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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): TAGCTGCTACTTTTTTTTGCTAGTCGTCTGTTGATCGTGTATGCCTTGTGTATGATTAAACTGAAGAGAATTATATGTCAAATGTGAA






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Reference ( family-622 )      :                                                                                                                                                                                                      TTGT-TGG-T--AAA--ATG-GG-TA-------GTAA--A--CC------------G--CCGGGCCGGGTCACCTTCGNAAC-CCGA-ATTTTTGA---G---TTTTC-TTCNTT---AAT-AT--ACC-ATT------G---CTTGTT-T-TGA-----A-ACT-T----GCA--GAA-TATATTC--C--CAG--TG-AT-ACACTTAG-T-CTTCGA-T--GCAAAA--TTC-AGC-A-------CA-TAATATTA---C--CG-TAGAT--AA-AGA--AAT-CAATG---ATCGC---A-----TTCGAAT--------CTG-G--TGGGTAAA--AT-G---GGT----A--GCGAGA---CCAAAAT--T---CANA--CTATCGC---GTATTTTTC-GTGAACTAT-----------G-CACTTGT----TGCT-GAAAACCT-TGC-ATTTT-----TTCAATTCAAAGGAA-GTTGAATT-TN-ATAC-TCAG-G-GCATTTTCTATG-ATTTAAATGTCTTCTATTTCATTT-ACTG-GCGATTTTTGCGACTGCCGGGCCAGAAGGGAACC-GATGC--GATTGA-CCCGGGC--CGG-CGTT----ATTTATTCCG
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Reference ( family-622 )      :                                                                                                                                                                                                      TTGT-TGG-T--AAA--ATG-GG-TA-------GTAA--A--CC------------G--CCGGGCCGGGTCACCTTCGNAAC-CCGA-ATTTTTGA---G---TTTTC-TTCCTT---AAT-AT--ACC-ATT------G---CTTGTT-T-TGA-----A-ACT-T----GCA--GAA-TATATTC--C--CAG--TG-AT-ACACTTAG-T-CTTCGA-T--GCAAAA--TTC-AGC-A-------CA-TAATATTA---C--CG-TAGAT--AA-AGA--AAT-CAATG---ATCGC---A-----TTCGAAT--------CTG-G--TGGGTAAA--AT-G---GGT----A--GCGAGA---CC--AAAATT---CANA--CTATCGC---ATATTTTTC-GTGAACTAT-----------G-CACTTGT----TGCT-GAAAACCT-TGC-ATTTT-----TTCAATCCAAAGGAA-GTTGAATT-TN-ATAC-TCAG-G-GCATTTTTTATG-ATTTAAATGTCTTCTATTTCACTT-ACTG-GCGATTTTTGCAANTGCCGGGCCAGAAGGGAACCGGATGC--GATTGA-CCCGGGC--CGG-CGTT----ATTTATTCCG
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Reference ( family-622 )      :                                                                                                                                                                                                      TTGT-TGG-T--AAA--ATG-GG-TA-------GTAA--A--CC------------G--CCGGGCCGGGTCACCTTCGNAAC-CCGA-ATTTTTGA---G---TTTTC-TTCCTT---AAT-AT--ACC-ATT------G---CTTGTT-T-TGA-----A-ACT-T----GCA--GAA-TATATTC--C--CAG--TG-AT-ACACTTAG-T-CTTCGA-T--GCAAAA--TTC-AGC-A-------CA-TAATATTA---C--CG-TAGAT--AA-AGA--AAT-CAATG---ATCGC---A-----TTCGAAT--------CTG-G--TGGGTAAA--AT-G---GGT----A--GCGAGA---CC--AAAATT---CANA--CTATCGC---ATATTTTTC-GTGAACTAT-----------G-CACTTGT----TGCT-GAAAACCT-TGC-ATTTT-----TTCAATCCAAAGGAA-GTTGAATT-TN-ATAC-TCAG-G-GCATTTTTTATG-ATTTAAATGTCTTCTATTTCACTT-ACTG-GCGATTTTTGCAANTGCCGGGCCAGAAGGGAACCGGATGC--GATTGA-CCCGGGC--CGG-CGTT----ATTTATTCCG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               CTTCGAAAC-CCGA-ATTTTTTA---A---TTTTC-TTCCTT---AAT-AT--ACC-ATTAATTTTG---CTTGTT-T-TGA-----A-ACT-T----GCA--GAA-TATATTC--T--CAG--TG-AT-ACACTTAG-T-CTTCGA-T--GCAAAA--TTC-AGC-A-------CA-TAACAGTA---C--
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                      TTGT-GGG-T--AAA--ATG-GG-TA-------GTAA--AAGCC------------GGACCGTGCCGGCTCACCTTCGTAAC-CCGA--TTTTTAAAAAG---CTTTC-TTCGTT---AAT-GT--ACC-ATT------G---CTTGTT-T-T
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                          -TGG-T--ATA--ATG-GG-TA-------GCCAGGA--CC------------GGACCAGGCCGGGTCACCTTCGTAACTTCGA-CGTTTT-A---GTTTTTTTC-TTCCTT---AAT-AT--ATT-GTT------T---CTT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aTAT-----------G-CACTTCT----TGCT-GAAAGCCT-TGC-TTTTT-----TTCACTTCTA--GAATGTTGAATT-TG-ATAT-TCAG-T-GCATC--------ATTT-AATGTCTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                      TTGT-TGG-T--AAA--ATG-GG-TA-------GTAA--A--CT------------G--CCGGGCCGGGTCACCTTCGAAAC-CCGA-ATTTTTGA---G---TTTTC-TTCCTT---AAT-AT--ACC-ATT------G---TTTGTT-T-TGA-----A-ATT-T----GTA--GAA-TATATTC--C--CAG--TG-AT-ACACTTAG-T-CTTCGC-T--GCAAAA--TTC-AGC-A-------CA-TAATATTA---C--CGATAGAT--AA-AGA--AAT-CAATG---ATTGC---A-----TTCG-AT--------CTG-G--TGGGTAAA--AT-G---GGT----A--GCGAGA---TC--AAAACT---CAAA--CTATCGC---ATGTTTTTC-ATGATCTGT-----------G-CATTTGT----TGCT-GAAAACTT-TGC-ATTTT-----TTCAATCCAAAGGAA-GTTGAATT-TC-ATAC-TCAA-G-ACATTTTTTATG-ATTTAAATGTCTTTTATTTCACTT-ACTG-GTGATTTTTGCAAATGCCGGGCCAGAAGGAAACCGGATGC--GATTGA-CCCGGGC--CGG-CATT----ATTTATTCCG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                      TTGT-TGGGT--AAAGAATGCGG-TA-------G-AA--A--CCATGCGCCAACCTG--CCGGGCCGGGTCACCTGCCAAAT-CCGA-ATTTTTGA---G----TTTC-TTCATT---AA--ATCAACCAATT------G---CTTGCT-TGTGA-----ACACC-TAATGGCATCGAA-TATCATC--C--CAGCCTG-AGAACACTTAGATACCTCGA-TAGGCAAAACTTTC-CAC-AAACTATCCA-CAATATCA---C-----TAGAT--AACAGAACAATACAATGACAATTGC---A-----TTCGAATGCTTTCGACTG-GTATAGGTAAAACAT-GGCTGGT----C--GCGAGATCCCC--AAAACT---AACA--CCA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gacT-----------G-CACTTGTATGTTGCT-GAAAACTTGTGCCATTTT-----TTCAATCCAA-GGAA-GTTGAATT-TTCATACCTCAA-GCGCATTTCT-ATGCATTTAAATGTCT-CTATTTCATTTTACTGCGCGATTTTTGCAACTGCC-GGCCAGAAAGGAACC-GATGCCGGA-TGA-CACGGGCATCGGCCGTTTATAATTT-TTCCGattacgcgca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                           gGG-T--AAA--ATC-GG-TA-------GTAA--A--A-------------A--CCGGGACAGGGCACCTTCGTAAC-CCGAGATGTTT-A---G---TTTTC-TTAGTT---AAT-AT--ATA-CTT------T---CATATCAA-TGATGCATA-ACTCT----GTA-------ATGCCCCAC--CAGA-TG-AT-ACAGTGCA-T-ATTCAC-T--ACAAAA--TTC-AAG-G-------CA-TAATTTTA---CTTCG-T---T--AT-GGA--AAT-----------------A-----TT----T--------CAG-G--GGGGTAAA--AT-G---GGT----A--GCGAG--------AAAAT-------A--TTA-------ATATTTTTCTGTG-ACTAT-----------G-atttaatttgctcacttatatttccgcgtagtcgctacacgttaaaataaaaattgtgcatgttctaataaaaactcgaagaggattatatcatccaaacgctgtga
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgAAA--AT-G---GGT----A--TCGAGA---CCTGTGTGTT---TACA--C-ATTGCTGAATATTTTTC-GTAAACTATATCGAACTATAA-CACATGT----TGCT-GGAAAACT-TGC-ATTTT-----TT-AATTCATAG--A-ATTCATTT-TG-AAAC-CCAGCG-ACA----------AATTAAATGCCTTTTACTGTACTT-CTTG-GTGATCTCTCCGAGT-TCTGGCCAAAAGGAAACCTGATGC--CATTGA-TCAAGGC--TGG-CATT----ATTTACTCC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                       TGT-TGG-T--AAA--ATG-GG-TA-------GTAA--A--CT------------G--CCGGGCCGGGTCACCTGCGAAAT-CCGA-ATTTTTGA---G---TTTTC-TTCCTT---AAT-AT--TCC-ATT------G---CTTGTT-T-TGA-----A-ACT-T----GCA--GAA-TATATTC--C--CAG--TG-AT-ACACTTAG-T-CTTCGA-T--GCAAAA--TTC-AGC-A-------CA-TAATATTA---C--CGTTAAAT--AA-AGA--AAT-CAATG---A--GC---A-----Tcgat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TAATATTA---C--CGATAGAT--AA-AGA--AAT-CAggaaaccatantaatattaccgatagataaagaaatca
gi|8                          : tgttggtaaaatgggtagtaaactgccgggccgggtcacctgcgaaatccgaatttttgagttttcttccttaatattccattgcttgttttgaaacttgcagaatatattcccagtgatacacttagtcttcgatgcaaaattcagcacataatattaccgttaaataaagaaatcaatgagcatggaaaccatanTTGTGTGG-TGGAAA--A-G-GG-TACATACTAGTAA--A--CTCCG---------G--CCGGGCCG--TCACCTTCAAAACTCCGA-AGTTTTTA---G---TTTTC-TTCCTT---AATTAT--ACC-ATTCATTTTG---CT-GTT-T-TGA-----A-ACT------GCA--GAAATATATTT--CTCCAG--TTTAT-ACACTTAG-T-CTTCGA-T--GCAAAA---TC-AGC-A-------CATTAACATTA---
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aG-T-CTTTGG-T--GTAAAA--TTC-AGC------------TAATA---------------AT--A---GA--AGC-AAAGG---ATCGA---A-----TAC-AAC--------ATGCG--TGA-TAAA--AT-G---GGTTACCATTGCTAAC---CC--AAA--T---CAGATACTGTTGT---GTATTTTCC-ATGAACTAT-----------A-CGTCTAT----CGCT-GGAAACCT-TGC-ATTTTTTTCATTCAACTCAAAGAGA-GTTGA


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .   . .    .    .  .  .          .  AATAGGG                               T   T    .      AGTTTT        .      .     .  .    .   CATTTTG         . .   AC        CT       GAAA      T  CTC     TGC    .        . .      . .       .    .  CA          .        .   CGTTAA    AAC     .    .     .   TT  ATTCGAT                    . .         .   . .     A           ACCTG      ACTA    C .  C TT  .           .   A     G                   .       .        .   .     .            A A G  .        . G     .   GCG      TCTATGC                     A   .   G              C GC T        A      T     .   T   .       .    C    .       A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .   . .    .    .  .  .          .  AGCCGGA                               A   .    .      GGGG          .      .     .  .    .   AATT            . .   A         T        GAA       A  A       ATG    .        . .      . .       .    .  CA          .        .   CGATAG    GG      .    .     .   TT  ATACAAC                    . .         .   . .     C           ATC        GTTT    C .  T TT  .           .   A     G                   .       .        .   .     .            A A G  .        . C     .   GT       .                           A   .   G              G T  .        G      .     .   .   .       .    C    .       .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .   . .    .    .  .  .          .  CTCCGG                                T   .    .      TAAT          .      .     .  .    .   G               . .   A         G        GAA       C  T       TTT    .        . .      . .       .    .  GG          .        .   TGTAA     AA      .    .     .   TC  ATTT                       . .         .   . .     A           CCC        AT      G .  T .   .           .   .     G                   .       .        .   .     .            A . A  .        . G     .   AG       .                                                                                                                
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Reference ( family-622 )      :                                                                                                                                                                                                      TTGT-TGG-T--AAA--ATG-GG-TA-------GTAA--A--CC------------G--CCGGGCCGGGTCACCTTCGNAAC-CCGA-ATTTTTGA---G---TTTTC-TTCCTT---AAT-AT--ACC-ATT------G---CTTGTT-T-TGA-----A-ACT-T----GCA--GAA-TATATTC--C--CAG--TG-AT-ACACTTAG-T-CTTCGA-T--GCAAAA--TTC-AGC-A-------CA-TAATATTA---C--CG-TAGAT--AA-AGA--AAT-CAATG---ATCGC---A-----TTCG-AT--------CTG-G--TGGGTAAA--AT-G---GGT----A--GCGAGA---CCAAAAC--T---NANACTATCGC---ATATTTTTC-GTGAACTATG-----------CACTTGT----TGCT-GAAAACCT-TGC-ATTTT-----TTCAATCCAAAGGAA-GTTGAATT-TN-ATAC-TCAG-G-GCATTTCT-----AT----TTAAATGTCTTCTATTTCACTT-ACTG-GCGATTTTTGCAANTGCCGGGCCAGAAGGGAACCGGATGC--GATTGA-CCCGGGC--CGG-CGTT----ATTTATTCCG
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TAATATTA---C--CGATAGAT--AA-AGA--AAT-CAggaaaccatantaatattaccgatagataaagaaatca
gi|8                          : tgttggtaaaatgggtagtaaactgccgggccgggtcacctgcgaaatccgaatttttgagttttcttccttaatattccattgcttgttttgaaacttgcagaatatattcccagtgatacacttagtcttcgatgcaaaattcagcacataatattaccgttaaataaagaaatcaatgagcatggaaaccatanTTGTGTGG-TGGAAA--A-G-GG-TACATACTAGTAA--A--CTCCG---------G--CCGGGCCG--TCACCTTCAAAACTCCGA-AGTTTTTA---G---TTTTC-TTCCTT---AATTAT--ACC-ATTCATTTTG---CT-GTT-T-TGA-----A-ACT------GCA--GAAATATATTT--CTCCAG--TTTAT-ACACTTAG-T-CTTCGA-T--GCAAAA---TC-AGC-A-------CATTAACATTA---
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aG-T-CTTTGG-T--GTAAAA--TTC-AGC------------TAATA---------------AT--A---GA--AGC-AAAGG---ATCGA---A-----TACA-AC--------ATGCG--TGA-TAAA--AT-G---GGTTACCATTGCTAAC---CCAAATC--A---GATACTGTTGT---GTATTTTCC-ATGAACTATA-----------CGTCTAT----CGCT-GGAAACCT-TGC-ATTTTTTTCATTCAACTCAAAGAGA-GTTGA
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Unaligned ( gi|15 ): TAGCTGCTACTTTTTTTTGCTAGTCGTCTGTTGATCGTGTATGCCTTGTGTATGATTAAACTGAAGAGAATTATATGTCAAATGTGAA