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Reference ( gi|2 ) : CATGGTAC-----C-CT--ACAT------TGTGT--AACCAA----TTCTTCTCACA----GC-----CTTT-----AC-----------ATT-TTTCAGACCTTGTAC----ATT---TAAANNNNNN------CTCTTCTCACGGCC----T-TT----ACTT--T-------A----CA----T--T-TTT----CAG-ACC-------------T---TGTA-C-A-----------T-----TT----------------A------A------A---C--AT-TG----A-AGATA-------TA-------TT--CT-C--TA--CCACA-A--ATAC-TTCA---GT--T-TGTT-TC---T-----A-T------T---T---------------C--ATC---TGGA-TC------C-A---TG---T-ATT-GCTG-T--C--T----CA----------A--TG---AT-A----G---ACAAC-----AT----A--T-----TT---TAAA-GC---AAC--C------TGGCCA-AT--T--CTG-GTCTT-GAATT
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gi|19 : tcttttgaagtaatttgacattcatgaagttaacattttttaagCATGGTACATGCAC-CT--ACTT------TGTAC--AACCAA----CTCTTTTCACA----AC-----TTGT-----ACTTGAA------ATT-TTTCAAAACTTGTAC----ATT---Tttacatatatacatgtattttagttgttatacatattgtcagtaatcagaaatacttcagttatagttttattccatctggatcattgtactgctgtgtctatgatagataacatgttaaagcaactgggccatttat
gi|1 : tgaactttgtcattttttaaCATAGTAC--------T--AC-T------GGTGG--AACC------------TCACA-----------CTTT-----ACTTGAT------ATT-TTT--GA-----TA-----ATT---TGAAA--------------TTTTCA-GACC----C-AT----A--T--T-------A----CA----T--T-TT------AG-----------------T---TGT--T-A-----------T-----AT----------------A------A------AAAAC--ACATG----A-TG-TA-------TA-------TT--CT-C--AA--CCACA-A--ATAC-TTTA---GT--T-TAAT-TC----------------------T---------------C--A------AAA-TC------C-A---TGACCT-CAT-GCTG-TTCT--T----CT----------A--TAGC-AT-A----GA--ACAAT-----AC----A--T-----TTGTATAAATTC---AAC--T------CG--CA-TT--T--CTG-TTCTT-GAtagttgttaagaaaaaataacatattttaaagcaatccagccatttctattcttgaattgatttttg
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gi|21 : taccta------CTCTTTTCACAGGT----T-TT----ACTT--G-------A----TA----T--A-TCT----CAG-ACC-------------A---T-TA-C-A-----------T-----TTTAGTTGCTATAA----A------A------A---T--AT-TG----A-AGATATACATG-TA-------TT--TT-C--TG--CCACA-A--A-AC----------------TT-TC---T-----T-T------T---T---------------T--ATC---TGGA-TC------C-A---CG---T-ACT-GCTG-T--C--T----CT----------A--TA---AC-A----G---GTAAC-----AT----A--T-----TA---TAAA-GA---AAC--g
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|36 : A-TA-------TT--CT-C--TA--CCACA-A--ATG-----C----AGT-T-CATTT-----T---T-A-T------T---TC---------------A------GGG-TC-C------A-------TG-------------------TG-T---------------------------------------------------T-----TT---TAAA-GC---AA--T--C------AAATCA-T--T-T--TTG-TTCTT-GAAT
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-823 ) : CATGGTACATG-A--CCTA-CTTTGTGTAACCAACT----CCTCTCACAGCNTTTACTTG---ACATTTTTCAGAC----------CA-TG-TAC--ATT---T-----AA---CCAACT--CT----TCTCAC-AGCT----T-TT----A-CTT--G-A------TA----T--T-TTT----------------CAG-A-C-C-A-T-----------GT--ACA--T-T----T--T-A-----TT--T------T--------A-------AA------C----AT--TG----A-AGATA-TA-------TT--CT-C--TA--CCACA-A--ATACTT--C----GGT-T-TATTT-----T---T-A-T------T---TC---------------ATC---TGGA-TC-C------A-------TG--T-------AC----TGCTG-T--C-----TCTA----TG--AT-A----G---ATAAC-----AT----A--T-----TT---TAAA-GC---AA--C--C------CGGCCA-T--T-T--CTG-TTCTT-GAATT
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gi|19 : tgaactCATGGTACATGCA--CCTA-CTTTGTACAACCAACT----CTTTTCACAACTTGTACTTG---AAATTTTTCAAAA----------CT-TG-TAC--ATT---T-----gaaaaaataacatattttaaagcaatccagccatttctattcttgaattgatttttg
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gi|2 : tgaactttgtcattttttaacatggtacatgcacctactttgtacaaccaactcttttcacaacttgtacttgaaatttttcaaaacttgtacattttagttgttaagaaaCATGGTAC-------CCTA-CATTGTGTAACCAATT----CTTCTCACAGCCTTTAC--------ATTTTTCAGAC----------CT-TG-TAC--ATT---T-----AAANNNNNNCT--CT----TCTCAC-GGCC----T-TT----A-CTT--T-A------CA----T--T-TTT----------------CAG-A-C-C-T-T-----------GT--ACA--T-T----T------------------------------A-------AA------C----AT--TG----A-AGATA-TA-------TT--CT-C--TA--CCACA-A--ATACTT--C----AGT-T-TGTTT-----C---T-A-T------T---TC---------------ATC---TGGA-TC-C------A-------TG--T-------AT----TGCTG-T--C-----TCAA----TG--AT-A----G---ACAAC-----AT----A--T-----TT---TAAA-GC---AA--C--C------TGGCCA-A--T-T--CTG-GTCTT-GAATTgatttttg
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gi|31 : gaatagatagtaccc---T-----AA---CCAACT--CT----TCTCAT-AGCT----T-TT----A-CTT--C-A------TA----T--T-TTT----------------CCC-A-C-T-A-T-----------GT--ATA--T-T----T--T-A-----GTAGT------T--------ATGGA---AA------C----AG--TG----A-AGATA-TA-------AT--TT-C--TA--CCACA-A--ATACTT--A----GGT-C-TATTT-----T---T-A-T------T---TC---------------ATT---Tc
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gi|33 : tTACTG--C----GAT-T-TATTT-----T---T-A-T------T---TC---------------ATC---TGGA-TC-C------A-------TA--T-------AC----TGCTG-T--C-----TTTA----TG--AT-A----G---AAAAC-----AT----
gi|34 : aaatgcttaacaatt---T-----AA---CCAACT--GT----TCTCAC-AACT----T-TT----A-CTT--G-ATAAAAGTA----T--T-TTT----------------CAG-A-C-G-G-T-----------TT--ATAT-T-T----T--T-G-----TT--T------TTATGA---A-------AA------C----AT--CA----A-AGATA-gatgtagtgatcaatcac
gi|35 : ctttgtg-TATTC-----T---TCA-C------T---GA---------------ATC---TG-A-CC-C------A-------TG--C-------AC----TGCTGAC--C-----CCTA----AG--AC-A----G---ATAAC-----GT----A--T-----TT---TTAA-GC---AAACC--T------CGGCCCTT--T-T--CTA-TTC
gi|36 : A-TA-------TT--CT-C--TA--CCACA-A--ATG-----C----AGT-T-CATTT-----T---T-A-T------T---TC---------------A------GGG-TC-C------A-------TG-------------------TG-T---------------------------------------------------T-----TT---TAAA-GC---AA--T--C------AAATCA-T--T-T--TTG-TTCTT-GAAT
gi|37 : C---------------ATC---TTGA-TC-C------C-------TG--T-------AC----TGCTG-T--TG----TCTA----TG--AT-G----A---GTAAC-----AT----A--T-----TT---T-AG-GA---AA--C--C------CAGCCA-T--T-T---TC-TCTTT-GAc
gi|38 : ---------------ATC---TGGA-TC-C------A-------TG--T-------AC----TGCTG-T--C-----TCTA----TG--AT-A----G---GTAAC-----AT----A--T-----TC---TAAA-GC---AA--C--C------CAGCCATT--T-T--CTG-TTTTT-tcagaatca
gi|39 : GGTACATG-AA-CCTA-CTTTGTGTAACCAACTAGCTCCTCTTACTGCCTTTATTTG---ACATTTTTCAGAT----------Ct
gi|4 : ---CCAACT--CTGTCTTCTCAC--GCT----T-TT----A-CTTTTG-AAAAAG-TA----T--T-TTCGTTC------------CAG-A-C-C-GGT-----------TT--ACA--T-TCT--T--T-G-----TT--T------CTTCTATGAA-------AA------C----AT--CC----A-AAGTA-TAATTTTACTTGACT-C--GA--CCA-A-ATTATGCTTGAC----TAC-T-T-TTT-----C---T-A-T------T---TC---------------ATC---TGGA-TC-CG-----A-------TAATC-------AC----TGCTG-T--TCTCAATCGA----TG--AT-A----G---ACGTC-----AT----T--T-----CT---AAAA-GC---AA--CTTC------TGGCC-----T-T--CTGTTTCTTCGAATtt
gi|40 : ttgtgttttCATG-GTTCTTA-CTTTGGGTAACCAATT----CTTCTCATGGCTTTTACTTG---ACATTCGACAGAA----------CA-TG-TAgcg
gi|41 : ag---ATAAC-----AT----T--T-----TT---CAAA-AC---GA--C--CAGATACTGGCCA-T--T-C--CTG-TTCTT-GAAT
gi|42 : gtcttga-A--CCAA-TTTTGTGTGATCAACT----CCATTTACAGCATTTATTTGACAACATTTTcgatttttt
gi|43 : atagactatTGTAATCAGCT----CCTCTTACAGCATTT-TTTG---ACACCCTTCTGActga
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gi|6 : ATTTTTAAG------------CA-TGGTAC--CTA---T-----A----CT--TT--CT----TCTCAG-AA------T-TT----A-CTT--G-A------CA----T--T-TTT----------------CAG-A-C-C-G-T-----------GT--ACA--T-T----T--T-AA----TTG-T------T--------A------------------------TA----A-AAACA-TA-----------------------GAA-G--ATA----------------TATTC-----TC--T-A-T------C---AC---------------A-------AA-TA-C------A-------C---C-------AC----TGTTG-T--C-----TATA----TG--AT-A----G---ATAAC-----AT----A--T-----TT---TAAA-GC---AA--C--C------TAGCCA-T--T-T--CTG-TTCTT-GAATtcaact
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gi|9 : aatagaccgtccctaattttttg--ATT---T-----AA---CCAACT--TT----TCTCAC-TCCT----T-CT----A-CTT--GGA------TA----T--T-TTT----------------CAG-A-C-C-AAT-----------GT--G-----------T--T-A-----TG--A---------------A-------AA------C----AT--TG----A-AGGTA-TA-------TT--TT-C--TA--CCACA-A--ATATGT--G----CAT-T-TATTT-----T---T-A-T------T---AC---------------ATC---TGAA-TC-C------A-------TG--T-------AC----TGCTG-T--C-----TTTACTACTG--AA-A----G---ATAAC-----AT----A--T-----TT---TAAA-GCATGAG--C--C------CGGCCA-T--T-T--CTG-TTCTT-GAATTcga
blockSeqs : A GTT A AGCT C ACA CATGGTACCTA C G CT GTG TGTAC ANN GC GTCT T AAAT A GTAA A TT G TAAAAG AAAG AA C GTTC T T A . G TTTTAGTACAT AC AT A TCAG AG G TTTCTTCTATGAA AAAACG CACT AT TTCA G G CAATTTA GAC T AG TA T TT TCATTG C A C TTTAA GAG C T AGGTAA CGA TCACATAATTATGAC TAG G T CTGTAC CTTTGAT AT TGCACTC . A TCTCAA CTAC C A CATGTAT TAGCT CAGG AG CTCAT . . ATG AC TT AGATAC T AC A TA T C
blockSeqs : A AA . . C . A . . . . GTGT . . . . . . . A . G AAAAA . . . . . . . . A TTAAATTAA T T . TAG . . GTTGTTATGAAA AA T AA . . . ATTTTAC T A . A . . GACT . . T . AA . A A . CA . . . G . . T . . TTG ATT . . AAAAG . . . A . . . . T . T . . . T .
blockSeqs : . A . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . AAAAG . . . . . . . . . . . . . CT . . GTTGTTATGAAA AT . . . . . CATGTA T . . . . . TG . . G . C . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . TACG . . . . . . . . . . T . . . T .
blockSeqs : . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . GTCGTTATGAA . . . . . . GATT T . . . . . TG . . A . C . . . . . . . . . . . . . . CT . . . GAT . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTGTTGTAAA . . . . . . G C . . . . . CA . . C . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTGTTATATA . . . . . . . T . . . . . CA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTAATTATGAA . . . . . . . C . . . . . CA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTTGTTATGGA . . . . . . . T . . . . . TG . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTTGTTATGAA . . . . . . . C . . . . . CA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTACTTTTTGA . . . . . . . C . . . . . AA . . G . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTTTATGAA . . . . . . . T . . . . . CA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTTTTATGA . . . . . . . A . . . . . AG . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTTGTAATA . . . . . . . T . . . . . CG . . C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTGCTATA . . . . . . . C . . . . . CA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTGTTATG . . . . . . . T . . . . . TG . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTGTTA . . . . . . . C . . . . . CT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTTGAA . . . . . . . T . . . . . GC . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTAATG . . . . . . . G . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTGTTA . . . . . . . C . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTATA . . . . . . . C . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTTA . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGAA . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTT . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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Reference ( family-823 ) : CATGGTACATG-G--CCTA-CTTTGTGTAACCAACT----CCTCTCACAGCNTTTACTTG---ACATTTTTCA-----GANCA-T-G-----TAC--ATT---T-----AA---------CCAACT--CT----TCTCAC-AGCT----T-TT----A-CTT--G-A------TA----T--T-TTT----------------CAG-A-C-C-A-T-----------GT--ACA--T----TTT-AGT--TGTT------AT-G----AA--A----C-AT--TG----A-AGATA-------TA-------TT--CT-C--TA--CCACA-A--ATACTT--C----GGT-T-TATTT-----T---T-A-T------T---TC---------------ATC---TGGA-TC-C------A-------TG--T-------AC----TGCTG-T--C-----TCTA----TG--AT-A----G---ATAAC-----AT----A--T-----TT---TAAA-GC---AA--C--C------CGGCCA-T--T-T--CTG-TTCTT-GAATT
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gi|19 : tgaactttgtcattttttaa-A----A---ATAAC-----AT----A--T-----TT---TAAA-GC---AA--T--C------CAGCCA-T--T-T--CTA-TTCTT-GAATTtagttgttaagaaaaaataacatattttaaagcaatccagccatttctattcttgaattgatttttg
gi|2 : tgaactttgtcattttttaacatggtacatgcacctactttgtacaaccaactcttttcacaacttgtacttgaaatttttcaaaacttgtacattttagttgttaagaaaCATGGTAC-------CCTA-CATTGTGTAACCAATT----CTTCTCACAGCCTTTAC--------ATTTTTCA-----GACCT-T-G-----TAC--ATT---T-----AAANN------NNNNCT--CT----TCTCAC-GGCC----T-TT----A-CTT--T-A------CA----T--T-TTT----------------CAG-A-C-C-T-T-----------GT--ACA--T----TT-------------------------AA--A----C-AT--TG----A-AGATA-------TA-------TT--CT-C--TA--CCACA-A--ATACTT--C----AGT-T-TGTTT-----C---T-A-T------T---TC---------------ATC---TGGA-TC-C------A-------TG--T-------AT----TGCTG-T--C-----TCAA----TG--AT-A----G---ACAAC-----AT----A--T-----TT---TAAA-GC---AA--C--C------TGGCCA-A--T-T--CTG-GTCTT-GAATTgatttttg
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gi|22 : T--ACA--T----TTT-ACT--TGTT------AT-G----AA--AA---C-AT--TG----A-CGATA-------TAG------TT--TT-T--TA--CCACA-A--ATACTT--T----GGT-T-CCTTT-----T---T-A-CAGGTAAT---TC---------------ATC---TGGA-TC-C------A-------TG--T-------AC----TGTTG-T--C-----TTTA----TG--AT-ACAT-GTATATAAC-----AT----A--T-----TT---TAAA-GC---AA--C--C------CGGCCA-T--T-T--CTT-TGCTC-GAAT
gi|23 : tTT---T-----AA---------CCAACA--CT----TCTCGC-AGCT----T-GC----A-CTT--G-A------TA----T--T-TCT----------------CAG-A-A-C-A-T-----------GT--ACA--T----TTT-AGT--TGTT------AT-G----A-------------------------TA-------TA-------TT--AT-C--T----CA---------------------T-T-TA-TT-----T---T-A-T------T---TC---------------ATC---TGGA-CC-C------A-------TG--C-------AA----TGCTA-T--CT----TCTA----TG--AT-A----G---AT---------T----A------------------------------------------A-T--T-T--CTG-TTCTT-GAATc
gi|24 : acctactttgTT--G-A------CA----T--T-TTT----------------CAG-A-C-C-A-T-----------TT--ACA--T----ATT-AGT--TGTT------A-----------A----C-AT--TA----C-AGATG-------TA-------TT--TT-C--TA--CCACA-A--ATATTT--C----AAT-T--ATTT-----GGAGT-A-T------A---TC---------------AT-------------------A-------TA--T-------AC----TGCTA-T--C-----CGTA----TG--AT-A----T---ATGAC-----AT----A--C-----TT---TAAA-GC---AA--C--C------CGACCA-C--T-T--CTG-TTCTT-GAACTcagtt
gi|25 : t----------------CAG-A-C-C-A-T-----------TT--ACA--T----TGT-AGT---ATT------TT-G----AA--AA---C-AT--TG----A-AGATA-------TG-------TT--CT-C--TA--GAAAA-A--ATACTT--A----AATCT-TATTT-----T---T-A-T------T---TC---------------ATC---TAGA-TC-C------A-------TT--T-------AC----TGTTG-T--C-----TCAA----TG--AT-A----G---ATGAC-----AT----A--T-----TT---TAAA-GC---AA--C--C------CAACCA-T--T-T--CTG-TTCTC-GAATgat
gi|26 : -A------TA----T--T-TTT----------------CAG-A-A-C-A-T-----------GC--ACA--T----TTT-AGTACTTTT-------T-G----AA--A----C-AT--TG----G-AGATA-------TA-------CT--TT-C--TA--CCACA-A--TTACTT----------------TT-----C---T-A-A------T---TA---------------AT-----GCA-TC--------A-------TG--T-------AC----TGTTG-C--C-----TCTG----TG--GT-A----T---ATACT-----AT----C--T-----TT---GAAA-GC---AA--C--C------CGGCCA-T--T-T--CTA-TTATG-GAATcg
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gi|34 : aaatgcttaacaatt---T-----AA---------CCAACT--GT----TCTCAC-AACT----T-TT----A-CTT--G-ATAAAAGTA----T--T-TTT----------------CAG-A-C-G-G-T-----------TT--ATA--T----TTT-TGT--TTTT------AT-GA---AA--A----C-AT--CA----A-AGATA-------gatgtagtgatcaatcac
gi|35 : ctttgtg-TATTC-----T---TCA-C------T---GA---------------ATC---TG-A-CC-C------A-------TG--C-------AC----TGCTGAC--C-----CCTA----AG--AC-A----G---ATAAC-----GT----A--T-----TT---TTAA-GC---AAACC--T------CGGCCCTT--T-T--CTA-TTC
gi|36 : A-------TA-------TT--CT-C--TA--CCACA-A--ATG-----C----AGT-T-CATTT-----T---T-A-T------T---TC---------------A------GGG-TC-C------A-------TG-------------------TG-T---------------------------------------------------T-----TT---TAAA-GC---AA--T--C------AAATCA-T--T-T--TTG-TTCTT-GAAT
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gi|38 : ---------------ATC---TGGA-TC-C------A-------TG--T-------AC----TGCTG-T--C-----TCTA----TG--AT-A----G---GTAAC-----AT----A--T-----TC---TAAA-GC---AA--C--C------CAGCCATT--T-T--CTG-TTTTT-tcagaatca
gi|39 : GGTACATG-AA-CCTA-CTTTGTGTAACCAACTAGCTCCTCTTACTGCCTTTATTTG---ACATTTTTCA-----GATCt
gi|4 : ---------CCAACT--CTGTCTTCTCAC--GCT----T-TT----A-CTTTTG-AAAAAG-TA----T--T-TTCGTTC------------CAG-A-C-C-GGT-----------TT--ACA--T----TCT---T--TGTTTCTTCTAT-G----AA--AA---C-AT--CC----A-AAGTA-------TAATTTTACTTGACT-C--GA--CCA-A-ATTATGCTTGAC----TAC-T-T-TTT-----C---T-A-T------T---TC---------------ATC---TGGA-TC-CG-----A-------TAATC-------AC----TGCTG-T--TCTCAATCGA----TG--AT-A----G---ACGTC-----AT----T--T-----CT---AAAA-GC---AA--CTTC------TGGCC-----T-T--CTGTTTCTTCGAATtt
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gi|41 : ag---ATAAC-----AT----T--T-----TT---CAAA-AC---GA--C--CAGATACTGGCCA-T--T-C--CTG-TTCTT-GAAT
gi|42 : gtcttga--CCAA-TTTTGTGTGATCAACT----CCATTTACAGCATTTATTTGACAACATTTTcgatttttt
gi|43 : atagactataTGTAATCAGCT----CCTCTTACAGCATTT-TTTG---ACACCCTTCT-----GActga
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gi|45 : T--CT----TCTCAC-AGCT----C-TA----C-CTT--GGA------TA----T--T-TTT----------------CAA-A-C-C-A-C-----------GT--ACA--g
gi|5 : CAACT--CT----GC-CAC-AGCT----T-GT----AACGT--C-A-------------------------------------AA-A-C-T-A-T-----------GT--ACA--T----ATT-AGT--TATT------AT-G----AA--A----CTATAATG----A-AGATAG------TAGATT---TT--CC-C--TA--CCAAA-A--ACACTC--T----GGT-T-TTTTTTTTAAT---T-A-T------T---TCCA-------------ATT-----GA-TC-C------ACTTTGATTG--TTGCACTCAC----CGCTC-T--C-----TC-A----TGC-AT-ATAC-G---ACAACTAGCTAT----AAGT-----AT---TAAA-GC---AA--C--C------CAGCCA-TACTAT--CTGTTTCTT-GA
gi|6 : ATTTTTAA-----G--CA-T-GG----TAC--CTA---T-----A----------CT--TT--CT----TCTCAG-AA------T-TT----A-CTT--G-A------CA----T--T-TTT----------------CAG-A-C-C-G-T-----------GT--ACA--T----TTT-AAT--TGTT------AT------AA--A----------------A-ACATA-------GA-------------------------A-G--ATA----------------TATTC-----TC--T-A-T------C---AC---------------A-------AA-TA-C------A-------C---C-------AC----TGTTG-T--C-----TATA----TG--AT-A----G---ATAAC-----AT----A--T-----TT---TAAA-GC---AA--C--C------TAGCCA-T--T-T--CTG-TTCTT-GAATtcaact
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gi|8 : --CCTAATTTTTTGTAATCAGCT----CCTCTTAGAGCATTTATTTG---ACATCTTTCA-----GA
gi|8 : aatagaccgtc---T-----AA---------TCAGCT--CC----TCTTAG-AGCA----T-TT----A-TTT--G-A------CA----T--C-TTT----------------CAG-A---------------------------------TTG-CGC--TATT------AT-G----GA--AG---C-AT--GG----A-A-----------T--------TT--TT-C--T--------------------------GT-T-TATTT-----T---T-AAT------TCGATC---------------ATC---TTGA-TC-C------G-------CG--C-------AC----TGCTG-T--C-----TTTC----TG--AT-AAAAAG---AAAAC-----AC----A--TCTCATTT---TAAA-AC---AA--C--C------CAGCCA-T--T-C--CCG-CTCTT-GAATttgcgctattatggaagcatggaatttttctgtttatttttaattcgatcatcttgatccgcgcactgctgtctttctgataaaaagaaaacacatctcattttaaaacaacccagccattcccgctcttgaatcga
gi|9 : aatagaccgtccctaattttttg--ATT---T-----AA---------CCAACT--TT----TCTCAC-TCCT----T-CT----A-CTT--GGA------TA----T--T-TTT----------------CAG-A-C-C-AAT-----------GT----------------------GTT------AT-G----AA--AA---C-AT--TG----A-AGGTA-------TA-------TT--TT-C--TA--CCACA-A--ATATGT--G----CAT-T-TATTT-----T---T-A-T------T---AC---------------ATC---TGAA-TC-C------A-------TG--T-------AC----TGCTG-T--C-----TTTACTACTG--AA-A----G---ATAAC-----AT----A--T-----TT---TAAA-GCATGAG--C--C------CGGCCA-T--T-T--CTG-TTCTT-GAATTcga
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|46 ): ACATTCTTCGTTTAAATTTGCATGTTGAGCATTTTTTCAGC