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Reference ( family-6380 ) : CACGGAGACA-GCC-GG-GATNTGAACCGTCTT--AGTCAG-G--AAACCT--GNACCTC----CT-A----TCCCC--GG-GGCACCCAAACGTCATGGCG-ACGGTCTCCT-C-CCCATGGTCAG--TGTG-CCT-TGCCC-AAGGTCCAG-CCGGGCCT--GCTGGCG-GTGCAGAAA-CTCCATNCCCAGG-----AGCATCTG-GTCCTGC-AGTG-GGGCCACAA-----TACAGTTCCATGTCNATCTGCGT---AC--CCCA--G-CGA-A----CG-CTCACCGGGTC---C-ACTA-TGAACCC-GTTCATGCGGGC-GT----TCTCCCC-CGC--TGGATGAGGGT-GACG-CGTTGCTTGATGGGCGGTTTGG-GATCCAACCCCTCATAGACTC-G--G-TAGACAGAACGCTCACCTCCGCCCCCGTGTCCACCACNGCCTGGAGTTCNATGCCCTGCACCACCA-TGTCCGCGGTGGAGCCGGTGGCAGGCCGGACTTGGC---GGGGGGCCGGGGACGCC--CGGGGT-TCTCCTGCAGGCCAGCGTGGCCCACCC-ACGGTTCCACTCCCTCCCGGCTGTCGACCCCGTCCAAGCCGT---TGTCC--T--CCTC--GCCCG---C-GGGGGCCCCATCT-----CGGC--GT-GGGCGCCACCAGGGGACTGGCCTATGGCCCCCGGCTCC----CCG---GT------C-CTGTG-GTCCCC---GCTACCCGGTG-CCG-AC-------GCCTGG-T---CGGACGCGGC-GAGGACTGGTCGTCCCCCCGGAACAACCTGCTCACCCTCCGGGGGGGGGGGGGGGGGGACTCATNTCCGCCGTCCTCTCCCCTGACCGCCCACCTCCNNCACCACCCGCTCCCC-AATT-CCTCTGGGAGAAGGCACTCTCCGGGAACGAAGGGTCCGACCTCGG-----------GGGGCAGCT---CGTANGT-GTCCTCG--GCCCACCCTATCTCGCACGGGTTCTCGGANTCGTCCGA-T-C---------CTCCTCCCG--GGGCGCTACCCGG---AAGCGTACCCGGA--GCTTGCCCCTCCGG-GNT-TTCCACTCTCCGACCCG---TCCCTT-GCC-GCGCCT------A-GCT---CCNCC---------GGAGAACGCTCCGGGGTGAGCACGCGAACTCTTTTCTGAGTG-GTCCCTCGGCCGGAGGCTGTGCCGGGCTTAGGCCCGCGTTCCCTCGGTCGCGC-CTGGANCTCCGGCCCCTGGTTGCCTCCGTCTTTCCCCCGCAG-TTCGGGACANTCTCTCTTAAAGTGGCCCGGAGCGCCACACTTAAAACAGC-CCGCGGGCTCCCCATTACCGCTCGGGGAGGGGGATCTCCGGGACGCAG-GG-GCCTGCCACGCAGCTCTTTCTCCAAGTCCGCCAGGCGCCGGCGCATC-TCGCGCNACTCCTGCGCCGA-----TG-CCGGAG-GGGTATCC
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7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-6380 ) : CACGGAGACA-GCC-GG-GATNTGAACCGTCTT--AGTCAGGGAAA-CCT--GNACCTC----CT-A----T-TCCCGGG--GCACCCAAACGTCATGGCG-ACGGTCTCCT-C-CCCATGGTCAG--TGTG-CCT-TGCCC-AAGGTCCAG-CCGGGC--CTGCTGGCG-GTGCAGAAA-CTCCATNCCCAGG-----AGCATCTG-GTCCTGC-AGTG-GGGCCACAA-----TACAGTTCCATGTCNATCTGCGT---AC--CCCA--G-CGA-A----CG-CTCACCGGGTC---C-ACTA-TGAACCC-GTTCATGCGGGC-GT----TCTCCCC-CGC--TGGATGAGGGT-GACG-CGTTGCTTGATGGGCGGTTTGG-GATCCAACCCCTCATAGACTC-G--G-TAGACAGAACGCTCACCTCCGCCCCCGTGTCCACCACNGCCTGGAGTTCNATGCCCTGCACCACCA-TGTCCGCGGTGGAGCCGGTGGCAGGCCGGACTTGGC---GGGGGGCCGGGGACGCC--CGGGGT-TCTCCTGCAGGCCAGCGTGGCCCACCC-ACGGTTCCACTCCCTCCCGGCTGTCGACCCCGTCCAAGCCGT---TGTCC--T--CCTC--GCCCG---C-GGGGGCCCCATCT-----CGGC--GT-GGGCGCCACCAGGGGACTGGCCTATGGCCCCCGGCTCC----CCG---GT------C-CTGTG-GTCCCC---GCTACCCGGTG-CCG-AC-------GCCTGG-T---CGGACGCGGC-GAGGACTGGTCGTCCCCCCGGAACAACCTGCTCACCCTCCGGGGGGGGGGGGGGGGGGACTCATNTCCGCCGTCCTCTCCCCTGACCGCCCACCTCCNNCACCACCCGCTCCCC-AATT-CCTCTGGGAGAAGGCACTCTCCGGGAACGAAGGGTCCGACCTCGG-----------GGGGCAGCT---CGTANGT-GTCCTCG--GCCCACCCTATCTCGCACGGGTTCTCGGANTCGTCCGA-T-C---------CTCCTCCCG--GGGCGCTACCCGG---AAGCGTACCCGGA--GCTTGCCCCTCCGG-GNT-TTCCACTCTCCGACCCG---TCCCTT-GCC-GCGCCT------A-GCT---CCNCC---------GGAGAACGCTCCGGGGTGAGCACGCGAACTCTTTTCTGAGTG-GTCCCTCGGCCGGAGGCTGTGCCGGGCTTAGGCCCGCGTTCCCTCGGTCGCGC-CTGGANCTCCGGCCCCTGGTTGCCTCCGTCTTTCCCCCGCAG-TTCGGGACANTCTCTCTTAAAGTGGCCCGGAGCGCCACACTTAAAACAGC-CCGCGGGCTCCCCATTACCGCTCGGGGAGGGGGATCTCCGGGACGCAG-GG-GCCTGCCACGCAGCTCTTTCTCCAAGTCCGCCAGGCGCCGGCGCATC-TCGCGCNACTCCTGCGCCGA-----TG-CCGGAG-GGGTATCC
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7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-6380 ) : CACGGAGACA-GCC-GG-GATNTGAACCGTCTT--AGTCAGGGAAA------------CCTGNACC-----------CC----------CGGG--GCACCCAAACGTCATGGTA-ACGGTCTCCT-C-CCCATGGTCAG--TGTG-CCT-TGCCC-AAGGTCCAG-CCGGGCCT--GCTGGCG-GTGCAGAAA-CTCCATNCCCAGG-----AGCATCTG-GTCCTGC-AGTG-GGGCCACA------TACAGTTCCATGTCNATCTGCGTA-CT-CCCA--CG-AC-------C-CTCACCGGGTC---C-ACTA-TGAACCC-GTTCATGCGGGC-GT----TCTCCCC-CGC--TGGATGAGGGT-GACG-CGTTGCTTGATGGGCGGTTTGG-GATCCAACCCCTCATAGACTC-G--G-TAGACAGAACGCTCACCTCCGCCCCCGTGTCCACCACNGCCTGGAGTTCNATGCCCTGCACCACCA-TGTCCGCGGTGGAGCCGGTGGCAGGCCGGACTTGGC---GGGGGGCCGGGGACGCC--CGGGGT-TCTCCTGCAGGCCAGCGTGGCCCACCC-ACGGTTCCACTCCCTCCCGGCTGTCGACCCCGTCCAAGCCGT---TGTCC--T--CCTC--GCCCG---C-GGGGGCCCCATCT-----CGGC--GT-GGGCGCCACCAGGGGACTGGCCTATGGCCCCCGGCTCC----CCG---GT------C-CTGTG-GTCCCC---GCTACCCGGTG-CCG-AC-------GCCTGG-T---CGGACGCGGC-GAGGACTGGTCGTCCCCCCGGAACAACCTGCTCACCCTCCGGGGGGGGGGGGGGGGGGACTCATNTCCGCCGTCCTCTCCCCTGACCGCCCACCTCCNNCACCACCCGCTCCCC-AATT-CCTCTGGGAGAAGGCACTCTCCGGGAACGAAGGGTCCGACCTCGG-----------GGGGCAGCT---CGTANGT-GTCCTCG--GCCCACCCTATCTCGCACGGGTTCTCGGANTCGTCCGA-CC---------CTCCTCCCG--GGGCGCTACCCGG---AAGCGTACCCGGA--GCTTGCCCCTCCGG-GNT-TTCCACTCTCCGACCCG---TCCCTT-GCC-GCGCCT------A-GCT---CCNCC---------GGAGAACGCTCCGGGGTGAGCACGCGAACTCTTTTCTGAGTGCGTCCCTCGGCCGGAGGC-GTGCCGGGCTTAGGCCCGCGTTCCCTCGGTCGCGC-CTGGANCTCCGGCCCCTGGTTGCCTCCGTCTTTCCCCCGCAG-TTCGGGACANTCTCTCTTAAAGTGGCCCGGAGCGCCACACTTAAAACAGC-CCGCGGGCTCCCCATTACCGCTCGGGGAGGGGGATCTCCGGGACGCAG-GG-GCCTGCCACGCAGCTCTTTCTCCAAGTCCGCCAGGCGCCGGCGCATC-TCGCGCNACTCCTGCGCCGA-----TG-CCGGAG-GGGTATCC
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gi|2 : ggggttttcctggcctccaaatccagtggggcaggtttgggtccctgagctgtctcgagtgtgggccagggtagctgatgcttcgagctgttctcactagggtcctccatgaaccatgctccacaaggttctctcaggtccaactcaccccgggaccaatctgccaacctggcaattcacagagcccagccaagccgtcctgtcgactgcaggcaacagccaagcccccaccgcaccaacttctctccacagggggttggtgcttgaagaaaatctcccaactgtccaacaaggtgcccagcatcggaccaaccacaaattcccaggcgcctgttcagatggaagggtcaaggccacaagacatccagggattgacgtcttggtcagtgaaacctgtaccccggagcatccaaacgtcatgggaacaactcctcccctggtcagagttccgtccaggtctagccggctgctgggttgcagaaactccatgcctaggagcatctgtcttgtagtggggccacatacaggtccatgtccatcttggatgcccagcaaacgttcaccgggcccactataaacccttcatgcaggcatctcccctgctggataacggtgacgcgttgcttgatggggtttgggatcaacccaataaactctggaagataggacctcacctccactcctgtgtccaccactgcctgagttcaatcctgcaccactagtccacgtggacctgtggcagctagacttggcgagggggcggggacacccgggttcccctgcagttccactcatccccgactgtcgatcctgtccaagccgtttcctcctcaggcacgtaggagccctatcttctaccggtgggcaccactattactcctcgaaacgcgattccctagtccaatggtctccgctacccgcgccgcacgattggtcagcgcagtaggaatggtcgtccccctggaacaacctgttcacctcgggggggggggggggggggactcatacccaccgtccctcccctgaccggttgctggatggaggcacccccggaataaggttttaattggggggGG-----------GGGGGAACT---CATACGTTGTCCTCG--GCCTACCC-ATCTAGCggcctacccatctagcgt
gi|3 : ggggttttcctggcctccaaatccagtggggcaggtttgggtccctgagctgtctcgagtgtgggccagggtagctgatgcttcgagctgttctcactagggtcctccatgaaccatgctccacaaggttctctcaggtccaactcaccccgggaccaatctgccaacctggcaattcacagagcccagccaagccgtcctgtcgactgcaggcaacagccaagcccccaccgcaccaacttctctccacagggggttggtgcttgaagaaaatctcccaactgtccaacaaggtgcccagcatcggaccaaccacaaattcccaggcgcctgttcagatggaagggtcaaggccacaagacatccagggattgacgtcttggtcagtgaaacctgtaccccggagcatccaaacgtcatgggaacaactcctcccctggtcagagttccgtccaggtctagccggctgctgggttgcagaaactccatgcctaggagcatctgtcttgtagtggggccacatacaggtccatgtccatcttggatgcccagcaaacgttcaccgggcccactataaacccttcatgcaggcatctcccctgctggataacggtgacgcgttgcttgatggggtttgggatcaacccaataaactctggaagataggacctcacctccactcctgtgtccaccactgcctgagttcaatcctgcaccactagtccacgtggacctgtggcagctagacttggcgagggggcggggacacccgggttcccctgcagttccactcatccccgactgtcgatcctgtccaagccgtttcctcctcaggcacgtaggagccctatcttctaccggtgggcaccactattactcctcgaaacgcgattccctagtccaatggtctccgctacccgcgccgcacgattggtcagcgcagtaggaatggtcgtccccctggaacaacctgttcacctcgggggggggggggggggggactcatacccaccgtccctcccctgaccggttgctggatggaggcacccccggaataaggttttaattggggggggggggggggCACGGAAACA-GAC-GG-GATTTAAACCGTCTT--GGTCAGGGAAA------------CC------------------C----------TGGG--GCACCCGAACGTCATGGTA-ATGGTCTCCTAC-CCTATGGTGAG--TGTGTCCT-TTCCC-A-GGTCCAG-CCGGGCTT--GCTTGTG-ATGCAGGAA-CTCCATCCCCAAG-----AGCATCTG-GTTCTGA-AGTG-GGGCCACA------TACAGTTTCATATCCATCTGCGTT-CCACCCAAGCG-ACACG----C-CTCACCGAGTC---C-ACTATTGAACCCTTTTCATGT--GCAGT----GCTCCCgt
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