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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A-GATATAT-TTAAT--GAAGATGGATCATT--AAAAT-------------CAG------------------ATAGCCTCACGA--AA-GAAA-AA-ATTGGTT-AT-GCGAGTATAAG-ATGAT-AAGACATATTTTCAA--A-AAAT---TTGAA--T-TCAGGTAT-GATT--TT-GT-AAAATTC-CCTATATC--A-AATTAA-T-G-ATAT-AGATAGAAAATTTAT-CTCACAACAT-CTGAATGAAAA-TTTTAATTCA-CTTTAA--AAAAC-T-AA-TTC----C-AAGAACC---CTCACTTA--AAGTTAGA-T-ATAGAG--TTTCCAAATAACAG-ATAATAAAA---AAATGGGAAT-CAATATT-TTTTAATTAAAGTTAAATGTA-TT-GACG---CAAATCCTT-G-GCAGAATT--CA--ATTA---AACTAATACACAACT--TAT-TGAGTAATAATA----TTCTTATTA-GCA-AA--TG--GGAT--A---GAAATGTAACT-AATAAGTG--CAA-CACGT-GC--AGTA-A-TGAAATTCGA-AAACACAAAACATCTCATT----------------ATGT-A-----CAA--CA------TA-TATG-G-AAGATC-GCGAGTAGGC-TGCCTCAAATT-ACAA---TTATTTG--GAAA---AC-GTTGTCG-TTGGGTTTTATTTAGACGATAACGAATTGGTAAAGATG-TACA-AACTATTTTC-TC-T-T-TTTAT-AGCGTTT----G---GATTT-ATAAATTATGTAAGATGTATT-GTAG-AGTTGTA---AGGTTCAT-AGAACAAAAGAT---TT-TGTAATTCGCTCCATAAAGGAGTAC--------------ATTGTCAAGTTGTAA-GCGTTTACGTAAAACCCAAATTAGAGAAACTTTTTTCAGAATTTTGTGTCCAAATTATAATTAATTTGCATAGATATA-AT--------ATGTGTGTATGTGTAAATGTATACATGTGTATATCTGCGTGCATGTGTAATAGC------TATCTCTAA-GCCACTATTCGAGGATCCTGTCCTTTAATAGAGCTGCCTATTGTGTCGCGGATCGGATATGAACGGTCGTGATATGTGT-G-ACTCA--GTGGCAGCGTGGCATTTATC--TTT--ATTA-TA-ACACATT----GAATAATATAT--ATACTATGTATT-------TTCTATTCACAA-----TATTGTTCTTT-ACTTGAAATATATATGCAATTTTAAATCTTAAAATTATGATGAAATGAAT-AATAACCAATA-ATTTACATG-CGGGTAAACGAAATT-GCTATGTAACAATATTGTATCCTATACATCT-GTTTTCATAAATAAAAAGATTGAAAACTGGGGAAAAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaacatttattaataattgatttgtgaagatAACAA-ATTGGTT-AT-GCGAGTATAAG-ATTAT-AAGACATATTTTCAA--ATAAAT---
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATAAGCATGAT-A-GACATATTTAAAA--A-AAAT---T-GAAGTC-TCAGGTATTGATT--TTCGTTAAAATTC-CCTATAT---G-AATCAAAAAG-ACATTAGATAGAAAATTAATACTCATAATTT-CAGAACGAAAA-TCTTTATTCTACTTTAAT-AAAACTC-AAATTC----CCAAAAACC---ATCACT-ACAAAGTTAGAGT-AAAAAGATTT-CCAAATAA----ACAATAAAAGGAAA-TTG-AAT-CAATATT-TTTTAATTAAAGTCAAATGGAATTAGAAGA--CAAATCCTTCA-GCAGAATTACCA--ATT-TAGAACTAATACACAACT--TATATGAATAATAATC----TTCTCTTTA-GCAGAA--TG--GGCT--A---GAGAAA-AACT-AATAAATG--TAACCA-GT-AA--AGTACA-TGAAAT-CGACAAACACAATACATCTCATTTTCTAATTAGTAGTTTATGTTA-----CAAATTA------TA-TATAAG-AAGATC-GCAAGTAT-CATGCACCAAATTCACAACAATTATTTG--GAAA--CAC-ATTGTTG-TTGGGTTTGATTTAGACGATAAGGAATTGGTA-----------------TTTTC-TC-TCT-TTTAT-AGAGTTTA---G---GATTT-ATAAAT---GTAAGATGTATT-GTAA-AGTTGTA--CAGGTTCAT-GAAACAAAAGAA---TT-TGTGATTCGCTCCATAAAGGAATACTTGATCTCTAACACATTGTCAAGTTCTAAAGCGTTTATGTACAACC-AAATTAGAGAAACTTTTTTCAGAATTGTGTGTCCAAATTATAATTA-TTTGCATAGATATATATGTGTAGAAATGTGTGTATGTGTAAATGT----ATGTGTAAATGTGTATGTCTGTGTAATAGC------TATATCGAAAGCCACTATTAGAGGGCCCTGTCCTCTAATAGAGGTGCCCATTGTG-------TCGGATATGAACTGTCGTGATATGTATGG-ACTCAATGTGGCAGCATGTCATTTATCTTTTT--ATTA-TACACACATT----GAATA--ATAT--ATACTATGTATC-------ATCTATTCACAA-----T-TTGTTCTTTCACTTA------------------AAATCTTAAAATTATGATGAAATG----AATAACCAATA-ATTTACAT-----GTAAACG-AATT-GCTGTGTAACAATATTGTATCCTATACATCT-G-TTTCAaagatgataagacatanataattaaatg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGA---AA-TGGAATT-CAATATT----------------AATACA-TT-AAAGA--CAAAATCTT-A-GCAGAATT--CA--ATCAAA-AACTAGTACAAAACT--TAT-TGAGTAATAATT----TCCTTATTA-GCA-AA--GG--GGATTGAACTGAAATGTATCT-AATAAGTGTATAAAGG-GT-TT--GGCA-A-CGTAGT-TGA-AAACACAAAACACCTCATT----------------ATGG-A-----CAG--CACACGTGTA-TATA-G-AAGAGC-GCGAATAT-C-TGCATTAATGTCACAA---TTATTTG--ATAA--CAC-ATCA-AG-TTGGGTTTTATTTAGACAATATCGAATTGGTAAATATA-TACA-A-ATATTTTC-TC-TCT-TTCAT-AGCATTTACATGTATGATTT-ATAAA-TAT-TAA-ATGTATT-GTAG-AGTTGTA--CAGGTTGAT-GAAACAAGATAT---TT-TGTAATTTGCTCCACCAAGGAATACTTGAGAGCAT----ATTGTCAAGTCCAAATGCTTTTGTGTAAAACC-AAAGAACAGAAAC-TTGTTCATGATTCTGTGCCCAAGCTATTATTA-TACG-ATA---ACA-AT---------TCTTTGTACATATATATGCATACAGGTGTA--------TGCTTGTGTAGTAGCTATATATATATCTAAAGACACTATTAGAGGGTCCTTTCTTGTAATAGAGCTGCCCATTGctgttttgtatggttatgtcttgtttcatacataaaaagattataaactgaagaaata
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tTAAAGCCACTATTAGAGGGTCCTGTCCTTTTATAGAGCTGCCCATTGTacacagatatatgcccttttcctattttaagatacacacaatatcagaataatatattatgtatcagatatgttctattcacaatacagtatttttctgtcccttgaaattatgtatcttaaatcttg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CCTCTAATAGAGCTGCCCATTGTGTCG-------GATATGAACTGTCGTGATATGTGT-GGACTCAATGTGGCAGCGTGGCATTTATC--TTTTTATTG-TACACACATT----GAATA--ATAT--ATACTATGTATT-------TCCTATTCACAA-----TATTGTTCTTTCACTTGAAATATG----------TAAATCTTAAAATTATGATGAAATGAATACATAACAAATA-ATTTACA-----GGTAAACG-AATT-GCCGTGTAACAATATTGTATCCTTTACATCT-G-TTTCGTt
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gaactgttgaggtttgttcgctcgtttcagagtgaagcgctaaacataccacttatTAT---TTT--AAGA-TACACACAATATCAGAATA--ATAT--AT--TATGTATCAGATATGTTCTATTCACAATACAGTATTTTTCTGTCCCTTGAAAT---TATGT-ATCTTAAATCTTtgttttgtata
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tagaaatggaattcaatattaatacattaaagacaaaatcttagcagaattcaatcaaaaactagtacaaaacttattgagtaataatttccttattagcaaaggggattgaactgaaatgtatctaataagtgtataaagggtttggcaacgtagttgaaaacacaaaacacctcattatggacagcacacgtgtatatagaagagcgcgaatatctgcattaatgtcacaattatttgataacacatcaagttgggttttatttagacaatatcgaattggtaaatatatacaaatattttctctctttcatagcatttacatgtatgatttataaatattaaatgtattgtagagttgtacaggttgatgaaacaagatattttgtaatttgctccaccaaggaatacttgagagcatattgtcaagtccaaatgcttttgtgtaaaaccaaagaacagaaacttgttcatgattctgtgcccaagctattattatacgataacaattctttgtacatatatatgcatacaggtgtatgcttgtgtagtagctatatatatatctaaagacactattagagggtcctttcttgtaatagagctgcccattgacacagatatatgcccttttccATTGTTCTTTCACTTGAAATATGTA----------AATCTTAAAATTATGATGAAATGAATAAATAACAAATA-ATTTACA-----GGTAAACG-AATT-GCTATGTAACAATATTGTATCCTTTACATCT-G-TTTCATg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGAATAGATAACCAATATATTT-TATG-----TAAACG-AATA-GCTATGCAACAATATTGAATCTTATACACCT-G-TTTCATtgttttgtatatgttatgtcttgtttcataaatgaaaagattgaaaactgaaaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTATATGACG---AATTG-AATTTGCCGTGTAACAATATTGTATCCTTTACATCT-G-TTTCGTtatttggtatatgttatgacttgtttcataaataaaaagattaaaaact
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tatattttctatttttttttttttatttcaaactttttaaattcgTTGTATATGTTATGTCTTG-TTTCATAGATAAAAAGATTGAAAACTGAAAAAAAtgttttgtatatgttatgtcttacatatacat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gttT-G-TTTCATACATAAAAAGATTATAAACTGAAGAAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ataagcatgatagacatatttaaaaaaaattgaagtctcaggtattgattttcgttaaaattccctatatgaatcaaaaagacattagatagaaaattaatactcataatttcagaacgaaaatctttattctactttaataaaactcaaattcccaaaaaccatcactacaaagttagagtaaaaagatttccaaataaacaataaaaggaaattgaatcaatattttttaattaaagtcaaatggaattagaagacaaatccttcagcagaattaccaatttagaactaatacacaacttatatgaataataatcttctctttagcagaatgggctagagaaaaactaataaatgtaaccagtaaagtacatgaaatcgacaaacacaatacatctcattttctaattagtagtttatgttacaaattatatataagaagatcgcaagtatcatgcaccaaattcacaacaattatttggaaacacattgttgttgggtttgatttagacgataaggaattggtattttctctcttttatagagtttaggatttataaatgtaagatgtattgtaaagttgtacaggttcatgaaacaaaagaatttgtgattcgctccataaaggaatacttgatctctaacacattgtcaagttctaaagcgtttatgtacaaccaaattagagaaacttttttcagaattgtgtgtccaaattataattatttgcatagatatatatgtgtagaaatgtgtgtatgtgtaaatgtatgtgtaaatgtgtatgtctgtgtaatagctatatcgaaagccactattagagggccctgtcctctaatagaggtgcccattgtgtcggatatgaactgtcgtgatatgtatggactcaatgtggcagcatgtcatttatctttttattatacacacattgaataatatatactatgtatcatctattcacaatttgttctttcacttaaaatcttaaaattatgatgaaatgaataaccaataatttacatgtaaacgaattgctgtgtaacaatattgtatcctatacatctgtttcactgttttgtatggttatgtctT-G-TTTCATAAATAAAAAGATTGAAAACTGAAAAAAAAta
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         attgttctttcacttgaaatatgtaaatcttaaaattatgatgaaatgaataaataacaaataatttacaggtaaacgaattgctatgtaacaatattgtatcctttacatctgtttcattgttttgtatatgttatgtctT-G-TTTCATAAATAAAAAGATTAAAAACT
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TAAGAACTTGCTTAATATCTTTAATTCGGTCCCAAAGA
Unaligned ( gi|18 ): TGCTAGTATTCAATTGTTAACAGGAAGACCAAAAC






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Reference ( family-4671 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AACTTAAAGCATATAAAAGCAATGTGGATTCCACGCCTTGTCATCACGACAGTAAGATCCATATANATGNAAAGNATATACATGTGATCGAAGTNNTTTCTGCAAGAGCCCATNTGAAGATTAGGTCATTGATCGACTTTAGTTTCTAAGAACTTCCGACAATATCAACTGACGATTATGGCATTCNTGACTANCATTTTCCAAACCTCTTCTATATTAAATCAGTGACATATCTTCTTGTGTTCAAACCTCCTGCTACAAGA----ACAAACAACAATACCGTCTCTTAAGCTCTACATTAATTAAATTTCTCCGCTACAANCANTNTGGTGNNAATTTAGANAAAGTTNTCCTNNTACGTACAATGGGNNGCCANT--ATNTTTTTCAGCGTGATTGGNTAAAAACAAGTGGCATTNNTGTTATG-TNAA---AGATATAT-TTAAT--GAAGATGGATCATT--AAAAT-------------CA------------------GATAGCCTCACGA--AG-AAAACAA-ATTGG-TTAT-GCGAGTATAAG-ATGAT-AAGACATATTTTCAA-A-AAA----TTCGAA--T-TCAGGTAT-GAT--TTTCGT-AAAATTC-CCTATATC---GAATTAAAT-G-ATATTAGATAGAAAATT-A-T-CTCACAACAT-C-GAACG-AAAA-TCTTTATTCAACTTTAA-TAAAAC--T-AAATTC----C-AAAAACC---CTCGCTTACAAAGTTAGA-T-ATAGAG--TT-CCAAATAACA-GATAATAAAA---AA-TGGNAAT-CAATATTTTTTAATTAAAGTTAAATGTA-TT-GAAGA--CAAATCCTT-A-GCAGAATT--CA--ATTATA-AACTAATACACAAC--TTAT-TGAG---TAATAAT-NTTCTTATT-AGC--A-AAT--GGGAT--A---GAAATGTAAC-TAATAAGTG--CAAACA-GT-GC--GGTA-A-TGAAA-TCGA-AAACACAAAACATCTCATTT-CTGATTG-----A------ATGT-A-----CA-A--CATA-TATG-G-AAGATC-GCGAGTA-NC-TGCNTCAAATTCACAA---TTATTTG--GAAA--CAC-ATCGTCG-TTGGGTTTNATTTAGACGATAACGAATTGGT-AAAGATA-TAC-A-ACTATTTTC-TC-TCT-TTTAT-AGCGTTTA---G---GATTT-ATAAATTATGTAAGATGTATT-GTAG-AGTTGTA--CAGGTTCAT-GAAACAAAAGAT---TT-TGTAATTCGCTCCATAAAGGAATACTTG---------ACATTGTCAAGTTCT-AA-GCGTTTACGTAAAA-CCAAATTAGAGAAACTTTTTTCAGAATTNTGTGTCCAAATTATAATT-ATTCGCATAGATATA-AT--------ATGTGTGTACGTGTAAATGTATACATGTGTA-AT-TGCG--TGCNTGTGTAATAGC------TATATCTAAAGCCACTATTAGAGGGTCCTGTCCTCTAATAGAGCTGCCCATTGTGTCG----TCGGATATGAACTGTCGTGATATGTGT-G-ACTCAATGTGGCAGCGTGGCATTTATC--TTT--ATTA-TACACACATT----GAATA--ATAT--ATACTATGTATT-------TTCTATTCACAA-----TATTGTTCTTTCACTTGAA----A-TATGTAA-TTTAAATCTT-AAAATTATGATGAAATGAATAAATAACAAATA-ATTTACAT--GGGTAAACG-AATT-GCCGTGTAACAATATTGTATCCTTTACATCT-G-TTTCATAAATAAAAAGATTGAAAACTGAAGAAAAA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-G-TTTCATAAATGAAAAGATTGAAAACTGAAAAAtgttttgtatatgttatgtcttgtttcataaatgaaaagattgaaaactgaaaaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                             attgttctttcacttgaaatatgtaaatcttaaaattatgatgaaatgaataaataacaaataatttacaggtaaacgaattgctatgtaacaatattgtatcctttacatctgtttcattgttttgtatatgttatgtctAAAGCAATGTGGATTCCACGCTTTATTA-----AGAGTAA---TCATATATATAAAAAAGATATACA---GA---AAGT---TTCTGCAAA---CCAT-TGAAAAT-AGAT-ATTGATCA--TTTAGTT---AAGA-CTTCTGA-AATATCAACTGACGATTATAGCATTCATA---AACATTTTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTATAT--GACGAATTG-AATTTGCCGTGTAACAATATTGTATCCTTTACATCT-G-TTTCGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatattttctatttttttttttttatttcaaactttttaaattcgATGAATAGATAACCAATATATTT-TAT--G--TAAACG-AATA-GCTATGCAACAATATTGAATCTTATACACCT-G-TTTCATtgttttgtatatgttatgtcttacatatacat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-G-TTTCATAAATAAAAAGATTAAAAACTtatttggtatatgttatgacttgtttcataaataaaaagattaaaaact
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atgaatagataaccaatatattttatgtaaacgaatagctatgcaacaatattgaatcttatacacctgtttcattatttggtatatgttatgactAACAA-ATTGG-TTAT-GCGAGTATAAG-ATTAT-AAGACATATTTTCAA-ATAAA----T
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTGTATATGTTATGTCTTG-TTTCATAGATAAAAAGATTGAAAACTGAAAAAAAaagatgataagacatanataattaaatg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gttTAAAGCCACTATTAGAGGGTCCTGTCCTTTTATAGAGCTGCCCATTGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AACTTAAAGCATATAAAAGCAATGTGGATTCCACGC-TTGTCATCACGACAGTAAGATC-ATATA-ATGTAAAGTATATATATGTGATCGAAGTC---TCTGCAAGAGCCCATATGAAGATTAGGTCATT-ATTGACTTTAGTTTCTAAGAACTTTCGACAATATCAACTGACGATTATGGCATTCTTGACTAACATTTTCCAAACCTCTTCTATATTAAATCAGTGACATATCTTCTTGTGTTCAAACCTCCTGCTACAAGA----ACAAACAACAATACCGTCTCTTAAGCTCTACATTAATTAAATTTCTCTTCTACAACTATTATGGTGCAAATTTAGACAAAGTTTTCCTTATACGTACAATGGATTATCAAT--ATGTTTT---GCATAATTGGGTAAAAACAAGTAATATTTTTATTATGTTAAA---AGATATATCTTAATCGAAAGATGGATCATT--AAAAT-------------CAGGTAAGAGACCAAATTATGATAGCCTCACGA--AG-AAAACAACAATGGTTTATAGCGAGTATAAG-ATGAT-AAGAC-TATTTCCAATA-AAAATGTTTCAAA--TGTCAGGTAT-GATTCTTTCGT-ACAATTCACCTATATTTAATAATTAAAT-ATATATTAGATAGAAG-------------AACATGC-GAACGAAAAA-TCTTTATTCAACTTTAATTAAAACATT-AAATACAACAT-AAAAAATAAACTCGCTTACAAAGTTAAA-TGATAGAG--TT-CCAAATAACAGGATAAATAAG---AA-TGGTTACACAATATCGTTTAATACAAGTTAAATGTA-AT-AAATATTCAAATCCTT-ACGCAGATAT--CATCATTATC-AACTAATACACAACTGTTAT-T-AGTGTTAATAATCTTTCTTATTAAGCAAA-AATGAGGGATGCA---GAAATGTAACTTAATAAGTG--CAAACA-GTAGCCTAGTA-AGTGGAA-TCGA-AAACACAAAACATCTCATTTATTGATTGTAACAA------ATGT-AACATTCA-C--CATACTATG-GAAAGATCTGCAAATA-GC-TGCCTCAAATT--CAA---TTATTTGACGAAAACCACAATTGTCGCTTGGGTTTATTTTAGACAATAACGATTT--TAAAAGATATTAC-ACCCTATTTTCGTCTTCTATTTATAAGCGTTTA---G---GATTTAATAG---ATGTAAAATGTATTAGTAGTAGTTGTAACTAGGTTCACAGAAACAAAAGATATCTTATGTAATT-GCTTCt
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gi|5                          : ataagcatgatagacatatttaaaaaaaattgaagtctcaggtattgattttcgttaaaattccctatatgaatcaaaaagacattagatagaaaattaatactcataatttcagaacgaaaatctttattctactttaataaaactcaaattcccaaaaaccatcactacaaagttagagtaaaaagatttccaaataaacaataaaaggaaattgaatcaatattttttaattaaagtcaaatggaattagaagacaaatccttcagcagaattaccaatttagaactaatacacaacttatatgaataataatcttctctttagcagaatgggctagagaaaaactaataaatgtaaccagtaaagtacatgaaatcgacaaacacaatacatctcattttctaattagtagtttatgttacaaattatatataagaagatcgcaagtatcatgcaccaaattcacaacaattatttggaaacacattgttgttgggtttgatttagacgataaggaattggtattttctctcttttatagagtttaggatttataaatgtaagatgtattgtaaagttgtacaggttcatgaaacaaaagaatttgtgattcgctccataaaggaatacttgatctctaacacattgtcaagttctaaagcgtttatgtacaaccaaattagagaaacttttttcagaattgtgtgtccaaattataattatttgcatagatatatatgtgtagaaatgtgtgtatgtgtaaatgtatgtgtaaatgtgtatgtctgtgtaatagctatatcgaaagccactattagagggccctgtcctctaatagaggtgcccattgtgtcggatatgaactgtcgtgatatgtatggactcaatgtggcagcatgtcatttatctttttattatacacacattgaataatatatactatgtatcatctattcacaatttgttctttcacttaaaatcttaaaattatgatgaaatgaataaccaataatttacatgtaaacgaattgctgtgtaacaatattgtatcctatacatctgtttcactgttttgtatggttatgtctAGA---AA-TGGAATT-CAATATT---------------AATACA-TT-AAAGA--CAAAATCTT-A-GCAGAATT--CA--ATCAAA-AACTAGTACAAAAC--TTAT-TGAG---TAATAAT-TTCCTTATT-AGC--A-AAG--GGGATTGAACTGAAATGTATC-TAATAAGTGTATAAAGG-GT-TT--GGCA-A-CGTAG-TTGA-AAACACAAAACACCTCATT-----ATGG-----A------CAGC-A-----CACG--TGTA-TATA-G-AAGAGC-GCGAATA-TC-TGCATTAATGTCACAA---TTATTTG--ATAA--CAC-ATCA-AG-TTGGGTTTTATTTAGACAATATCGAATTGGT-AAATATA-TAC-A-AATATTTTC-TC-TCT-TTCAT-AGCATTTACATGTATGATTT-ATAAA-TAT-TAA-ATGTATT-GTAG-AGTTGTA--CAGGTTGAT-GAAACAAGATAT---TT-TGTAATTTGCTCCACCAAGGAATACTTGAGAGC----ATATTGTCAAGTCCA-AATGCTTTTGTGTAAAA-CCAAAGAACAGAAAC-TTGTTCATGATTCTGTGCCCAAGCTATTATT-ATACG-ATA---ACA-AT---------TCTTTGTACATATATATGCATACAGGTGTA----------TGCTTGTGTAGTAGCTATATATATATCTAAAGACACTATTAGAGGGTCCTTTCTTGTAATAGAGCTGCCCATTGta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tTAT---TTT--AAGA-TACACACAATATCAGAATA--ATAT--AT--TATGTATCAGATATGTTCTATTCACAATACAGTATTTTTCTGTCCCTTGAA----ATTATGTAT-CTTAAATCTT-acacagatatatgcccttttcctattttaagatacacacaatatcagaataatatattatgtatcagatatgttctattcacaatacagtatttttctgtcccttgaaattatgtatcttaaatcttg
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TAAGAACTTGCTTAATATCTTTAATTCGGTCCCAAAGA
Unaligned ( gi|18 ): TGCTAGTATTCAATTGTTAACAGGAAGACCAAAAC






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Reference ( family-4671 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AACTTAAAGCATATAAAAGCAATGTGGATTCCACGCCTTATTA--ACGA-AGTAA--CCATATACATAAAAAGNATATACA---GA--GAAGT-TCTGCAAG---CCA-T-TGAAGATTAGATCATT-ATTA--TTTAGTTT--AAGA-CTTCCGA-AATATCAACTGACGATTATAGCATTCTTAA--AACATTTTCCAGACCTNTTCTATATTAAANCAGTGGCATATCTTCTTGTGTTCAAACCTCCTGCTACAAGACAGCACAAACGACAATACCGTCTCTTAAGCTCCACATNAATTAAATT--TCTTTTACAACCATTATGGTGC-AAT----ACAAA--TTTCCTTTT---TA-AAGGG--N-GCCAAT--ATGTTTTG-A-TGATTGGGTAAA---AAGTAGNA-TTTTATTATG-TGAA---AGATATAT-TTAAT--GAAGATGGATCATT--AAAAT-------------CA------------------GATAGCCTCACGA--AG-AAAACAA-ATTGG-TTAT-GCGAGTATAAG-ATGAT-AAGACATATTTTCAA-A-AAA----TTCGAA--T-TCAGGTAT-GAT--TTTCGT-AAAATTC-CCTATATC---GAATTAAAT-G-ATATTAGATAGAAAATTTAT-CTCACAACAT-C-GAACG-AAAATCTTTATTCAACTTTAA-TAAAACA-TAAATTC----C-AAGAACC---CTCACTTACAAAGTTAGA-T-ATAGAG--TT-CCAAATAACA-GATAATAAAA---AA-TGGGAAT-CAATATTTTTTAATTAAAGTTAAATGTA-TT-GAAGA--CAAATCCTT-A-GCAGAATT--CA--ATTATA-AACTAATACACAAC--TTAT-TGAG---TAATAAT-NTTCTTATT-AGC--A-AAT--GGGAT--A---GAAATGTAAC-TAATAAGTG--CAAACA-GT-GC--AGTA-A-TGAAA-TCGA-AAACACAAAACATCTCATTTT---ATTG---------A------ATGT-A-----CA-A--CATA-TATG-G-AAGATC-GCGAGTA-GC-TGCCTCAAATTCACAA---TTATTTG--GAAA--CAC-GTTGTCG-TTGGGTTTTATTTAGACGATAACGAATTGGT-AAAGATG-TAC-A-ACTATTTTC-TC-TCT-TTTAT-AGCGTTTA---G---GATTT-ATAAATTATGTAAGATGTATT-GTAG-AGTTGTA--CAGGTTCAT-GAAACAAAAGAT---TT-TGTAATTCGCTCCATAAAGGAGTACTTGA-------CACATTGTCAAGTTNTAACGCGTTTACGTAAAA-CCAAATTAGAGAAACTTTTTTCAGAATTTTGTGTCCAAATTATAATT-ATTTGCATAGATATA-AT--------ATGTGTGTACGTGTAAATGTATACATGTGTATATCTGCGTGCNTGTGTAATAGC------TATNTCTAAAGCCACTATTAGAGGGTCCTGTCCTTTAATAGAGCTGCCCATTGTGTCGCGGATCGGATATGAACNGTCGTGATATGTGT-G-ACTCAATGTGGCAGCGTGGCATTTATC--TTT--ATTA-TACACACATT----GAATA--ATAT--ATACTATGTATT-------TTCTATTCACAA-----TATTGTTCTTTCACTTGAA----A-TATGTA-A--TTAAATCTT-AAAATTATGATGAAATGAATAAATAACNAATA-ATTTACAT--GGGTAAACG-AATT-GCCGTGTAACAATATTGTATCCTTTACATCT-G-TTTCATAAATAAAAAGATTGAAAACTGAAGAAAAA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-G-TTTCATAAATGAAAAGATTGAAAACTGAAAAAtgttttgtatatgttatgtcttgtttcataaatgaaaagattgaaaactgaaaaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                    attgttctttcacttgaaatatgtaaatcttaaaattatgatgaaatgaataaataacaaataatttacaggtaaacgaattgctatgtaacaatattgtatcctttacatctgtttcattgttttgtatatgttatgtctAAAGCAATGTGGATTCCACGCTTTATTA--A--G-AGTAA--TCATATATATAAAAAAGATATACA---GA--AAGTT-TCTGCAAA---CCA-T-TGAAAA-TAGAT-ATTGATCA--TTTAG-TT--AAGA-CTTCTGA-AATATCAACTGACGATTATAGCATTCAT-A--AACATTTTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTATAT--GACGAATTG-AATTTGCCGTGTAACAATATTGTATCCTTTACATCT-G-TTTCGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatattttctatttttttttttttatttcaaactttttaaattcgATGAATAGATAACCAATATATTT-TAT--G--TAAACG-AATA-GCTATGCAACAATATTGAATCTTATACACCT-G-TTTCATtgttttgtatatgttatgtcttacatatacat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-G-TTTCATAAATAAAAAGATTAAAAACTtatttggtatatgttatgacttgtttcataaataaaaagattaaaaact
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgaatagataaccaatatattttatgtaaacgaatagctatgcaacaatattgaatcttatacacctgtttcattatttggtatatgttatgactAACAA-ATTGG-TTAT-GCGAGTATAAG-ATTAT-AAGACATATTTTCAA-ATAAA----T
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTGTATATGTTATGTCTTG-TTTCATAGATAAAAAGATTGAAAACTGAAAAAAAaagatgataagacatanataattaaatg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gttTAAAGCCACTATTAGAGGGTCCTGTCCTTTTATAGAGCTGCCCATTGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AACTTAAAGCATATAAAAGCAATGTGGATTCCACGC-TTGTCATCACGACAGTAAGATCATATA-ATGTAAAGTATATATATGTGATCGAAGTCTCTGCAAGAGCCCA-TATGAAGATTAGGTCATT-ATTGACTTTAGTTTCTAAGAACTTTCGACAATATCAACTGACGATTATGGCATTCTTGACTAACATTTTCCAAACCTCTTCTATATTAAATCAGTGACATATCTTCTTGTGTTCAAACCTCCTGCTACAAGA----ACAAACAACAATACCGTCTCTTAAGCTCTACATTAATTAAATTTCTCTTCTACAACTATTATGGTGCAAATTTAGACAAAGTTTTCCTTATACGTACAATGGATT-ATCAAT--ATGTTTTGCA-TAATTGGGTAAAAACAAGTAATATTTTTATTATGTTAAA---AGATATATCTTAATCGAAAGATGGATCATT--AAAAT-------------CAGGTAAGAGACCAAATTATGATAGCCTCACGA--AG-AAAACAACAATGGTTTATAGCGAGTATAAG-ATGAT-AAGAC-TATTTCCAATA-AAAATGTTTCAAA--TGTCAGGTAT-GATTCTTTCGT-ACAATTCACCTATATTTAATAATTAAAT-ATATATTAGATAGAAG------------AACATGC-GAACGAAAAATCTTTATTCAACTTTAATTAAAACATTAAATACAACAT-AAAAAATAAACTCGCTTACAAAGTTAAA-TGATAGAG--TT-CCAAATAACAGGATAAATAAG---AA-TGGTTACACAATATCGTTTAATACAAGTTAAATGTA-AT-AAATATTCAAATCCTT-ACGCAGATAT--CATCATTATC-AACTAATACACAACTGTTAT-T-AGTGTTAATAATCTTTCTTATTAAGCAAA-AATGAGGGATGCA---GAAATGTAACTTAATAAGTG--CAAACA-GTAGCCTAGTA-AGTGGAA-TCGA-AAACACAAAACATCTCA-TTT---ATTGATTGTAACAA------ATGT-AACATTCA-C--CATACTATG-GAAAGATCTGCAAATA-GC-TGCCTCAAATT--CAA---TTATTTGACGAAAACCACAATTGTCGCTTGGGTTTATTTTAGACAATAACGATTT--TAAAAGATATTAC-ACCCTATTTTCGTCTTCTATTTATAAGCGTTTA---G---GATTTAATAG---ATGTAAAATGTATTAGTAGTAGTTGTAACTAGGTTCACAGAAACAAAAGATATCTTATGTAATT-GCTTCt
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gi|5                          : ataagcatgatagacatatttaaaaaaaattgaagtctcaggtattgattttcgttaaaattccctatatgaatcaaaaagacattagatagaaaattaatactcataatttcagaacgaaaatctttattctactttaataaaactcaaattcccaaaaaccatcactacaaagttagagtaaaaagatttccaaataaacaataaaaggaaattgaatcaatattttttaattaaagtcaaatggaattagaagacaaatccttcagcagaattaccaatttagaactaatacacaacttatatgaataataatcttctctttagcagaatgggctagagaaaaactaataaatgtaaccagtaaagtacatgaaatcgacaaacacaatacatctcattttctaattagtagtttatgttacaaattatatataagaagatcgcaagtatcatgcaccaaattcacaacaattatttggaaacacattgttgttgggtttgatttagacgataaggaattggtattttctctcttttatagagtttaggatttataaatgtaagatgtattgtaaagttgtacaggttcatgaaacaaaagaatttgtgattcgctccataaaggaatacttgatctctaacacattgtcaagttctaaagcgtttatgtacaaccaaattagagaaacttttttcagaattgtgtgtccaaattataattatttgcatagatatatatgtgtagaaatgtgtgtatgtgtaaatgtatgtgtaaatgtgtatgtctgtgtaatagctatatcgaaagccactattagagggccctgtcctctaatagaggtgcccattgtgtcggatatgaactgtcgtgatatgtatggactcaatgtggcagcatgtcatttatctttttattatacacacattgaataatatatactatgtatcatctattcacaatttgttctttcacttaaaatcttaaaattatgatgaaatgaataaccaataatttacatgtaaacgaattgctgtgtaacaatattgtatcctatacatctgtttcactgttttgtatggttatgtctAGA---AA-TGGAATT-CAATATT---------------AATACA-TT-AAAGA--CAAAATCTT-A-GCAGAATT--CA--ATCAAA-AACTAGTACAAAAC--TTAT-TGAG---TAATAAT-TTCCTTATT-AGC--A-AAG--GGGATTGAACTGAAATGTATC-TAATAAGTGTATAAAGG-GT-TT--GGCA-A-CGTAG-TTGA-AAACACAAAACACCTCA--TT---ATGG---------A------CAGC-A-----CACG--TGTA-TATA-G-AAGAGC-GCGAATA-TC-TGCATTAATGTCACAA---TTATTTG--ATAA--CAC-ATCA-AG-TTGGGTTTTATTTAGACAATATCGAATTGGT-AAATATA-TAC-A-AATATTTTC-TC-TCT-TTCAT-AGCATTTACATGTATGATTT-ATAAA-TAT-TAA-ATGTATT-GTAG-AGTTGTA--CAGGTTGAT-GAAACAAGATAT---TT-TGTAATTTGCTCCACCAAGGAATACTTGAGAG----CATATTGTCAAGTCCAAATGCTTTTGTGTAAAA-CCAAAGAACAGAAAC-TTGTTCATGATTCTGTGCCCAAGCTATTATT-ATACG-ATA---ACA-AT---------TCTTTGTACATATATATGCATACAGGTGTA--------TGCTTGTGTAGTAGCTATATATATATCTAAAGACACTATTAGAGGGTCCTTTCTTGTAATAGAGCTGCCCATTGta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTAT---TTT--AAGA-TACACACAATATCAGAATA--ATAT--AT--TATGTATCAGATATGTTCTATTCACAATACAGTATTTTTCTGTCCCTTGAA----ATTATGTATC--TTAAATCTT-acacagatatatgcccttttcctattttaagatacacacaatatcagaataatatattatgtatcagatatgttctattcacaatacagtatttttctgtcccttgaaattatgtatcttaaatcttg
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-G-TTTCATAAATAAAAAGATTGAAAACTGAAAAAAAAtgttttgtatatgttatgtcttgtttcataaataaaaagattgaaaactgaaaaaaaaa
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tggactcaatgtggcagcgtggcatttatcattttattgtacacacattgaatatatatttatactatgtatttcctattcataatattgttctttcacttgaaatatgtaaatcttaaaaattaagatgaaatgaaaaataacaaataatttacaggtaacgaattgccgtgtaacaatattgtatcctttacatctgtttcattgttttgtatatgttatgtctGTAGGATTTTTT--TTT--TCCAGTACACACATT----GAATA--ATAT--ATACTATGT---------------------------------TCTTTCACTTGAA----A-TATGTA-A------ATCTT-AAAATTAAGATGAAATGAATAAATAACAAATA-ATTTACA----GGTAAACG-AATT-GCCGTGTAACAATATTGTATCCTTTACATCT-G-TTTCAT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|18 ): TGCTAGTATTCAATTGTTAACAGGAAGACCAAAAC






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Reference ( family-4671 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACTTAAAGCATATAAAAGCAATGTGGATTCCACGCCTTATTA--ACGA-AGTAA--TCATATACATAAAAAA-ATATATA---GA--AAAGT-TCTGCAAG---CCA-T-TGAAGAT-AGATCATT-ATTA--TTTAGTT---AAGA-CTTCCGA-AATATCAACTGACGATTATAGCATTCTTGA--AACATTTTCCAGACCTNTTCTATATTAAANCAGTGGCATATCTTCTTGTGTTCAAACCTCCTGCTACAAGACAGCACAAACGACAATACCGTCTCTTAAGCTCCACATNAATTAAATT--TCTTCTACAACCATTATGGTGT-AAT----ACAAA--TTTCCTTTT---TA-AAGGG---GCCAAT--ATGTTTCG-A-TGATTGGGTAAA---AAGTAGTA-TTTTATTATG-TGAA---AGATATAT-TTAAT--GAAGATGGATCATT--AAAAT-------------CA------------------GATAGCCTCACGA--AG-AAAACAA-ATTGG-TTAT-GCGAGTATAAG-ATGAT-AAGACATATTTTCAA-A-AAA----TTCGAA--T-TCAGGTAT-GAT--TTTCGT-AAAATTC-CCTATATC---GAATTAAAT-G-ATATTAGATAGAAAATTTAT-CTCACAACAT-C-GAACGAAAAATCTTTATTCAACTTTAA-TAAAACA-TAAATTC----C-AAGAACC---CTCACTTACAAAGTTAGA-T-ATAGAG--TT-CCAAATAACA-GATAATAAAA---AA-TGGGAAT-CAATATTTTTTAATTAAAGTTAAATGTA-TT-GAAGA--CAAATCCTT-A-GCAGAATT--CA--ATTATA-AACTAATACACAAC--TTAT-TGAG---TAATAAT-NTTCTTATT-AGC--A-AAT--GGGAT--A---GAAATGTAAC-TAATAAGTG--CAAACA-GT-GC--AGTA-A-TGAAA-TCGA-AAACACAAAACATCTCATTTT---ATTG---------A------ATGT-A-----CA-A--CATA-TATG-G-AAGATC-GCGAGTA-GC-TGCCTCAAATTCACAA---TTATTTG--GAAA--CAC-GTTGTCG-TTGGGTTTTATTTAGACGATAACGAATTGGT-AAAGATG-TAC-A-ACTATTTTC-TC-TCT-TTTAT-AGCGTTTA---G---GATTT-ATAAATTATGTAAGATGTATT-GTAG-AGTTGTA--CAGGTTCAT-GAAACAAAAGAT---TT-TGTAATTCGCTCCATAAAGGAGTACTTGA-------CACATTGTCAAGTTNTAACGCGTTTACGTAAAA-CCAAATTAGAGAAACTTTTTTCAGAATTTTGTGTCCAAATTATAATT-ATTTGCATAGATATA-AT--------ATGTGTGTACGTGTAAATGTATACATGTGTATATCTGCGTGCNTGTGTAATAGC------TATNTCTAAAGCCACTATTAGAGGGTCCTGTCCTTTAATAGAGCTGCCCATTGTGTCGCGGATCGGATATGAACNGTCGTGATATGTGT-G-ACTCAATGTGGCAGCGTGGCATTTATC--TTT--ATTA-TACACACATT----GAATA--ATAT--ATACTATGTATT-------TTCTATTCACAA-----TATTGTTCTTTCACTTGAA----A-TATGTA-A--TTAAATCTT-AAAATTATGATGAAATGAATAAATAACNAATA-ATTTACAT--GGGTAAACG-AATT-GCCGTGTAACAATATTGTATCCTTTACATCT-G-TTTCATAAATAAAAAGATTGAAAACTGAAGAAAAA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-G-TTTCATAAATGAAAAGATTGAAAACTGAAAAAtgttttgtatatgttatgtcttgtttcataaatgaaaagattgaaaactgaaaaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                     attgttctttcacttgaaatatgtaaatcttaaaattatgatgaaatgaataaataacaaataatttacaggtaaacgaattgctatgtaacaatattgtatcctttacatctgtttcattgttttgtatatgttatgtctAAAGCAATGTGGATTCCACGCTTTATTA--A--G-AGTAA--TCATATATATAAAAAAGATATACA---GA--AAGTT-TCTGCAAA---CCA-T-TGAAAAT-AGAT-ATTGATCA--TTTAGTT---AAGA-CTTCTGA-AATATCAACTGACGATTATAGCATTCAT-A--AACATTTTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTATAT--GACGAATTG-AATTTGCCGTGTAACAATATTGTATCCTTTACATCT-G-TTTCGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatattttctatttttttttttttatttcaaactttttaaattcgATGAATAGATAACCAATATATTT-TAT--G--TAAACG-AATA-GCTATGCAACAATATTGAATCTTATACACCT-G-TTTCATtgttttgtatatgttatgtcttacatatacat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-G-TTTCATAAATAAAAAGATTAAAAACTtatttggtatatgttatgacttgtttcataaataaaaagattaaaaact
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgaatagataaccaatatattttatgtaaacgaatagctatgcaacaatattgaatcttatacacctgtttcattatttggtatatgttatgactAACAA-ATTGG-TTAT-GCGAGTATAAG-ATTAT-AAGACATATTTTCAA-ATAAA----T
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTGTATATGTTATGTCTTG-TTTCATAGATAAAAAGATTGAAAACTGAAAAAAAaagatgataagacatanataattaaatg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gttTAAAGCCACTATTAGAGGGTCCTGTCCTTTTATAGAGCTGCCCATTGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACTTAAAGCATATAAAAGCAATGTGGATTCCACGC-TTGTCATCACGACAGTAAGATCATATA-ATGTAAAGTATATATATGTGATCGAAGTCTCTGCAAGAGCCCA-TATGAAGATTAGGTCATT-ATTGACTTTAGTTTCTAAGAACTTTCGACAATATCAACTGACGATTATGGCATTCTTGACTAACATTTTCCAAACCTCTTCTATATTAAATCAGTGACATATCTTCTTGTGTTCAAACCTCCTGCTACAAGA----ACAAACAACAATACCGTCTCTTAAGCTCTACATTAATTAAATTTCTCTTCTACAACTATTATGGTGCAAATTTAGACAAAGTTTTCCTTATACGTACAATGGATTATCAAT--ATGTTTTGCA-TAATTGGGTAAAAACAAGTAATATTTTTATTATGTTAAA---AGATATATCTTAATCGAAAGATGGATCATT--AAAAT-------------CAGGTAAGAGACCAAATTATGATAGCCTCACGA--AG-AAAACAACAATGGTTTATAGCGAGTATAAG-ATGAT-AAGAC-TATTTCCAATA-AAAATGTTTCAAA--TGTCAGGTAT-GATTCTTTCGT-ACAATTCACCTATATTTAATAATTAAAT-ATATATTAGATAGAAG------------AACATGC-GAACGAAAAATCTTTATTCAACTTTAATTAAAACATTAAATACAACAT-AAAAAATAAACTCGCTTACAAAGTTAAA-TGATAGAG--TT-CCAAATAACAGGATAAATAAG---AA-TGGTTACACAATATCGTTTAATACAAGTTAAATGTA-AT-AAATATTCAAATCCTT-ACGCAGATAT--CATCATTATC-AACTAATACACAACTGTTAT-T-AGTGTTAATAATCTTTCTTATTAAGCAAA-AATGAGGGATGCA---GAAATGTAACTTAATAAGTG--CAAACA-GTAGCCTAGTA-AGTGGAA-TCGA-AAACACAAAACATCTCA-TTT---ATTGATTGTAACAA------ATGT-AACATTCA-C--CATACTATG-GAAAGATCTGCAAATA-GC-TGCCTCAAATT--CAA---TTATTTGACGAAAACCACAATTGTCGCTTGGGTTTATTTTAGACAATAACGATTT--TAAAAGATATTAC-ACCCTATTTTCGTCTTCTATTTATAAGCGTTTA---G---GATTTAATAG---ATGTAAAATGTATTAGTAGTAGTTGTAACTAGGTTCACAGAAACAAAAGATATCTTATGTAATT-GCTTCt
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gi|5                          : ataagcatgatagacatatttaaaaaaaattgaagtctcaggtattgattttcgttaaaattccctatatgaatcaaaaagacattagatagaaaattaatactcataatttcagaacgaaaatctttattctactttaataaaactcaaattcccaaaaaccatcactacaaagttagagtaaaaagatttccaaataaacaataaaaggaaattgaatcaatattttttaattaaagtcaaatggaattagaagacaaatccttcagcagaattaccaatttagaactaatacacaacttatatgaataataatcttctctttagcagaatgggctagagaaaaactaataaatgtaaccagtaaagtacatgaaatcgacaaacacaatacatctcattttctaattagtagtttatgttacaaattatatataagaagatcgcaagtatcatgcaccaaattcacaacaattatttggaaacacattgttgttgggtttgatttagacgataaggaattggtattttctctcttttatagagtttaggatttataaatgtaagatgtattgtaaagttgtacaggttcatgaaacaaaagaatttgtgattcgctccataaaggaatacttgatctctaacacattgtcaagttctaaagcgtttatgtacaaccaaattagagaaacttttttcagaattgtgtgtccaaattataattatttgcatagatatatatgtgtagaaatgtgtgtatgtgtaaatgtatgtgtaaatgtgtatgtctgtgtaatagctatatcgaaagccactattagagggccctgtcctctaatagaggtgcccattgtgtcggatatgaactgtcgtgatatgtatggactcaatgtggcagcatgtcatttatctttttattatacacacattgaataatatatactatgtatcatctattcacaatttgttctttcacttaaaatcttaaaattatgatgaaatgaataaccaataatttacatgtaaacgaattgctgtgtaacaatattgtatcctatacatctgtttcactgttttgtatggttatgtctAGA---AA-TGGAATT-CAATATT---------------AATACA-TT-AAAGA--CAAAATCTT-A-GCAGAATT--CA--ATCAAA-AACTAGTACAAAAC--TTAT-TGAG---TAATAAT-TTCCTTATT-AGC--A-AAG--GGGATTGAACTGAAATGTATC-TAATAAGTGTATAAAGG-GT-TT--GGCA-A-CGTAG-TTGA-AAACACAAAACACCTCA--TT---ATGG---------A------CAGC-A-----CACG--TGTA-TATA-G-AAGAGC-GCGAATA-TC-TGCATTAATGTCACAA---TTATTTG--ATAA--CAC-ATCA-AG-TTGGGTTTTATTTAGACAATATCGAATTGGT-AAATATA-TAC-A-AATATTTTC-TC-TCT-TTCAT-AGCATTTACATGTATGATTT-ATAAA-TAT-TAA-ATGTATT-GTAG-AGTTGTA--CAGGTTGAT-GAAACAAGATAT---TT-TGTAATTTGCTCCACCAAGGAATACTTGAGAG----CATATTGTCAAGTCCAAATGCTTTTGTGTAAAA-CCAAAGAACAGAAAC-TTGTTCATGATTCTGTGCCCAAGCTATTATT-ATACG-ATA---ACA-AT---------TCTTTGTACATATATATGCATACAGGTGTA--------TGCTTGTGTAGTAGCTATATATATATCTAAAGACACTATTAGAGGGTCCTTTCTTGTAATAGAGCTGCCCATTGta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTAT---TTT--AAGA-TACACACAATATCAGAATA--ATAT--AT--TATGTATCAGATATGTTCTATTCACAATACAGTATTTTTCTGTCCCTTGAA----ATTATGTATC--TTAAATCTT-acacagatatatgcccttttcctattttaagatacacacaatatcagaataatatattatgtatcagatatgttctattcacaatacagtatttttctgtcccttgaaattatgtatcttaaatcttg
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-G-TTTCATAAATAAAAAGATTGAAAACTGAAAAAAAAtgttttgtatatgttatgtcttgtttcataaataaaaagattgaaaactgaaaaaaaaa
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tggactcaatgtggcagcgtggcatttatcattttattgtacacacattgaatatatatttatactatgtatttcctattcataatattgttctttcacttgaaatatgtaaatcttaaaaattaagatgaaatgaaaaataacaaataatttacaggtaacgaattgccgtgtaacaatattgtatcctttacatctgtttcattgttttgtatatgttatgtctGTAGGATTTTTT--TTT--TCCAGTACACACATT----GAATA--ATAT--ATACTATGT---------------------------------TCTTTCACTTGAA----A-TATGTA-A------ATCTT-AAAATTAAGATGAAATGAATAAATAACAAATA-ATTTACA----GGTAAACG-AATT-GCCGTGTAACAATATTGTATCCTTTACATCT-G-TTTCAT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TAAGAACTTGCTTAATATCTTTAATTCGGTCCCAAAGA
Unaligned ( gi|18 ): TGCTAGTATTCAATTGTTAACAGGAAGACCAAAAC






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Reference ( family-4671 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACTTAAAGCATATAAAAGCAATGTGGATTCCACGCCTTATTA--ACGA-AGTAA--TCATATACATAAAAAA-ATATACA---GA--AAAGT-TCTGCAAG---CCA-T-TGAAGAT-AGATCATT-ATTA--TTTAGTT---AAGA-CTTCCGA-AATATCAACTGACGATTATAGCATTCTTGA--AACATTTTCCAGACCTNTTCTATATTAAANCAGTGGCATATCTTCTTGTGTTCAAACCTCCTGCTACAAGACAGCACAAACGACAATACCGTCTCTTAAGCTCCACATNAATTAAATT--TCTTCTACAACCATTATGGTGT-AAT----ACAAA--TTTCCTTTT---TA-AAGGGA--GCCAAT--ATGTTTCG-A-TGATTGGGTAAA---AAGTAGTA-TTTNATTATG-TGAA---AGATATAT-TTAAT--GAAGATGGATCATT--AAAAT-------------CA------------------GATAGCCTCACGA--AG-AAAACAA-ATTGG-TTAT-GCGAGTATAAG-ATGAT-AAGACATATTTTCAA-A-AAA----TTCGAA--T-TCAGGTAT-GAT--TTTCGT-AAAATTC-CCTATATC---GAATTAAAT-G-ATATTAGATAGAAAATTTAT-CTCACAACAT-C-GAACGAAAAATCTTTATTCAACTTTAA-TAAAACA-TAAATTC----C-AAGAACC---CTCACTTACAAAGTTAGA-T-ATAGAG--TT-CCAAATAACA-GATAATAAAA---AA-TGGGAAT-CAATATTTTTTAATTAAAGTTAAATGTA-TT-GAAGA--CAAATCCTT-A-GCAGAATT--CA--ATTATA-AACTAATACACAAC--TTAT-TGAG---TAATAAT-NTTCTTATT-AGC--A-AAT--GGGAT--A---GAAATGTAAC-TAATAAGTG--CAAACA-GT-GC--AGTA-A-TGAAA-TCGA-AAACACAAAACATCTCATTTT---ATTG---------A------ATGT-A-----CA-A--CATA-TATG-G-AAGATC-GCGAGTA-GC-TGCCTCAAATTCACAA---TTATTTG--GAAA--CAC-GTTGTCG-TTGGGTTTTATTTAGACGATAACGAATTGGT-AAAGATG-TAC-A-ACTATTTTC-TC-TCT-TTTAT-AGCGTTTA---G---GATTT-ATAAATTATGTAAGATGTATT-GTAG-AGTTGTA--CAGGTTCAT-GAAACAAAAGAT---TT-TGTAATTCGCTCCATAAAGGAGTACTTGA-------CACATTGTCAAGTTNTAACGCGTTTACGTAAAA-CCAAATTAGAGAAACTTTTTTCAGAATTTTGTGTCCAAATTATAATT-ATTTGCATAGATATA-AT--------ATGTGTGTACGTGTAAATGTATACATGTGTATATCTGCGTGCNTGTGTAATAGC------TATNTCTAAAGCCACTATTAGAGGGTCCTGTCCTTTAATAGAGCTGCCCATTGTGTCGCGGATCGGATATGAACNGTCGTGATATGTGT-G-ACTCAATGTGGCAGCGTGGCATTTATC--TTT--ATTA-TACACACATT----GAATA--ATAT--ATACTATGTATT-------TTCTATTCACAA-----TATTGTTCTTTCACTTGAA----A-TATGTA-A--TTAAATCTT-AAAATTATGATGAAATGAATAAATAACNAATA-ATTTACAT--GGGTAAACG-AATT-GCCGTGTAACAATATTGTATCCTTTACATCT-G-TTTCATAAATAAAAAGATTGAAAACTGAAGAAAAA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-G-TTTCATAAATGAAAAGATTGAAAACTGAAAAAtgttttgtatatgttatgtcttgtttcataaatgaaaagattgaaaactgaaaaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                     attgttctttcacttgaaatatgtaaatcttaaaattatgatgaaatgaataaataacaaataatttacaggtaaacgaattgctatgtaacaatattgtatcctttacatctgtttcattgttttgtatatgttatgtctAAAGCAATGTGGATTCCACGCTTTATTA--A--G-AGTAA--TCATATATATAAAAAAGATATACA---GA--AAGTT-TCTGCAAA---CCA-T-TGAAAAT-AGAT-ATTGATCA--TTTAGTT---AAGA-CTTCTGA-AATATCAACTGACGATTATAGCATTCAT-A--AACATTTTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTATAT--GACGAATTG-AATTTGCCGTGTAACAATATTGTATCCTTTACATCT-G-TTTCGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatattttctatttttttttttttatttcaaactttttaaattcgATGAATAGATAACCAATATATTT-TAT--G--TAAACG-AATA-GCTATGCAACAATATTGAATCTTATACACCT-G-TTTCATtgttttgtatatgttatgtcttacatatacat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-G-TTTCATAAATAAAAAGATTAAAAACTtatttggtatatgttatgacttgtttcataaataaaaagattaaaaact
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgaatagataaccaatatattttatgtaaacgaatagctatgcaacaatattgaatcttatacacctgtttcattatttggtatatgttatgactAACAA-ATTGG-TTAT-GCGAGTATAAG-ATTAT-AAGACATATTTTCAA-ATAAA----T
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTGTATATGTTATGTCTTG-TTTCATAGATAAAAAGATTGAAAACTGAAAAAAAaagatgataagacatanataattaaatg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gttTAAAGCCACTATTAGAGGGTCCTGTCCTTTTATAGAGCTGCCCATTGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACTTAAAGCATATAAAAGCAATGTGGATTCCACGC-TTGTCATCACGACAGTAAGATCATATA-ATGTAAAGTATATATATGTGATCGAAGTCTCTGCAAGAGCCCA-TATGAAGATTAGGTCATT-ATTGACTTTAGTTTCTAAGAACTTTCGACAATATCAACTGACGATTATGGCATTCTTGACTAACATTTTCCAAACCTCTTCTATATTAAATCAGTGACATATCTTCTTGTGTTCAAACCTCCTGCTACAAGA----ACAAACAACAATACCGTCTCTTAAGCTCTACATTAATTAAATTTCTCTTCTACAACTATTATGGTGCAAATTTAGACAAAGTTTTCCTTATACGTACAATGGATTATCAAT--ATGTTTTGCA-TAATTGGGTAAAAACAAGTAATATTTTTATTATGTTAAA---AGATATATCTTAATCGAAAGATGGATCATT--AAAAT-------------CAGGTAAGAGACCAAATTATGATAGCCTCACGA--AG-AAAACAACAATGGTTTATAGCGAGTATAAG-ATGAT-AAGAC-TATTTCCAATA-AAAATGTTTCAAA--TGTCAGGTAT-GATTCTTTCGT-ACAATTCACCTATATTTAATAATTAAAT-ATATATTAGATAGAAG------------AACATGC-GAACGAAAAATCTTTATTCAACTTTAATTAAAACATTAAATACAACAT-AAAAAATAAACTCGCTTACAAAGTTAAA-TGATAGAG--TT-CCAAATAACAGGATAAATAAG---AA-TGGTTACACAATATCGTTTAATACAAGTTAAATGTA-AT-AAATATTCAAATCCTT-ACGCAGATAT--CATCATTATC-AACTAATACACAACTGTTAT-T-AGTGTTAATAATCTTTCTTATTAAGCAAA-AATGAGGGATGCA---GAAATGTAACTTAATAAGTG--CAAACA-GTAGCCTAGTA-AGTGGAA-TCGA-AAACACAAAACATCTCA-TTT---ATTGATTGTAACAA------ATGT-AACATTCA-C--CATACTATG-GAAAGATCTGCAAATA-GC-TGCCTCAAATT--CAA---TTATTTGACGAAAACCACAATTGTCGCTTGGGTTTATTTTAGACAATAACGATTT--TAAAAGATATTAC-ACCCTATTTTCGTCTTCTATTTATAAGCGTTTA---G---GATTTAATAG---ATGTAAAATGTATTAGTAGTAGTTGTAACTAGGTTCACAGAAACAAAAGATATCTTATGTAATT-GCTTCt
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gi|5                          : ataagcatgatagacatatttaaaaaaaattgaagtctcaggtattgattttcgttaaaattccctatatgaatcaaaaagacattagatagaaaattaatactcataatttcagaacgaaaatctttattctactttaataaaactcaaattcccaaaaaccatcactacaaagttagagtaaaaagatttccaaataaacaataaaaggaaattgaatcaatattttttaattaaagtcaaatggaattagaagacaaatccttcagcagaattaccaatttagaactaatacacaacttatatgaataataatcttctctttagcagaatgggctagagaaaaactaataaatgtaaccagtaaagtacatgaaatcgacaaacacaatacatctcattttctaattagtagtttatgttacaaattatatataagaagatcgcaagtatcatgcaccaaattcacaacaattatttggaaacacattgttgttgggtttgatttagacgataaggaattggtattttctctcttttatagagtttaggatttataaatgtaagatgtattgtaaagttgtacaggttcatgaaacaaaagaatttgtgattcgctccataaaggaatacttgatctctaacacattgtcaagttctaaagcgtttatgtacaaccaaattagagaaacttttttcagaattgtgtgtccaaattataattatttgcatagatatatatgtgtagaaatgtgtgtatgtgtaaatgtatgtgtaaatgtgtatgtctgtgtaatagctatatcgaaagccactattagagggccctgtcctctaatagaggtgcccattgtgtcggatatgaactgtcgtgatatgtatggactcaatgtggcagcatgtcatttatctttttattatacacacattgaataatatatactatgtatcatctattcacaatttgttctttcacttaaaatcttaaaattatgatgaaatgaataaccaataatttacatgtaaacgaattgctgtgtaacaatattgtatcctatacatctgtttcactgttttgtatggttatgtctAGA---AA-TGGAATT-CAATATT---------------AATACA-TT-AAAGA--CAAAATCTT-A-GCAGAATT--CA--ATCAAA-AACTAGTACAAAAC--TTAT-TGAG---TAATAAT-TTCCTTATT-AGC--A-AAG--GGGATTGAACTGAAATGTATC-TAATAAGTGTATAAAGG-GT-TT--GGCA-A-CGTAG-TTGA-AAACACAAAACACCTCA--TT---ATGG---------A------CAGC-A-----CACG--TGTA-TATA-G-AAGAGC-GCGAATA-TC-TGCATTAATGTCACAA---TTATTTG--ATAA--CAC-ATCA-AG-TTGGGTTTTATTTAGACAATATCGAATTGGT-AAATATA-TAC-A-AATATTTTC-TC-TCT-TTCAT-AGCATTTACATGTATGATTT-ATAAA-TAT-TAA-ATGTATT-GTAG-AGTTGTA--CAGGTTGAT-GAAACAAGATAT---TT-TGTAATTTGCTCCACCAAGGAATACTTGAGAG----CATATTGTCAAGTCCAAATGCTTTTGTGTAAAA-CCAAAGAACAGAAAC-TTGTTCATGATTCTGTGCCCAAGCTATTATT-ATACG-ATA---ACA-AT---------TCTTTGTACATATATATGCATACAGGTGTA--------TGCTTGTGTAGTAGCTATATATATATCTAAAGACACTATTAGAGGGTCCTTTCTTGTAATAGAGCTGCCCATTGta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTAT---TTT--AAGA-TACACACAATATCAGAATA--ATAT--AT--TATGTATCAGATATGTTCTATTCACAATACAGTATTTTTCTGTCCCTTGAA----ATTATGTATC--TTAAATCTT-acacagatatatgcccttttcctattttaagatacacacaatatcagaataatatattatgtatcagatatgttctattcacaatacagtatttttctgtcccttgaaattatgtatcttaaatcttg
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-G-TTTCATAAATAAAAAGATTGAAAACTGAAAAAAAAtgttttgtatatgttatgtcttgtttcataaataaaaagattgaaaactgaaaaaaaaa
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Reference ( family-4671 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACTTAAAGCATATAAAAGCAATGTGGATTCCACGCCTTATTA--ACGA-AGTAA--TCATATACATAAAAAA-ATATACA---GA--AAAGT-TCTGCAAG---CCA-T-TGAAGAT-AGATCATT-ATTA--TTTAGTT---AAGA-CTTCCGA-AATATCAACTGACGATTATAGCATTCTTGA--AACATTTTCCAGACCTNTTCTATATTAAANCAGTGGCATATCTTCTTGTGTTCAAACCTCCTGCTACAAGACAGCACAAACGACAATACCGTCTCTTAAGCTCCACATNAATTAAATT--TCTTCTACAACCATTATGGTGT-AAT----ACAAA--TTTCCTTTT---TA-AAGGGA--GCCAAT--ATGTTTCG-A-TGATTGGGTAAA---AAGTAGTA-TTTNATTATG-TGAA---AGATATAT-TTAAT--GAAGATGGATCATT--AAAAT-------------CA------------------GATAGCCTCACGA--AG-AAAACAA-ATTGG-TTAT-GCGAGTATAAG-ATGAT-AAGACATATTTTCAA-A-AAA----TTCGAA--T-TCAGGTAT-GAT--TTTCGT-AAAATTC-CCTATATC---GAATTAAAT-G-ATATTAGATAGAAAATTTAT-CTCACAACAT-C-GAACGAAAAATCTTTATTCAACTTTAA-TAAAACA-TAAATTC----C-AAGAACC---CTCACTTACAAAGTTAGA-T-ATAGAG--TT-CCAAATAACA-GATAATAAAA---AA-TGGGAAT-CAATATTTTTTAATTAAAGTTAAATGTA-TT-GAAGA--CAAATCCTT-A-GCAGAATT--CA--ATTATA-AACTAATACACAAC--TTAT-TGAG---TAATAAT-NTTCTTATT-AGC--A-AAT--GGGAT--A---GAAATGTAAC-TAATAAGTG--CAAACA-GT-GC--AGTA-A-TGAAA-TCGA-AAACACAAAACATCTCA-TT-----AT-----------G---ATGT-A-----CAA--CA------TA-TATG-G-AAGATC-GCGAGTA-GC-TGCCTCAAATTCACAA---TTATTTG--GAAA--CAC-GTTGTCG-TTGGGTTTTATTTAGACGATAACGAATTGGT-AAAGATG-TAC--A--CTATTTTC-TC-TCT-TTTAT-AGCGTTTA---G---GATTTATAAA-T-ATGTAAGATGTATT-GTAG-AGTTGTA--CAGGTTCAT-GAAACAAAAGAT---TT-TGTAATTCGCTCCATAAAGGAGTACTTGA-------CACATTGTCAAGTTNTAACGCGTTTACGTAAAA-CCAAATTAGAGAAACTTTTTTCAGAATTTTGTGTCCAAATTATAATT-ATTTGCATAGATATA-AT--------ATGTGTGTACGTGTAAATGTATACATGTGTATATCTGCGTGCNTGTGTAATAGC------TATNTCTAAAGCCACTATTAGAGGGTCCTGTCCTTTAATAGAGCTGCCCATTGTGTCGCGGATCGGATATGAACNGTCGTGATATGTGT-G-ACTCAATGTGGCAGCGTGGCATTTATC--TTTATTA-TACACACATT----GAATA--ATAT--ATACTATGTATT-------TTCTATTCACAA-----TATTGTTCTTTCACTTGAAA-TATGTA--------TAAATCTT-AAAATTATGATGAAATGAATAAATAACNAATA-ATTTACA----GGTAAACG-AATT-GCCGTGTAACAATATTGTATCCTTTACATCT-G-TTTCATAAATAAAAAGATTGAAAACTGAAGAAAAA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T-G-TTTCATAAATGAAAAGATTGAAAACTGAAAAAtgttttgtatatgttatgtcttgtttcataaatgaaaagattgaaaactgaaaaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                     attgttctttcacttgaaatatgtaaatcttaaaattatgatgaaatgaataaataacaaataatttacaggtaaacgaattgctatgtaacaatattgtatcctttacatctgtttcattgttttgtatatgttatgtctAAAGCAATGTGGATTCCACGCTTTATTA--A--G-AGTAA--TCATATATATAAAAAAGATATACA---GA--AAGTT-TCTGCAAA---CCA-T-TGAAAAT-AGAT-ATTGATCA--TTTAGTT---AAGA-CTTCTGA-AATATCAACTGACGATTATAGCATTCAT-A--AACATTTTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          G-AATTTGCCGTGTAACAATATTGTATCCTTTACATCT-G-TTTCGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatattttctatttttttttttttatttcaaactttttaaattcgttatatgacgaattATGAATAGATAACCAATATATTT-TA----TGTAAACG-AATA-GCTATGCAACAATATTGAATCTTATACACCT-G-TTTCATtgttttgtatatgttatgtcttacatatacat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T-G-TTTCATAAATAAAAAGATTAAAAACTtatttggtatatgttatgacttgtttcataaataaaaagattaaaaact
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgaatagataaccaatatattttatgtaaacgaatagctatgcaacaatattgaatcttatacacctgtttcattatttggtatatgttatgactAACAA-ATTGG-TTAT-GCGAGTATAAG-ATTAT-AAGACATATTTTCAA-ATAAA----T
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTGTATATGTTATGTCTTG-TTTCATAGATAAAAAGATTGAAAACTGAAAAAAAaagatgataagacatanataattaaatg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gttTAAAGCCACTATTAGAGGGTCCTGTCCTTTTATAGAGCTGCCCATTGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACTTAAAGCATATAAAAGCAATGTGGATTCCACGC-TTGTCATCACGACAGTAAGATCATATA-ATGTAAAGTATATATATGTGATCGAAGTCTCTGCAAGAGCCCA-TATGAAGATTAGGTCATT-ATTGACTTTAGTTTCTAAGAACTTTCGACAATATCAACTGACGATTATGGCATTCTTGACTAACATTTTCCAAACCTCTTCTATATTAAATCAGTGACATATCTTCTTGTGTTCAAACCTCCTGCTACAAGA----ACAAACAACAATACCGTCTCTTAAGCTCTACATTAATTAAATTTCTCTTCTACAACTATTATGGTGCAAATTTAGACAAAGTTTTCCTTATACGTACAATGGATTATCAAT--ATGTTTTGCA-TAATTGGGTAAAAACAAGTAATATTTTTATTATGTTAAA---AGATATATCTTAATCGAAAGATGGATCATT--AAAAT-------------CAGGTAAGAGACCAAATTATGATAGCCTCACGA--AG-AAAACAACAATGGTTTATAGCGAGTATAAG-ATGAT-AAGAC-TATTTCCAATA-AAAATGTTTCAAA--TGTCAGGTAT-GATTCTTTCGT-ACAATTCACCTATATTTAATAATTAAAT-ATATATTAGATAGAAG------------AACATGC-GAACGAAAAATCTTTATTCAACTTTAATTAAAACATTAAATACAACAT-AAAAAATAAACTCGCTTACAAAGTTAAA-TGATAGAG--TT-CCAAATAACAGGATAAATAAG---AA-TGGTTACACAATATCGTTTAATACAAGTTAAATGTA-AT-AAATATTCAAATCCTT-ACGCAGATAT--CATCATTATC-AACTAATACACAACTGTTAT-T-AGTGTTAATAATCTTTCTTATTAAGCAAA-AATGAGGGATGCA---GAAATGTAACTTAATAAGTG--CAAACA-GTAGCCTAGTA-AGTGGAA-TCGA-AAACACAAAACATCTCATTT-----ATTGATTGTAACAA---ATGT-AACATTCAC--CA------TACTATG-GAAAGATCTGCAAATA-GC-TGCCTCAAATT--CAA---TTATTTGACGAAAACCACAATTGTCGCTTGGGTTTATTTTAGACAATAACGATTT--TAAAAGATATTAC--ACCCTATTTTCGTCTTCTATTTATAAGCGTTTA---G---GATTTA-ATA-G-ATGTAAAATGTATTAGTAGTAGTTGTAACTAGGTTCACAGAAACAAAAGATATCTTATGTAATT-GCTTCt
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gi|5                          : ataagcatgatagacatatttaaaaaaaattgaagtctcaggtattgattttcgttaaaattccctatatgaatcaaaaagacattagatagaaaattaatactcataatttcagaacgaaaatctttattctactttaataaaactcaaattcccaaaaaccatcactacaaagttagagtaaaaagatttccaaataaacaataaaaggaaattgaatcaatattttttaattaaagtcaaatggaattagaagacaaatccttcagcagaattaccaatttagaactaatacacaacttatatgaataataatcttctctttagcagaatgggctagagaaaaactaataaatgtaaccagtaaagtacatgaaatcgacaaacacaatacatctcattttctaattagtagtttatgttacaaattatatataagaagatcgcaagtatcatgcaccaaattcacaacaattatttggaaacacattgttgttgggtttgatttagacgataaggaattggtattttctctcttttatagagtttaggatttataaatgtaagatgtattgtaaagttgtacaggttcatgaaacaaaagaatttgtgattcgctccataaaggaatacttgatctctaacacattgtcaagttctaaagcgtttatgtacaaccaaattagagaaacttttttcagaattgtgtgtccaaattataattatttgcatagatatatatgtgtagaaatgtgtgtatgtgtaaatgtatgtgtaaatgtgtatgtctgtgtaatagctatatcgaaagccactattagagggccctgtcctctaatagaggtgcccattgtgtcggatatgaactgtcgtgatatgtatggactcaatgtggcagcatgtcatttatctttttattatacacacattgaataatatatactatgtatcatctattcacaatttgttctttcacttaaaatcttaaaattatgatgaaatgaataaccaataatttacatgtaaacgaattgctgtgtaacaatattgtatcctatacatctgtttcactgttttgtatggttatgtctAGA---AA-TGGAATT-CAATATT---------------AATACA-TT-AAAGA--CAAAATCTT-A-GCAGAATT--CA--ATCAAA-AACTAGTACAAAAC--TTAT-TGAG---TAATAAT-TTCCTTATT-AGC--A-AAG--GGGATTGAACTGAAATGTATC-TAATAAGTGTATAAAGG-GT-TT--GGCA-A-CGTAG-TTGA-AAACACAAAACACCTCA-TT-----AT-----------G---G----A-----CAG--CACACGTGTA-TATA-G-AAGAGC-GCGAATA-TC-TGCATTAATGTCACAA---TTATTTG--ATAA--CAC-ATCA-AG-TTGGGTTTTATTTAGACAATATCGAATTGGT-AAATATA-TACA-A--ATATTTTC-TC-TCT-TTCAT-AGCATTTACATGTATGATTTATAAA-T-AT-TAA-ATGTATT-GTAG-AGTTGTA--CAGGTTGAT-GAAACAAGATAT---TT-TGTAATTTGCTCCACCAAGGAATACTTGAGAG----CATATTGTCAAGTCCAAATGCTTTTGTGTAAAA-CCAAAGAACAGAAAC-TTGTTCATGATTCTGTGCCCAAGCTATTATT-ATACG-ATA---ACA-AT---------TCTTTGTACATATATATGCATACAGGTGTA--------TGCTTGTGTAGTAGCTATATATATATCTAAAGACACTATTAGAGGGTCCTTTCTTGTAATAGAGCTGCCCATTGta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tTAT---TTTAAGA-TACACACAATATCAGAATA--ATAT--AT--TATGTATCAGATATGTTCTATTCACAATACAGTATTTTTCTGTCCCTTGAAATTATGTATCT-----TAAATCTT-acacagatatatgcccttttcctattttaagatacacacaatatcagaataatatattatgtatcagatatgttctattcacaatacagtatttttctgtcccttgaaattatgtatcttaaatcttg
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gaactgttgaggtttgttcgctcgtttcagagtgaagcgctaaacataccacttatTT--TCTTCGACAAACAATTTGGTGT-AAT----AAAAA--TATTTTGTT---TA-AAGGGAA-GCCACT--CTTTTTCA-AGTG-TTGGTTAAA---AAGTGGCA-TT-AAGTATG-TGAA---AGATCTTT-TTGAT--GAAAATGGGTCATTTAAGAATATAGAACAATTTGCA------------------GATG---TTATAAATAGTAAAAGTA-ACTGG-CTTT-GTGAATATAAA-ATGCTCAAAACA-GTTTTCAA-A-AAtgttttgtata
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TAAGAACTTGCTTAATATCTTTAATTCGGTCCCAAAGA
Unaligned ( gi|18 ): TGCTAGTATTCAATTGTTAACAGGAAGACCAAAAC