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Reference ( gi|5 ) : ACTGTATAGTGGGTCAAT--ATCACGGCC-GGA-AAA-----AA-TC-AC-AATTT-TTTTTTA---C----ATAGC-AACA-AAT------CG-----T-GGAC------AG----T---TGAATTCGT-GGA--AAAA-C--A--TAGA----TGATCTT----A--A--T--TC-TG---AA-CCCA-----A---TT----CA--A----T----TA-----T---AC--G-----T-AT-C----A------A----AA--TTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAATT-C------GCAG--AA---ATTTTG-TT-A---CAGTGAAT--A-T--------AGT--G-A-A-A-ATT-A-ACTC-CGC-G-AGTCAAT-TTC-CTGCTATA
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gi|15 : T--A-T--------AGC--G-GGA-A-ATT-A-ACTC-ACA-G-AGTTAAT-TTT-C-GCTATA
gi|11 : atagtgagttaatattgcgacaggaaaaaataacgatttttttcacttagcaataaattgtggttcgttaaattcgcagaaaatcaaatcttgatcctgaacccaattaaatgaaacatattaaaattaattcactaaatgttaaattcgcagaaattttgttttagcaaaT--A-T--------AGT--G-GGA-A-ATT-A-ACTC-ATG-G-AATTAAT-TTT-C-ACTATA
gi|9 : gtttagctggttaatatcatggtcagaaatttttttgatttttttccacttagcagcaaattgcagtcagttgaatctgtggaaaaacaaatcttgatcctgaacccaattcaattatacgtgtatcaaataattcactgaatgttaaattcatggaaattttgttgcagcaaaT--A-T--------AGTA-G-G-A-A-ATT-A-AC-C-CACAG-AGTTAAT-TT--TTGCTATAca
gi|32 : ctgtatagcgtgttaatatcacggtcactaaaaatcgcgttttttttcactgagcagcaaatcgtggtcagttgaattcacagaaaaacaaattaatcctgaacttaattgattcaattacacgtattgaaattaattcgctgaatgttaaatttacagaaattttgtttccgcaaaT--A-T--------AGC--G-G-GGA-ATT-A-ACTCACG--G-AGTTAAT-TTT-C-GCTATAc
gi|26 : tcgagaaaaaatcgcaattttacaaatcggggtcggttgaattcgcggaaaaacaaacctgaatccgaaacaaatatttaattcactgaatgttaaattcagcgaaT--A-T--------AGT--G-G-A-A-ATT-A-GCTC--GC-GGAGTCAATATTCGCT
gi|41 : atgtattgcgggttaatatcgggtcggaaaagtaaaagtcacaattttttcactaagcaacgaagtgtggtcggttgaattcccagaagttgttattaataccaaaaattaattcacagaatgttaaaatttgtggaaattttgtttT--A-T--------AGCA-G-G-A-A-ATT-A-ACGC--GCAG-AGTCAAT-TTT-C-GCTca
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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consensus : ACTGTATAGCGGGTTAAT--ATCGCGGTC-G-GA-AAA-----AA-T--CGCGATT--T-TTTTT---CACTTAGC-AACA-AAT------CG-----C-G---GTCGG-T--TGAATTCGC-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--CC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----CA---A----T----TA-----TAC--G-----T-AT---N-A------A----AA--TTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCGG--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAATA-T--------AGCG-AAAATT-A-ACTCCGCGA--GTTAATTTCCCGCTATA
Reference ( family-5474 ) : ACTGTATAGCGGGTTAAT--ATCGCGGTC-G-GA-AAA-----AA-T--CGCGATT--T-TTTTT---CACTTAGC-AACA-AAT------CG-----C-G---GTCGG-T--TGAATTCGC-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--CC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----CA---A----T----TA-----TAC--G-----T-AT---N-A------A----AA--TTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCGG--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAATA-T--------AGCG-AAAATT-A-ACTCCGCGA--GTTAATTTCCCGCTATA
gi|1 : GCATAGCGGGTTAAT--ATCGCGGTC-G-GA-AAA-----AA-T--CACAA----T-TTTTT---CACTC-GCGAAGA-AAT------CGCTTACC-A---ACCAATT--TGAATTTGC-AGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-TTT----A--A--T-----------A---TCA--A-----T---TT----CA---A----T----T------T-C--T-----T-ATG--A-A------A----AA--TCA---A-TT---CTCTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------ACAG--AAAT----TTTGTTT-C--NTAATA-T--------G--A-AAAATC-A-ATTCTCTGAATGTTAA
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gi|14 : ttgagtttggaATTGTATAGCAGGTTAAT--ATCGTGGTT-G-GA-AAA-----AA----CATGACT--T-TTTT----CACTTAGC-AAAA-AAT------CG-----C-G---GTCGG-T--TGAATTTGC-AGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----T--A--T--AT-TT-----------------------TT----CAT--A----T----TAA----TA---A-----T-AC---T-A------A----TA--TGA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCGG--AATT----TTTGTTT-CAGCGAATG-T--------AGCG-AAAATG-A-ACTTCGCAA--GTTAATTTGCCGCTATAca
gi|15 : ATAGTGAGTTAAT--ATTGCGACA-G-GA-AAA-----AA-T--AACGATT--T-T-TTT---CACTTAGC-AATA-AAT------TG-----T-G---GTTCG-T--TAAATTCGC-AGA--AAA-T-----C-----A-----A--AT-CTT----G--A--T--CC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----AA---A----T----GA-----AAC--A-----T-AT---T-A------A----AA--TTA---A-TT---CACTA-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCAG--AAAT----TTTGTTT-TAGCAAATA-T--------AGCG-AAAATT-A-ACTCTGTGA--GTTAATTTCCCGCTATAca
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gi|17 : ATGGCGGGTTAAT--ATCTTGGTCAG-GA-AAA-----AA-T--CGTGATT--T-ATT-----CACTTAGC-AACA-AAT------CG-----C-A---GTCAG-T--TGAATTTGC-GGA--AAACA-----C-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--CC-TG---AA---TCC--G-----A---TT----CA---A----A----AA-----TTC--G-----T-AT---C-A------A----AA--TCAATTA-TT---AACTG-------------A-ATG-TT-AGA-TT-C------GTGG---ATT----TTTGTTT-AGGCGAAT-------------------ATT-A-TCTCTGCAA--GTTAATTTCc
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gi|19 : ttggtagaATAGCGGGTTA-T--ATCGAGGTC-A-GA-AAA-----AAAT--CATGATT--T-TTT-----CACTTAGC-AGCACAATA-----TG-----C-A---GTCG--T--TGAATTTGC-AAA--AAA-A-----CCAACCA-----A--AT-CTT----A--A--T--TC-TG---AA---CTC--------A---TT----CAATTA----T----TA-----TAC--G-----T-A----A-A------A----AA--TTA---A-TT---CTCTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-T------GCAA--AAA-----TTTGTTT-CAGCGAATA-T--------AGTG-AAAATT-A-ACTCCGc
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gi|21 : A-T--CGCGAAT--T-TTT-----CACTTAGC-AACA-AGT------GG-----C-G---GTCGG-T--TGAATTCGC-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-TGT----A--A--TATCC-TG---AA---CCC--G-----A---TC----CA---T----G----TA-----TAT--A-----TTAT---A-A------A----AA--TTA---A-TT---CACTG-------------C-ATA-TT-AAA-TT-T------GCGG--AAAT----TTTGTTT-CACCGAATA-T--------AGTG--AAATT--------GCCA--TTTAATTTCCCGTTATAc
gi|22 : atagcactacagtatatATAGCGGGTTAAT--ATCGAGGTC-A-GA-AAA-----AAAT--CATGATT--T-T--TT---CACTTAGC-AGCA-AAT------TG-----C-A---GTCGG-T--TGAATTCGC-AAA--AAA-ACCAACC-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--TC-TG---AA---CTC--A-----A---TT----CA---A----TTATATA-----TAC--G-----T-AA---A-A------A----AA--TTA---A-TT---CTCTG-------------A-ATG-Tc
gi|23 : cTGCACAGCGGGTTAAT--ATCGCAGTT-G-G---AA-----AA-----------------------------------A-AAT------CG-----C-T---GTCAG-T--TGAATTTGT-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----AATA--T--CC-TG---AA---CCC--G-----A---TT----CA---A----T----T------TAA--GT----T-AT---C-------------AA--TCA---A-TT---CACTA-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GTGG--AAATTTTATTTATTT-CAGCAAATA-T--------AGCA-CAAATT-A-AACCTGCAA--ATTAATTTCCTGTTATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatgagcactaacacca
gi|24 : CTGTACAGCGAGTTAAT--ATT-CGGTA-A-AA-AAA-----AA----CGTCATG--T-TTTT---------------CA-TAT------CG-----C-G------------TGAA--------G--AAA-A-----C-----A-----A--AT-C------A--A-----CC-TG----------C--A-----AAATTT----CA---AATTGT----TA-----TTA--A-----T-AT---G-A------A----A-----A---A-TT---AATTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-T------GCGA--AAA-----TTTGTTT-CAGCTAATATT--------GGGG-GAAATG-G-ACTCTGTGA--GTTAATTTCCGGCTATAc
gi|25 : ACGGTATAGCAGGTTAAT--ATCACc
gi|25 : T---CACTTAAC-TACA-AAT------CA-----A-G---GGCAG-TAGTGATTTTGT-GGA--AAA-A-----C-----A-----ATTAT-CTT----A--A--T--CC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----CA---A----T----TA-----TAT--GTATTAT-AT---T-A------A----AG--TTA---A-TT---Cttaactacaaatcaagggcagtagtgattttgtggaaaaacaattatcttaatcctgaacccaattcaattatatgtattatattaaagttaattccatgtcaattaatgtattatattaaagttaattcactgtcagaaatgttaaatttgcaaaaatttgctg
gi|25 : acggtatagcaggttaataC--A-----A---TT-----A---A----TG---TA-----T-T--A-----T-AT---T-A------A----AG--TTA---A-TT---CACTGTCAGA--------A-ATG-TT-AAA-TT-T------GCAA--AAAT----TTcatgtcaattaatgtattatattaaagttaattcactgtcagaaatgttaaatttgcaaaaatttgctg
gi|26 : acggtatagcaggttaatatcacttaactacaaatcaagggcagtagtgattttgtggaaaaacaattatcttaatcctgaacccaattcaattatatgtattatattaaagttaattccatgtTGTATTGCGGGTTAAT--ATCG-GGTC-G-GA-AAAGTAAAAG-T--CACAATT--T-TTT-----CACTAAGC-AACG-AAG------TG-----T-G---GTCGG-T--TGAATTCCC-AGA-------------------------------------A--G--T-----TG-----------------------TT---------A----T----TAA----TAC-----------C---A-A------A----AA--TTA---A-TT---CACAG-------------A-ATG-TT-AAAATT-T------GTGG--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAAT-------------------ATT-G-ACTCCGCGA--GCTAATTT-CCACTATAgctg
gi|27 : aACTGTACAGCGAGTTAAT--ATTGCGGTA-A-AA-AAA-----AATT--CGTGA----T-TTTTT---CAT-------------T------CG-----C-G----------------------GAA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-C------A--A-----CC-TGC--AAATTTCC--A-----A---TT---------G----T----TA-----TTA--A-----T-AT---G-A------A----A-----A---A-TT---AATTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-T------GCGA--AAAT----TTTGTTT-CAGCTAATA-T--------TGGG-AAAATT-G-ACTCTGTGA--GTTAATTTCCGGCTAca
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gi|31 : acCC--A-----AAT-TT----CA---A----T----TAATTTTTAC--------C-AT---G-A------ATGTCAA--TGG---A-TTTTGCACGG-------------A-GTG-TT-GAA-TT-C------GCAG--AACT----TTTTTTTACCGCGAATA-T--------AGCG-AAAAAT-T-CCCCCGCAA--GTTCATTTCgca
gi|32 : atttaacagtaaattttcgattcatatctttTC-GAGA-AAA-----AA-T--CGCAATT--T-T-----------------ACA-AAT------CG-----G-G---GTCGG-T--TGAATTCGC-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AC-CTG----A--A--T--CC-GA---AA------------------------CA---A----A----TA-----T-----------------------------------TTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA------------------------------TT-CAGCGAATA-T--------AGCG-AAAATT-A-ACTCCGTGA--GTTAATTCCCCGCTATAtgc
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gi|34 : taggtaagtgaaaaatcttaaaaatcctagagcactgaCCGTATAGCGGGTTAAT--GTTGTGGTT-G-GT-TAA-----AA-T--CATTATT--T-T-TTT---CACTTACC-AACA-AAT------CG-----C-A---GTCAA-T--TGAATTTGT-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AA-CTT----A--A--T--tg
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gi|36 : gcagactttaaaatgtttttatgaaggatgagaaatcttgc--T-TATTT---CGCT-----AATA-TAT------CG-----C-G---GCCGG-T--TGAATTCGC-AGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CGT----AATA--T--CC-TG---AA---CCG--AACCTTA---TT----CA---A----T----CA-----TAC--G-----T-AT---C-A------A----
gi|37 : atttatgtggcaTGTGTAGTGGGT--------CGCAGTC-G-AA-AAA-----AA-T--CGCAATC--C-TTTCT---C--TTAGC-AACA-AAT------TA-----C-G---GCCAG-T--TGAGTTCGC-GGA--GAG-A-----C-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--CC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----ta
gi|38 : ACTGCATAGTGGGTTTAT--ATCGCAGTC-G-AT-GAA-----AA-C--CGCGATT--T-T-TTT---CACTTAGC-AACA-ATT------CG-----C-C---GTCGA-T--TGGATTCGC-GGA--TGA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----
gi|39 : TGTATAGCGGGTT--T--AT---------------A-----AA-T--TGCGATT--T-TTTTT---CACTCAGC-AACG-AAT------TG-----C-A---GTCCG-T--TGAATTCGTAGAA--AAA-A-----C-----A-----T--AT-CTT----A--A--T--CC-GA---AA---CC
gi|4 : CTGTATGGTAGGTTAAT--ATCACAGTC-A-GA-AAA-----AAAT--TTTGATT--TATTTTT---CATTTAGT-GACA-AAT------CA-----C-A---GTAGG-T--TGAATTCGC-GAA--AAA-AA----C-----A-----A--AT-CTT----A--ACAT--CC-TGTGTAA---CC---G-----A---TT----CA---A----T----TA-----TAC--C-----TTAT---C-A------G--------TTA---A-TT---CATTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------ACAG--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAATA-T--------AGCA-AAAATA-A-ACT---CGA--ATATATTTCCCACTA
gi|40 : ACTGTATAGCGGGTTAAT--ATTGTG---------------------------ATT--T-TTTTT---CACTTAAC-AACA-AAT------CA-----A-G---CTTGG-T--TGAATTCGC-GGG--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTatgacta
gi|41 : TG-TT-AAA-TT-T------GCGA--AAAT----TTTGTTT-CAGCGGAAA-TTTTGTTTCAGCG-AAAATT-G-ACTCTGCGC--GTTAATTTCCTGCTATA
gi|42 : G-------------A-AAG-TT-AAA-TT-T------GCTG--AAAT----TTTGTTT-CAAAGAATA-T--------AGCA-AAAATT-A---TCTGTGA--ATTAATTTCCCACTATAc
gi|43 : CTGTATAGCGGGTTAAT--ATCGTTGTC-G-GACAAA-----CA-T--TGCAA----C-TTTTT---CACTTTGC-AACA-AAT------AG-----C-G---Gc
gi|44 : AA-TT-C------GAGG--AAAT----TTTGTTC-CAGCGGATT-T--------AGCG-AAAATT-A-A-TTTGCAA--GTTAATCTCCTGC
gi|46 : ACTGCATAGCGTGTTAAT--ATCACGGTC-G-CT-AAA-----AA-T--CAC
gi|5 : gtACTGTATAGTGGGTCAAT--ATCACGGCC-G-GA-AAA-----AA-T--CACAATT--T-TTTTT---TACATAGC-AACA-AAT------CG-----T-G---GACAG-T--TGAATTCGT-GGA--AAA-A-----C-----ATAGATG--AT-CTT----A--A--T--TC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----CA---A----T----TA-----TAC--G-----T-AT---C-A------A----AA--TTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCAG--AAAT----TTTGTTA-CAGTGAATA-T--------AGTG-AAAATT-A-ACTCCGCGA--GTCAATTTCCTGCTATA
gi|6 : ATAGTGAGTTAA---ATTGCGACA-G-GG-AAA-----AA-TAAC-CGATT--T-TTTTT---CACT-AGC-AATA-AAT------TG-----TTG---GTTCG-T--TAAATTCGC-AGA--AAA-T-----C-----A-----A--AT-CTT----G--A--T--CCATG---AA---CCC--A-----AA--TT----TA---AGA--T----GA-----AAC--A-----T-AT---T-A------A----AAAATTA---A-TT---CACTA-------------A-ATG-TTAAAA-TT-C------GCAG--AAA-----TTTGTTT-TAGCAAATA-T--------AGCG-AAAATTAA-ACTCTGTGA--GTTAATTTCCCGCTATA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-5474 ) : ACTGTATAGCGGGTTAAT--ATCGCGGTC-G-GA-AAA-----AA-T--CGCGATT--T-TTTTT---CACTTAGC-AACA-AAT------CG-----C-G---GTCGG-T--TGAATTCGC-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--CC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----CA---A----T----TA-----TAC--G-----T-AT---N-A------A----AA--TTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCGG--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAATA-T--------AGCG-AAAATT-A-ACTCCGCGA--GTTAATTTCCCGCTATA
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gi|24 : CTGTACAGCGAGTTAAT--ATT-CGGTA-A-AA-AAA-----AA----CGTCATG--T-TTTT---------------CA-TAT------CG-----C-G------------TGAA--------G--AAA-A-----C-----A-----A--AT-C------A--A-----CC-TG----------C--A-----AAATTT----CA---AATTGT----TA-----TTA--A-----T-AT---G-A------A----A-----A---A-TT---AATTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-T------GCGA--AAA-----TTTGTTT-CAGCTAATATT--------GGGG-GAAATG-G-ACTCTGTGA--GTTAATTTCCGGCTATAc
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gi|25 : acggtatagcaggttaataC--A-----A---TT-----A---A----TG---TA-----T-T--A-----T-AT---T-A------A----AG--TTA---A-TT---CACTGTCAGA--------A-ATG-TT-AAA-TT-T------GCAA--AAAT----TTcatgtcaattaatgtattatattaaagttaattcactgtcagaaatgttaaatttgcaaaaatttgctg
gi|26 : acggtatagcaggttaatatcacttaactacaaatcaagggcagtagtgattttgtggaaaaacaattatcttaatcctgaacccaattcaattatatgtattatattaaagttaattccatgtTGTATTGCGGGTTAAT--ATCG-GGTC-G-GA-AAAGTAAAAG-T--CACAATT--T-TTT-----CACTAAGC-AACG-AAG------TG-----T-G---GTCGG-T--TGAATTCCC-AGA-------------------------------------A--G--T-----TG-----------------------TT---------A----T----TAA----TAC-----------C---A-A------A----AA--TTA---A-TT---CACAG-------------A-ATG-TT-AAAATT-T------GTGG--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAAT-------------------ATT-G-ACTCCGCGA--GCTAATTT-CCACTATAgctg
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gi|34 : taggtaagtgaaaaatcttaaaaatcctagagcactgaCCGTATAGCGGGTTAAT--GTTGTGGTT-G-GT-TAA-----AA-T--CATTATT--T-T-TTT---CACTTACC-AACA-AAT------CG-----C-A---GTCAA-T--TGAATTTGT-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AA-CTT----A--A--T--tg
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gi|37 : atttatgtggcaTGTGTAGTGGGT--------CGCAGTC-G-AA-AAA-----AA-T--CGCAATC--C-TTTCT---C--TTAGC-AACA-AAT------TA-----C-G---GCCAG-T--TGAGTTCGC-GGA--GAG-A-----C-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--CC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----ta
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gi|40 : ACTGTATAGCGGGTTAAT--ATTGTG---------------------------ATT--T-TTTTT---CACTTAAC-AACA-AAT------CA-----A-G---CTTGG-T--TGAATTCGC-GGG--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTatgacta
gi|41 : TG-TT-AAA-TT-T------GCGA--AAAT----TTTGTTT-CAGCGGAAA-TTTTGTTTCAGCG-AAAATT-G-ACTCTGCGC--GTTAATTTCCTGCTATA
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gi|43 : CTGTATAGCGGGTTAAT--ATCGTTGTC-G-GACAAA-----CA-T--TGCAA----C-TTTTT---CACTTTGC-AACA-AAT------AG-----C-G---Gc
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gi|46 : ACTGCATAGCGTGTTAAT--ATCACGGTC-G-CT-AAA-----AA-T--CAC
gi|5 : gtACTGTATAGTGGGTCAAT--ATCACGGCC-G-GA-AAA-----AA-T--CACAATT--T-TTTTT---TACATAGC-AACA-AAT------CG-----T-G---GACAG-T--TGAATTCGT-GGA--AAA-A-----C-----ATAGATG--AT-CTT----A--A--T--TC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----CA---A----T----TA-----TAC--G-----T-AT---C-A------A----AA--TTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCAG--AAAT----TTTGTTA-CAGTGAATA-T--------AGTG-AAAATT-A-ACTCCGCGA--GTCAATTTCCTGCTATA
gi|6 : ATAGTGAGTTAA---ATTGCGACA-G-GG-AAA-----AA-TAAC-CGATT--T-TTTTT---CACT-AGC-AATA-AAT------TG-----TTG---GTTCG-T--TAAATTCGC-AGA--AAA-T-----C-----A-----A--AT-CTT----G--A--T--CCATG---AA---CCC--A-----AA--TT----TA---AGA--T----GA-----AAC--A-----T-AT---T-A------A----AAAATTA---A-TT---CACTA-------------A-ATG-TTAAAA-TT-C------GCAG--AAA-----TTTGTTT-TAGCAAATA-T--------AGCG-AAAATTAA-ACTCTGTGA--GTTAATTTCCCGCTATA
gi|7 : taATAGTGAGTTAA---ATTGCGACA-G-GG-AAA-----AA-TAAC-CGATT--T-TTTTT---CACT-AGC-AATA-AAT------TG-----TTG---GTTCG-T--TAAATTCGC-AGA--AAA-T-----C-----A-----A--AT-CTT----G--A--T--CCATG---AA---CCC--A-----AA--TT----TA---AGA--T----GA-----AAC--A-----T-AT---T-A------A----AAAATTA---A-TT---CACTA-------------A-ATG-TTAAAA-TT-C------GCAG--AAA-----TTTGTTT-TAGCAAATA-T--------AGCG-AAAATTAA-ACTCTGTGA--GTTAATTTCCCGCTATA
gi|8 : taTAGTGAGTTAAT--ATTGTGGTT-G-GA-AAA-----A--T--CACGATT--T-TTTT----CACTTAGC-AACA-AATTACGGTCGGTTGTC-G---GTCGG-T--TGTATTTGT-GGG--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--CC-GG---AA---CCC--A-----A---TT----CA---A----T----TA-----TAC--G-----T-AT---A-A------A----AA--CTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCGG--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAATA-T--------AACGAAAAATG-A-ACTCTCTGA--CTTAATTTCCCGCTGT
gi|9 : CTGTATAGCGTGTTAAT--ATCACGGTC-A-CT-AAA-----AA-T--CGCG-TT--T-TTTTT---CACTGAGC-AGCA-AAT------CG-----T-G---GTCAG-T--TGAATTCAC-AGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT---T----A--A--T--CC-TG---AA---CTT--A-----A---TTGATTCA---A----T----TA-----CAC--G-----T-AT---T-G------A----AA--TTA---A-TT---CGCTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-T------ACAG--AAAT----TTTGTTT-CCGCAAATA-T--------AGCA-AAAATT-A-ACTCTGTGG--GTTAATTTCCTACTATA
blockSeqs : TA A A C GTAAA ATCA AA A TTTTT . T TACGGT GTTGT T AAA . AG C GG T CCAAC CAACC TAGAT TT T TAAA AT CA AT A TGT CCGAACCTTA GATTC AATTG TATA TATGTATTAT GTGA TTAATA TGTC AA ATT A TTG TCACAAATGATTC C G A A T ATCGGG GC TTTA A T TTTGTTTC A A T .
blockSeqs : . . . . . ATCA . . TC . C A . T . . . A . C TA . . . . . AT CA AT A T ATTTCCAA T ATTA AA ATTTTTACC GA . . AA . . . TCAGA . . A . . . . . . T . . A . .
blockSeqs : . . . . . TTCG . . TT . . . . . . . . . . . A . . . . . AT . . . C TTCATAA C TTA G TACGTGT TT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . ATCT . . TT . . . . . . . . . . . A . . . . . T . . . . CAAAAT C AGA . ATTAATT G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . ATTT . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACCCGA T AGA . TATATT C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TAAC . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCCAAA C TA . TAAGTT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TAAC . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCCAAA A TA . TACCTA G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . ATG . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCCAA C A . TACCTT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TTT . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCCAA C A . CTAAT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TTG . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCTGA C T . ATAAT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TAA . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCCGA C A . TTTAT C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCG . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACCAT T A . ATAAT C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TTG . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCCAA G A . AACAT A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCG . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCCGA C A . AACAT A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCG . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTCAA C T . TTCGT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCA . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCCGA C A . TACGT A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TTG . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCCAA C A . TACGT A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TTG . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGTAA C A . TACGT C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCG . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCCAA T A . TTAAT G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCA . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCCAA C A . TTAAT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCG . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCCAA C G . TACAG T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CCG . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCCAA C T . TATGT A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TTG . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTTAA C A . TACGT G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TTG . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTCA C A . TACGT A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCA . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCGA C A . AACAT A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCA . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAA C A . AACAT G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCA . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAA T A . TACGT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC T A . CACGT C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C A . TTAT C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . ATAC C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TATG T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TAC T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TG A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : ***** TACGT************* N**** **
originalCons : ACTGTATAGCGGGTTAAT--ATCGCGGTC-G-GA-AAA-----AA-T--CGCGATT--T-TTTTT---CACTTAGC-AACA-AAT------CG-----C-G---GTCGG-T--TGAATTCGC-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--CC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----CA---A----T----TA-----TAC--G-----T-AT---N-A------A----AA--TTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCGG--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAATA-T--------AGCG-AAAATT-A-ACTCCGCGA--GTTAATTTCCCGCTATA
finalCons : ACTGTATAGCGGGTTAAT--ATCGCGGTC-G-GA-AAA-----AA-T--CGCGATT--T-TTTTT---CACTTAGC-AACA-AAT------CG-----C-G---GTCGG-T--TGAATTCGC-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--CC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----CA---A----T----TATACGT-------------ATN----A------A----AA--TTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCGG--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAATA-T--------AGCG-AAAATT-A-ACTCCGCGA--GTTAATTTCCCGCTATA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|45 ): GCACTGATATTTGTTATCCTTTGTTTAATTTTATGAATAAATATTTACT
Unaligned ( gi|47 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTGGAAAAA
Alignments
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lowQualScore : 11 1 1 1 22222 888888 11 1 0 66666 0 1 2 444444 55555 2 111 1 11 2 11 2 66666 22222 22222 11 1 2222 55 33 33 2 444 666666666666666666 33333 66666666 5555 333333333333333333 66666 333333 2222 55 222 1 111 8888888888888 1 1 2 1 1 333333 11 2222 1 2 44444444 1 3 1 11
lowQualScore : .. . . . ..... ...... .. . . ..... . . . ...... ..... . ... . .. . .. . ..... ..... ..... .. . .... .. .. .. . ... .................. ..... ........ .... .................. ..... ...... .... .. ... . ... ............. . . . . . ...... .. .... . . ........ . . . ..
lowQualScore : 77 2 2 1 99999 000000 55 1 3 77777 1 1 1 111111 33333 1 888 1 55 2 55 2 44444 77777 77777 55 1 3333 77 11 11 3 333 111111111111111111 77777 55555555 1111 444444444444444444 77777 222222 4444 44 000 1 999 9999999999999 1 1 2 1 1 111111 55 3333 1 2 00000000 1 3 1 66
consensus : ACTGTATAGCGGGTTAAT--ATCGCGGTC-G-GA-AAA-----AA-T--CGCGATT--T-TTTTT---CACTTAGC-AACA-AAT------CG-----C-G---GTCGG-T--TGAATTCGC-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--CC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----CA---A----T----TA-----TAC--G-----T-AT---N-A------A----AA--TTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCGG--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAATA-T--------AGCG-AAAATT-A-ACTCCGCGA--GTTAATTTCCCGCTATA
Reference ( family-5474 ) : ACTGTATAGCGGGTTAAT--ATCGCGGTC-G-GA-AAA-----AA-T--CGCGATT--T-TTTTT---CACTTAGC-AACA-AAT------CG-----C-G---GTCGG-T--TGAATTCGC-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--CC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----CA---A----T----TA-----TAC--G-----T-AT---N-A------A----AA--TTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCGG--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAATA-T--------AGCG-AAAATT-A-ACTCCGCGA--GTTAATTTCCCGCTATA
gi|1 : GCATAGCGGGTTAAT--ATCGCGGTC-G-GA-AAA-----AA-T--CACAA----T-TTTTT---CACTC-GCGAAGA-AAT------CGCTTACC-A---ACCAATT--TGAATTTGC-AGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-TTT----A--A--T-----------A---TCA--A-----T---TT----CA---A----T----T------T-C--T-----T-ATG--A-A------A----AA--TCA---A-TT---CTCTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------ACAG--AAAT----TTTGTTT-C--NTAATA-T--------G--A-AAAATC-A-ATTCTCTGAATGTTAA
gi|1 : -----T-AT---G-A------A----AAA-TCA---A-TT---CTCTG-------------A-ATG-TT-AAA-T--C------GCAG--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAATA-G--------AGCG-AAAATT-A-AATACGCGA--ATT-ATTTCCCAGTATAatcgcagaaattttgtttcagcgaatagagcgaaaattaaatacgcgaattatttcccagtataca
gi|10 : gcatagcgggttaatatcgcggtcggaaaaaatcacaattttttcactcgcgaagaaatcgcttaccaaccaatttgaatttgcagaaaaacaaattttaatatcaatttcaatttcttatgaaaaatcaattctctgaatgttaaattcacagaaattttgtttcntaaACTGTATAGCGGGTGAAT--ATCATGGTC-G-GA-AAA-----AA-A--TGCAATA--T-TTT-----CACTTAGC-AACA-AAT------CG-----C-A---GTCGG-T--TGAATTTTT-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----A--A--------TGT--AA---TTCATA-----A---TT----T----A----T----TAC----TA---A-----T-ATG--A-A------A----AA--TTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-TAA-TT-A------GCAG--AAAT----TTTGTTT-CAGGGAATA-T--------AGCA-AAAATT-A-ACTCCGCGA--GTTAATTTCCCACTATca
gi|11 : GTTTAGCTGGTTAAT--ATCATGGTC-A-GA-AAT-----TT-T--TTTGATT--T-TTTTC---CACTTAGC-AGCA-AAT------TG-----C-A---GTCAG-T--TGAATCTGT-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----G--A--T--CC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----CA---A----T----TA-----TACGTG-----T-AT---C-A------A----A----TA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------ATGG--AAAT----TTTGTTG-CAGCAAATA-T--------AGTG-AAAATT-A-ATTCCATGA--GTTAATTTCCCACTATAta
gi|12 : ATTGTATAGCAGGTTAAT--ATCGTGGTT-G-GA-AAA-----AA----CATGACT--T-TTTT----CACTTAGC-AA-A-AAT------CG-----C-G---GTCGG-T--TGAATTTGC-AGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----T--A--T--AT-T------------------------TT----CAT--A----T----TAA----TA---A-----T-AC---T-A------A----TA--TGA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCGG--AATT----TTTGTTT-CAGCGAATG-T--------AGCG-AAAATG-A-ACTTCGCAA--GTTAATTTGCCGCTAca
gi|13 : tGGTT-G-GA-AAA-----AA-T--TGCGATT--T-TTTTTTTTCTCTTAGC-AACA-AAT------TG-----C-A---TTTGG-T--TGAATTTGT-GGG--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CCT----A--A--TATCC-TG---AA---C----A-----A---TT----TT---T----T----TA-----TTT--A-----T-AT---G-A------A----AAA-TTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-T------GCAG--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAATG-T--------AGCG-AAAATT-C-ACTCCGCAA--GTTAATTTCGCGCTATAatacag
gi|14 : ttgagtttggaATTGTATAGCAGGTTAAT--ATCGTGGTT-G-GA-AAA-----AA----CATGACT--T-TTTT----CACTTAGC-AAAA-AAT------CG-----C-G---GTCGG-T--TGAATTTGC-AGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----T--A--T--AT-TT-----------------------TT----CAT--A----T----TAA----TA---A-----T-AC---T-A------A----TA--TGA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCGG--AATT----TTTGTTT-CAGCGAATG-T--------AGCG-AAAATG-A-ACTTCGCAA--GTTAATTTGCCGCTATAca
gi|15 : ATAGTGAGTTAAT--ATTGCGACA-G-GA-AAA-----AA-T--AACGATT--T-T-TTT---CACTTAGC-AATA-AAT------TG-----T-G---GTTCG-T--TAAATTCGC-AGA--AAA-T-----C-----A-----A--AT-CTT----G--A--T--CC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----AA---A----T----GA-----AAC--A-----T-AT---T-A------A----AA--TTA---A-TT---CACTA-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCAG--AAAT----TTTGTTT-TAGCAAATA-T--------AGCG-AAAATT-A-ACTCTGTGA--GTTAATTTCCCGCTATAca
gi|16 : CTGTATGGCGGGACAAT--ATTGTGGTC-G-GA-AAA-----AA-T-----GATT--T-TTTTT---CATTTAGC-AACA-AAT------CG-----C-G------------------------A--AAATA-----T-----G-----A--AT-CTT----A--A--T--CC-TG---AA---CCT--G-----A---TT----CA---A----T----TA-----AAC--A-----T-AT---T-ATTAATAA----AA--TTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCAA--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAATA-T--------AGCA-AAATTT-A-ACTCTGCAA--GTTAATTTCCTGCGATA
gi|17 : ATGGCGGGTTAAT--ATCTTGGTCAG-GA-AAA-----AA-T--CGTGATT--T-ATT-----CACTTAGC-AACA-AAT------CG-----C-A---GTCAG-T--TGAATTTGC-GGA--AAACA-----C-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--CC-TG---AA---TCC--G-----A---TT----CA---A----A----AA-----TTC--G-----T-AT---C-A------A----AA--TCAATTA-TT---AACTG-------------A-ATG-TT-AGA-TT-C------GTGG---ATT----TTTGTTT-AGGCGAAT-------------------ATT-A-TCTCTGCAA--GTTAATTTCc
gi|18 : tagTAAT--ATCACAGTC-A-GA-AAA-----AA-T--T-TGATT--T-ATTT----CA-TTA-T-GACATAAT------CA-----C-GAAAGTAGG-T---GAAT-CGC-GAA--AAA-AA----C-----A-----A-------T----A--ACAT--CC-TG---TA---ACC--A-----T---TT----CA--------T----CA-----TAC---------------C-A------C----AG--TAA---A-TT---CATTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------ACAG--AAAT----TT--TTT-CAGCGACTATT--------AGCA-AAAATA-A-ACT---CGA--ATATATTTCCCACTATAac
gi|19 : ttggtagaATAGCGGGTTA-T--ATCGAGGTC-A-GA-AAA-----AAAT--CATGATT--T-TTT-----CACTTAGC-AGCACAATA-----TG-----C-A---GTCG--T--TGAATTTGC-AAA--AAA-A-----CCAACCA-----A--AT-CTT----A--A--T--TC-TG---AA---CTC--------A---TT----CAATTA----T----TA-----TAC--G-----T-A----A-A------A----AA--TTA---A-TT---CTCTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-T------GCAA--AAA-----TTTGTTT-CAGCGAATA-T--------AGTG-AAAATT-A-ACTCCGc
gi|2 : TATAGTA--TCACT--ATCGCGGTT-G-GA-AAA-----AA-T--TGCGATT--T-TTTTT---CACTTAGC-ACCA-AAT------TA-----C-A---GTTGT-T--TGAATTCGC-AGA--GGA-G-----C-----A-----A--AT-CCT----AATA--T--TT-TG---AA-----C--A-----A---TT----TGTT-A----T----TAAT---TAA--T-----T-GG---A-A------A----AA--TTT---A-TT---TACTGTCACAAATGATTCA-ATG-TT-ATA-TT-T------GTGG--AAAT----TTTGTTT-CAGTGAATG-T--------AGCG-AAAATT-ATACTCTGCGA--CTTAATTTCCAGCTATAga
gi|20 : T--ATCACGGTC-A-GA-AAA-----TA-T--CGCAATT--T-TTT-----CACTTAAC-AACA-AAT------CA-----C-A---GTCAG-T--TGAATTCGA-GGAGGAAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--CC-GG---AT---CCC--A-----A---TT----GA---A----T----AA-----TAC--G-----T-AC---T-A------A----AA--TTG---A-TT---CACTA-------------C-ATG-T---AA----C------ATGG--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAATA-A--------AGCG-AACATT-A-ACTCCACGA--GTTAATTTGCTGTTATAcag
gi|21 : A-T--CGCGAAT--T-TTT-----CACTTAGC-AACA-AGT------GG-----C-G---GTCGG-T--TGAATTCGC-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-TGT----A--A--TATCC-TG---AA---CCC--G-----A---TC----CA---T----G----TA-----TAT--A-----TTAT---A-A------A----AA--TTA---A-TT---CACTG-------------C-ATA-TT-AAA-TT-T------GCGG--AAAT----TTTGTTT-CACCGAATA-T--------AGTG--AAATT--------GCCA--TTTAATTTCCCGTTATAc
gi|22 : atagcactacagtatatATAGCGGGTTAAT--ATCGAGGTC-A-GA-AAA-----AAAT--CATGATT--T-T--TT---CACTTAGC-AGCA-AAT------TG-----C-A---GTCGG-T--TGAATTCGC-AAA--AAA-ACCAACC-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--TC-TG---AA---CTC--A-----A---TT----CA---A----TTATATA-----TAC--G-----T-AA---A-A------A----AA--TTA---A-TT---CTCTG-------------A-ATG-Tc
gi|23 : cTGCACAGCGGGTTAAT--ATCGCAGTT-G-G---AA-----AA-----------------------------------A-AAT------CG-----C-T---GTCAG-T--TGAATTTGT-GGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----AATA--T--CC-TG---AA---CCC--G-----A---TT----CA---A----T----T------TAA--GT----T-AT---C-------------AA--TCA---A-TT---CACTA-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GTGG--AAATTTTATTTATTT-CAGCAAATA-T--------AGCA-CAAATT-A-AACCTGCAA--ATTAATTTCCTGTTATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatgagcactaacacca
gi|24 : CTGTACAGCGAGTTAAT--ATT-CGGTA-A-AA-AAA-----AA----CGTCATG--T-TTTT---------------CA-TAT------CG-----C-G------------TGAA--------G--AAA-A-----C-----A-----A--AT-C------A--A-----CC-TG----------C--A-----AAATTT----CA---AATTGT----TA-----TTA--A-----T-AT---G-A------A----A-----A---A-TT---AATTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-T------GCGA--AAA-----TTTGTTT-CAGCTAATATT--------GGGG-GAAATG-G-ACTCTGTGA--GTTAATTTCCGGCTATAc
gi|25 : ACGGTATAGCAGGTTAAT--ATCACc
gi|25 : T---CACTTAAC-TACA-AAT------CA-----A-G---GGCAG-TAGTGATTTTGT-GGA--AAA-A-----C-----A-----ATTAT-CTT----A--A--T--CC-TG---AA---CCC--A-----A---TT----CA---A----T----TA-----TAT--GTATTAT-AT---T-A------A----AG--TTA---A-TT---Cttaactacaaatcaagggcagtagtgattttgtggaaaaacaattatcttaatcctgaacccaattcaattatatgtattatattaaagttaattccatgtcaattaatgtattatattaaagttaattcactgtcagaaatgttaaatttgcaaaaatttgctg
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gi|38 : ACTGCATAGTGGGTTTAT--ATCGCAGTC-G-AT-GAA-----AA-C--CGCGATT--T-T-TTT---CACTTAGC-AACA-ATT------CG-----C-C---GTCGA-T--TGGATTCGC-GGA--TGA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----
gi|39 : TGTATAGCGGGTT--T--AT---------------A-----AA-T--TGCGATT--T-TTTTT---CACTCAGC-AACG-AAT------TG-----C-A---GTCCG-T--TGAATTCGTAGAA--AAA-A-----C-----A-----T--AT-CTT----A--A--T--CC-GA---AA---CC
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gi|40 : ACTGTATAGCGGGTTAAT--ATTGTG---------------------------ATT--T-TTTTT---CACTTAAC-AACA-AAT------CA-----A-G---CTTGG-T--TGAATTCGC-GGG--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTatgacta
gi|41 : TG-TT-AAA-TT-T------GCGA--AAAT----TTTGTTT-CAGCGGAAA-TTTTGTTTCAGCG-AAAATT-G-ACTCTGCGC--GTTAATTTCCTGCTATA
gi|42 : G-------------A-AAG-TT-AAA-TT-T------GCTG--AAAT----TTTGTTT-CAAAGAATA-T--------AGCA-AAAATT-A---TCTGTGA--ATTAATTTCCCACTATAc
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gi|44 : AA-TT-C------GAGG--AAAT----TTTGTTC-CAGCGGATT-T--------AGCG-AAAATT-A-A-TTTGCAA--GTTAATCTCCTGC
gi|46 : ACTGCATAGCGTGTTAAT--ATCACGGTC-G-CT-AAA-----AA-T--CAC
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gi|6 : ATAGTGAGTTAA---ATTGCGACA-G-GG-AAA-----AA-TAAC-CGATT--T-TTTTT---CACT-AGC-AATA-AAT------TG-----TTG---GTTCG-T--TAAATTCGC-AGA--AAA-T-----C-----A-----A--AT-CTT----G--A--T--CCATG---AA---CCC--A-----AA--TT----TA---AGA--T----GA-----AAC--A-----T-AT---T-A------A----AAAATTA---A-TT---CACTA-------------A-ATG-TTAAAA-TT-C------GCAG--AAA-----TTTGTTT-TAGCAAATA-T--------AGCG-AAAATTAA-ACTCTGTGA--GTTAATTTCCCGCTATA
gi|7 : taATAGTGAGTTAA---ATTGCGACA-G-GG-AAA-----AA-TAAC-CGATT--T-TTTTT---CACT-AGC-AATA-AAT------TG-----TTG---GTTCG-T--TAAATTCGC-AGA--AAA-T-----C-----A-----A--AT-CTT----G--A--T--CCATG---AA---CCC--A-----AA--TT----TA---AGA--T----GA-----AAC--A-----T-AT---T-A------A----AAAATTA---A-TT---CACTA-------------A-ATG-TTAAAA-TT-C------GCAG--AAA-----TTTGTTT-TAGCAAATA-T--------AGCG-AAAATTAA-ACTCTGTGA--GTTAATTTCCCGCTATA
gi|8 : taTAGTGAGTTAAT--ATTGTGGTT-G-GA-AAA-----A--T--CACGATT--T-TTTT----CACTTAGC-AACA-AATTACGGTCGGTTGTC-G---GTCGG-T--TGTATTTGT-GGG--AAA-A-----C-----A-----A--AT-CTT----A--A--T--CC-GG---AA---CCC--A-----A---TT----CA---A----T----TA-----TAC--G-----T-AT---A-A------A----AA--CTA---A-TT---CACTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-C------GCGG--AAAT----TTTGTTT-CAGCGAATA-T--------AACGAAAAATG-A-ACTCTCTGA--CTTAATTTCCCGCTGT
gi|9 : CTGTATAGCGTGTTAAT--ATCACGGTC-A-CT-AAA-----AA-T--CGCG-TT--T-TTTTT---CACTGAGC-AGCA-AAT------CG-----T-G---GTCAG-T--TGAATTCAC-AGA--AAA-A-----C-----A-----A--AT---T----A--A--T--CC-TG---AA---CTT--A-----A---TTGATTCA---A----T----TA-----CAC--G-----T-AT---T-G------A----AA--TTA---A-TT---CGCTG-------------A-ATG-TT-AAA-TT-T------ACAG--AAAT----TTTGTTT-CCGCAAATA-T--------AGCA-AAAATT-A-ACTCTGTGG--GTTAATTTCCTACTATA
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