lowQualScore : 11
lowQualScore : 2 99 5 666 5555 2 66 2
lowQualScore : . .. . ... .... . .. .
lowQualScore : 7 00 3 777 7777 7 33 9
consensus : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTA
Reference ( gi|12 ) : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTA
gi|7 : TTTTTTGAGAT-TT--GTTTGTT--AAAAAAC----G-GGAAAAAAATACAT-TTTTGTCCTA
gi|5 : tTTTTGTTAGAT-TTTGGTTT-TT--AAAAAAC----G-GAAAAAAAATACATGTTTTGTCCTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncat
gi|2 : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-AT--AAAAAAC----GAA--AAAAAATACAT-TTATTTCCTAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|1 : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT---ATAAAC----G-G---AAAAATATGT-TTTTGTCCacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatg
gi|8 : ttTTTTTTTGGATCTT--GTTT-CT--AAAAAAGATAGG-A--AAAAAATACA--TTTTGTCCTAcctaacccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttta
gi|4 : TTTTTTAGAC-TT--GTTT-TT--TAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTAtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|3 : TTTTTTAGAT-TTA-GTTT-TT--GAAAAAC----G-GGAAAAAAATACAT-TTTTGTCCTAacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatg
gi|15 : TTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacatttt
gi|9 : TTTTTTAGAT-TT--GTCT-TT--TAAAAAC----G-G--AAAAAA-ATAA-TTTTGTCCTA
gi|16 : TTTTTTAGAT-GT---TTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-acnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|17 : TTTTTTAGAT-GT---TTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACA
gi|11 : TTGTTTAGAT-TTT-GTTT-TTTTAAAAAAC----G-GA-AAAAAATACTA-TTTTGTC
gi|13 : TTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAGAA----G-G--GAAAAATACTT-TTTTGTCCTAta
gi|6 : TTTTA-AT-TT--GTCT-TT--AAAAAAC----C-GC-GAAAAATACAT-TTTTGTCCTAa
gi|14 : GAT-TT--GTTTATT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTATCCTAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncat
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCCCATG
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 2 88 5 555 5555 2 55 2
lowQualScore : . .. . ... .... . .. .
lowQualScore : 5 44 0 777 3333 5 33 7
consensus : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTA
Reference ( family-4607 ) : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTA
gi|1 : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT---ATAAAC----G-G---AAAAATATGT-TTTTGTCC
gi|11 : ttTTGTTTAGAT-TTT-GTTT-TTTTAAAAAAC----G-GA-AAAAAATACTA-TTTTGTCcctaacccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttta
gi|12 : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTAta
gi|13 : TTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAGAA----G-G--GAAAAATACTT-TTTTGTCCTA
gi|14 : GAT-TT--GTTTATT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTATCCTAa
gi|15 : TTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGa
gi|16 : TTTTTTAGAT-GT---TTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-
gi|17 : TTTTTTAGAT-GT---TTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACA
gi|2 : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-AT--AAAAAAC----GAA--AAAAAATACAT-TTATTTCCTA
gi|3 : TTTTTTAGAT-TTA-GTTT-TT--GAAAAAC----G-GGAAAAAAATACAT-TTTTGTCCTAacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatg
gi|4 : TTTTTTAGAC-TT--GTTT-TT--TAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTAacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacatttt
gi|5 : TTTTGTTAGAT-TTTGGTTT-TT--AAAAAAC----G-GAAAAAAAATACATGTTTTGTCCTAacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatg
gi|6 : TTTTA-AT-TT--GTCT-TT--AAAAAAC----C-GC-GAAAAATACAT-TTTTGTCCTAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|7 : TTTTTTGAGAT-TT--GTTTGTT--AAAAAAC----G-GGAAAAAAATACAT-TTTTGTCCTAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncat
gi|8 : tTTTTTTTGGATCTT--GTTT-CT--AAAAAAGATAGG-A--AAAAAATACA--TTTTGTCCTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncat
gi|9 : TTTTTTAGAT-TT--GTCT-TT--TAAAAAC----G-G--AAAAAA-ATAA-TTTTGTCCTAtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCCCATG
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 2 88 5 555 5555 2 55 2
lowQualScore : . .. . ... .... . .. .
lowQualScore : 5 44 0 777 3333 5 33 7
consensus : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTA
Reference ( family-4607 ) : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTA
gi|1 : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT---ATAAAC----G-G---AAAAATATGT-TTTTGTCC
gi|11 : ttTTGTTTAGAT-TTT-GTTT-TTTTAAAAAAC----G-GA-AAAAAATACTA-TTTTGTCcctaacccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttta
gi|12 : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTAta
gi|13 : TTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAGAA----G-G--GAAAAATACTT-TTTTGTCCTA
gi|14 : GAT-TT--GTTTATT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTATCCTAa
gi|15 : TTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGa
gi|16 : TTTTTTAGAT-GT---TTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-
gi|17 : TTTTTTAGAT-GT---TTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACA
gi|2 : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-AT--AAAAAAC----GAA--AAAAAATACAT-TTATTTCCTA
gi|3 : TTTTTTAGAT-TTA-GTTT-TT--GAAAAAC----G-GGAAAAAAATACAT-TTTTGTCCTAacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatg
gi|4 : TTTTTTAGAC-TT--GTTT-TT--TAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTAacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacatttt
gi|5 : TTTTGTTAGAT-TTTGGTTT-TT--AAAAAAC----G-GAAAAAAAATACATGTTTTGTCCTAacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatg
gi|6 : TTTTA-AT-TT--GTCT-TT--AAAAAAC----C-GC-GAAAAATACAT-TTTTGTCCTAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|7 : TTTTTTGAGAT-TT--GTTTGTT--AAAAAAC----G-GGAAAAAAATACAT-TTTTGTCCTAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncat
gi|8 : tTTTTTTTGGATCTT--GTTT-CT--AAAAAAGATAGG-A--AAAAAATACA--TTTTGTCCTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncat
gi|9 : TTTTTTAGAT-TT--GTCT-TT--TAAAAAC----G-G--AAAAAA-ATAA-TTTTGTCCTAtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
blockSeqs : C TG A TTA ATAG A GA G
blockSeqs : . T G G . . AA .
blockSeqs : . A . G . . GA .
blockSeqs : . . . G . . A .
blockSeqs : . . . G . . C .
blockSeqs : . . . G . . . .
blockSeqs : . . . G . . . .
blockSeqs : . . . A . . . .
blockSeqs : . . . G . . . .
blockSeqs : . . . T . . . .
blockSeqs : . . . A . . . .
blockSeqs : . . . A . . . .
blockSeqs : . . . A . . . .
blockSeqs : . . . A . . . .
blockSeqs : . . . T . . .
blockSeqCons : G**
originalCons : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTA
finalCons : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TTG--AAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCCCATG
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 2 88 5 555 5555 2 55 2
lowQualScore : . .. . ... .... . .. .
lowQualScore : 5 44 0 777 3333 5 33 7
consensus : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTA
Reference ( family-4607 ) : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTA
gi|1 : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT---ATAAAC----G-G---AAAAATATGT-TTTTGTCC
gi|11 : ttTTGTTTAGAT-TTT-GTTT-TTTTAAAAAAC----G-GA-AAAAAATACTA-TTTTGTCcctaacccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttta
gi|12 : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTAta
gi|13 : TTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAGAA----G-G--GAAAAATACTT-TTTTGTCCTA
gi|14 : GAT-TT--GTTTATT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTATCCTAa
gi|15 : TTTTTTAGAT-TT--GTTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGa
gi|16 : TTTTTTAGAT-GT---TTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-
gi|17 : TTTTTTAGAT-GT---TTT-TT--GAAAAAC----G-G--AAAAAATACA
gi|2 : TTTTTTTAGAT-TT--GTTT-AT--AAAAAAC----GAA--AAAAAATACAT-TTATTTCCTA
gi|3 : TTTTTTAGAT-TTA-GTTT-TT--GAAAAAC----G-GGAAAAAAATACAT-TTTTGTCCTAacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatg
gi|4 : TTTTTTAGAC-TT--GTTT-TT--TAAAAAC----G-G--AAAAAATACAT-TTTTGTCCTAacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacatttt
gi|5 : TTTTGTTAGAT-TTTGGTTT-TT--AAAAAAC----G-GAAAAAAAATACATGTTTTGTCCTAacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatg
gi|6 : TTTTA-AT-TT--GTCT-TT--AAAAAAC----C-GC-GAAAAATACAT-TTTTGTCCTAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|7 : TTTTTTGAGAT-TT--GTTTGTT--AAAAAAC----G-GGAAAAAAATACAT-TTTTGTCCTAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncat
gi|8 : tTTTTTTTGGATCTT--GTTT-CT--AAAAAAGATAGG-A--AAAAAATACA--TTTTGTCCTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncat
gi|9 : TTTTTTAGAT-TT--GTCT-TT--TAAAAAC----G-G--AAAAAA-ATAA-TTTTGTCCTAtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGCCCATG