lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111
lowQualScore : 2 22 33333333333333 2222222222 222 3333 2222222 7777777777777777777777 22222222222 11111111 11 22 222222 11 111111111 222 111111 33333 22 1111111111 1 333333333333 22222 11 333333333333 1 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111 222222222222 1 22 3 5555555555555555 333 2222 1 222222 11 55555555555555555555 33333 4444 2 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3333333333333333333333333333333 33333333 1111 8888888888 1 3333 33333333333333333 33333 1 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 5555555 111 222 1 11 77777777777777777777 33333333 222222 1 1 66666666666666666 1 1 1 33333333333333333333333
lowQualScore : 8888 0 2 3 2 5555 44 7777 2 444 33 2 2 2 33 5555 66666666666666 2 2 0000000000 444 333 3 1111 33 6 8888 666 2 4 4444444 2 2 666666 22 666 6 4444444444444444444444 2 2 2 444 88888888 33 2 5555 33333333333 33 2 33 44444444 666 33 33 88 2 33 2 7 2 88 111111 2 2 2 77 222222222 111 3 000000 88 3 7777 5 7 7777 55 11111 3 55 99 7777777 0 9999999999 2 333333333333 77 3 5 3 88888 0 55 3 999999999999 3 0 3 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 4 4 99999 999999999999 777 3 5 11 88 5 2 3 0 5 7777 3 5 3 3 4 5555555555555555 222 2 66 3333 55 6 4 4 2 555555 3 3 11 33333333333333333333 4 1 2 8888 4 2 77777 3 2 7 3333 0 666 4 4 0 6 4 5 6 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6 1 2 9 6 5555555555555555555555555555555 3 0 22222222 1111 66 1111111111 5 3 4 6 3 0 7 3 99 7 2222 00000000000000000 2 3 3 33333 3 0 1 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 6 6 66 8 0000000 55 666 8 777 8 0 22 6 2 99999999999999999999 0 00000000 1 7 111111 3 6 1 88 5 99 5 00000000000000000 5 6 5 5 33333333333333333333333
lowQualScore : .... . . . . .... .. .... . ... .. . . . .. .... .............. . . .......... ... ... . .... .. . .... ... . . ....... . . ...... .. ... . ...................... . . . ... ........ .. . .... ........... .. . .. ........ ... .. .. .. . .. . . . .. ...... . . . .. ......... ... . ...... .. . .... . . .... .. ..... . .. .. ....... . .......... . ............ .. . . . ..... . .. . ............ . . . ............................................................................................................................................ . . . ..... ............ ... . . .. .. . . . . . .... . . . . . ................ ... . .. .... .. . . . . ...... . . .. .................... . . . .... . . ..... . . . .... . ... . . . . . . . ................................................................................................................................................ . . . . . ............................... . . ........ .... .. .......... . . . . . . . . .. . .... ................. . . . ..... . . . ...................................................................................................................................... . . . .. . ....... .. ... . ... . . .. . . .................... . ........ . . ...... . . . .. . .. . ................. . . . . .......................
lowQualScore : 9999 1 9 6 7 3333 22 4444 4 444 44 5 5 5 44 0000 99999999999999 4 4 1111111111 444 444 2 4444 44 5 2222 555 4 5 7777777 2 2 111111 99 777 2 0000000000000000000000 4 4 4 111 55555555 22 4 0000 55555555555 22 4 22 44444444 000 44 44 44 5 44 7 5 7 11 444444 7 7 7 33 222222222 555 1 555555 66 6 7777 1 3 7777 00 99999 6 55 55 3333333 8 4444444444 0 000000000000 99 0 0 9 88888 3 22 1 222222222222 3 0 6 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 3 3 77777 777777777777 888 2 5 22 55 0 8 3 0 8 1111 6 1 5 3 0 9999999999999999 444 2 22 8888 55 6 0 5 5 888888 9 9 11 99999999999999999999 6 1 5 5555 0 8 77777 1 8 2 1111 8 222 0 8 8 6 0 8 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 5 3 7 2222222222222222222222222222222 9 7 44444444 2222 11 6666666666 0 3 2 8 6 5 0 6 00 5 9999 88888888888888888 1 6 6 55555 6 9 9 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 00 2 8888888 88 000 8 555 8 0 22 5 2 66666666666666666666 2 88888888 5 4 000000 5 9 6 11 5 11 0 88888888888888888 0 0 0 0 00000000000000000000000
consensus : CATAAG---CCCG-TA-GAAG-CTA----GCA-GCCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-A--C--GA--GG-ATATT-GAA-ANTAA---T--CAAAC---AATCGATCAAA-TG-TGAT--AATTT----TTTC---AA-CAAA--ATAA-TTAA-T-AAATA------T--AG--TCTTAATT----A-C-AA-GTT-T-A-A-GTTTG-A-TACTTGAA-GGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA------T---AGTTC--CAAA-TGATG--CA---ACAC-AT-G-GGT--CCT--AA--AA-AG--GA-TAAT-A-TCAATCTA-A--TTC-TTT-GA-ATA-GTCANCG------AAAGGGAGCATAGAC-AA------AATGTA-G----GAGGCCC-TT----T--TGACT----ATCTA-TC-CCC--GTT-C--T--CATTTT-GGGGGCCT-AAAGAGTCA------A-----TAAATG--GGNTTCCACAGGCC-CTTAAAGG-A--ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAAATT-TTCAACGCAT-AAAGG-TCATAACGAAG-GTTAATAAC-ACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACT-CGTAAAGTAGGGGTCATGNAATNAAAT----AAC-GTT-TGATAANGGA--CAAAGACAAACAACGAANTCAAGCAG-ACAG-AGTCANT----AAATG-GGGTTCCACAGGCCCTTAAAGG-T-AA-TTTAG--CTCA-CCTGAAAG--TTTCGA-ATTTTCA-A-C--ATAAAGGTCATA-ACGAAAGGTTAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAACTNGTT--AAAGTAGGGGTGATGNAATG-AAA-C-AA---C-A-N-T-N--ATAANGGACAAGACAACAACGAANTCAA----GCAG-ATAGAGTCGT--TAAATG-GGGTTNCACAGGCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCA-CCTGAAAG--TTTCGA-ATTTTCANGCATAAAGGTCATA-ACGAAAGGTTAATAACACCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAA-AGTAAAGTAGGGGTNATGCAATNA-------AAN----AAC-ANTG-ATAA--AAGGACAAGACAACC------AACGAAACTCAA-GCAA-------AGA-CAG-AGTCGNTAAATG-GGGTTCCACAGGC-CCTTAAAGGTNATTTAGCTCA--CCTGAAAGTT-------------TCGAATTTT-C-ANGCATAAAGGTCATAACGAAG-GTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTCGTAAAGTAGGGGTCATGNAATGCAAANAACGNTTATAAAGGGCAAGACA-ACAACG-AANTCAAG-----NCGNT---AGAGTC-AATAAA-TGGGN-TTCCACAGGCC--CTTAAAGGTAATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCANGCATAAAGGTC-ATAACGAAGG--TTA-AT-AAC---ACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGTCTAGGTTAGAGCATTTTTAACTTGGAACATCTCATTTGG-GC-AATGAATT
Reference ( gi|1 ) : CATAAA---CCCG-TAAGAAG-CTA----GCAAGCCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-A--C--GA--GGGATATT-GAA-ATTAA---T--CAAAC---AAACAATCAAAATG-TGAT--AATTT----TTTC---AA-CAAA--ATAAATTAA-T-AAATA------T--AG--TTTTAATT----G-C-AA-GTT-TTA-A-ATTTG-A-TACTTGAA-GGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA------T---GGTTT--CAAA-TGATG--CA---ACAA-AT-G-GGT--CCT--AA--AA-AG--GA-TGAT-ATTCAATCTA-A--TTC-TTT-GA-ATA-TTCAATA------AAAGAAAGCATAGAC-AA------AACATA-G----GACGCCC-TT----T--TGACA----ATCTA-T--CCC--GTT-C--T--CATTTTTGGGGGCTTCAAAGAGACA------A-----TAAATG--GGCTTCCACAGGCC-CTTAAGGG-A--ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAAATT-TTCAACACATAAAAGG-TCATAACGAAG-GTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTGCGTAAAGTAGGGGTCATGGAATCAAAC----AAC-GTT-TGATGCAGGA--CAAAGACAAACAACGAACCCAAGCAG-ATAG-A-TCACT----AAATG-GGGTTCCACAAGCCCTTAAAGG-T-GATTTTAGA-CTCATCCTGAAAG-TTTTCGA-ATTTTCA-A-C--ATAAAGGTCATA-ACGAAAGGTTAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTAGTT--AAAGTAGGGGTCATGGAATC-AA--C-AA---C-A-T-G-G--ATAAAGGACAAGACAACAACGAACTCAA----GCAG-ATAGAGT-AT--TAAATG-GGGTTCCACAGGCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCA-AC-GAAAG--TTTCGA-ATTTTCACACATAAAGGTCATA-ACGTAAGGCTAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACAGTAAAATAGGGGTCATGGAATCA-------AAC----AAC-ATTGCATAA--AAGGACAAAACAACC------AACGAAACTCAA-GCAAT--AAGCAGA-TAG-AGTCATTAGATG-GGGTTCCACTGGC-CCTTAAAGGTTATTCAGCTCA--AATGAAGGTT-------------TCGAATTTT-C-ACGAAAAAAGGTCATAACGAAG-GTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTTGTGAAATCAGGGTTATA-AATGTAAACAATAGTGATAAAATGCAAGCCA-ACAACA-AAGTTAAG-----GCGTT---AGA-TCGAATAAA-AGTGA-TTTCATATGCA--CTTAAAGGTATTTTAGCTCGCCTGAAAGTTTCGAATTTTCATGCATAAAAGTT-ATAACTAATA--TAA-AA-AACTTAACCTAATGAAATGAATATAGGCAACAGCTAGCCGGGAGAGCTGACTTGACTATCATTTTCCGCCTTCAGTTTATCACAGTACGAGTACCACTTGAAGGTTGGGACTTTGTGATCTCTGTATCATATGAACAAAGGGAGCGTTTTTGCGCTTAACACGAAGGTGATGGCTTGTTCGTAATGATAGGGGCTAGGTTAAACCATTTGTAA--TGA---ATCGGGTTTGGTGCTAATGAATT
gi|2 : CATAAG---CCCG-TA-GAAG-CCA----G--AGCCAA-------AGA---AA-----TCAT-CAA--GT--ACTGAA-GTACT----TAG-A--G--GA--GG-ATATT-GAA-A--GA---T--ACAAC---AAACAATCAAA----TAAT--AATTT----CCTT------CAAA--ATAA-TTGA-C-TAAT-------T--AG--TCTTA-TT----G-CCAA-GTT-TGA-ATACTTC-A-TA-----G-GGCAA---T--------TG---GC-TCAG----ATGA----------GGTTT--TAAA-TGATG--CA----CAG-AT-TTGGTTCCCT--AA------G--CA-TTAT-AC-CAATCTA----TAC-TTT-GA-ATAGTCCAACA------AAGGAGCACATGAGC-AA------A-TGTA-G-----ACGCCCGTT----C--TGAT------TCTC-T--CCC--ATTTC--T--CATTTTTGG---CCT-AAAGAT-CA------C-----TAA-TG--GGGTTCCACATTCT-CCTAAAGG-TCTACTTAGCT-ACC-GAAAGTTTCGA--TT-TTC--CACATA----G-T-ATAACGAAG-GTAAATAACTACCTTTAC
gi|9 : ctgagctgcagcactatacgcagcCATAAGGCCCTCG-TAAGAAGACTA----GCA-GCCAAACTGTGAAGAGCGAA--A-TCCAT-CAAA-GT---TT-----TACT----TAG-CTCC--GA--GGG-TATT-GAA-AT-AA---T--CAAAC---AA----TC-AAATGTTGAT--ATCTTTA--TTTCATGAA-CAAG--TTAA--TAATT-AAATA------T---C--TCGTAATA----G-C-AACATTCTTATA-CTTTGTG-CAC----A-GGCAAACCT--------TGAAAG--TCAT----CTGAC-----T---AGCTT--C-----------------CAA-ATCG-GGT--CCT---A--AA-AG--GA-TCAT-AGC--ATATATA--TTCTTTT-GACATA-GTCATCG------AAAGGA--CATATAC-AAGTGTAGGAGATA-A----GTTGC---------T--TGACCGT--ATCTA-TTGCCC--GTT-C-----CATTTT--GGGGTTT--AAGGGGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|12 : ccagctgatagctagcagccacctaactaaaggcagccaATAAG---CCCG-TA-GAAG-CTA----GCA-GCCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTATT----TAG-A--C--GA--GG---AC---AA-A----------CAAAC-------AATC-AAATG-TGAT--AATTT----TTTC---AA-C-AA--GT-AATTAA-T-AAATA------T--AG--TCTTAATTA---G-C-AA-G----------TTTG-A-TACTTGAA-GGCAA---T--------TG--AGA-TCAC----CTCA------A---GGTTT--CAAA-TGATG--CA---ACAC-AT-G-GGT--CCTA-AA--AA-AG--GA-TAAT-A-TCAATCTA-A---AC-TTT-GA-ATA-GTCAACA------AAAG-GAGCATAGAC-AA------AATGTA-G----GACGCCC-AT----T--TGACT----ATCTA-TC-CCC--GTT-C--T--AATTTT--GGGGCCT-AAAGAGTCA------A-----TAAATG--AGCTTCCACAGGCC-CCTAAAGGTA--ATTTATCTCACCTGAAAGTTTCG-GATT-TTC-ATACAT-AAAGG-TCATAACGAAG-GTTAATAAC-ACCTTcggggtgtgacccctggagtactatcaagagtcagcctcgccaacttctcacggcgtgtgttatttggtccataatagggggtgattgcaaactgagcacatacactgacagaccgggtaccaacgaaactctataaaatcaa
gi|5 : ctgaagctagcagccactaaccagcagccaATAAG---CC-G-TAAGAAG-CTA----GCA-GCCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAAAGT--ACTGAAAGTAAT----TAG-A--C--GA--GG-ATATT-GCA-AGTA---------------------TCAAA-TG-TGAT--T-TTT----TTTC---AA-CAAATGATAAAT-------AATA------T--AG--TCTTAAT---------AA-GC----A-A-GTTTG-A-TACTTGAA-GGCAA---T--------TG--AGCCTCAC----CTGA------T---GGTTT--CAAA-TGATG--CA---ACAC-AT-G-GGT--CCTA-AA--AA-AG--GATTCAT-A-TCAATCTA-A---TC-TTT-GA-ATA-GTCAATAGTCAACAAAAGGAGCATAGAC-TA------AATGTG-G----GACGCCC-GT----T--TGACT----ATCTA-T--CCCA-GTT-C--T--CATTTT--AGGGCCT-AAAGAGTCA------A-----TAAATG--GGCTTCCACAGACC-CTTAAAGGTA--ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCG-AATT-TTC-ATACAT-AAAGG-TCATAACGAAG-GTTAATAAC-ACCTTTGC
gi|11 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaATAAG---CCCGGTATGA-G-CTA----GCA-GCCAA----T-AAGA---AA--AATCCAT-CCAA-GTTTACTGAAAGTACT----TAC-A--G--GA--GG-ATATT-GAA-AG-AA---T--CAATT---AAACAATCACA-----GATTAAATTT----TTTC---AA-CCAA--ATAA-TTAA-T-AAATA------TTAAGCGTTTTAATTA---G-C-AA-GTT-T---------G-A-TACTT-AA-GGCA----T--------TG--AGC-TCAC-----TGA------T---GGTTT---AAA-TGATG--CAT--ACAACATTG-GGT--CCCC-AA--AA-AG--GA-TGAT-AT-CAGACTA-C--ATC-TT--GA-ATA-T-CAATA------AAAGGA-GCATAGAC-AA------AATGTACG----GACGCCC-TT----T--TG-CATCCTATCTA-T--CCCCCGTT-C--TGTCATTT---GGCGCTTCGA-GAGTCA------A-----TAAATGTGGGTTTCC-CAGGCC-CTTAAAGGTA--ATTTAGCTCACCTGAAAG-TTCG-AATT-TTC-ACAC---AAAGG-TCATAACGAAT-GTTAATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatgtaataaaaaaacgattatacagggcaagacaacaacgtactcaagcaggtagagtcactaaatggggttccacaggcccttaaaggtaatttagctca
gi|3 : gcctgaagcagcagccactaaccagcagcaATAAG---CCCG-TA-GAAG-CTA----GCAA-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-A--T--GA--GG-ATATT-AAA-AATAA---T--CAAAC---AATCAATCAAA-TG-TGAT--AATTT----TTTC---AA-CAAA---TAA-TTGA-T-AAATG------T--AG--TCTTAATT----A----------TCA-A-GTTTG-A-TACTTGAAAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA------T---AGTTC--CAAA-TAATG--CA---ACAC-AT-G-GGT--CCTA-AA--AA-AG--GA-TAAT-A-TCAACAT--A--TTC-TTT-GA-ATA-GTCAGCG------AAAG-GAGCATAGAC-AT------AATGTA-G----GAGGCCC-TTAAGCTTGTGACT----ATCTA-TC-CCC--ATT-T--T--CATT
gi|4 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaATAAG---CC-G-TA-GAAG-CTA----GCA-GCCAA----T-AAGA---A-----TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGT-CT----TAG-A--C--G-----GACATT-GAA-AATAA---T--CAAAC---AAT---TCAAA--G-TGAT--A-TTT----TTTC---AA----A--ATAAAT-AA-T-AAATA------T--AG--TCTTAATT----A----------TCA-A-GTTTG-A-TTCTTGAA-GGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGATACATGT---AATTC--CTAA-TAATG--CA---ACAC-AT-G-GGT--CCTAAAA--AA-AG--GA-TAAT-A-GAAATCT--A--TTC-TTT-GA-ATA-GTCAGCG------AAAG-GAGCAGAGAC-AA------AATGTA-G----CAGGCCC-TT----T--TATCT----ATCTA-TC-CCC--GTT-T--T--CATTTTGGGGgtggagttgaagggccggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgattggattagggggtgatgcaatgaaataacagtgataacggacaagaaaacaaataaaatcaaacaaacacacttgttgaataacgttgcaaagaccatttaatgcagtttagctcacctgaaattttcaagcatgaatgtcatcacggagattaataacttaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatggaatcaaacaacatttataaagggcaagacaacaacgaactcaagcagatagagtcattaaataggatttcacaggccccttaaggttatttagctcacctgaaagttccgaattttcacgaataagtctagacgaagggttaataacatcttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatactagtaaagtggggtaggatcaggaaatcataggcacaacaaattatacaggcaagtaccaggcacgaactcaagcaagattagtagtcattaaatggggtccacagacgccttaacagttatttagctcacctgaaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatagagttcataacgaaggttaataacaccttt
gi|8 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaATAAG---CCCG-TA-GAAG-CTA----ACA-GCCAA----T-AAGA---AA--A-CCCAT-CAAA-GT-------------------------------------ATT-GAA-AATAA---T--CAAAG---AATCAATCAAA-TG-TGAT--AATT--------C---AA-CAAA---TAA-TTAA-T-AAATA------T--AG--TCTTAATT----A-T-AA---------A-GTTTG-A-TAATTGAA-G-CAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGG----------AGTTC--CAAA-TGATG--CA---ACAC-AT-G-GGT---CT--AA--AACAG--GA-TAAT-A-GCAATCT--G--TTC-TTT-GA-ATA-GTCAGCA------AAAG-GAGCATAGAC-AA------AACGTA-G----GAGGCCCTTT----T--TGACT----ATCTA-TA-CTC--GTT-T--T--CA-TTTTGGGG---TTGAAGAGttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggattaggggtgatgcaatgaaaaaccagtgataacggacaagaaaacattaaaatcaaacaaacacacttgttaaatagggttgcaaagaccattaaaggccgtttagctcacctgaaattttcaagcataaatgtcataacgaagaattaataacaacttcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|6 : agactgaagctagcagccactaaccagcagccaATAAG---CCCG-TC-GAAG-CTA----GCA-GTCAA----T-AAGG---AA--A-TTCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAC-A--C---A--GAAATACT-GAAGATTA----T--TAAAC---AATCGATCAAA-TT-TGAT--A-TTT----TTTA---AA-CAAA---TAA-TCAA-T-AAAGA------T--AT--TCCTGATT----A-T-AA---------A-GTTTG-A-TACTTGGA-TTCAA---C--------AA--AGC-TCAC----CTAA------A---AGTTT--CAAA-TGATG--CA---TCGC-AT-G-GTT--CCC--AATGAA-AGTTAA-TGACAATTCAATCTA----------T-GG-AGG-GTCGA-A------AAAAAGAGCGTAGAC-Acaggggtatcaccaggggtctatttaagagagcggcaccaactttcagacaatcatggcgattggattaggggcgatgcaatgaaataacactgtgataacggacaagaaaacaataaaatcaaggaaacacaattaaaggcagttcacctgaaattttcaagcataaatgccataacgaagaattaataacaactt
gi|14 : tggtgatggaagctgcattcgcagtgattgttcagctggcctcctccgatgtcattgcaaaagtctactaggttaaacctagcagtcattaaccagcagataATAAG---CCCG-TA-GAA---TA----GT---CCAA-------------AA--A-TTCAT-CGAA-GT--ACTGAGAGTACT----CAG-A--C--A----GAATACC-AAA-ATTA----T--TAAAC---AATCGATCAAAAT--TGAT--ATTTT----TTCT---AA-CAA--------TTGA-T-CAACA------T--CT--TCTAAATT----A----------TCA-A-GTTTA-A-TACATGAA-GGCAA---C--------TG--AGC-TAAT----CTGA------A---AGTTC--CAAA-TGATA--CA---CCA------------CAT--AAT-AA-AG--GT-TAAT-AAT-AATCTA-A--TT--TTT-CA-GGA-GTCAACG------AAAG-GAGCATAGAC-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattgggccttaagagggcaaggcaacttgacagatccatgtaatggttgaatggtgatgaaggaatgaaacaatagttataatgggtaagacaacaacagagccaaatagacagagagagtcgttaaatagggttcataggtctataagggatattgaatcca
gi|7 : actaggttgaatctagcagccacaaacctgcagtcatcaagcctttagaatctagcagccactaatcagttgccaATACG---CCTG-TAC-AAG-CTATATAGCA-GCCAA----T-GAGA---AA--A-TACAT-CAAA-GT--ACTAAGAGTACT----TAA-A------G--GGAACACA-AAA-GTTGG------CAAAC---ACTGGATCAAA--G-TGAT--GATAT----TTCA---AA-C--------AGTCAA-T-AAACA------T--AT--TCCTAATT----ATC-AA-GCT-TGA---------A-TACTTACA-GGCAA---T--------TG--AGA-TTAT----CTGA------T---AGTTC--CTAA-GTATA--CATC-ACAA-A--G-ACT--CAT--AAT-GA-AG--Gc
gi|18 : attcacaaacataaacattagaagaaattggaacatggcagaaatttcattaaaatgtttcttatgaacctaaaagccacaattttccaaatcaaatataaatgaactttttaatgatttgatcaacccatgacccagggccaggatatcgggggatgggatgtttcaatacgtaaaatttcgacgagaaccgcaagggttcgattcgtagcctatttagatttaaatacatagtgtagatacgagtttctctaggggatacaaaaggtgtttacaaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccacgctggttctagcagccaATAAA---CCCG-TAG---------------AGCCAAG---T-AAGA---AA--A-TC-AT-CAAA-GT--ACCGAAAGTACT----CAG-A-----GA---GAATATTCAAA-ATTAG---T--Ctc
gi|22 : ctgtcgcagaaattacatgaatcgaaactagcaggcactatctagcagccaATAAA---CTCA-TA-GAAG-CTA----GC-AGCCAA----T-AAGtagatactcgtatggaccttggtagactcttttcaaagataaagtttgtattaaccttcattatctaaaattaggaacgttccgataagcgcaatt
gi|15 : aagctagcagccaataaacccatggaagccagcagcaaAG---CCAA-TAAGTAC-CTA----GCA-GTCAA----T-AAGA---AA--A-TTCAT-CAAC-GT--ACGGACAGTACC----CGG-A--CTTAA--A----ACT-GAA-AATAA---T--CAAAC---AA----TC--------GAT--A--TT----TTTC------CAAA--C--AATTAA-T-CAACA------T--AT--TGTTAAT---------AA-----TGA-A-ATTTG-A-TACTTCAA-GGCAA---TTACCGGGATA--AGC-TCAC----CTGA------A---AGTAC--CAAA-T--TT--CATCTCCAG-AT-GAAGT--CCT-------------------T-ATTCGGTTTT-T--TTC-TTTGGA-ATA---AAATA------ACAGAcccctggaagccagcagccaataggctatgaaaagctagcagcaaataagcc
gi|21 : accagactgaagctagcagccattaccccgcAAG-C-A----GCA-GCCAA----T-AAGA---AT--A-TGCAT-CAAA-GT--ACTGAGAGTACTAGTCTAGTACTC--GAACGGAATAAC-AAA-A--AG---TAGCAAAT---AATCAATCAAAAAT-TGAC--AATTT----T---------CCAA--ACAAATTAA-G-AAACA------T--A
gi|10 : A----GCAGACCGC----C-AAGA---AATAA-TCCATGCAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAGGA--C--AA--GG-ATATT-GGA-AATAA---TT-CAAACCCAAAGAAATCCAATGG-TGAT--AATTTGTTTTTCC---AATCAAA--ATAA-TTAA-TGAAATA------T--AGGGTCCTTATTAGGAG-C-AT-GTT-TG--------G-A-TACCTGAA-GGCAA---T--------GC--GGC-TCACAACCCTGGAAT---T---GGTTT--CAAAATGATGGGCA---ACAC-AT-G-GGG--TCT--AA--AA-AG--GA-TAAT-AATCAATCTA-AAATTG-TT--GA-ATA-GTCACCA------AAAGGGAGC-TAGCCCAA------AATATG-GTAGAAAGGCCC-TT----T--TGGGATT--ATCTAAT--CCC--GTT-CCTT--CATTTTAGGGGCCT--AAAGAGTCA------A-----CAAATG--GGCTTCCACAGGCC-CTTAAAGGTA--ATGTAGCTCACCCGAAAGTTTCG--ATT-TTC-ATAC-----------------AAG-GTTAATAAC-ACCTTT
gi|16 : tgataatgctgagcgcgctctaaccagcacgccaataGCCAA----T-AAGA---AA--A-ATCAT-CAAA-GT--ACTGAGAGTACT----CAG----------------------A-ATTAG------CAAA-------------------TGAT--AATTT----GTC---------AA--AT-GATTAA-T-TAACA------C--AT--TCTTAATC----A-T-AA-GTT-CT----------A-TACCTGAC-GACAA---T--------TG--AGC-TCAC----ATCA------CAAAGGTTC-----A-TAATG---A---A---------GGT----T--AA--AA-A--------------CAATATA-A---TC-TTT-GA-AGAGTCCACGA------AAAGAA
gi|24 : ctttcagcagctactaacaattaagtgACT----CAG-A--C--G----GGATATT-AAC-ACTAATTGT--TAAAA---AATGGACCAAAAT--TGAT--AAGTT----TTTCT--AA-C-----AT---TTGA-T-AAATA------T--AC--TGATAATC----ATC-AA-GTT-Ttatgaaaacgaggtagtggaatccttcagctatgta
gi|19 : TTT----TTTC---AA-CAAA---TAA-TTAA-T-AAATACATGTAT--AG--TCTTAATTA---G-C-AA-GTT-T---------G-A-TACTTGAA-GGCAA---T--------TG--AGC-TCAT----CTGA------T---AGTTC--CAAA-TG--------------------GGT--CCT--AA--AA-A---------T-AG-CAATCTA----TTC-TTT-GA-ATA-GTCATCG------AAAGGA-GCATAGAC-AA------AATGTA-G----GAGGACC-TT----T--TGACT----ATCTA-gat
gi|23 : atAAA--ACAATTTA--T-AAGCA---------AA--TCTTAATT----A---AA-----TCA-A-GTTTG-AATACTTGAA-AACAA---C--------TG--AGC-TTA-----CTGA------A---AGTTTTGCTAA-TGTTA--CA---TCAA-AT-
gi|13 : tA------T--AG--TCTTAATT----A----------TCA-A-GTTTG-A-TACTTGAA-GGCAA---T--------TG--AGT-TCAC----CTGT------T---TGTTC--CAAA-TGATG--CA---GCAC-AT-G-GGT--CCT--AA--AA-AG--AA-TAAT-A-GCAATCT--A--TTA-TTT-GA-ATA-ATCAGCG------AAAG-GAGCATAGAC-AA------AATGTG-G----GAGGCCA-TT----T--TGACT----ATCTA-TC-CCC--GTT-T--T--CA-TTTTGGGG--TTGAAGGAactgtcgaaatgaggattaat
gi|4 : TCAAACAAACAC-----ACTTGTTAAATA--GGGTTGCAAAGACC-ATTAAAGG-CC-GTTTAGCTCACCT---------GAAATT-TTCAA-GCAT-AAATG-TCATAACGAAGAATTAATAAC-AACTTCACccggggtacaacctgagacttatttaagagagcggcgccaactttcagacaatcatggtgattggattaggggtgatgcaatgaactaacagtgataacggacaagaaaacaaaacacacttgttagataaggttacaaagaccata
gi|17 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaataagccgtagaagctagcagccaataagaatccatcaaagtactgaaagtcttagacggacattgaaaataatcaaacaattcaaagtgatattttttcaaaataaataataaatatagtcttaattatcaagtttgattcttgaaggcaattgagctcacctgatacatgtaattcctaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaaggataatagaaatctattctttgaatagtcagcgaaaggagcagagacaaaatgtagcaggcccttttatctatctatccccgttttcattttggggttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggattaggggtgatgcaatgaaaaaccagtgataacggacaagaaaacattaaaaTCAAACAAACACACTTGG-----TAAATG--AGGTTGGAAAGGCC-ATAAAAAG-CT-GTTTAGATCACCTGAAAGTTTCG-AATT-TTTAAC-CATAAAA-G-TCATAACGAAGAATTGATAAC-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|3 : gggtaccaactggggccaaaagagggcggcgcaacatttcagacaatcgtggtgattggattagaagtgatgcaataaaatagcagtgattacggacaagaaaataataaaaTTGCAAAGACCATTTAATGC-A--GTTTAGCTCACCTGAAA---------TT-TTCAA-GCATGAA-TG-TCATCACGGAG-ATTAATAAC----TTAACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACT-CGTAAAGTAGGGGTCATGGAATCAAAC----AAC-ATT-T-ATAAAGGG--C-AAGAC-AACAACGAACTCAAGCAG-ATAG-AGTCATT----AAATA-GGATTTCACAGGCCCCTTAAGG-T-TA-TTTAG--CTCA-CCTGAAAG--TTCCGA-ATTTTC--A-CGAATAA--GTC-TAGACGAAGGGTTAATAACATCT
gi|8 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcaaccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagatgaggatattaaaaataatcaaacaatcaatcaaatgtgataattttttcaacaaataattgataaatgtagtcttaattatcaagtttgatacttgaaaggcaattgagctcacctgatagttccaaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaacatattctttgaatagtcagcgaaaggagcatagacataatgtaggaggcccttaagcttgtgactatctatccccattttcattgtggagttgaagggccggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgattggattagggggtgatgcaatgaaataacagtgataacggacaagaaaacaaataaaatcaaacaaacacacttgttgaataacgTTAAAGG-------CAGTTCACCT---------GAAATT-TTCAA-GCAT-AAATG-CCATAACGAAGAATTAATAAC-AACTTtgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatactagtaaagtggggtaggatcaggaaatcataggcacaacaaattatacaggcaagtaccaggcacgaactcaagcaagattagtagtcattaaatggggtccacagacgccttaacagttatttagctcacctgaaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatagagttcataacgaaggttaataacaccttt
gi|14 : agactgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctaacagccaataagaaaacccatcaaagtattgaaaataatcaaagaatcaatcaaatgtgataattcaacaaataattaataaatatagtcttaattataaagtttgataattgaagcaattgagctcacctggagttccaaatgatgcaacacatgggtctaaaacaggataatagcaatctgttctttgaatagtcagcaaaaggagcatagacaaaacgtaggaggccctttttgactatctatactcgttttcattttggggttgaagagcaggggtatcaccaggggtctatttaagagagcggcaccaactttcagacaatcatggcgattggattaggggcgatgcaatgaaataacactgtgataacggacaagaaaacaataaaatcaaggaaacacaaAAGGC-A--ACTGAGCTAATCTGAAAGTTCC-AAAT-----GATACACCA------CATAATAAAG-GTTAATAAT-A
gi|15 : actaggttgaatctagcagccacaaacctgcagtcatcaagcctttagaatctagcagccactaatcagttgccaataagcccgtagaatagtccaaaaattcatcgaagtactgagagtactcagacagaataccaaaattattaaacaatcgatcaaaattgatattttttctaacaattgatcaacatcttctaaattatcaagtttaatacatgGGG-A----TAAGCTCACCTGAAAGTACC-AAATT-Tatctaatttttcaggagtcaacgaaaggagcatagacac
gi|29 : accagactgaagctagcagccattaccccgcagccaataagtacctagcagtcaataagaaaattcatcaacgtacggacagtacccggacttaaaactgaaaataatcaaacaatcgatatttttccaaacaattaatcaacatattgttaataatgaaatttgatacttcaaggcaattacc--ATTTAGCTCCCCTGAAAATTTCGAA-TT-TTCAA-GCATAAA-GG-TCATAACGAAG-GTCAATAAC-ACCTcatctccagatgaagtccttattcggtttttttctttggaataaaataacaga
gi|6 : tAGCTCACCTAAAAGTTTC-AAATGATGCATCGCAT----GGTTCCCAATGAAA-GTTAATGAC-A
gi|5 : tggtgatggaagctgcattcgcagtgattgttcagctggcctcctccgatgtcattgcaaaagtctactaggttaaacctagcagtcattaaccagcagataataagcccgtcgaagctagcagtcaataaggaaattcatcaaagtactgaaagtacttacacagaaatactgaagattattaaacaatcgatcaaatttgatattttttaaacaaataatcaataaagatattcctgattataaagtttgatacttggattcaacaaAACT-CGTAAAGTAGGGGTCATGTAATAAAAA----AAC-GAT-T-ATACAGGG--CAA-GACAA-CAACGTACTCAAGCAG-GTAG-AGTCACT----AAATG-GGGTTCCACAGGCCCTTAAAGG-T-AA-TTTAG--CTCAattcaatctatggagggtcgaaaaaaagagcgtagacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattgggccttaagagggcaaggcaacttgacagatccatgtaatggttgaatggtgatgaaggaatgaaacaatagttataatgggtaagacaacaacagagccaaatagacagagagagtcgttaaatagggttcataggtctataagggatattgaatcca
gi|2 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaataagccgtaagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaaagtactgaaagtaattagacgaggatattgcaagtatcaaatgtgattttttttcaacaaatgataaataatatagtcttaataagcaagtttgatacttgaaggcaattgagcctcacctgatggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggattcatatcaatctaatctttgaatagtcaatagtcaacaaaaggagcatagactaaatgtgggacgcccgtttgactatctatcccagttctcattttagggcctaaagagtcaataaatgggcttccacagacccttaaaggtaatttagctcacctgaaagtttcgaattttcatacataaaggtcataacgaaggttaataacacctttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACT---TAAAGATGGGGTCGTGGAATCAAAC----AAC-CTC-TTATA-AGG----AAAGACACA-AACGAAATC-AGCAGAATAG-AGT--CT----AAATG-AG---TCACAGGCCTT--AAGG-T-AA-TTTAG--CTCA-CCTGAAAATTTTTCGACATTTTCACA-C--ATAAA-GTCATA-ACGGAAGGTAAATAAC
gi|26 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGCAAAGTAGGGGTCATGGAATCAAATCAAAAAC-ATT-TTATAAAGGA--C-AAGAC-AACAACGAACTCAAGCAG-ATAGAA-TCATT----cgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|4 : gagttTAGGGGTGATGCAATGAAA-----AAC-CAG-TGATAACGGA--CAA-GA-AAACATTAAAATCAAACAA-ACAC-ACTTGTT----AAATA-GGGTTGCAAAGACCATTAAAGG-CCG--TTTAG--CTCA-CCTGAAA-----------TTTTCA-AGC--ATAAATGTCATA-ACGAAGAATTAATAACAACT
gi|8 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaataagccgtagaagctagcagccaataagaatccatcaaagtactgaaagtcttagacggacattgaaaataatcaaacaattcaaagtgatattttttcaaaataaataataaatatagtcttaattatcaagtttgattcttgaaggcaattgagctcacctgatacatgtaattcctaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaaggataatagaaatctattctttgaatagtcagcgaaaggagcagagacaaaatgtagcaggcccttttatctatctatccccgttttcattttggggttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggatTAGGGGCGATGCAATGAAAT----AAC-ACTGTGATAACGGA--CAA-GA-AAACAATAAAATCAAGGAA-A---------------------------CACAA----TTAAAGG-C-AGTT--------CA-CCTGAAA-----------TTTTCA-AGC--ATAAATGCCATA-ACGAAGAATTAATAACAACTtcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|17 : agactgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctaacagccaataagaaaacccatcaaagtattgaaaataatcaaagaatcaatcaaatgtgataattcaacaaataattaataaatatagtcttaattataaagtttgataattgaagcaattgagctcacctggagttccaaatgatgcaacacatgggtctaaaacaggataatagcaatctgttctttgaatagtcagcaaaaggagcatagacaaaacgtaggaggccctttttgactatctatactcgttttcattttggggttgaagagcaggggtatcaccaggggtctatttaagagagcggcaccaactttcagacaatcatggcgattggatTAGAAGTGATGCAATAAAAT----AGCAGT---GATTACGGA--CAA-GA-AAATAATAAAATCAAACAA-ACA-----CACTTGGTAAATG-AGGTTGGAAAGGCCATAAAAAGCT-G--TTTAGA--TCA-CCTGAAAG--TTTCGA-ATTTTTA-ACC--ATAAAAGTCATA-ACGAAGAATTGATAACt
gi|28 : gggtaccaactggggccaaaagagggcggcgcaacatttcagacaatcgtggtgattggatATACTGGAATCAAAGG---ACAACGAACTCAAGCAA-ACGG-AGTCATT----AAATG-GGGTTGCATAAACCCT
gi|12 : attAG-AGTCAAT----AAATG-AGCTTCCACAGGCCCCTAAAGG-T-AATTT---ATCTCA-CCTGAAAG--TTTCGG-ATTTTCATA-C--ATAAAGGTCATA-ACG-AAGGTTAATAACACCT
gi|5 : ctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtatttagacgaggacaaacaaacaatcaaatgtgataattttttcaacaagtaattaataaatatagtcttaattagcaagtttgatacttgaaggcaattgagatcacctcaaggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaatctaaactttgaatagtcaacaaaaggagcatagacaaaatgtaggacgcccatttgactatctatccccgttctaattttggggcctaaAG-AGTCAAT----AAATG-GGCTTCCACAGACCCTTAAAGG-T-AA-TTTAG--CTCA-CCTGAAAG--TTTCGA-ATTTTCATA-C--ATAAAGGTCATA-ACG-AAGGTTAATAACACCTt
gi|11 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaataagccgtaagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaaagtactgaaagtaattagacgaggatattgcaagtatcaaatgtgattttttttcaacaaatgataaataatatagtcttaataagcaagtttgatacttgaaggcaattgagcctcacctgatggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggattcatatcaatctaatctttgaatagtcaatagtcaacaaaaggagcatagactaaatgtgggacgcccgtttgactatctatcccagttctcattttagggcctaaAG-AGTCAAT----AAATGTGGGTTTCCCAGGCCCTTAAAGG-T-AA-TTTAG--CTCA-CCTGAAAG---TTCGA-ATTTTC--A-C--ACAAAGGTCATA-ACG-AATGTTAATttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatgtaataaaaaaacgattatacagggcaagacaacaacgtactcaagcaggtagagtcactaaatggggttccacaggcccttaaaggtaatttagctca
gi|10 : gcctgaagcagcagccactaaccagcagcaataagcccggtatgagctagcagccaataagaaaaatccatccaagtttactgaaagtacttacaggaggatattgaaagaatcaattaaacaatcacagattaaattttttcaaccaaataattaataaatattaagcgttttaattagcaagtttgatacttaaggcattgagctcactgatggtttaaatgatgcatacaacattgggtccccaaaaaggatgatatcagactacatcttgaatatcaataaaaggagcatagacaaaatgtacggacgcccttttgcatcctatctatcccccgttctgtcatttggcgcttcgAG-AGTCAAC----AAATG-GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGG-T-AA-TGTAG--CTCA-CCCGAAAG--TTTCG--ATTTTCATA-C-------------------AAGGTTAATAACACCT
gi|29 : tgataatgctgagcgcgctctaaccagcacgccaataagcagaccgccaagaaataatccatgcaaagtactgaaagtacttaggacaaggatattggaaataattcaaacccaaagaaatccaatggtgataatttgtttttccaatcaaaataattaatgaaatatagggtccttattaggagcatgtttggatacctgaaggcaatgcggctcacaaccctggaattggtttcaaaatgatgggcaacacatggggtctaaaaaggataataatcaatctaaaattgttgaatagtcaccaaaagggagctagcccaaaatatggtagaaaggcccttttgggattatctaatcccgttccttcattttaggggcctaaTTTAG--CTC-CCCTGAAAA-TTT-CGA-ATTTTCA-AGC--ATAAAGGTCATA-ACG-AAGGTCAATAACACCTtt
gi|2 : taTAACT---T--AAAGATGGGGTCGTGGAATCAAA--C-AA---C-C-TCT-T--AT-AAGGA-AAGACACAAACGAAATC-A----GCAGAATAGAGT--C--TAAATG-AG---TCACAGGCCTT--AAGGTAATTTAGCTCA-CCTGAAAATTTTTCGACATTTTCACACATAAA-GTCATA-ACGGAAGGTAAATAAC
gi|6 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAA-TGGTT--GAA-TGGTGATGAAGGAATG-AAA-C-AA---T-A-G-T-T--ATAATGGGTAAGACAACAACAGAGCCAAATAGACAG-AGAGAGTCGT--TAAATA-GGGTT-CATAGGTCTATAAGGGcgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|5 : tggtgatggaagctgcattcgcagtgattgttcagctggcctcctccgatgtcattgcaaaagtctactaggttaaacctagcagtcattaaccagcagataataagcccgtcgaagctagcagtcaataaggaaattcatcaaagtactgaaagtacttacacagaaatactgaagattattaaacaatcgatcaaatttgatattttttaaacaaataatcaataaagatattcctgattataaagtttgatacttggattcaacaaagctcacctaaaagtttcaaatgatgcatcgcatggttcccaatgaaagttaatgacaattcaatctatggagggtcgaaaaaaagagcgtagacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattgggccttaagagggcaaggcaacttgacagatccatgAACTCGT---AAAGTAGGGGTCATGTAATA-AA--A-AA-----A-C-G-ATTATACAGGGCAAGACAACAACGTACTCAA----GCAG-GTAGAGTCAC--TAAATG-GGGTTCCACAGGCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCA-atattgaatcca
gi|3 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaataagccgtaagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaaagtactgaaagtaattagacgaggatattgcaagtatcaaatgtgattttttttcaacaaatgataaataatatagtcttaataagcaagtttgatacttgaaggcaattgagcctcacctgatggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggattcatatcaatctaatctttgaatagtcaatagtcaacaaaaggagcatagactaaatgtgggacgcccgtttgactatctatcccagttctcattttagggcctaaagagtcaataaatgggcttccacagacccttaaaggtaatttagctcacctgaaagtttcgaattttcatacataaaggtcataacgaaggttaataacacctttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACTCGT---AAAGTAGGGGTCATGGAATC-AAA-C-AA---C-A-T-T-T--ATAAAGGGCAAGACAACAACGAACTCAA----GCAG-ATAGAGTCAT--TAAATA-GGATTTCACAGGCCCCTTAAGGTTATTTAGCTCA-CCTGAAAG--TTCCGA-ATTTTCACGAATAA--GTC-TAGACGAAGGGTTAATAACATCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAA-AGTGGGGTAG-GATCAGGAAATCATAGGCACAAC----AA--ATTATACAGGCAAGTACCAGGC-----------ACG-AACTCAA-GCA--------AGATTAGTAGTCATTAAATG-GGG-TCCACAGACGCCTTAACAGTTATTTAGCTCA--CCTGAAAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-NNGAATAGAGTTCATAACGAAG-GTTAATAACACCTTT
gi|26 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcaaccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagatgaggatattaaaaataatcaaacaatcaatcaaatgtgataattttttcaacaaataattgataaatgtagtcttaattatcaagtttgatacttgaaaggcaattgagctcacctgatagttccaaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaacatattctttgaatagtcagcgaaaggagcatagacataatgtaggaggcccttaagcttgtgactatctatccccattttcattgtggagttgaagggccggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgattggattagggggtgatgcaatgaaataacagtgataacggacaagaaaacaaataaaatcaaacaaacacacttgttgaataacgttgcaaagaccatttaatgcagtttagctcacctgaaattttcaagcatgaatgtcatcacggagattaataacttaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGTTGCAAAGTAGGGGTCATGGAATC-AAATC-AAAAAC-A-T-T-TT-ATAAAGGACAAGACAACAACGAACTCAA----GCAG-ATAGAATCAT--T
gi|4 : gTAGGGGTGATGCAATG-AA--A-AA---CCA-G-T-G--ATAACGGACAAGAAAACATTAAAATCAA----ACAA-ACACACTTGT--TAAATA-GGGTTGCAAAGACCATTAAAGGCCGTTTAGCTCA-CCTGA----------A-ATTTTCAAGCATAAATGTCATA-ACGAAGAATTAATAACAACT
gi|8 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaataagccgtagaagctagcagccaataagaatccatcaaagtactgaaagtcttagacggacattgaaaataatcaaacaattcaaagtgatattttttcaaaataaataataaatatagtcttaattatcaagtttgattcttgaaggcaattgagctcacctgatacatgtaattcctaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaaggataatagaaatctattctttgaatagtcagcgaaaggagcagagacaaaatgtagcaggcccttttatctatctatccccgttttcattttggggttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggatTAGGGGCGATGCAATG-AAA-T-AA---C-ACT-GTG--ATAACGGACAAGAAAACAATAAAATCAA----GGAA-A------------------------CACAA----TTAAAGGCAGTTCACCT------GA----------A-ATTTTCAAGCATAAATGCCATA-ACGAAGAATTAATAACAACTtcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|13 : agactgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctaacagccaataagaaaacccatcaaagtattgaaaataatcaaagaatcaatcaaatgtgataattcaacaaataattaataaatatagtcttaattataaagtttgataattgaagcaattgagctcacctggagttccaaatgatgcaacacatgggtctaaaacaggataatagcaatctgttctttgaatagtcagcaaaaggagcatagacaaaacgtaggaggccctttttgactatctatactcgttttcattttggggttgaagagcaggggtatcaccaggggtctatttaagagagcggcaccaactttcagacaatcatggcgattggatTAGGGGTGATGCAATG-AA--CTAA---C-A-G-T-G--ATAACGGACAAGAAAACAA--AACACA------C----T----T-GT--TAGATA-AGGTTACAAAGACCt
gi|17 : atagtcttaattatcaagtttgatacttgaaggcaattgagttcacctgtttgttccaaatgatgcagcacatgggtcctaaaaagaataatagcaatctattatttgaataatcagcgaaaggagcatagacaaaatgtgggaggccattttgactatctatccccgttttcattttggggttgaaggaccggggtacaacctgagacttatttaagagagcggcgccaactttcagacaatcatggtgattggatTAGAAGTGATGCAATA-AAA-T-AG---C-A-G-T-G--ATTACGGACAAGAAAATAATAAAATCAA----ACAA-ACACACT--TGGTAAATG-AGGTTGGAAAGGCCATAAAAAGCTGTTTAGATCA-CCTGAAAG--TTTCGA-ATTTTTAACCATAAAAGTCATA-ACGAAGAATTGATAACata
gi|28 : gggtaccaactggggccaaaagagggcggcgcaacatttcagacaatcgtggtgattggatACAACGAACTCAA----GCAA-ACGGAGTCAT--TAAATG-GGGTTGCATAAACCCT
gi|12 : attatactggaatcaaaggAGAGTCAA--TAAATG-AGCTTCCACAGGCCCCTAAAGGTAATTTATCTCA-CCTGAAAG--TTTCGG-ATTTTCATACATAAAGGTCATA-ACG-AAGGTTAATAACACCT
gi|5 : ctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtatttagacgaggacaaacaaacaatcaaatgtgataattttttcaacaagtaattaataaatatagtcttaattagcaagtttgatacttgaaggcaattgagatcacctcaaggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaatctaaactttgaatagtcaacaaaaggagcatagacaaaatgtaggacgcccatttgactatctatccccgttctaattttggggcctaaAGAGTCAA--TAAATG-GGCTTCCACAGACCCTTAAAGGTAATTTAGCTCA-CCTGAAAG--TTTCGA-ATTTTCATACATAAAGGTCATA-ACG-AAGGTTAATAACACCTt
gi|11 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaataagccgtaagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaaagtactgaaagtaattagacgaggatattgcaagtatcaaatgtgattttttttcaacaaatgataaataatatagtcttaataagcaagtttgatacttgaaggcaattgagcctcacctgatggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggattcatatcaatctaatctttgaatagtcaatagtcaacaaaaggagcatagactaaatgtgggacgcccgtttgactatctatcccagttctcattttagggcctaaAGAGTCAA--TAAATGTGGGTTTCCCAGGCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCA-CCTGAAAG---TTCGA-ATTTTCACAC--AAAGGTCATA-ACG-AATGTTAATttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatgtaataaaaaaacgattatacagggcaagacaacaacgtactcaagcaggtagagtcactaaatggggttccacaggcccttaaaggtaatttagctca
gi|10 : gcctgaagcagcagccactaaccagcagcaataagcccggtatgagctagcagccaataagaaaaatccatccaagtttactgaaagtacttacaggaggatattgaaagaatcaattaaacaatcacagattaaattttttcaaccaaataattaataaatattaagcgttttaattagcaagtttgatacttaaggcattgagctcactgatggtttaaatgatgcatacaacattgggtccccaaaaaggatgatatcagactacatcttgaatatcaataaaaggagcatagacaaaatgtacggacgcccttttgcatcctatctatcccccgttctgtcatttggcgcttcgAGAGTCAA--CAAATG-GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGTAATGTAGCTCACCC-GAAAG--TTTCG--ATTTTCATAC-----------------AAGGTTAATAACACCT
gi|29 : tgataatgctgagcgcgctctaaccagcacgccaataagcagaccgccaagaaataatccatgcaaagtactgaaagtacttaggacaaggatattggaaataattcaaacccaaagaaatccaatggtgataatttgtttttccaatcaaaataattaatgaaatatagggtccttattaggagcatgtttggatacctgaaggcaatgcggctcacaaccctggaattggtttcaaaatgatgggcaacacatggggtctaaaaaggataataatcaatctaaaattgttgaatagtcaccaaaagggagctagcccaaaatatggtagaaaggcccttttgggattatctaatcccgttccttcattttaggggcctaaATTTAGCTCC-CCTGAAAA--TTTCGA-ATTTTCAAGCATAAAGGTCATA-ACG-AAGGTCAATAACACCTtt
gi|5 : tGTAAAGTAGGGGTCATGTAATAA-------AAA----AACGATT--ATAC--AGGG-CAAGACAAC-------AACGTA-CTCAA-GCA---------GG-TAG-AGTCACTAAATG-GGGTTCCACAGGC-CCTTAAAGGTAATTTAGCTCA--
gi|26 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaataagccgtaagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaaagtactgaaagtaattagacgaggatattgcaagtatcaaatgtgattttttttcaacaaatgataaataatatagtcttaataagcaagtttgatacttgaaggcaattgagcctcacctgatggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggattcatatcaatctaatctttgaatagtcaatagtcaacaaaaggagcatagactaaatgtgggacgcccgtttgactatctatcccagttctcattttagggcctaaagagtcaataaatgggcttccacagacccttaaaggtaatttagctcacctgaaagtttcgaattttcatacataaaggtcataacgaaggttaataacacctttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcGCAAAGTAGGGGTCATGGAATCA-------AATCAAAAAC-ATTTTAT-A--AAGGACAAGACAA-C------AACG-AACTC----------AAGCAGA-TAG-AATCATT
gi|4 : gagttTAGGGGTGATGCAATGA-------AAA----ACC-AGTG-ATAA--C-GGACAAGAAAAC--------ATTAAAATCAA-ACAA---------A-CAC-ACTTGTTAAATA-GGGTTGCAAAGAC-CATTAAAGGCCGTTTAGCTCA--CCTGA---------------------AATTTT-C-AAGCATAAATGTCATAACGAAGAATTAATAACAACTTCACA
gi|17 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaataagccgtagaagctagcagccaataagaatccatcaaagtactgaaagtcttagacggacattgaaaataatcaaacaattcaaagtgatattttttcaaaataaataataaatatagtcttaattatcaagtttgattcttgaaggcaattgagctcacctgatacatgtaattcctaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaaggataatagaaatctattctttgaatagtcagcgaaaggagcagagacaaaatgtagcaggcccttttatctatctatccccgttttcattttggggttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggatTAGAAGTGATGCAATAA-------AAT----AGC-AGTG-ATTA--C-GGACAAGAAAAT-------AATAAAA-TCAA-ACAA---------A-CAC-ACTTGGTAAATG-AGGTTGGAAAGGC-CATAAAAAGCTGTTTAGATCA--CCTGAAAGTT-------------TCGAATTTT-TAACCATAAAA-GTCATAACGAAGAATTGATAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|3 : gggtaccaactggggccaaaagagggcggcgcaacatttcagacaatcgtggtgattggatGGGGTGATGCAATGA-------AAT----AAC-AGTG-ATAA--C-GGACAAGAAAACA------AATAAAA-TCAA-ACAA---------A-CAC-ACTTGTTGAATA-ACGTTGCAAAGAC-CATTTAATGCAGTTTAGCTCA--CCTGAA---------------------ATTTT-C-AAGCATGAATGTCATCACGGAG-ATTAATAAC---TTAACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTCGTAAAGTAGGGGTCATGGAAT-CAAACAACATTTATAAAGGGCAAGACA-ACAACG-AACTCAAG-----CAGAT---AGAGTC-ATTAAATAG-GA-TTTCACAGGCC--CCTTAAGGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTCCGAATTTTCACGAATAA
gi|2 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcaaccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagatgaggatattaaaaataatcaaacaatcaatcaaatgtgataattttttcaacaaataattgataaatgtagtcttaattatcaagtttgatacttgaaaggcaattgagctcacctgatagttccaaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaacatattctttgaatagtcagcgaaaggagcatagacataatgtaggaggcccttaagcttgtgactatctatccccattttcattgtggagttgaagggccggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgattggattagGCATGG--AA--ACAAAACAACCCTTTTAAGCACAGCACAACACAATCCAAGCAGA-TAG-AGTCACT-TATG-GGGTTCCATAGGC-CCTTAAGG--TATT-AGCTCACCGGTGAAAGTT-------------TCGAATTTTAC-AC---ATAAGGT-ATAACGAAA-G-TAATAAC-CTTTTACgtctagacgaagggttaataacatcttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatactagtaaagtggggtaggatcaggaaatcataggcacaacaaattatacaggcaagtaccaggcacgaactcaagcaagattagtagtcattaaatggggtccacagacgccttaacagttatttagctcacctgaaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatagagttcataacgaaggttaataacaccttt
gi|28 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgaggC------AACGAA-CTCAA-GCAA---------A-CGG-AGTCATTAAATG-GGGTTGCATAAAC-CCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|12 : attatactggaatcaaaggaAG-AGTCAATAAATG-AGCTTCCACAGGC-CCCTAAAGGTAATTTATCTCA--CCTGAAAGTT-------------TCGGATTTT-C-ATACATAAAGGTCATAACGAAG-GTTAATAACACCTT
gi|5 : ctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtatttagacgaggacaaacaaacaatcaaatgtgataattttttcaacaagtaattaataaatatagtcttaattagcaagtttgatacttgaaggcaattgagatcacctcaaggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaatctaaactttgaatagtcaacaaaaggagcatagacaaaatgtaggacgcccatttgactatctatccccgttctaattttggggcctaaAG-AGTCAATAAATG-GGCTTCCACAGAC-CCTTAAAGGTAATTTAGCTCA--CCTGAAAGTT-------------TCGAATTTT-C-ATACATAAAGGTCATAACGAAG-GTTAATAACACCTTTGC
gi|11 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaataagccgtaagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaaagtactgaaagtaattagacgaggatattgcaagtatcaaatgtgattttttttcaacaaatgataaataatatagtcttaataagcaagtttgatacttgaaggcaattgagcctcacctgatggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggattcatatcaatctaatctttgaatagtcaatagtcaacaaaaggagcatagactaaatgtgggacgcccgtttgactatctatcccagttctcattttagggcctaaAG-AGTCAATAAATGTGGGTTTCCCAGGC-CCTTAAAGGTAATTTAGCTCA--CCTGAAAG-T-------------TCGAATTTT-C-AC--ACAAAGGTCATAACGAAT-GTTAATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatgtaataaaaaaacgattatacagggcaagacaacaacgtactcaagcaggtagagtcactaaatggggttccacaggcccttaaaggtaatttagctca
gi|10 : gcctgaagcagcagccactaaccagcagcaataagcccggtatgagctagcagccaataagaaaaatccatccaagtttactgaaagtacttacaggaggatattgaaagaatcaattaaacaatcacagattaaattttttcaaccaaataattaataaatattaagcgttttaattagcaagtttgatacttaaggcattgagctcactgatggtttaaatgatgcatacaacattgggtccccaaaaaggatgatatcagactacatcttgaatatcaataaaaggagcatagacaaaatgtacggacgcccttttgcatcctatctatcccccgttctgtcatttggcgcttcgAG-AGTCAACAAATG-GGCTTCCACAGGC-CCTTAAAGGTAATGTAGCTCA--CCCGAAAGTT-------------TCG-ATTTT-C-AT--------------AC-AAG-GTTAATAACACCTTT
gi|8 : tgataatgctgagcgcgctctaaccagcacgccaataagcagaccgccaagaaataatccatgcaaagtactgaaagtacttaggacaaggatattggaaataattcaaacccaaagaaatccaatggtgataatttgtttttccaatcaaaataattaatgaaatatagggtccttattaggagcatgtttggatacctgaaggcaatgcggctcacaaccctggaattggtttcaaaatgatgggcaacacatggggtctaaaaaggataataatcaatctaaaattgttgaatagtcaccaaaagggagctagcccaaaatatggtagaaaggcccttttgggattatctaatcccgttccttcattttaggggcctaaTTAAAGG-----CAGTTCA--CCTGAA---------------------ATTTT-C-AAGCATAAATGCCATAACGAAGAATTAATAACAACTT
gi|29 : agactgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctaacagccaataagaaaacccatcaaagtattgaaaataatcaaagaatcaatcaaatgtgataattcaacaaataattaataaatatagtcttaattataaagtttgataattgaagcaattgagctcacctggagttccaaatgatgcaacacatgggtctaaaacaggataatagcaatctgttctttgaatagtcagcaaaaggagcatagacaaaacgtaggaggccctttttgactatctatactcgttttcattttggggttgaagagcaggggtatcaccaggggtctatttaagagagcggcaccaactttcagacaatcatggcgattggattaggggcgatgcaatgaaataacactgtgataacggacaagaaaacaataaaatcaaggaaacacaaTATTTAGCTCC--CCTGAAAATT-------------TCGAATTTT-C-AAGCATAAAGGTCATAACGAAG-GTCAATAACACCT
gi|5 : AACTCGTAAAGTAGGGGTCATGTAATA-AAAAAACGATTATACAGGGCAAGACA-ACAACG-TACTCAAG-----CAGGT---AGAGTC-ACTAAA-TGGGG-TTCCACAGGCC--CTTAAAGGTAATTTAGCTC
gi|2 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaataagccgtaagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaaagtactgaaagtaattagacgaggatattgcaagtatcaaatgtgattttttttcaacaaatgataaataatatagtcttaataagcaagtttgatacttgaaggcaattgagcctcacctgatggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggattcatatcaatctaatctttgaatagtcaatagtcaacaaaaggagcatagactaaatgtgggacgcccgtttgactatctatcccagttctcattttagggcctaaagagtcaataaatgggcttccacagacccttaaaggtaatttagctcacctgaaagtttcgaattttcatacataaaggtcataacgaaggttaataacacctttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGGTCATG-AA-GCAA-CAAACCTTATAAAG-----GCCAGACAACGTAAGCTCAG------CAGT---AGA-GC-ACTAA----TGA-GTTCACA-GCAGCCTTAAAGGTATTTAAGCTCA-CTGAAA-TTTCGAATTTTCACA-ATAAAGGTC-ATAACGAAa
gi|4 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtGGGTGATGCAATG-AAAAACCAGTGATAACGGACAAGAAA-ACATTA-AAATCAAACAAACACACT---TG--TTAAATAG-----GG-TTGCAAAGACC--ATTAAAGGCCGTTTAGCTCACCTGAAA--------TTTTCAAGCATAAATGTC-ATAACGAAGAATTAATAACAACTTCACggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|11 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaataagccgtagaagctagcagccaataagaatccatcaaagtactgaaagtcttagacggacattgaaaataatcaaacaattcaaagtgatattttttcaaaataaataataaatatagtcttaattatcaagtttgattcttgaaggcaattgagctcacctgatacatgtaattcctaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaaggataatagaaatctattctttgaatagtcagcgaaaggagcagagacaaaatgtagcaggcccttttatctatctatccccgttttcattttggggttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggattagG-----GCGCTTCGAGAGTC-AATAAA-TGTGGGTTTCCCAGGCC--CTTAAAGGTAATTTAGCTCACCTGAAAG-TTCGAATTTTCA--CACAAAGGTC-ATAACGAATG--TTA-Aannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|12 : gcctgaagcagcagccactaaccagcagcaataagcccggtatgagctagcagccaataagaaaaatccatccaagtttactgaaagtacttacaggaggatattgaaagaatcaattaaacaatcacagattaaattttttcaaccaaataattaataaatattaagcgttttaattagcaagtttgatacttaaggcattgagctcactgatggtttaaatgatgcatacaacattgggtccccaaaaaggatgatatcagactacatcttgaatatcaataaaaggagcatagacaaaatgtacggacgcccttttgcatcctatctatcccccgttctgtcatttAATAAA-TGAGC-TTCCACAGGCC--CCTAAAGGTAATTTATCTCACCTGAAAGTTTCGGATTTTCATACATAAAGGTC-ATAACGAAGG--TTA-AT-AAC---ACCTt
gi|5 : ctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtatttagacgaggacaaacaaacaatcaaatgtgataattttttcaacaagtaattaataaatatagtcttaattagcaagtttgatacttgaaggcaattgagatcacctcaaggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaatctaaactttgaatagtcaacaaaaggagcatagacaaaatgtaggacgcccatttgactatctatccccgttctaattttggggcctaaagagtcAATAAA-TGGGC-TTCCACAGACC--CTTAAAGGTAATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCATACATAAAGGTC-ATAACGAAGG--TTA-AT-AAC---ACCTt
gi|10 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaataagccgtaagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaaagtactgaaagtaattagacgaggatattgcaagtatcaaatgtgattttttttcaacaaatgataaataatatagtcttaataagcaagtttgatacttgaaggcaattgagcctcacctgatggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggattcatatcaatctaatctttgaatagtcaatagtcaacaaaaggagcatagactaaatgtgggacgcccgtttgactatctatcccagttctcattttagggcctaaagagtcAACAAA-TGGGC-TTCCACAGGCC--CTTAAAGGTAATGTAGCTCACCCGAAAGTTTCG-ATTTTCATAC---AAGGTTAATAACttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatgtaataaaaaaacgattatacagggcaagacaacaacgtactcaagcaggtagagtcactaaatggggttccacaggcccttaaaggtaatttagctca
gi|17 : tgataatgctgagcgcgctctaaccagcacgccaataagcagaccgccaagaaataatccatgcaaagtactgaaagtacttaggacaaggatattggaaataattcaaacccaaagaaatccaatggtgataatttgtttttccaatcaaaataattaatgaaatatagggtccttattaggagcatgtttggatacctgaaggcaatgcggctcacaaccctggaattggtttcaaaatgatgggcaacacatggggtctaaaaaggataataatcaatctaaaattgttgaatagtcaccaaaagggagctagcccaaaatatggtagaaaggcccttttgggattatctaatcccgttccttcattttaggggcctaaagagtcTTTAGATCACCTGAAAGTTTCGAATTTTTAACCATAAAAGTC-ATAACGAAaccttt
gi|29 : gggtaccaactggggccaaaagagggcggcgcaacatttcagacaatcgtggtgattggattagaagtgatgcaataaaatagcagtgattacggacaagaaaataataaaatcaaacaaacacacttggtaaatgaggttggaaaggccataaaaagctgTTTAGCTCCCCTGAAAATTTCGAATTTTCAAGCATAAAGGTC-ATAACGAAGG--TCA-AT-AAC---ACCTgaattgataac
gi|6 : taAGCTCACCTAAAAGTTTCAAA---TGATGCAT
gi|20 : tggtgatggaagctgcattcgcagtgattgttcagctggcctcctccgatgtcattgcaaaagtctactaggttaaacctagcagtcattaaccagcagataataagcccgtcgaagctagcagtcaataaggaaattcatcaaagtactgaaagtacttacacagaaatactgaagattattaaacaatcgatcaaatttgatattttttaaacaaataatcaataaagatattcctgattataaagtttgatacttggattcaacaaAGGGTCTAGGTTAGAGCATTTTTAACTTGGAACATCTCATTTGG-GC-AATGAATTcgcatggttcccaatgaaagttaatgacaattcaatctatggagggtcgaaaaaaagagcgtagacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattgggccttaagagggcaaggcaacttgacagatccatgtaatggttgaatggtgatgaaggaatgaaacaatagttataatgggtaagacaacaacagagccaaatagacagagagagtcgttaaatagggttcataggtctataagggatattgaatcca
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): GCTAGCAGCCAACTAACCCCACAGTCAACAATAAGCCGTAGAAGCTGTATACCAAAAAATGAAATTCAGCCAAGTTTAAAGCAAACTGATATT
Unaligned ( gi|27 ): TAGGGGCCAGGTTATAGAATTTTTAACTGGGATTATCTGATTTGGGCAATAAATTCATTCAATCCTTGCCTTTCATTGGAAG
Unaligned ( gi|30 ): AGCCAGCAGCTAATAAGCCCATATAAGCCAGCAGCCAATAAGCC
Unaligned ( gi|31 ): AGGCTGAAGCTAGCAGCCACTAACAGCAGCCAATAAGCACG
Unaligned ( gi|32 ): ACGAAAGTTAGCAGCCACTAACCAGCAACCAATAAG
Unaligned ( gi|33 ): CTGTTGTAACAATTATATGATTTGGATAAATACCA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111111111 1111 6666666666 11111111111 111 11111 1111111 1 111111111 11 11 33 33 33333 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22 22222 11 11 11 2 2 2 44 2 2 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111111 11 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 22222 1 1 2 11 222 4444444444444 1 5555555555555 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 111 11 111 111 1 1 1 222 111 1 1
lowQualScore : 444 2 7 55555 666 4444 2 2 6666 2 444 33 2 2 2 33 4444 3333333333333 2 0 2 8888888888 333 8888 33 6666 333333 7777 99999999 1 2 2 666666 2 666666 7777777777 6 2 88888 2 333 88888888 33 2 55555 88888888888 2 33 2 33 33 2 4 66 99 5 2 2 2 000 2 22222 2 2 1 5555555 4 2 2 555 3 444444444 6 7777 44 77 44 44 3 3 00 55 5 4 1 77 1 55 1 33 88888 6 3 2 8 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 55 1 1 99999 3 6 44 2 33 3 2 888 1 3 22 6 77 8888 0 88 0 0 0 77 0 0 5 4 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 1 7 6 1 4 1 777 5 1 66 2 9999 111111111 2 1 7 3 0 3 1 66 99 2 1 1 1 5 6 1 6 6 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 6 1 6 1 77777 1 3 1 3 3 44 333 7 6 3333333333333 11 7 0 3 3 1 6 1 5555555555555 3 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 1 8 8 8 0 66 11 555 0 0 0 8 11 1 1 0 0 8 5 66 8 22 666 6 2 3 2 999 3 33 9 0 8 0 6 333 7 3 6 888 6 3 3
lowQualScore : ... . . ..... ... .... . . .... . ... .. . . . .. .... ............. . . . .......... ... .... .. .... ...... .... ........ . . . ...... . ...... .......... . . ..... . ... ........ .. . ..... ........... . .. . .. .. . . .. .. . . . . ... . ..... . . . ....... . . . ... . ......... . .... .. .. .. .. . . .. .. . . . .. . .. . .. ..... . . . . ....................................................................................................................................... .. . . ..... . . .. . .. . . ... . . .. . .. .... . .. . . . .. . . . . ........................................................................................................................................... . . . . . . . ... . . .. . .... ......... . . . . . . . .. .. . . . . . . . . . .............................................................................................................................. . . . . . ..... . . . . . .. ... . . ............. .. . . . . . . . ............. . ...................................................................................................................................... . . . . . . .. .. ... . . . . .. . . . . . . .. . .. ... . . . . ... . .. . . . . . ... . . . ... . . .
lowQualScore : 111 4 1 66666 111 2222 0 0 2222 0 111 22 4 4 4 22 7777 2222222222222 2 8 2 1111111111 999 1111 11 1111 555555 4444 99999999 6 0 1 111111 0 444444 1111111111 7 2 66666 2 999 11111111 11 2 22222 33333333333 2 11 2 22 11 4 7 33 00 3 7 7 7 444 7 11111 7 7 0 3333333 1 9 9 888 3 666666666 7 1111 66 99 66 66 6 6 00 55 0 0 4 99 0 88 7 33 00000 7 2 5 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 0 0 33333 7 7 00 5 88 2 5 888 0 2 00 5 88 3333 7 55 0 0 0 55 0 0 0 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 0 3 7 0 7 0 111 3 1 33 6 4444 444444444 0 1 6 4 2 0 7 00 22 5 5 0 0 2 7 0 3 5 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 7 0 7 0 77777 0 3 0 3 7 00 333 3 7 3333333333333 77 3 7 3 7 0 5 0 0000000000000 2 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 2 0 0 8 8 44 66 666 8 8 8 8 88 0 0 8 8 0 8 44 8 22 000 6 5 2 5 888 2 55 2 0 8 0 0 333 0 7 7 777 7 3 3
consensus : CATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------A--CGAGG-ATATT-GAAANTAAT-C---AAAC---AATCG-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-CAAAATAA-TTAAT-AAA------TA-TA---G--TCTTAATTA--AAG-TC-AAGTTTG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA---TA------G-TTC--CAAA-TGATG--CA-AC-ACA-TGGGT--CCT--AA-AA-A-GGAT-AATA-N-CA-ATCTAA--TTCTTTGA-ATAGT-CAACG------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TT----T--TG--A--C--TATCTAT-C-CCCGTTC--TCATTTT-GGGGGCTT-AAAGAGTCAATAAA--TGGGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGT-AATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCG-AATTTTCA-ACACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACT-CGTAAAGTAGGGGTCGTGGAATCAAAC----AACGTTTTATACGGGA--CAAAGACAAACAACGAACTCAAGCAGA-TAGAGTCATTAAATGGGGTTNCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAGTTTTTCGACATTTTCACACATAAAGGTCATAACGGAAGGTNAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTGGTTGAAGTAGGGGTGATGNAATGAAACAACANTG--ATAACGGACAAGACAACAACGAANTCAA----GCAGACAGAGTCG-TTAAATGGGGTTNCANAGGCCCTTAAAGGCNGTTTAGCTCACC--TGAAAGTTTCGAATTTTCACGCATAAANGTCATA-ACGAAGGATTAATAACANCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAACAGTGGGGTAGGGGTCATGNAATCA-A---ACAAC-ANTG-ATAAA-GGACAAGA-AACCA---ACGAAACTCAAGCAA-----ANATAG-AGTCGTTAAATGGGGTTCCACAGAC-CCTTAAANGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTCGTAAAGTAGGG-GTC-ATGAAATGCAAAAAACGNTTATAAAGGGCAAGACAACAACGAACTCAA-GNCGGTAGAGTC-ANTAAATGGGATTCCACAG--GCCCTTAAAGGTATTTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCACGCATAAAGGTCATA-ACGAA-GGT-AATAAC---ACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGGCTAGGTTANAGCATTTTTAACTTGGA-CATCTGATTTGG-GC-AATGAATT
Reference ( family-675 ) : CATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------A--CGAGG-ATATT-GAAANTAAT-C---AAAC---AATCG-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-CAAAATAA-TTAAT-AAA------TA-TA---G--TCTTAATTA-CAAGTTT-AAGTTTG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA---TA------G-TTC--CAAA-TGATG--CA-AC-ACA-TGGGT--CCT--AA-AA-A-GGAT-AATA-T-CA-ATCTAA--TTCTTTGA-ATAGT-CANCG------AAAGGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TT----T--TG--A--C--TATCTAT-C-CCCGTTC--TCATTTT-GGGGGCCT-AAAGAGTCAATAAA--TGGGNTTCCACAGGCCCTTAAAGG--AATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAAATTTTCA-ACGCAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACT-CGTAAAGTAGGGGTCATGNAATNAAAT----AACGTTTGATAANGGA--CAAAGACAAACAACGAANTCAAGCAGA-CAGAGTCANTAAATGGGGTTCCACAGGCCCTTAAAGGTAA-TTTAG-CTCA-CCTGAAAG--TTTCGA-ATTTTCA-ACATAAAGGTCATAACGAAAGGTTAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAACTNGTTAAAGTAGGGGTGATGNAATGAAACAACANTN--ATAANGGACAAGACAACAACGAANTCAA----GCAGATAGAGTCG-TTAAATGGGGTTNCACAGGCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCACC--TGAAAGTTTCGAATTTTCANGCATAAAGGTCATA-ACGAAAGGTTAATAACACCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAA-AGTAAAGTAGGGGTNATGCAATNA-A---ANAAC-ANTG-ATAAAAGGACAAGACAACCA---ACGAAACTCAAGCAA-----AGACAG-AGTCGNTAAATGGGGTTCCACAGGC-CCTTAAAGGTNATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCANGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTCGTAAAGTAGGG-GTC-ATGNAATGCAAANAACGNTTATAAAGGGCAAGACAACAACGAANTCAA-GNCGNTAGAGTC-AATAAATGGGNTTCCACAG--GCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCANGCATAAAGGTCATA-ACGAA-GGTTAATAAC---ACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGTCTAGGTTAGAGCATTTTTAACTTGGAACATCTCATTTGG-GC-AATGAATT
gi|1 : CATAAA---CCCG-TAAG-----AAG---CTA----GCAAG-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------A--CGAGGGATATT-GAAATTAAT-C---AAAC---AAACA-ATC--AAAATG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-CAAAATAAATTAAT-AAA------TA-TA---G--TTTTAATTG-CAAGTTTTAAATTTG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA---TG------G-TTT--CAAA-TGATG--CA-AC-AAA-TGGGT--CCT--AA-AA-A-GGAT-GATA-TTCA-ATCTAA--TTCTTTGA-ATATT-CAATA------AAAGAAAGCATA-GAC-AAAAC---ATA-GGA-C-------GCCC-TT----T--TG--A--C--AATCTAT-C-CC-GTTC--TCATTTTTGGGGGCTTCAAAGAGACAATAAA--TGGGCTTCCACAGGCCCTTAAGGG--AATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAAATTTTCA-ACACATAAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTGCGTAAAGTAGGGGTCATGGAATCAAAC----AACGTTTGATGCAGGA--CAAAGACAAACAACGAACCCAAGCAGA-TAGA-TCACTAAATGGGGTTCCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAGT-TTTCGA-ATTTTCA-ACATAAAGGTCATAACGAAAGGTTAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTAGTTAAAGTAGGGGTCATGGAAT-CAACAACATGG--ATAAAGGACAAGACAACAACGAACTCAA----GCAGATAGAGT-A-TTAAATGGGGTTCCACAGGCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCAAC---GAAAGTTTCGAATTTTCACACATAAAGGTCATA-ACGTAAGGCTAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACAGTAAAATAGGGGTCATGGAATCA-A---ACAAC-ATTGCATAAAAGGACAAAACAACCA---ACGAAACTCAAGCAATAAGCAGATAG-AGTCATTAGATGGGGTTCCACTGGC-CCTTAAAGGTTATTCAGCTCAAATGAAGGTTTCGAATTTTCACGA-------------AAAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTTGTGAAATCAGG-GTT-AT-AAATGTAAACAATAGTGATAAAATGCAAGCCAACAACAAAGTTAA-GGCGTTAGA-TCGAATAAAAGTGATTTCATAT--GCACTTAAAGGTATTTTAGCTCGCCTGAAAGTTTCGAATTTTCATGCATAAAAGTTATA-ACTAA-TATAAAAAACTTAACCT
gi|1 : AGGGGCTAGGTTAAACCATTTGTAA--TGA---ATCGGGTTTGGTGCTAATGAATTaatgaaatgaatataggcaacagctagccgggagagctgacttgactatcattttccgccttcagtttatcacagtacgagtaccacttgaaggttgggactttgtgatctctgtatcatatgaacaaagggagcgtttttgcgcttaacacgaaggtgatggcttgttcgtaatgataggggctaggttaaaccatttgtaatgaatcgggtttggtgctaatgaatt
gi|10 : cataaacccgtaagaagctagcaagccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagacgagggatattgaaattaatcaaacaaacaatcaaaatgtgataattttttcaacaaaataaattaataaatatagttttaattgcaagttttaaatttgatacttgaaggcaattgagctcacctgatggtttcaaatgatgcaacaaatgggtcctaaaaaggatgatattcaatctaattctttgaatattcaataaaagaaagcatagacaaaacataggacgcccttttgacaatctatcccgttctcatttttgggggcttcaaagagacaataaatgggcttccacaggcccttaagggaatttagctcacctgaaagtttcgaaattttcaacacataaaaggtcataacgaaggttaataacacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgcgtaaagtaggggtcatggaatcaaacaacgtttgatgcaggacaaagacaaacaacgaacccaagcagatagatcactaaatggggttccacaagcccttaaaggtgattttagactcatcctgaaagttttcgaattttcaacataaaggtcataacgaaaggttaataacacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaactagttaaagtaggggtcatggaatcaacaacatggataaaggacaagacaacaacgaactcaagcagatagagtattaaatggggttccacaggcccttaaaggtaatttagctcaacgaaagtttcgaattttcacacataaaggtcataacgtaaggctaataacacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacagtaaaataggggtcatggaatcaaacaacattgcataaaaggacaaaacaaccaacgaaactcaagcaataagcagatagagtcattagatggggttccactggcccttaaaggttattcagctcaaatgaaggtttcgaattttcacgaaaaaaggtcataacgaaggttaataacacctttacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagacctctttaacttgtgaaatcagggttataaatgtaaacaatagtgataaaatgcaagccaacaacaaagttaaggcgttagatcgaataaaagtgatttcatatgcacttaaaggtattttagctcgcctgaaagtttcgaattttcatgcataaaagttataactaatataaaaaacttaacctaatgaaatgaatataggcaacagctagccgggagagctgacttgactatcattttccgccttcagtttatcacagtacgagtaccacttgaaggttgggactttgtgatctctgtatcatatgaacaaagggagcgtttttgcgcttaacacgaaggtgatggcttgttcgtaatgatA----GCA-GACCGC----C-AAGA---AATAA-TCCATGCAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAGG------A--CAAGG-ATATT-GGAAATAATTC---AAACCCAAAGAA-ATC--CAA-TGGTGAT--AA--TTTGTTTTTCC---AATCAAAATAA-TTAATGAAA------TA-TA---GGGTCCTTATTA-GGAGCAT---GTTTGGA-TACCT-----G-AAGGCAA---T--------GC--GGC-TCACAACCCTGGAATTG------G-TTT--CAAAATGATGGGCA-AC-ACA-TGGGG--TCT--AA-AA-A-GGAT-AATAAT-CA-ATCTAAAATTGTT-GA-ATAGT-CACCA------AAAGGGAGC-TA-GCCCAAAATATGGTA-GAAAG-------GCCC-TT----T--TGGGA--T--TATCTAA-T-CCCGTTCCTTCATTTT-AGGGGCCT-AAAGAGTCAACAAA--TGGGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGT-AATGTAGCTCACCCGAAAGTTTCG--ATTTTCATAC------------------AAGGTTAATAAC-ACCTTT
gi|11 : tgataatgctgagcgcgctctaaccagcacgccaataATAAG---CCCGGTA-T-----GAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--AATCCAT-CCAA-GTTTACTGAAAGTACT----TAC-------A--GGAGG-ATATT-GAAAG-AAT-C---AATT---AAACA-ATC--ACA-----GATTAAA--TTT----TTTC---AA-CCAAATAA-TTAAT-AAA------TATTAAGCG--TTTTAATT----AG--C-AAGTTTG-A-TACTT-------AAGGC-A---T--------TG--AGC-TCA-----CTGA---TG------G-TT---TAAA-TGATG--CATACAACATTGGGTC-CCC--AA-AA-A-GGAT-GATA-T-CA-GACTAC--ATC-TTGA-ATA-T-CAAT-------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTACGGA-C-------GCCC-TT----T--TGC-ATCC--TATCTATCC-CCCGTTCTGTCATTT---GGCGCTT-CGAGAGTCAATAAATGTGGGTTTCC-CAGGCCCTTAAAGGT-AATTTAGCTCACCTGAAAG-TTCG-AATTTTCA----CAC-AAAGGTCATAACGAATGTTAAT
gi|12 : gcctgaagcagcagccactaaccagcagcaATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTATT----TAG-------A--CGAGG-A---------------C---AAAC---AAACA-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-C-AAGTAA-TTAAT-AAA------TA-TA---G--TCTTAATT----AG--C-AAGTTTG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGA-TCAC----CTCA---AG------G-TTT--CAAA-TGATG--CA-AC-ACA-TGGGT--CCTA-AA-AA-A-GGAT-AATA-T-CA-ATCTAA---ACTTTGA-ATAGT-CAAC-------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-C-------GCCC-AT----T--TG--A--C--TATCTAT-C-CCCGTTC--TAATTTT--GGGGCCT-AAAGAGTCAATAAA--TGAGCTTCCACAGGCCCCTAAAGGT-AATTTATCTCACCTGAAAGTTTCG-GATTTTC--ATACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTT
gi|13 : ctgaagctagcagccactaaccagcagccaA-TA---G--TCTTAATTA------TC-AAGTTTG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGT-TCAC----CTGT---TT------G-TTC--CAAA-TGATG--CA-GC-ACA-TGGGT--CCT--AA-AA-A-GAAT-AATA-G-CA-ATCT-A--TTATTTGA-ATAAT-CAGCG------AAA-GGAGCATA-GAC-AAAAT---GTG-GGA-G-------GCCA-TT----T--TG--A--C--TATCTAT-C-CCCGTTT--TCATTTT-GGGG
gi|13 : TGATTGGATTAGGGGTGATGCAATGAACTAACAGTG--ATAACGGACAAGAAAACAA--------A----ACACAC----TTG-TTAGATAAGGTTACAAAGACCttgaaggaccggggtacaacctgagacttatttaagagagcggcgccaactttcagacaatcatggtgattggattaggggtgatgcaatgaactaacagtgataacggacaagaaaacaaaacacacttgttagataaggttacaaagaccata
gi|14 : atagtcttaattatcaagtttgatacttgaaggcaattgagttcacctgtttgttccaaatgatgcagcacatgggtcctaaaaagaataatagcaatctattatttgaataatcagcgaaaggagcatagacaaaatgtgggaggccattttgactatctatccccgttttcattttggggttgaaggaccggggtacaacctgagacttatttaagagagcggcgccaactttcagacaatcatggATAAG---CCCG-TA-G-----AA-----TA----GT----CCAA-------------AA--A-TTCAT-CGAA-GT--ACTGAGAGTACT----CAG-------A--C-AGA-ATACC-AAAATTA-T-T---AAAC---AATCG-ATC--AAA-AT-TGAT--AT--TTT----TTCT---AA-CAA------TTGAT-CAA------CA-TC---T--TCTAAATTA------TC-AAGTTTA-A-TACAT-----G-AAGGCAA---C--------TG--AGC-TAAT----CTGA---AA------G-TTC--CAAA-TGATA--CA-CC-ACA----------T--AATAA-A-GGTT-AATA-A-TA-ATCTAA--TT-TTTCA-GGAGT-CAACG------AAA-GGAGCATA-GAC-Aata
gi|15 : actaggttgaatctagcagccacaaacctgcagtcatcaagcctttagaatctagcagccactaatcagttgccaCATTAC---CCCG-CA-GCCAATAAGTACCTA----GCA-G-TCAA----T-AAGA---AA--A-TTCAT-CAAC-GT--ACGGACAGTACC----CGG-------A--CTTAA-A-ACT-GAAAATAAT-C---AAAC---AATCG-AT-----------------A--TTT----TTCC--------AAACAA-TTAAT-CAA------CA-TA---T--TGTTAAT----AA--TG-AAATTTG-A-TACTT-----C-AAGGCAA---TTACCGGGATA--AGC-TCAC----CTGA---AA------G-TAC--CAAA-Tc
gi|16 : accagactgaagctagcagcA----GTG-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-ATCAT-CAAA-GT--ACTGAGAGTACT----CAG-------A----------ATT----------------------------AGC--AAA-TG---AT--AA--TTT----GTC---------AAATGA-TTAAT-TAA------CA-CA---T--TCTTAATCA-------T-AAGTTCT-A-TACCT-----G-ACGACAA---T--------TG--AGC-TCAC----ATCA---CAAAG---G-TTC-----A-TAATG---A-A--------GGT----T--AA-AA-A-------------CA-ATATAA---TCTTTGA-AGAGT-CCACG------AAAAGAAttcatctccagatgaagtccttattcggtttttttctttggaataaaataacaga
gi|17 : ctttcagcagctactaacaattaTGATTGGATTAGAAGTGATGCAATAAAATAGCAGTG--ATTACGGACAAGAAAATAATAAAATCAA----ACAAACACACTTG-GTAAATGAGGTTGGAAAGGCCATAAAAAGCTGTTTAGATCACC--TGAAAGTTTCGAATTTTTAACCATAAAAGTCATA-ACGAAGAATTGATAACtatgaaaacgaggtagtggaatccttcagctatgta
gi|18 : gggtaccaactggggccaaaagagggcggcgcaacatttcagacaatcgtggATAAA---CCCG-TA-G-----A----------------G-CCAAG---T-AAGA---AA--A-TC-AT-CAAA-GT--ACCGAAAGTACT----CAG-------A---GAGA-ATATTCAAAATTAGT-CT--AGAT---ACTCGTATG--GAC-CT-TGGT--AGACTCT----TTTC---A---AAGATAA-
gi|19 : ctgtcgcagaaattacatgaatcgaaactagcaggcactatctagcagcca--TTT----TTTC---AA-C-AAATAA-TTAAT-AAATACATGTA-TA---G--TCTTAATT----AG--C-AAGTTTG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAT----CTGA---TA------G-TTC--CAA-----------------A-TGGGT--CCT--AA-A---------AATA-G-CA-ATCT-A--TTCTTTGA-ATAGT-CATCG------AAA-GGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GACC-TT----T--TG--A--C--TATCTAagtttgtattaaccttcattatctaaaattaggaacgttccgataagcgcaatt
gi|2 : atCATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CCA----G-A-G-CCAA-------AGA---AA-----TCAT-CAA--GT--ACTGAA-GTACT----TAG-------A--GGAGG-ATATT-GAAAG--AT-A---CAAC---AAACA-ATC--AAA----TAAT--AA--TTT----CCTT------CAAAATAA-TTGAC-TAA------T--TA---G--TCTT-ATTG-C-----C-AAGTTTGAA-TACTTCA---T-AGGGCAA---T--------TG---GC-TCAG----ATGA----G------G-TTT--TAAA-TGATG--C--AC-AGATTTGGTTCCCT------A-A-GCAT-TATA-C-CA-ATCT-A--TACTTTGA-ATAGTCCAAC--------AAAGGAGCACATGAG-CAAAT---GTA--GA-C-------GCCCGTT----C--TG--A--T----TCTCT-C-CCATTTC--TCATTTT---TGGCCT-AAAGA-TCACT-AA--TGGGGTTCCACATTCTCCTAAAGGTCTACTTAGCT-ACC-GAAAGTTTCG--ATTTTC---CACAT-A---GT-ATAACGAAGGTAAATAACTACCTTTAC
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagcGAAACAAAACAACCCTT--TTAA-GCACAGCACAACA-C-AATCCAA----GCAGATAGAGTCACTTA--TGGGGTTCCATAGGCCCTT-AAGGTA--TTAGCTCACCGGTGAAAGTTTCGAATTTT-ACACAT-AAGGT-ATA-ACGAAAG--TAATAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatgAACT---TAAAGATGGGGTCGTGGAATCAAAC----AACCTCTTATAAGG-----AAAGACACA-AACGAAATCA-GCAGAATAGAGTC--TAAATGAG---TCACAGGCCTT--AAGGTAA-TTTAG-CTCA-CCTGAAAATTTTTCGACATTTTCACACATAAA-GTCATAACGGAAGGTAAATAACcttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntAGTAGGG--TC-ATGAA--GCAACAAAC-CTTATAAAGGCCA-GACAACG-TAAGCTCA---GCAGTAGAG-C-ACTAA-TGAGTT--CACAGCAGCC-TTAAAGGTATTTAAGCTCAC-TGAAA-TTTCGAATTTTCACA-ATAAAGGTCATA-ACGAA-GGTcgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtAACT-GTTAAGTAGGGTGTCCATG-AAT-CAACAAA--TTTATAA-GTCCAAGACAACAACGAA-TCAGCGACGAT-GAGTC-AATA--TGGG--TCCACA----CCCTTAAATGTGTATTAGCTCACCTG-AAGTTTCGAATTTCCA--CA-ATAGGTCCTA-AC-AA-GGT--ATAAC---Aatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|20 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGGTCTAGGTTAGAGCATTTTTAACTTGGAACATCTCATTTGG-GC-AATGAATT
gi|21 : c-----AAG---C-A----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AT--A-TGCAT-CAAA-GT--ACTGAGAGTACTAGTCTAGTACTCGAA--CG-GA-ATAAC-AAAAAGTAG-C---AAAT---AATCA-ATCAAAAA-T--TGAC--AA--TTT----TCCA---AA-CA----AA-TTAAG-AAA------CA-TA---cactcgatccatgctttttatagggaaggctgcaatcctacgagccccttttttatgtccaaacgctagggggtagtaaccagctggtg
gi|22 : ATAAA---CTCA-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAG
gi|22 : aagctagcagccaataaacccatggaagccagcagcaaATAAG---CCCC-TG-G-----AAG---CCA----GCA-G-CCAA----T-AGGcccctggaagccagcagccaataggctatgaaaagctagcagcaaataagcc
gi|23 : aagctagcagccaataaacccatggaagccagcagcaaataaactcatagaagctagcagccaAAAACAA-TTTAT-AAG------CA--A---A--TCTTAATTA--AA--TC-AAGTTTG-AATACTT-----G-AAAACAA---C--------TG--AGC-TTA-----CTGA---AA------G-TTTTGCTAA-TGTTA--CA-TC-AAA-Tctatgaaaagctagcagcaaataagcc
gi|24 : tACT----CAG-------A--CG-GG-ATATT-AACACTAAT-TGTTAAAA---AATGG-ACC--AAA-AT-TGAT--AA--GTT----TTTCT--AA-CA---T---TTGAT-AAA------TA-TA---C--TGATAATCATCAAGTTT-GAactgtcgaaatgaggattaat
gi|26 : T-TGCAAAGTAGGGGTCATGGAATCAAATCAAAAACATTTTATAAAGGA--CAA-GACAA-CAACGAACTCAAGCAGA-TAGAATCATTt
gi|27 : gagAGGGGCCAGGTTATAGAATTTTTAACTGGGATTATCTGATTTGG-GC-AATAAATT
gi|28 : tATACTGGAATCAAAGG---ACAACGAACTCAAGCAAA-CGGAGTCATTAAATGGGGTTGCATAAACCCTcattcaatccttgcctttcattggaag
gi|29 : attATTTAGCTCCCCTGAAAATTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTCAATAACACCT
gi|3 : tATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-A-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------A--TGAGG-ATATT-AAAAATAAT-C---AAAC---AATCA-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-C-AAATAA-TTGAT-AAA------TG-TA---G--TCTTAATTA------TC-AAGTTTG-A-TACTT-----GAAAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA---TA------G-TTC--CAAA-TAATG--CA-AC-ACA-TGGGT--CCTA-AA-AA-A-GGAT-AATA-T-CA-ACAT-A--TTCTTTGA-ATAGT-CAGCG------AAA-GGAGCATA-GAC-ATAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TTAAGCTTGTG--A--C--TATCTAT-C-CCCATTT--TCATTGT-GGAG--TT-GAAGGGCC
gi|3 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaGGGGTGATGCAATGA-A---ATAAC-AGTG-ATAAC-GGACAAGAAAACAA---ATAAAA-TCAAACAA-----ACACAC---TTGTTGAATAACGTTGCAAAGAC-CATTTAATGCAGTTTAGCTCACCTGAAA--------TTTTCAAGC-------------ATGAATGTCATCACGGAGATTAATAAC---TTAACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTCGTAAAGTAGGG-GTC-ATGGAAT-CAAACAACATTTATAAAGGGCAAGACAACAACGAACTCAA-GCAGATAGAGTC-ATTAAATAGGATTTCACAG--GCCCCTTAAGGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTCCGAATTTTCACGAATAA--GTC-TAGACGAAGGGTTAATAAC---ATCTggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgattggattagggggtgatgcaatgaaataacagtgataacggacaagaaaacaaataaaatcaaacaaacacacttgttgaataacgttgcaaagaccatttaatgcagtttagctcacctgaaattttcaagcatgaatgtcatcacggagattaataacttaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatggaatcaaacaacatttataaagggcaagacaacaacgaactcaagcagatagagtcattaaataggatttcacaggccccttaaggttatttagctcacctgaaagttccgaattttcacgaataagtctagacgaagggttaataacatcttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatactagtaaagtggggtaggatcaggaaatcataggcacaacaaattatacaggcaagtaccaggcacgaactcaagcaagattagtagtcattaaatggggtccacagacgccttaacagttatttagctcacctgaaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatagagttcataacgaaggttaataacaccttt
gi|3 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcaaccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagatgaggatattaaaaataatcaaacaatcaatcaaatgtgataattttttcaacaaataattgataaatgtagtcttaattatcaagtttgatacttgaaaggcaattgagctcacctgatagttccaaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaacatattctttgaatagtcagcgaaaggagcatagacataatgtaggaggcccttaagcttgtgactatctatccccattttcattgtggagttgaagggccggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgattggattagAACTCGT-AAAGTAGGGGTCATGGAATCAAACAACATTT--ATAAAGGGCAAGACAACAACGAACTCAA----GCAGATAGAGTCA-TTAAATAGGATTTCACAGGCCCCTTAAGGTTATTTAGCTCACC--TGAAAGTTCCGAATTTTCACGAATAA--GTC-TAGACGAAGGGTTAATAACATCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAA-AGTGGGGTA-GGATCAGGAAATCATAGGCACAACAAATT-ATACA--GGCAAG--TACCAGGCACG-AACTCAAGCAA-----GATTAGTAGTCATTAAATGGGG-TCCACAGACGCCTTAACAGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAATAGAGTTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTtgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatactagtaaagtggggtaggatcaggaaatcataggcacaacaaattatacaggcaagtaccaggcacgaactcaagcaagattagtagtcattaaatggggtccacagacgccttaacagttatttagctcacctgaaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatagagttcataacgaaggttaataacaccttt
gi|30 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcaaccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagatgaggatattaaaaataatcaaacaatcaatcaaatgtgataattttttcaacaaataattgataaatgtagtcttaattatcaagtttgatacttgaaaggcaattgagctcacctgatagttccaaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaacatattctttgaatagtcagcgaaaggagcatagacataatgtaggaggcccttaagcttgtgactatctatccccattttcattgtggagttgaagggccggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgattggattagggggtgatgcaatgaaataacagtgataacggacaagaaaacaaataaaatcaaacaaacacacttgttgaataacgttgcaaagaccatttaatgcagtttagctcacctgaaattttcaagcatgaatgtcatcacggagattaataacttaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAG---CCCA-TA-T-----AAG---CCA----GCA-G-CCAA----T-AAG
gi|4 : agccagcagctaATAAG---CC-G-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---A-----TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGT-CT----TAG-------A--CG--G-ACATT-GAAAATAAT-C---AAAC---AAT----TC--AAA--G-TGAT--A---TTT----TTTC---AA----AATAA-ATAAT-AAA------TA-TA---G--TCTTAATTA------TC-AAGTTTG-A-TTCTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA---TACATGTAA-TTC--CTAA-TAATG--CA-AC-ACA-TGGGT--CCTAAAA-AA-A-GGAT-AATA-G-AA-ATCT-A--TTCTTTGA-ATAGT-CAGCG------AAA-GGAGCAGA-GAC-AAAAT---GTA-GCA-G-------GCCC-TT----T--TA--T--C--TATCTAT-C-CCCGTTT--TCATTTT-GGGG--TT-GAAGGGCC---------GGGGTACCACcc
gi|4 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaTAGGGGTGATGCAATGAAAAACCAGTG--ATAACGGACAAGAAAACATTAAAATCAA----ACAAACACACTTG-TTAAATAGGGTTGCAAAGACCATTAAAGGCCGTTTAGCTCACC--TGA--------AATTTTCAAGCATAAATGTCATA-ACGAAGAATTAATAACAACTTctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggattaggggtgatgcaatgaaaaaccagtgataacggacaagaaaacattaaaatcaaacaaacacacttgttaaatagggttgcaaagaccattaaaggccgtttagctcacctgaaattttcaagcataaatgtcataacgaagaattaataacaacttcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|4 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaataagccgtagaagctagcagccaataagaatccatcaaagtactgaaagtcttagacggacattgaaaataatcaaacaattcaaagtgatattttttcaaaataaataataaatatagtcttaattatcaagtttgattcttgaaggcaattgagctcacctgatacatgtaattcctaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaaggataatagaaatctattctttgaatagtcagcgaaaggagcagagacaaaatgtagcaggcccttttatctatctatccccgttttcattttggggttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggatACTCGT-AAAGTAGGGGTAATGTAATCAAACAACATTT--GCAAAGGACAAGACACCAACGAACTCAA----GCAGcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|5 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaataagccgtagaagctagcagccaataagaatccatcaaagtactgaaagtcttagacggacattgaaaataatcaaacaattcaaagtgatattttttcaaaataaataataaatatagtcttaattatcaagtttgattcttgaaggcaattgagctcacctgatacatgtaattcctaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaaggataatagaaatctattctttgaatagtcagcgaaaggagcagagacaaaatgtagcaggcccttttatctatctatccccgttttcattttggggttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggattaggggtgatgcaatgaaaaaccagtgataacggacaagaaaacattaaaatcaaacaaacacacttgttaaatagggttgcaaagaccattaaaggccgtttagctcacctgaaattttcaagcataaatgtcataacgaagaattaataacaacttcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntATAAG---CC-G-TAAG-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAAAGT--ACTGAAAGTAAT----TAG-------A--CGAGG-ATATT-GCAAGTA---------------------TC--AAA-TG-TGAT--T---TTT----TTTC---AA-CAAA-TGA-TAAAT-AA-------TA-TA---G--TCTTAAT----AAGC---AAGTTTG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGCCTCAC----CTGA---TG------G-TTT--CAAA-TGATG--CA-AC-ACA-TGGGT--CCT--AA-AA-AAGGATTCATA-T-CA-ATCTAA--T-CTTTGA-ATAGT-CAATAGTCAACAAAAGGAGCATA-GAC-TAAAT---GTG-GGA-C-------GCCC-GT----T--TG--A--C--TATCTAT-C-CCAGTTC--TCATTTT--AGGGCCT-AAAGAGTCAATAAA--TGGGCTTCCACAGACCCTTAAAGGT-AATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCG-AATTTTC--ATACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTGC
gi|5 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaAACTCGTAAAGTAGGG-GTC-ATGTAATA-AAAAAACGATTATACAGGGCAAGACAACAACGTACTCAA-GCAGGTAGAGTC-ACTAAATGGGGTTCCACAG--GCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatgtaataaaaaaacgattatacagggcaagacaacaacgtactcaagcaggtagagtcactaaatggggttccacaggcccttaaaggtaatttagctca
gi|6 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaataagccgtaagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaaagtactgaaagtaattagacgaggatattgcaagtatcaaatgtgattttttttcaacaaatgataaataatatagtcttaataagcaagtttgatacttgaaggcaattgagcctcacctgatggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggattcatatcaatctaatctttgaatagtcaatagtcaacaaaaggagcatagactaaatgtgggacgcccgtttgactatctatcccagttctcattttagggcctaaagagtcaataaatgggcttccacagacccttaaaggtaatttagctcacctgaaagtttcgaattttcatacataaaggtcataacgaaggttaataacacctttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAG---CCCG-TC-G-----AAG---CTA----GCA-G-TCAA----T-AAGG---AA--A-TTCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAC-------A--CAGAA-ATACT-GAAGATTAT-T---AAAC---AATCG-ATC--AAA-TT-TGAT---A--TTT----TTTA---AA-C-AAATAA-TCAAT-AAA------GA-TA---T--TCCTGATTA-TA------AAGTTTG-A-TACTT-----G-GATTCAA---C--------AA--AGC-TCAC----CTAA---AA------G-TTT--CAAA-TGATG--CA-TC-GCA-TGGTT--CCC--AATGA-A-AGTT-AATG-A-CA-ATTCAA---TCTATGG-AGGGT-CGA-A------AAAAAGAGCGTA-GAC-A
gi|6 : tggtgatggaagctgcattcgcagtgattgttcagctggcctcctccgatgtcattgcaaaagtctactaggttaaacctagcagtcattaaccagcagataTAA-TGGTTGAA-TGGTGATGAAGGAATGAAACAATAGTT--ATAATGGGTAAGACAACAACAGAGCCAAATAGACAGAGAGAGTCG-TTAAATAGGGTT-CATAGGTCTATAAGGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattgggccttaagagggcaaggcaacttgacagatccatgtaatggttgaatggtgatgaaggaatgaaacaatagttataatgggtaagacaacaacagagccaaatagacagagagagtcgttaaatagggttcataggtctataagggatattgaatcca
gi|7 : tggtgatggaagctgcattcgcagtgattgttcagctggcctcctccgatgtcattgcaaaagtctactaggttaaacctagcagtcattaaccagcagataataagcccgtcgaagctagcagtcaataaggaaattcatcaaagtactgaaagtacttacacagaaatactgaagattattaaacaatcgatcaaatttgatattttttaaacaaataatcaataaagatattcctgattataaagtttgatacttggattcaacaaagctcacctaaaagtttcaaatgatgcatcgcatggttcccaatgaaagttaatgacaattcaatctatggagggtcgaaaaaaagagcgtagacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattgggccttaagagggcaaggcaacttgacagatccatgATACG---CCTG-TA-C-----AAG---CTATATAGCA-G-CCAA----T-GAGA---AA--A-TACAT-CAAA-GT--ACTAAGAGTACT----TAA-------A---GGGA-ACA-C-AAAAGTTGG-C---AAAC---ACTGG-ATC--AAA--G-TGAT--GA--TAT----TTC---------AAACAG-TCAAT-AAA------CA-TA---T--TCCTAATTA------TC-AAGCTTGAA-TACTT-----A-CAGGCAA---T--------TG--AGA-TTAT----CTGA---TA------G-TTC--CTAA-GTATA--CA-TC-ACA-atattgaatcca
gi|8 : attcacaaacataaacattagaagaaattggaacatggcagaaatttcattaaaatgtttcttatgaacctaaaagccacaattttccaaatcaaatataaatgaactttttaatgatttgatcaacccatgacccagggccaggatatcgggggatgggatgtttcaatacgtaaaatttcgacgagaaccgcaagggttcgattcgtagcctatttagatttaaatacatagtgtagatacgagtttctctaggggatacaaaaggtgtttacaaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccacgctggttctagcagccaATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----ACA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-CCCAT-CAAA-GT--A-------------------------------------TT-GAAAATAAT-C---AAAG---AATCA-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TT--------C---AA-CAAA-TAA-TTAAT-AAA------TA-TA---G--TCTTAATTA-TAA------AGTTTG-A-TAATT-----G-AAG-CAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGG----A------G-TTC--CAAA-TGATG--CA-AC-ACA-TGGGT---CT--AA-AACA-GGAT-AATA-G-CA-ATCT-G--TTCTTTGA-ATAGT-CAGC-------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAC---GTA-GGA-G-------GCCCTTT----T--TG--A--C--TATCTAT-A-CTCGTTT--TCATTTT-GGGG--TT-GAAGAGaagactcataatgaaggtc
gi|8 : agactgaagctagcagccactaaccagcagccaTAGGGGCGATGCAATGAAATAACACTGTGATAACGGACAAGAAAACAATAAAATCAA----GGAAA----------------------CACAA----TTAAAGGCA-----GTTCACC--TGAAA--------TTTTCAAGCATAAATGCCATA-ACGAAGAATTAATAACAACTTcaggggtatcaccaggggtctatttaagagagcggcaccaactttcagacaatcatggcgattggattaggggcgatgcaatgaaataacactgtgataacggacaagaaaacaataaaatcaaggaaacacaattaaaggcagttcacctgaaattttcaagcataaatgccataacgaagaattaataacaactt
gi|9 : agactgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctaacagccaataagaaaacccatcaaagtattgaaaataatcaaagaatcaatcaaatgtgataattcaacaaataattaataaatatagtcttaattataaagtttgataattgaagcaattgagctcacctggagttccaaatgatgcaacacatgggtctaaaacaggataatagcaatctgttctttgaatagtcagcaaaaggagcatagacaaaacgtaggaggccctttttgactatctatactcgttttcattttggggttgaagagcaggggtatcaccaggggtctatttaagagagcggcaccaactttcagacaatcatggcgattggatCATAAGGCCCTCG-TAAG-----AAGA--CTA----GCA-G-CCAAACTGTGAAGAGCGAA--A-TCCAT-CAAA-GT---TT-----TACT----TAG-------CTCCGAGG-GTATT-GAAA-TAAT-C---AAAC---A-----ATC--AAA-TGTTGAT--AT--CTTTA--TTTCATGAA-CAAGTTAA-TAATT-AAA------TA-T----C--TCGTAATAG-CAACATT----CTT--A-TACTTTGTGCA-CAGGCAAACCT--------TGAAAG--TCAT----CTGAC--TA------GCTTC--CAAA-T----------------CGGGT--CCT---A-AA-A-GGAT-CATA-G-CATATATAT--TCTTTTGACATAGT-CATCG------AAAGG--ACATA-TAC--AAGT---GTA-GGA-GATAAGTTGC---------T--TG--A--CCGTATCTAT-TGCCCGTTC---CATTTT--GGGGTTT-AAGGGGCC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): GCTAGCAGCCAACTAACCCCACAGTCAACAATAAGCCGTAGAAGCTGTATACCAAAAAATGAAATTCAGCCAAGTTTAAAGCAAACTGATATT
Unaligned ( gi|31 ): AGGCTGAAGCTAGCAGCCACTAACAGCAGCCAATAAGCACG
Unaligned ( gi|32 ): ACGAAAGTTAGCAGCCACTAACCAGCAACCAATAAG
Unaligned ( gi|33 ): CTGTTGTAACAATTATATGATTTGGATAAATACCA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111111111 1111 44444 11111111111 111111 22222222 111111111 11 1111111 11 22 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22 2222 11 1 11 1 1 1 1 1 1 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 2222222222 111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 1 22222 1 1 1 22 222 3333333333333 1 5555555555555 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 222 11 1 1 111 11 1 1 11 3333 1 1
lowQualScore : 444 2 7 55555 666 4444 2 2 6666 2 444 33 2 2 2 33 4444 3333333333333 2 0 2 9999999 2 2 333 6666 33 3333 2 333333 4444 22 777777777 4 2 2 555555 22 777 0 88888 22 2 2 8 3333 55555 333 88888888 33 2 4444 66666666666 2 33 2 33 44 2 2 2 33 2 99 8 2 5 2 66 2 000000 2 2 0 44444444 2 2 555 3 444444444 6 7777 44 77 44 44 3 3 55555 3 4 77 3 99 0 5 8888888 5 0 22 77 77 5 1 2 8 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 55 0 8888 3 66 2 33 3 2 888 3 0 6 44 6 1 88 5 5 5 5 5 5 5 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 1 1 3 0 1 77 4 444 3 0 2222222222 2 8 1 5 1 0 0 666666 5 44 0 8 1 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5 44 6 3 1 77777 3 1 3 3 7 00 333 7 6666666666666 0 7 3 1 6 5555555555555 3 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 5 5 5 2 222 77 22 5 0 5 5 5 1 3 55 33 2 6 1 1 2 111 3 7 11 0 5 0 0 88 8 5 11 0 6 1 6 7777 3 3
lowQualScore : ... . . ..... ... .... . . .... . ... .. . . . .. .... ............. . . . ....... . . ... .... .. .... . ...... .... .. ......... . . . ...... .. ... . ..... .. . . . .... ..... ... ........ .. . .... ........... . .. . .. .. . . . .. . .. . . . . .. . ...... . . . ........ . . ... . ......... . .... .. .. .. .. . . ..... . . .. . .. . . ....... . . .. .. .. . . . . ....................................................................................................................................... .. . .... . .. . .. . . ... . . . .. . . .. . . . . . . . . .......................................................................................................................................... . . . . . . .. . ... . . .......... . . . . . . . ...... . .. . . . .............................................................................................................................. . .. . . . ..... . . . . . .. ... . ............. . . . . . ............. . ............................................................................................................................ . . . . . ... .. .. . . . . . . . .. .. . . . . . ... . . .. . . . . .. . . .. . . . . .... . .
lowQualScore : 111 4 1 66666 111 2222 0 0 2222 0 111 22 4 4 4 22 7777 2222222222222 2 8 2 2222222 2 2 999 8888 11 9999 2 555555 5555 99 555555555 5 0 1 888888 88 222 3 88888 99 1 1 4 1111 66666 999 11111111 11 2 7777 33333333333 2 11 2 22 55 4 4 5 77 7 00 0 7 3 7 33 7 999999 7 7 1 22222222 9 9 888 3 666666666 7 1111 66 99 66 66 6 6 55555 6 3 88 6 22 1 7 6666666 7 1 99 99 44 7 4 5 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 7 3333 7 88 5 88 2 5 888 2 0 5 00 7 0 55 5 5 5 5 0 0 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 4 0 0 4 0 99 3 999 0 4 1111111111 7 6 0 2 0 8 8 000000 0 66 8 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 33 7 3 0 77777 3 0 3 3 3 77 333 3 0000000000000 7 3 3 0 5 0000000000000 2 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 7 7 7 7 444 00 11 0 7 7 7 0 7 0 99 55 2 7 0 3 3 777 5 8 00 8 0 6 8 88 0 0 00 8 0 0 7 7777 3 3
consensus : CATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------A--CGAGG-ATATT-GAAANTAA---T-C-AAAC---AATCG-ATC--AAA-TG-T-GAT--AA--TTT----T--TTC-A---A-CAAAATAA-TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA----TC--AA-GTT-TG-ATACTT--G-A-----AGGCAA---T--------TGA--GC-TCAC----CTGA---TA------G-TTC--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-A-GGAT-AATAN-CA-ATCTAA--TTCTTTGA-ATAGT-CAACG------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTC--T--CA-TTTTGGGGGCTT-AAAGAGTCAATAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGTA-ATT-------TA-GCTCACCTGAAAGTTTCG-AATTT--TC-ACACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACT-CGTAAAGTAGGGGTCGTGGAATCAAAC----AACGTTTTATACGGGA--CAAAGACAAACAACGAACTCAAGCAGA-TAGAGTCATTAAATGGGGTTNCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAGTTTTTCGACATTTTCACACATAAAGGTCATAACGGAAGGTNAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTGGTTGGATTAGGGGTGATGCAATGAAACAACAGTG--ATAACGGACAAGAAAACAACAAAATCAAGCAGAC----AGAGTCGTTAAATAGGGTTNCAAAGGCCNTTAAAGGCNGTTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGCATAAANGTCATA-ACGAAGAATTAATAACANCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAACAGTGGANTAGGGG-TCATGNAATCA-A---ACAAC-ANTG-AT-AAAGGACAAGA-AACCA---ACGAAACTCAAGCAA-----ANATAG-AGTCGTTAAATGGGGTTCCACAGAC-CCTTAAANGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGNAATGCAAAA-AACANTTATAAAGGGCA-AG-ACAACAACGAACTCAA-GNCGATAGAGTC-ACTAAATGGGGTTCCACAG--GCCCTTAAAGGTATTTTAGCTCACC--TGAAAGTTTCGAATTTTCACGCATAAAGGTCATA-ACGAAGG--TAATAACATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGGCTAGGTTANAGCATTTTTAACTTGG-A-CATCTGATTTGG-GC-AATGAATT
Reference ( family-675 ) : CATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------A--CGAGG-ATATT-GAAANTAA---T-C-AAAC---AATCG-ATC--AAA-TG-T-GAT--AA--TTT----T--TTC-A---A-CAAAATAA-TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA-AAGTC--AA-GTT-TG-ATACTT--G-A-----AGGCAA---T--------TGA--GC-TCAC----CTGA---TA------G-TTC--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-A-GGAT-AATAN-CA-ATCTAA--TTCTTTGA-ATAGT-CAACG------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTC--T--CA-TTTTGGGGGCTT-AAAGAGTCAATAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGTA-ATT-------TA-GCTCACCTGAAAGTTTCG-AATTT--TCAACACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACT-CGTAAAGTAGGGGTCGTGGAATCAAAC----AACGTTTTATACGGGA--CAAAGACAAACAACGAACTCAAGCAGA-TAGAGTCATTAAATGGGGTTNCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAGTTTTTCGACATTTTCACACATAAAGGTCATAACGGAAGGTNAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTGGTTGAAGTAGGGGTGATGNAATGAAACAACANTG--ATAACGGACAAGACAACAACGAANTCAAGCAGAC----AGAGTCGTTAAATGGGGTTNCANAGGCCCTTAAAGGCNGTTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCACGCATAAANGTCATA-ACGAAGGATTAATAACANCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAACAGTGGGGTAGGGG-TCATGNAATCA-A---ACAAC-ANTG-AT-AAAGGACAAGA-AACCA---ACGAAACTCAAGCAA-----ANATAG-AGTCGTTAAATGGGGTTCCACAGAC-CCTTAAANGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGAAATGCAAAA-AACGNTTATAAAGGGCA-AG-ACAACAACGAACTCAA-GNCGGTAGAGTC-ANTAAATGGGATTCCACAG--GCCCTTAAAGGTATTTTAGCTCACC--TGAAAGTTTCGAATTTTCACGCATAAAGGTCATA-ACGAAGG--TAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGGCTAGGTTANAGCATTTTTAACTTGG-A-CATCTGATTTGG-GC-AATGAATT
gi|1 : CATAAA---CCCG-TAAG-----AAG---CTA----GCAAG-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------A--CGAGGGATATT-GAAATTAA---T-C-AAAC---AAACA-ATC--AAAATG-T-GAT--AA--TTT----T--TTC-A---A-CAAAATAAATTAAT-AAATA------T--AG--TTTTAATTGCAAGTTTTAA-ATT-TG-ATACTT--G-A-----AGGCAA---T--------TGA--GC-TCAC----CTGA---TG------G-TTT--CAAA-TGATG--CA-ACA-AA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-A-GGAT-GATATTCA-ATCTAA--TTCTTTGA-ATATT-CAATA------AAAGAAAGCATA-GAC-AAAAC---ATA-GGA-C-------GCCC-TT----T--TG--A--C--AATCTAT--CCC-GTTC--T--CATTTTTGGGGGCTTCAAAGAGACAATAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAGGG-A-ATT-------TA-GCTCACCTGAAAGTTTCGAAATTT--TCAACACATAAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTGCGTAAAGTAGGGGTCATGGAATCAAAC----AACGTTTGATGCAGGA--CAAAGACAAACAACGAACCCAAGCAGA-TAGA-TCACTAAATGGGGTTCCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAG-TTTTCGA-ATTTTCA-ACATAAAGGTCATAACGAAAGGTTAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTAGTTAAAGTAGGGGTCATGGAAT-CAACAACATGG--ATAAAGGACAAGACAACAACGAACTCAAGCAGAT----AGAGT-ATTAAATGGGGTTCCACAGGCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCAAC-GAAAGTTTCGAATTTTCACACATAAAGGTCATA-ACGTAAGGCTAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACAGTAAAATAGGGG-TCATGGAATCA-A---ACAAC-ATTGCATAAAAGGACAAAACAACCA---ACGAAACTCAAGCAATAAGCAGATAG-AGTCATTAGATGGGGTTCCACTGGC-CCTTAAAGGTTATTCAGCTCAAATGAAGGTTTCGAATTTTCACGA-------------AAAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTTGTGAAATC-AGG-GTT-AT-AAATGTAAAC-AATAGTGATAAAATGCA-AG-CCAACAACAAAGTTAA-GGCGTTAGA-TCGAATAAAAGTGATTTCATAT--GCACTTAAAGGTATTTTAGCTCGCC--TGAAAGTTTCGAATTTTCATGCATAAAAGTTATA-ACTAATA--TAAAAA
gi|1 : AGGGGCTAGGTTAAACCATTTGTAA--TGA----ATCGGGTTTGGTGCTAATGAATTacttaacctaatgaaatgaatataggcaacagctagccgggagagctgacttgactatcattttccgccttcagtttatcacagtacgagtaccacttgaaggttgggactttgtgatctctgtatcatatgaacaaagggagcgtttttgcgcttaacacgaaggtgatggcttgttcgtaatgataggggctaggttaaaccatttgtaatgaatcgggtttggtgctaatgaatt
gi|10 : cataaacccgtaagaagctagcaagccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagacgagggatattgaaattaatcaaacaaacaatcaaaatgtgataattttttcaacaaaataaattaataaatatagttttaattgcaagttttaaatttgatacttgaaggcaattgagctcacctgatggtttcaaatgatgcaacaaatgggtcctaaaaaggatgatattcaatctaattctttgaatattcaataaaagaaagcatagacaaaacataggacgcccttttgacaatctatcccgttctcatttttgggggcttcaaagagacaataaatgggcttccacaggcccttaagggaatttagctcacctgaaagtttcgaaattttcaacacataaaaggtcataacgaaggttaataacacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgcgtaaagtaggggtcatggaatcaaacaacgtttgatgcaggacaaagacaaacaacgaacccaagcagatagatcactaaatggggttccacaagcccttaaaggtgattttagactcatcctgaaagttttcgaattttcaacataaaggtcataacgaaaggttaataacacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaactagttaaagtaggggtcatggaatcaacaacatggataaaggacaagacaacaacgaactcaagcagatagagtattaaatggggttccacaggcccttaaaggtaatttagctcaacgaaagtttcgaattttcacacataaaggtcataacgtaaggctaataacacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacagtaaaataggggtcatggaatcaaacaacattgcataaaaggacaaaacaaccaacgaaactcaagcaataagcagatagagtcattagatggggttccactggcccttaaaggttattcagctcaaatgaaggtttcgaattttcacgaaaaaaggtcataacgaaggttaataacacctttacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagacctctttaacttgtgaaatcagggttataaatgtaaacaatagtgataaaatgcaagccaacaacaaagttaaggcgttagatcgaataaaagtgatttcatatgcacttaaaggtattttagctcgcctgaaagtttcgaattttcatgcataaaagttataactaatataaaaaacttaacctaatgaaatgaatataggcaacagctagccgggagagctgacttgactatcattttccgccttcagtttatcacagtacgagtaccacttgaaggttgggactttgtgatctctgtatcatatgaacaaagggagcgtttttgcgcttaacacgaaggtgatggcttgttcgtaatgatA----GCA-GACCGC----C-AAGA---AATAA-TCCATGCAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAGG------A--CAAGG-ATATT-GGAAATAA---TTC-AAACCCAAAGAA-ATC--CAA-TGGT-GAT--AA--TTTGTTTT--TCC-A---ATCAAAATAA-TTAATGAAATA------T--AGGGTCCTTATTA-GGAGC--AT-GTT-TGGATACCT--G-A-----AGGCAA---T--------GCG--GC-TCACAACCCTGGAATTG------G-TTT--CAAAATGATGGGCA-ACA-CA-T-GGGG--TC-T--AA-AA-A-GGAT-AATAATCA-ATCTAAAATTGTT-GA-ATAGT-CACCA------AAAGGGAGC-TA-GCCCAAAATATGGTA-GAAAG-------GCCC-TT----T--TGGGA--T--TATCTAAT-CCC-GTTCCTT--CA-TTTTAGGGGCCT-AAAGAGTCAACAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGTA-ATG-------TA-GCTCACCCGAAAGTTTCG--ATTT--TC-ATAC----------------AAGGTTAATAAC-ACCTTT
gi|11 : tgataatgctgagcgcgctctaaccagcacgccaataATAAG---CCCGGTA-T-----GAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--AATCCAT-CCAA-GTTTACTGAAAGTACT----TAC-------A--GGAGG-ATATT-GAAAG-AA---T-C-AATT---AAACA-ATC--ACA------GATTAAA--TTT----T--TTC-A---A-CCAAATAA-TTAAT-AAATA------TTAAGCGTTTTAATTA-G---C--AA-GTT-TG-ATACTT----A-----AGGCA----T--------TGA--GC-TCAC-----TGA---TG------G-TTT---AAA-TGATG--CATACAACA-TTGGGT--CC-CC-AA-AA-A-GGAT-GATAT-CA-GACTAC--ATCTT-GA-ATA-T-CAAT-------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTACGGA-C-------GCCC-TT----T--TGC-ATCC--TATCTATC-CCCCGTTC--TGTCA-TTT--GGCGCTT-CGAGAGTCAATAAATGTGGGTTTCC-CAGGCCCTTAAAGGTA-ATT-------TA-GCTCACCTGAAAG-TTCG-AATTT--T---CACAC-AAAGGTCATAACGAATGTTAAT
gi|12 : gcctgaagcagcagccactaaccagcagcaATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTATT----TAG-------A--CGAGG-A------------------C-AAAC---AAACA-ATC--AAA-TG-T-GAT--AA--TTT----T--TTC-A---A-CAAG-TAA-TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA-G---C--AA-GTT-TG-ATACTT--G-A-----AGGCAA---T--------TGA--GA-TCAC----CTCA---AG------G-TTT--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-AAGGAT-AATAT-CA-ATCTAA--A-CTTTGA-ATAGT-CAAC-------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-C-------GCCC-AT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTC--T--AA-TTTTGGGG-CCT-AAAGAGTCAATAAATG--AGCTTCCACAGGCCCCTAAAGGTA-ATT-------TA-TCTCACCTGAAAGTTTCG-GATTT--TC-ATACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTT
gi|13 : ctgaagctagcagccactaaccagcagccaA------T--AG--TCTTAATTA----TC--AA-GTT-TG-ATACTT--G-A-----AGGCAA---T--------TGA--GT-TCAC----CTGT---TT------G-TTC--CAAA-TGATG--CA-GCA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-A-GAAT-AATAG-CA-ATCT-A--TTATTTGA-ATAAT-CAGCG-------AAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTG-GGA-G-------GCCA-TT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTT--T--CA-TTTTGGGG--TT-GAAG
gi|13 : TGATTGGATTAGGGGTGATGCAATGAACTAACAGTG--ATAACGGACAAGAAAACA--------AAACACAC--------TTGTTAGATAAGGTTACAAAGACCgaccggggtacaacctgagacttatttaagagagcggcgccaactttcagacaatcatggtgattggattaggggtgatgcaatgaactaacagtgataacggacaagaaaacaaaacacacttgttagataaggttacaaagaccata
gi|14 : atagtcttaattatcaagtttgatacttgaaggcaattgagttcacctgtttgttccaaatgatgcagcacatgggtcctaaaaagaataatagcaatctattatttgaataatcagcgaaaggagcatagacaaaatgtgggaggccattttgactatctatccccgttttcattttggggttgaaggaccggggtacaacctgagacttatttaagagagcggcgccaactttcagacaatcatggATAAG---CCCG-TA-G-----AA-----TA----GT----CCAA-------------AA--A-TTCAT-CGAA-GT--ACTGAGAGTACT----CAG-------A--C-AGA-ATACC-AAAATTA----T-T-AAAC---AATCG-ATC--AAA-AT-T-GAT--AT--TTT----T--TCT-A---A-CAA------TTGAT-CAACA------T--CT--TCTAAATTA----TC--AA-GTT-TA-ATACAT--G-A-----AGGCAA---C--------TGA--GC-TAAT----CTGA---AA------G-TTC--CAAA-TGATA--CA-CCA-CA------------T--AATAA-A-GGTT-AATAA-TA-ATCTAA--TT-TTTCA-GGAGT-CAACG-------AAAGGAGCATA-GAC-Aata
gi|15 : actaggttgaatctagcagccacaaacctgcagtcatcaagcctttagaatctagcagccactaatcagttgccaCATTAC---CCCG-CA-GCCAATAAGTACCTA----GCA-G-TCAA----T-AAGA---AA--A-TTCAT-CAAC-GT--ACGGACAGTACC----CGG-------A--CTTAA-A-ACT-GAAAATAA---T-C-AAAC---AATCG-AT------------------A--TTT----T--TCC---------AAACAA-TTAAT-CAACA------T--AT--TGTTAAT----AATG--AA-ATT-TG-ATACTT--C-A-----AGGCAA---TTACCGGGATAA--GC-TCAC----CTGA---AA------G-TAC--CAAA-Tc
gi|15 : accagactgaagctagcagcCTTCAAGGCA-ATTACCGGGATAAGCTCACCTGAAAGTACCA-AATTTCATCTCCAGAT-GAAGttcatctccagatgaagtccttattcggtttttttctttggaataaaataacaga
gi|16 : accagactgaagctagcagccattaccccgcagccaataagtacctagcagtcaataagaaaattcatcaacgtacggacagtacccggacttaaaactgaaaataatcaaacaatcgatatttttccaaacaattaatcaacatattgttaataatgaaatttgataA----GTG-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-ATCAT-CAAA-GT--ACTGAGAGTACT----CAG-------A----------ATT-----------------------------AGC--AAA-TG----AT--AA--TTT----G--TC----------AAATGA-TTAAT-TAACA------C--AT--TCTTAATCA-----T--AA-GTT-CT-ATACCT--G-A-----CGACAA---T--------TGA--GC-TCAC-------A---T------------------------------CA-CA-A-AGGT--TCAT--AATGA-A-GGTT-AAAAA-CA-ATATAA---TCTTTGA-AGAGT-CCACG------AAAAGAAtccttattcggtttttttctttggaataaaataacaga
gi|17 : ctttcagcagctactaacaattaTGATTGGATTAGAAGTGATGCAATAAAATAGCAGTG--ATTACGGACAAGAAAATAATAAAATCAAACAAAC----ACACTTGGTAAATGAGGTTGGAAAGGCCATAAAAAGCTGTTTAGATCACCTGAAAGTTTCGAATTTTTAACCATAAAAGTCATA-ACGAAGAATTGATAACtatgaaaacgaggtagtggaatccttcagctatgta
gi|18 : gggtaccaactggggccaaaagagggcggcgcaacatttcagacaatcgtggATAAA---CCCG-TA-G-----A----------------G-CCAAG---T-AAGA---AA--A-TC-AT-CAAA-GT--ACCGAAAGTACT----CAG-------A---GAGA-ATATTCAAAATTAG---T-CTAGAT---ACTCGTATG--GAC-CT-T-GGT--AGACTCT----T--TTC-A------AAGATAA-
gi|19 : ctgtcgcagaaattacatgaatcgaaactagcaggcactatctagcagcca--TTT----T--TTC-A---A-CAAA-TAA-TTAAT-AAATACATGTAT--AG--TCTTAATTA-G---C--AA-GTT-TG-ATACTT--G-A-----AGGCAA---T--------TGA--GC-TCAT----CTGA---TA------G-TTC--CAA-----------------A-T-GGGT--CC-T--AA-A---------AATAG-CA-ATCT-A--TTCTTTGA-ATAGT-CATCG-------AAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GACC-TT----T--TG--A--C--TATCTAagtttgtattaaccttcattatctaaaattaggaacgttccgataagcgcaatt
gi|2 : atCATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CCA----G-A-G-CCAA-------AGA---AA-----TCAT-CAA--GT--ACTGAA-GTACT----TAG-------A--GGAGG-ATATT-GAAAG--A---T-A-CAAC---AAACA-ATC--AAA----T-AAT--AA--TTT----C--CTT-------CAAAATAA-TTGAC-TAAT-------T--AG--TCTT-ATT----GCC--AA-GTT-TGAATACTTCAT-A-----GGGCAA---T--------TG---GC-TCAG----ATGA----G------G-TTT--TAAA-TGATG--C--ACA-GATT-TGGTTCCC-T------A-A-GCAT-TATAC-CA-ATCT-A--TACTTTGA-ATAGTCCAAC--------AAAGGAGCACATGAG-CAAAT---GTA--GA-C-------GCCCGTT----C--TG--A--T----TCTCTC-CCA-TTTC--T--CA-TTTT--TGGCCT-AAAGA-TCACT-AATG--GGGTTCCACATTCTCCTAAAGGTCTACT-------TA-GCT-ACC-GAAAGTTTCG--ATTT--TC--CACAT-A---GT-ATAACGAAGGTAAATAACTACCTTTAC
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagcGTACGAG-GGC-ATGGAA-ACAAAACAACCCTTTTAA---GCACAGCACAACA-C-AATCCAA-GCAGATAGAGTC-ACTTA-TGGGGTTCCATAG--GCCCTT-AAGGTA--TTAGCTCACCGGTGAAAGTTTCGAATTTT-ACACAT-AAGGT-ATA-ACGAAAG--TAATAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtAACT---TAAAGATGGGGTCGTGGAATCAAAC----AACCTCTTATAAGG-----AAAGACACA-AACGAAATCA-GCAGAATAGAGTC--TAAATGAG---TCACAGGCCTT--AAGGTAATTT-AG-CTCA-CCTGAAAATTTTTCGACATTTTCACACATAAA-GTCATAACGGAAGGTAAATAACcttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntAGTA-GGG--TC-ATGAA--GCAACA-AAC-CTTATAAAGGCCA--G-ACAACG-TAAGCTCA---GCAGTAGAG-C-ACTAA-TGAG--TTCACAGCAGCC-TTAAAGGTATTTAAGCTCAC---TGAAA-TTTCGAATTTTCACA-ATAAAGGTCATA-ACGAAGG--TATCAACcgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtAACT-GTTAAGTA-GGGTGTCCATGAA-T-CAACA-AA--TTTATAA-GTCCA-AG-ACAACAACGAA-TCAGCGACGAT-GAGTC-AATA--TGGG--TCCACA----CCCTTAAATGTGTATTAGCTCACC--TG-AAGTTTCGAATTTCCACA-AT--AGGTCCTA-AC-AAGG--T-ATAACActttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|20 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGGTCTAGGTTAGAGCATTTTTAACTTGGAA-CATCTCATTTGG-GC-AATGAATT
gi|21 : c-----AAG---C-A----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AT--A-TGCAT-CAAA-GT--ACTGAGAGTACTAGTCTAGTACTCGAA--CG-GA-ATAAC-AAAAAGTA---G-C-AAAT---AATCA-ATCAAAAA-T--T-GAC--AA--TTT----T--CCA-A---A-CA----AA-TTAAG-AAACA------T--Acactcgatccatgctttttatagggaaggctgcaatcctacgagccccttttttatgtccaaacgctagggggtagtaaccagctggtg
gi|22 : ATAAA---CTCA-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAG
gi|22 : aagctagcagccaataaacccatggaagccagcagcaaATAAG---CCCC-TG-G-----AAG---CCA----GCA-G-CCAA----T-AGGcccctggaagccagcagccaataggctatgaaaagctagcagcaaataagcc
gi|23 : aagctagcagccaataaacccatggaagccagcagcaaataaactcatagaagctagcagccaAAAACAA-TTTAT-AAGCA---------AA--TCTTAATTA-AA-TC--AA-GTT-TGAATACTT--G-A-----AAACAA---C--------TGA--GC-TTA-----CTGA---AA------G-TTTTGCTAA-TGTTA--CA-TCA-AA-T-ctatgaaaagctagcagcaaataagcc
gi|24 : tACT----CAG-------A--CG-GG-ATATT-AACACTAATTGT-T-AAAA---AATGG-ACC--AAA-AT-T-GAT--AA--GTT----T--TTCTA---A-C---AT---TTGAT-AAATA------T--AC--TGATAATCA----TC--AA-GTT-TG-ATactgtcgaaatgaggattaat
gi|26 : T-TGCAAAGTAGGGGTCATGGAATCAAATCAAAAACATTTTATAAAGGA--CAA-GACAA-CAACGAACTCAAGCAGA-TAGAATCATT
gi|27 : gagAGGGGCCAGGTTATAGAATTTTTAACTGGG-ATTATCTGATTTGG-GC-AATAAATT
gi|28 : tTTATACTGGAATCAAAGG---ACAACGAACTCAAGCAAA-CGGAGTCATTAAATGGGGTTGCATAAACCCTcattcaatccttgcctttcattggaag
gi|29 : aTATTTAGCTCCCCTGAAAATTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTCAATAACACCT
gi|3 : ATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-A-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------A--TGAGG-ATATT-AAAAATAA---T-C-AAAC---AATCA-ATC--AAA-TG-T-GAT--AA--TTT----T--TTC-A---A-C-AAATAA-TTGAT-AAATG------T--AG--TCTTAATTA----TC--AA-GTT-TG-ATACTT--GAA-----AGGCAA---T--------TGA--GC-TCAC----CTGA---TA------G-TTC--CAAA-TAATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-TA-AA-AA-A-GGAT-AATAT-CA-ACAT-A--TTCTTTGA-ATAGT-CAGCG-------AAAGGAGCATA-GAC-ATAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TTAAGCTTGTG--A--C--TATCTATC-CCC-ATTT--T--CA-TTGTGGAG--TT-GAAGGGCC
gi|3 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaTGGATTAGGGGGTGATGCAATGA-A---ATAAC-AGTG-AT-AACGGACAAGA-AAACA---AATAAAATCAAACAA-----ACACAC---TTGTTGAATAACGTTGCAAAGAC-CATTTAATGCAGTTTAGCTCACCTGAAA--------TTTTCAAGC-------------ATGAATGTCATCACGGAGATTAATAAC---TTAACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGGAAT-CAAAC-AACATTTATAAAGGGCA-AG-ACAACAACGAACTCAA-GCAGATAGAGTC-ATTAAATAGGATTTCACAG--GCCCCTTAAGGTTATTTAGCTCACC--TGAAAGTTCCGAATTTTCACGAATAA--GTC-TAGACGAAGGGTTAATAACATCTggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgattggattagggggtgatgcaatgaaataacagtgataacggacaagaaaacaaataaaatcaaacaaacacacttgttgaataacgttgcaaagaccatttaatgcagtttagctcacctgaaattttcaagcatgaatgtcatcacggagattaataacttaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatggaatcaaacaacatttataaagggcaagacaacaacgaactcaagcagatagagtcattaaataggatttcacaggccccttaaggttatttagctcacctgaaagttccgaattttcacgaataagtctagacgaagggttaataacatcttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatactagtaaagtggggtaggatcaggaaatcataggcacaacaaattatacaggcaagtaccaggcacgaactcaagcaagattagtagtcattaaatggggtccacagacgccttaacagttatttagctcacctgaaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatagagttcataacgaaggttaataacaccttt
gi|3 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcaaccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagatgaggatattaaaaataatcaaacaatcaatcaaatgtgataattttttcaacaaataattgataaatgtagtcttaattatcaagtttgatacttgaaaggcaattgagctcacctgatagttccaaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaacatattctttgaatagtcagcgaaaggagcatagacataatgtaggaggcccttaagcttgtgactatctatccccattttcattgtggagttgaagggccggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgatAACTCGT-AAAGTAGGGGTCATGGAATCAAACAACATTT--ATAAAGGGCAAGACAACAACGAACTCAAGCAGAT----AGAGTCATTAAATAGGATTTCACAGGCCCCTTAAGGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTCCGAATTTTCACGAATAA--GTC-TAGACGAAGGGTTAATAACATCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAA-AGTGGGGTA-GGA-TCAGGAAATCATAGGCACAACAAATT-AT-ACAGG-CAAG--TACCAGGCACG-AACTCAAGCAA-----GATTAGTAGTCATTAAATGGGG-TCCACAGACGCCTTAACAGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAATAGAGTTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTtgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatactagtaaagtggggtaggatcaggaaatcataggcacaacaaattatacaggcaagtaccaggcacgaactcaagcaagattagtagtcattaaatggggtccacagacgccttaacagttatttagctcacctgaaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatagagttcataacgaaggttaataacaccttt
gi|30 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcaaccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagatgaggatattaaaaataatcaaacaatcaatcaaatgtgataattttttcaacaaataattgataaatgtagtcttaattatcaagtttgatacttgaaaggcaattgagctcacctgatagttccaaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaacatattctttgaatagtcagcgaaaggagcatagacataatgtaggaggcccttaagcttgtgactatctatccccattttcattgtggagttgaagggccggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgattggattagggggtgatgcaatgaaataacagtgataacggacaagaaaacaaataaaatcaaacaaacacacttgttgaataacgttgcaaagaccatttaatgcagtttagctcacctgaaattttcaagcatgaatgtcatcacggagattaataacttaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAG---CCCA-TA-T-----AAG---CCA----GCA-G-CCAA----T-AAG
gi|4 : agccagcagctaATAAG---CC-G-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---A-----TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGT-CT----TAG-------A--CG--G-ACATT-GAAAATAA---T-C-AAAC---AAT----TC--AAA--G-T-GAT--A---TTT----T--TTC-A---A----AATAA-ATAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA----TC--AA-GTT-TG-ATTCTT--G-A-----AGGCAA---T--------TGA--GC-TCAC----CTGA---TACATGTAA-TTC--CTAA-TAATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-TAAAA-AA-A-GGAT-AATAG-AA-ATCT-A--TTCTTTGA-ATAGT-CAGCG-------AAAGGAGCAGA-GAC-AAAAT---GTA-GCA-G-------GCCC-TT----T--TA--T--C--TATCTATC-CCC-GTTT--T--CA-TTTTGGGG--TT-GAAGGGCCcc
gi|4 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaGATTGGATTAGGGGTGATGCAATGAAAAACCAGTG--ATAACGGACAAGAAAACATTAAAATCAAACAAAC----ACACTTGTTAAATAGGGTTGCAAAGACCATTAAAGGCCGTTTAGCTCACCTGA--------AATTTTCAAGCATAAATGTCATA-ACGAAGAATTAATAACAACTTggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggattaggggtgatgcaatgaaaaaccagtgataacggacaagaaaacattaaaatcaaacaaacacacttgttaaatagggttgcaaagaccattaaaggccgtttagctcacctgaaattttcaagcataaatgtcataacgaagaattaataacaacttcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|4 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaataagccgtagaagctagcagccaataagaatccatcaaagtactgaaagtcttagacggacattgaaaataatcaaacaattcaaagtgatattttttcaaaataaataataaatatagtcttaattatcaagtttgattcttgaaggcaattgagctcacctgatacatgtaattcctaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaaggataatagaaatctattctttgaatagtcagcgaaaggagcagagacaaaatgtagcaggcccttttatctatctatccccgttttcattttggggttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggaACTCGTAAAGTA-GGG-GTA-ATGTAAT-CAAAC-AACATTTGCAAAGGACA-AG-ACACCAACGAACTCAA-Gcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|5 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaataagccgtagaagctagcagccaataagaatccatcaaagtactgaaagtcttagacggacattgaaaataatcaaacaattcaaagtgatattttttcaaaataaataataaatatagtcttaattatcaagtttgattcttgaaggcaattgagctcacctgatacatgtaattcctaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaaggataatagaaatctattctttgaatagtcagcgaaaggagcagagacaaaatgtagcaggcccttttatctatctatccccgttttcattttggggttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggattaggggtgatgcaatgaaaaaccagtgataacggacaagaaaacattaaaatcaaacaaacacacttgttaaatagggttgcaaagaccattaaaggccgtttagctcacctgaaattttcaagcataaatgtcataacgaagaattaataacaacttcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntATAAG---CC-G-TAAG-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAAAGT--ACTGAAAGTAAT----TAG-------A--CGAGG-ATATT-GCAAGTA----------------------TC--AAA-TG-T-GAT--T---TTT----T--TTC-A---A-CAAA-TGA-TAAAT-AA-TA------T--AG--TCTTAAT---AAG-C--AA-GTT-TG-ATACTT--G-A-----AGGCAA---T--------TGA--GCCTCAC----CTGA---TG------G-TTT--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-AAGGATTCATAT-CA-ATCTAA--T-CTTTGA-ATAGT-CAATAGTCAACAAAAGGAGCATA-GAC-TAAAT---GTG-GGA-C-------GCCC-GT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCA-GTTC--T--CA-TTTTAGGG-CCT-AAAGAGTCAATAAATG--GGCTTCCACAGACCCTTAAAGGTA-ATT-------TA-GCTCACCTGAAAGTTTCG-AATTT--TC-ATACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTGCcag
gi|5 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGTAATA-AAAA-AACGATTATACAGGGCA-AG-ACAACAACGTACTCAA-GCAGGTAGAGTC-ACTAAATGGGGTTCCACAG--GCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatgtaataaaaaaacgattatacagggcaagacaacaacgtactcaagcaggtagagtcactaaatggggttccacaggcccttaaaggtaatttagctca
gi|6 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaataagccgtaagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaaagtactgaaagtaattagacgaggatattgcaagtatcaaatgtgattttttttcaacaaatgataaataatatagtcttaataagcaagtttgatacttgaaggcaattgagcctcacctgatggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggattcatatcaatctaatctttgaatagtcaatagtcaacaaaaggagcatagactaaatgtgggacgcccgtttgactatctatcccagttctcattttagggcctaaagagtcaataaatgggcttccacagacccttaaaggtaatttagctcacctgaaagtttcgaattttcatacataaaggtcataacgaaggttaataacacctttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAG---CCCG-TC-G-----AAG---CTA----GCA-G-TCAA----T-AAGG---AA--A-TTCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAC-------A--CAGAA-ATACT-GAAGATTA---T-T-AAAC---AATCG-ATC--AAA-TT-T-GAT---A--TTT----T--TTA-A---A-C-AAATAA-TCAAT-AAAGA------T--AT--TCCTGATTA----TA--AA-GTT-TG-ATACTT--G-G-----ATTCAA---C--------AAA--GC-TCAC----CTAA---AA------G-TTT--CAAA-TGATG--CA-TCG-CA-T-GGTT--CC-C--AATGA-A-AGTT-AATGA-CA-ATTCAA---TCTATGG-AGGGT-CGA-A------AAAAAGAGCGTA-GAC-A
gi|6 : tggtgatggaagctgcattcgcagtgattgttcagctggcctcctccgatgtcattgcaaaagtctactaggttaaacctagcagtcattaaccagcagataTAA-TGGTTGAA-TGGTGATGAAGGAATGAAACAATAGTT--ATAATGGGTAAGACAACAACAGAGCCAAATAGACAGAGAGAGTCGTTAAATAGGGTT-CATAGGTCTATAAGGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattgggccttaagagggcaaggcaacttgacagatccatgtaatggttgaatggtgatgaaggaatgaaacaatagttataatgggtaagacaacaacagagccaaatagacagagagagtcgttaaatagggttcataggtctataagggatattgaatcca
gi|7 : tggtgatggaagctgcattcgcagtgattgttcagctggcctcctccgatgtcattgcaaaagtctactaggttaaacctagcagtcattaaccagcagataataagcccgtcgaagctagcagtcaataaggaaattcatcaaagtactgaaagtacttacacagaaatactgaagattattaaacaatcgatcaaatttgatattttttaaacaaataatcaataaagatattcctgattataaagtttgatacttggattcaacaaagctcacctaaaagtttcaaatgatgcatcgcatggttcccaatgaaagttaatgacaattcaatctatggagggtcgaaaaaaagagcgtagacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattgggccttaagagggcaaggcaacttgacagatccatgATACG---CCTG-TA-C-----AAG---CTATATAGCA-G-CCAA----T-GAGA---AA--A-TACAT-CAAA-GT--ACTAAGAGTACT----TAA-------A---GGGA-ACA-C-AAAAGTTG---G-C-AAAC---ACTGG-ATC--AAA--G-T-GAT--GA--TAT----T--TC----------AAACAG-TCAAT-AAACA------T--AT--TCCTAATTA----TC--AA-GCT-TGAATACTT--A-C-----AGGCAA---T--------TGA--GA-TTAT----CTGA---TA------G-TTC--CTAA-GTATA--CA-TCA-CA-atattgaatcca
gi|8 : attcacaaacataaacattagaagaaattggaacatggcagaaatttcattaaaatgtttcttatgaacctaaaagccacaattttccaaatcaaatataaatgaactttttaatgatttgatcaacccatgacccagggccaggatatcgggggatgggatgtttcaatacgtaaaatttcgacgagaaccgcaagggttcgattcgtagcctatttagatttaaatacatagtgtagatacgagtttctctaggggatacaaaaggtgtttacaaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccacgctggttctagcagccaATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----ACA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-CCCAT-CAAA-GT--A-------------------------------------TT-GAAAATAA---T-C-AAAG---AATCA-ATC--AAA-TG-T-GAT--AA--TT----------C-A---A-CAAA-TAA-TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA----TA--AA-GTT-TG-ATAATT--G-A-----AG-CAA---T--------TGA--GC-TCAC----CTGG----A------G-TTC--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT---C-T--AA-AACA-GGAT-AATAG-CA-ATCT-G--TTCTTTGA-ATAGT-CAGC-------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAC---GTA-GGA-G-------GCCCTTT----T--TG--A--C--TATCTATA-CTC-GTTT--T--CA-TTTTGGGG--TT-GAAGAGaagactcataatgaaggtc
gi|8 : agactgaagctagcagccactaaccagcagccaGATTGGATTAGGGGCGATGCAATGAAATAACACTGTGATAACGGACAAGAAAACAATAAAATCAAGGAAAC----A-------------------CAA------TTAAAGGCAGT-----TCACCTGA--------AATTTTCAAGCATAAATGCCATA-ACGAAGAATTAATAACAACTTcaggggtatcaccaggggtctatttaagagagcggcaccaactttcagacaatcatggcgattggattaggggcgatgcaatgaaataacactgtgataacggacaagaaaacaataaaatcaaggaaacacaattaaaggcagttcacctgaaattttcaagcataaatgccataacgaagaattaataacaactt
gi|9 : agactgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctaacagccaataagaaaacccatcaaagtattgaaaataatcaaagaatcaatcaaatgtgataattcaacaaataattaataaatatagtcttaattataaagtttgataattgaagcaattgagctcacctggagttccaaatgatgcaacacatgggtctaaaacaggataatagcaatctgttctttgaatagtcagcaaaaggagcatagacaaaacgtaggaggccctttttgactatctatactcgttttcattttggggttgaagagcaggggtatcaccaggggtctatttaagagagcggcaccaactttcagacaatcatggcCATAAGGCCCTCG-TAAG-----AAGA--CTA----GCA-G-CCAAACTGTGAAGAGCGAA--A-TCCAT-CAAA-GT---TT-----TACT----TAG-------CTCCGAGG-GTATT-GAAA-TAA---T-C-AAAC---AATC-------AAA-TG-TTGAT--AT--CTT----TATTTC-ATGAA-CAAGTTAA-TAATT-AAATA------T--C---TCGTAAT----AG-C--AACATTCTT-ATACTT--T-GTGCACAGGCAAACCT--------TGAAAG--TCAT----CTGAC--TA------GCTTC--CAAA-T----------------C-GGGT--CC-T--AA-AA---GGAT-CATAG-CATATATAT--TCTTTTGACATAGT-CATCG------AAA-GGA-CATA-TAC-AAG-T---GTA-GGA-GATAAGTTGC---------T--TG--A--CCGTATCTATTGCCC-GTTC-----CA-TTTT-GGGGTTT-AAGGGGCC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): GCTAGCAGCCAACTAACCCCACAGTCAACAATAAGCCGTAGAAGCTGTATACCAAAAAATGAAATTCAGCCAAGTTTAAAGCAAACTGATATT
Unaligned ( gi|31 ): AGGCTGAAGCTAGCAGCCACTAACAGCAGCCAATAAGCACG
Unaligned ( gi|32 ): ACGAAAGTTAGCAGCCACTAACCAGCAACCAATAAG
Unaligned ( gi|33 ): CTGTTGTAACAATTATATGATTTGGATAAATACCA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111111 1111 1111111111 11111111 111111 22222222 111111111 11 11 111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22 2222 11 1 11 1 1 1 1 1 1 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 111 2222222222 111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 1 22222 1 1 1 22 222 3333333333333 1 5555555555555 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 1 1 111 11 1 1 11 3333 1 1
lowQualScore : 444 2 7 55555 666 4444 2 2 6666 2 444 33 2 2 2 33 4444 33333333333 2 0 2 8888888888 333 8888 33 6666 333333 7777 55555555555 44 2 555555 22 555 1111111111 2 2 6 2 88888 2 333 88888888 33 2 4444 66666666 2 33 2 33 44 2 2 2 33 2 99 8 2 5 2 66 2 000000 2 2 0 77777777 2 2 555 3 444444444 6 7777 44 77 44 44 3 3 55555 3 4 77 3 99 6 1 66 6 333 3 2 8 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 55 0 8888 3 66 2 33 3 2 888 3 0 6 44 6 1 88 5 5 5 5 5 5 5 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5 0 0 000 3 0 77 1 22 3 0 2222222222 8 1 3 1 0 0 666666 0 44 0 8 1 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5 1 6 3 1 77777 3 1 3 3 7 00 333 7 6666666666666 0 7 3 1 6 5555555555555 3 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 5 5 5 6 77 77 88 5 0 5 5 5 1 3 55 33 0 6 1 1 2 111 3 7 11 0 5 0 0 88 8 5 11 0 1 6 7777 3 3
lowQualScore : ... . . ..... ... .... . . .... . ... .. . . . .. .... ........... . . . .......... ... .... .. .... ...... .... ........... .. . ...... .. ... .......... . . . . ..... . ... ........ .. . .... ........ . .. . .. .. . . . .. . .. . . . . .. . ...... . . . ........ . . ... . ......... . .... .. .. .. .. . . ..... . . .. . .. . . .. . ... . . . ....................................................................................................................................... .. . .... . .. . .. . . ... . . . .. . . .. . . . . . . . . .......................................................................................................................................... . . . ... . . .. . .. . . .......... . . . . . . ...... . .. . . . .............................................................................................................................. . . . . . ..... . . . . . .. ... . ............. . . . . . ............. . ............................................................................................................................ . . . . . .. .. .. . . . . . . . .. .. . . . . . ... . . .. . . . . .. . . .. . . . .... . .
lowQualScore : 111 4 1 66666 111 2222 0 0 2222 0 111 22 4 4 4 22 7777 22222222222 2 8 2 1111111111 999 1111 11 1111 555555 4444 99999999999 88 0 555555 66 999 0000000000 1 1 3 1 66666 2 999 11111111 11 2 7777 33333333 2 11 2 22 55 4 4 5 77 7 00 0 7 3 7 33 7 999999 7 7 1 55555555 9 9 888 3 666666666 7 1111 66 99 66 66 6 6 55555 6 3 88 6 22 7 7 55 7 000 2 5 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 7 3333 7 88 5 88 2 5 888 2 0 5 00 7 0 55 5 5 5 5 0 0 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 7 7 000 0 4 99 3 11 4 4 1111111111 6 6 0 0 8 8 000000 6 66 8 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 7 3 0 77777 3 0 3 3 3 77 333 3 0000000000000 7 3 3 0 5 0000000000000 2 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 7 7 7 6 44 00 00 0 7 7 7 0 7 0 99 55 3 7 0 3 0 777 5 8 00 8 0 6 8 88 0 0 00 8 0 7 7777 3 3
consensus : CATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------ACGAGG-ATATT-GAAANTAAT-C---AAAC---AATCG-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-CAAAATAA--TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA------TAG-TTC--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-A-GGAT-AATAN-CA-ATCTAA--TTCTTTGA-ATAGT-CAACG------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTC--T--CA-TTTTGGGGGCTT-AAAGAGTCAATAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGTA-ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCG-AATTTTC-ACACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACT-CGTAAAGTAGGGGTCGTGGAATCAAAC----AACGTTTTATACGGGA--CAAAGACAAACAACGAACTCAAGCAGA-TAGAGTCATTAAATGGGGTTNCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAGTTTTTCGACATTTTCACACATAAAGGTCATAACGGAAGGTNAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTGATTGGATTAGGGGTGATGCA---ATGAAACAACA--GTGATAACGGACAAGAAAACAACAAAATCAAGCAGAC----AGAGTCGTTAAATAGGGTTNCAAAGGCCNTTAAAGGCNGTTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGCATAAANGTCATA-ACGAAGAATTAATAACANCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAACAGTGGANTAGGGG-TCATGNAATCA-A---ACAAC-ANTG-AT-AAAGGACAAGA-AACCA---ACGAAACTCAAGCAA-----ANATAG-AGTCGTTAAATGGGGTTCCACAGAC-CCTTAAANGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGNAATGCAAAA-AACANTTATAAAGGGCA-AG-ACAACAACGAACTCAA-GNCGATAGAGTC-ACTAAATGGGGTTCCACAG--GCCCTTAAAGGTATTTTAGCTCACC--TGAAAGTTTCGAATTTTCACGCATAAAGGTCATA-ACGAAGG--TAATAACATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGGCTAGGTTANAGCATTTTTAACTTGG-A-CATCTGATTTGG-GC-AATGAATT
Reference ( family-675 ) : CATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------ACGAGG-ATATT-GAAANTAAT-C---AAAC---AATCG-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-CAAAATAA--TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA------TAG-TTC--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-A-GGAT-AATAN-CA-ATCTAA--TTCTTTGA-ATAGT-CAACG------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTC--T--CA-TTTTGGGGGCTT-AAAGAGTCAATAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGTA-ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCG-AATTTTC-ACACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACT-CGTAAAGTAGGGGTCGTGGAATCAAAC----AACGTTTTATACGGGA--CAAAGACAAACAACGAACTCAAGCAGA-TAGAGTCATTAAATGGGGTTNCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAGTTTTTCGACATTTTCACACATAAAGGTCATAACGGAAGGTNAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTGGTTGGATTAGGGGTGATGCA---ATGAAACAACA--GTGATAACGGACAAGAAAACAACAAAATCAAGCAGAC----AGAGTCGTTAAATAGGGTTNCAAAGGCCNTTAAAGGCNGTTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGCATAAANGTCATA-ACGAAGAATTAATAACANCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAACAGTGGANTAGGGG-TCATGNAATCA-A---ACAAC-ANTG-AT-AAAGGACAAGA-AACCA---ACGAAACTCAAGCAA-----ANATAG-AGTCGTTAAATGGGGTTCCACAGAC-CCTTAAANGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGNAATGCAAAA-AACANTTATAAAGGGCA-AG-ACAACAACGAACTCAA-GNCGATAGAGTC-ACTAAATGGGGTTCCACAG--GCCCTTAAAGGTATTTTAGCTCACC--TGAAAGTTTCGAATTTTCACGCATAAAGGTCATA-ACGAAGG--TAATAACATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGGCTAGGTTANAGCATTTTTAACTTGG-A-CATCTGATTTGG-GC-AATGAATT
gi|1 : CATAAA---CCCG-TAAG-----AAG---CTA----GCAAG-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------ACGAGGGATATT-GAAATTAAT-C---AAAC---AAACA-ATC--AAAATG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-CAAAATAAA-TTAAT-AAATA------T--AG--TTTTAATTGCAAGTTT---TAA-ATT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA------TGG-TTT--CAAA-TGATG--CA-ACA-AA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-A-GGAT-GATATTCA-ATCTAA--TTCTTTGA-ATATT-CAATA------AAAGAAAGCATA-GAC-AAAAC---ATA-GGA-C-------GCCC-TT----T--TG--A--C--AATCTAT--CCC-GTTC--T--CATTTTTGGGGGCTTCAAAGAGACAATAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAGGG-A-ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAAATTTTCAACACATAAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTGCGTAAAGTAGGGGTCATGGAATCAAAC----AACGTTTGATGCAGGA--CAAAGACAAACAACGAACCCAAGCAGA-TAGA-TCACTAAATGGGGTTCCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAG-TTTTCGA-ATTTTCA-ACATAAAGGTCATAACGAAAGGTTAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTAGTTAAAGTAGGGGTCATGGA---AT-CAACAACA--TGGATAAAGGACAAGACAACAACGAACTCAAGCAGAT----AGAGT-ATTAAATGGGGTTCCACAGGCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCAAC-GAAAGTTTCGAATTTTCACACATAAAGGTCATA-ACGTAAGGCTAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACAGTAAAATAGGGG-TCATGGAATCA-A---ACAAC-ATTGCATAAAAGGACAAAACAACCA---ACGAAACTCAAGCAATAAGCAGATAG-AGTCATTAGATGGGGTTCCACTGGC-CCTTAAAGGTTATTCAGCTCAAATGAAGGTTTCGAATTTTCACGA-------------AAAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTTGTGAAATC-AGG-GTT-AT-AAATGTAAAC-AATAGTGATAAAATGCA-AG-CCAACAACAAAGTTAA-GGCGTTAGA-TCGAATAAAAGTGATTTCATAT--GCACTTAAAGGTATTTTAGCTCGCC--TGAAAGTTTCGAATTTTCATGCATAAAAGTTATA-ACTAATA--TAAAAA
gi|1 : AGGGGCTAGGTTAAACCATTTGTAA--TGA----ATCGGGTTTGGTGCTAATGAATTacttaacctaatgaaatgaatataggcaacagctagccgggagagctgacttgactatcattttccgccttcagtttatcacagtacgagtaccacttgaaggttgggactttgtgatctctgtatcatatgaacaaagggagcgtttttgcgcttaacacgaaggtgatggcttgttcgtaatgataggggctaggttaaaccatttgtaatgaatcgggtttggtgctaatgaatt
gi|10 : cataaacccgtaagaagctagcaagccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagacgagggatattgaaattaatcaaacaaacaatcaaaatgtgataattttttcaacaaaataaattaataaatatagttttaattgcaagttttaaatttgatacttgaaggcaattgagctcacctgatggtttcaaatgatgcaacaaatgggtcctaaaaaggatgatattcaatctaattctttgaatattcaataaaagaaagcatagacaaaacataggacgcccttttgacaatctatcccgttctcatttttgggggcttcaaagagacaataaatgggcttccacaggcccttaagggaatttagctcacctgaaagtttcgaaattttcaacacataaaaggtcataacgaaggttaataacacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgcgtaaagtaggggtcatggaatcaaacaacgtttgatgcaggacaaagacaaacaacgaacccaagcagatagatcactaaatggggttccacaagcccttaaaggtgattttagactcatcctgaaagttttcgaattttcaacataaaggtcataacgaaaggttaataacacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaactagttaaagtaggggtcatggaatcaacaacatggataaaggacaagacaacaacgaactcaagcagatagagtattaaatggggttccacaggcccttaaaggtaatttagctcaacgaaagtttcgaattttcacacataaaggtcataacgtaaggctaataacacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacagtaaaataggggtcatggaatcaaacaacattgcataaaaggacaaaacaaccaacgaaactcaagcaataagcagatagagtcattagatggggttccactggcccttaaaggttattcagctcaaatgaaggtttcgaattttcacgaaaaaaggtcataacgaaggttaataacacctttacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagacctctttaacttgtgaaatcagggttataaatgtaaacaatagtgataaaatgcaagccaacaacaaagttaaggcgttagatcgaataaaagtgatttcatatgcacttaaaggtattttagctcgcctgaaagtttcgaattttcatgcataaaagttataactaatataaaaaacttaacctaatgaaatgaatataggcaacagctagccgggagagctgacttgactatcattttccgccttcagtttatcacagtacgagtaccacttgaaggttgggactttgtgatctctgtatcatatgaacaaagggagcgtttttgcgcttaacacgaaggtgatggcttgttcgtaatgatA----GCA-GACCGC----C-AAGA---AATAA-TCCATGCAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAGG------ACAAGG-ATATT-GGAAATAATTC---AAACCCAAAGAA-ATC--CAA-TGGTGAT--AA--TTTGTTTTTCC---AATCAAAATAA--TTAATGAAATA------T--AGGGTCCTTATTA------GGAGCAT-GTT-TGGA-TACCT-----G-AAGGCAA---T--------GC--GGC-TCACAACCCTGGAAT---TGG-TTT--CAAAATGATGGGCA-ACA-CA-T-GGGG--TC-T--AA-AA-A-GGAT-AATAATCA-ATCTAAAATTGTT-GA-ATAGT-CACCA------AAAGGGAGC-TA-GCCCAAAATATGGTA-GAAAG-------GCCC-TT----T--TGGGA--T--TATCTAAT-CCC-GTTCCTT--CA-TTTTAGGGGCCT-AAAGAGTCAACAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGTA-ATGTAGCTCACCCGAAAGTTTCG--ATTTTC-ATAC----------------AAGGTTAATAAC-ACCTTT
gi|11 : tgataatgctgagcgcgctctaaccagcacgccaataATAAG---CCCGGTA-T-----GAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--AATCCAT-CCAA-GTTTACTGAAAGTACT----TAC-------AGGAGG-ATATT-GAAAG-AAT-C---AATT---AAACA-ATC--ACA-----GATTAAA--TTT----TTTC---AA-CCAAATAA--TTAAT-AAATA------TTAAGCGTTTTAATTA------G---CAA-GTT-TG-A-TACTT-------AAGGCA----T--------TG--AGC-TCAC-----TGA------TGG-TTT---AAA-TGATG--CATACAACA-TTGGGT--CC-CC-AA-AA-A-GGAT-GATAT-CA-GACTAC--ATCTT-GA-ATA-T-CAAT-------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTACGGA-C-------GCCC-TT----T--TGC-ATCC--TATCTATC-CCCCGTTC--TGTCA-TTT--GGCGCTT-CGAGAGTCAATAAATGTGGGTTTCC-CAGGCCCTTAAAGGTA-ATTTAGCTCACCTGAAAG-TTCG-AATTTTC-ACAC---AAAGGTCATAACGAATGTTAAT
gi|12 : gcctgaagcagcagccactaaccagcagcaATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTATT----TAG-------ACGAGG-A---------------C---AAAC---AAACA-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-CAAG-TAA--TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------G---CAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGA-TCAC----CTCA------AGG-TTT--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-AAGGAT-AATAT-CA-ATCTAA--A-CTTTGA-ATAGT-CAAC-------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-C-------GCCC-AT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTC--T--AA-TTTTGGGG-CCT-AAAGAGTCAATAAATG--AGCTTCCACAGGCCCCTAAAGGTA-ATTTATCTCACCTGAAAGTTTCG-GATTTTC-ATACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTT
gi|13 : ctgaagctagcagccactaaccagcagccaA------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGT-TCAC----CTGT------TTG-TTC--CAAA-TGATG--CA-GCA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-A-GAAT-AATAG-CA-ATCT-A--TTATTTGA-ATAAT-CAGCG-------AAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTG-GGA-G-------GCCA-TT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTT--T--CA-TTTTGGGG--TT-GAAG
gi|13 : TGATTGGATTAGGGGTGATGCA---ATGAACTAACA--GTGATAACGGACAAGAAAACA--------AAACACAC--------TTGTTAGATAAGGTTACAAAGACCATgaccggggtacaacctgagacttatttaagagagcggcgccaactttcagacaatcatggtgattggattaggggtgatgcaatgaactaacagtgataacggacaagaaaacaaaacacacttgttagataaggttacaaagaccata
gi|14 : atagtcttaattatcaagtttgatacttgaaggcaattgagttcacctgtttgttccaaatgatgcagcacatgggtcctaaaaagaataatagcaatctattatttgaataatcagcgaaaggagcatagacaaaatgtgggaggccattttgactatctatccccgttttcattttggggttgaaggaccggggtacaacctgagacttatttaagagagcggcgccaactttcagacaatcatggATAAG---CCCG-TA-G-----AA-----TA----GT----CCAA-------------AA--A-TTCAT-CGAA-GT--ACTGAGAGTACT----CAG-------AC-AGA-ATACC-AAAATTA-T-T---AAAC---AATCG-ATC--AAA-AT-TGAT--AT--TTT----TTCT---AA-CAA-------TTGAT-CAACA------T--CT--TCTAAATTA------T---CAA-GTT-TA-A-TACAT-----G-AAGGCAA---C--------TG--AGC-TAAT----CTGA------AAG-TTC--CAAA-TGATA--CA-CCA-CA------------T--AATAA-A-GGTT-AATAA-TA-ATCTAA--TT-TTTCA-GGAGT-CAACG-------AAAGGAGCATA-GAC-Aa
gi|15 : actaggttgaatctagcagccacaaacctgcagtcatcaagcctttagaatctagcagccactaatcagttgccaCATTAC---CCCG-CA-GCCAATAAGTACCTA----GCA-G-TCAA----T-AAGA---AA--A-TTCAT-CAAC-GT--ACGGACAGTACC----CGG-------ACTTAA-A-ACT-GAAAATAAT-C---AAAC---AATCG-AT-----------------A--TTT----TTCC--------AAACAA--TTAAT-CAACA------T--AT--TGTTAATAA------T---GAA-ATT-TG-A-TACTT-----C-AAGGCAA---TTACCGGGATA--AGC-TCAC----CTGA------AAG-TAC--CAAA-Tc
gi|16 : accagactgaagctagcagcA----GTG-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-ATCAT-CAAA-GT--ACTGAGAGTACT----CAG-------A--------ATT----------------------------AGC--AAA-TG---AT--AA--TTT----GTC---------AAATGA--TTAAT-TAACA------C--AT--TCTTAATCA------T----AA-GTT-CT-A-TACCT-----G-ACGACAA---T--------TG--AGC-TCAC-------A------T------------------------CA-CA-A-AGGT--TCAT--AATGA-A-GGTT-AAAAA-CA-ATATAA---TCTTTGA-AGAGT-CCACG------AAAAGAAttcatctccagatgaagtccttattcggtttttttctttggaataaaataacaga
gi|17 : ctttcagcagctactaacaattaTGATTGGATTAGAAGTGATGCA---ATAAAATAGCA--GTGATTACGGACAAGAAAATAATAAAATCAAACAAAC----ACACTTGGTAAATGAGGTTGGAAAGGCCATAAAAAGCTGTTTAGATCACCTGAAAGTTTCGAATTTTTAACCATAAAAGTCATA-ACGAAGAATTGATAACtatgaaaacgaggtagtggaatccttcagctatgta
gi|18 : gggtaccaactggggccaaaagagggcggcgcaacatttcagacaatcgtggATAAA---CCCG-TA-G-----A----------------G-CCAAG---T-AAGA---AA--A-TC-AT-CAAA-GT--ACCGAAAGTACT----CAG-------A-GAGA-ATATTCAAAATTAGT-CT--AGAT---ACTCGTATG--GAC-CT-TGGT--AGACTCT----TTTC---A---AAGATAAAGTT--T-GTAT-------T--AA--CCTTCATTA------T---C
gi|19 : ctgtcgcagaaattacatgaatcgaaactagcaggcactatctagcagcca--TTT----TTTC---AA-CAAA-TAA--TTAAT-AAATACATGTAT--AG--TCTTAATTA------G---CAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAT----CTGA------TAG-TTC--CAA-----------------A-T-GGGT--CC-T--AA-A---------AATAG-CA-ATCT-A--TTCTTTGA-ATAGT-CATCG-------AAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GACC-TT----T--TG--A--C--TATCTAtaaaattaggaacgttccgataagcgcaatt
gi|2 : atCATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CCA----G-A-G-CCAA-------AGA---AA-----TCAT-CAA--GT--ACTGAA-GTACT----TAG-------AGGAGG-ATATT-GAAAG--AT-A---CAAC---AAACA-ATC--AAA----TAAT--AA--TTT----CCTT------CAAAATAA--TTGAC-TAAT-------T--AG--TCTT-ATTG------C---CAA-GTT-TGAA-TACTTCA---T-AGGGCAA---T--------TG---GC-TCAG----ATGA-------GG-TTT--TAAA-TGATG--C--ACA-GATT-TGGTTCCC-T------A-A-GCAT-TATAC-CA-ATCT-A--TACTTTGA-ATAGTCCAAC--------AAAGGAGCACATGAG-CAAAT---GTA--GA-C-------GCCCGTT----C--TG--A--T----TCTCTC-CCA-TTTC--T--CA-TTTT--TGGCCT-AAAGA-TCACT-AATG--GGGTTCCACATTCTCCTAAAGGTCTACTTAGCT-ACC-GAAAGTTTCG--ATTTTC--CACAT-A---GT-ATAACGAAGGTAAATAACTACCTTTAC
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagcGTACGAG-GGC-ATGGAA-ACAAAACAACCCTTTTAA---GCACAGCACAACA-C-AATCCAA-GCAGATAGAGTC-ACTTA-TGGGGTTCCATAG--GCCCTT-AAGGTA--TTAGCTCACCGGTGAAAGTTTCGAATTTT-ACACAT-AAGGT-ATA-ACGAAAG--TAATAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtAACT---TAAAGATGGGGTCGTGGAATCAAAC----AACCTCTTATAAGG-----AAAGACACA-AACGAAATCA-GCAGAATAGAGTC--TAAATGAG---TCACAGGCCTT--AAGGTAATTT-AG-CTCA-CCTGAAAATTTTTCGACATTTTCACACATAAA-GTCATAACGGAAGGTAAATAACcttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntAGTA-GGG--TC-ATGAA--GCAACA-AAC-CTTATAAAGGCCA--G-ACAACG-TAAGCTCA---GCAGTAGAG-C-ACTAA-TGAG--TTCACAGCAGCC-TTAAAGGTATTTAAGCTCAC---TGAAA-TTTCGAATTTTCACA-ATAAAGGTCATA-ACGAAGG--TATCAACcgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtAACT-GTTAAGTA-GGGTGTCCATG-AAT-CAACA-AA--TTTATAA-GTCCA-AG-ACAACAACGAA-TCAGCGACGAT-GAGTC-AATA--TGGG--TCCACA----CCCTTAAATGTGTATTAGCTCACC--TG-AAGTTTCGAATTTCCACA-AT--AGGTCCTA-AC-AAGG--T-ATAACActttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|20 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGGTCTAGGTTAGAGCATTTTTAACTTGGAA-CATCTCATTTGG-GC-AATGAATT
gi|21 : c-----AAG---C-A----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AT--A-TGCAT-CAAA-GT--ACTGAGAGTACTAGTCTAGTACTCGAACG-GA-ATAAC-AAAAAGTAG-C---AAAT---AATCA-ATCAAAAA-T--TGAC--AA--TTT----TCCA---AA-CA----AA--TTAAG-AAACA------T--Acactcgatccatgctttttatagggaaggctgcaatcctacgagccccttttttatgtccaaacgctagggggtagtaaccagctggtg
gi|22 : ATAAA---CTCA-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAG
gi|22 : aagctagcagccaataaacccatggaagccagcagcaaATAAG---CCCC-TG-G-----AAG---CCA----GCA-G-CCAA----T-AGGcccctggaagccagcagccaataggctatgaaaagctagcagcaaataagcc
gi|23 : aagctagcagccaataaacccatggaagccagcagcaaataaactcatagaagctagcagccaAAAACAA--TTTAT-AAGCA---------AA--TCTTAATTAAA----T---CAA-GTT-TG-AATACTT-----G-AAAACAA---C--------TG--AGC-TTA-----CTGA------AAG-TTTTGCTAA-TGTTA--CA-TCA-AA-T-ctatgaaaagctagcagcaaataagcc
gi|24 : tACT----CAG-------ACG-GG-ATATT-AACACTAAT-TGTTAAAA---AATGG-ACC--AAA-AT-TGAT--AA--GTT----TTTCT--AA-CA---T----TTGAT-AAATA------T--AC--TGATAATCA------T---CAA-GTT-TG-A-Tactgtcgaaatgaggattaat
gi|26 : T-TGCAAAGTAGGGGTCATGGAATCAAATCAAAAACATTTTATAAAGGA--CAA-GACAA-CAACGAACTCAAGCAGA-TAGAATCATT
gi|27 : gagAGGGGCCAGGTTATAGAATTTTTAACTGGG-ATTATCTGATTTGG-GC-AATAAATT
gi|28 : tTTATACTGGAATCAAAGG---ACAACGAACTCAAGCAAA-CGGAGTCATTAAATGGGGTTGCATAAACCCTcattcaatccttgcctttcattggaag
gi|29 : aTATTTAGCTCCCCTGAAAATTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTCAATAACACCT
gi|3 : ATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-A-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------ATGAGG-ATATT-AAAAATAAT-C---AAAC---AATCA-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-C-AAATAA--TTGAT-AAATG------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TACTT-----GAAAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA------TAG-TTC--CAAA-TAATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-TA-AA-AA-A-GGAT-AATAT-CA-ACAT-A--TTCTTTGA-ATAGT-CAGCG-------AAAGGAGCATA-GAC-ATAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TTAAGCTTGTG--A--C--TATCTATC-CCC-ATTT--T--CA-TTGTGGAG--TT-GAAGGGCC
gi|3 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaTGGATTAGGGGGTGATGCAATGA-A---ATAAC-AGTG-AT-AACGGACAAGA-AAACA---AATAAAATCAAACAA-----ACACAC---TTGTTGAATAACGTTGCAAAGAC-CATTTAATGCAGTTTAGCTCACCTGAAA--------TTTTCAAGC-------------ATGAATGTCATCACGGAGATTAATAAC---TTAACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGGAAT-CAAAC-AACATTTATAAAGGGCA-AG-ACAACAACGAACTCAA-GCAGATAGAGTC-ATTAAATAGGATTTCACAG--GCCCCTTAAGGTTATTTAGCTCACC--TGAAAGTTCCGAATTTTCACGAATAA--GTC-TAGACGAAGGGTTAATAACATCTggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgattggattagggggtgatgcaatgaaataacagtgataacggacaagaaaacaaataaaatcaaacaaacacacttgttgaataacgttgcaaagaccatttaatgcagtttagctcacctgaaattttcaagcatgaatgtcatcacggagattaataacttaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatggaatcaaacaacatttataaagggcaagacaacaacgaactcaagcagatagagtcattaaataggatttcacaggccccttaaggttatttagctcacctgaaagttccgaattttcacgaataagtctagacgaagggttaataacatcttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatactagtaaagtggggtaggatcaggaaatcataggcacaacaaattatacaggcaagtaccaggcacgaactcaagcaagattagtagtcattaaatggggtccacagacgccttaacagttatttagctcacctgaaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatagagttcataacgaaggttaataacaccttt
gi|3 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcaaccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagatgaggatattaaaaataatcaaacaatcaatcaaatgtgataattttttcaacaaataattgataaatgtagtcttaattatcaagtttgatacttgaaaggcaattgagctcacctgatagttccaaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaacatattctttgaatagtcagcgaaaggagcatagacataatgtaggaggcccttaagcttgtgactatctatccccattttcattgtggagttgaagggccggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgatTAGGGGTCATGGA---ATCAAACAACA--TTTATAAAGGGCAAGACAACAACGAACTCAAGCAGAT----AGAGTCATTAAATAGGATTTCACAGGCCCCTTAAGGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTCCGAATTTTCACGAATAA--GTC-TAGACGAAGGGTTAATAACATCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAA-AGTGGGGTA-GGA-TCAGGAAATCATAGGCACAACAAATT-AT-ACAGG-CAAG--TACCAGGCACG-AACTCAAGCAA-----GATTAGTAGTCATTAAATGGGG-TCCACAGACGCCTTAACAGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAATAGAGTTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTtgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatactagtaaagtggggtaggatcaggaaatcataggcacaacaaattatacaggcaagtaccaggcacgaactcaagcaagattagtagtcattaaatggggtccacagacgccttaacagttatttagctcacctgaaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatagagttcataacgaaggttaataacaccttt
gi|30 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcaaccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagatgaggatattaaaaataatcaaacaatcaatcaaatgtgataattttttcaacaaataattgataaatgtagtcttaattatcaagtttgatacttgaaaggcaattgagctcacctgatagttccaaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaacatattctttgaatagtcagcgaaaggagcatagacataatgtaggaggcccttaagcttgtgactatctatccccattttcattgtggagttgaagggccggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgattggattagggggtgatgcaatgaaataacagtgataacggacaagaaaacaaataaaatcaaacaaacacacttgttgaataacgttgcaaagaccatttaatgcagtttagctcacctgaaattttcaagcatgaatgtcatcacggagattaataacttaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagATAAG---CCCA-TA-T-----AAG---CCA----GCA-G-CCAA----T-AAG
gi|4 : agccagcagctaATAAG---CC-G-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---A-----TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGT-CT----TAG-------ACG--G-ACATT-GAAAATAAT-C---AAAC---AAT----TC--AAA--G-TGAT--A---TTT----TTTC---AA----AATAA--ATAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TTCTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGATACATGTAA-TTC--CTAA-TAATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-TAAAA-AA-A-GGAT-AATAG-AA-ATCT-A--TTCTTTGA-ATAGT-CAGCG-------AAAGGAGCAGA-GAC-AAAAT---GTA-GCA-G-------GCCC-TT----T--TA--T--C--TATCTATC-CCC-GTTT--T--CA-TTTTGGGG--TT-GAAGGGCCcc
gi|4 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaGATTGGATTAGGGGTGATGCA---ATGAAAAACCA--GTGATAACGGACAAGAAAACATTAAAATCAAACAAAC----ACACTTGTTAAATAGGGTTGCAAAGACCATTAAAGGCCGTTTAGCTCACCTGA--------AATTTTCAAGCATAAATGTCATA-ACGAAGAATTAATAACAACTTggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggattaggggtgatgcaatgaaaaaccagtgataacggacaagaaaacattaaaatcaaacaaacacacttgttaaatagggttgcaaagaccattaaaggccgtttagctcacctgaaattttcaagcataaatgtcataacgaagaattaataacaacttcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|4 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaataagccgtagaagctagcagccaataagaatccatcaaagtactgaaagtcttagacggacattgaaaataatcaaacaattcaaagtgatattttttcaaaataaataataaatatagtcttaattatcaagtttgattcttgaaggcaattgagctcacctgatacatgtaattcctaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaaggataatagaaatctattctttgaatagtcagcgaaaggagcagagacaaaatgtagcaggcccttttatctatctatccccgttttcattttggggttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggaACTCGTAAAGTA-GGG-GTA-ATGTAAT-CAAAC-AACATTTGCAAAGGACA-AG-ACACCAACGAACTCAA-Gcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|5 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaataagccgtagaagctagcagccaataagaatccatcaaagtactgaaagtcttagacggacattgaaaataatcaaacaattcaaagtgatattttttcaaaataaataataaatatagtcttaattatcaagtttgattcttgaaggcaattgagctcacctgatacatgtaattcctaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaaggataatagaaatctattctttgaatagtcagcgaaaggagcagagacaaaatgtagcaggcccttttatctatctatccccgttttcattttggggttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggattaggggtgatgcaatgaaaaaccagtgataacggacaagaaaacattaaaatcaaacaaacacacttgttaaatagggttgcaaagaccattaaaggccgtttagctcacctgaaattttcaagcataaatgtcataacgaagaattaataacaacttcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntATAAG---CC-G-TAAG-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAAAGT--ACTGAAAGTAAT----TAG-------ACGAGG-ATATT-GCAAGTA---------------------TC--AAA-TG-TGAT--T---TTT----TTTC---AA-CAAA-TGA--TAAAT-AA-TA------T--AG--TCTTAATAA------G---CAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGCCTCAC----CTGA------TGG-TTT--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-AAGGATTCATAT-CA-ATCTAA--T-CTTTGA-ATAGT-CAATAGTCAACAAAAGGAGCATA-GAC-TAAAT---GTG-GGA-C-------GCCC-GT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCA-GTTC--T--CA-TTTTAGGG-CCT-AAAGAGTCAATAAATG--GGCTTCCACAGACCCTTAAAGGTA-ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCG-AATTTTC-ATACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTGCcag
gi|5 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGTAATA-AAAA-AACGATTATACAGGGCA-AG-ACAACAACGTACTCAA-GCAGGTAGAGTC-ACTAAATGGGGTTCCACAG--GCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatgtaataaaaaaacgattatacagggcaagacaacaacgtactcaagcaggtagagtcactaaatggggttccacaggcccttaaaggtaatttagctca
gi|6 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaataagccgtaagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaaagtactgaaagtaattagacgaggatattgcaagtatcaaatgtgattttttttcaacaaatgataaataatatagtcttaataagcaagtttgatacttgaaggcaattgagcctcacctgatggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggattcatatcaatctaatctttgaatagtcaatagtcaacaaaaggagcatagactaaatgtgggacgcccgtttgactatctatcccagttctcattttagggcctaaagagtcaataaatgggcttccacagacccttaaaggtaatttagctcacctgaaagtttcgaattttcatacataaaggtcataacgaaggttaataacacctttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAG---CCCG-TC-G-----AAG---CTA----GCA-G-TCAA----T-AAGG---AA--A-TTCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAC-------ACAGAA-ATACT-GAAGATTAT-T---AAAC---AATCG-ATC--AAA-TT-TGAT---A--TTT----TTTA---AA-C-AAATAA--TCAAT-AAAGA------T--AT--TCCTGATTA------T---AAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-GATTCAA---C--------AA--AGC-TCAC----CTAA------AAG-TTT--CAAA-TGATG--CA-TCG-CA-T-GGTT--CC-C--AATGA-A-AGTT-AATGA-CA-ATTCAA---TCTATGG-AGGGT-CGA-A------AAAAAGAGCGTA-GAC-A
gi|6 : tggtgatggaagctgcattcgcagtgattgttcagctggcctcctccgatgtcattgcaaaagtctactaggttaaacctagcagtcattaaccagcagataTAA-TGGTTGAAT----GGTGATGAAGGAATGAAACAATA--GTTATAATGGGTAAGACAACAACAGAGCCAAATAGACAGAGAGAGTCGTTAAATAGGGTT-CATAGGTCTATAAGGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattgggccttaagagggcaaggcaacttgacagatccatgtaatggttgaatggtgatgaaggaatgaaacaatagttataatgggtaagacaacaacagagccaaatagacagagagagtcgttaaatagggttcataggtctataagggatattgaatcca
gi|7 : tggtgatggaagctgcattcgcagtgattgttcagctggcctcctccgatgtcattgcaaaagtctactaggttaaacctagcagtcattaaccagcagataataagcccgtcgaagctagcagtcaataaggaaattcatcaaagtactgaaagtacttacacagaaatactgaagattattaaacaatcgatcaaatttgatattttttaaacaaataatcaataaagatattcctgattataaagtttgatacttggattcaacaaagctcacctaaaagtttcaaatgatgcatcgcatggttcccaatgaaagttaatgacaattcaatctatggagggtcgaaaaaaagagcgtagacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattgggccttaagagggcaaggcaacttgacagatccatgATACG---CCTG-TA-C-----AAG---CTATATAGCA-G-CCAA----T-GAGA---AA--A-TACAT-CAAA-GT--ACTAAGAGTACT----TAA-------A-GGGA-ACA-C-AAAAGTTGG-C---AAAC---ACTGG-ATC--AAA--G-TGAT--GA--TAT----TTC---------AAACAG--TCAAT-AAACA------T--AT--TCCTAATTA------T---CAA-GCT-TGAA-TACTT-----A-CAGGCAA---T--------TG--AGA-TTAT----CTGA------TAG-TTC--CTAA-GTATA--CA-TCA-CA-atattgaatcca
gi|8 : attcacaaacataaacattagaagaaattggaacatggcagaaatttcattaaaatgtttcttatgaacctaaaagccacaattttccaaatcaaatataaatgaactttttaatgatttgatcaacccatgacccagggccaggatatcgggggatgggatgtttcaatacgtaaaatttcgacgagaaccgcaagggttcgattcgtagcctatttagatttaaatacatagtgtagatacgagtttctctaggggatacaaaaggtgtttacaaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccacgctggttctagcagccaATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----ACA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-CCCAT-CAAA-GT--A-----------------------------------TT-GAAAATAAT-C---AAAG---AATCA-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TT--------C---AA-CAAA-TAA--TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------T---AAA-GTT-TG-A-TAATT-----G-AA-GCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGG-------AG-TTC--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT---C-T--AA-AACA-GGAT-AATAG-CA-ATCT-G--TTCTTTGA-ATAGT-CAGC-------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAC---GTA-GGA-G-------GCCCTTT----T--TG--A--C--TATCTATA-CTC-GTTT--T--CA-TTTTGGGG--TT-GAAGAGaagactcataatgaaggtc
gi|8 : agactgaagctagcagccactaaccagcagccaGATTGGATTAGGGGCGATGCA---ATGAAATAACACTGTGATAACGGACAAGAAAACAATAAAATCAAGGAAAC----A-------------------CAA------TTAAAGGCAGT-----TCACCTGA--------AATTTTCAAGCATAAATGCCATA-ACGAAGAATTAATAACAACTTcaggggtatcaccaggggtctatttaagagagcggcaccaactttcagacaatcatggcgattggattaggggcgatgcaatgaaataacactgtgataacggacaagaaaacaataaaatcaaggaaacacaattaaaggcagttcacctgaaattttcaagcataaatgccataacgaagaattaataacaactt
gi|9 : agactgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctaacagccaataagaaaacccatcaaagtattgaaaataatcaaagaatcaatcaaatgtgataattcaacaaataattaataaatatagtcttaattataaagtttgataattgaagcaattgagctcacctggagttccaaatgatgcaacacatgggtctaaaacaggataatagcaatctgttctttgaatagtcagcaaaaggagcatagacaaaacgtaggaggccctttttgactatctatactcgttttcattttggggttgaagagcaggggtatcaccaggggtctatttaagagagcggcaccaactttcagacaatcatggcCATAAGGCCCTCG-TAAG-----AAGA--CTA----GCA-G-CCAAACTGTGAAGAGCGAA--A-TCCAT-CAAA-GT---TT-----TACT----TAGCT-----CCGAGG-GTATT-GAAA-TAAT-C---AAAC---A-----ATC--AAA-TGTTGAT--AT--CTTTA--TTTCATGAA-CAAGTTAA--TAATT-AAATA------T---C--TCGTAA-TA------G---CAACATTCTT-A-TACTTTGTGCA-CAGGCAAACCT--------TGAAAG--TCAT----CTGAC-----TAGCTTC--CAAA-T----------------C-GGGT--CC-T---A-AA-A-GGAT-CATAG-CATATATAT--TCTTTTGACATAGT-CATCG-------AAAGGA-CATA-TAC--AAGT---GTA-GGA-GATAAGTTGC---------T--TG--A--CCGTATCTATTGCCC-GTTC-----CA-TTTT-GGGGTTT-AAGGGGCC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): GCTAGCAGCCAACTAACCCCACAGTCAACAATAAGCCGTAGAAGCTGTATACCAAAAAATGAAATTCAGCCAAGTTTAAAGCAAACTGATATT
Unaligned ( gi|31 ): AGGCTGAAGCTAGCAGCCACTAACAGCAGCCAATAAGCACG
Unaligned ( gi|32 ): ACGAAAGTTAGCAGCCACTAACCAGCAACCAATAAG
Unaligned ( gi|33 ): CTGTTGTAACAATTATATGATTTGGATAAATACCA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111111 1111 1111111111 11111111 111111 22222222 111111111 11 11 111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22 2222 11 1 11 1 1 1 1 1 1 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 111 2222222222 111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 1 22222 1 1 1 22 222 3333333333333 1 5555555555555 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 1 1 111 11 1 1 11 3333 1 1
lowQualScore : 444 2 7 55555 666 4444 2 2 6666 2 444 33 2 2 2 33 4444 33333333333 2 0 2 8888888888 333 8888 33 6666 333333 7777 55555555555 44 2 555555 22 555 1111111111 2 2 6 2 88888 2 333 88888888 33 2 4444 66666666 2 33 2 33 44 2 2 2 33 2 99 8 2 5 2 66 2 000000 2 2 0 77777777 2 2 555 3 444444444 6 7777 44 77 44 44 3 3 55555 3 4 77 3 99 6 1 66 6 333 3 2 8 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 55 0 8888 3 66 2 33 3 2 888 3 0 6 44 6 1 88 5 5 5 5 5 5 5 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5 0 000 3 0 77 1 22 3 0 2222222222 8 1 3 1 0 0 666666 0 44 0 8 1 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5 1 6 3 1 77777 3 1 3 3 7 00 333 7 6666666666666 0 7 3 1 6 5555555555555 3 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 5 5 5 6 77 77 88 5 0 5 5 5 1 3 55 33 0 6 1 1 2 111 3 7 11 0 5 0 0 88 8 5 11 0 1 6 7777 3 3
lowQualScore : ... . . ..... ... .... . . .... . ... .. . . . .. .... ........... . . . .......... ... .... .. .... ...... .... ........... .. . ...... .. ... .......... . . . . ..... . ... ........ .. . .... ........ . .. . .. .. . . . .. . .. . . . . .. . ...... . . . ........ . . ... . ......... . .... .. .. .. .. . . ..... . . .. . .. . . .. . ... . . . ....................................................................................................................................... .. . .... . .. . .. . . ... . . . .. . . .. . . . . . . . . .......................................................................................................................................... . . ... . . .. . .. . . .......... . . . . . . ...... . .. . . . .............................................................................................................................. . . . . . ..... . . . . . .. ... . ............. . . . . . ............. . ............................................................................................................................ . . . . . .. .. .. . . . . . . . .. .. . . . . . ... . . .. . . . . .. . . .. . . . .... . .
lowQualScore : 111 4 1 66666 111 2222 0 0 2222 0 111 22 4 4 4 22 7777 22222222222 2 8 2 1111111111 999 1111 11 1111 555555 4444 99999999999 88 0 555555 66 999 0000000000 1 1 3 1 66666 2 999 11111111 11 2 7777 33333333 2 11 2 22 55 4 4 5 77 7 00 0 7 3 7 33 7 999999 7 7 1 55555555 9 9 888 3 666666666 7 1111 66 99 66 66 6 6 55555 6 3 88 6 22 7 7 55 7 000 2 5 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 7 3333 7 88 5 88 2 5 888 2 0 5 00 7 0 55 5 5 5 5 0 0 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 7 000 0 4 99 3 11 4 4 1111111111 6 6 0 0 8 8 000000 6 66 8 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 7 3 0 77777 3 0 3 3 3 77 333 3 0000000000000 7 3 3 0 5 0000000000000 2 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 7 7 7 6 44 00 00 0 7 7 7 0 7 0 99 55 3 7 0 3 0 777 5 8 00 8 0 6 8 88 0 0 00 8 0 7 7777 3 3
consensus : CATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------ACGAGG-ATATT-GAAANTAAT-C---AAAC---AATCG-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-CAAAATAA--TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA------TAG-TTC--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-A-GGAT-AATAN-CA-ATCTAA--TTCTTTGA-ATAGT-CAACG------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTC--T--CA-TTTTGGGGGCTT-AAAGAGTCAATAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGTA-ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCG-AATTTTC-ACACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACT-CGTAAAGTAGGGGTCGTGGAATCAAAC----AACGTTTTATACGGGA--CAAAGACAAACAACGAACTCAAGCAGA-TAGAGTCATTAAATGGGGTTNCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAGTTTTTCGACATTTTCACACATAAAGGTCATAACGGAAGGTNAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTGATTGGATTAGGGGTGATGCA---ATGAAACAACA--GTGATAACGGACAAGAAAACAACAAAATCAAGCAGAC----AGAGTCGTTAAATAGGGTTNCAAAGGCCNTTAAAGGCNGTTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGCATAAANGTCATA-ACGAAGAATTAATAACANCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAACAGTGGANTAGGGG-TCATGNAATCA-A---ACAAC-ANTG-AT-AAAGGACAAGA-AACCA---ACGAAACTCAAGCAA-----ANATAG-AGTCGTTAAATGGGGTTCCACAGAC-CCTTAAANGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGNAATGCAAAA-AACANTTATAAAGGGCA-AG-ACAACAACGAACTCAA-GNCGATAGAGTC-ACTAAATGGGGTTCCACAG--GCCCTTAAAGGTATTTTAGCTCACC--TGAAAGTTTCGAATTTTCACGCATAAAGGTCATA-ACGAAGG--TAATAACATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGGCTAGGTTANAGCATTTTTAACTTGG-A-CATCTGATTTGG-GC-AATGAATT
Reference ( family-675 ) : CATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------ACGAGG-ATATT-GAAANTAAT-C---AAAC---AATCG-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-CAAAATAA--TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA------TAG-TTC--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-A-GGAT-AATAN-CA-ATCTAA--TTCTTTGA-ATAGT-CAACG------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTC--T--CA-TTTTGGGGGCTT-AAAGAGTCAATAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGTA-ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCG-AATTTTC-ACACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACT-CGTAAAGTAGGGGTCGTGGAATCAAAC----AACGTTTTATACGGGA--CAAAGACAAACAACGAACTCAAGCAGA-TAGAGTCATTAAATGGGGTTNCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAGTTTTTCGACATTTTCACACATAAAGGTCATAACGGAAGGTNAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTGATTGGATTAGGGGTGATGCA---ATGAAACAACA--GTGATAACGGACAAGAAAACAACAAAATCAAGCAGAC----AGAGTCGTTAAATAGGGTTNCAAAGGCCNTTAAAGGCNGTTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGCATAAANGTCATA-ACGAAGAATTAATAACANCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAACAGTGGANTAGGGG-TCATGNAATCA-A---ACAAC-ANTG-AT-AAAGGACAAGA-AACCA---ACGAAACTCAAGCAA-----ANATAG-AGTCGTTAAATGGGGTTCCACAGAC-CCTTAAANGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGNAATGCAAAA-AACANTTATAAAGGGCA-AG-ACAACAACGAACTCAA-GNCGATAGAGTC-ACTAAATGGGGTTCCACAG--GCCCTTAAAGGTATTTTAGCTCACC--TGAAAGTTTCGAATTTTCACGCATAAAGGTCATA-ACGAAGG--TAATAACATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGGCTAGGTTANAGCATTTTTAACTTGG-A-CATCTGATTTGG-GC-AATGAATT
gi|1 : CATAAA---CCCG-TAAG-----AAG---CTA----GCAAG-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------ACGAGGGATATT-GAAATTAAT-C---AAAC---AAACA-ATC--AAAATG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-CAAAATAAA-TTAAT-AAATA------T--AG--TTTTAATTGCAAGTTT---TAA-ATT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA------TGG-TTT--CAAA-TGATG--CA-ACA-AA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-A-GGAT-GATATTCA-ATCTAA--TTCTTTGA-ATATT-CAATA------AAAGAAAGCATA-GAC-AAAAC---ATA-GGA-C-------GCCC-TT----T--TG--A--C--AATCTAT--CCC-GTTC--T--CATTTTTGGGGGCTTCAAAGAGACAATAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAGGG-A-ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAAATTTTCAACACATAAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTGCGTAAAGTAGGGGTCATGGAATCAAAC----AACGTTTGATGCAGGA--CAAAGACAAACAACGAACCCAAGCAGA-TAGA-TCACTAAATGGGGTTCCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAG-TTTTCGA-ATTTTCA-ACATAAAGGTCATAACGAAAGGTTAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTAGTTAAAGTAGGGGTCATGGA---AT-CAACAACA--TGGATAAAGGACAAGACAACAACGAACTCAAGCAGAT----AGAGT-ATTAAATGGGGTTCCACAGGCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCAAC-GAAAGTTTCGAATTTTCACACATAAAGGTCATA-ACGTAAGGCTAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACAGTAAAATAGGGG-TCATGGAATCA-A---ACAAC-ATTGCATAAAAGGACAAAACAACCA---ACGAAACTCAAGCAATAAGCAGATAG-AGTCATTAGATGGGGTTCCACTGGC-CCTTAAAGGTTATTCAGCTCAAATGAAGGTTTCGAATTTTCACGA-------------AAAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTTGTGAAATC-AGG-GTT-AT-AAATGTAAAC-AATAGTGATAAAATGCA-AG-CCAACAACAAAGTTAA-GGCGTTAGA-TCGAATAAAAGTGATTTCATAT--GCACTTAAAGGTATTTTAGCTCGCC--TGAAAGTTTCGAATTTTCATGCATAAAAGTTATA-ACTAATA--TAAAAA
gi|1 : AGGGGCTAGGTTAAACCATTTGTAA--TGA----ATCGGGTTTGGTGCTAATGAATTacttaacctaatgaaatgaatataggcaacagctagccgggagagctgacttgactatcattttccgccttcagtttatcacagtacgagtaccacttgaaggttgggactttgtgatctctgtatcatatgaacaaagggagcgtttttgcgcttaacacgaaggtgatggcttgttcgtaatgataggggctaggttaaaccatttgtaatgaatcgggtttggtgctaatgaatt
gi|10 : cataaacccgtaagaagctagcaagccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagacgagggatattgaaattaatcaaacaaacaatcaaaatgtgataattttttcaacaaaataaattaataaatatagttttaattgcaagttttaaatttgatacttgaaggcaattgagctcacctgatggtttcaaatgatgcaacaaatgggtcctaaaaaggatgatattcaatctaattctttgaatattcaataaaagaaagcatagacaaaacataggacgcccttttgacaatctatcccgttctcatttttgggggcttcaaagagacaataaatgggcttccacaggcccttaagggaatttagctcacctgaaagtttcgaaattttcaacacataaaaggtcataacgaaggttaataacacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgcgtaaagtaggggtcatggaatcaaacaacgtttgatgcaggacaaagacaaacaacgaacccaagcagatagatcactaaatggggttccacaagcccttaaaggtgattttagactcatcctgaaagttttcgaattttcaacataaaggtcataacgaaaggttaataacacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaactagttaaagtaggggtcatggaatcaacaacatggataaaggacaagacaacaacgaactcaagcagatagagtattaaatggggttccacaggcccttaaaggtaatttagctcaacgaaagtttcgaattttcacacataaaggtcataacgtaaggctaataacacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacagtaaaataggggtcatggaatcaaacaacattgcataaaaggacaaaacaaccaacgaaactcaagcaataagcagatagagtcattagatggggttccactggcccttaaaggttattcagctcaaatgaaggtttcgaattttcacgaaaaaaggtcataacgaaggttaataacacctttacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagacctctttaacttgtgaaatcagggttataaatgtaaacaatagtgataaaatgcaagccaacaacaaagttaaggcgttagatcgaataaaagtgatttcatatgcacttaaaggtattttagctcgcctgaaagtttcgaattttcatgcataaaagttataactaatataaaaaacttaacctaatgaaatgaatataggcaacagctagccgggagagctgacttgactatcattttccgccttcagtttatcacagtacgagtaccacttgaaggttgggactttgtgatctctgtatcatatgaacaaagggagcgtttttgcgcttaacacgaaggtgatggcttgttcgtaatgatA----GCA-GACCGC----C-AAGA---AATAA-TCCATGCAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAGG------ACAAGG-ATATT-GGAAATAATTC---AAACCCAAAGAA-ATC--CAA-TGGTGAT--AA--TTTGTTTTTCC---AATCAAAATAA--TTAATGAAATA------T--AGGGTCCTTATTA------GGAGCAT-GTT-TGGA-TACCT-----G-AAGGCAA---T--------GC--GGC-TCACAACCCTGGAAT---TGG-TTT--CAAAATGATGGGCA-ACA-CA-T-GGGG--TC-T--AA-AA-A-GGAT-AATAATCA-ATCTAAAATTGTT-GA-ATAGT-CACCA------AAAGGGAGC-TA-GCCCAAAATATGGTA-GAAAG-------GCCC-TT----T--TGGGA--T--TATCTAAT-CCC-GTTCCTT--CA-TTTTAGGGGCCT-AAAGAGTCAACAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGTA-ATGTAGCTCACCCGAAAGTTTCG--ATTTTC-ATAC----------------AAGGTTAATAAC-ACCTTT
gi|11 : tgataatgctgagcgcgctctaaccagcacgccaataATAAG---CCCGGTA-T-----GAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--AATCCAT-CCAA-GTTTACTGAAAGTACT----TAC-------AGGAGG-ATATT-GAAAG-AAT-C---AATT---AAACA-ATC--ACA-----GATTAAA--TTT----TTTC---AA-CCAAATAA--TTAAT-AAATA------TTAAGCGTTTTAATTA------G---CAA-GTT-TG-A-TACTT-------AAGGCA----T--------TG--AGC-TCAC-----TGA------TGG-TTT---AAA-TGATG--CATACAACA-TTGGGT--CC-CC-AA-AA-A-GGAT-GATAT-CA-GACTAC--ATCTT-GA-ATA-T-CAAT-------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTACGGA-C-------GCCC-TT----T--TGC-ATCC--TATCTATC-CCCCGTTC--TGTCA-TTT--GGCGCTT-CGAGAGTCAATAAATGTGGGTTTCC-CAGGCCCTTAAAGGTA-ATTTAGCTCACCTGAAAG-TTCG-AATTTTC-ACAC---AAAGGTCATAACGAATGTTAAT
gi|12 : gcctgaagcagcagccactaaccagcagcaATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTATT----TAG-------ACGAGG-A---------------C---AAAC---AAACA-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-CAAG-TAA--TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------G---CAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGA-TCAC----CTCA------AGG-TTT--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-AAGGAT-AATAT-CA-ATCTAA--A-CTTTGA-ATAGT-CAAC-------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-C-------GCCC-AT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTC--T--AA-TTTTGGGG-CCT-AAAGAGTCAATAAATG--AGCTTCCACAGGCCCCTAAAGGTA-ATTTATCTCACCTGAAAGTTTCG-GATTTTC-ATACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTT
gi|13 : ctgaagctagcagccactaaccagcagccaA------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGT-TCAC----CTGT------TTG-TTC--CAAA-TGATG--CA-GCA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-A-GAAT-AATAG-CA-ATCT-A--TTATTTGA-ATAAT-CAGCG-------AAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTG-GGA-G-------GCCA-TT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTT--T--CA-TTTTGGGG--TT-GAAG
gi|13 : TGATTGGATTAGGGGTGATGCA---ATGAACTAACA--GTGATAACGGACAAGAAAACA--------AAACACAC--------TTGTTAGATAAGGTTACAAAGACCATgaccggggtacaacctgagacttatttaagagagcggcgccaactttcagacaatcatggtgattggattaggggtgatgcaatgaactaacagtgataacggacaagaaaacaaaacacacttgttagataaggttacaaagaccata
gi|14 : atagtcttaattatcaagtttgatacttgaaggcaattgagttcacctgtttgttccaaatgatgcagcacatgggtcctaaaaagaataatagcaatctattatttgaataatcagcgaaaggagcatagacaaaatgtgggaggccattttgactatctatccccgttttcattttggggttgaaggaccggggtacaacctgagacttatttaagagagcggcgccaactttcagacaatcatggATAAG---CCCG-TA-G-----AA-----TA----GT----CCAA-------------AA--A-TTCAT-CGAA-GT--ACTGAGAGTACT----CAG-------AC-AGA-ATACC-AAAATTA-T-T---AAAC---AATCG-ATC--AAA-AT-TGAT--AT--TTT----TTCT---AA-CAA-------TTGAT-CAACA------T--CT--TCTAAATTA------T---CAA-GTT-TA-A-TACAT-----G-AAGGCAA---C--------TG--AGC-TAAT----CTGA------AAG-TTC--CAAA-TGATA--CA-CCA-CA------------T--AATAA-A-GGTT-AATAA-TA-ATCTAA--TT-TTTCA-GGAGT-CAACG-------AAAGGAGCATA-GAC-Aa
gi|15 : actaggttgaatctagcagccacaaacctgcagtcatcaagcctttagaatctagcagccactaatcagttgccaCATTAC---CCCG-CA-GCCAATAAGTACCTA----GCA-G-TCAA----T-AAGA---AA--A-TTCAT-CAAC-GT--ACGGACAGTACC----CGG-------ACTTAA-A-ACT-GAAAATAAT-C---AAAC---AATCG-AT-----------------A--TTT----TTCC--------AAACAA--TTAAT-CAACA------T--AT--TGTTAATAA------T---GAA-ATT-TG-A-TACTT-----C-AAGGCAA---TTACCGGGATA--AGC-TCAC----CTGA------AAG-TAC--CAAA-Tc
gi|16 : accagactgaagctagcagcA----GTG-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-ATCAT-CAAA-GT--ACTGAGAGTACT----CAG-------A--------ATT----------------------------AGC--AAA-TG---AT--AA--TTT----GTC---------AAATGA--TTAAT-TAACA------C--AT--TCTTAATCA------T----AA-GTT-CT-A-TACCT-----G-ACGACAA---T--------TG--AGC-TCAC-------A------T------------------------CA-CA-A-AGGT--TCAT--AATGA-A-GGTT-AAAAA-CA-ATATAA---TCTTTGA-AGAGT-CCACG------AAAAGAAttcatctccagatgaagtccttattcggtttttttctttggaataaaataacaga
gi|17 : ctttcagcagctactaacaattaTGATTGGATTAGAAGTGATGCA---ATAAAATAGCA--GTGATTACGGACAAGAAAATAATAAAATCAAACAAAC----ACACTTGGTAAATGAGGTTGGAAAGGCCATAAAAAGCTGTTTAGATCACCTGAAAGTTTCGAATTTTTAACCATAAAAGTCATA-ACGAAGAATTGATAACtatgaaaacgaggtagtggaatccttcagctatgta
gi|18 : gggtaccaactggggccaaaagagggcggcgcaacatttcagacaatcgtggATAAA---CCCG-TA-G-----A----------------G-CCAAG---T-AAGA---AA--A-TC-AT-CAAA-GT--ACCGAAAGTACT----CAG-------A-GAGA-ATATTCAAAATTAGT-CT--AGAT---ACTCGTATG--GAC-CT-TGGT--AGACTCT----TTTC---A---AAGATAAAGTT--T-GTAT-------T--AA--CCTTCATTA------T---C
gi|19 : ctgtcgcagaaattacatgaatcgaaactagcaggcactatctagcagcca--TTT----TTTC---AA-CAAA-TAA--TTAAT-AAATACATGTAT--AG--TCTTAATTA------G---CAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAT----CTGA------TAG-TTC--CAA-----------------A-T-GGGT--CC-T--AA-A---------AATAG-CA-ATCT-A--TTCTTTGA-ATAGT-CATCG-------AAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GACC-TT----T--TG--A--C--TATCTAtaaaattaggaacgttccgataagcgcaatt
gi|2 : atCATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CCA----G-A-G-CCAA-------AGA---AA-----TCAT-CAA--GT--ACTGAA-GTACT----TAG-------AGGAGG-ATATT-GAAAG--AT-A---CAAC---AAACA-ATC--AAA----TAAT--AA--TTT----CCTT------CAAAATAA--TTGAC-TAAT-------T--AG--TCTT-ATTG------C---CAA-GTT-TGAA-TACTTCA---T-AGGGCAA---T--------TG---GC-TCAG----ATGA-------GG-TTT--TAAA-TGATG--C--ACA-GATT-TGGTTCCC-T------A-A-GCAT-TATAC-CA-ATCT-A--TACTTTGA-ATAGTCCAAC--------AAAGGAGCACATGAG-CAAAT---GTA--GA-C-------GCCCGTT----C--TG--A--T----TCTCTC-CCA-TTTC--T--CA-TTTT--TGGCCT-AAAGA-TCACT-AATG--GGGTTCCACATTCTCCTAAAGGTCTACTTAGCT-ACC-GAAAGTTTCG--ATTTTC--CACAT-A---GT-ATAACGAAGGTAAATAACTACCTTTAC
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagcGTACGAG-GGC-ATGGAA-ACAAAACAACCCTTTTAA---GCACAGCACAACA-C-AATCCAA-GCAGATAGAGTC-ACTTA-TGGGGTTCCATAG--GCCCTT-AAGGTA--TTAGCTCACCGGTGAAAGTTTCGAATTTT-ACACAT-AAGGT-ATA-ACGAAAG--TAATAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtAACT---TAAAGATGGGGTCGTGGAATCAAAC----AACCTCTTATAAGG-----AAAGACACA-AACGAAATCA-GCAGAATAGAGTC--TAAATGAG---TCACAGGCCTT--AAGGTAATTT-AG-CTCA-CCTGAAAATTTTTCGACATTTTCACACATAAA-GTCATAACGGAAGGTAAATAACcttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntAGTA-GGG--TC-ATGAA--GCAACA-AAC-CTTATAAAGGCCA--G-ACAACG-TAAGCTCA---GCAGTAGAG-C-ACTAA-TGAG--TTCACAGCAGCC-TTAAAGGTATTTAAGCTCAC---TGAAA-TTTCGAATTTTCACA-ATAAAGGTCATA-ACGAAGG--TATCAACcgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtAACT-GTTAAGTA-GGGTGTCCATG-AAT-CAACA-AA--TTTATAA-GTCCA-AG-ACAACAACGAA-TCAGCGACGAT-GAGTC-AATA--TGGG--TCCACA----CCCTTAAATGTGTATTAGCTCACC--TG-AAGTTTCGAATTTCCACA-AT--AGGTCCTA-AC-AAGG--T-ATAACActttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|20 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGGTCTAGGTTAGAGCATTTTTAACTTGGAA-CATCTCATTTGG-GC-AATGAATT
gi|21 : c-----AAG---C-A----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AT--A-TGCAT-CAAA-GT--ACTGAGAGTACTAGTCTAGTACTCGAACG-GA-ATAAC-AAAAAGTAG-C---AAAT---AATCA-ATCAAAAA-T--TGAC--AA--TTT----TCCA---AA-CA----AA--TTAAG-AAACA------T--Acactcgatccatgctttttatagggaaggctgcaatcctacgagccccttttttatgtccaaacgctagggggtagtaaccagctggtg
gi|22 : ATAAA---CTCA-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAG
gi|22 : aagctagcagccaataaacccatggaagccagcagcaaATAAG---CCCC-TG-G-----AAG---CCA----GCA-G-CCAA----T-AGGcccctggaagccagcagccaataggctatgaaaagctagcagcaaataagcc
gi|23 : aagctagcagccaataaacccatggaagccagcagcaaataaactcatagaagctagcagccaAAAACAA--TTTAT-AAGCA---------AA--TCTTAATTAAA----T---CAA-GTT-TG-AATACTT-----G-AAAACAA---C--------TG--AGC-TTA-----CTGA------AAG-TTTTGCTAA-TGTTA--CA-TCA-AA-T-ctatgaaaagctagcagcaaataagcc
gi|24 : tACT----CAG-------ACG-GG-ATATT-AACACTAAT-TGTTAAAA---AATGG-ACC--AAA-AT-TGAT--AA--GTT----TTTCT--AA-CA---T----TTGAT-AAATA------T--AC--TGATAATCA------T---CAA-GTT-TG-A-Tactgtcgaaatgaggattaat
gi|26 : T-TGCAAAGTAGGGGTCATGGAATCAAATCAAAAACATTTTATAAAGGA--CAA-GACAA-CAACGAACTCAAGCAGA-TAGAATCATT
gi|27 : gagAGGGGCCAGGTTATAGAATTTTTAACTGGG-ATTATCTGATTTGG-GC-AATAAATT
gi|28 : tTTATACTGGAATCAAAGG---ACAACGAACTCAAGCAAA-CGGAGTCATTAAATGGGGTTGCATAAACCCTcattcaatccttgcctttcattggaag
gi|29 : aTATTTAGCTCCCCTGAAAATTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTCAATAACACCT
gi|3 : ATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-A-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------ATGAGG-ATATT-AAAAATAAT-C---AAAC---AATCA-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-C-AAATAA--TTGAT-AAATG------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TACTT-----GAAAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA------TAG-TTC--CAAA-TAATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-TA-AA-AA-A-GGAT-AATAT-CA-ACAT-A--TTCTTTGA-ATAGT-CAGCG-------AAAGGAGCATA-GAC-ATAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TTAAGCTTGTG--A--C--TATCTATC-CCC-ATTT--T--CA-TTGTGGAG--TT-GAAGGGCC
gi|3 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaTGGATTAGGGGGTGATGCAATGA-A---ATAAC-AGTG-AT-AACGGACAAGA-AAACA---AATAAAATCAAACAA-----ACACAC---TTGTTGAATAACGTTGCAAAGAC-CATTTAATGCAGTTTAGCTCACCTGAAA--------TTTTCAAGC-------------ATGAATGTCATCACGGAGATTAATAAC---TTAACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGGAAT-CAAAC-AACATTTATAAAGGGCA-AG-ACAACAACGAACTCAA-GCAGATAGAGTC-ATTAAATAGGATTTCACAG--GCCCCTTAAGGTTATTTAGCTCACC--TGAAAGTTCCGAATTTTCACGAATAA--GTC-TAGACGAAGGGTTAATAACATCTggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgattggattagggggtgatgcaatgaaataacagtgataacggacaagaaaacaaataaaatcaaacaaacacacttgttgaataacgttgcaaagaccatttaatgcagtttagctcacctgaaattttcaagcatgaatgtcatcacggagattaataacttaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatggaatcaaacaacatttataaagggcaagacaacaacgaactcaagcagatagagtcattaaataggatttcacaggccccttaaggttatttagctcacctgaaagttccgaattttcacgaataagtctagacgaagggttaataacatcttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatactagtaaagtggggtaggatcaggaaatcataggcacaacaaattatacaggcaagtaccaggcacgaactcaagcaagattagtagtcattaaatggggtccacagacgccttaacagttatttagctcacctgaaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatagagttcataacgaaggttaataacaccttt
gi|3 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcaaccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagatgaggatattaaaaataatcaaacaatcaatcaaatgtgataattttttcaacaaataattgataaatgtagtcttaattatcaagtttgatacttgaaaggcaattgagctcacctgatagttccaaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaacatattctttgaatagtcagcgaaaggagcatagacataatgtaggaggcccttaagcttgtgactatctatccccattttcattgtggagttgaagggccggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgatTAGGGGTCATGGA---ATCAAACAACA--TTTATAAAGGGCAAGACAACAACGAACTCAAGCAGAT----AGAGTCATTAAATAGGATTTCACAGGCCCCTTAAGGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTCCGAATTTTCACGAATAA--GTC-TAGACGAAGGGTTAATAACATCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAA-AGTGGGGTA-GGA-TCAGGAAATCATAGGCACAACAAATT-AT-ACAGG-CAAG--TACCAGGCACG-AACTCAAGCAA-----GATTAGTAGTCATTAAATGGGG-TCCACAGACGCCTTAACAGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAATAGAGTTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTtgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatactagtaaagtggggtaggatcaggaaatcataggcacaacaaattatacaggcaagtaccaggcacgaactcaagcaagattagtagtcattaaatggggtccacagacgccttaacagttatttagctcacctgaaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatagagttcataacgaaggttaataacaccttt
gi|30 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcaaccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagatgaggatattaaaaataatcaaacaatcaatcaaatgtgataattttttcaacaaataattgataaatgtagtcttaattatcaagtttgatacttgaaaggcaattgagctcacctgatagttccaaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaacatattctttgaatagtcagcgaaaggagcatagacataatgtaggaggcccttaagcttgtgactatctatccccattttcattgtggagttgaagggccggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgattggattagggggtgatgcaatgaaataacagtgataacggacaagaaaacaaataaaatcaaacaaacacacttgttgaataacgttgcaaagaccatttaatgcagtttagctcacctgaaattttcaagcatgaatgtcatcacggagattaataacttaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagATAAG---CCCA-TA-T-----AAG---CCA----GCA-G-CCAA----T-AAG
gi|4 : agccagcagctaATAAG---CC-G-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---A-----TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGT-CT----TAG-------ACG--G-ACATT-GAAAATAAT-C---AAAC---AAT----TC--AAA--G-TGAT--A---TTT----TTTC---AA----AATAA--ATAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TTCTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGATACATGTAA-TTC--CTAA-TAATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-TAAAA-AA-A-GGAT-AATAG-AA-ATCT-A--TTCTTTGA-ATAGT-CAGCG-------AAAGGAGCAGA-GAC-AAAAT---GTA-GCA-G-------GCCC-TT----T--TA--T--C--TATCTATC-CCC-GTTT--T--CA-TTTTGGGG--TT-GAAGGGCCcc
gi|4 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaGATTGGATTAGGGGTGATGCA---ATGAAAAACCA--GTGATAACGGACAAGAAAACATTAAAATCAAACAAAC----ACACTTGTTAAATAGGGTTGCAAAGACCATTAAAGGCCGTTTAGCTCACCTGA--------AATTTTCAAGCATAAATGTCATA-ACGAAGAATTAATAACAACTTggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggattaggggtgatgcaatgaaaaaccagtgataacggacaagaaaacattaaaatcaaacaaacacacttgttaaatagggttgcaaagaccattaaaggccgtttagctcacctgaaattttcaagcataaatgtcataacgaagaattaataacaacttcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|4 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaataagccgtagaagctagcagccaataagaatccatcaaagtactgaaagtcttagacggacattgaaaataatcaaacaattcaaagtgatattttttcaaaataaataataaatatagtcttaattatcaagtttgattcttgaaggcaattgagctcacctgatacatgtaattcctaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaaggataatagaaatctattctttgaatagtcagcgaaaggagcagagacaaaatgtagcaggcccttttatctatctatccccgttttcattttggggttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggaACTCGTAAAGTA-GGG-GTA-ATGTAAT-CAAAC-AACATTTGCAAAGGACA-AG-ACACCAACGAACTCAA-Gcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|5 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaataagccgtagaagctagcagccaataagaatccatcaaagtactgaaagtcttagacggacattgaaaataatcaaacaattcaaagtgatattttttcaaaataaataataaatatagtcttaattatcaagtttgattcttgaaggcaattgagctcacctgatacatgtaattcctaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaaggataatagaaatctattctttgaatagtcagcgaaaggagcagagacaaaatgtagcaggcccttttatctatctatccccgttttcattttggggttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggattaggggtgatgcaatgaaaaaccagtgataacggacaagaaaacattaaaatcaaacaaacacacttgttaaatagggttgcaaagaccattaaaggccgtttagctcacctgaaattttcaagcataaatgtcataacgaagaattaataacaacttcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntATAAG---CC-G-TAAG-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAAAGT--ACTGAAAGTAAT----TAG-------ACGAGG-ATATT-GCAAGTA---------------------TC--AAA-TG-TGAT--T---TTT----TTTC---AA-CAAA-TGA--TAAAT-AA-TA------T--AG--TCTTAATAA------G---CAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGCCTCAC----CTGA------TGG-TTT--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-AAGGATTCATAT-CA-ATCTAA--T-CTTTGA-ATAGT-CAATAGTCAACAAAAGGAGCATA-GAC-TAAAT---GTG-GGA-C-------GCCC-GT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCA-GTTC--T--CA-TTTTAGGG-CCT-AAAGAGTCAATAAATG--GGCTTCCACAGACCCTTAAAGGTA-ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCG-AATTTTC-ATACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTGCcag
gi|5 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGTAATA-AAAA-AACGATTATACAGGGCA-AG-ACAACAACGTACTCAA-GCAGGTAGAGTC-ACTAAATGGGGTTCCACAG--GCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatgtaataaaaaaacgattatacagggcaagacaacaacgtactcaagcaggtagagtcactaaatggggttccacaggcccttaaaggtaatttagctca
gi|6 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaataagccgtaagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaaagtactgaaagtaattagacgaggatattgcaagtatcaaatgtgattttttttcaacaaatgataaataatatagtcttaataagcaagtttgatacttgaaggcaattgagcctcacctgatggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggattcatatcaatctaatctttgaatagtcaatagtcaacaaaaggagcatagactaaatgtgggacgcccgtttgactatctatcccagttctcattttagggcctaaagagtcaataaatgggcttccacagacccttaaaggtaatttagctcacctgaaagtttcgaattttcatacataaaggtcataacgaaggttaataacacctttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAG---CCCG-TC-G-----AAG---CTA----GCA-G-TCAA----T-AAGG---AA--A-TTCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAC-------ACAGAA-ATACT-GAAGATTAT-T---AAAC---AATCG-ATC--AAA-TT-TGAT---A--TTT----TTTA---AA-C-AAATAA--TCAAT-AAAGA------T--AT--TCCTGATTA------T---AAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-GATTCAA---C--------AA--AGC-TCAC----CTAA------AAG-TTT--CAAA-TGATG--CA-TCG-CA-T-GGTT--CC-C--AATGA-A-AGTT-AATGA-CA-ATTCAA---TCTATGG-AGGGT-CGA-A------AAAAAGAGCGTA-GAC-A
gi|6 : tggtgatggaagctgcattcgcagtgattgttcagctggcctcctccgatgtcattgcaaaagtctactaggttaaacctagcagtcattaaccagcagataTAA-TGGTTGAAT----GGTGATGAAGGAATGAAACAATA--GTTATAATGGGTAAGACAACAACAGAGCCAAATAGACAGAGAGAGTCGTTAAATAGGGTT-CATAGGTCTATAAGGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattgggccttaagagggcaaggcaacttgacagatccatgtaatggttgaatggtgatgaaggaatgaaacaatagttataatgggtaagacaacaacagagccaaatagacagagagagtcgttaaatagggttcataggtctataagggatattgaatcca
gi|7 : tggtgatggaagctgcattcgcagtgattgttcagctggcctcctccgatgtcattgcaaaagtctactaggttaaacctagcagtcattaaccagcagataataagcccgtcgaagctagcagtcaataaggaaattcatcaaagtactgaaagtacttacacagaaatactgaagattattaaacaatcgatcaaatttgatattttttaaacaaataatcaataaagatattcctgattataaagtttgatacttggattcaacaaagctcacctaaaagtttcaaatgatgcatcgcatggttcccaatgaaagttaatgacaattcaatctatggagggtcgaaaaaaagagcgtagacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattgggccttaagagggcaaggcaacttgacagatccatgATACG---CCTG-TA-C-----AAG---CTATATAGCA-G-CCAA----T-GAGA---AA--A-TACAT-CAAA-GT--ACTAAGAGTACT----TAA-------A-GGGA-ACA-C-AAAAGTTGG-C---AAAC---ACTGG-ATC--AAA--G-TGAT--GA--TAT----TTC---------AAACAG--TCAAT-AAACA------T--AT--TCCTAATTA------T---CAA-GCT-TGAA-TACTT-----A-CAGGCAA---T--------TG--AGA-TTAT----CTGA------TAG-TTC--CTAA-GTATA--CA-TCA-CA-atattgaatcca
gi|8 : attcacaaacataaacattagaagaaattggaacatggcagaaatttcattaaaatgtttcttatgaacctaaaagccacaattttccaaatcaaatataaatgaactttttaatgatttgatcaacccatgacccagggccaggatatcgggggatgggatgtttcaatacgtaaaatttcgacgagaaccgcaagggttcgattcgtagcctatttagatttaaatacatagtgtagatacgagtttctctaggggatacaaaaggtgtttacaaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccacgctggttctagcagccaATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----ACA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-CCCAT-CAAA-GT--A-----------------------------------TT-GAAAATAAT-C---AAAG---AATCA-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TT--------C---AA-CAAA-TAA--TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------T---AAA-GTT-TG-A-TAATT-----G-AA-GCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGG-------AG-TTC--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT---C-T--AA-AACA-GGAT-AATAG-CA-ATCT-G--TTCTTTGA-ATAGT-CAGC-------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAC---GTA-GGA-G-------GCCCTTT----T--TG--A--C--TATCTATA-CTC-GTTT--T--CA-TTTTGGGG--TT-GAAGAGaagactcataatgaaggtc
gi|8 : agactgaagctagcagccactaaccagcagccaGATTGGATTAGGGGCGATGCA---ATGAAATAACACTGTGATAACGGACAAGAAAACAATAAAATCAAGGAAAC----A-------------------CAA------TTAAAGGCAGT-----TCACCTGA--------AATTTTCAAGCATAAATGCCATA-ACGAAGAATTAATAACAACTTcaggggtatcaccaggggtctatttaagagagcggcaccaactttcagacaatcatggcgattggattaggggcgatgcaatgaaataacactgtgataacggacaagaaaacaataaaatcaaggaaacacaattaaaggcagttcacctgaaattttcaagcataaatgccataacgaagaattaataacaactt
gi|9 : agactgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctaacagccaataagaaaacccatcaaagtattgaaaataatcaaagaatcaatcaaatgtgataattcaacaaataattaataaatatagtcttaattataaagtttgataattgaagcaattgagctcacctggagttccaaatgatgcaacacatgggtctaaaacaggataatagcaatctgttctttgaatagtcagcaaaaggagcatagacaaaacgtaggaggccctttttgactatctatactcgttttcattttggggttgaagagcaggggtatcaccaggggtctatttaagagagcggcaccaactttcagacaatcatggcCATAAGGCCCTCG-TAAG-----AAGA--CTA----GCA-G-CCAAACTGTGAAGAGCGAA--A-TCCAT-CAAA-GT---TT-----TACT----TAGCT-----CCGAGG-GTATT-GAAA-TAAT-C---AAAC---A-----ATC--AAA-TGTTGAT--AT--CTTTA--TTTCATGAA-CAAGTTAA--TAATT-AAATA------T---C--TCGTAA-TA------G---CAACATTCTT-A-TACTTTGTGCA-CAGGCAAACCT--------TGAAAG--TCAT----CTGAC-----TAGCTTC--CAAA-T----------------C-GGGT--CC-T---A-AA-A-GGAT-CATAG-CATATATAT--TCTTTTGACATAGT-CATCG-------AAAGGA-CATA-TAC--AAGT---GTA-GGA-GATAAGTTGC---------T--TG--A--CCGTATCTATTGCCC-GTTC-----CA-TTTT-GGGGTTT-AAGGGGCC
blockSeqs : GCC G A CCAAT TAC TATA . A ACTG G GCG TA A G A TT AGTC TACTCGAACG . C CTAATTGTT CCA TCGT AA TGG TAAA GTTT ATGAACAAGT AG G CATGTA TA GGG GGAG C C G A TGTGC A ACC TACCGGGA AA C AACC TACATGTA C TG A GG TA A T T TC A AA T C A T AT T AAAATT C C AGTCAACA T C ATG C GATAAGTT G AAGC TG GG TC CG G C CTT . A GC . TG T C A . AT A C T T CAAA C AG G AT A C CA A A G AT G T . . . . T C C . A . GGA G CT A AT A AGAGAGAGTC A A A T AAGTTT AA G T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . T G G C TAGGC A G . . A A GGC A GATTAGTA T G T A NNNNNNNNNNNGA A NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN C C T C G TA AC CC A C C A A T GC CA . C A G GCA A T GG C A CA G G GT G C AAC . .
blockSeqs : . . A . A . . . G . . . . . . . . CTCCGA . . ATAATTC . GAA . TGT AGAC TA AATCAAAA . . . . GCG AAT . . A . CA . . . . . . AATTG . . . . A . . . . . C T . A . T . ACAT . . AA . . . . AG T . . C . . . . TGT . G GC . . . T G . AT A C . . . A AA G . A C AC A . A AT . G . A . A AC C ACACTT G A A T AAGTTC AT . A G . . A A . A . . . . . . ACACAC . . A G . A C . . . A A A AT A . . A G C A GC . C A A G A T . A A CC . G . T C ATT . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . GACAA . . TTAGTCT . ACA . TG AA . AACCAAA . . . . G G . . A . . . . . . . . CTA . . . . A . . . . . A T . . . T . AATT . . GA . . . . C . . . . . . . . T . G GC . . . T A . AT A C . CT . . . . AC . . G . . C . C TT A AGAGTC T C C C . AT . A . . . C . . . G G A AT A . . A G C A AC . A . G G T A . . . A . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . AGGA . . ATAATC . ACA . AT AA . AACAAG . . . . G G . . . . . . . . . . . TG . . . . G . . . . . . . . . . G . ATTC . . AA . . . . C . . . . . . . . T . G GT . . . T . . . . . . . G . A AC G ACACTT G A A A . . . . . . . T T C GA A . . A G C A CA . T . . G A A . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . ACGA . . AGTAGC . TCG . TG AT . AACAAA . . . . T T . . . . . . . . . . . AG . . . . C . . . . . . . . . . A . AAA . . A . . . . G . . . . . . . . T . G C . . . . . . . . . . G . C AT A TT . T T . . . T T C C . . . . G C A CA . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . ACTT . . ATAATC . TCG . CT AA . AACAAA . . . . T T . . . . . . . . . . . TT . . . . A . . . . . . . . . . A . ATT . . A . . . . G . . . . . . . . T . A C . . G . A . . A . A . . . . . T A T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . AGGA . . ATAATC . ACA . AT AA . AACAAA . . . . T T . . . . . . . . . . . AA . . . . T . . . . . . . . . . G . AAT . . G . . . . C . . . . . . . . T . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . ATGA . . ATTATT . TCA . TG AA . AACAAA . . . . A T . . . . . . . . . . . AA . . . . A . . . . . . . . . . C . ATT . . G . . . . G . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . ACGA . . GTTGGC . TGG . TG AA . AACAAA . . . . G T . . . . . . . . . . . TA . . . . A . . . . . . . . . . T . ATA . . G . . . . G . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . ACAG . . ATAATC . TCA . TT AA . AACAA . . . . G G . . . . . . . . . . . AA . . . . A . . . . . . . . . . G . ATT . . G . . . . C . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . ACA . . GAATC . TCG . TG GA . AAAGA . . . . A C . . . . . . . . . . . TA . . . . T . . . . . . . . . . T . ATT . . G . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . AGA . . TTATT . TGG . T AA . CAAAA . . . . C T . . . . . . . . . . . TG . . . . T . . . . . . . . . . A . AAT . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . ACG . . TAATC . TCA . G AT . TAACA . . . . G T . . . . . . . . . . . AA . . . . A . . . . . . . . . . G . AAT . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . ACG . . GATA . T . G A . AACA . . . . G T . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . G . GTT . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . AGG . . GTA . . . . A . AAAA . . . . G G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . T . AAA . . . . T T . . . . . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . AAA . . . . T T . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . AAA . . . . G T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C G
blockSeqs : . .
blockSeqCons : TG** AACAAA***** ** T********* N* ATT*** G******* A* AT* AGAGTC**** ****** T*
originalCons : CATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------ACGAGG-ATATT-GAAANTAAT-C---AAAC---AATCG-ATC--AAA-TG-TGAT--AA--TTT----TTTC---AA-CAAAATAA--TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA------TAG-TTC--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-A-GGAT-AATAN-CA-ATCTAA--TTCTTTGA-ATAGT-CAACG------AAAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTC--T--CA-TTTTGGGGGCTT-AAAGAGTCAATAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGTA-ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCG-AATTTTC-ACACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACT-CGTAAAGTAGGGGTCGTGGAATCAAAC----AACGTTTTATACGGGA--CAAAGACAAACAACGAACTCAAGCAGA-TAGAGTCATTAAATGGGGTTNCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAGTTTTTCGACATTTTCACACATAAAGGTCATAACGGAAGGTNAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTGATTGGATTAGGGGTGATGCA---ATGAAACAACA--GTGATAACGGACAAGAAAACAACAAAATCAAGCAGAC----AGAGTCGTTAAATAGGGTTNCAAAGGCCNTTAAAGGCNGTTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGCATAAANGTCATA-ACGAAGAATTAATAACANCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAACAGTGGANTAGGGG-TCATGNAATCA-A---ACAAC-ANTG-AT-AAAGGACAAGA-AACCA---ACGAAACTCAAGCAA-----ANATAG-AGTCGTTAAATGGGGTTCCACAGAC-CCTTAAANGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGNAATGCAAAA-AACANTTATAAAGGGCA-AG-ACAACAACGAACTCAA-GNCGATAGAGTC-ACTAAATGGGGTTCCACAG--GCCCTTAAAGGTATTTTAGCTCACC--TGAAAGTTTCGAATTTTCACGCATAAAGGTCATA-ACGAAGG--TAATAACATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGGCTAGGTTANAGCATTTTTAACTTGG-A-CATCTGATTTGG-GC-AATGAATT
finalCons : CATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------ACGAGG-ATATT-GAAANTAAT-C---AAAC---AATCG-ATC--AAATG--TGAT--AA--TTT----TTTCAACAAA-----TAA--TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTAT---------CAA-GTT-TG-A-TACTT-----G-AAGGCAA---T--------TG--AGC-TCAC----CTGA------TAG-TTC--CAAA-TGATG--CA-ACA-CA-T-GGGT--CC-T--AA-AA-A-GGAT-AATAN-CA-ATCTATT---CTTTGA-ATAGT-CAACG-------AAAGGAGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTC--T--CA-TTTTGGGGGCTT-AAAGAGTCAATAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGTA-ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGA-ATTTTC-ACACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACT-CGTAAAGTAGGGGTCGTGGAATCAAAC----AACGTTTTATACGGGA--CAAAGACAAACAACGAACTCAAGCAGA-TAGAGTCATTAAATGGGGTTNCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAGTTTTTCGACATTTTCACACATAAAGGTCATAACGGAAGGTNAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTGATTGGATTAGGGGTGATGCA---ATGAAACAACA--GTGATAACGGACAAGAAAACAACAAAATCAAGCAGACAGAGTC----GTTAAATAGGGTTNCAAAGGCCNTTAAAGGCNGTTTAGCTCACCTGA------CGAATTTTCAAGCATAAANGTCATA-ACGAAGAATTAATAACANCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAACAGTGGANTAGGGG-TCATGNAATCA-A---ACAAC-ANTG-AT-AAAGGACAAGA-AACCA---ACGAAACTCAAGCAA-----ANATAG-AGTCGTTAAATGGGGTTCCACAGAC-CCTTAAANGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGNAAT-CAAAA-AACANTTATAAAGGGCA-AG-ACAACAACGAACTCAA-GNCGATAGAGTC-ACTAAATGGGGTTCCACAG--GCCCTTAAAGGTATTTTAGCTCACC--TGAAAGTTTCGAATTTTCACGCATAAAGGTCATA-ACGAAGG--TAATAACATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGGCTAGGTTANAGCATTTTTAACTTGG-A-CATCTGATTTGG-GC-AATGAATT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): GCTAGCAGCCAACTAACCCCACAGTCAACAATAAGCCGTAGAAGCTGTATACCAAAAAATGAAATTCAGCCAAGTTTAAAGCAAACTGATATT
Unaligned ( gi|31 ): AGGCTGAAGCTAGCAGCCACTAACAGCAGCCAATAAGCACG
Unaligned ( gi|32 ): ACGAAAGTTAGCAGCCACTAACCAGCAACCAATAAG
Unaligned ( gi|33 ): CTGTTGTAACAATTATATGATTTGGATAAATACCA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111111111 111111 1111111111 11111111111 111111111 11 11 111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2222 111 1 11 11 1 1 1 1 1 1 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 111 2222222222 7777777 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 1 22222 1 1 1 22 222 3333333333333 1 5555555555555 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 111111 1 1 111 11 1 1 11 3333 1 1
lowQualScore : 444 2 7 55555 666 4444 2 2 6666 2 444 33 2 2 2 33 4444 3333333333333 2 0 2 8888888888 333 6666 33 222222 333333 4444 55 0 2 333 666 2 44 4 555555 22 777 1111111111 2 2 4 4 2 88888 333 88888888 33 2 4444 66666666666 2 33 2 33 77 2 2 2 33 2 8 8 6666 2 666 2 2 5555 2 2 2 88888888 0 2 2 2 2 555 3 222222222 6 6666 44 77 44 44 3 3 55555 3 8 33 3 99 6 1 66 6 333 3 2 8 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 88 2 3 4444 222 6 7 3 6 11 6 1 88 5 5 5 5 5 5 5 1 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5 0 000 3 0 77 1 22 3 0 2222222222 8 1 3 1 0 0 9999999 0 44 0 8 1 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5 1 6 3 1 77777 3 1 3 3 7 00 333 7 6666666666666 0 7 3 1 6 5555555555555 3 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 5 5 5 0 5 555555 66 5 3 0 5 5 3 0 1 5 55 5 1 1 2 111 3 7 11 0 5 0 0 88 8 5 11 0 1 6 7777 3 3
lowQualScore : ... . . ..... ... .... . . .... . ... .. . . . .. .... ............. . . . .......... ... .... .. ...... ...... .... .. . . ... ... . .. . ...... .. ... .......... . . . . . ..... ... ........ .. . .... ........... . .. . .. .. . . . .. . . . .... . ... . . .... . . . ........ . . . . . ... . ......... . .... .. .. .. .. . . ..... . . .. . .. . . .. . ... . . . .............................................................................................................................................. .. . . .... ... . . . . .. . . .. . . . . . . . . .......................................................................................................................................... . . ... . . .. . .. . . .......... . . . . . . ....... . .. . . . .............................................................................................................................. . . . . . ..... . . . . . .. ... . ............. . . . . . ............. . ............................................................................................................................ . . . . . . ...... .. . . . . . . . . . .. . . . . ... . . .. . . . . .. . . .. . . . .... . .
lowQualScore : 111 4 1 66666 111 2222 0 0 2222 0 111 22 4 4 4 22 7777 2222222222222 2 8 2 1111111111 999 8888 11 000000 555555 5555 00 6 1 777 111 0 88 0 555555 66 111 0000000000 1 1 2 2 2 66666 999 11111111 11 2 7777 33333333333 2 11 2 22 44 4 5 7 77 7 0 0 5555 7 333 7 7 3333 7 7 7 77777777 8 7 7 7 7 444 1 777777777 2 5555 22 33 22 22 6 6 55555 6 8 33 6 22 7 7 55 7 000 2 5 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 00 5 7 0000 777 7 3 3 7 33 7 0 55 5 5 5 5 0 0 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 7 000 0 4 99 3 11 4 4 1111111111 6 6 0 0 8 8 0000000 6 66 8 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 7 3 0 77777 3 0 3 3 3 77 333 3 0000000000000 7 3 3 0 5 0000000000000 2 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 0 0 0 8 0 666666 00 0 2 2 0 0 2 2 4 0 33 7 7 3 0 777 5 8 00 8 0 6 8 88 0 0 00 8 0 7 7777 3 3
consensus : CATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------A--CGAGG-ATATT-GAAANTAAT-C---AAAC---AATCG-ATC--AAA-TG-T-GAT--AA--TTT----T--TTC-A---AC--AAA-TAA--TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TACTTG-A-----AGGCAA---T--------TGA--GC-TCAC----CTGA---TA------G-TTC--CAAA-TGATG--CA-ACA-CAT-G-GGT--CC-T-AA-AA--A-GGAT-AATA-N-CA-ATCT-A---TTCTTT-GA-ATAGT-CAA-------CGAAAG-G-AGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTC--T--CA-TTTTGGGGGCTT-AAAGAGTCAATAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGTA-ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCG-AATTTTC-ACACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTGCGTAAAGNNGGGGTCGTGGAATCAAACAACNTCTTATACGGGA--CAAAGACA-ACAACGAACTCAAGCAGA-TAGAGTCACTAAATGGGGTTNCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAGTTTTTCGACATTTTCACACATAAAGGTCATAACGGAAGGTNAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTGATTGGATTAGGGGTGATGCA---ATGAAACAACA--GTGATAACGGACAAGAAAACAACAAAATCAAGCAGAC----AGAGTCGTTAAATAGGGTTNCAAAGGCCNTTAAAGGCNGTTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGCATAAANGTCATA-ACGAAGAATTAATAACANCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAACAGTGGANTAGGGG-TCATGNAATCA-A---ACAAC-ANTG-AT-AAAGGACAAGA-AACCA---ACGAAACTCAAGCAA-----ANATAG-AGTCGTTAAATGGGGTTCCACAGAC-CCTTAAANGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGGAAT-CAAA----A-AACATTT-ATAAAGGGCA-AG-ACAACAACGAACTCAA-GCAGATAGAGTC-ACTAAATGGGGTTCCACAG--GCCCTTAAAGGTATTTTAGCTCACC--TGAAAGTTTCGAATTTTCACGCATAAAGGTCATA-ACGAAGG--TAATAACATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGGCTAGGTTANAGCATTTTTAACTTGG-A-CATCTGATTTGG-GC-AATGAATT
Reference ( family-675 ) : CATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------A--CGAGG-ATATT-GAAANTAAT-C---AAAC---AATCG-ATC--AAA-TG-T-GAT--AA--TTT----T--TTC-A---AC--AAA-TAA--TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TACTTG-A-----AGGCAA---T--------TGA--GC-TCAC----CTGA---TA------G-TTC--CAAA-TGATG--CA-ACA-CAT-G-GGT--CC-T-AA-AA--A-GGAT-AATA-N-CA-ATCT-A---TTCTTT-GA-ATAGT-CAA-------CGAAAG-G-AGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTC--T--CA-TTTTGGGGGCTT-AAAGAGTCAATAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGTA-ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCG-AATTTTC-ACACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACT-CGTAAAGTAGGGGTCGTGGAATCAAACAACGTTTTATACGGGA--CAAAGACAAACAACGAACTCAAGCAGA-TAGAGTCATTAAATGGGGTTNCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAGTTTTTCGACATTTTCACACATAAAGGTCATAACGGAAGGTNAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTGATTGGATTAGGGGTGATGCA---ATGAAACAACA--GTGATAACGGACAAGAAAACAACAAAATCAAGCAGAC----AGAGTCGTTAAATAGGGTTNCAAAGGCCNTTAAAGGCNGTTTAGCTCACCTGA------CGAATTTTCAAGCATAAANGTCATA-ACGAAGAATTAATAACANCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAACAGTGGANTAGGGG-TCATGNAATCA-A---ACAAC-ANTG-AT-AAAGGACAAGA-AACCA---ACGAAACTCAAGCAA-----ANATAG-AGTCGTTAAATGGGGTTCCACAGAC-CCTTAAANGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGNAAT-CAAA----A-AACANTT-ATAAAGGGCA-AG-ACAACAACGAACTCAA-GNCGATAGAGTC-ACTAAATGGGGTTCCACAG--GCCCTTAAAGGTATTTTAGCTCACC--TGAAAGTTTCGAATTTTCACGCATAAAGGTCATA-ACGAAGG--TAATAACATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGGCTAGGTTANAGCATTTTTAACTTGG-A-CATCTGATTTGG-GC-AATGAATT
gi|1 : CATAAA---CCCG-TAAG-----AAG---CTA----GCAAG-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------A--CGAGGGATATT-GAAATTAAT-C---AAAC---AAACA-ATC--AAAATG-T-GAT--AA--TTT----T--TTC-A---AC--AAAATAAA-TTAAT-AAATA------T--AG--TTTTAATTGCAAGTTT---TAA-ATT-TG-A-TACTTG-A-----AGGCAA---T--------TGA--GC-TCAC----CTGA---TG------G-TTT--CAAA-TGATG--CA-ACA-AAT-G-GGT--CC-T-AA-AA--A-GGAT-GATATT-CA-ATCTAA---TTCTTT-GA-ATATT-CAA-------TAAAAGAA-AGCATA-GAC-AAAAC---ATA-GGA-C-------GCCC-TT----T--TG--A--C--AATCTAT--CCC-GTTC--T--CATTTTTGGGGGCTTCAAAGAGACAATAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAGGG-A-ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCGAAATTTTCAACACATAAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTGCGTAAAGTAGGGGTCATGGAATCAAACAACGTTTGATGCAGGA--CAAAGACAAACAACGAACCCAAGCAGA-TAGA-TCACTAAATGGGGTTCCACAAGCCCTTAAAGGTGATTTTAGACTCATCCTGAAAG-TTTTCGA-ATTTTCA-ACATAAAGGTCATAACGAAAGGTTAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACTAGTTAAAGTAGGGGTCATGGA---AT-CAACAACA--TGGATAAAGGACAAGACAACAACGAACTCAAGCAGAT----AGAGT-ATTAAATGGGGTTCCACAGGCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCAAC-GAAAGTTTCGAATTTTCACACATAAAGGTCATA-ACGTAAGGCTAATAACACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACAGTAAAATAGGGG-TCATGGAATCA-A---ACAAC-ATTGCATAAAAGGACAAAACAACCA---ACGAAACTCAAGCAATAAGCAGATAG-AGTCATTAGATGGGGTTCCACTGGC-CCTTAAAGGTTATTCAGCTCAAATGAAGGTTTCGAATTTTCACGA-------------AAAAAGGTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGACCTCTTTAACTTGTGAAATC-AGG-GTT-AT-AAATGTAAA----C-AATAGTG-ATAAAATGCA-AG-CCAACAACAAAGTTAA-GGCGTTAGA-TCGAATAAAAGTGATTTCATAT--GCACTTAAAGGTATTTTAGCTCGCC--TGAAAGTTTCGAATTTTCATGCATAAAAGTTATA-ACTAATA--TAAAAA
gi|1 : AGGGGCTAGGTTAAACCATTTGTAA--TGA----ATCGGGTTTGGTGCTAATGAATTacttaacctaatgaaatgaatataggcaacagctagccgggagagctgacttgactatcattttccgccttcagtttatcacagtacgagtaccacttgaaggttgggactttgtgatctctgtatcatatgaacaaagggagcgtttttgcgcttaacacgaaggtgatggcttgttcgtaatgataggggctaggttaaaccatttgtaatgaatcgggtttggtgctaatgaatt
gi|10 : cataaacccgtaagaagctagcaagccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagacgagggatattgaaattaatcaaacaaacaatcaaaatgtgataattttttcaacaaaataaattaataaatatagttttaattgcaagttttaaatttgatacttgaaggcaattgagctcacctgatggtttcaaatgatgcaacaaatgggtcctaaaaaggatgatattcaatctaattctttgaatattcaataaaagaaagcatagacaaaacataggacgcccttttgacaatctatcccgttctcatttttgggggcttcaaagagacaataaatgggcttccacaggcccttaagggaatttagctcacctgaaagtttcgaaattttcaacacataaaaggtcataacgaaggttaataacacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgcgtaaagtaggggtcatggaatcaaacaacgtttgatgcaggacaaagacaaacaacgaacccaagcagatagatcactaaatggggttccacaagcccttaaaggtgattttagactcatcctgaaagttttcgaattttcaacataaaggtcataacgaaaggttaataacacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaactagttaaagtaggggtcatggaatcaacaacatggataaaggacaagacaacaacgaactcaagcagatagagtattaaatggggttccacaggcccttaaaggtaatttagctcaacgaaagtttcgaattttcacacataaaggtcataacgtaaggctaataacacctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacagtaaaataggggtcatggaatcaaacaacattgcataaaaggacaaaacaaccaacgaaactcaagcaataagcagatagagtcattagatggggttccactggcccttaaaggttattcagctcaaatgaaggtttcgaattttcacgaaaaaaggtcataacgaaggttaataacacctttacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagacctctttaacttgtgaaatcagggttataaatgtaaacaatagtgataaaatgcaagccaacaacaaagttaaggcgttagatcgaataaaagtgatttcatatgcacttaaaggtattttagctcgcctgaaagtttcgaattttcatgcataaaagttataactaatataaaaaacttaacctaatgaaatgaatataggcaacagctagccgggagagctgacttgactatcattttccgccttcagtttatcacagtacgagtaccacttgaaggttgggactttgtgatctctgtatcatatgaacaaagggagcgtttttgcgcttaacacgaaggtgatggcttgttcgtaatgatA----GCA-GACCGC----C-AAGA---AATAA-TCCATGCAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAGG------A--CAAGG-ATATT-GGAAATAATTC---AAACCCAAAGAA-ATC--CAA-TGGT-GAT--AA--TTTGTTTT--TCC-A---ATCAAAA-TAA--TTAATGAAATA------T--AGGGTCCTTATTA------GGAGCAT-GTT-TGGA-TACCTG-A-----AGGCAA---T--------GCG--GC-TCACAACCCTGGAATTG------G-TTT--CAAAATGATGGGCA-ACA-CAT-G-GGG--TC-T-AA-AA--A-GGAT-AATA-ATCA-ATCT-AAAATTGTT--GA-ATAGT-CAC-------CAAAAG-GGAGC-TA-GCCCAAAATATGGTA-GAAAG-------GCCC-TT----T--TGGGA--T--TATCTAAT-CCC-GTTCCTT--CA-TTTTAGGGGCCT-AAAGAGTCAACAAATG--GGCTTCCACAGGCCCTTAAAGGTA-ATGTAGCTCACCCGAAAGTTTCG--ATTTTC-ATAC----------------AAGGTTAATAAC-ACCTTT
gi|11 : tgataatgctgagcgcgctctaaccagcacgccaataATAAG---CCCGGTA-T-----GAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--AATCCAT-CCAA-GTTTACTGAAAGTACT----TAC-------A--GGAGG-ATATT-GAAAG-AAT-C---AATT---AAACA-ATC--ACA------GATTAAA--TTT----T--TTC-A---ACC-AAA-TAA--TTAAT-AAATA------TTAAGCGTTTTAATTA------G---CAA-GTT-TG-A-TACTT--A-----AGGCA----T--------TGA--GC-TCAC-----TGA---TG------G-TTT---AAA-TGATG--CATACAACATTG-GGT--CC-CCAA-AA--A-GGAT-GATA-T-CA-GACT-A---CATCTT-GA-ATA-T-CAA-------TAAAAG-G-AGCATA-GAC-AAAAT---GTACGGA-C-------GCCC-TT----T--TGC-ATCC--TATCTATC-CCCCGTTC--TGTCA-TTT--GGCGCTT-CGAGAGTCAATAAATGTGGGTTTCC-CAGGCCCTTAAAGGTA-ATTTAGCTCACCTGAAAG-TTCG-AATTTTC-ACAC---AAAGGTCATAACGAATGTTAAT
gi|12 : gcctgaagcagcagccactaaccagcagcaATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTATT----TAG-------A--CGAGG-A---------------C---AAAC---AAACA-ATC--AAA-TG-T-GAT--AA--TTT----T--TTC-A---AC--AAG-TAA--TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------G---CAA-GTT-TG-A-TACTTG-A-----AGGCAA---T--------TGA--GA-TCAC----CTCA---AG------G-TTT--CAAA-TGATG--CA-ACA-CAT-G-GGT--CC-TAAA-AA--A-GGAT-AATA-T-CA-ATCT-A---AACTTT-GA-ATAGT-CAA-------CAAAAG-G-AGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-C-------GCCC-AT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTC--T--AA-TTTT-GGGGCCT-AAAGAGTCAATAAATG--AGCTTCCACAGGCCCCTAAAGGTA-ATTTATCTCACCTGAAAGTTTCG-GATTTTC-ATACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTT
gi|13 : ctgaagctagcagccactaaccagcagccaA------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TACTTG-A-----AGGCAA---T--------TGA--GT-TCAC----CTGT---TT------G-TTC--CAAA-TGATG--CA-GCA-CAT-G-GGT--CC-T-AA-AA--A-GAAT-AATA-G-CA-ATCT-A---TTATTT-GA-ATAAT-CAG-------CGAAAG-G-AGCATA-GAC-AAAAT---GTG-GGA-G-------GCCA-TT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCC-GTTT--T--CA-TTTTGGGG--TT-GAAG
gi|13 : TGATTGGATTAGGGGTGATGCA---ATGAACTAACA--GTGATAACGGACAAGAAAACA--------AAACACAC--------TTGTTAGATAAGGTTACAAAGACCATgaccggggtacaacctgagacttatttaagagagcggcgccaactttcagacaatcatggtgattggattaggggtgatgcaatgaactaacagtgataacggacaagaaaacaaaacacacttgttagataaggttacaaagaccata
gi|14 : atagtcttaattatcaagtttgatacttgaaggcaattgagttcacctgtttgttccaaatgatgcagcacatgggtcctaaaaagaataatagcaatctattatttgaataatcagcgaaaggagcatagacaaaatgtgggaggccattttgactatctatccccgttttcattttggggttgaaggaccggggtacaacctgagacttatttaagagagcggcgccaactttcagacaatcatggATAAG---CCCG-TA-G-----AA-----TA----GT----CCAA-------------AA--A-TTCAT-CGAA-GT--ACTGAGAGTACT----CAG-------A--C-AGA-ATACC-AAAATTA-T-T---AAAC---AATCG-ATC--AAA-AT-T-GAT--AT--TTT----T--TCT-A---AC--AA-------TTGAT-CAACA------T--CT--TCTAAATTA------T---CAA-GTT-TA-A-TACATG-A-----AGGCAA---C--------TGA--GC-TAAT----CTGA---AA------G-TTC--CAAA-TGATA--CA-CCA-CA------------T-AATAA--A-GGTT-AATA-A-TA-ATCT-A---ATTTTT-CA-GGAGT-CAA-------CGAAAG-G-AGCATA-GAC-Aa
gi|15 : actaggttgaatctagcagccacaaacctgcagtcatcaagcctttagaatctagcagccactaatcagttgccaCATTAC---CCCG-CA-GCCAATAAGTACCTA----GCA-G-TCAA----T-AAGA---AA--A-TTCAT-CAAC-GT--ACGGACAGTACC----CGG-------A--CTTAA-A-ACT-GAAAATAAT-C---AAAC---AATCG-AT------------------A--TTT----T--TCC-A---A-----A-CAA--TTAAT-CAACA------T--AT--TGTTAATAA------T---GAA-ATT-TG-A-TACTTC-A-----AGGCAA---TTACCGGGATAA--GC-TCAC----CTGA---AA------G-TAC--CAAA-Tc
gi|16 : accagactgaagctagcagcA----GTG-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-ATCAT-CAAA-GT--ACTGAGAGTACT----CAG-------A----------ATT----------------------------AGC--AAA-TG----AT--AA--TTT----G--T--------C--AAA-TGA--TTAAT-TAACA------C--AT--TCTTAATCA------T----AA-GTT-CT-A-TACCTG-A-----CGACAA---T--------TGA--GC-TCAC-------A---T------------------------------CA-CAA-A-GGT--TCAT-AATGA--A-GGTT-AAAA-A-CA-ATAT-A---ATCTTT-GA-AGAGT-CCA-------CGAAAA-G-AATATG-AAA-ACGAG---GTA-GTG-G-------AATC-CT----T--CA--G--C--TATGTAttcatctccagatgaagtccttattcggtttttttctttggaataaaataacaga
gi|17 : ctttcagcagctactaacaattaTGATTGGATTAGAAGTGATGCA---ATAAAATAGCA--GTGATTACGGACAAGAAAATAATAAAATCAAACAAAC----ACACTTGGTAAATGAGGTTGGAAAGGCCATAAAAAGCTGTTTAGATCACCTGAAAGTTTCGAATTTTTAACCATAAAAGTCATA-ACGAAGAATTGATAAC
gi|18 : gggtaccaactggggccaaaagagggcggcgcaacatttcagacaatcgtggATAAA---CCCG-TA-G-----A----------------G-CCAAG---T-AAGA---AA--A-TC-AT-CAAA-GT--ACCGAAAGTACT----CAG-------A---GAGA-ATATTCAAAATTAGT-CT--AGAT---ACTCGTATG--GAC-CT-T-GGT--AGACTCT----T--TTC-A---A---AGA-TAAAGTT--T-GTAT-------T--AA--CCTTCATTA------T---C
gi|19 : ctgtcgcagaaattacatgaatcgaaactagcaggcactatctagcagcca--TTT----T--TTC-A---AC--AAA-TAA--TTAAT-AAATACATGTAT--AG--TCTTAATTA------G---CAA-GTT-TG-A-TACTTG-A-----AGGCAA---T--------TGA--GC-TCAT----CTGA---TA------G-TTC--CAA-----------------AT-G-GGT--CC-T-AA-A----------AATA-G-CA-ATCT-A---TTCTTT-GA-ATAGT-CAT-------CGAAAG-G-AGCATA-GAC-AAAAT---GTA-GGA-G-------GACC-TT----T--TG--A--C--TATCTAtaaaattaggaacgttccgataagcgcaatt
gi|2 : atCATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CCA----G-A-G-CCAA-------AGA---AA-----TCAT-CAA--GT--ACTGAA-GTACT----TAG-------A--GGAGG-ATATT-GAAAG--AT-A---CAAC---AAACA-ATC--AAA-TA----AT--AA--TTT----CC-TTC-A---A----AA-TAA--TTGAC-TAAT-------T--AG--TCTTA-TTG------C---CAA-GTT-TG-AATACTTC-ATA---GGGCAA---T--------TG---GC-TCAG----ATGA----G------G-TTT--TAAA-TGATG--CA--CA-GAT-TTGGTTCCC-T-AA-------GCAT-TATA-C-CA-ATCT-A---TACTTT-GA-ATAGTCCAA-------C-AAAG-G-AGCACATGAG-CAAAT---GTA--GA-C-------GCCCGTT----C--TG--A--T----TCTCTC-CCA-TTTC--T--CA-TTTT--TGGCCT-AAAGA-TCACT-AATG--GGGTTCCACATTCTCCTAAAGGTCTACTTAGCT-ACC-GAAAGTTTCG--ATTTTC--CACAT-A---GT-ATAACGAAGGTAAATAACTACCTTTAC
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagcGTACGAG-GGC-ATGGAAA-CAAA----ACAACCCTT-TTAA---GCACAGCACAACA-C-AATCCAA-GCAGATAGAGTC-ACTTA-TGGGGTTCCATAG--GCCCTT-AAGGTA--TTAGCTCACCGGTGAAAGTTTCGAATTTT-ACACAT-AAGGT-ATA-ACGAAAG--TAATAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtAACT---TAAAGATGGGGTCGTGGAATCAAACAACCTCTTATAAGG-----AAAGACACA-AACGAAATCA-GCAGAATAGAGTC--TAAATGAG---TCACAGGCCTT--AAGGTAATTT-AG-CTCA-CCTGAAAATTTTTCGACATTTTCACACATAAA-GTCATAACGGAAGGTAAATAACcttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntAGTA-GGG--TC-ATG-AAG-CAAC----A-AAC-CTT-ATAAAGGCCA--G-ACAACG-TAAGCTCA---GCAGTAGAG-C-ACTAA-TGAG--TTCACAGCAGCC-TTAAAGGTATTTAAGCTCAC---TGAAA-TTTCGAATTTTCACA-ATAAAGGTCATA-ACGAAGG--TATCAACcgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|2 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtAACT-GTTAAGTA-GGGTGTCCATG-AAT-CAAC----A-AA--TTT-ATAA-GTCCA-AG-ACAACAACGAA-TCAGCGACGAT-GAGTC-AATA--TGGG--TCCACA----CCCTTAAATGTGTATTAGCTCACC--TG-AAGTTTCGAATTTCCACA-AT--AGGTCCTA-AC-AAGG--T-ATAACActttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactgttaagtagggtgtccatgaatcaacaaatttataagtccaagacaacaacgaatcagcgacgatgagtcaatatgggtccacacccttaaatgtgtattagctcacctgaagtttcgaatttccacaataggtcctaacaaggtataaca
gi|20 : ctgagctgcagcactatacgcagccataagcccgtagaagccagagccaaagaaatcatcaagtactgaagtacttagaggaggatattgaaagatacaacaaacaatcaaataataatttccttcaaaataattgactaattagtcttattgccaagtttgaatacttcatagggcaattggctcagatgaggttttaaatgatgcacagatttggttccctaagcattataccaatctatactttgaatagtccaacaaaggagcacatgagcaaatgtagacgcccgttctgattctctcccatttctcatttttggcctaaagatcactaatggggttccacattctcctaaaggtctacttagctaccgaaagtttcgattttccacatagtataacgaaggtaaataactacctttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacttcagcccataacctgtgtgtacgagggcatggaaacaaaacaacccttttaagcacagcacaacacaatccaagcagatagagtcacttatggggttccataggcccttaaggtattagctcaccggtgaaagtttcgaattttacacataaggtataacgaaagtaataaccttttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaagatggggtcgtggaatcaaacaacctcttataaggaaagacacaaacgaaatcagcagaatagagtctaaatgagtcacaggccttaaggtaatttagctcacctgaaaatttttcgacattttcacacataaagtcataacggaaggtaaataaccgttacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagtgtagtagggtcatgaagcaacaaaccttataaaggccagacaacgtaagctcagcagtagagcactaatgagttcacagcagccttaaaggtatttaagctcactgaaatttcgaattttcacaataaaggtcataacgaaggtatcaacctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGGGTCTAGGTTAGAGCATTTTTAACTTGGAA-CATCTCATTTGG-GC-AATGAATT
gi|21 : c-----AAG---C-A----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AT--A-TGCAT-CAAA-GT--ACTGAGAGTACTAGTCTAGTACTCGAA--CG-GA-ATAAC-AAAAAGTAG-C---AAAT---AATCA-ATCAAAAA-T--T-GAC--AA--TTT----T--CCA-A---AC--A----AA--TTAAG-AAACA------T--Acactcgatccatgctttttatagggaaggctgcaatcctacgagccccttttttatgtccaaacgctagggggtagtaaccagctggtg
gi|22 : ATAAA---CTCA-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAG
gi|22 : aagctagcagccaataaacccatggaagccagcagcaaATAAG---CCCC-TG-G-----AAG---CCA----GCA-G-CCAA----T-AGGcccctggaagccagcagccaataggctatgaaaagctagcagcaaataagcc
gi|23 : aagctagcagccaataaacccatggaagccagcagcaaataaactcatagaagctagcagcca--AAA-CAA--TTTAT-AAGCA---------AA--TCTTAATTAAA----T---CAA-GTT-TG-AATACTTG-A-----AAACAA---C--------TGA--GC-TTA-----CTGA---AA------G-TTTTGCTAA-TGTTA--CA-TCA-AAT-ctatgaaaagctagcagcaaataagcc
gi|24 : taACT----CAG-------A--CG-GG-ATATT-AACACTAAT-TGTTAAAA---AATGG-ACC--AAA-AT-T-GAT--AA--GTT----T--TTCTA---AC--A---T----TTGAT-AAATA------T--AC--TGATAATCA------T---CAA-GTT-TG-A-Tactgtcgaaatgaggattaat
gi|26 : TTGCAAAGTA-GGG-GTC-ATGGAAT-CAAATCAAA-AACATTTTATAAAGGACA-AG-ACAACAACGAACTCAA-GCAGATAGAATC-ATT
gi|27 : gagAGGGGCCAGGTTATAGAATTTTTAACTGGG-ATTATCTGATTTGG-GC-AATAAATT
gi|28 : tTTATACTGGAATCAAAGG---ACAACGAACTCAAGCAAA-CGGAGTCATTAAATGGGGTTGCATAAACCCTcattcaatccttgcctttcattggaag
gi|29 : aTATTTAGCTCCCCTGAAAATTTCGAATTTTCAAGC-------------ATAAAGGTCATAACGAAGGTCAATAACACCT
gi|3 : ATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----GCA-A-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAG-------A--TGAGG-ATATT-AAAAATAAT-C---AAAC---AATCA-ATC--AAA-TG-T-GAT--AA--TTT----T--TTC-A---AC--AAA-TAA--TTGAT-AAATG------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TACTTGAA-----AGGCAA---T--------TGA--GC-TCAC----CTGA---TA------G-TTC--CAAA-TAATG--CA-ACA-CAT-G-GGT--CC-TAAA-AA--A-GGAT-AATA-T-CA-ACAT-A---TTCTTT-GA-ATAGT-CAG-------CGAAAG-G-AGCATA-GAC-ATAAT---GTA-GGA-G-------GCCC-TTAAGCTTGTG--A--C--TATCTATC-CCC-ATTT--T--CA-TTGTGGAG--TT-GAAGGGCC
gi|3 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaTGGATTAGGGGGTGATGCAATGA-A---ATAAC-AGTG-AT-AACGGACAAGA-AAACA---AATAAAATCAAACAA-----ACACAC---TTGTTGAATAACGTTGCAAAGAC-CATTTAATGCAGTTTAGCTCACCTGAAA--------TTTTCAAGC-------------ATGAATGTCATCACGGAGATTAATAAC---TTAACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGGAAT-CAAA----C-AACATTT-ATAAAGGGCA-AG-ACAACAACGAACTCAA-GCAGATAGAGTC-ATTAAATAGGATTTCACAG--GCCCCTTAAGGTTATTTAGCTCACC--TGAAAGTTCCGAATTTTCACGAATAA--GTC-TAGACGAAGGGTTAATAACATCTggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgattggattagggggtgatgcaatgaaataacagtgataacggacaagaaaacaaataaaatcaaacaaacacacttgttgaataacgttgcaaagaccatttaatgcagtttagctcacctgaaattttcaagcatgaatgtcatcacggagattaataacttaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatggaatcaaacaacatttataaagggcaagacaacaacgaactcaagcagatagagtcattaaataggatttcacaggccccttaaggttatttagctcacctgaaagttccgaattttcacgaataagtctagacgaagggttaataacatcttgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatactagtaaagtggggtaggatcaggaaatcataggcacaacaaattatacaggcaagtaccaggcacgaactcaagcaagattagtagtcattaaatggggtccacagacgccttaacagttatttagctcacctgaaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatagagttcataacgaaggttaataacaccttt
gi|3 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcaaccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagatgaggatattaaaaataatcaaacaatcaatcaaatgtgataattttttcaacaaataattgataaatgtagtcttaattatcaagtttgatacttgaaaggcaattgagctcacctgatagttccaaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaacatattctttgaatagtcagcgaaaggagcatagacataatgtaggaggcccttaagcttgtgactatctatccccattttcattgtggagttgaagggccggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgatTAGGGGTCATGGA---ATCAAACAACA--TTTATAAAGGGCAAGACAACAACGAACTCAAGCAGAT----AGAGTCATTAAATAGGATTTCACAGGCCCCTTAAGGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTCCGAATTTTCACGAATAA--GTC-TAGACGAAGGGTTAATAACATCTTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATACTAGTAA-AGTGGGGTA-GGA-TCAGGAAATCATAGGCACAACAAATT-AT-ACAGG-CAAG--TACCAGGCACG-AACTCAAGCAA-----GATTAGTAGTCATTAAATGGGG-TCCACAGACGCCTTAACAGTTATTTAGCTCACCTGAAAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAATAGAGTTCATAACGAAGGTTAATAACACCTTTtgaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatactagtaaagtggggtaggatcaggaaatcataggcacaacaaattatacaggcaagtaccaggcacgaactcaagcaagattagtagtcattaaatggggtccacagacgccttaacagttatttagctcacctgaaagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaatagagttcataacgaaggttaataacaccttt
gi|30 : aggctgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctagcaaccaataagaaaatccatcaaagtactgaaagtacttagatgaggatattaaaaataatcaaacaatcaatcaaatgtgataattttttcaacaaataattgataaatgtagtcttaattatcaagtttgatacttgaaaggcaattgagctcacctgatagttccaaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaggataatatcaacatattctttgaatagtcagcgaaaggagcatagacataatgtaggaggcccttaagcttgtgactatctatccccattttcattgtggagttgaagggccggggtactggtcacctggggcttatttaagagagcggcgccaactttcagacaaccatggtgattggattagggggtgatgcaatgaaataacagtgataacggacaagaaaacaaataaaatcaaacaaacacacttgttgaataacgttgcaaagaccatttaatgcagtttagctcacctgaaattttcaagcatgaatgtcatcacggagattaataacttaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagATAAG---CCCA-TA-T-----AAG---CCA----GCA-G-CCAA----T-AAG
gi|4 : agccagcagctaATAAG---CC-G-TA-G-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---A-----TCCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGT-CT----TAG-------A--CG--G-ACATT-GAAAATAAT-C---AAAC---AAT----TC--AAA--G-T-GAT--A---TTT----T--TTC-A---A----AA-TAA--ATAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------T---CAA-GTT-TG-A-TTCTTG-A-----AGGCAA---T--------TGA--GC-TCAC----CTGA---TACATGTAA-TTC--CTAA-TAATG--CA-ACA-CAT-G-GGT--CC-T-AA-AAAAA-GGAT-AATA-G-AA-ATCT-A---TTCTTT-GA-ATAGT-CAG-------CGAAAG-G-AGCAGA-GAC-AAAAT---GTA-GCA-G-------GCCC-TT----T--TA--T--C--TATCTATC-CCC-GTTT--T--CA-TTTTGGGG--TT-GAAGGGCCcc
gi|4 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaGATTGGATTAGGGGTGATGCA---ATGAAAAACCA--GTGATAACGGACAAGAAAACATTAAAATCAAACAAAC----ACACTTGTTAAATAGGGTTGCAAAGACCATTAAAGGCCGTTTAGCTCACCTGA--------AATTTTCAAGCATAAATGTCATA-ACGAAGAATTAATAACAACTTggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggattaggggtgatgcaatgaaaaaccagtgataacggacaagaaaacattaaaatcaaacaaacacacttgttaaatagggttgcaaagaccattaaaggccgtttagctcacctgaaattttcaagcataaatgtcataacgaagaattaataacaacttcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|4 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaataagccgtagaagctagcagccaataagaatccatcaaagtactgaaagtcttagacggacattgaaaataatcaaacaattcaaagtgatattttttcaaaataaataataaatatagtcttaattatcaagtttgattcttgaaggcaattgagctcacctgatacatgtaattcctaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaaggataatagaaatctattctttgaatagtcagcgaaaggagcagagacaaaatgtagcaggcccttttatctatctatccccgttttcattttggggttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggaACTCGTAAAGTA-GGG-GTA-ATGTAAT-CAAA----C-AACATTT-GCAAAGGACA-AG-ACACCAACGAACTCAA-Gcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactcgtaaagtaggggtaatgtaatcaaacaacatttgcaaaggacaagacaccaacgaactcaagcag
gi|5 : ggcttagctagcagccactaacccagcaagccaataagccgtagaagctagcagccaataagaatccatcaaagtactgaaagtcttagacggacattgaaaataatcaaacaattcaaagtgatattttttcaaaataaataataaatatagtcttaattatcaagtttgattcttgaaggcaattgagctcacctgatacatgtaattcctaataatgcaacacatgggtcctaaaaaaaggataatagaaatctattctttgaatagtcagcgaaaggagcagagacaaaatgtagcaggcccttttatctatctatccccgttttcattttggggttgaagggccggggtaccacctgggacctatttaagagagcggcgcaaactttcagacaatcatggagattggattaggggtgatgcaatgaaaaaccagtgataacggacaagaaaacattaaaatcaaacaaacacacttgttaaatagggttgcaaagaccattaaaggccgtttagctcacctgaaattttcaagcataaatgtcataacgaagaattaataacaacttcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntATAAG---CC-G-TAAG-----AAG---CTA----GCA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-TCCAT-CAAAAGT--ACTGAAAGTAAT----TAG-------A--CGAGG-ATATT-GCAAGTA---------------------TC--AAA-TG-T-GAT--T---TTT----T--TTC-A---AC--AAA-TGA--TAAAT-AA-TA------T--AG--TCTTAATAA------G---CAA-GTT-TG-A-TACTTG-A-----AGGCAA---T--------TGA--GCCTCAC----CTGA---TG------G-TTT--CAAA-TGATG--CA-ACA-CAT-G-GGT--CC-T-AA-AA--AAGGATTCATA-T-CA-ATCT-A---ATCTTT-GA-ATAGT-CAATAGTCAACAAAAG-G-AGCATA-GAC-TAAAT---GTG-GGA-C-------GCCC-GT----T--TG--A--C--TATCTATC-CCA-GTTC--T--CA-TTTTAGGG-CCT-AAAGAGTCAATAAATG--GGCTTCCACAGACCCTTAAAGGTA-ATTTAGCTCACCTGAAAGTTTCG-AATTTTC-ATACAT-AAAGGTCATAACGAAGGTTAATAAC-ACCTTTGCcag
gi|5 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaAACTCGTAAAGTA-GGG-GTC-ATGTAAT-AAAA----A-AACGATT-ATACAGGGCA-AG-ACAACAACGTACTCAA-GCAGGTAGAGTC-ACTAAATGGGGTTCCACAG--GCCCTTAAAGGTAATTTAGCTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactcgtaaagtaggggtcatgtaataaaaaaacgattatacagggcaagacaacaacgtactcaagcaggtagagtcactaaatggggttccacaggcccttaaaggtaatttagctca
gi|6 : ggctgaagctagcagccactaaccagcaccaataagccgtaagaagctagcagccaataagaaaatccatcaaaagtactgaaagtaattagacgaggatattgcaagtatcaaatgtgattttttttcaacaaatgataaataatatagtcttaataagcaagtttgatacttgaaggcaattgagcctcacctgatggtttcaaatgatgcaacacatgggtcctaaaaaaggattcatatcaatctaatctttgaatagtcaatagtcaacaaaaggagcatagactaaatgtgggacgcccgtttgactatctatcccagttctcattttagggcctaaagagtcaataaatgggcttccacagacccttaaaggtaatttagctcacctgaaagtttcgaattttcatacataaaggtcataacgaaggttaataacacctttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAG---CCCG-TC-G-----AAG---CTA----GCA-G-TCAA----T-AAGG---AA--A-TTCAT-CAAA-GT--ACTGAAAGTACT----TAC-------A--CAGAA-ATACT-GAAGATTAT-T---AAAC---AATCG-ATC--AAA-TT-T-GAT---A--TTT----T--TTA-A---AC--AAA-TAA--TCAAT-AAAGA------T--AT--TCCTGATTA------T---AAA-GTT-TG-A-TACTTG-G-----ATTCAA---C--------AAA--GC-TCAC----CTAA---AA------G-TTT--CAAA-TGATG--CA-TCG-CAT-G-GTT--CC-C-AATGA--A-AGTT-AATG-A-CA-ATTC-A---ATCTAT-GG-AGGGT-CGA-------AAAAAA-G-AGCGTA-GAC-A
gi|6 : tggtgatggaagctgcattcgcagtgattgttcagctggcctcctccgatgtcattgcaaaagtctactaggttaaacctagcagtcattaaccagcagataTAA-TGGTTGAAT----GGTGATGAAGGAATGAAACAATA--GTTATAATGGGTAAGACAACAACAGAGCCAAATAGACAGAGAGAGTCGTTAAATAGGGTT-CATAGGTCTATAAGGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattgggccttaagagggcaaggcaacttgacagatccatgtaatggttgaatggtgatgaaggaatgaaacaatagttataatgggtaagacaacaacagagccaaatagacagagagagtcgttaaatagggttcataggtctataagggatattgaatcca
gi|7 : tggtgatggaagctgcattcgcagtgattgttcagctggcctcctccgatgtcattgcaaaagtctactaggttaaacctagcagtcattaaccagcagataataagcccgtcgaagctagcagtcaataaggaaattcatcaaagtactgaaagtacttacacagaaatactgaagattattaaacaatcgatcaaatttgatattttttaaacaaataatcaataaagatattcctgattataaagtttgatacttggattcaacaaagctcacctaaaagtttcaaatgatgcatcgcatggttcccaatgaaagttaatgacaattcaatctatggagggtcgaaaaaaagagcgtagacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatattgggccttaagagggcaaggcaacttgacagatccatgATACG---CCTG-TA-C-----AAG---CTATATAGCA-G-CCAA----T-GAGA---AA--A-TACAT-CAAA-GT--ACTAAGAGTACT----TAA-------A---GGGA-ACA-C-AAAAGTTGG-C---AAAC---ACTGG-ATC--AAA--G-T-GAT--GA--TAT----T--T--------C--AAA-CAG--TCAAT-AAACA------T--AT--TCCTAATTA------T---CAA-GCT-TGAA-TACTTA-C-----AGGCAA---T--------TGA--GA-TTAT----CTGA---TA------G-TTC--CTAA-GTATA--CA-TCA-CAatattgaatcca
gi|8 : attcacaaacataaacattagaagaaattggaacatggcagaaatttcattaaaatgtttcttatgaacctaaaagccacaattttccaaatcaaatataaatgaactttttaatgatttgatcaacccatgacccagggccaggatatcgggggatgggatgtttcaatacgtaaaatttcgacgagaaccgcaagggttcgattcgtagcctatttagatttaaatacatagtgtagatacgagtttctctaggggatacaaaaggtgtttacaaccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccacgctggttctagcagccaATAAG---CCCG-TA-G-----AAG---CTA----ACA-G-CCAA----T-AAGA---AA--A-CCCAT-CAAA-GT--A-------------------------------------TT-GAAAATAAT-C---AAAG---AATCA-ATC--AAA-TG-T-GAT--AA--TT----------C-A---AC--AAA-TAA--TTAAT-AAATA------T--AG--TCTTAATTA------T---AAA-GTT-TG-A-TAATTG-A-----AG-CAA---T--------TGA--GC-TCAC----CTGG----A------G-TTC--CAAA-TGATG--CA-ACA-CAT-G-GGT---C-T-AA-AAC-A-GGAT-AATA-G-CA-ATCT-G---TTCTTT-GA-ATAGT-CAG-------CAAAAG-G-AGCATA-GAC-AAAAC---GTA-GGA-G-------GCCCTTT----T--TG--A--C--TATCTATA-CTC-GTTT--T--CA-TTTTGGGG--TT-GAAGAGaagactcataatgaaggtc
gi|8 : agactgaagctagcagccactaaccagcagccaGATTGGATTAGGGGCGATGCA---ATGAAATAACACTGTGATAACGGACAAGAAAACAATAAAATCAAGGAAAC----A-------------------CAA------TTAAAGGCAGT-----TCACCTGA--------AATTTTCAAGCATAAATGCCATA-ACGAAGAATTAATAACAACTTcaggggtatcaccaggggtctatttaagagagcggcaccaactttcagacaatcatggcgattggattaggggcgatgcaatgaaataacactgtgataacggacaagaaaacaataaaatcaaggaaacacaattaaaggcagttcacctgaaattttcaagcataaatgccataacgaagaattaataacaactt
gi|9 : agactgaagctagcagccactaaccagcagccaataagcccgtagaagctaacagccaataagaaaacccatcaaagtattgaaaataatcaaagaatcaatcaaatgtgataattcaacaaataattaataaatatagtcttaattataaagtttgataattgaagcaattgagctcacctggagttccaaatgatgcaacacatgggtctaaaacaggataatagcaatctgttctttgaatagtcagcaaaaggagcatagacaaaacgtaggaggccctttttgactatctatactcgttttcattttggggttgaagagcaggggtatcaccaggggtctatttaagagagcggcaccaactttcagacaatcatggcCATAAGGCCCTCG-TAAG-----AAGA--CTA----GCA-G-CCAAACTGTGAAGAGCGAA--A-TCCAT-CAAA-GT---TT-----TACT----TAG-------CTCCGAGG-GTATT-GAAA-TAAT-C---AAAC---AATC-------AAA-TG-TTGAT--AT--CTT----TATTTC-ATGAAC--AAG-TTA--ATAATTAAATA------T--C---TCGTAAT-A------G---CAACATTCTT-A-TACTTT-GTGCACAGGCAAACCT--------TGAAAG--TCAT----CTGAC--TA------GCTTC--CAAA-T---------------C-G-GGT--CC-T-AA-AA----GGAT-CATA-G-CATATAT-A---TTCTTTTGACATAGT-CAT-------CGAAAG-G-A-CATA-TAC-AAG-T---GTA-GGA-GATAAGTTGC---------T--TG--A--CCGTATCTATTGCCC-GTTC-----CA-TTTT-GGGGTTT-AAGGGGCC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): GCTAGCAGCCAACTAACCCCACAGTCAACAATAAGCCGTAGAAGCTGTATACCAAAAAATGAAATTCAGCCAAGTTTAAAGCAAACTGATATT
Unaligned ( gi|31 ): AGGCTGAAGCTAGCAGCCACTAACAGCAGCCAATAAGCACG
Unaligned ( gi|32 ): ACGAAAGTTAGCAGCCACTAACCAGCAACCAATAAG
Unaligned ( gi|33 ): CTGTTGTAACAATTATATGATTTGGATAAATACCA