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lowQualScore                  :                   1  1 444   22 2 33 1   3 1 1   222  00 0 1  888  1   222  33  2  33  555555  22  99999999   3 1  1   6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666  3 4444 22 77777777777 3333 22 22   444444  1 444 22  5555 444 444444   555555555555555555555555555555555 1 666 22 1 1 55555 222 1 22 22  1 22     1 555555555555555555555555555555555555 22   555 3  1 3333 3333 3333 6   666 444 3333 22 1 7777   88888  222 111111111111111111111  666 22 1 000 5555 99999999999    1   666   1 222 22222222222222  666666  55 1 99 1 44  44 3333  44   1   22 22 1  44 66   333     4     33  44 0000000 2 888888888  2  3  2    
lowQualScore                  :                   .  . ...   .. . .. .   . . .   ...  .. . .  ...  .   ...  ..  .  ..  ......  ..  ........   . .  .   .........................................................................  . .... .. ........... .... .. ..   ......  . ... ..  .... ... ......   ................................. . ... .. . . ..... ... . .. ..  . ..     . .................................... ..   ... .  . .... .... .... .   ... ... .... .. . ....   .....  ... .....................  ... .. . ... .... ...........    .   ...   . ... ..............  ......  .. . .. . ..  .. ....  ..   .   .. .. .  .. ..   ...     .     ..  .. ....... . .........  .  .  .    
lowQualScore                  :                   7  7 888   44 6 88 6   2 5 5   777  66 7 5  444  4   444  33  8  88  333333  00  55555555   0 5  5   5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555  5 3333 33 33333333333 7777 11 11   444444  6 666 33  0000 111 666666   333333333333333333333333333333333 6 000 22 6 6 66666 666 6 22 22  6 99     6 555555555555555555555555555555555555 33   444 1  5 3333 3333 3333 2   999 222 3333 11 5 9999   99999  777 444444444444444444444  333 11 6 000 0000 22222222222    6   000   6 999 88888888888888  000000  22 9 33 7 88  11 7777  00   7   55 55 8  33 44   555     7     44  99 4444444 9 666666666  9  1  8    
consensus                     :             GATTGA-TT-A---TTT--ATT--G-TTTTA-C-GTC---CC-NCTC-GA--GAA-TAT---TT--CA-CT--CA------TA--TG---G----AGA-C-GT-CAC---C-------A----T----TT-GC-C-G----G-----TG-AAG-------G-G----C----TGC-----AA-A--A-T--T-----------T-A--G--G--CCT------AT-G---C--TC----G-G-C------GCT---C----A---G--G----G-C-C--------T-T---T--G-A-G-----C-A-G-G--G--AG-G-GATCTT-T---------N-------------T----C-------G--TGC-C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----A--C-A----CGG--GG-CC---T---C-G---------G-----TT---T--T-T--CC----G-----------GTCT-CAT---CCG-A---A-N---G-A----C-CG----C-CC--C-A--T-T-CAG--T----CG-CCTC-TTA--C--G-AC--A-CGCA---AGGGG-ATGCT--GGG-G--G----C-C---------TA-TT-CTAACCC
Reference ( gi|7 )            :             GATTGA-TT-A---TTT--ACT--G-TTTTA-C-GTC---CC-CCTC-GA--TAA-TAT---TT--CA-CT--CA------TA--TG---G----AGA-C-GT-CAC---C-------A----T----TT-GC-C-G----G-----TG-CAG-------G-G----C----AGC-----AA-A--A-T--T-----------T-A--G--G--CCT------AT-G---C--TC----G-G-C------ACT---C----A---G--G----G-C-C--------T-T---T--G-A-G-----C-A-G-G--G--AG-G-GATCTT-T---------T-------------T----C-------G--TGC-C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----A--C-A----CGG--GG-CC---T---C-G---------G-----TT---T--T-T--CC----G-----------GTCT-CAT---CCG-A---A-T---G-A----C-CG----C-CC--C-A--T-T-CAG--T----CG-CCTC-TTA--C--G-AC--A-CGCA---AGGGG-ATGCT--GGA-G--G----C-C---------TA-TT-CTGACCC
gi|12                         :             GATTGA-TT-A---TTT--ATT--G-TTT-A-C-GTC---CCACCGC-GA----A-TAT---TT--CA-CT--CA------TA--TG---G----AGA-C-GT-CAC---C-------A----A----T--GC-C-G----G-----TG-AAG-------G-G----C----TGC-----AA-A--A-T--T-------------A--G--G--CCT------AT-G---A--TC----G-G-C------ACT---C----A---A--G----G-C-C--------T-T---T--------------------------------CTT-T---------A-------------T----G-------G--TGC-C-A-CA-C----T----T----G-CTG---T---G----A----A----CGG--A--CC---T---C-G---------G-----TT---T--T-T--CC----G-----------GTCT-CAT---CCG-A---T-G---G-A----C-CG----C-CC--C-A--T-T-CAG--T----CG-CCTC-TTA--CGAG-AC--A-CGCA---AGGGG-ATGCT--GAG-G--A----C-A---------TA-TT-CTAACCC
gi|14                         :             GATTGA-TT-A---TTT--ATT--G-TTTTA-C-GTC---CC-ACTC-CA--GAA-TAT---TT--CA-CT--CA------TT--TG---A----A--------------------------------------------------------G-------G-G----C----TGT-----AA-A--T-T--T-----------T----G--G--CCT------GT-G---C--TC----G-A-C------ACC---C----A---G--T----G-C-C--------T-T---T--G-A-G-----C-A-G-T--G--AG-G-G----------------------------------------------TG----A-CA-C----C----T----G-CTGC--T---G----A--C-A----CGG--A--CC---T---C-G---------G-----TT---T--T-T--CC----G-----------GTTC-CAC---TCG-A---A-T---T-A----C-C-----T-CC--C-A--T-T-TAG--T----CG-CTCT-TTA--C--G-AC--A-CGCA---AGGGA-ATGCT--GGA-G--G----g
gi|31                         :            tGGTTGG-TT-G---TAT--ATT--G-TTTAA-C-GTC---CC-TCTC-AA--GAA-TAT---GC--CA-TT--CA------TA--TG---G----AGG-T-AT-CAC---C-------A----------T-GC------------------------------------------------A-A--A-T--T-----------T-A--G--G--CCT------TT-G---C--TC----G-G-C------GCggacattattc
gi|1                          :             GATTGA-T--A---TTT--ACT--G-TTTTA-C-GTC---CC-GGCC-GAG-TAACTCT---TT--CA-CTTGCAGTTGTTTA--TG---G----AGA-T-CT-CACT--C-------A----A----TA-CCTC-A----G-----TA-GAG-------T-G---------ATCGTGTGAA-A--ATT--T-----------T-A--G--GGACCT------TT-G---CTTTC----GTG-C------ACT---C----A---A--GTCGCG-C-CGTTTTACAT-T---T--G-A-------C-A-G-A--G--AT-G-GATCTT-A---------TGTGAGGGAATAAAT----CCCCGCATG--TGC-C-A-CG-C----C----TTGACA-CTGATAT---G----AACT-A----CGGCAGG-CC---C---T-GCATA-----GACGATTT---T--T-T--CC----GAAAAAATGTTTGTCTGCATA--CCG-ATACA-T---G-A----C-CG----C-CC--C-AATC-T-CAGC-T----CG--CTC-TT---C--G-AC--A-
gi|28                         :       tgaatgGATTGAATT-A---TT---ATT--G-TT--A-C-GTC---CA-CCTT-AA----A-TAT---TT--CA-CT--CAC-----TA--TG---------AA-C-GT-CAC---C-------A------------AC-C-G----A-----TG-AAG-------C-T----C-------------A-A--A-T--T-----------T-A--G--C--CCT------AT-
gi|19                         : aattgaactttgGATTGA-TT-A---TTTTGATT--G-TTTTA-C-GTCACTCC-ACCC-GAGACAT-TATGAGTTA-CATCT--CA------TA--TG---G----AGATC-TC-CAC---CGCTCGAGA----T----AT-GC-CTA----G-----TG-AAA-------T-G----C----GGCTGCA-AA-A--A-T--TCTAAGCGCTGAT-A--A--G--CCTCGCGAAAT-GACAC--TT----C-A-C------ACTGTAC----A---C--G----G-C-CCT------T-C---T--G-A-G-----C-A-G-GGAG--AG-G-AATATT-T---------T-------------T----ct
gi|47                         :             GGTTGG-TT-G---TAT--ATT--G-TTTTA-C-GTC---CC-TTTT-GA--ttt
gi|5                          :            ttATTGA-TT-AATTTTT--ACT--G-TTT-A-C-GTC---CC-ACTC-GA--GAA-TAT---TT--CA-CT--CA------TA--TG---G----AGG-C-GT-CAC---C-------A----T----TT-GC-C-G----G-----TG-AAG-------G-G----C----TGC-----AA-A--A-T--T-----------T-A--G--G--CCTC-----AT-G---C--TC----G-G-C------ACT---C----A---G--G----G-C-C--------T-T---T--G-A-G-----C-A-G-G--G--AGCG-GATCCT-T---------T-------------T----C-------G--TGC-C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----A--C-AC---CGG--GA-CC---T---C-G---------G-----TT---T--T-T--TC----G-----------GTCT-CA----CCGTA---A-T---G-A----CTCG----C-CC--C-A--T-T-CAG--T----CG--CTC-TTA--C--G-AC--G-C-CA---A-GGG-ATGCT--GGA-G--G----C-C---------TA-TT-CTAACCC
gi|3                          :              ATTGA-TC-A---TTT--ACT----TTTTA-C-TTC---CC-ACTC-GA--GAA-TAT---GT--CA-CTGTCA------GA--TGTAAGC---AGATC-GT-CAC---C-------A----TCGCCTC-ACTC-GAGTTG-----TG-AAG-------G-ATTCTC----A-C-----AA-ATTA-T--T-----------TTA--T--G--TCT------AT-G---C--TCTCTCG-G-CTACAACACTT--C----ATGTG--A----G-A-C--------T-TGGTT--G-A-G-----CTA-G-G--G--AG-G---TCTT-T---------T-------------T----T-------G--GGT-C-A-CA-C----CGGCTT----G-TTG---T--------A--C-A----CGG--A--CC---T---C-G---------G-----TT---T--T-T--CCT---G-----------GTCT-CAT---CCG-A---A-T---GGA----C-CG----C-CC--CCA--T-TGCAG--T----CG-CC-C-TTA--C--ACAC--A-CGCA---AGGGG-ATACT--GAG-G--A----C-C---------AG-TT-CTgggacccc
gi|29                         :            gaATTGA-TT-A---TTT--CTT--G-TTTTA-C-GGC---CC-ACTC-GA--GAA-TAT---TT--CA-TT--CG------TA--TA---G----AGA-C-GT-CAC---C-------A---------TT-AC-C-G----G-----TG-AAGGGTGAAAG-G----C----TGC-----AA-A--A-T--G-----------T-A--G--G--t
gi|36                         :              ATTGA-TT-A---TTT--ATT--G-TTTTA-C-GTC---CC-AC-C-GA--GAA-TAT---TT--TG-CT--CA------TA--TG---G----AGA-C-GT-TGC---C-------C----C----TT-GT-T-G----G-----T
gi|35                         :              ATTGA-TT-A---TTT--ATT--G-TTTTA-C-GTC---CC-AC-C-GA--GAA-TAT---TT--TG-CT--CA------TA--TG---G----AGA-C-GT-TGC---C-------C----C----TT-GT-T-G----G-----Tca
gi|13                         :               TTGA-TT-A---TTT--ATT--G-TTTTC-C-GTC---CA-C-TC-GG--AGA-TAT---TT--CA-CT--AA------T--------G----AGA-A-GG-TAC---C-----------------TT-GC-C-G----G-----TG--AG-------G-G----C----TGC-----AA-A----T--T-----------T-A--G--T--CCT------AT-G---C--TC----G-G-C------A-T---C----A---G--G--------C--------T-T---T--G---G-----C-A-G-G--A-----G-GAT--T-T---------T-------------T----C-------G--AGC-A-A-CA-C---------T----G-CTG---T---G----A--C-A----CAA--GA-C----T---C-G---------T-----TT---T--T-T--TC----G-----------GTCT-CAT---CCG-A---A-T---G-A----C-CG------CC--C-A--TAT-CAG--T----CG-CCT--TTA--C--G-AC------CA-----GGA-ATGCT--GGca
gi|22                         :            ttgTTTA-TT-A---TTC--ACTTTG-TTTAG-C-GTC---CA-CC---GA--AAG-TA-----------CT--C------------G---G----AGA-CCGT-CACAAAC-------A----A----T--GC-C-T----G-----TG--AG-------G-A----T----GGCTG---AC-A--A-T--T-----------T-ATTGATG--CCTT-----AT-G------TC----G-G-C------ACC---------------G----G---------------------G-A-G-----C-A-G-G--G--AG-G-GACTAT-T---------TAC-----------T----C-------GATTGC-C-A-CA-C----C---------G-CTT---T---G----A--C-A----CGG--G---T---T---C-A---------A-----TT---T--T-T---------------------TCC-CAT---CTG-gactgtctaac
gi|43                         :        ttgatgtTTGG-TT-G---TAT--ATT--G-TTGCA-C-GTC---CC-TTTT-GA--GAA-TAG---TT--CA-CT--CA------T
gi|38                         :              gTTGA-TT-G---TAT--ATT--G-TTTGA-C--TC---CG-CTTT-AG--AGA-TTT---TT--CA-CT--C--------A--TG---G----AGA-C-
gi|6                          :                TGG-TT-G---TAT--ATC--G-TTTAA-C-GAC---CC-ACTC-CA--GAT-TAT---TT--CA-CT--CA------TA--TG---G----AGG-C-GT-CAC---C-------G----T----T--GC-C-G----G-----TA-AAG-------G-T----C----TGC-----AA-A--G-T--T-----------T-A--G--G--CCC------AT-G---C--TC----G-G-C------ACT---T----A---A--G----G-C-T--------T-T---T--G-T-G-----C-A-G-G--G--AA-T-GGTCTT-TAATCACTCTT-------------TATAAC-------G--TGG-C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----A--C-A----CGG--GG-CC---T---T-G---------G-----TT---T--T-G--GC----G-----------GTAT-CAT---CCG-A---A-G---G-A----------------------------------------CCTC-TTA--C--G-AC--A-CACA---AAGTG-ATGCT--GGG-G--A----C-CTACATAATGTA-TT-CTAACCCacatcttcccatt
gi|18                         :                TGA-TTGA---TAT--ACT--G-TTTTAAT-ATC---CC-ACTT-GA---GA-TTT---TT--CA-CC--CA------TA--TG--------AGA-C-GT-C-C---C-------A----T----T--GT-C-G----G-----TA-AAA-------AAG----CT---GGC-----AA-A--A-T--T-----------T-A--A-----CTT------AG-G---C--TT----G-T-T------GCT---T----A---C--G----G-C-C--------T-T---TTTG-A-G-----C-A-G-A--A--AG-A-TATCTT-T---------A-------------T----T-------T--TGC-C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----A--C-A----TGG--GA-CC---T---C-GTTTTATATGG-----TT---C--TAT--CCCGGGG-----------GTCT-CAT----CG-A---A-G---G-A----C-Cggacc
gi|11                         :                TGA-TT-A---TT--------G-CTTTC-C-GTC---CA-C-TG-GG--GAG-TAT---TT---G-CT--CA-------A--TGTC-G-----GA-C-GT-CAC---G------------------T-GC-C-G----G------G--AA-------G-G----C----TGT-----AACA--A-T--T-----------T----G--G--CAT------AA-G---C--TC----G---C-------CT---C--------G--G----T-C-C--------TGTG--T--G-A-G-----C---G-A--A--AG-A-GATCTT-A---------A-------------T------------G--TGC-G-A-C-------C----T----G-C-G---T---G----A--C-AA---CGA------C---T-----G---------A-----TT---T--------C----G-----------GTC--CAT---TCG-A-----T-----A----C-TG----C-CCATC----T-T-GGG--T----CG-ACGC-TTA--C--G-AC--A--GCA----GGGG-ATGAT--GGG-G--G----TGC---------CA-TTGCTGAACC
gi|15                         :    tggttgaattcaTGA-TT-G---TAT--ATT--GGTTTTA-CCATC---TCATCTC-GG--CGA-------------------A------T---TGA--G----AGA---GT-CAC-----------A----T----T--GA-C-G----G-----TG--AG-------G-A----A----TGC-----AC-A--A-T--T-------------A--G--A--C--------GT-G---C--TC----G-G-T------GCT---TTAT-A---G--G----C-C-A--------T-T---T--G-A-G------------------A-G-GAT--T-T---------A-------------T----C-------G--TGTAC-A-CA-C----G----T------CTG---T---G----A----------GG--GG-T----T---C-G---------G-----TA---T--T-A--TT----A-----------GTAC-TAT---CC--A---A-G---G-A----C-GG----C-CA--A-G--T-T-AAG--T-----G-T-TC-TTA--C--G-AC--A-gacccacg
gi|42                         :                TGA-TT-G---TAT--GTT--A-TTTAA-T-GCC---CC-TTAC-AA--GAA-TAT---TT--CA-CT--CA------TA--Taaagcaggttatctaattc
gi|4                          :                cGA-TT-AA--TTT----T--G-TTGAA-C-TTC---CC-ACAC-GA--GAA-TGT---TT--CA-AT--CA------TA--TG---G----A-A-C-GTATGC---A-------A----T----C------------G-----TGATAT-------G-G----C----TGC-----AA-A--A-TATT-----------T-AA-G--G--CCT------AT-G---C--TC----GCG-C------ACTG--C----A---GT-G----G-A-A--------C-T---T--G-A-G-----C-----G--G--AG-G--ATCTA-C---------T------------------C-------G--TGCTC-A-CA-C----C----T----GTCTG---T---G----A--C-A----CGT--TG-CC---T---CAG---------G-----TT---TACT-T---------------------TAT-TAT----CG-A---A-TTCAA-A----C-CGT---C-TC--C-AT-T-T-CAG--T----CG-CCTCATTAGTC--G-AC--ACCGCC---AGGGGAATG-T--GGA-T--GAACAC-C---------TA-TT-
gi|8                          :                 tg-TT-G---TTT--ACTA-G-TTTTA-T-ATT---AT-ACTT-----TAA-CAT---CC--CG-CT--CA------AAAGTG---G----AAA-C-GT-CAC---C-------A----T----T--GC-C-G----G-----AG-AAG-------G-A----C----TGC-----A-----------------------------------T------AT--------TC----G-G-C------GCT---TTAATA---T--GC---G-C-C--------T-T---T--G-A-G-----C-A-GTG--G--AG-G-GATCTT-T---------CGA-----------T----T-------G--TGC-C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---A----A--C-ATTTACGG--GG-CT---T---T-G---------A-----TT---T--T-T--GC----G-----------GTCT-CTT---CCA-A---A-G---G-ACACCC-CA----C-CCCTC-A--T-T-TAG--T----CG-CCTC-CCA--C--A-AC--A-AGTATTGAGGGtctacgctgacatc
gi|10                         :                                  T--G-TTTAA-T-GTT---CC-ACTC-GA--GAA-TAT---TA--TA-CT--CA------TA--CG---G----AGA-C-AT-TAC---C-------A----T----T--GT-C-G----G-----TG--AG-------GTG----T----TAC-----AA-A--A-T--T-----------T-A--G--G--CCT------AT-G---A--TC----G-G-C------GCT---G----A---T--G----G-C-C--------T-T---T--G-A-G-----C-A-A-G--A--AG-G-GATCTT-T---------A-------------T----C-------G--TGC-A-A-CA-CATATC----T----G-TTG---T---G----A--C-A----CGG--AG-CC---T---C-A---------A-----TG---T--G-T--GC----G-----------GTCT-CAT---CTA-A---A-G---G-A----C-TG----T-TC--C-A--T-T-TAacttttgtaaaccgatcccc
gi|23                         :                      ttgattgcaagtT--A-TTTTG-C-ATC---CC-ATTCTAA--AAA-T-T---TT--CA-CT--CA------TG---G---G----AAA-A-AT-CAC---C-------A----G----CT-TT-T-G----G-----TG-AAG-------T-T----C----CCC-----AA-A----T--T-----------T-A--G--A--TCC------AT-G---C--TT----G-G-C------ACT---T----G---T--G----G-C----------------T--GTA-G-----C-T-G-T--G--GG-A-ATTCTT-A---------C-------------T----T-------G--TGC-CAA-TG-C----C----T----G--TG---T---G----A--C-A----TGG--GA-CC---T---C-T---------G-----TT---T--tacacttagacgcttcgtactgagaacctattctaatttg
gi|30                         :                                         tTA-C-ATT---CC-ATTC-GA--TAA-T-T---TT--CA-CT---G------TA--TA---GCTCTAAA-C-GT-TAC---C-------AGCGGT----TT----T-G----G-----TG-AAGT------G-G----C------C-----AA-A--A-T--T-----------T----G--A--TCT------GT-G---
gi|16                         :                                                      tattgttaaaaaAA-T-T---CT--CA-CT--C-------TG--TG---T----AGA-C-GT-CAC---C-------A----------T-GC-C-G----GTTATTTG-TAGC------C-G----C----TGT------A-A--A-T--T-----------T-A-----G--CCT------TTGG---A--TC----G-G-T------GC----C----G---GATG----G---C--------T-T---T--G-A-GC----C-A-G-A--G--TA-G-GAT-GT-T---------A-------------T----C-------A--TGT-A-A-CA-----------T----T-CTGAATT---G----A--C-AT---TGG--GG-TC---T---T-C---------G-----TT---T--T-TTCCC----G-----------GTCC-CAT---CCA-T---A-G---A-A----C-CG----CACC--C-AT-T-T-TAG--T----CG-CCT--TTA--C--A-ACCAA-TGCG---AGGG
gi|20                         :                                                                ggAA-TAT---T---CA-CT--C-------TA--TT---GT---AGA-C-GT-CAC-----------A----T----CC-AC-C-A----------TC-TAA-------G-TAT--C----TTC-----AAGA--A-C--T-----------T-C--A--G--CCTTATA--AT-G---C---C----G----------ACT--------A---G--G----G-C-C--------T-T---C--G-A-GGCATGC-A-A-G--G--GG-C-GATCTTTT---------T-------------T----C-------G--TGC-T-G-CATC----C----T----GACTG---TG--G----A--C-A----CGG--GGCCC---T---CGG---------G-----TTTG-T--T-C--CC----G-----------GGCT-CCT---TCG-A---A-tac
gi|2                          :                                                            gtcgaagA-TAT---T---CATCT--CA------TA--TGA--G----AGA-C-GT-CAC---C-------A----T----TTTGC-C-G----G-----TG-AAG-------G-G----CCTACAAC-----AA-A----T--T-----------T-A--G--G--CCG------AA-T---C--TC----G-TTC------ACT---C----A---G--G----G-C-C--------T-T---T--G-A-G-----C-A-G-G-----AG-G-GATCTT-T---------T-------------TT---C-------G--TGC-C-ATCA-C----C----T----GGCTG---TCTGA----A--C-A----CGGC-GG-CC---TG--C-G---------G-----TT---T--T-TACCC----G-----------GT-T-CATG--CCG-A---ACT---G-A----C-CG----CACC--C-A--T-T-CAG--T----CGTCCTA-TTA--C--G-AC--A-CGCA---AGGGG-ATGCT--GGA-A--G----C-C---------TATTT-CTAACCCcagaaccg
gi|9                          :                   gtgtgtgaaaaacggcttaacaatggtcatgtaacactcggagaattag-TAT---TTTCCA-CT--CA------TA--TG---A----GGA-C-GT--AC---C-------T----A----TT-GC-C-G----G-----Tgacccgcc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                             tccaaattact-T--T-----------T-A--G--G--CCTG-----GT-G---C--TCG---G-G-C------GCT---C----A---T--G----G-TGT--------T-T---T--G-A-G-----C-GTG-G--G--AA-GCGATTCT-TGTTA-----T-------------T----A-------G--CGC-CAA-CT-C----C----T----GCCTG---T---AGTATA--T-A----CTA--GG-TCCTTT---C-G---------T-----TT---T--T-G--GC----GA----------GTCT-CAtgtttgtgcatttttgaaaatttagatagcctgtatctcagagcgagggatgtgcgccactatctgaggcgtttatggtttttgaagcagggatctgttctggacacgggacggttgtttgcggtctcgagccccattgtagtaaggtcttacaaagaacaaggggtatactgagggctacatgtattataacccgatcctc
gi|17                         :                                                                                                                                                                           caccattgtggtgtgaagcgcgctgtgagaaatt-----------T-A--G--G--CCT------GT-G---C--TC----G-G-C------ACT---C----A---T--G----G-C-C--------T-T---A--G-A-A-----C-A-A-G--G--AG-G-TATCTT-T---------A-------------T----C-------G--TGC-A-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----T--C-A----CGG--GG-CC---T---A-A---------G-----CT---T--T-T--CC----G-----------GTCT-CAT---CCA-A---A-G---G-A----C-CA----C-CC--C-A--T-T-CAG--T----CG-CCTC-TTA--A--G-AC--A-AGCA---AGGGG--TACTGAGGACG--G----C-C---------TA-TT-CTcatcaagtaacagagcgcggtctccatttag
gi|24                         :                                                                                                                                                                             gagggatttttatcgtgccacacctgctgtga-----------T-A--G--G--CCTT-----AT-GA--C--TC----G---C------AC----C----A---G--G----GAC-C--------T-TA--T--G-C-G-----C-A-A-G--GCGAG-G-GATCTT-T---------TGAA----------T----C-------G--TGC-C-AACA-C----C----T----G-C-G---T---G----A--CCA----CGG--GG-CC---TGATC-G---------GG----TTGGGT--T-T--GC----G-----------GTCT-CATCCACCG-A---A-T---G-ATTACC-CG----C-CC--C-AT-T-T-CAAGCT----CG-CCTC-atcctggatcct
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                    --TC----G-G--------GCT---C----A---G--G--------C--------C-T---T--G-A-G-------A-G-A--G--AT-G-GAATTT-T---------A-------------T----C-------G--TGC---A-CA-C----C----T----G-CTG---T--------A--C-A----CGG------C---T---A-G---------G-----TT---T--T-T--GC----G-----------GT-T-CAT---CCG-A---A-----G----------------CC--C-A--T-T-ACG--T----CG--CTC-TTA--C--G-ACA-A-AGCA---AGGGG-
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                        ----G-G-C------GTT---T----A---T--G----G-T-T--------T-T---T--G-AAG-----C-A-G-G--G--A------TCTG-T---------T---------------------------------------------------------CTG-------G----A--C-A----CGG--GA-C----------G---------G-----TTG--T--T-T--GC----G-----------GTCT-C-------------------G-A-------G----C-CC--C-A--T-TGTAG--T----AA-GGTC-TTA--C--A-AA--G-AACA---AGGGGTATACT--GAG-G--G----C-TACATG----TA-TT-ATAACCCtctgaggatatttgcgggtcttcac
gi|25                         :                                                                                                                                                                    tccaaattacttattttccactcatatgaggacgtacctattgccggttgtttgtgcatttttgaaaatttagatagcctgtatctcagagcgagggatgtgcgccactatctga--G----G-C-C--------T-T---T--G-A-G--------------G--AA-G--ATCTA-T---------G-------------T---------------TGC-C-A-CA-C----G---------G-CTG---T---G----A--C-A----CAA--A---C---T---C------------------T---T--T-T--TC----G-----------GTCT-CA-----CG-A---AGT---C-C----T-CA----C-CC--C-A--T-T-TA---T----TG---TT-CTA--C--G-A-------CA---AGG----TGCT---GA-GTAG----C-C---------TA-gatcctc
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctccggtaatttat-C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----A--C-A----CGA--AA-CC---T---C-G---------T-----TT---T--C-T--AC----G-----------GTCT-CAT---CTG-A---A-caaccggtccccacggat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttataacgat-C-A-CA-C----C----T----T-GTG---T---G----A--C-A-----AG--GG-CT---T---C-G---------G-----TT---T--T-T--CC----G-----------GTCT-C-C---CCG-A---A-G---G-A------CGATAAC-TA--T-G--T-T-TAG--TACACCA-CTTC-TTA--T--A-AT--A-CTCA---AAGGgggaccca
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AT---CCG-A---A-G---G-A----T-CG----C-CC--C-AA-T-T-TAG--T----CG-CCTT-TCA--C--A-AC--A-AGC----AGGGG-TTACT--GAG-G--A----C-C---------TA-TT-CTAACCCagacaatgggcaacatttctaa
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --T-T-TAG--T----CG-CCTC-TTA--C--G-AC--A-AACA---AGGGG-TTACT--AG--G--A----C-C---------TA-TT-CTAACCCggacc
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --T-T-TAG--T----CG-TCTC-TTA--C--G-GC--A-CGCA---A-GGG-ATGCT--AGG-G--GTAA-C-T---------TA-TT-CCAACCgggtcc
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              t--T----CG-CCTC-TTA--C--G-AC--A-AGCA---AGGGA-ATGTT--AGG-G--A----C-T---------TA-TT-CTGACCC

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Unaligned ( gi|33 ): TGCTTGTATTTCGTTTAATGTCCTGCAAAAAATGTTTCCTTTCATTTGGAGTCGTCACTATTGTCAGTGAGAGGACTGCAAA
Unaligned ( gi|44 ): TTGGTTGTATAATGTTTAACGTCCCACTCAAGAATTTTT
Unaligned ( gi|45 ): TGAATGATTATTTGTTTGTTTTACGTTCCACCGAGAAT
Unaligned ( gi|46 ): AGGTAAAGTGGCCCATATTTTGACCTTTGCATGGCACT
Unaligned ( gi|48 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACAATTAGGAG

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consensus                     :                              GATTGA--TT-A---T--TT--A--TT-G-TTTTA-C-GTC---CCA-CTC-G-A-G-A-A-T---AT---TT--CA-CT--C-A------TA--TG---G-AGA-C-GT-CAC---C-------AT----T-T-GC-C-G----GTGA-----AG-------G-G--C----T---G-C-AA--A--AT--T-----------T--A--G--G--CCT------A-T-G---C--TC----G-G-C------GC-T---C---A----G--G----G-C-C--------T-T---T--G-A-G-----C-A-G-G--G--AG-G-GA-TCT-T---------------T--N-----------T--C-----G--TGC-C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----A--C----A-CGG--GG-CC---T---C---------G----G-----TT---T--T-T--CC----G-----------GTCT-CAT---CCG-A---A---G-G-A----C-CG----C-CC--C-A--T-T-CAG--T----CG-CCTC-TTA--C--G-AC--A---CGC-A---AGGGG-ATGCTGGG---GG----C-C---------TA-TT-CT-AACCC
Reference ( family-57 )       :                              GATTGA--TT-A---T--TT--A--TT-G-TTTTA-C-GTC---CCN-CTC-G-A-G-A-A-T---AT---TT--CA-CT--C-A------TA--TG---G-AGA-C-GT-CAC---C-------AT----T-T-GC-C-G----GTGA-----AG-------G-G--C----T---G-C-AA--A--AT--T-----------T--A--G--G--CCT------A-T-G---C--TC----G-G-C------GC-T---C---A----G--G----G-C-C--------T-T---T--G-A-G-----C-A-G-G--G--AG-G-GA-TCT-T---------------T--N-----------T--C-----G--TGC-C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----A--C----A-CGG--GG-CC---T---C---------G----G-----TT---T--T-T--CC----G-----------GTCT-CAT---CCG-A---A---N-G-A----C-CG----C-CC--C-A--T-T-CAG--T----CG-CCTC-TTA--C--G-AC--A---CGC-A---AGGGG-ATGCTGGG---GG----C-C---------TA-TT-CT-AACCC
gi|1                          :                              GATTGA--T--A---T--TT--A--CT-G-TTTTA-C-GTC---CCG-GCC-G-A-GTA-ACT---CT---TT--CA-CTTGC-AGTTGTTTA--TG---G-AGA-T-CT-CACT--C-------AA----T-A-CCTC-A----GTAG-----AG-------T-GATCGTG-T---G-A-AA--A--TT--T-----------T--A--G--GGACCT------T-T-G---CTTTC----GTG-C------AC-T---C---A----A--GTCGCG-C-CGTTTTACAT-T---T--G-A-------C-A-G-A--G--AT-G-GA-TCT-TATGTGAGGGAATAAAT--C-----------C--CCGCATG--TGC-C-A-CG-C----C----TTGACA-CTGATAT---G----AACT----A-CGGCAGG-CC---C---T---------GCATAGACGATTT---T--T-T--CC----GAAAAAATGTTTGTCTGCATA--CCG-ATACA---T-G-A----C-CG----C-CC--C-AATC-T-CAGC-T----CG--CTC-TT---C--G-AC--A---
gi|10                         :                          tgaatgTTGA--TT-G---C--AA--G--TT-G-TTTAA-T-GTT---CCA-CTC-G-A-G-A-A-T---AT---TA--TA-CT--C-A------TA--CG---G-AGA-C-AT-TAC---C-------AT----T---GT-C-G----GTGA-----GG-------T-G--T----T---A-C-AA--A--AT--T-----------T--A--G--G--CCT------A-T-G---A--TC----G-G-C------GC-T---G---A----T--G----G-C-C--------T-T---T--G-A-G-----C-A-A-G--A--AG-G-GA-TCT-T---------------T--A-----------T--C-----G--TGC-A-A-CA-CATATC----T----G-TTG---T---G----A--C----A-CGG--AG-CC---T---C---------A----A-----TG---T--G-T--GC----G-----------GTCT-CAT---CTA-A---A---G-G-A----C-TG----T-TC--C-A--T-T-TAT--A----CA----C-TTA-----G-AC--GCTTCG-------------TACTGAG---AA----C-C---------TA-TT-CT-AA
gi|11                         :                              GGTTGAATTC-A---TGATT--A--TT-G-CTTTC-C-GTC---C-A-CTG-G-G-G-A-G-T---AT---TT---G-CT--C-A-------A--TGTC-G--GA-C-GT-CAC---G---------------T-GC-C-G----G-GA-----AG-------G----C----T---G-T-AAC-A--AT--T-----------T-----G--G--CAT------A-A-G---C--TC----G---C-------C-T---C--------G--G----T-C-C--------TGTG--T--G-A-G-----C---G-A--A--AG-A-GA-TCT-T---------------A--A-----------T--------G--TGC-G-A-C-------C----T----G-C-G---T---G----A--C----AACGA------C---T-------------G----A-----TT---T--------C----G-----------GTC--CAT---TCG-A---------T-A----C-TG----C-CCATC----T-T-GGG--T----CG-ACGC-TTA--C--G-AC--A----GC-A----GGGG-ATGATGGG---GG----TGC---------CA-TTGCTGAACCtttg
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gi|14                         :                           ttgGATTGA--TT-A---T--TT--A--TT-G-TTTTA-C-GTC---CCA-CTC-C-A-G-A-A-T---AT---TT--CA-CT--C-A------T-----------------------------------------T------------TGA-----AG-------G-G--C----T---G-T-AA--A--TT--T-----------T-----G--G--CCT------G-T-G---C--TC----G-A-C------AC-C---C---A----G--T----G-C-C--------T-T---T--G-A-G-----C-A-G-T--G--AG-G-G-------------------------------------------------TG----A-CA-C----C----T----G-CTGC--T---G----A--C----A-CGG--A--CC---T---C---------G----G-----TT---T--T-T--CC----G-----------GTTC-CAC---TCG-A---A---T-T-A----C-C-----T-CC--C-A--T-T-TAG--T----CG-CTCT-TTA--C--G-AC--A---CGC-A---AGGGA-ATGCTGGA---GG----
gi|15                         :                                tTGA--TT-G---T--AT--A--TT-GGTTTTA-CCATC---TCATCTC-G-GCG-A-A-T--------------------------------TGA--G-AGA---GT-CAC-----------AT----T---GA-C-G----GTGA------G-------G-A--A----T---G-C-AC--A--AT--T--------------A--G--A--C--------G-T-G---C--TC----G-G-T------GC-T---TTATA----G--G----C-C-A--------T-T---T--G-A-G------------------A-G-GA-T---T---------------T--A-----------T--C-----G--TGTAC-A-CA-C----G----T------CTG---T---G----A----------GG--GG-T----T---C---------G----G-----TA---T--T-A--TT----A-----------GTAC-TAT---CC--A---A---G-G-A----C-GG----C-CA--A-G--T-T-AAG--T-----G-T-TC-TTA--C--G-AC--A---ggacattattc
gi|16                         :                                                                                     -G-A-A-T----T---CT--CA-CT--C--------TG--TG---T-AGA-C-GT-CAC---C-------A-------T-GC-C-G----GTTATTTGTAGC------C-G--C----T---G-T--A--A--AT--T-----------T--A-----G--CCT------T-TGG---A--TC----G-G-T------GC-----C---G----GATG----G---C--------T-T---T--G-A-GC----C-A-G-A--G--TA-G-GA-T-G-T---------------T--A-----------T--C-----A--TGT-A-A-CA-----------T----T-CTGAATT---G----A--C----ATTGG--GG-TC---T---T---------C----G-----TT---T--T-TTCCC----G-----------GTCC-CAT---CCA-T---A---G-A-A----C-CG----CACC--C-AT-T-T-TAG--T----CG-CCT--TTA--C--A-ACCAA---TGC-G---AGGGaaagcaggttatctaattc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         g--G--AG-G-GA-TTT-T---------------T--A-----------T--C-----G--TGC-C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----A--T----A------GG-CC---T---tac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                               -----------T--A--G--G--CCT------G-T-G---C--TC----G-G-C------AC-T---C---A----T--G----G-C-C--------T-T---A--G-A-A-----C-A-A-G--G--AG-G-TA-TCT-T---------------T--A-----------T--C-----G--TGC-A-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----T--C----A-CGG--GG-CC---T---A---------A----G-----CT---T--T-T--CC----G-----------GTCT-CAT---CCA-A---A---G-G-A----C-CA----C-CC--C-A--T-T-CAG--T----CG-CCTC-TTA--A--G-AC--A---AGC-A---AGGGG--TACTGAGGACGG----C-C---------TA-TT-CT-ATCCgtgctcggcactcatggccttagaacaaggaggtatctttatcgtgcaacacctgctgtgtcacggggcctaagcttttccggtctcatccaaaggaccaccccattcagtcgcctcttaagacaagcaaggggtactgaggacggcctattctatcctggatcct
gi|18                         : gagggatttttatcgtgccacacctgctgtgaTGA--TTGA---T--AT--A--CT-G-TTTTAAT-ATC---CCA-CTT-G-A-G-A-T-T----T---TT--CA-CC--C-A------TA--TG-----AGA-C-GT-C-C---C-------AT----T---GT-C-G----GTAA-----AA-------AAG--C----T---GGC-AA--A--AT--T-----------T--A--A-----CTT------A-G-G---C--TT----G-T-T------GC-T---T---A----C--G----G-C-C--------T-T---TTTG-A-G-----C-A-G-A--A--AG-A-TA-TCT-T---------------T--A-----------T--T-----T--TGC-C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----A--C----A-TGG--GA-CC---T---CGTTTTATATG----G-----TT---C--TAT--CCCGGGG-----------GTCT-CAT----CG-A---A---G-G-A----C-Ctggatcct
gi|19                         :                              GATTGA--TT-A---T--TTTGA--TT-G-TTTTA-C-GTCACTCCA-CCC-G-A-G-ACATT---ATGAGTTA-CATCT--C-A------TA--TG---G-AGATC-TC-CAC---CGCTCGAGAT----A-T-GC-CTA----GTGA-----AATGC----G-G--C----T---G-CAAA--A--AT--TCTAAGCGCTGAT--A--A--G--CCTCGCGAAA-T-GACAC--TT----C-A-C------AC-TGTAC---A----C--G----G-C-CCT------T-C---T--G-A-G-----C-A-G-GGAG--AG-G-AA-TAT-T---------------T--T-----------T--
gi|2                          :                                                                           CA-CTC-GGA-G-A-A-TTAGATA--TT--CATCT--C-A------TA--TGA--G-AGA-C-GT-CAC---C-------AT----T-TTGC-C-G----GTGA-----AG-------G-G--CC---T---A-C-AACAA--AT--T-----------T--A--G--G--CCG------A-A-T---C--TC----G-TTC------AC-T---C---A----G--G----G-C-C--------T-T---T--G-A-G-----C-A-G-G-----AG-G-GA-TCT-T---------------T--T-----------TT-C-----G--TGC-C-ATCA-C----C----T----GGCTG---TCTGA----A--C----A-CGGC-GG-CC---TG--C---------G----G-----TT---T--T-TACCC----G-----------GT-T-CATG--CCG-A---A---CTG-A----C-CG----CACC--C-A--T-T-CAG--T----CGTCCTA-TTA--C--G-AC--A---CGC-A---AGGGG-ATGCTGGA---AG----C-C---------TATTT-CT-AACCCttt
gi|20                         :                                             gtgtgtgaaaaacggcttaacaatggtcatgtaaTC-G-AAG-A-A-T---AT---T---CA-CT--CTA------T---TG---T-AGA-C-GT-CAC-----------AT----C-C-AC-C-A----TCTA-----AG-------T-AT-C----T---T-C-AAG-A--AC--T-----------T--C--A--G--CCTTATA--A-T-G---C---C----G-A-C-------------T---A----G--G----G-C-C--------T-T---C--G-A-GGCATGC-A-A-G--G--GG-C-GA-TCTTT---------------T--T-----------T--C-----G--TGC-T-G-CATC----C----T----GACTG---TG--G----A--C----A-CGG--GGCCC---T---CG--------G----G-----TTTG-T--T-C--CC----G-----------GGCT-CCT---TCG-AAC-A---G-A-A----C-CG----gacccgcc
gi|21                         :                                                                                                                                           g-CAC---C-------AT----TGT-G----GT---GTGA-----AG-------C-G--CGCTGT---G-A-GA--A--AT--T-----------TTTA--G--G--CCT------GGT-G---C--TC----G-GGC------GC-T---C---A----T--G----G-TGT--------T-T---T--G-A-G-----C-GTG-G--G--AA-GCGA-TTC-T---------------T--G-----------T--TATTA-G--CGC-CAA-CT-C----C----T----GCCTG---T---AGTATA--T----A-CTA--GG-TCCTTT---C---------G----T-----TT---T--T-G--GC----GA----------GTCT-CA
gi|22                         :                                TTTA--TT-A---T--TC--ACTTT-G-TTTAG-C-GTC---C-A-C-C-G-A-A-A-G-T---A-----------CT--C-------------G---G-AGA-CCGT-CACAAAC-------AA----T---GC-C-T----GTGA-----GGAT-----G-G--C----T---G---AC--A--AT--T-----------T--ATTGATG--CCTT-----A-T-G------TC----G-G-C------AC-C---------------G----G---------------------G-A-G-----C-A-G-G--G--AG-G-GACTAT-T---------------TA-C-----------T--C-----GATTGC-C-A-CA-C----C---------G-CTT---T---G----A--C----A-CGG--G---T---T---C---------A----A-----TT---T--T-T---------------------TCC-CAT---CTG-catcaagtaacagagcgcggtctccatttag
gi|23                         :                                              ttgatgt--TT-A-TTTTG-C-ATC---CCA-TTCTA-A-A-A-A-T----T---TT--CA-CT--C-A------TG---G---G-AAA-A-AT-CAC---C-------AG----C-T-TT-T-G----GTGA-----AG-------T-T--C----C---C-C-AA--A---T--T-----------T--A--G--A--TCC------A-T-G---C--TT----G-G-C------AC-T---T---G----T--G----G-C----------------T--GTA-G-----C-T-G-T--G--GG-A-AT-TCT-T---------------A--C-----------T--T-----G--TGC-CAA-TG-C----C----T----G--TG---T---G----A--C----A-TGG--GA-CC---T---C---------T----G-----TT---T--
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                               -----------T--A--G--G--CCTT-----A-T-GA--C--TC----G---C------AC-----C---A----G--G----GAC-C--------T-TA--T--G-C-G-----C-A-A-G--GCGAG-G-GA-TCT-T---------------T--TGAA--------T--C-----G--TGC-C-AACA-C----C----T----G-C-G---T---G----A--CC---A-CGG--GG-CC---TGATC---------G----GG----TTGGGT--T-T--GC----G-----------GTCT-CATCCACCG-A---A---T-G-ATTACC-CG----C-CC--C-AT-T-T-CAAGCT----CG-CCTC-
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --G----G-C-C--------T-T---T--G-A-G--------------G--AA-G--A-TCT-A---------------T--G-----------T-----------TGC-C-A-CA-C----G---------G-CTG---T---G----A--C----A-CAA--A---C---T---C---------------------T---T--T-T--TC----G-----------GTCT-CA-----CG-A---A---G-T-C----CTCA----C-CC--C-A--T-T-TA---T----TG---TT-CTA--C--G-A---------C-A---AGG----TGCTGAGT--AG----C-C---------TA-
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                          ctccggtaatttat--TC----G-G--------GC-T---C---A----G--G--------C--------C-T---T--G-A-G-------A-G-A--G--AT-G-GA-ATT-T---------------T--A-----------T--C-----G--TGC---A-CA-C----C----T----G-CTG---T--------A--C----A-CGG------C---T---A---------G----G-----TT---T--T-T--GC----G-----------GT-T-CAT---CCG-A---A---G------------------CC--C-A--T-T-ACG--T----CG--CTC-TTA--C--G-ACA-A---AGC-A---AGGGG--T-CTGAG---Gcaaccggtccccacggat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -C-A-CA-C----C----T----T-GTG---T---G----A--C----A--AG--GG-CT---T---C---------G----G-----TT---T--T-T--CC----G-----------GTCT-C-C---CCG-A---A---G-G-A------CGATAAC-TA--T-G--T-T-TAG--TACACCA-CTTC-TTA--T--A-AT--A---CTCAA---AGGAG-ACAATGGG---atatttgcgggtcttcac
gi|28                         :                              GATTGAA-TT-A---T--T---A--TT-G-TT--A-C-GTC---CAC-CTT-A-A-----A-T---AT---TT--CA-CT--C-AC-----TA--TG------AA-C-GT-CAC---C-------A---------AC-C-G----ATGA-----A----------G--C----T-----C--A--A--AT--T-----------T--A--G--C--CCT------A-T-caacatttctaa
gi|29                         :                   aattgaactttgATTGA--TT-A---T--TT--C--TT-G-TTTTA-C-GGC---CCA-CTC-G-A-G-A-A-T---AT---TT--CA-TT--C-G------TA--TA---G-AGA-C-GT-CAC---C-------A-----T-T-AC-C-G----GTGA-----AGGGTGAAAG-G--C----T---G-C-AA--A--AT--G-----------T--A--G--G--ct
gi|3                          :                               ATTGA--TC-A---T--TT--A--CT---TTTTA-C-TTC---CCA-CTC-G-A-G-A-A-T---AT---GT--CA-CTGTC-A------GA--TGTAAGCAGATC-GT-CAC---C-------ATCGCCT-C-ACTC-GAGTTGTGA-----AG-------G-A--T----TCTCA-C-AA--ATTAT--T-----------TT-A--T--G--TCT------A-T-G---C--TCTCTCG-G-CTACAACAC-TT--C---ATGT-G--A----G-A-C--------T-TGGTT--G-A-G-----CTA-G-G--G--AG-G----TCT-T---------------T--T-----------T--T-----G--GGT-C-A-CA-C----CGGCTT----G-TTG---T--------A--C----A-CGG--A--CC---T---C---------G----G-----TT---T--T-T--CCT---G-----------GTCT-CAT---CCG-A---A---T-GGA----C-CG----C-CC--CCA--T-TGCAG--T----CG-CC-C-TTA--C--ACAC--A---CGC-A---AGGGG-ATACTGAG---GA----C-C---------AG-TT-CT-
gi|31                         :                            gaGGTTGG--TT-G---T--AT--A--TT-G-TTTAA-C-GTC---CCT-CTC-A-A-G-A-A-T---AT---GC--CA-TT--C-A------TA--TG---G-AGG-T-AT-CAC---C-------A-------T-GC---------------------------------------------A--A--AT--T-----------T--A--G--G--CCT------T-T-G---C--TC----G-G-C------GC-t
gi|33                         :                                       T-A---T--TT------C-G-TTTAA-T-GTC---CTG-C-A-A-A-A-A-A-T---GT---TT--C--CTTTC-A------TT--TG---G-AGT-C-GT-CAC---T-------AT----T---GT-C-A----GTGAG----AG-------G-A--C----T---G-C-AA--A--
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgcttgAT---CCG-A---A---G-G-A----T-CG----C-CC--C-AA-T-T-TAG--T----CG-CCTT-TCA--C--A-AC--A---AGC-----AGGGG-TTACTGAG---GA----C-C---------TA-TT-CT-AACCC
gi|35                         :                               ATTGA--TT-A---T--TT--A--TT-G-TTTTA-C-GTC---CCA-C-C-G-A-G-A-A-T---AT---TT--TG-CT--C-A------TA--TG---G-AGA-C-GT-TGC---C-------CC----T-T-GT-T-G----GTggacc
gi|36                         :                               ATTGA--TT-A---T--TT--A--TT-G-TTTTA-C-GTC---CCA-C-C-G-A-G-A-A-T---AT---TT--TG-CT--C-A------TA--TG---G-AGA-C-GT-TGC---C-------CC----T-T-GT-T-G----GTca
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----A--C----A-CGA--AA-CC---T---C---------G----T-----TT---T--C-T--AC----G-----------GTCT-CAT---CTG-A---AG--G-G-A----C-Cca
gi|38                         :                      ttataacgatTTGA--TT-G---T--AT--A--TT-G-TTTGA-C---T---CCG-CTT-T-A-G-AGA-T---TT---TT--CA-CT--C---------A--TG---G-AGA-C-ca
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --T-T-TAG--T----CG-CCTC-TTA--C--G-AC--A---AAC-A---AGGGG-TTACT-AG---GA----C-C---------TA-TT-CT-AACCCacatcttcccatt
gi|4                          :                                  GA--TT-A---A--TT-----TT-G-TTGAA-C-TTC---CCA-CAC-G-A-G-A-A-T---GT---TT--CA-AT--C-A------TA--TG---G-A-A-C-GTATGC---A-------AT----C-------------GTGAT----AT-------G-G--C----T---G-C-AA--A--ATATT-----------T--AA-G--G--CCT------A-T-G---C--TC----GCG-C------AC-TG--C---A----GT-G----G-A-A--------C-T---T--G-A-G-----C-----G--G--AG-G--A-TCT-A------------------C-----------T--C-----G--TGCTC-A-CA-C----C----T----GTCTG---T---G----A--C----A-CGT--TG-CC---T---CA--------G----G-----TT---TACT-T---------------------TAT-TAT----CG-A---ATTCA-A-A----C-CGT---C-TC--C-AT-T-T-CAG--T----CG-CCTCATTAGTC--G-AC--AC--CGC-C---AGGGGAATG-TGGA---TGAACAC-C---------TATTT-CT-gggtcc
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tg--T-T-TAG--T----CG-TCTC-TTA--C--G-GC--A---CGC-A---A-GGG-ATGCTAGG---GGTAA-C-T---------TA-TT-CC-AACCcgctgacatc
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         t--T----CG-CCTC-TTA--C--G-AC--A---AGC-A---AGGGA-ATGTTAGG---GA----C-T---------TA-TT-CT-GACCC
gi|42                         :                                 TGA--TT-G---T--AT--G--TT-A-TTTAA-T-GCC---CCT-TAC-A-A-G-A-A-T---AT---TT--CA-CT--C-A------TA--Tggg
gi|43                         :                               cTTGG--TT-G---T--AT--A--TT-G-TTGCA-C-GTC---CCT-TTT-G-A-G-A-A-T---AG---TT--CA-CT--C-A------T
gi|44                         :                               gTTGG--TT-G---T--AT--A--AT-G-TTTAA-C-GTC---CCA-CTC-A-A-G-A-A-T---TT---TT--
gi|45                         :                              GAATGA--TT-A---T--TT--G--TTTG-TTTTA-C-GTT---CCA-C-C-G-A-G-A-A-T---
gi|5                          :                              tATTGA--TT-AATTT--TT--A--CT-G-TTT-A-C-GTC---CCA-CTC-G-A-G-A-A-T---AT---TT--CA-CT--C-A------TA--TG---G-AGG-C-GT-CAC---C-------AT----T-T-GC-C-G----GTGA-----AG-------G-G--C----T---G-C-AA--A--AT--T-----------T--A--G--G--CCTC-----A-T-G---C--TC----G-G-C------AC-T---C---A----G--G----G-C-C--------T-T---T--G-A-G-----C-A-G-G--G--AGCG-GA-TCC-T---------------T--T-----------T--C-----G--TGC-C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----A--C----ACCGG--GA-CC---T---C---------G----G-----TT---T--T-T--TC----G-----------GTCT-CA----CCGTA---A---T-G-A----CTCG----C-CC--C-A--T-T-CAG--T----CG--CTC-TTA--C--G-AC--G---C-C-A---A-GGG-ATGCTGGA---GG----C-C---------TA-TT-CT-AACCC
gi|6                          :                                 TGG--TT-G---T--AT--A--TC-G-TTTAA-C-GAC---CCA-CTC-C-A-G-A-T-T---AT---TT--CA-CT--C-A------TA--TG---G-AGG-C-GT-CAC---C-------GT----T---GC-C-G----GTAA-----AG-------G-T--C----T---G-C-AA--A--GT--T-----------T--A--G--G--CCC------A-T-G---C--TC----G-G-C------AC-T---T---A----A--G----G-C-T--------T-T---T--G-T-G-----C-A-G-G--G--AA-T-GG-TCT-T---------------T--AATCACTCTTTATAAC-----G--TGG-C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----A--C----A-CGG--GG-CC---T---T---------G----G-----TT---T--T-G--GC----G-----------GTAT-CAT---CCG-A---A---G-G-A----------------------------------------CCTC-TTA--C--G-AC--A---CAC-A---AAGTG-ATGCTGGG---GA----C-CTACATAATGTA-TT-CT-AACCCgggacccc
gi|7                          :                              GATTGA--TT-A---T--TT--A--CT-G-TTTTA-C-GTC---CCC-CTC-G-A-T-A-A-T---AT---TT--CA-CT--C-A------TA--TG---G-AGA-C-GT-CAC---C-------AT----T-T-GC-C-G----GTGC-----AG-------G-G--C----A---G-C-AA--A--AT--T-----------T--A--G--G--CCT------A-T-G---C--TC----G-G-C------AC-T---C---A----G--G----G-C-C--------T-T---T--G-A-G-----C-A-G-G--G--AG-G-GA-TCT-T---------------T--T-----------T--C-----G--TGC-C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---G----A--C----A-CGG--GG-CC---T---C---------G----G-----TT---T--T-T--CC----G-----------GTCT-CAT---CCG-A---A---T-G-A----C-CG----C-CC--C-A--T-T-CAG--T----CG-CCTC-TTA--C--G-AC--A---CGC-A---AGGGG-ATGCTGGA---GG----C-C---------TA-TT-CT-GACCCggacc
gi|8                          :                                    --TT-G---T--TT--A--CTAG-TTTTA-T-ATT---ATA-CTT-T-A-----A-C---AT---CC--CG-CT--C-A------AAAGTG---G-AAA-C-GT-CAC---C-------AT----T---GC-C-G----GAGA-----AG-------G-A--C----T---G-C-A------------------------------------T------A-T--------TC----G-G-C------GCTT---T---AATATG--C----G-C-C--------T-T---T--G-A-G-----C-A-GTG--G--AG-G-GA-TCT-T---------------TCGA-----------T--T-----G--TGC-C-A-CA-C----C----T----G-CTG---T---A----A--CATTTA-CGG--GG-CT---T---T---------G----A-----TT---T--T-T--GC----G-----------GTCT-CTT---CCA-A---A---G-G-ACACCC-CA----C-CCCTC-A--T-T-TAG--T----CG-CCTC-CCA--C--A-AC--A---AGT-ATTGAGGG
gi|9                          :                                                                                           -T---AT---TTTCCA-CT--C-A------TA--TG---A-GGA-C-GT--AC---C-------TA----T-T-GC-C-G----GTacttttgtaaaccgatcccc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                 tccaaattact----G-G-C------GT-T---T---A----T--G----G-T-T--------T-T---T--G-AAG-----C-A-G-G--G--A-------TCT-G---------------T--T---------------------------------------------------CTG-------G----A--C----A-CGG--GA-C------------------G----G-----TTG--T--T-T--GC----G-----------GTCT-C-------------------G-A-------G----C-CC--C-A--T-TGTAG--T----AA-GGTC-TTA--C--A-AA--G---AAC-A---AGGGGTATACTGAG---GG----C-TACATG----TA-TT-AT-AACCCtgtttgtgcatttttgaaaatttagatagcctgtatctcagagcgagggatgtgcgccactatctgaggcgtttatggtttttgaagcagggatctgttctggacacgggacggttgtttgcggtctcgagccccattgtagtaaggtcttacaaagaacaaggggtatactgagggctacatgtattataacccgatcctc