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Reference ( gi|3 ) : AGAGTTTTTGAAATCA-GCCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--GGTAAATA-T-TT--TT-AAA--G-T-----CC--GGT-GAA--T-T---T---T--CG--TCC-A-C-A-------AGCGGTCC-AGAGGA-CC-AGT-GAA--ATTT-TA---T------CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTACA-TGCA-T--GACTTTTG------A------A-----TGTAGTTG-TGATATCGG-CA-AAA--G-T--TTT-AAA-TCTG---GTGA-ATAT-C-TA-A-ATCAA-T-AA-A-T-GC-AAGCGC--TT-T-AA-----T-GACTTGGA-A-TAAA--A-GTACCA----GCTGATTGGAAAC-ACG-AG--AATCCTAGA-AATTTTCT-----TT-----T-CA-T-TA-TTTT---ACG-AAGAT--A--TT--GAATTGTAAAC-AA--TATGGACG-----GT-AGCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------TTT------GTTAA-GTGAATTCG-ATGTCG-TC--A-AT-T-CC-GC-ATATAAACAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGT-ATGA-T--T-AATGGAAA--TCGA-C-GTT-A-----CATGTACG---T---GCATCAGTGGTAT-T--CC-G-GG---------TTT-GG-------GA---C-CC-ATTT--AATA-CTGT--TTG-C-AC--AAA-TGCACGCAAC-TAA-GCAG-CCTT-CGGAAAACTAGTCTGC-T---TA---TTCAATACAT--AAACGT---AATT--CT-TTTACGTC--TGTTTC-----AT-A-AGG-------CATTTAA--T--C---A--CGTGGATGGCATA-CAAAT-G-ACGC--GAA-TT-T-ACTCTTACCC-C-AGATGTG-AAGCC----------AC--ATATT-ACTTGCTG-TACAGT-ATCATATTT---AATTTG-TA--TTAAATCC----TTATTTGG--TCTG------G------GTT-CCT--TTT---------CCTCATTC--AAGTA-----AA--AAAATAC-CG-----AC-CGGTAAA---TATTTCT-T-C-AGACC-AGTAA-A-TT-T--TA-T-TA----AT--TCA-C---TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--A-TT-T--TT----ATC------TATTTCAAAAACT
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gi|9 : TTTTGAAAT-A-GCCGGTC-T--TAC----GAAA-C----GGTAA-TA-T-TC--TT-AA---G-T---------GGT-GA---T-T---T---T--CA--TCC-A-----------AGCGGTCCTAGA-----C--GT--AA--ATTT-TA---A------TGAT-AATT-TTGAACTT-C-ACCT-TGTA---TG-A-T--GA--TTTG------A------ACGTAATGTAGTTG-TG-TAT-GG-CA-AAG--G-T--T---ACA-TCTG----CAA-ATA-----ATA-ATCAAGT-GA-A-T-TC-AAG-GC--TT-T-AAA----T-G-CTTG-A-A-CGA-----GTAC-A----GCTGAT-GGAA----CGTAG--GATT---GA-A----TCG-----TT--------A-T--A-TCTT---TCG-A-GAT--T--TT--GAATTGTA--C-AGG-TATGGATG------T-AG-TGC-T-GAT-AAAA-AA-T---------ATT------GTTAG-GTGAATTCG-ATGTTA-TC--ATAT-T-CC-GC-ATA----CAGATGCAAT-T-GGG-CAGTGT-ATGA-T--TTAATGGAAA--TCGA-C-TTT-A-----CATGTACG---TTCTGTA-CA-TGTTAT-T--CCCA-GG---------TTT-GG-------GA---CTCC-ATT------A-CTGA--TTG-C-AC--ATA-TACACGCAAC-TAA-GCAG-CCTT-CAGAAAACAAGTCTGC-T---AAAAATGCAATACATTTAAACGT---AATT--GT-TTTATGTC--TGTTTC-----AT-A-AGG-------CATTTAAATC--C---A--CGTGGATGACATA-AAAAC-GGAC-C--GAA-TC-T-ACTCTTACCC-C-AGATATG-AAGCC----------ACGAATATT-GACTGCTG-TGCAGT-A-AATATTA---AATT-G-TA--TTAAA-AC----TTATTTTA--ACTG------TTT----GTTGTTT--TTT---------CCTCATTC--AAGTA-----AA--GAAATAT-CG-----AC-CGGTAAA---TATTTCT-T-C-AGACC-AGTAA-A-TT-T--TA-A-GA----AT--TCA-C---TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--A-TA-T--TT----TTC------TATTTCAAAA
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consensus : AGAGTTTTTGAAATCA-GCCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTTT-AAA--G-T-----CC--GG-T-GAA-T-TTT--CG--TCCA-CA-------A-GCGGTCCATAGGA-CC-G-GT-AAAATT-------TTAA---CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTACG-TGCA-T--GACTTTTG------A------A-----TGTAGTTG-TGATATCGG-CAAAA--GG---TTT-AAA-TCT-GC-AGATAT---T-TAAATCA-A-T-AAA-TTC---AAGCGC--TT-T-AA-----T-GACTTGGA-AT-CGA--G--TA--CCA----GCTGATTGGAAAC-ACG-AG--AAT-CT-AGACAATTTCCT-----TT-----T-CATC-A-TTTT---ACG-AAGATA--TT--GAATTGTAAACGGGT-ATGGATG-----GT-AGCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------------NTTGTT-AGGTGAATTCG-ATGTCG-TC--A-AT-T-CC-GC-ATAT-A-ACAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGT-ATGA-T--T-AATGGAAA--TCGA-C-GTT----ACATGTACG---T---GCAT-C--TGNTAT-T--CC-G-GG---------TTT-GG-------GA---C-CC-ATT----ATA-CTGT--TTG-C-AC--AAA----TGCACGCAAC-TAAGCAG-CCTT-CGGAAAACAAGTCTGC-T---TA---T-TCAATACAT--AAACGT---AAT-T-GT--TTTACGTC--TGTTTC-AT-A-----AGG-------CATTTAAATCC-A--CGTGGATGGCATA-CAAACGGA-C-C--GAATT-T-ACTCTTACCC-C-AGATGTGAAGCCACGA--------AT-ATTGCTTGCTG-TACAGT-ATNATATTT---AATTTG-TA--TTAAATCC----TTATTTG-G--TCTG------G--GT--T-T-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGAC-CGGTAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--A-TT-T--TTTTCTATTTCAAAAACT
Reference ( family-6633 ) : AGAGTTTTTGAAATCA-GCCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTTT-AAA--G-T-----CC--GG-T-GAA-T-TTT--CG--TCCA-CA-------A-GCGGTCCACAGGA-CC-G-GT-GAAATT-------TTAA---CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTACG-TGCA-T--GACTTTTG------A------A-----TGTAGTTG-TGATATCGG-CAAAA--GG---TTT-AAA-TCT-GC-GGATAT---T-TAAATCA-A-T-AAA-TTC---AAGCGC--TT-T-AA-----T-GACTTGGA-AT-AAA--G--TA--CCA----GCTGATTGGAAAC-ACG-AG--AAT-CT-AGACAATTTCCT-----TT-----T-CATC-A-TTTT---ACG-AAGATA--TT--GAATTGTAAACGGGT-ATGGATG-----GT-AGCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------------NTTGTT-AGGTGAATTCG-ATGTCG-TC--A-AT-T-CC-GC-ATAT-A-ACAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGT-ATGA-T--T-AATGGAAA--TCGA-C-GTT----ACATGTACG---T---GCAT-C--TGNTAT-T--CC-G-GG---------TTT-GG-------GA---C-CC-ATT----ATA-CTGT--TTG-C-AC--AAA----TGCACGCAAC-TAAGCAG-CCTT-CGGAAAACAAGTCTGC-T---TA---T-TCAATACAT--AAACGT---AAT-T-NT--TTTACGTC--TGTTTC-AT-A-----AGG-------CATTTAAATCC-A--CGTGGATGGCATA-CAAACGGA-C-C--GAATT-T-ACTCTTACCC-C-AGATGTGAAGCCACGA--------AT-ATTGCTTGCTG-TACAGT-ATNATATTT---AATTTG-TA--TTAAATCC----TTATTTG-G--TCTG------G--GT--T-T-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGAC-CGGTAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--A-TT-T--TTNTCTATTTCAAAAACT
gi|1 : GAGTTTTTGAAATCA-GCTGGTC-T--TACCGGCAAAA-T-C--GGTAAAAATATTTT-AAACAG-T-----CCCGGG-T-GAA-T-TTTT-CG--TCCAACA-------A-GCGGTCCATA-GA-CCAA-GT-GAAATT-------TTAA---CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTACA-TGCA-TTGGACTTTTG------A------AT----TTTAGTTG-TGATATCGATCAGAA--GGTGATTT-AAA-TCT-GC-TGATAT---TACAGATCA-A-T-AAG-ATCGCAAAGCGC--TT-T-AA-----TAGACTTGGATAT-AAA--GTATA--CCA----GCTGATTGG-AAC-ACG-AG--G----------AATTTCCT-----GT-----TACATC-A-TTTTTAAACGAAAGATA--TTTCGAATTGTAAACGA---ATGGA-G-----GT-ACCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------------TTTGTT-AAGTGAATTCG-ATGTCG-T-----AT-T-CCTGCAATAT-ATACAGATGCA-TAC-TGGTCAGTGT-ATGA-TTAT-AATGGAAAATTCGA-C-GTT----ACATGTACG---T---GCAT-CCGTGGTAT-TAAAC-GTGG---------TTTAGG-------GACG-C-CC-ATTTCAAATACCTGTTCTTG-CAACAAAAA----TGCACGCAAC--AAGCAG-CCTTACGGAAACTAGATC-GC-T---TAT--T-TCAATACAT--AAACGTC--AAT-T-CT--TTTACGTC--TGTTTC-ATAA-----AGG-------CATTTAATTCC-ATCTGTGGATGGCATACCCAATGGA-C-CCTAATTT-T-ACTCTTTACC-C-AGATGTGAAA--ACCA--------ACAATTACTTGCTG-TACAGT-ATCATA--T---AA-TTG-TAATTCAAATCC----TTATTTG-G--TTTG------G--G---G-T-------CT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGACTTGGCAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGT-AA-TTTT----A-TTAAT--TCA-C--GGTCC-CTTGACCAAGTAA--ATTT-T--TTATCTATTTCAA
gi|10 : AGATTTTTAACTCA-GCTGGTC-C--CACCGGCAAAAAT-C--AGTAAATAT-AATT-AAA--G-T-----CC--AG-T-GAA-T-TTT--CG--TCCA-TA-------A-GCGGTCTGAAAAA-CG-A-GT---AATTTATATGGTTAA---CGATCAATT-TAAAACTTTA-ACCTCCCTGCA-TGCA-T--GAATTTTT------AATGTACA-----TGTAGTTG-TGATATCAA-CTAAC--CA---TTT-GAA-TCT--C----TGT--------ATCA-A-T-AAA-TTC---AAGCAT--TT-T-AAATTGGT-GGCTTGGA-AC-TGA--G--TA--CCACATTACTGATTGCAAAC-AT---G--AAT-CA-AGACAATTTTCT-----TT-----T-TATC-ATTTTT---ACG-AACATA--TTC-GAATTGTAAGCGGGT-ATGGATA-----GA-AACTGC-T-TGT-AATACAGCT---------------TTTGTT-AGGTGAATTCT-AATTTG-TC--ATAT-G-CC-GT-G----G-ACAGATGCA-T-------CATTGC-AT------------GAAA--TAGA-T-GTC----ACATGCA-----------------TGCTAT-T--TT-G-GG---------CTG-GA-------GC---T-CC-ATT----CAC-CTGTC-TTGCC-AC--AAAG---CGCACACACC-T-AGCAG-TCTT-AG--AAACAAGTCTGC-----TA---TATCAAT-CGT--TTAT-T---AATCT-GCTATTTAAGTCTATGTTGA-AT-G-----AGG-------CATTTAAAGCCAA--TGTGGATGGCATA-CAAATAGA-C-C--AAATT-T-ACTTTTACCCTT-GGATGT
gi|11 : GTTTTT-AAATCA-GCCGGTC-T--TAC-GGCAAAC-C-CCGGAAAAATAT-TTTTGAAA--G-T-----CC--AG-T-GAA-T-T----CAA-TCCA-CA-------A-GCGGTC-ATAGGAACC-G-GT--AAATT-------TTAAAACCGATCA-TT-TTGAACTTTC-AACTCTGTAAC-TGCA-T--GACTTTTGA-----A------A-----CGTAGTTGCTGATATCGG-CAAAA--GG---TTTAAAA-TCT-GC-AGATAT---T-AATATC--A-T-GAATTTC---AAGCGCCTTT-T-AA-----T-GATTTGGA-AT-CGA--G--TA--C---------------AGAC-GTG-CG--AAT-TTCAGACAATTTCCT-----TT-----A-CGTCTG-TTTTA--ACG-AAAAGAATTT--GAATTG--AACGGGT-AT-GATG-----GT-AGCTGC-T-GATAAAAACAACTAGCTTAGTCTTTATAATCATT-AGGTGAATTTG-ATGTCATTC--A-ATAT-TC-TC-TTAC-A---AGATGCA-T-C-TGG-CAGTGTAATGATT--T-TATGGAAA--TCGA-C-ATTAAGGAC-TGTA-----T---ACATGC--TAA-AT---------GG---------TTT-GC-------GG---C-CC--T------TA-CTGT--TTG-C--C--ATA----CACACG-AAT-TAAGCAGCCCTT-CGG--AACAAGTCTGCTT---TA---T-TCAATAAA---AAACGT---AAT-T-GT--TTTACGTC--TGTTTC-a
gi|12 : AGTTTTTGAAATCA-GCCAGTC-----AC-------A-C-C--ATTAAATAT-TTTT-AAA--G-TGACGTCC--AG-T-GAA-T-TTT--CA--TCCA-TATTCCATAA-TTGGTCCGAAGGA-CC-G-AT-AATATG-------GTAA---TAATCAATT-CAGAACTTTA-ACCTCTGTATG-TGCA-T--GGTTTTCA------A------G-----T---GTTG-TGATATCGA-CTAAA--TG---TTT-GAG-TCT-GC-ATATAC---T-TAAAT-----------TT------------------A-----T-GACTTGGA-AT-CAA--G--TAATATA----GCTGATTGTAA---ACG-AG--AAT-CT-AGACAATCTCCA-----TT-----C-CAT
gi|13 : T--TTTATGTC--TGTTTC-AT-A-----AAGGCTTTAGCATTTAAATCT-A--CGTGGATGGCATA-CAAACGGA-C-C--AAATT-T-ACTCTTACCC-C-AG--------CCATGA--------AT-ATTGACTGCTG-TGCAGT-A-AATATT----AATGAG-TG--GTAAAGCTGGTTCTATCTG----TTTG------T--TG--T-T-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGAC-CGGTAAC---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-TGAAT--TCA-C-CGGTCCTCTTGACC-AGTAA--A-TT-T--TT-TCTATTTCAAAAAa
gi|14 : AGAGTTTTTGAAATCC-GCCGGTC-A--AGCCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTCT-AAT--G-T-----CC--GG-T--AA-TATTT--CG--TATA-TA-------A-TTGGTCCGTCGGA-CC-G-GT-AATATT-------TTTA---CGCTCAATT-CGGAACTTTG-ACATCTTTCCG-TGCA-T--GGTTTTTGGTTTTAA------A-----TTTAGGCG-TGAAATCGA-CCAAA--CG---TTT-GAA-TCT-GC-G--TAT---G-GAAAATACA-T-AAA-TTC---AAGAGC--TTAT-AA-----T-GATT
gi|15 : TGGATG-----GG-AGCTGC-T-GAT-AAA-CAACT---------------TTTGTT-TTGTGAATT-G-ATGTCG-TC--ATAT-T-CC-GC-GTA-----CAGATGCA-T-C-TGG-AAGTGT-ATGA-T--TCAATGGAAA--TCGA-C-GTT----AGGTGTACG---T---ACAT------GTAT----------G---------T---GT-------AA---C-CCCATT----A---CTGT--TTG-C-AC--AAAATAATGCACG-------------------------CAAGTCTGC-T---T----------------------T---A-T-T-GT--TTTACATC--TGTTTC-AT-ATGATAAGG-------CATTTAAATCC-A--TGTGGATGGCAT
gi|16 : ct-C-C--AAATT-T-ACTTTTACCC-TTGGATGTGAAGCTATGA--------AT-ATTGCTTGTTA-TACAGT-A-AATA-TT---AATTTG-TA--TCAAAGTT----TTATTTA-G--TCTA------GCTGT--T-TGTTGTTGTT------TTCCTTATTC--AAGTA--------------------AC-TGGTAAA---TATTTTT-TCCAGACC-AATAAA-TTTCATTAA-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGAAC-ATTGATTA-TT-T--TTT
gi|17 : atACCC-C-AGATGTGAAGCCAC----------AT-ATTACTTGTTG-TTCAGT-ATCATATT----AATTTG-TA--TTAAATCC----TTATTTG-G--TCTG------G--GT--T-C-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGAC-CGGTAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--A-TT-T--TTATCTATTTCAAAAACTtctt
gi|18 : AGAGTTTTAGAAATCA-GCTGGTC-T--TACC-----AA-------GCAAATAT-TTTT-AAA--G-T-----CC--AG-TTGAA-T-TT---CA--TCC--CA-------A-TTGGTCCATAAGA-CT-G-GT-GATATA-------TTAA---CGATCAATT-T-GAACTTTC-CCCTCTGTACC-TGCA-T--GACTTTTG------A------A-----TGTA-TT-----TATCGG-CAAAA--GG---TTT-GAA-TCT-AC-AGGTAT---T-TAAATCA-A-T-A
gi|19 : G-TAAAGT-ATTA-ATTTGTAAACTTG-AT--TTATATC------TGTTTG-----TTG-------------T-T-------TT------TCCCTCATTTCAAAGTA-----AA--G-AGG-ACTCGAC-CAGTAAA---TATTTCTGT-CAAATC-AGTAAA-TTTT----AATTAAA--TCAAC-TG-TCCTCTTGCCC-AGT-A--A-TT-T--TTTTCTATTTAAAAAA
gi|2 : caGAGTTTTTGAAATCAAGTCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--AGTAAATAT-TTTT-TAAT-G-TT----CC--GG-T-GAA-T-TTTTTCG--TCCA-CA-------A-GCGGTCTACAGGA-CC-G-GT-AAAATT-------TTAA---CGATCTATT-TTGAACTTTC-ACCTCT------------------TTTG------A------A-----TG-AGTTG-TGATATCT--CAAAA--TG---TTT-AAA-TCT-GC-AGATAT---T-TAAATCA-A-T-AAA-TTC---AAGCAC--TT-T-AA-----T-GACTTGGG-AT-TGA--G--TA--CCA----GCTGATTG-AAAC-ACG-CA--AAT-CT-AGACAATTTCCT-----TTAAATTT-CATC-A-TTTTT--ACG-AGGATA--TTT-GAATTGTAAACGGGTTATG-ATG-----AT-AGCTGC-TTGAT-AAAACAACT---------------ATTGTC-AGGTGAATACG-ATGTCA-T-----AT-T-CT-GC-ATA-----CAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGT-ACGA-T--TTAATGGAAA--TCGA-CCGTT----ACATGTACG---T---GCAT-----GCTAT-T--CG-A-GG---------TTT-GGTCTTTGAGA---C-CCCATT-----TA-CTGT--TTG-C-AC--AAA----TGCAAGCAAC-TAAGCAG-CCTT-CGGAAAACAAGTCTGC-T---TT---T-TCAGTACAT--AAACGC---AAT-T-TG--TTTATGTC--TGTTTC-AT-A-----AGG-------CATTTAAATCC-A--TGTGGATGGCATA-CAAACGGA-C-C--GAATT-T-ACTCTTACCC-C-AGATGTAAAGCCATGAATAATTATAT-ATTGTTTGCTG-TACAGT-A-AATAATT----ATTTGTTA--TT-AATCC----TTATTTT-GTCTCTGTTTGTTG--GT--T-T-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAT-CGAC-CGGTAAA---TA-TTCT-T-CAGGCC-AGTAGA-TTTA----T-TTAAT--TTA-C-TGGT-CTCTTGACC-AGCAA--A-TT-T--TTTTCTATTTCAAAAA
gi|20 : ATATT----GATTTG-TT--TTGAAGTT----TTGCTTA-G--TTTG------G--TT--T-T-------TT------CTTTCCAGAC--AAATACCGGTAACTA-AAATAC-TGAC-CGGTGAA---TATTTGT-T-CCAACC-AATAAA-TTTC----A-TTAAT--TCA-C-AGGTCCACTTGACC-AGTGA--A-TTAT--TTT
gi|21 : T-ATT-TATTT---A-TTTT-TG--TT---TCT----TTGTTTTTG--TTTT------C--CT--T-T-------TTATGATATCCCTCATTG--AAGTA-----AT--G-AAATAC-CAAC-CAGTAAA---TATTTCT---------------------------TTAAT--CCA-C-TAGTCCCCTTG--------G--A-TT-T--TTTCCTATTTTAAGAGCT
gi|22 : TTTTGAAATCA-GCCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTTT-AAA--G-T-----CC--GG-T-GAA-T-TTT--CG--TCCA-CA-------A-GCGGTCCATAGGA-CG-A-GT-AAAATT-------TTAG---CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTA
gi|23 : TT----ACATGTACG---T---GCAT----TG-TAT-T--CT-G-GT---------TTT-GG-------GA---C-CCCATT----A---CTGT--TTG-C-AC--AAA----TGCACGCTAC-TAAGCAG-CCTT-CAGAAAACAAGTCCG
gi|24 : AGAGTTTTTGAAATCA-GCCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-T--GGTAAATAT-TTTT-AAA--G-T-----CC--GG-T-GAA-T-TTT--CG--TTCA-CC-------A-GC
gi|26 : C-C-AGATGTGAAGCCATGA--------AT-ATTACTTGCTA-TACAGTAATCATA-TT---AATTTG-TA--TTAAaa
gi|27 : AAACC-AGTAAA-TTTC----A-TTAAT--TCA-C--------------C-AGTAA--A-TT-T--TTTACTATTTTAAAAACT
gi|3 : AGAGTTTTTGAAATCA-GCCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTTT-AAA--G-T-----CC--GG-T-GAA-T-TTT--CG--TCCA-CA-------A-GCGGTCCAGAGGA-CC-A-GT-GAAATT-------TTAT---CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTACA-TGCA-T--GACTTTTG------A------A-----TGTAGTTG-TGATATCGG-CAAAA--GT---TTT-AAA-TCTGGT-GAATAT---C-TAAATCA-A-T-AAA-TGC---AAGCGC--TT-T-AA-----T-GACTTGGA-ATAAAA--G--TA--CCA----GCTGATTGGAAAC-ACG-AG--AATCCT-AGA-AATTTTCT-----TT-----T-CATT-A-TTTT---ACG-AAGATA--TT--GAATTGTAAAC-AAT-ATGGACG-----GT-AGCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------------TTTGTT-AAGTGAATTCG-ATGTCG-TC--A-AT-T-CC-GC-ATATAA-ACAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGT-ATGA-T--T-AATGGAAA--TCGA-C-GTT----ACATGTACG---T---GCAT-CAGTGGTAT-T--CC-G-GG---------TTT-GG-------GA---C-CC-ATTTA--ATA-CTGT--TTG-C-AC--AAA----TGCACGCAAC-TAAGCAG-CCTT-CGGAAAACTAGTCTGC-T---TA---T-TCAATACAT--AAACGT---AAT-T-CT--TTTACGTC--TGTTTC-AT-A-----AGG-------CATTTAA--TC-A--CGTGGATGGCATA-CAAAT-GA-CGC--GAATT-T-ACTCTTACCC-C-AGATGTGAAGCCAC----------AT-ATTACTTGCTG-TACAGT-ATCATATTT---AATTTG-TA--TTAAATCC----TTATTTG-G--TCTG------G--GT--TCC-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--A-AAATAC-CGAC-CGGTAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--A-TT-T--TTATCTATTTCAAAAACT
gi|4 : GTTTTTGAAATCAAGTCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--AGTAAATAT-TTTT-TAA--T-TT----CC--GG-T-GAA-T-TTTTTCG--TCCA-CA-------A-GCGGTCTACAGGA-CC-G-GTAAAAATT-------TTAA---CGATCTATT-TTGAACTTTC-ACCT------------------CTTTTG------A------A-----TG-AGTTG-TGATATCTG-CGAAAATGT---TTT-AAA-TCT-GC-AGATAT---T-TAAATCA-A-T-AAA-TTC---AAGCAC--TT-T-AA-----T-GACTTGGG-AT-TGA--G--TA--CCA----GCTGATTGGAAAC-ACG-CA--AAT-CT-AGACAATTTCCTTTAAATT-----T-CATC-ATTTTT---ACG-AGGATAT-TT--GAATTGTAAACGGGT-AT-GATG-----AT-AGCTGCTT-GAT-AAAACAACT---------------ATTGTC-AGGTGAATACG-ATGTCA-T---A----T-CT-GC---AT-A-ACAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGT-ACGATT--T-AATGGAAA--TCGACC-GTTA---ACATGTACG---T---GCA-----TGCTAT-T--CG-A-GG---------TTT-GGTCTTT--GAGACC-CC-ATT-----TA-CTGT--TTG-C-AC--AAA----TGCAAGCAAC-TAAGCAG-CCTT-CGGAAAACAAGTCTGC-T---TT---T-TCAGTACAT--AAACGC---AAT----T--TTTATGTC--TGTTTC--T-A-----AGG-------CATTTAAATCC-A--TGTGGATGGCATA-CAAACGGA-C-C--GAATT-T-ACTCTTACCC-C-AGATGT-AAGCCATGAATATAT--AT-ATTGTTTGCTG-TACAGT-A-AATATT-----ATTTG-TA--TT-AATCC----TTATTTT-GTCTCTGTTTGTTG--GT--T-T-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAT-CGAC-CGGTAAA---TATATCT-T-CAGGCC-AGTAGA--TTT----A-TTAAT--TTA-C-TGGT-CTCTTGACC-AGCAA--A-TT-T--TTTTCTATTTCAAAAA
gi|5 : GAGTTTTTGAAATCA-GCCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTTT-AAA--GCT-----CC--AG-T-GAA-T-TTT--CG--TCCA-CA-------A-GCGGTCCATAGGA-CC-A-GT-GAAATT-------T-AT---CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTACA-TGCA-T--GACTTTTA------A------AAA---TGTAGTTG-TGATATCGG-CAAAA--GG---TTTTAAA-TCT-GC-TGATAT---T-TAAATCA-A-T-AAA-TGC---AAGCGC--TT-TTAA-----T-GACTTGGA-AT-AAA--G--TA--CCA----GCTGATTGGAAAC-ACG-AG--AAT-CT-AGACAATTTTCT-----TT-----T-CATT-A-TTT----ACG-AAGATA--TTTGAAATTGTAAACAA-T-ATGGACGCGTAGGC-AGCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------------TTTGTT-AAGTGAATTCG-TTGTCG-TC--A-AT-T-CC-GC-ATAT-ATACAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGT-ATGA-T--TTAATGGAAA--TCGG-C-GTT----ACATGTACG---T---GCAT-CAGTGGTAT-T--CC-G-AG---------TTT-GG-------GA---C-CCCATTTA--ATA-CTGT--TTG-C-AC--AAA----TGCACGCAAC-TAAGCAG-CCTT-CGGAAAACTAGTCTGC-T---TAA--T-TCAATACAT--AAACGT---AAT------------------GTT-C-AT-A-----AGG-------CATTTAAATCC-A--CGTGGATGGCATA-CAAATGGA-C-C--GAATT-T-ACTCTTACCC-C-AGATGTGAAGCCAC----------AT-ATTACTTGCTG-TACAGT-ATCAT---T---AATTTG-TA--TTAAATCC----TTATTTG-G--TCTG------G--GT--T-C-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGAC-CGGTAAA---TATTTCT-TCCAGACC-AGTAAATTTTT----A-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--A-TT-T--TTATCTATTTCAAAAACT
gi|6 : AGAGTTTT-GAAATCA-GCCGGTC-TCTTACCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTTT-AAA--G-T-----CC--GGGT-GAAGT-TTT--CG--TCCAACA-------AAGCGGTCCATAGGA-CC-A-GT-GAAATT-------TTAT---CGATCAATTCTTGAACTTTC-ACCTCTGTACA-TGCA-T--GACTTTTG------A------A-----TGTAGTTG-TGATATCGA-CAAAA--GG---TTT-AGATTCT-GCTTGAT-T---T-T-AATCA-A-TAAAA-TGC---AAGCGC--TT-T--A-----T-GACTTGGA-AT--AA--G--TA--CCA----GCTGATTGGAAAC-A-A-AG--A---CT-AGACAATTTTCT-----TT-----T-CATT-A-TTTT---ACG-AAGATA--TT--G-ATTGTAAAC-GAT-ATGGACG-----GTCAGCTGC-T-GAT--AAACAACT----------------TTGTT-AAGTGAATTCG-ATGTCG-TCCAA-AT-TCCC-GC-ATAT-ATACAGATGCA-T-C-T-G-CAGTGT-ATGATT--T-AATGGAAA--TCGA-C-GTT----ACATGTACG---T---GCAT-CAGTGGTAT-T--CC-G-GG---------TTT-GG-------GA---C-CC-CCTTA--ATA-CTGT--TTG-C-A---AAA----TGCACGCAAC-TAA-CAG-CCTT-CGGAAAACTAGTCTGC-TC--TA---T-TCAATACAT--AAACGT---AAT-T-CT--TTTACGTC--TGTTTCAAT-A-----AGG-------C-----CATCC-A--CGT-GATGTCATG-CAAATGGA-C-C--GAATTCT-ACTCTTACCC-C-AGATGTG-AGCCAC----------AT-ATTACTTGCTGTTACAGT-ATCATA-TT---AATTTG-TA--TT-ACTCC----TTATTTG-G--TCTG------G--GT--T-T-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGAC-CGGT-AA---TATTTCT-T-CAGACCAAGT-AA-TTTG----A-TT-AT--TCA-CATGGTCCTC-TGACC-AGTAA--A-TT-T--TTATCTATTTCAAAA
gi|7 : GGTCCT--TAACGGCAGAA-CGC--GGTAAAT-T-TTAT-AAA--G-T-----TCA-GG-T-GAA-T-TTT--CTATTCCA-CA-------G-ACGGTCCATAG-A-CC-GAGT-AAAATT-------TTAA---TGAATAATTATTGAACTTCCCACCTCT-TACAATGGAAT--GA-TTTTG------A------A-----CGTAGTTG-TGATTTCAG-CGAAA--GT---TTT-AAA-GTT-GC-AGAGATAACT-TAAATCA-A-T-GAA-TTC---AAGCGC--GT-TGAA-----T-GACTTGGA-AT-GAACAG--TA--C-A----GCTGAT-GAAAACGATGTAGCCAAT-CT-AGACAATTTTCT-----TT-----A-CATTTG-TTTT---G----AGATACATT--TAATTGTAAACGG-T-A-GGATG-----GT-AGCTGC-T-GAT-AAAA-AACT---------------AATGTTAAGGTGAATTCGAATTTCA-TT--ATATGT-CC-GC---------CATACGAG-T-CATGG-CAGTGT-ATGA-TG-T-AATGGAGA--T-GA-C--TT----ACATGTACGTTCT---GTA--CGATGCTATAT--CC-G-AG---------GTT-GA-------GA---C-CC-AT------TA-CTGT--TT--C-AC---AA----T-CACGCACCATAGTCAG-CCTTACAGAAAAC-AGTCTGC-CAAAAA---T-TCAATAATT--TAACGT---ATA-T-GT--TCTATGTC--TG-TTC-AT-AC----AAG--------ATTT-AATCC-AGGTGTGAATGGCATA-CAAACAGAGC-CA-GAATT-TCACTCTTACCC-----------AGCCATGA--------AT-ATTGA-TGCTG-TGCAGT-A-AATA-TT---AATTTG-TA--TTAAAAAC----TTATTAT-A--TCTGT-----T--GT--TGC-------TT------TTTCTCATTC--AAGTA-----AA--GAAAATAA-CGAC-CGG---ACCCTATTTCT-A-CAGA-C-AGT-AA-TTTT----A-TGAATCATCA-C--GGTCCTCTTGACC-AGTAG--A-TT-TTCTTTTCTATTTCAAAAAct
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Reference ( family-6633 ) : AGAGTTTTTGAAATCA-GCCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTTT-AAA--G-T-----CC--GG-T-GAA-T-TTT--CG--TCCA-CA-------A-GCGGTCCATAGGA-CC-G-GT-AAAATT-------TTAA---CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTACG-TGCA-T--GACTTTTG------A------A-----TGTAGTTG-TGATATCGG-CAAAA--GG---TTT-AAA-TCT-GCAGAT--AT---T-TAAATCA-A-T-AAA-TTC---AAGCGC--TT-T-AA-----T-GACTTGGA-AT---CGAG--TA--CCA----GCTGATTGGAAAC-ACG-AG--AAT-CT-AGACAATTTCCT-----TT-----T-CATC-A-TTTT---ACG-AAGATA--TT--GAATTGTAAACGGGT-ATGGATG-----GT-AGCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------------NTTGTT-AGGTGAATTCG-ATGTCG-TC--A-AT-T-CC-GC-ATAT-A-ACAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGT-ATGA-T--T-AATGGAAA--TCGA-C-GTT----ACATGTACG---T---GCAT-C--TGNTAT-T--CC-G-GG---------TTT-GG-------GA---C-CC-ATT----ATA-CTGT--TTG-C-AC--A----AA-TGCACGCAAC-TAAGCAG-CCTT-CGGAAAACAAGTCTGC-T---TA---T-T-CAATACAT--AAACGT---AAT-TG-T--TTTACGTC--TGTTTC-AT-A-AGG-------CATTTAAATCC-A--CGTGGATGGCATA-CAAACGGA-C-C--GAATT-T-ACTCTTACCC-C-AGATGTGAAGCCACGA--------AT-ATTGCTTGCTG-TACAGT-ATNATATTT---AATTTG-TA--TTAAATCC----TTATTTG-G--TCTG------G--GT--T-T-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGAC-CGGTAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--ATT-T--TTT-TCTATTTCAAAAACT
gi|1 : GAGTTTTTGAAATCA-GCTGGTC-T--TACCGGCAAAA-T-C--GGTAAAAATATTTT-AAACAG-T-----CCCGGG-T-GAA-T-TTTT-CG--TCCAACA-------A-GCGGTCCATA-GA-CCAA-GT-GAAATT-------TTAA---CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTACA-TGCA-TTGGACTTTTG------A------AT----TTTAGTTG-TGATATCGATCAGAA--GGTGATTT-AAA-TCT-GCTGAT--AT---TACAGATCA-A-T-AAG-ATCGCAAAGCGC--TT-T-AA-----TAGACTTGGATAT---AAAGTATA--CCA----GCTGATTGG-AAC-ACG-AG--G----------AATTTCCT-----GT-----TACATC-A-TTTTTAAACGAAAGATA--TTTCGAATTGTAAACGA---ATGGA-G-----GT-ACCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------------TTTGTT-AAGTGAATTCG-ATGTCG-T-----AT-T-CCTGCAATAT-ATACAGATGCA-TAC-TGGTCAGTGT-ATGA-TTAT-AATGGAAAATTCGA-C-GTT----ACATGTACG---T---GCAT-CCGTGGTAT-TAAAC-GTGG---------TTTAGG-------GACG-C-CC-ATTTCAAATACCTGTTCTTG-CAACAAA----AA-TGCACGCAAC--AAGCAG-CCTTACGGAAACTAGATC-GC-T---TAT--T-T-CAATACAT--AAACGTC--AAT-TC-T--TTTACGTC--TGTTTC-ATAA-AGG-------CATTTAATTCC-ATCTGTGGATGGCATACCCAATGGA-C-CCTAATTT-T-ACTCTTTACC-C-AGATGTGAAA--ACCA--------ACAATTACTTGCTG-TACAGT-ATCATA--T---AA-TTG-TAATTCAAATCC----TTATTTG-G--TTTG------G--G---G-T-------CT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGACTTGGCAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGT-AA-TTTT----A-TTAAT--TCA-C--GGTCC-CTTGACCAAGTAA--ATT-T--TTTATCTATTTCAA
gi|10 : AGATTTTTAACTCA-GCTGGTC-C--CACCGGCAAAAAT-C--AGTAAATAT-AATT-AAA--G-T-----CC--AG-T-GAA-T-TTT--CG--TCCA-TA-------A-GCGGTCTGAAAAA-CG-A-GT---AATTTATATGGTTAA---CGATCAATT-TAAAACTTTA-ACCTCCCTGCA-TGCA-T--GAATTTTT------AATGTACA-----TGTAGTTG-TGATATCAA-CTAAC--CA---TTT-GAA-TCT--C---T--GT--------ATCA-A-T-AAA-TTC---AAGCAT--TT-T-AAATTGGT-GGCTTGGA-AC---TGAG--TA--CCACATTACTGATTGCAAAC-AT---G--AAT-CA-AGACAATTTTCT-----TT-----T-TATC-ATTTTT---ACG-AACATA--TTC-GAATTGTAAGCGGGT-ATGGATA-----GA-AACTGC-T-TGT-AATACAGCT---------------TTTGTT-AGGTGAATTCT-AATTTG-TC--ATAT-G-CC-GT-G----G-ACAGATGCA-T-------CATTGC-AT------------GAAA--TAGA-T-GTC----ACATGCA-----------------TGCTAT-T--TT-G-GG---------CTG-GA-------GC---T-CC-ATT----CAC-CTGTC-TTGCC-AC--A----AAGCGCACACACC-T-AGCAG-TCTT-AG--AAACAAGTCTGC-----TA---TAT-CAAT-CGT--TTAT-T---AATCTG-CTATTTAAGTCTATGTTGA-AT-G-AGG-------CATTTAAAGCCAA--TGTGGATGGCATA-CAAATAGA-C-C--AAATT-T-ACTTTTACCCTT-GGATGT
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gi|12 : AGTTTTTGAAATCA-GCCAGTC-----AC-------A-C-C--ATTAAATAT-TTTT-AAA--G-TGACGTCC--AG-T-GAA-T-TTT--CA--TCCA-TATTCCATAA-TTGGTCCGAAGGA-CC-G-AT-AATATG-------GTAA---TAATCAATT-CAGAACTTTA-ACCTCTGTATG-TGCA-T--GGTTTTCA------A------G-----T---GTTG-TGATATCGA-CTAAA--TG---TTT-GAG-TCT-GCATAT--AC---T-TAAAT-----------TT------------------A-----T-GACTTGGA-AT---CAAG--TAATATA----GCTGATTGTAA---ACG-AG--AAT-CT-AGACAATCTCCA-----TT-----C-CAT
gi|13 : -T--TTTATGTC--TGTTTC-AT-A-AAGGCTTTAGCATTTAAATCT-A--CGTGGATGGCATA-CAAACGGA-C-C--AAATT-T-ACTCTTACCC-C-AG--------CCATGA--------AT-ATTGACTGCTG-TGCAGT-A-AATATT----AATGAG-TG--GTAAAGCTGGTTCTATCTG----TTTG------T--TG--T-T-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGAC-CGGTAAC---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-TGAAT--TCA-C-CGGTCCTCTTGACC-AGTAA--A-T-T--TTT-TCTATTTCAAAAAa
gi|14 : AGAGTTTTTGAAATCC-GCCGGTC-A--AGCCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTCT-AAT--G-T-----CC--GG-T--AA-TATTT--CG--TATA-TA-------A-TTGGTCCGTCGGA-CC-G-GT-AATATT-------TTTA---CGCTCAATT-CGGAACTTTG-ACATCTTTCCG-TGCA-T--GGTTTTTGGTTTTAA------A-----TTTAGGCG-TGAAATCGA-CCAAA--CG---TTT-GAA-TCT-GC--GT--AT---G-GAAAATACA-T-AAA-TTC---AAGAGC--TTAT-AA-----T-GATT
gi|15 : TGGATG-----GG-AGCTGC-T-GAT-AAA-CAACT---------------TTTGTT-TTGTGAATT-G-ATGTCG-TC--ATAT-T-CC-GC-GTA-----CAGATGCA-T-C-TGG-AAGTGT-ATGA-T--TCAATGGAAA--TCGA-C-GTT----AGGTGTACG---T---ACAT------GTAT-------G-TG---------T----A-------AC---C-CC-AT------TA-CTGT--TTG-C-AC--AAAATAA-TGCACG-------------------------CAAGTCTGCTT---TA---T-TGTTTTACAT-------------C-TG-T--TT--CATA--TG-----AT-A-AGG-------CATTTAAATCC-A--TGTGGATGGCAT
gi|16 : ct-C-C--AAATT-T-ACTTTTACCC-TTGGATGTGAAGCTATGA--------AT-ATTGCTTGTTA-TACAGT-A-AATA-TT---AATTTG-TA--TCAAAGTT----TTATTTA-G--TCTA------GCTGT--T-TGTTGTTGTT------TTCCTTATTC--AAGTA--------------------AC-TGGTAAA---TATTTTT-TCCAGACC-AATAAA-TTTCATTAA-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGAAC-ATTGATTATT-T--TTT-
gi|17 : atACCC-C-AGATGTGAAGCCAC----------AT-ATTACTTGTTG-TTCAGT-ATCATATT----AATTTG-TA--TTAAATCC----TTATTTG-G--TCTG------G--GT--T-C-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGAC-CGGTAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--ATT-T--TTA-TCTATTTCAAAAACTtctt
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Reference ( family-6633 ) : AGAGTTTTTGAAATCA-GCCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTTT-AAA--G-T-----CC--GG-T-GAA-T-TTT--CG--TCCA-CA-------A-GCGGTCCATAGGA-CC-G-GT-AAAATT-------TTAA---CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTACG-TGCA-T--GACTTTTG------A------A-----TGTAGTTG-TGATATCGG-CAAAA--GG---TTT-AAA-TCT-GCAGAT--AT---T-TAAATCA-A-T-AAA-TTC---AAGCGC--TT-T-AA-----T-GACTTGGA-AT---CGAG--TA--CCA----GCTGATTGGAAAC-ACG-AG--AAT-CT-AGACAATTTCCT-----TT-----T-CATC-A-TTTT---ACG-AAGATA--TT--GAATTGTAAACGGGT-ATGGATG-----GT-AGCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------------NTTGTT-AGGTGAATTCG-ATGTCG-TC--A-AT-T-CC-GC-ATAT-A-ACAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGT-ATGA-T--T-AATGGAAA--TCGA-C-GTT----ACATGTACG---T---GCAT-C--TGNTAT-T--CC-G-GG---------TTT-GG-------GA---C-CC-ATT----ATA-CTGT--TTG-C-AC--A----AA-TGCACGCAAC-TAAGCAG-CCTT-CGGAAAACAAGTCTGC-T---TA---T-T-CAATACAT--AAACGT---AAT-TG-T--TTTACGTC--TGTTTC-AT-A-AGG-------CATTTAAATCC-A--CGTGGATGGCATA-CAAACGGA-C-C--GAATT-T-ACTCTTACCC-C-AGATGTGAAGCCACGA--------AT-ATTGCTTGCTG-TACAGT-ATNATATTT---AATTTG-TA--TTAAATCC----TTATTTG-G--TCTG------G--GT--T-T-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGAC-CGGTAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--ATT-T--TTT-TCTATTTCAAAAACT
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gi|7 : GGTCCT--TAACGGCAGAA-CGC--GGTAAAT-T-TTAT-AAA--G-T-----TCA-GG-T-GAA-T-TTT--CTATTCCA-CA-------G-ACGGTCCATAG-A-CC-GAGT-AAAATT-------TTAA---TGAATAATTATTGAACTTCCCACCTCT-TACAATGGAAT--GA-TTTTG------A------A-----CGTAGTTG-TGATTTCAG-CGAAA--GT---TTT-AAA-GTT-GCAGAG--ATAACT-TAAATCA-A-T-GAA-TTC---AAGCGC--GT-TGAA-----T-GACTTGGA-ATGAAC-AG--TA--C-A----GCTGAT-GAAAACGATGTAGCCAAT-CT-AGACAATTTTCT-----TT-----A-CATTTG-TTTT---G----AGATACATT--TAATTGTAAACGG-T-A-GGATG-----GT-AGCTGC-T-GAT-AAAA-AACT---------------AATGTTAAGGTGAATTCGAATTTCA-TT--ATATGT-CC-GC---------CATACGAG-T-CATGG-CAGTGT-ATGA-TG-T-AATGGAGA--T-GA-C--TT----ACATGTACGTTCT---GTA--CGATGCTATAT--CC-G-AG---------GTT-GA-------GA---C-CC-AT------TA-CTGT--TT--C-AC-------AA-T-CACGCACCATAGTCAG-CCTTACAGAAAAC-AGTCTGC-CAAAAA---T-T-CAATAATT--TAACGT---ATA-TG-T--TCTATGTC--TG-TTC-AT-ACAAG--------ATTT-AATCC-AGGTGTGAATGGCATA-CAAACAGAGC-CA-GAATT-TCACTCTTACCC-----------AGCCATGA--------AT-ATTGA-TGCTG-TGCAGT-A-AATA-TT---AATTTG-TA--TTAAAAAC----TTATTAT-A--TCTGT-----T--GT--TGC-------TT------TTTCTCATTC--AAGTA-----AA--GAAAATAA-CGAC-CGG---ACCCTATTTCT-A-CAGA-C-AGT-AA-TTTT----A-TGAATCATCA-C--GGTCCTCTTGACC-AGTAG--ATT-TTCTTT-TCTATTTCAAAAAct
gi|8 : tGAGTTTTTGAAATCA-GTCGGTC-T--TCCTTGCAAAA-C-C--AGTAAATAT-TTTT-AAT--G-T-----CC--GG-T-GAA-T-TTT--CG--TCCA-CA-------A-GCGGTCTACAGGA-CC-A-TT-AAAATT-------TTAA---CGATCTATT-TTGAACTTTC-ACCTCT------------------TTTG------A------A-----TGTAGTTG-TGATATCAG-CAAAA--GG------------------------T---T-TAAATCA-A-T-AAA-ATC---AAGTGC--TT-T-AA-----T-GACTTGGG-AT---TGAG--AA--CCA----GCTGATTGGAAAC-ATG-CG--AAT-CT-AGACAATTTCCTTTAAATT-----T-CATC-ATTTTT---ACG-AGGATAT-TT--GAATTGTAAACGGGT-AT-GATG-----AT-AGCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------------ACTGTC-AGGTGAATGCG-ATGTCG-TC----AT-T-CT-GC-AT-----ACAG----A-T-C-TGG-CAGTGT-ACGATT--T-AATGGAAA--TCGA-C-ATT----ACATGTACG---T---GCA-----TGCTAT-T--CC-G-AGGTTTGGGTCTTT-GG-------GAC--C-CC-ATT-----TA-CTGT--TTG-C-AC--A----AA-TGCAAGCAGC-TAAGCAG-CCTT-CGGAAAACAAGTCTGC-T---TT---T-T-CAGTACGT--AAACGTATAAAT-TGAT--TTTATGTC--TGTTTC-AT-A-AGG-------CATTTAAATCC-A--CATGGATGGCATA-CAAATGG-------------------TTACCC-C-AGATGTAAAGCCATGA--------AT-ATTGCTTGCTG-TACAGT-A-AATA-TT---AATTTG-TA--TTAAATCC----TTATTTT-G--TCTGTTTGTTG--GT--T-T-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-TGAC-CGGTAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGACT-AGCAA--ATT-T--TTT-TCTATTTCAAAAACT
gi|9 : TTTTGAAAT-A-GCCGGTC-T--TAC----GAAA-C----GGTAA-TAT-TCTT-AA---G-T---------GG-T-GA--T-TTT--CA--TCCA----------A-GCGGTCC-TAG-A-C----GT-AAA-TT-------TTAA---TGAT-AATT-TTGAACTT-C-ACCT-TGTATG----A-T--GA--TTTG------A------ACGTAATGTAGTTG-TG-TAT-GG-CAAAG--G-----TT-ACA-TCT-GCAAAT--AA---T---AATCA-AGT-GAA-TTC---AAG-GC--TT-T-AAA----T-G-CTTGAA------CGAG--TA--C-A----GCTGAT-GGAA----CGTAG--GAT--T-GAA-----TCGT-----T---------AT--A-TCTT---TCG-A-GATT--TT--GAATTGTA--CAGGT-ATGGATG------T-AG-TGC-T-GAT-AAAA-AA-T---------------ATTGTT-AGGTGAATTCG-ATGTTA-TC--ATAT-T-CC-GC-ATA-----CAGATGCAAT-T-GGG-CAGTGT-ATGA-T--TTAATGGAAA--TCGA-C-TTT----ACATGTACG---TTCTGTAC-A--TGTTAT-T--CCCA-GG---------TTT-GG-------GA---CTCC-ATT----A---CTGA--TTG-C-AC--A----TA-TACACGCAAC-TAAGCAG-CCTT-CAGAAAACAAGTCTGC-T---AAAAAT-G-CAATACATTTAAACGT---AAT-TG-T--TTTATGTC--TGTTTC-AT-A-AGG-------CATTTAAATCC-A--CGTGGATGACATA-AAAACGGA-C-C--GAATC-T-ACTCTTACCC-C-AGATATGAAGCCACGA--------AT-ATTGACTGCTG-TGCAGT-A-AATA-TT---AAATTG-TA--TTAAA-AC----TTATTTT-A--ACTGTT----T--GTTGT-T-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAT-CGAC-CGGTAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-AGAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--ATA-T--TTT-TCTATTTCAAAA
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blockSeqs : A . . . . . . . . . T . . . . . TT A . . . . A . . . A . G A . . C . ACGTAA . . CA . T . AT . TA . . . . . . . G A . . AAA . . T . T T . TA . . . TTAAA T CTG T . CA C G G . G . . . . . T . . . CAT G . . ATATATA . . . . . TTC . . . A . . TCAG A TCCC . . . TCTTT C . C TTAAT . . . . . . . . . . TAAAAA . . . . TGAT C . . . . . . . . . . . . . . . GAATATAT . . . TT ATT . . A . TGTC TTTGTTG . CC . . . . . . . . . C . A . . . . . C . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . T G . . T . AA . . TG . . . AG . GG . . . . . . . . . . . CG . . C . T G . A . . . . C TTG . . T . G A . G . . . . . A . . . TAT . . . TTACA . . . . . TTT . . . . . . TGC C TCG . . . . . . . TCA . . . . . . . . . . TTTA . . . . TGT C . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . TC TTT . . A . AG GCT . T . . . . . . . . . . . A . . . . . T . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G A . . C . A . . GT . . . AG . TT . . . . . . . . . . . AA . . C . T G . A . . . . T TA . . . . A G . G . . . . . A . . . CA . . . ATA . . . . . TTT . . . . . . T G TCC . . . . . . . TT . . . . . . . . . . TTA . . . . TGT C . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . A TT . . A . GG G . T . . . . . . . . . . . A . . . . . T . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . G G . . . . A . . GG . . . . . TT . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . C . . . . T A . . . . . . . . . . . . . A . . . C . . . ATA . . . . . TT . . . . . . . C TCC . . . . . . . T . . . . . . . . . . TTT . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A TT . . A . TA C . T . . . . . . . . . . . A . . . . . T . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . GG . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A TT . . . . TA G . T . . . . . . . . . . . A . . . . . T . . . . .
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originalCons : AGAGTTTTTGAAATCA-GCCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTTT-AAA--G-T-----CC--GG-T-GAA-T-TTT--CG--TCCA-CA-------A-GCGGTCCATAGGA-CC-G-GT-AAAATT-------TTAA---CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTACG-TGCA-T--GACTTTTG------A------A-----TGTAGTTG-TGATATCGG-CAAAA--GG---TTT-AAA-TCT-GCAGAT--AT---T-TAAATCA-A-T-AAA-TTC---AAGCGC--TT-T-AA-----T-GACTTGGA-AT---CGAG--TA--CCA----GCTGATTGGAAAC-ACG-AG--AAT-CT-AGACAATTTCCT-----TT-----T-CATC-A-TTTT---ACG-AAGATA--TT--GAATTGTAAACGGGT-ATGGATG-----GT-AGCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------------NTTGTT-AGGTGAATTCG-ATGTCG-TC--A-AT-T-CC-GC-ATAT-A-ACAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGT-ATGA-T--T-AATGGAAA--TCGA-C-GTT----ACATGTACG---T---GCAT-C--TGNTAT-T--CC-G-GG---------TTT-GG-------GA---C-CC-ATT----ATA-CTGT--TTG-C-AC--A----AA-TGCACGCAAC-TAAGCAG-CCTT-CGGAAAACAAGTCTGC-T---TA---T-T-CAATACAT--AAACGT---AAT-TG-T--TTTACGTC--TGTTTC-AT-A-AGG-------CATTTAAATCC-A--CGTGGATGGCATA-CAAACGGA-C-C--GAATT-T-ACTCTTACCC-C-AGATGTGAAGCCACGA--------AT-ATTGCTTGCTG-TACAGT-ATNATATTT---AATTTG-TA--TTAAATCC----TTATTTG-G--TCTG------G--GT--T-T-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGAC-CGGTAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--ATT-T--TTT-TCTATTTCAAAAACT
finalCons : AGAGTTTTTGAAATCA-GCCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTTT-AAA--G-T-----CC--GG-T-GAA-T-TTT--CG--TCCA-CA-------A-GCGGTCCATAGGA-CCG--GT-AAAATT-------TTAA---CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTACG-TGCA-T--GACTTTTG------AA-----------TGTAGTTG-TGATATCGG-CAAAAGG-----TTT-AAA-TCT-GCAGAT--ATTT----AAATCA-A-T-AAA-TTC---AAGCGC--TT-T-AA-----T-GACTTGGA-AT---CGAG--TA--CCA----GCTGATTGGAAAC-ACG-AG--AAT-CT-AGACAATTTCCT-----TTT------CATCA--TTTT---ACG-AAGATA--TT--GAATTGTAAACGGGT-ATGGATG-----GT-AGCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------------NTTGTT-AGGTGAATTCG-ATGTCG-TCA---AT-T-CC-GCATAA-----CAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGT-ATGATTT---AATGGAAA--TCGA-C-GTT----ACATGTACG---T---GCAT-C--TGNTATTCC----G-GG---------TTT-GG-------GA---C-CC-ATTT-----A-CTGT--TTG-C-AC--A----AA-TGCACGCAAC-TAAGCAG-CCTT-CGGAAAACAAGTCTGCTTTA------T-T-CAATACAT--AAACGT---AAT-TG-T--TTTACGTC--TGTTTC-AT-A-AGG-------CATTTAAATCC-A--CGTGGATGGCATA-CAAACGGA-C-C--GAATT-T-ACTCTTACCC-C-AGATGTGAAGCCACGA--------AT-ATTGCTTGCTG-TACAGT-ATNATATT----AATTTG-TA--TTAAATCC----TTATTTG-G--TCTG------G--GT--T-T-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGAC-CGGTAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-TTAAT--TCA-CT-GGTCCTCTTGACC-AGTAA--ATT-T--TTT-TCTATTTCAAAAACT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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lowQualScore : 3 5 44 4 5 5 44 5 5 99 5 22222 99 5 5 5 5 44 99 0 1111111 5 7 555 7 7777777 777 3 7 0 66 9 99 8 222222 111111111111 9 9 1111111 9 7 9 22 99 000000 9 9 9 1 444 22 1 2 88888 1 3 88888 66 66 8 1111 2 8 3 77 66 3 3 4 77777 2222222 3333 666 6 33 33 0 5 6 5 33333 3 3 3 3 1111111111111111 3 3 3 88888 7 3 3 11111111111 3 3 3 3 3 3 66 3 3 6666 888 88888 0 1111111 1 333333333 1 7777777 777 1 55 77777777777 33 1 1 22 5555 1 1 1 2 666 66 222 2222222 2 22 4 88888 3 3 8888888 3 3 22 6 3 3 99 3 3 9 9 2 7777777777 1 1 7 66 5 5 44 7 1 7777 7 44444 000000000 77 7777777777 777777 77 77777 77 7 7 7 777 7 3 5 7 5 3333 5 44 5 22 5 44 5 44 5
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Reference ( family-6633 ) : AGAGTTTTTGAAATCA-GCCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTTT-AAA--G-T-----CC--GG-T-GAA-T-TTT--CG--TCCA-CA-------A-GCGGTCCATAGGA-CC-G-GT-AAAATT-------TTAA---CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTACG-TGCA-T--GACTTTTG------A------A-----TGTAGTTG-TGATATCGG-CAAAA--GG---TTT-AAA-TCT-GCAGAT--AT---T-TAAATCA-A-T-AAA-TTC---AAGCGC--TT-T-AA-----T-GACTTGGA-AT---CGAG--TA--CCA----GCTGATTGGAAAC-ACG-AG--AAT-CT-AGACAATTTCCT-----TT-----T-CATC-A-TTTT---ACG-AAGATA--TT--GAATTGTAAACGGGT-ATGGATG-----GT-AGCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------------NTTGTTA-GGTGAATTCGA-TGTCG-TC--A-AT-T-CC-GC-AT---A---ACAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGT-ATGATT-TAATGGAAA--TCGA-C-GTT----ACATGTACGT---GCAT-C--TGNTAT-T--CC-G-GG---------TTT-GG-------GA---C-CC-ATT---T-A-----CTGT--TTG-C-AC--A----AA-TGCACGCAAC-TAAGCAG-CCTT-CGGAAAACAAGTCTGCTTTA--TTCAATACAT--AAACGT---AAT-TG-T--TTTACGTC--TGTTTC-----AT-A-AGG-------CATTTAAATCC-A--CGTGGATGGCATA-CAAACGGA-C-C--GAATT-T-ACTCTTACCC-C-AGATGTGAAGCCACGA--------AT-ATTGCTTGCTG-TACAGT-ATNATA-TTAATTTG-TA--TTAAATCC----TT-ATTTG-G--TCTG------G--GT--T--T-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGAC-CGGTAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--ATT-T--TTT-TCTATTTCAAAAACT
gi|1 : GAGTTTTTGAAATCA-GCTGGTC-T--TACCGGCAAAA-T-C--GGTAAAAATATTTT-AAACAG-T-----CCCGGG-T-GAA-T-TTTT-CG--TCCAACA-------A-GCGGTCCATA-GA-CCAA-GT-GAAATT-------TTAA---CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTACA-TGCA-TTGGACTTTTG------A------AT----TTTAGTTG-TGATATCGATCAGAA--GGTGATTT-AAA-TCT-GCTGAT--AT---TACAGATCA-A-T-AAG-ATCGCAAAGCGC--TT-T-AA-----TAGACTTGGATAT---AAAGTATA--CCA----GCTGATTGG-AAC-ACG-AG--G----------AATTTCCT-----GT-----TACATC-A-TTTTTAAACGAAAGATA--TTTCGAATTGTAAACGA---ATGGA-G-----GT-ACCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------------TTTGTTA-AGTGAATTCGA-TGTCG-T-----AT-T-CCTGCAAT---ATATACAGATGCA-TAC-TGGTCAGTGT-ATGATTATAATGGAAAATTCGA-C-GTT----ACATGTACGT---GCAT-CCGTGGTAT-TAAAC-GTGG---------TTTAGG-------GACG-C-CC-ATT---TCAAATACCTGTTCTTG-CAACAAA----AA-TGCACGCAAC--AAGCAG-CCTTACGGAAACTAGATC-GCTTAT--TTCAATACAT--AAACGTC--AAT-TC-T--TTTACGTC--TGTTTC-----ATAA-AGG-------CATTTAATTCC-ATCTGTGGATGGCATACCCAATGGA-C-CCTAATTT-T-ACTCTTTACC-C-AGATGTGAAA--ACCA--------ACAATTACTTGCTG-TACAGT-ATCATA--TAA-TTG-TAATTCAAATCC----TT-ATTTG-G--TTTG------G--G---G--T-------CT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGACTTGGCAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGT-AA-TTTT----A-TTAAT--TCA-C--GGTCC-CTTGACCAAGTAA--ATT-T--TTTATCTATTTCAA
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gi|11 : GTTTTT-AAATCA-GCCGGTC-T--TAC-GGCAAAC-C-CCGGAAAAATAT-TTTTGAAA--G-T-----CC--AG-T-GAA-T-T----CAA-TCCA-CA-------A-GCGGTC-ATAGGAACC-G-GT-AAA-TT-------TTAAAACCGATCA-TT-TTGAACTTTC-AACTCTGTAAC-TGCA-T--GACTTTTG------A------AA----CGTAGTTGCTGATATCGG-CAAAA--GG---TTT-AAAATCT-GCAGAT--AT---T-AATATC--A-T-GAATTTC---AAGCGCCTTT-T-AA-----T-GATTTGGA-AT---CGAG--TA--C---------------AGAC-GTG-CG--AAT-TTCAGACAATTTCCT-----TT-----A-CGTCTG-TTTTA--ACG-AAAAGAATTT--GAATTG--AACGGGT-AT-GATG-----GT-AGCTGC-T-GATAAAAACAACTAGCTTAGTCTTTATAATCATTA-GGTGAATTTGA-TGTCATTC--A-ATAT-TC-TC-TT---A---CAAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGTAATGATT-TTATGGAAA--TCGA-C-ATTAAGGAC-TGTA--T---ACATGC--TAA-AT---------GG---------TTT-GC-------GG---C-CC---T---T-A-----CTGT--TTG-C--C--A----TA-CACACG-AAT-TAAGCAGCCCTT-CGG--AACAAGTCTGCTTTA--TTCAATAAA---AAACGT---AAT-TG-T--TTTACGTC--TGTTTC-----a
gi|12 : AGTTTTTGAAATCA-GCCAGTC-----AC-------A-C-C--ATTAAATAT-TTTT-AAA--G-TGACGTCC--AG-T-GAA-T-TTT--CA--TCCA-TATTCCATAA-TTGGTCCGAAGGA-CC-G-AT-AATATG-------GTAA---TAATCAATT-CAGAACTTTA-ACCTCTGTATG-TGCA-T--GGTTTTCA------A------G-----T---GTTG-TGATATCGA-CTAAA--TG---TTT-GAG-TCT-GCATAT--AC---T-TAAAT-----------TT------------------A-----T-GACTTGGA-AT---CAAG--TAATATA----GCTGATTGTAA---ACG-AG--AAT-CT-AGACAATCTCCA-----TT-----C-CAT
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gi|14 : AGAGTTTTTGAAATCC-GCCGGTC-A--AGCCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTCT-AAT--G-T-----CC--GG-T--AA-TATTT--CG--TATA-TA-------A-TTGGTCCGTCGGA-CC-G-GT-AATATT-------TTTA---CGCTCAATT-CGGAACTTTG-ACATCTTTCCG-TGCA-T--GGTTTTTGGTTTTAA------A-----TTTAGGCG-TGAAATCGA-CCAAA--CG---TTT-GAA-TCT-GC--GT--AT---G-GAAAATACA-T-AAA-TTC---AAGAGC--TTAT-AA-----T-GATT
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gi|17 : atACCC-C-AGATGTGAAGCCAC----------AT-ATTACTTGTTG-TTCAGT-ATCATA-TTAATTTG-TA--TTAAATCC----TT-ATTTG-G--TCTG------G--GT--T--C-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGAC-CGGTAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--ATT-T--TTA-TCTATTTCAAAAACTtctt
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gi|23 : TT----ACATGTACGT---GCAT----TG-TAT-T--CT-G-GT---------TTT-GG-------GA---C-CC-CAT---T-A-----CTGT--TTG-C-AC--A----AA-TGCACGCTAC-TAAGCAG-CCTT-CAGAAAACAAGTCCG
gi|24 : AGAGTTTTTGAAATCA-GCCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-T--GGTAAATAT-TTTT-AAA--G-T-----CC--GG-T-GAA-T-TTT--CG--TTCA-CC-------A-GC
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gi|27 : AAACC-AGTAAA-TTTC----A-TTAAT--TCA-C--------------C-AGTAA--ATT-T--TTT-ACTATTTTAAAAACT
gi|3 : AGAGTTTTTGAAATCA-GCCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTTT-AAA--G-T-----CC--GG-T-GAA-T-TTT--CG--TCCA-CA-------A-GCGGTCCAGAGGA-CC-A-GT-GAAATT-------TTAT---CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTACA-TGCA-T--GACTTTTG------A------A-----TGTAGTTG-TGATATCGG-CAAAA--GT---TTT-AAA-TCTGGTGAAT--AT---C-TAAATCA-A-T-AAA-TGC---AAGCGC--TT-T-AA-----T-GACTTGGA-ATA--AAAG--TA--CCA----GCTGATTGGAAAC-ACG-AG--AATCCT-AGA-AATTTTCT-----TT-----T-CATT-A-TTTT---ACG-AAGATA--TT--GAATTGTAAAC-AAT-ATGGACG-----GT-AGCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------------TTTGTTA-AGTGAATTCGA-TGTCG-TC--A-AT-T-CC-GC-ATATAA---ACAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGT-ATGA-T-TAATGGAAA--TCGA-C-GTT----ACATGTACGT---GCAT-CAGTGGTAT-T--CC-G-GG---------TTT-GG-------GA---C-CC-ATTTAAT-A-----CTGT--TTG-C-AC--A----AA-TGCACGCAAC-TAAGCAG-CCTT-CGGAAAACTAGTCTGC-TTA--TTCAATACAT--AAACGT---AAT-TC-T--TTTACGTC--TGTTTC-----AT-A-AGG-------CATTTAA--TC-A--CGTGGATGGCATA-CAAAT-GA-CGC--GAATT-T-ACTCTTACCC-C-AGATGTGAAGCCAC----------AT-ATTACTTGCTG-TACAGT-ATCATATTTAATTTG-TA--TTAAATCC----TT-ATTTG-G--TCTG------G--GT--TC-C-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--A-AAATAC-CGAC-CGGTAAA---TATTTCT-T-CAGACC-AGTAAA-TTTT----A-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--ATT-T--TTA-TCTATTTCAAAAACT
gi|4 : GTTTTTGAAATCAAGTCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--AGTAAATAT-TTTT-TAA--T-TT----CC--GG-T-GAA-T-TTTTTCG--TCCA-CA-------A-GCGGTCTACAGGA-CC-G-GTAAAAATT-------TTAA---CGATCTATT-TTGAACTTTC-ACCT------------------CTTTTG------A------A-----TG-AGTTG-TGATATCTG-CGAAAATGT---TTT-AAA-TCT-GCAGAT--AT---T-TAAATCA-A-T-AAA-TTC---AAGCAC--TT-T-AA-----T-GACTTGGG-AT---TGAG--TA--CCA----GCTGATTGGAAAC-ACG-CA--AAT-CT-AGACAATTTCCTTTAAATT-----T-CATC-ATTTTT---ACG-AGGATAT-TT--GAATTGTAAACGGGT-AT-GATG-----AT-AGCTGCTT-GAT-AAAACAACT---------------ATTGTCA-GGTGAATACGA-TGTCA-T---A----T-CT-GC-AT---A---ACAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGT-ACGATT-TAATGGAAA--TCGACC-GTTA---ACATGTACGT---GCA-----TGCTAT-T--CG-A-GG---------TTT-GGTCTTT--GAGACC-CC-ATT---T-A-----CTGT--TTG-C-AC--A----AA-TGCAAGCAAC-TAAGCAG-CCTT-CGGAAAACAAGTCTGCTTT---TTCAGTACAT--AAACGC---AAT----T--TTTATGTC--TGTTTC------T-A-AGG-------CATTTAAATCC-A--TGTGGATGGCATA-CAAACGGA-C-C--GAATT-T-ACTCTTACCC-C-AGATGT-AAGCCATGAATATAT--AT-ATTGTTTGCTG-TACAGT-A-AATA-TT-ATTTG-TA--TT-AATCC----TT-ATTTT-GTCTCTGTTTGTTG--GT--T--T-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAT-CGAC-CGGTAAA---TATATCT-T-CAGGCC-AGTAGA--TTT----A-TTAAT--TTA-C-TGGT-CTCTTGACC-AGCAA--ATT-T--TTT-TCTATTTCAAAAA
gi|5 : GAGTTTTTGAAATCA-GCCGGTC-T--TACCGGCAAAA-C-C--GGTAAATAT-TTTT-AAA--GCT-----CC--AG-T-GAA-T-TTT--CG--TCCA-CA-------A-GCGGTCCATAGGA-CC-A-GT-GAAATT-------T-AT---CGATCAATT-TTGAACTTTC-ACCTCTGTACA-TGCA-T--GACTTTTA------A------AAA---TGTAGTTG-TGATATCGG-CAAAA--GG---TTTTAAA-TCT-GCTGAT--AT---T-TAAATCA-A-T-AAA-TGC---AAGCGC--TT-TTAA-----T-GACTTGGA-AT---AAAG--TA--CCA----GCTGATTGGAAAC-ACG-AG--AAT-CT-AGACAATTTTCT-----TT-----T-CATT-A-TTT----ACG-AAGATA--TTTGAAATTGTAAACAA-T-ATGGACGCGTAGGC-AGCTGC-T-GAT-AAAACAACT---------------TTTGTTA-AGTGAATTCGT-TGTCG-TC--A-AT-T-CC-GC-AT---ATATACAGATGCA-T-C-TGG-CAGTGT-ATGATT-TAATGGAAA--TCGG-C-GTT----ACATGTACGT---GCAT-CAGTGGTAT-T--CC-G-AG---------TTT-GG-------GA---C-CCCATT---T-AATA--CTGT--TTG-C-AC--A----AA-TGCACGCAAC-TAAGCAG-CCTT-CGGAAAACTAGTCTGCTTAA--TTCAATACAT--AAACGT---AAT------------------GTT-C-----AT-A-AGG-------CATTTAAATCC-A--CGTGGATGGCATA-CAAATGGA-C-C--GAATT-T-ACTCTTACCC-C-AGATGTGAAGCCAC----------AT-ATTACTTGCTG-TACAGT-ATCAT---TAATTTG-TA--TTAAATCC----TT-ATTTG-G--TCTG------G--GT--T--C-------TT------TTCCTCATTC--AAGTA-----AA--G-AAATAC-CGAC-CGGTAAA---TATTTCT-TCCAGACC-AGTAAATTTTT----A-TTAAT--TCA-C-TGGTCCTCTTGACC-AGTAA--ATT-T--TTA-TCTATTTCAAAAACT
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