lowQualScore : 222 6666666666666666666 333333333333 9999999999999999 222222222222 222 5555555555555555555555555555555555555555555 2222222222 222222222 1 44444444444 111
lowQualScore : 777 8888888888888888888 99 444444444444 4 44 88 3 9999999999999999 0 8 888888888888 222 44 666 2 2 7777777777777777777777777777777777777777777 6666 2222222222 555 5 222222222 0 6 777 6 88 6 6 6 3 5 77777777777 999 6
lowQualScore : ... ................... .. ............ . .. .. . ................ . . ............ ... .. ... . . ........................................... .... .......... ... . ......... . . ... . .. . . . . . ........... ... .
lowQualScore : 000 0000000000000000000 22 888888888888 0 88 66 6 5555555555555555 4 2 111111111111 888 22 000 7 9 1111111111111111111111111111111111111111111 4444 3333333333 888 7 222222222 5 5 666 0 33 0 0 0 0 5 55555555555 555 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCTTTATAAAGAACAAAAGTAACTAGCATTT--ACAAGATA--TGANT-----AT-AATCTGCCGATTAT--AAAGTCTC-CCAAA---------GAAGTACTGGCTGTATNAAAGTGGG----C-------TTT-T-CTG--AG--TACTACNATTTT-C-------------C--------------TC-------------CCTTGCACA-A--AA---T-----CC---ATGCCAATTTTAATT-----TCATTTAAAAAATCTAGATCACAAAGACTCTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCCTGGTTCTNAAGTTACTAAAAGTTTATTCNNGATCAAGGTC
Reference ( gi|2 ) : AATTTGTGTAACTGACAAATAAATATACCTAATATCTCTACTTTTTGATAAAAATTTCTCCCTAAATTATACATGTAAATAG-ATTT--ACAAGATA--AGGAT-----AT-AATCTGCTGATTAT--AAAGTCTC-CCAAATCATGAAATGAAGTACTGGCTGTATAAAAGTGGG----C-------TTT-A-CTG--AG--TACTACTATTTT-C-------------C--------------TC-------------CCTTGCACA-A--AC---T-----CC---ATGCTAATTTTGAAT-----TCATTTAAAAAATCTTGGTCATAAAAACTCCCAGCCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTTCTGGTTCTAAAGTTA-TATAAGTTTATTTACAACCAAGGTC
gi|5 : ATTTCTTTATAAAGAACAAAAGTAA-------TT--AAAAGATA--TTACC-----AT-AATTTGCTGATTAT--CAAGTCTC-CCAAAT--------AAAGTACTGGATGCAATGAAGAAGG----C-------TTTTC-CCG--AG--TACTATGATTTT-C-------------C--------------CC-------------ACTTGCACA-A--AA---T-----CC---ATGCCAGTTTTTATC-----TTATCTA
gi|8 : atctgtgttaagcaataaatactcataccagtaatgtgtcaaaccacaccaaaatttcatAACTAGCATTTGAACAAGATG--TGATT-----AT-AATCTGTCAATTAT--AAAGTCTC-CTAAA----G----GAAGTATTGGCTGTAC-AAAGTGAA----CT------TTT-T-CTT--AA--CACAACTATATT-C-------------C--------------TC-------------CTTTGCACA-T--AA---TCCATGCC---ATGCCAATTTTAAGT-----TCATTTAAAAAATTT
gi|1 : cacattttgagaag--ACAAAATA--TGATT-----AT-AATCTGCTAATATT--AAAGTCTC-CCAAATTAAGAAATG-------GGA-GTGTTAAGGTGGG----C-------TTT-C-CTG--AA--GACTTCCATTTC-C-------------CCATTATCAATAAATTC-------------CCTGGCGTA-A--AG---T-----CC---ACGCCAATTTTAATT-----TTACTT-AAAAATCTATATCACAAAa
gi|13 : aaaaaaatagattatgtcatttatggtttcaaaggaagttgaatatgacaatgtgctactcatcttcaacaaatattaattaaa--ACAAGATA--TGATT-----AT-AATTTGTCAATTAT--TAATTCTC-CCATA-CA-------AAGCATTGAATGTATAAAAGTGGG----C-------TTT-TTCTG--AG--TATAACTATTTT-C-------------C--------------TC-------------CCTTGCAggcattgattttgaaatttttcaaaaaatcctccagtttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaggtcccgtaatcagtcctggttctaaagtataaaagtatttctgatcaacg
gi|11 : aa--ACAGGATA--TGAATTAATCAT-AACTTGCCGAATATTTAATATCTCTCCAA--CG-GAAATAA----CTGGCTGTTTAAAAGTGGG----CT------TTT-T-CTGTAGG--TACTACCA-TTT-C-------------C--------------TC-------------CCTTG-ATT-T--AC---T-----CC---TCGCCAATtgct
gi|14 : ggtctgtatattaa--ACAAGATA---TGAT-----AT-AATTTACCGACTAT--AAATTCTC-CCA----------------ACTG-----ATTAATGTGGT----CT------TTT-T-CTA--AGTATATCACTGTTTT-T-------------C--------------TC-------------CCTTGCACA-
gi|3 : ataaaatatgtaaCAAGATATGATAAT-----A--AATATGCC-ATTCT--CAAGTCTC-CCAAAT--------GAAGTACTGGCTGTATAAAAGTGGT----CTTGTTTTTTT-T-TTT--AG--AACTACAACTTC-CCCCACATAATTAAC--------------TC-------------CCTCGCACA-A--AA---T-----CC---AATCCAATTTTAATT-----TCATTT-AAAAATCTAGATCACAAAA--TCTCAACCt
gi|9 : AGATA--TGATT-----AT-AATCTGTTGATTAT--AAAGTCTC-AC--------AAACGAAGTACTAGCTGTATGAAAGttaaatttttttttttaataaaatccccttttttcttcagtaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtcttggttctcaagttactaaaattttcaagatcaaggtc
gi|7 : cagtacccataggtaattaaaaaaatagAT-----ATCAACCT----ATTAT--AAAGTCTC-TCAAA-CA-------AAGT-CTGGCTGTACAAA-GTGAGTTTTC-------TTT-T-TTA--AA--TACTACTGTATT-T-------------C--------------TC-------------CCTTGCACATA--AC---TTATG-CCATGATGCCATTTTTAAAT-----TCAGTTAAAAGTTCTgttttttttcccccgaattcaaaaatttcacccacattaattaacgcccttgcacaaatatctagatcaca
gi|10 : atctaaaacaattcaatataatatgaaacgatgtgattata-----AT-AATTTGCTGATTATT-CAAGTCTC-CCAAAT--------AAAGTACTGGATGCAATGAAGAAGG----C-------TTT-T-CCC---G--TACTATGATTTT-C-------------C--------------CC-------------ACTTGCACA-A--AA---T-----CC---ATGCCAGTTTTTATC-----TTATCTAaaatctctaaatggcaaagattttggtttccagaaa
gi|4 : acaaaaaagtaattaaaagtattaccATCAGCCTATTTT--AA-GTCTC-CCAA---------TTAAACACTGGCTGCATGAAAATGGGA---T-------TTT-T-CTG--AG-----------TTC-C-------------C--------------CT-------------CCTTGCACA-GTTA----T-----CA---AGACAAAGTTTG-----------TTTAAAAAATCTAGAACACAAAGAC
gi|6 : ATGATATAAA----TGGCTGGAGCAAAGAAAGGTT-T-------TTT-T-CTG--AA--TACTACTATTTC-C-------------CCGCACATTGATAGCTC-------------CCTTGCATA-A--AA---T-----CC---ATGTCAATTCTAATT-----TCATTT-AAAAATCTTGATCACAAAGACTcttgactttcaaattttaaaaaaaactccccttgttttccttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcttggttcaaaagttgtataatg
gi|15 : tataacaaggaacagatcaaaatgctaaaatattgaatcaaagGGG----C-------TTT-T-CTG--AG--TAGTACGACTTTAC-------------C--------------TCAAGTTAATTGCCCCCTAACACA-A--AC---T-----TC---ATGTTAATCTT-AATCTAGATCAT---AAAGATCTTGATttgattttgaaactttttaaaaatccctatgtttcctttactaaa
gi|17 : -------TTT-T-CTG--AG--AACTTCTATTAT-C-------------CCCCACATCAATAACTC-------------CCTTGCTCA-A--AA---T-----CT---ATATCAATTTTAATT-----TCTTATAAAAAATCTtttccaa
gi|12 : TT-C-------------C--------------TC-------------C-TTGCACA-T--ATCCAT-----CC---ATGCCAATTTTATGT-----TTATTTAAAAATTC
gi|3 : tgtaAGTCTTGGTTCTCAAGTTACTA-AAATT--TTCAAGATCAAGGTCaaaaatcatagagattttgaaaatttcaaggaaaaaattccatttccttctgtaaa
gi|1 : caagatatgataataaatatgccattctcaagtctcccaaatgaagtactggctgtataaaagtggtcttgtttttttttttagaactacaacttcccccacataattaactccctcgcacaaaatccaatccaattttaatttcatttaaaaatctagatcacaaaatctcaaccttaaatttttttttttaataaaatccccttttttcttcagtaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAGTCCTGGTTCTAAAG-TA-TAAAAG--TATTTCTGATCAA
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): TCCAAAGTACTGGGATTTTTCCACACATTAATAACCCCCTTGCAAAAAATGCATGCCAATTCAAATTTTTTTTTAAAAATCAAAATCACAAA
Alignments
lowQualScore : 5555555 3333333333333 1111 6666666666666666666666666666 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 2222
lowQualScore : 3 2 8 0 3333333 66 9999999 3 0 44 2 77 3 3 5555555555555 3 3 555 55 3333 5 8888888 5 6666 555 2 2 4444444444444444444444444444 444 2 2 999 2 444 66666 2 33 0 1 2 5 3 3 33 0 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 7 3 0000 222
lowQualScore : . . . . ....... .. ....... . . .. . .. . . ............. . . ... .. .... . ....... . .... ... . . ............................ ... . . ... . ... ..... . .. . . . . . . .. . .................................................................................................. . . . .... ...
lowQualScore : 0 5 0 8 6666666 99 7777777 3 8 66 3 99 3 1 5555555555555 1 1 444 44 9999 3 7777777 3 8888 666 9 5 8888888888888888888888888888 111 5 7 333 7 777 77777 7 99 9 1 9 1 3 3 11 2 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 3 3 3333 777
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCTCCNTAAANAACAAA-AGTAA-TAG-ATTT--ACAAGATATGATT-----ATAA-TCT--GCCGATTAT--AAAGTCTC-CCA-A-AC--------G-AAG-TA-C---TGGCTGTATNAAAGTGGG----C-TT-------TT-CT-G--AG--TACTACTATTTT-CC--------------T-------------CCC---TTGCACA-A-A---AT-CC---AT-----GCCA-ATT--TTAATTTCATT-TAAAAA-ATC-TAGATCACAAAGACTCTCGACCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTCCTGGTTCTAAAGTTA-TAAAAGTTTATTTACGATCAAGGTC
Reference ( family-8009 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCTTTATAAAGAACAAA-AGTAACTAGCATTT--ACAAGATATGANT-----ATAA-TCT--GCCGATTAT--AAAGTCTC-CCA-A-A---------G-AAG-TA-C---TGGCTGTATNAAAGTGGG----C-TT-------TT-CT-G--AG--TACTACNATTTT-CC--------------T-------------CCC---TTGCACA-A-A---AT-CC---AT-----GCCA-ATT--TTAATTTCATT-TAAAAA-ATC-TAGATCACAAAGACTCTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCCTGGTTCTNAAGTTACTAAAAGTTTATTCNNGATCAAGGTC
gi|1 : AACAAATATTAATTAA-A-----ACAAAATATGATT-----ATAA-TCT--GCTAATATT--AAAGTCTC-CCA-A-AT--------T-AAG-AA-A---TGGGAGTGTTAAGGTGGG----C-TT-------TC-CT-G--AA--GACTTCCATTTC-CCCATTATCAATAAATT-------------CCC---TGGCGTA-A-A---GT-CC---AC-----GCCA-ATT--TTAATTTTACT-T-AAAA-ATC-TATATCACAAAGGC
gi|1 : aaaaaaatagattatgtcatttatggtttcaaaggaagttgaatatgacaatgtgctactcatcttcAGTCCTGGTTCTAAAG-TA-TAAAAG--TATTTCTGATCAAattgattttgaaatttttcaaaaaatcctccagtttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaggtcccgtaatcagtcctggttctaaagtataaaagtatttctgatcaacg
gi|10 : aaaaaaatagattatgtcatttatggtttcaaaggaagttgaatatgacaatgtgctactcatcttcaacaaatattaattaaaacaaaatatgattataatctgctaatattaaagtctcccaaattaagaaatgggagtgttaaggtgggctttcctgaagacttccatttccccattatcaataaattccctggcgtaaagtccacgccaattttaattttacttaaaaatctatatcacaaaggcattgattttgaaatttttcaaaaaatcctccagtttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaggtcccgtaatcAAA-AGTAA-------TT--AAAAG-TATTACC-----ATAA-TTT--GCTGATTATT-CAAGTCTC-CCA-A-AT--------A-AAG-TA-C---TGGATGCAATGAAGAAGG----C-TT-------TT-CC----CG--TACTATGATTTT-CC--------------C-------------CAC---TTGCACA-A-A---AT-CC---AT-----GCCA-GTT--TTTATCTTATC-TAcg
gi|11 : acaa--ACAGGATATGAATTAATCATAA-CTT--GCCGAATATTTAATATCTCTCCA-ACG---------G-AAA-TAAC---TGGCTGTTTAAAAGTGGG----CTTT-------TT-CT-GTAGG--TACTACCA-TTT-CC--------------T-------------CCC---TTG-ATT-T-A---CT-CC---TC-----GCCA-AT
gi|12 : ggtctgtatattaaTT-CC--------------T-------------CC----TTGCACA-T-ATCCAT-CC---AT-----GCCA-ATT--TTATGTTTATT-TAAAAA-TTCAAAAATCATAGAGATTTTGAA
gi|13 : tgta--ACAAGATATGATT-----ATAA-TTT--GTCAATTAT--TAATTCTC-CCATA-C---------A-AAG-CA-T---TGAATGTATAAAAGTGGG----C-TT-------TTTCT-G--AG--TATAACTATTTT-CC--------------T-------------CCC---TTGCAaatttcaaggaaaaaattccatttccttctgtaaa
gi|14 : aa--ACAAGATATGA-T-----ATAA-TTT--ACCGACTAT--AAATTCTC-CCA--------------------A-C---TG-----ATTAATGTGGT----CTTT-------TT-CT-A--AGTATATCACTGTTTT-TC--------------T-------------CCC---TTGCACA-tgct
gi|15 : ataaaatatgtaaGGG----C-TT-------TT-CT-G--AG--TAGTACGACTTTACC--------------TCAAGTTAATTGCCCCC---TAACACA-A-A---CT-TC---AT-----GTTA-ATC--TT---------------A-ATC-TAGATCATAAAGA-TCTt
gi|16 : C--------------C-------------CCC---TTGCAAA-A-A---AT-GC---AT-----GCCA-ATT--CAAATTTTTTT-TTAAAA-ATC-AAAATCACAAAtgattttccaa
gi|17 : tccaaagtactgggatttttccacacattaataa-TT-------TT-CT-G--AG--AACTTCTATTAT-CCCCCACATCAATAACT-------------CCC---TTGCTCA-A-A---AT-CT---AT-----ATCA-ATT--TTAATTTCTTA-TAAAAA-ATC-T
gi|2 : ATTTCTCCCTAAATTATACA-TGTAAATAG-ATTT--ACAAGATAAGGAT-----ATAA-TCT--GCTGATTAT--AAAGTCTC-CCA-A-ATCATGAAATG-AAG-TA-C---TGGCTGTATAAAAGTGGG----C-TT-------TA-CT-G--AG--TACTACTATTTT-CC--------------T-------------CCC---TTGCACA-A-A---CT-CC---AT-----GCTA-ATT--TTGAATTCATT-TAAAAA-ATC-TTGGTCATAAAAACTCCCAGCCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTTCTGGTTCTAAAGTTA-TATAAGTTTATTTACAACCAAGGTC
gi|3 : aatttgtgtaactgacaaataaatatacctaatatctctactttttgataaaaCAAGATATGATA-----ATAAATAT--GCC-ATTCT--CAAGTCTC-CCA-A-AT--------G-AAG-TA-C---TGGCTGTATAAAAGTGGT----C-TTGTTTTTTTT-TT-T--AG--AACTACAACTTC-CCCCACATAATTAAC-T-------------CCC---TCGCACA-A-A---AT-CC---AA-----TCCA-ATT--TTAATTTCATT-T-AAAA-ATC-TAGATCACAAAA--TCTCAACC
gi|3 : AGTCTTGGTTCTCAAGTTACTAAAA-TT--TTCAAGATCAAGGTCttaaatttttttttttaataaaatccccttttttcttcagtaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtcttggttctcaagttactaaaattttcaagatcaaggtc
gi|4 : caagatatgataataaatatgccattctcaagtctcccaaatgaagtactggctgtataaaagtggtcttgtttttttttttagaactacaacttcccccacataattaactccctcgcacaaaatccaatccaattttaatttcatttaaaaatctagatcacaaaatctcaaccttaaatttttttttttaataaaatccccttttttcttcagtaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncA-TCA--GCCTATTTT--AA-GTCTC-CCA-A-T---------T-AAA-CA-C---TGGCTGCATGAAAATGGGA---T-TT-------TT-CT-G--AG-----------TTC-CC--------------C-------------TCC---TTGCACA-GTT---AT-CA---A------GACA-A------AGTTT-GTT-TAAAAA-ATC-TAGAACACAAAGAC-CTTGAC
gi|5 : ATTTCTTTATAAAGAACAAA-AGTAA-------TT--AAAAGATATTACC-----ATAA-TTT--GCTGATTAT--CAAGTCTC-CCA-A-AT--------A-AAG-TA-C---TGGATGCAATGAAGAAGG----C-TT-------TT-CCCG--AG--TACTATGATTTT-CC--------------C-------------CAC---TTGCACA-A-A---AT-CC---AT-----GCCA-GTT--TTTATCTTATC-TAtttcaaattttaaaaaaaactccccttgttttccttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcttggttcaaaagttgtataatg
gi|6 : atctgtgttaagcaataaatactcataccagtaatgtgtcaaaccacaccaaaatttcatCA-A-A---------G-ATGATA-TAAATGGCTGGAGCAAAGAAAGGTT-T-TT-------TT-CT-G--AA--TACTACTATTTC-CCCGCACATTGATAGCT-------------CCC---TTGCATA-A-A---AT-CC---AT-----GTCA-ATT--CTAATTTCATT-T-AAAA-ATC-TTGATCACAAAGACTTT
gi|7 : tataacaaggaacagatcaaaatgctaaaatattgaatGATGTGATT-----ATAA-TATCAACCTATTAT--AAAGTCTC-TCA-A-AC--------A-AAG-T--C---TGGCTGTA-CAAAGTGAGTTTTC-TT-------TT-TT-A--AA--TACTACTGTATT-TC--------------T-------------CCC---TTGCACATA-ACTTATGCCATGAT-----GCCA-TTT--TTAAATTCAGT-TAAAAG-TTC-TAAATCgattttgaaactttttaaaaatccctatgtttcctttactaaa
gi|8 : atctaaaacaattcaatataatatgaaacAGA-AG-AACTAGCATTTGAACAAGATGTGATT-----ATAA-TCT--GTCAATTAT--AAAGTCTC-CTA-A-A---------GGAAG-TA-T---TGGCTGTA-CAAAGTGAA----C-TT-------TTTCT-T--AA--CACAACTATATT-CC--------------T-------------CCT---TTGCACA-T-A---AT-CC---ATGCCATGCCA-ATT--TTAAGTTCATT-TAAAAA-ATT-TAtctaaatggcaaagattttggtttccagaaa
gi|9 : cacattttgAGATATGATT-----ATAA-TCT--GTTGATTAT--AAAGTCTC-ACA-A-AC--------G-AAG-TA-C---TAGCTGTATGAAA---GG----T-TT-------T--------------------TTTT-CC----------------------------CCCGAATT-CAAA-A-A---TT-TC---AC------CCACATTAATTAACGCCCTTGCACAAATATC-TAGATCACA
Alignments
lowQualScore : 111 5555555555 11111111111 111111 55555555555555555555555555555 111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111
lowQualScore : 1 1 222 5 3 5 1111111111 99999 1 3 0 44 2 77 99999999999 3 0 55 555555 8888888 5 33 33 2 2 55555555555555555555555555555 444 2 222 99999 444 2 33 1 2 5 3 3 33 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7 333 3
lowQualScore : . . ... . . . .......... ..... . . . .. . .. ........... . . .. ...... ....... . .. .. . . ............................. ... . ... ..... ... . .. . . . . . .. .............................................................................. . ... .
lowQualScore : 0 0 888 7 0 7 1111111111 11111 9 3 8 66 3 99 22222222222 3 1 44 444444 7777777 3 77 77 7 5 77777777777777777777777777777 111 5 000 33333 777 7 99 1 9 1 3 3 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 777 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCTCCATAAACAA--CAAA-AGTAA-T-AG-A-TT--ACAAGATATGA-----TTATAA-TCT--GCCGATTAT--AAAGTCTCCCAAAC--------G-AAGTA-CTGGCTGTATNAAAGTGGG----C-TT-------TT-CTG--AGTAC--TACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-ATT--TTAATTTCATT-TAAAAA-ATC-TAGATCACAAAGACTCTCGACCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTCCTGGTTCTAAAGTTATAAAAGTTTATTTACGATCAAGGTC
Reference ( family-8009 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCTCCNTAAANAA--CAAA-AGTAA-T-AG-ATTT--ACAAGATATGA-----TTATAA-TCT--GCCGATTAT--AAAGTCTCCCAAAC--------G-AAGTA-CTGGCTGTATNAAAGTGGG----C-TT-------TT-CTG--AGTAC--TACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-ATT--TTAATTTCATT-TAAAAA-ATC-TAGATCACAAAGACTCTCGACCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTCCTGGTTCTAAAGTTATAAAAGTTTATTTACGATCAAGGTC
gi|1 : AA--CAAATATTAA-TTAA-A-----ACAAAATATGA-----TTATAA-TCT--GCTAATATT--AAAGTCTCCCAAAT--------T-AAGAA-ATGGGAGTGTTAAGGTGGG----C-TT-------TC-CTG--AAGAC--TTCCATTTC-CCCATTATCAATAAATTC-------------CC---TGGCGTA-AA---GT-----CC---ACGCCA-ATT--TTAATTTTACT-T-AAAA-ATC-TATATCACAAAGGC
gi|1 : aaaaaaatagattatgtcatttatggtttcaaaggaagttgaatatgacaatgtgctactcatcttcAGTCCTGGTTCTAAAG-TATAAAAG--TATTTCTGATCAAattgattttgaaatttttcaaaaaatcctccagtttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaggtcccgtaatcagtcctggttctaaagtataaaagtatttctgatcaacg
gi|10 : aaaaaaatagattatgtcatttatggtttcaaaggaagttgaatatgacaatgtgctactcatcttcaacaaatattaattaaaacaaaatatgattataatctgctaatattaaagtctcccaaattaagaaatgggagtgttaaggtgggctttcctgaagacttccatttccccattatcaataaattccctggcgtaaagtccacgccaattttaattttacttaaaaatctatatcacaaaggcattgattttgaaatttttcaaaaaatcctccagtttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaggtcccgtaatcACAA---AAA-AGTAA-T-------T--AAAAG-TATTA-----CCATAA-TTT--GCTGATTATT-CAAGTCTCCCAAAT--------A-AAGTA-CTGGATGCAATGAAGAAGG----C-TT-------TT-CCC---GTAC--TATGATTTT-CC--------------CC-------------AC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-GTT--TTTATCTTATC-TAcg
gi|11 : --ACAGGATATGAATTAATCATAA-CTT--GCCGAATATTTAATATCTCTCCAAC--------GGAAATAACTGGCTGTTTAAAAGTGGG----CTTT-------TT-CTGTAGGTAC--TACCA-TTT-CC--------------TC-------------CC---TTG-ATT-TA---CT-----CC---TCGCCA-AT
gi|12 : ggtctgtatattaaTT-CC--------------TC-------------C----TTGCACA-TATCCAT-----CC---ATGCCA-ATT--TTATGTTTATT-TAAAAA-TTCAAAAATCATAGAGATTTT
gi|13 : tgta--ACAAGATATGA-----TTATAA-TTT--GTCAATTAT--TAATTCTCCCATAC--------A-AAGCA-TTGAATGTATAAAAGTGGG----CTTT-------TT-CTG--AGTAT--AACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCAgaaaatttcaaggaaaaaattccatttccttctgtaaa
gi|14 : aa--ACAAGATATGA-----T-ATAA-TTT--ACCGACTAT--AAATTCTCCCAA----------------------CTG-ATTAATGTGGT----C-TT-------TTTCTA--AGTATATCACTGTTTT-TC--------------TC-------------CC---TTGCACA-tgct
gi|15 : ataaaatatgtaaGGG----C-TT-------TT-CTG--AGTAG--TACGACTTTACC--------------TCAAGTTAATTGCCCCC---TAACACA-AA---CT-----TC---ATGTTA-ATC--TTAAT----------------C-TAGATCATAAAGA-TCTTGAt
gi|16 : C--------------CC-------------CC---TTGCAAA-AA---AT-----GC---ATGCCA-ATT--CAAATTTTTTT-TTAAAA-ATC-AAAATCACAAAttttccaa
gi|17 : tccaaagtactgggatttttccacacattaataa-TT-------TT-CTG--AGAAC--TTCTATTAT-CCCCCACATCAATAACTC-------------CC---TTGCTCA-AA---AT-----CT---ATATCA-ATT--TTAATTTCTTA-TAAAAA-ATC-T
gi|2 : ATTTCTCCCTAAATTA--TACA-TGTAAAT-AG-ATTT--ACAAGATAAGG-----ATATAA-TCT--GCTGATTAT--AAAGTCTCCCAAATCATGAAATG-AAGTA-CTGGCTGTATAAAAGTGGG----C-TT-------TA-CTG--AGTAC--TACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCACA-AA---CT-----CC---ATGCTA-ATT--TTGAATTCATT-TAAAAA-ATC-TTGGTCATAAAAACTCCCAGCCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTTCTGGTTCTAAAGTTATATAAGTTTATTTACAACCAAGGTC
gi|3 : aatttgtgtaactgacaaataaatatacctaatatctctactttttgataaaaCAAGATATGA-----TAATAAATAT--GCC-ATTCT--CAAGTCTCCCAAAT--------G-AAGTA-CTGGCTGTATAAAAGTGGT----C-TTGTTTTTTTT-TTT--AGAAC--TACAACTTC-CCCCACATAATTAAC-TC-------------CC---TCGCACA-AA---AT-----CC---AATCCA-ATT--TTAATTTCATT-T-AAAA-ATC-TAGATCACAAAA--TCTCAACC
gi|3 : AGTCTTGGTTCTCAAGTTACTAAAATT--TTCAAGATCAAGGTCttaaatttttttttttaataaaatccccttttttcttcagtaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtcttggttctcaagttactaaaattttcaagatcaaggtc
gi|4 : caagatatgataataaatatgccattctcaagtctcccaaatgaagtactggctgtataaaagtggtcttgtttttttttttagaactacaacttcccccacataattaactccctcgcacaaaatccaatccaattttaatttcatttaaaaatctagatcacaaaatctcaaccttaaatttttttttttaataaaatccccttttttcttcagtaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncA-TCA--GCCTATTTT--AA-GTCTCCCAA-T--------T-AAACA-CTGGCTGCATGAAAATGGGA---T-TT-------TT-CTG--AGT-----------TC-CC--------------CT-------------CC---TTGCACA-GTT--AT-----CA---A-GACA-A------AGTTT-GTT-TAAAAA-ATC-TAGAACACAAAGAC-CTTGAC
gi|5 : ATTTCTTTATAAAGAA--CAAA-AGTAA-T-------T--AAAAGATATTA-----CCATAA-TTT--GCTGATTAT--CAAGTCTCCCAAAT--------A-AAGTA-CTGGATGCAATGAAGAAGG----C-TT-------TTCCCG--AGTAC--TATGATTTT-CC--------------CC-------------AC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-GTT--TTTATCTTATC-TAtttcaaattttaaaaaaaactccccttgttttccttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcttggttcaaaagttgtataatg
gi|6 : atctgtgttaagcaataaatactcataccagtaatgtgtcaaaccacaccaaaatttcatTGGCTGGAGCAAAGAAAGGTT-T-TT-------TT-CTG--AATAC--TACTATTTC-CCCGCACATTGATAGCTC-------------CC---TTGCATA-AA---AT-----CC---ATGTCA-ATT--CTAATTTCATT-T-AAAA-ATC-TTGATCACAAAGACTTT
gi|7 : tataacaaggaacagatcaaaatgctaaaatattgaatcaaagatgatataaaAAACAATTCAAT-A-TAA-T-A----TG--AAACGATGTGA-----TTATAA-TATCAACCTATTAT--AAAGTCTCTCAAAC--------A-AAGT--CTGGCTGTA-CAAAGTGAGTTTTC-TT-------TT-TTA--AATAC--TACTGTATT-TC--------------TC-------------CC---TTGCACATAACTTATG----CCATGATGCCA-TTT--TTAAATTCAGT-TAAAAG-TTC-TAAATCgattttgaaactttttaaaaatccctatgtttcctttactaaa
gi|8 : atctaAGA-AGAAC-T-AGCATTTGAACAAGATGTGA-----TTATAA-TCT--GTCAATTAT--AAAGTCTCCTAAAG--------G-AAGTA-TTGGCTGTA-CAAAGTGAA----CTTT-------TT-CTT--AACAC--AACTATATT-CC--------------TC-------------CT---TTGCACA-TA---ATCCATGCC---ATGCCA-ATT--TTAAGTTCATT-TAAAAA-ATT-TAtctaaatggcaaagattttggtttccagaaa
gi|9 : cacattttgCCATAGGTAA--TTAA-AAAAA-T-AG-A---------GATATGA-----TTATAA-TCT--GTTGATTAT--AAAGTCTCACAAAC--------G-AAGTA-CTAGCTGTATGAAA---GG----T-TT-------T-------------------TTTT-CC---------------C-------------CCGAATT-CAAA-AA---TT-----TC---AC-CCACATTAATTAACGCCCTTGCACAAATATC-TAGATCACA
Alignments
lowQualScore : 111 4444444444 11111111111 111111 55555555555555555555555555555 111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111
lowQualScore : 222 5 3 5 8888888888 99999 1 3 0 44 2 77 99999999999 3 0 55 555555 8888888 5 33 33 2 2 55555555555555555555555555555 444 2 222 99999 444 2 33 1 2 5 3 3 33 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7 333 3
lowQualScore : ... . . . .......... ..... . . . .. . .. ........... . . .. ...... ....... . .. .. . . ............................. ... . ... ..... ... . .. . . . . . .. .............................................................................. . ... .
lowQualScore : 888 7 0 7 4444444444 11111 9 3 8 66 3 99 22222222222 3 1 44 444444 7777777 3 77 77 7 5 77777777777777777777777777777 111 5 000 33333 777 7 99 1 9 1 3 3 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 777 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCTCCATAAACAA--CAAA-AGTAA-T-AG-ATT---ACAAGATATGA-----TTATAA-TCT--GCCGATTAT--AAAGTCTCCCAAAC--------G-AAGTA-CTGGCTGTATNAAAGTGGG----C-TT-------TT-CTG--AGTAC--TACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-ATT--TTAATTTCATT-TAAAAA-ATC-TAGATCACAAAGACTCTCGACCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTCCTGGTTCTAAAGTTATAAAAGTTTATTTACGATCAAGGTC
Reference ( family-8009 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCTCCATAAACAA--CAAA-AGTAA-T-AG-ATT---ACAAGATATGA-----TTATAA-TCT--GCCGATTAT--AAAGTCTCCCAAAC--------G-AAGTA-CTGGCTGTATNAAAGTGGG----C-TT-------TT-CTG--AGTAC--TACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-ATT--TTAATTTCATT-TAAAAA-ATC-TAGATCACAAAGACTCTCGACCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTCCTGGTTCTAAAGTTATAAAAGTTTATTTACGATCAAGGTC
gi|1 : CAA--CAAATATTAA-TTAA-A-----ACAAAATATGA-----TTATAA-TCT--GCTAATATT--AAAGTCTCCCAAAT--------T-AAGAA-ATGGGAGTGTTAAGGTGGG----C-TT-------TC-CTG--AAGAC--TTCCATTTC-CCCATTATCAATAAATTC-------------CC---TGGCGTA-AA---GT-----CC---ACGCCA-ATT--TTAATTTTACT-T-AAAA-ATC-TATATCACAAAGGC
gi|1 : aaaaaaatagattatgtcatttatggtttcaaaggaagttgaatatgacaatgtgctactcatcttAGTCCTGGTTCTAAAG-TATAAAAG--TATTTCTGATCAAattgattttgaaatttttcaaaaaatcctccagtttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaggtcccgtaatcagtcctggttctaaagtataaaagtatttctgatcaacg
gi|10 : aaaaaaatagattatgtcatttatggtttcaaaggaagttgaatatgacaatgtgctactcatcttcaacaaatattaattaaaacaaaatatgattataatctgctaatattaaagtctcccaaattaagaaatgggagtgttaaggtgggctttcctgaagacttccatttccccattatcaataaattccctggcgtaaagtccacgccaattttaattttacttaaaaatctatatcacaaaggcattgattttgaaatttttcaaaaaatcctccagtttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaggtcccgtaatcACAA---AAA-AGTAA-T------T---AAAAG-TATTA-----CCATAA-TTT--GCTGATTATT-CAAGTCTCCCAAAT--------A-AAGTA-CTGGATGCAATGAAGAAGG----C-TT-------TT-CCC---GTAC--TATGATTTT-CC--------------CC-------------AC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-GTT--TTTATCTTATC-TAcg
gi|11 : ---ACAGGATATGAATTAATCATAA-CTT--GCCGAATATTTAATATCTCTCCAAC--------GGAAATAACTGGCTGTTTAAAAGTGGG----CTTT-------TT-CTGTAGGTAC--TACCA-TTT-CC--------------TC-------------CC---TTG-ATT-TA---CT-----CC---TCGCCA-AT
gi|12 : ggtctgtatattaaTT-CC--------------TC-------------C----TTGCACA-TATCCAT-----CC---ATGCCA-ATT--TTATGTTTATT-TAAAAA-TTCAAAAATCATAGAGATTTT
gi|13 : tgta---ACAAGATATGA-----TTATAA-TTT--GTCAATTAT--TAATTCTCCCATAC--------A-AAGCA-TTGAATGTATAAAAGTGGG----CTTT-------TT-CTG--AGTAT--AACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCAgaaaatttcaaggaaaaaattccatttccttctgtaaa
gi|14 : aa---ACAAGATATGA-----T-ATAA-TTT--ACCGACTAT--AAATTCTCCCAA----------------------CTG-ATTAATGTGGT----C-TT-------TTTCTA--AGTATATCACTGTTTT-TC--------------TC-------------CC---TTGCACA-tgct
gi|15 : ataaaatatgtaaGGG----C-TT-------TT-CTG--AGTAG--TACGACTTTACC--------------TCAAGTTAATTGCCCCC---TAACACA-AA---CT-----TC---ATGTTA-ATC--TTAAT----------------C-TAGATCATAAAGA-TCTTGAt
gi|16 : C--------------CC-------------CC---TTGCAAA-AA---AT-----GC---ATGCCA-ATT--CAAATTTTTTT-TTAAAA-ATC-AAAATCACAAAttttccaa
gi|17 : tccaaagtactgggatttttccacacattaataa-TT-------TT-CTG--AGAAC--TTCTATTAT-CCCCCACATCAATAACTC-------------CC---TTGCTCA-AA---AT-----CT---ATATCA-ATT--TTAATTTCTTA-TAAAAA-ATC-T
gi|2 : ATTTCTCCCTAAATTA--TACA-TGTAAAT-AG-ATTT--ACAAGATAAGG-----ATATAA-TCT--GCTGATTAT--AAAGTCTCCCAAATCATGAAATG-AAGTA-CTGGCTGTATAAAAGTGGG----C-TT-------TA-CTG--AGTAC--TACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCACA-AA---CT-----CC---ATGCTA-ATT--TTGAATTCATT-TAAAAA-ATC-TTGGTCATAAAAACTCCCAGCCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTTCTGGTTCTAAAGTTATATAAGTTTATTTACAACCAAGGTC
gi|3 : aatttgtgtaactgacaaataaatatacctaatatctctactttttgataaaaCAAGATATGA-----TAATAAATAT--GCC-ATTCT--CAAGTCTCCCAAAT--------G-AAGTA-CTGGCTGTATAAAAGTGGT----C-TTGTTTTTTTT-TTT--AGAAC--TACAACTTC-CCCCACATAATTAAC-TC-------------CC---TCGCACA-AA---AT-----CC---AATCCA-ATT--TTAATTTCATT-T-AAAA-ATC-TAGATCACAAAA--TCTCAACC
gi|3 : AGTCTTGGTTCTCAAGTTACTAAAATT--TTCAAGATCAAGGTCttaaatttttttttttaataaaatccccttttttcttcagtaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtcttggttctcaagttactaaaattttcaagatcaaggtc
gi|4 : caagatatgataataaatatgccattctcaagtctcccaaatgaagtactggctgtataaaagtggtcttgtttttttttttagaactacaacttcccccacataattaactccctcgcacaaaatccaatccaattttaatttcatttaaaaatctagatcacaaaatctcaaccttaaatttttttttttaataaaatccccttttttcttcagtaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncA-TCA--GCCTATTTT--AA-GTCTCCCAA-T--------T-AAACA-CTGGCTGCATGAAAATGGGA---T-TT-------TT-CTG--AGT-----------TC-CC--------------CT-------------CC---TTGCACA-GTT--AT-----CA---A-GACA-A------AGTTT-GTT-TAAAAA-ATC-TAGAACACAAAGAC-CTTGAC
gi|5 : ATTTCTTTATAAAGAA--CAAA-AGTAA-T------T---AAAAGATATTA-----CCATAA-TTT--GCTGATTAT--CAAGTCTCCCAAAT--------A-AAGTA-CTGGATGCAATGAAGAAGG----C-TT-------TTCCCG--AGTAC--TATGATTTT-CC--------------CC-------------AC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-GTT--TTTATCTTATC-TAtttcaaattttaaaaaaaactccccttgttttccttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcttggttcaaaagttgtataatg
gi|6 : atctgtgttaagcaataaatactcataccagtaatgtgtcaaaccacaccaaaatttcatTGGCTGGAGCAAAGAAAGGTT-T-TT-------TT-CTG--AATAC--TACTATTTC-CCCGCACATTGATAGCTC-------------CC---TTGCATA-AA---AT-----CC---ATGTCA-ATT--CTAATTTCATT-T-AAAA-ATC-TTGATCACAAAGACTTT
gi|7 : tataacaaggaacagatcaaaatgctaaaatattgaatcaaagatgatataaaAAACAATTCAAT-A-TAA-T-A---TG---AAACGATGTGA-----TTATAA-TATCAACCTATTAT--AAAGTCTCTCAAAC--------A-AAGT--CTGGCTGTA-CAAAGTGAGTTTTC-TT-------TT-TTA--AATAC--TACTGTATT-TC--------------TC-------------CC---TTGCACATAACTTATG----CCATGATGCCA-TTT--TTAAATTCAGT-TAAAAG-TTC-TAAATCgattttgaaactttttaaaaatccctatgtttcctttactaaa
gi|8 : atctaAGA-AGAAC-T-AGCATTTGAACAAGATGTGA-----TTATAA-TCT--GTCAATTAT--AAAGTCTCCTAAAG--------G-AAGTA-TTGGCTGTA-CAAAGTGAA----CTTT-------TT-CTT--AACAC--AACTATATT-CC--------------TC-------------CT---TTGCACA-TA---ATCCATGCC---ATGCCA-ATT--TTAAGTTCATT-TAAAAA-ATT-TAtctaaatggcaaagattttggtttccagaaa
gi|9 : cacattttgCCATAGGTAA--TTAA-AAAAA-T-AG-A---------GATATGA-----TTATAA-TCT--GTTGATTAT--AAAGTCTCACAAAC--------G-AAGTA-CTAGCTGTATGAAA---GG----T-TT-------T-------------------TTTT-CC---------------C-------------CCGAATT-CAAA-AA---TT-----TC---AC-CCACATTAATTAACGCCCTTGCACAAATATC-TAGATCACA
Alignments
lowQualScore : 111 4444444444 11111111111 111111 55555555555555555555555555555 111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111
lowQualScore : 222 5 3 5 8888888888 99999 1 3 0 44 2 77 99999999999 3 0 55 555555 8888888 5 33 33 2 2 55555555555555555555555555555 444 2 222 99999 444 2 33 1 2 5 3 3 33 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7 333 3
lowQualScore : ... . . . .......... ..... . . . .. . .. ........... . . .. ...... ....... . .. .. . . ............................. ... . ... ..... ... . .. . . . . . .. .............................................................................. . ... .
lowQualScore : 888 7 0 7 4444444444 11111 9 3 8 66 3 99 22222222222 3 1 44 444444 7777777 3 77 77 7 5 77777777777777777777777777777 111 5 000 33333 777 7 99 1 9 1 3 3 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 777 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCTCCATAAACAA--CAAA-AGTAA-T-AG-ATT---ACAAGATATGA-----TTATAA-TCT--GCCGATTAT--AAAGTCTCCCAAAC--------G-AAGTA-CTGGCTGTATNAAAGTGGG----C-TT-------TT-CTG--AGTAC--TACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-ATT--TTAATTTCATT-TAAAAA-ATC-TAGATCACAAAGACTCTCGACCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTCCTGGTTCTAAAGTTATAAAAGTTTATTTACGATCAAGGTC
Reference ( family-8009 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCTCCATAAACAA--CAAA-AGTAA-T-AG-ATT---ACAAGATATGA-----TTATAA-TCT--GCCGATTAT--AAAGTCTCCCAAAC--------G-AAGTA-CTGGCTGTATNAAAGTGGG----C-TT-------TT-CTG--AGTAC--TACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-ATT--TTAATTTCATT-TAAAAA-ATC-TAGATCACAAAGACTCTCGACCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTCCTGGTTCTAAAGTTATAAAAGTTTATTTACGATCAAGGTC
gi|1 : CAA--CAAATATTAA-TTAA-A-----ACAAAATATGA-----TTATAA-TCT--GCTAATATT--AAAGTCTCCCAAAT--------T-AAGAA-ATGGGAGTGTTAAGGTGGG----C-TT-------TC-CTG--AAGAC--TTCCATTTC-CCCATTATCAATAAATTC-------------CC---TGGCGTA-AA---GT-----CC---ACGCCA-ATT--TTAATTTTACT-T-AAAA-ATC-TATATCACAAAGGC
gi|1 : aaaaaaatagattatgtcatttatggtttcaaaggaagttgaatatgacaatgtgctactcatcttAGTCCTGGTTCTAAAG-TATAAAAG--TATTTCTGATCAAattgattttgaaatttttcaaaaaatcctccagtttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaggtcccgtaatcagtcctggttctaaagtataaaagtatttctgatcaacg
gi|10 : aaaaaaatagattatgtcatttatggtttcaaaggaagttgaatatgacaatgtgctactcatcttcaacaaatattaattaaaacaaaatatgattataatctgctaatattaaagtctcccaaattaagaaatgggagtgttaaggtgggctttcctgaagacttccatttccccattatcaataaattccctggcgtaaagtccacgccaattttaattttacttaaaaatctatatcacaaaggcattgattttgaaatttttcaaaaaatcctccagtttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaggtcccgtaatcACAA---AAA-AGTAA-T------T---AAAAG-TATTA-----CCATAA-TTT--GCTGATTATT-CAAGTCTCCCAAAT--------A-AAGTA-CTGGATGCAATGAAGAAGG----C-TT-------TT-CCC---GTAC--TATGATTTT-CC--------------CC-------------AC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-GTT--TTTATCTTATC-TAcg
gi|11 : ---ACAGGATATGAATTAATCATAA-CTT--GCCGAATATTTAATATCTCTCCAAC--------GGAAATAACTGGCTGTTTAAAAGTGGG----CTTT-------TT-CTGTAGGTAC--TACCA-TTT-CC--------------TC-------------CC---TTG-ATT-TA---CT-----CC---TCGCCA-AT
gi|12 : ggtctgtatattaaTT-CC--------------TC-------------C----TTGCACA-TATCCAT-----CC---ATGCCA-ATT--TTATGTTTATT-TAAAAA-TTCAAAAATCATAGAGATTTT
gi|13 : tgta---ACAAGATATGA-----TTATAA-TTT--GTCAATTAT--TAATTCTCCCATAC--------A-AAGCA-TTGAATGTATAAAAGTGGG----CTTT-------TT-CTG--AGTAT--AACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCAgaaaatttcaaggaaaaaattccatttccttctgtaaa
gi|14 : aa---ACAAGATATGA-----T-ATAA-TTT--ACCGACTAT--AAATTCTCCCAA----------------------CTG-ATTAATGTGGT----C-TT-------TTTCTA--AGTATATCACTGTTTT-TC--------------TC-------------CC---TTGCACA-tgct
gi|15 : ataaaatatgtaaGGG----C-TT-------TT-CTG--AGTAG--TACGACTTTACC--------------TCAAGTTAATTGCCCCC---TAACACA-AA---CT-----TC---ATGTTA-ATC--TTAAT----------------C-TAGATCATAAAGA-TCTTGAt
gi|16 : C--------------CC-------------CC---TTGCAAA-AA---AT-----GC---ATGCCA-ATT--CAAATTTTTTT-TTAAAA-ATC-AAAATCACAAAttttccaa
gi|17 : tccaaagtactgggatttttccacacattaataa-TT-------TT-CTG--AGAAC--TTCTATTAT-CCCCCACATCAATAACTC-------------CC---TTGCTCA-AA---AT-----CT---ATATCA-ATT--TTAATTTCTTA-TAAAAA-ATC-T
gi|2 : ATTTCTCCCTAAATTA--TACA-TGTAAAT-AG-ATTT--ACAAGATAAGG-----ATATAA-TCT--GCTGATTAT--AAAGTCTCCCAAATCATGAAATG-AAGTA-CTGGCTGTATAAAAGTGGG----C-TT-------TA-CTG--AGTAC--TACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCACA-AA---CT-----CC---ATGCTA-ATT--TTGAATTCATT-TAAAAA-ATC-TTGGTCATAAAAACTCCCAGCCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTTCTGGTTCTAAAGTTATATAAGTTTATTTACAACCAAGGTC
gi|3 : aatttgtgtaactgacaaataaatatacctaatatctctactttttgataaaaCAAGATATGA-----TAATAAATAT--GCC-ATTCT--CAAGTCTCCCAAAT--------G-AAGTA-CTGGCTGTATAAAAGTGGT----C-TTGTTTTTTTT-TTT--AGAAC--TACAACTTC-CCCCACATAATTAAC-TC-------------CC---TCGCACA-AA---AT-----CC---AATCCA-ATT--TTAATTTCATT-T-AAAA-ATC-TAGATCACAAAA--TCTCAACC
gi|3 : AGTCTTGGTTCTCAAGTTACTAAAATT--TTCAAGATCAAGGTCttaaatttttttttttaataaaatccccttttttcttcagtaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtcttggttctcaagttactaaaattttcaagatcaaggtc
gi|4 : caagatatgataataaatatgccattctcaagtctcccaaatgaagtactggctgtataaaagtggtcttgtttttttttttagaactacaacttcccccacataattaactccctcgcacaaaatccaatccaattttaatttcatttaaaaatctagatcacaaaatctcaaccttaaatttttttttttaataaaatccccttttttcttcagtaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncA-TCA--GCCTATTTT--AA-GTCTCCCAA-T--------T-AAACA-CTGGCTGCATGAAAATGGGA---T-TT-------TT-CTG--AGT-----------TC-CC--------------CT-------------CC---TTGCACA-GTT--AT-----CA---A-GACA-A------AGTTT-GTT-TAAAAA-ATC-TAGAACACAAAGAC-CTTGAC
gi|5 : ATTTCTTTATAAAGAA--CAAA-AGTAA-T------T---AAAAGATATTA-----CCATAA-TTT--GCTGATTAT--CAAGTCTCCCAAAT--------A-AAGTA-CTGGATGCAATGAAGAAGG----C-TT-------TTCCCG--AGTAC--TATGATTTT-CC--------------CC-------------AC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-GTT--TTTATCTTATC-TAtttcaaattttaaaaaaaactccccttgttttccttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcttggttcaaaagttgtataatg
gi|6 : atctgtgttaagcaataaatactcataccagtaatgtgtcaaaccacaccaaaatttcatTGGCTGGAGCAAAGAAAGGTT-T-TT-------TT-CTG--AATAC--TACTATTTC-CCCGCACATTGATAGCTC-------------CC---TTGCATA-AA---AT-----CC---ATGTCA-ATT--CTAATTTCATT-T-AAAA-ATC-TTGATCACAAAGACTTT
gi|7 : tataacaaggaacagatcaaaatgctaaaatattgaatcaaagatgatataaaAAACAATTCAAT-A-TAA-T-A---TG---AAACGATGTGA-----TTATAA-TATCAACCTATTAT--AAAGTCTCTCAAAC--------A-AAGT--CTGGCTGTA-CAAAGTGAGTTTTC-TT-------TT-TTA--AATAC--TACTGTATT-TC--------------TC-------------CC---TTGCACATAACTTATG----CCATGATGCCA-TTT--TTAAATTCAGT-TAAAAG-TTC-TAAATCgattttgaaactttttaaaaatccctatgtttcctttactaaa
gi|8 : atctaAGA-AGAAC-T-AGCATTTGAACAAGATGTGA-----TTATAA-TCT--GTCAATTAT--AAAGTCTCCTAAAG--------G-AAGTA-TTGGCTGTA-CAAAGTGAA----CTTT-------TT-CTT--AACAC--AACTATATT-CC--------------TC-------------CT---TTGCACA-TA---ATCCATGCC---ATGCCA-ATT--TTAAGTTCATT-TAAAAA-ATT-TAtctaaatggcaaagattttggtttccagaaa
gi|9 : cacattttgCCATAGGTAA--TTAA-AAAAA-T-AG-A---------GATATGA-----TTATAA-TCT--GTTGATTAT--AAAGTCTCACAAAC--------G-AAGTA-CTAGCTGTATGAAA---GG----T-TT-------T-------------------TTTT-CC---------------C-------------CCGAATT-CAAA-AA---TT-----TC---AC-CCACATTAATTAACGCCCTTGCACAAATATC-TAGATCACA
blockSeqs : TTC . G A AGCATTTGA ATTAA C A CA G TT TCATGAAATG A AT TTTTC GTTTTTT T TA AT G A CCCACATCAATAACTC GAA T TCC CCATG ATG C AA T G A T A AT T TTT C
blockSeqs : T . G . AGATTT . C . . G T CGG . TA GTTT . C . . C . CGCACATTGATAGCTC . . CTT G . . . T . A . . AC T TT A
blockSeqs : C . G . ATG . T . . A . TA . TA CT . . . . T . TCAAGTTAATTGCCC . . T . . . . T . T . . AC
blockSeqs : T . G . AGA . T . . G . CA . TT CT . . . . T . CCACATAATTAACTC . . . . . . . C . A . . AC
blockSeqs : . . A . T . A . . G . TG . TA AT . . . . G . CC . . . . . . . C . A . . A
blockSeqs : . . . T . C . . T . TT . TA CT . . . . T . TC . . . . . . . C . A . . .
blockSeqs : . T . . G . TA . TG C . . . . T . TC . . . . . . . T . A . .
blockSeqs : . T . . T . CA . AT C . . . . A . TC . . . . . . . C . A . .
blockSeqs : . T . . A . GG . GC C . . . . G . TC . . . . . . . C . A . .
blockSeqs : . . . . G . CG . TG C . . . . T . CC . . . . . . . C . A . .
blockSeqs : . . . . . . C C . . . . T . TC . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : C C . . . . T . CT . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . CC . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TC . . . . . .
blockSeqs : . TC . .
blockSeqs : C .
blockSeqCons : AGATT***** TC***************************
originalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCTCCATAAACAA--CAAA-AGTAA-T-AG-ATT---ACAAGATATGA-----TTATAA-TCT--GCCGATTAT--AAAGTCTCCCAAAC--------G-AAGTA-CTGGCTGTATNAAAGTGGG----C-TT-------TT-CTG--AGTAC--TACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-ATT--TTAATTTCATT-TAAAAA-ATC-TAGATCACAAAGACTCTCGACCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTCCTGGTTCTAAAGTTATAAAAGTTTATTTACGATCAAGGTC
finalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCTCCATAAACAA--CAAA-AGTAA-TAGATT-----ACAAGATATGA-----TTATAA-TCT--GCCGATTAT--AAAGTCTCCCAAAC--------G-AAGTA-CTGGCTGTATNAAAGTGGG----C-TT-------TT-CTG--AGTAC--TACTATTTT-CCTC---------------------------CC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-ATT--TTAATTTCATT-TAAAAA-ATC-TAGATCACAAAGACTCTCGACCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTCCTGGTTCTAAAGTTATAAAAGTTTATTTACGATCAAGGTC
Alignments
lowQualScore : 111 4444444444 11111111111 111111 55555555555555555555555555555 111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111
lowQualScore : 222 5 3 5 8888888888 99999 1 3 0 44 2 77 99999999999 3 0 55 555555 8888888 5 33 33 2 2 55555555555555555555555555555 444 2 222 99999 444 2 33 1 2 5 3 3 33 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7 333 3
lowQualScore : ... . . . .......... ..... . . . .. . .. ........... . . .. ...... ....... . .. .. . . ............................. ... . ... ..... ... . .. . . . . . .. .............................................................................. . ... .
lowQualScore : 888 7 0 7 4444444444 11111 9 3 8 66 3 99 22222222222 3 1 44 444444 7777777 3 77 77 7 5 77777777777777777777777777777 111 5 000 33333 777 7 99 1 9 1 3 3 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 777 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCTCCATAAACAA--CAAA-AGTAA-T-AG-ATT---ACAAGATATGA-----TTATAA-TCT--GCCGATTAT--AAAGTCTCCCAAAC--------G-AAGTA-CTGGCTGTATNAAAGTGGG----C-TT-------TT-CTG--AGTAC--TACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-ATT--TTAATTTCATT-TAAAAA-ATC-TAGATCACAAAGACTCTCGACCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTCCTGGTTCTAAAGTTATAAAAGTTTATTTACGATCAAGGTC
Reference ( family-8009 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCTCCATAAACAA--CAAA-AGTAA-T-AG-ATT---ACAAGATATGA-----TTATAA-TCT--GCCGATTAT--AAAGTCTCCCAAAC--------G-AAGTA-CTGGCTGTATNAAAGTGGG----C-TT-------TT-CTG--AGTAC--TACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-ATT--TTAATTTCATT-TAAAAA-ATC-TAGATCACAAAGACTCTCGACCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTCCTGGTTCTAAAGTTATAAAAGTTTATTTACGATCAAGGTC
gi|1 : CAA--CAAATATTAA-TTAA-A-----ACAAAATATGA-----TTATAA-TCT--GCTAATATT--AAAGTCTCCCAAAT--------T-AAGAA-ATGGGAGTGTTAAGGTGGG----C-TT-------TC-CTG--AAGAC--TTCCATTTC-CCCATTATCAATAAATTC-------------CC---TGGCGTA-AA---GT-----CC---ACGCCA-ATT--TTAATTTTACT-T-AAAA-ATC-TATATCACAAAGGC
gi|1 : aaaaaaatagattatgtcatttatggtttcaaaggaagttgaatatgacaatgtgctactcatcttAGTCCTGGTTCTAAAG-TATAAAAG--TATTTCTGATCAAattgattttgaaatttttcaaaaaatcctccagtttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaggtcccgtaatcagtcctggttctaaagtataaaagtatttctgatcaacg
gi|10 : aaaaaaatagattatgtcatttatggtttcaaaggaagttgaatatgacaatgtgctactcatcttcaacaaatattaattaaaacaaaatatgattataatctgctaatattaaagtctcccaaattaagaaatgggagtgttaaggtgggctttcctgaagacttccatttccccattatcaataaattccctggcgtaaagtccacgccaattttaattttacttaaaaatctatatcacaaaggcattgattttgaaatttttcaaaaaatcctccagtttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaggtcccgtaatcACAA---AAA-AGTAA-T------T---AAAAG-TATTA-----CCATAA-TTT--GCTGATTATT-CAAGTCTCCCAAAT--------A-AAGTA-CTGGATGCAATGAAGAAGG----C-TT-------TT-CCC---GTAC--TATGATTTT-CC--------------CC-------------AC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-GTT--TTTATCTTATC-TAcg
gi|11 : ---ACAGGATATGAATTAATCATAA-CTT--GCCGAATATTTAATATCTCTCCAAC--------GGAAATAACTGGCTGTTTAAAAGTGGG----CTTT-------TT-CTGTAGGTAC--TACCA-TTT-CC--------------TC-------------CC---TTG-ATT-TA---CT-----CC---TCGCCA-AT
gi|12 : ggtctgtatattaaTT-CC--------------TC-------------C----TTGCACA-TATCCAT-----CC---ATGCCA-ATT--TTATGTTTATT-TAAAAA-TTCAAAAATCATAGAGATTTT
gi|13 : tgta---ACAAGATATGA-----TTATAA-TTT--GTCAATTAT--TAATTCTCCCATAC--------A-AAGCA-TTGAATGTATAAAAGTGGG----CTTT-------TT-CTG--AGTAT--AACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCAgaaaatttcaaggaaaaaattccatttccttctgtaaa
gi|14 : aa---ACAAGATATGA-----T-ATAA-TTT--ACCGACTAT--AAATTCTCCCAA----------------------CTG-ATTAATGTGGT----C-TT-------TTTCTA--AGTATATCACTGTTTT-TC--------------TC-------------CC---TTGCACA-tgct
gi|15 : ataaaatatgtaaGGG----C-TT-------TT-CTG--AGTAG--TACGACTTTACC--------------TCAAGTTAATTGCCCCC---TAACACA-AA---CT-----TC---ATGTTA-ATC--TTAAT----------------C-TAGATCATAAAGA-TCTTGAt
gi|16 : C--------------CC-------------CC---TTGCAAA-AA---AT-----GC---ATGCCA-ATT--CAAATTTTTTT-TTAAAA-ATC-AAAATCACAAAttttccaa
gi|17 : tccaaagtactgggatttttccacacattaataa-TT-------TT-CTG--AGAAC--TTCTATTAT-CCCCCACATCAATAACTC-------------CC---TTGCTCA-AA---AT-----CT---ATATCA-ATT--TTAATTTCTTA-TAAAAA-ATC-T
gi|2 : ATTTCTCCCTAAATTA--TACA-TGTAAAT-AG-ATTT--ACAAGATAAGG-----ATATAA-TCT--GCTGATTAT--AAAGTCTCCCAAATCATGAAATG-AAGTA-CTGGCTGTATAAAAGTGGG----C-TT-------TA-CTG--AGTAC--TACTATTTT-CC--------------TC-------------CC---TTGCACA-AA---CT-----CC---ATGCTA-ATT--TTGAATTCATT-TAAAAA-ATC-TTGGTCATAAAAACTCCCAGCCCCCTATCTCCATCAGTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTTCTGGTTCTAAAGTTATATAAGTTTATTTACAACCAAGGTC
gi|3 : aatttgtgtaactgacaaataaatatacctaatatctctactttttgataaaaCAAGATATGA-----TAATAAATAT--GCC-ATTCT--CAAGTCTCCCAAAT--------G-AAGTA-CTGGCTGTATAAAAGTGGT----C-TTGTTTTTTTT-TTT--AGAAC--TACAACTTC-CCCCACATAATTAAC-TC-------------CC---TCGCACA-AA---AT-----CC---AATCCA-ATT--TTAATTTCATT-T-AAAA-ATC-TAGATCACAAAA--TCTCAACC
gi|3 : AGTCTTGGTTCTCAAGTTACTAAAATT--TTCAAGATCAAGGTCttaaatttttttttttaataaaatccccttttttcttcagtaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtcttggttctcaagttactaaaattttcaagatcaaggtc
gi|4 : caagatatgataataaatatgccattctcaagtctcccaaatgaagtactggctgtataaaagtggtcttgtttttttttttagaactacaacttcccccacataattaactccctcgcacaaaatccaatccaattttaatttcatttaaaaatctagatcacaaaatctcaaccttaaatttttttttttaataaaatccccttttttcttcagtaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncA-TCA--GCCTATTTT--AA-GTCTCCCAA-T--------T-AAACA-CTGGCTGCATGAAAATGGGA---T-TT-------TT-CTG--AGT-----------TC-CC--------------CT-------------CC---TTGCACA-GTT--AT-----CA---A-GACA-A------AGTTT-GTT-TAAAAA-ATC-TAGAACACAAAGAC-CTTGAC
gi|5 : ATTTCTTTATAAAGAA--CAAA-AGTAA-T------T---AAAAGATATTA-----CCATAA-TTT--GCTGATTAT--CAAGTCTCCCAAAT--------A-AAGTA-CTGGATGCAATGAAGAAGG----C-TT-------TTCCCG--AGTAC--TATGATTTT-CC--------------CC-------------AC---TTGCACA-AA---AT-----CC---ATGCCA-GTT--TTTATCTTATC-TAtttcaaattttaaaaaaaactccccttgttttccttagtaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagtcttggttcaaaagttgtataatg
gi|6 : atctgtgttaagcaataaatactcataccagtaatgtgtcaaaccacaccaaaatttcatTGGCTGGAGCAAAGAAAGGTT-T-TT-------TT-CTG--AATAC--TACTATTTC-CCCGCACATTGATAGCTC-------------CC---TTGCATA-AA---AT-----CC---ATGTCA-ATT--CTAATTTCATT-T-AAAA-ATC-TTGATCACAAAGACTTT
gi|7 : tataacaaggaacagatcaaaatgctaaaatattgaatcaaagatgatataaaAAACAATTCAAT-A-TAA-T-A---TG---AAACGATGTGA-----TTATAA-TATCAACCTATTAT--AAAGTCTCTCAAAC--------A-AAGT--CTGGCTGTA-CAAAGTGAGTTTTC-TT-------TT-TTA--AATAC--TACTGTATT-TC--------------TC-------------CC---TTGCACATAACTTATG----CCATGATGCCA-TTT--TTAAATTCAGT-TAAAAG-TTC-TAAATCgattttgaaactttttaaaaatccctatgtttcctttactaaa
gi|8 : atctaAGA-AGAAC-T-AGCATTTGAACAAGATGTGA-----TTATAA-TCT--GTCAATTAT--AAAGTCTCCTAAAG--------G-AAGTA-TTGGCTGTA-CAAAGTGAA----CTTT-------TT-CTT--AACAC--AACTATATT-CC--------------TC-------------CT---TTGCACA-TA---ATCCATGCC---ATGCCA-ATT--TTAAGTTCATT-TAAAAA-ATT-TAtctaaatggcaaagattttggtttccagaaa
gi|9 : cacattttgCCATAGGTAA--TTAA-AAAAA-T-AG-A---------GATATGA-----TTATAA-TCT--GTTGATTAT--AAAGTCTCACAAAC--------G-AAGTA-CTAGCTGTATGAAA---GG----T-TT-------T-------------------TTTT-CC---------------C-------------CCGAATT-CAAA-AA---TT-----TC---AC-CCACATTAATTAACGCCCTTGCACAAATATC-TAGATCACA