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gi|16 : a-GA-T-GAA-GC------TTTGA-T----ATA--AAACATA---TGAAAA-TA-TT--AAA--------T-TAGATAATCG--A-CCT-CGTT------C--TTGA-G---ACA---TTTGG-T-G-ATTTTATCAGC-AC-TTTGCCC-A-GTC--TTTA------T--A-AAGCG-T---AA--A--AA--GTGATG----
gi|7 : -TT--AAG--------T-TAGATAATTG--A-CCT-CGCT------C--TTGA-G---AAA---TCCAG-T-A-ATTTTTACAGC-AC-TTTCCTC-A-TTC--TTTA------T--A-AGCCG-T---AG--A--AA--GTGACA----A--------A---AAAG-AA--GAGAGCAA-----TA-------------GC-------A--------T---------T-TCT-GTT-GTAA--A-GTGA----ATC-ATC---------A--AT-TGT------CGTATATGGT-GTG-AAACAA-CTTTT-----C-AT----------ATAA--TTGT-A-TA-T---TAC-G---CA-------TTAA--TTTCA---AGTTCAGC---AATCATTTT-AAG-CCTGTAACAGGAT--TACTT--CA--ACTAA---CCA-GCATT-AGGTA-T--TTACC-T--TGAAA-G----TG-----TG-----------CACAATAT---TT
gi|1 : tagagatttataggtcgtggctaaaaaactagccattgaatcttcttaatttttatgtatttttatgctgaaactttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TAGATACTCG--A-ACT-TACTGCTCTCC--TTGACG---AGAACTTCTTG-T-GTATTTTA-CAGCCAC-TTTCCCC-A-GTTCTTTTA------T--T-AAGTG-T---AAGAA--AA--GTGATG----AAGAGCCAAT---AAAG-AAAAGAGAGCAAATATACAT---A--AGATGATTTCTCTTAA--------TCTAA---CAT-TCT-ATT-GTAA--ACATGGGCATATCTATA---------AACCT-TCTACCACTCACA-ATAG--GTGTAAACAAACTGTT-----T-ATCATATTACTGATAA--TTTT-AATA-T---TAC-A---CA-------TTAAATTTCTA---AGTTCAGC---AAT-ATTTT-AAGGCCTGTA-CAGGA-----------A--GCC------CT-GCATT-AG-TATT--T-ACC-TGTTGAAA-CCAAGTTA----TGTCCCGTGGCTCCCCAATATGTTTTGCCAGCACACCGT-ACAGCAGACAATA--CGTT-GCTTAAG-CTGCCACCAAATTAATACCC-CAATCGATGAAATT--CTTAT-TTG-ATTTC-ATTTAAGTAG--CAATGTA-TCATCCATTGGATAAGCT---AAAGAGTTTTAGAGTTAAACAA-A---ATAGTTATGACAGACTCATATATA-TGTTGCGGCGTTTCGATA-TTGAATAACTAGTGTGCG-AAAT-TAATGGTGATCCATG-CCTACACGACACTCATTT---ACCGAGTA-AGTACA-CGTTTTCTAAAG-AAAGGGG---------GTAATTAAAAGAACGCCGAA----------------------AA---TCCT-CAA------AATATC-TGCTAGAAATTCGATTATTAC--C---TTTG-TATA-CCTAGATGTA-GAATTAGT-AAATA-TACATACAGA-TCAGCT-------ATGTATTTT-GA--T-GTGAT----TTT---T--A----GTC--TACTACTT-AATAATAATTGAT-CC--TGGGTGTG---TGCAC---TATAATA--T--G-ATC-AA----GAT---A-T-A-ACCCTTACT--A-TT-------ATTTG-CATC--------GTGG---AAC-TACTTACGAT----------ACTTAC-----A-----G--AT-GAA-GAG--TCC-TAAATC-A-T-TT-A-AA--AATTTA-C--ACAC-AAAAGTAAT---A-TTCACA
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gi|19 : ttC-A-GTC--TTTA------C--A-AAGAG-T---AA--A--CA--GTGATGAAA-A--------T---TAAG-AA--GATAACAA-----TATAC-A--AGAAGAGCT------A--------
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gi|9 : agattgattagggttgaggctataaaaaaaatgctaaccattgaaattttatggagatatttttatatatttttaagaaggaagtcttctttttcattctcaagtatacttgttatactttagtttgataatcgcgaccttcgttcttgagcataacggtggttttaacagcacttttcctctatgtctttaatgttttagaggcgtttcaaactaagtgacgagctaagcaagagctattaaaaagagtagcgcatgttgatctcatctttcattgtaagtgatctgtacgttgtattatggtgtgaaacaacttttcattaaacttgtcttatgtacaacttagattgtttcaacttcagggtctattttttaagccttaaaggatatttagggataagtcgttgcattaagctattaatcccctttgaaatttaacgttgcctcacaattttgtatcacgtcagcatcttggttaggtcccattggtggagactatatctaggttaatgaattctctactaccc-AACTAG----CG-AAAA-T--T--T--TCTAAC-ACTAC------CCCCTTTTAA-C--G--A-AGTACA-CGTTTTCTAAAGAAAAGGGGTAA------AT----------------AA----------------------AAGA-TCCT-TTA------AAAATCTTGCTA-AAATTCGA-T--TAT--CC--TTTGTTATG-CCT---TTTATAAATTAGCAAA-TA-TA-ATAC--A-TCAG-T-------ATGTA-TTTTGA--A-TT--T----TTT---A--------GC--TA-TACTT-AATTATAGTTGAC-CT--T-----TG---TGCAC---T----TA--T--A-ATC-GA----AGT---A-T-A-G--ATT--T--A-TC-------C--TG-CATCATTATTATGT-----AA--TACTT-C-AT----------ACTT-------A-----G--AT-G-A-AAG--TCC-T--
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|6 : atctAATCATTTT-AAG-CCTGTAACAGGAT--T-CTTTTCA--GCTAA---GCT-GCATT-AGCTATT--T-ACC-T--TGAAAA----TT----G-TG---CA--------CAGTAT---TTGC---------AT-ACATT-GACA-T-AC--GTTTGCTTTAG-CTGCAAAAAAATTA----CC-CA-TC----AAATTT-CTTAT-TTT-ATTTC-ATT-AA-GTAG--T----TA-T--TCCATTGG-TAAGCT--AA----TTTT---A-AG--AGAAA-AA-A---ATA------A-A---TCATA-----AT-G--GAGTTT-AATA-T-GAA-A-CTAG----CGAAA-T-T--T--T--TCTAAC-CCTAC----C-TCCTT-TTAA-CAA---AGTACA-CGTTTTCTAAAG-AAAAGGGGG----TA--AAA------------TCCT------------CA----------A---------AA------AATCTTGCTA-AAATTCGATA--TAT-T-----TTGTTATA-CCT---TTTATAAATTAGT-AAATA-TA-ATAC--A-TCAG-T--AT-----GTATTTTGA--TTT--T---------TTTTTAAA---AGC--TA-TACTT-AATTATAGTTGAC-CT--T-----TG---TGCAC---T----TA--T--A-ATC-AA----AGT---A-T-A-A--ATT--T--A-TC-------A--TG-CATC--------GT-----AA--TCCTT-C-AT----------ACTT-------A-----G--AT-G-A-GAG--TCC-T--CTCA-C-AT-A-AG--AATTTA-C--ACGC-A-AA---AAT---A-TTCACA
gi|7 : GGCTA----AAAAA--C-TAGCCAT-TGAATC--TTCTT-----A-ATTTTTATGTATTTTT-ATG-C-TG-AA-AC------TTTG
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gi|9 : a-AACTAG----CGAAA-A-T--T--T--TCTAAC-ACTAC----C-CCCTT-TTAA-CGA---AGTACA-CGTTTTCTAAAG-AAAAGGGGTAAA-TA--AAAGA----------TCCT------------TT----------A---------AA------AATCTTGCTA-AAATTCGAT---TAT-C--C-TTTGTTATG-CCT---TTTATAAATTAGC-AAATA-TA-ATAC--A-TCAG-T--AT-----GTATTTTGA--ATT--T---------TTT--------AGC--TA-TACTT-AATTATAGTTGAC-CT--T-----TG---TGCAC---T----TA--T--A-ATC-GA----AGT---A-T-A-G--ATT--T--A-TC-------C--TG-CATCATTATTATGT-----AA--TACTT-C-AT----------ACTT-------A-----G--AT-G-A-AAG--TCC-T--
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Unaligned ( gi|22 ): GGTAGAGATTGATAGGTTGAGGCTAAAAAACTA