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consensus : GTGTT--G-A-ATGT-G-CGG-C--GT-G-GC--------G-TA------A-TG-G-A-T-A-A--G-G-CT---G-TG--GA-CTT--T---A-AACG-T-CCAACTG
Reference ( family-518 ) : GTGTT--G-A-ATGT-G-CGG-C--GT-G-GC--------G-TA------A-TG-G-A-T-A-A--G-G-CT---G-TG--GA-CTT--T---A-AACG-T-CCAACTG
gi|1 : TT--G-A-ATGTTG-CGG-C--GT-G-GCAGTACAGTG-TA------T-TG-C-A-T-A-A--G-GGCC---G-TG--GA-CTT--T-----AACG-T-
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gi|11 : gTT--G-A-ATGT-G-CGG-C--GT-G-GC--------G-AA------A-TG-G-A-T-A-A--G-G-CT---G-TG--GA-CTA--G---A-ACCG-T-CCAACTgtt
gi|12 : ggtttGTGTT--T-G-ATGT-G-CGG-C--GT-G-GC--------A-TA------A-TG-G-A-T-A-AG-G-G-CT---G-TG--GA-CTT--T---A-AATG-T-CAATCTGtt
gi|13 : TT--G-A-ATGT-G-CGG-C--GT-G-G---------G-AAT-----A-TG-G---T-A-A--G-G-CT---G-T---GA-CTT--T---A-AATG-T-CCAtt
gi|14 : ggcgtGTGTTT-G-A-ATGT-G-CGGGC--GT-G-GC--------A-TA------A-TG-G-A-T-A-A--G-G-CT---G-TG--GA-CTT--T---A-AATG-T-CCAACTGtgtgct
gi|15 : TT--G-A-ATGT-G-CGG-C--GT-G-GC--------A-TA------A-TG-G-A-T-A-A--G-G-CG---G-TG--GA-CTT--T---A-AATG-T-CCAACTG
gi|16 : tgtGTGTT--G-A-AATT-G-CGG-C---T-A-GC--------AATA------A-TG---A-T-A-C--GAG-CT---GATG--GA-CTT--T---A-AATG-T-CCAACTGgt
gi|17 : T--G-ATATGT-G-CGG-C--GT-G-GC--------G-TA------A-TGCGCA-T-ACA--G-C-CTGTCG-TG--GA-CTT--TGAGA-AACG-T-g
gi|18 : aGTGTTT-A-A-ATGT-G-CGG-C--GT-G-GC--------G-TA------A-TG-A-A-T-A-A--G-G-TT---G-TG--GA-CTT--T---A-AACG-T-CCAACTgc
gi|19 : TT--G-A-ATGT-G-CGG-C--GT-G-GC--------G-TA------A-TG-G-A-T-A-A--G-G-CC---G-TG--GA-CTT--T---A-AACG-TGCCAACT
gi|2 : tgtTT--G-A-ATGT-G-CGG-C--GT-G-GC--------G-TACATGTAA-TG-G-A-T-A-A--G-G-CC---G-TG--GA-CTT--T---A-AACG-T-
gi|20 : tgtGTGTT--G-A-ATGT-G-CGG-C--GT-G-GC--------A-TA------A-TG-G-A-T-A-A--G-G-CT---G-TG--GA-CTT--T---A-AATG-T-CCAACTGgccgtaaac
gi|21 : TT--G-A-AT-T-G-CGG-C---T-A-GC--------A-TA------A-TG---A-T-A-A--G-G-CT---G-TG--GATCTT--TG--A-AATG-T-CTAACTG
gi|22 : tGTGTTT-G-A-ATGT-G-CGG-C--GT-G-GC--------G-TA------A-TG-G-A-T-A-A--G-G-CT---G-TG--GA-CTT--T---A-AACG-A-CCAgt
gi|23 : gGTGTTT-G-A-AAGT-G-TGG-C--GT-G-GC--------G-TA------A-TG-G-A-T-A-A--G-A-CT---G-TG--GA-CTT--T---A-AACG-T-ACA
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gi|27 : gGTGTTTCG-A-ATGT-GGCGT-C--GT-G-GC--------G-TA------A-TG-G-A-T-A-A--G-G-CT---G-TG--
gi|3 : gTT--GTA-ATGT-G-CGG-C--GT-G-GC--------A-TA------A-TG-GAA-T-A-A--G-G-CT---G-TG--GA-CTTTAT---A-GATG-TCCCAACTGac
gi|4 : ttTT--G-A-ATGT-C-CGGTC--GTTG-GC--------A-AA------A-TG-G-A-T-A-AACG-G-CT---G-TG--GA---T--T---A-AATG-T-CCAACTtt
gi|5 : tgcGTGTTT-G-A-ATGC-G-CGG-TT-GT-G-GC--------A-TA------AATG-G-A-A-A-A--G-G-CT---G-TG---A-CTT--T---A-AATG-T-CCAACTGtgttt
gi|6 : GTGTTCTG-A-ATGTCG-CGG-CC-GT-G--C--------G-TA------A-TG-G-ACT-A-A--G-G-CACA-G-TG--GA-CTT--T---A-AACG-TGCCAACttt
gi|7 : GTGTTT-G-A-ATGT-G-CGG-C--GT-G-GC--------A-TA------A-TG-G-A-TAA-A--G-G-CT---G-TG--GA-CTT--T---A-AA-G-T-CC-ACTG
gi|8 : gGTGTT--G-C-ATGT-G-TGG-C--GT-GAGC--------A-TA------A-TG-G-A-T-A-AA-G-G-CT---G-TG--GA-CTT--T---A-AATG-T-CTAACTGttt
gi|9 : aGTGTTT-G-A-ATGT-G-CGG-CACGT-G-CT--------A-TA------A-TG-G-A-T-A-A--A-G-CT---G-TGAAGA-CTT--C---ATAATGTT-CCAAg