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Reference ( gi|2 )            :                                                 TCATTTAA-TAAT-C--TTTAAA--CTGATGGCTTAACA------A----TTAT---G--AT--TGGACG-------AAAAAA-AAT----T------A---TGA-TTTCTT------AAT---AAAAAAAATT-TTTTA----GT--GCGGGAGTTCACCTGCACTAAACATTCGACCG---G-AACT--ACTTTT-CTCA--GGAATGTGTCTTACGC----------TATTTT-----------TAGAATGGGGATTTCCAC-A-AAA--------TC-AATGC---GT-ATTC-G-T-GTATTCGTTTGAATTGTTTTTCTTA-ATTCGCTTACGTAAGAAATGCAAAAACAAAACC---TGTATACGAATAAAATA-ACATAACTTTAATTAAACAAAC--ACAACACTAAATT----TAATTGTGATGATCACAAATAATAAACAATATGTGTTAGTTCACGGAAACATCGGGAT------TTACCGTTCGCTTCATAACTTCGATCATGAACGGATTGACTC--GCGCACACGTGCTCCGAATCTCCAGCA-AGTTAAATGACAATTAACTGC-GTG-CGACGTTTCCATTCGCTTGCGTCCGGCACTCCATGTAATTCCA-TTGCTCCACTTTTTGCTCTGCTTGAT-TTAGATTTTGTCC-GACTCCATGC----TTCC-TTGC----TCCACGGTTCCCAC-GACAC-AGCCAGTGTTGAGAGTCTCC-T-CAAACACCATGCAACA-CACATTGTCTC--ACCGCTTGACATCTTCACGTA-TCTCTA-----ATTCAGCTTTTAA-TCATTGCACC-----TT------TCCCCTCA--AAT-CGTTTAACTCTGCTCAGTAACTCTACCTTCGCCATACACGCACACA--CCATTTTTGAATTCCATGTA-ATGTTGATTTCTGTTA----------------------C-------------CTTTCAAAATCGTTAATT-AAAGCTTTTTGATGACGGAAACTAT
gi|6                          :                                                 TCATTTAAATATT-C--TCTAAAAACTGATGGCTTAACAGATGAAA----TTAT---GTAATGATGGACA-------CGAAAT-AGT----TCTTTTAA---TGA-TTTCCT--------T---AAGATAATTT-TTTTACTTAGTTGACGGGAGTTCACCTGCACTAAA
gi|11                         :                        aatttttgaatttaactttcttataTCATATAA-CAATGC--TTT-------GATTGTTTAACAGCT---A----TTTT---G--AT--TGGAT----------AGAA-AATGTCCT----------TGA-ATTCTT------CAC---A-------TTGTTTTG----GT--TTGGGATGTCATCTGCACTAAGCA----ATCG---G-AACT--ACtgaatctgcgaatattaaa
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gi|14                         :                                                 TCATTTAA-TAAT-C--TCTAAA--CTGATGGC
gi|8                          : agatgaaaaaagaaactgtaatttcatagttctatttattgattcataaaATTTGA-TAAC-C--TTTAAA--GTGATGGCTTAACAACG---A----TTCT---G--AT--AAGATG----------AAA-AAT----T------CGTTTTA-TTTCTT------AATGTAAAAAAAAA------TG----GT--CCTGGAGTTCATCT
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gi|5                          :                                                    TTTCA-TAAT-A--TTTAAG---TGATGGCTTAACA------ACGA-TTCT---G--AT--TGGATG----------AAA-AAT----T----------CGT-TTTATT------ACTGC-AGCAAAAA-----------------CAAAA--TCATCTGCACTTGGCAGTTAA-CGTTTG-GACT--AC--TT-CTCAATGGAATGCGTCTT-CGTTCCCTGTTCGTATTTTATTCCTAGTTATAGAACGGGTATTTCCGC-ATAAATTTCATTTTC-AACTT---GG-ATACAA-T-ACATTCGTTTGGAT--TTTTTGTTACATT-GCT---ATCAAAAAT----AAACACAATCAAATGCATA--AATGAAAAA-Aa
gi|9                          :                                                     TTAA-TAGT-C--TTTAAA--TTGTTGGCTTAACA------ACGAGTT-T---G--GT--TAGATG---------AAAA-CTT----T------ATT-TGA-TTTTTTTTATTGAAA---AAAAAAGA-----TTG----GT--CCGGGATTTTATCTGCTCTAAGCACTCA---G---G-AG-T--ACTTTT-CTC
gi|18                         :                                                    aTTAA-TAAT-C--TTTAAG--GTGATGACTTAACAACG---A----TTCT---G--AT--TGGATG-------A
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gi|7                          :                                                                   TTAAA---TGATGGCTTAACA------A----CTATTCCG--AT--TGGATG---------AAAA-GTT----T------GTT-TGATTTTCTT------TTT---AAAAA--------------------TGGCAGTTAATCTGAACTAAGCACT----TG---G-GACT--ACTTTT-CTCT--GGACTGCGTTTTta
gi|1                          :                                                                                                                                            agaacttc---TGA-TTTCTT------AATTTTAAAAAA-----TTTTAT---GT--TCGGGAGTTCAAACGCAC-AAA------ACC----------------------------ATGTGTATTACGC----------TATTTT-----------TAGAATGGGGATTTCCACAA-AAA--------TC-AATGCAAAGCGAT---G-T-GTATTGGTTTGAATTGTTTTT-----ATT-GCCTAC-TAA-AAAT---AAAACTAAA-C---GGTATACGAATAAAAT--ACA-AAATTTAATTAATAAAATAAACAACACT-AATTAGGCTAATTGTGA--GTCACAAAT--TA---AATATGTGTGAGTTCAC-GAGACATCTGGGTAGCAAATTACCGTCTGCTTCATAA--TCGATGAGGGACGGATT--CTTCGGCG---ACG---TTCG-ATCTCGGGAATAGTTTAATG--AATTAACTGCTGTG-TGACGTTT-CAGCCGCTTTCGTCCG---CTCCATG--GTTCTGCTCGATCCAC----GGTTC--CCAGACACAAGATTTCGTCCTTACTCCATGCATGGTTCCTTTGCTCGATCCACG--TTCCACGGACACTAGCCAGTGTGGAAATTCTCCGTGCAAACACCATGCAACACCACTCTGTCTCGAACCGCGTGACATCTTCACTTATTTTCTACATGTATTCAGCCTTTAATTCATTGCACC-----TTCAAATCTCCCCTCACCAAT-CCGTTAACTCT--------------CCTTCGCCAGA-ACGAAAACAGCCCA-TTTCAAATTCCATAGATATGTTGATTTCTGTTG----------------------CGATCCTATGTATTCTTACGGCGCCTTT--TTCAAAATTTTTCGATGGCGGCAACTATccccgttcaaaatttagttct
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGCTGTGTCGACGTTGC-AGCCGCCTTCGTCCG--ACTCCATGC--TTCC--TTGCTCCACttgttttaatattcaaatacattaaagtgataagaaatgaaaacttaacaattcgtttttttatcgaggtatcaatgaaaaaagtcggcagtcttacaccacttttcatcaatgc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tctttgattgaggtatcaatgaaaaaacaggcaggtaacattttcatcaatgcgtgtaagtttcatttcttatcattaataatgtacttgaaataataaaacaaacagtttccgtcatcaaaaagttttaatttacgattttgaaagggcgcgtatgaatacataatacgcaacagaaatcaacatggaattcaaaatggatgttcgttctggcgaaggagatttactaagcagagttaaacggatttgaggagaaattgaaggtgcaatgattaaaagctgaattagagataaacgaagatgtcaagtggtgagacaatgtgtgttgaatggtgtttgaggagacgttcaacactggctgtgtcgtgggaaccTTCGTCC-GACTCCATGC----TTCC-TTGC----TCCACGGTTCCCAC-GACAC-AGCCAGTGTTGAACGTCTCC-T-CAAACACCATTCAACA-CACATTGTCTC--ACCACTTGACATCTTCGTTTA-TCTCTA-----ATTCAGCTTTTAA-TCATTGCACCTTCAATT------TCTCCTCA--AATCCGTTTAACTCTGCTTAGTAAATCT-CCTTCGCCAGA-ACGAACAT---CCA-TTTTGAATTCC------ATGTTGATTTCTGTTGCGTATTATGTATTCATACGCGCC-------------CTTTCAAAATCGTAAATT-AAAACTTTTTGATGACGGAAACTGTaggagaaaggacgggcaactttcgccagtgcagtgctcagttggtgtttctgtgctgtggaacactcc
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|16 ): AGAAATGAAACTTACAATTCGTTTCATGATCGAGGTATCAATGAAAAAAAATCGGCAGTTAACATCATCA
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Reference ( family-6838 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCATTTAA-TAAT-C--TTTAAA---T-GATGGCTTAACA-CA---GATTCTG--AT--TGGATG--------AAAAA--AA--T-TNT------GATTT-CTTA-AT---AA-A--AAAA---AT--TT--TT-----GGTN--CGGGAGTTCATCTGCACTAAGCANTC-A--CG---GG--ACT--ACTTTT-CTCNGGAATGCGTCTTACGCT----------ATTTT-----------TAGAACGGGGATTTCCGCA-AAA--------TCAA---C--GCG-ATGC-G---TGTATTCGTTTGAATTGTTTTT-TTA-ATT-GCCTAC-TAA-AAAT----AAA-CAAAACC---TGTATACGAATAAAATA-ANATAAATTTAATTAANAAAACAAACANCACTAAATTAGGCTAATTGTGATGGTCACAANTAATAA--GATATGTGTGAGTTCAC-GAGACATCNGGGTAGCAAATTACCGTCTGCTTCATAA--TCGATGAGGGACGGATT--CTTCGGCG---ACG---TTCG-ATCTCGGGAATAGTTTAATG--AATTAACTGCTGTGTCGACGTTNCCAGCCGCCTTCGTCCG--ACTCCATGC-GTTCCGCTCGNTCCAC----GGTTC--CCA-GACACAAGATTTCGTCCTNACTCCATGCATGGTTCCTTTGCTCGATCCACGGTTCCCACGGACACTAGCCAGTGTNGAANNTCTCCGTGCAAACACCATNCAACACCACNCTGTCTCGAACCGCNTGACATCTTCGCTTATTCTCTACATGTATTCAGCCTTTAATTCATTGCACCTTCAATTCAAATCTCCCCTCACCAATCCNNTTAACTCTGCTTAGTAAATCT-CCTTCGCCAGA-ACGAANACAGCCCA-TTTCGAATTCCATAGATATGTTGATTTCTGTTGCGTATTATGTATTCATACGCGCCGATCCTATGTATTCTTNCGGCGCCNTNAATTCAAAACTTTTCGATGGCGGNAACTGT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agatgaaaaaagaaactgtaatttcatagttctatttattgattcataaaTCATTTGA-CAAC-A--TTTAAAG--T-GATAGCTTAAAA-AA---GATTCTG--AT--AAAATGA-------AAAAA--AA--G-TTT------GATTT-CTTA-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTAA-TAAT-C--TTTAAGG--T-GATGACTTAACA-AC---GATTCTG--AT--TGGATG--------A
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCATTTAA-TAAT-C--TTTAAAC--T-GATGGCTTAACA-------ATTATG--AT--TGGACG--------AAAAA--AAA-T-TAT------GATTT-CTTA-AT---AA-A--AAAA---AT--TT--TTT----AGTG--CGGGAGTTCACCTGCACTAAACATTC-GACCG---GA--ACT--ACTTTT-CTCAGGAATGTGTCTTACGCT----------ATTTT-----------TAGAATGGGGATTTCCACA-AAA--------TCAA---T--GCGTATTC-G---TGTATTCGTTTGAATTGTTTTTCTTA-ATTCGCTTACGTAAGAAATGCAAAAA-CAAAACC---TGTATACGAATAAAATA-ACATAACTTTAATTAAACAAAC--ACAACACTAAATT----TAATTGTGATGATCACAAATAATAAACAATATGTGTTAGTTCACGGAAACATCGGGAT------TTACCGTTCGCTTCATAACTTCGATCATGAACGGATTGACTC--GCGCACACGTGCTCCGAATCTCCAGCA-AGTTAAATGACAATTAACTGC-GTG-CGACGTTTCCATTCGCTTGCGTCCGGCACTCCATGTAATTCCA-TTGCTCCACTTTTTGCTCTGCTT-GAT-TTAGATTTTGTCC-GACTCCATGC----TTCC-TTGC----TCCACGGTTCCCAC-GACAC-AGCCAGTGTTGAGAGTCTCC-T-CAAACACCATGCAACA-CACATTGTCTC--ACCGCTTGACATCTTCACGTA-TCTCTA-----ATTCAGCTTTTAA-TCATTGCACCTT-----------TCCCCTCA--AAT-CGTTTAACTCTGCTCAGTAACTCTACCTTCGCCATACACGCACACA--CCATTTTTGAATTCCATGTA-ATGTTGATTTCTGTTAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTCGTCC-GACTCCATGC----TTCCTT-GCTC----CACGGTTCCCACG-ACAC-AGCCAGTGTTGAACGTCTCC-T-CAAACACCATTCAACAC-ACATTGTCTC--ACCACTTGACATCTTCGTTTAT-CTCTA-----ATTCAGCTTTTAAT-CATTGCACCTTCAATT------TCTCCTCA--AATCCGTTTAACTCTGCTTAGTAAATCT-CCTTCGCCAGA-ACGAACA---TCCA-TTTTGAATTCC------ATGTTGATTTCTGTTGCGTATTATGTATTCATACGCGCC-------------CTTTCAAAATCGTAAATT-AAAACTTTTTGATGACGGAAACTGTctttcaaaatcgttaattaaagctttttgatgacggaaactat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tctttgattgaggtatcaatgaaaaaacaggcaggtaacattttcatcaatgcgtgtaagtttcatttcttatcattaataatgtacttgaaataataaaacaaCTGCTGTGTCGACGTTGC-AGCCGCCTTCGTCCG--ACTCCATGC--TTC--CTTGCTCCAC----GGTTC--CCACGACACAggcggctgcaacgtcgacacagcagaggagaaaggacgggcaactttcgccagtgcagtgctcagttggtgtttctgtgctgtggaacactcc
gi|4                          : tctttgattgaggtatcaatgaaaaaacaggcaggtaacattttcatcaatgcgtgtaagtttcatttcttatcattaataatgtacttgaaataataaaacaaacagtttccgtcatcaaaaagttttaatttacgattttgaaagggcgcgtatgaatacataatacgcaacagaaatcaacatggaattcaaaatggatgttcgttctggcgaaggagatttactaagcagagttaaacggatttgaggagaaattgaaggtgcaatgattaaaagctgaattagagataaacgaagatgtcaagtggtgagacaatgtgtgttgaatggtgtttgaggagacgttcaacactggcAT-C--TTTAAAC--T-GATGGCTTAACAACA----ATTATG--AT--TGGACG--------AAAAA--AAAAT-TCT------GATTT-CTTA-AT---AA-A--AAAA---AT--TT--TT-----AGTG--CGAGAGTTCAACTGCACTAAACATTCTA--CC---GGAAACTAAACTTTTGCTCAGGAATGTGTCTTACGCA----------ATTTT-----------TAGAATGGGGATTTCCACA-AAA--------TCAAATGCAAGCG-ATG-------GTATTCGTTTGAA-TGTTTTT-T---ATT-G-CTAC-TAA-AAAT----AAA-CAAACCG---TGTATACGAATATAATACAAATAA--TTAATTAA-AAAACA---ACCACTAA------TTAATTGTGAT-GTCACAATTAATAA--GATA-GTGTGAGTTCAC-GAGACATC-GGGTAaggagaaaggacgggcaactttcgccagtgcagtgctcagttggtgtttctgtgctgtggaacactcc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTCA-TAAT-A--TTTAAG---T-GATGGCTTAACA-AC---GATTCTG--AT--TGGATG--------AAAAA--------TTC------GTTTT-ATTA-CT---GC-AGCAAAA---A--------------------CAAAA--TCATCTGCACTTGGCAGTT-AA-CGTTTGG--ACT--ACTTCT-CAATGGAATGCGTCTT-CGTTCCCTGTTCGTATTTTATTCCTAGTTATAGAACGGGTATTTCCGCATAAATTTCATTTTCAA---CTTG-G-ATACAA---TACATTCGTTTGGATT-TTTTG-TTACATT-G-CTAT-CAA-AAAT----AAA-CACAATCAAATGCATA--AATGAAAAA-A
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCATTTAAATATT-C--TCTAAAAACT-GATGGCTTAACA-GATGAAATTATGTAATGATGGACA--------CGAAAT-AG--T-TCTTTTAATGATTT-CCT---T---AA-G--ATAA---TT--TT--TTTACTTAGTTGACGGGAGTTCACCTGCACTAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aatttttgaatttaactttcttataTTAAA---T-GATGGCTTAACA-AC---TATTCCG--AT--TGGATG--------AAAAG--TT--TGTTT------GATTTTCTTT-TT---AA-A--AA--------------T-----GGC-------AGTTAATCTGAACTAAGCACTT-----G---GG--ACT--ACTTTT-CTCTGGACTGCGTTTTatgaatctgcgaatattaaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agaacttcATTTGA-TAAC-C--TTTAAAG--T-GATGGCTTAACA-AC---GATTCTG--AT--AAGATG--------AAAAATTCG--T-TTT-------ATTT-CTTA-ATGTAAA-A--AAAA---A--------T-----GGTC--CTGGAGTTCATCTccccgttcaaaatttagttct
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTAA-TAGT-C--TTTAAA---TTGTTGGCTTAACA-AC---GAGTTTG--GT--TAGATG--------AAAAC--TT--TATTT------GATTT-TTTTTATTG-AA-A--AAAA---AA--GA--TT-----GGTC--CGGGATTTTATCTGCTCTAAGCACTC-A-------GG--AGT--ACTTTT-CTCctctagaatgcgtcatcgttccccaatctaagttc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): AAGAATGAAACTTACACTTCATTTTTTGATCGAGGTAATCAAAATTGAAAAAAATCGGCAAGTTAACATCATCAATGCGCG
Unaligned ( gi|16 ): AGAAATGAAACTTACAATTCGTTTCATGATCGAGGTATCAATGAAAAAAAATCGGCAGTTAACATCATCA
Unaligned ( gi|17 ): AAGAAATGAAACTGATCGAGGTATCAATGACAAAAATCGGCAGTTTACA






Alignments
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|16 ): AGAAATGAAACTTACAATTCGTTTCATGATCGAGGTATCAATGAAAAAAAATCGGCAGTTAACATCATCA
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CGTTAATT-AAAGCTTTTTGATGACGGAAACTATctttcaaaatcgttaattaaagctttttgatgacggaaactat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                tcatttaataatctttaaactgatggcttaacaattatgattggacgaaaaaaaattatgatttcttaataaaaaaaattttttagtgcgggagttcacctgcactaaacattcgaccggaactacttttctcaggaatgtgtcttacgctatttttagaatggggatttccacaaaatcaatgcgtattcgtgtattcgtttgaattgtttttcttaattcgcttacgtaagaaatgcaaaaacaaaacctgtatacgaataaaataacataactttaattaaacaaacacaacactaaatttaattgtgatgatcacaaataataaacaatatgtgttagttcacggaaacatcgggatttaccgttcgcttcataacttcgatcatgaacggattgactcgcgcacacgtgctccgaatctccagcaagttaaatgacaattaactgcgtgcgacgtttccattcgcttgcgtccggcactccatgtaattccattgctccactttttgctctgcttgatttagattttgtccgactccatgcttccttgctccacggttcccacgacacagccagtgttgagagtctcctcaaacaccatgcaacacacattgtctcaccgcttgacatcttcacgtatctctaattcagcttttaatcattgcacctttcccctcaaatcgtttaactctgctcagtaactctaccttcgccatacacgcacacaccatttttgaattccatgtaatgttgatttctgttacctttcaaaatTTCGTCCG-ACTCCATGC----TTCCTT-GCTC----CACGGTTCCCACG-ACAC-AGCCAGTGTTGAACGTCTCC-T-CAAACACCATTCAACAC-ACATTGTCTC--ACCACTTGACATCTTCGTTTAT-CTCTA-----ATTCAGCTTTTAAT-CATTGCACCTTCAA-TTTCTCCTCA--AATCCGTTTAACTCTGCTTAGTAAA-TCT-CCTTCGCCAGA-ACGA--ACA-TCCATTTTGAATTCC-------ATGTTGATTTCTGTTGCGTATTATGTATTCATACGCGCC-------------CTTTCAAAATCGTAAATT-AAAACTTTTTGATGACGGAAACTGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tctttgattgaggtatcaatgaaaaaacaggcaggtaacattttcatcaatgcgtgtaagtttcatttcttatcattaataatgtacttgaaataataaaacaaCTGCTGTGTCGACGTTG-CAGCCGCCTTCGTCCG--ACTCCATGC--TTC--CTTGCTCCAC----GGTTC--CCACGACACAggcggctgcaacgtcgacacagcagaggagaaaggacgggcaactttcgccagtgcagtgctcagttggtgtttctgtgctgtggaacactcc
gi|4                          : tctttgattgaggtatcaatgaaaaaacaggcaggtaacattttcatcaatgcgtgtaagtttcatttcttatcattaataatgtacttgaaataataaaacaaacagtttccgtcatcaaaaagttttaatttacgattttgaaagggcgcgtatgaatacataatacgcaacagaaatcaacatggaattcaaaatggatgttcgttctggcgaaggagatttactaagcagagttaaacggatttgaggagaaattgaaggtgcaatgattaaaagctgaattagagataaacgaagatgtcaagtggtgagacaatgtgtgttgaatggtgtttgaggagacgttcaacactggcAT-C--TTTAAAC--T-GATGGCTTAACA-ACAA--TTATG--AT--TGGAC--G--AAAA--------A--A--AAAT-TC-T-----GATTT-CT-TA-AT---AA-AA--AAA---AT--TT--TT-----AGTG--CGAGAGTTCAACTGCACTAAACATTCTA--CC---GGAAACTAAACTTTTGCTCAGGAATGTGTCTTACGC----------AATTTT-----------TAGAATGGGGATTTCCACA-AAA--------TCAAATGCAAGCG-ATG-------GTATTCGTTTGAA-TGTTTTT-T---ATT-G-CTAC-TAA-AAAT----AAA-CA-----AACCGTGTATACGAATATAATACAAATAA--TTAATTAA-A-AAACAA-C--CACTAAT-----TAATTGTGATG-TCACAATTAATAA--GATA-GTGTGAGTTCAC-GAGACATC-GGGTAaggagaaaggacgggcaactttcgccagtgcagtgctcagttggtgtttctgtgctgtggaacactcc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTCA-TAAT-A--TTTAAG---T-GATGGCTTAACA-ACGA--TTCTG--AT--TGGAT--G--AAAA--------ATTC--G--T-TT-T------ATTA-CTGCA-GC---AA-AAACAAA---A---------------------------TCATCTGCACTTGGCAGTTAA--CGTTTGG--ACT--ACTTCT-CAATGGAATGCGTCTT-CGTTCCCTGTTCGTATTTTATTCCTAGTTATAGAACGGGTATTTCCGCATAAATTTCATTTTCAA---CTTG-G-ATACAA---TACATTCGTTTGGATT-TTTTG-TTACATT-G-CTAT-CAA-AAAT----AAA-CACAATCAAATGCATAAATGAA-AAAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCATTTAAATATT-C--TCTAAAAACT-GATGGCTTAACAGATGAAATTATGTAATGATGGACACG--AAAT--------A--G--T--T-CT-TTTAATGATTT-CC-T---T---AA-GA--TAA---TT--TT--TTTACTTAGTTGACGGGAGTTCACCTGCACTAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aatttttgaatttaactttcttataTTAAA---T-GATGGCTTAACA-ACTA--TTCCG--AT--TGGAT--G--AAAA--------G--T--T--TGTT-T-----GATTTTCT-TT-TT---AA-AA--A--------------T-----GGC-------AGTTAATCTGAACTAAGCACTT-----G---GG--ACT--ACTTTT-CTCTGGACTGCGTTTTatgaatctgcgaatattaaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agaacttcATTTGA-TAAC-C--TTTAAAG--T-GATGGCTTAACA-ACGA--TTCTG--AT--AAGAT--G--AAAA--------ATTC--G--T-TT-T------ATTT-CT-TA-ATGTAAA-AA--AAA---A--------T-----GGTC--CTGGAGTTCATCTccccgttcaaaatttagttct
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTAA-TAGT-C--TTTAAA---TTGTTGGCTTAACA-ACGA--GTTTG--GT--TAGAT--G--AAAA--------C--T--T--TATT-T-----GATTT-TT-TTTATTG-AA-AA--AAA---AA--GA--TT-----GGTC--CGGGATTTTATCTGCTCTAAGCACTC-A-------GG--AGT--ACTTTT-CTCctctagaatgcgtcatcgttccccaatctaagttc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): AAGAATGAAACTTACACTTCATTTTTTGATCGAGGTAATCAAAATTGAAAAAAATCGGCAAGTTAACATCATCAATGCGCG
Unaligned ( gi|16 ): AGAAATGAAACTTACAATTCGTTTCATGATCGAGGTATCAATGAAAAAAAATCGGCAGTTAACATCATCA
Unaligned ( gi|17 ): AAGAAATGAAACTGATCGAGGTATCAATGACAAAAATCGGCAGTTTACA






Alignments
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CGTTAATT-AAAGCTTTTTGATGACGGAAACTATctttcaaaatcgttaattaaagctttttgatgacggaaactat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                   tcatttaataatctttaaactgatggcttaacaattatgattggacgaaaaaaaattatgatttcttaataaaaaaaattttttagtgcgggagttcacctgcactaaacattcgaccggaactacttttctcaggaatgtgtcttacgctatttttagaatggggatttccacaaaatcaatgcgtattcgtgtattcgtttgaattgtttttcttaattcgcttacgtaagaaatgcaaaaacaaaacctgtatacgaataaaataacataactttaattaaacaaacacaacactaaatttaattgtgatgatcacaaataataaacaatatgtgttagttcacggaaacatcgggatttaccgttcgcttcataacttcgatcatgaacggattgactcgcgcacacgtgctccgaatctccagcaagttaaatgacaattaactgcgtgcgacgtttccattcgcttgcgtccggcactccatgtaattccattgctccactttttgctctgcttgatttagattttgtccgactccatgcttccttgctccacggttcccacgacacagccagtgttgagagtctcctcaaacaccatgcaacacacattgtctcaccgcttgacatcttcacgtatctctaattcagcttttaatcattgcacctttcccctcaaatcgtttaactctgctcagtaactctaccttcgccatacacgcacacaccatttttgaattccatgtaatgttgatttctgttacctttcaaaatTTCGTCCG-ACTCCATGC----TTCCTT-GCTC----CACGGTTCCCACG-ACAC-AGCCAGTGTTGAACGTCTCC-T-CAAACACCATTCAACAC-ACATTGTCTC--ACCACTTGACATCTTCGTTTAT-CTCTA-----ATTCAGCTTTTAAT-CATTGCACCTTCAA-TTTCTCCTCA--AATCCGTTTAACTCTGCTTAGTAAA-TCT-CCTTCGCCAGA-ACG--AACA-TCCATTTTGAATTCC-------ATGTTGATTTCTGTTGCGTATTATGTATTCATACGCGCC-------------CTTTCAAAATCGTAAATT-AAAACTTTTTGATGACGGAAACTGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tctttgattgaggtatcaatgaaaaaacaggcaggtaacattttcatcaatgcgtgtaagtttcatttcttatcattaataatgtacttgaaataataaaacaaCTGCTGTGTCGACGTTG-CAGCCGCCTTCGTCCG--ACTCCATGC--TTC--CTTGCTCCAC----GGTTC--CCACGACACAggcggctgcaacgtcgacacagcagaggagaaaggacgggcaactttcgccagtgcagtgctcagttggtgtttctgtgctgtggaacactcc
gi|4                          : tctttgattgaggtatcaatgaaaaaacaggcaggtaacattttcatcaatgcgtgtaagtttcatttcttatcattaataatgtacttgaaataataaaacaaacagtttccgtcatcaaaaagttttaatttacgattttgaaagggcgcgtatgaatacataatacgcaacagaaatcaacatggaattcaaaatggatgttcgttctggcgaaggagatttactaagcagagttaaacggatttgaggagaaattgaaggtgcaatgattaaaagctgaattagagataaacgaagatgtcaagtggtgagacaatgtgtgttgaatggtgtttgaggagacgttcaacactggcAT-C--TTTAAAC--T-GATGGCTTAACA-ACAA--TTATG--AT--TGGAC--G--------AAAAA--A--AAAT-TC-T-----GA-TTTCT-T------AAT---AA-AA--AAA---AT--TT--TT-----AGTG--CGAGAGTTCAACTGCACTAAACATTCTA--CC---GGAAACTAAACTTTTGCTCAGGAATGTGTCTTACGC----------AATTTT-----------TAGAATGGGGATTTCCACA-AAA--------TCAAATGCAAGCG-ATG-------GTATTCGTTTGAA-TGTTTTT-T---ATT-G-CTAC-TAA-AAAT----AAA-CA-----AACCGTGTATACGAATATAATACAAATAA--TTAATTAA-A-AAACAA-C--CACTAAT-----TAATTGTGATG-TCACAATTAATAA--GATA-GTGTGAGTTCAC-GAGACATC-GGGTAaggagaaaggacgggcaactttcgccagtgcagtgctcagttggtgtttctgtgctgtggaacactcc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTCA-TAAT-A--TTTAAG---T-GATGGCTTAACA-ACGA--TTCTG--AT--TGGAT--G--------AAAAATTC--G--T-TT-T------A-TTACTGC------AGC---AA-AAACAAA---A---------------------------TCATCTGCACTTGGCAGTTAA--CGTTTGG--ACT--ACTTCT-CAATGGAATGCGTCTT-CGTTCCCTGTTCGTATTTTATTCCTAGTTATAGAACGGGTATTTCCGCATAAATTTCATTTTCAA---CTTG-G-ATACAA---TACATTCGTTTGGATT-TTTTG-TTACATT-G-CTAT-CAA-AAAT----AAA-CACAATCAAATGCATAAATGAA-AAAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCATTTAAATATT-C--TCTAAAAACT-GATGGCTTAACAGATGAAATTATGTAATGATGGACACG--------AAATA--G--T--T-CT-TTTAATGA-TTTCC-T--------T---AA-GA--TAA---TT--TT--TTTACTTAGTTGACGGGAGTTCACCTGCACTAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aatttttgaatttaactttcttataTTAAA---T-GATGGCTTAACA-ACTA--TTCCG--AT--TGGAT--G--------AAAAG--T--T--TGTT-T-----GATTTTCT-T------TTT---AA-AA--A--------------T-----GGC-------AGTTAATCTGAACTAAGCACT-----TG---GG--ACT--ACTTTT-CTCTGGACTGCGTTTTatgaatctgcgaatattaaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agaacttcATTTGA-TAAC-C--TTTAAAG--T-GATGGCTTAACA-ACGA--TTCTG--AT--AAGAT--G--------AAAAATTC--G--T-TT-T------A-TTTCT-T------AATGTAAA-AA--AAA---A--------T-----GGTC--CTGGAGTTCATCTccccgttcaaaatttagttct
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTAA-TAGT-C--TTTAAA---TTGTTGGCTTAACA-ACGA--GTTTG--GT--TAGAT--G--------AAAAC--T--T--TATT-T-----GA-TTTTT-TTTATTGAAA---AA-AA--AAG---A-------TT-----GGTC--CGGGATTTTATCTGCTCTAAGCACTC-A-------GG--AGT--ACTTTT-CTCctctagaatgcgtcatcgttccccaatctaagttc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): AAGAATGAAACTTACACTTCATTTTTTGATCGAGGTAATCAAAATTGAAAAAAATCGGCAAGTTAACATCATCAATGCGCG
Unaligned ( gi|16 ): AGAAATGAAACTTACAATTCGTTTCATGATCGAGGTATCAATGAAAAAAAATCGGCAGTTAACATCATCA
Unaligned ( gi|17 ): AAGAAATGAAACTGATCGAGGTATCAATGACAAAAATCGGCAGTTTACA






Alignments
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CGTTAATT-AAAGCTTTTTGATGACGGAAACTATctttcaaaatcgttaattaaagctttttgatgacggaaactat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                   tcatttaataatctttaaactgatggcttaacaattatgattggacgaaaaaaaattatgatttcttaataaaaaaaattttttagtgcgggagttcacctgcactaaacattcgaccggaactacttttctcaggaatgtgtcttacgctatttttagaatggggatttccacaaaatcaatgcgtattcgtgtattcgtttgaattgtttttcttaattcgcttacgtaagaaatgcaaaaacaaaacctgtatacgaataaaataacataactttaattaaacaaacacaacactaaatttaattgtgatgatcacaaataataaacaatatgtgttagttcacggaaacatcgggatttaccgttcgcttcataacttcgatcatgaacggattgactcgcgcacacgtgctccgaatctccagcaagttaaatgacaattaactgcgtgcgacgtttccattcgcttgcgtccggcactccatgtaattccattgctccactttttgctctgcttgatttagattttgtccgactccatgcttccttgctccacggttcccacgacacagccagtgttgagagtctcctcaaacaccatgcaacacacattgtctcaccgcttgacatcttcacgtatctctaattcagcttttaatcattgcacctttcccctcaaatcgtttaactctgctcagtaactctaccttcgccatacacgcacacaccatttttgaattccatgtaatgttgatttctgttacctttcaaaatTTCGTCCG-ACTCCATGC----TTCCTT-GCTC----CACGGTTCCCACG-ACAC-AGCCAGTGTTGAACGTCTCC-T-CAAACACCATTCAACAC-ACATTGTCTC--ACCACTTGACATCTTCGTTTAT-CTCTA-----ATTCAGCTTTTAAT-CATTGCACCTTCAA-TTTCTCCTCA--AATCCGTTTAACTCTGCTTAGTAAA-TCT-CCTTCGCCAGA-ACG--AACA-TCCATTTTGAATTCC-------ATGTTGATTTCTGTTGCGTATTATGTATTCATACGCGCC-------------CTTTCAAAATCGTAAATT-AAAACTTTTTGATGACGGAAACTGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tctttgattgaggtatcaatgaaaaaacaggcaggtaacattttcatcaatgcgtgtaagtttcatttcttatcattaataatgtacttgaaataataaaacaaCTGCTGTGTCGACGTTG-CAGCCGCCTTCGTCCG--ACTCCATGC--TTC--CTTGCTCCAC----GGTTC--CCACGACACAggcggctgcaacgtcgacacagcagaggagaaaggacgggcaactttcgccagtgcagtgctcagttggtgtttctgtgctgtggaacactcc
gi|4                          : tctttgattgaggtatcaatgaaaaaacaggcaggtaacattttcatcaatgcgtgtaagtttcatttcttatcattaataatgtacttgaaataataaaacaaacagtttccgtcatcaaaaagttttaatttacgattttgaaagggcgcgtatgaatacataatacgcaacagaaatcaacatggaattcaaaatggatgttcgttctggcgaaggagatttactaagcagagttaaacggatttgaggagaaattgaaggtgcaatgattaaaagctgaattagagataaacgaagatgtcaagtggtgagacaatgtgtgttgaatggtgtttgaggagacgttcaacactggcAT-C--TTTAAAC--T-GATGGCTTAACA-ACAA--TTATG--AT--TGGAC--G--------AAAAA--A--AAAT-TC-T-----GA-TTTCT-T------AAT---AA-AA--AAA---AT--TT--TT-----AGTG--CGAGAGTTCAACTGCACTAAACATTCTA--CC---GGAAACTAAACTTTTGCTCAGGAATGTGTCTTACGC----------AATTTT-----------TAGAATGGGGATTTCCACA-AAA--------TCAAATGCAAGCG-ATG-------GTATTCGTTTGAA-TGTTTTT-T---ATT-G-CTAC-TAA-AAAT----AAA-CA-----AACCGTGTATACGAATATAATACAAATAA--TTAATTAA-A-AAACAA-C--CACTAAT-----TAATTGTGATG-TCACAATTAATAA--GATA-GTGTGAGTTCAC-GAGACATC-GGGTAaggagaaaggacgggcaactttcgccagtgcagtgctcagttggtgtttctgtgctgtggaacactcc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTCA-TAAT-A--TTTAAG---T-GATGGCTTAACA-ACGA--TTCTG--AT--TGGAT--G--------AAAAATTC--G--T-TT-T------A-TTACTGC------AGC---AA-AAACAAA---A---------------------------TCATCTGCACTTGGCAGTTAA--CGTTTGG--ACT--ACTTCT-CAATGGAATGCGTCTT-CGTTCCCTGTTCGTATTTTATTCCTAGTTATAGAACGGGTATTTCCGCATAAATTTCATTTTCAA---CTTG-G-ATACAA---TACATTCGTTTGGATT-TTTTG-TTACATT-G-CTAT-CAA-AAAT----AAA-CACAATCAAATGCATAAATGAA-AAAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCATTTAAATATT-C--TCTAAAAACT-GATGGCTTAACAGATGAAATTATGTAATGATGGACACG--------AAATA--G--T--T-CT-TTTAATGA-TTTCC-T--------T---AA-GA--TAA---TT--TT--TTTACTTAGTTGACGGGAGTTCACCTGCACTAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aatttttgaatttaactttcttataTTAAA---T-GATGGCTTAACA-ACTA--TTCCG--AT--TGGAT--G--------AAAAG--T--T--TGTT-T-----GATTTTCT-T------TTT---AA-AA--A--------------T-----GGC-------AGTTAATCTGAACTAAGCACT-----TG---GG--ACT--ACTTTT-CTCTGGACTGCGTTTTatgaatctgcgaatattaaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agaacttcATTTGA-TAAC-C--TTTAAAG--T-GATGGCTTAACA-ACGA--TTCTG--AT--AAGAT--G--------AAAAATTC--G--T-TT-T------A-TTTCT-T------AATGTAAA-AA--AAA---A--------T-----GGTC--CTGGAGTTCATCTccccgttcaaaatttagttct
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTAA-TAGT-C--TTTAAA---TTGTTGGCTTAACA-ACGA--GTTTG--GT--TAGAT--G--------AAAAC--T--T--TATT-T-----GA-TTTTT-TTTATTGAAA---AA-AA--AAG---A-------TT-----GGTC--CGGGATTTTATCTGCTCTAAGCACTC-A-------GG--AGT--ACTTTT-CTCctctagaatgcgtcatcgttccccaatctaagttc


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Reference ( family-6838 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCATTTAA-TAAT-C--TTTAAA---T-GATGGCTTAACA-ACGA--TTCTG--AT--TGGAT--G--------AAAAAN--TTGTT-T----GATTT-CT-T------AAT---AA-AA--AAAATT-TTTTG----GT---C-GGG-AGTTCATCTGCACTAAGCANT---C-----G----GGACTA--CTTTT-CTCTGGAATGCGTCTTACGC----------TATTTT-----------TAGAATGGGGATTTCCACA-AAA--------TCAA---C--GCG-ATGC-G---TGTATTCGTTTGAATTGTTTTT-TTA-ATT-GCCTAC-TAA-AAAT----AAA-CA-----AAACGCGTATACGAATAAAATA-ACATAA-TTTAATTAA-A-AAACAA-CAACACTAATT---CTAATTGTGATG-TCACAAATAATAA--GATATGTGTGAGTTCAC-GAGACATC-GGGTAGCAANTTACCGTCCGCTTCATAACTTCGATNANGGACGGATTGACTCCGGCGCACACGTGCTCCGAATCTCCGGNATAGTTNAATGACAATTAACTGCTGTGTCGACGTTT-CAGCCGCTTTCGTCCG--ACTCCATGC-GTTCCGCTCGCTCCAC----GGTTC--CCA-GACACAAGATTTCGTCCG-ACTCCATGC----TTCCTTTGCTC--TCCACGGTTCCCACGGACAC-AGCCAGTGTTGAAAGTCTCC-T-CAAACACCATGCAACACCACATTGTCTC--ACCGCTTGACATCTTCGCTTATTCTCTA-----ATTCAGCTTTTAATTCATTGCACCTTCAA-TTTCCCCTCA--AATCCGTTTAACTCTGCTCAGT-AA-TCT-CCTTCGCCAGA-ACG-AAACA-CCCATTTCGAATTCCAT-G-A-ATGTTGATTTCTGTTGCGTATTATGTATTCATACGCGCCGATCCTATGTATTCTTNCGGCGCCGTTAATT-AAAACTTTTCGATGACGGAAACTAT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCATTTAA-TAAT-C--TCTAAAC--T-GATGGCa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agatgaaaaaagaaactgtaatttcatagttctatttattgattcataaaTCATTTGA-CAAC-A--TTTAAAG--T-GATAGCTTAAAA-AAGA--TTCTG--AT--AAAAT--G--------AAAAAA--AAGTT-T----GATTT-CT-T------A
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTAA-TAAT-C--TTTAAGG--T-GATGACTTAACA-ACGA--TTCTG--AT--TGGAT--G--------A
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCATTTAA-TAAT-C--TTTAAAC--T-GATGGCTTAACA-A-----TTATG--AT--TGGAC--G--------AAAAAAAATTAT-------GATTT-CT-T------AAT---AA-AA--AAAATT-TTTTA----GTG--C-GGG-AGTTCACCTGCACTAAACATT---C-----GACCGGAACTA--CTTTT-CTCAGGAATGTGTCTTACGC----------TATTTT-----------TAGAATGGGGATTTCCACA-AAA--------TCAA---T--GCGTATTC-G---TGTATTCGTTTGAATTGTTTTTCTTA-ATTCGCTTACGTAAGAAATGCAAAAA-CA-----AAACCTGTATACGAATAAAATA-ACATAACTTTAATTAA-ACAAAC-A-CAACACTAAAT---TTAATTGTGATGATCACAAATAATAAACAATATGTGTTAGTTCACGGAAACATC-GGG-----ATTTACCGTTCGCTTCATAACTTCGATCATGAACGGATTGACTC--GCGCACACGTGCTCCGAATCTCCAGCA-AGTTAAATGACAATTAACTGC-GTG-CGACGTTTCCATTCGCTTGCGTCCGGCACTCCATGTAATTCCA-TTGCTCCACTTTTTGCTCTGCTT-GAT-TTAGATTTTGTCCG-ACTCCATGC----TTCC-TTG--C--TCCACGGTTCCCAC-GACAC-AGCCAGTGTTGAGAGTCTCC-T-CAAACACCATGCAACA-CACATTGTCTC--ACCGCTTGACATCTTCACGTA-TCTCTA-----ATTCAGCTTTTAA-TCATTGCACC------TTTCCCCTCA--AAT-CGTTTAACTCTGCTCAGT-AACTCTACCTTCGCCATACACGCACACA-CCATTTTTGAATTCCAT-GTA-ATGTTGATTTCTGTTAC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CGTTAATT-AAAGCTTTTTGATGACGGAAACTATctttcaaaatcgttaattaaagctttttgatgacggaaactat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                            tcatttaataatctttaaactgatggcttaacaattatgattggacgaaaaaaaattatgatttcttaataaaaaaaattttttagtgcgggagttcacctgcactaaacattcgaccggaactacttttctcaggaatgtgtcttacgctatttttagaatggggatttccacaaaatcaatgcgtattcgtgtattcgtttgaattgtttttcttaattcgcttacgtaagaaatgcaaaaacaaaacctgtatacgaataaaataacataactttaattaaacaaacacaacactaaatttaattgtgatgatcacaaataataaacaatatgtgttagttcacggaaacatcgggatttaccgttcgcttcataacttcgatcatgaacggattgactcgcgcacacgtgctccgaatctccagcaagttaaatgacaattaactgcgtgcgacgtttccattcgcttgcgtccggcactccatgtaattccattgctccactttttgctctgcttgatttagattttgtccgactccatgcttccttgctccacggttcccacgacacagccagtgttgagagtctcctcaaacaccatgcaacacacattgtctcaccgcttgacatcttcacgtatctctaattcagcttttaatcattgcacctttcccctcaaatcgtttaactctgctcagtaactctaccttcgccatacacgcacacaccatttttgaattccatgtaatgttgatttctgttacctttcaaaatTTCGTCCG-ACTCCATGC----TTCCTT-GCTC----CACGGTTCCCACG-ACAC-AGCCAGTGTTGAACGTCTCC-T-CAAACACCATTCAACAC-ACATTGTCTC--ACCACTTGACATCTTCGTTTAT-CTCTA-----ATTCAGCTTTTAAT-CATTGCACCTTCAA-TTTCTCCTCA--AATCCGTTTAACTCTGCTTAGTAAA-TCT-CCTTCGCCAGA-ACG--AACA-TCCATTTTGAATTCC-------ATGTTGATTTCTGTTGCGTATTATGTATTCATACGCGCC-------------CTTTCAAAATCGTAAATT-AAAACTTTTTGATGACGGAAACTGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tctttgattgaggtatcaatgaaaaaacaggcaggtaacattttcatcaatgcgtgtaagtttcatttcttatcattaataatgtacttgaaataataaaacaaCTGCTGTGTCGACGTTG-CAGCCGCCTTCGTCCG--ACTCCATGC--TTC--CTTGCTCCAC----GGTTC--CCACGACACAggcggctgcaacgtcgacacagcagaggagaaaggacgggcaactttcgccagtgcagtgctcagttggtgtttctgtgctgtggaacactcc
gi|4                          : tctttgattgaggtatcaatgaaaaaacaggcaggtaacattttcatcaatgcgtgtaagtttcatttcttatcattaataatgtacttgaaataataaaacaaacagtttccgtcatcaaaaagttttaatttacgattttgaaagggcgcgtatgaatacataatacgcaacagaaatcaacatggaattcaaaatggatgttcgttctggcgaaggagatttactaagcagagttaaacggatttgaggagaaattgaaggtgcaatgattaaaagctgaattagagataaacgaagatgtcaagtggtgagacaatgtgtgttgaatggtgtttgaggagacgttcaacactggcAT-C--TTTAAAC--T-GATGGCTTAACA-ACAA--TTATG--AT--TGGAC--G--------AAAAAA--AAATTCT----GATTT-CT-T------AAT---AA-AA--AAAATT-TTTAG----TG---C-GAG-AGTTCAACTGCACTAAACATT---CTACCGG----AAACTAAACTTTTGCTCAGGAATGTGTCTTACGC----------AATTTT-----------TAGAATGGGGATTTCCACA-AAA--------TCAAATGCAAGCG-ATG-------GTATTCGTTTGAA-TGTTTTT-T---ATT-G-CTAC-TAA-AAAT----AAA-CA-----AACCGTGTATACGAATATAATACAAATAA--TTAATTAA-A-AAACAA-C--CACTAAT-----TAATTGTGATG-TCACAATTAATAA--GATA-GTGTGAGTTCAC-GAGACATC-GGGTAaggagaaaggacgggcaactttcgccagtgcagtgctcagttggtgtttctgtgctgtggaacactcc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTCA-TAAT-A--TTTAAG---T-GATGGCTTAACA-ACGA--TTCTG--AT--TGGAT--G--------AAAAAT--TCGTT-T----TATTA-CTGC------AGC---AA-AAACAAAA--------------------------TCATCTGCACTTGGCAGTTAAC-----GTTT-GGACTA--CTTCT-CAATGGAATGCGTCTT-CGTTCCCTGTTCGTATTTTATTCCTAGTTATAGAACGGGTATTTCCGCATAAATTTCATTTTCAA---CTTG-G-ATACAA---TACATTCGTTTGGATT-TTTTG-TTACATT-G-CTAT-CAA-AAAT----AAA-CACAATCAAATGCATAAATGAA-AAAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCATTTAAATATT-C--TCTAAAAACT-GATGGCTTAACAGATGAAATTATGTAATGATGGACACG--------AAATAG--TTCTT-TTAATGATTT-CC-T--------T---AA-GA--TAATTT-TTTTACTTAGTTGAC-GGG-AGTTCACCTGCACTAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aatttttgaatttaactttcttataTTAAA---T-GATGGCTTAACA-ACTA--TTCCG--AT--TGGAT--G--------AAAAGT--TTGTT-T----GATTTTCT-T------TTT---AA-AA--A---------TG----GC---------AGTTAATCTGAACTAAGCACT---T-----G----GGACTA--CTTTT-CTCTGGACTGCGTTTTatgaatctgcgaatattaaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agaacttcATTTGA-TAAC-C--TTTAAAG--T-GATGGCTTAACA-ACGA--TTCTG--AT--AAGAT--G--------AAAAAT--TCGTT-T----TATTT-CT-T------AATGTAAA-AA--AAAA------TG----GTC--C-TGG-AGTTCATCTccccgttcaaaatttagttct
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): AAGAATGAAACTTACACTTCATTTTTTGATCGAGGTAATCAAAATTGAAAAAAATCGGCAAGTTAACATCATCAATGCGCG
Unaligned ( gi|16 ): AGAAATGAAACTTACAATTCGTTTCATGATCGAGGTATCAATGAAAAAAAATCGGCAGTTAACATCATCA
Unaligned ( gi|17 ): AAGAAATGAAACTGATCGAGGTATCAATGACAAAAATCGGCAGTTTACA