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gi|11 : aaggTTTGTACAT-CCGTTCCGCTGT---GTTT-TACA-ACTCC-AATATT-G-------CATATGAC--ATTCACA-GCTTCTAAG--TGCTACGGGTCTTTC--CAATTCT-AACGTC-ATTTGAC-AAGCCC----AT-------GACGTC--ACAATTGACC--------CAGAACCGCGG-TAAATACTAGTA-GCGA-ATTTA----ACAGC---------TTTTGTTttc
gi|12 : AGACGGA-TAG--T-TATCACGTGG--TTGGCATT-A---T-T-CGTGAA-TCCGC--AC-GCG-CTGC---TTT----------------AAAC-TACC-GATCATC---TTTTACGTAA---ATC--CT--A-GTTGAGCTCT--AGTCTGAA------Tttac
gi|13 : ACA-GTTGAGCTCT--AGTCTGAA------TACTCGTATACCTTTGTACAT-CCGTTACGCTAC---GTT--TACA-ACTCC-AATATTAT-------C-GATGTC--A-TTACA-G
gi|14 : tatttgtaAA-TCTT-CAGTCTCATAACGTG-CATTGTGCGTAA-AGGTGAGGTCGG-GTTATTGAGT---ATTG
gi|15 : TAGAGACGAG-TA---T-TATCACGTGG--TCCACATATA---T-TACTTGAA-TCCGC--TC-GAG-TTGC---TTCTCC-GGTTTTA--TCAAAGT-TATC-GATCATC---TTTgtgtcactaattgatgtcaagctattagacttataat
gi|16 : tgaggGGACTAG--TCTA-CACGTGGAGTTGGCATA-ACATT-T-CGTGAG-TCTGC--AC-GCGCCTGC---TTTTCTAAGCTGTAACTCAAA
gi|17 : GATGGA-TAT--T-TATCACATGG--TTTGCGTA-A---T-G-CGTGAA-TCCGT--AC-ACA-CTagc
gi|2 : gG--TTAGCATA-A---T-T-CGTGAA-TCCGC--AC-GCG-CTGT---TTTTCT-AACTT-A--TCAA-GC-TACC-GA-CATC---TTTGACGTAA---ATC--GTGCA-GTCGAGCTCG--AGTCTGAA------TAGCCCTATACATTTGTACAT-TCTTTACGCTAT---GTT--TACA-ACT-C-AATATTAG-------C-TATGAC--A-TCACA-TC--CTAAG--TGCTAC--GTC-TTC--AAACTCT-AACGTAGA-CTGAT-AG---CA---AT-------GACGTC--ATAATAGA----------CAGAC-GGCGGTTAAATAATAA-A-GCGA-ATTT-----ACAGC---------TTTTGTTACAAATATTCAAAAC----AAT--AGTTACG--G----CAA-TCTTTCAGTCTCA-AT-GTGTCATTGTGCGTAATCGTTTA--TCGGTTTTGTTGGGTTCCATTGACTtccgatctttcacgcaaat
gi|3 : TAGAGACGAA-TAG--T-TATCATGTGG--TTGGCATA-A---T-T-TGTGAA-TCCGC--AC-GCG-CTCC---TTTCCT-GACTTTA--TCAAAGC-TACC-GATCATC---TTTTTTGTAA---ATC--CTACA-GTCGAGCTCT--AGTCTGAA------TAGTCATATACCTTTGTACAT-CCGTTACGCTAT---GTTTATACA-ACTCC-AATATTAG-------C-TATGAC--A-TCACA-GC--CTAAG--TGCTAA--GTC-TTC--CAAATCT-AACGA--A-CTGAC-AG---C----AT-------GACGTC--ACAATTTA----------CAGAG-CGCGG-TAAATAATTA-A-GCGA-ATTT-----ACAGC---------TTTTGTTAC-AATATTGAAAGCA--AAAT--TTTTAC---G----CAATTCTTTCAGTCTCA-AA-GTG-CATTGTGCGTAATAGTTTA--TTGGTTTTGTTGGGTTCCATTGATTcgtcaaacataagtatcttatcgttt
gi|4 : TAGAGACGGA-TAA--T-TATCACGTGG--TTGGAATA-A---T-T-CGTGAA-TCCGC--AC-GCG-CTGC---TTTTCT-GGCTTTA--TCAAAGA-TACC-GATCATC---TTT-ACGTAA---ATC--GTACA-GTCGAGCTCT--ATTCTGAA------TAGTTGCATACCTTTGTACAT-CCGTTATGCTAT---GTCTA--CA-ACTCC-AATATTAG-------C-TATGAC--A-TCACG-GC--ATAAG--TGCTAA--GTC-TTC--AAAATCT-AACGT--A-CTGAC-AG---C----AT-------GACGTC--ACAATTGA----------CAGAG-CGCGG-TAAATAACAA-A-CCGA-ATTT-----ACACCTTCTTTTTTTTTTTTTAC-AATATTCAAAGCA--AAAT--TTTTAG---G----CAA-TCTTTCAGTCTCA-AT-GTG-CATTGTG
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gi|6 : CA-GTCGAGCTCT--AGTCTGAA------TAGTCATATACATTtccattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|6 : AC-AATGTTCAAAGCA--AAAG--TTTTAC---G----CAA-TCTTTCAGTCTCA-AA-GTG-CATTATGCGTAATAGTTTA--TCGGTTTTGTTGGGTTCCATTGATTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttagcttgtgtattaatatcccccttaacaatgttcaaagcaaaagttttacgcaatctttcagtctcaaagtgcattatgcgtaatagtttatcggttttgttgggttccattgattgtcaagcattagattatagt
gi|7 : cagtcgagctctagtctgaatagtcatatacattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttagcttgtgtattaatatcccccttaAG--TACTAC--GTC-TTC--AAAATCT-AACGT--A-AGGAC-AG---C----AT-------GACGTC--ACAGTTGA----------CAAAG-CGCGG-TAAATAATAA-A-GCGA-ATTT-----ACGGC---------TTTTGTTAC-AATATTCAAAGGA--ACAT--CTGTGC---G----CAA-TCTCTCAGTCAGA-AT-GAG-CATTGTAAGTAATAGTTTA--TCGGTTCTGTAGGATTCCTTTGACTgtcaagcattagattatagt
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blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . T . TT . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . C . TA . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . C . TA . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
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originalCons : TAGAGACGGA-TAG--T-TATCACGTGG--TTGGCATA-A---T-T-CGTGAA-TCCGC--AC-GCG-CTGC---TTTTCT-GGCTTTA--TCAAAGC-TACC-GATCATC---TTTTACGTAA---ATC--GTACA-GTCGAGCTCT--AGTCTGAA------TAGTCGTATACCTTTGTACAT-CCGTTACGCTAT---GTTTATACA-ACTCC-AATATTAG-------C-TATGAC--A-TCACA-GC--CTAAG--TGCTAC--GTC-TTC--AAAATCT-AACGT--A-CTGAC-AG---C----AT-------GACGTC--ACAATTGA----------CAGAG-CGCGG-TAAATAATAA-A-GCGA-ATTT-----ACAGC---------TTTTGTTAC-AATATTCAAAGCA--AAAT--TTTTAC---G----CAA-TCTTTCAGTCTCA-AA-GTG-CATTGTGCGTAATAGTTTA--TCGGTTTTGTTGGGTTCCATTGACT
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Reference ( family-485 ) : TAGAGACGGA-TAG--T-TATCACGTGG--TTGGCATA-A---T-T-CGTGAA-TCCGC--AC-GCG-CTGC---TTTTCT-GGCTTTA--TCAAAGC-TACC-GATCATC---TTTTACGTAA---ATC--GTACA-GTCGAGCTCT--AGTCTGAA------TAGTCGTATACCTTTGTACAT-CCGTTACGCTAT---GTTTA-ACAA--CTCC-AATATTAG-------C-TATGAC--A-TCACA-GC--CTAAG--TGCTAC--GTC-TTC--AAAATCT-AACGT--A-CTGAC-AG---C----AT-------GACGTC--ACAATTGA----------CAGAG-CGCGG-TAAATAATAA-A-GCGA-ATTT-----ACAGC---------TTTTGTTAC-AATATTCAAAGCA--AAAT--TTTTAC---G----CAA-TCTTTCAGTCTCA-AA-GTG-CATTGTGCGTAATAGTTTA--TCGGTTTTGTTGGGTTCCATTGACT
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gi|7 : cagtcgagctctagtctgaatagtcatatacattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttagcttgtgtattaatatcccccttaAG--TACTAC--GTC-TTC--AAAATCT-AACGT--A-AGGAC-AG---C----AT-------GACGTC--ACAGTTGA----------CAAAG-CGCGG-TAAATAATAA-A-GCGA-ATTT-----ACGGC---------TTTTGTTAC-AATATTCAAAGGA--ACAT--CTGTGC---G----CAA-TCTCTCAGTCAGA-AT-GAG-CATTGTAAGTAATAGTTTA--TCGGTTCTGTAGGATTCCTTTGACTgtcaagcattagattatagt
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