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Reference ( family-547 ) : ATATTT----TGTTTTGGTCGTCG--AAAATA-T--AT-TGATAN-----AA--AA-GCA---A--ATT-----ATGCTA----AAGACA--------TC--CT--GA-TC----T------AT---CA-----T-C-A------GA-T-------AT-T----GCAA----TTG--G--AATCACANTAGGGA-CACA--TAA-A--TA----CA-C---AAT-AA--T-G-ACTGA-AATT-A-TTGTGCAG----TC-A-T-A-T--CATTT-GTC-T-GTA---A--TTAC--A---CTT--G-A-T-T--T---T----A--AA-----A-------AA--------T-----G--GCA--CTT-AAT-TA-CAAT-CAG---AAA------T-------A--GTAAA-T-T--C-TC-----TATCT-AG-T-CT-TA-TAATGA-CGC--AATC-A---CT-T----GA-G-GAC-CGCATCG-TAT-TAT-GC--GCCCCCTGTAT--TCAGG-GGGAAATA-ACTCGCG-C-TGCACTCTGA-GCAATGTA
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Reference ( family-547 ) : ATATTT----TGTTTTGGTCGTTG--AAAATA-T--AT-TGATAN-----AA--AA-GCA---A--ATT-----ATGCTA----AAGACA--------TC--CT--GA-TC----T------AT---CA-----T-C-A------GA-T-------AT-T----GCAA----TTG--G--AATCACANTAGGGA-CACA--TAA-A--TA----CA-C---AAT-AA--T-G-ACTGA-AATT-AN-TGTGCAG----TC-A-T-A-T--CATTT-GTC-T-GTA---A--TTAC--A---CTT--G-A-T-T--T---T----A--AA-----A-------AA--------T-----G--GCA--CTT-AAT-TA-CAAT-CAG---AAA------T-------A--GTAAA-T-T--C-TC-----TATCT-AG-T-CT-TA-TAATGA-CGC--AATC-A---CT-T----GA-G-GAC-CGCATCG-TAT-TAT-GC--GCCCCCTGTAT--TCAGG-GGGAAATA-ACTCGCG-C-TGCACTCTGA-GCAATGTA
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gi|10 : ttccccgaggttatagcttacatctgtgctataaatcttttattgtaacctagtcataaatttaactatcctcgctcattcaaatatgccttgaaggcctggtacattaatttatattaatttgtcctgtctcgacacacaaccccaatcattgatgacatcgctgactttcattaaatagatgccgaaaattgcaaccgaaatgtcatctattgctccaatagagtccgacgaggcattaaactatacacaatccaccccacagacccacaccctcac----TGGTTTAGTTGTTG--AAA-TA----AT-TGATATGAGCTAA--AA-GCA---T--ATT-------------------CA--------TC--CT--AA-TC----T------CT---AA---------A------GA-T-------AC-C----GAGACCTCTTA--A--AATCACACAATGGA-CACA--CAA-G--TA----TA------AT-CA--C-GGATTAA-AATT-AT-TGCTTCT----TT-A-T-A-T--CATTT-GTC-T-TTA---A--TTACAAA---ATT----A-T-T--T---TTTACA--AA-----C-------AATTGTTACCT-----A--GCT--CTT-AAT-TA-CCAT-CAG---Aatcgttgtagcaccc
gi|11 : ttcactgacaccagctggtgtgcatgattatatcagcaagctaaatgattacgtgcgttcgttggacatgtgataacTATTTG---TGATTTAGTCATCA--AAAACA-TTGAC-TGACAT-----TA--AT-------A--ATC-----ATGTTA----AAGATA--------TC--CTAAGA--A----T------ATTGACA-----T-C-ATGACCCAA-C-------AT-TACCGGCGA------A--A--AATCACACAAAGGA-CACA--TAG-A--TA----TA-----AAC-AG--T-G-ACGAA-AGGT-AT-TGTACAG----TC-A-T-A-C--TATTT-AT----------A--TTCC--A---ATTTCT-A-T-T--T---T----C--AA-----A-------A
gi|12 : tacatgcgttggttcaacatataattccaggtatatctacatg--AATCACAGTAGGGA-CACA--T-----------------------------G-ACTGA-AATT-AG-TGTACAA----TC-A-T-A-T--CATTT-GTT-T-GTA---A--TTAC--A---CTT--G-A-T-T--T--------A--AA-----A-------AA--------T-----G--GCA--CTT-AAT-TA-CAAT-CAG---AAA------T-------A--GTAAA-T-T--G-TC-----TATCT-AG-T--T-GA-TAATGA-CGC--AATC-A---CT-T----GA-G-GAC-CGCATCG-TAT-TAT-GC--GCCCCCTGTAT--TCAGG-GGAAAATA-ACTCGCG-C-TGtcgc
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gi|15 : actgatctataaagttgccgagggctgtaaagaaaaatcgTATTT----TGTTTTGGTCGTTG----AATA-T--AT-TGATAA-----AA--AG-GCAATTA--ATT-----ATGCCA----A--ACA--------CC--CT--GA-TT----CGAAAAGAT---CA-------C-G------GA------------------CAACCC-TCG--T--AATCACAATAccc
gi|16 : gaggtttaaacatctgtgcataaatctttttaattcttaacaattttatggtcttgaggctctgtatatATTT-GTCAT-GT-------TTAC--AG--CTT--G-ACT-T--T---T----A--AA-----A-------AA--------T-----G--GCA--CTTTAAT-TA-CAAT-CAA---AAA------T-------A--GTAAC-T-T--C-TCT----TATCTAAG-T-CT-T--TAATGA-CGC---ATT-A---C--T----GA-GCGAC-CGCATCG-T-T-TAT-GG--GCCCCCTGT-T--TCAGGAGGGAAATA-ACTC-CG-CGTGCACTCTGA-at
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gi|18 : taA-T---AATCAA--T-G-ACTAA-CATT-GT-TGCGCAG----TC-A-T-A-T--CATTT-GTC-T-GTA---A--TTGC--A---CTT--A-A-TGT--T---T----A--CA-----A-------Atgcatcct
gi|18 : tATCG-TGT-TAT-GC--GCCCCCTATAT--TCAGG-GGGAAATA-ACTCGCA-C-AGCACTGTGA-AAAATGTAtatttgtgaactggcacatgacgtaatcgtgttatgcgccccctatattcagggggaaataactcgcacagcactgtgaaaaatgtatcccat
gi|19 : tataatcaatgactaacattgttgcgcagtcatatcatttgtctgtaattgcacttaatgtttacaaatatttgtgaactggcacatgacgtaT-TA-TAATGA-CGT--AATC-C---CC-T----GA-G-GAC-TACAACA-GGT-TAT-GC--GCACCCTGCAC--TCGAG-----------CT-GCA---TGCACTGTGA-AAAATGTAtcccat
gi|2 : TATTT----TGTTTTGGTCTTTG--AAAATAAT--ATCTGATAA-----AA--AAAGCA---A--ATT-----ATGCCATTTGAAGACA--------CC--CT--GAATTACAGT------ATA--CAAGA--T-CTA------GA-TGCCGAAAAT-T----GCAA----TGA--A--AATCACAATATCGA-CACA--TAA-A--TA----CA-C---AAT-AA--TAG-ACTGA-AATT-AAGTGTGCAA----TC-AAT-AAT--CATTT-GTC-T-GTA---A--TT-C--A---CTT--G-A-T-T--T---T----A--AA-----A-------AA--------A-----G--GCA--CTTAAAT-TA-CAAT-CAG---AAA------T-------A--GTAAA-T-T--CGTC-----TATCT-AG-T-CT-TA-T-ATGA-TGC--AATCAA---CT-T----GA-G-GAC-CGCATCG-TAT-TAT-GC--G--CCCTGTATC-TCAGG-GGGAAAT--ACTCGCG-C-TGCACTCGGA-GCAATGTAtcgcattgacaaaagcccaagatacgagaagcaattcataatttaaaacaatcatttctatatttaca
gi|21 : ctcctcgaggttaaacattgtgttataaatccttttaattttaaccagtttatggtcttgaggcctggtatatcATTG----TACTGTGGTTGTAG--AAAATA-T-----TGAT-C-----AA--AT-GTG---ACGATT------TGCTA----AAGACA--------TC--CT--GA-TT----T------tccca
gi|23 : cacccttgacattttgtccatagtgtaaaaagatatgttgataatatttgcgtgtggattcatttctggcatgtcta-----A-------AC--------T-----G--ACA--CTT-AAT-TA-CAAT-CAG---ATA------T-------AC-CTAAA-T-TAAA-T------TGTTT----T-CT-CA-TATTGA-TGT--AATG-A---AC-T----GA-G-GA---ACAATG-TAT-TCT-GT--ATACCTTATAT--TTAAG-GAGAAATA-ACtaatct
gi|25 : tatctgtaacaataatctactTT-AATCTA-CA-T-CAG---AAA------T-------T--GTAAAAT-T--C-TC-----TATCT-AG-T-CT-TATTAATGA-CGT---ATC-CCT-CT-T----GA-G-GACTTACAACA-GGT-TATCGC--GCACCGTGCAC--TCGAG-----------CTTGCA---TGCAC-GTGA-AAAATGTA
gi|26 : aTT-AAT-TA-CAAT-CAG---ACATATTGTT-------A--GTAAA-T-A--T-TT-----T--------C-CT-CA-TATTAA-TGT--TATG-A---GT-T----GA-G-GAA-CACAGTG-TGT-TGG-GT--ATTACCTGTAT--TTAAG-AGGAAATA-ACTTGTT-C-TGCATTtgc
gi|27 : tTT--G---T-T--T---T----C--AC-----A-------AA--------T-----A--AGA--ATT-TGT-TA-ATGT-CAG---AAA------T-------A--TTAAA-T-T--C-AC-----TATCT-AT-TCCT-TA-TAACGA-CGC--
gi|27 : C--GCCTCCTGTAT--TCTGGTGGTAAATA-TTTCGCG-C-AGCACTGTGA-AAAATGctcctgtattctggtggtaaatatttcgcgcagcactgtgaaaaatg
gi|28 : ttgttttcacaaataagaatttgttaatgtcagaaatattaaattcactatctattccttataacgaAG----TC-A-T-A-T--TATGT-ATC-A-ATA---A--TTAC--A---CTT--G---T-TAAT---T----G--AA-----ATCCTTC-AT--------T-----G--ACA--CTT-AAC-TA-CAAT-CAG---AGT------T-------A--TTAAT-T-T--C-CC-----TATGT-AATT-CT-TA-TGAT---TGC----TT-A------T----GA-G-GAC-
gi|3 : TATTT----TGTGTTGGTCGTTGCAGAAATA-T--AT-TGATAT------A--AA-GCA---A--ATTTAACGGTGCTA----AAGACA--------TC--TA--GA-TC----T------AT---AA-------A-A------GA-T-------CT-A----G--A----CTGCCG--AAACACA-TAGGGA-C-CA--TAA-A--TGATATCA-C---A---AA--T-GTACTGA-AATTAAG-TGTGCAA----TT-A-T---T--CATTT-GTC-T-GTA---A--TTAC--A---CTT--GAA-T-T--T---T----A--AAC----A-------AA--------T-----G--GCA--CT---------------------AA------C-------A--GTAAA-T-TC-C-TC-----TAT-T-AG-T-C--TA-TAATGA-CGC---ATC-A---CT-T----GATG-GAC-CG-ATCG-TACATAT-GC--G--CCCTGT-T--TCGGG-TGGAAATACACTCGTG-C-TGCACTCTGAGGCAATGTA
gi|30 : cctccccaaggtttaaacatcttcgtgttattaatctttcaatcttctaactaagtcaaaagtcgtatttccagttactatggttggactatatactaattacatg-------AA--------T-----G--GCA--CTT-TAT-TA-CATT---G---CAA------T-------AC-ATAAA-T-T--T-TT-----TG-----G-------------GA-TAC--ATTT-T---CT-T----CA-G-GA-----ATCAATAC-AAT-GC--ACCCTCTATAT--TCA-G-GGGAAATC-ACTCGtccat
gi|31 : --GCA--ATT-AAG-TA-CGAC-CAG---AAA------T-------G--GCAAAATGT--C-CC-----CATAT----T-CC-TT-TAATGA------AATC-A---ATAT----------AC-TGCA-------------C--GTCCTCTGTAA--TCAGG-AGGAAATA-GCTCGC
gi|35 : TT-AAC-TA-CACC-CAG---AAA------T-------A--GTAAA-T-T--C----------TCT-AG-T-CT-TA-GACTTA-TTC--AAAC-A---CT-TTTTAAA-T-GAC-CG-ATTG-TA
gi|39 : -C-TGCACTCTGA-GCAATGTAgt
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gi|5 : cccgaggtttaaaatctgtctataaatcttttaattttaacctttatggtcttgaggcctggtatatcTATTT----TGTTTTGGTCGTTG--AAAATA-T-----TGATAC-----AA--AA-GTATTGA--GTT-----AT--TA----AAGACAGTGCCTTATC--CT--GA-TC----T------AT---CA-----C------------------------T----GCA------TG--GGAAATCACACAAGGGG-CATA--TA-----------TA-C---AAT-AA--T-G-ACTAA-AATT-AT-TGTACAT----TC-A-T-A-T--CATTT-GTC-T-GTA---A--TTAC--A---CTT--T-T-TCT--T---T----A--AATTGATA-------AA--------TGACACG--GCA--CTT-AAT-CA-TAAC-TAG---Atcccta
gi|6 : ttgatttacacaacataatttttaatacattaagtcatacgtgagtatatgttccgttcattggcacccgatgttttcgtcagcagtgtggaataattacatgtatttgttgcgcatttctggcatatcTATTT----TGTGTTGGTCGTTG--AAAATA-T--AT-TGAT
gi|6 : tacatg-TAT-GC--GCCCC-TGTAT--TCGGG-TGGAAATA-ACTCGTG-C-TGCACTCTGA-GCAATGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgcgcccctgtattcgggtggaaataactcgtgctgcactctgagcaatgtatcccattaaa
gi|7 : tacatgtattttgtgttggtcgttgaaaatatattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATATCT----TGTTTAGGTCATTG--AAAATA-T--AT-TGATAT-----AA--AA-GCA---A--ATT-----ATGCTA----AAGACA--------TC--CT--GG-TC----T------AT---CA-----T-C-A------GA-T-------AT-T----GCAA----TTG--G--AATCACAATAGGGA-CACA--TAA-A--TA----CA-C---AAT-AA--T-G-ACTGA-AATT-AG-TGTGCAA----TC-A-T-A-T--CATTT-GTC-T-GTA---A--TTAC--A---CTT--G-A-T-T--T---T----A--AA-----A-------AA--------T-----G--GCA--CTT-AAT-TA-CAAT-CAG---AAA------T-------A--GTAAA-T-T--C-TC-----TATCT-AG-T-CT-TA-TAATGA-CGC--AATC-A---CT-T----GA-G-GAC-CGCATCG-TAT-TAT-GC--GCCCCCTGTAT--TCAGG-GGAAAATA-ACTCGCA-C-TGCACTCTGA-GCAATGTAtcccattaaa
gi|8 : ATATTTGTTGTGTTTTGGTCTTCA--AAACTA-T---C-TGACAAGCT--AA--AA-G-A---A--CTC-----ATTCTC----AA-------------C--CT--GA--------------AT---C--------T-A------GA-T-------AC------GAAA------------AATCACATTCGGGA-CACA--TAG-A--TA----TAAC---AA---A--T-G-ACTAAGAATT--T-TGTACTA----TC-A-C-A-T--AAAGT-GTT-A-GCA---A--TTAT--A---CTT--A-A-T-T--TCTGC----A--AA-----ACTTCCTTAATTGCAT--T-----G--GTA--CTT-AAT-AA-CAAC-CAG---AA---------------A--GTAAA-T-T--T-TC-----TATCT-AT-T-CCATA-AAACGA-CAT--AATC-
gi|9 : tttttatccgcggtgtgaaaggattacaagttgataactgcatgatttggtggtacatgcaatctctggt--AAAATA-T--AC-TTATAT-----AA--A--GCAC--A--ATT-----AT-CTA----AAGACA--------TCAGCT--GA-TC----T------AT---AAACTATT-CTA------GA-TGCTCGAAATGT----G-AA----TTG--G--AAACACAATAGGTATCGCAGTTAATACTTA----CA-CTAAAAT-AAATT-G-ACTGA-AATT-AG-T-TGCAGGAATTCAA-T-A-T--CATTT-GT
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Reference ( family-547 ) : ATATTT----TGTTTTGGTCGTTG--AAAATA-T--AT-TGATAN-----AA--AA-GCA---A--ATT-----ATGCTA----AAGACA--------TC--CT--GA-TC----T------AT---CA-----T-C-A------GA-T-------AT-T----GCAA----TTG--G--AATCACANTAGGGA-CACA--TAA-A--TA----CA-C---AAT-AA--T-G-ACTGA-AATT-AN-TGTGCAG----TC-A-T-A-T--CATTT-GTC-T-GTA---A--TTAC--A---CTT--G-A-T-T--T---T----A--AA-----A-------AA--------T-----G--GCA--CTT-AAT-TA-CAAT-CAG---AAA------T-------A--GTAAA-T-T--C-TC-----TATCT-AG-T-CT-TA-TAATGA-CGC--AATC-A---CT-T----GA-G-GAC-CGCATCG-TAT-TAT-GC--GCCCCCTGTAT--TCAGG-GGGAAATA-ACTCGCG-C-TGCACTCTGA-GCAATGTA
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