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consensus : CCTTTCC-GAAAACG---TGAG--TT--A-TCT----TTCCTT--G--ATC-CGG-AA-C-G-----T-AGT--GCG-C---T----TG-C---GT-A-ATTTAATTTT--A---TTTTAGACTTC-CG-------GGT-ATT-ATATT-C-AAGA-AGC----G---T--CATTAAC--A-AC-A-GT--G--CAGAAAG-CCGCAAA-G-ATAT-TGCCG--T-A-TG--TA-CGGCA-ATC-G-C-GC-TTA-C---AAA--T-A----T-GGAA--A-ATAA-ATGT-T-A---TCAAAA---GAAG-A-C-GA---CTCCCCTT-CCC-AT---CT-T--G-ATTT--T----ACGT---GTTTTGT-AAC-----C-AAAAT-----T-AAT-C-T--ACA---TAAT--A-T-AG--ATC-AGC-------A--T--C-T---A--TTG-CA-T--------------AAG---TT---CC-A----C---GGAC---CTT-T------------------------TA--------AAA--TGTT-G------CTT-G-AT--C---AA-TA-TCAG-T------GTAG--TA-A-G-CA-AGTTCTG-ACACA------AT------G-T---------AC------------G-TT-TAATTC-TG----T-A-TG-T-C--A-G-ACCGA-CGTTTA--TGGA-TTCT-G-GAAATA
Reference ( gi|8 ) : CCTTTCT-GAAAACG---TGAG--TT--A-TCA----TTCCTT--G--ATC-TGG-AA-C-G-----T-AGT--GCG-C---A----TG-C---GT-A-ATTTAATTTT--A---TTTTAAACTTC-TG-------GGT-ATT-ATATT-C-AAGA-AGC----G---T--CATTAAC--A-AC-A-GT--G--CAGAAAA-CCTCAGA-G-ATAT-TGCCG--T-A-TG--TA-CGGCACATC-G-C-GC-TTA-C---AAA--T-A----T-GGAA--A-ATAA-ATGT-T-A---TC-AAA---GAAG-A-C-GA---CTCCCCTT-CCC-AT---C--T--G-A-TT--T----ACGT---GTTTTGT-AAC-----C-AAAAT-----T-AAT-C-T--AC----TAAT--A-T-AG--ATC-AGC-------A--T--C-T---A--TTG-CA-T--------------AAG---TT---CC-A----C---GGAC---CTT-T------------------------TA--------AAA--TGTT-G------CTT-G-AT--C---A--TA-TCAG-T------GTAG--TA-A-G-CA-AGTTCTG-ACACA------AT------G-T---------AT------------G-TT-TAATTC-TG----T-A-TG-T-C--A-G-ACCGA-CGTTTA--TGGA-TTCT-G-GAAATA
gi|6 : CCTTTCC-GAAAACG---TGAG--TT--A-TTAATCTTTCCTT--G--ATC-CGG-AA-C-GT----T-AGT--GCG-C---T----TG-C---GTAA-ATTTAA---A--A---TTTT-AACTTC-CG-------GGT-ATT-ATATT-C--AGA-AGC----G---TCCCATTAAC--A-AC-A-GT--G--CAGAAAAGCCGCAGAGG-ATAT-TGCCG--TAA-TG--TA-CGGCA-ATC-G-C-GCTTTA-C---AAA--TAA----T-GGAA--A-ATAA-ATGT-T-A---TCAAAA---GAAG-A-C-GA-----CCCCTT-CCCAAT---CT-T--G-ATTT--T----ACGT---G-TTTGT-AAC-----C-AAAAT-----TAAAT-C-T--ACA---TAAT--A-TAAG--ATC-AGC-------A--T--C-T---A--TTG-CA-TCCCTGACCTTTTTAAAA---CA---CC-ACAACC---AAGC---CTTAT------------------------AA--------AAA--TGTT-G------CTT-G-AT--CCAAA--AA-TCAG-T------GTAGT-TA-A-G-CA-AGTTCTG-ACAC-------AT------G-T---------AT------------GTTT-TAATTC-TG----T-A-TG-T-C--A-G-ACCGA-CGTTTA--TAGA-TTC--G-GAA
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gi|4 : CCTTTCCCGAAAACG---TGAG--TT--AATCT----TTCCTT--G--ATC-CGG-GA-A-G-----T-AGT--GCG-C---T----TGAC---GT-A-ATT--A------A---TTTTAAACTTC-CG-------GGT-ATT-ATATTTC-AAGA-AGC----G---T--CATTAAC--A------GT--G--CAGA---------------T-T-TGCCG--A-A-TG--TA-CGGCA-ATC-CTC-GC-TTA-C---AAAGTT-A----T-GGAA--A-ATAA-ATGT-T-A---TCAAAA---GAAGAA-CGGA---CTCCCCTTACCC-AT---CT-T--G-ATTT--T----ACGT---GTTTTTTAAAC-----C-AAAAT-----T-AAT-CTT--ACA---TAAT--A-T-A---ATC-AGC-------AATT--C-T---A--TTGCCA-T--------------AAGT--TT---CC-A----CG--GGAT---CTT-T------------------------ca
gi|7 : CCTTTCT-GAAAACG---TGAG--TTT-A-TC-----TTCCCT--G--AGC-CGG-AAAC-GCTACCT-AGT--GC--C--------TG-C---GT-A-ATTTAATTTT--A--------GACTTC-CG-------GGT------TA-----------------G---TA-CATTAAC--A-AC-A-GT--G--CAGAAA--CCGCAAA-G-ATAT-TGCC---T-A-TGC-TA-TGGCA-ATT-G-C-GC-TGA-C---AAA--T-A----TTGGAA--A-ATCA-ATGT-T-A---TC-AAAA--GAAG-A-C-GA---TCCCCCTT-CCC-AT---CTTT--G-A-TT--T----ACGT---GTTTTGC-AAC-----C-------------AAT-C-T--ACA---TGAT--A-T-AG--ATC-AAC-------A--T--C-T---T--TTG-CA-T--------------AAT---TT---TCAA----CG--GGAT---CTT-T------------------------TA--------actctgggaccttttaaaacaccacaaccccgccacaaccaggccttataaaaaatgttgcttgatcaatatcagttagtaagcaagttctgacacaatgtatgttaattctgtatgtccagaccgacgtttatggattctggaaatact
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gi|14 : TTTCT-GACAATG---TGAG--TT--A-TCT----TCCCTT--C--ACT-CGG-AA-C-G-----T-AGT--GCG-C---T----TG-C---AT-A-CATTATTTTT--AGACTTTTAGAC-----A-------GGC-AAT-GCATT-CAAAGA-AGC----G---T--CGTGGTC--A-GA-A-GT--G--CAGAAA
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gi|13 : c----TTCCTT--G--ATC-TGC-AA-T-A-----T-AGT--GCG-C---T----TG-T---GT-A----TA--TTA--A---TTTTAGACTTC-CG-------GGT-AGT-ATATT-C-AGGA-AGC----G---T--CGTTATC--A-CC-A-GT--G--TAGAGAG-CCTCAAA-G-ATAT-TGGTG--T-A-GG--TA-CAGCA-ATC-G-T-GC-TAA-C---AAA--T-actcttggaatcattctataaaacacccaaccagccttataaaatattgctttgcatcaaatatcagttgtgttgttgtaatgcagggtttgacacaattatatttaatctgttatgtcaggaccgacttacttggatttctggaaatac
gi|19 : cgaaaataaaagtaacat-AA-C-G-----T-AGT--ACG-C---T----TG-C---GT-A-ATTTAATTTT--A--------GACTTT-TG-------GGT-AGT-ATATT-C-AAGA-AGC----G---T--AATTAAC--
gi|10 : T-ATATT-C-ATAA-AGC----G---T--CATTAAC--A-AC-A-GT--G--CAGAAAA-CCGCGAA-G-ATAT-TGCTT--T-A-TG--TA-CAGCA-ATC-G-C-GC-TTA-C---AAA--T-A----T-GGAA--A-ATCA-ATGT-T-A---TCAAAA---GAAG-A-T-GA---CTCCCCTT-CCC-AT---CT-T--G-ATTT--T----ACGT---GC-----------------AAGC-----T-AAT-C-T--A-----TAAT--ATT-AT--ATT--GCTTGGGTTA--T--T-T---ACTTTG-GA-CCCTTCCG-------ATG---TTCTACC-A----C---AGTCAGTCTT-A------------------------TA--------AAA--TGTA-C------CTT-G-AT--CA--A--AA-TCAG-T------GTAG--TA-A-G-CA-AGTTCTG-ACACAATATACAT------G-C---------AC------------G-TC-TAAATA-TG----C-A-TG-T-C--A-T-ACCGA-CGCTTA--TG----TCT-G-GAAATA
gi|1 : gA-G-AT-T-TGCCG--T-A-TA--TA-CGGCAc
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gi|12 : AT-----T-AAT-C-T--AC------AT--G-T-AT--ATT-A-T-------A--T--A-T---A--TTG-CA-T--------------AAAT--TT---CC-T----CG--GGAT---CTT-T------------------------TA--------AAA--ctctggaccttttgatagccctgtgttctatcacaaacagcattataaaatgtcggggtcgcttgtttaatatcaatgtagtaaaccagttctgacacaatatatatgtactgctacgtctaattctgtatgcgagacagatggtttctggaaatat
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gi|4 : cctttctgaaaacgtgagtttatcttccctgagccggaaacgctacctagtgcctgcgtaatttaattttagacttccgggttagtacattaacaacagtgcagaaaccgcaaagatattgcctatgctatggcaattgcgctgacaaatattggaaaatcaatgttatcaaaagaagacgatcccccttcccatctttgatttacgtgttttgcaaccaatctacatgatatagatcaacatcttttgcataattttcaacgggatcttttattacacgggcgacctttctaaaaaccaca----C---AGGC---CTT-A------------------------TA--------AAAAATGTT-G------CTT-G-AT--CA--A--TA-TCAG-T-------TAG--TA-A-G-CA-AGTTCTG-ACACA------AT------G-T---------AT------------G--T-TAATTC-TG----T-A-TG-TCC--A-G-ACCGA-CGTTTA--TGGA-TTCT-G-GAAATAcct
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gi|12 : cgaaaacagttgagttaatctttccttgatccggtaattgttagtgcgcttgcttaattatcaattataaacttccgcgggtattatattcaagacagcgtcattaacaaccagtgcagaaagccgcagagatattgccgtatgatacggcaatctcgcatacaatatggaaataaaaaatgatcaaagaagacgactcccttcccatattgattttacgtgtttttaaccaaaaattaatactacataatactgaatcagcatcatattgcataaagtttccatcgggatctttactcttggaatcattctataaaacacccaaccagC---CTT-A------------------------TA--------AAA--TGTT-G------CTT-G-AT--C---AA-TA-TC-----------------------CA--GTTCTG-ACACA------ATATACATG-T---------AC------------G-TC-AAATTC-TG----T-T-TG-T-C--A-G-ACAGA-CGCTTA--TGAA-TTCT-G-GAAATAc
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gi|1 : cccatttccatctcaatcatacgtgttttggaactaaaattacactatattatacattggacaagtttccttggactctttactctggaccttttgatagccctgtgttctatcacaaacagcaAG-T------G-AG--TACA-G-CATAGTTCTG-ACAC-------AT------T-TACTCTCAAAAT------------G--T-TAATTC-TGAGGAT-ATTGTT-C--AGG-ACCGAGCG-TAA--T--A-TTCT-G-AAAAt
gi|20 : ctttatccgaaaacggtccgagttgtatctttcctttggatccttgaacgtagtctgcggcgggtttgcgtaatttaattttagaacttcacgcttttattagtttggtgattcatattcaagaaccccgagtcattaacagacagtgcagaattgccgtatatacggcaaatcttcgcttacaaataatgttgtcaaatagtatgctatcaaaaagaaagaccgacacctcccgttcccatcttgattttacgtagattttaaaccaaaatttacataactacccattaataaataattatctagcatctatgattgcattaagttcatccaggagatcattaatactctaggaactttttaataccaccaataactctctctctgtataaaaaatagattgcattgagtctaattatcaagatatacaatatggTC-TG----T-A-TG-T-C--A-G-ACCGA-CGTTAA--TGGA-TTCT-G-GAAATAacttt
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-6368 ) : CCTTTCC-GAAAACG---TGAG--TT--A-T----CTTTCCTT--G--ATCCG-G-AA-C-G-----T-AGT-----GCG--CTT---G-C---GTA-A-TTTAATTTT--A---TTTTAGACTTC-CG-------GGT-ATT-ATATT-C-AAGA-AGC----G---T-C--ATTAAC--A-AC-A-GT--G--CAGAAA-G-CCGCAAAG-ATAT-TGCCG--TA-TG--TA-CGG-CA-A-T-CG-C-GCTT-A-C---AAA--TA----T-GGAA--A-ATAA-ATGT-T-A--TCAAAAG--AAG-AC-GA--C---TCCCCTT-CCC-AT---CTT-G-ATTT-T--ACGT---G--TTTTGT-AAC-----C-AA-------------AATT-----AA-----T-C-T--AC------ATA--ATA-T-AG--ATC-AG--C---A--T--C-T---A--TTG-CA-T--------------AAG------TT---C-------CAC---G---GAC-----CTTTTA--------AA------------------------A--TGTT-G------CTT-G-AT--C--AA-TA-TC-AG-T------GTAG--TA-A-G-CA-AGTTCTG-ACACA------AT------G------------T-AC-------G-T-T-TAATTC-TG----TA-TG-T-C--A-G-ACCGA-CGTTTA--TGGA-TTCT-G-GAAATA
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gi|9 : CCTTTCC-GAAAACG---TGAG--TT--A-T----CTTTCCTT--G--ATCCG-G-AA-C-G-----T-AGT-----GCG--CTT---G-C---GTA-A-TTTAATTTT--A--------AACTTC-CG-------GGT-ATT-ATATT-C-AAGA-AGC----G---T-C--ATTAAC--A-AC-A-GT--G--CAGAAA-G-CCGCAAAG-ATAT-TGCCG--TA-TG--TA-CGG-CA-A-T-TG-C-GCTT-A-C---AAA--TA----T-GGAA--A-ATCA-ATGT-T-A--TCAAAAG--AAG-AT-G-------------------AT---CTT-G-ATTT-T--ACGT---G--TTTTGC-AAC-----C-AA-------------A-------------------------------------A-T-AG--ATC-AG--C---A--T--C-T---A--TTG-CA-T--------------AAGTCT---TT---A-------CACTCTG---GAC-----CTTTTAAAACTTATAA------------------------A--TGTTGG------CTT-G-ATC-C--AA-TATTC-AG-T------GTAGATCA-A-G-C--AGTTCTG-GCACA------AT------G------------T-AC-------G-T-T-GAATTCATA----TA-TG-T-C--A-G-ACCGA-CGTTTA--TGAA-
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-6368 ) : CCTTTCC-GAAAACG---TGAG--TT--A-T----CTTTCCTT--G--ATCCG-G-AA-C-G-----T-AGT-----GCG--CTT---G-C---GTA-A-TTTAATTTT--A---TTTTAGACTTC-CG-------GGT-ATT-ATATT-C-AAGA-AGC----G---T-C--ATTAAC--A-AC-A-GT--G--CAGAAA-G-CCGCAGAG-ATAT-TGCCG--TA-TG--TA-CGG-CA-A-T-CG-C-GCTT-A-C---AAA--TA----T-GGAA--A-ATAA-ATGT-T-A--TCAAAAG--AAG-AC-GA--C---TCCCCTT-CCC-AT---CTT-G-ATTT-T--ACGT---G--TTTTGT-AAC-----C-AA-------------AATT-----AA-----T-C-T--AC------ATA--ATA-T-AG--ATC-AG--C---A--T--C-T---A--TTG-CA-T--------------AAG------TT---C-------CA----C---G---GAC---CTTNT-A--------AA------------------------A--TGTT-G------CT-T-G-AT--C--AA-TA-TC-AG-T------GTA-G--TA-A-G-CA-AGTTCTG-ACACA------AT------G------------T-AC-------G-T-T-TAATTC-TG----TA-TG-T-C--A-G-ACCGA-CGTTTA--TGGA-TTCT-G-GAAATA
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gi|9 : CCTTTCC-GAAAACG---TGAG--TT--A-T----CTTTCCTT--G--ATCCG-G-AA-C-G-----T-AGT-----GCG--CTT---G-C---GTA-A-TTTAATTTT--A--------AACTTC-CG-------GGT-ATT-ATATT-C-AAGA-AGC----G---T-C--ATTAAC--A-AC-A-GT--G--CAGAAA-G-CCGCAAAG-ATAT-TGCCG--TA-TG--TA-CGG-CA-A-T-TG-C-GCTT-A-C---AAA--TA----T-GGAA--A-ATCA-ATGT-T-A--TCAAAAG--AAG-AT-G-------------------AT---CTT-G-ATTT-T--ACGT---G--TTTTGC-AAC-----C-AA-------------A-------------------------------------A-T-AG--ATC-AG--C---A--T--C-T---A--TTG-CA-T--------------AAGTCT---TT---A-------CA----CTCTG---GAC---CTTTT-AAAACTTATAA------------------------A--TGTTGG------CT-T-G-ATC-C--AA-TATTC-AG-T------GTA-GATCA-A-G-C--AGTTCTG-GCACA------AT------G------------T-AC-------G-T-T-GAATTCATA----TA-TG-T-C--A-G-ACCGA-CGTTTA--TGAA-
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . A ATTTTAT G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . C . . . . . . . . T GT . . . . A . . . . . GA . C . . . . . . . AAAGTTTCCATCGG . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . A ATTTTA A . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . C . . . . . . . . T GT . . . . T . . . . . AG . C . . . . . . . AGACTTTACTCTG . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . A ATTTTA A . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . T GC . . . . T . . . . . AG . C . . . . . . . AAATTTCCTCGG . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . A TTAAT A . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . C . . . . . . . . T GT . . . . T . . . . . AG . T . . . . . . . AAGTTTCCACGG . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . . . . A ATTT G . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T GC . . . . T . . . . . A . C . . . . . . . AAGTTTCCTTG . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . A ATAT A . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . A . C . . . . . . . AAGTTCCACGG . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . A AAAT A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . C . . . . . . . AAGTTCCACG . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . AAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : *** ** ** ***** ** ATTTAT****** ******* **** G** **** ** C***** T** GT* ***** T****** ****** AG*** *** AAGTTTCCACGG************************************** *** ******* T** ****
originalCons : CCTTTCC-GAAAACG---TGAG--TT--A-T----CTTTCCTT--G--ATCCG-G-AA-C-G-----T-AGT-----GCG--CTT---G-C---GTA-A-TTTAATTTT--A---TTTTAGACTTC-CG-------GGT-ATT-ATATT-C-AAGA-AGC----G---T-C--ATTAAC--A-AC-A-GT--G--CAGAAA-G-CCGCAGAG-ATAT-TGCCG--TA-TG--TA-CGG-CA-A-T-CG-C-GCTT-A-C---AAA--TA----T-GGAA--A-ATAA-ATGT-T-A--TCAAAAG--AAG-AC-GA--C---TCCCCTT-CCC-AT---CTT-G-ATTT-T--ACGT---G--TTTTGT-AAC-----C-AA-------------AATT-----AA-----T-C-T--AC------ATA--ATA-T-AG--ATC-AG--C---A--T--C-T---A--TTG-CA-T--------------AAG------TT---C-------CA----C---G---GAC---CTTNT-A--------AA------------------------A--TGTT-G------CT-T-G-AT--C--AA-TA-TC-AG-T------GTA-G--TA-A-G-CA-AGTTCTG-ACACA------AT------G------------T-AC-------G-T-T-TAATTC-TG----TA-TG-T-C--A-G-ACCGA-CGTTTA--TGGA-TTCT-G-GAAATA
finalCons : CCTTTCC-GAAAACG---TGAG--TT--A-T----CTTTCCTT--G--ATCCG-G-AA-C-G-----T-AGT-----GCG--CTT---G-C---GTA-A-TTTAATTTAT------TTTAGACTTC-CG-------GGT-ATT-ATATT-C-AAGA-AGC----G---T-C--ATTAAC--A-AC-A-GT--G--CAGAAAG--CCGCAGAG-ATAT-TGCCG--TA-TG--TA-CGG-CA-A-T-CG-C-GCTT-A-C---AAA--TA----T-GGAA--A-ATAA-ATGT-T-A--TCAAAAG--AAG-AC-GAC-----TCCCCTT-CCC-AT---CTT-G-ATTT-T--ACGT---GT--TTTGT-AAC-----C-AA-------------AATT-----AAT------C-T--AC------ATA--ATA-TAG---ATC-AG--C---A--T--C-T---A--TTG-CA-TAAGTTTCCACGG--------------------------------------GAC---CTTNT-A--------AA------------------------A--TGTT-G------CT-T-G-AT--C--AA-TA-TC-AG-T------GTA-G--TA-A-G-CA-AGTTCTG-ACACA------AT------G------------T-AC-------GT--T-TAATTC-TG----TA-TG-T-C--A-G-ACCGA-CGTTTA--TGGA-TTCT-G-GAAATA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): TAATTTTACAGTATAACATACTGAACTTACCTGAACAATATANCCACGGGATCTTTACTCGGGACCTTTTAGTTTTAAAACACCACAAC
Unaligned ( gi|18 ): TGCATAAGTCTAATTCAGACAGCTGATTAATATCTAGGAAAGTTCTGATCCCAACGAATAACTTCATCTCTGTATAAA
Alignments
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consensus : CCTTTCC-GAAAACG---TGAG--TT--A-T----CTTTCCTT--G--ATCCG-G-AA-C-G-----T-AGT-----GCG--C-TTG---C---GTA-A-TTTAATTT-ATTTTAGA-CTTC----CG-------------GGT-ATT-ATATT-C-AAGA-AGC----G---T-C--ATTAAC--A-AC-A-GT--G--CAGAAA-G-CCGCAGAG-ATAT-TGCCG--TA-TG--TA-CGG-CA-A-TCG-C-GCTT-A-C---AAA--TA----T-GGAA--A-ATAA-ATG-T-TA--TCAAAAG--AAG-AC-GA--C---TCCCCTT-CCC-A-T---CTT-G-ATTT-T--ACG---TG--TTTTGT-AAC-----C-AA-------------AATT-----AA-----T-C-T--AC------ATA--ATA-T-AG--ATC-AG--C---A--T--C-T---A--TTG-CA-T-------A-AG-----TT--T--------C-------CA-CG----G--GACCTTNT-A--------AA------------------------A--TGTT-G------C-T-TG-AT--C--AA-TA-TC-AG------T-GTA-G--TA-A-G-CA-AGTTCTG-ACACA------AT------G------------T-AC-------G-T-T-TAATTC-TG----TA-TG-T-C--A-G-ACCGA-CGTTTA--TGGA-TTCT-G-GAAATA
Reference ( family-6368 ) : CCTTTCC-GAAAACG---TGAG--TT--A-T----CTTTCCTT--G--ATCCG-G-AA-C-G-----T-AGT-----GCG--C-TTG---C---GTA-A-TTTAATTT-ATTTTAGA-CTTC----CG-------------GGT-ATT-ATATT-C-AAGA-AGC----G---T-C--ATTAAC--A-AC-A-GT--G--CAGAAA-G-CCGCAGAG-ATAT-TGCCG--TA-TG--TA-CGG-CA-A-TCG-C-GCTT-A-C---AAA--TA----T-GGAA--A-ATAA-ATG-T-TA--TCAAAAG--AAG-AC-GA--C---TCCCCTT-CCC-A-T---CTT-G-ATTT-T--ACG---TG--TTTTGT-AAC-----C-AA-------------AATT-----AA-----T-C-T--AC------ATA--ATA-T-AG--ATC-AG--C---A--T--C-T---A--TTG-CA-T-------A-AG-----TT--T--------C-------CA-CG----G--GACCTTNT-A--------AA------------------------A--TGTT-G------C-T-TG-AT--C--AA-TA-TC-AG------T-GTA-G--TA-A-G-CA-AGTTCTG-ACACA------AT------G------------T-AC-------G-T-T-TAATTC-TG----TA-TG-T-C--A-G-ACCGA-CGTTTA--TGGA-TTCT-G-GAAATA
gi|1 : TCC-GAAAACGGTCCGAG--TTGTA-T----CTTTCCTTTGG--ATCCTTG-AA-C-G-----T-AGTCTGCGGCGGGT-TTG---C---GTA-A-TTTAATTT-----TAGAACTTCA---CGCTTTTATTAGTTTGGTGATTCATATT-C-AAGA-ACCCCGAG---T-C--ATTAAC--AGAC-A-GT--G--CAGAA----------------T-TGCCG--TA-TA--TA-CGG-CA-AATCTTC-GCTT-A-C---AAA--TAATGTT-GTCA--A-ATAGTATG-C-TA--TCAAAAAGAAAG-ACCGA--CACCTCCCGTT-CCC-A-T---CTT-G-ATTT-T--ACG---TAGATTTTA--AAC-----C-AA-------------AATTTACATAA-------C-T--ACCCATTAATA--A-A-T-AATTATCTAG--C---A--T--C-TATGA--TTG-CATT-------A-AG-----TTCAT--------C-------CA-GG----A--GATC
gi|1 : cttta--C--AA-TA-TGGAG------T-G-A-G--TACA-G-CATAGTTCTG-ACAC-------AT------T------------T-ACTCTCAAAA-TGT-TAATTC-TGAGGATATTGTT-C--AGG-ACCGAGCG-TAA--T--A-TTCT-G-AAAAattaatactctaggaactttttaataccaccaataactctctctctgtataaaaaatagattgcattgagtctaattatcaagatatacaatatggagtgagtacagcatagttctgacacatttactctcaaaatgttaattctgaggatattgttcaggaccgagcgtaatattctgaaaaacttt
gi|10 : ctttatccgaaaacggtccgagttgtatctttcctttggatccttgaacgtagtctgcggcgggtttgcgtaatttaattttagaacttcacgcttttattagtttggtgattcatattcaagaaccccgagtcattaacagacagtgcagaattgccgtatatacggcaaatcttcgcttacaaataatgttgtcaaatagtatgctatcaaaaagaaagaccgacacctcccgttcccatcttgattttacgtagattttaaaccaaaatttacataactacccattaataaataattatctagcatctatgattgcattaagttcatccaggagatcattaatactctaggaactttttaataccaccaataactctctctctgtataaaaaatagattgcattgagtctaattatcaagatataT-ATATT-C-ATAA-AGC----G---T-C--ATTAAC--A-AC-A-GT--G--CAGAAA-A-CCGCGAAG-ATAT-TGCTT--TA-TG--TA-CAG-CA-A-TCG-C-GCTT-A-C---AAA--TA----T-GGAA--A-ATCA-ATG-T-TA--TCAAAAG--AAG-AT-GA--C---TCCCCTT-CCC-A-T---CTT-G-ATTT-T--ACG---TG--C-----------------A-------------AGCT-----AA-----T-C-T--ATA-----ATATTATA-T-TG--CTT-GGGTT---A--T--T-T---ACTTTG-GA-CCCTTCCGA-TG-----TT--CTA------C-------CA-CA----GTCAGTCTTAT-A--------AA------------------------A--TGTA-C------C-T-TG-AT--C--AA-AA-TC-AG------T-GTA-G--TA-A-G-CA-AGTTCTG-ACACAATATACAT------G------------C-AC-------G-T-C-TAAATA-TG----CA-TG-T-C--A-T-ACCGA-CGCTTA--TG----TCT-G-GAAATAacttt
gi|11 : gCCCATT-TCC-A-T---CTC-A-ATCA-T--ACG---TG--TTTTGG-AAC-----T-AA-------------AATT-----AC-----A-C-T--AT------AT----TA-T-A-----------------------C---A--TTG-GA-C-------A-AG-----TT--T--------C-------C--TT----G--GACTCTTT-A--------c
gi|11 : TTAT-A--------AA------------------------A--TGTC-GGGGTCGC-T-TG-TT--T--AA-TA-TC-AA------T-GTA-G--TA-A-A-CC-AGTTCTG-ACACA------AT------ATATATGTACTGCT-AC-------G-T-C-TAATTC-TG----TA-TG-C-G--A-G-ACAG-------A--TGGT-TTCT-G-GAAATActctggaccttttgatagccctgtgttctatcacaaacagcattataaaatgtcggggtcgcttgtttaatatcaatgtagtaaaccagttctgacacaatatatatgtactgctacgtctaattctgtatgcgagacagatggtttctggaaatat
gi|12 : cccatttccatctcaatcatacgtgttttggaactaaaattacactatattatacattggacaagtttccttggactctttactctggaccttttgatagccctgtgttctatcacaaacagcaATT-----AA-----T-C-T--AC------ATG---TA-T-A----TT-A---T---A--T--A-T---A--TTG-CA-T-------A-AA-----TT--T--------C-------CT-CG----G--GATCTTTT-A--------AA------------------------A--t
gi|12 : CCTTAT-A--------AA------------------------A--TGTT-G------C-T-TG-AT--C--AA-TA-TC-------------------------CA--GTTCTG-ACACA------ATATACATG------------T-AC-------G-T-C-AAATTC-TG----TT-TG-T-C--A-G-ACAGA-CGCTTA--TGAA-TTCT-G-GAAATAcccctgtgttctaccacaatcagccttataaaatgttgcttgatcaatatccagttctgacacaatatacatgtacgtcaaattctgtttgtcagacagacgcttatgaattctggaaatacc
gi|13 : attaatctacatgtatattatatatattgcataaatttcctcgggatcttttaaaacccctgtgttctaccacaatcagC-GAAAATA---AAAG--TA--A-C----ATTTCCTT--G--ATCTG-C-AA-T-A-----T-AGT-----GCG--C-TTG---T---GTA-----TA-TTA-ATTTTAGA-CTTC----CG-------------GGT-AGT-ATATT-C-AGGA-AGC----G---T-C--GTTATC--A-CC-A-GT--G--TAGAGA-G-CCTCAAAG-ATAT-TGGTG--TA-GG--TA-CAG-CA-A-TCG-T-GCTA-A-C---AAA--Tcc
gi|14 : TTTCT-GACAATG---TGAG--TT--A-T----CTTCCCTT--C--ACTCG-G-AA-C-G-----T-AGT-----GCG--C-TTG---C---ATACA-TT--AT----TTTTAGA-CTTTTAGACA-------------GGC-AAT-GCATT-CAAAGA-AGC----G---T-C--GTGGTC--A-GA-A-GT--G--CAGAAA-G-
gi|15 : CCTTAT-A--------AA------------------------AA-TGTT-G------C-TATG-AT--C--AA-GA-TA-TG------T-GGATG--TA-A-C-CA-
gi|17 : cttttttactcactctgggccttttaaaacaccaacaaccagCTTTCC-GAATACG---CGAG--TT--A-T----ATTTCCTT--G--ATCCG-G-AA-T-A-----T-AGT-----GCG--C-TTG---C---GTA------AATTA-AGTTTGGA-CTTC----AG-------------GGT-AAT-ACATgtgttgtcaaggtttg
gi|19 : -AA-C-G-----T-AGT-----ACG--C-TTG---C---GTA-A-TTTAATTT-----TAGA-CTTT----TG-------------GGT-AGT-ATATT-C-AAGA-AGC----G---T-A--ATTAAC--
gi|2 : CCTTTCC-GAAAACG---TGAAGTTT--A-T----CTTTCCTT--GCAATCCG-GCAA-C-G-----T-AGT-----GCG--CTTTGTGCC---GTACA-TTTAATAT-AATTTAAA-CTTCG---CG-------------GGT-ATT-ATATT-C--AGA-AGC----G---TCC--ATTAACTAA-AC-ACGTTGG--CAGAAA-GTCCGCAAAGAATATCTGCCGGTTAGTGGTTAGCGGCCA-A-TTG-TGGCTT-ACC---AAA--TA----T-GGAA--A-ATCA-ATG-TCTAATTTGAAAG--AAG-AC-GATGC---CCTCCTT-CCC-A-TTCGCTTGG-ATTTATTAACG---TG---GTTGT--ACTAAGGC-AA-------------AATT-----AA-----T-C-TTAAC------ATG--ATA-T-AG--ATT-CA--C---A--TGGC-T---A--TTG-CA-T-------AGAC-----TT--T--------A-------CT-CT----G--GACCTTTT-A--------AAACACTCCACAACCAACCTTATAAAA--TGTT-G------C-T-TG-ATGCC--AACTA-TC-AG------TGGTA-G--TA-A-GTCA-AGTTCTG--CACAC-----AT------G------------TGAC-------G-C-T-TAATTC-TG----TA-T--T-CAAA-A-ACCGA-CGTTTA--TGGACTTCTCG-GAAAT
gi|20 : TC-TG----TA-TG-T-C--A-G-ACCGA-CGTTAA--TGGA-TTCT-G-GAAATAca
gi|3 : C-GAAAACAGT-TGAG--TT--AAT----CTTTCCTT--G--ATCCG-GTAA-TTG-----TTAGT-----GCG--C-TTG---C---TTA-A-TT--ATCA-ATTATAAA-CTTC----CGCG-----------GGT-ATT-ATATT-C-AAGACAGC----G---T-C--ATTAAC--A-ACCA-GT--G--CAGAAA-G-CCGCAGAG-ATAT-TGCCG--TA-TGA-TA-CGG-CA-A-TCT-C-GCAT-A-C----AA--TA----T-GGAAATA-AAAA-ATG----A--TC-AAAG--AAG-AC-GA--C---T-CCCTT-CCC-A-T---ATT-G-ATTT-T--ACG---TG--TTTT-T-AAC-----CAAA-------------AATT-----AA-----TAC-T--AC------ATA--ATACT-GA--ATC-AG--C---A--T--CAT---A--TTG-CA-TA------A-AG-----TT--T--------C-------CATCG----G--GATCTTcct
gi|3 : CCTTAT-A--------AA------------------------A--TATT-G------CTT-TGCAT--CA-AA-TA-TC-AGTTGTGTT-GTT-G--TA-ATG-CA-GGGTTTG-ACACA------AT-------------------T-AT-------A-T-T-TAA-TC-TGT---TA-TG-T-C--AGG-ACCGA-C--TTACTTGGATTTCT-G-GAAATAtactcttggaatcattctataaaacacccaaccagccttataaaatattgctttgcatcaaatatcagttgtgttgttgtaatgcagggtttgacacaattatatttaatctgttatgtcaggaccgacttacttggatttctggaaatac
gi|4 : cgaaaacagttgagttaatctttccttgatccggtaattgttagtgcgcttgcttaattatcaattataaacttccgcgggtattatattcaagacagcgtcattaacaaccagtgcagaaagccgcagagatattgccgtatgatacggcaatctcgcatacaatatggaaataaaaaatgatcaaagaagacgactcccttcccatattgattttacgtgtttttaaccaaaaattaatactacataatactgaatcagcatcatattgcataaagtttccatcgggatctttactcttggaatcattctataaaacacccaaccagCCTTTCCCGAAAACG---TGAG--TT--AAT----CTTTCCTT--G--ATCCG-G-GA-A-G-----T-AGT-----GCG--C-TTGA--C---GTA-A-TT--A----ATTTTAAA-CTTC----CG-------------GGT-ATT-ATATTTC-AAGA-AGC----G---T-C--ATTAAC--A------GT--G--CAGA---------------T-T-TGCCG--AA-TG--TA-CGG-CA-A-TCCTC-GCTT-A-C---AAAGTTA----T-GGAA--A-ATAA-ATG-T-TA--TCAAAAG--AAGAACGGA--C---TCCCCTTACCC-A-T---CTT-G-ATTT-T--ACG---TG--TTTTTTAAAC-----C-AA-------------AATT-----AA-----T-CTT--AC------ATA--ATA-T-A---ATC-AG--C---AATT--C-T---A--TTGCCA-T-------A-AG-----TT--T--------C-------CA-CG----G--GATCTTc
gi|4 : --GGCCTTAT-A--------AA------------------------AAATGTT-G------C-T-TG-AT--C--AA-TA-TC-AG------T--TA-G--TA-A-G-CA-AGTTCTG-ACACA------AT------G------------T-AT-------G---T-TAATTC-TG----TA-TG-TCC--A-G-ACCGA-CGTTTA--TGGA-TTCT-G-GAAATAtactctgggaccttttaaaacaccacaaccccgccacaaccaggccttataaaaaatgttgcttgatcaatatcagttagtaagcaagttctgacacaatgtatgttaattctgtatgtccagaccgacgtttatggattctggaaatact
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