lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111 1 1 33 3333333 11 3333333333 1111 333333333 222222222222 1 11111 4444444444444444 333333333333333333333 22222222222 11 11 11111 111 1 111 1 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111 22 11 11 2222222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111 22222222 11111111 111 1 111111 2222 1111 1 1 11 1111 1 11 111111 111111 111111111 111111 11111111 11 2222222222222222222222 1111111111111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222222222 333333333333333333 111 11111111 111
lowQualScore : 777 88 4444 7 5 5 66 00 5 8888 0000000 5 6 66 6 3 5555555555 1 3 4444 6 99 6 666666666 6 7 999999999999 66 1 1 77 66 5 66 4 5 66 2 11111 5 3 3333333333333333 0 555555555555555555555 888 44444444444 0 4 4 00 4 55 66 5 11111 888 2 66 4 55 000 4 0 66 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5 5 222 0 00 44 55 22 4 3333333 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 444444 66 55 9999 4 4 55555555 66 0 5 77777777 000 5 5 66 0 5 000000 5 1111 5 99 55 1111 3 5 5 1 6 6 0 22 1 4 4 4 3333 4 2 44 4 8 4 4 4 4 3 2 000000 000000 55 7 3 777 333333333 777 4 333333 55 55 4 0 5 4 4 55 55 66666666 4 33 6 4 4 2222222222222222222222 2 2 99999 2 2 77777 5 33 2 5555 0 3 777777 5 1 2 7777777777777777777 2 99999 3 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 2 4 4 5555 33 2 2 77777 2 4 55 6666 777 444444444 4 4 2 2 2 333 2 2 2 2 6 1 1 44 000000000000000000 1 8888888 555555 1 999 1 1 3 77777 1 22 1 22 1 1 22 1 444 99999999 3 22 55 222 3 1 1 1 3 5 666
lowQualScore : ... .. .... . . . .. .. . .... ....... . . .. . . .......... . . .... . .. . ......... . . ............ .. . . .. .. . .. . . .. . ..... . . ................ . ..................... ... ........... . . . .. . .. .. . ..... ... . .. . .. ... . . .. ....................................................................... . . ... . .. .. .. .. . ....... ................................................................... ...... .. .. .... . . ........ .. . . ........ ... . . .. . . ...... . .... . .. .. .... . . . . . . . .. . . . . .... . . .. . . . . . . . . ...... ...... .. . . ... ......... ... . ...... .. .. . . . . . .. .. ........ . .. . . . ...................... . . ..... . . ..... . .. . .... . . ...... . . . ................... . ..... . . ...................................................................... . . . . .... .. . . ..... . . .. .... ... ......... . . . . . ... . . . . . . . .. .................. . ....... ...... . ... . . . ..... . .. . .. . . .. . ... ........ . .. .. ... . . . . . . ...
lowQualScore : 555 55 2222 0 0 7 11 77 0 6666 7777777 3 7 22 7 5 8888888888 7 2 2222 7 22 7 000000000 7 5 333333333333 00 0 5 99 99 0 99 0 0 99 5 88888 0 8 5555555555555555 1 888888888888888888888 888 11111111111 8 4 4 66 4 77 11 4 99999 111 2 11 4 11 333 4 2 11 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 0 111 4 11 00 88 66 6 4444444 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 444444 99 44 4444 4 4 33333333 22 2 0 99999999 000 4 0 99 9 0 000000 0 2222 7 99 66 7777 6 7 7 2 7 7 0 22 9 0 0 0 4444 0 0 33 0 0 0 0 0 0 6 4 555555 555555 00 3 6 000 555555555 000 0 999999 55 55 0 8 0 4 0 55 55 88888888 0 88 1 0 0 8888888888888888888888 9 9 44444 9 9 11111 0 44 5 3333 3 1 222222 0 2 5 7777777777777777777 4 44444 1 1 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 4 2 7 0000 22 4 4 66666 4 4 33 9999 444 111111111 0 0 0 0 0 555 0 0 0 0 0 9 9 44 000000000000000000 9 1111111 555555 9 666 7 7 1 77777 5 11 5 11 5 5 11 5 666 77777777 2 22 44 888 2 6 6 6 2 0 666
consensus : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGCTAAAGAATTA----GAAAGTGTACATTTGAATTT-TTGTAAG-AAAG-TTTT-GGGTGTTAAAAAA---AT-TACAGCTTCGATGATGATTTATTCAGAATTAGGTAG----------ATTTCCATTAG----AA-TT--A-G----A----A-CATTTAGAATGGTAAAATA--T---------TNNTTCAAANT--GAGA--A-A--CACNGATA-ATTGTATTTT--ACGTAG--TA-TNTA--T------TC--C--GAAATGTATGTACAATGTCTTGTAGANTCAAA---TTC---T---A---AATG-TTGGT-TG--TC-TAN-TG--TAAGGGATNTAT----TGT-N-CTCTNTT--G-GA-TTN--GGATA-TGTCTGGT--A-TGAA---GATT------AT--GTTA---A--TGA-A-A-AACCG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-AGTGAAACAAAGG-TTAAA-GGATGTGTT------TATAC-----A----A----------A--------G--TGT------T--TTTCGAT-AGTTC-TTCA----AAGTGT------CGTA--TAT-ATAGATATATTTG----TC-AT-GG---A----TCGGA-TTTGCAACT-TTA--TTNAC-GAAAA--CCGATTCC-A--GAT-CAATAT--A-A-ACAA-TGCAT----AAGTAAATT-TAGATTGTCATCTCATTAG---CTGGAAATTG-AAA-GAGGGAGATATTTCAATATACC-TGAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T-A-TC-ATTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGTATATGAA---AAA-CTA-AGA-AAA---TTGTATA-T--TG--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCAANGTA-T--AA--ATT----AT--T-ACAGCTATTCTCNAATA-CAAA-TACT--AGTG--TTAT-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCT--TCT-A----AACTTAA------A-TCAGAGGCCA-CA----A-CA-TA--------AA-G---AGGTTTATCC-T-CAATAT---T---T-A----TA-TA--TATG----T---GTAT------ATC-T-----TTACA-TCAC----GC-ATACTC-T-GTTTCG-T----A-TTC-TCA-AA---T-T-GT-T--AT----A---ATTGT----A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-TC-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-ATGTTTC-T-TT-TGTA---T-C-C--TA-T--AA-G-C--A-GTAT--T---G----C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-TA-C-AATACA
Reference ( gi|5 ) : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGTTAAAGAATTA----GAATGTGTACATTTGAAGTT-TTGTAAG-AAA--TCTT-GGGTGTTAAAAAA---AT-CACAACTTCGATATTGATGTATTCAGAATTAAGTAG----------ATTTCCATTAG----AA-TT--A-G----A----A-CATTTAGAATGGTAAAATA--T---------TTTTTCAAAAT--GAGA--A-A--CACTGATA-ATTGTATTTT--ACGTAA--TA-TATA--T------TC--C--GAAATGTATGCACAATGTCTTTTAGAACCAAA---TTC---C---A---AATG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATATAC----TGT-C-CTCTGTT--G-GA-CTA--GGATA-TGTCTGGT--A-TGAA---GATT------AT--GTTA---A--TGA-A-A-AACTG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-AATGCGACAAATG-TTAAA-GGATGTATT------CATAC-----A----A----------A--------G--TGT------T--CTTCAAG-TGTTA-TTCA----AAGTGT------CGTA--TAT-ATAGATATATTTG----TC-AT-GG---A----TCAGA-TTTGCAACT-TTA--TTAAC-GAAAG--CCGATTCC-A--GAT-CAATAT--A-A-ACAA-TGCAT----AAGTAAATT-TAGATTGTCACCTCATTAG---CTGGAAATTG-AAA-GAGGAAGATATTTCAATATACC-TGAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAC-TGAA-G-ACGAA-T-A-TC-ATTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGTATATGAA---AAA-CTA-AGG-AAA---TTGTATA-T--AG--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCAATGTA-T--AA--ATT----AC--T-ACATCTATTCTCTAATA-CAAA-TACT--CGTG--TTAT-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCT--TCT-A----AACTTAA------A-TCAGAGGCCA-CA----A-CA-CA--------AA-G---AGGTTTATCC-T-CAATAT---T---T-A----TA-TA--TATG----T---GTAT------ATC-T-----TTACA-TCAC----GT-ATACTC-T-GTTTTG-T----A-TTC-TCA-AA---T-T-GT-T--AT----A---ATTGT----A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-TC-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-ATGTTTCGT-TT-TGTA---T-C-C--TA-T--AA-G-C--A-GTAT--T---T----C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-TA-A-AATACA
gi|10 : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGCTAAAGAATTA----GAAAGTGTACATTTGATTTT-TTGTAAG-AAAG-TTTT-GGATGTTAAAAAA---TC-CACAGCTTCTATGATGATTTATTCAGAATTAGGTAG----------ATTTCCATTAG----AA-TTAGA-G----A----A-CATTTAGAATGGTAAACTATTT---------TTTTTCAATCT--GAGA--A-A--CACTGATA-ATTGGATTTT--ACGT-----------------------------AATGTATGCACAGTGTCTTATAGAACCAAA---TTT---T---A---AATG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATATAC----TGT-T-CTCTGTT--G-GA-CTA--GGATA-TGTCTAGT--A-TAAA---GATT------AT--GTTA---G--TGA-A-A-AACTGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAT-TACAA-AATGT-ACAAAGG-TTAAA--GATATATT------TATAC-----A----A----------AAC------A--TGTA-----TAGTTTCAAG-AATTC-TTCA----AAGTGG------CGAA--TAT-ATAGATTCATT
gi|3 : agtattttagcaatgcaatgtaaaaagagtacgaatgttctgctgtctaaaatgaagtctttacacctgaatgtgttgacaaagttgaatttatttgacacatatgtgagtagtattgcatattatagctgtgaAGAGTGGGGTTTCAGTATCTCTGCAACAGAATTA----TAAAGTGTACATTTGGATTT-TTGCAAG-AAAG-TTCT-ACATGTTAAAAAATCTATGTACATTTTCGATGATGATTTATTCAGAATTAGGTAC----------ATTTCCATTAG----AA-TT--A-G----AGAGAA-CATTTAGAATGGTAAAATA--TAATGTTTTTTTTTTCAAACT--GAGA--A-A--CACTGATA-ACTGTATTTT--ACGTGA--TA-TACA--TGTGCATTT--A--GAAATGTGTAAAGGATGTCTTGTGGAATCAAA---TAC---C---A---AATG-TTGGT-TA--TG-TAG-TG--TAAGGAATATGT----TGT-T-TTCTCTT--G-AT-TTA--GGGTA-TGTTTGGT--A-CGAA---AA-C------ATC-GTTA---A--TGA-A-A-ACCCG-------------------------GTGT-TAT-TGC-A-AGTAAAACGACGG-GTAAG-GGATATATA------TATACCAAAAA----A----------A--------A--TGA------T--C--------GCTA------------TGT------CGTA--TGT-ATATGTATATTTA----CC-AT-GG---G----TTGGA-TCTGCAACT-TTA--TTTAG-GAAAC--CCACGTCC-A--TGT-CAATAT--ATATACAG-TGCAT----TAGTAAATT-TAGATTGTCCTCTCATAAG---CTGGAAATCG-AAG-GAGG
gi|4 : acacgtaaatgattttgcgatggtgtttattaaaacattatgtgttccagctgaggttagagatattgctttatttctaatatcatgtaccccctatttttttaaatatttatttcagtattgctaatgatactgtacttttttcagatacagcagatggtttacaaaatatgttggacgcattgtagttacatcccaaaattgaaacacagtgttaaaagtgttggttttagaagtcgtaaactgaaaaactgtcatacatggtgttatgatgatgtacctctagatgtcatgtggtagaaaatatgaactagttaggaatcctgttccgttttaatgataaatttaataaagcataaaatgttttagctatgcaatgtagatctagaaagagtatgaatgctctgttagctacaacgaagttctaacacttaattatctcaacaaagtatctgacacacatgtgagtagtattgccacttatacttgtgaAGTGTGGGGTTC---TATTCCTGCTAAATAATTATCTAGAAAGTGTACATTTGAATTT-TTGTAAT-AAAG-TCTT-GGGTGTT--AAAA---ATCCACAGCTTCGATGATGATTTATTCCGAATTAGGTAC----------ATTTCCATTAG----AA-TT--A-GAGACA----A-CATGTAAAATGGTAA
gi|42 : tgtgtaaatggtctgaaaattatgacatcatatcaaatgctcagtttggtttttaaaaaggatataataccaccgatgccatatttatattacagtatttaattaacaggaatataatgaaaggaaagaaactttattgttgttttgtaaattatcaaaagggcgttcgattcggtaaatagaggtatgttgttttgcaaaatatctcaatgtggtatagattgtaaaattatgaatatcattcgttcaatgtatgtaaatgttaagtcttgtgtaaaatataaatcacaattgtcagaatatttctcttgtaatcagggtttaatgcaaggaaaatcattgtctccaattttattttcgttatatgtgaatgattttgaaatggagtttataaaaaaaaaaaaacgtgtgttccaattgaggttcgagatatcgctctatttcttataatgtatgctgatgatattgtacttttctcggatacagcagaaggtttacaaaacatgttgaacactctatgtagttacacctcgaaatggaaacttaatgttaatactgaataaacaaaaattgttgtttttagaaaaggtcgtaaactaaaaaaattatacatggtgtctttagatgtggtagataactttaactacataggagtcacgtttaatatcaatggcaaattaaataaagcacaaagtattttagcaatgcaacgtaaaaagagtatttaaaaagagtatgaatgttctgctatctaaaatgaagtctttattcctgaatgtgttgacaaagttgaatttatttggcacatatgtgagtagcattgcatattatagctgtgaGGTTC---TATTCCT-CTAAAGAATTA----GAAAGTGT
gi|12 : aaattcaatgtacagtattttacaatgcaatgtaaagaaagtatgaattttctgtttctttacacctgaatgtgtgacaaagtgaattatttaacatatggtgagagtattgcatattatagtgaattGAATTG----GAAAGTATTCATCTAGATTT-TTGTAAACAAA--TTTT-ATCAGTTAAAAAA---AG-TACTGTTTCCATGATAGTGTACTCGGAACTAGGACGC---------ACTCCTCTT-GTCTTAA-AT--A-G----G----A-AATATAGAATGATTAAATA--C---------TGGTTGAAATT--GAAA--A-A--ATCAGAAA-ATTGTATTTT--GGATAG--TA-TTTA--C------CA--T--GAAATGT---TAGAA-GT-TTGTA-ATTCAGATTTTTT---C---G---CTTG-TTAGT-TG--TC-AGA-TG--TAAAGGATTTAT----TGT-A-CTCCTTT--G-AA-TTT--GGAAA-GGTATGGA--A-TTCC---AATA------AT--ATCA---A--CGA-A-A-AGCAT-------------------------TTTT-TAC-TAC-A-AGTGAAACAAAGG-TTGAA-TGATGTGTT------TGTGC-----A----A----------GAATTGAATG--CGT------T--TTTTGAT-AATTC-ATCA----AAATGTAACTTACATG--TAT-ATAAATATGTAAA----TG-AT-GG---T----TTTAA-GTTGCAATT-TTAT-TTAAC-AAAAG--CC-ATTCC-A--AATACAGT--------ACAA-TATAT----AAGCAAAT
gi|15 : TTG----GAAAATGTTCATTTGAATTT-TTGTAAA-AAA--GATTCGGGTGTCAAGAa
gi|6 : tttaaccaaaatgaaaaatttgcatttaaatgttagtacactgttgtcactgtttgatacgtttataggaagtctagcaatttatggtttggggctcacatccagcaaatgatcatgtTGTACATT-GAATTT-TTGTAAG-AAAGGTTTT-GG-CGTTAAAAAA----T-TACAGCTT-GATGATGATTTATTCAGAATTAGGTAG----------ATT-CCATTAA----AAATT--A-G----AGAGAA-CATTTAGATTAGTAAAGTT--T---------TTTTTCAAC-T--GAGA--A-A--CACTGATA-ATTGTATTTT--ACGTAA--TA-TATATTT------TC--T--G-AATGTATGT-CAATGTCTTTTAGAACCAAA---TTC---T---A---AATG-TTGTT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATATTC----TGT---CTCTGCT--G-GA-CTA--GGAT--TGT-TGGT--A-TGAA---GATT------AT---TTA---A--TG----A-AACTG-------------------------GTTT-T-T-TAC---AATGCGACAA--G-GTAA---GATAT-TT------TATAC-----A----ACATGTT----A--------G--T-T------T--TTTCAAT-AGTTC-TTCA----AAGTGT-------GTA---AT-ATAGATATATTTG----TC-AT-GG--------TCAGA-TTTGCAACT-TTA----A---GAAAA--ACAATT-C-A--G-T-CAA-AT--A-A-ACAA-TGCAT----AAGTAAA---TAAATTGT---TTCAT--------------------------AGATATTTTAATATACC-TGAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAA-TG-TGT-T-CATAATTAG-G-A-TATGTGAA-G-ACGAA-T-A-TC-ATTAT-AT-TT------TAATATATTT--TGTCAC-TGTATATGAA---AAA-CTA-AGA-AAA---TTGTACA-T--TG--ATA--AA---ATT-ATTATGATAAA-CGTC-ATGTA-T--AA--ATT----AT--TAACA-GTATT-TCTAATA-CAAA--ATC--TGTGT-TTAT-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCT--TCT-A----AACTTAA------T-T--GAGGCCA--A----A-CA-TA--------AA-G---AGGTTTATCC-T-CAATAT---T---T-A----TA-TA----------------------------T-----TTACATTCA-----GC--TACTC-T-GTTTCG-T----A-AT--TTA-AA---T-T-GT-TTAAT----A---ATTGT----A-CTTTTA-TT-GG-T---T---A-T-TT-T--A-TT-GA-TG-TT----------TTA---T--TG-T-------AATA------T-ATGTTTC-T-TT-TATA---T-C-C--TA-T--AA-G-C--A-ATAT--T---G----C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-TA-C-AATACggtctactatgtctatgatggtttacaatgaattgggacggacaccactacatgtgctaagaaagtatagaaagttacaaataattatattttaaagagtatttatcaggaaatgttacaactcaaattcttttaattgttggttgacatatgtaaaagatttattaaattctttaggatttggagatgagttgttcataagtacaattccatacttcttatctgaagtaaaacaaagactacaggatgtgtttatacaag
gi|1 : acTTTGAATTTGTTGTAAA-AAAG-TTTT-ATGTGTTAAAGAT---CT-TACTATGTC--TAT-GATGGTTTTACAATGAATTGGGACGGACACCACTTACAT--G----TG-CT--AAG----A----AGTAT---GAATATTGAAATA--T---------TGGTTTAAAATTAAAGA--AGA--CAAAAATG-ATTGTATTTTTAAAG-AG--TATTATA---------TCAGC--GAAATGTTTA---GATGTTTGT--GACTCAAA---TTCTTTT---A---ATTG-TTGGT-TGAACA-TA--TG--TAAGAGATTTAT----TAT-A-CTCT-TA--G-GATTTG--GGATATTGT-TGGA--ATTGTACTTGTTG------AT--ATAA---ATTTGA-A-ACAA--A-------------------------ATTT-TAT-GATGA-AGTAAAACAAAGA-CTACATGGATGTGTTA-----TATAC-----A----AGAAAATAAATA--------G--TGT------T--TTTGGAGACGTCA--CCA----AAATGT------ACTATTTAT-ATCAATA----TG----TCAAT-GA---AGGTTTTAAA--TTACAATT-GTA--TTTAC-AAAAAGCCCTATTCCTAGTGGT-TTATATTCA-A-A------CAT----AAGTAAATTACCGACTAGC-CCTCACTAGAATATTGAAATTGAAAA-AAGGTAGATTTAGTAATATTCCAAGAAAAGAA-AGA-AAA--ATGTAAATTA-TGTGT-C------AGAGAA-CAT-TCAA-GTATGAAGT-ATTC-ATTTT--TA-T------TA------GT--TGTCGC-TTTTTATAAT---GAT-TTG-GGGAAAA---CAGTATT-A--AA--AGA--AAT--ATT-ATTATAAACACCCCTCTACTTT-C--AA--GCT----GTTGT-ACAATTATTATCAACTT-GGAA-TATTACCGGA--AT-T-AT------GTACT-TTTGGG----TAAATA-C-CT-----ATATAAA-TGT--TC-------ATCT--A------G-TCAGA--------------------------------------TTAT-C-T-CA--GT---T---T-A----T--TG--TAAG--------ATAT------ATC-C-----TT-CA---------GT-ATATCC-T-GCCATG-T----A---CATCA-TA-----T-GA-T--AT----A---A--AG----A-T--T---CT-GA-T-A-T---T-TATT-TC-A-T---G-TA-TTA-----------AAT-T--TG-T--------TTG------T-ATAT---AC-TT-TATA---C-C-T--TA-G--AA---C--T-GTATGGT---T----C-TTAATT--G---T-CAA-T-A-AACCAA-TA-C-AA
gi|11 : ggtaaatttcacaaaactcaaaatgttttttagcgccgcaatgtagaaaaagtttaagtagcttgtttaaccaaaaaagatttgcattgaatgttagcacacagttgtcactgtttgatacgtatatactaggaagtctagcaaattatgttgttgaagttttggggctcacaccagcaaataatttggaaacacttcatAGAATATTGAAATA--T---------TGGTTAAAAAT--TAAACAA-A--GACAAATACATTGTATTTT--AAG-AACGTA-TTTA--T------TT--CAGGAAAC---TGTAGAAT---TTGT-GACTCAAA---GTC---T---CTTTAATGGTTGGTATGA-CC-TATGTG--TAAGAGATTTAT----TATAC-TTCT-TTAGG-GA-TTT--GGATA-TGTTTGGC--A---------ATT-------C--GTTACTGA--TGATATA-AACTG-------------------------
gi|7 : ttacatttgaatgttagcaccacagttgtcactgttttgatacgtatagtagcagagtctttagcaaattatggttgtaagtttggctcacatctagcaaatgatttgggaaaatcgttcactttgaattttttgtaaaaaagttttatcgctgttaagaacgtcaactatgctctatgccatggtttacaatgaatttgggcggacaccactacatgtgctcaagaagtaaT--GAGA--A-A--CACTGATA-ACTGTATTTT--ACGTAA--TA-TATA--T------TC--T--GAAATGTACACACAATGTCTT----------------C---T---A---AACG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAAGGATACATATGTTGT-T-CTCTGTT--G-GA-CTATAGGATA-TGTCTGGT--A-TGAA---AATT------AT--GTTA---A--TGA-A-A-A-CTG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-AATG-GACAAAGG-TTAAA-AGATATATT------TATAC-----A----A----------A--------ACATGTATAGTTT--TTTCAAT-AGTTC-TTCACA--AAGTGT------CGTA--TATTATAGATATATTAG----TC-AT-GG---A----TCAGA-TTTGCAACT-TTA--TTTAA-GGAAA--CCGATTCG-A--GAT-CAATAT--A-A-ACAA-TGCAT----AAGTAAATT-TAGATTGTCATCTCATAAG---CTGGAAATTG-AAA-GAGGGAGGTATTTCAATATACC-TGAATGTAA-CCG-GAA--ATGTAAATGG-TGT-T-CACA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-AAGAA-T-A-TC-ATTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGTATATGAA---AAA-CTA-AAA-AAAAACCTGTATA-T--TG--ATA--AAT--ATT-ATTATG-AAAACCGTCAATGTA-T--AA--ATT----AT--T-ACAGCTACTCTCTAATA-TAAA-TACT--AGTG--CTAT-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCT--TCT-A----AACTTAA------A-TTAGAGGCCA-CA----A-CA-TG--------AA-G---AGGTTTAACC-T-CAATAT---T---T-A----CA-TA--CATGTATAT---GTAT------ATC-T-----TTACA-TCGC----GC-ATACTC-T-GTTTTG-T----A-TTC-TCA-AA---T-T-GT-T--AT----ATATATTGTA---A-C--TCATTT-AG-T-G-T---C---TT-TC-ATTT-GA-TG-TTA---------CATAT-T--GG-T-------AATA------T-ATGTT---C-TT-TGTA---TCC-C--TATT--AA-G-C--ACGTAC--T---G----C-TT--TT--C---G-GAA-T-A-AA-CAATTA-C-AATAaaaaaacaaattatctgaagtacaaacaaagactacaggaagggtgttactatacaagaacataaatagtgtcttcatcatgtgataaattccacaat
gi|15 : AGA--A-AGTTACAAATA-ATTATATTTT--AAAGAG--TA-TTTA--T------CA--G--GAAATGT---TACAA---CT--------CAAA---TTC---TTTTA---ATTG-TTGGT-TG--ACATA--TG--TAAAAGATTTAT----TAA-A-TTCTTTA--G-GA-TTT--GGAGA-TGAGTTGTTCA-T-AA---G--T------A-----CA---A--TTC-C-A-TACT---------------------------TCT-TAT-CTG-A-AGTAAAACAAAGA-CTACA-GGATGTGTT------TATAC-----A----A----------
gi|17 : tttaaccaaaatgaaaaatttgcatttaaatgttagtacactgttgtcactgtttgatacgtttataggaagtctagcaatttatggtttggggctcacatccagcaaatgatcatgtttggaaaatgttcatttgaatttttgtaaaaaagattcgggtgtcaagaggtctactatgtctatgatggtttacaatgaattgggacggacaccactacatgtgctaagaaagtatTG-TCGGT-TC--TC-AGA-TGGATAAAACATTTAT----TGT-CGCTCCTTA--GAGA-TTT--GGATA----CTATT--A-TGGA----ATTCCAATAATCGATTA---A--CGA-A-A-GAGCA-------------------------TTTT-TACATAC-ACAGTGAAACAAACGGTTGAA-TGATGTGTTTGCTGGCATAA-----ATTGGA----------AT-------G--CGT------T--GTTT----TGATAATTCATCAAAAGTAA------CTTA--TAT----GA-ATATGTGATAATG-AT-GGGCTA----TAAG---TTGCAA-T-TTA--TTAACAAAAAG--CCAATTTC-A--AATACGATAT--G-T-ACAGTTATAT----AAGCAAATA-TCGCATGTCATCACA-TAA---CTAGAAGTTG-AAACAAGGTAGATATCATAATGTg
gi|74 : ttacccatgaaaatgtttagaagttgtgtaattcagatatgtttacttgTGT------CGTA--CGT-TTAGGTATATTTA----CC-ATGGG---G----TCGGA-TTTGCAgttcaaaaatgaagaatttg
gi|9 : TTTG----TC-AT-GG--------TCAGA-TTTGCAACTATTACTTTAA--GAAAA--CCGATTCC-A--GAT-CAATAT--A-A-ACAA-TGTATTTATAAGTGAATT-TAGATTGTCATCTCATTAG---TTGGAAATTG-AAA-GAGGGAGATATTTCAATATACC-TAAATGTAA-CCGTAAATTATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T-A-TC-ATTTT-ATAAT------TA------TT--TGTC-C-TGTATATGAA---AAA-CAA-AGA-AAA---TTGTATA-T--TG--ATA--TAT--ACT-AATATGAAAAACCGTCAAAGTA-T--AA--ATT----AT--T-ACAGCTATTCTCTAGTA-CAAA-TACT--AG------------------------TT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCT--TCT-A----AACTTAA------AGTAAGAGGCCA-CA----A-CA-TA--------AA-G---GGGTT
gi|18 : ----TC-AT-GG---A----TCAGAATTTGCAACT-TTA--TTTAA-GAAAA--CCGATTCC-A--GATTCAATAT--A-A-ACAA-TGTATTTATAAGTGAATT-TAGATTGTCATCTCATTAG---TTGGAA-TTG-AAA-GAGGGAGATATTTCAATATACC-TAAATGTAA-CCGTAAATTATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T-A-TC-ATTTT-ATAAT------TA------TT--T-TC-C-TGTATATGAA---AAA---A-AAA-AAA---TTGTATA-T--TG--ATATTTAT--ACTAAGTATGAAAAACCGTCAAAGTA-T--AA--ATT----AT--T-ACAGCTATTCTCTAGTA-CAAA-TACT--AG------------------------TT-GG----TAAATT-TCTT-----GTATAAA-GCT--TCT-A----AACTTAA------AGTAAGAGCCTA-CA----A-CATTA--------AA-GTC-GGGTTTATatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatcacgcatactctgttcgtatctcaaattgtttataattgtaacttattggtgtcttttcattaatattattgtaatgtatgtttctttttgtatcctataagcagtattgcttttggaaataaacaatacaatac
gi|13 : ATATTTTAATATACC-TGAATGTAAACCG-AAA--ATGTAA-TTGCTGT-TTCATA--TGGAG-AATA--TGAATG-ACGAA-T-A-TC-ATTTTTATATT------TA------TT--TGTC-C-TGTAT-TGAA---AAA-CT--AGA-AAA---TTGTACATT--GG--GTA--AAT--ATT-ATTATG-AAAACCGTCAATGTA-T--AA--ATT----AT--T-AAAGCTATTCTATAATA-CAAA-TACT--AGTG--TTATAAT------GTATG-TTT-GG----AAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCT--TCTAA----AACTTAA------A-TTAGAGGGCC-CA----A-CA-TA--------AA-G---AGGTTTATCC-T-CAATAT---T---T-A----TA-CA-----G----TAAAGTAT------ATC-TATATATTACA-CCAC----GCAATACTC-T-GTTTCG-T----A-ATC-TTACAA---T-T-GT-T--ATA---A---ATTGTA---A-T--TTA-TT-GG-T-G-T---T-T-TT-TCTA-TT-AA-TGTTTA---------TTA---T--TG---------AATA------T-A-GTTTC-T-TT-AATA---A-C-C--TA-T---A-G-C--A-GTAT--T---G----CTTT--TT--G---G-AAA-TAA-AA-CAA-TA-C-AATA
gi|37 : ggagacttaaaataagtataataccagtgtG-AAA--ATGTAAATTA-TGT-T-CA------GAG-AATAT-TGAA-G-ATGAA-T-A-TC-ATTTT-ATATT------AA------TA--TGTC-C-TTTTTAT
gi|16 : atttagtaatattccaagaaaagaaa-AAA--ATCTAA-TTG-CAT-T----A--TC-AG-A-TAA-TGAA-GGACGAA-TTA-TC-ATTT--------------A------TC--TGTC-CATGTATATGAA---AAAACTA-AG--AAA---TT-TACA-T--TGTAATT--AATCGATT-ATGCTGAAAAAC-GTCCAAGTAGTCGAAGTATT----GT--T-ACAGCTATTCTCGAATAGCAAAATACT--AATG--TTAT-AT------GTAAT-TTT-G-----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-ACT---CT-A----A-CTTAA------A-TTAAAGGCCA-CA----A-CATCA--------GA-G------TTTATC--T-CAATAT---T---T-AATGATA-TA--TA-A----T---ATATTAGGTAATC-T-----T-ACA-TCAC----GC-ATACTC-T-GTTTCG-T----A-TTC-TTA-AA---TGT-GT-T--AA----A---ATTGTA---A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-TT---CT-GA--G-TTA---------TTA---T--TG---------AATA------T-ATGTTCTTT-AT-TATA---T-C-C--TA-TAAAA-G-C--A-GTAA--T---TGG--C-TT--TT--G---GTAAA-T-A-AACCAA-TACC-AATACagtgattgtagaaaacagtatttaagcttctccaactatttaatatcaactggaaatattacggaattatgtaaacttggtaaatacc
gi|19 : agaA--ATGTAAATTA-TGT-T-CA------GAG-AACAT-TGAA-G-ATGAA-T-A-TC-ATTTT-ATATTAGTACATG------TA--TGTC-C-TTTTTAT-AA---TGA-TTGTAGA-AAA---CAGTATT-T--AA--AGA--AAT--ATT-ATTACAAACACCCCTCTACTTT-C--AA--GCT----TG--T-ACAACTATTATCAACTG-GAAA-TATTA-CG-GAATTAT-A--------TAAA-CTT-GG----TAAATA-C-CT-----ATATAAATGTT--TAT--------CT---------A-TCAGA--TCT-CA----GTTA-CATGTATTGTAA-G---A---TTATCC-T-TAGTATCAAT---C-C----TG-TC--CATG----T---ATAC------ATC--------AATA-TGA------T-ATATTA-T-GTTCTGTT----A-TTA-TTT-CA---T-T-G--T--AT----A---ATT
gi|21 : TTG-TGT-G-CAAA--TAGAG-A-TAT-TGAT-G-GTCAA-T----CGAT----ATATT------TA------TT--TGTC-A-TGAGTTTGAG---AAA-ATA-TGA-AAA---TTGTATA-TTGAA--AAA--AAT--ATT-ACTATAAAAAAGCAT-GATGCG-T--GA--AACAAAAAC--C-A-ATTCATTCAC--ATG-TAAA-TACA--AATG--TGAT-ATAAAAAAATAATGTTT-GGAACTTGAA-T-C-TC-----ATATGAA-GCT--T-T-A----AAATTGAAATAGCA-TCAGATGCAATCA----A-CA-T------------------GTTC------------T---T---T-A----TA-C---TAC-----C---GTA-------A---T-----TGAGA--CAC-------ATACTT-G-ATTATG-T----G-TTT-GCA-AA-------------AT----A---A-TGT---------TTA---------A-C---C-T-TT------TT-GA-T--------------TTAAT-T--TA-T-------CA----------ATGTCT-GT-TC-TAAA---A-T-T--TA-T--AA-G-C--A-ATGC--T---G----C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-TG-C-AATACAtgtttgtatatactttatacctatgaactgtatggttcatggtcaataaacgatacaataca
gi|14 : TTT-A-GTT------TA------GTAATATC-T-TTTATATGAACATAAA-----AGA-AAA---TTACATG-T--TG--ATA--A-----TT-ATTATGAAAATCCGTCAAAGTG-T--AA--ATT----AA--T-ACGT--A--CTCAAATA-CATA-TATC--AGTG--TTAT-GT------GTAAT-TT--GG------AATT-T-TTTTTTCATATAAA-GCT--TCT-A----AACTGAA------A-TCAGAGATCA-CT----T-CA-TA--------AG-G---ATGTTTACCC-T-CAATATG--T---TAA----TA-AA--CATGTCC-T---GTAT------ATTAT-----TTGAG---GC----GC-ATGCTC-T-ATTTAG-T----G-TTT-ACA-AATGGT-T-GT-T--AT----A------------A-C--TTA-TT-GA-T-G-T---C---TT-TC-A-T---A-T--TTATT-------TTAA-----TG-T-------AATA------T-ATGTT---C-TT-TGTAG--T-A-CAATA-C--AATA-C--A-GTAT--
gi|52 : ctaaaggtaaatataaaattaatgcagatattttgcagtacattgtactagtaaacataaatgtttcgtaacatttagatttgatggaaaatacaaataaacacgtgtattttctcgtcattagatttaaccGTG--TAAT-GT------GCAAT-TTT-GG-----AAATTGT-TT-----ATATAAA-GCT--TCC-A----ATATGAA------A-TCAGAGACCA-CATCTGATCA-TA--------AA-G---AGGT
gi|31 : attaTAT-GT------GTAAT-TTT-GG----GAAATC-T-T---------------------T-A----AACTGAA------A-TCAGTGGTCA-CA----A-CG-TG--------AA-G---AGGTTTATCG-T-CAACATA--T---C-A-----A-T---TATG----C---ATGT-------TC-T-----TGATA-TCA------------TC-C--TTTCA-T----G-TTT-ACA-AA---T-T-GT-A--AT----A---AT--A----A-T--TCA-TT-AA-T-G-T---C-T-TTCTC-A--T-AA-TT-TCA----------TAAT-TACTG-T-------AATA------T-ACGTT---C-TT-TGTA---C-C-A--TA-A--AA-G-C--A-GTAC--TGGCTACTGC-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-TA-C-AATacttttgaaaacattacacatataattta
gi|59 : catgAT-GT------ATAAT-TTG-GG----GGAAAT-G-TT-----GTATAAA-GCT--TCT-AGCTGAACTGAA------A-TCGGAGGCCA-CA----T-AA-TA--------AA-G---AGGT
gi|43 : gccT-AT-------TAAA-CTT-GG----TAAATA-T-CT-----GTATAAATGCTCATCT-A-------TTAG------A-TC----TCTG-TA----A-TT-GG--------AA-G---A---TTATCC-T-CAGTAT---C---T-A----T------CCTG----T---CCA-----------T-----TTACA-TCACTATTAT-ATATTA-T-GTTCTGTT----A-TTacatgtacatgtatat
gi|29 : ttccaacaatcatcaacttgaaatattatagaatTACAAA-GCT---CT-A----AATGTAA------A-TTAGGGGCCA-CA---------CA--------AA-GCGAGGGTTTATCC-TTCAATAT---TAAAT-A----TAATA--TATA----T---GTA-------ATG-T-----TT-------------T-ATAC-----ATTTCG-TCGTAA-TTC-TCA-AA---A-TAGTAT--AT----A---ATTGTTCACA-CA-TTA-TTTGG-C-G-TGTTC-T-TT-TC-A-TTTGA-TG-TTAAATATATTGTTAATAT--TG-TT------AATA------T-ATGCTTCTT-TC-T-TA---TTC-C--TA-T--AA-G-C--A-GTGC--T---G----C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-TA-T-AATACAatttc
gi|24 : tagtacatgtTACAAA-GCT--TCT-A----AATGTAA------A-TTATGGGCCA-CA----A-CA-TA--------AGCG---GGGTTTATCCTT-CAATAT---T---T-A----AA-TAATTATA----T---GTAA------GTG-T-----TT-------------T-ATACTT-TCG--TCG-T----AGTTC-TCA-AA-----T-GTAT--AT----A---ATTGCTA--A-C--TTATTT-GGCT-GTT---C-T-TT-TC-ATTT-GA-TG-TTATATATTGT-TTAATAT--TGTT-------AATA------TAATG-TTCTT-TT-TAT----T-C-C--TA-T--AA-GCC--A-GTGC--T---G----C-TT--TTA-G---G-AAA-T-A-AA-CAAGTA-T-AATa
gi|70 : tattcgtgccaaacgccactataaactatcaaatcttgatccagaatcttcacttgacttagtacagt-CA-TA--------AA-G---AGGTTTATCT-T-CAATt
gi|41 : t------ATA-T-----TTAAA-TCTC----GC-ATACT--T-GTTTCG-T----A-ATC-TTA-AA---T-T-GT-T--AT----AAACATTGT----A-A--TTA-TTAGG-TAG-T---TAT-TT-TC-ATTT-GAGTA-TTA----------TACT-C--CA-CAAAGATAAATA------T-ATGGTT--T-TT-TATA---TACAC--TA-C--TA-G-C----GCAT--T---G----CTTT--TT--A---G-AAA-T-A-CA-CAA-TA-A-tgttaatgaattatctgagtcgtatgctctatt
gi|9 : -----TTACA-TCAC----GC-ATACTC-T-GTTC-G-T----A-T-C-TCA-AA---T-T-GT-TT-AT----A---ATTGT----AAC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-TC-A-TT-AA-TA-TTA---------TT--------G-T-------AATG------T-ATGTTTCTT-TT-TGTA---T-C-C--TA-T--AA-G-C--A-GTAT--T---G----C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-TA-C-AATACca
gi|45 : tttgtcatggtcagatttgcaactattactttaagaaaaccgattccagatcaatataaacaatgtatttataagtgaatttagattgtcatctcattagttggaaattgaaagagggagatatttcaatatacctaaatgtaaccgtaaattatgtaaattgtgttcatatagagatattgaagacgaatatcattttataattatttgtcctgtatatgaaaaacaaagaaaattgtatattgatatatactaatatgaaaaaccgtcaaagtataaattattacagctattctctagtacaaatactagttggtaaatttttgtataaagcttctaaacttaaagtaagaggccacaacataaaggggttatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-----TTACA-AAAC----GC-ATCCTCCT-GTTTCG-T----A-T-C-TCA-AA---T-T-GT-T--AT----A---ATTGTA---A-C--TTA--G-GG-T-G-T---C-T-TT-T--G-TT-GA-TGTTTA---------TTA---T--TG-T-------AA-A------T-ATGTTTTCT-TT-T-TG---T-C-C--TA-T--AA-G-CAGA-GTA---G---T----G-TT--TT--GGGAG-AAA-T-A-CA-CGA-T
gi|40 : ACTC-T-GTTTCG-T----A-ATC-TCA-AA---T-T-GT-T--AT----A---ATTGTA---A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-TC-A-TT-GA-TG-TTtacaatgc
gi|47 : CTC-T-ATTTCG-T----A-CTC-TCA-AA---T-T-GT-T--ATTTAAA---ATTCT----AAC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-TC-A-TT-GA-CG-TTA---------ATA---T--TG-T-------AATACATGTAT-ATGTTTCAT-TT-TGTA---T-C-C--TA-T--AA-G-C--A-GTAC--T---G----C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-TA-ttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtattgcttttggaaataaacaacacaat
gi|50 : -TCA-AA---T-T-GT-T--AT----A---ATTGT----AAC--TTA-AT-GG-T-G-T---C-T-TT-TT-G-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-ATGTTTCTT-TT-TGTA---T-C-C--TA-T--AA-G-C--A-GTAG--T---G----T-TT--TT--G---G-AAA-T-A-CA-CAT-TA-C-AATcat
gi|55 : T-T--AT----A---ATTGT----AAC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-TC-A-TT-GA-TG-TTA---------T--AT-T---G-T-------AATA------T-ATGTTTC-T-TT-TGTA---T-C-C--TA-T--AA-G-C--A-GTAC--T---A----C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-TA-C-AATACg
gi|57 : ---ATTGT----AAT--TTA-TT-GG-T-G-T---T-T-TT-TC-A-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-ATGTTTC-T-TT-TATA-----C-C--TA-T--AA-G-C--A-GTAT--T---G----C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-TA-C-AATAt
gi|53 : TTGT----A-A--TTG-AT-GG-T-G-T---C-T-TG--C-A-TT-AA-A---TA---------TTTAT-T--TG-T-------AATG------T-ATGTTTTCT-TTATTTG---T-T-C--TA-T--AA-G-C--A-GTAG--T---G----C-TT--TT--T---G-AAATT-ATAA-CAACTA-ACAATACA
gi|58 : --TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-TC-A-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-ATGCTTC-T-TT-TATA-----C-C--TA-T--AA-G-C--A-GTAT--T---G----C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-TA-C-AATACata
gi|64 : catataT-GA-CG---A---------TTAAC-G--TA-T-------AAC----------TGGTACGT-T---ATA---T-C-C--TA-T--AA-G-C--A-GTAT--T---G----C--T--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-TA-C-AATAC
gi|68 : g---------TTAAT-----G-T-------AATA------G-ATA----GTCTT-TGTAACAT-A-T--TA-T--AA-G-C--A-GCAC--T---A----C-TT--TT--G---G-GAA-T-A-AA-
gi|69 : gtGTTTCTT-TT-TGTA---T-C-C--TA-T--AA-G-C--A-GTAT--T---G----C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-TA-CAA-TA-C-AA
gi|65 : aagagGTTACGT-T---ATA---T-C-C--TA-T--AA-G-C--A-GTAT--T---G----C-TT--TTTGG---A-AAA-T-A-AA-CAA-TA-C-AATACA
gi|71 : taacgtataactgA---T-C-C--TA-T--AA-G-C--A-GTATACT---G----C-TT--TT--G---GAAAA-T-A-GC-CAA-TA-C-AATACAa
gi|73 : ta-C-C--TA-T--AA-G-G--A-GTAT--T---G----C-TT--T---G---G-AAA-T-A-AA-CAA-TA-T-CATAC
gi|72 : tcaa-C-C--TA-T--AA-G-C--A-GTTT--T---G----C-TT--TTG-G---G-AAA-T-T-AA-TCA-TA-C-AATACAga
33 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): GATTAAGTGCATGAGCAAAAAGTATGATTTAATCTCTGATGCCCAATTTGGTTTTAAAGCTGGATATAGTACAAGTGATGCTATTTTTGTTTTACACTGGTTAATAACACGGACACTTGCAAAACGTAAACACCTTTTTTGTTGCTTTGTGGATTATCAAAAGGCTCTTTTGATAAGTATGATATGAAACATGCTCATTTTTAAATTATCGAAATATGGAACTTTGACTGTCAAATGTTAAAGTCAATGAAACTCTAATATAAAAACATGTGGTACGCCACTACTTAAATCAATGGTCAGAGTTGCTCAGGATGTTCGCCGAGGGGTTGATGCAGGGCGAGTCACTCTCCTCCCATTGTTATTTTCGTTCCATATAAATTACCTTTTGAAATGAAATTATTGGAAGTCATCGTGTATTATCTGTAAGAAATTAGAGAAATAGCTTTATTTTTTCATCGATATGCTTTGAGATGACACTGTTTTATTATTCCAGACAACGGAACACACAGGTTTACAAAGATATGTTAACTGTTTGACTCAACTTATGACATCTACAGTGGAATTGATACCCGGTAAACGAGACAAAACTAATGTTTTGCTAGTATTCAGAAAAAAGTTGGTAGATTGAAACAGAAACTATTTTTTGGAAATATAATATGGAAAAGCTATTGATGTTGTGAGACAATCGTTAATTTATCTAGTATCCACTTTGAATTTCAATGGTAATTCAATTAAAACACAAAGTGTTCTTAGGCATCAGCAATGTAAAAATAGGCTTAAGTTGTACCTGTTAAGCTAAAAATCGAAAACATCTTGCAACATTAAATGTAGTACAAAGTTGTCATTGTTCAATACTTACTATTAGTAGTATAGCAAATTATGGCTCCTGTGAAGTCTGGGATTAAATCCAGCATAATGAATTGGGAAGAGTATTCATCTAGATTTGTAAACAAATTTTATCAGTGAAGAAGCAGTCTGTTCCATGGTATGGTGTACCGTAACTAGGACGCCTCCTCTTCATCTTAAATAGGAAATATAGAATAATTAAATACTTGTTAAATTGAAAAAAA
Unaligned ( gi|8 ): AAGAAATTATATTGTTGCTTCGTAGATTATCAAAAAGCTTTTGATAAAATAGACAAAACTATGCTATTTTTTCAAATTAGCAAAACATGGTATTGATTGTCAAATGTTACAAATTATCAAGTCTATGTACTCTAATATTAAATCATGTGTAATACACAAAAATCTGTCAATTGTAATGAGGGTTTGATGCAAGGGGAATCACTCTCACCATTTCTTTTCTCTCTGTATGAGAATGATTGAGATGGAATTCATTGAAAAAATGTGTATCCCAATTGAAATAAAAGAAATTGTTTTCATGTTAATTATATATGTTGATGATACGGAACTTTTTCAGAGACAAAACAAGGTTTACAAGATATGTTGAATTGTTTACAAGATTATACCTCAAAGTGGAATATAAAACTTAAAAGTCAATTTGGATAAAACAAAGATAGTTGTTTTTAGAAAAGGTGGGAAATAAAAAATAATAATTGTTGGAAGTATGACAACACGTTGGTTAGCATTGAAGAAAATTTCAATTATTTGGGTATAATATTAAATTATAAAGGAAAATTTCCCAAAACACAAAATGCTTTAGCAGCGCAATATATGTAGAAAAGGTTT
Unaligned ( gi|20 ): TGATTTTATATTGGTCAGAAACCAGAAGTCAAAACACTATTTTGTTGCTTTCTACATCATCACTAAACTTTATGGAGTTTTTTAAGTCACCGAATTTGATCGTCAAATATCTAATGTTATAATATGAATGTATGCTCATATAAAACTTGCGTACCGACAAAAACATACGCTGTCAGAGCTTTTGGGATGCCGAGAGGCTTGATCAAAAGGAATCACTCTCCTCATTCTTATTTACTTTTCATATAAATGATTTTGAACTGGAATATATTGAAAGCATGTGTATACCTGTAAAAATAGGTAAGTTGCTTTATTTTCCATCATATATGCATATGATATTGTGGTTTTCTGAGACGGAACGAAGTTAGCAAGGTA
Unaligned ( gi|22 ): ACAAAAATGATATGGAAATGAGGGCTTAGTGCAGAACTAGTTTTCGGTGTCTTTTCTCTGCATATGGTATTCAATAGAAATGCATGCGTATACCTGTAGAAATAAGAGACACTGTGTTCCTCTTGGTATCGTATGCAGACGATACAGTATTTTTTTTTCAGAGACAGAACAAAAGGTCTAAAAGACATCAATATACACAGCAACGTTTGGTATAAAGGGTGATGTAGATAAAATTTAAATAATTGTACTTTGAAATTATGGTAAATTGAAGGAAAATCACTGTTTGAAGTATAAATATGAGTAAATTGATATTGTGGAAAATGTCAATTGCCTATGCTTAATTTTAAATTTATAAGTAAATTC
Unaligned ( gi|23 ): TCCTTCTTATGTACGCTGATGATATGGTTTTGTTATCTGATAGCGTTTGAGGGTCTACAGAGATGTTAAATACTCTATCTAATTACACGAAAAGAATGGGATTGAATGTTAATGTACAGAAAACAAAAATAATGAATATTAGAAATGGCAGTAAAGTTAAGGACAAACGAAAAAAAATGGTATTATAATGATGATTTCTTTTGGATAAGTAAATGAATTTAATTTTAGGCATACTTATGTGCTACAATGGTAAATTTTGAAAACACAAAGACACTCGCAAATCAAATCAAGTGGTTAGAAAGCTTTATTTGCAATTAAT
Unaligned ( gi|25 ): ATGAATATCAATGTTATATCTAGTATGTCCTTTTATATAATGATTTGTAGAAAACAGTATTTAAAGAAATATTATTAAAACACCCTCACTTTCAAGCTTTTAATAATATTACGGAATTGGTAAATACCTATATAAATGTCATCTATCAGTTCTCAGTTATGTACATTATCCTCATGCATCTATTTCCTGTTCCAATGCTCATCATGAATATATAATGTTCTTGTTATTTATTCATTGTATAATCTATTTGTATACTACTGTATACCTATGAACTGTATGTTCTTGGTCAATAAAACAATACA
Unaligned ( gi|26 ): AAATAATAAAGAAAAAAAAAAGAAAACAGTATTTAAACAAATATTATTATAAACACCCCTATACTTTCAAGCTTGTACAACTACTATCAATTAACTGGAAACATTACGGAATTATGTAAACTTGGTAAATACCTATATAAATGTTCATCTATCAGATCTCAGTTATTGTAAGATTATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTACATCAATATGATATATTATGTTATGTTATTATTTCATTGTATAAGTCAGTATATACTTTATACCTATGAACTGTATGGTTCTTGGTCAATAAACAATA
Unaligned ( gi|27 ): AAAAGGCGTTCGACTTGGTAAATGGAGGTATGTTGTTTTACAAGCTATCTCAATGTGGTATAGATTGTAAAATTATGAATATCATTCGTTCAATGTATGCAAATTTTAAGTCTTGTGTAAAGTATAAATCACAATTGCCAGAATATTTCTCTTGTAAATAAGGTTTAATGCGAGGAGAATCATTGTCACCAATTTTATTTTCGTTATATGTGAATGATTTTGAAATGGAGTTTATAAAAAAACTTGTGTGTTCTACGGTAATTGAGGT
Unaligned ( gi|28 ): CATGAGATTACTGTAACTTTTCTCGGATACACTAGAAAGGTTGTACAAAACATTTGAGCACTCTATTAGTTACACCTCGAAATGGAAACTTAATGTCATACTTGGAAAAAACAAAAAATGGTTGTTTTTTAGAAAAGGTGGTAAACTAAAAAATTGTTTATATACATGTGTAATGATAATGGTACCTGTTAGATGTGGTAGAGTAACTTTAACTACTTCATGGAGTCACGTTTTAATTTCCCATGGCAATTAATCAAAGCACAAAGTA
Unaligned ( gi|30 ): AAAGTTATATTGTTGTTTTGTAGACTTCCAGAAGGCTTTTGATTCAATTGATAGATCTGAATTGTGGTGTAAAATAGTTAATGACGGTATACAGCGGAAGATGTTCAATGCTTTAAGTTATTGTATAATAATGTTCAAAGCTGTGTGAAGTATGCCGGTTTTTTAGTGATTATTTTTGCAATGATACAGGTCTAATGCAGGGTGAAACTTTGTCACTTATTTCATTTTCGTTATATATACTC
Unaligned ( gi|32 ): TATTACGAATAAAGTTATAAACCCGATACGCAAGCCCTATAGATACCCGTTAAAGGTGTTGCATTTATAAAGTATCTCAGTTATGTGTAAAGATTGTCTACCTCAGTATCTAACGGTCCTGTCTATGCCTTTGATTGCATCAACATGATATATTATTTTCGTTTATCATTCACATTGATATTGTTACTTGGTATAAACTTGATACGCTATGAACTGATG
Unaligned ( gi|33 ): AGTTAAATAATCATTGTTTTTAATGCAGAAACAAAATTGTCGGTTTTTAAAACGTATGTTGAAGTATATTATCATACGGATCTGAAATAGGGGATTTCATAAAGCCCCAGATGTTGAGAAAGTTCACATTAAATTTTAAGAATATATTGGGTGTAAAATAGAAAAAACATGTACAATATGGTTTATTTGAAATTGAAGATAC
Unaligned ( gi|34 ): ATATTGTTGACTCTTTCATATCATGAGACATTTGTATTTATATTGCAGTGATACTATTATGCATACATGTAGGTTTCTATATTATGTAATGTTTTGTCATTGTACAAATTAGTTTATGCATAACGTTAAACCTATGAAATGTATGGTTCTTGGTAATATTGATTGATCGATACCAATTACAATGACCAAGTACAT
Unaligned ( gi|35 ): AGAAAACAAAAATAATGATATTTAGAAATGTCAGTAAAGTTAAGGACAACGAAAAATGGTAATATAATGATATTCTTTTGGATAATGCAAATGAATTTGATTATTTAGGCATACTTATTTGCTATAATGGTAAATTTTTGAAAACACAAAGACACGTCGCAGATCGAGGTAGAAAAGCTTTATTTGCAATTAA
Unaligned ( gi|36 ): TTAAATTGGTTATCTGAAAAATAAAAGTTTGTATAATATATGATAATTATAAATATTATTATAAACACCCCTCTACTTTCAAGCTTGTACAACTATTATCAACTGGAAATATTACGGAATTATGTAAACTTGGTAAATACCTATATAAATGTTCATCTATCAGAACTCGGTTATTGTAAGATTATCCTCAGT
Unaligned ( gi|38 ): ACCTATAAATGTTCATTTATTAGATCTCAGTTATTGTAAGATTGTCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTGCATCAACATGATATATTATTTTCTGTTATCATTCCATTGTATAATTTGTTATTTGTATATACTTTATACCTATGAACTGTATGGTTCTTGGTCAATAAG
Unaligned ( gi|39 ): ATTAAATAAAGCATGTAGTACACCGTCAAATATTGATAAATGTCATGAGGGTTTGATGCAGGGAAATCCACTCTCCCCATTTCTATTTTCAGTTTATGTAAACTATTCATATAGAGTTCATAGAAATCGTTTTTGCTTATAAGGAAATTATTTGTATTGATTGTGTGT
Unaligned ( gi|44 ): TGTTGCTTCGTAGTATTATCAAAAAGCTTTTGATAAAGATAAACAAAATATTGCTATTTTTTCAAATTAGCAAAAACATGGTATTGATTGTCAAATGTGACAAATTATCAAATCTATGTACTCTAACTATAATCATGTGTAATACAC
Unaligned ( gi|46 ): AGTAAATAACAACAAAAACAATGGTGTGTAAATGATACATTTCTGCACAATATTATTTTAAACACCCCTCTACTCTCAAGCTTGTACAATTATCATCAACTGGAAATATTTCGGAATTATGTAAATTTGGTAAATACCTAT
Unaligned ( gi|48 ): TTAAACTAAAAATGCATTTAGAAAATGTTCCAGCAACATAGTTGTCGTTGTTTAATTCGTATAATAGGCAAGTCCTACACATTATGGTTGTGTGGTGTGGGGCTCGCACATTCATGCAAAATTAACGATTTTGGAA
Unaligned ( gi|49 ): GAGAATCACTGTCACCCAAATTTTATTTTCGTTATATGTAAATGATTTTTGAAATGGAGTTCATAAAAAAGCTTGTGTGTTCCATTGAGGTTTCGTAGATATACGCTGATTGTCTTACTAAT
Unaligned ( gi|51 ): ATCCTCAACATGCCAATAAACATGTTCTTTGTATTATTTGAGAAGGATGCTCTCTTTCTTGTTCACAAATTGATTTTATAACTTAGTGATGTATTTTGTATTTATGTAATTAA
Unaligned ( gi|54 ): GATTATGTAAACTTGGTAACAACCTATATAAATGTTCATCTATCAGATCTCAGTTATTGTAAGATTATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTACATCAATATGATATA
Unaligned ( gi|56 ): TCATAAAGTTGAGTAGTTAATTATGTAAAATTGATAAATACTTATATAAATGTTCATTTATTAGTTCTCAATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTACAT
Unaligned ( gi|60 ): TATTATGTTCTGTTATTATTTCATTGTATAATTTGTTTGTATATACTTTATACCTATGAACTGTATATGGTTCTTGGTCAATAAACAATAC
Unaligned ( gi|61 ): CAACATATGGCATGTCACTAAATACTAGAAAATTGAAAAAGGTAGATATTTATATGTTTCAAGAATGAAAGAATTGTAAAAT
Unaligned ( gi|62 ): TGTACGTCAATGTGATATATAATTTTCTGTACTTTATACCTATGAACTGTATGGTTCTTGGTCAATCAACAATACAAT
Unaligned ( gi|63 ): GTGTAAATCGTCCAATATCTATGACGTCGTGTCAGATGCTCGATTTGTGTTTTTAAAAAAAAGAGTTATGGTACTA
Unaligned ( gi|66 ): TAATGTGCTGCTTGTATACGCATTATACTTATCAACTGTATAGTTCTTGGTCAATGAATAATAC
Unaligned ( gi|67 ): TATTTGAGAAGCATGCTCTATTTCATGTTTACAAATTGGTTTTATAACTTATAGAATATATCT
Unaligned ( gi|75 ): ATTTTTAATTAATAATATAATTTTTTTCCTAATAAATTTT
Unaligned ( gi|76 ): GTATGGTTCTTGGTCAATAAACAATACAAACAATA
Unaligned ( gi|77 ): CGTTCGATTCGGTAAATAGGGGTATGTTGT
Alignments
lowQualScore : 1111 111 3333333333333 11 11 1111111111 3333333333333333333333333333 1 222222222222 3333333333333333 222 11 22222222222222222222222222 11 11111111111111111111111111111 4444444444444444444444444444 111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 11 1 1111 11 1111 1 1111111 11111111111111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111111 222222222222222
lowQualScore : 1111 3 77 8888 3 3 666 4 4 4 4 0 111 4444444444444 3 777 5 11 7 66 4 7777777777 1 6 8888 4444444444444444444444444444 55 1 0 000000000000 66 5 1 55 55 4 2 4 66 1 444 6 3333333333333333 000 5 3 6 4 22 2 22222222222222222222222222 4 4 4 4 22 55 1 8888 88 4 55 4 666 4 4 8 55 99999999999999999999999999999 4 55 4 7777777777777777777777777777 4 4 4 4 777 55 4 0 77 55 1 333333333 88888888888888888888888888888888888888888888888888 5 3 66 5 222222 66 4 4 4 9 3 55 4 777 4 8 2 6 00 3 4 66 3 666666 4 8888 5 5 3 3 9999 2 5 5 5 5 8 11 0 3 3 3 0000 3 0 3 3 6 3 77 3 3 3 0 888888 888888 77 6 3 2 1 555 9999999 555 55555555555555555 44 44 3 3 1 3 44 44 44 3 1 3 555 1 3 3 88 3 444 2 2 777777 2 2 88888 2 2 66666 2 2 5555 5 666666 4 0 5555 2 888888 2 2 22 33 2 2 2 6 555 77 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 2 2 2 4 4 2 77777 2 333 4 44 6666 666 999999999 3 3 1 1 1 333 1 1 1 1 1 5 1 1 44 222222222222222 44 3 7777777 444444 1 1 22 6666 3333 1 3 66 777 11 1 11 1 1 11 1 4444444 1 33 1 11 2 33 44 222 5 2 1 1 2 4 11 1
lowQualScore : .... . .. .... . . ... . . . . . ... ............. . ... . .. . .. . .......... . . .... ............................ .. . . ............ .. . . .. .. . . . .. . ... . ................ ... . . . . .. . .......................... . . . . .. .. . .... .. . .. . ... . . . .. ............................. . .. . ............................ . . . . ... .. . . .. .. . ......... .................................................. . . .. . ...... .. . . . . . .. . ... . . . . .. . . .. . ...... . .... . . . . .... . . . . . . .. . . . . .... . . . . . . .. . . . . ...... ...... .. . . . . ... ....... ... ................. .. .. . . . . .. .. .. . . . ... . . . .. . ... . . ...... . . ..... . . ..... . . .... . ...... . . .... . ...... . . .. .. . . . . ... .. .................................................................. .. . . . . . . ..... . ... . .. .... ... ......... . . . . . ... . . . . . . . . .. ............... .. . ....... ...... . . .. .... .... . . .. ... .. . .. . . .. . ....... . .. . .. . .. .. ... . . . . . . .. .
lowQualScore : 7777 9 44 5555 6 6 999 0 0 0 0 5 555 9999999999999 7 000 0 00 2 55 0 5555555555 9 4 5555 1111111111111111111111111111 66 0 7 999999999999 33 7 0 55 55 0 6 4 11 1 666 9 4444444444444444 000 0 2 6 1 11 4 44444444444444444444444444 0 0 0 0 99 55 0 5555 99 9 55 0 555 0 0 2 55 99999999999999999999999999999 0 55 0 1111111111111111111111111111 0 0 0 0 000 44 0 6 22 55 4 555555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444 4 8 99 0 888888 11 4 0 0 0 0 55 0 000 4 9 6 7 66 7 4 11 3 999999 4 9999 0 0 1 6 0000 0 0 7 7 7 9 00 8 6 6 6 5555 6 9 6 6 7 3 99 3 3 1 6 888888 888888 33 2 1 9 9 000 2222222 000 77777777777777777 22 22 1 8 0 3 66 66 66 3 6 3 000 0 3 3 55 7 111 7 7 777777 7 7 11111 7 7 77777 4 4 0000 3 888888 7 6 0000 4 444444 2 1 99 11 2 7 7 2 444 33 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 33 2 2 2 4 2 1 33333 1 555 0 88 2222 777 666666666 5 5 7 7 7 000 7 7 7 7 7 0 7 7 00 555555555555555 66 3 1111111 888888 7 6 22 0000 4444 5 0 11 333 88 3 88 3 3 88 3 2222222 3 11 3 88 7 22 55 333 3 7 3 3 7 1 99 4
consensus : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GGTGTTAAAAA----A---AT-T-ACAGC---TTCNATG--ATGGTTTATTCA--GAATT-AGG-NAG------ACTTC----CATTAG----AA-TT-----A-G----A----A-CATNTAGAATGGTAAAATA--T---------TTNTTCAAANT--GAGA--A-ACACTGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-GTATNTA--T------TC--C--GAAATGTATGTACAATGTCTTGTAGANTCAAAT---T------C---T---A---A--ATG-TTGGT-TG-TC-TAC-TG--TAAGGGATNTAT----TGTN-CTCTNTT--G-GATTN--GG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---GATT------AT--GTTAA-T--GAAA-AACCG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTAAA-GGA--TGTGTT--T------ATAC-----A----A----------A--------G--TG-----T------T--TTTCGATAGTTCNTCA--AA-GTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCGG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTTACGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCAACGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCT-ATTC--TCNAATA-CAAA-TACTA--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-TAAA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTT-C-T----T-T-T-ATA-T-CC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
Reference ( family-468 ) : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GGTGTTAAAAA----A---AT-T-ACAGC---TTCGATG--ATGATTTATTCA--GAATT-AGG-TAG------ATTTC----CATTAG----AA-TT-----A-G----A----A-CATTTAGAATGGTAAAATA--T---------TNNTTCAAANT--GAGA--A-ACACNGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-GTATNTA--T------TC--C--GAAATGTATGTACAATGTCTTGTAGANTCAAAT---T------C---T---A---A--ATG-TTGGT-TG-TC-TAN-TG--TAAGGGATNTAT----TGTN-CTCTNTT--G-GATTN--GG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---GATT------AT--GTTAA-T--GAAA-AACCG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTAAA-GGA--TGTGTT--T------ATAC-----A----A----------A--------G--TG-----T------T--TTTCGATAGTTCTTCA--AA-GTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCGG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTNACGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCAANGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCT-ATTC--TCNAATA-CAAA-TACTA--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-TAAA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTT-C-T----T-T-T-GTA-T-CC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
gi|1 : TGGGGCTC----ACACCAGC--AAATAATTT----GGAAAC-ACTT--CA-TTTTGAATTTGTT-GTAAAAAAGTTTTA--TGTGTTAAAGA----T---CT-T-ACTAT---GTCTATG--ATGGTTT-TACAATGAATT-GGG-ACGGACACCACTTA----CAT--G----TG-CT-----AAG----A----AGTAT---GAATATTGAAATA--T---------TGGTTTAAAATTAAAGA--AGACAAAAATG-ATTGTATTTTTAAAG-A-GTAT-TA--TA-----TCAGC--GAAATGT-T-TA-GATGT-TTGT-GACTCAAAT---T------C---TTTTA---A--TTG-TTGGT-TG-AA-CATATG--TAAGAGATTTAT----TATA-CTCT-TA--G-GATTT--GGGATATTGT-TGGA--A------TTGTACTTGTTG------AT--ATAAA-TTTGAAACAA--A-------------------------ATTT-TAT-GATGA-A---GTA-AAACAAA-GACTACATGGA--TGTGTTA-T------ATAC-----A----AGAAAATAAATA--------G--TG-----T------T--TTTGGAGACGTCACCA--AA-ATGT------ACTATTTAT-ATCAATATGTCAA-TGAA-GGTTTTA--A-A---TTACAATT-GTA-TTTACAAAAAGCCCTATTCCTAGTGGT-TTATATTCA-A-ACA------T----AAGTAAATTACCGACTAGCC--CTCACTAGAATATTGAAATTGAAA-AAAGGTAGATTTAGTAATATTCCAAGAAAAGAA-AGA-AAA--ATGTAAATTA-TGTGT-C------AGAGAA-CAT-TCAA-GTATGAAGT--ATTCA-TTTT--TA-T------TA------GT--TGTCGC-TTT-TTAT-AA---TGA-TTTGG-GGAAAA---CAGTATT-----------AA-A--AGA--AAT--ATT-ATTATAAACACCCCTCTACTTT-C--AA--GCTGTTGT-ACAATT-ATTA--TCAACTT-GGAA-TATTA--CCG-GAATT-AT------GTACT-TTTGGG----TAAATA-C-CT-----ATATAAA-TGTTC-------ATCT--A------G-TCAGA----------------------------------TTAT-C-T-CA--GT-T---T--A----T--TG--TAAG--------ATA----T------ATC-C-----T-T--CA------------GT-ATATCC-T-G--C-CATG-TACATCA-TA-----T-G---A-T--AT----A---A--AG----A-T--T---CT-GA-T-A-T---T-TATT-T-C-A-T---G-TA-TTA-----------AAT-T--TGTT-------TGTA------T-AT-A--------C----T-T-T-ATA-C-CT--TA-G--AA---C--T-G-------T-AT--G-GTTC-TTAATT--G---T-CAA-T-A-AACCAA-T--A-CAA
gi|10 : ggtaaatttcacaaaactcaaaatgttttttagcgccgcaatgtagaaaaagtttaagtagcttgtttaaccaaaaaagatttgcattgaatgttagcacacagttgtcactgtttgatacgtatatactaggaagtctagcaaattatgttgttgaagtttAGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GATTTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GATGTTAAAAA----A---TC-C-ACAGC---TTCTATG--ATGATTTATTCA--GAATT-AGG-TAG------ATTTC----CATTAG----AA-TTAG---A-G----A----A-CATTTAGAATGGTAAACTATTT---------TTTTTCAATCT--GAGA--A-ACACTGATA-ATTGGATTTT--ACGT---------------------------AATGTATGCACAGTGTCTTATAGAACCAAAT---T------T---T---A---A--ATG-TTGGT-TG-TC-TAC-TG--TAAGGGATATAC----TGTT-CTCTGTT--G-GACTA--GG-ATAT-GTCTAGT--A------T-AAA---GATT------AT--GTTAG-T--GAAA-AACTGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAT-TAC-A-AAATGT----ACAAA-GGTTAAA--GA--TATATT--T------ATAC-----A----A----------AAC------A--TG-----TA-----TAGTTTCAAGAATTCTTCA--AA-GTGG------CGAAT--AT-ATAGATTCATT
gi|11 : agtattttagcaatgcaatgtaaaaagagtacgaatgttctgctgtctaaaatgaagtctttacacctgaatgtgttgacaaagttgaatttatttgacacatatgtgagtagtattgcatattatagctgtga----GAAAATCG-TT--CACTTT-GAATTT-TTTGTAAAAAAGTTTTATCGCTGTTAAGAACGTCA---AC-T-AT-GC---T-CTATGCCATGGTTTA--CAATGAATTTGGG-CGG------ACA-C----CACTAC----AT-GTGCTCAA-G----A----A--GTAAAGAATATTGAAATA--T---------TGGTTAAAAAT--TAAACAA-AGACAAATACATTGTATTTT--AAGAACGTATTTA--T------TT--CAGGAAAC---TGTAGAAT---TTGT-GACTCAAAG---T------C---T---CTTTA--ATGGTTGGTATGACC-TATGTG--TAAGAGATTTAT----TATA-CTTCTTTAGG-GATTT--GG-ATAT-GTTTGGC--AATTCGTT-ACT---GATG------AT--ATAAACT--GAAA-AAACA-------------------------A-AT-TAT-CTG-A-A---GTACAAACAAA-GACTACA-GGAAGGGTGTTACT------ATAC-----A----A----------
gi|12 : ttacatttgaatgttagcaccacagttgtcactgttttgatacgtatagtagcagagtctttagcaaattatggttgtaagtttggctcacatctagcaaatgatttggGAATTG----GAAAGT-A-TT--CA-TCT-AGATTT-TT-GTAAACAAATTTTA--TCAGTTAAAAA----A---AG-T-ACTGT---TTCCATG--ATAGTGTACTCG--GAACT-AGG-ACGC-----ACTCC----TCTT-GTCTTAA-AT-----A-G----G----A-AATATAGAATGATTAAATA--C---------TGGTTGAAATT--GAAA--A-AATCAGAAA-ATTGTATTTT--GGATA-GTATTTA--C------CA--T--GAAATGT---TAGAA-GT-TTGTA-ATTCAGAT---TTTTTCGC---T-----------TG-TTAGT-TG-TC-AGA-TG--TAAAGGATTTAT----TGTA-CTCCTTT--G-AATTT--GG-AAAG-GTATGGA--A------T-TCC---AATA------AT--ATCAA-C--GAAA-AGCAT-------------------------TTTT-TAC-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTGAA-TGA--TGTGTT--T------GTGC-----A----A----------GAATTGAATG--CG-----T------T--TTTTGATAATTCATCA--AA-ATGTAACTTACATGT--AT-ATAAATATGTAAA-TGAT-GGTTTTA--A-G---TTGCAATT-TTATTTAACAAAAG--CC-ATTCC-AA--ATACAGT--------ACAAT-ATAT----AAGCAAATgaacataaatagtgtcttcatcatgtgataaattccacaat
gi|13 : ATATTTTAATATACCT-GAATGTAAACCG-AAA--ATGTAA-TTGCTGT-TTCATA--TGGAG-AATAT--GAATG-ACGAA-T--A-TCA-TTTTTATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-AT-TGAA---AAA-CT----AGAAAA---TTGTACA-----------TTGG--GTA--AAT--ATT-ATTATG-AAAACCGTCAATGTA-T--AA--ATTAT--T-AAAGCT-ATTC--TATAATA-CAAA-TACTA--GTG-TTA-TAAT------GTATG-TTT-GG----AAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCTAA----AACTTAA------A-TTAGA----GGGCC-CA----A-CA-TAAA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-CA-----G----TAAAGTA----T------ATC-TATATAT-TA-CA-CCAC-------GCAATACTC-T-GTTT-CGTA-ATC-TTACAA---T-T-G---T-T--ATA---A---ATTGTA---A-T--TTA-TT-GG-T-G-T---T-T-TT-T-CTA-TT-AA-TGTTTA---------TTA---T--TG---------AATA------T-A--G--TTT-C-T----T-T-A-ATA-A-CC--TA-T---A-G-C--A-G-------T-AT--T-G--CTTT--TT--G---G-AAA-TAA-AA-CAA-T--A-CAATAa
gi|14 : ggagacttaaaataagtataataccagtgtTTT-A-GTT------TA------GTAATATC-T-TTT-ATATGAACATAAA-------AGAAAA---TTACATG-----------TT-G--ATA--A-----TT-ATTATGAAAATCCGTCAAAGTG-T--AA--ATTAA--T-ACG--T-A--C--TCAAATA-CATA-TATCA--GTG-TTA-T-GT------GTAAT-TT--GG------AATT-T-TTTTTTCATATAAA-GCTTCT-A----AACTGAA------A-TCAGA----GATCA-CT----T-CA-TAAG-G--ATG-TTTACCC-T-CAATATGT---TA-A----TA-AA--CATGTCC-T---GTA----T------ATTAT-----T-TG-AG---GC-------GC-ATGCTC-T-ATTT-AGTG-TTT-ACA-AATGGT-T-G---T-T--AT----A------------A-C--TTA-TT-GA-T-G-T---C---TT-T-C-A-T---A-T--TTA---------TT--T-TAATG-T-------AATA------T-AT-G--TT----C----T-T-T-GTAGT-ACAATA-C--AATA-C--A-G-------T-AT--
gi|15 : ctaaaggtaaatataaaattaatgcagatattttgcagtacattgtactagtaaacataaatgtttcgtaacatttagatttgatggaaaatacaaataaacacgtgtattttctcgtcattagatttaaccTTG----GAAAAT-G-TT--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAAAAAGATTCG--GGTGTCAAGAG----G---TC-T-ACTAT---GTCTATG--ATGGTTTA--CAATGAATT-GGGACGG------A-CAC----CACT----------------------------A-CAT-----GTGCTAAGAAA--G---------T-ATAGAAAGT--TACA--A-ATA-------ATTATATTTT--AAAGA-GTATTTA--T------CA--G--GAAATGT---TACA-----------ACTCAAAT---T------CTTTT---A---A--TTG-TTGGT-TG-ACATA--TG--TAAAAGATTTAT----TAAA-TTCTTTA--G-GATTT--GG-AGAT-GAGTTGTTCA------T--AA---G--T------A-----CAA-T--TCCA-TACT---------------------------TCT-TAT-CTG-A-A---GTA-AAACAAA-GACTACA-GGA--TGTGTT--T------ATAC-----A----A----------
gi|16 : tttaaccaaaatgaaaaatttgcatttaaatgttagtacactgttgtcactgtttgatacgtttataggaagtctagcaatttatggtttggggctcacatccagcaaatgatcatgt-AAA--ATCTAA-TTG-CAT-T----A--TC-AG-A-TAA-TGAA-GGACGAA-TT-A-TCA-TTT--------------A------TC--TGTC-CATGT-ATATGAA---AAAACT--A-AGAAA----TT-TACA-----------TT-GTAATT--AATCGATT-ATGCTGAAAAAC-GTCCAAGTAGTCGAAGTATTGT--T-ACAGCT-ATTC--TCGAATAGCAAAATACTA--ATG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-G-----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-ACT-CT-A----A-CTTAA------A-TTAAA----GGCCA-CA----A-CA-TCA--G--AG--TTTATC--T-CAATAT-T---T--AATGATA-TA--TA-A----T---ATA----TTAGGTAATC-T-----T--A-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TTA-AA---TGT-G---T-T--AA----A---ATTGTA---A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-T---CT-GA--G-TTA---------TTA---T--TG---------AATA------T-AT-G--TTC-T-T----TAT-T-ATA-T-CC--TA-TAAAA-G-C--A-G-------TAAT--TGG--C-TT--TT--G---GTAAA-T-A-AACCAA-T--ACCAATACg
gi|17 : agaAAATGT-T-TAGAA-GTTGTGTA-ATTCAGATATGT------T---T---A---CTTGTG-TCGGT-TC-TC-AGA-TGGATAAAACATTTAT----TGTCGCTCCTTA--GAGATTT--GG-ATA----CTATT--A------T-GGA----ATTCCAATAATCGATTAA-C--GAAA-GAGCA-------------------------TTTT-TACATAC-ACA---GTG-AAACAAACGGTTGAA-TGA--TGTGTT--TGCTGGCATAA-----ATTGGA----------AT-------G--CG-----T------TG-TTTTGATAATTCATCA--AAAGTAA------CTTAT--AT----GA-ATATGTGATAAT-G-ATGGGCTA-TAAGTTGCAA-T-TTA-TTAACAAAAAG-CCAATTTC-AA--ATACGATAT--G-T-ACAGTTATAT----AAGCAAATA-TCGCAT-GTCATCACA-TAAC---TAGAAGTTGAAACAAGGT-AGATATCATAATGT
gi|18 : ttacccatga-TCAT-GGATCAG--AAT---TTGCAACT-TTA-TTTAAGAAAA--CCGATTCC-AG--ATTCAATAT--A-A-ACAAT-GTATTTATAAGTGAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGT---TGGAA-TTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-AAATGTAA-CCGTAAATTATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATAAT------TA------TT--T-TC-C-TGT-ATATGAA---AAA-----A-AAAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATATTTAT--ACTAAGTATGAAAAACCGTCAAAGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCT-ATTC--TCTAGTA-CAAA-TACTA--G------------------------TT-GG----TAAATT-TCTT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------AGTAAGA----GCCTA-CA----A-CATTAAA-GTCGGG-TTTATgttcaaaaatgaagaatttg
gi|19 : A--ATGTAAATTA-TGT-T-CA------GAG-AACAT-TGAA-G-ATGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATTAGTACATG------TA--TGTC-C-TTT-TTAT-AA---TGA-TT--GTAGAAAA---CAGTATT-----------TA-A--AGA--AAT--ATT-ATTACAAACACCCCTCTACTTT-C--AA--GCTTG--T-ACAACT-ATTA--TCAACTG-GAAA-TATTACGGAA-TTA-T-A--------TAAA-CTT-GG----TAAATA-C-CT-----ATATAAATGTTTAT--------CT---------A-TCAGA--------------------------------------TC-T-CAG----T---T--A----CA-TG--TAT-----T---GTAAGATT------ATC-C-----T-TAGTA-TCA-------------ATCC-T-GTCCATGTA-TACATCA-AT---A-T-G---A-T--AT--------ATTAT----G-T--T---CT-GT-T-A-T---T-A-TT-T-C-A-TT-G--TA-TAA---------TTTGT-T--TG-T--------ATA------T-A-----------C----T-T-T-ATA---CC--TA-T--GA-A-C--T-G-------T-AT--G-G--T-TC--AT--G---GTCAA-T-A-AA-CGA-T--A-CAATACA
gi|2 : AGTCTGGGATTA---AAT-CCAGCATAATGAATTG----GGAAGA-G-TATTCA-TCT-AGATTT----GTAAACAAATTTTATCAGTG--AAGAA-------------GCAGTCTGTTCCATGGTATGGTGTA-CCG--TAACT-AGG-ACG------CCTCCTCTTCATCTT----AA-AT-----A-G----G----A-AATATAGAATAATTAAATA--C---------TTGTT-AAATT--GAAA--A-A
gi|21 : gattaagtgcatgagcaaaaagtatgatttaatctctgatgcccaatttggttttaaagctggatatagtacaagtgatgctatttttgttttacactggttaataacacggacacttgcaaaacgtaaacaccttttttgttgctttgtggattatcaaaaggctcttttgataagtatgatatgaaacatgctcatttttaaattatcgaaatatggaactttgactgtcaaatgttaaagtcaatgaaactctaatataaaaacatgtggtacgccactacttaaatcaatggtcagagttgctcaggatgttcgccgaggggttgatgcagggcgagtcactctcctcccattgttattttcgttccatataaattaccttttgaaatgaaattattggaagtcatcgtgtattatctgtaagaaattagagaaatagctttattttttcatcgatatgctttgagatgacactgttttattattccagacaacggaacacacaggtttacaaagatatgttaactgtttgactcaacttatgacatctacagtggaattgatacccggtaaacgagacaaaactaatgttttgctagtattcagaaaaaagttggtagattgaaacagaaactattttttggaaatataatatggaaaagctattgatgttgtgagacaatcgttaatttatctagtatccactttgaatttcaatggtaattcaattaaaacacaaagtgttcttaggcatcagcaatgtaaaaataggcttaagttgtacctgttaagctaaaaatcgaaaacatcttgcaacattaaatgtagtacaaagttgtcattgttcaatacttactattagtagtatagcaaattatggctcctgtgaTTG-TGT-G-CAAA--TAGAG-A-TAT-TGAT-G-GTCAA-TCGA-T--------ATATT------TA------TT--TGTC-A-TGA-GTTTGAG---AAA-AT--A-TGAAAA---TTGTATA-----------TT-GAAAAA--AAT--ATT-ACTATAAAAAAGCAT-GATGCG-T--GA--A--AC--A-AAAACCAATTCATTCACATG-TAAA-TACAA--ATG-TGA-T-ATAAAAAAATAATGTTT-GGAACTTGAA-T-C-TC-----ATATGAA-GCTT-T-A----AAATTGAAATAGCA-TCAGA----TGCAATCA----A-CA-T---------G-TTC------------T-T---T--A----TA-C---TAC-----C---GTA-----------A---T-----T-GA-----GAC-------AC-ATACTT-G-ATTA-TGTG-TTT-GCA-AA----------------AT----A---A-TGT---------TTA---------A-C---C-T-TT-------TT-GA-T--------------TTAAT-T--TA-T-------CA----------AT-G--TCT-G-T----T-C-T-AAA-A-TT--TA-T--AA-G-C--A-A-------T-GC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--G-CAATACAaa
gi|24 : TACAAA-GCTTCT-A----AATGTAA------A-TTATG----GGCCA-CA----A-CA-TAAGCG--GGG-TTTATCCTT-CAATAT-T---T--A----AA-TAATTATA----T---GTA----A------GTG-T-----T-T-----------------T-ATACTT-TCG--T-CGTAGTTC-TCA-AA-----T-G---TAT--AT----A---ATTGCTA--A-C--TTATTT-GGCT-GTT---C-T-TT-T-C-ATTT-GA-TG-TTATATATTGT-TTAATAT--TGTT-------AATA------TAAT-G--TTC-T-T----T-T-T-AT--T-CC--TA-T--AA-GCC--A-G-------T-GC--T-G--C-TT--TTA-G---G-AAA-T-A-AA-CAAGT--A-TAAT
gi|25 : tattcgtgccaaacgccactataaactatcaaatcttgatccagaatcttcacttgacttagtacagt-ATGAA-T--A-TCAATGTT-ATATC------TA------GTA-TGTC-C-TTTTATATAAT---GAT-TT--GTAGAAAA---CAGTATT-----------TA-A--AGA--AAT--ATT-ATTA--AAACACCCTCAt
gi|29 : TACAAA-GCT-CT-A----AATGTAA------A-TTAGG----GGCCA-CA------CA-AAGC-G--AGGGTTTATCC-TTCAATAT-TAAAT--A----TAATA--TATA----T---GTAA---T------GTT-T-----TATA-CA-TTTC-------G--------------T-CGTAATTC-TCA-AA---A-TAG---TAT--AT----A---ATTGTTCACA-CA-TTA-TTTGG-C-G-TGTTC-T-TT-T-C-A-TTTGA-TG-TTAAATATATTGTTAATAT--TG-TT------AATA------T-AT-G--CTT-C-T----T-T-C-TTA-TTCC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-GC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-TAATACActttcaagcttttaataatattacggaattggtaaatacctatataaatgtcatctatcagttctcagttatgtacattatcctcatgcatctatttcctgttccaatgctcatcatgaatatataatgttcttgttatttattcattgtataatctatttgtatactactgtatacctatgaactgtatgttcttggtcaataaaacaataca
gi|3 : tagtacatgtAGAGTGGGGTTTCAGTATCTCTGC-AACAGAATTA----TAAAGT-G-TA--CA-TTT-GGATTT-TT-GCAAGAAAGTTCTA--CATGTTAAAAA----ATCTATGT-ACATT---TTCGATG--ATGATTTATTCA--GAATT-AGG-TAC------ATTTC----CATTAG----AA-TT-----A-G----AGAGAA-CATTTAGAATGGTAAAATA--TAATGTTTTTTTTTTCAAACT--GAGA--A-ACACTGATA-ACTGTATTTT--ACGTG-ATATACA--TGTGCATTT--A--GAAATGTGTAAAGGATGTCTTGTGGAATCAAAT---A------C---C---A---A--ATG-TTGGT-TA-TG-TAG-TG--TAAGGAATATGT----TGTT-TTCTCTT--G-ATTTA--GG-GTAT-GTTTGGT--A------C-GAA---AA-C------ATC-GTTAA-T--GAAA-ACCCG-------------------------GTGT-TAT-TGC-A-A---GTA-AAACGAC-GGGTAAG-GGA--TATATA--T------ATACCAAAAA----A----------A--------A--TG----------------ATCGCTA--------------TGT------CGTAT--GT-ATATGTATATTTA-CCAT-GGGTTGG--A-T---CTGCAACT-TTA-TTTAGGAAAC--CCACGTCC-AT--GT-CAATAT--ATATACAGT-GCAT----TAGTAAATT-TAGATT-GTCCTCTCATAAGC---TGGAAATCGAAG-GAGGa
gi|31 : acacgtaaatgattttgcgatggtgtttattaaaacattatgtgttccagctgaggttagagatattgctttatttctaatatcatgtaccccctatttttttaaatatttatttcagtattgctaatgatactgtacttttttcagatacagcagatggtttacaaaatatgttggacgcattgtagttacatcccaaaattgaaacacagtgttaaaagtgttggttttagaagtcgtaaactgaaaaactgtcatacatggtgttatgatgatgtacctctagatgtcatgtggtagaaaatatgaactagttaggaatcctgttccgttttaatgataaatttaataaagcataaaatgttttagctatgcaatgtagatctagaaagagtatgaatgctctgttagctacaacgaagttctaacacttaattatctcaacaaagtatctgacacacatgtgagtagtattgccacttatacttgtgaTA-T-GT------GTAAT-TTT-GG----GAAATC-T-T-------------------T-A----AACTGAA------A-TCAGT----GGTCA-CA----A-CG-TGAA-G--AGG-TTTATCG-T-CAACATAT---C--A-----A-T---TATG----C---ATG----T-------TC-T-----T-GA-TA-TCA---------------TC-C--TTT-CATG-TTT-ACA-AA---T-T-G---T-A--AT----A---AT--A----A-T--TCA-TT-AA-T-G-T---C-T-TTCT-C-A--T-AA-TT-TCA----------TAAT-TACTG-T-------AATA------T-AC-G--TT----C----T-T-T-GTA-C-CA--TA-A--AA-G-C--A-GTACTGGCT-AC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAAT
gi|36 : catgT-ATCTGAA---AAA--T--A-A-AAGT---TTGTATAATATATGATAATT----ATA--AAT--ATT-ATTATAAACACCCCTCTACTTT-C--AA--GCTTG--T-ACAACT-ATTA--TCAACTG-GAAA-TATTACGGAA-T---T-AT------GTAAA-CTT-GG----TAAATA-C-CT-----ATATAAA-TGTTC-------ATCT---------A-TCAGAACTCGGTTA-T-------TG-T-AA-G--A----TTATCC-T-CAGT
gi|37 : ttaaattggtG-AAA--ATGTAAATTA-TGT-T-CA------GAG-AATAT-TGAA-G-ATGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------AA------TA--TGTC-C-TTT-TTAT-AG---TGA-TT--GTAGAAAA---CAGTAT
gi|4 : atttagtaatattccaagaaaagaaaAGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAATAATTATCTAGAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAATAAAGTCTTG--GGTGTTAAAAA---------T-CCACAGC---TTCGATG--ATGATTTATTCC--GAATT-AGG-TAC------ATTTC----CATTAG----AA-TT-----A-GAGACA----A-CATGTAAAATGGTAAttaagcttctccaactatttaatatcaactggaaatattacggaattatgtaaacttggtaaatacc
gi|40 : tgtgtaaatggtctgaaaattatgacatcatatcaaatgctcagtttggtttttaaaaaggatataataccaccgatgccatatttatattacagtatttaattaacaggaatataatgaaaggaaagaaactttattgttgttttgtaaattatcaaaagggcgttcgattcggtaaatagaggtatgttgttttgcaaaatatctcaatgtggtatagattgtaaaattatgaatatcattcgttcaatgtatgtaaatgttaagtcttgtgtaaaatataaatcacaattgtcagaatatttctcttgtaatcagggtttaatgcaaggaaaatcattgtctccaattttattttcgttatatgtgaatgattttgaaatggagtttataaaaaaaaaaaaacgtgtgttccaattgaggttcgagatatcgctctatttcttataatgtatgctgatgatattgtacttttctcggatacagcagaaggtttacaaaacatgttgaacactctatgtagttacacctcgaaatggaaacttaatgttaatactgaataaacaaaaattgttgtttttagaaaaggtcgtaaactaaaaaaattatacatggtgtctttagatgtggtagataactttaactacataggagtcacgtttaatatcaatggcaaattaaataaagcacaaagtattttagcaatgcaacgtaaaaagagtatttaaaaagagtatgaatgttctgctatctaaaatgaagtctttattcctgaatgtgttgacaaagttgaatttatttggcacatatgtgagtagcattgcatattatagctgtgaACTC-T-GTTT-CGTA-ATC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGTA---A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TT
gi|40 : -C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-C--A-CAATttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtattgcttttggaaataaacaacacaat
gi|41 : actctgtttcgtaatctcaaattgttataattgtaacttattggtgtcttttcattgatgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn------ATA-T-----T-TA-AA-TCTC-------GC-ATACT--T-GTTT-CGTA-ATC-TTA-AA---T-T-G---T-T--AT----AAACATTGT----A-A--TTA-TTAGG-TAG-T---TAT-TT-T-C-ATTT-GAGTA-TTA----------TACT-C--CA-CAAAGATAAATA------T-AT-G--GTT-T-T----T-TAT-ATA-C-AC--TA-C--TA-G-C----G-------C-AT--T-G--CTTT--TT--A---G-AAA-T-A-CA-CAA-T--A-
gi|42 : GGTTC---TATTCCT-C-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-Taca
gi|45 : aaattcaatgtacagtattttacaatgcaatgtaaagaaagtatgaattttctgtttctttacacctgaatgtgtgacaaagtgaattatttaacatatggtgagagtattgcatattatagtgaatt-----T-TA-CA-AAAC-------GC-ATCCTCCT-GTTT-CGTA-T-C-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGTA---A-C--TTA--G-GG-T-G-T---C-T-TT-T---G-TT-GA-TGTTTA---------TTA---T--TG-T-------AA-A------T-AT-G--TTT-T-C----T-T-T-TTG-T-CC--TA-T--AA-G-CAGA-G-------T-AG--T-G----TT--TT--GGGAG-AAA-T-A-CA-CGATT--A-CAATGC
gi|47 : CTC-T-ATTT-CGTA-CTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--ATTTAAA---ATTCT----AAC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-CG-TTA---------ATA---T--TG-T-------AATACATGTAT-AT-G--TTT-CAT----T-T-T-GTA-T-CC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-AC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CA
gi|5 : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGT-TAAAGAATTA----GAATGT-G-TA--CA-TTT-GAAGTT-TT-GTAAGAAA-TCTTG--GGTGTTAAAAA----A---AT-C-ACAAC---TTCGATA--TTGATGTATTCA--GAATT-AAG-TAG------ATTTC----CATTAG----AA-TT-----A-G----A----A-CATTTAGAATGGTAAAATA--T---------TTTTTCAAAAT--GAGA--A-ACACTGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-ATATATA--T------TC--C--GAAATGTATGCACAATGTCTTTTAGAACCAAAT---T------C---C---A---A--ATG-TTGGT-TG-TC-TAC-TG--TAAGGGATATAC----TGTC-CTCTGTT--G-GACTA--GG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---GATT------AT--GTTAA-T--GAAA-AACTG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---ATG-CGACAAA-TGTTAAA-GGA--TGTATT--C------ATAC-----A----A----------A--------G--TG-----T------T--CTTCAAGTGTTATTCA--AA-GTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCAG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTAACGAAAG--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCACCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGA-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAC-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGGAAA---TTGTATA-----------TA-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCAATGTA-T--AA--ATTAC--T-ACATCT-ATTC--TCTAATA-CAAA-TACTC--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-CAAA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GT-ATACTC-T-GTTT-TGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTT-CGT----T-T-T-GTA-T-CC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-T--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-AAATACAt
gi|50 : -TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----AAC--TTA-AT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-T-G-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTT-C-T----T-T-TTGTA-T-CC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-AG--T-G--T-TT--TT--G---G-AAA-T-A-CA-CAT-T--A-CAAT
gi|51 : ATCC-T-CAACAT-G---CCAA----TA-AA--CATG----T------------------TC-T-----T-TG-TA-TTATTTGAGAAGG-ATGCTC-T-CTTT-CTTG-TTC-ACA-AA---T-T-GATTT-T--AT----A------------A-C--TTA-GT-GA-T-G-T---A-T-TT-TGT-A-TT-TA-TG-TAA---------TTAAg
gi|52 : ATTA--GTG-TAA-T-GT------GCAAT-TTT-GG-----AAATTGT-TT-----ATATAAA-GCTTCC-A----ATATGAA------A-TCAGA----GACCA-CATCTGATCA-TAAA-G--AGG-T
gi|53 : TTGT----A-A--TTG-AT-GG-T-G-T---C-T-TG---C-A-TT-AA-A---TA---------TTTAT-T--TG-T-------AATG------T-AT-G--TTTTC-T----T-TAT-TTG-T-TC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-AG--T-G--C-TT--TT--T---G-AAATT-ATAA-CAA-CTAA-CAATACAacttttgaaaacattacacatataattta
gi|55 : ---T-T--AT----A---ATTGT----AAC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------T--AT-T---G-T-------AATA------T-AT-G--TTT-C-T----T-T-T-GTA-T-CC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-AC--T-A--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACata
gi|57 : ---ATTGT----AAT--TTA-TT-GG-T-G-T---T-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTT-C-T----T-T-T-ATA---CC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATAt
gi|58 : --TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--CTT-C-T----T-T-T-ATA---CC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATAC
gi|59 : catataA-T-GT------ATAAT-TTG-GG----GGAAAT-G-TT-----GTATAAA-GCTTCT-AGCTGAACTGAA------A-TCGGA----GGCCA-CA----T-AA-TAAA-G--AGG-T
gi|6 : gccT-G-TA--CA-TT--GAATTT-TT-GTAAGAAAGGTTTT--GGCGTTAAAAA----A----T-T-ACAGC---TT-GATG--ATGATTTATTCA--GAATT-AGG-TAG------ATT-C----CATTAA----AAATT-----A-G----AGAGAA-CATTTAGATTAGTAAAGTT--T---------TTTTTCAA-CT--GAGA--A-ACACTGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-ATATATATTT------TC--T--G-AATGTATGT-CAATGTCTTTTAGAACCAAAT---T------C---T---A---A--ATG-TTGTT-TG-TC-TAC-TG--TAAGGGATATTC----TGT--CTCTGCT--G-GACTA--GG-AT-T-GT-TGGT--A------T-GAA---GATT------AT---TTAA-T--G--A-AACTG-------------------------GTTT-T-T-TAC-A-A----TG-CGAC-AA-GGT---A-AGA--TAT-TT--T------ATAC-----A----A----------C--------A--TGTTAGTT------T--TTTCAATAGTTCTTCA--AA-GTGT-------GTA---AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GG-TCAG--A-T---TTGCAACT-TTA----A-GAAAA--ACAATT-C-AG---T-CAA-AT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAA---TAAATT-G---TTTCAT--------------------------AGATATTTTAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAA-TG-TGT-T-CATAATTAG-G-A-TATGTGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTAT-AT-TT------TAATATATTT--TGTCAC-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTACA-----------TT-G--ATA--AA---ATT-ATTATGATAAA-CGTC-ATGTA-T--AA--ATTAT--TAACAG-T-ATT---TCTAATA-CAAA-ATCT---GTGTTTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------T-T--GA----GGCCA--A----A-CA-TAAA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--------------------------------T-----T-TA-CATTCA--------GC--TACTC-T-GTTT-CGTA-AT--TTA-AA---T-T-G---T-TTAAT----A---ATTGT----A-CTTTTA-TT-GG-T---T---A-T-TT-T---A-TT-GA-TG-TT----------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTT-C-T----T-T-T-ATA-T-CC--TA-T--AA-G-C--A-A-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACacatgtacatgtatat
gi|60 : ac-TT-T-C-A-TT-G--TA-TAA---------TTTGT-T--TG-T-------A-TA------T-AC---------------T-T-T-ATA---CC--TA-T--GA-A-C--T-G-------T-ATA-T-G--G-TTC-TT--G---GTCAA-T-A-AA-CAA-T--A-
gi|62 : tattatgttctgttatta--TG-T-------GATA------T-AT-AATTTT-C-TGTACT-T-T-ATA---CC--TA-T--GA-A-C--T-G-------T-AT--G-G--T-TC--TT--G---GTCAA-T-C-AA-CAA-T--A-CAAT
gi|64 : tgtacgtcaa-T-T-ATA-T-CC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C--T--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATAC
gi|65 : gtgacgattaacgtataactggtacg-T-T-ATA-T-CC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TTTGG---A-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
gi|68 : taacgtataactggttacg---------TTAAT-----G-T-------AATA------G-ATAG--TCT-T-T----G-T-A-ACA-T-AT--TA-T--AA-G-C--A-G-------C-AC--T-A--C-TT--TT--G---G-GAA-T-A-AA-a
gi|69 : gt-G--TTT-C-T----T-T-TTGTA-T-CC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-TA-CAA-T--A-CAA
gi|7 : aagagT--GAGA--A-ACACTGATA-ACTGTATTTT--ACGTA-ATATATA--T------TC--T--GAAATGTACACACAATGTCTT----------------------C---T---A---A--ACG-TTGGT-TG-TC-TAC-TG--TAAAGGATACATATGTTGTT-CTCTGTT--G-GACTATAGG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---AATT------AT--GTTAA-T--GAAA-A-CTG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---ATG-GA-CAAA-GGTTAAA-AGA--TATATT--T------ATAC-----A----A----------A--------ACATG-----TATAGTTT--TTTCAATAGTTCTTCACAAA-GTGT------CGTAT--ATTATAGATATATTAG-TCAT-GGATCAG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTTAAGGAAA--CCGATTCG-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATAAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGGTATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-GAA--ATGTAAATGG-TGT-T-CACA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-AAGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AAAAAAAACCTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATG-AAAACCGTCAATGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCT-ACTC--TCTAATA-TAAA-TACTA--GTG-CTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TTAGA----GGCCA-CA----A-CA-TGAA-G--AGG-TTTAACC-T-CAATAT-T---T--A----CA-TA--CATGTATAT---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCGC-------GC-ATACTC-T-GTTT-TGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----ATATATTGTA---A-C--TCATTT-AG-T-G-T---C---TT-T-C-ATTT-GA-TG-TTA---------CATAT-T--GG-T-------AATA------T-AT-G--TT----C----T-T-T-GTA-TCCC--TATT--AA-G-C--ACG-------T-AC--T-G--C-TT--TT--C---G-GAA-T-A-AA-CAATT--A-CAATA
gi|70 : -CA-TAAA-G--AGG-TTTATCT-T-CAAT
gi|71 : tA-T-CC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-ATACT-G--C-TT--TT--G---G-AAAAT-A-GC-CAA-T--A-CAATACAtgttaatgaattatctgagtcgtatgctctatt
gi|72 : ta-CC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-TT--T-G--C-TT--TTG-G---G-AAA-T-T-AA-TCA-T--A-CAATACA
gi|73 : aa-CC--TA-T--AA-G-G--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--T---G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-TCATACata
gi|74 : tcaaTGT------CGTAC--GT-TTAGGTATATTTA-CCATGGGGTCGG--A-T---TTGCAga
gi|9 : TTTG-TCAT-GG-TCAG--A-T---TTGCAACTATTACTTTAAGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GTATTTATAAGTGAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGT---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-AAATGTAA-CCGTAAATTATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATAAT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CA--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--TAT--ACT-AATATGAAAAACCGTCAAAGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCT-ATTC--TCTAGTA-CAAA-TACTA--G------------------------TT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------AGTAAGA----GGCCA-CA----A-CA-TAAA-G--GGG-TT
gi|9 : -----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTT--CGTA-T-C-TCA-AA---T-T-G---T-TT-AT----A---ATTGT----AAC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-AA-TA-TTA---------TT--------G-T-------AATG------T-AT-G--TTT-C-T----T-T-TTGTA-T-CC--TA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatcacgcatactctgttcgtatctcaaattgtttataattgtaacttattggtgtcttttcattaatattattgtaatgtatgtttctttttgtatcctataagcagtattgcttttggaaataaacaatacaatac
28 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): AAGAAATTATATTGTTGCTTCGTAGATTATCAAAAAGCTTTTGATAAAATAGACAAAACTATGCTATTTTTTCAAATTAGCAAAACATGGTATTGATTGTCAAATGTTACAAATTATCAAGTCTATGTACTCTAATATTAAATCATGTGTAATACACAAAAATCTGTCAATTGTAATGAGGGTTTGATGCAAGGGGAATCACTCTCACCATTTCTTTTCTCTCTGTATGAGAATGATTGAGATGGAATTCATTGAAAAAATGTGTATCCCAATTGAAATAAAAGAAATTGTTTTCATGTTAATTATATATGTTGATGATACGGAACTTTTTCAGAGACAAAACAAGGTTTACAAGATATGTTGAATTGTTTACAAGATTATACCTCAAAGTGGAATATAAAACTTAAAAGTCAATTTGGATAAAACAAAGATAGTTGTTTTTAGAAAAGGTGGGAAATAAAAAATAATAATTGTTGGAAGTATGACAACACGTTGGTTAGCATTGAAGAAAATTTCAATTATTTGGGTATAATATTAAATTATAAAGGAAAATTTCCCAAAACACAAAATGCTTTAGCAGCGCAATATATGTAGAAAAGGTTT
Unaligned ( gi|20 ): TGATTTTATATTGGTCAGAAACCAGAAGTCAAAACACTATTTTGTTGCTTTCTACATCATCACTAAACTTTATGGAGTTTTTTAAGTCACCGAATTTGATCGTCAAATATCTAATGTTATAATATGAATGTATGCTCATATAAAACTTGCGTACCGACAAAAACATACGCTGTCAGAGCTTTTGGGATGCCGAGAGGCTTGATCAAAAGGAATCACTCTCCTCATTCTTATTTACTTTTCATATAAATGATTTTGAACTGGAATATATTGAAAGCATGTGTATACCTGTAAAAATAGGTAAGTTGCTTTATTTTCCATCATATATGCATATGATATTGTGGTTTTCTGAGACGGAACGAAGTTAGCAAGGTA
Unaligned ( gi|22 ): ACAAAAATGATATGGAAATGAGGGCTTAGTGCAGAACTAGTTTTCGGTGTCTTTTCTCTGCATATGGTATTCAATAGAAATGCATGCGTATACCTGTAGAAATAAGAGACACTGTGTTCCTCTTGGTATCGTATGCAGACGATACAGTATTTTTTTTTCAGAGACAGAACAAAAGGTCTAAAAGACATCAATATACACAGCAACGTTTGGTATAAAGGGTGATGTAGATAAAATTTAAATAATTGTACTTTGAAATTATGGTAAATTGAAGGAAAATCACTGTTTGAAGTATAAATATGAGTAAATTGATATTGTGGAAAATGTCAATTGCCTATGCTTAATTTTAAATTTATAAGTAAATTC
Unaligned ( gi|23 ): TCCTTCTTATGTACGCTGATGATATGGTTTTGTTATCTGATAGCGTTTGAGGGTCTACAGAGATGTTAAATACTCTATCTAATTACACGAAAAGAATGGGATTGAATGTTAATGTACAGAAAACAAAAATAATGAATATTAGAAATGGCAGTAAAGTTAAGGACAAACGAAAAAAAATGGTATTATAATGATGATTTCTTTTGGATAAGTAAATGAATTTAATTTTAGGCATACTTATGTGCTACAATGGTAAATTTTGAAAACACAAAGACACTCGCAAATCAAATCAAGTGGTTAGAAAGCTTTATTTGCAATTAAT
Unaligned ( gi|26 ): AAATAATAAAGAAAAAAAAAAGAAAACAGTATTTAAACAAATATTATTATAAACACCCCTATACTTTCAAGCTTGTACAACTACTATCAATTAACTGGAAACATTACGGAATTATGTAAACTTGGTAAATACCTATATAAATGTTCATCTATCAGATCTCAGTTATTGTAAGATTATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTACATCAATATGATATATTATGTTATGTTATTATTTCATTGTATAAGTCAGTATATACTTTATACCTATGAACTGTATGGTTCTTGGTCAATAAACAATA
Unaligned ( gi|27 ): AAAAGGCGTTCGACTTGGTAAATGGAGGTATGTTGTTTTACAAGCTATCTCAATGTGGTATAGATTGTAAAATTATGAATATCATTCGTTCAATGTATGCAAATTTTAAGTCTTGTGTAAAGTATAAATCACAATTGCCAGAATATTTCTCTTGTAAATAAGGTTTAATGCGAGGAGAATCATTGTCACCAATTTTATTTTCGTTATATGTGAATGATTTTGAAATGGAGTTTATAAAAAAACTTGTGTGTTCTACGGTAATTGAGGT
Unaligned ( gi|28 ): CATGAGATTACTGTAACTTTTCTCGGATACACTAGAAAGGTTGTACAAAACATTTGAGCACTCTATTAGTTACACCTCGAAATGGAAACTTAATGTCATACTTGGAAAAAACAAAAAATGGTTGTTTTTTAGAAAAGGTGGTAAACTAAAAAATTGTTTATATACATGTGTAATGATAATGGTACCTGTTAGATGTGGTAGAGTAACTTTAACTACTTCATGGAGTCACGTTTTAATTTCCCATGGCAATTAATCAAAGCACAAAGTA
Unaligned ( gi|30 ): AAAGTTATATTGTTGTTTTGTAGACTTCCAGAAGGCTTTTGATTCAATTGATAGATCTGAATTGTGGTGTAAAATAGTTAATGACGGTATACAGCGGAAGATGTTCAATGCTTTAAGTTATTGTATAATAATGTTCAAAGCTGTGTGAAGTATGCCGGTTTTTTAGTGATTATTTTTGCAATGATACAGGTCTAATGCAGGGTGAAACTTTGTCACTTATTTCATTTTCGTTATATATACTC
Unaligned ( gi|32 ): TATTACGAATAAAGTTATAAACCCGATACGCAAGCCCTATAGATACCCGTTAAAGGTGTTGCATTTATAAAGTATCTCAGTTATGTGTAAAGATTGTCTACCTCAGTATCTAACGGTCCTGTCTATGCCTTTGATTGCATCAACATGATATATTATTTTCGTTTATCATTCACATTGATATTGTTACTTGGTATAAACTTGATACGCTATGAACTGATG
Unaligned ( gi|33 ): AGTTAAATAATCATTGTTTTTAATGCAGAAACAAAATTGTCGGTTTTTAAAACGTATGTTGAAGTATATTATCATACGGATCTGAAATAGGGGATTTCATAAAGCCCCAGATGTTGAGAAAGTTCACATTAAATTTTAAGAATATATTGGGTGTAAAATAGAAAAAACATGTACAATATGGTTTATTTGAAATTGAAGATAC
Unaligned ( gi|34 ): ATATTGTTGACTCTTTCATATCATGAGACATTTGTATTTATATTGCAGTGATACTATTATGCATACATGTAGGTTTCTATATTATGTAATGTTTTGTCATTGTACAAATTAGTTTATGCATAACGTTAAACCTATGAAATGTATGGTTCTTGGTAATATTGATTGATCGATACCAATTACAATGACCAAGTACAT
Unaligned ( gi|35 ): AGAAAACAAAAATAATGATATTTAGAAATGTCAGTAAAGTTAAGGACAACGAAAAATGGTAATATAATGATATTCTTTTGGATAATGCAAATGAATTTGATTATTTAGGCATACTTATTTGCTATAATGGTAAATTTTTGAAAACACAAAGACACGTCGCAGATCGAGGTAGAAAAGCTTTATTTGCAATTAA
Unaligned ( gi|38 ): ACCTATAAATGTTCATTTATTAGATCTCAGTTATTGTAAGATTGTCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTGCATCAACATGATATATTATTTTCTGTTATCATTCCATTGTATAATTTGTTATTTGTATATACTTTATACCTATGAACTGTATGGTTCTTGGTCAATAAG
Unaligned ( gi|39 ): ATTAAATAAAGCATGTAGTACACCGTCAAATATTGATAAATGTCATGAGGGTTTGATGCAGGGAAATCCACTCTCCCCATTTCTATTTTCAGTTTATGTAAACTATTCATATAGAGTTCATAGAAATCGTTTTTGCTTATAAGGAAATTATTTGTATTGATTGTGTGT
Unaligned ( gi|43 ): TTCCAACAATCATCAACTTGAAATATTATAGAATTATTAAACTTGGTAAATATCTGTATAAATGCTCATCTATTAGATCTCTGTAATTGGAAGATTATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATTTACATCACTATTATATATTATGTTCTGTTATTATTTC
Unaligned ( gi|44 ): TGTTGCTTCGTAGTATTATCAAAAAGCTTTTGATAAAGATAAACAAAATATTGCTATTTTTTCAAATTAGCAAAAACATGGTATTGATTGTCAAATGTGACAAATTATCAAATCTATGTACTCTAACTATAATCATGTGTAATACAC
Unaligned ( gi|46 ): AGTAAATAACAACAAAAACAATGGTGTGTAAATGATACATTTCTGCACAATATTATTTTAAACACCCCTCTACTCTCAAGCTTGTACAATTATCATCAACTGGAAATATTTCGGAATTATGTAAATTTGGTAAATACCTAT
Unaligned ( gi|48 ): TTAAACTAAAAATGCATTTAGAAAATGTTCCAGCAACATAGTTGTCGTTGTTTAATTCGTATAATAGGCAAGTCCTACACATTATGGTTGTGTGGTGTGGGGCTCGCACATTCATGCAAAATTAACGATTTTGGAA
Unaligned ( gi|49 ): GAGAATCACTGTCACCCAAATTTTATTTTCGTTATATGTAAATGATTTTTGAAATGGAGTTCATAAAAAAGCTTGTGTGTTCCATTGAGGTTTCGTAGATATACGCTGATTGTCTTACTAAT
Unaligned ( gi|54 ): GATTATGTAAACTTGGTAACAACCTATATAAATGTTCATCTATCAGATCTCAGTTATTGTAAGATTATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTACATCAATATGATATA
Unaligned ( gi|56 ): TCATAAAGTTGAGTAGTTAATTATGTAAAATTGATAAATACTTATATAAATGTTCATTTATTAGTTCTCAATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTACAT
Unaligned ( gi|61 ): CAACATATGGCATGTCACTAAATACTAGAAAATTGAAAAAGGTAGATATTTATATGTTTCAAGAATGAAAGAATTGTAAAAT
Unaligned ( gi|63 ): GTGTAAATCGTCCAATATCTATGACGTCGTGTCAGATGCTCGATTTGTGTTTTTAAAAAAAAGAGTTATGGTACTA
Unaligned ( gi|66 ): TAATGTGCTGCTTGTATACGCATTATACTTATCAACTGTATAGTTCTTGGTCAATGAATAATAC
Unaligned ( gi|67 ): TATTTGAGAAGCATGCTCTATTTCATGTTTACAAATTGGTTTTATAACTTATAGAATATATCT
Unaligned ( gi|75 ): ATTTTTAATTAATAATATAATTTTTTTCCTAATAAATTTT
Unaligned ( gi|76 ): GTATGGTTCTTGGTCAATAAACAATACAAACAATA
Unaligned ( gi|77 ): CGTTCGATTCGGTAAATAGGGGTATGTTGT
Alignments
lowQualScore : 1111 11 22222222222 11 11 111111 333333333333333333333333333 222222222222 11 3333333333333333 222 11 22222222222222222222222222 11 11111111111111111111111111111 4444444444444444444444444444 111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 11 1 1111 11 1111 1 2222222 11111111111111111 11111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222 222222222222222
lowQualScore : 1111 3 77 7777 3 3 555 3 3 3 3 00 7777 99999999999 777777 1 00 5 55 3 444 444444 22 8888 333333333333333333333333333 2 1 0 0 000000000000 44 5 1 11 4 4 55 2 4 66 1 444 6 3333333333333333 000 5 3 6 4 22 2 22222222222222222222222222 4 4 99 4 33 55 1 8888 88 4 55 4 666 4 4 8 55 99999999999999999999999999999 4 55 4 7777777777777777777777777777 4 4 4 4 777 55 4 0 77 55 1 333333333 88888888888888888888888888888888888888888888888888 5 2 66 5 222222 66 4 4 4 9 3 55 4 777 4 4 4 6 00 3 4 66 3 666666 4 8888 5 5 3 3 9999 2 5 5 5 5 8 11 0 3 3 3 0000 3 0 3 3 6 3 77 3 3 3 0 888888 888888 77 6 3 2 1 444 1111111 444 55555555555555555 33 33 2 0 66 2 88888 44 777 3 2 555 1 0 3 66666 3 33333333 2 2 777777 22 2 77777 2 2 66666 2 2 4444 0 7 666666 4 4444 2 888888 2 66666 22 22 0 2 2 2 5 555 66 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 2 2 4 4 2 77777 2 333 3 44 66666666 000000000 3 3 1 1 1 222 1 1 1 1 1 4 1 1 44 111111111111111 44 3 6666666 444444 1 1 22 33 3333 1 33 4 1 11 5 1 11 1 1 11 1 4444444 1 33 1 11 2 33 44 222 6 2 1 1 2 4 11 1
lowQualScore : .... . .. .... . . ... . . . . .. .... ........... ...... . .. . .. . ... ...... .. .... ........................... . . . . ............ .. . . .. . . .. . . .. . ... . ................ ... . . . . .. . .......................... . . .. . .. .. . .... .. . .. . ... . . . .. ............................. . .. . ............................ . . . . ... .. . . .. .. . ......... .................................................. . . .. . ...... .. . . . . . .. . ... . . . . .. . . .. . ...... . .... . . . . .... . . . . . . .. . . . . .... . . . . . . .. . . . . ...... ...... .. . . . . ... ....... ... ................. .. .. . . .. . ..... .. ... . . ... . . . ..... . ........ . . ...... .. . ..... . . ..... . . .... . . ...... . .... . ...... . ..... .. .. . . . . . ... .. ..................................................................... . . . . . . ..... . ... . .. ........ ......... . . . . . ... . . . . . . . . .. ............... .. . ....... ...... . . .. .. .... . .. . . .. . . .. . . .. . ....... . .. . .. . .. .. ... . . . . . . .. .
lowQualScore : 7777 9 44 7777 3 3 555 6 6 6 6 00 7777 00000000000 444444 0 00 7 00 6 999 111111 22 5555 222222222222222222222222222 5 0 7 8 999999999999 22 7 0 00 0 0 55 6 4 11 1 666 9 4444444444444444 000 0 2 6 1 11 4 44444444444444444444444444 0 0 55 0 11 55 0 5555 99 9 55 0 555 0 0 2 55 99999999999999999999999999999 0 55 0 1111111111111111111111111111 0 0 0 0 000 44 0 6 22 55 4 555555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444 4 8 99 0 888888 11 4 0 0 0 0 55 0 000 4 4 4 7 66 7 4 11 3 999999 4 9999 0 0 1 6 0000 0 0 7 7 7 9 00 8 6 6 6 5555 6 9 6 6 7 3 99 3 3 1 6 888888 888888 33 2 1 9 9 777 0000000 777 66666666666666666 99 99 9 1 55 6 00000 22 777 1 6 888 0 8 1 77777 1 44444444 5 5 222222 99 5 11111 5 5 22222 2 2 7777 8 2 444444 4 7777 2 333333 1 00000 33 99 5 1 5 5 7 000 88 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1 1 2 0 0 77777 0 333 8 55 44444444 111111111 3 3 7 7 7 999 7 6 6 6 6 8 6 6 44 555555555555555 44 2 8888888 666666 6 5 11 88 3333 4 44 3 4 99 5 3 88 3 2 77 2 1111111 2 00 3 88 6 11 44 333 5 6 3 3 6 0 88 3
consensus : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GGTGT----TAAAAA----A---AT-TACAGC---TTCNATG--ATGGTTTATTCG--GAA-TTAGG-NAG------ACTTC----CATTAG----AA-TT-----AG----A----ACATNTAGAATGGTAAAATA--T---------TTNTTCAAANT--G-AGAA-A--CACNGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-GTATNTA--T------TC--C--GAAATGTATGTACAATGTCTTGTAGANTCAAAT---T------C---T---A---A--AT-GTTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATNTAT----TGTN-CTCTNTT--G-GATTN--GG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---GATT------AT--GTTAA-T--GAAA-AACCG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTAAA-GGA--TGTGTT--T------ATAC-----A----A----------A--------G--TG-----T------T--TTTCGATAGTTCNTCA--AA-GTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCGG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTT-ACGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCA-ACGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCNAAT-A-C---AAA-TACTA--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
Reference ( family-468 ) : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GGTGT----TAAAAA----A---AT-TACAGC---TTCNATG--ATGGTTTATTCA--GAA-TTAGG-NAG------ACTTC----CATTAG----AA-TT-----AG----A----ACATNTAGAATGGTAAAATA--T---------TTNTTCAAANT--G-AGAA-A--CACTGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-GTATNTA--T------TC--C--GAAATGTATGTACAATGTCTTGTAGANTCAAAT---T------C---T---A---A--AT-GTTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATNTAT----TGTN-CTCTNTT--G-GATTN--GG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---GATT------AT--GTTAA-T--GAAA-AACCG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTAAA-GGA--TGTGTT--T------ATAC-----A----A----------A--------G--TG-----T------T--TTTCGATAGTTCNTCA--AA-GTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCGG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTT-ACGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCA-ACGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCNAAT-A-C---AAA-TACTA--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
gi|1 : TGGGGCTC----ACACCAGC--AAATAATTT----GGAAAC-ACTT--CA-TTTTGAATTTGTT-GTAAAAAAGTTTTA--TGTGT----TAAAGA----T---CT-TACTAT---GTCTATG--ATGGTTT-TACAATGAA-TTGGG-ACGGACACCACTTA----CAT--G----TG-CT-----AA----G----AAGTAT-GAATATTGAAATA--T---------TGGTTTAAAATTAA-AGAAGA--CAAAAATG-ATTGTATTTTTAAAG-A-GTAT-TA--TA-----TCAGC--GAAATGT-T-TA-GATGT-TTGT-GACTCAAAT---T------C---TTTTA---A--TT-GTTGGT-TGAACA-TA--TG--TAAGAGATTTAT----TATA-CTCT-TA--G-GATTT--GGGATATTGT-TGGA--A------TTGTACTTGTTG------AT--ATAAA-TTTGAAACAA--A-------------------------ATTT-TAT-GATGA-A---GTA-AAACAAA-GACTACATGGA--TGTGTTA-T------ATAC-----A----AGAAAATAAATA--------G--TG-----T------T--TTTGGAGACGTCACCA--AA-ATGT------ACTATTTAT-ATCAATATGTCAA-TGAA-GGTTTTA--A-A---TTACAATT-GTA-TTT-ACAAAAAGCCCTATTCCTAGTGGT-TTATATTCA-A-ACA------T----AAGTAAATTACCGACTAGCC--CTCACTAGAATATTGAAATTGAAA-AAAGGTAGATTTAGTAATATTCCAAGAAAAGAA-AGA-AAA--ATGTAAATTA-TGTGT-C------AGAGAA-CAT-TCAA-GTATGAAGT--ATTCA-TTTT--TA-T------TA------GT--TGTCGC-TTT-TTAT-AA---TGA-TTTGG-GGAAAA---CAGTATT-----------AA-A--AGA--AAT--ATT-ATTATAAACACCCCTCT-ACTTT-C--AA--GCTGTTGT-ACAATTATTA--TCAACT-T-G---GAA-TATTA--CCG-GAATT-AT------GTACT-TTTGGG----TAAATA-C-CT-----ATATAAA-TGTTC-------ATCT--A------G-TCAGA--------------------------------------TTAT-C-T-CA--GT-T---T--A----T--TG--TAAG--------ATA----T------ATC-C-----T-T--CA------------GT-ATATCC-T-G--C-CATG-TACATCA-TA-----T-G---A-T--AT----A---A--AG----A-T--T---CT-GA-T-A-T---T-TATT-T-C-A-T---G-TA-TTA-----------AAT-T--TGTT-------TGTA------T-AT-A-------C----T-T--T-A-T--ACCTTA-G--AA---C--T-G-------T-AT--G-GTTC-TTAATT--G---T-CAA-T-A-AACCAA-T--A-CAA
gi|10 : ggtaaatttcacaaaactcaaaatgttttttagcgccgcaatgtagaaaaagtttaagtagcttgtttaaccaaaaaagatttgcattgaatgttagcacacagttgtcactgtttgatacgtatatactaggaagtctagcaaattatgttgttgaagtttAGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GATTTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GATGT----TAAAAA----A---TC-CACAGC---TTCTATG--ATGATTTATTCA--GAA-TTAGG-TAG------ATTTC----CATTAG----AA-TTAG---AG----A----ACATTTAGAATGGTAAACTATTT---------TTTTTCAATCT--G-AGAA-A--CACTGATA-ATTGGATTTT--ACGT---------------------------AATGTATGCACAGTGTCTTATAGAACCAAAT---T------T---T---A---A--AT-GTTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATATAC----TGTT-CTCTGTT--G-GACTA--GG-ATAT-GTCTAGT--A------T-AAA---GATT------AT--GTTAG-T--GAAA-AACTGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAT-TAC-A-AAATGT----ACAAA-GGTTAAA--GA--TATATT--T------ATAC-----A----A----------AAC------A--TG-----TA-----TAGTTTCAAGAATTCTTCA--AA-GTGG------CGAAT--AT-ATAGATTCATT
gi|11 : agtattttagcaatgcaatgtaaaaagagtacgaatgttctgctgtctaaaatgaagtctttacacctgaatgtgttgacaaagttgaatttatttgacacatatgtgagtagtattgcatattatagctgtga----GAAAATCG-TT--CACTTT-GAATTT-TTTGTAAAAAAGTTTTATCGCTGT----TAAGAACGTCA---AC-TAT-GC----TCTATGCCATGGTTTA--CAATGAATTTGGG-CGG------AC-AC----CACTAC----AT-GTGCTCAAG----A----A-GTAAAGAATATTGAAATA--T---------TGGTTAAAAATTAA-ACAA-A--GACAAATACATTGTATTTT--AAGAACGTATTTA--T------TT--CAGGAAAC---TGTAGAAT---TTGT-GACTCAAAG---T------C---T---CTTTA--ATGGTTGGTATGA-CC-TATGTG--TAAGAGATTTAT----TATA-CTTCTTTAGG-GATTT--GG-ATAT-GTTTGGC--AATTCGTT-ACT---GATG------AT--ATAAACT--GAAA-AAACA-------------------------A-AT-TAT-CTG-A-A---GTACAAACAAA-GACTACA-GGAAGGGTGTTACT------ATAC-----A----A----------
gi|12 : ttacatttgaatgttagcaccacagttgtcactgttttgatacgtatagtagcagagtctttagcaaattatggttgtaagtttggctcacatctagcaaatgatttggGAATTG----GAAAGT-A-TT--CA-TCT-AGATTT-TT-GTAAACAAATTTTA--TCAGT----TAAAAA----A---AG-TACTGT---TTCCATG--ATAGTGTACTCG--GAA-CTAGG-ACGC-----ACTCC----TCTT-GTCTTAA-AT-----AG----G----AAATATAGAATGATTAAATA--C---------TGGTTGAAATT--G-AAAA-A--ATCAGAAA-ATTGTATTTT--GGATA-GTATTTA--C------CA--T--GAAATGT---TAGAA-GT-TTGTA-ATTCAGAT---TTTTTCGC---T-----------T-GTTAGT-TG--TC-AGA-TG--TAAAGGATTTAT----TGTA-CTCCTTT--G-AATTT--GG-AAAG-GTATGGA--A------T-TCC---AATA------AT--ATCAA-C--GAAA-AGCAT-------------------------TTTT-TAC-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTGAA-TGA--TGTGTT--T------GTGC-----A----A----------GAATTGAATG--CG-----T------T--TTTTGATAATTCATCA--AA-ATGTAACTTACATGT--AT-ATAAATATGTAAA-TGAT-GGTTTTA--A-G---TTGCAATT-TTA-TTTAACAAAAG--CC-ATTCC-AA--ATACAGT--------ACAAT-ATAT----AAGCAAATgaacataaatagtgtcttcatcatgtgataaattccacaat
gi|13 : ATATTTTAATATACCT-GAATGTAAACCG-AAA--ATGTAA-TTGCTGT-TTCATA--TGGAG-AATAT--GAATG-ACGAA-T--A-TCA-TTTTTATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-AT-TGAA---AAA-CT----AGAAAA---TTGTACA-----------TTGG--GTA--AAT--ATT-ATTATG-AAAACCGTCA-ATGTA-T--AA--ATTAT--T-AAAGCTATTC--TATAAT-A-C---AAA-TACTA--GTG-TTA-TAAT------GTATG-TTT-GG----AAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCTAA----AACTTAA------A-TTAGA----GGGCC-CA----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-CA-----G----TAAAGTA----T------ATC-TATATAT-TA-CA-CCAC-------GCAATACTC-T-GTTT-CGTA-ATC-TTACAA---T-T-G---T-T--ATA---A---ATTGTA---A-T--TTA-TT-GG-T-G-T---T-T-TT-T-CTA-TT-AA-TGTTTA---------TTA---T--TG---------AATA------T-A--G--TTTC-T----T-T--A-A-T--AACCTA-T---A-G-C--A-G-------T-AT--T-G--CTTT--TT--G---G-AAA-TAA-AA-CAA-T--A-CAATAa
gi|14 : ggagacttaaaataagtataataccagtgtTTT-A-GTT------TA------GTAATATC-T-TTT-ATATGAACATAAA-------AGAAAA---TTACATG-----------TT-G--ATA--A-----TT-ATTATGAAAATCCGTCA-AAGTG-T--AA--ATTAA--T-ACG--TA--C--TCAAAT-A-C---ATA-TATCA--GTG-TTA-T-GT------GTAAT-TT--GG------AATT-T-TTTTTTCATATAAA-GCTTCT-A----AACTGAA------A-TCAGA----GATCA-CT----T-CA-TA----AG-G--ATG-TTTACCC-T-CAATATGT---TA-A----TA-AA--CATGTCC-T---GTA----T------ATTAT-----T-TG-AG---GC-------GC-ATGCTC-T-ATTT-AGTG-TTT-ACA-AATGGT-T-G---T-T--AT----A------------A-C--TTA-TT-GA-T-G-T---C---TT-T-C-A-T---A-T--TTA---------TT--T-TAATG-T-------AATA------T-AT-G--TTCT-T----T-G--T-AGT--ACAATA-C--AATA-C--A-G-------T-AT--
gi|15 : ctaaaggtaaatataaaattaatgcagatattttgcagtacattgtactagtaaacataaatgtttcgtaacatttagatttgatggaaaatacaaataaacacgtgtattttctcgtcattagatttaaccTTG----GAAAAT-G-TT--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAAAAAGATTCG--GGTGT----CAAGAG----G---TC-TACTAT---GTCTATG--ATGGTTTA--CAATGAA-TTGGGACGG------AC-AC----CACT---------------------------ACATG-----TGCTAAG---------------------AAAGT--ATAGAA-AGTTACAAATA-ATTATATTTT--AAAGA-GTATTTA--T------CA--G--GAAATGT---TACA-----------ACTCAAAT---T------CTTTT---A---A--TT-GTTGGT-TG--ACATA--TG--TAAAAGATTTAT----TAAA-TTCTTTA--G-GATTT--GG-AGAT-GAGTTGTTCA------T--AA---G--T------A-----CAA-T--TCCA-TACT---------------------------TCT-TAT-CTG-A-A---GTA-AAACAAA-GACTACA-GGA--TGTGTT--T------ATAC-----A----A----------
gi|16 : tttaaccaaaatgaaaaatttgcatttaaatgttagtacactgttgtcactgtttgatacgtttataggaagtctagcaatttatggtttggggctcacatccagcaaatgatcatgt-AAA--ATCTAA-TTG-CAT-T----A--TC-AG-A-TAA-TGAA-GGACGAA-TT-A-TCA-TTT--------------A------TC--TGTC-CATGT-ATATGAA---AAAACT--A-AGAAA----TT-TACA-----------TT-GTAATT--AATCGATT-ATGCTGAAAAAC-GTCC-AAGTAGTCGAAGTATTGT--T-ACAGCTATTC--TCGAAT-AGC---AAAATACTA--ATG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-G-----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-ACT-CT-A----A-CTTAA------A-TTAAA----GGCCA-CA----A-CA-TC----A--G--AG--TTTATC--T-CAATAT-T---T--AATGATA-TA--TA-A----T---ATA----TTAGGTAATC-T-----T--A-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TTA-AA---TGT-G---T-T--AA----A---ATTGTA---A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-T---CT-GA--G-TTA---------TTA---T--TG---------AATA------T-AT-G--TTCT-T----TAT--T-A-T--ATCCTA-TAAAA-G-C--A-G-------TAAT--TGG--C-TT--TT--G---GTAAA-T-A-AACCAA-T--ACCAATACg
gi|17 : agaAAATGT-T-TAGAA-GTTGTGTA-ATTCAGATATGT------T---T---A---CTTGT-GTCGGT-TC--TC-AGA-TGGATAAAACATTTAT----TGTCGCTCCTTA--GAGATTT--GG-ATA----CTATT--A------T-GGA----ATTCCAATAATCGATTAA-C--GAAA-GAGCA-------------------------TTTT-TACATAC-ACA---GTG-AAACAAACGGTTGAA-TGA--TGTGTT--TGCTGGCATAA-----ATTGGA----------AT-------G--CG-----T------TG-TTTTGATAATTCATCA--AAAGTAA------CTTAT--AT----GA-ATATGTGATAAT-G-ATGGGCTA-TAAGTTGCAA-T-TTA-TTA-ACAAAAAG-CCAATTTC-AA--ATACGATAT--G-T-ACAGTTATAT----AAGCAAATA-TCGCAT-GTCATCACA-TAAC---TAGAAGTTGAAACAAGGT-AGATATCATAATGT
gi|18 : ttacccatga-TCAT-GGATCAG--AAT---TTGCAACT-TTA-TTT-AAGAAAA--CCGATTCC-AG--ATTCAATAT--A-A-ACAAT-GTATTTATAAGTGAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGT---TGGAA-TTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-AAATGTAA-CCGTAAATTATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATAAT------TA------TT--T-TC-C-TGT-ATATGAA---AAA-----A-AAAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATATTTAT--ACTAAGTATGAAAAACCGTCA-AAGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCTAGT-A-C---AAA-TACTA--G------------------------TT-GG----TAAATT-TCTT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------AGTAAGA----GCCTA-CA----A-CATTA----AA-GTCGGG-TTTATgttcaaaaatgaagaatttg
gi|19 : A--ATGTAAATTA-TGT-T-CA------GAG-AACAT-TGAA-G-ATGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATTAGTACATG------TA--TGTC-C-TTT-TTAT-AA---TGA-TT--GTAGAAAA---CAGTATT-----------TA-A--AGA--AAT--ATT-ATTACAAACACCCCTCT-ACTTT-C--AA--GCTTG--T-ACAACTATTA--TCAACT-G-G---AAA-TATTACGGAA-TTA-T-A--------TAAA-CTT-GG----TAAATA-C-CT-----ATATAAATGTTTAT--------CT---------A-TCAGA------------------------------------------TC-T-CAG----T---T--A----CA-TG--TAT-----T---GTAAGATT------ATC-C-----T-TAGTA-TCA-------------ATCC-T-GTCCATGTA-TACATCA-AT---A-T-G---A-T--AT--------ATTAT----G-T--T---CT-GT-T-A-T---T-A-TT-T-C-A-TT-G--TA-TAA---------TTTGT-T--TG-T--------ATA------T-A----------C----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-AT--G-G--T-TC--AT--G---GTCAA-T-A-AA-CGA-T--A-CAATACA
gi|2 : AGTCTGGGATTA---AAT-CCAGCATAATGAATTG----GGAAGA-G-TATTCA-TCT-AGATTT----GTAAACAAATTTTATCAGTG------AAGAA------------GCAGTCTGTTCCATGGTATGGTGTA-CCG--TAA-CTAGG-ACG------CCTCCTCTTCATCTT----AA-AT-----AG----G----AAATATAGAATAATTAAATA--C---------TTGTT-AAATT--G-AAAA-A--
gi|21 : gattaagtgcatgagcaaaaagtatgatttaatctctgatgcccaatttggttttaaagctggatatagtacaagtgatgctatttttgttttacactggttaataacacggacacttgcaaaacgtaaacaccttttttgttgctttgtggattatcaaaaggctcttttgataagtatgatatgaaacatgctcatttttaaattatcgaaatatggaactttgactgtcaaatgttaaagtcaatgaaactctaatataaaaacatgtggtacgccactacttaaatcaatggtcagagttgctcaggatgttcgccgaggggttgatgcagggcgagtcactctcctcccattgttattttcgttccatataaattaccttttgaaatgaaattattggaagtcatcgtgtattatctgtaagaaattagagaaatagctttattttttcatcgatatgctttgagatgacactgttttattattccagacaacggaacacacaggtttacaaagatatgttaactgtttgactcaacttatgacatctacagtggaattgatacccggtaaacgagacaaaactaatgttttgctagtattcagaaaaaagttggtagattgaaacagaaactattttttggaaatataatatggaaaagctattgatgttgtgagacaatcgttaatttatctagtatccactttgaatttcaatggtaattcaattaaaacacaaagtgttcttaggcatcagcaatgtaaaaataggcttaagttgtacctgttaagctaaaaatcgaaaacatcttgcaacattaaatgtagtacaaagttgtcattgttcaatacttactattagtagtatagcaaattatggctcctgtgaTTG-TGT-G-CAAA--TAGAG-A-TAT-TGAT-G-GTCAA-TCGA-T--------ATATT------TA------TT--TGTC-A-TGA-GTTTGAG---AAA-AT--A-TGAAAA---TTGTATA-----------TT-GAAAAA--AAT--ATT-ACTATAAAAAAGCATGATGCGTG----AA--ACAA-----AAACCAATTCATTCACAT-G-T---AAA-TACAA--ATG-TGA-T-ATAAAAAAATAATGTTT-GGAACTTGAA-T-C-TC-----ATATGAA-GCTT-T-A----AAATTGAAATAGCA-TCAGA----TGCAATCA----A-CA-T-------------G-TTC------------T-T---T--A----TA-C---TAC-----C---GTA-----------A---T-----T-GA-----GAC-------AC-ATACTT-G-ATTA-TGTG-TTT-GCA-AA----------------AT----A---A-TGT---------TTA---------A-C---C-T-TT-------TT-GA-T--------------TTAAT-T--TA-T-------CA----------AT-G--TCTG-T----T-C--T-A-A--AATTTA-T--AA-G-C--A-A-------T-GC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--G-CAATACAaa
gi|24 : TACAAA-GCTTCT-A----AATGTAA------A-TTATG----GGCCA-CA----A-CA-TA----AGCG--GGG-TTTATCCTT-CAATAT-T---T--A----AA-TAATTATA----T---GTA----A------GTG-T-----T-T-----------------T-ATACTT-TCG--T-CGTAGTTC-TCA-AA-----T-G---TAT--AT----A---ATTGCTA--A-C--TTATTT-GGCT-GTT---C-T-TT-T-C-ATTT-GA-TG-TTATATATTGT-TTAATAT--TGTT-------AATA------TAAT-G--TTCT-T----T-T--T-A-T---TCCTA-T--AA-GCC--A-G-------T-GC--T-G--C-TT--TTA-G---G-AAA-T-A-AA-CAAGT--A-TAAT
gi|25 : tattcgtgccaaacgccactataaactatcaaatcttgatccagaatcttcacttgacttagtacagt-ATGAA-T--A-TCAATGTT-ATATC------TA------GTA-TGTC-C-TTTTATATAAT---GAT-TT--GTAGAAAA---CAGTATT-----------TA-A--AGA--AAT--ATT-ATTA--AAACACCCTCA-t
gi|26 : AA---AAA-----A-AGAAAA---CAGTATT-----------TA-A--ACA--AAT--ATT-ATTATAAACACCCCTAT-ACTTT-C--AA--GCTTG--T-ACAACTACTA--TCAATTAA-CTGGAAA-CATTACGGAA-T---T-AT------GTAAA-CTT-GG----TAAATA-C-CT-----ATATAAA-TGTTC-------ATCT---------A-TCAGA------TCT-CA----G-T--TATTGTAA-G--A----TTATCC-T-CAGTAT-C---T--A----T------CCTG----T---CCA----T------G-----------TA-CA-TCA-----------ATA----T-GAT---ATA-TT----A--------T-G---T-T--AT----G-----------------TTA-TT-A--------------TT-T-C-A-TT-G------TA---------TAAGT-C--AG-T--------ATA------T-A----------C----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-AT--G-G--T-TC--TT--G---GTCAA-T-A-AA-CAA-T--A-ctttcaagcttttaataatattacggaattggtaaatacctatataaatgtcatctatcagttctcagttatgtacattatcctcatgcatctatttcctgttccaatgctcatcatgaatatataatgttcttgttatttattcattgtataatctatttgtatactactgtatacctatgaactgtatgttcttggtcaataaaacaataca
gi|29 : aaataataaagaaaTACAAA-GCT-CT-A----AATGTAA------A-TTAGG----GGCCA-CA------CA-AA----GC-G--AGGGTTTATCC-TTCAATAT-TAAAT--A----TAATA--TATA----T---GTAA---T------GTT-T-----TATA-CA-TTTC-------G--------------T-CGTAATTC-TCA-AA---A-TAG---TAT--AT----A---ATTGTTCACA-CA-TTA-TTTGG-C-G-TGTTC-T-TT-T-C-A-TTTGA-TG-TTAAATATATTGTTAATAT--TG-TT------AATA------T-AT-G--CTTC-T----T-TCTT-A-T---TCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-GC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-TAATACA
gi|3 : tagtacatgtAGAGTGGGGTTTCAGTATCTCTGC-AACAGAATTA----TAAAGT-G-TA--CA-TTT-GGATTT-TT-GCAAGAAAGTTCTA--CATGT----TAAAAA----ATCTATGTACATT---TTCGATG--ATGATTTATTCA--GAA-TTAGG-TAC------ATTTC----CATTAG----AA-TT-----AG----AGAGAACATTTAGAATGGTAAAATA--TAATGTTTTTTTTTTCAAACT--G-AGAA-A--CACTGATA-ACTGTATTTT--ACGTG-ATATACA--TGTGCATTT--A--GAAATGTGTAAAGGATGTCTTGTGGAATCAAAT---A------C---C---A---A--AT-GTTGGT-TA--TG-TAG-TG--TAAGGAATATGT----TGTT-TTCTCTT--G-ATTTA--GG-GTAT-GTTTGGT--A------C-GAA---AA-C------ATC-GTTAA-T--GAAA-ACCCG-------------------------GTGT-TAT-TGC-A-A---GTA-AAACGAC-GGGTAAG-GGA--TATATA--T------ATACCAAAAA----A----------A--------A--TG----------------ATCGCTA--------------TGT------CGTAT--GT-ATATGTATATTTA-CCAT-GGGTTGG--A-T---CTGCAACT-TTA-TTT-AGGAAAC--CCACGTCC-AT--GT-CAATAT--ATATACAGT-GCAT----TAGTAAATT-TAGATT-GTCCTCTCATAAGC---TGGAAATCGAAG-GAGGa
gi|31 : acacgtaaatgattttgcgatggtgtttattaaaacattatgtgttccagctgaggttagagatattgctttatttctaatatcatgtaccccctatttttttaaatatttatttcagtattgctaatgatactgtacttttttcagatacagcagatggtttacaaaatatgttggacgcattgtagttacatcccaaaattgaaacacagtgttaaaagtgttggttttagaagtcgtaaactgaaaaactgtcatacatggtgttatgatgatgtacctctagatgtcatgtggtagaaaatatgaactagttaggaatcctgttccgttttaatgataaatttaataaagcataaaatgttttagctatgcaatgtagatctagaaagagtatgaatgctctgttagctacaacgaagttctaacacttaattatctcaacaaagtatctgacacacatgtgagtagtattgccacttatacttgtgaTA-T-GT------GTAAT-TTT-GG----GAAATC-T-T-------------------T-A----AACTGAA------A-TCAGT----GGTCA-CA----A-CG-TG----AA-G--AGG-TTTATCG-T-CAACATAT---C--A-----A-T---TATG----C---ATG----T-------TC-T-----T-GA-TA-TCA---------------TC-C--TTT-CATG-TTT-ACA-AA---T-T-G---T-A--AT----A---AT--A----A-T--TCA-TT-AA-T-G-T---C-T-TTCT-C-A--T-AA-TT-TCA----------TAAT-TACTG-T-------AATA------T-AC-G--TT---C----T-T--T-G-T--ACCATA-A--AA-G-C--A-GTACTGGCT-AC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAAT
gi|33 : catgA----GAAAGT-T-CA--CA-TT--AAATTT-T----AAGAATATATTG--GGTGTAAAATAGAAA----A---A---ACATG---TACAAT---ATGGTTTATTTG--AAA-TT--G-AAG------A
gi|36 : agttaaataatcattgtttttaatgcagaaacaaaattgtcggtttttaaaacgtatgttgaagtatattatcatacggatctgaaataggggatttcataaagccccagatgttgT-ATCTGAA---AAA--T--A-A-AAGT---TTGTATAATATATGATAATT----ATA--AAT--ATT-ATTATAAACACCCCTCT-ACTTT-C--AA--GCTTG--T-ACAACTATTA--TCAACT-G-G---AAA-TATTACGGAA-T---T-AT------GTAAA-CTT-GG----TAAATA-C-CT-----ATATAAA-TGTTC-------ATCT---------A-TCAGAACTCGGTTA-T-------TG-T-----AA-G--A----TTATCC-T-CAGTtac
gi|37 : ttaaattggtG-AAA--ATGTAAATTA-TGT-T-CA------GAG-AATAT-TGAA-G-ATGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------AA------TA--TGTC-C-TTT-TTAT-AG---TGA-TT--GTAGAAAA---CAGTAT
gi|4 : atttagtaatattccaagaaaagaaaAGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAATAATTATCTAGAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAATAAAGTCTTG--GGTGT----T--AAA----A---ATCCACAGC---TTCGATG--ATGATTTATTCC--GAA-TTAGG-TAC------ATTTC----CATTAG----AA-TT-----AGAGACA----ACATGTAAAATGGTAAttaagcttctccaactatttaatatcaactggaaatattacggaattatgtaaacttggtaaatacc
gi|40 : tgtgtaaatggtctgaaaattatgacatcatatcaaatgctcagtttggtttttaaaaaggatataataccaccgatgccatatttatattacagtatttaattaacaggaatataatgaaaggaaagaaactttattgttgttttgtaaattatcaaaagggcgttcgattcggtaaatagaggtatgttgttttgcaaaatatctcaatgtggtatagattgtaaaattatgaatatcattcgttcaatgtatgtaaatgttaagtcttgtgtaaaatataaatcacaattgtcagaatatttctcttgtaatcagggtttaatgcaaggaaaatcattgtctccaattttattttcgttatatgtgaatgattttgaaatggagtttataaaaaaaaaaaaacgtgtgttccaattgaggttcgagatatcgctctatttcttataatgtatgctgatgatattgtacttttctcggatacagcagaaggtttacaaaacatgttgaacactctatgtagttacacctcgaaatggaaacttaatgttaatactgaataaacaaaaattgttgtttttagaaaaggtcgtaaactaaaaaaattatacatggtgtctttagatgtggtagataactttaactacataggagtcacgtttaatatcaatggcaaattaaataaagcacaaagtattttagcaatgcaacgtaaaaagagtatttaaaaagagtatgaatgttctgctatctaaaatgaagtctttattcctgaatgtgttgacaaagttgaatttatttggcacatatgtgagtagcattgcatattatagctgtgaACTC-T-GTTT-CGTA-ATC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGTA---A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TT
gi|40 : -C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-C--A-CAATttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtattgcttttggaaataaacaacacaat
gi|41 : actctgtttcgtaatctcaaattgttataattgtaacttattggtgtcttttcattgatgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn------ATA-T-----T-TA-AA-TCTC-------GC-ATACT--T-GTTT-CGTA-ATC-TTA-AA---T-T-G---T-T--AT----AAACATTGT----A-A--TTA-TTAGG-TAG-T---TAT-TT-T-C-ATTT-GAGTA-TTA----------TACT-C--CA-CAAAGATAAATA------T-AT-G--GTTT-T----T-TA-T-A-T--ACACTA-C--TA-G-C----G-------C-AT--T-G--CTTT--TT--A---G-AAA-T-A-CA-CAA-T--A-
gi|42 : GGTTC---TATTCCT-C-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-Taca
gi|45 : aaattcaatgtacagtattttacaatgcaatgtaaagaaagtatgaattttctgtttctttacacctgaatgtgtgacaaagtgaattatttaacatatggtgagagtattgcatattatagtgaatt-----T-TA-CA-AAAC-------GC-ATCCTCCT-GTTT-CGTA-T-C-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGTA---A-C--TTA--G-GG-T-G-T---C-T-TT-T---G-TT-GA-TGTTTA---------TTA---T--TG-T-------AA-A------T-AT-G--TTTT-C----T-T--T-T-T--GTCCTA-T--AA-G-CAGA-G-------T-AG--T-G----TT--TT--GGGAG-AAA-T-A-CA-CGATT--A-CAATGC
gi|47 : CTC-T-ATTT-CGTA-CTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--ATTTAAA---ATTCT----AAC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-CG-TTA---------ATA---T--TG-T-------AATACATGTAT-AT-G--TTTCAT----T-T--T-G-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CA
gi|5 : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGT-TAAAGAATTA----GAATGT-G-TA--CA-TTT-GAAGTT-TT-GTAAGAAA-TCTTG--GGTGT----TAAAAA----A---AT-CACAAC---TTCGATA--TTGATGTATTCA--GAA-TTAAG-TAG------ATTTC----CATTAG----AA-TT-----AG----A----ACATTTAGAATGGTAAAATA--T---------TTTTTCAAAAT--G-AGAA-A--CACTGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-ATATATA--T------TC--C--GAAATGTATGCACAATGTCTTTTAGAACCAAAT---T------C---C---A---A--AT-GTTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATATAC----TGTC-CTCTGTT--G-GACTA--GG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---GATT------AT--GTTAA-T--GAAA-AACTG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---ATG-CGACAAA-TGTTAAA-GGA--TGTATT--C------ATAC-----A----A----------A--------G--TG-----T------T--CTTCAAGTGTTATTCA--AA-GTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCAG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTA-ACGAAAG--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCACCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGA-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAC-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGGAAA---TTGTATA-----------TA-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCA-ATGTA-T--AA--ATTAC--T-ACATCTATTC--TCTAAT-A-C---AAA-TACTC--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-CA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GT-ATACTC-T-GTTT-TGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTCGT----T-T--T-G-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-T--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-AAATACAt
gi|50 : -TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----AAC--TTA-AT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-T-G-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--TTG-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AG--T-G--T-TT--TT--G---G-AAA-T-A-CA-CAT-T--A-CAAT
gi|51 : ATCC-T-CAACAT-G---CCAA----TA-AA--CATG----T------------------TC-T-----T-TG-TA-TTATTTGAGAAGG-ATGCTC-T-CTTT-CTTG-TTC-ACA-AA---T-T-GATTT-T--AT----A------------A-C--TTA-GT-GA-T-G-T---A-T-TT-TGT-A-TT-TA-TG-TAA---------TTAAg
gi|52 : ATTA--GTG-TAA-T-GT------GCAAT-TTT-GG-----AAATTGT-TT-----ATATAAA-GCTTCC-A----ATATGAA------A-TCAGA----GACCA-CATCTGATCA-TA----AA-G--AGG-T
gi|53 : TTGT----A-A--TTG-AT-GG-T-G-T---C-T-TG---C-A-TT-AA-A---TA---------TTTAT-T--TG-T-------AATG------T-AT-G--TTTT-C----T-T--T-A-TTTGTTCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AG--T-G--C-TT--TT--T---G-AAATT-ATAA-CAA-CTAA-CAATACAacttttgaaaacattacacatataattta
gi|55 : ---T-T--AT----A---ATTGT----AAC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------T--AT-T---G-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-G-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AC--T-A--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACata
gi|57 : ---ATTGT----AAT--TTA-TT-GG-T-G-T---T-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATAt
gi|58 : --TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--CTTC-T----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATAC
gi|59 : catataA-T-GT------ATAAT-TTG-GG----GGAAAT-G-TT-----GTATAAA-GCTTCT-AGCTGAACTGAA------A-TCGGA----GGCCA-CA----T-AA-TA----AA-G--AGG-T
gi|6 : gccT-G-TA--CA-TT--GAATTT-TT-GTAAGAAAGGTTTT--GGCGT----TAAAAA----A----T-TACAGC---TT-GATG--ATGATTTATTCA--GAA-TTAGG-TAG------A-TTC----CATTAA----AAATT-----AG----AGAGAACATTTAGATTAGTAAAGTT--T---------TTTTTCAA-CT--G-AGAA-A--CACTGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-ATATATATTT------TC--T--G-AATGTATGT-CAATGTCTTTTAGAACCAAAT---T------C---T---A---A--AT-GTTGTT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATATTC----TGT--CTCTGCT--G-GACTA--GG-AT-T-GT-TGGT--A------T-GAA---GATT------AT---TTAA-T--G--A-AACTG-------------------------GTTT-T-T-TAC-A-A----TG-CGAC-AA-GGT---A-AGA--TAT-TT--T------ATAC-----A----A----------C--------A--TGTTAGTT------T--TTTCAATAGTTCTTCA--AA-GTGT-------GTA---AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GG-TCAG--A-T---TTGCAACT-TTA-----A-GAAAA--ACAATT-C-AG---T-CAA-AT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAA---TAAATT-G---TTTCAT--------------------------AGATATTTTAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAA-TG-TGT-T-CATAATTAG-G-A-TATGTGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTAT-AT-TT------TAATATATTT--TGTCAC-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTACA-----------TT-G--ATA--AA---ATT-ATTATGATAAA-CGTC--ATGTA-T--AA--ATTAT--TAACAG-TATT---TCTAAT-A-C---AAA-ATCT---GTGTTTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------T-T--GA----GGCCA--A----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--------------------------------T-----T-TA-CATTCA--------GC--TACTC-T-GTTT-CGTA-AT--TTA-AA---T-T-G---T-TTAAT----A---ATTGT----A-CTTTTA-TT-GG-T---T---A-T-TT-T---A-TT-GA-TG-TT----------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-A-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACacatgtacatgtatat
gi|60 : ac-TT-T-C-A-TT-G--TA-TAA---------TTTGT-T--TG-T-------A-TA------T-AC--------------T-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-ATA-T-G--G-TTC-TT--G---GTCAA-T-A-AA-CAA-T--A-
gi|62 : tattatgttctgttatta--TG-T-------GATA------T-AT-AATTTTC-TGTACT-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-AT--G-G--T-TC--TT--G---GTCAA-T-C-AA-CAA-T--A-CAAT
gi|64 : tgtacgtcaa-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C--T--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATAC
gi|65 : gtgacgattaacgtataactggtacg-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TTTGG---A-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
gi|68 : taacgtataactggttacg---------TTAAT-----G-T-------AATA------G-ATAG--TCTT-T----G-T--A-A-C--ATATTA-T--AA-G-C--A-G-------C-AC--T-A--C-TT--TT--G---G-GAA-T-A-AA-a
gi|69 : gt-G--TTTC-T----T-T--TTG-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-TA-CAA-T--A-CAA
gi|7 : aagagT--G-AGAA-A--CACTGATA-ACTGTATTTT--ACGTA-ATATATA--T------TC--T--GAAATGTACACACAATGTCTT----------------------C---T---A---A--AC-GTTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAAGGATACATATGTTGTT-CTCTGTT--G-GACTATAGG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---AATT------AT--GTTAA-T--GAAA-A-CTG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---ATG-GA-CAAA-GGTTAAA-AGA--TATATT--T------ATAC-----A----A----------A--------ACATG-----TATAGTTT--TTTCAATAGTTCTTCACAAA-GTGT------CGTAT--ATTATAGATATATTAG-TCAT-GGATCAG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTT-AAGGAAA--CCGATTCG-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATAAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGGTATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-GAA--ATGTAAATGG-TGT-T-CACA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-AAGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AAAAAAAACCTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATG-AAAACCGTCA-ATGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTACTC--TCTAAT-A-T---AAA-TACTA--GTG-CTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TTAGA----GGCCA-CA----A-CA-TG----AA-G--AGG-TTTAACC-T-CAATAT-T---T--A----CA-TA--CATGTATAT---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCGC-------GC-ATACTC-T-GTTT-TGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----ATATATTGTA---A-C--TCATTT-AG-T-G-T---C---TT-T-C-ATTT-GA-TG-TTA---------CATAT-T--GG-T-------AATA------T-AT-G--TTCT-T----T-G--T-A-T---CCCTATT--AA-G-C--ACG-------T-AC--T-G--C-TT--TT--C---G-GAA-T-A-AA-CAATT--A-CAATA
gi|70 : -CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCT-T-CAAT
gi|71 : t--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-ATACT-G--C-TT--TT--G---G-AAAAT-A-GC-CAA-T--A-CAATACAtgttaatgaattatctgagtcgtatgctctatt
gi|72 : taCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-TT--T-G--C-TT--TTG-G---G-AAA-T-T-AA-TCA-T--A-CAATACA
gi|73 : aaCCTA-T--AA-G-G--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--T---G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-TCATACata
gi|74 : tcaaTGT------CGTAC--GT-TTAGGTATATTTA-CCATGGGGTCGG--A-T---TTGCAga
gi|9 : TTTG-TCAT-GG-TCAG--A-T---TTGCAACTATTACTTT-AAGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GTATTTATAAGTGAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGT---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-AAATGTAA-CCGTAAATTATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATAAT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CA--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--TAT--ACT-AATATGAAAAACCGTCA-AAGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCTAGT-A-C---AAA-TACTA--G------------------------TT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------AGTAAGA----GGCCA-CA----A-CA-TA----AA-G--GGG-TT
gi|9 : -----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTT--CGTA-T-C-TCA-AA---T-T-G---T-TT-AT----A---ATTGT----AAC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-AA-TA-TTA---------TT--------G-T-------AATG------T-AT-G--TTTC-T----T-T--TTG-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatcacgcatactctgttcgtatctcaaattgtttataattgtaacttattggtgtcttttcattaatattattgtaatgtatgtttctttttgtatcctataagcagtattgcttttggaaataaacaatacaatac
26 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): AAGAAATTATATTGTTGCTTCGTAGATTATCAAAAAGCTTTTGATAAAATAGACAAAACTATGCTATTTTTTCAAATTAGCAAAACATGGTATTGATTGTCAAATGTTACAAATTATCAAGTCTATGTACTCTAATATTAAATCATGTGTAATACACAAAAATCTGTCAATTGTAATGAGGGTTTGATGCAAGGGGAATCACTCTCACCATTTCTTTTCTCTCTGTATGAGAATGATTGAGATGGAATTCATTGAAAAAATGTGTATCCCAATTGAAATAAAAGAAATTGTTTTCATGTTAATTATATATGTTGATGATACGGAACTTTTTCAGAGACAAAACAAGGTTTACAAGATATGTTGAATTGTTTACAAGATTATACCTCAAAGTGGAATATAAAACTTAAAAGTCAATTTGGATAAAACAAAGATAGTTGTTTTTAGAAAAGGTGGGAAATAAAAAATAATAATTGTTGGAAGTATGACAACACGTTGGTTAGCATTGAAGAAAATTTCAATTATTTGGGTATAATATTAAATTATAAAGGAAAATTTCCCAAAACACAAAATGCTTTAGCAGCGCAATATATGTAGAAAAGGTTT
Unaligned ( gi|20 ): TGATTTTATATTGGTCAGAAACCAGAAGTCAAAACACTATTTTGTTGCTTTCTACATCATCACTAAACTTTATGGAGTTTTTTAAGTCACCGAATTTGATCGTCAAATATCTAATGTTATAATATGAATGTATGCTCATATAAAACTTGCGTACCGACAAAAACATACGCTGTCAGAGCTTTTGGGATGCCGAGAGGCTTGATCAAAAGGAATCACTCTCCTCATTCTTATTTACTTTTCATATAAATGATTTTGAACTGGAATATATTGAAAGCATGTGTATACCTGTAAAAATAGGTAAGTTGCTTTATTTTCCATCATATATGCATATGATATTGTGGTTTTCTGAGACGGAACGAAGTTAGCAAGGTA
Unaligned ( gi|22 ): ACAAAAATGATATGGAAATGAGGGCTTAGTGCAGAACTAGTTTTCGGTGTCTTTTCTCTGCATATGGTATTCAATAGAAATGCATGCGTATACCTGTAGAAATAAGAGACACTGTGTTCCTCTTGGTATCGTATGCAGACGATACAGTATTTTTTTTTCAGAGACAGAACAAAAGGTCTAAAAGACATCAATATACACAGCAACGTTTGGTATAAAGGGTGATGTAGATAAAATTTAAATAATTGTACTTTGAAATTATGGTAAATTGAAGGAAAATCACTGTTTGAAGTATAAATATGAGTAAATTGATATTGTGGAAAATGTCAATTGCCTATGCTTAATTTTAAATTTATAAGTAAATTC
Unaligned ( gi|23 ): TCCTTCTTATGTACGCTGATGATATGGTTTTGTTATCTGATAGCGTTTGAGGGTCTACAGAGATGTTAAATACTCTATCTAATTACACGAAAAGAATGGGATTGAATGTTAATGTACAGAAAACAAAAATAATGAATATTAGAAATGGCAGTAAAGTTAAGGACAAACGAAAAAAAATGGTATTATAATGATGATTTCTTTTGGATAAGTAAATGAATTTAATTTTAGGCATACTTATGTGCTACAATGGTAAATTTTGAAAACACAAAGACACTCGCAAATCAAATCAAGTGGTTAGAAAGCTTTATTTGCAATTAAT
Unaligned ( gi|27 ): AAAAGGCGTTCGACTTGGTAAATGGAGGTATGTTGTTTTACAAGCTATCTCAATGTGGTATAGATTGTAAAATTATGAATATCATTCGTTCAATGTATGCAAATTTTAAGTCTTGTGTAAAGTATAAATCACAATTGCCAGAATATTTCTCTTGTAAATAAGGTTTAATGCGAGGAGAATCATTGTCACCAATTTTATTTTCGTTATATGTGAATGATTTTGAAATGGAGTTTATAAAAAAACTTGTGTGTTCTACGGTAATTGAGGT
Unaligned ( gi|28 ): CATGAGATTACTGTAACTTTTCTCGGATACACTAGAAAGGTTGTACAAAACATTTGAGCACTCTATTAGTTACACCTCGAAATGGAAACTTAATGTCATACTTGGAAAAAACAAAAAATGGTTGTTTTTTAGAAAAGGTGGTAAACTAAAAAATTGTTTATATACATGTGTAATGATAATGGTACCTGTTAGATGTGGTAGAGTAACTTTAACTACTTCATGGAGTCACGTTTTAATTTCCCATGGCAATTAATCAAAGCACAAAGTA
Unaligned ( gi|30 ): AAAGTTATATTGTTGTTTTGTAGACTTCCAGAAGGCTTTTGATTCAATTGATAGATCTGAATTGTGGTGTAAAATAGTTAATGACGGTATACAGCGGAAGATGTTCAATGCTTTAAGTTATTGTATAATAATGTTCAAAGCTGTGTGAAGTATGCCGGTTTTTTAGTGATTATTTTTGCAATGATACAGGTCTAATGCAGGGTGAAACTTTGTCACTTATTTCATTTTCGTTATATATACTC
Unaligned ( gi|32 ): TATTACGAATAAAGTTATAAACCCGATACGCAAGCCCTATAGATACCCGTTAAAGGTGTTGCATTTATAAAGTATCTCAGTTATGTGTAAAGATTGTCTACCTCAGTATCTAACGGTCCTGTCTATGCCTTTGATTGCATCAACATGATATATTATTTTCGTTTATCATTCACATTGATATTGTTACTTGGTATAAACTTGATACGCTATGAACTGATG
Unaligned ( gi|34 ): ATATTGTTGACTCTTTCATATCATGAGACATTTGTATTTATATTGCAGTGATACTATTATGCATACATGTAGGTTTCTATATTATGTAATGTTTTGTCATTGTACAAATTAGTTTATGCATAACGTTAAACCTATGAAATGTATGGTTCTTGGTAATATTGATTGATCGATACCAATTACAATGACCAAGTACAT
Unaligned ( gi|35 ): AGAAAACAAAAATAATGATATTTAGAAATGTCAGTAAAGTTAAGGACAACGAAAAATGGTAATATAATGATATTCTTTTGGATAATGCAAATGAATTTGATTATTTAGGCATACTTATTTGCTATAATGGTAAATTTTTGAAAACACAAAGACACGTCGCAGATCGAGGTAGAAAAGCTTTATTTGCAATTAA
Unaligned ( gi|38 ): ACCTATAAATGTTCATTTATTAGATCTCAGTTATTGTAAGATTGTCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTGCATCAACATGATATATTATTTTCTGTTATCATTCCATTGTATAATTTGTTATTTGTATATACTTTATACCTATGAACTGTATGGTTCTTGGTCAATAAG
Unaligned ( gi|39 ): ATTAAATAAAGCATGTAGTACACCGTCAAATATTGATAAATGTCATGAGGGTTTGATGCAGGGAAATCCACTCTCCCCATTTCTATTTTCAGTTTATGTAAACTATTCATATAGAGTTCATAGAAATCGTTTTTGCTTATAAGGAAATTATTTGTATTGATTGTGTGT
Unaligned ( gi|43 ): TTCCAACAATCATCAACTTGAAATATTATAGAATTATTAAACTTGGTAAATATCTGTATAAATGCTCATCTATTAGATCTCTGTAATTGGAAGATTATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATTTACATCACTATTATATATTATGTTCTGTTATTATTTC
Unaligned ( gi|44 ): TGTTGCTTCGTAGTATTATCAAAAAGCTTTTGATAAAGATAAACAAAATATTGCTATTTTTTCAAATTAGCAAAAACATGGTATTGATTGTCAAATGTGACAAATTATCAAATCTATGTACTCTAACTATAATCATGTGTAATACAC
Unaligned ( gi|46 ): AGTAAATAACAACAAAAACAATGGTGTGTAAATGATACATTTCTGCACAATATTATTTTAAACACCCCTCTACTCTCAAGCTTGTACAATTATCATCAACTGGAAATATTTCGGAATTATGTAAATTTGGTAAATACCTAT
Unaligned ( gi|48 ): TTAAACTAAAAATGCATTTAGAAAATGTTCCAGCAACATAGTTGTCGTTGTTTAATTCGTATAATAGGCAAGTCCTACACATTATGGTTGTGTGGTGTGGGGCTCGCACATTCATGCAAAATTAACGATTTTGGAA
Unaligned ( gi|49 ): GAGAATCACTGTCACCCAAATTTTATTTTCGTTATATGTAAATGATTTTTGAAATGGAGTTCATAAAAAAGCTTGTGTGTTCCATTGAGGTTTCGTAGATATACGCTGATTGTCTTACTAAT
Unaligned ( gi|54 ): GATTATGTAAACTTGGTAACAACCTATATAAATGTTCATCTATCAGATCTCAGTTATTGTAAGATTATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTACATCAATATGATATA
Unaligned ( gi|56 ): TCATAAAGTTGAGTAGTTAATTATGTAAAATTGATAAATACTTATATAAATGTTCATTTATTAGTTCTCAATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTACAT
Unaligned ( gi|61 ): CAACATATGGCATGTCACTAAATACTAGAAAATTGAAAAAGGTAGATATTTATATGTTTCAAGAATGAAAGAATTGTAAAAT
Unaligned ( gi|63 ): GTGTAAATCGTCCAATATCTATGACGTCGTGTCAGATGCTCGATTTGTGTTTTTAAAAAAAAGAGTTATGGTACTA
Unaligned ( gi|66 ): TAATGTGCTGCTTGTATACGCATTATACTTATCAACTGTATAGTTCTTGGTCAATGAATAATAC
Unaligned ( gi|67 ): TATTTGAGAAGCATGCTCTATTTCATGTTTACAAATTGGTTTTATAACTTATAGAATATATCT
Unaligned ( gi|75 ): ATTTTTAATTAATAATATAATTTTTTTCCTAATAAATTTT
Unaligned ( gi|76 ): GTATGGTTCTTGGTCAATAAACAATACAAACAATA
Unaligned ( gi|77 ): CGTTCGATTCGGTAAATAGGGGTATGTTGT
Alignments
lowQualScore : 1111 11 22222222222 11 111111 333333333333333333333333333 222222222222 3333333333333333 222 11 22222222222222222222222222 11 11111111111111111111111111111 4444444444444444444444444444 111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 11 1 1111 11 1111 1 2222222 11111111111111111 11111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222 222222222222222
lowQualScore : 1111 3 77 7777 3 3 555 3 3 3 3 00 7777 99999999999 777777 1 00 7777 1 4 3 444 444444 1 1 8888 333333333333333333333333333 2 1 0 0 000000000000 44 5 1 55 4 55 4 55 1 4 66 1 444 6 3333333333333333 000 5 3 6 4 22 2 22222222222222222222222222 4 4 99 4 33 55 1 8888 88 4 55 4 666 4 4 8 55 99999999999999999999999999999 4 55 4 7777777777777777777777777777 4 4 4 4 777 55 4 0 77 55 1 333333333 88888888888888888888888888888888888888888888888888 5 2 66 5 222222 66 4 4 4 9 3 55 4 777 4 4 4 6 00 3 4 66 3 666666 4 8888 5 5 3 3 9999 2 5 5 5 5 8 11 0 3 3 3 0000 3 0 3 3 6 3 77 3 3 3 0 888888 888888 77 6 3 2 1 444 1111111 444 55555555555555555 33 33 2 0 66 2 88888 44 777 3 2 555 1 0 3 66666 3 33333333 2 2 777777 22 2 77777 2 2 66666 2 2 4444 0 7 666666 4 4444 2 888888 2 66666 22 22 0 2 2 2 5 555 66 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 2 2 4 4 2 77777 2 333 3 44 66666666 000000000 3 3 1 1 1 222 1 1 1 1 1 4 1 1 44 111111111111111 44 3 6666666 444444 1 1 22 33 3333 1 33 4 1 11 5 1 11 1 1 11 1 4444444 1 33 1 11 2 33 44 222 6 2 1 1 2 4 11 1
lowQualScore : .... . .. .... . . ... . . . . .. .... ........... ...... . .. .... . . . ... ...... . . .... ........................... . . . . ............ .. . . .. . .. . .. . . .. . ... . ................ ... . . . . .. . .......................... . . .. . .. .. . .... .. . .. . ... . . . .. ............................. . .. . ............................ . . . . ... .. . . .. .. . ......... .................................................. . . .. . ...... .. . . . . . .. . ... . . . . .. . . .. . ...... . .... . . . . .... . . . . . . .. . . . . .... . . . . . . .. . . . . ...... ...... .. . . . . ... ....... ... ................. .. .. . . .. . ..... .. ... . . ... . . . ..... . ........ . . ...... .. . ..... . . ..... . . .... . . ...... . .... . ...... . ..... .. .. . . . . . ... .. ..................................................................... . . . . . . ..... . ... . .. ........ ......... . . . . . ... . . . . . . . . .. ............... .. . ....... ...... . . .. .. .... . .. . . .. . . .. . . .. . ....... . .. . .. . .. .. ... . . . . . . .. .
lowQualScore : 7777 9 44 7777 3 3 555 6 6 6 6 00 7777 00000000000 444444 0 00 7777 5 9 6 999 111111 4 5 5555 222222222222222222222222222 5 0 7 8 999999999999 22 7 0 55 0 55 0 55 0 4 11 1 666 9 4444444444444444 000 0 2 6 1 11 4 44444444444444444444444444 0 0 55 0 11 55 0 5555 99 9 55 0 555 0 0 2 55 99999999999999999999999999999 0 55 0 1111111111111111111111111111 0 0 0 0 000 44 0 6 22 55 4 555555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444 4 8 99 0 888888 11 4 0 0 0 0 55 0 000 4 4 4 7 66 7 4 11 3 999999 4 9999 0 0 1 6 0000 0 0 7 7 7 9 00 8 6 6 6 5555 6 9 6 6 7 3 99 3 3 1 6 888888 888888 33 2 1 9 9 777 0000000 777 66666666666666666 99 99 9 1 55 6 00000 22 777 1 6 888 0 8 1 77777 1 44444444 5 5 222222 99 5 11111 5 5 22222 2 2 7777 8 2 444444 4 7777 2 333333 1 00000 33 99 5 1 5 5 7 000 88 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1 1 2 0 0 77777 0 333 8 55 44444444 111111111 3 3 7 7 7 999 7 6 6 6 6 8 6 6 44 555555555555555 44 2 8888888 666666 6 5 11 88 3333 4 44 3 4 99 5 3 88 3 2 77 2 1111111 2 00 3 88 6 11 44 333 5 6 3 3 6 0 88 3
consensus : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GGTGT----TAAAAA----A---AT-TACAGC---TTCNATG--ATGGTTT----ATTCGGAATT-AGG-NAG------ACTTC----CATTAG----AA-TT-----AG----A----ACATNTAGAATGGTAAAATA--T---------TTNTTCAAANT--G-AGA--A-A--CACNGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-GTATNTA--T------TC--C--GAAATGTATGTACAATGTCTTGTAGANTCAAAT---T------C---T---A---A--ATG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATNTAT----TGTN-CTCTNTT--G-GATTN--GG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---GATT------AT--GTTAA-T--GAAA-AACCG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTAAA-GGA--TGTGTT--T------ATAC-----A----A----------A--------G--TG-----T------T--TTTCGATAGTTCNTCA--AA-GTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCGG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTT-ACGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCA-ACGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCNAAT-A-C---AAA-TACTA--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
Reference ( family-468 ) : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GGTGT----TAAAAA----A---AT-TACAGC---TTCNATG--ATGGTTT----ATTCGGAATT-AGG-NAG------ACTTC----CATTAG----AA-TT-----AG----A----ACATNTAGAATGGTAAAATA--T---------TTNTTCAAANT--G-AGA--A-A--CACNGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-GTATNTA--T------TC--C--GAAATGTATGTACAATGTCTTGTAGANTCAAAT---T------C---T---A---A--ATG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATNTAT----TGTN-CTCTNTT--G-GATTN--GG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---GATT------AT--GTTAA-T--GAAA-AACCG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTAAA-GGA--TGTGTT--T------ATAC-----A----A----------A--------G--TG-----T------T--TTTCGATAGTTCNTCA--AA-GTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCGG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTT-ACGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCA-ACGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCNAAT-A-C---AAA-TACTA--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
gi|1 : TGGGGCTC----ACACCAGC--AAATAATTT----GGAAAC-ACTT--CA-TTTTGAATTTGTT-GTAAAAAAGTTTTA--TGTGT----TAAAGA----T---CT-TACTAT---GTCTATG--ATGGTTTTACAAT---GAATT-GGG-ACGGACACCACTTA----CAT--G----TG-CT-----AA----G----AAGTAT-GAATATTGAAATA--T---------TGGTTTAAAATTAA-AGA--AGA--CAAAAATG-ATTGTATTTTTAAAG-A-GTAT-TA--TA-----TCAGC--GAAATGT-T-TA-GATGT-TTGT-GACTCAAAT---T------C---TTTTA---A--TTG-TTGGT-TGAACA-TA--TG--TAAGAGATTTAT----TATA-CTCT-TA--G-GATTT--GGGATATTGT-TGGA--A------TTGTACTTGTTG------AT--ATAAA-TTTGAAACAA--A-------------------------ATTT-TAT-GATGA-A---GTA-AAACAAA-GACTACATGGA--TGTGTTA-T------ATAC-----A----AGAAAATAAATA--------G--TG-----T------T--TTTGGAGACGTCACCA--AA-ATGT------ACTATTTAT-ATCAATATGTCAA-TGAA-GGTTTTA--A-A---TTACAATT-GTA-TTT-ACAAAAAGCCCTATTCCTAGTGGT-TTATATTCA-A-ACA------T----AAGTAAATTACCGACTAGCC--CTCACTAGAATATTGAAATTGAAA-AAAGGTAGATTTAGTAATATTCCAAGAAAAGAA-AGA-AAA--ATGTAAATTA-TGTGT-C------AGAGAA-CAT-TCAA-GTATGAAGT--ATTCA-TTTT--TA-T------TA------GT--TGTCGC-TTT-TTAT-AA---TGA-TTTGG-GGAAAA---CAGTATT-----------AA-A--AGA--AAT--ATT-ATTATAAACACCCCTCT-ACTTT-C--AA--GCTGTTGT-ACAATTATTA--TCAACT-T-G---GAA-TATTA--CCG-GAATT-AT------GTACT-TTTGGG----TAAATA-C-CT-----ATATAAA-TGTTC-------ATCT--A------G-TCAGA--------------------------------------TTAT-C-T-CA--GT-T---T--A----T--TG--TAAG--------ATA----T------ATC-C-----T-T--CA------------GT-ATATCC-T-G--C-CATG-TACATCA-TA-----T-G---A-T--AT----A---A--AG----A-T--T---CT-GA-T-A-T---T-TATT-T-C-A-T---G-TA-TTA-----------AAT-T--TGTT-------TGTA------T-AT-A-------C----T-T--T-A-T--ACCTTA-G--AA---C--T-G-------T-AT--G-GTTC-TTAATT--G---T-CAA-T-A-AACCAA-T--A-CAA
gi|10 : ggtaaatttcacaaaactcaaaatgttttttagcgccgcaatgtagaaaaagtttaagtagcttgtttaaccaaaaaagatttgcattgaatgttagcacacagttgtcactgtttgatacgtatatactaggaagtctagcaaattatgttgttgaagtttAGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GATTTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GATGT----TAAAAA----A---TC-CACAGC---TTCTATG--ATGATTT----ATTCAGAATT-AGG-TAG------ATTTC----CATTAG----AA-TTAG---AG----A----ACATTTAGAATGGTAAACTATTT---------TTTTTCAATCT--G-AGA--A-A--CACTGATA-ATTGGATTTT--ACGT---------------------------AATGTATGCACAGTGTCTTATAGAACCAAAT---T------T---T---A---A--ATG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATATAC----TGTT-CTCTGTT--G-GACTA--GG-ATAT-GTCTAGT--A------T-AAA---GATT------AT--GTTAG-T--GAAA-AACTGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAT-TAC-A-AAATGT----ACAAA-GGTTAAA--GA--TATATT--T------ATAC-----A----A----------AAC------A--TG-----TA-----TAGTTTCAAGAATTCTTCA--AA-GTGG------CGAAT--AT-ATAGATTCATT
gi|11 : agtattttagcaatgcaatgtaaaaagagtacgaatgttctgctgtctaaaatgaagtctttacacctgaatgtgttgacaaagttgaatttatttgacacatatgtgagtagtattgcatattatagctgtga----GAAAATCG-TT--CACTTT-GAATTT-TTTGTAAAAAAGTTTTATCGCTGT----TAAGAACGTCA---AC-TAT-GC---T-CTATGCCATGGTTT----ACAATGAATTTGGG-CGG------ACA-C----CACTAC----AT-GTGCTCAAG----A----A-GTAAAGAATATTGAAATA--T---------TGGTTAAAAAT--T-AAACAA-A--GACAAATACATTGTATTTT--AAGAACGTATTTA--T------TT--CAGGAAAC---TGTAGAAT---TTGT-GACTCAAAG---T------C---T---CTTTA--ATGGTTGGTATGA-CC-TATGTG--TAAGAGATTTAT----TATA-CTTCTTTAGG-GATTT--GG-ATAT-GTTTGGC--AATTCGTT-ACT---GATG------AT--ATAAACT--GAAA-AAACA-------------------------A-AT-TAT-CTG-A-A---GTACAAACAAA-GACTACA-GGAAGGGTGTTACT------ATAC-----A----A----------
gi|12 : ttacatttgaatgttagcaccacagttgtcactgttttgatacgtatagtagcagagtctttagcaaattatggttgtaagtttggctcacatctagcaaatgatttggGAATTG----GAAAGT-A-TT--CA-TCT-AGATTT-TT-GTAAACAAATTTTA--TCAGT----TAAAAA----A---AG-TACTGT---TTCCATG--ATAGTGT----ACTCGGAACT-AGG-ACGC-----ACTCC----TCTT-GTCTTAA-AT-----AG----G----AAATATAGAATGATTAAATA--C---------TGGTTGAAATT--G-AAA--A-A--ATCAGAAA-ATTGTATTTT--GGATA-GTATTTA--C------CA--T--GAAATGT---TAGAA-GT-TTGTA-ATTCAGAT---TTTTTCGC---T-----------TG-TTAGT-TG--TC-AGA-TG--TAAAGGATTTAT----TGTA-CTCCTTT--G-AATTT--GG-AAAG-GTATGGA--A------T-TCC---AATA------AT--ATCAA-C--GAAA-AGCAT-------------------------TTTT-TAC-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTGAA-TGA--TGTGTT--T------GTGC-----A----A----------GAATTGAATG--CG-----T------T--TTTTGATAATTCATCA--AA-ATGTAACTTACATGT--AT-ATAAATATGTAAA-TGAT-GGTTTTA--A-G---TTGCAATT-TTA-TTTAACAAAAG--CC-ATTCC-AA--ATACAGT--------ACAAT-ATAT----AAGCAAATgaacataaatagtgtcttcatcatgtgataaattccacaat
gi|13 : ATATTTTAATATACCT-GAATGTAAACCG-AAA--ATGTAA-TTGCTGT-TTCATA--TGGAG-AATAT--GAATG-ACGAA-T--A-TCA-TTTTTATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-AT-TGAA---AAA-CT----AGAAAA---TTGTACA-----------TTGG--GTA--AAT--ATT-ATTATG-AAAACCGTCA-ATGTA-T--AA--ATTAT--T-AAAGCTATTC--TATAAT-A-C---AAA-TACTA--GTG-TTA-TAAT------GTATG-TTT-GG----AAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCTAA----AACTTAA------A-TTAGA----GGGCC-CA----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-CA-----G----TAAAGTA----T------ATC-TATATAT-TA-CA-CCAC-------GCAATACTC-T-GTTT-CGTA-ATC-TTACAA---T-T-G---T-T--ATA---A---ATTGTA---A-T--TTA-TT-GG-T-G-T---T-T-TT-T-CTA-TT-AA-TGTTTA---------TTA---T--TG---------AATA------T-A--G--TTTC-T----T-T--A-A-T--AACCTA-T---A-G-C--A-G-------T-AT--T-G--CTTT--TT--G---G-AAA-TAA-AA-CAA-T--A-CAATAa
gi|14 : ggagacttaaaataagtataataccagtgtTTT-A-GTT------TA------GTAATATC-T-TTT-ATATGAACATAAA-------AGAAAA---TTACATG-----------TT-G--ATA--A-----TT-ATTATGAAAATCCGTCA-AAGTG-T--AA--ATTAA--T-ACG--TA--C--TCAAAT-A-C---ATA-TATCA--GTG-TTA-T-GT------GTAAT-TT--GG------AATT-T-TTTTTTCATATAAA-GCTTCT-A----AACTGAA------A-TCAGA----GATCA-CT----T-CA-TA----AG-G--ATG-TTTACCC-T-CAATATGT---TA-A----TA-AA--CATGTCC-T---GTA----T------ATTAT-----T-TG-AG---GC-------GC-ATGCTC-T-ATTT-AGTG-TTT-ACA-AATGGT-T-G---T-T--AT----A------------A-C--TTA-TT-GA-T-G-T---C---TT-T-C-A-T---A-T--TTA---------TT--T-TAATG-T-------AATA------T-AT-G--TTCT-T----T-G--T-AGT--ACAATA-C--AATA-C--A-G-------T-AT--
gi|15 : ctaaaggtaaatataaaattaatgcagatattttgcagtacattgtactagtaaacataaatgtttcgtaacatttagatttgatggaaaatacaaataaacacgtgtattttctcgtcattagatttaaccTTG----GAAAAT-G-TT--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAAAAAGATTCG--GGTGT----CAAGAG----G---TC-TACTAT---GTCTATG--ATGGTTT----ACAATGAATT-GGGACGG------AC-AC----CACT---------------------------ACATG-----TGCTAAG---------------------AAAGT--ATAGA--A-AGTTACAAATA-ATTATATTTT--AAAGA-GTATTTA--T------CA--G--GAAATGT---TACA-----------ACTCAAAT---T------CTTTT---A---A--TTG-TTGGT-TG--ACATA--TG--TAAAAGATTTAT----TAAA-TTCTTTA--G-GATTT--GG-AGAT-GAGTTGTTCA------T--AA---G--T------A-----CAA-T--TCCA-TACT---------------------------TCT-TAT-CTG-A-A---GTA-AAACAAA-GACTACA-GGA--TGTGTT--T------ATAC-----A----A----------
gi|16 : tttaaccaaaatgaaaaatttgcatttaaatgttagtacactgttgtcactgtttgatacgtttataggaagtctagcaatttatggtttggggctcacatccagcaaatgatcatgt-AAA--ATCTAA-TTG-CAT-T----A--TC-AG-A-TAA-TGAA-GGACGAA-TT-A-TCA-TTT--------------A------TC--TGTC-CATGT-ATATGAA---AAAACT--A-AGAAA----TT-TACA-----------TT-GTAATT--AATCGATT-ATGCTGAAAAAC-GTCC-AAGTAGTCGAAGTATTGT--T-ACAGCTATTC--TCGAAT-AGC---AAAATACTA--ATG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-G-----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-ACT-CT-A----A-CTTAA------A-TTAAA----GGCCA-CA----A-CA-TC----A--G--AG--TTTATC--T-CAATAT-T---T--AATGATA-TA--TA-A----T---ATA----TTAGGTAATC-T-----T--A-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TTA-AA---TGT-G---T-T--AA----A---ATTGTA---A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-T---CT-GA--G-TTA---------TTA---T--TG---------AATA------T-AT-G--TTCT-T----TAT--T-A-T--ATCCTA-TAAAA-G-C--A-G-------TAAT--TGG--C-TT--TT--G---GTAAA-T-A-AACCAA-T--ACCAATACg
gi|17 : agaAAATGT-T-TAGAA-GTTGTGTA-ATTCAGATATGT------T---T---A---CTTGTG-TCGGT-TC--TC-AGA-TGGATAAAACATTTAT----TGTCGCTCCTTA--GAGATTT--GG-ATA----CTATT--A------T-GGA----ATTCCAATAATCGATTAA-C--GAAA-GAGCA-------------------------TTTT-TACATAC-ACA---GTG-AAACAAACGGTTGAA-TGA--TGTGTT--TGCTGGCATAA-----ATTGGA----------AT-------G--CG-----T------TG-TTTTGATAATTCATCA--AAAGTAA------CTTAT--AT----GA-ATATGTGATAAT-G-ATGGGCTA-TAAGTTGCAA-T-TTA-TTA-ACAAAAAG-CCAATTTC-AA--ATACGATAT--G-T-ACAGTTATAT----AAGCAAATA-TCGCAT-GTCATCACA-TAAC---TAGAAGTTGAAACAAGGT-AGATATCATAATGT
gi|18 : ttacccatga-TCAT-GGATCAG--AAT---TTGCAACT-TTA-TTT-AAGAAAA--CCGATTCC-AG--ATTCAATAT--A-A-ACAAT-GTATTTATAAGTGAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGT---TGGAA-TTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-AAATGTAA-CCGTAAATTATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATAAT------TA------TT--T-TC-C-TGT-ATATGAA---AAA-----A-AAAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATATTTAT--ACTAAGTATGAAAAACCGTCA-AAGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCTAGT-A-C---AAA-TACTA--G------------------------TT-GG----TAAATT-TCTT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------AGTAAGA----GCCTA-CA----A-CATTA----AA-GTCGGG-TTTATgttcaaaaatgaagaatttg
gi|19 : A--ATGTAAATTA-TGT-T-CA------GAG-AACAT-TGAA-G-ATGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATTAGTACATG------TA--TGTC-C-TTT-TTAT-AA---TGA-TT--GTAGAAAA---CAGTATT-----------TA-A--AGA--AAT--ATT-ATTACAAACACCCCTCT-ACTTT-C--AA--GCTTG--T-ACAACTATTA--TCAACT-G-G---AAA-TATTACGGAA-TTA-T-A--------TAAA-CTT-GG----TAAATA-C-CT-----ATATAAATGTTTAT--------CT---------A-TCAGA------------------------------------------TC-T-CAG----T---T--A----CA-TG--TAT-----T---GTAAGATT------ATC-C-----T-TAGTA-TCA-------------ATCC-T-GTCCATGTA-TACATCA-AT---A-T-G---A-T--AT--------ATTAT----G-T--T---CT-GT-T-A-T---T-A-TT-T-C-A-TT-G--TA-TAA---------TTTGT-T--TG-T--------ATA------T-A----------C----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-AT--G-G--T-TC--AT--G---GTCAA-T-A-AA-CGA-T--A-CAATACA
gi|2 : AGTCTGGGATTA---AAT-CCAGCATAATGAATTG----GGAAGA-G-TATTCA-TCT-AGATTT----GTAAACAAATTTTATCAGTG------AAGAA------------GCAGTCTGTTCCATGGTATGGTGT----A-CCGTAACT-AGG-ACG------CCTCCTCTTCATCTT----AA-AT-----AG----G----AAATATAGAATAATTAAATA--C---------TTGTT-AAATT--G-AAA--A-A--
gi|21 : gattaagtgcatgagcaaaaagtatgatttaatctctgatgcccaatttggttttaaagctggatatagtacaagtgatgctatttttgttttacactggttaataacacggacacttgcaaaacgtaaacaccttttttgttgctttgtggattatcaaaaggctcttttgataagtatgatatgaaacatgctcatttttaaattatcgaaatatggaactttgactgtcaaatgttaaagtcaatgaaactctaatataaaaacatgtggtacgccactacttaaatcaatggtcagagttgctcaggatgttcgccgaggggttgatgcagggcgagtcactctcctcccattgttattttcgttccatataaattaccttttgaaatgaaattattggaagtcatcgtgtattatctgtaagaaattagagaaatagctttattttttcatcgatatgctttgagatgacactgttttattattccagacaacggaacacacaggtttacaaagatatgttaactgtttgactcaacttatgacatctacagtggaattgatacccggtaaacgagacaaaactaatgttttgctagtattcagaaaaaagttggtagattgaaacagaaactattttttggaaatataatatggaaaagctattgatgttgtgagacaatcgttaatttatctagtatccactttgaatttcaatggtaattcaattaaaacacaaagtgttcttaggcatcagcaatgtaaaaataggcttaagttgtacctgttaagctaaaaatcgaaaacatcttgcaacattaaatgtagtacaaagttgtcattgttcaatacttactattagtagtatagcaaattatggctcctgtgaTTG-TGT-G-CAAA--TAGAG-A-TAT-TGAT-G-GTCAA-TCGA-T--------ATATT------TA------TT--TGTC-A-TGA-GTTTGAG---AAA-AT--A-TGAAAA---TTGTATA-----------TT-GAAAAA--AAT--ATT-ACTATAAAAAAGCATGATGCGTG----AA--ACAA-----AAACCAATTCATTCACAT-G-T---AAA-TACAA--ATG-TGA-T-ATAAAAAAATAATGTTT-GGAACTTGAA-T-C-TC-----ATATGAA-GCTT-T-A----AAATTGAAATAGCA-TCAGA----TGCAATCA----A-CA-T-------------G-TTC------------T-T---T--A----TA-C---TAC-----C---GTA-----------A---T-----T-GA-----GAC-------AC-ATACTT-G-ATTA-TGTG-TTT-GCA-AA----------------AT----A---A-TGT---------TTA---------A-C---C-T-TT-------TT-GA-T--------------TTAAT-T--TA-T-------CA----------AT-G--TCTG-T----T-C--T-A-A--AATTTA-T--AA-G-C--A-A-------T-GC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--G-CAATACAaa
gi|24 : TACAAA-GCTTCT-A----AATGTAA------A-TTATG----GGCCA-CA----A-CA-TA----AGCG--GGG-TTTATCCTT-CAATAT-T---T--A----AA-TAATTATA----T---GTA----A------GTG-T-----T-T-----------------T-ATACTT-TCG--T-CGTAGTTC-TCA-AA-----T-G---TAT--AT----A---ATTGCTA--A-C--TTATTT-GGCT-GTT---C-T-TT-T-C-ATTT-GA-TG-TTATATATTGT-TTAATAT--TGTT-------AATA------TAAT-G--TTCT-T----T-T--T-A-T---TCCTA-T--AA-GCC--A-G-------T-GC--T-G--C-TT--TTA-G---G-AAA-T-A-AA-CAAGT--A-TAAT
gi|25 : tattcgtgccaaacgccactataaactatcaaatcttgatccagaatcttcacttgacttagtacagt-ATGAA-T--A-TCAATGTT-ATATC------TA------GTA-TGTC-C-TTTTATATAAT---GAT-TT--GTAGAAAA---CAGTATT-----------TA-A--AGA--AAT--ATT-ATTA--AAACACCCTCA-t
gi|26 : AA---AAA-----A-AGAAAA---CAGTATT-----------TA-A--ACA--AAT--ATT-ATTATAAACACCCCTAT-ACTTT-C--AA--GCTTG--T-ACAACTACTA--TCAATTAA-CTGGAAA-CATTACGGAA-T---T-AT------GTAAA-CTT-GG----TAAATA-C-CT-----ATATAAA-TGTTC-------ATCT---------A-TCAGA------TCT-CA----G-T--TATTGTAA-G--A----TTATCC-T-CAGTAT-C---T--A----T------CCTG----T---CCA----T------G-----------TA-CA-TCA-----------ATA----T-GAT---ATA-TT----A--------T-G---T-T--AT----G-----------------TTA-TT-A--------------TT-T-C-A-TT-G------TA---------TAAGT-C--AG-T--------ATA------T-A----------C----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-AT--G-G--T-TC--TT--G---GTCAA-T-A-AA-CAA-T--A-ctttcaagcttttaataatattacggaattggtaaatacctatataaatgtcatctatcagttctcagttatgtacattatcctcatgcatctatttcctgttccaatgctcatcatgaatatataatgttcttgttatttattcattgtataatctatttgtatactactgtatacctatgaactgtatgttcttggtcaataaaacaataca
gi|29 : aaataataaagaaaTACAAA-GCT-CT-A----AATGTAA------A-TTAGG----GGCCA-CA------CA-AA----GC-G--AGGGTTTATCC-TTCAATAT-TAAAT--A----TAATA--TATA----T---GTAA---T------GTT-T-----TATA-CA-TTTC-------G--------------T-CGTAATTC-TCA-AA---A-TAG---TAT--AT----A---ATTGTTCACA-CA-TTA-TTTGG-C-G-TGTTC-T-TT-T-C-A-TTTGA-TG-TTAAATATATTGTTAATAT--TG-TT------AATA------T-AT-G--CTTC-T----T-TCTT-A-T---TCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-GC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-TAATACA
gi|3 : tagtacatgtAGAGTGGGGTTTCAGTATCTCTGC-AACAGAATTA----TAAAGT-G-TA--CA-TTT-GGATTT-TT-GCAAGAAAGTTCTA--CATGT----TAAAAA----ATCTATGTACATT---TTCGATG--ATGATTT----ATTCAGAATT-AGG-TAC------ATTTC----CATTAG----AA-TT-----AG----AGAGAACATTTAGAATGGTAAAATA--TAATGTTTTTTTTTTCAAACT--G-AGA--A-A--CACTGATA-ACTGTATTTT--ACGTG-ATATACA--TGTGCATTT--A--GAAATGTGTAAAGGATGTCTTGTGGAATCAAAT---A------C---C---A---A--ATG-TTGGT-TA--TG-TAG-TG--TAAGGAATATGT----TGTT-TTCTCTT--G-ATTTA--GG-GTAT-GTTTGGT--A------C-GAA---AA-C------ATC-GTTAA-T--GAAA-ACCCG-------------------------GTGT-TAT-TGC-A-A---GTA-AAACGAC-GGGTAAG-GGA--TATATA--T------ATACCAAAAA----A----------A--------A--TG----------------ATCGCTA--------------TGT------CGTAT--GT-ATATGTATATTTA-CCAT-GGGTTGG--A-T---CTGCAACT-TTA-TTT-AGGAAAC--CCACGTCC-AT--GT-CAATAT--ATATACAGT-GCAT----TAGTAAATT-TAGATT-GTCCTCTCATAAGC---TGGAAATCGAAG-GAGGa
gi|31 : acacgtaaatgattttgcgatggtgtttattaaaacattatgtgttccagctgaggttagagatattgctttatttctaatatcatgtaccccctatttttttaaatatttatttcagtattgctaatgatactgtacttttttcagatacagcagatggtttacaaaatatgttggacgcattgtagttacatcccaaaattgaaacacagtgttaaaagtgttggttttagaagtcgtaaactgaaaaactgtcatacatggtgttatgatgatgtacctctagatgtcatgtggtagaaaatatgaactagttaggaatcctgttccgttttaatgataaatttaataaagcataaaatgttttagctatgcaatgtagatctagaaagagtatgaatgctctgttagctacaacgaagttctaacacttaattatctcaacaaagtatctgacacacatgtgagtagtattgccacttatacttgtgaTA-T-GT------GTAAT-TTT-GG----GAAATC-T-T-------------------T-A----AACTGAA------A-TCAGT----GGTCA-CA----A-CG-TG----AA-G--AGG-TTTATCG-T-CAACATAT---C--A-----A-T---TATG----C---ATG----T-------TC-T-----T-GA-TA-TCA---------------TC-C--TTT-CATG-TTT-ACA-AA---T-T-G---T-A--AT----A---AT--A----A-T--TCA-TT-AA-T-G-T---C-T-TTCT-C-A--T-AA-TT-TCA----------TAAT-TACTG-T-------AATA------T-AC-G--TT---C----T-T--T-G-T--ACCATA-A--AA-G-C--A-GTACTGGCT-AC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAAT
gi|33 : catgA----GAAAGT-T-CA--CA-TT--AAATTT-T----AAGAATATATTG--GGTGTAAAATAGAAA----A---A---ACATG---TACAAT---ATGGTTT----ATTTGAAATT---G-AAG------A
gi|36 : agttaaataatcattgtttttaatgcagaaacaaaattgtcggtttttaaaacgtatgttgaagtatattatcatacggatctgaaataggggatttcataaagccccagatgttgT-ATCTGAA---AAA--T--A-A-AAGT---TTGTATAATATATGATAATT----ATA--AAT--ATT-ATTATAAACACCCCTCT-ACTTT-C--AA--GCTTG--T-ACAACTATTA--TCAACT-G-G---AAA-TATTACGGAA-T---T-AT------GTAAA-CTT-GG----TAAATA-C-CT-----ATATAAA-TGTTC-------ATCT---------A-TCAGAACTCGGTTA-T-------TG-T-----AA-G--A----TTATCC-T-CAGTtac
gi|37 : ttaaattggtG-AAA--ATGTAAATTA-TGT-T-CA------GAG-AATAT-TGAA-G-ATGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------AA------TA--TGTC-C-TTT-TTAT-AG---TGA-TT--GTAGAAAA---CAGTAT
gi|4 : atttagtaatattccaagaaaagaaaAGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAATAATTATCTAGAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAATAAAGTCTTG--GGTGT----T--AAA----A---ATCCACAGC---TTCGATG--ATGATTT----ATTCCGAATT-AGG-TAC------ATTTC----CATTAG----AA-TT-----AGAGACA----ACATGTAAAATGGTAAttaagcttctccaactatttaatatcaactggaaatattacggaattatgtaaacttggtaaatacc
gi|40 : tgtgtaaatggtctgaaaattatgacatcatatcaaatgctcagtttggtttttaaaaaggatataataccaccgatgccatatttatattacagtatttaattaacaggaatataatgaaaggaaagaaactttattgttgttttgtaaattatcaaaagggcgttcgattcggtaaatagaggtatgttgttttgcaaaatatctcaatgtggtatagattgtaaaattatgaatatcattcgttcaatgtatgtaaatgttaagtcttgtgtaaaatataaatcacaattgtcagaatatttctcttgtaatcagggtttaatgcaaggaaaatcattgtctccaattttattttcgttatatgtgaatgattttgaaatggagtttataaaaaaaaaaaaacgtgtgttccaattgaggttcgagatatcgctctatttcttataatgtatgctgatgatattgtacttttctcggatacagcagaaggtttacaaaacatgttgaacactctatgtagttacacctcgaaatggaaacttaatgttaatactgaataaacaaaaattgttgtttttagaaaaggtcgtaaactaaaaaaattatacatggtgtctttagatgtggtagataactttaactacataggagtcacgtttaatatcaatggcaaattaaataaagcacaaagtattttagcaatgcaacgtaaaaagagtatttaaaaagagtatgaatgttctgctatctaaaatgaagtctttattcctgaatgtgttgacaaagttgaatttatttggcacatatgtgagtagcattgcatattatagctgtgaACTC-T-GTTT-CGTA-ATC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGTA---A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TT
gi|40 : -C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-C--A-CAATttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtattgcttttggaaataaacaacacaat
gi|41 : actctgtttcgtaatctcaaattgttataattgtaacttattggtgtcttttcattgatgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn------ATA-T-----T-TA-AA-TCTC-------GC-ATACT--T-GTTT-CGTA-ATC-TTA-AA---T-T-G---T-T--AT----AAACATTGT----A-A--TTA-TTAGG-TAG-T---TAT-TT-T-C-ATTT-GAGTA-TTA----------TACT-C--CA-CAAAGATAAATA------T-AT-G--GTTT-T----T-TA-T-A-T--ACACTA-C--TA-G-C----G-------C-AT--T-G--CTTT--TT--A---G-AAA-T-A-CA-CAA-T--A-
gi|42 : GGTTC---TATTCCT-C-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-Taca
gi|45 : aaattcaatgtacagtattttacaatgcaatgtaaagaaagtatgaattttctgtttctttacacctgaatgtgtgacaaagtgaattatttaacatatggtgagagtattgcatattatagtgaatt-----T-TA-CA-AAAC-------GC-ATCCTCCT-GTTT-CGTA-T-C-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGTA---A-C--TTA--G-GG-T-G-T---C-T-TT-T---G-TT-GA-TGTTTA---------TTA---T--TG-T-------AA-A------T-AT-G--TTTT-C----T-T--T-T-T--GTCCTA-T--AA-G-CAGA-G-------T-AG--T-G----TT--TT--GGGAG-AAA-T-A-CA-CGATT--A-CAATGC
gi|47 : CTC-T-ATTT-CGTA-CTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--ATTTAAA---ATTCT----AAC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-CG-TTA---------ATA---T--TG-T-------AATACATGTAT-AT-G--TTTCAT----T-T--T-G-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CA
gi|5 : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGT-TAAAGAATTA----GAATGT-G-TA--CA-TTT-GAAGTT-TT-GTAAGAAA-TCTTG--GGTGT----TAAAAA----A---AT-CACAAC---TTCGATA--TTGATGT----ATTCAGAATT-AAG-TAG------ATTTC----CATTAG----AA-TT-----AG----A----ACATTTAGAATGGTAAAATA--T---------TTTTTCAAAAT--G-AGA--A-A--CACTGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-ATATATA--T------TC--C--GAAATGTATGCACAATGTCTTTTAGAACCAAAT---T------C---C---A---A--ATG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATATAC----TGTC-CTCTGTT--G-GACTA--GG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---GATT------AT--GTTAA-T--GAAA-AACTG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---ATG-CGACAAA-TGTTAAA-GGA--TGTATT--C------ATAC-----A----A----------A--------G--TG-----T------T--CTTCAAGTGTTATTCA--AA-GTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCAG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTA-ACGAAAG--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCACCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGA-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAC-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGGAAA---TTGTATA-----------TA-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCA-ATGTA-T--AA--ATTAC--T-ACATCTATTC--TCTAAT-A-C---AAA-TACTC--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-CA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GT-ATACTC-T-GTTT-TGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTCGT----T-T--T-G-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-T--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-AAATACAt
gi|50 : -TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----AAC--TTA-AT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-T-G-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--TTG-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AG--T-G--T-TT--TT--G---G-AAA-T-A-CA-CAT-T--A-CAAT
gi|51 : ATCC-T-CAACAT-G---CCAA----TA-AA--CATG----T------------------TC-T-----T-TG-TA-TTATTTGAGAAGG-ATGCTC-T-CTTT-CTTG-TTC-ACA-AA---T-T-GATTT-T--AT----A------------A-C--TTA-GT-GA-T-G-T---A-T-TT-TGT-A-TT-TA-TG-TAA---------TTAAg
gi|52 : ATTA--GTG-TAA-T-GT------GCAAT-TTT-GG-----AAATTGT-TT-----ATATAAA-GCTTCC-A----ATATGAA------A-TCAGA----GACCA-CATCTGATCA-TA----AA-G--AGG-T
gi|53 : TTGT----A-A--TTG-AT-GG-T-G-T---C-T-TG---C-A-TT-AA-A---TA---------TTTAT-T--TG-T-------AATG------T-AT-G--TTTT-C----T-T--T-A-TTTGTTCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AG--T-G--C-TT--TT--T---G-AAATT-ATAA-CAA-CTAA-CAATACAacttttgaaaacattacacatataattta
gi|55 : ---T-T--AT----A---ATTGT----AAC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------T--AT-T---G-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-G-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AC--T-A--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACata
gi|57 : ---ATTGT----AAT--TTA-TT-GG-T-G-T---T-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATAt
gi|58 : --TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--CTTC-T----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATAC
gi|59 : catataA-T-GT------ATAAT-TTG-GG----GGAAAT-G-TT-----GTATAAA-GCTTCT-AGCTGAACTGAA------A-TCGGA----GGCCA-CA----T-AA-TA----AA-G--AGG-T
gi|6 : gccT-G-TA--CA-TT--GAATTT-TT-GTAAGAAAGGTTTT--GGCGT----TAAAAA----A----T-TACAGC---TT-GATG--ATGATTT----ATTCAGAATT-AGG-TAG------A-TTC----CATTAA----AAATT-----AG----AGAGAACATTTAGATTAGTAAAGTT--T---------TTTTTCAA-CT--G-AGA--A-A--CACTGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-ATATATATTT------TC--T--G-AATGTATGT-CAATGTCTTTTAGAACCAAAT---T------C---T---A---A--ATG-TTGTT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATATTC----TGT--CTCTGCT--G-GACTA--GG-AT-T-GT-TGGT--A------T-GAA---GATT------AT---TTAA-T--G--A-AACTG-------------------------GTTT-T-T-TAC-A-A----TG-CGAC-AA-GGT---A-AGA--TAT-TT--T------ATAC-----A----A----------C--------A--TGTTAGTT------T--TTTCAATAGTTCTTCA--AA-GTGT-------GTA---AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GG-TCAG--A-T---TTGCAACT-TTA-----A-GAAAA--ACAATT-C-AG---T-CAA-AT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAA---TAAATT-G---TTTCAT--------------------------AGATATTTTAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAA-TG-TGT-T-CATAATTAG-G-A-TATGTGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTAT-AT-TT------TAATATATTT--TGTCAC-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTACA-----------TT-G--ATA--AA---ATT-ATTATGATAAA-CGTC--ATGTA-T--AA--ATTAT--TAACAG-TATT---TCTAAT-A-C---AAA-ATCT---GTGTTTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------T-T--GA----GGCCA--A----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--------------------------------T-----T-TA-CATTCA--------GC--TACTC-T-GTTT-CGTA-AT--TTA-AA---T-T-G---T-TTAAT----A---ATTGT----A-CTTTTA-TT-GG-T---T---A-T-TT-T---A-TT-GA-TG-TT----------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-A-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACacatgtacatgtatat
gi|60 : ac-TT-T-C-A-TT-G--TA-TAA---------TTTGT-T--TG-T-------A-TA------T-AC--------------T-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-ATA-T-G--G-TTC-TT--G---GTCAA-T-A-AA-CAA-T--A-
gi|62 : tattatgttctgttatta--TG-T-------GATA------T-AT-AATTTTC-TGTACT-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-AT--G-G--T-TC--TT--G---GTCAA-T-C-AA-CAA-T--A-CAAT
gi|64 : tgtacgtcaa-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C--T--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATAC
gi|65 : gtgacgattaacgtataactggtacg-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TTTGG---A-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
gi|68 : taacgtataactggttacg---------TTAAT-----G-T-------AATA------G-ATAG--TCTT-T----G-T--A-A-C--ATATTA-T--AA-G-C--A-G-------C-AC--T-A--C-TT--TT--G---G-GAA-T-A-AA-a
gi|69 : gt-G--TTTC-T----T-T--TTG-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-TA-CAA-T--A-CAA
gi|7 : aagagT--G-AGA--A-A--CACTGATA-ACTGTATTTT--ACGTA-ATATATA--T------TC--T--GAAATGTACACACAATGTCTT----------------------C---T---A---A--ACG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAAGGATACATATGTTGTT-CTCTGTT--G-GACTATAGG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---AATT------AT--GTTAA-T--GAAA-A-CTG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---ATG-GA-CAAA-GGTTAAA-AGA--TATATT--T------ATAC-----A----A----------A--------ACATG-----TATAGTTT--TTTCAATAGTTCTTCACAAA-GTGT------CGTAT--ATTATAGATATATTAG-TCAT-GGATCAG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTT-AAGGAAA--CCGATTCG-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATAAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGGTATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-GAA--ATGTAAATGG-TGT-T-CACA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-AAGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AAAAAAAACCTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATG-AAAACCGTCA-ATGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTACTC--TCTAAT-A-T---AAA-TACTA--GTG-CTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TTAGA----GGCCA-CA----A-CA-TG----AA-G--AGG-TTTAACC-T-CAATAT-T---T--A----CA-TA--CATGTATAT---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCGC-------GC-ATACTC-T-GTTT-TGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----ATATATTGTA---A-C--TCATTT-AG-T-G-T---C---TT-T-C-ATTT-GA-TG-TTA---------CATAT-T--GG-T-------AATA------T-AT-G--TTCT-T----T-G--T-A-T---CCCTATT--AA-G-C--ACG-------T-AC--T-G--C-TT--TT--C---G-GAA-T-A-AA-CAATT--A-CAATA
gi|70 : -CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCT-T-CAAT
gi|71 : t--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-ATACT-G--C-TT--TT--G---G-AAAAT-A-GC-CAA-T--A-CAATACAtgttaatgaattatctgagtcgtatgctctatt
gi|72 : taCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-TT--T-G--C-TT--TTG-G---G-AAA-T-T-AA-TCA-T--A-CAATACA
gi|73 : aaCCTA-T--AA-G-G--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--T---G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-TCATACata
gi|74 : tcaaTGT------CGTAC--GT-TTAGGTATATTTA-CCATGGGGTCGG--A-T---TTGCAga
gi|9 : TTTG-TCAT-GG-TCAG--A-T---TTGCAACTATTACTTT-AAGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GTATTTATAAGTGAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGT---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-AAATGTAA-CCGTAAATTATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATAAT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CA--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--TAT--ACT-AATATGAAAAACCGTCA-AAGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCTAGT-A-C---AAA-TACTA--G------------------------TT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------AGTAAGA----GGCCA-CA----A-CA-TA----AA-G--GGG-TT
gi|9 : -----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTT--CGTA-T-C-TCA-AA---T-T-G---T-TT-AT----A---ATTGT----AAC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-AA-TA-TTA---------TT--------G-T-------AATG------T-AT-G--TTTC-T----T-T--TTG-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatcacgcatactctgttcgtatctcaaattgtttataattgtaacttattggtgtcttttcattaatattattgtaatgtatgtttctttttgtatcctataagcagtattgcttttggaaataaacaatacaatac
26 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): AAGAAATTATATTGTTGCTTCGTAGATTATCAAAAAGCTTTTGATAAAATAGACAAAACTATGCTATTTTTTCAAATTAGCAAAACATGGTATTGATTGTCAAATGTTACAAATTATCAAGTCTATGTACTCTAATATTAAATCATGTGTAATACACAAAAATCTGTCAATTGTAATGAGGGTTTGATGCAAGGGGAATCACTCTCACCATTTCTTTTCTCTCTGTATGAGAATGATTGAGATGGAATTCATTGAAAAAATGTGTATCCCAATTGAAATAAAAGAAATTGTTTTCATGTTAATTATATATGTTGATGATACGGAACTTTTTCAGAGACAAAACAAGGTTTACAAGATATGTTGAATTGTTTACAAGATTATACCTCAAAGTGGAATATAAAACTTAAAAGTCAATTTGGATAAAACAAAGATAGTTGTTTTTAGAAAAGGTGGGAAATAAAAAATAATAATTGTTGGAAGTATGACAACACGTTGGTTAGCATTGAAGAAAATTTCAATTATTTGGGTATAATATTAAATTATAAAGGAAAATTTCCCAAAACACAAAATGCTTTAGCAGCGCAATATATGTAGAAAAGGTTT
Unaligned ( gi|20 ): TGATTTTATATTGGTCAGAAACCAGAAGTCAAAACACTATTTTGTTGCTTTCTACATCATCACTAAACTTTATGGAGTTTTTTAAGTCACCGAATTTGATCGTCAAATATCTAATGTTATAATATGAATGTATGCTCATATAAAACTTGCGTACCGACAAAAACATACGCTGTCAGAGCTTTTGGGATGCCGAGAGGCTTGATCAAAAGGAATCACTCTCCTCATTCTTATTTACTTTTCATATAAATGATTTTGAACTGGAATATATTGAAAGCATGTGTATACCTGTAAAAATAGGTAAGTTGCTTTATTTTCCATCATATATGCATATGATATTGTGGTTTTCTGAGACGGAACGAAGTTAGCAAGGTA
Unaligned ( gi|22 ): ACAAAAATGATATGGAAATGAGGGCTTAGTGCAGAACTAGTTTTCGGTGTCTTTTCTCTGCATATGGTATTCAATAGAAATGCATGCGTATACCTGTAGAAATAAGAGACACTGTGTTCCTCTTGGTATCGTATGCAGACGATACAGTATTTTTTTTTCAGAGACAGAACAAAAGGTCTAAAAGACATCAATATACACAGCAACGTTTGGTATAAAGGGTGATGTAGATAAAATTTAAATAATTGTACTTTGAAATTATGGTAAATTGAAGGAAAATCACTGTTTGAAGTATAAATATGAGTAAATTGATATTGTGGAAAATGTCAATTGCCTATGCTTAATTTTAAATTTATAAGTAAATTC
Unaligned ( gi|23 ): TCCTTCTTATGTACGCTGATGATATGGTTTTGTTATCTGATAGCGTTTGAGGGTCTACAGAGATGTTAAATACTCTATCTAATTACACGAAAAGAATGGGATTGAATGTTAATGTACAGAAAACAAAAATAATGAATATTAGAAATGGCAGTAAAGTTAAGGACAAACGAAAAAAAATGGTATTATAATGATGATTTCTTTTGGATAAGTAAATGAATTTAATTTTAGGCATACTTATGTGCTACAATGGTAAATTTTGAAAACACAAAGACACTCGCAAATCAAATCAAGTGGTTAGAAAGCTTTATTTGCAATTAAT
Unaligned ( gi|27 ): AAAAGGCGTTCGACTTGGTAAATGGAGGTATGTTGTTTTACAAGCTATCTCAATGTGGTATAGATTGTAAAATTATGAATATCATTCGTTCAATGTATGCAAATTTTAAGTCTTGTGTAAAGTATAAATCACAATTGCCAGAATATTTCTCTTGTAAATAAGGTTTAATGCGAGGAGAATCATTGTCACCAATTTTATTTTCGTTATATGTGAATGATTTTGAAATGGAGTTTATAAAAAAACTTGTGTGTTCTACGGTAATTGAGGT
Unaligned ( gi|28 ): CATGAGATTACTGTAACTTTTCTCGGATACACTAGAAAGGTTGTACAAAACATTTGAGCACTCTATTAGTTACACCTCGAAATGGAAACTTAATGTCATACTTGGAAAAAACAAAAAATGGTTGTTTTTTAGAAAAGGTGGTAAACTAAAAAATTGTTTATATACATGTGTAATGATAATGGTACCTGTTAGATGTGGTAGAGTAACTTTAACTACTTCATGGAGTCACGTTTTAATTTCCCATGGCAATTAATCAAAGCACAAAGTA
Unaligned ( gi|30 ): AAAGTTATATTGTTGTTTTGTAGACTTCCAGAAGGCTTTTGATTCAATTGATAGATCTGAATTGTGGTGTAAAATAGTTAATGACGGTATACAGCGGAAGATGTTCAATGCTTTAAGTTATTGTATAATAATGTTCAAAGCTGTGTGAAGTATGCCGGTTTTTTAGTGATTATTTTTGCAATGATACAGGTCTAATGCAGGGTGAAACTTTGTCACTTATTTCATTTTCGTTATATATACTC
Unaligned ( gi|32 ): TATTACGAATAAAGTTATAAACCCGATACGCAAGCCCTATAGATACCCGTTAAAGGTGTTGCATTTATAAAGTATCTCAGTTATGTGTAAAGATTGTCTACCTCAGTATCTAACGGTCCTGTCTATGCCTTTGATTGCATCAACATGATATATTATTTTCGTTTATCATTCACATTGATATTGTTACTTGGTATAAACTTGATACGCTATGAACTGATG
Unaligned ( gi|34 ): ATATTGTTGACTCTTTCATATCATGAGACATTTGTATTTATATTGCAGTGATACTATTATGCATACATGTAGGTTTCTATATTATGTAATGTTTTGTCATTGTACAAATTAGTTTATGCATAACGTTAAACCTATGAAATGTATGGTTCTTGGTAATATTGATTGATCGATACCAATTACAATGACCAAGTACAT
Unaligned ( gi|35 ): AGAAAACAAAAATAATGATATTTAGAAATGTCAGTAAAGTTAAGGACAACGAAAAATGGTAATATAATGATATTCTTTTGGATAATGCAAATGAATTTGATTATTTAGGCATACTTATTTGCTATAATGGTAAATTTTTGAAAACACAAAGACACGTCGCAGATCGAGGTAGAAAAGCTTTATTTGCAATTAA
Unaligned ( gi|38 ): ACCTATAAATGTTCATTTATTAGATCTCAGTTATTGTAAGATTGTCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTGCATCAACATGATATATTATTTTCTGTTATCATTCCATTGTATAATTTGTTATTTGTATATACTTTATACCTATGAACTGTATGGTTCTTGGTCAATAAG
Unaligned ( gi|39 ): ATTAAATAAAGCATGTAGTACACCGTCAAATATTGATAAATGTCATGAGGGTTTGATGCAGGGAAATCCACTCTCCCCATTTCTATTTTCAGTTTATGTAAACTATTCATATAGAGTTCATAGAAATCGTTTTTGCTTATAAGGAAATTATTTGTATTGATTGTGTGT
Unaligned ( gi|43 ): TTCCAACAATCATCAACTTGAAATATTATAGAATTATTAAACTTGGTAAATATCTGTATAAATGCTCATCTATTAGATCTCTGTAATTGGAAGATTATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATTTACATCACTATTATATATTATGTTCTGTTATTATTTC
Unaligned ( gi|44 ): TGTTGCTTCGTAGTATTATCAAAAAGCTTTTGATAAAGATAAACAAAATATTGCTATTTTTTCAAATTAGCAAAAACATGGTATTGATTGTCAAATGTGACAAATTATCAAATCTATGTACTCTAACTATAATCATGTGTAATACAC
Unaligned ( gi|46 ): AGTAAATAACAACAAAAACAATGGTGTGTAAATGATACATTTCTGCACAATATTATTTTAAACACCCCTCTACTCTCAAGCTTGTACAATTATCATCAACTGGAAATATTTCGGAATTATGTAAATTTGGTAAATACCTAT
Unaligned ( gi|48 ): TTAAACTAAAAATGCATTTAGAAAATGTTCCAGCAACATAGTTGTCGTTGTTTAATTCGTATAATAGGCAAGTCCTACACATTATGGTTGTGTGGTGTGGGGCTCGCACATTCATGCAAAATTAACGATTTTGGAA
Unaligned ( gi|49 ): GAGAATCACTGTCACCCAAATTTTATTTTCGTTATATGTAAATGATTTTTGAAATGGAGTTCATAAAAAAGCTTGTGTGTTCCATTGAGGTTTCGTAGATATACGCTGATTGTCTTACTAAT
Unaligned ( gi|54 ): GATTATGTAAACTTGGTAACAACCTATATAAATGTTCATCTATCAGATCTCAGTTATTGTAAGATTATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTACATCAATATGATATA
Unaligned ( gi|56 ): TCATAAAGTTGAGTAGTTAATTATGTAAAATTGATAAATACTTATATAAATGTTCATTTATTAGTTCTCAATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTACAT
Unaligned ( gi|61 ): CAACATATGGCATGTCACTAAATACTAGAAAATTGAAAAAGGTAGATATTTATATGTTTCAAGAATGAAAGAATTGTAAAAT
Unaligned ( gi|63 ): GTGTAAATCGTCCAATATCTATGACGTCGTGTCAGATGCTCGATTTGTGTTTTTAAAAAAAAGAGTTATGGTACTA
Unaligned ( gi|66 ): TAATGTGCTGCTTGTATACGCATTATACTTATCAACTGTATAGTTCTTGGTCAATGAATAATAC
Unaligned ( gi|67 ): TATTTGAGAAGCATGCTCTATTTCATGTTTACAAATTGGTTTTATAACTTATAGAATATATCT
Unaligned ( gi|75 ): ATTTTTAATTAATAATATAATTTTTTTCCTAATAAATTTT
Unaligned ( gi|76 ): GTATGGTTCTTGGTCAATAAACAATACAAACAATA
Unaligned ( gi|77 ): CGTTCGATTCGGTAAATAGGGGTATGTTGT
Alignments
lowQualScore : 1111 11 22222222222 11 111111 333333333333333333333333333 222222222222 3333333333333333 222 11 22222222222222222222222222 11 11111111111111111111111111111 4444444444444444444444444444 111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 11 1 1111 11 1111 1 2222222 11111111111111111 11111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222 222222222222222
lowQualScore : 1111 3 77 7777 3 3 555 3 3 3 3 00 7777 99999999999 777777 1 00 7777 1 4 3 444 444444 1 1 8888 333333333333333333333333333 2 1 0 0 000000000000 44 5 1 55 4 55 4 55 1 4 66 1 444 6 3333333333333333 000 5 3 6 4 22 2 22222222222222222222222222 4 4 99 4 33 55 1 8888 88 4 55 4 666 4 4 8 55 99999999999999999999999999999 4 55 4 7777777777777777777777777777 4 4 4 4 777 55 4 0 77 55 1 333333333 88888888888888888888888888888888888888888888888888 5 2 66 5 222222 66 4 4 4 9 3 55 4 777 4 4 4 6 00 3 4 66 3 666666 4 8888 5 5 3 3 9999 2 5 5 5 5 8 11 0 3 3 3 0000 3 0 3 3 6 3 77 3 3 3 0 888888 888888 77 6 3 2 1 444 1111111 444 55555555555555555 33 33 2 0 66 2 88888 44 777 3 2 555 1 0 3 66666 3 33333333 2 2 777777 22 2 77777 2 2 66666 2 2 4444 0 7 666666 4 4444 2 888888 2 66666 22 22 0 2 2 2 5 555 66 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 2 2 4 4 2 77777 2 333 3 44 66666666 000000000 3 3 1 1 1 222 1 1 1 1 1 4 1 1 44 111111111111111 44 3 6666666 444444 1 1 22 33 3333 1 33 4 1 11 5 1 11 1 1 11 1 4444444 1 33 1 11 2 33 44 222 6 2 1 1 2 4 11 1
lowQualScore : .... . .. .... . . ... . . . . .. .... ........... ...... . .. .... . . . ... ...... . . .... ........................... . . . . ............ .. . . .. . .. . .. . . .. . ... . ................ ... . . . . .. . .......................... . . .. . .. .. . .... .. . .. . ... . . . .. ............................. . .. . ............................ . . . . ... .. . . .. .. . ......... .................................................. . . .. . ...... .. . . . . . .. . ... . . . . .. . . .. . ...... . .... . . . . .... . . . . . . .. . . . . .... . . . . . . .. . . . . ...... ...... .. . . . . ... ....... ... ................. .. .. . . .. . ..... .. ... . . ... . . . ..... . ........ . . ...... .. . ..... . . ..... . . .... . . ...... . .... . ...... . ..... .. .. . . . . . ... .. ..................................................................... . . . . . . ..... . ... . .. ........ ......... . . . . . ... . . . . . . . . .. ............... .. . ....... ...... . . .. .. .... . .. . . .. . . .. . . .. . ....... . .. . .. . .. .. ... . . . . . . .. .
lowQualScore : 7777 9 44 7777 3 3 555 6 6 6 6 00 7777 00000000000 444444 0 00 7777 5 9 6 999 111111 4 5 5555 222222222222222222222222222 5 0 7 8 999999999999 22 7 0 55 0 55 0 55 0 4 11 1 666 9 4444444444444444 000 0 2 6 1 11 4 44444444444444444444444444 0 0 55 0 11 55 0 5555 99 9 55 0 555 0 0 2 55 99999999999999999999999999999 0 55 0 1111111111111111111111111111 0 0 0 0 000 44 0 6 22 55 4 555555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444 4 8 99 0 888888 11 4 0 0 0 0 55 0 000 4 4 4 7 66 7 4 11 3 999999 4 9999 0 0 1 6 0000 0 0 7 7 7 9 00 8 6 6 6 5555 6 9 6 6 7 3 99 3 3 1 6 888888 888888 33 2 1 9 9 777 0000000 777 66666666666666666 99 99 9 1 55 6 00000 22 777 1 6 888 0 8 1 77777 1 44444444 5 5 222222 99 5 11111 5 5 22222 2 2 7777 8 2 444444 4 7777 2 333333 1 00000 33 99 5 1 5 5 7 000 88 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1 1 2 0 0 77777 0 333 8 55 44444444 111111111 3 3 7 7 7 999 7 6 6 6 6 8 6 6 44 555555555555555 44 2 8888888 666666 6 5 11 88 3333 4 44 3 4 99 5 3 88 3 2 77 2 1111111 2 00 3 88 6 11 44 333 5 6 3 3 6 0 88 3
consensus : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GGTGT----TAAAAA----A---AT-TACAGC---TTCNATG--ATGGTTT----ATTCGGAATT-AGG-NAG------ACTTC----CATTAG----AA-TT-----AG----A----ACATNTAGAATGGTAAAATA--T---------TTNTTCAAANT--G-AGA--A-A--CACNGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-GTATNTA--T------TC--C--GAAATGTATGTACAATGTCTTGTAGANTCAAAT---T------C---T---A---A--ATG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATNTAT----TGTN-CTCTNTT--G-GATTN--GG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---GATT------AT--GTTAA-T--GAAA-AACCG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTAAA-GGA--TGTGTT--T------ATAC-----A----A----------A--------G--TG-----T------T--TTTCGATAGTTCNTCA--AA-GTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCGG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTT-ACGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCA-ACGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCNAAT-A-C---AAA-TACTA--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
Reference ( family-468 ) : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GGTGT----TAAAAA----A---AT-TACAGC---TTCNATG--ATGGTTT----ATTCGGAATT-AGG-NAG------ACTTC----CATTAG----AA-TT-----AG----A----ACATNTAGAATGGTAAAATA--T---------TTNTTCAAANT--G-AGA--A-A--CACNGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-GTATNTA--T------TC--C--GAAATGTATGTACAATGTCTTGTAGANTCAAAT---T------C---T---A---A--ATG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATNTAT----TGTN-CTCTNTT--G-GATTN--GG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---GATT------AT--GTTAA-T--GAAA-AACCG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTAAA-GGA--TGTGTT--T------ATAC-----A----A----------A--------G--TG-----T------T--TTTCGATAGTTCNTCA--AA-GTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCGG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTT-ACGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCA-ACGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCNAAT-A-C---AAA-TACTA--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
gi|1 : TGGGGCTC----ACACCAGC--AAATAATTT----GGAAAC-ACTT--CA-TTTTGAATTTGTT-GTAAAAAAGTTTTA--TGTGT----TAAAGA----T---CT-TACTAT---GTCTATG--ATGGTTTTACAAT---GAATT-GGG-ACGGACACCACTTA----CAT--G----TG-CT-----AA----G----AAGTAT-GAATATTGAAATA--T---------TGGTTTAAAATTAA-AGA--AGA--CAAAAATG-ATTGTATTTTTAAAG-A-GTAT-TA--TA-----TCAGC--GAAATGT-T-TA-GATGT-TTGT-GACTCAAAT---T------C---TTTTA---A--TTG-TTGGT-TGAACA-TA--TG--TAAGAGATTTAT----TATA-CTCT-TA--G-GATTT--GGGATATTGT-TGGA--A------TTGTACTTGTTG------AT--ATAAA-TTTGAAACAA--A-------------------------ATTT-TAT-GATGA-A---GTA-AAACAAA-GACTACATGGA--TGTGTTA-T------ATAC-----A----AGAAAATAAATA--------G--TG-----T------T--TTTGGAGACGTCACCA--AA-ATGT------ACTATTTAT-ATCAATATGTCAA-TGAA-GGTTTTA--A-A---TTACAATT-GTA-TTT-ACAAAAAGCCCTATTCCTAGTGGT-TTATATTCA-A-ACA------T----AAGTAAATTACCGACTAGCC--CTCACTAGAATATTGAAATTGAAA-AAAGGTAGATTTAGTAATATTCCAAGAAAAGAA-AGA-AAA--ATGTAAATTA-TGTGT-C------AGAGAA-CAT-TCAA-GTATGAAGT--ATTCA-TTTT--TA-T------TA------GT--TGTCGC-TTT-TTAT-AA---TGA-TTTGG-GGAAAA---CAGTATT-----------AA-A--AGA--AAT--ATT-ATTATAAACACCCCTCT-ACTTT-C--AA--GCTGTTGT-ACAATTATTA--TCAACT-T-G---GAA-TATTA--CCG-GAATT-AT------GTACT-TTTGGG----TAAATA-C-CT-----ATATAAA-TGTTC-------ATCT--A------G-TCAGA--------------------------------------TTAT-C-T-CA--GT-T---T--A----T--TG--TAAG--------ATA----T------ATC-C-----T-T--CA------------GT-ATATCC-T-G--C-CATG-TACATCA-TA-----T-G---A-T--AT----A---A--AG----A-T--T---CT-GA-T-A-T---T-TATT-T-C-A-T---G-TA-TTA-----------AAT-T--TGTT-------TGTA------T-AT-A-------C----T-T--T-A-T--ACCTTA-G--AA---C--T-G-------T-AT--G-GTTC-TTAATT--G---T-CAA-T-A-AACCAA-T--A-CAA
gi|10 : ggtaaatttcacaaaactcaaaatgttttttagcgccgcaatgtagaaaaagtttaagtagcttgtttaaccaaaaaagatttgcattgaatgttagcacacagttgtcactgtttgatacgtatatactaggaagtctagcaaattatgttgttgaagtttAGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GATTTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GATGT----TAAAAA----A---TC-CACAGC---TTCTATG--ATGATTT----ATTCAGAATT-AGG-TAG------ATTTC----CATTAG----AA-TTAG---AG----A----ACATTTAGAATGGTAAACTATTT---------TTTTTCAATCT--G-AGA--A-A--CACTGATA-ATTGGATTTT--ACGT---------------------------AATGTATGCACAGTGTCTTATAGAACCAAAT---T------T---T---A---A--ATG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATATAC----TGTT-CTCTGTT--G-GACTA--GG-ATAT-GTCTAGT--A------T-AAA---GATT------AT--GTTAG-T--GAAA-AACTGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAT-TAC-A-AAATGT----ACAAA-GGTTAAA--GA--TATATT--T------ATAC-----A----A----------AAC------A--TG-----TA-----TAGTTTCAAGAATTCTTCA--AA-GTGG------CGAAT--AT-ATAGATTCATT
gi|11 : agtattttagcaatgcaatgtaaaaagagtacgaatgttctgctgtctaaaatgaagtctttacacctgaatgtgttgacaaagttgaatttatttgacacatatgtgagtagtattgcatattatagctgtga----GAAAATCG-TT--CACTTT-GAATTT-TTTGTAAAAAAGTTTTATCGCTGT----TAAGAACGTCA---AC-TAT-GC---T-CTATGCCATGGTTT----ACAATGAATTTGGG-CGG------ACA-C----CACTAC----AT-GTGCTCAAG----A----A-GTAAAGAATATTGAAATA--T---------TGGTTAAAAAT--T-AAACAA-A--GACAAATACATTGTATTTT--AAGAACGTATTTA--T------TT--CAGGAAAC---TGTAGAAT---TTGT-GACTCAAAG---T------C---T---CTTTA--ATGGTTGGTATGA-CC-TATGTG--TAAGAGATTTAT----TATA-CTTCTTTAGG-GATTT--GG-ATAT-GTTTGGC--AATTCGTT-ACT---GATG------AT--ATAAACT--GAAA-AAACA-------------------------A-AT-TAT-CTG-A-A---GTACAAACAAA-GACTACA-GGAAGGGTGTTACT------ATAC-----A----A----------
gi|12 : ttacatttgaatgttagcaccacagttgtcactgttttgatacgtatagtagcagagtctttagcaaattatggttgtaagtttggctcacatctagcaaatgatttggGAATTG----GAAAGT-A-TT--CA-TCT-AGATTT-TT-GTAAACAAATTTTA--TCAGT----TAAAAA----A---AG-TACTGT---TTCCATG--ATAGTGT----ACTCGGAACT-AGG-ACGC-----ACTCC----TCTT-GTCTTAA-AT-----AG----G----AAATATAGAATGATTAAATA--C---------TGGTTGAAATT--G-AAA--A-A--ATCAGAAA-ATTGTATTTT--GGATA-GTATTTA--C------CA--T--GAAATGT---TAGAA-GT-TTGTA-ATTCAGAT---TTTTTCGC---T-----------TG-TTAGT-TG--TC-AGA-TG--TAAAGGATTTAT----TGTA-CTCCTTT--G-AATTT--GG-AAAG-GTATGGA--A------T-TCC---AATA------AT--ATCAA-C--GAAA-AGCAT-------------------------TTTT-TAC-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTGAA-TGA--TGTGTT--T------GTGC-----A----A----------GAATTGAATG--CG-----T------T--TTTTGATAATTCATCA--AA-ATGTAACTTACATGT--AT-ATAAATATGTAAA-TGAT-GGTTTTA--A-G---TTGCAATT-TTA-TTTAACAAAAG--CC-ATTCC-AA--ATACAGT--------ACAAT-ATAT----AAGCAAATgaacataaatagtgtcttcatcatgtgataaattccacaat
gi|13 : ATATTTTAATATACCT-GAATGTAAACCG-AAA--ATGTAA-TTGCTGT-TTCATA--TGGAG-AATAT--GAATG-ACGAA-T--A-TCA-TTTTTATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-AT-TGAA---AAA-CT----AGAAAA---TTGTACA-----------TTGG--GTA--AAT--ATT-ATTATG-AAAACCGTCA-ATGTA-T--AA--ATTAT--T-AAAGCTATTC--TATAAT-A-C---AAA-TACTA--GTG-TTA-TAAT------GTATG-TTT-GG----AAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCTAA----AACTTAA------A-TTAGA----GGGCC-CA----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-CA-----G----TAAAGTA----T------ATC-TATATAT-TA-CA-CCAC-------GCAATACTC-T-GTTT-CGTA-ATC-TTACAA---T-T-G---T-T--ATA---A---ATTGTA---A-T--TTA-TT-GG-T-G-T---T-T-TT-T-CTA-TT-AA-TGTTTA---------TTA---T--TG---------AATA------T-A--G--TTTC-T----T-T--A-A-T--AACCTA-T---A-G-C--A-G-------T-AT--T-G--CTTT--TT--G---G-AAA-TAA-AA-CAA-T--A-CAATAa
gi|14 : ggagacttaaaataagtataataccagtgtTTT-A-GTT------TA------GTAATATC-T-TTT-ATATGAACATAAA-------AGAAAA---TTACATG-----------TT-G--ATA--A-----TT-ATTATGAAAATCCGTCA-AAGTG-T--AA--ATTAA--T-ACG--TA--C--TCAAAT-A-C---ATA-TATCA--GTG-TTA-T-GT------GTAAT-TT--GG------AATT-T-TTTTTTCATATAAA-GCTTCT-A----AACTGAA------A-TCAGA----GATCA-CT----T-CA-TA----AG-G--ATG-TTTACCC-T-CAATATGT---TA-A----TA-AA--CATGTCC-T---GTA----T------ATTAT-----T-TG-AG---GC-------GC-ATGCTC-T-ATTT-AGTG-TTT-ACA-AATGGT-T-G---T-T--AT----A------------A-C--TTA-TT-GA-T-G-T---C---TT-T-C-A-T---A-T--TTA---------TT--T-TAATG-T-------AATA------T-AT-G--TTCT-T----T-G--T-AGT--ACAATA-C--AATA-C--A-G-------T-AT--
gi|15 : ctaaaggtaaatataaaattaatgcagatattttgcagtacattgtactagtaaacataaatgtttcgtaacatttagatttgatggaaaatacaaataaacacgtgtattttctcgtcattagatttaaccTTG----GAAAAT-G-TT--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAAAAAGATTCG--GGTGT----CAAGAG----G---TC-TACTAT---GTCTATG--ATGGTTT----ACAATGAATT-GGGACGG------AC-AC----CACT---------------------------ACATG-----TGCTAAG---------------------AAAGT--ATAGA--A-AGTTACAAATA-ATTATATTTT--AAAGA-GTATTTA--T------CA--G--GAAATGT---TACA-----------ACTCAAAT---T------CTTTT---A---A--TTG-TTGGT-TG--ACATA--TG--TAAAAGATTTAT----TAAA-TTCTTTA--G-GATTT--GG-AGAT-GAGTTGTTCA------T--AA---G--T------A-----CAA-T--TCCA-TACT---------------------------TCT-TAT-CTG-A-A---GTA-AAACAAA-GACTACA-GGA--TGTGTT--T------ATAC-----A----A----------
gi|16 : tttaaccaaaatgaaaaatttgcatttaaatgttagtacactgttgtcactgtttgatacgtttataggaagtctagcaatttatggtttggggctcacatccagcaaatgatcatgt-AAA--ATCTAA-TTG-CAT-T----A--TC-AG-A-TAA-TGAA-GGACGAA-TT-A-TCA-TTT--------------A------TC--TGTC-CATGT-ATATGAA---AAAACT--A-AGAAA----TT-TACA-----------TT-GTAATT--AATCGATT-ATGCTGAAAAAC-GTCC-AAGTAGTCGAAGTATTGT--T-ACAGCTATTC--TCGAAT-AGC---AAAATACTA--ATG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-G-----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-ACT-CT-A----A-CTTAA------A-TTAAA----GGCCA-CA----A-CA-TC----A--G--AG--TTTATC--T-CAATAT-T---T--AATGATA-TA--TA-A----T---ATA----TTAGGTAATC-T-----T--A-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TTA-AA---TGT-G---T-T--AA----A---ATTGTA---A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-T---CT-GA--G-TTA---------TTA---T--TG---------AATA------T-AT-G--TTCT-T----TAT--T-A-T--ATCCTA-TAAAA-G-C--A-G-------TAAT--TGG--C-TT--TT--G---GTAAA-T-A-AACCAA-T--ACCAATACg
gi|17 : agaAAATGT-T-TAGAA-GTTGTGTA-ATTCAGATATGT------T---T---A---CTTGTG-TCGGT-TC--TC-AGA-TGGATAAAACATTTAT----TGTCGCTCCTTA--GAGATTT--GG-ATA----CTATT--A------T-GGA----ATTCCAATAATCGATTAA-C--GAAA-GAGCA-------------------------TTTT-TACATAC-ACA---GTG-AAACAAACGGTTGAA-TGA--TGTGTT--TGCTGGCATAA-----ATTGGA----------AT-------G--CG-----T------TG-TTTTGATAATTCATCA--AAAGTAA------CTTAT--AT----GA-ATATGTGATAAT-G-ATGGGCTA-TAAGTTGCAA-T-TTA-TTA-ACAAAAAG-CCAATTTC-AA--ATACGATAT--G-T-ACAGTTATAT----AAGCAAATA-TCGCAT-GTCATCACA-TAAC---TAGAAGTTGAAACAAGGT-AGATATCATAATGT
gi|18 : ttacccatga-TCAT-GGATCAG--AAT---TTGCAACT-TTA-TTT-AAGAAAA--CCGATTCC-AG--ATTCAATAT--A-A-ACAAT-GTATTTATAAGTGAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGT---TGGAA-TTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-AAATGTAA-CCGTAAATTATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATAAT------TA------TT--T-TC-C-TGT-ATATGAA---AAA-----A-AAAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATATTTAT--ACTAAGTATGAAAAACCGTCA-AAGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCTAGT-A-C---AAA-TACTA--G------------------------TT-GG----TAAATT-TCTT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------AGTAAGA----GCCTA-CA----A-CATTA----AA-GTCGGG-TTTATgttcaaaaatgaagaatttg
gi|19 : A--ATGTAAATTA-TGT-T-CA------GAG-AACAT-TGAA-G-ATGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATTAGTACATG------TA--TGTC-C-TTT-TTAT-AA---TGA-TT--GTAGAAAA---CAGTATT-----------TA-A--AGA--AAT--ATT-ATTACAAACACCCCTCT-ACTTT-C--AA--GCTTG--T-ACAACTATTA--TCAACT-G-G---AAA-TATTACGGAA-TTA-T-A--------TAAA-CTT-GG----TAAATA-C-CT-----ATATAAATGTTTAT--------CT---------A-TCAGA------------------------------------------TC-T-CAG----T---T--A----CA-TG--TAT-----T---GTAAGATT------ATC-C-----T-TAGTA-TCA-------------ATCC-T-GTCCATGTA-TACATCA-AT---A-T-G---A-T--AT--------ATTAT----G-T--T---CT-GT-T-A-T---T-A-TT-T-C-A-TT-G--TA-TAA---------TTTGT-T--TG-T--------ATA------T-A----------C----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-AT--G-G--T-TC--AT--G---GTCAA-T-A-AA-CGA-T--A-CAATACA
gi|2 : AGTCTGGGATTA---AAT-CCAGCATAATGAATTG----GGAAGA-G-TATTCA-TCT-AGATTT----GTAAACAAATTTTATCAGTG------AAGAA------------GCAGTCTGTTCCATGGTATGGTGT----A-CCGTAACT-AGG-ACG------CCTCCTCTTCATCTT----AA-AT-----AG----G----AAATATAGAATAATTAAATA--C---------TTGTT-AAATT--G-AAA--A-A--
gi|21 : gattaagtgcatgagcaaaaagtatgatttaatctctgatgcccaatttggttttaaagctggatatagtacaagtgatgctatttttgttttacactggttaataacacggacacttgcaaaacgtaaacaccttttttgttgctttgtggattatcaaaaggctcttttgataagtatgatatgaaacatgctcatttttaaattatcgaaatatggaactttgactgtcaaatgttaaagtcaatgaaactctaatataaaaacatgtggtacgccactacttaaatcaatggtcagagttgctcaggatgttcgccgaggggttgatgcagggcgagtcactctcctcccattgttattttcgttccatataaattaccttttgaaatgaaattattggaagtcatcgtgtattatctgtaagaaattagagaaatagctttattttttcatcgatatgctttgagatgacactgttttattattccagacaacggaacacacaggtttacaaagatatgttaactgtttgactcaacttatgacatctacagtggaattgatacccggtaaacgagacaaaactaatgttttgctagtattcagaaaaaagttggtagattgaaacagaaactattttttggaaatataatatggaaaagctattgatgttgtgagacaatcgttaatttatctagtatccactttgaatttcaatggtaattcaattaaaacacaaagtgttcttaggcatcagcaatgtaaaaataggcttaagttgtacctgttaagctaaaaatcgaaaacatcttgcaacattaaatgtagtacaaagttgtcattgttcaatacttactattagtagtatagcaaattatggctcctgtgaTTG-TGT-G-CAAA--TAGAG-A-TAT-TGAT-G-GTCAA-TCGA-T--------ATATT------TA------TT--TGTC-A-TGA-GTTTGAG---AAA-AT--A-TGAAAA---TTGTATA-----------TT-GAAAAA--AAT--ATT-ACTATAAAAAAGCATGATGCGTG----AA--ACAA-----AAACCAATTCATTCACAT-G-T---AAA-TACAA--ATG-TGA-T-ATAAAAAAATAATGTTT-GGAACTTGAA-T-C-TC-----ATATGAA-GCTT-T-A----AAATTGAAATAGCA-TCAGA----TGCAATCA----A-CA-T-------------G-TTC------------T-T---T--A----TA-C---TAC-----C---GTA-----------A---T-----T-GA-----GAC-------AC-ATACTT-G-ATTA-TGTG-TTT-GCA-AA----------------AT----A---A-TGT---------TTA---------A-C---C-T-TT-------TT-GA-T--------------TTAAT-T--TA-T-------CA----------AT-G--TCTG-T----T-C--T-A-A--AATTTA-T--AA-G-C--A-A-------T-GC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--G-CAATACAaa
gi|24 : TACAAA-GCTTCT-A----AATGTAA------A-TTATG----GGCCA-CA----A-CA-TA----AGCG--GGG-TTTATCCTT-CAATAT-T---T--A----AA-TAATTATA----T---GTA----A------GTG-T-----T-T-----------------T-ATACTT-TCG--T-CGTAGTTC-TCA-AA-----T-G---TAT--AT----A---ATTGCTA--A-C--TTATTT-GGCT-GTT---C-T-TT-T-C-ATTT-GA-TG-TTATATATTGT-TTAATAT--TGTT-------AATA------TAAT-G--TTCT-T----T-T--T-A-T---TCCTA-T--AA-GCC--A-G-------T-GC--T-G--C-TT--TTA-G---G-AAA-T-A-AA-CAAGT--A-TAAT
gi|25 : tattcgtgccaaacgccactataaactatcaaatcttgatccagaatcttcacttgacttagtacagt-ATGAA-T--A-TCAATGTT-ATATC------TA------GTA-TGTC-C-TTTTATATAAT---GAT-TT--GTAGAAAA---CAGTATT-----------TA-A--AGA--AAT--ATT-ATTA--AAACACCCTCA-t
gi|26 : AA---AAA-----A-AGAAAA---CAGTATT-----------TA-A--ACA--AAT--ATT-ATTATAAACACCCCTAT-ACTTT-C--AA--GCTTG--T-ACAACTACTA--TCAATTAA-CTGGAAA-CATTACGGAA-T---T-AT------GTAAA-CTT-GG----TAAATA-C-CT-----ATATAAA-TGTTC-------ATCT---------A-TCAGA------TCT-CA----G-T--TATTGTAA-G--A----TTATCC-T-CAGTAT-C---T--A----T------CCTG----T---CCA----T------G-----------TA-CA-TCA-----------ATA----T-GAT---ATA-TT----A--------T-G---T-T--AT----G-----------------TTA-TT-A--------------TT-T-C-A-TT-G------TA---------TAAGT-C--AG-T--------ATA------T-A----------C----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-AT--G-G--T-TC--TT--G---GTCAA-T-A-AA-CAA-T--A-ctttcaagcttttaataatattacggaattggtaaatacctatataaatgtcatctatcagttctcagttatgtacattatcctcatgcatctatttcctgttccaatgctcatcatgaatatataatgttcttgttatttattcattgtataatctatttgtatactactgtatacctatgaactgtatgttcttggtcaataaaacaataca
gi|29 : aaataataaagaaaTACAAA-GCT-CT-A----AATGTAA------A-TTAGG----GGCCA-CA------CA-AA----GC-G--AGGGTTTATCC-TTCAATAT-TAAAT--A----TAATA--TATA----T---GTAA---T------GTT-T-----TATA-CA-TTTC-------G--------------T-CGTAATTC-TCA-AA---A-TAG---TAT--AT----A---ATTGTTCACA-CA-TTA-TTTGG-C-G-TGTTC-T-TT-T-C-A-TTTGA-TG-TTAAATATATTGTTAATAT--TG-TT------AATA------T-AT-G--CTTC-T----T-TCTT-A-T---TCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-GC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-TAATACA
gi|3 : tagtacatgtAGAGTGGGGTTTCAGTATCTCTGC-AACAGAATTA----TAAAGT-G-TA--CA-TTT-GGATTT-TT-GCAAGAAAGTTCTA--CATGT----TAAAAA----ATCTATGTACATT---TTCGATG--ATGATTT----ATTCAGAATT-AGG-TAC------ATTTC----CATTAG----AA-TT-----AG----AGAGAACATTTAGAATGGTAAAATA--TAATGTTTTTTTTTTCAAACT--G-AGA--A-A--CACTGATA-ACTGTATTTT--ACGTG-ATATACA--TGTGCATTT--A--GAAATGTGTAAAGGATGTCTTGTGGAATCAAAT---A------C---C---A---A--ATG-TTGGT-TA--TG-TAG-TG--TAAGGAATATGT----TGTT-TTCTCTT--G-ATTTA--GG-GTAT-GTTTGGT--A------C-GAA---AA-C------ATC-GTTAA-T--GAAA-ACCCG-------------------------GTGT-TAT-TGC-A-A---GTA-AAACGAC-GGGTAAG-GGA--TATATA--T------ATACCAAAAA----A----------A--------A--TG----------------ATCGCTA--------------TGT------CGTAT--GT-ATATGTATATTTA-CCAT-GGGTTGG--A-T---CTGCAACT-TTA-TTT-AGGAAAC--CCACGTCC-AT--GT-CAATAT--ATATACAGT-GCAT----TAGTAAATT-TAGATT-GTCCTCTCATAAGC---TGGAAATCGAAG-GAGGa
gi|31 : acacgtaaatgattttgcgatggtgtttattaaaacattatgtgttccagctgaggttagagatattgctttatttctaatatcatgtaccccctatttttttaaatatttatttcagtattgctaatgatactgtacttttttcagatacagcagatggtttacaaaatatgttggacgcattgtagttacatcccaaaattgaaacacagtgttaaaagtgttggttttagaagtcgtaaactgaaaaactgtcatacatggtgttatgatgatgtacctctagatgtcatgtggtagaaaatatgaactagttaggaatcctgttccgttttaatgataaatttaataaagcataaaatgttttagctatgcaatgtagatctagaaagagtatgaatgctctgttagctacaacgaagttctaacacttaattatctcaacaaagtatctgacacacatgtgagtagtattgccacttatacttgtgaTA-T-GT------GTAAT-TTT-GG----GAAATC-T-T-------------------T-A----AACTGAA------A-TCAGT----GGTCA-CA----A-CG-TG----AA-G--AGG-TTTATCG-T-CAACATAT---C--A-----A-T---TATG----C---ATG----T-------TC-T-----T-GA-TA-TCA---------------TC-C--TTT-CATG-TTT-ACA-AA---T-T-G---T-A--AT----A---AT--A----A-T--TCA-TT-AA-T-G-T---C-T-TTCT-C-A--T-AA-TT-TCA----------TAAT-TACTG-T-------AATA------T-AC-G--TT---C----T-T--T-G-T--ACCATA-A--AA-G-C--A-GTACTGGCT-AC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAAT
gi|33 : catgA----GAAAGT-T-CA--CA-TT--AAATTT-T----AAGAATATATTG--GGTGTAAAATAGAAA----A---A---ACATG---TACAAT---ATGGTTT----ATTTGAAATT---G-AAG------A
gi|36 : agttaaataatcattgtttttaatgcagaaacaaaattgtcggtttttaaaacgtatgttgaagtatattatcatacggatctgaaataggggatttcataaagccccagatgttgT-ATCTGAA---AAA--T--A-A-AAGT---TTGTATAATATATGATAATT----ATA--AAT--ATT-ATTATAAACACCCCTCT-ACTTT-C--AA--GCTTG--T-ACAACTATTA--TCAACT-G-G---AAA-TATTACGGAA-T---T-AT------GTAAA-CTT-GG----TAAATA-C-CT-----ATATAAA-TGTTC-------ATCT---------A-TCAGAACTCGGTTA-T-------TG-T-----AA-G--A----TTATCC-T-CAGTtac
gi|37 : ttaaattggtG-AAA--ATGTAAATTA-TGT-T-CA------GAG-AATAT-TGAA-G-ATGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------AA------TA--TGTC-C-TTT-TTAT-AG---TGA-TT--GTAGAAAA---CAGTAT
gi|4 : atttagtaatattccaagaaaagaaaAGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAATAATTATCTAGAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAATAAAGTCTTG--GGTGT----T--AAA----A---ATCCACAGC---TTCGATG--ATGATTT----ATTCCGAATT-AGG-TAC------ATTTC----CATTAG----AA-TT-----AGAGACA----ACATGTAAAATGGTAAttaagcttctccaactatttaatatcaactggaaatattacggaattatgtaaacttggtaaatacc
gi|40 : tgtgtaaatggtctgaaaattatgacatcatatcaaatgctcagtttggtttttaaaaaggatataataccaccgatgccatatttatattacagtatttaattaacaggaatataatgaaaggaaagaaactttattgttgttttgtaaattatcaaaagggcgttcgattcggtaaatagaggtatgttgttttgcaaaatatctcaatgtggtatagattgtaaaattatgaatatcattcgttcaatgtatgtaaatgttaagtcttgtgtaaaatataaatcacaattgtcagaatatttctcttgtaatcagggtttaatgcaaggaaaatcattgtctccaattttattttcgttatatgtgaatgattttgaaatggagtttataaaaaaaaaaaaacgtgtgttccaattgaggttcgagatatcgctctatttcttataatgtatgctgatgatattgtacttttctcggatacagcagaaggtttacaaaacatgttgaacactctatgtagttacacctcgaaatggaaacttaatgttaatactgaataaacaaaaattgttgtttttagaaaaggtcgtaaactaaaaaaattatacatggtgtctttagatgtggtagataactttaactacataggagtcacgtttaatatcaatggcaaattaaataaagcacaaagtattttagcaatgcaacgtaaaaagagtatttaaaaagagtatgaatgttctgctatctaaaatgaagtctttattcctgaatgtgttgacaaagttgaatttatttggcacatatgtgagtagcattgcatattatagctgtgaACTC-T-GTTT-CGTA-ATC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGTA---A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TT
gi|40 : -C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-C--A-CAATttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtattgcttttggaaataaacaacacaat
gi|41 : actctgtttcgtaatctcaaattgttataattgtaacttattggtgtcttttcattgatgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn------ATA-T-----T-TA-AA-TCTC-------GC-ATACT--T-GTTT-CGTA-ATC-TTA-AA---T-T-G---T-T--AT----AAACATTGT----A-A--TTA-TTAGG-TAG-T---TAT-TT-T-C-ATTT-GAGTA-TTA----------TACT-C--CA-CAAAGATAAATA------T-AT-G--GTTT-T----T-TA-T-A-T--ACACTA-C--TA-G-C----G-------C-AT--T-G--CTTT--TT--A---G-AAA-T-A-CA-CAA-T--A-
gi|42 : GGTTC---TATTCCT-C-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-Taca
gi|45 : aaattcaatgtacagtattttacaatgcaatgtaaagaaagtatgaattttctgtttctttacacctgaatgtgtgacaaagtgaattatttaacatatggtgagagtattgcatattatagtgaatt-----T-TA-CA-AAAC-------GC-ATCCTCCT-GTTT-CGTA-T-C-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGTA---A-C--TTA--G-GG-T-G-T---C-T-TT-T---G-TT-GA-TGTTTA---------TTA---T--TG-T-------AA-A------T-AT-G--TTTT-C----T-T--T-T-T--GTCCTA-T--AA-G-CAGA-G-------T-AG--T-G----TT--TT--GGGAG-AAA-T-A-CA-CGATT--A-CAATGC
gi|47 : CTC-T-ATTT-CGTA-CTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--ATTTAAA---ATTCT----AAC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-CG-TTA---------ATA---T--TG-T-------AATACATGTAT-AT-G--TTTCAT----T-T--T-G-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CA
gi|5 : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGT-TAAAGAATTA----GAATGT-G-TA--CA-TTT-GAAGTT-TT-GTAAGAAA-TCTTG--GGTGT----TAAAAA----A---AT-CACAAC---TTCGATA--TTGATGT----ATTCAGAATT-AAG-TAG------ATTTC----CATTAG----AA-TT-----AG----A----ACATTTAGAATGGTAAAATA--T---------TTTTTCAAAAT--G-AGA--A-A--CACTGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-ATATATA--T------TC--C--GAAATGTATGCACAATGTCTTTTAGAACCAAAT---T------C---C---A---A--ATG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATATAC----TGTC-CTCTGTT--G-GACTA--GG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---GATT------AT--GTTAA-T--GAAA-AACTG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---ATG-CGACAAA-TGTTAAA-GGA--TGTATT--C------ATAC-----A----A----------A--------G--TG-----T------T--CTTCAAGTGTTATTCA--AA-GTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCAG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTA-ACGAAAG--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCACCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGA-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAC-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGGAAA---TTGTATA-----------TA-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCA-ATGTA-T--AA--ATTAC--T-ACATCTATTC--TCTAAT-A-C---AAA-TACTC--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-CA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GT-ATACTC-T-GTTT-TGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTCGT----T-T--T-G-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-T--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-AAATACAt
gi|50 : -TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----AAC--TTA-AT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-T-G-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--TTG-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AG--T-G--T-TT--TT--G---G-AAA-T-A-CA-CAT-T--A-CAAT
gi|51 : ATCC-T-CAACAT-G---CCAA----TA-AA--CATG----T------------------TC-T-----T-TG-TA-TTATTTGAGAAGG-ATGCTC-T-CTTT-CTTG-TTC-ACA-AA---T-T-GATTT-T--AT----A------------A-C--TTA-GT-GA-T-G-T---A-T-TT-TGT-A-TT-TA-TG-TAA---------TTAAg
gi|52 : ATTA--GTG-TAA-T-GT------GCAAT-TTT-GG-----AAATTGT-TT-----ATATAAA-GCTTCC-A----ATATGAA------A-TCAGA----GACCA-CATCTGATCA-TA----AA-G--AGG-T
gi|53 : TTGT----A-A--TTG-AT-GG-T-G-T---C-T-TG---C-A-TT-AA-A---TA---------TTTAT-T--TG-T-------AATG------T-AT-G--TTTT-C----T-T--T-A-TTTGTTCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AG--T-G--C-TT--TT--T---G-AAATT-ATAA-CAA-CTAA-CAATACAacttttgaaaacattacacatataattta
gi|55 : ---T-T--AT----A---ATTGT----AAC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------T--AT-T---G-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-G-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AC--T-A--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACata
gi|57 : ---ATTGT----AAT--TTA-TT-GG-T-G-T---T-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATAt
gi|58 : --TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--CTTC-T----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATAC
gi|59 : catataA-T-GT------ATAAT-TTG-GG----GGAAAT-G-TT-----GTATAAA-GCTTCT-AGCTGAACTGAA------A-TCGGA----GGCCA-CA----T-AA-TA----AA-G--AGG-T
gi|6 : gccT-G-TA--CA-TT--GAATTT-TT-GTAAGAAAGGTTTT--GGCGT----TAAAAA----A----T-TACAGC---TT-GATG--ATGATTT----ATTCAGAATT-AGG-TAG------A-TTC----CATTAA----AAATT-----AG----AGAGAACATTTAGATTAGTAAAGTT--T---------TTTTTCAA-CT--G-AGA--A-A--CACTGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-ATATATATTT------TC--T--G-AATGTATGT-CAATGTCTTTTAGAACCAAAT---T------C---T---A---A--ATG-TTGTT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATATTC----TGT--CTCTGCT--G-GACTA--GG-AT-T-GT-TGGT--A------T-GAA---GATT------AT---TTAA-T--G--A-AACTG-------------------------GTTT-T-T-TAC-A-A----TG-CGAC-AA-GGT---A-AGA--TAT-TT--T------ATAC-----A----A----------C--------A--TGTTAGTT------T--TTTCAATAGTTCTTCA--AA-GTGT-------GTA---AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GG-TCAG--A-T---TTGCAACT-TTA-----A-GAAAA--ACAATT-C-AG---T-CAA-AT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAA---TAAATT-G---TTTCAT--------------------------AGATATTTTAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAA-TG-TGT-T-CATAATTAG-G-A-TATGTGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTAT-AT-TT------TAATATATTT--TGTCAC-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTACA-----------TT-G--ATA--AA---ATT-ATTATGATAAA-CGTC--ATGTA-T--AA--ATTAT--TAACAG-TATT---TCTAAT-A-C---AAA-ATCT---GTGTTTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------T-T--GA----GGCCA--A----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--------------------------------T-----T-TA-CATTCA--------GC--TACTC-T-GTTT-CGTA-AT--TTA-AA---T-T-G---T-TTAAT----A---ATTGT----A-CTTTTA-TT-GG-T---T---A-T-TT-T---A-TT-GA-TG-TT----------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-A-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACacatgtacatgtatat
gi|60 : ac-TT-T-C-A-TT-G--TA-TAA---------TTTGT-T--TG-T-------A-TA------T-AC--------------T-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-ATA-T-G--G-TTC-TT--G---GTCAA-T-A-AA-CAA-T--A-
gi|62 : tattatgttctgttatta--TG-T-------GATA------T-AT-AATTTTC-TGTACT-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-AT--G-G--T-TC--TT--G---GTCAA-T-C-AA-CAA-T--A-CAAT
gi|64 : tgtacgtcaa-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C--T--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATAC
gi|65 : gtgacgattaacgtataactggtacg-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TTTGG---A-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
gi|68 : taacgtataactggttacg---------TTAAT-----G-T-------AATA------G-ATAG--TCTT-T----G-T--A-A-C--ATATTA-T--AA-G-C--A-G-------C-AC--T-A--C-TT--TT--G---G-GAA-T-A-AA-a
gi|69 : gt-G--TTTC-T----T-T--TTG-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-TA-CAA-T--A-CAA
gi|7 : aagagT--G-AGA--A-A--CACTGATA-ACTGTATTTT--ACGTA-ATATATA--T------TC--T--GAAATGTACACACAATGTCTT----------------------C---T---A---A--ACG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAAGGATACATATGTTGTT-CTCTGTT--G-GACTATAGG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---AATT------AT--GTTAA-T--GAAA-A-CTG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---ATG-GA-CAAA-GGTTAAA-AGA--TATATT--T------ATAC-----A----A----------A--------ACATG-----TATAGTTT--TTTCAATAGTTCTTCACAAA-GTGT------CGTAT--ATTATAGATATATTAG-TCAT-GGATCAG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTT-AAGGAAA--CCGATTCG-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATAAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGGTATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-GAA--ATGTAAATGG-TGT-T-CACA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-AAGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AAAAAAAACCTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATG-AAAACCGTCA-ATGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTACTC--TCTAAT-A-T---AAA-TACTA--GTG-CTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TTAGA----GGCCA-CA----A-CA-TG----AA-G--AGG-TTTAACC-T-CAATAT-T---T--A----CA-TA--CATGTATAT---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCGC-------GC-ATACTC-T-GTTT-TGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----ATATATTGTA---A-C--TCATTT-AG-T-G-T---C---TT-T-C-ATTT-GA-TG-TTA---------CATAT-T--GG-T-------AATA------T-AT-G--TTCT-T----T-G--T-A-T---CCCTATT--AA-G-C--ACG-------T-AC--T-G--C-TT--TT--C---G-GAA-T-A-AA-CAATT--A-CAATA
gi|70 : -CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCT-T-CAAT
gi|71 : t--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-ATACT-G--C-TT--TT--G---G-AAAAT-A-GC-CAA-T--A-CAATACAtgttaatgaattatctgagtcgtatgctctatt
gi|72 : taCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-TT--T-G--C-TT--TTG-G---G-AAA-T-T-AA-TCA-T--A-CAATACA
gi|73 : aaCCTA-T--AA-G-G--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--T---G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-TCATACata
gi|74 : tcaaTGT------CGTAC--GT-TTAGGTATATTTA-CCATGGGGTCGG--A-T---TTGCAga
gi|9 : TTTG-TCAT-GG-TCAG--A-T---TTGCAACTATTACTTT-AAGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GTATTTATAAGTGAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGT---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-AAATGTAA-CCGTAAATTATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATAAT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CA--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--TAT--ACT-AATATGAAAAACCGTCA-AAGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCTAGT-A-C---AAA-TACTA--G------------------------TT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------AGTAAGA----GGCCA-CA----A-CA-TA----AA-G--GGG-TT
gi|9 : -----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTT--CGTA-T-C-TCA-AA---T-T-G---T-TT-AT----A---ATTGT----AAC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-AA-TA-TTA---------TT--------G-T-------AATG------T-AT-G--TTTC-T----T-T--TTG-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatcacgcatactctgttcgtatctcaaattgtttataattgtaacttattggtgtcttttcattaatattattgtaatgtatgtttctttttgtatcctataagcagtattgcttttggaaataaacaatacaatac
blockSeqs : CAGT T AT TCTA C . ATT C . . T TC AAAA CGTCAAC AGTCTG T CC . T A T ACG C T T TCTT ACATGTGCTCAAGA C T TAATGTTTTT TT C C . T CA . GT T C . C AAC T TGTGCATTTA ATG C T C A AG A ATGTTTACTTG G A A A TG GA A ATGT CG G AG A ATA . . C TC TGGAATTCCAATAATCGA C . . TGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN T A . C AAT AC C G AG A TGCTGGC AAGAATTGAATGCGTT A T CA A AACTTA . T A G T T CT A AAG A C A C G A . . A ATAT T TTAT . . A T C G C . . A T TT C . T TAAT . A G T G . CG . A T AGTACA ATATAT AA A A T G CAT ACTA AAC ATATATGATAATT TT CG A AT T AGTCG GT T A G CAT T A CTGG A CGGAATT . A AAAAAA TG . AACTT G C TTTTC T A GCTG T AATAGC G ACTC T TCTGAT T ATTGT GC TC G T T G AAA CA ATGATATATAATATATTAGGTAATCTTACATCACGC C C A G A C TGGT A ATT A TA TTAAA TCACACA T T C A T GTT A . C G T T T G GT AATATATTGTTAATA AA T AAAGATA CATGTA A A AT CA GTAC A CT T G TT A T AA T C AG C TACTGGC A AC G . T C TG GGA T T A T C G TA C
blockSeqs : T C T . . . A . . . . TC . ATCTATG AGC T GT . A T . TA . C C . AAAAATTAGAGAGA A A TTT GG A A . . . . . A . . A TA T TTTCAG GTA G T T G GG C TCTCTTTAA . . . . C . T . T T . . A . . T . ATTCGTTACTGATGATA . . . CAA . . . . . G . T . G ACT AAAACATGTATAGTTT A A . . . . . . . A G . . . . . . C . G . . A GT . TTAT . . A T T A . . . . T TT . . . TA . A . . . . T . . . . . A . . . G . TTGT . TTGTA . . . A A AT . A . G C A . GC . CGGAAT . . . G . A . . . . . . G . G . . A . A A . . . . A . A TACAGTAAAGTATATCTATATATTACACCACGCA . . . A . . TG . . A T AAAC TAAC T A . . . . . . . . . T . . GT TATATTGTTTAATA AC . T . . . . CG . . A T . . C . . . . . . . . A . . T . A . T A . . . T . .
blockSeqs : A T A . . . T . . . . . . AATC TGT C . . T G . CG . C A . AGAATTAGAGAGA C A T GG G T . . . . . A . . G GA T TTTTCT ATG G T C G AG T TTTTTCGCT . . . . A . T . A T . . T . . A . TAAAGATTATG . . . ATT . . . . . A . G . G T ATTGGAATGCGTTG A A . . . . . . . A A . . . . . . A . A . . T AA . . . . C A C A . . . . . . . . . TA . A . . . . . . . . . . . . . . G . TTGT . TTGAA . . . A A GT . T . G C G . C . CGGAAT . . . T . T . . . . . . T . . . . T . A G . . . . . . . CATACATGTATATGTATATCTTTACATCGCGC . . . . . . T . . . . ATAT ACTT . . . . . . . . . . . T . . G TTTGT . . . . . . . C . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . G . T . . . . T . .
blockSeqs : T T T . . . T . . . . . . ATC TAT T . . A T . AC . C C . AGAATTAGAGACA A G C TG C G . . . . . A . . A TG A CCAT ATG C T C G AG C TCTTTTAAT . . . . A . T . A T . . T . . G . TTCCAATAATA . . . CAT . . . . . G . T . G T AAAACATGTATAG G T . . . . . . . G G . . . . . . G . G . . . AA . . . . A T C A . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . G . TTGT . TTGG . . . C A AT . T . A C T . C . GTGTTT . . . T . T . . . . . . T . . . . A . C A . . . . . . . TAAACATGTCCTGTATATTATTTGAGGCGC . . . . . . A . . . . AA AAT . . . . . . . . . . . . . . A TTAAT . . . . . . . T . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : T T T . . . T . . . . . . AAG ATT C . . C G . AC . C T . GTCTTAAATAGG C A C TT C T . . . . . T . . C TA A TCAG ACA G T C G G T TTTAAA . . . . G . T . A T . . T . . C . CGAAAACATCG . . . CGG . . . . . A . G . G T AACATGTTAGTTT G T . . . . . . . A A . . . . . . C . A . . . AA . . . . A A C A . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . G . ATA . TTG . . . A C TC . G . C C A . C . GTGTT . . . A . T . . . . . . T . . . . A . A A . . . . . . . TAATATATATGTAATGTTTTATACATTTCG . . . . . . A . . . . A AAC . . . . . . . . . . . . . . G TAAGT . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : T . T . . . A . . . . . . GTC ATG G . . T A . TA . T T . AGAATTAGAGA C T T TT C C . . . . . T . . C TA A TTCC TG G T C T A A ACCAAA . . . . C . A . T C . . T . . T . TGAAGATTATG . . . TGG . . . . . G . G . A T CAAAAAAAATG G T . . . . . . . A A . . . . . . A . G . . . AA . . . . A T T . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . A . CTA . TTG . . . T C TC . G . A A A . G . GTGTT . . . A . T . . . . . . T . . . . A . A C . . . . . . . TAAACATGTTCTTTGTATTATTTGAGAAGG . . . . . . T . . . . A AAC . . . . . . . . . . . . . . G TTAAT . . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . AAT AGC A . . T G . AA . T T . TTAAATAGG C G T TT . A . . . . . T . . C TA A TTCT T C . . T A A TCCAAA . . . . C . A . C G . . A . . C . TGAAAATTATG . . . TGG . . . . . G . A . A C AAAGTGTT . . . . . . . . . G A . . . . . . A . G . . . AA . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . G . CTA . TAA . . . A C TC . G . A A A . T . ATGTT . . . T . G . . . . . . T . . . . A . A A . . . . . . . CATGTATTGTAAGATTATCCTTAGTATCA . . . . . . T . . . . A AAC . . . . . . . . . . . . . . T TTTAT . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . AA AAC G . . T C . TA . T T . AGAATTAGA C T . . . C . . . . . T . . C T . . . C . . . . A TCTAAA . . . . C . A . T G . . A . . C . TGAAGATTAT . . . TGG . . . . . G . A . A T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . G . CTA . TAA . . . T C AT . C . T A A . G . ATGTG . . . A . T . . . . . . G . . . . G . G A . . . . . . . TATATATGTGTATATCTTTACATCACGT . . . . . . T . . . . A AAC . . . . . . . . . . . . . . G TTTGT . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . AT AGC G . . T A . TA . . . . . . T . . . . . . C . . . . . CTAAA . . . . . . A . . G . . A . . . . TAAGTA . . . T . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . CAA . TAA . . . T T AT . T . G C T . C . GTGTT . . . T . T . . . . . . T . . . . A . A A . . . . . . . AATAATTATATGTAAGTGTTTT . . . . . . T . . . . G AAC . . . . . . . . . . . . . . A TTAAT . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . GC G . . T A . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . CT . TAG . . . A T AT . T . G C T . C . GTGTA . . . T . G . . . . . . G . . . . A . A A . . . . . . . ATTATGCATGTTCTTGATATCA . . . . . . T . . . . A AAC . . . . . . . . . . . . . . G CATAT . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . TA . TTG . . . A T AT . T . G C T . T . GTGCT . . . T . T . . . . . . G . . . . T . A A . . . . . . . TACTACCGTAATTGAGACAC . . . . . . T . . . . A AAT . . . . . . . . . . . . . . G TAAT . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . TTG . . . A A G . . . . . T . C . G . . . T . T . . . . . . T . . . . A . A A . . . . . . . TCCTGTCCATGTACATCA . . . . . . T . . . . A AAC . . . . . . . . . . . . . . G TACT . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . TTG . . . . G . . . T . T . . . . . . T . . . . A . G A . . . . . . . TATATTTACATTCAGC . . . . . . T . . . . A AAC . . . . . . . . . . . . . . G TTA . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . A A . . . . . . . . . . T . . . . A AC . . . . . . . . . . . . . . G TTT . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . T . . . . A GT . . . . . . . . . . . . . . G TTA . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A AT . . . . . . . . . . . . . . G TTA . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A AA . . . . . . . . . . . . . . G ATA . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A AC . . . . . . . . . . . . . . A TTA . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A AC . . . . . . . . . . . . . . G TAT . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . A TTA . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . TTA . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . TTA . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : T*** T* **** ****** AGAATTAGAGAGA************** ** ** TA* TTNT************ ATG AG TCTAAA******************** ** C* TGAAAATTATG****************** ** CGG************************* G* T******** AAAAATGTATAGTT************************************ ** ** ** AA**** C*** TA** CTA**** T** A***** A**** A* T**** AAC****** C* ** **
originalCons : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GGTGT----TAAAAA----A---AT-TACAGC---TTCNATG--ATGGTTT----ATTCGGAATT-AGG-NAG------ACTTC----CATTAG----AA-TT-----AG----A----ACATNTAGAATGGTAAAATA--T---------TTNTTCAAANT--G-AGA--A-A--CACNGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-GTATNTA--T------TC--C--GAAATGTATGTACAATGTCTTGTAGANTCAAAT---T------C---T---A---A--ATG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATNTAT----TGTN-CTCTNTT--G-GATTN--GG-ATAT-GTCTGGT--A------T-GAA---GATT------AT--GTTAA-T--GAAA-AACCG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTAAA-GGA--TGTGTT--T------ATAC-----A----A----------A--------G--TG-----T------T--TTTCGATAGTTCNTCA--AA-GTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCGG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTT-ACGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCA-ACGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCNAAT-A-C---AAA-TACTA--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TCA-AA---T-T-G---T-T--AT----A---ATTGT----A-C--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
finalCons : AGTGTGGGGTTCT---ATTCCTGCT-AAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GGTGT----TAAAAA----A---AT-TACAGC---TTCNATG--ATGGTTT----ATTCGGAATT-AGG-NAG------ACTTC----CATTAGAATTAGAGAGA--------------ACATNTAGAATGGTAAAATA--T---------TTNTTCAAANT--G-AGA--A-A--CACNGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-GTATNTATTNT------------GAAATGTATGTACAATGTCTTGTAGANTCAAATTCTAAA--------------------TG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATNTAT----TGTN-CTCTNTT--G-GATTN--GG-ATAT-GTCTGGT--ATGAAAATTATG------------------TTAA-T--GAAA-AACCGG-------------------------TTT-TAT-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTAAAG-GA--TGTGTTT--------ATACAAAAATGTATAGTT------------------------------------TTTCGATAGTTCNTCA--AA-GTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCGG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTT-ACGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATATAA----ACAAT-GCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAACTA----AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCA-ACGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCNAAT-A-C---AAA-TACTA--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CAA-----CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TCA-AAT----T-G---T-T--AT----A---ATTGTAAC------TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
26 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): AAGAAATTATATTGTTGCTTCGTAGATTATCAAAAAGCTTTTGATAAAATAGACAAAACTATGCTATTTTTTCAAATTAGCAAAACATGGTATTGATTGTCAAATGTTACAAATTATCAAGTCTATGTACTCTAATATTAAATCATGTGTAATACACAAAAATCTGTCAATTGTAATGAGGGTTTGATGCAAGGGGAATCACTCTCACCATTTCTTTTCTCTCTGTATGAGAATGATTGAGATGGAATTCATTGAAAAAATGTGTATCCCAATTGAAATAAAAGAAATTGTTTTCATGTTAATTATATATGTTGATGATACGGAACTTTTTCAGAGACAAAACAAGGTTTACAAGATATGTTGAATTGTTTACAAGATTATACCTCAAAGTGGAATATAAAACTTAAAAGTCAATTTGGATAAAACAAAGATAGTTGTTTTTAGAAAAGGTGGGAAATAAAAAATAATAATTGTTGGAAGTATGACAACACGTTGGTTAGCATTGAAGAAAATTTCAATTATTTGGGTATAATATTAAATTATAAAGGAAAATTTCCCAAAACACAAAATGCTTTAGCAGCGCAATATATGTAGAAAAGGTTT
Unaligned ( gi|20 ): TGATTTTATATTGGTCAGAAACCAGAAGTCAAAACACTATTTTGTTGCTTTCTACATCATCACTAAACTTTATGGAGTTTTTTAAGTCACCGAATTTGATCGTCAAATATCTAATGTTATAATATGAATGTATGCTCATATAAAACTTGCGTACCGACAAAAACATACGCTGTCAGAGCTTTTGGGATGCCGAGAGGCTTGATCAAAAGGAATCACTCTCCTCATTCTTATTTACTTTTCATATAAATGATTTTGAACTGGAATATATTGAAAGCATGTGTATACCTGTAAAAATAGGTAAGTTGCTTTATTTTCCATCATATATGCATATGATATTGTGGTTTTCTGAGACGGAACGAAGTTAGCAAGGTA
Unaligned ( gi|22 ): ACAAAAATGATATGGAAATGAGGGCTTAGTGCAGAACTAGTTTTCGGTGTCTTTTCTCTGCATATGGTATTCAATAGAAATGCATGCGTATACCTGTAGAAATAAGAGACACTGTGTTCCTCTTGGTATCGTATGCAGACGATACAGTATTTTTTTTTCAGAGACAGAACAAAAGGTCTAAAAGACATCAATATACACAGCAACGTTTGGTATAAAGGGTGATGTAGATAAAATTTAAATAATTGTACTTTGAAATTATGGTAAATTGAAGGAAAATCACTGTTTGAAGTATAAATATGAGTAAATTGATATTGTGGAAAATGTCAATTGCCTATGCTTAATTTTAAATTTATAAGTAAATTC
Unaligned ( gi|23 ): TCCTTCTTATGTACGCTGATGATATGGTTTTGTTATCTGATAGCGTTTGAGGGTCTACAGAGATGTTAAATACTCTATCTAATTACACGAAAAGAATGGGATTGAATGTTAATGTACAGAAAACAAAAATAATGAATATTAGAAATGGCAGTAAAGTTAAGGACAAACGAAAAAAAATGGTATTATAATGATGATTTCTTTTGGATAAGTAAATGAATTTAATTTTAGGCATACTTATGTGCTACAATGGTAAATTTTGAAAACACAAAGACACTCGCAAATCAAATCAAGTGGTTAGAAAGCTTTATTTGCAATTAAT
Unaligned ( gi|27 ): AAAAGGCGTTCGACTTGGTAAATGGAGGTATGTTGTTTTACAAGCTATCTCAATGTGGTATAGATTGTAAAATTATGAATATCATTCGTTCAATGTATGCAAATTTTAAGTCTTGTGTAAAGTATAAATCACAATTGCCAGAATATTTCTCTTGTAAATAAGGTTTAATGCGAGGAGAATCATTGTCACCAATTTTATTTTCGTTATATGTGAATGATTTTGAAATGGAGTTTATAAAAAAACTTGTGTGTTCTACGGTAATTGAGGT
Unaligned ( gi|28 ): CATGAGATTACTGTAACTTTTCTCGGATACACTAGAAAGGTTGTACAAAACATTTGAGCACTCTATTAGTTACACCTCGAAATGGAAACTTAATGTCATACTTGGAAAAAACAAAAAATGGTTGTTTTTTAGAAAAGGTGGTAAACTAAAAAATTGTTTATATACATGTGTAATGATAATGGTACCTGTTAGATGTGGTAGAGTAACTTTAACTACTTCATGGAGTCACGTTTTAATTTCCCATGGCAATTAATCAAAGCACAAAGTA
Unaligned ( gi|30 ): AAAGTTATATTGTTGTTTTGTAGACTTCCAGAAGGCTTTTGATTCAATTGATAGATCTGAATTGTGGTGTAAAATAGTTAATGACGGTATACAGCGGAAGATGTTCAATGCTTTAAGTTATTGTATAATAATGTTCAAAGCTGTGTGAAGTATGCCGGTTTTTTAGTGATTATTTTTGCAATGATACAGGTCTAATGCAGGGTGAAACTTTGTCACTTATTTCATTTTCGTTATATATACTC
Unaligned ( gi|32 ): TATTACGAATAAAGTTATAAACCCGATACGCAAGCCCTATAGATACCCGTTAAAGGTGTTGCATTTATAAAGTATCTCAGTTATGTGTAAAGATTGTCTACCTCAGTATCTAACGGTCCTGTCTATGCCTTTGATTGCATCAACATGATATATTATTTTCGTTTATCATTCACATTGATATTGTTACTTGGTATAAACTTGATACGCTATGAACTGATG
Unaligned ( gi|34 ): ATATTGTTGACTCTTTCATATCATGAGACATTTGTATTTATATTGCAGTGATACTATTATGCATACATGTAGGTTTCTATATTATGTAATGTTTTGTCATTGTACAAATTAGTTTATGCATAACGTTAAACCTATGAAATGTATGGTTCTTGGTAATATTGATTGATCGATACCAATTACAATGACCAAGTACAT
Unaligned ( gi|35 ): AGAAAACAAAAATAATGATATTTAGAAATGTCAGTAAAGTTAAGGACAACGAAAAATGGTAATATAATGATATTCTTTTGGATAATGCAAATGAATTTGATTATTTAGGCATACTTATTTGCTATAATGGTAAATTTTTGAAAACACAAAGACACGTCGCAGATCGAGGTAGAAAAGCTTTATTTGCAATTAA
Unaligned ( gi|38 ): ACCTATAAATGTTCATTTATTAGATCTCAGTTATTGTAAGATTGTCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTGCATCAACATGATATATTATTTTCTGTTATCATTCCATTGTATAATTTGTTATTTGTATATACTTTATACCTATGAACTGTATGGTTCTTGGTCAATAAG
Unaligned ( gi|39 ): ATTAAATAAAGCATGTAGTACACCGTCAAATATTGATAAATGTCATGAGGGTTTGATGCAGGGAAATCCACTCTCCCCATTTCTATTTTCAGTTTATGTAAACTATTCATATAGAGTTCATAGAAATCGTTTTTGCTTATAAGGAAATTATTTGTATTGATTGTGTGT
Unaligned ( gi|43 ): TTCCAACAATCATCAACTTGAAATATTATAGAATTATTAAACTTGGTAAATATCTGTATAAATGCTCATCTATTAGATCTCTGTAATTGGAAGATTATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATTTACATCACTATTATATATTATGTTCTGTTATTATTTC
Unaligned ( gi|44 ): TGTTGCTTCGTAGTATTATCAAAAAGCTTTTGATAAAGATAAACAAAATATTGCTATTTTTTCAAATTAGCAAAAACATGGTATTGATTGTCAAATGTGACAAATTATCAAATCTATGTACTCTAACTATAATCATGTGTAATACAC
Unaligned ( gi|46 ): AGTAAATAACAACAAAAACAATGGTGTGTAAATGATACATTTCTGCACAATATTATTTTAAACACCCCTCTACTCTCAAGCTTGTACAATTATCATCAACTGGAAATATTTCGGAATTATGTAAATTTGGTAAATACCTAT
Unaligned ( gi|48 ): TTAAACTAAAAATGCATTTAGAAAATGTTCCAGCAACATAGTTGTCGTTGTTTAATTCGTATAATAGGCAAGTCCTACACATTATGGTTGTGTGGTGTGGGGCTCGCACATTCATGCAAAATTAACGATTTTGGAA
Unaligned ( gi|49 ): GAGAATCACTGTCACCCAAATTTTATTTTCGTTATATGTAAATGATTTTTGAAATGGAGTTCATAAAAAAGCTTGTGTGTTCCATTGAGGTTTCGTAGATATACGCTGATTGTCTTACTAAT
Unaligned ( gi|54 ): GATTATGTAAACTTGGTAACAACCTATATAAATGTTCATCTATCAGATCTCAGTTATTGTAAGATTATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTACATCAATATGATATA
Unaligned ( gi|56 ): TCATAAAGTTGAGTAGTTAATTATGTAAAATTGATAAATACTTATATAAATGTTCATTTATTAGTTCTCAATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTACAT
Unaligned ( gi|61 ): CAACATATGGCATGTCACTAAATACTAGAAAATTGAAAAAGGTAGATATTTATATGTTTCAAGAATGAAAGAATTGTAAAAT
Unaligned ( gi|63 ): GTGTAAATCGTCCAATATCTATGACGTCGTGTCAGATGCTCGATTTGTGTTTTTAAAAAAAAGAGTTATGGTACTA
Unaligned ( gi|66 ): TAATGTGCTGCTTGTATACGCATTATACTTATCAACTGTATAGTTCTTGGTCAATGAATAATAC
Unaligned ( gi|67 ): TATTTGAGAAGCATGCTCTATTTCATGTTTACAAATTGGTTTTATAACTTATAGAATATATCT
Unaligned ( gi|75 ): ATTTTTAATTAATAATATAATTTTTTTCCTAATAAATTTT
Unaligned ( gi|76 ): GTATGGTTCTTGGTCAATAAACAATACAAACAATA
Unaligned ( gi|77 ): CGTTCGATTCGGTAAATAGGGGTATGTTGT
Alignments
lowQualScore : 1111 11 3333333333333 11 111111 222222222222222 222222222222 33333333333333 222 11 22222222222222222222222222 11 1111111111111111111111111111111 4444444444444444444444444444 1111111 2222222222222222222222 111111 11 1 1111 11 1111 1 2222222 11111111111111111 11111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222222
lowQualScore : 1111 3 77 7777 3 3 555 3 3 3 3 00 7777 5555555555555 777777 1 00 7777 1 4 3 444 444444 1 1 111111111111111 5 1 0 000000000000 44 5 1 55 4 55 4 55 1 4 66 1 444 77 00000000000000 000 5 3 6 4 22 2 22222222222222222222222222 4 4 99 4 33 55 1 8888 88 4 55 4 666 4 4 8 8888888888888888888888888888888 4 55 4 7777777777777777777777777777 4 4 4 4 777 55 4 0 77 55 1 0000000 55 5555555555555555555555 44 2 5 66 222222 66 4 4 4 9 3 55 4 777 4 4 4 6 00 3 4 66 3 666666 4 8888 5 5 3 3 9999 2 5 5 5 5 8 11 0 3 3 3 0000 3 0 3 3 6 3 77 3 3 3 0 888888 888888 77 6 3 2 1 444 1111111 444 55555555555555555 33 33 2 0 66 2 88888 44 777 3 2 555 1 0 3 66666 3 33333333 2 2 777777 22 2 77777 2 2 66666 2 2 4444 0 7 666666 4 4444 2 888888 2 66666 22 22 0 2 2 2 5 555 66 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 2 2 4 4 2 44 2 1 3 44 88888888 1 1 22 1 44 3 3 1 1 1 222 1 1 1 1 1 4 1 1 44 111111111111111 44 3 6666666 444444 1 1 22 55 3333 1 33 2 1 11 5 1 11 1 1 11 1 4444444 1 33 1 11 2 33 44 222 6 2 1 1 2 4 11 1
lowQualScore : .... . .. .... . . ... . . . . .. .... ............. ...... . .. .... . . . ... ...... . . ............... . . . ............ .. . . .. . .. . .. . . .. . ... .. .............. ... . . . . .. . .......................... . . .. . .. .. . .... .. . .. . ... . . . ............................... . .. . ............................ . . . . ... .. . . .. .. . ....... .. ...................... .. . . .. ...... .. . . . . . .. . ... . . . . .. . . .. . ...... . .... . . . . .... . . . . . . .. . . . . .... . . . . . . .. . . . . ...... ...... .. . . . . ... ....... ... ................. .. .. . . .. . ..... .. ... . . ... . . . ..... . ........ . . ...... .. . ..... . . ..... . . .... . . ...... . .... . ...... . ..... .. .. . . . . . ... .. ..................................................................... . . . . . . .. . . . .. ........ . . .. . .. . . . . . ... . . . . . . . . .. ............... .. . ....... ...... . . .. .. .... . .. . . .. . . .. . . .. . ....... . .. . .. . .. .. ... . . . . . . .. .
lowQualScore : 7777 9 44 7777 3 3 555 6 6 6 6 00 7777 1111111111111 444444 0 00 7777 5 9 6 999 111111 4 5 666666666666666 0 0 7 999999999999 22 7 0 55 0 55 0 55 0 4 11 1 666 00 11111111111111 000 0 2 6 1 11 4 44444444444444444444444444 0 0 55 0 11 55 0 5555 99 9 55 0 555 0 0 2 4444444444444444444444444444444 0 55 0 1111111111111111111111111111 0 0 0 0 000 44 0 6 22 55 4 5555555 55 9999999999999999999999 66 8 0 99 888888 11 4 0 0 0 0 55 0 000 4 4 4 7 66 7 4 11 3 999999 4 9999 0 0 1 6 0000 0 0 7 7 7 9 00 8 6 6 6 5555 6 9 6 6 7 3 99 3 3 1 6 888888 888888 33 2 1 9 9 777 0000000 777 66666666666666666 99 99 9 1 55 6 00000 22 777 1 6 888 0 8 1 77777 1 44444444 5 5 222222 99 5 11111 5 5 22222 2 2 7777 8 2 444444 4 7777 2 333333 1 00000 33 99 5 1 5 5 7 000 88 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1 1 2 0 0 22 0 9 8 55 66666666 7 7 44 7 00 3 3 7 7 7 999 7 6 6 6 6 8 6 6 44 555555555555555 44 2 8888888 666666 6 5 11 33 3333 4 44 9 4 99 5 3 88 3 2 77 2 1111111 2 00 3 88 6 11 44 333 5 6 3 3 6 0 88 3
consensus : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GGTGT----TAAAAA----A---AT-T-ACAGC---TTCNATG--ATGGTTT----ATTCGGAATT-AGG-NAG------ACTTCCATTAGA----A-TTAGAGAGAACATNTAGAATGGTAAAATA--T---------TTNTTCAAANT--G-AGA--A-A--CACNGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-GTATN-TA--T-----TN-C--GAAATGTATGTACAATGTCTTGTAGANTCAAAT---T------C---T---A---A--ATG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATNTAT----TGTN-CTCTNTT--G-GATTN--GG-ATAT-GTCTGGTA---------TGAAA-----ATT----AT--GTTAA-T--GAAA-AACCG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTAAA-GGA--TGTGTT--T----ATACAA--A----A-A-TGT--ATA-G-T--TTTT-CGATAGTTCNTC-A--AAGTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCGG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTT-ACGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAA-TGCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCA-ACGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCNAAT-A-C---AAA-TACTA--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TCA-AAT-T-G-T-T--AT----A---AT-TG-T--A-AC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
Reference ( family-468 ) : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GGTGT----TAAAAA----A---AT-T-ACAGC---TTCNATG--ATGGTTT----ATTCGGAATT-AGG-NAG------ACTTCCATTAGA----A-TTAGAGAGAACATNTAGAATGGTAAAATA--T---------TTNTTCAAANT--G-AGA--A-A--CACNGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-GTATN-TA--T-----TN-T--GAAATGTATGTACAATGTCTTGTAGANTCAAAT---T------C---T---A---A--ATG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATNTAT----TGTN-CTCTNTT--G-GATTN--GG-ATAT-GTCTGGTA---------TGAAA-----ATT----AT--GTTAA-T--GAAA-AACCG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTAAA-GGA--TGTGTT--T----ATACAA--A----A-A-TGT--ATA-G-T--TTTT-CGATAGTTCNTC-A--AAGTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCGG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTT-ACGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAA-TGCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCA-ACGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCNAAT-A-C---AAA-TACTA--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TCA-AAT-T-G-T-T--AT----A---AT-TG-T--A-AC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
gi|1 : TGGGGCTC----ACACCAGC--AAATAATTT----GGAAAC-ACTT--CA-TTTTGAATTTGTT-GTAAAAAAGTTTTA--TGTGT----TAAAGA----T---CT-T-ACTAT---GTCTATG--ATGGTTTTACAAT---GAATT-GGG-ACGGACACCACTTACAT--GT----G-CTA---AGAA-GTAT-GAATATTGAAATA--T---------TGGTTTAAAATTAA-AGA--AGA--CAAAAATG-ATTGTATTTTTAAAG-A-GTATTATA--T-----CAGC--GAAATGT-T-TA-GATGT-TTGT-GACTCAAAT---T------C---TTTTA---A--TTG-TTGGT-TGAACA-TA--TG--TAAGAGATTTAT----TATA-CTCT-TA--G-GATTT--GGGATATTGT-TGGAA---------TTGTA-----CTTGTTGAT--ATAAA-TTTGAAACAA--A-------------------------ATTT-TAT-GATGA-A---GTA-AAACAAA-GACTACATGGA--TGTGTTA-T----ATACAAGAA----A-A-TAA--ATA-G-TGTTTTT-GGAGACGTCACC-A--AAATGT------ACTATTTAT-ATCAATATGTCAA-TGAA-GGTTTTA--A-A---TTACAATT-GTA-TTT-ACAAAAAGCCCTATTCCTAGTGGT-TTATATTCA-A-ACA------T----AAGTAAATTACCGACTAGCC--CTCACTAGAATATTGAAATTGAAA-AAAGGTAGATTTAGTAATATTCCAAGAAAAGAA-AGA-AAA--ATGTAAATTA-TGTGT-C------AGAGAA-CAT-TCAA-GTATGAAGT--ATTCA-TTTT--TA-T------TA------GT--TGTCGC-TTT-TTAT-AA---TGA-TTTGG-GGAAAA---CAGTATT-----------AA-A--AGA--AAT--ATT-ATTATAAACACCCCTCT-ACTTT-C--AA--GCTGTTGT-ACAATTATTA--TCAACT-T-G---GAA-TATTA--CCG-GAATT-AT------GTACT-TTTGGG----TAAATA-C-CT-----ATATAAA-TGTTC-------ATCT--A------G-TCAGA--------------------------------------TTAT-C-T-CA--GT-T---T--A----T--TG--TAAG--------ATA----T------ATC-C-----T-T--CA------------GT-ATATCC-T-G--C-CATG-TACATCA-TA--T-G-A-T--AT----A---A--------A-GA--TT--CT-GA-T-A-T---T-TATT-T-C-A-T---G-TA-TTA-----------AAT-T--TGTT-------TGTA------T-AT-A-------C----T-T--T-A-T--ACCTTA-G--AA---C--T-G-------T-AT--G-GTTC-TTAATT--G---T-CAA-T-A-AACCAA-T--A-CAA
gi|10 : ggtaaatttcacaaaactcaaaatgttttttagcgccgcaatgtagaaaaagtttaagtagcttgtttaaccaaaaaagatttgcattgaatgttagcacacagttgtcactgtttgatacgtatatactaggaagtctagcaaattatgttgttgaagtttAGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-TA--CA-TTT-GATTTT-TT-GTAAGAAAGTTTTG--GATGT----TAAAAA----A---TC-C-ACAGC---TTCTATG--ATGATTT----ATTCAGAATT-AGG-TAG------ATTTCCATTAGA----A-TT--AGAGAACATTTAGAATGGTAAACTATTT---------TTTTTCAATCT--G-AGA--A-A--CACTGATA-ATTGGATTTT--ACGT--------------------------AATGTATGCACAGTGTCTTATAGAACCAAAT---T------T---T---A---A--ATG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATATAC----TGTT-CTCTGTT--G-GACTA--GG-ATAT-GTCTAGTA---------TAAAG-----ATT----AT--GTTAG-T--GAAA-AACTGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAT-TAC-A-AAATGT----ACAAA-GGTTAAA--GA--TATATT--T----ATACAA--A----ACA-TGT--ATA-G-----TTT-CAAGAATTCTTC-A--AAGTGG------CGAAT--AT-ATAGATTCATT
gi|11 : agtattttagcaatgcaatgtaaaaagagtacgaatgttctgctgtctaaaatgaagtctttacacctgaatgtgttgacaaagttgaatttatttgacacatatgtgagtagtattgcatattatagctgtga----GAAAATCG-TT--CACTTT-GAATTT-TTTGTAAAAAAGTTTTATCGCTGT----TAAGAACGTCA---AC-T-AT-GC---T-CTATGCCATGGTTT----ACAATGAATTTGGG-CGG------ACA-CCACTACATGTGC-TCA---AGAA-GTAAAGAATATTGAAATA--T---------TGGTTAAAAAT--T-AAACAA-A--GACAAATACATTGTATTTT--AAGAACGTATT-TA--T-----TT-CAGGAAAC---TGTAGAAT---TTGT-GACTCAAAG---T------C---T---CTTTA--ATGGTTGGTATGA-CC-TATGTG--TAAGAGATTTAT----TATA-CTTCTTTAGG-GATTT--GG-ATAT-GTTTGGCAATTCGTTACTG--------ATG----AT--ATAAACT--GAAA-AAACA-------------------------A-AT-TAT-CTG-A-A---GTACAAACAAA-GACTACA-GGAAGGGTGTTACT----ATACAA--G----A-A-CATAAATA-G-TG-TCTT-C
gi|12 : ttacatttgaatgttagcaccacagttgtcactgttttgatacgtatagtagcagagtctttagcaaattatggttgtaagtttggctcacatctagcaaatgatttggGAATTG----GAAAGT-A-TT--CA-TCT-AGATTT-TT-GTAAACAAATTTTA--TCAGT----TAAAAA----A---AG-T-ACTGT---TTCCATG--ATAGTGT----ACTCGGAACT-AGG-ACGC-----ACTCCTCTT-GT----C-TTAAATAGGAAATATAGAATGATTAAATA--C---------TGGTTGAAATT--G-AAA--A-A--ATCAGAAA-ATTGTATTTT--GGATA-GTATT-TA--C-----CA-T--GAAATGT---TAGAA-GT-TTGTA-ATTCAGAT---TTTTTCGC---T-----------TG-TTAGT-TG--TC-AGA-TG--TAAAGGATTTAT----TGTA-CTCCTTT--G-AATTT--GG-AAAG-GTATGGAA---------TTCCA-----ATA----AT--ATCAA-C--GAAA-AGCAT-------------------------TTTT-TAC-TAC-A-A---GTG-AAACAAA-GGTTGAA-TGA--TGTGTT--T----GTGCAA--G----A-ATTGA--ATGCG-T--TTTT-TGATAATTCATC-A--AAATGTAACTTACATGT--AT-ATAAATATGTAAA-TGAT-GGTTTTA--A-G---TTGCAATT-TTA-TTTAACAAAAG--CC-ATTCC-AA--ATACAGT--------ACAA-TATAT----AAGCAAATatcatgtgataaattccacaat
gi|13 : ATATTTTAATATACCT-GAATGTAAACCG-AAA--ATGTAA-TTGCTGT-TTCATA--TGGAG-AATAT--GAATG-ACGAA-T--A-TCA-TTTTTATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-AT-TGAA---AAA-CT----AGAAAA---TTGTACA-----------TTGG--GTA--AAT--ATT-ATTATG-AAAACCGTCA-ATGTA-T--AA--ATTAT--T-AAAGCTATTC--TATAAT-A-C---AAA-TACTA--GTG-TTA-TAAT------GTATG-TTT-GG----AAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCTAA----AACTTAA------A-TTAGA----GGGCC-CA----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-CA-----G----TAAAGTA----T------ATC-TATATAT-TA-CA-CCAC-------GCAATACTC-T-GTTT-CGTA-ATC-TTACAAT-T-G-T-T--ATA---A---AT-TG-T--A-AT--TTA-TT-GG-T-G-T---T-T-TT-T-CTA-TT-AA-TGTTTA---------TTA---T--TG---------AATA------T-A--G--TTTC-T----T-T--A-A-T--AACCTA-T---A-G-C--A-G-------T-AT--T-G--CTTT--TT--G---G-AAA-TAA-AA-CAA-T--A-CAATAa
gi|14 : ggagacttaaaataagtataataccagtgtTTT-A-GTT------TA------GTAATATC-T-TTT-ATATGAACATAAA-------AGAAAA---TTACATG-----------TT-G--ATA--A-----TT-ATTATGAAAATCCGTCA-AAGTG-T--AA--ATTAA--T-ACG--TA--C--TCAAAT-A-C---ATA-TATCA--GTG-TTA-T-GT------GTAAT-TT--GG------AATT-T-TTTTTTCATATAAA-GCTTCT-A----AACTGAA------A-TCAGA----GATCA-CT----T-CA-TA----AG-G--ATG-TTTACCC-T-CAATATGT---TA-A----TA-AA--CATGTCC-T---GTA----T------ATTAT-----T-TG-AG---GC-------GC-ATGCTC-T-ATTT-AGTG-TTT-ACA-AAT-G-G-T-T------------GT-TA-T--A-AC--TTA-TT-GA-T-G-T---C---TT-T-C-A-T---A-T--TTA---------TT--T-TAATG-T-------AATA------T-AT-G--TTCT-T----T-G--T-AGT--ACAATA-C--AATA-C--A-G-------T-AT--
gi|15 : ctaaaggtaaatataaaattaatgcagatattttgcagtacattgtactagtaaacataaatgtttcgtaacatttagatttgatggaaaatacaaataaacacgtgtattttctcgtcattagatttaaccTTG----GAAAAT-G-TT--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAAAAAAGATTCG--GGTGT----CAAGAG----G---TC-T-ACTAT---GTCTATG--ATGGTTT----ACAATGAATT-GGGACGG------AC-ACCACT------------------ACATG-----TGCTAAGA---------------------AAGT--ATAGA--A-AGTTACAAATA-ATTATATTTT--AAAGA-GTATT-TA--T-----CA-G--GAAATGT---TACA-----------ACTCAAAT---T------CTTTT---A---A--TTG-TTGGT-TG--ACATA--TG--TAAAAGATTTAT----TAAA-TTCTTTA--G-GATTT--GG-AGAT-GAGTTGT----------TCATA-----AGT----A-----CAA-T--TCCA-TACT---------------------------TCT-TAT-CTG-A-A---GTA-AAACAAA-GACTACA-GGA--TGTGTT--T----ATACAA--
gi|16 : tttaaccaaaatgaaaaatttgcatttaaatgttagtacactgttgtcactgtttgatacgtttataggaagtctagcaatttatggtttggggctcacatccagcaaatgatcatgt-AAA--ATCTAA-TTG-CAT-T----A--TC-AG-A-TAA-TGAA-GGACGAA-TT-A-TCA-TTT--------------A------TC--TGTC-CATGT-ATATGAA---AAAACT--A-AGAAA----TT-TACA-----------TT-GTAATT--AATCGATT-ATGCTGAAAAAC-GTCC-AAGTAGTCGAAGTATTGT--T-ACAGCTATTC--TCGAAT-AGC---AAAATACTA--ATG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-G-----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-ACT-CT-A----A-CTTAA------A-TTAAA----GGCCA-CA----A-CA-TC----A--G--AG--TTTATC--T-CAATAT-T---T--AATGATA-TA--TA-A----T---ATA----TTAGGTAATC-T-----T--A-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTTT-CGTA-TTC-TTA-AATGT-G-T-T--AA----A---AT-TG-T--A-AC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-T---CT-GA--G-TTA---------TTA---T--TG---------AATA------T-AT-G--TTCT-T----TAT--T-A-T--ATCCTA-TAAAA-G-C--A-G-------TAAT--TGG--C-TT--TT--G---GTAAA-T-A-AACCAA-T--ACCAATACg
gi|17 : agaAAATGT-T-TAGAA-GTTGTGTA-ATTCAGATATGT------T---T---A---CTTGTG-TCGGT-TC--TC-AGA-TGGATAAAACATTTAT----TGTCGCTCCTTA--GAGATTT--GG-ATA----CTATTA---------TGGAATTCCAATA----ATCGATTAA-C--GAAA-GAGCA-------------------------TTTT-TACATAC-ACA---GTG-AAACAAACGGTTGAA-TGA--TGTGTT--TGCTGGCATAA--ATTGGA-A-TGC--GTT-G-T--TTT---GATAATTCATCAA--AAGTAA------CTTAT--AT----GA-ATATGTGATAAT--GATGGGCTA-TAAGTTGCAA-T-TTA-TTA-ACAAAAAG-CCAATTTC-AA--ATACGATAT--G-T-ACAGTTATAT----AAGCAAATA-TCGCAT-GTCATCACA-TAAC---TAGAAGTTGAAACAAGGT-AGATATCATAATGT
gi|18 : ttacccatga-TCAT-GGATCAG--AAT---TTGCAACT-TTA-TTT-AAGAAAA--CCGATTCC-AG--ATTCAATAT--A-A-ACAA-TGTATTTATAAGTGAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGT---TGGAA-TTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-AAATGTAA-CCGTAAATTATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATAAT------TA------TT--T-TC-C-TGT-ATATGAA---AAA-----A-AAAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATATTTAT--ACTAAGTATGAAAAACCGTCA-AAGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCTAGT-A-C---AAA-TACTA--G------------------------TT-GG----TAAATT-TCTT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------AGTAAGA----GCCTA-CA----A-CATTA----AA-GTCGGG-TTTATgttcaaaaatgaagaatttg
gi|19 : A--ATGTAAATTA-TGT-T-CA------GAG-AACAT-TGAA-G-ATGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATTAGTACATG------TA--TGTC-C-TTT-TTAT-AA---TGA-TT--GTAGAAAA---CAGTATT-----------TA-A--AGA--AAT--ATT-ATTACAAACACCCCTCT-ACTTT-C--AA--GCTTG--T-ACAACTATTA--TCAACT-G-G---AAA-TATTACGGAA-TTA-T-A--------TAAA-CTT-GG----TAAATA-C-CT-----ATATAAATGTTTAT--------CT---------A-TCAGA------------------------------------------TC-T-CAG----T---T--A----CA-TG--TAT-----T---GTAAGATT------ATC-C-----T-TAGTA-TCA-------------ATCC-T-GTCCATGTA-TACATCA-ATA-T-G-A-T--AT--------AT-TA-T--G-----TT--CT-GT-T-A-T---T-A-TT-T-C-A-TT-G--TA-TAA---------TTTGT-T--TG-T--------ATA------T-A----------C----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-AT--G-G--T-TC--AT--G---GTCAA-T-A-AA-CGA-T--A-CAATACA
gi|2 : AGTCTGGGATTA---AAT-CCAGCATAATGAATTG----GGAAGA-G-TATTCA-TCT-AGATTT----GTAAACAAATTTTATCAGTG------AAGAA-------------GCAGTCTGTTCCATGGTATGGTGT----A-CCGTAACT-AGG-ACG------CCTCCTCTTCAT----C-TTAAATAGGAAATATAGAATAATTAAATA--C---------TTGTT-AAATT--G-AAA--A-A--
gi|21 : gattaagtgcatgagcaaaaagtatgatttaatctctgatgcccaatttggttttaaagctggatatagtacaagtgatgctatttttgttttacactggttaataacacggacacttgcaaaacgtaaacaccttttttgttgctttgtggattatcaaaaggctcttttgataagtatgatatgaaacatgctcatttttaaattatcgaaatatggaactttgactgtcaaatgttaaagtcaatgaaactctaatataaaaacatgtggtacgccactacttaaatcaatggtcagagttgctcaggatgttcgccgaggggttgatgcagggcgagtcactctcctcccattgttattttcgttccatataaattaccttttgaaatgaaattattggaagtcatcgtgtattatctgtaagaaattagagaaatagctttattttttcatcgatatgctttgagatgacactgttttattattccagacaacggaacacacaggtttacaaagatatgttaactgtttgactcaacttatgacatctacagtggaattgatacccggtaaacgagacaaaactaatgttttgctagtattcagaaaaaagttggtagattgaaacagaaactattttttggaaatataatatggaaaagctattgatgttgtgagacaatcgttaatttatctagtatccactttgaatttcaatggtaattcaattaaaacacaaagtgttcttaggcatcagcaatgtaaaaataggcttaagttgtacctgttaagctaaaaatcgaaaacatcttgcaacattaaatgtagtacaaagttgtcattgttcaatacttactattagtagtatagcaaattatggctcctgtgaTTG-TGT-G-CAAA--TAGAG-A-TAT-TGAT-G-GTCAA-TCGA-T--------ATATT------TA------TT--TGTC-A-TGA-GTTTGAG---AAA-AT--A-TGAAAA---TTGTATA-----------TT-GAAAAA--AAT--ATT-ACTATAAAAAAGCATGATGCGTG----AA--ACAA-----AAACCAATTCATTCACAT-G-T---AAA-TACAA--ATG-TGA-T-ATAAAAAAATAATGTTT-GGAACTTGAA-T-C-TC-----ATATGAA-GCTT-T-A----AAATTGAAATAGCA-TCAGA----TGCAATCA----A-CA-T-------------G-TTC------------T-T---T--A----TA-C---TAC-----C---GTA-----------A---T-----T-GA-----GAC-------AC-ATACTT-G-ATTA-TGTG-TTT-GCA-AA-----------AT----A---ATGTT-T--A-AC--------------------C-T-TT-------TT-GA-T--------------TTAAT-T--TA-T-------CA----------AT-G--TCTG-T----T-C--T-A-A--AATTTA-T--AA-G-C--A-A-------T-GC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--G-CAATACAaa
gi|24 : TACAAA-GCTTCT-A----AATGTAA------A-TTATG----GGCCA-CA----A-CA-TA----AGCG--GGG-TTTATCCTT-CAATAT-T---T--A----AA-TAATTATA----T---GTA----A------GTG-T-----T-T-----------------T-ATACTT-TCG--T-CGTAGTTC-TCA-AA--T-G-TAT--AT----A---AT-TGCT--A-AC--TTATTT-GGCT-GTT---C-T-TT-T-C-ATTT-GA-TG-TTATATATTGT-TTAATAT--TGTT-------AATA------TAAT-G--TTCT-T----T-T--T-A-T---TCCTA-T--AA-GCC--A-G-------T-GC--T-G--C-TT--TTA-G---G-AAA-T-A-AA-CAAGT--A-TAAT
gi|25 : tattcgtgccaaacgccactataaactatcaaatcttgatccagaatcttcacttgacttagtacagt-ATGAA-T--A-TCAATGTT-ATATC------TA------GTA-TGTC-C-TTTTATATAAT---GAT-TT--GTAGAAAA---CAGTATT-----------TA-A--AGA--AAT--ATT-ATTA--AAACACCCTCA-t
gi|26 : AA---AAA-----A-AGAAAA---CAGTATT-----------TA-A--ACA--AAT--ATT-ATTATAAACACCCCTAT-ACTTT-C--AA--GCTTG--T-ACAACTACTA--TCAATTAA-CTGGAAA-CATTACGGAA-T---T-AT------GTAAA-CTT-GG----TAAATA-C-CT-----ATATAAA-TGTTC-------ATCT---------A-TCAGA------TCT-CA----G-T--TATTGTAA-G--A----TTATCC-T-CAGTAT-C---T--A----T------CCTG----T---CCA----T------G-----------TA-CA-TCA-----------ATA----T-GAT---ATA-TT----A-----T-G-T-T--AT----G------------------TTA-TT-A--------------TT-T-C-A-TT-G------TA---------TAAGT-C--AG-T--------ATA------T-A----------C----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-AT--G-G--T-TC--TT--G---GTCAA-T-A-AA-CAA-T--A-ctttcaagcttttaataatattacggaattggtaaatacctatataaatgtcatctatcagttctcagttatgtacattatcctcatgcatctatttcctgttccaatgctcatcatgaatatataatgttcttgttatttattcattgtataatctatttgtatactactgtatacctatgaactgtatgttcttggtcaataaaacaataca
gi|29 : aaataataaagaaaTACAAA-GCT-CT-A----AATGTAA------A-TTAGG----GGCCA-CA------CA-AA----GC-G--AGGGTTTATCC-TTCAATAT-TAAAT--A----TAATA--TATA----T---GTAA---T------GTT-T-----TATA-CA-TTTC-------G--------------T-CGTAATTC-TCA-AAA-TAG-TAT--AT----A---AT-TG-TTCACACA-TTA-TTTGG-C-G-TGTTC-T-TT-T-C-A-TTTGA-TG-TTAAATATATTGTTAATAT--TG-TT------AATA------T-AT-G--CTTC-T----T-TCTT-A-T---TCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-GC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-TAATACA
gi|3 : tagtacatgtAGAGTGGGGTTTCAGTATCTCTGC-AACAGAATTA----TAAAGT-G-TA--CA-TTT-GGATTT-TT-GCAAGAAAGTTCTA--CATGT----TAAAAA----ATCTATGT-ACATT---TTCGATG--ATGATTT----ATTCAGAATT-AGG-TAC------ATTTCCATTAGA----A-TTAGAGAGAACATTTAGAATGGTAAAATA--TAATGTTTTTTTTTTCAAACT--G-AGA--A-A--CACTGATA-ACTGTATTTT--ACGTG-ATATA-CA--TGTGCATT-TA-GAAATGTGTAAAGGATGTCTTGTGGAATCAAAT---A------C---C---A---A--ATG-TTGGT-TA--TG-TAG-TG--TAAGGAATATGT----TGTT-TTCTCTT--G-ATTTA--GG-GTAT-GTTTGGTA---------CGAAA-----A-C----ATC-GTTAA-T--GAAA-ACCCG-------------------------GTGT-TAT-TGC-A-A---GTA-AAACGAC-GGGTAAG-GGA--TATATA--T----ATACCA--A----A-A------AAA-A-T--------GATCGCT----------ATGT------CGTAT--GT-ATATGTATATTTA-CCAT-GGGTTGG--A-T---CTGCAACT-TTA-TTT-AGGAAAC--CCACGTCC-AT--GT-CAATAT--ATATACAG-TGCAT----TAGTAAATT-TAGATT-GTCCTCTCATAAGC---TGGAAATCGAAG-GAGGa
gi|31 : acacgtaaatgattttgcgatggtgtttattaaaacattatgtgttccagctgaggttagagatattgctttatttctaatatcatgtaccccctatttttttaaatatttatttcagtattgctaatgatactgtacttttttcagatacagcagatggtttacaaaatatgttggacgcattgtagttacatcccaaaattgaaacacagtgttaaaagtgttggttttagaagtcgtaaactgaaaaactgtcatacatggtgttatgatgatgtacctctagatgtcatgtggtagaaaatatgaactagttaggaatcctgttccgttttaatgataaatttaataaagcataaaatgttttagctatgcaatgtagatctagaaagagtatgaatgctctgttagctacaacgaagttctaacacttaattatctcaacaaagtatctgacacacatgtgagtagtattgccacttatacttgtgaTA-T-GT------GTAAT-TTT-GG----GAAATC-T-T-------------------T-A----AACTGAA------A-TCAGT----GGTCA-CA----A-CG-TG----AA-G--AGG-TTTATCG-T-CAACATAT---C--A-----A-T---TATG----C---ATG----T-------TC-T-----T-GA-TA-TCA---------------TC-C--TTT-CATG-TTT-ACA-AAT-T-G-T-A--AT----A---A-----T--A-AT--TCA-TT-AA-T-G-T---C-T-TTCT-C-A--T-AA-TT-TCA----------TAAT-TACTG-T-------AATA------T-AC-G--TT---C----T-T--T-G-T--ACCATA-A--AA-G-C--A-GTACTGGCT-AC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAAT
gi|33 : catgA----GAAAGT-T-CA--CA-TT--AAATTT-T----AAGAATATATTG--GGTGTAAAATAGAAA----A---A----ACATG---TACAAT---ATGGTTT----ATTTGAAATT---G-AAG------A
gi|36 : agttaaataatcattgtttttaatgcagaaacaaaattgtcggtttttaaaacgtatgttgaagtatattatcatacggatctgaaataggggatttcataaagccccagatgttgT-ATCTGAA---AAA--T--A-A-AAGT---TTGTATAATATATGATAATT----ATA--AAT--ATT-ATTATAAACACCCCTCT-ACTTT-C--AA--GCTTG--T-ACAACTATTA--TCAACT-G-G---AAA-TATTACGGAA-T---T-AT------GTAAA-CTT-GG----TAAATA-C-CT-----ATATAAA-TGTTC-------ATCT---------A-TCAGAACTCGGTTA-T-------TG-T-----AA-G--A----TTATCC-T-CAGTtac
gi|37 : ttaaattggtG-AAA--ATGTAAATTA-TGT-T-CA------GAG-AATAT-TGAA-G-ATGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------AA------TA--TGTC-C-TTT-TTAT-AG---TGA-TT--GTAGAAAA---CAGTAT
gi|4 : atttagtaatattccaagaaaagaaaAGTGTGGGGTTC---TATTCCTGC-TAAATAATTATCTAGAAAGT-G-TA--CA-TTT-GAATTT-TT-GTAATAAAGTCTTG--GGTGT----TAAAAA---------T-CCACAGC---TTCGATG--ATGATTT----ATTCCGAATT-AGG-TAC------ATTTCCATTAGA----A-TTAGAGACAACATGTAAAATGGTAAttaagcttctccaactatttaatatcaactggaaatattacggaattatgtaaacttggtaaatacc
gi|40 : tgtgtaaatggtctgaaaattatgacatcatatcaaatgctcagtttggtttttaaaaaggatataataccaccgatgccatatttatattacagtatttaattaacaggaatataatgaaaggaaagaaactttattgttgttttgtaaattatcaaaagggcgttcgattcggtaaatagaggtatgttgttttgcaaaatatctcaatgtggtatagattgtaaaattatgaatatcattcgttcaatgtatgtaaatgttaagtcttgtgtaaaatataaatcacaattgtcagaatatttctcttgtaatcagggtttaatgcaaggaaaatcattgtctccaattttattttcgttatatgtgaatgattttgaaatggagtttataaaaaaaaaaaaacgtgtgttccaattgaggttcgagatatcgctctatttcttataatgtatgctgatgatattgtacttttctcggatacagcagaaggtttacaaaacatgttgaacactctatgtagttacacctcgaaatggaaacttaatgttaatactgaataaacaaaaattgttgtttttagaaaaggtcgtaaactaaaaaaattatacatggtgtctttagatgtggtagataactttaactacataggagtcacgtttaatatcaatggcaaattaaataaagcacaaagtattttagcaatgcaacgtaaaaagagtatttaaaaagagtatgaatgttctgctatctaaaatgaagtctttattcctgaatgtgttgacaaagttgaatttatttggcacatatgtgagtagcattgcatattatagctgtgaACTC-T-GTTT-CGTA-ATC-TCA-AAT-T-G-T-T--AT----A---AT-TG-T--A-AC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TT
gi|40 : -C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-C--A-CAATttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagtattgcttttggaaataaacaacacaat
gi|41 : actctgtttcgtaatctcaaattgttataattgtaacttattggtgtcttttcattgatgttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn------ATA-T-----T-TA-AA-TCTC-------GC-ATACT--T-GTTT-CGTA-ATC-TTA-AAT-T-G-T-T--AT----AAACAT-TG-T--A-A---TTA-TTAGG-TAG-T---TAT-TT-T-C-ATTT-GAGTA-TTA----------TACT-C--CA-CAAAGATAAATA------T-AT-G--GTTT-T----T-TA-T-A-T--ACACTA-C--TA-G-C----G-------C-AT--T-G--CTTT--TT--A---G-AAA-T-A-CA-CAA-T--A-
gi|42 : GGTTC---TATTCCT-C-TAAAGAATTA----GAAAGT-G-Taca
gi|45 : aaattcaatgtacagtattttacaatgcaatgtaaagaaagtatgaattttctgtttctttacacctgaatgtgtgacaaagtgaattatttaacatatggtgagagtattgcatattatagtgaatt-----T-TA-CA-AAAC-------GC-ATCCTCCT-GTTT-CGTA-T-C-TCA-AAT-T-G-T-T--AT----A---AT-TG-T--A-AC--TTA--G-GG-T-G-T---C-T-TT-T---G-TT-GA-TGTTTA---------TTA---T--TG-T-------AA-A------T-AT-G--TTTT-C----T-T--T-T-T--GTCCTA-T--AA-G-CAGA-G-------T-AG--T-G----TT--TT--GGGAG-AAA-T-A-CA-CGATT--A-CAATGC
gi|47 : CTC-T-ATTT-CGTA-CTC-TCA-AAT-T-G-T-T--ATTTAAA---AT-TC-T--A-AC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-CG-TTA---------ATA---T--TG-T-------AATACATGTAT-AT-G--TTTCAT----T-T--T-G-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AC--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CA
gi|5 : AGTGTGGGGTTC---TATTCCTGT-TAAAGAATTA----GAATGT-G-TA--CA-TTT-GAAGTT-TT-GTAAGAAA-TCTTG--GGTGT----TAAAAA----A---AT-C-ACAAC---TTCGATA--TTGATGT----ATTCAGAATT-AAG-TAG------ATTTCCATTAGA----A-TTAGA----ACATTTAGAATGGTAAAATA--T---------TTTTTCAAAAT--G-AGA--A-A--CACTGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-ATATA-TA--T-----TC-C--GAAATGTATGCACAATGTCTTTTAGAACCAAAT---T------C---C---A---A--ATG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATATAC----TGTC-CTCTGTT--G-GACTA--GG-ATAT-GTCTGGTA---------TGAAG-----ATT----AT--GTTAA-T--GAAA-AACTG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---ATG-CGACAAA-TGTTAAA-GGA--TGTATT--C----ATACAA--A---------GT------G-T--TCTT-CAAGTGTTATTC-A--AAGTGT------CGTAT--AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GGATCAG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTA-ACGAAAG--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAA-TGCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCACCTCATTAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGA-AGATATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAC-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGGAAA---TTGTATA-----------TA-G--ATA--AAT--ATT-ATTATGAAAAACCGTCA-ATGTA-T--AA--ATTAC--T-ACATCTATTC--TCTAAT-A-C---AAA-TACTC--GTG-TTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TCAGA----GGCCA-CA----A-CA-CA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--TATG----T---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCAC-------GT-ATACTC-T-GTTT-TGTA-TTC-TCA-AAT-T-G-T-T--AT----A---AT-TG-T----AC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTAAT-T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTCGT----T-T--T-G-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-T--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-AAATACAt
gi|50 : -TCA-AAT-T-G-T-T--AT----A---AT-TG-T--A-AC--TTA-AT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-T-G-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTCTT----T-T--T-G-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AG--T-G--T-TT--TT--G---G-AAA-T-A-CA-CAT-T--A-CAAT
gi|51 : ATCC-T-CAACAT-G---CCAA----TA-AA--CATG----T------------------TC-T-----T-TG-TA-TTATTTGAGAAGG-ATGCTC-T-CTTT-CTTG-TTC-ACA-AAT-T-GAT-T-------------T-TA-T--A-AC--TTA-GT-GA-T-G-T---A-T-TT-TGT-A-TT-TA-TG-TAA---------TTAAg
gi|52 : ATTA--GTG-TAA-T-GT------GCAAT-TTT-GG-----AAATTGT-TT-----ATATAAA-GCTTCC-A----ATATGAA------A-TCAGA----GACCA-CATCTGATCA-TA----AA-G--AGG-T
gi|53 : T-TG-T--A-AT--TGA-T--GG-T-G-T---C-T-TG---C-A-TT-AA-A---TA---------TTTAT-T--TG-T-------AATG------T-AT-G--TTTT-C----T-T--T-A-TTTGTTCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AG--T-G--C-TT--TT--T---G-AAATT-ATAA-CAA-CTAA-CAATACAacttttgaaaacattacacatataattta
gi|55 : -T-T--AT----A---AT-TG-T--A-AC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------T--AT-T---G-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-G-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AC--T-A--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACata
gi|57 : ---AT-TG-T--A-AT--TTA-TT-GG-T-G-T---T-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATAt
gi|58 : --TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-GA-TG-TTA---------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--CTTC-T----T-T--T-A-T--A-CCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATAC
gi|59 : catataA-T-GT------ATAAT-TTG-GG----GGAAAT-G-TT-----GTATAAA-GCTTCT-AGCTGAACTGAA------A-TCGGA----GGCCA-CA----T-AA-TA----AA-G--AGG-T
gi|6 : gccT-G-TA--CA-TT--GAATTT-TT-GTAAGAAAGGTTTT--GGCGT----TAAAAA----A----T-T-ACAGC---TT-GATG--ATGATTT----ATTCAGAATT-AGG-TAG------A-TTCCATTAAA----AATTAGAGAGAACATTTAGATTAGTAAAGTT--T---------TTTTTCAA-CT--G-AGA--A-A--CACTGATA-ATTGTATTTT--ACGTA-ATATA-TATTT-----TC-T--G-AATGTATGT-CAATGTCTTTTAGAACCAAAT---T------C---T---A---A--ATG-TTGTT-TG--TC-TAC-TG--TAAGGGATATTC----TGT--CTCTGCT--G-GACTA--GG-AT-T-GT-TGGTA---------TGAAG-----ATT----AT---TTAA-T--G--A-AACTG-------------------------GTTT-T-T-TAC-A-A----TG-CGAC-AA-GGT---A-AGA--TAT-TT--T----ATAC-A--A----C-A-TGT---TA-GTT--TTTT-CAATAGTTCTTC-A--AAGTGT-------GTA---AT-ATAGATATATTTG-TCAT-GG-TCAG--A-T---TTGCAACT-TTA-----A-GAAAA--ACAATT-C-AG---T-CAA-AT--A-A-ACAA-TGCAT----AAGTAAA---TAAATT-G---TTTCAT--------------------------AGATATTTTAATATACCT-GAATGTAA-CCG-AAA--ATGTAAA-TG-TGT-T-CATAATTAG-G-A-TATGTGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTAT-AT-TT------TAATATATTT--TGTCAC-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AGAAAA---TTGTACA-----------TT-G--ATA--AA---ATT-ATTATGATAAA-CGTC--ATGTA-T--AA--ATTAT--TAACAG-TATT---TCTAAT-A-C---AAA-ATCT---GTGTTTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------T-T--GA----GGCCA--A----A-CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCC-T-CAATAT-T---T--A----TA-TA--------------------------------T-----T-TA-CATTCA--------GC--TACTC-T-GTTT-CGTA-AT--TTA-AAT-T-G-T-TTAAT----A---AT-TG-T----ACTTTTA-TT-GG-T---T---A-T-TT-T---A-TT-GA-TG-TT----------TTA---T--TG-T-------AATA------T-AT-G--TTTC-T----T-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-A-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACacatgtacatgtatat
gi|60 : ac-TT-T-C-A-TT-G--TA-TAA---------TTTGT-T--TG-T-------A-TA------T-AC--------------T-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-ATA-T-G--G-TTC-TT--G---GTCAA-T-A-AA-CAA-T--A-
gi|62 : tattatgttctgttatta--TG-T-------GATA------T-AT-AATTTTC-TGTACT-T--T-A-T--A-CCTA-T--GA-A-C--T-G-------T-AT--G-G--T-TC--TT--G---GTCAA-T-C-AA-CAA-T--A-CAAT
gi|64 : tgtacgtcaa-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C--T--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATAC
gi|65 : gtgacgattaacgtataactggtacg-T--T-A-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TTTGG---A-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACA
gi|68 : taacgtataactggttacg---------TTAAT-----G-T-------AATA------G-ATAG--TCTT-T----G-T--A-A-C--ATATTA-T--AA-G-C--A-G-------C-AC--T-A--C-TT--TT--G---G-GAA-T-A-AA-a
gi|69 : gt-G--TTTC-T----T-T--TTG-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-TA-CAA-T--A-CAA
gi|7 : aagagT--G-AGA--A-A--CACTGATA-ACTGTATTTT--ACGTA-ATATA-TA--T-----TC-T--GAAATGTACACACAATGTCTT----------------------C---T---A---A--ACG-TTGGT-TG--TC-TAC-TG--TAAAGGATACATATGTTGTT-CTCTGTT--G-GACTATAGG-ATAT-GTCTGGTA---------TGAAA-----ATT----AT--GTTAA-T--GAAA-A-CTG-------------------------GTTT-TAT-TAC-A-A---ATG-GA-CAAA-GGTTAAA-AGA--TATATT--T----ATACAA--A----ACA-TGT--ATA-G-T--TTTTTCAATAGTTCTTC-ACAAAGTGT------CGTAT--ATTATAGATATATTAG-TCAT-GGATCAG--A-T---TTGCAACT-TTA-TTT-AAGGAAA--CCGATTCG-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAA-TGCAT----AAGTAAATT-TAGATT-GTCATCTCATAAGC---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGGTATTTCAATATACCT-GAATGTAA-CCG-GAA--ATGTAAATGG-TGT-T-CACA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-AAGAA-T--A-TCA-TTTT-ATATT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CT--A-AAAAAAAACCTGTATA-----------TT-G--ATA--AAT--ATT-ATTATG-AAAACCGTCA-ATGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTACTC--TCTAAT-A-T---AAA-TACTA--GTG-CTA-T-AT------GTAAT-TTT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------A-TTAGA----GGCCA-CA----A-CA-TG----AA-G--AGG-TTTAACC-T-CAATAT-T---T--A----CA-TA--CATGTATAT---GTA----T------ATC-T-----T-TA-CA-TCGC-------GC-ATACTC-T-GTTT-TGTA-TTC-TCA-AAT-T-G-T-T--AT----ATATAT-TG-T--A-AC--TCATTT-AG-T-G-T---C---TT-T-C-ATTT-GA-TG-TTA---------CATAT-T--GG-T-------AATA------T-AT-G--TTCT-T----T-G--T-A-T---CCCTATT--AA-G-C--ACG-------T-AC--T-G--C-TT--TT--C---G-GAA-T-A-AA-CAATT--A-CAATA
gi|70 : -CA-TA----AA-G--AGG-TTTATCT-T-CAAT
gi|71 : t--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-ATACT-G--C-TT--TT--G---G-AAAAT-A-GC-CAA-T--A-CAATACAtgttaatgaattatctgagtcgtatgctctatt
gi|72 : taCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-TT--T-G--C-TT--TTG-G---G-AAA-T-T-AA-TCA-T--A-CAATACA
gi|73 : aaCCTA-T--AA-G-G--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--T---G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-TCATACata
gi|74 : tcaaTGT------CGTAC--GT-TTAGGTATATTTA-CCATGGGGTCGG--A-T---TTGCAga
gi|9 : TTTG-TCAT-GG-TCAG--A-T---TTGCAACTATTACTTT-AAGAAAA--CCGATTCC-AG--AT-CAATAT--A-A-ACAA-TGTATTTATAAGTGAATT-TAGATT-GTCATCTCATTAGT---TGGAAATTGAAA-GAGGG-AGATATTTCAATATACCT-AAATGTAA-CCGTAAATTATGTAAATTG-TGT-T-CATA--TAGAG-A-TAT-TGAA-G-ACGAA-T--A-TCA-TTTT-ATAAT------TA------TT--TGTC-C-TGT-ATATGAA---AAA-CA--A-AGAAAA---TTGTATA-----------TT-G--ATA--TAT--ACT-AATATGAAAAACCGTCA-AAGTA-T--AA--ATTAT--T-ACAGCTATTC--TCTAGT-A-C---AAA-TACTA--G------------------------TT-GG----TAAATT-T-TT-----GTATAAA-GCTTCT-A----AACTTAA------AGTAAGA----GGCCA-CA----A-CA-TA----AA-G--GGG-TT
gi|9 : -----T-TA-CA-TCAC-------GC-ATACTC-T-GTT--CGTA-T-C-TCA-AAT-T-G-T-TT-AT----A---AT-TG-T--A-AC--TTA-TT-GG-T-G-T---C-T-TT-T-C-A-TT-AA-TA-TTA---------TT--------G-T-------AATG------T-AT-G--TTTC-T----T-T--TTG-T--ATCCTA-T--AA-G-C--A-G-------T-AT--T-G--C-TT--TT--G---G-AAA-T-A-AA-CAA-T--A-CAATACatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatcacgcatactctgttcgtatctcaaattgtttataattgtaacttattggtgtcttttcattaatattattgtaatgtatgtttctttttgtatcctataagcagtattgcttttggaaataaacaatacaatac
26 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): AAGAAATTATATTGTTGCTTCGTAGATTATCAAAAAGCTTTTGATAAAATAGACAAAACTATGCTATTTTTTCAAATTAGCAAAACATGGTATTGATTGTCAAATGTTACAAATTATCAAGTCTATGTACTCTAATATTAAATCATGTGTAATACACAAAAATCTGTCAATTGTAATGAGGGTTTGATGCAAGGGGAATCACTCTCACCATTTCTTTTCTCTCTGTATGAGAATGATTGAGATGGAATTCATTGAAAAAATGTGTATCCCAATTGAAATAAAAGAAATTGTTTTCATGTTAATTATATATGTTGATGATACGGAACTTTTTCAGAGACAAAACAAGGTTTACAAGATATGTTGAATTGTTTACAAGATTATACCTCAAAGTGGAATATAAAACTTAAAAGTCAATTTGGATAAAACAAAGATAGTTGTTTTTAGAAAAGGTGGGAAATAAAAAATAATAATTGTTGGAAGTATGACAACACGTTGGTTAGCATTGAAGAAAATTTCAATTATTTGGGTATAATATTAAATTATAAAGGAAAATTTCCCAAAACACAAAATGCTTTAGCAGCGCAATATATGTAGAAAAGGTTT
Unaligned ( gi|20 ): TGATTTTATATTGGTCAGAAACCAGAAGTCAAAACACTATTTTGTTGCTTTCTACATCATCACTAAACTTTATGGAGTTTTTTAAGTCACCGAATTTGATCGTCAAATATCTAATGTTATAATATGAATGTATGCTCATATAAAACTTGCGTACCGACAAAAACATACGCTGTCAGAGCTTTTGGGATGCCGAGAGGCTTGATCAAAAGGAATCACTCTCCTCATTCTTATTTACTTTTCATATAAATGATTTTGAACTGGAATATATTGAAAGCATGTGTATACCTGTAAAAATAGGTAAGTTGCTTTATTTTCCATCATATATGCATATGATATTGTGGTTTTCTGAGACGGAACGAAGTTAGCAAGGTA
Unaligned ( gi|22 ): ACAAAAATGATATGGAAATGAGGGCTTAGTGCAGAACTAGTTTTCGGTGTCTTTTCTCTGCATATGGTATTCAATAGAAATGCATGCGTATACCTGTAGAAATAAGAGACACTGTGTTCCTCTTGGTATCGTATGCAGACGATACAGTATTTTTTTTTCAGAGACAGAACAAAAGGTCTAAAAGACATCAATATACACAGCAACGTTTGGTATAAAGGGTGATGTAGATAAAATTTAAATAATTGTACTTTGAAATTATGGTAAATTGAAGGAAAATCACTGTTTGAAGTATAAATATGAGTAAATTGATATTGTGGAAAATGTCAATTGCCTATGCTTAATTTTAAATTTATAAGTAAATTC
Unaligned ( gi|23 ): TCCTTCTTATGTACGCTGATGATATGGTTTTGTTATCTGATAGCGTTTGAGGGTCTACAGAGATGTTAAATACTCTATCTAATTACACGAAAAGAATGGGATTGAATGTTAATGTACAGAAAACAAAAATAATGAATATTAGAAATGGCAGTAAAGTTAAGGACAAACGAAAAAAAATGGTATTATAATGATGATTTCTTTTGGATAAGTAAATGAATTTAATTTTAGGCATACTTATGTGCTACAATGGTAAATTTTGAAAACACAAAGACACTCGCAAATCAAATCAAGTGGTTAGAAAGCTTTATTTGCAATTAAT
Unaligned ( gi|27 ): AAAAGGCGTTCGACTTGGTAAATGGAGGTATGTTGTTTTACAAGCTATCTCAATGTGGTATAGATTGTAAAATTATGAATATCATTCGTTCAATGTATGCAAATTTTAAGTCTTGTGTAAAGTATAAATCACAATTGCCAGAATATTTCTCTTGTAAATAAGGTTTAATGCGAGGAGAATCATTGTCACCAATTTTATTTTCGTTATATGTGAATGATTTTGAAATGGAGTTTATAAAAAAACTTGTGTGTTCTACGGTAATTGAGGT
Unaligned ( gi|28 ): CATGAGATTACTGTAACTTTTCTCGGATACACTAGAAAGGTTGTACAAAACATTTGAGCACTCTATTAGTTACACCTCGAAATGGAAACTTAATGTCATACTTGGAAAAAACAAAAAATGGTTGTTTTTTAGAAAAGGTGGTAAACTAAAAAATTGTTTATATACATGTGTAATGATAATGGTACCTGTTAGATGTGGTAGAGTAACTTTAACTACTTCATGGAGTCACGTTTTAATTTCCCATGGCAATTAATCAAAGCACAAAGTA
Unaligned ( gi|30 ): AAAGTTATATTGTTGTTTTGTAGACTTCCAGAAGGCTTTTGATTCAATTGATAGATCTGAATTGTGGTGTAAAATAGTTAATGACGGTATACAGCGGAAGATGTTCAATGCTTTAAGTTATTGTATAATAATGTTCAAAGCTGTGTGAAGTATGCCGGTTTTTTAGTGATTATTTTTGCAATGATACAGGTCTAATGCAGGGTGAAACTTTGTCACTTATTTCATTTTCGTTATATATACTC
Unaligned ( gi|32 ): TATTACGAATAAAGTTATAAACCCGATACGCAAGCCCTATAGATACCCGTTAAAGGTGTTGCATTTATAAAGTATCTCAGTTATGTGTAAAGATTGTCTACCTCAGTATCTAACGGTCCTGTCTATGCCTTTGATTGCATCAACATGATATATTATTTTCGTTTATCATTCACATTGATATTGTTACTTGGTATAAACTTGATACGCTATGAACTGATG
Unaligned ( gi|34 ): ATATTGTTGACTCTTTCATATCATGAGACATTTGTATTTATATTGCAGTGATACTATTATGCATACATGTAGGTTTCTATATTATGTAATGTTTTGTCATTGTACAAATTAGTTTATGCATAACGTTAAACCTATGAAATGTATGGTTCTTGGTAATATTGATTGATCGATACCAATTACAATGACCAAGTACAT
Unaligned ( gi|35 ): AGAAAACAAAAATAATGATATTTAGAAATGTCAGTAAAGTTAAGGACAACGAAAAATGGTAATATAATGATATTCTTTTGGATAATGCAAATGAATTTGATTATTTAGGCATACTTATTTGCTATAATGGTAAATTTTTGAAAACACAAAGACACGTCGCAGATCGAGGTAGAAAAGCTTTATTTGCAATTAA
Unaligned ( gi|38 ): ACCTATAAATGTTCATTTATTAGATCTCAGTTATTGTAAGATTGTCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTGCATCAACATGATATATTATTTTCTGTTATCATTCCATTGTATAATTTGTTATTTGTATATACTTTATACCTATGAACTGTATGGTTCTTGGTCAATAAG
Unaligned ( gi|39 ): ATTAAATAAAGCATGTAGTACACCGTCAAATATTGATAAATGTCATGAGGGTTTGATGCAGGGAAATCCACTCTCCCCATTTCTATTTTCAGTTTATGTAAACTATTCATATAGAGTTCATAGAAATCGTTTTTGCTTATAAGGAAATTATTTGTATTGATTGTGTGT
Unaligned ( gi|43 ): TTCCAACAATCATCAACTTGAAATATTATAGAATTATTAAACTTGGTAAATATCTGTATAAATGCTCATCTATTAGATCTCTGTAATTGGAAGATTATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATTTACATCACTATTATATATTATGTTCTGTTATTATTTC
Unaligned ( gi|44 ): TGTTGCTTCGTAGTATTATCAAAAAGCTTTTGATAAAGATAAACAAAATATTGCTATTTTTTCAAATTAGCAAAAACATGGTATTGATTGTCAAATGTGACAAATTATCAAATCTATGTACTCTAACTATAATCATGTGTAATACAC
Unaligned ( gi|46 ): AGTAAATAACAACAAAAACAATGGTGTGTAAATGATACATTTCTGCACAATATTATTTTAAACACCCCTCTACTCTCAAGCTTGTACAATTATCATCAACTGGAAATATTTCGGAATTATGTAAATTTGGTAAATACCTAT
Unaligned ( gi|48 ): TTAAACTAAAAATGCATTTAGAAAATGTTCCAGCAACATAGTTGTCGTTGTTTAATTCGTATAATAGGCAAGTCCTACACATTATGGTTGTGTGGTGTGGGGCTCGCACATTCATGCAAAATTAACGATTTTGGAA
Unaligned ( gi|49 ): GAGAATCACTGTCACCCAAATTTTATTTTCGTTATATGTAAATGATTTTTGAAATGGAGTTCATAAAAAAGCTTGTGTGTTCCATTGAGGTTTCGTAGATATACGCTGATTGTCTTACTAAT
Unaligned ( gi|54 ): GATTATGTAAACTTGGTAACAACCTATATAAATGTTCATCTATCAGATCTCAGTTATTGTAAGATTATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTACATCAATATGATATA
Unaligned ( gi|56 ): TCATAAAGTTGAGTAGTTAATTATGTAAAATTGATAAATACTTATATAAATGTTCATTTATTAGTTCTCAATCCTCAGTATCTATCCTGTCCATGTACAT
Unaligned ( gi|61 ): CAACATATGGCATGTCACTAAATACTAGAAAATTGAAAAAGGTAGATATTTATATGTTTCAAGAATGAAAGAATTGTAAAAT
Unaligned ( gi|63 ): GTGTAAATCGTCCAATATCTATGACGTCGTGTCAGATGCTCGATTTGTGTTTTTAAAAAAAAGAGTTATGGTACTA
Unaligned ( gi|66 ): TAATGTGCTGCTTGTATACGCATTATACTTATCAACTGTATAGTTCTTGGTCAATGAATAATAC
Unaligned ( gi|67 ): TATTTGAGAAGCATGCTCTATTTCATGTTTACAAATTGGTTTTATAACTTATAGAATATATCT
Unaligned ( gi|75 ): ATTTTTAATTAATAATATAATTTTTTTCCTAATAAATTTT
Unaligned ( gi|76 ): GTATGGTTCTTGGTCAATAAACAATACAAACAATA
Unaligned ( gi|77 ): CGTTCGATTCGGTAAATAGGGGTATGTTGT