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Reference ( gi|24 ) : GGATGGGA---G--GTG-G-----------C-G-----A-CGG----A----T--------GA----A----C-----AA----G-----------C----G----AACGA-AC--------GG---A--------------AC------G-C-AGGATCAC----T-A----TAA------A------T-C----C--C-C-C----T---CTT-T-GCT--AG-C-TGGGG
gi|5 : GGATAGGA---G--GCG-G-----------G-A-----A-CGG----A----T--------GA----A----C-----AA----A-----------C----GGAGGAACGA-AT--------GG---ATGAACAAATACAGAAC------A-C-AGGATCAC----T-A----GAA------C------A-C----C--C-C-C----TCCACTT-T-GTT--AG-C-AGGGG
gi|25 : cGGATGGAA---G--GCG-G-----------G-G-----A-CGG----A------------------------------------------------C----G----AATGG-AC--------AG---A--------------AC------A-C-TGGATCACTAG-T-A----TAA------A------C-C----C--C-C-T----G---TTT-T-GCT--AG-C-GGGGt
gi|16 : GGATGGGA---A--GCG-G-----------G-G-----A-CGG----A------------------------------------------------C----G----GACGG-AC--------GG---A--------------AC------A-C-AGGATCAC----T-G----TAAC-----A------CAC----C--C-A-C----T---CTC-C-GCT--cgtatt
gi|46 : cGGATGAGA---G--ATG-G-----------G-GG----A-CGG----A------------------------------------------------C----G----AACGA-AT--------GG--------------------------G-C--GGAACAC----T-A----CAA------A------C-C----C--C-A-C----G---CTT-T-GCT--AG-C-AGGtcatcagcggggttatgt
gi|26 : GAATGGGA---G--GCG-G-----------G-G-----A-CGG----A------------------------C-----AA----A-----------C----T----AACAATAC--------AG---A---------------C------A-A-AGGATCAC----T-A----C-A------C------T-C----C--C-C-C----TG--CTT-C-ACT--AG-C-tgta
gi|20 : GGATGGGA---G--GTG-G----------------------GG----A----A--------G-----A----C-----AA----A-----------C----G-----ACG--AC--------GGCCCA--------------ACA-----A-C-AGG-TCAC----T-A----GAA------A------T-C----C--T-G-C----T----TC-C-GCT--AG---TGGGgagagatta
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gi|47 : GGATGGGG---G--GTG-G-----------G-G-----A-CGG----A-----------------------------------------------------------------C--------AG---A--------------TT------A-C-AGGATCAC----T-T----TAA------A------C-T----G--C-C-C----G---CTT-C-CCA--AG---TGGGaggggacataa
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gi|36 : GATGGGA---G--GTG-G-----------G-G-----A-CAG----A------------------------------------------------C----A----AATGA-AC--------GG---A--------------GC------A-C-ATGATCAC----T-A----T-A------T------T-C----CATC-CAC----G---CTT-C-TCT--AG---TGGGGcccttcatttgcagg
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gi|11 : GATGGGA---G--GTG-G-----------G-G-----A-AGG----C----C--------GG----C----T-----AG----A-----------C----G----AACAC-AC--------GG---A--------------CA------A-C-AGGATCAC----T-A----TAAC-----A------C-C----C--C-C-C----C---Cgtatatataaacccccacctcactagggagatat
gi|42 : GATGGGA---G--GTG-A-----------G-G-----A-C-----------T--------GA---------------------------------C----A----AACGA-AC--------AG---A--------------CA------A-C-AGGACCGC----T-A----TAA------G------A-C----T--C-C-C----TG--CTTCC-GCT--AG---TGGGccctcccggcttccgctagtgggaa
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gi|23 : GATGGGA---G--GCA-G----------------------GG----T----T--------GG---------------------G-----------C----A----AATGG-AC--------GG---A--------------AC------A-C-AAGATCAT----T-A----TAAC-----AACAAC-C-C----C--C-C-C----C---CTT-C-GCT--AG---TGAGGgca
gi|3 : caGATGGGATGTG--GGG-G-----------C-GTACAGA-CAG----A----T--------GA----ATGGAC-----AA----A-----------C----A----AATGA-ACAGAA----GG---A--------------AC------A-C-AGGATCAC----T--------A------A------C-C----C--CAC-CCCATC---CTT-C-ACT--AG-gga
gi|21 : aGATGGGA---GTCG-G-G-----------G-G-----A-CGGGCAAA----T--------GG----A----C-----AG----A-----------C----A----AAC-A-AC-------------A--------------AC------A-C-AGGACCACTAG-T-A----TAA------A--------C----C--C-C-C----G---CTT-atctagcggggaatat
gi|52 : GATGGAG---G--GTG-G----------------------GG----A----A--------AG----A----C-----AA----A-----------C----G----GACAG-AC-------------A--------------AC----------AGGATCAC----T-A----TAA------A------C-C----catgggtatta
gi|6 : GATGGGA---G--GCG-GGGATGGAAGAAC-G-----ATCGGACAAA----T--------GATCAGA----C-----AA----A-----------C----G----AACAG-AC--------AA---A--------------AC------A-C-AGGATCAC----T-ttcactaacggg
gi|28 : aATGGGA---A--TCG-G----------------------GA----A----C--------GA----A----C-----GA----A-----------C----G----GACGG-AC--------GG---A--------------AC------A-C-AGGATCAC----T-A----TAG------A------T-C----T--C-T-T----G---CTT-C-GCT--AG-C-tccgcttcactaacaggaggtataa
gi|8 : aATGGAA---G--GCG-G-----------T-G-----A-TGG----A----T--------GA----A----C-----GA----A-----------CAGATG----AACAA-AC--------GG---ACAG-----------ACAGAAA-A-C-AGGATCAC----T-A----TAA------A--------C----C--C-C-C----A---CTT-G-GCA--AG-ggtggtataa
gi|2 : gcATAAGA---G--GCG-G-----------G-G-----A-TGG----A----T--------GA----A----C-----AG----A-----------C----A----AATGA-ACAAACAGAAGG---A--------------ACATACATG-T-AGGATCAC----T-A----TAA------A------A-C----C--C-C-C----G---CTaggagagca
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gi|18 : ACGGGA---G--GCA-G-----------G-A-----A-TGG----A----C--------GA----A----C-----GA----A-----------C----A----AACAG-AT--------GG---A--------------CA------A-C-AGGATCAT----A-A----TA----------------C----C--C-C-C----TG--CTTAT-GCT--AG-C-GGGAGggtat
gi|19 : ATGGGA---G--GCG-G-----------G-G-----A-CG------------------------------C-----A-----------------C----G----AACAG-AT--------GG---A--------------AC------A-C-AAGATCAC----T-A----TAtacatg
gi|41 : ATGGGA---G--GCA-A-----------G-G-----A-CGG----G----T--------GA----A----------------------------C----G----GAGAA-AC--------AG------------------AC------G---AG---CAC----T-A----TAA------A------G-C----C--T-T-G----T----TT-C-GCT--AG-T-AGGAGccacccacctaccccacccccactggtgggtgggtat
gi|27 : TGGAA---G--GCG-G-----------G-G-----A-CAG----A----C--------GA----A-----------A----T---------------------AACGG-AC--------GG---A--------------AC------A-C-AGGATTAC----T-A----TAA------A--------A----C--C-C-A----G---CTT-C-GCT--AG-C-TGGGGgtatact
gi|1 : TGAGA---G--GTG-G-----------G-G-----A-CAG----A----C--------AA----A----CGGACAAA----GAAACAGATGAAC----G----AACAG-AC--------GG---A--------------AC------A-C-AGGATCAC----T-A----TAA------A------C-C----C--C-C-T----A---CTT-G-GCT---G-C-Ttggggtat
gi|9 : gtTGGGA---G--GTG-GGGGA-------CAG-----A-CGG----A----TAGATAAATGG----A----C-----GA----A-----------C----A----AATGG-AC--------AG---A--------------AT------A-C-AGGATTAC----T-A----TAA------A------T-T----C--C-C-G----A---TCT-C-GCT--AG-TGTGGGGtcactagcagagctagctagggtata
gi|22 : TGGGA---G--GTG-G-----------G-G-----A-CGG----A------------------------------------------------C----G----ATCGG-AC--------AG---A--------------AC------A-C-AGGGTTGC----T-ACATGTAT------A------C-C----C--C-C-C----TC--CTT-C-GCT--ta
gi|38 : gTGGGA---G--GCG-G-----------G-A-----A-TGG----A----T--------GA----A----C----------------------------G----AACAG-AC--------AG---A--------------CA------A-C-AGACTCAC----T-A----TAA------A--------C----C--C-C-C----G---CTTCC-ACT--AA-C-AGAGGtcaaaagcgggagta
gi|44 : TGGGA---G--GTGCA-----------C-A-----A-TGGC---A----T-------------------C-----AC----A-----------C----G----GACGG-AC-------------A--------------A---------C-ATGATTGC----T-A----TGA------A--------C----T--T-C-C----G---CTT-CGGCT--AG-C-GGGGGgt
gi|37 : GGGA---G--GCA-G-----------G-G-----A-CGG----AAAAAT--------GG----A----C-----GA----A-----------C----G----AACAG-AC--------AA---A--------------AC------A-C-AGGATCAC----T-A----TAA------A------C-C----C--C-C-C----G---CTT-T-GCT--AG-c
gi|40 : GGGA---G--GCG-G-----------T-G-----A-CAG----A----C--------GA----A----C-----AA----G-----------C----G-------GA-A---------GT---A--------------AT--------C-AGGATCAC----T-AC---TAG---------------C----C--C-C-C----A---CTT-T-GCTAGAG-G-TGGGGt
gi|13 : aaGGTA---G--GTG-G-----------G-G--------GG----A----C--------GG----A----C----------------------------G----AACGA-AC--------GG---A--------------CA------A-C-AGGTTCAC----T-A----TAC------A------T-t
gi|43 : GGA---A--GCG-G-----------G-G-----A-CGG----A------------------------------------------------C----G----GACGG-AC--------GG---A--------------AC------A-C-AGGATCAC----T-G----TAAC-----A------CAC----C--C-A-C----T---CTC-C-GCT--gtaccacccccacccccacataatgtagcgggggtatag
gi|35 : GGA---G--G-G-G-----------A-G-----A-CG-------------------------A----C-----A-----------------C----G----A-TGG-AC--------GG---A--------------CA------A-C-AGGATCAC----T-T----TAACCCC--C------C-C----C--C-C-C----C---CCC-C-ACT--AG-C-GGGGGtcatcagcgggg
gi|31 : gcGA---G--ATG-G-------------G-----A-CGG----A----T--------GA----A----C-----AA----A-----------A----A----AACGG-GG--------GG---A--------------AC------A-C-AGGATCAC----T-A----TTT------A------T-CT---C--T-C-C----TG--CTT-C-ACT--A--T-TGGGGtataa
gi|49 : ---G--ATG-GA----------T-G-----A-CAG----A----T--------GA----A---------------------------------G----AATGG-AT--------GG---A--------------AC------A-C-AGGATCAC----T-A----TAA------A------C-A----C--C-C-C----A---CTT-C-ACT--AG---TGGGGgtata
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gi|29 : ggatgcgagtggggatagatgaacagacta-CGG----A----T--------GA----G----A-----GATG--G-----------G----G----GACGA--C--------GA---C--------------AT------G-G-CGGAACAC----T-A----CAA------A------C-C----C--C-A-C----G---CTT-T-GCT--AG-C-AGGGggtgt
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gi|48 : ----A----T--------GG----A----C-----AA----A-----------T----G----AACAG-AC-------------A--------------AC----------AGGATCAC----T-A----TAA------A------C-C----C--C-T-C----G---CTT-T-GCT--AG-aaagggta
gi|12 : gcaggaatgaa----C-----AG----A-----------T----G----AATGG-AC--------GG---A--------------AC------A-C-AAGATCAC----T-T----TA----------------C----C--C-C-C----C---Caggggta
gi|17 : gcagatgggagt----G----AACGG-AC--------AG---A--------------AC------A-C-AGGATCAC----T-A----TAA------A------C-C----C--A-T-C----A---CTT-C-CCC--AGAC-TGGcccccccacctccccccgcttcactagcagagggttta
gi|61 : gtagcgaataagagtcggat----G----AACAG-AT--------GG---A--------------TC------A-T-AGGATCAC----T-G----TAA------A------C-C----C--C-C-cagaggggggatag
gi|45 : at----G----GACGG-AC--------AG---A--------------TT------A-C-AGGATCAC----T-T----TAA------A------A-C----TG-C-C-C----G---CTT-C-CCA--AG---TGGGtac
gi|55 : ggggtagtggatggggtgg----AACGG-AC--------GG---A--------------AT------A-C-AGGATCAC----TAA----TAA------A------C-C----A--C-C-C----G---CTT-C-ACG--AG---TGGaggt
gi|58 : ac----AACGG-AC--------GG---A--------------AC------T-C-AGAACCGC----T-A----TAG------A--------C----A--T-C-C----T---GTT-TCGCT--AA---TGGGGcagtatatt
gi|53 : ACGA-AC--------GG---ACATC----------AC------A-C-AGGATCGC----T-A----TAA------A------T-A----C--C-C-C----G---CTT-T-GCT--AG---TGGgtata
gi|54 : gagttgcCGG-AC--------AG---A--------------CA------A-C-AGGATCAC----T-A----TAA------A-------------------------C---CTT-C-GCT--AA-C-GGGGGtggtat
gi|62 : gtacatgatgnATCAC----T-A----TAA------A------T-C----C--C-C-C----A---TTT-T-GCT--AG-C-GGGGGtataata
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): GCGGATAAGAGTGAGATGAATGGACAAAACACAAGATCACTACAAACAAGATCACTACAACCCCCCCCCCCCTTCACTAGTGAGGG
Unaligned ( gi|30 ): CGGATGGGAGGAGGGACACCCGAATGGACAAACAGGACCACTCTCCCCCCCCCCCCCCAGCTGCATAGCAGGGGGTATTG
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Unaligned ( gi|56 ): AGATGGAGGCGGGGACGTATGAACGAAGCAGACGGAACATATACCCCCCCCCCCCCCA
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consensus : GGATGGGAGGCGGGG-----ACGGA----C--------G--------A---A-C--------G--------------------A-A------------CGA-A----CGG----------AC-GG-AAC-A------C-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CC-------CC----------G--CTT-C-GCT--AG-C-NGGGG
Reference ( family-4749 ) : GGATGGGAGGCGGGG-----ACGGA----C--------G--------A---A-C--------G--------------------A-A------------CGA-A----CGG----------AC-GG-AAC-A------C-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CC-------CC----------G--CTT-C-GCT--AG-C-TGGGG
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gi|11 : GATGGGAGGTGGGG-----AAGGC----C--------G--------G---C-T--------A--------------------G-A------------CGA-A----CAC----------AC-GG-ACA-A------C-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------AC------A------------------C-----C---CC-------CCCCCCCTCCCGG--CTTCC-GCT--AG---TGGGggagatat
gi|12 : -A------------TGA-A----TGG----------AC-GG-AAC-A------C-AAGAT-CAC----T-T----T-ACCCCCCCCCCCCCC-------A------------------CCTC--C---CC-------CC----------G--CTT-C-ACT--AG-C-AGAGGaa
gi|13 : gcagatgggagtcagGGTAGGTGGGG-------GGA----C--------G--------G---A-C--------G--------------------A-A------------CGA-A----CGG----------AC-A------A------C-AGGTT-CAC----T-A----T-A-------------gttta
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gi|15 : CGGA----TAA------G--------A---G-T--------G--------------------AGA------------TGA-A----TGG----------AC-AA-AAC-A------C-AAGAT-CAC----T-A----C-A-------------A-------ACAAGATCACTACAACCCCC-----C---CC-------CC----------C--CTT-C-ACT--AG---TGAGGgca
gi|16 : gGGATGGGAAGCGGGG-----ACGGA----C--------G--------G---A-C--------G----------------------------------------------G----------AC-GG-AAC-A------C-AGGAT-CAC----T-G----T-A-------------ACACACCCA------------------C-----T---CT-------CC----------G--CTT-C-ATC--AG-C-GGGGg
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gi|20 : GGATGGGAGGTGGGG-----A-AGA----C--------A--------A---A-C--------G----------------------A------------CG--A----CGG-----------C-CC-AACAA------C-AGG-T-CAC----T-A----G-A-------------A-------A----------------------------TC-------CT----------G--CTTCC-GCT--AG---TGGGaggaaaatccccgctttcctagagggaggtatgatt
gi|21 : agtGATGGGAGTCGGGGG----ACGGG----C--------A--------A---A-T--------G--------------------G-A------------CAG-A----CAA----------AC-AACAAC-A------C-AGGAC-CACTAG-T-A----T-A-------------A-------A------------------------C---CC-------CC----------G--CTT-C-aggtgta
gi|22 : TGGGAGGTGGGG-----ACGGA----C--------G--------A---T-C--------G----------------------------------------------G----------AC-AG-AAC-A------C-AGGGT-TGC----T-ACATGT-A-------------T-------A------------------C-----C---CC-------CCT---------C--CTT-C-GCT--atgggtatta
gi|23 : gGATGGGAGGCAGGG-----TTGGG----C--------A--------A---A-T--------G----------------------------------------------G----------AC-GG-AAC-A------C-AAGAT-CAT----T-A----T-A-------------AC------AACAAC-------------C-----C---CC-------CC----------C--CTT-C-GCT--AG---TGAGGtcaaaagcgggagta
gi|24 : caGGATGGGAGGTGGCG-----ACGGA----T--------G--------A---A-C--------A--------------------A-G------------CGA-A----CGA----------AC-GG-AAC-G------C-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------T-----C---CC-------CC----------T--CTT-T-GCT--AG-C-TGGGGgga
gi|25 : GGATGGAAGGCGGGG-----ACGG-------------------------------------------------------------A------------CGA-A----TGG----------AC-AG-AAC-A------C-TGGAT-CACTAG-T-A----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CC-------CT----------G--TTT-T-GCT--AG-C-GGGG
gi|26 : GAATGGGAGGCGGGG-----ACGGA----C--------A--------A---A-C--------T--------------------A-A------------CAATA----CAG----------AC----AA-----------AGGAT-CAC----T-A----C-A-------------C-------T------------------C-----C---CC-------CT----------G--CTT-C-ACT--AG-C-cgtatt
gi|27 : TGGAAGGCGGGG-----ACAGA----C--------G--------A---A---------------------------------A------------T-A-A----CGG----------AC-GG-AAC-A------C-AGGAT-TAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------------A---CC-------CA----------G--CTT-C-GCT--AG-C-TGGGGgagagatta
gi|28 : ATGGGAATCGGGA-----ACG------------------------A---A-C--------G--------------------A-A------------CGG-A----CGG----------AC-GG-AAC-A------C-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------G-------A------------------T-----C---TC-------TT----------G--CTT-C-GCT--AG-C-tggggtat
gi|29 : aGGATGAGAGATGGGG--------GA----C--------G--------A--------------------------------------------------CGACA----TGG-----------C-GG-AAC-A------C--------------T-A----C-A-------------A-------A------------------C-----C---CC-------AC----------G--CTT-T-GCT--AG-C-AGGGggtggtataa
gi|3 : nnnnnnnnnagagtagcGA-----ATGGA----C--------A--------A---A-C--------A--------------------A-A------------TGA-A----CAG----------AA-GG-AAC-A------C-AGGAT-CAC----T----------------------A-------A------------------C-----CCCACC-------CC----------ATCCTT-C-ACT--AG-
gi|31 : agatgggatgtgggggcgtacagacagatGGG-----ACGGA----T--------G--------A---A-C--------A--------------------A-A------------AAA-A----CGG----------GG-GG-AAC-A------C-AGGAT-CAC----T-ATT--T-A-------------T-------C------------------T-----C---TC-------CT----------G--CTT-C-ACT--A--T-TGGGGatctagcggggaatat
gi|32 : gagatGATGGGAGGTGGGG-----ACAGA----T--------G--------A---A-C--------G--------------------A-A------------CGG-A----CAG---------------------------C-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------ACACAAC-A------------------C-----C---CC-------CC----------gtata
gi|33 : GG-----ATGG--------------G--------A---GTC--------G--------------------G-A------------CGA-A----CGG----------AC-GG-GAC-A------C-CAGAT-TAG----T-A----T-AAC-----------A-------G------------------CCCCCTC---CC-------CC----------G--CTT-C-GCT--AG-cccccttcatttgcagg
gi|35 : GGAGGGG-----A--GA----C--------G--------AC--A-C--------G--------------------A-----------------------TGG----------AC-GG-ACA-A------C-AGGAT-CAC----T-T----T-A-------------ACCCC---C------------------C-----C---CC-------CC----------C--CCC-C-ACT--AG-C-GGGGGaggggacataa
gi|36 : gcGATGGGAGGTGGGG-----ACAGA----C--------A--------A---A-T--------G--------------------A------------------------------------AC-GG-AGC-A------C-ATGAT-CAC----T-A----T-A-------------T-------T------------------C-----CAT-CC-------AC----------G--CTT-C-TCT--AG---TGGGGtataa
gi|37 : aGGGAGGCAGGG-----ACGGAAAAAT--------G--------G---A-C--------G--------------------A-A------------CGA-A----CAG----------AC-AA-AAC-A------C-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CC-------CC----------G--CTT-T-GCT--AG-gta
gi|38 : TGGGAGGCGGGA-----ATGGA----T--------G--------A---A-C--------G--------------------A-A------------CAG-A----CAG----------AC-A------A------C-AGACT-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------------C---CC-------CC----------G--CTTCC-ACT--AA-C-AGAGGt
gi|39 : GA-----ACGAA----T--------A--------A---A-T--------G--------------------A-A------------C-A-A----CGG----------CCCGG-AAT-A------C-AGAAT-CAC----T-A----T-A-------------A-------AT-----------------C-----C---CC-------CC----------A--CTT-C-ACT--AG-C-gt
gi|4 : ggat-----ATGGA----T--------G--------A---A-C--------A--------------------A-A------------CAA-A----CGA----------AC-AG-AAC-A------C-GGGAT-CGC----T-A----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CCCACCCCTCC----------A--CTT-C-ACT--AG---TGGGGaaagggta
gi|40 : ggatgcgagtggggatagatgaacagactaGGGAGGCGGTG-----ACAG---------------------------A-C--------G--------------------A-A------------CAA-G----CGG----------AA-GT-AAT--------C-AGGAT-CAC----T-AC---T-A-------------G--------------------------------C---CC-------CC----------A--CTT-T-GCTAGAG-G-TGGGGggtgt
gi|41 : aaATGGGAGGCAAGG-----ACGGG----T--------G--------A---A-C--------G--------------------G-A------------GAA-A----CAG----------AC-G---------------AG----CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------------G---CC-------TT----------G--TTT-C-GCT--AG-T-AGGAGt
gi|42 : GATGGGAGGTGAGG-----ACTGA----C--------A--------A---A-C--------G--------------------A-A------------CAG-A----CA---------------------A------C-AGGAC-CGC----T-A----T-A-------------AG------A------------------C-----T---CC-------CT----------G--CTTCC-GCT--AG---TGGGgtatact
gi|43 : caGGAAGCGGGG-----ACGGA----C--------G--------G---A-C--------G----------------------------------------------G----------AC-GG-AAC-A------C-AGGAT-CAC----T-G----T-A-------------ACACACCCA------------------C-----T---CT-------CC----------G--CTT-C-ATC--AG-C-GGGGc
gi|44 : -A----CGG----------AC-GG-ACA-A------C-ATGAT-TGC----T-A----T-G-------------A-------A------------------------C---TT-------CC----------G--CTT-CGGCT--AG-C-GGGGG
gi|45 : tgggaggtgcacaatggcatcacGG-A----CGG----------AC-AG-ATT-A------C-AGGAT-CAC----T-T----TAA-------------A-------A------------------C-----T---GC-------CC----------G--CTT-C-CCA--AG---TGGGc
gi|46 : ggggtagtggatggggtggGGATGAGAGATGGGG--------GA----C--------G--------G---A-C--------G--------------------A-A------------CGA-A----TGG----------GC-GG-AAC-A------C--------------T-A----C-A-------------A-------A------------------C-----C---CC-------AC----------G--CTT-T-GCT--AG-C-AGGaggt
gi|47 : GGATGGGGGGTGGGG-----ACGGA----C--------A-------------------------------------------------------------------------------------G-ATT-A------C-AGGAT-CAC----T-T----T-A-------------A-------A------------------C-----T---GC-------CC----------G--CTT-C-CCA--AG---TGGGtgta
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gi|49 : GG-----ATGGA----T--------G--------ACAGA-T--------G--------------------A-A-------------GA-A----TGG----------AT-GG-AAC-A------C-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------C-----A---CC-------CC----------A--CTT-C-ACT--AG---TGGGGaggggta
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gi|53 : -A------------CGA-A----CGG----------AC-AT-CAC-A------C-AGGAT-CGC----T-A----T-A-------------A-------A------------------T-----A---CC-------CC----------G--CTT-T-GCT--AG---TGG
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gi|55 : gtacatgatgnA-A----CGG----------AC-GG-AAT-A------C-AGGAT-CAC----TAA----T-A-------------A-------A------------------C-----C---AC-------CC----------G--CTT-C-ACG--AG---TGGtataata
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gi|57 : aGGATGGGAGGTGGGG-----GTGGA---------------------------------------------------------------------------G-A----CTG----------AC----AAC-----------GGATCCAC----T-A----T-A-------------AC------A------------------C-----C---CC-------CC----------tacccccccccccccca
gi|58 : gcA-A----CGG----------AC-GG-AAC-T------C-AGAAC-CGC----T-A----T-A-------------G-------A------------------C-----A---TC-------CT----------G--TTT-C-GCT--AA---TGGGGccccc
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gi|6 : atGATGGGAGGCGGGG-----ATGGA----A--------G--------A---A-C--------GATCGGACAAATGATCAGACAA-A------------CGA-A----CAG----------AC-AA-AAC-A------C-AGGAT-CAC----T------------------------------------------------------------T-------CC----------G--CTT-C-ACT--AA-C-AGGAG
gi|61 : a-A------------TGA-A----CAG----------AT-GG-ATC-A------T-AGGAT-CAC----T-G----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CC-------Cgtataa
gi|62 : AT-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------T-----C---CC-------CC----------A--TTT-T-GCT--AG-C-GGGGGtac
gi|7 : ATGGGAGGCGGGG-----AGGGA----C--------GAATGGCTAA---A-T--------G--------------------G-A------------CAA-A----CGG----------AC-GA-AAC-A------CGGGGGT-CACAATAT-A----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CC-------CC----------G--CTT-C-ACT--AG---TGAGGtat
gi|8 : ATGGAAGGCGGTG-----ATGGA----T--------G--------A---A-C--------G--------------------A-ACAGATGAACAAACGG-A----CAG----------AC-AG-AAA-A------C-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------------C---CC-------CC----------A--CTT-G-GCA--AG-ggtat
gi|9 : gcTGGGAGGTGGGGGACAGACGGA----TAGATAAATG--------G---A-C--------G--------------------A-A------------CAA-A----TGG----------AC-AG-AAT-A------C-AGGAT-TAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------T-----T---CC-------CG----------A--TCT-C-GCT--AG-TGTGGGGaggagagca
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|34 ): AGTAGCGAATGGAGGAGGGGATGGACAGAAACACACAATCACTAATATATTCCCCCCCCCGCCCCCAGCTTTGTGCTA
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Reference ( family-4749 ) : GGATGGGAGGCGGGG-----ACGGA----C--------G--------A---A-C--------G--------------------A-A------------CGA-A----CGG----------AC-GG-AAC-A------C-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CC--------CC----------G--CTT-C-GC------T-----AG-CNGGGG
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gi|11 : GATGGGAGGTGGGG-----AAGGC----C--------G--------G---C-T--------A--------------------G-A------------CGA-A----CAC----------AC-GG-ACA-A------C-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------AC------A------------------C-----C---CC--------CCCCCCCTCCCGG--CTTCC-GC------T-----AG-TGGGggagatat
gi|12 : -A------------TGA-A----TGG----------AC-GG-AAC-A------C-AAGAT-CAC----T-T----T-ACCCCCCCCCCCCCC-------A------------------CCTC--C---CC--------CC----------G--CTT-C-AC------T-----AG-CAGAGGaa
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gi|15 : CGGA----TAA------G--------A---G-T--------G--------------------AGA------------TGA-A----TGG----------AC-AA-AAC-A------C-AAGAT-CAC----T-A----C-A-------------A-------ACAAGATCACTACAACCCCC-----C---CC--------CC----------C--CTT-C-AC------T-----AG-TGAGGGgca
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gi|2 : ATAAGAGGCGGGG-----ATGGA----T--------G--------A---A-CAGACAAATG--------------------A-A------------CAA-A----CAG----------AA-GG-AAC-ATACATGT-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------A-----C---CC--------CC----------G--CTaccccacccccactggtgggtgggtat
gi|20 : GGATGGGAGGTGGGG-----A-AGA----C--------A--------A---A-C--------G----------------------A------------CG--A----CGG-----------C-CC-AACAA------C-AGG-T-CAC----T-A----G-A-------------A-------A----------------------------TC--------CT----------G--CTTCC-GC------T-----AG-TGGGAGaggaaaatccccgctttcctagagggaggtatgatt
gi|21 : agtGATGGGAGTCGGGGG----ACGGG----C--------A--------A---A-T--------G--------------------G-A------------CAG-A----CAA----------AC-AACAAC-A------C-AGGAC-CACTAG-T-A----T-A-------------A-------A------------------------C---CC--------CC----------G--CTT-C-gtgta
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gi|23 : gGATGGGAGGCAGGG-----TTGGG----C--------A--------A---A-T--------G----------------------------------------------G----------AC-GG-AAC-A------C-AAGAT-CAT----T-A----T-A-------------AC------AACAAC-------------C-----C---CC--------CC----------C--CTT-C-GC------T-----AG-TGAGGGta
gi|24 : caGGATGGGAGGTGGCG-----ACGGA----T--------G--------A---A-C--------A--------------------A-G------------CGA-A----CGA----------AC-GG-AAC-G------C-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------T-----C---CC--------CC----------T--CTT-T-GC------T-----AG-CTGGGGga
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gi|31 : agatgggatgtgggggcgtacagacagatGGG-----ACGGA----T--------G--------A---A-C--------A--------------------A-A------------AAA-A----CGG----------GG-GG-AAC-A------C-AGGAT-CAC----T-ATT--T-A-------------T-------C------------------T-----C---TC--------CT----------G--CTT-C-AC------T-----AT-TGGGGGatctagcggggaatat
gi|32 : gagatGATGGGAGGTGGGG-----ACAGA----T--------G--------A---A-C--------G--------------------A-A------------CGG-A----CAG---------------------------C-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------AC------ACAACACCC----------C-----C---CC--------CC----------C--CTT-C-AT------T-----TG-CAGGtata
gi|33 : GG-----ATGG--------------G--------A---GTC--------G--------------------G-A------------CGA-A----CGG----------AC-GG-GAC-A------C-CAGAT-TAG----T-A----T-AAC-----------A-------G------------------CCCCCTC---CC--------CC----------G--CTT-C-GC------T-----AG-AGGGG
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gi|37 : aGGGAGGCAGGG-----ACGGAAAAAT--------G--------G---A-C--------G--------------------A-A------------CGA-A----CAG----------AC-AA-AAC-A------C-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CC--------CC----------G--CTT-T-GC------T-----AG-ta
gi|38 : TGGGAGGCGGGA-----ATGGA----T--------G--------A---A-C--------G--------------------A-A------------CAG-A----CAG----------AC-A------A------C-AGACT-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------------C---CC--------CC----------G--CTTCC-AC------T-----AA-CAGAGGt
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gi|43 : caGGAAGCGGGG-----ACGGA----C--------G--------G---A-C--------G----------------------------------------------G----------AC-GG-AAC-A------C-AGGAT-CAC----T-G----T-A-------------ACACACCCA------------------C-----T---CT--------CC----------G--CTT-C-AT------C-----AG-CGGGGc
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gi|45 : tgggaggtgcacaatggcatcacGG-A----CGG----------AC-AG-ATT-A------C-AGGAT-CAC----T-T----TAA-------------A-------A------------------C-----T---GC--------CC----------G--CTT-C-CC------A-----AG-TGGGAGc
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gi|50 : cCAGGA-----ATGAA----T--------G--------G---A-C--------A--------------------A-A------------TGA-A----CAG----------AC-A------A------C-AGGAT-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CC--------TC----------G--CTT-T-GC------T-----AG-AGGGGGt
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gi|18 : gtagcgaataagagtACGGGAGGCAGGA-----AT----------------GGA----C--------GA---A-C--------G--------------------A--------A------------CAA-A----CAG----------AT-GG-ACA-A------CAGGA-T-C--------A----T-A-------------AT------A------------------C-----C---CC--------CT----------G--CTTATG-C------T-----AGCGGGAGactggcagaggggggatag
gi|19 : ATGGGAGGCGGGG-----AC----------------G----------------------C--------------------------------------A------------CGA-A----CAG----------AT-GG-AAC-A------CAAGA-T-CAC----T-A----T-----------------------A------------------C-----C---AC--------CC----------A--CCT-tacatg
gi|2 : ATAAGAGGCGGGG-----AT----------------GGA----T--------GA---A-CAGACAAATG--------------------A--------A------------CAA-A----CAG----------AA-GG-AAC-ATACATGTAGGA-T-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------A-----C---CC--------CC----------G--CTaccccacccccactggtgggtgggtat
gi|20 : GGATGGGAGGTGGGG-----A-----------------AGA----C--------AA---A-C--------G-----------------------------A------------CG--A----CGG-----------C-CC-AACAA------CAGG--T-CAC----T-A----G-A-------------A-------A----------------------------TC--------CT----------G--CTTCCG-C------T-----AGTGGGAGaggaaaatccccgctttcctagagggaggtatgatt
gi|21 : agtGATGGGAGTCGGGGG----AC----------------GGG----C--------AA---A-T--------G--------------------G--------A------------CAG-A----CAA----------AC-AACAAC-A------CAGGA-C-CACTAG-T-A----T-A-------------A-------A------------------------C---CC--------CC----------G--CTT-Cgtgta
gi|22 : TGGGAGGTGGGG-----AC----------------GGA----C--------GA---T-C--------G-----------------------------------------------------G----------AC-AG-AAC-A------CAGGG-T-TGC----T-ACATGT-A-------------T-------A------------------C-----C---CC--------CCT---------C--CTT-CG-C------TTCAAAAGCGGGAGatgggtatta
gi|23 : gGATGGGAGGCAGGG-----TT----------------GGG----C--------AA---A-T--------G-----------------------------------------------------G----------AC-GG-AAC-A------CAAGA-T-CAT----T-A----T-A-------------AC------AACAAC-------------C-----C---CC--------CC----------C--CTT-CG-C------T-----AGTGAGGGta
gi|24 : caGGATGGGAGGTGGCG-----AC----------------GGA----T--------GA---A-C--------A--------------------A--------G------------CGA-A----CGA----------AC-GG-AAC-G------CAGGA-T-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------T-----C---CC--------CC----------T--CTT-TG-C------T-----AGCTGGGGga
gi|25 : GGATGGAAGGCGGGG-----AC----------------GG------------------------------------------------------------A------------CGA-A----TGG----------AC-AG-AAC-A------CTGGA-T-CACTAG-T-A----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CC--------CT----------G--TTT-TG-C------T-----AGCGGGG
gi|26 : GAATGGGAGGCGGGG-----AC----------------GGA----C--------AA---A-C--------T--------------------A--------A------------CAATA----CAG----------AC----AA----------AGGA-T-CAC----T-A----C-A-------------C-------T------------------C-----C---CC--------CT----------G--CTT-CA-C------T-----AGCGAGAGcgtatt
gi|27 : TGGAAGGCGGGG-----AC----------------AGA----C--------GA---A----------------------------------------A------------T-A-A----CGG----------AC-GG-AAC-A------CAGGA-T-TAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------------A---CC--------CA----------G--CTT-CG-C------T-----AGCTGGGGatta
gi|28 : ATGGGAATCGGGA-----AC----------------G----------------A---A-C--------G--------------------A--------A------------CGG-A----CGG----------AC-GG-AAC-A------CAGGA-T-CAC----T-A----T-A-------------G-------A------------------T-----C---TC--------TT----------G--CTT-CG-C------T-----AGCGGTGGtggggtat
gi|29 : aGGATGAGAGATGGGG------------------------GA----C--------GA---------------------------------------------------------CGACA----TGG-----------C-GG-AAC-A------C--------------T-A----C-A-------------A-------A------------------C-----C---CC--------AC----------G--CTT-TG-C------T-----AGCAGGGtataa
gi|3 : nnnnnnnnnagagtagcGATGGGATGTGGGG-----GCGTACAGACAGATGAATGGA----C--------AA---A-C--------A--------------------A--------A------------TGA-A----CAG----------AA-GG-AAC-A------CAGGA-T-CAC----T----------------------A-------A------------------C-----CCCACC--------CC----------ATCCTT-CA-C------T-----AG
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gi|32 : gagatGATGGGAGGTGGGG-----AC----------------AGA----T--------GA---A-C--------G--------------------A--------A------------CGG-A----CAG---------------------------CAGGA-T-CAC----T-A----T-A-------------AC------ACAACACCC----------C-----C---CC--------CC----------C--CTT-CA-T------T-----TGCAGGtata
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gi|35 : GGAGGGG-----A------------------GA----C--------GAC--A-C--------G--------------------A------------------------------TGG----------AC-GG-ACA-A------CAGGA-T-CAC----T-T----T-A-------------ACCCC---C------------------C-----C---CC--------CC----------C--CCC-CA-C------T-----AGCGGGGGacataa
gi|36 : gcGATGGGAGGTGGGG-----AC----------------AGA----C--------AA---A-T--------G--------------------A-------------------------------------------AC-GG-AGC-A------CATGA-T-CAC----T-A----T-A-------------T-------T------------------C-----CAT-CC--------AC----------G--CTT-CT-C------T-----AGTGGGGGtataa
gi|37 : aGGGAGGCAGGG-----AC----------------GGAAAAAT--------GG---A-C--------G--------------------A--------A------------CGA-A----CAG----------AC-AA-AAC-A------CAGGA-T-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CC--------CC----------G--CTT-TG-C------T-----AGta
gi|38 : TGGGAGGCGGGA-----AT----------------GGA----T--------GA---A-C--------G--------------------A--------A------------CAG-A----CAG----------AC-A------A------CAGAC-T-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------------C---CC--------CC----------G--CTTCCA-C------T-----AACAGAGGt
gi|39 : GA-----AC----------------GAA----T--------AA---A-T--------G--------------------A--------A------------C-A-A----CGG----------CCCGG-AAT-A------CAGAA-T-CAC----T-A----T-A-------------A-------AT-----------------C-----C---CC--------CC----------A--CTT-CA-C------T-----AGCAAAGGgt
gi|4 : ggat-----AT----------------GGA----T--------GA---A-C--------A--------------------A--------A------------CAA-A----CGA----------AC-AG-AAC-A------CGGGA-T-CGC----T-A----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CCCACCCCT-CC----------A--CTT-CA-C------T-----AGTGGGGGgta
gi|40 : ggatgcgagtggggatagatgaacagactaGGGAGGCGGTG-----AC----------------AG-------------------A-C--------G--------------------A--------A------------CAA-G----CGG----------AA-GT-AAT--------CAGGA-T-CAC----T-AC---T-A-------------G--------------------------------C---CC--------CC----------A--CTT-TG-C------T-----AGAGGTGGgtgt
gi|41 : aaATGGGAGGCAAGG-----AC----------------GGG----T--------GA---A-C--------G--------------------G--------A------------GAA-A----CAG----------AC-G--------------AG-----CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------------G---CC--------TT----------G--TTT-CG-C------T-----AGTAGGAGggt
gi|42 : GATGGGAGGTGAGG-----AC----------------TGA----C--------AA---A-C--------G--------------------A--------A------------CAG-A----CA---------------------A------CAGGA-C-CGC----T-A----T-A-------------AG------A------------------C-----T---CC--------CT----------G--CTTCCG-C------T-----AGTGGGgtatact
gi|43 : caGGAAGCGGGG-----AC----------------GGA----C--------GG---A-C--------G-----------------------------------------------------G----------AC-GG-AAC-A------CAGGA-T-CAC----T-G----T-A-------------ACACACCCA------------------C-----T---CT--------CC----------G--CTT-CA-T------C-----AGCGGGGc
gi|44 : -A----CGG----------AC-GG-ACA-A------CATGA-T-TGC----T-A----T-G-------------A-------A------------------C-----T---TC--------C-----------G--CTT-CGGC------T-----AGCGGGGG
gi|45 : tgggaggtgcacaatggcatcacGG-A----CGG----------AC-AG-ATT-A------CAGGA-T-CAC----T-T----TAA-------------A-------A------------------C-----T---GC--------CC----------G--CTT-CC-C------A-----AGTGGGAGc
gi|46 : ggggtagtggatggggtggGGATGAGAGATGGGG------------------------GA----C--------GG---A-C--------G--------------------A--------A------------CGA-A----TGG----------GC-GG-AAC-A------C--------------T-A----C-A-------------A-------A------------------C-----C---CC--------AC----------G--CTT-TG-C------T-----AGCAGGgt
gi|47 : GGATGGGGGGTGGGG-----AC----------------GGA----C--------A------------------------------------------------------------------------------------G-ATT-A------CAGGA-T-CAC----T-T----T-A-------------A-------A------------------C-----T---GC--------CC----------G--CTT-CC-C------A-----AGTGGGAGtgta
gi|48 : agtGCAGGA-----AT----------------GAAA---T--------GG---A-C--------A--------------------A--------A------------TGA-A----CAG----------AC-A------A------CAGGA-T-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CC--------TC----------G--CTT-TG-C------T-----AGAGGGGgta
gi|49 : GG-----AT----------------GGA----T--------GACAGA-T--------G--------------------A--------A-------------GA-A----TGG----------AT-GG-AAC-A------CAGGA-T-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------C-----A---CC--------CC----------A--CTT-CA-C------T-----AGTGGGGta
gi|5 : GGATAGGAGGCGGGA-----AC----------------GGA----T--------GA---A-CAAACGGAGG--------------------A--------A------------CGA-A----TGGATGAACAAATAC-AG-AAC-A------CAGGA-T-CAC----T-A----G-A-------------AC------A------------------C-----C---CCCT------CC----------A--CTT-TG-T------T-----AGCAGGGG
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gi|51 : GGATGGGAGGTGGGG-----AC----------------AGA----C--------GA---A-C--------A--------------------G--------A------------CGA-A--------------------AG-AAC-A------C--TA-T-CAC----T-ta
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gi|53 : --------A------------CGA-A----CGG----------AC-AT-CAC-A------CAGGA-T-CGC----T-A----T-A-------------A-------A------------------T-----A---CC--------CC----------G--CTT-TG-C------T-----AGTGGTGG
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gi|55 : gtacatgatgnA-A----CGG----------AC-GG-AAT-A------CAGGA-T-CAC----TAA----T-A-------------A-------A------------------C-----C---AC--------CC----------G--CTT-CA-C------G-----AGTGGtataata
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gi|57 : aGGATGGGAGGTGGGG-----GT----------------GGA--------------------------------------------------------------------------G-A----CTG----------AC----AAC----------GGA-TCCAC----T-A----T-A-------------AC------A------------------C-----C---CC--------CC----------tacccccccccccccca
gi|58 : gcA-A----CGG----------AC-GG-AAC-T------CAGAA-C-CGC----T-A----T-A-------------G-------A------------------C-----A---TC--------CT----------G--TTT-CG-C------T-----AATGGGGGccccc
gi|59 : GGATGGGAGGTGGGG-----AT----------------AGA----C--------GA---A-T--------G-----------------------------A------------CAA-----------------------G-AA--A------CAGGA-T-CAC----T-G----T-tata
gi|6 : atGATGGGAGGCGGGG-----AT----------------GGA----A--------GA---A-C--------GATCGGACAAATGATCAGACAA--------A------------CGA-A----CAG----------AC-AA-AAC-A------CAGGA-T-CAC----T------------------------------------------------------------T--------CC----------G--CTT-CA-C------T-----AACAGGAG
gi|61 : a--------A------------TGA-A----CAG----------AT-GG-ATC-A------TAGGA-T-CAC----T-G----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CC--------Cgtataa
gi|62 : A-T-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------T-----C---CC--------CC----------A--TTT-TG-C------T-----AGCGGGGGtac
gi|7 : ATGGGAGGCGGGG-----AG----------------GGA----C--------GA---A-T--------G--------------------GCTAAATGGA------------CAA-A----CGG----------AC-GA-AAC-A------CGGGGGT-CACAATAT-A----T-A-------------A-------A------------------C-----C---CC--------CC----------G--CTT-CA-C------T-----AGTGAGGGtat
gi|8 : ATGGAAGGCGGTG-----AT----------------GGA----T--------GA---A-C--------G--------------------A--------ACAGATGAACAAACGG-A----CAG----------AC-AG-AAA-A------CAGGA-T-CAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------------C---CC--------CC----------A--CTT-GG-C------A-----AGAGGAGgtat
gi|9 : gcTGGGAGGTGGGGGACAGAC----------------GGA----TAGATAAATGG---A-C--------G--------------------A--------A------------CAA-A----TGG----------AC-AG-AAT-A------CAGGA-T-TAC----T-A----T-A-------------A-------A------------------T-----T---CC--------CG----------A--TCT-CG-C------T-----AGTGTGGGagca
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): CGGATGGGAGGAGGGACACCCGAATGGACAAACAGGACCACTCTCCCCCCCCCCCCCCAGCTGCATAGCAGGGGGTATTG
Unaligned ( gi|34 ): AGTAGCGAATGGAGGAGGGGATGGACAGAAACACACAATCACTAATATATTCCCCCCCCCGCCCCCAGCTTTGTGCTA
Unaligned ( gi|60 ): GAAGTGGGGATGGACAAACCAATGGAATACAGTATCAGTATAAA