lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111
lowQualScore : 3 1 11 1 3333333333333333 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222 3333333333 2 777777777777777777777777777777777777777777777777 22 22 777777777777777777777777777777 2222222222222 111 111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 44444444 1 22 111111 22222 22222222 666666666666666666666666 1 111 33333 111111111111111111 22222222 1111 77777777777777777777777777777 22222222 333333 22 2 555555555555555 888888888888888888888888888888888888888 2222 3333333333333333333333333333333 11 11 22 1111111 11111 11 33333333333333333 22222222222 1111 22222222 2222 99999999999999999999999999999999999999 222 11111 22 1
lowQualScore : 7 3 3 8 55 3 1 2 4 7 33 8 3 1 4 4 44 4 7777777777777777 4 4 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 6 0 777 0 777 4 1 222222 4444444444 4 4 55 4 2 3 888888888888888888888888888888888888888888888888 3 88 3 3 33 55 3 1 3 88 3 3 6 3 888888888888888888888888888888 88 3 3 7 7 3 4444444444444 3 55 3 3 55 55 3 999 4 111 55 4 55 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 777 77777777 4 777 7 8 22 555 4 777777 66666 22222222 5 5 333333333333333333333333 0 000 9 55 3 88888 5 3 3 3 3 3 111111111111111111 2 66666666 3 1111 55555555555555555555555555555 22222222 000000 33 44 3 3 3 44 55 44 777 4 0 8888 4 2 999999999999999 1 4 4 0 555555555555555555555555555555555555555 77 5 3333 77 1111111111111111111111111111111 55 33 6 5 00 1 8 5555555 66 888 777 5 66 00000 11 4 4 44444444444444444 4 4 4 4 8888 44444444444 4 4444 4 88888888 4 4 777 0000 55555555555555555555555555555555555555 99999 000 3 5 3 77777 44 44 00 3 3 3 3 2
lowQualScore : . . . . .. . . . . . .. . . . . . .. . ................ . . . ......................................................................................................... . . ... . ... . . ...... .......... . . .. . . . ................................................ . .. . . .. .. . . . .. . . . . .............................. .. . . . . . ............. . .. . . .. .. . ... . ... .. . .. ....................................................................... ... ........ . ... . . .. ... . ...... ..... ........ . . ........................ . ... . .. . ..... . . . . . . .................. . ........ . .... ............................. ........ ...... .. .. . . . .. .. .. ... . . .... . . ............... . . . . ....................................... .. . .... .. ............................... .. .. . . .. . . ....... .. ... ... . .. ..... .. . . ................. . . . . .... ........... . .... . ........ . . ... .... ...................................... ..... ... . . . ..... .. .. .. . . . . .
lowQualScore : 3 6 6 2 00 6 3 7 0 5 33 0 0 3 0 0 88 4 1111111111111111 4 6 8 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 8 999 8 888 4 9 444444 3333333333 4 0 55 0 5 6 333333333333333333333333333333333333333333333333 6 66 6 6 22 00 6 9 1 00 6 6 2 6 777777777777777777777777777777 66 6 6 3 3 6 9999999999999 6 00 6 6 00 00 6 222 0 000 55 0 55 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888 88888888 4 888 8 9 22 777 4 222222 00000 66666666 7 7 999999999999999999999999 0 000 4 00 6 33333 6 3 3 3 1 1 888888888888888888 9 11111111 2 4444 99999999999999999999999999999 77777777 555555 55 22 1 1 3 22 22 66 000 0 0 5555 0 5 888888888888888 6 4 4 1 333333333333333333333333333333333333333 99 7 0000 99 7777777777777777777777777777777 88 33 7 7 44 7 7 0000000 99 888 222 0 99 99999 99 4 4 88888888888888888 0 0 0 0 5555 55555555555 4 4444 4 11111111 4 0 000 4444 77777777777777777777777777777777777777 33333 222 6 0 3 66666 66 66 88 3 3 3 6 2
consensus : TGTTCA-A-CGA-AGTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTTG-CT-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATG-TATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAACTTTATGTNGNNCNCCGNCACTCCCTCGCTTTTGCATGACTCGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTTCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAGAAAAATC-------ATA-AAATTTTNACTGGGTTAT---T-TAATTT-CTAAATCAA-CGATG-T--CAAATTACC-ATGT-AAG--AAG-CC-ATACCACC-TG----------------TT------A-----------------------CAA-TA--TAC-T-TT-GC--AA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAA-CACA--------AT--GGG-C---C---G-----AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TAACC--CCCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCAC-ACC---TTTGAA--ACCAC-G--C------------TC-------------C-A----------T-------------T---G------------GATT---TTG--------TTA-AACAA---ACAACT-AATG-GTGT-TGTT-AATT------ACCCCGC----CATGCTGAA-T---AGT-GC-TGACAA----------AACGAATTATTCC-CCTTGCGGT---TTAAAACG--C-TTGA-----CCAANA-TC-G-AAA-G-TA--------G---------AA-ATC-GCG-T-TTTTATTCGTCG-AAGATA---CA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AAA--TT--TCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTT-GA-TAAGTTT--AAA---C-TTAATAAATA----TTAT-TGTA---A-----------AGC-AATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAANATTA-CACG-AA--ATGAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A--CTC--AGCAAAAAA---CTTATTCT-GCA-A----GTA-TC--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-A--------------TTGGA-A-TA-TAA-AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-T-TT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGTATC-C---AA--CA---------GT-GA------T-----TTT----TGCC-TTGAT-CCACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAAC-CACCAGTA
Reference ( gi|3 ) : TGTTCA-A-CGA-AGGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTTG-AT-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-------ATA-AAATTTTAACTGGGTTAT---T-TAATTT-CTAAATCAAACGAT--T--CAAATTACC-ATGT-AAG--AAG-CCCATACCACC-TG----------------TT------A-----------------------CAA-TA--TAC-T-T--GC--AA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGA-CACATT------AT--GG------C---G-----AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TAACC--CTCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCAC-ACC---TTTGAA--ACCAC-G--C------------TC-------------C------------T-------------T---G------------GATT---TTG--------TTA-AACAA---ACAA-T-AATG-GTGT-TGTT-AATT------ACCCCACT---CATGCTG-A-T---AGT-GC-TGACAA----------A-------------CCTTGCAGT---TTAAAACG--C-TTGA-A--CCCAATA-TC-G-AAA-G-TA--------G---------AA-AT--GCG-T-TTTTATTCGTCG-AAGAT----CA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AAA--TA--TCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTT-GATTAAGTTT--AAA---C-TTAA-AAATA----TTAT-TGTA---A-----------AAC-AATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAAAATTA-CATGGAA--ATGAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A--C-C--AGCAAAAAAAATCTTATTCTTGCACA---TGTATTC--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-A--------------TGAGA-A-TA-TAA-AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-T-TT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGTATT-C-------CA---------G--GA------T-----TTT----TGCC-TTGAT-CTACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAAC-CACCAGTA
gi|4 : TGTTCA-A-CGA-AGGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTTG-AT-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-------ATA-AAATTTTAACTGGGTTAT---T-TAATTT-CTAAATCAAACGAT--T--CAAATTACC-ATGT-AAG--AAG-CCCATACCACC-TG----------------TT------A-----------------------CAA-TA--TAC-T-T--GC--AA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGA-CACATT------AT--GG------C---G-----AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TAACC--CTCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCAC-ACC---TTTGAA--ACCAC-G--C------------TC-------------C------------T-------------T---G------------GATT---TTG--------TTA-AACAA---ACAA-T-AATG-GTGT-TGTT-AATT------ACCCCACT---CATGCTG-A-T---AGT-GC-TGACAA----------A-------------CCTTGCAGT---TTAAAACG--C-TTGA-A--CCCAATA-TC-G-AAA-G-TA--------G---------AA-AT--GCG-T-TTTTATTCGTCG-AAGAT----CA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AAA--TA--TCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTT-GATTAAGTTT--AAA---C-TTAA-AAATA----TTAT-TGTA---A-----------AAC-AATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAAAATTA-CATGGAA--ATGAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A--C-C--AGCAAAAAAAATCTTATTCTTGCACA---TGTATTC--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-A--------------TGAGA-A-TA-TAA-AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-T-TT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGTATT-C-------CA---------G--GA------T-----TTT----TGCC-TTGAT-CTACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAAC-CACCAGTA
gi|1 : TGTTCA-A-CGA-AGTTT--GGTT-TTTCTGACAG-GAGATTT-CCTGTTCTTT-ATTCCGTCATTGTCT-TCG-ACCG--GAGC-GATCAAATAC----AAGT-ATG--TGAAACTTTTT-CTGGTAAACTTTATGTTGATTACTCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NNN-NNNNNNNNNNNNNNTCATAATT-TAATTT-TCTAATCAA-TGAT--TGTCAAATTACC-ATGTAAAG--AAG--CCATAGCACC-TG-----------------T------A-----------------------CAATTA--TAC-T-T--GC--AA-TCGGACTAATTTT---CAC-TCT-CCTGAA-CGCA--------ATG-GG------CGCAG-----AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TTACC--C-CA-CGC--A-T-CTCA--GAAATTTA-GTC-GAAATTCAC-ACCT--TTTGAA--ACCAC-G--C------------TC-------------CCAA---------T-------------TCCAG------------GATTTCCTTGATTTTGTTTTACAACAATCCACAACT-CAT--GTGT-TATT-AATT------ACCCCGC----CATGCTGAA-T---AGT-GCTTGACAA----------AACAAATCTATTCCCCTTGCGGT---TT-AAACG--C-TAAAGA--CCAAATA-TCAG-AAA-GTTA--------G---------AA-ATTCGCGCC-TTTTATTCGTTG-AAGATTA--CA---A---CG-C--C-----G---AA-AAAG-----------AA--CGT-TCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTT-GA-TAAGTTC--AAA---C-TTAATAAATA----TTAT-T-TAAATA-----------AGC-AATG-AGTAAGAGTT-TTTA----------TGAAAATCA-CCCG-----------CCAT-----TCACGTTT--A-A--CTC--AGCAAAA-------TA-TCTTGT-----------------GAGTCA--TTAAA--ATCA-TTCCAATA-TGT-ACATG--T--C--T-TAC-AA--GATA---TCATT---AATT-TACAT-AGA-C--AACT----AAGC-GATT-GC-A--------------TT-GA-A-TATTAA-AT----GCAAGAGACG-TTCCAA-T-TGATGAAC-CAATGGG-TGA----T---GTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CGT-CACGAATTTACGTATC-CACGAAAACA---------GT-GA------T-----TTTGTGCTGCCTTTGATCCTACG-AAAATT---GATTT--GCCCATACGAATA-TTGATTGCAAAC-CAC
gi|6 : gtgacctcgcacaagttctagactctaaacttgtacttgtttcatcatattcgttgaacaccaattttcgggatttgttgatgaccgccacccacacgaattcaagaTGTTCA-A-CGA-AGTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTTG-CT-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATG-TATAA-TGAAAC-TTTTTCCGGTAAACTTaatat
gi|2 : TGTTCA-AGCGA-ATGT----GTGATTCCTGATAG-AAGATTT-CCT-TTCT-G-CT-CCGTCATTGT-C-ACG-ACCG----AC-GATCAA-TAGTTA-ATGT-ATAA-TGAAAC---TTCCCGGTAAgtgtgatacccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaattttttctaatcaacgatgtcaaattaccatgtaagaagccataccacctgtacaatatactttgcaatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgtcgagtggtagattttacacctgatctacccacgcatctcaaaattagtcgaaatttcacacctttgaaaacacgctcccaattcacggatccttgattttgatttaacaaacaactaatgtgttgttaattaccccgcatgctgaatagtgctgacaaaacgaattattccccttgcggtttaaacgtgaccaatattgaaagtagaaatcgcgttttatttgtcgaagatacaatcgacgaataaaggtaaatttcatgaaattacatgaaaatttgaaaagtttaaacttgataaatattattttatataagcaatgtttaagagttttattaaatcatcgatctcacgttaactcagcaaaaatatcttagagtcattaaaaattattccaatatgtacatgaagtatacaaagatatcattaaattgtacgtaagacaactaaggattgcattgaaatataaatgcaagagacgttccgattgatgaaccaatgtgattttttttttcacggtggg
gi|7 : ttcacatcattcgttgaacaccaatttaagtgattcggatgaccctcaaccacgaattcaaaTGTTCA-A-CGGGAGTTT--GGTG-CTTCTGATAGCAAGATTTTCCTGTTCTTG-CT-C-GCTATTGT-C-ACG-ACCGT-GAGC-GAT----------------A-AA-TAACACTTTTTCCTGGTAAATTctatagcagacccacgctttgaggacttcgcgcttgtccaatgcaatctccgattcacgccgggtaacgctgaaaaaatcgcgctcatataaatctttactgttatttaattttctatcaatgatgtcacattaccatgtaaagagcaatacactgacaatatactttccaaatggaataattgttctctctgacataatgggcgcaggttggtagatttacacatactcccacacaatctcaaaattaagtcgaactcaccctttgaaaccactgctcccaatagatcccattgatttttgttaacgaaacaattaatgtgtgttattaccccacatgctgaattgtgctgacaattagagaattatcccttggcgtatattaaaacgctgccaagatcgaaagtagtatatatgagaatcgcgttttatgcgtcgtaggatacaatcaccgagaacaaaggtaaattcatgaaaaatttataatgtttaaacttaattatttattgttagtatgtatggtatcgaatgcagtaagagttttatattgccttaaattttaacgtacaaatgaaatcatcgatctacgttttaaacccaggcaaaataacttcttctgtacaaaatgtaattaatagagtcaaattaaactattaatcccaataatgtactgaagatttatacaaacagataaactcattaatttgttaagaccaaacttaagattgccattagaaatatcaatctgcacaagagacgtccgagatgaaccagtgtgatctatttttcacggtgggcctcatcaccgtaattacgtatccacaaacagtgatttgccttccacgaatgatgaccacgaatattgatgaaacacacagta
gi|12 : aTGTTCA-A-CGA-AGTTT--G-TG-TT-CTGATAG-AAGATTTTCCTGTTTCTG-CTCCCGTCATTGTCC-ACG-CGAGT-GAGC-GAT-CA--AA----ATG-TATAA-TGAAACTTTTaaaccttgtgtgatatccacgcctcgcgcttttttttcaatgcatccccgatctcacgcggggtagctaaaaaaatcgctgttcataaaattttcctgggttattaattttctacatcacgatgtccaaagtaacatcgtacaataatactttgcaatcgtgactttttcactctctgaacacaatgctgaaatggggcgccggcagtggtagattttacacctcatctaacacacgcttctctcacaattagtcgcaattcacactttgaaaacacgttccaattttgaaacggatccttgattttgttaaacaaacaactaatgtgttcatgctgaattcaggtggctgacaaaagacattatttcccttgcgtttaaacgctttgacaatatcgaaaagtagaattgcgttttattcgtcgaagatacaatcgccgaat
gi|10 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacaTGTTCATA-CGA--GTTT--GG-G-TT-CTGATAG-AATATCTTCCTGTACTTGCGT-CCGTCATTTCCCTACGGACCAT-GCCCCGATCAA-TAC----ATGC-ATAA-TGAAACTTTT-TCCGGTAAACTTgtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcatgaagagaatcggctgttcatgaaaaatttttgctgggttattataattttcaatgcaaccattagaagccatactacctgcataagtgtttttcagttccaagcacaaaagttacattgcaagtcggactaatttttattctcctgaacacaaatggggcgcccaattggtagattttacaccatgatctaccccacgcacccaaaattagtcgaaattcaccacctttgaaaccacgctcccaattcatggatccttgat
gi|15 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaaTGTTCATC-CAA-AGTTT--GGTG-CTTCTGATAG-GAGATATTCCTGTTCTTG-CT-TCGTCACTGTCC-ACG-ATCGTCGAGC-GATCAA-TATAACAATG-TATAAGTAAAAATTTTTTCTGGAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaccgcctgtacgatatattttgcaattggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtcgtagattttacacctgatccaccccacgtatctcaaaattagtcgaaat
gi|17 : accataatcatctgaaatagaatgaagaactacatcattggtagatctgaatgaatatttggtttcatcattattcgtttgacacctttttgtgatttcattgaagacctcaaccacgaattcaaaTGTTCA-A-CGA-AGTTTTCGGTG-TTTCTGA-actaattgagatattgtttaatcttcatcaaa
gi|25 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaaTGTTCA-T-CGA-AGTTT--GATG-CTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTTG-CT-CCATCATTGTCC-GCA-AATGT-GAGtactacggtttactagtaaaaacgcttgaccaatatcgaaagtagaaatcggcgtttattcgtcgaggatacaatcgctgaataaaggttaaaaatttcattaaaatta
gi|5 : TTCA-A-CAA---GTT--TGTG-TTTCTGATAG-AATATTTTCCT-TTCTTG-CT-CCGTCAT-GTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GAT--A-TAC----ATG-----A-TGAA---TTTTCTCGGTAAACTTTATGTGATACTCCGGTACTCCCTCGCTTTTGCATGACTCGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTTCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAGAAAAATCGCTGTTCATA-AA--TTTAA-----TTTT---C-TAAT---------CAACCGAT--G--TAAATTACCGATGT-AAGAAAAG-CC---AACACC-TG-----------------T------A-----------------------CGA-TA--TAC-TATTGGG--AA-TCGGACTAATATTT--CAC-TCT-CCTGAACCACACT------G---GG------C---G-----CGA-TGGTAA-ATTTTT-ACACC-TGGATC----TA--C--TCCA-CGC--A-TCCTCA--AA----TA-GTCAAAA---CCC-ACC---TTTGAA--ACCAC-G--T------------TC-------------CCAAA--------T-------------TCACG------------GATC---TTGATTTTGT-TTA-AACAA---ACAATT-AAT--GTGT-TATTAAATT------ACCCCG------ATGCTGAA-T---A-T-GC-TGACAA----------AACTATATC-----CCTTGCGGT---TTAAAACGCTC-TTGA-AAGACCAATATTC-G-AAA-G-TA--------G---------AA-AT---CG-------------------------------------C--C-----G---AATAATGGTA-------AAA--TATTTCA-TGAAATA-TTACCG-TAAGAATTT-GA-TAAGTTT--AAA---CTTTAA-TAATA----TTAT-T-TAAT-A-----------AGC-AATG-A-T-AGAGTT-T-----------------AATTA--------------AATC-TCGATC-CTCGTTC--AGA--CTC--AGCAAA---------ATTC---------------TC--TAGA-TCAC-TTAAAA-ATCA-TTCCAATA-TGT-ACATG-AG--TGAT-TACAAA--GAT----TCATA--TAATTGTA-GTAAGATC--AA-T----CAGCTGATT-GC-A--------------TTGAA-A-TA-TAA-AT----GCCAGAGATGTT--CGATT---GTAAACGC---ATGTTGA--------TTTTTTCAACG-GT-GG---CCTCCATCCA-GAATTTACGTAT----------CATGAAACAGTG--GA------T-----TTT------CC---GAT-CCACG-AAAT-T---GA--T--GCCC--ACG-ATA-TTGA-TG-AA
gi|2 : gtggtttctatcatttattcgttgcaacaccaatttttctggattcgttgatgaccccaaccacgaatttacaC-------ATATAAATCTTTACTG--TTAT---T-TAATTTTCTA--TCAA-TGATG-T--CACATTACC-ATGT-AAA--GAG-CA-ATAC-AC--TG------------------------A-----------------------CAA-TA--TAC-T-T--TCCAAA-T-GGAATAATTGTT----C-TCT-C-TG----ACATA------AT--GGG-----C---GC----AGGTTGGTAG-A-TTT--ACAC-----AT-------ACT--CCCA-CAC--AAT-CTCA--AAA--TTAAGTCG--AACTCAC--CC---TTTGAA--ACCACTG--C------------TC-------------CCAATAGATCCCAT-------------T---G------------ATTT---TTG--------TTA-ACGAA---ACAA-TTAATGTGTGT-T-----ATT------ACCCCAC-----ATGCTG-AAT---TGT-GC-TGACAATTAGAGAATTATC-----------CCTTGGCGTATATTAAAACG--C-T-G------CCAAGA-TC-G-AAA-G-TA--------GTATATATGAGA-ATC-GCG-T-TTT-ATGCGTCGTAGGATA---CA---A------T--CACCGAG---AACAAAGGT--------AAA--T---TCA-TGAA--A------------AATTT--ATAATGTTT--AAA---C-TTAA-TTAT-----TTAT-TGTT---AGTATGTATGGTATCGAATGCAGTAAGAGTT--TTA-T-ATTGCCTTAAATTTTAACGTACAA--ATGAAATCATCGATCT-ACGTTTTAA-A--C-CCAGGCAAAATAA--CTTCTTCT-GTACAAAATGTAATTAATAGAGTCAAATTAAACTATTAATCCCAATAATGTA-C-TGAAGATT--TATACAAACAGATAAACTCATT--AATTTGT---TAAGA-CCAAACT----TAA--GATT-GCCA--------------TTAGA-AATA-TCA-ATCTGCACAAGAGACGT--CCGA----GATGAAC-CAG--TG-TGA-T-CT---ATTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCACCGTAATTACGTATC-CACAAA--CA---------GT-GA-------------TT----TGCC-T---T-CCACG---AA-T---GA--T--GACC--ACGAATA-TTGA-TG-AAACACA-CAGTAcaacaa
gi|7 : ttcacatcattcgttgaacaccaatttaagtgattcggatgaccctcaaccacgaattcaaatgttcaagcgaatgtgtgattcctgatagaagatttcctttctgctccgtcattgtcacgaccgacgatcaatagttaatgtataatgaaacttcccggtaactatagcagacccacgctttgaggacttcgcgcttgtccaatgcaatctccgattcacgccgggtaacgctgaaaaaatcgcgctC-------ATA-AAATTTTC-CTGGGTTAT---T-AATTTT-CTACATCA--CGATGTC--CAAA--------GT-AA--------------CATC--G----------------T-------A-----------------------CAA-TAA-TAC-T-TT-GC--AA-TCG---TGACTTTTTC-AC-TCT--CTGAA-CACAATGCTGAAATGGGG------C---GCCGGCAG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-CATC----TAACA----CA-CGCTTC-T-CTCA--CAA--TTA-GTC-GCAATTCAC-A-C---TTTGAA--AACAC-G--T------------TC-------------CAATT--------T-------------T---GAAACGGATCCTTGATT---TTG--------TTA-AACAA---ACAACT-AAT--GTGT-----------------------T---CATGCTGAA-TTCAGGTGGC-TGACAA----------AAGACATTATTTC-CCTTGC-GT---TT-AAACG--CTTTGA------CAATA-TC-GAAAA-G-TA--------G---------AA-TT--GCG---TTTTATTCGTCG-AAGATA---CA---A---TCGC--C-----G---AAT
gi|12 : atgttcaacgggagtttggtgcttctgatagcaagattttcctgttcttgctcgctattgtcacgaccgtgagcgataaataacactttttcctggtaaattaaaccttgtgtgatatccacgcctcgcgcttttttttcaatgcatccccgatctcacgcggggtagctaaaaaaatcgctgttA-AAATTTTTGCTGGGTTAT---TATAATTT------TCAA----T--G--CAA----CC-AT-T-A-G--AAG-CC-ATACTACC-TGCATAAGTGTTTTTCAGTTCCAAGCA-----------------------CAA-AAGTTACAT-T--GC--AAGTCGGACTAATTTTT---AT-TCT-CCTGAA-CACAA-------AT--GGGGCGCCC---A-----AT--TGGTAG-A-TTTT-ACACCAT-GATC----TA--C--CCCA-CGC--A-C-C-CA--AAA--TTA-GTCG-AAATTCACCACC---TTTGAA--ACCAC-G--C------------TC-------------C------------
gi|8 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacatgttcaacgaagtttgtgttctgatagaagattttcctgtttctgctcccgtcattgtccacgcgagtgagcgatcaaaatgtataatgaaacttttgtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcatgaagagaatcggctgttcatgaATTGGGTTAC---T-T----T-CTAA-TCAG-TGATG-T--CAAATTACC-ATGT-AGG--AAG-CC-ATACCACC-TG----------------CT------AAAGGTTTTTTTCAGTCTCAAGCACAA-TA--TAC-T-TT-GC--AA-GCAGACTAACTTT--CCAT-ATT-CCTGAA-CATA--------AT--GGGTCAC-C---A-----GG--TGGTAG-A-TTTTCACACC-T-GATC----TA-CC--CT-G-CAC--A-T-GTCA--AAA--TTT-GT-GGAAATTCA--ACC---TTTGAA--ACCCC-G--C------------TC-------------C------------TGTTTCA-------T---GGATCCTT-----GATT---TTG--------TTT-AAT----------T-AAT--GTGT-TGTT-AATTAACTTAACTCTACCCTGCATGCTG-A-caattcatggatccttgat
gi|9 : tGGGTTAT---T-TAATTT-TCTAATCAA-TGATG-T--CACATTACC-ATGT-AAG--AAG-CA-ATACCACC-TG----------------T-------A-----------------------CAA-TA--TAC-T-TT-GC--AA-TCGGACTAATTGTT--CAC-TCT-CCTGGA-CATAAT------GG--GG------C---GCAG--AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACA-T-GATC----TA--C--CCCA-CAC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCG-AAATTCAC-ACC---TTTGAA--ACCAC-G--C------------TC-------------C------------CAATTCACAGATCCT---T------------GATT---TTG--------TTA-AACAA---ACAA-TTAATG--TGT-TGTT-AATT------ACCCCAC-----ATGCTG-AAT---TGT-GC-TGACAA----------AATGAATTATTCC-CCTTGCGGT---TTAAAACG--C-TTGA-----CCAAGA-TC-G-AAA-G-TATATATATAG---------AA-ATC-GCG-T-TTT-ATTCGTCG-TAGATA---CA---A---T--CACC-----G---AACAAAGGT--------AAA----------------A-TTT-CA-TGAAAATTTTGAT-AAGTTT--AAA---C-TTTA-A--TA----TTAT-TGTAAT-A-----------AAC-AATG-AGTAAGAGT--TTTA-TCATTGCCTTAAATATTA-CACGTAC--ATGAAATCATCGATCTCACGTTT--A-AC-C-C--AGCatacttgatcaattcagagtggcagtgctgacaaaacgaattatttcccttgtgatttaaagctacagtattagggaagataactctcatgctcgaccagaatttaaagtagaaatctcattgtattagaaagagatacagtcactgaataaagttaaaatttcaagaaattacatgaaaattcaataagtttaaatgttttagaaataaatgttattg
gi|6 : AT---T-T--TTT-CTAA-TCAA-CGATG-T--CAAATTACC-ATGT-AAG--AAG-CC-ATACCACC-TG----------------T-------A-----------------------CAA-TA--TAC-T-TT-GC--AA-TCGGACTAATTTTT--CAC-TCT-CCTGAA-CACA--------AT--GGGGCGT-C---G-----AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TA-----CCCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCGAAATTTCAC-ACC---TTTGAA--AACAC-G--C------------TCCCAATTCACGGATC------------C-------------T---T------------GATT---TTGA-------TTT-AACAA---ACAACT-AAT--GTGT-TGTT-AATT------ACCCCG-----CATGCTGAA-T---AGT-GC-TGACAA----------AACGAATTATTCC-CCTTGCGGT---TT-AAACG-----TGA-----CCAATA-TT-G-AAA-G-TA--------G---------AA-ATC-GCG---TTTTATTTGTCG-AAGATA---CA---A---T--CGAC-----G---AATAAAGGT--------AAA--TT--TCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTT-GA-AAAGTTT--AAA---C-TTGATAAATA----TTAT-TTTATATA-----------AGC-AATG-TTTAAGAGT--TTTA-TTA-----------------------------AATCATCGATCTCACG-TT--A-A--CTC--AGCAAAAA-----------------------TATCT--TAGAGTCA--TTAAAA-ATTA-TTCCAATA-TGT-ACATGAAG--T--A-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-A--------------TTGAA-A-TA-TAA-AT----GCAAGAGACG-TTCCGA-T-TGATGAAC-C-A-ATG-TGATT-TT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---
gi|11 : tgttcaacgaagtttggtgtttctgatagaagattttcctgttcttgctccgtcattgtccacgaccgtgagcgatcaatacatgtataatgaaactttttccggtaaacttgtgtgatacccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaT-AAG--TAGTCCCA-AGCACTGTG----------------TA------A-----------------------CA----------T-T--GC--AA-TCAGACTAA-TTTTTCCACTTCTGTCTGAA------------------A------C---C-----AG--GGGTAGTA-TTTTCACACCTT-GATCAGAGTTACTGGCCCAGCAC--A-C-CTCAGTGAA--TCC-GTCAAATATTCAC-ACCTCTTTTGAAATACCAT-GATCTTGTTTCATGGATC-------------C------------T-------------T----------------GATT---TTGCATGAA--TTA-AACAA---ACAA-T-TATG-GTGTAAGTT-AATTA-----ACTTCACT---
gi|10 : cccatatactgtgtattagaagccatgtcattgcgcattttTACCGCC-TG----------------T-------A-----------------------CGA-TA--TAT-T-TT-GC--AA-TTGGACTAATTTTT--CAC-TCT-CCTGAA-CACA--------AT--GGGGCGC-C---G-----AG--TCGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----CA--C--CCCA-CGT--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCGAAAgaacgcctgcatgcttatgaatacttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcacacttggtcaaagcgaaagtagaacaccgcggttgtagttcgaaaatgtacagtcgctgaataaaggtaaaattttcagaaattacatgaaaatttaataagttta
gi|17 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaatgttcatacgagtttgggttctgatagaatatcttcctgtacttgcgtccgtcatttccctacggaccatgccccgatcaatacatgcataatgaaactttttccggtaaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAACG--C-TTGA-----CCAATA-TC-G-AAA-G-TA--------G---------AA-ATCGGCG----TTTATTCGTCG-AGGATA---CA---ATCGC--T--------G---AATAAAGGTTAA-----AAA--TT--TCATTAAA--A-TTA-t
gi|8 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaatgttcaacgaagttttcggtgtttctgatactacggtttactagtaATG--C-TCGA-----CCAGAA-TT-T-AAA-G-TA--------G---------AA-AT--CTC-A-TTGTATTAGAAA-GAGATA---CAGTCA---C--T--------G---AATAAAGTT--------AAAA-TT--TCA-AGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTC-AA-TAAGTTT--AAATGTT-TTAG-AAATAAATGTTAT-TG
gi|11 : tattgggttactttctaatcagtgatgtcaaattaccatgtaggaagccataccacctgctaaaggtttttttcagtctcaagcacaatatactttgcaagcagactaactttccatattcctgaacataatgggtcaccaggtggtagattttcacacctgatctaccctgcacatgtcaaaatttgtggaaattcaacctttgaaaccccgctcctgtttcatggatccttgattttgtttaattaatgtgttgttaattaacttaactctaccctgcatgctgaatacttgatcaattcagagtggcagtgctgacaaaacgaattatttcccttgtgatttaaagctacagtattagggaagataactctcACA--C-TTGG-----TCAA-A-GC-G-AAA-G-TA--------G---------AACACC-GCG-G-TTGTAGT--TCG-AAAAT----GT---A---CAGT--C-----GCTGAATAAAGGT--------AAAATTT--TCA--GAA--A-TTA-CA-TGAAAATTT-AA-TAAGTTT--A
gi|16 : cccatatactgtgtattagaagccatgtcattgcgcatttttaagtagtcccaagcactgtgtaacattgcaatcagactaatttttccacttctgtctgaaaccaggggtagtattttcacaccttgatcagagttactggcccagcacacctcagtgaatccgtcaaatattcacacctcttttgaaataccatgatcttgtttcatggatccttgattttgcatgaattaaacaaacaattatggtgtaagttaattaacttcactgaacgcctgcatgcttatgaatacttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcACA--C-TTGA-----CCATAA-AC-G-AAA-G-CA--------G---------AA-AC---CG-CATTGTATTCG--A-AAAAT----GT---A---CAGT--C-----GCTGAATAAAGAT--------AAAA-TT--TCA-TGAA--A-TTA-CT-TGAAAATTT-AA-TAAATTT--A
gi|14 : aaataaacaacaattaacttcactgaaccctgcatgttctgtatttgttaattaaaagatattagattagtctgggtcaatgttatcagtcggagtgccaactaaacgaatttcactattaaggaagataactctcTGG-A--CCGAAAA-GC-A-AAAAG-TA--------G---------AA-ATC-GCG-T-TTGTATTTG--A-AAAATGTTACA---G---T--T--C-----GCTGAATAAAGGTA-------AAA--TT--TCA-TGAA--A--TA-CA-TGAAAG-TT-GAATAAGTTTAAAAA---G-TTAATAAATG-----TATCTG---------------------AATG-AATAATAGTTA---AGTTAT--------AGATTA-CATG
gi|20 : aataggaagataactctcaccacA-G-TT--------G---------AA-ACC-GCG-T-TGT-ATTCG--A-AAAAT----GT---A---CAGT--C-----GCTGAAAAAAGGT--------AAAA-TT--TCA-TAAA--A-TTA-CA-TGAAAATTT-AA-TAAGTTT--AAA---C-GTAATAAATG----TCAT-TGTA---ATT---------AAT-AATA-AGTtatgcaccttaatgtgtcagcgattttgttataaacaatatgtcgataaatgcgatgaaaaaatctacagtatcaatctttaactcctatatcagcgcagc
gi|13 : A--------G---------AA-AT--CCG-C-TTTTATTCG----AAGAT---------A---C--T--TCGCT-G---AATAAAGGTTACATGTAAAA--TT--TCA-GGAA--AATTA-CAATGAAAATTT-AAT-AAG-----GAA---C-TTAATAAATA----TTAT-TGTA---ATCAAT------AAC-AACG-AGAAGAAGTTAT--A-TTATGGC-TTAAATATTA-CATGATATCCTGAAATCATCGATCTCATGTTT--A-AGCT-C--AGT--AAAATATCTGATTATGTCAAG---GATA-----TAGAGTCA--TT-AAC-ATTT-TTCCAATA-TGTACCTTGTAGT-T--T-TATAAA--GATA---TCATTTAAAGTTGTACGTAAGA-C--AAC------AA--GATTCGC-ATTGAAATATAAATGTAAGA-A-TA-TAA-AT----GCAAGAGACGT------TC-TGATGGA----------TGA--------TTTTTTC-ACGAGTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGTAAT-C-------CACC-------G--AA------CAGTGATTT----TGCC-T--AT-CCACGAAAAA-T---GA--T--GCC---ACGAATA-TTGA-TA-AAAC-CA-CAGTtacatattacgtctattgca
gi|22 : AATA-TGTA-CATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATA--AAATTGTACGTAAGA-T--AACT----AAG--GATT-GC-T--------------TTGAA-A-TA-TAA-AT----GCAAGAGACG-TTCCGAT
gi|18 : --GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACTACCCAAG--GATT-GC-AT-------------TGGCATA-TA-TAA-AC----ACAAGATACG-TCCCGATT-GGA-GAAC-C-A-ATG-TGA-TATTA--TTTTTTT-------------------TTCACGAATTTACGTATC-CACGAAA-CA---------GT-GA------T-----TTC----TGCC-TT-AT-CCGCG-AAAACT---GA--T--GCCC--ACAAATA-TTGA-TG-AAAC-CA-CAGTA
gi|19 : -GC-A--------------TTGAA-A-TT-TAATAT----G-ATGAGA-GTT--CGATTGTAATGAAG-CAA-ATG--AA-T-GTGGGTTTTTTC-ACG-GTGGGGTGCCTC-ATCCACGAATCTACGTATCACGAACA--CA---------GT-GG------T-----TTT----TGC---TGA--CCACG-AAAA-TTGAAA--T--GCCC--ACGACTATTTGA-TG-AACC-CAC
gi|26 : ttgA-A-TA-TAA-AT----GCAAGAGACG-TTCTGA-T-TGTTGAAC-CAA-ag
gi|21 : a-TGA-T-TT---TTTTT-C-AAA-CTGGG---C----ATCCACGAATCCACAAA---A-------CA---------GTGGA------T-----TTT-----GCC-T-GAT-CCACG-AAAA-TT--GA--T--ACCCA--CGAATA-TTGA-TG-AAAC-CA-CAGTAtg
gi|23 : aCG-GTGGG---C----ATCCATGAATTTAAGTAT--C-------CA---------C--GAAACAGTTAA---TTT----TGTC-T-GAT-CTACG-AAAA-TC--GA--T--GCCC--ACGATTA-TTGA-TG-AAAC-C-CCA
gi|24 : CATC-ACGA-TTTA-GTATCACGAAA---CA---------GT-GA------T-----TTT----TGCC--TGAT-CCACG-AAAA-T---GA--TTCGCCC--ACGAATA-TTGA-TG-AAAC-CAC
gi|15 : AT-C-ACA-AAAA-----GG--T--GTCAA-ACGAATA-ATGA-TG-AAAC-CAag
gi|1 : accataatcatctgaaatagaatgaagaactacatcattggtagatctgaatgaatattCG-AAAA-TT--GG--T--GTTCA-ACGAATA--TGA-TG-AAAC-ttcattgaagacctcaaccacgaattcaaatgttcatccaaagtttggtgcttctgataggagatattcctgttcttgcttcgtcactgtccacgatcgtcgagcgatcaatataacaatgtataagtaaaaattttttctggaaaacactaattgagatattgtttaatcttcatcaaa
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 11111 55555555555555555555555555555555555 111 111 1111111 3333333333333 1 777777777777777777777777777777777777777777777777 111 44444444444444444444444444 22222 111 33333333333333333333333333333333333333333 44444444 11 11111111111 222 3333333333333333333333333 1111111111111 333333333333333333333333333333 111111111 111111111 11111111 111111111 11 4444444444444444444 22222222 11 111111 333333333 11 44444444444444444444444444444444 1111111111111111111111111111111111 11 11 11 11 11 22222222222222 111 1111 1111111 55555555555555 111 11111 11
lowQualScore : 6 3 3 3 44 3 0 0 3 4 3 3 3 44 3 3 4 4 99999 8 4 6 11111 0 00000000000000000000000000000000000 4 444 1 888 0 9999999 0 7777777777777 11 777 4 0 999999 2 66 4 4 6666 8 555555555555555555555555555555555555555555555555 3 88 3 66 3 777 3 3 3 99 3 33333333333333333333333333 44 3 3 6 6 3 7777 33333 3 44 3 3 44 44 3 88 3 000 55 3 11111111111111111111111111111111111111111 777 33333333 4 777 8 99 4 3 4 99999999999 222 1 8888888888888888888888888 4 4 55 0000000000000 4 666 888888888888888888888888888888 222222222 888888 3 444444444 88 6 4 3 3 3 2 33333333 000000000 2 2 2 11 5 5555 2 888 5555555555555555555 999 11111111 555 22 2 33 44 2 3 1 6 3 44 7 99999 2 3 3 000000 666666666 0 8888 4 44 33333333333333333333333333333333 66 5 5 7 5 9999999999999999999999999999999999 33 00 5 5 55 0 6 11 66 5 66 777 66 4 66 9999 00 4 4 3 3 3 3 55555555555555 7777 888 8 44 4 0000 4 7777777 4 3 666 888 3 99999999999999 3 4 7777 666 3 3 55555 44 44 88 3 3 3 99
lowQualScore : . . . . .. . . . . . . . . .. . . . . ..... . . . ..... . ................................... . ... . ... . ....... . ............. .. ... . . ...... . .. . . .... . ................................................ . .. . .. . ... . . . .. . .......................... .. . . . . . .... ..... . .. . . .. .. . .. . ... .. . ......................................... ... ........ . ... . .. . . . ........... ... . ......................... . . .. ............. . ... .............................. ......... ...... . ......... .. . . . . . . ........ ......... . . . .. . .... . ... ................... ... ........ ... .. . .. .. . . . . . .. . ..... . . . ...... ......... . .... . .. ................................ .. . . . . .................................. .. .. . . .. . . .. .. . .. ... .. . .. .... .. . . . . . . .............. .... ... . .. . .... . ....... . . ... ... . .............. . . .... ... . . ..... .. .. .. . . . ..
lowQualScore : 7 3 3 3 66 3 4 4 6 3 6 6 6 22 6 6 0 0 66666 0 0 4 11111 9 11111111111111111111111111111111111 2 777 0 555 8 3333333 8 1111111111111 22 000 0 8 222222 0 55 0 0 1111 0 999999999999999999999999999999999999999999999999 6 66 3 66 3 222 3 3 3 22 3 22222222222222222222222222 66 3 3 7 7 3 1111 66666 3 66 3 3 66 66 3 88 6 000 00 6 66666666666666666666666666666666666666666 000 00000000 0 000 0 00 0 2 0 00000000000 222 9 7777777777777777777777777 0 0 55 9999999999999 0 444 111111111111111111111111111111 333333333 888888 1 000000000 55 2 0 1 1 1 9 22222222 777777777 7 7 7 99 7 7777 7 333 5555555555555555555 333 11111111 000 55 9 99 44 9 1 2 2 1 22 3 11111 3 6 6 555555 555555555 5 5555 0 44 22222222222222222222222222222222 99 0 0 0 0 4444444444444444444444444444444444 66 00 7 0 66 4 5 99 99 0 11 888 11 4 11 4444 66 0 0 6 6 6 6 00000000000000 7777 888 8 77 0 2222 0 2222222 0 6 444 777 6 55555555555555 6 6 7777 777 1 1 55555 22 22 55 1 1 1 00
consensus : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTATGTGATACCC-CGNCACTCCCTCGCTTTTGCANGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTCCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAAAAAAATC-------AT--A-AAATTTTNACTGGGTTAT---T-TAATTT-CTAAATCAA-CGAT-GTC-AAATTACC-ATGTAA-G--AAGCC-ATACCACCTG----------------TT------A-----------------------CAAT-A--TACT-TT-GCAA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAA-CACA--A-TG----------G---G----C-C-G--AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TAACC--CCCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTC------CCA---------A---TTC---GA--C-T------GATT---TTG--------TTA-AACAA---ACAATTAATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GC-TGACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GA--CC-AATA-TC-G-AAA-G--------TAG---------AA-A-TC-GCG-TTTTTATTCGTCG-AAGA-T---ACA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTTATTTATTATTGCCTTAAANATTACACG---A-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA-AA---CTTATTCT-G--CA-A---GTA-T-C--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATC---CAC---A----ACAGT-GATTTT----TGCC-TTGATCC-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
Reference ( family-4914 ) : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTATGTNGNNCNC-CGNCACTCCCTCGCTTTTGCATGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTTCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAGAAAAATC-------AT--A-AAATTTTNACTGGGTTAT---T-TAATTT-CTAAATCAA-CGAT-GTC-AAATTACC-ATGTAA-G--AAGCC-ATACCACCTG----------------TT------A-----------------------CAAT-A--TACT-TT-GCAA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAA-CACA--A-TG----------G---G----C-C-G--AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TAACC--CCCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTC------C-----------A---TT----G------------GATT---TTG--------TTA-AACAA---ACAACTAATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GC-TGACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GA--CC-AANA-TC-G-AAA-G--------TAG---------AA-A-TC-GCG-TTTTTATTCGTCG-AAGA-T---ACA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTTATTTATTATTGCCTTAAANATTACACG---AAAT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA-AA---CTTATTCT-G--CA-A---GTA-T-C--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATC---C-----A----ACAGT-GATTTT----TGCC-TTGATCC-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
gi|1 : ATCC--CG-AAAA-TT--GG--T--GTTCA-ACGAATA--TGA-TG-AAAC
gi|1 : gtgacctcgcacaagttctagactctaaacttgtacttTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTT-TTTCTGACAG-GAGATTT-CCTGTTCTTTAT-T-CCGTCATTGTCT-TCG-ACCG--GAGC-GATCAAATAC----AAGT-ATG--TGAAACTTTTTCT-GGTAAA-----CTTTATGTTGATTAC-TCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NN--N-NNNNNNNNNNNNNNTCATAATT-TAATTT-TCTAATCAA-TGATTGTC-AAATTACC-ATGTAAAG--AAGCC-ATAGCACCTG----------------T-------A-----------------------CAATTA--TACT-T--GCAA-TCGGACTAATTTT---CAC-TCT-CCTGAA-CGCA--A-TG----------G---G----CGCAG--AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TTACC--CC-A-CGC--A-T-CTCA--GAAATTTA-GTCG-AAATTCA-CACCT--TTTGAA--ACCAC-GCTC------CCA---------A---TTCCA-G------------GATTTCCTTGATTTTGTTTTACAACAATCCACAACTCAT--GTGT-TATT-AATTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GCTTGACAA--AACAA-ATCTATTCCCC-TTGCGGT---TT--------A---------------------AA---------C------GC-TAAA------GA--CCAAATA-TCAG-AAA-GT-------TAG---------AA-ATTC-GCGCCTTTTATTCGTTG-AAGATT---ACA---A---CG-C--C-----G---AA-AAAG----------AA---C--GTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTC--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T------TAAATA-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTT-TTTA---------TGAAAATCACCCG--------------CCAT-----TCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA--------TATCTT-G--T-----------------GAGTCA--TTAAA--ATCA-TTCCAATA-TGT-ACATG--T--C--T-TAC-AA--GATA---TCATT---AATT-TACAT-AGA-C--AACT----AAGC-GATT-GC-ATT-G-A-A-TATTAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCAA-T-TGATGAAC-CAATGGG-TGA---T---GTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CGT-CACGAATTTACGT-ATC---CACGAAA----ACAGT-GATTTTGTGCTGCCTTTGATCCTACG-AAAATT---GATTT--GCCCATACGAATA-TTGATTGCAAACCAC-ttgttgatgaccgccacccacacgaattcaagatgttcaacgaagtttggtttttctgacaggagatttcctgttctttattccgtcattgtcttcgaccggagcgatcaaatacaagtatgtgaaactttttctggtaaactttatgttgattactcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcataatttaattttctaatcaatgattgtcaaattaccatgtaaagaagccatagcacctgtacaattatacttgcaatcggactaattttcactctcctgaacgcaatgggcgcagagtggtagattttacacctgatcttaccccacgcatctcagaaatttagtcgaaattcacaccttttgaaaccacgctcccaattccaggatttccttgattttgttttacaacaatccacaactcatgtgttattaattaccccgccatgctgaatagtgcttgacaaaacaaatctattccccttgcggtttaaacgctaaagaccaaatatcagaaagttagaaattcgcgccttttattcgttgaagattacaacgccgaaaaagaacgttcatgaaattacatgaaaatttgataagttcaaacttaataaatattatttaaataagcaatgagtaagagtttttatgaaaatcacccgccattcacgtttaactcagcaaaatatcttgtgagtcattaaaatcattccaatatgtacatgtcttacaagatatcattaatttacatagacaactaagcgattgcattgaatattaaatgcaagagacgttccaattgatgaaccaatgggtgatgtttttcacggtgggcctcgtcacgaatttacgtatccacgaaaacagtgattttgtgctgcctttgatcctacgaaaattgatttgcccatacgaatattgattgcaaaccacaatat
gi|10 : gtgacctcgcacaagttctagactctaaacttgtacttgtttcatcatattcgttgaacaccaattttcgggatttgttgatgaccgccacccacacgaattcaagaTGTTCATA-CGA---GTTT--GG-G-TT-CTGATAG-AATATCTTCCTGTACTT-GCGT-CCGTCATTTCCCTACGGACCAT-GCCCCGATCAA-TAC----ATGC-ATAA-TGAAACTTTTT-CCGGTAAA-----CTTaatat
gi|10 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaaTACCGCCTG----------------T-------A-----------------------CGAT-A--TATT-TT-GCAA-TTGGACTAATTTTT-C-AC-TCT-CCTGAA-CACA--A-TG----------G---GGCG-C-C-G--AG--TCGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----CA--C--CCCA-CGT--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCGAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaccgcctgtacgatatattttgcaattggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtcgtagattttacacctgatccaccccacgtatctcaaaattagtcgaaat
gi|11 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaatgttcatacgagtttgggttctgatagaatatcttcctgtacttgcgtccgtcatttccctacggaccatgccccgatcaatacatgcataatgaaactttttccggtaaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACA-TT-GCAA-TCAGACTAATTTTT-CCACTTCTGTCTGAA-------------------------A----C-C----AG--GGGTAGTA-TTTTCACACCTT-GATCAGAGTTACTGGCCCAGCAC--A-C-CTCAGTGAA--TCC-GTCAAATATTCA-CACCTCTTTTGAAATACCAT-GATCTTGTTTC-----------A---TG----GATCCTT------GATT---TTGCATGAA--TTA-AACAA---ACAATT-ATG-GTGTAAGTT-AATTA-----------t
gi|11 : cccatatactgtgtattagaagccatgtcattgcgcatttttaagtagtcccaagcactgtgtaA---------C------AC-T--T------GG--TC-AA-A-GC-G-AAA-G--------TAG---------AACA-CC-GCG-GTTGTAGT--TCG-AAAA-TGT-ACA---GTCGC--T--------G---AATAAAGGT--------AA---AATTTTCA--GAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTAAT-AA-GTTT--Aacttcactgaacgcctgcatgcttatgaatacttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcacacttggtcaaagcgaaagtagaacaccgcggttgtagttcgaaaatgtacagtcgctgaataaaggtaaaattttcagaaattacatgaaaatttaataagttta
gi|12 : cccatatactgtgtattagaagccatgtcattgcgcatttttaagtagtcccaagcactgtgtaacattgcaatcagactaatttttccacttctgtctgaaaccaggggtagtattttcacaccttgatcagagttactggcccagcacacctcagtgaatccgtcaaatattcacacctcttttgaaataccatgatcttgtttcatggatccttgattttgcatgaattaaacaaacaattatggtgtaagttaattaacttcactgaacgcctgcatgcttatgaatacttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--G-TG-TT-CTGATAG-AAGATTTTCCTGTTTCT-GC-TCCCGTCATTGTCC-ACG-CGAGT-GAGC-GATCAA--A-----ATGT-ATAA-TGAAACTTTT
gi|12 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacaTC-------ATGAA-AAATTTTTGCTGGGTTAT---TATAATTT------TCAA-TG-----C-AA----CC-AT-TA--G--AAGCC-ATACTACCTGCATAAGTGTTTTTCAGTTCCAAGCA-----------------------CAAA-AGTTACA-TT-GCAAGTCGGACTAATTTTT---AT-TCT-CCTGAA-CACA--AATG----------G---GGCGCC-C-A--AT--TGGTAG-A-TTTT-ACACCAT-GATC----TA--C--CCCA-CGC--A-C-C-CA--AAA--TTA-GTC-GAAATTCACCACC---TTTGAA--ACCAC-GCTC------C-----------gtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcatgaagagaatcggctgttcatgaaaaatttttgctgggttattataattttcaatgcaaccattagaagccatactacctgcataagtgtttttcagttccaagcacaaaagttacattgcaagtcggactaatttttattctcctgaacacaaatggggcgcccaattggtagattttacaccatgatctaccccacgcacccaaaattagtcgaaattcaccacctttgaaaccacgctcccaattcatggatccttgat
gi|13 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacatgttcaacgaagtttgtgttctgatagaagattttcctgtttctgctcccgtcattgtccacgcgagtgagcgatcaaaatgtataatgaaacttttgtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcatgaagagaatcggctgtAG---------AA-A-TC--CG-CTTTTATTCG----AAGA-T---AC--------T--T--C-----GCTGAATAAAGGTTACATGTAAA---A--TTTCA-GGAA--AATTA-CAATGAAAATTTAAT-AA-G-----GAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---ATCAATAACA----ACG-AGAAGAAGTTAT--ATTATGGC-TTAAATATTACATG---ATATCCTGAAATCATCGATCTCATGTTT--A-AGCTCAG-TAAAATAT---CTGATTAT-GT-CA-A---GGA-T-A--TAGAGTCA--TT-AAC-ATTT-TTCCAATA-TGTACCTTGTAGT-T--T-TATAAA--GATA---TCATTTAAAGTTGTACGTAAGA-C--AAC------AA--GATTCGC-ATTGA-A-A-TA-TAAATGTAAGAATATAAAT----GCAAGAGACGT------TC-TGATGGA----------TGA-------TTTTTTC-ACGAGTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGTAATC---CACCG-A----ACAGT-GA-TTT----TGCC-T--ATCC-ACGAAAAA-T---GA--T--GCC---ACGAATA-TTGA-TA-AAACCA--CAGTcaattcatggatccttgat
gi|14 : ---------C------AC-T--G------GA--CCGAAAA-GC-A-AAAAG--------TAG---------AA-A-TC-GCG-TTTGTATTTG--A-AAAA-TGTTACA---G---T--T--C-----GCTGAATAAAGGTA-------AA---A--TTTCA-TGAA--A--TA-CA-TGAAAGTTGAAT-AA-GTTTAAAAAG-TT-----AATAAAT-G-TATCT-----G--------------A----ATG-AATAATAGTTA
gi|15 : aataggaagataactctcacC-ACA-AAAA-----GG--T--GTCAA-ACGAATA-ATGA-TG-AAACCAagttatagattacatgtatgcaccttaatgtgtcagcgattttgttataaacaatatgtcgataaatgcgatgaaaaaatctacagtatcaatctttaactcctatatcagcgcagc
gi|15 : accataatcatctgaaatagaatgaagaactacatcattggtagatctgaatgaatattTGTTCATC-CAA-A-GTTT--GGTG-CTTCTGATAG-GAGATATTCCTGTTCTT-GC-T-TCGTCACTGTCC-ACG-ATCGTCGAGC-GATCAA-TATAACAATGT-ATAAGTAAAAATTTTTTCTGGAAAA-----Catttcattgaagacctcaaccacgaattcaaatgttcatccaaagtttggtgcttctgataggagatattcctgttcttgcttcgtcactgtccacgatcgtcgagcgatcaatataacaatgtataagtaaaaattttttctggaaaacactaattgagatattgtttaatcttcatcaaa
gi|16 : accataatcatctgaaatagaatgaagaactacatcattggtagatctgaatgaatatttggtttcatcattattcgtttgacacctttttgtgatttcattgaagacctcaaccacgaattcaaa---A---------------------GT-GC-CAACTA--AACGA-AT-T--TCACTATTAAGG------A-------A---------------------GATAACTCTCAC------AC-T--T------GA--CC-ATAA-AC-G-AAA-G--------CAG---------AA-A-CC-GCA-TTGT-ATTCGAAA-AATG-T---ACA---GTCGC--T--------G---AATAAAGAT--------AA---AA-TTTCA-TGAA--A-TTA-CT-TGAAAATTTAAT-AA-ATTT--Aactaattgagatattgtttaatcttcatcaaa
gi|17 : aaataaacaacaattaacttcactgaaccctgcatgttctgtatttgttaattaaaagatattagattagtctgggtcaatgttatcagtcggTGTTCA-A-CGA-A-GTTTTCGGTG-TTTCTGATA
gi|17 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaaTACGGT---TTACTAGTAAA---------------------AA---------C------GC-T--T------GA--CC-AATA-TC-G-AAA-G--------TAG---------AA-A-TCGGCG---TTTATTCGTCG-AGGA-T---ACA---A------T--CGCT--G---AATAAAGGTTAA-----AA---A--TTTCATTAAA--A-TTA-ctacggtttactagtaaaaacgcttgaccaatatcgaaagtagaaatcggcgtttattcgtcgaggatacaatcgctgaataaaggttaaaaatttcattaaaatta
gi|18 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaatgttcaacgaagttttcggtgtttctgatac--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACTACCCAAG--GATT-GC-ATTGGCATA-TA-TAA--------------AC----ACAAGATACG-TCCCGATT-GGA-GAAC-C-A-ATG-TGA-TAT---TATTTT----------------T-TTTTCACGAATTTACGT-ATC---CACGA-A----ACAGT-GATTTC----TGCC-TT-ATCC-GCG-AAAACT---GA--T--GCCC--ACAAATA-TTGA-TG-AAACCA--CAGTA
gi|19 : -GC-ATTGA-A-A-TT-TAAT-------------AT----G-ATGAGA-GTT--CGATTGTAATGAAG-CAA-ATG--AA-TGTGGGTTTTTTC-ACG-GTGGGGTGCCT-CATCCACGAATCTACGT-ATCA--C-----GAAC-ACAGT-GGTTTT----TGC---TGA-CC-ACG-AAAA-TTGAAA--T--GCCC--ACGACTATTTGA-TG-AACCCAC-
gi|2 : ttgTGTTCA-AGCGA-ATGT-----GTGATTCCTGATAG-AAGATTT-CCT-TTCT--GC-T-CCGTCATTGTC--ACG-ACCG----AC-GATCAA-TAGTTA-ATGT-ATAA-TGAAACTT---CCCGGTAA------CTATA-GCAGA------------CCCACGCTTT-G-AGGACTTCGC-GCTTGTCCAA-TGCAATCTCCGATT---CACGCCGGGTAA-CGC--TGAAAAAATCGCGCTC-AT--ATAAATCTTTACTG--TTAT---T-TAATTTTCTA--TCAA-TGAT-GTC-ACATTACC-ATGTAA-A--GAGCA-ATAC-AC-TG------------------------A-----------------------CAAT-A--TACT-TT-CCAA-ATGGAATAATTGTT-C----TCT-C-TGA--CATA--A-TG----------G---G----C-G-C--AGGTTGGTAG-A-TTT--ACAC-----AT-------ACT--CCCA-CAC--AAT-CTCA--AAA--TTAAGTCG--AACTCA-C-CC---TTTGAA--ACCACTGCTC------CCAATAGATCCCA---TT----G------------ATTT---TTG--------TTA-ACGAA---ACAATTAATGTGTGT-T-----ATTA-----------CCCCAC--ATGCTGAAT---T---------------------GT-GC-TGACAATTAGAGA-AT-TAT--CCC-TTGGCGTATATTA-------A---------------------AA---------C------GC-T----------G--CC-AAGA-TC-G-AAA-G--------TAGTATATATGAGA-A-TC-GCG-TTTT-ATGCGTCGTAGGA-T---ACA---A------T--CACCGAG---AACAAAGGT--------AA---A--TT-CA-TGAA--A------------AATTT-AT-AATGTTT--AAAC-TT-----AATTATTTATTGT-TAGTATGTA---T-----GGTATCGAATGCAGTAAGAGTT--TTAT-ATTGCCTTAAATTTTA-ACGTACAAAT---GAAATCATCGATCT-ACGTTTTAA-A-CCCAGGCAAAATAA---CTTCTTCT-GTACA-AAATGTAAT-TAATAGAGTCAAATTAAACTATTAATCCCAATAATGTA-C-TGAAGATT--TATACAAACAGATAAACTCATT--AATTTGT---TAAGA-CCAAACT----TAA--GATT-GCCATTAG-A-AATA-TCA--------------ATCTGCACAAGAGACGT--CCGA----GATGAAC-CAG--TG-TGA-TCT---ATTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCACCGTAATTACGT-ATC---CACA--A----ACAGT-GA--TT----TGCC-T---TCC-ACG---AA-T---GA--T--GACC--ACGAATA-TTGA-TG-AAA-CACACAGTAag
gi|20 : ttcacatcattcgttgaacaccaatttaagtgattcggatgaccctcaaccacgaattcaaaA-G--------TTG---------AA-A-CC-GCG-TTGT-ATTCGAAA-AATG-T---ACA---GTCGC--T--------G---AAAAAAGGT--------AA---AA-TTTCA-TAAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTAAT-AA-GTTT--AAAC-GT-----AATAAAT-GTCAT-T-----GTA---ATT---AATA----ATA-AGT
gi|21 : -TGA-TTT---TTTTT-C-AAA-CTGGG---C----ATCCACGAATCCACA--A-----------A----ACAGT-GGATTT----TGCC-T-GATCC-ACG-AAAATT---GA--T--ACCC--ACGAATA-TTGA-TG-AAACCA--CAGTAtacatattacgtctattgca
gi|22 : aAATA-TGTA-CATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATA--AAATTGTACGTAAGA-T--AACT----AAG--GATT-GC-TTTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCGAT
gi|23 : CG-GTGGG---C----ATCCATGAATTTAAGT-ATC---C-----ACGAAACAGT-TAATTT----TGTC-T-GATCT-ACG-AAAA-TC--GA--T--GCCCA--CGATTA-TTGA-TG-AAACC-C-CA
gi|24 : -CATC-ACGA-TTTA-GT-ATCA--CGA---A----ACAGT-GATTTT----TGCC--TGATCC-ACG-AAAA-T---GA--TTCGCCC--ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-
gi|25 : TGTTCA-T-CGA-A-GTTT--GATG-CTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCATCATTGTCC-GCA-AATGT-GAGag
gi|26 : -A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCTGA-T-TGTTGAAC-CAA-
gi|3 : aTGTTCA-A-CGA-A-GGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTT-GA-T-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAA-----CTTNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-------AT--A-AAATTTTAACTGGGTTAT---T-TAATTT-CTAAATCAAACGAT--TC-AAATTACC-ATGTAA-G--AAGCCCATACCACCTG----------------TT------A-----------------------CAAT-A--TACT-T--GCAA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGA-CACATTA-TG----------G----------C-G--AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TAACC--CTCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTC------C---------------TT----G------------GATT---TTG--------TTA-AACAA---ACAA-TAATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCACTCATGCTGA-T---A---------------------GT-GC-TGACAA--A--------------CC-TTGCAGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GAACCC-AATA-TC-G-AAA-G--------TAG---------AA-A-T--GCG-TTTTTATTCGTCG-AAGA-T----CA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TATCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGATTAA-GTTT--AAAC-TT-----AA-AAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AACA----ATG-AGTAAGAGTTATTTATTATTGCCTTAAAAATTACATGG--AAAT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-C-CAG-CAAAA-AAAATCTTATTCTTG--CACAT--GTA-TTC--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATGAG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGT-ATT---C-----------CAG--GATTTT----TGCC-TTGATCT-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTAtg
gi|4 : TGTTCA-A-CGA-A-GGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTT-GA-T-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAA-----CTTNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-------AT--A-AAATTTTAACTGGGTTAT---T-TAATTT-CTAAATCAAACGAT--TC-AAATTACC-ATGTAA-G--AAGCCCATACCACCTG----------------TT------A-----------------------CAAT-A--TACT-T--GCAA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGA-CACATTA-TG----------G----------C-G--AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TAACC--CTCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTC------C---------------TT----G------------GATT---TTG--------TTA-AACAA---ACAA-TAATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCACTCATGCTGA-T---A---------------------GT-GC-TGACAA--A--------------CC-TTGCAGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GAACCC-AATA-TC-G-AAA-G--------TAG---------AA-A-T--GCG-TTTTTATTCGTCG-AAGA-T----CA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TATCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGATTAA-GTTT--AAAC-TT-----AA-AAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AACA----ATG-AGTAAGAGTTATTTATTATTGCCTTAAAAATTACATGG--AAAT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-C-CAG-CAAAA-AAAATCTTATTCTTG--CACAT--GTA-TTC--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATGAG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGT-ATT---C-----------CAG--GATTTT----TGCC-TTGATCT-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
gi|5 : TTCA-A-C-A-A-GTTT--G-TG-TTTCTGATAG-AATATTTTCCT-TTCTT-GC-T-CCGTCAT-GTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GAT--A-TAC----ATG-----A-TGAA---TTTTCTCGGTAAA-----CTTTATGTGATACTC-CGGTACTCCCTCGCTTTTGCATGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTTCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAGAAAAATC-------GC-------TGTTCA-TAA---AT---T-TAATTT-TCTAATCAACCGAT-GT--AAATTACCGATGTAA-GAAAAGCC-A-A-CACCTG-----------------T------A-----------------------CGAT-A--TACTATTGGGAA-TCGGACTAATATTT--CAC-TCT-CCTGAACCACA--C-TG----------G---G----CGC-G--A---TGGTAA-ATTTTT-ACACC-TGGATC----TA--C--TCCA-CGC--A-TCCTCA--AA----TA-GTCAAAA---CC-CACC---TTTGAA--ACCAC-GTTC------CCAA--------A---TTCAC-G------------GATC---TTGATTTTGT-TTA-AACAA---ACAATTAAT--GTGT-TATTAAATTA-----------CCCCG---ATGCTGAAT---A----------------------T-GC-TGACAA--AAC------TATATCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--CTTGAAAGA--CC-AATATTC-G-AAA-G--------TAG---------AA-A-TC-GC-----------------------------------------C-----G---AATAATGGT--------AAAATA--TTTCA-TGAAATA-TTACCG-TAAGAATTTGAT-AA-GTTT--AAACTTT-----AAT-AAT-ATTAT-T------TAAT-A-----AGCA----ATG-A-T-AGAG---TTTA--ATT----------------------------AAATC-TCGATC-CTCGTTC--AGA-CTCAG-CAAA----------ATTC----------------T-C--TAGA-TCAC-TTAAAA-ATCA-TTCCAATA-TGT-ACATG-AG--TGAT-TACAAA--GAT----TCATA--TAATTGTA-GTAAGATC--AA-T----CAGCTGATT-GC-ATTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCCAGAGATGTT--CGATT---GTAAACGC---ATGTTGA-------TTTTTTCAACG-GTGGC---CTC-CATCCA-GAATTTACGT-ATCATGA-----A----ACAGTGGATTTT------CC---GATCC-ACG-AAAT-T---GA--T--GCCC--ACG-ATA-TTGA-TG-AA
gi|6 : gtggtttctatcatttattcgttgcaacaccaatttttctggattcgttgatgaccccaaccacgaatttacaTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTT-CCGGTAAA-----C-TTGTGTGATACCC-Ccaacaa
gi|6 : AT---T-T--TTT-CTAA-TCAA-CGAT-GTC-AAATTACC-ATGTAA-G--AAGCC-ATACCACCTG-----------------T------A-----------------------CAAT-A--TACT-TT-GCAA-TCGGACTAATTTTT--CAC-TCT-CCTGAA-CACA--A-TG----------GGGCG----T-C-G--AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TA-----CCCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCGAAATTTCA-CACC---TTTGAA--AACAC-GCTC------CCA---------A---TTCAC-GGATCCTT-----GATT---TTGA-------TTT-AACAA---ACAACTAAT--GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCG--CATGCTGAAT---A---------------------GT-GC-TGACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TT--------A---------------------AA---------C------G-----T------GA--CC-AATA-TT-G-AAA-G--------TAG---------AA-A-TC-GCG--TTTTATTTGTCG-AAGA-T---ACA---A---T--CGAC-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAA-AA-GTTT--AAAC-TT-----GATAAAT-ATTAT-T-----TTATATA-----AGCA----ATG-TTTAAGAGT--TTTATT-------------------------------AAATCATCGATCTCACG-TT--A-A-CTCAG-CAAAA-A------------------------TA-T-CT-TAGAGTCA--TTAAAA-ATTA-TTCCAATA-TGT-ACATGAAG--T--A-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCGA-T-TGATGAAC-C-A-ATG-TGATTTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaattttttctaatcaacgatgtcaaattaccatgtaagaagccataccacctgtacaatatactttgcaatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgtcgagtggtagattttacacctgatctacccacgcatctcaaaattagtcgaaatttcacacctttgaaaacacgctcccaattcacggatccttgattttgatttaacaaacaactaatgtgttgttaattaccccgcatgctgaatagtgctgacaaaacgaattattccccttgcggtttaaacgtgaccaatattgaaagtagaaatcgcgttttatttgtcgaagatacaatcgacgaataaaggtaaatttcatgaaattacatgaaaatttgaaaagtttaaacttgataaatattattttatataagcaatgtttaagagttttattaaatcatcgatctcacgttaactcagcaaaaatatcttagagtcattaaaaattattccaatatgtacatgaagtatacaaagatatcattaaattgtacgtaagacaactaaggattgcattgaaatataaatgcaagagacgttccgattgatgaaccaatgtgattttttttttcacggtggg
gi|7 : tgttcaacgaagtttggtgtttctgatagaagattttcctgttcttgctccgtcattgtccacgaccgtgagcgatcaatacatgtataatgaaactttttccggtaaacttgtgtgatacccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaTGTTCA-A-CGGGA-GTTT--GGTG-CTTCTGATAGCAAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-C-GCTATTGTC--ACG-ACCGT-GAGC-GATAAA-TA-----------------ACACTTTTTCCTGGTAAATTAAACCTTGTGTGATATCCACG------CCTCGC--------------GCTTTTTTTTCAA--TGCATCCCCGATC--TCACGCGGGGTA---GC--TAAAAAAATCGCTGTTCAT--A-AAATTTTC-CTGGGTTAT---T-AATTTT-CTACATCA--CGAT-GTCCAAA--------GTAA--------------CATC-G----------------T-------A-----------------------CAAT-AA-TACT-TT-GCAA-TCG---TGACTTTT-TCAC-TCT-C-TGAA-CACA--A-TGCTGAAATGGGGC--G----C-C-GGCAG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-CATC----TAA----CACA-CGCTTC-T-CTCA--CAA--TTA-GTC-GCAATTCA-CA-C---TTTGAA--AACAC-GTTC------C-----------AATTTT----GAAACGGATCCTTGATT---TTG--------TTA-AACAA---ACAACTAAT--GTGT-T---------------------------CATGCTGAATTCAG---------------------GTGGC-TGACAA--AA-GACAT-TATTTCCC-TTGC-GT---TT--------A---------------------AA---------C------GCTT--T------GA---C-AATA-TC-GAAAA-G--------TAG----------A-A-TT-GCG--TTTTATTCGTCG-AAGA-T---ACA---A---TCGC--C-----G---AAT
gi|8 : aATTGGGTTAC---T-T----T-CTAA-TCAG-TGAT-GTC-AAATTACC-ATGTAG-G--AAGCC-ATACCACCTG----------------CT------AAAGGTTTTTTTCAGTCTCAAGCACAAT-A--TACT-TT-GCAA-GCAGACTAACTTT--CCAT-ATT-CCTGAA-CATA--A-TG----------G---GTCA-C-C-A--GG--TGGTAG-A-TTTTCACACC-T-GATC----TA--C--CCTG-CAC--A-T-GTCA--AAA--TTT-GT-GGAAATTCA--ACC---TTTGAA--ACCCC-GCTC------CTGTTTC-----A---TG----GATCCTT------GATT---TTG--------TT-----------TAATTAATG--TGT-TGTT-AATTAACTTAACTCTACCCTGC--ATGCTGAAT---ACTTGATCAATTCAGAGTGGCAGT-GC-TGACAA--AACGA-AT-TATTTCCC-TTGTGAT---TTA-------AAGCTACAGTATTAGGGAAGATAA---------CTCTCATGC-T--C------GA--CC-AGAA-TT-T-AAA-G--------TAG---------AA-A-TC-TCA-TTGT-ATTAGAAA-GAGA-T---ACAGTCA---C--T--------G---AATAAAGTT--------AA---AA-TTTCA-AGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTCAAT-AA-GTTT--AAATGTTTTAGAAATAAAT-GTTAT-T-----G
gi|9 : tGGGTTAT---T-TAATTT-TCTAATCAA-TGAT-GTC-ACATTACC-ATGTAA-G--AAGCA-ATACCACCTG-----------------T------A-----------------------CAAT-A--TACT-TT-GCAA-TCGGACTAATTGTT--CAC-TCT-CCTGGA-CATA--A-TG----------GGGCG----C-A-G--AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACA-T-GATC----TA--C--CCCA-CAC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTC-GAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTC------CCA---------A---TTCACAGATCCTT------GATT---TTG--------TTA-AACAA---ACAATTAAT--GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCA--CATGCTGAAT---T---------------------GT-GC-TGACAA--AATGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GA--CC-AAGA-TC-G-AAA-GTATATATATAG---------AA-A-TC-GCG--TTTTATTCGTCG-TAGA-T---ACA---A---TCAC--C-----G---AACAAAGGTA-------AA---A--TTTCA-TGAA--A------A-T-----TTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-------T-AAT-ATTAT-T-----GTAAT-A-----AACA----ATG-AGTAAGAGT--TTTATCATTGCCTTAAATATTACACGT--ACAT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CCCAG-C
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 11111 33333333333333333333333333333333 111 111 1111111 3333333333333 1 777777777777777777777777777777777777777777777777 111 4444444444444444444444444 22222 111111111 999999999999999999999999 111111 11 11111111111 22 3333333333333333333333333 1111111111111 3333333333333333333333333333333333333333 111111 11111111 111111111 111 4444444444444444444 22222222 11 111111 333333333 55555555555555555555555555555555555555555 1111111111111111111111111111111111 11 11 11 11 11 22222222222222 111 1111 1111111 33333333333 111 11111 11
lowQualScore : 6 3 3 3 44 3 0 0 3 4 3 3 3 44 3 3 4 4 99999 8 4 6 11111 1 777 5 5 00000000000000000000000000000000 4 444 888 0 9999999 7777777777777 11 00 4 0 999999 2 66 4 4 6666 8 555555555555555555555555555555555555555555555555 3 88 3 66 3 777 3 3 3 99 3 3333333333333333333333333 44 3 3 6 6 3 7777 33333 3 44 3 3 44 44 3 88 3 666 3 55 3 111111111 444444444444444444444444 4 999999 8888 777 0 44 4 3 4 99999999999 33 1 8888888888888888888888888 4 4 55 0000000000000 4 666 8888888888888888888888888888888888888888 999999 3 444444 99 66 3 3 3 00000000 2 000000000 2 333 88 8 5555 111 5555555555555555555 999 11111111 555 22 2 33 44 2 3 1 6 3 44 7 99999 2 3 3 000000 666666666 0 8888 4 22222222222222222222222222222222222222222 66 5 5 7 5 9999999999999999999999999999999999 33 00 5 5 55 0 6 11 66 5 66 777 66 4 66 9999 00 4 4 3 3 3 3 55555555555555 7777 888 8 44 4 0000 4 7777777 4 3 666 888 3 33333333333 3 4 7777 666 3 3 55555 44 44 88 3 3 3 99
lowQualScore : . . . . .. . . . . . . . . .. . . . . ..... . . . ..... . ... . . ................................ . ... ... . ....... ............. .. .. . . ...... . .. . . .... . ................................................ . .. . .. . ... . . . .. . ......................... .. . . . . . .... ..... . .. . . .. .. . .. . ... . .. . ......... ........................ . ...... .... ... . .. . . . ........... .. . ......................... . . .. ............. . ... ........................................ ...... . ...... .. .. . . . ........ . ......... . ... .. . .... ... ................... ... ........ ... .. . .. .. . . . . . .. . ..... . . . ...... ......... . .... . ......................................... .. . . . . .................................. .. .. . . .. . . .. .. . .. ... .. . .. .... .. . . . . . . .............. .... ... . .. . .... . ....... . . ... ... . ........... . . .... ... . . ..... .. .. .. . . . ..
lowQualScore : 7 3 3 3 66 3 4 4 6 3 6 6 6 22 6 6 0 0 66666 0 0 4 11111 0 111 0 0 99999999999999999999999999999999 2 777 555 8 3333333 1111111111111 22 22 0 8 222222 0 55 0 0 1111 0 999999999999999999999999999999999999999999999999 6 66 3 66 3 222 3 3 3 22 3 2222222222222222222222222 66 3 3 7 7 3 1111 66666 3 66 3 3 66 66 3 88 6 444 6 00 6 555555555 666666666666666666666666 0 555555 0000 000 8 00 0 2 0 00000000000 99 9 7777777777777777777777777 0 0 55 9999999999999 0 444 6666666666666666666666666666666666666666 666666 3 222222 22 88 3 3 1 44444444 7 777777777 7 111 77 9 7777 000 5555555555555555555 333 11111111 000 55 9 99 44 9 1 2 2 1 22 3 11111 3 6 6 555555 555555555 5 5555 0 11111111111111111111111111111111111111111 99 0 0 0 0 4444444444444444444444444444444444 66 00 7 0 66 4 5 99 99 0 11 888 11 4 11 4444 66 0 0 6 6 6 6 00000000000000 7777 888 8 77 0 2222 0 2222222 0 6 444 777 6 11111111111 6 6 7777 777 1 1 55555 22 22 55 1 1 1 00
consensus : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-CC-CGGCANNCCCTCGCTTTTGCANGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTCCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAAAAAAATC-------AT--A-AAATTTTNACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAA-CGAT-GTC-AAATTACC-ATGTAA-G--AAGCC-ATACCACCTG----------------TT------A-----------------------CAAT-A--TACT-TT-GCAA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAA-CACA--A-TG----------G-G----C-C-G---AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TAACC--CCCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCC-AAT----TCA-GGA---------T---T-----GATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAATTAATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GCT-GACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TT------GA--CCAA-TA-TC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT---ACA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAANATTA---CACG--A-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA-AA---CTTATTCT-G--CA-A---GTA-T-C--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATC-CAC---A---ACAGT-GATTTT----TGCC-TTGATCC-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
Reference ( family-4914 ) : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-CC-CGNCACTCCCTCGCTTTTGCANGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTCCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAAAAAAATC-------AT--A-AAATTTTNACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAA-CGAT-GTC-AAATTACC-ATGTAA-G--AAGCC-ATACCACCTG----------------TT------A-----------------------CAAT-A--TACT-TT-GCAA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAA-CACA--A-TG----------G-G----C-C-G---AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TAACC--CCCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCC-AAT----TC---GA---------C---T-----GATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAATTAATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GCT-GACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TT------GA--CCAA-TA-TC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT---ACA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAANATTA---CACG--A-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA-AA---CTTATTCT-G--CA-A---GTA-T-C--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATC-CAC---A---ACAGT-GATTTT----TGCC-TTGATCC-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
gi|1 : ATCC--CG-AAAA-TT--GG--T--GTTCA-ACGAATA--TGA-TG-AAAC
gi|1 : gtgacctcgcacaagttctagactctaaacttgtacttTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTT-TTTCTGACAG-GAGATTT-CCTGTTCTTTAT-T-CCGTCATTGTCT-TCG-ACCG--GAGC-GATCAAATAC----AAGT-ATG--TGAAACTTTTTCT-GGTAAA-----CTTTA--TGTTGATTACTCC-CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NN--N-NNNNNNNNNNNTCATAATT-TAATTT-TCTAATCAA-TGATTGTC-AAATTACC-ATGTAAAG--AAGCC-ATAGCACCTG----------------T-------A-----------------------CAATTA--TACT-T--GCAA-TCGGACTAATTTT---CAC-TCT-CCTGAA-CGCA--A-TG----------G-G----CGCAG---AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TTACC--CC-A-CGC--A-T-CTCA--GAAATTTA-GTCG-AAATTCA-CACC---TTTTGAA--ACCAC-GCTCCC-AAT----TCCAGGA---------T---TTCCTTGATTTT-G------TTTTACAACAATCCACAACTCATG--TGT-TATT-AATTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GCTTGACAA--AACAA-ATCTATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------A----------C------GC-TAAA----GA--CCAAATA-TCAG-AAAG--------TTAG---------AA-ATTC-GCGCCTTTTATTCGTTG-AAGATT--ACA---A---CG-C--C-----G---AA-AAAG----------AA---C--GTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTC--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T------TAAATA-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTT-TTTA----------TGAAAATCA---CCCG-------------CCAT-----TCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA--------TATCTT-G--T-----------------GAGTCA--TTAAA--ATCA-TTCCAATA-TGT-ACATG--T--C--T-TAC-AA--GATA---TCATT---AATT-TACAT-AGA-C--AACT----AAGC-GATT-GC-ATT-G-A-A-TATTAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCAA-T-TGATGAAC-CAATGGG-TGA---T---GTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CGT-CACGAATTTACGT-ATC-CACGAAA---ACAGT-GATTTTGTGCTGCCTTTGATCCTACG-AAAATT---GATTT--GCCCATACGAATA-TTGATTGCAAACCAC-ttgttgatgaccgccacccacacgaattcaagatgttcaacgaagtttggtttttctgacaggagatttcctgttctttattccgtcattgtcttcgaccggagcgatcaaatacaagtatgtgaaactttttctggtaaactttatgttgattactcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcataatttaattttctaatcaatgattgtcaaattaccatgtaaagaagccatagcacctgtacaattatacttgcaatcggactaattttcactctcctgaacgcaatgggcgcagagtggtagattttacacctgatcttaccccacgcatctcagaaatttagtcgaaattcacaccttttgaaaccacgctcccaattccaggatttccttgattttgttttacaacaatccacaactcatgtgttattaattaccccgccatgctgaatagtgcttgacaaaacaaatctattccccttgcggtttaaacgctaaagaccaaatatcagaaagttagaaattcgcgccttttattcgttgaagattacaacgccgaaaaagaacgttcatgaaattacatgaaaatttgataagttcaaacttaataaatattatttaaataagcaatgagtaagagtttttatgaaaatcacccgccattcacgtttaactcagcaaaatatcttgtgagtcattaaaatcattccaatatgtacatgtcttacaagatatcattaatttacatagacaactaagcgattgcattgaatattaaatgcaagagacgttccaattgatgaaccaatgggtgatgtttttcacggtgggcctcgtcacgaatttacgtatccacgaaaacagtgattttgtgctgcctttgatcctacgaaaattgatttgcccatacgaatattgattgcaaaccacaatat
gi|10 : gtgacctcgcacaagttctagactctaaacttgtacttgtttcatcatattcgttgaacaccaattttcgggatttgttgatgaccgccacccacacgaattcaagaTGTTCATA-CGA---GTTT--GG-G-TT-CTGATAG-AATATCTTCCTGTACTT-GCGT-CCGTCATTTCCCTACGGACCAT-GCCCCGATCAA-TAC----ATGC-ATAA-TGAAACTTTTT-CCGGTAAA-----CTTaatat
gi|10 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaaTACCGCCTG----------------T-------A-----------------------CGAT-A--TATT-TT-GCAA-TTGGACTAATTTTT-C-AC-TCT-CCTGAA-CACA--A-TG----------G-GGCG-C-C-G---AG--TCGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----CA--C--CCCA-CGT--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCGAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaccgcctgtacgatatattttgcaattggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtcgtagattttacacctgatccaccccacgtatctcaaaattagtcgaaat
gi|11 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaatgttcatacgagtttgggttctgatagaatatcttcctgtacttgcgtccgtcatttccctacggaccatgccccgatcaatacatgcataatgaaactttttccggtaaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACA-TT-GCAA-TCAGACTAATTTTT-CCACTTCTGTCTGAA-----------------------A----C-C-----AG--GGGTAGTA-TTTTCACACCTT-GATCAGAGTTACTGGCCCAGCAC--A-C-CTCAGTGAA--TCC-GTCAAATATTCA-CACCTCTTTT-GAAATACCAT-GATCTT-GTT----TCATGGATCC------T---T-----GATTTT-GCATGAATT--A-AACAA---ACAATT-ATG-GTGTAAGTT-AATTA-----------t
gi|11 : cccatatactgtgtattagaagccatgtcattgcgcatttttaagtagtcccaagcactgtgtaA---------C------AC-TT------GG--TCAA--A-GC-G-AAAG--------T-AG---------AACAC-C-GCGG-TTGTAGT--TCG-AAAATGT-ACA---GTCGC--T--------G---AATAAAGGT--------AA---AATTTTCA--GAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTAAT-AA-GTTT--Aacttcactgaacgcctgcatgcttatgaatacttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcacacttggtcaaagcgaaagtagaacaccgcggttgtagttcgaaaatgtacagtcgctgaataaaggtaaaattttcagaaattacatgaaaatttaataagttta
gi|12 : cccatatactgtgtattagaagccatgtcattgcgcatttttaagtagtcccaagcactgtgtaacattgcaatcagactaatttttccacttctgtctgaaaccaggggtagtattttcacaccttgatcagagttactggcccagcacacctcagtgaatccgtcaaatattcacacctcttttgaaataccatgatcttgtttcatggatccttgattttgcatgaattaaacaaacaattatggtgtaagttaattaacttcactgaacgcctgcatgcttatgaatacttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--G-TG-TT-CTGATAG-AAGATTTTCCTGTTTCT-GC-TCCCGTCATTGTCC-ACG-CGAGT-GAGC-GATCAA--A-----ATGT-ATAA-TGAAACTTTT
gi|12 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacaTC-------ATGAA-AAATTTTTGCTGGGTTATTATAATTT------TCAA-TG-----C-AA----CC-AT-TA--G--AAGCC-ATACTACCTGCATAAGTGTTTTTCAGTTCCAAGCA-----------------------CAAA-AGTTACA-TT-GCAAGTCGGACTAATTTTT---AT-TCT-CCTGAA-CACA--AATG----------G-GGCGCC-C-A---AT--TGGTAG-A-TTTT-ACACCAT-GATC----TA--C--CCCA-CGC--A-C-C-CA--AAA--TTA-GTC-GAAATTCACCACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCC-AAT----TC---gtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcatgaagagaatcggctgttcatgaaaaatttttgctgggttattataattttcaatgcaaccattagaagccatactacctgcataagtgtttttcagttccaagcacaaaagttacattgcaagtcggactaatttttattctcctgaacacaaatggggcgcccaattggtagattttacaccatgatctaccccacgcacccaaaattagtcgaaattcaccacctttgaaaccacgctcccaattcatggatccttgat
gi|13 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacatgttcaacgaagtttgtgttctgatagaagattttcctgtttctgctcccgtcattgtccacgcgagtgagcgatcaaaatgtataatgaaacttttgtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcatgaagagaatcggctgt-AG---------AA-AT-C--CGC-TTTTATTCG----AAGAT---AC--------T--T--C-----GCTGAATAAAGGTTACATGTAAA---A--TTTCA-GGAA--AATTA-CAATGAAAATTTAAT-AA-G-----GAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---ATCAATAACA----ACG-AGAAGAAGTTAT--A-TTATGGC-TTAAATATTA---CATG--ATATCCTGAAATCATCGATCTCATGTTT--A-AGCTCAG-TAAAATAT---CTGATTAT-GT-CA-A---GGA-T-A--TAGAGTCA--TT-AAC-ATTT-TTCCAATA-TGTACCTTGTAGT-T--T-TATAAA--GATA---TCATTTAAAGTTGTACGTAAGA-C--AAC------AA--GATTCGC-ATTGA-A-A-TA-TAAATGTAAGAATATAAAT----GCAAGAGACGT------TC-TGATGGA----------TGA-------TTTTTTC-ACGAGTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGTAATC-CACCG-A---ACAGT-GA-TTT----TGCC-T--ATCC-ACGAAAAA-T---GA--T--GCC---ACGAATA-TTGA-TA-AAACCA--CAGTatggatccttgat
gi|14 : -AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-GCGT-TTGTATTTG--A-AAAATGTTACA---G---T--T--C-----GCTGAATAAAGGTA-------AA---A--TTTCA-TGAA--A--TA-CA-TGAAAGTTGAAT-AA-GTTTAAAAAG-TT-----AATAAAT-G-TATCT-----G--------------A----ATG-AATAATAGTTA---AGTTAT--------AGATTA---CATG--T-AT---G
gi|15 : aataggaagataactctcaccactggaccgaaaagcaaC-ACA-AAAA-----GG--T--GTCAA-ACGAATA-ATGA-TG-AAACCAcaccttaatgtgtcagcgattttgttataaacaatatgtcgataaatgcgatgaaaaaatctacagtatcaatctttaactcctatatcagcgcagc
gi|15 : accataatcatctgaaatagaatgaagaactacatcattggtagatctgaatgaatattTGTTCATC-CAA-A-GTTT--GGTG-CTTCTGATAG-GAGATATTCCTGTTCTT-GC-T-TCGTCACTGTCC-ACG-ATCGTCGAGC-GATCAA-TATAACAATGT-ATAAGTAAAAATTTTTTCTGGAAAA-----CACTAATTGA-GAT-Aatttcattgaagacctcaaccacgaattcaaatgttcatccaaagtttggtgcttctgataggagatattcctgttcttgcttcgtcactgtccacgatcgtcgagcgatcaatataacaatgtataagtaaaaattttttctggaaaacactaattgagatattgtttaatcttcatcaaa
gi|16 : accataatcatctgaaatagaatgaagaactacatcattggtagatctgaatgaatatttggtttcatcattattcgtttgacacctttttgtgatttcattgaagacctcaaccacgaattcaaa---A---------------------GT-GCC-AACTA--AACGA-AT-T--TCACTATTAAGG------A-------A---------------------GATAACTCTCAC------AC-TT------GA--CCAT-AA-AC-G-AAAG--------C-AG---------AA-AC-C-GCAT-TGT-ATTCGAAA-AATGT---ACA---GTCGC--T--------G---AATAAAGAT--------AA---AA-TTTCA-TGAA--A-TTA-CT-TGAAAATTTAAT-AA-ATTT--Attgtttaatcttcatcaaa
gi|17 : aaataaacaacaattaacttcactgaaccctgcatgttctgtatttgttaattaaaagatattagattagtctgggtcaatgttatcagtcggTGTTCA-A-CGA-A-GTTTTCGGTG-TTTCTGATA
gi|17 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaaTACGGT---TTACTAGTAAA---------------------AA---------C------GC-TT------GA--CCAA-TA-TC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT-CGGCG---TTTATTCGTCG-AGGAT---ACA---A------T--CGCT--G---AATAAAGGTTAA-----AA---A--TTTCATTAAA--A-TTA-ctacggtttactagtaaaaacgcttgaccaatatcgaaagtagaaatcggcgtttattcgtcgaggatacaatcgctgaataaaggttaaaaatttcattaaaatta
gi|18 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaatgttcaacgaagttttcggtgtttctgatac--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACTACCCAAG--GATT-GC-ATTGGCATA-TA-TAA--------------AC----ACAAGATACG-TCCCGATT-GGA-GAAC-C-A-ATG-TGA-TAT---TATTTT----------------T-TTTTCACGAATTTACGT-ATC-CACGA-A---ACAGT-GATTTC----TGCC-TT-ATCC-GCG-AAAACT---GA--T--GCCC--ACAAATA-TTGA-TG-AAACCA--CAGTA
gi|19 : -GC-ATTGA-A-A-TT-TAAT-------------AT----G-ATGAGA-GTT--CGATTGTAATGAAG-CAA-ATG--AA-TGTGGGTTTTTTC-ACG-GTGGGGTGCCT-CATCCACGAATCTACGT-AT--CAC---GAACACAGT-GGTTTT----TGC---TGA-CC-ACG-AAAA-TTGAAA--T--GCCC--ACGACTATTTGA-TG-AACCCAC-
gi|2 : ttgTGTTCA-AGCGA-ATGT-----GTGATTCCTGATAG-AAGATTT-CCT-TTCT--GC-T-CCGTCATTGTC--ACG-ACCG----AC-GATCAA-TAGTTA-ATGT-ATAA-TGAAACTT---CCCGGTAA------CT----------AT-A-------GCAGACCCACGCTTT-G-AGGACTTCGC-GCTTGTCCAA-TGCAATCTCCGATT---CACGCCGGGTAA-CGC--TGAAAAAATCGCGCTC-AT--ATAAATCTTTACTG--TTATT-TAATTTTCTA--TCAA-TGAT-GTC-ACATTACC-ATGTAA-A--GAGCA-ATAC-AC-TG------------------------A-----------------------CAAT-A--TACT-TT-CCAA-ATGGAATAATTGTT-C----TCT-C-TGA--CATA--A-TG----------G-G----C-G-C---AGGTTGGTAG-A-TTT--ACAC-----AT-------ACT--CCCA-CAC--AAT-CTCA--AAA--TTAAGTCG--AACTCA-C-CC---TTT-GAA--ACCACTGCTCCC-AATAGATCC---CA---------T---T-----GATTTTTG------TT--A-ACGAA---ACAATTAATGTGTGT-T-----ATTA-----------CCCCAC--ATGCTGAAT---T---------------------GT-GCT-GACAATTAGAGA-AT-TAT--CCC-TTGGCGTATATTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--------G--CCAA-GA-TC-G-AAAG--------T-AGTATATATGAGA-AT-C-GCGT-TTT-ATGCGTCGTAGGAT---ACA---A------T--CACCGAG---AACAAAGGT--------AA---A--TT-CA-TGAA--A------------AATTT-AT-AATGTTT--AAAC-TT-----AATTATTTATTGT-TAGTATGTA---T-----GGTATCGAATGCAGTAAGAGTT--TTA-T-ATTGCCTTAAATTTTAACGTACA--A-AT---GAAATCATCGATCT-ACGTTTTAA-A-CCCAGGCAAAATAA---CTTCTTCT-GTACA-AAATGTAAT-TAATAGAGTCAAATTAAACTATTAATCCCAATAATGTA-C-TGAAGATT--TATACAAACAGATAAACTCATT--AATTTGT---TAAGA-CCAAACT----TAA--GATT-GCCATTAG-A-AATA-TCA--------------ATCTGCACAAGAGACGT--CCGA----GATGAAC-CAG--TG-TGA-TCT---ATTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCACCGTAATTACGT-ATC-CACA--A---ACAGT-GA--TT----TGCC-T---TCC-ACG---AA-T---GA--T--GACC--ACGAATA-TTGA-TG-AAA-CACACAGTAag
gi|20 : ttcacatcattcgttgaacaccaatttaagtgattcggatgaccctcaaccacgaattcaaaAG--------T-TG---------AA-AC-C-GCGT-TGT-ATTCGAAA-AATGT---ACA---GTCGC--T--------G---AAAAAAGGT--------AA---AA-TTTCA-TAAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTAAT-AA-GTTT--AAAC-GT-----AATAAAT-GTCAT-T-----GTA---ATT---AATA----ATA-AGT
gi|21 : -TGA-TTT---TTTTT-C-AAA-CTGGG---C----ATCCACGAATCCAC--------AA---A---ACAGT-GGATTT----TGCC-T-GATCC-ACG-AAAATT---GA--T--ACCC--ACGAATA-TTGA-TG-AAACCA--CAGTAtacatattacgtctattgca
gi|22 : aAATA-TGTA-CATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATA--AAATTGTACGTAAGA-T--AACT----AAG--GATT-GC-TTTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCGAT
gi|23 : CG-GTGGG---C----ATCCATGAATTTAAGT-ATC-CACGA-A---ACAGT-TAATTT----TGTC-T-GATCT-ACG-AAAA-TC--GA--T--GCCCA--CGATTA-TTGA-TG-AAACC-C-CA
gi|24 : -CATC-ACGA-TTTA-GT-ATCACGA---A---ACAGT-GATTTT----TGCC--TGATCC-ACG-AAAA-T---GA--TTCGCCC--ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-
gi|25 : TGTTCA-T-CGA-A-GTTT--GATG-CTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCATCATTGTCC-GCA-AATGT-GAGag
gi|26 : -A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCTGA-T-TGTTGAAC-CAA-
gi|3 : aTGTTCA-A-CGA-A-GGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTT-GA-T-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAA-----CTTNN--NNN-NNN-NN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-------AT--A-AAATTTTAACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAAACGAT--TC-AAATTACC-ATGTAA-G--AAGCCCATACCACCTG----------------TT------A-----------------------CAAT-A--TACT-T--GCAA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGA-CACATTA-TG----------G--------C-G---AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TAACC--CTCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCC---------TT---G--------------------GATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAAT-AATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCACTCATGCTGA-T---A---------------------GT-GCT-GACAA--A--------------CC-TTGCAGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TT------GAACCCAA-TA-TC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT---GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT----CA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TATCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGATTAA-GTTT--AAAC-TT-----AA-AAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AACA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAAAATTA---CATGGAA-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-C-CAG-CAAAA-AAAATCTTATTCTTG--CACAT--GTA-TTC--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATGAG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGT-ATT-C----------CAG--GATTTT----TGCC-TTGATCT-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTAtg
gi|4 : TGTTCA-A-CGA-A-GGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTT-GA-T-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAA-----CTTNN--NNN-NNN-NN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-------AT--A-AAATTTTAACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAAACGAT--TC-AAATTACC-ATGTAA-G--AAGCCCATACCACCTG----------------TT------A-----------------------CAAT-A--TACT-T--GCAA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGA-CACATTA-TG----------G--------C-G---AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TAACC--CTCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCC---------TT---G--------------------GATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAAT-AATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCACTCATGCTGA-T---A---------------------GT-GCT-GACAA--A--------------CC-TTGCAGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TT------GAACCCAA-TA-TC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT---GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT----CA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TATCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGATTAA-GTTT--AAAC-TT-----AA-AAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AACA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAAAATTA---CATGGAA-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-C-CAG-CAAAA-AAAATCTTATTCTTG--CACAT--GTA-TTC--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATGAG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGT-ATT-C----------CAG--GATTTT----TGCC-TTGATCT-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
gi|5 : TTCA-A-C-A-A-GTTT--G-TG-TTTCTGATAG-AATATTTTCCT-TTCTT-GC-T-CCGTCAT-GTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GAT--A-TAC----ATG-----A-TGAA---TTTTCTCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-TC-CGGTACTCCCTCGCTTTTGCATGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTTCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAGAAAAATC-------GC-------TGTTCA-TAA---ATT-TAATTT-TCTAATCAACCGAT-GT--AAATTACCGATGTAA-GAAAAGCC-A-A-CACCTG-----------------T------A-----------------------CGAT-A--TACTATTGGGAA-TCGGACTAATATTT--CAC-TCT-CCTGAACCACA--C-TG----------G-G----CGC-G---A---TGGTAA-ATTTTT-ACACC-TGGATC----TA--C--TCCA-CGC--A-TCCTCA--AA----TA-GTCAAAA---CC-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GTTCCCAAAT----TCACGGATC-------T---T-----GATTTT-GT-----TT--A-AACAA---ACAATTAAT--GTGT-TATTAAATTA-----------CCCCG---ATGCTGAAT---A----------------------T-GCT-GACAA--AAC------TATATCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TCTTGAAAGA--CCAA-TATTC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-GC----------------------------------------C-----G---AATAATGGT--------AAAATA--TTTCA-TGAAATA-TTACCG-TAAGAATTTGAT-AA-GTTT--AAACTTT-----AAT-AAT-ATTAT-T------TAAT-A-----AGCA----ATG-A-T-AGAG---TTTA---ATT------------------------------AAATC-TCGATC-CTCGTTC--AGA-CTCAG-CAAA----------ATTC----------------T-C--TAGA-TCAC-TTAAAA-ATCA-TTCCAATA-TGT-ACATG-AG--TGAT-TACAAA--GAT----TCATA--TAATTGTA-GTAAGATC--AA-T----CAGCTGATT-GC-ATTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCCAGAGATGTT--CGATT---GTAAACGC---ATGTTGA-------TTTTTTCAACG-GTGGC---CTC-CATCCA-GAATTTACGT-ATCATGA---A---ACAGTGGATTTT------CC---GATCC-ACG-AAAT-T---GA--T--GCCC--ACG-ATA-TTGA-TG-AA
gi|6 : gtggtttctatcatttattcgttgcaacaccaatttttctggattcgttgatgaccccaaccacgaatttacaTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTT-CCGGTAAA-----C-TTG--TGT-GAT-AC-CC-Ccaacaa
gi|6 : ATT-T--TTT-CTAA-TCAA-CGAT-GTC-AAATTACC-ATGTAA-G--AAGCC-ATACCACCTG----------------T-------A-----------------------CAAT-A--TACT-TT-GCAA-TCGGACTAATTTTT-C-AC-TCT-CCTGAA-CACA--A-TG----------G-GGCG-T-C-G---AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TA-----CCCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCGAAATTTCA-CACC---TTT-GAA--AACAC-GCTCCC-AAT----TCACGGA---------TCCTT-----GATTTT-GA-----TT--T-AACAA---ACAACTAATG--TGT-TGTT-AATTA-----------CCCCGC--ATGCTGAAT---A---------------------GT-GCT-GACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------A----------C------G---T------GA--CCAA-TA-TT-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-GCGT-TTT-ATTTGTCG-AAGAT---ACA---A---T--CGAC-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAA-AA-GTTT--AAAC-TT-----GATAAAT-ATTAT-T-----TTATATA-----AGCA----ATG-TTTAAGAGT--TTTA-TT---------------------------------AAATCATCGATCTCACG-TT--A-A-CTCAG-CAAAA-A------------------------TA-T-CT-TAGAGTCA--TTAAAA-ATTA-TTCCAATA-TGT-ACATGAAG--T--A-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCGA-T-TGATGAAC-C-A-ATG-TGATTTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaattttttctaatcaacgatgtcaaattaccatgtaagaagccataccacctgtacaatatactttgcaatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgtcgagtggtagattttacacctgatctacccacgcatctcaaaattagtcgaaatttcacacctttgaaaacacgctcccaattcacggatccttgattttgatttaacaaacaactaatgtgttgttaattaccccgcatgctgaatagtgctgacaaaacgaattattccccttgcggtttaaacgtgaccaatattgaaagtagaaatcgcgttttatttgtcgaagatacaatcgacgaataaaggtaaatttcatgaaattacatgaaaatttgaaaagtttaaacttgataaatattattttatataagcaatgtttaagagttttattaaatcatcgatctcacgttaactcagcaaaaatatcttagagtcattaaaaattattccaatatgtacatgaagtatacaaagatatcattaaattgtacgtaagacaactaaggattgcattgaaatataaatgcaagagacgttccgattgatgaaccaatgtgattttttttttcacggtggg
gi|7 : tgttcaacgaagtttggtgtttctgatagaagattttcctgttcttgctccgtcattgtccacgaccgtgagcgatcaatacatgtataatgaaactttttccggtaaacttgtgtgatacccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaTGTTCA-A-CGGGA-GTTT--GGTG-CTTCTGATAGCAAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-C-GCTATTGTC--ACG-ACCGT-GAGC-GATAAA-TA-----------------ACACTTTTTCCTGGTAAATTAAACCTTG--TGT-GAT-AT-CCACG------CCTCGC--------------GCTTTTTTTTCAA--TGCATCCCCGATC--TCACGCGGGGTA---GC--TAAAAAAATCGCTGTTCAT--A-AAATTTTC-CTGGGTTATT-AATTTT-CTACATCA--CGAT-GTCCAAA--------GTAA--------------CATC-G----------------T-------A-----------------------CAAT-AA-TACT-TT-GCAA-TCG---TGACTTTT-TCAC-TCT-C-TGAA-CACA--A-TGCTGAAATGGGGCG----C-C-GGC-AG--TGGTAG-A-TTTT-ACACC-T-CATC----TAA----CACA-CGCTTC-T-CTCA--CAA--TTA-GTC-GCAATTCA-CA-C---TTT-GAA--AACAC-GTTCCA-ATT----TT---GAAACGGATCCT---T-----GATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAACTAAT--GTGT-T---------------------------CATGCTGAATTCAG---------------------GTGGCT-GACAA--AA-GACAT-TATTTCCC-TTGC-GT---TT--------A---------------------AA---------C------GCTTT------GA---CAA-TA-TC-GAAAAG--------T-AG----------A-AT-T-GCG--TTTTATTCGTCG-AAGAT---ACA---A---TCGC--C-----G---AAT
gi|8 : aATTGGGTTACT-T----T-CTAA-TCAG-TGAT-GTC-AAATTACC-ATGTAG-G--AAGCC-ATACCACCTG----------------CT------AAAGGTTTTTTTCAGTCTCAAGCACAAT-A--TACT-TT-GCAA-GCAGACTAACTTT--CCAT-ATT-CCTGAA-CATA--A-TG----------G-GTCA-C-C-A---GG--TGGTAG-A-TTTTCACACC-T-GATC----TA--C--CCTG-CAC--A-T-GTCA--AAA--TTT-GT-GGAAATTCA--ACC---TTT-GAA--ACCCC-GCTCCT-GTT----TCATGGA---------TCCTT-----GATTTT-G------TT-------------TAATTAATG--TGT-TGTT-AATTAACTTAACTCTACCCTGC--ATGCTGAAT---ACTTGATCAATTCAGAGTGGCAGT-GCT-GACAA--AACGA-AT-TATTTCCC-TTGTGAT---TTA-------AAGCTACAGTATTAGGGAAGATAA---------CTCTCATGC-TC------GA--CCAG-AA-TT-T-AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-TCAT-TGT-ATTAGAAA-GAGAT---ACAGTCA---C--T--------G---AATAAAGTT--------AA---AA-TTTCA-AGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTCAAT-AA-GTTT--AAATGTTTTAGAAATAAAT-GTTAT-T-----G
gi|9 : tGGGTTATT-TAATTT-TCTAATCAA-TGAT-GTC-ACATTACC-ATGTAA-G--AAGCA-ATACCACCTG----------------T-------A-----------------------CAAT-A--TACT-TT-GCAA-TCGGACTAATTGTT-C-AC-TCT-CCTGGA-CATA--A-TG----------G-G----G-C-GCAGAG--TGGTAG-A-TTTT-ACACA-T-GATC----TA--C--CCCA-CAC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCG-AAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCC-AAT----TCACAGA---------TCCTT-----GATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAATTAATG--TGT-TGTT-AATTA-----------CCCCAC--ATGCTGAAT---T---------------------GT-GCT-GACAA--AATGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TT------GA--CCAA-GA-TC-G-AAAGTATATATAT-AG---------AA-AT-C-GCG--TTTTATTCGTCG-TAGAT---ACA---A---TCAC--C-----G---AACAAAGGTA-------AA---A--TTTCA-TGAA--A------A-T-----TTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-------T-AAT-ATTAT-T-----GTAAT-A-----AACA----ATG-AGTAAGAGT--TTTA-TCATTGCCTTAAATATTA---CACGT-ACAT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CCCAG-C
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 11111 111111111111 2222222222222 111 111 1111111 3333333333333 111 777777777777777777777777777777777777777777777777 111 44444444444444444444444444 1 22222 66666666666666666666666666 111111 1111 11 11111111111 222 3333333333333333333333333 1111111111111 3333333333333333333333333333333333333333 111111 11111111 111111111 111 4444444444444444444 22222222 11 111111 333333333 55555555555555555555555555555555555555555 1111111111111111111111111111111111 11 11 11 11 11 22222222222222 111 1111 1111111 33333333333 111 11111 11
lowQualScore : 6 3 3 3 44 3 0 0 3 4 3 3 3 44 3 3 4 4 99999 8 4 6 11111 1 777 5 5 888888888888 0 9999999999999 4 444 888 0 9999999 7777777777777 11 00 4 0 999999 000 66 4 4 4 55 8 0 555555555555555555555555555555555555555555555555 3 88 3 3 3 3 777 3 3 3 99 3 33333333333333333333333333 44 3 0 6 3 7777 33333 3 44 3 3 44 44 3 88 3 666 3 55 3 666 55555555555555555555555555 4 555555 2222 777 0 44 4 3 4 99999999999 222 1 8888888888888888888888888 4 4 55 0000000000000 4 666 8888888888888888888888888888888888888888 999999 3 444444 99 66 3 3 3 00000000 2 000000000 2 333 88 8 5555 111 5555555555555555555 999 11111111 555 22 2 33 44 2 3 1 6 3 44 7 99999 2 3 3 000000 666666666 0 8888 4 22222222222222222222222222222222222222222 66 5 5 7 5 9999999999999999999999999999999999 33 00 5 5 55 0 6 11 66 5 66 777 66 4 66 9999 00 4 4 3 3 3 3 55555555555555 7777 888 8 44 4 0000 4 7777777 4 3 666 888 3 33333333333 3 4 7777 666 3 3 55555 44 44 88 3 3 3 99
lowQualScore : . . . . .. . . . . . . . . .. . . . . ..... . . . ..... . ... . . ............ . ............. . ... ... . ....... ............. .. .. . . ...... ... .. . . . .. . . ................................................ . .. . . . . ... . . . .. . .......................... .. . . . . .... ..... . .. . . .. .. . .. . ... . .. . ... .......................... . ...... .... ... . .. . . . ........... ... . ......................... . . .. ............. . ... ........................................ ...... . ...... .. .. . . . ........ . ......... . ... .. . .... ... ................... ... ........ ... .. . .. .. . . . . . .. . ..... . . . ...... ......... . .... . ......................................... .. . . . . .................................. .. .. . . .. . . .. .. . .. ... .. . .. .... .. . . . . . . .............. .... ... . .. . .... . ....... . . ... ... . ........... . . .... ... . . ..... .. .. .. . . . ..
lowQualScore : 7 3 3 3 66 3 4 4 6 3 6 6 6 22 6 6 0 0 66666 0 0 4 11111 0 111 0 0 999999999999 3 3333333333333 2 777 555 8 3333333 1111111111111 22 22 0 8 222222 000 55 0 0 0 55 0 5 999999999999999999999999999999999999999999999999 6 66 3 2 3 3 222 3 3 3 22 3 22222222222222222222222222 66 3 0 7 3 1111 66666 3 66 3 3 66 66 3 88 6 444 6 00 6 444 99999999999999999999999999 0 555555 0000 000 8 00 0 2 0 00000000000 222 9 7777777777777777777777777 0 0 55 9999999999999 0 444 6666666666666666666666666666666666666666 666666 3 222222 22 88 3 3 1 44444444 7 777777777 7 111 77 9 7777 000 5555555555555555555 333 11111111 000 55 9 99 44 9 1 2 2 1 22 3 11111 3 6 6 555555 555555555 5 5555 0 11111111111111111111111111111111111111111 99 0 0 0 0 4444444444444444444444444444444444 66 00 7 0 66 4 5 99 99 0 11 888 11 4 11 4444 66 0 0 6 6 6 6 00000000000000 7777 888 8 77 0 2222 0 2222222 0 6 444 777 6 11111111111 6 6 7777 777 1 1 55555 22 22 55 1 1 1 00
consensus : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-CC-CGGCANNCCCTCGCTTTTGCANGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTCCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAAAAAAATC-------AT--A-AAATTTTNACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAA-C-GAT-GTC-AAATTACC-ATGTAA-GAA--GCC-ATACCACCTG----------------TT------A-----------------------CAAT-A--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------G---G----C-C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CCCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC--AC--GG----A-CCT---T-----GATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAATTAATG-GTGT-TGTTAA-TTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GCT-GACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TT------GA--CCAA-TA-TC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT---ACA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAANATTA---CACG--A-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA-AA---CTTATTCT-G--CA-A---GTA-T-C--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATC-CAC---A---ACAGT-GATTTT----TGCC-TTGATCC-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
Reference ( family-4914 ) : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-CC-CGGCANNCCCTCGCTTTTGCANGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTCCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAAAAAAATC-------AT--A-AAATTTTNACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAA-C-GAT-GTC-AAATTACC-ATGTAA-GAA--GCC-ATACCACCTG----------------TT------A-----------------------CAAT-A--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------G---G----C-C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CCCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC--A---GG----A---T---T-----GATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAATTAATG-GTGT-TGTTAA-TTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GCT-GACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TT------GA--CCAA-TA-TC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT---ACA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAANATTA---CACG--A-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA-AA---CTTATTCT-G--CA-A---GTA-T-C--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATC-CAC---A---ACAGT-GATTTT----TGCC-TTGATCC-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
gi|1 : ATCC--CG-AAAA-TT--GG--T--GTTCA-ACGAATA--TGA-TG-AAAC
gi|1 : gtgacctcgcacaagttctagactctaaacttgtacttTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTT-TTTCTGACAG-GAGATTT-CCTGTTCTTTAT-T-CCGTCATTGTCT-TCG-ACCG--GAGC-GATCAAATAC----AAGT-ATG--TGAAACTTTTTCT-GGTAAA-----CTTTA--TGTTGATTACTCC-CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NN--N-NNNNNNNNNNNTCATAATT-TAATTT-TCTAATCAA-T-GATTGTC-AAATTACC-ATGTAAAGAA--GCC-ATAGCACCTG----------------T-------A-----------------------CAATTA--TACT-T-GC-AA-TCGGACTAATTTT---CAC-TCT-CCTGAAC-GCA--A-TG----------G---G----CGCAG--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TTACC--CC-A-CGC--A-TC-TCA--GAAATTTA-GTCG-AAATTCA-CACC---TTTTGAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTCC-A---GG----A---T---TTCCTTGATTTT-G------TTTTACAACAATCCACAACTCATG--TGT-TATTAA-TTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GCTTGACAA--AACAA-ATCTATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------A----------C------GC-TAAA----GA--CCAAATA-TCAG-AAAG--------TTAG---------AA-ATTC-GCGCCTTTTATTCGTTG-AAGATT--ACA---A---CG-C--C-----G---AA-AAAG----------AA---C--GTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTC--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T------TAAATA-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTT-TTTA----------TGAAAATCA---CCCG-------------CCAT-----TCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA--------TATCTT-G--T-----------------GAGTCA--TTAAA--ATCA-TTCCAATA-TGT-ACATG--T--C--T-TAC-AA--GATA---TCATT---AATT-TACAT-AGA-C--AACT----AAGC-GATT-GC-ATT-G-A-A-TATTAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCAA-T-TGATGAAC-CAATGGG-TGA---T---GTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CGT-CACGAATTTACGT-ATC-CACGAAA---ACAGT-GATTTTGTGCTGCCTTTGATCCTACG-AAAATT---GATTT--GCCCATACGAATA-TTGATTGCAAACCAC-ttgttgatgaccgccacccacacgaattcaagatgttcaacgaagtttggtttttctgacaggagatttcctgttctttattccgtcattgtcttcgaccggagcgatcaaatacaagtatgtgaaactttttctggtaaactttatgttgattactcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcataatttaattttctaatcaatgattgtcaaattaccatgtaaagaagccatagcacctgtacaattatacttgcaatcggactaattttcactctcctgaacgcaatgggcgcagagtggtagattttacacctgatcttaccccacgcatctcagaaatttagtcgaaattcacaccttttgaaaccacgctcccaattccaggatttccttgattttgttttacaacaatccacaactcatgtgttattaattaccccgccatgctgaatagtgcttgacaaaacaaatctattccccttgcggtttaaacgctaaagaccaaatatcagaaagttagaaattcgcgccttttattcgttgaagattacaacgccgaaaaagaacgttcatgaaattacatgaaaatttgataagttcaaacttaataaatattatttaaataagcaatgagtaagagtttttatgaaaatcacccgccattcacgtttaactcagcaaaatatcttgtgagtcattaaaatcattccaatatgtacatgtcttacaagatatcattaatttacatagacaactaagcgattgcattgaatattaaatgcaagagacgttccaattgatgaaccaatgggtgatgtttttcacggtgggcctcgtcacgaatttacgtatccacgaaaacagtgattttgtgctgcctttgatcctacgaaaattgatttgcccatacgaatattgattgcaaaccacaatat
gi|10 : gtgacctcgcacaagttctagactctaaacttgtacttgtttcatcatattcgttgaacaccaattttcgggatttgttgatgaccgccacccacacgaattcaagaTGTTCATA-CGA---GTTT--GG-G-TT-CTGATAG-AATATCTTCCTGTACTT-GCGT-CCGTCATTTCCCTACGGACCAT-GCCCCGATCAA-TAC----ATGC-ATAA-TGAAACTTTTT-CCGGTAAA-----CTTaatat
gi|10 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaaTACCGCCTG----------------T-------A-----------------------CGAT-A--TATT-TTGC-AA-TTGGACTAATTTTT-C-AC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------G---GGCG-C-C-G--AG--TCGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----CA--C--CCCA-CGT--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaccgcctgtacgatatattttgcaattggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtcgtagattttacacctgatccaccccacgtatctcaaaattagtcgaaat
gi|11 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaatgttcatacgagtttgggttctgatagaatatcttcctgtacttgcgtccgtcatttccctacggaccatgccccgatcaatacatgcataatgaaactttttccggtaaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACA-TTGC-AA-TCAGACTAATTTTT-CCACTTCTGTCTGAA-------------------------A----C-C----AG--GGGTAGTATTTTCACACCTTG-ATCAGAGTTACTGGCCCAGCAC--A-CC-TCAGTGAA--TCC-GTCAAATATTCA-CACCTCTTTT-GAAATACCAT-GATCTTGT-TTC--AT--GG----ATCCT---T-----GATTTT-GCATGAATT--A-AACAA---ACAATT-ATG-GTGTAAGTTAA-TTA-----------t
gi|11 : cccatatactgtgtattagaagccatgtcattgcgcatttttaagtagtcccaagcactgtgtaA---------C------AC-TT------GG--TCAA--A-GC-G-AAAG--------T-AG---------AACAC-C-GCGG-TTGTAGT--TCG-AAAATGT-ACA---GTCGC--T--------G---AATAAAGGT--------AA---AATTTTCA--GAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTAAT-AA-GTTT--Aacttcactgaacgcctgcatgcttatgaatacttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcacacttggtcaaagcgaaagtagaacaccgcggttgtagttcgaaaatgtacagtcgctgaataaaggtaaaattttcagaaattacatgaaaatttaataagttta
gi|12 : cccatatactgtgtattagaagccatgtcattgcgcatttttaagtagtcccaagcactgtgtaacattgcaatcagactaatttttccacttctgtctgaaaccaggggtagtattttcacaccttgatcagagttactggcccagcacacctcagtgaatccgtcaaatattcacacctcttttgaaataccatgatcttgtttcatggatccttgattttgcatgaattaaacaaacaattatggtgtaagttaattaacttcactgaacgcctgcatgcttatgaatacttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--G-TG-TT-CTGATAG-AAGATTTTCCTGTTTCT-GC-TCCCGTCATTGTCC-ACG-CGAGT-GAGC-GATCAA--A-----ATGT-ATAA-TGAAACTTTT
gi|12 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacaTC-------ATGAA-AAATTTTTGCTGGGTTATTATAATTT------TCAA-T-G-----C-AA----CC-AT-TA--GAA--GCC-ATACTACCTGCATAAGTGTTTTTCAGTTCCAAGCA-----------------------CAAA-AGTTACA-TTGC-AAGTCGGACTAATTTTT---AT-TCT-CCTGAAC-ACA--AATG----------G---GGCGCC-C-A--AT--TGGTAG-ATTTT-ACACCATG-ATC----TA--C--CCCA-CGC--A-CC--CA--AAA--TTA-GTC-GAAATTCACCACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC--AT--GG----ATCCT---T-----GATgtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcatgaagagaatcggctgttcatgaaaaatttttgctgggttattataattttcaatgcaaccattagaagccatactacctgcataagtgtttttcagttccaagcacaaaagttacattgcaagtcggactaatttttattctcctgaacacaaatggggcgcccaattggtagattttacaccatgatctaccccacgcacccaaaattagtcgaaattcaccacctttgaaaccacgctcccaattcatggatccttgat
gi|13 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacatgttcaacgaagtttgtgttctgatagaagattttcctgtttctgctcccgtcattgtccacgcgagtgagcgatcaaaatgtataatgaaacttttgtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcatgaagagaatcggctgt-AG---------AA-AT-C--CGC-TTTTATTCG----AAGAT---AC--------T--T--C-----GCTGAATAAAGGTTACATGTAAA---A--TTTCA-GGAA--AATTA-CAATGAAAATTTAAT-AA-G-----GAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---ATCAATAACA----ACG-AGAAGAAGTTAT--A-TTATGGC-TTAAATATTA---CATG--ATATCCTGAAATCATCGATCTCATGTTT--A-AGCTCAG-TAAAATAT---CTGATTAT-GT-CA-A---GGA-T-A--TAGAGTCA--TT-AAC-ATTT-TTCCAATA-TGTACCTTGTAGT-T--T-TATAAA--GATA---TCATTTAAAGTTGTACGTAAGA-C--AAC------AA--GATTCGC-ATTGA-A-A-TA-TAAATGTAAGAATATAAAT----GCAAGAGACGT------TC-TGATGGA----------TGA-------TTTTTTC-ACGAGTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGTAATC-CACCG-A---ACAGT-GA-TTT----TGCC-T--ATCC-ACGAAAAA-T---GA--T--GCC---ACGAATA-TTGA-TA-AAACCA--CAGT
gi|14 : -AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-GCGT-TTGTATTTG--A-AAAATGTTACA---G---T--T--C-----GCTGAATAAAGGTA-------AA---A--TTTCA-TGAA--A--TA-CA-TGAAAGTTGAAT-AA-GTTTAAAAAG-TT-----AATAAAT-G-TATCT-----G--------------A----ATG-AATAATAGTTA---AGTTAT--------AGATTA---CATG--T-AT---G
gi|15 : aataggaagataactctcaccactggaccgaaaagcaaC-ACA-AAAA-----GG--T--GTCAA-ACGAATA-ATGA-TG-AAACCAcaccttaatgtgtcagcgattttgttataaacaatatgtcgataaatgcgatgaaaaaatctacagtatcaatctttaactcctatatcagcgcagc
gi|15 : accataatcatctgaaatagaatgaagaactacatcattggtagatctgaatgaatattTGTTCATC-CAA-A-GTTT--GGTG-CTTCTGATAG-GAGATATTCCTGTTCTT-GC-T-TCGTCACTGTCC-ACG-ATCGTCGAGC-GATCAA-TATAACAATGT-ATAAGTAAAAATTTTTTCTGGAAAA-----CACTAATTGA-GAT-Aatttcattgaagacctcaaccacgaattcaaatgttcatccaaagtttggtgcttctgataggagatattcctgttcttgcttcgtcactgtccacgatcgtcgagcgatcaatataacaatgtataagtaaaaattttttctggaaaacactaattgagatattgtttaatcttcatcaaa
gi|16 : accataatcatctgaaatagaatgaagaactacatcattggtagatctgaatgaatatttggtttcatcattattcgtttgacacctttttgtgatttcattgaagacctcaaccacgaattcaaa---A---------------------GT-GCC-AACTA--AACGA-AT-T--TCACTATTAAGG------A-------A---------------------GATAACTCTCAC------AC-TT------GA--CCAT-AA-AC-G-AAAG--------C-AG---------AA-AC-C-GCAT-TGT-ATTCGAAA-AATGT---ACA---GTCGC--T--------G---AATAAAGAT--------AA---AA-TTTCA-TGAA--A-TTA-CT-TGAAAATTTAAT-AA-ATTT--Attgtttaatcttcatcaaa
gi|17 : aaataaacaacaattaacttcactgaaccctgcatgttctgtatttgttaattaaaagatattagattagtctgggtcaatgttatcagtcggTGTTCA-A-CGA-A-GTTTTCGGTG-TTTCTGATA
gi|17 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaaTACGGT---TTACTAGTAAA---------------------AA---------C------GC-TT------GA--CCAA-TA-TC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT-CGGCG---TTTATTCGTCG-AGGAT---ACA---A------T--CGCT--G---AATAAAGGTTAA-----AA---A--TTTCATTAAA--A-TTA-ctacggtttactagtaaaaacgcttgaccaatatcgaaagtagaaatcggcgtttattcgtcgaggatacaatcgctgaataaaggttaaaaatttcattaaaatta
gi|18 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaatgttcaacgaagttttcggtgtttctgatac--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACTACCCAAG--GATT-GC-ATTGGCATA-TA-TAA--------------AC----ACAAGATACG-TCCCGATT-GGA-GAAC-C-A-ATG-TGA-TAT---TATTTT----------------T-TTTTCACGAATTTACGT-ATC-CACGA-A---ACAGT-GATTTC----TGCC-TT-ATCC-GCG-AAAACT---GA--T--GCCC--ACAAATA-TTGA-TG-AAACCA--CAGTA
gi|19 : -GC-ATTGA-A-A-TT-TAAT-------------AT----G-ATGAGA-GTT--CGATTGTAATGAAG-CAA-ATG--AA-TGTGGGTTTTTTC-ACG-GTGGGGTGCCT-CATCCACGAATCTACGT-AT--CAC---GAACACAGT-GGTTTT----TGC---TGA-CC-ACG-AAAA-TTGAAA--T--GCCC--ACGACTATTTGA-TG-AACCCAC-
gi|2 : ttgTGTTCA-AGCGA-ATGT-----GTGATTCCTGATAG-AAGATTT-CCT-TTCT--GC-T-CCGTCATTGTC--ACG-ACCG----AC-GATCAA-TAGTTA-ATGT-ATAA-TGAAACTT---CCCGGTAA------CT----------AT-A-------GCAGACCCACGCTTT-G-AGGACTTCGC-GCTTGTCCAA-TGCAATCTCCGATT---CACGCCGGGTAA-CGC--TGAAAAAATCGCGCTC-AT--ATAAATCTTTACTG--TTATT-TAATTTTCTA--TCAA-T-GAT-GTC-ACATTACC-ATGTAA-AGA--GCA-ATAC-AC-TG------------------------A-----------------------CAAT-A--TACT-TTCC-AA-ATGGAATAATTGTT-C----TCT-C-TGA-C-ATA--A-TG----------G---G----C-G-C--AGGTTGGTAG-ATTT--ACAC-----AT-------ACT--CCCA-CAC--AATC-TCA--AAA--TTAAGTCG--AACTCA-C-CC---TTT-GAA--ACCACTGCTCCCAA-T----A---GATCCCA---T---T-----GATTTTTG------TT--A-ACGAA---ACAATTAATGTGTGT-T----A-TTA-----------CCCCAC--ATGCTGAAT---T---------------------GT-GCT-GACAATTAGAGA-AT-TAT--CCC-TTGGCGTATATTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--------G--CCAA-GA-TC-G-AAAG--------T-AGTATATATGAGA-AT-C-GCGT-TTT-ATGCGTCGTAGGAT---ACA---A------T--CACCGAG---AACAAAGGT--------AA---A--TT-CA-TGAA--A------------AATTT-AT-AATGTTT--AAAC-TT-----AATTATTTATTGT-TAGTATGTA---T-----GGTATCGAATGCAGTAAGAGTT--TTA-T-ATTGCCTTAAATTTTAACGTACA--A-AT---GAAATCATCGATCT-ACGTTTTAA-A-CCCAGGCAAAATAA---CTTCTTCT-GTACA-AAATGTAAT-TAATAGAGTCAAATTAAACTATTAATCCCAATAATGTA-C-TGAAGATT--TATACAAACAGATAAACTCATT--AATTTGT---TAAGA-CCAAACT----TAA--GATT-GCCATTAG-A-AATA-TCA--------------ATCTGCACAAGAGACGT--CCGA----GATGAAC-CAG--TG-TGA-TCT---ATTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCACCGTAATTACGT-ATC-CACA--A---ACAGT-GA--TT----TGCC-T---TCC-ACG---AA-T---GA--T--GACC--ACGAATA-TTGA-TG-AAA-CACACAGTAag
gi|20 : ttcacatcattcgttgaacaccaatttaagtgattcggatgaccctcaaccacgaattcaaaAG--------T-TG---------AA-AC-C-GCGT-TGT-ATTCGAAA-AATGT---ACA---GTCGC--T--------G---AAAAAAGGT--------AA---AA-TTTCA-TAAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTAAT-AA-GTTT--AAAC-GT-----AATAAAT-GTCAT-T-----GTA---ATT---AATA----ATA-AGT
gi|21 : -TGA-TTT---TTTTT-C-AAA-CTGGG---C----ATCCACGAATCCAC--------AA---A---ACAGT-GGATTT----TGCC-T-GATCC-ACG-AAAATT---GA--T--ACCC--ACGAATA-TTGA-TG-AAACCA--CAGTAtacatattacgtctattgca
gi|22 : aAATA-TGTA-CATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATA--AAATTGTACGTAAGA-T--AACT----AAG--GATT-GC-TTTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCGAT
gi|23 : CG-GTGGG---C----ATCCATGAATTTAAGT-ATC-CACGA-A---ACAGT-TAATTT----TGTC-T-GATCT-ACG-AAAA-TC--GA--T--GCCCA--CGATTA-TTGA-TG-AAACC-C-CA
gi|24 : -CATC-ACGA-TTTA-GT-ATCACGA---A---ACAGT-GATTTT----TGCC--TGATCC-ACG-AAAA-T---GA--TTCGCCC--ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-
gi|25 : TGTTCA-T-CGA-A-GTTT--GATG-CTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCATCATTGTCC-GCA-AATGT-GAGag
gi|26 : -A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCTGA-T-TGTTGAAC-CAA-
gi|3 : aTGTTCA-A-CGA-A-GGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTT-GA-T-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAA-----CTTNN--NNN-NNN-NN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-------AT--A-AAATTTTAACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAAAC-GAT--TC-AAATTACC-ATGTAA-GAA--GCCCATACCACCTG----------------TT------A-----------------------CAAT-A--TACT-T-GC-AA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGAC-ACATTA-TG----------G----------C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CTCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCT----------------------T---G-----GATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAAT-AATG-GTGT-TGTTAA-TTA-----------CCCCACTCATGCTGA-T---A---------------------GT-GCT-GACAA--A--------------CC-TTGCAGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TT------GAACCCAA-TA-TC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT---GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT----CA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TATCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGATTAA-GTTT--AAAC-TT-----AA-AAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AACA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAAAATTA---CATGGAA-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-C-CAG-CAAAA-AAAATCTTATTCTTG--CACAT--GTA-TTC--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATGAG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGT-ATT-C----------CAG--GATTTT----TGCC-TTGATCT-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTAtg
gi|4 : TGTTCA-A-CGA-A-GGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTT-GA-T-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAA-----CTTNN--NNN-NNN-NN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-------AT--A-AAATTTTAACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAAAC-GAT--TC-AAATTACC-ATGTAA-GAA--GCCCATACCACCTG----------------TT------A-----------------------CAAT-A--TACT-T-GC-AA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGAC-ACATTA-TG----------G----------C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CTCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCT----------------------T---G-----GATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAAT-AATG-GTGT-TGTTAA-TTA-----------CCCCACTCATGCTGA-T---A---------------------GT-GCT-GACAA--A--------------CC-TTGCAGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TT------GAACCCAA-TA-TC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT---GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT----CA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TATCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGATTAA-GTTT--AAAC-TT-----AA-AAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AACA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAAAATTA---CATGGAA-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-C-CAG-CAAAA-AAAATCTTATTCTTG--CACAT--GTA-TTC--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATGAG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGT-ATT-C----------CAG--GATTTT----TGCC-TTGATCT-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
gi|5 : TTCA-A-C-A-A-GTTT--G-TG-TTTCTGATAG-AATATTTTCCT-TTCTT-GC-T-CCGTCAT-GTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GAT--A-TAC----ATG-----A-TGAA---TTTTCTCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-TC-CGGTACTCCCTCGCTTTTGCATGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTTCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAGAAAAATC-------GC-------TGTTCA-TAA---ATT-TAATTT-TCTAATCAA-CCGAT-GT--AAATTACCGATGTAA-GAAAAGCC-A-AC-ACCTG----------------T-------A-----------------------CGAT-A--TACTATTGGGAA-TCGGACTAATATTT-C-AC-TCT-CCTGAACCACA--C-TG----------G---G----CGC-G--A---TGGTAA-ATTTTTACACC-TGGATC----TA--C--TCCA-CGC--A-TCCTCA--AA----TA-GTCAAAA---CC-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GTTCCCAAATTC--AC--GG----A---TCT-T-----GATTTT-G------TTT-A-AACAA---ACAATTAATG--TGT-TATTAAATTA-----------CCCCG---ATGCTGAAT---A----------------------T-GCT-GACAA--AAC------TATATCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TCTTGAAAGA--CCAA-TATTC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-GC----------------------------------------C-----G---AATAATGGT--------AAAATA--TTTCA-TGAAATA-TTACCG-TAAGAATTTGAT-AA-GTTT--AAACTTT-----AAT-AAT-ATTAT-T------TAAT-A-----AGCA----ATG-A-T-AGAG---TTTA---ATT------------------------------AAATC-TCGATC-CTCGTTC--AGA-CTCAG-CAAA----------ATTC----------------T-C--TAGA-TCAC-TTAAAA-ATCA-TTCCAATA-TGT-ACATG-AG--TGAT-TACAAA--GAT----TCATA--TAATTGTA-GTAAGATC--AA-T----CAGCTGATT-GC-ATTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCCAGAGATGTT--CGATT---GTAAACGC---ATGTTGA-------TTTTTTCAACG-GTGGC---CTC-CATCCA-GAATTTACGT-ATCATGA---A---ACAGTGGATTTT------CC---GATCC-ACG-AAAT-T---GA--T--GCCC--ACG-ATA-TTGA-TG-AA
gi|6 : gtggtttctatcatttattcgttgcaacaccaatttttctggattcgttgatgaccccaaccacgaatttacaTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTT-CCGGTAAA-----C-TTG--TGT-GAT-AC-CC-Ccaacaa
gi|6 : ATT-T--TTT-CTAA-TCAA-C-GAT-GTC-AAATTACC-ATGTAA-GAA--GCC-ATACCACCTG----------------T-------A-----------------------CAAT-A--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTTTT-C-AC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------G---GGCG-T-C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TA-----CCCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGAAATTTCA-CACC---TTT-GAA--AACAC-GCTCCCAA-TTC--AC--GG----A---TCCTT-----GATTTT-GA-----TT--T-AACAA---ACAACTAATG--TGT-TGTTAA-TTA-----------CCCCGC--ATGCTGAAT---A---------------------GT-GCT-GACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------A----------C------G---T------GA--CCAA-TA-TT-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-GCGT-TTT-ATTTGTCG-AAGAT---ACA---A---T--CGAC-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAA-AA-GTTT--AAAC-TT-----GATAAAT-ATTAT-T-----TTATATA-----AGCA----ATG-TTTAAGAGT--TTTA-TT---------------------------------AAATCATCGATCTCACG-TT--A-A-CTCAG-CAAAA-A------------------------TA-T-CT-TAGAGTCA--TTAAAA-ATTA-TTCCAATA-TGT-ACATGAAG--T--A-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCGA-T-TGATGAAC-C-A-ATG-TGATTTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaattttttctaatcaacgatgtcaaattaccatgtaagaagccataccacctgtacaatatactttgcaatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgtcgagtggtagattttacacctgatctacccacgcatctcaaaattagtcgaaatttcacacctttgaaaacacgctcccaattcacggatccttgattttgatttaacaaacaactaatgtgttgttaattaccccgcatgctgaatagtgctgacaaaacgaattattccccttgcggtttaaacgtgaccaatattgaaagtagaaatcgcgttttatttgtcgaagatacaatcgacgaataaaggtaaatttcatgaaattacatgaaaatttgaaaagtttaaacttgataaatattattttatataagcaatgtttaagagttttattaaatcatcgatctcacgttaactcagcaaaaatatcttagagtcattaaaaattattccaatatgtacatgaagtatacaaagatatcattaaattgtacgtaagacaactaaggattgcattgaaatataaatgcaagagacgttccgattgatgaaccaatgtgattttttttttcacggtggg
gi|7 : tgttcaacgaagtttggtgtttctgatagaagattttcctgttcttgctccgtcattgtccacgaccgtgagcgatcaatacatgtataatgaaactttttccggtaaacttgtgtgatacccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaTGTTCA-A-CGGGA-GTTT--GGTG-CTTCTGATAGCAAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-C-GCTATTGTC--ACG-ACCGT-GAGC-GATAAA-TA-----------------ACACTTTTTCCTGGTAAATTAAACCTTG--TGT-GAT-AT-CCACG------CCTCGC--------------GCTTTTTTTTCAA--TGCATCCCCGATC--TCACGCGGGGTA---GC--TAAAAAAATCGCTGTTCAT--A-AAATTTTC-CTGGGTTATT-AATTTT-CTACATCA--C-GAT-GTCCAAA--------GTAA--------------CATC-G----------------T-------A-----------------------CAAT-AA-TACT-TTGC-AA-TCG---TGACTTTT-TCAC-TCT-C-TGAAC-ACA--A-TGCTGAAATGGGGC--G----C-C-GGCAG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TC-ATC----TAA----CACA-CGCTTC-TC-TCA--CAA--TTA-GTC-GCAATTCA-CA-C---TTT-GAA--AACAC-G-TTCCAA-TTTTGAAACGG----ATCCT---T-----GATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAACTAAT--GTGT-T---------------------------CATGCTGAATTCAG---------------------GTGGCT-GACAA--AA-GACAT-TATTTCCC-TTGC-GT---TT--------A---------------------AA---------C------GCTTT------GA---CAA-TA-TC-GAAAAG--------T-AG----------A-AT-T-GCG--TTTTATTCGTCG-AAGAT---ACA---A---TCGC--C-----G---AAT
gi|8 : aATTGGGTTACT-T----T-CTAA-TCAG-T-GAT-GTC-AAATTACC-ATGTAG-GAA--GCC-ATACCACCTG----------------CT------AAAGGTTTTTTTCAGTCTCAAGCACAAT-A--TACT-TTGC-AA-GCAGACTAACTTT--CCAT-ATT-CCTGAAC-ATA--A-TG----------G---GTCA-C-C-A--GG--TGGTAG-ATTTTCACACC-TG-ATC----TA--C--CCTG-CAC--A-TG-TCA--AAA--TTT-GT-GGAAATTCA--ACC---TTT-GAA--ACCCC-GCTCCTGT-TTC--AT--GG----A---TCCTT-----GATTTT-G------TT-------------TAATTAATG--TGT-TGTTAA-TTAACTTAACTCTACCCTGC--ATGCTGAAT---ACTTGATCAATTCAGAGTGGCAGT-GCT-GACAA--AACGA-AT-TATTTCCC-TTGTGAT---TTA-------AAGCTACAGTATTAGGGAAGATAA---------CTCTCATGC-TC------GA--CCAG-AA-TT-T-AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-TCAT-TGT-ATTAGAAA-GAGAT---ACAGTCA---C--T--------G---AATAAAGTT--------AA---AA-TTTCA-AGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTCAAT-AA-GTTT--AAATGTTTTAGAAATAAAT-GTTAT-T-----G
gi|9 : tGGGTTATT-TAATTT-TCTAATCAA-T-GAT-GTC-ACATTACC-ATGTAA-GAA--GCA-ATACCACCTG-----------------T------A-----------------------CAAT-A--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTGTT--CAC-TCT-CCTGGAC-ATA--A-TG----------GGGCG----C-A-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACA-TG-ATC----TA--C--CCCA-CAC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTC-GAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC--AC--AG----ATCCT---T-----GATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAATTAAT--GTGT-TGTTAA-TTA-----------CCCCA--CATGCTGAAT---T---------------------GT-GCT-GACAA--AATGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TT------GA--CCAA-GA-TC-G-AAAGTATATATAT-AG---------AA-AT-C-GCG--TTTTATTCGTCG-TAGAT---ACA---A---TCAC--C-----G---AACAAAGGTA-------AA---A--TTTCA-TGAA--A------A-T-----TTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-------T-AAT-ATTAT-T-----GTAAT-A-----AACA----ATG-AGTAAGAGT--TTTA-TCATTGCCTTAAATATTA---CACGT-ACAT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CCCAG-C
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 11111 111111111111 2222222222222 111 111 1111111 3333333333333 111 777777777777777777777777777777777777777777777777 111 4444444444444444444444444 1 22222 111111 222 111111 1111 11 11111111111 22 3333333333333333333333333 1111111111111 3333333333333333333333333333333333333333 111111 11111111 111111111 111 4444444444444444444 22222222 11 111111 333333333 55555555555555555555555555555555555555555 1111111111111111111111111111111111 11 11 11 11 11 22222222222222 111 1111 1111111 33333333333 111 11111 11
lowQualScore : 6 3 3 3 44 3 0 0 3 4 3 3 3 44 3 3 4 4 99999 8 4 6 11111 1 777 5 5 888888888888 0 9999999999999 4 444 888 0 9999999 7777777777777 11 00 4 0 999999 000 66 4 4 4 55 8 0 555555555555555555555555555555555555555555555555 3 88 3 3 3 3 777 3 3 3 99 3 3333333333333333333333333 44 3 0 6 3 7777 33333 3 44 3 3 44 44 3 88 3 666 3 55 3 666 000000 888 666 4 555555 2222 777 0 99 4 3 4 99999999999 33 1 8888888888888888888888888 4 4 55 0000000000000 4 666 8888888888888888888888888888888888888888 999999 3 444444 99 66 3 3 3 00000000 2 000000000 2 333 88 8 5555 111 5555555555555555555 999 11111111 555 22 2 33 44 2 3 1 6 3 44 7 99999 2 3 3 000000 666666666 0 8888 4 22222222222222222222222222222222222222222 66 5 5 7 5 9999999999999999999999999999999999 33 00 5 5 55 0 6 11 66 5 66 777 66 4 66 9999 00 4 4 3 3 3 3 55555555555555 7777 888 8 44 4 0000 4 7777777 4 3 666 888 3 33333333333 3 4 7777 666 3 3 55555 44 44 88 3 3 3 99
lowQualScore : . . . . .. . . . . . . . . .. . . . . ..... . . . ..... . ... . . ............ . ............. . ... ... . ....... ............. .. .. . . ...... ... .. . . . .. . . ................................................ . .. . . . . ... . . . .. . ......................... .. . . . . .... ..... . .. . . .. .. . .. . ... . .. . ... ...... ... ... . ...... .... ... . .. . . . ........... .. . ......................... . . .. ............. . ... ........................................ ...... . ...... .. .. . . . ........ . ......... . ... .. . .... ... ................... ... ........ ... .. . .. .. . . . . . .. . ..... . . . ...... ......... . .... . ......................................... .. . . . . .................................. .. .. . . .. . . .. .. . .. ... .. . .. .... .. . . . . . . .............. .... ... . .. . .... . ....... . . ... ... . ........... . . .... ... . . ..... .. .. .. . . . ..
lowQualScore : 7 3 3 3 66 3 4 4 6 3 6 6 6 22 6 6 0 0 66666 0 0 4 11111 0 111 0 0 999999999999 3 3333333333333 2 777 555 8 3333333 1111111111111 22 22 0 8 222222 000 55 0 0 0 55 0 5 999999999999999999999999999999999999999999999999 6 66 3 2 3 3 222 3 3 3 22 3 2222222222222222222222222 66 3 0 7 3 1111 66666 3 66 3 3 66 66 3 88 6 444 6 00 6 444 999999 222 444 0 555555 0000 000 8 00 0 2 0 00000000000 99 9 7777777777777777777777777 0 0 55 9999999999999 0 444 6666666666666666666666666666666666666666 666666 3 222222 22 88 3 3 1 44444444 7 777777777 7 111 77 9 7777 000 5555555555555555555 333 11111111 000 55 9 99 44 9 1 2 2 1 22 3 11111 3 6 6 555555 555555555 5 5555 0 11111111111111111111111111111111111111111 99 0 0 0 0 4444444444444444444444444444444444 66 00 7 0 66 4 5 99 99 0 11 888 11 4 11 4444 66 0 0 6 6 6 6 00000000000000 7777 888 8 77 0 2222 0 2222222 0 6 444 777 6 11111111111 6 6 7777 777 1 1 55555 22 22 55 1 1 1 00
consensus : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-CC-CGGCANNCCCTCGCTTTTGCANGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTCCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAAAAAAATC-------AT--A-AAATTTTNACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAA-C-GAT-GTC-AAATTACC-ATGTAA-GAA--GCC-ATACCACCTG----------------T-------A-----------------------CAAT-A--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------G-G----C-C-G---AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CCCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----ACGGAT--CC---TTGATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAATTAATG-GTGT-TGTTAA-TTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GCT-GACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TT------GA--CCAA-TA-TC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT---ACA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAANATTA---CACG--A-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA-AA---CTTATTCT-G--CA-A---GTA-T-C--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATC-CAC---A---ACAGT-GATTTT----TGCC-TTGATCC-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
Reference ( family-4914 ) : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-CC-CGGCANNCCCTCGCTTTTGCANGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTCCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAAAAAAATC-------AT--A-AAATTTTNACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAA-C-GAT-GTC-AAATTACC-ATGTAA-GAA--GCC-ATACCACCTG----------------TT------A-----------------------CAAT-A--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------G-G----C-C-G---AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CCCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----ACGGA---CC---TTGATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAATTAATG-GTGT-TGTTAA-TTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GCT-GACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TT------GA--CCAA-TA-TC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT---ACA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAANATTA---CACG--A-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA-AA---CTTATTCT-G--CA-A---GTA-T-C--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATC-CAC---A---ACAGT-GATTTT----TGCC-TTGATCC-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
gi|1 : ATCC--CG-AAAA-TT--GG--T--GTTCA-ACGAATA--TGA-TG-AAAC
gi|1 : gtgacctcgcacaagttctagactctaaacttgtacttTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTT-TTTCTGACAG-GAGATTT-CCTGTTCTTTAT-T-CCGTCATTGTCT-TCG-ACCG--GAGC-GATCAAATAC----AAGT-ATG--TGAAACTTTTTCT-GGTAAA-----CTTTA--TGTTGATTACTCC-CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NN--N-NNNNNNNNNNNTCATAATT-TAATTT-TCTAATCAA-T-GATTGTC-AAATTACC-ATGTAAAGAA--GCC-ATAGCACCTG----------------T-------A-----------------------CAATTA--TACT-T-GC-AA-TCGGACTAATTTT---CAC-TCT-CCTGAAC-GCA--A-TG----------G-G----CGCAG---AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TTACC--CC-A-CGC--A-TC-TCA--GAAATTTA-GTCG-AAATTCA-CACC---TTTTGAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----CAGGATTTCC---TTGATTTT-G------TTTTACAACAATCCACAACTCATG--TGT-TATTAA-TTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GCTTGACAA--AACAA-ATCTATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------A----------C------GC-TAAA----GA--CCAAATA-TCAG-AAAG--------TTAG---------AA-ATTC-GCGCCTTTTATTCGTTG-AAGATT--ACA---A---CG-C--C-----G---AA-AAAG----------AA---C--GTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTC--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T------TAAATA-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTT-TTTA----------TGAAAATCA---CCCG-------------CCAT-----TCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA--------TATCTT-G--T-----------------GAGTCA--TTAAA--ATCA-TTCCAATA-TGT-ACATG--T--C--T-TAC-AA--GATA---TCATT---AATT-TACAT-AGA-C--AACT----AAGC-GATT-GC-ATT-G-A-A-TATTAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCAA-T-TGATGAAC-CAATGGG-TGA---T---GTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CGT-CACGAATTTACGT-ATC-CACGAAA---ACAGT-GATTTTGTGCTGCCTTTGATCCTACG-AAAATT---GATTT--GCCCATACGAATA-TTGATTGCAAACCAC-ttgttgatgaccgccacccacacgaattcaagatgttcaacgaagtttggtttttctgacaggagatttcctgttctttattccgtcattgtcttcgaccggagcgatcaaatacaagtatgtgaaactttttctggtaaactttatgttgattactcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcataatttaattttctaatcaatgattgtcaaattaccatgtaaagaagccatagcacctgtacaattatacttgcaatcggactaattttcactctcctgaacgcaatgggcgcagagtggtagattttacacctgatcttaccccacgcatctcagaaatttagtcgaaattcacaccttttgaaaccacgctcccaattccaggatttccttgattttgttttacaacaatccacaactcatgtgttattaattaccccgccatgctgaatagtgcttgacaaaacaaatctattccccttgcggtttaaacgctaaagaccaaatatcagaaagttagaaattcgcgccttttattcgttgaagattacaacgccgaaaaagaacgttcatgaaattacatgaaaatttgataagttcaaacttaataaatattatttaaataagcaatgagtaagagtttttatgaaaatcacccgccattcacgtttaactcagcaaaatatcttgtgagtcattaaaatcattccaatatgtacatgtcttacaagatatcattaatttacatagacaactaagcgattgcattgaatattaaatgcaagagacgttccaattgatgaaccaatgggtgatgtttttcacggtgggcctcgtcacgaatttacgtatccacgaaaacagtgattttgtgctgcctttgatcctacgaaaattgatttgcccatacgaatattgattgcaaaccacaatat
gi|10 : gtgacctcgcacaagttctagactctaaacttgtacttgtttcatcatattcgttgaacaccaattttcgggatttgttgatgaccgccacccacacgaattcaagaTGTTCATA-CGA---GTTT--GG-G-TT-CTGATAG-AATATCTTCCTGTACTT-GCGT-CCGTCATTTCCCTACGGACCAT-GCCCCGATCAA-TAC----ATGC-ATAA-TGAAACTTTTT-CCGGTAAA-----CTTaatat
gi|10 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaaTACCGCCTG----------------T-------A-----------------------CGAT-A--TATT-TTGC-AA-TTGGACTAATTTTT-C-AC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------G-GGCG-C-C-G---AG--TCGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----CA--C--CCCA-CGT--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaccgcctgtacgatatattttgcaattggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtcgtagattttacacctgatccaccccacgtatctcaaaattagtcgaaat
gi|11 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaatgttcatacgagtttgggttctgatagaatatcttcctgtacttgcgtccgtcatttccctacggaccatgccccgatcaatacatgcataatgaaactttttccggtaaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACA-TTGC-AA-TCAGACTAATTTTT-CCACTTCTGTCTGAA-----------------------A----C-C-----AG--GGGTAGTATTTTCACACCTTG-ATCAGAGTTACTGGCCCAGCAC--A-CC-TCAGTGAA--TCC-GTCAAATATTCA-CACCTCTTTT-GAAATACCAT-GATCTTGT-TTC----ATGGAT--CC---TTGATTTT-GCATGAATT--A-AACAA---ACAATT-ATG-GTGTAAGTTAA-TTA-----------t
gi|11 : cccatatactgtgtattagaagccatgtcattgcgcatttttaagtagtcccaagcactgtgtaA---------C------AC-TT------GG--TCAA--A-GC-G-AAAG--------T-AG---------AACAC-C-GCGG-TTGTAGT--TCG-AAAATGT-ACA---GTCGC--T--------G---AATAAAGGT--------AA---AATTTTCA--GAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTAAT-AA-GTTT--Aacttcactgaacgcctgcatgcttatgaatacttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcacacttggtcaaagcgaaagtagaacaccgcggttgtagttcgaaaatgtacagtcgctgaataaaggtaaaattttcagaaattacatgaaaatttaataagttta
gi|12 : cccatatactgtgtattagaagccatgtcattgcgcatttttaagtagtcccaagcactgtgtaacattgcaatcagactaatttttccacttctgtctgaaaccaggggtagtattttcacaccttgatcagagttactggcccagcacacctcagtgaatccgtcaaatattcacacctcttttgaaataccatgatcttgtttcatggatccttgattttgcatgaattaaacaaacaattatggtgtaagttaattaacttcactgaacgcctgcatgcttatgaatacttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--G-TG-TT-CTGATAG-AAGATTTTCCTGTTTCT-GC-TCCCGTCATTGTCC-ACG-CGAGT-GAGC-GATCAA--A-----ATGT-ATAA-TGAAACTTTT
gi|12 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacaTC-------ATGAA-AAATTTTTGCTGGGTTATTATAATTT------TCAA-T-G-----C-AA----CC-AT-TA--GAA--GCC-ATACTACCTGCATAAGTGTTTTTCAGTTCCAAGCA-----------------------CAAA-AGTTACA-TTGC-AAGTCGGACTAATTTTT---AT-TCT-CCTGAAC-ACA--AATG----------G-GGCGCC-C-A---AT--TGGTAG-ATTTT-ACACCATG-ATC----TA--C--CCCA-CGC--A-CC--CA--AAA--TTA-GTC-GAAATTCACCACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----ATGGAT--CC---TTGATgtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcatgaagagaatcggctgttcatgaaaaatttttgctgggttattataattttcaatgcaaccattagaagccatactacctgcataagtgtttttcagttccaagcacaaaagttacattgcaagtcggactaatttttattctcctgaacacaaatggggcgcccaattggtagattttacaccatgatctaccccacgcacccaaaattagtcgaaattcaccacctttgaaaccacgctcccaattcatggatccttgat
gi|13 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacatgttcaacgaagtttgtgttctgatagaagattttcctgtttctgctcccgtcattgtccacgcgagtgagcgatcaaaatgtataatgaaacttttgtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcatgaagagaatcggctgt-AG---------AA-AT-C--CGC-TTTTATTCG----AAGAT---AC--------T--T--C-----GCTGAATAAAGGTTACATGTAAA---A--TTTCA-GGAA--AATTA-CAATGAAAATTTAAT-AA-G-----GAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---ATCAATAACA----ACG-AGAAGAAGTTAT--A-TTATGGC-TTAAATATTA---CATG--ATATCCTGAAATCATCGATCTCATGTTT--A-AGCTCAG-TAAAATAT---CTGATTAT-GT-CA-A---GGA-T-A--TAGAGTCA--TT-AAC-ATTT-TTCCAATA-TGTACCTTGTAGT-T--T-TATAAA--GATA---TCATTTAAAGTTGTACGTAAGA-C--AAC------AA--GATTCGC-ATTGA-A-A-TA-TAAATGTAAGAATATAAAT----GCAAGAGACGT------TC-TGATGGA----------TGA-------TTTTTTC-ACGAGTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGTAATC-CACCG-A---ACAGT-GA-TTT----TGCC-T--ATCC-ACGAAAAA-T---GA--T--GCC---ACGAATA-TTGA-TA-AAACCA--CAGT
gi|14 : -AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-GCGT-TTGTATTTG--A-AAAATGTTACA---G---T--T--C-----GCTGAATAAAGGTA-------AA---A--TTTCA-TGAA--A--TA-CA-TGAAAGTTGAAT-AA-GTTTAAAAAG-TT-----AATAAAT-G-TATCT-----G--------------A----ATG-AATAATAGTTA---AGTTAT--------AGATTA---CATG--T-AT---G
gi|15 : aataggaagataactctcaccactggaccgaaaagcaaC-ACA-AAAA-----GG--T--GTCAA-ACGAATA-ATGA-TG-AAACCAcaccttaatgtgtcagcgattttgttataaacaatatgtcgataaatgcgatgaaaaaatctacagtatcaatctttaactcctatatcagcgcagc
gi|15 : accataatcatctgaaatagaatgaagaactacatcattggtagatctgaatgaatattTGTTCATC-CAA-A-GTTT--GGTG-CTTCTGATAG-GAGATATTCCTGTTCTT-GC-T-TCGTCACTGTCC-ACG-ATCGTCGAGC-GATCAA-TATAACAATGT-ATAAGTAAAAATTTTTTCTGGAAAA-----CACTAATTGA-GAT-Aatttcattgaagacctcaaccacgaattcaaatgttcatccaaagtttggtgcttctgataggagatattcctgttcttgcttcgtcactgtccacgatcgtcgagcgatcaatataacaatgtataagtaaaaattttttctggaaaacactaattgagatattgtttaatcttcatcaaa
gi|16 : accataatcatctgaaatagaatgaagaactacatcattggtagatctgaatgaatatttggtttcatcattattcgtttgacacctttttgtgatttcattgaagacctcaaccacgaattcaaa---A---------------------GT-GCC-AACTA--AACGA-AT-T--TCACTATTAAGG------A-------A---------------------GATAACTCTCAC------AC-TT------GA--CCAT-AA-AC-G-AAAG--------C-AG---------AA-AC-C-GCAT-TGT-ATTCGAAA-AATGT---ACA---GTCGC--T--------G---AATAAAGAT--------AA---AA-TTTCA-TGAA--A-TTA-CT-TGAAAATTTAAT-AA-ATTT--Attgtttaatcttcatcaaa
gi|17 : aaataaacaacaattaacttcactgaaccctgcatgttctgtatttgttaattaaaagatattagattagtctgggtcaatgttatcagtcggTGTTCA-A-CGA-A-GTTTTCGGTG-TTTCTGATA
gi|17 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaaTACGGT---TTACTAGTAAA---------------------AA---------C------GC-TT------GA--CCAA-TA-TC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT-CGGCG---TTTATTCGTCG-AGGAT---ACA---A------T--CGCT--G---AATAAAGGTTAA-----AA---A--TTTCATTAAA--A-TTA-ctacggtttactagtaaaaacgcttgaccaatatcgaaagtagaaatcggcgtttattcgtcgaggatacaatcgctgaataaaggttaaaaatttcattaaaatta
gi|18 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaatgttcaacgaagttttcggtgtttctgatac--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACTACCCAAG--GATT-GC-ATTGGCATA-TA-TAA--------------AC----ACAAGATACG-TCCCGATT-GGA-GAAC-C-A-ATG-TGA-TAT---TATTTT----------------T-TTTTCACGAATTTACGT-ATC-CACGA-A---ACAGT-GATTTC----TGCC-TT-ATCC-GCG-AAAACT---GA--T--GCCC--ACAAATA-TTGA-TG-AAACCA--CAGTA
gi|19 : -GC-ATTGA-A-A-TT-TAAT-------------AT----G-ATGAGA-GTT--CGATTGTAATGAAG-CAA-ATG--AA-TGTGGGTTTTTTC-ACG-GTGGGGTGCCT-CATCCACGAATCTACGT-AT--CAC---GAACACAGT-GGTTTT----TGC---TGA-CC-ACG-AAAA-TTGAAA--T--GCCC--ACGACTATTTGA-TG-AACCCAC-
gi|2 : ttgTGTTCA-AGCGA-ATGT-----GTGATTCCTGATAG-AAGATTT-CCT-TTCT--GC-T-CCGTCATTGTC--ACG-ACCG----AC-GATCAA-TAGTTA-ATGT-ATAA-TGAAACTT---CCCGGTAA------CT----------AT-A-------GCAGACCCACGCTTT-G-AGGACTTCGC-GCTTGTCCAA-TGCAATCTCCGATT---CACGCCGGGTAA-CGC--TGAAAAAATCGCGCTC-AT--ATAAATCTTTACTG--TTATT-TAATTTTCTA--TCAA-T-GAT-GTC-ACATTACC-ATGTAA-AGA--GCA-ATAC-AC-TG------------------------A-----------------------CAAT-A--TACT-TTCC-AA-ATGGAATAATTGTT-C----TCT-C-TGA-C-ATA--A-TG----------G-G----C-G-C---AGGTTGGTAG-ATTT--ACAC-----AT-------ACT--CCCA-CAC--AATC-TCA--AAA--TTAAGTCG--AACTCA-C-CC---TTT-GAA--ACCACTGCTCCCAA-T--------AGA---TCCCATTGATTTTTG------TT--A-ACGAA---ACAATTAATGTGTGT-T----A-TTA-----------CCCCAC--ATGCTGAAT---T---------------------GT-GCT-GACAATTAGAGA-AT-TAT--CCC-TTGGCGTATATTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--------G--CCAA-GA-TC-G-AAAG--------T-AGTATATATGAGA-AT-C-GCGT-TTT-ATGCGTCGTAGGAT---ACA---A------T--CACCGAG---AACAAAGGT--------AA---A--TT-CA-TGAA--A------------AATTT-AT-AATGTTT--AAAC-TT-----AATTATTTATTGT-TAGTATGTA---T-----GGTATCGAATGCAGTAAGAGTT--TTA-T-ATTGCCTTAAATTTTAACGTACA--A-AT---GAAATCATCGATCT-ACGTTTTAA-A-CCCAGGCAAAATAA---CTTCTTCT-GTACA-AAATGTAAT-TAATAGAGTCAAATTAAACTATTAATCCCAATAATGTA-C-TGAAGATT--TATACAAACAGATAAACTCATT--AATTTGT---TAAGA-CCAAACT----TAA--GATT-GCCATTAG-A-AATA-TCA--------------ATCTGCACAAGAGACGT--CCGA----GATGAAC-CAG--TG-TGA-TCT---ATTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCACCGTAATTACGT-ATC-CACA--A---ACAGT-GA--TT----TGCC-T---TCC-ACG---AA-T---GA--T--GACC--ACGAATA-TTGA-TG-AAA-CACACAGTAag
gi|20 : ttcacatcattcgttgaacaccaatttaagtgattcggatgaccctcaaccacgaattcaaaAG--------T-TG---------AA-AC-C-GCGT-TGT-ATTCGAAA-AATGT---ACA---GTCGC--T--------G---AAAAAAGGT--------AA---AA-TTTCA-TAAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTAAT-AA-GTTT--AAAC-GT-----AATAAAT-GTCAT-T-----GTA---ATT---AATA----ATA-AGT
gi|21 : -TGA-TTT---TTTTT-C-AAA-CTGGG---C----ATCCACGAATCCAC--------AA---A---ACAGT-GGATTT----TGCC-T-GATCC-ACG-AAAATT---GA--T--ACCC--ACGAATA-TTGA-TG-AAACCA--CAGTAtacatattacgtctattgca
gi|22 : aAATA-TGTA-CATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATA--AAATTGTACGTAAGA-T--AACT----AAG--GATT-GC-TTTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCGAT
gi|23 : CG-GTGGG---C----ATCCATGAATTTAAGT-ATC-CACGA-A---ACAGT-TAATTT----TGTC-T-GATCT-ACG-AAAA-TC--GA--T--GCCCA--CGATTA-TTGA-TG-AAACC-C-CA
gi|24 : -CATC-ACGA-TTTA-GT-ATCACGA---A---ACAGT-GATTTT----TGCC--TGATCC-ACG-AAAA-T---GA--TTCGCCC--ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-
gi|25 : TGTTCA-T-CGA-A-GTTT--GATG-CTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCATCATTGTCC-GCA-AATGT-GAGag
gi|26 : -A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCTGA-T-TGTTGAAC-CAA-
gi|3 : aTGTTCA-A-CGA-A-GGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTT-GA-T-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAA-----CTTNN--NNN-NNN-NN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-------AT--A-AAATTTTAACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAAAC-GAT--TC-AAATTACC-ATGTAA-GAA--GCCCATACCACCTG----------------TT------A-----------------------CAAT-A--TACT-T-GC-AA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGAC-ACATTA-TG----------G--------C-G---AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CTCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCT-----------------------TGGATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAAT-AATG-GTGT-TGTTAA-TTA-----------CCCCACTCATGCTGA-T---A---------------------GT-GCT-GACAA--A--------------CC-TTGCAGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TT------GAACCCAA-TA-TC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT---GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT----CA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TATCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGATTAA-GTTT--AAAC-TT-----AA-AAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AACA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAAAATTA---CATGGAA-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-C-CAG-CAAAA-AAAATCTTATTCTTG--CACAT--GTA-TTC--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATGAG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGT-ATT-C----------CAG--GATTTT----TGCC-TTGATCT-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTAtg
gi|4 : TGTTCA-A-CGA-A-GGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTT-GA-T-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAA-----CTTNN--NNN-NNN-NN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-------AT--A-AAATTTTAACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAAAC-GAT--TC-AAATTACC-ATGTAA-GAA--GCCCATACCACCTG----------------TT------A-----------------------CAAT-A--TACT-T-GC-AA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGAC-ACATTA-TG----------G--------C-G---AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CTCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCT-----------------------TGGATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAAT-AATG-GTGT-TGTTAA-TTA-----------CCCCACTCATGCTGA-T---A---------------------GT-GCT-GACAA--A--------------CC-TTGCAGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TT------GAACCCAA-TA-TC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT---GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT----CA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TATCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGATTAA-GTTT--AAAC-TT-----AA-AAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AACA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAAAATTA---CATGGAA-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-C-CAG-CAAAA-AAAATCTTATTCTTG--CACAT--GTA-TTC--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATGAG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGT-ATT-C----------CAG--GATTTT----TGCC-TTGATCT-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
gi|5 : TTCA-A-C-A-A-GTTT--G-TG-TTTCTGATAG-AATATTTTCCT-TTCTT-GC-T-CCGTCAT-GTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GAT--A-TAC----ATG-----A-TGAA---TTTTCTCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-TC-CGGTACTCCCTCGCTTTTGCATGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTTCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAGAAAAATC-------GC-------TGTTCA-TAA---ATT-TAATTT-TCTAATCAA-CCGAT-GT--AAATTACCGATGTAA-GAAAAGCC-A-AC-ACCTG----------------T-------A-----------------------CGAT-A--TACTATTGGGAA-TCGGACTAATATTT-C-AC-TCT-CCTGAACCACA--C-TG----------G-G----CGC-G---A---TGGTAA-ATTTTTACACC-TGGATC----TA--C--TCCA-CGC--A-TCCTCA--AA----TA-GTCAAAA---CC-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GTTCCCAAATTC----ACGGA---TC---TTGATTTT-G------TTT-A-AACAA---ACAATTAATG--TGT-TATTAAATTA-----------CCCCG---ATGCTGAAT---A----------------------T-GCT-GACAA--AAC------TATATCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TCTTGAAAGA--CCAA-TATTC-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-GC----------------------------------------C-----G---AATAATGGT--------AAAATA--TTTCA-TGAAATA-TTACCG-TAAGAATTTGAT-AA-GTTT--AAACTTT-----AAT-AAT-ATTAT-T------TAAT-A-----AGCA----ATG-A-T-AGAG---TTTA---ATT------------------------------AAATC-TCGATC-CTCGTTC--AGA-CTCAG-CAAA----------ATTC----------------T-C--TAGA-TCAC-TTAAAA-ATCA-TTCCAATA-TGT-ACATG-AG--TGAT-TACAAA--GAT----TCATA--TAATTGTA-GTAAGATC--AA-T----CAGCTGATT-GC-ATTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCCAGAGATGTT--CGATT---GTAAACGC---ATGTTGA-------TTTTTTCAACG-GTGGC---CTC-CATCCA-GAATTTACGT-ATCATGA---A---ACAGTGGATTTT------CC---GATCC-ACG-AAAT-T---GA--T--GCCC--ACG-ATA-TTGA-TG-AA
gi|6 : gtggtttctatcatttattcgttgcaacaccaatttttctggattcgttgatgaccccaaccacgaatttacaTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTT-CCGGTAAA-----C-TTG--TGT-GAT-AC-CC-Ccaacaa
gi|6 : ATT-T--TTT-CTAA-TCAA-C-GAT-GTC-AAATTACC-ATGTAA-GAA--GCC-ATACCACCTG----------------T-------A-----------------------CAAT-A--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTTTT-C-AC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------G-GGCG-T-C-G---AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TA-----CCCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGAAATTTCA-CACC---TTT-GAA--AACAC-GCTCCCAA-TTC----ACGGAT--CC---TTGATTTT-GA-----TT--T-AACAA---ACAACTAATG--TGT-TGTTAA-TTA-----------CCCCGC--ATGCTGAAT---A---------------------GT-GCT-GACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------A----------C------G---T------GA--CCAA-TA-TT-G-AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-GCGT-TTT-ATTTGTCG-AAGAT---ACA---A---T--CGAC-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAA-AA-GTTT--AAAC-TT-----GATAAAT-ATTAT-T-----TTATATA-----AGCA----ATG-TTTAAGAGT--TTTA-TT---------------------------------AAATCATCGATCTCACG-TT--A-A-CTCAG-CAAAA-A------------------------TA-T-CT-TAGAGTCA--TTAAAA-ATTA-TTCCAATA-TGT-ACATGAAG--T--A-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCGA-T-TGATGAAC-C-A-ATG-TGATTTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaattttttctaatcaacgatgtcaaattaccatgtaagaagccataccacctgtacaatatactttgcaatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgtcgagtggtagattttacacctgatctacccacgcatctcaaaattagtcgaaatttcacacctttgaaaacacgctcccaattcacggatccttgattttgatttaacaaacaactaatgtgttgttaattaccccgcatgctgaatagtgctgacaaaacgaattattccccttgcggtttaaacgtgaccaatattgaaagtagaaatcgcgttttatttgtcgaagatacaatcgacgaataaaggtaaatttcatgaaattacatgaaaatttgaaaagtttaaacttgataaatattattttatataagcaatgtttaagagttttattaaatcatcgatctcacgttaactcagcaaaaatatcttagagtcattaaaaattattccaatatgtacatgaagtatacaaagatatcattaaattgtacgtaagacaactaaggattgcattgaaatataaatgcaagagacgttccgattgatgaaccaatgtgattttttttttcacggtggg
gi|7 : tgttcaacgaagtttggtgtttctgatagaagattttcctgttcttgctccgtcattgtccacgaccgtgagcgatcaatacatgtataatgaaactttttccggtaaacttgtgtgatacccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaTGTTCA-A-CGGGA-GTTT--GGTG-CTTCTGATAGCAAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-C-GCTATTGTC--ACG-ACCGT-GAGC-GATAAA-TA-----------------ACACTTTTTCCTGGTAAATTAAACCTTG--TGT-GAT-AT-CCACG------CCTCGC--------------GCTTTTTTTTCAA--TGCATCCCCGATC--TCACGCGGGGTA---GC--TAAAAAAATCGCTGTTCAT--A-AAATTTTC-CTGGGTTATT-AATTTT-CTACATCA--C-GAT-GTCCAAA--------GTAA--------------CATC-G----------------T-------A-----------------------CAAT-AA-TACT-TTGC-AA-TCG---TGACTTTT-TCAC-TCT-C-TGAAC-ACA--A-TGCTGAAATGGGGCG----C-C-GGC-AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TC-ATC----TAA----CACA-CGCTTC-TC-TCA--CAA--TTA-GTC-GCAATTCA-CA-C---TTT-GAA--AACAC-G-TTCCAA-TTTTGAAACGGAT--CC---TTGATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAACTAAT--GTGT-T---------------------------CATGCTGAATTCAG---------------------GTGGCT-GACAA--AA-GACAT-TATTTCCC-TTGC-GT---TT--------A---------------------AA---------C------GCTTT------GA---CAA-TA-TC-GAAAAG--------T-AG----------A-AT-T-GCG--TTTTATTCGTCG-AAGAT---ACA---A---TCGC--C-----G---AAT
gi|8 : aATTGGGTTACT-T----T-CTAA-TCAG-T-GAT-GTC-AAATTACC-ATGTAG-GAA--GCC-ATACCACCTG----------------CT------AAAGGTTTTTTTCAGTCTCAAGCACAAT-A--TACT-TTGC-AA-GCAGACTAACTTT--CCAT-ATT-CCTGAAC-ATA--A-TG----------G-GTCA-C-C-A---GG--TGGTAG-ATTTTCACACC-TG-ATC----TA--C--CCTG-CAC--A-TG-TCA--AAA--TTT-GT-GGAAATTCA--ACC---TTT-GAA--ACCCC-GCTCCTGT-TTC----ATGGAT--CC---TTGATTTT-G------TT-------------TAATTAATG--TGT-TGTTAA-TTAACTTAACTCTACCCTGC--ATGCTGAAT---ACTTGATCAATTCAGAGTGGCAGT-GCT-GACAA--AACGA-AT-TATTTCCC-TTGTGAT---TTA-------AAGCTACAGTATTAGGGAAGATAA---------CTCTCATGC-TC------GA--CCAG-AA-TT-T-AAAG--------T-AG---------AA-AT-C-TCAT-TGT-ATTAGAAA-GAGAT---ACAGTCA---C--T--------G---AATAAAGTT--------AA---AA-TTTCA-AGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTCAAT-AA-GTTT--AAATGTTTTAGAAATAAAT-GTTAT-T-----G
gi|9 : tGGGTTATT-TAATTT-TCTAATCAA-T-GAT-GTC-ACATTACC-ATGTAA-GAA--GCA-ATACCACCTG----------------T-------A-----------------------CAAT-A--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTGTT-C-AC-TCT-CCTGGAC-ATA--A-TG----------G-G----G-C-GCAGAG--TGGTAG-ATTTT-ACACA-TG-ATC----TA--C--CCCA-CAC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCG-AAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----ACAGAT--CC---TTGATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAATTAATG--TGT-TGTTAA-TTA-----------CCCCAC--ATGCTGAAT---T---------------------GT-GCT-GACAA--AATGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-TT------GA--CCAA-GA-TC-G-AAAGTATATATAT-AG---------AA-AT-C-GCG--TTTTATTCGTCG-TAGAT---ACA---A---TCAC--C-----G---AACAAAGGTA-------AA---A--TTTCA-TGAA--A------A-T-----TTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-------T-AAT-ATTAT-T-----GTAAT-A-----AACA----ATG-AGTAAGAGT--TTTA-TCATTGCCTTAAATATTA---CACGT-ACAT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CCCAG-C
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 11111 111111111111 2222222222222 111 111 1111111 3333333333333 111 666666666666666666666666666666666666666666666666 111 44444444444444444444444444 1 22222 111 1111111111111 222222 11 11111111111 222 3333333333333333333333333 1111111111111 333333333333333333333333333333 111111111 111111111 11111111 111111111 11 4444444444444444444 22222222 11 111111 333333333 55555555555555555555555555555555555555555 1111111111111111111111111111111111 11 11 11 11 11 22222222222222 111 1111 1111111 33333333333 111 11111 11
lowQualScore : 6 3 3 3 44 3 0 0 3 4 3 3 3 44 3 3 4 4 99999 8 4 6 11111 1 777 5 5 888888888888 0 9999999999999 4 444 888 0 9999999 7777777777777 11 00 4 0 999999 000 55 3 3 3 55 3 55 55 7 1 111111111111111111111111111111111111111111111111 3 77 3 3 3 777 3 3 3 99 3 33333333333333333333333333 44 3 0 6 3 7777 33333 3 44 3 3 44 44 3 66 2 3 000 55 3 1111111111111 55 55 4 555555 4 777 0 99 4 3 4 99999999999 222 1 8888888888888888888888888 4 4 55 0000000000000 4 666 888888888888888888888888888888 333333333 999999 3 333333333 99 3 3 3 3 3 33333333 000000000 2 2 2 11 5 5555 2 888 5555555555555555555 999 11111111 555 22 2 33 44 2 3 1 6 3 44 7 99999 2 3 3 000000 666666666 0 8888 4 22222222222222222222222222222222222222222 66 5 5 7 5 9999999999999999999999999999999999 33 00 5 5 55 0 6 11 66 5 66 777 66 4 66 9999 00 4 4 3 3 3 3 55555555555555 7777 888 8 44 4 0000 4 7777777 4 3 666 888 3 33333333333 3 4 7777 666 3 3 55555 44 44 88 3 3 3 99
lowQualScore : . . . . .. . . . . . . . . .. . . . . ..... . . . ..... . ... . . ............ . ............. . ... ... . ....... ............. .. .. . . ...... ... .. . . . .. . .. .. . . ................................................ . .. . . . ... . . . .. . .......................... .. . . . . .... ..... . .. . . .. .. . .. . . ... .. . ............. .. .. . ...... . ... . .. . . . ........... ... . ......................... . . .. ............. . ... .............................. ......... ...... . ......... .. . . . . . ........ ......... . . . .. . .... . ... ................... ... ........ ... .. . .. .. . . . . . .. . ..... . . . ...... ......... . .... . ......................................... .. . . . . .................................. .. .. . . .. . . .. .. . .. ... .. . .. .... .. . . . . . . .............. .... ... . .. . .... . ....... . . ... ... . ........... . . .... ... . . ..... .. .. .. . . . ..
lowQualScore : 7 3 3 3 66 3 4 4 6 3 6 6 6 22 6 6 0 0 66666 0 0 4 11111 0 111 0 0 999999999999 3 3333333333333 2 777 555 8 3333333 1111111111111 22 22 0 8 222222 000 00 6 6 6 00 6 00 00 3 2 888888888888888888888888888888888888888888888888 3 99 3 3 3 222 3 3 3 22 3 22222222222222222222222222 66 3 0 7 3 1111 66666 3 66 3 3 66 66 3 88 3 6 000 00 6 1111111111111 00 00 0 000000 0 000 8 00 0 2 0 00000000000 222 9 7777777777777777777777777 0 0 55 9999999999999 0 444 111111111111111111111111111111 333333333 666666 3 999999999 22 3 4 3 3 1 22222222 777777777 7 7 7 99 7 7777 7 333 5555555555555555555 333 11111111 000 55 9 99 44 9 1 2 2 1 22 3 11111 3 6 6 555555 555555555 5 5555 0 11111111111111111111111111111111111111111 99 0 0 0 0 4444444444444444444444444444444444 66 00 7 0 66 4 5 99 99 0 11 888 11 4 11 4444 66 0 0 6 6 6 6 00000000000000 7777 888 8 77 0 2222 0 2222222 0 6 444 777 6 11111111111 6 6 7777 777 1 1 55555 22 22 55 1 1 1 00
consensus : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-CC-CGGCANNCCCTCGCTTTTGCANGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTCCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAAAAAAATC-------AT--A-AAATTTTNACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAA-C-GAT-GTC-AAATTAC-C-ATGT--AA-GAA--G--CC-ATACCACCTGT------------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------G---G----C-C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CCCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----ACGGA--TCC--TTGATTTT-G------TTA-AACAA---ACAATTAATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GC-TGACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GA--CC-AATA-TC-G-AAAG--------TAG---------AA-A-TC-GCG-TTTTTATTCGTCG-AAGA-T---ACA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAANATTA---CACG--A-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA-AA---CTTATTCT-G--CA-A---GTA-T-C--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATC-CAC---A---ACAGT-GATTTT----TGCC-TTGATCC-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
Reference ( family-4914 ) : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-CC-CGGCANNCCCTCGCTTTTGCANGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTCCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAAAAAAATC-------AT--A-AAATTTTNACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAA-C-GAT-GTC-AAATTAC-C-ATGT--AA-GAA--G--CC-ATACCACCTGT------------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------G---G----C-C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CCCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----ACGGA--TCC--TTGATTTT-G------TTA-AACAA---ACAATTAATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GC-TGACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GA--CC-AATA-TC-G-AAAG--------TAG---------AA-A-TC-GCG-TTTTTATTCGTCG-AAGA-T---ACA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAANATTA---CACG--A-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA-AA---CTTATTCT-G--CA-A---GTA-T-C--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATC-CAC---A---ACAGT-GATTTT----TGCC-TTGATCC-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
gi|1 : ATCC--CG-AAAA-TT--GG--T--GTTCA-ACGAATA--TGA-TG-AAAC
gi|1 : gtgacctcgcacaagttctagactctaaacttgtacttTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTT-TTTCTGACAG-GAGATTT-CCTGTTCTTTAT-T-CCGTCATTGTCT-TCG-ACCG--GAGC-GATCAAATAC----AAGT-ATG--TGAAACTTTTTCT-GGTAAA-----CTTTA--TGTTGATTACTCC-CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NN--N-NNNNNNNNNNNTCATAATT-TAATTT-TCTAATCAA-T-GATTGTC-AAATTAC-C-ATGT--AAAGAA--G--CC-ATAGCACCTGT------------------------A-----------------------CAATTA--TAC--TTGC-AA-TCGGACTAATTTT---CAC-TCT-CCTGAAC-GCA--A-TG----------G---G----CGCAG--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TTA-C--CCCA-CGC--A-TC-TCA--GAAATTTA-GTC-GAAATTCA-CACCT--TTTGAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----CAGGATTTCC--TTGATTTT-GTT----TTACAACAATCCACAACTCAT--GTGT-TATT-AATTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GCTTGACAA--AACAA-ATCTATTCCCC-TTGCGGT---TT--------A---------------------AA---------C------GC-TAAA------GA--CCAAATA-TCAG-AAAGT-------TAG---------AA-ATTC-GCGCCTTTTATTCGTTG-AAGATT---ACA---A---CG-C--C-----G---AA-AAAG----------AA---C--GTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTC--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T------TAAATA-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTT-TTTA----------TGAAAATCA---CCCG-------------CCAT-----TCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA--------TATCTT-G--T-----------------GAGTCA--TTAAA--ATCA-TTCCAATA-TGT-ACATG--T--C--T-TAC-AA--GATA---TCATT---AATT-TACAT-AGA-C--AACT----AAGC-GATT-GC-ATT-G-A-A-TATTAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCAA-T-TGATGAAC-CAATGGG-TGA---T---GTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CGT-CACGAATTTACGT-ATC-CACGAAA---ACAGT-GATTTTGTGCTGCCTTTGATCCTACG-AAAATT---GATTT--GCCCATACGAATA-TTGATTGCAAACCAC-ttgttgatgaccgccacccacacgaattcaagatgttcaacgaagtttggtttttctgacaggagatttcctgttctttattccgtcattgtcttcgaccggagcgatcaaatacaagtatgtgaaactttttctggtaaactttatgttgattactcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcataatttaattttctaatcaatgattgtcaaattaccatgtaaagaagccatagcacctgtacaattatacttgcaatcggactaattttcactctcctgaacgcaatgggcgcagagtggtagattttacacctgatcttaccccacgcatctcagaaatttagtcgaaattcacaccttttgaaaccacgctcccaattccaggatttccttgattttgttttacaacaatccacaactcatgtgttattaattaccccgccatgctgaatagtgcttgacaaaacaaatctattccccttgcggtttaaacgctaaagaccaaatatcagaaagttagaaattcgcgccttttattcgttgaagattacaacgccgaaaaagaacgttcatgaaattacatgaaaatttgataagttcaaacttaataaatattatttaaataagcaatgagtaagagtttttatgaaaatcacccgccattcacgtttaactcagcaaaatatcttgtgagtcattaaaatcattccaatatgtacatgtcttacaagatatcattaatttacatagacaactaagcgattgcattgaatattaaatgcaagagacgttccaattgatgaaccaatgggtgatgtttttcacggtgggcctcgtcacgaatttacgtatccacgaaaacagtgattttgtgctgcctttgatcctacgaaaattgatttgcccatacgaatattgattgcaaaccacaatat
gi|10 : gtgacctcgcacaagttctagactctaaacttgtacttgtttcatcatattcgttgaacaccaattttcgggatttgttgatgaccgccacccacacgaattcaagaTGTTCATA-CGA---GTTT--GG-G-TT-CTGATAG-AATATCTTCCTGTACTT-GCGT-CCGTCATTTCCCTACGGACCAT-GCCCCGATCAA-TAC----ATGC-ATAA-TGAAACTTTTT-CCGGTAAA-----CTTaatat
gi|10 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaaTACCGCCTGT------------------------A-----------------------CGA-TA--TATT-TTGC-AA-TTGGACTAATTTTT-C-AC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------G---GGCG-C-C-G--AG--TCGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----CA--C--CCCA-CGT--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaccgcctgtacgatatattttgcaattggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtcgtagattttacacctgatccaccccacgtatctcaaaattagtcgaaat
gi|11 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaatgttcatacgagtttgggttctgatagaatatcttcctgtacttgcgtccgtcatttccctacggaccatgccccgatcaatacatgcataatgaaactttttccggtaaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAT-GTC-A--TTGCGC-ATTTTTAA-GTA--GTCCC-A-AGCAC-TGT------------------------G-----------------------TAA-CA--T-----TGC-AA-TCAGACTAATTTTT-CCACTTCTGTCTGAA-------------------------A----C-C----AG--GGGTAGTATTTTCACACCTTG-ATCAGAGTTACTGGCCCAGCAC--A-CC-TCAGTGAA--TCC-GTCAAATATTCA-CACCTCTTTTGAAATACCAT-GATCTTGT-TTC----ATGGA--TCC--TTGATTTT-GCATGAATTA-AACAA---ACAATT-ATG-GTGTAAGTT-AATTA-----------t
gi|11 : cccatatactgtgtattagaagccA---------C------AC-T--T------GG--TC-AA-A-GC-G-AAAG--------TAG---------AACA-CC-GCG-GTTGTAGT--TCG-AAAA-TGT-ACA---GTCGC--T--------G---AATAAAGGT--------AA---AATTTTCA--GAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTAAT-AA-GTTT--Aacttcactgaacgcctgcatgcttatgaatacttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcacacttggtcaaagcgaaagtagaacaccgcggttgtagttcgaaaatgtacagtcgctgaataaaggtaaaattttcagaaattacatgaaaatttaataagttta
gi|12 : cccatatactgtgtattagaagccatgtcattgcgcatttttaagtagtcccaagcactgtgtaacattgcaatcagactaatttttccacttctgtctgaaaccaggggtagtattttcacaccttgatcagagttactggcccagcacacctcagtgaatccgtcaaatattcacacctcttttgaaataccatgatcttgtttcatggatccttgattttgcatgaattaaacaaacaattatggtgtaagttaattaacttcactgaacgcctgcatgcttatgaatacttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--G-TG-TT-CTGATAG-AAGATTTTCCTGTTTCT-GC-TCCCGTCATTGTCC-ACG-CGAGT-GAGC-GATCAA--A-----ATGT-ATAA-TGAAACTTTT
gi|12 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacaTC-------ATGAA-AAATTTTTGCTGGGTTATTATAATTT------TCAA-T-G-----C-AA----C-C-AT-T--A--GAA--G--CC-ATACTACCTGC------------------------ATAAGTGTTTTTCAGTTCCAAGCACAA-AAGTTACA-TTGC-AAGTCGGACTAATTTTT---AT-TCT-CCTGAAC-ACA--AATG----------G---GGCGCC-C-A--AT--TGGTAG-ATTTT-ACACCATG-ATC----TA--C--CCCA-CGC--A-CC--CA--AAA--TTA-GTC-GAAATTCACCACC---TTTGAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----ATGGA--TCC--TTGATgtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcatgaagagaatcggctgttcatgaaaaatttttgctgggttattataattttcaatgcaaccattagaagccatactacctgcataagtgtttttcagttccaagcacaaaagttacattgcaagtcggactaatttttattctcctgaacacaaatggggcgcccaattggtagattttacaccatgatctaccccacgcacccaaaattagtcgaaattcaccacctttgaaaccacgctcccaattcatggatccttgat
gi|13 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacatgttcaacgaagtttgtgttctgatagaagattttcctgtttctgctcccgtcattgtccacgcgagtgagcgatcaaaatgtataatgaaacttttgtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcatgaagagaatcggctgtAG---------AA-A-TC--CG-CTTTTATTCG----AAGA-T---AC--------T--T--C-----GCTGAATAAAGGTTACATGTAAA---A--TTTCA-GGAA--AATTA-CAATGAAAATTTAAT-AA-G-----GAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---ATCAATAACA----ACG-AGAAGAAGTTAT--A-TTATGGC-TTAAATATTA---CATG--ATATCCTGAAATCATCGATCTCATGTTT--A-AGCTCAG-TAAAATAT---CTGATTAT-GT-CA-A---GGA-T-A--TAGAGTCA--TT-AAC-ATTT-TTCCAATA-TGTACCTTGTAGT-T--T-TATAAA--GATA---TCATTTAAAGTTGTACGTAAGA-C--AAC------AA--GATTCGC-ATTGA-A-A-TA-TAAATGTAAGAATATAAAT----GCAAGAGACGT------TC-TGATGGA----------TGA-------TTTTTTC-ACGAGTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGTAATC-CACCG-A---ACAGT-GA-TTT----TGCC-T--ATCC-ACGAAAAA-T---GA--T--GCC---ACGAATA-TTGA-TA-AAACCA--CAGT
gi|14 : -AAAG--------TAG---------AA-A-TC-GCG-TTTGTATTTG--A-AAAA-TGTTACA---G---T--T--C-----GCTGAATAAAGGTA-------AA---A--TTTCA-TGAA--A--TA-CA-TGAAAGTTGAAT-AA-GTTTAAAAAG-TT-----AATAAAT-G-TATCT-----G--------------A----ATG-AATAATAGTTA---AGTTAT--------AGATTA---CATG--T-AT---G
gi|15 : aataggaagataactctcaccactggaccgaaaagcaaC-ACA-AAAA-----GG--T--GTCAA-ACGAATA-ATGA-TG-AAACCAcaccttaatgtgtcagcgattttgttataaacaatatgtcgataaatgcgatgaaaaaatctacagtatcaatctttaactcctatatcagcgcagc
gi|15 : accataatcatctgaaatagaatgaagaactacatcattggtagatctgaatgaatattTGTTCATC-CAA-A-GTTT--GGTG-CTTCTGATAG-GAGATATTCCTGTTCTT-GC-T-TCGTCACTGTCC-ACG-ATCGTCGAGC-GATCAA-TATAACAATGT-ATAAGTAAAAATTTTTTCTGGAAAA-----CACTAATTGA-GAT-Aatttcattgaagacctcaaccacgaattcaaatgttcatccaaagtttggtgcttctgataggagatattcctgttcttgcttcgtcactgtccacgatcgtcgagcgatcaatataacaatgtataagtaaaaattttttctggaaaacactaattgagatattgtttaatcttcatcaaa
gi|16 : accataatcatctgaaatagaatgaagaactacatcattggtagatctgaatgaatatttggtttcatcattattcgtttgacacctttttgtgatttcattgaagacctcaaccacgaattcaaa---A---------------------GT-GC-CAACTA--AACGA-AT-T--TCACTATTAAGG------A-------A---------------------GATAACTCTCAC------AC-T--T------GA--CC-ATAA-AC-G-AAAG--------CAG---------AA-A-CC-GCA-TTGT-ATTCGAAA-AATG-T---ACA---GTCGC--T--------G---AATAAAGAT--------AA---AA-TTTCA-TGAA--A-TTA-CT-TGAAAATTTAAT-AA-ATTT--Attgtttaatcttcatcaaa
gi|17 : aaataaacaacaattaacttcactgaaccctgcatgttctgtatttgttaattaaaagatattagattagtctgggtcaatgttatcagtcggTGTTCA-A-CGA-A-GTTTTCGGTG-TTTCTGATA
gi|17 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaaTACGGT---TTACTAGTAAA---------------------AA---------C------GC-T--T------GA--CC-AATA-TC-G-AAAG--------TAG---------AA-A-TCGGCG---TTTATTCGTCG-AGGA-T---ACA---A------T--CGCT--G---AATAAAGGTTAA-----AA---A--TTTCATTAAA--A-TTA-ctacggtttactagtaaaaacgcttgaccaatatcgaaagtagaaatcggcgtttattcgtcgaggatacaatcgctgaataaaggttaaaaatttcattaaaatta
gi|18 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaatgttcaacgaagttttcggtgtttctgatac--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACTACCCAAG--GATT-GC-ATTGGCATA-TA-TAA--------------AC----ACAAGATACG-TCCCGATT-GGA-GAAC-C-A-ATG-TGA-TAT---TATTTT----------------T-TTTTCACGAATTTACGT-ATC-CACGA-A---ACAGT-GATTTC----TGCC-TT-ATCC-GCG-AAAACT---GA--T--GCCC--ACAAATA-TTGA-TG-AAACCA--CAGTA
gi|19 : -GC-ATTGA-A-A-TT-TAAT-------------AT----G-ATGAGA-GTT--CGATTGTAATGAAG-CAA-ATG--AA-TGTGGGTTTTTTC-ACG-GTGGGGTGCCT-CATCCACGAATCTACGT-AT--CAC---GAACACAGT-GGTTTT----TGC---TGA-CC-ACG-AAAA-TTGAAA--T--GCCC--ACGACTATTTGA-TG-AACCCAC-
gi|2 : ttgTGTTCA-AGCGA-ATGT-----GTGATTCCTGATAG-AAGATTT-CCT-TTCT--GC-T-CCGTCATTGTC--ACG-ACCG----AC-GATCAA-TAGTTA-ATGT-ATAA-TGAAACTT---CCCGGTAA------CT----------AT-A-------GCAGACCCACGCTTT-G-AGGACTTCGC-GCTTGTCCAA-TGCAATCTCCGATT---CACGCCGGGTAA-CGC--TGAAAAAATCGCGCTC-AT--ATAAATCTTTACTG--TTATT-TAATTTTCTA--TCAA-T-GAT-GTC-ACATTAC-C-ATGT--AA-AGA--G--CA-ATAC-AC-TG-------------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-TTCC-AA-ATGGAATAATTGTT-C----TCT-C-TGA-C-ATA--A-TG----------G---G----C-G-C--AGGTTGGTAG-ATTT--ACAC-----AT-------ACT--CCCA-CAC--AATC-TCA--AAA--TTAAGTCG--AACTCA-C-CC---TTTGAA--ACCACTGCTCCCAA-T--------AGA--TCCCATTGATTTTTG------TTA-ACGAA---ACAATTAATGTGTGT-T-----ATTA-----------CCCCAC--ATGCTGAAT---T---------------------GT-GC-TGACAATTAGAGA-AT-TAT--CCC-TTGGCGTATATTA-------A---------------------AA---------C------GC-T----------G--CC-AAGA-TC-G-AAAG--------TAGTATATATGAGA-A-TC-GCG-TTTT-ATGCGTCGTAGGA-T---ACA---A------T--CACCGAG---AACAAAGGT--------AA---A--TT-CA-TGAA--A------------AATTT-AT-AATGTTT--AAAC-TT-----AATTATTTATTGT-TAGTATGTA---T-----GGTATCGAATGCAGTAAGAGTT--TTA-T-ATTGCCTTAAATTTTAACGTACA--A-AT---GAAATCATCGATCT-ACGTTTTAA-A-CCCAGGCAAAATAA---CTTCTTCT-GTACA-AAATGTAAT-TAATAGAGTCAAATTAAACTATTAATCCCAATAATGTA-C-TGAAGATT--TATACAAACAGATAAACTCATT--AATTTGT---TAAGA-CCAAACT----TAA--GATT-GCCATTAG-A-AATA-TCA--------------ATCTGCACAAGAGACGT--CCGA----GATGAAC-CAG--TG-TGA-TCT---ATTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCACCGTAATTACGT-ATC-CACA--A---ACAGT-GA--TT----TGCC-T---TCC-ACG---AA-T---GA--T--GACC--ACGAATA-TTGA-TG-AAA-CACACAGTAag
gi|20 : ttcacatcattcgttgaacaccaatttaagtgattcggatgaccctcaaccacgaattcaaaAG--------TTG---------AA-A-CC-GCG-TTGT-ATTCGAAA-AATG-T---ACA---GTCGC--T--------G---AAAAAAGGT--------AA---AA-TTTCA-TAAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTAAT-AA-GTTT--AAAC-GT-----AATAAAT-GTCAT-T-----GTA---ATT---AATA----ATA-AGT
gi|21 : -TGA-TTT---TTTTT-C-AAA-CTGGG---C----ATCCACGAATCCAC--------AA---A---ACAGT-GGATTT----TGCC-T-GATCC-ACG-AAAATT---GA--T--ACCC--ACGAATA-TTGA-TG-AAACCA--CAGTAtacatattacgtctattgca
gi|22 : aAATA-TGTA-CATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATA--AAATTGTACGTAAGA-T--AACT----AAG--GATT-GC-TTTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCGAT
gi|23 : CG-GTGGG---C----ATCCATGAATTTAAGT-ATC-CACGA-A---ACAGT-TAATTT----TGTC-T-GATCT-ACG-AAAA-TC--GA--T--GCCCA--CGATTA-TTGA-TG-AAACC-C-CA
gi|24 : -CATC-ACGA-TTTA-GT-ATCACGA---A---ACAGT-GATTTT----TGCC--TGATCC-ACG-AAAA-T---GA--TTCGCCC--ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-
gi|25 : TGTTCA-T-CGA-A-GTTT--GATG-CTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCATCATTGTCC-GCA-AATGT-GAGag
gi|26 : -A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCTGA-T-TGTTGAAC-CAA-
gi|3 : aTGTTCA-A-CGA-A-GGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTT-GA-T-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAA-----CTTNN--NNN-NNN-NN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-------AT--A-AAATTTTAACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAAAC-GAT--TC-AAATTAC-C-ATGT--AA-GAA--G--CCCATACCACCTGTT-----------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-T-GC-AA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGAC-ACATTA-TG----------G----------C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CTCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTCCT----------------------TGGATTTT-G------TTA-AACAA---ACAAT-AATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCACTCATGCTGA-T---A---------------------GT-GC-TGACAA--A--------------CC-TTGCAGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GAACCC-AATA-TC-G-AAAG--------TAG---------AA-A-T--GCG-TTTTTATTCGTCG-AAGA-T----CA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TATCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGATTAA-GTTT--AAAC-TT-----AA-AAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AACA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAAAATTA---CATGGAA-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-C-CAG-CAAAA-AAAATCTTATTCTTG--CACAT--GTA-TTC--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATGAG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGT-ATT-C----------CAG--GATTTT----TGCC-TTGATCT-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTAtg
gi|4 : TGTTCA-A-CGA-A-GGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTT-GA-T-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAA-----CTTNN--NNN-NNN-NN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-------AT--A-AAATTTTAACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAAAC-GAT--TC-AAATTAC-C-ATGT--AA-GAA--G--CCCATACCACCTGTT-----------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-T-GC-AA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGAC-ACATTA-TG----------G----------C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CTCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTCCT----------------------TGGATTTT-G------TTA-AACAA---ACAAT-AATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCACTCATGCTGA-T---A---------------------GT-GC-TGACAA--A--------------CC-TTGCAGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GAACCC-AATA-TC-G-AAAG--------TAG---------AA-A-T--GCG-TTTTTATTCGTCG-AAGA-T----CA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TATCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGATTAA-GTTT--AAAC-TT-----AA-AAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AACA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAAAATTA---CATGGAA-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-C-CAG-CAAAA-AAAATCTTATTCTTG--CACAT--GTA-TTC--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATGAG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGT-ATT-C----------CAG--GATTTT----TGCC-TTGATCT-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
gi|5 : TTCA-A-C-A-A-GTTT--G-TG-TTTCTGATAG-AATATTTTCCT-TTCTT-GC-T-CCGTCAT-GTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GAT--A-TAC----ATG-----A-TGAA---TTTTCTCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-TC-CGGTACTCCCTCGCTTTTGCATGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTTCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAGAAAAATC-------GC-------TGTTCA-TAA---ATT-TAATTT-TCTAATCAA-CCGAT-GT--AAATTAC-CGATGT--AA-GAAAAG--CC-A-AC-ACCTGT------------------------A-----------------------CGA-TA--TACTATTGGGAA-TCGGACTAATATTT-C-AC-TCT-CCTGAACCACA--C-TG----------G---G----CGC-G--A---TGGTAA-ATTTTTACACC-TGGATC----TA--C--TCCA-CGC--A-TCCTCA--AA----TA-GTCAAAA---CC-CACC---TTTGAA--ACCAC-GTTCCCAAATTC----ACGGA--T-C--TTGATTTT-GT-----TTA-AACAA---ACAATTAAT--GTGT-TATTAAATTA-----------CCCCG---ATGCTGAAT---A----------------------T-GC-TGACAA--AAC------TATATCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--CTTGAAAGA--CC-AATATTC-G-AAAG--------TAG---------AA-A-TC-GC-----------------------------------------C-----G---AATAATGGT--------AAAATA--TTTCA-TGAAATA-TTACCG-TAAGAATTTGAT-AA-GTTT--AAACTTT-----AAT-AAT-ATTAT-T------TAAT-A-----AGCA----ATG-A-T-AGAG---TTTA---ATT------------------------------AAATC-TCGATC-CTCGTTC--AGA-CTCAG-CAAA----------ATTC----------------T-C--TAGA-TCAC-TTAAAA-ATCA-TTCCAATA-TGT-ACATG-AG--TGAT-TACAAA--GAT----TCATA--TAATTGTA-GTAAGATC--AA-T----CAGCTGATT-GC-ATTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCCAGAGATGTT--CGATT---GTAAACGC---ATGTTGA-------TTTTTTCAACG-GTGGC---CTC-CATCCA-GAATTTACGT-ATCATGA---A---ACAGTGGATTTT------CC---GATCC-ACG-AAAT-T---GA--T--GCCC--ACG-ATA-TTGA-TG-AA
gi|6 : gtggtttctatcatttattcgttgcaacaccaatttttctggattcgttgatgaccccaaccacgaatttacaTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTT-CCGGTAAA-----C-TTG--TGT-GAT-AC-CC-Ccaacaa
gi|6 : ATT-T--TTT-CTAA-TCAA-C-GAT-GTC-AAATTAC-C-ATGT--AA-GAA--G--CC-ATACCACCTGT------------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTTTT--CAC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------GGGCG----T-C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TA-----CCCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGAAATTTCA-CACC---TTTGAA--AACAC-GCTCCCAA-TTC----ACGGA--TCC--TTGATTTT-GA-----TTT-AACAA---ACAACTAAT--GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCG--CATGCTGAAT---A---------------------GT-GC-TGACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TT--------A---------------------AA---------C------G-----T------GA--CC-AATA-TT-G-AAAG--------TAG---------AA-A-TC-GCG--TTTTATTTGTCG-AAGA-T---ACA---A---T--CGAC-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAA-AA-GTTT--AAAC-TT-----GATAAAT-ATTAT-T-----TTATATA-----AGCA----ATG-TTTAAGAGT--TTTA-TT---------------------------------AAATCATCGATCTCACG-TT--A-A-CTCAG-CAAAA-A------------------------TA-T-CT-TAGAGTCA--TTAAAA-ATTA-TTCCAATA-TGT-ACATGAAG--T--A-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCGA-T-TGATGAAC-C-A-ATG-TGATTTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaattttttctaatcaacgatgtcaaattaccatgtaagaagccataccacctgtacaatatactttgcaatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgtcgagtggtagattttacacctgatctacccacgcatctcaaaattagtcgaaatttcacacctttgaaaacacgctcccaattcacggatccttgattttgatttaacaaacaactaatgtgttgttaattaccccgcatgctgaatagtgctgacaaaacgaattattccccttgcggtttaaacgtgaccaatattgaaagtagaaatcgcgttttatttgtcgaagatacaatcgacgaataaaggtaaatttcatgaaattacatgaaaatttgaaaagtttaaacttgataaatattattttatataagcaatgtttaagagttttattaaatcatcgatctcacgttaactcagcaaaaatatcttagagtcattaaaaattattccaatatgtacatgaagtatacaaagatatcattaaattgtacgtaagacaactaaggattgcattgaaatataaatgcaagagacgttccgattgatgaaccaatgtgattttttttttcacggtggg
gi|7 : tgttcaacgaagtttggtgtttctgatagaagattttcctgttcttgctccgtcattgtccacgaccgtgagcgatcaatacatgtataatgaaactttttccggtaaacttgtgtgatacccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaTGTTCA-A-CGGGA-GTTT--GGTG-CTTCTGATAGCAAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-C-GCTATTGTC--ACG-ACCGT-GAGC-GATAAA-TA-----------------ACACTTTTTCCTGGTAAATTAAACCTTG--TGT-GAT-AT-CCACG------CCTCGC--------------GCTTTTTTTTCAA--TGCATCCCCGATC--TCACGCGGGGTA---GC--TAAAAAAATCGCTGTTCAT--A-AAATTTTC-CTGGGTTATT-AATTTT-CTACATCA--C-GAT-GTCCAAA---------GT--AA----------------CATC-GT------------------------A-----------------------CAA-TAA-TACT-TTGC-AA-TCG---TGACTTTT-TCAC-TCT-C-TGAAC-ACA--A-TGCTGAAATGGGGC--G----C-C-GGCAG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TC-ATC----TAACA--C--A-CGCTTC-TC-TCA--CAA--TTA-GTCGCAA-TTCA-CAC----TTTGAA--AACAC-GTTCC-AA-TTTTGAAACGGA--TCC--TTGATTTT-G------TTA-AACAA---ACAACTAAT--GTGT-T---------------------------CATGCTGAATTCAG---------------------GTGGC-TGACAA--AA-GACAT-TATTTCCC-TTGC-GT---TT--------A---------------------AA---------C------GCTT--T------GA---C-AATA-TC-GAAAAG--------TAG----------A-A-TT-GCG--TTTTATTCGTCG-AAGA-T---ACA---A---TCGC--C-----G---AAT
gi|8 : aATTGGGTTACT-T----T-CTAA-TCAG-T-GAT-GTC-AAATTAC-C-ATGT--AG-GAA--G--CC-ATACCACCTGCTAAAGGTTTTTTTCAGTCTCAAGCA-----------------------CAA-TA--TACT-TTGC-AA-GCAGACTAACTTT--CCAT-ATT-CCTGAAC-ATA--A-TG----------G---GTCA-C-C-A--GG--TGGTAG-ATTTTCACACC-TG-ATC----TA--C--CCTG-CAC--A-TG-TCA--AAA--TTT-GT-GGAAATTCA--ACC---TTTGAA--ACCCC-GCTCCTGT-TTC----ATGGA--TCC--TTGATTTT-G------TT-----------TAATTAATG--TGT-TGTT-AATTAACTTAACTCTACCCTGC--ATGCTGAAT---ACTTGATCAATTCAGAGTGGCAGT-GC-TGACAA--AACGA-AT-TATTTCCC-TTGTGAT---TTA-------AAGCTACAGTATTAGGGAAGATAA---------CTCTCATGC-T--C------GA--CC-AGAA-TT-T-AAAG--------TAG---------AA-A-TC-TCA-TTGT-ATTAGAAA-GAGA-T---ACAGTCA---C--T--------G---AATAAAGTT--------AA---AA-TTTCA-AGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTCAAT-AA-GTTT--AAATGTTTTAGAAATAAAT-GTTAT-T-----G
gi|9 : tGGGTTATT-TAATTT-TCTAATCAA-T-GAT-GTC-ACATTAC-C-ATGT--AA-GAA--G--CA-ATACCACCTGT------------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTGTT--CAC-TCT-CCTGGAC-ATA--A-TG----------GGGCG----C-A-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACA-TG-ATC----TA--C--CCCA-CAC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTC-GAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----ACAGA--TCC--TTGATTTT-G------TTA-AACAA---ACAATTAAT--GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCA--CATGCTGAAT---T---------------------GT-GC-TGACAA--AATGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GA--CC-AAGA-TC-G-AAAGTATATATATAG---------AA-A-TC-GCG--TTTTATTCGTCG-TAGA-T---ACA---A---TCAC--C-----G---AACAAAGGTA-------AA---A--TTTCA-TGAA--A------A-T-----TTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-------T-AAT-ATTAT-T-----GTAAT-A-----AACA----ATG-AGTAAGAGT--TTTA-TCATTGCCTTAAATATTA---CACGT-ACAT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CCCAG-C
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 11111 111111111111 2222222222222 111 111 1111111 3333333333333 111 666666666666666666666666666666666666666666666666 111 44444444444444444444444444 1 22222 111 1111111111111 222222 11 11111111111 222 3333333333333333333333333 1111111111111 333333333333333333333333333333 111111111 111111111 11111111 111111111 11 4444444444444444444 22222222 11 111111 333333333 55555555555555555555555555555555555555555 1111111111111111111111111111111111 11 11 11 11 11 22222222222222 111 1111 1111111 33333333333 111 11111 11
lowQualScore : 6 3 3 3 44 3 0 0 3 4 3 3 3 44 3 3 4 4 99999 8 4 6 11111 1 777 5 5 888888888888 0 9999999999999 4 444 888 0 9999999 7777777777777 11 00 4 0 999999 000 55 3 3 3 55 3 55 55 7 1 111111111111111111111111111111111111111111111111 3 77 3 3 3 777 3 3 3 99 3 33333333333333333333333333 44 3 0 6 3 7777 33333 3 44 3 3 44 44 3 66 2 3 000 55 3 1111111111111 55 55 4 555555 4 777 0 99 4 3 4 99999999999 222 1 8888888888888888888888888 4 4 55 0000000000000 4 666 888888888888888888888888888888 333333333 999999 3 333333333 99 3 3 3 3 3 33333333 000000000 2 2 2 11 5 5555 2 888 5555555555555555555 999 11111111 555 22 2 33 44 2 3 1 6 3 44 7 99999 2 3 3 000000 666666666 0 8888 4 22222222222222222222222222222222222222222 66 5 5 7 5 9999999999999999999999999999999999 33 00 5 5 55 0 6 11 66 5 66 777 66 4 66 9999 00 4 4 3 3 3 3 55555555555555 7777 888 8 44 4 0000 4 7777777 4 3 666 888 3 33333333333 3 4 7777 666 3 3 55555 44 44 88 3 3 3 99
lowQualScore : . . . . .. . . . . . . . . .. . . . . ..... . . . ..... . ... . . ............ . ............. . ... ... . ....... ............. .. .. . . ...... ... .. . . . .. . .. .. . . ................................................ . .. . . . ... . . . .. . .......................... .. . . . . .... ..... . .. . . .. .. . .. . . ... .. . ............. .. .. . ...... . ... . .. . . . ........... ... . ......................... . . .. ............. . ... .............................. ......... ...... . ......... .. . . . . . ........ ......... . . . .. . .... . ... ................... ... ........ ... .. . .. .. . . . . . .. . ..... . . . ...... ......... . .... . ......................................... .. . . . . .................................. .. .. . . .. . . .. .. . .. ... .. . .. .... .. . . . . . . .............. .... ... . .. . .... . ....... . . ... ... . ........... . . .... ... . . ..... .. .. .. . . . ..
lowQualScore : 7 3 3 3 66 3 4 4 6 3 6 6 6 22 6 6 0 0 66666 0 0 4 11111 0 111 0 0 999999999999 3 3333333333333 2 777 555 8 3333333 1111111111111 22 22 0 8 222222 000 00 6 6 6 00 6 00 00 3 2 888888888888888888888888888888888888888888888888 3 99 3 3 3 222 3 3 3 22 3 22222222222222222222222222 66 3 0 7 3 1111 66666 3 66 3 3 66 66 3 88 3 6 000 00 6 1111111111111 00 00 0 000000 0 000 8 00 0 2 0 00000000000 222 9 7777777777777777777777777 0 0 55 9999999999999 0 444 111111111111111111111111111111 333333333 666666 3 999999999 22 3 4 3 3 1 22222222 777777777 7 7 7 99 7 7777 7 333 5555555555555555555 333 11111111 000 55 9 99 44 9 1 2 2 1 22 3 11111 3 6 6 555555 555555555 5 5555 0 11111111111111111111111111111111111111111 99 0 0 0 0 4444444444444444444444444444444444 66 00 7 0 66 4 5 99 99 0 11 888 11 4 11 4444 66 0 0 6 6 6 6 00000000000000 7777 888 8 77 0 2222 0 2222222 0 6 444 777 6 11111111111 6 6 7777 777 1 1 55555 22 22 55 1 1 1 00
consensus : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-CC-CGGCANNCCCTCGCTTTTGCANGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTCCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAAAAAAATC-------AT--A-AAATTTTNACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAA-C-GAT-GTC-AAATTAC-C-ATGT--AA-GAA--G--CC-ATACCACCTGT------------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------G---G----C-C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CCCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----ACGGA--TCC--TTGATTTT-G------TTA-AACAA---ACAATTAATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GC-TGACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GA--CC-AATA-TC-G-AAAG--------TAG---------AA-A-TC-GCG-TTTTTATTCGTCG-AAGA-T---ACA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAANATTA---CACG--A-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA-AA---CTTATTCT-G--CA-A---GTA-T-C--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATC-CAC---A---ACAGT-GATTTT----TGCC-TTGATCC-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
Reference ( family-4914 ) : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-CC-CGGCANNCCCTCGCTTTTGCANGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTCCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAAAAAAATC-------AT--A-AAATTTTNACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAA-C-GAT-GTC-AAATTAC-C-ATGT--AA-GAA--G--CC-ATACCACCTGT------------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------G---G----C-C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CCCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----ACGGA--TCC--TTGATTTT-G------TTA-AACAA---ACAATTAATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GC-TGACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GA--CC-AATA-TC-G-AAAG--------TAG---------AA-A-TC-GCG-TTTTTATTCGTCG-AAGA-T---ACA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAANATTA---CACG--A-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA-AA---CTTATTCT-G--CA-A---GTA-T-C--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATC-CAC---A---ACAGT-GATTTT----TGCC-TTGATCC-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
gi|1 : ATCC--CG-AAAA-TT--GG--T--GTTCA-ACGAATA--TGA-TG-AAAC
gi|1 : gtgacctcgcacaagttctagactctaaacttgtacttTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTT-TTTCTGACAG-GAGATTT-CCTGTTCTTTAT-T-CCGTCATTGTCT-TCG-ACCG--GAGC-GATCAAATAC----AAGT-ATG--TGAAACTTTTTCT-GGTAAA-----CTTTA--TGTTGATTACTCC-CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NN--N-NNNNNNNNNNNTCATAATT-TAATTT-TCTAATCAA-T-GATTGTC-AAATTAC-C-ATGT--AAAGAA--G--CC-ATAGCACCTGT------------------------A-----------------------CAATTA--TAC--TTGC-AA-TCGGACTAATTTT---CAC-TCT-CCTGAAC-GCA--A-TG----------G---G----CGCAG--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TTA-C--CCCA-CGC--A-TC-TCA--GAAATTTA-GTC-GAAATTCA-CACCT--TTTGAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----CAGGATTTCC--TTGATTTT-GTT----TTACAACAATCCACAACTCAT--GTGT-TATT-AATTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GCTTGACAA--AACAA-ATCTATTCCCC-TTGCGGT---TT--------A---------------------AA---------C------GC-TAAA------GA--CCAAATA-TCAG-AAAGT-------TAG---------AA-ATTC-GCGCCTTTTATTCGTTG-AAGATT---ACA---A---CG-C--C-----G---AA-AAAG----------AA---C--GTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTC--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T------TAAATA-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTT-TTTA----------TGAAAATCA---CCCG-------------CCAT-----TCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA--------TATCTT-G--T-----------------GAGTCA--TTAAA--ATCA-TTCCAATA-TGT-ACATG--T--C--T-TAC-AA--GATA---TCATT---AATT-TACAT-AGA-C--AACT----AAGC-GATT-GC-ATT-G-A-A-TATTAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCAA-T-TGATGAAC-CAATGGG-TGA---T---GTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CGT-CACGAATTTACGT-ATC-CACGAAA---ACAGT-GATTTTGTGCTGCCTTTGATCCTACG-AAAATT---GATTT--GCCCATACGAATA-TTGATTGCAAACCAC-ttgttgatgaccgccacccacacgaattcaagatgttcaacgaagtttggtttttctgacaggagatttcctgttctttattccgtcattgtcttcgaccggagcgatcaaatacaagtatgtgaaactttttctggtaaactttatgttgattactcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcataatttaattttctaatcaatgattgtcaaattaccatgtaaagaagccatagcacctgtacaattatacttgcaatcggactaattttcactctcctgaacgcaatgggcgcagagtggtagattttacacctgatcttaccccacgcatctcagaaatttagtcgaaattcacaccttttgaaaccacgctcccaattccaggatttccttgattttgttttacaacaatccacaactcatgtgttattaattaccccgccatgctgaatagtgcttgacaaaacaaatctattccccttgcggtttaaacgctaaagaccaaatatcagaaagttagaaattcgcgccttttattcgttgaagattacaacgccgaaaaagaacgttcatgaaattacatgaaaatttgataagttcaaacttaataaatattatttaaataagcaatgagtaagagtttttatgaaaatcacccgccattcacgtttaactcagcaaaatatcttgtgagtcattaaaatcattccaatatgtacatgtcttacaagatatcattaatttacatagacaactaagcgattgcattgaatattaaatgcaagagacgttccaattgatgaaccaatgggtgatgtttttcacggtgggcctcgtcacgaatttacgtatccacgaaaacagtgattttgtgctgcctttgatcctacgaaaattgatttgcccatacgaatattgattgcaaaccacaatat
gi|10 : gtgacctcgcacaagttctagactctaaacttgtacttgtttcatcatattcgttgaacaccaattttcgggatttgttgatgaccgccacccacacgaattcaagaTGTTCATA-CGA---GTTT--GG-G-TT-CTGATAG-AATATCTTCCTGTACTT-GCGT-CCGTCATTTCCCTACGGACCAT-GCCCCGATCAA-TAC----ATGC-ATAA-TGAAACTTTTT-CCGGTAAA-----CTTaatat
gi|10 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaaTACCGCCTGT------------------------A-----------------------CGA-TA--TATT-TTGC-AA-TTGGACTAATTTTT-C-AC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------G---GGCG-C-C-G--AG--TCGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----CA--C--CCCA-CGT--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaccgcctgtacgatatattttgcaattggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtcgtagattttacacctgatccaccccacgtatctcaaaattagtcgaaat
gi|11 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaatgttcatacgagtttgggttctgatagaatatcttcctgtacttgcgtccgtcatttccctacggaccatgccccgatcaatacatgcataatgaaactttttccggtaaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAT-GTC-A--TTGCGC-ATTTTTAA-GTA--GTCCC-A-AGCAC-TGT------------------------G-----------------------TAA-CA--T-----TGC-AA-TCAGACTAATTTTT-CCACTTCTGTCTGAA-------------------------A----C-C----AG--GGGTAGTATTTTCACACCTTG-ATCAGAGTTACTGGCCCAGCAC--A-CC-TCAGTGAA--TCC-GTCAAATATTCA-CACCTCTTTTGAAATACCAT-GATCTTGT-TTC----ATGGA--TCC--TTGATTTT-GCATGAATTA-AACAA---ACAATT-ATG-GTGTAAGTT-AATTA-----------t
gi|11 : cccatatactgtgtattagaagccA---------C------AC-T--T------GG--TC-AA-A-GC-G-AAAG--------TAG---------AACA-CC-GCG-GTTGTAGT--TCG-AAAA-TGT-ACA---GTCGC--T--------G---AATAAAGGT--------AA---AATTTTCA--GAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTAAT-AA-GTTT--Aacttcactgaacgcctgcatgcttatgaatacttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcacacttggtcaaagcgaaagtagaacaccgcggttgtagttcgaaaatgtacagtcgctgaataaaggtaaaattttcagaaattacatgaaaatttaataagttta
gi|12 : cccatatactgtgtattagaagccatgtcattgcgcatttttaagtagtcccaagcactgtgtaacattgcaatcagactaatttttccacttctgtctgaaaccaggggtagtattttcacaccttgatcagagttactggcccagcacacctcagtgaatccgtcaaatattcacacctcttttgaaataccatgatcttgtttcatggatccttgattttgcatgaattaaacaaacaattatggtgtaagttaattaacttcactgaacgcctgcatgcttatgaatacttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--G-TG-TT-CTGATAG-AAGATTTTCCTGTTTCT-GC-TCCCGTCATTGTCC-ACG-CGAGT-GAGC-GATCAA--A-----ATGT-ATAA-TGAAACTTTT
gi|12 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacaTC-------ATGAA-AAATTTTTGCTGGGTTATTATAATTT------TCAA-T-G-----C-AA----C-C-AT-T--A--GAA--G--CC-ATACTACCTGC------------------------ATAAGTGTTTTTCAGTTCCAAGCACAA-AAGTTACA-TTGC-AAGTCGGACTAATTTTT---AT-TCT-CCTGAAC-ACA--AATG----------G---GGCGCC-C-A--AT--TGGTAG-ATTTT-ACACCATG-ATC----TA--C--CCCA-CGC--A-CC--CA--AAA--TTA-GTC-GAAATTCACCACC---TTTGAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----ATGGA--TCC--TTGATgtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcatgaagagaatcggctgttcatgaaaaatttttgctgggttattataattttcaatgcaaccattagaagccatactacctgcataagtgtttttcagttccaagcacaaaagttacattgcaagtcggactaatttttattctcctgaacacaaatggggcgcccaattggtagattttacaccatgatctaccccacgcacccaaaattagtcgaaattcaccacctttgaaaccacgctcccaattcatggatccttgat
gi|13 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacatgttcaacgaagtttgtgttctgatagaagattttcctgtttctgctcccgtcattgtccacgcgagtgagcgatcaaaatgtataatgaaacttttgtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcatgaagagaatcggctgtAG---------AA-A-TC--CG-CTTTTATTCG----AAGA-T---AC--------T--T--C-----GCTGAATAAAGGTTACATGTAAA---A--TTTCA-GGAA--AATTA-CAATGAAAATTTAAT-AA-G-----GAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---ATCAATAACA----ACG-AGAAGAAGTTAT--A-TTATGGC-TTAAATATTA---CATG--ATATCCTGAAATCATCGATCTCATGTTT--A-AGCTCAG-TAAAATAT---CTGATTAT-GT-CA-A---GGA-T-A--TAGAGTCA--TT-AAC-ATTT-TTCCAATA-TGTACCTTGTAGT-T--T-TATAAA--GATA---TCATTTAAAGTTGTACGTAAGA-C--AAC------AA--GATTCGC-ATTGA-A-A-TA-TAAATGTAAGAATATAAAT----GCAAGAGACGT------TC-TGATGGA----------TGA-------TTTTTTC-ACGAGTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGTAATC-CACCG-A---ACAGT-GA-TTT----TGCC-T--ATCC-ACGAAAAA-T---GA--T--GCC---ACGAATA-TTGA-TA-AAACCA--CAGT
gi|14 : -AAAG--------TAG---------AA-A-TC-GCG-TTTGTATTTG--A-AAAA-TGTTACA---G---T--T--C-----GCTGAATAAAGGTA-------AA---A--TTTCA-TGAA--A--TA-CA-TGAAAGTTGAAT-AA-GTTTAAAAAG-TT-----AATAAAT-G-TATCT-----G--------------A----ATG-AATAATAGTTA---AGTTAT--------AGATTA---CATG--T-AT---G
gi|15 : aataggaagataactctcaccactggaccgaaaagcaaC-ACA-AAAA-----GG--T--GTCAA-ACGAATA-ATGA-TG-AAACCAcaccttaatgtgtcagcgattttgttataaacaatatgtcgataaatgcgatgaaaaaatctacagtatcaatctttaactcctatatcagcgcagc
gi|15 : accataatcatctgaaatagaatgaagaactacatcattggtagatctgaatgaatattTGTTCATC-CAA-A-GTTT--GGTG-CTTCTGATAG-GAGATATTCCTGTTCTT-GC-T-TCGTCACTGTCC-ACG-ATCGTCGAGC-GATCAA-TATAACAATGT-ATAAGTAAAAATTTTTTCTGGAAAA-----CACTAATTGA-GAT-Aatttcattgaagacctcaaccacgaattcaaatgttcatccaaagtttggtgcttctgataggagatattcctgttcttgcttcgtcactgtccacgatcgtcgagcgatcaatataacaatgtataagtaaaaattttttctggaaaacactaattgagatattgtttaatcttcatcaaa
gi|16 : accataatcatctgaaatagaatgaagaactacatcattggtagatctgaatgaatatttggtttcatcattattcgtttgacacctttttgtgatttcattgaagacctcaaccacgaattcaaa---A---------------------GT-GC-CAACTA--AACGA-AT-T--TCACTATTAAGG------A-------A---------------------GATAACTCTCAC------AC-T--T------GA--CC-ATAA-AC-G-AAAG--------CAG---------AA-A-CC-GCA-TTGT-ATTCGAAA-AATG-T---ACA---GTCGC--T--------G---AATAAAGAT--------AA---AA-TTTCA-TGAA--A-TTA-CT-TGAAAATTTAAT-AA-ATTT--Attgtttaatcttcatcaaa
gi|17 : aaataaacaacaattaacttcactgaaccctgcatgttctgtatttgttaattaaaagatattagattagtctgggtcaatgttatcagtcggTGTTCA-A-CGA-A-GTTTTCGGTG-TTTCTGATA
gi|17 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaaTACGGT---TTACTAGTAAA---------------------AA---------C------GC-T--T------GA--CC-AATA-TC-G-AAAG--------TAG---------AA-A-TCGGCG---TTTATTCGTCG-AGGA-T---ACA---A------T--CGCT--G---AATAAAGGTTAA-----AA---A--TTTCATTAAA--A-TTA-ctacggtttactagtaaaaacgcttgaccaatatcgaaagtagaaatcggcgtttattcgtcgaggatacaatcgctgaataaaggttaaaaatttcattaaaatta
gi|18 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaatgttcaacgaagttttcggtgtttctgatac--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACTACCCAAG--GATT-GC-ATTGGCATA-TA-TAA--------------AC----ACAAGATACG-TCCCGATT-GGA-GAAC-C-A-ATG-TGA-TAT---TATTTT----------------T-TTTTCACGAATTTACGT-ATC-CACGA-A---ACAGT-GATTTC----TGCC-TT-ATCC-GCG-AAAACT---GA--T--GCCC--ACAAATA-TTGA-TG-AAACCA--CAGTA
gi|19 : -GC-ATTGA-A-A-TT-TAAT-------------AT----G-ATGAGA-GTT--CGATTGTAATGAAG-CAA-ATG--AA-TGTGGGTTTTTTC-ACG-GTGGGGTGCCT-CATCCACGAATCTACGT-AT--CAC---GAACACAGT-GGTTTT----TGC---TGA-CC-ACG-AAAA-TTGAAA--T--GCCC--ACGACTATTTGA-TG-AACCCAC-
gi|2 : ttgTGTTCA-AGCGA-ATGT-----GTGATTCCTGATAG-AAGATTT-CCT-TTCT--GC-T-CCGTCATTGTC--ACG-ACCG----AC-GATCAA-TAGTTA-ATGT-ATAA-TGAAACTT---CCCGGTAA------CT----------AT-A-------GCAGACCCACGCTTT-G-AGGACTTCGC-GCTTGTCCAA-TGCAATCTCCGATT---CACGCCGGGTAA-CGC--TGAAAAAATCGCGCTC-AT--ATAAATCTTTACTG--TTATT-TAATTTTCTA--TCAA-T-GAT-GTC-ACATTAC-C-ATGT--AA-AGA--G--CA-ATAC-AC-TG-------------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-TTCC-AA-ATGGAATAATTGTT-C----TCT-C-TGA-C-ATA--A-TG----------G---G----C-G-C--AGGTTGGTAG-ATTT--ACAC-----AT-------ACT--CCCA-CAC--AATC-TCA--AAA--TTAAGTCG--AACTCA-C-CC---TTTGAA--ACCACTGCTCCCAA-T--------AGA--TCCCATTGATTTTTG------TTA-ACGAA---ACAATTAATGTGTGT-T-----ATTA-----------CCCCAC--ATGCTGAAT---T---------------------GT-GC-TGACAATTAGAGA-AT-TAT--CCC-TTGGCGTATATTA-------A---------------------AA---------C------GC-T----------G--CC-AAGA-TC-G-AAAG--------TAGTATATATGAGA-A-TC-GCG-TTTT-ATGCGTCGTAGGA-T---ACA---A------T--CACCGAG---AACAAAGGT--------AA---A--TT-CA-TGAA--A------------AATTT-AT-AATGTTT--AAAC-TT-----AATTATTTATTGT-TAGTATGTA---T-----GGTATCGAATGCAGTAAGAGTT--TTA-T-ATTGCCTTAAATTTTAACGTACA--A-AT---GAAATCATCGATCT-ACGTTTTAA-A-CCCAGGCAAAATAA---CTTCTTCT-GTACA-AAATGTAAT-TAATAGAGTCAAATTAAACTATTAATCCCAATAATGTA-C-TGAAGATT--TATACAAACAGATAAACTCATT--AATTTGT---TAAGA-CCAAACT----TAA--GATT-GCCATTAG-A-AATA-TCA--------------ATCTGCACAAGAGACGT--CCGA----GATGAAC-CAG--TG-TGA-TCT---ATTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCACCGTAATTACGT-ATC-CACA--A---ACAGT-GA--TT----TGCC-T---TCC-ACG---AA-T---GA--T--GACC--ACGAATA-TTGA-TG-AAA-CACACAGTAag
gi|20 : ttcacatcattcgttgaacaccaatttaagtgattcggatgaccctcaaccacgaattcaaaAG--------TTG---------AA-A-CC-GCG-TTGT-ATTCGAAA-AATG-T---ACA---GTCGC--T--------G---AAAAAAGGT--------AA---AA-TTTCA-TAAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTAAT-AA-GTTT--AAAC-GT-----AATAAAT-GTCAT-T-----GTA---ATT---AATA----ATA-AGT
gi|21 : -TGA-TTT---TTTTT-C-AAA-CTGGG---C----ATCCACGAATCCAC--------AA---A---ACAGT-GGATTT----TGCC-T-GATCC-ACG-AAAATT---GA--T--ACCC--ACGAATA-TTGA-TG-AAACCA--CAGTAtacatattacgtctattgca
gi|22 : aAATA-TGTA-CATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATA--AAATTGTACGTAAGA-T--AACT----AAG--GATT-GC-TTTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCGAT
gi|23 : CG-GTGGG---C----ATCCATGAATTTAAGT-ATC-CACGA-A---ACAGT-TAATTT----TGTC-T-GATCT-ACG-AAAA-TC--GA--T--GCCCA--CGATTA-TTGA-TG-AAACC-C-CA
gi|24 : -CATC-ACGA-TTTA-GT-ATCACGA---A---ACAGT-GATTTT----TGCC--TGATCC-ACG-AAAA-T---GA--TTCGCCC--ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-
gi|25 : TGTTCA-T-CGA-A-GTTT--GATG-CTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCATCATTGTCC-GCA-AATGT-GAGag
gi|26 : -A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCTGA-T-TGTTGAAC-CAA-
gi|3 : aTGTTCA-A-CGA-A-GGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTT-GA-T-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAA-----CTTNN--NNN-NNN-NN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-------AT--A-AAATTTTAACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAAAC-GAT--TC-AAATTAC-C-ATGT--AA-GAA--G--CCCATACCACCTGTT-----------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-T-GC-AA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGAC-ACATTA-TG----------G----------C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CTCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTCCT----------------------TGGATTTT-G------TTA-AACAA---ACAAT-AATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCACTCATGCTGA-T---A---------------------GT-GC-TGACAA--A--------------CC-TTGCAGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GAACCC-AATA-TC-G-AAAG--------TAG---------AA-A-T--GCG-TTTTTATTCGTCG-AAGA-T----CA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TATCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGATTAA-GTTT--AAAC-TT-----AA-AAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AACA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAAAATTA---CATGGAA-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-C-CAG-CAAAA-AAAATCTTATTCTTG--CACAT--GTA-TTC--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATGAG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGT-ATT-C----------CAG--GATTTT----TGCC-TTGATCT-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTAtg
gi|4 : TGTTCA-A-CGA-A-GGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTT-GA-T-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAA-----CTTNN--NNN-NNN-NN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-------AT--A-AAATTTTAACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAAAC-GAT--TC-AAATTAC-C-ATGT--AA-GAA--G--CCCATACCACCTGTT-----------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-T-GC-AA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGAC-ACATTA-TG----------G----------C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CTCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTCCT----------------------TGGATTTT-G------TTA-AACAA---ACAAT-AATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCACTCATGCTGA-T---A---------------------GT-GC-TGACAA--A--------------CC-TTGCAGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GAACCC-AATA-TC-G-AAAG--------TAG---------AA-A-T--GCG-TTTTTATTCGTCG-AAGA-T----CA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TATCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGATTAA-GTTT--AAAC-TT-----AA-AAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AACA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAAAATTA---CATGGAA-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-C-CAG-CAAAA-AAAATCTTATTCTTG--CACAT--GTA-TTC--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATGAG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGT-ATT-C----------CAG--GATTTT----TGCC-TTGATCT-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
gi|5 : TTCA-A-C-A-A-GTTT--G-TG-TTTCTGATAG-AATATTTTCCT-TTCTT-GC-T-CCGTCAT-GTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GAT--A-TAC----ATG-----A-TGAA---TTTTCTCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-TC-CGGTACTCCCTCGCTTTTGCATGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTTCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAGAAAAATC-------GC-------TGTTCA-TAA---ATT-TAATTT-TCTAATCAA-CCGAT-GT--AAATTAC-CGATGT--AA-GAAAAG--CC-A-AC-ACCTGT------------------------A-----------------------CGA-TA--TACTATTGGGAA-TCGGACTAATATTT-C-AC-TCT-CCTGAACCACA--C-TG----------G---G----CGC-G--A---TGGTAA-ATTTTTACACC-TGGATC----TA--C--TCCA-CGC--A-TCCTCA--AA----TA-GTCAAAA---CC-CACC---TTTGAA--ACCAC-GTTCCCAAATTC----ACGGA--T-C--TTGATTTT-GT-----TTA-AACAA---ACAATTAAT--GTGT-TATTAAATTA-----------CCCCG---ATGCTGAAT---A----------------------T-GC-TGACAA--AAC------TATATCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--CTTGAAAGA--CC-AATATTC-G-AAAG--------TAG---------AA-A-TC-GC-----------------------------------------C-----G---AATAATGGT--------AAAATA--TTTCA-TGAAATA-TTACCG-TAAGAATTTGAT-AA-GTTT--AAACTTT-----AAT-AAT-ATTAT-T------TAAT-A-----AGCA----ATG-A-T-AGAG---TTTA---ATT------------------------------AAATC-TCGATC-CTCGTTC--AGA-CTCAG-CAAA----------ATTC----------------T-C--TAGA-TCAC-TTAAAA-ATCA-TTCCAATA-TGT-ACATG-AG--TGAT-TACAAA--GAT----TCATA--TAATTGTA-GTAAGATC--AA-T----CAGCTGATT-GC-ATTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCCAGAGATGTT--CGATT---GTAAACGC---ATGTTGA-------TTTTTTCAACG-GTGGC---CTC-CATCCA-GAATTTACGT-ATCATGA---A---ACAGTGGATTTT------CC---GATCC-ACG-AAAT-T---GA--T--GCCC--ACG-ATA-TTGA-TG-AA
gi|6 : gtggtttctatcatttattcgttgcaacaccaatttttctggattcgttgatgaccccaaccacgaatttacaTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTT-CCGGTAAA-----C-TTG--TGT-GAT-AC-CC-Ccaacaa
gi|6 : ATT-T--TTT-CTAA-TCAA-C-GAT-GTC-AAATTAC-C-ATGT--AA-GAA--G--CC-ATACCACCTGT------------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTTTT--CAC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------GGGCG----T-C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TA-----CCCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGAAATTTCA-CACC---TTTGAA--AACAC-GCTCCCAA-TTC----ACGGA--TCC--TTGATTTT-GA-----TTT-AACAA---ACAACTAAT--GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCG--CATGCTGAAT---A---------------------GT-GC-TGACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TT--------A---------------------AA---------C------G-----T------GA--CC-AATA-TT-G-AAAG--------TAG---------AA-A-TC-GCG--TTTTATTTGTCG-AAGA-T---ACA---A---T--CGAC-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAA-AA-GTTT--AAAC-TT-----GATAAAT-ATTAT-T-----TTATATA-----AGCA----ATG-TTTAAGAGT--TTTA-TT---------------------------------AAATCATCGATCTCACG-TT--A-A-CTCAG-CAAAA-A------------------------TA-T-CT-TAGAGTCA--TTAAAA-ATTA-TTCCAATA-TGT-ACATGAAG--T--A-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGA-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCGA-T-TGATGAAC-C-A-ATG-TGATTTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaattttttctaatcaacgatgtcaaattaccatgtaagaagccataccacctgtacaatatactttgcaatcggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgtcgagtggtagattttacacctgatctacccacgcatctcaaaattagtcgaaatttcacacctttgaaaacacgctcccaattcacggatccttgattttgatttaacaaacaactaatgtgttgttaattaccccgcatgctgaatagtgctgacaaaacgaattattccccttgcggtttaaacgtgaccaatattgaaagtagaaatcgcgttttatttgtcgaagatacaatcgacgaataaaggtaaatttcatgaaattacatgaaaatttgaaaagtttaaacttgataaatattattttatataagcaatgtttaagagttttattaaatcatcgatctcacgttaactcagcaaaaatatcttagagtcattaaaaattattccaatatgtacatgaagtatacaaagatatcattaaattgtacgtaagacaactaaggattgcattgaaatataaatgcaagagacgttccgattgatgaaccaatgtgattttttttttcacggtggg
gi|7 : tgttcaacgaagtttggtgtttctgatagaagattttcctgttcttgctccgtcattgtccacgaccgtgagcgatcaatacatgtataatgaaactttttccggtaaacttgtgtgatacccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaTGTTCA-A-CGGGA-GTTT--GGTG-CTTCTGATAGCAAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-C-GCTATTGTC--ACG-ACCGT-GAGC-GATAAA-TA-----------------ACACTTTTTCCTGGTAAATTAAACCTTG--TGT-GAT-AT-CCACG------CCTCGC--------------GCTTTTTTTTCAA--TGCATCCCCGATC--TCACGCGGGGTA---GC--TAAAAAAATCGCTGTTCAT--A-AAATTTTC-CTGGGTTATT-AATTTT-CTACATCA--C-GAT-GTCCAAA---------GT--AA----------------CATC-GT------------------------A-----------------------CAA-TAA-TACT-TTGC-AA-TCG---TGACTTTT-TCAC-TCT-C-TGAAC-ACA--A-TGCTGAAATGGGGC--G----C-C-GGCAG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TC-ATC----TAACA--C--A-CGCTTC-TC-TCA--CAA--TTA-GTCGCAA-TTCA-CAC----TTTGAA--AACAC-GTTCC-AA-TTTTGAAACGGA--TCC--TTGATTTT-G------TTA-AACAA---ACAACTAAT--GTGT-T---------------------------CATGCTGAATTCAG---------------------GTGGC-TGACAA--AA-GACAT-TATTTCCC-TTGC-GT---TT--------A---------------------AA---------C------GCTT--T------GA---C-AATA-TC-GAAAAG--------TAG----------A-A-TT-GCG--TTTTATTCGTCG-AAGA-T---ACA---A---TCGC--C-----G---AAT
gi|8 : aATTGGGTTACT-T----T-CTAA-TCAG-T-GAT-GTC-AAATTAC-C-ATGT--AG-GAA--G--CC-ATACCACCTGCTAAAGGTTTTTTTCAGTCTCAAGCA-----------------------CAA-TA--TACT-TTGC-AA-GCAGACTAACTTT--CCAT-ATT-CCTGAAC-ATA--A-TG----------G---GTCA-C-C-A--GG--TGGTAG-ATTTTCACACC-TG-ATC----TA--C--CCTG-CAC--A-TG-TCA--AAA--TTT-GT-GGAAATTCA--ACC---TTTGAA--ACCCC-GCTCCTGT-TTC----ATGGA--TCC--TTGATTTT-G------TT-----------TAATTAATG--TGT-TGTT-AATTAACTTAACTCTACCCTGC--ATGCTGAAT---ACTTGATCAATTCAGAGTGGCAGT-GC-TGACAA--AACGA-AT-TATTTCCC-TTGTGAT---TTA-------AAGCTACAGTATTAGGGAAGATAA---------CTCTCATGC-T--C------GA--CC-AGAA-TT-T-AAAG--------TAG---------AA-A-TC-TCA-TTGT-ATTAGAAA-GAGA-T---ACAGTCA---C--T--------G---AATAAAGTT--------AA---AA-TTTCA-AGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTCAAT-AA-GTTT--AAATGTTTTAGAAATAAAT-GTTAT-T-----G
gi|9 : tGGGTTATT-TAATTT-TCTAATCAA-T-GAT-GTC-ACATTAC-C-ATGT--AA-GAA--G--CA-ATACCACCTGT------------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTGTT--CAC-TCT-CCTGGAC-ATA--A-TG----------GGGCG----C-A-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACA-TG-ATC----TA--C--CCCA-CAC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTC-GAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----ACAGA--TCC--TTGATTTT-G------TTA-AACAA---ACAATTAAT--GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCA--CATGCTGAAT---T---------------------GT-GC-TGACAA--AATGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GA--CC-AAGA-TC-G-AAAGTATATATATAG---------AA-A-TC-GCG--TTTTATTCGTCG-TAGA-T---ACA---A---TCAC--C-----G---AACAAAGGTA-------AA---A--TTTCA-TGAA--A------A-T-----TTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-------T-AAT-ATTAT-T-----GTAAT-A-----AACA----ATG-AGTAAGAGT--TTTA-TCATTGCCTTAAATATTA---CACGT-ACAT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CCCAG-C
blockSeqs : T G G T TC A C T . G C CT G C C . TAACA T G T TTAAA T AAT . . NNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNN N NNN NNN NNNNNNN GCGCTCATAT TG A CTAAA AC G C G G TT . AA TC C T TAAAGGTTTTTTTCAGTCTCAAGCA . GT A G G TCC T G C TT A CTGAAATGGGGCGCCGGC GT T C T G AGAG ACTGG G TT A C GT . A GA A C TCT AT T AATTTTGAAAC . CA T CATGAA . . GT A G A ACTTAACTCTA CTC A ACTTGATCAATTCAGAGTGGCA G . TT ACGAATTATTC A ATA AAAGCTACAGTATTAGGGAAGAT TAACTCTCA TCTCAT T CTTGAAA AC . A T . A TATATATA TATATATGA C . G G T TCGT . GTT ATCACCGA CTG TACATGTA AAT AT T AT AT C A A T T AA T TTAGA A T C AGTATG ATCAAT TCGA C TATTTATTATTGCCTTAAAAATTACATGGAAAT TA G G T G TAACTTCTTCTGTACAAAATGTAATTAA AA CT A A AC T AT GA A CA AAC TA T CA ACCC CT C C C T A . ATGTAAGAATATAA CTGC TTT T GT G AAA T TGTGGG A A GTG CTC A CACGAAC G T . TT T A TTGA TT TC AT T T C CA
blockSeqs : T . . . . . . T . . . C . . . . GTTA T . C . A N . . NNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNN N NNN NNN NNNNNNN GCTGTTCATA TA . CTAAA AC G . . . . . . . C T ATAAGTGTTTTTCAGTTCCAAGCA . A . . . TCC . . . TT . GGGCGCCCA . . T A . . ACT . . . . . . . AA A . . . . CAAATTCAC . . . T . . G . G . . CTC A TCAG . . . AGACATTATTT . . ACTAGTAAA . . . T AC . T . . . . . . . . C T TCG . GT GTCGCT CTG TAA . A . . T . . A T . . G . A . . G TATA . . TATTTATTATTGCCTTAAAAATTACATGGAAAT . . . C . AAAATCTTATTCTTGCACATGTATTC C C . . AA A T . . . . . . . . . . . . . . . T . TTT T T . AAA . TTTT . . . CTC . CACCGA . T . TT . . TT . . A . . . C
blockSeqs : . . . . . . . T . . . C . . . . C . . T . T N . . CTCCGGTACT TTTTGCATGACT T ATC GTC AACGCAT ATGAA AA . TCTAA CC G . . . . . . . . T TA . . . . . CC . . . . . GGGCGCCG . . C . . . ACC . . . . . . . GG A . . . . TGTTTCAT . . . A . . G . G . . C A A . . . ACGAATTATTT . . AA . . . T . . G . . . . . . . . T T AAA . . GTCGCT . A . A . . T . . A . . . . . T . . G ATT . . TATATTATGGCTTAAATATTACATGATATCCT . . . T . AAAATCTTATTCTTGCACATGTATTC . C . . AA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC T G . AAA . TAT . . . CT . CACGAA . A . TT . . CT . . A . . . C
blockSeqs : . . . . . . . T . . . C . . . . C . . T . T A . . TCCACG TTTGAGGACTT T TG T ACGC ATA AA . CTACA T G . . . . . . . . T TA . . . . . TC . . . . . GGGCGTCG . . . . . . ACC . . . . . . . GG A . . . . CAATTCAT . . . . . . G . A . . C A T . . . ATGAATTATTC . . AA . . . T . . T . . . . . . . . T T TCG . . ATCGCT . A . A . . T . . A . . . . . A . . G ATA . . TTTATATTGCCTTAAATTTTAACGTACAAAT . . . T . TATCTGATTATGTCAAGGATA . C . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT T T . AA . TCT . . . CT . CACGAA . A . T . . TT . . A . . . C
blockSeqs : . . . . . . . G . . . C . . . . C . . C . T G . . GCAGA . . T . GC ATA CA . TCTAA T G . . . . . . . . T A . . . . . CC . . . . . GGTCACCA . . . . . . ACA . . . . . . . AA A . . . . CAATTCAC . . . . . . G . G . . C A A . . . ACGAATTTC . . AA . . . T . . T . . . . . . . . T T AAA . . GTCGCT . . . . . . T . . A . . . . . A . . G ATA . . TTTATCATTGCCTTAAATATTACACGTACAT . . . C . ATTCTC . A . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT T T . AG . TTT . . . CT . CACAA . T . T . . TC . . A . . . C
blockSeqs : . . . . . . . G . . . C . . . . C . . C . T G . . GC C . TCTA C G . . . . . . . . T G . . . . . C . . . . . GGGCGCAG . . . . . . C . . . . . . . GA T . . . . TGTTTCAT . . . . . . . . G . . C A A . . . GAGAATTAT . . AA . . . T . . T . . . . . . . . T T TCG . . ATCGAC . . . . . . T . . G . . . . . A . . G T . . TAAGTTATAGATTACATGTAT . . . . . ATATCT . A . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT T T . AA . TTT . . . TC . ACGAA . T . T . . T . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . T . . . C . . . . C . . . . C . . . . CTAA C G . . . . . . . . T A . . . . . C . . . . . GGCGCG . . . . . . C . . . . . . . GC A . . . . CAATTCAC . . . . . . . . G . . C . A . . . ACTATAT . . AA . . . T . . T . . . . . . . . T T TCG . . ATCGCC . . . . . . T . . G . . . . . A . . T A . . TTTAATT . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT T T . A . TTT . . . T . ATGAA . T . T . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . CTAA T . . . . . . . . . T A . . . . . C . . . . . GGCGC . . . . . . C . . . . . . . GG A . . . . CAAT . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . AA . . . T . . T . . . . . . . . T T TCG . . GTCACT . . . . . . T . . G . . . . . A . . G A . . TTTATT . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . AAA . T . T . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A . . . . . C . . . . . ACC . . . . . . C . . . . . . . G . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . A . . . C . . A . . . . . . . . T T TCG . . ATCACC . . . . . . T . . G . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C . . . T . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C . . . . . GCG . . . . . . C . . . . . . . G . . . . . T . . . A . . . T . . G . . . . . . . . . . AAA . . GTTC . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . . . . . GCG . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . TCG . . ACTC . . . . . . . . . G . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . ACTC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TTC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C .
blockSeqCons : CTCCGGTACT** GCTATA******* G* GGGCGCCG****************** ACC** ** GG *** ** ****** *** C** ACGAATTATTC** AA**************************** T******** ******** T* GTCGCT************* G***** ATA****** TATTATTATTGCCTTAAATATTACATGAAT*********** AAATCTTATTCTGCACGTGTATTC********** C* ** AA** TTT**** CACGAA***** **** T** T**** **
originalCons : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-AC-CC-CGGCANNCCCTCGCTTTTGCANGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTCCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAAAAAAATC-------AT--A-AAATTTTNACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAA-C-GAT-GTC-AAATTAC-C-ATGT--AA-GAA--G--CC-ATACCACCTGT------------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TG----------G---G----C-C-G--AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CCCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----ACGGA--TCC--TTGATTTT-G------TTA-AACAA---ACAATTAATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCGC-CATGCTGAAT---A---------------------GT-GC-TGACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GC-T--T------GA--CC-AATA-TC-G-AAAG--------TAG---------AA-A-TC-GCG-TTTTTATTCGTCG-AAGA-T---ACA---A---C--T--C-----G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-T-----GTA---A-----AGCA----ATG-AGTAAGAGTTATTTA-TTATTGCCTTAAANATTA---CACG--A-AT---GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAA-AA---CTTATTCT-G--CA-A---GTA-T-C--TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC-CAA-ATG-TGA-TTT---TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATC-CAC---A---ACAGT-GATTTT----TGCC-TTGATCC-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
finalCons : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GAT-ACTCCGGTACT--CCCTCGCTTTTGCANGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTCCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAAAAAAATCGCTATA-------AAATTTTNACTGGGTTATT-TAATTT-CTAAATCAA-C-GATG-TC-AAATTAC-C-ATGT--AA-GAA--G--CC-ATACCACCTGT------------------------A-----------------------CAA-TA--TACT-TTGC-AA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAAC-ACA--A-TGGGGCGCCG------------------AG--TGGTAG-ATTTT-ACACC-TG-ATC----TAACC--CCCA-CGC--A-TC-TCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTTGAA--ACCAC-GCTCCCAA-TTC----ACGGA--TCC--TTGATTTT-G------TTA-AACAA---ACAATTAATG-GTGT-TGTT-AATTA-----------CCCCGC--ATGCTGAAT---A---------------------GT-GC-TGACAA--AACGAATTATTC--CCC-TTGCGGT---TTAA----------------------------AA---------C------GC-TT--------GA--CC-AATA-TC-G-AAAG--------TAG---------AA-A-TC-GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGA-T---ACAGTCGCT-------------G---AATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAAT-ATTAT-TG-----TAATA------AGCA----ATG-AGTAAGAGTTATTATTATTGCCTTAAATATTACATGAAT-----------GAAATCATCGATCTCACGTTT--A-A-CTCAG-CAAAAAAATCTTATTCTGCACGTGTATTC----------TAGAGTCA--TTAAAC-ATTA-TTCCAATA-TGTAACATGAAG--T--T-TACAAA--GATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-GC-ATTGG-A-A-TA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC-CAA--TG-TGATTT----TTTTTTC-ACG-GTGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATCCACGAA-----ACAGT-GATTTT----TGCCT--GATCC-ACG-AAAAT----GA--T--GCCC--ACGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
Alignments
lowQualScore : 11111 11111 333333333333333333 2222222222222 111 111 1111111 333333333333333333333 111111 1 666666666666666666666666666666666666666666666666 111 11111111 11111 1111111111111 111111 11 33333333333333333333333 11 3333333333333333333333333 1111111111111 3333333333333333333333333333333333333333 111111 11111111 111111111 11 111 22222222 11 22222222222222222 7777777777777777777777777777777777777777777 99999999999999999999999999999999 11 11 1111111 11 22222222222222 111 1111111111 111 11 11111 11
lowQualScore : 6 3 3 3 44 3 0 0 3 4 3 3 3 44 3 3 4 4 99999 8 4 0 4 11111 888888888888888888 3 00 6666666666666 3 0 333 0 666 0 2222222 999999999999999999999 444 11 111111 4 0 999999 2 55 3 3 3 55 3 55 55 7 1 0 111111111111111111111111111111111111111111111111 3 77 3 66 3 777 3 3 3 99 3 22222222 77 44 3 3 3 6 6 3 7777 99999 3 44 3 3 44 44 3 9 2 3 666 3 55 3 1111111111111 55 55 4 999999 8888 777 0 44 4 4 4 00000000000000000000000 55 777 0 4444444444444444444444444 4 4 55 0000000000000 4 666 8888888888888888888888888888888888888888 999999 777777 99 66 3 3 2 00000000 2 000000000 2 333 11 5 4 2 111 3 2 444 11111111 555 22 2 33 2 2 3 1 6 3 44 7 99999 4 3 3 3 4 11111111111111111 4 6666666666666666666666666666666666666666666 66 66 5 5 7 5 11111111111111111111111111111111 77 5 00 5 5 55 0 6 0000000 66 777 66 4 66 9999 00 4 4 5555 3 3 55555555555555 7777 888 7 44 55 7 5555555555 3 111 3 3 3 555 2 6 0 3 2 55555 3 3 3 7777 11 0 3 3 33333 44 44 11 3 3 3 3 99
lowQualScore : . . . . .. . . . . . . . . .. . . . . ..... . . . . ..... .................. . .. ............. . . ... . ... . ....... ..................... ... .. ...... . . ...... . .. . . . .. . .. .. . . . ................................................ . .. . .. . ... . . . .. . ........ .. .. . . . . . . .... ..... . .. . . .. .. . . . . ... . .. . ............. .. .. . ...... .... ... . .. . . . ....................... .. ... . ......................... . . .. ............. . ... ........................................ ...... ...... .. .. . . . ........ . ......... . ... .. . . . ... . . ... ........ ... .. . .. . . . . . . .. . ..... . . . . . ................. . ........................................... .. .. . . . . ................................ .. . .. . . .. . . ....... .. ... .. . .. .... .. . . .... . . .............. .... ... . .. .. . .......... . ... . . . ... . . . . . ..... . . . .... .. . . . ..... .. .. .. . . . . ..
lowQualScore : 7 3 3 3 66 3 4 4 6 3 6 6 6 22 6 6 0 0 66666 0 0 9 7 11111 111111111111111111 1 77 9999999999999 7 1 000 1 333 9 0000000 888888888888888888888 333 33 555555 0 8 222222 0 00 6 6 6 00 6 00 00 3 2 4 888888888888888888888888888888888888888888888888 3 99 3 66 3 222 3 3 3 22 3 11111111 11 66 3 3 3 7 7 3 1111 44444 3 66 3 3 66 66 3 9 3 6 444 6 00 6 1111111111111 00 00 0 555555 0000 000 8 00 0 0 0 55555555555555555555555 00 000 8 4444444444444444444444444 0 0 55 9999999999999 0 444 6666666666666666666666666666666666666666 666666 555555 22 88 3 3 9 44444444 7 777777777 7 111 99 7 3 7 000 1 7 555 11111111 000 55 9 99 9 9 1 2 2 1 22 3 11111 4 6 6 6 0 77777777777777777 0 6666666666666666666666666666666666666666666 99 99 0 0 0 0 99999999999999999999999999999999 99 7 00 7 0 66 4 5 9999999 99 888 11 4 11 4444 66 0 0 4444 6 6 00000000000000 7777 888 3 88 00 3 0000000000 3 555 6 3 3 888 8 7 4 3 3 22222 3 3 5 1111 22 4 3 3 55555 66 66 22 3 3 3 3 00
consensus : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GATA-TCCGGTACNCCCTCGCTTTTGCANGACT-CGCTGCTTTTTCAAATNGAATCTCCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAAAAAAATCG-C---T----AT------A-AAATTTTNACTGGGTT------ATT-TAATTT-CTAAATCAA-CGAT-GTC-AAATTAC-C-ATGT--AA-G--AAG--CC-ATACCACCTGT------------------------A-----------------------CAAT-A--TACT-TT-GCAA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAA-CACA--A-TG--------GGGCGCCG--AGT-GGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TAACC--CCCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCC-AATTC----ACGGAT--CC--TTGATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAATTAATG-GTGT-TGTT-AATT-A-----------C-----------CCCGC--ATGC---TGAAT---A---------------------GTG-CT-GACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GCTT------GA--CCAA-TA-TC-GAAA-G--------T-AG---------AA-AT-C-GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT---ACAGT-CGCC--GAATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAATA-TTAT-TG-TA-AT-A--AGC---------AATG-AGTAAGAGTTA--TT-A---TTATTGCCTTAAA-ATTA---CACG--A-A---TGAAATCATCGATC--TCACGTTT--A-A-CTCA-GCAAAAAAA-TCTTATTCT-G-CAC---ATGTA-TC--TAGAGTC--A-TTAAAC-ATT-ATTCCAAT-ATGTAACATGAAG-T--T--TACAA--AGATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-G-CATT-GA-A-ATA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC--C-AA-----T----G-TGA-TTTTTTTTTC-ACG-G-TGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATCCA--CG-AA-ACAGT-GATTTT----TGCC--TGATCC-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCC--A-CGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
Reference ( family-4914 ) : TGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCCCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GATACTCCGGTACTCCCTCGCTTTTGCANGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTCCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAAAAAAATCG-C---T----AT------A-AAATTTTNACTGGGTT------ATT-TAATTT-CTAAATCAA-CGAT-GTC-AAATTAC-C-ATGT--AA-G--AAG--CC-ATACCACCTGT------------------------A-----------------------CAAT-A--TACT-TT-GCAA-TCGGACTAATTTTT-CCAC-TCT-CCTGAA-CACA--A-TG--------GGGCGCCG--AGT-GGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TAACC--CCCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCC-AATTC----ACGGAT--CC--TTGATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAATTAATG-GTGT-TGTT-AATT-A-----------C-----------CCCGC--ATGC---TGAAT---A---------------------GTG-CT-GACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GCTT------GA--CCAA-TA-TC-GAAA-G--------T-AG---------AA-AT-C-GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT---ACAGT-CGCT--GAATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-----AATAAATA-TTAT-TG-TA-AT-A--AGC---------AATG-AGTAAGAGTTA--TT-A---TTATTGCCTTAAATATTA---CATG--A-A---TGAAATCATCGATC--TCACGTTT--A-A-CTCA-GCAAAAAAA-TCTTATTCT-G-CAC---GTGTATTC--TAGAGTC--A-TTAAAC-ATT-ATTCCAAT-ATGTAACATGAAG-T--T--TACAA--AGATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-G-CATT-GG-A-ATA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCGATT-TGATGAAC--C-AA-----T----G-TGA-TTTTTTTTTC-ACG-G-TGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGT-ATCCA--CG-AA-ACAGT-GATTTT----TGCC--TGATCC-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCC--A-CGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
gi|1 : ATCC--CG-AAAA-TT--GG--T--GTTC--AACGAATA-T-GA-TG-AAAC
gi|1 : gtgacctcgcacaagttctagactctaaacttgtacttTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTT-TTTCTGACAG-GAGATTT-CCTGTTCTTTAT-T-CCGTCATTGTCT-TCG-ACCG--GAGC-GATCAAATAC----AAGT-ATG--TGAAACTTTTTCT-GGTAAA-----CTTTA--TGTTGAT-------TACTCCCNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N---N----NN------N-NNNNNNNNNNNNNNNNNTCATAATT-TAATTT-TCTAATCAA-TGATTGTC-AAATTAC-C-ATGT--AAAG--AAG--CC-ATAGCACCTGT------------------------A-----------------------CAATTA--TACT-T--GCAA-TCGGACTAATTTT---CAC-TCT-CCTGAA-CGCA--A-TG--------GG-CGCAG--AGT-GGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TTACC--CC-A-CGC--A-T-CTCA--GAAATTTA-GTCG-AAATTCA-CACC---TTTTGAA--ACCAC-GCTCCC-AATTC----CAGGATTTCC--TTGATTTT-G------TTTTACAACAATCCACAACTCATG--TGT-TATT-AATT-A-----------C-----------CCCGCC-ATGC---TGAAT---A---------------------GTG-CTTGACAA--AACAA-ATCTATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------A----------C------GCTAAA----GA--CCAAATA-TCAGAAA-G--------TTAG---------AA-ATTC-GCGCCTTTTATTCGTTG-AAGATT--ACAA--CGCC--GAA-AAAG----------AA---C--GTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAT-AA-GTTC--AAAC-TT-----AATAAATA-TTAT-TT-AA-AT-A--AGC---------AATG-AGTAAGAGTTT--TT---------------------------ATG--A-------AAATCACCCGCCATTCACGTTT--A-A-CTCA-GCAAAA-------TA-TCT----------TGT--------GAGTC--A-TTAAA--ATC-ATTCCAAT-ATGT-ACATG--T-C--T--TAC-A--AGATA---TCATT---AATT-TACAT-AGA-C--AACT----AAGC-GATT-G-CATT--G-A-ATATTAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCAA-T-TGATGAAC--C-AA-----TGG--G-TGA---TGTTTTTC-ACG-G-TGGG---CCT-CGT-CACGAATTTACGT-ATCCA--CGAAA-ACAGT-GATTTTGTGCTGCCTTTGATCCTACG-AAAATT---GATTT--GCCCATA-CGAATA-TTGATTGCAAACCAC-ttgttgatgaccgccacccacacgaattcaagatgttcaacgaagtttggtttttctgacaggagatttcctgttctttattccgtcattgtcttcgaccggagcgatcaaatacaagtatgtgaaactttttctggtaaactttatgttgattactcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcataatttaattttctaatcaatgattgtcaaattaccatgtaaagaagccatagcacctgtacaattatacttgcaatcggactaattttcactctcctgaacgcaatgggcgcagagtggtagattttacacctgatcttaccccacgcatctcagaaatttagtcgaaattcacaccttttgaaaccacgctcccaattccaggatttccttgattttgttttacaacaatccacaactcatgtgttattaattaccccgccatgctgaatagtgcttgacaaaacaaatctattccccttgcggtttaaacgctaaagaccaaatatcagaaagttagaaattcgcgccttttattcgttgaagattacaacgccgaaaaagaacgttcatgaaattacatgaaaatttgataagttcaaacttaataaatattatttaaataagcaatgagtaagagtttttatgaaaatcacccgccattcacgtttaactcagcaaaatatcttgtgagtcattaaaatcattccaatatgtacatgtcttacaagatatcattaatttacatagacaactaagcgattgcattgaatattaaatgcaagagacgttccaattgatgaaccaatgggtgatgtttttcacggtgggcctcgtcacgaatttacgtatccacgaaaacagtgattttgtgctgcctttgatcctacgaaaattgatttgcccatacgaatattgattgcaaaccacaatat
gi|10 : gtgacctcgcacaagttctagactctaaacttgtacttgtttcatcatattcgttgaacaccaattttcgggatttgttgatgaccgccacccacacgaattcaagaTGTTCATA-CGA---GTTT--GG-G-TT-CTGATAG-AATATCTTCCTGTACTT-GCGT-CCGTCATTTCCCTACGGACCAT-GCCCCGATCAA-TAC----ATGC-ATAA-TGAAACTTTTT-CCGGTAAA-----CTTaatat
gi|10 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaaTACCGCCTGT------------------------A-----------------------CGAT-A--TATT-TT-GCAA-TTGGACTAATTTTT-C-AC-TCT-CCTGAA-CACA--A-TG--------GGGCGCCG--AGT-CGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----CA--C--CCCA-CGT--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCGAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaccgcctgtacgatatattttgcaattggactaatttttcactctcctgaacacaatggggcgccgagtcgtagattttacacctgatccaccccacgtatctcaaaattagtcgaaat
gi|11 : gtgctctcgcacaaaactacatttagtaactgttggtcatcattttatcgttgataacaccaatttctcgtgattcgttgatgaccgtacaaccacgaattcaaatgttcatacgagtttgggttctgatagaatatcttcctgtacttgcgtccgtcatttccctacggaccatgccccgatcaatacatgcataatgaaactttttccggtaaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAT-GTC-A--TTGCGC-ATTTTTAA-G--TAGTCCC-A-AGCAC-TGT------------------------G-----------------------TAAC-A--T-----T-GCAA-TCAGACTAATTTTT-CCACTTCTGTCTGAA-----------------------ACC---AGG-GGTAGTA-TTTTCACACCTT-GATCAGAGTTACTGGCCCAGCAC--A-C-CTCAGTGAA--TCC-GTCAAATATTCA-CACCTCTTTT-GAAATACCAT-GATCTT-GTTTC----ATGGAT--CC--TTGATTTT-GCATGAATT--A-AACAA---ACAATT-ATG-GTGTAAGTT-AATTAA-----------CTTCACTGAACGCCTGC--ATGCTTATGAAT---A---------------------t
gi|11 : cccatatactgtgtattagaagccA---------C------ACTT------GG--TCAA--A-GC-GAAA-G--------T-AG---------AACAC-C-GCGG-TTGTAGT--TCG-AAAATGT-ACAGT-CGCT--GAATAAAGGT--------AA---AATTTTCA--GAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTAAT-AA-GTTT--Acttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcacacttggtcaaagcgaaagtagaacaccgcggttgtagttcgaaaatgtacagtcgctgaataaaggtaaaattttcagaaattacatgaaaatttaataagttta
gi|12 : cccatatactgtgtattagaagccatgtcattgcgcatttttaagtagtcccaagcactgtgtaacattgcaatcagactaatttttccacttctgtctgaaaccaggggtagtattttcacaccttgatcagagttactggcccagcacacctcagtgaatccgtcaaatattcacacctcttttgaaataccatgatcttgtttcatggatccttgattttgcatgaattaaacaaacaattatggtgtaagttaattaacttcactgaacgcctgcatgcttatgaatacttgtttatataaaaggatagcttggggtccaattgtataaatttggagaaggtactgtactattagggaagaaacctcTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--G-TG-TT-CTGATAG-AAGATTTTCCTGTTTCT-GC-TCCCGTCATTGTCC-ACG-CGAGT-GAGC-GATCAA--A-----ATGT-ATAA-TGAAACTTTT
gi|12 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacaGCATGAAGAGAATCGGC---T----GTTCATGAA-AAATTTTTGCTGGGTT------ATTATAATTT------TCAA-TG-----C-AA----C-C-AT-T--A--G--AAG--CC-ATACTACCTGC------------------------ATAAGTGTTTTTCAGTTCCAAGCACAAA-AGTTACA-TT-GCAAGTCGGACTAATTTTT---AT-TCT-CCTGAA-CACA--AATG--------GGGCGCCC--AATTGGTAG-A-TTTT-ACACCAT-GATC----TA--C--CCCA-CGC--A-C-C-CA--AAA--TTA-GTC-GAAATTCACCACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCC-AATTC----ATGGAT--CC--TTGATgtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcatgaagagaatcggctgttcatgaaaaatttttgctgggttattataattttcaatgcaaccattagaagccatactacctgcataagtgtttttcagttccaagcacaaaagttacattgcaagtcggactaatttttattctcctgaacacaaatggggcgcccaattggtagattttacaccatgatctaccccacgcacccaaaattagtcgaaattcaccacctttgaaaccacgctcccaattcatggatccttgat
gi|13 : cgtggatttcgttgatgaccgaaaccacgaattcaacatgttcaacgaagtttgtgttctgatagaagattttcctgtttctgctcccgtcattgtccacgcgagtgagcgatcaaaatgtataatgaaacttttgtagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AG---------AA-AT-C--CGC-TTTTATTCG----AAGAT---AC-TT-CGCT--GAATAAAGGTTACATGTAAA---A--TTTCA-GGAA--AATTA-CAATGAAAATTTAAT-AA-G-----GAAC-TT-----AATAAATA-TTAT-TG-TA-ATCAATAAC---------AACG-AGAAGAAGTTA---T-A---TTA-TGGCTTAAATATTA---CATG--ATATCCTGAAATCATCGATC--TCATGTTT--A-AGCTCA-GT-AAAATA-TCTGATTAT-GTCAA---GGATA-----TAGAGTC--A-TT-AAC-ATT-TTTCCAAT-ATGTACCTTGTAGTT--T--TATAA--AGATA---TCATTTAAAGTTGTACGTAAGA-C--AAC------AA--GATTCG-CATT-GA-A-ATA-TAAATGTAAGAATATAAAT----GCAAGAGACGT------TC-TGATGGA-------------------TGA----TTTTTTC-ACGAG-TGGG---CCT-CATCCACGAATTTACGTAATCCA--CC-GA-ACAGT-GA-TTT----TGCC--T-ATCC-ACGAAAAA-T---GA--T--G-CC--A-CGAATA-TTGA-TA-AAACCA--CAGT
gi|14 : AAA-G--------T-AG---------AA-AT-C-GCGT-TTGTATTTG--A-AAAATGTTACAGTTCGCT--GAATAAAGGTA-------AA---A--TTTCA-TGAA--A--TA-CA-TGAAAGTTGAAT-AA-GTTTAAAAAG-TT-----AATAAATG--TATCTG----------------------AATG-AATAATAGTTAAGTT-A---T-----------AGATTA---CATG--T-A---TG
gi|15 : aataggaagataactctcaccactggaccgaaaagcaaTGTTCATC-CAA-A-GTTT--GGTG-CTTCTGATAG-GAGATATTCCTGTTCTT-GC-T-TCGTCACTGTCC-ACG-ATCGTCGAGC-GATCAA-TATAACAATGT-ATAAGTAAAAATTTTTTCTGGAAAA-----CACTAATTGA-GATATTcaccttaatgtgtcagcgattttgttataaacaatatgtcgataaatgcgatgaaaaaatctacagtatcaatctttaactcctatatcagcgcagc
gi|16 : accataatcatctgaaatagaatgaagaactacatcattggtagatctgaatgaatatttggtttcatcattattcgtttgacacctttttgtgatttcattgaagacctcaaccacgaattcaaa---A---------------------GTG-CC-AACTA--AACGA-AT-T--TCACTATTAAGG------A-------A---------------------GATAACTCTCAC------ACTT------GA--CCAT-AA-AC-GAAA-G--------C-AG---------AA-AC-C-GCAT-TGT-ATTCGAAA-AATGT---ACAGT-CGCT--GAATAAAGAT--------AA---AA-TTTCA-TGAA--A-TTA-CT-TGAAAATTTAAT-AA-ATTT--Agtttaatcttcatcaaa
gi|17 : aaataaacaacaattaacttcactgaaccctgcatgttctgtatttgttaattaaaagatattagattagtctgggtcaatgttatcagtcggTGTTCA-A-CGA-A-GTTTTCGGTG-TTTCTGATA
gi|17 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaaTACGGT---TTACTAGTAAA---------------------AA---------C------GCTT------GA--CCAA-TA-TC-GAAA-G--------T-AG---------AA-AT-CGGCG---TTTATTCGTCG-AGGAT---ACAAT-CGCT--GAATAAAGGTTAA-----AA---A--TTTCATTAAA--A-TTA-ctacggtttactagtaaaaacgcttgaccaatatcgaaagtagaaatcggcgtttattcgtcgaggatacaatcgctgaataaaggttaaaaatttcattaaaatta
gi|18 : tactgttggttgtcatcatttattcgtgaatccaatttcgggatttcgtttgatgaccgcaaccacgattcaatgttcaacgaagttttcggtgtttctgatacGATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACTACCCAAG--GATT-G-CATT-GGCATATA-TAA--------------AC----ACAAGATACG-TCCCGATT-GGA-GAAC--C-AA-----T----G-TGA-TATTATTTT-----------------T-TTTTCACGAATTTACGT-ATCCA--CG-AA-ACAGT-GATTTC----TGCC--TTATCC-GCG-AAAACT---GA--T--GCCC--A-CAAATA-TTGA-TG-AAACCA--CAGTA
gi|19 : -G-CATT-GA-A-ATT-TAAT-------------AT----G-ATGAGA-GTT--CGATTGTAATGAAG--C-AAATGAAT----G-TGG-GTTTTTT--C-ACG-G-TGGGGTGCCT-CATCCACGAATCTACGT-AT-CA--CG-AACACAGT-GGTTTT----TG-C--TGA-CC-ACG-AAAA-TTGAAA--T--GCCC--A-CGACTATTTGA-TG-AACCCAC-
gi|2 : ttgATT-CGTTGAACACC-AA-----TTTAAG-TGA-TT----------CG-GATGAC---CCT-CAACCACGAATTCAAAT-GTTCAAGCG-AA-TGTGT-GATT--------CC--TGATag
gi|2 : ttcacatcTGTTCA-AGCGA-ATGT-----GTGATTCCTGATAG-AAGATTT-CCT-TTCT--GC-T-CCGTCATTGTC--ACG-ACCG----AC-GATCAA-TAGTTA-ATGT-ATAA-TGAAACTT---CCCGGTAA------CT----------ATA-----GCAGACCCACGCTTT-G-AGGACTTCGC-GCTTGTCCAA-TGCAATCTCCGATT---CACGCCGGGTAA-CGC--TGAAAAAATCG-CGCTC----AT------ATAAATCTTTACTG--TT------ATT-TAATTTTCTA--TCAA-TGAT-GTC-ACATTAC-C-ATGT--AA-A--GAG--CA-ATAC-AC-TG-------------------------A-----------------------CAAT-A--TACT-TT-CCAA-ATGGAATAATTGTT-C----TCT-C-TGA--CATA--A-TG--------GG-CGCAG--GTT-GGTAG-A-TTT--ACAC-----AT-------ACT--CCCA-CAC--AAT-CTCA--AAA--TTAAGTCG--AACTCA-C-CC---TTT-GAA--ACCACTGCTCCC-AAT--------AGAT--CCCATTGATTTTTG------TT--A-ACGAA---ACAATTAATGTGTGT-T-----ATT-A-----------C-----------CCCAC--ATGC---TGAAT---T---------------------GTG-CT-GACAATTAGAGA-AT-TAT--CCC-TTGGCGTATATTA-------A---------------------AA---------C------GCT--------G--CCAA-GA-TC-GAAA-G--------T-AGTATATATGAGA-AT-C-GCG--TTTTATGCGTCGTAGGAT---ACAAT-CACCGAGAACAAAGGT--------AA---A---TTCA-TGA--------------AAAATTT-AT-AATGTTT--AAAC-TT-----AAT---TATTTAT-TGTTA-GT-A--TGTATGGTATCGAATGCAGTAAGAGTT---TT-A----TATTGCCTTAAATTTTAACGTACA--A-A---TGAAATCATCGATC--T-ACGTTTTAA-A-CCCAGGCAAAATAA--CTTCTTCT-G-TACAAAATGTAATTAATAGAGTCAAA-TTAAACTATTAATCCCAATAATGT-AC-TGAAGAT--TTATACAAACAGATAAACTCATT--AATTTGT---TAAGA-CCAAACT----TAA--GATT-GCCATTAGA-A-ATA-TCA--------------ATCTGCACAAGAGACG--TCCGA----GATGAAC--C-AG-----T----G-TGA-TCTATTTTTC-ACG-G-TGGG---CCT-CATCACCGTAATTACGT-ATCCA--C--AA-ACAGT-GA--TT----TGCC--T--TCC-ACG---AA-T---GA--T--GACC--A-CGAATA-TTGA-TG-AAA-CACACAGTAagaagatttcctttctgctccgtcattgtcacgaccgacgatcaatagttaatgtataatgaaacttcccggtaactatagcagacccacgctttgaggacttcgcgcttgtccaatgcaatctccgattcacgccgggtaacgctgaaaaaatcgcgctcatataaatctttactgttatttaattttctatcaatgatgtcacattaccatgtaaagagcaatacactgacaatatactttccaaatggaataattgttctctctgacataatgggcgcaggttggtagatttacacatactcccacacaatctcaaaattaagtcgaactcaccctttgaaaccactgctcccaatagatcccattgatttttgttaacgaaacaattaatgtgtgttattaccccacatgctgaattgtgctgacaattagagaattatcccttggcgtatattaaaacgctgccaagatcgaaagtagtatatatgagaatcgcgttttatgcgtcgtaggatacaatcaccgagaacaaaggtaaattcatgaaaaatttataatgtttaaacttaattatttattgttagtatgtatggtatcgaatgcagtaagagttttatattgccttaaattttaacgtacaaatgaaatcatcgatctacgttttaaacccaggcaaaataacttcttctgtacaaaatgtaattaatagagtcaaattaaactattaatcccaataatgtactgaagatttatacaaacagataaactcattaatttgttaagaccaaacttaagattgccattagaaatatcaatctgcacaagagacgtccgagatgaaccagtgtgatctatttttcacggtgggcctcatcaccgtaattacgtatccacaaacagtgatttgccttccacgaatgatgaccacgaatattgatgaaacacacagta
gi|20 : ttcacatcattcgttgaacaccaatttaagtgattcggatgaccctcaaccacgaattcaaaA-G--------T-TG---------AA-AC-C-GCGT-TGT-ATTCGAAA-AATGT---ACAGT-CGCT--GAAAAAAGGT--------AA---AA-TTTCA-TAAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTAAT-AA-GTTT--AAAC-GT-----AATAAATG-TCAT-TG-TA-AT-T--AAT---------AATA-AGTTACA--TA--TT-ACGTCTATTGC
gi|21 : -TGA-TTTTTTTT-C-AAA-C-TGGG---C----ATCCACGAAT---------CCA--CA-AA-ACAGT-GGATTT----TGCC--TGATCC-ACG-AAAATT---GA--T--ACCC--A-CGAATA-TTGA-TG-AAACCA--CAGTAa
gi|22 : aAAT-ATGTA-CATGAAG-T--T--TACAA--AGATA---TCATA--AAATTGTACGTAAGA-T--AACT----AAG--GATT-G-CTTT-GA-A-ATA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCGAT
gi|23 : CG-G-TGGG---C----ATCCATGAATTTAAGT-ATCCA--CG-AA-ACAGT-TAATTT----TGTC--TGATCT-ACG-AAAA-TC--GA--T--GCCC--A-CGATTA-TTGA-TG-AAACC-C-CA
gi|24 : -CATC-ACGA-TTTA-GT-ATC-A--CG-AA-ACAGT-GATTTT----TGCC--TGATCC-ACG-AAAA-T---GA--TTCGCCC--A-CGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-
gi|25 : TGTTCA-T-CGA-A-GTTT--GATG-CTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCATCATTGTCC-GCA-AATGT-GAGag
gi|26 : -A-ATA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCTGA-T-TGTTGAAC--C-AA-----T----G-
gi|3 : aTGTTCA-A-CGA-A-GGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTT-GA-T-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAA-----CTTNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-----------AT------A-AAATTTTAACTGGGTT------ATT-TAATTT-CTAAATCAAACGAT--TC-AAATTAC-C-ATGT--AA-G--AAG--CCCATACCACCTGTT-----------------------A-----------------------CAAT-A--TACT-T--GCAA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGA-CACATTA-TG--------G-----CG--AGT-GGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TAACC--CTCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCT----------------------TGGATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAAT-AATG-GTGT-TGTT-AATT-A-----------C-----------CCCACTCATGC---TGA-T---A---------------------GTG-CT-GACAA--A--------------CC-TTGCAGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GCTT------GAACCCAA-TA-TC-GAAA-G--------T-AG---------AA-AT---GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT---CAACT-CG-----AATAAAGGT--------AA---A--TATCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGATTAA-GTTT--AAAC-TT-----AA-AAATA-TTAT-TG-TA-A-----AAC---------AATG-AGTAAGAGTTA--TTTA---TTATTGCCTTAAAAATTA---CATGGAA-A---TGAAATCATCGATC--TCACGTTT--A-A-C-CA-GCAAAAAAAATCTTATTCTTG-CAC---ATGTATTC--TAGAGTC--A-TTAAAC-ATT-ATTCCAAT-ATGTAACATGAAG-T--T--TACAA--AGATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-G-CATG-AG-A-ATA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC--CAAA-----T----G-TGA-TTTTTTTTTC-ACG-G-TGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGT-ATTC----------CAG--GATTTT----TGCCT-TGATCT-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-A-CGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
gi|4 : TGTTCA-A-CGA-A-GGTT--GGTG-TTTCTGA-AG-AAGATTTGCCTGTTCTT-GA-T-CCGTTATTGTTC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCCA-TAC----ATGTTATAA-TGAAACTTTTTTCCGGTAAA-----CTTNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-----------AT------A-AAATTTTAACTGGGTT------ATT-TAATTT-CTAAATCAAACGAT--TC-AAATTAC-C-ATGT--AA-G--AAG--CCCATACCACCTGTT-----------------------A-----------------------CAAT-A--TACT-T--GCAA-TCAGACTGATTTTTTCCAC-TCT-CCTGGA-CACATTA-TG--------G-----CG--AGT-GGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TAACC--CTCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTTGGAAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCT----------------------TGGATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAAT-AATG-GTGT-TGTT-AATT-A-----------C-----------CCCACTCATGC---TGA-T---A---------------------GTG-CT-GACAA--A--------------CC-TTGCAGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GCTT------GAACCCAA-TA-TC-GAAA-G--------T-AG---------AA-AT---GCGT-TTTTATTCGTCG-AAGAT---CAACT-CG-----AATAAAGGT--------AA---A--TATCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGATTAA-GTTT--AAAC-TT-----AA-AAATA-TTAT-TG-TA-A-----AAC---------AATG-AGTAAGAGTTA--TTTA---TTATTGCCTTAAAAATTA---CATGGAA-A---TGAAATCATCGATC--TCACGTTT--A-A-C-CA-GCAAAAAAAATCTTATTCTTG-CAC---ATGTATTC--TAGAGTC--A-TTAAAC-ATT-ATTCCAAT-ATGTAACATGAAG-T--T--TACAA--AGATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-G-CATG-AG-A-ATA-TAA--------------AT----GCAAGAGACGTTTCCAATT-TGATGAAC--CAAA-----T----G-TGA-TTTTTTTTTC-ACG-G-TGGG---CCTCCATCCACGAATTTACGT-ATTC----------CAG--GATTTT----TGCCT-TGATCT-ACG-AAAA-T---GA--T--GCCCA-A-CGAATA-TTGA-TG-AAACCAC-CAGTA
gi|5 : TTCA-A-C-A-A-GTTT--G-TG-TTTCTGATAG-AATATTTTCCT-TTCTT-GC-T-CCGTCAT-GTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GAT--A-TAC----ATG-----A-TGAA---TTTTCTCGGTAAA-----CTTTA--TGT-GATACTCCGGTACTCCCTCGCTTTTGCATGACT-CGCTGCTTTTTCAAATCGAATCTTCGATCGTCCGCGCGGGGTAAACGCATTAGAAAAATCG-C---T----GT-----------TCATAA-------------ATT-TAATTT-TCTAATCAACCGAT-GT--AAATTAC-CGATGT--AA-GAAAAG--CC-A-A-CACCTGT------------------------A-----------------------CGAT-A--TACTATTGGGAA-TCGGACTAATATTT--CAC-TCT-CCTGAACCACA--C-T---------GGGCG-CG--A-T-GGTAA-ATTTTT-ACACC-TGGATC----TA--C--TCCA-CGC--A-TCCTCA--AA----TA-GTCAAAA---CC-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GTTCCCAAATTC----ACGGAT---C--TTGATTTT-GT-----TT--A-AACAA---ACAATTAAT--GTGT-TATTAAATT-A-----------C-----------CCCG---ATGC---TGAAT---A----------------------TG-CT-GACAA--AAC------TATATCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GCTCTTGAAAGA--CCAA-TATTC-GAAA-G--------T-AG---------AA-AT-C-GC-------------CG-A---------------------ATAATGGT--------AAAATA--TTTCA-TGAAATA-TTACCG-TAAGAATTTGAT-AA-GTTT--AAACTTT-----AAT-AATA-TTAT-T--TA-AT-A--AGC---------AATG-A-T-AGAGT----TT-A-----ATT------------------------------AAATC-TCGATC---CTCGTTC--AGA-CTCA-GCAAA---------ATTC----------------TC--TAGA-TC--ACTTAAAA-ATC-ATTCCAAT-ATGT-ACATG-AG-TGAT--TACAA--AGAT----TCATA--TAATTGTA-GTAAGATC--AA-T----CAGCTGATT-G-CATT-GA-A-ATA-TAA--------------AT----GCCAGAGATGTT--CGATT---GTAAAC--G-CA-----T----GTTGA----TTTTTTCAACG-G-TGGC---CTC-CATCCA-GAATTTACGT-AT-CA--TG-AA-ACAGTGGATTTT-------C--CGATCC-ACG-AAAT-T---GA--T--GCCC--A-CG-ATA-TTGA-TG-AA
gi|6 : gtggtttctatcatttattcgttgcaacaccaatttttctggattcgttgatgaccccaaccacgaatttacaTGTTCA-A-CGA-A-GTTT--GGTG-TTTCTGATAG-AAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-CCGTCATTGTCC-ACG-ACCGT-GAGC-GATCAA-TAC----ATGT-ATAA-TGAAACTTTTTCC-GGTAAA-----CTT-----GT-G------TGATACCCCCNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N---N----NN------N-NNNNNNNCA-TAA---------ATT-T--TTT-CTAA-TCAA-CGAT-GTC-AAATTAC-C-ATGT--AA-G--AAG--CC-ATACCACCTGT------------------------A-----------------------CAAT-A--TACT-TT-GCAA-TCGGACTAATTTTT-C-AC-TCT-CCTGAA-CACA--A-TG--------GGGCGTCG--AGT-GGTAG-A-TTTT-ACACC-T-GATC----TA-----CCCA-CGC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCGAAATTTCA-CACC---TTT-GAA--AACAC-GCTCCC-AATTC----ACGGAT--CC--TTGATTTT-GA-----TT--T-AACAA---ACAACTAAT--GTGT-TGTT-AATT-A-----------C-----------CCCGC--ATGC---TGAAT---A---------------------GTG-CT-GACAA--AACGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TT--------A---------------------AA---------C------G--T------GA--CCAA-TA-TT-GAAA-G--------T-AG---------AA-AT-C-GCG--TTTTATTTGTCG-AAGAT---ACAAT-CGAC--GAATAAAGGT--------AA---A--TTTCA-TGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTTGAA-AA-GTTT--AAAC-TT-----GATAAATA-TTAT-TT-TATAT-A--AGC---------AATG-TTTAAGAGTT---TT-A---TT---------------------------------AAATCATCGATC--TCACG-TT--A-A-CTCA-GCAAAAATA-TCT-------------------------TAGAGTC--A-TTAAAA-ATT-ATTCCAAT-ATGT-ACATGAAG-T--A--TACAA--AGATA---TCATT--AAATTGTACGTAAGA-C--AACT----AAG--GATT-G-CATT-GA-A-ATA-TAA--------------AT----GCAAGAGACG-TTCCGA-T-TGATGAAC--C-AA-----T----G-TGATTTTTTTTTTC-ACG-G-TGGG---caacaa
gi|7 : TGTTCA-A-CGGGA-GTTT--GGTG-CTTCTGATAGCAAGATTTTCCTGTTCTT-GC-T-C-GCTATTGTC--ACG-ACCGT-GAGC-GATAAA-TA-----------------ACACTTTTTCCTGGTAAATTAAACCTTG--TGT-GATA-TCC---ACGCC-TCGC--------------GCTTTTTTTTCAA--TGCATCCCCGATC--TCACGCGGGGTA---GC--TAAAAAAATCG-C---TGTTCAT------A-AAATTTTC-CTGGGTT------ATT-AATTTT-CTACATCA--CGAT-GTCCAAA---------GT--AA----------------CATC-GT------------------------A-----------------------CAAT-AA-TACT-TT-GCAA-TCG---TGACTTTT-TCAC-TCT-C-TGAA-CACA--A-TGCTGAAATGGGGCGCCGGCAGT-GGTAG-A-TTTT-ACACC-T-CATC----TAACA--C--A-CGCTTC-T-CTCA--CAA--TTA-GTCGCAA-TTCA-CAC----TTT-GAA--AACAC-GTTCC--AATTTTGAAACGGAT--CC--TTGATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAACTAATG------TGTT----------------------------------C--ATGC---TGAATTCAG---------------------GTGGCT-GACAA--AA-GACAT-TATTTCCC-TTGCG-T---TTA-------A---------------------A----------C------GCTTT-----GA--C-AA-TA-TC-GAAAAG--------T-AG---------AA--T-T-GCGT-TTT-ATTCGTCG-AAGAT---ACAAT-CGCC--GAAT
gi|8 : aATTGGGTT------ACT-T----T-CTAA-TCAG-TGAT-GTC-AAATTAC-C-ATGT--AG-G--AAG--CC-ATACCACCTGCTAAAGGTTTTTTTCAGTCTCAAGCA-----------------------CAAT-A--TACT-TT-GCAA-GCAGACTAACTTT--CCAT-ATT-CCTGAA-CATA--A-TG--------GGTCACCA--GGT-GGTAG-A-TTTTCACACC-T-GATC----TA--C--CCTG-CAC--A-T-GTCA--AAA--TTT-GT-GGAAATTCA--ACC---TTT-GAA--ACCCC-GCTCCT-GTTTC----ATGGAT--CC--TTGATTTT-G------TT-------------TAATTAATG--TGT-TGTT-AATT-AACTTAACTCTAC-----------CCTGC--ATGC---TGAAT---ACTTGATCAATTCAGAGTGGCAGTG-CT-GACAA--AACGA-AT-TATTTCCC-TTGTGAT---TTA-------AAGCTACAGTATTAGGGAAGATAA---------CTCTCATGCTC------GA--CCAG-AA-TT-TAAA-G--------T-AG---------AA-AT-C-TCAT-TGT-ATTAGAAA-GAGAT---ACAGT-CACT--GAATAAAGTT--------AA---AA-TTTCA-AGAA--A-TTA-CA-TGAAAATTCAAT-AA-GTTT--AAATGTTTTAGAAATAAATG-TTAT-TG-
gi|9 : tGGGTT------ATT-TAATTT-TCTAATCAA-TGAT-GTC-ACATTAC-C-ATGT--AA-G--AAG--CA-ATACCACCTGT------------------------A-----------------------CAAT-A--TACT-TT-GCAA-TCGGACTAATTGTT-C-AC-TCT-CCTGGA-CATA--A-TG--------GGGCGCAG--AGT-GGTAG-A-TTTT-ACACA-T-GATC----TA--C--CCCA-CAC--A-T-CTCA--AAA--TTA-GTCG-AAATTCA-CACC---TTT-GAA--ACCAC-GCTCCC-AATTC----ACAGAT--CC--TTGATTTT-G------TT--A-AACAA---ACAATTAATG--TGT-TGTT-AATT-A-----------C-----------CCCAC--ATGC---TGAAT---T---------------------GTG-CT-GACAA--AATGA-AT-TATTCCCC-TTGCGGT---TTA-------A---------------------AA---------C------GCTT------GA--CCAA-GA-TC-GAAA-GTATATATAT-AG---------AA-AT-C-GCG--TTTTATTCGTCG-TAGAT---ACAAT-CACC--GAACAAAGGTA-------AA---A--TTTCA-TGAA--A------A-T-----TTTGAT-AA-GTTT--AAAC-TT-------T-AATA-TTAT-TG-TA-AT-A--AAC---------AATG-AGTAAGAGTT---TT-A---TCATTGCCTTAAATATTA---CACGT-ACA---TGAAATCATCGATC--TCACGTTT--A-A-CCCA-GC