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gi|12 : ccattaacagtttctaaatggattactgttaacatcattacgcacggtacatgattccgcaatgtccgcattcacatacaatccgtggaatttcattgcagcagacttggagcatgtaggatacacgcagatacatgtacatgtac-AA-TTTCA---TA---CCAGCAGA-T-----T-----AG--A-AT--ATGTA-----AGCT-A--------A-T-TT-ATG----T---TTGCCA----------AT-T---A-T-GCAG-AATT-C-CAAACCCACAGATCAAACCAAAATT--GAT--A----ATCT-A----CA---------AAATG-TTG-ACT-C------TGCAGAATTTAA-----acatttacatct
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-5464 ) : NNAATACTGTAAAC-----------GTACN-TT---TTTACGCG--CG------GTACTTATTT---CC--GCTA---A-GTCC-GCGGTC-ACATA-----AAATCCG--CATAATTTCA---TA-CCAGCGG-----ACT---TAA-A-GTA------TGTA-----AGCT--A--------T-T-T-C-ATG----T---AAGC-CA--T--ATGCA---ACTC-G-GCGG-AATTTCGTACCCGCGGACCAAA--CC-A-AA----NN-GATAAT-C--ACA-G--AAATT-ATG-AC---T-C------CGTGGAA---TTAA------A-TACGTCTACAGT-NTT---GAAAAA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|17 : -----TTATTT---CT--GCAA---A-ATCC-ACAATA-ACA-------AAATCCG--CTTAATTTCA---TA-TCAGCAT-----GCT---TGA-A-ATA------TATA-----AGCT--A--------T-T-T-TGATA----T---AATC-CA--T--GTG-A---TGTC-A-GGGA--AATCTTGTTCCCTTGGA--TA-----------AACCCC-A-AA----A-T---GATAA----T-C---CACA--AAATT-ATG-AC---T-C------CATGGAA---ATAG------A-TA
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gi|21 : AGTACTGTAAAC-----------GTACT-TT---TTTAC-TG--TGT-----GT---------------AC-----TTATTT---CC--ATTG---A-ATCC-GTAACT-AC-TAACGGTAAATCCA--CATAATTT-A---TA-CCAAAGG-----ACT---ACA-A-GTA------TGCA-----AGat
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gi|23 : AGTACTGTAAAC-----------GTACT-TT---TTTACGTG--TG------GT---------------AC-----TTATTT---CC--ATTG---A-ATCC-GTAACT-ACATACCGGTAAATCCA--CATAATTT-A---TA-CCAAAGG-----ACT---ACA-A-GTA------TGCA-----AGCattcatgtatt
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blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus : NNAATACTGTAAAC-----------GTACA-TT---TTTACGCG--CG------GT---------------AC-----TTATTT---CC--GCTA---A-GTCC-GCGGTC-ACATA-----AAATCCG--CGTAATTTCA---TA-CCAGCGG-----ACT---TAA-A-GTA------TGTA-----AGCT--A--------T-T-T-C-ATG----T---AAGC-CA--T--ATGCA---ACTCGGCG--G--AATTTCGTACCCGCGGAC-CA-----------AA--CC-A-AA----A-T---GATAA----T-C--GCA-G--AAATT-ATG-AC---T-C------CGTGGAA---TTAA------A-TACGTCTACAGT-NTT---GAAAAA
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gi|3 : ctaattgctTACTGTAAACATATATATATTGTACA-TT---TTTATGTG--TG------GT---------------AC-----TTATTT---CC--TCTA---A-ATCC-ACTGTC-AAAT------AAATATG--CATAGTTTCA---TG-CCAGTAG-----ACT---TGA-A-GTA------TGTACATGTAACT--A--------TAT-T-C-ATATTTTT---AAGT-CG--T--ATGCA---ATTTCCCA--G--AATTTCTTTTTCGAGAAC-CA-----------AA--TC-A-AAT---A-T---GAAAA----T-CT-GCA-G---ACTT-TTG-AC---T-C------CATGGAA---TCAA------A-TATGTCTACAGT-ATT---AAAA
gi|4 : ACACTATAAAC-----------ATACA-TT---TTATTGCA--CA------GTTTTTATTTTTGCTAGACAGTTTTTATTT---TTTTGCTA---A-GCTT-GCGATC-ACAT--------------------TTTGA----A-CCAGCAT-----ACT---TAA-AAGCA------TGTA-----AGCT--A--------T-T-TTC-ATG----T---CAGC-CA--T--TTGCA---ATTCAGCA--G--AATTTTATACA-GCAGAC-CA-----------AA--CC-AGAA----A-T---GATAA----T-CCGATG-A--AAATG-ATG-AC---A-C------TGGAGAA---TTTA------A-Tt
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gi|7 : AACACTGTAAAC-----------CTACT-TT---TTTACATG--TG------GT---------------AC-----TTATTT---CC--CCTT---A-GTCT-GGGGTC-ACGTA-----AAATCTG--CAGAATTTCA---GA-CCAGTGG-----ACT---TAC-A-GTA------TGGA-----AGCT--A--------T-T-T-G-ATG----T---AAGC-CA--T--ATGCA---ATTCGGCA--G--AATTTCATTCTTGTAGAC-CA-----------AA--CC-T-AA----A-CA--GACAA---------ACA-G--AAATT-ATG-AC---T-C------CATGGAA---TTAA------AGTACCTCTACAGT-TTT---GAAAAAgtcatgtggtatttagaat
gi|8 : tgATTGTAAAT-----------GTGCA-AT---TTTACGGA--CA------GT---------------AT-----TTATTT---CT--GCTATAAA-GCCT-GCAGTC-ATATA-----AACTCTG--CCTAATCAAA---TA-CCAGTGG-----ACT---TTA-A-GTA------TGTG-----AGCCA-A--------T-T-T-C-ATT----T---AAGC-CA--C--ACGCA---ACTCGGCA--G--AATTTTATATCCACAGAT-AA-----------AA--CA-A-AAAAACA-C---GATAA----T-C---CACG--AAACT-ACG-CC---T-C------CATGG-A---TTA
gi|9 : aaAATACTGTAATTT----------GTTAA-TT---TTCTCGCT--TGCTACATGT---------------AC-----TTATTT---CT--GCTA---A-GTCC-ACCTTC-AAATT-----AACGCCA--CACAATTTTA---T--CCAGAAG-----AC----TAA-A-CTA------TGTA-----AGCTAAA--------T-T-T---ATG----C---AAGC-TA--C--ATGCT---ACTCGGCA--GATAATT---------------CA----------------C-A-AA----A-T----------------------------T-ATG-AT---T-C------TGTGAAA---TTGA------A-TATGCCGA-AGT-TTTGCAGAAAAAtgacttaaat
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