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gi|4                          :                                                                                                                                              ctatatgatgcgtattcttgtgtcatgattcatatttttcacacggtataatttaacgtaaaaccaatgatgctgtagtttaaaaactatcagttattatgttttgtcgacttgaggttattaccaggctggccatatcgacacag-TTTTTCCCTCT--T-TGTGCG---GT----TACCAGACTTGTAACACTAN--NNNNNNNNNNN--NNNN-NNNNNN-NN-NN-NN-NN-NNNN--------NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-NNN--NN--NN--NNN-NNNNNNNNN---N----N----T------------------------------------G-CT---TAAAA-TCAATGAT-C-T-GTTGTG----AAAA--CTA-TCAAGTCCg
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A--C----------TT--A-CA---TAACA-CCAATGAT-C-T-GTAGTT----TAAA--CTA-TCAAGTTCATTATTGTTTTGTCGG-ATTT-AGGTTATTACCAGGCTGG-C-CATTAT-C-ACACGT---GAAT-----T-T--TTTCCCTCTT-TG-TGC----G--G-TTACCA-GACT-TGTAA--CACTANNNNN----NNN--NN-NNNNNNN---NNNNNNN-NNN--NNNNNNNNN-N-NNN-NNNNNNN-NNNNN------NNNN--NNNNNNNNN-N--NN-N---NNN-N-NN-NN------NN-NNN---TGCTTAAAATCAATGAT-C-----T-GTTG-TG----AAAACTATCAAG--TCCg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                         gttaaatttccttcaaccaactacgcaatatttcttgtcattttatttgtgtgcatatcattgctaccgagctataacaagccaagaatctttggcgtatcacggtctggatagttggtttagatcgtctttgccgctacttttgcgggtaccagacttgtaacaccagggctgggccgggcgcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAT-C-T-GTTGTT----TAAA--CTA-TCAAGTTC-TTATTGTTTTATCAG-ACTCGTGGTTATTAACAGCCTGG-T-CATCAT-C-ACACGT---GAA--------C--TTATCCTTTT-TG-CGC----GAAT-TT-CCA-
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAGGCTGG-C-CATCAT-C-AGACGT---GAAC-----Ttgccacttcagtagtttggtcctcctccctgctcgggttctcctgctgctgctctacaaactcaagggcaaaacagagctagaatggatatggaagcaattaacttttgtcaatcggagggggccttgcattaagtaccctcaactcaccctaaaaccacctcatcgtaccatctgtttgagctc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              a---CGT--AAAACCAATGATGC-----T-GTAG-TTTA--AAAACTATCA-G--TT-ATTAT------GTTTT-GTCG-ACTT--GAGGTT-ATT--ACC--AGGCTGGCCAT-A-TC-GACACAG-GA-CTGTTTTCCCCC-TTTTGTGCGGtatcctt
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gttaaatttccttcaaccaactacgcaatatttcttgtcattttatttgtgtgcatatcattgctaccgagctataacaagccaagaatctttggcgtatcacggtctggatagttggtttagatcgtctttgccgctacttttgcgggtaccagacttgtaacaccagggctgggccgggcgcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttacataacaccaatgatAC--AGGCTGGCCATCA-TCAGACGT-G-AA-C---TTATCCttaccagacttgtaacactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcttaaaatcaatgatctgttgtgaaaactatcaagtcc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --TTATTT-ATTATA--TCTTGAATGGTGACGGGATTGGCTTT-Ttt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTTCA--T---GGATCGTAACGGGATTGGCTTT-TCAGCTTAATT--T-CGCTTCAA-T-TCC-CTTGCTG--GCCTA-CGGTG--t
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -CTC-T--ACTA--CTTTA-CG-CA--ACCAT-CGG-----AG-TTGCG-GT-ACTGCCGCT---GTCACCAAC----G-TTGCGTACTC--C-ATTGGTGGCGG-TT-GCAGTG--CCATTAGC----ATGGCC-CTTGC---A---AGTG-GC-GC----TATCGTCGCACCCCAACTCCAATG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cggcgACTGCAACC---GCCACCAAT----G---GAGTACGCAAC-GTTGGTGACAG-CG-GCAGTA--CCG-CAACTCCGATGG----TTGCGTAA---AGTA-GT-
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cggcgctctCC---GTCACCAAT----G-TTGGGCACTC--C-ATTGGTCGCGG-TT-GCAGCG--CCATCTAC----ATGGTC-TCTGC---A---AGTGNNN-NN----NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNTAATAAT--TTT---AAACCATTTTGCT-gccattagcatggcccttgcaagtggcgctatcgtcgcaccccaactccaatg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AATTG-TGAACTGCT-T--ATA-TCGTTAAT------A--TTAC--CAG---CTTGAG-----ATATA-GTG-A
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTG-TGAACTGCT-T--ATA-TCGTTAATTACTCCA--TT------G---CTTGAA-----ATATA-GTGCAGTATGTG--TCTTATTAT--TTTGC-ACT-TTGCGC--ATGGCC--AC-TA---TGTTGCA--ATTGAACATG-TTTATGTCC--TTGCC----ACAGCCGGACTTTTCGTA-TCTCAT-TTAGA
10 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): TTTTACTATGAGAGATATTCTATTTCGGATTTGTAAATTGATGGTTTGATGTTTTTGTGACGCTTGCACATTTGCGCCTTACCCATTGCACAATGAGTCTATTGTATGATCCACTCCGCAATCTTTTATTGTAAGTTTGTTGTTTTTTGTTAGACAGGCTCATTGCTACGGTAGCCTCCAAAAATTCACCTCGACGCAGTAACGTCATCAACAAAATAATAACATCAGAACTACTAGTATTATCTTGCCCTTATTTTCAGCGCAGGACAGGTCTGGGGATTATTT
Unaligned ( gi|9 ): TGATGATTTGAATTGATGATTTTGATGTTTTGTAACGATTTTGTGCATTTGTGCGCTACCCCATTGCCACAATAAGTCTATGATGAACCGTCACATATTGTGTGTTTGTGATTTTGTTGTTTGACGAGCAGCCCATTGGCTACGTATCCTCAAAAATTCACCACGGTCAGTAACCGCCACTTAACAAAATAATAAAAACATCGGAACTATTTACTTTCCTTATTCTTCAGACCATTGGA
Unaligned ( gi|10 ): TGCACCAATAAGCTCTTGATGGGCCGTCACTATTTTTGTTTGAATTTGTTGCGGAGGGCGCGCTTAGTGGCACTGGTAGCCTAAATTTTATTACATTCAACCGCCGCTCAGTAAGACAGCATTAAAGTATACCATTTTCCATCATAATCATTTAATCTTTGTTTTTGATGATCATGACATCT
Unaligned ( gi|13 ): GATTTGAATTGATGATTGGATGCTTCGCCTTTTTGTTTTTGACGCTTGTGCATTTGTGCCGATGCATTCTACCATGAGTCTATTGATGGGCCGTCACATATTCTTTG
Unaligned ( gi|15 ): TGTACGGTAGCCTCAAATTTCACCGCGGCCTTACTAGTAACGCCATCAACAAAATAAT
Unaligned ( gi|16 ): TAATAAACCATCGGAACTATTTTACCTTGTCCTGATTTATTCAGACAGTCTTGCAT
Unaligned ( gi|17 ): GTGGCAGCCCATTTGTACGGTAGCCTCAAATTTCACCGCGGCCAGTAACGCCA
Unaligned ( gi|19 ): AACTATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGATATCTTGGATAA
Unaligned ( gi|21 ): ATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGACATCTTGGAT
Unaligned ( gi|22 ): ACTATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGACATCTTG






Alignments
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TCATGGATCGTAACGGGATTGGCTTT-TCAGCTTAATT--TC--GCTTCAAT-TCCCTTG--CTG--GCCTA-CGGTG--
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attAATTG-TGAACTGCT-T--ATA-TCGTTAAT-A--TTAC--CA--G---CTTGAGA---TA---TAGTG-A
gi|2                          : TCAATTCG-TTCAA---ACTACG-CAATATT-CT-GTCATTTT-----AT---TT-G-GTG-CCATATCA--T--CTACCGAGCT---ATAAACCAAGC-A-G-AATCT-TTAGCATGATC-AAAGTCTG-GATAGTTTGGTTTTAGA--TCT-TCTTTGCCGCTACTATGTGCGAAGGG----TACCAGATTTGTAACAC--CAGGGCTGGGGCA---TGCG-CCCCCC-CCCTCGCC-TTCTTCA--------CTAT-ATGATGTGTAT-TTCACT--T-T-AAT--AC--TT--GTG-TCTTGATT-A----T----TT----------------TA--C----------CTA-CG---TAAAAGCCAATGAT-CGTGTAGTT----TAAA--CTA-TCAAG--T-CAT-ATTGTTTTGT-CGGG-ACT-TGAG-TTATTACCCAGCTG-GGTCATCATTC-A-CACGTGAAT-CCC---CC--CCCTCTT--TGGT--GCGGT----CCAAG-A-CTATG-GAAACACTAGG-CT----GGG--GC-ATGCCCC---CTCTCTT-TTC--ACAATATTA-T-GCG-AAT-CAC-TATTG-C-----AAT--ACTT-GTGT-AGAT-GA-TTCA-AATAATA------TC-TGG---CGCCAAATCA---------CT-GTTG-TTTTAAAAAAC-GTCAAG--TCCATTATT-----GTTTTCATCGGACTG--AAGGTTTATT--AAC--AGT-TGGCCATCA-TCAGACATG-AAACTTATCCAT-TTTTGCGCG-AATTTCC-ATG-CCACCTAAGTA-GTTTGGTTCCCCTTCCT--GCTC-GGTCCTCCTGGCGC--------TGCTCTACAAAC-GCAAGGGCAAAA--CAGCAGCTAGA-ATGGAATATGGAAGCAATT-ATTT--T-TTTTTTGTCAATC---GA-GGGTC------TGCATTAAGTACCCTCAACGTCGCCCGTAAAAAATCACCTCAATCTGTA-CATCC-T-GTGAGGTCG-TTTGTTACAAA-TTAGGGCGATTTGCTACC---TAAACAATGACCAGCGCTT----T--TTA-TC-ATTTTGATTCTTGGATGG-GAC-GGATT-GCTTT-TCAG-TTAATCTGCT--G-TACAATCCCCC--A--CTG--GTCTGCCGGTG--ACCAT-TGG-----AG-TTGCG-GTTACTGCCGCC---GTCACCAAT----GTTTGGCCACTCCGATTGGTGGCGG-TT-GCAGTG--CCATTAACATGGCC-CTTGCA---AGTG-GT-GCNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNN--NNC---AAACCATTTGGCT-TTGAA-TG-GGAACTGC--TTAATA-TCGTTGATCA--TTAA--CA--G---ATT-AGA---TA---TCGTG-AGTCTGTGTTTCTTATTAAATTATGC-ACT-TTGCGC--ATGAC---CACTA---T-TGGCA--ATTGAAGATG-TAAATGTT-CT-TG-CACAGGG-GACTTTTCGTA-TCTCAC-TTTGAGA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tt--TTATTT-ATTATA--TCTTGAATGGTGACGGGATTGGCTTT-T
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AC--AGGCTGGCCATCA-TCAGACGTG-AA-CTTATCCTT-t
gi|3                          : TCAATTCGTTTCAA---ACTACG-CAATATT-CTTGTCATTTT-----AT---TT-GTGTGGC-ATATCA--TTGCTACCGAGCT---ATAA--CAAGCCAAG-AATCT-TTGGCAT--TCTAAAGTCTG-GATAGTT-GGTTT-AGA--TCG-TCTTTGCCGCTACT-TGTGCG---GG----TACCAGATTTGTAACAC--CAGGGCTGGGGCGA--TGCG-CCCCCC-CC-TC-CC-TT-TTCA--------CTAT-ATGATGTGTGTATTCACTATTGT-AAT--AC--TT--GTG-TCTTGATTCA----T----TT----------------TA--C----------CTA-CG---TAAAA-CCAATGAT-C-TGTAGTT----TAAA--CTA-TCAAG--TTCATTATTGTTTTGT-CGG--ACT-TGAGGTTATTACCAGGCTG-G-TCATCAT-C-A-CACGTGAAT-TCCC--CC--CCCTCTT--TG-T--GCGTT--TACCA-G-A-CT-TG-TACAC--TAGGGCT----GGG--GC-ATGCCCC---CTCTCTT-TTC--ACAATATTA-T-GCG-AATTCAC-TATT-GC-----AAT--ACTTTGTGT-A----GA-TTCA-A-TA-TA------TC-TTG---CGCAAAATC-----A----CT-GTTG-TT----AAAACTGTCAAG--TCCATTATT-----GTTTT-ATCGGACTT--GAGGTT-ATT--AAC--AGTCTGGCCATCA-TCAGACATG-AA-CTTATCCAT-TTTTGCGCGGAATTTCC-ATG-CCACCTAAGTA-GTTTGGTCCTCCTTCCT--GCTCGGGTCCTCCTGGCGC--------TGCTCTACAAAC-GCAAGGGCAAAA--CAG-AGCTAGA-ATGG-ATATGGAAGCAATT-ATTTTTT-TTTTTTGTCAATCGGAGG-GGGTCT-----TGCATTAAGTACCCTCAAC-TCGCCC-T--AAAATCACCTC-ATCTGTACCATCC-G-GTGAGGTCG-TTTGTTACAAA-TTAGGG-GCTTTGCTAC----TAAACAATGACCAG-GCTT----T--TTATTTCATTTTA--TCTTGGATGGTGACGGGATTGGCTTT-TCAGCTTAATC--CT--GCTACAAT-CCCC--A--CTG--GTCTG-CGGTG--ACCAT-TGG-----AG-TTGCG-GTTACTGCCGCC---GTCACCAAT----G-TTGGGCACTCC-ATTGGTGGCGG-TT-GCAGTG--CCATTAACATGGCC-CTTGCA---AGTG-GT-GC----TTTCGTCGC-ACCCACCTCCAATGGAAGA--GTGCTACTAAT--TTC---AAACCATTTGGCT-TTGAATTG-TGAACTGCT-TTAATA-TCGTTGAT-A--TTAA--CA--G---ATTGAGA---TA---TCGTG-AGTCTGTG--TCTTATTAA--TATGC-ACT-TTGCGC--ATGA----CACTA---TGTGGCA--ATTGAAGATG-TAAATGTC-GT-TG-CA-A----GACTTTTCGTA-TCTCAC-TTTGAGA
gi|4                          :   AATTTCCTTCAACCAACTACG-CAATATTTCTTGTCATTTT-----AT---TT-GTGTG-C-ATATCA--TTGCTACCGAGCT---ATAA--CAAGCCAAG-AATCT-TTGGCGTA-TC-ACGGTCTG-GATAGTT-GGTTT-AGA--TCG-TCTTTGCCGCTACT-TTTGCG---GG----TACCAGACTTGTAACAC--CAGGGCTGGGCCGG---GCG-C
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gttaA--C----------TTA-CA---TAACA-CCAATGAT-C-TGTAGTT----TAAA--CTA-TCAAG--TTCATTATTGTTTTGT-CGG--ATT-T-AGGTTATTACCAGGCTG-G-CCATTAT-C-A-CACGTGAAT-T-TT--TT--CCCTCTT--TG-T--GCGGT--TACCA-G-A-CT-TGTAACAC--TANNNNN----NNN--NN-NNNNNNN---NNNNNNN-NNN--NNNNNNNNN-N-NNN-NNNNNNN-NNNNNNN-----NNN--NNNNNNNNN-N--N-NN-NNNN-N-NN-NN------NN-NTG---CTTAAAATCA----ATGATCT-GTTG-TG----AAAACTATCAAG--TCCatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttacataacaccaatgatctgtagtttaaactatcaagttcattattgttttgtcggatttaggttattaccaggctggccattatcacacgtgaattttttccctctttgtgcggttaccagacttgtaacactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcttaaaatcaatgatctgttgtgaaaactatcaagtcc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gttaaatttccttcaaccaactacgcaatatttcttgtcattttatttgtgtgcatatcattgctaccgagctataacaagccaagaatctttggcgtatcacggtctggatagttggtttagatcgtctttgccgctacttttgcgggtaccagacttgtaacaccagggctgggccgggcgcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTG-TGAACTGCT-T--ATA-TCGTTAATTA--CTC---CATTG---CTTGAAA---TA---TAGTGCAGTATGTG--TCTTATTAT--TTTGC-ACT-TTGCGC--ATGGC---CACTA---TGTTGCA--ATTGAACATG-TTTATGTC-CT-TGCCACAGCCGGACTTTTCGTA-TCTCAT-TTAGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                        --------CTAT-ATGATGCGT---------ATT---------C--TT--GTG-TCATGATTCA----TATTTTT----------------CA--CACGGTATAATTTAACG---TAAAA-CCAATGATGC-TGTAGTT----TAAAAACTA-TCA-G--TT-ATTAT-GTTTTGT-CG---ACT-TGAGGTTATTACCAGGCTG-G-CCAT-AT-CGA-CACAGGACTGTTTT--CC--CCCT-TT--TG-T--GCGGG--TACTA-G-A-CT-TG-TAAAC--TA-GGCT----GGG--GCGATCCCCC---CATTCCT-TTC--ACTATATGATT-GCG-TATTCAC-TATTGAC-----AAT--AC-TTGTGTCA--T-GATTTCAGA-TATTG------TCTTTG---CGTAAAACCA----AGAT-CTCGTGGTTT----AAAACTAT--AG--TTCATTATT-----GTTTT-ATCGGACTT--GAGGTagactcgatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattgttgtgacgtttttgtggatttgcgcctaccattgcacatgagtctcttttgatggaccgtcacctattttgttgtgattttgttcgttttgtgcgaggcagcccatttgtaccggtgagcctcaaaattcaccgcggccgtaacgccagtcaacaaaatatataaacatcgaaactatttaccttgtcctgatttattcagacatcttgat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ----CT-GTTG-TT----TAAACTATCAAG--TTC-TTATT-----GTTTT-ATCAGACTC--GTGGTT-ATT--AAC--AGCCTGGTCATCA-TCACACGTG-AA-CTTATCC-T-TTTTGCGCG-AATTTCC-ATG-CCACTTCAGTA-GTTTGGTCCTCCTCCCT--GCTCGGGTTCTCCTGCTGC--------TGCTCTACAAAC-TCAAGGGCAAAA--CAG-AGCTAGA-ATGG-ATATGGAAGCAATT-A-------ACTTTTGTCAATCGGAGG-GGGCCT-----TGCATTAAGTACCCTCAAC-TCACCC-T--AAAACCACCTC-ATC-GTACCATCT-GTTTGAGCTCg
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): TTTTACTATGAGAGATATTCTATTTCGGATTTGTAAATTGATGGTTTGATGTTTTTGTGACGCTTGCACATTTGCGCCTTACCCATTGCACAATGAGTCTATTGTATGATCCACTCCGCAATCTTTTATTGTAAGTTTGTTGTTTTTTGTTAGACAGGCTCATTGCTACGGTAGCCTCCAAAAATTCACCTCGACGCAGTAACGTCATCAACAAAATAATAACATCAGAACTACTAGTATTATCTTGCCCTTATTTTCAGCGCAGGACAGGTCTGGGGATTATTT
Unaligned ( gi|9 ): TGATGATTTGAATTGATGATTTTGATGTTTTGTAACGATTTTGTGCATTTGTGCGCTACCCCATTGCCACAATAAGTCTATGATGAACCGTCACATATTGTGTGTTTGTGATTTTGTTGTTTGACGAGCAGCCCATTGGCTACGTATCCTCAAAAATTCACCACGGTCAGTAACCGCCACTTAACAAAATAATAAAAACATCGGAACTATTTACTTTCCTTATTCTTCAGACCATTGGA
Unaligned ( gi|10 ): TGCACCAATAAGCTCTTGATGGGCCGTCACTATTTTTGTTTGAATTTGTTGCGGAGGGCGCGCTTAGTGGCACTGGTAGCCTAAATTTTATTACATTCAACCGCCGCTCAGTAAGACAGCATTAAAGTATACCATTTTCCATCATAATCATTTAATCTTTGTTTTTGATGATCATGACATCT
Unaligned ( gi|13 ): GATTTGAATTGATGATTGGATGCTTCGCCTTTTTGTTTTTGACGCTTGTGCATTTGTGCCGATGCATTCTACCATGAGTCTATTGATGGGCCGTCACATATTCTTTG
Unaligned ( gi|15 ): TGTACGGTAGCCTCAAATTTCACCGCGGCCTTACTAGTAACGCCATCAACAAAATAAT
Unaligned ( gi|16 ): TAATAAACCATCGGAACTATTTTACCTTGTCCTGATTTATTCAGACAGTCTTGCAT
Unaligned ( gi|17 ): GTGGCAGCCCATTTGTACGGTAGCCTCAAATTTCACCGCGGCCAGTAACGCCA
Unaligned ( gi|19 ): AACTATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGATATCTTGGATAA
Unaligned ( gi|21 ): ATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGACATCTTGGAT
Unaligned ( gi|22 ): ACTATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGACATCTTG






Alignments
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --TCATGGATCGTAACGGGATTGGCTTT-TCAGCTTAATTT-CGC--TTCAAT-TCCCTTG--CTG--GCCTA-CGGTG--
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 attAATTG-TGAACTGCT-T--ATA-TCGTTAAT-A--TTAC--CA--G---CTTGAGA---TA---TAGTG-A
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tt--TTA-TTT-ATTATA--TCTTGAATGGTGACGGGATTGGCTTT-T
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AC--AGGCTGGCCATCA-TCAGACGTG-AA-CTTATCCt
gi|3                          : TCAATTCGTTTCAA---ACTACG-CAATATT-CTTGTCATTTT-----AT---TT-GTGTGGC-ATATCA--TTGCTACCGAGCT---ATAA--CAAGCCAAGAATCT-TTGGCAT-TC-TAAAGTCTG-GATAGTT-GGTTT-AGA--TCG-TCTTTGCCGCTACT-TGTGCG---GG----TACCAGATTTGTAACAC--CAGGGCTGGGGCGA--TGCG-CCCCCC-CC-TC-CC-TT-TTCA--------CTAT-ATGATGTGTGTATTCACTATTGT-AAT--AC--TT--GTG-TCTTGATTCA----T----TT----------------TA--C----------CTA-CG---TAAAA-CCAATGAT-CTGTAGTT----TAAA--CTA-TCAAG--TTCATTATTGTTTTGT-CGG--ACT-TGAGGTTATTACCAGGCTG-G-TCATCAT-C-A-CACGTGAAT-TCCC--CC--CCCTCTT--TG-T--GCGTT--TACCA-G-A-CT-TGTAC-AC--TAGGGCT----GGG--GC-ATGCCCC---CTCTCTT-TTC--ACAATATTA-T-GCG-AATTCAC-TATTG-C-----AAT--ACTTTGTGT-A----GA-TTCA-A-TA-TA------TC-TTG---CGCAAAATCA---------CT-GTTG-TT----AAAACTGTCAAG--TCCATTATT-----GTTTT-ATCGGACTT--GAGGTT-ATT--AAC--AGTCTGGCCATCA-TCAGACATG-AA-CTTATCCAT-TTTTGCGCGGAATTTCC-ATG-CCACCTAAGTA-GTTTGGTCCTCCTTCCT--GCTCGGGTCCTCCTGGCGC--------TGCTCTACAAAC-GCAAGGGCAAAA--CAG-AGCTAGA-ATGG-ATATGGAAGCAATTATTTTTTTTTTTTGTCAATCGGAGG-GGGTCT-----TGCATTAAGTACCCTCAAC-TCGCCC-T--AAAATCACCTC-ATCTGTACCATCC-G-GTGAGGTCG-TTTGTTACAAA-TTAGGG-GCTTTGCTA--C-TAAACAATGACCAG-GCTT----T--TTATTTC-ATTTTA--TCTTGGATGGTGACGGGATTGGCTTT-TCAGCTTAATCC-TGC--TACAAT-CCCC--A--CTG--GTCTG-CGGTG--ACCAT-TGG-----AG-TTGCG-GTTACTGCCGCC---GTCACCAAT----G-TTGGGCACTCC-ATTGGTGGCGG-TT-GCAGTG--CCATTAACATGGCC-CTTGCA---AGTG-GT-GC----TTTCGTCGC-ACCCACCTCCAATGGAAGA--GTGCTACTAAT--TTC---AAACCATTTGGCT-TTGAATTG-TGAACTGCT-TTAATA-TCGTTGAT-A--TTAA--CA--G---ATTGAGA---TA---TCGTG-AGTCTGTG--TCTTATTAA--TATGC-ACT-TTGCGC--ATGA----CACTA---TGTGGCA--ATTGAAGATG-TAAATGTC-GT-TG---CA---AGACTTTTCGTA-TCTCAC-TTTGAGAtt
gi|4                          :   AATTTCCTTCAACCAACTACG-CAATATTTCTTGTCATTTT-----AT---TT-GTGTG-C-ATATCA--TTGCTACCGAGCT---ATAA--CAAGCCAAGAATCT-TTGGCGT-AT-CACGGTCTG-GATAGTT-GGTTT-AGA--TCG-TCTTTGCCGCTACT-TTTGCG---GG----TACCAGACTTGTAACAC--CAGGGCTGGGCCGG---GCG-C
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gttaA--C----------TTA-CA---TAACA-CCAATGAT-CTGTAGTT----TAAA--CTA-TCAAG--TTCATTATTGTTTTGT-C-GG-ATT-T-AGGTTATTACCAGGCTG-G-CCATTAT-C-A-CACGTGAAT-T-TT--TT--CCCTCTT--TG-T--GCGGT--TACCA-G-A-CT-TGTAACAC--TANNNNN----NNN--NN-NNNNNNN---NNNNNNN-NNN--NNNNNNNNN-N-NNN-NNNNNNN-NNNNNNN-----NNN--NNNNNNNNN-N--N-NN-NNNN-N-NN-NN------NN-NTG---CTTAAAATCA----ATGATCT-GTTG-TG----AAAACTATCAAG--TCCatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttacataacaccaatgatctgtagtttaaactatcaagttcattattgttttgtcggatttaggttattaccaggctggccattatcacacgtgaattttttccctctttgtgcggttaccagacttgtaacactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcttaaaatcaatgatctgttgtgaaaactatcaagtcc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gttaaatttccttcaaccaactacgcaatatttcttgtcattttatttgtgtgcatatcattgctaccgagctataacaagccaagaatctttggcgtatcacggtctggatagttggtttagatcgtctttgccgctacttttgcgggtaccagacttgtaacaccagggctgggccgggcgcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTG-TGAACTGCT-T--ATA-TCGTTAATTA--CTC---CATTG---CTTGAAA---TA---TAGTGCAGTATGTG--TCTTATTAT--TTTGC-ACT-TTGCGC--ATGGC---CACTA---TGTTGCA--ATTGAACATG-TTTATGTC-CT-TGCCACAGCCGGACTTTTCGTA-TCTCAT-TTAGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                       --------CTAT-ATGATGCGT---------ATT---------C--TT--GTG-TCATGATTCA----TATTTTT----------------CA--CACGGTATAATTTAACG---TAAAA-CCAATGATGCTGTAGTT----TAAAAACTA-TCA-G--TT-ATTAT-GTTTTGT-CG---ACT-TGAGGTTATTACCAGGCTG-G-CCAT-AT-CGA-CACAGGACTGTTTT--CC--CCCT-TT--TG-T--GCGGG--TACTA-G-A-CT-TGTAA-AC--TA-GGCT----GGG--GCGATCCCCC---CATTCCT-TTC--ACTATATGATT-GCG-TATTCAC-TATTGAC-----AAT--AC-TTGTGTCA--T-GATTTCAGA-TATTG------TCTTTG---CGTAAAACCA----AGAT-CTCGTGGTTT----AAAACTAT--AG--TTCATTATT-----GTTTT-ATCGGACTT--GAGGTagactcgatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattgttgtgacgtttttgtggatttgcgcctaccattgcacatgagtctcttttgatggaccgtcacctattttgttgtgattttgttcgttttgtgcgaggcagcccatttgtaccggtgagcctcaaaattcaccgcggccgtaacgccagtcaacaaaatatataaacatcgaaactatttaccttgtcctgatttattcagacatcttgat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ----CT-GTTG-TT----TAAACTATCAAG--TTC-TTATT-----GTTTT-ATCAGACTC--GTGGTT-ATT--AAC--AGCCTGGTCATCA-TCACACGTG-AA-CTTATCC-T-TTTTGCGCG-AATTTCC-ATG-CCACTTCAGTA-GTTTGGTCCTCCTCCCT--GCTCGGGTTCTCCTGCTGC--------TGCTCTACAAAC-TCAAGGGCAAAA--CAG-AGCTAGA-ATGG-ATATGGAAGCAATTA------ACTTTTGTCAATCGGAGG-GGGCCT-----TGCATTAAGTACCCTCAAC-TCACCC-T--AAAACCACCTC-ATC-GTACCATCT-GTTTGAGCTCg
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): TTTTACTATGAGAGATATTCTATTTCGGATTTGTAAATTGATGGTTTGATGTTTTTGTGACGCTTGCACATTTGCGCCTTACCCATTGCACAATGAGTCTATTGTATGATCCACTCCGCAATCTTTTATTGTAAGTTTGTTGTTTTTTGTTAGACAGGCTCATTGCTACGGTAGCCTCCAAAAATTCACCTCGACGCAGTAACGTCATCAACAAAATAATAACATCAGAACTACTAGTATTATCTTGCCCTTATTTTCAGCGCAGGACAGGTCTGGGGATTATTT
Unaligned ( gi|9 ): TGATGATTTGAATTGATGATTTTGATGTTTTGTAACGATTTTGTGCATTTGTGCGCTACCCCATTGCCACAATAAGTCTATGATGAACCGTCACATATTGTGTGTTTGTGATTTTGTTGTTTGACGAGCAGCCCATTGGCTACGTATCCTCAAAAATTCACCACGGTCAGTAACCGCCACTTAACAAAATAATAAAAACATCGGAACTATTTACTTTCCTTATTCTTCAGACCATTGGA
Unaligned ( gi|10 ): TGCACCAATAAGCTCTTGATGGGCCGTCACTATTTTTGTTTGAATTTGTTGCGGAGGGCGCGCTTAGTGGCACTGGTAGCCTAAATTTTATTACATTCAACCGCCGCTCAGTAAGACAGCATTAAAGTATACCATTTTCCATCATAATCATTTAATCTTTGTTTTTGATGATCATGACATCT
Unaligned ( gi|13 ): GATTTGAATTGATGATTGGATGCTTCGCCTTTTTGTTTTTGACGCTTGTGCATTTGTGCCGATGCATTCTACCATGAGTCTATTGATGGGCCGTCACATATTCTTTG
Unaligned ( gi|15 ): TGTACGGTAGCCTCAAATTTCACCGCGGCCTTACTAGTAACGCCATCAACAAAATAAT
Unaligned ( gi|16 ): TAATAAACCATCGGAACTATTTTACCTTGTCCTGATTTATTCAGACAGTCTTGCAT
Unaligned ( gi|17 ): GTGGCAGCCCATTTGTACGGTAGCCTCAAATTTCACCGCGGCCAGTAACGCCA
Unaligned ( gi|19 ): AACTATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGATATCTTGGATAA
Unaligned ( gi|21 ): ATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGACATCTTGGAT
Unaligned ( gi|22 ): ACTATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGACATCTTG






Alignments
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --TCATGGATCGTAACGGGATTGGCTTT-TCAGCTTAATTT-CGC--TTCAAT-TCCCTTG--CTG--GCCTA-CGGTG--
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 attAATTG-TGAACTGCT-T--ATA-TCGTTAAT-A--TTAC--CA--G---CTTGAGA---TA---TAGTG-A
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tt--TTA-TTT-ATTATA--TCTTGAATGGTGACGGGATTGGCTTT-T
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AC--AGGCTGGCCATCA-TCAGACGTG-AA-CTTATCCt
gi|3                          : TCAATTCGTTTCAA---ACTACG-CAATATT-CTTGTCATTTT-----AT---TT-GTGTGGC-ATATCA--TTGCTACCGAGCT---ATAA--CAAGCCAAGAATCT-TTGGCAT-TC-TAAAGTCTG-GATAGTT-GGTTT-AGA--TCG-TCTTTGCCGCTACT-TGTGCG---GG----TACCAGATTTGTAACAC--CAGGGCTGGGGCGA--TGCG-CCCCCC-CC-TC-CC-TT-TTCA--------CTAT-ATGATGTGTGTATTCACTATTGT-AAT--AC--TT--GTG-TCTTGATTCA----T----TT----------------TA--C----------CTA-CG---TAAAA-CCAATGAT-CTGTAGTT----TAAA--CTA-TCAAG--TTCATTATTGTTTTGT-CGG--ACT-TGAGGTTATTACCAGGCTG-G-TCATCAT-C-A-CACGTGAAT-TCCC--CC--CCCTCTT--TG-T--GCGTT--TACCA-G-A-CT-TGTAC-AC--TAGGGCT----GGG--GC-ATGCCCC---CTCTCTT-TTC--ACAATATTA-T-GCG-AATTCAC-TATTG-C-----AAT--ACTTTGTGT-A----GA-TTCA-A-TA-TA------TC-TTG---CGCAAAATCA---------CT-GTTG-TT----AAAACTGTCAAG--TCCATTATT-----GTTTT-ATCGGACTT--GAGGTT-ATT--AAC--AGTCTGGCCATCA-TCAGACATG-AA-CTTATCCAT-TTTTGCGCGGAATTTCC-ATG-CCACCTAAGTA-GTTTGGTCCTCCTTCCT--GCTCGGGTCCTCCTGGCGC--------TGCTCTACAAAC-GCAAGGGCAAAA--CAG-AGCTAGA-ATGG-ATATGGAAGCAATTATTTTTTTTTTTTGTCAATCGGAGG-GGGTCT-----TGCATTAAGTACCCTCAAC-TCGCCC-T--AAAATCACCTC-ATCTGTACCATCC-G-GTGAGGTCG-TTTGTTACAAA-TTAGGG-GCTTTGCTA--C-TAAACAATGACCAG-GCTT----T--TTATTTC-ATTTTA--TCTTGGATGGTGACGGGATTGGCTTT-TCAGCTTAATCC-TGC--TACAAT-CCCC--A--CTG--GTCTG-CGGTG--ACCAT-TGG-----AG-TTGCG-GTTACTGCCGCC---GTCACCAAT----G-TTGGGCACTCC-ATTGGTGGCGG-TT-GCAGTG--CCATTAACATGGCC-CTTGCA---AGTG-GT-GC----TTTCGTCGC-ACCCACCTCCAATGGAAGA--GTGCTACTAAT--TTC---AAACCATTTGGCT-TTGAATTG-TGAACTGCT-TTAATA-TCGTTGAT-A--TTAA--CA--G---ATTGAGA---TA---TCGTG-AGTCTGTG--TCTTATTAA--TATGC-ACT-TTGCGC--ATGA----CACTA---TGTGGCA--ATTGAAGATG-TAAATGTC-GT-TG-CA------AGACTTTTCGTA-TCTCAC-TTTGAGAtt
gi|4                          :   AATTTCCTTCAACCAACTACG-CAATATTTCTTGTCATTTT-----AT---TT-GTGTG-C-ATATCA--TTGCTACCGAGCT---ATAA--CAAGCCAAGAATCT-TTGGCGT-AT-CACGGTCTG-GATAGTT-GGTTT-AGA--TCG-TCTTTGCCGCTACT-TTTGCG---GG----TACCAGACTTGTAACAC--CAGGGCTGGGCCGG---GCG-C
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gttaA--C----------TTA-CA---TAACA-CCAATGAT-CTGTAGTT----TAAA--CTA-TCAAG--TTCATTATTGTTTTGT-C-GG-ATT-T-AGGTTATTACCAGGCTG-G-CCATTAT-C-A-CACGTGAAT-T-TT--TT--CCCTCTT--TG-T--GCGGT--TACCA-G-A-CT-TGTAACAC--TANNNNN----NNN--NN-NNNNNNN---NNNNNNN-NNN--NNNNNNNNN-N-NNN-NNNNNNN-NNNNNNN-----NNN--NNNNNNNNN-N--N-NN-NNNN-N-NN-NN------NN-NTG---CTTAAAATCA----ATGATCT-GTTG-TG----AAAACTATCAAG--TCCatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttacataacaccaatgatctgtagtttaaactatcaagttcattattgttttgtcggatttaggttattaccaggctggccattatcacacgtgaattttttccctctttgtgcggttaccagacttgtaacactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcttaaaatcaatgatctgttgtgaaaactatcaagtcc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gttaaatttccttcaaccaactacgcaatatttcttgtcattttatttgtgtgcatatcattgctaccgagctataacaagccaagaatctttggcgtatcacggtctggatagttggtttagatcgtctttgccgctacttttgcgggtaccagacttgtaacaccagggctgggccgggcgcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTG-TGAACTGCT-T--ATA-TCGTTAATTA--CTC---CATTG---CTTGAAA---TA---TAGTGCAGTATGTG--TCTTATTAT--TTTGC-ACT-TTGCGC--ATGGC---CACTA---TGTTGCA--ATTGAACATG-TTTATGTC-CT-TGCCACA-GCCGGACTTTTCGTA-TCTCAT-TTAGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                       --------CTAT-ATGATGCGT---------ATT---------C--TT--GTG-TCATGATTCA----TATTTTT----------------CA--CACGGTATAATTTAACG---TAAAA-CCAATGATGCTGTAGTT----TAAAAACTA-TCA-G--TT-ATTAT-GTTTTGT-CG---ACT-TGAGGTTATTACCAGGCTG-G-CCAT-AT-CGA-CACAGGACTGTTTT--CC--CCCT-TT--TG-T--GCGGG--TACTA-G-A-CT-TGTAA-AC--TA-GGCT----GGG--GCGATCCCCC---CATTCCT-TTC--ACTATATGATT-GCG-TATTCAC-TATTGAC-----AAT--AC-TTGTGTCA--T-GATTTCAGA-TATTG------TCTTTG---CGTAAAACCA----AGAT-CTCGTGGTTT----AAAACTAT--AG--TTCATTATT-----GTTTT-ATCGGACTT--GAGGTagactcgatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattgttgtgacgtttttgtggatttgcgcctaccattgcacatgagtctcttttgatggaccgtcacctattttgttgtgattttgttcgttttgtgcgaggcagcccatttgtaccggtgagcctcaaaattcaccgcggccgtaacgccagtcaacaaaatatataaacatcgaaactatttaccttgtcctgatttattcagacatcttgat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ----CT-GTTG-TT----TAAACTATCAAG--TTC-TTATT-----GTTTT-ATCAGACTC--GTGGTT-ATT--AAC--AGCCTGGTCATCA-TCACACGTG-AA-CTTATCC-T-TTTTGCGCG-AATTTCC-ATG-CCACTTCAGTA-GTTTGGTCCTCCTCCCT--GCTCGGGTTCTCCTGCTGC--------TGCTCTACAAAC-TCAAGGGCAAAA--CAG-AGCTAGA-ATGG-ATATGGAAGCAATTA------ACTTTTGTCAATCGGAGG-GGGCCT-----TGCATTAAGTACCCTCAAC-TCACCC-T--AAAACCACCTC-ATC-GTACCATCT-GTTTGAGCTCg
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): TTTTACTATGAGAGATATTCTATTTCGGATTTGTAAATTGATGGTTTGATGTTTTTGTGACGCTTGCACATTTGCGCCTTACCCATTGCACAATGAGTCTATTGTATGATCCACTCCGCAATCTTTTATTGTAAGTTTGTTGTTTTTTGTTAGACAGGCTCATTGCTACGGTAGCCTCCAAAAATTCACCTCGACGCAGTAACGTCATCAACAAAATAATAACATCAGAACTACTAGTATTATCTTGCCCTTATTTTCAGCGCAGGACAGGTCTGGGGATTATTT
Unaligned ( gi|9 ): TGATGATTTGAATTGATGATTTTGATGTTTTGTAACGATTTTGTGCATTTGTGCGCTACCCCATTGCCACAATAAGTCTATGATGAACCGTCACATATTGTGTGTTTGTGATTTTGTTGTTTGACGAGCAGCCCATTGGCTACGTATCCTCAAAAATTCACCACGGTCAGTAACCGCCACTTAACAAAATAATAAAAACATCGGAACTATTTACTTTCCTTATTCTTCAGACCATTGGA
Unaligned ( gi|10 ): TGCACCAATAAGCTCTTGATGGGCCGTCACTATTTTTGTTTGAATTTGTTGCGGAGGGCGCGCTTAGTGGCACTGGTAGCCTAAATTTTATTACATTCAACCGCCGCTCAGTAAGACAGCATTAAAGTATACCATTTTCCATCATAATCATTTAATCTTTGTTTTTGATGATCATGACATCT
Unaligned ( gi|13 ): GATTTGAATTGATGATTGGATGCTTCGCCTTTTTGTTTTTGACGCTTGTGCATTTGTGCCGATGCATTCTACCATGAGTCTATTGATGGGCCGTCACATATTCTTTG
Unaligned ( gi|15 ): TGTACGGTAGCCTCAAATTTCACCGCGGCCTTACTAGTAACGCCATCAACAAAATAAT
Unaligned ( gi|16 ): TAATAAACCATCGGAACTATTTTACCTTGTCCTGATTTATTCAGACAGTCTTGCAT
Unaligned ( gi|17 ): GTGGCAGCCCATTTGTACGGTAGCCTCAAATTTCACCGCGGCCAGTAACGCCA
Unaligned ( gi|19 ): AACTATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGATATCTTGGATAA
Unaligned ( gi|21 ): ATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGACATCTTGGAT
Unaligned ( gi|22 ): ACTATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGACATCTTG






Alignments
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --TCATGGATCGTAACGGGATTGGCTTT-TCAGCTTAATTT-CGC--TTCAAT-TCCCTTG--CTG--GCCTA-CGGTG--
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 attAATTG-TGAACTGCT-T--ATA-TCGTTAAT-A--TTAC--CA--G---CTTGAGA---TA---TAGTG-A
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tt--TTA-TTT-ATTATA--TCTTGAATGGTGACGGGATTGGCTTT-T
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AC--AGGCTGGCCATCA-TCAGACGTG-AA-CTTATCCt
gi|3                          : TCAATTCGTTTCAA---ACTACG-CAATATT-CTTGTCATTTT-----AT---TT-GTGTGGC-ATATCA--TTGCTACCGAGCT---ATAA--CAAGCCAAGAATCT-TTGGCAT-TC-TAAAGTCTG-GATAGTT-GGTTT-AGA--TCG-TCTTTGCCGCTACT-TGTGCG---GG----TACCAGATTTGTAACAC--CAGGGCTGGGGCGA--TGCG-CCCCCC-CC-TC-CC-TT-TTCA--------CTAT-ATGATGTGTGTATTCACTATTGT-AAT--AC--TT--GTG-TCTTGATTCA----T----TT----------------TA--C----------CTA-CG---TAAAA-CCAATGAT-CTGTAGTT----TAAA--CTA-TCAAG--TTCATTATTGTTTTGT-CGG--ACT-TGAGGTTATTACCAGGCTG-G-TCATCAT-C-A-CACGTGAAT-TCCC--CC--CCCTCTT--TG-T--GCGTT--TACCA-G-A-CT-TGTAC-AC--TAGGGCT----GGG--GC-ATGCCCC---CTCTCTT-TTC--ACAATATTA-T-GCG-AATTCAC-TATTG-C-----AAT--ACTTTGTGT-A----GA-TTCA-A-TA-TA------TC-TTG---CGCAAAATCA---------CT-GTTG-TT----AAAACTGTCAAG--TCCATTATT-----GTTTT-ATCGGACTT--GAGGTT-ATT--AAC--AGTCTGGCCATCA-TCAGACATG-AA-CTTATCCAT-TTTTGCGCGGAATTTCC-ATG-CCACCTAAGTA-GTTTGGTCCTCCTTCCT--GCTCGGGTCCTCCTGGCGC--------TGCTCTACAAAC-GCAAGGGCAAAA--CAG-AGCTAGA-ATGG-ATATGGAAGCAATTATTTTTTTTTTTTGTCAATCGGAGG-GGGTCT-----TGCATTAAGTACCCTCAAC-TCGCCC-T--AAAATCACCTC-ATCTGTACCATCC-G-GTGAGGTCG-TTTGTTACAAA-TTAGGG-GCTTTGCTA--C-TAAACAATGACCAG-GCTT----T--TTATTTC-ATTTTA--TCTTGGATGGTGACGGGATTGGCTTT-TCAGCTTAATCC-TGC--TACAAT-CCCC--A--CTG--GTCTG-CGGTG--ACCAT-TGG-----AG-TTGCG-GTTACTGCCGCC---GTCACCAAT----G-TTGGGCACTCC-ATTGGTGGCGG-TT-GCAGTG--CCATTAACATGGCC-CTTGCA---AGTG-GT-GC----TTTCGTCGC-ACCCACCTCCAATGGAAGA--GTGCTACTAAT--TTC---AAACCATTTGGCT-TTGAATTG-TGAACTGCT-TTAATA-TCGTTGAT-A--TTAA--CA--G---ATTGAGA---TA---TCGTG-AGTCTGTG--TCTTATTAA--TATGC-ACT-TTGCGC--ATGA----CACTA---TGTGGCA--ATTGAAGATG-TAAATGTC-GT-TG-CA------AGACTTTTCGTA-TCTCAC-TTTGAGAtt
gi|4                          :   AATTTCCTTCAACCAACTACG-CAATATTTCTTGTCATTTT-----AT---TT-GTGTG-C-ATATCA--TTGCTACCGAGCT---ATAA--CAAGCCAAGAATCT-TTGGCGT-AT-CACGGTCTG-GATAGTT-GGTTT-AGA--TCG-TCTTTGCCGCTACT-TTTGCG---GG----TACCAGACTTGTAACAC--CAGGGCTGGGCCGG---GCG-C
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gttaA--C----------TTA-CA---TAACA-CCAATGAT-CTGTAGTT----TAAA--CTA-TCAAG--TTCATTATTGTTTTGT-C-GG-ATT-T-AGGTTATTACCAGGCTG-G-CCATTAT-C-A-CACGTGAAT-T-TT--TT--CCCTCTT--TG-T--GCGGT--TACCA-G-A-CT-TGTAACAC--TANNNNN----NNN--NN-NNNNNNN---NNNNNNN-NNN--NNNNNNNNN-N-NNN-NNNNNNN-NNNNNNN-----NNN--NNNNNNNNN-N--N-NN-NNNN-N-NN-NN------NN-NTG---CTTAAAATCA----ATGATCT-GTTG-TG----AAAACTATCAAG--TCCatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttacataacaccaatgatctgtagtttaaactatcaagttcattattgttttgtcggatttaggttattaccaggctggccattatcacacgtgaattttttccctctttgtgcggttaccagacttgtaacactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcttaaaatcaatgatctgttgtgaaaactatcaagtcc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gttaaatttccttcaaccaactacgcaatatttcttgtcattttatttgtgtgcatatcattgctaccgagctataacaagccaagaatctttggcgtatcacggtctggatagttggtttagatcgtctttgccgctacttttgcgggtaccagacttgtaacaccagggctgggccgggcgcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTG-TGAACTGCT-T--ATA-TCGTTAATTA--CTC---CATTG---CTTGAAA---TA---TAGTGCAGTATGTG--TCTTATTAT--TTTGC-ACT-TTGCGC--ATGGC---CACTA---TGTTGCA--ATTGAACATG-TTTATGTC-CT-TGCCACA-GCCGGACTTTTCGTA-TCTCAT-TTAGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                       --------CTAT-ATGATGCGT---------ATT---------C--TT--GTG-TCATGATTCA----TATTTTT----------------CA--CACGGTATAATTTAACG---TAAAA-CCAATGATGCTGTAGTT----TAAAAACTA-TCA-G--TT-ATTAT-GTTTTGT-CG---ACT-TGAGGTTATTACCAGGCTG-G-CCAT-AT-CGA-CACAGGACTGTTTT--CC--CCCT-TT--TG-T--GCGGG--TACTA-G-A-CT-TGTAA-AC--TA-GGCT----GGG--GCGATCCCCC---CATTCCT-TTC--ACTATATGATT-GCG-TATTCAC-TATTGAC-----AAT--AC-TTGTGTCA--T-GATTTCAGA-TATTG------TCTTTG---CGTAAAACCA----AGAT-CTCGTGGTTT----AAAACTAT--AG--TTCATTATT-----GTTTT-ATCGGACTT--GAGGTagactcgatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattgttgtgacgtttttgtggatttgcgcctaccattgcacatgagtctcttttgatggaccgtcacctattttgttgtgattttgttcgttttgtgcgaggcagcccatttgtaccggtgagcctcaaaattcaccgcggccgtaacgccagtcaacaaaatatataaacatcgaaactatttaccttgtcctgatttattcagacatcttgat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ----CT-GTTG-TT----TAAACTATCAAG--TTC-TTATT-----GTTTT-ATCAGACTC--GTGGTT-ATT--AAC--AGCCTGGTCATCA-TCACACGTG-AA-CTTATCC-T-TTTTGCGCG-AATTTCC-ATG-CCACTTCAGTA-GTTTGGTCCTCCTCCCT--GCTCGGGTTCTCCTGCTGC--------TGCTCTACAAAC-TCAAGGGCAAAA--CAG-AGCTAGA-ATGG-ATATGGAAGCAATTA------ACTTTTGTCAATCGGAGG-GGGCCT-----TGCATTAAGTACCCTCAAC-TCACCC-T--AAAACCACCTC-ATC-GTACCATCT-GTTTGAGCTCg


blockSeqs                     :         T     CCA      .       T  TG       .      .    . T   G CA     .  T           .     AAC     C        .       GAT   A      .   A   T G   T   .    .              A  T   AAG  .            T       .     G        AT     .      .  C  G  .  C    .           .         GTA      A  GTAATAC       .    .        C TATTTTTCACACGGTATAAT                         A  .       G        C        .       AA   .     .  TC  TA T       .   G    . G  GT             GG     C  T G .    T    GTTTT    .        .   G .      T      A . .  A  G  C  AC  G G  .      .   G  G    .         .   .   A    T TT    .   T   .     NN        .   T T    AGAT    T    AA   ATA        T   .            ATGAT      C    T  TTAA            .          .         C        G        T   .    .              .         .  A       A .         G       .   .      A    .                 .     G   C          .                   .  A         .    C       .  G A    G          TTTTTT         A   G    .     T                    C   G   C  GTAA     C     A   TG  C     GT          .           .      C         CC                C    T         TT  .   T  AT                          .    C     TT    TG      C    TTG     .      C     .      .   .      .     .  T         .           .    T           G           .  .      .               .      .      N  .  NNNN         A        C      N   N            .    .               .        .        TTTA    .       TCA     C    TTGC         .    .       C        TT         AT     .   .      .     C     C  .   G     .       G   . AA     .  .  C  C GCCG    T       .      .
blockSeqs                     :         C     .        .       .  TG       .      .    . T   . A      .  T           .     A       C        .       TC    A      .   A   . G   .   .    .              .  T   .    .            T       .     G        T      .      .  .  .  .  .    .           .         AT       A  TAATAC        .    .        C TTTTAC                                       .  .       .        G        .       .    .     .  TC  TA T       .   G    . G  GT             G      C  . . .    T    TCCC     .        .   . .      T      . . .  .  T  .  .   G N  .      .   .  G    .         .   .   A    T T     .   N   .     AC        .   T N    CAT     .    GA   TTG        .   .            AGAT       .    .  .               .          .         .        T        .   .    .              .         .  .       A .         .       .   .      A    .                 .     G   C          .                   .  A         .    .       .  G .    G          TTTT           A   G    .     T                    C   .   C  T        C     .   TG  C     T           .           .      .         C                 .    T         T   .   A  .                           .    C     CC    .       .    A       .      .     .      .   .      .     .  T         .           .    .           .           .  .      .               .      .      .  .  .            .        N      N   N            .    .               .        .        TTA     .       TTA     A    GC           .    .       .        .          .      .   .      .     C     C  .   G     .       G   . AA     .  .  .  C GGG     T       .      .
blockSeqs                     :               .        .       .  G        .      .    . .   . A      .  .           .     A       .        .       AT    C      .   A   . G   .   .    .              .  T   .    .            T       .     G        G      .                       .           .         .        .  C             .    .        . TTTTAC                                       .  .       .        .        .       .    .     .  C   TA T       .   .    . G  GT             G      T  . . .    T    CCC      .        .   . .      T      . . .  .  T  .  .   N G  .      .   .  N    .         .   .   N    N T     .   T   .     C         .   N T    NN      .    A    TA         .   .            .          .    .  .               .          .         .        T        .   .    .              .         .  .       . .         .       .   .      C    .                 .     .   T          .                   .  A         .    .       .  G .    G          .              A   .    .     .                    C   .   C  T        C     .   G   .     G                                                                         .   .   T  .                           .    .     C     .       .    A       .      .     .      .   .      .     .  .         .           .    .           .           .  .      .               .      .      .  .  .            .        N      A   G            .    .               .        .        TT      .       TA      A    GA           .    .       .        .          .      .   .      .     .     C  .   .     .       C   . TT     .  .  .  . A       T       .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .       .        .        .       .    .     .  T   A  .       .   .    . .  T              G      .  . . .    G    TTT      .        .   . .      .      . . .  .  T  .  .   . .  .      .   .  C    .         .   .   T    G N     .   .   .     C         .   . .    A       .    N    NN         .   .            .          .    .  .               .          .         .        C                 .              .         .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .                           .                                                  .                                    .           .    .           .           .  .      .               .      .      .  .  .            .        C                                                     .        TT      .       TA      .    GA           .    .       .                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        .    .  .               .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               


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10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|9 ): TGATGATTTGAATTGATGATTTTGATGTTTTGTAACGATTTTGTGCATTTGTGCGCTACCCCATTGCCACAATAAGTCTATGATGAACCGTCACATATTGTGTGTTTGTGATTTTGTTGTTTGACGAGCAGCCCATTGGCTACGTATCCTCAAAAATTCACCACGGTCAGTAACCGCCACTTAACAAAATAATAAAAACATCGGAACTATTTACTTTCCTTATTCTTCAGACCATTGGA
Unaligned ( gi|10 ): TGCACCAATAAGCTCTTGATGGGCCGTCACTATTTTTGTTTGAATTTGTTGCGGAGGGCGCGCTTAGTGGCACTGGTAGCCTAAATTTTATTACATTCAACCGCCGCTCAGTAAGACAGCATTAAAGTATACCATTTTCCATCATAATCATTTAATCTTTGTTTTTGATGATCATGACATCT
Unaligned ( gi|13 ): GATTTGAATTGATGATTGGATGCTTCGCCTTTTTGTTTTTGACGCTTGTGCATTTGTGCCGATGCATTCTACCATGAGTCTATTGATGGGCCGTCACATATTCTTTG
Unaligned ( gi|15 ): TGTACGGTAGCCTCAAATTTCACCGCGGCCTTACTAGTAACGCCATCAACAAAATAAT
Unaligned ( gi|16 ): TAATAAACCATCGGAACTATTTTACCTTGTCCTGATTTATTCAGACAGTCTTGCAT
Unaligned ( gi|17 ): GTGGCAGCCCATTTGTACGGTAGCCTCAAATTTCACCGCGGCCAGTAACGCCA
Unaligned ( gi|19 ): AACTATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGATATCTTGGATAA
Unaligned ( gi|21 ): ATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGACATCTTGGAT
Unaligned ( gi|22 ): ACTATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGACATCTTG






Alignments
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --TCATGGATCGTAACGGGATTGGCTTT-TCAGCTTAATTT-CGC--TTCAAT-TCCCTTG--CTG--GCCTA-CGGTG--
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   attAATTG-TGAACTGC--TT--ATA-TCGTTAAT-A--TTAC--CA--G---CTTGAGA---TA---TAGTG-A
gi|2                          : TCAATTCG-TTCAA---ACTACG-CAATATT-CT-GTCATTTT-----AT---TT-G-GTG-CCATATCA--T--CTACCGAGCT---ATAAACCAAGC--AGAATCT-TTAGCATGAT-CAAAGTCTG-GATAGTTTGGTTTTAGA--TCT-TCTTTGCCGCTACTATGTGCGAAGGG----TACCAGATTTGTAACAC--CAGGGCTGGGGCA---TGCG-CCCCCC-CCCTCGCC-TTCTTCA--------CTAT-ATGATGTGTAT-TTCACT--T-T-AAT--AC--TT--GTG-TCTTGATT-A----T----TT----------------TA--C----------CTA-CG---TAAAAGCCAATGATCGTGTAGTT----TAAA--CTA-TCAAG--T-CAT-ATTGTTTTGT-CGGG-ACT-TGAG-----T-TA---TTACCCAGCTGGG----TCATCATTC-ACACGTGA--ATCCCCCCCC-TCTT-TGGTGCGGT----CCAAG-A-CTATGGAA-ACACTAGG-CT----GGG--GC-ATGCCCC---CTCTCTT-TTC--ACAATATTA-T-GCG-AAT-CAC-TATTG-C-----AAT--ACTT-GTGT-AGATGA-TTCA-----AATAATATC-TGG---CGCCAAATCA-----C-----T-GTTG-TTTTAAAAAAC-GTCAAG--TCCATTATT-----GTTTTCATCGGACTG--AAGGTTTATT--AAC--AGT-TGGCCATCA-TCAGACATG-AAACTTATCCAT-TTTTGCGCG-AATTTCC-ATG-CCACCTAAGTA-GTTTGGTTCCCCTTCCT--GCTC-GGTCCTCCTGGCGC--------TGCTCTACAAAC-GCAAGGGCAAAA--CAGCAGCTAGA-ATGGAATATGGAAGCAATTATTTT--TTTTTTGTCAATC---GA-GGGTC------TGCATTAAGTACCCTCAACGTCGCCCGTAAAAAATCACCTCAATCTGTA-CATCC-T-GTGAGGTCG-TTTGTTACAAA-TTAGGGCGATTTGCTAC-C-TAAACAATGACCAGCGCTT----T--TTA--TC-ATTTTGATTCTTGGATGG-GAC-GGATT-GCTTT-TCAG-TTAAT-C-TGCTGTACAATCCCCC--A--CTG--GTCTGCCGGTG--ACCAT-TGG-----AG-TTGCG-GTTACTGCCGCC---GTCACCAAT----GTTTGGCCACTCCGATTGGTGGCGG-TT-GCAGTG--CCATTAACATGGCC-CTTGCA---AGTG-GT-GCNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNN--NNC---AAACCATTTGGCT-TTGAA-TG-GGAACTGC--TTA-ATA-TCGTTGATCA--TTAA--CA--G---ATT-AGA---TA---TCGTG-AGTCTGTGTTTCTTATTAAATTATGC-ACT-TTGCGC--ATGAC---CACTA---T-TGGCA--ATTGAAGATG-TAAATGTT-CT-TG-CACAGG--GGACTTTTCGTA-TCTCAC-TTTGAGA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tt--TTA-TTT-ATTATA--TCTTGAATGGTGACGGGATTGGCTTT-T
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AC--AGGCTGGCCATCA-TCAGACGTG-AA-CTTATCCt
gi|3                          : TCAATTCGTTTCAA---ACTACG-CAATATT-CTTGTCATTTT-----AT---TT-GTGTGGC-ATATCA--TTGCTACCGAGCT---ATAA--CAAGCCAAGAATCT-TTGGCAT-TC-TAAAGTCTG-GATAGTT-GGTTT-AGA--TCG-TCTTTGCCGCTACT-TGTGCG---GG----TACCAGATTTGTAACAC--CAGGGCTGGGGCGA--TGCG-CCCCCC-CC-TC-CC-TT-TTCA--------CTAT-ATGATGTGTGTATTCACTATTGT-AAT--AC--TT--GTG-TCTTGATTCA----T----TT----------------TA--C----------CTA-CG---TAAAA-CCAATGAT-CTGTAGTT----TAAA--CTA-TCAAG--TTCATTATTGTTTTGT-CGG--ACT-TGAG----GT-TA---TTACCAGGCTGG-----TCATCAT-C-ACACGTGA--ATTCCCCCCCCTCTT-TG-TGCGTT--TACCA-G-A-CT-TGTAC-AC--TAGGGCT----GGG--GC-ATGCCCC---CTCTCTT-TTC--ACAATATTA-T-GCG-AATTCAC-TATTG-C-----AAT--ACTTTGTGT-A---GA-TTCA------ATA-TATC-TTG---CGCAAAATCA-----C-----T-GTTG-TT----AAAACTGTCAAG--TCCATTATT-----GTTTT-ATCGGACTT--GAGGTT-ATT--AAC--AGTCTGGCCATCA-TCAGACATG-AA-CTTATCCAT-TTTTGCGCGGAATTTCC-ATG-CCACCTAAGTA-GTTTGGTCCTCCTTCCT--GCTCGGGTCCTCCTGGCGC--------TGCTCTACAAAC-GCAAGGGCAAAA--CAG-AGCTAGA-ATGG-ATATGGAAGCAATTATTTTTTTTTTTTGTCAATCGGAGG-GGGTCT-----TGCATTAAGTACCCTCAAC-TCGCCC-T--AAAATCACCTC-ATCTGTACCATCC-G-GTGAGGTCG-TTTGTTACAAA-TTAGGG-GCTTTGCTA--C-TAAACAATGACCAG-GCTT----T--TTATTTC-ATTTTA--TCTTGGATGGTGACGGGATTGGCTTT-TCAGCTTAATCC-TGC--TACAAT-CCCC--A--CTG--GTCTG-CGGTG--ACCAT-TGG-----AG-TTGCG-GTTACTGCCGCC---GTCACCAAT----G-TTGGGCACTCC-ATTGGTGGCGG-TT-GCAGTG--CCATTAACATGGCC-CTTGCA---AGTG-GT-GC----TTTCGTCGC-ACCCACCTCCAATGGAAGA--GTGCTACTAAT--TTC---AAACCATTTGGCT-TTGAATTG-TGAACTGC--TTTAATA-TCGTTGAT-A--TTAA--CA--G---ATTGAGA---TA---TCGTG-AGTCTGTG--TCTTATTAA--TATGC-ACT-TTGCGC--ATGA----CACTA---TGTGGCA--ATTGAAGATG-TAAATGTC-GT-TG-CA------AGACTTTTCGTA-TCTCAC-TTTGAGAtt
gi|4                          :   AATTTCCTTCAACCAACTACG-CAATATTTCTTGTCATTTT-----AT---TT-GTGTG-C-ATATCA--TTGCTACCGAGCT---ATAA--CAAGCCAAGAATCT-TTGGCGT-AT-CACGGTCTG-GATAGTT-GGTTT-AGA--TCG-TCTTTGCCGCTACT-TTTGCG---GG----TACCAGACTTGTAACAC--CAGGGCTGGGCCGG---GCG-C
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gttaA--C----------TTA-CA---TAACA-CCAATGAT-CTGTAGTT----TAAA--CTA-TCAAG--TTCATTATTGTTTTGT-CGG--ATT-T-AG----GT-TA---TTACCAGGCTGG-----CCATTAT-C-ACACGTGA--ATTTTTTCCC-TCTT-TG-TGCGGT--TACCA-G-A-CT-TGTAACAC--TA-NNNN----NNN--NN-NNNNNNN---NNNNNNN-NNN--NNNNNNNNN-N-NNN-NNNNNNN-NNNNNNN-----NNN--NNNNNNNNN-N--NNN-NNNN-----NNNN-NNNN-NTG---CTTAAAATCAATGATC-----T-GTTG-TG----AAAACTATCAAG--TCCatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttacataacaccaatgatctgtagtttaaactatcaagttcattattgttttgtcggatttaggttattaccaggctggccattatcacacgtgaattttttccctctttgtgcggttaccagacttgtaacactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcttaaaatcaatgatctgttgtgaaaactatcaagtcc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gttaaatttccttcaaccaactacgcaatatttcttgtcattttatttgtgtgcatatcattgctaccgagctataacaagccaagaatctttggcgtatcacggtctggatagttggtttagatcgtctttgccgctacttttgcgggtaccagacttgtaacaccagggctgggccgggcgcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTG-TGAACTGC--TT--ATA-TCGTTAATTA--CTC---CATTG---CTTGAAA---TA---TAGTGCAGTATGTG--TCTTATTAT--TTTGC-ACT-TTGCGC--ATGGC---CACTA---TGTTGCA--ATTGAACATG-TTTATGTC-CT-TGCCACA-GCCGGACTTTTCGTA-TCTCAT-TTAGA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                       --------CTAT-ATGATGCGT---------ATT---------C--TT--GTG-TCATGATTCA----TATTTTT----------------CA--CACGGTATAATTTAACG---TAAAA-CCAATGATGCTGTAGTT----TAAAAACTA-TCA-G--TT-ATTAT-GTTTTGT-CG---ACT-TGAG----GT-TA---TTACCAGGCTGG-----CCAT-AT-CGACACAGGACTGTTTTCCCCC-T-TT-TG-TGCGGG--TACTA-G-A-CT-TGTAA-AC--TA-GGCT----GGG--GCGATCCCCC---CATTCCT-TTC--ACTATATGATT-GCG-TATTCAC-TATTGAC-----AAT--AC-TTGTGTCA--TGATTTCA-----GATATTGTCTTTG---CGTAAAACCAAGAT-C-----TCGTGGTTT----AAAACTAT--AG--TTCATTATT-----GTTTT-ATCGGACTT--GAGGTagactcgatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattgttgtgacgtttttgtggatttgcgcctaccattgcacatgagtctcttttgatggaccgtcacctattttgttgtgattttgttcgttttgtgcgaggcagcccatttgtaccggtgagcctcaaaattcaccgcggccgtaacgccagtcaacaaaatatataaacatcgaaactatttaccttgtcctgatttattcagacatcttgat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -----C-----T-GTTG-TT----TAAACTATCAAG--TTC-TTATT-----GTTTT-ATCAGACTC--GTGGTT-ATT--AAC--AGCCTGGTCATCA-TCACACGTG-AA-CTTATCC-T-TTTTGCGCG-AATTTCC-ATG-CCACTTCAGTA-GTTTGGTCCTCCTCCCT--GCTCGGGTTCTCCTGCTGC--------TGCTCTACAAAC-TCAAGGGCAAAA--CAG-AGCTAGA-ATGG-ATATGGAAGCAATTA------ACTTTTGTCAATCGGAGG-GGGCCT-----TGCATTAAGTACCCTCAAC-TCACCC-T--AAAACCACCTC-ATC-GTACCATCT-GTTTGAGCTCg
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): TTTTACTATGAGAGATATTCTATTTCGGATTTGTAAATTGATGGTTTGATGTTTTTGTGACGCTTGCACATTTGCGCCTTACCCATTGCACAATGAGTCTATTGTATGATCCACTCCGCAATCTTTTATTGTAAGTTTGTTGTTTTTTGTTAGACAGGCTCATTGCTACGGTAGCCTCCAAAAATTCACCTCGACGCAGTAACGTCATCAACAAAATAATAACATCAGAACTACTAGTATTATCTTGCCCTTATTTTCAGCGCAGGACAGGTCTGGGGATTATTT
Unaligned ( gi|9 ): TGATGATTTGAATTGATGATTTTGATGTTTTGTAACGATTTTGTGCATTTGTGCGCTACCCCATTGCCACAATAAGTCTATGATGAACCGTCACATATTGTGTGTTTGTGATTTTGTTGTTTGACGAGCAGCCCATTGGCTACGTATCCTCAAAAATTCACCACGGTCAGTAACCGCCACTTAACAAAATAATAAAAACATCGGAACTATTTACTTTCCTTATTCTTCAGACCATTGGA
Unaligned ( gi|10 ): TGCACCAATAAGCTCTTGATGGGCCGTCACTATTTTTGTTTGAATTTGTTGCGGAGGGCGCGCTTAGTGGCACTGGTAGCCTAAATTTTATTACATTCAACCGCCGCTCAGTAAGACAGCATTAAAGTATACCATTTTCCATCATAATCATTTAATCTTTGTTTTTGATGATCATGACATCT
Unaligned ( gi|13 ): GATTTGAATTGATGATTGGATGCTTCGCCTTTTTGTTTTTGACGCTTGTGCATTTGTGCCGATGCATTCTACCATGAGTCTATTGATGGGCCGTCACATATTCTTTG
Unaligned ( gi|15 ): TGTACGGTAGCCTCAAATTTCACCGCGGCCTTACTAGTAACGCCATCAACAAAATAAT
Unaligned ( gi|16 ): TAATAAACCATCGGAACTATTTTACCTTGTCCTGATTTATTCAGACAGTCTTGCAT
Unaligned ( gi|17 ): GTGGCAGCCCATTTGTACGGTAGCCTCAAATTTCACCGCGGCCAGTAACGCCA
Unaligned ( gi|19 ): AACTATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGATATCTTGGATAA
Unaligned ( gi|21 ): ATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGACATCTTGGAT
Unaligned ( gi|22 ): ACTATTTACCTTGTCCTGATTTATCAGACATCTTG