lowQualScore                  :                                                       111                                          2222       11111111        11111111111111                   22222     3333333333333333333                                        22222222222222222                                                                                           222                                                 1111                                                                                                2                                                 
lowQualScore                  :           1    1 1 1   2 222   11    11  55     2   6 999 11 66666  2  1   2222   5555   1 333333  2222  1    00000000 1      22222222222222      222    22    44444     2222222222222222222   11    33333    222     11 222 1  2   44444444444444444   555      33   2   1   44     1 11 4444      33  2 1   33 1  4444444444 1 5  1     1  11 555 11 555       1   11   11 444444444  444  33 11  6666 1   4     3    222 4 11 1     1      11 88  9999  1  1    1 55555   1  1 1  1   1          1   3 1 1 22 1  555555       2  55555   55555 2       
lowQualScore                  :           .    . . .   . ...   ..    ..  ..     .   . ... .. .....  .  .   ....   ....   . ......  ....  .    ........ .      ..............      ...    ..    .....     ...................   ..    .....    ...     .. ... .  .   .................   ...      ..   .   .   ..     . .. ....      ..  . .   .. .  .......... . .  .     .  .. ... .. ...       .   ..   .. .........  ...  .. ..  .... .   .     .    ... . .. .     .      .. ..  ....  .  .    . .....   .  . .  .   .          .   . . . .. .  ......       .  .....   ..... .       
lowQualScore                  :           4    3 3 3   7 333   88    88  33     6   4 888 88 55555  7  3   8888   4444   3 888888  2222  3    11111111 5      33333333333333      777    11    33333     3333333333333333333   99    44444    444     88 333 3  8   66666666666666666   000      88   8   4   77     4 99 8888      55  6 3   11 1  9999999999 1 6  1     1  66 999 44 888       0   44   44 666666666  999  99 33  4444 0   0     5    999 6 66 1     1      55 44  2222  3  1    2 44444   3  3 5  5   5          6   5 8 8 55 8  222222       0  00000   00000 0       
consensus                     :    NTTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTATTT--G--G----TCG-AA-ACA----ACA--C-CAC-A------TG-A-CTT-TTTA-T------A-AACAACG-A--AT-T-----GACCTG---ATGT--TTCCTTAAAATAGA---AG--T-TAAAT-TGAACCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---T-AG-AAG---N---T--------AATT---GACCTG--ATG-TTT-CCT--AAAAT-A--G----CACCAC--TT-T-CGT--T-AT----------C-C-TT-TCAGC-TT--TC--T--A---TTGTGAC-GTC--ACA--AT--------TAG--AG-TG--CT----AGCCTTTCAGC-TTTC-C-A-T--T-GTGAC-GTCACA--A-TTA--N-AGTGC-TAAA-A--TC-AAT-AA-T-TT-AGC-GTTGCATTAT-TAT-A-C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGT-----T-ATTGCAG
Reference ( gi|3 )            :    TTTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTATTT--G--G----CCG-AA-ACA----ACA--T-CAC-A------TG-AACTT-TTTA-T------A-AACAATA-A--AT-T-----GACCTG---ATGT--TTCCTTAAGATAGA---AG--T-TAAAT-TGAACCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---T-AG-AAG---A---T--------AATT---GACCTG--ATG-TTT-CCT--AAAAT-A--G----CACCAC--TT-T-CGT--T-AT----------T-C-TT-TCAGC-TT--TC-AT--A---TTGTGAC-GTC--ACA--AT--------TAG--AG-TG--CT----AGCCTTTCAGC-TTTC-C-A-T--T-GTGAC-GTCACA--A-TTA--G-AGTGC-TAAA-A--TC-AAT-AA-T-TT-AGC-GTTGCATTAT-TATCA-C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGT-----T-ATTGCAG
gi|4                          :     TTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTATT---G--G----CCG-AA-ACA----ACA--T-CAC-A------TG-A-CTT-TTTA-T------A-AACAATA-A--AT-T-----GACCTG---ATGT--TTCCT-AAGATAGA---AG--T-TAA-T-TGA-CCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---T-AG-AAG---A---T--------AATT---GACCTG--ATG-TTT-CCT--AAAATTA--G----CAC-A---TT-T-CGT--T-AT----------T-C-TT-TCAGC-TT--TC-ACTAA---TTGTGAC-GTC--ACA--AT--------TAG--AG-TG--CT----AGCCTTTCAGC-TTTC-C-A-T--T-GTGAC-GTCACA--A-TTA--G-AGTGC-TAAA-A--TC-AAT-AA-T-TT-AGC-GTTCCATTAT-TATCA-C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGT-----T-ATTGCAG
gi|6                          :     TTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTATT---G--G----TCG-AA-ACA----ATA--T-CAC-A------TG-A-CTT-TTTA--------A-AACAATG-A--AT-T-----GACCTG---ATGT--TTCCT-AAAATA-A---AG--T-TAA-T-TGA-CCT--GATG-----CTTC---CTAAA--A---T-AA-AAG---T---T--------AATT---GACCTG--ATGTTTT-CCTA-AAAAT-A--G----CACCAC--TT-T-CGT--T-AT----------T-C-TT-TCAGC-TT--TT--T--A---TTGTGAC-GTC--ACA--AT--------TAG--AG-TG--CT----AGCCTTTCAGC-TTTC-C-A----T-GTGAT-GTCACA--A-TTA--C-AGTGC-TAAA-A--TC-AAT-AA-T-TT-AGC-GTTGCATTA--TATTA-C-T--A-AA------TATTGGG-AT-----AGT-----T-ATTGCAGc
gi|11                         :     TTATTA-TTTT-T-T-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTATT---G--G----TCG-AA-ACA----ACA--C-CAC-A------TG-A-CTT-ATTA-T------A-AATA-------------------------ATGT-----------ATAGA---A----------------CT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---T-AG-AAGT--A---T--------TATA---GACCTG--ATG-TTT-CCT--AAAAT-A--G----CACCAC--TT-T-CGT--T-AT----------C-C-TT-CCAGC-TT--TC--T--A---TTGTGAC-GTATAACA--AT--------TAT--AG-TG--CT----CTCCTTTCCGC-TTTC-C-A-T--T-GTGAC-GCCACA--A-TTA--T-AGTGC-TAAA-A--TC-AAT-AA-T-TT-AGC-GTTGCTTTAT-TA-CA-C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGT-----T-ATTGCGGc
gi|7                          :     TTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--GACTT-CTATT---G--G----TCG-AA-ACA----ACA--C-CAC-A------TT-A--TT-TTTA-T------A----AACA-A-----T-----GAATTG---A-------CCT-------GA---A---T-TAA---------------G-----TTTC---CTAAA--A---T-AG-AAGTAAA---TTGACCTGNAATT---GACCTG--ATG-TAT-CCT--AAAAT-A--G----CACCAC--TT-T-CGT--T-AT----------A-C-TG-TCAGC-TT--TC--T--A---TTGTGAC-ATC--ACA--AT--------TAC--AG-TA--AT----ATCCTTTCAGC-TTTT-T-A-T--T-GTGAC-GTCACA--A-TTA--T-AGAGC-TAAA-A--TC-AAT-AA-C-TT-AGC-ACTGCATTAT-TAT-A-C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGTTACCGT-ATTGCAGcaaaactgt
gi|10                         :     TTATTA-TTTT-T-C-ATTTG---TAA--TTTC--TT--CATTT-CTATT---G--G----TCG-AA-AC----------------------------------------------AACACCA-C--AT-T------ACTT-----TTT--TTTTTTA---TAAA---CA--A-TGAAT-TTA-CCT--GATG-----TTTC---CTACA--A---T-AG-AAG---T---T--------GATT---GACCTG--ATG-TTT-CCC--AAAAT-A--G----CACCAC--TC-T-CGT--T-AT----------C-C-TG-TCAGT-TT--TC--T--A---TTGTGAT-GGC--ACA--AT--------TAT--AG-CG--CT----ATCCTTTCACT-TTTC-T-A-T--T-GTGAC-ATCACA--A-TTA--T-ATTGC-TAAA-A--TC-AAT-AA-C-TT-AGC-GTTGCATTAT-TAT-A-C-T--A-AA------CGTTGTG-AT-----AGT-----T-A-TGCAGcaaaactgtt
gi|12                         :     TTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-ATATT---G--G----TCG-AA-ACA----ACA--G-CAC-A------TG-A-CTT-TTTA-T------A-AACAATG-A--AT-T-----GACCTG---ATGT--TT--TTGAAATAGA---AG--TATTATTATAGACTT--TATG-----TTTC---CTAAA--A---T-AT-CAC---CCTTT--------CGTT---ATCCTGTCA-G-CTT-TCT--ATTGT-G--A----CGTCACAATTAT-AGTGCT-AT----------C-C-TT-TCAGC-TT--C---T--A---TTGTGAC-GTC--ACA--AT--------TAT--AG-TG--CT----Acaaaactg
gi|2                          :     TTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--CATTTGCTA-----GGAG----ACG-AAGACA----ACACGT-TAC-A------TG--ACTT-TTTA-T------AGAACAATG-A--A--T-----GACCTGAATATGTTCTTCGCTAATGTA-A---AG--T-T-AAT-TG-ACCT--GG-A-----TTTC---CTTAGTCA---T-AG-A-----G---T---------ATT---GA-CTG--ATG-TTT-CCTA-AAAAT-A--GAA--CACCAA--TC-T-CAT--T-AA----------C-C-TT-TTAAG-AT--TC-AT--AATGTTGTGAC-GTC--ACA--AT-------------AGTTG--CTG---AGCTTTTCAG---TTC-C-A-T--TGGTGAC-GTCACA--A--TA--GCAGTGC-TAAAGA--TT-AAT-AAGT-TT-TGG-GTTGCATTAG-AGATA-C-T--A-AA------TATTGTG-CT-----AGT-----TAATTGAAGaaataaataacttagcattgcattatcatactagatattgtgatagctattgcagcaaaactgtt
gi|19                         :     TTATTA-TTTT-T-C-ATA-G---TTA--TTTT--TT--AATTT-TTA-TT--G--G----TCG-AA-ACA----ACA--T-CAC-T------TG--ACTT-ATCA-T------A-AATGTTA-ATTAT-A-----GACCTG---ATGT--TTCC-TAAAATAGcagaag
gi|45                         :     TTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTA-TT--G--G----TCG-AA-ACA----ACA--C-CAC-A------TG--ACTT-TTTA-T------A-AACAAcaccactttccttatcctttcagctttctattgtgacgtcacaattatagtgctaaaataaatcatttatcaatgcattattataataattattgtt
gi|30                         :    aTTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTA-TT--G--T----TCG-AA-ACA----ACA--C-CAC-A------TA-AGTTT-T
gi|29                         :   taTTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTT---TT--AATTT-CTA-TT--G--T----TCGAAA-ACA----ACA--C-CAC-A------TA-AGTTT-Taattgactctatgaaggagcactgaaattattgagtaaattaattaagtgttactcaaactttgcacttgtaaaat
gi|32                         :   taTTATTA-TTTT---C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTA-TT--G--T----TCG----ACA----ACA--C-CAC-A------TA-AGTTT-Taattgactctatgaaggacactgaaattattgagtaaattatatacaagtgttactcaaactttacacttgtaaaat
gi|55                         :    aTTATTA-CTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-aattgactctatgaaggagcactgaattattgagtaaattatatacaagtgttactcaaactttacacttgtaaaat
gi|5                          : catagTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--GATTT-CTATT---G--G----CCG-AA-ACA----ACA--T-CAC-T------TG-ACATT-TTT--T------A-AACAATG-A--AT-T-----GACTTG---ATAT--TTCCT-AAGATAGA---TG--T-TAA-T-TGA-CCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---T-AG-AAG---T---T--------AATT---GACCTG--ATG-GTT-CCT--AAAAT-A--G----CACCAC--TT-T-CGT--T-AT----------T-C-TT-TCAGC-TT--TC--T--A---TTGTGAT-GTC--ACA--AT--------TAG--AG-TG--CT----AGCCTTTCAGC-TTTC-C-A-T--T-ATGAC-GTCACA--A-TTA--C-AGTGC-TAAA-G--TC-AAT-AA-T-TT-AGC-GTTGCATTGT-TATTA-C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGT-----T-ATTACAG
gi|8                          :      TATTAATTTT-T-C-ATT-G---TAA--TT-C--TT--AATTT-CTATT---G--G----TCG-AA-ACA----ATA--TTCAC-A------TG-ACTTT-TTTA--------A-AACA-TG-A--AT-T-----GACCTG---ATGT--TTCCT-AAAATAGA---AG--T-TAA-T-TGA-CCT--GATG-----CTTC---CTAAA--A---T-AA-AAG---G---T--------AATT---GACCTG--ATG-TTTTCCT--AAAAT-A--G----CACCAC--TT---CGT--T-AT----------T-C-TT-TCAGC-TT--TT--T--A---TTGT-AC-GTC--ACA--AT--------TAG--AG-TG--CT----AGCCTTTCAGC-TTTC-C-A-T--T-GTGAT-GTCACA--A-TTA--C-AG-GC-TAAA-A--TC-AAT--A-T-TT-AGC-GTTGCATTA--TATTA-CTT--A-AA------TATTGGG-AT-----AGT-----T-ATTGCAGc
gi|13                         :      TATTA-TTTT-T-C-ATTTG---TAA--TTTT--CT--CATTT-CTATT---G--G----TCG-AA-ACA-----CAG-C-CAC-A------TG-A-CTT-TTTA-T------A-------A-A--A---------ACC-A---ATGT----------------------------AT-TGA-CCT--GATG-----TT-C---CTAAA--A-----AG-AAG---T---T--------AATT---GACCTG--ATGTTTT-CCT--AAAAT----G----CACCAC---T-T-CGT--TAAT----------C-C-TT-TCAGC-TT--TC--T------TTGTGACAGTC--ACA--AT--------TAGGAAGTTG--CT----AGCC-TTCAGC-TTTC-C-A-T--T-TGGAC-GTCACA--A-TTA--C-AGTGCTTAAA-A--TC-AAT-AA-T-TT-AGC-GTTGCATTAT-TAT-A-C-TAAA-AA------TATTGc
gi|1                          :      TATTA-TTTT-TTC-TTT-GGTATAT--TTTC--TT--CATTTTCTATTTTGG--GTTTCCCG-AT-ACACAAAACA--T-C-C-AACCCCTCGCGACTTATTTA-TTAAG--A-ACCAATG-A--AT-TTT---GACCTG---ATGT--TCC--TAAAATAGACCAGG--TCTAAATATGAACCTCAGCTG-----CTTCTGCCTAAA--GAACT-AATGAG---T---T--------AATT---GACTTG--ATG-TTT-CCTGAAAAAT-A--GGCTCCACCAC--TT-TTCAA--T-ATGAATCGCCTGT-C-TA-TCAGA-TTCTTC--T--A---TTGTGAC-GTC--ACA--AT--------TAGA-AG-TGGACT----AGCCCTTCAGCTTTTT-C-A-TTAT-GTGAC-GTCACA--ATTTA--C-AGTGC-TTAA-A--TCAAAT-AA-T-TT-AGC-GTAGCATTATATATTACC-T--A-AA------TATTGTG-CT-----AG------T-ATTGCAGcagcaaaactgttta
gi|15                         :      TATTA-TTTT-T-A-ATT-G---TAA--TTTC--TT--CATGT-CTATT---G--G----TCG-AA-ACA----ACA--C-CAC-A------TG-A-CTT-TTTA-T------A-AACAATG-A--AT-T-----GACCTG---ATGT--TTCC-TAAAATAGT---AG--T-T-AAT-TG-ACCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---T-AG-caaaactgtttattaatataataaaaccaatgtatagcagtgcctgatttcggtcaattcattggtttcctaattagcaccaatcccctgc
gi|26                         :      TATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAC--TTTC--TT--AATTT-CTATT---G--G----TCC-AA-ACA----ACA--C-CAC-A------TG-A-CTT-TTTA-T------A-AACAATG-A--AT-C-----GACCTG---ATGT--TTCC-TAAAATAGA---AG----TAAAT-TG-ACCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---T-AG-cactactttcgttatcctttcagctttctattgtgacgtcacaattacagtgctaaaatcaataatttagcgttgcattattatactaaatattgtgatagttattgcagc
gi|23                         :      TATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAAAATGTC--TG--AATTT-CTATT---G--G----CCG-AA-ACA----ACA--C-CAC-A------TG-A-CTT-ATTA-T------A-AATA-------------------------ATGT--T--------ATAGA-------------------CCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---T-AC-AAGT--A---T--------TATG---GACCT----------------AAAAT-A--G----CACCAC--TC-T-CGT--C-AT----------C-C-TT-TCAGC-TT--TC--T--A---Tcaacactttcgttat
gi|27                         :      TATTA-TTTT-T-C-GTT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CCAATT--G--G----TCG-AA-ACA----ACC--T-CATGG------TG-A-----CTTA-T------C-AAGAATA-C--ATGTTTATAGACCTG---ATGT--TTCCTAAA
gi|52                         :      TATTA-TTTT---C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AACTT-CTATTT-----G----TCG-AA-ACA----ACA--C-CAC-A------ctagcaccactttctttatcctttcagctttcctttgtgatgtc
gi|21                         :       ATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AACTT-CTATT---G--G----TCG-AA-ACA----ACA--C-CAC-A------TG-A-CTT-TTTA-T------A-AACAATG-A--AT-T-----GACCTG---ATGT--TTCC-TAAAATAGA---AG--T-T-AAT-TG-ACCC--GATG-----TTTC---CTAAA--G---T-AG-AAG---T---T--------AATT---GAC-----ATG-TTT-CTT--AAGAT-A--G----CACCAC--TT-T-CGT--T-AA----------T-C-TG-TCAGa
gi|9                          :       ATTA-TTTT-T-CCATT-G---TAA--TTTCCTTT--AATTT-CTATT---G--G----TCGTAA-ACA----ACA--C-CA--A------T---ACTT-TTC---------------ATA-A--AT------------A---ATGT-----------ACAGA-------------------CCT--GATG-----TT-C---CTAAA--A---TAAG-AAGT--A---T---------ATT---G-CCTG--ACG-TTT-CCT--AAAAT-A--G----CA-CAC--TT-T-CGT--T-TC----------T-C-CCGTCAGC-TT--TCTAA--A---TTGTGAC-GTA--ACA--AT--------TAT--AG-TG--C-----ATCCTTT-AGC-TTTCTT-A-T--T-GT-AT-GTCACA--A-TTA--T-AGTGC-TAAA-A--TC-AACGAA-C-TCAAGCTGTTGCATTAT-TATAA-C-T--ACAAAAATATTATTGTG-ATATGTAAGT-----T-ATTGCAG
gi|20                         :       ATTA-TTTG-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTA-GT--A--A----CCG-AA-ACG----ACA--G-CAA-G------TG--ACGT-ATTA-T------G-CATAATGTC--AT-A-----GACCTG---GTGT--GTCC-TAAAATAGA---AGTAT-TA----TAGACC-----TG-----TTTC---CTAAA--A---T-AG-caaaaact
gi|14                         :         TA-TTTT-T-T-CTT-G---TA----TTC--TT--TACTT-CTATT---G--G----TCG-AA-ACA----ACA--C-CAC-A------TG-A--CT-TTTA-T------A-AACAATG-A--AT-T-----GACCTG---ATGT--TTCC-TAAAATAGA---AG--T-T-AAT-TG-ACCT--GATG-----TTT----CTAAA--A---T-AGCACC---ACTTT--------CGTT---ATCCTGTCA-G-CTT-TCT--ATTGT-G--A----CGTCACAATTAT-AGTGCT-AT----------C-C-TT-TCAGC-TT--TC--T--A---TTGTGAC-GTC--ACA--AT--------TAT--AG-TG--CT----Acatcactttcgttatccttttagcttttcattgggacatcacaattatcatgttatcatttcatctttccg
gi|18                         :         TA-TTTT-T-C-ATT-G---CAA--TTTC--TTTTAATTT-CT-CTT--G--G----TCA-AA-ACA----ACA--T-CAC-G------TG-AA--T-TATATT------A-AATAACG-T--GT-T-----CACCTA---ATGT--TTCC-TAAAATAGaaatcaataacttagcgttgcattattatactaaatattgtatatagttattgcagcaaaactgt
gi|17                         :       gcTA-TTTT-T-C-ATT-G---CAA--TTTC--TTTTAATTT-CT-CTT--G--G----TCA-AA-ACA----ACA--T-CAC-G------TG-AA--T-TATATT------A-AATAACGTG--TT-T-----CACCTA---ATGT--TTCC-TAAAATAGcatcacgttcgttattctttcagctttccattgtgacgtcacacttatagtcctaaaattgataatttagcgttgcattattatatgaatattgttatgattattacaacat
gi|16                         :       gcTA-TTTTCT-C-ATT-G---CAA--TTTC--TTTTAATTT-CT-CTT--G--G----TCA-AA-ACA----ACA--T-CAC-G------TG-AA--T-TATATT------A-AATAACGTG--TT-T-----CACCTA---ATGT--TTCC-TAAAATAGcatcacgtcgttattctttcagctttccattgtgacgtcacacttatagtcctaaaatgataatttagcgttgcattattatatgaatattgttatgattattacaacatt
gi|46                         :          tgcTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATT---TA-TT--G--G----TC---A-ACA----ACC--C-CCT-A------TG-A--TT-ATTA-T------A-catcacgtcgttattctttcagctttccattgtgacgtcacacttatagtcctaaaatgataatttagcgttgcattattatagaatattgttatgatttataacaacattgtat
gi|24                         :                               A--TTTC--TT--AATTT-CTATT---G--G----TCG-AA-ACA----ATA--T-CAC-A------TG-ACTTT-TTTA--------A-AACAATG-A--AT-T-----GACCTG---ATGT--TTCCT-AAAATAGA---AG--T-TAA-T-TGA-CCT--GATG-----CTTC---CTAAA--A---T-AA-AAG---T---T--------AATT---GACCTG--ATG-TTT-CCT--AAAAT-A--G----CACCAC--TT-T-CGcaaggccagcacatgt
gi|19                         :                                                                                                        TT-TTTA-TTGGTCGA-AACAACA-------T-----CACTTG---A--------CTTATCATAAA---TG--T-TAATTATAGACCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---T-AG-
gi|28                         :                                                                                                             ttattatttttcatagttattttttaa-----GACCTG---ATGT--TTCC-TAAAATAGcaccactttccttatcctttcagctttctattgtgacgtcacaattatagtgctaaaataaatcatttatcaatgcattattataataattattgtt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                ta-TGAAT-TGA-CCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---T-AG-AAG---T---T--------AATT---GACCTG--ATG-TTT-C-T--AAAAT-A--G----CACCAC--TT-T-CGT--T-AT----------C-C-TG-TCAGC-TT--TC--T--A---TTGTGAC-GTC--ACA--AT--------TAT--AG-TG--CT----ATCCTTTCAGC-TTTC-T-A-T--T-GTGAC-GTCACA--A-TTA--T-AGTGC-TAAA-A--TC-AAT-AA-C-TT-AGC-GTTGCATTAT-TAT-A-C-T--A-AA------TATTGTATAT-----AGT-----T-ATTGCAGcaccactttagctatcctttcagctttccattttgacgtcacatttatagtgccaaaatcaagaatttagttttgcattattatactatatattgtgatagttattgcagcaaaattt
gi|12                         :                                                                                                                   tattttttcttgtattctttacttctattggtcgaaacaacaccacatgacttttataaacaa-TGAAT-TGA-CCT--GATG-----TTTT----TGAA--A---T-AG-AAGT--A---T--------TATTATAGACTTT--ATG-TTT-CCT--AAAAT-A--T----CACC-C--TT-T-CGT--T-AT----------C-C-TG-TCAGC-TT--TC--T--A---TTGTGAC-GTC--ACA--AT--------TAT--AG-TG--CT----ATCCTTTCAGC-TT-C-T-A-T--T-GTGAC-GTCACA--A-TTA--T-AGTGC-TAAA-A--TA-AAT-AA-C-TT-AGC-ATTGCATTAT-CAT-A-C-T--A-GA------TATTGTG-AT-----AGC-----T-ATTGCAGcaaaactgt
gi|15                         :                                                                                                            ttattatttttcattgtaatttcttaatttatattggtcgaaacaacagcacatgactttttataaacaa-TGAAT-TGA-CCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---T-AG-TAG---T---T--------AATT---GACCTG--ATG-TTT-CCT--AAAAT-A--G----CACTAC--TT-T-CGT--T-AT----------C-C-TT-TCAGC-TT--TC--T--A---TTGTGAC-GTC--ACA--AT--------TAC--AG-TG--CT----Acaaaactgtt
gi|26                         :                                                                                                             tattatttttaattgtaatttcttcatgtctattggtcgaaacaacaccacatgactttttataaacaa-TGAAT-CGA-CCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---T-AG-AAG---T---A--------AATT---GACCTG--ATG-TTT-CCT--AAAAT-A--G----CAACAC--TT-T-CGT--T-AT----------aaatcaataatttagcgttgcattattatactaaatattgtgatagttattgcagc
gi|27                         :                                                                                                                      tattatttttcattgtactttcttaatttctattggtccaaacaacaccacatgactttttataaacaaAACCT--CATGGTGACTTAT---CAAGA--A---T-AC-ATG---T---T--------TATA---GACCTG--ATG-TTT-CCT--AAACT-A--G----CACCAC--TT-T-CTT--T-AT----------C-C-TT-TCAGC-TT--TC-CT------TTGTGAT-GTC--
gi|28                         :                                                                                                                                                tattatttttcgttgtaatttcttaatttccaattggtcgaaacACCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---T-AG-
gi|20                         :                                                                                                                                                                                         tagACCT--GGTG-----TGTC---CTAAA--A---T-AG-AAGT--A---T--------TATA---GACCTG------TTT-CCT--AAAAT-A--G----CATCAC--TT-T-CGT--T-AT----------C-C-TT-TTAGC-TT--TT--C--A---TTGGGAC-ATC--ACA--AT--------TAT--CA-TG--TT----ATCATTTCATC-TTTC-C-caccactttagctatcctttcagctttccattttgacgtcacatttatagtgccaaaatcaagaatttagttttgcattattatactatatattgtgatagttattgcagcaaaattt
gi|18                         :                                                                                                                attatttgtcattgtaatttcttaatttctagtaaccgaaacgacagcaagtgacgtattatgcataatgtcatagACCT--AATG-----TTTC---CTAAA--A---T-AG-g
gi|31                         :                                                                                                               gctatttttcattgcaatttcttttaatttctcttggtcaaaacaacatcacgtgaattatattaaataacgtgttcACCT--AATG-----TTTC---TTAAA--A---T-Acatcacgttcgttattctttcagctttccattgtgacgtcacacttatagtcctaaaattgataatttagcgttgcattattatatgaatattgttatgattattacaacat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                       --A---T-AA-ATG---T---T--------AATTATAGACCTG--ATG-TTT-CCT--AAAAT-A--G----CACCAC--TT-T-CCT--T-AT----------C-C-TT-TCAGC-TT--TC--T--A---TTGTGAC-GTC--ACA--AT--------TAT--AG-TG--CT----Aataccaatttcgttatcctttccgttttccattgtgacgtcacaataacagtgctaaaagcaatgatttagagctacattgatattctaaattgtgtgttatttaatgcaggaaaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                       ttattatttttcatagttattttttaatttttattggtcgaaacaacatcacttgacttatc---A---T--------AACT---ATCCCA--ATA-TTT-AGT--AATAT-AATG----CAACGC--TA---AAT--T-AT----------T-GATT-TTAGCACT--GT-A---A---TTGTGAC-ATC--ACA------------TGG--AA-AG--CTGAA-AGGCT---AGC-ACTC-T-AAT--T-GTGAC-GTCACA--A--TA--A-AAAGC-TGAA-A---G-AAT-AA-aaataaatcatttatcaatgcattattataataattattgtt
gi|18                         :                                                                            ttattatttttcattgtaatttcttaatttctattggtcgaaacaatatcacatgactttttaaaacaatgaattgacctgatgtttcctaaaataaagttaattgacctgatgcttcctaaaataaaagttaattgacctgatgttttcctaaaaatagcaccactttcgTT---CACCTA--ATG-TTT-CCT--AAAAT-A--G----CATCAC--GT-T-CGT--T-AT----------T-C-TT-TCAGC-TT--TC--C--A---TTGTGAC-GTC--ACA--CT--------TAT--AG-TC--CT----Atgcagc
gi|17                         :                                                                                                                                                                             gctatttttcattgcaatttcttttaatttctcttggtcaaaacaacatcacgtgaattatattaaataacgtgTT---CACCTA--ATG-TTT-CCT--AAAAT-A--G----CATCAC---G-T-CGT--T-AT----------T-C-TT-TCAGC-TT--TC--C--A---TTGTGAC-GTC--ACA--CT--------TAT--AG-TC--CT----Aaaattgataatttagcgttgcattattatatgaatattgttatgattattacaacat
gi|16                         :                                                                                                                                                                            gctatttttcattgcaatttcttttaatttctcttggtcaaaacaacatcacgtgaattatattaaataacgtgtTT---CACCTA--ATG-TTT-CCT--AAAAT-A--G----CATCAC---G-T-CGT--T-AT----------T-C-TT-TCAGC-TT--TC--C--A---TTGTGAC-GTC--ACA--CT--------TAT--AG-TC--CT----Aaaatgataatttagcgttgcattattatatgaatattgttatgattattacaacatt
gi|28                         :                                                                                                                                                                            tgctattttctcattgcaatttcttttaatttctcttggtcaaaacaacatcacgtgaattatattaaataacgtgt---GACCTG--ATG-TTT-CCT--AAAAT-A--G----CACCAC--TT-T-AGC--T-AT----------C-C-TT-TCAGC-TT--TC--C--A---TTTTGAC-GTC--ACA--TT--------TAT--AG-TG--CC----Aaaatgataatttagcgttgcattattatagaatattgttatgatttataacaacattgtat
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                           taACCTA--ATG-TTT-CTT--AAAAT-A--A----TACCAA--TT-T-CGT--T-AT----------C-C-TT-TCCGT-TT--TC--C--A---TTGTGAC-GTC--ACA--AT--------AAC--AG-TG--CT----Aaaatcaagaatttagttttgcattattatactatatattgtgatagttattgcagcaaaattt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CCAC--TT-C-CGT--T-AT----------T-C-TC-TCAGC-TT--TC--T--A---TTGTGAC-GTC--ACA--AT--------TAG--AG-TG--CT----AGCCTTTCAGC-TTTC-C-A-T--T-GTGAC-GTCACA--A-TTA--C-AGTGC-TAAA-A--TC-AAT-GA-T-TT-AGC-GTTGCATTAT-TATTG-C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGC-----T-ATTGCAGaaagcaatgatttagagctacattgatattctaaattgtgtgttatttaatgcaggaaaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AC--TT----AT--T-AA----------T-C-TT-T-AGC-AC--TG-CT--A---TTGTGAC-GTC--ACC--AA--------TGG--AA-----CTGAAAAGC---TCAGC-AA-C-T-A-T--T-GTGAC-GTCACAACA-TTAT-G-AATCT-TAAA-AGGTT-AAT-GA-GATT-GGT-GTTCTATTTT-TAcaaaactgtttg
gi|14                         :                                                                                                                                               ttattatttttcattgtaatttcttcatttgctaggagacgaagacaacacgttacatgactttttatagaacaatgaatgacctgaatatgttcttcgctaatgtaaagttaattgacctggatttccttagtcatagagtattgactgatgtttccGT--T-AT----------T-GATT-TTAGC-AC--T--AT--AA--TTGTGAC-GTC--ACA--A---------TAG--AA-AG--CTGAA-AGGAT---AGCACTAT-A-A-T--T-GTGAC-GTCACA--A--TA--G-AAAGC-TGAtttgggttgcattagagatactaaatattgtgctagttaattgaagcagaag
gi|7                          :                                                                                                                                                                 tattttttcttgtattctttacttctattggtcgaaacaacaccacatgacttttataaacaatgaattgacctgatgtttcctaaaatagaagttaattgacctgatgtttctaaaatagcaccactttcgttatcctgGT--T-AT----------T-GATT-TTAGC-TC--T--AT--AA--TTGTGAC-GTC--ACA--A---------TAA--AA-AG--CTGAA-AGGATATTA-C-TGT--A-A-T--T-GTGAT-GTCACA--A--TA--G-AAAGC-TGAttagcgttgcattattatactaaatattgtatatagttattgcagcaaaactgt
gi|12                         :                                                                                                                                           ttattatttttcattgtaatttcttgacttctattggtcgaaacaacaccacattatttttataaacaatgaattgacctgaattaagtttcctaaaatagaagtaaattgacctgnaattgacctgatgtatcctaaaatagcaccactttcgttatactgGT--T-AT----------T-TATT-TTAGC-AC--T--AT--AA--TTGTGAC-GTC--ACA--A---------TAG--AA--G--CTGAA-AGGAT---AGCACTAT-A-A-T--T-GTGAC-GTCACA--A--TA--G-AAAGC-TGAttagcactgcattattatactaaatattgtgatagttaccgtattgcagcaaaactgtt
gi|4                          :                                                                                                                                                        ttattatttttcattgtaatttcttaatttatattggtcgaaacaacagcacatgactttttataaacaatgaattgacctgatgtttttgaaatagaagtattattatagactttatgtttcctaaaatatcaccctttcgttatcctgT--T-AT----------T-GATT-TTAGC-AC--TC-TA--A---TTGTGAC-GTC--ACA--AT---------GG--AA-AG--CTGAA-AGGCT---AGC-ACTC-T-AAT--T-GTGAC-GTCACA--A-TTAGTG-AAAGC-TGAA-A---G-AAT-AA-ttagcattgcattatcatactagatattgtgatagctattgcagcaaaactgtt
gi|31                         :                                                                                                                                    ttattatttttcattgtaatttcttaatttctattggccgaaacaacatcacatgactttttataaacaataaattgacctgatgtttcctaagatagaagttaattgacctgatgtttcctaaaatagaagataattgacctgatgtttcctaaaattagcacatttcgT--C-AT----------TGC-TT-TTAGC-AC--TG-TT--A---TTGTGAC-GTC--ACA--AT--------tttagcgttccattattatcactaaatattgtgatagttattgcagc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  acctaatgtttcttaaaataataccaatttcgttatcctttccgttttccT----------T-A-TT-TTAGC-AC--T--AT--AA--TTGTGAC-GTC--ACA--A---------TAG--AA-AG--CT----tttagagctacattgatattctaaattgtgtgttatttaatgcaggaaaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                         ttattatttttcatagttattttttaatttttattggtcgaaacaacatcacttgacttatcataaatgttaattatagacctgatgtttcctaaaatagcaccactttccttatcctttc-TT-TTAGC-CT--GT-A---A---TTGTGAC-ATC--ACA--AT---------GG--AA-AG--CTGAA-AGGCT---AGC-ACTC-T-AAT--T-GTGAC-GT-ACA--A--TA--A-AAAGC-TGAA-A---G-AAT-AA-C-GA-AGT-GGTGC--TAT-Tatcatttatcaatgcattattataataattattgtt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                          tattaatttttcattgtaattcttaatttctattggtcgaaacaatattcacatgacttttttaaaacatgaattgacctgatgtttcctaaaatagaagttaattgacctgatgcttcctaaaataaaaggtaattgacctgatgttttcctaa--A---TTGTGAC-GTC--ATA--A---------TGG--AA-AG--CTGAA-AGGCT---AGC-ACTC-TAA-T--T-GTGAC-ATCACA--A--TA--G-AAAGC-TGAA-A---G-AAT-AA-tcaatatttagcgttgcattatattacttaaatattgggatagttattgcagc
gi|13                         :                                                                                                                                                                           tattatttttcattgtaatttcttgatttctattggccgaaacaacatcacttgacattttttaaacaatgaattgacttgatatttcctaagatagatgttaattgacctgatgtttcctaaaatagaagttaattgacctgatggttcctaaaatagcaccactttcg--A---TTGTGAC-GTC---CA--AA--------TGG--AA-AG--CTGA--AGGCTAGCAAC-TTCC-TAA-T--T-GTGACTGTCACA--A---A--G-AAAGC-TGAA-A--GG-ATT-AA-C-GA-AGT-GGTGCATT-T-TAtacagtgctaaagtcaataatttagcgttgcattgttattactaaatattgtgatagttattacagc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                          tattatttttcatttgtaattttctcatttctattggtcgaaacacagccacatgactttttataaaaaccaatgtattgacctgatgttcctaaaaagaagttaattgacctgatgttttcc--A---TTGTGAC-GTC--ACA--AT---------GG--AA-AG--CTGAA-AGGCT---AGC-ACTC-T-AAT--T-GTGAC-GTCACA--A--TA--G-AAAGC-TGAG-A---G-AAT-AA-tacagtgcttaaaatcaataatttagcgttgcattattatactaaaaatattgcagcaaaactgttta
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ccacttccg--A---TTGTGAC-GTC--ACATAATGAAAAAGCTGA--AG-GG--CT----AGTC---CA-C-TTCT-A-A-T--T-GTGAC-GTCACA--A--TA--G-Atacagtgctaaaatcaatgatttagcgttgcattattattgctaaatattgtgatagctattgcagcaaaactgtttg
gi|15                         :                                                                                            tattattttttctttggtatattttcttcattttctattttgggtttcccgatacacaaaacatccaacccctcgcgacttatttattaagaaccaatgaattttgacctgatgttcctaaaatagaccaggtctaaatatgaacctcagctgcttctgcctaaagaactaatgagttaattgacttgatgtttcctgaaaaataggctccaccacttttcaatatgaatcgcctgtctatcagattct--A---TTGTGAC-GTC--ACA--A---------TAG--AA-AG--CT----ttacagtgcttaaatcaaataatttagcgtagcattatatattacctaaatattgtgctagtattgcagcaaaactgtttattaatataataaaaccaatgtatagcagtgcctgatttcggtcaattcattggtttcctaattagcaccaatcccctgc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                           tattatttttaattgtaatttcttcatgtctattggtcgaaacaacaccacatgactttttataaacaatgaattgacctgatgtttcctaaaatagtagttaattgacctgatgtttcctaaaatagcactactttcgttatcctttcG--TT----ATCCTTTCAGC-TTTC-T-A-T--T-GTGAC-GTCACA--A-TTA--C-AGTGC-TAAA-A--TC-AAT-AA-T-TT-AGC-GTTGCATTAT-TAT-A-C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGT-----T-ATTGCAGtacagtgctaaaatcaataatttagcgttgcattattatactaaatattgtgatagttattgcagc
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                      tattatttttaattgtaatttcttcatgtctattggtcgaaacaacaccacatgactttttataaacaatgaattgacctgatgtttcctaaaatagtagttaattgacctgatgtttcctaaaatagcactactttcG--CT----ATCCTTTCAGC-TTTC-C-A-T--T-TTGAC-GTCACA--T-TTA--T-AGTGC-CAAA-A--TC-AAG-AA-T-TT-AGT-TTTGCATTAT-TAT-A-C-T--A-TA------TATTGTG-AT-----AGT-----T-ATTGCAGc
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tagacctgatgtttcctaaaatagcaccactttaG--TT----ATTCTTTCAGC-TTTC-C-A-T--T-GTGAC-GTCACA--C-TTA--T-AGTCC-TAAA-A--TT-GAT-AA-T-TT-AGC-GTTGCATTAT-TAT-A---T--G-AA------TATTGTT-AT-----GAT-----T-ATTACAcaaaattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    gctatttttcattgcaatttcttttaatttctcttggtcaaaacaacatcacgtgaattatattaaataacgtgttcacctaatgtttcctaaaatagcatcacgttcG--TT----ATTCTTTCAGC-TTTC-C-A-T--T-GTGAC-GTCACA--C-TTA--T-AGTCC-TAAA-A--T--GAT-AA-T-TT-AGC-GTTGCATTAT-TAT-A---T--G-AA------TATTGTT-AT-----GAT-----T-ATTACAacat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    gctatttttcattgcaatttcttttaatttctcttggtcaaaacaacatcacgtgaattatattaaataacgtgtttcacctaatgtttcctaaaatagcatcacgtcG--TT----ATTCTTTCAGC-TTTC-C-A-T--T-GTGAC-GTCACA--C-TTA--T-AGTCC-TAAA-A--T--GAT-AA-T-TT-AGC-GTTGCATTAT-TAT-A------G-AA------TATTGTT-AT-----GAT-----T-acatt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgctattttctcattgcaatttcttttaatttctcttggtcaaaacaacatcacgtgaattatattaaataacgtgtttcacctaatgtttcctaaaatagcatcacgtcG--TT----ATCCTTTCCGT-TTTC-C-A-T--T-GTGAC-GTCACA--A-TAA--C-AGTGC-TAAA-A--GC-AAT-GA-T-TT-AGA-GCTACATTGA-TATT--C-T--A-AA------TTGTGTG-TT-----ATT-----T-AATGCAGtataacaacattgtat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acctaatgtttcttaaaataataccaatttcT----ATCCTTTCAGC-TTTC-T-A-T--T-GTGAC-GTCACA--A-TTA--T-AGTGC-TAAA-A--TA-AAT-CA-T-TT-ATC-AATGCATTAT-TAT-A-A-T--A-AT------TATTGTgaaaa
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttattatttttcatagttattttttaatttttattggtcgaaacaacatcacttgacttatcataaatgttaattatagacctgatgtttcctaaaatagcaccactttcctT----ATCCTTTCAGC-TTTC-C-T-T--T-GTGAT-GTCt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tattatttttcgttgtaatttcttaatttccaattggtcgaaacaacctcatggtgacttatcaagaatacatgtttatagacctgatgtttcctaaactagcaccactttctt-A-T--T-GTGAC-GTCACA--A--TA--G-AAAGC-TGAA-A--
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                          tattatttttaattgtaatttcttcatgtctattggtcgaaacaacaccacatgactttttataaacaatgaattgacctgatgtttcctaaaatagtagttaattgacctgatgtttcctaaaatagcactactttcgttatcc-A-T--T-GTGAC-GTCACA--A--TA--G-AAAGC-TGAA-A--tacagtgctaaaatcaataatttagcgttgcattattatactaaatattgtgatagttattgcagc
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttattatttttcatagttattttttaatttttattggtcgaaacaacatcacttgacttatcataaatgttaattatagacctgatgtttcctaaaatagcaccactttccttatccCA--A-TTA--T-AGTGC-TAAA-A--TC-AAT-AA-C-TT-AGC-GTTGCATTGT-TAT-A-C-T--A-AA------TATTATG-AT-----AGT-----T-ATTGCAGtatagtgctaaaataaatcatttatcaatgcattattataataattattgtt
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A--A-TTA--T-AGTGC-TAAA-A--TC-AAT-AA-T-TC-AGC-GGTGcaaaactg

Unaligned ( gi|25 ): AACAATTATAGCATGTTGAATTTGGTCAATTCATGGTTTTATAGCACCAACCCTGAGTAACATATAGACCTCGGACTGCGTCCTCGGTCAATATTGTACTTAGGGTTGGTGCTATAAACCATGAATTGACCTCATCAACATGCTATAAT
Unaligned ( gi|33 ): TAGAAAATAATAGATTAATTATAGCACGTCGAATTTTGTTAACCCATGATTTCTCTAGCATCAACCCGACTTCAATATACTTAATATACACTTCA
Unaligned ( gi|34 ): ATAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCGTTCTCGGTCA
Unaligned ( gi|35 ): AATAATGAAGCAATTGTAGCATGCTGTTATCAATCAATGGTTTCACTGCACAATAATAACCCCAGGCTTTGTCCTTGGTCAATATTG
Unaligned ( gi|36 ): TTCGAACTGCGTCCGGTCAATATTTACTTCAGGTTGGGGCTATACAAACCACTGCATTGACGCTCAGCAACATGACTATAATG
Unaligned ( gi|37 ): GAAAATAATAAAACGATCATAACATGTTGAATTCGATCTCTCCATTTTCTTAGTACCAATAGTACCAACCCTGATTTAGAT
Unaligned ( gi|38 ): TAGAAAATAATAGATTAATTATAGCACGTCGAATTTTGTTAACCCATGATTTCTCTAGCATCAACCCGACTTCAATATAC
Unaligned ( gi|39 ): ATATATAACAATTATAGCCATGTTGATGGTGCGGTCAATCATTAGGTCTTTATAGCACCAGAACCCTGCGTACATATAG
Unaligned ( gi|40 ): TTTAAATAAAAACAAACATTATAAGCATGTTGACTGAGGCATGCATATTCACGGTTTTATCGTCACCAACCGCTGAGT
Unaligned ( gi|42 ): TTAGATAATTCATCATTGGCATAAAATTTATTGAATAATTGGTTACGACTATAACAATACTTCTTTATTACTTTT
Unaligned ( gi|43 ): TAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCTCGGACT
Unaligned ( gi|44 ): GAAAATAATAGATTAATTATAGCACGTCGAATTTTGTTAACCCATGATTTCCTAGCATCAACCCCGACTTCA
Unaligned ( gi|47 ): ATAGAATGTTTGTACGTAACTTCTTGTTTTATAGCACAACCCTGAAAAATATATGACCCGGACT
Unaligned ( gi|48 ): CTAAAATATATTAACTGACCTTACTATACTAATTGTGATAGTTATGCAGCAAAACTGTTAAA
Unaligned ( gi|49 ): ATAATCAAATGATTATAGCACGTTAAGTTCGGTCTACCCATGCTTTTATTGCACCACCCCCG
Unaligned ( gi|50 ): AATAATCAAATGATTATAGCACGTTAAGTTCGGTCTACCCATGCTTTTATTGCACCACCCCC
Unaligned ( gi|51 ): GCGTCTCGGTAATTGTCTAGGGTTGCATGTATAACTCATGATTTGACTTCTCTAACTACAAT
Unaligned ( gi|53 ): ATACTAAATATTGTTATAATTATTGTTGCAAAATGTGTTAGAAAATA
Unaligned ( gi|54 ): ACATTTTACCGTAGTTTTATCTATTTCTGTTGTCATCAAACA

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                   111                                                               1111111111111                       11          11111111111111    22                                                                                                                                                                              111                                                                                                                                                       
lowQualScore                  :                                                                                                                       1    1 1 1   2 222   11    11  55     2   5 888 11  66666666666  2  1   2222    33   1    1   22 3333333 1    5555555555555      222 22 22  22    99 4    1   22222222222222 1  44   22    44444    333     22 222   6666   88888888888   222        33 1   2   33    1 1 2222 4444      11  2 1  1 33 1  444444   444 1       22  7777 22 1       1   22       111  3 1 11  1 5         1    1   22 1            1   1     1    1   1   1  1   1   1    1      1  3 5 3333 1 22 1  444444       1  44444   44444 1       
lowQualScore                  :                                                                                                                       .    . . .   . ...   ..    ..  ..     .   . ... ..  ...........  .  .   ....    ..   .    .   .. ....... .    .............      ... .. ..  ..    .. .    .   .............. .  ..   ..    .....    ...     .. ...   ....   ...........   ...        .. .   .   ..    . . .... ....      ..  . .  . .. .  ......   ... .       ..  .... .. .       .   ..       ...  . . ..  . .         .    .   .. .            .   .     .    .   .   .  .   .   .    .      .  . . .... . .. .  ......       .  .....   ..... .       
lowQualScore                  :                                                                                                                       3    3 3 3   6 333   77    77  22     5   9 888 88  11111111111  6  3   7777    11   3    3   55 1111111 5    8888888888888      888 22 22  22    33 8    6   44444444444444 9  00   44    33333    000     33 999   9999   77777777777   555        88 4   8   33    4 4 9999 8888      88  7 3  3 33 4  000000   333 4       00  9999 00 4       5   00       000  1 3 88  2 2         7    7   55 8            7   0     6    6   6   6  6   6   6    6      7  3 0 5555 7 33 7  888888       8  55555   55555 8       
consensus                     :                                                                                                                NTTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTATTT--G--GT-----------CG-AA-ACA----ACAC--CAC-ATGA-CTT-TTTAT----A-AACA-ATG--AATT---GACCTG---A--T--GT--TTCCTTA-AAAT-AGA---AGT-TAA---AT-TGA-CCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---TAG----AAG-T--T---A--ATT---GACCTGAT--G-TTT-CCT--AAAA-T-A----G----CACCAC--TT-T-CG-T--T-AT------CCT---T-TCAGCTT--TC----T--A-TTGTGAC-GTC--ACAATTAT--AG-T-G--CT-ATCCTTTCAGC-TTTC-CAT--T-GTGACGTCACAA-TTATAGTGC-TAAA-ATC-AAT-AA-TTT-AGC-GTTG-CATTAT-TA-T-A----C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGT-----T-ATTGCAG
Reference ( family-446 )      :                                                                                                                NTTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTATTT--G--GT-----------CG-AA-ACA----ACAC--CAC-ATGA-CTT-TTTAT----A-AACA-ACG--AATT---GACCTG---A--T--GT--TTCCTTA-AAAT-AGA---AGT-TAA---AT-TGAACCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---TAG----AAG-N--T---A--ATT---GACCTGAT--G-TTT-CCT--AAAA-T-A----G----CACCAC--TT-T-CG-T--T-AT------CCT---T-TCAGCTT--TC----T--A-TTGTGAC-GTC--ACAATTAG--AG-T-G--CT-AGCCTTTCAGC-TTTC-CAT--T-GTGACGTCACAA-TTANAGTGC-TAAA-ATC-AAT-AA-TTT-AGC-GTTG-CATTAT-TA-T-A----C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGT-----T-ATTGCAG
gi|1                          :                                                                                                                  TATTA-TTTT-TTC-TTT-GGTATAT--TTTC--TT--CATTTTCTATTTTGG--GTTTCCCGATACACA-AA-ACATCCAACCC--CTC-GCGA-CTTATTTATTAAGA-ACCA-ATG--AATTTT-GACCTG---A--T--GT--TCC--TA-AAAT-AGACCAGGTCTAA---ATATGAACCTCAGCTG-----CTTCTGCCTAAA--GAACTAAT---GAG-T--T---A--ATT---GACTTGAT--G-TTT-CCTGAAAAA-T-A----GGCTCCACCAC--TT-TTCA-A--T-ATGAATCGCCTGTCTATCAGATTCTTC----T--A-TTGTGAC-GTC--ACAATTAGA-AG-T-GGACT-AGCCCTTCAGCTTTTT-CATTAT-GTGACGTCACAATTTACAGTGC-TTAA-ATCAAAT-AA-TTT-AGC-GTAG-CATTA--TA-T-ATTACC-T--A-AA------TATTGTG-CT-----AG------T-ATTGCAG
gi|10                         :                                                                                                                 TTATTA-TTTT-T-C-ATTTG---TAA--TTTC--TT--CATTT-CTATT---G--GT-----------CG-AA-ACA----ACAC--CAC-ATTA-CTT-TTT--------------------------------------------TTTTTTATAAAC-AA--------TGA---AT-TTA-CCT--GATG-----TTTC---CTACA--A---TAG----AAG-T--T---G--ATT---GACCTGAT--G-TTT-CCC--AAAA-T-A----G----CACCAC--TC-T-CG-T--T-AT------CCT---G-TCAGTTT--TC----T--A-TTGTGAT-GGC--ACAATTAT--AG-C-G--CT-ATCCTTTCACT-TTTC-TAT--T-GTGACATCACAA-TTATATTGC-TAAA-ATC-AAT-AA-CTT-AGC-GTTG-CATTAT-TA-T-A----C-T--A-AA------CGTTGTG-AT-----AGT-----T-A-TGCAGcaaaactgtttattaatataataaaaccaatgtatagcagtgcctgatttcggtcaattcattggtttcctaattagcaccaatcccctgc
gi|11                         :                                                                                                                 TTATTA-TTTT-T-T-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTATT---G--GT-----------CG-AA-ACA----ACAC--CAC-ATGA-CTT-ATTAT----A-AATA----------------------A--T--GT------------AT-AGA---A-----------------CT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---TAG----AAG-TA-T---T--ATA---GACCTGAT--G-TTT-CCT--AAAA-T-A----G----CACCAC--TT-T-CG-T--T-AT------CCT---T-CCAGCTT--TC----T--A-TTGTGAC-GTATAACAATTAT--AG-T-G--CT-CTCCTTTCCGC-TTTC-CAT--T-GTGACGCCACAA-TTATAGTGC-TAAA-ATC-AAT-AA-TTT-AGC-GTTG-CTTTAT-TA-C-A----C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGT-----T-ATTGCGGcaaaactg
gi|12                         :                                                                                                                 TTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-ATATT---G--GT-----------CG-AA-AC-----------------------------------AACA-GCA--CAT----GAC-------------T--TT--TTATAAAC-AA--------TGA---AT-TGA-CCT--GATG-----TTTT----TGAA--A---TAG----AAG-TATT---ATTATA---GACTTTAT--G-TTT-CCT--AAAA-T-A----T----CACC-C--TT-T-CG-T--T-AT------CCT---G-TCAGCTT--TC----T--A-TTGTGAC-GTC--ACAATTAT--AG-T-G--CT-ATCCTTTCAGC-TT-C-TAT--T-GTGACGTCACAA-TTATAGTGC-TAAA-ATA-AAT-AA-CTT-AGC-ATTG-CATTAT-CA-T-A----C-T--A-GA------TATTGTG-AT-----AGC-----T-ATTGCAGcaaaactgt
gi|13                         :                                                                                                                  TATTA-TTTT-T-C-ATTTG---TAA--TTTT--CT--CATTT-CTATT---G--GT-----------CG-AA-A------------CAC-A-GC-C---------------ACA---------T---GACTT-----------T--TT--------AT-AAA---AAC-CAATGTAT-TGA-CCT--GATG-----TT-C---CTAAA--A----AG----AAG-T--T---A--ATT---GACCTGAT--GTTTT-CCT--AAAA-T------G----CACCAC---T-T-CG-T--TAAT------CCT---T-TCAGCTT--TC----T----TTGTGACAGTC--ACAATTAGGAAGTT-G--CT-AGCC-TTCAGC-TTTC-CAT--T-TGGACGTCACAA-TTACAGTGCTTAAA-ATC-AAT-AA-TTT-AGC-GTTG-CATTAT-TA-T-A----C-TAAA-AA------TATTGcaaaactgtt
gi|14                         :                                                                                                                     TA-TTTT-T-T-CTT-G---TA----TTC--TT--TACTT-CTATT---G--GT-----------CG-AA-ACA----ACAC--CAC-ATGA-CTT-TT-AT----A-AACA-ATG--AATT---GACCTG---A--T--GT--TTCC-TA-AAAT-AGA---AGT-T-A---AT-TG-ACCT--GATG-----TTT----CTAAA--A---TAGCACCACT-T--T---C--GTT---ATCCTG-TCAG-CTT-TCT--ATTG-T-G----A----CGTCACAATTAT-AG-TGCT-AT------CCT---T-TCAGCTT--TC----T--A-TTGTGAC-GTC--ACAATTAT--AG-T-G--CT-Acagcaaaactgttta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           -TGA---AT-TGA-CCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---TAG----AAG-T--T---A--ATT---GACCTGAT--G-TTT-C-T--AAAA-T-A----G----CACCAC--TT-T-CG-T--T-AT------CCT---G-TCAGCTT--TC----T--A-TTGTGAC-GTC--ACAATTAT--AG-T-G--CT-ATCCTTTCAGC-TTTC-TAT--T-GTGACGTCACAA-TTATAGTGC-TAAA-ATC-AAT-AA-CTT-AGC-GTTG-CATTAT-TA-T-A----C-T--A-AA------TATTGTATAT-----AGT-----T-ATTGCAGaaatcaataacttagcgttgcattattatactaaatattgtatatagttattgcagcaaaactgt
gi|15                         :                                                   tattttttcttgtattctttacttctattggtcgaaacaacaccacatgacttttataaacaaTATTA-TTTT-T-A-ATT-G---TAA--TTTC--TT--CATGT-CTATT---G--GT-----------CG-AA-A-------CAA--CAC------C---------------ACA---------T---GAC-------------T--TT--TTATAAAC-AA--------TGA---AT-TGA-CCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---TAG----TAG-T--T---A--ATT---GACCTGAT--G-TTT-CCT--AAAA-T-A----G----CACTAC--TT-T-CG-T--T-AT------CCT---T-TCAGCTT--TC----T--A-TTGTGAC-GTC--ACAATTAC--AG-T-G--CT-Acaaaactgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ---A--ATT---GACCTGAT--G-TTT-CCT--AAAA-T-A----G----TAG------T-T-AA-T--T-GA------CCTGA-T----GTTT--CC----T--A-AAATAGC-ACT--AC--TT-------TCG--TT-ATCCTTTCAGC-TTTC-TAT--T-GTGACGTCACAA-TTACAGTGC-TAAA-ATC-AAT-AA-TTT-AGC-GTTG-CATTAT-TA-T-A----C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGT-----T-ATTGCAGaaatcaataatttagcgttgcattattatactaaatattgtgatagttattgcagc
gi|16                         :                                              tattatttttaattgtaatttcttcatgtctattggtcgaaacaacaccacatgactttttataaacaatgTA-TTTTCT-C-ATT-G---CAA--TTTC--TTTTAATTT-CT-CTT--G--GT-----------CA-AA-ACA----ACAT--CAC-GTGA-ATT-ATATT----A-AATA-ACGT-GTTT---CACCTA---A--T--GT--TTCC-TA-AAAT-AGc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgcTT---CACCTAAT--G-TTT-CCT--AAAA-T-A----G----CATCAC--GT---CG-T--T-AT------TCT---T-TCAGCTT--TC----C--A-TTGTGAC-GTC--ACACTTAT--AG-T-C--CT-Acatcacgtcgttattctttcagctttccattgtgacgtcacacttatagtcctaaaatgataatttagcgttgcattattatagaatattgttatgatttataacaacattgtat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgctattttctcattgcaatttcttttaatttctcttggtcaaaacaacatcacgtgaattatattaaataacgtgt-G--TT-ATTCTTTCAGC-TTTC-CAT--T-GTGACGTCACAC-TTATAGTCC-TAAA-AT--GAT-AA-TTT-AGC-GTTG-CATTAT-TA-T-A---------G-AA------TATTGTT-AT-----GAT-----T-aaatgataatttagcgttgcattattatagaatattgttatgatttataacaacattgtat
gi|17                         :       tgctattttctcattgcaatttcttttaatttctcttggtcaaaacaacatcacgtgaattatattaaataacgtgtttcacctaatgtttcctaaaatagcatcacgtcTA-TTTT-T-C-ATT-G---CAA--TTTC--TTTTAATTT-CT-CTT--G--GT-----------CA-AA-ACA----ACAT--CAC-GTGA-ATT-ATATT----A-AATA-ACGT-GTTT---CACCTA---A--T--GT--TTCC-TA-AAAT-AGtataacaacattgtat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcTT---CACCTAAT--G-TTT-CCT--AAAA-T-A----G----CATCAC--GT---CG-T--T-AT------TCT---T-TCAGCTT--TC----C--A-TTGTGAC-GTC--ACACTTAT--AG-T-C--CT-Acatcacgtcgttattctttcagctttccattgtgacgtcacacttatagtcctaaaatgataatttagcgttgcattattatatgaatattgttatgattattacaacatt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gctatttttcattgcaatttcttttaatttctcttggtcaaaacaacatcacgtgaattatattaaataacgtgt-G--TT-ATTCTTTCAGC-TTTC-CAT--T-GTGACGTCACAC-TTATAGTCC-TAAA-AT--GAT-AA-TTT-AGC-GTTG-CATTAT-TA-T-A------T--G-AA------TATTGTT-AT-----GAT-----T-ATTACAaaatgataatttagcgttgcattattatatgaatattgttatgattattacaacatt
gi|18                         :         gctatttttcattgcaatttcttttaatttctcttggtcaaaacaacatcacgtgaattatattaaataacgtgtttcacctaatgtttcctaaaatagcatcacgtcTA-TTTT-T-C-ATT-G---CAA--TTTC--TTTTAATTT-CT-CTT--G--GT-----------CA-AA-ACA----ACAT--CAC-GTGA-ATT-ATATT----A-AATA-ACG--TGTT---CACCTA---A--T--GT--TTCC-TA-AAAT-AGacatt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcTT---CACCTAAT--G-TTT-CCT--AAAA-T-A----G----CATCAC--GT-T-CG-T--T-AT------TCT---T-TCAGCTT--TC----C--A-TTGTGAC-GTC--ACACTTAT--AG-T-C--CT-Acatcacgttcgttattctttcagctttccattgtgacgtcacacttatagtcctaaaattgataatttagcgttgcattattatatgaatattgttatgattattacaacat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gctatttttcattgcaatttcttttaatttctcttggtcaaaacaacatcacgtgaattatattaaataacgtg-G--TT-ATTCTTTCAGC-TTTC-CAT--T-GTGACGTCACAC-TTATAGTCC-TAAA-ATT-GAT-AA-TTT-AGC-GTTG-CATTAT-TA-T-A------T--G-AA------TATTGTT-AT-----GAT-----T-ATTACAaaattgataatttagcgttgcattattatatgaatattgttatgattattacaacat
gi|19                         :     gctatttttcattgcaatttcttttaatttctcttggtcaaaacaacatcacgtgaattatattaaataacgtgttcacctaatgtttcctaaaatagcatcacgttcTTATTA-TTTT-T-C-ATA-G---TTA--TTTT--TT--AATTT-TTA-TT--G--GT-----------CG-AA-ACA----ACAT--CAC-TTGA-CTT-ATCAT----A-AAT--GTT--AATTATAGACCTG---A--T--GT--TTCC-TA-AAAT-AGacat
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   --A---TAA----ATG-T--T---A--ATTATAGACCTGAT--G-TTT-CCT--AAAA-T-A----G----CACCAC--TT-T-CC-T--T-AT------CCT---T-TCAGCTT--TC----T--A-TTGTGAC-GTC--ACAATTAT--AG-T-G--CT-Acaccactttccttatcctttcagctttctattgtgacgtcacaattatagtgctaaaataaatcatttatcaatgcattattataataattattgtt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttattatttttcatagttattttttaatttttattggtcgaaacaacatcacttgacttatcT-ATCCTTTCAGC-TTTC-TAT--T-GTGACGTCACAA-TTATAGTGC-TAAA-ATA-AAT-CA-TTT-ATC-AATG-CATTAT-TA-T-A----A-T--A-AT------TATTGTaaataaatcatttatcaatgcattattataataattattgtt
gi|2                          : ttattatttttcatagttattttttaatttttattggtcgaaacaacatcacttgacttatcataaatgttaattatagacctgatgtttcctaaaatagcaccactttcctTTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--CATTTGCTA-----GGAGA-----------CG-AAGACA----ACACGTTAC-ATGA-CTT-TTTAT----AGAACA-ATG--AA-T---GACCTGAATA--T--GTTCTTCGCTA-ATGT-A-A---AGT-T-A---AT-TG-ACCT--GG-A-----TTTC---CTTAGTCA---TAG-----AG-T---------ATT---GA-CTGAT--G-TTT-CCTA-AAAA-T-A----GAA--CACCAA--TC-T-CA-T--T-AA------CCT---T-TTAAGAT--TCATAAT--G-TTGTGAC-GTC--ACAAT-----AGTT-G--CTGAGCTTTTCAG---TTC-CAT--TGGTGACGTCACAA-TAGCAGTGC-TAAAGATT-AAT-AAGTTT-TGG-GTTG-CATTAGAGA-T-A----C-T--A-AA------TATTGTG-CT-----AGT-----TAATTGAAGt
gi|20                         :                                                                                                                   ATTA-TTTG-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTA-GT--A--AC-----------CG-AA-ACG----ACAG--CAA-GTGA-CGT-ATTAT----G-CATA-ATGT-CATA---GACCTG---G--T--GT--GTCC-TA-AAAT-AGA---AGT-------AT-T-------------------------------A---TAG----A---------------------CCTG------TTT-CCT--AAAA-T-A----G----CATCAC--TT-T-CG-T--T-AT------CCT---T-TTAGCTT--TT----C--A-TTGGGAC-ATC--ACAATTAT--CA-T-G--TT-ATCATTTCATC-TTTC-Ccagaag
gi|21                         :                                                                                                                   ATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AACTT-CTATT---G--GT-----------CG-AA-ACA----ACAC--CAC-ATGA-CTT-TTTAT----A-AACA-ATG--AATT---GACCTG---A--T--GT--TTCC-TA-AAAT-AGA---AGT-T-A---AT-TG-ACCC--GATG-----TTTC---CTAAA--G---TAG----AAG-T--T---A--ATT---GAC---AT--G-TTT-CTT--AAGA-T-A----G----CACCAC--TT-T-CG-T--T-AA------TCT---G-TCAGg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCAC--TT-C-CG-T--T-AT------TCT---C-TCAGCTT--TC----T--A-TTGTGAC-GTC--ACAATTAG--AG-T-G--CT-AGCCTTTCAGC-TTTC-CAT--T-GTGACGTCACAA-TTACAGTGC-TAAA-ATC-AAT-GA-TTT-AGC-GTTG-CATTAT-TATT-G----C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGC-----T-ATTGCAG
gi|23                         :                                                                                                                  TATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAAAATGTC--TG--AATTT-CTATT---G--GC-----------CG-AA-ACA----ACAC--CAC-ATGA-CTT-ATTAT----A-AATA----------------------A--T--GT--T---------AT-AGA--------------------CCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---TAC----AAGTA--T---T--ATG---GA--------------CCT--AAAA-T-A----G----CACCAC--TC-T-CG-T--C-AT------CCT---T-TCAGCTT--TC----T--A-Tcaaaactgtttg
gi|24                         :                                                                                                                                           A--TTTC--TT--AATTT-CTATT---G--GT-----------CG-AA-ACA----ATAT--CAC-ATGA-CTT-TTTTA----A-AACA-ATG--AATT---GACCTG---A--T--GT--TTCCT-A-AAAT-AGA---AGT-TAA----T-TGA-CCT--GATG-----CTTC---CTAAA--A---TAA----AAG-T--T---A--ATT---GACCTGAT--G-TTT-CCT--AAAA-T-A----G----CACCAC--TT-T-CG-
gi|26                         :                                                                                                                  TATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAC--TTTC--TT--AATTT-CTATT---G--GT-----------CC-AA-ACA----ACAC--CAC-ATGA-CTT-TTTAT----A-AACA-ATG--AATC---GACCTG---A--T--GT--TTCC-TA-AAAT-AGA---AG--TAA---AT-TG-ACCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---TAG----
gi|27                         :                                                                                                                  TATTA-TTTT-T-C-GTT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CCAATT--G--GT-----------CG-AA-ACA----ACCT--CATGGTGA-CTT-ATCAA----G-AATACATGTTTATA---GACCTG---A--T--GT--TTCC-TA-AACT-AGcaacactttcgttat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AACCT--CATGGTGACTTAT---CAAGA--A---TAC----ATG-T--T---T--ATA---GACCTGAT--G-TTT-CCT--AAAC-T-A----G----CACCAC--TT-T-CT-T--T-AT------CCT---T-TCAGCTT--TC----C--T-TTGTGAT-GTC--caccactttctttatcctttcagctttcctttgtgatgtc
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tattatttttcgttgtaatttcttaatttccaattggtcgaaac---GACCTGAT--G-TTT-CCT--AAAA-T-A----G----CACCAC--TT-T-AG-C--T-AT------CCT---T-TCAGCTT--TC----C--A-TTTTGAC-GTC--ACATTTAT--AG-T-G--CC-A
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ta-G--CT-ATCCTTTCAGC-TTTC-CAT--T-TTGACGTCACAT-TTATAGTGC-CAAA-ATC-AAG-AA-TTT-AGT-TTTG-CATTAT-TA-T-A----C-T--A-TA------TATTGTG-AT-----AGT-----T-ATTGCAGaaatcaagaatttagttttgcattattatactatatattgtgatagttattgcagcaaaattt
gi|29                         :                                                                               tagacctgatgtttcctaaaatagcaccactttaTTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTT---TT--AATTT-CTA-TT--G--TT-----------CGAAA-ACA----ACAC--CAC-ATAA-GTT-TTAAT----caaaattt
gi|3                          :                                                                                                               taTTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTATTT--G--GC-----------CG-AA-ACA----ACAT--CAC-ATGAACTT-TTTAT----A-AACA-ATA--AATT---GACCTG---A--T--GT--TTCCTTA-AGAT-AGA---AGT-TAA---AT-TGAACCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---TAG----AAG-A--T---A--ATT---GACCTGAT--G-TTT-CCT--AAAA-T-A----G----CACCAC--TT-T-CG-T--T-AT------TCT---T-TCAGCTT--TCA---T--A-TTGTGAC-GTC--ACAATTAG--AG-T-G--CT-AGCCTTTCAGC-TTTC-CAT--T-GTGACGTCACAA-TTAGAGTGC-TAAA-ATC-AAT-AA-TTT-AGC-GTTG-CATTAT-TA-TCA----C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGT-----T-ATTGCAGtgactctatgaaggacactgaaattattgagtaaattatatacaagtgttactcaaactttacacttgtaaaat
gi|30                         :                                                                                                                tTTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTA-TT--G--TT-----------CG-AA-ACA----ACAC--CAC-ATAA-GTT-TTAAT----
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taACCTAAT--G-TTT-CTT--AAAA-T-A----A----TACCAA--TT-T-CG-T--T-AT------CCT---T-TCCGTTT--TC----C--A-TTGTGAC-GTC--ACAATAAC--AG-T-G--CT-Atgactctatgaaggagcactgaaattattgagtaaattaattaagtgttactcaaactttgcacttgtaaaat
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -G--TT-ATCCTTTCCGT-TTTC-CAT--T-GTGACGTCACAA-TAACAGTGC-TAAA-AGC-AAT-GA-TTT-AGA-GCTA-CATTGA-TA-T-T----C-T--A-AA------TTGTGTG-TT-----ATT-----T-AATGCAGaaagcaatgatttagagctacattgatattctaaattgtgtgttatttaatgcaggaaaa
gi|32                         :                                                                                  acctaatgtttcttaaaataataccaatttcTTATTA-TTTT---C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTA-TT--G--TT-----------CG----ACA----ACAC--CAC-ATAA-GTT-TTAAT----gaaaa
gi|4                          :                                                                                                                aTTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTATT---G--GC-----------CG-AA-ACA----ACAT--CAC-ATGA-CTT-TTTAT----A-AACA-ATA--AATT---GACCTG---A--T--GT--TTCCT-A-AGAT-AGA---AGT-TAA----T-TGA-CCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---TAG----AAG-A--T---A--ATT---GACCTGAT--G-TTT-CCT--AAAA-TTA----G----CAC-A---TT-T-CG-T--T-AT------TCT---T-TCAGCTT--TCAC--T--AATTGTGAC-GTC--ACAATTAG--AG-T-G--CT-AGCCTTTCAGC-TTTC-CAT--T-GTGACGTCACAA-TTAGAGTGC-TAAA-ATC-AAT-AA-TTT-AGC-GTTC-CATTAT-TA-TCA----C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGT-----T-ATTGCAGtgactctatgaaggagcactgaattattgagtaaattatatacaagtgttactcaaactttacacttgtaaaat
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAA-TTATAGTGC-TAAA-ATC-AAT-AA-CTT-AGC-GTTG-CATTGT-TA-T-A----C-T--A-AA------TATTATG-AT-----AGT-----T-ATTGCAGc
gi|45                         :                                                                                                                 TTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTATT---G--GT-----------CG-AA-ACA----ACAC--CAC-ATGA-CTT-TTTAT----A-AACA-Acaaaactg
gi|46                         :                                                                                                                        aTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATT---TA-TT--G--GT-----------C---A-ACA----ACCC--CCT-ATGA--TT-ATTAT----A-
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C-TAAA-AT---AT-A---TT-AAC---TGACCTTAC-TA-T-A----C-T--A-A---------TTGTG-AT-----AGT-----T-A-TGCAGcaaggccagcacatgt
gi|5                          :                                                                                                                  TATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--GATTT-CTATT---G--GC-----------CG-AA-ACA----ACAT--CAC-TTGA-CAT-TTTTT----A-AACA-ATG--AATT---GACTTG---A--T--AT--TTCCT-A-AGAT-AGA---TGT-TAA----T-TGA-CCT--GATG-----TTTC---CTAAA--A---TAG----AAG-T--T---A--ATT---GACCTGAT--G-GTT-CCT--AAAA-T-A----G----CACCAC--TT-T-CG-T--T-AT------TCT---T-TCAGCTT--TC----T--A-TTGTGAT-GTC--ACAATTAG--AG-T-G--CT-AGCCTTTCAGC-TTTC-CAT--T-ATGACGTCACAA-TTACAGTGC-TAAA-GTC-AAT-AA-TTT-AGC-GTTG-CATTGT-TATT-A----C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGT-----T-ATTACAGcaaaactgttaaa
gi|52                         :                                                                                                                  TATTA-TTTT---C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AACTT-CTATTT-----GT-----------CG-AA-ACA----ACAC--CAC-Ac
gi|55                         :                                                                                                                 TTATTA-CTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-a
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  catagAA-TTATAGTGC-TAAA-ATC-AAT-AA-TTC-AGC-GGTG-
gi|6                          :                                                                                                                 TTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--AATTT-CTATT---G--GT-----------CG-AA-ACA----ATAT--CAC-ATGA-CTT-TTTA-----A-AACA-ATG--AATT---GACCTG---A--T--GT--TTCCT-A-AAAT-A-A---AGT-TAA----T-TGA-CCT--GATG-----CTTC---CTAAA--A---TAA----AAG-T--T---A--ATT---GACCTGAT--G-TTTTCCT--AAAAAT-A----G----CACCAC--TT-T-CG-T--T-AT------TCT---T-TCAGCTT--TT----T--A-TTGTGAC-GTC--ACAATTAG--AG-T-G--CT-AGCCTTTCAGC-TTTC-CA---T-GTGATGTCACAA-TTACAGTGC-TAAA-ATC-AAT-AA-TTT-AGC-GTTG-CATTAT-AT-T-A----C-T--A-AA------TATTGGG-AT-----AGT-----T-ATTGCAG
gi|7                          :                                                                                                                 TTATTA-TTTT-T-C-ATT-G---TAA--TTTC--TT--GACTT-CTATT---G--GT-----------CG-AA-ACA----ACAC--CAC-ATTA--TT-TTTAT----A-AACA-ATG--AATT---GACCTG---AATTAAGT--TTCCT-A-AAAT-AGA---AGT--AA---AT-TGA-CCT--GN-------------------------------------------A--ATT---GACCTGAT--G-TAT-CCT--AAAA-T-A----G----CACCAC--TT-T-CG-T--T-AT------ACT---G-TCAGCTT--TC----T--A-TTGTGAC-ATC--ACAATTAC--AG-T-A--AT-ATCCTTTCAGC-TTTT-TAT--T-GTGACGTCACAA-TTATAGAGC-TAAA-ATC-AAT-AA-CTT-AGC-ACTG-CATTAT-TA-T-A----C-T--A-AA------TATTGTG-AT-----AGTTACCGT-ATTGCAGc
gi|8                          :                                                                                                                  TATTAATTTT-T-C-ATT-G---TAA--TT-C--TT--AATTT-CTATT---G--GT-----------CG-AA-ACA----ATATT-CAC-ATGA-CTT-TTT-T----A-AAAC-ATG--AATT---GACCTG---A--T--GT--TTCCT-A-AAAT-AGA---AGT-TAA----T-TGA-CCT--GATG-----CTTC---CTAAA--A---TAA----AAG-G--T---A--ATT---GACCTGAT--G-TTTTCCT--AAAA-T-A----G----CACCAC--TT---CG-T--T-AT------TCT---T-TCAGCTT--TT----T--A-TTGT-AC-GTC--ACAATTAG--AG-T-G--CT-AGCCTTTCAGC-TTTC-CAT--T-GTGATGTCACAA-TTACAG-GC-TAAA-ATC-AAT--A-TTT-AGC-GTTG-CATTAT-AT-T-A----CTT--A-AA------TATTGGG-AT-----AGT-----T-ATTGCAGcaaaactgtt
gi|9                          :                                                                                                                   ATTA-TTTT-T-CCATT-G---TAA--TTTCCTTT--AATTT-CTA-TT--G--GT-----------CGTAA-ACA----ACAC--CA--AT-A-CTT-TTCAT----A-AATA-ATG--TACA---GACCTG---A--T--GT--T--CCTA-AAATAAGA---AG--TAT---AT-TG--CCT--GACG-----TTTC---CTAAA--A---TAGC---ACA-C--TTTCG--TTT---CTCCCG-TCAG-CTT-TCT--AAAT-T-GTGACG----TAACAA--TTAT-AG-TG-C-AT------CCT---T-T-AGCTT--TCT---T--A-TTGT-AT-GTC--ACAATTAT--AG-T-G--CT-Ac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACCT--GATG-----TT-C---CTAAA--A---TAA----GAA-G--T---AT-ATT---G-CCTGAC--G-TTT-CCT--AAAA-T-A----G----CA-CAC--TT-T-CGTT--T-CT------CCC---G-TCAGCTT--TC----TAAA-TTGTGAC-GTA--ACAATTAT--AG-T-G--C--ATCCTTT-AGC-TTTCTTAT--T-GT-ATGTCACAA-TTATAGTGC-TAAA-ATC-AACGAA-CTCAAGCTGTTG-CATTAT-TA-TAA----C-T--ACAAAAATATTATTGTG-ATATGTAAGT-----T-ATTGCAGaaatcaacgaactcaagctgttgcattattataactacaaaaatattattgtgatatgtaagttattgcagcaaaaact