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gi|13 : gatattgagtttg-A---AAATTCTTC----TTTCTC-CTAGT--AAT-TGATC-AGCA-TC-ATA-T--CGGATT-CGGAGCGCTCGC---G-ATTTTCTAA-CAGTTCGATTCCgtcgtatatgagtttttctgattctcttgacttctataagtgcgcgatcgtttctgtaaggttttctgtgtgaatctcttcttctatccccgtgagaattaatcttgggttattttcggtagttaggttaaagtctgttgtgttgcaggaagggttcggatgcgctacatgttggtccgaatggtaaagagttctgggcggatcgggtttctgtcgcggagcgggggcattttggtttgcttggatgtccggcggggtctatgggggtcaggagtctgccttctgggcgtgtggctgaatttcttcagtgtaagggtgtgatctatgactgtcggatcttctcggataggttactggtgtttgaggaggctcatcttggggaatcctgaagtttcttgcttttttagtcgtacaggaaggtatttgattcgtagtcgttaatcaatcagttggctcttactggtttcttcttcagaagagtgccagaaccttgcgtaaatgtgtgtctgagatgggaggggagccctagcagggttcttaaagtcttttgacgagttcggtggctacactttcagttccagtaagactggcgttcagtaggaggtcggtgttcgctggcgctttggtcatggctggtcgggattcctttaggagttgccgctggtcttgtttggtggcttgcactaggtggggcatgaagggaattttaggcacgagtattggtgtccttccttgcagtctgtggtaaggtagctccaacgggcatcatacagtcctctcggggacggttaagaaccgagatccacgcccttttgcggatatgaactgcatggctcgtgaataagtcttctgcaccttttctattcgcttagaattggctggtgatggacttgttgggatgttgaaagttctggtcgatatgtgtgttctgtatttccaacagctgtaaggggtacgagggagcaacaatccgacgtatcgacatatccctcgcggcaatacggcggggtaagcatgagtgtacgggccatttccgtattaggggcacaaggcggtccggaggtccaaagggactacttttgaatatcgacgacagggcggtggggtgaggaaaattcctgtaggagtgtcgacattggtctgggcttcgttctgaatcataatcgtgttccatgatgctcacggggggactgaatacaggggagcgcctggacttgagacagcgctggcctcgtctttatacaaggtggtcgccagcattcgaaggtgcttgataggttcatcgccctgtatcaccgattgataggtactgcctatgtcggttgtaacagattacagccggcgtaaaaggcggccagcctgatggcagtaacagcctcaatccagaattactcgtcacacgataaagggattcccctatcaattactcgtacactgtcaaaatatgggtcctaggccgggggtgggagttaggccggtcgtcccatttcctcgaagcatgtcgtatgcagtgatgttgatgttctataaccacgcgaagccatcgacaggctttggctgaatacgtcgtgctggccggtatcacatgataggaatggagttggacaatggtaaatttttctgccataagtcgctcggggcgggaggcggggctaaatttagccgtgctgggcacacgcgatgggggatggagttttgacaaggggtctactccccagagtcagtcgcaaacaaggtgcggagcgttacaatcgcgcactagcgtttctgttgcgtccataaggatattgcgcacggagggtccgaagatttgcagtaagtcttcatgagacaagtacgcctccttctgcgaaactcaaacgaccaccgttgctctctctttgttgatggtctacctccagctgtatattgaaggggcgtgtcacgttggctgtgcagacatatcgtccaggtaattgtagaaaggagcgggggggtaaagggaacccacctattgtgg
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gi|10 : T-GGC-AAACG-TGAT---A-GAT----TCTTG-A-AAGGGGTGTA-CTT-GT--ATCAGA-TC-AAACAG-GGTCGACTT-GAAATGGGCACAACAGCGG---CGTAA---AATATCC-ACG---TCCG-AGATGC-----AGTAA-GCTA---ATAAT-TCTTTC-T-----------------GGGCT-TTGCCC--TCTTGTTGATGG-T-ACCAAgtataaacggcttcacgatttggcggttgacaacaatctccaggattgttgaaaatgcggcccaggaggaaggcacccacatactgctggctacctcttcgtcgtttgcaaaagtggggaacaatatccttttttcagactcggctaatcgaatagcgaggcatctggcgagggcaaagccagaaattgcttaagaatcggatgaatctccaaaaacccaagacttgcaggataagattttactcctcgttgagctgataaacgggtgggttatgataccaagccgtaatgaaccaggtaattcaaaataaaacctgcccatccttatcctttgaaaatatgattcaatgatggctgcctcatcgtgtttgagttctacatagccttgctcgtcagatatcgactgtaagagccattccaaaactgtttaacgtcttgtcgcggtccttgaaaatgaagcgccgttgagatccaaatcctatacaatatgaggaccagggcttgtcgatatcaaactgtcgcaaatgtacacacacgcatcgccaccgcataaattggagtgaattccgtttcctctgactgcattcaaacatcgataataaatgatacattttcaagtccttttctttccttagttatgggtttcgtactgttacaaaagcagtaaatgagaggctcggtgacgaactttctctgacaactgcggcatgtgttgacctccacaaagcgtggccttttaataatttctggtcaatccattttttaccactggtcacagtccccgattaaactgcagaccgtggtcggtcgtgttgcttgctgcctagggtttataaatgtctctgtagcaagttgcatttctgaaaaatcccttacaatgagcgcaattcctctgttagtcccgtccgacgggtgacatgggggttcggctaaacaaaacgattcatcgaatgaggacacacagttccggtgatcttcaatgtgactgtagccaacatcgcaattaatcgcccacaatagtatgatttccatcgctccgggcatagagacaaatagcatactgtaatgccgcgttaccagcaggaatgttaagcaatcccgttcccctgtcaaaggtaaataaacggtcccagtcgccaaacggtagcgctattcagttttgaaaactgaaataattttcaactcgatactggcggggcgagcgcactttgtaattctcccattcactaaggctccaacacgttgattaacaggacacccagctgtatccatcaagctagcgcttgttgtttgctcgtcaacactcc
gi|3 : TATCCAGCT---TCTG-CAATGCG--CAGGTAATAGCTTCTGCAA----GTTT-TCGAAGCATTTTTAAACGAGGCT-gtatagaaggcttcacgattggcagtggacatatcatcaggattgtagaaatgagcggcggggtaaggacccacgtactgttggttctttgtcgtgttgaaaaagtgagggaaatagcctttttcagctctgttaatccgaaagcagggggcatcttagcgagggcaaaggttaaaaaattgtacgaatcgatga
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ACTGTTTTAACGTGTCGGGTCCTTGACATACAAAGCGCCGTTGC
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gi|6 : TCTTTAATAACTCCGATAATCAGGCAGCG-TGTCGTATTACTCAACT--GAACTCGTTGACG-TTTGCTCGTACACCATG-AGTATTTCTTCACCAGG---ATG-TTC-CACATCACGATTGACCGGTTCTTCTGAATTAAAGTGAGAGAT-AGCAGACAT-GGAC-TTCTTCT------C-CTTTTAACA---TTTTTTCCAA--AATAT-CCAGAG-CA-GCACTTTAGACCGG--CACAGATAATTTAAAGC-----AGTC-AACCCTTATG--AAC-TTTGCAGA--C-GGATTT-C-CACTCTGAGGTC--T--CTGAAGAATAA---TTTTTGGGCCCCCG-CCCAGAC-----------AAGTATT---GATGA-ACGATCT--CC--ACCCAA--TTTC-A-T-C--TC-CAGCC--GCCTTA-AACTG-TT-GAATACAT-G-GTCGTGT-GA-----ATGGATC-TCA---TCG--TG--TTGATA-GATTAATACT------ATCGG--TATTATGT----CAAAGAGA-TAA-------GAC-ACCCTTCTCCCCAAAGGCCTGTAACGT-C-TCT-TCGCAAA--TTGTAAAC----GAG-CATATGAT-C-CTAGCGT-AAA----AC---AAGCCA-CATCAGCT-AC-----------TT----TCCA--AAGGGGCCA----GTC--T-CAA-A---AAATTCTTC----TTTCTC-CTGATC-AAT-TGA-TCAACAATC-ATG-T--CGGATT-CGGGGCGCTCAC---G-GTTT--TC---TAA-GAGTT----C-ATTCCTCTTGACCTTCTAgtataaacggcttcacgatttggcggttgacaacaatctccaggattgttgaaaatgcggcccaggaggaaggcacccacatactgctggctacctcttcgtcgtttgcaaaagtggggaacaatatccttttttcagactcggctaatcgaatagcgaggcatctggcgagggcaaagccagaaattgcttaagaatcggatgaatctccaaaaacccaagacttgcaggataagattttactcctcgttgagctgataaacgggtgggttatgataccaagccgtaatgaaccaggtaattcaaaataaaacctgcccatccttatcctttgaaaatatgattcaatgatggctgcctcatcgtgtttgagttctacatagccttgctcgtcagatatcgactgtaagagccattccaaaactgtttaacgtcttgtcgcggtccttgaaaatgaagcgccgttgagatccaaatcctatacaatatgaggaccagggcttgtcgatatcaaactgtcgcaaatgtacacacacgcatcgccaccgcataaattggagtgaattccgtttcctctgactgcattcaaacatcgataataaatgatacattttcaagtccttttctttccttagttatgggtttcgtactgttacaaaagcagtaaatgagaggctcggtgacgaactttctctgacaactgcggcatgtgttgacctccacaaagcgtggccttttaataatttctggtcaatccattttttaccactggtcacagtccccgattaaactgcagaccgtggtcggtcgtgttgcttgctgcctagggtttataaatgtctctgtagcaagttgcatttctgaaaaatcccttacaatgagcgcaattcctctgttagtcccgtccgacgggtgacatgggggttcggctaaacaaaacgattcatcgaatgaggacacacagttccggtgatcttcaatgtgactgtagccaacatcgcaattaatcgcccacaatagtatgatttccatcgctccgggcatagagacaaatagcatactgtaatgccgcgttaccagcaggaatgttaagcaatcccgttcccctgtcaaaggtaaataaacggtcccagtcgccaaacggtagcgctattcagttttgaaaactgaaataattttcaactcgatactggcggggcgagcgcactttgtaattctcccattcactaaggctccaacacgttgattaacaggacacccagctgtatccatcaagctagcgcttgttgtttgctcgtcaacactcc
gi|6 : CTC-A-C--GG-TTTT--C---TAAG-AGTTC-----ATTCCTCTTGACCTTCT-AAGGTA-GT-ATC--CTT-GTAA---TTT-CTGATGT-AAT-TCCTCTTCAT--TCGCGTGAGGATTA---CTGATGT--TTGCAG---TAG-TG---TAA---TCGATTG------A-GCAAA-TTTC-----C-CC-ACA-----ACC--AATTC---AACAA-GAGCTTTAG--C---A-ATT--GGTT---CTT----CGGA-CAGGCG--ATTTTT------CTTGG-ATCT-C-GGC-GGGTTCAATGA----C-AA----C-CCTTCTCGAT------CCGAA--TTC-TCT-AATGTAA---T-T------TG-ATG------CT-GTTCGG-----------GTG--TTTGG-CAA---TC-ATCC----GGGAATCCTGAAG--C--TCT-TGCTT--GTTT--TT---CAGAAA--TT-ATTCATA-------TACG--ACTG---A--AATAAGT--G-TTTCACTG--G-TCTT--CT----CAATAA---TTGCA-AA-CTT-CGATAAA--AT-TGTC-GAAG--AT--GAT---AGCCC----AG--------A--T-CT-AAAGCT--GTGAAA-GAGTTCTGTGGTCAC----CCAGATTTCCAGTTAGACT-GCGA-TTCAGAA-----TACCGGTCATGTCT---GGCCACC---------GTCAGTCCG---TCCT----AAGT---T--TGC-------GCTGGTCG------GCC--AC-A-GTCCGGCAT-A--GA----AA----------AAGTAAT--T--TCCCT-CC-----GCT--TATTACAGGTAGC----ACGGG-ATGAATACAG--CT-CTCGGCGGTA-GG-TAACGA--CGCGA--CAA---------CG-----A--A-GA-------GCC-CA-AAATAATTC-TC-T-CAC-------AT-CCGT---GACATATGGCT-GT-AT-GACTTAT-T--GCG-TGTTGGAC----CAG--GGAATG---GC--T-GTA-TTT-CAA-A--CGTAA-GACGGTCAAAC-A-GAAAC-AGACAATTC---C-ACGTTCAT-CG-CATTATCCCCTTCC-TCGC-AATTACAGTCaggtagtatccttgtaatttctgatgtaattcctcttcattcgcgtgaggattactgatgtttgcagtagtgtaatcgattgagcaaatttccccacaaccaattcaacaagagctttagcaattggttcttcggacaggcgatttttcttggatctcggcgggttcaatgacaacccttctcgatccgaattctctaatgtaatttgatgctgttcgggtgtttggcaatcatccgggaatcctgaagctcttgcttgtttttcagaaattattcatatacgactgaaataagtgtttcactggtcttctcaataattgcaaacttcgataaaattgtcgaagatgatagcccagatctaaagctgtgaaagagttctgtggtcacccagatttccagttagactgcgattcagaataccggtcatgtctggccaccgtcagtccgtcctaagtttgcgctggtcggccacagtccggcatagaaaaagtaatttccctccgcttattacaggtagcacgggatgaatacagctctcggcggtaggtaacgacgcgacaacgaagagcccaaaataattctctcacatccgtgacatatggctgtatgacttattgcgtgttggaccagggaatggctgtatttcaaacgtaagacggtcaaacagaaacagacaattccacgttcatcgcattatccccttcctcgcaattacagtc
gi|7 : tctttaataactccgataatcaggcagcgtgtcgtattactcaactgaactcgttgacgtttgctcgtacaccatgagtatttcttcaccaggatgttccacatcacgattgaccggttcttctgaattaaagtgagagatagcagacatggacttcttctccttttaacattttttccaaaatatccagagcagcactttagaccggcacagataatttaaagcagtcaacccttatgaactttgcagacggatttccactctgaggtctctgaagaataatttttgggcccccgcccagacaagtattgatgaacgatctccacccaatttcatctccagccgccttaaactgttgaatacatggtcgtgtgaatggatctcatcgtgttgatagattaatactatcggtattatgtcaaagagataagacacccttctccccaaaggcctgtaacgtctcttcgcaaattgtaaacgagcatatgatcctagcgtaaaacaagccacatcagctactttccaaaggggccagtctcaaaaaattcttctttctcctgatcaattgatcaacaatcatgtcggattcggggcgTGA-ATATC--TCGTGCG-GCCGA----CCCAT--TGGAAGT--A---TCC-CCCAAAGTGCT-A---TTTCCCGCCAT-AATC-CTC--GTCGTAG-----GGC-TA---TTA--CCTTGCT-GGC-AAACG-TGAT---G-GAT----T--TGCA-AAGCGGTCTAGCTT-CCCGA-C--AA-T------CAAAACAT---T-CG--AC-TT-GAAAT-GCGCCCA----CG--------G-C---G-----AAA--AATAATC---C-AC-----GGCCTC-CGCAAA--TGCA-TAAG-CT---------AA-G--------AA---T--TTCCTCTG-GAA-----A--TCCAAAGACTA---TTG-CC--TC---T--TCGATGT-TGACCA
gi|8 : ACAG--CC-TGCGG-GG---GG-TAA-GA--CGCGA--CAC----------G-----A--ATGA-------GAC-CG-AAAATATTC-TC-T--AC-------AT-CCGT---GA-AT-TGGCTGGTGAT-GATT--T-T--GGA-TGTTGA------CGG--GAAATG---GCT-TTGTA-TTT-CAACA--CGTAA-G--G-T---AC-AGGGAACAA-ACA--TC---C-ACGT--AT-CG-CA-TATCCCCTTCC-TCGC-AA-TACAGTCGT-GT-AGCA-TTG---GT---ACG---C----TCGT---------ACA--AAGC-GTC-ACGGGGATTCAAAGGA-----TCTTGAAT-ATC-AC-------C-CTT---GT---AAAA-ATTCCTGT-AA----GTCGACATTG-GTCTGGG------TC--GACGATCAAAC--T-GTG-T--TCCCAT-ATGCTCA-C-----GACTGTAT-------AGC-CCTGGTCTTCTAA-AGCGCTG--CTCGTTTT-----A-AG-T--TT-CCA-CAT-AG-AGGT-CTTGA-TAG-T--AT-G--CTG-AACAC-----AATGAGGA-TGC--ATGTCGGT--CAACAGA--TT--------CGGGTAACAGGTGGAACAGCC--ATGCCAGTA-ACA-CC-CA---TAGAA-T---TCGT-ACA-CGAT-ACGGGATTCCTC-ATC---TA-CCC-TCC-ACTG------TATAGGG-TCCTA--------GCGTGACTT--------CGCCC--CCATTTTT----AG-CA-TGTG-TATGCAGTGATGTTG-ATGTTC--TAACCA-GCG-AGCCATCGA-CATGCTTTGGCTGA-ATATCG-TCGTGCT-GGCGG-TATCCCATATTAGGAATG-A---TGG-C----AATGGT-A---TTTT-CGCCATGAATC-CTC--GTCGGTA-----GGC-TAAA-TTA-GCCGTGCT-GGC-AAACG-TGAT-----GAT----TCTTG-A-AAGGGGT-TA-CTT-----A--CAGA-T------CAAA-CA--GGT-CG--AC-TT-GAAAT-GGGCACA-CAGCG--------G-C---G----T-AA--AATA-TC---C-AC-----G---TC-CG-AGA--TGCAGTAAG-CT---------AA-G---------A---T--TCCTTCTG-GAA-----A--TC-AAAGACT----TTGCCC--TC---TTGTTGATGG-T-ACCAAttatagaaggcttcacattcgcgcagacatatcatcagatttgtaaaaatgagcgggggtacagacccacgacctggtttctctgccggttgaaaaaaataggaaatatcctttttccatattcctttaaattccgaaaccagaggcatcttgcaggcaaaaggcaaatagtaaaacggcttcacccatgaacttgcatgtaatattcactcccaggatcaaaagttggttaatcatcacaaccagttacactgtgaaccaggaaattcaataataaactgtccatctatcctttgacaatgctaatgaatggtgcgctttcacggtttgatccacatatagcctgtaacgtcaggttctgtctgctataagaccattccataaactgtttctaacttcggtccttgaaatatgacccttggagccttgaccacataatgacacggcttgtccatataccagacgtcgcatattgttgacacacacgttcgcccacgatcacatggatgtgattccgtttcctgactgcttcaaaatctataatacttacatttcaagtcccttttcttctagtggttgattcgcgtccaaagcatatagagcatttacgacttttgaaccagacgcatgtttacctccacaagcagctgttttaataagcttggacatccattcttacatgctcctccgctgccccattaaaactgcacaccgtgcgttcgtagtattacgttgctaggtttaatttctataacaaggtgcatttcgaaaaatccttacaatgagagcaattcgtctgagtccctccgacaggggtcgctaaacaaaacgacatcata
gi|9 : a---GT---AAA----TCCTGT-AA----GTCGACATTGAGG-TGGG------TCTAGACGATCA-----TCGTG-TGTCCCCATTATGCTCAAC-----GACTGTAT-------AGC-CT--GTCTTCTAA-AGCACTAG-CTC-TTTT-----A-AGGC--TT-CCA-TGT-AG-AGGT-CTTGAATATGT--AT-G--CTG-A-C-C-----GATGAGAA-TGC---TGTCAGT--CAACAGAAATT--------CG--GACAAGGTGGA-CAGCC--ATGCCA-TA-ACA-CC-C----TAGAAGT---TCGT-A-A--GAT-A-GGGATTCCTC-ATCA--TAACTTATCT---TA------TAC-GGG-TC-TA--------G-GTGACTT--------CGCCC--A-TTTTCT----AGTCA--ATC-GATGCAGTGATGTTG-ATGTTC--TAAC-ACGCG-AGCCATC-A-CATGCTTTGACTGA-ATACC--TCATGCT-GGCGG--ATCCCATATTAGGGATTTA---TGG-C----AATGGTTA---TTATCCGC-ATGAATC-GTC--GT----A-----GGC-TAGA-ATA-GCCGTGCT-G-C-AAACG-TGAT---G-GAT----TCTTG-A-AAGGGGTCTA-GTT-CC--A-CCAGA-T------CAAA-CAG-GAT-GG--AC-TT-GAAAT-GCGCACAGCAGCG--------G-C---G----T-AA--AATA-TC---C-AC-----G---TC-CG-AGA--TGCAGTAAG-CT---------AA-G--------AA---T--TCTTTCTG-GAA-----A--TC-AAAGACT----TTGCCC--TC---TTGTTGATGG-T-ACCAAgtatagaaggcttcacgattggcgggacatatcatcaggattgtagaaatgagcggcggggtaaggacccacgtactgttggttct
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