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Reference ( gi|20 ) : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-G--TTTTG--------GA-AGTC--CCTA-TT--A-CTAA--C-GCTAA----------A--CG-TTT-A------A-AATT---AAG--AC--A-ATTACAT-GT------A---AGT-A-GC--AAATCT-A-G--T--AT-AG--A-TC-T-T-A-TA-ATTACATGTACATG-CGGG---AT--A---------G-AC--------TT-------CAT-----A-------G--T-------GC-----------T---T----A-T----G---------A--AT---AA-CG-AAAT-A----TTCA-CTA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGAC--AT-A-G--G-GT-AT-A--C--AAAT--C-G------TT--T---------T--A-A-------AAA-------T--------T-T-TC-A-C----A-A--A-AA-G-C-------AA-C-----A----A---TT----------A---------C---------C---AA-T-----------------------TAC----A-T---ATAT--CAACGA-ATATGA
gi|18 : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-G--TTTTG--------GA-GATC--CCTA-TT--AACTAA--C-GCTAA----------A--CG-TTT-A------A-AATT---AAG--AC--A-ATTACATTGT------A---AGT-A-GC--AAATCT-A-G--T--AT-AG--A-TC-T-T-A-TA-ATTACATGTACATG-CGGG---AT--A---------G-AC--------TT-------CAT-----A-------G--T-------GC---------------T----A-T----G---------A--AT---AA-CG-AAAT-A----TTCA-CTA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA--T----T--ACTAACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGAC--AT-A----G-AT-AT-A--C--AAAT--C-G------TT--T---------TTAA-A-------AAA-------T--------T-T-TCAA-CA---A-A--A-AA-G-C-------AA-C-----A----A---TT----------A---------C---------C---AA-T-----------------------TAC----A-T---ATAT--CAACGA-ATATGA
gi|17 : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-G--TTTTG--------GA-GATC--CCTA-TT--AACTAA--C-GCTAA----------A--CG-TTT-A------A-AATT---AAG--AC--A-ATTACATTGT------A---AGT-A-GC--AAATCT-A-G--T--AT-AG--A-TC-T-T-A-TA-ATTACATGTACATG-CGGG---AT--A---------G-AC--------TT-------CAT-----A-------G--T-------GC---------------T----A-T----G---------A--AT---AA-CG-AAAT-A----TTCA-CTA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA--T----T--ACTAACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGAC--AT-A----G-AT-AT-A--C--AAAT--C-G------TT--T---------TTAA-A-------AAA-------T--------T-T-TCAA-CA---A-A--A-AA-G-C-------AA-C-----A----A---TT----------A---------C---------C---AA-T-----------------------TAC----A-T---ATAT--CAACGA-ATATGA
gi|16 : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-G--TTTTG--------GA-GATC--CCTA-TT--AACTAA--C-GCTAA----------A--CG-TTT-A------A-AATT---AAG--AC--A-ATTACATTGT------A---AGT-A-GC--AAATCT-A-G--T--AT-AG--A-TC-T-T-A-TA-ATTACATGTACATG-CGGG---AT--A---------G-AC--------TT-------CAT-----A-------G--T-------GC---------------T----A-T----G---------A--AT---AA-CG-AAAT-A----TTCA-CTA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA--T----T--ACTAACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGAC--AT-A----G-AT-AT-A--C--AAAT--C-G------TT--T---------TTAA-A-------AAA-------T--------T-T-TCAA-CA---A-A--A-AA-G-C-------AA-C-----A----A---TT----------A---------C---------C---AA-T-----------------------TAC----A-T---ATAT--CAACGA-ATATGA
gi|19 : CTAT-C-ATT-AAA-T-ACA---G-AA-G--TTTTG--------AC-CGTC--CCTA-TT--A-CTAA--A-GTTAA----------A--CG-TTT-A------A-AATT---AAG--AC--A-AT-------T------A---AGT-A-AC--AAATCC-C-G--T--AT-AG--A-TC-T-T-A-CA-ATAATTTA-ATATG-CGGG---AT--A---------G-AC--------TT-------CAT-----A-------G--T-------AC-----------T---T----A-T----C---------A--AC---AA-CT-AGAT-A----TTTT-CTA--A-G-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-G-AT-TA-TGAA--AT-A-G--G-GT-AT-A--C--AAAA--C-G------TT-------------------------AAA-------T--------T-T-TC-A-C----A-A--A-AA-G-C-------AA-C-----A----A---TT----------AATTAATTAGC---------C---AA-T-----------------------TAC----A-TTA-ATAT--CAACGT-ATA
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gi|6 : aCTATGC-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-G--TTTTG--------AC-AGTC--CCTA-TT--A-CTAA--A-GCTAA----------A--CG-TTT-A------ATAATT---AAG--AC--A-ATTTTA----------A---AGT-A-GC--AAATCC-A-G--T--AT-AG--A-TC-T-T-A-------ACAATTACATG-CGGG---TT--A---------G-AT--------TT-------CAT-----A-------G--T-------ACA----------TG--T----ACT----A---------ATCAT---AA-CA-AAAT-A----TTTT-CTA--ACA-T---------TAA-ACTT-TA-TT----T--GCT-AAG--C-A-T------G-C-AA-TA-TGAC--AT-A-G--G-GT-AT-A--C--AAA---C-GAGTAAATT--TTTCACAAAAT--G-A-------AAA-------T--------G-T-TC-A-C----A-A--A-AA-A---------GA-C-----A----A---TT----------A---------TTAATTAGCGC---AA-T-----------------------TAC----ATT---AT-T--CACTGT-ATATGA
gi|5 : aaCTATGC-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-G--TTTTG--------AC-AGTC--CCTA-TT--A-CTAA--A-GCTAA----------A--CG-TTT-A------ATAATT---AAG--AC--A-ATTTTA----------A---AGT-A-GC--AAATCC-A-G--T--AT-AG--A-TC-T-T-A-------ACAATTACATG-CGGG---TT--A---------G-AT--------TT-------CAT-----A-------G--T-------ACA----------TG--T----ACT----A---------ATCAT---AA-CA-AAAT-A----TTTT-CTA--ACA-T---------TAA-ACTT-TA-TT----T--GCT-AAG--C-A-T------G-C-AA-TA-TGAC--AT-A-G--G-GT-AT-A--C--AAA---C-GAGTAAATT--TTTCACAAAAT--G-A-------AAA-------T--------G-T-TC-A-C----A-A--A-AA-A---------GA-C-----A----A---TT----------A---------TTAATTAGCGC---AA-T-----------------------TAC----ATT---AT-T--CACTGT-ATATGA
gi|4 : aaCTATGC-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-G--TTTTG--------AC-AGTC--CCTA-TT--A-CTAA--A-GCTAA----------A--CG-TTT-A------ATAATT---AAG--AC--A-ATTTTA----------A---AGT-A-GC--AAATCC-A-G--T--AT-AG--A-TC-T-T-A-------ACAATTACATG-CGGG---TT--A---------G-AT--------TT-------CAT-----A-------G--T-------ACA----------TG--T----ACT----A---------ATCAT---AA-CA-AAAT-A----TTTT-CTA--ACA-T---------TAA-ACTT-TA-TT----T--GCT-AAG--C-A-T------G-C-AA-TA-TGAC--AT-A-G--G-GT-AT-A--C--AAA---C-GAGTAAATT--TTTCACAAAAT--G-A-------AAA-------T--------G-T-TC-A-C----A-A--A-AA-A---------GA-C-----A----A---TT----------A---------TTAATTAGCGC---AA-T-----------------------TAC----ATT---AT-T--CACTGT-ATATGA
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gi|12 : aCTGT-C-ATA-AAA---ATAT--G-AA-G--TTTTG--------AC-AGTC--ACTA-TT--A-CTAA--A-GCTAA----------A--CGGTTT-A------A-AATT---AAG--GCC-A-ATTA-----------------GT-A-GC--AAATC--A-T--TC-AT-AG--AATC-T-T--------TACA-ATACATGGCGGG---AT--A---------G-AT--------TTAAAATC-CAT-----AA------G--T-------AA-----------T---TTCTAA-TC---A---------A--AT---AA-CG-AAAT-T----TTT--CTA--ACA-T---------T-A-ACTT-TA-TT----C--ACT-ACA--C-A-T------G-C-AT-TA-TGA---AT-A-GGCG-GTAATAA--C--AA----C-G------TT--------------------------AA-------T--------TGT-TC-A-C----A-A--A-AA-G-CA------AA-C-----ATTAGA---TT----------AATTTAG---C---------C---AA-T-----------------------TAT----A-TTG-A-AT--C-ACGT-ATATGAt
gi|9 : ataaaCTGT-C-ATA-AAA-T-ATA---G-AA-G--TTTTG--------AC-AGTC--ACTA-TT--A-C-AA--A-GCTTA----------A--CG-TTT----------AATT---AAG--GC--A----------T------A---AGT-A-GCAAAAATCC-ATT--T--AT-AG--A-TC-T-T-A-CA-ATTACATGC--------GG---AT--A---------G-AT--------TTAAAAATCCAT-----AGTTACATG--T-------AC-----------TTAAT----A-C----A---------A--AT---AA-CG-AAAT-A----TTTT-TCT--ACATT---------T-A-ACTT-TT-AT----C--ACT-A-C--A-A-T------G-C-AA-TA-TGAC--AT-A-G--G-GT-ATAA--C--AAACAAC-G------TT-----------------A-------AAT-------T--------T-T-TC-A-CA---A-A--A-AA-G-CA------AA-C-----A----A---TT----------AATTAATTAGC---------C---GA-T-----------------------TAT----A-TTTGAAATC-CAACGT-ATATGA
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gi|7 : ataaCTGT-C-ATA-AAA-T-ATA---G-AA-G--TTTTG--------AC-AGTC--ACTA-TT--A-C-AA--A-GCTTA----------A--CG-TTT----------AATT---AAG--GC--A----------T------A---AGT-A-GCAAAAATCC-ATT--T--AT-AG--A-TC-T-T-A-CA-ATTACATGC--------GG---AT--A---------G-AT--------TTAAAAATCCAT-----AGTTACATG--T-------AC-----------TTAAT----A-C----A---------A--AT---AA-CG-AAAT-A----TTTT-TCT--ACATT---------T-A-ACTT-TT-AT----C--ACT-A-C--A-A-T------G-C-AA-TA-TGAC--AT-A-G--G-GT-ATAA--C--AAACAAC-G------TT-----------------A-------AAT-------T--------T-T-TC-A-CA---A-A--A-AA-G-CA------AA-C-----A----A---TT----------AATTAATTAGC---------C---GA-T-----------------------TAT----A-TTTGAAATC-CAACGT-ATATGAt
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gi|15 : atacCTAT-C-ATG-GAA-T-ACA---G-AA-G--TAAGA--------AA-AG-C--CCTA-TT--A-CTAA--A-GCTAA----------A--CG-TTT--------A-GATT---AAG--GC--A-ATTACAT-GT------AGAGAG--A-GC--AAATCC-A-G--T--AT-AG--T-CT-T-T-A-CA-CTTA-----ACAT--CGGG---AT--AGATACTAACG-AC--------TT-------CAA-----A-------G--T-------ACAATTATTGTAAT---T----A-T----G---------A--AT---AA-TG-AAA--A----TTAT-CTA--ACT-T---------A-A-ACTTCTA--T----T--ACT-ACC--CAA-T------A-C-AT-TA-T-------------G-GT-ATGA--C--AAAA--C-G------GT--G---------T--A-A-------G------------------T-G-TC-AGC----A-A--ACAA-G-C-------AA-C-----A----A---TT----------
gi|1 : aaaCTAT-C-ATGGAAA-T-ACA---G-AA-G--TTTTG--------AC-AGTC--CCTA-TT--A-CTAAAGC-GCTAA----------A--CG-TTT-A------A-AATTAGCAAG--AA--ACATT---T-TT------AAC-AGT-A-GC--AAATCCGA-GCCT--AT-AT--A--C-T-T-C-CA-ATTACATG--CGCG-CCGC---TT--A---------A-AT--------TT-------CATC----A-------G--TAC-----AC-----------TG--T----A-C----T---------A--ATCAAAA-CA-ATAT-A----TTTT-CTAAGACA-T---------T-A-ACTTCTA-TT----TTCACT-ACA--C-ATT------GCC-AA-TA-TGA---AT-A----G-GT-AT-A--CCAAAAA--C-A------AT-----------------A-------AAA-------T--------T-T-TC-A-C----A-A--A-AA-G-C-------Agattattaagcaagtacattaat
gi|3 : taaCTATTC-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-G--TTTTT--------GACAGAT--CCTA-TTTTA-CTAA--AAGCTAA----------AACCG-TTT-A------A-AATTT--AAG--AC--A-ATTTTA----------A---AGTTA-AC--AAATCC-A----T--A--AG--A-TC-T-T-A-CA-ATTACATG-------CGGG---TT--A---------G-AT--------TT-------CAT-----A-------G--TA------AA-----------T---T----A-C----AATTCCC---A--AT---AA-C--AAAT-A----TT---CTA--ACA-T---------T---ACTT-TA-TT----T----T-GTCAAC-A-T------GCC-AA-TA-TGAC---T-A-G--GTGT-ATCA--C--AA----C-GATAAA-TT--T---------C--C-A-------AAA-------TGGATAATGT-T-TC-A-C----A-A--A-AAGG-C-------AA-CATATGA----A---TT----------AATTAG----C---------CAAAAA-T-----------------------TAC----A-TTA-ATAT--CAATGT-ATATtaaatgttcaacaaaaaagcaacaattaataattagccaattactacttaataatcaatgttaatgat
gi|23 : aaCTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-G--TTTTG--------AA-AGTT--CCTATTT--A-CTCA--A-G-TAA----------G--CG-TTT-G------A-AATTA--AAG--GCGAA-ATT-TTT-AA------A---AGT-AGGC--AAATCT-AGG--T--AT-AGA-A-TCGG-T-ACCA-ATTACA-------G-C-GG---AT--A---------G-A---------------------------------------------AC-----------T---T----A-T----G---------A--ATA--AA-CG-AAGT-A----TT----------------------------------------T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-A--CA-TGAC--AT-A-G--GCGT-AT-A--C--AAAA--CAG------TT-------------------------ACA-------T--------T-T-TC-A-C----A-A--A-AA-GCC-------AA-C-----A----AAATTT----------AATTAGTAAGC---------C---AATT-----------------------TAC----A-TTA-ATAT--CAAt
gi|32 : aaCCAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-------TTTTA--------AA-AGAC--CCTT-TT--A-CTAA--A-GCTAA----------A--C---TT-AACTTCTA-AATC---AAG--GC--A-GT-------T------A---AGT-A-GC------------------------A-TC-T-T-A-CA-AT------TACATG-CGGG---AT--A---------G-AT--------TA-------CAaacg
gi|26 : TAT-C-AAG-AAA-T-ACA---G-AA-G--TTT----------GACAGTC--CCTA-TT--A-CTAA--A-GCTGA----------A-------------------ATT---AAG--G---A-ATT---T-TC------A---AGT-A-GC--AAATCC-A-G--T--AT-AG--A-TC-T-T-A-CA-ATTACA------TG-CGGG---AT--A---------G-AC--------TT-------CAT-----A-------G--T-------AC-----------T---T----T-TC---A---------A--AT---AA-C--AAAT-A----TTTT-CTA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA--T----T--ACT-A-C--C-A-T------G-C-AT-TA-TGAC--AT-A----G-GT-AT-A--C--AAAA--C-G------T------------------A-------AAA-------T--------T-T-TC-A-C----A-A--A-AA-G-C-------AA-C-----A----A---TT----------------------------------AA-T-----------------------TAcgacttcaaagtac
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gi|19 : CTAT-C-ATT-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-CGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GTTA-A---A--CG-TTT-A------A-A-ATT-A-----AG--AC-AA-----T-------T--------A--A-G--T------A-AC--AAATCC-C-GT-AT-AG--A-T-C--T-T--A-CA-ATAATTTA-ATATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A--C-----------T---T-------AT-C----A---A-C---AACT-AGATAT--T-TT-C-TA--A-G-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-G-A-TTA-TGAA--AT-A-GG--GTAT-A--C--A--------A--AAC-G-----TT------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G-C-AA-C-----A----A---TTAAT-----------TAATTAGC---------C---AA-TT--A----C----AT-TA--ATA-T--CAAC-GTATA
gi|2 : ataa-ATT-AAA-T-ACA---G-AATACTTTTGCCAAATTT-GAC-AGTC--CA---CA-T-----A-TTA-----CTA-A---A--CG-CTC-A------G-ACAT---------------AA-----TTA--------------G--A-G-----------GC--AAATC--A-GT-AT-AACCA-T-C--T-TT-A-CA-ATTCCGACTATGCGCGGA---AT------------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--ATGT-----------T---T-------TT-C----A---A--------GTAAACGT--T-T------------T---------T-A-ACTT-TA-TTATCCT--ACCGACC--C-A-TTAAATCG-C-ATATAGTGACAAAT-A-GT--GTAT-G--C-----------A--AAC-G-----TT-----AAAAT--------T-TTC-A-CTACTAAAAACCAGT----AA--A-------------------AA-A-C-AA-T-----T----A---TTAATGGTAATAGAAGC------C---------C---CA-TT--AAAGGT----ATAT---GTA-T--CAAC-GTATATGA
gi|20 : acattacattcggaCTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GGA-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAC--GCTA-A---A--CG-TTT-A------A-A-ATT-A-----AG--AC-AA-----TTACATG-T--------A--A-G--T------A-GC--AAATCT-A-GT-AT-AG--A-T-C--T-T--A-TA-ATTACATGTACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--G--C-----------T---T-------AT-G----A---A-T---AACG-AAATAT--T-CA-C-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-A-TTA-TGAC--AT-A-GG--GTAT-A--C--A--------A--ATC-G-----TTTTA--AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G-C-AA-C-----A----A---TTA--------------------C---------C---AA-TT--A----C----A--T---ATA-T--CAAC-GAATATGA
gi|21 : TG-TAA-T-ACA---A-AA-------GT----TTT-GAA-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTG-A---A--CG-TTT-A------A-A-ATT-A-----AG--AC-AA-----TTA-----------------A-G--A------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--A-T-C--T-T--A-CA-ATTATATG------CGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------TATCAAATA-------G-----T--A--C-----------T---T-------GT-C----A---T-T---AACG-AAATAT--T-TT-T-TA--ACG-T---------C-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-A-TTA-TGAC--AT-A-GG--GTAT-A--C--A--------A--AAG-G-----TT------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G-A-AA-C-----AATTTA---TTAAT-----------TAG----C---------C---AA-TT--A----C----AT-TA--ATA-T--TAAC-GTATATG
gi|22 : AT-C-ATG-ATA-T-ACT---G-AA-------GA----TTT-GAA-AGTT--CT---TA-TTCCTTG-CTAAG--ATTACATGTA--CG-TTC-T------A-A-ATT-A-----AG--AC-AA-----TT------T----------------T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--A-T-C--T-T--A-CA-------------CGCAGG---AT--A---------GA-TT-----------------AT-----A-------C-----G--A--C-----------T---T-------A--A----G---A-T---TAC-----TCT--TGTT-C-TA--ACG-CGTTGCCGTGT-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACA--C-A-A------A-C-G-CTA-TCAC--AA-A-GT--ACAT-A--C--A--------A--AAC-G------T-----AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AG-A-C-AA-C-----A----A---ATGAA-----------TAA----C---------T---AA-TT--A----CA---AT-A---ATA-T--CTTT-GTATA
gi|23 : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAA-AGTT--CC---TATTT----A-CTCAA--G-TA-A---G--CG-TTT-G------A-A-ATTAA-----AG--GC-GAAATTTTTA-----A--------A--A-G--T------AGGC--AAATCT-AGGT-AT-AGA-A-T-CG-G-T--ACCA-ATTACA-------GC-GG---AT--A---------GA--------------------------------------------A--C-----------T---T-------AT-G----A---A-TA--AACG-AAG---------------------------------------TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-A-C-A-TGAC--AT-A-GGC-GTAT-A--C--A--------A--AACAG-----TT------ACAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-GCC-AA-C-----A----AAATTTAAT-----------TAGTAAGC---------C---AATTT--A----C----AT-TA--ATA-T--CAA
gi|24 : aaT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----ATT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CT------CTA-A---A--GG-CTTGA------A-A-ATT-A-----AG--GC-AA-----TTT-----A--------A--A-G--TC-----A-GC--AAATCC-A-GT-ATCAG--A-T-C--T-TTAA-CA-AT------TACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A--CT----------T---T-------TT-C----A---A-T---AACG-AAATATTGT-TT-CTTA--ACG-T---------T-ACACTT-TA--T----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-A--TA-TGAC--AT-A--G--GTAT-A--C--------------AAC-G-----TT-----GACAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-A-C-AA-C-----A----A---TTAAT-----------T--------------------AA-TT--A----aacg
gi|25 : gtat-C-ATG-AAAAT-ACAAGGG-AA-------GT----TTT-AAA-A-TCG-CC---T---T----A-C-AAA--GCTG-A---A--------------------AT--A-----AG--GC-AA-----TTT-----TT-------A--A-G--T------A-GC--AA-TCC-A-GT-AT-AG--A-T-CATT-T--A-CA-ATTACATG------CGGG---AT--AA--------GA-CT--------T-------CAT-----A-------------T--A--C-----------T---TT------GT-C----A---A-T---AACG-AAAT-T--T-TT-C-TA--ACG-T---------T-T-AC---TA-------T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-A--TA-TGA---AT-A--G--GTA--A--C--A--------A--AAC-G-----T-------AAAT--------T-TTC-A-CA-----------------AA--A-------------------AA-G-C-AA-C-----A----A---CTAAT-----------TAG----C---------C---AA-TT--A----T----AT-TG--ATA-T--CAAC-GTATATAAgcaaattaa
gi|26 : TAT-C-AAG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TT--GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTG-A---A--------------------ATT-A-----AG--G--AA-----TTT-----TC-------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--A-T-C--T-T--A-CA-ATTACA------TGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A--C-----------T---T-------TTCA----A---A-T---AAC--AAATAT--T-TT-C-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA--T----T--ACT-A-C--C-A-T------G-C-A-TTA-TGAC--AT-A--G--GTAT-A--C--A--------A--AAC-G------T-----AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G-C-AA-C-----A----A---TTAAT-----------T--------------------AA-TT--
gi|27 : tataatG---AT--A---------GA-CT----------------CAT-----A-------G-----T--A--C-----------T---A-------CT-C----A---A-T---AACG-AACTAT--T-TTTC-TA--ACG-T-----------A-ACTT-TA-TT----T--TCTAACC--CAA-T------G-C--------------T-A-GG--GTAT-AAGCA-A--------A--AAC-GGT---TT-----CAATT--------T-TTC-A-A------------------AA--A-------------------AA-G-C-AA-C-----A----A---TTGAT-----------T--------------------AA-TTTAG----CCT--AT-T----TATT--CAAC-GTAgtaaaatta
gi|28 : ttgaaaaatgctccgattataaatgtactcatagtaatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTATATGCAGA---AT--A---------TA-TT--------A-------CAC-----A-------A-----T-----T-----------T---T-------AT----------A-T---TACG----TAT--C-TT-C-TA--ACT-T---------T-A-TCTT-TT-TT----TTTACT-ACT--T-A-T------A-C-G-TTA-TGAC--AT-A-AGT-GTAT-G--C--A--------A--AAC-G-----TT-----AAATT--------T-CTT-A-C------------------AA--A-------------------AG-G-C-AA-C-----A----A---TTAAT-----------TAG----C---------C---AG-TA--A----CA---AT-G---ATA-T--CATC-GT
gi|29 : tcta---AT--A---------GA-CT----------------CAT-----A-------G-----T--A--C-----------T---A-------CT-C----A---A-T---AACG-AACTAT--T-TTTC-TA--ACG-T-----------A-ACTT-TA-TT----T--TCTAACC--CAA-T------G-C--------------T-A-GG--GTAT-AAGCA-A--------A--AAC-GGT---TT-----CAATT--------T-TTC-A-A------------------AA--A-------------------AA-G-C-AA-C-----A----A---TTGAT-----------T--------------------AA-TTTAG----CCT--AT-T----TATT--CAAC-GTA
gi|3 : CTATTC-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTTTGAC-AGAT--CC---TA-TTTT--A-CTAAAA-GCTA-A---AACCG-TTT-A------A-A-ATTTA-----AG--AC-AA-----TTT-----T--------A--A-AGTT------A-AC--AAATCC-A--T-A--AG--A-T-C--T-T--A-CA-ATTACATG------CGGG---TT--A---------GA-TT--------T-------CAT-----A-------GTAAATT--A--CAA---------T---T-------CC-C----A---A-T---AAC--AAATA-----TT-C-TA--ACA-T---------T---ACTT-TA-TT----T----T-GTCAAC-A-T------GCC-A-ATA-TGAC---T-A-GGT-GTAT----C--A--------C--AAC-GATAAATTTCC--AAAATGGATAATGT-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AAGG-C-AA-CATATGA----A---TTAAT-----------TAG----C---------CAAAAA-TT--A----C----AT-TA--ATA-T--CAAT-GTATATctg
gi|30 : aaT-C-ATG-AAA-TTACA---G-AAT------GT----TTT-GACCAGTCGGCCAAATA-T-----A-CTAAA--GC-----------G-TCG-A------A-G-ATT-A-----AGCGGC-AA-----T-A-----TTTCCCCAAA--A-G--T------A-GC--AAAGCA-GTGT-AT-AA--A-T-C--T---------ATTACAACTACATGCGGGGAAATTGA---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------t
gi|31 : tG-AAATAT--T-CA-G-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACC-ACC--C-A-T------G-C-A-TTT-TGAC--AC-A-GG--GCAT-A--C--A--------A--TTC-G-----TT------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G-C-AA-C-----A----A---TTAAT-----------TAATTAGC---------C---AA-TT--A----C----AT-TA--ATA-T--CAAC-GTA
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gi|34 : AT-C-ATG-GGA-T-ATA---G-GC-------GT----TTT-GAA-AGTC--CC---TA-TT----A-TTAAA--GCTA-A---A--CG-TTC-T------A-A-ATT-A-----AG--AT-AA-----T-------T--------A--A-A--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AA--A-T-C--T-T--A-CA-ATT
gi|35 : ttgA-TT----A-CTCAT--GGTA--------CG-CTT-C------T-A-ATT-A-----AG--AC-AT-----TT-----------------------T------G-GCC-AAATCC-A-GT-AT-AG--A-T-C--T-T--A-C
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gi|37 : A--A-------------------AA-G-C-AA-C-----A----A---TTAAT-----------TAATAAGC---------C---AA-TT--A----T----TT-TG--ATA-T--CAAC-GTATATGActt
gi|4 : CTATGC-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--CG-TTT-A------ATA-ATT-A-----AG--AC-AA-----TTT-----TA-------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--A-T-C--T-TA-A-CA-AT------TACATGCGGG---TT--A---------GA-TT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A--CA----------TG--T-------AC-T----AATCA-T---AACA-AAATAT--T-TT-C-TA--ACA-T---------TAA-ACTT-TA-TT----T--GCT-AAG--C-A-T------G-C-A-ATA-TGAC--AT-A-GG--GTAT-A--C-----------A--AAC-GA----GT-----AAATT--------T-TTC-A-CAAAATGAAAATGTTCACAAA--A-------------------AA-GAC-AA-T-----T----A---TTAAT-----------TAG----CG--------C---AA-TT--A----C----AT-T---AT--T--CACT-GTATATGAt
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Reference ( family-5477 ) : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--G-CAA-----TTA-----T--------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACATGTACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A-C-----------T---T-------AT-N----A---AT---AACG-AAATAT--T-TT-C-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-AN-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C--A--------A--AAC-G-----TT-----AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----C----AT-T---AT-AT--CAAC-GTATATGA
gi|1 : CTAT-C-ATGGAAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAAGCGCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-AGCAAGAA--A-CAT-----TTT-----T--------AACA-G--T------A-GC--AAATCCGA-GC-CT-AT--ATAC--T-T--C-CA-ATTACATG--CGCGCCGC---TT--A---------AA-TT--------T-------CATC----A-------G-----TACA-C-----------TG--T-------AC-T----A---ATCAAAACA-ATATAT--T-TT-C-TAAGACA-T---------T-A-ACTTCTA-TT----TTCACT-ACA--C-ATT------GCC-AA-TA-TGA-A--T-A----G-GTAT-A--CCAA--------A--AAC-A-----AT-----AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-GCATAAATGTTCAACAAAAAAGC-AA-----C-----A----A---TTAAT-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----CT---AC-TTA-ATAAT--CAAT-GTTAATGA
gi|10 : taaCTGT-C-ATA-GAA-T-ACA---ACAA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TAATT----A-CTAAA--GTAA-A---A--C-GTTT-A------A-A--TT-A-----AG--G-CAA-----TTA-----------------A-C--T------A--C--AA-TCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-TT-A-CAGATTACATGC-----CGGG---AT--A---------GAACT--------T-------CATC----A-------G-----T--AAC-----------TG--T-------AC-T----T---CT---A-CG-AAATAT--T-TT-C-TA--ACA-T---------T-A-ACTT-TATTT----T--ACT-ACA--C-A-T------G-C-AA-TA--GAAA--T-ATG--G-GTAT-A--C--GTTTATTACA--AAT-G-----AT------AATT--------T-TTC-AGCA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AAC----C-----A----A---T---T-----AG-----T-----TAATTCA-A----C-A---AA-TTA----C----AT-TG--AT-ATCCCAATGGTATATGAt
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gi|13 : ataaaTA-AAA-T-ACA---C-GT-------GT----TTT-GAC-ATTC--------A-TT----AGCTAAAA-GCTA-A---AA-C-GTTT-A------A-A--TT-A-----AG--G-CAT-----TTA-------------------G--T------A-GC--AACTCC-A-GT-AT-AG--AT-C--TGT--A-CA-ATTACCCG-------GGG---AT--A---------CA--T--------T-------CAT-----A-------G-----T--A-CAGATGTAAC--T---A-------AT-C----A---AT---AACT-AAATAA--T-TT-G-TC--ACGAT---------T-A-ACCT-TT-TT----T--ACT-ACA--C-A--------G-C-AA-T--TGACA--TGA-G--G-GTAT-A--C--A--------A--AAC-G-----AT------AAAT--------T-TTCGA-C------------------AAACA-------------------AA-G---------------------A-AAC----C-----A----A---T---TAAGTCAA-----T-----T-----ATG----TGC---AA-TTA----CA---AT-TTTAAT-TT--CACT-GTATATGA
gi|14 : actgtatCTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GG----TAT-GAA-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GGTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--G-CAA-----TTACATG-T--------A--A-A--T------A-GC--AAATCC-T-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-CTTACATG------CGGG---TT--A---------GA-TTACACGAATT-------CAT-----A-------G-----T--A-C-----------T---T-------AT-TTTAAA---AT---AACT-AAATAT--T-TT-C-TA--ACG-C---------T-A-AATT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------A-C-AT-TA-TGACA--T-A-G--G-GCAT-A--C--A--------A--AAC-A-----TT------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-C---------------------C-AA-----C-----A----A---C---T-----GA-----T-----T-----A-A----C-C---AA-GTA----CTTTAAT-TA--AT-AT--CAAC-GTAT
gi|15 : aCTAT-C-ATG-GAA-T-ACA---G-AA-------GT----AAG-AAA-AG-C--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C-GTTT--------A-G-ATT-A-----AG--G-CAA-----TTA-----C--------A--T-G--TAGAGAGA-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--TC-T--T-T--A-CA-CTTA-----ACAT-CGGG---AT--AGATACTAACGA-CT--------T-------CAA-----A-------G-----T--A-CAATTATTGTAAT---T-------AT-G----A---AT---AATG-AAA-AT--T-AT-C-TA--ACT-T---------A-A-ACTTCTA--T----T--ACT-ACC--CAA-T------A-C-AT-TA-T-------------G-GTATGA--C--A--------A--AAC-G-----GT-----GTAAG--------T-GTC-AGC------------------AA--AC------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----GA-----T-----TATTA-A-G------C---AA-GTA----C----AT-T---Ag
gi|16 : aaaCTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GGA-GATC--CC---TA-TT----AACTAAC--GCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTACATTGT--------A--A-G--T------A-GC--AAATCT-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-TA-ATTACATGTACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--G-C---------------T-------AT-G----A---AT---AACG-AAATAT--T-CA-C-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA--T----T--ACTAACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A----G-ATAT-A--C--A--------A--ATC-G-----TTTTTAAAAAAT--------T-TTCAA-CA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----A-------------------------C-C---AA-TTA----C----A--T---AT-AT--CAAC-GAATATGAat
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gi|18 : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GGA-GATC--CC---TA-TT----AACTAAC--GCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTACATTGT--------A--A-G--T------A-GC--AAATCT-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-TA-ATTACATGTACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--G-C---------------T-------AT-G----A---AT---AACG-AAATAT--T-CA-C-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA--T----T--ACTAACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A----G-ATAT-A--C--A--------A--ATC-G-----TTTTTAAAAAAT--------T-TTCAA-CA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----A-------------------------C-C---AA-TTA----C----A--T---AT-AT--CAAC-GAATATGA
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gi|2 : ataa-ATT-AAA-T-ACA---G-AATACTTTTGCCAAATTT-GAC-AGTC--CA---CA-T-----A-TTA-----CTA-A---A--C-GCTC-A------G-ACAT---------------AA-----TTA--------------G--A-G-----------GC--AAATC--A-GT-AT-AACCAT-C--T-TT-A-CA-ATTCCGACTATGCGCGGA---AT------------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A-TGT---------T---T-------TT-C----A---A-------GTAAACGT--T-TT---------------------T-A-ACTT-TA-TTATCCT--ACCGACC--C-A-TTAAATCG-C-ATATAGTGACAAAT-A-G--T-GTAT-G--C--A--------A--A-C-G-----TT-----AAAAT--------T-TTC-A-CTACTAAAAACCAGT----AA--A-------------------AA-A---------------------C-AA-----T-----T----A---T---T-----AA-----TGGTAAT-----A-GAAGCC-C---CA-TTAAAGGT----ATAT---GT-AT--CAAC-GTATATGA
gi|20 : acattacattcggaCTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GGA-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAC--GCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTACATG-T--------A--A-G--T------A-GC--AAATCT-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-TA-ATTACATGTACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--G-C-----------T---T-------AT-G----A---AT---AACG-AAATAT--T-CA-C-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C--A--------A--ATC-G-----TTTTA--AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----A-------------------------C-C---AA-TTA----C----A--T---AT-AT--CAAC-GAATATGA
gi|21 : TG-TAA-T-ACA---A-AA-------GT----TTT-GAA-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTG-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTA-----------------A-G--A------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTATATG------CGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------TATCAAATA-------G-----T--A-C-----------T---T-------GT-C----A---TT---AACG-AAATAT--T-TT-T-TA--ACG-T---------C-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C--A--------A--AAG-G-----TT------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------A-AA-----C-----AATTTA---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----C----AT-TA--AT-AT--TAAC-GTATATG
gi|22 : AT-C-ATG-ATA-T-ACT---G-AA-------GA----TTT-GAA-AGTT--CT---TA-TTCCTTG-CTAAG--ATTACATGTA--C-GTTC-T------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----TT------T----------------T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-------------CGCAGG---AT--A---------GA-TT-----------------AT-----A-------C-----G--A-C-----------T---T-------A--A----G---AT---TAC-----TCT--TGTT-C-TA--ACG-CGTTGCCGTGT-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACA--C-A-A------A-C-GC-TA-TCACA--A-A-G--T-ACAT-A--C--A--------A--AAC-G------T-----AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AG-A---------------------C-AA-----C-----A----A---A---T-----GA-----A-----T-----A-A----C-T---AA-TTA----CA---AT-A---AT-AT--CTTT-GTATA
gi|23 : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAA-AGTT--CC---TATTT----A-CTCAA--G-TA-A---G--C-GTTT-G------A-A-ATTAA-----AG--G-CGAAATTTTTA-----A--------A--A-G--T------AGGC--AAATCT-AGGT-AT-AGA-AT-CG-G-T--ACCA-ATTACA-------GC-GG---AT--A---------GA--------------------------------------------A-C-----------T---T-------AT-G----A---ATA--AACG-AAG---------------------------------------TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-AC--A-TGACA--T-A-G--GCGTAT-A--C--A--------A--AACAG-----TT------ACAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-GC--------------------C-AA-----C-----A----AAATT---T-----AA-----T-----TAGTA-A-G----C-C---AATTTA----C----AT-TA--AT-AT--CAA
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gi|25 : gtat-C-ATG-AAAAT-ACAAGGG-AA-------GT----TTT-AA--AATCG-CC---T---T----A-C-AAA--GCTG-A---A--------------------AT--A-----AG--G-CAA-----TTT-----TT-------A--A-G--T------A-GC--AA-TCC-A-GT-AT-AG--AT-CATT-T--A-CA-ATTACATG------CGGG---AT--AA--------GA-CT--------T-------CAT-----A-------------T--A-C-----------T---TT------GT-C----A---AT---AACG-AAAT-T--T-TT-C-TA--ACG-T---------T-T-AC---TA-------T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-A--TA-TGA-A--T-A----G-GTA--A--C--A--------A--AAC-G-----T-------AAAT--------T-TTC-A-CA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---C---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----T----AT-TG--AT-AT--CAAC-GTATATAAa
gi|26 : TAT-C-AAG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TT--GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTG-A---A--------------------ATT-A-----AG--G--AA-----TTT-----TC-------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACA------TGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A-C-----------T---T-------TTCA----A---AT---AAC--AAATAT--T-TT-C-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA--T----T--ACT-A-C--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A----G-GTAT-A--C--A--------A--AAC-G------T-----AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-
gi|27 : tataatG---AT--A---------GA-CT----------------CAT-----A-------G-----T--A-C-----------T---A-------CT-C----A---AT---AACG-AACTAT--T-TTTC-TA--ACG-T-----------A-ACTT-TA-TT----T--TCTAACC--CAA-T------G-C--------------T-A-G--G-GTAT-AAGCA-A--------A--AAC-GGT---TT-----CAATT--------T-TTC-A-A------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----GATTAATT-----T-----A-G----C-C---TA-T------------T-T---AT--T--CAAC-GTAattgtaaaatta
gi|28 : ttgaaaaatgctccgattataaatgtactcatagtaatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTATATGCAGA---AT--A---------TA-TT--------A-------CAC-----A-------A-----T----T-----------T---T-------AT----------AT---TACG----TAT--C-TT-C-TA--ACT-T---------T-A-TCTT-TT-TT----TTTACT-ACT--T-A-T------A-C-GT-TA-TGACA--T-A-A--GTGTAT-G--C--A--------A--AAC-G-----TT-----AAATT--------T-CTT-A-C------------------AA--A-------------------AG-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AG-TAA----CA---AT-G---AT-AT--CATC-GT
gi|29 : tcta---AT--A---------GA-CT----------------CAT-----A-------G-----T--A-C-----------T---A-------CT-C----A---AT---AACG-AACTAT--T-TTTC-TA--ACG-T-----------A-ACTT-TA-TT----T--TCTAACC--CAA-T------G-C--------------T-A-G--G-GTAT-AAGCA-A--------A--AAC-GGT---TT-----CAATT--------T-TTC-A-A------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----GATTAATT-----T-----A-G----C-C---TA-T------------T-T---AT--T--CAAC-GTA
gi|3 : CTATTC-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTTTGAC-AGAT--CC---TA-TTTT--A-CTAAAA-GCTA-A---AACC-GTTT-A------A-A-ATTTA-----AG--A-CAA-----TTT-----T--------A--A-AGTT------A-AC--AAATCC-A--T-A--AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACATG------CGGG---TT--A---------GA-TT--------T-------CAT-----A-------GTAAATT--A-CAA---------T---T-------CC-C----A---AT---AAC--AAATA-----TT-C-TA--ACA-T---------T---ACTT-TA-TT----T----T-GTCAAC-A-T------GCC-AA-TA-TGAC---T-A-G--GTGTAT----C--A--------C--AAC-GATAAATTTCC--AAAATGGATAATGT-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AAGG---------------------C-AA-----CATATGA----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-CAAAAA-TTA----C----AT-TA--AT-AT--CAAT-GTATATctg
gi|30 : aaT-C-ATG-AAA-TTACA---G-AAT------GT----TTT-GACCAGTCGGCCAAATA-T-----A-CTAAA--GC------------GTCG-A------A-G-ATT-A-----AGCGG-CAA-----T-A-----TTTCCCCAAA--A-G--T------A-GC--AAAGCA-GTGT-AT-AA--AT-C--T---------ATTACAACTACATGCGGGGAAATTGA---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------t
gi|31 : tG-AAATAT--T-CA-G-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACC-ACC--C-A-T------G-C-AT-TT-TGACA--C-A-G--G-GCAT-A--C--A--------A--TTC-G-----TT------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----CAATT-A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----C----AT-TA--AT-AT--CAAC-GTA
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gi|33 : ACG-AAATAT--T-TT-C-TA--ACA-T---------T-G-ACTT-TA-CT----T--ATT-ACC--C-A-T------A-C-AT-TA-TCACA--T-A-G--A-GTAT-A--C--A--------A--AAC-G-----TT------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AG-G---------------------T-GA-----T-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-A----C-C---AA-
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Reference ( family-5477 ) : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--G-CAA-----TTA-----T--------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACATGTACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A-C-----------T---T-------AT-N----A---AT---AACG-AAATAT--T-TT-C-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C--A--------A--AAC-G-----TT-----AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----C----AT-T---AT-AT--CAAC-GTATATGA
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gi|19 : CTAT-C-ATT-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-CGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GTTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----T-------T--------A--A-G--T------A-AC--AAATCC-C-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATAATTTA-ATATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A-C-----------T---T-------AT-C----A---AC---AACT-AGATAT--T-TT-C-TA--A-G-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-G-AT-TA-TGAAA--T-A-G--G-GTAT-A--C--A--------A--AAC-G-----TT------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----CAATT-A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----C----AT-TA--AT-AT--CAAC-GTATA
gi|2 : ataa-ATT-AAA-T-ACA---G-AATACTTTTGCCAAATTT-GAC-AGTC--CA---CA-T-----A-TTA-----CTA-A---A--C-GCTC-A------G-ACAT---------------AA-----TTA--------------G--A-G-----------GC--AAATC--A-GT-AT-AACCAT-C--T-TT-A-CA-ATTCCGACTATGCGCGGA---AT------------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A-TGT---------T---T-------TT-C----A---A-------GTAAACGT--T-TT---------------------T-A-ACTT-TA-TTATCCT--ACCGACC--C-A-TTAAATCG-C-ATATAGTGACAAAT-A-G--T-GTAT-G--C--A--------A--A-C-G-----TT-----AAAAT--------T-TTC-A-CTACTAAAAACCAGT----AA--A-------------------AA-A---------------------C-AA-----T-----T----A---T---T-----AA-----TGGTAAT-----A-GAAGCC-C---CA-TTAAAGGT----ATAT---GT-AT--CAAC-GTATATGA
gi|20 : acattacattcggaCTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GGA-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAC--GCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTACATG-T--------A--A-G--T------A-GC--AAATCT-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-TA-ATTACATGTACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--G-C-----------T---T-------AT-G----A---AT---AACG-AAATAT--T-CA-C-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C--A--------A--ATC-G-----TTTTA--AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----A-------------------------C-C---AA-TTA----C----A--T---AT-AT--CAAC-GAATATGA
gi|21 : TG-TAA-T-ACA---A-AA-------GT----TTT-GAA-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTG-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTA-----------------A-G--A------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTATATG------CGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------TATCAAATA-------G-----T--A-C-----------T---T-------GT-C----A---TT---AACG-AAATAT--T-TT-T-TA--ACG-T---------C-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C--A--------A--AAG-G-----TT------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------A-AA-----C-----AATTTA---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----C----AT-TA--AT-AT--TAAC-GTATATG
gi|22 : AT-C-ATG-ATA-T-ACT---G-AA-------GA----TTT-GAA-AGTT--CT---TA-TTCCTTG-CTAAG--ATTACATGTA--C-GTTC-T------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----TT------T----------------T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-------------CGCAGG---AT--A---------GA-TT-----------------AT-----A-------C-----G--A-C-----------T---T-------A--A----G---AT---TAC-----TCT--TGTT-C-TA--ACG-CGTTGCCGTGT-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACA--C-A-A------A-C-GC-TA-TCACA--A-A-G--T-ACAT-A--C--A--------A--AAC-G------T-----AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AG-A---------------------C-AA-----C-----A----A---A---T-----GA-----A-----T-----A-A----C-T---AA-TTA----CA---AT-A---AT-AT--CTTT-GTATA
gi|23 : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAA-AGTT--CC---TATTT----A-CTCAA--G-TA-A---G--C-GTTT-G------A-A-ATTAA-----AG--G-CGAAATTTTTA-----A--------A--A-G--T------AGGC--AAATCT-AGGT-AT-AGA-AT-CG-G-T--ACCA-ATTACA-------GC-GG---AT--A---------GA--------------------------------------------A-C-----------T---T-------AT-G----A---ATA--AACG-AAG---------------------------------------TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-A--CA-TGACA--T-A-G--GCGTAT-A--C--A--------A--AACAG-----TT------ACAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-GC--------------------C-AA-----C-----A----AAATT---T-----AA-----T-----TAGTA-A-G----C-C---AATTTA----C----AT-TA--AT-AT--CAA
gi|24 : aaT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----ATT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CT------CTA-A---A--G-GCTTGA------A-A-ATT-A-----AG--G-CAA-----TTT-----A--------A--A-G--TC-----A-GC--AAATCC-A-GT-ATCAG--AT-C--T-TTAA-CA-AT------TACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A-CT----------T---T-------TT-C----A---AT---AACG-AAATATTGT-TT-CTTA--ACG-T---------T-ACACTT-TA--T----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-A--TA-TGACA--T-A----G-GTAT-A--C--------------AAC-G-----TT-----GACAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-A---------------------C-AA-----CAATT-A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-A---AA-TTA----aacg
gi|25 : gtat-C-ATG-AAAAT-ACAAGGG-AA-------GT----TTT-AA--AATCG-CC---T---T----A-C-AAA--GCTG-A---A--------------------AT--A-----AG--G-CAA-----TTT-----TT-------A--A-G--T------A-GC--AA-TCC-A-GT-AT-AG--AT-CATT-T--A-CA-ATTACATG------CGGG---AT--AA--------GA-CT--------T-------CAT-----A-------------T--A-C-----------T---TT------GT-C----A---AT---AACG-AAAT-T--T-TT-C-TA--ACG-T---------T-T-AC---TA-------T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-A--TA-TGA-A--T-A----G-GTA--A--C--A--------A--AAC-G-----T-------AAAT--------T-TTC-A-CA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---C---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----T----AT-TG--AT-AT--CAAC-GTATATAAa
gi|26 : TAT-C-AAG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TT--GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTG-A---A--------------------ATT-A-----AG--G--AA-----TTT-----TC-------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACA------TGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A-C-----------T---T-------TTCA----A---AT---AAC--AAATAT--T-TT-C-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA--T----T--ACT-A-C--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A----G-GTAT-A--C--A--------A--AAC-G------T-----AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-
gi|27 : tataatG---AT--A---------GA-CT----------------CAT-----A-------G-----T--A-C-----------T---A-------CT-C----A---AT---AACG-AACTAT--T-TTTC-TA--ACG-T-----------A-ACTT-TA-TT----T--TCTAACC--CAA-T------G-C--------------T-A-G--G-GTAT-AAGCA-A--------A--AAC-GGT---TT-----CAATT--------T-TTC-A-A------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----GATTAATT-----T-----A-G----C-C---TA-T------------T-T---AT--T--CAAC-GTAattgtaaaatta
gi|28 : ttgaaaaatgctccgattataaatgtactcatagtaatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTATATGCAGA---AT--A---------TA-TT--------A-------CAC-----A-------A-----T----T-----------T---T-------AT----------AT---TACG----TAT--C-TT-C-TA--ACT-T---------T-A-TCTT-TT-TT----TTTACT-ACT--T-A-T------A-C-GT-TA-TGACA--T-A-A--GTGTAT-G--C--A--------A--AAC-G-----TT-----AAATT--------T-CTT-A-C------------------AA--A-------------------AG-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AG-TAA----CA---AT-G---AT-AT--CATC-GT
gi|29 : tcta---AT--A---------GA-CT----------------CAT-----A-------G-----T--A-C-----------T---A-------CT-C----A---AT---AACG-AACTAT--T-TTTC-TA--ACG-T-----------A-ACTT-TA-TT----T--TCTAACC--CAA-T------G-C--------------T-A-G--G-GTAT-AAGCA-A--------A--AAC-GGT---TT-----CAATT--------T-TTC-A-A------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----GATTAATT-----T-----A-G----C-C---TA-T------------T-T---AT--T--CAAC-GTA
gi|3 : CTATTC-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTTTGAC-AGAT--CC---TA-TTTT--A-CTAAAA-GCTA-A---AACC-GTTT-A------A-A-ATTTA-----AG--A-CAA-----TTT-----T--------A--A-AGTT------A-AC--AAATCC-A--T-A--AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACATG------CGGG---TT--A---------GA-TT--------T-------CAT-----A-------GTAAATT--A-CAA---------T---T-------CC-C----A---AT---AAC--AAATA-----TT-C-TA--ACA-T---------T---ACTT-TA-TT----T----T-GTCAAC-A-T------GCC-AA-TA-TGAC---T-A-G--GTGTAT----C--A--------C--AAC-GATAAATTTCC--AAAATGGATAATGT-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AAGG---------------------C-AA-----CATATGA----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-CAAAAA-TTA----C----AT-TA--AT-AT--CAAT-GTATATctg
gi|30 : aaT-C-ATG-AAA-TTACA---G-AAT------GT----TTT-GACCAGTCGGCCAAATA-T-----A-CTAAA--GC------------GTCG-A------A-G-ATT-A-----AGCGG-CAA-----T-A-----TTTCCCCAAA--A-G--T------A-GC--AAAGCA-GTGT-AT-AA--AT-C--T---------ATTACAACTACATGCGGGGAAATTGA---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------t
gi|31 : tG-AAATAT--T-CA-G-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACC-ACC--C-A-T------G-C-AT-TT-TGACA--C-A-G--G-GCAT-A--C--A--------A--TTC-G-----TT------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----CAATT-A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----C----AT-TA--AT-AT--CAAC-GTA
gi|32 : CCAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-----------T----TTT-AAA-AGAC--CC---TT-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C---TT-AACTTCTA-A-ATC-A-----AG--G-CAG-----T-------T--------A--A-G--T------A-GC---------------------AT-C--T-T--A-CA-AT------TACATGCGGG---AT--AGATTACAC-GA-CT--------T-------CAA-----A-------G-----T--A-C-----------a
gi|33 : ACG-AAATAT--T-TT-C-TA--ACA-T---------T-G-ACTT-TA-CT----T--ATT-ACC--C-A-T------A-C-AT-TA-TCACA--T-A-G--A-GTAT-A--C--A--------A--AAC-G-----TT------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AG-G---------------------T-GA-----T-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-A----C-C---AA-
gi|34 : AT-C-ATG-GGA-T-ATA---G-GC-------GT----TTT-GAA-AGTC--CC---TA-TT----A-TTAAA--GCTA-A---A--C-GTTC-T------A-A-ATT-A-----AG--A-TAA-----T-------T--------A--A-A--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AA--AT-C--T-T--A-CA-ATT
gi|35 : ttgA-TT----A-CTCAT--GGTA--------C-GCTT-C------T-A-ATT-A-----AG--A-CAT-----TT-----------------------T------G-GCC-AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-C
gi|36 : cttattcttgtttcaagaC--C-A-T------G-CCAT-TA-TGAC---T-A-G--G--TAT-A--C--A--------A--AAC-G-----TT------AAAT--------T-TTCAA-C------------------AA--A-------------------AT-G---------------------C-AA-----C-----A----A---C---T-----AA-----------T-----A-G----C-C---CA-TTA----T----AT-TG--AT-AT--CAAC-ggcaggagtgaatt
gi|37 : A--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----AA-----T-----TAATA-A-G----C-C---AA-TTA----T----TT-TG--AT-AT--CAAC-GTATATGActt
gi|4 : CTATGC-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C-GTTT-A------ATA-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTT-----TA-------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-TA-A-CA-AT------TACATGCGGG---TT--A---------GA-TT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A-CA----------TG--T-------AC-T----AATCAT---AACA-AAATAT--T-TT-C-TA--ACA-T---------TAA-ACTT-TA-TT----T--GCT-AAG--C-A-T------G-C-AA-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C-----------A--AAC-GA----GT-----AAATT--------T-TTC-A-CAAAATGAAAATGTTCACAAA--A-------------------AA-GA--------------------C-AA-----T-----T----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----CGC---AA-TTA----C----AT-T---AT--T--CACT-GTATATGAt
gi|5 : aaCTATGC-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C-GTTT-A------ATA-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTT-----TA-------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-TA-A-CA-AT------TACATGCGGG---TT--A---------GA-TT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A-CA----------TG--T-------AC-T----AATCAT---AACA-AAATAT--T-TT-C-TA--ACA-T---------TAA-ACTT-TA-TT----T--GCT-AAG--C-A-T------G-C-AA-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C-----------A--AAC-GA----GT-----AAATT--------T-TTC-A-CAAAATGAAAATGTTCACAAA--A-------------------AA-GA--------------------C-AA-----T-----T----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----CGC---AA-TTA----C----AT-T---AT--T--CACT-GTATATGA
gi|6 : aaCTATGC-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C-GTTT-A------ATA-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTT-----TA-------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-TA-A-CA-AT------TACATGCGGG---TT--A---------GA-TT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A-CA----------TG--T-------AC-T----AATCAT---AACA-AAATAT--T-TT-C-TA--ACA-T---------TAA-ACTT-TA-TT----T--GCT-AAG--C-A-T------G-C-AA-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C-----------A--AAC-GA----GT-----AAATT--------T-TTC-A-CAAAATGAAAATGTTCACAAA--A-------------------AA-GA--------------------C-AA-----T-----T----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----CGC---AA-TTA----C----AT-T---AT--T--CACT-GTATATGA
gi|7 : aaCTGT-C-ATA-AAA-T-ATA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--AC---TA-TT----A-C-AAA--GCTT-A---A--C-GTTT----------A-ATT-A-----AG--G-C---------A-----T--------A--A-G--T------A-GCAAAAATCC-ATTT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACATGC-------GG---AT--A---------GA-TT--------TAAAAATCCAT-----AGTTACATG-----T--A-C-----------TTAAT-------AC-A----A---AT---AACG-AAATAT--T-TT-T-CT--ACATT---------T-A-ACTT-TT-AT----C--ACT-A-C--A-A-T------G-C-AA-TA-TGACA--T-A-G--G-GTATAA--C--A--------AACAAC-G-----TT-----AAATT--------T-TTC-A-CA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AAACAATT-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---GA-TTA----T----AT-TTG-AA-ATC-CAAC-GTATATGA
gi|8 : ataaCTGT-C-ATA-AAA-T-ATA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--AC---TA-TT----A-C-AAA--GCTT-A---A--C-GTTT----------A-ATT-A-----AG--G-C---------A-----T--------A--A-G--T------A-GCAAAAATCC-ATTT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACATGC-------GG---AT--A---------GA-TT--------TAAAAATCCAT-----AGTTACATG-----T--A-C-----------TTAAT-------AC-A----A---AT---AACG-AAATAT--T-TT-T-CT--ACATT---------T-A-ACTT-TT-AT----C--ACT-A-C--A-A-T------G-C-AA-TA-TGACA--T-A-G--G-GTATAA--C--A--------AACAAC-G-----TT-----AAATT--------T-TTC-A-CA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AAACAATT-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---GA-TTA----T----AT-TTG-AA-ATC-CAAC-GTATATGAt
gi|9 : ataaCTGT-C-ATA-AAA-T-ATA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--AC---TA-TT----A-C-AAA--GCTT-A---A--C-GTTT----------A-ATT-A-----AG--G-C---------A-----T--------A--A-G--T------A-GCAAAAATCC-ATTT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACATGC-------GG---AT--A---------GA-TT--------TAAAAATCCAT-----AGTTACATG-----T--A-C-----------TTAAT-------AC-A----A---AT---AACG-AAATAT--T-TT-T-CT--ACATT---------T-A-ACTT-TT-AT----C--ACT-A-C--A-A-T------G-C-AA-TA-TGACA--T-A-G--G-GTATAA--C--A--------AACAAC-G-----TT-----AAATT--------T-TTC-A-CA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AAACAATT-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---GA-TTA----T----AT-TTG-AA-ATC-CAAC-GTATATGAt
blockSeqs : T C . A T AGG C TACTTTT CAAA T CC GG AAA A CCTT G A C TGT AC G AACTTCTA C A . CGG AATTT ATTTCCCCAA . A GT AGAGAG G AA . G C C CC . AT G TA C G T ATGTACAT GAA TG GATACTAAC A ACACGAATT CAAAT GTTACAT TAAAT . A AATTATTGTAATTATGA A T TG G T T . A GTTGCCGTGT C C TT ATCC TT A AA A . TAAATC C C TA G AA G GGC C G AG GTTTATTAC AC A ATAAATTTCCA GGATAATG G G G AAAATGAAAATGTTCACA AC AAGATAAATGTTCACAGAA G C A CATATG TTAG AAT . AAGTC TTAATTC T AAGC G AAA T AAGG TTTA A TTA A CC G
blockSeqs : G . . A . . . T . . C G . T TT A A . . A . GAA . T . GC . ACATTGT . . . C . AA . T . . A . T . T . . T ATGTACAT . . GATTACAC . TAAAAATC C GTTACAT . . . AGATGTAACTAATCA . . . . T . . T TA . . T . . A . A . . . . A . . . TG T A AG AA AC . TTTTTAAA . . A G AAAATGAAAATGTTCACA . C . A . ACAATT ATTT . . . TGGTAAT . . G . . . A . TG A C .
blockSeqs : G . . . . . . . . . C . . . . A . . . . . AAT . . . G . ACATTGT . . . . . AA . T . . A . G . T . . T ATGTACAT . . A . TAAAAATC A GTTACAT . . . ATGTAACTAATCA . . . . . . . T TA . . T . . A . A . . . . T . . . G T A . AA AC . TTTTTAAA . . A . AAAATGAAAATGTTCACA . . . A . ACAATT . . . . TTAATTT . . G . . . A . TG A C .
blockSeqs : G . . . . . . . . . C . . . . A . . . . . AAT . . . A . ACATTGT . . . . . C . T . . . . . . A . . T GACTATGC . . . . TAAAAATC . . . . . TTTCTAATCAA . . . . . . . T TA . . T . . G . . . . . . T . . . G . A . A C . TTTTTAAA . . A . TACTAAAAACCAGT . . . A . ACAATT . . . . TTAATTT . . G . . . A . TG T C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . AAT . . . G . ACATGT . . . . . . . T . . . . . . A . . T ATGTACAT . . . . TAAAATC . . . . . ATGTACTAATC . . . . . . . . T . . T . . A . . . . . . A . . . G . . . A . . TTTTAA . . A . A . . . . . CAATC . . . . TTATTA . . . . . . . . G A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . AA . . . G . ACATGT . . . . . . . . . . . . . . A . . T AACTACAT . . . . T . . . . . ATGTACTAATC . . . . . . . . T . . T . . A . . . . . . T . . . G . . . A . . GTTTC . . . . A . . . . . CAATT . . . . TTAGTA . . . . . . . . A A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . AA . . . G . TTT . . . . . . . . . . . . . . . . . T TTAATAT . . . . T . . . . . ATGTACTAATC . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . T . . . G . . . A . . GTTTC . . . . A . . . . . CAATT . . . . TTAATA . . . . . . . . A A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . AA . . . A . TTC . . . . . . . . . . . . . . . . . T ATACAT . . . . T . . . . . TTATTTTAAA . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . T . . . G . . . A . . AGTA . . . . A . . . . . CAATT . . . . TTT . . . . . . . . A A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . AA . . . A . TTA . . . . . . . . . . . . . . . . . A TACAT . . . . T . . . . . TTAATACAA . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . T . . . G . . . A . . AGTA . . . . A . . . . . CC . . . . TT . . . . . . . . A A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . AA . . . A . TTA . . . . . . . . . . . . . . . . . T TACAT . . . . T . . . . . TTAATACAA . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . . T . . . G . . . A . . AGTA . . . . A . . . . . CC . . . . TT . . . . . . . . A A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . AA . . . A . TTA . . . . . . . . . . . . . . . . . T TACAT . . . . T . . . . . TTAATACAA . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . T . . . G . . . A . . ATA . . . . A . . . . . C . . . . TT . . . . . . . . G A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . AA . . . A . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . T TACAT . . . . T . . . . . GTTTTTCA . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . T . . . G . . . A . . GTG . . . . A . . . . . C . . . . TT . . . . . . . . A A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . AA . . . A . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . T TACAT . . . . T . . . . . AATTCCCA . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . T . . . A . . . A . . TTA . . . . . . . . . . C . . . . TT . . . . . . . . A A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . AA . . . A . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . T ATGC . . . . T . . . . . TGTACTT . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . C . . . G . . . A . . TTG . . . . . . . . . . C . . . . AT . . . . . . . . G A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . AG . . . G . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . T ACAT . . . . T . . . . . TTTTTCA . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . T . . . G . . . A . . TTA . . . . . . . . . . C . . . . TT . . . . . . . . G A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . AA . . . G . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . T ATGC . . . . T . . . . . TTTGTCA . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . T . . . G . . . A . . TTA . . . . . . . . . . C . . . . TT . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . AA . . . G . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . T ATGC . . . . T . . . . . TTTTCAA . . . . . . . . C . . C . . . . . . . . . A . . . G . . . A . . TTA . . . . . . . . . . T . . . . TT . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . TA . . . G . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . T ATGC . . . . T . . . . . TTATCA . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . T . . . G . . . A . . TTA . . . . . . . . . . C . . . . TT . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . GA . . . A . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . T ATG . . . . T . . . . . TTATGA . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . T . . . G . . . A . . AT . . . . . . . . . . C . . . . TT . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . AA . . . G . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T CCG . . . . A . . . . . TTGTCA . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . T . . . G . . . A . . TT . . . . . . . . . . C . . . . TT . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . AA . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T ATG . . . . T . . . . . TTATGA . . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . A . . . G . . . A . . AT . . . . . . . . . . C . . . . TT . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . TA . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATG . . . . T . . . . . TACTCA . . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . A . . . G . . . A . . TT . . . . . . . . . . C . . . . TT . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . CT . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATG . . . . T . . . . . TACTCA . . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . A . . . G . . . A . . TT . . . . . . . . . . C . . . . TT . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . A . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATG . . . . T . . . . . TATGA . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . G . . . A . . TT . . . . . . . . . . C . . . . TT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . T . . . . . TATGA . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . TA . . . . . . . . . . C . . . . TT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . TATGA . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . TT . . . . . . . . . . C . . . . TT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . TTAAG . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . TA . . . . . . . . . . T . . . . TT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . .
blockSeqCons : ** ***** AT************* ** ATGTACAT ***** ** TTATCA***************************** *** ** ** G*** A********** TTA********** ********************* *** **** *** A*
originalCons : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--G-CAA-----TTA-----T--------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACATGTACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A-C-----------T---T-------AT-N----A---AT---AACG-AAATAT--T-TT-C-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C--A--------A--AAC-G-----TT-----AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----C----AT-T---AT-AT--CAAC-GTATATGA
finalCons : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--G-CAA-----TTAT-------------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACATGTACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----T--A-CTTATCA-----------------------------AT---AACG-AAATAT--T-TT-C-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-AG---G-GTAT-A--CA----------A--AAC-GTTA----------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----C----AT-T---ATA-T--CAAC-GTATATGA
Alignments
lowQualScore : 333333333333333 22222222 111111111 1111111111111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333 2222222222222 444444444444444444 1111111111111111111 111111111111111111111 11111111111 11111111111111111 222
lowQualScore : 6 1 1 2 1 222 1 5555555 2222 1 22 33 222 2 4444 5 44 1 222 33 1 7777777777 1 2 33333 2222 33333 444444444444444 11 1 11 555555 1 66 1 6 1 1 44 1 44 1 88 1 1 2 77777777 222 11 111111111 1 8888888888888888 77777 4444444444444444444444444444444444444444444444444 1 1 1 2 11 1 1 11 77777777777 3 1 2 66 2222 33 7 11 3 1 333333 2 1 66 1 11 1 5555 3 5 33 66666666666 66 1 6666666666666 0 44444444 1 6 2 555555555555555555 11 0000000000000000000 1 555555555555555555555 1 88888888888 5555 222 222 33333 11111111111111111 1 2222 5 222 1 2222 8888 1 444 11 66 1
lowQualScore : . . . . . ... . ....... .... . .. .. ... . .... . .. . ... .. . .......... . . ..... .... ..... ............... .. . .. ...... . .. . . . . .. . .. . .. . . . ........ ... .. ......... . ................ ..... ................................................. . . . . .. . . .. ........... . . . .. .... .. . .. . . ...... . . .. . .. . .... . . .. ........... .. . ............. . ........ . . . .................. .. ................... . ..................... . ........... .... ... ... ..... ................. . .... . ... . .... .... . ... .. .. .
lowQualScore : 2 5 4 8 4 444 4 9999999 9999 4 66 33 444 7 7777 3 55 3 333 22 3 7777777777 3 7 33333 0000 33333 666666666666666 88 3 88 222222 3 88 3 7 3 3 55 3 55 3 55 3 4 0 88888888 333 88 111111111 3 3333333333333333 11111 3333333333333333333333333333333333333333333333333 4 4 3 6 88 3 3 88 00000000000 9 3 6 44 7777 55 7 77 8 2 666666 5 2 99 2 77 2 2222 8 0 44 33333333333 44 2 4444444444444 7 55555555 2 2 5 000000000000000000 77 6666666666666666666 2 222222222222222222222 2 77777777777 2222 111 111 00000 22222222222222222 2 7777 0 222 2 7777 2222 3 333 77 00 4
consensus : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--G-CAA-----TTA-----T--------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACATGTACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----TA-C-----------T---T-------A--TC----A-AT-AACG-AAATA-T--T-TTC-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C--A--------A--AAC-G-----TT-----AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----C----AT-T---AT-AT--CAAC-GTATATGA
Reference ( family-5477 ) : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--G-CAA-----TTA-----T--------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACATGTACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----TA-C-----------T---T-------A--TC----A-AT-AACG-AAATA-T--T-TTC-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C--A--------A--AAC-G-----TT-----AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----C----AT-T---AT-AT--CAAC-GTATATGA
gi|1 : CTAT-C-ATGGAAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAAGCGCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-AGCAAGAA--A-CAT-----TTT-----T--------AACA-G--T------A-GC--AAATCCGA-GC-CT-AT--ATAC--T-T--C-CA-ATTACATG--CGCGCCGC---TT--A---------AA-TT--------T-------CATC----AGTACACTG-----TA-C-----------T---A-------A--TC----A-A--AACA-ATATA-T--T-TTC-TAAGACA-T---------T-A-ACTTCTA-TT----TTCACT-ACA--C-ATT------GCC-AA-TA-TGA-A--T-A----G-GTAT-A--CCAA--------A--AAC-A-----AT-----AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-GCATAAATGTTCAACAAAAAAGC-AA-----C-----A----A---TTAAT-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----CT---AC-TTA-ATAAT--CAAT-GTTAATGA
gi|10 : taaCTGT-C-ATA-GAA-T-ACA---ACAA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TAATT----A-CTAAA--GTAA-A---A--C-GTTT-A------A-A--TT-A-----AG--G-CAA-----TTA-----------------A-C--T------A--C--AA-TCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-TT-A-CAGATTACATGC-----CGGG---AT--A---------GAACT--------T-------CATC----A-------G-----TAAC-----------TG--T-------ACTTC-------T-A-CG-AAATA-T--T-TTC-TA--ACA-T---------T-A-ACTT-TATTT----T--ACT-ACA--C-A-T------G-C-AA-TA--GAAA--T-ATG--G-GTAT-A--C--GTTTATTACA--AAT-G-----AT------AATT--------T-TTC-AGCA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AAC----C-----A----A---T---T-----AG-----T-----TAATTCA-A----C-A---AA-TTA----C----AT-TG--AT-ATCCCAATGGTATATGAt
gi|11 : atacCTAT-CCATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC----A-TT----A-C-AAA--GCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTT-----T--------A--AAG--T------A-GC--AAATCC-A-AT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-A------ATACATGCGGG---TT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----TA-C-----------A---TGTAACTAA--TC----A-AT-AACA-AAA-A-T--T-TTC-TA--ATA-T---------T-A-ACTT-TA-TT-------A-T-ACA--C-A-T------G-C-AT--A-TGACA----A-G--G-GTAT-A--C--A--------A--AAC-G-----AT-----AAA----------T-TTC-A-C------------------AA--AAAGATAAATGTTCACAGAAAA-G---------------------C-AACAAT-C-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA--TA----C----AT-TA--AT-AT--CAAT-GTATATGA
gi|12 : aCTGT-C-ATA-AAAAT-AT----G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--AC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--CGGTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--GCCAA-----TT------------------A-G--T------A-GC--AAAT-C-A-TTCAT-AGA-AT-CT-T-T--A-CA-A-TACATG-----GCGGG---AT--A---------GA-TT--------TAAAATC-CATA----A-------G-----TA-A-----------T---TTCTA---A--TCA---A-AT-AACG-AAAT--T--T-TTC-TA--ACA-T---------T-A-ACTT-TA-TT----C--ACT-ACA--C-A-T------G-C-AT-TA-TGA-A--T-A-GGCG-GTA--A--T--A--------AC-AAC-G-----TT-------AAT--------TGTTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------CAAA-----C-----ATTAGA---T---T-----AAT----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----T----AT-T---GA-AT--C-AC-GTATATGAt
gi|13 : ataaaTA-AAA-T-ACA---C-GT-------GT----TTT-GAC-ATTC--------A-TT----AGCTAAAA-GCTA-A---AA-C-GTTT-A------A-A--TT-A-----AG--G-CAT-----TTA-------------------G--T------A-GC--AACTCC-A-GT-AT-AG--AT-C--TGT--A-CA-ATTACCCG-------GGG---AT--A---------CA--T--------T-------CAT-----A-------G-----TA-CAGATGTAAC--T---A-------A--TC----A-AT-AACT-AAATA-A--T-TTG-TC--ACGAT---------T-A-ACCT-TT-TT----T--ACT-ACA--C-A--------G-C-AA-T--TGACA--TGA-G--G-GTAT-A--C--A--------A--AAC-G-----AT------AAAT--------T-TTCGA-C------------------AAACA-------------------AA-G---------------------A-AAC----C-----A----A---T---TAAGTCAA-----T-----T-----ATG----TGC---AA-TTA----CA---AT-TTTAAT-TT--CACT-GTATATGA
gi|14 : actgtatCTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GG----TAT-GAA-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GGTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--G-CAA-----TTACATG-T--------A--A-A--T------A-GC--AAATCC-T-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-CTTACATG------CGGG---TT--A---------GA-TTACACGAATT-------CAT-----A-------G-----TA-C-----------T---T-------A--TTTTAAA-AT-AACT-AAATA-T--T-TTC-TA--ACG-C---------T-A-AATT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------A-C-AT-TA-TGACA--T-A-G--G-GCAT-A--C--A--------A--AAC-A-----TT------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-C---------------------C-AA-----C-----A----A---C---T-----GA-----T-----T-----A-A----C-C---AA-GTA----CTTTAAT-TA--AT-AT--CAAC-GTAT
gi|15 : aCTAT-C-ATG-GAA-T-ACA---G-AA-------GT----AAG-AAA-AG-C--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C-GTTT--------A-G-ATT-A-----AG--G-CAA-----TTA-----C--------A--T-G--TAGAGAGA-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--TC-T--T-T--A-CA-CTTA-----ACAT-CGGG---AT--AGATACTAACGA-CT--------T-------CAA-----A-------G-----TA-CAATTATTGTAAT---T-------A--TG----A-AT-AATG-AAA-A-T--T-ATC-TA--ACT-T---------A-A-ACTTCTA--T----T--ACT-ACC--CAA-T------A-C-AT-TA-T-------------G-GTATGA--C--A--------A--AAC-G-----GT-----GTAAG--------T-GTC-AGC------------------AA--AC------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----GA-----T-----TATTA-A-G------C---AA-GTA----C----AT-T---Ag
gi|16 : aaaCTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GGA-GATC--CC---TA-TT----AACTAAC--GCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTACATTGT--------A--A-G--T------A-GC--AAATCT-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-TA-ATTACATGTACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----TG-C---------------T-------A--TG----A-AT-AACG-AAATA-T--T-CAC-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA--T----T--ACTAACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A----G-ATAT-A--C--A--------A--ATC-G-----TTTTTAAAAAAT--------T-TTCAA-CA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----A-------------------------C-C---AA-TTA----C----A--T---AT-AT--CAAC-GAATATGAat
gi|17 : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GGA-GATC--CC---TA-TT----AACTAAC--GCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTACATTGT--------A--A-G--T------A-GC--AAATCT-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-TA-ATTACATGTACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----TG-C---------------T-------A--TG----A-AT-AACG-AAATA-T--T-CAC-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA--T----T--ACTAACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A----G-ATAT-A--C--A--------A--ATC-G-----TTTTTAAAAAAT--------T-TTCAA-CA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----A-------------------------C-C---AA-TTA----C----A--T---AT-AT--CAAC-GAATATGA
gi|18 : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GGA-GATC--CC---TA-TT----AACTAAC--GCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTACATTGT--------A--A-G--T------A-GC--AAATCT-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-TA-ATTACATGTACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----TG-C---------------T-------A--TG----A-AT-AACG-AAATA-T--T-CAC-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA--T----T--ACTAACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A----G-ATAT-A--C--A--------A--ATC-G-----TTTTTAAAAAAT--------T-TTCAA-CA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----A-------------------------C-C---AA-TTA----C----A--T---AT-AT--CAAC-GAATATGA
gi|19 : CTAT-C-ATT-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-CGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GTTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----T-------T--------A--A-G--T------A-AC--AAATCC-C-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATAATTTA-ATATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----TA-C-----------T---T-------A--TC----A-AC-AACT-AGATA-T--T-TTC-TA--A-G-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-G-AT-TA-TGAAA--T-A-G--G-GTAT-A--C--A--------A--AAC-G-----TT------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----CAATT-A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----C----AT-TA--AT-AT--CAAC-GTATA
gi|2 : ataa-ATT-AAA-T-ACA---G-AATACTTTTGCCAAATTT-GAC-AGTC--CA---CA-T-----A-TTA-----CTA-A---A--C-GCTC-A------G-ACAT---------------AA-----TTA--------------G--A-G-----------GC--AAATC--A-GT-AT-AACCAT-C--T-TT-A-CA-ATTCCGACTATGCGCGGA---AT------------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----TA-TGT---------T---T-------T--TC----A-A-----GTAAACG-T--T-TT--------------------T-A-ACTT-TA-TTATCCT--ACCGACC--C-A-TTAAATCG-C-ATATAGTGACAAAT-A-G--T-GTAT-G--C--A--------A--A-C-G-----TT-----AAAAT--------T-TTC-A-CTACTAAAAACCAGT----AA--A-------------------AA-A---------------------C-AA-----T-----T----A---T---T-----AA-----TGGTAAT-----A-GAAGCC-C---CA-TTAAAGGT----ATAT---GT-AT--CAAC-GTATATGA
gi|20 : acattacattcggaCTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GGA-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAC--GCTA-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTACATG-T--------A--A-G--T------A-GC--AAATCT-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-TA-ATTACATGTACATGCGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------CAT-----A-------G-----TG-C-----------T---T-------A--TG----A-AT-AACG-AAATA-T--T-CAC-TA--ACG-T---------T-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C--A--------A--ATC-G-----TTTTA--AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----A-------------------------C-C---AA-TTA----C----A--T---AT-AT--CAAC-GAATATGA
gi|21 : TG-TAA-T-ACA---A-AA-------GT----TTT-GAA-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTG-A---A--C-GTTT-A------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTA-----------------A-G--A------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTATATG------CGGG---AT--A---------GA-CT--------T-------TATCAAATA-------G-----TA-C-----------T---T-------G--TC----A-TT-AACG-AAATA-T--T-TTT-TA--ACG-T---------C-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-AT-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C--A--------A--AAG-G-----TT------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-G---------------------A-AA-----C-----AATTTA---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----C----AT-TA--AT-AT--TAAC-GTATATG
gi|22 : AT-C-ATG-ATA-T-ACT---G-AA-------GA----TTT-GAA-AGTT--CT---TA-TTCCTTG-CTAAG--ATTACATGTA--C-GTTC-T------A-A-ATT-A-----AG--A-CAA-----TT------T----------------T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-------------CGCAGG---AT--A---------GA-TT-----------------AT-----A-------C-----GA-C-----------T---T-------A--------AGAT-TAC-----TC-T--TGTTC-TA--ACG-CGTTGCCGTGT-A-ACTT-TA-TT----T--ACT-ACA--C-A-A------A-C-GC-TA-TCACA--A-A-G--T-ACAT-A--C--A--------A--AAC-G------T-----AAAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AG-A---------------------C-AA-----C-----A----A---A---T-----GA-----A-----T-----A-A----C-T---AA-TTA----CA---AT-A---AT-AT--CTTT-GTATA
gi|23 : CTAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAA-AGTT--CC---TATTT----A-CTCAA--G-TA-A---G--C-GTTT-G------A-A-ATTAA-----AG--G-CGAAATTTTTA-----A--------A--A-G--T------AGGC--AAATCT-AGGT-AT-AGA-AT-CG-G-T--ACCA-ATTACA-------GC-GG---AT--A---------GA------------------------------------------A-C-----------T---T-------A--TG----A-ATAAACG-AAG---------------------------------------TA-TT----T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-A--CA-TGACA--T-A-G--GCGTAT-A--C--A--------A--AACAG-----TT------ACAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AA-GC--------------------C-AA-----C-----A----AAATT---T-----AA-----T-----TAGTA-A-G----C-C---AATTTA----C----AT-TA--AT-AT--CAA
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gi|25 : gtat-C-ATG-AAAAT-ACAAGGG-AA-------GT----TTT-AA--AATCG-CC---T---T----A-C-AAA--GCTG-A---A--------------------AT--A-----AG--G-CAA-----TTT-----TT-------A--A-G--T------A-GC--AA-TCC-A-GT-AT-AG--AT-CATT-T--A-CA-ATTACATG------CGGG---AT--AA--------GA-CT--------T-------CAT-----A-------------TA-C-----------T---TT------G--TC----A-AT-AACG-AAAT--T--T-TTC-TA--ACG-T---------T-T-AC---TA-------T--ACT-ACC--C-A-T------G-C-A--TA-TGA-A--T-A----G-GTA--A--C--A--------A--AAC-G-----T-------AAAT--------T-TTC-A-CA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---C---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AA-TTA----T----AT-TG--AT-AT--CAAC-GTATATAAa
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gi|28 : ttgaaaaatgctccgattataaatgtactcatagtaatcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTATATGCAGA---AT--A---------TA-TT--------A-------CAC-----A-------A-----T--T-----------T---T-------A--T-------AT-TACG----TA-T--C-TTC-TA--ACT-T---------T-A-TCTT-TT-TT----TTTACT-ACT--T-A-T------A-C-GT-TA-TGACA--T-A-A--GTGTAT-G--C--A--------A--AAC-G-----TT-----AAATT--------T-CTT-A-C------------------AA--A-------------------AG-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---AG-TAA----CA---AT-G---AT-AT--CATC-GT
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gi|32 : CCAT-C-ATG-AAA-T-ACA---G-----------T----TTT-AAA-AGAC--CC---TT-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C---TT-AACTTCTA-A-ATC-A-----AG--G-CAG-----T-------T--------A--A-G--T------A-GC---------------------AT-C--T-T--A-CA-AT------TACATGCGGG---AT--AGATTACAC-GA-CT--------T-------CAA-----A-------G-----TA-C-----------a
gi|33 : ACG-AAATA-T--T-TTC-TA--ACA-T---------T-G-ACTT-TA-CT----T--ATT-ACC--C-A-T------A-C-AT-TA-TCACA--T-A-G--A-GTAT-A--C--A--------A--AAC-G-----TT------AAAT--------T-TTC-A-C------------------AA--A-------------------AG-G---------------------T-GA-----T-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-A----C-C---AA-
gi|34 : AT-C-ATG-GGA-T-ATA---G-GC-------GT----TTT-GAA-AGTC--CC---TA-TT----A-TTAAA--GCTA-A---A--C-GTTC-T------A-A-ATT-A-----AG--A-TAA-----T-------T--------A--A-A--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AA--AT-C--T-T--A-CA-ATT
gi|35 : ttgA-TT----A-CTCAT--GGTA--------C-GCTT-C------T-A-ATT-A-----AG--A-CAT-----TT-----------------------T------G-GCC-AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-T--A-C
gi|36 : cttattcttgtttcaagaC--C-A-T------G-CCAT-TA-TGAC---T-A-G--G--TAT-A--C--A--------A--AAC-G-----TT------AAAT--------T-TTCAA-C------------------AA--A-------------------AT-G---------------------C-AA-----C-----A----A---C---T-----AA-----------T-----A-G----C-C---CA-TTA----T----AT-TG--AT-AT--CAAC-ggcaggagtgaatt
gi|37 : A--A-------------------AA-G---------------------C-AA-----C-----A----A---T---T-----AA-----T-----TAATA-A-G----C-C---AA-TTA----T----TT-TG--AT-AT--CAAC-GTATATGActt
gi|4 : CTATGC-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C-GTTT-A------ATA-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTT-----TA-------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-TA-A-CA-AT------TACATGCGGG---TT--A---------GA-TT--------T-------CAT-----AGTACAT-G-----TA-C-----------T---A-------A--TC------AT-AACA-AAATA-T--T-TTC-TA--ACA-T---------TAA-ACTT-TA-TT----T--GCT-AAG--C-A-T------G-C-AA-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C-----------A--AAC-GA----GT-----AAATT--------T-TTC-A-CAAAATGAAAATGTTCACAAA--A-------------------AA-GA--------------------C-AA-----T-----T----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----CGC---AA-TTA----C----AT-T---AT--T--CACT-GTATATGAt
gi|5 : aaCTATGC-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C-GTTT-A------ATA-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTT-----TA-------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-TA-A-CA-AT------TACATGCGGG---TT--A---------GA-TT--------T-------CAT-----AGTACAT-G-----TA-C-----------T---A-------A--TC------AT-AACA-AAATA-T--T-TTC-TA--ACA-T---------TAA-ACTT-TA-TT----T--GCT-AAG--C-A-T------G-C-AA-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C-----------A--AAC-GA----GT-----AAATT--------T-TTC-A-CAAAATGAAAATGTTCACAAA--A-------------------AA-GA--------------------C-AA-----T-----T----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----CGC---AA-TTA----C----AT-T---AT--T--CACT-GTATATGA
gi|6 : aaCTATGC-ATG-AAA-T-ACA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--CC---TA-TT----A-CTAAA--GCTA-A---A--C-GTTT-A------ATA-ATT-A-----AG--A-CAA-----TTT-----TA-------A--A-G--T------A-GC--AAATCC-A-GT-AT-AG--AT-C--T-TA-A-CA-AT------TACATGCGGG---TT--A---------GA-TT--------T-------CAT-----AGTACAT-G-----TA-C-----------T---A-------A--TC------AT-AACA-AAATA-T--T-TTC-TA--ACA-T---------TAA-ACTT-TA-TT----T--GCT-AAG--C-A-T------G-C-AA-TA-TGACA--T-A-G--G-GTAT-A--C-----------A--AAC-GA----GT-----AAATT--------T-TTC-A-CAAAATGAAAATGTTCACAAA--A-------------------AA-GA--------------------C-AA-----T-----T----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----CGC---AA-TTA----C----AT-T---AT--T--CACT-GTATATGA
gi|7 : aaCTGT-C-ATA-AAA-T-ATA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--AC---TA-TT----A-C-AAA--GCTT-A---A--C-GTTT----------A-ATT-A-----AG--G-C---------A-----T--------A--A-G--T------A-GCAAAAATCC-ATTT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACATGC-------GG---AT--A---------GA-TT--------TAAAAATCCAT-----AGTTACATG-----TA-C-----------TTAAT-------A--CA----A-AT-AACG-AAATA-T--T-TTT-CT--ACATT---------T-A-ACTT-TT-AT----C--ACT-A-C--A-A-T------G-C-AA-TA-TGACA--T-A-G--G-GTATAA--C--A--------AACAAC-G-----TT-----AAATT--------T-TTC-A-CA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AAACAATT-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---GA-TTA----T----AT-TTG-AA-ATC-CAAC-GTATATGA
gi|8 : ataaCTGT-C-ATA-AAA-T-ATA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--AC---TA-TT----A-C-AAA--GCTT-A---A--C-GTTT----------A-ATT-A-----AG--G-C---------A-----T--------A--A-G--T------A-GCAAAAATCC-ATTT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACATGC-------GG---AT--A---------GA-TT--------TAAAAATCCAT-----AGTTACATG-----TA-C-----------TTAAT-------A--CA----A-AT-AACG-AAATA-T--T-TTT-CT--ACATT---------T-A-ACTT-TT-AT----C--ACT-A-C--A-A-T------G-C-AA-TA-TGACA--T-A-G--G-GTATAA--C--A--------AACAAC-G-----TT-----AAATT--------T-TTC-A-CA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AAACAATT-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---GA-TTA----T----AT-TTG-AA-ATC-CAAC-GTATATGAt
gi|9 : ataaCTGT-C-ATA-AAA-T-ATA---G-AA-------GT----TTT-GAC-AGTC--AC---TA-TT----A-C-AAA--GCTT-A---A--C-GTTT----------A-ATT-A-----AG--G-C---------A-----T--------A--A-G--T------A-GCAAAAATCC-ATTT-AT-AG--AT-C--T-T--A-CA-ATTACATGC-------GG---AT--A---------GA-TT--------TAAAAATCCAT-----AGTTACATG-----TA-C-----------TTAAT-------A--CA----A-AT-AACG-AAATA-T--T-TTT-CT--ACATT---------T-A-ACTT-TT-AT----C--ACT-A-C--A-A-T------G-C-AA-TA-TGACA--T-A-G--G-GTATAA--C--A--------AACAAC-G-----TT-----AAATT--------T-TTC-A-CA-----------------AA--A-------------------AA-G---------------------C-AAACAATT-----A----A---T---T-----AA-----T-----T-----A-G----C-C---GA-TTA----T----AT-TTG-AA-ATC-CAAC-GTATATGAt