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lowQualScore                  :          ..........      .    ..     ...  .        . ...  .   . .    .    ...    .     .  .   ..  .   ....  ..        ....    ...    .  ...     ...    .  .  .        .........  .  ...  .    .       .     ....  .     . .         ....   .  ....     ....................................................................................................................................         .. ..  .   .     .  .            .      .    .       ..   . ...  .        ...         ..  .. ..  ....................  ..   . ...   .       .         ... .    ....    .  .............  .  .   .. .    .......................        .  .          .... .    . ....  ....  ..      .      
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Reference ( gi|4 )            :     TTTCC----CGT-GATGTGAC-TTTC--TGTTG---GT-GGATTTCCTGAGCTG-TGA-C-TTTC-TGTT-TTTGGA-TTTCCCGTGTTTT-GT-GAC----TG--ACTTTTCG-CG-ACGTG--AATT-ACCCTTTTTG-G-ACTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AG---TA-ATGTATTGTATT-GTAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATG-ATTTA-TTC---TGTAA------------A---------A---T---------TGAT-TGTAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGGGG--------GGGT--TTTGGGGGG--T--TGTTTTCGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGC-TCGTAC-G-GATTATCTCTC-TATTCCCGCGG--AC--T-CTC--AA------CG--GA-ACAGAC-GTG-T-T-TATCAGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTG-GTA-TT-----TGTTA-GTC--TGTGTA-----------TG----------AATATATG-TTCTTATAAGTGG-T--T-TTTCCT--G-GTC---TTGATATATAGAGAAAC
gi|16                         :     TTTCCTATTCGT-GGTGTGACGTTCC--TATTG---GT-GGATTTCCAGTGATG-TGA-C-TTT
gi|3                          : gtgacTTCC----CGTAGGTGTGAC-TTTCGCTATTC---GT-GGATTTCCCGTGAT--TGC-T-TTTC-TGTT-TGTG-A-TTTTCCGTGCTTT-GT-GAC----TGTGACTTTCC--CT-ACGTG--AATG-CCCATCTTTG-G-ACTG-TAAAATTTGCTATGATT-ATT--AG-AG----A-ATGTATTGTATTTGTAAAAATCTC-ATAGGAGT--AATCAA-G-ATTTA-TT----TGTAA------------A---------A---TAATTGCTATTGAT-TGGAAG-CCACAGTCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNG-------GGGGG--T--TGTTTT-GCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GT-TAC-TCCG-GG-TCGCACCGTGCTG-GATTATCTCTC-TCTT-CCGCGG--ACTGT-CGC--AA------GG--GGTGC-GATGGTG-T-TCTAT-AGAGCTCGGCACTGCGGC--ATTTGTAT--TTTGTCT--GTATTT-----TGTTA-GTC--TGTGTATGGTAATTTTGTG----------AATATAT--TTCTTATAAGTGGTT--T-TTTCTT--G-GTCGGGTTG-TATATAGAGAGA
gi|1                          :       TCC----TGT-C-TGTGAC-TTTT--CGTTGCGTGT-GGATTTCCCGTGGTG-TGA-CGTTCC-TATT-TGTGGA-TTTCCTGTGTTTT-GTGGAC----TG--ACTTTTCGCCG-ACGTG--AATT-ACCGTTTTGGAG-ACTGATTCAATTTGCTATGATTTATTTAGG-AG---TAGATGTATTGTATTGGTAAA----TC-ATAGG-G-TAAATCAATGAATTTATTTT---TGTAA------------AATTATTGC-A---T---------TGAT-TGTAAG-CCACA-TGTTGAAGG------GCTCTGGTTTATTCGTAAATTGGGAACATTCCTCTCAAAATGGGGGGGGTACGTGATGTGA--TTTGGGGGT--T--TTTTTTTGCGGT-TT-CGGTCGGGCTCGTGTGTAC-ATCG-AGCTCGC-TCGTGC-G-GATTATCTCTC-TCTTCCCGCGGAAAC--TGGTCGAAG------CG--GT-GCGGAT-GTG-T-A-TAT--GAGCTC-GCATCG-GGA--A-TTG-----TTTG-CTG-GTA--T-----TGTTACGTC--T-TGTA-----------TGTACTTGGTGAAATATATG-TTCTTATAAGTGG-T--T-TTCCTTTGA-GTG---TTGGTATATAGAGAAACtc
gi|2                          :       TTC----TGT-GCTGTGAC-TTTT--CGTTG---GTTGGATTTCCCGTGGTGATGAACGTTCC-TATTATGTGGA-TTTCCTGT-TTTT-GT-GAC----TG--ACTTTTCG-CG-AACTGGCAATTCACCCGTTTGGAG-ACTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AGGAG---TA-ATGTATTGTATTGGTAAA----TC-A-AGG-GTTAAATCAATG-AATTATTTT---TGTAA------------AATTATTGC-A---T---------TGAT-TGTAAGACCACAAT----AGAGTTTGAAGGGCTGGTTTATTCGTAATTGGGACATATCCTCCCAAGAATGGGGGGGGAGT-----GGATGATTTGGAGGGGTT--TTTTTTTGCGGT-TT-CGGTC-GGCTC--GTG-ACATCCG-AGCTCGC-TCGTGC-GCGATTATCTCTC-TCTTCCCGCGGAAAC--TGGTCG-AA------GG--GT-GCGGAT-GTG-T-A-TAT--GAGCTC-GCATCGTGGCAAA-TTGT----TTT-TCTG-GTA--------TGTTACGTC--T-TGTA-----------TGTACTTGTGA-AATAT-TGTTTCTTATAAGTGG-T--T-TTCCTT--GAGTT---TTGGTATATAGAGAAACac
gi|9                          :                                               TTTCCTAATTTG-TGA-C-TTTCATGTT-CATGGAGTTTTCTGTCCCTGAGT-GACCTGGTG--ACATTTTG-TATGCGT---AACT-GC---TTTTG-GAACAG-TT-AA-----TATG---------AG-AG---TA-AAAT----TATT-GTAAA----TCAATAGG-G-TATATCAATC-A-TTA-TTCATATGTAAGTTGTACCATCTA---------ATGTT---------TGATATGT------ACAGTGCTGGAGGac
gi|8                          :                                               TTTCCTAATTTG-TGA-C-TTTCATGTT-CATGGAGTTTTCTGTCCCTGAGT-GACCTGGTG--ACATTTTG-TATGCGT---AACT-GC---TTTTG-GAACAG-TT-AA-----TATG---------AG-AG---TA-AAAT----TATT-GTAAA----TCAATAGG-G-TATATCAATC-A-TTA-TTCATATGTAAGTTGTACCATCTA---------ATGTT---------TGATATGT------ACAGTGCTGGAGGc
gi|5                          :                                                                                                       ----TG--ACTTTTTG-CG-ACGTG--AATT-ACCCCTTTTG-G-ACTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTAATA-ATGTATTGTATT-GTAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATC-ATATA-TTC---TGTAA------------ATTTTATTGCA---T---------TGAT-TGTAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCC---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNN--NNNNNGGGG--T--TGATTTTGTGGT-TTTCGGTTCGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGC-ACGTGC---GATTGTCTCTC-TCTTCCCGCGG--AC--T-ATCA-AA------GG--GA-ACAGAC-GTGTT-T-TAT-GGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTATA---GTTGTCTACATA--T-----TGTGA-GTCTTTGTGTT-----------TGTT--------AATACACG-TTATTATAAGTGG-T--T-TTTCTT--GAGTG---TT-ATACACA-AGAc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GAT--TTTGGGGGG--T--TGATTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGTTCG-GTGTAC-TCTG-AGCTCGC-ACGTGC-G-AA-TATCTCTC-TCTTCCCTTGG--AC--T-CTC--AA------AG--GGTACAGAT-GTG-T-T-TTACAGAGCTCGGCACTGTGTT--A-CTGCATACTTTTTTTACGT--TT-----TGGAA-GTC--TTTGTATT---------TGTT--------AATACACG-TTGTTATAAGTGG-T--TGTCTTTT--G-GGT---TTG-TATATACATAAActaaac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GAT--TGTGGGGGA--T--AGGTTTTAGAAT-ATCCGGTCGGGCTCG-GAGTCC-TCTGTA--TTGC-ACGTGC-T-G-----CTCTT--------------AC--T-CTC--AAGT----C---GA-GCGGAC-GTG-T-T-CCTTAGATTGCAGCACTGTGGg
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --TTTTAGGGG--T--TGTT----CGGTATTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-GGCTCGC-ACGTGC-G-GATTATCTCTCTTCTTCCCGCAG--AC--T-GTC--GAAAT---TGTTGC-GCATGT-GTG-TGT-TAT-AGAGCTC-GCACTGCGG---A-TTGTA---TTTGTCT--GTA-TT-----TG-TA-GTC--TGTGT
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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consensus                     :    TTTCC----CGT-GGTGTGACTTTC--C-GTTG---GT-GGATTTCCCGNGNTG-TGA-CTTTC-TGTT-CGTGGA-TTTCCCGTNCTTT-GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GACGCG--AATT-ACC-C-TTTTGG-A--CTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-AT---GTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATGA-TTTATTC---T-GTAA--------A----TT--T------ATTG-----ATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCGAAGNNCTGGTTTATTCGTAANTNGGGNACATCCCCCCNAGAATGGGGGGGG-GCG-GAT----TTTGGGGGG--T--TGNTTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC-G-GATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-GTCG--AAG--GGTGCGGA--T-GTG-T---T-T-A-T-AGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTGCGTATT-----TGTTA-GTC---TGTGTA-----T--------T-G-TG-AAT-------ATATG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTTCT-T--G-GT---GTTNGTATATAGAGAAAC
Reference ( family-7211 )     :    TTTCC----CGT-GGTGTGACTTTC--C-GTTG---GT-GGATTTCCCGTGNTG-TGA-CTTTCATGTT-CGTGGAGTTTTCTGTNCTTTAGTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GACGTG--AATT-ACC-T-TTTTGG-A--CTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-AT---GTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATNA-TTTATTC---T-GTAA--------A----TT--T------ATTG-----ATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCGAAGNNCTGGTTTATTCGTAANTNGGGNACATCCCCCCNAGAATGGGGGGGG-GCG-GAT----TTTGGGGGG--T--TGNTTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC-G-GATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-GTCG--AAG--GGNGCGGA--T-GTG-T---T-T-A-T-AGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTGCGTATT-----TGTTA-GTC---TGTGTA-----T--------T-G-T--AAT-------ACATG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTTCT-T--G-GT---NTTGGTATATAGAGAAAC
gi|1                          :      TCC----TGT-C-TGTGACTTTT--C-GTTGCGTGT-GGATTTCCCGTGGTG-TGA-CGTTCCTATT-TGTGGA-TTTCCTGTGTTTT-GTGGAC----TG--ACTTTTCGCCGACGTG--AATT-ACC-G-TTTTGG-AGACTGATTCAATTTGCTATGATTTATTTAGG-AGTAGAT---GTATTGTATT-GGTAAA----TC-ATAGG-GT-AAATCAATGAATTTATTT---TTGTAA--------A----AT--T------ATTGCATTGATTG-TAAG-CCACA-TGTTGAAGG------GCTCTGGTTTATTCGTAAATTGGGAACATTCCTCTCAAAATGGGGGGGGTACGTGATGTGATTTGGGGGT--T--TTTTTTTGCGGT-TTC-GGTCGGGCTCGTGTGTAC-ATCG-AGCTCGCT-CGTGC-G-GATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGGAAACTGGTCG--AAGC-GGTGCGGA--T-GTG-T---A-T-A-T--GAGCTC-GCATCG-GGA--A-TTG-----TTTG-CTG-GTA-T-----TGTTACGTC---T-TGTA-----TGTACTTGGT-G-A--AAT-------ATATG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTCCT-TTGA-GT---GTTGGTATATAGAGAAAC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ----TTTTAGGGG--T--TGTT----CGGTATTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-GGCTCGCA-CGTGC-G-GATTATCTCT--CTTCTTC-CCGCAG--ACT-GTCG--AAATTGTTGCGCA--T-GTG-TGTGT-T-A-T-AGAGCTC-GCACTGCGG---A-TTGTA---TTTGTCT--GTATT-----TG-TA-GTC---TGTGTac
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGGGGG--TGGTGTTTGTGCGGT-TTACGATCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC-G-AA-TGTCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-GTCG--AAG--GGTGCGGA--T-GTGTT---T-T-A-T-AGAGCTCAGCATTACG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tg-GAT----TGTGGGGGA--T--AGGTTTTAGAAT-ATCCGGTCGGGCTCG-GAGTCC-TCTGTA--TTGCA-CGTGC-T-G-----------C-TCTT----------ACT-CTCA--AGT--CGAGCGGA--C-GTG-T---T-C-CTT-AGATTGCAGCACTGTGG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgtgtagtTTGTCTCTGTC-TCTTTACCGCGA--ACA-CTCA--AGA--TCAGCAGA--T-GTG-T---T-TCA-T-AGAGCACAGCATTGCtta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acgtgctactGGGGGG--G--TGATTTTGCGGT-TTCCGGTCGAGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC---TATTATCTC
gi|16                         :    TTTCCTATTCGT-GGTGTGACGTTC--CTATTG---GT-GGATTTCCAGTGATG-TGA-CTTT
gi|2                          : gtgacTTC----TGT-GCTGTGACTTTT--C-GTTG---GTTGGATTTCCCGTGGTGATGAACGTTCCTATTATGTGGA-TTTCCTGTTTTT--GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GAACTGGCAATTCACC-C-GTTTGG-AGACTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AGGAGTA-AT---GTATTGTATT-GGTAAA----TC-A-AGG-GTTAAATCAATGA-ATTATTT---TTGTAA--------A----AT--T------ATTGCATTGATTG-TAAGACCACAAT----AGAGTTTGAAGGGCTGGTTTATTCGTAATTGGGACATATCCTCCCAAGAATGGGGGGGGAGTG-GATGA--TTTGGAGGGGTT--TTTTTTTGCGGT-TT-CGGTC-GGCTC--GTG-ACATCCG-AGCTCGCT-CGTGC-GCGATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGGAAACTGGTCG--AAG--GGTGCGGA--T-GTG-T---A-T-A-T--GAGCTC-GCATCGTGGCAAA-TTGT----TTT-TCTG-GTA-------TGTTACGTCTTGTATGTAC----T--------T-G-TGAAAT-------AT-TGTTTCTTATAAGTGG-TT-TTCCT-T--GAGT---TTTGGTATATAGAGAAAC
gi|3                          :     TTCC----CGTAGGTGTGACTTTCGCT-ATTC---GT-GGATTTCCCGTGAT--TGC-TTTTC-TGTT-TGTGA--TTTTCCGTGCTTT-GTG-AC----TGTGACTTTCC-C-TACGTG--AATG-CCCAT-CTTTGG-A--CTG-TAAAATTTGCTATGATT-ATT--AG-AG-A-AT---GTATTGTATTTG-TAAAAATCTC-ATAGGAGT--AATCAA-GA-TTTATT----T-GTAA--------AATAATTGCT------ATTG-----ATTG-GAAG-CCACAGT-CT------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-NNN----NNNGGGGGG--T--TG-TTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GT-TAC-TCCG-GG-TCGCACCGTGCTG-GATTATCTCT--C-TCTT--CCGCGG--ACT-GTCGCAAGG--GGTGC-GA--TGGTG-T---TCT-A-T-AGAGCTCGGCACTGCGGC--ATTTGTAT--TTTGTCTGTAT-TT-----TGTTA-GTC---TGTGTA-----T--------G-G-T--AATTTTGTGAATATATTTCTTATAAGTGGTTT-TTTCT-T--G-GTCGGGTT-GTATATAGAGAGAac
gi|4                          :    TTTCC----CGT-GATGTGACTTTC--T-GTTG---GT-GGATTTCCTGAGCTG-TGA-CTTTC-TGTT-TTTGGA-TTTCCCGTGTTTT-GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GACGTG--AATT-ACCCT-TTTTGG-A--CTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-AT---GTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATGA-TTTATTC---T-GTAA--------A---------------ATTG-----ATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGGGG-G---GGT----TTTGGGGGG--T--TGTTTTCGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCT-CGTAC-G-GATTATCTCT--C-TATTC-CCGCGG--ACT-CTC---AAC--GGAACAGA--C-GTG-T---T-T-A-TCAGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTG-GTATT-----TGTTA-GTC---TGTGTA--------------T-G----AAT-------ATATG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTTCC-T--G-GT---CTTGATATATAGAGAAACtc
gi|5                          :                                                                                                     ----TG--ACTTTTTGC-GACGTG--AATT-ACC-CCTTTTGG-A--CTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-ATAATGTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATCA-TATATTC---T-GTAA--------A----TT--TTATTGCATTG-----ATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-NNN---------GGGG--T--TGATTTTGTGGT-TTTCGGTTCGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC---GATTGTCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-ATCA--AAG--GGAACAGA--C-GTGTT---T-T-A-T-GGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTATA---GTTGTCTACATA-T-----TGTGA-GTCTT-TGTGT------T--------T-GTT--AAT-------ACACG-TTATTATAAGTGG-TT-TTTCT-T--GAGT---GTT
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consensus                     :    TTTCC----CGT-GGTGTGACTTTC--C-GTTG---GT-GGATTTCCCGNGNTG-TGA-C-TTTC-TGTT-CGTGGA-TTTCCCGTNCTTT-GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GA-C--GCG-AATTGCCC--TTTT-GG-A--CTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-AT---GTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATGA-TTTATTC---T-GTAA--------A----TT--T------ATTG-----ATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCGAAGNNCTGGTTTATTCGTAANTNGGGNACATCCCCCCNAGAATGGGGGGGG-GCG-GAT----TTTGGGGGG--T--TGNTTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC-G-GATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-GTCG--AAG--GGT--GCGGA--T-GTG-T---T-T-A-T-AGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTGCGTATT-----TGTTA-GTC---TGTGTAT-------TT--GTG-AATATA-TG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTTCT-T--G-GT--GTTNGTATATAGAGAAAC
Reference ( family-7211 )     :    TTTCC----CGT-GGTGTGACTTTC--C-GTTG---GT-GGATTTCCCGNGNTG-TGA-C-TTTC-TGTT-CGTGGA-TTTCCCGTNCTTT-GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GA-C--GCG-AATTACCC--TTTT-GG-A--CTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-AT---GTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATGA-TTTATTC---T-GTAA--------A----TT--T------ATTG-----ATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCGAAGNNCTGGTTTATTCGTAANTNGGGNACATCCCCCCNAGAATGGGGGGGG-GCG-GAT----TTTGGGGGG--T--TGNTTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC-G-GATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-GTCG--AAG--GGT--GCGGA--T-GTG-T---T-T-A-T-AGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTGCGTATT-----TGTTA-GTC---TGTGTA--------TT--GTG-AATATA-TG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTTCT-T--G-GT--GTTNGTATATAGAGAAAC
gi|1                          :      TCC----TGT-C-TGTGACTTTT--C-GTTGCGTGT-GGATTTCCCGTGGTG-TGA-CGTTCC-TATT-TGTGGA-TTTCCTGTGTTTT-GTGGAC----TG--ACTTTTCGCCGA-C--GTG-AATTACCG--TTTT-GG-AGACTGATTCAATTTGCTATGATTTATTTAGG-AGTAGAT---GTATTGTATT-GGTAAA----TC-ATAGG-GT-AAATCAATGAATTTATTT---TTGTAA--------A----AT--T------ATTGCATTGATTG-TAAG-CCACA-TGTTGAAGG------GCTCTGGTTTATTCGTAAATTGGGAACATTCCTCTCAAAATGGGGGGGGTACGTGATGTGATTTGGGGGT--T--TTTTTTTGCGGT-TTC-GGTCGGGCTCGTGTGTAC-ATCG-AGCTCGCT-CGTGC-G-GATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGGAAACTGGTCG--AAGC-GGT--GCGGA--T-GTG-T---A-T-A-T--GAGCTC-GCATCG-GGA--A-TTG-----TTTG-CTG-GTA-T-----TGTTACGTCTTGTATGTA--------CTTGGTGAAATATA-TG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTCCT-TTGA-GT--GTTGGTATATAGAGAAAC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ----TTTTAGGGG--T--TGTT----CGGTATTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-GGCTCGCA-CGTGC-G-GATTATCTCT--CTTCTTC-CCGCAG--ACT-GTCG--AAATTGTT--GCGCA--T-GTG-TGTGT-T-A-T-AGAGCTC-GCACTGCGG---A-TTGTA---TTTGTCT--GTATT-----TG-TA-GTC---TGTGTac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CGCGG--ACC-CTCA--AAG--GGT--GCGGAAAT-ATG-A---T-A-A---AGAGCTCGGCACTGCAGC--A-TTGTA---TTTGGCTACGTATTGTAAGTGTTT-GTC----GT-TA--------TTC-GTG-AATACA-TG-TAGTTCTAAGTGG-TTGTTTTTGT--G-GA--GTTTGTATAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGGGGG--TGGTGTTTGTGCGGT-TTACGATCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC-G-AA-TGTCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-GTCG--AAG--GGT--GCGGA--T-GTGTT---T-T-A-T-AGAGCTCAGCATTACG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tg-GAT----TGTGGGGGA--T--AGGTTTTAGAAT-ATCCGGTCGGGCTCG-GAGTCC-TCTGTA--TTGCA-CGTGC-T-G-----CTCT--T-ACTCT-C----A--A---GTCG--A---------GCGGA--C-GTG-T---T-C-CTT-AGATTGCAGCACTGTGG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgtgtagtTTGTCTCTGTC-TCTTTACCGCGA--ACA-CTCA--A----GATCAGCAGA--T-GTG-T---T-TCA-T-AGAGCACAGCATTGCtta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acgtgctactGGGGGG--G--TGATTTTGCGGT-TTCCGGTCGAGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC---TATTATCTC
gi|16                         :    TTTCCTATTCGT-GGTGTGACGTTC--CTATTG---GT-GGATTTCCAGTGATG-TGA-C-TTT
gi|2                          : gtgacTTC----TGT-GCTGTGACTTTT--C-GTTG---GTTGGATTTCCCGTGGTGATGAACGTTCC-TATTATGTGGA-TTTCCTGTT-TTT-GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GAACTGGCA-ATTCACCC--GTTT-GG-AGACTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AGGAGTA-AT---GTATTGTATT-GGTAAA----TC-A-AGG-GTTAAATCAATGA-ATTATTT---TTGTAA--------A----AT--T------ATTGCATTGATTG-TAAGACCACAAT----AGAGTTTGAAGGGCTGGTTTATTCGTAATTGGGACATATCCTCCCAAGAATGGGGGGGGAGTG-GATGA--TTTGGAGGGGTT--TTTTTTTGCGGT-TT-CGGTC-GGCTC--GTG-ACATCCG-AGCTCGCT-CGTGC-GCGATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGGAAACTGGTCG--AAG--GGT--GCGGA--T-GTG-T---A-T-A-T--GAGCTC-GCATCGTGGCAAA-TTGT----TTT-TCTG-GTA-------TGTTACGTCTTGTATGTAC-------TT--GTG-AA-ATATTGTTTCTTATAAGTGG-TT-TTCCT-T--GAGT--TTTGGTATATAGAGAAAC
gi|3                          :     TTCC----CGTAGGTGTGACTTTCGCT-ATTC---GT-GGATTTCCCGTGAT--TGC-T-TTTC-TGTT-TGTG-A-TTTTCCGTGCTTT-GTG-AC----TGTGACTTTCC-C-TA-C--GTG-AAT-GCCCATCTTT-GG-A--CTG-TAAAATTTGCTATGATT-ATT--AG-AG-A-AT---GTATTGTATTTG-TAAAAATCTC-ATAGGAGT--AATCAA-GA-TTTATT----T-GTAA--------AATAATTGCT------ATTG-----ATTG-GAAG-CCACAGT-CT------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-NNN----NNNGGGGGG--T--TG-TTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GT-TAC-TCCG-GG-TCGCACCGTGCTG-GATTATCTCT--C-TCTT--CCGCGG--ACT-GTCGCAAGG--GGT--GC-GA--TGGTG-T---TCT-A-T-AGAGCTCGGCACTGCGGC--ATTTGTAT--TTTGTCTGTAT-TT-----TGTTA-GTC---TGTGTATGGTAATTTT--GTG-AATATA-T--TTCTTATAAGTGGTTT-TTTCT-T--G-GTCGGGTTGTATATAGAGAGAac
gi|4                          :    TTTCC----CGT-GATGTGACTTTC--T-GTTG---GT-GGATTTCCTGAGCTG-TGA-C-TTTC-TGTT-TTTGGA-TTTCCCGTGTTTT-GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GA-C--GTG-AATTACCC--TTTTTGG-A--CTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-AT---GTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATGA-TTTATTC---T-GTAA--------A---------------ATTG-----ATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGGGG-G---GGT----TTTGGGGGG--T--TGTTTTCGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCT-CGTAC-G-GATTATCTCT--C-TATTC-CCGCGG--ACT-CTC---AAC--GGA--ACAGA--C-GTG-T---T-T-A-TCAGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTG-GTATT-----TGTTA-GTC---TGTGTA-------------TG-AATATA-TG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTTCC-T--G-GT--CTTGATATATAGAGAAACtc
gi|5                          :                                                                                                      ----TG--ACTTTTTGC-GA-C--GTG-AATTACCCC-TTTT-GG-A--CTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-ATAATGTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATCA-TATATTC---T-GTAA--------A----TT--TTATTGCATTG-----ATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-NNN---------GGGG--T--TGATTTTGTGGT-TTTCGGTTCGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC---GATTGTCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-ATCA--AAG--GGA--ACAGA--C-GTGTT---T-T-A-T-GGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTATA---GTTGTCTACATA-T-----TGTGA-GTCTT-TGTGT---------TT--GTT-AATACA-CG-TTATTATAAGTGG-TT-TTTCT-T--GAGT--GTTA-TACACA-AGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -GAT----TTTGGGGGG--T--TGATTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGTTCG-GTGTAC-TCTG-AGCTCGCA-CGTGC-G-AA-TATCTCT--C-TCTTC-CCTTGG--ACT-CTCA--AAG--GGT--ACAGA--T-GTGTT---T-T-A-C-AGAGCTCGGCACTGTGTT--A-CTGCATACTTTTTTTACGT-TT-----TGGAA-GTC---TTTGTAT-------TT--GTT-AATACA-CG-TTGTTATAAGTGG-TTGTCTTT-T--G-G---GTTTGTATATACATAAActaaac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ----TTTGGGGGG--T--TGATTTTGTGGT-TTTTGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-TGTGC---AATTGTCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-GTCG--AAG--GGT--GCGGA--T-GTGTT---T-T-A-T-AGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTG-GTATT-----TGTTA-GTC---TGTGTATGTAT---TT--GTG-AATATA-TG-TTCTTATAAGTAA-GT-TTTCT-T--G-GT--CTTTGTATATAGAGAAg
gi|8                          :                                              TTTCCTAATTTG-TGA-C-TTTCATGTT-CATGGAGTTTTCTGTCCCTGAGTG-ACCTGGTG--ACATTTTGT--A-T--GCGTAACTG--C--TTTT-GGAA--CAG-TT-AA-----TATG---------AG-AGTA-AA---AT----TATT-G-TAAA----TCAATAGG-G-TATATCAATCA--TTATTCATAT-GTAAGTTGTACCA----TC--T------AATG-----TTTGATATG--TACAGTGCTGGAGG
gi|9                          :                                              TTTCCTAATTTG-TGA-C-TTTCATGTT-CATGGAGTTTTCTGTCCCTGAGTG-ACCTGGTG--ACATTTTGT--A-T--GCGTAACTG--C--TTTT-GGAA--CAG-TT-AA-----TATG---------AG-AGTA-AA---AT----TATT-G-TAAA----TCAATAGG-G-TATATCAATCA--TTATTCATAT-GTAAGTTGTACCA----TC--T------AATG-----TTTGATATG--TACAGTGCTGGAGGc





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Reference ( family-7211 )     :    TTTCC----CGT-GGTGTGACTTTC--C-GTTG---GT-GGATTTCCCGNGNTG-TGA-C-TTTC-TGTT-CGTGGA-TTTCCCGTNCTTT-GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GA-C--GCG-AATTGCCC--TTTT-GG-A--CTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-AT---GTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATGA-TTTATTC---T-GTAA--------A----TT--T------ATTG-----ATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCGAAGNNCTGGTTTATTCGTAANTNGGGNACATCCCCCCNAGAATGGGGGGGG-GCG-GAT----TTTGGGGGG--T--TGNTTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC-G-GATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-GTCG--AAG--GGT--GCGGA--T-GTG-T---T-T-A-T-AGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTGCGTATT-----TGTTA-GTC---TG----TGTA-------TTT-GTG-AATATA-TG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTTCT-T--G-GT--GTTNGTATATAGAGAAAC
gi|1                          :      TCC----TGT-C-TGTGACTTTT--C-GTTGCGTGT-GGATTTCCCGTGGTG-TGA-CGTTCC-TATT-TGTGGA-TTTCCTGTGTTTT-GTGGAC----TG--ACTTTTCGCCGA-C--GTG-AATTACCG--TTTT-GG-AGACTGATTCAATTTGCTATGATTTATTTAGG-AGTAGAT---GTATTGTATT-GGTAAA----TC-ATAGG-GT-AAATCAATGAATTTATTT---TTGTAA--------A----AT--T------ATTGCATTGATTG-TAAG-CCACA-TGTTGAAGG------GCTCTGGTTTATTCGTAAATTGGGAACATTCCTCTCAAAATGGGGGGGGTACGTGATGTGATTTGGGGGT--T--TTTTTTTGCGGT-TTC-GGTCGGGCTCGTGTGTAC-ATCG-AGCTCGCT-CGTGC-G-GATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGGAAACTGGTCG--AAGC-GGT--GCGGA--T-GTG-T---A-T-A-T--GAGCTC-GCATCG-GGA--A-TTG-----TTTG-CTG-GTA-T-----TGTTACGTCTTGTA----TGTA-------CTTGGTGAAATATA-TG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTCCT-TTGA-GT--GTTGGTATATAGAGAAAC
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGGGGG--TGGTGTTTGTGCGGT-TTACGATCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC-G-AA-TGTCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-GTCG--AAG--GGT--GCGGA--T-GTGTT---T-T-A-T-AGAGCTCAGCATTACG
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgtgtagtTTGTCTCTGTC-TCTTTACCGCGA--ACA-CTCA--A----GATCAGCAGA--T-GTG-T---T-TCA-T-AGAGCACAGCATTGCtta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acgtgctactGGGGGG--G--TGATTTTGCGGT-TTCCGGTCGAGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC---TATTATCTC
gi|16                         :    TTTCCTATTCGT-GGTGTGACGTTC--CTATTG---GT-GGATTTCCAGTGATG-TGA-C-TTT
gi|2                          : gtgacTTC----TGT-GCTGTGACTTTT--C-GTTG---GTTGGATTTCCCGTGGTGATGAACGTTCC-TATTATGTGGA-TTTCCTGTT-TTT-GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GAACTGGCA-ATTCACCC--GTTT-GG-AGACTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AGGAGTA-AT---GTATTGTATT-GGTAAA----TC-A-AGG-GTTAAATCAATGA-ATTATTT---TTGTAA--------A----AT--T------ATTGCATTGATTG-TAAGACCACAAT----AGAGTTTGAAGGGCTGGTTTATTCGTAATTGGGACATATCCTCCCAAGAATGGGGGGGGAGTG-GATGA--TTTGGAGGGGTT--TTTTTTTGCGGT-TT-CGGTC-GGCTC--GTG-ACATCCG-AGCTCGCT-CGTGC-GCGATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGGAAACTGGTCG--AAG--GGT--GCGGA--T-GTG-T---A-T-A-T--GAGCTC-GCATCGTGGCAAA-TTGT----TTT-TCTG-GTA-------TGTTACGTCTTGTA----TGTA-------CTT-GTG-AA-ATATTGTTTCTTATAAGTGG-TT-TTCCT-T--GAGT--TTTGGTATATAGAGAAAC
gi|3                          :     TTCC----CGTAGGTGTGACTTTCGCT-ATTC---GT-GGATTTCCCGTGAT--TGC-T-TTTC-TGTT-TGTG-A-TTTTCCGTGCTTT-GTG-AC----TGTGACTTTCC-C-TA-C--GTG-AAT-GCCCATCTTT-GG-A--CTG-TAAAATTTGCTATGATT-ATT--AG-AG-A-AT---GTATTGTATTTG-TAAAAATCTC-ATAGGAGT--AATCAA-GA-TTTATT----T-GTAA--------AATAATTGCT------ATTG-----ATTG-GAAG-CCACAGT-CT------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-NNN----NNNGGGGGG--T--TG-TTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GT-TAC-TCCG-GG-TCGCACCGTGCTG-GATTATCTCT--C-TCTT--CCGCGG--ACT-GTCGCAAGG--GGT--GC-GA--TGGTG-T---TCT-A-T-AGAGCTCGGCACTGCGGC--ATTTGTAT--TTTGTCTGTAT-TT-----TGTTA-GTC---TG----TGTATGGTAATTTT-GTG-AATATA-T--TTCTTATAAGTGGTTT-TTTCT-T--G-GTCGGGTTGTATATAGAGAGAac
gi|4                          :    TTTCC----CGT-GATGTGACTTTC--T-GTTG---GT-GGATTTCCTGAGCTG-TGA-C-TTTC-TGTT-TTTGGA-TTTCCCGTGTTTT-GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GA-C--GTG-AATTACCC--TTTTTGG-A--CTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-AT---GTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATGA-TTTATTC---T-GTAA--------A---------------ATTG-----ATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGGGG-G---GGT----TTTGGGGGG--T--TGTTTTCGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCT-CGTAC-G-GATTATCTCT--C-TATTC-CCGCGG--ACT-CTC---AAC--GGA--ACAGA--C-GTG-T---T-T-A-TCAGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTG-GTATT-----TGTTA-GTC---TG----TGTA------------TG-AATATA-TG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTTCC-T--G-GT--CTTGATATATAGAGAAACtc
gi|5                          :                                                                                                      ----TG--ACTTTTTGC-GA-C--GTG-AATTACCCC-TTTT-GG-A--CTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-ATAATGTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATCA-TATATTC---T-GTAA--------A----TT--TTATTGCATTG-----ATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-NNN---------GGGG--T--TGATTTTGTGGT-TTTCGGTTCGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC---GATTGTCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-ATCA--AAG--GGA--ACAGA--C-GTGTT---T-T-A-T-GGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTATA---GTTGTCTACATA-T-----TGTGA-GTC---TT----TGTG-------TTT-GTT-AATACA-CG-TTATTATAAGTGG-TT-TTTCT-T--GAGT--GTTA-TACACA-AGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -GAT----TTTGGGGGG--T--TGATTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGTTCG-GTGTAC-TCTG-AGCTCGCA-CGTGC-G-AA-TATCTCT--C-TCTTC-CCTTGG--ACT-CTCA--AAG--GGT--ACAGA--T-GTGTT---T-T-A-C-AGAGCTCGGCACTGTGTT--A-CTGCATACTTTTTTTACGT-TT-----TGGAA-GTC---TT----TGTA-------TTT-GTT-AATACA-CG-TTGTTATAAGTGG-TTGTCTTT-T--G-G---GTTTGTATATACATAAActaaac
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Reference ( family-7211 )     :    TTTCC----CGT-GGTGTGACTTTC--C-GTTG---GT-GGATTTCCCGNGNTG-TGA-C-TTTC-TGTT-CGTGGA-TTTCCCGTNCTTT-GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GA-C--GCG-AATTGCCC--TTTT-GG-A--CTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-AT---GTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATGA-TTTATTC---T-GTAA--------A----TT--T------ATTG-----ATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCGAAGNNCTGGTTTATTCGTAANTNGGGNACATCCCCCCNAGAATGGGGGGGG-GCG-GAT----TTTGGGGGG--T--TGNTTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC-G-GATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-GTCG--AAG--GGT--GCGGA--T-GTG-T---T-T-A-T-AGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTGCGTATT-----TGTTA-GTC---TG----TGTA-------TTT-GTG-AATATA-TG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTTCT-T--G-GT--GTTNGTATATAGAGAAAC
gi|1                          :      TCC----TGT-C-TGTGACTTTT--C-GTTGCGTGT-GGATTTCCCGTGGTG-TGA-CGTTCC-TATT-TGTGGA-TTTCCTGTGTTTT-GTGGAC----TG--ACTTTTCGCCGA-C--GTG-AATTACCG--TTTT-GG-AGACTGATTCAATTTGCTATGATTTATTTAGG-AGTAGAT---GTATTGTATT-GGTAAA----TC-ATAGG-GT-AAATCAATGAATTTATTT---TTGTAA--------A----AT--T------ATTGCATTGATTG-TAAG-CCACA-TGTTGAAGG------GCTCTGGTTTATTCGTAAATTGGGAACATTCCTCTCAAAATGGGGGGGGTACGTGATGTGATTTGGGGGT--T--TTTTTTTGCGGT-TTC-GGTCGGGCTCGTGTGTAC-ATCG-AGCTCGCT-CGTGC-G-GATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGGAAACTGGTCG--AAGC-GGT--GCGGA--T-GTG-T---A-T-A-T--GAGCTC-GCATCG-GGA--A-TTG-----TTTG-CTG-GTA-T-----TGTTACGTCTTGTA----TGTA-------CTTGGTGAAATATA-TG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTCCT-TTGA-GT--GTTGGTATATAGAGAAAC
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CGCGG--ACC-CTCA--AAG--GGT--GCGGAAAT-ATG-A---T-A-A---AGAGCTCGGCACTGCAGC--A-TTGTA---TTTGGCTACGTATTGTAAGTGTTT-GTC----G----T-TA-------TTC-GTG-AATACA-TG-TAGTTCTAAGTGG-TTGTTTTTGT--G-GA--GTTTGTATAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGGGGG--TGGTGTTTGTGCGGT-TTACGATCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC-G-AA-TGTCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-GTCG--AAG--GGT--GCGGA--T-GTGTT---T-T-A-T-AGAGCTCAGCATTACG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tg-GAT----TGTGGGGGA--T--AGGTTTTAGAAT-ATCCGGTCGGGCTCG-GAGTCC-TCTGTA--TTGCA-CGTGC-T-G-----CTCT--T-ACTCT-C----A--A---GTCG--A---------GCGGA--C-GTG-T---T-C-CTT-AGATTGCAGCACTGTGG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgtgtagtTTGTCTCTGTC-TCTTTACCGCGA--ACA-CTCA--A----GATCAGCAGA--T-GTG-T---T-TCA-T-AGAGCACAGCATTGCtta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acgtgctactGGGGGG--G--TGATTTTGCGGT-TTCCGGTCGAGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC---TATTATCTC
gi|16                         :    TTTCCTATTCGT-GGTGTGACGTTC--CTATTG---GT-GGATTTCCAGTGATG-TGA-C-TTT
gi|2                          : gtgacTTC----TGT-GCTGTGACTTTT--C-GTTG---GTTGGATTTCCCGTGGTGATGAACGTTCC-TATTATGTGGA-TTTCCTGTT-TTT-GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GAACTGGCA-ATTCACCC--GTTT-GG-AGACTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AGGAGTA-AT---GTATTGTATT-GGTAAA----TC-A-AGG-GTTAAATCAATGA-ATTATTT---TTGTAA--------A----AT--T------ATTGCATTGATTG-TAAGACCACAAT----AGAGTTTGAAGGGCTGGTTTATTCGTAATTGGGACATATCCTCCCAAGAATGGGGGGGGAGTG-GATGA--TTTGGAGGGGTT--TTTTTTTGCGGT-TT-CGGTC-GGCTC--GTG-ACATCCG-AGCTCGCT-CGTGC-GCGATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGGAAACTGGTCG--AAG--GGT--GCGGA--T-GTG-T---A-T-A-T--GAGCTC-GCATCGTGGCAAA-TTGT----TTT-TCTG-GTA-------TGTTACGTCTTGTA----TGTA-------CTT-GTG-AA-ATATTGTTTCTTATAAGTGG-TT-TTCCT-T--GAGT--TTTGGTATATAGAGAAAC
gi|3                          :     TTCC----CGTAGGTGTGACTTTCGCT-ATTC---GT-GGATTTCCCGTGAT--TGC-T-TTTC-TGTT-TGTG-A-TTTTCCGTGCTTT-GTG-AC----TGTGACTTTCC-C-TA-C--GTG-AAT-GCCCATCTTT-GG-A--CTG-TAAAATTTGCTATGATT-ATT--AG-AG-A-AT---GTATTGTATTTG-TAAAAATCTC-ATAGGAGT--AATCAA-GA-TTTATT----T-GTAA--------AATAATTGCT------ATTG-----ATTG-GAAG-CCACAGT-CT------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-NNN----NNNGGGGGG--T--TG-TTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GT-TAC-TCCG-GG-TCGCACCGTGCTG-GATTATCTCT--C-TCTT--CCGCGG--ACT-GTCGCAAGG--GGT--GC-GA--TGGTG-T---TCT-A-T-AGAGCTCGGCACTGCGGC--ATTTGTAT--TTTGTCTGTAT-TT-----TGTTA-GTC---TG----TGTATGGTAATTTT-GTG-AATATA-T--TTCTTATAAGTGGTTT-TTTCT-T--G-GTCGGGTTGTATATAGAGAGAac
gi|4                          :    TTTCC----CGT-GATGTGACTTTC--T-GTTG---GT-GGATTTCCTGAGCTG-TGA-C-TTTC-TGTT-TTTGGA-TTTCCCGTGTTTT-GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GA-C--GTG-AATTACCC--TTTTTGG-A--CTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-AT---GTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATGA-TTTATTC---T-GTAA--------A---------------ATTG-----ATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGGGG-G---GGT----TTTGGGGGG--T--TGTTTTCGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCT-CGTAC-G-GATTATCTCT--C-TATTC-CCGCGG--ACT-CTC---AAC--GGA--ACAGA--C-GTG-T---T-T-A-TCAGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTG-GTATT-----TGTTA-GTC---TG----TGTA------------TG-AATATA-TG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTTCC-T--G-GT--CTTGATATATAGAGAAACtc
gi|5                          :                                                                                                      ----TG--ACTTTTTGC-GA-C--GTG-AATTACCCC-TTTT-GG-A--CTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-ATAATGTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATCA-TATATTC---T-GTAA--------A----TT--TTATTGCATTG-----ATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN-NNN---------GGGG--T--TGATTTTGTGGT-TTTCGGTTCGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC---GATTGTCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-ATCA--AAG--GGA--ACAGA--C-GTGTT---T-T-A-T-GGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTATA---GTTGTCTACATA-T-----TGTGA-GTC---TT----TGTG-------TTT-GTT-AATACA-CG-TTATTATAAGTGG-TT-TTTCT-T--GAGT--GTTA-TACACA-AGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -GAT----TTTGGGGGG--T--TGATTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGTTCG-GTGTAC-TCTG-AGCTCGCA-CGTGC-G-AA-TATCTCT--C-TCTTC-CCTTGG--ACT-CTCA--AAG--GGT--ACAGA--T-GTGTT---T-T-A-C-AGAGCTCGGCACTGTGTT--A-CTGCATACTTTTTTTACGT-TT-----TGGAA-GTC---TT----TGTA-------TTT-GTT-AATACA-CG-TTGTTATAAGTGG-TTGTCTTT-T--G-G---GTTTGTATATACATAAActaaac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ----TTTGGGGGG--T--TGATTTTGTGGT-TTTTGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-TGTGC---AATTGTCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-GTCG--AAG--GGT--GCGGA--T-GTGTT---T-T-A-T-AGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTG-GTATT-----TGTTA-GTC---TGTGTATGTA-------TTT-GTG-AATATA-TG-TTCTTATAAGTAA-GT-TTTCT-T--G-GT--CTTTGTATATAGAGAAg
gi|8                          :                                              TTTCCTAATTTG-TGA-C-TTTCATGTT-CATGGAGTTTTCTGTCCCTGAGTG-ACCTGGTG--ACATTTTGT--A-T--GCGTAACTG--C--TTTT-GGAA--CAG-TT-AA-----TATG---------AG-AGTA-AA---AT----TATT-G-TAAA----TCAATAGG-G-TATATCAATCA--TTATTCATAT-GTAAGTTGTACCA----TC--T------AATG-----TTTGATATG--TACAGTGCTGGAGG
gi|9                          :                                              TTTCCTAATTTG-TGA-C-TTTCATGTT-CATGGAGTTTTCTGTCCCTGAGTG-ACCTGGTG--ACATTTTGT--A-T--GCGTAACTG--C--TTTT-GGAA--CAG-TT-AA-----TATG---------AG-AGTA-AA---AT----TATT-G-TAAA----TCAATAGG-G-TATATCAATCA--TTATTCATAT-GTAAGTTGTACCA----TC--T------AATG-----TTTGATATG--TACAGTGCTGGAGGc


blockSeqs                     :         TATT   AGG          GCT     .    T          T A  A   A G    A    AT     G        GC   A   .  CTGG  TG         G  ACTG   T     C  AT    T  AGA    .  C  T        ATTT   .   G    .  AAT  A       T G    AATC  A     A TT          A      CATAT     GTTGTACCATCT                CATTG    A    AC      G       TTTGAA GG               T G   C          A             AGTG    GA           GT GG  T         A               .      A    T        C     GC   T       GT T     A      AA   G    CA   TT   CA     AA G   T GTG C C T CA      G         CAA T     TAC       AC  ATTGTAAG     C   TGTGTA       TGGTAATT  .   .      T  T             T  G     G .  A TCG   T
blockSeqs                     :         .      GG           CT      .    .          T G  .   . .    A    T      G        GT   A   .  CTGG  .          T  C      T     C  C     .  AA     .  A  T        ATTT   .   .    .  .    A       . .    .     A     . TT          T      CATAT     GTTGTACCATCT                .        A    C       G       TCCNNN NN               N N   N          N             NNN     .            .  .   T         .               .      .    .        .     TG   T       .  .     .      .    .    .    .    .      .  .   T .   . . . A       A         C   .     T         GT  ATT          .   TTGTA        T         .   .      .  .             .  G     . .  A A     G
blockSeqs                     :         .      GC           C       .    .          T A  .   . .    .    T      .        CC   .   .  .     .          G  C      .     C  .     .  AA     .  C  T        ATTT   .   .    .  .    A       . .    .     .     . TT          T      TTT       AATAATTGCT                  .        .    C       G       TCCNNN NN               N N   N          N             NNN     .            .  .   G         .               .      .    .        .     G    T       .  .     .      .    .    .    .    .      .  .   T .   . . . A       A         C   .     .         AC  ATT          .   TG           C         .   .      .  .             .  .     . .  . T     T
blockSeqs                     :         .      GA           T       .    .          A C  .   . .    .    C      .        CC   .   .  .     .          G  C      .     C  .     .  A      .  C  T        ATT    .   .    .  .    A       . .    .     .     . T           T      CT        ATTTTATTGC                  .        .    C       G       TNNNN  NN               N N   N          N             G       .            .  .   A         .               .      .    .        .     G    T       .  .     .      .    .    .    .    .      .  .   T .   . . . A       A         C   .     .         AC  ATT          .   TG           T         .   .      .  .             .  .     . .  . T     G
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Reference ( family-7211 )     :    TTTCC----CGT-GNTGTGACTTTC--C-GTTG---GT-GGATTTCCCGNGNTG-TGA-C-TTTC-TGTT-CGTGGA-TTTCCCGTNCTTT-GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GA-C--GCG-AATTGCCC--TTTTGGA-ACTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-AT---GTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATGA-TTTATTC-T-TGTAAATT-TA--AT--C-TATTGATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCGAAGNNCTGGTTTATTCGTAANTNGGGNACATCCCCCCNAGAATGGGGGGGG-AG-G-GAT----TTTGGGGGG--T--TGNTTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC-G-GATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-GTCG--AAG--GGT--GCGGA--T-GTG-T---T-T-A-T-AGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTG-GTA-T-T-----TGTTA-GTC---TG----TGTA-------TTT-GTG-AATATA-TG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTTCT-T--G-GT--GTTNGTATATAGAGAAAC
gi|1                          :      TCC----TGT--CTGTGACTTTT--C-GTTGCGTGT-GGATTTCCCGTGGTG-TGA-CGTTCC-TATT-TGTGGA-TTTCCTGTGTTTT-GTGGAC----TG--ACTTTTCGCCGA-C--GTG-AATTACCG--TTTTGGAGACTGATTCAATTTGCTATGATTTATTTAGG-AGTAGAT---GTATTGTATT-GGTAAA----TC-ATAGG-GT-AAATCAATGAATTTATTT-T-TGTAAAAT-TA--TT--G-CATTGATTG-TAAG-CCACA-TGTTGAAGG------GCTCTGGTTTATTCGTAAATTGGGAACATTCCTCTCAAAATGGGGGGGGTAC-GTGATGTGATTTGGGGGT--T--TTTTTTTGCGGT-TTC-GGTCGGGCTCGTGTGTAC-ATCG-AGCTCGCT-CGTGC-G-GATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGGAAACTGGTCG--AAGC-GGT--GCGGA--T-GTG-T---A-T-A-T--GAGCTC-GCATCG-GGA--A-TTG-----TTTG-CTG-GTA---T-----TGTTACGTCTTGTA----TGTA-------CTTGGTGAAATATA-TG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTCCT-TTGA-GT--GTTGGTATATAGAGAAAC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ----TTTTAGGGG--T--TGTT----CGGTATTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-GGCTCGCA-CGTGC-G-GATTATCTCT--CTTCTTC-CCGCAG--ACT-GTCG--AAATTGTT--GCGCA--T-GTG-TGTGT-T-A-T-AGAGCTC-GCACTGCGG---A-TTGTA---TTTGTCT--GTA-T-T-----TG-TA-GTC---TG----TGTac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CGCGG--ACC-CTCA--AAG--GGT--GCGGAAAT-ATG-A---T-A-A---AGAGCTCGGCACTGCAGC--A-TTGTA---TTTGGCTACGTA-T-TGTAAGTGTTT-GTC----G----T-TA-------TTC-GTG-AATACA-TG-TAGTTCTAAGTGG-TTGTTTTTGT--G-GA--GTTTGTATAT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgtgtTTGTCTCTGTC-TCTTTACCGCGA--ACA-CTCA--A----GATCAGCAGA--T-GTG-T---T-TCA-T-AGAGCACAGCATTGCtta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acgtgctactGGGGGG--G--TGATTTTGCGGT-TTCCGGTCGAGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC---TATTATCTC
gi|16                         :    TTTCCTATTCGT-GGTGTGACGTTC--CTATTG---GT-GGATTTCCAGTGATG-TGA-C-TTT
gi|2                          : gtgacTTC----TGT-GCTGTGACTTTT--C-GTTG---GTTGGATTTCCCGTGGTGATGAACGTTCC-TATTATGTGGA-TTTCCTGTT-TTT-GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GAACTGGCA-ATTCACCC--GTTTGGAGACTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AGGAGTA-AT---GTATTGTATTGG-TAAA----TC-A-AGG-GTTAAATCAATGA-ATTATTT-T-TGTAAAAT-TA--TT--G-CATTGATTG-TAAGACCACAAT----AGAGTTTGAAGGGCTGGTTTATTCGTAATTGGGACATATCCTCCCAAGAATGGGGGGGG-AGTG-GATGA--TTTGGAGGGGTT--TTTTTTTGCGGT-TT-CGGTC-GGCTC--GTG-ACATCCG-AGCTCGCT-CGTGC-GCGATTATCTCT--C-TCTTC-CCGCGGAAACTGGTCG--AAG--GGT--GCGGA--T-GTG-T---A-T-A-T--GAGCTC-GCATCGTGGCAAA-TTGT----TTT-TCTG-GTA---------TGTTACGTCTTGTA----TGTA-------CTT-GTG-AA-ATATTGTTTCTTATAAGTGG-TT-TTCCT-T--GAGT--TTTGGTATATAGAGAAAC
gi|3                          :     TTCC----CGTAGGTGTGACTTTCGCT-ATTC---GT-GGATTTCCCGTGAT--TGC-T-TTTC-TGTT-TGTG-A-TTTTCCGTGCTTT-GTG-AC----TGTGACTTTCC-C-TA-C--GTG-AAT-GCCCATCTTTGGA--CTG-TAAAATTTGCTATGATT-ATT--AG-AG-A-AT---GTATTGTATTTG-TAAAAATCTC-ATAGGAGT--AATCAA-GA-TTTATT----TGTAAAAT--A--ATTGC-TATTGATTG-GAAG-CCACAGT-CT------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NN-N-NNN----NNNGGGGGG--T--TG-TTTTGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GT-TAC-TCCG-GG-TCGCACCGTGCTG-GATTATCTCT--C-TCTT--CCGCGG--ACT-GTCGCAAGG--GGT--GC-GA--TGGTG-T---TCT-A-T-AGAGCTCGGCACTGCGGC--ATTTGTAT--TTTGTCT--GTATT-T-----TGTTA-GTC---TG----TGTATGGTAATTTT-GTG-AATATA-T--TTCTTATAAGTGGTTT-TTTCT-T--G-GTCGGGTTGTATATAGAGAGAac
gi|4                          :    TTTCC----CGT-GATGTGACTTTC--T-GTTG---GT-GGATTTCCTGAGCTG-TGA-C-TTTC-TGTT-TTTGGA-TTTCCCGTGTTTT-GTG-AC----TG--ACTTTTCGC-GA-C--GTG-AATTACCC--TTTTTGG-ACTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-AT---GTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATGA-TTTATTC---TGTAAA--------------ATTGATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGGG---G-G-GGT----TTTGGGGGG--T--TGTTTTCGCGGT-TTCCGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCT-CGTAC-G-GATTATCTCT--C-TATTC-CCGCGG--ACT-CTC---AAC--GGA--ACAGA--C-GTG-T---T-T-A-TCAGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTG-GTA-T-T-----TGTTA-GTC---TG----TGTA------------TG-AATATA-TG-TTCTTATAAGTGG-TT-TTTCC-T--G-GT--CTTGATATATAGAGAAACtc
gi|5                          :                                                                                                      ----TG--ACTTTTTGC-GA-C--GTG-AATTACCC--CTTTTGG-ACTG-TTCAATTTGCTATGATTTATT--AG-AGTA-ATAATGTATTGTATT-G-TAAA----TC-ATAGG-GTTAAATCAATCA-TATATTC-T--GTAAATT-TT--AT--TGCATTGATTG-TAAG-CCACAGTGCTGAAGGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NN-N-NNN---------GGGG--T--TGATTTTGTGGT-TTTCGGTTCGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-CGTGC---GATTGTCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-ATCA--AAG--GGA--ACAGA--C-GTGTT---T-T-A-T-GGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTATA---GTTGTCT--ACA-TAT-----TGTGA-GTC---TT----TGTG-------TTT-GTT-AATACA-CG-TTATTATAAGTGG-TT-TTTCT-T--GAGT--GTTA-TACACA-AGA
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ----TTTGGGGGG--T--TGATTTTGTGGT-TTTTGGTCGGGCTCG-GTGTAC-TCCG-AGCTCGCA-TGTGC-A--ATTGTCTCT--C-TCTTC-CCGCGG--ACT-GTCG--AAG--GGT--GCGGA--T-GTG-T---T-TTA-T-AGAGCTCGGCACTGCGGC--A-TTGTA---TTTGTCTG-GTA-T-T-----TGTTA-GTC---TGTGTATGTA-------TTT-GTG-AATATA-TG-TTCTTATAAGTAA-GT-TTTCT-T--G-GT--CTTTGTATATAGAGAAg
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