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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gttaattccatcttaaAAGGACC--CCAT-TGTG-GAA-TAT-GT--------T--------AATG----TGCTT--------TC-A--GCTGGCT--A--TC--CC-TTA---GTGCT----A---AA-T--C-AG-TG-----A----------TTACG-----------T--------TT------CA-TTT-------------ATG-----T------------TAA-----------TGA-----------TACAA---TG-AT---T-----C-TAG---------T---CTTTATGAATGTTTGT--GC-A--AATATTTTAAG-ATTCTACCTGTA-TA-TGTG-A-----TA-------ATT--T----G------------------TA-TTTGA-T-CCAAATGAT-A---TTA-----T-----T---T---T-----TG--T-A-A--T--TA----A-------A---------TAT-------G-CCT------------G-TAT-----------AT-T----ATCATGT-CTTACACT--GGATAA-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACC--CCAT-TA-G-AAA-TAA-GCA---C---C--------A--G----TGATT--------TC-A-TT--GGAT--A--TC--C--TCA--GGTG-T----A---AA-T--C-A------------------------A-----------T--------T--------A-TTT----------T--AC---------------------------------------------------A---C--AC------G-TC-TAG---------T---CCT-GTAATT-----T--GA-AT-AATATTTTAAG-ATTATACGTG-T-TA-TG-G-A-----T--------ATC--T----G------A---A---TTTATA-CTTCA-T-G---AT--T-C---TTGTC---A-----T---T---TAATA-TG--C-T-A--T--T-----T-------G---------TAT-----CAC-CCT------------C-TAT------C----AT-T----G--AT-T-TTTATCTT--GAATtcattgatttttgatcgat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggACC--CCAT-CG-G-AAA-TAA-GCA---C------------------------T--------TC-A-TT--GGCT--A--TC--C--TTA--GGTG-T----A---AA-T--C-AA-TG-----A----------T---A-----------T--------TT------CA-TT--------------ATG-----T------------T-------------C-A-----------TG-AA---T--GT---AT-G-CC-TAG---------T---CCT-ATGATT-----T--GC-AT-GGCATTTTA--------ACCTA-A-TA-TG-G-A-----T--------ATTTCT----G------ATCTA---GTCAT--TTTAA-TAC---A-------------------------------------TG--C-T-A--T--T-----A-------A---------TAT-----CAC-CCT------------G-TAT------C----AC-T----A--AT-T-TTTACCCT--G
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gaACC--C--T-TG-G-AAT-AAA-GCA---C---C--------A--CCAACTGCTTC-------TC-A-TG--GGCTCAA--TATCC--TT----GCG-TTTCAA---AA-T--C-CA-TG-----A----------T---ACACTTTGTAATT--------CT------CA-TTT----------TC-ATG-----T------------TCAACT--------T-A-----------TA-AAATAT--AC---TG-G-TCCTAG---------T---CTT-ATGA-T-----T--GC-AT-AATCTT----------TACCTG-ACTACTG-G-A-----T--------ATT--T-----------------------CA-CTT-A-T-T---AT--T-C----GGTC---G-----T-----------------------------------------------------T-----CAC-CCT------------G-TAT------C----AT-T----G--AT-T-CTTACCCTTCAAATAA-A----TCT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACC--CCAC-TG-G-AAA-TAA-GCA---C---CGCTAGGTGA--G----TGCTT--------TC-A-AG--GGCT--AGCTATCC--TTATAGGTG-T----A---AA-T--C-----------------------------------------------------------TT----------T--ATG-----T------------T-------------T-A-----------T--AA---T--A-----T-G-TC-TTG---------T---CCT-ATAATT-----T--GC-AT-
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gCC--CCAT-TG-G-AAA-TAA-GCA---C---C--------A--G----TGCTTTCAAGAAATC-A-TG--GGAT--A--TC--C--TT--AGGTG-T----A---AA-T--C-CA-TG-----A----------TGC-A-----------T--------TTG-----TA-TTT----------C--A-G-----T------------T-------------T-A-----------TA-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CC--TCAA-TG-G-AAA-TAA-GCA---C---C--------A--T----TGATT--------TA-A-CG--GATT--A--TA--CCTTTA-GGATG-T----A---AA-ctg
gi|11                         :                                                                                                                  tgtgaagatatgaaatgttgtgaagagagttgttttgtagacttttggttttaggattataattgtaatactttttttaaatacttagttttacttttcaaacttgatacagggttttttatatctactatatatttgtattaagagtcttgcctatatatgtttgccaaagtcttgtatacatctttgtattgactatatcatattgC--CCATATG-G-AAA-TAA-GCA---C---CC-------A--G----TGCTT--------TC-A-TG--GG----A--TT--C--CTT-AGGTG-T----A---AA-T--C-CA-TG-----A----------T---A-----------CATTTTGTATT------CA-TTTATGTTAACTTT--ATAC----T------------T-------------T-A-----------TA-AA---A--AT---AT-G-TC-TAG---------T---CTT-ATGATT-----T--GC-A---------TAAA-ATTTTACCTC-A-TA-TGTG-AATCTGC--------ATT--T----G------A---A---TTTATA-TTTCA-T-T---AT--T-C---TTGTTCA-T-----T---T---TAATG-TG--CTT-A--T----------------A---------TAT-----CAC-CCT------------G-TAT------C----AT-T----G--AT-T-TTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C--CCTT-TG-G-AA--TAA-GCA---CA--C--------A--C----TGCTT--------TC-A-TG--G-CT--A--TC--C--TTA--GGTG-T----A---AA-T--C-CA-TG-----ATACATCTTTGT---A-----------T--------TT------CA-TTT----------TTCATG-----T------------T-------------T-ATGTTATAAATTTA-AA---T--AA---AT-GTTC-TAG---------T---CTT-ATGATT-----G--GCAAT-AATAT-------ATT-TACCTG-A-TA-TG-G-A-----T--------AT------------------------------TTTCA-T-T---AT--T-A---TTGTC---G-----T-----------------------------------------------------T-----CAC-CCT------------G-TAT------C----AT-T----G--AT-TCCTTACCCTTCAAATAA-A----
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C--CCAT-TG-GGAAA-TAGAGTA---T---C--------A--G----TGCTT--------TC-AATG--GGGA--A--TC--C--TTA--GATG-T----A---AA-TTTC-A--TG-----A----------T---ACATGTTTGTA-T--------TT------CA-TTT----------T--TTG-----T------------TAATTTTTATACTTT-A-----------TA-AA---T--ATATGTT-T-TT-TAG---------T---CTT-ATAAAT-----T--GC-A----------AAA-ATT-TATTTT-T-TC-TG-C-A-----A--------GTT--T----G------A---ATTTGGTATT-TTTCA-T-T---AT--T-CAGGTTGTCATTT-----T---T---TAAATGTG--C-TTA--T--T-----A-------AATATCTATCTATC----TAG-CCT------------G-TAT------C----AT-T----G--AT-T-TTTACCCT--TAATAA-A------TAT--GTCTATCTA--TTTATCTAATT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acgC--CCAT-TG-G-AAA-TAA-ACA---C---T--------A--G----TGCTT--------TC-A-TT--GGCT--A--CC--C--TT--AGATG-T----A---AA-T--C-CA-TG-----ATACATTTG--T---A-----------T--------TT------CA-TTT----------T--AT------T------------T-------------T----------------AA---C---T---TT-G-TT-CAA---------A---TT---TGACC-----T--GT-AT---T-TTCTAGT-AATATATTTGCA-CA-TG-A-A-----A--------ATT--T---------------A---GCCATA-Ttcaccaattctgtgatttacaaaatgtacttttatttat
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   --CCAT-TG-G-AAA-TAA-GCA---C---C--------A--G----TGCTT--------TC-A-TG--GGCT--A--TC--C--TT--AGGTG-T----A---AA-T--CTAA-TG-----ATCATTTG---T---A-----------T--------TT------CA-TTT----------T--ATGTTAACT------------T-------------T-A-----------TA-AA---T--AT---AT-C-TC-TAG---------T----TT-ATGATT-----T--GC-AT-AATATTTTAa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aa--CCAT-TGCG-AAA-TAA-GCA---C---C--------A--G----TGCTT--------TCAA-TA--GGAT--A--TC--C--TT--AGGCG-T----A---AA-T--C-ACTTG-----A----------TAC-A-----------T--------TTGATATGCATTTT----------T--ATG-----TTAACTTTATACCT-------------T-A-----------TA-AA---T--AT---AT-G-TC-TAG---------T---CTT-ATAAAT-----T--GC-ATAAATACTT---------TATCTG-A-TA-TG-A-A-----T--------ACC--T----GCATTAAA---A---TTTGTA-TTTCATT-T---AT--T-A---TTCTA---TAAAAATAAAT---G-----TG--C-T-A--T--T-----A-------A---------TATCATCCTAA-CCT------------GTTATC-----C----ATAT----G--AT----TTA-CCT--G-ATAATA----TCTATCA---TATTTAC-TTCATTCAAccttg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                G-C----A---AA-T--C-AG-TG-----A----------T---T-----------G--------TT------CA-TTT----------T--ATG-----T------------C-------------T-A-----------AT-GA---T--AC---AT-G-TC-TAG---------T---CTT-AT-AAT-----TTTGT-AT-AATATTTTAAG-ATTCTACCTG-A-TA-TG-G-A-----T--------AAT--T----G------T---A---TTGATA-TTTTA-T-T---AT--T-T---TTGTC---A-----T---T---TAATA-TG--C-T-AGCTG-T-----ATATACATG---------TAT-----TAT-CCT------------G-TAT------C----AT-T----G--AT-T-TTTATTCT--GAATAaaaataattgaaatgtttattgattg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -----------TA-AA---TTTAT---TTAG-AT-TAA---------TTGTCTT-A-AAAC-----T--GC-GT-AACATTTTACG-ATCAT-TTTG-A-TA-TG-G-AAACATT--------ATT--TTTATG------A--------CTATG-CTCTA-T-T---GT--T------TGAC---C-----TA--T---T-----TG--T-G-A--T----------------A---------TAA-----GAC-CCT------------G-TATATCTTTC----AT-T----G--AT-T-TTTA-CCT--GAATAA-A----ACTA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttattcaatcaatgcaacgatacttatacaacgatgatctcgatC-TAG---------T---CAT-ATGATT-----T--GC-AT-AATATTTTAAG-ATAATGTTGG-A-CA-TG-G-A-----C--------AAG--T----G------T---A---TTTATA-TTTCA-T-C---AT--T-C---TTGTC---C-----T---T---T-----TT--T-T-A-----------A-------A---------TAT-----ctgctact
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTTAAG-ATTATAG-TG-A-TA-GG-G-A-----TTT------ATC--T----G------------------TA-TTTAA-T-----AT--T------TATA---TA----T---T---T-----CA--T-T-A--T--T-----T-------A---------TAT-----TAC-CCT------------T-TAT------C-----T-T----A--GT-T-TTTATCCT--GAATAA-gttatttgatgttatctgctaactattcgatatatatatttattgaa
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -T---AT--T-C---TTGTCA--T-----T---T---TAATA-TG--C-T-A--T--T-----A-------A---------TAT-----CGC-CTT------------G-TAT------C----AT-T----G--AT-T-TTTACCTG--GAATAA-A----TCTACCTATCT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --T-C---TTGTC---A-----T---T---C-----TG----T-A--TGCT-----A-------A---------TAT-----TAGGCCTAATATCACACAGG-TAT------C----GT-T----G--AT-T-TTTACCCT--GAATa
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ggaccccattggaaatataagacctgtgatccttaggtgtaaatcaatgctattgtctagtcctatgggcctatatctgaaaa---T---T-----TGACC-T-A--T--TTGTGAA-------A---------TAA-----GAT-CCT------------G-TAT------CTTTCAT-T----G--AT-T-TTTA-CCT--GAATAA-A----ttaaa
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---T---T-----TG--T-G-A--T--T-----A-----------------TAA-----GAC-CCT------------G-TAT------C----TT-TCAATG--AT-T-TTTACC-T--GAATAA-A----ACTAaattaattcta
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cattttattttatattgattggctagaattaattggctatctatcaT------C----AT-T----G--AT-T-TTTA-CCT--GAATAA-AAGCTTCTACCActa
19 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): TATGGAGAATTTGAAAAATTGTGAAGAGAGTTCCTTTTTTACTTTTGACTGTTATAGTGTGATATAGAAAATTTAATACTTTGTAAATTTAATATAAATTTTAAACAGGGTTTTTAGTTACCTGAGATATCAATATGAGGTGCCTTGATTGCGTAGTTGCCAAAATCTTGCTTACATCTTTGTTTTATTTATTTTGGTTATACATGTATATTATTTTTGTTATATATATTAGTTATTACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTATTAAATCAATGCAACGATACTTATACAACGAGGATCTCTATTAAATTTATTCAAGATAAATTGTCTTAAAACTGCGTAACATTTTACTATCATATTGATATGAAACATTATTTTTATGACTATGCTTCTGATGTTTGACCTATTTGTGATATAAAACCCTGTATCTTTCGTTGATTTTTACCTGAATAAAACTACTGC
Unaligned ( gi|13 ): TTATCAAATCAATGGCCAACGGTACTTATTACCAACGGAGGAGATCTCTATTTAAACTTTAAAATATAAATTTTCTTAACTGCCACCCCCGTCCCCCCGTAACAATTTTACTATCATATGATATTGAACCATATATTTATGACTATGCTCTATTGTTTTTTGAAACTATTTTATAATAGACCTGTATCTTTCATTTTTACCTGAAAAACTCTACTAT
Unaligned ( gi|21 ): CAACGAGGATATCTATTTAATTTTTTAAAGATAAATTGTCTTAAAACTGCGAAACATTTTACTATCATATTGATATGGAACATAAATTTTATGACTATGCTTCTATTGTTTGACCTATTTGTGATATTTAAGACCTGTATCTTTCATTGATTTTTACCTGAATAAAACTAAGTACTAC
Unaligned ( gi|22 ): AACGATGATCTCTATAAATTTTTAAAGGATAAATTGTACTTAACAACTGTGTAACATACTATCATATTGATATGGAACATTGTATTTTTACGACTATTGCTCATATTGTTTGACCTATTTGTGATATTAAGACCCTGTATCTTTCATGATTACCTCAATAAAACTACTACTA
Unaligned ( gi|23 ): AACGATGATCTCTATAAATTTTTAAAGGATAAATTGTACTTAACAACTGTGTAACATACTATCATATTGATATGGAACATTGTATTTTTACGACTATTGCTCATATTGTTTGACCTATTTGTGATATTAAGACCCTGTATCTTTCATGATTACCTCAATAAAACTACTACTA
Unaligned ( gi|27 ): TATGTTAACTTTATACTTTATAGTCTTGATTGGCCCCAATAATCTTTTACCCTGAATGGAATCTGCTTTTTGAAATTTATATTTCATTAATTATCTGTCATTTTAAAGTGCCATGATAATCACCTGTATCTTG
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                 ttattcaatcaatgcaacgatacttatacaacgatgatctcgattaaatttatttagattaattGGAC--CCCAT-TA-G-AAATA--AGC--A---C---C--------AG----TGATT--------TC-ATT--G----GAT----AT-CC-TCA--GG-T---G-----T----A---AA--TC-A------A-T----------------------------------------------------TA-TTT----------T--AC------------------------------------------------------ACAC--G---T-C----T---A---------GTCCT-GTAATT-----T-GA----A-T-AATATTTT-AAGATTATACGTG-T-TA-TG-G-A------T--------ATC--TG------AA-T--T---T-A--T----A-CTTC----AT-G-ATT-C---T-T----G-TCAT-T---TAATA----T-----G----C-----TA---------T---T-----T-------GT-AT--C---------AC-----CC-TC------T-A----T------C----AT-TGATT-TTTATCTT--GAATctgctact
gi|18                         :                                    AATCGTTGAAACCTTTGT--T-TATATTT---GCTATTTTAA-----A-TACGTCGTTTTAGTTTTTTCTT----CTCAAACCGTGATAC--GGTTTTT-TCTTTAAAT-AC---CTG-GATACTTCCGTA-T-ATTAAGGTCTGCC-TTGCA-TTTACCCA-TATTAGCC---AAATC-TTGTACTCACATTC-------CTATTTACAGTA-TTTTTG--T-GT-TGT-TACT-T
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaGAAC--CCCAT-CG-G-AAATA--AGC--A---C----------------------T--------TC-ATT--G----GCT----AT-CC-TTA--GG-T---G-----T----A---AA--TC-A------A-T-----G---A--------T---A-----------T--------T-T------CA-TT--------------ATG-------------T------------T-----CA-T-----------GA-A-TGTAT--G---C-C----T---A---------GTCCT-ATGATT-----T-GC----A-T-GGCATTTT-A-------ACCTA-A-TA-TG-G-A------T--------ATTTCTG-------A-T--C---T-AGTC----A-TTTT----AA-T-A-----------------CA---------------T-----G----C-----TA---------T---T-----A-------AT-AT--C---------AC-----CC-TG------T-A----T------C----AC-TAATT-TTTACCCT--G
gi|2                          :                                                                       AAATTTA-----A-TACTTTGTA--AATTTAA-TAT-------AAAT-TTTAAACA-GGGTTTT-T-----AGTTAC---CTGAGATA--TCAATA-T-G---AGGT--GCC-TTG-A-TT-G--CG-TAGTTGCC--AAAATC-TTGC-TT-ACATCTTTGT--TTTATTTATTTTG-GTTATACAT-GTATAT-TATT-TTTGTTATATATAT--T-AGTTATTAC-A-TNNNNNN--NNNNN-NN-N-NNNNN--NNN--N---N---N--------NN----NNNNN--------NN-NNN--N----NNN----NN-NN-NNN-NNN-N---GTTTATT----A---AA--TC-A------A-TGCAACG---A--------T---A-----------C--------T-T-------A-TAC----------A--ACGAGGATC-------T------------C-----TATT-----------AA-A-TTTAT------T-CAAGAT---AAATT-----GTCTT-A-AAAC-----T-GC----G-T-AACATTTT-ACTATCATA-TTG-A-TA-TGAA-A------C--------ATT-----------A-T--T---T-T--T----A---TG----AC-T-ATG-C---T-T----C-TGATGT---T--------T-----GAC--C-----TA---------TTTGT-----G-------AT-ATAAA---------AC-----CC-TG------T-ATCTTT------C----GT-TGATT-TTTA-CCT--GAATAAA----ACTA-
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatggagaatttgaaaaattgtgaagagagttccttttttacttttgactgttatagtgtgatataga---G-----C----A---AA--TC-A------G-T-----G---A--------T---T-----------G--------T-T------CA-TTT----------T--ATG-------------T------------C-----TA-A-----------TG-A-TACAT--G---T-C----T---A---------GTCTT-ATAATT-----TTGT----A-T-AATATTTT-AAGATTCTACCTG-A-TA-TG-G-A------T--------AAT--TG------TA-T--T---G-A--T----A-TTTT----AT-T-ATT-T---T-T----G-TCAT-T---TAATA----T-----G----C-----TAGC-------TG--T-----ATATACATGT-AT--T---------AT-----CC-TG------T-A----T------C----AT-TGATT-TTTATTCT--GAATActgc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -----G---A--------T---A-----------T--------C-T-------A-TTT----------A--ATT-------------T------------T-----T--T-----------AA-A-GATAA--A---T-T------------------GTCTT-A-AAAC-----T-GC----G-A-AACATTTT-ACTATCATAT-TG-A-TA-TG-G-A---------------ACA--TA------AA-T--T---T----T----A-TG------AC-T-ATG-C---T-T----C-TATTGT---T--------T-----GAC--C-----TA---------T---TTGT--G-------AT-AT--TTAAG-----AC-----C--TG------T-A----T------CTTTCAT-TGATT-TTTA-CCT--GAATAAA----ACTA-
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          caacgagGGAC--CCCAT-TG-G-AAATATAAG---A---C---C--------TG----TG-------------------------------AT-CC-TTA--GG-T---G-----T----A---AA--TC-A------A-T-----G---C--------T---A-----------T--------TGT------C---------------T--A-G-------------TC-----------C-----TA-T-----------GG-G-CCTAT--A---T-C----TGAAA---------ATCTT-GTCATTC----T-G-----------TATGCT-AATATTAGGCCTA-A-TA-Tagtactac
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T-C---T-T----G-TCAT-T---C--------T-----GTATGC-----TAATATTAGGCC---T-----A-------AT-AT--C---------AC-----ACAGG------T-A----T------C----GT-TGATT-TTTACCCT--GAATcacacaggtatcgttgatttttaccctgaatttaaa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                  ggaccccattggaaatataagacctgtgatccttaggtgtaaatcaatgctattgtctagtcctatgggcctatatctgaaaa--CCCAT-TG-G-AAATA--AAC--A---C---T--------AG----TGCTT--------TC-ATT--G----GCT----AC-CC-TT--AGA-T---G-----T----A---AA--TC-C------A-T-----G---ATACATTTGT---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--AT--------------T------------T-----T---------------A-A-C-TTT--G---T-T----C---A---------AATT---TGACC-----T-GT----A-T---T-TTCT-AGTAATATATTTGCA-CA-TG-A-A------A--------ATT--Tttaaa
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -C----T---A---------GTCAT-ATGATT-----T-GC----A-T-AATATTTT-AAGATAATGTTGG-A-CA-TG-G-A------C--------AAG--TG------TA-T--T---T-A--T----A-TTTC----AT-C-ATT-C---T-T----G-TCCT-T---T--------T-----T----T-----TA-------------------A-------AT-A-----------------------TGT-----T-A----T------------T-TGA-T-GTTA-TCT--G-CTAA------CTATTCGATA-TATATA--TTTATTGAAagccatata
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ----T---A---------GTCTT---GATT-----G-GCCCCAA-T-AATCTTTT-AC-------CCTG-A--A-TG-G-AATCTGCT--------TTT--TG------AAAT--T---T-A--T----A-TTTC----AT-TAATT-A---TCT----G-TCAT-T---TTAAAG---T-----G----C-----CA-------------T-----G-------ATAAT--C---------A------CC-TG------T-A----T------C-----T-TG
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tatgttaactttatactttaCCAT-TG-G-AAATA--AGC--A---C---C--------AG----TGCTT--------TC-ATG--G----GCT----AT-CC-TT--AGG-T---G-----T----A---AA--TCTA------A-T-----G---ATCATTTG-T---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--ATGTTAAC--------T------------T-----TA-T-----------AA-A-TATAT--C---T-C----T---A---------GT-TT-ATGATT-----T-GC----A-T-AATATTTT-A
gi|29                         :                                                                                                                                                            aaA--TCCGTAAT-A---AGGT--GCCCTTG-A-TT-ATCCA-TATTAGCCTAAAAATC-TTGC-CT-ACATCAAGGT--TTT---TACATTA-TTTTT---T-GT-TGT-TACTATTTTTA-------C--T-TTTTGTTACAA-TAccttg
gi|3                          : gttaattccatcttaaTTTTTGATCTTAAAATTATAATCGT-GATAC-TTTGT--TAT-TATTCATTGCTAATTTTA-----A-TACGTCTTT--AATTTTA-CTT----TTCAAAC-GTGATACA-GGTTTTTATTT---AAT-AC---CTG-GATA--TCCGTA-T-A---AGGT--GCC-TTG-ATTT-ACCCA-TATTAGCC--AAAATC-TTGT-CT-ACATCC---T--TT--ATTACATTA-TTTTT---T-GT-TGT-TAC-------T-------T--T-TGTTG-TACAA-T---NNN--NNNNN-NN-N-NNNNN--NNN--N---N---N--------NN----NNNNN--------NN-NNN--N----NNN----NN-NN-NNN-NNN-N---N-----T----A---AAT-TC-A------A-T-----G---ATACATTTGT---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--ATGTTAAC--------T------------T-----TA-T-----------AA-A-TATAT--G---T-C----T---A---------GTCTT-ATAAAT-----T-GC----A-T-AATATTT---------TATCTG-A-TA-TG-GAA------TCTGCATTAATT--TG------AA-T--T---T-G--T----ATTTTC----AT-T-ATT-C---T-T----G-TCAT-T---TTAAATG--T-----G----C-----TA---------T---T-----A-------AT-AT--C---------ATCCTAGCC-TG------T-A----T------C----A--TGATT-TTTA
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgaagcattgtgaagagggttcttttatataGAC--CCCAC-TG-G-AAATA--AGC--A---C---CGCTAGGTGAG----TGCTT--------TC-AAG--GGCTAGCT----AT-CC-TTATAGG-T---G-----T----A---AA--TC-------------------------------------------------------------------TT----------T--ATG-------------T------------T-----TA-T-----------A-----ATAT--G---T-C----T---T---------GTCCT-ATAATT-----T-GC----A-T-
gi|31                         :                                                                                                                                                          -GATA--TCCGTA-T-A----GGT--GCC-TTG-ATTT-ACCCA-TATTAGCC--AAAA-C-TTGT-CT-ACATCC------TTTATTTACAGTATTTTTT---T-GT-TGT-TACT-TTTTAC-------T--T---TTGTTACAA-TAAG
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTT-AAGATTATAG-TG-A-TA-GG-G-A------TTT------ATC--TG------TA-T--T---T-AA-T----A-TTT-----ATAT-ATT--------------TCAT-T------------------------------A---------T---T-----T-------AT-AT--T---------AC-----CC-TT------T-A----T------C-----T-TAGTT-TTTATCCT--GAATAA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    C--CCCAT-TG-G-AAATA--AGC--A---C---C--------AG----TGCTTTCAAGAAATC-ATG--G----GAT----AT-CC-TT--AGG-T---G-----T----A---AA--TC-C------A-T-----G---A--------TGC-A-----------T--------T-TG-----TA-TTT----------C--A-G-------------T------------T-----TA-T-----------A
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T-ATTGT---T-T----G-ACCTAT---T--------T-----G----T-----GA---------T-----------------AT-AA--G---------AC-----CC-TG------T-A----T------CTTTCAT-TGATT-TTTA-CCT--GAAGAAA----ACTA-ctg
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     atttttatggctatgctccTACA--TAAGGAC--CC-AT-TG-G-ATTTA--AGA--A---TTCTC--------TC----TGCTT---------C-ATG--G----GTC----AT-CC-TT--GGG-TTTAT-----T----A---AA--TC-A------A-T-----G---ctac
gi|4                          :                                             TAC-TTTGT--AAT-TATTTATTGTTAATTTTA-----A-TACGTTGTT--AGTTTTA-CTT----TC--AAC-GTGATACA-G-TTTTT-TTA---AAT-AC---CTG-GATA--TCCGTA-T-A---AGGC--GCT-TTA-A-TT-ATCCA-TATTAG-T--AAAATCTTTGT-CT-GCATCC---T--ATTAATTATA-TA-TTTTT---TGGT-CGT-TATT-TTTTTT-------T--TCTTCTGTTACAACTTAGAA---CCCAT-TG--------------------------------AA----TGCTT--------TC-ATG--G----GCT----AT-CC-TT--AGG-T---G-----T----A---AA--TC-A------A-T-----G---G--------T---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------C--A----------------------------------------------------------T--G---T-C----T---A---------GTCTT-ATGATT-----T-GC----A-G-AACATTTTAAAGATTGTCCCTG-A-TA-TG-G-A------T--------A---------------------------------------------T-ATT-C---T-G----G-TCAT-T---TAAA-----TA----G----C-----TA---------T---T-----A-------AT-AT--C---------AC-----CC-TG------T-A----T------C----AT-T-ATT-TTTAACCC--GAATAAA----TCTA-TCTATC-TATCTA--TGTATTTAcaacggtacttataca
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T-ATT-C---T-T----G-TCAT-T---T--------TAATATG----C-----TA---------T---T-----A-------AT-AT--C---------GC-----CT-TG------T-A----T------C----AT-TGATT-TTTACCTG--GAATAAA----TCTA-CCTATC-TActgctgtatgggcgactttatattgaatttctcgatgg
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -T---T--------T-----GAC--C-----TA---------T---TTGTGAA-------AT-AA--G---------AT-----CC-TG------T-A----T------CTTTCAT-TGATT-TTTA-CCT--GAATAAA----
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gi|5                          :                                                            tatcttTTG-TAATTTTGCTTTTA-TACTTTGTA--AATTTAA-TTTATATTTCAAAC------AGA-G-----T-TTT---AGTTAC---CTGAGATA--TCAGTA-TTG---AGGT--GCC-TTA-A-TT-GAGTAGTGT--GCC--AAAACC-TTGC-TT-ACATCC---TTGTTTATTTA--------TTT---T-GT-TATATAA------------------T-TAGTATTAACA-TAAGGACTTTCAAT-TG-GAAAATA--AGC--ATTCT---C--------TC----TGCGT--------TC-ATG--G----GTC----AT-CC-TT--GGG-T---T-----T----ATTCAA--TC-A------A-TGCAACG---A--------T---A-----------C--------T-TGTACAACA-ATA----------T--A-A-------------T------------C-----TA-T-----------CA-A--ATTT--A---T-T----T---AAGATTAATTGTCTT-AAAACT-----T--C----G-T-AACATTTT-ACTATCATA-TTG-A-TA-TG-G-AACAT--T--------ATT--TT------TA-TGAC---T-A--T----G-CTTC-------T-ATTGT---T-T----G-ACCTAT---T--------T-----G----C-----GA---------T-----------------AT-AA--G---------AC-----AC-TG------T-ATCTTT------C----AT-TGATT-TTTA-CCT--GAATAAA----ACTA-Tac
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Reference ( family-544 )      :                NTTTTTGATTTTAAAATTATAATCGT-GATAC-TTTGT--TATTATTTATTGCTAATTTTAA-TACGTTGTT--AGTTTTA-CTT----TTCAAAC-GTGATACA-GGTTTTT-TTT---AAT-AC---CTG-GATA--TCCGTA-T-A---AGGT--GCC-TTG-A-TT-ACCCA-TATTAGCC--AAAATC-TTGT-C-T-A--CATCC---TT--TTATT-----------TAC---A-GTA-T-TTTT-T-GTTGT-TACT-TTTTTT--TT-TNTTGTTACAA-TAAGGACC--CCAT-TG-G-AAA-TA--AGC--A---C---C--------AG----TGCTT--------TC-ATG--G----GCT----AT-CCTTA-AGG-T---G-----T----A---AA--TC-A------A-T-----G-----A--------T---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--ATG-------------T------------T-----TA-T-----------AAA-TAT-AT--G---T----C----T---A----GTC-TTATGANT-----T-GC----A-T-AATATTTT-A-A--ATTATACCTG-A-TA-TG-G-A------T--------ATT--TG------AA-T--T---T-------A--T----A-TTTC----AT-T-ATTC---T-T----G-TC--AT-T---T--------T-----G----C-----TA---------T---T-----A-------AT-AT--C---------A--C-----CC-TG------T-A----T------C----AT-T----GATT-TTTACCCT--GAAT-AAANCTAT-CTATC-TATCTA--TTTATTTAATCT
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tatggagaatttgaaaaattgtgaagagagttccttttttacttttgactgttatagtgtgatataga---G-----C----A---AA--TC-A------G-T-----G-----A--------T---T-----------G--------T-T------CA-TTT----------T--ATG-------------T------------C-----TA-A-----------TGA-TAC-AT--G---T----C----T---A----GTC-TTATAATT-----TTGT----A-T-AATATTTT-A-AG-ATTCTACCTG-A-TA-TG-G-A------T--------AAT--TG------TA-T--T---G-------A--T----A-TTTT----AT-T-ATTT---T-T----G-TC--AT-T---TAATA----T-----G----C-----TAGC-------TG--T-----ATATACATGT-AT--T---------A--T-----CC-TG------T-A----T------C----AT-T----GATT-TTTATTCT--GAAT-Actgc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -----G-----A--------T---A-----------T--------C-T-------A-TTT----------A--ATT-------------T------------T-----T--T-----------AAA-GAT-AA--A---T----T-------------GTC-TTA-AAAC-----T-GC----G-A-AACATTTT-A-CT-ATCATAT-TG-A-TA-TG-G-A---------------ACA--TA------AA-T--T---TTATGACTA--T----G-CTTCT---AT-T-GTT------T----G-ACCTAT-T---TG-------T-----G----A-----TA---------T---TT----A-------AG-A----------------------CC-TG------T-A----T------CTTTCAT-T----GATT-TTTA-CCT--GAAT-AAAACTA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caacgagGGACC--CCAT-TG-G-AAA-TATAAG---A---C---C--------TG----TG-------------------------------AT-CCTTA--GG-T---G-----T----A---AA--TC-A------A-T-----G-----C--------T---A-----------T--------TGT------C---------------T--A-G-------------TC-----------C-----TA-T-----------GGG-CCT-AT--A---T----C----TGAAA----ATC-TTGTCATTC----T-G-----------TATGCT-A-AT-ATTAGGCCTA-A-TA-Tagtactac
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TC---T-T----G-TC--AT-T---C--------T-----GTATGC-----TAATATTAGGCC---T-----A-------AT-AT--C---------A--C-----ACAGG------T-A----T------C----GT-T----GATT-TTTACCCT--GAAT-cacacaggtatcgttgatttttaccctgaatttaaa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                     ggaccccattggaaatataagacctgtgatccttaggtgtaaatcaatgctattgtctagtcctatgggcctatatctgaaaaC--CCAT-TG-G-AAA-TA--AAC--A---C---T--------AG----TGCTT--------TC-ATT--G----GCT----AC-CCTT--AGA-T---G-----T----A---AA--TC-C------A-T-----G-----ATACATTTGT---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--AT--------------T------------T-----TA-ttaaa
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----C----T---A----GTC-ATATGATT-----T-GC----A-T-AATATTTT-A-AG-ATAATGTTGG-A-CA-TG-G-A------C--------AAG--TG------TA-T--T---T-------A--T----A-TTTC----AT-C-ATTC---T-T----G-TC--CT-T---T--------T-----T----T-----TA-------------------A-------AT-AT-------------------------G------TTA----T------------T-T----GATG-TT-ATC-T--GC-T-AA--CTATTCGATA-TATATA--TTTATTGAAactttgttcaaatttgacctgtattttctagtaatatatttgcacatgaaaatttagccatata
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ----T---A----GTC-TT--GATT-----G-GCCCCAA-T-AATCTTTT-A-C--------CCTG-A--A-TG-G-AATCTGCT--------TTT--TG------AAAT--T---T-------A--T----A-TTTC----AT-TAATTA---TCT----G-TC--AT-T---TTAAAG---T-----G----C-----CA-------------T-----G-------ATAAT--C---------A--------CC-TG------T-A----T------C-----T-T----G
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatgttaactttatacttta--CCAT-TG-G-AAA-TA--AGC--A---C---C--------AG----TGCTT--------TC-ATG--G----GCT----AT-CCTT--AGG-T---G-----T----A---AA--TCTA------A-T-----G-----ATCATTTG-T---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--ATGTTAAC--------T------------T-----TA-T-----------AAA-TAT-AT--C---T----C----T---A----GT--TTATGATT-----T-GC----A-T-AATATTTT-A-
gi|29                         :                                                                                                                                                      aaA--TCCGTAAT-A---AGGT--GCCCTTG-A-TT-ATCCA-TATTAGCCTAAAAATC-TTGC-C-T-A--CATCAAGGTT--TT--------------TAC---A-TTA-T-TTTT-T-GTTGT-TACTATTTTTA--CT-TTTTGTTACAA-TAccttg
gi|3                          : gttaattccatcttaaTTTTTGATCTTAAAATTATAATCGT-GATAC-TTTGT--TATTATTCATTGCTAATTTTAA-TACGTCTTT--AATTTTA-CTT----TTCAAAC-GTGATACA-GGTTTTTATTT---AAT-AC---CTG-GATA--TCCGTA-T-A---AGGT--GCC-TTG-ATTT-ACCCA-TATTAGCC--AAAATC-TTGT-C-T-A--CATCC----T--TTA-T-----------TAC---A-TTA-T-TTTT-T-GTTGT-TAC-------T--TT-TGTTG-TACAA-T---NNNN--NNNN-NN-N-NNN-NN--NNN--N---N---N--------NN----NNNNN--------NN-NNN--N----NNN----NN-NNNNN-NNN-N---N-----T----A---AAT-TC-A------A-T-----G-----ATACATTTGT---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--ATGTTAAC--------T------------T-----TA-T-----------AAA-TAT-AT--G---T----C----T---A----GTC-TTATAAAT-----T-GC----A-T-AATATTT-----------TATCTG-A-TA-TG-GAA------TCTGCATTAATT--TG------AA-T--T---T-------G--T----ATTTTC----AT-T-ATTC---T-T----G-TC--AT-T---TTAAATG--T-----G----C-----TA---------T---T-----A-------AT-AT--C---------A--TCCTAGCC-TG------T-A----T------C----A--T----GATT-TTTA
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgaagcattgtgaagagggttcttttatataGACC--CCAC-TG-G-AAA-TA--AGC--A---C---CGCTAGGTGAG----TGCTT--------TC-AAG--GGCTAGCT----AT-CCTTATAGG-T---G-----T----A---AA--TC---------------------------------------------------------------------TT----------T--ATG-------------T------------T-----TA-T-----------A----AT-AT--G---T----C----T---T----GTC-CTATAATT-----T-GC----A-T-
gi|31                         :                                                                                                                                                    -GATA--TCCGTA-T-A----GGT--GCC-TTG-ATTT-ACCCA-TATTAGCC--AAAA-C-TTGT-C-T-A--CATCC----T--TTATT-----------TAC---A-GTATT-TTTT-T-GTTGT-TACT-TTTTAC--TT---TTGTTACAA-TAAG
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATTTT-A-T--TTTATAT-TG-A-T--TG-G-C------T--------A-----G------AA-T--T---A-------A--T--------TG----GC-T-ATC------T----A-TC--AT-T---TG-------T-----G-----------A---------T---T-----A--------T-AA--G---------A--C-----CC-TG------T-A----T------C----TT-TCAATGATT-TTTACC-T--GAAT-AAAACTA--CTA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cTTTT-A-AG-ATTATAG-TG-A-TA-GG-G-A------TTT------ATC--TG------TA-T--T---T-------AA-T----A-TTT-----ATAT-ATT-------------TC--AT-T------------------------------A---------T---T-----T-------AT-AT--T---------A--C-----CC-TT------T-A----T------C-----T-T----AGTT-TTTATCCT--GAAT-AA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CC--CCAT-TG-G-AAA-TA--AGC--A---C---C--------AG----TGCTTTCAAGAAATC-ATG--G----GAT----AT-CCTT--AGG-T---G-----T----A---AA--TC-C------A-T-----G-----A--------TGC-A-----------T--------T-TG-----TA-TTT----------C--A-G-------------T------------T-----TA-T-----------A
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -T---T--------T-----GAC--C-----TA---------T---TTGT--G-------AT-AT--A---------AGAC-----CC-TG------T-A----T------CTTTCAT-T----GATT-TTTA-CCT--GAAG-AAAACTA--CTActg
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   atttttatggctatgctcctattgTACA--TAAGGACC--C-AT-TG-G-ATT-TA--AGA--A---TTCTC--------TC----TGCTT---------C-ATG--G----GTC----AT-CCTT--GGG-TTTAT-----T----A---AA--TC-A------A-T-----G-----c
gi|4                          :                                             TAC-TTTGT--AATTATTTATTGTTAATTTTAA-TACGTTGTT--AGTTTTA-CTT----TC--AAC-GTGATACA-G-TTTTT-TTA---AAT-AC---CTG-GATA--TCCGTA-T-A---AGGC--GCT-TTA-A-TT-ATCCA-TATTAG-T--AAAATCTTTGT-C-T-G--CATCC---TA--TTAAT-----------TAT---A--TA-T-TTTT-TGGTCGT-TATT-TTTTTT--TTCTTCTGTTACAACTTAGAA-C--CCAT-TG---------------------------------AA----TGCTT--------TC-ATG--G----GCT----AT-CCTT--AGG-T---G-----T----A---AA--TC-A------A-T-----G-----G--------T---A-----------T--------T-T------CA-TTT---------------------------------------------------------------------C-AT--G---T----C----T---A----GTC-TTATGATT-----T-GC----A-G-AACATTTT-A-AAGATTGTCCCTG-A-TA-TG-G-A------T--------A---------------------------------------------------T-ATTC---T-G----G-TC--AT-T---TAAA-----TA----G----C-----TA---------T---T-----A-------AT-AT--C---------A--C-----CC-TG------T-A----T------C----AT-T-----ATT-TTTAACCC--GAAT-AAATCTAT-CTATC-TATCTA--TGTATTTAcaacggtacttataca
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -T-ATTC---T-T----G-TC--AT-T---T--------TAATATG----C-----TA---------T---T-----A-------AT-AT--C---------G--C-----CT-TG------T-A----T------C----AT-T----GATT-TTTACCTG--GAAT-AAATCTAC-CTATC-TActgctgtatgggcgactttatattgaatttctcgatgg
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -T---T--------T-----GAC--C-----TA---------T---TTGTGAA-------AT-AA--G---------A--T-----CC-TG------T-A----T------CTTTCAT-T----GATT-TTTA-CCT--GAAT-AAA
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                         --AAAATG-TTGT-CAT-AAATATCC---TT--TTATT-----------TATTATA-GTA-T-TTT-----------ACT-TTTCTT--TT-T---GTTACAA-TAaattaattcta
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----T------C----AT-T----GATT-TTTA-CCT--GAATAAAAGCT-T-CTACC-
gi|5                          :                                            tatcttTTGT--AATT-----TTGCT---TTTA--TACTTTGTA--AATTTAA-TTTATATTTCAAAC------AGA-G-----T-TTT---AGTTAC---CTGAGATA--TCAGTA-TTG---AGGT--GCC-TTA-A-TT-GAGTAGTGT--GCC--AAAACC-TTGC-T-T-A--CATCC---TTGTTTATT-----------TA-------------TTT-T-GTTATATAAT-T-----------AGTATTAACA-TAAGGACTTTCAAT-TG-G-AAAATA--AGC--A---TTCTC--------TC----TGCGT--------TC-ATG--G----GTC----AT-CCTTG--GG-T---T-----T----ATTCAA--TC-A------A-T-----GCAACGA--------T---A-----------C--------T-TGTACAACA-ATA----------T--A-A-------------T------------C-----TA-TC----------AAA-TTT-AT--T---TAAGAT----T---AATT-GTC-TTAAAACT-----T--C----G-T-AACATTTT-A-CT-ATCATAT-TG-A-TA-TG-G-AACAT--T--------ATT--TT------TA-TGAC---T-------A--T----G-CTTCT---AT-T-GTT------T----G-AC--CTAT---T--------T-----G----C-----GA---------T-----------------AT-AA--G---------A--C-----AC-TG------T-A----T------CTTTCAT-T----GATT-TTTA-CCT--GAAT-AAAACTAT-ac
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACC--C--T-TG-G-AAT-AA--AGC--A---C---C--------ACCAACTGCTTC-------TC-ATG--G----GCTCAATAT-CCTT----G-C---G-----TTTCAA---AA--TC-C------A-T-----G-----A--------T---ACACTTTGTAATT--------C-T------CA-TTT----------TC-ATG-------------T------------TCAACTTA-T-----------AAAATAT-ACTGG---T----CC---T---A----GTC-TTATGA-T-----T-GC----A-T-AATCTT------------TACCTG-ACTACTG-G-A------T--------ATT--TC------AC-T--T-----------------------------AT-T-ATTC-----G----G-TC--GT----------------------------------------------------------------T--C---------A--C-----CC-TG------T-A----T------C----AT-T----GATT-CTTACCCTTCAAAT-AAATCT
gi|14                         :                                                                       ATTTTAAATACTTTGTA--AATTTAA-TTT-------AAAT-TTGAAACAAGGTTTTT-AGT-----T-AC---CCGAGATA--TCAGTA-T-G---AGGT--GCC-TTG-A-TT-G--CG-TAGTTTCC--AAAATC-TTGC-T-T-A--CATCCTTGTT--TTGTT-----------TA------------TTTT-T-GTTATATA-------TA--TT-AGTTATTAC-A-TAAGGAAC--CCAT-AG-G-AAA-T---AGT--ATTCT---C--------TC----TGCTT--------TC-ATG--G----GTC----AT-CCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acattgtaaatttC--CCTT-TG-G-AA--TA--AGC--A---CA--C--------AC----TGCTT--------TC-ATG--G-----CT----AT-CCTTA--GG-T---G-----T----A---AA--TC-C------A-T-----G-----A--------T---ACATCTTTGTA-T--------T-T------CA-TTT----------TTCATG-------------T------------T-----TA-TGTTATAAATTTAAA-TAA-AT--G---TT---C----T---A----GTC-TTATGATT-----G-GC----AAT-AATAT---------ATT-TACCTG-A-TA-TG-G-A------T--------AT---------------------------------------TTTC----AT-T-ATTA---T-T----G-TC--GT----------------------------------------------------------------T--C---------A--C-----CC-TG------T-A----T------C----AT-T----GATTCCTTACCCTTCAAAT-AAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ----GTC-TTA-AAAC-----T-GC----G-T-AACATTTT-ACG--ATCAT-TTTG-A-TA-TG-G-AAACAT-T--------ATT--TT------TA-TGAC---T-------A--T----G-CTCT----AT-T-GTT------T----G-AC--CTAT---T--------T-----G----T-----GA---------T-----------------AT-AA--G---------A--C-----CC-TG------T-A----TATCTTTC----AT-T----GATT-TTTA-CCT--GAAT-AAAACTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                    ttattcaatcaatgcaacgatacttatacaacgatgatctcgattaaatttatttagattaattGGACC--CCAT-TA-G-AAA-TA--AGC--A---C---C--------AG----TGATT--------TC-ATT--G----GAT----AT-CCTCA--GG-T---G-----T----A---AA--TC-A------A-T------------------------------------------------------TA-TTT----------T--AC-----------------------------------------------------AC-AC--G---T----C----T---A----GTC-CTGTAATT-----T-GA----A-T-AATATTTT-A-AG-ATTATACGTG-T-TA-TG-G-A------T--------ATC--TG------AA-T--T---T-------A--T----A-CTTC----AT-G-ATTC---T-T----G-TC--AT-T---TAATA----T-----G----C-----TA---------T---T-----T-------GT-AT--C---------A--C-----CC-TC------T-A----T------C----AT-T----GATT-TTTATCTT--GAAT-ctgctact
gi|18                         :                                    AATCGTTGAAACCTTTGT--T--TATAT-TTGCTATTTTAAA-TACGTCGTTTTAGTTTTTTCTT----CTCAAACCGTGATAC--GGTTTTT-TCTTTAAAT-AC---CTG-GATACTTCCGTA-T-ATTAAGGTCTGCC-TTGCA-TTTACCCA-TATTAGCC--AAA-TC-TTGTAC-TCA--CATTC---CT----ATT-----------TAC---A-GTA-T-TTTTGT-GTTGT-TACT-T
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaGAACC--CCAT-CG-G-AAA-TA--AGC--A---C----------------------T--------TC-ATT--G----GCT----AT-CCTTA--GG-T---G-----T----A---AA--TC-A------A-T-----G-----A--------T---A-----------T--------T-T------CA-TT--------------ATG-------------T------------T-----CA-T-----------GAA-TGT-AT--G---C----C----T---A----GTC-CTATGATT-----T-GC----A-T-GGCATTTT-A---------ACCTA-A-TA-TG-G-A------T--------ATTTCTG-------A-T--C---T-------AGTC----A-TTTT----AA-T-A----------------C--A---------------T-----G----C-----TA---------T---T-----A-------AT-AT--C---------A--C-----CC-TG------T-A----T------C----AC-T----AATT-TTTACCCT--G
gi|2                          :                                                                      AAATTTAA-TACTTTGTA--AATTTAA-TAT-------AAAT-TTTAAACA-GGGTTTT-T-----AGTTAC---CTGAGATA--TCAATA-T-G---AGGT--GCC-TTG-A-TT-G--CG-TAGTTGCC--AAAATC-TTGC-T-T-A--CATCTTTGTT--TTATTTATTTTGGTTATAC---ATGTA-TATTAT-T-TTTGT-TA---TATATA--TT-AGTTATTAC-A-TNNNNNNN--NNNN-NN-N-NNN-NN--NNN--N---N---N--------NN----NNNNN--------NN-NNN--N----NNN----NN-NNNNN-NNN-N---GTTTATT----A---AA--TC-A------A-TGCAACG-----A--------T---A-----------C--------T-T-------A-TAC----------A--ACGAGGATC-------T------------C-----TATT-----------AAA-TTT-AT------T----CAAGAT---AAATTGTC-TTA-AAAC-----T-GC----G-T-AACATTTT-A-CT-ATCATA-TTG-A-TA-TGAA-A------C--------ATT-----------A-T--T---T-------T--T----A---TG----AC-T-ATGC---T-T----C-TG--ATGT---T--------T-----GAC--C-----TA---------TTTGT-----G-------AT-ATAAA---------A--C-----CC-TG------T-ATCTTT------C----GT-T----GATT-TTTA-CCT--GAAT-AAAACTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tatggagaatttgaaaaattgtgaagagagttccttttttacttttgactgttatagtgtgatataga---G-----C----A---AA--TC-A------G-T-----G-----A--------T---T-----------G--------T-T------CA-TTT----------T--ATG-------------T------------C-----TA-A-----------TGA-TAC-AT--G---T----C----T---A----GTC-TTATAATT-----TTGT----A-T-AATATTTT-A-AG-ATTCTACCTG-A-TA-TG-G-A------T--------AAT--TG------TA-T--T---G-------A--T----A-TTTT----AT-T-ATTT---T-T----G-TC--AT-T---TAATA----T-----G----C-----TAGC-------TG--T-----ATATACATGT-AT--T---------A--T-----CC-TG------T-A----T------C----AT-T----GATT-TTTATTCT--GAAT-Actgc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -----G-----A--------T---A-----------T--------C-T-------A-TTT----------A--ATT-------------T------------T-----T--T-----------AAA-GAT-AA--A---T----T-------------GTC-TTA-AAAC-----T-GC----G-A-AACATTTT-A-CT-ATCATAT-TG-A-TA-TG-G-A---------------ACA--TA------AA-T--T---TTATGACTA--T----G-CTTCT---AT-T-GTT------T----G-ACCTAT-T---TG-------T-----G----A-----TA---------T---TT----A-------AG-A----------------------CC-TG------T-A----T------CTTTCAT-T----GATT-TTTA-CCT--GAAT-AAAACTA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caacgagGGACC--CCAT-TG-G-AAA-TATAAG---A---C---C--------TG----TG-------------------------------AT-CCTTA--GG-T---G-----T----A---AA--TC-A------A-T-----G-----C--------T---A-----------T--------TGT------C---------------T--A-G-------------TC-----------C-----TA-T-----------GGG-CCT-AT--A---T----C----TGAAA----ATC-TTGTCATTC----T-G-----------TATGCT-A-AT-ATTAGGCCTA-A-TA-Tagtactac
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TC---T-T----G-TC--AT-T---C--------T-----GTATGC-----TAATATTAGGCC---T-----A-------AT-AT--C---------A--C-----ACAGG------T-A----T------C----GT-T----GATT-TTTACCCT--GAAT-cacacaggtatcgttgatttttaccctgaatttaaa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                     ggaccccattggaaatataagacctgtgatccttaggtgtaaatcaatgctattgtctagtcctatgggcctatatctgaaaaC--CCAT-TG-G-AAA-TA--AAC--A---C---T--------AG----TGCTT--------TC-ATT--G----GCT----AC-CCTT--AGA-T---G-----T----A---AA--TC-C------A-T-----G-----ATACATTTGT---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--AT--------------T------------T-----TA-ttaaa
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----C----T---A----GTC-ATATGATT-----T-GC----A-T-AATATTTT-A-AG-ATAATGTTGG-A-CA-TG-G-A------C--------AAG--TG------TA-T--T---T-------A--T----A-TTTC----AT-C-ATTC---T-T----G-TC--CT-T---T--------T-----T----T-----TA-------------------A-------AT-AT-------------------------G------TTA----T------------T-T----GATG-TT-ATC-T--GC-T-AA--CTATTCGATA-TATATA--TTTATTGAAactttgttcaaatttgacctgtattttctagtaatatatttgcacatgaaaatttagccatata
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ----T---A----GTC-TT--GATT-----G-GCCCCAA-T-AATCTTTT-A-C--------CCTG-A--A-TG-G-AATCTGCT--------TTT--TG------AAAT--T---T-------A--T----A-TTTC----AT-TAATTA---TCT----G-TC--AT-T---TTAAAG---T-----G----C-----CA-------------T-----G-------ATAAT--C---------A--------CC-TG------T-A----T------C-----T-T----G
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatgttaactttatacttta--CCAT-TG-G-AAA-TA--AGC--A---C---C--------AG----TGCTT--------TC-ATG--G----GCT----AT-CCTT--AGG-T---G-----T----A---AA--TCTA------A-T-----G-----ATCATTTG-T---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--ATGTTAAC--------T------------T-----TA-T-----------AAA-TAT-AT--C---T----C----T---A----GT--TTATGATT-----T-GC----A-T-AATATTTT-A-
gi|29                         :                                                                                                                                                      aaA--TCCGTAAT-A---AGGT--GCCCTTG-A-TT-ATCCA-TATTAGCCTAAAAATC-TTGC-C-T-A--CATCAAGGTT--TT--------------TAC---A-TTA-T-TTTT-T-GTTGT-TACTATTTTTA--CT-TTTTGTTACAA-TAccttg
gi|3                          : gttaattccatcttaaTTTTTGATCTTAAAATTATAATCGT-GATAC-TTTGT--TATTATTCATTGCTAATTTTAA-TACGTCTTT--AATTTTA-CTT----TTCAAAC-GTGATACA-GGTTTTTATTT---AAT-AC---CTG-GATA--TCCGTA-T-A---AGGT--GCC-TTG-ATTT-ACCCA-TATTAGCC--AAAATC-TTGT-C-T-A--CATCC----T--TTA-T-----------TAC---A-TTA-T-TTTT-T-GTTGT-TAC-------T--TT-TGTTG-TACAA-T---NNNN--NNNN-NN-N-NNN-NN--NNN--N---N---N--------NN----NNNNN--------NN-NNN--N----NNN----NN-NNNNN-NNN-N---N-----T----A---AAT-TC-A------A-T-----G-----ATACATTTGT---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--ATGTTAAC--------T------------T-----TA-T-----------AAA-TAT-AT--G---T----C----T---A----GTC-TTATAAAT-----T-GC----A-T-AATATTT-----------TATCTG-A-TA-TG-GAA------TCTGCATTAATT--TG------AA-T--T---T-------G--T----ATTTTC----AT-T-ATTC---T-T----G-TC--AT-T---TTAAATG--T-----G----C-----TA---------T---T-----A-------AT-AT--C---------A--TCCTAGCC-TG------T-A----T------C----A--T----GATT-TTTA
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgaagcattgtgaagagggttcttttatataGACC--CCAC-TG-G-AAA-TA--AGC--A---C---CGCTAGGTGAG----TGCTT--------TC-AAG--GGCTAGCT----AT-CCTTATAGG-T---G-----T----A---AA--TC---------------------------------------------------------------------TT----------T--ATG-------------T------------T-----TA-T-----------A----AT-AT--G---T----C----T---T----GTC-CTATAATT-----T-GC----A-T-
gi|31                         :                                                                                                                                                    -GATA--TCCGTA-T-A----GGT--GCC-TTG-ATTT-ACCCA-TATTAGCC--AAAA-C-TTGT-C-T-A--CATCC----T--TTATT-----------TAC---A-GTATT-TTTT-T-GTTGT-TACT-TTTTAC--TT---TTGTTACAA-TAAG
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATTTT-A-T--TTTATAT-TG-A-T--TG-G-C------T--------A-----G------AA-T--T---A-------A--T--------TG----GC-T-ATC------T----A-TC--AT-T---TG-------T-----G-----------A---------T---T-----A--------T-AA--G---------A--C-----CC-TG------T-A----T------C----TT-TCAATGATT-TTTACC-T--GAAT-AAAACTA--CTA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cTTTT-A-AG-ATTATAG-TG-A-TA-GG-G-A------TTT------ATC--TG------TA-T--T---T-------AA-T----A-TTT-----ATAT-ATT-------------TC--AT-T------------------------------A---------T---T-----T-------AT-AT--T---------A--C-----CC-TT------T-A----T------C-----T-T----AGTT-TTTATCCT--GAAT-AA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CC--CCAT-TG-G-AAA-TA--AGC--A---C---C--------AG----TGCTTTCAAGAAATC-ATG--G----GAT----AT-CCTT--AGG-T---G-----T----A---AA--TC-C------A-T-----G-----A--------TGC-A-----------T--------T-TG-----TA-TTT----------C--A-G-------------T------------T-----TA-T-----------A
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -T---T--------T-----GAC--C-----TA---------T---TTGT--G-------AT-AT--A---------AGAC-----CC-TG------T-A----T------CTTTCAT-T----GATT-TTTA-CCT--GAAG-AAAACTA--CTActg
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   atttttatggctatgctcctattgTACA--TAAGGACC--C-AT-TG-G-ATT-TA--AGA--A---TTCTC--------TC----TGCTT---------C-ATG--G----GTC----AT-CCTT--GGG-TTTAT-----T----A---AA--TC-A------A-T-----G-----c
gi|4                          :                                             TAC-TTTGT--AATTATTTATTGTTAATTTTAA-TACGTTGTT--AGTTTTA-CTT----TC--AAC-GTGATACA-G-TTTTT-TTA---AAT-AC---CTG-GATA--TCCGTA-T-A---AGGC--GCT-TTA-A-TT-ATCCA-TATTAG-T--AAAATCTTTGT-C-T-G--CATCC---TA--TTAAT-----------TAT---A--TA-T-TTTT-TGGTCGT-TATT-TTTTTT--TTCTTCTGTTACAACTTAGAA-C--CCAT-TG---------------------------------AA----TGCTT--------TC-ATG--G----GCT----AT-CCTT--AGG-T---G-----T----A---AA--TC-A------A-T-----G-----G--------T---A-----------T--------T-T------CA-TTT---------------------------------------------------------------------C-AT--G---T----C----T---A----GTC-TTATGATT-----T-GC----A-G-AACATTTT-A-AAGATTGTCCCTG-A-TA-TG-G-A------T--------A---------------------------------------------------T-ATTC---T-G----G-TC--AT-T---TAAA-----TA----G----C-----TA---------T---T-----A-------AT-AT--C---------A--C-----CC-TG------T-A----T------C----AT-T-----ATT-TTTAACCC--GAAT-AAATCTAT-CTATC-TATCTA--TGTATTTAcaacggtacttataca
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -T-ATTC---T-T----G-TC--AT-T---T--------TAATATG----C-----TA---------T---T-----A-------AT-AT--C---------G--C-----CT-TG------T-A----T------C----AT-T----GATT-TTTACCTG--GAAT-AAATCTAC-CTATC-TActgctgtatgggcgactttatattgaatttctcgatgg
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -T---T--------T-----GAC--C-----TA---------T---TTGTGAA-------AT-AA--G---------A--T-----CC-TG------T-A----T------CTTTCAT-T----GATT-TTTA-CCT--GAAT-AAA
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                         --AAAATG-TTGT-CAT-AAATATCC---TT--TTATT-----------TATTATA-GTA-T-TTT-----------ACT-TTTCTT--TT-T---GTTACAA-TAaattaattcta
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----T------C----AT-T----GATT-TTTA-CCT--GAATAAAAGCT-T-CTACC-
gi|5                          :                                            tatcttTTGT--AATT-----TTGCT---TTTA--TACTTTGTA--AATTTAA-TTTATATTTCAAAC------AGA-G-----T-TTT---AGTTAC---CTGAGATA--TCAGTA-TTG---AGGT--GCC-TTA-A-TT-GAGTAGTGT--GCC--AAAACC-TTGC-T-T-A--CATCC---TTGTTTATT-----------TA-------------TTT-T-GTTATATAAT-T-----------AGTATTAACA-TAAGGACTTTCAAT-TG-G-AAAATA--AGC--A---TTCTC--------TC----TGCGT--------TC-ATG--G----GTC----AT-CCTTG--GG-T---T-----T----ATTCAA--TC-A------A-T-----GCAACGA--------T---A-----------C--------T-TGTACAACA-ATA----------T--A-A-------------T------------C-----TA-TC----------AAA-TTT-AT--T---TAAGAT----T---AATT-GTC-TTAAAACT-----T--C----G-T-AACATTTT-A-CT-ATCATAT-TG-A-TA-TG-G-AACAT--T--------ATT--TT------TA-TGAC---T-------A--T----G-CTTCT---AT-T-GTT------T----G-AC--CTAT---T--------T-----G----C-----GA---------T-----------------AT-AA--G---------A--C-----AC-TG------T-A----T------CTTTCAT-T----GATT-TTTA-CCT--GAAT-AAAACTAT-ac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C--CCAT-TG-GGAAA-TAG-AGT--A---T---C--------AG----TGCTT--------TCAATG--G----GGA----AT-CCTT--AGA-T---G-----T----A---AATTTC-ATGATACA-T-----GTTT--G--------T---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--TTGTTAATTTTTATACT------------T-----TA-T-----------AAA-TAT-AT--GTTTT----T----T---A----GTC-TTATAAAT-----T-GC----A---AAAATTT-------ATTTTTTCTG---CA-AG--------------------TT--TG------AA-T--TTGGT-------A--T----T-TTTC----AT-T-ATTCAGGT-T----G-TC--AT-T---TTTTAAATGT-----G----CT----TA---------T---TA----A-------AT-AT--CTATCTATCTA--G-----CC-TG------T-A----T------C----AT-T----GATT-TTTACCCT--TAAT-AAA--TA---TGTC-TATCTA--TTTATCTAATTTaactact
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acg--CCAT-TGCG-AAA-TA--AGC--A---C---C--------AG----TGCTT--------TCAATA--G----GAT----AT-CCTT--AGG-C---G-----T----A---AA--TC-A------CTT-----G-----A--------TAC-A-----------T--------T-TGATATGCATTTT----------T--ATG-------------TTAACTTTATACCT-----TA-T-----------AAA-TAT-AT--G---T----C----T---A----GTC-TTATAAAT-----T-GC----A-TAAATACTT-----------TATCTG-A-TA-TG-A-A------T--------ACC--TGCATTAAAA-T--T---T-------G--T----A-TTTCATTTAT-T-ATTC---TATAAAAA-TA--AA-T---G--------T-----G----C-----TA---------T---T-----A-------AT-AT--C---------A--T-----CC-TAACCTGTT-A----TC-----C----ATAT----GA---TTTA-CCT--G-AT-AA---TAT-CTATCATATTTAC-TTCATTCAAtcaccaattctgtgatttacaaaatgtacttttatttat
gi|8                          :                  TTTTGGTTTTAGGATTATAATTGT-AATAC-TTT--------------------TTTTAAATAC----TT--AGTTTTA-CTT----TTCAAAC-TTGATACA-GGGTTTT-TT-----AT-ATCTACTA-TATA--TTTGTA-T-T---AAGA--GTC-TTG-C-CT-ATATA-TGTTTGCC--AAAGTC-TTGT-A-T-A--CATCT---TT--GTATT-----------GAC---T-ATA-T-aaaataattgaaatgtttattgattg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                             tgtgaagatatgaaatgttgtgaagagagttgttttgtagacCC--TCAA-TG-G-AAA-TA--AGC--A---C---C--------AT----TGATT--------TA-ACG--G----ATT----ATACCTTT-AGGAT---G-----T----A---AA--catattgcctcaatggaaataagcaccattgatttaacggattatacctttaggatgtaaa
gi|9                          :                                                                                                  tgtgaagatatgaaatgttgtgaagagagttgttttgtagacttttggttttaggattataattgtaatactttttttaaatacttagttttacttttcaaacttgatacagggttttttatatctactatatatttgtattaagagtcttgcctatatatgtttgccaaagtcttgtatacatctttgtattgactatatcatattgAAGGACC--CCAT-TGTG-GAA-TA--TGTTAA---T-------------G----TGCTT--------TC-A-GCTG----GCT----ATCCCTTA---G-T---GC----T----A---AA--TC-A------G-T-----G-----A--------TTACG-----------T--------T-T------CA--TT----------T--ATG-------------T------------T-----AA-T------------GA-TACAAT--GAT-T----C----T---A----GTCTTTATGAATGTTTGT-GC----A---AATATTTT-A-AG-ATTCTACCTGTA-TA-TGTG-A------TA-------ATT--TG------TA-T--T---TG------A--TCCAAA-TGAT----AT-T-ATTT---T-T----G-TA--AT-TAAATA-------T-----G----CCTGTATA---------T---T-----ATC-----AT-GT--CTT-------A--C-----AC-TGGA----TAA----T------C----AT-T----GATT-TTT


blockSeqs                     :                                          T     C     TA    A TTA             A   G     TT       T   ATATTTC    CG       A G     A CTTTA   T  CTA   A    CT      A ATTA     CT   C   C T  T A   G    A   TA      T    A A C AA     TTGT GT   T TATTTTGGTTA  TTATAG   T A    G G     A  CTATTTTTACTTT          A C        TT    A  C G   A  TA   TA TTC CGCTAGGTGAG            TCAAGAAA  A   CT GCTA A CAAT  A    ATA  A TTA TTTAT TTCA TTC  TT  ATGATAC  T GCAAC ATACATCTTTGTATTTCATTTTTCATGTTTATGTTATAAATTT                                                                             A   A  GTTT   AAGA AAGA GAA AATT   T      T GTTTG T  CCCA AT         . AAGATTG   TG  A C  C  A A TACCTGCATTAAAATTTGTATTTCATTT                                      A A   CAGGT  AAAA T  CT  TTAATATGCTAGCTGTATATACAT                                      A  CTATCTATCT   TCCTAG    A  ACCTGT T TCTT ATCTTT TTTC  A CAAT    C    C   TC    A   T   TT     A      C 
blockSeqs                     :                                          .     .     TA    A TCA             A   T     .        .   TTT        G        . G     . TT      T  .     A    .       . TG       .    .   . T  . C   .    T   .       .    . . . .      TTGT .    T .            CATG     . .    . .     A  TTTTTTTTTTCTT          A .        .     .  T .   .  G    .  .   CACCAAC                C         A   .  .    C .     C    NN   . .   C     .    .    T   TA       . .     ATACATTTGATATGCATTTTTATGTTAACTTTATACCTTAT                                                                               .   .  TGG    T    C    .   ATT    .      T C     .  .    TA         . CGATCA    CC  T .  .  T . TCTGCATTAATTTGAATTTGTATTTTC                                       . .   ATC    .    .  .   TCTGTATGCTAATATTAGGCCTA                                       .  AAA          GAC       .  GA     A .    C      TTTC  . .       .    C   TC    .   A   T      .      . 
blockSeqs                     :                                          .     .     AA    A TTA             .   G     .        .   CTC        T        . G     . GT      .  .     A    .       . A        .    .   . T  . T   .    A   .       .    . . . .      AGGT .    T .            AAG      . .    . .     .  CTTTTCTTTTT            A .        .     .  . .   .  .    .  .   TCTCTC                 .         .   .  .    T .     .    NN   . .   .     .    .    .   C        . .     ATACATTTTGTATTCATTTATGTTAACTTTATACTTTAT                                                                                 .   .  GAT    .    .    .   .      .      A .     .  .    T          . AGATTA    CC  . .  .  . . AACATTATTTTTATGACTATGCTCT                                         . .   CTA    .    .  .   TAAATATGCCTGTATATTATC                                         .  CTT          C         .  .      . .    .      TTTC  . .       .    T   .     .   A   C      .      . 
blockSeqs                     :                                          .     .     AA    A AT              .   T     .        .   TTC        T        . G     . TT      .  .     .    .       . G        .    .   . .  . C   .    T   .       .    . . . .      T    .    T .            CAG      . .    . .     .  TATATATTAG             A .        .     .  . .   .  .    .  .   TCTCTC                 .         .   .  .    C .     .    TA   . .   .     .    .    .   C        . .     ATACACTTTGTAATTCTCATTTTCATGTTCAACTTAT                                                                                   .   .  G      .    .    .   .      .      T .     .  .    T          . CTATCA    TT  . .  .  . . ACATAAATTTTATGACTATGCTTCT                                         . .   CT     .    .  .   TTTTTAAATGTGCTTATTAA                                          .  C            C         .  .      . .    .      TTTC  . .       .    C   .     .   A   T      .      . 
blockSeqs                     :                                                .     T     . .               .   G     .        .   TTC        G        . G     . TA      .  .     .    .       . G        .    .   . .  . C   .    A   .       .    . . . .      C    .    T .            CAT      . .    . .     .  CTTTTTACTT             A .        .     .  . .   .  .    .  .   CCAG                   .         .   .  .    A .     .    A    . .   .     .    .    .   C        . .     TTTGTATTTCATTTTTTGTTAATTTTTATACTTTAT                                                                                    .   .  G      .    .    .   .      .      T .     .  .    T          . AGATTC    CG  . .  .  . . ATCTGCTTTTTGAAATTTATATTTC                                         . .   AT     .    .  .   TTTGACCTATTTGTGAA                                             .  C            C         .  .      . .    .      .     . .       .    T   .     .   A   T      .        
blockSeqs                     :                                                      .     . .               .   G     .        .   TC         G        . G     . TT      .  .     .    .       . A        .    .   . .  . T   .    A   .       .    . . . .      T    .    A .            CAT      . .    . .     .  ATTTTTTA               A .        .     .  . .   .  .    .  .   ACAC                   .         .   .  .    C .     .    A    . .   .     .    .    .   A        . .     ATACATTTGTATTTCATTTTATGTTAACTTTAT                                                                                       .   .  G      .    .    .   .      .      A .     .  .    T          . CTATCA    CC  . .  .  . . ACATTATTTTTATGACTATGCTTCT                                         . .   CT     .    .  .   GTTTGACCTATTTGTG                                              .  C            C         .  .      . .    .      .     . .       .    C   .     .   A   T      .        
blockSeqs                     :                                                                              .   T     .        .   .          T        . .     . T       .  .     .    .       . A        .    .   . .  . A   .    A   .       .    . . . .      T    .    T .            CAG      . .    . .     .  TATTAG                 A .        .     .  . .   .  .    .  .   CTC                    .         .   .  .    N .     .    A    . .   .     .    .    .   A        . .     ATCATTTGTATTTCATTTTATGTTAACTTTAT                                                                                        .   .  G      .    .    .   .      .      T .     .  .    T          . ATATTA    CC  . .  .  . . TAATTTGTATTTGATCCAAATGAT                                          . .   CT     .    .  .   TTTAAATGTGCTATTA                                              .  G            C         .  .      . .    .      .     . .       .    T   .     .   T   .               
blockSeqs                     :                                                                              .   .     .        .   .          .        . .     . .       .  .     .    .       . A        .    .   . .  . T   .    A   .       .    . . . .      T    .    T .            CTA      . .    . .     .  CTTTTG                 C .        .     .  . .   .  .    .  .   CAG                    .         .   .  .    C .     .    A    . .   .     .    .    .   A        . .     CAACGATACTTGTACAACAATATAATCTATC                                                                                         .   .  G      .    .    .   .      .      A .     .  .    T          . AGATAA    CC  . .  .  . . TATTTCTGATCTAGTCATTTT                                             . .   TT     .    .  .   TTTGACCTATTTGTG                                               .  C            C         .  .      . .    .      .     . .       .    C   .     .   T   .               
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                         .       . T        .    .   . .  . .   .    .   .       .    . . . .      .    .    . .            .        . .    . .     .                         . .        .     .  . .   .  .    .  .   CTG                    .         .   .  .    N .     .    A    . .   .     .    .    .   A        . .     ATGCATTTGTATTTCAGTTTAT                                                                                                  .   .  A      .    .    .   .      .      T .     .  .    A          . CTATCA    CC  . .  .  . . TTTGAATTTGGTATTTTTC                                               . .   CT     .    .  .   TTTAATGTGCTTAT                                                .  T            T         .  .      . .    .      .     . .       .    A   .     .   A                   
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .     .  . .   .  .    .  .   AA                     .         .   .  .    T .     .    A    . .   .     .    .    .   A        . .     TATTTTAC                                                                                                                              .    .    .   .      .      A .     .  .    .          . .         T   . .  .  . . TATTTTC                                                           . .   .      .    .  .   ATTTGCGAT                                                     .  C            G         .  .      . .    .      .     . .       .    .   .     .                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .     .  . .   .  .    .  .   G                      .         .   .  .    C .     .    .    . .   .     .    .    .   .        . .                                                                                                                                                .    .   .      .      A .     .  .    .          . .         G   . .  .  . . TA                                                                . .   .      .    .  .   TGCTATTA                                                      .  G            T         .  .      . .    .      .     . .       .    .   .     .                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .     .  . .   .  .    .  .   .                      .         .   .  .    . .     .           .   .     .    .    .              .                                                                                                                                                         .      .      . .     .  .    .          . .         T   . .  .                                                                        . .   .      .    .  .   TTTTTTAA                                                      .  G            C         .  .      . .    .      .     . .       .    .   .                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .                                                                                                   .      .    .  .   TATTT                                                         .  C            .         .  .      . .    .      .     . .       .                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .                                                             .  .            .         .  .      . .    .      .     . .       .                                      
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13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-544 )      :                NTTTTTGATTTTAAAATTATAATCGT-GATAC-TTTGTNAT--TATTTATTGCTAATTTTAA-TACGTTGTT--AGTTTTA-CTT----TTCAAAC-GTGATACA-GGTTTTT-TTT---AAT-AC---CTG-GATA--TCCGTA-T-A---AGGT--GCC-TTG-A-TT-ACCCA-TATTAGCC--AAAATC-TTGT-CT-ACATCC---T--T-------TTATTT-------ACA-GTA-TTTT-T-T-GTTGT-TA---C--TTTTT----AC-T-TTTGTTACAA-TAAGGAC--CCCAT-TG-G-AAATA--AGCA---C---C--------A--G----TGCTT--------TC-A-TG--G----GCT----AT--CCT--T-AGG-T---G-T-----A---AA-T--C-A------A-T-----G-----A----------T---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--ATG------T------------T-------------TA-----------T-AAA-TAT-AT--G--T----C----T---A----GTC-TTATGANT-----T-GC----AT-AATATTTT-A-A--ATTATACCTG-A-TA-TG-G-A------T--------ATT--TG------AA-T--TT-------A--T----A-TTTC----AT-T-ATT-C---T-T----G-TC--AT-T---T------T-----G----C-----TA---------T-T-----A-------AT-ATC--A--C-----CC-TG------T-A----T------C----AT-T----GATT-TTTACCCT--GAAT-AAANCTAT-CTATC-TATCTA--TTTATTTAATCT
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gi|2                          :                                                                      AAATTTAA-TACTTTGTA--AATTTAA-TAT-------AAAT-TTTAAACA-GGGTTTT-T-----AGTTAC---CTGAGATA--TCAATA-T-G---AGGT--GCC-TTG-A-TT-GC--G-TAGTTGCC--AAAATC-TTGC-TT-ACATCT---T--TGTTTTATTTATTTTGGTTATACATGTA-TATTAT-T-TTTGT-TA------TATAT----AT-TAGTTATTACAT-NNNNNNN--NNNNN-NN-N-NNNNN--NNNN---N---N--------N--N----NNNNN--------NN-N-NN--N----NNN----NN--NNN--N-NNN-N---G-TTTATTA---AA-T--C-A------A-T-----GCAACGA----------T---A-----------C--------T-T-------A-TAC----------A--ACGAGGATCT------------C-------------TA-----------TTAAA-TTT-AT-----T----CAAGAT---AAATTGTC-TTA-AAAC-----T-GC----GT-AACATTTT-A-CT-ATCATAT-TG-A-TA-TG-A-AA-----C--------ATT-----------A-T--TT-------T--T----A-TG------AC-T-ATG-C---T-T----C-TG--ATGT---T------T-----GAC--C-----TA---------T-TTGT--G-------AT-ATA--AAAC-----CC-TG------T-A----T------CTTTCGT-T----GATT-TTTA-CCT--GAAT-AAAACTA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tatggagaatttgaaaaattgtgaagagagttccttttttacttttgactgttatagtgtgatataga---G-C-----A---AA-T--C-A------G-T-----G-----A----------T---T-----------G--------T-T------CA-TTT----------T--ATG------T------------C-------------TA-----------A-TGA-TAC-AT--G--T----C----T---A----GTC-TTATAATT-----TTGT----AT-AATATTTT-A-AG-ATTCTACCTG-A-TA-TG-G-A------T--------AAT--TG------TA-T--TG-------A--T----A-TTTT----AT-T-ATT-T---T-T----G-TC--AT-T---TAATA--T-----G----C-----TAGC-------TGT-----ATATACATGT-ATT--A--T-----CC-TG------T-A----T------C----AT-T----GATT-TTTATTCT--GAAT-Actgc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -----G-----A----------T---A-----------T--------C-T-------A-TTT----------A--ATT------T------------T-------------T------------T-AAA-GAT-AA--A--T----T-------------GTC-TTA-AAAC-----T-GC----GA-AACATTTT-A-CT-ATCATAT-TG-A-TA-TG-G-A---------------ACA--TA------AA-T--TTTATGACTA--T----G-CTTCT---AT-T-GTT-------T----G-ACCTAT-T---TG-----T-----G----A-----TA---------T-TT----A-------AG-A-------------CC-TG------T-A----T------CTTTCAT-T----GATT-TTTA-CCT--GAAT-AAAACTA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               caacgagGGAC--CCCAT-TG-G-AAATATAAG-A---C---C--------T--G----TG--------------------------------AT--CCT--T-AGG-T---G-T-----A---AA-T--C-A------A-T-----G-----C----------T---A-----------T--------TGT------C---------------T--A-G------TC-----------C-------------TA-----------T-GGG-CCT-AT--A--T----C----TGAAA----ATC-TTGTCATTC----T-G----------TATGCT-A-AT-ATTAGGCCTA-A-TA-Tagtactac
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T-C---T-T----G-TC--AT-T---C------T-----GTATGC-----TAATATTAGGCC-T-----A-------AT-ATC--A--C-----ACAGG------T-A----T------C----GT-T----GATT-TTTACCCT--GAAT-cacacaggtatcgttgatttttaccctgaatttaaa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                       ggaccccattggaaatataagacctgtgatccttaggtgtaaatcaatgctattgtctagtcctatgggcctatatctgaaaa--CCCAT-TG-G-AAATA--AACA---C---T--------A--G----TGCTT--------TC-A-TT--G----GCT----AC--CCT--T-AGA-T---G-T-----A---AA-T--C-C------A-T-----G-----ATACATTTG--T---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--AT-------T------------T-------------TA-----------ttaaa
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ----C----T---A----GTC-ATATGATT-----T-GC----AT-AATATTTT-A-AG-ATAATGTTGG-A-CA-TG-G-A------C--------AAG--TG------TA-T--TT-------A--T----A-TTTC----AT-C-ATT-C---T-T----G-TC--CT-T---T------T-----T----T-----TA-----------------A-------AT-AT----------------G------TTA----T------------T-T----GATG-TT-ATC-T--GC-T-AA--CTATTCGATA-TATATA--TTTATTGAAactttgttcaaatttgacctgtattttctagtaatatatttgcacatgaaaatttagccatata
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ----T---A----GTC-TT--GATT-----G-GCCCCAAT-AATCTTTT-A-C--------CCTG-A--A-TG-G-AATCTGCT--------TTT--TG------AAAT--TT-------A--T----A-TTTC----AT-TAATT-A---TCT----G-TC--AT-T---TTAAAG-T-----G----C-----CA-----------T-----G-------ATAATC--A--------CC-TG------T-A----T------C-----T-T----G
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tatgttaactttatactttaCCAT-TG-G-AAATA--AGCA---C---C--------A--G----TGCTT--------TC-A-TG--G----GCT----AT--CCT--T-AGG-T---G-T-----A---AA-T--CTA------A-T-----G-----ATCATTTG---T---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--ATGTTAAC-T------------T-------------TA-----------T-AAA-TAT-AT--C--T----C----T---A----GT--TTATGATT-----T-GC----AT-AATATTTT-A-
gi|29                         :                                                                                                                                                      aaA--TCCGTAAT-A---AGGT--GCCCTTG-A-TT-ATCCA-TATTAGCCTAAAAATC-TTGC-CT-ACATCAAGGT--T-------TT---T-------ACA-TTA-TTTT-T-T-GTTGT-TA---CTATTTTT----ACTT-TTTGTTACAA-TAccttg
gi|3                          : gttaattccatcttaaTTTTTGATCTTAAAATTATAATCGT-GATAC-TTTGTTAT--TATTCATTGCTAATTTTAA-TACGTCTTT--AATTTTA-CTT----TTCAAAC-GTGATACA-GGTTTTTATTT---AAT-AC---CTG-GATA--TCCGTA-T-A---AGGT--GCC-TTG-ATTT-ACCCA-TATTAGCC--AAAATC-TTGT-CT-ACATCC------T-------TTA-TT-------ACA-TTA-TTTT-T-T-GTTGT-TA---C--TTT---------T-GTTG-TACAA-T--NNNN--NNNNN-NN-N-NNNNN--NNNN---N---N--------N--N----NNNNN--------NN-N-NN--N----NNN----NN--NNN--N-NNN-N---N-T-----A---AATT--C-A------A-T-----G-----ATACATTTG--T---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--ATGTTAAC-T------------T-------------TA-----------T-AAA-TAT-AT--G--T----C----T---A----GTC-TTATAAAT-----T-GC----AT-AATATTT-----------TATCTG-A-TA-TG-GAA------TCTGCATTAATT--TG------AA-T--TT-------G--T----ATTTTC----AT-T-ATT-C---T-T----G-TC--AT-T---TTAAATGT-----G----C-----TA---------T-T-----A-------AT-ATC--A--TCCTAGCC-TG------T-A----T------C----A--T----GATT-TTTA
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgaagcattgtgaagagggttcttttatataGAC--CCCAC-TG-G-AAATA--AGCA---C---CGCTAGGTGA--G----TGCTT--------TC-A-AG--GGCTAGCT----AT--CCTTAT-AGG-T---G-T-----A---AA-T--C-----------------------------------------------------------------------TT----------T--ATG------T------------T-------------TA-----------T-A----AT-AT--G--T----C----T---T----GTC-CTATAATT-----T-GC----AT-
gi|31                         :                                                                                                                                                    -GATA--TCCGTA-T-A----GGT--GCC-TTG-ATTT-ACCCA-TATTAGCC--AAAA-C-TTGT-CT-ACATCC------T-------TTATTT-------ACA-GTATTTTT-T-T-GTTGT-TA---C--TTTTT----AC-T-TTTGTTACAA-TAAG
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTTT-A-T--TTTATAT-TG-A-T--TG-G-C------T--------A-----G------AA-T--TA-------A--T--------TG----GC-T-ATC-------T----A-TC--AT-T---TG-----T-----G-----------A---------T-T-----A--------T-AAG--A--C-----CC-TG------T-A----T------C----TT-TCAATGATT-TTTACC-T--GAAT-AAAACTA--CTA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cTTTT-A-AG-ATTATAG-TG-A-TA-GG-G-A------TTT------ATC--TG------TA-T--TT-------AA-T----A-TTT-----ATAT-ATT--------------TC--AT-T----------------------------A---------T-T-----T-------AT-ATT--A--C-----CC-TT------T-A----T------C-----T-T----AGTT-TTTATCCT--GAAT-AA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         C--CCCAT-TG-G-AAATA--AGCA---C---C--------A--G----TGCTTTCAAGAAATC-A-TG--G----GAT----AT--CCT--T-AGG-T---G-T-----A---AA-T--C-C------A-T-----G-----A----------TGC-A-----------T--------T-TG-----TA-TTT----------C--A-G------T------------T-------------TA-----------T-A
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -T---T------T-----GAC--C-----TA---------T-TTGT--G-------AT-ATA--AGAC-----CC-TG------T-A----T------CTTTCAT-T----GATT-TTTA-CCT--GAAG-AAAACTA--CTActg
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     atttttatggctatgctcctattgTACA--TAAGGAC--CC-AT-TG-G-ATTTA--AGAA---TTCTC--------T--C----TGCTT---------C-A-TG--G----GTC----AT--CCT--T-GGG-TTTAT-T-----A---AA-T--C-A------A-T-----G-----c
gi|4                          :                                             TAC-TTTGTAAT--TATTTATTGTTAATTTTAA-TACGTTGTT--AGTTTTA-CTT----TC--AAC-GTGATACA-G-TTTTT-TTA---AAT-AC---CTG-GATA--TCCGTA-T-A---AGGC--GCT-TTA-A-TT-ATCCA-TATTAG-T--AAAATCTTTGT-CT-GCATCC---T--A-------TTAATT-------ATA--TA-TTTT-T-TGGTCGT-TATTTT--TTTTT----TC-T-TCTGTTACAACTTAGAA---CCCAT-TG------------------------------A--A----TGCTT--------TC-A-TG--G----GCT----AT--CCT--T-AGG-T---G-T-----A---AA-T--C-A------A-T-----G-----G----------T---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------------------------------------------------------------------C-AT--G--T----C----T---A----GTC-TTATGATT-----T-GC----AG-AACATTTT-A-AAGATTGTCCCTG-A-TA-TG-G-A------T--------A------------------------------------------------T-ATT-C---T-G----G-TC--AT-T---TAAA---TA----G----C-----TA---------T-T-----A-------AT-ATC--A--C-----CC-TG------T-A----T------C----AT-T-----ATT-TTTAACCC--GAAT-AAATCTAT-CTATC-TATCTA--TGTATTTAcaacggtacttataca
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -T-ATT-C---T-T----G-TC--AT-T---T------TAATATG----C-----TA---------T-T-----A-------AT-ATC--G--C-----CT-TG------T-A----T------C----AT-T----GATT-TTTACCTG--GAAT-AAATCTAC-CTATC-TActgctgtatgggcgactttatattgaatttctcgatgg
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -T---T------T-----GAC--C-----TA---------T-TTGTGAA-------AT-AAG--A--T-----CC-TG------T-A----T------CTTTCAT-T----GATT-TTTA-CCT--GAAT-AAA
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ----T------C----AT-T----GATT-TTTA-CCT--GAATAAAAGCT-T-CTACC-aattaattcta
gi|5                          :                                            tatcttTTGTAAT--T-----TTGCT---TTTA--TACTTTGTA--AATTTAA-TTTATATTTCAAAC------AGA-G-----T-TTT---AGTTAC---CTGAGATA--TCAGTA-TTG---AGGT--GCC-TTA-A-TT-GAGTAGTGT--GCC--AAAACC-TTGC-TT-ACATCC---TTGT-------TTATTT-------A---------TT-T-T-GTTATATA---A--TTAGT----A--------TTAACA-TAAGGACTTTCAAT-TG-GAAAATA--AGCATTCT---C--------T--C----TGCGT--------TC-A-TG--G----GTC----AT--CCT--T-GGG-T---T-T-----ATTCAA-T--C-A------A-TGCAACG-----A----------T---A-----------C--------T-TGTACAACA-ATA----------T--A-A------T------------C-------------TA-----------TCAAA-TTT-AT--T--TAAGAT----T---AATT-GTC-TTAAAACT-----T--C----GT-AACATTTT-A-CT-ATCATA-TTG-A-TA-TG-G-AACAT--T--------ATT--TT------TA-TGACT-------A--T----G-CTTC-------T-ATTGT---T-T----G-AC--CTAT---T------T-----G----C-----GA---------T---------------AT-AAG--A--C-----AC-TG------T-ATCTTT------C----AT-T----GATT-TTTA-CCT--GAAT-AAAACTAT-ac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --CCCAT-TG-GGAAATAG-AGTA---T---C--------A--G----TGCTT--------TC-AATG--G----GGA----AT--CCT--T-AGA-T---G-T-----A---AA-TTTC-ATGATACA-T-----GTTT--G----------T---A-----------T--------T-T------CA-TTT----------T--TTG------T------------TAATTTTTATACTTTA-----------T-AAA-TAT-AT--G--T----T----TTTTA----GTC-TTATAAAT-----T-GC----AA-AA-ATTT-------ATTTTTTCTG---CA-AG--------------------TT--TG------AA-T--TTGGT----A--T----T-TTTC----AT-T-ATT-CAGGT-T----G-TC--AT-T---T------T---------------------------T-T-----A-------A----------------------------------------------ATGT----GCTT-ATTA-------AAT-A--TCTAT-CTATC-TAaactact
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acgCCAT-TGCG-AAATA--AGCA---C---C--------A--G----TGCTT--------TCAA-TA--G----GAT----AT--CCT--T-AGG-C---G-T-----A---AA-T--C-A------CTT-----G-----A----------TAC-A-----------T--------T-TGATATGCATTTT----------T--ATG------TTAACTTTATACCT-------------TA-----------T-AAA-TAT-AT--G--T----C----T---A----GTC-TTATAAAT-----T-GC----ATAAATACTT-----------TATCTG-A-TA-TG-A-A------T--------ACC--TGCATTAAAA-T--TT-------G--T----A-TTTCATTTAT-T-ATT-C---TATAAAAA-TA--AA-T---G------T-----G----C-----TA---------T-T-----A-------AT-ATC--A--T-----CC-TAACCTGTT-A----TC-----C----ATAT----GA---TTTA-CCT--G-AT-AA---TAT-CTATCATATTTAC-TTCATTCAAgcctgtatcattgatttttacccttaataaatatgtctatctatttatctaattttcaccaattctgtgatttacaaaatgtacttttatttat
gi|8                          :                  TTTTGGTTTTAGGATTATAATTGT-AATAC-TTT--------------------TTTTAAATAC----TT--AGTTTTA-CTT----TTCAAAC-TTGATACA-GGGTTTT-TT-----AT-ATCTACTA-TATA--TTTGTA-T-T---AAGA--GTC-TTG-C-CT-ATATA-TGTTTGCC--AAAGTC-TTGT-AT-ACATCT---T--T-------GTATTG-------AC---TA-TATC-A-T-ATTGC------C--T--------------------CAA-T--GGA---------------AATA--AGCA---C---C--------A--T----TGATT--------TA-A-CG--G----ATT----ATACCTT--T-AGGAT---G-T-----A---AA-aaaataattgaaatgtttattgattg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                          tgtgaagatatgaaatgttgtgaagagagttgttttgtagacAAGGAC--CCCAT-TGTG-GAATA--TG-----T---T--------AATG----TGCTT--------TC-A--GCTG----GCT----AT--CCC--T-TAG-T---GCT-----A---AA-T--C-A------G-T-----G-----A----------TTACG-----------T--------T-T------CA--TT----------T--ATG------T------------T-------------AA-----------T--GA-TACAAT--GATT----C----T---A----GTCTTTATGAATGTTTGT-GC----A--AATATTTT-A-AG-ATTCTACCTGTA-TA-TGTG-A------TA-------ATT--TG------TA-T--TTG------A--TCCAAA-TGAT----AT-T-ATT-T---T-T----G-TA--AT-TAAATA-----T-----G----CCTGTATA---------T-T-----ATC-----AT-GTCTTA--C-----AC-TGGA----TAA----T------C----AT-T----GATT-TTT
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Unaligned ( gi|42 ): TATTTTTATGACTATGCTTCTATTGTTTGACCTATTTGTGATATCTTTCATTGATTTTTACCTGAATAAAACTAC
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Unaligned ( gi|48 ): TGTATCTTTCATTGATTTTTGCCGGAATATAACTACTACTAC
Unaligned ( gi|50 ): CTGTCATTGTTTACCTGAATAAAACTACTACTACTAC