lowQualScore : 1 111 222222222 111111 33333333333333333333333 111 55555555555555555555555555555 11111 11111 666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111 222222 1111111111111 3333333333333333333333333333333 111111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111111111 222222222222222222222222222 1111111 1111111
lowQualScore : 33 1 22 2 2 333 5555 111 2 2 2 2 55 2 22 333 777777777 2 6 4 2 0 444444 3 2 2 22222222222222222222222 2 999 77 2 2 66666666666666666666666666666 2 22222 33 2 2 22222 444 2 5 777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 222222222 55 1 444444 1 66666666 22 1 1 3 3 9999999999999 3 1 1 22 44 3 777 444444 3333333333333333333333333333333 2 555 1 999999999 0 33 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 88888 555555555555 1 7 1 44 44 3 1 1 77 1 55 66666666 44 333 1 1 22 1 888888888888888888888888888 77 7777777 0 555 44 88888 4444444 66 1 1 333 1 555 1 33 1 1 22 777 6
lowQualScore : .. . .. . . ... .... ... . . . . .. . .. ... ......... . . . . . ...... . . . ....................... . ... .. . . ............................. . ..... .. . . ..... ... . . ................................................... . ......... .. . ...... . ........ .. . . . . ............. . . . .. .. . ... ...... ............................... . ... . ......... . .. . ........................................................... . ..... ............ . . . .. .. . . . .. . .. ........ .. ... . . .. . ........................... .. ....... . ... .. ..... ....... .. . . ... . ... . .. . . .. ... .
lowQualScore : 22 8 99 1 0 555 6666 777 0 0 1 1 88 1 99 777 222222222 0 0 0 0 3 333333 4 2 1 77777777777777777777777 2 222 11 1 1 77777777777777777777777777777 5 99999 44 5 5 66666 444 5 0 222222222222222222222222222222222222222222222222222 5 333333333 22 8 444444 8 66666666 55 8 8 5 5 5555555555555 5 7 5 44 11 3 222 888888 1111111111111111111111111111111 8 000 8 000000000 6 99 7 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 8 99999 777777777777 8 0 7 88 88 5 7 7 66 7 99 33333333 11 222 8 9 11 9 666666666666666666666666666 22 2222222 4 000 11 77777 1111111 55 8 8 222 8 000 8 11 9 9 66 999 0
consensus : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGNA--CGAA--TTAGAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTACT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-AATTACTT--TTCC-GG-AT---------ATTNCA-------AGGTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------GT---T----------TN-T--G-TCA----CGC--GG-TT-C---TTT---AGAA-CCGG-TTT--TCAG--A--G---CAAA-GCT-A-TAT--AAGGAAAAGCG-TGGG---T-GTTAAA------TA-CCAG--TTT-AG--G--ACGACAC-G--G-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A----CGTA-C-GCT--T--AA-ATTTT---ATG-A----AATG-T---TCAT-C-AA---ATTTAA-A--TT-TATTTAATCC---A-ACTT-NA--A--TATACA-ATTACATG-T-A---T-TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AA----TAT-TGT--AC-A-GTA-TT-----AAA----C-A-----G-C-TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-CCACA-T-A-------A---------T-----G---TGT--T-------TGT---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--AT--GGATT-TAAAGGA
Reference ( gi|4 ) : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGTA--CGAA--CTAGAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTACT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-AATTACTT--TTTC-GG-A----------ATTAGA-------AGGTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------GT---T----------TT-T--G-TCA----CGT--GG-TT-C---TTT---AGAA-CCGG-TTT--TCAG--A--A---CAAA-GCT-A-TAT--AAGGAAAAGCG-TGAG---T-GTTAAA------TA-CCAG--TTT-A---G--ACGACAC-G--G-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A----CGTA-C-GTT--T--AA-ATTTT---ATG-A----AATG-T---TCGT-C-AA---ATTTAA-A--TT-TATTTAATCC---A-ACTT-CA--A--TGTACA-ATTACATG-T-A---T-TAT-A-TA-T--AT-G----T---A-C--AA----TAC-TGT--AT-A-GTA-TT-----AAA----T-A-----G-C-TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-CCACA-T-A-------A---------T-----A---TGT--T-------TGT---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--AT--AGATT-TAAAGGA
gi|10 : ATTTCT--TTCGT--TT-G-T---GGTA--TGAA--TTAGAC-AGAA-A-TC-AA--TAT-CTACT--T---GGT-----T---TAA-T-A-ATG-AATTGCTT--GTCT-GG-A----------AATATA-------AGGTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------GT---T----------TA-T--G-TTA----GGT--GG-TT-C---TTT---AGAA-CCGA-TTT---CGG--ATAG---CAAG-GCT-A-TAT-----------C---------T-GTTAAT------TA-CCAG--TTT-AT--G--ACGACAC-G--G-G-C-A--G-T-T-GTA-AC--A-------A-A-AGT--T--AA-ATTTT---ATG-G----AATG-T---T------------TTTAT-A--TT-TATTCAATCC---A-ACTT-CATGA--TATACA-ATTA---------------T-G-TA-T--AT-G----T---G-C--AA----CA----------------TT-----AAA----T-A-----T-C-TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-TCACA-C-A-------A---------T-----G---TGTTGT-------TGT---TT--A-----CTA---GTT-T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAACAATGA--TT--GAGTT-TAAA
gi|19 : gATTTCT--TTCGT--CT-G-A---GGAA--CGAA--TTAGAC-AG-----------------------------T-----G---------A-ATG-GATTA-----TTCC-GG-AT---------ATTTCA-------AG-TTTTC---AA-TT-CG-AATACCTTAATAG-GTA--T----------CG-TCAG-TCA----TGT--GG-TT-C---AAT---AGAA-TTGG-TTT--T-----A--AT--CGTA-GCT-----------------C---------T-GTTAAA-------G-TCAG--TTT-AG--G--ATGACAC-G--T-A-A-A--G-C-T-G-A--C--A----AA-A-C-GCT--T--AA-TTTTT---
gi|31 : ATTTCT--TTCGT--TT-G-A---GGTA--AGAA--TTAGAC-AGAA-ttatatattgttataatactatgttttgttaaaacattaaagctgctgcgtgtcgttgctactccattgttaggttgttttattactgaatgggttataaaa
gi|12 : tgATTTCTGGT-CGTCATT-G-A---GG-----GCA---TAGAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTACT--TACGGGTAATA-G---TAA-TGA-ATG-GATTATTA--T----GG-AT---------ATTT---------AGGTTT-C---AAATT-CG-GAAACCTTTATA--GT---A----------TT-CA-G-TCA----TGC--GGGTT-C---A-----AGAAACCGG-TT----------------------CT-A-T-------------TG-TACT---C-GTTAAAGTCACTCA-TCAG--TTTTA---G--ACGACACTA--G-A---A--G-C-T-G-A-CA--A----C--A-C-GCT--T-----------------A----AATG-T----------------TTTAA-G----------AATCC---A-ACT---------TGTAT---TTACATA-C-T---T-TAT-A-TA-CTAAT-G----T----------------T-TGTGAAC-A--CA-TT-----GA-------A-----G-C--G-C-TGC--G-CG-T-C---T-T--GC--------T--AGTCA-TT-TAGAA-T-G-------A---------T-----G---TTT--T-------TAT---TT--A-----caaggttttcattcgaataccagtttctgtcacgtgtttttttttaagaaccgg
gi|17 : TTTTT--T-CGT--TT-G-A---GGTA--CGAA--TTAGAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTACT--T---GGC-----G---TAG-T-A-ATG-AATTACTT--GTTC-GG-A----------ATTGTA-------AGGTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------GT---T----------TT-T--G-TCA----CGT--GG-TT-C---TTT---AGAA-CCGG-TTT--TCAG--A--A---CAAA-GCT-A-TAT--AAGGAAAAGCA-TGGG---T-GTTAAA------TA-CCAG--TTT-AG--G--ACGACAC-G--G-A-C-A--G-C-T-G-A-GA--A----CGTA-C-GTT--T--AA-ATTTT---ATG-A----AATG-T---TCAT-C-AA---ATTTAA-A-----TATTTAATCC---A-ACTT-TA--A--TATACA-ATTACA-G-TCA---TGTAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AA----TAT-TGT--Aactgatcttacagaatgaatggtata
gi|6 : atTTCTT--T-CGT--TT-G-A---GGTA--CGAA--TGAGAC-AGAA-A-TC-AT--CTT-CTACT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-AATGACTT--GTCC-GG-A----------AATGTA-------AGGTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------GT---T----------TG-T--G-TCA----CGT--GG-TT-C---TTT---AGAA-CCTG--TT--TCAGATA--G---CAAG-GCT-A-TAT--AAAGAGATGCA-TAGG---T-GTTAAA------TA-CCCG--TTT-AG--G--ACGACAC-G--G-G-C-A--G-T-T-ACA-AC--A-------A-CAGTA--A--AA-AATCT---ATG-T----AATGTT---TTAT-T-GA---AGTTAA-A--TT-TATTTAATCC---A-ACTT-TATGA--TATACA-TTTACATG---------TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--GA-------------------TA-TT-----ACA----T-A-----G-C-TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-CCACA-C-A-------A---------T-----G---TGTTGT-------TGT---TT--G-----CTA---GAA-T--TCAA-C-T---T-TTA---G-TT-GG-A-AAGTAATGA--AT--GAATT-TAGAGGA
gi|8 : TCTTT--T-CGT--TT-G-A---GGT---CGAA--TTAGAC-AGAA-A-T---A--TTT---ACT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATGCAATTACTTG-TTTC-G--A----------GTTATA-------AGGTTTTCC--A--TT-TG-AATAC----------T---T----------TTAT--G-CTA-----GT--GG-TT-C---TTT---AGAC-CCGGGTTT--TCAG--A--G-----AA-GTT-A-TAT--AAGGAA--GCAATGGG---TTGTTAAA------TA-C-AG--TTT-AAGGG--ACGAAAC-G--G-A-C----G-C-T-G-A--C--A-----GTA-A-GTT--TT-AA-ATTTT---AT--A----AATG-------GT-C-AATCAATTTAG-A--TT--ATTTAATC------ACTG--A--A--TATACA-ATTACATG-T-A---T-----G-CA-T--AA-G----T---A-C--AC----TAT-TGT--AC-A-GTA-AT-----AAA----C-A-----G-C-TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-CCACA-T-A-------A---------C-----GTGTTGT--T-------TAT---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--AT--GGATT-TAAAGGA
gi|32 : TTTCT--TTCAT--TT-G-A---GGTA--CGAA--TTAGAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTACT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-AATTACTT--GTTC-GG-A----------ATTATA-------AGGTTT
gi|9 : TTTCT--TTCGT--TG-GCA---GGAA--CGAA--TTAGACCAGAACACTC-AAATTTC-CTA-T--T---GGT-----TAATTAG-T-A-ATG-AATGGATA--TTCC-GG-A----------TTTTCA-------AGTTCTTCTCAA--TT-CG-AATACCTTTCATAGGT---TGA--------TC-A--G-TCA----TGC--GG-TT-CCAATAT---AAAC-CCGG-TTC--TTA
gi|5 : T--T-CGT--TT-G-A---TGTA--CGAA--TTAGAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTACT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-AATTACTT--GTTC-GG-A----------TTTAAG-------AGGTTT-A---A--TT-CG-AATACAT-------GT---T----------TT-T--G-TCA----CGT--GG-TT-C---TTT---AGAA-CCGG-CTT--TCAG--A--G---CAAA-GCT-A-TAT--AAGGAAAAGCA-TGGG---T-GTTAAA------TA-CCAG--TTT-A---G----GAC------G-A-C-G--G-C-T-G-A-GC--A----CGTA-C-GTT--T--AA-ATTTT---ATG------AATG-T---TCATGC-AA---ATTTAG-A-----TATTTATTGC---A-GCTTGGA--A--TATACA-ATTACTTG-T-G---T-TAT-GTTA-T--ATGG----T---AGC--AA----TA----T--GC-A-GTA-TT-----AAA----C-AC----G-CTTG-C-AGCGGG-TG-T-CG--T-TG-GC--------T--A---A-TT-TCACA-T-A-------A---------T---------TG---T-------TGT---TT--AATTAGTTA---A---T--TCAA-CGT---TGTCA---T-TT-GGAA-AAGTAATGA--AT--GGATT-TAAAGGAttttcgtactctgttaaagtcagatcttaggacgacacgtacgagctgacaacacgcttaaatcttttaaaatgaatgcgaacttgctatttacaagtactgttatcggtacgtttgtttaaacatttaaaagaccttgcgtgtcgttgctagtccatttagagtgttattgtttatttactactcttgtatcagaaatgaatggccccagctttaacgg
gi|2 : tT--T-CGT--AT-G-A---GGTA--CGAA--TTAGAC-AGAA-A-TC-AA--TTTTCTACTGGT---GTT-----G---TAA-T-ACACG-AATTACTT--GT-C-GG-A----------TTTAAG-------AGGTTTTC---A--T--CG-A-TACCT-------GT---T----------TT-T--G-TCAA---CGT--GG-TT-C---TTT---AGAA-CCGG-TTT--TCCA--A--G---CAAAAGCTTA-TAT--AAGGAAAGCTA-TGGG---T-GTTAAA------TA-CCAG--TTT-A---GGGACGACAC-G--G-A-C-AAAG-C-TTG-A-GC--T----CGTA-C-GTT--T--AA-ATTTT---ATG-A----AATG-T---TCAT-C-AA---ATTTGA-------TATTTATTCC---A-ACTT-GA--G--TATACA-ATTACATG-T-------TATTG-TA-T--AC-G----T---A-C--AA----TAA-TGT--AC-A-GTA-TT-----AAA----C-A-----G-C-TG-C-AGC--G-TG-T--G--T-TTTGC--------TT-A---A-TTGCCACAAT-A-------A---------T-----G---TGT--TGGTTGTTTAT---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--TG--GGATT-TAAAG
gi|11 : tctT--T-CGT--TTTG-A---GGAA--CGGAATCTAGAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTACT--T---GGT-----A---TAG-T-AGATG-AATGA-TT--ATTC-GATA----------CTTTCA-------AAGTTTTCA--A--TT-CG-AATACCT--------T---TATAGGTATGATC-A--G-TCATG--CGC--GG-TT-CAA-TAT---AGAA-CCGG-TT----------------------CT-A-T-T-----------CG-TAAGCTCT-GTAAAG------T----AG--TTT-AG--G--ACGACAC-GT-A-A-G-A--G-C-T-G-A-AA--A----CA-----GCT--T--AA-ATTTTAG-ATG-A----Actga
gi|14 : tctT--T-CGT--TT-G-A---GGAA--CGAA--TTAGAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTACT--T---GGTAATA-G---TAA-TGA-ATG-GATTA-----TTCC-GG-AT---------ATTTCA-------A-GTTTTCA--A--TT-CG-AATGCCT-------tcccacattgtatttacatccttatagtactggttttgttaaattaaagctgctgcgtgtcatttagagtgttatgttgtttttattactgatctttgtatcagaaaatgaatggtttataaagg
gi|23 : tT--T-CGT--TT-G-A---GGAA--CGAA--TTAGAC-ATAA-A-TC-AA--TTT-CTACT--G---GGC-----GA--TAG-T-A-ATG-AATGGATTAATTCC-GA-T----------ATTTCA-------A-GTTTTCA--A--TT-CG-AATACttataggtatgatcagtcaaccggttctatcgtaactctgtttaggacacgtagagctgacaacatgcttaattcttttttaatgaatccaacttgtatttacatactgttatagtactgttttgtttaaacattaaagctgctgcgtgtcgttgctagtccatttagagtgttatatgttgttttattactgatcttgtatcagaaatgaatgggttataaagga
gi|20 : tctT--T-CGT--TT-G-ATCAAGAC--CGAA--TTAGAC-A-AA-A-TC-AT--TTC-CTACT--T---GGTAACTCG---TA----A-ATG-AATtagtacctttataggtatgttaagtcatgcggttcaatattcgtagctctcttcaagtcagtttaggacgacacgtagagctgacaacacgcttaaat
gi|7 : aatct--T-CGT--TT-G-A---GGAAA-CGAA--TTAGAC-AGAA-A-TC-AATTTTT-CTACT--T---GGTTATA-G---TAA-TGA-ATG-GATTA-----TTCC-GG-AT---------ATTTCC-------AAGTTTTCCA-A--TT-CG-AATACCC-------TT---TATAGG-----TA-T--GATCAGTTCTGC--GG-TT-CAA-ATA---AGAA-TCGG-TTTAATCAGT-A--T---CGAT-CCT-GTTAC--AAT---AATCT-TCAG---T--TTAGG------TA-C-------T-G---A--AC-ACCT-G--T-A-G-A--GCC-T-G-A-CA--A----C--A-C-GCT--T--AA----TT---ATT-AACCCAATG-------------A---ATCCAACA--TTGTATT-----------ACAT-TA--C--TGTATA-AGTACTGG-T-T---T-TGT-T-TA---------------------AA----TACATGT--A--A-G----C-----GAA----T-------G-C-TG-T--GC--GATGTT-CG--T-TG-GC--------T--T---A-GT-CCATT-T-AGAGTGT-A---------T-----A---TG---T-------TGT---TTA-A-----ATA---C---T--TGAT-C-T---T-GTA---T-TC-AG-A-----AATGA--AT--GGGTT-TAgcgatctattccggatatttcaagtacttcaacttacgataaccttatggtatgatcagttcatcgccgttcattatagaacggaaggcttactcttagaaacaccacccacaagattgaggctgcttctgcttaaaagtcaggttttaggacgcacgtagcagcctgaccaacagctaaattttttcaataaaatccta
gi|35 : --T-CGT--TT-G-A---ACTAGGTGAA--TTAGAC-TGAA-A-TT-AT--TTT-CT-TT--T---GTT-----G---GAA-T-G-ATG-AATtaaag
gi|13 : GT--TT-G-G------A--CGAAA-TTAACC-AGAA---TC-AA--TTT-CTAC---T---GGT-----GAAATAG-T-A-ATG-AATGGATTA-TTCC-GG-AT---------ATCTTC-------ACGTTTTCA--A--TTACG-TATACCT-------
gi|1 : --TT-G-A---GGTA--GGAA--TTAGAC-A-AA-A-TCTAA--TTT-CTACT--T---GGT---------TAAGT-A-TCG-AA-TACTTG-TTTC-GG-ATCACTTAGCTATTA-----------GTTTTC---T--TC-CGAAATACTT-------GT---T----------TTATGAG-TCA----CGTGGGG-TTAC---TTT-----AA-CCGGTTTT--TCAG--A--G---CAAA-GCT-A-TATTAAAGGAAAAGCA-TGGG---T-GTT-AA------TAGCCAGTATTT-AG--G--ACGACAC-G--G-ATC-A--G-C-T-T-AGGC--A----CGTGCC-GTT--TTAAA-ATTTT---ATGAA----AATGTT---TCAT-CAAA---ATTTAA-A-----TATTTAATCCA--A-ACTT-GA--A--TATACA-ATTACATG---------TAT-G-CA-T--AC-G----TTAAA-CT-AAACTCTACATGT--AT-ATACA-TTTATCCAAA----C-A-----G-C-TG-C-AGC--G-TG-T-CGT-T-T--GC--------CTAA---A-TT-CCACA-T-A-------AT--------T-----G---TGT--T-------TGTCCATTAAA-----TTA---G---T--TC-A-C-T---T-TCC---A-TT-GG-A-AAGTAATAAACAT--GGA-T-TAAAGGAtataggtatcgaatcaaggatctgtaaaggtcagtttaggacgacacgatagagctgcacccacgcctaattttttataatgaattcccacacttgtattacatacgctatagttgtactgtttgtttaaacatgaaatgactgctacgttgtcgttgctagtaccatttagagctgtggttatgttgttttattactggtcttgtatcagtaatgaaagggttataaagg
gi|18 : tatg-A---GGAA--CGAA--TTAGAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTTGT--T---GGTA----A---TAG-T-A-ATG-AATGGATT--ATCCTGG-AT---------ATTTCA-------A-GTTTTCA--A--TT-CG-AATACCTTTATAG-GTATGT----------TC-A--G-TCA----TGC--GG-TT-C---AAT---AGAA-CCAG-TTC--T-----A--ATTTCGTA-GCT-----------------CA-T---------TTAAA-------G-TCAG--TTA-AG--G--ACGACAT-G--T-A-G-A--G-C-T-G-A-CA--A----CGCG-C-A-T--G--AA-ATTTTTGAATG-A----AAT--T---CCAT-A-AA---ATg
gi|22 : -T-A-ATG-AATGGCTTA-TTCC-GG-AT---------ATTTCA-------AG-TTTTC---AA-TT-CG-AATACCT--------T---TATAGGTATGATC-A--G-TCA----TGC--GG-TT-C---AAT---AGAA-CCGG-TTC--TAAT--A--G---TAA---CT-A-------------------------T-GTTAAA------AG-TCAG--TTT-AG--G--ACGACAC-G--T-A-G-A--A-C-T-G-A--C--A-----GCA-C-GCTAAA--AA-ATTTTA--ATG-A----A-----------T-C-CA---ACTTGT-A--TT-TATATAcagattgtgctgcttgtttggatcatgaaataacatgtcactggtatgaaaacaatcttgtaaagaaca
gi|31 : G-A----------ATTAGACAGAACAAGGTTTTC---A--TT-CG-AATACCA-------GT---T----------TC-T--G-TCA----CGT--GT-TT-T---TTTTTAAGAA-CCGG-ttgttatagtactgtgatttgtt
gi|16 : tgatttctttcgtttgaggtaa---A--TT-CG-AATACCT-------GT---T----------TT----G-TCA----TGT--GG-TT-C---TTT---AGAA-CCGG-TTT--TCAG--A--G---CAAA-ACT-T-TAT--AAAGAAAAGCA-TGGG---T-GTTAAA------TA-CCAG--TTT-AG--G--ACGACAC-G--A-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A----CGTA-C-GTT--T--AA-ATTTT---ATG-A----AATG-T---TCAT-C-AA---ATTTAA-A-----TATCGAATCC---A-ACTT-GA--A--TGTACA-ATTACATG---------TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AA----TAT-TGT--AC-A-GTA-TT-----AAA----C-A-----G-C-TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-CTACA-T-A-------A---------T-----G---TG---T-------TGT---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTACTAA--AT--GGATT-TAAAGGA
gi|3 : AATCG-TAAGCT-T-GTTAAA-------G-TCAG--TTT-A---G----GAAAC-G--G-A-C-A--A-CGTAG-A-G---G----CGAA-C---------AA-A---------G-A----AAA-------CGC---------TTTAA-A--T---ATTTAAAAT---G-AATT-CA--AC-TGT-TA-ATTATACA-T-ACTGT-TAT-A-TACT--AT-G----G---G-A--GA----TTT-TGT--AA-A-ACA-TT-----AAA------------G-CGTG-C-TGC--G-TG-T-CGC-T-T--GC--------T--g
gi|9 : aatggaattatggttccggatattattttccaaacgttgttcgaatcatcgaaggaaataaaactctattatataagagtaacaacaagacttggtcaactggcgtgtgtctaaatctcagatccaggggttttatat---T-GTTAAA-------G-TCAGATCTT-A---GG-ACGACAC-G--T-A-CGA--G-C-T-G-A-CA--A----C--A-C-GCT--T--AA-ATCTT---TTA-A----AATG-------------A---ATGCGA-A--CT-TGCT--------------------A--TTTACA-AGTAC-TG-T-------------TA-T--CG-G----T---A-C--GT----T---TGT--TTAA-ACA-TTTA---AAA----G-A-----C-C-TT----GC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G--T-CCATT-T-A-------G---------A-----G---TGTTAT-------TGT---TT--A-----TT--------T--ACTA-C-T---C-TTG---TATC-AG-A-----AATGA--AT--GGcaccatttatttagaagtgatagtatcatctgctttttgaacacctgttcttgtatagaaatgatgggttacgaaccattaaaggcgaagaactttgtttatgtatttg
gi|21 : tttctttcgttggcaggaacgaattagaccagaacactcaaatttcctattggttaattagtaatgaatggatattccggattttcaagttcttctcaattcgaatacctttcataggttgatcagtcatgcggttccaatataaacccggttcttattttcgtactcTTAAA------TA-CCAG--TTT-A---GT-ACGACAC-G--G-A-C-A----C-T-G-A-GC--A----CGTA-C-GTT--T--AA-ATTTT---ATG-A----AATG-T---TCAT-C-AA---ATTTAA-------TATTTAATCCAGAA-ACTT-TG--AACTATAC--ATTACA-----A---G-TAT-G-CA-T--AC-G----T---A-C--AA----TAT-TGT--AC-A-GTAGTT-----AAA----CAA-----G-CATG-C-AGC--G-TG-T-CG--TAT--GC--------T--A---ATTT-CCACA-T-C-------A---------TTGTCGT---TGT--T-------TAT---TT--A-----TTA---G---TA-TCAA-C-T---T-TCAT--T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGAGGTT-TAAAAGAccccagctttaacgg
gi|13 : agggtgtttTAAA------GG-TCAG--TTT-A---GG-ACGACAC-G--ATA-G-A--G-C-T-----GC--A----CCCA-C-GCC--T--AATTTTTT---AT-------AATG-------------A---ATT-----------------CCC---ACACT---------TGT----ATTACATA-C-G---C-TAT-A--G-T---T-G----T---A-C--TG----T-T-TGT--TTAA-ACA-TG-----AAA----T-G-----A-C-TG-C-TAC--GTTG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G-TA-CCATT-T-A-------GAGCTGTGGTT-----A---TGT--T-------GTT---TT--A-----TTACTGG---T-------C-T---T-GTA---T-C--------AGTAATGA--AA--GGGTTATAAAGG
gi|27 : gtttggacgaaattaaccagaatcaatttctactggtgaaatagtaatgaatggattattccggatatcttcacgttttcaattacgtataccttataggtatcgaatcaaggatctgA-CCAG--TTT-A---GG-ACGACAC-G--G-A-T-C--G-C-T-G-A-GCTGA----CATA-A-GTT--T--AT-ATTTT---ATG-A----AATA-T---T--T-T-A------TTAA-AGCTA-TATTTAATCA---A-ATTT-TT--A--TG-ATA---TACA-G-T----------------T--AT-G----T---A-C--AG----TG-------AT-------TT-----AA-----------------TG-C-A------TG-T-AGTAT-T--GC--------T--A---G-TT-CCTCG-C-A-------G---------T-----A---TAC--TAG-----TGTG--TT--G-----TTA-------T--TCA
gi|23 : CAG--TTT-A---GG-ACGACAC-G--T-A-G-A--G-C-T-G-A-CA--A----C--A-C-GCT--T--AA-ATttagtatag
gi|14 : tctttcgtttgaggaacgaattagacataaatcaatttctactgggcgatagtaatgaatggattaattccgatatttcaagttttcaattcgaatactagtacctttataggtatgttaagtcatgcggttcaatattcgtagctctcttcaagtG--TTT-A---G----GACAC-G--T-A-G-A--G-C-T-G-A-CA--A----CATG-C---T--T--AA-----------------------T---TC-----------TTT------TT-TAATGAATCC---A-ACT---------TGTAT---TTACATACT-G---T-TAT-A----------G----T---A-C--TG----TTT-TGT--TTAA-ACA-TT-----AA-------A-----G-C-TG-C-TGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G--T-CCATT-T-AGAGTGTTA---------T-----A---TGT--T-------GTT---TT--A-----TTA-------C--TGAT-C-T---T-GTA---T-C--------AGAAATGA--AT--GGGTTATAAAGGA
gi|6 : tttcgtttgaggaacgaattagacagaaatcaatttctacttggtaatagtaatgaatggattattccggatatttcaagttttcaattcgaatgcctttataggtatgatcagtcaaccggttctatcgtaactctTT-A---GCAACGACAC-GCTG---C-A--G-C-T-A-T-GT--AATATCGTA-C-ATA--T--AC-ATAC----ATGTA----AATG-TATATCAT---AA---AGTTGG-A--TT-AAATAAATTT---A-ACTT-CA--A--TAAAAC-ATTACATA-G-A---T-T------------T-T----T--------------TAC-TGT--------TG-TT-------G----T-A-----A-C-TG-C--CC--G-TG-T-CG--T-C---C--------T--A---A-
gi|24 : ttctttcgtttgaggtacgaatgagacagaaatcatcttctacttggtgtaataatgaatgacttgtccggaaatgtaaggttttcattcgaatacctgtttgtgtcacgtggttctttagaacctgtttcagatagcaaggctatataaagagatgcataggtgttaaatacccgt-G-A-GC--GAT--CGTAAC-GTT--T--AATATTTT---ATG-A----AGGA-T---TCAT-C-AA-----TTAG-A--TT--ATTTATTCC---A-ACTT-GA--A--TATACA-ATTACATA-T-A-----TGT-A-TA-C--AT------T---A-CGAAA----TAT-TGT--AC-A-GTA-TTA----AAA----C-A-----GTC-TG-CGAGC--G-TG-T-CGT-T-T--GC--------T------A-TT-CCA-A-T-A-------A---------T-----G---TGT--TGTA----TAT---TT--ACGTTCTTAC--GACCT--TCAA-C-TCTAT-TCA---T-TT-ttccacacaatgtgttgttgtttgctagaattcaacttttagttggaaagtaatgaatgaatttagagga
gi|25 : -ATTTT---ATG-A----AATG-T---TCAT-C-AA---ATTTAG-A--T---AATTATTCC---A-ACTT-GA--A--TATGCA-ATTACATG-T-A---T-----G-TA-T--AC-G----T---A-C--AA----TAT-TGC--AC-A-ATA-TT-----AAA----C-A-----G-C-TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-CCACA-T-AT------G---------T-----G---TGT--T-------TAT---TT--A-----TT----G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-TG-G-AAGTAAT-A--AT--GGATT-TAAAGGA
gi|26 : TTTAA-A--TG------AATCC---A-ACTG---------GTAT---TTACATG-T-A---CATAT-G-TA-C--AT-GCTGTT---A-T--AG----TAC-TGT--TT-T-GT--TT-----AAA----C-ATTAAAG-C-TG-C-TGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G--T-CCATT-T-A-------GAGTGT----T-----A---TGT--T-------GTT---TT--A-----TTA-------C--TGAT-C-T---T-GTA---T-C--------AGAAATGA--AT--GGGTTATAAA
gi|40 : gagctgacaacacgcttaattt-TATTTAATCC---A-ACTT-GA--A--TATACA-ATTACAAG-T-A---T-
gi|28 : ATAC---A-ACTT-TA--A--CATACACATTATATG-T-A---T-----G-TA-T--A--G----T---A-C--AA----TAT-TGT--AC-A--TA-TT-----AAA----C-A-----G-CGTGGC-AACTGG-TG-TTCG--T-T--GC--------T--A---A-TT-CCACA-TTA-------A---------T-----G---TGT--TGTT----TAT---CT--A-----TTAAA-G---T--T-AA-C-T---T-TCA---T-T--GA-A-AAGTGATGA--AT--GGATT-TAAAGGAgc
gi|19 : aaattacatac---T-TAT-A-TA-T---T-G----TT--A-T--AA----TAC-TAT--GT-T-TTG-TT-----AAAACATT-AAA---G-C-TG-C-TGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T------A-CT-CCAT--T-G-------T---------T-----A---GGT--T-------GTT---TT--A-----TTA---g
gi|30 : atttctttcgtctgaggaacgaattagacagtgaatggattattccggatatttcaagttttcaattcgaataccttaataggtatcgtcagtcatgtggttcaatagaattggttttaatcgtagctctgttaaagtcagtttaggatgacacgtaaagctgacaaaacgcttaattttt-GTA-TT-----AAA----C-A-----G-C-TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-CCACA-T-A-------A---------T-----G---TGT--TGTT----TAT---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-CG-A-AAGTAATGA--AT--GGATT-TAAAGctgaatgggttataaaa
gi|36 : -TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GCTACATATGT--A---A-TT-CCACA-T-A-------A---------T-----G---TCT--T-------
gi|34 : acagcctg--T-------TGT---TT--A-----ATA---G---TATTCAA-C-T---T-TCA---T-TTTGG-A-AAGTAATGA--AT--GGGTT-TAAAGGAg
gi|33 : gtgttg--T-------TGT---TT--A-----ATA---G---TATTCAA-C-T---T-TCACATT-TT-GG-AGAAGTAATGA--AT--GGGTT-TAAAGGAg
gi|38 : tgttg--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATAA--AT--GGATT-TAAA
gi|37 : A---G---T--TCAAAC-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATTA--AT--GGATT-TAAAGGA
gi|39 : ---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--AT--GGATT-TAAAAGAg
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): AGAAACGAACATACTTAAGACAGAAATCAAGTTTCTATTTTTGGTAATTAGTACATGATTTGGAAATGGTATTACTTGTCCGCGCATTTCTCCAATTTTTCAACCGTCATCTTTTTCAATTCGCATTTATTGGGATTCCAATGACTCGATACATGCGTTCAGAATAAAGTTTGGTTCTAAATCGCGGCTCTGATTTTATAGACTATGTTTTGTTTAAAACATTAGAGAAATGCTGCGTGTCGTTTGCTAGTCCATTTAGTTGTTCATGTAGTTTTATTACTGATCGTCTATGATAGGAAATTGAATCGGGTATAATAGGAAT
Unaligned ( gi|29 ): CGTTTTTTAATCTAAGCTGACTGCGGTGTCAGTTGCTAGCCATTTGAGTGCGTTATGATCTGTTATTGCGACTACAGATATTGCTTACAGGAACAATGAATGGCAGTTATAGAAGGA
Alignments
lowQualScore : 1 222222222 111111111111 111111 6666666666666666666666666666666666 1111111 111111 5555555555555555555555555 111111111111 111111111111 1111 2222222222 11111 222222222222 11111111111111111111111 11111111 111 222222222222222222222 1111111
lowQualScore : 33 1 22 2 1 333 2 44 1 66666 1 1 1 1 1 1 77 1 22 22 333 777777777 1 5 5 1 999999999999 000000000000 1 6666 33 555555 888888 3 1 4444444444444444444444444444444444 4 6666666 22 2 2 222222 333 2 333 4 777777 5555555 0 22 1111111111111111111111111 2 6666666 333 2 555555555555 77 22 3 22 44 444 666 22 3 1 3 3 777777777777 3 22 22 44 3 0000 1 1 8888888888 22 4444444444 3 444 1 1 00000 22 3 1 2 000000000000 1 1 22 55 3333 333 1 22 0 22 22 11111111111111111111111 1 00000000 1 000 1 22 44 3 1 1 77 1 55 66666666 44 333 1 1 22 777777 1 1 666 9999 22 444444444444444444444 333 44 88888 1111111 66 1 1 333 1 444 1 22 1 1 22 22 5
lowQualScore : .. . .. . . ... . .. . ..... . . . . . . .. . .. .. ... ......... . . . . ............ ............ . .... .. ...... ...... . . .................................. . ....... .. . . ...... ... . ... . ...... ....... . .. ......................... . ....... ... . ............ .. .. . .. .. ... ... .. . . . . ............ . .. .. .. . .... . . .......... .. .......... . ... . . ..... .. . . . ............ . . .. .. .... ... . .. . .. .. ....................... . ........ . ... . .. .. . . . .. . .. ........ .. ... . . .. ...... . . ... .... .. ..................... ... .. ..... ....... .. . . ... . ... . .. . . .. .. .
lowQualScore : 11 1 88 0 8 222 8 33 8 44444 8 8 8 8 9 9 11 9 66 66 333 000000000 8 5 5 8 333333333333 999999999999 9 4444 33 555555 777777 8 9 9999999999999999999999999999999999 0 1111111 88 0 0 000000 999 2 999 4 111111 9999999 4 99 7777777777777777777777777 1 8888888 555 0 444444444444 22 44 5 44 11 333 888 44 5 7 3 3 888888888888 3 55 33 00 2 4444 7 8 0000000000 55 0000000000 3 888 7 7 99999 44 5 7 2 666666666666 7 7 44 11 7777 000 7 44 3 44 44 22222222222222222222222 8 11111111 7 000 7 77 88 5 7 7 66 7 99 33333333 11 222 8 8 55 000000 8 8 888 8888 44 555555555555555555555 000 00 33333 0000000 22 7 7 000 7 888 7 66 8 8 55 66 7
consensus : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGNA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--TTCC-GGAT-A-TTTCAAG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G-T----T-----TNT-----------G-TCA------CGC--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--GCAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCG-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGC-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA-ATT----TATTTAATCC---A-ACT-T-GA--A--T-ATACA-ATTACATG-T-AT---TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TG----T--GT-----T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGA
Reference ( family-676 ) : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGNA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--TTCC-GGAT-A-TTNCAAG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G-T----T-----TNT-----------G-TCA------CGC--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--GCAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCG-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGC-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA-ATT----TATTTAATCC---A-ACT-T-NA--A--T-ATACA-ATTACATG-T-AT---TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TG----T--GT-----T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGA
gi|1 : --TT-G-A---GGTA--GG-AA-----T-TA-GAC-A-AA-A-TCTAA--TTT-CTA--CT--T---GGT---------TAAGT-A-TCG-A------------A-----TACTTG-TTTC-GGATCA-CTT--AGCTATTAGTTTTC---T--TC-CGAAATACTT-------GTT----T-----TATGA---------G-TCA------CGTGGGG-TTAC---TT-T-----AA-C---CGGTTT---T--TCAG--A--GCAAA-GCT-A--TATTAAAGGAAAAGCA-TGGGT-G-------TT-----AA------TAG---CCAGTATTTA--GG-AC--GACAC--G-G-ATC-A--G-C-T-T-AGGC--A--C-GTGCCGT-T--TTAAA-ATTTT----ATGAAAA-TGTTTCA-T-CAAAAT--TTAA-A------TATTTAATCCA--A-ACT-T-GA--A--T-ATACA-ATTACATG--------TAT-G-CA-T--AC-G----TTAAA-C--TAAACT--C--T--ACATGT-A-TATACATTTATCC-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CGT-T-T--GC--------CTAA---A-TT-C--CACA------T-A-AT--TG----T--GT-----T-------TG------TCCATTAAA-----TTA---G---T--TC-A-C-T---T-TCC---A-TT-GG-A-AAGTAATAAACATGGA---T-TAAAGGA
gi|10 : tatgATTTCT--TTCGT--TT-G-T---GGTA--TG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TAT-CTA--CT--T---GGT-----T---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TGCTT--GTCT-GGAA-A-T-ATAAG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G-T----T-----TAT-----------G-TTA------GGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGA-TT---T---CGG--ATAGCAAG-GCT-A--TAT-----------C------T-G-------TT---A-AT------TA----CCAG--TTTA--TG-AC--GACAC--G-G-G-C-A--G-T-T-GTA-AC--A------A-AAG-T--T--AA-ATTTT----ATG-GAA-TG-TT----------T--TTAT-ATT----TATTCAATCC---A-ACT-T-CATGA--T-ATACA-ATTA--------------T-G-TA-T--AT-G----T---G-C--AACATT-------------------------------AAAT-A-----T-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-T--CACA------C-A-A---TG----T--GTTG---T-------TG------T---TT--A-----CTA---GTT-T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAACAATGA--TTGAG--TT-TAAAg
gi|11 : gT--T-CGT--TTTG-A---GGAA--CGGAA-----TCTA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----A---TAG-T-AGATG-A------------AT----GATTA--TTC---GAT-ACTTTCAAA------GTTTTCA--A--TT-CG-AATACC----------T----T-----TATAGGTATGATCAG-TCATG----CGC--GG-TT-CAA-TA-T---AGAA-C---CGG-TTCTAT--TC-------GT-AA-GCT-C--TGT--AAAG--------------------------------------------TAG--TTTA--GG-AC--GACAC--GTA-A-G-A--G-C-T-G-A-AA--A--C-A----GC-T--T--AA-ATTTTAG--ATG-AA
gi|12 : tctATTTCTGGT-CGTCATT-G-A---GG-----G-CA-----T--A-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--TACGGGTAATA-G---TAA-TGA-ATG-G------------AT----TA-----TTAT-GGAT-A-TTT--AG------GTTT-C---AAATT-CG-GAAACCTTTATA--G-TA---T-----TCA-----------G-TCA------TGC--GGGTT-C---A------AGAAAC---CGG-TT----------------------CT-A--T-------------TG-TACTC-G-------TT---A-AAGTCACTCA----TCAG--TTTT--AG-AC--GACACT-A-G-A---A--G-C-T-G-A-CA--A--C---A-CGC-T--T------------------AAA-TG-T-----------T--TTAA-G-----------AATCC---A-ACT-T-G------T-AT-----TTACATA-C-TT---TAT-A-TA-CTAAT-G----T------------TT--G--TGAACA--C-A-T-----------T-GA---A-----G-C----G-C-TGC--G-CG-T-C---T-T--GC--------T--AGTCA-TT-T--AGAA------T-G-A---TG----T--TT-----T-------TA------T---TT--A-----tcccacattgtatttacatccttatagtactggttttgttaaattaaagctgctgcgtgtcatttagagtgttatgttgtttttattactgatctttgtatcagaaaatgaatggtttataaagg
gi|13 : GT--TT-G-------GA--CG-AAA----T-TA-ACC-AGAA---TC-AA--TTT-CTA--C---T---GGT-----GAAATAG-T-A-ATG-A------------AT----GGATTA-TTCC-GGAT-A-TCTTCAC------GTTTTCA--A--TTACG-TATACCT-------actgatcttacagaatgaatggtata
gi|13 : T---A-AA------GG----TCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-ATA-G-A--G-C-T-----GC--A--C-CCA-CGC-C--T--AATTTTTT----AT---AA-TG-----------AAT--T------------------CCC---ACACT-T-G------T-------ATTACATA-C-GC---TATAG-T------T-G----T---A-C--TGT-TT--GTTT--A-A-AC-A-T-----------G-AAAT-G-----A-C---TG-C-TAC--GTTG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G-TA-C--CATT------T-A-GAGCTG----T--GG-----T-------TATGTTGTT---TT--A-----TTACTGG---T-------C-T---T-GTA---T-C--------AGTAATGA--AAGGG--TTATAAAGGtataggtatcgaatcaaggatctgtaaaggtcagtttaggacgacacgatagagctgcacccacgcctaattttttataatgaattcccacacttgtattacatacgctatagttgtactgtttgtttaaacatgaaatgactgctacgttgtcgttgctagtaccatttagagctgtggttatgttgttttattactggtcttgtatcagtaatgaaagggttataaagg
gi|14 : gtttggacgaaattaaccagaatcaatttctactggtgaaatagtaatgaatggattattccggatatcttcacgttttcaattacgtataccttataggtatcgaatcaaggatctgT--T-CGT--TT-G-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGTAATA-G---TAA-TGA-ATG-G------------AT----TA-----TTCC-GGAT-A-TTTCAAG-------TTTTC---AA-TT-CG-AATGCCT--------------T-----TATAGGTATGATCAG-TCA------ACC--GG-TT-C---T
gi|14 : tG--TTTA--GG-AC-----AC--G-T-A-G-A--G-C-T-G-A-CA--A--C-AT---GC-T--T--AA---------------------TTC---------T--TT----TT----TAATGAATCC---A-ACT-T-GT--A--T-TTACA---TAC-TG-T------------TA-T--A--G----T---A-C--TGTTTT--G--TTTA-A-AC-A-T-----------T-AAA--------G-C---TG-C-TGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G--T-C--CATT------T-A-G---AG----T--GT-----TATA----TGTTGT--T---TT--A-----TTA-------C--TGAT-C-T---T-GTA---T-C--------AGAAATGA--ATGGG--TTATAAAGGAatcgtaactctgtttaggacacgtagagctgacaacatgcttaattcttttttaatgaatccaacttgtatttacatactgttatagtactgttttgtttaaacattaaagctgctgcgtgtcgttgctagtccatttagagtgttatatgttgttttattactgatcttgtatcagaaatgaatgggttataaagga
gi|15 : tttcgtttgaggaacgaattagacagaaatcaatttctacttggtaatagtaatgaatggattattccggatatttcaagttttcaattcgaatgcctttataggtatgatcagtcaaccggttctatcgtaactct-A---GAAA--CG-AACATACT-TAAGAC-AGAA-A-TC-AAG-TTT-CTATTTT--T---GGT-----AAT-TAG-T-ACATG-ATTTGGAAATGGTAT----TACTT--GTCC-GCGC-A-TTTC
gi|16 : ---A--TT-CG-AATACCT-------G-T----T-----T-T-----------G-TCA------TGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--GCAAA-ACT-T--TAT--AAAGAAAAGCA-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-A-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA-A------TATCGAATCC---A-ACT-T-GA--A--T-GTACA-ATTACATG--------TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--TACA------T-A-A---TG----T--G------T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTACTAA--ATGGA--TT-TAAAGGAtccaatttttcaaccgtcatctttttcaattcgcatttattgggattccaatgactcgatacatgcgttcagaataaagtttggttctaaatcgcggctctgattttatagactatgttttgtttaaaacattagagaaatgctgcgtgtcgtttgctagtccatttagttgttcatgtagttttattactgatcgtctatgataggaaattgaatcgggtataataggaat
gi|17 : TTTTT--T-CGT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGC-----G---TAG-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--GTTC-GGA--A-TTGTAAG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G-T----T-----TTT-----------G-TCA------CGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--ACAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCA-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-A-GA--A--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA-A------TATTTAATCC---A-ACT-T-TA--A--T-ATACA-ATTACA-G-TCATG--TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--Ag
gi|18 : at-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTT--GT--T---GGTA----A---TAG-T-A-ATG-A------------AT----GGATT--ATCCTGGAT-A-TTTCAA-------GTTTTCA--A--TT-CG-AATACCTTTATAG-G-TATG-T-----TCA-----------G-TCA------TGC--GG-TT-C---AA-T---AGAA-C---CAG-TT---C--TAAT--T--TCGTA-GCT------------------CA-T-------------TT---A-AA-------G----TCAG--TTAA--GG-AC--GACAT--G-T-A-G-A--G-C-T-G-A-CA--A--C-G---CGCAT--G--AA-ATTTTTGA-ATG-AAA-T--TCCA-T-A-AAA---TCAG-ATTGTGCTGCTT----------GTT-T-GG--A--TCATGAA-ATAACATG-TCAC---TG--G-TA-T--GA-A----A---A-C--AATCTT--G--T--AAA-G
gi|19 : ATTTCT--TTCGT--CT-G-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-AG-------------------------------T-----G---------A-ATG-G------------AT----TA-----TTCC-GGAT-A-TTTCAA-------GTTTTCA--A--TT-CG-AATACCTTAATAG-G-TA---T-----CGTCA---------G-TCA------TGT--GG-TT-C---AA-T---AGAA-T---TGG-TT---T--T--A--A--TCGTA-GCT------------------C------T-G-------TT---A-AA-------G----TCAG--TTTA--GG-AT--GACAC--G-T-A-A-A--G-C-T-G-A--C--A--A-A-A-CGC-T--T--AA-TTTTT----aaca
gi|19 : ATA-T-AT---TGT---TA-T--A--A----T---A-C--TATGTTTTG--TT-AAA-AC-A-T-----------T-AAA--------G-C---TG-C-TGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T------A-CT-C--CAT---------------TG----TTAGG-----T-------TGT-----T---TT--A-----TTA---ttatatattgttataatactatgttttgttaaaacattaaagctgctgcgtgtcgttgctactccattgttaggttgttttattactgaatgggttataaaa
gi|2 : atttctttcgtctgaggaacgaattagacagtgaatggattattccggatatttcaagttttcaattcgaataccttaataggtatcgtcagtcatgtggttcaatagaattggttttaatcgtagctctgttaaagtcagtttaggatgacacgtaaagctgacaaaacgcttaatttttttT--T-CGT--AT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTTTCTA--CTGGT---GTT-----G---TAA-T-ACACG-A------------AT----TACTT--GTC--GGAT---TTAAGAG------GTTTTC---A--T--CG-A-TACCT-------G-T----T-----TTT-----------G-TCAA-----CGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCCA--A--GCAAAAGCTTA--TAT--AAGGAAAGCTA-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GGGAC--GACAC--G-G-A-C-AAAG-C-TTG-A-GC--T--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTGA--------TATTTATTCC---A-ACT-T-GA--G--T-ATACA-ATTACATG-TTAT---T---G-TA-T--AC-G----T---A-C--AATAAT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T--G--T-TTTGC--------TT-A---A-TTGC--CACAA-----T-A-A---TG----T--GT-----TGGTTGTTTA------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--TGGGA--TT-TAAAGctgaatgggttataaaa
gi|20 : tctT--T-CGT--TT-G-ATCAAGAC--CG-AA-----T-TA-GAC-A-AA-A-TC-AT--TTC-CTA--CT--T---GGTAACTCG---TAA-----ATG-A------------ATGCGAT-CTA--TTCC-GGAT-A-TTTCAAG------TACTTC---AACTTACG-ATAACCT-------T-A----TGG---TAT-----------GATCAGTTCATCGC--CG-TT-CA--TTAT---AGAA-CGGAAGG-CT---TACTCTT--A--GAAAC-ACC-ACCCAC--AAG----ATTG-AGGCT-GCTTCTGCTT---A-AA------AG----TCAGGTTTTA--GG-AC--G-CAC--G-T-AGC-A--GCC-T-G-A-CC--A------A-CAG-C--T--AA-ATTTTTTCAATA-AAA-Tctga
gi|21 : aatctGGGT-G-------TTTTTA-AA------TA----CCAG--TTTA--GT-AC--GACAC--G-G-A-C-A----C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA--------TATTTAATCCAGAA-ACT-T-TG--AACT-ATAC--ATTACA-----AG---TAT-G-CA-T--AC-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-AGT-----------T-AAACAA-----G-CA--TG-C-AGC--G-TG-T-CG--TAT--GC--------T--A---ATTT-C--CACA------T-C-AT--TGTCGTT--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TTA---G---TA-TCAA-C-T---T-TCAT--T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGAGGTT-TAAAAGAccta
gi|22 : a-T-A-ATG-A------------AT----GGCTTA-TTCC-GGAT-A-TTTCAA-------GTTTTCA--A--TT-CG-AATACC----------T----T-----TATAGGTATGATCAG-TCA------TGC--GG-TT-C---AA-T---AGAA-C---CGG-TT---C--TAAT--A--GTAA---CT-A-----------------------T-G-------TT---A-AA------AG----TCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-T-A-G-A--A-C-T-G-A--C--A----GCA-CGC-TAAA--AA-ATTTTA---ATG-A---------A-T-C-CAAC--TTGT-ATT----TATATA
gi|23 : T--T-CGT--TT-G-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-ATAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--G---GGC-----GA--TAG-T-A-ATG-A------------AT----GGATTAATTCC-G-AT-A-TTTCAAG-------TTTTC---AA-TT-CG-AATACTA-------G-TACCTT-----TATAGGTATGTTAAG-TCA------TGC--GG-TT-C---ttgttatagtactgtgatttgtt
gi|23 : tctCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-T-A-G-A--G-C-T-G-A-CA--A--C---A-CGC-T--T--AA-ATaatattcgtagctctcttcaagtcagtttaggacgacacgtagagctgacaacacgcttaaat
gi|24 : tctttcgtttgaggaacgaattagacataaatcaatttctactgggcgatagtaatgaatggattaattccgatatttcaagttttcaattcgaatactagtacctttataggtatgttaagtcatgcggttcaatattcgtagctctcttcaagt-G-A-GC--GATC-GTAACGT-T--T--AATATTTT----ATG-AAG-GA-TTCA-T-C-AA----TTAG-ATT-----ATTTATTCC---A-ACT-T-GA--A--T-ATACA-ATTACATA-T-AT----GT-A-TA-C--AT------T---A-CGAAATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------TAAAAC-A-----GTC---TG-CGAGC--G-TG-T-CGT-T-T--GC--------T------A-TT-C--CA-A------T-A-A---TG----T--GT-----TGTA----TA------T---TT--ACGTTCTTAC--GACCT--TCAA-C-TCTAT-TCA---T-TT-
gi|25 : -ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAG-AT------AATTATTCC---A-ACT-T-GA--A--T-ATGCA-ATTACATG-T-AT-------G-TA-T--AC-G----T---A-C--AATATT--G--C--ACA-AT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-ATG---TG----T--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TT----G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-TG-G-AAGTAAT-A--ATGGA--TT-TAAAGGA
gi|26 : T--TTAA-ATG---------AATCC---A-ACT----G--G--T-AT-----TTACATG-T-ACA--TAT-G-TA-C--AT-GCTGTT---A-T--AGTACT--G--T--TTT-GT---T-----------T-AAAC-ATTAAAG-C---TG-C-TGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G--T-C--CATT------T-A-G---AG----T--GT-----TA------TGTTGT--T---TT--A-----TTA-------C--TGAT-C-T---T-GTA---T-C--------AGAAATGA--ATGGG--TTATAAA
gi|27 : gagctgacaacacgcttaatttA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-T-C--G-C-T-G-A-GCTGA--C-ATA-AGT-T--T--AT-ATTTT----ATG-AAA-TATTTTA-T-T-AAAG--CTA---------TATTTAATCA---A-ATT-T----------------------------T---TAT-G-------AT-A----T---A-C--AGTTAT--G--T--ACA-GTGA-T-----------T-TAA--------------TG-C-A------TG-T-AGTAT-T--GC--------T--A---G-TT-CCTCGCAGTATACT-A-G---TG----T--GTTG---T-------TA------T---TC--A-----TTA---G---T--
gi|28 : ATAC---A-ACT-T-TA--A--C-ATACACATTATATG-T-AT-------G-TA-T--A--G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA--T-A-T-----------T-AAAC-A-----G-CG--TGGC-AACTGG-TG-TTCG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------TTA-A---TG----T--GT-----TGTT----TA------T---CT--A-----TTAAA-G---T--T-AA-C-T---T-TCA---T-T--GA-A-AAGTGATGA--ATGGA--TT-TAAAGGAatag
gi|3 : aaattacatacT-G-------TT---A-AA-------G----TCAG--TTTA--GG-A----A-AC--G-G-A-C-A--A-CGTAG-A-G---G--C-GAA-C---------AA-A----------G-AAAACG-CT---T-T-AAATATTTAA-A-------ATG-AATTC---A-ACTGT-TA--A--TTATACA---TAC----T-GT---TAT-A-TACT--AT-G----G---G-A--GATTTT--G--T--AAA-AC-A-T-----------T-AAA--------G-CG--TG-C-TGC--G-TG-T-CGC-T-T--GC--------T--g
gi|30 : aatggaattatggttccggatattattttccaaacgttgttcgaatcatcgaaggaaataaaactctattatataagagtaacaacaagacttggtcaactggcgtgtgtctaaatctcagatccaggggttttatataatcgtaagct-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TGTGT-T--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-CG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGcaccatttatttagaagtgatagtatcatctgctttttgaacacctgttcttgtatagaaatgatgggttacgaaccattaaaggcgaagaactttgtttatgtatttg
gi|31 : ATTTCT--TTCGT--TT-G-A---GGTA--AG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-
gi|31 : tgCAAG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCA-------G-T----T-----TCT-----------G-TCA------CGT--GT-TT-T---TT-TTTAAGAA-C---CGG-caaggttttcattcgaataccagtttctgtcacgtgtttttttttaagaaccgg
gi|32 : tgatttctttcgtttgaggtaagaattagacagaaTTTCT--TTCAT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--GTTC-GGA--A-TTATAAG------GTTT
gi|33 : -----T-------TG------T---TT--A-----ATA---G---TATTCAA-C-T---T-TCACATT-TT-GG-AGAAGTAATGA--ATGGG--TT-TAAAGGA
gi|34 : tgttgG----T--GT-----TGT-----TG------T---TT--A-----ATA---G---TATTCAA-C-T---T-TCA---T-TTTGG-A-AAGTAATGA--ATGGG--TT-TAAAGGA
gi|35 : --T-CGT--TT-G-A---ACTAGGTG-AA-----T-TA-GAC-TGAA-A-TT-AT--TTT-CT---TT--T---GTT-----G---GAA-T-G-ATG-A------------AT----g
gi|36 : AC-A-----G-CCTGTG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GCTACATATGT--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TG----T--CT-----T-------
gi|37 : A---G---T--TCAAAC-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATTA--ATGGA--TT-TAAAGGAg
gi|38 : --A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATAA--ATGGA--TT-TAAAg
gi|39 : ---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAAGA
gi|4 : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----C-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--TTTC-GGA--A-TTAGAAG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G-T----T-----TTT-----------G-TCA------CGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--ACAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCG-TGAGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--G--AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCG-T-C-AAAT--TTAA-ATT----TATTTAATCC---A-ACT-T-CA--A--T-GTACA-ATTACATG-T-AT---TAT-A-TA-T--AT-G----T---A-C--AATACT--G--T--ATA-GT-A-T-----------T-AAAT-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TA----T--GT-----T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATAGA--TT-TAAAGGAg
gi|40 : ----TATTTAATCC---A-ACT-T-GA--A--T-ATACA-ATTACAAG-T-AT---
gi|5 : T--T-CGT--TT-G-A---TGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--GTTC-GGAT---TTAAGAG------GTTT-A---A--TT-CG-AATACAT-------G-T----T-----TTT-----------G-TCA------CGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-CT---T--TCAG--A--GCAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCA-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC-----------G-A-C-G--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG--AA-TG-TTCA-TGC-AAAT--TTAG-A------TATTTATTGC---A-GCT-TGGA--A--T-ATACA-ATTACTTG-T-GT---TAT-GTTA-T--ATGG----T---AGC--AATA-------T--GCA-GT-A-T-----------T-AAAC-AC----G-CT--TG-C-AGCGGG-TG-T-CG--T-TG-GC--------T--A---A-TT-T--CACA------T-A-A---T-----T--G------T-------TG------T---TT--AATTAGTTA---A---T--TCAA-CGT---TGTCA---T-TT-GGAA-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGAgc
gi|6 : tTTCTT--T-CGT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-GA-GAC-AGAA-A-TC-AT--CTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----GACTT--GTCC-GGA--A-ATGTAAG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G-T----T-----TGT-----------G-TCA------CGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CTG--T---T--TCAGATA--GCAAG-GCT-A--TAT--AAAGAGATGCA-TAGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCCG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-G-C-A--G-T-T-ACA-ACA-A--CAGTA-A---------AA-AATCT----ATG-TAA-TGTTTTA-T-T-GAAG--TTAA-ATT----TATTTAATCC---A-ACT-T-TATGA--T-ATACA-TTTACATG--------TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--GATAT------T--AC-----------------------AT-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------C-A-A---TG----T--GTTG---T-------TG------T---TT--G-----CTA---GAA-T--TCAA-C-T---T-TTA---G-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGAA--TT-TAGAGGA
gi|7 : --T-CGT--TT-G-A---GGAAA-CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AATTTTT-CTA--CT--T---GGTTATA-G---TAA-TGA-ATG-G------------AT----TA-----TTCC-GGAT-A-TTTCCAA------GTTTTCCA-A--TT-CG-AATACCC-------T-T----TATAGGTAT-----------GATCAGTTC--TGC--GG-TT-CAA-AT-A---AGAA-T---CGG-TT---TAATCAG-------------T-A--T-------------CG-ATCCT-G-------TT---ACAA------TAATCTTCAG--TTTA--GGTACTGAACACCTG-T-A-G-A--GCC-T-G-A-CA--A--C---A-CGC-T--T--AA----TT----ATT-AA-----CCCA-A-T-GAAT--CCAACATTG---TATT-----------ACA-T-TA--C--T-GTATA-AGTAC-TG---GT---TTT-G-TT-T--AA-A----T---A-C--A----T--G--T--A-A-G----------------C-GAAT-------G-C---TG-T--GC--GATGTT-CG--T-TG-GC--------T--T---A-GT-C--CATT------T-A-G---AG----T--GTATATGT-------TG------T---TTA-A-----ATA---C---T--TGAT-C-T---T-GTA---T-TC-AG-A-----AATGA--ATGGG--TT-TA
gi|8 : TCTTT--T-CGT--TT-G-A---GGT---CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-T---A--TTT---A--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATGCA------------AT----TACTTG-TTTC-GAGT----TATAAG------GTTTTCC--A--TT-TG-AATACTT--------------T-----TAT-----------G-CTA-------GT--GG-TT-C---TT-T---AGAC-C---CGGGTT---T--TCAG--A--G--AA-GTT-A--TAT--AAGGAA--GCAATGGGTTG-------TT---A-AA------TA----C-AG--TTTAAGGG-AC--GAAAC--G-G-A-C----G-C-T-G-A--C--A----GTA-AGT-T--TT-AA-ATTTT----AT--AAA-TG-GTCAAT-C-AA-T--TTAG-ATT-----ATTTAATC------ACT---GA--A--T-ATACA-ATTACATG-T-AT-------G-CA-T--AA-G----T---A-C--ACTATT--G--T--ACA-GT-A-A-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---CGTGT-T--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGAtaaag
gi|9 : TTTCT--TTCGT--TG-GCA---GGAA--CG-AA-----T-TA-GACCAGAACACTC-AAATTTC-CTA---T--T---GGT-----TAATTAG-T-A-ATG-A------------AT----GGATA--TTCC-GGAT---TTTCAAG------TTCTTCTCAA--TT-CG-AATACCTTTCATAGG-T----T-----GATCA---------G-TCA------TGC--GG-TT-CCAATA-T---AAAC-C---CGG-TT---C--TTA
gi|9 : T-G-------TT---A-AA-------G----TCAGATCTTA--GG-AC--GACAC--G-T-A-CGA--G-C-T-G-A-CA--A--C---A-CGC-T--T--AA-ATCTT----TTA-AAA-TG-----------AAT--GCGA-ACT----TGCT---------------------A--T-TTACA-AGTAC-TGTT-ATCGGTAC-G-TT-T--GT-T----T---A----AACATT-----T--A----------------------AAAG-A-----C-C---TT----GC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G--T-C--CATT------T-A-G---AG----T--GTTA---T-------TG------T---TT--A-----TT--------T--ACTA-C-T---C-TTG---TATC-AG-A-----AATGA--ATGGttttcgtactctgttaaagtcagatcttaggacgacacgtacgagctgacaacacgcttaaatcttttaaaatgaatgcgaacttgctatttacaagtactgttatcggtacgtttgtttaaacatttaaaagaccttgcgtgtcgttgctagtccatttagagtgttattgtttatttactactcttgtatcagaaatgaatggccccagctttaacgg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): CGTTTTTTAATCTAAGCTGACTGCGGTGTCAGTTGCTAGCCATTTGAGTGCGTTATGATCTGTTATTGCGACTACAGATATTGCTTACAGGAACAATGAATGGCAGTTATAGAAGGA
Alignments
lowQualScore : 1 222222222 111111111111 1111111 222 555555555555555555555555555555555555 1111111 111111 5555555555555555555555555 111111111111 111111111111 1111 2222222222 222222222222 11111111111111111111111 11111111 111 222222222222222222222 1111111
lowQualScore : 33 1 22 2 1 333 2 44 1 66666 1 1 1 1 1 1 77 1 22 22 333 777777777 1 5 5 1 999999999999 000000000000 1 1 33 1 5 1 2222222 111 55 3 1 555555555555555555555555555555555555 4 6666666 22 2 2 333333 333 2 333 4 777777 5555555 0 22 1111111111111111111111111 2 6666666 333 2 555555555555 77 22 3 22 44 444 666 22 3 1 3 3 777777777777 3 22 22 44 3 0000 1 1 6666666666 22 4444444444 3 444 1 1 22 88888 1 1 1 2 000000000000 1 1 22 55 3333 333 1 22 0 22 22 11111111111111111111111 1 00000000 1 000 1 22 44 3 1 1 77 1 55 66666666 44 333 1 1 22 777777 1 1 666 9999 22 444444444444444444444 333 44 88888 1111111 66 1 1 333 1 444 1 22 1 1 22 22 5
lowQualScore : .. . .. . . ... . .. . ..... . . . . . . .. . .. .. ... ......... . . . . ............ ............ . . .. . . . ....... ... .. . . .................................... . ....... .. . . ...... ... . ... . ...... ....... . .. ......................... . ....... ... . ............ .. .. . .. .. ... ... .. . . . . ............ . .. .. .. . .... . . .......... .. .......... . ... . . .. ..... . . . . ............ . . .. .. .... ... . .. . .. .. ....................... . ........ . ... . .. .. . . . .. . .. ........ .. ... . . .. ...... . . ... .... .. ..................... ... .. ..... ....... .. . . ... . ... . .. . . .. .. .
lowQualScore : 11 1 88 0 8 222 8 33 8 44444 8 8 8 8 9 9 11 9 66 66 333 000000000 8 5 5 8 333333333333 999999999999 9 9 11 9 4 9 0000000 222 22 8 9 666666666666666666666666666666666666 2 2222222 99 1 1 000000 999 2 999 4 111111 9999999 4 99 7777777777777777777777777 1 8888888 555 0 444444444444 22 44 5 44 11 333 888 44 5 7 3 3 888888888888 3 55 33 00 2 4444 7 8 8888888888 55 0000000000 3 888 7 7 44 33333 7 7 7 2 555555555555 7 7 44 11 7777 000 7 44 3 44 44 22222222222222222222222 8 11111111 7 000 7 77 88 5 7 7 66 7 99 33333333 11 222 8 8 55 000000 8 8 888 8888 44 555555555555555555555 000 00 33333 0000000 22 7 7 000 7 888 7 66 8 8 55 66 7
consensus : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGNA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--TTCC-G-GAT-A-TTTCA-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G----T---T-----TNT-----------G-TCA------CGC--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--GCAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCG-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGC-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA-ATT----TATTTAATCC---A-AC-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACATG-T-AT---TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TG----T--GT-----T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGA
Reference ( family-676 ) : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGNA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--TTCC-G-GAT-A-TTTCA-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G----T---T-----TNT-----------G-TCA------CGC--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--GCAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCG-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGC-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA-ATT----TATTTAATCC---A-AC-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACATG-T-AT---TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TG----T--GT-----T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGA
gi|1 : --TT-G-A---GGTA--GG-AA-----T-TA-GAC-A-AA-A-TCTAA--TTT-CTA--CT--T---GGT---------TAAGT-A-TCG-A------------A-----TACTTG-TTTC-G-GATCA-CTT---AGCTATTAGTTTTC---T--TC-CGAAATACTT-------GT---T---T-----TATGA---------G-TCA------CGTGGGG-TTAC---TT-T-----AA-C---CGGTTT---T--TCAG--A--GCAAA-GCT-A--TATTAAAGGAAAAGCA-TGGGT-G-------TT-----AA------TAG---CCAGTATTTA--GG-AC--GACAC--G-G-ATC-A--G-C-T-T-AGGC--A--C-GTGCCGT-T--TTAAA-ATTTT----ATGAAAA-TGTTTCA-T-CAAAAT--TTAA-A------TATTTAATCCA--A-AC-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACATG--------TAT-G-CA-T--AC-G----TTAAA-C--TAAACT--C--T--ACATGT-A-TATACATTTATCC-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CGT-T-T--GC--------CTAA---A-TT-C--CACA------T-A-AT--TG----T--GT-----T-------TG------TCCATTAAA-----TTA---G---T--TC-A-C-T---T-TCC---A-TT-GG-A-AAGTAATAAACATGGA---T-TAAAGGA
gi|10 : tatgATTTCT--TTCGT--TT-G-T---GGTA--TG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TAT-CTA--CT--T---GGT-----T---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TGCTT--GTCT-G-GAA-A-TAT-A-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G----T---T-----TAT-----------G-TTA------GGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGA-TT---T---CGG--ATAGCAAG-GCT-A--TAT-----------C------T-G-------TT---A-AT------TA----CCAG--TTTA--TG-AC--GACAC--G-G-G-C-A--G-T-T-GTA-AC--A------A-AAG-T--T--AA-ATTTT----ATG-GAA-TG-TT----------T--TTAT-ATT----TATTCAATCC---A-AC-T--T-CATGA-T-ATACA-ATTA--------------T-G-TA-T--AT-G----T---G-C--AACATT-------------------------------AAAT-A-----T-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-T--CACA------C-A-A---TG----T--GTTG---T-------TG------T---TT--A-----CTA---GTT-T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAACAATGA--TTGAG--TT-TAAAg
gi|11 : gT--T-CGT--TTTG-A---GGAA--CGGAA-----TCTA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----A---TAG-T-AGATG-A------------AT----GATTA--TTC----GAT-ACTTTCA-AA------GTTTTCA--A--TT-CG-AATACC-------------T---T-----TATAGGTATGATCAG-TCATG----CGC--GG-TT-CAA-TA-T---AGAA-C---CGG-TTCTAT--TC-------GT-AA-GCT-C--TGT--AAAG--------------------------------------------TAG--TTTA--GG-AC--GACAC--GTA-A-G-A--G-C-T-G-A-AA--A--C-A----GC-T--T--AA-ATTTTAG--ATG-AA
gi|12 : tctATTTCTGGT-CGTCATT-G-A---GG-----G-CA-----T--A-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--TACGGGTAATA-G---TAA-TGA-ATG-G------------AT----TA-----TTAT-G-GAT-A-TTT---AG------GTTT-C---AAATT-CG-GAAACCTTTATA--G----TA--T-----TCA-----------G-TCA------TGC--GGGTT-C---A------AGAAAC---CGG-TT----------------------CT-A--T-------------TG-TACTC-G-------TT---A-AAGTCACTCA----TCAG--TTTT--AG-AC--GACACT-A-G-A---A--G-C-T-G-A-CA--A--C---A-CGC-T--T--AA-AT----------------G-TT-------------TTAA-G-----------AATCC---A-AC-T--T-G-----T-AT-----TTACATA-C-TT---TAT-A-TA-CTAAT-G----T------------TT--G--TGAACA--C-A-T-----------T-GA---A-----G-C----G-C-TGC--G-CG-T-C---T-T--GC--------T--AGTCA-TT-T--AGAA------T-G-A---TG----T--TT-----T-------TA------T---TT--A-----tcccacattgtatttacatccttatagtactggttttgttaaattaaagctgctgcgtgtcatttagagtgttatgttgtttttattactgatctttgtatcagaaaatgaatggtttataaagg
gi|13 : GT--TT-G-------GA--CG-AAA----T-TA-ACC-AGAA---TC-AA--TTT-CTA--C---T---GGT-----GAAATAG-T-A-ATG-A------------AT----GGATTA-TTCC-G-GAT-A-TCTTC-AC------GTTTTCA--A--TTACG-TATACCT-------actgatcttacagaatgaatggtata
gi|13 : T---A-AA------GG----TCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-ATA-G-A--G-C-T-----GC--A--C-CCA-CGC-C--T--AATTTTTT----AT---AA-TG-----------AAT--T------------------CCC---ACAC-T--T-G-----T-------ATTACATA-C-GC---TATAG-T------T-G----T---A-C--TGT-TT--GTTT--A-A-AC-A-T-----------G-AAAT-G-----A-C---TG-C-TAC--GTTG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G-TA-C--CATT------T-A-GAGCTG----T--GG-----T-------TATGTTGTT---TT--A-----TTACTGG---T-------C-T---T-GTA---T-C--------AGTAATGA--AAGGG--TTATAAAGGtataggtatcgaatcaaggatctgtaaaggtcagtttaggacgacacgatagagctgcacccacgcctaattttttataatgaattcccacacttgtattacatacgctatagttgtactgtttgtttaaacatgaaatgactgctacgttgtcgttgctagtaccatttagagctgtggttatgttgttttattactggtcttgtatcagtaatgaaagggttataaagg
gi|14 : gtttggacgaaattaaccagaatcaatttctactggtgaaatagtaatgaatggattattccggatatcttcacgttttcaattacgtataccttataggtatcgaatcaaggatctgT--T-CGT--TT-G-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGTAATA-G---TAA-TGA-ATG-G------------AT----TA-----TTCC-G-GAT-A-TTTCA-A-------GTTTTCA--A--TT-CG-AATGCCT-------
gi|14 : tG--TTTA--GG-AC-----AC--G-T-A-G-A--G-C-T-G-A-CA--A--C-AT---GC-T--T--AA---------------------TTC---------T--TT----TT----TAATGAATCC---A-AC-T--T-GT--A-T-TTACA---TAC-TG-T------------TA-T--A--G----T---A-C--TGTTTT--G--TTTA-A-AC-A-T-----------T-AAA--------G-C---TG-C-TGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G--T-C--CATT------T-A-G---AG----T--GT-----TATA----TGTTGT--T---TT--A-----TTA-------C--TGAT-C-T---T-GTA---T-C--------AGAAATGA--ATGGG--TTATAAAGGAttataggtatgatcagtcaaccggttctatcgtaactctgtttaggacacgtagagctgacaacatgcttaattcttttttaatgaatccaacttgtatttacatactgttatagtactgttttgtttaaacattaaagctgctgcgtgtcgttgctagtccatttagagtgttatatgttgttttattactgatcttgtatcagaaatgaatgggttataaagga
gi|15 : tttcgtttgaggaacgaattagacagaaatcaatttctacttggtaatagtaatgaatggattattccggatatttcaagttttcaattcgaatgcctttataggtatgatcagtcaaccggttctatcgtaactct-A---GAAA--CG-AACATACT-TAAGAC-AGAA-A-TC-AAG-TTT-CTATTTT--T---GGT-----AAT-TAG-T-ACATG-ATTTGGAAATGGTAT----TACTT--GTCC-G-CGC-A-TTTC
gi|16 : ---A--TT-CG-AATACCT-------G----T---T-----T-T-----------G-TCA------TGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--GCAAA-ACT-T--TAT--AAAGAAAAGCA-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-A-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA-A------TATCGAATCC---A-AC-T--T-GA--A-T-GTACA-ATTACATG--------TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--TACA------T-A-A---TG----T--G------T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTACTAA--ATGGA--TT-TAAAGGAtccaatttttcaaccgtcatctttttcaattcgcatttattgggattccaatgactcgatacatgcgttcagaataaagtttggttctaaatcgcggctctgattttatagactatgttttgtttaaaacattagagaaatgctgcgtgtcgtttgctagtccatttagttgttcatgtagttttattactgatcgtctatgataggaaattgaatcgggtataataggaat
gi|17 : TTTTT--T-CGT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGC-----G---TAG-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--GTTC-G-GA--A-TTGTA-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G----T---T-----TTT-----------G-TCA------CGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--ACAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCA-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-A-GA--A--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA-A------TATTTAATCC---A-AC-T--T-TA--A-T-ATACA-ATTACA-G-TCATG--TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--Ag
gi|18 : at-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTT--GT--T---GGTA----A---TAG-T-A-ATG-A------------AT----GGATT--ATCCTG-GAT-A-TTTCA-A-------GTTTTCA--A--TT-CG-AATACCTTTATAG-G----TATGT-----TCA-----------G-TCA------TGC--GG-TT-C---AA-T---AGAA-C---CAG-TT---C--TAAT--T--TCGTA-GCT------------------CA-T-------------TT---A-AA-------G----TCAG--TTAA--GG-AC--GACAT--G-T-A-G-A--G-C-T-G-A-CA--A--C-G---CGCAT--G--AA-ATTTTTGA-ATG-AAA-T--TCCA-T-A-AAA---TCAG-ATTGTGCTGCTT----------GT-T--T-GG--A-TCATGAA-ATAACATG-TCAC---TG--G-TA-T--GA-A----A---A-C--AATCTT--G--T--AAA-G
gi|19 : ATTTCT--TTCGT--CT-G-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-AG-------------------------------T-----G---------A-ATG-G------------AT----TA-----TTCC-G-GAT-A-TTTCA-A-------GTTTTCA--A--TT-CG-AATACCTTAATAG-G----TA--T-----CGTCA---------G-TCA------TGT--GG-TT-C---AA-T---AGAA-T---TGG-TT---T--T--A--A--TCGTA-GCT------------------C------T-G-------TT---A-AA-------G----TCAG--TTTA--GG-AT--GACAC--G-T-A-A-A--G-C-T-G-A--C--A--A-A-A-CGC-T--T--AA-TTTTT----aaca
gi|19 : ATA-T-AT---TGT---TA-T--A--A----T---A-C--TATGTTTTG--TT-AAA-AC-A-T-----------T-AAA--------G-C---TG-C-TGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T------A-CT-C--CAT---------------TG----TTAGG-----T-------TGT-----T---TT--A-----TTA---ttatatattgttataatactatgttttgttaaaacattaaagctgctgcgtgtcgttgctactccattgttaggttgttttattactgaatgggttataaaa
gi|2 : atttctttcgtctgaggaacgaattagacagtgaatggattattccggatatttcaagttttcaattcgaataccttaataggtatcgtcagtcatgtggttcaatagaattggttttaatcgtagctctgttaaagtcagtttaggatgacacgtaaagctgacaaaacgcttaatttttttT--T-CGT--AT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTTTCTA--CTGGT---GTT-----G---TAA-T-ACACG-A------------AT----TACTT--GTC--G-GAT----TTAAGAG------GTTTTC---A--T--CG-A-TACCT-------G----T---T-----TTT-----------G-TCAA-----CGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCCA--A--GCAAAAGCTTA--TAT--AAGGAAAGCTA-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GGGAC--GACAC--G-G-A-C-AAAG-C-TTG-A-GC--T--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTGA--------TATTTATTCC---A-AC-T--T-GA--G-T-ATACA-ATTACATG-TTAT---T---G-TA-T--AC-G----T---A-C--AATAAT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T--G--T-TTTGC--------TT-A---A-TTGC--CACAA-----T-A-A---TG----T--GT-----TGGTTGTTTA------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--TGGGA--TT-TAAAGctgaatgggttataaaa
gi|20 : tctT--T-CGT--TT-G-ATCAAGAC--CG-AA-----T-TA-GAC-A-AA-A-TC-AT--TTC-CTA--CT--T---GGTAACTCG---TAA-----ATG-A------------ATGCGAT-CTA--TTCC-G-GAT-A-TTTCA-AG------TACTTC---AACTTACG-ATAACCT-------T----A---TGG---TAT-----------GATCAGTTCATCGC--CG-TT-CA--TTAT---AGAA-CGGAAGG-CT---TACTCTT--A--GAAAC-ACC-ACCCAC--AAG----ATTG-AGGCT-GCTTCTGCTT---A-AA------AG----TCAGGTTTTA--GG-AC--G-CAC--G-T-AGC-A--GCC-T-G-A-CC--A------A-CAG-C--T--AA-ATTTTTTCAATA-AAA-Tctga
gi|21 : aatctGGGT-G-------TTTTTA-AA------TA----CCAG--TTTA--GT-AC--GACAC--G-G-A-C-A----C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA--------TATTTAATCCAGAA-ACTT--T-GA--ACT-ATAC--ATTACA-----AG---TAT-G-CA-T--AC-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-AGT-----------T-AAACAA-----G-CA--TG-C-AGC--G-TG-T-CG--TAT--GC--------T--A---ATTT-C--CACA------T-C-AT--TGTCGTT--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TTA---G---TA-TCAA-C-T---T-TCAT--T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGAGGTT-TAAAAGAccta
gi|22 : a-T-A-ATG-A------------AT----GGCTTA-TTCC-G-GAT-A-TTTCA-A-------GTTTTCA--A--TT-CG-AATACC-------------T---T-----TATAGGTATGATCAG-TCA------TGC--GG-TT-C---AA-T---AGAA-C---CGG-TT---C--TAAT--A--GTAA---CT-A-----------------------T-G-------TT---A-AA------AG----TCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-T-A-G-A--A-C-T-G-A--C--A----GCA-CGC-TAAA--AA-ATTTTA---ATG-A---------A-T-C-CAAC--TTGT-ATT----TATATA
gi|23 : T--T-CGT--TT-G-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-ATAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--G---GGC-----GA--TAG-T-A-ATG-A------------AT----GGATTAATTCC---GAT-A-TTTCA-A-------GTTTTCA--A--TT-CG-AATACTA-------GTACCT---T-----TATAGGTATGTTAAG-TCA------TGC--GG-TT-C---ttgttatagtactgtgatttgtt
gi|23 : tctCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-T-A-G-A--G-C-T-G-A-CA--A--C---A-CGC-T--T--AA-ATaatattcgtagctctcttcaagtcagtttaggacgacacgtagagctgacaacacgcttaaat
gi|24 : tctttcgtttgaggaacgaattagacataaatcaatttctactgggcgatagtaatgaatggattaattccgatatttcaagttttcaattcgaatactagtacctttataggtatgttaagtcatgcggttcaatattcgtagctctcttcaagt-G-A-GC--GATC-GTAACGT-T--T--AATATTTT----ATG-AAG-GA-TTCA-T-C-AA----TTAG-ATT-----ATTTATTCC---A-AC-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACATA-T-A----TGT-A-TA-C--AT------T---A-CGAAATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------TAAAAC-A-----GTC---TG-CGAGC--G-TG-T-CGT-T-T--GC--------T------A-TT-C--CA-A------T-A-A---TG----T--GT-----TGTA----TA------T---TT--ACGTTCTTAC--GACCT--TCAA-C-TCTAT-TCA---T-TT-
gi|25 : -ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAG-AT------AATTATTCC---A-AC-T--T-GA--A-T-ATGCA-ATTACATG-T-AT-------G-TA-T--AC-G----T---A-C--AATATT--G--C--ACA-AT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-ATG---TG----T--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TT----G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-TG-G-AAGTAAT-A--ATGGA--TT-TAAAGGA
gi|26 : T--TTAA-ATG---------AATCC---A-AC-T--G-G-----T-AT-----TTACATG-T-ACA--TAT-G-TA-C--AT-GCTGTT---A-T--AGTACT--G--T--TTT-GT---T-----------T-AAAC-ATTAAAG-C---TG-C-TGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G--T-C--CATT------T-A-G---AG----T--GT-----TA------TGTTGT--T---TT--A-----TTA-------C--TGAT-C-T---T-GTA---T-C--------AGAAATGA--ATGGG--TTATAAA
gi|27 : gagctgacaacacgcttaatttA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-T-C--G-C-T-G-A-GCTGA--C-ATA-AGT-T--T--AT-ATTTT----ATG-AAA-TATTTTA-T-T-AAAG--CTA---------TATTTAATCA---A-AT-T--T---------------------------T---TAT-G-------AT-A----T---A-C--AGTTAT--G--T--ACA-GTGA-T-----------T-TAA--------------TG-C-A------TG-T-AGTAT-T--GC--------T--A---G-TT-CCTCGCAGTATACT-A-G---TG----T--GTTG---T-------TA------T---TC--A-----TTA---G---T--
gi|28 : ATAC---A-AC-T--T-TA--A-C-ATACACATTATATG-T-AT-------G-TA-T--A--G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA--T-A-T-----------T-AAAC-A-----G-CG--TGGC-AACTGG-TG-TTCG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------TTA-A---TG----T--GT-----TGTT----TA------T---CT--A-----TTAAA-G---T--T-AA-C-T---T-TCA---T-T--GA-A-AAGTGATGA--ATGGA--TT-TAAAGGAatag
gi|3 : aaattacatacT-G-------TT---A-AA-------G----TCAG--TTTA--GG-A----A-AC--G-G-A-C-A--A-CGTAG-A-G---G--C-GAA-C---------AA-A----------G-AAAACG-CT---T-T-AAATATTTAA-A-------ATG-AATTC---A-AC-TGTT-AA--T-T-ATACA---TAC----T-GT---TAT-A-TACT--AT-G----G---G-A--GATTTT--G--T--AAA-AC-A-T-----------T-AAA--------G-CG--TG-C-TGC--G-TG-T-CGC-T-T--GC--------T--g
gi|30 : aatggaattatggttccggatattattttccaaacgttgttcgaatcatcgaaggaaataaaactctattatataagagtaacaacaagacttggtcaactggcgtgtgtctaaatctcagatccaggggttttatataatcgtaagct-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TGTGT-T--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-CG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGcaccatttatttagaagtgatagtatcatctgctttttgaacacctgttcttgtatagaaatgatgggttacgaaccattaaaggcgaagaactttgtttatgtatttg
gi|31 : ATTTCT--TTCGT--TT-G-A---GGTA--AG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-
gi|31 : tgCA-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCA-------G----T---T-----TCT-----------G-TCA------CGT--GT-TT-T---TT-TTTAAGAA-C---CGG-caaggttttcattcgaataccagtttctgtcacgtgtttttttttaagaaccgg
gi|32 : tgatttctttcgtttgaggtaagaattagacagaaTTTCT--TTCAT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--GTTC-G-GA--A-TTATA-AG------GTTT
gi|33 : -----T-------TG------T---TT--A-----ATA---G---TATTCAA-C-T---T-TCACATT-TT-GG-AGAAGTAATGA--ATGGG--TT-TAAAGGA
gi|34 : tgttgG----T--GT-----TGT-----TG------T---TT--A-----ATA---G---TATTCAA-C-T---T-TCA---T-TTTGG-A-AAGTAATGA--ATGGG--TT-TAAAGGA
gi|35 : --T-CGT--TT-G-A---ACTAGGTG-AA-----T-TA-GAC-TGAA-A-TT-AT--TTT-CT---TT--T---GTT-----G---GAA-T-G-ATG-A------------AT----g
gi|36 : AC-A-----G-CCTGTG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GCTACATATGT--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TG----T--CT-----T-------
gi|37 : A---G---T--TCAAAC-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATTA--ATGGA--TT-TAAAGGAg
gi|38 : --A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATAA--ATGGA--TT-TAAAg
gi|39 : ---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAAGA
gi|4 : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----C-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--TTTC-G-GA--A-TTAGA-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G----T---T-----TTT-----------G-TCA------CGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--ACAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCG-TGAGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--G--AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCG-T-C-AAAT--TTAA-ATT----TATTTAATCC---A-AC-T--T-CA--A-T-GTACA-ATTACATG-T-AT---TAT-A-TA-T--AT-G----T---A-C--AATACT--G--T--ATA-GT-A-T-----------T-AAAT-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TA----T--GT-----T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATAGA--TT-TAAAGGAg
gi|40 : ----TATTTAATCC---A-AC-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACAAG-T-AT---
gi|5 : T--T-CGT--TT-G-A---TGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--GTTC-G-GAT-----TTA-AGA-----GGTTTA---A--TT-CG-AATACAT-------G----T---T-----TTT-----------G-TCA------CGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-CT---T--TCAG--A--GCAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCA-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC-----------G-A-C-G--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG--AA-TG-TTCA-TGC-AAAT--TTAG-A------TATTTATTGC---A-GC-T--TGGA--A-T-ATACA-ATTACTTG-T-GT---TAT-GTTA-T--ATGG----T---AGC--AATA-------T--GCA-GT-A-T-----------T-AAAC-AC----G-CT--TG-C-AGCGGG-TG-T-CG--T-TG-GC--------T--A---A-TT-T--CACA------T-A-A---T-----T--G------T-------TG------T---TT--AATTAGTTA---A---T--TCAA-CGT---TGTCA---T-TT-GGAA-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGAgc
gi|6 : tTTCTT--T-CGT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-GA-GAC-AGAA-A-TC-AT--CTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----GACTT--GTCC-G-GAA-A-TGT-A-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G----T---T-----TGT-----------G-TCA------CGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CTG--T---T--TCAGATA--GCAAG-GCT-A--TAT--AAAGAGATGCA-TAGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCCG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-G-C-A--G-T-T-ACA-ACA-A--CAGTA-A---------AA-AATCT----ATG-TAA-TGTTTTA-T-T-GAAG--TTAA-ATT----TATTTAATCC---A-AC-T--T-TATGA-T-ATACA-TTTACATG--------TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--GATAT------T--AC-----------------------AT-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------C-A-A---TG----T--GTTG---T-------TG------T---TT--G-----CTA---GAA-T--TCAA-C-T---T-TTA---G-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGAA--TT-TAGAGGA
gi|7 : --T-CGT--TT-G-A---GGAAA-CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AATTTTT-CTA--CT--T---GGTTATA-G---TAA-TGA-ATG-G------------AT----TA-----TTCC-G-GAT-A-TTTCC-AA------GTTTTCCA-A--TT-CG-AATACCC-------T----T---TATAGGTAT-----------GATCAGTTC--TGC--GG-TT-CAA-AT-A---AGAA-T---CGG-TT---TAATCAG-------------T-A--T-------------CG-ATCCT-G-------TT---ACAA------TAATCTTCAG--TTTA--GGTACTGAACACCTG-T-A-G-A--GCC-T-G-A-CA--A--C---A-CGC-T--T--AA----TT----ATT-AA-----CCCA-A-T-GAAT--CCAACATTG---TATT-----------AC-A--T-TA--C-T-GTATA-AGTAC-TG---GT---TTT-G-TT-T--AA-A----T---A-C--A----T--G--T--A-A-G----------------C-GAAT-------G-C---TG-T--GC--GATGTT-CG--T-TG-GC--------T--T---A-GT-C--CATT------T-A-G---AG----T--GTATATGT-------TG------T---TTA-A-----ATA---C---T--TGAT-C-T---T-GTA---T-TC-AG-A-----AATGA--ATGGG--TT-TA
gi|8 : TCTTT--T-CGT--TT-G-A---GGT---CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-T---A--TTT---A--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATGCA------------AT----TACTTG-TTTC-GAGTT-A-T---A-AG------GTTTTCC--A--TT-TG-AATACTT----------------T-----TAT-----------G-CTA-------GT--GG-TT-C---TT-T---AGAC-C---CGGGTT---T--TCAG--A--G--AA-GTT-A--TAT--AAGGAA--GCAATGGGTTG-------TT---A-AA------TA----C-AG--TTTAAGGG-AC--GAAAC--G-G-A-C----G-C-T-G-A--C--A----GTA-AGT-T--TT-AA-ATTTT----AT--AAA-TG-GTCAAT-C-AA-T--TTAG-ATT-----ATTTAATC------AC-T----GA--A-T-ATACA-ATTACATG-T-AT-------G-CA-T--AA-G----T---A-C--ACTATT--G--T--ACA-GT-A-A-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---CGTGT-T--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGAtaaag
gi|9 : TTTCT--TTCGT--TG-GCA---GGAA--CG-AA-----T-TA-GACCAGAACACTC-AAATTTC-CTA---T--T---GGT-----TAATTAG-T-A-ATG-A------------AT----GGATA--TTCC-G-GAT---TTTCA-AG------TTCTTCTCAA--TT-CG-AATACCTTTCATAGG----T---T-----GATCA---------G-TCA------TGC--GG-TT-CCAATA-T---AAAC-C---CGG-TT---C--TTA
gi|9 : T-G-------TT---A-AA-------G----TCAGATCTTA--GG-AC--GACAC--G-T-A-CGA--G-C-T-G-A-CA--A--C---A-CGC-T--T--AA-ATCTT----TTA-AAA-TG-----------AAT--GCGA-ACT----TGCT-----------------------A-T-TTACA-AGTAC-TGTT-ATCGGTAC-G-TT-T--GT-T----T---A----AACATT-----T--A----------------------AAAG-A-----C-C---TT----GC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G--T-C--CATT------T-A-G---AG----T--GTTA---T-------TG------T---TT--A-----TT--------T--ACTA-C-T---C-TTG---TATC-AG-A-----AATGA--ATGGttttcgtactctgttaaagtcagatcttaggacgacacgtacgagctgacaacacgcttaaatcttttaaaatgaatgcgaacttgctatttacaagtactgttatcggtacgtttgtttaaacatttaaaagaccttgcgtgtcgttgctagtccatttagagtgttattgtttatttactactcttgtatcagaaatgaatggccccagctttaacgg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): CGTTTTTTAATCTAAGCTGACTGCGGTGTCAGTTGCTAGCCATTTGAGTGCGTTATGATCTGTTATTGCGACTACAGATATTGCTTACAGGAACAATGAATGGCAGTTATAGAAGGA
Alignments
lowQualScore : 1 222222222 111111111111 1111111 222 555555555555555555555555555555555555 1111111 111111 5555555555555555555555555 111111111111 111111111111 1111 2222222222 222222222222 11111111111111111111111 11111111 111 222222222222222222222 1111111
lowQualScore : 33 1 22 2 1 333 2 44 1 66666 1 1 1 1 1 1 77 1 22 22 333 777777777 1 5 5 1 999999999999 000000000000 1 1 33 1 5 1 2222222 111 55 3 1 555555555555555555555555555555555555 4 6666666 22 2 2 333333 333 2 333 4 777777 5555555 0 22 1111111111111111111111111 2 6666666 333 2 555555555555 77 22 3 22 44 444 666 22 3 1 3 3 777777777777 3 22 22 44 3 0000 1 1 6666666666 22 4444444444 3 444 1 1 22 88888 1 1 1 2 000000000000 1 1 22 55 3333 333 1 22 0 22 22 11111111111111111111111 1 00000000 1 000 1 22 44 3 1 1 77 1 55 66666666 44 333 1 1 22 777777 1 1 666 9999 22 444444444444444444444 333 44 88888 1111111 66 1 1 333 1 444 1 22 1 1 22 22 5
lowQualScore : .. . .. . . ... . .. . ..... . . . . . . .. . .. .. ... ......... . . . . ............ ............ . . .. . . . ....... ... .. . . .................................... . ....... .. . . ...... ... . ... . ...... ....... . .. ......................... . ....... ... . ............ .. .. . .. .. ... ... .. . . . . ............ . .. .. .. . .... . . .......... .. .......... . ... . . .. ..... . . . . ............ . . .. .. .... ... . .. . .. .. ....................... . ........ . ... . .. .. . . . .. . .. ........ .. ... . . .. ...... . . ... .... .. ..................... ... .. ..... ....... .. . . ... . ... . .. . . .. .. .
lowQualScore : 11 1 88 0 8 222 8 33 8 44444 8 8 8 8 9 9 11 9 66 66 333 000000000 8 5 5 8 333333333333 999999999999 9 9 11 9 4 9 0000000 222 22 8 9 666666666666666666666666666666666666 2 2222222 99 1 1 000000 999 2 999 4 111111 9999999 4 99 7777777777777777777777777 1 8888888 555 0 444444444444 22 44 5 44 11 333 888 44 5 7 3 3 888888888888 3 55 33 00 2 4444 7 8 8888888888 55 0000000000 3 888 7 7 44 33333 7 7 7 2 555555555555 7 7 44 11 7777 000 7 44 3 44 44 22222222222222222222222 8 11111111 7 000 7 77 88 5 7 7 66 7 99 33333333 11 222 8 8 55 000000 8 8 888 8888 44 555555555555555555555 000 00 33333 0000000 22 7 7 000 7 888 7 66 8 8 55 66 7
consensus : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGNA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--TTCC-G-GAT-A-TTTCA-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G----T---T-----TNT-----------G-TCA------CGC--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--GCAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCG-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGC-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA-ATT----TATTTAATCC---A-AC-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACATG-T-AT---TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TG----T--GT-----T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGA
Reference ( family-676 ) : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGNA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--TTCC-G-GAT-A-TTTCA-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G----T---T-----TNT-----------G-TCA------CGC--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--GCAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCG-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGC-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA-ATT----TATTTAATCC---A-AC-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACATG-T-AT---TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TG----T--GT-----T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGA
gi|1 : --TT-G-A---GGTA--GG-AA-----T-TA-GAC-A-AA-A-TCTAA--TTT-CTA--CT--T---GGT---------TAAGT-A-TCG-A------------A-----TACTTG-TTTC-G-GATCA-CTT---AGCTATTAGTTTTC---T--TC-CGAAATACTT-------GT---T---T-----TATGA---------G-TCA------CGTGGGG-TTAC---TT-T-----AA-C---CGGTTT---T--TCAG--A--GCAAA-GCT-A--TATTAAAGGAAAAGCA-TGGGT-G-------TT-----AA------TAG---CCAGTATTTA--GG-AC--GACAC--G-G-ATC-A--G-C-T-T-AGGC--A--C-GTGCCGT-T--TTAAA-ATTTT----ATGAAAA-TGTTTCA-T-CAAAAT--TTAA-A------TATTTAATCCA--A-AC-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACATG--------TAT-G-CA-T--AC-G----TTAAA-C--TAAACT--C--T--ACATGT-A-TATACATTTATCC-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CGT-T-T--GC--------CTAA---A-TT-C--CACA------T-A-AT--TG----T--GT-----T-------TG------TCCATTAAA-----TTA---G---T--TC-A-C-T---T-TCC---A-TT-GG-A-AAGTAATAAACATGGA---T-TAAAGGA
gi|10 : tatgATTTCT--TTCGT--TT-G-T---GGTA--TG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TAT-CTA--CT--T---GGT-----T---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TGCTT--GTCT-G-GAA-A-TAT-A-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G----T---T-----TAT-----------G-TTA------GGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGA-TT---T---CGG--ATAGCAAG-GCT-A--TAT-----------C------T-G-------TT---A-AT------TA----CCAG--TTTA--TG-AC--GACAC--G-G-G-C-A--G-T-T-GTA-AC--A------A-AAG-T--T--AA-ATTTT----ATG-GAA-TG-TT----------T--TTAT-ATT----TATTCAATCC---A-AC-T--T-CATGA-T-ATACA-ATTA--------------T-G-TA-T--AT-G----T---G-C--AACATT-------------------------------AAAT-A-----T-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-T--CACA------C-A-A---TG----T--GTTG---T-------TG------T---TT--A-----CTA---GTT-T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAACAATGA--TTGAG--TT-TAAAg
gi|11 : gT--T-CGT--TTTG-A---GGAA--CGGAA-----TCTA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----A---TAG-T-AGATG-A------------AT----GATTA--TTC----GAT-ACTTTCA-AA------GTTTTCA--A--TT-CG-AATACC-------------T---T-----TATAGGTATGATCAG-TCATG----CGC--GG-TT-CAA-TA-T---AGAA-C---CGG-TTCTAT--TC-------GT-AA-GCT-C--TGT--AAAG--------------------------------------------TAG--TTTA--GG-AC--GACAC--GTA-A-G-A--G-C-T-G-A-AA--A--C-A----GC-T--T--AA-ATTTTAG--ATG-AA
gi|12 : tctATTTCTGGT-CGTCATT-G-A---GG-----G-CA-----T--A-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--TACGGGTAATA-G---TAA-TGA-ATG-G------------AT----TA-----TTAT-G-GAT-A-TTT---AG------GTTT-C---AAATT-CG-GAAACCTTTATA--G----TA--T-----TCA-----------G-TCA------TGC--GGGTT-C---A------AGAAAC---CGG-TT----------------------CT-A--T-------------TG-TACTC-G-------TT---A-AAGTCACTCA----TCAG--TTTT--AG-AC--GACACT-A-G-A---A--G-C-T-G-A-CA--A--C---A-CGC-T--T--AA-AT----------------G-TT-------------TTAA-G-----------AATCC---A-AC-T--T-G-----T-AT-----TTACATA-C-TT---TAT-A-TA-CTAAT-G----T------------TT--G--TGAACA--C-A-T-----------T-GA---A-----G-C----G-C-TGC--G-CG-T-C---T-T--GC--------T--AGTCA-TT-T--AGAA------T-G-A---TG----T--TT-----T-------TA------T---TT--A-----tcccacattgtatttacatccttatagtactggttttgttaaattaaagctgctgcgtgtcatttagagtgttatgttgtttttattactgatctttgtatcagaaaatgaatggtttataaagg
gi|13 : GT--TT-G-------GA--CG-AAA----T-TA-ACC-AGAA---TC-AA--TTT-CTA--C---T---GGT-----GAAATAG-T-A-ATG-A------------AT----GGATTA-TTCC-G-GAT-A-TCTTC-AC------GTTTTCA--A--TTACG-TATACCT-------actgatcttacagaatgaatggtata
gi|13 : T---A-AA------GG----TCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-ATA-G-A--G-C-T-----GC--A--C-CCA-CGC-C--T--AATTTTTT----AT---AA-TG-----------AAT--T------------------CCC---ACAC-T--T-G-----T-------ATTACATA-C-GC---TATAG-T------T-G----T---A-C--TGT-TT--GTTT--A-A-AC-A-T-----------G-AAAT-G-----A-C---TG-C-TAC--GTTG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G-TA-C--CATT------T-A-GAGCTG----T--GG-----T-------TATGTTGTT---TT--A-----TTACTGG---T-------C-T---T-GTA---T-C--------AGTAATGA--AAGGG--TTATAAAGGtataggtatcgaatcaaggatctgtaaaggtcagtttaggacgacacgatagagctgcacccacgcctaattttttataatgaattcccacacttgtattacatacgctatagttgtactgtttgtttaaacatgaaatgactgctacgttgtcgttgctagtaccatttagagctgtggttatgttgttttattactggtcttgtatcagtaatgaaagggttataaagg
gi|14 : gtttggacgaaattaaccagaatcaatttctactggtgaaatagtaatgaatggattattccggatatcttcacgttttcaattacgtataccttataggtatcgaatcaaggatctgT--T-CGT--TT-G-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGTAATA-G---TAA-TGA-ATG-G------------AT----TA-----TTCC-G-GAT-A-TTTCA-A-------GTTTTCA--A--TT-CG-AATGCCT-------
gi|14 : tG--TTTA--GG-AC-----AC--G-T-A-G-A--G-C-T-G-A-CA--A--C-AT---GC-T--T--AA---------------------TTC---------T--TT----TT----TAATGAATCC---A-AC-T--T-GT--A-T-TTACA---TAC-TG-T------------TA-T--A--G----T---A-C--TGTTTT--G--TTTA-A-AC-A-T-----------T-AAA--------G-C---TG-C-TGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G--T-C--CATT------T-A-G---AG----T--GT-----TATA----TGTTGT--T---TT--A-----TTA-------C--TGAT-C-T---T-GTA---T-C--------AGAAATGA--ATGGG--TTATAAAGGAttataggtatgatcagtcaaccggttctatcgtaactctgtttaggacacgtagagctgacaacatgcttaattcttttttaatgaatccaacttgtatttacatactgttatagtactgttttgtttaaacattaaagctgctgcgtgtcgttgctagtccatttagagtgttatatgttgttttattactgatcttgtatcagaaatgaatgggttataaagga
gi|15 : tttcgtttgaggaacgaattagacagaaatcaatttctacttggtaatagtaatgaatggattattccggatatttcaagttttcaattcgaatgcctttataggtatgatcagtcaaccggttctatcgtaactct-A---GAAA--CG-AACATACT-TAAGAC-AGAA-A-TC-AAG-TTT-CTATTTT--T---GGT-----AAT-TAG-T-ACATG-ATTTGGAAATGGTAT----TACTT--GTCC-G-CGC-A-TTTC
gi|16 : ---A--TT-CG-AATACCT-------G----T---T-----T-T-----------G-TCA------TGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--GCAAA-ACT-T--TAT--AAAGAAAAGCA-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-A-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA-A------TATCGAATCC---A-AC-T--T-GA--A-T-GTACA-ATTACATG--------TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--TACA------T-A-A---TG----T--G------T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTACTAA--ATGGA--TT-TAAAGGAtccaatttttcaaccgtcatctttttcaattcgcatttattgggattccaatgactcgatacatgcgttcagaataaagtttggttctaaatcgcggctctgattttatagactatgttttgtttaaaacattagagaaatgctgcgtgtcgtttgctagtccatttagttgttcatgtagttttattactgatcgtctatgataggaaattgaatcgggtataataggaat
gi|17 : TTTTT--T-CGT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGC-----G---TAG-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--GTTC-G-GA--A-TTGTA-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G----T---T-----TTT-----------G-TCA------CGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--ACAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCA-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-A-GA--A--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA-A------TATTTAATCC---A-AC-T--T-TA--A-T-ATACA-ATTACA-G-TCATG--TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--Ag
gi|18 : at-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTT--GT--T---GGTA----A---TAG-T-A-ATG-A------------AT----GGATT--ATCCTG-GAT-A-TTTCA-A-------GTTTTCA--A--TT-CG-AATACCTTTATAG-G----TATGT-----TCA-----------G-TCA------TGC--GG-TT-C---AA-T---AGAA-C---CAG-TT---C--TAAT--T--TCGTA-GCT------------------CA-T-------------TT---A-AA-------G----TCAG--TTAA--GG-AC--GACAT--G-T-A-G-A--G-C-T-G-A-CA--A--C-G---CGCAT--G--AA-ATTTTTGA-ATG-AAA-T--TCCA-T-A-AAA---TCAG-ATTGTGCTGCTT----------GT-T--T-GG--A-TCATGAA-ATAACATG-TCAC---TG--G-TA-T--GA-A----A---A-C--AATCTT--G--T--AAA-G
gi|19 : ATTTCT--TTCGT--CT-G-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-AG-------------------------------T-----G---------A-ATG-G------------AT----TA-----TTCC-G-GAT-A-TTTCA-A-------GTTTTCA--A--TT-CG-AATACCTTAATAG-G----TA--T-----CGTCA---------G-TCA------TGT--GG-TT-C---AA-T---AGAA-T---TGG-TT---T--T--A--A--TCGTA-GCT------------------C------T-G-------TT---A-AA-------G----TCAG--TTTA--GG-AT--GACAC--G-T-A-A-A--G-C-T-G-A--C--A--A-A-A-CGC-T--T--AA-TTTTT----aaca
gi|19 : ATA-T-AT---TGT---TA-T--A--A----T---A-C--TATGTTTTG--TT-AAA-AC-A-T-----------T-AAA--------G-C---TG-C-TGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T------A-CT-C--CAT---------------TG----TTAGG-----T-------TGT-----T---TT--A-----TTA---ttatatattgttataatactatgttttgttaaaacattaaagctgctgcgtgtcgttgctactccattgttaggttgttttattactgaatgggttataaaa
gi|2 : atttctttcgtctgaggaacgaattagacagtgaatggattattccggatatttcaagttttcaattcgaataccttaataggtatcgtcagtcatgtggttcaatagaattggttttaatcgtagctctgttaaagtcagtttaggatgacacgtaaagctgacaaaacgcttaatttttttT--T-CGT--AT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTTTCTA--CTGGT---GTT-----G---TAA-T-ACACG-A------------AT----TACTT--GTC--G-GAT----TTAAGAG------GTTTTC---A--T--CG-A-TACCT-------G----T---T-----TTT-----------G-TCAA-----CGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCCA--A--GCAAAAGCTTA--TAT--AAGGAAAGCTA-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GGGAC--GACAC--G-G-A-C-AAAG-C-TTG-A-GC--T--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTGA--------TATTTATTCC---A-AC-T--T-GA--G-T-ATACA-ATTACATG-TTAT---T---G-TA-T--AC-G----T---A-C--AATAAT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T--G--T-TTTGC--------TT-A---A-TTGC--CACAA-----T-A-A---TG----T--GT-----TGGTTGTTTA------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--TGGGA--TT-TAAAGctgaatgggttataaaa
gi|20 : tctT--T-CGT--TT-G-ATCAAGAC--CG-AA-----T-TA-GAC-A-AA-A-TC-AT--TTC-CTA--CT--T---GGTAACTCG---TAA-----ATG-A------------ATGCGAT-CTA--TTCC-G-GAT-A-TTTCA-AG------TACTTC---AACTTACG-ATAACCT-------T----A---TGG---TAT-----------GATCAGTTCATCGC--CG-TT-CA--TTAT---AGAA-CGGAAGG-CT---TACTCTT--A--GAAAC-ACC-ACCCAC--AAG----ATTG-AGGCT-GCTTCTGCTT---A-AA------AG----TCAGGTTTTA--GG-AC--G-CAC--G-T-AGC-A--GCC-T-G-A-CC--A------A-CAG-C--T--AA-ATTTTTTCAATA-AAA-Tctga
gi|21 : aatctGGGT-G-------TTTTTA-AA------TA----CCAG--TTTA--GT-AC--GACAC--G-G-A-C-A----C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA--------TATTTAATCCAGAA-ACTT--T-GA--ACT-ATAC--ATTACA-----AG---TAT-G-CA-T--AC-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-AGT-----------T-AAACAA-----G-CA--TG-C-AGC--G-TG-T-CG--TAT--GC--------T--A---ATTT-C--CACA------T-C-AT--TGTCGTT--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TTA---G---TA-TCAA-C-T---T-TCAT--T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGAGGTT-TAAAAGAccta
gi|22 : a-T-A-ATG-A------------AT----GGCTTA-TTCC-G-GAT-A-TTTCA-A-------GTTTTCA--A--TT-CG-AATACC-------------T---T-----TATAGGTATGATCAG-TCA------TGC--GG-TT-C---AA-T---AGAA-C---CGG-TT---C--TAAT--A--GTAA---CT-A-----------------------T-G-------TT---A-AA------AG----TCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-T-A-G-A--A-C-T-G-A--C--A----GCA-CGC-TAAA--AA-ATTTTA---ATG-A---------A-T-C-CAAC--TTGT-ATT----TATATA
gi|23 : T--T-CGT--TT-G-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-ATAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--G---GGC-----GA--TAG-T-A-ATG-A------------AT----GGATTAATTCC---GAT-A-TTTCA-A-------GTTTTCA--A--TT-CG-AATACTA-------GTACCT---T-----TATAGGTATGTTAAG-TCA------TGC--GG-TT-C---ttgttatagtactgtgatttgtt
gi|23 : tctCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-T-A-G-A--G-C-T-G-A-CA--A--C---A-CGC-T--T--AA-ATaatattcgtagctctcttcaagtcagtttaggacgacacgtagagctgacaacacgcttaaat
gi|24 : tctttcgtttgaggaacgaattagacataaatcaatttctactgggcgatagtaatgaatggattaattccgatatttcaagttttcaattcgaatactagtacctttataggtatgttaagtcatgcggttcaatattcgtagctctcttcaagt-G-A-GC--GATC-GTAACGT-T--T--AATATTTT----ATG-AAG-GA-TTCA-T-C-AA----TTAG-ATT-----ATTTATTCC---A-AC-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACATA-T-A----TGT-A-TA-C--AT------T---A-CGAAATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------TAAAAC-A-----GTC---TG-CGAGC--G-TG-T-CGT-T-T--GC--------T------A-TT-C--CA-A------T-A-A---TG----T--GT-----TGTA----TA------T---TT--ACGTTCTTAC--GACCT--TCAA-C-TCTAT-TCA---T-TT-
gi|25 : -ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAG-AT------AATTATTCC---A-AC-T--T-GA--A-T-ATGCA-ATTACATG-T-AT-------G-TA-T--AC-G----T---A-C--AATATT--G--C--ACA-AT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-ATG---TG----T--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TT----G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-TG-G-AAGTAAT-A--ATGGA--TT-TAAAGGA
gi|26 : T--TTAA-ATG---------AATCC---A-AC-T--G-G-----T-AT-----TTACATG-T-ACA--TAT-G-TA-C--AT-GCTGTT---A-T--AGTACT--G--T--TTT-GT---T-----------T-AAAC-ATTAAAG-C---TG-C-TGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G--T-C--CATT------T-A-G---AG----T--GT-----TA------TGTTGT--T---TT--A-----TTA-------C--TGAT-C-T---T-GTA---T-C--------AGAAATGA--ATGGG--TTATAAA
gi|27 : gagctgacaacacgcttaatttA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-T-C--G-C-T-G-A-GCTGA--C-ATA-AGT-T--T--AT-ATTTT----ATG-AAA-TATTTTA-T-T-AAAG--CTA---------TATTTAATCA---A-AT-T--T---------------------------T---TAT-G-------AT-A----T---A-C--AGTTAT--G--T--ACA-GTGA-T-----------T-TAA--------------TG-C-A------TG-T-AGTAT-T--GC--------T--A---G-TT-CCTCGCAGTATACT-A-G---TG----T--GTTG---T-------TA------T---TC--A-----TTA---G---T--
gi|28 : ATAC---A-AC-T--T-TA--A-C-ATACACATTATATG-T-AT-------G-TA-T--A--G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA--T-A-T-----------T-AAAC-A-----G-CG--TGGC-AACTGG-TG-TTCG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------TTA-A---TG----T--GT-----TGTT----TA------T---CT--A-----TTAAA-G---T--T-AA-C-T---T-TCA---T-T--GA-A-AAGTGATGA--ATGGA--TT-TAAAGGAatag
gi|3 : aaattacatacT-G-------TT---A-AA-------G----TCAG--TTTA--GG-A----A-AC--G-G-A-C-A--A-CGTAG-A-G---G--C-GAA-C---------AA-A----------G-AAAACG-CT---T-T-AAATATTTAA-A-------ATG-AATTC---A-AC-TGTT-AA--T-T-ATACA---TAC----T-GT---TAT-A-TACT--AT-G----G---G-A--GATTTT--G--T--AAA-AC-A-T-----------T-AAA--------G-CG--TG-C-TGC--G-TG-T-CGC-T-T--GC--------T--g
gi|30 : aatggaattatggttccggatattattttccaaacgttgttcgaatcatcgaaggaaataaaactctattatataagagtaacaacaagacttggtcaactggcgtgtgtctaaatctcagatccaggggttttatataatcgtaagct-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TGTGT-T--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-CG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGcaccatttatttagaagtgatagtatcatctgctttttgaacacctgttcttgtatagaaatgatgggttacgaaccattaaaggcgaagaactttgtttatgtatttg
gi|31 : ATTTCT--TTCGT--TT-G-A---GGTA--AG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-
gi|31 : tgCA-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCA-------G----T---T-----TCT-----------G-TCA------CGT--GT-TT-T---TT-TTTAAGAA-C---CGG-caaggttttcattcgaataccagtttctgtcacgtgtttttttttaagaaccgg
gi|32 : tgatttctttcgtttgaggtaagaattagacagaaTTTCT--TTCAT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--GTTC-G-GA--A-TTATA-AG------GTTT
gi|33 : -----T-------TG------T---TT--A-----ATA---G---TATTCAA-C-T---T-TCACATT-TT-GG-AGAAGTAATGA--ATGGG--TT-TAAAGGA
gi|34 : tgttgG----T--GT-----TGT-----TG------T---TT--A-----ATA---G---TATTCAA-C-T---T-TCA---T-TTTGG-A-AAGTAATGA--ATGGG--TT-TAAAGGA
gi|35 : --T-CGT--TT-G-A---ACTAGGTG-AA-----T-TA-GAC-TGAA-A-TT-AT--TTT-CT---TT--T---GTT-----G---GAA-T-G-ATG-A------------AT----g
gi|36 : AC-A-----G-CCTGTG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GCTACATATGT--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TG----T--CT-----T-------
gi|37 : A---G---T--TCAAAC-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATTA--ATGGA--TT-TAAAGGAg
gi|38 : --A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATAA--ATGGA--TT-TAAAg
gi|39 : ---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAAGA
gi|4 : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----C-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--TTTC-G-GA--A-TTAGA-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G----T---T-----TTT-----------G-TCA------CGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--ACAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCG-TGAGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--G--AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCG-T-C-AAAT--TTAA-ATT----TATTTAATCC---A-AC-T--T-CA--A-T-GTACA-ATTACATG-T-AT---TAT-A-TA-T--AT-G----T---A-C--AATACT--G--T--ATA-GT-A-T-----------T-AAAT-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TA----T--GT-----T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATAGA--TT-TAAAGGAg
gi|40 : ----TATTTAATCC---A-AC-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACAAG-T-AT---
gi|5 : T--T-CGT--TT-G-A---TGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--GTTC-G-GAT-----TTA-AGA-----GGTTTA---A--TT-CG-AATACAT-------G----T---T-----TTT-----------G-TCA------CGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-CT---T--TCAG--A--GCAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCA-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC-----------G-A-C-G--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGT-T--T--AA-ATTTT----ATG--AA-TG-TTCA-TGC-AAAT--TTAG-A------TATTTATTGC---A-GC-T--TGGA--A-T-ATACA-ATTACTTG-T-GT---TAT-GTTA-T--ATGG----T---AGC--AATA-------T--GCA-GT-A-T-----------T-AAAC-AC----G-CT--TG-C-AGCGGG-TG-T-CG--T-TG-GC--------T--A---A-TT-T--CACA------T-A-A---T-----T--G------T-------TG------T---TT--AATTAGTTA---A---T--TCAA-CGT---TGTCA---T-TT-GGAA-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGAgc
gi|6 : tTTCTT--T-CGT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-GA-GAC-AGAA-A-TC-AT--CTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----GACTT--GTCC-G-GAA-A-TGT-A-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G----T---T-----TGT-----------G-TCA------CGT--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CTG--T---T--TCAGATA--GCAAG-GCT-A--TAT--AAAGAGATGCA-TAGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCCG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-G-C-A--G-T-T-ACA-ACA-A--CAGTA-A---------AA-AATCT----ATG-TAA-TGTTTTA-T-T-GAAG--TTAA-ATT----TATTTAATCC---A-AC-T--T-TATGA-T-ATACA-TTTACATG--------TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--GATAT------T--AC-----------------------AT-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------C-A-A---TG----T--GTTG---T-------TG------T---TT--G-----CTA---GAA-T--TCAA-C-T---T-TTA---G-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGAA--TT-TAGAGGA
gi|7 : --T-CGT--TT-G-A---GGAAA-CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AATTTTT-CTA--CT--T---GGTTATA-G---TAA-TGA-ATG-G------------AT----TA-----TTCC-G-GAT-A-TTTCC-AA------GTTTTCCA-A--TT-CG-AATACCC-------T----T---TATAGGTAT-----------GATCAGTTC--TGC--GG-TT-CAA-AT-A---AGAA-T---CGG-TT---TAATCAG-------------T-A--T-------------CG-ATCCT-G-------TT---ACAA------TAATCTTCAG--TTTA--GGTACTGAACACCTG-T-A-G-A--GCC-T-G-A-CA--A--C---A-CGC-T--T--AA----TT----ATT-AA-----CCCA-A-T-GAAT--CCAACATTG---TATT-----------AC-A--T-TA--C-T-GTATA-AGTAC-TG---GT---TTT-G-TT-T--AA-A----T---A-C--A----T--G--T--A-A-G----------------C-GAAT-------G-C---TG-T--GC--GATGTT-CG--T-TG-GC--------T--T---A-GT-C--CATT------T-A-G---AG----T--GTATATGT-------TG------T---TTA-A-----ATA---C---T--TGAT-C-T---T-GTA---T-TC-AG-A-----AATGA--ATGGG--TT-TA
gi|8 : TCTTT--T-CGT--TT-G-A---GGT---CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-T---A--TTT---A--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATGCA------------AT----TACTTG-TTTC-GAGTT-A-T---A-AG------GTTTTCC--A--TT-TG-AATACTT----------------T-----TAT-----------G-CTA-------GT--GG-TT-C---TT-T---AGAC-C---CGGGTT---T--TCAG--A--G--AA-GTT-A--TAT--AAGGAA--GCAATGGGTTG-------TT---A-AA------TA----C-AG--TTTAAGGG-AC--GAAAC--G-G-A-C----G-C-T-G-A--C--A----GTA-AGT-T--TT-AA-ATTTT----AT--AAA-TG-GTCAAT-C-AA-T--TTAG-ATT-----ATTTAATC------AC-T----GA--A-T-ATACA-ATTACATG-T-AT-------G-CA-T--AA-G----T---A-C--ACTATT--G--T--ACA-GT-A-A-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---CGTGT-T--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGAtaaag
gi|9 : TTTCT--TTCGT--TG-GCA---GGAA--CG-AA-----T-TA-GACCAGAACACTC-AAATTTC-CTA---T--T---GGT-----TAATTAG-T-A-ATG-A------------AT----GGATA--TTCC-G-GAT---TTTCA-AG------TTCTTCTCAA--TT-CG-AATACCTTTCATAGG----T---T-----GATCA---------G-TCA------TGC--GG-TT-CCAATA-T---AAAC-C---CGG-TT---C--TTA
gi|9 : T-G-------TT---A-AA-------G----TCAGATCTTA--GG-AC--GACAC--G-T-A-CGA--G-C-T-G-A-CA--A--C---A-CGC-T--T--AA-ATCTT----TTA-AAA-TG-----------AAT--GCGA-ACT----TGCT-----------------------A-T-TTACA-AGTAC-TGTT-ATCGGTAC-G-TT-T--GT-T----T---A----AACATT-----T--A----------------------AAAG-A-----C-C---TT----GC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G--T-C--CATT------T-A-G---AG----T--GTTA---T-------TG------T---TT--A-----TT--------T--ACTA-C-T---C-TTG---TATC-AG-A-----AATGA--ATGGttttcgtactctgttaaagtcagatcttaggacgacacgtacgagctgacaacacgcttaaatcttttaaaatgaatgcgaacttgctatttacaagtactgttatcggtacgtttgtttaaacatttaaaagaccttgcgtgtcgttgctagtccatttagagtgttattgtttatttactactcttgtatcagaaatgaatggccccagctttaacgg
blockSeqs : GG T CA T C TCA T GG G CATAC C A C C C . TT T TT GG ACG AACTCG . G G C TTTGGAAATGGT GCGATCTAT T A A C C G GA TCA AA A . GTACCTTTATAGGTATGTTAA A GTTCATC . G . CAATA TTA A GGA G CTAT GGATA AA TATATAAGGAAAGCTATGGG T CTTCTGC TTT C GTCACTCA GT AG G TG CT TA GC AA C G T T GCGATCGT A CA AA T T TTCA . A TTTTATT AT GATTGTGCT C AGA C T GT CATG C C C A TTATCGGTAC T C TA TG CTGT . G GA TT TT GAACACAT A CATTAAA T CTG G GA TG T T T TA A TT TACATATG T GTC T G CT GTATAC T T AGC TCGT TA TATATGTTGT . A CGTTC CGACC AT A G CTA G CAT A TT A G . GG A
blockSeqs : . T . . . . A A . A . . . . . . AT . . . . AATAG . G C . . GGATTAAT . . T . T . G CA AC A . TTTATAGGTATGATCA A GTTCT . . . AATA . . . . TAC AGATA G TTATAAAGAAAAGCATGGG . . . . TAATCT AT . T . T AT CG . C . A C GCTGACAT . G . . T TGA . . TTCATGC . ACATTGT G . . . . TATG . . . A TCATGTAT . . . T . . . . . . TTAAACAT . CAA . A . A GG A . . T . G . . . . . . A . . T TGT . TGGTTGTTTA . . ATTAG CTGG AT . . . . T . T . . . . A
blockSeqs : . T . . . . G . . . . . . . . . G . . . . AATAG . G C . . GGATTAT . . T . C . A A . . . TTTATAGGTATGATCA . TGC . . . ATTA . . . . TAA AGA A ATATAAGGAAAAGCATGGG . . . . TA . . . . . G C . . . . . ACAACAGT . C . . . AG . . TTTTATT . TATTT G . . . . GGA . . . A CGCTATA . . . T . . . . . . TAAAACAT . CAC . G . T . . . . C . G . . . . . . . . . . TGT . TTATGTTGT . . . GTT A . . . . . . T . . . . A
blockSeqs : . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TATAG . . . . . GGCTTAT . . T . C . G A . . . TTATAGGTATGTTCA . AC . . . AAAT . . . . T AGA A ATATAAGGAAAAGCGTGAG . . . . GG . . . . . G G . . . . . GCACCC . C . . . A . . GTCAATC . TATTT T . . . . GT . . . A TACATAT . . . T . . . . . . ACAGTAGT . TA . G . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TATGTTGT . . . AAG . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . GAAA . . . . . TACTTGT . . T . T . C A . . . TAATAGGTATCGTCA . G . . . TT . . . . T ATT A ATATAAGGAAAAGCATGGG . . . . TA . . . . . T G . . . . . CAACAT . C . . . . . . TTCATC . AATTT T . . . . GA . . . A CTTTAT . . . T . . . . . . ACAGTGAT . TG . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATATGTTG . . . GAA . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TAAT . . . . . TGCTTG . . C . C . G A . . . TTCATAGGTTGATCA . T . . . TT . . . . T CAA A ATATAAAGAGATGCATAGG . . . . TA . . . . . A G . . . . . GCACGT . C . . . . . . TTCATC . AATTT T . . . . TA . . . A TCACTG . . . T . . . . . . ACAGTAT . CA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGTATA . . . G . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . AAT . . . . . GATTAT . . T . C . G A . . . TTATAGTATTCA . T . . . TT . . . . C TTA A ATATAAGGAAGCAATGGG . . . . TA . . . . . G C . . . . . GAACGT . T . . . . . . TCCATA . AACTT T . . . . GG . . . A TATTGT . . . A . . . . . . ACAGTAT . CA . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGTTTA . . . G . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . TACTTG . . T . A . G A . . . TTTATAGGTAT . C . . . AA . . . . T ATA C ACCCACAAGATTGAGGC . . . . AG . . . . . T C . . . . . GCTCGT . T . . . . . . TTCATC . GATT T . . . . GA . . . A TGTTAT . . . C . . . . . . ACAGTAT . CA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGTTG . . . G . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . TACTTG . . T . C . G A . . . TATGGTAT . T . . . AA . . . . T AGA A CTGTAAAG . . . . TA . . . . . T G . . . . . GCACGT . C . . . . . . TTCATC . AATG T . . . . GA . . . A TATTAT . . . C . . . . . . ACAATAT . CA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGTTA . . . G . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . GGATTA . . T . C . G C . . . GTTTAT . T . . . TT . . . . C AGA A ATTGTACT . . . . AG . . . . . G A . . . . . GCACGT . T . . . . . . TTCATC . GATT T . . . . GA . . . A TGTTAT . . . T . . . . . . AAAACAT . CA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGTTG . . . G . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . TACTTG . . T . C . G . . . . GTTTTT . T . . . AA . . . . T AGA G ATCGATCC . . . . TA . . . . . T C . . . . . GCACGT . G . . . . . . TTCATC . TTT T . . . . GA . . . A TTATT . . . C . . . . . . ATAGTAT . CA . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGTTG . . . G . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . TACTTG . . T . C . G . . . . GTTTTT . T . . . TT . . . . T AA A ATATC . . . . TA . . . . . G C . . . . . AAACA . T . . . . . . TTCGTC . AAT T . . . . TA . . . A AGTAT . . . T . . . . . . GCAGTAT . CA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TATTG . . . G . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . TACTTT . . T . T . A . . . . GTTTCT . C . . . TT . . . . T AG . CAT . . . . TA . . . . . T G . . . . . CAACG . C . . . . . . CCCAAT . AAT T . . . . AA . . . A TATGT . . . T . . . . . . ACAGTAA . TA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTGT . . . G . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . TACTTG . . A . G . G . . . . GTTTTT . C . . . TT . . . . T . . C . . . . TA . . . . . T G . . . . . GGCGA . C . . . . . . CTTT . GAT T . . . . CA . . . A GTTTT . . . T . . . . . . AAACAT . TA . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTA . . . G . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . GACTTG . . T . T . G . . . . GTTTTT . C . . . TT . . . . C . . A . . . . G . . . . . G T . . . . . CAAC . T . . . . . . TTC . GAT T . . . . GA . . . T TTAT . . . T . . . . . . TTTGTT . CA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTG . . . G . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . GGATAT . . T . C . . . . . . GTTTGT . C . . . TT . . . . . . . . . G . . . . . G C . . . . . CAAA . T . . . . . . ATC . AG T . . . . TA . . . A TAT . . . T . . . . . . ACATAT . GA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTA . . . G . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . TAT . . T . C . . . . . . GTTTT . T . . . A . . . . . . . . G . . . . . G C . . . . . CAGC . T . . . . . . TT . AT . . . . . GA . . . A TAT . . . A . . . . . . AAG . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTA . . . G . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . TAT . . . . . . . . . . . TTAT . . . . . . . . . G . . . . . G C . . . . . CAAC . T . . . . . . TT . AT . . . . . G . . . . TAT . . . A . . . . . . AC . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTA . . . A . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G C . . . . . CAAC . C . . . . . . . . AA . . . . . G . . . . TAT . . . T . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTG . . . C . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . . . CAGT . T . . . . . . . . T . . . . . G . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTG . . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G C . . . . . CAAC . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . CCA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : G******** TACTTG****** T* G****** TTTATAGGTAT************************* ** ATATAAGGAAGCATGGG******** TA********** ** C** GCACGT****** ** TTCATC**** *** TATTAT****** *** ACAGTAT**************** ** ** *** *** ** **
originalCons : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGNA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTT--TTCC-G-GAT-A-TTTCA-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCT-------G----T---T-----TNT-----------G-TCA------CGC--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--GCAAA-GCT-A--TAT--AAGGAAAAGCG-TGGGT-G-------TT---A-AA------TA----CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-A-GC--A--C-GTA-CGC-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TG-TTCA-T-C-AAAT--TTAA-ATT----TATTTAATCC---A-AC-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACATG-T-AT---TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TG----T--GT-----T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGA
finalCons : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGNA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGTG--------TAA-T-A-ATG-A------------ATTACTTG------TCC-G-GAT-A-TTTCA-AG------GTTTTC---A--TT-CG-AATACCTTTTATAGGTAT-------------------------G-TCA------CGC--GG-TT-C---TT-T---AGAA-C---CGG-TT---T--TCAG--A--GCAAA-GCTATATAAGGAAGCATGGG--------T-G-------TT---A-AATA----------CCAG--TTTA--GG-AC--GACAC--G-G-AC--A--G-C-T-G-AGCACGT------A-CGC-T--T--AA-ATTTT----ATG-AAA-TGTTCATC----AAAT--TTAA-ATT----TATTTAATCC---A-AC-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACATGTATTAT------G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--TACAGTAT----------------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TG----T--GT-----T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): CGTTTTTTAATCTAAGCTGACTGCGGTGTCAGTTGCTAGCCATTTGAGTGCGTTATGATCTGTTATTGCGACTACAGATATTGCTTACAGGAACAATGAATGGCAGTTATAGAAGGA
Alignments
lowQualScore : 1 222222222 1111111 222 44444444444444444444444 1111111 111111 55555555555555555555555555555555555 111111111111 1111 222222222 222222222222222 11111111111 11111111 111 222222222222222222222 1111111
lowQualScore : 33 1 22 2 1 333 2 44 1 66666 1 1 1 1 1 1 77 1 22 22 333 777777777 1 5 5 1 999999999999 77777 1 444 3 1 1 77 1 5 1 2222222 111 44 3 1 44444 33333333333333333333333 6 7777777 2 22 2 111111 333 2 333 2 444 888888888888 0 22 33333333333333333333333333333333333 2 2 2 333 2 999999 44 22 22 3 22 44 444 666 22 3 1 3 3 777777777777 1 1 22 22 44 3 0000 3 3 8888 1 55555 555555555 2 333 1 1 3 22 88888 1 1 1 222222222222222 1 1 22 55 3333 333 1 44 0 22 44 66 5555 1 1 11111111111 1 11111111 1 000 1 22 44 3 1 1 77 1 55 66666666 44 333 1 1 22 777777 1 1 666 9999 22 444444444444444444444 333 44 88888 1111111 66 1 1 333 1 444 1 22 1 1 22 22 5
lowQualScore : .. . .. . . ... . .. . ..... . . . . . . .. . .. .. ... ......... . . . . ............ ..... . ... . . . .. . . . ....... ... .. . . ..... ....................... . ....... . .. . ...... ... . ... . ... ............ . .. ................................... . . . ... . ...... .. .. .. . .. .. ... ... .. . . . . ............ . . .. .. .. . .... . . .... . ..... ......... . ... . . . .. ..... . . . ............... . . .. .. .... ... . .. . .. .. .. .... . . ........... . ........ . ... . .. .. . . . .. . .. ........ .. ... . . .. ...... . . ... .... .. ..................... ... .. ..... ....... .. . . ... . ... . .. . . .. .. .
lowQualScore : 11 1 88 0 8 222 8 33 8 44444 8 8 8 8 9 9 11 9 66 66 333 000000000 8 5 5 8 333333333333 22222 4 333 8 9 9 88 9 0 9 0000000 999 55 8 9 88888 22222222222222222222222 0 9999999 0 88 0 888888 999 2 999 2 111 666666666666 4 99 99999999999999999999999999999999999 1 1 1 777 1 777777 88 44 44 5 44 11 333 888 44 5 7 3 3 888888888888 7 7 55 33 00 2 4444 6 8 1111 9 11111 888888888 2 000 7 7 5 44 33333 7 7 7 111111111111111 7 7 44 11 7777 000 7 11 4 44 88 55 2222 8 8 88888888888 8 00000000 7 000 7 77 88 5 7 7 66 7 99 33333333 11 222 8 8 55 000000 8 8 888 8888 44 555555555555555555555 000 00 33333 0000000 22 7 7 000 7 888 7 66 8 8 55 66 7
consensus : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGNA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTTG--T-C-C-GGAT-A-TTTCA-AG------GTTTTC---A--TT-CGAA-TAC-----C--T--TTTATAGGT--AT-----G-TCA------CGC-GG--TT-C---TT-T---AG-AAC---CGG-TT---T--T-CAG--A--GCAAA-GCT-A--TAT--AA--G---G--AA--GC-A-TG--GGT-G-T-T---A-AATA----CCAG--T--TTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-AG-C--A--C-GTA-C-GC-T--T--AA-ATTTT----ATGAAA-TG-TT-CA-T-CAAA-T--TTAAATT----TATTTAATCC---A-A-C-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACATG-T-AT---TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TG----T--GT-----T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGA
Reference ( family-676 ) : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGNA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTTG--T-C-C-GGAT-A-TTTCA-AG------GTTTTC---A--TT-CGAA-TAC-----C--T--TTTATAGGT--AT-----G-TCA------CGC-GG--TT-C---TT-T---AG-AAC---CGG-TT---T--T-CAG--A--GCAAA-GCT-A--TAT--AA--G---G--AA--GC-A-TG--GGT-G-T-T---A-AATA----CCAG--T--TTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-AG-C--A--C-GTA-C-GC-T--T--AA-ATTTT----ATGAAA-TG-TT-CA-T-CAAA-T--TTAAATT----TATTTAATCC---A-A-C-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACATG-T-AT---TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TG----T--GT-----T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGA
gi|1 : --TT-G-A---GGTA--GG-AA-----T-TA-GAC-A-AA-A-TCTAA--TTT-CTA--CT--T---GGT---------TAAGT-A-TCG-A------------AT-----ACTTG--T-TTC-GGATCA-CTT---AGCTATTAGTTTTC---T--TC-CGAAATAC-----T--TGTTTTATGAGT------------CA------CGT-GGGGTTAC---TT-T---A---AC---CGG-TT---T--TTCAG--A--GCAAA-GCT-A--TATTAAA--G---G--AAAAGC-A-TG--GGT-G-T-T---A-A-TAG---CCAG--TATTTA--GG-AC--GACAC--G-G-ATC-A--G-C-T-T-AGGC--A--C-GTG-CCGT-T--TTAAA-ATTTT----ATGAAAATG-TTTCA-T-CAAAAT--TTAAAT------ATTTAATCC---A-AAC-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACATG--------TAT-G-CA-T--AC-G----TTAAA-C--TAAACT--C--T--ACATGT-A-TATACATTTATCC-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CGT-T-T--GC--------CTAA---A-TT-C--CACA------T-A-AT--TG----T--GT-----T-------TG------TCCATTAAA-----TTA---G---T--TC-A-C-T---T-TCC---A-TT-GG-A-AAGTAATAAACATGGA---T-TAAAGGA
gi|10 : tatgATTTCT--TTCGT--TT-G-T---GGTA--TG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TAT-CTA--CT--T---GGT-----T---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TGCTTG--T-C-T-GGAA-A-TAT-A-AG------GTTTTC---A--TT-CGAA-TAC-----C--T--GTT-----T--AT-----G-TTA------GGT-GG--TT-C---TT-T---AG-AAC---CGA-TT---T----CGG--ATAGCAAG-GCT-A--TAT------------------C---------T-G-T-T---A-ATTA----CCAG--T--TTA--TG-AC--GACAC--G-G-G-C-A--G-T-T-GTAA-C--A------A-A-AG-T--T--AA-ATTTT----ATGGAA-TG-TT-----------T--TTATATT----TATTCAATCC---A-A-C-T--T-CATGA-T-ATACA-ATTA--------------T-G-TA-T--AT-G----T---G-C--AACATT-------------------------------AAAT-A-----T-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-T--CACA------C-A-A---TG----T--GTTG---T-------TG------T---TT--A-----CTA---GTT-T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAACAATGA--TTGAG--TT-TAAAg
gi|11 : gT--T-CGT--TTTG-A---GGAA--CGGAA-----TCTA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----A---TAG-T-AGATG-A------------AT----GA-TTA--T-T-C--GAT-ACTTTCA-AA------GTTTTCA--A--TT-CGAA-TAC-----C-----TTTATAGGT--AT-----GATCAGTCATGCGC-GG--TT-CAA-TA-T---AG-AAC---CGG-TTCTAT--T-C-------GT-AA-GCT-C--TGT--AA--A---G--------------------------------------TAG--T--TTA--GG-AC--GACAC--GTA-A-G-A--G-C-T-G-AA-A--A--C-A-----GC-T--T--AA-ATTTTAG--ATGAA
gi|12 : tctATTTCTGGT-CGTCATT-G-A---GG-----G-CA-----T--A-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--TACGGGTAATA-G---TAA-TGA-ATG-G------------AT----TA-TTA--T-----GGAT-A-TTT---AG------G-TTTCAA-A--TT-CGGA-AAC-----C-----TTTATA-GT--ATTCA--G-TCA------TGCGGG--TT-C------A---AGAAAC---CGG-TT---C--T-tcccacattgtatttacatccttatagtactggttttgttaaattaaagctgctgcgtgtcatttagagtgttatgttgtttttattactgatctttgtatcagaaaatgaatggtttataaagg
gi|12 : A----TCAG--T--TTT--AG-AC--GACACT-A-G-A---A--G-C-T-G-AC-A--A--C---A-C-GC-T--T--AA-AT---------------G-TT--------------TTAAG-----------AATCC---A-A-C-T--T-G-----T-AT-----TTACATA-C-TT---TAT-A-TA-CTAAT-G----T------------TT--G--TGAACA--C-A-T-----------T-GA---A-----G-C----G-C-TGC--G-CG-T-C---T-T--GC--------T--AGTCA-TT-T--AGAA------T-G-A---TG----T--TT-----T-------TA------T---TT--A-----attgtactcgttaaagtcactcatcagttttagacgacactagaagctgacaacacgcttaaatgttttaagaatccaacttgtatttacatactttatatactaatgtttgtgaacacattgaagcgctgcgcgtcttgctagtcatttagaatgatgtttttatttaactgatcttacagaatgaatggtata
gi|13 : atttctggtcgtcattgagggcatagacagaaatcaatttctacttacgggtaatagtaatgaatggattattatggatatttaggtttcaaattcggaaacctttatagtattcagtcatgcgggttcaagaaaccggttctattgtactcgttaaagtcactcGT--TT-G-------GA--CG-AAA----T-TA-ACC-AGAA---TC-AA--TTT-CTA--CT------GGT-----GAAATAG-T-A-ATG-A------------AT----GGATTA--TTC-C-GGAT-A-TCTTC-AC------GTTTTC---AA-TTACGTA-TAC-----C--T--T--ATAGGT--AT-----actgatcttacagaatgaatggtata
gi|13 : ---G--AA--TC-A-AG--GAT-C-TGT---A-AAGG----TCAG--T--TTA--GG-AC--GACAC--G-ATA-G-A--G-C-T----G-C--A--C-CCA-C-GC-C--T--AATTTTTT----AT--AA-TG-----------AA-T--T-----------------CCC---ACA-C-T--T-G-----T-------ATTACATA-C-GC---TATAG-T------T-G----T---A-C--TGT-TT--GTTT--A-A-AC-A-T-----------G-AAAT-G-----A-C---TG-C-TAC--GTTG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G-TA-C--CATT------T-A-GAGCTG----T--GG-----T-------TATGTTGTT---TT--A-----TTACTGG---T-------C-T---T-GTA---T-C--------AGTAATGA--AAGGG--TTATAAAGGcgaatcaaggatctgtaaaggtcagtttaggacgacacgatagagctgcacccacgcctaattttttataatgaattcccacacttgtattacatacgctatagttgtactgtttgtttaaacatgaaatgactgctacgttgtcgttgctagtaccatttagagctgtggttatgttgttttattactggtcttgtatcagtaatgaaagggttataaagg
gi|14 : gtttggacgaaattaaccagaatcaatttctactggtgaaatagtaatgaatggattattccggatatcttcacgttttcaattacgtataccttataggtatcT--T-CGT--TT-G-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGTAATA-G---TAA-TGA-ATG-G------------AT----TAT-----T-C-C-GGAT-A-TTTCA-A-------GTTTTCA--A--TT-CGAA-TGC-----C-----TTTATAGGT--ATGATCAG-TCA------ACC-GG--TT-C---T
gi|14 : tG--T--TTA--GG-AC-----AC--G-T-A-G-A--G-C-T-G-AC-A--A--C-AT----GC-T--T--AA--------------------TT-C---------T--TT---TT----TAATGAATCC---A-A-C-T--T-GT--A-T-TTACA---TAC-TG-T------------TA-T--A--G----T---A-C--TGTTTT--G--TTTA-A-AC-A-T-----------T-AAA--------G-C---TG-C-TGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G--T-C--CATT------T-A-G---AG----T--GT-----TATA----TGTTGT--T---TT--A-----TTA-------C--TGAT-C-T---T-GTA---T-C--------AGAAATGA--ATGGG--TTATAAAGGAatcgtaactctgtttaggacacgtagagctgacaacatgcttaattcttttttaatgaatccaacttgtatttacatactgttatagtactgttttgtttaaacattaaagctgctgcgtgtcgttgctagtccatttagagtgttatatgttgttttattactgatcttgtatcagaaatgaatgggttataaagga
gi|15 : tttcgtttgaggaacgaattagacagaaatcaatttctacttggtaatagtaatgaatggattattccggatatttcaagttttcaattcgaatgcctttataggtatgatcagtcaaccggttctatcgtaactct-A---GAAA--CG-AACATACT-TAAGAC-AGAA-A-TC-AAG-TTT-CTATTTT--T---GGT-----AAT-TAG-T-ACATG-ATTTGGAAATGGTAT----TACTTG--T-C-C-GCGC-A-TTTC
gi|16 : ---A--TT-CGAA-TAC-----C--TG-TTT---------T-----G-TCA------TGT-GG--TT-C---TT-T---AG-AAC---CGG-TT---T--T-CAG--A--GCAAA-ACT-T--TAT--AA--A---G--AAAAGC-A-TG--GGT-G-T-T---A-AATA----CCAG--T--TTA--GG-AC--GACAC--G-A-A-C-A--G-C-T-G-AG-C--A--C-GTA-C-GT-T--T--AA-ATTTT----ATGAAA-TG-TT-CA-T-CAAA-T--TTAAA------TATCGAATCC---A-A-C-T--T-GA--A-T-GTACA-ATTACATG--------TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--TACA------T-A-A---TG----T--G------T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTACTAA--ATGGA--TT-TAAAGGAtccaatttttcaaccgtcatctttttcaattcgcatttattgggattccaatgactcgatacatgcgttcagaataaagtttggttctaaatcgcggctctgattttatagactatgttttgtttaaaacattagagaaatgctgcgtgtcgtttgctagtccatttagttgttcatgtagttttattactgatcgtctatgataggaaattgaatcgggtataataggaat
gi|17 : TTTTT--T-CGT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGC-----G---TAG-T-A-ATG-A------------AT----TACTTG--T-T-C-GGA--A-TTGTA-AG------GTTTTC---A--TT-CGAA-TAC-----C--T--GTTTT-------T-----G-TCA------CGT-GG--TT-C---TT-T---AG-AAC---CGG-TT---T--T-CAG--A--ACAAA-GCT-A--TAT--AA--G---G--AAAAGC-A-TG--GGT-G-T-T---A-AATA----CCAG--T--TTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-AG-A--A--C-GTA-C-GT-T--T--AA-ATTTT----ATGAAA-TG-TT-CA-T-CAAA-T--TTAAA------TATTTAATCC---A-A-C-T--T-TA--A-T-ATACA-ATTACA-G-TCATG--TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--AATATT--G--T--Ag
gi|18 : at-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTT--GT--T---GGTA----A---TAG-T-A-ATG-A------------AT----GGATTA--T-C-CTGGAT-A-TTTCA-A-------GTTTTCA--A--TT-CGAA-TAC-----C-----TTTATAGGT--ATGTTCAG-TCA------TGC-GG--TT-C---AA-T---AG-AAC---CAG-TT---C--T-AAT--T--TCGTA-GCT-------------------------C-A-T---------T-T---A-AA-G----TCAG--T--TAA--GG-AC--GACAT--G-T-A-G-A--G-C-T-G-AC-A--A--C-G---C-GCAT--G--AA-ATTTTTGA-ATGAAA-T--TC-CA-T-AAAA----TCAGATTGTGCTGCTT----------G-T-T--T-GG--A-TCATGAA-ATAACATG-TCAC---TG--G-TA-T--GA-A----A---A-C--AATCTT--G--T--AAA-G
gi|19 : ATTTCT--TTCGT--CT-G-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-AG-------------------------------T-----G---------A-ATG-G------------AT----TATT------C-C-GGAT-A-TTTCA-A-------GTTTTCA--A--TT-CGAA-TAC-----C-----TTAATAGGT--ATCGTCAG-TCA------TGT-GG--TT-C---AA-T---AG-AAT---TGG-TT---T--T---A--A--TCGTA-GCT-------------------------C---------T-G-T-T---A-AA-G----TCAG--T--TTA--GG-AT--GACAC--G-T-A-A-A--G-C-T-G-A--C--A--A-A-A-C-GC-T--T--AA-TTTTT----aaca
gi|19 : ATA-T-AT---TGT---TA-T--A--A----T---A-C--TATGTTTTG--TT-AAA-AC-A-T-----------T-AAA--------G-C---TG-C-TGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T------A-CT-C--CAT---------------TG----TTAGG-----T-------TGT-----T---TT--A-----TTA---ttatatattgttataatactatgttttgttaaaacattaaagctgctgcgtgtcgttgctactccattgttaggttgttttattactgaatgggttataaaa
gi|2 : atttctttcgtctgaggaacgaattagacagtgaatggattattccggatatttcaagttttcaattcgaataccttaataggtatcgtcagtcatgtggttcaatagaattggttttaatcgtagctctgttaaagtcagtttaggatgacacgtaaagctgacaaaacgcttaatttttttT--T-CGT--AT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTTTCTA--CTGGT---GTT-----G---TAA-T-ACACG-A------------AT----TACTTG--T-C---GGAT----TTAAGAG------GTTTTC---A--T--CGA--TAC-----C--T--GTTTT-------T-----G-TCAA-----CGT-GG--TT-C---TT-T---AG-AAC---CGG-TT---T--T-CCA--A--GCAAAAGCTTA--TAT--AA--G---G--AAA-GCTA-TG--GGT-G-T-T---A-AATA----CCAG--T--TTA--GGGAC--GACAC--G-G-A-C-AAAG-C-TTG-AG-C--T--C-GTA-C-GT-T--T--AA-ATTTT----ATGAAA-TG-TT-CA-T-CAAA-T--TTGA-------TATTTATTCC---A-A-C-T--T-GA--G-T-ATACA-ATTACATG-TTAT---T---G-TA-T--AC-G----T---A-C--AATAAT--G--T--ACA-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T--G--T-TTTGC--------TT-A---A-TTGC--CACAA-----T-A-A---TG----T--GT-----TGGTTGTTTA------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--TGGGA--TT-TAAAGctgaatgggttataaaa
gi|20 : tctT--T-CGT--TT-G-ATCAAGAC--CG-AA-----T-TA-GAC-A-AA-A-TC-AT--TTC-CTA--CT--T---GGTAACTCG---TAA-----ATG-A------------ATGCGAT-CTAT--T-C-C-GGAT-A-TTTCA-AG------TACTTC---AACTTACGAT-AAC-----C------TTAT-GGT--AT-----GATCAGTTCATCGC-CG--TT-CA--TTAT---AG-AACGGAAGG-CT---TACT-CTT--A--GAAAC-ACC-ACCCAC--AA--GATTG--AG--GC---TGCTTCT-GCT-T---A-AAAG----TCAGGTT--TTA--GG-AC--G-CAC--G-T-AGC-A--GCC-T-G-AC-C--A------A-C-AG-C--T--AA-ATTTTTTCAATAAAA-Tctga
gi|21 : aatctG--GGT-G-T-TTTTA-AATA----CCAG--T--TTA--GT-AC--GACAC--G-G-A-C-A----C-T-G-AG-C--A--C-GTA-C-GT-T--T--AA-ATTTT----ATGAAA-TG-TT-CA-T-CAAA-T--TTAA-------TATTTAATCCAGAA-A-CTT--T-GA--ACT-ATAC--ATTACA-----AG---TAT-G-CA-T--AC-G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA-GT-AGT-----------T-AAACAA-----G-CA--TG-C-AGC--G-TG-T-CG--TAT--GC--------T--A---ATTT-C--CACA------T-C-AT--TGTCGTT--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TTA---G---TA-TCAA-C-T---T-TCAT--T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGAGGTT-TAAAAGAccta
gi|22 : a-T-A-ATG-A------------AT----GGCTTA--TTC-C-GGAT-A-TTTCA-A-------GTTTTCA--A--TT-CGAA-TAC-----C-----TTTATAGGT--ATGATCAG-TCA------TGC-GG--TT-C---AA-T---AG-AAC---CGG-TT---C--T-AAT--A--GTAA---CT-A---------------------------------T-G-T-T---A-AAAG----TCAG--T--TTA--GG-AC--GACAC--G-T-A-G-A--A-C-T-G-A--C--A----GCA-C-GC-TAAA--AA-ATTTTA---ATGA----------A-T-CCAA-C--TTGTATT----TATATA
gi|23 : T--T-CGT--TT-G-A---GGAA--CG-AA-----T-TA-GAC-ATAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--G---GGC-----GA--TAG-T-A-ATG-A------------AT----GGATTAATT-C-C--GAT-A-TTTCA-A-------GTTTTCA--A--TT-CGAA-TACTAGTAC--C--TTTATAGGT--ATGTTAAG-TCA------TGC-GG--TT-C---ttgttatagtactgtgatttgtt
gi|23 : tctCAG--T--TTA--GG-AC--GACAC--G-T-A-G-A--G-C-T-G-AC-A--A--C---A-C-GC-T--T--AA-ATaatattcgtagctctcttcaagtcagtttaggacgacacgtagagctgacaacacgcttaaat
gi|24 : tctttcgtttgaggaacgaattagacataaatcaatttctactgggcgatagtaatgaatggattaattccgatatttcaagttttcaattcgaatactagtacctttataggtatgttaagtcatgcggttcaatattcgtagctctcttcaagt-G-AG-C--GATC-GTAAC-GT-T--T--AATATTTT----ATGAAG-GA-TT-CA-T-CAA-----TTAGATT-----ATTTATTCC---A-A-C-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACATA-T-A----TGT-A-TA-C--AT------T---A-CGAAATATT--G--T--ACA-GT-A-T-----------TAAAAC-A-----GTC---TG-CGAGC--G-TG-T-CGT-T-T--GC--------T------A-TT-C--CA-A------T-A-A---TG----T--GT-----TGTA----TA------T---TT--ACGTTCTTAC--GACCT--TCAA-C-TCTAT-TCA---T-TT-
gi|25 : -ATTTT----ATGAAA-TG-TT-CA-T-CAAA-T--TTAGAT------AATTATTCC---A-A-C-T--T-GA--A-T-ATGCA-ATTACATG-T-AT-------G-TA-T--AC-G----T---A-C--AATATT--G--C--ACA-AT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-ATG---TG----T--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TT----G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-TG-G-AAGTAAT-A--ATGGA--TT-TAAAGGA
gi|26 : -T--TTAAATG---------AATCC---A-A-C-T--G-G-----T-AT-----TTACATG-T-ACA--TAT-G-TA-C--AT-GCTGTT---A-T--AGTACT--G--T--TTT-GT---T-----------T-AAAC-ATTAAAG-C---TG-C-TGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G--T-C--CATT------T-A-G---AG----T--GT-----TA------TGTTGT--T---TT--A-----TTA-------C--TGAT-C-T---T-GTA---T-C--------AGAAATGA--ATGGG--TTATAAA
gi|27 : gagctgacaacacgcttaatttA----CCAG--T--TTA--GG-AC--GACAC--G-G-A-T-C--G-C-T-G-AG-CTGA--C-ATA-A-GT-T--T--AT-ATTTT----ATGAAA-TATTT-TA-T-TAAA-G--CTA--------TATTTAATCA---A-A-T-T--T---------------------------T---TAT-G-------AT-A----T---A-C--AGTTAT--G--T--ACA-GTGA-T-----------T-TAA--------------TG-C-A------TG-T-AGTAT-T--GC--------T--A---G-TT-CCTCGCAGTATACT-A-G---TG----T--GTTG---T-------TA------T---TC--A-----TTA---G---T--
gi|28 : ATAC---A-A-C-T--T-TA--A-C-ATACACATTATATG-T-AT-------G-TA-T--A--G----T---A-C--AATATT--G--T--ACA--T-A-T-----------T-AAAC-A-----G-CG--TGGC-AACTGG-TG-TTCG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------TTA-A---TG----T--GT-----TGTT----TA------T---CT--A-----TTAAA-G---T--T-AA-C-T---T-TCA---T-T--GA-A-AAGTGATGA--ATGGA--TT-TAAAGGAatag
gi|3 : aaattacatacT-A--TAT--AATCG---T--AA--GC---T-----T-G-T-T---A-AA-G----TCAG--T--TTA--GG-A----A-AC--G-G-A-C-A--A-CGTAG-AG----G--C-GAA-C----------AA-A----------GAAAACG-CT----T-TAAA-TATTTAAA-------ATG-AATTC---A-A-C-TGTT-AA--T-T-ATACA---TAC----T-GT---TAT-A-TACT--AT-G----G---G-A--GATTTT--G--T--AAA-AC-A-T-----------T-AAA--------G-CG--TG-C-TGC--G-TG-T-CGC-T-T--GC--------T--g
gi|30 : aatggaattatggttccggatattattttccaaacgttgttcgaatcatcgaaggaaataaaactctattatataagagtaacaacaagacttggtcaactggcgtgtgtctaaatctcagatccaggggttt-GT-A-T-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TGTGT-T--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-CG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGcaccatttatttagaagtgatagtatcatctgctttttgaacacctgttcttgtatagaaatgatgggttacgaaccattaaaggcgaagaactttgtttatgtatttg
gi|31 : ATTTCT--TTCGT--TT-G-A---GGTA--AG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-
gi|31 : tgCA-AG------GTTTTC---A--TT-CGAA-TAC-----CAGT--TTC---------T-----G-TCA------CGT-GT--TT-T---TT-TTTAAG-AAC---CGG-caaggttttcattcgaataccagtttctgtcacgtgtttttttttaagaaccgg
gi|32 : tgatttctttcgtttgaggtaagaattagacagaaTTTCT--TTCAT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTTG--T-T-C-GGA--A-TTATA-AG------GTTT
gi|33 : -----T-------TG------T---TT--A-----ATA---G---TATTCAA-C-T---T-TCACATT-TT-GG-AGAAGTAATGA--ATGGG--TT-TAAAGGA
gi|34 : tgttgG----T--GT-----TGT-----TG------T---TT--A-----ATA---G---TATTCAA-C-T---T-TCA---T-TTTGG-A-AAGTAATGA--ATGGG--TT-TAAAGGA
gi|35 : --T-CGT--TT-G-A---ACTAGGTG-AA-----T-TA-GAC-TGAA-A-TT-AT--TTT-CT---TT--T---GTT-----G---GAA-T-G-ATG-A------------AT----g
gi|36 : AC-A-----G-CCTGTG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GCTACATATGT--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TG----T--CT-----T-------
gi|37 : A---G---T--TCAAAC-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATTA--ATGGA--TT-TAAAGGAg
gi|38 : --A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATAA--ATGGA--TT-TAAAg
gi|39 : ---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAAGA
gi|4 : ATTTCT--T-CGT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----C-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTTT--T-T-C-GGA--A-TTAGA-AG------GTTTTC---A--TT-CGAA-TAC-----C--T--GTTTT-------T-----G-TCA------CGT-GG--TT-C---TT-T---AG-AAC---CGG-TT---T--T-CAG--A--ACAAA-GCT-A--TAT--AA--G---G--AAAAGC-G-TG--AGT-G-T-T---A-AATA----CCAG--T--TTA--G--AC--GACAC--G-G-A-C-A--G-C-T-G-AG-C--A--C-GTA-C-GT-T--T--AA-ATTTT----ATGAAA-TG-TT-CG-T-CAAA-T--TTAAATT----TATTTAATCC---A-A-C-T--T-CA--A-T-GTACA-ATTACATG-T-AT---TAT-A-TA-T--AT-G----T---A-C--AATACT--G--T--ATA-GT-A-T-----------T-AAAT-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---TA----T--GT-----T-------TG------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATAGA--TT-TAAAGGAg
gi|40 : ----TATTTAATCC---A-A-C-T--T-GA--A-T-ATACA-ATTACAAG-T-AT---
gi|5 : T--T-CGT--TT-G-A---TGTA--CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AA--TTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----TACTTG--T-T-C-GGA-----TTTA-AGA-----GGTTTA---A--TT-CGAA-TAC-----A--T--GTT-----T--TT-----G-TCA------CGT-GG--TT-C---TT-T---AG-AAC---CGG-CT---T--T-CAG--A--GCAAA-GCT-A--TAT--AA--G---GAAAA--GC-A-TG--GGT-G-T-T---A-AATA----CCAG--T--TTA--GG-AC-----------G-A-C-G--G-C-T-G-AG-C--A--C-GTA-C-GT-T--T--AA-ATTTT----ATG-AA-TG-TT-CA-TGCAAA-T--TTAGA------TATTTATTGC---A-G-C-T--TGGA--A-T-ATACA-ATTACTTG-T-GT---TAT-GTTA-T--ATGG----T---AGC--AATA-------T--GCA-GT-A-T-----------T-AAAC-AC----G-CT--TG-C-AGCGGG-TG-T-CG--T-TG-GC--------T--A---A-TT-T--CACA------T-A-A---T-----T--G------T-------TG------T---TT--AATTAGTTA---A---T--TCAA-CGT---TGTCA---T-TT-GGAA-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGAgc
gi|6 : tTTCTT--T-CGT--TT-G-A---GGTA--CG-AA-----T-GA-GAC-AGAA-A-TC-AT--CTT-CTA--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATG-A------------AT----GACTTG--T-C-C-GGAA-A-TGT-A-AG------GTTTTC---A--TT-CGAA-TAC-----C--T--GTT-----T--GT-----G-TCA------CGT-GG--TT-C---TT-T---AG-AAC---CTG--T---T--T-CAGATA--GCAAG-GCT-A--TAT--AA--A---G--AGATGC-A-TA--GGT-G-T-T---A-AATA----CCCG--T--TTA--GG-AC--GACAC--G-G-G-C-A--G-T-T-ACAA-CA-A--CAGTA-A----------AA-AATCT----ATGTAA-TGTTT-TA-T-TGAA-G--TTAAATT----TATTTAATCC---A-A-C-T--T-TATGA-T-ATACA-TTTACATG--------TAT-G-TA-T--AT-G----T---A-C--GATAT------T--AC-----------------------AT-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------C-A-A---TG----T--GTTG---T-------TG------T---TT--G-----CTA---GAA-T--TCAA-C-T---T-TTA---G-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGAA--TT-TAGAGGA
gi|7 : --T-CGT--TT-G-A---GGAAA-CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-TC-AATTTTT-CTA--CT--T---GGTTATA-G---TAA-TGA-ATG-G------------AT----TAT-----T-C-C-GGAT-A-TTTCC-AA------GTTTTCCA-A--TT-CGAA-TAC-----C--C--TTTATAGGT--AT-----GATCAGTTC--TGC-GG--TT-CAA-AT-A---AG-AAT---CGG-TT---TAAT-CAG-------------T-A--T--------C---G--AT--CC---------T-G-T-T---ACAATAATCTTCAG--T--TTA--GGTACTGAACACCTG-T-A-G-A--GCC-T-G-AC-A--A--C---A-C-GC-T--T--AA----TT----ATTAA--------C--C-CAA-------------------TGAATCC---A-A-CAT--T-GT--A-T--TAC--ATTAC-------------T-G-TA-T--AA-G----T---A-CT-GGTTTT--GTTT--A-A-AT-A-CATG--------T-AAGC-GAAT--G-C---TG-T--GC--GATGTT-CG--T-TG-GC--------T--T---A-GT-C--CATT------T-A-G---AG----T--GTATATGT-------TG------T---TTA-A-----ATA---C---T--TGAT-C-T---T-GTA---T-TC-AG-A-----AATGA--ATGGG--TT-TA
gi|8 : TCTTT--T-CGT--TT-G-A---GGT---CG-AA-----T-TA-GAC-AGAA-A-T---A--TTT---A--CT--T---GGT-----G---TAA-T-A-ATGCA------------AT----TACTTG--T-T-T-CGA--G-TTATA-AG------GTTTTCC--A--TT-TGAA-TAC--------T--TTTAT-GCT--A------------------GT-GG--TT-C---TT-T---AG-ACC---CGGGTT---T--T-CAG--A--G--AA-GTT-A--TAT--AA--G---G--AA--GC-AATG--GGTTG-T-T---A-AATA----C-AG--T--TTAAGGG-AC--GAAAC--G-G-A-C----G-C-T-G-A--C--A----GTA-A-GT-T--TT-AA-ATTTT----AT-AAA-TG-GT-CAAT-CAA--T--TTAGATT-----ATTTAATC------A-C-T----GA--A-T-ATACA-ATTACATG-T-AT-------G-CA-T--AA-G----T---A-C--ACTATT--G--T--ACA-GT-A-A-----------T-AAAC-A-----G-C---TG-C-AGC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---A-TT-C--CACA------T-A-A---CGTGT-T--GT-----T-------TA------T---TT--A-----TTA---G---T--TCAA-C-T---T-TCA---T-TT-GG-A-AAGTAATGA--ATGGA--TT-TAAAGGAtaaag
gi|9 : TTTCT--TTCGT--TG-GCA---GGAA--CG-AA-----T-TA-GACCAGAACACTC-AAATTTC-CTA---T--T---GGT-----TAATTAG-T-A-ATG-A------------ATGGA-TATT------C-C-GGAT---TTTCA-AG------TTCTTCTCAA--TT-CGAA-TAC-----C--T--TTCATAGGTTGATCA---G-TCA------TGC-GG--TT-CCAATA-T---AA-ACC---CGG-TT---C--T-----------------T-A--TTT--TC--G---T--AC--TC---------T-G-T-T---A-AA-G----TCAGATC--TTA--GG-AC--GACAC--G-T-A-CGA--G-C-T-G-AC-A--A--C---A-C-GC-T--T--AA-ATCTT----TTAAAA-TG-----------AA-T--GCGAACT----TGCT------------------------A-T-TTACA-AGTAC-TGTT-ATCGGTAC-G-TT-T--GT-T----T---A----AACATT-----T--A----------------------AAAG-A-----C-C---TT----GC--G-TG-T-CG--T-T--GC--------T--A---G--T-C--CATT------T-A-G---AG----T--GTTA---T-------TG------T---TT--A-----TT--------T--ACTA-C-T---C-TTG---TATC-AG-A-----AATGA--ATGG
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): CGTTTTTTAATCTAAGCTGACTGCGGTGTCAGTTGCTAGCCATTTGAGTGCGTTATGATCTGTTATTGCGACTACAGATATTGCTTACAGGAACAATGAATGGCAGTTATAGAAGGA