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Reference ( gi|2 ) : TCTATGGTT---G--AT-TCTGCA---T-CCAGTTCTCCCATGAT-T--GGCAGGCA--TTT-GATC-GCG--TCAAGGGCTG-ATTGGGA--CACA---G----TGTTCTC---CCTGGAGT------AGAGATCGGGAT--A------------GT-GCTCAA-CA----CATTTCTCCATCTGCT-GTCC-TTTGTT--GGTA-A---TC-------ACTTCCCC--CAGTG-GAGGAT--TTG-ATAGGCGCCGC--CTT-ACTCTGGACTGGTCCCAGGGCTTTCTTGA--TGCAATCATT-CAT-TCC-TCTGA-T-G--TTA-CCCACTG--CA-GCAGCCGTCTGAATGT--TCT--CGCTA-AGCTC-------T--GTCCAGTACT--CATTGGCACAGCGTCT-G--GC--AGTTTGCTGGGC-CTTGC--TTCTT--GC-A-GCCTCT--GGGGATA--TACAGGTTTCTCTC----GC--T-GAG--TATAC-GCT-TGT--A-TTATGCAAG----AGCGTTG-CGTTTG---GCT-TCTATGA-CGGGAGTCGTCTC-TGTTGACGTT-TACAAATTTGGC----T---T----CGAA-C-----CA----G-TC-GCATG---TCTT---G--GTT-G-----TC---TT-CCC---AAA-G---TAGCCAACGCTG-TGCGATGC---------AT--A-GT--------GTCTCGCA-G-------AGCTT-T---TC-----TTGC-CCGA--AG-CTTTAT-CAAACAGCTCTACACAG-TTTGGTTGGTTCACC-CTGC-T---GAT-GTCAATGCGA-GGTTTCCCTTGTTTCTTGGTTTGATGGAA-TTTC-TTTGG-CTGCA-TT-CT--GAT-TTTGCA-AC-ATAC--CAAGGAGTGG-CC-TGT-GTCGCAATCTGCGCTGT-GGTAAGAGT-GTGTGTGGAGAACATTC----------GTGAT-AGCA--AAACGCCTGACCAGGATC-AGATCC--AGTCGATGCCAGTG-TTTAGAG-CATGAGTGTCTCCAGAAGAC-CTTGTGCTGTGGCTT
gi|7 : TCTATGGTT---G--GT-TCTGCG---T-TCAGTTCTTCTATGAT-T--GGCAAGCA--TTT-GATC-GCG--TCAAGGGCTG-ATTGGGA--CACA---G----TGTTCTC---CCTGGAGT------AGAGATT--------------------GT-GTTCAA-CC----CGTCTCTCCATCTGCT-GCCC-TTTGTT--GGTA-A---TC-------ACTT-CCC--CAGTG-GAGGAT--TTG-AGAGGCGCCGT--CTT-GCTCTGGACTGGTCCCAGGGCTTTCTTGA--TGCCATCATA-CAT-TCC-TCTGA-T-G--TTA-CCCAATG--CA-GCA-----------GT--ACT--CACTG----------------GCACAGCG-T--C--TGGCA----GTTT-G------------CTGGGC-CTTGC--TTCTT--GC-A-A-TTCT--GAGAATC--TGCAGGTTTCGCTC----GC--T-GGG--AGTAC-GCT-TGT--A-TTCTGCAAG----AGCATCG-CGCTTG---GCT-T
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gi|4 : ATCAATACATCTCC-CCTGA-TTG--TTA-CCAACTG--CAAGC-GTCGTCTGAATGT--TCC--C--TA--GCTC-------TTCGTCCAGTACT--CAT-GGCATAGCGTCT-G--GC--AGTTTGCTGGGC---TGC--TTCTT----------T-------------------TTTCTGTC----GC--T-GGGATTGTAC--CT-TGT--A-TCGTGCAAG----AGCG-CG-CGTTTG---GCTATCTATGA-CGGGAG-CATCTC--GTT--CG--------ACT--GC----TA--T----CGAATC-----CATCTCG-TC-CTATGA--TATT------GTT-G-----TCCTGCT-CCC---AAG-GAATTAACCAACGCTGTTGCGA-GC---------AT--A-GT--------GTCTCGCATG-------AACTT-T---CCATT--TTTC-CCGA--tgaagtagcccc
gi|1 : CCATTATTTCCATTGGCGCAGCGTCT-G--GC--GCTAAGCCTGGCACTTGC--TCCCTTGGT-ATGCCTTTGAGAGGGTG---GCAGG-TTCCCTCTACAGT--G-GAG--AAT-T-GCT-TGT--ACTCCCGCGAGTGCCAGCAGCA-CGCTTGTAAATA-TCAATAAGCGTGGG--GTCTC---TTG-CG------ATATTTGG-----T---G----CGAA-CAAACGCA----G-TC-ATCTGA--ACTC---GAAGTA-T-----TC---TT-CCC---AAA-GA--TAGTCAAGGC-G-TGtcgcagagtctccgggacttattcaagttctgtaagaagcgtcattcaaactgcttacaagctgcggtcatccagctgatgtcaatgcgaagttcctttgtttcttgcttgaggaatttcgtttggctgcattcctgatatttgcaacaacaaagggaggtct
gi|9 : ccatggttttggctctctgtacaatcgagctcttccaatactaaggcatgtattcaaatacaaatcgaaggctatcgggatccacttgtgttctcaaaccgggtagcggtcggaatcaaggttcaaacgaagccatctctccatctgattgctttggtcaagtaatgattcccagtggggattttgagggggttgttttaattctgtgctgatctatagtagttttagatgaccatcaatcccatcccatcgactagctcgaagaG--TATAC-ATTATGT--A-TCAT-TAAG---------TA-C--TTG---TCT-TCTACAT-CGGGAGCCATCTC-TGTTGAC-----------TTGGC----T---TAATTCGAA-C-----CA----G-TT-GCATG---ACTT---G--GTT-G-----TC---TT-CCCA--AAA-G---TAGCCAACGCTG-TGCGATGCATATATAATAT--A-GT--------GTCTCGCC-G-------AGCTT-ataggatgatgctatacagatattacccattatgctctgtggcgaagtgtttctgggctgtgctgtcatcatactactcacccttatctcaaaggctcatacgaactgatctatcgtgtagatctgactgagtcattttgcttttaacgtcgatacgaggggccactggtttctttcccacatgaaactttttttggttgcagcctgatcctgcagcaactataagtggtggtccgtggttgcagtctgcactgtgggtaagagcggtgcgtggagacattccttaatcacggcagtggcacggcacgcctgatcatgatcaaaatcccaaattggtgccattgctttgcagccatgggtgttcgcaggagatacttgtgttgaggttt
gi|10 : cattag--TATAC-ATA-TGT--A-TCAT-TAAG---------TA-C-TTTG---TCT-TCTACAT-CGGGAGCCATCTC-TGTTGA------------TTGGCTTAAT---T----CGAA-C-----CA----GTTT-GC-TG---ACTT---G--GTTGG-----TC---TTACCCA--AAA-G---TAGCCAA-GCTG-TGCGATGC---------AT--ATATAATATATGGTCTCGCC-G-------AGCTT-ccaatttttccgtcgcagagtcttcgcgggaactgaagttccaagttcttgcccgaaggcttcatcaaactgctctacaaggtctggctgggtcatcctgctgatgtcaatacgaggtttttcttggtttgatggaatttctttggcctgcattcctgattttgcatacaatacaaggagtggtcatgcgccg
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gi|4 : tttgtcttctacatcgggagccatctcctgttgacttggctaattcgaaccagtttgctgacttggttggggggtcttccccaaaaagtagccaacgctgtgcgatgcatatataataCGAT-C---------GC--A-GA--------GTCTC-CG-G-------GACTTAT---TCAAGTTCTGT-AAGA--AG-CGTCATTCAAACTGCT-TACA-AG-CT--GC-GGT-CATC-CAGC-T---GAT-GTCAATGCGA-AG-TTCCTTTGTTTCTT-GCTTGA-GGAA-TTTCGTTTGG-CTGCA-TTCCT--GATATTTGCA-AC-A-AC--AAAGG-GAGG-TC-T
gi|9 : atcaatacatctcccctgattgttaccaactgcaagcgtcgtctgaatgttccctagctcttcgtccagtactcatggcatagcgtctggcagtttgctgggctgcttcttttttctgtcgctgggattgtaccttgtatcgtgcaagagcgcgcgtttggctatctatgacgggagcatctcgttcgactgctatcgaatccatctcgtcctatgatattgttgtcctgctcccaaggaattaaccaacgctgttgcgagcatagtgtctcgcatgaactttccatttttcc-T---TC-----TTGC-CCGA--AGGCTTCAT-CAAACTGCTCTACAAGG-TCTGGCTGGGTCATC-CTGC-T---GAT-GTCAATACGA-GGTT-------TTTCTTGGTTTGATGGAA-TTTC-TTTGGCCTGCA-TTCCT--GAT-TTTGCATACAATA---CAAGGAGTGG-TCATGC-GCCG
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Reference ( family-589 ) : TCTATGGTT--GG--TTCTGCGT-CCA-----GTTCTTCCATGAT-T--GGCAGGCA---TTCGATC-GCG--TCGAGGGCTG-ATCGGGA--CACA---GCGTTCTC---CCTGGAGT------AGAGATCGGGAT--A------------GT-GTTCAA-C----CCGTCTCTCCATCTGCT-GCCC-TTTGTC-GGTA-ATC----ACTTCCC-CCAGTG-GAGGAT--TTG------A-GAGG--CGC--CGTCTT-G-CTCTGGACTG-GTC---C-CA-GGCTTTCTTGAT-G-CCATCA-TACAT-TCC-TCTGA-T-G--TTA-C-CCANTG--CA-GCAGTCGTCTG-A-TGTNCTC----GCTG-AGCT-C-G--------TCCA-GCA-T---CATTGGCACAGCGTCTG--GC--AGTTTGCTGGGC-CTTGCTTCTT--GC-A-GCTTCTGAGA-ATNT-GCAGGTTTCGCTC-GC-TG-GG--TGTA-C-GCTTGTA-TTNTGCGAG----AGCATCG-CGCTTG---GCT-TCTACGA-CG-GGAGCCATCTC-TGTTG-ACG---A-----TTGGC----T---T----CGAA-C-----CA----G-TC-GCATGAACT--T---G--GTT-G-----TCTT---CCC---AAA-G---TAGCCAACGCTGT-GCGATG----C---------AT--A-GT--------GTCTCGC-CG-------AGCTTC---TC---TTGC-CCGA------AGG--CTTC-A--------T-CAAACTG-CTCTACAA---AG-GT--------CTG-------GCTG-G-GTCATC-CTG-CT---GA-----T-GTCGATGCG-A-GGTT--CC-CTG-TTTCTTGGTTTGATGGAA-TTTC-TTTGG-CTGCA-TT-CT--GAT-TTTGCA-ACAA-TAC-NAAGGAGTGG-TC-CGC-GTCGCAGTCTGCACTGT-GGTAAGAGC-GTGCGTGGAG-ACGTTCCT----------GGTGG-GCGGNACGCCTGACCAGGATC-AGATCC--AGTCGATGCCANTGCTTTGNAGCCATGGGTGTCCGCAGGAGACACTTGTGCTGNGGCTT
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gi|10 : ccatggttttggctctctgtacaatcgagctcttccaatactaaggcatgtattcaaatacaaatcgaaggctatcgggatccacttgtgttctcaaaccgggtagcggtcggaatcaaggttcaaacgaagccatctctccatctgattgctttggtcaagtaatgattcccagtggggattttgagggggttgttttaattctgtgctgatctatagtagttttagatgaccatcaatcccatcccatcgactagctcgaagaccattatttccattggcgcagcgtctggcgctaagcctggcacttgctcccttggtatgcctttgagagggtggcaggttccctctacagtggagaattgcttgtactcccgcgagtgccagcagcacgcttgtaaatatcaataagcgtggggtctcttgcgatatttggtgcgaacaaacgcagtcatctgaactcgaagtattcttcccaaagatagtcaaggcgtgataggatgatgctatacagatattacccattatgctctgtggcgaagtgtttctggTTG---TCT-TCTACAT-CG-GGAGCCATCTC-TGTT----G---A-----TTGGCTTAAT---T----CGAA-C-----CA----GTTT-GC-TG-ACT--T---G--GTTGG-----TCTTA--CCCA--AAA-G---TAGCCAA-GCTGT-GCGATG----C---------AT--ATATAATATATGGTCTCGC-CG-------AGCTTC---
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gi|8 : tATGGTT--GG--TTCTGCGT-TCA-----GTTCTTCTATGAT-T--G-CAAGCA---TTTGATCCGCG--TCAAGG-CTG-ATTGGGA--CACA---GTGTTCTC---CCTGGAGT------AGAGATTG--------------------T-GTTCAA-C----CCGTCTCTCCATCTGCT-GCCC-TTTGTT-GGTA-ATC----ACTTCCC-C-AGTG-GAGGAT--TTG------A-GAGG--CGC--CGTCTT-G-CTCTGGACTG-GTC---C-CA-GGCTTTCTTGAT-G-CCATCA-TACAT-TCC-TCTGA-T-G--TTA-C-CCAATG--CA-GCA------------GTACTC----ACT-----------------------------------GGCACAGCGTCTG--GC--AGTTTGCCTGGC-CTTGCTTCTT--GC-A-A-TTCTGAGA-ATCT-GCAGGTTTCGCTC-GC-TG-GG--AGTA-C-GCTTGTA-TTCTGCAAG----AGCATCG-CGCTTG---GCT-
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Reference ( family-589 ) : TCTATGGTT--GG--TTCTGCGT-CCA-----GTTCTTCCATGAT-T--GGCAGGCA---TTCGATC-GCG--TCGAGGGCTG-ATCGGGA--CACA---GCGTTCTC---CCTGGAGT------AGAGATCGGGAT--A------------GT-GTTCAA-C----CCGTCTCTCCATCTGCT-GCCC-TTTGTC-GGTA-ATC----ACTTCCC-CCAGTG-GAGGAT--TTG------A-GAGG--CGC--CGTCTT-G-CTCTGGACTG-GTC---C-CA-GGCTTTCTTGAT-G-CCATCA-TACAT-TCC-TCTGA-T-G--TTA-C-CCANTG--CA-GCAGTCGTCTG-A-TGTNCTC----GCTG-AG--C--C--G--------CCAGTA-T---CATTGGCACAGCG-TCTG--GC--AGTTTGCCGGGC-CTTGCTTCTT--GC-A-GCTTCTGAGA-ATNT-GCAGGTTTCGCTC-GC-TG-GGN--GTA-C-GCTTGT--A-TTCCGCGAG----AGCGTCG-CGCTTG---GCT-TCTACGA-CG-GGAGCCATCTC-TGTTG-ACG---A-----TTGGC----T---T----CGAA-C-----CA----G-TC-GCATGAACT--T---G--GTT-G-----TCTT---CCC---AAA-G---TAGCCAACGCTGT-GCGATG----C---------AT--A-GT--------GTCTCGC-CG-------AGCTTC---TC---TTGC-CCGA------AGG--CTTC-A--------T-CAAACTG-CTCTACAA---AG-GT--------CTG-------GCTG-G-GTCATC-CTG-CT---GA-----T-GTCGATGCG-A-GGTT--CC-CTG-TTTCTTGGTTTGATGGAA-TTTC-TTTGG-CTGCA-TT-CT--GAT-TTTGCA-ACAA-TAC-NAAGGAGTGG-TC-CGCG-TCGCAGTCTGCACTGTGG-TAAGAGCG-TGCGTGGAG-ACGTTCNTGA----------TGG-GCGGNACGCCTGACCAGGATCAGA-TCC--AGTCGATGCCANTGCTTTGNAGCCATGGGTGTCCGCAGGAGACACTTGTGCTGNGGCTT
gi|1 : CCATGGTTTTGG--CTCTCTGT-ACAATCGAGCTCTTCCAATAC-TAAGGCATGTA---TTCAAAT-ACAAATCGAAGGCT--ATCGGGA--TCCACTTGTGTTCTCAAACC--GGGT------AGCGGTCGGAATCAA------------G--GTTCAAACGAAGCCATCTCTCCATCTGAT-TGCT-TTGGTCAAGTA-ATG----ATT---C-CCAGTG-GGGATT--TTG------A-GGGG---GT--TGTTTTAA-TTCTGTGCTG-ATC---TATA-GTAGTTTTAGAT-GACCATCA----AT-CCC-----A-T--------C-CCA------------TCGACTA------GCTC----G--A-AG--------A--------CCATTA-TTTCCATTGGCGCAGCG-TCTG--GC--GCTAAGCCTGGCACTTGCTCCCTTGGT-ATGCCTTTGAGA-GGGTGGCAGGTTCC-CTCTAC-AGTGGA--GAATT-GCTTGT--ACTCCCGCGAGTGCCAGCAGCA-CGCTTGTAAATA-TCAATAAGCGTGGGG---TCTC---TTG--CG---ATAT--TTGG-----T---G----CGAA-CAAACGCA----G-TC-ATCTGAACT--C---GAAGTA-T-----TCTT---CCC---AAA-GA--TAGTCAAGGC-GT-G
gi|1 : GCTGT-GC--TGTCATC---------AT--A-CT--------A-CTCAC-C----------CTTA---TC---T-----CAA------AGG--CT-C-A--------TACGAACTG-ATCTATCGTGTAG-AT--------CTG-------ACTG-A-GTCATT-TTG-CTTTTAA-----C-GTCGATACG-A-GGGG--CCACTGGTTTCTTTCCCACATGAAACTTTT-TTTGG-TTGCA-GC-CT--GAT-CCTGCA-GCAACTA--TAAGTGGTGG-TC-CGTGGTTGCAGTCTGCACTGTGGGTAAGAGCGGTGCGTGGAG-ACATTCCTTAATCACGGCAGTGGCACGGCACGCCTGATCATGATCAAAATCCCAAATTGGTGCCATTGCTTTGCAGCCATGGGTGTTCGCAGGAGATACTTGTGTTGAGGTTTataggatgatgctatacagatattacccattatgctctgtggcgaagtgtttctgggctgtgctgtcatcatactactcacccttatctcaaaggctcatacgaactgatctatcgtgtagatctgactgagtcattttgcttttaacgtcgatacgaggggccactggtttctttcccacatgaaactttttttggttgcagcctgatcctgcagcaactataagtggtggtccgtggttgcagtctgcactgtgggtaagagcggtgcgtggagacattccttaatcacggcagtggcacggcacgcctgatcatgatcaaaatcccaaattggtgccattgctttgcagccatgggtgttcgcaggagatacttgtgttgaggttt
gi|10 : ccatggttttggctctctgtacaatcgagctcttccaatactaaggcatgtattcaaatacaaatcgaaggctatcgggatccacttgtgttctcaaaccgggtagcggtcggaatcaaggttcaaacgaagccatctctccatctgattgctttggtcaagtaatgattcccagtggggattttgagggggttgttttaattctgtgctgatctatagtagttttagatgaccatcaatcccatcccatcgactagctcgaagaccattatttccattggcgcagcgtctggcgctaagcctggcacttgctcccttggtatgcctttgagagggtggcaggttccctctacagtggagaattgcttgtactcccgcgagtgccagcagcacgcttgtaaatatcaataagcgtggggtctcttgcgatatttggtgcgaacaaacgcagtcatctgaactcgaagtattcttcccaaagatagtcaaggcgtgataggatgatgctatacagatattacccattatgctctgtggcgaagtgtttctggTTG---TCT-TCTACAT-CG-GGAGCCATCTC-TGTT----G---A-----TTGGCTTAAT---T----CGAA-C-----CA----GTTT-GC-TG-ACT--T---G--GTTGG-----TCTTA--CCCA--AAA-G---TAGCCAA-GCTGT-GCGATG----C---------AT--ATATAATATATGGTCTCGC-CG-------AGCTTC---
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gi|13 : cCAA------AGGGCCTTCTA--------C-GAACCTGATTCTACA-----G-AT--------CGG-------ACCG-AAGTCATT-TTGGCT---GGACGTCT-GTCGA-GCG-G-G-----CC-CTGGTTTCTT---TCCACGAGA-CTTT-TTTCG-CTGCAGCT-TT--GAT-CT-GTA-GC---TAC-AAGGGAGTGGGTC-CGTG-TCGCAGTCTGCACTGTGG-TAAG-GCG-TGGAGGGAG-ACGTTCTTGA----------TGG-GCGGCACGTCTAACC-GAATCtatt
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Reference ( family-589 ) : TCTATGGTT--GG--TTCTGCGT-CCA-----GTTCTTCCATGAT-T--GGCAGGCA---TTCGATC-GCG--TCGAGGGCTG-ATCGGGA--CACA---GCGTTCTC---CCTGGAGT------AGAGATCGGGAT--A------------GT-GTTCAA-C----CCGTCTCTCCATCTGCT-GCCC-TTTGTC-GGTA-ATC----ACTTCCC-CCAGTG-GAGGAT--TTG------A-GAGG--CGC--CGTCTT-G-CTCTGGACTG-GTC---C-CA-GGCTTTCTTGAT-G-CCATCA-TACAT-TCC-TCTGA-T-G--TTA-C-CCANTG--CA-GCAGTCGTCT-G-A-TGTNCTC----GCTG-AG--C--C--G---------CCAGTA-T---CATTGGCACAGCG-TCTG--GC--AGTTTGCCGGGC-CTTGCTTCTT--GC-A-GCTTCTGAGA-ATNT-GCAGGTTTCGCTC-GCTG-GGA--GTA-C-GCTTGT--A-TTCCGCGAG----AGCGTCG-CGCTTG---GCT-TCTACGA-CG-GGAGCCATCTC-TGTTG-ACG---A-----TTGGC----T---T----CGAA-C-----CA----G-TC-GCATGAACT--T---G--GTT-G-----TCTT---CCC---AAA-G---TAGCCAACGCTGT-GCGATG----C---------AT--A-GT--------GTCTCGC-CG-------AGCTTC---TC---TTGC-CCGA------AGG--CTTC-A--------T-CAAACTG-CTCTACAA---AG-GT--------CTG-------GCTG-G-GTCATC-CTG-CT---GA-----T-GTCGATGCG-A-GGTT--CC-CTG-TTTCTTGGTTTGATGGAA-TTTC-TTTGG-CTGCA-TT-CT--GAT-TTTGCA-ACAA-TAC-NAAGGAGTGG-TC-CGCG-TCGCAGTCTGCACTGTGG-TAAGAGCG-TGCGTGGAG-ACGTTCNTGA----------TGG-GCGGNACGCCTGACCAGGATCAGA-TCC--AGTCGATGCCANTGCTTTGNAGCCATGGGTGTCCGCAGGAGACACTTGTGCTGNGGCTT
gi|1 : CCATGGTTTTGG--CTCTCTGT-ACAATCGAGCTCTTCCAATAC-TAAGGCATGTA---TTCAAAT-ACAAATCGAAGGCT--ATCGGGA--TCCACTTGTGTTCTCAAACC--GGGT------AGCGGTCGGAATCAA------------G--GTTCAAACGAAGCCATCTCTCCATCTGAT-TGCT-TTGGTCAAGTA-ATG----ATT---C-CCAGTG-GGGATT--TTG------A-GGGG---GT--TGTTTTAA-TTCTGTGCTG-ATC---TATA-GTAGTTTTAGAT-GACCATCA----AT-CCC-----A-T--------C-CCA------------TCGACT-A------GCTC----G--A-AG--------A---------CCATTA-TTTCCATTGGCGCAGCG-TCTG--GC--GCTAAGCCTGGCACTTGCTCCCTTGGT-ATGCCTTTGAGA-GGGTGGCAGGTTCC-CTCTACAGTGGA--GAATT-GCTTGT--ACTCCCGCGAGTGCCAGCAGCA-CGCTTGTAAATA-TCAATAAGCGTGGGG---TCTC---TTG--CG---ATAT--TTGG-----T---G----CGAA-CAAACGCA----G-TC-ATCTGAACT--C---GAAGTA-T-----TCTT---CCC---AAA-GA--TAGTCAAGGC-GT-G
gi|1 : GCTGT-GC--TGTCATC---------AT--A-CT--------A-CTCAC-C----------CTTA---TC---T-----CAA------AGG--CT-C-A--------TACGAACTG-ATCTATCGTGTAG-AT--------CTG-------ACTG-A-GTCATT-TTG-CTTTTAA-----C-GTCGATACG-A-GGGG--CCACTGGTTTCTTTCCCACATGAAACTTTT-TTTGG-TTGCA-GC-CT--GAT-CCTGCA-GCAACTA--TAAGTGGTGG-TC-CGTGGTTGCAGTCTGCACTGTGGGTAAGAGCGGTGCGTGGAG-ACATTCCTTAATCACGGCAGTGGCACGGCACGCCTGATCATGATCAAAATCCCAAATTGGTGCCATTGCTTTGCAGCCATGGGTGTTCGCAGGAGATACTTGTGTTGAGGTTTataggatgatgctatacagatattacccattatgctctgtggcgaagtgtttctgggctgtgctgtcatcatactactcacccttatctcaaaggctcatacgaactgatctatcgtgtagatctgactgagtcattttgcttttaacgtcgatacgaggggccactggtttctttcccacatgaaactttttttggttgcagcctgatcctgcagcaactataagtggtggtccgtggttgcagtctgcactgtgggtaagagcggtgcgtggagacattccttaatcacggcagtggcacggcacgcctgatcatgatcaaaatcccaaattggtgccattgctttgcagccatgggtgttcgcaggagatacttgtgttgaggttt
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Reference ( family-589 ) : TCTATGGTT--GG--TTCTGCGT-CCA-----GTTCTTCCATGAT-T--GGCAGGCA---TTCGATC-GCG--TCGAGGGCTG-ATCGGGA--CACA---GCGTTCTC---CCTGGAGT------AGAGATCGGGAT--A------------GT-GTTCAA-C----CCGTCTCTCCATCTGCT-GCCC-TTTGTC-GGTA-ATC----ACTTCCC-CCAGTG-GAGGAT--TTG------A-GAGG--CGC--CGTCTT-G-CTCTGGACTG-GTC---C-CA-GGCTTTCTTGAT-G-CCATCA-TACAT-TCC-TCTGA-T-G--TTA-C-CCANTG--CA-GCAGTCGTCT-G-A-TGTNCTC----GCTG-AG--C--C--G---------CCAGTA-T---CATTGGCACAGCG-TCTG--GC--AGTTTGCCGGGC-CTTGCTTCTT--GC-A-GCTTCTGAGA-ATNT-GCAGGTTTCGCTC-GCTG-GGA--GTA-C-GCTTGT--A-TTCCGCGAG----AGCGTCG-CGCTTG---GCT-TCTACGA-CG-GGAGCCATCTC-TGTTG-ACG---A-----TTGGC----T---T----CGAA-C-----CA----G-TC-GCATGAACT--T---G--GTT-G-----TCTT---CCC---AAA-G---TAGCCAACGCTGT-GCGATG----C---------AT--A-GT--------GTCTCGC-CG-------AGCTTC---TC---TTGC-CCGA------AGG--CTTC-A--------T-CAAACTG-CTCTACAA---AG-GT--------CTG-------GCTG-G-GTCATC-CTG-CT---GA-----T-GTCGATGCG-A-GGTT--CC-CTG-TTTCTTGGTTTGATGGAA-TTTC-TTTGG-CTGCA-TT-CT--GAT-TTTGCA-ACAA-TAC-NAAGGAGTGG-TC-CGCG-TCGCAGTCTGCACTGTGG-TAAGAGCG-TGCGTGGAG-ACGTTCNTGA----------TGG-GCGGNACGCCTGACCAGGATCAGA-TCC--AGTCGATGCCANTGCTTTGNAGCCATGGGTGTCCGCAGGAGACACTTGTGCTGNGGCTT
gi|1 : CCATGGTTTTGG--CTCTCTGT-ACAATCGAGCTCTTCCAATAC-TAAGGCATGTA---TTCAAAT-ACAAATCGAAGGCT--ATCGGGA--TCCACTTGTGTTCTCAAACC--GGGT------AGCGGTCGGAATCAA------------G--GTTCAAACGAAGCCATCTCTCCATCTGAT-TGCT-TTGGTCAAGTA-ATG----ATT---C-CCAGTG-GGGATT--TTG------A-GGGG---GT--TGTTTTAA-TTCTGTGCTG-ATC---TATA-GTAGTTTTAGAT-GACCATCA----AT-CCC-----A-T--------C-CCA------------TCGACT-A------GCTC----G--A-AG--------A---------CCATTA-TTTCCATTGGCGCAGCG-TCTG--GC--GCTAAGCCTGGCACTTGCTCCCTTGGT-ATGCCTTTGAGA-GGGTGGCAGGTTCC-CTCTACAGTGGA--GAATT-GCTTGT--ACTCCCGCGAGTGCCAGCAGCA-CGCTTGTAAATA-TCAATAAGCGTGGGG---TCTC---TTG--CG---ATAT--TTGG-----T---G----CGAA-CAAACGCA----G-TC-ATCTGAACT--C---GAAGTA-T-----TCTT---CCC---AAA-GA--TAGTCAAGGC-GT-G
gi|1 : GCTGT-GC--TGTCATC---------AT--A-CT--------A-CTCAC-C----------CTTA---TC---T-----CAA------AGG--CT-C-A--------TACGAACTG-ATCTATCGTGTAG-AT--------CTG-------ACTG-A-GTCATT-TTG-CTTTTAA-----C-GTCGATACG-A-GGGG--CCACTGGTTTCTTTCCCACATGAAACTTTT-TTTGG-TTGCA-GC-CT--GAT-CCTGCA-GCAACTA--TAAGTGGTGG-TC-CGTGGTTGCAGTCTGCACTGTGGGTAAGAGCGGTGCGTGGAG-ACATTCCTTAATCACGGCAGTGGCACGGCACGCCTGATCATGATCAAAATCCCAAATTGGTGCCATTGCTTTGCAGCCATGGGTGTTCGCAGGAGATACTTGTGTTGAGGTTTataggatgatgctatacagatattacccattatgctctgtggcgaagtgtttctgggctgtgctgtcatcatactactcacccttatctcaaaggctcatacgaactgatctatcgtgtagatctgactgagtcattttgcttttaacgtcgatacgaggggccactggtttctttcccacatgaaactttttttggttgcagcctgatcctgcagcaactataagtggtggtccgtggttgcagtctgcactgtgggtaagagcggtgcgtggagacattccttaatcacggcagtggcacggcacgcctgatcatgatcaaaatcccaaattggtgccattgctttgcagccatgggtgttcgcaggagatacttgtgttgaggttt
gi|10 : ccatggttttggctctctgtacaatcgagctcttccaatactaaggcatgtattcaaatacaaatcgaaggctatcgggatccacttgtgttctcaaaccgggtagcggtcggaatcaaggttcaaacgaagccatctctccatctgattgctttggtcaagtaatgattcccagtggggattttgagggggttgttttaattctgtgctgatctatagtagttttagatgaccatcaatcccatcccatcgactagctcgaagaccattatttccattggcgcagcgtctggcgctaagcctggcacttgctcccttggtatgcctttgagagggtggcaggttccctctacagtggagaattgcttgtactcccgcgagtgccagcagcacgcttgtaaatatcaataagcgtggggtctcttgcgatatttggtgcgaacaaacgcagtcatctgaactcgaagtattcttcccaaagatagtcaaggcgtgataggatgatgctatacagatattacccattatgctctgtggcgaagtgtttctggTTG---TCT-TCTACAT-CG-GGAGCCATCTC-TGTT----G---A-----TTGGCTTAAT---T----CGAA-C-----CA----GTTT-GC-TG-ACT--T---G--GTTGG-----TCTTA--CCCA--AAA-G---TAGCCAA-GCTGT-GCGATG----C---------AT--ATATAATATATGGTCTCGC-CG-------AGCTTC---
gi|10 : tatacatatgtatcattaagtact---TT---TTGCTCCGA------AGG--CTTC-A--------T-CA--CTG-CTCTACAA---AG-GT--------CTG-------GCTG-G--TCATCACTG-CT---GA-----TTGTCAAT-CG-AAGGTT---------TTTCTTGGTTTGATGGAT-TATC-TTTGG-CTGCA-TT-CTG-GAT-TTTGCA-ACAA-TACACAAGGAGTGG-TC-TGCG-caatttttccgtcgcagagtcctcgcgggaactgaagttcaagttttgctccgaaggcttcatcactgctctacaaaggtctggctggtcatcactgctgattgtcaatcgaaggtttttcttggtttgatggattatctttggctgcattctggattttgcaacaatacacaaggagtggtctgcg
gi|11 : tatacatatgtatcattaagtactttgtcttctacatcgggagccatctctgttgattggcttaattcgaaccagtttgctgacttggttggtcttacccaaaagtagccaagctgtgcgatgcatatataatatatggtctcgccgagcttccaatttttccgtcgcagagtcctcgcgggaactgaagttcaagTTG---TCT-TCTACAT-CG-GGAGCCATCTCCTGTTG-AC----------TTGGC----TAATT----CGAA-C-----CA----G-TTTGC-TGA-CT--T---G--GTT-GGGGGGTCTT---CCCCAAAAA-G---TAGCCAACGCTGT-GCGATG----CATATATAATAT--A-GTG-------GTCTCGC-CGC------AGCTTCCAATG---TTGT-CCG
gi|11 : t--T---A--GTG-G-----TCTC---GCC---GCA-G---CTTCCAATGTTGT-CCGTCG----C---------AG--A-GT--------CCTTCGC-GGGAATGGAAGTTCCAAGTT---TTGC-CCGAC-----AGG--CTTC-A--------T-CAA-CTG-CTCTACAA---AG-GT--------CTG-------GCTG-G-GTCATC-CTGCCT---GAT----T-GTCAAT-CGAA-GGTT---------TTTCTTGGTTTGATGGAA-TTTC-TTTGG-CTGCA-TT-CCTGGAT-TTTGCA-ACAA-TAC-AAAGGAGTGG-TC-TGtcgcagagtccttcgcgggaatggaagttccaagttttgcccgacaggcttcatcaactgctctacaaaggtctggctgggtcatcctgcctgattgtcaatcgaaggtttttcttggtttgatggaatttctttggctgcattcctggattttgcaacaatacaaaggagtggtctg
gi|12 : tttgtcttctacatcgggagccatctcctgttgacttggctaattcgaaccagtttgctgacttggttggggggtcttccccaaaaagtagccaacgctgtgcgatgcatatataataTCTGTTGTT--GG--CTCCTCAT-CTA-----GTTTATCCA-AATAG--GGCAGCTA---AGTGATG-GCA--TCGAGCGCTGCATCAGT---TACG---ACGTTCTG---CGTGGAGT------AGAGCTCAAGGT--A------------GT-GCTCTA-T----CCACCTCTCCATCTGCT-TTTT-CTTGTC-AGTG-AT------GTTCTCGCC--T-----GAC--TTGCTCTTCA-GCGGGACACA-CGTGGT-GAC---AGACGG-GCC---T-GT-GGCTTGTGTGAT-G-CCAGCA-TACAT-GCTGCCTG--T-G--TTG-C-C--TTGGTCT-GCGTTTGTCT-G---TATCCT------CTG-AG--A--C--A---------GCAG-A-----CATTAGCACAGCG-TCTA--GC--
gi|13 : cCAA------AGGGCCTTCTA--------C-GAACCTGATTCTACA-----G-AT--------CGG-------ACCG-AAGTCATT-TTGGCT---GGACGTCT-GTCGA-GCG-G-G-----CC-CTGGTTTCTT---TCCACGAGA-CTTT-TTTCG-CTGCAGCT-TT--GAT-CT-GTA-GC---TAC-AAGGGAGTGGGTC-CGTG-TCGCAGTCTGCACTGTGG-TAAG-GCG-TGGAGGGAG-ACGTTCTTGA----------TGG-GCGGCACGTCTAACC-GAATCtatt
gi|14 : tttATGGTT--GGGATTCTGCAT-CCA-----GTTCTTCAA--AT-T--GACAGCCAGTTTTAGATC--CG--CTCAAGGCTG-ATTGCTA--CACA---TTGTTCTC---CCTGGAGCTA----AGAGATTCGGAA--A------------GTAGCTCAA-C----CCATCTCTCCATTCTCT-ATC---TTGTC-AGTATATC----ACTTTCC-CATGTG-GAGGATCTTTT------A-GAGG--CGC--CGTCTT-G-CTCTGGACTGTTTC---C-CA-GGCTTTC-TGAT-ttgaga
gi|15 : ctcAAGAT--CTG------AAGAGG--AGC--CATATT-G-GTTT----TA-ATC---A-CA-GGCTTCCATG-T-G-TC-TCA-CACAA-ACC-TCAGT-T-G---CA-CTCCAATGA-CA-TCATTC
gi|16 : aGCTGGATCGGT---CACG---ACGTTCTG---CGTGGAGTTTAAGTAGAGCTCAAGGT--A------------GT-GCTCTA-T----CCaagccacgc
gi|17 : -GCAGAACGCCTGATCAGGATCAGA-TCC--AGTTCATGCCAacc
gi|2 : TCTATGGTT--GA--TTCTGCAT-CCA-----GTTCTCCCATGAT-T--GGCAGGCA---TTTGATC-GCG--TCAAGGGCTG-ATTGGGA--CACA---GTGTTCTC---CCTGGAGT------AGAGATCGGGAT--A------------GT-GCTCAA-C----ACATTTCTCCATCTGCT-GTCC-TTTGTT-GGTA-ATC----ACTTCCC-CCAGTG-GAGGAT--TTG------A-TAGG--CGC--CGCCTT-A-CTCTGGACTG-GTC---C-CAGGGCTTTCTTGAT-G-CAATCA-TTCAT-TCC-TCTGA-T-G--TTA-C-CCACTG--CA-GCAGCCGTCT-GAA-TGTTCTC----GCTA-AGCTC--T--GT--------CCAGTACT---CATTGGCACAGCG-TCTG--GC--AGTTTGCTGGGC-CTTGCTTCTT--GC-A-GCCTCTGGGG-ATAT-ACAGGTTTCTCTC-GCTG-AGT--ATA-C-GCTTGT--A-TTATGCAAG----AGCGTTG-CGTTTG---GCT-TCTATGA-CG-GGAGTCGTCTC-TGTTG-ACGTTTACAAATTTGGC----T---T----CGAA-C-----CA----G-TC-GCATG-TCT--T---G--GTT-G-----TCTT---CCC---AAA-G---TAGCCAACGCTGT-GCGATG----C---------AT--A-GT--------GTCTCGC-AG-------AGCTTT---TC---TTGC-CCGA------A-G--CTTT-A--------T-CAAACAG-CTCTACAC---A--GT--------TTG-------GTTG-G-TTCACC-CTG-CT---GA-----T-GTCAATGCG-A-GGTTTCCC-TTG-TTTCTTGGTTTGATGGAA-TTTC-TTTGG-CTGCA-TT-CT--GAT-TTTGCA-AC-A-TAC-CAAGGAGTGG-CC-TGTG-TCGCAATCTGCGCTGTGG-TAAGAGTG-TGTGTGGAGAACATTCGTGA----------T-A-GCAAAACGCCTGACCAGGATCAGA-TCC--AGTCGATGCCAGTG-TTTAGAG-CATGAGTGTCTCCAGAAGAC-CTTGTGCTGTGGCTTg
gi|3 : CCATGGTT--GG--TTCTGCAT-CGA-----GCTCTTCCATTAC-T--GGTATGCA---TTCAATG-GCT--TTGAGAGCTG-CTGGAGT--CACT---GCATTCTC---TCTGGAGT------AAAGGTCGGGAT--ACTACTAGTAGTAGT-GTTTCA-C----CTATCACTCCATCTGAC-GGCC-TTGGTC-AGTA-ATG----ACTTCCC-C-AGTG-GAGGAT--TTG------A-GTGG--GGT---GTCTT-G-TTCTG-------------------------TGAT-G-CCACCA-AACAT-CTT-TCTGA-T-G--TTG-C-TCGCTT--CA-GCAGCTGTCTGG-A-TCGTCTC----CCTG-AG--CT-C--AGTCCAATATCCAGTACT---CACTGGCGCAGCG-TCTGCTGCTAAGATT----GGC-CTTGCTCCTG--GT-A-GC-CCTGAGA-CGGT-GCAGATTCCTTTC-AGTG-GGT--G-A-CTGCTTGT--A-CTCCGCGAG----TGCAGCA-TGTTTG---ACT-TCAATAA-CT-GG------------------G---A-----T---C----A---T----CAAA-C-----CA----G-TC-GTACG-ACT--TAGAG--GTT-T-----TCTTC--CCC---AAG-G---TAGTCAAGGCGTT-GCAATG----G---------AT--G-GT--------GTCTCGC-AT-------AGTTTC---CC---
gi|3 : TGCA-GCA--TAC--AAGGGGTGG-TC-CGTG-TCGCAGTTTGCATTGTGG-TAAGATCG-TGTGTGGAG-Acattactccgtagcagtgtctctgggcagtgatgcatcgcattctttctcaaagtcctttgccgccccccctcccaaatctttccttagcccccttgctgatgtcttaacccccccccccccccaccttcctttcaacggtgaaacttattcctgcagcatacaaggggtggtccgtgtcgcagtttgcattgtggtaagatcgtgtgtggaga
gi|4 : ccatggttggttctgcatcgagctcttccattactggtatgcattcaatggctttgagagctgctggagtcactgcattctctctggagtaaaggtcgggatactactagtagtagtgtttcacctatcactccatctgacggccttggtcagtaatgacttccccagtggaggatttgagtggggtgtcttgttctgtgatgccaccaaacatctttctgatgttgctcgcttcagcagctgtctggatcgtctccctgagctcagtccaatatccagtactcactggcgcagcgtctgctgctaagattggccttgctcctggtagccctgagacggtgcagattcctttcagtgggtgactgcttgtactccgcgagtgcagcatgtttgacttcaataactgggatcatcaaaccagtcgtacgacttagaggttttcttccccaaggtagtcaaggcgttgcaatggatggtgtctcgcatagtttccccattactccgtagcagtgtctctgggcagtgatgcatcgcattctttctcaaagtcctttgccgccccccctcccaaatctttccttagcccccttgctgatgtcttaacccccccccccccccaccttcctttcaacggtgaaacttattccATCAATACATCTCC-CCTGA-TTG--TTA-C-CAACTG--CAAGC-GTCGTCT-G-AATGTTCCCTA--GCT------CTTC--GT--------CCAGTACT---CAT-GGCATAGCG-TCTG--GC--AGTTTGCTGGGC---TGCTTCTT--TT-----TTCTG--------------------TC-GCTG-GGATTGTA-C--CTTGT--A-TCGTGCAAG----AGCG-CG-CGTTTG---GCTATCTATGA-CG-GGAGC-ATCTC--GTT---CG---A-----CTG-C----TA--T----CGAATC-----CATCTCG-TC-CTATGATAT--T---G---TT-G-----TCCTGCTCCC---AAG-GAATTAACCAACGCTGTTGCGA-G----C---------AT--A-GT--------GTCTCGCATG-------AACTTT---CCATTTTTC-CCGATCGCAGAGT--CTCC-GGGACTTATT-CAAGTT--CTGTAAGA---AGCGTCATTCAAACTGCTTACAAGCTGCG-GTCATC-CAG-CT---GA-----T-GTCAATGCG-A-AGTT--CCTTTG-TTTCTT-GCTTGA-GGAA-TTTCGTTTGG-CTGCA-TTCCT--GATATTTGCA-ACA---AC-AAAGG-GAGG-TC-
gi|5 : TTTC---TCTGACGT------ACAGTTTG--AA--A------------GT-GTTCAA-C----CCA---ATTCATCTGCT-GTGC-TTTGT-----A-CTCTTTGACCTCAC-CGA-TA-GTGGAT--TTG------A-GAGG--GGTGGCATCTT-T-CCATGTAA-G-GTCAACT-C----CTTGTTTAATTG-CT-TCA-TACAT-GCT-TTTGA-T-A--TT-------TTG--CA---AG-CGTCG-G-A-TGTGATCTAGTGTTGCAG--C--CAAG---------CCAA-G-T---CATTGGTA------TC-----------TTGCTGGAC-TTTGC----T--GCGA-ACTTCCCGGATGTTT-TCAGGTTTCGGTC-GCTT-TGG--TTT-G-GCTTGTAGA-TT--GTCAA----TGCCTCC-CCTTTG---TAT-TCTGTGA-AG-GGAAACAGGGC--GTTGTAC----------TGGGC----T---T----CAAA-C-----CA----C-TCTGC-TGAATTGCT---G--GTT-------TTTT---GCC---AAAGG---TTGTAATGGCTGT---AATT----T---------ATAAA-GT--------GTCTCt
gi|6 : gacagagactttgaTCTATGGTT--GG--TTTCGCGTTCCA-----GTTCTTC-ATGAT----GGCAAGCA---TT-GATC-GCG--TCAAGGGCTG-ATTGGGGACCACA---GTGTTCTC---CCTGGAGT------AGAGATTG--------------------T-GTTCAA-C----CCGTCTCTCCATCTGCTTGCCCCTTTGTT-GGTA-A-C----ACTTCCC-C-AGTGCGAGGAT--TTG------AAGAGG--CGC--CGTCTT-G-CTCTGGACTG-GTC---C-CA-GGCTTTCTTGAT-G-CCATCA-TACAT-TCC-TCTAACT-GTTTTACC-CCAATG--CA-----TCAT---------TACTC----AC---GG--C--C--A---------C--------------------GCGTTCTG--GC--AGTTTGCTGGGC-CTTGCTTCTT--GC-A-A-TTCTGAGA-ATCT-GCAGGTTTCGCTC-GCT--GGA--GTA-C-GCTTGT--A-TTT--CGAG----AGCATCGCCGCTTG---GCT-C---CGA-CA-GGtgaagtagcccc
gi|7 : ctTCTATGGTT--GG--TTCTGCGT-TCA-----GTTCTTCTATGAT-T--GGCAAGCA---TTTGATC-GCG--TCAAGGGCTG-ATTGGGA--CACA---GTGTTCTC---CCTGGAGT------AGAGATT--------------------GT-GTTCAA-C----CCGTCTCTCCATCTGCT-GCCC-TTTGTT-GGTA-ATC----ACTT-CC-CCAGTG-GAGGAT--TTG------A-GAGG--CGC--CGTCTT-G-CTCTGGACTG-GTC---C-CAGGGCTTTCTTGAT-G-CCATCA-TACAT-TCC-TCTGA-T-G--TTA-C-CCAATG--CA-GCA-------------GTACTC----AC-------------------------------------TGGCACAGCG-TCTG--GC--AGTTTGCTGGGC-CTTGCTTCTT--GC-A-A-TTCTGAGA-ATCT-GCAGGTTTCGCTC-GCTG-GGA--GTA-C-GCTTGT--A-TTCTGCAAG----AGCATCG-CGCTTG---GCT-Tt
gi|8 : tATGGTT--GG--TTCTGCGT-TCA-----GTTCTTCTATGAT-T--G-CAAGCA---TTTGATCCGCG--TCAAGG-CTG-ATTGGGA--CACA---GTGTTCTC---CCTGGAGT------AGAGATTG--------------------T-GTTCAA-C----CCGTCTCTCCATCTGCT-GCCC-TTTGTT-GGTA-ATC----ACTTCCC-C-AGTG-GAGGAT--TTG------A-GAGG--CGC--CGTCTT-G-CTCTGGACTG-GTC---C-CA-GGCTTTCTTGAT-G-CCATCA-TACAT-TCC-TCTGA-T-G--TTA-C-CCAATG--CA-GCA-------------GTACTC----AC-------------------------------------TGGCACAGCG-TCTG--GC--AGTTTGCCTGGC-CTTGCTTCTT--GC-A-A-TTCTGAGA-ATCT-GCAGGTTTCGCTC-GCTG-GGA--GTA-C-GCTTGT--A-TTCTGCAAG----AGCATCG-CGCTTG---GCT-
gi|9 : CTTG---TCT-TCTACAT-CG-GGAGCCATCTC-TGTTG-AC----------TTGGC----T---TAATTCGAA-C-----CA----G-TT-GCATG-ACT--T---G--GTT-G-----TCTT---CCCA--AAA-G---TAGCCAACGCTGT-GCGATG----CATATATAATAT--A-GT--------GTCTCGC-CG-------AGCTTC---
gi|9 : cattaggtatacattatgtatcattaagta---TC---TTGC-CCGA------AGG--CTTC-A--------T-CAAACTG-CTCTACAA----G-GT--------CTG-------GCTG-G-GTCATC-CTG-CT---GA-----T-GTCAATACG-A-GGTT---------TTTCTTGGTTTGATGGAA-TTTC-TTTGGCCTGCA-TTCCT--GAT-TTTGCATACAA-TAC--AAGGAGTGG-TCATGCG-CCGcaatttttccgtcgcagagtcttcgcgggaactgaagttccaagttcttgcccgaaggcttcatcaaactgctctacaaggtctggctgggtcatcctgctgatgtcaatacgaggtttttcttggtttgatggaatttctttggcctgcattcctgattttgcatacaatacaaggagtggtcatgcgccg
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blockSeqs : . . . . C TG T T . C . . G . T T . . . A AAGGTA . . . . G . C . G . G . . . . C . . . T . TGT T . . . T . . G A . C . AGCGTCGGATGTGATCTAGTGTTGCAGCCAAGCCAAGT . . . T . . AAT ATC . G . . . G . . CT C . AT . A . . . AC TGTTGATTGGCTTAATT . . . . CTA A . . . G . . . . G . C . . . CG TT . . . . . . A . CAGT . GT . . . . . A A . . . G . . . . . . . . A C . . .
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blockSeqs : . . . . T A T A . T . . A . T A . . . T GAAA . . . . C . T . C . . . . . . G . . . G . ACA T . . . G . . G A . T . TCATTACTCACGGCCAC . . . C . . AAT ATC . G . . . C . . T A . AT . T . . . C GTTCGACTGCTAT . . . . GCA A . . . G . . . . G . G . . . AT CC . . . . . . . . GAT . G . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . A . T . . . . A G . . . . C . T . C . . . . . . C . . . G . CCA T . . . T . . A A . A . GCAGTACTCAC . . . . . . T . . . . . . C . . . A . G . G . . . . GATCAT . . . . GC A . . . G . . . . C . C . . . CG TC . . . . .
blockSeqs : . T . . . . A G . . . . C . . . . . . . . . . C . . . . . CCA . . . . T . . G A . A . GCAGTACTCAC . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . .
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blockSeqs : T .
blockSeqCons : ** ***** T*** ** *** *** GGGAA*************** **** C* C** CCA***** G*** A* ** AAT*** C** **** G*** CC TGTTGACTTGGCTAAT********************* ***** A* ** *** C************* NG******** AAGGT************ *** CCCTG**** A**
originalCons : TCTATGGTT--GG--TTCTGCGT-CCA-----GTTCTTCCATGAT-T--GGCAGGCA---TTCGATC-GCG--TCGAGGGCTG-ATCGGGA--CACA---GCGTTCTC---CCTGGAGT------AGAGATCGGGAT--A------------GT-GTTCAA-C----CCGTCTCTCCATCTGCT-GCCC-TTTGTC-GGTA-ATC----ACTTCCC-CCAGTG-GAGGAT--TTG------A-GAGG--CGC--CGTCTT-G-CTCTGGACTG-GTC---C-CA-GGCTTTCTTGAT-G-CCATCA-TACAT-TCC-TCTGA-T-G--TTA-C-CCANTG--CA-GCAGTCGTCT-G-A-TGTNCTC----GCTG-AG--C--C--G---------CCAGTA-T---CATTGGCACAGCG-TCTG--GC--AGTTTGCCGGGC-CTTGCTTCTT--GC-A-GCTTCTGAGA-ATNT-GCAGGTTTCGCTC-GCTG-GGA--GTA-C-GCTTGT--A-TTCCGCGAG----AGCGTCG-CGCTTG---GCT-TCTACGA-CG-GGAGCCATCTC-TGTTG-ACG---A-----TTGGC----T---T----CGAA-C-----CA----G-TC-GCATGAACT--T---G--GTT-G-----TCTT---CCC---AAA-G---TAGCCAACGCTGT-GCGATG----C---------AT--A-GT--------GTCTCGC-CG-------AGCTTC---TC---TTGC-CCGA------AGG--CTTC-A--------T-CAAACTG-CTCTACAA---AG-GT--------CTG-------GCTG-G-GTCATC-CTG-CT---GA-----T-GTCGATGCG-A-GGTT--CC-CTG-TTTCTTGGTTTGATGGAA-TTTC-TTTGG-CTGCA-TT-CT--GAT-TTTGCA-ACAA-TAC-NAAGGAGTGG-TC-CGCG-TCGCAGTCTGCACTGTGG-TAAGAGCG-TGCGTGGAG-ACGTTCNTGA----------TGG-GCGGNACGCCTGACCAGGATCAGA-TCC--AGTCGATGCCANTGCTTTGNAGCCATGGGTGTCCGCAGGAGACACTTGTGCTGNGGCTT
finalCons : TCTATGGTT--GG--TTCTGCGT-CCA-----GTTCTTCCATGATT---GGCAGGCA---TTCGATC-GCG--TCGAGGGCTG-ATCGGGA--CACA---GCGTTCTC---CCTGGAGT------AGAGATCGGGAA---------------GT-GTTCAA-C----CCGTCTCTCCATCTGCT-GCCC-TTTGTC-GGTA-ATC----ACTTCCC-CCAGTG-GAGGAT--TTG------A-GAGGC--GC--CGTCTT-G-CTCTGGACTG-GTCCCA-----GGCTTTCTTGAT-G-CCATCA-TACAT-TCC-TCTGA-TG---TTA-C-CCANTG--CA-GCAGTCGTCT-G-A-TGTNCTC----GCTG-AG--C--C--G---------CCAGTA-T---CATTGGCACAGCG-TCTG--GC--AGTTTGCCGGGC-CTTGCTTCTT--GCAAT---TCTGAGA-ATNT-GCAGGTTTCGCTC-GCTG-GGA--GTAC--GCTTGT--A-TTCCGCGAG----AGCGTCG-CGCTTGG---CT-TCTACGA-CG-GGAGCCATCTCTGTTGACTTGGCTAAT---------------------CGAA-C-----CA----G-TC-GCATGA-CT--T---G--GTT-G-----TCTT---CCC---AAA-G---TAGCCAACGCTGT-GCGATGC-------------AT--A-GT--------GTCTCGCNG--------AGCTTC---TC---TTGC-CCGA------AGG--CTTC-A--------T-CAAACTG-CTCTACAAAGGT------------CTG-------GCTG-G-GTCATC-CTG-CT---GA-----T-GTCGATGCG-A-GGTTCCCTG----TTTCTTGGTTTGATGGAA-TTTC-TTTGG-CTGCA-TT-CT--GAT-TTTGCA-ACA--TAC-NAAGGAGTGG-TC-CGCG-TCGCAGTCTGCACTGTGG-TAAGAGCG-TGCGTGGAG-ACGTTCNTGA----------TGG-GCGGNACGCCTGACCAGGATCAGA-TCC--AGTCGATGCCANTGCTTTGNAGCCATGGGTGTCCGCAGGAGACACTTGTGCTGNGGCTT
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gi|8 : tATGGTT--GG--TTCTGCGT-TCA-----GTTCTTCTATGAT-T--G-CAAGCA---TTTGATCCGCG--TCAAGG-CTG-ATTGGGA--CACA---GTGTTCTC---CCTGGAGT--AGAGAT-T-G------------------T-GTTCAA-C----CCGTCTCTCCATCTGCT-GCCC-TTTGTT-GGTA-ATC----ACTTCCC-C-AGTG-GAGGAT--TTG------A-GAGG--CGC--CGTCTT-G-CTCTGGACTG-GTC---C-CA-GG-CTTTCTTGAT-G-CCATCA-TACAT-TCC-TCTGA-T-G--TTA-C-CCAATG--CA-GCA------------GTACTC----AC----------------------------------TGGCACAGCG-TCTG--GC--AGTTTGCCTGGC-CTTGCT-TCTTGCAAT---TCTGAGA-ATCT-GCAGGTTTCGCTC-GCTG-GGA--GTA-C-GCTTGT--A-TTCTGCAAG----AGCATCG-CGCTTG---GCT-
gi|9 : CTTG---TCT-TCTACAT-CG-GGAGCCATCTC-TGTT-G----AC----------TTG--GC-TTAA-TTCGAA-C-CA----G-TT-GCATG-ACT---T---G--GTT-G-----TCTT---CCCA--AAA-G---TAGCCAACGCTGT-GCGATG----CATATATAATAT--A-GT--------GTCTCGC-CG-------AGCT-----TC---
gi|9 : cattaggtatacattatgtatcattaagta---TC---TTGC-CCGA------AGG--CTTC-A--------T-CAAACTG-CTCTACAA----G-GT--------CTG-------GCTG-G-GTCATC-CTG-CT---GA-----T-GTCAATACG-A-GGTT---------TTTCTTGGTTTGATGGAA-TTTC-TTTGGCCTGCA-TTCCT--GAT-TTTGCATACAATAC--A--AGGAGTGG-TCATGCG-CCGcaatttttccgtcgcagagtcttcgcgggaactgaagttccaagttcttgcccgaaggcttcatcaaactgctctacaaggtctggctgggtcatcctgctgatgtcaatacgaggtttttcttggtttgatggaatttctttggcctgcattcctgattttgcatacaatacaaggagtggtcatgcgccg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): GCTGGATCGGTCACGACGTTCTGCGTGGAGTTTAAGTAGAGCTCAAGGTAGTGCTCTATCCACC