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gi|10 : TATCGGAA-GATGAAAAACTCAAAG-GG-AGTGC-T-TCATGCATTA---A--GCAA----A--AT-CAA-ATTAAA----GTG--GCAGAC--T-TGATTTATTGG--CTTGAATGG----CAC-G-TT--CGCTT----AAT-GA-GGAGCCGATGA-G--CAT-T----CAAT--ATA-TAGGC------CTTAT-T-TTGCA----TC-CC----CGGAAAA-T----G-------A---A--GGTG-----AA--CC--T-----G-GAAC-AGAAG-----------TT-CAC--------C--------A---------C---------T-----AGTCGCATATAT-AAA----AATTGTC-----T--G-------T--CAA-GATT--------GC--T-C-------------T--ATAAGT-TTATA---------TG--A-GC--C-A---CTCG-------GTT--AGCC--C--AGA-ACCG---C--CG-----AC-GA-G-ACCGCaccgtgcagcagcgcactttgggccacaagtagatctagtaaagcaatgtaaagtagaaaggttaaaccagctacaataatagctccacaattggagataaaagtattacaaaataaaaataaaaataaggtgattggtttaaaaaatactgtaatccagaacagt
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gi|12 : CAGAA-GATGAAAAACTCAACA-GGGAGCGC-T-CAATGCAT-A---A--GCAAGAAAA--AA-TAA-AT-AAA----GTG--GCAGAT--A-AGATGTATTGG--C-TGAATGGGC--CAC-G-GC--CGCTTA---AAT-GAGGGAGCC---GA-G-------------GT--ATA-TA--C------CTTATA--TGGCA----T--CC----CGAAAAA-T----GCA-----G---A--AGGG-----AA-CCC--T-----GGGAAC-AGAAG-----------TC-CAC--------CACTTTAATA---------C---------T-----AGTC-CATACAT-AAA----AA-TG-C-----T--G-------T--CAA-GT-T--------GC--T-C-------AA---AT--A-AAGT-CCA-A---------TG--A-GC--CTA---CT-G-------GTA--AGCT--T--AAA-A--A---C--CGAAT-CACTGCTG-ACTGCT--AAG
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gi|4 : A-GG-AGC-C-T-AGATGCAT-ATGAA--CCAA----AT-AA-CAA-AA-AAG----GTG--TAAGGA--TATGATT-ATCGTTTC-TGAATGGGCGCCACTG-GC--CCTTCC---AAT-G-GGGAG--------G--C---------------TA-TA-GG------CCTATA----GCA----T--CC----CTAAAAA-C----GCA-----A---ATGGGT------AA-CCC--T-----GGGAACCAAAAG-----------T--CAC--------CACTTTTT-A---------C---------T-----AGTCTCATACTT-AGAAT--AA-TG-C-----C--G-------TTCCAA-GTTT--------GA--T-C-------AA---ATTAA-AGGT-CCA-A---------TG--ATGC--C-A---CTGG-------GTA--AGCC--A--AAA-AC-A---C--CG
gi|17 : aattaattaatcgaataaccaccattatcaagattcaaaagtagctaaacctgtaatcgttagaaacagacgccgactcctccaaataccgcacgcgtattaggctttgtgattaaaaacaaaaaaaatataagggtctcagggtgaattttcgagctttggaattgatgacgataaaatatcacgtaaatcgtcgttcacaggcaattagttttattttgttcgccggaaacgaagcaagactatatcatgcacctggaaaatgcggggtttgattggcacgtccgagcaatgtgaaaatcagagagttcaataaccagtatgacccgaacaaagcataaacataacttgttcctattcaacattttagcatacataagcgcgcaaagttgtggaaccaaataagtttcacttatatattgctcattactccagcagcgtgtgaaaacaatgataaaatgataataatatacacatattt--C-TGAATGGGC--TAC-G-GC--CGCTTA---AAT-GAGCGGGCC---GAGG--TA--T----CAAT--ATA-T----------CTTTTA--TGGCA----T--CC----CTAAATA-T----GCAAACTTA---A--GGTA-----AA-CCT--T-----GGGAAC-AGAAA-----------TT-CAC--------A--------A---------C---------ccatgaaccaacacccatacagccgctggcctgccgcaccagtagagctagaaaactatgggaattttaggcccagtttcaaaccaactaccaatgaacttccacaaagtggagattgaaattagtttatacaaaaattgtaacataaataccgtaaggaaagttttgggttttatagatataa
gi|7 : ATGG----CAC-T-GC--CGCTTAGTAAATTGAGGAGACC---GA-GGGCA--TGGCTCAATTTATA-TA-GTAAAGAACTTATAT-TTGGA----T--CCCCCACGAAAAAGTCCGAGCA-----GTAAA--TGTGGATAAAA-CCA--CAAGAGGAAAAC-AG-AG-----------TA-TAC--------A--------A---------CTA-------T-----AATCACA-ACAA-AAA----AA-TG-C-----TGAG-------TA-CAA-A--G--------AT--T-C-------GACTCAT--A-AAGTGTCG-AGTGTGTATGCG--A-AC--ATA---CT-GAGACAGAGTAGCGACCGGC--AAA-G--A---CCACGCGT-CAC-GACGAACCGAT--AGGCAGCatttatac
gi|1 : -GGGGGGGCG---GA-GG-CAAGT----CAAT--ATA-TG---------CTTATAT-CGGCA----T--CC----CTAAAAA-T----GCA-----A---A--GGTG-----AAACTC--T-----GGGAA--AGAAG-----------TT-CAC--------C--------A---------CCTTTTATACT-----AGTC-AA-ACTT-AAA----AAATG-C-----T--G-------T--CAACG--TT-------GC--T-C-------AA---A-----AAAT-TCA-A---------TG--A-GC--CTAA--CT-G-------GTT--AGC------AAA-A--T---A--CGAAT-CACTGTTG-ACTGCT--AAGAGGCCTG---GAATGGGGAGGC-GGCAGT---ATCGGTACCTATCTCG--CTAGGTGTTTTCAATAT---CATT-ACC-AATCTGAAAAAAGCCCAA--AA-GCAAACGGCAAAAAATGTGGAATATAACAAAGCAAGCAACAACA--------ACAAAA----AAACAACTAATTAAT--A-ATTAT--AACC--TAT----ATACAGGTT--AAAAGAGG--AAT--GCAATCCTAGCTAACTAT-GACGTCGAC----CCAAATACCGCACG-CGCAT--GG-CTT-G------------AAAAGGGTG--AGAGGG--TGGGTGATAA----TTTC-AGCGT--GAA--TTTATGACGATA-------AC-GT--A-AAT------CCGTGACG-TCA---GCGA-------TATTTGTGC-----------GGAGCA-A-ACTA----ATG-GCCCGA-AAAT---GCGGGG---GAT------GGA--AGC--TATGCA-T-AAAACAG---GTTCAAT-ACCAG-TATTGACCGAACAAGC--ATAACA-A-----ATTTTTCACTTTGATAAATGGATTG-AACCTTT---AGT-GGTTAAATGTCAGTA-TCAGAA--GATAAAAA--A-AT-CAACAGGGGTGC-CT-AAA--TGCA-T-A---A--GC-AA----A--AACAA-AT--AAAC-GTG-TAA--GAT-ATGA--TCTATTTG--CT-GAATGGGC--CAT--G-GC--CGCTTT---AAT-GGGG--GAGCCGA--GG-CAT----CA--AT--ATATAA-C------CTTATTT--GACA----T--CCC----TA-CAAA-T----GCA-----A---A--GGT-G-----AACCC--TG---GG--AA--CAGAAGTT-CA-CCACTTTTATACT---------A--GCC-CATGCTT--AAA----A----A-TGCT------GT--C-AA----------------G---TT-G-GTCAATT--A-AA-T-TCA-A---------TGA-G-CCTAC---T-G-------G-TAA--GCC--A-AAGT--ACCGC----A-ACGA--GAC--CGT---GCA-GTAGC-G-----C-GGCAAGATC-T-GCA-CC-ACCAGCAGA-GCTAGT--AAAA--C-AATG-G---C-G-AT---T------AGGTT-CAA------C-CAGCTA-CA-ATGAGAGC-TCCAC-A-AGTGGAGA-TG---AAAA-GTATT--ACAAAAagcgcggtcatagcggccgagcataagagctggtaaaacaaatgtcagaagtagctagattccaaagaaaacacatgagggctcgacaattgagatgagcagatggcatggcacaaatcc
gi|9 : aaaagatgaaaaattcaacagggaggcctcattgcataaggaaaaacaaataaaggtgtaagatatcaattattggctgaatgggccacggtcgcttcaatggggggggggggggagggggggggggggggg-G--CA--T----CAAT--ATA-TA-GC------CTTAAAT--GGCACTGAT--CC----CTAAAAA-T----GCA-----A---T--GGTG-----AA-CCC--T-----GGGAAC-AGAAG-----------TG-CAC--------CTCTTTTATA---------C---------T-----AGTC-CATTCTT-AAA----AA-TG-C-----T--G-------T--CAA-GT-T--------GA--T-C-------AA---GT--A-AAGT-TCA-A---------TG--A-GC--CTA---CT-G-------GTA--AACCA-A--AAA-A--A---C--CG--C-CAC-GA-G-ACCGgtgtaacaaaaacaaggccattggtttaagagatacaagctagaactg
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gi|4 : -AATTAATTAATCGA-ATAAC--CACCATTATCAAGAT------TCAAAAGTAGCTAAACCTGTAATCGT---TAGAAACAGACGCCGACTCCTCCAAATACCGCACG-CGTATTAGG-CTTTGTGATTAAAAACAAAAAAAATATAAGGGTCTCAGGGTGA-AT----TTTCGAGCTTTGGAA--TTGATGACGATAAAATATCAC-GT--A-AAT------C---GTCGTTCACAGGCAATTAGTTTTAT-TTTGTTCGCCGGAAACGAAGCA-AGACTATATCATGCACCTGGAAAAT---GCGGGGTTTGATTGGCACGTCCGAGCAATGTG----AAAATCAGAGAGTTCAATAACCAG-TA-TGACCC---GAAC--AAAGCATAtgcagcaacgcgatctgcgccaccagtagagctagtaaaacaatgtagaatagccaggttcaaccag
gi|14 : CTT--GAA--TTGATGACGGTA-------ACCGT--A-AACGTAATGCCTTGACG-TCA---GCGA-------TTTATGTGC-----------GGCGCA-A-ACTA----ATG-GCTCGA-AAATAACGTTGGG---GAT------AGT--AGC--TGTGCC-TAAAA-----------------CAG-TC-TGACCGAC-AAAC--AAAACA-A-----ATTTTTCATTTTGATAAATGGATTG-AACCTTT---GGT-GGTTAAATCTCATTA-aacataacttgttcctattcaacattttagcatacataagcgcgcaaagttgtggaaccaaataagtttcacttatatattgctcattactccagcagcgtgtgaaaacaatgataaaatgataataatatacacatatttaggagcctagatgcatatgaaccaaataacaaaaaaggtgtaaggatatgattatcgtttctgaatgggcgccactggcccttccaatggggaggctataggcctatagcatccctaaaaacgcaaatgggtaaccctgggaaccaaaagtcaccactttttactagtctcatacttagaataatgccgttccaagtttgatcaaattaaaggtccaatgatgccactgggtaagccaaaaacaccgccatgaaccaacacccatacagccgctggcctgccgcaccagtagagctagaaaactatgggaattttaggcccagtttcaaaccaactaccaatgaacttccacaaagtggagattgaaattagtttatacaaaaattgtaacataaataccgtaaggaaagttttgggttttatagatataa
gi|15 : GATA-------AG-GT--ACAGG------CTGTGACG-TCA---GCAA-------GTCATGTGC-----------GGGGT------TAT---ATT-ACTTGG-AA------TAG----------------C--AAC--TACGCAGTAAA--CAT---TTTGAAT-GCCAG-TAATGACCG---AAAA--AGGAGA-ACTAGAAATTTTCACTTGCATATATGGATTT-AACCTTCAAAA---GGTTAAATCTCAat
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gi|5 : TA-TCAGTA--AATCGAAA-----T-CAACATGGA-GTGTTTCAT--TG-A-T-A---AAGGG-GA----A--AACAA-AT--GAA--ATGTC-G--GAC-ATGT--TTTATTTG--TC-GAATGAGC--C-C--GTGTTTCGCATA---AAT-GA-----------------AT----CA---T--A-ATAG-C------AT-ATAT--GGCA----TTCCCC--------AAA-T----GCA-----A---A--GGT-G-----AATCC--T----GGGAAA--C-GAAGTT-CA-CC--------ATTTTACAACTTA--GTC-CATACTT--AAATGTTA----G-TGCTTCCTT-GTTTC-AAATAATGTATAGCTATCG---TT-A-CTGAAAT--A-AAGT-TCA-A---------TG--G-CCTAC---T-T-------A-TA---GCC--C-AAAA--ACCGC----C-ACGA--TAC--CGT---GCA-GCAGC-GC----C-AC-----TT-T-GGG-CC-ACAAGTAGATTCTAGT--AAAAGGC-AATG-TAAAA-G-AG----GG--AAAGGGT-TAA------C-CAGCTT-CA-ATAATAGC-TCCAC---ATTGGAGA-TT---AAAA-GTATT--ACAAAt
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gi|12 : CAGAA--GAT-GAAA--AACT-CAACAGGGA-GCGCT-CAA--TGCA-T-A---A--GC-AAGAAAA--AATAA-AT--AAA--GTGGC-A--GAT-AAGA--TGTATTGG--CT-GAATGGGC--CAC--G-GC--CGCTTA---AAT-GAGG--GAGCCGA--GG-TAT--------AT--A------C------CTTATAT--GGCA----T--CCC----GA-AAAA-T----GCA-----G---A--AGG-G-----AACCC--TG---GG--AA--CAGAAGTC-CA-CCACTTTAATACT---------A--GTC-CATACAT--AAA----A----A-TGCT------GT--C-AA----------------G---TT-G-CTCAAAT--A-AAGT-CCA-A---------TGA-G-CCTAC---T-G-------G-TAA--GCT--T-AAAA--ACCGacctcgaatgcactgcggacggccgaaggaagccagcgagagtgagaggcggcc
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Reference ( family-5039 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAANAAANGNCCTGNAATTCTATTTTAGAATCCANTTATCAGAAGGATGAAAAACTCGACAGGAGCGCTAAATGCATAA-GCAAAC-AACAA-ATA---------AAGTN-CA-GANNT-GATTCAT-GG-CTGAATGG--CACGGTCGCTTAAATGGGGGAGCCGAGGCA--TCAATATATGGCCTTATATCGGCATCCCGAAAAA-TGCAAAGGTGAAACCCTGGGAACAGAAG-----------TT-CACCAC---------T-----AGTCCATACNT-AAAAA-TGCC-GT-CAA-G--T-GCT-CAAAT-AAAGTTCAACG--A-GC--CTA-CTGGTAAGCCCAAAA-A---CCG-----A-CCGCGATTGACCGCTAAGAAGCCTG---GAATGAGGAGG-CGGCCGTANCGGGGGCA-TATCTCG--CTAGGTGTTTTCAATATA--CATAC--CCAATCTGAAAAAA--CCAAAACA-GCAAACGGCAGAAAA----------AACAAAGCGAGCAACAAC---------A-CAAAAG---ACAAATTAATTAAT--A-ATTAT--AACC--TAT----AT------T-AAAAG-AGC--AAC--GTAATCGT-AGCTA--G--AC-GACGTCGAC----CCAAATACCGCACG-CGTAT--GG-CTTG-G-----------AAAAAAGG-TGG-AGAGGG----AGGGTGA-AA---TTTC-AGCTT--GAA--TTGATGACGATA-------AC-GT--A-AAN------CCGTGACG-TCA---GCGA-TATA---------TGT--GCGGG-------GCA-A-ACTA----ATGGCCC--GAAAAT-GCG--GGG---GA-TGG-------NAGC--TGTGCN-TAAAAACAG---GTTCAAT-ACCAG-TA-TGA-CCGA--AAAC--AN--AAC-ATAT--ATTTTTCACTTTGATAAATGGATTG-AACCTTT-A-GTGGTTAAATCTCATTA-TCAGAA--GAT-GAAA-AACTCAACAGGGAGCG-CT-CAA--TGCA-T-A---A--GC-AA----A-AACAAAT--A--AA-GTG-C-A--GAC--ATGATTTATTGG--CT-GAATGGGC--CAC--G-GC--CGCTTA---AAT-GAGG--GAGCCGA--GG-CAT----CAAT--ATA-TAG-C------CTTATAT--GGCA----T-CCCC-----A-AAAAT-------GCA-----AA--GGT-G-----AACCC--T----GG--AA--CAGAAGTTCA-CC--------ACT---------A--GTC-CA--TACNTAAA----A----A-TGCTG-----GT--C-AA----------------G---TT-G-CTCAAAT--A-AAGT-TCA-A---------TGA-G-CCTAC---T-G-------G-TAA--GCC--C-AAAA--ACCGC----C-ACGA--GAC--CGC---GCA-GCAGC-G-----C-GG-----TC-T-GCG-CC-ACCAGTAGA-GCTAGT--AAAA--CAAATG-C---A-G-AG---TAG--CCAGGTTC--AACCAGC------TA-CA-ATGAGAGCTCCAC-A-ATTGGAGA-TGAAA--AGTAT-T-ACAAAA
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gi|10 : aaaagatgaaaaattcaacagggaggcctcattgcataaggaaaaacaaataaaggtgtaagatatcaattattggctgaatgggccacggtcgcttcaatggggggggggggggaggggggggggggggggT-ATCGGAA--GAT-GAAA-AACTCAA-AGGGAGTG-CT-TCA--TGC-ATTA---A--GC-AA----A-ATCAA--ATT-AAA-GTGGC-A--GAC--TTGATTTATTGG--CTTGAATGG----CA--C-G-TT--CGCTTA---A-T-GAG--G-AGCCGATGAG-CATT---CAA-T--ATA-TAGGC------CTTATTT--TGCA----T-CCCC-----GGAAAAT-------G-------AA--GG-TG-----AACC---T----GG--AA--CAGAAGTTC-ACC--------ACT---------A--GTCGC--ATATATAAA----A----ATTGTCT-----GT--C-AA----------------GA--TT-G-CTC---T--ATAAGT-TTATA---------TGA-G-CC-AC---TCG-------G-TTA--G-CC--C-AGA--ACCGC----CGACGA--GAC--CGC---GCATTCAGC-G-----C-GG-----TC-T-GCG--C-A-CAGTAGA-GCTAGTG-AAAA--CAAgtgtaacaaaaacaaggccattggtttaagagatacaagctagaactg
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Reference ( family-5039 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAANAAANGNCCTGNAATTCTATTTTAGAATCCANTTATCAGAA-G-ATGAAAAACTCGACAGGAGCGCTAAATGCATAA-GCAAAC-AACAA-ATA---------AAGTN-CA-GANNT-GATTCAT-GG-CTGAATGG--CACGGTCGCTTAAATGGGGGAGCCGAGGCA--TCAATATATGGCCTTATATCGGCATCCCGAAAAA-TGCAAAGGTGAAACCCTGGGAACAGAAG-----------TT-CACCAC---------T-----AGTCCATACNT-AAAAA-TGCC-GT-CAA-G--T-GCT-CAAAT-AAAGTTCAACG--A-GC--CTA-CTGGTAAGCCCAAAA-A---CCG-----A-CCGCGGTCGACTGCTAAGAAGCCTG---GAATGAGGAGG-CGGCCGTANCGGNAGCA-TATCTCG--CTAGGTGTTTTCAATATA--CATA-ACC-AATCTGAAAAAA--CCAAAACA-GCAAACGGCAGAAAA----------AACAAAG--AGCAAC-----A-ACA-CAAAAG---ACAAATTAATTAAT--A-ATTAT--AACC--TAT----AT------T-AAAAG-AGC--AAC--GTAATCGT-AGCTA--G--AC-GACGTCGAC----CCAAATACCGCACG-CGTAT--GG-CTTG-G-----------AAAAAAGG-TGG-AGAGGG----AGGGTGA-AA---TTTC-AGCTT--GAA--TTGATGACGATA-------AC-GT--A-AAN------CCGTGACG-TCA---GCGA-TATA---------TGT--GCGGG-------GCA-A-ACTA----ATGGCCC--GAAAAT-GCG--GGG---GA-TGGCA-G-CTGTGCA---TAAAAA-CAG---GTTCAAT-ACCAG-TA-T-GA-CCG---A-A--AAC--A-NAAC-ATA---AT-TT-TTCACTTTGATAAATGGATTG-AACCTTT-A-GTGGTTAAATCTCATTA-TCAGAA--GAT-GAAA-AACTCAACAGGGA-GCGCT-CAA--TGCA-T-A---A--GC-AA----A-AACAAAT--A--AA-GTG-C-A--GAC--ATGATTTATTGG--CT-GAATGGGC--CAC--G-GC--CGCTTA---AAT-GAGG--GAGCCGA--GG-CAT----CAAT--ATA-TAG-C------CTTATAT--GGCA----T-CCCC-----A-AAAAT-------GCA-----AA--GGT-G-----AACCC--T----GG--AA--CAGAAGTTCA-CC--------ACT---------A--GTC-CA--TACNTAAA----A----A-TGCTG-----GT--C-AA----------------G---TT-G-CTCAAAT--A-AAGT-TCA-A---------TGA-G-CCTAC---T-G-------G-TAA--GCC--C-AAAA--ACCGC----C-ACGA--GAC--CGC---GCA-GCAGC-G-----C-GG-----TC-T-GCG-CC-ACCAGTAGA-GCTAGT--AAAA--CAAATG-C---A-G-AG---TAG--CCAGGTTC--AACCAGC------TA-CA-ATGAGAGCTCCAC-A-ATTGGAGA-TGAAA--AGTAT-T-ACAAAA
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gi|10 : aaaagatgaaaaattcaacagggaggcctcattgcataaggaaaaacaaataaaggtgtaagatatcaattattggctgaatgggccacggtcgcttcaatggggggggggggggaggggggggggggggggTA-TCGGAA--GAT-GAAA-AACTCAA-AGGGA-GTGCT-TCA--TGCA-TTA---A--GC-AA----A-ATCAAATT-A--AA-GTGGC-A--GAC--TTGATTTATTGG--CTTGAATGG----CAC--G-TT--CGCTTA---A-T-GAGG---AGCCGATGAG-CATT---CAAT--ATA-TAGGC------CTTATTT--TGCA----T-CCCC-----GGAAAAT-------G-------AA--GGT-G-----AACC---T----GG--AA--CAGAAGTTCA-CC--------ACT---------A--GTCGCA--TATATAAA----A----ATTGTCT-----GT--C-AA----------------GA--TT-G-CTC---T--ATAAGT-TTATA---------TGA-G-CC-AC---TCG-------G-TTA--GCC--C--AGA--ACCGC----CGACGA--GAC--CGC---GCATTCAGC-G-----C-GG-----TC-T-GCG--C-A-CAGTAGA-GCTAGTG-AAAA--CAAgtgtaacaaaaacaaggccattggtttaagagatacaagctagaactg
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Reference ( family-5039 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAANAAANGNCCTGNAATTCTATTTTAGAATCCANTTATCAGAA-G-ATGAAAAACTCGACAGGAGCGCTAAATGCATAA-GCAAAC-AACAA-ATA---------AAGTN-CA-GANNT-GATTCAT-GG-CTGAATGG--CACGGTCGCTTAAATGGGGGAGCCGAGGCA--TCAATATATGGCCTTATATCGGCATCCCGAAAAA-TGCAAAGGTGAAACCCTGGGAACAGAAG-----------TT-CACCAC---------T-----AGTCCATACNT-AAAAA-TGCC-GT-CAA-G--T-GCT-CAAAT-AAAGTTCAACG--A-GC--CTA-CTGGTAAGCCCAAAA-A---CCG-----A-CCGCGGTCGACTGCTAAGAAGCCTG---GAATGAGGAGG-CGGCCGTANCGGNAGCA-TATCTCG--CTAGGTGTTTTCAATATA--CATA-ACC-AATCTGAAAAAA--CCAAAACA-GCAAACGGCAGAAAA----------AACAAAG--AGCAAC----A--ACA-CAAAAG---ACAAATTAATTAAT--A-ATTAT--AACC--TAT----AT------T-AAAAG-AGC--AAC--GTAATCGT-AGCTA--G--AC-GACGTCGAC----CCAAATACCGCACG-CGTAT--GG-CTTG-G-----------AAAAAAGG-TGG-AGAGGG----AGGGTGA-AA---TTTC-AGCT-T--GAA--TTGATGACGATA-------AC-GT--A-AAN------CCGTGACG-TCA---GCG-ATATA---------TGT--GCGGG-------GCA-A-ACTA----ATGGCCC--GAAAAT-GCG--GGG---GA-TGGCA-G-CTGTGCA---TAAAAA-CAG---GTTCAAT-ACCAG-TA-T-GA-CCGA-A--AAC--ANAAC---A-A---AT-TTTTCACTTTGATAAATGGATT-GAACCTTT-A-GTGGTTAAATCTCATT-ATCAGAA--GAT-GAAA-AACTCAACAGGGAGCG-CT-CAA--TGC-AT-A---A--GC-AA----A-AACAA--AT--AAA-GTG-C-A--GAC--ATGATTTATTGG--CT-GAATGGGC--CA--C-G-GC--CGCTTA---AAT-GAG--GGAGCCGA--GG-CAT----CAA-T--ATA-TAG-C------CTTATAT--GGCA----T-CCCC-----A-AAAAT-------GCA-----AA--GG-TG-----AACCC--T----GG--AA--CAGAAGTTC-ACC--------ACT---------A--GTC-C--ATACNTAAA----A----A-TGCTG-----GT--C-AA----------------G---TT-G-CTCAAAT--A-AAGT-TCA-A---------TGA-G-CCTAC---T-G-------G-TAA--G-CC--CAAAA--ACCGC----C-ACGA--GAC--CGC---GCA-GCAGC-G-----C-GG-----TC-T-GCG-CC-ACCAGTAGA-GCTAGT--AAAA--CAAATG-C---AG-AG---T--AG--CCAGGTTC--AACCAGC------TA-CA-ATGAGAGCTCCAC-A-ATTGGAGA-TGAAA--AGTAT-T-ACAAAA
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blockSeqs : T . . . . . A . . . A . . . A . . GCG . . A G . . . T . . T . A A . A AA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . CGG . T . A . . . . . . . A . . . . . . . C . . T . ACTTTTACACT . . . A . . . TGTCAAGA . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . T . . . . T
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . GGA . C . A . . . . . . . T . . . . . . . G . . T . TCTTTTATACT . . . T . . . GTTCCAAG . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . T . . . . T
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . GA . C . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . A . ACT . . . T . . . GTCAAG . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . G . . . .
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-5039 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAANAAANGNCCTGNAATTCTATTTTAGAATCCANTTATCAGAA-G-ATGAAAAACTCGACAGGAGCGCTAAATGCATAA-GCAAAC-AACAA-ATA---------AAGTN-CA-GANNT-GATTCAT-GG-CTGAATGG--CACGGTCGCTTAAATGGGGGAGCCGAGGCA--TCAATATATGGCCTTATATCGGCATCCCGAAAAA-TGCAAAGGTGAAACCCTGGGAACAGAAG-----------TT-CACCAC---------T-----AGTCCATACNT-AAAAA-TGCC-GT-CAA-G--T-GCT-CAAAT-AAAGTTCAACG--A-GC--CTA-CTGGTAAGCCCAAAA-A---CCG-----A-CCGCGGTCGACTGCTAAGAAGCCTG---GAATGAGGAGG-CGGCCGTANCGGNAGCA-TATCTCG--CTAGGTGTTTTCAATATA--CATA-ACC-AATCTGAAAAAA--CCAAAACA-GCAAACGGCAGAAAA----------AACAAAG--AGCAAC----A--ACA-CAAAAG---ACAAATTAATTAAT--A-ATTAT--AACC--TAT----AT------T-AAAAG-AGC--AAC--GTAATCGT-AGCTA--G--AC-GACGTCGAC----CCAAATACCGCACG-CGTAT--GG-CTTG-G-----------AAAAAAGG-TGG-AGAGGG----AGGGTGA-AA---TTTC-AGCT-T--GAA--TTGATGACGATA-------AC-GT--A-AAN------CCGTGACG-TCA---GCG-ATATA---------TGT--GCGGG-------GCA-A-ACTA----ATGGCCC--GAAAAT-GCG--GGG---GA-TGGCA-G-CTGTGCA---TAAAAA-CAG---GTTCAAT-ACCAG-TA-T-GA-CCGA-A--AAC--ANAAC---A-A---AT-TTTTCACTTTGATAAATGGATT-GAACCTTT-A-GTGGTTAAATCTCATT-ATCAGAA--GAT-GAAA-AACTCAACAGGGAGCG-CT-CAA--TGC-AT-A---A--GC-AA----A-AACAA--AT--AAA-GTG-C-A--GAC--ATGATTTATTGG--CT-GAATGGGC--CA--C-G-GC--CGCTTA---AAT-GAG--GGAGCCGA--GG-CAT----CAA-T--ATA-TAG-C------CTTATAT--GGCA----T-CCCC-----A-AAAAT-------GCA-----AA--GG-TG-----AACCCT----GG--AA--CAGAAGTTC-ACCACTTT--T---A--C----TAGTC-C--ATACNTAAA----A----A-TGCTG-----GT--C-AA----------------G---TT-G-CTCAAAT--A-AAGT-TCA-A---------TGA-G-CCTAC---T-G-------G-TAA--G-CC--CAAAA--ACCGC----C-ACGA--GAC--CGC---GCA-GCAGC-G-----C-GG-----TC-T-GCG-CC-ACCAGTAGA-GCTAGT--AAAA--CAAATG-C---AG-AG---T--AG--CCAGGTTC--AACCAGC------TA-CA-ATGAGAGCTCCAC-A-ATTGGAGA-TGAAA--AGTAT-T-ACAAAA
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Unaligned ( gi|18 ): GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCAGAGAAATTAGTGATATCTTCTAAACGCGGCGTAAAACAAACGATCATAAAAGTTTGGAAATGATGCAATTCCTCTTTTTA
Unaligned ( gi|21 ): NNNNACATGGACATTGGTAAAAGAGATACTGTGAGCTAGAACTGTTCTTTA