lowQualScore                  :                                                                                                         1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :                                                                                      2222               3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                               1111111                                                                                                                                                                                                                                                  
lowQualScore                  :        2   5555 2 66    33   0  2    33   2   55  1    77  22 1 22 44  1 1   1 1 22  0000     1 22      0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000   2 4     555555   1 1  2  1  0000000  22  1  11 1   22 1   1 1 1 11 22 1   5555555 1  1 1   2 1 2 2  11  333333 2 1 11 1 1 1  222 1  222 3   1  2 1 1 1 1 4444444444   2222     1  2 2 1 1  777 2 1 1 1 1 1  2 1 1 2 11   11   1 1 2  1 1 1 22   3  1 1 1 2  11   66666   1  33 1     
lowQualScore                  :        .   .... . ..    ..   .  .    ..   .   ..  .    ..  .. . .. ..  . .   . . ..  ....     . ..      ...................................................................................................................   . .     ......   . .  .  .  .......  ..  .  .. .   .. .   . . . .. .. .   ....... .  . .   . . . .  ..  ...... . . .. . . .  ... .  ... .   .  . . . . . ..........   ....     .  . . . .  ... . . . . . .  . . . . ..   ..   . . .  . . . ..   .  . . . .  ..   .....   .  .. .     
lowQualScore                  :        9   7777 7 33    22   3  4    11   4   44  7    11  44 7 44 11  7 7   7 7 44  7777     8 55      1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111   4 8     000000   2 2  5  2  9999999  88  2  55 1   66 1   1 1 1 55 66 1   8888888 1  1 1   2 1 2 2  55  111111 2 1 55 1 1 1  444 1  999 2   0  1 0 0 0 0 5555555555   2222     0  1 1 0 0  777 2 1 1 1 1 1  3 1 1 3 66   66   1 1 3  1 1 1 77   5  2 2 2 5  77   00000   3  33 5     
consensus                     :   TGGTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCGG-ACCC--CCA-CGGG-TT-AAAG-CTA--A-T--T--GA-A-GGA-G-G--ATG-G-TCTGA-T--CCATGA-TCCATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNATA--CCA-TCGTACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GA-T-CGC-A-T-A-GA--TC------G-T-A--G-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCG
Reference ( gi|8 )            :   TGGTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCGG-ACCC--CCA-CGGG-TT-AAAG-TTA--A-T--T--GA-A-GGA-G-G--AT--G-TCTGA-T--CCATGA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCA-TTGTACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-T-CGC-A-T-A-GA--TC------G-T-A--G-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-C-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCG
gi|6                          :   TGGTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCGA-ACCG--CCA-CAGG-TT-AAAT-CTA--A-A--T--GA-A-GGA-G-G--AT--GGTCTGA-T--CCATGA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATA--CAA-ACGTACC------GTG-T-TT-AG-TA-------GC--AC-AG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GG-T-CGG-A-T-A-AA--TC------G-T-A--G-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----CTGGT-TG-T-G-G-TA-T-A-A-T-T-G-T-AA-T-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTC
gi|11                         :   TGGTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCGG-ACCC--C-A-CGGG-TT-AAAG-CTA--A-T--T--GA-A-G-A-G-G--GT--GGTCTGA-T--CCATGA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACCA-TCGTATT------TTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A---G--T--A-GAA-------C-A--T-CGC-A-T-A-GA----------G-T-A--G-T-G-GT-A-T-CC---T-AAT-GA-T-G-T-C-G----------TAG----GTGGT-CG---G-G-TA-T-A-A-T-C-G-C-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-GA-A-G-T--CGT-AA-A-A-G--A--GCG-----TAC-TG--T-ACTCGat
gi|44                         : gcTGGTA-TCT----A-TATTCTG--ACCCGG-ACAC--CCA-CGGA-TT-AAAG-CTA--A-T--T--GA-A-GTA-G-G--ATG-G-TCTGA-T--GCAT
gi|41                         :   TGGTA-TCTCCCCA-TC-TCTG--ACCGGG-CGCC--CCA-CGGGTTT-AAAGCTCA--A-TTCT--GA-ACGGATG-G--GT----TCTGA-T--CCA
gi|9                          :    GGTA-TCT----T-T--TCTG--ACC-GG-ACCC--CCA-CGG--TT-AAAG-CTA--A-T--T--GA-A-GGA-G-G--AT--GGTCTGA-N--NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTA----CCA-TCGTACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAAA------T-AA-T-CGC-A-T-A-GA--TC------G-T-A--G-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-TGG-G-TA-C-A-A-T-C-G-T-AGCC-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCG
gi|13                         :    GGTA-GCT----A-T--TCTA--ACCCGG-ACCT--CCA-CGGG-TT-AGAG-CTA--G-T--T--GA-A-GGA-G-G--ATG-G-TCTGA-T--CCATGA-
gi|1                          :    GGTAATCT----A-T--GCTGGAACCCGG-AACC--CCA--AGT-TT-AAAG-CTAACA-T--T--GA-A--GA-G-G--ATG-G-TCTGATT--CCATGA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatatttagcaccatagagagaacgtagaacgatcgcatagatcgtagtggtgtcgtaaggatgttgtgggtggtcgtggtataatcgtagcatggtcgttggaaagtcgtagaagaagcgtactgtactc
gi|3                          :  tcGGTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCAG-ACCC--CCA-CGAG-TT-AAAG-CTA--A-T--T--GA-A-GGA-G-A--ATG-G-TTTGA-T--CCATGA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacaatcgtaccatgcgtagtagcaccgtacggagaactgtagaacaatcgcctagatcgtagtggtatcttaagaaatgtcgtgggtggtcgtggtaaatcgtagcatggtcgtgaaagtcgtagagagaagcgtactgtactcg
gi|46                         :   gGGTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCGG--------------G-TT-AAAG-CTA--A-C--T--GA-A-GGA-G-G--AT--G-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacaaacgtaccgcgcgtagtacagtgtagcaccgtagggagaacgtagaacgatcgcatagatcgtagtggtatcctaatgatgtcgtaggtggtcggggtataatcgcagcatggtcgttgggaagtcgtaaaagaagcgtactgtac
gi|50                         : ctgGGTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCAG-ACCC--
gi|5                          :   ctgTA-TCT----A-T--TCTG--ACC--G-GCCC--CCA-CGAG-TT-AA-G-CTA--A-T--T--GA-A-GGA-G-G--AT--G-TCTGA-T--CCATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN-NNGTACCATCGTCGTG-C-AT-AG-TA-------GC--AC-CG--TAAGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-T-CGC-A-T-A-GA--TC--------T-A--GTT-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GATT-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G--A-C-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--TTT-G-GTAA-A-G-T--CGT-AGAA-A-G-AA--GCG-----TAC-T---T-ACTCG
gi|10                         :      TA-TCT----A-T--TCTG--ACCCAG-ACCC----A-CTGC-TT-CAAG-CTA--G-T--TTTGA-A-GGA-G-G--AT--G-----G-T--CCTGGA-TCCATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTA--CCAATCGTACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T--GG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-T-CGC-A-T-AGGA--TC------G-T-A--G-T-G-GCAA-T-CG---T-AA--GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-A--C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-TCCCGTAAG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--
gi|7                          :      TA-TCT----AAT--TCTG--ACC--G-ACCC--CCA-CGGG-TT-AAAG-CTA--G-T--T--GA-A-GGA-G-G--AT--G-AC--A-T---CATGA-ggtacgtc
gi|12                         :        -TCT----A-T--TCTG--ACCCGG-ACCC--C-------------GG-CTA--G-T--T--GA-A-GGA-G-G--ATG-G-TCTGA-T--CCATGA-gtccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggttaccatcgtacaatcgtagtagcatcgtagggagaacgtagaacaatcgcaatagatcgtagtggtatcgtaagggtcgtggtgtcgtggtctaacgagcaatggtcttgaaaggtcgtgagaaaagcgcactgtaactc
gi|2                          :        ggCT----A-T--TCTG--ACCCGG---CC--CCA-CG---------G-CTA--G-T--T--GA-A-GGA-G-GAAATG-G-TCTGA-T--CCATGA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatcgtaccatgcgagtagcaacctagggagaacgagaacaatcgcataatcgtagtggtattcgtaaggattgtcgtgagtggttcgtggataatcgtagcatggtcgttggaaagtcgtagaagaagcgtactgttactcg
gi|21                         :                       TG--ACCCGGAACCCCACCA-CGGC-TTCAACG-CTG-------T--GA-A-CG--G-G--ACTGG-TCTGA-TCCCCATGA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtactcatcgtaccatgcgtagtagcggaccgtagggagaacgtagaacaatcgcatagatcgtagtagttcgtaaggatgttcgtgggttgtcgtggtatacgtcgtaaacagtggtcgtgttggaaaagttctagaagaaagcgtactgcta
gi|4                          :                        G--ACCCGG-GCCC--CCAACGCGCTT-CAAG-CTA--G-T-----GA-A-GGA-G-G--TG--G-TCTGA-T--CCATGA-cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaggt
gi|19                         :                                   CCC--CCA-TGGG-TT-AAAA-CTA--ATT--T--GA-A-GGA-G-G--ATG-G-TCTGA-T--CCATGA-atgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtacccatcgtaccgtgacgtagtagcaccgtagggagaacgtatagaacaatcgcatagaattcgttagtgagtatcgtaaggatgtctgggtggtcgttggtataatcgtagcatgccgtcgttggaagtcgtagaaggaagcgtactgtttactcg
gi|16                         :                                                -TT-AAAG-CTA--G-T--TT-GA-A-GTA-G-G--AT--GGTCTGA-T--CCATGA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccgtgcgtagtagtactgtagggagaacgtagaacgatcgcatagatcgtagtggtagtggtatcgtactaaggatgtcgtgggtggccgtggtat
gi|20                         :                                                -TT-AAAG-CTA--A-T--T--GA-A-AAA-G-G--ATG-G-TCTGA-T--CCATGA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatcgtaccgtgcgtagcaccatagggagaacgtagaacaatcacatagatcgtagtggtatcgtaaggatgtcgtgggtggtcgtggtataatcgtagcatgatcgttggaaagtcgtagaagaagcgtactgtactcg
gi|18                         :                                                 aT-GAAG-CTA--A-T--T--GA-A-GGA-G-G--ATG-G-TCTGA-T--CCATGA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttactgtgcgtagtagcatcgtagtgagaaggtagaacgatcgtagtggttgttcgtgattattaatcgctagcatgatcgtaaagttcatctaacaaaggactgtactca
gi|15                         :                                                   -AAAG-CTA--A-T--T--GAGA-GGA-G-A--AT--GGTCTGA-T--CCATGA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacaaacgtactgtgcgttaagcactcgcctgatagaactaagaaacgatcgcattagatcgtagtgtgtgaaggatcgtggtgaaatggtcgttggtatgaatcgcttggaagagttcgtaaaaaaagcgtactgtactca
gi|17                         :                                                   -AAAG-CTA--A-T--T--GA-A-GGC-GTA--AG--G-TCTGA-T--TCATGA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatcgtaccgtgcgtagtagtaccgtagggagaacgtagaacaatgcatagatcgtagtggtatcgtaaggatgtcgtggatggtcgtggtacaatcgtagcatggtcattggaaagtcgtagaagcgtactgtactcg
gi|35                         :                                                   -AAAG-CTA--A-T--T--GA-A-GGA-G-G--GTG-G-CCTGA-T--CCATGA-gtctaaatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacaaacgtatcgtacgtagtagggagaacgaagaacgatcgcatagatcgtagtggtgtcgtaaagatgtcatgggtggtcatggtataatcgtagcacggtcgttggaaagtcgtagaagcagcgtactatactc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                          --CCA-TCGTACC------GTG-C-GT-AG-----------C--AC-CA--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-T-CAC-A-T-A-GA--TC------G-T-A--G-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--ATC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacaaa
gi|15                         :                                                                            ttaaagctagtttgaagtaggatggtctgatccatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngta--CCA-TCGTACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GT--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-T--GC-A-T-A-GA--TC------G-T-A--G-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----ATGGT-CG-T-G-G-TA-C-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--ATT-G-G-AA-A-G-T--CGT------A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCG
gi|4                          :                                                              aaagctaattgagaggagaatggtctgatccatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngta--CCA-TCGTACC------GTGAC-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-GTAT--A-GAA-------C-AA-T-CGC-A-T-A-GAATTC------GTT-A--G-T-GAGT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C------------TGG----GTGGT-CGTT-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-GCCGTC--GTT-G-G--A-A-G-T--CGT-AG-A-AGG-AA--GCG-----TAC-TGTTT-ACTCG
gi|12                         :                                            gacccgggcccccaacgcgcttcaagctagtgaaggaggtggtctgatccatgaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtac--CCA-TCGTACC------ATG-C-G--AG-TA-------GC--AA-CC--T-AGG--G-AGA-A-C-G-----A-GAA-------C-AA-T-CGC-A-T-A--A--TC------G-T-A--G-T-G-GT-A-TTCG---T-AAG-GA-TTG-T-C-G----------TGA----GTGGTTCG-T-G-G--A-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TGT-T-ACTCG
gi|7                          :                                                ggtctattctgacccggaccccggctagttgaaggaggatggtctgatccatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngta--CCA-TCGTACA------AT--C-GT-AG-TA-------GC--AT-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-T-CGCAA-T-A-GA--TC------G-T-A--G-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-G----G-T-C-G----------T-G----GT-GT-CG-T-G-G-TC-T-A-A---C-G---AG-CAA-T-G--GTC---TT-G-A-AA-G-G-T--CGTGAG-A-A---AA--GCG-----CAC-TG--TAACTC
gi|25                         :                                   tatctaattctgaccgacccccacgggttaaagctagttgaaggaggatgacatcatgagtccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggttaCA-TCGTACCC-----GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-T-CGC-A-T-A-GA--TC------G-T-A--G-T-G-TT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-T-G----------TGG----GTGGT-GG-T-G-A-TA-C-A-A-T-C-G-T-AA-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAA--G--T-ACTCG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                             CA-CCGTACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AACT-CGC-A-T-AAGA--TC------G-T-A--G-T-G-GTTA-T-CG---TTAGG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTG-T-CG-T-G-G-TA-C-A-A-T-C-G-T-AA-C-G-T-G--GTC--GTG-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-A-TCGt
gi|2                          :                                                                aaagctaattgaaggataggatggtctgataatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatCA-TCGTACC------ATG-C-GT-AG-TA-------GCGGAC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-T-CGC-A-T-A-GA--TC------G-T-A--G-T-A-GT---T-CG---T-AAG-GA-T-GTT-C-G----------TGG----GTTGT-CG-T-G-G-TA-T-ACG-T-C-G-TAAA-C-AGT-G--GTCGTGTT-G-GAAA-A-G-T--TCT-AG-A-A-GAAA--GCG-----TAC-TG--
gi|22                         :                                    ctattctgacccggccccacggctagttgaaggaggaaatggtctgatccatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtactCA-TCGTACC------GTG-C-GT-AGATA-------GC--AC-CG--T-ATG--G-AGA-A-C-G--T--C-GAA-------C-AA-T-CGC-A-TAA-GA--TC------G-T-A--G-T-G-GT-ATT-CG-----AAG-GA-T-G-T-C-GCCCCCCCCCCTGT----GTGGT-CG-T---G-TA-T-A-T-G-C-T-T-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-----T--GAT-AG-G-A---AA--G-G-----TAC-TG--T--CTCGcta
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                             CA-TTG---C------ATA-C-GTTAG-TA--------T--AC-CG--T-AGT--G-AGA-A-C-G--TC-A-GAA-------C-GA-T-CGC-A-T-A-GT--TC------G-T-A--G-T-G-GT-G-T-CG---T-A-G-AA-T-G-A-C-T----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-C-T-G-T-AA-C-A-A-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-TG-A-A-G-CA--GCGTTATATAC-TG--T-
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                              A-TCGTACC------ATG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-ACG--G-AGA-A-CTG--T--A-GAA-------C-AA-T-CGC-C-T-A-GA--TC------G-T-A--G-T-G-GT-A-T-CT---T-AAGAAA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA---A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--GT----G-AA-A-G-T--CGT-AG-AGA-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCG
gi|24                         :                          tcggtaatctatgctggaacccggaaccccaagtttaaagctaacattgaagaggatggtctgattccatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaca-TCGTACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GT--AC-CG--T-AGG--G-AGACA-C-G--T--A-GAA-------C-AA-TTCGC-A-T-A-GA--TC------G-T-AAAG-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----TTGGT-CGTT-G-G-TA-T-A-ACT-C-G-T-AGAA-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AG-ACG-T--CGT-AG-A-A-G--A--GCG-----TACTTG--T-AC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                  GTACC------GCG-C-GT-AG-TACAGTGTAGC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GA-T-CGC-A-T-A-GA--TC------G-T-A--G-T-G-GT-A-T-CC---T-AAT-GA-T-G-T-C-G----------TAG----GTGGT-CG-G-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-C-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-GA-A-G-T--CGT-AA-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-AC
gi|17                         :                                     gggtatctattctgacccagacccccacgagttaaagctaattgaaggagaatggtttgatccatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacaaacGTATC------GTA-C-GT-AG-TA-------G--------------G--G-AGA-A-C-G--A--A-GAA-------C-GA-T-CGC-A-T-A-GA--TC------G-T-A--G-T-G-GT-G-T-CG---T-AAA-GA-T-G-T-C-A----------TGG----GTGGT-CA-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-C-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-CA--GCG-----TAC-TA--T-ACTC
gi|31                         :                                                                             aaagctaattgaaggcgtaaggtctgattcatgagtctaaatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacaaacGTACC------GTG-T-GT-AG-TACATGTA-GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-T-TGC-A-T-A-GA--TC------G-T-A--G-T-G-TT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CA-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-T-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CG
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                           tgcaaacGTACC------GTG-TTGT-AG-TACTGT---GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-T-TGC-A-T-A-GA--TC------G-T-A----T-G-TT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CA-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-T-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G----CGT-AG-
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                cctaagcgcggtgcaaacGTGCT------GTT-C-GT-AG-TA-------TC--AC-CG--T-AGT--A-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GA-T-CGC-A-A-A-GC--TC------G-T-A--G-T-G-GT-G-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                       gtggtaaatacGTACC------ATG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AAA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GA-T----------------------------------------------------G-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-A-T-AA-A-A-T-G--ATC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                          gtacaaacGTACT------GTG-C-GT----TAA------GC--ACTCG--C-CTG--ATAGA-A-C-T--A--A-GAAA------C-GA-T-CGC-A-TTA-GA--TC------G-T-A--G-T-G--------TG---TGAAG-GA-T-----C-G----------TGGTGAAATGGT-CG-TTG-G-TA-TGA-A-T-C-G-C-------------------TT-G-G-AAGA-G-TT-CGT-AA-A-A-A-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCaaagtg
gi|20                         :                                                                                       tgaagctaattgaaggaggatggtctgatccatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacaaacTACT------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AT-CG--T-AGT--G-AGA-A-G-G--T--A-GAA-------C----------------GA--TC------G-T-A--G-T-G-GT-------------------T-G-T-------------------------T-CG-T-G-ATTATT-A-A-T-C-GCT-AG-C-A-T-G--ATC--GT------AA-A-GTT--CAT-CT-A-A-C-AA--A-G-----GAC-TG--T-ACTCa
gi|19                         :                                                                                                        attaaagctaattgaaaaaggatggtctgatccatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GT--AC-TG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GA-T-CGC-A-T-A-GA--TCGTAGTGG-T-A--G-T-G-GT-A-T-CGTACT-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGC-CG-T-G-G-TA-a
gi|32                         :                                                                     cccccatgggttaaaactaatttgaaggaggatggtctgatccatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCC------GTG-C-GTTAG-TA-------CT--AC-CG--T-AGT--G-AGA-C-C-G--T--A-GAA-------C-GA-A-CAC-A-T-G-GA--TC------G-T-A--G-A-G-GT-G-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-T-G----------TGG-------------------TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--ATC--GTT-G-G-CA-A-G-C--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TGC-TG--T-ACTCt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                      C------ATA-C-GT-AG-TA--------T--AC-CG--T-AGT--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GA-T-CGC-A-T-A-GT--TC------G-T-A--G-T-G-GT-G-T-CG---T-AAG-AA-T-G-A-C-T----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-C-T-G-T-AA-C-A-A-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-TG-A-A-G-CA--GCGTATA-TAC-TG--T-ACT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                  ccatg------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AT-CG--T-AGT--G-AGA-C-C-G--T--A-GAA-------C-GA-T-TGC-A-T-A-GA--TC------G-T-A--G-T-G-GT-G-T-CG---T-AAC-GA-T-G-T-C-G----------TGG----TTGGT-CG-T-G-T-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--ATT--GTT-G-G-AA-A-T-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----CAC-TA--T-ACTC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                         ggtacaaacgaatt------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGC--G-AGA-A-C-G--T----GAA-------CGGA-T-CGC-AGC-A-GG--TC------G-T-A--G-T-T-GT-G-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-TAA----------TGG----G-GGT-CG-T-G-G-TAGT-A-A-TAT-G-T--G-C-A-TCG--TTC--GTTGG-G-AA-A-G-T--CGT-TG-A-A-G--C--GCG-----TAC-TG--T-a
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                       ------GTG-C-GT-A--TA-------GC--AC--G--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-AAA-------C-AA-T-CGC-A-T-A-TA--TC------G-T-A----T---GT-A-T-C----T-AAG------G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-A-A-TA-C-A-A-T-C-G-T-A
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                   gaataaacgatTG-C-GT-AG-TA-------GCC-AC-CGCGT-AGG--G-AGA-A-C-G--TTGA-AAA-------C-GA-T-CGCCA-T-A-GA--TC------GAT-A--G-----GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG-------------------CA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--TCC--GTT-GAG-AA-A-G-T--CGTGAG-A-C-G-AA--GCG-----TAC-T
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                      tgctacaacgattccagt-TA-------GC--AC-CA--T-AGA--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GA-T-CGC-A-T-A-GA--TC------G-T-A--G-T-G-GT-G-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-T-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCta
gi|34                         :                                                                       ggtagctattctaacccggacctccacgggttagagctagttgaaggaggatggtctgatccatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatatt-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-T-CGC-A-T-A-GA--TC------G-T-T--G-T-G-GT-A-T-TG---T-AAA-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-C-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TA
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                          G--T-AAGT-A-AGA-A-C-G--T--A-GAA---------GA-T-CGC-A-T--------C------G-T-A--G-T-G-GT---T-CA---T-AAG-GG-T-G-T---G-----------GG----GTGGT-CG-T-A-G-
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                           --T-AGGTTG-AGA-ATC-G--T--AAGAATCTTTCTC-AA-T-CGC-A-T-A-GA--TC------G-TCA--G-TCG-GT-A-T-CGT--T-AAG-GATT-G-T-C-G----------aa
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tagcaactgtcgta-GA--TC------G-C-A--A-T-C-GT-A-T-CG---T-AAT-GA-T-G-T-C-G----------TGG----ATGGT-CG-T-G-G-TA-c
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -GT-A-T-CG---TTAAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----TTG-T-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-G-C--GTC--GT----G-GA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AAAGGC------TAC-TG--T-ACTCGt
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -GG-T-G-TAC-G----------TG------TGAA-CG-T-GTG-TA-T-A---T-C-G---AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G--A-A-G-T--CGT-AG-A-A-GAAA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCG
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGTT-CG-T-G-G-TG-G-ATA-T-CAG-T-AG-C-A-TTG--GCC--GTT-G-G-AA-A-G-C--CGT-TG-A-A-G-CA--ACG-----TAC-TG--T-TCTCt
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aggaaA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--ATC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-a

Unaligned ( gi|36 ): AAGCTAATGAAGGAGGGTGGCCTGATCATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACAAA
Unaligned ( gi|48 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222                                                                                                                                                                                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                    2   5555 2 55    33      2    22   2   66  1      1  22 22 55  1   22    66666   22  33   1   3333    6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666  4444 1  1    1   444444   1 1  3  1  9999999  22  1  11 1   22 1   1 1 1 11 22 1   5555555 22 2    2 1 2 2  11  333333 2 22  1 1 1  222 1  222 3   1  2 1 1 1 1 4444444444   2222     1  3 1 1 1  2 1 2 1 1 1 1 1  2 1 1 2 11   11   1 1 2  1 1 2 11   3  1 1 1 2  11   55555   1  33 1     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                    .   .... . ..    ..      .    ..   .   ..  .      .  .. .. ..  .   ..    .....   ..  ..   .   ....    ...................................................................................................................  .... .  .    .   ......   . .  .  .  .......  ..  .  .. .   .. .   . . . .. .. .   ....... .. .    . . . .  ..  ...... . ..  . . .  ... .  ... .   .  . . . . . ..........   ....     .  . . . .  . . . . . . . .  . . . . ..   ..   . . .  . . . ..   .  . . . .  ..   .....   .  .. .     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                    7   3333 5 99    11      2    99   2   00  6      5  11 11 22  5   11    00000   22  88   6   5555    4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444  0000 7  7    4   777777   2 2  5  2  4444444  77  1  55 1   66 1   1 1 1 55 66 1   7777777 44 2    2 1 2 1  44  000000 1 55  1 1 0  444 0  888 1   0  0 0 0 0 0 4444444444   2222     0  0 0 0 0  0 0 1 1 1 1 1 1  2 1 1 2 55   55   1 1 2  1 1 2 55   4  2 2 2 4  77   88888   3  22 4     
consensus                     :                                                                                                                                                                                               TGGTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCGG-ACCC--CCA-CGGG-TT-AAAGCT-AA--T--T--GA-AGG--AGGA-----TGG--TC--TGA-TCC----ATGA-TCCATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAA----TA----C-CA-TCGT-ACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GA-TCGC-A-T-A-GA--TC------G-T--AG-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCG
Reference ( family-746 )      :                                                                                                                                                                                               TGGTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCGG-ACCC--CCA-CGGG-TT-AAAGCT-AA--T--T--GA-AGG--AGGA-----TGG--TC--TGA-TCC----ATGA-TCCATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNA----TA----C-CA-TCGT-ACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GA-TCGC-A-T-A-GA--TC------G-T--AG-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                GGTAATCT----A-T--GCTGGAACCCGG-AACC--CCA--AGT-TT-AAAGCT-AACAT--T--GA-AG---AGGA-----TGG--TC--TGATTCC----ATGA-
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tc----TA----C-AA-TCGT-ACC------ATG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-ACG--G-AGA-A-CTG--T--A-GAA-------C-AA-TCGC-C-T-A-GA--TC------G-T--AG-T-G-GT-A-T-CT---T-AAGAAA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA---A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--GT----G-AA-A-G-T--CGT-AG-AGA-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacaatcgtaccatgcgtagtagcaccgtacggagaactgtagaacaatcgcctagatcgtagtggtatcttaagaaatgtcgtgggtggtcgtggtaaatcgtagcatggtcgtgaaagtcgtagagagaagcgtactgtactcg
gi|10                         : tcggtaatctatgctggaacccggaaccccaagtttaaagctaacattgaagaggatggtctgattccatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCAG-ACCC----A-CTGC-TT-CAAGCT-AG--T--TTTGA-AGG--AGGA-----TGG--TCC-TG-----------GA-TCCATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAG----TA----C-CAATCGT-ACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T--GG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-TCGC-A-T-AGGA--TC------G-T--AG-T-G-GCAA-T-CG---T-AA--GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-A--C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-TCCCGTAAG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--
gi|11                         :                                                                                                                                                                                               TGGTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCGG-ACCC--C-A-CGGG-TT-AAAGCT-AA--T--T--GA-AG---AGGG-----TGG--TC--TGA-TCC----ATGA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--TA----C-CA-TCGT-ATT------TTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A---G--T--A-GAA-------C--A-TCGC-A-T-A-GA----------G-T--AG-T-G-GT-A-T-CC---T-AAT-GA-T-G-T-C-G----------TAG----GTGGT-CG---G-G-TA-T-A-A-T-C-G-C-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-GA-A-G-T--CGT-AA-A-A-G--A--GCG-----TAC-TG--T-ACTCGggtacgtc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                  gc-TCT----A-T--TCTG--ACCCGG-ACCC--C-------------GGCT-AG--T--T--GA-AGG--AGGA-----TGG--TC--TGA-TCC----ATGA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTA----C-CA-TCGT-ACC------ATG-C-G--AG-TA-------GC--AA-CC--T-AGG--G-AGA-A-C-G-----A-GAA-------C-AA-TCGC-A-T-A--A--TC------G-T--AG-T-G-GT-A-TTCG---T-AAG-GA-TTG-T-C-G----------TGA----GTGGTTCG-T-G-G--A-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TGT-T-ACTCG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                              ggGGTA-GCT----A-T--TCTA--ACCCGG-ACCT--CCA-CGGG-TT-AGAGCT-AG--T--T--GA-AGG--AGGA-----TGG--TC--TGA-TCC----ATGA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA----TA----T-T--TAGC-ACC------ATA---G--AG--A-------GA--AC--G--T-AGA--A-CGA-T-C-G--C--A-TA----------GA-TCGT-A-----------------G-T--GG-T-G------T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-T-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                               -AAAGCT-AA--T--T--GA-AGGATAGGA-----TGG--TC--TGA-T
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----TA----T-CA-CCGT-ACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AACTCGC-A-T-AAGA--TC------G-T--AG-T-G-GTTA-T-CG---TTAGG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTG-T-CG-T-G-G-TA-C-A-A-T-C-G-T-AA-C-G-T-G--GTC--GTG-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-A-TCGaatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtatcaccgtaccgtgcgtagtagcaccgtagggagaacgtagaacaactcgcataagatcgtagtggttatcgttagggatgtcgtgggtgtcgtggtacaatcgtaacgtggtcgtgggaaagtcgtagaagaagcgtactgtatcg
gi|15                         :                                                                                     aaagctaattgaaggataggatggtctgataatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng-AAAGCT-AA--T--T--GAGAGG--AGAA-----TGG--TC--TGA-TCC----ATGA-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----TA----C-CA-TCGT-ACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GT--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-T-GC-A-T-A-GA--TC------G-T--AG-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----ATGGT-CG-T-G-G-TA-C-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--ATT-G-G-AA-A-G-T--CGT------A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaccatcgtaccgtgcgtagtagtaccgtagggagaacgtagaacaatgcatagatcgtagtggtatcgtaaggatgtcgtggatggtcgtggtacaatcgtagcatggtcattggaaagtcgtagaagcgtactgtactcg
gi|16                         :                                                                                  aaagctaattgagaggagaatggtctgatccatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng-TT-AAAGCT-AG--T--TT-GA-AGT--AGGA-----TGG--TC--TGA-TCC----AT--------GANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG----TA----C-CA-TCGT-ACC------GTG-C-GT-AG-----------C--AC-CA--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-TCAC-A-T-A-GA--TC------G-T--AG-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--ATC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                               -AAAGCT-AA--T--T--GA-AGG--CGTA-----AGG--TC--TGA-TTC----ATGAGTCTA-AATGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG------TA----C-AA-ACGT-ATC------GTA-C-GT-AG-TA-------G--------------G--G-AGA-A-C-G--A--A-GAA-------C-GA-TCGC-A-T-A-GA--TC------G-T--AG-T-G-GT-G-T-CG---T-AAA-GA-T-G-T-C-A----------TGG----GTGGT-CA-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-C-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-CA--GCG-----TAC-TA--T-ACTC
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                              T-GAAGCT-AA--T--T--GA-AGG--AGGA-----TGG--TC--TGA-TC------------CATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----A----TA----C-AA-ACGT-ACT------GTG-C-GTTA---A-------GC--ACTCG--C-CTG--ATAGA-A-C-T--A--A-GAAA------C-GA-TCGC-A-TTA-GA--TC------G-T--AG-T-G--------TG---TGAAG-GA-----T-C-G----------TGGTGAAATGGT-CGTT-G-G-TA-TGA-A-T-C-G-C-------------------TT-G-G-AAGA-GTT--CGT-AA-A-A-A-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                               CCC--CCA-TGGG-TT-AAAACT-AA--T--TT-GA-AGG--AGGA-----TGG--TC--TGA-TC------------CATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NN----N-NN-NNNNNACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GT--AC-TG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GA-TCGC-A-T-A-GA--TCGTAGTGG-T--AG-T-G-GT-A-T-CGTACT-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGC-CG-T-G-G-TA-T-a
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                      CT----A-T--TCTG--ACCCGG---CC--CCA-CGG---------CT-AG--T--T--GA-AGG--AGGAAA---TGG--TC--TGA-TCC----ATGA-
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----TA----CTCA-TCGT-ACC------ATG-C-GT-AG-TA-------GCGGAC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-TCGC-A-T-A-GA--TC------G-T--AG-T-A-GT---T-CG---T-AAG-GA-T-GTT-C-G----------TGG----GTTGT-CG-T-G-G-TA-T-ACG-T-C-G-TAAA-C-AGT-G--GTCGTGTT-G-GAAA-A-G-T--TCT-AG-A-A-GAAA--GCG-----TAC-TG--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtactcatcgtaccatgcgtagtagcggaccgtagggagaacgtagaacaatcgcatagatcgtagtagttcgtaaggatgttcgtgggttgtcgtggtatacgtcgtaaacagtggtcgtgttggaaaagttctagaagaaagcgtactgcta
gi|20                         :                                                       ctattctgacccggccccacggctagttgaaggaggaaatggtctgatccatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng-TT-AAAGCT-AA--T--T--GA-AAA--AGGA-----TGG--TC--TGA-TCC----ATGA-cta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aT-ACT------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AT-CG--T-AGT--G-AGA-A-G-G--T--A-GAA-------C---------------GA--TC------G-T--AG-T-G-GT-------------------T-G-T-------------------------T-CG-T-G-ATTATT-A-A-T-C-GCT-AG-C-A-T-G--ATC--GT------AA-A-GTT--CAT-CT-A-A-C-AA--A-G-----GAC-TG--T-ACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttactgtgcgtagtagcatcgtagtgagaaggtagaacgatcgtagtggttgttcgtgattattaatcgctagcatgatcgtaaagttcatctaacaaaggactgtactca
gi|21                         :                                                                                       attaaagctaattgaaaaaggatggtctgatccatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTG--ACCCGGAACCCCACCA-CGGC-TTCAACGCT-G------T--GA-ACG--GGAC-----TGG--TC--TGA-TCC----------CCATGAa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -CA-TCGT-ACC------GTG-C-GT-AGATA-------GC--AC-CG--T-ATG--G-AGA-A-C-G--T--C-GAA-------C-AA-TCGC-A-TAA-GA--TC------G-T--AG-T-G-GT-ATT-CG-----AAG-GA-T-G-T-C-GCCCCCCCCCCTGT----GTGGT-CG-T---G-TA-T-A-T-G-C-T-T-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-----T--GAT-AG-G-A---AA--G-G-----TAC-TG--T--CTCGcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaggt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----TA----C-AA-ACGA-ATT------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AT-CG--T-AGT--G-AGA-C-C-G--T--A-GAA-------C-GA-TTGC-A-T-A-GA--TC------G-T--AG-T-G-GT-G-T-CG---T-AAC-GA-T-G-T-C-G----------TGG----TTGGT-CG-T-G-T-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--ATT--GTT-G-G-AA-A-T-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----CAC-TA--T-ACTC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gg-TCGT-ACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GT--AC-CG--T-AGG--G-AGACA-C-G--T--A-GAA-------C-AATTCGC-A-T-A-GA--TC------G-TAAAG-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----TTGGT-CGTT-G-G-TA-T-A-ACT-C-G-T-AGAA-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AG-ACG-T--CGT-AG-A-A-G--A--GCG-----TACTTG--T-ACa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -CA-TCGT-ACCC-----GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-TCGC-A-T-A-GA--TC------G-T--AG-T-G-TT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-T-G----------TGG----GTGGT-GG-T-G-A-TA-C-A-A-T-C-G-T-AA-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAA--G--T-ACTCG
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TG-C-GT-AG-TA-------GCC-AC-CGCGT-AGG--G-AGA-A-C-G--TTGA-AAA-------C-GA-TCGCCA-T-A-GA--TC------GAT--AG-----GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG-------------------CA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--TCC--GTT-GAG-AA-A-G-T--CGTGAG-A-C-G-AA--GCG-----TAC-Tt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgctacaacgattccagtC------ATA-C-GTTAG-TA--------T--AC-CG--T-AGT--G-AGA-A-C-G--TC-A-GAA-------C-GA-TCGC-A-T-A-GT--TC------G-T--AG-T-G-GT-G-T-CG---T-A-G-AA-T-G-A-C-T----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-C-T-G-T-AA-C-A-A-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-TG-A-A-G-CA--GCGTTATATAC-TG--T-ta
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cattgC------ATA-C-GT-AG-TA--------T--AC-CG--T-AGT--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GA-TCGC-A-T-A-GT--TC------G-T--AG-T-G-GT-G-T-CG---T-AAG-AA-T-G-A-C-T----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-C-T-G-T-AA-C-A-A-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-TG-A-A-G-CA--GCGTATA-TAC-TG--T-ACT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccatgCGT-ACC------GTG-TTGT-AG-TACTGT---GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-TTGC-A-T-A-GA--TC------G-T--A--T-G-TT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CA-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-T-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G----CGT-AG-
gi|3                          :                                                                                                                                                                               cctaagcgcggtgcaaaGGTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCAG-ACCC--CCA-CGAG-TT-AAAGCT-AA--T--T--GA-AGG--AGAATGGTTTGA--TCCATGA-NNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG------TA----C-AA-ACGT-ACC------GCG-C-GT-AG-TACAGTGTAGC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GA-TCGC-A-T-A-GA--TC------G-T--AG-T-G-GT-A-T-CC---T-AAT-GA-T-G-T-C-G----------TAG----GTGGT-CG-G-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-C-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-GA-A-G-T--CGT-AA-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-AC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               g------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGC--G-AGA-A-C-G--T----GAA-------CGGA-TCGC-AGC-A-GG--TC------G-T--AG-T-T-GT-G-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-TAA----------TGG----G-GGT-CG-T-G-G-TAGT-A-A-TAT-G-T--G-C-A-TCG--TTC--GTTGG-G-AA-A-G-T--CGT-TG-A-A-G--C--GCG-----TAC-TG--T-
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CGT-ACC------GTG-T-GT-AG-TACATGTA-GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-TTGC-A-T-A-GA--TC------G-T--AG-T-G-TT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CA-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-T-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CG
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgcaaaCC------GTG-C-GTTAG-TA-------CT--AC-CG--T-AGT--G-AGA-C-C-G--T--A-GAA-------C-GA-ACAC-A-T-G-GA--TC------G-T--AG-A-G-GT-G-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-T-G----------TGG-------------------TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--ATC--GTT-G-G-CA-A-G-C--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TGC-TG--T-ACTC
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----TA----C-AA-ACGT-ACC------ATG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AAA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GA-T--------------------------------------------------G-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-A-T-AA-A-A-T-G--ATC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   g-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-TCGC-A-T-A-GA--TC------G-T--TG-T-G-GT-A-T-TG---T-AAA-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-C-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAaaagtg
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                               -AAAGCT-AA--T--T--GA-AGG--AGGG-----TGG--CC--TGA-TCC----ATGA-
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                 AAGCT-AA--T-----GA-AGG--AGGG-----TGG--CC--TGA-T-C----ATGA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacaaa
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CGT-GCT------GTT-C-GT-AG-TA-------TC--AC-CG--T-AGT--A-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GA-TCGC-A-A-A-GC--TC------G-T--AG-T-G-GT-G-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacaaa
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtggtaaata------GTG-C-GT-A--TA-------GC--AC--G--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-AAA-------C-AA-TCGC-A-T-A-TA--TC------G-T--A--T---GT-A-T-C----T-AAG------G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-A-A-TA-C-A-A-T-C-G-T-Aag
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gaataaacgat--T-AGGTTG-AGA-ATC-G--T--AAGAATCTTTCTC-AA-TCGC-A-T-A-GA--TC------G-TC-AG-TCG-GT-A-T-CGT--T-AAG-GATT-G-T-C-G----------
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                      tagcaactgtcgtaG--ACCCGG-GCCC--CCAACGCGCTT-CAAGCT-AG--T-----GA-AGG--AGG------TGG--TC--TGA-TCCATGAATGA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----CAGTACC-CA-TCGT-ACC------GTGAC-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-GTAT--A-GAA-------C-AA-TCGC-A-T-A-GAATTC------GTT--AG-T-GAGT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C------------TGG----GTGGT-CGTT-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-GCCGTC--GTT-G-G--A-A-G-T--CGT-AG-A-AGG-AA--GCG-----TAC-TGTTT-ACTCGc
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -GT-A-T-CG---TTAAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----TTG-T-CG-T-G-G-TA-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-G-C--GTC--GT----G-GA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AAAGGC------TAC-TG--T-ACTCG
gi|41                         :                                                                                                                                                                                               TGGTA-TCTCCCCA-TC-TCTG--ACCGGG-CGCC--CCA-CGGGTTT-AAAGCTCAA--TTCT--GA-A----CGGA-----TGGGTTC--TGA-TCC----A
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GG-T-G-TAC-G----------TG------TGAA-CG-T-GTG-TA-T-A---T-C-G---AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G--A-A-G-T--CGT-AG-A-A-GAAA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCG
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTT-CG-T-G-G-TG-G-ATA-T-CAG-T-AG-C-A-TTG--GCC--GTT-G-G-AA-A-G-C--CGT-TG-A-A-G-CA--ACG-----TAC-TG--T-TCTCt
gi|44                         :                                                                                                                                                                                          aggaaTGGTA-TCT----A-TATTCTG--ACCCGG-ACAC--CCA-CGGA-TT-AAAGCT-AA--T--T--GA-AGT--AGGA-----TGG--TC--TGA-TGC----ATa
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   G--T-AAGT-A-AGA-A-C-G--T--A-GAA---------GA-TCGC-A-T--------C------G-T--AG-T-G-GT---T-CA---T-AAG-GG-T-G-T---G-----------GG----GTGGT-CG-T-A-G-
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                GGTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCGG--------------G-TT-AAAGCT-AA--C--T--GA-AGG--AGGA-----TGaa
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ctg-GA--TC------G-C--AA-T-C-GT-A-T-CG---T-AAT-GA-T-G-T-C-G----------TGG----ATGGT-CG-T-G-G-TA-T-
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A-T-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--ATC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                  TA-TCT----A-T--TCTG--ACC--G-GCCC--CCA-CGAG-TT-AA-GCT-AA--T--T--GA-AGG--AGGA-----T-G--TC--TGA-TCC----ATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NN----N-NN-NNGT-ACCATCGTCGTG-C-AT-AG-TA-------GC--AC-CG--TAAGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-TCGC-A-T-A-GA--TC--------T--AGTT-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GATT-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G--A-C-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--TTT-G-GTAA-A-G-T--CGT-AGAA-A-G-AA--GCG-----TAC-T---T-ACTCG
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                GGTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCAG-ACCC--
gi|6                          :                                                                                                                                                                                            ctgTGGTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCGA-ACCG--CCA-CAGG-TT-AAATCT-AA--A--T--GA-AGG--AGGA-----TGG--TC--TGA-TCC----ATGA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA----TA----C-AA-ACGT-ACC------GTG-T-TT-AG-TA-------GC--AC-AG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-GG-TCGG-A-T-A-AA--TC------G-T--AG-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----CTGGT-TG-T-G-G-TA-T-A-A-T-T-G-T-AA-T-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                  TA-TCT----AAT--TCTG--ACC--G-ACCC--CCA-CGGG-TT-AAAGCT-AG--T--T--GA-AGG--AGGA-----TGA--C-----A-T-C----ATGAGTCCAat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----TA----C-CA-TCGT-ACA------AT--C-GT-AG-TA-------GC--AT-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-TCGCAA-T-A-GA--TC------G-T--AG-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-G----G-T-C-G----------T-G----GT-GT-CG-T-G-G-TC-T-A-A---C-G---AG-CAA-T-G--GTC---TT-G-A-AA-G-G-T--CGTGAG-A-A---AA--GCG-----CAC-TG--TAACTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggttaccatcgtacaatcgtagtagcatcgtagggagaacgtagaacaatcgcaatagatcgtagtggtatcgtaagggtcgtggtgtcgtggtctaacgagcaatggtcttgaaaggtcgtgagaaaagcgcactgtaactc
gi|8                          :       tatctaattctgaccgacccccacgggttaaagctagttgaaggaggatgacatcatgagtccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggtTGGTA-TCT----A-T--TCTG--ACCCGG-ACCC--CCA-CGGG-TT-AAAGTT-AA--T--T--GA-AGG--AGGA-----TG---TC--TGA-TCC----ATGA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NN----C-CA-TTGT-ACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAA-------C-AA-TCGC-A-T-A-GA--TC------G-T--AG-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-T-G-G-TA-C-A-A-T-C-G-T-AG-C-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                GGTA-TCT----T-T--TCTG--ACC-GG-ACCC--CCA-CGG--TT-AAAGCT-AA--T--T--GA-AGG--AGGA-----TGG--TC--TGA-NNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG------TA----C-CA-TCGT-ACC------GTG-C-GT-AG-TA-------GC--AC-CG--T-AGG--G-AGA-A-C-G--T--A-GAAA------T-AA-TCGC-A-T-A-GA--TC------G-T--AG-T-G-GT-A-T-CG---T-AAG-GA-T-G-T-C-G----------TGG----GTGGT-CG-TGG-G-TA-C-A-A-T-C-G-T-AGCC-A-T-G--GTC--GTT-G-G-AA-A-G-T--CGT-AG-A-A-G-AA--GCG-----TAC-TG--T-ACTCG