CCCC-TTACCAA-C----A-AC--TATTCA-------G-T---ATT--TT-T-CA--C-GC-G-C-AAAA--T------TCAAC------AAG-C-GCTCTGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AATG-T-ATTG--A---ATTC---T-T---G--A--TTA-TTGATTG-G--CTGCA-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTGG---tgaatcc
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgaaaaacgaatatttggtttctttgtcaattgaaacctcattcgagaaT--------C---TTC----------------------C---A--T------CC--G-GT-ACT-C---TAAT--A--------TAT------T--C---T-C----C-TC-T--CGA--TG----T-AGCGC-----CT--T-C--GGTTA-ACGGCCA---CC-GGC-CCAAG-TCA-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-G----T--GC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G--GACA-C----A-T-T--TC--CAATG-T-A--A-C-T-ATG----AGAAATTG-----T----A-CC-----AAC-A---TT-C-TAGT-GA--C-CGGGGT--CGT-ATG-------T-----T-ATTTAC---C-T--ACAGATTTGGTTAGAGCGAT-TT---------------A-----------A-------------A------------A-TAAAGGCCTCC--AA---------AT-T-C--TATAT----GACC-AT-GTG-------CC--A--A---A-G-TAAC--AGTAGACAGACCG-AAA-CTAA-------TTT--TAC-CT--TAA-AGGAAAA--GATA-G-TACTCTA-----A-T--T-T--AC-C--A---TA-A-TC---A-AA-A--A-A----------G-T--C-TTAAAAGGAGC--A--A-G--TAta
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtaccgggcctgttaagttattgccaatgattgtttttaatttattgacataaattttgtctctctatacaggatgtctccgccG-TACCG-GGCCTAATT--------TTGACATAA-AATTG-T-TTTG---C---GG------------------------T------T--A------TT--------C---CTC----------------------C---GCCTCT---TCC--AAGT-A-T-C---C--G--A--------TAT------T--A---T-TAAA-T-TT-G--C-AA-TGACAAT-A-GAC-----GT--T-G--TGTT--------T--------------G-T-A-TGGAT-GCCGA--C-CGA-AT--A-AAT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATA---A-T---A-AT---AAA--AAAAAAA----GT-T-G-TTACT-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----Ataacttatcattccattttaatcaaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acatggaacgggggggggatgtacatttgtaccattgactaagactcggcttgacattattcactgtcactgaccagcccacagagaatttgtaatattctatcaatagataatctgtcttttaaaggaaattatatctaactaatttactgtaaacataaggttggcgtatctaggtgctgttttgaaaaacgatgtaTG-TC-C-T--T-G---C-T---CC--C-C-ATG-T-----T-----T-A--------C-T--A----------------GAT-TTGATTATA--------A-----------A-------------T------------G-TG--------T--AAGTAATATCGAT-T-C--T---TTGTAG--C-AT-A-A-------CA--A----------T-GC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT--TAC-----AAA-AG--AAA--AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-A--A--C--A---GA-AATC---A-GA-A--A-T---------TT-T--C-TTAAGGGG-----G--A-A--TA----T-TC-ATAGA------A--T-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C---TT-CCT-C-----AC--AT--A-TGT-G-T--A---C-------TA--T--G--CA--C-GTG-G-G---A---A-C-CAAA-GA--A---CT------CT-C------TT--T--T-CAC-TT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C---T-A-C-ACTTC-C---------------T-----A-TT-TTT--TC-----CTCC-T-----A-C---A------TAA--A---------------------T-CA--C-GC-G-T-AAAC--T---------AC-------AG-C-GATT-GGT-C----------------------------------------------------AC-------------------------------------------A---ATTC---T-T---G--A---T--TTGATTG-GAAATG---T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-GA-AATC-TTGACT-TTCGAATGGTTGAA-AGTTTGACATATTTGGAATTTTGAA-ATTGGACTGTcgtacgtacggt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cag-TC-C-TA-T-A---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-------AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------ATATAAATGTGTA-------------T------------A-TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-A-------CA--A--A---A-T-T-AC--------------G-AAA-T--A-------TCCC-TAT-C----AA-AG--AAA--AATGTA-T--T-TA-----T-T--T-T--A--C--A---GA-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAGGG------A--A-G--TAA-T-T-CC--TAAA-A---TA--G-C--A-----TGA-A------C-----GAC-T-TT-CCT-C-AA-AAC--ACTAA---T-G-T--A---C--C-CA-TA--T--A--CA--C-TTG-G-A-------A-G-CAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T--C-CAC-TT--TTTTT-T--------CT-A-----CAA--C--TT-A-C-ACTTT-C-C---AG--T-ATT-T-----A-TC-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-G-C-AAAA--T------C--AC------AAG-C-GCTTGGGT-C---T--A---------------T-A---------A---------------------------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AATC-TTGG---
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ------AAG-C-GCTTGGGT-C---T--A-T------------------------------------A------A---------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-T---T-G--AGTC-TTatt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -AA--A-AC--TT--CA-A--T--------ATA---A-A---A-AT---TAA--A----AA----GT-T-----ACA-T----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATA----A------A-----T----A-CT-----ACC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-T---TT--C-A-ATG-T-----T-----T-AC---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------ATATAAATGAGTATT------------A-TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A--------TT--CAC-A---GAA-AG--AAA--AA--CG-TATT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---TA-A-TC---G-GA-A--A-A---------Tacattcaaactacataatcattaattagcatggagtatatgaaacggcagattctgagaatgactctccattccctttgtaatttctaatttccttgtccataataagcttaaaatcattttccgcttcgttccgcatttagcaataccctcttatgacgtcacctgagacacttgcatttagccactatattaatttatgtgacaaatgaccaattttattggtgatgtccagactttcaggagtgaaaggacttaactttatatcagggactggaccagtttttaagt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aatgaagctacaccgaagatttactctttatctaacatcgatttgtatctctctctaatcttctattcattcttctagtttattgccaagaaattttgtttacctcatgaacg-CG-TA--T--A--CA--C-GGG-G-A-TAAGGAA-C-CAAG-AATTA---CT-----GGC-CATTTTATT--T--C-CAC-TT--TT--T-T--------TC-ATAC--CAA--C--TT-A-CTACTTT-------AG--T-ATA-T-----AGTC-ATT--TCGGGCGCTCG-TGGAG-A-CGT-AACAC--TATA-A-------G-TTAAA-TCATT-T-CG--C-CC-G-C-TAAA--TAGTAGGC--ACCAATCAAAG-C-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAC--------T-A---------A----------AAGG---AA--------T-----------TT-----G--AT-G-T-A-TG--A---ATTTCTAT-T---G--A--TT--TTG-TTG-G--CTG-A-A-TTG-G-A-TA-TT--G-ACT-T-----T-G--AATC-TTGGA--TTTGAAT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acttcgctcaataatttaaatcaaatggtgttcgca-------TTT------C--A------CT--------T---TAC----------------------C---A--TGTCACTCC--G-CT-A-T-CAGCC--T--A--------TATATAATAT--C---TGC----T-TC-GGTC-A--TAGT--T-A-CGC------T--T-CGGCGTTA-AGG--AC---GC-GGCTC-AAG-T-AATA-ATAG---A--C-AGAGAT--ATATT-A-AATAA-GT--TT--TCTA--T--------ATG---A-A---ATAC---AAT--A----AA----GT-TTG-TTACAAC----A-T-T--TACGTA--G-T-C--AAT-T-A-G----A------A-----TTTTGA-CCGA---AACTATG-TCTC-TA-T-G---C-C---GTACC-T--TA-T-----TCTTCTT-AT---C---C-T--A----------------GAT-TTT--------------A-----------A-------------T------------AATA--------T--AA---------AT-TGCA-T---T----G--CCAT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--AATA--------G-AAACT--A-------TTTA-TAC-C---GAA-AG--AAA--GATGT---ACT-TAATCTCTGT--C-T--A--C--AGGGTA-A-TC---A-TATACCA-A---------TT-T--CCTTAAGG----------A-G--TAAAT-T-CC-ATAAA-----TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-------G-C-T-TT-CCT-CTATCAAC--AGTACTAAT-A-T--T---C--CACA-TAA-T--GACCAAAC-ATG-G-A-CCA---A-T-TAGC-A-------CT-----GCC-C------TT-----C-CAC-TTATTT--T-TATATCATACT-A-----CAA--CACGT-A-C-ACTTT-C-C---AG--T-ATG-A-----A-TC-AAT--TT-----CCCC-T-----ATC---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--G-GC-CGC-AAAA------------AC------AAG-C-GCTTGGGT-C---CTGA-T--T----------T-A---------A----------A------ACT-------T-----------TT-----G--AA-G-TCA-TGTAA---ATTC---T-C------A--TTG-TGGATTG-G---TG-A-A-TTG-G-A-TA-Ta
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                          tggaactgggaggaaataagaagggagttacatttgcttaccattgactaaatgaactcggcttgacattattcactgccatggccagcctcacagaggaattgtatagattactatcacatagaatatatcctgttgtttttgttaaaggattacgattatagtctaaaaacctatacatactcgtaatcggtacagtggcgtacctaactgctgtcatatgcttcaagacggcaggtgttcggtttgaaccgcgagcgttatgtacttagaagcatatatggaattggtactttattaatccagttttactcaagtaccatatatgtctactcatgagcatcgtgtttggtatcctacctgagc-GGCCTTGT--------AGTAACAAAATAATAAGT-TTTT---T---AAA------T------TCATTGTCTTTAAATAGT--A------TTTCTCGCCTC---TTC----------------------C---A--TGTA--TC-----GT-C-T-C---T--T--AAA------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TA----TTA-CGCGAAAA---------TATTA-AAA--CT---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-----A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------AT----A-A---A-ATTTTAAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C------T-T--TA--TA--G-TGC--A-T-T-ACG----A------A-----T----A-AT-----AAC-ATG-TT-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-------T-----T-AT---A---T-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T------------A-TA--------T---A---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TCT----C-C---AGA-AG--AAA--GA--TG-TAC--TA-----T-T--T-T--A--C--A---TA-A-TC---A-GA-A--A-A---------TT-T--CTTTAAGGGG-----A--A-G--TAA-TAT-TC-AT--C-A-A-TA--CTA--A-----TGGAA--A-T-C-----G-C---TT-CCT-C-CT-AAC--AT----AAT-A-T--A---C--C-CA-TA--T--G--CA--C-GTG-GAA-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T--C-CAC-TT--TT--TGT--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-ACTAT-C-C---AG--T-TTA-T-----A-TC--TT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAG--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-T-C-AAAA--TTA----C--AC------AGG-C-GCTTGGGT-C---T--A-T--TAAC-------T-A---------A----------GGGTTGTACAGAGGACAT-----------TT-----G--AA-G-T-A-GT--A---ATTC---T-T---C--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AANN-NNNN---NNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNAG--ATGTC-G-A-T-GAGCCTTCTGGGCTTTCGca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GACAAATCCTGGATCCGCCACTGCTACCG-GGCCTTGTT-------AGTTATTTGACTATGA-T-TTTT---T---AAA---------------------------------A------TT--------C---TTC----------------------C---A--TGT---TCC--G-GT-A-T-C---T--T--A--------TAT------T--C---C-C----T-TC-G--C-A--TA----T-A-CGC-----CT--T-T--TATTA-AGG--CG---CC-GGC-C-AAG-T-A-TA-AT-G---A--C-CGA-AT--A-ATT-A-AA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AA----GT-T-G-TTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------A-----T----A-CT-----AAC-ATG-TC-C-TA-T-G---C-C---GT--C-T-ATG-T-----T-----T-AT---C---C-T--A----------------GAT-TT---------------A-----------A-------------T------------A-TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------AA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A-------TTT--TAC-----GAA-AG--AAA--GATGTG-TACT-TA-----T-T--T-T--A--C--A---TA-A-TC---A-AA-A--A-A---------TT-T--C-TTAAAGGG-----A--A-G--TAA-T-T-CC-ATAAA-A-A-TA--C-A--A-----CGG-A--A-T-C-----G-C-T-TC-TCT-C-AT-AAC--ACTAA-AAT-A-T--A---C--C-CA-TA--C--G--CA--C-GTG-G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--A---CT-----GCC-C------TT--T--C-CAC-TT--TT--T-T--------CT-A-----CAA--C--GT-A-C-ACTTT-C-C---AG--T-ATA-T-----A-TC-ATT--TC-----CCCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---A-T--TT-T-CA--C-GC-C-C-AAAA--C------C--AC------AAG-C-GCTTGGGT-C---T--A-T--T----------T-A---------A----------A------AC--------T-----------TT-----G--AA-G-T-A-TG--A---ATTC---T-T---G--A--TT--TTGATTG-G--CTG-A-T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TTGG---NNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNN-NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTC-GAA-T-GAGCCTTCTGGGCTTTCGta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T------C--A------TT--------C---TT-------------------------------GT-----C--G-GT-A-T-C---T--T--AGTTTAGATTAT------T--C---C-CCGTTT-TCTG--C-G--TA----T-A-CGC-----TT--T-A--TGTTG-AAA--CT---CCTGGC-C-AAG-TTA-TA-AT-G---AGAC-CGA-AT--A-ATC-GTAA--A-AC--TT--TC-A--T--------ATG---A-A---A-AT---AAA--A----AGTGGTGT-T-A-CTACA-C----A-T-T--TA--TA--G-T-C--A-T-T-ATG----A------------T----A-CT-----AAC-ATG--C-C-TA-TTG---C-C---GT----T-ATG-T-----T-----T-A----C---C-TCAA----------------GAT-TTTT-------------A-----------A-------------T------------A-TA--------T--AA---------AT-T-C--T---T----G--C-AT-G-G-------CA--A--A---A-G-T-AC--A-----------G-AAA-T--A--------TT--TACTC---GAA-AG--AAAT-GATGTACTGTT-TA-----T-T--T-T--A--C------TA-A-TC---ATGA-AC-A-A---------AT-T--C-TTAAGGG---------A-A--TAA-T-T-CC-AT-AA-A-A-TA--C----A-----CGA-A--A-T-C-----G-C-T-TT-CCT-C-AT-AAC--ACT---AAT-A-T--A---CT-C-CA-TA-----G--CA--C-GT--G-A-CCA---A-T-TAAG-AA--AACGCT-----GCC-C------TTGCT--C-CAC-TT--TT--T-T--------CTAA-----CAA--C--GT-AGC-ACTTT-C-C-------T-ATA-T-----A-TC-ATT--T-------CCC-T-----A-C---AA-AC--TAT--A-------G-T---T-A--TT-T-CA--C-GC-C-C-AAAA--C------C--AC------AAG-C--CTTGGGC-C---T--A-T--TA---------G-A---------A----------A------AC--------T-----------TTGAACAG--AA-G-T---TG--A---ATTC---T-T---GA-A--TTG-TTGATTGTG--CTG---T-TTG-G-A-TA-TT--G-AAT-C-A---C-G--AATC-TT
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): ATGACGTCACCTGAGAATATTGCATACATTATGTCACTATATTATCGTTTTGATTTTCGTGACAAATGGCTAGTTTTATTGACTACGAGGAGAGTGACTGTGAAATATTGATGATTGACTCGGGTTTAAGGACTGAACTTTTATATATTACGTAGAGACTGGGCCAGTTTCTAAGTCACATGGAACTGGAGGAAAAATGGGGGTGGATTGGGCTATCTTCCGATGACTAGACATATATAATGACTCAGTTTGACATTATTCATCAGCAGCCCGCAAAGAATTCGTAATATTCTATCAAAAGATAACTTTTGTGTGTTAAAAGAAAATATATCGAACTGTACCACGGGACCAGTATATAGGTGAGCGTATCTA
Unaligned ( gi|29 ): AGTCACATGGAATGGGGGGGGAGAACGACTAAAAGGAGACTCGGCTTGACATATTACTGGCCGCCCCACAGAGTATCTTGCCTTTAGCATTCCACTGATGAAATCTTGTGTTTTACAGAAGATTTATATCGAACTCATTTACTGTAACTAAATCCGTATGTGGGCTATCTACTGTAAGGCTGTTTTAAAATCAATATAGTACCAGGGCGAGATTTTGAGAGGGGGG
Unaligned ( gi|30 ): AAGTCACATGGAACTGGGGTGGGGGGGGGGGCGACTAGACTCGGCTTGACATGATTTACTAGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATAATCTAAAGTATATCGAACTCTATTTTACTGTAAATAAATCCGTATGTGGGCGTATCTACTGTAGAGGGCTGTTTTCAAATTCAATATAGTACCCGTAGTGGCGGATTTAAAGGGGGACGGCCCCGCCCT
Unaligned ( gi|32 ): AGTCCGATGGAAACTGGGGGGGGGGGACTAAGACTCGGCTTGACATTATTTACTTGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATAATCTTTGTGTTTTAAAGAAATTGAATATCGAACTCATTTTACTGTTGATATCGTGTGGGCGTATCTTTTAAGAAATACGATATAGTACCGCAATGGCGGATTTAGA
Unaligned ( gi|37 ): ATTCATATCAAAATCATTACTGCCAGATTCCTGTATGCTTTCAGCAAGCTTACCCGGTAGATTTGATATAAATGAATGTTATTACATTTAAACCTTTCATTGTGGCAAGGTGGGCAATATTTACAGATA
Unaligned ( gi|40 ): ACGTCATTTTCAAAAGACTCTTGCATATATTTACACACAAAACACAACTATATTTTACGTTGTCATCTCTCTGACAAATGGTCAGTGTTATCAGCAGCACGGATAGTGACCGTGAAATAT
Unaligned ( gi|41 ): ACTTACTGTAATCATAAGGTTGGCGTACCTAACTGCTGTTTTGTTAAACGATGTCGTACCGGACGTTTTATTGACATATTATTGTATTTAACAGTTTTACAAGTAGCCTATATTTCTAA
Unaligned ( gi|43 ): TCATTGTACCGTCATTTACTGGTAAACAATAAATATCTGTATTGTGGGGCGATTCTAGCTGTCAGTGCTTGTTTTAAAATCAATATAGTACTCGAGTGGGCGATTTATGAGC
Unaligned ( gi|44 ): AGTCACATGGAACTGGGGGGCGACTAAGACTCGGCTTGACATTATTTATGGCCAGCCCACAGAGTATTCTATCCATAGATTAATCTTTGTGTTTACAAGAAATTAT
Unaligned ( gi|46 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA
Unaligned ( gi|48 ): AACAATAAGTTTTTTAAATTCATTGTCTTTTTAAAAATAGTATCTTCTCCGTATCTCTCCGCCTCT
Unaligned ( gi|49 ): ATAACAACAAAGAACGAACTGGTGGGATTACTTTTTCTCAACTAAACGACTTACCAGCTT