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gi|16 : -C-GATTCCC---A--AGGTG-ATGGAGCACTCGTCA----GCT-G---AAA-G-GCCCC-CCCTTTCCc
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Reference ( family-5693 ) : GCCTTTC--CGA-AA--A-CGT--G-AGTTA-TCTC-TCTTTG-T-ATTC-TA-ACTT-TT--CGTGTG-CA-T-GTG-A-CAACT-T----------C--CG--G---GTAGTA---AT---AT-AATC-A-T--AC-TA-C-A-C--GNTA---T-T-TGA-G--TGT--CTT-G-TT-TCTGTT----GTTA--TA----TC-GA-GT--ATG-A-A---TG-AAT--AA-----GT-CAA------T-G--AACAGTT-GA-----TA-TG--TTT-T---CTG-CGTTA--AA-GTT-----AGGA-AAA-AG-GTC---A-GT-GA--G----AA--AAA---A-TAAAAGA---TC--T----TGATCAAGTC-A-GG-A--TG-------T--TT-T---TTT-TTTTTAT------TNCAAAG---A-A-T-AA-GT-------G----C--CNCCC----------CC--CC-----CCC------T---------T-------GAAAGCGAACTGTAAAA---TC-AAATTCA-A-A-CAC-----CC-AC------------TTG-T-T-TCCC---G-ATGTCCCCTAT--TACGA-CTTG-TGTA-ATT-TT-----GGAACTAA-TTT-AATAGAA-CT-AAT-T-AA---CAGAA----C-T-------AC-C-GATTCCC---AAAAGGTG-ATGGCG-ACTCGTCA----G----CTG-AAA-GCCCCCCCCCCTCCCT
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Reference ( family-5693 ) : GCCTTTC--CGA-AA--A-CGT--G-AGTTA-TCTC-TCTTTG-T-ATTC-TA-ACTT-TT--CGTGTG-CA-T-GTG-A-CAACT-T----------C--CG--G---GTAGTA---AT---ATAAT-C-A-T--AC-TAC-A-C--GCTA---T-T-TGAG--TGT--CT----T-G-TT-TCTGTT----GTTA--TA----TC-GA-GT--ATG-A-A---TG-AAT--AA-----GT-CAA------T-G--AACAGTT-GA-----TA-TG--TTT-T---CTG-CGTTA--AA-GTT-----AGGA-AAA-AG-GTC---A-GT-GA--G----AA--AAA---A-TAAAAGA---TC--T----TGATCAAGTC-A-GG-A--TG-------T--TT-T---TTT-TTTTTAT------CCCAAAGA-A--T-AA-GTG----C--C---------CCC----------C---CC--CC----CCC------TT-------GAAAGCGAACTGTAAAA---TC-AAATTCA-A-A-CAC-----CC-AC------------TTG-T-T-TCCC---G-ATGTCCCCTAT--TACGA-CTTG-TGTA-ATT-TT-----GGAACTAA-TTT-AATAGAA-CT-AAT-T-AA---CAGAA----C-T-------AC-C-GATTCCC---AAAAGGTG-ATGGCG-ACTCGTCA----G----CTG-AAA-GCCCCCCCCCCTCCCT
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gi|5 : CTTTC--CGA-AA--A-CGT--G-AGTAA-ACTCATCTTTG-T-ATTC-CA-ACTT-TT--CGTGTG-CA-T-GTG-A-CAACTAT----------C--CC--GCGCGTAATATAAATGTTATAAT-C-AAT--AC-TAC-A-C--GCTG---T-T-TGAG--TGT--CT----T-GATT-TCTGTT----AGTAAATA----TC-GA-A-----G-AA---TG-------------GT-GAA------T--GAA-AGTT-GAA----TA-TG--TTT-T---CTG-CGTTA--AAAGTT-----AG---AAA-AG-GTC---AAGT-AA--G----AA--AAA---A-TAA----------------------GTC-A-GA-A-----------T-G----T-----TT----TTTA----T------TA-C-C-C--AG-GTAAATT-CA-GTGA---C--C---------CC----C----------CACACTC--C----CCC------TT-------G------------AAAA---TC--AATTC--A-A-CAT-----CC-AC------------TTGAT-TATCCC---GAATGTCCCGTAT--TACGA-CTTGATGAA-TTT-TT-----GGAACTAA-TTT-AATAGAA-CTAAAT-A-AA---CAGAA----C---------AC-C-GATTCAC---AAAAGGTG-ATGGCG-ACT-GTCA----G----CTG-AAAGGCCCCCCCCCCT
gi|6 : ggGCCTTTC--CGA-AA--A-CGT--G-ACTTA-TCTC-TCTTTG-T-ATTA-TA-ACTT-TT--CGTGTG-CA-T-GTT-A-CAAGT-A----------C--C------------------------AT-C-A-T--AC-CGC-A-C--ACTA---T-C-GGAG--TGT--TT----T-G-TT-TTTGTT----GTTA--TA----TC-CA-GT--ATC-AA---TG-AAT--AA-----GT-CAAC-----T--AAACAGTT-GA-----TA-TA--TTA-T---CTG-AATTA--AA-GTA-----AAAC-AAA-AG-GTCGTCA-GT-GA--A----AT--AAA---A-TCCA-GA---TC-T----TGATCAAGTC-A-GG-A-----------T-G----T-----TT----TCCC----------------C-C--AA-G-AA--T-AA-GTG----CAAC---------AC----A----------C---ACC--C----TTT------TT-------TCTCGTGATCTTTAAAA---TC-AAATTGA-A-A-CAC-----CC-GC------------ATG-T-T-TTCA---G-ATGTACCCTAT--AACGA-CTAG-TATA-ATT-TT-----TGGACTAA-TTT-AATAGCA-CA-AAG-T-AA---CAGAA----C-T-------AC-C-GATTCCC---AACAGGTG-ATGGCA-ACTTGTCA----G----CTG-AAA-GCCCCCCCCt
gi|7 : CCTTTC--CGA-AA----CGT--GGAGTTA-TCTC-TCTTGGGT-ATTC-TA-ACTT-TT---GTGTG-CAAT-GTG-A-CAACT------------C--CG--G---GTAGTA---AT---ATAAT-C-A-T--AC-TAC-ATC--GCTA---T-T-TGAG--TGTTCCT----T-G-TTGTCTGTT----GTTA--TA----TC-GAAGT--ATG-A-------------------------------T--AA-----------------TG--TAT-T---CTG-CATTA--A--GTT------GAA-AAA-AG-GTC---A-GT-AA--G----AA--AAA---A-TAAAAG-------------GATCAAGTC-A-GG-A-----------T-GG---T-----TT----TTTT----T------TATC-C-C--AA-G-AA--G-TA-GTG----C--C---------CC----C----------C---CCCTCC----CCC------TT-------GAAAGCGAACTGTAAAA---TC-AAATTCATA-A-CAC-----CC-AC------------TTG-T-T-TCCC---G-ATGTCCCTTA---TACGA-CTTG-TGTA-ATTCTT-----GGAACTAA-TTT-ACTAGAT-CT-AAT-T-AA---CAGAA----C-T-------AC-C-GATTCCCCAAAAAAGGTGAATGGCGAACTCGTCA----G----CTGAAAA-GCCTCCCCCC
gi|8 : gcGCCTTTC--CGA-AA--A-CGT--G-AGTTA-TCTC-TCTTTG-T-ATTC-TA-ACTT-TT--CGTGTG-CA-T-GTG-A-CAACT-T----------C--CG--G---GTAGTA---AT---ATAAT-C-A-T--AC-TAC-A-C---CTA---T-TGTGAG--TGT--CT----T-G-TT-TCTGTT----GTTA--TA----TC-AA-GT--ATG-AA---TG-AA---AA------------------------AGTT-GA-----TA-TG--TTT-T---CT--CAATA--AA-GTT------GGA-AAA-AG-ATC---A-GT-AA--G----AA--AAA---A-TAAAAG-------------GATCAAGTC-A-GG-A-----------T-G----T-----TT----TTTT----T------TATT-C-C--AA-G-AA--T-AA-GTG----C--C---------CC----C----------C---CCC--C----CCCTTTCATTT-------GAAAGCGAACTGTAAAA---TC-AAATTCA-A-A-CAC-----CC-AC------------TTG-T-T-TCCC---G-ATGTCCCCTAT--TACGA-CTTG-TGTA-ATT-TTG----GGAACTAA-TTT-AATAGAA-CT-TAT-T-AA---CAGAA----C-T-------A--C-GATTCCC---AAAAGGTG-ATGGCG-ACTCGTCA----G----CT
gi|9 : g-TA-TCTT-TA--AGTGT--CA-T--T--A-CAA-T-T----------CGTTG--G---GAAATA---GC---ATAAT-CTA-T--AT-CAC-G-CTGGATA---T-T-CGAG--TGT--CT----TTG-TT-TATAT--------A--TA----TC-G--------G-AA---CG-TAA--AA---------AA------A--AAAAAGTTTGA-----T--TG--TTT-TT--CTG-CGTTA--AA-GTT-----AGCA-AAA-GG-TTC---AAGT-AA--G----AA--AAA---AATAAAAG-------------GATCAAGTC-ATGG-AAATGAGAGAAAT-A----T-----CT----TATA----TATATAATATA-CAC--AA-A-AAGAT-AAAGTG----C--C---------AC----C----------C---CAA--A----------------------AAAAGCGAACTGTAAAA---TC-AAATTCA-A-A-CAC-----GC-AC------------TTG-T-T-TCCC---G-ATGTCCCCTATTATACGA-CAAA-TGTG-ATT-TTTG---GGAACTAACTTT-AATAGAA-CT-AATGT-AA---CAGAA----C-T-------AC-CTGATTCCA---AAAGGGTG-ATGACG-ACTTG--A----A----CTG-
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CTTTACCAGTCAATTTGTTTTCTAGGAGTCAACTTGTGTAACAACTTGCA