lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            11111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                              22222     2    1           11                         88888888888888888888888888    11                       11   11               11111      111111                       7777777777777777               333333333          1111      22222    1   11  11111              33333333              1                                      3333333333333333333333333333                                      222222222222             22       2222222                                                                       1111111  11111111111111       22222222222222222222222222222            111111       00000000000000000000000000000000000000000000                    111111111        11      55555555                11111                   1111             11      22222222                      7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777                        111111111111111111111111111     111                             33333333333                                                   22222222222222222222222                                                1111111        222222222                             222222222      2222                 222           444444444                             888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888      1               111111      111           1      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                              22222     0    1       5   11      5        0         22222222222222222222222222    33   5 5   5   66  7 0   77   11 6  5      4   44444  555 333333 4     66  4           0000000000000000         9999  444444444      666 6666   3  44444 44 0   44  55555     7777     55555555        66    8  444 777   1  2     555     3  44  3 4444444444444444444444444444      555 44     3  999999   999 3    888888888888   44   9    22       4444444  66666 5555 66666  2  666        2      33  5555  66    2 8 4  2  88  6666666  44444444444444  33   66666666666666666666666666666     55555  555555     2 66666666666666666666666666666666666666666666   2        4444    666666666  77    55 22   11111111 333    1 22  1 11111 1  22 88  4444    4444  22  4 99   11   2  55555555  333   333   22 2 2  4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444  2 4   44  4  0     1  222222222222222222222222222 1 1 000 666   333 333 999        3  11111111111 0   22   3333  1  1 3333    333   1  1  888888 1  22222222222222222222222  33   11  1 555555   33     33333 222 33333 11 5555555 33333  666666666  5555555555 11 222 1    444 333333333      8888     111   1 1 2 666 444     1 666666666    55    111 1     2 222  4 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555      5  1   33  2    222222 222  555     2     3    6 
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                              .....     .    .       .   ..      .        .         ..........................    ..   . .   .   ..  . .   ..   .. .  .      .   .....  ... ...... .     ..  .           ................         ....  .........      ... ....   .  ..... .. .   ..  .....     ....     ........        ..    .  ... ...   .  .     ...     .  ..  . ............................      ... ..     .  ......   ... .    ............   ..   .    ..       .......  ..... .... .....  .  ...        .      ..  ....  ..    . . .  .  ..  .......  ..............  ..   .............................     .....  ......     . ............................................   .        ....    .........  ..    .. ..   ........ ...    . ..  . ..... .  .. ..  ....    ....  ..  . ..   ..   .  ........  ...   ...   .. . .  ...................................................................  . .   ..  .  .     .  ........................... . . ... ...   ... ... ...        .  ........... .   ..   ....  .  . ....    ...   .  .  ...... .  .......................  ..   ..  . ......   ..     ..... ... ..... .. ....... .....  .........  .......... .. ... .    ... .........      ....     ...   . . . ... ...     . .........    ..    ... .     . ...  . ........................................................................      .  .   ..  .    ...... ...  ...     .     .    . 
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                              00000     0    4       7   11      7        7         00000000000000000000000000    22   0 0   0   99  4 8   55   99 0  0      4   00000  777 999999 4     11  4           2222222222222222         4444  444444444      444 0000   6  55555 66 0   66  22222     1111     55555555        99    7  666 333   1  7     444     1  22  1 7777777777777777777777777777      444 22     1  666666   444 3    222222222222   22   5    99       2222222  77777 7777 77777  5  999        5      44  3333  44    4 0 7  4  11  2222222  77777777777777  44   99999999999999999999999999999     99999  666666     4 88888888888888888888888888888888888888888888   0        2222    222222222  00    33 55   77777777 333    8 55  8 66666 9  99 22  5555    7777  99  2 22   33   0  99999999  777   555   77 0 0  9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999  0 0   88  0  9     9  666666666666666666666666666 9 9 333 777   333 333 000        5  00000000000 6   22   9999  8  7 7777    000   7  7  666666 7  99999999999999999999999  33   99  4 999999   22     33333 333 22222 77 6666666 00000  888888888  0000000000 66 000 1    333 888888888      1111     999   1 1 1 222 555     1 333333333    99    999 1     3 000  6 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111      9  3   55  6    777777 333  777     6     3    0 
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTGAAATTTTANACT-CTTTGGGCAT-GTTAAGA-GTT-GATGACA-GAGCCACTCAATTAAGAT-------T---------G-A-C-T--TTTT-AATA-T-ATT-TCA--TGGTAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG--AT-AA-A-TTT-A--T-ACTAA--AC-AAAAATAATACT------A-AG-GTG-CTACCAATA----AT-A--TTN--GTCATA---CCC--AAG-AT--C--A--A-GGC--AA-G---AATCC----TCATG--TTTTNATTATAATG-CCATTAAA-G-A---TTGGAA-TACTT---TGCCT-TT--AG-AG----ACAA--A----------------ACAGTT---G--TCAGC-AA------AAC--AA-AGTT----------TNAAA--AAAAGCTGTTAAAGTCGN------TT-----T----T-----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-NCATG-ACG-CC-AT-GTCC------AG--------------TT--TTG----TTAA--T-C--TT------A---T-TTTTA-----TTAA--A-TTAAA-TCC-TAG-C------GTT---------T-T----A---TT-----ATA-TGCTCGAA----ACATG------T-CA-TTTTT-TC--AAT--GCA--AT---TATG-C--AA-CN----A-TT--TC-AT----AAAA--ACCT--GC-C--AAA--TTC-CA--A-T---AC---TAG---TCTC-G-T-AT----T----AT-----AA---ATTA-TTTA--------AA--TA--T--T-T-AT--AT------T-AT-T-ATT--AT-TTGATTAT-TT----------A-T--------------T-T-G-T-A---GTA---A---GGACCCCATTGG-AA-TAA--NT---CTGAT-TTCA----GC-TT-T----TATG---GGT-TA-TC----C-T-TA--G-TT------AT-----TA-ATA--TCA--TT-A------TAT--GTCAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T---N--TT----------T--A---A-TTAT---T--A-----ATAATTGC--CATAGT---GCC-A-T-A---A---TTATG-TC--A-GGT-TTCAN-TTTG---TGATTTT-A---AG-T-T-AT-ATCA-------T----GACA-T--T----------TGT-GA----TC---A---TTATG--ATCATGACATTCTG-TGA--TA-TTTT------T---ACC--TGAAT-AAAATGAAATGA
Reference ( gi|5 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTGAAATTTTACACG-CTTTATGCAT-GTTAAGA-GTT-AATGACA-GAGCCACTCAATTAAGAT-------T---------G--------TTTT-GATA-T-ATT-TCA--TGATAATGAACCA--AGCT-ACCTTT-GTG--AT-AA-A-TCT-A--T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC-------A-AG-GT--CTACCAATA----AT-A--TTA--GTCATA---CAC--AAG-AT--C--A--A-GGC--AA-G---AATCC----TCATG-ATTGTAATTATAATG-TCATT-AA-G-A---TTGGAA-TACTT---TGCCT-TT--AG-AG----AC-A--A----------------ACAGTT---G--TCAGC-AA------AAC--GA-AGTT----------TAAAA--AAAGGCTGTTAAAGTCGA------TT-----T----T-----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-TCATG-ATG-CC-AT-ATCT------AG--------------TT--TTG----TTGA--T-C--TT------A---T-TTTTA-----TTGA--A-TTAAA-TGC-TAG--------GTT---------C-T----A---TT-----ATA-TGCTCGAA----ACATT------T-CA-TTTTT-TC--AATA-GCA--AT---TATG-C--AA-CC----A-TT--TT-AT----AAAA--GTCT--GC-C--AAA--TTC-CA--G-C---AC---TAG---TCTC-G-T-AT----C----AT-----AA---ATTA-TCCA--------AA--TA--T--T-T-AT--AT------T-AT-T-ATT--AT-TTGATTAT-TT----------A-T--------------T-T-G-C-A---GTA---A---GGATCCCATTGG-AA-TAA--TT---CTGAT-TTCA----GC-TT-T----TATG---GGT-TA-TC----T-T-TA--G-TT------AT-----TA-ATA--TCA--TT-A------TAT--GTCAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T---A--TT----------T--A---A-TTAT---T--A-----ATAATTGC--CATAGT---GCC-A-T-A---A---TTATG-T---A-GGTGTTCAG-TTTG---TGATTTT-A---AG-T-T-AT-ATCA--T----T----GACA-T--TG--------ATGT-GA----TC---A---TTATG--ATCATGACATTATG-TGA--TA-TTTT------T---ACG--TGAAT-AAAATTAAATAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTGAAATTTTACAGT-CTTTAGGCAT-GTTAAGA-GTT-GATGACA-GAGCCACTCAATTAAGATTTAACCAT---------GT-------TTTT-AATA-T-ATT-TCA--TGGTTATGCCCCA--AACT-ACCTTT-GTG--AA-AA-T-TTT-A--T-ACTAA--AC-AAAAATAATACTA-----G-AG-GTG-CTACCAATA----ATAA--TTAT-GTCATA---CCC--AAG-AT--CA-A--A-GGCA-AA-G---AATCC----TCTTG--TTTTTATTATAATG-CCATTAAA-A-A---TTGGAA-TACTT---TGCCT-TT--AG-AG----ACAA--A----------------ACAATT---G--TCTGC-AA------AAC--AA-AGTT----------TAAAA--AAAAGCTG-TAAAGT---------TT-----T----T-----AG-CC---AGCAAAGC-AAGGGA--AG----TT-TCATG-ACGACC-AT-GTCTTGAAACAGGATGATTTGGCAGTTT--TTG----TTTG--T-CAATTGGGGAAA---A-TTTTA-----TTAA--A-TTAAA-TTC-TAGTCTT----GTT---------T-TAAA-A---TT-----ATA-TGCTTGAA----TCATG------T-CA--TTTT-TC--AAT--GC---AT---TATG-C--AA-CA----A-T
gi|4                          : ttaataagtatattgttaattgcaactcacacaggagtgaaaaactctagacttaagattgttatacagaatgcttctggccctaaataggccagtctaaaaatactttatgttctgctttaatacaatgctattttgattatgctgcttcttcatggtatagtggtattggcaaacaatttcaacatagattgcaagttacacaaaataaagttgttagatttattctaaatctaggtcctagaaccagtatttctTGTGATATTTCAGACT-CTTTG-ACATTGCAAAAA-GTT-GATGACA-GAGCTAATCAATTAAGAT-------T---------GAACCTTA-TTTT-AATA-T-ATT-T-A--TGTTAAAGCACCG--CACT-ATTTTT-GTG--AT-CA-A-TTC-G--T-ACTAA--AT-AATGATAATGCTTG----A-AG-TG--CTACCAACA----AT-A--TT---GTTATA---GGT--AGG-AT-----A--A-AAT--AA-AAATAATCT----TTTTG-A---TAA----AAT----ATT-AA-G-A-------AT-TACT---------------------------------------------------T---G--TCAGC-AA------AGC--AA-AGTT----------TGAAA--AAAAGCTG-TAAAGTCGT------TA-----T----T-----AG-CCTCTAGTA---C-TTTGGA--AG----TC-GCATG-ACG-TC-AA-GTCC------AG--------------TT--TTG----GT-ACTT-C--TT------A-----CTTTA-----CTCT--A-TCAAA-TCG-TA---------GTT---------A-T----A---TTTTAAAATA-TGTGCGAG----CCATG------A-CA--TTTG-TC--AAT--GCATTATACATGTA-C--AA-CT----A--T--TT-GT----CAAA--TCCT--GCTT--AAA--CTA-GAATG-CTATAC---TAA---TCTT-G-T--T----------------------TTA-TTC---------AA--TG--T--TCT-GT---C------T-GT-TGATC--ACATTCACTAT-GT----------A-A--------------T-----C-A----TA---A---GAACCCTATTGGAAA-TAA---G---CTAAA-TTCA----GCTTT-T----TTTA---AGT-TA-T-----T-C-TAAGG-TT------AT-----T--ATA--TCT--TT-A------CAT--GTCAT-----G---A-----T--A----T--C-----CA---------------------T--A---A-TAATA--T--A-----ATTATGGCTGCATAGT---GCT-A-C-AG--A---TTATA-TC--A-TGT-TTCAA-TTTG---TGATTTT-A---AA-T-TCATAATCA-------T----GACA-T--Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttctttctcatttcattttattca
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                             acagcaaagttgtgagatttattctatatctatgtcgtagagtaagtgtttctTGTGAAATTTTACAAGTCTTTAGGCATTGTTAAGATGTTGAATG-CATGAGCCACT-AATTAAGAT-------TAACCGTATGG--------TTTT--ATAAT-ATT-TCAAGTGGTTATCT-CCAC-AACTGACTCTT-GTG--AA-AA-A-TTTTG--T-ACTAAGAAC-AAAAATAATACT------A-AG-GTG-CTACAAATA----AT-A--ATT--GT-ATAGCCCA---AAG-AT--C--A--AAGGC--AAAG---AATCC----GCTTG-TTTTTA-TTATAATG-CCATT-AA-A-AAAATTGGAAATACTT---TGCCT-TT--AGAAG----AC-A--A----------------ACAATT---GTCTCAGC-AAAGACACAAC--GA---TTATAACAAAAATAAAA--AAAAGCTG-TAAATT---------TT-----T----T-----AGCCC---AGCAAAGCAAAGAGG--AGATGTTT-TCATG-ACGACC-Actctgatattttacacttgaataaaataagcc
gi|16                         :                                                                                  aatgactttatgttctggctttaatacacattgccttattttgattatgcctgctttcttcaatggtaatgtggtagtggcaaacaattcaaatagaattgcagttacaaacaaaatataagttgttagatttatcttctgaaatctaggtctacgaaactccaagtttaatttctTGTGAACTTCTAGACT-CTTTGGGCAT-GTTAAGA-GTT-TATGACA-GAGCCACTCAACTAAGAT-------T---------GAACCTTGTTTTC-AATA-TAAAT-CCA--TGGCAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG--AT-AA-A-TTT-A--T-ACTAA--ACAAAAAATAATAC-------atgcgcgtcttgaaacaggagaggattttggcagttttgtttgtcaagttgcgggaaaatatgtttaaaattaccaagagttctagctgtgtttataaaattatactgcttaatcatgtacaatttttgcaatgcattatggcaacaaatttcataaaaagcctgcccaaaattcatacagtctcgcattaagttattaatattattatattactatttgattattacttgttagtaagaccctttgaaaattaagcgattttagctttttgggttatcctttaggctattatatctcatttatatgtcatgttaaccatactttaaattattaaattgcattagtgccaatagattatgtcaagtttcattttatgattttaagttatgatcatcatattctgtgatatttttacctgaataaaatgaaatga
gi|32                         :                                                     actcctaagaccttagatttttatacagaatgcattcttgcctaaggattttatgttctgctttgatcaagttattttttatatgaagctccaatttggaagttttttaggcaataaatttgaacatagattgtaaagttgatccttagcaaaaataaagttgtccagatttattctaaatcttggtcctagaaccaggatttctTGTGAAAGTTTA-GCT-CTTTGGGAAT-GTTA-GA-GTT-GAT-ACA-GAGCCACTCAATTAAG-----------------------------TTT-AATA-T-ATT-TCA--TGGCAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG--AA-AA-T-TTT-A--T-ACTAA--AC-AAAAATAATACTA-----G-AG-GTG-CTAta
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                    acataaaataaagtgattagattattctaaacctaggtcctagaaccagtatttctT-GTTAAGA-GTT-GGAGACA-GAGTTACTAAATTAAGAT-------T---------GAATCATA-TCTT-GACT-T-GTT-TCA--TAGTAACGTGCCA--AATT-ATCTTT-GTGTCTT-AGTA-TCA-AG-C-ACTAA--AC-AATAATAATAC-------T-AGAATTGCTACCAATA----AG-AATTTT--GTCATA---CCT--TAG-ATA-A--A--A-GGC--AA-G---------------TG-AATTTTATTCTA-----CAT-----------TTG-------TT---TGCCT-TT--AA-AAACTTAC-A--A----------------AC-GTT---A--ACCAC-AA------AAA--AAGAGTTGGGTTTTC--CAAAAACAAAAGCTGTAAAACTAGA------TTATCAAT----T-----AA-TT---TAAAAGAC-AAAGAA--TG----TT-ACATA-ATG-GT-AT--TCTC-----AG--------------TA--CTG----TTA-----C--TT----------T-TTTCATCTATTTCA--C-TTAAA------A----------------------------A---TC-----ATG-T-CT-GAA----ACGTG------T-CA-TTTTC-GC--AAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                    ggcattctagattatttgatcattT-ATTAAAC-GTT-GATAACA-GAGCTACTCCATTAga
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                gtgtttgcaagcaacttattgcaagtaacccaaacaatgtcgaatgttcatatttattctaaatcaaggccctaaatagacccaacatttttaaatgtgactttttaaataaattctttgggcaagctagAT-------G---------G--------TCTT-AATA-T-ATT-TCA--TGGTTATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG--AT-AA-A-TTT-A--C-ACTTA--AG-AAAAATAATACCGTACTAG-AG-GTG-CTACCAACA----GTAA--TTAT-GTCATA---CAC--AAG-ATAAA--A--A-GGCA-AA-G---AATCC----TCATG-TTT---ATTATAATG-CCACTAAA-G-A---TTGGAA-TACTT---TGCCT-TT--AG-AG----ACAA--A----------------ACAGTT---G--TTAGC-catattaaagattaagacatgtttgatttcaaatactatatatatcgagcattaaccagttaatactaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaccacccgtaagattttttttcggtgcaatgtcaaaaaggatcgaaatacctagcgtttagaagcaaaaccgcgacagcaaagtcgagtaaagttttcactagccagtaaggcatggatattacatgaatgtccagttttacaagtacttatttattttaaagataaaatattagccctttattttaatatgtgtttgaaacatatcctttttaacgcattatgcaactattactcacaacctgccaaaatttcaatgttagtcttgtattatttattattttttcctgttaatcacatgtaatatacaagctaggactccaatttcagccctgaggttatcacaatattatcattaataagtcgctttccatgttacttaattcttttaattgtcaaaattgcacagtggtacacattatatccgctttccttttgttattttgaatccacaatcatgacattccttgaaattttcc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cc-------T---------G--------TTTTCAATA-T-ATTGTCA--TGGTAATACACCCCTAACT-ACCTTTTGTG--A--AA-A-T-T-AAATGACTAA--AT-AAAAATAATACT------A-GG-GTG-CCACCAATATACAAT-A--T----GTCA-A---CCC--AAGTAT--A--A--A-GGC--AAAG---AATC-----TCATG--TTTTA-TTATAATG-CC-TT-AA-G-A---TTG-AA-TACTT---TGCCT-TT--AG-AG----AC-AACA----------------ACGTTT---G--TCTGC-CA------AACAAGA-GGTT----------TTAAA--AAAAACCCTTAAAGTC-A------TT-----T----TTTATAGG-CCA--AGCA--GC-AAGGGATCGT----TT-TCATG-A-G-CC-ATAATCG------AA--------------TT--TTT----GTGA--TAC--TT------A-----TTTTG-----TTTA--A-TTAAA-T---------------TT---------T-TATA-A---TT-----ATA-AGCTCGAA----ACAGT---------A--TTTT-TC--AAT--GC---AT---TATG-C--AA--C----A--C--TC-AT----AAAC--ATCT--GC-C--AAA--TTC-CA--------AG---TAG---TCTC-G-C-AT----T----AT-----AT---ATT--T-----------AA--TA-----T-C-AT--A-------T-AT-T-ACT--CT-TT-ATTAT-TCA---------A-T--------------T-T-G-T-A---GTA---A---GGAATTCATTGG-AA-TAA---G---ATGAG-GTCA----GC--T-G----TATG---GGT-TA-TC----C-T-TA--G-TT------AT-----T--ATA--CAA--TT--------TATG-GTCAT-----G---T-----T--A-------A-----CA--T---AACTT----------T--A---A-CT-T---T--------ATAATTG---CATAGT---GCC-A-T-A---G---ATATG-C---A-AGT-TTTAT-TATG---TAA-TTT-A---AGTT-T-ATGATCA-------T----GACA-T--TG-------------------TC-------TT---------------------GA--TA-TTTT------T---ACC--TAAAT-AAATTGAAATG
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaccaTT-GTGC-ATCAA-ACTAT-A--T-ACTGA--GT-AAAAATAAGACTAG----A-AG-TT--CTACTTGTA----AT----TTT--TTCATA---C-CTAAAG-AT--A--AATA-AAA--AA-A---AACCCTTGTTTATACATTGT-ATTACAAAT-TCATTAAA-G-A---TT
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAATAATACT------ATAT-GTG-CTTCCAATA----AT-AA-TTAT-GTCATA---CCC--AAG-AT--CA-A--A-GGTA-AA-G---AATCC----TCATG--TTTTTATTATAATG-CCATTAAA-G-A---TTGGAA-TACTtttaaaaggctgtaaagtcgctactatccatcaaagcaagaaaagtcacatgaagtcatgtccagttttgctaatattttttattatcaaattccagttttatattttaaagtatgtccgaaacatgtcctttttgtcaatgtattatgcaactacatgtattacaagtatttaaagcatgcc
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gAAAATAATACT------ATAT-GTG-CTTCCAATA----AT-AA-TTAATGTCATA---CCC--AAG-AT--CAAA--A-GGTAAAA-G---AATCC----TCATG--TTTTTATTATAATGCTTATTAAA-G-A---TT-GAA-TACT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              g--GTCATA---CCT--AAG-AT--C--A--AAGGC--AAAG---AATCC----TCATG--TTTTATTTTAAATG-CCATTAAA-G-A---TTAGAT-AACTT---TGCCT-TTAGAG-AG----ACAA--A----------------ACAGTT---G--TCTGCAAA------AAC--AA-AGTT----------TTAAA--AAA-GTTGT---AGTCGT------TT-----T----T-----AG-CC---AGCAAGGC-AATGGA--AG----TT-TCATG-ACG-CC-AT-ATCG------AG--------------TT--T------------T-T--TT------A-------TTA-----TTAA--A-TTAAATTGA-TAC--------GTTGTTACTTCGC-C----A---TT-----TTA-TATCCTAGTCCTACGTTTTAAAAT-CA-TATGC-TCGAAATATGTC--AT---TTTC-CTGAA-CA----A-TT--TC-AT----AAAA--ACCT--GC-C--AAA--TTC-CA--A-T---AC---TAA---TCTC-A-C-AT----T----AT-----------TTA-T-------------------T--T-G-AT--AT------T-A--T-AAT--A-----------TT----------A-T--------------T-T-G-T-A---GTA---A---AGACCCCATTc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --GTCATA---CCC--AAG-AT--C--A--AAGGC--AA-GG--AATCT----TCATG-TTTTTA-TTATAATG-CCATT-AA---------------AC-----TGCCA-TT--AA-AA----TG-G--A----------------ATAGTTTTAG--CCACC-AA------AGC--AA-GG
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aat--A-GGC--AAAG---AATCC----TCATG--TTTTTATTATAATG-CCATTAAA-A-A---TTGGAA-TACTT---TGCCT-TT--AG-AG----ACAA--A----------------ACAGTT---G--TCAGC-AA------AAT--AA-AGTT----------TTAAA--AAA-TCTG-TGAAGTCGT------TT-----T----T-----AG-CC---AGCAAGGC-gaattcatacgccatttgatgcttatttattaaattaaatcctagtctacgttgttaaaatcatatgcttaaacctgtcattttcaatgcaatgcaacaatttcataaaaacctgccaaaatccatgctattctaattattagtatttttaatatatattactattaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtcatgttaactaccatacgttaaattatatattaatgcatattccatgaaaatcattcaagttaattagtcatttaattgatgatcagacattctgtatatttgacctgaataaataaatg
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tcaaaatgtagctgtCATG-TTTTTA-TTATAATG-CCATT-AA-A-AA--TTGGAA-TACTAAAATGCCT-TT--AG-AG----ACAA--A----------------ACAGTT---G--TCAGC-AA------AAC--AA-AGTT----------TTAAA--AAAAGCTG-TAAAGTCGT------TT-----T----T-----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGT--AG----TT-TCATG-ATG-CC-AT-ATCC------AG--------------TT--TTG----TTGA--TAT--TT------A---T-TTTTA-----TTAA--A-TCAAA-TCC-TAG--------
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGATTGCAATG-CCATT-AAAG-A---TTGGAA-TGCTT---TGTCTGTC--AG-AA----AC-A--ACTTATGCAATATCATAACAGTT---G--TCGGC-AA------AGC--TA-AGTT----------TTTAA--AAAG-CTGT-AAAGTCGC------TA-----T----T-----AG-CC---AGCAAGAC-ACGTGA--AG----TC-ACATG-ACG-TC-AT-GTCC------AG--------------TT--TTG----TTAA--TAC--AT------A---T-TTTTA-------AA--A-TTAAA-TCC-TAGCCCTAC--GTT---------T-C----AAT-TC-----ATA-T--CCGAA----ACATG------C-CA--TTTT-CC--AAT-------TT---TATG-C--CA-CT----A-TT--TC-AT----CAAA--ACTT--GC-CA-AAA--TTC-CG--A-T---AC---TAA---TCTT-G-T-AT----T----AT-----AA-----TAGTACA--------TG--CA--T--T-T-ATTCGT------TAAT-T-GTTG-GT-TTGGTTTT-TT----------T-T--------------T-T-tcttac
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcaatgggtttttttgttctccaaAATG-TCAAA-AA-GGA---TCGAAA-TACCT---AGCGT-TT--AG-A------------------------------------------AGC-AA------AAC--CG-CG--------------------ACAGC----AAAGTCGAGTAAAGTT-----TTCACT-----AG-CC---AGTAAGGC--ATGGA--TA----TT-ACATG-A------AT-GTCC------AG--------------TT--TTA----CAAG--TAC--TT------A---T-TTATT-----TTAAAGA-TAAAA-TAT-TAGCCCTTT--ATT---------T-T----A---AT-----ATG-TGTTTGAA----ACATA------T-CC-TTTTT-----AAC--GC---AT---TATG-C--AA-CT----A-TTACTC-AC----AA-----CCT--GC-CA-AAA--TTT-CA--A-T---GT---TAG---TCTT-G-T-AT------------------------------------------TA--T--T----T--AT------T-AT-T-TTT--TC-CTG-TTAA-TC----------A-C--------------A-T-G-T-A---ATATACA---AG---CTA--GG------A--CT---CCAAT-TTCA----GC-CC-T----GA-----GGT-TA-TCACAATAT-TA----TC------AT-----TA-ATAAGTCGCTTT-C------CAT--GTTAC-----T---T-----A--A----T--T-----C---T------TT----------T--A---A-TTGT---C--A-----A-AATTG---CACAGT---GGT-A-C-AC--A---TTATA-T---C-CGCTTTCCT-TTTG---TTATTTT-G---AA-TCC-ACAATCA-------T----GACA-T--Tataat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                              gtgtttgcaagcaacttattgcaagtaacccaaacaatgtcgaatgttcatatttattctaaatcaaggccctaaatagacccaacatttttaaatgtgactttttaaataaattctttgggcaagctagtattaaacgttgataacagagctactccattacatattaaagattaagacatgtttgatttcaaatactatatatatcgagcattaaccagttaatactaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaccacccgtaagattttttttcggtgcGGAA-TACTT---TGC-------------------A--A----------------ACAGTT---G--TCAGC-AA------AAC--AG-AGTT----------TTAAA--AAAAGCTG-TAAAGTCT-------TC-----T----T-----AC-CC---AGCCAGGC-TAGGGA--AG----TTGTCATG-ACG-CCAAT-ATCA------AG--------------TT--T---------G--T-C--TT------A---CGTTTTA-----ccttgaaattttcc
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TT----------TAAAA--CA--GCTGT-AAATTCG-------TT-----T----T-----AG-CC---AGTAAAGC-AAGAGA--AG----CA-TCATG-ACG-CC-AT-GTCC------AG--------------TT--TTG----TTAA--T-A--CT------ATTTT-TTTTA-----TTAA--ATTTAAA-TCT-TA----------TTCTTAC----C-T----A---TTAAATGATA-TGCACGAA----ATA-T------G-CA-ATTTT-TC--AAT--GC---AT---TATG-C--AA-CT----A-TT--TA-ATTAAAAAAA--ACCT--GC-CA-AAA--TTC-CA--A-T---AT---TAG---TCaaaattatagagaacagaagaacagaatgtttatttctaatcagagtccaaaacagacaaagtgagttcataacaacattagaagattatatgcttgaaacatgtcatttttcaatgcattatgcaaaccatttcatcacaacctgccaattccaatactagtgtcgcattataaattatttaatatttatatatatattattgtttgattatttatttgtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaggttatatcattatatatgtcatgttatccattctttaattattataagtgcacagtgccatataacttatgtcaagtttcagtttgtgattttaagattatgatcatgacattctgtgatattttttacctgaataaaatgaaatga
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gtA--AAAGGCTGT-AAAGTCGC------TA-----C----T-----AT-CC---ATCAAAGC-AAGAAA--AG----TC-ACATG-AAG-TC-AT-GTCC------AG--------------TT--TTG----CTAA--T-A--T-----------T-TTTTA-----TT----A-TCAAA-TTC-CAG--------TTT---------TAT----A---TTTTAAAGTA-TGTCCGAA----ACATG------T-CC-TTTTTGTC--AAT--GT---AT---TATG-C--AA-CT----A-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttgtgcatcaaactatatactgagtaaaaataagactagaagttctacttgtaattttttcatacctaaagataaataaaaaaaaacccttgtttatacattgtattacaaattcattaaagatttttGCCATTAAAATGGAATAG--TT-----T----T-----AG-CC---ACCAAAGC-AAGGGA--A------T-TCAT--ACG-CC-AT--------------------------------------TTGA--TGC--TT------A---T-TT--A-----TTAA--A-TTAAA-TCC-TAGTCTAC---GTT---------G-TTAAAA---TC-----ATA-TGCTT-AA----ACCTG------T-CA-TTTT---C--AAT--GCA--AT------G-C--AA-CA----A-TT--TC-AT----AAAA--ACCT--GC-C--AAA--ATC-CA----T---GC---TAT---TCT-------------------------A---ATTA-TT----------AG--TA--T--T-T-TT--AA------T-ATAT-ATT--AC-T--ATTA--AT----------A-T--------------T-N-N-N-N---NNN---N---NNNNNNNNNNNN-NN-NNN--NN---NNNNN-NNNN----NN-NN-N----NNNN---NNN-NN-NN----N-N-NN--N-NN------NN-----NA-----------------------T--GTCAT-----G---T-----T--AAC--TA-C-----CA--T---ACGTT----------A--A---A-TTATA--T--A-----TTAA-TG---CATA-T---TCC-A-T-G---A-------------A-AA---TCA-------------TTC-A---AG-T-T-A--ATTA--G----T------CA-T--T------------T-AA----T--------TGATG--ATCA-GACATTCTG-T-A--TA--TTT------G---ACC--TGAAT-AAA--TAAATcatgtattacaagtatttaaagcatgcc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aatgtcatacccaagatcaaaggcaaggaatcttcatgtttttattataatgccattaaactCTGT-AAAGTCCA------TA-----T----T-----AG-CC---AGTAAGAC-AATGGA--TA----TT-ACATG-ATA-CC-AT-GTGC------AG--------------TG--TTG----TCAA--T-TA-TT------A---T-ATTTA-----C--A-----CAAA-TA--TAGC-------CTT---------C-T----A---TTATGAAATA-TGTTTGAA----AC-TT------A-TA-ATTTT-TC--GAC--GCA--A----AATG-C--AA--T----A-TT--CA-TT----CAAA--ACCT--TT-C--AAA----------------AC---------TCTT-G-T-ATTTGCT----AT-----TA---GTTG-T---------------TG--T--T-T-GT-------------C-T-GTT--TT-TTCA-TAC-TT----------C-T--------------TAT-G-T-AATTATA---G---GGATCCCATTGA-Ag
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -CC---AGCAAGGC-ATGGGG--AG----TC-ACATACACG-CC-AT-AGAC------AG--------------TTTATTATAATTCAA--T-C--TT------A-------TTA-----TT------TTAAA----------------------------------------------ATA-TGTTCGAA----ACTTG------T-CA-TTTTT-CT--AAGA------------ATG-C--AA-Ccattttatatcattgtatgccatgttatccatcatacttatcttgtaattacaagaattaatttcagcttttatgggttacccttagcttatcatatcttcattctatcatttttacaattgcatagtactatatagattatgtctggtttcaatttgtcatttgatcatgacattctctaattaatacatcgtaataaaaataaa
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GAGA--AG----TC-ACATG-ACG-CC-AT-GTCC------AG--------------TT--TTT----TTAA--TAC--AT------A---T-TTTTA-----GTC-----TTCCA-TTT-TAA--------G------------------A---TT---------TGTCCGAA----TTATA------T-AA-TTTTT--C--AAT--GC---AT---TATA-C--AA-CT----A-TT--TC-AT----AAAA--ACCT--GCAA--AAA--TTC-C
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CATG-ACA-CC-AT-GTCC------AG--------------TT--TTG----TTGA--T-A--TT------tatact
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTA-----TCAA--A-TTAAA-TCC-TAGTCTTAC--ATT---------T-T----AAAATT-----ATA-TGCTCGAA----AAATG------T-CA-TATTT--C--AAT--GTA---T---TATG-C--AA-CC----A-TT--TC-AT----AAAA--ACCA--GC-C--AAAA-TTC-CA--G-T---AC---TAG---TCTC-G-T-AT----C----AT-----AA---ATTA-TTT---------AA--TA--TTAT-T-GT--TT------T-AT----TT--AT-TTGATTAT-TT----------A-T--------------T-T-G-T-A---GGN---N---NNNNNNNNNNNN-NN-NNN--NN---NNNNN-NNNN----NN-NN-N----NNNN---NNN-NN-NN----N-N-NN--N-NN------NN-----NT-ATA--TCA--TT-A------TAT--GTCAT-----G---T-----T--A----T--C-----CAT-T---C--TT----------T--A---A-TTAT---T--------ATAATTG---CATAAT---GCC-A-T-AT--A---TTATG-TC--A-AG-ATTCAG-TTTG---TGATTTT-A---AG-T-T---------------------------------------TAT-GA----TC---A---T-----------GATATTCTG-TGA--TA-TTTT------T---ACC--TGATT-AAAATGAAAtaaaaaatcaaatcaaatcttaatgtctt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TA-----TTTA--A-TTAAA-TCCCTAGTCTTTGACGTT---------T-TTAAAA---TT-----ATA-TGCTTGAA----ACATG------T-CA-TTTTC--C--AAT--GCA---T---TATG-G--AA-CA----A-TT--TTCAT----AAAA--ACCT--GC-C--AAA--TTC-CA--A-T---GC---TAG---TCTCCG-T-AT----T----AT-----ATTT-ATTA-TTTA--------A---TA--T--TAT-AT--AT------T-AC-T---T--AT-TTGGATAT-TT----------AAT--------------T-T-G-T-A---GTA---A---G-ACCCCATTGG-AA---A--TTAAGC-GAT---CA----GC-TT-T----TATG---GGT-TA-TC----T-T-AG--G-TT------AT-----TAGAT---TCA--TT-A------TAT--GTCAT-----G---T-----TAAA----TA-C-----CAT-T---A--CT----------T--T---A-TTAA---T--T-----ATAATTG---CATAGC---GCC---T-A---G---TTA-------------TTCAA-TT-----TCATTTT------G-G-T-AT-CTTT--T----T----TAAA-----A--------AAGT----------------TTATGATATCATG-CATTCTGCCGA--TATTTTT------T---ACC--TGAAT-AAAATGAA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aA--A-TTAAA-TCC-TAGTCTTGAC-GTT---------T-TTAAAA---TT-----ATA-TGCTTGAA----ACATG------T-CA----TT-TC--AAT--GC---AT---TATG-C--AA-CA----A-TT--TC-AT----AAAA--ACCTTGGC-C--AAA--TTC-CA----T---GC---TAG---TCTC-GCT-AT----T----AT-----TATTTATTA-TTT---------AA--TA-----T-T-AT--A-------T-AT-T-ACT--AT-TTGA-TAT-TT----------A-T--------------T-T-GTT-A---GTA---ATTGAGACCCCATTGA-AA-TTA--AG---CTGA--TTCA----GC-TTCT----TATG---GGTGTA-TC----C-TATAG-G-TT------A------TA-AGAT-TCA--TT-A------TAT--GTCAT-----G---T-----T--AAAC-TAAC-----CAT-T---A--CT----------T--T---A-TTAT---T--------AT-ATTG---CATAGC---GCC---T-A---G---TTATG-T---C-AATTTTCAT-TTTG---TCATTTT--------T-T-A------------------AAAG-T--T----------TAT-GA----TC---A---T-----------GACATTCTG-CGA--TA-TTTT------T---ACC--TGAAT-AAAATGAAttg
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tt----A---TT-----ATACTGCTT-AA----TCATG------TACAATTTTT-GC--AAT--GCA---T---TATGGC--AA-CA----AATT--TC-AT----AAAAA-GCCT--GC-CCAAAA--TTC-----A-T---AC----AG---TCTC-G-C-AT----------T-----AA---GTTA-TT----------AA--TA--T--T-A-TT--AT--------AT-T-ACT--AT-TTGATTAT-T-----------A-C--------------T-T-G-TTA---GTA---A---GA--CCCTTTGA-AA---A--TTAAGC-GAT-TTTA----GC-TT-T----T-TG---GGT-TA-TCC---T-T-TA--GGCT------AT-----TATATC--TCA--TTTA------TAT--GTCAT-----G---T-----T--A----A--C-----CA--T---A--CT----------TTAA---A-TTAT---T--A-------AATTGC--ATTAGT---GCCAA-T-AG--A---TTATG-TC--A-AGT-TTCAT-TTTA---TGATTTT-A---AG-T-T-A---------------------------------------T-GA----TC---A---TCAT-----------ATTCTG-TGA--TA-TTTT------T---ACC--TGAAT-AAAATGAAATG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                          aatgactttatgttctggctttaatacacattgccttattttgattatgcctgctttcttcaatggtaatgtggtagtggcaaacaattcaaatagaattgcagttacaaacaaaatataagttgttagatttatcttctgaaatctaggtctacgaaactccaagtttaatttcttgtgaaattttacaagtctttaggcattgttaagatgttgaatgcatgagccactaattaagattaaccgtatggttttataatatttcaagtggttatctccacaactgactcttgtgaaaaattttgtactaagaacaaaaataatactaaggtgctacaaataataattgtatagcccaaagatcaaaggcaaagaatccgcttgtttttattataatgccattaaaaaaattggaaatactttgcctttagaagacaaacaattgtctcagcaaagacacaacgattataacaaaaataaaaaaaagctgtaaattttttagcccagcaaagcaaagaggagatgttttcatgacgaccaatgcgcgtcttgaaacaggagaggattttggcagttttgtttgtcaagttgcgggaaaatatgtttaaaattaccaagagttctagctgtgtttataaa----A---TT-----ATA-TGCTTGAA----ACATG------T-CA-TTTTT--C--AAT--GCA---T---TATG-C--AAACC----A-TT--TC-AT----CACA--ACCT--GC-C--AA---TTC-CA--A-T---AC---TAG---TGTC-G-C-AT----T----AT-----AA---ATTA-TTTA--------A---TA--T--T-T-AT--ATATA---T-AT-T-ATT--GT-TTGATTAT-TT----------A-T--------------T-T-G-T-A---GNN---N---NNNNNNNNNNNN-NN-NNN--NN---NNNNN-NNNN----NN-NN-N----NNNGACAGGT-TA-T-------------A-TC------AT-----TA------------T-A------TAT--GTCAT-----G---T-----T--A----T--C-----CAT-T---C--TT----------T--A---A-TTAT---T--------ATAAGTG---CACAGT---GCC-A-T-AT--AAC-TTATG-TC--A-AGT-TTCAG-TTTG---TGATTTT-A---AGAT-T-ATGATCA-------T----GACA-T--T---------CTGT-GA----T----A---T-----------------------------TTTT------T---ACC--TGAAT-AAAATGAAATG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ggaatactttgcaaacagttgtcagcaaaacagagttttaaaaaaagctgtaaagtcttcttacccagccaggctagggaagttgtcatgacgccaatatcaagtttgtcttacgttttaaaaattatagagaacagaagaacagaatgtttatttctaatcagagtccaaaacagacaaagtgagttcataacaacattagaag----A---TT-----ATA-TGCTCGAA----A-GTG------T-CA-TTTTT-----AAT--GCA---T---TATG-C--AA-CA----A-TT--TTCAT----AAAA--ACC---GC-C--AAAC-TTC-CA--AAT---AC---TATCACTCTC-G-CGAT----T----ATTTATTAA---TTTA-TTTACTTTATTTAA--TA--C--T---AT--AT------A-GT-T-ACTTAAT-TTGATTATCTT----------A-T--------------T-T-G-T-A---GTA---A---GTACCCCATTGGAAA-TAA---T---CTGAT---------------------------AGT-TA-------T-T-TA--A-T------------------TA--TCA--TT-G------TAT--GTC-T-----G---T-----A--A-------------CA--T---A-------------------------AT---T--A-----A-----G---CATAGTGGGGCC---T-A---AATTTTATG-T---A--ACGTTCAT-TTTG---TGATTTT-A---AG-T-T--T-A----------T----GACA----TG--------A-----------C---A---TTATG------TGATATT------------CTTT------T---ACC--TGAAT-AAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tgatagtattgggtttgctcctacaT-----ATA-CACTCAAA----ACATG------C-CA-TTTTT--C--AAT--GCA---T---TATG-C--AA-CT----A-TT--TC-AT----AAAA--ACCT--GC-C--AAAATTTC-TA----T---AC---TCA---TCTT-G-T-AT----T----AT-----GA---ATTA-TTTA--------A---TA--T--T---AT--AT------C-AT-T---T--AA-TTGATTGC-TTGTGAAAGTATA-T--------------T-T-G-T-A---GTA---A---GAA----------AA-TAA--G----CTGAT-TTCA----GG-TT-T----TATA---GGT-TA-TC----C-T-TAG-G-TT------AT-----T--TTA--TCA--TT-T------TAC--GT--T-----A---T-----T--A----T--C-----CAT-T---C--CT----------T--G---A-TTAT---T--------ATAAATG---CATAGT---GCT-A-T-AG--A---TTATG-TC--A-GGT-TTCAG-TTTT---TGGTTTT-A---AG-T-T-A--------------------------------------AT-GG----TC---A---T-----------GACATTCTG-TAA--TA-TTTG------T---ACC--TGAAC-AAAATGAAAtgaaaga
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ------T-CA-TTTTT--C--AAT--GCA---T---TATG-C--GA-CA----A-TT--TC-AT----AAAA--ACCT--GC-C--AAAA-TTC-CA--A-T---GC---TAG---ACTA-G-T-AT----T----ATTTAT-AT---ATTA-TTTA--------A---TA--T--T---AT--AT--------AT-T-ACT--AT-TTAATTNN-NN----------N-N--------------N-N-N-N-N---NNN---N---NNNNNNNNNNNN-NN-NNN--NN---NNNNN-NNNN----NN-NN-N----NNNN---NNN-NN-NN----N-N-NN--N-NN------NN-----NN-NNN--NNN--NN-N------NNT----CAT-----G---T-----T--AACTTTA-C-----CA--T---AC-TT----------T--A---A-TTAA---T--A------TAATTGT---ATAGT---GCC-A-TAA---A---TTATG-TC--A-AGT-TTCAT-TTTG---TCATTTT-A---AGTT-T-ATGATCA-------T----GACA-T--T---------CTGT-GA----T------------------------------------A-CTTT------T---ACC--TGAAT-AAAATGAAATG
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgTTT-TT--AAT--GTA---T---TATG-C--AA-CG----A-TT--TC-AT----AAAA--ACCT--GC-C--AAAG-TTT-CA--A-T---AC---TAG---TCTT-G-C-AT----T----AT-----AA---ATCA-TTTA--------AAATTA--T--T-TAAT--ATTACA--T-AT-T-ATT--AT-TT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcctgctgtatccccagagagagaTG-C--AA-CTCTTTA-CT--TT-CT----CAGATTGTCT--G-----AGA--TTTGTA--A-C---ACATGTA----TCCC-G-T-AT----CCTCGAT-----AATT-ATTG-TTTA--------A---TA--T--TAC-AT--AT------T-AC-T-ATT--A-----ATTAT-TT----------A-T--------------T-T-G-T-A---GTT---N---NNNNNNNNNNNN-NN-NNN--NN---NNNNN-NNNN----NN-NN-N----NNNN---NNN-NN-NN----N-N-NN--N-NN------NN-----NN-NNN---CA--TT-AAT----TAT--GTCAT-----G---T-----T--A-------C-----CA--T---AC-TT----------T--A---A-TTAA---T--T-----ACAATTG---CATAGT---GCC-A-T-AG--A---ATATG-TC--A-A--GTTTAT-TTTG---TGATTTTAA---AG-T-T-TT-ATGA--T----CCTGAGACATT--TG--------TTGT-AA----T----A---TT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TC-CA--A-T---TC---TAG---TTAT-G-T-AT----T----GT-----------TTA-T---------------TG--T--T-T-TT--GTC-----T-GT-TCATC--ATATTAAGCAT-CT----------A-A--------------T-T-A--------TA---A---GGACTTCATTGC-AA-AGG--AG---CCAAT-GTCA----GC-TT-C----AGTG---GGT-TACCC----T-T-CA--G-TT------AT-----C--ATA--TTA--TA-A------TAT---TCAT-----G---T-----T--A----T--C-----TA--TTCCA--TT----------T--ATTCT-TTGT---T--------ATAATTG---CATAGT---GCT-A-T-----A---TTTTG-TGCCA-GGT-TTCAA-TTTG---CAACTTT-A---AATT-T-ACAATCA--C----T-----AC--T--TT--------CTGT-GA----TA---T---TTATtactagtccagtaaaatgaaaaat
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---TCTT-A-T-AT----C----AG-----TA---AGTA-T--A--------AT--TAGTT--T-T-GT--ATAGTATAT-AT-C-ATT--AT-TTGATTGT-TT----------A-TTTGTGGAAGTACAGT-T-G-T-A---GTA---A---GTAACCCATTGG-AA-----------CTGAC-TTCA----GC-TT-T----TGT----GGT-TA-TT----C-T-TAG-G-TT------A
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acctgcccacagtatctcttaatata-G-T-AT----C----AC-----A------TG-TACA--------A---TA--T--T---AT--AT--------AT-T-ACT--AT-TTGATTAT-TT----------A-T--------------T-T-G-T-A---GTN---N---NNNNNNNNNNNN-NN-NNN--NN---NNNNN-NNNN----NN-NN-N----NNNN---NNN-NN-NN----N-N-NN--N-NN------NN-----NN-NNN--NNN--NN-N------NNNNNGTCAT-----G---T-----T--A----A--C-----CA--T---AC-TC----------T--A---A-TTAT---T--------ATAATTG---CATAGT---GTC-A-T-AG--A---TTATG-TC--A-AGT-TTCAT-TTTG---T-ATTTT-A---AG-T-T--T-ATCA--TCA--T----GACA-T--T---------CTGT-GA----T------------------------------------A-TTTT------T---ACC--TGAAT-AAAATGAAAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gtTTAA-TT----------A-T--------------C-T-G-T-A---GTA---A---G-ACCCCATTGA-AA-TAA--A----CTGATATTCA----GC-TT-T----TATG---GGT--A-TC----C-T-TA--G-GT------TT-----TA--TA--TCA--T--A-------AT--GTCAT-----G---TAAACTT--A----A--C-----CA--TT--C--TT----------T--A---A-TTAA---T--A------TAATTGC---ATAGT---GCC-A-T-AT--A---TTATG-T---C-AGT-TTCAG-TTTG---T---------------------------------------CA-T--T--------------------TC---A---ATATG--ATCATGACATTCTG-TGA--TA-TTTT------T---ACC--TGAAT-AAAATGAAATGtgt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atTTAT-TT----------A-T--------------T-TTA-T-AAACGTG---A---GCATC--ATT----A-CAA--TT---CTT-T-TTCA-------TT-T----CATA---T-T-TA-TC----C-T-TAA-G-TT------AT-----TA--TA--TCA--T-----------------AT-----A---T-----T--A----T--C-----TT--T---T--TT----------T--A---AATTAT---T--A------TAATTGC---ATAGT---GCT-A-T-A---G---ATATG-TC--A-GGT-TTCAGTTTTA---TGAT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tacat-A---ATA---A---GGACCATATTGG-AAACAA--T----CTGAT-TTCA----GC-TT-T----TATG---TAT-TA-TT----C-C-TA--T-TTTATTGAATCAGTATA-ATA--TGA--TT-A------TAT--TTTATTTCCTG---T-----T--A----T--C-----GA--T---C--TT----------C--A---G-TTAT---C--A------TAATTGT---ATAGT---GTT-ACT-T---A---TCATG-TC--A-GGT-TTCAA-TTTG---TTATTCT-A---AG-T------------------------------------------------------------TTATG--TTCATAACATTCTG-TGA--TA-TTTTG-----C---ACA--TGAAT-AAAATGAAATcatgacactctgtggtattttatgtctgaataaaatgaaatg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aCTCATTAG-AA-AAAAGCT---ATAAT-TTCA----GC-TT-TAATTTATG---GGT-AA-TC----C-T-TA--G---------AT-----TT-ATA--TAA-------------AT--GTCAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T---T--CT----------T-------------------------TGATTGT--TACAG----------------A---TTATG-T---A-ATTTTTCAA-TTTG---TGATTTT-A---AC-T-------TCA---------------------------------T-GA----TC---A---T------GTCCT---ATTCTG-TGA--TA-TTTTA-----C---ACC--TGAAT-GAAATAGAATGg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttttgcctgttcatcatatttttcatgcaggATTAC-AA-GAA--TT-----AAT-TTCA----GC-TT-T----TATG---GGT-TA-CC----C-T-TA--G-CT-----------------TA--TCA---T-A------TCT---TCAT-----T---C-----T--A----T--C-------------A--TT----------T--------TT--------------ACAATTG---CATAGT---ACT-A-T-ATAGA---TTATG-T---CTGGT-TTCAA-TTTG---TCATTT-------G--------ATCA-------T----GACA-T--Ta
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ctgtaaagtccatattagccagtaagacaatggatattacatgataccatgtgcagtgttgtcaattattatatttacacaaatatagccttctattatgaaatatgtttgaaacttataatttttcgacgcaaaatgcaatattcattcaaaacctttcaaaactcttgtatttgctattagttgttgtttgtctgttttttcatacttcttatgtaattatagggatcccattgaacattttatatcattgtatgccatgttatccatcatacttatcttgtaATTGG-AAATAA--G----CTGAT-TTTAAATAGC-TA-T----TATG---GAT-TA-TC----C-T-TA--GGTT------AT-----TG--TA--TCA--TT-ATACATGTAT--GTCAT-----G---T-----T--A----T--C-----TG--C---AC-TT----------T--A---G-TTAT---T--A-----A-AATTG---CATATT---GCC-A-T-AG--A---TTATA-TC--A-AGT-TCCAG-TTTctctaattaatacatcgtaataaaaataaa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtgtgaaatttT-T----GATG---GGT-TA-TC----C-T-TA--GGTT------AT-----TA------TCA-----A------TAT--GTCGT-----G---T-----T--A----T--T-----CA--TT--C--TT----------T--G---A-TTGT---T--A------TAATTGC---ATAGT---GCT-G-T-AG--A---TTATGCT---A-GGT-TTCAA-TGCG---TGATTTT-A---AG-T-T---------------------------------------TAT-GA----TC---A---T-----------GACATTCTG-TTA--TA-TTTTA-----T---ACC--TGAATAAAAATGAAATtggatcatgacattctct
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aatatacctttgttatcatgaatgtaataaacatatccgA--G-TT------AT-----CA--TG--TCA--TT-A------T----GTCAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T---G--TTATTCATTCTTT--A---G-TTGT---T--A-----A-AACTGC---ATGGT---GCT-A-T-ATAGA---TTATG-TC--A-GGT-TTCAA-TTTG---TGACTTT-A---AG-T-T-GCGATCA--T----A----G-CA-T--T---------CTGT-GA----T----A---TTTTG--CTC
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acctgctcattatattcattatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnca-ATA--TCA--TT-A------TAT--GTCAT-----G---T-----T--A----A--CTTAATCA--T---AC-TT----------T--A---A-GTAT---T--A------TAATTGC---ATAGT---GCC-A-T-A---GC--TTATG-CC--A-AGT-TTCAT-TTTG---TCATTTC-A---AA-T-T-TT-A--A--T----T---------T--TA--------A-GT----------------TTATG--ATCATGACATTCTG-TGA--TA-TTTT------T---ACC--TGAAT-AAAATGAAATccgaataaaataaaatga
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -ATA--TCA--TT-A------TAT--GTCAT-----G---T-----T--A----T--C-----CAT-T---C--TT----------T--A---A-TTGT---T--ATACATGTAATTG---CAGAGT---GCT-A-TGG---A---TTGTG-TC--A-GGT-TTCAGTTTTG---TGATT
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         t-ATA--TCA--TT-A------TAT--GTCAT-----G---T-----T--A----T--C-----TAATT---C--TT----------T--A---A-TTAA---T--------ATAATTG---CAT--T---GTC-A-T-atgacattttgtgatagtttacacttgaatgaaatggaatga
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tTA--TCA--TT-A------TAT--GTCAT-----GATAT-----G--A----T--C-----CA--TT--C--TT----------T--A---A-TTAT---C--A------TAATTGCA-TATAGT---GTC-T-T-AG--A---TTATG-TC--A-GGT-TTCAG-TTTG---TGATTTT-A---GG-T-T----------------------------------------------------------TTATG--ATCATGACATTCTG-TGA--TA-TTTT------T---ACC--TGAAT-AAAATGAAATGtcattgtaacaatcacccaacttagtaagagactatgatc
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             A--TCA--TT-A------TAT--GTCAT-----G---T-----T--A----T--C-----CAT-T---A--TC----------T--A---A-TAAT---T--------ATAATTG---CATAGT---GCC-A-T-AG--A---TTATG-TC--A-GGT-TTCAG-TTTG---TGATTTT-A---TG-T-T--T-ATGA--T----T----
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aa--TCA--TT-A------TAT--GTCAT-----G---T-----T--AACT-TAAC-----CA--T---AC-TT----------T--A---A-TTAT---T--A------TAATTGC---ATAGT---GCC-A-T-AG--A---TTATG-TC--A-AGT-TTCAT-TTTG---TCATTTT-A---AG-T------------------------------------------------------------TTATT--ATCATGACATTCTG-TGA--TA-TTTT------T---ACC--TAAAT-AAAATGAAATGctgacctaaataaaataaaatgga
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --GCCAC-----G---T-----A--A----T--C-----CA--TT--C--TT----------T--A---A-TTAT---T--GTT---ATAATTGC---ATGGT---CCT-A-T-AT--A---TTATG-TC--A-GGT-TTCAG-TTTG---TGATTTT-A---AG-T-T---------------------------------------TAT-GA----TC---A---T-----------GACATACTG-TGA--TA-TTTTA-----C---ACC--TGAAT-AAAATGAAAT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cagacacatttccacacag-----T--A----A--C-----CA--T---AC-TT----------T--G---G-TTAT---T--A------TAATTGC---ATAGT---GTC-A-T-AG--A---TTATG-T---C-GGGTTTCAT-TTTG---TGGTTTT-A---AG-T-T---------------------------------------TAT-GA----TC---A--------------TGACAATCTG-TGA--TATTTTT------T---ACC--TGAAT-AAAATg
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --A----T--C-----CA--TT--C--TT----------T--A---A-TTACATGT--ATT---GTAATTACA-TATACT---GCT-A-T-ATAGA---TCATG-TC--A-GAT-TTCAG-TATG---TGA-TTT-A---AG-T-T-gacga
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ta-----CA--T---G--TT----------T--A---A-T---------------ATA--TGC--CATAG----------------A---TTATG-TC--A-AGT-TTCAT-TTTG---TAATTTTTA---AG-T------------------------------------------------------------TTATG--ATCATGACATTCTG-TGA--TA-TTTT------T---ACC--TGAAT-AGAATGAAATGtaggatcatgatattctgtgatatttttactactacctgaataagatgaaatga
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttttcagcaa--TT----------T--A---A-TTAA---T--A------TAATTGC---ATAGT----CC-A-T-AT--A---TTATG-TC--A-AGT-TTCAG-TTTG--------------------------TCA--T----T---------------------------------TC---A---ATATG--ATCATGACATTCTG-TGA--TA--TTT------T---ACC--TGAAT-AAAATGAAATGa
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatatattactatttaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccattc--TT----------T--A---A-TTTC---TTAA-----ATAATTGC----TAGT---GCC-A-T-AG--A---TTATG-CGTCA-GGT-TTCAG-TTTG---TGATTTT-A---AG-T-T--T-ATGA--TCCTCT----GA-A-T--TG--------GGCT-GA----T
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gtgttattcttttaaatactttttaagttcttgtttatctgttgttgcaagtatggtgact--CATAGT---GC--------------TTGT--C---A-GGT-TTCAA-TTTG---TGATTTC-A---AG-T-T---------------------------------------TAC-GA----TC---A---T-------TCATGACATTCTG-TGA--TA-GTTTA-----C---ACC--TGAAT-TGAATGAAtttttttttacctgaataaatcgaaatgaa
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cccattattttaaaatgctggatatg-A-T-AG--A---TTATG-TC--A-GGT-TTCAG-TTTT---TGATTTT-A---AG-T------------------------------------------------------------TTATG--ATCATTAGATTCTG-TGA--TA-TTTT------T---GCC--TGAAT-AAAATGAAATGgg
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ag-A---A---TTATG-T---A-TGTGTATAA-TCTGACATGGTCCT-ATATAA-T-T-AT-GTCAGGT----T----ATCA-T--GG--------TTGTTGA----TTTTAAGT-TTATG--ATCATGACATACTG-TGA--TA-TTTA------TAACACC--TGAAT-AAAATGAAAT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cattctttaTTTT-A---AA-T-T-ATTATAA--T----T----G-CA-TAGTGCTATAGATATGT-CAGGTTTC---AGTTTTATG--ATCATGACACTCTG-TGG--TA--TTT------T---ATGTCTGAAT-AAAATGAAATg
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tacatttatttattttataaacgtgagcatcattacaattctttttcatttcatatttatccttaagttattatatcatatattatcttt--------ATGT-GA----TTTA-AGT-TTAGG--ATCATGATATTCTG-TGA--TA-TTTTTACTACT---ACC--TGAAT-AAGATGAAATGg
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taatccattctttaattacatgtattgtaattacatatactgctatatagatcatgtcagatttcagtTG--ATCATGACATTCTG-TGATTTA-TTTT------T---ACC--TGAAT-AAAAT
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TG--ATCATGACATTCTG-TGATTTA-TTTT------T---ACC--TGAAT-AAAATgatg
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         G--ATTATGATATTCTG-TGA--TA-TTTTC-----C---ACC--TGAATGAAAATTgatg
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGACATTTTG-TGA--TA-GTTTA-----C---ACT--TGAAT-GAAATGGAATGttaagacatgaa
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|57 ): TCAATTGCATAGTGCTGAGACTATGCGACATATTCCAATCCTTTTAATTTTATATTCATTTTATGCCATTTTATACCAAAATAAAA
Unaligned ( gi|58 ): ACATTTTTTCAAAGTTTTCTAAACGTTCATCTTATCCTTCGCCATAATGGTTGATGTAGAGAG
Unaligned ( gi|61 ): AATATTAAAGAAATGATTATCCATTCTTACGGTTTGGTTTCAATATTT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         22222222222222222222222222222                                                                         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                         11111          222222222                                       666666666666666666                                11               1111111                                        2222                      22222222                 1111    11      22                                                                                    222222222222222                                 111111111  1111111111                11     1111111                                                                       111111   22222222222222        222222222222222222222        1111111111111                        55555555555555555555555555555555555555                                                222222222             2222222222          1111111111                                           11                                                              222222222222      2222222222222222222222222      1111      111111                                                       11111111111111                          11111111                                                     1      11111111111111                                                  1111111        22222222                   222222222       2222                     222                                            44444444444444444444444444444                                        111111                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                       1 55555          222222222       5     5     5                   888888888888888888         4   4   66             00    4      4   7777777 77     555 4 4     55  4           77  7777             8888   4 88888888      3   6   3  3333 44 66   9  00 3       1  2   2 99       2   88888    33       0 2       555     2    2   33 5555 000000000000000       555 33        555 3  33   333333333  2222222222 2   555   3    88     2222222  66666  5555  2  666        2      33  5555  33    2 0 4  2 55555 2   222222   00000000000000        888888888888888888888  555   0000000000000  44 6666666    777777  33333333333333333333333333333333333333 88888 44444 777777777              1 1 6666    111111111 333 1 22 1  6666666666 333   1  0000000000  22 22   22 4   4444    6666666 2   22  4 22 22 4444 6    22222      333   888888888 2 2 8888  4444 55555 000000000000   22 5555555555555555555555555 22 4 5555  22  111111   0 6666 44  1   2  777777   1 8888888888 1 1 3 1 1 1 22222222222222 666    55555         33  99999999  22  1    3333  1  1 3333    222   1    1 3333 1 33 1 1    77777777777777  33   11  555555 222  33  2222  33333  55555  11 4444444 44444  55555555   11 111 2    555 444444444    1  6666     111   222 1 333 666 444     11   0  1 1   22 1    11     2   1 66666666666666666666666666666            11  11 11   1    33 3 11  1 444444 111 11       1            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                       . .....          .........       .     .     .                   ..................         .   .   ..             ..    .      .   ....... ..     ... . .     ..  .           ..  ....             ....   . ........      .   .   .  .... .. ..   .  .. .       .  .   . ..       .   .....    ..       . .       ...     .    .   .. .... ...............       ... ..        ... .  ..   .........  .......... .   ...   .    ..     .......  .....  ....  .  ...        .      ..  ....  ..    . . .  . ..... .   ......   ..............        .....................  ...   .............  .. .......    ......  ...................................... ..... ..... .........              . . ....    ......... ... . .. .  .......... ...   .  ..........  .. ..   .. .   ....    ....... .   ..  . .. .. .... .    .....      ...   ......... . . ....  .... ..... ............   .. ......................... .. . ....  ..  ......   . .... ..  .   .  ......   . .......... . . . . . . .............. ...    .....         ..  ........  ..  .    ....  .  . ....    ...   .    . .... . .. . .    ..............  ..   ..  ...... ...  ..  ....  .....  .....  .. ....... .....  ........   .. ... .    ... .........    .  ....     ...   ... . ... ... ...     ..   .  . .   .. .    ..     .   . .............................            ..  .. ..   .    .. . ..  . ...... ... ..       .            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                       0 99999          222222222       0     0     0                   000000000000000000         4   4   11             66    4      0   0000000 77     555 0 0     55  0           99  1111             5555   0 55555555      3   7   3  8888 22 55   2  88 1       6  7   5 22       5   88888    44       4 5       000     9    9   99 8888 777777777777777       000 99        444 1  99   333333333  5555555555 0   000   6    22     7777777  22222  3333  4  555        4      22  0000  44    2 5 4  2 66666 2   888888   33333333333333        222222222222222222222  888   9999999999999  55 4444444    444444  88888888888888888888888888888888888888 11111 88888 666666666              8 8 5555    222222222 000 7 44 7  5555555555 333   9  2222222222  66 99   99 2   5555    5555555 0   88  0 88 88 2222 0    88888      333   333333333 0 0 5555  2222 00000 555555555555   88 1111111111111111111111111 66 5 3333  66  111111   1 0000 55  9   0  777777   8 0000000000 8 8 6 8 8 8 00000000000000 111    77777         99  99999999  44  7    7777  7  7 5555    999   7    7 5555 7 88 2 6    44444444444444  22   66  777777 333  11  7777  22222  55555  77 5555555 44444  77777777   55 999 2    111 333333333    1  3333     888   888 0 888 666 333     44   5  1 1   11 1    55     1   1 44444444444444444444444444444            55  55 55   1    11 3 55  1 777777 999 55       1            
consensus                     :                                                                                                                                                                                           TGTGAAATTTTAGAC----TCTTTGGGCA------TT-GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATT-G-A--C----T------TTTTAATAT-ATT-TCA--TGGTAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--TA----AGGTGCTACCAAT----AAT-AA-TT-N--GTCATA-CCC-AAG-AT--C-A--AA-GGC-AAA-G-AATCCTCATG-TTT-T-TATTATAA-TGC-----CATT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TTAG-AGA--C--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGCAAA---A-CA--AAG---------TT----------TTAAA---AAAAGCTGTTAAAGTCGN----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-NCATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAA-T-C--TT------A---T-TT---TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAG-------CGTT--TT----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAACATGT-C-AT---TTTT----T----C---A-A--T-GC---A--A---T---TAT-GC----------AA--C-NATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TACTAG---TCT-------C-G-T-A----TT----A-----T-----A-A---ATTA--T----------TTA--------AA--T--ATT--T-AT--AT----T-ATTAT----T--AT-TTG-AT------TAT-T----------T-A-T-T-T-G-T--------------A---GTAA---GGACCCCATTGG-AA--TAAG-CTG--AT-TTCA----GC-TT-T----TATG---GGT-TATC-C----T-T--A-G-TTAT----------TA-ATA--TCA-TTA------T---AT--GT----CA-----TG-----TT--A---T---C-----CA--T---C-TTT--A---A-TTAT---T--A-----ATAAT-TGC--CATAGT---GCC---A-T---A---A---TTATG--TCAGGT-T-TCA-NT-TTGT-GATTTT-AAG-T-T--------------------------TTATGATCATGAC--AT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
Reference ( family-4676 )     :                                                                                                                                                                                           TGTGAAATTTTANAC----TCTTTGGGCA------T--GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATT-G-A--C----T------TTTTAATAT-ATT-TCA--TGGTAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--TA----AGGTGCTACCAAT----AAT-A--TT-N--GTCATA-CCC-AAG-AT--C-A--A--GGC-AA--G-AATCCTCATG-TTT-T-NATTATAA-TGC-----CATT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TTAG-AGA--C--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGCAAA---A-CA--AAG---------TT----------TNAAA---AAAAGCTGTTAAAGTCGN----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-NCATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAA-T-C--TT------A---T-TT---TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAG-------CGTT--TT----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAACATGT-C-AT---TTTT----T----C---A-A--T-GC---A--A---T---TAT-GC----------AA--C-NATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TACTAG---TCT-------C-G-T-A----TT----A-----T-----A-A---ATTA--T----------TTA--------AA--T--ATT--T-AT--AT----T-ATTAT----T--AT-TTG-AT------TAT-T----------T-A-T-T-T-G-T--------------A---GTAA---GGACCCCATTGG-AA--TAANTCTG--AT-TTCA----GC-TT-T----TATG---GGT-TATC-C----T-T--A-G-TTAT----------TA-ATA--TCA-TTA------T---AT--GT----CA-----TG-----TT--A---T---C-----CA--T---N-TTT--A---A-TTAT---T--A-----ATAAT-TGC--CATAGT---GCC---A-T---A---A---TTATG--TCAGGT-T-TCA-NT-TTGT-GATTTT-AAG-T-TAT-ATCA-TGACATT--TGTGA-TCATTATGATCATGAC--AT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                           TGTGAAATTTTACAAG---TCTTTAGGCA------TT-GTTAAGATGTTGAATG-CATGAGCCACT-AATTAAGATT-A-A--C----CGTATGGTTTTATAAT-ATT-TCAAGTGGTTAT-CTCCAC-AACTGACTCTT-GTG-------AA-AAATT-TTG-T-ACTAAGAAC-AAAAATAATAC--TA----AGGTGCTACAAAT----AAT-A--AT-T--GT-ATAGCCCAAAG-AT--CAA--A--GGCAAA--G-AATCCGCTTG-TTT-T-TATTATAA-TGC-----CATTAAAAAAATTGGAAATACTT---TGCCT-TTAGAAGA--C----A---------------AACAATT---GTCTCAGCAAAGACA-CA--ACGA--------TTATAACAAAAATAAAA---AAAAGCTG-TAAATT-------TT-----TT----AGCCC---AGCAAAGCAAAGAGG--AGATGTTT-TCATG-ACGACC-AATGCGC-GTCTTGAAACAGGAGAGGA-------TTTTGGCAG-T-T--TT------G---T-TTG--TCAAGT-TGCGGGAA-AA--TATGTTTAAAATTAC-C-AAG-------AGTT--CT----AGCTGTGT---TT-----A-----T-----AAAATTATACTGCTT-AATCATGTACAAT---TTTT----G----C---A-A--T-GC------A---T---TATGGC----------AA--CAAATT--T-CAT----AAAA-------AGCCT--GC-CCAA--A----A-TTC----A-TAC-AG---TCT-------C-G-C-A----T-----------T-----A-A---GTTA--T----------T----------AA--T--A-T--T-AT--TA----T-ATTAC----T--AT-TTG-AT------TA--T----------T-A-C-T-T-GTT--------------A---GTAA----GACCCT-TTGA-AAATTAAG--CG--AT-TTTA----GC-TT-T----T-TG---GGT-TATC-C----T-TTAG-G-CTAT----------TATATC--TCATTTA------T---AT--GT----CA-----TG-----TT--A---A---C-----CA--T---A-CTTTAA---A-TTAT---T--A-------AAT-TGC--ATTAGT---GCCA--A-T---AG--A---TTATG--TCAAGT-T-TCA-TT-TTAT-GATTTT-AAG-T-TA------------------TGA-TCATCAT-----------AT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|10                         :                 aatgactttatgttctggctttaatacacattgccttattttgattatgcctgctttcttcaatggtaatgtggtagtggcaaacaattcaaatagaattgcagttacaaacaaaatataagttgttagatttatcttctgaaatctaggtctacgaaactccaagtttaatttctATTCTAGAT----TATTTGATCA------TTTGTTAAGA-GTTGG-AGACA-GAGTTACTAAATTAAGATT-G-A--A----TCATA--TCTTGACTT-GTT-TCA--TAGTAACGTGCCA--AATT-ATCTTT-GTGTCTTAGTAT-CAA-----G-C-ACTAA--AC-AATAATAATAC--TAG---AATTGCTACCAAT----AAG-AATTT-T--GTCATA-CCT-TAG-ATA-A-A--A--GGC-AAGTG-AA----------TT-T-TATTCTA----------CAT--------TTG-------TT---TGCCT-TTAA-AAA--CTTACA---------------AAC-GTT---A--ACCACAAA---A--A--AAGAGTTGGGTTTT----------CCAAAAACAAAAGCTGTAAAACTAGA----TTATCAATT----AA-TT---TAAAAGAC-AAAGAA--TG----TT-ACATA-ATG-GT-A-----T-TCT------CAG--------------TACTGTTA----C--TT----------T-TT---TCA--T------------------------------C-TA----------TT--TC----AC---------TT-----AAAAATC-----A---------TGTCTGAAACGTGT-C-AT---TTTC----G----C---A-A--T-G
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggcTA--T-T------T-AA--T-T-----AAAT--C-CCTAGTCTTTGACGTT--TTTAAAA----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAAACATGT-C-AT---TTTC---------C---A-A--T-GC---A------T---TAT-GG----------AA--C-AATT--TTCAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TGCTAG---TCT-------CCG-T-A----TT----A-----T-----A-TTT-ATTA--T----------TTA--------A---T--ATTA-T-AT--AT----T-ACT------T--AT-TTG-GA------TAT-T----------T-AAT-T-T-G-T--------------A---GTAA---G-ACCCCATTGG-AAATTAAGC--G--AT---CA----GC-TT-T----TATG---GGT-TATC-T----T-A--G-G-TTAT----------TAGAT---TCA-TTA------T---AT--GT----CA-----TG-----TTAAA---TA--C-----CA--TTA-C-TTT------A-TTAA---T--T-----ATAAT-TG---CATAGC---GCC-----T---A---G---TTAT---TCA-AT-T-TCA-TT-TTGG-TATCTT-----T-TTT-A--A-AAAAGTT--TATGA-T-------ATCATG-C--AT--T--CTGCCGAT--ATT--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAATTGa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    a-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGTCTTGA-CGTT--TTTAAAA----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAAACATGT-C-AT---TT-----------C---A-A--T-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCTTGGC-C--A--A----A-TTCC--A--TGCTAG---TCT-------C-GCT-A----TT----A-----T-----T-ATTTATTA--T----------TTA--------A---T--ATT----AT--AT------ATTAC----T--AT-TTG-AT-------AT-T----------T-A-T-T-T-G-TT-------------A---GTAATTGAGACCCCATTGA-AA--TTAAGCTG--A--TTCA----GC-TTCT----TATG---GGTGTATC-C----TAT--AGG-TTA-----------TA-AGAT-TCA-TTA------T---AT--GT----CA-----TG-----TT--AAACTAA-C-----CA--TTA-C-TTT------A-TTAT---T--------AT-AT-TG---CATAGC---GCC-----T---A---G---TTATG--TCAATT-T-TCA-TT-TTGT-CATTTT-----T-TA---------AAA-----GT------TTATGATCATGAC--AT--T--CTG-CGAT--A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttT---TTA--T-C------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGTCTTA--CATT--TT----AAAA-------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAAAATGT-C-AT---ATTT---------C---A-A--T-GT---A------T---TAT-GC----------AA--C-CATT--T-CAT----AAAA-------A-CCA--GC-C--A--A----AATTCC--AG-TACTAG---TCT-------C-G-T-A----TC----A-----T-----A-A---ATTA--T----------TTA--------A---T--ATTATT-GT--TT----T-ATT------T--AT-TTG-AT------TAT-T----------T-A-T-T-T-G-T--------------A---GGNN---NNNNNNNNNNNN-NN--NNNNNNNN--NN-NNNN----NN-NN-N----NNNN---NNN-NNNN-N----N-N--N-N-NNNN----------NT-ATA--TCA-TTA------T---AT--GT----CA-----TG-----TT--A---T---C-----CAT-T---C-TTT--A---A-TTAT---T--------ATAAT-TG---CATAAT---GCC---A-T---AT--A---TTATG--TCAAGA-T-TCA-GT-TTGT-GATTTT-AAG-T----------------------------TTATGATCATGAT--AT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-T------T---A--CCTGATT-AAAATGAAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --GTCATA-CCT-AAG-AT--C-A--AA-GGC-AAA-G-AATCCTCATG-TTT-T--ATTTTAAATGC-----CATT--AAAGATTAG-ATAACTT---TGCCT-TTAG-AGAGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCTGCAAA---AACA--AAG---------TT----------TTAAA---AAA-GTTGT---AGTCGT----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AATGGA--AG----TT-TCATG-ACG-CC-A-----T-ATC------GAG--------------TTTTTTTA--------------------------TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--TGA-TA--------CGTTG-TT----ACTTCGCCATTTT-----A-----T-----A---------TCCT--A-----GT-C-CTACGTTTTAAAAT----C---ATA--T-GCTCGA--A---A---TAT-GTCATTTTCCTGAA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TACTAA---TCT-------C-A-C-A----TT----A-----T------------TTA--T----------TT---------GA--T--A-T--T-AT--AA----T-A------------------------------T----------T-A-T-T-T-G-T--------------A---GTAA---AGACCCCATT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -T-GATTGCAA-TGC-----CATT--AAAGATTGG-AATGCTT---TGTCTGTCAG-AAA--C--A-ACTTATGCAATATCATAACAGTT---G--TCGGCAAA---G-CT--AAG---------TT----------TTTAA---AAA-GCTGT-AAAGTCGC----TA-----TT----AG-CC---AGCAAGAC-ACGTGA--AG----TC-ACATG-ACG-TC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAA-TAC--AT------A---T-TT---TTA-----------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGCCCTA--CGTT--TC----AAT--------TC-----A-----T-----A---------T--CCGAAACATGC-C-A----TTTT----C----C---A-A--T-T-----------T---TAT-GC----------CA--C-TATT--T-CAT----CAAA-------A-CTT--GC-CA-A--A----A-TTCC--GA-TACTAA---TCT-------T-G-T-A----TT----A-----T-----A-A-----TA-------------GTA--------CA--TGCATT--T-ATTCGT----TAATTGT----TG-GT-TTG-GT------TTT-T----------T-T-T-T-T-A-T--------------A---AT
gi|16                         :                                                                                                                                                                   gcaatgggtttttttgttctccaaTGTGAACTTCTAGAC----TCTTTGGGCA------T--GTTAAGA-GTTTA-TGACA-GAGCCACTCAACTAAGATT-GAA--CCTTGT------TTTCAATATAAAT-CCA--TGGCAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--ACAAAAAATAATAC--TA----
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 actcctaagaccttagatttttatacagaatgcattcttgcctaaggattttatgttctgctttgatcaagttattttttatatgaagctccaatttggaagttttttaggcaataaatttgaacatagattgtaaagttgatccttagcaaaaataaagttgtccagatttattctaaatcttggtcctagaaccaggatttct----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAA-GTGT-C-AT---TTTT-------------A-A--T-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-AATT--TTCAT----AAAA-------A-CC---GC-C--A--A----ACTTCC--AAATACTATCACTCT-------C-G-CGA----TT----A-----TTTATTA-A---TTTA--T----------TTACTTTATTTAA--T--ACT----AT--AT----A-GTTAC----TTAAT-TTG-AT------TATCT----------T-A-T-T-T-G-T--------------A---GTAA---GTACCCCATTGGAAA--TAA-TCTG--AT---------------------------AGT-TAT-------T-T--A-A-T-----------------TA--TCA-TTG------T---AT--GT----C------TG-----TA--A-------------CA--T---A--------------AT---T--A-----A------G---CATAGTGGGGCC-----T---A---AATTTTATG--TAACG--T-TCA-TT-TTGT-GATTTT-AAG-T----------------------------TTATGA-CATGAC--AT--T--ATG-TGAT--A-TTCTT-T------T---A--CCTGAAT--AAATGAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgatagtattgggtttgctcctacaT-----A-----T-----A---------CACTCAAAACATGC-C-AT---TTTT---------C---A-A--T-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-TATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-CA-A--A----A-TTTC--TA-TACTCA---TCT-------T-G-T-A----TT----A-----T-----G-A---ATTA--T----------TT---------AA--T--A-T--T-AT--AT----C-AT--T----T--AA-TTG-AT------TGC-TTGTGAAAGTAT-A-T-T-T-G-T--------------A---GTAA---GAA----------AA--TAAG-CTG--AT-TTCA----GG-TT-T----TATA---GGT-TATC-C----T-T--AGG-TTAT----------T--TTA--TCA-TTT------T---AC--GT-----------TA-----TT--A---T---C-----CAT-T---C-CTT--G---A-TTAT---T--------ATAAA-TG---CATAGT---GCT---A-T---AG--A---TTATG--TCAGGT-T-TCA-GT-TTTT-GGTTTT-AAG-T-TA---------------------------ATGGTCATGAC--AT--T--CTG-TAAT--A-T--TT-G------T---A--CCTGAAC-AAAATGAAAga
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGT-C-AT---TTTT---------C---A-A--T-GC---A------T---TAT-GC----------GA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-CA-A--A----A-TTCC--AA-TGCTAG---ACT-------A-G-T-ATTATTT----A-----T-----A-T---ATTA--T----------TT---------AA--T--A-T--T-AT--A-----T-ATTAC----T--AT-TTA-AT--------T-N----------N-N-N-N-N-N-N--------------N---NNNN---NNNNNNNNNNNN-NN--NNNNNNNN--NN-NNNN----NN-NN-N----NNNN---NNN-NNNN-N----N-N--N-N-NNNN----------NN-NNN--NNN-NNN------N---NN--NT----CA-----TG-----TT--AAC-TTTAC-----CA--TA--C-TTT--A---A-TTAA---T--------ATAAT-TG---TATAGT---GCC---A-TA--A---A---TTATG--TCAAGT-T-TCA-TT-TTGT-CATTTT-AAG-T----------------------------TTATGATCATGAC--AT--T--CTG-TGAT--A-C--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                           TGTGAAATTTTACAG----TCTTTAGGCA------T--GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATTTA-A--CCATGT------TTTTAATAT-ATT-TCA--TGGTTATGCCCCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AA-AATTT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--TAG---AGGTGCTACCAAT----AAT-AA-TT-AT-GTCATA-CCC-AAG-AT--C-A--AA-GGC-AAA-G-AATCCTCTTG-TTT-T-TATTATAA-TGC-----CATT--AAAAATTGG-AATACTT---TGCCT-TTAG-AGA--C--A-A---------------AACAATT---G--TCTGCAAA---A-CA--AAG---------TT----------TAAAA---AAAAGCTG-TAAAGT-------TT-----TT----AG-CC---AGCAAAGC-AAGGGA--AG----TT-TCATG-ACGACC-A-----T-GTCTTGAAACAGGATGATTTGGCAGTTTTTGTTTG-T-CAATTGGGGAAA---A-TT---TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--T-C-TAGTCT----TGTT--TTAAA-A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAATCATGT-C-A----TTTT----T----C---A-A--T-GC------A---T---TAT-GC----------AA--C-AAT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttaataagtatattgttaattgcaactcacacaggagtgaaaaactctagacttaagattgttatacagaatgcttctggccctaaataggccagtctaaaaatactttatgttctgctttaatacaatgctattttgattatgctgcttcttcatggtatagtggtattggcaaacaatttcaacatagattgcaagttacacaaaataaagttgttagatttattctaaatctaggtcctagaaccagtatttct---TCC-------C-G-T-A----TCCTCGA-----T-----A-ATT-ATTG--T----------TTA--------A---T--ATTA-C-AT--AT----T-ACTAT----T--A------AT------TAT-T----------T-A-T-T-T-G-T--------------A---GTTN---NNNNNNNNNNNN-NN--NNNNNNNN--NN-NNNN----NN-NN-N----NNNN---NNN-NNNN-N----N-N--N-N-NNNN----------NN-NNN---CA-TTAAT----T---AT--GT----CA-----TG-----TT--A-------C-----CA--TA--C-TTT--A---A-TTAA---T--T-----ACAAT-TG---CATAGT---GCC---A-T---AG--A---ATATG--TCAAGT-T-T-A-TT-TTGT-GATTTTAAAG-T---------------TT--TATGA-TC---CTGA----GAC--AT--TTGTTG-TAAT--A-T--TTAC------T---AGTCC--AGT-AAAATGAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttctttctcatttcattttattca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgcaactctttactttctcagattgtctgagatttgtaacacatgtaTT-GTGC------ATCAAACTAT-A-T-ACTGA--GT-AAAAATAAGAC--TAG---AAGTTCTACTTGT----AAT----TT-T--TTCATA-CCTAAAG-AT--A-AATA--AAA-AA--A-AACCCT--TG-TTTATACATTGTAT-TACAAATTCATT--AAAGATTaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             A--AAG---------AT----------TTTTA---AAAGGCTGT-AAAGTCGC----TA-----CT----AT-CC---ATCAAAGC-AAGAAA--AG----TC-ACATG-AAG-TC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGCTAA-T-A--T-----------T-TT---TTA--T-T---------A--T-C-----AAAT--T-C-CA---------GTT--TT----ATATT------TT-----AAAG--T-----A---------TGTCCGAAACATGT-C-CT---TTTTG---T----C---A-A--T-GT------A---T---TAT-GC----------AA--C-TAtttaaaaggctgtaaagtcgctactatccatcaaagcaagaaaagtcacatgaagtcatgtccagttttgctaatattttttattatcaaattccagttttatattttaaagtatgtccgaaacatgtcctttttgtcaatgtattatgcaactacatgtattacaagtatttaaagcatgcc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttgtgcatcaaactatatactgagtaaaaataagactagaagttctacttgtaattttttcatacctaaagataaataaaaaaaaacccttgtttatacattgtattacaaattcatt--------AA--T--ATT----AT--AT------ATTAC----T--AT-TTG-AT------TAT-T----------T-A-T-T-T-G-T--------------A---GTNN---NNNNNNNNNNNN-NN--NNNNNNNN--NN-NNNN----NN-NN-N----NNNN---NNN-NNNN-N----N-N--N-N-NNNN----------NN-NNN--NNN-NNN------N---NNNNGT----CA-----TG-----TT--A---A---C-----CA--TA--C-TCT--A---A-TTAT---T--------ATAAT-TG---CATAGT---GTC---A-T---AG--A---TTATG--TCAAGT-T-TCA-TT-TTGT--ATTTT-AAG-T-T-T-ATC-------------------------ATCATGAC--AT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATcatgtattacaagtatttaaagcatgcc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtgtatcacatgtacTCC--AA-TTCTAG---TTA-------T-G-T-A----TT----G-----T------------TTA--T----------T-----------G--T--TTT--T-GT--CT----G-TTCAT----C--ATATTA-AG------CAT-C----------T-A-A-T-T-A-T--------------A------A---GGACTTCATTGC-AA--AGGAGCCA--AT-GTCA----GC-TT-C----AGTG---GGT-TACC-C----T-TC-A-G-TTAT----------C--ATA--TTA-TAA------T---AT---T----CA-----TG-----TT--A---T---C-----TA--TTCCA-TTT--ATTCT-TTGT---T--------ATAAT-TG---CATAGT---GCT---A-T---AT--T---TTGTG--CCAGGT-T-TCA-AT-TTGC-AACTTT-AAATT-TACAATCA-CTACTTTC-TGTGA-TATTTATtgt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --A-G-TTAT----------CA--TG--TCA-TTA------TGTCAT--GTTATCCA-----TG-----TT--A---T---T-----CA--T---TCTTT--A---G-TTGT---T--A-----A-AAC-TGC---ATGGT---GCT---A-T---ATAGA---TTATG--TCAGGT-T-TCA-AT-TTGT-GACTTT-AAG------------------------------TTGCGATCATAGC--AT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-TGC----T------CCCGAAT-AAAATAAAATGA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acctgctcattatattcattatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnca---C-----CA--T---TCTTT--A---A-TTAA---T--A------TAAT-TGC---ATAGT----CC---A-T---AT--A---TTATG--TCAAGT-T-TCA-GT-TTGT-CATTTC-AA--------------------------------TATGATCATGAC--AT--T--CTG-TGAT--A----TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatatattactatttaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--------------A---ATAA---GGACCATATTGG-AA--ACAATCTG--AT-TTCA----GC-TT-T----TATG---TAT-TATT-C----C-T--ATT-TTATTGAATCAGTATA-ATA--TGA-TTA------T---AT--TT----TATTTCCTG-----TT--A---T---C-----GA--T---C-TTC--A---G-TTAT---C--------ATAAT-TG---TATAGT---GTT---ACT---T---A---TCATG--TCAGGT-T-TCA-AT-TTGT-TATTCT-AAG-T----------------------------TTATGTTCATAAC--AT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-TG-----C---A--CATGAAT-AAAATGAAATG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aCTCATTAG-AA--AAAAGCTATAAT-TTCA----GC-TT-TAATTTATG---GGT-AATC-C----T-T--A-G---AT----------TT-ATA--TAA--------------AT--GT----CA-----TG-----TT--A---T---C-----CA--T---T-CTT-------------------------TGAT-TGT--TACAG--------------------A---TTATG--TAATTT-T-TCA-AT-TTGT-GATTTT-AAC-T----------------------------TCATGATCATGTCCTAT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-TA-----C---A--CCTGAAT-GAAATAGAATGA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tttttgcctgttcatcatatttttcatgcaggT------TAA-T----------T-A-T-C-T-G-T--------------A---GTAA---G-ACCCCATTGA-AA--TAAA-CTG--ATATTCA----GC-TT-T----TATG---GG--TATC-C----T-T--A-G-GT-T----------TT-ATA--TCA--TA----------AT--GT----CA-----TGTAAACTT--A---A---C-----CAT-T---C-TTT--A---A-TTAA---T--------ATAAT-TG---CATAGT---GCC---A-T---AT--A---TTATG--TCA-GT-T-TCA-GT-TTGT-CATTTC-AA--------------------------------TATGATCATGAC--AT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGAa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atG---------TT----------TTAAA---ACA-GCTGT-AAATTCG-----TT-----TT----AG-CC---AGTAAAGC-AAGAGA--AG----CA-TCATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAA-T-A--CT------ATTTT-TT---TTA--T-T------A-AAT-T-T-----AAAT--C-T-TAT-------TCTTACCT----A----------TTAAATGA-----T-----A---------TGCACGAAATATG--C-AA---TTTT----T----C---A-A--T-GC------A---T---TAT-GC----------AA--C-TATT--T-AATTAAAAAAA-------A-CCT--GC-CA-A--A----A-TTCC--AA-TATTAG---TC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                           TGTGACTTTTTAAATAAATTCTTTGGGCAAGCTAGT--ATTAAAC-GTTGA-TAACA-GAGCTACTCCATTA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtgtttgcaagcaacttattgcaagtaacccaaacaatgtcgaatgttcatatttattctaaatcaaggccctaaatagacccaacatttttaaa-TTT-T-CGGTGCAA-TGT-----CAAA--AAGGATCGA-AATACCT---AGCGT-TTAG-AAG--C--A-A---------------AACCGC----G--ACAGCAAA---G-TC--GAG---------T--------------------AAAGTTTTCA------------------CT----AG-CC---AGTAAGGC-A-TGGA--TA----TT-ACATG-A------A-----T-GTC------CAG--------------TTTTACAAG-TAC--TT------A---T-TT---ATT--T-T------A-AAGAT-A-----AAAT--A-T-TAG-------CCCT--TT----A----------TTTTAATA-----T-----G---------TGTTTGAAACATAT-C-CT---TTTT-------------A-A--C-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-TATTACT-CAC-------A-------A-CCT--GC-CA-A--A----A-TTTC--AA-TGTTAG---TCT-------T-G-T-A----TT----A-----T-----T-T---ATTA--T----------TT-------------T---TT--C-CT--GT----T-A--AT----C--AC-ATGTAA------TAT-A----------C-A------------------------A---GCTA---GGACTCCA-------------------AT-TTCA----GC-CC-T----GA-----GGT-TATCACAATAT-T--A---TCAT----------TA-ATAAGTCG-CT------------T--TC----CA-----TG-----TT--AC--T---T-----AA--TTC-T-TTT--A---A-TTGT---C--A-----A-AAT-TG---CACAGT---GGT---A-C---AC--A---TTATA--TCCGCT-T-TCC-TT-TTGT-TATTTT-GAA-TCCACAATCA-TGACATT--catattaaagattaagacatgtttgatttcaaatactatatatatcgagcattaaccagttaatactaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaccacccgtaagattttttttcggtgcaatgtcaaaaaggatcgaaatacctagcgtttagaagcaaaaccgcgacagcaaagtcgagtaaagttttcactagccagtaaggcatggatattacatgaatgtccagttttacaagtacttatttattttaaagataaaatattagccctttattttaatatgtgtttgaaacatatcctttttaacgcattatgcaactattactcacaacctgccaaaatttcaatgttagtcttgtattatttattattttttcctgttaatcacatgtaatatacaagctaggactccaatttcagccctgaggttatcacaatattatcattaataagtcgctttccatgttacttaattcttttaattgtcaaaattgcacagtggtacacattatatccgctttccttttgttattttgaatccacaatcatgacattccttgaaattttcc
gi|30                         : gtgtttgcaagcaacttattgcaagtaacccaaacaatgtcgaatgttcatatttattctaaatcaaggccctaaatagacccaacatttttaaatgtgactttttaaataaattctttgggcaagctagtattaaacgttgataacagagctactccattacatattaaagattaagacatgtttgatttcaaatactatatatatcgagcattaaccagttaatactaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaccacccgtaagatttt------TCTTAATAT-ATT-TCA--TGGTTATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-C-ACTTA--AG-AAAAATAATACCGTACTAGAGGTGCTACCAAC----AGTAA--TTAT--GTCATA-CAC-AAG-ATAAA-A--A--GGCAAA--G-AATCCTCATG-TTT----ATTATAA-TGC-----CACT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TTAG-AGA--C--A-A---------------AACAGTT---G--TTAGCccttgaaattttcc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ccatggT-T----GATG---GGT-TATC-C----T-T--A-GGTTAT----------TA------TCA---A------T---AT--GT----CG-----TG-----TT--A---T---T-----CA--T---TCTTT--G---A-TTGT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GCT---G-T---AG--A---TTATG--CTAGGT-T-TCA-AT-GCGT-GATTTT-AAG-T----------------------------TTATGATCATGAC--AT--T--CTG-TTAT--A-T--TT-TA-----T---A--CCTGAATAAAAATGAAAT
gi|32                         :                                                                                                                                                    aatatacctttgttatcatgaatgtaataaacatatccgTGTGAAAGTTTAG-C----TCTTTGGGAA------T--GTTA-GA-GTTGA-T-ACA-GAGCCACTCAATTAAG----------------------TTTAATAT-ATT-TCA--TGGCAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AA-AATTT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--TAG---AGGTGCTA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acataaaataaagtgattagattattctaaacctaggtcctagaaccagtatttctCATG-TTT-T-TATTATAA-TGC-----CATT--AAAAATTGG-AATACTAAAATGCCT-TTAG-AGA--C--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGCAAA---A-CA--AAG---------TT----------TTAAA---AAAAGCTGT-AAAGTCGT----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGT--AG----TT-TCATG-ATG-CC-A-----T-ATC------CAG--------------TTTTGTTGA-TAT--TT------A---T-TT---TTA--T-T------A-AA--T-C-----AAAT--C-C-TAG-------
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        T------TAT-T----------T-A-T-T-TTA-T--------------AAACGTGA---G--CATCATT----A--CAATTCTT---T-TTCA-------TT-T----CATA---T-T-TATC-C----T-T--AAG-TTAT----------TA--TA--TCA-T-----------------------A-----TA-----TT--A---T---C-----TT--T---T-TTT--A---AATTAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GCT---A-T---A---G---ATATG--TCAGGT-T-TCA-GT-TT----------------TATGATCA-TG---------------------------AC--AC--T--CTG-TGGT--A-T--TT-TA-----T---G--TCTGAAT-AAAATGAAATGtcttac
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tacatA--C---T-TTT--A---A-TTTC---TTAA-----ATAAT-TGC----TAGT---GCC---A-T---AG--A---TTATGCGTCAGGT-T-TCA-GT-TTGT-GATTTT-AAG-T-T-T-ATGA-T----CC--TCTGA---ATTGGGCTGAT------T--T--TT----------T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAATCGAAATGA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtgttattcttttaaatactttttaagttcttgtttatctgttgttgcaagtatggtgATTGG-AAA-TAAG-CTG--AT-TTTAAATAGC-TA-T----TATG---GAT-TATC-C----T-T--AGG-TTAT----------T--GTA--TCA-TTATACATGT---AT--GT----CA-----TG-----TT--A---T---CTG---CA------C-TTT--A---G-TTAT---T--A-----A-AAT-TG---CATATT---GCC---A-T---AG--A---TTATA--TCAAGT-T-CCA-GT-TT-T-GG---------------ATCA-TGACATT--a
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gtgtgaaattt-ATA--TCA-TTA------T---AT--GT----CA-----TG-----TT--A---A---CTTAATCA--TA--C-TTT--A---A-GTAT---T--------ATAAT-TG---CATAGT---GCC---A-T---A---GC--TTATG--CCAAGT-T-TCA-TT-TTGT-CATTTC-AAA-T-TTT-A--------ATT--T-TAAGT--TTATGATCATGAC--AT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATctct
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -------A-CCT--GC-C--C--ACAGTA-TCTCTTAA-TA-TA----TCT-------T-A-T-A----TC----AGTAAGT-----ATA---ATTAGTT----------TTG--------TA--T--AGT----AT--AT------ATCAT----T--AT-TTG-AT------TGT-T----------T-A-T-T-T-G-TGGAAGTACAGTTGTA---GTAA---GTAACCCATTGG-AA-------CTG--AC-TTCA----GC-TT-T----TGT----GGT-TATT-C----T-T--AGG-TTA
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --GC----CA-----CG-----TA--A---T---C-----CA--T---TCTTT--A---A-TTAT---T--GTT---ATAAT-TGC---ATGGT---CCT---A-T---AT--A---TTATG--TCAGGT-T-TCA-GT-TTGT-GATTTT-AAG-T----------------------------TTATGATCATGAC--AT--A--CTG-TGAT--A-T--TT-TA-----C---A--CCTGAAT-AAAATGAAATG
gi|4                          :                                                                                                                                                                        cagacacatttccacacagTGTGATATTTCAGAC----TCTTTGA-CA------TT-GCAAAAA-GTTGA-TGACA-GAGCTAATCAATTAAGATT-G-AACC----TTA----TTTTAATAT-ATT-T-A--TGTTAAAGCACCG--CACT-ATTTTT-GTG-------AT-CAATT-C-G-T-ACTAA--AT-AATGATAATGCT-TG----AAGTGCTACCAAC----AAT-A--TT----GTTATA-GGT-AGG-AT----A--A--AAT-AA--A-AATAATC-T--TTT-T-GA-TAAAA-T--------ATT--AAGAAT------TACT-----------------------------------------------T---G--TCAGCAAA---G-CA--AAG---------TT----------TGAAA---AAAAGCTG-TAAAGTCGT----TA-----TT----AG-CCTCTAGTA---C-TTTGGA--AG----TC-GCATG-ACG-TC-A-----A-GTC------CAG--------------TTTTGGTACTT-C--TT------A-----CT---TTA--C-T------C-TA--T-C-----AAAT--C-G-TAGTTA----TATT--TT----A----------AA-----A-----T-----A---------TGTGCGAGCCATGA-C-A----TTTG----T----C---A-A--T-GC---ATTA---TACATGT-AC----------AA--C-TATT--T--GT----CAAA-------T-CCT--GCTT--A--A----A-CTAG--AA-TGCTA------------------T-A----CT----A-----------A-T---CTTG--T----------TT-------------T--ATT--CAAT--GT----T--CTGT----C--TG-TTG-ATCA----CAT-T----------C-A-C-TAT-G-T--------------AATCATAA---GAACCCTATTGGAAA--TAAG-CTA--AA-TTCA----GCTTT-T----TTTA---AGT-TATT-C----T-A--AGG-TTAT----------T--ATA--TCT-TTA------C---AT--GT----CA-----TG-----AT--A---T---C-----CA----------T--A---A-TAATA--T--A-----ATTAT-GGCTGCATAGT---GCT---A-C---AG--A---TTATA--TCATGT-T-TCA-AT-TTGT-GATTTT-AAA-T----------------------------TCATAATCATGAC--AT--T--CTC-TGAT--A-T--TT-TA-----C---A--CTTGAAT-AAAATAA
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acagcaaagttgtgagatttattctatatctatgtcgtagagtaagtgtttct--A--GGC-AAA-G-AATCCTCATG-TTT-T-TATTATAA-TGC-----CATT--AAAAATTGG-AATACTT---TGCCT-TTAG-AGA--C--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGCAAA---A-TA--AAG---------TT----------TT-AA---AAAATCTG-TGAAGTCGT----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-gcc
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tcaaaatgtagctgtTA--TCA-TTA------T---AT--GT----CA-----TGATA--TG--A---T---C-----CA--T---TCTTT--A---A-TTAT---C--A------TAAT-TGCA-TATAGT---GTC---T-T---AG--A---TTATG--TCAGGT-T-TCA-GT-TTGT-GATTTT-AGG-T-T--------------------------TTATGATCATGAC--AT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --TCA-TTA------T---AT--GT----CA-----TG-----TT--AACTTAA-C-----CA--T---ACTTT--A---A-TTAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GCC---A-T---AG--A---TTATG--TCAAGT-T-TCA-TT-TTGT-CATTTT-AAG-T-T---------------------------TATTATCATGAC--AT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-T------T---A--CCTAAAT-AAAATGAAATGA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --A---T---C-----CA--T---TCTTT--A---A-TTACATGT--ATT---GTAAT-TACA-TATACT---GCT---A-T---ATAGA---TCATG--TCAGAT-T-TCA-GT-ATGT-GA-TTT-AAG-T----------------------------TTAGGATCATGAT--AT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-TTACTACT---A--CCTGAAT-AAGATGAAATGA
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taGAGA--AG----TC-ACATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTTTTAA-TAC--AT------A---T-TT---TTA--G-T----------------------------C-TTC-------CATT--TT----A----------AG-----A-----T-----T---------TGTCCGAATTATAT-A-AT---TTTT---------C---A-A--T-GC---A------T---TAT-AC----------AA--C-TATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GCAA--A--A----A-TTCC--TA-TACT
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -ATA--TCA-TTA------T---AT--GT----CA-----TG-----TT--A---T---C-----CAT-T---C-TTT--A---A-TTGT---T--ATACATGTAAT-TG---CAGAGT---GCT---A-TG--G---A---TTGTG--TCAGGT-T-TCAGTT-TTGT-GATT----------------A-TGACATT--T-------------------------------TG-TGAT--A-G--TT-TA-----C---A--CTTGAAT-GAAATGGAATGA
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     t--T---C-TTT--A---AATTATG--T--ATGTGTATAATCTGA--CATGGT----CCTATA-T---A---A---TTATG--TCAGGT-TATCA-TGGTTGTTGATTTT-AAG-T-T---------------------------TATGATCATGAC--AT--A--CTG-TGAT--A-T--TT-A------TAACA--CCTGAAT-AAAATGAAATG
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              catTTT----T----T---A-A--T-GT---A------T---TAT-GC----------AA--C-GATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----AGTTTC--AA-TACTAG---TCT-------T-G-C-A----TT----A-----T-----A-A---ATCA--T----------TTA--------AAATT--ATT--TAAT--ATTACAT-ATTAT----T--AT-TT
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tcctgctgtatccccagagagagaA--TCA-TTA------T---AT--GT----CA-----TG-----TT--A---T---C-----CAT-T---A-TCT--A---A-TAAT---T--------ATAAT-TG---CATAGT---GCC---A-T---AG--A---TTATG--TCAGGT-T-TCA-GT-TTGT-GATTTT-ATG-T-T-T-ATGA-T
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaT--A---A---C-----CA--T---ACTTT--G---G-TTAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GTC---A-T---AG--A---TTATG--TCGGGT-T-TCA-TT-TTGT-GGTTTT-AAG-T----------------------------TTATGATCATGAC--AA--T--CTG-TGAT--ATT--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAtctgacctaaataaaataaaatgga
gi|5                          :                                                                                                                                                                                           TGTGAAATTTTACAC----GCTTTATGCA------T--GTTAAGA-GTTAA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATT-G----------------TTTTGATAT-ATT-TCA--TGATAATGAACCA--AGCT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATC-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC---A----AGGT-CTACCAAT----AAT-A--TT-A--GTCATA-CAC-AAG-AT--C-A--A--GGC-AA--G-AATCCTCATGATTG-T-AATTATAA-TGT-----CATT--AA-GATTGG-AATACTT---TGCCT-TTAG-AGA--C--A-A---------------A-CAGTT---G--TCAGCAAA---A-CG--AAG---------TT----------TAAAA---AAAGGCTGTTAAAGTCGA----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-TCATG-ATG-CC-A-----T-ATC------TAG--------------TTTTGTTGA-T-C--TT------A---T-TT---TTA--T-T------G-AA--T-T-----AAAT--G-C-TAG--------GTT--CT----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAACATTT-C-AT---TTTT----T----C---A-A--TAGC---A--A---T---TAT-GC----------AA--C-CATT--T-TAT----AAAA-------G-TCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AG-CACTAG---TCT-------C-G-T-A----TC----A-----T-----A-A---ATTA--T----------CCA--------AA--T--ATT--T-AT--AT----T-ATTAT----T--AT-TTG-AT------TAT-T----------T-A-T-T-T-G-C--------------A---GTAA---GGATCCCATTGG-AA--TAATTCTG--AT-TTCA----GC-TT-T----TATG---GGT-TATC-T----T-T--A-G-TTAT----------TA-ATA--TCA-TTA------T---AT--GT----CA-----TG-----TT--A---T---C-----CA--T---A-TTT--A---A-TTAT---T--A-----ATAAT-TGC--CATAGT---GCC---A-T---A---A---TTATG--T-AGGTGT-TCA-GT-TTGT-GATTTT-AAG-T-TAT-ATCATTGACATTGATGTGA-TCATTATGATCATGAC--AT--T--ATG-TGAT--A-T--TT-T------T---A--CGTGAAT-AAAATTAAATAAcga
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --CATAGT---GCT--------------------TG--TCAGGT-T-TCA-AT-TTGT-GATTTC-AAG-T-T-----------------TACGA-TCATT-----CATGAC--AT--T--CTG-TGAT--A-G--TT-TA-----C---A--CCTGAAT-TGAATGAA
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cccattattttaaaatgctggatatg-----CA--T---G-TTT--A---A-T---------------ATA---TGC--CATAG--------------------A---TTATG--TCAAGT-T-TCA-TT-TTGT-AATTTTTAAG-T-T---------------------------TATGATCATGAC--AT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AGAATGAAATGAgg
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttttcagcaaAAAATAATAC--TAT---ATGTGCTTCCAAT----AAT-AA-TT-AATGTCATA-CCC-AAG-AT--C-A--AAAGGT-AAAAG-AATCCTCATG-TTT-T-TATTATAA-TGCT----TATT--AAAGATT-G-AATACTa
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    g-CC---AGCAAGGC-ATGGGG--AG----TC-ACATACACG-CC-A-----T-AGA------CAG--------------TTT---------------------------------A--T-T------ATAA--T-T-----CAAT--C-T-TAT-------TATT--TT----A----------AA-----A-----T-----A---------TGTTCGAAACTTGT-C-AT---TTTT----C----TAAGA-A--T-GC---A--A---c
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAATAATAC--TAT---ATGTGCTTCCAAT----AAT-AA-TT-AT-GTCATA-CCC-AAG-AT--C-A--AA-GGT-AAA-G-AATCCTCATG-TTT-T-TATTATAA-TGC-----CATT--AAAGATTGG-AATACTc
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  g-ATA--TCA-TTA------T---AT--GT----CA-----TG-----TT--A---T---C-----TAATT---C-TTT--A---A-TTAA---T--------ATAAT-TG---CAT--T---GTC---A-T---
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               t---A-T---AG--A---TTATG--TCAGGT-T-TCA-GT-TTTT-GATTTT-AAG-T-T---------------------------TATGATCATTAG--AT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-T------T---G--CCTGAAT-AAAATGAAATGAtcattgtaacaatcacccaacttagtaagagactatgatc
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agCATG-ACA-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTGA-------T------A---T-TTAAAAAA--T-C------A-AA--T-C-----AAAT--C-T-TAA-------TGTC--TT----
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                               ----T------TTTCAATAT-ATTGTCA--TGGTAATACACCCCTAACT-ACCTTTTGTG-------A--AAATT-A-AATGACTAA--AT-AAAAATAATAC--TA----GGGTGCCACCAATATACAAT-A--T-----GTCA-A-CCC-AAGTAT--A-A--A--GGCAAA--G-AAT-CTCATG-TTT-T--ATTATAA-TGC-----C-TT---AAGATT-G-AATACTT---TGCCT-TTAG-AGA--C--A-AC--------------AACGTTT---G--TCTGCCAA---A-CAAGAGG---------TT----------TTAAA---AAAAACCCTTAAAGTCAT----TT-----TTTATAGG-CCA--AGCA--GC-AAGGGATCGT----TT-TCATG-A-G-CC-A-----TAATC------GAA--------------TTTTTGTGA-TAC--TT------A-----TT---TTG--T-T------T-AA--T-T-----AAAT------------------TT--TTATA-A----------TT-----A-----T-----A---------AGCTCGAAACA-GT---A----TTTT----T----C---A-A--T-GC------A---T---TAT-GC----------AA--C-A--C--T-CAT----AAAC-------A-TCT--GC-C--A--A----A-TTCC--A---AGTAG---TCT-------C-G-C-A----TT----A-----T-----A-------TA--T----------TT---------AA--T--A-T--C-AT--A-----T-ATTAC----T--CT-TT--AT------TAT-T----------CAA-T-T-T-G-T--------------A---GTAA---GGAATTCATTGG-AA--TAAG-ATG--AG-GTCA----GC--T-G----TATG---GGT-TATC-C----T-T--A-G-TTAT----------T--ATA--CAA-TT-------T---ATG-GT----CA-----TG-----TT--A-------A-----CA--TAA-C-TTT--A---A-CT-T---T--------ATAAT-TG---CATAGT---GCC---A-T---A---G---ATATG---CAAGT-T-TTA-TT-ATGT-AA-TTT-AAG-T----------------------------TTATGATCATGAC--ATTGT--CT--TGAT--A-T--TT-T------T---A--CCTAAAT-AAATTGAAATGA
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaccatgGATTATGAT--AT--T--CTG-TGAT--A-T--TT-TC-----C---A--CCTGAAT-GAAA
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGATCATGAC--AT--T--CTG-TGATTTA-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAattttaagacatgaa
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGATCATGAC--AT--T--CTG-TGATTTA-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAtg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GG-AATACTT---TGC------------------A---------------AACAGTT---G--TCAGCAAA---A-CA--GAG---------TT----------TTAAA---AAAAGCTG-TAAAGTC-T----TC-----TT----AC-CC---AGCCAGGC-TAGGGA--AG----TTGTCATG-ACG-CCAA-----T-ATC------AAG--------------TTT-----G-T-C--TT------A---CGTT---TTA----A------A-AA--T-T-----Atg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAAACATGT-C-A----TTTT----T----C---A-A--T-GC------A---T---TAT-GCA---------AA--C-CATT--T-CAT----CACA-------A-CCT--GC-C-----A----A-TTCC--AA-TACTAG---TGT-------C-G-C-A----TT----A-----T-----A-A---ATTA--T----------TT---------AA--T--ATT--T-AT--ATATA-T-ATTAT----T--GT-TTG-AT------TAT-T----------T-A-T-T-T-G-T--------------A---GNNN---NNNNNNNNNNNN-NN--NNNNNNNN--NN-NNNN----NN-NN-N----NNNGACAGGT-TAT--------------A-TCAT----------TA-----------TA------T---AT--GT----CA-----TG-----TT--A---T---C-----CAT-T---C-TTT--A---A-TTAT---T--------ATAAG-TG---CACAGT---GCC---A-T---AT--AAC-TTATG--TCAAGT-T-TCA-GT-TTGT-GATTTT-AAG-----------------------------ATTATGATCATGAC--AT--T--CTG-TGAT--ATT--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGAtagagaacagaagaacagaatgtttatttctaatcagagtccaaaacagacaaagtgagttcataacaacattagaagattatatgcttgaaacatgtcatttttcaatgcattatgcaaaccatttcatcacaacctgccaattccaatactagtgtcgcattataaattatttaatatttatatatatattattgtttgattatttatttgtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaggttatatcattatatatgtcatgttatccattctttaattattataagtgcacagtgccatataacttatgtcaagtttcagtttgtgattttaagattatgatcatgacattctgtgatattttttacctgaataaaatgaaatga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                             ggaatactttgcaaacagttgtcagcaaaacagagttttaaaaaaagctgtaaagtcttcttacccagccaggctagggaagttgtcatgacgccaatatcaagtttgtcttacgttttaaaaattatagagaacagaagaacagaatgtttatttctaatcagagtccaaaacagacaaagtgagttcataacaacattagaag--GTCATA-CCC-AAG-AT--C-A--AA-GGC-AA--GGAATCTTCATG-TTT-T-TATTATAA-TGC-----CATT--AAA-------------C---TGCCA-TTA--AAA--T--G-G---------------AATAGTTTTAG--CCACCAAA---G-CA--AGG---------
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatGCCATTAAAATGGAATAGTT-----TT----AG-CC---ACCAAAGC-AAGGGA--A------T-TCAT--ACG-CC-A-----T--------------------------------TTGA-TGC--TT------A---T-TT-----A--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGTCTA---CGTTG-TT----AAAA-------TC-----A-----T-----A---------TGCTT-AAACCTGT-C-AT---TTT----------C---A-A--T-GC---A--A---T-------GC----------AA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-ATCC---A-TGCTAT---TCT--------------------------------------A---ATTA--T----------T----------AG--T--ATT--T------T----T-AATATA---T--AT-T---AC------TAT-T----------A-A-TAT-T-N-N--------------N---NNNN---NNNNNNNNNNNN-NN--NNNNNNNN--NN-NNNN----NN-NN-N----NNNN---NNN-NNNN-N----N-N--N-N-NNNN----------NN-ATG--TC---------------AT--GT----TA------A-----CT--A-------C-----CA--TAC-G-TTA--A---A-TTATA--T--A-----TTAA--TG---CATA-T---TCC---A-TGAAA---A---TCAT---TCAAGT-T---A-AT-TAGT-CA-TTT-AA-------------------T--TG---------ATGATCA-GAC--AT--T--CTG-T-AT--A----TT-T------G---A--CCTGAAT--AAAT-AAATGgaattcatacgccatttgatgcttatttattaaattaaatcctagtctacgttgttaaaatcatatgcttaaacctgtcattttcaatgcaatgcaacaatttcataaaaacctgccaaaatccatgctattctaattattagtatttttaatatatattactattaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtcatgttaactaccatacgttaaattatatattaatgcatattccatgaaaatcattcaagttaattagtcatttaattgatgatcagacattctgtatatttgacctgaataaataaatg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aatgtcatacccaagatcaaaggcaaggaatcttcatgtttttattataatgccattaaactCTGT-AAAGTCCA----TA-----TT----AG-CC---AGTAAGAC-AATGGA--TA----TT-ACATG-ATA-CC-A-----T-GTG------CAG--------------TGTTGTCAA-T-TA-TT------A---T-AT---TTA--CAC------A-AA--T---------AT-------AG-------CCTT--CT----A----------TT-----A-----TGAAATA---------TGTTTGAAACTTAT-A-AT---TTTT----CGACGC---A-AAAT-GC---A--ATATT---CAT-TC----------AAAAC-C-TT--T-CA------AAACTCTTGTA-TTT--GC-T--ATTA----G-TTGT-----TGTTTG---TCTGTTTTTTC-A-T-ACTTCTT----A-----T-----GTA---ATTA--TAGGGATCCCATTG--------AA--C--ATT--TTAT--AT----C-ATTGTATGCC--AT-GTT-ATCCATCATAC-T----------T-A-TCT-T-G-T--------------A-----------------ATTAC-AA--GAATT--A--AT-TTCA----GC-TT-T----TATG---GGT-TACC-C----T-T--A-G-CT----------------TA--TCA--TA------T---CT---T----CA-----TT-----CT--A---T---------CA--T---T-TTT------------------------ACAAT-TG---CATAGT---ACT---A-T---ATAGA---TTATG--TCTGGT-T-TCA-AT-TTGT-CATTT----G-------ATCA-TGACATT--
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|57 ): TCAATTGCATAGTGCTGAGACTATGCGACATATTCCAATCCTTTTAATTTTATATTCATTTTATGCCATTTTATACCAAAATAAAA
Unaligned ( gi|58 ): ACATTTTTTCAAAGTTTTCTAAACGTTCATCTTATCCTTCGCCATAATGGTTGATGTAGAGAG
Unaligned ( gi|61 ): AATATTAAAGAAATGATTATCCATTCTTACGGTTTGGTTTCAATATTT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                        11111111              2222                                       666666666666666666666                               11               1111111                                         2222                      2222                                                                                                                  222222222222222                                          111111111111111             11     1111111                                                                       111111   22222222222222        22222222222222222222        1111111111111                        55555555555555555555555555555555555555555                                                222222222             2222222222                                                               11         1                                                    222222222222      2222222222222222222222222      1111       111111                                                         11111111111111                              11111111                                                   1111111111111111111111                                                         1111111        22222222222                  222222222       2222                     222                                                             1                                            1111111111111111111111111         111111                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                        33333333          888 7777       5     5     5                   111111111111111111111          4 4   66             00    4      4   7777777 77     555 4 4     55  4           44 3 7777              4   77  0000      3   6   3  55   3      6           4  2 777777  2    2     2    33       0 2       555     2  33  2    5555 000000000000000       555 33     2   555   33 888888  2  222222222222222  555   0    88     2222222  66666  5555  2  666        2      33  5555  33    2 0 4  2 55555 2   222222   00000000000000        66666666666666666666  555   0000000000000  44 6666666    777777  33333333333333333333333333333333333333333 88888 44444 777777777              1 1  333    555555555 333 1 22 1  6666666666 333   1  8888888888  44 22   22 4   4444    6666666 2   22  2 00 22 4444 0    22222      333   888888888 2 2 4444  4444 55555 444444444444   22 4444444444444444444444444 22   8888 1 22  333333  1 555555 44  1   2  555555  3333  9999999999 1 1 1 1 1 22222222222222 333  333  66666         222  22222222 1 22  22   3333    1 3333   1    1    1 3333 1 33 7777777777777777777777  11 1  1 11  555555 222  333  2222   33333 222 33333 11 3333333 44444  55555555555   1  2 111   555 555555555    1  7777     111   222 1 333 666 444  1   11      1 1   1 1    77777777777777     88888888   6  7   11 2222  11  11   11  11 22   2   111 2222222222222222222222222 2 11  1 333333 333 11       1            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                        ........          ... ....       .     .     .                   .....................          . .   ..             ..    .      .   ....... ..     ... . .     ..  .           .. . ....              .   ..  ....      .   .   .  ..   .      .           .  . ......  .    .     .    ..       . .       ...     .  ..  .    .... ...............       ... ..     .   ...   .. ......  .  ...............  ...   .    ..     .......  .....  ....  .  ...        .      ..  ....  ..    . . .  . ..... .   ......   ..............        ....................  ...   .............  .. .......    ......  ......................................... ..... ..... .........              . .  ...    ......... ... . .. .  .......... ...   .  ..........  .. ..   .. .   ....    ....... .   ..  . .. .. .... .    .....      ...   ......... . . ....  .... ..... ............   .. ......................... ..   .... . ..  ......  . ...... ..  .   .  ......  ....  .......... . . . . . .............. ...  ...  .....         ...  ........ . ..  ..   ....    . ....   .    .    . .... . .. ......................  .. .  . ..  ...... ...  ...  ....   ..... ... ..... .. ....... .....  ...........   .  . ...   ... .........    .  ....     ...   ... . ... ... ...  .   ..      . .   . .    ..............     ........   .  .   .. ....  ..  ..   ..  .. ..   .   ... ......................... . ..  . ...... ... ..       .            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                        22222222          888 4444       0     0     0                   000000000000000000000          4 4   11             66    4      0   0000000 77     555 0 0     55  0           66 3 1111              0   22  1111      3   7   3  88   1      2           1  7 777777  5    5     5    44       4 5       000     9  99  9    8888 777777777777777       000 99     9   444   99 222222  7  666666666666666  000   1    22     7777777  22222  3333  4  555        4      22  0000  44    2 5 4  2 66666 2   888888   33333333333333        33333333333333333333  888   9999999999999  55 4444444    444444  99999999999999999999999999999999999999999 11111 88888 666666666              8 8  222    444444444 000 7 44 7  5555555555 333   9  3333333333  55 99   99 2   5555    5555555 0   88  0 88 88 2222 0    88888      333   333333333 0 0 2222  2222 00000 888888888888   88 9999999999999999999999999 66   1111 9 66  444444  9 222222 55  9   0  222222  9999  8888888888 8 8 8 8 8 00000000000000 000  000  99999         999  99999999 2 33  33   5555    7 5555   7    7    7 5555 7 88 9999999999999999999999  88 3  3 88  777777 333  555  7777   22222 333 11111 77 0000000 66666  44444444444   1  2 999   333 222222222    1  2222     888   888 0 888 666 333  1   44      1 1   7 1    77777777777777     22222222   5  7   33 1111  33  33   33  33 33   0   888 8888888888888888888888888 1 44  0 999999 000 55       1            
consensus                     :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTA-GAC----TCTTTGGGCA---T--T-GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATT-GA--C----T------T---TTTAATATAT-T-TCA--TGGTAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--T-A----AGGTGCTACCAATA-ATAA-TT-N--GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTGTTAAAGTCGN----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-NCATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAAT-C--TT------A---T-TT---TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAG-------C---GTT--TT----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAACATGT-C-AT---TTTT---------C---A-A--T-GC---A--A---T---TAT-GC----------AA--C-NATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TACTAG---TCT-------C-G-T-A----TT----A-----T-----A-A---ATTA--T----------TTA--------AA--T--ATT--T-A-T--AT----T-AT-TAT----T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------A-T-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GGACCCCATTG-G-AA--T-AA-GCTG--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TATC-C----T-T--A-G-TT------AT-----TA-ATA--T-CA-T--TA------T---AT---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--C-----TTT-AA-T---TAT---T--A-----ATAAT-TGC--CATAGT---GCC---A-T---AG--A---TT-ATG--TCAGGT-T-TCANT-TTGT-------------GATTTT--------AAGTTTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
Reference ( family-4676 )     :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTA-GAC----TCTTTGGGCA---T--T-GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATT-GA--C----T------T---TTTAATATAT-T-TCA--TGGTAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--T-A----AGGTGCTACCAATA-ATAA-TT-N--GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTGTTAAAGTCGN----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-NCATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAAT-C--TT------A---T-TT---TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAG-------C---GTT--TT----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAACATGT-C-AT---TTTT----T----C---A-A--T-GC---A--A---T---TAT-GC----------AA--C-NATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TACTAG---TCT-------C-G-T-A----TT----A-----T-----A-A---ATTA--T----------TTA--------AA--T--ATT--T-A-T--AT----T-AT-TAT----T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------A-T-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GGACCCCATTG-G-AA--T-AA-GCTG--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TATC-C----T-T--A-G-TT------AT-----TA-ATA--T-CA-T--TA------T---AT---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--C-----TTT-AA-T---TAT---T--A-----ATAAT-TGC--CATAGT---GCC---A-T---A---A---TT-ATG--TCAGGT-T-TCANT-TTGT-------------GATTTT--------AAGTTTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTACAAG----TCTTTAGGCA---T--T-GTTAAGATGTTGAATG-CATGAGCCACT-AATTAAGATT-AA--C----CGTATGGT---TTTATAATAT-T-TCAAGTGGTTAT-CTCCAC-AACTGACTCTT-GTG-------AA-AAATT-TTG-T-ACTAAGAAC-AAAAATAATAC--T-A----AGGTGCTACAAATA-ATAA-TT----GT-ATAGCCCAAAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCGCTTGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATTAAAAAAATTGGAAATACTT---TGCCT-TT--AGAAGAC----A---------------AACAATT---GTCTCAGC-AAAGACACA--A------CGATTATAACAAAAATA--AAA---AAAAGCTG-TAAATT-------TT-----TT----AGCCC---AGCAAAGCAAAGAGG--AGATGTTT-TCATG-ACGACC-AATGCGC-GTCTTGAAACAGGAGAGGA-------TTTTGGCAGT-T--TT------G---T-TTG--TCAAGT-TGCGGGAA-AA--TATGTTTAAAATTAC-C-AAG-------A---GTT--CT----AGCTGTGT---TT-----A-----T-----AAAATTATACTGCTT-AATCATGTACAAT---TTTT----G----C---A-A--T-GC------A---T---TATGGC----------AA--CAAATT--T-CAT----AAAA-------AGCCT--GC-CCAA--A----A-TTC----A-TAC-AG---TCT-------C-G-C-A----T-----------T-----A-A---GTTA--T----------T----------AA--T--A-T--T-A-T--TA----T-AT-TAC----T--AT-TTG-AT------TA----TT----------A-C-T-T-GTT--------------A---GT---AA----GACCCT-TTG-A-AAATT-AA-GC-G--AT-TTTA----GCTT-T----T-T-GGGT-TATC-C----T-TTAG-G-CT------AT-----TATATC--T-CATT--TA------T---AT---GT----CAT-----G---T-----T--A----A--C-----CA--TA-C-----TTTAAA-T---TAT---T--A-------AAT-TGC--ATTAGT---GCCA--A-T---AG--A---TT-ATG--TCAAGT-T-TCATT-TTAT-------------GATTTT--------AAG--TTATG--A----TC--AT--CAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|10                         :                  aatgactttatgttctggctttaatacacattgccttattttgattatgcctgctttcttcaatggtaatgtggtagtggcaaacaattcaaatagaattgcagttacaaacaaaatataagttgttagatttatcttctgaaatctaggtctacgaaactccaagtttaatttctATTCTA-GAT----TATTTGATCA---T--TTGTTAAGA-GTTGG-AGACA-GAGTTACTAAATTAAGATT-GA--A----TCATA--T---CTTGACTTGT-T-TCA--TAGTAACGTGCCA--AATT-ATCTTT-GTGTCTTAGTAT-CAA-----G-C-ACTAA--AC-AATAATAATAC--T-AG---AATTGCTACCAATA-AGAATTT-T--GTCATA-CCT-TAG-AT-AAAA-GGCAAGTGAA---------TT-T------TA-TTCT-A-----CAT--------TTG-------TT---TGCCT-TT--AA-AAACTTACA---------------AAC-GTT---A--ACCAC-AAA---AAA--AGAGTTGGG-TT----------TTCCAAAAACAAAAGCTGTAAAACTAGA----TTATCAATT----AA-TT---TAAAAGAC-AAAGAA--TG----TT-ACATA-ATG-GT-A-----T-TCT------CAG--------------TACTGTTA---C--TT----------T-TT---TCA--T------------------------------C-TA-------------TT--TC----AC---------TT-----AAAAATC-----A---------TGTCTGAAACGTGT-C-AT---TTTC----G----C---A-A--T-G
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggcTA--T-T------T-AA--T-T-----AAAT--C-CCTAGTCTTTGAC---GTT--TTTAAAA----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAAACATGT-C-AT---TTTC---------C---A-A--T-GC---A------T---TAT-GG----------AA--C-AATT--TTCAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TGCTAG---TCT-------CCG-T-A----TT----A-----T-----A-TTT-ATTA--T----------TTA--------A---T--ATTA-T-A-T--AT----T-AC-T------T--AT-TTG-GA------TA--T-TT----------AAT-T-T-G-T--------------A---GT---AA---G-ACCCCATTG-G-AAATT-AA-GC-G--AT---CA----GCTT-T----TAT-GGGT-TATC-T----T-A--G-G-TT------AT-----TAGAT---T-CA-T--TA------T---AT---GT----CAT-----G---T-----TAAA----TA-C-----CA--TTAC-----TTT--A-T---TAA---T--T-----ATAAT-TG---CATAGC---GCC-----T---A---G---TT-AT---TCA-AT-T-TCATT-TTGG-------------TATCTTTTTTAAAAAAG-TTTATGATA----TC--AT--G-C--AT--T--CTGCCGA---T-------------------------ATT--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAATTGa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              a-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGTCTTGA-C---GTT--TTTAAAA----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAAACATGT-C-AT---TT-----------C---A-A--T-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCTTGGC-C--A--A----A-TTCC--A--TGCTAG---TCT-------C-GCT-A----TT----A-----T-----T-ATTTATTA--T----------TTA--------A---T--ATT----A-T--AT------AT-TAC----T--AT-TTG-AT-------A--T-TT----------A-T-T-T-G-TT-------------A---GT---AATTGAGACCCCATTG-A-AA--TTAA-GCTG--AT-T-CA----GCTTCT----TAT-GGGTGTATC-C----TAT--A-GGTT------AT------A-AGA--TTCA-T--TA------T---AT---GT----CAT-----G---T-----T--AAAC-TAAC-----CA--TTAC-----TTT-A--T---TAT---T--A------TA-T-TGC---ATAGC---GCC-----T---A---G---TT-ATG--TCAATT-T-TCATT-TTGT-------------CATTTTTTAA----AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-CGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttT---TTA--T-C------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGTCTTA--C---ATT--TT----AAAA-------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAAAATGT-C-AT---ATTT---------C---A-A--T-GT---A------T---TAT-GC----------AA--C-CATT--T-CAT----AAAA-------A-CCA--GC-C--A--A----AATTCC--AG-TACTAG---TCT-------C-G-T-A----TC----A-----T-----A-A---ATTA--T----------TTA--------A---T--ATTATT-G-T--TT----T-AT-T------T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------A-T-T-T-G-T--------------A---GG---NN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NNNN-NNNN-N----N-N--N-N-NN------NN-----NNTATA--T-CA-T--TA------T---AT---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CAT-T--C-----TTT-AA-T---TAT---T--------ATAAT-TG---CATAAT---GCC---A-T---AT--A---TT-ATG--TCAAGA-T-TCAGT-TTGT-------------GATTTT--------AAG-TTTATG--A----TC--AT--GAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGATT-AAAATGAAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --GTCATA-CCT-AAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCATG-TT-T------TA-TTTTAAATGC-CATT--AAAGATTAG-ATAACTT---TGCCT-TTAGAG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCTGCAAAA---ACA--A------AG-TT----------TT---AA---AAAAGTTGT---AGTCGT----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AATGGA--AG----TT-TCATG-ACG-CC-A-----T-ATC------GAG--------------TTTTTTTA-------------------------TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--TGA-TA--------C---GTTG-TT----ACTTCGCCATTTT-----A-----T-----A---------TCCT--A-----GT-C-CTACGTTTTAAAAT----C---ATA--T-GCTCGA--A---A---TAT-GTCATTTTCCTGAA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TACTAA---TCT-------C-A-C-A----TT----A-----T------------TTA--T----------TT---------GA--T--A-T--T-A-T--AA----T-A---------------------------------TT----------A-T-T-T-G-T--------------A---GT---AA---AGACCCCATT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A-TTGC-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATGCTT---TGTCTGTC--AG-AAAC--A-ACTTATGCAATATCATAACAGTT---G--TCGGC-AAA---GCT--A------AG-TT----------TT--TAA---AAA-GCTGT-AAAGTCGC----TA-----TT----AG-CC---AGCAAGAC-ACGTGA--AG----TC-ACATG-ACG-TC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAATAC--AT------A---T-TT---TTA-----------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGCCCTA--C---GTT--TC----AAT--------TC-----A-----T-----A---------T--CCGAAACATGC-C-A----TTTT----C----C---A-A--T-T-----------T---TAT-GC----------CA--C-TATT--T-CAT----CAAA-------A-CTT--GC-CA-A--A----A-TTCC--GA-TACTAA---TCT-------T-G-T-A----TT----A-----T-----A-A-----TA-------------GTA--------CA--TGCATT--T-A-TTCGT----TAAT-TGT----TG-GT-TTG-GT------TT--T-TT----------T-T-T-T-A-T--------------A---AT---
gi|16                         :                                                                                                                                                                  gcaatgggtttttttgttctccaatgTGTGAACTTCTA-GAC----TCTTTGGGCA---T----GTTAAGA-GTTTA-TGACA-GAGCCACTCAACTAAGATT-GAACC----T------TGTTTTCAATATAAAT-CCA--TGGCAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--ACAAAAAATAATAC--T-A----
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              actcctaagaccttagatttttatacagaatgcattcttgcctaaggattttatgttctgctttgatcaagttattttttatatgaagctccaatttggaagttttttaggcaataaatttgaacatagattgtaaagttgatccttagcaaaaataaagttgtccagatttattctaaatcttggtcctagaaccaggatttct----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAA-GTGT-C-AT---TTTT-------------A-A--T-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-AATT--TTCAT----AAAA-------A-CC---GC-C--A--A----ACTTCC--AAATACTATCACTCT-------C-G-CGA----TT----A-----TTTATTA-A---TTTA--T----------TTACTTTATTTAA--T--ACT----A-T--AT----A-GT-TAC----TTAAT-TTG-AT------TA--TCTT----------A-T-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GTACCCCATTG-GAAA--T-AA-TCTG--AT------------------------AGT-TAT-------T-T--A-A-T------------------TA--T-CA-T--TG------T---AT---GT----C-T-----G---T-----A--A-------------CA-------------T-AA-T---TA-------A-----G----------CATAGTGGGGCC-----T---A---AATTTT-ATG--TAACG--T-TCATT-TTGT-------------GATTTT--------AAG-TTTATG--A-----C--AT--GAC--AT--T--ATG-TGA---T-------------------------A-TTCTT-T------T---A--CCTGAAT--AAATGAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgatagtattgggtttgctcctacaT-----A-----T-----A---------CACTCAAAACATGC-C-AT---TTTT---------C---A-A--T-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-TATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----AATTTC--TA-TACTCA---TCT-------T-G-T-A----TT----A-----T-----G-A---ATTA--T----------TTA--------A---T--ATT----A-T--AT----C-AT-T------T--AA-TTG-AT------TG--C-TTGTGAAAGTATA-T-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GAA-----------AA--T-AA-GCTG--AT-TTCA----GGTT-T----TAT-AGGT-TATC-C----T-T--AGG-TT------AT-----T--TTA--T-CA-T--TT------T---AC---GT------T-----A---T-----T--A----T--C-----CAT-T--C-----CTT-GA-T---TAT---T--------ATAAA-TG---CATAGT---GCT---A-T---AG--A---TT-ATG--TCAGGT-T-TCAGT-TTTT-------------GGTTTT--------AAG-TTAATG--G----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TAA---T-------------------------A-T--TT-G------T---A--CCTGAAC-AAAATGAAAga
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGT-C-AT---TTTT---------C---A-A--T-GC---A------T---TAT-GC----------GA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----AATTCC--AA-TGCTAG---ACT-------A-G-T-A----TT----A-----TTTAT-A-T---ATTA--T----------TTA--------A---T--ATT----A-T--AT------AT-TAC----T--AT-TTA-AT------TN--N-NN----------N-N-N-N-N-N--------------N---NN---NN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NNNN-NNNN-N----N-N--N-N-NN------NN-----NN-NNN--N-NN-N--NN------N---NN----T----CAT-----G---T-----T--AACTTTA-C-----CA--TA-C-----TTT-AA-T---TAA---T--A------TAAT-TGT---ATAGT---GCC---A-TA--A---A---TT-ATG--TCAAGT-T-TCATT-TTGT-------------CATTTT--------AAG-TTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-C--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTA-CAG----TCTTTAGGCA---T----GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATTTAA--CCATGT------T---TTTAATATAT-T-TCA--TGGTTATGCCCCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AA-AATTT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--T-AG---AGGTGCTACCAATA-ATAA-TT-AT-GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCTTGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAAATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAATT---G--TCTGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TA--AAA---AAAAGCTG-TAAAGT-------TT-----TT----AG-CC---AGCAAAGC-AAGGGA--AG----TT-TCATG-ACGACC-A-----T-GTCTTGAAACAGGATGATTTGGCAGTTTTTGTTTGT-CAATTGGGGAAA---A-TT---TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--T-C-TAGTCT----T---GTT--TTAAA-A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAATCATGT-C-A----TTTT----T----C---A-A--T-GC------A---T---TAT-GC----------AA--C-AAT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttaataagtatattgttaattgcaactcacacaggagtgaaaaactctagacttaagattgttatacagaatgcttctggccctaaataggccagtctaaaaatactttatgttctgctttaatacaatgctattttgattatgctgcttcttcatggtatagtggtattggcaaacaatttcaacatagattgcaagttacacaaaataaagttgttagatttattctaaatctaggtcctagaaccagtatttct---TCC-------C-G-T-A----TCCTCGA-----T-----A-ATT-ATTG--T----------TTA--------A---T--ATTA-C-A-T--AT----T-AC-TAT----T--A------AT------TA--T-TT----------A-T-T-T-G-T--------------A---GT---TN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NNNN-NNNN-N----N-N--N-N-NN------NN-----NN-NNN--N-CA-T--TAAT----T---AT---GT----CAT-----G---T-----T--A-------C-----CA--TA-C-----TTT-AA-T---TAA---T--T-----ACAAT-TG---CATAGT---GCC---A-T---AG--A---AT-ATG--TCAAGT-T-T-ATT-TTGT-------------GATTTTA-------AAGTTTTATG--A----TC--CTGAGAC--AT--TTGTTG-TAA---T-------------------------A-T--TTAC------T---AGTCC--AGT-AAAATGAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttctttctcatttcattttattca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                         tgcaactctttactttctcagattgtctgagatttgtaacacatgtaTT-GTGC------ATCAAACTAT-A-T-ACTGA--GT-AAAAATAAGAC--T-AG---AAGTTCTACTTGTA-AT---TT-T--TTCATA-CCTAAAG-AT-AAAT-AAAAAA-AAACCCT--TGTTTATACATTGTA-TTAC-AAATT-CATT--AAAGATTaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A--A------AG-AT----------TT--TTA---AAAGGCTGT-AAAGTCGC----TA-----CT----AT-CC---ATCAAAGC-AAGAAA--AG----TC-ACATG-AAG-TC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGCTAAT-A--T-----------T-TT---TTA--T-T---------A--T-C-----AAAT--T-C-CA------------GTT--TT----ATATT------TT-----AAAG--T-----A---------TGTCCGAAACATGT-C-CT---TTTTG---T----C---A-A--T-GT------A---T---TAT-GC----------AA--C-TAtttaaaaggctgtaaagtcgctactatccatcaaagcaagaaaagtcacatgaagtcatgtccagttttgctaatattttttattatcaaattccagttttatattttaaagtatgtccgaaacatgtcctttttgtcaatgtattatgcaactacatgtattacaagtatttaaagcatgcc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttgtgcatcaaactatatactgagtaaaaataagactagaagttctacttgtaattttttcatacctaaagataaataaaaaaaaacccttgtttatacattgtattacaaattcatt--------AA--T--ATT----A-T--AT------AT-TAC----T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------A-T-T-T-G-T--------------A---GT---NN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NNNN-NNNN-N----N-N--N-N-NN------NN-----NN-NNN--N-NN-N--NN------N---NNNNNGT----CAT-----G---T-----T--A----A--C-----CA--TA-C-----TCT-AA-T---TAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GTC---A-T---AG--A---TT-ATG--TCAAGT-T-TCATT-TTGT--------------ATTTT--------AAGTTT-ATC--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATcatgtattacaagtatttaaagcatgcc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gtgtatcacatgtacTCC--AA-TTCTAG---TTA-------T-G-T-A----TT----G-----T------------TTA--T----------T-----------G--T--TTT--T-G-T--CT----G-TT-CAT----C--ATATTA-AG------CA--T-CT----------A-A-T-T-A-T--------------A---------A---GGACTTCATTGCA-AA--G-GA-GCCA--AT-GTCA----GCTT-C----AGT-GGGT-TACC-C----T-TC-A-G-TT------AT-----CA--TA--T-TA-T--AA------T---AT----T----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----TA--T--TCCA--TTT-AT-TCTTTGT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GCT---A-T---A---T---TTTGTG--CCAGGT-T-TCAAT-TTGC-------------AACTTT--------AAA-TTTACA--A----TC--AC--TAC--TT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-tgt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --A-G-TT------AT-----CA--TG--T-CA-T--TA------TGTCAT---GTTATCCAT-----G---T-----T--A----T--T-----CA--TT-C-----TTT-AG-T---TGT---T--A-----A-AAC-TGC---ATGGT---GCT---A-T---ATAGA---TT-ATG--TCAGGT-T-TCAAT-TTGT-------------GACTTT--------AAG--TTGCG--A----TC--AT--AGC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TGC----T------CCCGAAT-AAAATAAAATGAat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acctgctcattatattcattatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnca--C-----CA--TT-C-----TTT-AA-T---TAA---T--A------TAAT-TGC---ATAGT----CC---A-T---AT--A---TT-ATG--TCAAGT-T-TCAGT-TTGT-------------CATTTC--------AA----TATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A----TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatatattactatttaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--------------A---AT---AA---GGACCATATTG-G-AAA-C-AA-TCTG--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GTAT-TATT-C----C-T--A-T-TTTATTGAATCAGTATA-ATA--T-GA-T--TA------T---AT---TT----TATTTCCTG---T-----T--A----T--C-----GA--T--C-----TTC-AG-T---TAT---C--A------TAAT-TGT---ATAGT---GTT---ACT---T---A---TC-ATG--TCAGGT-T-TCAAT-TTGT-------------TATTCT--------AAGTTT-ATG--T----TC--AT--AAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TG-----C---A--CATGAAT-AAAATGAAATG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aCTCATTA-G-AA--A-AAAGCTATAAT-TTCA----GCTT-TAATTTAT-GGGT-AATC-C----T-T--A-G---------AT-----TT-ATA--T-AA----------------AT---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--TT-C-----TTT-GA-T---TGT---T--A---------------------------C---A-----G---A---TT-ATG--TAATTT-T-TCAAT-TTGT-------------GATTTT--------AA-CTTCATG--A----TC--AT--GTCCTAT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TA-----C---A--CCTGAAT-GAAATAGAATGA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttttgcctgttcatcatatttttcatgcaggT------TA--A-TT----------A-T-C-T-G-T--------------A---GT---AA---G-ACCCCATTG-A-AA--T-AA-ACTG--ATATTCA----GCTT-T----TAT-GGGT--ATC-C----T-T--A-G-GT------TT-----TA--TA--T-CA-T---A----------AT---GT----CAT-----G---TAAACTT--A----A--C-----CA--TT-C-----TTT-AA-T---TAA---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GCC---A-T---AT--A---TT-ATG--TCAG-T-T-TCAGT-TTGT-------------CATTTC--------AA----TATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGAa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atG-TT----------TT--AAA---ACA-GCTGT-AAATTCG-----TT-----TT----AG-CC---AGTAAAGC-AAGAGA--AG----CA-TCATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAAT-A--CT------ATTTT-TT---TTA--T-T------A-AAT-T-T-----AAAT--C-T-TAT-------T---CTTACCT----A----------TTAAATGA-----T-----A---------TGCACGAAATATG--C-AA---TTTT----T----C---A-A--T-GC------A---T---TAT-GC----------AA--C-TATT--T-AATTAAAAAAA-------A-CCT--GC-CA-A--A----A-TTCC--AA-TATTAG---TC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                            TGTGACTTTTTA-AATAAATTCTTTGGGCAAGCTAGT-ATTAAAC-GTTGA-TAACA-GAGCTACTCCATTA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtgtttgcaagcaacttattgcaagtaacccaaacaatgtcgaatgttcatatttattctaaatcaaggccctaaatagacccaacatttttaaaTTT-T------CG-GTGC-AATGT-CAAA--AAGGATCGA-AATACCT---AGCGT-TT--AG-AAGC--A-A---------------AACCGC----G--ACAGC-AAA---GTC--G------AG-T----------------------AAAGTTTTCA------------------CT----AG-CC---AGTAAGGC-A-TGGA--TA----TT-ACATG-A------A-----T-GTC------CAG--------------TTTTACAAGTAC--TT------A---T-TT---ATT--T-T------A-AAGAT-A-----AAAT--A-T-TAG-------C---CCT--TT----A----------TTTTAATA-----T-----G---------TGTTTGAAACATAT-C-CT---TTTT-------------A-A--C-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-TATTACT-CAC-------A-------A-CCT--GC-CA-A--A----A-TTTC--AA-TGTTAG---TCT-------T-G-T-A----TT----A-----T-----T-T---ATTA--T----------TT-------------T---TT--C-C-T--GT----T-A---AT----C--AC-ATGTAA------TA--T-AC----------A------------------------A---GC---TA---GGACTCCA---------------------AT-TTCA----GCCC-T----GA---GGT-TATCACAATAT-T--A---TC------AT-----TA-ATAAGT-CG-C--T------------T---TC----CAT-----G---T-----T--A----C--T-----TAATT--CT----TTT-AA-T---TGT---C--A-----A-AAT-TG---CACAGT---GGT---A-C---AC--A---TT-ATA--TCCGCT-T-TCCTT-TTGT-------------TATTTT--------GAA-TCCACA--A----TC--AT--GAC--AT--T--CCT-TGA---A-------------------------A-T--TT-T------catattaaagattaagacatgtttgatttcaaatactatatatatcgagcattaaccagttaatactaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaccacccgtaagattttttttcggtgcaatgtcaaaaaggatcgaaatacctagcgtttagaagcaaaaccgcgacagcaaagtcgagtaaagttttcactagccagtaaggcatggatattacatgaatgtccagttttacaagtacttatttattttaaagataaaatattagccctttattttaatatgtgtttgaaacatatcctttttaacgcattatgcaactattactcacaacctgccaaaatttcaatgttagtcttgtattatttattattttttcctgttaatcacatgtaatatacaagctaggactccaatttcagccctgaggttatcacaatattatcattaataagtcgctttccatgttacttaattcttttaattgtcaaaattgcacagtggtacacattatatccgctttccttttgttattttgaatccacaatcatgacattccttgaaattttcc
gi|30                         : gtgtttgcaagcaacttattgcaagtaacccaaacaatgtcgaatgttcatatttattctaaatcaaggccctaaatagacccaacatttttaaatgtgactttttaaataaattctttgggcaagctagtattaaacgttgataacagagctactccattacatattaaagattaagacatgtttgatttcaaatactatatatatcgagcattaaccagttaatactaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaccacccgtaagatttt------T---CTTAATATAT-T-TCA--TGGTTATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-C-ACTTA--AG-AAAAATAATACCGT-ACTAGAGGTGCTACCAACA-GTAA-TTAT--GTCATA-CAC-AAG-ATAAAAA-GGCAAA-GAATCCTCATG--T-T------TA-TTAT-AATGC-CACT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TTAGC-cc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ccatggTG-T-AA--T-AA-AC----AT-ATCC----G--T-T----GAT-GGGT-TATC-C----T-T--A-GGTT------AT-----TA------T-CA-----A------T---AT---GT----CGT-----G---T-----T--A----T--T-----CA--TT-C-----TTT-GA-T---TGT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GCT---G-T---AG--A---TT-ATG--CTAGGT-T-TCAAT-GCGT-------------GATTTT--------AAG-TTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TTA---T-------------------------A-T--TT-TA-----T---A--CCTGAATAAAAATGAAAT
gi|32                         :                                                                                                                                                                      aatatacctttgttatcatgaaTGTGAAAGTTTA-G-C----TCTTTGGGAA---T----GTTA-GA-GTTGA-T-ACA-GAGCCACTCAATTAAG------------------------TTTAATATAT-T-TCA--TGGCAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AA-AATTT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--T-AG---AGGTGCTA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acataaaataaagtgattagattattctaaacctaggtcctagaaccagtatttctCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAAATTGG-AATACTAAAATGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTG-TAAAGTCGT----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGT--AG----TT-TCATG-ATG-CC-A-----T-ATC------CAG--------------TTTTGTTGATAT--TT------A---T-TT---TTA--T-T------A-AA--T-C-----AAAT--C-C-TAG-------
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T------TA--T-TT----------A-T-T-TTA-T--------------AAACGT---GA---G--CATCATTA-C-AA--T----TCTT---T-TTCA------TT-T----CAT-AT-T-TATC-C----T-T--AAG-TT------AT-----TA--TA--T-CA-T--------------------------AT-----A---T-----T--A----T--C-----TT--T--T-----TTT-AAAT---TAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GCT---A-T---A---G---AT-ATG--TCAGGT-T-TC------------------------------------AGTTTTATG--A----TC--AT--GAC--AC--T--CTG-TGG---T-------------------------A-T--TT-TA-----T---G--TCTGAAT-AAAATGAAATGtcttac
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tacat-----TTT-AA-T---TTC---TTAA-----ATAAT-TGC----TAGT---GCC---A-T---AG--A---TT-ATGCGTCAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GATTTT--------AAG-TTTATG--A----TCCTCT--GA---AT--T--GGGCTGATTTT-------------------------T-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAATCGAAATGA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtgttattcttttaaatactttttaagttcttgtttatctgttgttgcaagtatggtgactATTG-G-AAA-T-AA-GCTG--AT-TTTAAATAGCTA-T----TAT-GGAT-TATC-C----T-T--AGG-TT------AT-----T--GTA--T-CA-T--TATACATGT---AT---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--CTG---CA-----C-----TTT-AG-T---TAT---T--A-----A-AAT-TG---CATATT---GCC---A-T---AG--A---TT-ATA--TCAAGT-T-CCAGT-TT-T-------------G----------------------G--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTa
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtgtgaaattt-ATA--T-CA-T--TA------T---AT---GT----CAT-----G---T-----T--A----A--CTTAATCA--TA-C-----TTT-AA-G---TAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GCC---A-T---A---GC--TT-ATG--CCAAGT-T-TCATT-TTGTCATTTCAAATTTTAATTTT--------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATct
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -------A-CCT--GC-C--C--ACAGTA-TCTCTTAA-TA-TA----TCT-------T-A-T-A----TC----AGTAAGT-----ATA---ATTAGTT----------TTG--------TA--T--AGT----A-T--AT------AT-CAT----T--AT-TTG-AT------TG--T-TT----------A-T-T-T-G-TGGAAGTACAGTTGTA---GT---AA---GTAACCCATTG-G-AA--------CTG--AC-TTCA----GCTT-T----TGT--GGT-TATT-C----T-T--AGG-TT------A
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---GC----CAC-----G---T-----A--A----T--C-----CA--TT-C-----TTT-AA-T---TAT---T--GTT---ATAAT-TGC---ATGGT---CCT---A-T---AT--A---TT-ATG--TCAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GATTTT--------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--A--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TA-----C---A--CCTGAAT-AAAATGAAATG
gi|4                          :                                                                                                                                                                         cagacacatttccacacagTGTGATATTTCA-GAC----TCTTTGA-CA---T--T-GCAAAAA-GTTGA-TGACA-GAGCTAATCAATTAAGATT-GAACC----T------TAT-TTTAATATAT-T-T-A--TGTTAAAGCACCG--CACT-ATTTTT-GTG-------AT-CAATT-C-G-T-ACTAA--AT-AATGATAATGC--TTG----AAGTGCTACCAACA-ATA---T-T--GTTATA-GGT-AGG-AT-AAAA-TAAAAA-TAATC------TTT-T------TG-ATAA-AAT----ATT--AAGAAT------TACTT--------------------------------------------------G--TCAGC-AAA---GCA--A------AG-TT----------TG--AAA---AAAAGCTGT-AAAGTCGT----TA-----TT----AG-CCTCTAGTA---C-TTTGGA--AG----TC-GCATG-ACG-TC-A-----A-GTC------CAG--------------TTTTGGTACTTC--TT------A---C-TT---T-A--C-T------C-TA--T-C-----AAAT--C-G-TAG-------TTATATT--TT----A----------AA-----A-----T-----A---------TGTGCGAGCCATGA-C-AT---TTGT---------C---A-A--T-GC---ATTA---TACATGT-AC----------AA--C-TATT--T--GT----CAAA-------T-CCT--GC-TT-A--A----A-CTAG--AA-TGCTA------------------T-A----CT----A-----------A-T---CTTG--T----------TT-------------T--ATT--C-AAT--GT----T--C-TGT----C--TG-TTG-AT------CACAT-TC----------A-C-TAT-G-T--------------A---ATCATAA---GAACCCTATTG-G-AAA-T-AA-GCTA--AA-TTCA----GCTT-T----TTTTAAGT-TATT-C----T-A--A-GGTT------AT-----TA--TA--T-CT-T--TA------C---AT---GT----CAT-----G---A-----T--A----T--C-----CA--T------------AA-T---AATA--T--A-----ATTAT-GGCTGCATAGT---GCT---A-C---AG--A---TT-ATA--TCATGT-T-TCAAT-TTGT-------------GATTTT--------AAA-TTCATA--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTC-TGA---T-------------------------A-T--TT-TA-----C---A--CTTGAAT-AAAATAA
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acagcaaagttgtgagatttattctatatctatgtcgtagagtaagtgtttctA-GGCAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAAATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ATA--A------AG-TT----------TT---AA---AAAATCTG-TGAAGTCGT----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-gcc
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tcaaaatgtagctgtTA--T-CA-T--TA------T---AT---GT----CAT-----GATAT-----G--A----T--C-----CA--TT-C-----TTT-AA-T---TAT---C--A------TAAT-TGCA-TATAGT---GTC---T-T---AG--A---TT-ATG--TCAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GATTTT--------AGGTTTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --T-CA-T--TA------T---AT---GT----CAT-----G---T-----T--AACT-TAAC-----CA--TA-C-----TTT-AA-T---TAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GCC---A-T---AG--A---TT-ATG--TCAAGT-T-TCATT-TTGT-------------CATTTT--------AAG-TTTATT--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTAAAT-AAAATGAAATGA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --A----T--C-----CA--TT-C-----TTT-AA-T---TACATGT--ATT---GTAAT-TACA-TATACT---GCT---A-T---ATAGA---TC-ATG--TCAGAT-T-TCAGT-ATGT-------------GATTT---------AAGTTT-AGG--A----TC--AT--GAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TTACTACT---A--CCTGAAT-AAGATGAAATGA
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taGAGA--AG----TC-ACATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTTTTAATAC--AT------A---T-TT---TTA--G-T----------------------------C-TTC-------C---ATT--TT----A----------AG-----A-----T-----T---------TGTCCGAATTATAT-A-AT---TTTT---------C---A-A--T-GC---A------T---TAT-AC----------AA--C-TATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GCAA--A--A----A-TTCC--TA-TACT
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -ATA--T-CA-T--TA------T---AT---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CAT-T--C-----TTT-AA-T---TGT---T--ATACATGTAAT-TG---CAGAGT---GCT---A-TG--G---A---TT-GTG--TCAGGT-T-TC------------------------------------AGTTTTGTG--A----TT--AT--GAC--AT--T--TTG-TGA---T-------------------------A-G--TT-TA-----C---A--CTTGAAT-GAAATGGAATGA
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               t--T--C-----TTT-AAAT---TATG--T--ATGTGTATAATCTGA--CATGGT----CCTATA-T---A---A---TT-ATG--TCAGGT-TATCATGGTTGTT------------GATTTT--------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--A--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-A------TAACA--CCTGAAT-AAAATGAAATG
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           catTTT----T----T---A-A--T-GT---A------T---TAT-GC----------AA--C-GATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----AGTTTC--AA-TACTAG---TCT-------T-G-C-A----TT----A-----T-----A-A---ATCA--T----------TTA--------AAATT--ATT--TAA-T--ATTACAT-AT-TAT----T--AT-TT
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tcctgctgtatccccagagagagaA--T-CA-T--TA------T---AT---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--TA----TCT-AA-T---AAT---T--------ATAAT-TG---CATAGT---GCC---A-T---AG--A---TT-ATG--TCAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GATTTT--------ATG-TTTATG--------------------AT--T--CTG----------------------------------------------------A--CCTAAAT-AAAATAAAATG
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aa-----T--A----A--C-----CA--TA-C-----TTT-GG-T---TAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GTC---A-T---AG--A---TT-ATG--TCGGGT-T-TCATT-TTGT-------------GGTTTT--------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AA--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------TT--A--CCTGAAT-AAAATGAga
gi|5                          :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTA-CAC----GCTTTATGCA---T----GTTAAGA-GTTAA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATT-G---------------T---TTTGATATAT-T-TCA--TGATAATGAACCA--AGCT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATC-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC----A----AGGT-CTACCAATA-ATA--TT-A--GTCATA-CAC-AAG-AT-CAA--GGCAA--GAATCCTCATGATT-G------TAATTAT-AATGT-CATT--AA-GATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------A-CAGTT---G--TCAGC-AAA---ACG--A------AG-TT----------TA--AAA---AAAGGCTGTTAAAGTCGA----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-TCATG-ATG-CC-A-----T-ATC------TAG--------------TTTTGTTGAT-C--TT------A---T-TT---TTA--T-T------G-AA--T-T-----AAAT--G-C-TAG-----------GTT--CT----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAACATTT-C-AT---TTTT----T----C---A-A--TAGC---A--A---T---TAT-GC----------AA--C-CATT--T-TAT----AAAA-------G-TCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AG-CACTAG---TCT-------C-G-T-A----TC----A-----T-----A-A---ATTA--T----------CCA--------AA--T--ATT--T-A-T--AT----T-AT-TAT----T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------A-T-T-T-G-C--------------A---GT---AA---GGATCCCATTG-G-AA--T-AATTCTG--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TATC-T----T-T--A-G-TT------AT-----TA-ATA--T-CA-T--TA------T---AT---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--A-----TTT-AA-T---TAT---T--A-----ATAAT-TGC--CATAGT---GCC---A-T---A---A---TT-ATG--T-AGGTGT-TCAGT-TTGT-------------GATTTT--------AAGTTATATC--A----T----T--GAC--AT--TG-ATG-TGA---TCATTATGATCATGACATTATGTGATA-T--TT-T------T---A--CGTGAAT-AAAATTAAATAAcga
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --CATAGT---GCT---------------------TG--TCAGGT-T-TCAAT-TTGT-------------GATTTC--------AAG-TTTACG--ATCATTC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-G--TT-TA-----C---A--CCTGAAT-TGAATGAA
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cccattattttaaaatgctggatatgATA-T---GCC---A-T---AG--A---TT-ATG--TCAAGT-T-TCATT-TTGT-------------AATTTTT-------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AGAATGAAATGAgg
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttttcagcaacatgtttaatAAAATAATAC--T-AT---ATGTGCTTCCAATA-ATAA-TT-AATGTCATA-CCC-AAG-AT-CAAAAGGTAAAAGAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGCTTATT--AAAGATT-G-AATACTa
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               g-CC---AGCAAGGC-ATGGGG--AG----TC-ACATACACG-CC-A-----T-AGA------CAG--------------TTT--------------------------------A--T-T------ATAA--T-T-----CAAT--C-T-TAT-------T---ATT--TT----A----------AA-----A-----T-----A---------TGTTCGAAACTTGT-C-AT---TTTT----C----TAAGA-A--T-GC---A--A---c
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAATAATAC--T-AT---ATGTGCTTCCAATA-ATAA-TT-AT-GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGTAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATACTc
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     g-ATA--T-CA-T--TA------T---AT---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----TAATT--C-----TTT-AA-T---TAA---T--------ATAAT-TG---CAT--T---GTC---A-T---
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           t---A-T---AG--A---TT-ATG--TCAGGT-T-TCAGT-TTTT-------------GATTTT--------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--TAG--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---G--CCTGAAT-AAAATGAAATGAtcattgtaacaatcacccaacttagtaagagactatgatc
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agCATG-ACA-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTGA------T------A---T-TTAAAAAA--T-C------A-AA--T-C-----AAAT--C-T-TAA-------T---GTC--TT----
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                               ----T------T---TTCAATATAT-TGTCA--TGGTAATACACCCCTAACT-ACCTTTTGTG-------A--AAATT-A-AATGACTAA--AT-AAAAATAATAC--T-A----GGGTGCCACCAATATACAA-TA-T--GTCA-A-CCC-AAGTAT--AAA-GGCAAA-GAAT-CTCATG-TT-T------TA-TTAT-AATGC-C-TT---AAGATT-G-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-AC--------------AACGTTT---G--TCTGC-CAA---ACAAGA------GG-TT----------TT--AAA---AAAAACCCTTAAAGTCAT----TT-----TTTATAGG-CCA--AGCA--GC-AAGGGATCGT----TT-TCATG-A-G-CC-A-----TAATC------GAA--------------TTTTTGTGATAC--TT------A-----TT---TTG--T-T------T-AA--T-T-----AAAT---------------------TT--TTATA-A----------TT-----A-----T-----A---------AGCTCGAAACA-GT---A----TTTT----T----C---A-A--T-GC------A---T---TAT-GC----------AA--C-A--C--T-CAT----AAAC-------A-TCT--GC-C--A--A----A-TTCC--A---AGTAG---TCT-------C-G-C-A----TT----A-----T-----A-------TA--T----------TT---------AA--T--A-T--C-A-T--A-----T-AT-TAC----T--CT-TT--AT------TA--T-TCA---------A-T-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GGAATTCATTG-G-AA--T-AA-GATG--AG-GTCA----GC-T-G----TAT-GGGT-TATC-C----T-T--A-G-TT------AT-----T--ATA--C-AA-T--T-------T---ATG--GT----CAT-----G---T-----T--A-------A-----CA--TAAC-----TTT-AA-C---T-T---T--------ATAAT-TG---CATAGT---GCC---A-T---A---G---AT-ATG---CAAGT-T-TTATT-ATGT-------------AA-TTT--------AAG-TTTATG--A----TC--AT--GAC--ATTGT--CT--TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTAAAT-AAATTGAAATGA
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaccatgG--A----TT--AT--GAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TC-----C---A--CCTGAAT-GAAA
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---TTT-----------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAattttaagacatgaa
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---TTT-----------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAtg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GG-AATACTT---TGC------------------A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--G------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTG-TAAAGTC-T----TC-----TT----AC-CC---AGCCAGGC-TAGGGA--AG----TTGTCATG-ACG-CCAA-----T-ATC------AAG--------------TTT-----GT-C--TT------A---CGTT---TTA----A------A-AA--T-T-----Atg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAAACATGT-C-AT---TTTT---------C---A-A--T-GC---A------T---TAT-GC----------AAA-C-CATT--T-CAT----CACA-------A-CCT--GC-C--A--A------TTCC--AA-TACTAG---TGT-------C-G-C-A----TT----A-----T-----A-A---ATTA--T----------TT---------AA--T--ATT--T-A-T--ATATA-T-AT-TAT----T--GT-TTG-AT------TA--T-TT----------A-T-T-T-G-T--------------A---GN---NN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NGA--CA-------------G-G-TT----------------ATA--T-CA-TTATA------T---AT---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CAT-T--C-----TTT-AA-T---TAT---T--------ATAAG-TG---CACAGT---GCC---A-T---AT--AAC-TT-ATG--TCAAGT-T-TCAGT-TTGT-------------GATTTT--------AAG-ATTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------ATT--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGAtagagaacagaagaacagaatgtttatttctaatcagagtccaaaacagacaaagtgagttcataacaacattagaagattatatgcttgaaacatgtcatttttcaatgcattatgcaaaccatttcatcacaacctgccaattccaatactagtgtcgcattataaattatttaatatttatatatatattattgtttgattatttatttgtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaggttatatcattatatatgtcatgttatccattctttaattattataagtgcacagtgccatataacttatgtcaagtttcagtttgtgattttaagattatgatcatgacattctgtgatattttttacctgaataaaatgaaatga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                             ggaatactttgcaaacagttgtcagcaaaacagagttttaaaaaaagctgtaaagtcttcttacccagccaggctagggaagttgtcatgacgccaatatcaagtttgtcttacgttttaaaaattatagagaacagaagaacagaatgtttatttctaatcagagtccaaaacagacaaagtgagttcataacaacattagaag--GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGCAAG-GAATCTTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAA-------------C---TGCCA-TT--A--AAAT--G-G---------------AATAGTTTTAG--CCACC-AAA---GCA--A------GG-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatGCCATTAAAATGGAATAGTT-----TT----AG-CC---ACCAAAGC-AAGGGA--A------T-TCAT--ACG-CC-A-----T--------------------------------TTGATGC--TT------A---T-TT-----A--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGTCTA---C---GTTG-TT----AAAA-------TC-----A-----T-----A---------TGCTT-AAACCTGT-C-AT---TTT----------C---A-A--T-GC---A--A---T-------GC----------AA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-ATCC---A-TGCTAT---TCT--------------------------------------A---ATTA--T----------T----------AG--T--ATT--T-T-T--AA----T-ATATAT----T--AC-T---AT------TA----AT----------A-T-T-N-N-N--------------N---NN---NN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NNNN-NNNN-N----N-N--N-N-NN------NN-----NN-AT----------------------------GT----CAT-----G---T-----T--A----A--C-----TA--C--CATACGTTA-AA-T---TATA--T--A-----TTAA--TG---CATA-T---TCC---A-TGAAA---A---TC-AT---TCAAGT-T---AAT-TAGT-------------CA-TTT--------AA--TTGATG--A----TC--A---GAC--AT--T--CTG-T-A---T-------------------------A----TT-T------G---A--CCTGAAT--AAAT-AAATGgaattcatacgccatttgatgcttatttattaaattaaatcctagtctacgttgttaaaatcatatgcttaaacctgtcattttcaatgcaatgcaacaatttcataaaaacctgccaaaatccatgctattctaattattagtatttttaatatatattactattaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtcatgttaactaccatacgttaaattatatattaatgcatattccatgaaaatcattcaagttaattagtcatttaattgatgatcagacattctgtatatttgacctgaataaataaatg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aatgtcatacccaagatcaaaggcaaggaatcttcatgtttttattataatgccattaaactCTGT-AAAGTCCA----TA-----TT----AG-CC---AGTAAGAC-AATGGA--TA----TT-ACATG-ATA-CC-A-----T-GTG------CAG--------------TGTTGTCAAT-TA-TT------A---T-AT---TTA--CAC------A-AA--T---------AT-------AG-------C---CTT--CT----A----------TT-----A-----TGAAATA---------TGTTTGAAACTTAT-A-AT---TTTT----CGACGC---A-AAAT-GC---A--ATATT---CAT-TC----------AAAAC-C-TT--T-CA------AAACTCTTGTA-TTT--GC-T--ATTA----G-TTGT-----TGTTTG---TCTGTTTTTTC-A-T-ACTTCTT----A-----T-----GTA---ATTA--TAGGGATCCCATTG--------AA--C--ATT--TTA-T--AT----C-AT-TGTATGCC--AT-GTT-ATCCATCATA--C-TT----------A-TCT-T-G-T--------------A---AT---TA---------CA--A-G-AA--T------TA--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TACC-C----T-T--A-G-CT-----------------TA--T-CA----TA------T---CT----T----CAT-----T---C-----T--A----T--------CA--T--T-----TTT-----------------------ACAAT-TG---CATAGT---ACT---A-T---ATAGA---TT-ATG--TCTGGT-T-TCAAT-TTGT-------------CATT------------------TG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTC-TAA---T-------------------------
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|57 ): TCAATTGCATAGTGCTGAGACTATGCGACATATTCCAATCCTTTTAATTTTATATTCATTTTATGCCATTTTATACCAAAATAAAA
Unaligned ( gi|58 ): ACATTTTTTCAAAGTTTTCTAAACGTTCATCTTATCCTTCGCCATAATGGTTGATGTAGAGAG
Unaligned ( gi|61 ): AATATTAAAGAAATGATTATCCATTCTTACGGTTTGGTTTCAATATTT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                        11111111              2222                                       666666666666666666666                               11               1111111                                         2222                      2222                                                                                                                  222222222222222                                          111111111111111             11     1111111                                                                       111111   22222222222222        22222222222222222222        1111111111111                        55555555555555555555555555555555555555555                                            11111111111111       2222222222          1111111111                                           11                                                             2222222222222      2222222222222222222222222        111       111111                                    1111111111          11111111111111                              11111111                                                     11111111111111111111                                                           1111111        22222222222                  222222222       2222                                                                                    1                                            1111111111111111111111111         111111                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                        33333333          888 7777       5     5     5                   111111111111111111111          4 4   66             00    4      4   7777777 77     555 4 4     55  4           44 3 7777              4   77  0000      3   6   3  55   3      6           4  2 777777  2    2     2    33       0 2       555     2  33  2    5555 000000000000000       555 33     2   555   33 888888  2  222222222222222  555   0    88     2222222  66666  5555  2  666        2      33  5555  33    2 0 4  2 55555 2   222222   00000000000000        66666666666666666666  555   0000000000000  44 6666666    777777  33333333333333333333333333333333333333333 88888 44444 777777777              1 1     11111111111111 1  1  6666666666 333   1  0000000000  22 22   22 4   4444    6666666 2   22  2 22 22 4444 8    22222      333   8888888  2 2 4444  4444 55555 4444444444444   22 5555555555555555555555555 22  22 555 1 22  333333  1   4444 44  1   2  555555  3333  1111111111  1 1 1 1 22222222222222 333  333  66666         222  22222222 1 22  1    3333    1 3333   1    1    1 3333 1 33 3 88888888888888888888  11 1  1 11  11 222 333333 333  2222   33333 222 33333 11 3333333 44444  55555555555   1  2 111   555 555555555    1  7777     111  11 1  11 33  22     11 11     1 1   1 1    77777777777777 1    66666666   7  6   11 2222  11  11   11  11 22   2   111 2222222222222222222222222 2 11  1 444444 222 11       1            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                        ........          ... ....       .     .     .                   .....................          . .   ..             ..    .      .   ....... ..     ... . .     ..  .           .. . ....              .   ..  ....      .   .   .  ..   .      .           .  . ......  .    .     .    ..       . .       ...     .  ..  .    .... ...............       ... ..     .   ...   .. ......  .  ...............  ...   .    ..     .......  .....  ....  .  ...        .      ..  ....  ..    . . .  . ..... .   ......   ..............        ....................  ...   .............  .. .......    ......  ......................................... ..... ..... .........              . .     .............. .  .  .......... ...   .  ..........  .. ..   .. .   ....    ....... .   ..  . .. .. .... .    .....      ...   .......  . . ....  .... ..... .............   .. ......................... ..  .. ... . ..  ......  .   .... ..  .   .  ......  ....  ..........  . . . . .............. ...  ...  .....         ...  ........ . ..  .    ....    . ....   .    .    . .... . .. . ....................  .. .  . ..  .. ... ...... ...  ....   ..... ... ..... .. ....... .....  ...........   .  . ...   ... .........    .  ....     ...  .. .  .. ..  ..     .. ..     . .   . .    .............. .    ........   .  .   .. ....  ..  ..   ..  .. ..   .   ... ......................... . ..  . ...... ... ..       .            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                        22222222          888 4444       0     0     0                   000000000000000000000          4 4   11             66    4      0   0000000 77     555 0 0     55  0           66 3 1111              0   22  1111      3   7   3  88   1      2           1  7 777777  5    5     5    44       4 5       000     9  99  9    8888 777777777777777       000 99     9   444   99 222222  7  666666666666666  000   1    22     7777777  22222  3333  4  555        4      22  0000  44    2 5 4  2 66666 2   888888   33333333333333        33333333333333333333  888   9999999999999  55 4444444    444444  99999999999999999999999999999999999999999 11111 88888 666666666              8 8     88888888888888 7  7  5555555555 333   9  2222222222  66 99   99 2   5555    5555555 0   88  0 88 88 2222 0    88888      333   5555555  0 0 2222  2222 00000 8888888888888   88 1111111111111111111111111 66  66 555 9 66  444444  9   0000 55  9   0  222222  9999  6666666666  8 8 8 8 00000000000000 000  000  99999         999  99999999 2 33  7    5555    7 5555   7    7    7 5555 7 88 2 66666666666666666666  88 3  3 88  88 333 888888 555  7777   22222 333 11111 77 0000000 66666  44444444444   1  2 999   333 222222222    1  1111     888  44 0  44 88  88     44 44     0 0   7 0    99999999999999 0    99999999   1  0   33 0000  33  33   33  33 33   0   777 4444444444444444444444444 0 44  0 666666 999 44       1            
consensus                     :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTA-GAC----TCTTTGGGCA---T--T-GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATT-GA--C----T------T---TTTAATATAT-T-TCA--TGGTAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--T-A----AGGTGCTACCAATA-ATAA-TT-N--GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTGTTAAAGTCGN----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-NCATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAAT-C--TT------A---T-TT---TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAG-------C---GTT--TT----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAACATGT-C-ATTTT----T-C-------A-AT-GC---A--A---T---TAT-GC----------AA--C-NATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TACTAG---TCT-------CG-T-A----TT----A-----T-----A--A---ATTA--T----------TTA--------AA--T--AT--T-T-A-T--AT----T-AT-TAT----T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GGACCCCATTG-G-AA--T-AA-GCTG--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TATC-C----T-T--A-G-TT------AT-----TA-ATA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--C-----TTT-AA-T---TAT---T--A-----ATAAT-TGC--CATAGT---GC--C-AT--A--GA--TTATG--T--CAGGT-T-TCANT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAGTTTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
Reference ( family-4676 )     :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTA-GAC----TCTTTGGGCA---T--T-GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATT-GA--C----T------T---TTTAATATAT-T-TCA--TGGTAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--T-A----AGGTGCTACCAATA-ATAA-TT-N--GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTGTTAAAGTCGN----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-NCATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAAT-C--TT------A---T-TT---TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAG-------C---GTT--TT----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAACATGT-C-ATTTT----T-C-------A-AT-GC---A--A---T---TAT-GC----------AA--C-NATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TACTAG---TCT-------CG-T-A----TT----A-----T-----A--A---ATTA--T----------TTA--------AA--T--AT--T-T-A-T--AT----T-AT-TAT----T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GGACCCCATTG-G-AA--T-AA-GCTG--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TATC-C----T-T--A-G-TT------AT-----TA-ATA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--C-----TTT-AA-T---TAT---T--A-----ATAAT-TGC--CATAGT---GC--C-AT--A--GA--TTATG--T--CAGGT-T-TCANT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAGTTTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTACAAG----TCTTTAGGCA---T--T-GTTAAGATGTTGAATG-CATGAGCCACT-AATTAAGATT-AA--C----CGTATGGT---TTTATAATAT-T-TCAAGTGGTTAT-CTCCAC-AACTGACTCTT-GTG-------AA-AAATT-TTG-T-ACTAAGAAC-AAAAATAATAC--T-A----AGGTGCTACAAATA-ATAA-TT----GT-ATAGCCCAAAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCGCTTGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATTAAAAAAATTGGAAATACTT---TGCCT-TT--AGAAGAC----A---------------AACAATT---GTCTCAGC-AAAGACACA--A------CGATTATAACAAAAATA--AAA---AAAAGCTG-TAAATT-------TT-----TT----AGCCC---AGCAAAGCAAAGAGG--AGATGTTT-TCATG-ACGACC-AATGCGC-GTCTTGAAACAGGAGAGGA-------TTTTGGCAGT-T--TT------G---T-TTG--TCAAGT-TGCGGGAA-AA--TATGTTTAAAATTAC-C-AAG-------A---GTT--CT----AGCTGTGT---TT-----A-----T-----AAAATTATACTGCTT-AATCATGTACAATTTT----TGC-------A-AT-GC------A---T---TATGGC----------AA--CAAATT--T-CAT----AAAA-------AGCCT--GC-CCAA--A----A-TTC----A-TAC-AG---TCT-------CG-C-A----T-----------T-----A--A---GTTA--T----------T----------AA--T--A---T-T-A-T--TA----T-AT-TAC----T--AT-TTG-AT------TA----TT----------AC-T-T-GTT--------------A---GT---AA----GACCCT-TTG-A-AAATT-AA-GC-G--AT-TTTA----GCTT-T----T-T-GGGT-TATC-C----T-TTAG-G-CT------AT-----TATATC--T-CATT--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----A--C-----CA--TA-C-----TTTAAA-T---TAT---T--A-------AAT-TGC--ATTAGT---GC--CAAT--A--GA--TTATG--T--CAAGT-T-TCATT-TTAT-------------GA-TTTT--------AAG--TTATG--A----TC--AT--CAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|10                         :                  aatgactttatgttctggctttaatacacattgccttattttgattatgcctgctttcttcaatggtaatgtggtagtggcaaacaattcaaatagaattgcagttacaaacaaaatataagttgttagatttatcttctgaaatctaggtctacgaaactccaagtttaatttctATTCTA-GAT----TATTTGATCA---T--TTGTTAAGA-GTTGG-AGACA-GAGTTACTAAATTAAGATT-GA--A----TCATA--T---CTTGACTTGT-T-TCA--TAGTAACGTGCCA--AATT-ATCTTT-GTGTCTTAGTAT-CAA-----G-C-ACTAA--AC-AATAATAATAC--T-AG---AATTGCTACCAATA-AGAATTT-T--GTCATA-CCT-TAG-AT-AAAA-GGCAAGTGAA---------TT-T------TA-TTCT-A-----CAT--------TTG-------TT---TGCCT-TT--AA-AAACTTACA---------------AAC-GTT---A--ACCAC-AAA---AAA--AGAGTTGGG-TT----------TTCCAAAAACAAAAGCTGTAAAACTAGA----TTATCAATT----AA-TT---TAAAAGAC-AAAGAA--TG----TT-ACATA-ATG-GT-A-----T-TCT------CAG--------------TACTGTTA---C--TT----------T-TT---TCA--T------------------------------C-TA-------------TT--TC----AC---------TT-----AAAAATC-----A---------TGTCTGAAACGTGT-C-ATTTT----CGC-------A-AT-G
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggcTA--T-T------T-AA--T-T-----AAAT--C-CCTAGTCTTTGAC---GTT--TTTAAAA----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAAACATGT-C-ATTTT----C-C-------A-AT-GC---A------T---TAT-GG----------AA--C-AATT--TTCAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TGCTAG---TCTC------CG-T-A----TT----A-----T-----ATTT---ATTA--T----------TT---------AA--T--AT--TAT-A-T--AT----T-AC---T----T--AT-TTG-GA------TA--T-TTA---------AT-T-T-G-T--------------A---GT---AA----GACCCCATTG-G-AAATT-AA-GC-G--A---TCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TATC-T----T-A--G-G-TT------AT-----TAGAT---T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----TAAA----TA-C-----CA--TTAC-----TTT--A-T---TAA---T--T-----ATAAT-TG---CATAGC---GC--C--T--A--G---TTAT---T--CA-AT-T-TCATT-TTGG-------------TA-TCTTTTTTAAAAAAG-TTTATGATA----TC--AT--G-C--AT--T--CTGCCGA---T-------------------------ATT--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAATTGa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              a-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGTCTTGA-C---GTT--TTTAAAA----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAAACATGT-C-ATTT-------C-------A-AT-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCTTGGC-C--A--A----A-TTCC--A--TGCTAG---TCT-------CGCT-A----TT----A-----T-----T--ATTTATTA--T----------TTA--------A---T--AT--T---A-T--AT------AT-TAC----T--AT-TTG-AT-------A--T-TT----------AT-T-T-G-TT-------------A---GT---AATTGAGACCCCATTG-A-AA--TTAA-GCTG--AT-T-CA----GCTTCT----TAT-GGGTGTATC-C----TAT--A-GGTT------AT------A-AGA--TTCA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--AAAC-TAAC-----CA--TTAC-----TTT-A--T---TAT---T--A------TA-T-TGC---ATAGC---GC--C--T--A--G---TTATG--T--CAATT-T-TCATT-TTGT-------------CA-TTTTTTAA----AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-CGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttT---TTA--T-C------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGTCTTA--C---ATT--TT----AAAA-------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAAAATGT-C-ATATT----T-C-------A-AT-GT------A---T---TAT-GC----------AA--C-CATT--T-CAT----AAAA-------A-CCA--GC-CA-A--A----A-TTCC--AG-TACTAG---TCT-------CG-T-A----TC----A-----T-----A--A---ATTA--T----------TT---------AA--T--ATTAT-T-G-T--TT----T-AT---T----T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GG---NN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NNNN-NNNN-N----N-N--N-N-NN------NN-----NNTATA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CAT-T--C-----TTT-AA-T---TAT---T--------ATAAT-TG---CATAAT---GC--C-AT--A--TA--TTATG--T--CAAGA-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAG-TTTATG--A----TC--AT--GAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGATT-AAAATGAAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --GTCATA-CCT-AAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCATG-TT-T------TA-TTTTAAATGC-CATT--AAAGATTAG-ATAACTT---TGCCT-TTAGAG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCTGCAAAA---ACA--A------AG-TT----------TT---AA---AAAAGTTGT---AGTCGT----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AATGGA--AG----TT-TCATG-ACG-CC-A-----T-ATC------GAG--------------TTTTTTTA-------------------------TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--TGA-TA--------C---GTTG-TT----ACTTCGCCATTTT-----A-----T-----A---------TCCT--AGTCCTA--C-GTTTTAAAAT-C-------ATAT-GCTCGA--A---A---TAT-GTCATTTTCCTGAA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TACTAA---TCT-------CA-C-A----TT----A-----T-------------TTA--T----------TT---------GA--T--A---T-T-A-T--AA----T-A---------------------------------TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GT---AA---AGACCCCATT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A-TTGC-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATGCTT---TGTCTGTC--AG-AAAC--A-ACTTATGCAATATCATAACAGTT---G--TCGGC-AAA---GCT--A------AG-TT----------TT--TAA---AAA-GCTGT-AAAGTCGC----TA-----TT----AG-CC---AGCAAGAC-ACGTGA--AG----TC-ACATG-ACG-TC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAATAC--AT------A---T-TT---TTA-----------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGCCCTA--C---GTT--TC----AAT--------TC-----A-----T-----A---------T--CCGAAACATGC-C-ATTTT----C-C-------A-AT-T-----------T---TAT-GC----------CA--C-TATT--T-CAT----CAAA-------A-CTT--GC-CA-A--A----A-TTCC--GA-TACTAA---TCT-------TG-T-A----TT----A-----T-----A--A-----TA-------------GTA--------CA--TGCAT--T-T-A-TTCGT----TAAT-TGT----TG-GT-TTG-GT------TT--T-TT----------TT-T-T-A-T--------------A---AT---
gi|16                         :                                                                                                                                                                  gcaatgggtttttttgttctccaatgTGTGAACTTCTA-GAC----TCTTTGGGCA---T----GTTAAGA-GTTTA-TGACA-GAGCCACTCAACTAAGATT-GAACC----T------TGTTTTCAATATAAAT-CCA--TGGCAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--ACAAAAAATAATAC--T-A----
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              actcctaagaccttagatttttatacagaatgcattcttgcctaaggattttatgttctgctttgatcaagttattttttatatgaagctccaatttggaagttttttaggcaataaatttgaacatagattgtaaagttgatccttagcaaaaataaagttgtccagatttattctaaatcttggtcctagaaccaggatttct----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAA-GTGT-C-ATTTT----T---------A-AT-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-AATT--TTCAT----AAAA-------A-CC---GC-C--A--A----ACTTCC--AAATACTATCACTCT-------CG-CGA----TT----A-----TTTATTA--A---TTTA--T----------TTACTTTATTTAA--T--AC--T---A-T--AT----A-GT-TAC----TTAAT-TTG-AT------TA--TCTT----------AT-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GTACCCCATTG-GAAA--T-AA-TCTG--AT------------------------AGT-TAT-------T-T--A-A-T------------------TA--T-CA-T--TG--T---A------T---GT----C-T-----G---T-----A--A-------------CA-------------T-AA-T---TA-------A-----G----------CATAGTGGGGC--C--T--A--AATTTTATG--T--AACG--T-TCATT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAG-TTTATG--A-----C--AT--GAC--AT--T--ATG-TGA---T-------------------------A-TTCTT-T------T---A--CCTGAAT--AAATGAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgatagtattgggtttgctcctacaT-----A-----T-----A---------CACTCAAAACATGC-C-ATTTT----T-C-------A-AT-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-TATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----AATTTC--TA-TACTCA---TCT-------TG-T-A----TT----A-----T-----G--A---ATTA--T----------TTA--------A---T--AT--T---A-T--AT----C-AT-T------T--AA-TTG-AT------TG--C-TTGTGAAAGTATAT-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GAA-----------AA--T-AA-GCTG--AT-TTCA----GGTT-T----TAT-AGGT-TATC-C----T-T--A-GGTT------AT-----TT--TA--T-CA-T--TT--T---A------C---GT----TAT---------------T--A----T--C-----CA--TT-C-----CTT-GA-T---TAT---T--A------TAAA-TGC---ATAGT---GC--T-AT--A--GA--TTATG--T--CAGGT-T-TCAGT-TTTT-------------GG-TTTT--------AAG-TTAATG--G----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TAA---T-------------------------A-T--TT-G------T---A--CCTGAAC-AAAATGAAAga
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGT-C-ATTTT----T-C-------A-AT-GC---A------T---TAT-GC----------GA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----AATTCC--AA-TGCTAG---ACT-------AG-T-A----TT----A-----TTTAT-A--T---ATTA--T----------TTA--------A---T--AT--T---A-T--AT------AT-TAC----T--AT-TTA-AT------TN--N-NN----------NN-N-N-N-N--------------N---NN---NN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NNNN-NNNN-N----N-N--N-N-NN------NN-----NN-NNN--N-NN-N--NN--N---N------N----T----CAT-----G---T-----T--AACTTTA-C-----CA--TA-C-----TTT-AA-T---TAA---T--A------TAAT-TGT---ATAGT---GC--C-AT--A--AA--TTATG--T--CAAGT-T-TCATT-TTGT-------------CA-TTTT--------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-C--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTA-CAG----TCTTTAGGCA---T----GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATTTAA--CCATGT------T---TTTAATATAT-T-TCA--TGGTTATGCCCCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AA-AATTT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--T-AG---AGGTGCTACCAATA-ATAA-TT-AT-GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCTTGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAAATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAATT---G--TCTGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TA--AAA---AAAAGCTG-TAAAGT-------TT-----TT----AG-CC---AGCAAAGC-AAGGGA--AG----TT-TCATG-ACGACC-A-----T-GTCTTGAAACAGGATGATTTGGCAGTTTTTGTTTGT-CAATTGGGGAAA---A-TT---TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--T-C-TAGTCT----T---GTT--TTAAA-A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAATCATGT-C-ATTTT----T-C-------A-AT-GC------A---T---TAT-GC----------AA--C-AAT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttaataagtatattgttaattgcaactcacacaggagtgaaaaactctagacttaagattgttatacagaatgcttctggccctaaataggccagtctaaaaatactttatgttctgctttaatacaatgctattttgattatgctgcttcttcatggtatagtggtattggcaaacaatttcaacatagattgcaagttacacaaaataaagttgttagatttattctaaatctaggtcctagaaccagtatttct---TCC-------CG-T-A----TCCTCGA-----T-----A--ATT-ATTG--T----------TTA--------A---T--AT--TAC-A-T--AT----T-AC-TAT----T--A------AT------TA--T-TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GT---TN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NNNN-NNNN-N----N-N--N-N-NN------NN-----NN-NNN--N-CA-T--TAATT---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A-------C-----CA--TA-C-----TTT-AA-T---TAA---T--T-----ACAAT-TGC---ATAGT---GC--C-AT--A--GA--ATATG--T--CAAGT-T-T-ATT-TTGT-------------GA-TTTTA-------AAGTTTTATG--A----TC--CTGAGAC--AT--TTGTTG-TAA---T-------------------------A-T--TTAC------T---AGTCC--AGT-AAAATGAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttctttctcatttcattttattca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                         tgcaactctttactttctcagattgtctgagatttgtaacacatgtaTT-GTGC------ATCAAACTAT-A-T-ACTGA--GT-AAAAATAAGAC--T-AG---AAGTTCTACTTGTA-AT---TT-T--TTCATA-CCTAAAG-AT-AAAT-AAAAAA-AAACCCT--TGTTTATACATTGTA-TTAC-AAATT-CATT--AAAGATTaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A--A------AG-AT----------TT--TTA---AAAGGCTGT-AAAGTCGC----TA-----CT----AT-CC---ATCAAAGC-AAGAAA--AG----TC-ACATG-AAG-TC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGCTAAT-A--T-----------T-TT---TTA--T-T---------A--T-C-----AAAT--T-C-CA------------GTT--TT----ATATT------TT-----AAAG--T-----A---------TGTCCGAAACATGT-C-CTTTTTG--T-C-------A-AT-GT------A---T---TAT-GC----------AA--C-TAtttaaaaggctgtaaagtcgctactatccatcaaagcaagaaaagtcacatgaagtcatgtccagttttgctaatattttttattatcaaattccagttttatattttaaagtatgtccgaaacatgtcctttttgtcaatgtattatgcaactacatgtattacaagtatttaaagcatgcc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttgtgcatcaaactatatactgagtaaaaataagactagaagttctacttgtaattttttcatacctaaagataaataaaaaaaaacccttgtttatacattgtattacaaattcatt--------AA--T--AT--T---A-T--AT------AT-TAC----T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GT---NN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NNNN-NNNN-N----N-N--N-N-NN------NN-----NN-NNN--N-NN-N--NN--N---N------NNNNGT----CAT-----G---T-----T--A----A--C-----CA--TA-C-----TCT-AA-T---TAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GT--C-AT--A--GA--TTATG--T--CAAGT-T-TCATT-TTGT--------------A-TTTT--------AAGTTT-ATC--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATcatgtattacaagtatttaaagcatgcc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtgtatcacatgtacTCC--AA-TTCTAG---TTA-------TG-T-A----TT----G-----T-------------TTA--T----------T-----------G--T--TT--T-T-G-T--CT----G-TT-CAT----C--ATATTA-AG------CA--T-CT----------AA-T-T-A-T--------------A---------A---GGACTTCATTGCA-AA--G-GA-GCCA--AT-GTCA----GCTT-C----AGT-GGGT-TACC-C----T-TC-A-G-TT------AT-----CA--TA--T-TA-T--AA--T---A------T----T----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----TA--T--TCCA--TTT-AT-TCTTTGT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GC--T-AT--A--TT--TTGTG--C--CAGGT-T-TCAAT-TTGC-------------AA-CTTT--------AAA-TTTACA--A----TC--AC--TAC--TT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-tgt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --A-G-TT------AT-----CA--TG--T-CA-T--TA--TGTCA------T---GTTATCCAT-----G---T-----T--A----T--T-----CA--TT-C-----TTT-AG-T---TGT---T--A-----A-AAC-TGC---ATGGT---GC--T-AT--ATAGA--TTATG--T--CAGGT-T-TCAAT-TTGT-------------GA-CTTT--------AAG--TTGCG--A----TC--AT--AGC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TGC----T------CCCGAAT-AAAATAAAATGAat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acctgctcattatattcattatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnca--C-----CA--TT-C-----TTT-AA-T---TAA---T--A------TAAT-TGC---ATAGT----C--C-AT--A--TA--TTATG--T--CAAGT-T-TCAGT-TTGT-------------CA-TTTC--------AA----TATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A----TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tatatattactatttaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--------------A---AT---AA---GGACCATATTG-G-AAA-C-AA-TCTG--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GTAT-TATT-C----C-T--A-T-TTTATTGAATCAGTATA-ATA--T-GA-T--TA--T---A------T---TT----TATTTCCTG---T-----T--A----T--C-----GA--T--C-----TTC-AG-T---TAT---C--A------TAAT-TGT---ATAGT---GT--T-AC--T--TA--TCATG--T--CAGGT-T-TCAAT-TTGT-------------TA-TTCT--------AAG-TTTATG--T----TC--AT--AAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TG-----C---A--CATGAAT-AAAATGAAATG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aCTCATTA-G-AA--A-AAAGCTATAAT-TTCA----GCTT-TAATTTAT-GGGT-AATC-C----T-T--A-G---------AT-----TT-ATA--T-AA------------A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--TT-C-----TTT-GA-T---TGT---T--A--------------------------------C--A--GA--TTATG--T--AATTT-T-TCAAT-TTGT-------------GA-TTTT--------AA-CTTCATG--A----TC--AT--GTCCTAT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TA-----C---A--CCTGAAT-GAAATAGAATGA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tttttgcctgttcatcatatttttcatgcaggT------TA--A-TT----------AT-C-T-G-T--------------A---GT---AA---G-ACCCCATTG-A-AA--T-AA-ACTG--ATATTCA----GCTT-T----TAT-GGGT--ATC-C----T-T--A-G-GT------TT-----TA--TA--T-CA-T---A------A------T---GT----CAT-----G---TAAACTT--A----A--C-----CA--TT-C-----TTT-AA-T---TAA---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GC--C-AT--A--TA--TTATG--T--CAG-T-T-TCAGT-TTGT-------------CA-TTTC--------AA----TATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGAa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atG-TT----------TT--AAA---ACA-GCTGT-AAATTCG-----TT-----TT----AG-CC---AGTAAAGC-AAGAGA--AG----CA-TCATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAAT-A--CT------ATTTT-TT---TTA--T-T------A-AAT-T-T-----AAAT--C-T-TAT-------T---CTTACCT----A----------TTAAATGA-----T-----A---------TGCACGAAATATGC-A-ATTTT----T-C-------A-AT-GC------A---T---TAT-GC----------AA--C-TATT--T-AATTAAAAAAA-------A-CCT--GC-CA-A--A----A-TTCC--AA-TATTAG---TC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                            TGTGACTTTTTA-AATAAATTCTTTGGGCAAGCTAGT-ATTAAAC-GTTGA-TAACA-GAGCTACTCCATTA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtgtttgcaagcaacttattgcaagtaacccaaacaatgtcgaatgttcatatttattctaaatcaaggccctaaatagacccaacatttttaaaTTT-T------CG-GTGC-AATGT-CAAA--AAGGATCGA-AATACCT---AGCGT-TT--AG-AAGC--A-A---------------AACCGC----G--ACAGC-AAA---GTC--G------AG-T----------------------AAAGTTTTCA------------------CT----AG-CC---AGTAAGGC-A-TGGA--TA----TT-ACATG-A------A-----T-GTC------CAG--------------TTTTACAAGTAC--TT------A---T-TT---ATT--T-T------A-AAGAT-A-----AAAT--A-T-TAG-------C---CCT--TT----A----------TTTTAATA-----T-----G---------TGTTTGAAACATAT-C-CTTTT----T---------A-AC-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-TATTACT-CAC-------A-------A-CCT--GC-CA-A--A----A-TTTC--AA-TGTTAG---TCT-------TG-T-A----TT----A-----T-----T--T---ATTA--T----------TT-------------T---T--T-C-C-T--GT----T-A---AT----C--AC-ATGTAA------TA--T-AC----------A-----------------------A---GC---TA---GGACTCCA---------------------AT-TTCA----GCCC-T----GA---GGT-TATCACAATAT-T--A---TC------AT-----TA-ATAAGT-CG-C--T--------------T---TC----CAT-----G---T-----T--A----C--T-----TAATT--CT----TTT-AA-T---TGT---C--A-----A-AAT-TG---CACAGT---GG--T-AC--A--CA--TTATA--T--CCGCT-T-TCCTT-TTGT-------------TA-TTTT--------GAA-TCCACA--A----TC--AT--GAC--AT--T--CCT-TGA---A-------------------------A-T--TT-T------catattaaagattaagacatgtttgatttcaaatactatatatatcgagcattaaccagttaatactaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaccacccgtaagattttttttcggtgcaatgtcaaaaaggatcgaaatacctagcgtttagaagcaaaaccgcgacagcaaagtcgagtaaagttttcactagccagtaaggcatggatattacatgaatgtccagttttacaagtacttatttattttaaagataaaatattagccctttattttaatatgtgtttgaaacatatcctttttaacgcattatgcaactattactcacaacctgccaaaatttcaatgttagtcttgtattatttattattttttcctgttaatcacatgtaatatacaagctaggactccaatttcagccctgaggttatcacaatattatcattaataagtcgctttccatgttacttaattcttttaattgtcaaaattgcacagtggtacacattatatccgctttccttttgttattttgaatccacaatcatgacattccttgaaattttcc
gi|30                         : gtgtttgcaagcaacttattgcaagtaacccaaacaatgtcgaatgttcatatttattctaaatcaaggccctaaatagacccaacatttttaaatgtgactttttaaataaattctttgggcaagctagtattaaacgttgataacagagctactccattacatattaaagattaagacatgtttgatttcaaatactatatatatcgagcattaaccagttaatactaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaccacccgtaagatttt------T---CTTAATATAT-T-TCA--TGGTTATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-C-ACTTA--AG-AAAAATAATACCGT-ACTAGAGGTGCTACCAACA-GTAA-TTAT--GTCATA-CAC-AAG-ATAAAAA-GGCAAA-GAATCCTCATG--T-T------TA-TTAT-AATGC-CACT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TTAGC-cc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccatggTG-T-AA--T-AA-AC----AT-ATCC----G--T-T----GAT-GGGT-TATC-C----T-T--A-GGTT------AT-----TA------T-CA-----A--T---A------T---GT----CGT-----G---T-----T--A----T--T-----CA--TT-C-----TTT-GA-T---TGT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GC--T-GT--A--GA--TTATG--C--TAGGT-T-TCAAT-GCGT-------------GA-TTTT--------AAG-TTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TTA---T-------------------------A-T--TT-TA-----T---A--CCTGAATAAAAATGAAAT
gi|32                         :                                                                                                                                                                      aatatacctttgttatcatgaaTGTGAAAGTTTA-G-C----TCTTTGGGAA---T----GTTA-GA-GTTGA-T-ACA-GAGCCACTCAATTAAG------------------------TTTAATATAT-T-TCA--TGGCAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AA-AATTT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--T-AG---AGGTGCTA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acataaaataaagtgattagattattctaaacctaggtcctagaaccagtatttctCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAAATTGG-AATACTAAAATGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTG-TAAAGTCGT----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGT--AG----TT-TCATG-ATG-CC-A-----T-ATC------CAG--------------TTTTGTTGATAT--TT------A---T-TT---TTA--T-T------A-AA--T-C-----AAAT--C-C-TAG-------
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T------TA--T-TT----------AT-T-TTA-T--------------AAACGT---GA---G--CATCATTA-C-AA--T----TCTT---T-TTCA------TT-T----CAT-AT-T-TATC-C----T-T--AAG-TT------AT-----TA--TA--T-CA-T----------------------------AT-----A---T-----T--A----T--C-----TT--T--T-----TTT-AAAT---TAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GC--T-AT--A--GA--T-ATG--T--CAGGT-T-TC-------------------------------------AGTTTTATG--A----TC--AT--GAC--AC--T--CTG-TGG---T-------------------------A-T--TT-TA-----T---G--TCTGAAT-AAAATGAAATGtcttac
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tacat-----TTT-AA-T---TTC---TTAA-----ATAAT-TGC----TAGT---GC--C-AT--A--GA--TTATGCGT--CAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAG-TTTATG--A----TCCTCT--GA---AT--T--GGGCTGATTTT-------------------------T-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAATCGAAATGA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtgttattcttttaaatactttttaagttcttgtttatctgttgttgcaagtatggtgactATTG-G-AAA-T-AA-GCTG--AT-TTTAAATAGCTA-T----TAT-GGAT-TATC-C----T-T--A-GGTT------AT-----TG--TA--T-CA-T--TA--T---ACATGTAT---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--CTG---CA-----C-----TTT-AG-T---TAT---T--A-----A-AAT-TGC---ATATT---GC--C-AT--A--GA--TTATA--T--CAAGT-T-CCAGT-TT-T-------------G-----------------------G--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTa
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtgtgaaattt-ATA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----A--CTTAATCA--TA-C-----TTT-AA-G---TAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GC--C-AT--A--GC--TTATG--C--CAAGT-T-TCATT-TTGTCATTTCAAATTTTAA-TTTT--------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATct
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -------A-CCT--GC-C--C--ACAGTA-TCTCTTAA-TA-TA----TCT-------TA-T-A----TC----AGTAAGT-----AT-A---ATTAGTT----------TTG--------TA--T--AG--T---A-T--AT------AT-CAT----T--AT-TTG-AT------TG--T-TT----------AT-T-T-G-TGGAAGTACAGTTGTA---GT---AA---GTAACCCATTG-G-AA--------CTG--AC-TTCA----GCTT-T----TGT--GGT-TATT-C----T-T--AGG-TT------A
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---GC----CAC-----G---T-----A--A----T--C-----CA--TT-C-----TTT-AA-T---TAT---T--GTT---ATAAT-TGC---ATGGT---CC--T-AT--A--TA--TTATG--T--CAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAG-TTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--A--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TA-----C---A--CCTGAAT-AAAATGAAATG
gi|4                          :                                                                                                                                                                         cagacacatttccacacagTGTGATATTTCA-GAC----TCTTTGA-CA---T--T-GCAAAAA-GTTGA-TGACA-GAGCTAATCAATTAAGATT-GAACC----T------TAT-TTTAATATAT-T-T-A--TGTTAAAGCACCG--CACT-ATTTTT-GTG-------AT-CAATT-C-G-T-ACTAA--AT-AATGATAATGC--TTG----AAGTGCTACCAACA-ATA---T-T--GTTATA-GGT-AGG-AT-AAAA-TAAAAA-TAATC------TTT-T------TG-ATAA-AAT----ATT--AAGAAT------TACTT--------------------------------------------------G--TCAGC-AAA---GCA--A------AG-TT----------TG--AAA---AAAAGCTGT-AAAGTCGT----TA-----TT----AG-CCTCTAGTA---C-TTTGGA--AG----TC-GCATG-ACG-TC-A-----A-GTC------CAG--------------TTTTGGTACTTC--TT------A---C-TT---T-A--C-T------C-TA--T-C-----AAAT--C-G-TAG-------TTATATT--TT----A----------AA-----A-----T-----A---------TGTGCGAGCCATGA-C-ATTTG----T-C-------A-AT-GC---ATTA---TACATGT-AC----------AA--C-TATT--T--GT----CAAA-------T-CCT--GC-TT-A--A----A-CTAG--AA-TGCTA-----------------T-A----CT----A-----------A--T---CTTG--T----------TT-------------T--AT--T-C-AAT--GT----T--C-TGT----C--TG-TTG-AT------CACAT-TC----------AC-TAT-G-T--------------A---ATCATAA---GAACCCTATTG-G-AAA-T-AA-GCTA--AA-TTCA----GCTT-T----TTTTAAGT-TATT-C----T-A--A-GGTT------AT-----TA--TA--T-CT-T--TA--C---A------T---GT----CAT-----G---A-----T--A----T--C-----CA--T------------AA-T---AATA--T--A-----ATTAT-GGCTGCATAGT---GC--T-AC--A--GA--TTATA--T--CATGT-T-TCAAT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAA-TTCATA--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTC-TGA---T-------------------------A-T--TT-TA-----C---A--CTTGAAT-AAAATAA
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acagcaaagttgtgagatttattctatatctatgtcgtagagtaagtgtttctA-GGCAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAAATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ATA--A------AG-TT----------TT---AA---AAAATCTG-TGAAGTCGT----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-gcc
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcaaaatgtagctgtTA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----GATAT-----G--A----T--C-----CA--TT-C-----TTT-AA-T---TAT---C--------ATAAT-TGCA-TATAGT---GT--C-TT--A--GA--TTATG--T--CAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TTTT--------AGGTTTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--AACT-TAAC-----CA--TA-C-----TTT-AA-T---TAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GC--C-AT--A--GA--TTATG--T--CAAGT-T-TCATT-TTGT-------------CA-TTTT--------AAGTTT-ATT--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTAAAT-AAAATGAAATGA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --A----T--C-----CA--TT-C-----TTT-AA-T---TACATGT--ATT---GTAAT-TACA-TATACT---GC--T-AT--ATAGA--TCATG--T--CAGAT-T-TCAGT-ATGT-------------GA-TTT---------AAGTTT-AGG--A----TC--AT--GAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TTACTACT---A--CCTGAAT-AAGATGAAATGA
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taGAGA--AG----TC-ACATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTTTTAATAC--AT------A---T-TT---TTA--G-T----------------------------C-TTC-------C---ATT--TT----A----------AG-----A-----T-----T---------TGTCCGAATTATAT-A-ATTTT----T-C-------A-AT-GC---A------T---TAT-AC----------AA--C-TATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GCAA--A--A----A-TTCC--TA-TACT
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -ATA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CAT-T--C-----TTT-AA-T---TGT---T--ATACATGTAAT-TG---CAGAGT---GC--T-AT--G--GA--TTGTG--T--CAGGT-T-TC-------------------------------------AGTTTTGTG--A----TT--AT--GAC--AT--T--TTG-TGA---T-------------------------A-G--TT-TA-----C---A--CTTGAAT-GAAATGGAATGA
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            t--T--C-----TTT-AAAT---TATG--T--ATGTGTATAATCTGA--CATGGT---CC--T-AT--AT-AA--TTATG--T--CAGGT-TATCATGGTTGTT------------GA-TTTT--------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--A--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-A------TAACA--CCTGAAT-AAAATGAAATG
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       catTTT----T-T-------A-AT-GT---A------T---TAT-GC----------AA--C-GATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----AGTTTC--AA-TACTAG---TCT-------TG-C-A----TT----A-----T-----A--A---ATCA--T----------TTA--------AAATT--AT--T-TAA-T--ATTACAT-AT-TAT----T--AT-TT
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcctgctgtatccccagagagagaA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--TA----TCT-AA-T---AAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GC--C-AT--A--GA--TTATG--T--CAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TTTT--------ATG-TTTATG--------------------AT--T--CTG----------------------------------------------------A--CCTAAAT-AAAATAAAATG
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aa-----T--A----A--C-----CA--TA-C-----TTT-GG-T---TAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GT--C-AT--A--GA--TTATG--T--CGGGT-T-TCATT-TTGT-------------GG-TTTT--------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AA--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------TT--A--CCTGAAT-AAAATGAga
gi|5                          :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTA-CAC----GCTTTATGCA---T----GTTAAGA-GTTAA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATT-G---------------T---TTTGATATAT-T-TCA--TGATAATGAACCA--AGCT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATC-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC----A----AGGT-CTACCAATA-ATA--TT-A--GTCATA-CAC-AAG-AT-CAA--GGCAA--GAATCCTCATGATT-G------TAATTAT-AATGT-CATT--AA-GATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------A-CAGTT---G--TCAGC-AAA---ACG--A------AG-TT----------TA--AAA---AAAGGCTGTTAAAGTCGA----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-TCATG-ATG-CC-A-----T-ATC------TAG--------------TTTTGTTGAT-C--TT------A---T-TT---TTA--T-T------G-AA--T-T-----AAAT--G-C-TAG-----------GTT--CT----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAACATTT-C-ATTTT----TTC-------A-ATAGC---A--A---T---TAT-GC----------AA--C-CATT--T-TAT----AAAA-------G-TCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AG-CACTAG---TCT-------CG-T-A----TC----A-----T-----A--A---ATTA--T----------CCA--------AA--T--AT--T-T-A-T--AT----T-AT-TAT----T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------AT-T-T-G-C--------------A---GT---AA---GGATCCCATTG-G-AA--T-AATTCTG--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TATC-T----T-T--A-G-TT------AT-----TA-ATA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--A-----TTT-AA-T---TAT---T--A-----ATAAT-TGC--CATAGT---GC--C-AT--A---A--TTATG--T---AGGTGT-TCAGT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAGTTATATC--A----T----T--GAC--AT--TG-ATG-TGA---TCATTATGATCATGACATTATGTGATA-T--TT-T------T---A--CGTGAAT-AAAATTAAATAAcga
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --CATAGT---GC--T---------------TG--T--CAGGT-T-TCAAT-TTGT-------------GA-TTTC--------AAG-TTTACG--ATCATTC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-G--TT-TA-----C---A--CCTGAAT-TGAATGAA
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cccattattttaaaatgctggatatgATA-T---GC--C-AT--A--GA--TTATG--T--CAAGT-T-TCATT-TTGT-------------AATTTTT--------AAG-TTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AGAATGAAATGAgg
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttttcagcaacatgtttaatAAAATAATAC--T-AT---ATGTGCTTCCAATA-ATAA-TT-AATGTCATA-CCC-AAG-AT-CAAAAGGTAAAAGAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGCTTATT--AAAGATT-G-AATACTa
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               g-CC---AGCAAGGC-ATGGGG--AG----TC-ACATACACG-CC-A-----T-AGA------CAG--------------TTT--------------------------------A--T-T------ATAA--T-T-----CAAT--C-T-TAT-------T---ATT--TT----A----------AA-----A-----T-----A---------TGTTCGAAACTTGT-C-ATTTT----T-CTAAG---A-AT-GC---A--A---c
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAATAATAC--T-AT---ATGTGCTTCCAATA-ATAA-TT-AT-GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGTAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATACTc
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                g-ATA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----TAATT--C-----TTT-AA-T---TAA---T--------ATAAT-TG---CAT--T---GT--C-AT--
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          t-AT--A--GA--TTATG--T--CAGGT-T-TCAGT-TTTT-------------GA-TTTT--------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--TAG--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---G--CCTGAAT-AAAATGAAATGAtcattgtaacaatcacccaacttagtaagagactatgatc
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agAAT-TGC---ATAGT---GC--T-G---A--GA--CTATG--CGACATAT-T-CCAAT-CC------------------TTTT--------AA-TTTTAT---A----TT--------C--AT--T--TTA-TGC---C-------------------------A-T--TT-TA-----T---A--CCAAAAT-AAAA
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcCATG-ACA-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTGA------T------A---T-TTAAAAAA--T-C------A-AA--T-C-----AAAT--C-T-TAA-------T---GTC--TT----
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                               ----T------T---TTCAATATAT-TGTCA--TGGTAATACACCCCTAACT-ACCTTTTGTG-------A--AAATT-A-AATGACTAA--AT-AAAAATAATAC--T-A----GGGTGCCACCAATATACAA-TA-T--GTCA-A-CCC-AAGTAT--AAA-GGCAAA-GAAT-CTCATG-TT-T------TA-TTAT-AATGC-C-TT---AAGATT-G-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-AC--------------AACGTTT---G--TCTGC-CAA---ACAAGA------GG-TT----------TT--AAA---AAAAACCCTTAAAGTCAT----TT-----TTTATAGG-CCA--AGCA--GC-AAGGGATCGT----TT-TCATG-A-G-CC-A-----TAATC------GAA--------------TTTTTGTGATAC--TT------A-----TT---TTG--T-T------T-AA--T-T-----AAAT---------------------TT--TTATA-A----------TT-----A-----T-----A---------AGCTCGAAACA-GT---ATTTT----T-C-------A-AT-GC------A---T---TAT-GC----------AA--C-A--C--T-CAT----AAAC-------A-TCT--GC-C--A--A----A-TTCC--A---AGTAG---TCT-------CG-C-A----TT----A-----T-----A--------TA--T----------TT---------AA--T--A---T-C-A-T--A-----T-AT-TAC----T--CT-TT--AT------TA--T-TCA---------AT-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GGAATTCATTG-G-AA--T-AA-GATG--AG-GTCA----GC-T-G----TAT-GGGT-TATC-C----T-T--A-G-TT------AT-----T--ATA--C-AA-T--T---T---A------TG--GT----CAT-----G---T-----T--A-------A-----CA--TAAC-----TTT-AA-C---T-T---T--------ATAAT-TG---CATAGT---GC--C-AT--A--GA---TATG-----CAAGT-T-TTATT-ATGT-------------AA--TTT--------AAG-TTTATG--A----TC--AT--GAC--ATTGT--CT--TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTAAAT-AAATTGAAATGA
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaccatgG--A----TT--AT--GAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TC-----C---A--CCTGAAT-GAAA
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---TTT-----------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAattttaagacatgaa
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---TTT-----------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAtg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GG-AATACTT---TGC------------------A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--G------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTG-TAAAGTC-T----TC-----TT----AC-CC---AGCCAGGC-TAGGGA--AG----TTGTCATG-ACG-CCAA-----T-ATC------AAG--------------TTT-----GT-C--TT------A---CGTT---TTA----A------A-AA--T-T-----Atg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAAACATGT-C-ATTTT----T-C-------A-AT-GC------A---T---TAT-GCA---------AA--C-CATT--T-CAT----CACA-------A-CCT--GC-C-----A----A-TTCC--AA-TACTAG---TGT-------CG-C-A----TT----A-----T-----A--A---ATTA--T----------TT---------AA--T--AT--T-T-A-T--ATATA-T-AT-TAT----T--GT-TTG-AT------TA--T-TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GN---NN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NGA--CA-------------G-G-TT----------------ATA--T-CA-TTATA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CAT-T--C-----TTT-AA-T---TAT---T--------ATAAG-TG---CACAGT---GC--C-AT--A--TAACTTATG--T--CAAGT-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAG-ATTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------ATT--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGAtagagaacagaagaacagaatgtttatttctaatcagagtccaaaacagacaaagtgagttcataacaacattagaagattatatgcttgaaacatgtcatttttcaatgcattatgcaaaccatttcatcacaacctgccaattccaatactagtgtcgcattataaattatttaatatttatatatatattattgtttgattatttatttgtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaggttatatcattatatatgtcatgttatccattctttaattattataagtgcacagtgccatataacttatgtcaagtttcagtttgtgattttaagattatgatcatgacattctgtgatattttttacctgaataaaatgaaatga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                             ggaatactttgcaaacagttgtcagcaaaacagagttttaaaaaaagctgtaaagtcttcttacccagccaggctagggaagttgtcatgacgccaatatcaagtttgtcttacgttttaaaaattatagagaacagaagaacagaatgtttatttctaatcagagtccaaaacagacaaagtgagttcataacaacattagaag--GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGCAAG-GAATCTTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAA-------------C---TGCCA-TT--A--AAAT--G-G---------------AATAGTTTTAG--CCACC-AAA---GCA--A------GG-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatGCCATTAAAATGGAATAGTT-----TT----AG-CC---ACCAAAGC-AAGGGA--A------T-TCAT--ACG-CC-A-----T--------------------------------TTGATGC--TT------A---T-TT-----A--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGTCTA---C---GTTG-TT----AAAA-------TC-----A-----T-----A---------TGCTT-AAACCTGT-C-ATTTT------C-------A-AT-GC---A--A---T-------GC----------AA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-ATCC---A-TGCTAT---TCT--------------------------------------A---ATTA--T----------T----------AG--T--AT--T-T-T-T--AA----T-ATATAT----T--AC-T---AT------TA----AT----------AT-T-N-N-N--------------N---NN---NN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NNNN-NNNN-N----N-N--N-N-NN------NN-----NN-AT------------------------------GT----CAT-----G---T-----T--A----A--C-----TA--C--CATACGTTA-AA-T---TATA--T--A-----TTAA--TG---CATA-T---TC--C-ATGAA--AA--TCAT---T--CAAGT-T---AAT-TAGT-------------CA--TTT--------AA--TTGATG--A----TC--A---GAC--AT--T--CTG-T-A---T-------------------------A----TT-T------G---A--CCTGAAT--AAAT-AAATGgaattcatacgccatttgatgcttatttattaaattaaatcctagtctacgttgttaaaatcatatgcttaaacctgtcattttcaatgcaatgcaacaatttcataaaaacctgccaaaatccatgctattctaattattagtatttttaatatatattactattaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtcatgttaactaccatacgttaaattatatattaatgcatattccatgaaaatcattcaagttaattagtcatttaattgatgatcagacattctgtatatttgacctgaataaataaatg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aatgtcatacccaagatcaaaggcaaggaatcttcatgtttttattataatgccattaaactCTGT-AAAGTCCA----TA-----TT----AG-CC---AGTAAGAC-AATGGA--TA----TT-ACATG-ATA-CC-A-----T-GTG------CAG--------------TGTTGTCAAT-TA-TT------A---T-AT---TTA--CAC------A-AA--T---------AT-------AG-------C---CTT--CT----A----------TT-----A-----TGAAATA---------TGTTTGAAACTTAT-A-ATTTT----T-CGACGCAAA-AT-GC---A--ATATT---CAT-TC----------AAAAC-C-TT--T-CA------AAACTCTTGTA-TTT--GC-T--ATTA----G-TTGT-----TGTTTG---TCTGTTTTTTCA-T-ACTTCTT----A-----T-----GT-A---ATTA--TAGGGATCCCATTG--------AA--C--AT--T-TTA-T--AT----C-AT-TGTATGCC--AT-GTT-ATCCATCATA--C-TT----------ATCT-T-G-T--------------A---AT---TA---------CA--A-G-AA--T------TA--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TACC-C----T-T--A-G-CT-----------------TA--T-CA----TA--T---C------T----T----CAT-----T---C-----T--A----T--------CA--T--T-----TTT-----------------------ACAAT-TG---CATAGT---ACTAT-AT--A--GA--TTATG--T--CTGGT-T-TCAAT-TTGT-------------CA-TT------------------TG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTC-TAA---T-------------------------
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|58 ): ACATTTTTTCAAAGTTTTCTAAACGTTCATCTTATCCTTCGCCATAATGGTTGATGTAGAGAG
Unaligned ( gi|61 ): AATATTAAAGAAATGATTATCCATTCTTACGGTTTGGTTTCAATATTT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                        11111111              2222                                       666666666666666666666                               11               1111111                                         2222                      2222                                                                                                                  222222222222222                                          111111111111111             11     1111111                                                                       111111   22222222222222        22222222222222222222        1111111111111                        55555555555555555555555555555555555555555                                            11111111111111       2222222222          1111111111                                           11                                                             2222222222222      2222222222222222222222222        111       111111                                    1111111111          11111111111111                              11111111                                                     11111111111111111111                                                           1111111        22222222222                  222222222       2222                                                                                    1                                            1111111111111111111111111         111111                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                        33333333          888 7777       5     5     5                   111111111111111111111          4 4   66             00    4      4   7777777 77     555 4 4     55  4           44 3 7777              4   77  0000      3   6   3  55   3      6           4  2 777777  2    2     2    33       0 2       555     2  33  2    5555 000000000000000       555 33     2   555   33 888888  2  222222222222222  555   0    88     2222222  66666  5555  2  666        2      33  5555  33    2 0 4  2 55555 2   222222   00000000000000        66666666666666666666  555   0000000000000  44 6666666    777777  33333333333333333333333333333333333333333 88888 44444 777777777              1 1     11111111111111 1  1  6666666666 333   1  0000000000  22 22   22 4   4444    6666666 2   22  2 22 22 4444 8    22222      333   8888888  2 2 4444  4444 55555 4444444444444   22 5555555555555555555555555 22  22 555 1 22  333333  1   4444 44  1   2  555555  3333  1111111111  1 1 1 1 22222222222222 333  333  66666         222  22222222 1 22  1    3333    1 3333   1    1    1 3333 1 33 3 88888888888888888888  11 1  1 11  11 222 333333 333  2222   33333 222 33333 11 3333333 44444  55555555555   1  2 111   555 555555555    1  7777     111  11 1  11 33  22     11 11     1 1   1 1    77777777777777 1    66666666   7  6   11 2222  11  11   11  11 22   2   111 2222222222222222222222222 2 11  1 444444 222 11       1            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                        ........          ... ....       .     .     .                   .....................          . .   ..             ..    .      .   ....... ..     ... . .     ..  .           .. . ....              .   ..  ....      .   .   .  ..   .      .           .  . ......  .    .     .    ..       . .       ...     .  ..  .    .... ...............       ... ..     .   ...   .. ......  .  ...............  ...   .    ..     .......  .....  ....  .  ...        .      ..  ....  ..    . . .  . ..... .   ......   ..............        ....................  ...   .............  .. .......    ......  ......................................... ..... ..... .........              . .     .............. .  .  .......... ...   .  ..........  .. ..   .. .   ....    ....... .   ..  . .. .. .... .    .....      ...   .......  . . ....  .... ..... .............   .. ......................... ..  .. ... . ..  ......  .   .... ..  .   .  ......  ....  ..........  . . . . .............. ...  ...  .....         ...  ........ . ..  .    ....    . ....   .    .    . .... . .. . ....................  .. .  . ..  .. ... ...... ...  ....   ..... ... ..... .. ....... .....  ...........   .  . ...   ... .........    .  ....     ...  .. .  .. ..  ..     .. ..     . .   . .    .............. .    ........   .  .   .. ....  ..  ..   ..  .. ..   .   ... ......................... . ..  . ...... ... ..       .            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                        22222222          888 4444       0     0     0                   000000000000000000000          4 4   11             66    4      0   0000000 77     555 0 0     55  0           66 3 1111              0   22  1111      3   7   3  88   1      2           1  7 777777  5    5     5    44       4 5       000     9  99  9    8888 777777777777777       000 99     9   444   99 222222  7  666666666666666  000   1    22     7777777  22222  3333  4  555        4      22  0000  44    2 5 4  2 66666 2   888888   33333333333333        33333333333333333333  888   9999999999999  55 4444444    444444  99999999999999999999999999999999999999999 11111 88888 666666666              8 8     88888888888888 7  7  5555555555 333   9  2222222222  66 99   99 2   5555    5555555 0   88  0 88 88 2222 0    88888      333   5555555  0 0 2222  2222 00000 8888888888888   88 1111111111111111111111111 66  66 555 9 66  444444  9   0000 55  9   0  222222  9999  6666666666  8 8 8 8 00000000000000 000  000  99999         999  99999999 2 33  7    5555    7 5555   7    7    7 5555 7 88 2 66666666666666666666  88 3  3 88  88 333 888888 555  7777   22222 333 11111 77 0000000 66666  44444444444   1  2 999   333 222222222    1  1111     888  44 0  44 88  88     44 44     0 0   7 0    99999999999999 0    99999999   1  0   33 0000  33  33   33  33 33   0   777 4444444444444444444444444 0 44  0 666666 999 44       1            
consensus                     :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTA-GAC----TCTTTGGGCA---T--T-GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATT-GA--C----T------T---TTTAATATAT-T-TCA--TGGTAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--T-A----AGGTGCTACCAATA-ATAA-TT-N--GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTGTTAAAGTCGN----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-NCATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAAT-C--TT------A---T-TT---TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAG-------C---GTT--TT----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAACATGT-C-ATTTT----T-C-------A-AT-GC---A--A---T---TAT-GC----------AA--C-NATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TACTAG---TCT-------CG-T-A----TT----A-----T-----A--A---ATTA--T----------TTA--------AA--T--AT--T-T-A-T--AT----T-AT-TAT----T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GGACCCCATTG-G-AA--T-AA-GCTG--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TATC-C----T-T--A-G-TT------AT-----TA-ATA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--C-----TTT-AA-T---TAT---T--A-----ATAAT-TGC--CATAGT---GC--C-AT--A--GA--TTATG--T--CAGGT-T-TCANT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAGTTTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
Reference ( family-4676 )     :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTA-GAC----TCTTTGGGCA---T--T-GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATT-GA--C----T------T---TTTAATATAT-T-TCA--TGGTAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--T-A----AGGTGCTACCAATA-ATAA-TT-N--GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTGTTAAAGTCGN----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-NCATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAAT-C--TT------A---T-TT---TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAG-------C---GTT--TT----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAACATGT-C-ATTTT----T-C-------A-AT-GC---A--A---T---TAT-GC----------AA--C-NATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TACTAG---TCT-------CG-T-A----TT----A-----T-----A--A---ATTA--T----------TTA--------AA--T--AT--T-T-A-T--AT----T-AT-TAT----T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GGACCCCATTG-G-AA--T-AA-GCTG--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TATC-C----T-T--A-G-TT------AT-----TA-ATA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--C-----TTT-AA-T---TAT---T--A-----ATAAT-TGC--CATAGT---GC--C-AT--A--GA--TTATG--T--CAGGT-T-TCANT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAGTTTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTACAAG----TCTTTAGGCA---T--T-GTTAAGATGTTGAATG-CATGAGCCACT-AATTAAGATT-AA--C----CGTATGGT---TTTATAATAT-T-TCAAGTGGTTAT-CTCCAC-AACTGACTCTT-GTG-------AA-AAATT-TTG-T-ACTAAGAAC-AAAAATAATAC--T-A----AGGTGCTACAAATA-ATAA-TT----GT-ATAGCCCAAAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCGCTTGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATTAAAAAAATTGGAAATACTT---TGCCT-TT--AGAAGAC----A---------------AACAATT---GTCTCAGC-AAAGACACA--A------CGATTATAACAAAAATA--AAA---AAAAGCTG-TAAATT-------TT-----TT----AGCCC---AGCAAAGCAAAGAGG--AGATGTTT-TCATG-ACGACC-AATGCGC-GTCTTGAAACAGGAGAGGA-------TTTTGGCAGT-T--TT------G---T-TTG--TCAAGT-TGCGGGAA-AA--TATGTTTAAAATTAC-C-AAG-------A---GTT--CT----AGCTGTGT---TT-----A-----T-----AAAATTATACTGCTT-AATCATGTACAATTTT----TGC-------A-AT-GC------A---T---TATGGC----------AA--CAAATT--T-CAT----AAAA-------AGCCT--GC-CCAA--A----A-TTC----A-TAC-AG---TCT-------CG-C-A----T-----------T-----A--A---GTTA--T----------T----------AA--T--A---T-T-A-T--TA----T-AT-TAC----T--AT-TTG-AT------TA----TT----------AC-T-T-GTT--------------A---GT---AA----GACCCT-TTG-A-AAATT-AA-GC-G--AT-TTTA----GCTT-T----T-T-GGGT-TATC-C----T-TTAG-G-CT------AT-----TATATC--T-CATT--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----A--C-----CA--TA-C-----TTTAAA-T---TAT---T--A-------AAT-TGC--ATTAGT---GC--CAAT--A--GA--TTATG--T--CAAGT-T-TCATT-TTAT-------------GA-TTTT--------AAG--TTATG--A----TC--AT--CAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|10                         :                  aatgactttatgttctggctttaatacacattgccttattttgattatgcctgctttcttcaatggtaatgtggtagtggcaaacaattcaaatagaattgcagttacaaacaaaatataagttgttagatttatcttctgaaatctaggtctacgaaactccaagtttaatttctATTCTA-GAT----TATTTGATCA---T--TTGTTAAGA-GTTGG-AGACA-GAGTTACTAAATTAAGATT-GA--A----TCATA--T---CTTGACTTGT-T-TCA--TAGTAACGTGCCA--AATT-ATCTTT-GTGTCTTAGTAT-CAA-----G-C-ACTAA--AC-AATAATAATAC--T-AG---AATTGCTACCAATA-AGAATTT-T--GTCATA-CCT-TAG-AT-AAAA-GGCAAGTGAA---------TT-T------TA-TTCT-A-----CAT--------TTG-------TT---TGCCT-TT--AA-AAACTTACA---------------AAC-GTT---A--ACCAC-AAA---AAA--AGAGTTGGG-TT----------TTCCAAAAACAAAAGCTGTAAAACTAGA----TTATCAATT----AA-TT---TAAAAGAC-AAAGAA--TG----TT-ACATA-ATG-GT-A-----T-TCT------CAG--------------TACTGTTA---C--TT----------T-TT---TCA--T------------------------------C-TA-------------TT--TC----AC---------TT-----AAAAATC-----A---------TGTCTGAAACGTGT-C-ATTTT----CGC-------A-AT-G
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggcTA--T-T------T-AA--T-T-----AAAT--C-CCTAGTCTTTGAC---GTT--TTTAAAA----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAAACATGT-C-ATTTT----C-C-------A-AT-GC---A------T---TAT-GG----------AA--C-AATT--TTCAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TGCTAG---TCTC------CG-T-A----TT----A-----T-----ATTT---ATTA--T----------TT---------AA--T--AT--TAT-A-T--AT----T-AC---T----T--AT-TTG-GA------TA--T-TTA---------AT-T-T-G-T--------------A---GT---AA----GACCCCATTG-G-AAATT-AA-GC-G--A---TCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TATC-T----T-A--G-G-TT------AT-----TAGAT---T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----TAAA----TA-C-----CA--TTAC-----TTT--A-T---TAA---T--T-----ATAAT-TG---CATAGC---GC--C--T--A--G---TTAT---T--CA-AT-T-TCATT-TTGG-------------TA-TCTTTTTTAAAAAAG-TTTATGATA----TC--AT--G-C--AT--T--CTGCCGA---T-------------------------ATT--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAATTGa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              a-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGTCTTGA-C---GTT--TTTAAAA----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAAACATGT-C-ATTT-------C-------A-AT-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCTTGGC-C--A--A----A-TTCC--A--TGCTAG---TCT-------CGCT-A----TT----A-----T-----T--ATTTATTA--T----------TTA--------A---T--AT--T---A-T--AT------AT-TAC----T--AT-TTG-AT-------A--T-TT----------AT-T-T-G-TT-------------A---GT---AATTGAGACCCCATTG-A-AA--TTAA-GCTG--AT-T-CA----GCTTCT----TAT-GGGTGTATC-C----TAT--A-GGTT------AT------A-AGA--TTCA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--AAAC-TAAC-----CA--TTAC-----TTT-A--T---TAT---T--A------TA-T-TGC---ATAGC---GC--C--T--A--G---TTATG--T--CAATT-T-TCATT-TTGT-------------CA-TTTTTTAA----AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-CGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttT---TTA--T-C------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGTCTTA--C---ATT--TT----AAAA-------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAAAATGT-C-ATATT----T-C-------A-AT-GT------A---T---TAT-GC----------AA--C-CATT--T-CAT----AAAA-------A-CCA--GC-CA-A--A----A-TTCC--AG-TACTAG---TCT-------CG-T-A----TC----A-----T-----A--A---ATTA--T----------TT---------AA--T--ATTAT-T-G-T--TT----T-AT---T----T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GG---NN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NNNN-NNNN-N----N-N--N-N-NN------NN-----NNTATA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CAT-T--C-----TTT-AA-T---TAT---T--------ATAAT-TG---CATAAT---GC--C-AT--A--TA--TTATG--T--CAAGA-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAG-TTTATG--A----TC--AT--GAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGATT-AAAATGAAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --GTCATA-CCT-AAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCATG-TT-T------TA-TTTTAAATGC-CATT--AAAGATTAG-ATAACTT---TGCCT-TTAGAG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCTGCAAAA---ACA--A------AG-TT----------TT---AA---AAAAGTTGT---AGTCGT----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AATGGA--AG----TT-TCATG-ACG-CC-A-----T-ATC------GAG--------------TTTTTTTA-------------------------TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--TGA-TA--------C---GTTG-TT----ACTTCGCCATTTT-----A-----T-----A---------TCCT--AGTCCTA--C-GTTTTAAAAT-C-------ATAT-GCTCGA--A---A---TAT-GTCATTTTCCTGAA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TACTAA---TCT-------CA-C-A----TT----A-----T-------------TTA--T----------TT---------GA--T--A---T-T-A-T--AA----T-A---------------------------------TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GT---AA---AGACCCCATT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A-TTGC-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATGCTT---TGTCTGTC--AG-AAAC--A-ACTTATGCAATATCATAACAGTT---G--TCGGC-AAA---GCT--A------AG-TT----------TT--TAA---AAA-GCTGT-AAAGTCGC----TA-----TT----AG-CC---AGCAAGAC-ACGTGA--AG----TC-ACATG-ACG-TC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAATAC--AT------A---T-TT---TTA-----------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGCCCTA--C---GTT--TC----AAT--------TC-----A-----T-----A---------T--CCGAAACATGC-C-ATTTT----C-C-------A-AT-T-----------T---TAT-GC----------CA--C-TATT--T-CAT----CAAA-------A-CTT--GC-CA-A--A----A-TTCC--GA-TACTAA---TCT-------TG-T-A----TT----A-----T-----A--A-----TA-------------GTA--------CA--TGCAT--T-T-A-TTCGT----TAAT-TGT----TG-GT-TTG-GT------TT--T-TT----------TT-T-T-A-T--------------A---AT---
gi|16                         :                                                                                                                                                                  gcaatgggtttttttgttctccaatgTGTGAACTTCTA-GAC----TCTTTGGGCA---T----GTTAAGA-GTTTA-TGACA-GAGCCACTCAACTAAGATT-GAACC----T------TGTTTTCAATATAAAT-CCA--TGGCAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--ACAAAAAATAATAC--T-A----
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              actcctaagaccttagatttttatacagaatgcattcttgcctaaggattttatgttctgctttgatcaagttattttttatatgaagctccaatttggaagttttttaggcaataaatttgaacatagattgtaaagttgatccttagcaaaaataaagttgtccagatttattctaaatcttggtcctagaaccaggatttct----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAA-GTGT-C-ATTTT----T---------A-AT-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-AATT--TTCAT----AAAA-------A-CC---GC-C--A--A----ACTTCC--AAATACTATCACTCT-------CG-CGA----TT----A-----TTTATTA--A---TTTA--T----------TTACTTTATTTAA--T--AC--T---A-T--AT----A-GT-TAC----TTAAT-TTG-AT------TA--TCTT----------AT-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GTACCCCATTG-GAAA--T-AA-TCTG--AT------------------------AGT-TAT-------T-T--A-A-T------------------TA--T-CA-T--TG--T---A------T---GT----C-T-----G---T-----A--A-------------CA-------------T-AA-T---TA-------A-----G----------CATAGTGGGGC--C--T--A--AATTTTATG--T--AACG--T-TCATT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAG-TTTATG--A-----C--AT--GAC--AT--T--ATG-TGA---T-------------------------A-TTCTT-T------T---A--CCTGAAT--AAATGAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgatagtattgggtttgctcctacaT-----A-----T-----A---------CACTCAAAACATGC-C-ATTTT----T-C-------A-AT-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-TATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----AATTTC--TA-TACTCA---TCT-------TG-T-A----TT----A-----T-----G--A---ATTA--T----------TTA--------A---T--AT--T---A-T--AT----C-AT-T------T--AA-TTG-AT------TG--C-TTGTGAAAGTATAT-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GAA-----------AA--T-AA-GCTG--AT-TTCA----GGTT-T----TAT-AGGT-TATC-C----T-T--A-GGTT------AT-----TT--TA--T-CA-T--TT--T---A------C---GT----TAT---------------T--A----T--C-----CA--TT-C-----CTT-GA-T---TAT---T--A------TAAA-TGC---ATAGT---GC--T-AT--A--GA--TTATG--T--CAGGT-T-TCAGT-TTTT-------------GG-TTTT--------AAG-TTAATG--G----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TAA---T-------------------------A-T--TT-G------T---A--CCTGAAC-AAAATGAAAga
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGT-C-ATTTT----T-C-------A-AT-GC---A------T---TAT-GC----------GA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----AATTCC--AA-TGCTAG---ACT-------AG-T-A----TT----A-----TTTAT-A--T---ATTA--T----------TTA--------A---T--AT--T---A-T--AT------AT-TAC----T--AT-TTA-AT------TN--N-NN----------NN-N-N-N-N--------------N---NN---NN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NNNN-NNNN-N----N-N--N-N-NN------NN-----NN-NNN--N-NN-N--NN--N---N------N----T----CAT-----G---T-----T--AACTTTA-C-----CA--TA-C-----TTT-AA-T---TAA---T--A------TAAT-TGT---ATAGT---GC--C-AT--A--AA--TTATG--T--CAAGT-T-TCATT-TTGT-------------CA-TTTT--------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-C--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTA-CAG----TCTTTAGGCA---T----GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATTTAA--CCATGT------T---TTTAATATAT-T-TCA--TGGTTATGCCCCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AA-AATTT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--T-AG---AGGTGCTACCAATA-ATAA-TT-AT-GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCTTGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAAATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAATT---G--TCTGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TA--AAA---AAAAGCTG-TAAAGT-------TT-----TT----AG-CC---AGCAAAGC-AAGGGA--AG----TT-TCATG-ACGACC-A-----T-GTCTTGAAACAGGATGATTTGGCAGTTTTTGTTTGT-CAATTGGGGAAA---A-TT---TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--T-C-TAGTCT----T---GTT--TTAAA-A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAATCATGT-C-ATTTT----T-C-------A-AT-GC------A---T---TAT-GC----------AA--C-AAT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttaataagtatattgttaattgcaactcacacaggagtgaaaaactctagacttaagattgttatacagaatgcttctggccctaaataggccagtctaaaaatactttatgttctgctttaatacaatgctattttgattatgctgcttcttcatggtatagtggtattggcaaacaatttcaacatagattgcaagttacacaaaataaagttgttagatttattctaaatctaggtcctagaaccagtatttct---TCC-------CG-T-A----TCCTCGA-----T-----A--ATT-ATTG--T----------TTA--------A---T--AT--TAC-A-T--AT----T-AC-TAT----T--A------AT------TA--T-TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GT---TN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NNNN-NNNN-N----N-N--N-N-NN------NN-----NN-NNN--N-CA-T--TAATT---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A-------C-----CA--TA-C-----TTT-AA-T---TAA---T--T-----ACAAT-TGC---ATAGT---GC--C-AT--A--GA--ATATG--T--CAAGT-T-T-ATT-TTGT-------------GA-TTTTA-------AAGTTTTATG--A----TC--CTGAGAC--AT--TTGTTG-TAA---T-------------------------A-T--TTAC------T---AGTCC--AGT-AAAATGAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttctttctcatttcattttattca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                         tgcaactctttactttctcagattgtctgagatttgtaacacatgtaTT-GTGC------ATCAAACTAT-A-T-ACTGA--GT-AAAAATAAGAC--T-AG---AAGTTCTACTTGTA-AT---TT-T--TTCATA-CCTAAAG-AT-AAAT-AAAAAA-AAACCCT--TGTTTATACATTGTA-TTAC-AAATT-CATT--AAAGATTaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A--A------AG-AT----------TT--TTA---AAAGGCTGT-AAAGTCGC----TA-----CT----AT-CC---ATCAAAGC-AAGAAA--AG----TC-ACATG-AAG-TC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGCTAAT-A--T-----------T-TT---TTA--T-T---------A--T-C-----AAAT--T-C-CA------------GTT--TT----ATATT------TT-----AAAG--T-----A---------TGTCCGAAACATGT-C-CTTTTTG--T-C-------A-AT-GT------A---T---TAT-GC----------AA--C-TAtttaaaaggctgtaaagtcgctactatccatcaaagcaagaaaagtcacatgaagtcatgtccagttttgctaatattttttattatcaaattccagttttatattttaaagtatgtccgaaacatgtcctttttgtcaatgtattatgcaactacatgtattacaagtatttaaagcatgcc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttgtgcatcaaactatatactgagtaaaaataagactagaagttctacttgtaattttttcatacctaaagataaataaaaaaaaacccttgtttatacattgtattacaaattcatt--------AA--T--AT--T---A-T--AT------AT-TAC----T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GT---NN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NNNN-NNNN-N----N-N--N-N-NN------NN-----NN-NNN--N-NN-N--NN--N---N------NNNNGT----CAT-----G---T-----T--A----A--C-----CA--TA-C-----TCT-AA-T---TAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GT--C-AT--A--GA--TTATG--T--CAAGT-T-TCATT-TTGT--------------A-TTTT--------AAGTTT-ATC--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATcatgtattacaagtatttaaagcatgcc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtgtatcacatgtacTCC--AA-TTCTAG---TTA-------TG-T-A----TT----G-----T-------------TTA--T----------T-----------G--T--TT--T-T-G-T--CT----G-TT-CAT----C--ATATTA-AG------CA--T-CT----------AA-T-T-A-T--------------A---------A---GGACTTCATTGCA-AA--G-GA-GCCA--AT-GTCA----GCTT-C----AGT-GGGT-TACC-C----T-TC-A-G-TT------AT-----CA--TA--T-TA-T--AA--T---A------T----T----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----TA--T--TCCA--TTT-AT-TCTTTGT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GC--T-AT--A--TT--TTGTG--C--CAGGT-T-TCAAT-TTGC-------------AA-CTTT--------AAA-TTTACA--A----TC--AC--TAC--TT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-tgt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --A-G-TT------AT-----CA--TG--T-CA-T--TA--TGTCA------T---GTTATCCAT-----G---T-----T--A----T--T-----CA--TT-C-----TTT-AG-T---TGT---T--A-----A-AAC-TGC---ATGGT---GC--T-AT--ATAGA--TTATG--T--CAGGT-T-TCAAT-TTGT-------------GA-CTTT--------AAG--TTGCG--A----TC--AT--AGC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TGC----T------CCCGAAT-AAAATAAAATGAat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acctgctcattatattcattatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnca--C-----CA--TT-C-----TTT-AA-T---TAA---T--A------TAAT-TGC---ATAGT----C--C-AT--A--TA--TTATG--T--CAAGT-T-TCAGT-TTGT-------------CA-TTTC--------AA----TATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A----TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tatatattactatttaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--------------A---AT---AA---GGACCATATTG-G-AAA-C-AA-TCTG--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GTAT-TATT-C----C-T--A-T-TTTATTGAATCAGTATA-ATA--T-GA-T--TA--T---A------T---TT----TATTTCCTG---T-----T--A----T--C-----GA--T--C-----TTC-AG-T---TAT---C--A------TAAT-TGT---ATAGT---GT--T-AC--T--TA--TCATG--T--CAGGT-T-TCAAT-TTGT-------------TA-TTCT--------AAG-TTTATG--T----TC--AT--AAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TG-----C---A--CATGAAT-AAAATGAAATG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aCTCATTA-G-AA--A-AAAGCTATAAT-TTCA----GCTT-TAATTTAT-GGGT-AATC-C----T-T--A-G---------AT-----TT-ATA--T-AA------------A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--TT-C-----TTT-GA-T---TGT---T--A--------------------------------C--A--GA--TTATG--T--AATTT-T-TCAAT-TTGT-------------GA-TTTT--------AA-CTTCATG--A----TC--AT--GTCCTAT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TA-----C---A--CCTGAAT-GAAATAGAATGA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tttttgcctgttcatcatatttttcatgcaggT------TA--A-TT----------AT-C-T-G-T--------------A---GT---AA---G-ACCCCATTG-A-AA--T-AA-ACTG--ATATTCA----GCTT-T----TAT-GGGT--ATC-C----T-T--A-G-GT------TT-----TA--TA--T-CA-T---A------A------T---GT----CAT-----G---TAAACTT--A----A--C-----CA--TT-C-----TTT-AA-T---TAA---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GC--C-AT--A--TA--TTATG--T--CAG-T-T-TCAGT-TTGT-------------CA-TTTC--------AA----TATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGAa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atG-TT----------TT--AAA---ACA-GCTGT-AAATTCG-----TT-----TT----AG-CC---AGTAAAGC-AAGAGA--AG----CA-TCATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAAT-A--CT------ATTTT-TT---TTA--T-T------A-AAT-T-T-----AAAT--C-T-TAT-------T---CTTACCT----A----------TTAAATGA-----T-----A---------TGCACGAAATATGC-A-ATTTT----T-C-------A-AT-GC------A---T---TAT-GC----------AA--C-TATT--T-AATTAAAAAAA-------A-CCT--GC-CA-A--A----A-TTCC--AA-TATTAG---TC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                            TGTGACTTTTTA-AATAAATTCTTTGGGCAAGCTAGT-ATTAAAC-GTTGA-TAACA-GAGCTACTCCATTA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtgtttgcaagcaacttattgcaagtaacccaaacaatgtcgaatgttcatatttattctaaatcaaggccctaaatagacccaacatttttaaaTTT-T------CG-GTGC-AATGT-CAAA--AAGGATCGA-AATACCT---AGCGT-TT--AG-AAGC--A-A---------------AACCGC----G--ACAGC-AAA---GTC--G------AG-T----------------------AAAGTTTTCA------------------CT----AG-CC---AGTAAGGC-A-TGGA--TA----TT-ACATG-A------A-----T-GTC------CAG--------------TTTTACAAGTAC--TT------A---T-TT---ATT--T-T------A-AAGAT-A-----AAAT--A-T-TAG-------C---CCT--TT----A----------TTTTAATA-----T-----G---------TGTTTGAAACATAT-C-CTTTT----T---------A-AC-GC---A------T---TAT-GC----------AA--C-TATTACT-CAC-------A-------A-CCT--GC-CA-A--A----A-TTTC--AA-TGTTAG---TCT-------TG-T-A----TT----A-----T-----T--T---ATTA--T----------TT-------------T---T--T-C-C-T--GT----T-A---AT----C--AC-ATGTAA------TA--T-AC----------A-----------------------A---GC---TA---GGACTCCA---------------------AT-TTCA----GCCC-T----GA---GGT-TATCACAATAT-T--A---TC------AT-----TA-ATAAGT-CG-C--T--------------T---TC----CAT-----G---T-----T--A----C--T-----TAATT--CT----TTT-AA-T---TGT---C--A-----A-AAT-TG---CACAGT---GG--T-AC--A--CA--TTATA--T--CCGCT-T-TCCTT-TTGT-------------TA-TTTT--------GAA-TCCACA--A----TC--AT--GAC--AT--T--CCT-TGA---A-------------------------A-T--TT-T------catattaaagattaagacatgtttgatttcaaatactatatatatcgagcattaaccagttaatactaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaccacccgtaagattttttttcggtgcaatgtcaaaaaggatcgaaatacctagcgtttagaagcaaaaccgcgacagcaaagtcgagtaaagttttcactagccagtaaggcatggatattacatgaatgtccagttttacaagtacttatttattttaaagataaaatattagccctttattttaatatgtgtttgaaacatatcctttttaacgcattatgcaactattactcacaacctgccaaaatttcaatgttagtcttgtattatttattattttttcctgttaatcacatgtaatatacaagctaggactccaatttcagccctgaggttatcacaatattatcattaataagtcgctttccatgttacttaattcttttaattgtcaaaattgcacagtggtacacattatatccgctttccttttgttattttgaatccacaatcatgacattccttgaaattttcc
gi|30                         : gtgtttgcaagcaacttattgcaagtaacccaaacaatgtcgaatgttcatatttattctaaatcaaggccctaaatagacccaacatttttaaatgtgactttttaaataaattctttgggcaagctagtattaaacgttgataacagagctactccattacatattaaagattaagacatgtttgatttcaaatactatatatatcgagcattaaccagttaatactaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaccacccgtaagatttt------T---CTTAATATAT-T-TCA--TGGTTATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-C-ACTTA--AG-AAAAATAATACCGT-ACTAGAGGTGCTACCAACA-GTAA-TTAT--GTCATA-CAC-AAG-ATAAAAA-GGCAAA-GAATCCTCATG--T-T------TA-TTAT-AATGC-CACT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TTAGC-cc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccatggTG-T-AA--T-AA-AC----AT-ATCC----G--T-T----GAT-GGGT-TATC-C----T-T--A-GGTT------AT-----TA------T-CA-----A--T---A------T---GT----CGT-----G---T-----T--A----T--T-----CA--TT-C-----TTT-GA-T---TGT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GC--T-GT--A--GA--TTATG--C--TAGGT-T-TCAAT-GCGT-------------GA-TTTT--------AAG-TTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TTA---T-------------------------A-T--TT-TA-----T---A--CCTGAATAAAAATGAAAT
gi|32                         :                                                                                                                                                                      aatatacctttgttatcatgaaTGTGAAAGTTTA-G-C----TCTTTGGGAA---T----GTTA-GA-GTTGA-T-ACA-GAGCCACTCAATTAAG------------------------TTTAATATAT-T-TCA--TGGCAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AA-AATTT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--T-AG---AGGTGCTA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acataaaataaagtgattagattattctaaacctaggtcctagaaccagtatttctCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAAATTGG-AATACTAAAATGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTG-TAAAGTCGT----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGT--AG----TT-TCATG-ATG-CC-A-----T-ATC------CAG--------------TTTTGTTGATAT--TT------A---T-TT---TTA--T-T------A-AA--T-C-----AAAT--C-C-TAG-------
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T------TA--T-TT----------AT-T-TTA-T--------------AAACGT---GA---G--CATCATTA-C-AA--T----TCTT---T-TTCA------TT-T----CAT-AT-T-TATC-C----T-T--AAG-TT------AT-----TA--TA--T-CA-T----------------------------AT-----A---T-----T--A----T--C-----TT--T--T-----TTT-AAAT---TAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GC--T-AT--A--GA--T-ATG--T--CAGGT-T-TC-------------------------------------AGTTTTATG--A----TC--AT--GAC--AC--T--CTG-TGG---T-------------------------A-T--TT-TA-----T---G--TCTGAAT-AAAATGAAATGtcttac
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tacat-----TTT-AA-T---TTC---TTAA-----ATAAT-TGC----TAGT---GC--C-AT--A--GA--TTATGCGT--CAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAG-TTTATG--A----TCCTCT--GA---AT--T--GGGCTGATTTT-------------------------T-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAATCGAAATGA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtgttattcttttaaatactttttaagttcttgtttatctgttgttgcaagtatggtgactATTG-G-AAA-T-AA-GCTG--AT-TTTAAATAGCTA-T----TAT-GGAT-TATC-C----T-T--A-GGTT------AT-----TG--TA--T-CA-T--TA--T---ACATGTAT---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--CTG---CA-----C-----TTT-AG-T---TAT---T--A-----A-AAT-TGC---ATATT---GC--C-AT--A--GA--TTATA--T--CAAGT-T-CCAGT-TT-T-------------G-----------------------G--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTa
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtgtgaaattt-ATA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----A--CTTAATCA--TA-C-----TTT-AA-G---TAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GC--C-AT--A--GC--TTATG--C--CAAGT-T-TCATT-TTGTCATTTCAAATTTTAA-TTTT--------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATct
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -------A-CCT--GC-C--C--ACAGTA-TCTCTTAA-TA-TA----TCT-------TA-T-A----TC----AGTAAGT-----AT-A---ATTAGTT----------TTG--------TA--T--AG--T---A-T--AT------AT-CAT----T--AT-TTG-AT------TG--T-TT----------AT-T-T-G-TGGAAGTACAGTTGTA---GT---AA---GTAACCCATTG-G-AA--------CTG--AC-TTCA----GCTT-T----TGT--GGT-TATT-C----T-T--AGG-TT------A
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---GC----CAC-----G---T-----A--A----T--C-----CA--TT-C-----TTT-AA-T---TAT---T--GTT---ATAAT-TGC---ATGGT---CC--T-AT--A--TA--TTATG--T--CAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAG-TTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--A--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TA-----C---A--CCTGAAT-AAAATGAAATG
gi|4                          :                                                                                                                                                                         cagacacatttccacacagTGTGATATTTCA-GAC----TCTTTGA-CA---T--T-GCAAAAA-GTTGA-TGACA-GAGCTAATCAATTAAGATT-GAACC----T------TAT-TTTAATATAT-T-T-A--TGTTAAAGCACCG--CACT-ATTTTT-GTG-------AT-CAATT-C-G-T-ACTAA--AT-AATGATAATGC--TTG----AAGTGCTACCAACA-ATA---T-T--GTTATA-GGT-AGG-AT-AAAA-TAAAAA-TAATC------TTT-T------TG-ATAA-AAT----ATT--AAGAAT------TACTT--------------------------------------------------G--TCAGC-AAA---GCA--A------AG-TT----------TG--AAA---AAAAGCTGT-AAAGTCGT----TA-----TT----AG-CCTCTAGTA---C-TTTGGA--AG----TC-GCATG-ACG-TC-A-----A-GTC------CAG--------------TTTTGGTACTTC--TT------A---C-TT---T-A--C-T------C-TA--T-C-----AAAT--C-G-TAG-------TTATATT--TT----A----------AA-----A-----T-----A---------TGTGCGAGCCATGA-C-ATTTG----T-C-------A-AT-GC---ATTA---TACATGT-AC----------AA--C-TATT--T--GT----CAAA-------T-CCT--GC-TT-A--A----A-CTAG--AA-TGCTA-----------------T-A----CT----A-----------A--T---CTTG--T----------TT-------------T--AT--T-C-AAT--GT----T--C-TGT----C--TG-TTG-AT------CACAT-TC----------AC-TAT-G-T--------------A---ATCATAA---GAACCCTATTG-G-AAA-T-AA-GCTA--AA-TTCA----GCTT-T----TTTTAAGT-TATT-C----T-A--A-GGTT------AT-----TA--TA--T-CT-T--TA--C---A------T---GT----CAT-----G---A-----T--A----T--C-----CA--T------------AA-T---AATA--T--A-----ATTAT-GGCTGCATAGT---GC--T-AC--A--GA--TTATA--T--CATGT-T-TCAAT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAA-TTCATA--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTC-TGA---T-------------------------A-T--TT-TA-----C---A--CTTGAAT-AAAATAA
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acagcaaagttgtgagatttattctatatctatgtcgtagagtaagtgtttctA-GGCAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAAATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ATA--A------AG-TT----------TT---AA---AAAATCTG-TGAAGTCGT----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-gcc
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcaaaatgtagctgtTA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----GATAT-----G--A----T--C-----CA--TT-C-----TTT-AA-T---TAT---C--------ATAAT-TGCA-TATAGT---GT--C-TT--A--GA--TTATG--T--CAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TTTT--------AGGTTTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--AACT-TAAC-----CA--TA-C-----TTT-AA-T---TAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GC--C-AT--A--GA--TTATG--T--CAAGT-T-TCATT-TTGT-------------CA-TTTT--------AAGTTT-ATT--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTAAAT-AAAATGAAATGA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --A----T--C-----CA--TT-C-----TTT-AA-T---TACATGT--ATT---GTAAT-TACA-TATACT---GC--T-AT--ATAGA--TCATG--T--CAGAT-T-TCAGT-ATGT-------------GA-TTT---------AAGTTT-AGG--A----TC--AT--GAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TTACTACT---A--CCTGAAT-AAGATGAAATGA
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taGAGA--AG----TC-ACATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTTTTAATAC--AT------A---T-TT---TTA--G-T----------------------------C-TTC-------C---ATT--TT----A----------AG-----A-----T-----T---------TGTCCGAATTATAT-A-ATTTT----T-C-------A-AT-GC---A------T---TAT-AC----------AA--C-TATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GCAA--A--A----A-TTCC--TA-TACT
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -ATA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CAT-T--C-----TTT-AA-T---TGT---T--ATACATGTAAT-TG---CAGAGT---GC--T-AT--G--GA--TTGTG--T--CAGGT-T-TC-------------------------------------AGTTTTGTG--A----TT--AT--GAC--AT--T--TTG-TGA---T-------------------------A-G--TT-TA-----C---A--CTTGAAT-GAAATGGAATGA
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            t--T--C-----TTT-AAAT---TATG--T--ATGTGTATAATCTGA--CATGGT---CC--T-AT--AT-AA--TTATG--T--CAGGT-TATCATGGTTGTT------------GA-TTTT--------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--A--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-A------TAACA--CCTGAAT-AAAATGAAATG
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       catTTT----T-T-------A-AT-GT---A------T---TAT-GC----------AA--C-GATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----AGTTTC--AA-TACTAG---TCT-------TG-C-A----TT----A-----T-----A--A---ATCA--T----------TTA--------AAATT--AT--T-TAA-T--ATTACAT-AT-TAT----T--AT-TT
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcctgctgtatccccagagagagaA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--TA----TCT-AA-T---AAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GC--C-AT--A--GA--TTATG--T--CAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TTTT--------ATG-TTTATG--------------------AT--T--CTG----------------------------------------------------A--CCTAAAT-AAAATAAAATG
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aa-----T--A----A--C-----CA--TA-C-----TTT-GG-T---TAT---T--A------TAAT-TGC---ATAGT---GT--C-AT--A--GA--TTATG--T--CGGGT-T-TCATT-TTGT-------------GG-TTTT--------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--GAC--AA--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------TT--A--CCTGAAT-AAAATGAga
gi|5                          :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTA-CAC----GCTTTATGCA---T----GTTAAGA-GTTAA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATT-G---------------T---TTTGATATAT-T-TCA--TGATAATGAACCA--AGCT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATC-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC----A----AGGT-CTACCAATA-ATA--TT-A--GTCATA-CAC-AAG-AT-CAA--GGCAA--GAATCCTCATGATT-G------TAATTAT-AATGT-CATT--AA-GATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------A-CAGTT---G--TCAGC-AAA---ACG--A------AG-TT----------TA--AAA---AAAGGCTGTTAAAGTCGA----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-TCATG-ATG-CC-A-----T-ATC------TAG--------------TTTTGTTGAT-C--TT------A---T-TT---TTA--T-T------G-AA--T-T-----AAAT--G-C-TAG-----------GTT--CT----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAACATTT-C-ATTTT----TTC-------A-ATAGC---A--A---T---TAT-GC----------AA--C-CATT--T-TAT----AAAA-------G-TCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AG-CACTAG---TCT-------CG-T-A----TC----A-----T-----A--A---ATTA--T----------CCA--------AA--T--AT--T-T-A-T--AT----T-AT-TAT----T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------AT-T-T-G-C--------------A---GT---AA---GGATCCCATTG-G-AA--T-AATTCTG--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TATC-T----T-T--A-G-TT------AT-----TA-ATA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--A-----TTT-AA-T---TAT---T--A-----ATAAT-TGC--CATAGT---GC--C-AT--A---A--TTATG--T---AGGTGT-TCAGT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAGTTATATC--A----T----T--GAC--AT--TG-ATG-TGA---TCATTATGATCATGACATTATGTGATA-T--TT-T------T---A--CGTGAAT-AAAATTAAATAAcga
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --CATAGT---GC--T---------------TG--T--CAGGT-T-TCAAT-TTGT-------------GA-TTTC--------AAG-TTTACG--ATCATTC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-G--TT-TA-----C---A--CCTGAAT-TGAATGAA
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cccattattttaaaatgctggatatgATA-T---GC--C-AT--A--GA--TTATG--T--CAAGT-T-TCATT-TTGT-------------AATTTTT--------AAG-TTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AGAATGAAATGAgg
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttttcagcaacatgtttaatAAAATAATAC--T-AT---ATGTGCTTCCAATA-ATAA-TT-AATGTCATA-CCC-AAG-AT-CAAAAGGTAAAAGAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGCTTATT--AAAGATT-G-AATACTa
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               g-CC---AGCAAGGC-ATGGGG--AG----TC-ACATACACG-CC-A-----T-AGA------CAG--------------TTT--------------------------------A--T-T------ATAA--T-T-----CAAT--C-T-TAT-------T---ATT--TT----A----------AA-----A-----T-----A---------TGTTCGAAACTTGT-C-ATTTT----T-CTAAG---A-AT-GC---A--A---c
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAATAATAC--T-AT---ATGTGCTTCCAATA-ATAA-TT-AT-GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGTAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATACTc
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                g-ATA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----TAATT--C-----TTT-AA-T---TAA---T--------ATAAT-TG---CAT--T---GT--C-AT--
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          t-AT--A--GA--TTATG--T--CAGGT-T-TCAGT-TTTT-------------GA-TTTT--------AAGTTT-ATG--A----TC--AT--TAG--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---G--CCTGAAT-AAAATGAAATGAtcattgtaacaatcacccaacttagtaagagactatgatc
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agAAT-TGC---ATAGT---GC--T-G---A--GA--CTATG--CGACATAT-T-CCAAT-CC------------------TTTT--------AA-TTTTAT---A----TT--------C--AT--T--TTA-TGC---C-------------------------A-T--TT-TA-----T---A--CCAAAAT-AAAA
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcCATG-ACA-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTGA------T------A---T-TTAAAAAA--T-C------A-AA--T-C-----AAAT--C-T-TAA-------T---GTC--TT----
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                               ----T------T---TTCAATATAT-TGTCA--TGGTAATACACCCCTAACT-ACCTTTTGTG-------A--AAATT-A-AATGACTAA--AT-AAAAATAATAC--T-A----GGGTGCCACCAATATACAA-TA-T--GTCA-A-CCC-AAGTAT--AAA-GGCAAA-GAAT-CTCATG-TT-T------TA-TTAT-AATGC-C-TT---AAGATT-G-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-AC--------------AACGTTT---G--TCTGC-CAA---ACAAGA------GG-TT----------TT--AAA---AAAAACCCTTAAAGTCAT----TT-----TTTATAGG-CCA--AGCA--GC-AAGGGATCGT----TT-TCATG-A-G-CC-A-----TAATC------GAA--------------TTTTTGTGATAC--TT------A-----TT---TTG--T-T------T-AA--T-T-----AAAT---------------------TT--TTATA-A----------TT-----A-----T-----A---------AGCTCGAAACA-GT---ATTTT----T-C-------A-AT-GC------A---T---TAT-GC----------AA--C-A--C--T-CAT----AAAC-------A-TCT--GC-C--A--A----A-TTCC--A---AGTAG---TCT-------CG-C-A----TT----A-----T-----A--------TA--T----------TT---------AA--T--A---T-C-A-T--A-----T-AT-TAC----T--CT-TT--AT------TA--T-TCA---------AT-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GGAATTCATTG-G-AA--T-AA-GATG--AG-GTCA----GC-T-G----TAT-GGGT-TATC-C----T-T--A-G-TT------AT-----T--ATA--C-AA-T--T---T---A------TG--GT----CAT-----G---T-----T--A-------A-----CA--TAAC-----TTT-AA-C---T-T---T--------ATAAT-TG---CATAGT---GC--C-AT--A--GA---TATG-----CAAGT-T-TTATT-ATGT-------------AA--TTT--------AAG-TTTATG--A----TC--AT--GAC--ATTGT--CT--TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTAAAT-AAATTGAAATGA
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaccatgG--A----TT--AT--GAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TC-----C---A--CCTGAAT-GAAA
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---TTT-----------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAattttaagacatgaa
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---TTT-----------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAtg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GG-AATACTT---TGC------------------A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--G------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTG-TAAAGTC-T----TC-----TT----AC-CC---AGCCAGGC-TAGGGA--AG----TTGTCATG-ACG-CCAA-----T-ATC------AAG--------------TTT-----GT-C--TT------A---CGTT---TTA----A------A-AA--T-T-----Atg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTTGAAACATGT-C-ATTTT----T-C-------A-AT-GC------A---T---TAT-GCA---------AA--C-CATT--T-CAT----CACA-------A-CCT--GC-C-----A----A-TTCC--AA-TACTAG---TGT-------CG-C-A----TT----A-----T-----A--A---ATTA--T----------TT---------AA--T--AT--T-T-A-T--ATATA-T-AT-TAT----T--GT-TTG-AT------TA--T-TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GN---NN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NGA--CA-------------G-G-TT----------------ATA--T-CA-TTATA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CAT-T--C-----TTT-AA-T---TAT---T--------ATAAG-TG---CACAGT---GC--C-AT--A--TAACTTATG--T--CAAGT-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAG-ATTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------ATT--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGAtagagaacagaagaacagaatgtttatttctaatcagagtccaaaacagacaaagtgagttcataacaacattagaagattatatgcttgaaacatgtcatttttcaatgcattatgcaaaccatttcatcacaacctgccaattccaatactagtgtcgcattataaattatttaatatttatatatatattattgtttgattatttatttgtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaggttatatcattatatatgtcatgttatccattctttaattattataagtgcacagtgccatataacttatgtcaagtttcagtttgtgattttaagattatgatcatgacattctgtgatattttttacctgaataaaatgaaatga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                             ggaatactttgcaaacagttgtcagcaaaacagagttttaaaaaaagctgtaaagtcttcttacccagccaggctagggaagttgtcatgacgccaatatcaagtttgtcttacgttttaaaaattatagagaacagaagaacagaatgtttatttctaatcagagtccaaaacagacaaagtgagttcataacaacattagaag--GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGCAAG-GAATCTTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAA-------------C---TGCCA-TT--A--AAAT--G-G---------------AATAGTTTTAG--CCACC-AAA---GCA--A------GG-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatGCCATTAAAATGGAATAGTT-----TT----AG-CC---ACCAAAGC-AAGGGA--A------T-TCAT--ACG-CC-A-----T--------------------------------TTGATGC--TT------A---T-TT-----A--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAGTCTA---C---GTTG-TT----AAAA-------TC-----A-----T-----A---------TGCTT-AAACCTGT-C-ATTTT------C-------A-AT-GC---A--A---T-------GC----------AA--C-AATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-ATCC---A-TGCTAT---TCT--------------------------------------A---ATTA--T----------T----------AG--T--AT--T-T-T-T--AA----T-ATATAT----T--AC-T---AT------TA----AT----------AT-T-N-N-N--------------N---NN---NN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NNNN-N----NNN-NNNN-NNNN-N----N-N--N-N-NN------NN-----NN-AT------------------------------GT----CAT-----G---T-----T--A----A--C-----TA--C--CATACGTTA-AA-T---TATA--T--A-----TTAA--TG---CATA-T---TC--C-ATGAA--AA--TCAT---T--CAAGT-T---AAT-TAGT-------------CA--TTT--------AA--TTGATG--A----TC--A---GAC--AT--T--CTG-T-A---T-------------------------A----TT-T------G---A--CCTGAAT--AAAT-AAATGgaattcatacgccatttgatgcttatttattaaattaaatcctagtctacgttgttaaaatcatatgcttaaacctgtcattttcaatgcaatgcaacaatttcataaaaacctgccaaaatccatgctattctaattattagtatttttaatatatattactattaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtcatgttaactaccatacgttaaattatatattaatgcatattccatgaaaatcattcaagttaattagtcatttaattgatgatcagacattctgtatatttgacctgaataaataaatg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aatgtcatacccaagatcaaaggcaaggaatcttcatgtttttattataatgccattaaactCTGT-AAAGTCCA----TA-----TT----AG-CC---AGTAAGAC-AATGGA--TA----TT-ACATG-ATA-CC-A-----T-GTG------CAG--------------TGTTGTCAAT-TA-TT------A---T-AT---TTA--CAC------A-AA--T---------AT-------AG-------C---CTT--CT----A----------TT-----A-----TGAAATA---------TGTTTGAAACTTAT-A-ATTTT----T-CGACGCAAA-AT-GC---A--ATATT---CAT-TC----------AAAAC-C-TT--T-CA------AAACTCTTGTA-TTT--GC-T--ATTA----G-TTGT-----TGTTTG---TCTGTTTTTTCA-T-ACTTCTT----A-----T-----GT-A---ATTA--TAGGGATCCCATTG--------AA--C--AT--T-TTA-T--AT----C-AT-TGTATGCC--AT-GTT-ATCCATCATA--C-TT----------ATCT-T-G-T--------------A---AT---TA---------CA--A-G-AA--T------TA--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TACC-C----T-T--A-G-CT-----------------TA--T-CA----TA--T---C------T----T----CAT-----T---C-----T--A----T--------CA--T--T-----TTT-----------------------ACAAT-TG---CATAGT---ACTAT-AT--A--GA--TTATG--T--CTGGT-T-TCAAT-TTGT-------------CA-TT------------------TG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTC-TAA---T-------------------------


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                        AATAAAT           AGC AGT        .     .     .                   GAACCTTGTT                     A G   .              CT    .      T   TCTTAGT TC     AT  A G     .   A           CG T CTAG              T   AT  AAT       .   A   T  AA   A      T           T  A ACATTG  A    A     T    .          .       AAA     G  AG  .    TTAC CTTATGCAATATCAT       TTA .      A   .     AG GAGTTG  .  TTCCA            AAC        TA     GGAATAG  ATCAA  TATA  .  TCT        .      TC  .     GT    C   A  A .     A   TTGAAA   GATGATTTGGCAGT        GTCAATTGGGGAAAA       AAA   TTAT           GA T          CCC     GTCTTTGACGTTTTTAAAATT                     AAAAT GAAAT .                      . .     TCGACGCAA      T  A  TCGAA      ACA   .  CATTTTCCTG  AA A    AC T   TAAA    CTCTTGT .   TG  A A  TT CAGT C    TTAA       CAC   GTTTTTT  C G CTTC  CTCG GTAAG TTATTAAT        GT AGGGATCCCATTGAA           GC  TA AT  A TC  TACAT   A   ATGC TA  A   T  CCATCA  CAT   GTGAAAGTAT  C A T . GGAAGTACAGTTGT AAC  CAT  TTGAG         GA   ATTAAG   T TA  A    AATA    C AATT   T    G    A AATA A C  A TTTATTGAATCAGTATAA    AG T  . TA  AT GTC CATGTA NNN  TATC   TTCCT ATA AAACT AA AACTAA  TTAAT  CCATACG       .  A CTT   ATG ATACATG      C  CTGC     GGG  TA .  GA TA  TT     CG GA     G A   T G    CATTTCAAATTTTA T    TTTTAAAA   T  T   AT TCAT  CT  GA   CT  TG TG   C   TTT CATTATGATCATGACATTATGTGAT T TC  A TACTAC AAC GT       A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                        GAT               .   TT         .     .     .                   TAACCATGTT                     . .   .              .     .      .   C       T      T   . .     .   .           .  . G                 .   A   AT        .   .   .  A    .      A           T  . .       .    .     .    .          .       .       .  .   .    A    C                     .   .      .   .     .  .       .  TTT              .          TC     AGA      .      .     .  A          .      .   .     A     .   .  . .     .   .        .                     ATACTATTTT            .     CACA           T  T          TGA     GTCTTGACGTTTTTAAAATT                      AAG   .     .                      . .     AAAATC         .  .  AATAT      .     .  A           .  A    .  T   .       .       .   .   . A  .  .    A    AAA        .     C        . . .     .    .     TTATATA         .  TTACTTTATTTAA             .   .  AC  . .   ATAT    .   .    G   .   .  .       TC    A           . . . . T              .    .    NN            CA   TTAAG    N .   .    .       . .      .    .    . .    . .  G TTATTAGA              .  .  . .   .  .   .      G    .      .     .   .     .  ACTTTA  TG     TTCCA         .  A .     A   ATGTGTA      .  CAT      .    .  .  .  TA  AC     .  .      . .   T .    TG             .    TTAA       T  T   .  .     .   .    .   .  G    C   .   TT                        T .   . GC     T   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                        GAC               .   T          .     .     .                   GAATCATAT                      . .   .              .     .      .   .       T      T   . .     .   .           .  . G                 .   A   AT        .   .   .  C    .      .           T  . .       .    .     .    .          .       .       .  .   .    A    .                     .   .      .   .     .  .       .  TAA              .          TT     CGT      .      .     .  .          .      .   .     T     .   .  . .     .   .        .                     ATACATAT              .     TTT            .  T          CC      CGTTGTTACTTCGCCATTTT                      .     .     .                      . .     TCTAAG         .  .  ATTA       .     .  .           .  C    .  .   .       .       .   .   . A  .  .    A    AA         .     .        . . .     .    .     TATTTA          .  TTAAAAT                   .   .  TA  . .   TA      .   .    .   .   .  .       T     A           . . . . .              .    .    AG            G    ACAAT    T .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . NNNNNNTA              .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  ACTTAA  .      ATTCT         .  . .     G   TAAA         .  CAT      .    .  .  .  T   .      .  .      . .   G .    T              .    A          T  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   TT                        . .   . G      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                        CAG               .   .          .     .     .                   GAACCTTAT                      . .   .              .     .      .   .       A      T   . .     .   .           .  . G                 .   A   AT        .   .   .  C    .      .           T  . .       .    .     .    .          .       .       .  .   .    A    .                     .   .      .   .     .  .       .  TTT              .          TT     CGC      .      .     .  .          .      .   .     A     .   .  . .     .   .        .                     GTACTTAT              .     TCA            .  T          CC      GTCTTACATTTTAAAATT                        .     .     .                      . .     TGTC           .  .  AA         .     .  .           .  A    .  .   .       .       .   .   . A  .  .    G    AG         .     .        . . .     .    .     ATTTA           .  GTACA                     .   .  TT  . .   T       .   .    .   .   .  .       T     .           . . . . .              .    .    GT            A    AAAAG    T .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . GTTATAA               .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  TA      .      TTAC          .  . .     A   GTTA         .  AC       .    .  .  .  .   .      .  .      . .   T .    C              .    .          T  A   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . A      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                        GAC               .   .          .     .     .                   GT                             . .   .              .     .      .   .       T      T   . .     .   .           .  . G                 .   A   T         .   .   .  A    .      .           T  . .       .    .     .    .          .       .       .  .   .    A    .                     .   .      .   .     .  .       .  TTA              .          TT     CGC      .      .     .  .          .      .   .     T     .   .  . .     .   .        .                     ATATTTAT              .     TTA            .  T          CC      GTCTACGTTGTTAAAATC                        .     .     .                      . .     CGC            .  .  AA         .     .  .           .  T    .  .   .       .       .   .   . T  .  .    .    AA         .     .        . . .     .    .     AATTA           .  TTGTA                     .   .  T   . .   T       .   .    .   .   .  .       T     .           . . . . .              .    .    GA            N    ATAAG    N .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . GTTATTT               .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TTAC          .  . .     .   ATTG         .  CC       .    .  .  .  .   .      .  .      . .   G .    G              .    .          C  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . A      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                        CAC               .   .          .     .     .                   .                              . .   .              .     .      .   .       A      C   . .     .   .           .  . T                 .   A   T         .   .   .  A    .      .           T  . .       .    .     .    .          .       .       .  .   .    A    .                     .   .      .   .     .  .       .  TTA              .          T      CGT      .      .     .  .          .      .   .     A     .   .  . .     .   .        .                     CTTCTTAC              .     TTA            .  T          TC      GCCCTACGTTTCAATTC                         .     .     .                      . .     TTC            .  .  AA         .     .  .           .  A    .  .   .       .       .   .   . .  .  .    .    GA         .     .        . . .     .    .     ATAA            .  CCAAA                     .   .  T   . .   T       .   .    .   .   .  .       T     .           . . . . .              .    .    NN            N    ATAAG    N .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . NNNNNNN               .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      ATTC          .  . .     .   TA           .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   T .    G              .    .          T  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . A      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                        GC                .   .          .     .     .                                                  . .   .              .     .      .   .       T      T   . .     .   .           .  . T                 .   .   T         .   .   .  C    .      .           A  . .       .    .     .    .          .       .       .  .   .    A    .                     .   .      .   .     .  .       .  TGA              .          T      CGT      .      .     .  .          .      .   .     T     .   .  . .     .   .        .                     ATACATAT              .     TTA            .  C          TC      TTCTTACCTATTAAATG                         .     .     .                      . .     CC             .  .  A          .     .  .           .  T    .  .   .       .       .   .   . .  .  .    .    TA         .     .        . . .     .    .     GTAA            .  TTAA                      .   .  T   . .   A       .   .    .   .   .  .       C     .           . . . . .              .    .    NN            N    TAATT    N .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . NNNNNNN               .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  A       .      TAAC          .  . .     .   AG           .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   T .    G              .    .          T  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . A      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        . .   .              .     .      .   .       T      A   . .     .   .           .  . .                 .   .   A         .   .   .  C    .      .           T  . .       .    .     .    .          .       .       .  .   .    A    .                     .   .      .   .     .  .       .  TAA              .          T      CGT      .      .     .  .          .      .   .     A     .   .  . .     .   .        .                     GTCTTACG              .     TTA            .  T          CT      GTCTTGTTTTAAAATT                          .     .     .                      . .     TC             .  .  A          .     .  .           .  A    .  .   .       .       .   .   . .  .  .    .    AA         .     .        . . .     .    .     AAA             .  TTAA                      .   .  T   . .   C       .   .    .   .   .  .       N     .           . . . . .              .    .    NN            N    NNNN     C .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . NNNNNNN               .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TTC           .  . .     .   TA           .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   T .    C              .    .          T  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . A      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .   .       .      .   . .     .   .           .  . .                 .   .   T         .   .   .  C    .      .           T  . .       .    .     .    .          .       .       .  .   .    A    .                     .   .      .   .     .  .       .  TTA              .          T      CGA      .      .     .  .          .      .   .     T     .   .  . .     .   .        .                     ATGCTTAT              .     TTA            .  A          AT      GCCCTTTATTTTAAT                           .     .     .                      . .     CC             .  .  A          .     .  .           .  A    .  .   .       .       .   .   . .  .  .    .    AA         .     .        . . .     .    .     GAA             .  TTAA                      .   .  C   . .   T       .   .    .   .   .  .       T     .           . . . . .              .    .    GG            G    TAAT     T .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . TCATTAA               .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TTC           .  . .     .   AA           .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   A .    G              .    .          T  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . A      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  . .                                   .   .   .  C    .      .           T  . .       .    .     .    .          .       .       .  .   .    A    .                     .   .      .   .     .  .       .  TTA              .          T      CAT      .      .     .  .          .      .   .     G     .   .  . .     .   .        .                     ATTATTAT              .     CTC            .  C          CC      GTTATATTTTAAA                             .     .     .                      . .     TC             .  .  A          .     .  .           .  T    .  .   .       .       .   .   . .  .  .    .    AA         .     .        . . .     .    .     TTA             .  TTGA                      .   .  C   . .   G       .   .    .   .   .  .       T     .           . . . . .              .    .    GG            G    TAAG     T .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . GTTATTA               .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TAC           .  . .     .   AA           .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   A .    A              .    .          T  C   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . A      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  . .                                   .   .   .  .    .      .           .  . .       .    .     .    .          .       .       .  .   .    G    .                     .   .      .   .     .  .       .  TT               .          T      CCA      .      .     .  .          .      .   .     A     .   .  . .     .   .        .                     ATCTTAT               .     TTG            .  C          CG      GTTTTATATTTT                              .     .     .                      . .     TC             .  .  A          .     .  .           .  T    .  .   .       .       .   .   . .  .  .    .    AA         .     .        . . .     .    .     ATC             .  TTAA                      .   .  T   . .   T       .   .    .   .   .  .       T     .           . . . . .              .    .    GG            A    NNNN     T .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . GTTATTG               .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TAC           .  . .     .   AA           .  T        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   G .    G              .    .          T  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . A      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .      .           .  . .       .    .     .    .          .       .       .  .   .    .    .                     .   .      .   .     .  .       .  TT               .          T      CG       .      .     .  .          .      .   .     T     .   .  . .     .   .        .                     ATACTTA               .     TCA            .  T          GC      CCATTTTAAG                                .     .     .                      . .     TC             .  .  A          .     .  .           .  T    .  .   .       .       .   .   . .  .  .    .    AA         .     .        . . .     .    .     AAA             .  TTAA                      .   .  C   . .   T       .   .    .   .   .  .       A     .           . . . . .              .    .    GT            T    NNNN     T .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . GTTATTA               .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  A       .      TAC           .  . .     .   AA           .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   A .    C              .    .          T  C   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . C      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .  . .       .    .     .    .          .       .       .  .   .    .    .                     .   .      .         .  .       .  .                .          T      CT       .      .     .  .          .      .   .     A     .   .  . .     .   .        .                     ATATT                 .     TTT            .  T          CT      TTATTTTAAA                                .     .     .                      . .     TC             .  .  A          .     .  .           .  T    .  .   .       .       .   .   . .  .  .    .    TA         .     .        . . .     .    .     AAA             .  TTAA                      .   .  T   . .   T       .   .    .   .   .  .       T     .           . . . . .              .    .    GA            C    NNNN     T .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . TTATTAA               .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  C       .      TTC           .  . .     .   AA           .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   A .    T              .    .          T  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .  . .       .    .     .    .          .                                                                                      .                              T      .        .      .     .  .          .      .   .     T     .   .  . .     .   .        .                     CTTT                  .     TTA            .  C          CT      TTTTATAATT                                .     .     .                      . .     TC             .  .  A          .     .  .           .  T    .  .   .       .       .   .   . .  .  .    .    AA         .     .        . . .     .    .     AAA             .  TTAA                      .   .  T   . .   T       .   .    .   .   .  .       T     .           . . . . .              .    .    GG            G    GGAG     T .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . NNNNNNA               .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TTC           .  . .     .   AT           .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   G .    G              .    .          T  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .    .     .    .          .                                                                                                                     T      .        .      .     .  .          .      .   .     T     .   .  . .     .   .        .                     ATAT                  .     TT             .  T          CC      GCCTTCTATT                                .     .     .                      . .     TC             .  .  A          .     .  .           .  G    .  .   .       .       .   .   . .  .  .    .    AG         .     .        . . .     .    .     AA              .  TTAA                      .   .  .   . .   T       .   .    .   .   .  .       T     .           . . . . .              .    .    GG            G    TAAA     T .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . TTATCA                .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TTC           .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   T .    C              .    .          T  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .  .          .      .   .     A     .   .  . .     .   .        .                     .                     .     GT             .  T          C       GGTTCTATT                                 .     .     .                      . .     TT             .  .  A          .     .  .           .  C    .  .   .       .       .   .   . .  .  .    .    AA         .     .        . . .     .    .     AA              .  TAG                       .   .  .   . .   C       .   .    .   .   .  .       T     .           . . . . .              .    .    NN            G    TAAA     T .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . TTATCA                .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TTC           .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   A .    T              .    .          T  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .   .  . .     .   .        .                     .                     .     AA             .  T          C       TTTCACTT                                  .     .     .                      . .     TC             .  .  A          .     .  .           .  A    .  .   .       .       .   .   . .  .  .    .    A          .     .        . . .     .    .     A               .  TG                        .   .  .   . .   .       .   .    .   .   .  .       T     .           . . . . .              .    .    NN            G    TAAG     T .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . GTTTTA                .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  A       .      TTC           .  . .     .   A            .  T        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   G .    G              .    .          .  C   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .     T              .  .          .                                                 .     .     .                      . .     TC             .  .  A          .     .  .           .  C    .  .   .       .       .   .   . .  .  .    .    A          .     .        . . .     .    .     .               .  TT                        .   .  .   . .   .       .   .    .   .   .  .       T     .           . . . . .              .    .    G             G    NNNN     N .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . TTATTA                .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TAC           .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   G .    G              .    .          .  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A              .  .          .                                                 .     .     .                      . .     C              .  .  A          .     .  .           .  A                   .       .   .   . .  .  .    .    A          .     .        . . .     .    .     .               .  TT                        .   .  .   . .   .       .   .    .   .   .  .       C     .           . . . . .              .    .    G             N    NNNN     N .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . TTATTA                .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TTC           .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   T .    G              .    .          .  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .  .                                                            .     .     .                      . .     T              .  .  A          .     .  .           .  C                                                     .          .                                                                                .   .  .   . .   .       .   .    .   .      .       .     .           . . . . .              .    .    G             N    TT       T .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . ATTTA                 .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TTC           .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   G .    G              .    .          .  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     . .     T              .  .  .                                                                                                                                                                                                                                 .       .     .           . . . . .              .    .    .             G    T        . .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . TTA                   .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TAC           .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   A .    G              .    .          .  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C              .  .                                                                                                                                                                                                                                                                      .              .    .                  .    .        . .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . CT                    .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TTC           .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   G .    G              .    .          .  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .    .        . .   .    .       . .      .    .    . .    . .  . T                     .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TTC           .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   T .    C              .    .          .  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .  .                       .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  A       .      TTA           .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   G .    G              .    .          .  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TAC           .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   T .    G              .    .          .  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TTC           .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   G .    G              .    .          .  T   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TC            .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   T .    G              .    .          .  G   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  A       .      TT            .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   G .    G              .    .          .  .   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .  .  . .   .  .   .      .    .      .     .   .     .  T       .      TC            .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   A .    A              .    .          .  .   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .    .      .     .   .     .  .       .      TA            .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   T .    G              .    .          .  .   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .     .  .       .      TT            .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   G .    A              .    .          .  .   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .  .       .      C             .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   A .    G              .    .          .  .   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      .      T             .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   T .    C              .    .          .  .   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .             .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   G .    C              .    .          .  .   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .  . .     .   A            .  C        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   A .    .              .    .          .  .   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .  .        .    .  .  .  .   .      .  .      . .   A .    .              .    .          .  .   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .    .  .  .  .   .      .  .      . .   . .    .              .    .          .  .   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .      .   .        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .    .  .  .  .   .      .  .      . .   . .    .              .    .          .  .   .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   . .                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .  .                                                                          .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                         . .   .                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  .     .   .    .   .  .    .   .   .                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  .     .   .    .   .  .                                                                   


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                        GAC*****              ****                                       GAACCATGTT***********                **             **                              T**         **                   G***                      T***                                                                      **                                     A***                           **         ***                 TTA************                    CGN****                                        ****                 *****     ******   **************        ATACTTAT************  ***   TTA**********     T******    CC****  GTCTTACGTTTTAAAATT***********************             *********                      TC************                                          N*                                    **              AA***                                                             TTAA*********************                                                      T***                                               GG***              TAAG****                                                **   GTTATTA*************                                                                                                                       C***
originalCons                  :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTA-GAC----TCTTTGGGCA---T--T-GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATT-GA--C----T------T---TTTAATATAT-T-TCA--TGGTAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--T-A----AGGTGCTACCAATA-ATAA-TT-N--GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTGTTAAAGTCGN----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-NCATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAAT-C--TT------A---T-TT---TTA--T-T------A-AA--T-T-----AAAT--C-C-TAG-------C---GTT--TT----A----------TT-----A-----T-----A---------TGCTCGAAACATGT-C-ATTTT----T-C-------A-AT-GC---A--A---T---TAT-GC----------AA--C-NATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCC--AA-TACTAG---TCT-------CG-T-A----TT----A-----T-----A--A---ATTA--T----------TTA--------AA--T--AT--T-T-A-T--AT----T-AT-TAT----T--AT-TTG-AT------TA--T-TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GT---AA---GGACCCCATTG-G-AA--T-AA-GCTG--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TATC-C----T-T--A-G-TT------AT-----TA-ATA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--C-----TTT-AA-T---TAT---T--A-----ATAAT-TGC--CATAGT---GC--C-AT--A--GA--TTATG--T--CAGGT-T-TCANT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAGTTTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
finalCons                     :                                                                                                                                                                                            TGTGAAATTTTAGAC-----TCTTTGGGCA---T----GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATTAAGATTGAACCATGTT-----------TTTAATATAT-T-TCA--TGGTAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATTT--A-T-ACTAA--AC-AAAAATAATAC--T-AG---AGGTGCTACCAATA-ATAA-TTT---GTCATA-CCC-AAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGACA---A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--A------AG-TTTTA------------AA---AAAAGCTGTTAAAGTCGN----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-NCATG-ACG-CC-A-----T-GTC------CAG--------------TTTTGTTAATACTTAT------------TT---TTATTA----------AA--TT------AAATCC----TAGTCTTACGTTTTAAAATT-----------------------A-----T-----A---------TGCTCGAAACATGT-C-ATTTTTC------------A-AT-GC---A--A---T---TAT-GC----------AA--CN-ATT--T-CAT----AAAA-------A-CCT--GC-C--A--A----A-TTCCAA---TACTAG---TCT-------CG-T-A----TT----A-----T-----A--A---ATTA--TTTAA---------------------T--AT--T-T-A-T--AT----T-AT-TAT----T--AT-TTG-AT------TAT---TT----------AT-T-T-G-T--------------A---GT---AAGG---ACCCCATTG-G-AATAAG----CTG--AT-TTCA----GCTT-T----TAT-GGGT-TATC-C----T-T--A-GGTTATTA-------------TA--T-CA-T--TA--T---A------T---GT----CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--C-----TTT-AA-T---TAT---T--A-----ATAAT-TGC---ATAGT---GC--C-AT--A--GA--TTATG--T--CAGGT-T-TCANT-TTGT-------------GA-TTTT--------AAGTTTTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|58 ): ACATTTTTTCAAAGTTTTCTAAACGTTCATCTTATCCTTCGCCATAATGGTTGATGTAGAGAG
Unaligned ( gi|61 ): AATATTAAAGAAATGATTATCCATTCTTACGGTTTGGTTTCAATATTT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              11111111          222222222                                 11111111                                                 11               1111111                                                                  11                                                                                                                    222222222222222                                          111111111111111             11     1111111                                                                           11111111111111          1111111111111111                                                  111111111111111                                                  2222222          1111111111                                           1                                         22222222222222222                      222222222222222222                                       1111111111         111111111111111111                        11111111                                                                                                                               1111111        22222                      222222222                                                                                                         1                                             1111111111111111111111111         111111                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              33333333          222222222       5     5     5             88888888      4    666  0   2     4   4   66             00    4      4   7777777 77     555 4 4     55  4        88888     0              4   77  55       3   3  3 3  55   3      6     0     0  2 777777  2    2     2    33  0     22       555     2  33  2    5555 000000000000000       555 33     2   555   33 888888  2  222222222222222  555   0    88     2222222  66666  5555  2  666        2      33  5555  33    2 0 4  2  22  666666   33333333333333      333 1111111111111111    3333 77777  44   44444   555  22  2  88888  4 000000000000000    22   1    2         1  3    6666 3 3333 1  1  3333333 333    1 0000000000   1 5  22   2 4444     2   22  4 88  4444 0    77777777     333 0   1  1 555   4444 44444444444444444  1 22    1  555 22   333333333333333333 44444  4444444 44  1   1  777777   1  1111111111  1 3 1  333333333333333333 1   55555         444  33333333 3333  11   3333  1  1 3333       1      1 1 2      88888888888   1 1 11  4444444 222 333333 333  6666666   33333 222 33333 11 3333333 44444  44444 444   1  3 111   666 444444444    222  2   1 11 11 111  11  1 11 33  22  1   11 11     1 1   2 1    77777777777777 1  2222  66666666   6 1 5   11 2222  11  11   11  11 22   1   111 2222222222222222222222222 2 11  1 444444 111 11       1            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ........          .........       .     .     .             ........      .    ...  .   .     .   .   ..             ..    .      .   ....... ..     ... . .     ..  .        .....     .              .   ..  ..       .   .  . .  ..   .      .     .     .  . ......  .    .     .    ..  .     ..       ...     .  ..  .    .... ...............       ... ..     .   ...   .. ......  .  ...............  ...   .    ..     .......  .....  ....  .  ...        .      ..  ....  ..    . . .  .  ..  ......   ..............      ... ................    .... .....  ..   .....   ...  ..  .  .....  . ...............    ..   .    .         .  .    .... . .... .  .  ....... ...    . ..........   . .  ..   . ....     .   ..  . ..  .... .    ........     ... .   .  . ...   .... .................  . ..    .  ... ..   .................. .....  ....... ..  .   .  ......   .  ..........  . . .  .................. .   .....         ...  ........ ....  ..   ....  .  . ....       .      . . .      ...........   . . ..  ....... ... ...... ...  .......   ..... ... ..... .. ....... .....  ..... ...   .  . ...   ... .........    ...  .   . .. .. ...  ..  . .. ..  ..  .   .. ..     . .   . .    .............. .  ....  ........   . . .   .. ....  ..  ..   ..  .. ..   .   ... ......................... . ..  . ...... ... ..       .            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              22222222          222222222       0     0     0             11111111      5    555  6   4     4   4   11             66    4      0   0000000 77     555 0 0     55  0        33333     5              0   22  99       3   3  3 3  88   1      2     8     9  7 777777  5    5     5    44  5     99       000     9  99  9    8888 777777777777777       000 99     9   444   99 222222  7  666666666666666  000   1    22     7777777  22222  3333  4  555        4      22  0000  44    2 5 4  2  44  888888   88888888888888      111 1111111111111111    0000 22222  55   88888   000  66  2  77777  2 111111111111111    44   9    0         8  6    1111 5 7777 7  7  3333333 333    9 2222222222   0 7  99   1 5555     0   88  0 88  2222 0    99999999     222 2   9  9 222   0000 88888888888888888  9 66    8  777 55   333333333333333333 55555  4444444 33  8   9  444444   7  1111111111  7 5 7  777777777777777777 7   77777         666  22222222 2222  88   4444  6  6 4444       6      6 5 6      22222222222   3 3 88  9999999 333 777777 444  7777777   11111 222 00000 66 1111111 44444  99999 111   1  2 999   222 888888888    888  0   0 44 44 888  44  0 33 88  88  0   44 44     0 0   7 0    55555555555555 0  1111  88888888   4 0 3   33 0000  33  33   33  33 22   9   777 1111111111111111111111111 9 33  0 222222 888 44       1            
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTGAAATTTTA-GAC----TCTTTGGGCA------TT-GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATT--------AAGATTGAACC--ATGTTTTTAATAT-ATT-TCA--TGGTAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAA-----TACTAGAGGTGCTACCAATA-ATAA-TT--TGTCATA-CCC-AA-G-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTGTTAAAGTCGN----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-NCATG-ACG-CC-AT-GTC------CAG--------------TTTTGTTAAT-AC--TT------AT-TTTT----AT-TA-AA--TTA-----AATCC-TA--GTCTT--ACGTT-T-----T-A-------AAATT-ATA-TGCTCGAAACATGT-CA-TTTT----T-C----A-AT-GC---A--AT---TATG-C----------AACNA-TT--TCA-T----AAAAA-CCT--GC-C--AA----A-TTCC--A-----ATACT---AGTCT-CG-T---ATT----A-----T----A--A---AT-T--ATTT-AA---T--ATT--T-AT--AT------T-A-----TT-AT----T--AT-TTG-AT------TAT-TT----------AT-T-T-GT--------------A---G-TAA---GGACCCCATTG-G-AA--T-AA-GCTG--AT-TTCA----GC-TT-T----TATGGGT-TATCCT-T-AGGTTATT-----------ATA-T-C--AT--T-A--T---A------T---GT-------CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--C---TTT-AA-T---TAT---T--A-----ATAAT---TG-CAT-A--G--T---GC--CA-T--A--GA--TT-ATG--T--CAGGT-T-TCANT-TTGT-------------GA-TT----TT--------AAGTT-TTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
Reference ( family-4676 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTGAAATTTTA-GAC----TCTTTGGGCA------T--GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATT--------AAGATTGAACC--ATGTTTTTAATAT-ATT-TCA--TGGTAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAA-----TACTAGAGGTGCTACCAATA-ATAA-TT--TGTCATA-CCC-AA-G-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTGTTAAAGTCGN----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-NCATG-ACG-CC-AT-GTC------CAG--------------TTTTGTTAAT-AC--TT------AT-TTTT----AT-TA-AA--TTA-----AATCC-TA--GTCTT--ACGTT-T-----T-A-------AAATT-ATA-TGCTCGAAACATGT-CA-TTTT----T-C----A-AT-GC---A--AT---TATG-C----------AACNA-TT--TCA-T----AAAAA-CCT--GC-C--AA----A-TTCC--A-----ATACT---AGTCT-CG-T---ATT----A-----T----A--A---AT-T--ATTT-AA---T--ATT--T-AT--AT------T-A-----TT-AT----T--AT-TTG-AT------TAT-TT----------AT-T-T-GT--------------A---G-TAA---GGACCCCATTG-G-AA--T-AA-GCTG--AT-TTCA----GC-TT-T----TATGGGT-TATCCT-T-AGGTTATT-----------ATA-T-C--AT--T-A--T---A------T---GT-------CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--C---TTT-AA-T---TAT---T--A-----ATAAT---TG-CAT-A--G--T---GC--CA-T--A--GA--TT-ATG--T--CAGGT-T-TCANT-TTGT-------------GA-TT----TT--------AAGTT-TTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTGAAATTTTACAAG----TCTTTAGGCA------TT-GTTAAGATGTTGAATG-CATGAGCCACT-AATT--------AAGATT-AACCGTATGGTTTTATAAT-ATT-TCAAGTGGTTAT-CTCCAC-AACTGACTCTT-GTG-------AA-AAATT-TTG-T-ACTAAGAAC-AAAAATAA-----TACTA-AGGTGCTACAAATA-ATAA-TT---GT-ATAGCCC-AAAG-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCGCTTGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATTAAAAAAATTGGAAATACTT---TGCCT-TT--AGAAGAC----A---------------AACAATT---GTCTCAGC-AAAGACACA--A------CGATTATAACAAAAATA--AAA---AAAAGCTG-TAAATT-------TT-----TT----AGCCC---AGCAAAGCAAAGAGG--AGATGTTT-TCATG-ACGACC-A
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aatgactttatgttctggctttaatacacattgccttattttgattatgcctgctttcttcaatggtaatgtggtagtggcaaacaattcaaatagaattgcagttacaaacaaaatataagttgttagatttatcttctgaaatctaggtctacgaaactccaagtttaatttctT------AT-GTTT----A---A-AA--TTACCAAGAGTTC-TA--GC--T--GTGTT-TA----T-A-------AAATT-ATACTGCTT-AATCATGTACAATTTT----TGC----A-AT-GC---A---T---TATGGC----------AACAAATT--TCA-T----AAAAAGCCT--GC-CCAAA----A-TTC---------ATAC----AGTCT-CG-C---ATT----A-------------A---GT-T--ATT--AA---T--ATT--A-TT--AT--------A-----TT-AC----T--AT-TTG-AT------TAT-T-----------AC-T-T-GTT-------------A---G-TAA---G-ACCCT-TTG-A-AAATT-AA-GC-G--AT-TTTA----GC-TT-T----T-TGGGT-TATCCT-TTAGGCTATT-----------ATA-T-CTCAT--TTA--T---A------T---GT-------CAT-----G---T-----T--A----A--C-----CA--TA-C---TTT-AAAT---TAT---T--A-----A--AT---TG-CATTA--G--T---GC--CAAT--A--GA--TT-ATG--T--CAAGT-T-TCATT-TTAT-------------GA-TT----TT--------AAGTT---ATG--A----TC--AT--CAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGAatgcgcgtcttgaaacaggagaggattttggcagttttgtttgtcaagttgcgggaaaatatgtttaaaattaccaagagttctagctgtgtttataaaattatactgcttaatcatgtacaatttttgcaatgcattatggcaacaaatttcataaaaagcctgcccaaaattcatacagtctcgcattaagttattaatattattatattactatttgattattacttgttagtaagaccctttgaaaattaagcgattttagctttttgggttatcctttaggctattatatctcatttatatgtcatgttaaccatactttaaattattaaattgcattagtgccaatagattatgtcaagtttcattttatgattttaagttatgatcatcatattctgtgatatttttacctgaataaaatgaaatga
gi|10                         : aatgactttatgttctggctttaatacacattgccttattttgattatgcctgctttcttcaatggtaatgtggtagtggcaaacaattcaaatagaattgcagttacaaacaaaatataagttgttagatttatcttctgaaatctaggtctacgaaactccaagtttaatttcttgtgaaattttacaagtctttaggcattgttaagatgttgaatgcatgagccactaattaagattaaccgtatggttttataatatttcaagtggttatctccacaactgactcttgtgaaaaattttgtactaagaacaaaaataatactaaggtgctacaaataataattgtatagcccaaagatcaaaggcaaagaatccgcttgtttttattataatgccattaaaaaaattggaaatactttgcctttagaagacaaacaattgtctcagcaaagacacaacgattataacaaaaataaaaaaaagctgtaaattttttagcccagcaaagcaaagaggagatgttttcatgacgaccaatgcgcgtcttgaaacaggagaggattttggcagttttgtttgtcaagttgcgggaaaaATTCTA-GAT----TATTTGATCA------TTTGTTAAGA-GTTGG-AGACA-GAGTTACTAAATT--------AAGATTGAATC--ATATCTTGACT-T-GTT-TCA--TAGTAACGTGCCA--AATT-ATCTTT-GTGTCTTAGTAT-CAA-----G-C-ACTAA--AC-AATAATAA-----TACTAGAATTGCTACCAATA-AGAATTT--TGTCATA-CCT-TA-G-AT-AAAA-GGCAAGTGAA---------TT-T------TA-TTCT-A-----CAT--------TTG-------TT---TGCCT-TT--AA-AAACTTACA---------------AAC-GTT---A--ACCAC-AAA---AAA--AGAGTTGGG-TT----------TTCCAAAAACAAAAGCTGTAAAACTAGA----TTATCAATT----AA-TT---TAAAAGAC-AAAGAA--TG----TT-ACATA-ATG-GT-AT-TCT------CAG--------------TACTGT---T-AC--TT-------T-TTTC----AT--------------------C-TA---TTTC--AC--T-T-----A-A-------AAATC-ATG-T-CT-GAAACGTGT-CA-TTTT----CGC----A-AT-G
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ggcT----AT-TT-AA--TTA-----AATCCCTA--GTCTTTGACGTT-T-----TTA-------AAATT-ATA-TGCTTGAAACATGT-CA-TTTT----C-C----A-AT-GC------AT---TATG-G----------AACAATTT--TCA-T----AAAAA-CCT--GC-C--AA----A-TTCC--A-----ATGCT---AGTCTCCG-T---ATT----A-----T----ATTT---AT-T--ATTT-AA---T--ATTA-T-AT--AT------T-A-----C---T----T--AT-TTG-GA------TAT-TTA---------AT-T-T-GT--------------A---G-TAA----GACCCCATTG-G-AAATT-AA-GC-G--A---TCA----GC-TT-T----TATGGGT-TAT-CT-T-AGGTTATT-----------AGATT-C--AT--T-A--T---A------T---GT-------CAT-----G---T-----TAAA----TA-C-----CA--TTAC---TTT--A-T---TAA---T--T-----ATAAT---TG-CAT-A--G--C---GC--C--T--A--G---TT-AT---T--CA-AT-T-TCATT-TTGG-------------TA-TC----TTTTTTAAAAAAG-T-TTATGATA----TC--AT--G-C--AT--T--CTGCCGA---T-------------------------ATT--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAATTGa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     a-AA--TTA-----AATCC-TA--GTCTTG-ACGTT-T-----TTA-------AAATT-ATA-TGCTTGAAACATGT-CA-TTT-------C----A-AT-GC---A---T---TATG-C----------AACAA-TT--TCA-T----AAAAA-CCTTGGC-C--AA----A-TTCC--A------TGCT---AGTCT-CGCT---ATT----A-----T----T--ATTTAT-T--ATTT-AA---T--ATT----AT--AT--------A-----TT-AC----T--AT-TTG-AT-------AT-TT----------AT-T-T-GTT-------------A---G-TAATTGAGACCCCATTG-A-AA--TTAA-GCTG--AT-T-CA----GC-TTCT----TATGGGTGTATCCTAT-AGGTTATA-----------AGA-TTC--AT--T-A--T---A------T---GT-------CAT-----G---T-----T--AAAC-TAAC-----CA--TTAC---TTT-A--T---TAT---T--A------TA-T---TG-CAT-A--G--C---GC--C--T--A--G---TT-ATG--T--CAATT-T-TCATT-TTGT-------------CA-TT----TTTTAA----AAGTT-T-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-CGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttTTT----AT-CA-AA--TTA-----AATCC-TA--GTCTT--ACATT-T-----T-A-------AAATT-ATA-TGCTCGAAAAATGT-CA-TATT----T-C----A-AT-GT---A---T---TATG-C----------AACCA-TT--TCA-T----AAAAA-CCA--GC-C--AA----AATTCC--A-----GTACT---AGTCT-CG-T---ATC----A-----T----A--A---AT-T--ATTT-AA---T--ATTATT-GT--TT------T-A-----TT-------T--AT-TTG-AT------TAT-TT----------AT-T-T-GT--------------A---GGNNN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NN-NN-N----NNNNNNN-NNNNNN-N-NNNNNNNT-----------ATA-T-C--AT--T-A--T---A------T---GT-------CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CAT-T--C---TTT-AA-T---TAT---T--------ATAAT---TG-CAT-A--A--T---GC--CA-T--A--TA--TT-ATG--T--CAAGA-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TT----TT--------AAG-T-TTATG--A----TC--AT--GAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGATT-AAAATGAAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTCATA-CCT-AA-G-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCATG-TT-T------TA-TTTTAAATGC-CATT--AAAGATTAG-ATAACTT---TGCCT-TTAGAG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCTGCAAAA---ACA--A------AG-TT----------TT---AA---AAAAGTTGT---AGTCGT----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AATGGA--AG----TT-TCATG-ACG-CC-AT-ATC------GAG--------------TTTTTTTA--------------------TT----AT-TA-AA--TTA-----AAT--------TGAT--ACGTTGT-----T-ACTTCGCCATTTT-ATA-TCCT--AGTCCTA--CG-TTTTAAAAT-C----ATAT-GCTCGA--AA---TATG-TCATTTTCCTGAACAA-TT--TCA-T----AAAAA-CCT--GC-C--AA----A-TTCC--A-----ATACT---AATCT-CA-C---ATT----A-----T------------T-T--ATTT-GA---T--A-T--T-AT--AA------T-A------------------------------------TT----------AT-T-T-GT--------------A---G-TAA---AGACCCCATT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-TTGC-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATGCTT---TGTCTGTC--AG-AAAC--A-ACTTATGCAATATCATAACAGTT---G--TCGGC-AAA---GCT--A------AG-TT----------TT--TAA---AAA-GCTGT-AAAGTCGC----TA-----TT----AG-CC---AGCAAGAC-ACGTGA--AG----TC-ACATG-ACG-TC-AT-GTC------CAG--------------TTTTGTTAAT-AC--AT------AT-TTTT----A---A-AA--TTA-----AATCC-TA--GCCCT--ACGTT-T-----C----------AATTCATA-T--CCGAAACATGC-CA-TTTT----C-C----A-AT-T--------T---TATG-C----------CACTA-TT--TCA-T----CAAAA-CTT--GC-CA-AA----A-TTCC--G-----ATACT---AATCT-TG-T---ATT----A-----T----A--A------T--AGTA-CA---TGCATT--T-ATTCGT------TAA-----TT-GT----TG-GT-TTG-GT------TTT-TT----------TT-T-T-AT--------------A---A-T
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gcaatgggtttttttgttctccaatgTGTGAACTTCTA-GAC----TCTTTGGGCA------T--GTTAAGA-GTTTA-TGACA-GAGCCACTCAACT--------AAGATTGAACC--TTGTTTTCAATATAAAT-CCA--TGGCAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-T-ACTAA--ACAAAAAATAA-----TACTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actcctaagaccttagatttttatacagaatgcattcttgcctaaggattttatgttctgctttgatcaagttattttttatatgaagctccaatttggaagttttttaggcaataaatttgaacatagattgtaaagttgatccttagcaaaaataaagttgtccagatttattctaaatcttggtcctagaaccaggatttct-TA--GTATT--GGGTT-TGCTCCT-A-------CAATT-ATA-TGCTCGAAA-GTGT-CA-TTTT----T------A-AT-GC---A---T---TATG-C----------AACAATTT--TCA-T----AAAAA-CC---GC-C--AA----ACTTCCA-A-----ATACTATCACTCT-CG-CG--ATT----ATTTATT----A--A---TT-T--ATTT-ACTT-T--ATT--TAAT--AC------T-ATATAGTT-AC----TTAAT-TTG-AT------TATCTT----------AT-T-T-GT--------------A---G-TAA---GTACCCCATTG-GAAA--T-AA-TCTG--AT------------------------AGT-TAT--T-T-A----AT-------------TA-T-C--AT--T-G--T---A------T---GT-------C-T-----G---T-----A--A-------------CA-----------T-AA-T---TA-------A--------------G-CAT-A--G--TGGGGC--C--T--A--AATTTT-ATG--T--AACG--T-TCATT-TTGT-------------GA-TT----TT--------AAG-T-TTATG--A-----C--AT--GAC--AT--T--ATG-TGA---T-------------------------A-TTCTT-T------T---A--CCTGAAT--AAATGAAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgaT-ATA-CACTCAAAACATGC-CA-TTTT----T-C----A-AT-GC---A---T---TATG-C----------AACTA-TT--TCA-T----AAAAA-CCT--GC-C--AA----AATTTC--T-----ATACT---CATCT-TG-T---ATT----A-----T----G--A---AT-T--ATTT-AA---T--ATT----AT--AT------C-A-----TT-------T--AA-TTG-AT------TGC-TTGTGAAAGTATAT-T-T-GT--------------A---G-TAA---GAA-----------AA--T-AA-GCTG--AT-TTCA----GG-TT-T----TATAGGT-TATCCT-T-AGGTTATT-----------TTA-T-C--AT--T-T--T---A------C---GT---------T-----A---T-----T--A----T--C-----CAT-T--C---CTT-GA-T---TAT---T--------ATAAA---TG-CAT-A--G--T---GC--TA-T--A--GA--TT-ATG--T--CAGGT-T-TCAGT-TTTT-------------GG-TT----TT--------AAG-T-TAATG--G----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TAA---T-------------------------A-T--TT-G------T---A--CCTGAAC-AAAATGAAAga
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGT-CA-TTTT----T-C----A-AT-GC---A---T---TATG-C----------GACAA-TT--TCA-T----AAAAA-CCT--GC-C--AA----AATTCC--A-----ATGCT---AGACT-AG-T---ATT----A-----TTTATA--T---AT-T--ATTT-AA---T--ATT----AT--AT--------A-----TT-AC----T--AT-TTA-AT------TNN-NN----------NN-N-N-NN--------------N---N-NNN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NN-NN-N----NNNNNNN-NNNNNN-N-NNNNNNNN-----------NNN-N-N--NN--N-N--N---N------N----T-------CAT-----G---T-----T--AACTTTA-C-----CA--TA-C---TTT-AA-T---TAA---T--A------TAAT---TG-TAT-A--G--T---GC--CA-T--A--AA--TT-ATG--T--CAAGT-T-TCATT-TTGT-------------CA-TT----TT--------AAGTT-T-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-C--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTGAAATTTTA-CAG----TCTTTAGGCA------T--GTTAAGA-GTTGA-TGACA-GAGCCACTCAATT--------AAGATTTAACC--ATGTTTTTAATAT-ATT-TCA--TGGTTATGCCCCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AA-AATTT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAA-----TACTAGAGGTGCTACCAATA-ATAA-TTA-TGTCATA-CCC-AA-G-AT-CAAA-GGCAAA-GAATCCTCTTGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAAATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAATT---G--TCTGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TA--AAA---AAAAGCTG-TAAAGT-------TT-----TT----AG-CC---AGCAAAGC-AAGGGA--AG----TT-TCATG-ACGACC-AT-GTCTTGAAACAGGATGATTTGGCAGTTTTTGTTTGTCAA--TTGGGGAAAA-TTTT----AT-TA-AA--TTA-----AATTC-TA--GTCTT----GTT-T-----T-A-------AAATT-ATA-TGCTTGAATCATGT-CA-TTTT----T-C----A-AT-GC------AT---TATG-C----------AACAA-T
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttaataagtatattgttaattgcaactcacacaggagtgaaaaactctagacttaagattgttatacagaatgcttctggccctaaataggccagtctaaaaatactttatgttctgctttaatacaatgctattttgattatgctgcttcttcatggtatagtggtattggcaaacaatttcaacatagattgcaagttacacaaaataaagttgttagatttattctaaatctaggtcctagaaccagtatttctTCC-CG-T---ATCCTCGA-----T----A--ATT-AT-T--GTTT-AA---T--ATTA-C-AT--AT------T-A-----CT-AT----T--A------AT------TAT-TT----------AT-T-T-GT--------------A---G-TTN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NN-NN-N----NNNNNNN-NNNNNN-N-NNNNNNNN-----------NNN-N-C--AT--T-AATT---A------T---GT-------CAT-----G---T-----T--A-------C-----CA--TA-C---TTT-AA-T---TAA---T--T-----ACAAT---TG-CAT-A--G--T---GC--CA-T--A--GA--AT-ATG--T--CAAGT-T-T-ATT-TTGT-------------GA-TT----TTA-------AAGTT-TTATG--A----TC--CTGAGAC--AT--TTGTTG-TAA---T-------------------------A-T--TTAC------T---AGTCC--AGT-AAAATGAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttctttctcatttcattttattca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgcaactctttactttctcagattgtctgagatttgtaacacatgtaTT-GTGC------ATCAAACTAT-A-T-ACTGA--GT-AAAAATAA-----GACTAGAAGTTCTACTTGTA-AT---TT--TTTCATA-CCTAAA-G-AT-AAAT-AAAAAA-AAACCCT--TGTTTATACATTGTA-TTAC-AAATT-CATT--AAAGATTaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             A--A------AG-AT----------TT--TTA---AAAGGCTGT-AAAGTCGC----TA-----CT----AT-CC---ATCAAAGC-AAGAAA--AG----TC-ACATG-AAG-TC-AT-GTC------CAG--------------TTTTGCTAAT-AT-----------T-TTTT----AT-T---A--TCA-----AATTC-CA--GTTTT--ATATT-T-----T-A-------AA----GTA-TGTCCGAAACATGT-CC-TTTTTG--T-C----A-AT-GT------AT---TATG-C----------AACTA-tttaaaaggctgtaaagtcgctactatccatcaaagcaagaaaagtcacatgaagtcatgtccagttttgctaatattttttattatcaaattccagttttatattttaaagtatgtccgaaacatgtcctttttgtcaatgtattatgcaactacatgtattacaagtatttaaagcatgcc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttgtgcatcaaactatatactgagtaaaaataagactagaagttctacttgtaattttttcatacctaaagataaataaaaaaaaacccttgtttatacattgtattacaaattcatt-AA---T--ATT----AT--AT--------A-----TT-AC----T--AT-TTG-AT------TAT-TT----------AT-T-T-GT--------------A---G-TNN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NN-NN-N----NNNNNNN-NNNNNN-N-NNNNNNNN-----------NNN-N-N--NN--N-N--N---N------NNNNGT-------CAT-----G---T-----T--A----A--C-----CA--TA-C---TCT-AA-T---TAT---T--A------TAAT---TG-CAT-A--G--T---GT--CA-T--A--GA--TT-ATG--T--CAAGT-T-TCATT-TTGT--------------A-TT----TT--------AAGTT-T-ATC--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATcatgtattacaagtatttaaagcatgcc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gtgtatcacatgtacTCC--A-----ATTCT---AGT------------T----A-----T----G--T---AT-T--GTTT-AT---T--GTT--T-TT--GTC-----T-G-----TTCAT----C--ATATTA-AG------CAT-CT----------AA-T-T-AT--------------A-------A---GGACTTCATTGCA-AA--G-GA-GCCA--AT-GTCA----GC-TT-C----AGTGGGT-TACCCT-T-CAGTTATC-----------ATA-T-T--AT--A-A--T---A------T----T-------CAT-----G---T-----T--A----T--C-----TA--T--TCCATTT-AT-TCTTTGT---T--A------TAAT---TG-CAT-A--G--T---GC--TA-T--A--TT--TT-GTG--C--CAGGT-T-TCAAT-TTGC-------------AA-CT----TT--------AAA-T-TTACA--A----TC--AC--TAC--TT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-tgt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -AAGTTATC-----------ATG-T-C--AT--T-A--TGTCA------T---GTTATC---CAT-----G---T-----T--A----T--T-----CA--TT-C---TTT-AG-T---TGT---T--A-----A-AAC---TG-CAT-G--G--T---GC--TA-T--ATAGA--TT-ATG--T--CAGGT-T-TCAAT-TTGT-------------GA-CT----TT--------AAG---TTGCG--A----TC--AT--AGC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TGC----T------CCCGAAT-AAAATAAAATGAat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acctgctcattatattcattatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc--C-----CA--TT-C---TTT-AA-T---TAA---T--A------TAAT---TG-CAT-A--G--T----C--CA-T--A--TA--TT-ATG--T--CAAGT-T-TCAGT-TTGT-------------CA-TT----TC--------AA-----TATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A----TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatatattactatttaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--------------A---A-TAA---GGACCATATTG-G-AAA-C-AA-TCTG--AT-TTCA----GC-TT-T----TATGTAT-TATTCC-T-ATTTTATTGAATCAGTATAATA-T-G--AT--T-A--T---A------T---TT-------TATTTCCTG---T-----T--A----T--C-----GA--T--C---TTC-AG-T---TAT---C--A------TAAT---TG-TAT-A--G--T---GT--TA-C--T--TA--TC-ATG--T--CAGGT-T-TCAAT-TTGT-------------TA-TT----CT--------AAGTT-T-ATG--T----TC--AT--AAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TG-----C---A--CATGAAT-AAAATGAAATG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aCTCATTA-G-AA--A-AAAGCTATAAT-TTCA----GC-TT-TAATTTATGGGT-AATCCT-T-AGATT--T-----------ATA-T-A--A------------A------T---GT-------CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--TT-C---TTT-GA-T---TGT---T--A-------------------------------------C--A--GA--TT-ATG--T--AATTT-T-TCAAT-TTGT-------------GA-TT----TT--------AA-CT-TCATG--A----TC--AT--GTCCTAT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TA-----C---A--CCTGAAT-GAAATAGAATGA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttttgcctgttcatcatatttttcatgcaggT------TAA-TT----------AT-C-T-GT--------------A---G-TAA---G-ACCCCATTG-A-AA--T-AA-ACTG--ATATTCA----GC-TT-T----TATGGGT--ATCCT-T-AGGTT-TT-----------ATA-T-C--AT----A------A------T---GT-------CAT-----G---TAAACTT--A----A--C-----CA--TT-C---TTT-AA-T---TAA---T--A------TAAT---TG-CAT-A--G--T---GC--CA-T--A--TA--TT-ATG--T--CAG-T-T-TCAGT-TTGT-------------CA-TT----TC--------AA-----TATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGAa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atG-TT----------TT--AAA---ACA-GCTGT-AAATTCG-----TT-----TT----AG-CC---AGTAAAGC-AAGAGA--AG----CA-TCATG-ACG-CC-AT-GTC------CAG--------------TTTTGTTAAT-ACTATT------TT-TTTT----AT-TA-AAT-TTA-----AATCT-TA--TTCTT--ACCTA-T-----T---------AAATG-ATA-TGCACGAAATATGC-AA-TTTT----T-C----A-AT-GC------AT---TATG-C----------AACTA-TT--TAA-TTAAAAAAAA-CCT--GC-CA-AA----A-TTCC--A-----ATATT---AGTC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTGACTTTTTA-AATAAATTCTTTGGGCAAGCTAGT--ATTAAAC-GTTGA-TAACA-GAGCTACTCCATTACATATTAAAGATTAAGAC--ATGTTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtgtttgcaagcaacttattgcaagtaacccaaacaatgtcgaatgttcatatttattctaaatcaaggccctaaatagacccaacatttttaaaTTT-T------CG-GTGC-AATGT-CAAA--AAGGATCGA-AATACCT---AGCGT-TT--AG-AAGC--A-A---------------AACCGC----G--ACAGC-AAA---GTC--G------AG-T----------------------AAAGTTTTCA------------------CT----AG-CC---AGTAAGGC-A-TGGA--TA----TT-ACATG-A------AT-GTC------CAG--------------TTTTACAAGT-AC--TT------AT-TTAT----TT-TA-AAGATAA-----AATAT-TA--GCCCT--TTATT-T-----T-A-------A---T-ATG-TGTTTGAAACATAT-CC-TTTT----T------A-AC-GC---A---T---TATG-C----------AACTA-TTACTCA-C-------AA-CCT--GC-CA-AA----A-TTTC--A-----ATGTT---AGTCT-TG-T---ATT----A-----T----T--T---AT-T--ATTT------T---TT--C-CT--GT------T-A--------AT----C--AC-ATGTAA------TAT-AC----------A----------------------A---G-CTA---GGACTCCA---------------------AT-TTCA----GC-CC-T----GA--GGT-TATC-----ACAATAT-------------TA-T-C--AT--TAA--T---A------A---GTCGCTTTCCAT-----G---T-----T--A----C--T-----TAATT--CT--TTT-AA-T---TGT---C--A-----A-AAT---TG-CAC-A--G--T---GG--TA-C--A--CA--TT-ATA--T--CCGCT-T-TCCTT-TTGT-------------TA-TT----TT--------GAA-T-CCACA--A----TC--AT--GAC--AT--T--CCT-TGA---A-------------------------A-T--TT-T------gatttcaaatactatatatatcgagcattaaccagttaatactaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaccacccgtaagattttttttcggtgcaatgtcaaaaaggatcgaaatacctagcgtttagaagcaaaaccgcgacagcaaagtcgagtaaagttttcactagccagtaaggcatggatattacatgaatgtccagttttacaagtacttatttattttaaagataaaatattagccctttattttaatatgtgtttgaaacatatcctttttaacgcattatgcaactattactcacaacctgccaaaatttcaatgttagtcttgtattatttattattttttcctgttaatcacatgtaatatacaagctaggactccaatttcagccctgaggttatcacaatattatcattaataagtcgctttccatgttacttaattcttttaattgtcaaaattgcacagtggtacacattatatccgctttccttttgttattttgaatccacaatcatgacattccttgaaattttcc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gtgtttgcaagcaacttattgcaagtaacccaaacaatgtcgaatgttcatatttattctaaatcaaggccctaaatagacccaacatttttaaatgtgactttttaaataaattctttgggcaagctagtattaaacgttgataacagagctactccattacatattaaagattaagacatgtttgatttcaaatactatatatatcgagcattaaccagttaatactaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaccacccgtaagattttCC--ATGGTCTTAATAT-ATT-TCA--TGGTTATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATT-T-A-C-ACTTA--AG-AAAAATAATACCGTACTAGAGGTGCTACCAACA-GTAA-TTA-TGTCATA-CAC-AA-G-ATAAAAA-GGCAAA-GAATCCTCATG--T-T------TA-TTAT-AATGC-CACT--AAAGATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TTAGC-cc
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TG-T-AA--T-AA-AC----AT-ATCC----G---T-T----GATGGGT-TATCCT-T-AGGTTATT-----------AT----C--A-----A--T---A------T---GT-------CGT-----G---T-----T--A----T--T-----CA--TT-C---TTT-GA-T---TGT---T--A------TAAT---TG-CAT-A--G--T---GC--TG-T--A--GA--TT-ATG--C--TAGGT-T-TCAAT-GCGT-------------GA-TT----TT--------AAG-T-TTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TTA---T-------------------------A-T--TT-TA-----T---A--CCTGAATAAAAATGAAAT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatatacctttgttatcatgaaTGTGAAAGTTTA-G-C----TCTTTGGGAA------T--GTTA-GA-GTTGA-T-ACA-GAGCCACTCAATT--------AAG---------------TTTAATAT-ATT-TCA--TGGCAATGCACCA--AACT-ACCTTT-GTG-------AA-AATTT-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAA-----TACTAGAGGTGCTA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acataaaataaagtgattagattattctaaacctaggtcctagaaccagtatttctCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAAATTGG-AATACTAAAATGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--A------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTGT-AAAGTCGT----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGT--AG----TT-TCATG-ATG-CC-AT-ATC------CAG--------------TTTTGTTGAT-AT--TT------AT-TTTT----AT-TA-AA--TCA-----AATCC-TA--GTCTT--AC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T------TAT-TT----------AT-T-TTAT--------------AAACG-TGA---G--CATCATTA-C-AA--T----TCTT---T-TTCA-------TT-T----CATAT-T-TATCCT-T-AAGTTATT-----------ATA-T-C--AT--------------------------------AT-----A---T-----T--A----T--C-----TT--T--T---TTT-AAAT---TAT---T--A------TAAT---TG-CAT-A--G--T---GC--TA-T--A--GA---T-ATG--T--CAGGT-T-TC-----------------------------------------AGTT-TTATG--A----TC--AT--GAC--AC--T--CTG-TGG---T-------------------------A-T--TT-TA-----T---G--TCTGAAT-AAAATGAAATG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tacat---TTT-AA-T---TTC---TTAA-----ATAAT---TG-C-T-A--G--T---GC--CA-T--A--GA--TT-ATGCGT--CAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TT----TT--------AAG-T-TTATG--A----TCCTCT--GA---AT--T--GGGCTGATTTT-------------------------T-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAATCGAAATGA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtgttattcttttaaatactttttaagttcttgtttatctgttgttgcaagtatggtgactATTG-G-AAA-T-AA-GCTG--AT-TTTAAATAGC-TA-T----TATGGAT-TATCCT-T-AGGTTATT-----------GTA-T-C--AT--T-A--T---ACATGTAT---GT-------CAT-----G---T-----T--A----T--CTG---CA-----C---TTT-AG-T---TAT---T--A-----A-AAT---TG-CAT-A--T--T---GC--CA-T--A--GA--TT-ATA--T--CAAGT-T-CCAGT-TT-T-------------G----------------------------G--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTa
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gtgtgaaattt-----------ATA-T-C--AT--T-A--T---A------T---GT-------CAT-----G---T-----T--A----A--CTTAATCA--TA-C---TTT-AA-G---TAT---T--A------TAAT---TG-CAT-A--G--T---GC--CA-T--A--GC--TT-ATG--C--CAAGT-T-TCATT-TTGTCATTTCAAATTTTAA-TT----TT--------AAGTT-T-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATct
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A-CCT--GC-C--CACAGTA-TCTCTTA-----ATA-T---A-TCT-TA-T---ATC----AG----T----A--A---GTAT--AATT-AG---T---TT--T-GT--ATAGTATAT-A-----TC-AT----T--AT-TTG-AT------TGT-TT----------AT-T-T-GTGGAAGTACAGTTGTA---G-TAA---GTAACCCATTG-G-AA--------CTG--AC-TTCA----GC-TT-T----TGT-GGT-TATTCT-T-AGGTTA
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---GC-------CAC-----G---T-----A--A----T--C-----CA--TT-C---TTT-AA-T---TAT---T--GTT---ATAAT---TG-CAT-G--G--T---CC--TA-T--A--TA--TT-ATG--T--CAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TT----TT--------AAG-T-TTATG--A----TC--AT--GAC--AT--A--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TA-----C---A--CCTGAAT-AAAATGAAATG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cagacacatttccacacagTGTGATATTTCA-GAC----TCTTTGA-CA------TT-GCAAAAA-GTTGA-TGACA-GAGCTAATCAATT--------AAGATTGAACC--TTATTTT-AATAT-ATT-T-A--TGTTAAAGCACCG--CACT-ATTTTT-GTG-------AT-CAATT-C-G-T-ACTAA--AT-AATGATAA-----TGCTTGAAGTGCTACCAACA-ATA---T--TGTTATA-GGT-AG-G-AT-AAAA-TAAAAA-TAATC------TTT-T------TG-ATAA-AAT----ATT--AAGAAT------TACTT--------------------------------------------------G--TCAGC-AAA---GCA--A------AG-TT----------TG--AAA---AAAAGCTGT-AAAGTCGT----TA-----TT----AG-CCTCTAGTA---C-TTTGGA--AG----TC-GCATG-ACG-TC-AA-GTC------CAG--------------TTTTGGTACT-TC--TT------AC-TTT-----AC-TC-TA--TCA-----AATCG-TA--GT--T--ATATT-T-----T-A-------AAAT--ATG-TGC--GAGCCATGA-CA-TTTG----T-C----A-AT-GC---ATTATACATGTA-C----------AACTA-TT--T-G-T----CAAAT-CCT--GCTT--AA----A-CTAG--AATGCTATACT---AATCT-TG-T----T------------------------T-T--ATTC-AA---T--GTT------------------------CT-GT----C--TG-TTG-ATCA----CAT-TC----------AC-TAT-GT--------------AATCA-TAA---GAACCCTATTG-GAAA--T-AA-GCTA--AA-TTCA----GCTTT-T----TTTAAGT-TATTCT-A-AGGTTATT-----------ATA-T-C--TT--T-A--C---A------T---GT-------CAT-----G---A-----T--A----T--C-----CA-----------T-AA-T---AATA--T--A-----ATTATGGCTG-CAT-A--G--T---GC--TA-C--A--GA--TT-ATA--T--CATGT-T-TCAAT-TTGT-------------GA-TT----TT--------AAA-T-TCATA--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTC-TGA---T-------------------------A-T--TT-TA-----C---A--CTTGAAT-AAAATAA
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acagcaaagttgtgagatttattctatatctatgtcgtagagtaagtgtttctA-GGCAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAAATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ATA--A------AG-TT----------TT---AA---AAAATCTG-TGAAGTCGT----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-gcc
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcaaaatgtagctgtTA-T-C--AT--T-A--T---A------T---GT-------CAT-----GATAT-----G--A----T--C-----CA--TT-C---TTT-AA-T---TAT---C--A------TAAT---TG-CAT-ATAG--T---GT--CT-T--A--GA--TT-ATG--T--CAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TT----TT--------AGGTT-TTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGA
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -T-C--AT--T-A--T---A------T---GT-------CAT-----G---T-----T--AACT-TAAC-----CA--TA-C---TTT-AA-T---TAT---T--A------TAAT---TG-CAT-A--G--T---GC--CA-T--A--GA--TT-ATG--T--CAAGT-T-TCATT-TTGT-------------CA-TT----TT--------AAG-T-TTATT--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTAAAT-AAAATGAAATGA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --A----T--C-----CA--TT-C---TTT-AA-T---TACATGT--ATT---GTAAT---TA-CAT-A--TACT---GC--TA-T--ATAGA--TC-ATG--T--CAGAT-T-TCAGT-ATGT-------------GA-TT----T---------AAGTT-T-AGG--A----TC--AT--GAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TTACTACT---A--CCTGAAT-AAGATGAAATGA
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taGAGA--AG----TC-ACATG-ACG-CC-AT-GTC------CAG--------------TTTTTTTAAT-AC--AT------AT-TTTT----A---------------------------GTCTT--CCATT-T-----T-A-------AGATT-----TGTCCGAATTATAT-AA-TTTT----T-C----A-AT-GC---A---T---TATA-C----------AACTA-TT--TCA-T----AAAAA-CCT--GCAA--AA----A-TTCC--T-----ATACT---
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T-----------ATA-T-C--AT--T-A--T---A------T---GT-------CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--TT-C---TTT-AA-T---TGT---T--ATACATGTAAT---TG-CAG-A--G--T---GC--TA-T--G--GA--TT-GTG--T--CAGGT-T-TC-----------------------------------------AGTT-TTGTG--A----TT--AT--GAC--AT--T--TTG-TGA---T-------------------------A-G--TT-TA-----C---A--CTTGAAT-GAAATGGAATGA
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --T--C---TTT-AAAT---TATG--T--ATGTGTATAATC--TGACAT-G--G--T---CC--TA-T--AT-AA--TT-ATG--T--CAGGT-TATCATGGTTGTT------------GA-TT----TT--------AAGTT-T-ATG--A----TC--AT--GAC--AT--A--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-A------TAACA--CCTGAAT-AAAATGAAATG
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    catTTT----T-T----A-AT-GT---A---T---TATG-C----------AACGA-TT--TCA-T----AAAAA-CCT--GC-C--AA----AGTTTC--A-----ATACT---AGTCT-TG-C---ATT----A-----T----A--A---AT-C--ATTT-AAAATT--ATT--TAAT--ATTACA--T-A-----TT-AT----T--AT-TT
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcctgctgtatccccagagagagaA-T-C--AT--T-A--T---A------T---GT-------CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--TA--TCT-AA-T---AAT---T--------ATAAT---TG-CAT-A--G--T---GC--CA-T--A--GA--TT-ATG--T--CAGGT-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TT----TT--------ATG-T-TTATG--------------------AT--T--CTG----------------------------------------------------A--CCTAAAT-AAAATAAAATG
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aa-----T--A----A--C-----CA--TA-C---TTT-GG-T---TAT---T--A------TAAT---TG-CAT-A--G--T---GT--CA-T--A--GA--TT-ATG--T--CGGGT-T-TCATT-TTGT-------------GG-TT----TT--------AAG-T-TTATG--A----TC--AT--GAC--AA--T--CTG-TGA---T-------------------------ATT--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAga
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTGAAATTTTA-CAC----GCTTTATGCA------T--GTTAAGA-GTTAA-TGACA-GAGCCACTCAATT--------AAGATTG----------TTTTGATAT-ATT-TCA--TGATAATGAACCA--AGCT-ACCTTT-GTG-------AT-AAATC-T-A-T-ACTAA--AC-AAAAATAA-----TAC--AAGGT-CTACCAATA-ATA--TT--AGTCATA-CAC-AA-G-AT-CAA--GGCAA--GAATCCTCATGATT-G------TAATTAT-AATGT-CATT--AA-GATTGG-AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-A---------------A-CAGTT---G--TCAGC-AAA---ACG--A------AG-TT----------TA--AAA---AAAGGCTGTTAAAGTCGA----TT-----TT----AG-CC---AGCAAGGC-AAGGGA--AG----TT-TCATG-ATG-CC-AT-ATC------TAG--------------TTTTGTTGAT--C--TT------AT-TTTT----AT-TG-AA--TTA-----AATGC-TA--G--------GTT-C-----T-----------ATT-ATA-TGCTCGAAACATTT-CATTTTT----T-C----A-ATAGC---A--AT---TATG-C----------AACCA-TT--TTA-T----AAAAG-TCT--GC-C--AA----A-TTCC--A-----GCACT---AGTCT-CG-T---ATC----A-----T----A--A---AT-T--ATCCAAA---T--ATT--T-AT--AT------T-A-----TT-AT----T--AT-TTG-AT------TAT-TT----------AT-T-T-GC--------------A---G-TAA---GGATCCCATTG-G-AA--T-AATTCTG--AT-TTCA----GC-TT-T----TATGGGT-TATCTT-T-A-GTTATTA----------ATA-T-C--AT--T-A--T---A------T---GT-------CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--A---TTT-AA-T---TAT---T--A-----ATAAT---TGCCAT-A--G--T---GC--CA-T--A---A--TT-ATG--T---AGGTGT-TCAGT-TTGT-------------GA-TT----TT--------AAGTT-ATATC--A----T----T--GAC--AT--TG-ATG-TGA---TCATTATGATCATGACATTATGTGATA-T--TT-T------T---A--CGTGAAT-AAAATTAAATAAcga
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---TG-CAT-A--G--T---GC--T----------------TG--T--CAGGT-T-TCAAT-TTGT-------------GA-TT----TC--------AAG-T-TTACG--ATCATTC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-G--TT-TA-----C---A--CCTGAAT-TGAATGAA
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cccattattttaaaatgctggataTAAT-------AT-A-----T---GC--CA-T--A--GA--TT-ATG--T--CAAGT-T-TCATT-TTGT-------------AATTT----TT--------AAG-T-TTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AGAATGAAATGAgg
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tttttcagcaacatgttAAAATAA-----TACTATATGTGCTTCCAATA-ATAA-TTAATGTCATA-CCC-AA-G-AT-CAAAAGGTAAAAGAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGCTTATT--AAAGATT-G-AATACTa
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    g-CC---AGCAAGGC-ATGGGG--AG----TC-ACATACACG-CC-AT-AGA------CAG--------------TTT-------------------------------AT-TATAA--TTC-----AATCT-TA-----TT--A--TT-T-----T-A-------AAAT----A-TGTTCGAAACTTGT-CA-TTTT----T-CTAAGA-AT-GC---A--Ac
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAAATAA-----TACTATATGTGCTTCCAATA-ATAA-TTA-TGTCATA-CCC-AA-G-AT-CAAA-GGTAAA-GAATCCTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAAGATTGG-AATACTc
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gT-----------ATA-T-C--AT--T-A--T---A------T---GT-------CAT-----G---T-----T--A----T--C-----TAATT--C---TTT-AA-T---TAA---T--------ATAAT---TG-CAT-------T---GT--CA-T--
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A-T--A--GA--TT-ATG--T--CAGGT-T-TCAGT-TTTT-------------GA-TT----TT--------AAGTT-T-ATG--A----TC--AT--TAG--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---G--CCTGAAT-AAAATGAAATGAtcattgtaacaatcacccaacttagtaagagactatgatc
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agAAT---TG-CAT-A--G--T---GC--TG----A--GA--CT-ATG--CGACATAT-T-CCAAT-CC------------------TT----TT--------AA-TT-TTAT---A----TT--------C--AT--T--TTA-TGC---C-------------------------A-T--TT-TA-----T---A--CCAAAAT-AAAA
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcCATG-ACA-CC-AT-GTC------CAG--------------TTTTGTTGAT-AT--TT------A------AAAAAT-CA-AA--TCA-----AATCT-TAATGTCTT--
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AACC--ATGTTTTCAATAT-ATTGTCA--TGGTAATACACCCCTAACT-ACCTTTTGTG-------A--AAATT-A-AATGACTAA--AT-AAAAATAA-----TACTAG-GGTGCCACCAATATACAA-TA--TGTCA-A-CCC-AA-GTAT--AAA-GGCAAA-GAATC-TCATGTTT-T-------A-TTAT-AATGC-C-TT--AA-GATTG--AATACTT---TGCCT-TT--AG-AGAC--A-AC--------------AACGTTT---G--TCTGC-CAA---ACAAGA------GG-TT----------TT--AAA---AAAAACCCTTAAAGTCAT----TT-----TTTATAGG-CCA--AGCA--GC-AAGGGATCGT----TT-TCATG-A-G-CC-ATAATC------GAA--------------TTTTTGTGAT-AC--TT------A--TTTT----GT-TT-AA--TTA-----AAT-----------------TT-T-----T-A-------TAATT-ATA-AGCTCGAAACA-GT--A-TTTT----T-C----A-AT-GC------AT---TATG-C----------AACA---C--TCA-T----AAACA-TCT--GC-C--AA----A-TTCC--A-------AGT---AGTCT-CG-C---ATT----A-----T----A---------T--ATTT-AA---T--A-T--C-AT--A-------T-A-----TT-AC----T--CT-TT--AT------TAT-TCA---------AT-T-T-GT--------------A---G-TAA---GGAATTCATTG-G-AA--T-AA-GATG--AG-GTCA----GC--T-G----TATGGGT-TATCCT-T-A-GTTATT-----------ATA-C-A--AT--T----T---A------TG--GT-------CAT-----G---T-----T--A-------A-----CA--TAAC---TTT-AA-C---T-T---T--------ATAAT---TG-CAT-A--G--T---GC--CA-T--A--GA---T-ATG-----CAAGT-T-TTATT-ATGT-------------AA--T----TT--------AAG-T-TTATG--A----TC--AT--GAC--ATTGT--CT--TGA---T-------------------------A-T--TT-T------T---A--CCTAAAT-AAATTGAAATGA
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   G--A----TT--AT--GAT--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------A-T--TT-TC-----C---A--CCTGAAT-GAAA
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---TTT-----------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAattttaagacatgaa
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---TTT-----------------------A-T--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAtg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GG-AATACTT---TGC------------------A---------------AACAGTT---G--TCAGC-AAA---ACA--G------AG-TT----------TT--AAA---AAAAGCTG-TAAAGTC-T----TC-----TT----AC-CC---AGCCAGGC-TAGGGA--AG----TTGTCATG-ACG-CCAAT-ATC------AAG---------------TTTGT------C--TT------ACGTTTT----A--AA-AA--TTA-----tg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -A-------AGATT-ATA-TGCTTGAAACATGT-CA-TTTT----T-C----A-AT-GC------AT---TATG-CA---------AACCA-TT--TCA-T----CACAA-CCT--GC-C---A----A-TTCC--A-----ATACT---AGTGT-CG-C---ATT----A-----T----A--A---AT-T--ATTT-AA---T--ATT--T-AT--ATATA---T-A-----TT-AT----T--GT-TTG-AT------TAT-TT----------AT-T-T-GT--------------A---G-NNN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NN-NN-N----NNNNGA---------C-AGG---TT-----------ATA-T-C--ATTAT-A--T---A------T---GT-------CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CAT-T--C---TTT-AA-T---TAT---T--------ATAAG---TG-CAC-A--G--T---GC--CA-T--A--TAACTT-ATG--T--CAAGT-T-TCAGT-TTGT-------------GA-TT----TT--------AAG-A-TTATG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTG-TGA---T-------------------------ATT--TT-T------T---A--CCTGAAT-AAAATGAAATGAtagagaacagaagaacagaatgtttatttctaatcagagtccaaaacagacaaagtgagttcataacaacattagaagattatatgcttgaaacatgtcatttttcaatgcattatgcaaaccatttcatcacaacctgccaattccaatactagtgtcgcattataaattatttaatatttatatatatattattgtttgattatttatttgtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaggttatatcattatatatgtcatgttatccattctttaattattataagtgcacagtgccatataacttatgtcaagtttcagtttgtgattttaagattatgatcatgacattctgtgatattttttacctgaataaaatgaaatga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ggaatactttgcaaacagttgtcagcaaaacagagttttaaaaaaagctgtaaagtcttcttacccagccaggctagggaagttgtcatgacgccaatatcaagtttgtcttacgttttaaaaattatagagaacagaagaacagaatgtttatttctaatcagagtccaaaacagacaaagtgagttcataacaacattag--TGTCATA-CCC-AA-G-AT-CAAA-GGCAAG-GAATCTTCATGTTT-T------TA-TTAT-AATGC-CATT--AAA-------------C---TGCCA-TT--A--AAAT--G-G---------------AATAGTTTTAG--CCACC-AAA---GCA--A------GG-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaGCCATTAAAATGGAATAGTT-----TT----AG-CC---ACCAAAGC-AAGGGA--A------T-TCAT--ACG-CC-AT--------------------------------TTGAT-GC--TT------AT-TT------AT-TA-AA--TTA-----AATCC-TA--GTCT---ACGTTGT-----T-A-------AAATC-ATA-TGCTT-AAACCTGT-CA-TTTT------C----A-AT-GC---A--AT------G-C----------AACAA-TT--TCA-T----AAAAA-CCT--GC-C--AA----A-ATCC--------ATGCT---ATTCT-A------ATT----A-----T----T--AGT-AT-T---TTT-AA---T--A----T-AT--AT------T-A-----CT-AT----T--A------A------------T----------AT-T-N-NN--------------N---N-NNN---NNNNNNNNNNN-N-NN--N-NN-NNNN--NN-NNNN----NN-NN-N----NNNNNNN-NNNNNN-N-NNNNNNNN-----------ATG-T-C---------------A------T---GT-------TA------A---C-----T--A-------C-----CA--TA-C---GTTAAA-T---TATA--T--A-----TTAA----TG-CAT-A-----T---TC--CA-TGAA--AA--TC-AT---T--CAAGT-T---AAT-TAGT-------------CA--T----TT--------AA--T-TGATG--A----TC--A---GAC--AT--T--CTG-T-A---T-------------------------A----TT-T------G---A--CCTGAAT--AAAT-AAATGgaattcatacgccatttgatgcttatttattaaattaaatcctagtctacgttgttaaaatcatatgcttaaacctgtcattttcaatgcaatgcaacaatttcataaaaacctgccaaaatccatgctattctaattattagtatttttaatatatattactattaatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtcatgttaactaccatacgttaaattatatattaatgcatattccatgaaaatcattcaagttaattagtcatttaattgatgatcagacattctgtatatttgacctgaataaataaatg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aatgtcatacccaagatcaaaggcaaggaatcttcatgtttttattataatgccattaaactCTGT-AAAGTCCA----TA-----TT----AG-CC---AGTAAGAC-AATGGA--TA----TT-ACATG-ATA-CC-AT-GTG------CAG--------------TGTTGTCAAT-TA--TT------AT-ATTT----ACACA-AA---TA-----------TA--GCCTT--CTATT-A-----T-G-------AA----ATA-TGTTTGAAACTTAT-AA-TTTT----T-C----G-AC-GC---A--A----AATG-C----------AATA---T--TCATT----CAAAA-CCT--TT-C--AA----A---------------AC------TCT-TG-T---ATT----------T----G--CT--AT-T--AGTT-GT---T--GTT--T-GT------------------CT-GT----T--TT-TTC-A-------TAC-TT----------CT-TAT-GT--------------AATTA-TAG---GGATCCCATTG-A-A-------------------CA-------TT-T----TA------TATC----------ATT-----------GT--------------------A------T---GC-------CAT-----G---T-----T--A----T--C-----CA--T--C----AT-AC-T---TATC--T--T-----GTAAT---TA-CA--A--G-------------------AA--TTAATT--T--CAGCT-T-TTA----TG--------------GG-TTACCCTT--------AGCTTATCAT---A----TC--TT----C--AT--T--CTA-T-----C-------------------------A-T--TT-T------T---A--C
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -----ATACT-----TCT-TA-TGTAATT----A-----T----A--GGG-AT-CCCATTG-AA---C--ATT--TTAT--AT------C-A-----TT-GTATGCC--AT-GTT-ATCCATCATAC-TT----------ATCT-T-GT--------------A---A-TTA---------CA--A-G-AA--T------TA--AT-TTCA----GC-TT-T----TATGGGT-TACCCT-T-AGCTTATC-----------ATA-T-C---T-----------------------T-------CAT-----T---C-----T--A----T--------CA--T--T---TTT-----------------------ACAAT---TG-CAT-A--G--T---ACTATA-T--A--GA--TT-ATG--T--CTGGT-T-TCAAT-TTGT-------------CA-TT-----------------------TG--A----TC--AT--GAC--AT--T--CTC-TAA---T-------------------------aattgcatagtactatatagattatgtctggtttcaatttgtcatttgatcatgacattctctaattaatacatcgtaataaaaataaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|58 ): ACATTTTTTCAAAGTTTTCTAAACGTTCATCTTATCCTTCGCCATAATGGTTGATGTAGAGAG
Unaligned ( gi|61 ): AATATTAAAGAAATGATTATCCATTCTTACGGTTTGGTTTCAATATTT