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gi|22 : ttatgtatagccctttgcaaggatagaccaacggGG------TT-GAG--CAAAGCA-C--G-TG-ATTGNNNNNNN-NN-NNNNNNNNN-NNNNNNGTCTATAA-TT--T--CCCT----CGT---GT-GTC-TC--A-GGA-CGTC--G-TG-TGCAGC--AT-TTCTCG-GGGGAattgaggtgtgtaaaagcccaggtaatatgagttcccttagggcgttttgccttggggaaatgctatctgggttggacagatagctttatgtctccctcttagacgagggcga
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-500 ) : NATACCTCA-A-GGGAT-A-G-ACACGACGA-TT-AT-TGAAA-T--AC--GA--TTGG------TT-GAA--CAGA-TCA-CGTG-ATCGG-GG-CGACAAAACTTCAATGT-ACCC---------CT--CC----CTCGG--AGT-GCC-TC--G-GG-ACGTC--G-TG-TACTGC--AT-CCCTC-GGGGAGCCTTCGCG-----TTTTTTTCTTACGAGAGATA-TT-T-C-AAGCTG-TTA----------ACT----GTTATTG-T-T-G-CT-ATCT-T-G-TTA--TTG-TTTGA-CA-GC--TGTTGAC-AGG-----TG------AA--ATTAC-ATTACAAT-T--TATAA-T-C--TA-CATTG-AATTG-TA-TAAAATGA-A-TA--TC-TCT--AA--ACA-G---AAAA-AAAATCCAAATGCATGTA-TT-G-CT-AATTAAATTTGCTGG-------G--G----TTT---T--------TCGTTGTT---GT--T-TGTT-TTGGTGTTT--TTTTT-TTCGGT-A-TAA-T---AAAACCAATTTAT-TGCC---C-T-GCTTGGGA-GGGA-G-ACA--T---G-AAG-C--T-T---TGT-CCAACCC
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originalCons : NATACCTCA-A-GGGAT-A-G-ACACGACGA-TT-AT-TGAAA-T--AC--GA--TTGG------TT-GAA--CAGA-TCA-CGTG-ATCGG-GG-CGACAAAACTTCAATGT-ACCC---------CT--CC----CTCGG--AGT-GCC-TC--G-GG-ACGTC--G-TG-TACTGC--AT-CCCTC-GGGGAGCCTTCGCG-----TTTTTTTCTTACGAGAGATA-TT-T-C-AAGCTG-TTA----------ACT----GTTATTG-T-T-G-CT-ATCT-T-G-TTA--TTG-TTTGA-CA-GC--TGTTGAC-AGG-----TG------AA--ATTAC-ATTACAAT-T--TATAA-T-C--TA-CATTG-AATTG-TA-TAAAATGA-A-TA--TC-TCT--AA--ACA-G---AAAA-AAAATCCAAATGCATGTA-TT-G-CT-AATTAAATTTGCTGG-------G--G----TTT---T--------TCGTTGTT---GT--T-TGTT-TTGGTGTTT--TTTTT-TTCGGT-A-TAA-T---AAAACCAATTTAT-TGCC---C-T-GCTTGGGA-GGGA-G-ACA--T---G-AAG-C--T-T---TGT-CCAACCC
finalCons : NATACCTCA-A-GGGAT-A-G-ACACGACGA-TT-AT-TGAAA-T--AC--GA--TTGG------TT-GAA--CAGA-TCA-CGTG-ATCGG-GG-CGACAAAACTTCAATGT-ACCC---------CT--CC----CTCGG--AGT-GCC-TC--G-GG-ACGTC--G-TG-TACTGC--AT-CCCTC-GGGGAGCCTTCGCGT-----TTTTTTCTTACGAGAGATA-TT-T-C-AAGCTG-TTA----------ACT----GTTATTG-T-T-G-CT-ATCT-T-G-TTA--TTG-TTTGA-CA-GC--TGTTGAC-AGG-----TG------AA--ATTAC-AT-ACAAT-T--TATAA-T-C--TA-CATTG-AATTG-TA-TAAAATGA-A-TA--TCCT----AA--ACAG----AAAA-AAAATCCAAATGCATGTA-TT-G-CT-AATTAAATTTGCTGGGGTTTT------------------------TCGTTGTT---GT--T-TGTT-TTGGTGTTT---TTTT-TTCGGT-A-TAA-T---AAAACCAATTTAT-TGCC---C-T-GCTTGGGA-GGGA-G-ACA--T---G-AAG-C--T-T---TGT-CCAACCC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGTTTCACTTTCAACTCCAGGATGTACAATATACCTATAATTAATTTGATTATTATGTATTGTTGATATTTGATGA
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Reference ( family-500 ) : NATACCTCA-A-GGGAT-A-G-ACACGACGA-TT-AT-TGAAA-T--AC--GA--TTGG------TT-GAA--CAGA-TCA-CGTG-ATCGG-GG-CGACAAAACTTCAATGT-ACCC---------CT--CCCT----CGG--AGT-GCC-TC--G-GG-ACGTC--G-TG-TACTGC--AT-CCCTC-GGGGAGCCTTCGCG-----TTTTTTTCTTACGAGAGATA-TT-T-C-AAGCTG-T-TA----------ACT----GTTATTG-T-T-G-CT-ATCT-T-G-TTA--TTGTTT-GA-CA-GC--TGTTGA-CAGG-----TG------AAA---TTA-CA-TA-CAAT-T--TATAA-T-C--TA-CATTG-AATTG-TA-TAAAATGA-A----T-AT--CCT---AA--ACA-G---AAAAAAAATCCAAATGCATGTA-TT-G-CT-AATTAAATTTGCTGG-------G--G----TTT---T--------TCGTTGTT---GT-TTG--TT-T-TGG-TGTT-T---TTTT---T-TCGG----T-A-TAAT---AAAACCAATTTAT-TGCC---C-T-GCTTGGGA-GGGA-G-ACA--T---G-AAG-C--T-T---TGT-CCAACCC
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gi|21 : tatacctcaagggatagacacgacgattactgaaacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttgcaagctgttagctgttTAT-TGCC---C-T-G-TTAGGA-GGAA-G-ACA--T-----AAG-C--G-T---TGT-CCAAACCttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaacagggcaataaatgta
gi|22 : acaaagcttcaatgtcctcccacagttaacttggcccggggggaacatgatattacttgGG------TT-GAG--CAAA-GCA-CGTG-ATTGN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNGTCTATAATTT--CCCT----CGT---GT-GTC-TC--A-GG-ACGTC--G-TG-TGCAGC--AT-TTCTC-GGGGtc
gi|23 : TGCT---GT-TTGACTA-T-TGC-GGGA-T---TTTC---T-CCGG----TTA-TCAG---CAAACTG-TTTAT-TGCCT--C-T-GGTTGGGA-GGGA-GAACA--T---G-AAA----T-T---TCT-CCAACga
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gi|29 : ATTTAT-TGCC---C-T-GCTT-GGA-GGGA-G-ACA--T---G-A
gi|3 : atacagtatacATACCTCA-A-GGGAT-A-G-ACATGACGA-TT-AC-TGAAA-T--AC--GA--TTGG------TT-GAA--CAGA-TCA-CGTG-ATCAG-GG-CGACAAAACTTC-ATGT-ACCC---------CT--C-----------------CC-TC--A-GG-ACGTC--G-TT-TACTGC--AT-CCCTC-TGGGAGCCTTCGGGTTTTTTTTTTTTTTTACAAGAGATA-TTAT-C-AAGCAG-T-TA----------ACT----ATTATTG-T-T-G-CT-ATCT-T-G-TTA--TTGTTT-GA-CA-GT--TGTTGA-CAGG-----TG------AAA---TTA-CA-TA-CAAT-T--TATAA-T-C--TA-CACAG-AA--------AAAA----------------------------------------ATTCAAATGCATGTA-TT-G-CT-AATTAAATTTGCTGG----------------TT---T--------TCGTTGTT---GT-TTG--TT-T-GGG----------TTTT---T-TCGG----T-A-TAATAAAAAAACCAATTTAT-TGCC---C-T-GC-TAGGA-GGGA-G-ACA--T---GAAAG-C--T-TCAATGT-CCAACCC
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gi|9 : tatt---TTTT---T-TCGG----T-A-TAAT---AAA--CAAGTCAT-TGCC---tcggtataataaacaagtcattgcc
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