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lowQualScore                  :                              . ... .  .. .   . .  ....             
lowQualScore                  :                              7 222 7  00 7   1 4  5555             
consensus                     :                   GTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
Reference ( gi|21 )           :                   GTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGTG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|33                         :                   GTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCA-TA----GCATCCCCTCG
gi|18                         :                  tGTAAACTAGGC-A---A-AG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTC
gi|53                         :                tataTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGTG-TA----GCATCCCCTCG
gi|52                         :                    TAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCC
gi|47                         :                  aaTAAATAAGGC-A---A-TG--C-AAGCC-TA----GCATCCCCTCGCc
gi|36                         :                    TAAACAAGGC-A---A-CA--C-AAGGG-TA----GCATTCCCTCCCA
gi|2                          :                    TGAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCC
gi|12                         : tggcatctccgacgcaaaaTAAATGAGGC-A---A-GG--C-AAATG-TA----GCATCCCCTCG
gi|8                          :                ctttTAAATGAGGC-A---A-GG--C-AAATG-TA----GCATCCCCTCGa
gi|45                         :              atctttTAAACAAGGC-A---A-GG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCa
gi|39                         :                gcaaTATACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCC
gi|57                         :               atataTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATC
gi|50                         :                agatTGAACAAGGC-A---A-CG--C-AAACG-TA----GCAT-CCCTCG
gi|19                         :                  tcTAAA-AAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCTC
gi|1                          :            gcaagtacTGAACAAGGA-A---A-CG--C-AAACA-TA----GCATCCC
gi|43                         : catgtatttccaatgtaaatAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|22                         :                     AAATAAGGC-A---A-GG--C-AAGTG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|9                          :                     AAACAAGGC-A---A-TG--C-AAGTG-TA----GCATCCCCTac
gi|55                         :                    aAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCTTTCGCaataacac
gi|34                         :                     AAACAAGGC-G---A-TA--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|32                         :                    aAAACAAGGA-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTC
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gi|17                         :                    aAAACAAGGC-A---A-CA--C-AAGTA-TA----GCATCTCCTCAC
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gi|49                         :  ataaatcagtaggaatatgAAATAAGGC-A---A-CC--C-AAGCC-TA----GCATCCCCTCACA
gi|6                          :                     AAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCGTTA----GCATTC
gi|54                         :          tgatacaacatgAACAAGGC-A---A-CG--C-AAACG-TA----GCATCCCCTCGCAac
gi|56                         :                      AACAAGGC-A---A-TG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGC
gi|46                         :                      AACAAGGC-A---A-CG--CCAAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|25                         :                      AACAAGGC-A---AACG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
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gi|11                         :               attgtctAACAAGGC-A---A-TG--C-AAGTG-TA----ACATCCCCTC
gi|38                         :                    gtAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCagaaca
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gi|26                         :                    ttcACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCaca
gi|40                         :              actggtttcACTAGGC-A---A-CG--C-AAGTGTTA----GCATCCCCTCACA
gi|23                         :                         AAGGC-ATTGA-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCAac
gi|58                         :                         AAGGC-A---A-CG--C-AAGAA-TA----GCATCCCCTCGaca
gi|10                         :                      attAAGGC-A---A-TGGGC-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|59                         :                      ttaaAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTTGCAac
gi|42                         :                          AGGC-A---A-CG--C-AAGCA-TA----GCATCCCCTCGa
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CATGATGCATTTCCAATGCAAAAAAAAAAAGGAAAAGAAAACATAAC
Unaligned ( gi|7 ): TGAAGTGTAAAATAAACCAACGAAAGCGTAGTATTCCCTCAC






Alignments
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lowQualScore                  :                            . ... .  .. .     .  ....             
lowQualScore                  :                            7 222 7  99 7     4  5555             
consensus                     :                 GTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
Reference ( family-638 )      :                 GTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|1                          :                  TGAACAAGGA-A---A-CG--C-AAACA-TA----GCATCCC
gi|10                         :   catgtatttccaatgtaaatAAGGC-A---A-TGGGC-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|11                         :                ttaaAACAAGGC-A---A-TG--C-AAGTG-TA----ACATCCCCTCac
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gi|13                         :                ctttAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCa
gi|14                         :         agtcaagatggAACAAGGC-A---A-CG--C-AAACG-TA----GCATCCC
gi|15                         :          ccatgactgtAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATTCCC
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gi|17                         :                  gAAACAAGGC-A---A-CA--C-AAGTA-TA----GCATCTCCTCACac
gi|18                         :             agtgGTAAACTAGGC-A---A-AG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTC
gi|19                         :              tataTAAA-AAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCTC
gi|2                          :          gcaagtacTGAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCC
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gi|22                         :                   AAATAAGGC-A---A-GG--C-AAGTG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|23                         :                       AAGGC-ATTGA-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCAac
gi|24                         :                   AAACAAGGCCA---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCGCCTCGCAaca
gi|25                         :                   aAACAAGGC-A---AACG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|26                         :                     ACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCac
gi|27                         :           actggtttcAACAAAGC-A---A-TG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTC
gi|28                         :               attacAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----ACATCCCCa
gi|29                         :            gagttaatAACAAGGC-A---A-TG--C-AAGCG-TA----GCATCCC
gi|3                          :          atttgaaatAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCTC
gi|30                         : ataaatcagtaggaatatgAACAAGAC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATTCC
gi|31                         :           tcgtattgtAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCC
gi|32                         :           tttgcattAAACAAGGA-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTC
gi|33                         :             tttgGTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCA-TA----GCATCCCCTCG
gi|34                         :                  tAAACAAGGC-G---A-TA--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|35                         :                   aAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGTG-TA----GCATCCCC
gi|36                         :           attgtctTAAACAAGGC-A---A-CA--C-AAGGG-TA----GCATTCCCTCCCA
gi|37                         :                   AAGCAAGGC-A---A-CA--C-AAGTG-TA----GAATTCCCTCGC
gi|38                         :                  taAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCC
gi|39                         :          taattaatTATACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCC
gi|40                         :                atataACTAGGC-A---A-CG--C-AAGTGTTA----GCATCCCCTCACA
gi|41                         :                    AATAAGGC-A---A-TG--C-AAGCA-TA----GCATCCCCTCac
gi|42                         :                   tatatAGGC-A---A-CG--C-AAGCA-TA----GCATCCCCTCG
gi|43                         :           acaaattgAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|44                         :                    AACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCA-TA----GCATCCCC
gi|45                         :            gataatTAAACAAGGC-A---A-GG--C-AAGCG-TA----GCATCCCC
gi|46                         :                gcaaAACAAGGC-A---A-CG--CCAAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|47                         :                  TAAATAAGGC-A---A-TG--C-AAGCC-TA----GCATCCCCTCGC
gi|48                         :                    AATAAGGC-A---A-CG--C-AATCG-TA----GCATCCCC
gi|49                         :             ttcattAAATAAGGC-A---A-CC--C-AAGCC-TA----GCATCCCCTCACA
gi|5                          :                    AAAAAGGC-A---T-TG--C-AAGTG-TATGTAGCATCCTCTTGCA
gi|50                         :               ttcTGAACAAGGC-A---A-CG--C-AAACG-TA----GCAT-CCCTCGaca
gi|51                         :                  tcAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCT
gi|52                         :             attgtTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCC
gi|53                         :                aaTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGTG-TA----GCATCCCCTCGc
gi|54                         :                    AACAAGGC-A---A-CG--C-AAACG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|55                         :                   AAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCTTTCGC
gi|56                         :                    AACAAGGC-A---A-TG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGC
gi|57                         :                  TAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATC
gi|58                         :                   agatAAGGC-A---A-CG--C-AAGAA-TA----GCATCCCCTCG
gi|59                         :                     attAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTTGCA
gi|6                          :                   AAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCGTTA----GCATTCa
gi|7                          :       tgatacaacatgAAATAAACC-A---A-CG--A-AAGCG-TA----GTATTCCCTCACac
gi|8                          :         tgaagtgtaTAAATGAGGC-A---A-GG--C-AAATG-TA----GCATCCCCTCG
gi|9                          :             atctttAAACAAGGC-A---A-TG--C-AAGTG-TA----GCATCCCCTa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CATGATGCATTTCCAATGCAAAAAAAAAAAGGAAAAGAAAACATAAC






Alignments
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lowQualScore                  :                            . ... .  .. .     .  ....             
lowQualScore                  :                            7 222 7  99 7     4  5555             
consensus                     :                 GTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
Reference ( family-638 )      :                 GTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|1                          :                  TGAACAAGGA-A---A-CG--C-AAACA-TA----GCATCCC
gi|10                         :   catgtatttccaatgtaaatAAGGC-A---A-TGGGC-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|11                         :                ttaaAACAAGGC-A---A-TG--C-AAGTG-TA----ACATCCCCTCac
gi|12                         :                gtTAAATGAGGC-A---A-GG--C-AAATG-TA----GCATCCCCTCGagaaca
gi|13                         :                ctttAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCa
gi|14                         :         agtcaagatggAACAAGGC-A---A-CG--C-AAACG-TA----GCATCCC
gi|15                         :          ccatgactgtAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATTCCC
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gi|17                         :                  gAAACAAGGC-A---A-CA--C-AAGTA-TA----GCATCTCCTCACac
gi|18                         :             agtgGTAAACTAGGC-A---A-AG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTC
gi|19                         :              tataTAAA-AAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCTC
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gi|20                         : tggcatctccgacgcaaaaAACAAGGC-A---A-CA--C-AAGCG-TA----GCATCCCC
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gi|22                         :                   AAATAAGGC-A---A-GG--C-AAGTG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|23                         :                       AAGGC-ATTGA-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCAac
gi|24                         :                   AAACAAGGCCA---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCGCCTCGCAaca
gi|25                         :                   aAACAAGGC-A---AACG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|26                         :                     ACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCac
gi|27                         :           actggtttcAACAAAGC-A---A-TG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTC
gi|28                         :               attacAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----ACATCCCCa
gi|29                         :            gagttaatAACAAGGC-A---A-TG--C-AAGCG-TA----GCATCCC
gi|3                          :          atttgaaatAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCTC
gi|30                         : ataaatcagtaggaatatgAACAAGAC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATTCC
gi|31                         :           tcgtattgtAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCC
gi|32                         :           tttgcattAAACAAGGA-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTC
gi|33                         :             tttgGTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCA-TA----GCATCCCCTCG
gi|34                         :                  tAAACAAGGC-G---A-TA--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|35                         :                   aAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGTG-TA----GCATCCCC
gi|36                         :           attgtctTAAACAAGGC-A---A-CA--C-AAGGG-TA----GCATTCCCTCCCA
gi|37                         :                   AAGCAAGGC-A---A-CA--C-AAGTG-TA----GAATTCCCTCGC
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gi|39                         :          taattaatTATACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCC
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gi|42                         :                   tatatAGGC-A---A-CG--C-AAGCA-TA----GCATCCCCTCG
gi|43                         :           acaaattgAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|44                         :                    AACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCA-TA----GCATCCCC
gi|45                         :            gataatTAAACAAGGC-A---A-GG--C-AAGCG-TA----GCATCCCC
gi|46                         :                gcaaAACAAGGC-A---A-CG--CCAAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|47                         :                  TAAATAAGGC-A---A-TG--C-AAGCC-TA----GCATCCCCTCGC
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gi|49                         :             ttcattAAATAAGGC-A---A-CC--C-AAGCC-TA----GCATCCCCTCACA
gi|5                          :                    AAAAAGGC-A---T-TG--C-AAGTG-TATGTAGCATCCTCTTGCA
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gi|51                         :                  tcAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCT
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gi|56                         :                    AACAAGGC-A---A-TG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGC
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gi|6                          :                   AAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCGTTA----GCATTCa
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blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   
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blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   
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blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   
blockSeqs                     :                              .               .  .   


blockSeqCons                  :                 
originalCons                  :                 GTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
finalCons                     :                 GTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CATGATGCATTTCCAATGCAAAAAAAAAAAGGAAAAGAAAACATAAC






Alignments
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lowQualScore                  :                            . ... .  .. .     .  ....             
lowQualScore                  :                            7 222 7  99 7     4  5555             
consensus                     :                 GTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
Reference ( family-638 )      :                 GTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|1                          :                  TGAACAAGGA-A---A-CG--C-AAACA-TA----GCATCCC
gi|10                         :   catgtatttccaatgtaaatAAGGC-A---A-TGGGC-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|11                         :                ttaaAACAAGGC-A---A-TG--C-AAGTG-TA----ACATCCCCTCac
gi|12                         :                gtTAAATGAGGC-A---A-GG--C-AAATG-TA----GCATCCCCTCGagaaca
gi|13                         :                ctttAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCa
gi|14                         :         agtcaagatggAACAAGGC-A---A-CG--C-AAACG-TA----GCATCCC
gi|15                         :          ccatgactgtAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATTCCC
gi|16                         :          tgcatctgtAAACAAGGC-A---A-TG--C-ACGTG-TA----GCATTCCCTTGCA
gi|17                         :                  gAAACAAGGC-A---A-CA--C-AAGTA-TA----GCATCTCCTCACac
gi|18                         :             agtgGTAAACTAGGC-A---A-AG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTC
gi|19                         :              tataTAAA-AAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCTC
gi|2                          :          gcaagtacTGAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCC
gi|20                         : tggcatctccgacgcaaaaAACAAGGC-A---A-CA--C-AAGCG-TA----GCATCCCC
gi|21                         :        taatattatGTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGTG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|22                         :                   AAATAAGGC-A---A-GG--C-AAGTG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|23                         :                       AAGGC-ATTGA-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCAac
gi|24                         :                   AAACAAGGCCA---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCGCCTCGCAaca
gi|25                         :                   aAACAAGGC-A---AACG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|26                         :                     ACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCac
gi|27                         :           actggtttcAACAAAGC-A---A-TG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTC
gi|28                         :               attacAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----ACATCCCCa
gi|29                         :            gagttaatAACAAGGC-A---A-TG--C-AAGCG-TA----GCATCCC
gi|3                          :          atttgaaatAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCTC
gi|30                         : ataaatcagtaggaatatgAACAAGAC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATTCC
gi|31                         :           tcgtattgtAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCC
gi|32                         :           tttgcattAAACAAGGA-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTC
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gi|34                         :                  tAAACAAGGC-G---A-TA--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|35                         :                   aAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGTG-TA----GCATCCCC
gi|36                         :           attgtctTAAACAAGGC-A---A-CA--C-AAGGG-TA----GCATTCCCTCCCA
gi|37                         :                   AAGCAAGGC-A---A-CA--C-AAGTG-TA----GAATTCCCTCGC
gi|38                         :                  taAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCC
gi|39                         :          taattaatTATACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCC
gi|40                         :                atataACTAGGC-A---A-CG--C-AAGTGTTA----GCATCCCCTCACA
gi|41                         :                    AATAAGGC-A---A-TG--C-AAGCA-TA----GCATCCCCTCac
gi|42                         :                   tatatAGGC-A---A-CG--C-AAGCA-TA----GCATCCCCTCG
gi|43                         :           acaaattgAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|44                         :                    AACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCA-TA----GCATCCCC
gi|45                         :            gataatTAAACAAGGC-A---A-GG--C-AAGCG-TA----GCATCCCC
gi|46                         :                gcaaAACAAGGC-A---A-CG--CCAAGCG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|47                         :                  TAAATAAGGC-A---A-TG--C-AAGCC-TA----GCATCCCCTCGC
gi|48                         :                    AATAAGGC-A---A-CG--C-AATCG-TA----GCATCCCC
gi|49                         :             ttcattAAATAAGGC-A---A-CC--C-AAGCC-TA----GCATCCCCTCACA
gi|5                          :                    AAAAAGGC-A---T-TG--C-AAGTG-TATGTAGCATCCTCTTGCA
gi|50                         :               ttcTGAACAAGGC-A---A-CG--C-AAACG-TA----GCAT-CCCTCGaca
gi|51                         :                  tcAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCT
gi|52                         :             attgtTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCCC
gi|53                         :                aaTAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGTG-TA----GCATCCCCTCGc
gi|54                         :                    AACAAGGC-A---A-CG--C-AAACG-TA----GCATCCCCTCGCA
gi|55                         :                   AAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATCCTTTCGC
gi|56                         :                    AACAAGGC-A---A-TG--C-AAGCG-TA----GCATCCCCTCGC
gi|57                         :                  TAAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCG-TA----GCATC
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gi|6                          :                   AAACAAGGC-A---A-CG--C-AAGCGTTA----GCATTCa
gi|7                          :       tgatacaacatgAAATAAACC-A---A-CG--A-AAGCG-TA----GTATTCCCTCACac
gi|8                          :         tgaagtgtaTAAATGAGGC-A---A-GG--C-AAATG-TA----GCATCCCCTCG
gi|9                          :             atctttAAACAAGGC-A---A-TG--C-AAGTG-TA----GCATCCCCTa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CATGATGCATTTCCAATGCAAAAAAAAAAAGGAAAAGAAAACATAAC