lowQualScore : 11111111 111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 444 55 1 1 4 22222222 4 4 99999 2 44444 222222 111111111111111 444 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 55555555555 222222 2 1 2 666666666666666666 22 444 111 11 666666666666666666666666666666 11 2 222 11111 6666666666666666666666666666666666 1 111 3333333 1 2 44444444444 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 444444444 33333 111 1111 4444444444 22222 11 1111 2222 333333333333333333 1 1 1 33333333 2222 33 11111 111 88888888888888888888888888888 1 22222 33333333 11111 444444444 11 1 333333 4444444 333333333 666666666666666666666666666666666 44444 11 111 2222 11 111 11 111111 11 4 1 22222222 111 11 11 2222 1 333333 11 7777777777777777777 3 22222 5555555555555 11 3333 11 1 22222 1 1 1111 3333 11 1 11 5555555555555555 3 1 3333333 111 2 111 111111 111 1111111111111111111111111111111111111111 22 1111 55555555 4444444444444444444 222 9999999999999999999 1111111111 2 1 2222222222222 222 1111 11 22222222 3 33333333333 11 2 11 333 11 11111 2 1 33333333333 88888888888888888888888888888 11 2222222222 22222222222222222 222 44444444 11 2222 4444444 11111 111 1 11 2222 33333333333333333333333 22222222222 2222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 222222 11 3333333 1111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 4444444444 66666666666666666666666666666 44444444 11 666666666 22 11 2 2 1 55 1 1 8888888888888
lowQualScore : 6 555 55 6 5 7 6 0 11111111 0 0 11111 2 0 88888 000000 222222222222222 6 333 6 3 6 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 3 7 88888888888 222222 0 3 0 4 8 444444444444444444 8 6 2 6 6 6 1 44 2 000 6 5 111 6 88 6 6 3 6 6 6 6 66 6 6666 1 99 3 6 4 55 3 6 88 444444444444444444444444444444 8 8 0 99 5 8 5 5 8 000 77 1 77777 4444444444444444444444444444444444 1 5 888 888 5 77 000 6666666 4 2 0 66666666666 11 6 0 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8 2 444444444 33 00000 6 6 111 0000 6 11 99 6 3 99 99 3333333333 8 33333 55 8 8 8 3333 0000 88 222222222222222222 6 8 8 6 6 6 8 0 77777777 8 8 5555 11 8 8 8 8 8 0 3 9 0 66666 6 111 0 6 55555555555555555555555555555 0 11111 55555555 88888 3 222222222 33 0 6 888888 8888888 8 111111111 8 999999999999999999999999999999999 99 66666 88 11 8 8 666 8 1111 22 999 33 444444 33 0 0 88888888 777 4 2 33 33 1111 88 3 0 444444 666 33 4444444444444444444 4 22222 0000000000000 2 22 8 0000 2 3 33 0 6 55555 0 0 7777 8888 33 0 88 9999999999999999 2 3 4 4444444 111 0 111 444444 111 8888888888888888888888888888888888888888 3 4 66 1 2222 5 33333333 77 2222222222222222222 6 6 777 88888 99 4444444444444444444 9999999999 1 6 6 0 99 7777777777777 111 5 5 1 9999 5 33 1 00000000 77 5 66 6 11 5 11111111111 1 33 99 6 2 5 77 5 22 888 00 99 44444 2 44 0 44444444444 5 5 99999999999999999999999999999 8 11 0000000000 3 99999999999999999 8 8 222 77777777 1 55 6 6 44 3333 6 0000000 11111 6 6 6 444 3 3 11 8888 99999999999999999999999 888 55555555555 0 5 1 8 2222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 333333 1 00 2222222 2222 6 99 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5 6 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 8 7777 6666666666 33333333333333333333333333333 88888888 66 000000000 11 88 0 3 0 0 6 6 7 55 6 7 7 1111111111111
lowQualScore : . ... .. . . . . . ........ . . ..... . . ..... ...... ............... . ... . . . ......................................................................... . . . ........... ...... . . . . . .................. . . . . . . . .. . ... . . ... . .. . . . . . . . .. . .... . .. . . . .. . . .. .............................. . . . .. . . . . . ... .. . ..... .................................. . . ... ... . .. ... ....... . . . ........... .. . . .............................................................. . . ......... .. ..... . . ... .... . .. .. . . .. .. .......... . ..... .. . . . .... .... .. .................. . . . . . . . . ........ . . .... .. . . . . . . . . . ..... . ... . . ............................. . ..... ........ ..... . ......... .. . . ...... ....... . ......... . ................................. .. ..... .. .. . . ... . .... .. ... .. ...... .. . . ........ ... . . .. .. .... .. . . ...... ... .. ................... . ..... ............. . .. . .... . . .. . . ..... . . .... .... .. . .. ................ . . . ....... ... . ... ...... ... ........................................ . . .. . .... . ........ .. ................... . . ... ..... .. ................... .......... . . . . .. ............. ... . . . .... . .. . ........ .. . .. . .. . ........... . .. .. . . . .. . .. ... .. .. ..... . .. . ........... . . ............................. . .. .......... . ................. . . ... ........ . .. . . .. .... . ....... ..... . . . ... . . .. .... ....................... ... ........... . . . . .... ................................................................................... ...... . .. ....... .... . .. ........................................................................... . . .................................................................... . .... .......... ............................. ........ .. ......... .. .. . . . . . . . .. . . . .............
lowQualScore : 0 000 00 0 0 0 0 0 00000000 0 0 00000 5 0 55555 888888 777777777777777 0 777 0 3 7 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 3 3 77777777777 222222 0 2 0 0 0 000000000000000000 0 7 2 7 7 7 8 33 5 888 7 2 777 7 88 7 7 5 7 7 7 7 00 7 8888 7 22 7 7 0 88 7 7 99 666666666666666666666666666666 0 0 8 22 7 0 7 7 3 333 99 4 77777 6666666666666666666666666666666666 4 7 444 333 7 00 000 5555555 0 5 0 22222222222 00 6 8 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 0 555555555 55 33333 7 7 777 0000 7 77 22 7 0 22 22 2222222222 0 00000 00 0 0 0 0000 8888 88 444444444444444444 0 0 0 0 0 0 0 8 00000000 0 0 0000 00 0 0 0 0 0 8 8 0 8 00000 2 888 6 0 88888888888888888888888888888 0 22222 55555555 88888 2 000000000 88 0 0 000000 8888888 0 888888888 0 666666666666666666666666666666666 00 22222 22 00 0 0 000 0 2222 22 222 22 888888 88 0 5 00000000 555 5 2 88 00 2222 00 2 0 888888 000 88 8888888888888888888 2 22222 8888888888888 0 22 8 8888 2 0 88 0 0 55555 5 0 8888 8888 88 0 55 2222222222222222 2 8 5 0000000 777 8 777 333333 888 2222222222222222222222222222222222222222 0 0 11 4 1111 7 77777777 11 8888888888888888888 7 7 222 55555 22 2222222222222222222 2222222222 0 7 7 8 22 3333333333333 777 7 7 7 4444 7 66 7 77777777 99 0 99 9 66 0 33333333333 0 33 22 7 9 7 99 7 44 000 22 22 33333 1 99 0 77777777777 7 7 22222222222222222222222222222 0 00 6666666666 8 88888888888888888 0 0 000 44444444 0 00 7 7 00 3333 7 1111111 66666 7 7 0 000 0 2 00 2222 66666666666666666666666 444 66666666666 8 4 4 0 0000 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 888888 0 00 7777777 1111 7 22 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 7 3 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 0000 2222222222 55555555555555555555555555555 33333333 00 333333333 77 33 7 7 0 0 0 0 0 00 0 0 0 0000000000000
consensus : TTCAAATCTCACTGCTCGAATTTCCAATAAATCCCCTCAAAGAGAATGTCATT-GTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAA-GTACTTGTAAAAAAACAANATCTCACATTTTACAGTCTAGATACGTGTGAAT----G-GCT-TA---TCGGGTAAA-NTAATATTTTCAAGCA-ATTACTTTTT-GATAA----GTCCT--TGGAATTTG-ACAT-GTCTA-GT----------------------CTT--------GCTAGTT-TTTCA-----G--ATGGAGTATTTTTT--A---TTTATTAGATGGCAC-TTTCAAA-ATTA----------------GGTACA-CCCCAGCACTTCT-TAGAGTGCGG-CATT-GAA-GANTGCCGAGCAGAAT--TG-TNAA---TTTTACTGCA-ATT-CTTG-TCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCCA-GAANACAAA--AGCCATGA-GGTGGTTCCTCT-TATCNAC--AACG-----N-AA-ACGACAACTTCCTG-TGGAAAAA-TG-C-AAGGCC-C-ACCCNAC--TAAAG--ATATN----GACAT---C----CTT--TGTA-ACGANT-GCC---AAG-T-TCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---TG-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCNGGAGGCAT--AAATTCGTTGATTT--AGAG-ACAAT-C--TATCGA---GAAAAGT-TAT--C---GCT--ATGCTT-----CA-AGA-GGAGAT---TT-CAGAAGGTCCAT-CG-A-TATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT--T-TANAG--AAA--GAAA--T---CAAA-GAA----GATGCCCGCGG-A-AAT-AAAGA-T--GATTC-AT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TG-AAGG-CTGATGGAGAGG-------TCTCT-CA-AAAT---GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACAAGTAAAC-A---ANAT--AGAAAAGTTCGTTGTTAGGAGAAG--ACAGCCA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--A---T-TG--AN-GATTACAT---TGC-CATA--TC-TCCATGACT-TT-CGTCAAAN-AGTT-CC-ATGG----CTA--CCT-ATCCTCCNCAAA--GAT----------C--GCAGNT-T-TAATTCCCAAA-CTTTCTGAGAAG-ATTCCGGGAAATCC--GAC-CCATAC-C-AGAG-ACAAC----AAAACC-GGT-NNCCCC-AGT--G-T-TTACT--GCTGGTCAATA-----TA-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACT-NGGG----AAAATAG-AAGCGANG--GAGACCAA--ACCAGCAG--A---GAGTG----AAAAAT-AAAAC-CC--ATGG--A-AATTGNCT-CTCCTTTAGC-ATCA--GTGGANT--CTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAG--GATAAG--GAATCT-GATGTNGAAACAAACA-----A--TGCCCCTA-TCTTCCTCTG-------TTACTGA---GGTCAGGGAG---TTC--AG-GTATCG-GGTGTTG-AAA--T-TTATG----G---CAT----T--ATN--TCNCTNGATAAATNCAG----G-CAGGACTT-CTGGG-TCA-G-TGAC-TT-AG--A---T-AACCT-TGTCCG--AAACAG-ATC-TA--CAGGGGA-AATCTG-AGCTAC---GGAA--GNTAN---AAACCAGTGG-TGGATACG--GN-TN-C-------CACACA-GTCACA-CAGG-ACGGGGNT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGAGAAA-ATAAAGTCATCAA--TAA-GATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA--TTAAAACA-GGG--GACT-GGACACCCA-TTCAGCGTA--CA-----CTCCCCC-CACATCAACGG-----GG-ACATACTGGT-GGG---GT-GATGAAG-AC---GGTAA--GGGCTA-AAGT--CAC---CCG----GTACAGCAA--AGACAG-G-AA----AAGAA-CTAC-AGAA---CATAACAGAN-GGACGACAA-AG-GA-CAGGANCT---GTAT-AG-----CGATC-CACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA--CGGN---GATATCTG--CG-TATCA-GAC---CT--TNATAA-ANAGGCGGNTA--GTTGGTGGTGAA-CAAATTCAGGAC-AAT---TACAG-GTTTCTCC------TTACA----CG-AG--GTTCAGAAAGATCAGGATT-CT--TCCCN----N-C----GGAATCTGTA-----CTGATGTCCTCGG--TT---CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-TN-------CT-AT-G-GACAATA---------------G-TG-------TTCA--CNTCCT-NGATCC-----AG-GACGGTCAGTTCTTGTCA-T-TACTACT-T--CA-CAA--AACAACANGG-C-A--GTACGGCG-TC-C-CCG-TAG------TGT-GTGTGT----AGATTGACGAAGGAACAATCTCTA--TGTAG-----GA----GA--TACG--GACACAGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATCT--TACA-GTGAG--TTCTCTTANTGGTCAATCAACACACTACCACACAGAGATTTCACAACTTGTGACCAATGAGATAATATTTTATGAAT-CT--ACAATTTA
Reference ( gi|1 ) : TTTAAATCTCACTGCT-GCATTTCCAA--AGTCCCCTCAAATAGAAAGCCATTTGTCATTT----TG--GGTCAAACACAGAT-ATTGTAAAGTACT----GAAAAACAACATCTCA-ATT--AC-GTCTAGATACAAGTGAAT----A-GCTATAAAATCAGGTAAA-G-AACATTTTCAAGCA-ATGACTTTTTTGATAATTAAGTCCT--TGGAATATG-ATAT-GTCTA-AT----------------------TTT--------GTTAGTT-TTTCA-----GT-ATGGAGTATTTTTT--A---TTT-TTAGATGGCAC-TT-CAAA-ATTA----------------G-TACA-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGTGG-CATT-GAA-GATTGCCGAGCAGAA---TG-TGAA---TTTTATTGCA-ATC-CTTG-TCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGTCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCCA-GAAAACAAA--AGCCATGA-AGT-GTTCTTCT-TATTTGC--AGCG-----C-AA-ACAACAACTTCCTG-TGGAAAAAGTG-CGAAGGCC-C-ACCCAAC--GAAAG--ATATT----GACCT---T----TTT--TGTA-ATGAGT-GCC--CAAG-T-TCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---TGATACAAACACTGGAAGAGTCATT-TCTGG-GCCAT--AAATTTATAGATTTTAGGAGGACAAT-C--TATTCA---GAAAAGT-TAT--C---ACT--AT--TT-----CA-AGA-GGAGGT---CTTCAGAAAGTCCATTCG-A-TATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAGGAT--T-TAAAG--AAA--G--A--T---CAAA-GAA----GATGCTGGCAG-A-AAT-AAAGA-T--GATTC-AT-GGACAG---------TCT-A----AAA-ACA-GCCA-TG-AA-G-CTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCATTGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACAAGTAAAC-A---ATAT--AGAAAAATCCATTGTTAGGAGGAG--ACAA--AAAT-AGCC-AGGA-T--GACAC--A---T-TG--AA-GATTATAT---TGT-C-TA--TC-TCCGTGACT-TT-TGTCAAAG-AG---CC-ATGG----CTT--CCT-ATCCTCTTCGAA--GAT----------C--ACAGAC-T-TAATTCCCAAA-CTTTTTGAGAGGAAACCTGAAAAATCC--GAT-CCATAC-C-CAAG-ACAAC----AAAACC-AGT-ACCCCC-AGT--G-T-TTACT--GC-GGTCATTA-----CA-GCAAAG---ATGATGTTGTCAAAT--TACT-AGGG----AAGGTAG-AAATTAGA--GAGACCAA--ACCAA-AG--A---AAG------AAAAATAAAAAC-CT--ATGG--A-G--TGGCTGCTCCTTCAGT-AGCA--CCGAAAT--CTAC-AAGCAG---GCAGATG-AAACAA-G--ACAGGGAGATAAG--AAATCT-GATGTTGA---AAACA-----ACTTGTCTCTATTCTCCCTCTG-------TCACTGA---GGTCTGGGAG---TTT--AGGGTATCT-GGTATTACAAACTTTTTATG----G---CAT----T--ATA--TCACTTGATAAATTCAG----G-CAGGACTTCCTGGG-CCATG-TGAC-GT-AG--A---T-AACCT-TGTCCA--AAACAG-ATT-TA--CAGGGGG-AATCTG-ACCTACTTTGGAA--AGTAA---AAACTA-TGG-TGGATTTG--GG-TT-C-------CACA-A-GTCACA-CAGG-ATGGGTTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAAAGCAA-ATAAAGTCATCAA--TAGTGATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA--TGAAAA-A-GGG--GACT-GGACACCCACTTCAGTATA--CA-----CTGCCTC-CACATCGAATG-----AG-ACATACTGGT-GGG---GT-GATAAA--AC---GGTAAACAGGCTA-AAGT--CAC---CCG----ATACAGCAA--AGACA--G-AA----AAGAA-CTAC-AGAA---CATAACAG-C-GGATAACAA-TG-GA-CAGGGACT---TTAT-AG-----CAATC-CACGCTACAT-CAC-AGGAA---ATATGAA--TGGA---GATATCTG--CA-CATCA-GAC---CT--TAATAA-AGAGGCAGTTA--GTTGGTGTTGAA-TAAATTCAGGACAAA----CACAG-GTTTCTCC------TTACA----CA-AG--GTTCAGAAAGGTCAAGGTT-CT--TCCCC----G-G----GGAATCTGTA-----CTGATGTCTTCAG--TT---CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-TA-------CT-AT-G-GACAATA---------------G-TG-------TTCA--CTTCTT-AGATTC-----AG-GACGGTCGGTTCTTGTCAAT-TACTACCTC--CA-CAA--AACAACCAAG-CCA--GTACAGCG-TC-C-CCG-TTG------TCT-GTGTGT----AGATTGATGAAGAAACAATCTCTA--T-TA------GA----AA--TATG--GACACAGT--------GACAGTGC-ATAGCGTATCTGTTACAGGTGAG--TCCTCTTACT-GTCAATCAA-ACATTGCCTCAC--AGATTTCACAGCTTGTGACCATTGAGATTATATTAAAAGAATACTAGACAATTTAGCCCACGCGAATAA
gi|5 : TTCAAATCTCACTGCTCGAATTTCCAATAAATCCCCTCAAAGAGAATGTCATT-GTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAA-GTACTTGTAAAAAAACAAAATCTCACATTTTACAGTCTAGACGTTGGTGAAT----GCGCTGTG---TCGGGTAAA-ATGATATTTTCAGGCATATTACTTTTT-GA-AATGAA-TTCT--TGGAGTTTGGACATTGTCTACAT----------------------CTTCTACTGCAGTTAGTTGTTTCACGATGGCGATGGTGTATTTTTT--AGTATTTATTAGA--GCAC-TTTCAAA-AGTA----------------T-TACG-ACCC-GCACTTCC-TTAGGTGCGGGCATTCGAATGAGAGC-GAGCAGAAAT-TG-TAGC---ATTTACTGCGCATTGCTTGGTCA-TCACCGAAATGT-GATAAACTAATGTCGAG-AGTA-AACA-CT--GAAGAGTCCAAGAATACAAAT-AGC--TGACAGT-TTGGTTCTCTATT-AC--AACA-----T-AA-ACAACAACTTCCTGCTGGAAAAAATG-CCAAGGCCAC-GGCCAAC--TAAGT--A-GTTGAGAGAC----------TAC--TGTAGATGAAT-GCC----AG-TCTCCAATTT--GT-TT-CACAAA---TCGTAC-AACACTGGTAGAGTCACTGTCTGG-GCTACTAAAATTTATAGA---TAGG----CAATAC--TATC-------AAAGT-TAT--TCTAACA--AT--TTTTGTCCATCGACGGAGAG---TTACAGATGGTCCATTCA-A-TATTATCCT---TCAACAAACATCAACAAGAT--T-TAAAGGAAGA--G--A--TCA-CAAA-GAAGAATGACGCGAACGGTA-AAT-AAATA-CTAGACACTAT-GGCCAGGTTTCAGCTTCT-ATTTTAGATACATGCCATTGTAA-G-CCAACTGGGAGGATGTTTCTCTCT-CC-AAAT---ACA-TGGTGGA-CC-CAGTGGG-TGTCAGGAAAGTATAGAAC
gi|11 : CATCTCA-ATTT-AC-ATCTAG-TACGTGTGAATTAATG-GCT-TA---TCGAGTAAATG-AATATTTTCAAGCA-ATTACTTTTT-GATA--T--GTCCTAATGGAATTTG-ACAT-GT-----------------------------TT--------GCTAGTT-TT-CA-----G------AGTATTTTTTGTA---TTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAA-ATTA----------------GGTACA-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGTGG-CATT-GAA-GATTG-CGAGCAGAAT--TG-TGAA---TTTTATTGCA-ATT-CTTG-TCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCCA-GAAAACAAA--AGCCATGA-t
gi|8 : TACATGTGAAT----G-GAT-TA---TCGGGTAAT-TTAATATTTTCAAGCA-ATGACTTTTT-GATAA----ATCCT--TGGAATTTG-ACAT-GTCTA-GTATTGCCTACATTCTACTGTAAGTTT--------GCTAGTT-TTTCA-----GG-ATAGAATATTTTGT--A---TTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAA-ATTA----------------GGTACA-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGCGG-CGTT-GAA-GATTG-TGAGCAGAAT--TG-TGAA---TTTTATTGCA-ATC-CTTG-TCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACACCT--GAAGAGTCCA-GAAAACAAA--AACCATGA-AGTGGTTCT--C-TATCTAC--AACG-----C-AA-ACAACAACTTCCTG-TGG-AAATGTG-C-AAGGCC-C-ACCCAAC--TAAAG--ATATT----GACAT---C----CTC--TGTA-ACAATT-G-C--AAAG-T-TTCA--TT--GTGTT-CA-AAA---TG-TGC-AACACTGGAtg
gi|4 : T--A---TTTATCAAATGGCACATT-CCAA-ACTAAGTGTACCAAGCCTGGG-TACA-CCCCAGCATTTTA-TAGAGTGTGA-CATT-GAC-GAATG-CGAGAGGAAT--TG-TCAG---TTTTACTGCA-ATT-CTTG-CCA-TCTGC-AGATGT-G-TGAAC-AATGCAGAG-A-GG-AACATCT--GAAGAATACA-GATTACCAG--AGCCATGA-GGT-GGTCCT-T-TACCAAC--AACGAAAAACGAA-ACGACAACTTCCTG-TGGAAAAA-TG-C-AAGACT-C-ACCCCAC--TAAAG--ATATA----GATAT---G----CTT--TGTG-AGGAAT-G-T--CAAA-T-TCCA--CT--ATGTT-CC-AAG---TG-TGC-AACACAGGCAGA-TCAT----CGG-GGCAT--AAATTCATTGATCT--GGA-GACAAT-C----TTGA---GGAAAATATAG--C---ACTTCGC--CT-----CA-AGA-AGATAT---CC----AAAATCCA--AGAA-TATT-TCCT---TC--C-GACATC-ACAAGAT--T-TACAG--AAA--GAAA--T---TAAA-GGT----GATACCCACAG-A-AAT-AAAGA-T--AA-TC-AT-GGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCTA-TG-AAGG-CTGATGGAGAG--------TCCCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATGCATCAGGTGGAC-A---AGAT--AGAACAGTCC-TTGAT-GGA------ACAATTACAG-AATC-AAGA-TTCAACAT------T-TG--AT-GATTACAT---T-T-CATA--TC-TCAATGAC--CT-CGTCAAAG-AGTT-TC-ATGG----CTA--CAT-GTTTTCCCCAAA--GCT----------T--GCAAAT-A-TAATTTCCAAT-CTTTCTAAGA--AATTCTCAGAAATTC--GAC-CCATAC-C-AGAA-ACAAC----AACAGT-GGT-GACCCC-AAT--G-T-TTACT--GCTGGTCGATA-----TA-GCAAAG---ATAATGTGGCCAAAT--TACT-AGGG----AAAATAA-ATGTGAGG--GATACCAA--AGCAG-AG--AT--GAG------AAAAAT-AAAAC-CC--ATGG--A-AATTGTCT-CTCCCTCAAC-ATCA--GTGGAAT--CTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACGA-G--ATAAT--GATAAG--AAATCT-TATG-TGAAACAAACA-----A--TGCCCATA-TCTTCATATG-------TCTCTGA---GTTTAGGGAGATATTT-----GTATTT-GTTA--AAGAA------ATG----ACC-CA-----T--ATC--TCCCTTGATAAA-GCAG----G-CAAG-CT--ATGGG-TCA-G-TGGCAGT--G--A---T-AACCT-TGTAC---AAACAG-ACT-TA--CA-AGGA-AAGC---AGCTGCT---GAG--GATAA---AGATCAGTAG-TGGATCTG--GC-TA-C-------CACACA-GTCACA-CGGG-ACGGGGTG-CTC-ATC--TTAACAG--------ACAGATACA-ATAAAGTCATCAA--CAA-GATAACACCG-GATCAT--AA------GATAAA-AAAGTTCT--TTAGAACA-GGA--AGCT-GGA-ACCCAA-TCAGCATA--CA-----CTCCTCC-CACATCAACGG-----GG-ACATACTGGT-GGGT--AT-GATA---------GGTAAGGGGGCCA-GAGT--CAC---ACG----GTACAACGA--GAAAG--G-GA----AAGAA-CTAC-ATAT---CATACAAA-C-AGATGATAA-AG-GA-CAGAAACT---ATAT-AG-----ga
gi|3 : tcatttatattttctatttgtagagagtcc-CAAATATGG----------------G-TACAACCCCAGCACTTTT-TAGAATGTGG-CATC-GAA-GATTGC-GAG-AGAAAATTG-TCAA---CCTTACTGCA-ATC-CTTG-CCA-TC-GC-AGATGTTG-TCAAC-AATGCACAGCA-CG-AGCATCT--GAAGAATCCA-GATTACAAAGAAACCATGA-GGT-GGTCC-CT-TACCAAC--AACG-----A-AA-ACGACATCTTCCTG-TGGAAAA--TG-C-AAGATC-C-ACCCCAC--TAAAG--ATATA----GACAT---G----CTTG-TGTG---GATT-GCC----AGCT-TCCA--TT--ATGCTACA-AAA---TGTTTCAA-CACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGCAT--GAACTTGTTGATT---AGAG-ACAAT-A--TAG-AA---GAAAAAA-AATGGC---GCT--ATGCTT--------AGA-GGAGAT---AT-CA-AAGGTCGA--CA-AGTATT-TTCT---TC--C-CACATC-ACAG-AT--T-TACAG--AAA--G--AAAT----AAA-GG-----GATGCCCACAG-AGAAT-AAAGA-T--GATCC-A--AGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCCA-TG-AA-GGCTG-TGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TATCA-G-AAATAT-CAACAAGTGGACTA---ATA---AGAACAGT-CATTGCT--GAGAAATTACAG-------AGTCGAAGA-T---ACAC--ATATT-TG--AT-GA-TACAT---T-T-CATA--TCTTCCATGAC---C-TGTCAAAATAT---TC-ATGG-----TA--ACT-ATCCTCCACAAA--ACT----------T--ACAATCAT-TAATTCCCAAA-CTTTCTGAGAAG--TTCCAGGAAATCC--GAC-CCATAC-C-AGAG-ACAAC----AAAACC-GGT-CACACC-AGT--GTT-TTACT--GCTGGTCAATA-----TA-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACT-CGGG----AAAAT-G-AAGCGGAA--AAG---AA--ACAAG-CG--G---GGGTGCGGAAAAAAT-AAAAC-AC--ATGG--ACA--TTATATCTCCTTTAGC-ATCA--GTGGACT--CTAC-AAGTAA---ACGAAAG-AAACAAGG--ACAAG--GATAAG--GATCTT-GATG-TGAAACAAACA-----A--TGTCCCTA-TCTTCCTCTGT------TCACTGA---GGTC-AGGAA---TTC--AG------T-TGTAT--CAGA-TTGTTA-GCAGTG---CAT----TCCATATTTCACTAGGTAAAATCAG----G-CA-AACTT-ATGGATTCA-G-TGAT-TT-TG--ATGGT-AACCT-TGTCCAACAGACAG---T-CA--CTGAGGA----CTGCAACTAC---AAAA--ATTAC---GAACCAGTGA-TGGATACG--GC-TC-A-------CAC--A-GTCACA-CAGG-ACGGGGAC-CTG-ATCTTTTA-CAG--------ACGAGAAAA-ATAAAGTCATCAA--TAA----AACAATG-GGTAATCAAA-----AGA--A--AAAATTCATTTCAAAC-A-AAA--GACT-GGAAACCAA--TAAGC-TA--CA-----CT--CTC-ACCATT-AACG-----GGAACATACTGGT-GGG---AT-GAGGAAGGATATGGGTG---AGGCTA-AA-TCACAC---TCG----GTACAGCAA----ACAG-G-AA----AAGAA-CTAC-AGAA---CAT-ACAGAG-GGACGACAA-AG-GA-CAGGACCTGTATTAG-AG------GATC-CACACTA-AT-CAC-AGAAA---ACATCAA--CGG----GATATTTG---G-TATCACGAC---AT--ATATAA-AAAGGCAGTTA--GTGCGTGGTGAA-CAAA-TCAGGAC-------TACAG-G-TTCTCC------T---A----CA-AA--CGTCAGAA--GTTAAGATT-TA--TCCCT----T-T----GGAATCTGTA-----CTGATGTCCTCGG---T---CAT----CTCCTGGTG-TG--TGAT------------------GAAAACA---------------G-TGAAACAATTTCA--ATTTCT-CGAT-------AGTGAGGGTC-ATTCTTGTC--T-CTCTAC--T--CA-CAA--AGAAACAGAA-C----ATATACTA-TC-CACCG--AG------TGT-GTGTGT----AGA-TGACGA--GAACAATCTTTA--TGTA------GA----
gi|12 : ttcagatggcacattccaaaactgtagcgtacCAACACTCTTATAGAGTGTGC-CA-------GGCTGCC-ACCA-AA---TACTCAAAAGTTCTATTGCA-CGA-CTGT-TCAGCCAGC-AAATGT-G-TGAAC-AACACAAGG-A-TATCACATCCGGGAAGA---CA-AAAAACAAA--A-C--TGA-TGTGGTTC-------TTTACCAAGAA-----G-AATACAAGAATTGCCAA-CAGAGGAATTGTCCAA--TC-C-ACCC--C--AAAAG-----------GACCT---TAAAATTTACTGCA-AAGAAT-GCC--T-AC-T-CCCA--AT--CTGTT-CC-AAA---TG
gi|23 : TG-C-AAGGTC-C-ACCCCAC--TAAGG--ATATA----GACATGC-C----TTG--TGTA---GATT-GCC----AGCT-TCCA--AT--ATGTT-CC-AAA---TGTT-CAA-CACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGCAT--GAACTTGTTGATTT--AGAG-ATAAT-C--TATGAA---GAAAAGA-TGG--C---GCT--ATGCTT--------AGA-GGActtaccaccaaccacaacagtcaccaagtagccttgatcttgagtaatc
gi|22 : G-CAAAGGCC-CCAACCAACTAAAAAGGAATATT----GACATGCAC----TCT--GGTA-ACAAATTGCAGATAAG-T-TTCA--TTTTGTGTT-CA-AAAAATTG-TGCAACAACTGG-AGAGTCATA-TTTGG-G-CAT--AAATTAATAGATTT--AGAGAGCAAT-TGATATTCAGGGGAAAAGT-TAT--C---
gi|2 : A-GGAGGTGTTTTTCAAAGGTTCCATCAG-A-TATG-TCTTGTTTC--A-AACATC-ACAAGATGTTATAAAG--GAAATG--A--TATTCAAATGAA----GATGCTGGCGG-A-AATGAAAGAAT--GAT-C-ATTGGATCG---------TCTTA----AGA-ACA-GCCAATGGAA-G-CTGATGGAGAGG-------TCTCTGCATAAATTAGGCAT-GGTGAATCAGCAGT-GGATGTCA-GAAA-TATTGAACAAGTAA-C-AGGAATATCAGGAAAAGTTGGTTGTGAGAAGAAG--AGAGCCAGCTGAGCC-AGGAAT--GAAACTCA---TGTGGAAA-GATTGTATAATTGCGC-TAAGTC-TCCATGACTGTTGTGTCAAAC-AGTGTCCGATGGTGGGCTTTCCCTCATCCTCTACAAACAGATGCAACTGGGGC--GCTG-C-T-CAATTGCAAAAACTTTTTGAGAAGGACCCTGAAAGATTCCGGATCCCATACGCGCGAGTACAGTAATGAAAACCAAGT-CCCCCCAAGTCAG-TATTACTTCGCTGGTCATTGGGTATCACGCAAAGGGAAGAATGTTGTCAAAGGATACTGAGGGTGAAAAGATAGAAAATTATAAGGAGACCAATTACCAATAGTAA---AAGTA----AAGAATTAAAACGCTAAATGGAAA-G--TGGCTGCTCCTTTAGTGAGCATGCGGAAATGCTTACAAAGTAAGGTGCGAATGAAAACAA-ATTACAAGGAGATAAGATAAATCTGGATGTGGA---AAACAAAACCATTGGTCTCTAGTGT-CCTCTAGTACAGTTTACTGAATTGGTGAGGGAG---ATTGCAGGGTATTTGGGTGTTG-AATCGTTTTATG----GGCATAT----T--ATC--TCCGTTCATAAATGCCGGACCG-CAGGAACTTCTGGC-TCGAGTTAAC-TT-AG--A---TAAACCTGTGTCC---AAACAGTATTCTAAGCAGGGGATAGTCTT-GCTTAC-AAGGAATTATTAAGATAAGCTA-TGGTTGGACTTG--GGATT-CTCTAATTCACA-A-GTCACAGCAGGTATGGGGTTACTGTATCT-TTAGCAGAGCGAATCACAAATTAAGATATAGTCATCGAATTAGGTATAACACAATGGTGAC--AAATACTCTATCACAAGAATTCA--TTAAAA-ACAGGACGACTGGGATACCAACTGCAGCATATTCATCTCTCTGC--C-CACATCAACTGGGGACAG-ATAT-CTGGT-GGGGATGT-AATTGG--AC---TATA---GGACTACAAGT--CACTTGCCGTATTATCAAGCAATTAGACAGGG-AACATGAAGAA-CTAC-AGAAT--CAT-ACAG-TGGGATAACAAGTGTGATC--GGACT---GTATGAGTATGCCAATC-----CTACATGCACTAGAAAAAGATATAAAGCTGGAGGTGATATCTGATTAGCAATA-GATG--CTGCTGGTAA-AGAGGCGAGTAGTGTTAG-GTTAAAGTAAA-TCAGGACCAAT---CACA--GTTTCTCC------T---A----CA-AA--GGTCAG-AAGATCAGGGTTGCTGATCGCG----T-GTAATGGAATCCGTGGTAGCCTGATGTCCTCGG---T---CACGAGTATCCTGGTGCTG--TGATAGA-------CCAAT-T-GACGATT---------------GTTG-------TTCATGCTGCTTAAGATTCAAATGAA-GACGGTCAGTTCTTGTCATT-AACTGACGT--CA-CAAGGAACA--CAAG--GATTGTA-GGCG-TTGT-CCGCTTGTGTAGTTCTAGTGTGTTTCAAGATGAGTG-AGAACAAATCTCTA--T-TAGTTAGTGA----GA--TAGG--GACACAGTTCAAGTGAGATAGTGTAATAG-GTA-CT-CTACATGTGAAGTTTCTCTTAATGGTCAATCAA-
gi|19 : ctctgtgcaGTCCAT-CA-A-TATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAAAC--T-TAAAG--AAA--GAAA--T---CAAA-GAA----GATGCT-GCAG-A-AAT-AAAGA-T--GATT--AT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TG-AAGG-CTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACTAGTAAAC-G---AAAT--AGAAA
gi|32 : -A-TATT-TCCT---TC--C-AACTTC-ACAGGAT--T-TACAA--AAA--
gi|17 : aggttcacgaACAAGTAAAC-A---AAAT--AGAAAAGTT-GTTGTTAGAAG-AG--ACCA--A--T-AGCC-AGGA-T--GACTC--A---T-TG--AAAGATTATAT---TGC-C-TA--TC-TCCATGACT-TT--GTCAAAC-AGTT-CC-ATGG----CTT--CCT-ATCCTCTCCAAC--GAT----------C--ACTGCT-C-TAATTCAAAAA-CTTTTTGAGAAG-GACCTG-AAAATCC--GAT-CCATAC-C-CGAG-ACcaagt
gi|9 : C-ATGG----TCA--CCT-ATCCTC--CAGA--AAC----------CTTACA-AT-TATAATCCCCAAC-CTTTCTGAGAAGT--TCCAGGAAATCC--GAC-CCATAC-C-AAAG-ACAAC----AAAACC-GGTCACACCC--GT--G-T-TTACT--GCTGGTCAATA-----TA-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACT-CGGC----AAAATAG-AAAC---G--GAAAACAA--ACCAGCAG--AGATGAG------AAAAAT-AAATC-CC--ATGA--A-AATTGTCT-CCCCTTTAAC-ATTA--GTGGACT--CTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACAA-G--ACAAG--GATAAG--GAATCT-GATGTGGAAC-AAACA-----A--TGCCCCTA-TCTTCCTCTG-------TTACTGA---GATCAGGAAG---TTC--AGTGTACCG-GGTGTTG-AAAC-------G----G---TAT----TCCATATTTCACGAGATAAA-TCAG----G-CA-AACTT--TGGG-TCA
gi|14 : gtcaaaatatttCTG-------TTACTGA---GGTCAGGAAG---TTC--AGTGTGCCG-GGTGTTAAGGA--------G----G---CATCCCAT--ATT--TCATTAGGTAAA--CAG----GGCAA-ACTG--TGGG-TCA-G-TGAT-ATTAGTGG---T-GACCT-TGTCCA--AA-CAG-ATC-TA--CAGGGG--AACC---AGCTAC---AGAA--GATAC---AAACCAGTGG-TGGATACG--GC-TA-C-------CACACA-GTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATC--TTTACAG--------ACAGAGACA-ATAAAGGCATCAA--TAA-GATAACA-AG-GAatga
gi|25 : ---GGTCAGGGAG---TTC--AGGGTATTG-GGTGTTG-AAG--TTTTATG----G---CAT-------ATA--TCCCTTCATAAATCC-G----A-CAG-ACT--CTGGG-CCA-G-TAAC-TT-AG--A---T-AACCT-TGTCC---AAACAG-ATC-TA--CAGGGGatactcatagcaaaacaatcat
gi|13 : ctatAAAT-CAG----G-CAG-ACT--CTGGG-CCA-G-TGAC--T-GGC-A---T-AACCT-TGTC-G--AAACAG-ATC-TA--CAGGGG--AATCTG---CTACA--GGAA--ATAAA---AAACTA-TGG-TGGACATG--GG-TT-C-------CACACA-GTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGAGCAA-ATAAAGTCATCAG--TAG-GATTACGCAG-GATAAT---A-----CTATCAC-AGAATTCA--TGAAAACA-GGG--GACT-GGG-AACCA-TACAGCATA--CA-----CTCCTCC-CACATCAACGG-----GG-ACATACTGGT-GGG---G
gi|24 : GAA--GATAC---CAACCAATGG-TGAAGATGAAGG-CTAC-------CACA-CCGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATG--TTTGCGG--------ATAGTGACA-ATAACGTCATAAA--TAA-GACAACATCG-GATAAT--AA-----TGatggtga
gi|26 : ctacaTCACA-CAGG-ATGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------AAAAAGCAA-GTAAAGTCATCAA--GAG-GATAACACAC-GATAAT---A-----CTATCAC-AGGATTCA--TGAAAACA-GGG--GACT-GGACACCtc
gi|29 : A-ATAAAGTCATCAA--TAA-AATGGCACAG-AACAAT--AA------AATTAA-AAAGTTCA--TTAAAACA-GGA--GACT-GGGCACCCA--TCAGCGTA--CA-----CTCCTCC-CACATa
gi|10 : AAAC-A-AAA--GACT-GG-CAACCAAT-CAGCGTG--CA-----TT-CCTCTCACATTAACGG-----CG-ACATACTGGT-GGG---G---ATGAA--------GT-------CTA-AAGT--CAC---TCA----GTACAGCAA---GACA--GGAA----AAGAA-CTAC-AGAA---CAT-ACAGAA-GGACGACAA-AG-GA-CAGGACCT---GTAT-AG-----TGATC-CACACTACAT-AAC-AGAAA---ACACCAA--CGAG---GATATTTG--CG-TATCA-GAT---TA--TAATAAGACAGGCCGGTA--GGTGGTGTTTAA-CAA--TCAGAGC-------TACAGTGTTTTTTCGCCTAATTACAGAGTCAGAG--ATTCAGAGAG--------T-CT--TTACCTACAGCG----GAAATATGT------CTGACCTGTT--G--TTGGCCAC----ATAGTGATA-TGGTTGAT-TATTTAAGCCT-AT---TACAAT---------------------------TCTA--C-TCTT--GACCT-----AG-GATGGtaa
gi|7 : tcA-----CT-CCTCTCACATT-AATGG----AG-ACATACTAGTAGAG---GTGGATAAAG-AT---GGGAAACGG---A-AAGT--GAT---CAG----ATACAGC-A--AGAGA--G-GA----AAGAAGCTCCAAGAAATTCAGAA------GGATGATAA-AG-GA-CAAGATCT---ATAC-TG-----T-ATCATAGGGTGCAT-CAC-AGAAA---ACATTAA--CGGT---GACATCTG--TG-TATCC-GACCCTCT--TCGTAA-GAAGGTGG-------TGGTAGTGAC-CAGATT-AGGAC-AG----TATCG-G-TTCT-C------TTACT----TT-GGTCATCCATTACAACCTGGATT-CTA-TCCAA----A-C----AGAATGTGTA-----CAGATGCCTTGGGAATT----------ATCTTGGTC-TG--TAGT-TG-------TG-GT-G-G-TAGTAAATGTGAGACCTGGGG-TA-------TCCA--CATGTT-TGA-CC-----AG-GACGGTCAGTTCCTG--AAT-T--T-CCTCATCA-CAT--CACAA--ATGCCCA--GTGCGGgc
gi|34 : ctC-CACATCAACGG-----GG-ACATACTGGT-GGG---tctgcactgatgatcaacaaaacgtctgggttggaagttggaacag
gi|35 : ctcAACAA-TG-GA-CAGGGACT---GTAT-GG-----GTATC-CATGCTACAT-CAC-aatgaggaatga
gi|27 : ACAT-CGC-AGAAA---ACATCAA--TGGT---GATGTCTG--CG-TGTCC-GAC---TA--CAATAA-ACAAGCTGT-A--GT-AGTGGTAAA-TAAAT------CAAATCACCACAG-G-TTCTCC-------TACA-----G-AG--GT
gi|33 : -CT--TCCCT----A-T----GGTATCTGTA-----CTGATGTCCTCGG---T---CAC----ATCCTGca
gi|6 : ATGTCCTCGG--T----CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-CC-------AT-ATCGTGACAAAT---------------G-TG-------TTCAT-CTTCT--AGAT-C-----AG-GACGGTCGGTTCTTGTCA-T-TACTACT----CA-CAA--AACAACAAGG---A--GTAGAATA-TC-C-CTA-TAG------TGT-ATGTGT----AGAT-GATGAG--AACAATCTCTA--TGTA------GG----AGATTAT---GACACAGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC---TACA-GTGAG--TTCTCTTATT-GTCAATCAACACACTACCACACAGAGATTTCACAACTTGTGACCAATGAGATAATATTTTATGAAT-CT--ACAATTTA
gi|18 : T---CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-TT-------C-----G-G----TA---------------C-TG-------TTCA--TATCCT-TGA-TC-----AG-GATGGTCAGTTCTTGTC--TCTACTAC--T--CA-CAA--AGAAACAGAA-C----ATACA-CGATC-C-CCG-TAG------TGT-GTGTGT----AGA-TGAC-AAG-AACAATCTTTATGT-TG------GACAACGA--TACACCAACACAGT--------GACAGTGT-ACAatgaatgaataaggctgatacaactatactagaaaatacacagtagagtgtatggaatccccataattaaccaaacaagttgctgattatatgtgcaagtttaactatgatttacagtcacttacattgttaagtatgcaaaacaacagtgtgtgacaatcaaaagatatctttaattatcctgtagctttcaatttacaatatctgaatatcacgatattactactaagagctagatttgaaaaaggtcttgtttatgaaataagattttagaaaataagattctccctttcagttttatataattcaattatttcttctttcattctacatttacaatagcatcctatggga
gi|30 : tcggCA--CCTGCT-GGAT-C-----AG-GACGGTCAGTTCCCGTC--TCTACTGCTGA--CACCAG--AACAACATGG---A--ATACACCA-TC-C-Caata
gi|28 : GGTTCTTGTCA-T-TACTACT----CA-CAC--TACAACACGG---A--GTACGGTT-TC-C-CTA-TAG------TGT-GTGTGT----AGA-TGATGA--GAACAATCTCTA--TGTAG-----GA----GA--AATG--TACACatg
gi|36 : GTGT-ATAG-GTATCT---ACAG-TGAG--TCCTCTTAC
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ACGTCCGCGACACGTACTGGTTTGTGATGACGTATATGTGACAGGTGTCGCACGTCCTGTTGGATCAGGAGGTCAAGTTCCTGTCTCGACTGCTGGGACACGAAAAACAAACATGGATAACACAGTCCCATGGCTCTGTGGTGTGGAACGTACGGCATTACAACCTCTATGTAGGGACAGGTCATTCCAGTACACACGATAAAAATGTGTACATATCTACA
Unaligned ( gi|16 ): ACGTCCGCGACACGTACTGGTTTGTGATGACGTATATGTGACAGGTGTCGCACGTCCTGTTGGATCAGGAGGTCAAGTTCCTGTCTCGACTGCTGGGACACGAAAAACAAACATGGATAACACAGTCCCATGGCTCTGTGGTGTGGAACGTACGGCATTACAACCTCTATGTAGGGACAGGTCATTCCAGTACACACGATAAAAATGTGTACATATCTACA
Unaligned ( gi|20 ): CACTCCTCCCGCCATTAACGGCGACATACTTGTGGGGAATGTTATTGGGGAGTGACGAAGGTACGACAGGTACAGGACGGGAACTCCAGGTATTGAAGGGAGACGAAATAAGGGACAGCGTTCTGTATAGAATCCCAATGTACATACGGAGAACCGATGGAGATATCT
Unaligned ( gi|21 ): CACTCCTCCCGCCATTAACGGCGACATACTTGTGGGGAATGTTATTGGGGAGTGACGAAGGTACGACAGGTACAGGACGGGAACTCCAGGTATTGAAGGGAGACGAAATAAGGGACAGCGTTCTGTATAGAATCCCAATGTACATACGGAGAACCGATGGAGATATCT
Unaligned ( gi|31 ): ATATAATTCAACTCTCTTTTCATTCATTCTACATTTAATATAGCATCTATGGG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 2 2222 11 1 2 2222 2 22 11 2 11 222222222222222 11 1 1 11 2222 11 1 1 222222222222222222222222222222222222 1 444444444 111111 2 888888888888888888 1 111 11 11 222222 111111 11 11 1111 222222222 111 1 1 1 333333333 1111 333333333333 3333333333333333 3333333 111111 111 2222222 1111111 111 222222222 1111 1 333333333 3333 1111 111 4444444444444 111 2222222 11 22222222 11 333 2222222 33333333333 22222 11 1111 11 11 1111 111 11 22222 333333 111 3333333333333 111 1 1111 1111 111 1111 22 11 1 11111 2222222 111 111 2222 66666666666666666666666666666666 11 1111 222222222 111111 2 111 3333333333 2222 111 111 111111111 11 11111111 22222222222 11 2222 88888888888888888888888888888888888888 111 11111 222 11111 11 22 11 111 3333333 1111 111111 11111 2222222 1 111 1 222 1 444444444444444444444 222222 22222222222222222 111111 33333 999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11111 222222 11 33333 11 1 44444444444444444 1111 11111111 444444444444444 11111111111 6666666666666666 22222222 2222 1 11 11 1 11 22222
lowQualScore : 5 3 88 2 4 0 4444 88 5 0 4444 1 3 22 44 3 33 555555555555555 00 0 3 0 33 1111 33 0 0 2 222222222222222222222222222222222222 0 3 222222222 33 3 666666 0 6 1 666666666666666666 6 6 5 5 77 5 5 1 8 0 5 77 1 1 000 33 5 5 5 1 5 5 5 5 0 5 5 5 0 77 1 5 1 33 1 4 77 99 555555 22 1 999999 0 6 6 33 33 5 5 5 1 0 0000 1 000000000 444 1 5 88888 4 66 66 5 5 888 5 5 1 5 1 1 2 5 999999999 6 99 55 4 4444 666 111111111111 6 3 6 4444444444444444 6 3333333 6 1 888888 5 000 77 5 5 2 5 1 5555555 6 3 6 0000000 0 6 6 6 9999 999 6 666666666 6 4444 6 6 3 3 555555555 6 6 5555 6 6 6 6 6 6 9 44 6 1 6 4444 888 3 0 9999999999999 8 8 444 4444444 11 99 0 55555555 11 8 8 000 1 6 6 2222222 3 6 1 99 3 77 11 88888888888 6 44444 44 99 99 6 88 6 7777 8 22 8 11 8 8 11 0 7777 8 8 444 1 11 1 00000 0 111111 1 5 111 3 4444444444444 8 8 444 11 1 6 7777 3 5555 8 444 1 8 2222 22 11 8 6 999 8 33333 8 1111111 6 000 555 5 4444 5 5 3 5 33333333333333333333333333333333 1 1 1 99 0 0000 5 777777777 5 5 5 5 5 0 111111 5 5 8 5 555 77 4444444444 0000 8888 000 1 8 5 77 5 111 1 888888888 4 5 5 1 5 5 11 0 88888888 666 4 4 66 0 4 22222222222 00 5 77 5 5 88 0000 6 66 4 666 7 4 0 55 4 4 55555555555555555555555555555555555555 66 666 66 22222 000 22222 11 66 55 22 66 4 8 55 222 4444444 7777 2 5 88 4 888 3 333333 5 5 77777 6666666 1 6 1 3 4 111 99 1 99 9 6 666 6 5 1 444444444444444444444 000000 8 6 11111111111111111 6 888888 66 44444 8888 44 66 000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8 55 1 0 99999 999999 4 5 8 8888 22 4 4 4 33333 4 11 55 3 1 22222222222222222 4 0000 99999999 3 66 999999999999999 5 2 99999999999 7777777777777777 44444444 1 5 5 6666 3 33 1 33 5 4 88 4 4 88 4 88888
lowQualScore : . . .. . . . .... .. . . .... . . .. .. . .. ............... .. . . . .. .... .. . . . .................................... . . ......... .. . ...... . . . .................. . . . . .. . . . . . . .. . . ... .. . . . . . . . . . . . . . .. . . . .. . . .. .. ...... .. . ...... . . . .. .. . . . . . .... . ......... ... . . ..... . .. .. . . ... . . . . . . . . ......... . .. .. . .... ... ............ . . . ................ . ....... . . ...... . ... .. . . . . . ....... . . . ....... . . . . .... ... . ......... . .... . . . . ......... . . .... . . . . . . . .. . . . .... ... . . ............. . . ... ....... .. .. . ........ .. . . ... . . . ....... . . . .. . .. .. ........... . ..... .. .. .. . .. . .... . .. . .. . . .. . .... . . ... . .. . ..... . ...... . . ... . ............. . . ... .. . . .... . .... . ... . . .... .. .. . . ... . ..... . ....... . ... ... . .... . . . . ................................ . . . .. . .... . ......... . . . . . . ...... . . . . ... .. .......... .... .... ... . . . .. . ... . ......... . . . . . . .. . ........ ... . . .. . . ........... .. . .. . . .. .... . .. . ... . . . .. . . ...................................... .. ... .. ..... ... ..... .. .. .. .. .. . . .. ... ....... .... . . .. . ... . ...... . . ..... ....... . . . . . ... .. . .. . . ... . . . ..................... ...... . . ................. . ...... .. ..... .... .. .. ...................................................... . .. . . ..... ...... . . . .... .. . . . ..... . .. .. . . ................. . .... ........ . .. ............... . . ........... ................ ........ . . . .... . .. . .. . . .. . . .. . .....
lowQualScore : 0 0 55 5 0 0 0000 00 5 0 0000 0 3 77 00 7 88 888888888888888 22 0 0 0 88 2222 88 0 0 5 555555555555555555555555555555555555 0 2 555555555 55 5 000000 4 7 7 777777777777777777 7 7 7 7 11 7 7 0 6 7 7 99 7 0 000 66 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 1 99 7 7 0 66 7 3 99 22 000000 00 0 222222 7 7 7 11 66 0 0 0 0 1 6666 0 999999999 888 0 0 99999 5 99 99 0 0 888 0 0 7 4 4 0 1 0 777777777 7 22 55 0 0000 888 777777777777 7 0 4 6666666666666666 7 0000000 4 0 333333 7 000 99 7 7 3 7 0 3333333 7 5 7 0000000 7 7 7 7 3333 222 7 777777777 7 2222 7 7 3 7 000000000 7 7 3333 7 7 7 7 7 7 8 33 7 0 7 2222 222 8 8 2222222222222 0 0 222 8888888 00 00 8 00000000 00 0 0 000 0 7 7 8888888 7 7 0 22 0 00 77 00000000000 7 55555 55 22 22 7 22 7 0000 0 00 0 00 0 0 00 8 0000 0 0 000 4 00 0 00000 8 888888 0 0 888 2 6666666666666 0 0 000 44 0 0 0000 2 0000 0 000 4 0 2222 00 00 0 6 666 0 00000 0 7777777 7 000 777 7 3333 7 7 0 7 99999999999999999999999999999999 0 0 0 00 1 6666 0 444444444 0 0 0 0 7 6 000000 7 7 0 7 777 99 5555555555 6666 0000 000 0 9 7 99 7 666 0 777777777 3 0 0 0 0 0 99 2 11111111 222 4 4 11 1 4 66666666666 00 7 00 0 0 55 7777 3 11 0 666 3 0 7 55 0 0 77777777777777777777777777777777777777 99 888 99 55555 000 55555 55 11 11 22 22 4 9 44 222 4444444 0000 2 6 33 4 888 2 666666 9 2 33333 7777777 0 7 0 7 0 333 22 0 22 5 7 888 7 5 0 000000000000000000000 444444 0 7 88888888888888888 7 333333 11 55555 5555 66 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 55 0 7 00000 111111 0 7 0 5555 77 0 0 0 33333 0 00 55 3 0 00000000000000000 4 6666 11111111 2 99 999999999999999 0 5 66666666666 3333333333333333 22222222 0 7 7 3333 3 88 0 33 0 0 00 0 0 00 0 55555
consensus : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-ATTT-ACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GCTAGTT-TTTCA-------G-ATGGAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTT-CT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACTGCA--ATC-CTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTCCTCTTACCNACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACAT---NCT-T-TGTA-ACGANT-GC---C-AANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCCGGAGGC-AT--AAATTTATNGATTT--AGAG-A-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGAT----TT-CAGAAGGTCCA-T-C-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CCCG--CGG-A-AAT-AAAGA-T--GAT-C-AT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAGG-------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGTCCGTTGTTAGAAGAAGT-ACAGCAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTCATA--TCT-CCATGACT-TT-CGTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TNCCT-ATCCTCCNCAAA--GNTCGCAANT----------NTAATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-GATTCC-NGGAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAAC----AAAACC-GGTCACCCC-AGT--GT-TT-ACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAG---CGAGGGAGACCAA--ACCAGCAG--AGATGNG----AAAAA-T-AAAACCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTT----AGCATCAGCGGA---NTCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAGGAGATAAG--AAATCT-GATGTGG-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CA-GT-G-TA-TCGGG-TGTT-G-A--A---G---TTT-ATGG---CAT----TATNTCACTNGATAAAT-CAG----G-CAGG-ACTT-CTGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-AATCTG-ANCTAC---GGAA--GAT---ANAAACCAGTGG-TG--GA-T-ACGGCTNC-------CACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGACACCCA-NT-CAGCGTA--CA-CTCCT--CCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATG-AA---GAC---GGTAT-A--G-GGCTA-AAGT--CACNC-G--GTAC-----AGCAA--AGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-ACAGAGGGACGA--CAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-----CGATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGGCGG-TAGTTGGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-CAA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACGAG--GTTCAGAAAGA-TCAG-GATT-CT--T--CC--C----NACGG-AATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT--N-------NC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GATC------AG-GACGGTCA-GTTCTTG----TC-NTT-ACT-A-CTN---CA-C--AA--AACAA-CANGG-CA--GTACGGC---G-TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AGATTGACG-A-GG-A--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--TTACA-GTGAG--TCCTCTTANTGGTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
Reference ( family-437 ) : TTCAAATCTCACTGCTCGAATTTCCAATAAATCCCCTCAAAGAGAATGTCATT-GTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAA-GTACTTGTAAAAAAACAANATCTCACATTTTACAGTCTAGATACGT--GTGAAT----G-GCT-TA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATTACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-GT----------------------CTT--------GCTAGTT-TTTCA-------G-ATGGAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTT-CT-TAGAGTGC-GGCATT-GAA-GANTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACTGCA--ATT-CTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-GG--TGGTTCCTCTTATCNACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATNGACAT---CCT-T-TGTA-ACGANT-GC---C-AAGTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCNGGAGGC-AT--AAATTCGTTGATTT--AGAG-A-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TATCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGAT----TT-CAGAAGGTCCA-T-C-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CCCG--CGG-A-AAT-AAAGA-T--GATTC-AT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAGG-------TCTCT-CA-AAAT---GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGTTCGTTGTTAGGAGAAG--ACAGCCA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AN-GATTACAT---TGCCATA--TCT-CCATGACT-TT-CGTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TACCT-ATCCTCCNCAAA--GATCGCAGNT----------TTAATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-GATTCC-GGGAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAAC----AAAACC-GGTNNCCCC-AGT--GT-TT-ACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAG---CGANGGAGACCAA--ACCAGCAG--AGA-GTG----AAAAA-T-AAAACCC---ATGGAAATTGNCT-CTCCTTT----AGCATCAGTGGA---NTCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAG--GATAAG--GAATCT-GATGTNG-AAAC-AAACAA--T--GCCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CA-G--G-TA-TCGGG-TGTT-G-A--A---A---TTT-ATGG---CAT----TATNTCNCTNGATAAATNCAG----G-CAGG-ACTT-CTGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCCGAAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-AATCTG-AGCTAC---GGAA--GNT---ANAAACCAGTGG-TG--GA-T-ACGGNTNC-------CACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGNT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGG-GACT-GGACACCCA-TT-CAGCGTA--CA-CTCCC--CCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATG-AA---GAC---GGTA--A--G-GGCTA-AAGT--CACCC-G--GTAC-----AGCAA--AGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CATAACAGANGGACGA--CAAA-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-----CGATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGGCGGNTAGTTGGT--GGTGAA--CAAATTCAGGA-CAATTACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACGAG--GTTCAGAAAGA-TCAG-GATT-CT--T--CC--C----NNCGG-AATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT--T-------NC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TT-CA--CNTCCT-N---GATCC-----AG-GACGGTCA-GTTCTTG----TC-ATT-ACT-A-CTT---CA-C--AA--AACAA-CANGG-CA--GTACGGC---G-TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AGATTGACG-AAGG-A--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACAGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--TTACA-GTGAG--TTCTCTTANTGGTCAATCAACACACTACCACACAGAGATTTCACAACTTGTGACCAATGAGATAATATTTTATGAAT-CT--ACAATTTA
gi|1 : TTTAAATCTCACTGCT-GCATTTCCAA--AGTCCCCTCAAATAGAAAGCCATTTGTCATTT----TG--GGTCAAACACAGAT-ATTGTAAAGTACT----GAAAAACAACATCTCA-ATT--AC-GTCTAGATACAA--GTGAAT----A-GCTATAAAATCAGGTAAAG-AACATTTTCAAGCA-ATGACTTTTTTG--ATAATTAAGTCCT--TGGAATAT-GATA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GTTAGTT-TTTCA-------GTATGGAGTATTTTT---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TT-CAAAATTA----------------G-TAC-A-CCCCAGCACTT-CT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--T-GTGAA---TTTTATTGCA--ATC-CTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGTCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-AG--TG-TTCTTCTTATTTGCAGCGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAAAAGTG--CGAAGGCC-C-ACCCAACGAAAGA----TATTGACCT---TTT-T-TGTA-ATGAGT-GC---CCAAGTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-GATACAAACACTGGAAGAGTCAT--TTCTGGGCC-AT--AAATTTATAGATTTTAGGAGGA-CAAT-C--TATT---CAGAAAAGT-TATCACTA--------T--TTCA-AGA-GGAGGTC---TT-CAGAAAGTCCA-TTC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAGGAT-TTAAAGAAAG--AT------CAAA-GAAG-ATG-CTGG--CAG-A-AAT-AAAGA-T--GATTC-AT-GGACAG---------TCT-A----AAA-ACA-GCCA-TGAA-GCTGATGGAGA-G-------TCTCT-CA-AAA----GCATTGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACAAGTAAAC-AATA-TA----GAAAAATCCATTGTTAGGAGGAG--ACAAAAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTC-TA--TCT-CCGTGACT-TT-TGTCAAAGAG---CC-ATGGC------TTCCT-ATCCTCTTCGAA--GATCACAGAC----------TTAATTCCCAAA-CTTTTTGAGAG-GAAACCTGAAAAA--TCCGA--TCCATAC-CC-AAG-ACAAC----AAAACC-AGTACCCCC-AGT--GT-TT-ACT--GC-GGTCA----TTAC-A-GCAAAG---ATGATGTTGTCAAAT--TACTAGGG-----AAGGTAGAAA---TTAGAGAGACCAA--ACCAA-AG--AAA---G----AAAAA-TAAAAACCT---ATGGAG--TGGCTGCTCCTTC----AGTAGCACCGAA---ATCTAC-AAGCAG---GCAGATG-AAACAA-G--ACAGGGAGATAAG--AAATCT-GATGTTG-A----AAACAACTT--GTCTCTATTCTCCCTCTG-------TC-ACTGA---GGTCTGGGAG---TT-TAGG--G-TA-TCTGG-TATT-ACA--A---ACTTTTT-ATGG---CAT----TATATCACTTGATAAATTCAG----G-CAGG-ACTTCCTGGG-CC-ATG-TGAC-GTAG--A---T-AACCT-TGTCCAAAACAG-A---TTTA--CAGGGGG-AATCTG-ACCTACTTTGGAA--AGT---AAAAACTA-TGG-TG--GA-T-TTGGGTTC-------CACA-AGTCACA-CAGG-ATGGGTTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAAA-G-CAAATAAAGTCATC-AATAGTG--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TG-AAAA-AGGG-GACT-GGACACCCACTT-CAGTATA--CA-CTGCC--TCCAC-ATCGAA-TGAGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-AT--AA---AAC---GGTA--AACA-GGCTA-AAGT--CACCC-G--ATAC-----AGCAA--AGACA-GAA-----AAGAACTACAGAA-CATAACAG-CGGATAA--CAAT-G-GACAG-GGACTTTAT---AG-----CAATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGGAA---ATATGAA-T----GGAGATATCTGCACATC---A-GAC---CT--TAATAA-AGAGGCAGTTAGTTGGT--GTTGAA--TAAATTCAGGA-CAAACACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACAAG--GTTCAGAAAGG-TCAA-GGTT-CT--T--CC--C----CGGGG-AATCTGTA-----CTGA--TGTCTTCAG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT--T-------AC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TT-CA--CTTCTT-A---GATTC-----AG-GACGGTCG-GTTCTTG----TCAATT-ACT-ACCTC---CA-C--AA--AACAACCAAGC-CA--GTACAGC---G-TCC-CC----GTTG---T----CTGTGTGT--AGATTGATG-AAGA-A--AC-AATCTCTAT-TA------GA----AATA--------TG--G---ACACAGT--------GACAGTGC-ATAGCGTATCTGTTACAGGTGAG--TCCTCTTACT-GTCAATCAA-ACATTGCCTCAC--AGATTTCACAGCTTGTGACCATTGAGATTATATTAAAAGAATACTAGACAATTTA
gi|10 : AAACAAAA-GACT-GG-CAACCA-AT-CAGCGTG--CA-TTCCT--CTCAC-ATTAAC-GGCGAC--ATA-CTGGTGG-G-G----ATG-AA---G-------T----------CTA-AAGT--CACTC-A--GTAC-----AGCAA---GACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CATA-CAGAAGGACGA--CAAA-G-GACAG-GACCTGTAT---AG-----TGATC-C--ACACTACAT-AAC-AGAAA---ACACCAA-C----GAGGATATTTGCGTATC---A-GAT---TA--TAATAAGACAGGCCGGTAGGTGGT--GTTTAA--CAA--TCAGAG-C---TACAGTGTTTTTTCGCCTAATTAC--A-GAG----TCAG--AGATTCAGAGAGT-CT--TTACCTAC----AGCGGAAATATGT------CTGACCTGTTGTTGG----CCAC----ATAGTGATA-TGGTTGAT--TATTTAAGCC---TAT---TACAAT---------------------------TC-TA--CT--CT-T---GACCT-----AG-GATGGgcccacgcgaataa
gi|11 : tcATCTCA-ATTT-ACA-TCTAG-TACGT--GTGAATTAATG-GCT-TA---TCGAGTAAATGAATATTTTCAAGCA-ATTACTTTTT-G--ATAT----GTCCTAATGGAATTT-GACA-TGT-----------------------------TT--------GCTAGTT-TT-CA-------G-A----GTATTTTT---TGTATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTT-CT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGC-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATTGCA--ATT-CTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-gc
gi|12 : cCAACACTC-TTATAGAGTGT-GCCA-------GGCTGCC-ACCA--AA--TACTCAAAAGTTCTATTGCACGACT-GTT---CAGCCAGC-AAATGT-G-TGAAC-AACACAAGG-A-TATCACATCCGGGAAGA---C-AAAAAACAAA--A-C--TGA-TG--TGGTTC--TTTACCAAGAA-GAATA------CAAGAATTGCCAA-CAG-AGGAATTGTCC-AA--TC-C-ACCCCAA-AAGGA----CCTTAAAAT---TTA-C-TGCA-AAGAAT-GC---C-TACTCCCA--AT--CTGTT-CC-AAA---T-G-tg
gi|13 : AAAT-CAG----G-CAG--ACT--CTGGG-CC-A-G-TGAC-TGGC--A---T-AACCT-TGTC-GAAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-A-TCTG---CTAC---AGGA--AAT---AAAAAACTATGG-TG--GA-C-ATGGGTTC-------CACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-CAAATAAAGTCATC-AGTAG-G--ATTACGCAG-GATAAT---A-----CTATCAC-AGAATTCA-TG-AAAACAGGG-GACT-GGG-AACCA-TA-CAGCATA--CA-CTCCT--CCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-GATG-GTG-Acttaccaccaaccacaacagtcaccaagtagccttgatcttgagtaatc
gi|14 : CTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGAAG---TT-CA-GT-G-TG-CCGGG-TGTT-A-A--G---G-------A-GG---CATCCCATATTTCATTAGGTAAA--CAG----GGCAA--ACTG--TGGG-TC-A-G-TGATATTAGTGG---T-GACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-A--CC--AGCTAC---AGAA--GAT---ACAAACCAGTGG-TG--GA-T-ACGGCTAC-------CACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATC--TTTACAG--------ACAGA-G-ACAATAAAGGCATC-AATAA-G--ATAACA-AG-GA
gi|15 : A--CGTCCGCGA-----CAC----GTACTGGTT-TG--TGAT--G-------ACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGATC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC-TCG-ACT-G-CTGGGACA-CGAAA--AACAAACATGGATA--ACACAGT-------C-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGA---ACGTACGGCATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATATC---TACA-atactcatagcaaaacaatcat
gi|16 : A--CGTCCGCGA-----CAC----GTACTGGTT-TG--TGAT--G-------ACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGATC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC-TCG-ACT-G-CTGGGACA-CGAAA--AACAAACATGGATA--ACACAGT-------C-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGA---ACGTACGGCATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATATC---TACA-
gi|17 : ACAAGTAAAC-AAAA-TA----GAAAAGTT-GTTGTTAGAAGA-G--AC--CAA--T-AGCC-AGGA-T--GACTC--AT---TG--AAAGATTATAT---TGCC-TA--TCT-CCATGACT-TT--GTCAAACAGT-TCC-ATGGC------TTCCT-ATCCTCTCCAAC--GATCACTGCT----------CTAATTCAAAAA-CTTTTTGAGAAGGA--CC-TGAAAA--TCCGA--TCCATAC-CC-GAG-AC
gi|18 : TCGG---T-CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT--T-------TC-------G-G----TA---------------C-TG-------TT-CA--TATCCT-T---GATC------AG-GATGGTCA-GTTCTTG----TC-TCT-ACT-A-C-T---CA-C--AA--AGAAA-CAGAA-CA---TAC-AC---GATCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AGA-TGAC---AAG-A--AC-AATCTTTATGTTG-----GACAACGATA--------CACCA---ACACAGT--------GACAGTGT-ACAA-ATA
gi|19 : GTCCA-T-C-AATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAAAC-TTAAAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG--CTG--CAG-A-AAT-AAAGA-T--GATT--AT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGA-G-------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACTAGTAAAC-GAAA-TA----GAAA
gi|2 : A-GGAGGTGTTTTT-CAAAGGTTCCA-T-CAGATATG-TCTTGTTTC--A-AACATC-ACAAGATGTTATA-AAGGAAATGATATTCAAATGAAG-ATG-CTGG--CGG-A-AATGAAAGAAT--GAT-C-ATTGGATCG---------TCTTA----AGA-ACA-GCCAATGGAAGCTGATGGAGAGG-------TCTCTGCATAAATTAGGCA-TGGTGAATCAGCAGT-GGATGTCA-GAAA-TATTGAACAAGTAA-C-AGGAATATCAGGAAAAGTTGGTTGTGAGAAGAAG--AGAGCCAGCTGAGCC-AGGAAT--GAAACTCATG--TGGAAA-GATTGTATAATTGCGCTAAGTCT-CCATGACTGTTGTGTCAAACAGTGTCCGATGGTGGGCTTTCCCTCATCCTCTACAAACAGAT-GCAACTGGGGCGCTGCTCAATTGCAAAAACTTTTTGAGAA-GGACCC-TGAAAGATTCCGGATCCCATACGCGCGAGTACAGTAATGAAAACCAAGTCCCCCCAAGTCAGTATT-ACTTCGCTGGTCATTGGGTATCACGCAAAGGGAAGAATGTTGTCAAAGGATACTGAGGGTGAAAAGATAGAAAATTATAAGGAGACCAATTACCAATAGTAAAA-GTA----AAGAATT-AAAACGCTAAATGGAAAGTGGCTGCTCCTTTAGTGAGCAT--GCGGAAATGCTTACAAAGTAAGGTGCGAATGAAAACAA-ATTACAAGGAGATAAGATAAATCTGGATGTGGAAAACAAAACCA--TTGGTCTCTA-GTGTCCTCTAGTACAGTTT-ACTGAATTGGTGAGGGAGA--TTGCAGG--G-TATTTGGG-TGTT-G-A--ATCGT---TTT-ATGGGCATAT----TATCTCCGTTCATAAATGCCGGACCG-CAGGAACTT-CTGGC-TCGA-GTTAAC-TTAG--A---TAAACCTGTGTCC-AAACAGTAT--TCTAAGCAGGGGATAGTCTT-GCTTACAA-GGAATTATTAAGATAAGCTA-TGGTTG--GACT-TGGGATTCTCTAATTCACA-AGTCACAGCAGGTATGGGGTTACTGTATCT-TTAGCAGAGCGAATCACAAATT-AAGATATAGTCATCGAATTA-GGTATAACACAATGGTGAC--AAATACTCTATCACAAGAATTCA-TTAAAAACAGGACGACTGGGATACCAA-CTGCAGCATATTCATCTCTCTGCCCAC-ATCAACTGGGGACAGATATCTGGTGG-G----G-ATGTAATTGGAC-----TAT-A--G-GACTACAAGT--CACTT-GCCGTATTATCAAGCAATTAGACAGGGAACATGAAGAACTACAGAATCAT-ACAGTGGGATAA--CAAGTGTGATCG-GA-CTGTATG--AGTATGCCAATC-------CTACATGCACTAGAAAAAGATATAAAGCTGGAGGTGATATCTGATTAGCAATA-GATG--CTGCTGGTAA-AGAGGCGAGTAGT--GTTAGGTTAAAGTAAA-TCAGGACCAATCACA--GTTTCTCC------T-----ACAAA--GGTCAG-AAGA-TCAG-GGTTGCTGAT--CG--CGTGTAATGG-AATCCGTGGTAGCCTGA--TGTCCTCGG----TCACGAGTATCCTGGTGCTG--TGATAGA-------CC---AAT-T-GACGATT---------------GTTG-------TT-CATGCTGCTTAA---GATTCAAATGAA-GACGGTCA-GTTCTTG----TC-ATTAACTGA-CGT---CA-C--AAGGAAC-A-CAAGG--ATTGTA-GGCGTTG-TCC-GCTTGTGTAG---TTCTAGTGTGTTTCAAGATGAGTG-A--G-A--ACAAATCTCTAT-TAGTTAGTGA----GATA--------GG--G---ACACAGTTCAAGTGAGATAGTGTAATAG-GTACT--CTACATGTGAAGTTTCTCTTAATGGTCAATCAA
gi|20 : ctctgtgca--CA-CTCCT--CCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CTTGTGG-G-G-------------AAT---GTTATTG--G-GG-----AGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAGG--TATTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG------AATC-CCAATG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|21 : --CA-CTCCT--CCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CTTGTGG-G-G-------------AAT---GTTATTG--G-GG-----AGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAGG--TATTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG------AATC-CCAATG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|22 : -AAGGCC-CCAACCAACTAAAAAGGAATATTGACATGCACTC-T-GGTA-ACAAATTGCAGAT-AAGTTTCA--TTTTGTGTT-CA-AAAAATT-G-TGCAACAACTGG-AGAGTCATA-TTTGG--GC-AT--AAATTAATAGATTT--AGAG-AGCAAT-TGATATTCAGGGGAAAAGT-TATC
gi|23 : gca-TG--C-AAGGTC-C-ACCCCACTAAGGA----TATAGACATG--CCT-TGTGTA---GATT-GC---C-AGCTTCCA--AT--ATGTT-CC-AAA---T-G-TTC-AACACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGC-AT--GAACTTGTTGATTT--AGAG-A-TAAT-C--TATG---AAGAAAAGA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGA
gi|24 : CTAC---AGAA--GAT---ACCAACCAATGG-TGAAGA-TGAAGGCTAC-------CACACCGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATG--TTTGCGG--------ATAGT-G-ACAATAACGTCATA-AATAA-G--ACAACATCG-GATAAT--AA-----TG
gi|25 : ---GGTCAGGGAG---TT-CA-G--GGTA-TTGGG-TGTT-G-A--A---G---TTTTATGG---CAT-----ATATCCCTTCATAAATCC-G----A-CAG--ACT--CTGGG-CC-A-G-TAAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGtc
gi|26 : ctatTCACA-CAGG-ATGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------AAAAA-G-CAAGTAAAGTCATC-AAGAG-G--ATAACACAC-GATAAT---A-----CTATCAC-AGGATTCA-TG-AAAACAGGG-GACT-GGACACC
gi|27 : ACAT-CGC-AGAAA---ACATCAA-T----GGTGATGTCTGCGTGTC---C-GAC---TA--CAATAA-ACAAGCTG-TAG-TAGT--GGTAAA--TAAA-TCA-AA-TCACCACAG-G-TTCTCC-------TAC--A-GAG--GTa
gi|28 : -GTTCTTG----TC-ATT-ACT-A-CT----CA-C--AC--TACAA-CACGG--A--GTACGGT---T-TCC-CT----ATAG---T----GTGTGTGT--AGA-TGATG-A--G-A--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GAAA--------TG--T---ACACca
gi|29 : gAATAAAGTCATC-AATAA-A--ATGGCACAG-AACAAT--AA------AATTAA-AAAGTTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGGCACCCA--T-CAGCGTA--CA-CTCCT--CCCAC-ATTAA
gi|3 : TCAGATGGCACATTCCAAAACTGTAGCGTACCAAATATGGGTAC-AACCCCAGCACTT-TT-TAGAATGT-GGCATC-GAA-GATTGC-GAG-AG-AAAATTGTCAA---CCTTACTGCA--ATC-CTT-GCCA-TC-GC-AGATGTTG-TCAAC-AATGCACAGCA-CG-AGCATCT--GAAGAATCC-AGATTACAAAGAAACCATGA-GG--TGGTCCCT--TACCAACAACGAAAA------CGACATCTTCCTG-TGG-AAAA--TG--C-AAGATC-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGACAT---GCT-TGTGTG---GATT-GC---C-AGCTTCCA--TT--ATGCTACA-AAA---T-G-TTTCAACACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGC-AT--GAACTTGTTGATT---AGAG-A-CAAT-A--TAGAA--GAAAAAAAA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGAGAT----AT-CA-AAGGTCGA-C-A-AGTATT-TTCT---TC--C-CACATC-ACA-GAT-TTACAGAAAGAAAT-------AAA-GG-G-ATG-CCCA--CAG-AGAAT-AAAGA-T--GATCC-A--AGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTG-TGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TATCA-GAAA-TATC-AACAAGTGGACTAATA--A----GAACAGT-CATTGCT--GAGAAATTACAG-------AGTCGAAGA-T---ACAC--ATATTTG--AT-GAT-ACAT---T-TCATA--TCTTCCATGACC-T---GTCAAAATAT-TC--ATGG-------TAACT-ATCCTCCACAAA--ACTTACAATCA---------TTAATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-G-TTCC-AGGAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAAC----AAAACC-GGTCACACC-AGT--GT-TTTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGG-----AAAAT-GAAG---CGGAAAAGA---A--ACAAGCGG--GG--GTGCGGAAAAAA-T-AAAACAC---ATGGACATTATAT-CTCCTTT----AGCATCAGTGGA---CTCTAC-AAGTAA---ACGAAAG-AAACAAGG--ACAAG--GATAAG--GATCTT-GATGT-G-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TTCACTGA---GGTCA-GGAA---TT-CA-GTTG-TA-TCAGATTGTTAG-C--A---G---TGC-ATTC---CA-----TATTTCACTAGGTAAAATCAG----G-CA-A-ACTT-ATGGATTC-A-G-TGAT-TTTG--ATGGT-AACCT-TGTCC--AACAG-ACAGTC-A--CTGAGGA----CTGCAACTAC---AAAA--ATT---ACGAACCAGTGA-TG--GA-T-ACGGCT---------CACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAC-CTG-ATCTTTTA-CAG--------AC-GA-GAAAAATAAAGTCATC-AATAA-A--ACAAT---G-GGTAATCAAA-----AGA--A--AAAATTCATTT-CAAACAAAA-GACT-GGAAACCAA--T-AAGC-TA--CA-CTCTC--AC--C-ATTAAC-GGGAAC--ATA-CTGGTGG-G-A-TG-AGG-AAG--GATATGGGTG--A----GGCTA-AA-TCACACTC-G--GTAC-----AGCAA----ACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-ACAGAGGGACGA--CAAA-G-GACAG-GACCTGTATTAGAG------GATC-C--ACACTA-AT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GG-GATATTTG-GTATC---ACGAC---AT--ATATAA-AAAGGCAGTTAGTGCGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C---TACAG-G-TTCTCC-------TACAAACG------TCAGAA--G-TTAA-GATT-TA--T--CC--C----TTTGG-AATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG----TCAT----CTCCTGGTG-TG--TGAT---------------------GAAAACA---------------G-TGAAACAATTT-CA--ATTTCT-C---GAT-------AGTGAGGGTCA--TTCTTG----TC--TC-TCT-A-C-T---CA-C--AA--AGAAA-CAGAA-CAT-ATAC--T---A-TCCACC----G-AG---T----GTGTGTGT--AGA-TGACG-A--G-A--AC-AATCTTTATGTAG-----
gi|30 : t-CA--CCTGCT-G---GATC------AG-GACGGTCA-GTTCCCG----TC-TCT-ACT-G-CTGA--CACC--AG--AACAA-CATGG--A--ATACACC---A-TCC-Ca
gi|32 : AGGTTCA-C-G-AATATT-TCCT---TC--C-AACTTC-ACAGGAT-TTACAAAAACAAGT------atg
gi|33 : -CT--T--CC--C----TATGG-TATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG----TCAC----ATCCTG
gi|34 : CT--CCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G----A-ATG-AG---GA
gi|35 : A--CAAT-G-GACAG-GGACTGTAT---GG-----GTATC-C--ATGCTACAT-CAC-atga
gi|36 : aGTGT-ATAG-GTATC--T-ACA-GTGAG--TCCTCTTA
gi|4 : ---T--ATTTATCAAATGGCAC-ATTCCAAACTAAGTGTACCAAGCCTG-GGTAC-A-CCCCAGCATTT-TA-TAGAGTGT-GACATT-GAC-GAATGC-GAGAGG-AA--TTGTCAG---TTTTACTGCA--ATT-CTT-GCCA-TCTGC-AGATGT-G-TGAAC-AATGCAGAG-A-GG-AACATCT--GAAGAATAC-AGATTACCAG--AGCCATGA-GG--TGGT-CCT-TTACCAACAACGAAAAACGAAACGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGACT-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGATAT---GCT-T-TGTG-AGGAAT-GT---C-AAATTCCA--CT--ATGTT-CC-AAG---T-G-TGCAA-CACAGGCAGA-TCAT----CGG-GGC-AT--AAATTCATTGATCT--GGAG-A-CAAT-C--T--T---GAGGAAAATATAGCACTT--------CGCCTCA-AGA-AGATAT----C--CAAAA--TCCA-A-G-AATATT-TCCT---TC--C-GACATC-ACAAGAT-TTACAGAAAGAAAT------TAAA-GGTG-ATA-CCCA--CAG-A-AAT-AAAGA-T--AAT-C-AT-GGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCTA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCCCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATGCATCAGGTGGAC-AAGA-TA----GAACAGTCC-TTGATGGAACAATT-ACAG-------AATC-AAGA-TTCAACAT---T---TG--AT-GATTACAT---T-TCATA--TCT-CAATGACC-T--CGTCAAAGAGT-TTC-ATGGC------TACAT-GTTTTCCCCAAA--GCTTGCAAAT----------ATAATTTCCAAT-CTTTCTAAGAA--ATTCT-CAGAAA--TTCGA--CCCATAC-CA-GAA-ACAAC----AACAGT-GGTGACCCC-AAT--GT-TT-ACT--GCTGGTCG----ATAT-A-GCAAAG---ATAATGTGGCCAAAT--TACTAGGG-----AAAATAAATG---TGAGGGATACCAA-----AGCAG--AGATGAG----AAAAA-T-AAAACCC---ATGGAAATTGTCT-CTCCCTC----AACATCAGTGGA---ATCTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACGA-G--ATAAT--GATAAG--AAATCT-TATGT-G-AAAC-AAACAA--T--GCCCATA-TCTTCATATG-------TC-TCTGA---GTTTAGGGAGATATT-T-----G-TA-TT----TGTT-A-AAGA---A-------ATGA---CCCA---TATCTCCCTTGATAAA-GCAG----G-CAAG---CT-ATGGG-TC-A-G-TGGC-AGTG--A---T-AACCT-TGTAC-AAACAG-A---CTTA--CA-AGGA-AAGC---AGCTGC---TGAG--GAT---AAAGATCAGTAG-TG--GA-T-CTGGCTAC-------CACACAGTCACA-CGGG-ACGGGGTG-CTC-ATC--TTAACAG--------ACAGA-T-ACAATAAAGTCATC-AACAA-G--ATAACACCG-GATCAT--AA------GATAAA-AAAGTTCT-TT-AGAACAGGA-AGCT-GGA-ACCCA-AT-CAGCATA--CA-CTCCT--CCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-GTA-TG-ATA------------GGTA--AGGG-GGCCA-GAGT--CACAC-G--GTAC-----AAC-G--AGAAAGGGA-----AAGAACTACATAT-CAT-ACAAACAGATGA--TAAA-G-GACAG-AAACTATAT---AG-----cattgc
gi|5 : tcatttatattttctatttgtagagagtccTTCAAATCTCACTGCTCGAATTTCCAATAAATCCCCTCAAAGAGAATGTCATT-GTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAA-GTACTTGTAAAAAAACAAAATCTCACATTTTACAGTCTAG--ACGTTGGTGAAT----GCGCTGTG---TCGGGTAAAATGATATTTTCAGGCATATTACTTTTT-GAAATGA----ATTCT--TGGAGTTTGGACATTGTCTACAT----------------------CTTCTACTGCAGTTAGTTGTTTCACGATGGCG-ATGGTGTATTTTTTAGT--ATTTATTAGA--GCAC-TTTCAAAAGTA-----------------TTACGA-CCC--GCACTTCCT-TAG-GTGCGGGCATTCGAATGAGAG-CGAGCAGAAA--TTGTAGC---ATTTACTGCGC-ATTGCTTGGTCA-TCACCGAAATGT-GATAAACTAATGTCGAG-AGTA-AACA-CT--GAAGAGTCCAAGAATACAAAT-AGC--TGACAGTTTGGTT-CTC-TAT-TACAACATAAA------CAACAACTTCCTGCTGGAAAAAA-TGC-C-AAGGCCAC-GGCCAACTAAGTA-----GTTGAGAG---ACTAC-TGTAGATGAAT-GC---C-AGTCTCCAATTT--GT-TT-CACAAA---TCG-TAC-AACACTGGTAGAGTCACTGTCTG--GGCTACTAAAATTTATAGAT------AG-G-CAATAC--TATC-------AAAGT-TATT-CTAACAATTTTTG-TCCATCGACGGAGAG----TTACAGATGGTCCATT-C-AATATTATCCT---TCAACAAACATCAACAAGAT-TTAAAGGAAGAGATCA----CAAA-GAAGAATGACGCGAACGGTA-AAT-AAATA-CTAGACACTAT-GGCCAGGTTTCAGCTTCT-ATTTTAGATACATGCCATTGTAAGCCAACTGGGAGGATGTTTCTCTCT-CC-AAAT---ACA-TGGTGGA-CC-CAGTGGG-TGTCAGGAAAGTATAGAAC
gi|6 : A--TGTCCTCGG---T-CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT--C-------CA---TATCGTGACAAAT---------------G-TG-------TT-CA--TCTTCT-A---GATC------AG-GACGGTCG-GTTCTTG----TC-ATT-ACT-A-CT----CA-C--AA--AACAA-CAAGG--A--GTAGAAT---A-TCC-CT----ATAG---T----GTATGTGT--AGAT-GATG-A--G-A--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATT--------AT--G---ACACAGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--T-ACA-GTGAG--TTCTCTTATTG-TCAATCAACACACTACCACACAGAGATTTCACAACTTGTGACCAATGAGATAATATTTTATGAAT-CT--ACAATTTAt
gi|7 : A-CTCCT--CTCAC-ATTAAT-GGAGAC--ATA-CTAGTAGAG-G-TGGATA-AA---GAT---GGGA--A--ACGG--A-AAGT--GATCA-G--ATAC-----AGCAA---GAGAGGAA-----AGAAGCTCCAAGA-AATT-CAGAAGGATGA--TAAA-G-GACAA-GATCTATAC---TG-----T-ATCAT--AGGGTGCAT-CAC-AGAAA---ACATTAA-C----GGTGACATCTGTGTATC---C-GACCCTCT--TCGTAA-GAAGGTGG-----TGGT--AGTGAC--CAGATT-AGGA-CAG-TATCG-G-TTCT-C------TTAC--TTTGGTCATCCATTACAA-CCTG-GATT-CTA-T--CC--A----AACAG-AATGTGTA-----CAGA--TG-CCTTGGGAATT-------ATCTTGGTC-TG--TAGT--T-------GT---GGT-G-G-TAGTAAATGTGAGACCTGGGG-TA-------TC-CA--CATGTT-T---GA-CC-----AG-GACGGTCA-GTTCCTGAATTTC-CTC-ATC-A-CAT---CA-C--AA--Aatgaatgaataaggctgatacaactatactagaaaatacacagtagagtgtatggaatccccataattaaccaaacaagttgctgattatatgtgcaagtttaactatgatttacagtcacttacattgttaagtatgcaaaacaacagtgtgtgacaatcaaaagatatctttaattatcctgtagctttcaatttacaatatctgaatatcacgatattactactaagagctagatttgaaaaaggtcttgtttatgaaataagattttagaaaataagattctccctttcagttttatataattcaattatttcttctttcattctacatttacaatagcatcctatggga
gi|8 : ctTACAT--GTGAAT----G-GAT-TA---TCGGGTAATTTAATATTTTCAAGCA-ATGACTTTTT-G--ATAA----ATCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-GTATTGCCTACATTCTACTGTAAGTTT--------GCTAGTT-TTTCA-------GGATAGAATATTTTG---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTT-CT-TGGAGTGC-GGCGTT-GAA-GATTGT-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATTGCA--ATC-CTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACACCT--GAAGAGTCC-AGAAAACAAA--AACCATGA-AG--TGGTT-CTC-TATCTACAACGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAATG-TG--C-AAGGCC-C-ACCCAACTAAAGA----TATTGACAT---CCT-C-TGTA-ACAATT-GC---A-AAGTTTCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGC-AACACTGG-AGAtgcccagtgcggtctgcactgatgatcaacaaaacgtctgggttggaagttggaacag
gi|9 : GTCAAAATAT-TTC-ATGGT------CACCT-ATCCTCCAGAAA--CCTTACAATT----------ATAATCCCCAAC-CTTTCTGAGAA-G-TTCC-AGGAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-AAG-ACAAC----AAAACC-GGTCACACC-CGT--GT-TT-ACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGC-----AAAATAGAA------ACGGAAAACAA--ACCAGCAG--AGATGAG----AAAAA-T-AAATCCC---ATGAAAATTGTCT-CCCCTTT----AACATTAGTGGA---CTCTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACAA-G--ACAAG--GATAAG--GAATCT-GATGTGG--AAC-AAACAA--T--GCCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GATCAGGAAG---TT-CA-GT-G-TA-CCGGG-TGTT-G-A--A-----------ACGG---TATTCCATATTTCACGAGATAAAT-CAG----G-CA-A-ACTT--TGGG-TC-A-A-TGA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): ATATAATTCAACTCTCTTTTCATTCATTCTACATTTAATATAGCATCTATGGG
Alignments
lowQualScore : 1 11 1 2222 11 1 1 2222 111 11 11 11 222222 222222 11 1 1 11 2222 11 1 1 888888888888888888888888888888888888 333333333333 111111 2 888888888888888888 1 111 11 11111 111111 11 11 1111 111111 111 1 1 1 444444444 1111 333333333333 3333333333333333 3333333 111111 111 2222222 11111 11111 222222222 1111 1 33333333 2222 1111 22 33333333333333 111 2222222 11111 22222222 11 222222 2222222 3333333333333 22222 11 1111 11 11 1111 111 11 22222 2222222 111 11 111 2 1111 1111 111 1111 22 11 1 11111 2222222 111 111 555555555555555555555555 11 222222222 111111 111 3333333333 2222 11111 111 11111111111 11 11111111 22222222222 11 11 111 6666666666666666666666666666666666666 111 11111 222 11111 11 111 11 111 3333333 1111 111111 11111 2222222 11111111 222 1 444444444444444444444 222222 11 22222222222 111111 33333 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 111111 33333 11 1 44444444444444444 1111 11111111 33333333333333 11111111111 6666666666666666 22222222 2222 1 11 11 1 11 1 11
lowQualScore : 5 1 88 1 1 5 4444 88 5 5 4444 1 777 7 44 33 33 555555 222222 00 0 1 0 33 1111 33 0 0 2 333333333333333333333333333333333333 8 5 666666666666 1 0 666666 0 6 1 666666666666666666 6 6 5 0 77 5 5 0 8 0 5 77 1 1 000 77 1 5 5 1 5 5 5 5 0 5 5 5 0 77 1 5 1 33 1 4 66 99 1 99999 3 1 999999 0 6 6 33 33 5 5 5 1 0 0000 0 1 111111 5 111 1 5 88888 1 66 66 5 5 888 5 5 1 5 1 1 2 5 222222222 6 99 1 4444 666 111111111111 6 1 6 4444444444444444 6 3333333 6 1 888888 5 000 77 5 5 2 5 1 0 5555555 6 3 6 6 33333 0 6 6 6 66666 6 1 6 6 666666666 6 4444 6 6 3 66666666 6 6 0000 6 6 6 6 6 6 9 33 6 1 6 4444 11 3 77777777777777 8 8 444 4444444 11111 0 22222222 11 8 666666 1 6 6 2222222 1 6 1 99 1 77 1 0000000000000 6 44444 1 55 99 6 88 6 7777 8 0 8 11 8 8 11 0 7777 8 8 444 1 11 1 00000 0 5555555 0 111 3 8 6 3 11 8 8 444 11 0 0 7777 3 5555 8 444 1 8 2222 55 11 8 5 88 8 33333 8 1111111 6 000 555 5 77 5 3 5 888 555555555555555555555555 1 1 1 5 11 888 777777777 5 5 5 5 5 0 111111 5 5 5 5 555 77 2222222222 0000 44444 1 8 5 77 000 99999999999 4 5 5 0 5 5 11 0 88888888 666 4 4 66 0 4 22222222222 00 5 77 5 5 11 222 6 66 777 7 4 0 55 4 4 7777777777777777777777777777777777777 66 222 66 22222 000 22222 11 5 777 1 22 77 4 8 55 222 4444444 7777 2 5 88 4 888 3 333333 5 5 77777 6666666 1 6 1 6 6 33333333 99 1 99 6 6 666 6 5 1 444444444444444444444 000000 8 6 55 6 99999999999 888888 66 44444 8888 44 66 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 8 55 1 0 99999 4 555555 4 5 8 8888 55 4 4 4 44444 4 11 55 3 1 22222222222222222 4 0000 99999999 3 66 77777777777777 5 2 99999999999 7777777777777777 0 44444444 1 5 5 6666 3 33 1 33 5 1 88 1 1 22 1 5 88
lowQualScore : . . .. . . . .... .. . . .... . ... . .. .. .. ...... ...... .. . . . .. .... .. . . . .................................... . . ............ . . ...... . . . .................. . . . . .. . . . . . . .. . . ... .. . . . . . . . . . . . . . .. . . . .. . . .. .. . ..... . . ...... . . . .. .. . . . . . .... . . ...... . ... . . ..... . .. .. . . ... . . . . . . . . ......... . .. . .... ... ............ . . . ................ . ....... . . ...... . ... .. . . . . . . ....... . . . . ..... . . . . ..... . . . . ......... . .... . . . ........ . . .... . . . . . . . .. . . . .... .. . .............. . . ... ....... ..... . ........ .. . ...... . . . ....... . . . .. . .. . ............. . ..... . .. .. . .. . .... . . . .. . . .. . .... . . ... . .. . ..... . ....... . ... . . . . .. . . ... .. . . .... . .... . ... . . .... .. .. . . .. . ..... . ....... . ... ... . .. . . . ... ........................ . . . . .. ... ......... . . . . . . ...... . . . . ... .. .......... .... ..... . . . .. ... ........... . . . . . . .. . ........ ... . . .. . . ........... .. . .. . . .. ... . .. ... . . . .. . . ..................................... .. ... .. ..... ... ..... .. . ... . .. .. . . .. ... ....... .... . . .. . ... . ...... . . ..... ....... . . . . . ........ .. . .. . . ... . . . ..................... ...... . . .. . ........... ...... .. ..... .... .. .. .................................................... . .. . . ..... . ...... . . . .... .. . . . ..... . .. .. . . ................. . .... ........ . .. .............. . . ........... ................ . ........ . . . .... . .. . .. . . .. . . .. . . ..
lowQualScore : 0 0 55 0 0 5 0000 00 5 5 0000 0 777 3 00 22 88 222222 222222 22 0 0 0 88 2222 88 0 0 5 444444444444444444444444444444444444 0 6 888888888888 0 8 000000 4 7 7 777777777777777777 7 7 7 4 11 7 7 3 6 7 7 99 7 0 000 99 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 1 99 7 7 0 66 7 3 00 22 7 33333 3 0 222222 7 7 7 11 66 0 0 0 0 1 6666 8 0 555555 0 999 0 0 99999 0 99 99 0 0 888 0 0 7 4 4 0 1 0 333333333 7 22 0 0000 888 777777777777 7 0 4 6666666666666666 7 0000000 4 0 333333 7 000 99 7 7 3 7 0 1 3333333 7 5 7 7 33333 7 7 7 7 77777 7 0 7 7 777777777 7 2222 7 7 3 77777777 7 7 8888 7 7 7 7 7 7 8 55 7 0 7 2222 44 8 44444444444444 0 0 222 8888888 44444 8 44444444 00 0 000000 0 7 7 8888888 0 7 0 22 0 00 0 3333333333333 7 55555 0 88 22 7 22 7 0000 0 6 0 00 0 0 00 8 0000 0 0 000 4 00 0 00000 8 6666666 8 888 2 0 0 8 00 0 0 000 44 6 0 0000 2 0000 0 000 4 0 2222 44 00 0 0 88 0 00000 0 7777777 7 000 777 7 00 7 0 7 333 666666666666666666666666 0 3 0 0 99 888 444444444 0 0 0 0 7 6 000000 7 7 7 7 777 99 7777777777 6666 33333 0 9 7 99 333 00000000000 3 0 0 8 0 0 99 2 11111111 222 4 4 11 1 4 66666666666 00 7 00 0 0 66 777 3 11 000 3 0 7 55 0 0 6666666666666666666666666666666666666 99 444 99 55555 000 55555 55 0 555 0 22 11 4 9 44 222 4444444 0000 2 6 33 4 888 2 666666 9 2 33333 7777777 0 7 0 7 7 00000000 22 0 22 7 7 222 7 5 0 000000000000000000000 444444 0 7 88 7 33333333333 333333 11 55555 5555 66 11 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 55 0 7 00000 0 555555 0 7 0 5555 00 0 0 0 66666 0 00 55 3 0 00000000000000000 4 6666 11111111 2 99 11111111111111 0 5 66666666666 3333333333333333 7 22222222 0 7 7 3333 3 88 0 33 0 0 00 0 0 00 0 5 00
consensus : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GCTAGTT-TTTCA-------G-ATGGAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTC-CTCTTACCAACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATGC--T-C-TG-TA-ACGANT-GC---C-AANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCCGGAGGC-AT--AAATTTATNGATTT--AGAG-A-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGAT----TT-CAGAAGGTCCA-T-C-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CTCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGAT-CAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAGG-------TCTCT-CA-AAA----GCAT-GGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGTCCGTTGTTAGAAGAANTACAGCAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTCATA--TCT-CCATGACT-TT-CGTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TNCCT-ATCCTCCNCAAA--GNTCGCAANTN----------T-AATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-GATTCCCGGAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACCCCA-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAACG---AGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAAT-AAAA-CCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTT----AGCATCAGCGGA---NTCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAGGAGATAAG--AAATCT-GATGTGG-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTAT-CTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTA-TCGGG-TGTT-G-AA--G---TTT-ATGG---CAT----TATNTCACTNGAT-AAAT--CGG---GCAGG-ACTTC-TGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCCAAA-CAG-A---TCTA--CAGGGGA-AATCTG-ANCTAC---GGAA-----GATANAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG----CT----NCCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGACACCCANT-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATG-AA---GACGGT-ATN-G----GGCTA-AAGT--CACNC-G--GTAC-----AGCAA--AGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CATA-C---AGAGGGACGA--CAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-----CGATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-T-AGTTGGT--GGTGAA--CAAAT-CAGGA-CAA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACGAG--GTTCAGAAAGA-TCAG-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTCA-GTTCTTG----TC-NCT-ACT-A-CT-----CA-C--AA--AACAA-CANGG-CA--GTACGGC---G-TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AGA-CG-ACG-AGGA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--TTACA-GTGAG--TCCTCTTANTGGTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
Reference ( family-437 ) : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GCTAGTT-TTTCA-------G-ATGGAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTC-CTCTTACCNACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATNC--T-T-TG-TA-ACGANT-GC---C-AANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCCGGAGGC-AT--AAATTTATNGATTT--AGAG-A-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGAT----TT-CAGAAGGTCCA-T-C-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CCCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGAT-CAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAGG-------TCTCT-CA-AAA----GCAT-GGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGTCCGTTGTTAGAAGAAGTACAGCAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTCATA--TCT-CCATGACT-TT-CGTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TNCCT-ATCCTCCNCAAA--GNTCGCAANTN----------T-AATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-GATTCCNGGAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACCCCA-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAGCG---AGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAAT-AAAA-CCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTT----AGCATCAGCGGA---NTCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAGGAGATAAG--AAATCT-GATGTGG-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTAT-CTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTA-TCGGG-TGTT-G-AA--G---TTT-ATGG---CAT----TATNTCACTNGAT-AAAT--CAG---GCAGG-ACTTC-TGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCCAAA-CAG-A---TCTA--CAGGGGA-AATCTG-ANCTAC---GGAA-----GATANAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG----CT----NCCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGACACCCANT-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATG-AA---GACGGT-ATA-G----GGCTA-AAGT--CACNC-G--GTAC-----AGCAA--AGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CATA-C---AGAGGGACGA--CAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-----CGATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-T-AGTTGGT--GGTGAA--CAAAT-CAGGA-CAA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACGAG--GTTCAGAAAGA-TCAG-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTCA-GTTCTTG----TC-NTT-ACT-A-CT-N---CA-C--AA--AACAA-CANGG-CA--GTACGGC---G-TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AGATTG-ACG-AGGA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--TTACA-GTGAG--TCCTCTTANTGGTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
gi|1 : TTTAAATCTCACTGCT-GCATTTCCAA--AGTCCCCTCAAATAGAAAGCCATTTGTCATTT----TG--GGTCAAACACAGAT-ATTGTAAAGTACT----GAAAAACAACATCTCA-A-TT-AC-GTCTAGATACAA--GTGAAT----A-GCTATAAAATCAGGTAAAG-AACATTTTCAAGCA-ATGACTTTTTTG--ATAATTAAGTCCT--TGGAATAT-GATA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GTTAGTT-TTTCA-------GTATGGAGTATTTTT---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TT-CAAAATTA----------------G-TAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--T-GTGAA---TTTTATT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGTCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-AG--TG-TTC-TTCTTATTTGCAGCGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAAAAGTG--CGAAGGCC-C-ACCCAACGAAAGA----TATTGACCTTT--T-T-TG-TA-ATGAGT-GC---CCAAGTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-GATACAAACACTGGAAGAGTCAT--TTCTGGGCC-AT--AAATTTATAGATTTTAGGAGGA-CAAT-C--TATT---CAGAAAAGT-TATCACTA--------T--TTCA-AGA-GGAGGTC---TT-CAGAAAGTCCA-TTC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAGGAT-TTAAAGAAAGA--T------CAAA-GAAG-ATG-CTGG--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TGATTCAT-GGACAG---------TCT-A----AAA-ACA-GCCA-TGAAG-CTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCATTGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACAAGTAAAC-AATA-TA----GAAAAATCCATTGTTAGGAGGAG-ACAAAAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTC-TA--TCT-CCGTGACT-TT-TGTCAAAGAG---CC-ATGGC------TTCCT-ATCCTCTTCGAA--GATCACAGACT----------T-AATTCCCAAA-CTTTTTGAGAG-GAAACCTGAAAAA-TCCGA--TCCATAC-CC-AAG-ACAACAA----AACCA-GTACCCCCA-GT--G-T-TTACT--GC-GGTCA----TTAC-A-GCAAAG---ATGATGTTGTCAAAT--TACTAGGG-----AAGGTAGAAATT---AGAGAGACCAA--ACCAA-AG-AAA---G--AAAAAT-AAAAACCT---ATGGAG--TGGCTGCTCCTTC----AGTAGCACCGAA---ATCTAC-AAGCAG---GCAGATG-AAACAA-G--ACAGGGAGATAAG--AAATCT-GATGTTG-AAA----ACAACTT--GTCTCTATTCTCCCTCTG-------TC-ACTGA---GGTCTGGGAG---TT-TAG-GGTA-TCTGG-TATT-ACAA--ACTTTTT-ATGG---CAT----TATATCACTTGAT-AAATT-CAG---GCAGG-ACTTCCTGGG-CC-ATG-TGAC-GTAG--A---T-AACCT-TGTCCAAAACAG-A---TTTA--CAGGGGG-AATCTG-ACCTACTTTGGAA-----AGTAAAAACTA-TGG-TG--GAT-TTGG----GT----TCCACA-AGTCACA-CAGG-ATGGGTTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAAA-G-CAAATAAAGTCATC-AATAGTG--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TG-AAAA-AGGG-GACT-GGACACCCACTTCAGTATA--CA---CTGCCTCCAC-ATCGAA-TGAGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATA-AA----ACGGT-AAACA----GGCTA-AAGT--CACCC-G--ATAC-----AGCAA--AGACAG-AA-----AAGAACTACAGAA-CATAAC---AGCGG-ATAA--CAAT-G-GACAG-GGACTTTAT---AG-----CAATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGGAA---ATATGAA-T----GGAGATATCTGCACATC---A-GAC---CT--TAATAA-AGAGG-CA-G-TTAGTTGGT--GTTGAA--TAAATTCAGGA-CAAACACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACAAG--GTTCAGAAAGG-TCAA-GGTT-CT--TC-CC----CGG----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCTTCAG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------TAC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TT-CA--CTTCTT-A---GATTC------AG-GACGGTCG-GTTCTTG----TCAATT-ACT-ACCT-C---CA-C--AA--AACAACCAAGC-CA--GTACAGC---G-TCC-CC----GTTG---T----CTGTGTGT--AGATTG-ATGAAGAA--AC-AATCTCTAT-TA------GA----AATA--------TG--G---ACACAGT--------GACAGTGC-ATAGCGTATCTGTTACAGGTGAG--TCCTCTTACT-GTCAATCAA-ACATTGCCTCAC--AGATTTCACAGCTTGTGACCATTGAGATTATATTAAAAGAATACTAGACAATTTA
gi|10 : AAACAAAA-GACT-GG-CAACCAAT-CAGCGTG--CA---TTCCTCTCAC-ATTAAC-GGCGAC--ATA-CTGGTGG-G-G----ATG-AA---G-------T---------CTA-AAGT--CACTC-A--GTAC-----AGCAA---GACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CATA-C---AGAAGGACGA--CAAA-G-GACAG-GACCTGTAT---AG-----TGATC-C--ACACTACAT-AAC-AGAAA---ACACCAA-C----GAGGATATTTGCGTATC---A-GAT---TA--TAATAAGACAGGCCG-G-T-AGGTGGT--GTTTAA--C-AAT-CAGAG-C---TACAGTGTTTTTTCGCCTAATTAC--A-GAG----TCAG--AGATTCAGAGAGT-CT--TTACC----TACAGCGGAAATATGT------CTGACCTGTTGTTGG----CCAC----ATAGTGATA-TGGTTGATTATTTAAGCC---TAT---TACAAT---------------------------TC-TA--CT--CT-T---GA-CCT-----AG-GATGGgcccacgcgaataa
gi|11 : tcATCTCA-A-TTTACA-TCTAG-TACGT--GTGAATTAATG-GCT-TA---TCGAGTAAATGAATATTTTCAAGCA-ATTACTTTTT-G--ATAT----GTCCTAATGGAATTT-GACA-TGT-----------------------------TT--------GCTAGTT-TT-CA-------G-A----GTATTTTT---TGTATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGC-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATT--GCAATTCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-gc
gi|12 : cCAACACTCTTATAGAGTGT-GCCA-------GGCTGCC-ACCA--AA--TACTCAAAAGTTCTATT--GCACGACTG-TTCAGCCAGC-AAATGT-G-TGAAC-AACACAAGG-A-TATCACATCCGGGAAGA---C-AAAAAACAAA--A-C--TGA-TG--TGGTTC---TTTACCAAGAA-GAATA------CAAGAATTGCCAA-CAG-AGGAATTGTCC-AA--TC-C-ACCCCAA-AAGGA----CCTTAAAATTT--A-C-TG-CA-AAGAAT-GC---C-TACTCCCA--AT--CTGTT-CC-AAA---T-G-tg
gi|13 : -AAAT--CAG---GCAG--ACT-C-TGGG-CC-A-G-TGAC-TGGC--A---T-AACCT-TGTCGAAA-CAG-A---TCTA--CAGGGGA-A-TCTG---CTAC---AGGA-----AATAAAAAACTATGG-TG--GAC-ATGG----GT----TCCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-CAAATAAAGTCATC-AGTAG-G--ATTACGCAG-GATAAT---A-----CTATCAC-AGAATTCA-TG-AAAACAGGG-GACT-GGG-AACCATA-CAGCATA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-GATG-GTG-Acttaccaccaaccacaacagtcaccaagtagccttgatcttgagtaatc
gi|14 : CTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGAAG---TT-CAG-TGTG-CCGGG-TGTT-A-AG--G-------A-GG---CATCCCATATTTCATTAGGT-AAAC--AGG---GCAA--ACTG--TGGG-TC-A-G-TGATATTAGTGG---T-GACCT-TGTCCAAA-CAG-A---TCTA--CAGGGGA-A--CC--AGCTAC---AGAA-----GATACAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG----CT----ACCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATC--TTTACAG--------ACAGA-G-ACAATAAAGGCATC-AATAA-G--ATAACA-AG-GA
gi|15 : A--CGTCCGCGA-----CAC----GTACTGGTT-TG--TGAT-------GACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGA-TC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC-TCG-ACT-G-CT-GGGACA-CGAAA--AACAAACATGGATA--ACACAGT-------C-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGAACGTACG--GCATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATATC---TACA-atactcatagcaaaacaatcat
gi|16 : A--CGTCCGCGA-----CAC----GTACTGGTT-TG--TGAT-------GACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGA-TC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC-TCG-ACT-G-CT-GGGACA-CGAAA--AACAAACATGGATA--ACACAGT-------C-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGAACGTACG--GCATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATATC---TACA-
gi|17 : ACAAGTAAAC-AAAA-TA----GAAAAGTT-GTTGTTAGAAGAG--AC--CAA--T-AGCC-AGGA-T--GACTC--AT---TG--AAAGATTATAT---TGCC-TA--TCT-CCATGACT-TT--GTCAAACAGT-TCC-ATGGC------TTCCT-ATCCTCTCCAAC--GATCACTGCTC----------T-AATTCAAAAA-CTTTTTGAGAAGGA--CCTGAAAA--TCCGA--TCCATAC-CC-GAG-AC
gi|18 : TCGG---T-CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------TTC-------G-G----TA---------------C-TG-------TT-CA--TATCCT-T---GA-TC------AG-GATGGTCA-GTTCTTG----TC-TCT-ACT-A-CT-----CA-C--AA--AGAAA-CAGAA-CA---TAC-AC---GATCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AGA-TG-AC--AAGA--AC-AATCTTTATGTTG-----GACAACGATA--------CACCA---ACACAGT--------GACAGTGT-ACAA-ATA
gi|19 : GTCCA-T-C-AATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAAAC-TTAAAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CT-G--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TGAT-TAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCAT-GGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACTAGTAAAC-GAAA-TA----GAAA
gi|2 : A-GGAGGTGTTTTT-CAAAGGTTCCA-T-CAGATATG-TCTTGTTTC--A-AACATC-ACAAGATGTTATA-AAGGAAATGATATTCAAATGAAG-ATG-CTGG--CGG-A-AATGAA-----AGAATGAT-CATTGGATCG---------TCTTA----AGA-ACA-GCCAATGGAAGCTGATGGAGAGG-------TCTCTGCATAAATTAGGCAT-GGTGAATCAGCAGT-GGATGTCA-GAAA-TATTGAACAAGTAA-C-AGGAATATCAGGAAAAGTTGGTTGTGAGAAGAAG-AGAGCCAGCTGAGCC-AGGAAT--GAAACTCATG--TGGAAA-GATTGTATAATTGCGCTAAGTCT-CCATGACTGTTGTGTCAAACAGTGTCCGATGGTGGGCTTTCCCTCATCCTCTACAAACAGAT-GCAACTGGGGCGCTGCTC-AATTGCAAAAACTTTTTGAGAA-GGACCCTGAAAGATTCCGGATCCCATACGCGCGAGTACAGTAATGAAAACCAAGTCCCCCCAAGTCAG-TATTACTTCGCTGGTCATTGGGTATCACGCAAAGGGAAGAATGTTGTCAAAGGATACTGAGGGTGAAAAGATAGAAAATTATAAGGAGACCAATTACCAATAGTAAAAGTA--AAGAATTAAAA-CGCTAAATGGAAAGTGGCTGCTCCTTTAGTGAGCAT--GCGGAAATGCTTACAAAGTAAGGTGCGAATGAAAACAA-ATTACAAGGAGATAAGATAAATCTGGATGTGGAAAACAAAACCA--TTGGTCTCTAG-TGTCCTCTAGTACAGTTT-ACTGAATTGGTGAGGGAGA--TTGCAG-GGTATTTGGG-TGTT-G-AATCGT--TTT-ATGGGCATAT----TATCTCCGTTCAT-AAATGCCGGACCGCAGGAACTTC-TGGC-TCGA-GTTAAC-TTAG--A---TAAACCTGTGTCCAAA-CAGTAT--TCTAAGCAGGGGATAGTCTT-GCTTACAA-GGAATTATTAAGATAAGCTA-TGGTTG--GAC-TTGGGATTCTCTAATTCACA-AGTCACAGCAGGTATGGGGTTACTGTATCT-TTAGCAGAGCGAATCACAAATT-AAGATATAGTCATCGAATTA-GGTATAACACAATGGTGAC--AAATACTCTATCACAAGAATTCA-TTAAAAACAGGACGACTGGGATACCAACTGCAGCATATTCATCTCTCTGCCCAC-ATCAACTGGGGACAGATATCTGGTGG-G----G-ATGTAATTGGAC--T-ATA-G----GACTACAAGT--CACTT-GCCGTATTATCAAGCAATTAGACAGGGAACATGAAGAACTACAGAATCATA-C---AGTGGGATAA--CAAGTGTGATCG-GA-CTGTATG--AGTATGCCAATC-------CTACATGCACTAGAAAAAGATATAAAGCTGGAGGTGATATCTGATTAGCAATA-GATG--CTGCTGGTAA-AGAGG-CGAG-T-AGT--GTTAGGTTAAAGTAAAT-CAGGACCAATCACA--GTTTCTCC------T-----ACAAA--GGTCAG-AAGA-TCAG-GGTTGCTGATC-GCGTGTAAT----GGAATCCGTGGTAGCCTGA--TGTCCTCGG----TCACGAGTATCCTGGTGCTG--TGATAG-----ACC---AAT-T-GACGATT---------------GTTG-------TT-CATGCTGCTTAA---GA-TTCAAATGAA-GACGGTCA-GTTCTTG----TC-ATTAACTGA-CG-T---CA-C--AAGGAAC-A-CAAGG--ATTGTA-GGCGTTG-TCC-GCTTGTGTAG---TTCTAGTGTGTTTCAAGATGA-GTG-A-GA--ACAAATCTCTAT-TAGTTAGTGA----GATA--------GG--G---ACACAGTTCAAGTGAGATAGTGTAATAG-GTACT--CTACATGTGAAGTTTCTCTTAATGGTCAATCAA
gi|20 : ctctgtgca--CA---CTCCTCCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CTTGTGG-G-G-------------AATGTT-ATT-G----GG----GAGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAGG----TA-TTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG------AATC-CCAATG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|21 : --CA---CTCCTCCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CTTGTGG-G-G-------------AATGTT-ATT-G----GG----GAGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAGG----TA-TTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG------AATC-CCAATG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|22 : -AAGGCC-CCAACCAACTAAAAAGGAATATTGACATGCACT-C-TGGTA-ACAAATTGCAGAT-AAGTTTCA--TTTTGTGTT-CA-AAAAATT-G-TGCAACAACTGG-AGAGTCATA-TTTGG--GC-AT--AAATTAATAGATTT--AGAG-AGCAAT-TGATATTCAGGGGAAAAGT-TATC
gi|23 : gca-TG--C-AAGGTC-C-ACCCCACTAAGGA----TATAGACATGC--C-T-TG-TG-TAGATT-GC---C-AGCTTCCA--AT--ATGTT-CC-AAA---T-G-TTC-AACACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGC-AT--GAACTTGTTGATTT--AGAG-A-TAAT-C--TATG---AAGAAAAGA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGA
gi|24 : CTAC---AGAA-----GATACCAACCAATGG-TGAAGATGAAGG----CT----ACCACACCGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATG--TTTGCGG--------ATAGT-G-ACAATAACGTCATA-AATAA-G--ACAACATCG-GATAAT--AA-----TG
gi|25 : ---GGTCAGGGAG---TT-CAG-GGTA-TTGGG-TGTT-G-AA--G---TTTTATGG---CAT-----ATATCCCTTCAT-AAAT--CCG---ACAG--ACT-C-TGGG-CC-A-G-TAAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCCAAA-CAG-A---TCTA--CAGGGGtc
gi|26 : ctatTCACA-CAGG-ATGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------AAAAA-G-CAAGTAAAGTCATC-AAGAG-G--ATAACACAC-GATAAT---A-----CTATCAC-AGGATTCA-TG-AAAACAGGG-GACT-GGACACC
gi|27 : ACAT-CGC-AGAAA---ACATCAA-T----GGTGATGTCTGCGTGTC---C-GAC---TA--CAATAA-ACAAG-CT-G-T-AG-TAGT--GGTAAA--TAAAT-CAAAT-CAC-CACAG-G-TTCTCC-------TAC--A-GAG--GTa
gi|28 : -GTTCTTG----TC-ATT-ACT-A-CT-----CA-C--AC--TACAA-CACGG--A--GTACGGT---T-TCC-CT----ATAG---T----GTGTGTGT--AGA-TG-ATG-A-GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GAAA--------TG--T---ACACca
gi|29 : gAATAAAGTCATC-AATAA-A--ATGGCACAG-AACAAT--AA------AATTAA-AAAGTTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGGCACCCA-T-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATTAA
gi|3 : TCAGATGGCACATTCCAAAACTGTAGCGTACCAAATATGGGTAC-AACCCCAGCACTTTT-TAGAATGT-GGCATC-GAA-GATTGC-GAG-AG-AAAATTGTCAA---CCTTACT--GCAATCCTT-GCCA-TC-GC-AGATGTTG-TCAAC-AATGCACAGCA-CG-AGCATCT--GAAGAATCC-AGATTACAAAGAAACCATGA-GG--TGGTCC-CT--TACCAACAACGAAAA------CGACATCTTCCTG-TGG-AAAA--TG--C-AAGATC-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGACATGC--T-TGTG-TG---GATT-GC---C-AGCTTCCA--TT--ATGCTACA-AAA---T-G-TTTCAACACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGC-AT--GAACTTGTTGATT---AGAG-A-CAAT-A--TAGAA--GAAAAAAAA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGAGAT----AT-CA-AAGGTCGA-C-A-AGTATT-TTCT---TC--C-CACATC-ACA-GAT-TTACAGAAAGAAAT-------AAA-GG-G-ATG-CCCA--CAG-AGAAT-AA-----AGA-TGAT-CCA-AGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTG-TGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCAT-GGTGGA-CA-CAGT-GG-TATCA-GAAA-TATC-AACAAGTGGACTAATA--A----GAACAGTC-ATTGCT-GAGAAATTACAG-------AGTCGAAGA-T---ACAC--ATATTTG--AT-GAT-ACAT---T-TCATA--TCTTCCATGACC-T---GTCAAAATAT-TC--ATGG-------TAACT-ATCCTCCACAAA--ACTTACAATCA----------TTAATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-G-TTCCAGGAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACACCA-GT--GTT-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGG-----AAAAT-GAAGCG---GAAAAG---AA--ACAAGCGG-GGGTGCGGAAAAAAT-AAAA-CAC---ATGGACATTATAT-CTCCTTT----AGCATCAGTGGA---CTCTAC-AAGTAA---ACGAAAG-AAACAAGG--ACAAG--GATAAG--GATCTT-GATGT-G-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTAT-CTTCCTCTG-------TTCACTGA---GGTCA-GGAA---TT-CAGTTGTA-TCAGATTGTTAG-CA--G---TGC-ATTC---CA-----TATTTCACTAGGTAAAAT--CAG---GCA-A-ACTTA-TGGATTC-A-G-TGAT-TTTG--ATGGT-AACCT-TGTCC-AA-CAG-ACAGTC-A--CTGAGGA----CTGCAACTAC---AAAA-----ATTACGAACCAGTGA-TG--GAT-ACGG----CT------CACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAC-CTG-ATCTTTTA-CAG--------AC-GA-GAAAAATAAAGTCATC-AATAA-A--ACAAT---G-GGTAATCAAA-----AGA--A--AAAATTCATTT-CAAACAAAA-GACT-GGA-AACCAAT-AAGC-TA--CA---CT-CTCAC-C-ATTAAC-GGGAAC--ATA-CTGGTGG-G-A-TG-AGG-AA---G--GAT-ATG-GGTGAGGCTA-AA-TCACACTC-G--GTAC-----AGCAA----ACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CATA-C---AGAGGGACGA--CAAA-G-GACAG-GACCTGTATTAGAG------GATC-C--ACACTA-AT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GG-GATATTTG-GTATC---ACGAC---AT--ATATAA-AAAGG-CA-GTT-AGTGCGT--GGTGAA--CAAAT-CAGGA-C---TACAG-G-TTCTCC-------TACAAACG------TCAGAA--G-TTAA-GATT-TA--TC-CC----TTT----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG----TCAT----CTCCTGGTG-TG--TGAT-------------------GAAAACA---------------G-TGAAACAATTT-CA--ATTTCT-C---GA-T-------AGTGAGGGTCA--TTCTTG----TC-TCT--CT-A-CT-----CA-C--AA--AGAAA-CAGAA-CAT-ATAC--T---A-TCCACC----G-AG---T----GTGTGTGT--AGA-TG-ACG-A-GA--AC-AATCTTTATGTAG-----
gi|30 : t-CA--CCTGCT-G---GA-TC------AG-GACGGTCA-GTTCCCG----TC-TCT-ACT-G-CTGA---CACC--AG--AACAA-CATGG--A--ATACACC---A-TCC-Ca
gi|32 : AGGTTCA-C-G-AATATT-TCCT---TC--C-AACTTC-ACAGGAT-TTACAAAAACAAGT------atg
gi|33 : -CT--TC-CC----TAT----GGTATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG----TCAC----ATCCTG
gi|34 : CTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G----A-ATG-AG---GA
gi|35 : A--CAAT-G-GACAG-GGACTGTAT---GG-----GTATC-C--ATGCTACAT-CAC-atga
gi|36 : aGTGT-ATAG-GTATC--T-ACA-GTGAG--TCCTCTTA
gi|4 : -AT----------------------TTT---------CTA--T-TTGTA-------G-A--GAGT----CC---T--ATTTATCAAATGGCAC-ATTCCAAACTAAGTGTACCAAGCCTG-GGTAC-A-CCCCAGCATTTTA-TAGAGTGT-GACATT-GAC-GAATGC-GAGAGG-AA--TTGTCAG---TTTTACT--GCAATTCTT-GCCA-TCTGC-AGATGT-G-TGAAC-AATGCAGAG-A-GG-AACATCT--GAAGAATAC-AGATTACCAG--AGCCATGA-GG--TGGT-C-CT-TTACCAACAACGAAAAACGAAACGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGACT-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGATATGC--T-T-TG-TG-AGGAAT-GT---C-AAATTCCA--CT--ATGTT-CC-AAG---T-G-TGCAA-CACAGGCAGA-TCAT----CGG-GGC-AT--AAATTCATTGATCT--GGAG-A-CAAT-C--T--T---GAGGAAAATATAGCACTT--------CGCCTCA-AGA-AGATAT----C--CAAAA--TCCA-A-G-AATATT-TCCT---TC--C-GACATC-ACAAGAT-TTACAGAAAGAAAT------TAAA-GGTG-ATA-CCCA--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TAAT-CAT-GGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCTA-TGAAGGCTGATGGAGA-G-------TCCCT-CA-AAA----GCAT-GGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATGCATCAGGTGGAC-AAGA-TA----GAACAGTCC-TTGATGGAACAATTACAG-AA--T----C-AAGA-TTCAACAT---T---TG--AT-GATTACAT---T-TCATA--TCT-CAATGAC--CT-CGTCAAAGAGT-TTC-ATGGC------TACAT-GTTTTCCCCAAA--GCTTGCAAATA----------T-AATTTCCAAT-CTTTCTAAGAA--ATTCTCAGAAA--TTCGA--CCCATAC-CA-GAA-ACAACAA----CAGTG-GTGACCCCA-AT--G-T-TTACT--GCTGGTCG----ATAT-A-GCAAAG---ATAATGTGGCCAAAT--TACTAGGG-----AAAATAAATGTG---AGGGATACCAA-----AGCAG-AGATGAG--AAAAAT-AAAA-CCC---ATGGAAATTGTCT-CTCCCTC----AACATCAGTGGA---ATCTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACGA-G--ATAAT--GATAAG--AAATCT-TATGT-G-AAAC-AAACAA--T--GCCCATAT-CTTCATATG-------TC-TCTGA---GTTTAGGGAGATATT-----TGTA-TT----TGTT-A-AA--G----AA-ATGA---CCCA---TATCTCCCTTGAT-AAAG--CAG---GCAAG---CTA-TGGG-TC-A-G-TGGC-AGTG--A---T-AACCT-TGTACAAA-CAG-A---CTTA--CA-AGGA-AAGC---AGCTGC---TGAG-----GATAAAGATCAGTAG-TG--GAT-CTGG----CT----ACCACACAGTCACA-CGGG-ACGGGGTG-CTC-ATC--TTAACAG--------ACAGA-T-ACAATAAAGTCATC-AACAA-G--ATAACACCG-GATCAT--AA------GATAAA-AAAGTTCT-TT-AGAACAGGA-AGCT-GGA-ACCCAAT-CAGCATA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-GTA-TG-ATA---------GGTAAGG-G----GGCCA-GAGT--CACAC-G--GTAC-----AAC-G--AGAAAGGGA-----AAGAACTACATAT-CATA-C---AAACAGATGA--TAAA-G-GACAG-AAACTATAT---AG-----cattgc
gi|5 : tcatttatTTCAAATCTCACTGCTCGAATTTCCAATAAATCCCCTCAAAGAGAATGTCA-TTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGT-AAGTACTTGTAAAAAAACAAAATCTCACATTTTACAGTCTAG--ACGTTGGTGAAT----GCGCTGTG---TCGGGTAAAATGATATTTTCAGGCATATTACTTTTT-GAAATGA----ATTCT--TGGAGTTTGGACATTGTCTACAT----------------------CTTCTACTGCAGTTAGTTGTTTCACGATGGCG-ATGGTGTATTTTTTAGT--ATTTATTAGA--GCAC-TTTCAAAAGTA-----------------TTACGA-CCC--GCACTTCC-TTAGGTGCGGGCATTCGAATGAGAG-CGAGCAGAAA--TTGTAGC---ATTTACTGCGCATTGCTTGGTCA-TCACCGAAATGT-GATAAACTAATGTCGAG-AGTA-AACA-CT--GAAGAGTCCAAGAATACAAAT-AGC--TGACAGTTTGGTTCTCTATT----ACAACATAAA------CAACAACTTCCTGCTGGAAAAAA-TGC-C-AAGGCCAC-GGCCAACTAAGTA-----GTTGAGAGAC--TAC-TG-TAGATGAAT-GC---C-AGTCTCCAATTT--GT-TT-CACAAA---TCG-TAC-AACACTGGTAGAGTCACTGTCTG--GGCTACTAAAATTTATAGAT------AG-G-CAATAC--TATC-------AAAGT-TATT-CTAACAATTTTTG-TCCATCGACGGAGAG----TTACAGATGGTCCATT-C-AATATTATCCT---TCAACAAACATCAACAAGAT-TTAAAGGAAGAGATCA----CAAA-GAAGAATGACGCGAACGGTA-AAT-AAATACTAGA-C-AC-TAT-GGCCAGGTTTCAGCTTCT-ATTTTAGATACATGCCATTGTAAGCCAACTGGGAGGATGTTTCTCTCT-CC-AAAT---ACAT-GGTGGA-CC-CAGTGGG-TGTCAGGAAAGTATAGAAC
gi|6 : A--TGTCCTCGG---T-CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------CCA---TATCGTGACAAAT---------------G-TG-------TT-CA--TCTTCT-A---GA-TC------AG-GACGGTCG-GTTCTTG----TC-ATT-ACT-A-CT-----CA-C--AA--AACAA-CAAGG--A--GTAGAAT---A-TCC-CT----ATAG---T----GTATGTGT--AGAT-G-ATG-AG-A--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATT--------AT--G---ACACAGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--T-ACA-GTGAG--TTCTCTTATTG-TCAATCAACACACTACCACACAGAGATTTCACAACTTGTGACCAATGAGATAATATTTTATGAAT-CT--ACAATTTAt
gi|7 : A---CTCCTCTCAC-ATTAAT-GGAGAC--ATA-CTAGTAGAG-G-TGGATA-AA---GATGGG-AAA-C----GG--A-AAGT--GATCA-G--ATAC-----AGCAA---GAGAGGAA-----AGAAGCTCCAAGA-AATT-C---AGAAGGATGA--TAAA-G-GACAA-GATCTATAC---TG-----T-ATCAT--AGGGTGCAT-CAC-AGAAA---ACATTAA-C----GGTGACATCTGTGTATC---C-GACCCTCT--TCGTAA-GAAGG-TG-G------TGGT--AGTGAC--CAGAT-TAGGA-CAG-TATCG-G-TTCT-C------TTAC--TTTGGTCATCCATTACAA-CCTG-GATT-CTA-TC-CA----AAC----AGAATGTGTA-----CAGA--TG-CCTTGGGAATT-------ATCTTGGTC-TG--TAGT-------TGT---GGT-G-G-TAGTAAATGTGAGACCTGGGG-TA-------TC-CA--CATGTT-T---GA-CC------AG-GACGGTCA-GTTCCTGAATTTC-CTC-ATC-A-CA-T---CA-C--AA--Aatgaatgaataaggctgatacaactatactagaaaatacacagtagagtgtatggaatccccataattaaccaaacaagttgctgattatatgtgcaagtttaactatgatttacagtcacttacattgttaagtatgcaaaacaacagtgtgtgacaatcaaaagatatctttaattatcctgtagctttcaatttacaatatctgaatatcacgatattactactaagagctagatttgaaaaaggtcttgtttatgaaataagattttagaaaataagattctccctttcagttttatataattcaattatttcttctttcattctacatttacaatagcatcctatggga
gi|8 : ct-TACAT--GTGAAT----G-GAT-TA---TCGGGTAATTTAATATTTTCAAGCA-ATGACTTTTT-G--ATAA----ATCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-GTATTGCCTACATTCTACTGTAAGTTT--------GCTAGTT-TTTCA-------GGATAGAATATTTTG---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCGTT-GAA-GATTGT-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACACCT--GAAGAGTCC-AGAAAACAAA--AACCATGA-AG--TGGTT--CTC-TATCTACAACGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAATG-TG--C-AAGGCC-C-ACCCAACTAAAGA----TATTGACATCC--T-C-TG-TA-ACAATT-GC---A-AAGTTTCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGC-AACACTGG-AGAtgcccagtgcggtctgcactgatgatcaacaaaacgtctgggttggaagttggaacag
gi|9 : GTCAAAATAT-TTC-ATGGT------CACCT-ATCCTCCAGAAA--CCTTACAATTA----------T-AATCCCCAAC-CTTTCTGAGAA-G-TTCCAGGAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-AAG-ACAACAA----AACCG-GTCACACCC-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGC-----AAAATAGAAAC------GGAAAACAA--ACCAGCAG-AGATGAG--AAAAAT-AAAT-CCC---ATGAAAATTGTCT-CCCCTTT----AACATTAGTGGA---CTCTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACAA-G--ACAAG--GATAAG--GAATCT-GATGTGG--AAC-AAACAA--T--GCCCCTAT-CTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GATCAGGAAG---TT-CAG-TGTA-CCGGG-TGTT-G-AA----------ACGG---TATTCCATATTTCACGAGAT-AAAT--CAG---GCA-A-ACTT--TGGG-TC-A-A-TGA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): ATATAATTCAACTCTCTTTTCATTCATTCTACATTTAATATAGCATCTATGGG
Alignments
lowQualScore : 1 11 1 2222 11 1 1 2222 111 11 11 11 222222 222222 11 1 1 11 2222 11 1 1 888888888888888888888888888888888888 333333333333 111111 2 888888888888888888 1 111 11 22 111111 11 1111 11111 1 1 1 444444444 1111 333333333333 3333333333333333 3333333 111111 111 2222222 1111 11111 222222222 1111 1 44444444 2222 111 22 33333333333333 111 11 222 11111 111 1111 11 333 2222222 3333333333333 33333 111 1111 11 11 1111 111 11 22222 2222222 111 11 111 2 1111 1111 111 1111 22 11 1 11111 2222222 111 111 555555555555555555555555 11 222222222 111111 111 3333333333 2222 11111 111 11111111111 11 11111111 22222222222 11 11 111 6666666666666666666666666666666666666 111 11111 222 11111 11 111 11 111 3333333 1111 111111 11111 2222222 11111111 222 1 444444444444444444444 222222 11 22222222222 111111 33333 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 111111 2222222 11 44444444444444444 1111 11111111 1 222222222222 11111111111 6666666666666666 22222222 2222 1 11 11 1 11 1 11
lowQualScore : 5 1 88 1 1 5 4444 88 5 5 4444 1 777 7 44 33 33 555555 222222 00 0 1 0 33 1111 33 0 0 2 333333333333333333333333333333333333 8 5 666666666666 1 0 666666 0 6 1 666666666666666666 6 6 5 0 77 5 5 0 8 0 5 77 1 1 000 77 1 5 5 1 5 5 5 5 0 5 5 5 0 77 1 5 1 33 1 1 66 99 1 6 66 3 1 999999 0 6 6 77 5 33 5 5 5 1 0 0000 0 1 00000 5 999 1 5 88888 1 66 66 5 5 888 5 5 1 5 1 1 2 5 222222222 6 99 1 4444 666 111111111111 6 1 6 4444444444444444 6 3333333 6 1 888888 5 000 77 5 5 2 5 1 0 5555555 6 3 6 6 1111 0 6 6 6 66666 6 1 6 6 666666666 6 4444 6 6 3 55555555 6 6 0000 6 6 6 6 6 6 1 33 4 888 1 99 11 3 66666666666666 8 8 444 11 0 222 11111 0 444 7777 11 8 8 000 1 6 6 2222222 1 6 1 99 1 77 1 0000000000000 6 44444 3 888 99 6 88 6 7777 8 0 8 11 8 8 11 0 7777 8 8 444 1 11 1 00000 0 5555555 0 111 3 8 6 3 11 8 8 444 11 0 0 7777 3 5555 8 444 1 8 2222 55 11 8 5 88 8 33333 8 1111111 6 000 555 5 77 5 3 5 888 555555555555555555555555 1 1 1 5 11 3 888 777777777 5 5 5 5 5 0 111111 5 5 5 5 555 77 2222222222 0000 44444 1 8 5 77 000 99999999999 4 5 5 0 5 5 11 0 88888888 666 4 4 66 0 4 22222222222 00 5 77 5 5 11 222 6 66 777 7 4 0 55 4 4 6666666666666666666666666666666666666 66 222 66 22222 000 22222 11 5 777 1 22 77 4 8 55 222 4444444 7777 2 5 88 4 888 3 333333 5 5 77777 6666666 1 6 1 6 6 33333333 99 1 99 6 6 666 6 5 1 444444444444444444444 000000 8 6 55 6 99999999999 888888 66 44444 8888 44 66 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 8 55 1 0 99999 4 555555 4 5 8 8888 55 4 4 8888888 4 11 55 8 4 1 44444444444444444 4 0000 99999999 3 66 0 77 888888888888 5 2 99999999999 7777777777777777 0 44444444 1 5 5 6666 3 33 1 33 5 1 88 1 1 22 1 5 88
lowQualScore : . . .. . . . .... .. . . .... . ... . .. .. .. ...... ...... .. . . . .. .... .. . . . .................................... . . ............ . . ...... . . . .................. . . . . .. . . . . . . .. . . ... .. . . . . . . . . . . . . . .. . . . .. . . .. .. . . .. . . ...... . . . .. . .. . . . . . .... . . ..... . ... . . ..... . .. .. . . ... . . . . . . . . ......... . .. . .... ... ............ . . . ................ . ....... . . ...... . ... .. . . . . . . ....... . . . . .... . . . . ..... . . . . ......... . .... . . . ........ . . .... . . . . . . . .. . ... . .. .. . .............. . . ... .. . ... ..... . ... .... .. . . ... . . . ....... . . . .. . .. . ............. . ..... . ... .. . .. . .... . . . .. . . .. . .... . . ... . .. . ..... . ....... . ... . . . . .. . . ... .. . . .... . .... . ... . . .... .. .. . . .. . ..... . ....... . ... ... . .. . . . ... ........................ . . . . .. . ... ......... . . . . . . ...... . . . . ... .. .......... .... ..... . . . .. ... ........... . . . . . . .. . ........ ... . . .. . . ........... .. . .. . . .. ... . .. ... . . . .. . . ..................................... .. ... .. ..... ... ..... .. . ... . .. .. . . .. ... ....... .... . . .. . ... . ...... . . ..... ....... . . . . . ........ .. . .. . . ... . . . ..................... ...... . . .. . ........... ...... .. ..... .... .. .. .................................................... . .. . . ..... . ...... . . . .... .. . . ....... . .. .. . . . ................. . .... ........ . .. . .. ............ . . ........... ................ . ........ . . . .... . .. . .. . . .. . . .. . . ..
lowQualScore : 0 0 55 0 0 5 0000 00 5 5 0000 0 777 3 00 22 88 222222 222222 22 0 0 0 88 2222 88 0 0 5 444444444444444444444444444444444444 0 6 888888888888 0 8 000000 4 7 7 777777777777777777 7 7 7 4 11 7 7 3 6 7 7 99 7 0 000 99 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 1 99 7 7 0 66 7 4 00 22 7 7 33 7 0 222222 7 7 7 44 7 66 0 0 0 0 1 6666 8 4 22222 0 000 0 0 99999 0 99 99 0 0 888 0 0 7 4 4 0 1 0 333333333 7 22 0 0000 888 777777777777 7 0 4 6666666666666666 7 0000000 4 0 333333 7 000 99 7 7 3 7 0 1 3333333 7 5 7 7 2222 7 7 7 7 77777 7 0 7 7 777777777 7 2222 7 7 3 00000000 7 7 8888 7 7 7 7 7 7 7 55 2 333 0 22 44 8 22222222222222 0 0 222 00 8 000 44444 8 000 4444 00 0 0 000 0 7 7 8888888 0 7 0 22 0 00 0 3333333333333 7 00000 7 333 22 7 22 7 0000 0 6 0 00 0 0 00 8 0000 0 0 000 4 00 0 00000 8 6666666 8 888 2 0 0 8 00 0 0 000 44 6 0 0000 2 0000 0 000 4 0 2222 44 00 0 0 88 0 00000 0 7777777 7 000 777 7 00 7 0 7 333 666666666666666666666666 0 3 0 0 99 1 888 444444444 0 0 0 0 7 6 000000 7 7 7 7 777 99 7777777777 6666 33333 0 9 7 99 333 00000000000 3 0 0 8 0 0 99 2 11111111 222 4 4 11 1 4 66666666666 00 7 00 0 0 66 777 3 11 000 3 0 7 55 0 0 1111111111111111111111111111111111111 99 444 99 55555 000 55555 55 0 555 0 22 11 4 9 44 222 4444444 0000 2 6 33 4 888 2 666666 9 2 33333 7777777 0 7 0 7 7 00000000 22 0 22 7 7 222 7 5 0 000000000000000000000 444444 0 7 88 7 33333333333 333333 11 55555 5555 66 11 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 55 0 7 00000 0 555555 0 7 9 5555 00 0 0 5555555 0 00 55 9 4 0 00000000000000000 4 6666 11111111 2 99 0 00 555555555555 0 5 66666666666 3333333333333333 7 22222222 0 7 7 3333 3 88 0 33 0 0 00 0 0 00 0 5 00
consensus : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GCTAGTT-TTTCA-------G-ATGGAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCTG--AAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTC-CT-TTACCAACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-T-G--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATGC--T-CTG-TA-ANGANT-GC---C-AANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCCGGAGGC-AT--AAATTTATNGATTT--AGAG-A-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGAT----TT-CAGAAGGTCCA-T-C-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CTCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGAT-CAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCAT-GGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC---AANAT--AGAAAAGTCCGTTGTTAGAAGAANTACAGCAA--T-AGCC-AGG-AT--GACA--CAT---TG--AA-GATTAT---ATTGTCATA--TCT-CCATGACT-TT-CGTCAAANAGT-TCC-ATGG------CTNCCT-ATCCTCCNCAA--AGNTCGCAANT----------NT-AATT-CCCAAACTTTCTGAGAA-GATTCCCGGAAA---TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAAC----AAAACC-GGTCACCCC-AGT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAA---CGAGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAA-TAAAA-CCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTT----AGCATCAGCGGA---NTCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAGGAGATAAG--AAATCT-GATGTGG-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTAT-CTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTA-TCGGG-TGTT-G-AA--G---TTT-ATGG---CAT----TATNTCACTNGAT-AAAT--CGG---GCAGG-ACTTC-TGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCCAAA-CAG-A---TCTA--CAGGGGA-AATCTG-ANCTAC---GGAA-----GATANAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG----CT----NCCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGACACCCANT-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATG-AA---GACGGT-ATN-G----GGCTA-AAGT--CACNC-G--GTAC-----AGCAA--AGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CATA-C---AGAGGGACGA--CAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-----CGATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-T-AGTTGGT--GGTGAA--CAAAT-CAGGA-CAA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACGAG--GTTCAGAAAGA-TCAG-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-NCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CANGG-CA--GTACGGC---G-TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CG-AGGA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--TTACA-GTGAG--TCCTCTTANTGGTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
Reference ( family-437 ) : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GCTAGTT-TTTCA-------G-ATGGAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCTG--AAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTC-CTCTTACCAACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-T-G--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATGC--T-CTG-TA-ACGANT-GC---C-AANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCCGGAGGC-AT--AAATTTATNGATTT--AGAG-A-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGAT----TT-CAGAAGGTCCA-T-C-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CTCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGAT-CAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAGG-------TCTCT-CA-AAA----GCAT-GGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC---AANAT--AGAAAAGTCCGTTGTTAGAAGAANTACAGCAA--T-AGCC-AGG-AT--GACA--CAT---TG--AA-GATTAT---ATTGTCATA--TCT-CCATGACT-TT-CGTCAAANAGT-TCC-ATGG------CTNCCT-ATCCTCCNCAA--AGNTCGCAANT----------NT-AATT-CCCAAACTTTCTGAGAA-GATTCCCGGAAA---TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAAC----AAAACC-GGTCACCCC-AGT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAA---CGAGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAA-TAAAA-CCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTT----AGCATCAGCGGA---NTCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAGGAGATAAG--AAATCT-GATGTGG-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTAT-CTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTA-TCGGG-TGTT-G-AA--G---TTT-ATGG---CAT----TATNTCACTNGAT-AAAT--CGG---GCAGG-ACTTC-TGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCCAAA-CAG-A---TCTA--CAGGGGA-AATCTG-ANCTAC---GGAA-----GATANAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG----CT----NCCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGACACCCANT-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATG-AA---GACGGT-ATN-G----GGCTA-AAGT--CACNC-G--GTAC-----AGCAA--AGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CATA-C---AGAGGGACGA--CAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-----CGATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-T-AGTTGGT--GGTGAA--CAAAT-CAGGA-CAA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACGAG--GTTCAGAAAGA-TCAG-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-NCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CANGG-CA--GTACGGC---G-TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-CG-A-CG-AGGA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--TTACA-GTGAG--TCCTCTTANTGGTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
gi|1 : TTTAAATCTCACTGCT-GCATTTCCAA--AGTCCCCTCAAATAGAAAGCCATTTGTCATTT----TG--GGTCAAACACAGAT-ATTGTAAAGTACT----GAAAAACAACATCTCA-A-TT-AC-GTCTAGATACAA--GTGAAT----A-GCTATAAAATCAGGTAAAG-AACATTTTCAAGCA-ATGACTTTTTTG--ATAATTAAGTCCT--TGGAATAT-GATA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GTTAGTT-TTTCA-------GTATGGAGTATTTTT---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TT-CAAAATTA----------------G-TAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--T-GTGAA---TTTTATT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGTCGAG-A-TA-AACATCTG--AAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-AG--TG-TTC-TTCTTATTTGCAGCGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAAAAGT-G--CGAAGGCC-C-ACCCAACGAAAGA----TATTGACCTTT--T-TTG-TA-ATGAGT-GC---CCAAGTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-GATACAAACACTGGAAGAGTCAT--TTCTGGGCC-AT--AAATTTATAGATTTTAGGAGGA-CAAT-C--TATT---CAGAAAAGT-TATCACTA--------T--TTCA-AGA-GGAGGTC---TT-CAGAAAGTCCA-TTC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAGGAT-TTAAAGAAAGA--T------CAAA-GAAG-ATG-CTGG--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TGATTCAT-GGACAG---------TCT-A----AAA-ACA-GCCA-TGAAG-CTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCATTGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACAAGTAAAC---AATAT--AGAAAAATCCATTGTTAGGAGGAG-ACAAAAA--T-AGCC-AGG-AT--GACA--CAT---TG--AA-GATTAT---ATTGTC-TA--TCT-CCGTGACT-TT-TGTCAAAGAG---CC-ATGG------CTTCCT-ATCCTCTTCGA--AGATCACAGAC----------TT-AATT-CCCAAACTTTTTGAGAG-GAAACCTGAAAAA--TCCGA--TCCATAC-CC-AAG-ACAAC----AAAACC-AGTACCCCC-AGT--G-T-TTACT--GC-GGTCA----TTAC-A-GCAAAG---ATGATGTTGTCAAAT--TACTAGGG-----AAGGTAGAAA---TTAGAGAGACCAA--ACCAA-AG-AAA---G--AAAAA-TAAAAACCT---ATGGAG--TGGCTGCTCCTTC----AGTAGCACCGAA---ATCTAC-AAGCAG---GCAGATG-AAACAA-G--ACAGGGAGATAAG--AAATCT-GATGTTG-AAA----ACAACTT--GTCTCTATTCTCCCTCTG-------TC-ACTGA---GGTCTGGGAG---TT-TAG-GGTA-TCTGG-TATT-ACAA--ACTTTTT-ATGG---CAT----TATATCACTTGAT-AAATT-CAG---GCAGG-ACTTCCTGGG-CC-ATG-TGAC-GTAG--A---T-AACCT-TGTCCAAAACAG-A---TTTA--CAGGGGG-AATCTG-ACCTACTTTGGAA-----AGTAAAAACTA-TGG-TG--GAT-TTGG----GT----TCCACA-AGTCACA-CAGG-ATGGGTTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAAA-G-CAAATAAAGTCATC-AATAGTG--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TG-AAAA-AGGG-GACT-GGACACCCACTTCAGTATA--CA---CTGCCTCCAC-ATCGAA-TGAGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATA-AA----ACGGT-AAACA----GGCTA-AAGT--CACCC-G--ATAC-----AGCAA--AGACAG-AA-----AAGAACTACAGAA-CATAAC---AGCGG-ATAA--CAAT-G-GACAG-GGACTTTAT---AG-----CAATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGGAA---ATATGAA-T----GGAGATATCTGCACATC---A-GAC---CT--TAATAA-AGAGG-CA-G-TTAGTTGGT--GTTGAA--TAAATTCAGGA-CAAACACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACAAG--GTTCAGAAAGG-TCAA-GGTT-CT--TC-CC----CGG----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCTTCAG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------TAC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TT-CA--CTTCTT-A---GATTC------AG-GACGGTC-GGTTCTTG----TCAATT-ACT-ACCTC----CA-C--AA--AAC-AACCAAGC-CA--GTACAGC---G-TCC-CC----GTTG---T----CTGTGTGT--AG-ATTG-A-TGAAGAA--AC-AATCTCTAT-TA------GA----AATA--------TG--G---ACACAGT--------GACAGTGC-ATAGCGTATCTGTTACAGGTGAG--TCCTCTTACT-GTCAATCAA-ACATTGCCTCAC--AGATTTCACAGCTTGTGACCATTGAGATTATATTAAAAGAATACTAGACAATTTA
gi|10 : AAACAAAA-GACT-GG-CAACCAAT-CAGCGTG--CA---TTCCTCTCAC-ATTAAC-GGCGAC--ATA-CTGGTGG-G-G----ATG-AA---G-------T---------CTA-AAGT--CACTC-A--GTAC-----AGCAA---GACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CATA-C---AGAAGGACGA--CAAA-G-GACAG-GACCTGTAT---AG-----TGATC-C--ACACTACAT-AAC-AGAAA---ACACCAA-C----GAGGATATTTGCGTATC---A-GAT---TA--TAATAAGACAGGCCG-G-T-AGGTGGT--GTTTAA--C-AAT-CAGAG-C---TACAGTGTTTTTTCGCCTAATTAC--A-GAG----TCAG--AGATTCAGAGAGT-CT--TTACC----TACAGCGGAAATATGT------CTGACCTGTTGTTGG----CCAC----ATAGTGATA-TGGTTGATTATTTAAGCC---TAT---TACAAT---------------------------TC-TA--CT--CT-T---GA-CCT-----AG-GATGGgcccacgcgaataa
gi|11 : tcATCTCA-A-TTTACA-TCTAG-TACGT--GTGAATTAATG-GCT-TA---TCGAGTAAATGAATATTTTCAAGCA-ATTACTTTTT-G--ATAT----GTCCTAATGGAATTT-GACA-TGT-----------------------------TT--------GCTAGTT-TT-CA-------G-A----GTATTTTT---TGTATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGC-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATT--GCAATTCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCTG--AAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-gc
gi|12 : cCAACACTCTTATAGAGTGT-GCCA-------GGCTGCC-ACCA--AA--TACTCAAAAGTTCTATT--GCACGACTG-TTCAGCCAGC-AAATGT-G-TGAAC-AACACAAGG-A-TATCACATCCGGGAAGA---C-AAAAAACAAA--A--C-TGA-TG--TGGTTC-TT--TACCAAGAA-GAATA------CAAGAATTGCCAA-CAG-AGGAA-TTGTCC-AA--TC-C-ACCCCAA-AAGGA----CCTTAAAATTT--A-CTG-CA-AAGAAT-GC---C-TACTCCCA--AT--CTGTT-CC-AAA---T-G-tg
gi|13 : -AAAT--CAG---GCAG--ACT-C-TGGG-CC-A-G-TGAC-TGGC--A---T-AACCT-TGTCGAAA-CAG-A---TCTA--CAGGGGA-A-TCTG---CTAC---AGGA-----AATAAAAAACTATGG-TG--GAC-ATGG----GT----TCCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-CAAATAAAGTCATC-AGTAG-G--ATTACGCAG-GATAAT---A-----CTATCAC-AGAATTCA-TG-AAAACAGGG-GACT-GGG-AACCATA-CAGCATA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-GATG-GTG-Acttaccaccaaccacaacagtcaccaagtagccttgatcttgagtaatc
gi|14 : CTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGAAG---TT-CAG-TGTG-CCGGG-TGTT-A-AG--G-------A-GG---CATCCCATATTTCATTAGGT-AAAC--AGG---GCAA--ACTG--TGGG-TC-A-G-TGATATTAGTGG---T-GACCT-TGTCCAAA-CAG-A---TCTA--CAGGGGA-A--CC--AGCTAC---AGAA-----GATACAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG----CT----ACCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATC--TTTACAG--------ACAGA-G-ACAATAAAGGCATC-AATAA-G--ATAACA-AG-GA
gi|15 : A--CGTCCGCGA-----CAC----GTACTGGTT-TG--TGAT-------GACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGA-TC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC-TCG-ACT-GC--TGGGACA-CGAAA--AACAAA-CATGGATA--ACACAG-------TC-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGAA-CGTA-CG--GCATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATATC---TACA-atactcatagcaaaacaatcat
gi|16 : A--CGTCCGCGA-----CAC----GTACTGGTT-TG--TGAT-------GACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGA-TC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC-TCG-ACT-GC--TGGGACA-CGAAA--AACAAA-CATGGATA--ACACAG-------TC-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGAA-CGTA-CG--GCATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATATC---TACA-
gi|17 : ACAAGTAAAC---AAAAT--AGAAAAGTT-GTTGTTAGAAGAG--AC--CAA--T-AGCC-AGG-AT--GACT--CAT---TG--AAAGATTAT---ATTGCC-TA--TCT-CCATGACT-TT--GTCAAACAGT-TCC-ATGG------CTTCCT-ATCCTCTCCAA--CGATCACTGCT----------CT-AATT-CAAAAACTTTTTGAGAAGGA--CCTGAAAA---TCCGA--TCCATAC-CC-GAG-AC
gi|18 : TCGG---T-CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------TTC-------G-G----TA---------------C-TG-------TT-CA--TATCCT-T---GA-TC------AG-GATGGTC-AGTTCTTG----TC-TCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AGA-AA-CAGAA-CA---TAC-AC---GATCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-C--AAGA--AC-AATCTTTATGTTG-----GACAACGATA--------CACCA---ACACAGT--------GACAGTGT-ACAA-ATA
gi|19 : GTCCA-T-C-AATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAAAC-TTAAAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CT-G--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TGAT-TAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCAT-GGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACTAGTAAAC---GAAAT--AGAAA
gi|2 : A-GGAGGTGTTTTT-CAAAGGTTCCA-T-CAGATATG-TCTTGTTTC--A-AACATC-ACAAGATGTTATA-AAGGAAATGATATTCAAATGAAG-ATG-CTGG--CGG-A-AATGAA-----AGAATGAT-CATTGGATCG---------TCTTA----AGA-ACA-GCCAATGGAAGCTGATGGAGAGG-------TCTCTGCATAAATTAGGCAT-GGTGAATCAGCAGT-GGATGTCA-G-AAATATTGAACAAGT-AACAGGAATATCAGGAAAAGTTGGTTGTGAGAAGAAG-AGAGCCAGCTGAGCC-AGGAAT--GAAACTCATG--TGGAAA-GATTGTATAATTGCGCTAAGTCT-CCATGACTGTTGTGTCAAACAGTGTCCGATGGTGGGCTTTCCCTCATCCTCTACAAACAGAT-GCAACTGGGGCGCTGCTC-AATTGCAAAAACTTTTTGAGAAGGA--CCCTGAAAGATTCCGGATCCCATACGCGCGAGTACAGTAATGAAAACCAAGTCCCCCCAAGTCAG-TATTACTTCGCTGGTCATTGGGTATCACGCAAAGGGAAGAATGTTGTCAAAGGATACTGAGGGTGAAAAGATAGAAAATTATAAGGAGACCAATTACCAATAGTAAAAGTA--AAGAATTAAAA-CGCTAAATGGAAAGTGGCTGCTCCTTTAGTGAGCAT--GCGGAAATGCTTACAAAGTAAGGTGCGAATGAAAACAA-ATTACAAGGAGATAAGATAAATCTGGATGTGGAAAACAAAACCA--TTGGTCTCTAG-TGTCCTCTAGTACAGTTT-ACTGAATTGGTGAGGGAGA--TTGCAG-GGTATTTGGG-TGTT-G-AATCGT--TTT-ATGGGCATAT----TATCTCCGTTCAT-AAATGCCGGACCGCAGGAACTTC-TGGC-TCGA-GTTAAC-TTAG--A---TAAACCTGTGTCCAAA-CAGTAT--TCTAAGCAGGGGATAGTCTT-GCTTACAA-GGAATTATTAAGATAAGCTA-TGGTTG--GAC-TTGGGATTCTCTAATTCACA-AGTCACAGCAGGTATGGGGTTACTGTATCT-TTAGCAGAGCGAATCACAAATT-AAGATATAGTCATCGAATTA-GGTATAACACAATGGTGAC--AAATACTCTATCACAAGAATTCA-TTAAAAACAGGACGACTGGGATACCAACTGCAGCATATTCATCTCTCTGCCCAC-ATCAACTGGGGACAGATATCTGGTGG-G----G-ATGTAATTGGAC--T-ATA-G----GACTACAAGT--CACTT-GCCGTATTATCAAGCAATTAGACAGGGAACATGAAGAACTACAGAATCATA-C---AGTGGGATAA--CAAGTGTGATCG-GA-CTGTATG--AGTATGCCAATC-------CTACATGCACTAGAAAAAGATATAAAGCTGGAGGTGATATCTGATTAGCAATA-GATG--CTGCTGGTAA-AGAGG-CGAG-T-AGT--GTTAGGTTAAAGTAAAT-CAGGACCAATCACA--GTTTCTCC------T-----ACAAA--GGTCAG-AAGA-TCAG-GGTTGCTGATC-GCGTGTAAT----GGAATCCGTGGTAGCCTGA--TGTCCTCGG----TCACGAGTATCCTGGTGCTG--TGATAG-----ACC---AAT-T-GACGATT---------------GTTG-------TT-CATGCTGCTTAA---GA-TTCAAATGAA-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-ATTAACTGACG-T----CA-C--AAGGAAC--A-CAAGG--ATTGTA-GGCGTTG-TCC-GCTTGTGTAG---TTCTAGTGTGTTTCAAG-A-TG-AGTG-A-GA--ACAAATCTCTAT-TAGTTAGTGA----GATA--------GG--G---ACACAGTTCAAGTGAGATAGTGTAATAG-GTACT--CTACATGTGAAGTTTCTCTTAATGGTCAATCAA
gi|20 : ctctgtgca--CA---CTCCTCCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CTTGTGG-G-G-------------AATGTT-ATT-G----GG----GAGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAGG----TA-TTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG------AATC-CCAATG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|21 : --CA---CTCCTCCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CTTGTGG-G-G-------------AATGTT-ATT-G----GG----GAGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAGG----TA-TTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG------AATC-CCAATG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|22 : -AAGGCC-CCAACCAACTAAAAAGGAATATTGACATGCACT-CTGGTA-ACAAATTGCAGAT-AAGTTTCA--TTTTGTGTT-CA-AAAAATT-G-TGCAACAACTGG-AGAGTCATA-TTTGG--GC-AT--AAATTAATAGATTT--AGAG-AGCAAT-TGATATTCAGGGGAAAAGT-TATC
gi|23 : gca-T-G--C-AAGGTC-C-ACCCCACTAAGGA----TATAGACATGC--C-TTG-TG-TAGATT-GC---C-AGCTTCCA--AT--ATGTT-CC-AAA---T-G-TTC-AACACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGC-AT--GAACTTGTTGATTT--AGAG-A-TAAT-C--TATG---AAGAAAAGA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGA
gi|24 : CTAC---AGAA-----GATACCAACCAATGG-TGAAGATGAAGG----CT----ACCACACCGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATG--TTTGCGG--------ATAGT-G-ACAATAACGTCATA-AATAA-G--ACAACATCG-GATAAT--AA-----TG
gi|25 : ---GGTCAGGGAG---TT-CAG-GGTA-TTGGG-TGTT-G-AA--G---TTTTATGG---CAT-----ATATCCCTTCAT-AAAT--CCG---ACAG--ACT-C-TGGG-CC-A-G-TAAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCCAAA-CAG-A---TCTA--CAGGGGtc
gi|26 : ctatTCACA-CAGG-ATGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------AAAAA-G-CAAGTAAAGTCATC-AAGAG-G--ATAACACAC-GATAAT---A-----CTATCAC-AGGATTCA-TG-AAAACAGGG-GACT-GGACACC
gi|27 : ACAT-CGC-AGAAA---ACATCAA-T----GGTGATGTCTGCGTGTC---C-GAC---TA--CAATAA-ACAAG-CT-G-T-AG-TAGT--GGTAAA--TAAAT-CAAAT-CAC-CACAG-G-TTCTCC-------TAC--A-GAG--GTa
gi|28 : GTTCTTG----TC-ATT-ACT-AC--T----CA-C--AC--TAC-AA-CACGG--A--GTACGGT---T-TCC-CT----ATAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-TG-A-GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GAAA--------TG--T---ACACca
gi|29 : gAATAAAGTCATC-AATAA-A--ATGGCACAG-AACAAT--AA------AATTAA-AAAGTTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGGCACCCA-T-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATTAA
gi|3 : TCAGATGGCACATTCCAAAACTGTAGCGTACCAAATATGGGTAC-AACCCCAGCACTTTT-TAGAATGT-GGCATC-GAA-GATTGC-GAG-AG-AAAATTGTCAA---CCTTACT--GCAATCCTT-GCCA-TC-GC-AGATGTTG-TCAAC-AATGCACAGCA-CG-AGCATCTG--AAGAATCC-AGATTACAAAGAAACCATGA-GG--TGGTCC-CT--TACCAACAACGAAAA------CGACATCTTCCTG-TGG-AAAA--T-G--C-AAGATC-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGACATGC--T--TG-TG-TGGATT-GC---C-AGCTTCCA--TT--ATGCTACA-AAA---T-G-TTTCAACACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGC-AT--GAACTTGTTGATT---AGAG-A-CAAT-A--TAGAA--GAAAAAAAA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGAGAT----AT-CA-AAGGTCGA-C-A-AGTATT-TTCT---TC--C-CACATC-ACA-GAT-TTACAGAAAGAAAT-------AAA-GG-G-ATG-CCCA--CAG-AGAAT-AA-----AGA-TGAT-CCA-AGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTG-TGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCAT-GGTGGA-CA-CAGT-GG-TATCA-GAAA-TATC-AACAAGTGGACT--AATA---AGAACAGTC-ATTGCT-GAGAAATTACAG-------AGTCGAAG-AT---ACA--CATATTTG--AT-GAT-AC---ATT-TCATA--TCTTCCATGACC-T---GTCAAAATAT-TC--ATGG-------TAACT-ATCCTCCACAA--AACTTACAATC----------ATTAATT-CCCAAACTTTCTGAGAA-G-TTCCAGGAAA---TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAAC----AAAACC-GGTCACACC-AGT--GTT-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGG-----AAAAT-GAAG---CGGAAAAG---AA--ACAAGCGG-GGGTGCGGAAAAAA-TAAAA-CAC---ATGGACATTATAT-CTCCTTT----AGCATCAGTGGA---CTCTAC-AAGTAA---ACGAAAG-AAACAAGG--ACAAG--GATAAG--GATCTT-GATGT-G-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTAT-CTTCCTCTG-------TTCACTGA---GGTCA-GGAA---TT-CAGTTGTA-TCAGATTGTTAG-CA--G---TGC-ATTC---CA-----TATTTCACTAGGTAAAAT--CAG---GCA-A-ACTTA-TGGATTC-A-G-TGAT-TTTG--ATGGT-AACCT-TGTCC-AA-CAG-ACAGTC-A--CTGAGGA----CTGCAACTAC---AAAA-----ATTACGAACCAGTGA-TG--GAT-ACGG----CT------CACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAC-CTG-ATCTTTTA-CAG--------AC-GA-GAAAAATAAAGTCATC-AATAA-A--ACAAT---G-GGTAATCAAA-----AGA--A--AAAATTCATTT-CAAACAAAA-GACT-GGA-AACCAAT-AAGC-TA--CA---CT-CTCAC-C-ATTAAC-GGGAAC--ATA-CTGGTGG-G-A-TG-AGG-AA---G--GAT-ATG-GGTGAGGCTA-AA-TCACACTC-G--GTAC-----AGCAA----ACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CATA-C---AGAGGGACGA--CAAA-G-GACAG-GACCTGTATTAGAG------GATC-C--ACACTA-AT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GG-GATATTTG-GTATC---ACGAC---AT--ATATAA-AAAGG-CA-GTT-AGTGCGT--GGTGAA--CAAAT-CAGGA-C---TACAG-G-TTCTCC-------TACAAACG------TCAGAA--G-TTAA-GATT-TA--TC-CC----TTT----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG----TCAT----CTCCTGGTG-TG--TGAT-------------------GAAAACA---------------G-TGAAACAATTT-CA--ATTTCT-C---GA-T-------AGTGAGGGTC-A-TTCTTG----TC-TCT--CT-AC--T----CA-C--AA--AGA-AA-CAGAA-CAT-ATAC--T---A-TCCACC----G-AG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CG-A-GA--AC-AATCTTTATGTAG-----
gi|30 : t-CA--CCTGCT-G---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCCCG----TC-TCT-ACT-GC--TGA--CACC--AG--AAC-AA-CATGG--A--ATACACC---A-TCC-Ca
gi|32 : AGGTTCA-C-G-AATATT-TCCT---TC--C-AACTTC-ACAGGAT-TTACAAAAACAAGT------atg
gi|33 : -CT--TC-CC----TAT----GGTATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG----TCAC----ATCCTG
gi|34 : CTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G----A-ATG-AG---GA
gi|35 : A--CAAT-G-GACAG-GGACTGTAT---GG-----GTATC-C--ATGCTACAT-CAC-atga
gi|36 : aGTGT-ATAG-GTATC--T-ACA-GTGAG--TCCTCTTA
gi|4 : -AT----------------------TTT---------CTA--T-TTGTA-------G-A--GAGT----CC---T--ATTTATCAAATGGCAC-ATTCCAAACTAAGTGTACCAAGCCTG-GGTAC-A-CCCCAGCATTTTA-TAGAGTGT-GACATT-GAC-GAATGC-GAGAGG-AA--TTGTCAG---TTTTACT--GCAATTCTT-GCCA-TCTGC-AGATGT-G-TGAAC-AATGCAGAG-A-GG-AACATCTG--AAGAATAC-AGATTACCAG--AGCCATGA-GG--TGGT-C-CT-TTACCAACAACGAAAAACGAAACGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-T-G--C-AAGACT-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGATATGC--T-TTG-TG-AGGAAT-GT---C-AAATTCCA--CT--ATGTT-CC-AAG---T-G-TGCAA-CACAGGCAGA-TCAT----CGG-GGC-AT--AAATTCATTGATCT--GGAG-A-CAAT-C--T--T---GAGGAAAATATAGCACTT--------CGCCTCA-AGA-AGATAT----C--CAAAA--TCCA-A-G-AATATT-TCCT---TC--C-GACATC-ACAAGAT-TTACAGAAAGAAAT------TAAA-GGTG-ATA-CCCA--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TAAT-CAT-GGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCTA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCCCT-CA-AAA----GCAT-GGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATGCATCAGGTGGAC---AAGAT--AGAACAGTCC-TTGATGGAACAATTACAG-AA--T----C-AAG-ATTCAACA--T-T---TG--AT-GATTAC---ATT-TCATA--TCT-CAATGACC-T--CGTCAAAGAGT-TTC-ATGG------CTACAT-GTTTTCCCCAA--AGCTTGCAAAT----------AT-AATT-TCCAATCTTTCTAAGAA--ATTCTCAGAAA---TTCGA--CCCATAC-CA-GAA-ACAAC----AACAGT-GGTGACCCC-AAT--G-T-TTACT--GCTGGTCG----ATAT-A-GCAAAG---ATAATGTGGCCAAAT--TACTAGGG-----AAAATAAATG---TGAGGGATACCAA-----AGCAG-AGATGAG--AAAAA-TAAAA-CCC---ATGGAAATTGTCT-CTCCCTC----AACATCAGTGGA---ATCTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACGA-G--ATAAT--GATAAG--AAATCT-TATGT-G-AAAC-AAACAA--T--GCCCATAT-CTTCATATG-------TC-TCTGA---GTTTAGGGAGATATT-----TGTA-TT----TGTT-A-AA--G----AA-ATGA---CCCA---TATCTCCCTTGAT-AAAG--CAG---GCAAG---CTA-TGGG-TC-A-G-TGGC-AGTG--A---T-AACCT-TGTACAAA-CAG-A---CTTA--CA-AGGA-AAGC---AGCTGC---TGAG-----GATAAAGATCAGTAG-TG--GAT-CTGG----CT----ACCACACAGTCACA-CGGG-ACGGGGTG-CTC-ATC--TTAACAG--------ACAGA-T-ACAATAAAGTCATC-AACAA-G--ATAACACCG-GATCAT--AA------GATAAA-AAAGTTCT-TT-AGAACAGGA-AGCT-GGA-ACCCAAT-CAGCATA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-GTA-TG-ATA---------GGTAAGG-G----GGCCA-GAGT--CACAC-G--GTAC-----AAC-G--AGAAAGGGA-----AAGAACTACATAT-CATA-C---AAACAGATGA--TAAA-G-GACAG-AAACTATAT---AG-----cattgc
gi|5 : tcatttatTTCAAATCTCACTGCTCGAATTTCCAATAAATCCCCTCAAAGAGAATGTCA-TTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGT-AAGTACTTGTAAAAAAACAAAATCTCACATTTTACAGTCTAG--ACGTTGGTGAAT----GCGCTGTG---TCGGGTAAAATGATATTTTCAGGCATATTACTTTTT-GAAATGA----ATTCT--TGGAGTTTGGACATTGTCTACAT----------------------CTTCTACTGCAGTTAGTTGTTTCACGATGGCG-ATGGTGTATTTTTTAGT--ATTTATTAGA--GCAC-TTTCAAAAGTA-----------------TTACGA-CCC--GCACTTCC-TTAGGTGCGGGCATTCGAATGAGAG-CGAGCAGAAA--TTGTAGC---ATTTACTGCGCATTGCTTGGTCA-TCACCGAAATGT-GATAAACTAATGTCGAG-AGTA-AACA-CTG--AAGAGTCCAAGAATACAAAT-AGC--TGACAGTTTGGTTCTCTATT----ACAACATAAA------CAACAACTTCCTGCTGGAAAAAA-T-GC-C-AAGGCCAC-GGCCAACTAAGTA-----GTTGAGAGAC--TACTG-TAGATGAAT-GC---C-AGTCTCCAATTT--GT-TT-CACAAA---TCG-TAC-AACACTGGTAGAGTCACTGTCTG--GGCTACTAAAATTTATAGAT------AG-G-CAATAC--TATC-------AAAGT-TATT-CTAACAATTTTTG-TCCATCGACGGAGAG----TTACAGATGGTCCATT-C-AATATTATCCT---TCAACAAACATCAACAAGAT-TTAAAGGAAGAGATCA----CAAA-GAAGAATGACGCGAACGGTA-AAT-AAATACTAGA-C-AC-TAT-GGCCAGGTTTCAGCTTCT-ATTTTAGATACATGCCATTGTAAGCCAACTGGGAGGATGTTTCTCTCT-CC-AAAT---ACAT-GGTGGA-CC-CAGTGGG-TGTCAGGAAAGTATAGAAC
gi|6 : A--TGTCCTCGG---T-CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------CCA---TATCGTGACAAAT---------------G-TG-------TT-CA--TCTTCT-A---GA-TC------AG-GACGGTC-GGTTCTTG----TC-ATT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CAAGG--A--GTAGAAT---A-TCC-CT----ATAG---T----GTATGTGT--AG-A-TG-A-TG-AG-A--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATT--------AT--G---ACACAGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--T-ACA-GTGAG--TTCTCTTATTG-TCAATCAACACACTACCACACAGAGATTTCACAACTTGTGACCAATGAGATAATATTTTATGAAT-CT--ACAATTTAt
gi|7 : A---CTCCTCTCAC-ATTAAT-GGAGAC--ATA-CTAGTAGAG-G-TGGATA-AA---GATGGG-AAA-C----GG--A-AAGT--GATCA-G--ATAC-----AGCAA---GAGAGGAA-----AGAAGCTCCAAGA-AATT-C---AGAAGGATGA--TAAA-G-GACAA-GATCTATAC---TG-----T-ATCAT--AGGGTGCAT-CAC-AGAAA---ACATTAA-C----GGTGACATCTGTGTATC---C-GACCCTCT--TCGTAA-GAAGG-TG-G------TGGT--AGTGAC--CAGAT-TAGGA-CAG-TATCG-G-TTCT-C------TTAC--TTTGGTCATCCATTACAA-CCTG-GATT-CTA-TC-CA----AAC----AGAATGTGTA-----CAGA--TG-CCTTGGGAATT-------ATCTTGGTC-TG--TAGT-------TGT---GGT-G-G-TAGTAAATGTGAGACCTGGGG-TA-------TC-CA--CATGTT-T---GA-CC------AG-GACGGTC-AGTTCCTGAATTTC-CTC-ATC-ACA-T----CA-C--AA--Aatgaatgaataaggctgatacaactatactagaaaatacacagtagagtgtatggaatccccataattaaccaaacaagttgctgattatatgtgcaagtttaactatgatttacagtcacttacattgttaagtatgcaaaacaacagtgtgtgacaatcaaaagatatctttaattatcctgtagctttcaatttacaatatctgaatatcacgatattactactaagagctagatttgaaaaaggtcttgtttatgaaataagattttagaaaataagattctccctttcagttttatataattcaattatttcttctttcattctacatttacaatagcatcctatggga
gi|8 : ct-TACAT--GTGAAT----G-GAT-TA---TCGGGTAATTTAATATTTTCAAGCA-ATGACTTTTT-G--ATAA----ATCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-GTATTGCCTACATTCTACTGTAAGTTT--------GCTAGTT-TTTCA-------GGATAGAATATTTTG---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCGTT-GAA-GATTGT-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACACCTG--AAGAGTCC-AGAAAACAAA--AACCATGA-AG--TGGTT--CTC-TATCTACAACGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAATG-T-G--C-AAGGCC-C-ACCCAACTAAAGA----TATTGACATCC--T-CTG-TA-ACAATT-GC---A-AAGTTTCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGC-AACACTGG-AGAtgcccagtgcggtctgcactgatgatcaacaaaacgtctgggttggaagttggaacag
gi|9 : GTCAAAATAT-TTC-ATGG------TCACCT-ATCCTCCAGAA--ACCTTACAATT----------AT-AATC-CCCAACCTTTCTGAGAA-G-TTCCAGGAAA---TCCGA--CCCATAC-CA-AAG-ACAAC----AAAACC-GGTCACACC-CGT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGC-----AAAATAGAAA---C---GGAAAACAA--ACCAGCAG-AGATGAG--AAAAA-TAAAT-CCC---ATGAAAATTGTCT-CCCCTTT----AACATTAGTGGA---CTCTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACAA-G--ACAAG--GATAAG--GAATCT-GATGTGG--AAC-AAACAA--T--GCCCCTAT-CTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GATCAGGAAG---TT-CAG-TGTA-CCGGG-TGTT-G-AA----------ACGG---TATTCCATATTTCACGAGAT-AAAT--CAG---GCA-A-ACTT--TGGG-TC-A-A-TGA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): ATATAATTCAACTCTCTTTTCATTCATTCTACATTTAATATAGCATCTATGGG
Alignments
lowQualScore : 1 11 1 2222 11 1 1 2222 111 11 11 11 222222 222222 11 1 1 11 2222 11 1 1 888888888888888888888888888888888888 333333333333 111111 2 888888888888888888 1 111 11 111111 11 1111 11111 1 1 1 444444444 333333333333 3333333333333333 3333333 11111 111 2222222 1111 11111 222222222 1111 1 33333333 2222 1111 22 33333333333333 111 2222222 11111 22222222 11 222222 2222222 3333333333333 22222 1111 11 11 1111 111 11 22222 2222222 111 11 1 111 2 1111 1111 111 1111 22 11 1 11111 2222222 111 111 555555555555555555555555 222222222 111111 111 3333333333 2222 11111 111 11111111111 11 11111111 22222222222 11 11 1111 666666666666666666666666666666666666 111 11111 222 11111 111 111 11 111 3333333 1111 111111 11111 2222222 1 111 2222 1 444444444444444444444 222222 11 22222222222 111111 33333 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 111111 2222222 11 44444444444444444 1111 11111111 333333333 11111111111 6666666666666666 22222222 2222 1 11 11 1 11 1 11
lowQualScore : 5 1 88 1 1 5 4444 88 5 5 4444 1 777 7 44 33 33 555555 222222 00 0 1 0 33 1111 33 0 0 2 333333333333333333333333333333333333 8 5 666666666666 1 0 666666 0 6 1 666666666666666666 6 6 5 0 77 5 5 0 8 0 5 77 1 1 000 77 1 5 5 1 5 5 5 5 0 5 5 5 0 77 1 5 1 33 1 1 66 99 999 6 7 1 999999 0 6 6 77 5 33 5 5 5 1 0 0000 0 1 00000 5 5 1 1 5 5 888 1 66 66 5 5 888 5 5 1 5 1 1 2 5 222222222 6 99 1 6 44 99 6 111111111111 6 1 6 4444444444444444 6 3333333 6 1 88888 5 000 77 5 5 2 5 1 5555555 6 3 6 6 1111 0 6 6 6 66666 6 1 6 6 666666666 6 4444 6 6 3 3 00000000 6 6 0000 6 6 6 6 6 6 9 33 6 1 6 4444 11 3 66666666666666 8 8 444 4444444 11111 0 22222222 11 8 666666 1 6 6 2222222 1 6 1 99 1 77 1 0000000000000 6 44444 6 6 99 99 6 88 6 7777 8 0 8 11 8 8 11 0 7777 8 8 444 1 11 1 00000 0 5555555 0 111 3 8 6 3 11 6 444 11 0 0 7777 3 5555 8 444 1 8 2222 55 11 8 5 999 8 33333 8 1111111 6 000 555 5 77 5 3 5 888 555555555555555555555555 1 1 1 5 7777 3 888 777777777 5 5 5 5 5 0 111111 5 5 5 5 555 77 2222222222 0000 44444 1 8 5 77 000 99999999999 4 5 5 0 5 5 11 0 88888888 666 4 4 66 0 4 22222222222 00 5 77 5 5 11 2222 6 66 777 7 4 0 55 4 4 555555555555555555555555555555555555 66 222 66 22222 000 22222 000 5 777 44 22 77 4 8 55 222 4444444 7777 2 5 88 4 888 3 333333 5 5 77777 6666666 1 6 1 6 6 3 111 99 1 99 6 6 6666 6 5 1 444444444444444444444 000000 8 6 55 6 99999999999 888888 66 44444 8888 44 66 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 8 55 1 0 99999 4 555555 4 5 8 8888 55 4 4 8888888 4 11 55 8 4 1 44444444444444444 4 0000 99999999 3 66 88 5 777777777 5 2 99999999999 7777777777777777 0 44444444 1 5 5 6666 3 33 1 33 5 1 88 1 1 22 1 5 88
lowQualScore : . . .. . . . .... .. . . .... . ... . .. .. .. ...... ...... .. . . . .. .... .. . . . .................................... . . ............ . . ...... . . . .................. . . . . .. . . . . . . .. . . ... .. . . . . . . . . . . . . . .. . . . .. . . .. .. ... . . . ...... . . . .. . .. . . . . . .... . . ..... . . . . . . ... . .. .. . . ... . . . . . . . . ......... . .. . . .. .. . ............ . . . ................ . ....... . . ..... . ... .. . . . . . ....... . . . . .... . . . . ..... . . . . ......... . .... . . . . ........ . . .... . . . . . . . .. . . . .... .. . .............. . . ... ....... ..... . ........ .. . ...... . . . ....... . . . .. . .. . ............. . ..... . . .. .. . .. . .... . . . .. . . .. . .... . . ... . .. . ..... . ....... . ... . . . . .. . ... .. . . .... . .... . ... . . .... .. .. . . ... . ..... . ....... . ... ... . .. . . . ... ........................ . . . . .... . ... ......... . . . . . . ...... . . . . ... .. .......... .... ..... . . . .. ... ........... . . . . . . .. . ........ ... . . .. . . ........... .. . .. . . .. .... . .. ... . . . .. . . .................................... .. ... .. ..... ... ..... ... . ... .. .. .. . . .. ... ....... .... . . .. . ... . ...... . . ..... ....... . . . . . . ... .. . .. . . .... . . . ..................... ...... . . .. . ........... ...... .. ..... .... .. .. .................................................... . .. . . ..... . ...... . . . .... .. . . ....... . .. .. . . . ................. . .... ........ . .. .. . ......... . . ........... ................ . ........ . . . .... . .. . .. . . .. . . .. . . ..
lowQualScore : 0 0 55 0 0 5 0000 00 5 5 0000 0 777 3 00 22 88 222222 222222 22 0 0 0 88 2222 88 0 0 5 444444444444444444444444444444444444 0 6 888888888888 0 8 000000 4 7 7 777777777777777777 7 7 7 4 11 7 7 3 6 7 7 99 7 0 000 99 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 1 99 7 7 0 66 7 4 00 22 333 7 8 0 222222 7 7 7 44 7 66 0 0 0 0 1 6666 8 4 22222 0 0 0 0 0 0 888 0 99 99 0 0 888 0 0 7 4 4 0 1 0 333333333 7 22 0 7 88 22 7 777777777777 7 0 4 6666666666666666 7 0000000 4 0 33333 7 000 99 7 7 3 7 0 3333333 7 5 7 7 2222 7 7 7 7 77777 7 0 7 7 777777777 7 2222 7 7 3 7 88888888 7 7 8888 7 7 7 7 7 7 8 55 7 0 7 2222 44 8 22222222222222 0 0 222 8888888 44444 8 44444444 00 0 000000 0 7 7 8888888 0 7 0 22 0 00 0 3333333333333 7 55555 3 7 22 22 7 22 7 0000 0 6 0 00 0 0 00 8 0000 0 0 000 4 00 0 00000 8 6666666 8 888 2 0 0 8 00 0 000 44 6 0 0000 2 0000 0 000 4 0 2222 44 00 0 0 666 0 00000 0 7777777 7 000 777 7 00 7 0 7 333 666666666666666666666666 0 3 0 0 8888 1 888 444444444 0 0 0 0 7 6 000000 7 7 7 7 777 99 7777777777 6666 33333 0 9 7 99 333 00000000000 3 0 0 8 0 0 99 2 11111111 222 4 4 11 1 4 66666666666 00 7 00 0 0 66 7777 3 11 000 3 0 7 55 0 0 777777777777777777777777777777777777 99 444 99 55555 000 55555 444 0 555 44 22 11 4 9 44 222 4444444 0000 2 6 33 4 888 2 666666 9 2 33333 7777777 0 7 0 7 7 3 333 22 0 22 7 7 2222 7 5 0 000000000000000000000 444444 0 7 88 7 33333333333 333333 11 55555 5555 66 11 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 55 0 7 00000 0 555555 0 7 9 5555 00 0 0 5555555 0 00 55 9 4 0 00000000000000000 4 6666 11111111 2 99 22 0 222222222 0 5 66666666666 3333333333333333 7 22222222 0 7 7 3333 3 88 0 33 0 0 00 0 0 00 0 5 00
consensus : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GCTAGTT-TTTCA-------G-ATGGAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCTG--AAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTCCT-TTACCAACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-T-G--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATGC--T-CTG-TA-ANGANT-G-C---CAANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCCGGAGGC-AT--AAATTTATNGA-TTTAG--AGA-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGAT----TT-CAGAAGGTCCA-TC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CTCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TCAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGTCCGTTGTTAGAAGAANTACAGCAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTCATA--TCT-CCATGACT-TT-CGTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TNCCT-ATCCTCCNCAAA--GNTCGCAANTN----------T-AATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-GATTCCCG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACCCCA-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAACG---AGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTT----AGCATCAGCGGA---NTCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAGGAGATAAG--AAATCT-GATGTGG-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTA-TCGGG-TGTT-G-AA--G---TTT-ATGG---CAT----TATNTCACTNGAT-AAA-T--CGG---GCAGG-ACTT-CTGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-AATCTG-ANCTAC---GGAA-----GATANAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG----CT----NCCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGACACCCA-NT-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATG-AA---GACGGT-ATNG----GGCTA-AAGT--CAC-NCG--GTAC-----AGCAA--AGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-----CGATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-TAGTTGGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C-AA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACGAG--GTTCAGAAAGA-TCAG-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-NCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CANGG-CA--GTACGGC---G-TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AGA-TGA-CG-A-GA----AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--TTACA-GTGAG--TCCTCTTANTGGTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
Reference ( family-437 ) : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GCTAGTT-TTTCA-------G-ATGGAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCTG--AAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTCCT-TTACCAACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-T-G--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATGC--T-CTG-TA-ANGANT-G-C---CAANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCCGGAGGC-AT--AAATTTATNGA-TTTAG--AGA-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGAT----TT-CAGAAGGTCCA-TC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CTCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TCAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGTCCGTTGTTAGAAGAANTACAGCAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTCATA--TCT-CCATGACT-TT-CGTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TNCCT-ATCCTCCNCAAA--GNTCGCAANTN----------T-AATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-GATTCCCG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACCCCA-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAACG---AGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTT----AGCATCAGCGGA---NTCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAGGAGATAAG--AAATCT-GATGTGG-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTA-TCGGG-TGTT-G-AA--G---TTT-ATGG---CAT----TATNTCACTNGAT-AAA-T--CGG---GCAGG-ACTT-CTGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-AATCTG-ANCTAC---GGAA-----GATANAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG----CT----NCCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGACACCCA-NT-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATG-AA---GACGGT-ATNG----GGCTA-AAGT--CAC-NCG--GTAC-----AGCAA--AGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-----CGATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-TAGTTGGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C-AA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACGAG--GTTCAGAAAGA-TCAG-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-NCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CANGG-CA--GTACGGC---G-TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AGA-TGA-CG-AGGA----AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--TTACA-GTGAG--TCCTCTTANTGGTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
gi|1 : TTTAAATCTCACTGCT-GCATTTCCAA--AGTCCCCTCAAATAGAAAGCCATTTGTCATTT----TG--GGTCAAACACAGAT-ATTGTAAAGTACT----GAAAAACAACATCTCA-A-TT-AC-GTCTAGATACAA--GTGAAT----A-GCTATAAAATCAGGTAAAG-AACATTTTCAAGCA-ATGACTTTTTTG--ATAATTAAGTCCT--TGGAATAT-GATA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GTTAGTT-TTTCA-------GTATGGAGTATTTTT---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TT-CAAAATTA----------------G-TAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--T-GTGAA---TTTTATT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGTCGAG-A-TA-AACATCTG--AAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-AG--T-GTTCTTCTTATTTGCAGCGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAAAAGT-G--CGAAGGCC-C-ACCCAACGAAAGA----TATTGACCTTT--T-TTG-TA-ATGAGT-GCC---CAAGTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-GATACAAACACTGGAAGAGTCAT--TTCTGGGCC-AT--AAATTTATAGATTTTAGGAGGA-CAAT-C--TATT---CAGAAAAGT-TATCACTA--------T--TTCA-AGA-GGAGGTC---TT-CAGAAAGTCCATTC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAGGAT-TTAAAGAAAG--AT------CAAA-GAAG-ATG-CTGG--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TGATTCAT-GGACAG---------TCT-A----AAA-ACA-GCCA-TGAA-GCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCATTGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACAAGTAAAC-AATA-TA----GAAAAATCCATTGTTAGGAGGAG-ACAAAAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTC-TA--TCT-CCGTGACT-TT-TGTCAAAGAG---CC-ATGGC------TTCCT-ATCCTCTTCGAA--GATCACAGACT----------T-AATTCCCAAA-CTTTTTGAGAG-GAAACCTGAAAAA--TCCGA--TCCATAC-CC-AAG-ACAACAA----AACCA-GTACCCCCA-GT--G-T-TTACT--GC-GGTCA----TTAC-A-GCAAAG---ATGATGTTGTCAAAT--TACTAGGG-----AAGGTAGAAATT---AGAGAGACCAA--ACCAA-AG-AAA---G--AAAAATAAAAACCT---ATGGAG--TGGCTGCTCCTTC----AGTAGCACCGAA---ATCTAC-AAGCAG---GCAGATG-AAACAA-G--ACAGGGAGATAAG--AAATCT-GATGTTG-A----AAACAACTT--GTCTCTATTCTCCCTCTG-------TC-ACTGA---GGTCTGGGAG---TT-TAG-GGTA-TCTGG-TATT-ACAA--ACTTTTT-ATGG---CAT----TATATCACTTGAT-AAATT--CAG---GCAGG-ACTTCCTGGG-CC-ATG-TGAC-GTAG--A---T-AACCT-TGTCCAAAACAG-A---TTTA--CAGGGGG-AATCTG-ACCTACTTTGGAA-----AGTAAAAACTA-TGG-TG--GAT-TTGG----GT----TCCACA-AGTCACA-CAGG-ATGGGTTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAAA-G-CAAATAAAGTCATC-AATAGTG--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TG-AAAA-AGGG-GACT-GGACACCCACTT-CAGTATA--CA---CTGCCTCCAC-ATCGAA-TGAGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-AT--AA---AACGGTAAACA----GGCTA-AAGT--CAC-CCG--ATAC-----AGCAA--AGACA-GAA-----AAGAACTACAGAA-CATAAC---AG-CGGATA--ACAAT-G-GACAG-GGACTTTAT---AG-----CAATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGGAA---ATATGAA-T----GGAGATATCTGCACATC---A-GAC---CT--TAATAA-AGAGG-CA-GTTAGTTGGT--GTTGAA--TAAATTCAGGA-CAAA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACAAG--GTTCAGAAAGG-TCAA-GGTT-CT--TC-CC----CGG----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCTTCAG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------TAC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TT-CA--CTTCTT-A---GATTC------AG-GACGGTC-GGTTCTTG----TCAATT-ACT-ACCTC----CA-C--AA--AAC-AACCAAGC-CA--GTACAGC---G-TCC-CC----GTTG---T----CTGTGTGT--AGATTGA-TGAAGAA----AC-AATCTCTAT-TA------GA----AATA--------TG--G---ACACAGT--------GACAGTGC-ATAGCGTATCTGTTACAGGTGAG--TCCTCTTACT-GTCAATCAA-ACATTGCCTCAC--AGATTTCACAGCTTGTGACCATTGAGATTATATTAAAAGAATACTAGACAATTTA
gi|10 : AAACAAAA-GACT-GG-CAACCA-AT-CAGCGTG--CA---TTCCTCTCAC-ATTAAC-GGCGAC--ATA-CTGGTGG-G-G----ATG-AA---G-------T--------CTA-AAGT--CAC-TCA--GTAC-----AGCAA---GACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAAGGACG--ACAAA-G-GACAG-GACCTGTAT---AG-----TGATC-C--ACACTACAT-AAC-AGAAA---ACACCAA-C----GAGGATATTTGCGTATC---A-GAT---TA--TAATAAGACAGGCCG-G-TAGGTGGT--GTTTAA--C-AA-TCAGAG-C----TACAGTGTTTTTTCGCCTAATTAC--A-GAG----TCAG--AGATTCAGAGAGT-CT--TTACC----TACAGCGGAAATATGT------CTGACCTGTTGTTGG----CCAC----ATAGTGATA-TGGTTGATTATTTAAGCC---TAT---TACAAT---------------------------TC-TA--CT--CT-T---GA-CCT-----AG-GATGGgcccacgcgaataa
gi|11 : tcATCTCA-A-TTTACA-TCTAG-TACGT--GTGAATTAATG-GCT-TA---TCGAGTAAATGAATATTTTCAAGCA-ATTACTTTTT-G--ATAT----GTCCTAATGGAATTT-GACA-TGT-----------------------------TT--------GCTAGTT-TT-CA-------G-A----GTATTTTT---TGTATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGC-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATT--GCAATTCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCTG--AAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-gc
gi|12 : cCAACACTCTTATAGAGTGT-GCCA-------GGCTGCC-ACCA--AA--TACTCAAAAGTTCTATT--GCACGACTG-TTCAGCCAGC-AAATGT-G-TGAAC-AACACAAGG-A-TATCACATCCGGGAAGA---C-AAAAAACAAA--A--C-TGA-TG--TGGTTC-T-TTACCAAGAA-GAATA------CAAGAATTGCCAA-CAG-AGGAA-TTGTCC-AA--TC-C-ACCCCAA-AAGGA----CCTTAAAATTT--A-CTG-CA-AAGAAT-G-C---CTACTCCCA--AT--CTGTT-CC-AAA---T-G-tg
gi|13 : -AAA-T--CAG---GCAG--ACT--CTGGG-CC-A-G-TGAC-TGGC--A---T-AACCT-TGTCG-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-A-TCTG---CTAC---AGGA-----AATAAAAAACTATGG-TG--GAC-ATGG----GT----TCCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-CAAATAAAGTCATC-AGTAG-G--ATTACGCAG-GATAAT---A-----CTATCAC-AGAATTCA-TG-AAAACAGGG-GACT-GGG-AACCA-TA-CAGCATA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-GATG-GTG-Acttaccaccaaccacaacagtcaccaagtagccttgatcttgagtaatc
gi|14 : CTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGAAG---TT-CAG-TGTG-CCGGG-TGTT-A-AG--G-------A-GG---CATCCCATATTTCATTAGGT-AAA-C--AGG---GCAA--ACTG--TGGG-TC-A-G-TGATATTAGTGG---T-GACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-A--CC--AGCTAC---AGAA-----GATACAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG----CT----ACCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATC--TTTACAG--------ACAGA-G-ACAATAAAGGCATC-AATAA-G--ATAACA-AG-GA
gi|15 : A--CGTCCGCGA-----CAC----GTACTGGTT-TG--TGAT-------GACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGA-TC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC-TCG-ACT-GC--TGGGACA-CGAAA--AACAAA-CATGGATA--ACACAG-------TC-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGA---A-CGTACGGCATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATATC---TACA-atactcatagcaaaacaatcat
gi|16 : A--CGTCCGCGA-----CAC----GTACTGGTT-TG--TGAT-------GACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGA-TC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC-TCG-ACT-GC--TGGGACA-CGAAA--AACAAA-CATGGATA--ACACAG-------TC-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGA---A-CGTACGGCATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATATC---TACA-
gi|17 : ACAAGTAAAC-AAAA-TA----GAAAAGTT-GTTGTTAGAAGAG--AC--CAA--T-AGCC-AGGA-T--GACTC--AT---TG--AAAGATTATAT---TGCC-TA--TCT-CCATGACT-TT--GTCAAACAGT-TCC-ATGGC------TTCCT-ATCCTCTCCAAC--GATCACTGCTC----------T-AATTCAAAAA-CTTTTTGAGAAGGA--CCTG-AAAA--TCCGA--TCCATAC-CC-GAG-AC
gi|18 : TCGG---T-CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------TTC-------G-G----TA---------------C-TG-------TT-CA--TATCCT-T---GA-TC------AG-GATGGTC-AGTTCTTG----TC-TCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AGA-AA-CAGAA-CA---TAC-AC---GATCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AGA-TGA-C--AAGA----AC-AATCTTTATGTTG-----GACAACGATA--------CACCA---ACACAGT--------GACAGTGT-ACAA-ATA
gi|19 : GTCCA-TC-AATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAAAC-TTAAAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CT-G--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TTAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACTAGTAAAC-GAAA-TA----GAAA
gi|2 : A-GGAGGTGTTTTT-CAAAGGTTCCA-TCAGATATG-TCTTGTTTC--A-AACATC-ACAAGATGTTATA-AAGGAAATGATATTCAAATGAAG-ATG-CTGG--CGG-A-AATGAA-----AGAATGA-TCATTGGATCG---------TCTTA----AGA-ACA-GCCAATGGAAGCTGATGGAGAGG-------TCTCTGCATAAATTAGGCA-TGGTGAATCAGCAGT-GGATGTCA-GAAA-TATTGAACAAGTAA-C-AGGAATATCAGGAAAAGTTGGTTGTGAGAAGAAG-AGAGCCAGCTGAGCC-AGGAAT--GAAACTCATG--TGGAAA-GATTGTATAATTGCGCTAAGTCT-CCATGACTGTTGTGTCAAACAGTGTCCGATGGTGGGCTTTCCCTCATCCTCTACAAACAGAT-GCAACTGGGGCGCTGCTC-AATTGCAAAAACTTTTTGAGAA-GGACCCTG-AAAGATTCCGGATCCCATACGCGCGAGTACAGTAATGAAAACCAAGTCCCCCCAAGTCAG-TATTACTTCGCTGGTCATTGGGTATCACGCAAAGGGAAGAATGTTGTCAAAGGATACTGAGGGTGAAAAGATAGAAAATTATAAGGAGACCAATTACCAATAGTAAAAGTA--AAGAATTAAAACGCTAAATGGAAAGTGGCTGCTCCTTTAGTGAGCAT--GCGGAAATGCTTACAAAGTAAGGTGCGAATGAAAACAA-ATTACAAGGAGATAAGATAAATCTGGATGTGGAAAACAAAACCA--TTGGTCTCTA-GTGTCCTCTAGTACAGTTT-ACTGAATTGGTGAGGGAGA--TTGCAG-GGTATTTGGG-TGTT-G-AATCGT--TTT-ATGGGCATAT----TATCTCCGTTCAT-AAA-TGCCGGACCGCAGGAACTT-CTGGC-TCGA-GTTAAC-TTAG--A---TAAACCTGTGTCC-AAACAGTAT--TCTAAGCAGGGGATAGTCTT-GCTTACAA-GGAATTATTAAGATAAGCTA-TGGTTG--GAC-TTGGGATTCTCTAATTCACA-AGTCACAGCAGGTATGGGGTTACTGTATCT-TTAGCAGAGCGAATCACAAATT-AAGATATAGTCATCGAATTA-GGTATAACACAATGGTGAC--AAATACTCTATCACAAGAATTCA-TTAAAAACAGGACGACTGGGATACCAA-CTGCAGCATATTCATCTCTCTGCCCAC-ATCAACTGGGGACAGATATCTGGTGG-G----G-ATGTAATTGGAC--T-ATAG----GACTACAAGT--CAC-TTGCCGTATTATCAAGCAATTAGACAGGGAACATGAAGAACTACAGAATCAT-AC---AGTGGGATA--ACAAGTGTGATCG-GA-CTGTATG--AGTATGCCAATC-------CTACATGCACTAGAAAAAGATATAAAGCTGGAGGTGATATCTGATTAGCAATA-GATG--CTGCTGGTAA-AGAGG-CGAG-TAGT--GTTAGGTTAAAGTAAA-TCAGGACC-AATCACA--GTTTCTCC------T-----ACAAA--GGTCAG-AAGA-TCAG-GGTTGCTGATC-GCGTGTAAT----GGAATCCGTGGTAGCCTGA--TGTCCTCGG----TCACGAGTATCCTGGTGCTG--TGATAG-----ACC---AAT-T-GACGATT---------------GTTG-------TT-CATGCTGCTTAA---GA-TTCAAATGAA-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-ATTAACTGACG-T----CA-C--AAGGAAC--A-CAAGG--ATTGTA-GGCGTTG-TCC-GCTTGTGTAG---TTCTAGTGTGTTTCAAGA-TGAGTG-A-GA----ACAAATCTCTAT-TAGTTAGTGA----GATA--------GG--G---ACACAGTTCAAGTGAGATAGTGTAATAG-GTACT--CTACATGTGAAGTTTCTCTTAATGGTCAATCAA
gi|20 : ctctgtgca--CA---CTCCTCCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CTTGTGG-G-G-------------AATGTT-ATTG----GG----GAGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAG----GT-ATTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG------AATC-CCAATG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|21 : --CA---CTCCTCCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CTTGTGG-G-G-------------AATGTT-ATTG----GG----GAGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAG----GT-ATTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG------AATC-CCAATG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|22 : -AAGGCC-CCAACCAACTAAAAAGGAATATTGACATGCACT-CTGGTA-ACAAATTG-CAGATAAGTTTCA--TTTTGTGTT-CA-AAAAATT-G-TGCAACAACTGG-AGAGTCATA-TTTGG--GC-AT--AAATTAATAGA-TTTAG--AGAGCAAT-TGATATTCAGGGGAAAAGT-TATC
gi|23 : gca-T-G--C-AAGGTC-C-ACCCCACTAAGGA----TATAGACATGC--C-TTG-TG-TAGATT-G-C---CAGCTTCCA--AT--ATGTT-CC-AAA---T-G-TTC-AACACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGC-AT--GAACTTGTTGA-TTTAG--AGA-TAAT-C--TATG---AAGAAAAGA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGA
gi|24 : CTAC---AGAA-----GATACCAACCAATGG-TGAAGATGAAGG----CT----ACCACACCGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATG--TTTGCGG--------ATAGT-G-ACAATAACGTCATA-AATAA-G--ACAACATCG-GATAAT--AA-----TG
gi|25 : ---GGTCAGGGAG---TT-CAG-GGTA-TTGGG-TGTT-G-AA--G---TTTTATGG---CAT-----ATATCCCTTCAT-AAA-T--CCG---ACAG--ACT--CTGGG-CC-A-G-TAAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGtc
gi|26 : ctatTCACA-CAGG-ATGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------AAAAA-G-CAAGTAAAGTCATC-AAGAG-G--ATAACACAC-GATAAT---A-----CTATCAC-AGGATTCA-TG-AAAACAGGG-GACT-GGACACC
gi|27 : ACAT-CGC-AGAAA---ACATCAA-T----GGTGATGTCTGCGTGTC---C-GAC---TA--CAATAA-ACAAG-CT-G-TAG-TAGT--GGTAAA--TAAA-TCAAAT-C-AC-CACAG-G-TTCTCC-------TAC--A-GAG--GTa
gi|28 : GTTCTTG----TC-ATT-ACT-AC--T----CA-C--AC--TAC-AA-CACGG--A--GTACGGT---T-TCC-CT----ATAG---T----GTGTGTGT--AGA-TGA-TG-A-GA----AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GAAA--------TG--T---ACACca
gi|29 : gAATAAAGTCATC-AATAA-A--ATGGCACAG-AACAAT--AA------AATTAA-AAAGTTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGGCACCCA--T-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATTAA
gi|3 : TCAGATGGCACATTCCAAAACTGTAGCGTACCAAATATGGGTAC-AACCCCAGCACTTTT-TAGAATGT-GGCATC-GAA-GATTGC-GAG-AG-AAAATTGTCAA---CCTTACT--GCAATCCTT-GCCA-TC-GC-AGATGTTG-TCAAC-AATGCACAGCA-CG-AGCATCTG--AAGAATCC-AGATTACAAAGAAACCATGA-GG--TGGTCCCT-T-ACCAACAACGAAAA------CGACATCTTCCTG-TGG-AAAA--T-G--C-AAGATC-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGACATGC--T--TG-TG-TGGATT-G-C---CAGCTTCCA--TT--ATGCTACA-AAA---T-G-TTTCAACACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGC-AT--GAACTTGTTGA-TT-AG--AGA-CAAT-A--TAGAA--GAAAAAAAA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGAGAT----AT-CA-AAGGTCGA-CA-AGTATT-TTCT---TC--C-CACATC-ACA-GAT-TTACAGAAAGAAAT-------AAA-GG-G-ATG-CCCA--CAG-AGAAT-AA-----AGA-TGA-TCCA-AGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTG-TGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TATCA-GAAA-TATC-AACAAGTGGACTAATA--A----GAACAGTC-ATTGCT-GAGAAATTACAG-------AGTCGAAGA-T---ACAC--ATATTTG--AT-GAT-ACAT---T-TCATA--TCTTCCATGACC-T---GTCAAAATAT-TC--ATGG-------TAACT-ATCCTCCACAAA--ACTTACAATCA----------TTAATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-G-TTCCAG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACACCA-GT--GTT-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGG-----AAAAT-GAAGCG---GAAAAG---AA--ACAAGCGG-GGGTGCGGAAAAAAT-AAAACAC---ATGGACATTATAT-CTCCTTT----AGCATCAGTGGA---CTCTAC-AAGTAA---ACGAAAG-AAACAAGG--ACAAG--GATAAG--GATCTT-GATGT-G-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TTCACTGA---GGTCA-GGAA---TT-CAGTTGTA-TCAGATTGTTAG-CA--G---TGC-ATTC---CA-----TATTTCACTAGGTAAAA-T--CAG---GCA-A-ACTT-ATGGATTC-A-G-TGAT-TTTG--ATGGT-AACCT-TGTCC--AACAG-ACAGTC-A--CTGAGGA----CTGCAACTAC---AAAA-----ATTACGAACCAGTGA-TG--GAT-ACGG----CT------CACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAC-CTG-ATCTTTTA-CAG--------AC-GA-GAAAAATAAAGTCATC-AATAA-A--ACAAT---G-GGTAATCAAA-----AGA--A--AAAATTCATTT-CAAACAAAA-GACT-GGA-AACCA-AT-AAGC-TA--CA---CT-CTCAC-C-ATTAAC-GGGAAC--ATA-CTGGTGG-G-A-TG-AGG-AA---G--GAT-ATGGGTGAGGCTA-AA-TCACAC-TCG--GTAC-----AGCAA----ACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAA-G-GACAG-GACCTGTATTAGAG------GATC-C--ACACTA-AT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GG-GATATTTG-GTATC---ACGAC---AT--ATATAA-AAAGG-CA-GTTAGTGCGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C----TACAG-G-TTCTCC-------TACAAACG------TCAGAA--G-TTAA-GATT-TA--TC-CC----TTT----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG----TCAT----CTCCTGGTG-TG--TGAT-------------------GAAAACA---------------G-TGAAACAATTT-CA--ATTTCT-C---GA-T-------AGTGAGGGTC-A-TTCTTG----TC-TCT--CT-AC--T----CA-C--AA--AGA-AA-CAGAA-CAT-ATAC--T---A-TCCACC----G-AG---T----GTGTGTGT--AGA-TGA-CG-A-GA----AC-AATCTTTATGTAG-----
gi|30 : t-CA--CCTGCT-G---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCCCG----TC-TCT-ACT-GC--TGA--CACC--AG--AAC-AA-CATGG--A--ATACACC---A-TCC-Ca
gi|32 : AGGTTCA-CG-AATATT-TCCT---TC--C-AACTTC-ACAGGAT-TTACAAAAACAAGT------atg
gi|33 : -CT--TC-CC----TAT----GGTATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG----TCAC----ATCCTG
gi|34 : CTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G----A-ATG-AG---GA
gi|35 : --ACAAT-G-GACAG-GGACTGTAT---GG-----GTATC-C--ATGCTACAT-CAC-atga
gi|36 : aGTGT-ATAG-GTATC--T-ACA-GTGAG--TCCTCTTA
gi|4 : -AT----------------------TTT---------CTA--T-TTGTA-------G-A--GAGT----CC---T--ATTTATCAAATGGCAC-ATTCCAAACTAAGTGTACCAAGCCTG-GGTAC-A-CCCCAGCATTTTA-TAGAGTGT-GACATT-GAC-GAATGC-GAGAGG-AA--TTGTCAG---TTTTACT--GCAATTCTT-GCCA-TCTGC-AGATGT-G-TGAAC-AATGCAGAG-A-GG-AACATCTG--AAGAATAC-AGATTACCAG--AGCCATGA-GG--TGGT-CCT-TTACCAACAACGAAAAACGAAACGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-T-G--C-AAGACT-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGATATGC--T-TTG-TG-AGGAAT-G-T---CAAATTCCA--CT--ATGTT-CC-AAG---T-G-TGCAA-CACAGGCAGA-TCAT----CGG-GGC-AT--AAATTCATTGA-TCTGG--AGA-CAAT-C--T--T---GAGGAAAATATAGCACTT--------CGCCTCA-AGA-AGATAT----C--CAAAA--TCCA-AG-AATATT-TCCT---TC--C-GACATC-ACAAGAT-TTACAGAAAGAAAT------TAAA-GGTG-ATA-CCCA--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TAA-TCAT-GGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCTA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCCCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATGCATCAGGTGGAC-AAGA-TA----GAACAGTCC-TTGATGGAACAATTACAG-AA--T----C-AAGA-TTCAACAT---T---TG--AT-GATTACAT---T-TCATA--TCT-CAATGAC--CT-CGTCAAAGAGT-TTC-ATGGC------TACAT-GTTTTCCCCAAA--GCTTGCAAATA----------T-AATTTCCAAT-CTTTCTAAGAA--ATTCTCA-GAAA--TTCGA--CCCATAC-CA-GAA-ACAACAA----CAGTG-GTGACCCCA-AT--G-T-TTACT--GCTGGTCG----ATAT-A-GCAAAG---ATAATGTGGCCAAAT--TACTAGGG-----AAAATAAATGTG---AGGGATACCAA-----AGCAG-AGATGAG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCT-CTCCCTC----AACATCAGTGGA---ATCTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACGA-G--ATAAT--GATAAG--AAATCT-TATGT-G-AAAC-AAACAA--T--GCCCATA-TCTTCATATG-------TC-TCTGA---GTTTAGGGAGATATT-----TGTA-TT----TGTT-A-AA--G----AA-ATGA---CCCA---TATCTCCCTTGAT-AAA-G--CAG---GCAAG---CT-ATGGG-TC-A-G-TGGC-AGTG--A---T-AACCT-TGTAC-AAACAG-A---CTTA--CA-AGGA-AAGC---AGCTGC---TGAG-----GATAAAGATCAGTAG-TG--GAT-CTGG----CT----ACCACACAGTCACA-CGGG-ACGGGGTG-CTC-ATC--TTAACAG--------ACAGA-T-ACAATAAAGTCATC-AACAA-G--ATAACACCG-GATCAT--AA------GATAAA-AAAGTTCT-TT-AGAACAGGA-AGCT-GGA-ACCCA-AT-CAGCATA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-GTA-TG-ATA---------GGTAAGGG----GGCCA-GAGT--CAC-ACG--GTAC-----AAC-G--AGAAAGGGA-----AAGAACTACATAT-CAT-AC---AAACAGATG--ATAAA-G-GACAG-AAACTATAT---AG-----cattgc
gi|5 : tcatttatTTCAAATCTCACTGCTCGAATTTCCAATAAATCCCCTCAAAGAGAATGTCA-TTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGT-AAGTACTTGTAAAAAAACAAAATCTCACATTTTACAGTCTAG--ACGTTGGTGAAT----GCGCTGTG---TCGGGTAAAATGATATTTTCAGGCATATTACTTTTT-GAAATGA----ATTCT--TGGAGTTTGGACATTGTCTACAT----------------------CTTCTACTGCAGTTAGTTGTTTCACGATGGCG-ATGGTGTATTTTTTAGT--ATTTATTAGA--GCAC-TTTCAAAAGTA-----------------TTACGA-CCC--GCACTTCC-TTAGGTGCGGGCATTCGAATGAGAG-CGAGCAGAAA--TTGTAGC---ATTTACTGCGCATTGCTTGGTCA-TCACCGAAATGT-GATAAACTAATGTCGAG-AGTA-AACA-CTG--AAGAGTCCAAGAATACAAAT-AGC--TGACAGTTTGGTT-CT-CTATT-ACAACATAAA------CAACAACTTCCTGCTGGAAAAAA-T-GC-C-AAGGCCAC-GGCCAACTAAGTA-----GTTGAGAGAC--TACTG-TAGATGAAT-G-C---CAGTCTCCAATTT--GT-TT-CACAAA---TCG-TAC-AACACTGGTAGAGTCACTGTCTG--GGCTACTAAAATTTATAGA-T------AGG-CAATAC--TATC-------AAAGT-TATT-CTAACAATTTTTG-TCCATCGACGGAGAG----TTACAGATGGTCCATTC-AATATTATCCT---TCAACAAACATCAACAAGAT-TTAAAGGAAGAGATCA----CAAA-GAAGAATGACGCGAACGGTA-AAT-AAATACTAGA-C-A-CTAT-GGCCAGGTTTCAGCTTCT-ATTTTAGATACATGCCATTGTAAGCCAACTGGGAGGATGTTTCTCTCT-CC-AAAT---ACA-TGGTGGA-CC-CAGTGGG-TGTCAGGAAAGTATAGAAC
gi|6 : A--TGTCCTCGG---T-CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------CCA---TATCGTGACAAAT---------------G-TG-------TT-CA--TCTTCT-A---GA-TC------AG-GACGGTC-GGTTCTTG----TC-ATT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CAAGG--A--GTAGAAT---A-TCC-CT----ATAG---T----GTATGTGT--AGA-TGA-TG-AG-A----AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATT--------AT--G---ACACAGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--T-ACA-GTGAG--TTCTCTTATTG-TCAATCAACACACTACCACACAGAGATTTCACAACTTGTGACCAATGAGATAATATTTTATGAAT-CT--ACAATTTAt
gi|7 : A---CTCCTCTCAC-ATTAAT-GGAGAC--ATA-CTAGTAGAG-G-TGGATA-AA---GATGGG-AAAC----GG--A-AAGT--GAT-CAG--ATAC-----AGCAA---GAGAGGAA-----AGAAGCTCCAAGA-AAT-TC---AGAAGGATG--ATAAA-G-GACAA-GATCTATAC---TG-----T-ATCAT--AGGGTGCAT-CAC-AGAAA---ACATTAA-C----GGTGACATCTGTGTATC---C-GACCCTCT--TCGTAA-GAAGG-TG-G-----TGGT--AGTGAC--CAGA-TTAGGA-C-AG-TATCG-G-TTCT-C------TTAC--TTTGGTCATCCATTACAA-CCTG-GATT-CTA-TC-CA----AAC----AGAATGTGTA-----CAGA--TG-CCTTGGGAATT-------ATCTTGGTC-TG--TAGT-------TGT---GGT-G-G-TAGTAAATGTGAGACCTGGGG-TA-------TC-CA--CATGTT-T---GA-CC------AG-GACGGTC-AGTTCCTGAATTTC-CTC-ATC-ACA-T----CA-C--AA--Aatgaatgaataaggctgatacaactatactagaaaatacacagtagagtgtatggaatccccataattaaccaaacaagttgctgattatatgtgcaagtttaactatgatttacagtcacttacattgttaagtatgcaaaacaacagtgtgtgacaatcaaaagatatctttaattatcctgtagctttcaatttacaatatctgaatatcacgatattactactaagagctagatttgaaaaaggtcttgtttatgaaataagattttagaaaataagattctccctttcagttttatataattcaattatttcttctttcattctacatttacaatagcatcctatggga
gi|8 : ct-TACAT--GTGAAT----G-GAT-TA---TCGGGTAATTTAATATTTTCAAGCA-ATGACTTTTT-G--ATAA----ATCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-GTATTGCCTACATTCTACTGTAAGTTT--------GCTAGTT-TTTCA-------GGATAGAATATTTTG---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCGTT-GAA-GATTGT-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACACCTG--AAGAGTCC-AGAAAACAAA--AACCATGA-AG--TGGTT-CT-CTATCTACAACGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAATG-T-G--C-AAGGCC-C-ACCCAACTAAAGA----TATTGACATCC--T-CTG-TA-ACAATT-G-C---AAAGTTTCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGC-AACACTGG-AGAtgcccagtgcggtctgcactgatgatcaacaaaacgtctgggttggaagttggaacag
gi|9 : GTCAAAATAT-TTC-ATGGT------CACCT-ATCCTCCAGAAA--CCTTACAATTA----------T-AATCCCCAAC-CTTTCTGAGAA-G-TTCCAG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-AAG-ACAACAA----AACCG-GTCACACCC-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGC-----AAAATAGAAAC------GGAAAACAA--ACCAGCAG-AGATGAG--AAAAAT-AAATCCC---ATGAAAATTGTCT-CCCCTTT----AACATTAGTGGA---CTCTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACAA-G--ACAAG--GATAAG--GAATCT-GATGTGG--AAC-AAACAA--T--GCCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GATCAGGAAG---TT-CAG-TGTA-CCGGG-TGTT-G-AA----------ACGG---TATTCCATATTTCACGAGAT-AAA-T--CAG---GCA-A-ACTT--TGGG-TC-A-A-TGA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): ATATAATTCAACTCTCTTTTCATTCATTCTACATTTAATATAGCATCTATGGG
Alignments
lowQualScore : 1 11 1 2222 11 1 1 2222 111 11 11 11 222222 222222 11 1 1 11 2222 11 1 1 888888888888888888888888888888888888 333333333333 111111 2 888888888888888888 1 111 11 111111 11 1111 11111 1 1 1 444444444 333333333333 3333333333333333 3333333 11111 111 2222222 1111 11111 222222222 1111 1 33333333 2222 1111 22 33333333333333 111 2222222 11111 22222222 11 222222 2222222 3333333333333 22222 1111 11 11 1111 111 11 22222 2222222 111 11 1 111 2 1111 1111 111 1111 22 11 1 11111 2222222 111 111 555555555555555555555555 222222222 111111 111 3333333333 2222 11111 111 11111111111 11111111 1 22222222222 11 1111 666666666666666666666666666666666666 111 11111 222 11111 111 111 11 111 3333333 1111 111111 11111 2222222 1 111 2222 1 444444444444444444444 222222 11 22222222222 111111 33333 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 111111 2222222 11 44444444444444444 1111 11111111 1 1 11 11111111111 6666666666666666 22222222 222 1 11 2 1 11 1 11
lowQualScore : 5 1 88 1 1 5 4444 88 5 5 4444 1 777 7 44 33 33 555555 222222 00 0 1 0 33 1111 33 0 0 2 333333333333333333333333333333333333 8 5 666666666666 1 0 666666 0 6 1 666666666666666666 6 6 5 0 77 5 5 0 8 0 5 77 1 1 000 77 1 5 5 1 5 5 5 5 0 5 5 5 0 77 1 5 1 33 1 1 66 99 999 6 7 1 999999 0 6 6 77 5 33 5 5 5 1 0 0000 0 1 00000 5 5 1 1 5 5 888 1 66 66 5 5 888 5 5 1 5 1 1 2 5 222222222 6 99 1 6 44 99 6 111111111111 6 1 6 4444444444444444 6 3333333 6 1 88888 5 000 77 5 5 2 5 1 5555555 6 3 6 6 1111 0 6 6 6 66666 6 1 6 6 666666666 6 4444 6 6 3 3 00000000 6 6 0000 6 6 6 6 6 6 9 33 6 1 6 4444 11 3 66666666666666 8 8 444 4444444 11111 0 22222222 11 8 666666 1 6 6 2222222 1 6 1 99 1 77 1 0000000000000 6 44444 6 6 99 99 6 88 6 7777 8 0 8 11 8 8 11 0 7777 8 8 444 1 11 1 00000 0 5555555 0 111 3 8 6 3 11 6 444 11 0 0 7777 3 5555 8 444 1 8 2222 55 11 8 5 11 8 8 33333 8 1111111 6 000 555 5 77 88 5 888 555555555555555555555555 1 1 1 5 7777 3 888 777777777 5 5 5 5 5 0 111111 5 5 5 5 000 5 77 2222222222 0000 44444 1 8 5 77 000 99999999999 4 5 5 0 5 5 66 5 0 88888888 0 4 4 66 0 4 22222222222 4 5 5 77 5 5 11 2222 6 66 777 7 4 0 55 4 4 555555555555555555555555555555555555 66 222 66 22222 000 22222 000 5 777 44 22 77 4 8 55 222 4444444 7777 2 5 88 4 888 3 333333 5 5 77777 6666666 1 6 1 6 6 3 111 99 1 99 6 6 6666 6 5 1 444444444444444444444 000000 8 6 55 6 99999999999 888888 66 44444 8888 44 66 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 8 55 1 0 99999 4 555555 4 5 8 8888 55 4 4 8888888 4 11 55 8 4 1 44444444444444444 4 0000 99999999 3 66 0 5 0 5 66 33 5 2 99999999999 7777777777777777 0 44444444 1 5 5 777 3 33 1 3 5 1 88 1 1 22 1 5 88
lowQualScore : . . .. . . . .... .. . . .... . ... . .. .. .. ...... ...... .. . . . .. .... .. . . . .................................... . . ............ . . ...... . . . .................. . . . . .. . . . . . . .. . . ... .. . . . . . . . . . . . . . .. . . . .. . . .. .. ... . . . ...... . . . .. . .. . . . . . .... . . ..... . . . . . . ... . .. .. . . ... . . . . . . . . ......... . .. . . .. .. . ............ . . . ................ . ....... . . ..... . ... .. . . . . . ....... . . . . .... . . . . ..... . . . . ......... . .... . . . . ........ . . .... . . . . . . . .. . . . .... .. . .............. . . ... ....... ..... . ........ .. . ...... . . . ....... . . . .. . .. . ............. . ..... . . .. .. . .. . .... . . . .. . . .. . .... . . ... . .. . ..... . ....... . ... . . . . .. . ... .. . . .... . .... . ... . . .... .. .. . . .. . . ..... . ....... . ... ... . .. .. . ... ........................ . . . . .... . ... ......... . . . . . . ...... . . . . ... . .. .......... .... ..... . . . .. ... ........... . . . . . . .. . . ........ . . . .. . . ........... . . . .. . . .. .... . .. ... . . . .. . . .................................... .. ... .. ..... ... ..... ... . ... .. .. .. . . .. ... ....... .... . . .. . ... . ...... . . ..... ....... . . . . . . ... .. . .. . . .... . . . ..................... ...... . . .. . ........... ...... .. ..... .... .. .. .................................................... . .. . . ..... . ...... . . . .... .. . . ....... . .. .. . . . ................. . .... ........ . .. . . . . .. .. . . ........... ................ . ........ . . . ... . .. . . . . .. . . .. . . ..
lowQualScore : 0 0 55 0 0 5 0000 00 5 5 0000 0 777 3 00 22 88 222222 222222 22 0 0 0 88 2222 88 0 0 5 444444444444444444444444444444444444 0 6 888888888888 0 8 000000 4 7 7 777777777777777777 7 7 7 4 11 7 7 3 6 7 7 99 7 0 000 99 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 1 99 7 7 0 66 7 4 00 22 333 7 8 0 222222 7 7 7 44 7 66 0 0 0 0 1 6666 8 4 22222 0 0 0 0 0 0 888 0 99 99 0 0 888 0 0 7 4 4 0 1 0 333333333 7 22 0 7 88 22 7 777777777777 7 0 4 6666666666666666 7 0000000 4 0 33333 7 000 99 7 7 3 7 0 3333333 7 5 7 7 2222 7 7 7 7 77777 7 0 7 7 777777777 7 2222 7 7 3 7 88888888 7 7 8888 7 7 7 7 7 7 8 55 7 0 7 2222 44 8 22222222222222 0 0 222 8888888 44444 8 44444444 00 0 000000 0 7 7 8888888 0 7 0 22 0 00 0 3333333333333 7 55555 3 7 22 22 7 22 7 0000 0 6 0 00 0 0 00 8 0000 0 0 000 4 00 0 00000 8 6666666 8 888 2 0 0 8 00 0 000 44 6 0 0000 2 0000 0 000 4 0 2222 44 00 0 0 66 0 0 00000 0 7777777 7 000 777 7 00 77 7 333 666666666666666666666666 0 3 0 0 8888 1 888 444444444 0 0 0 0 7 6 000000 7 7 7 7 000 7 99 7777777777 6666 33333 0 9 7 99 333 00000000000 3 0 0 8 0 0 99 0 2 11111111 0 4 4 11 1 4 66666666666 3 7 7 00 0 0 66 7777 3 11 000 3 0 7 55 0 0 777777777777777777777777777777777777 99 444 99 55555 000 55555 444 0 555 44 22 11 4 9 44 222 4444444 0000 2 6 33 4 888 2 666666 9 2 33333 7777777 0 7 0 7 7 3 333 22 0 22 7 7 2222 7 5 0 000000000000000000000 444444 0 7 88 7 33333333333 333333 11 55555 5555 66 11 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 55 0 7 00000 0 555555 0 7 9 5555 00 0 0 5555555 0 00 55 9 4 0 00000000000000000 4 6666 11111111 2 99 0 0 0 0 99 88 0 5 66666666666 3333333333333333 7 22222222 0 7 7 222 3 88 0 3 0 0 00 0 0 00 0 5 00
consensus : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GCTAGTT-TTTCA-------G-ATGGAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCTG--AAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTCCT-TTACCAACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-T-G--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATGC--T-CTG-TA-ANGANT-G-C---CAANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCCGGAGGC-AT--AAATTTATNGA-TTTAG--AGA-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGAT----TT-CAGAAGGTCCA-TC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CTCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TCAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGTCCGTTGTTAGAAGAANTACAGCAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTCATA--TCT-CCATGACT-TT-CGTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TNCCT-ATCCTCCNCAAA--GNTCGCAANTN----------T-AATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-GATTCCCG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACCCCA-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAACG---AGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTTAG----CATCAGCGGAA---TCTACAA-GTAAA---CGGAAGAAA-CAA-G--ACAAGGAGATAAGA--AATCTG-ATGTGGAAA-CAAA-CAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTATC-GGG-TGTT-G-AA--G---TTT-ATGG---CAT----TATNTCACTNGAT-AAA-T--CGG---GCAGGA-CTT-CTGGG-TC-A-GT-GAC-TTAG--A---TAA-CCT-TGTCC-AAACAG-A---T-CTA--CAGGGGA-AATCTG-ANCTAC---GGAA-----GATANAAACCAGTGGT-G--GAT-ACGG------CTA--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TT-AGCAGA--------CAGAG-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCACA-GAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGACACCCA-NT-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATG-AA---GACGGT-ATNG----GGCTA-AAGT--CAC-NCG--GTAC-----AGCAA--AGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-----CGATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-TAGTTGGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C-AA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACGAG--GTTCAGAAAGA-TCAG-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-NCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CANGG-CA--GTACGGC---G-TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--TTACA-GTGAG--TCCTCTTANT-GTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
Reference ( family-437 ) : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GCTAGTT-TTTCA-------G-ATGGAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCTG--AAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTCCT-TTACCAACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-T-G--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATGC--T-CTG-TA-ANGANT-G-C---CAANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCCGGAGGC-AT--AAATTTATNGA-TTTAG--AGA-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGAT----TT-CAGAAGGTCCA-TC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CTCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TCAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGTCCGTTGTTAGAAGAANTACAGCAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTCATA--TCT-CCATGACT-TT-CGTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TNCCT-ATCCTCCNCAAA--GNTCGCAANTN----------T-AATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-GATTCCCG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACCCCA-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAACG---AGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTTAG----CATCAGCGGAN---TCTACAA-GTAAA---CGGAAGAAA-CAA-G--ACAAGGAGATAAGA--AATCTG-ATGTGGAAA-CAAA-CAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTATC-GGG-TGTT-G-AA--G---TTT-ATGG---CAT----TATNTCACTNGAT-AAA-T--CGG---GCAGGA-CTT-CTGGG-TC-A-GT-GAC-TTAG--A---TAA-CCT-TGTCC-AAACAG-A---T-CTA--CAGGGGA-AATCTG-ANCTAC---GGAA-----GATANAAACCAGTGGT-G--GAT-ACGG------CTN--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TT-AGCAGA--------CAGAG-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCACA-GAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGACACCCA-NT-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATG-AA---GACGGT-ATNG----GGCTA-AAGT--CAC-NCG--GTAC-----AGCAA--AGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-----CGATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-TAGTTGGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C-AA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACGAG--GTTCAGAAAGA-TCAG-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-NCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CANGG-CA--GTACGGC---G-TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--TTACA-GTGAG--TCCTCTTANTGGTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
gi|1 : TTTAAATCTCACTGCT-GCATTTCCAA--AGTCCCCTCAAATAGAAAGCCATTTGTCATTT----TG--GGTCAAACACAGAT-ATTGTAAAGTACT----GAAAAACAACATCTCA-A-TT-AC-GTCTAGATACAA--GTGAAT----A-GCTATAAAATCAGGTAAAG-AACATTTTCAAGCA-ATGACTTTTTTG--ATAATTAAGTCCT--TGGAATAT-GATA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GTTAGTT-TTTCA-------GTATGGAGTATTTTT---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TT-CAAAATTA----------------G-TAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--T-GTGAA---TTTTATT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGTCGAG-A-TA-AACATCTG--AAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-AG--T-GTTCTTCTTATTTGCAGCGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAAAAGT-G--CGAAGGCC-C-ACCCAACGAAAGA----TATTGACCTTT--T-TTG-TA-ATGAGT-GCC---CAAGTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-GATACAAACACTGGAAGAGTCAT--TTCTGGGCC-AT--AAATTTATAGATTTTAGGAGGA-CAAT-C--TATT---CAGAAAAGT-TATCACTA--------T--TTCA-AGA-GGAGGTC---TT-CAGAAAGTCCATTC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAGGAT-TTAAAGAAAG--AT------CAAA-GAAG-ATG-CTGG--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TGATTCAT-GGACAG---------TCT-A----AAA-ACA-GCCA-TGAA-GCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCATTGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACAAGTAAAC-AATA-TA----GAAAAATCCATTGTTAGGAGGAG-ACAAAAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTC-TA--TCT-CCGTGACT-TT-TGTCAAAGAG---CC-ATGGC------TTCCT-ATCCTCTTCGAA--GATCACAGACT----------T-AATTCCCAAA-CTTTTTGAGAG-GAAACCTGAAAAA--TCCGA--TCCATAC-CC-AAG-ACAACAA----AACCA-GTACCCCCA-GT--G-T-TTACT--GC-GGTCA----TTAC-A-GCAAAG---ATGATGTTGTCAAAT--TACTAGGG-----AAGGTAGAAATT---AGAGAGACCAA--ACCAA-AG-AAA---G--AAAAATAAAAACCT---ATGGAG--TGGCTGCTCCTTCAG----TAGCACCGAAA---TCTACAA-GCAGG---CAGATGAAA-CAA-G--ACAGGGAGATAAGA--AATCTG-ATGTTGA----AAA-CAACTT--GTCTCTATTCTCCCTCTG-------TC-ACTGA---GGTCTGGGAG---TT-TAG-GGTATC-TGG-TATT-ACAA--ACTTTTT-ATGG---CAT----TATATCACTTGAT-AAATT--CAG---GCAGGA-CTTCCTGGG-CC-ATGT-GAC-GTAG--A---TAA-CCT-TGTCCAAAACAG-A---T-TTA--CAGGGGG-AATCTG-ACCTACTTTGGAA-----AGTAAAAACTA-TGGT-G--GAT-TTGG------GTT--CCACA-AGTCACA-CAGG-ATGGGTTT-CTG-ATC--TT-AGCAGA--------CAAAG-CAAATAAAGTCATC-AATAGTG--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCACA-GAATTCA-TG-AAAA-AGGG-GACT-GGACACCCACTT-CAGTATA--CA---CTGCCTCCAC-ATCGAA-TGAGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-AT--AA---AACGGTAAACA----GGCTA-AAGT--CAC-CCG--ATAC-----AGCAA--AGACA-GAA-----AAGAACTACAGAA-CATAAC---AG-CGGATA--ACAAT-G-GACAG-GGACTTTAT---AG-----CAATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGGAA---ATATGAA-T----GGAGATATCTGCACATC---A-GAC---CT--TAATAA-AGAGG-CA-GTTAGTTGGT--GTTGAA--TAAATTCAGGA-CAAA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACAAG--GTTCAGAAAGG-TCAA-GGTT-CT--TC-CC----CGG----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCTTCAG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------TAC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TT-CA--CTTCTT-A---GATTC------AG-GACGGTC-GGTTCTTG----TCAATT-ACT-ACCTC----CA-C--AA--AAC-AACCAAGC-CA--GTACAGC---G-TCC-CC----GTTG---T----CTGTGTGT--AG-ATTG-A-TGAAGAA--AC-AATCTCTAT-TA------GA----AATA--------TG--G---ACACAGT--------GACAGTGC-ATAGCGTATCTGTTACAGGTGAG--TCCTCTTACT-GTCAATCAA-ACATTGCCTCAC--AGATTTCACAGCTTGTGACCATTGAGATTATATTAAAAGAATACTAGACAATTTA
gi|10 : AAACAAAA-GACT-GG-CAACCA-AT-CAGCGTG--CA---TTCCTCTCAC-ATTAAC-GGCGAC--ATA-CTGGTGG-G-G----ATG-AA---G-------T--------CTA-AAGT--CAC-TCA--GTAC-----AGCAA---GACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAAGGACG--ACAAA-G-GACAG-GACCTGTAT---AG-----TGATC-C--ACACTACAT-AAC-AGAAA---ACACCAA-C----GAGGATATTTGCGTATC---A-GAT---TA--TAATAAGACAGGCCG-G-TAGGTGGT--GTTTAA--C-AA-TCAGAG-C----TACAGTGTTTTTTCGCCTAATTAC--A-GAG----TCAG--AGATTCAGAGAGT-CT--TTACC----TACAGCGGAAATATGT------CTGACCTGTTGTTGG----CCAC----ATAGTGATA-TGGTTGATTATTTAAGCC---TAT---TACAAT---------------------------TC-TA--CT--CT-T---GA-CCT-----AG-GATGGgcccacgcgaataa
gi|11 : tcATCTCA-A-TTTACA-TCTAG-TACGT--GTGAATTAATG-GCT-TA---TCGAGTAAATGAATATTTTCAAGCA-ATTACTTTTT-G--ATAT----GTCCTAATGGAATTT-GACA-TGT-----------------------------TT--------GCTAGTT-TT-CA-------G-A----GTATTTTT---TGTATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGC-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATT--GCAATTCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCTG--AAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-gc
gi|12 : cCAACACTCTTATAGAGTGT-GCCA-------GGCTGCC-ACCA--AA--TACTCAAAAGTTCTATT--GCACGACTG-TTCAGCCAGC-AAATGT-G-TGAAC-AACACAAGG-A-TATCACATCCGGGAAGA---C-AAAAAACAAA--A--C-TGA-TG--TGGTTC-T-TTACCAAGAA-GAATA------CAAGAATTGCCAA-CAG-AGGAA-TTGTCC-AA--TC-C-ACCCCAA-AAGGA----CCTTAAAATTT--A-CTG-CA-AAGAAT-G-C---CTACTCCCA--AT--CTGTT-CC-AAA---T-G-tg
gi|13 : -AAA-T--CAG---GCAG-A-CT--CTGGG-CC-A-GT-GAC-TGGC--A---TAA-CCT-TGTCG-AAACAG-A---T-CTA--CAGGGGA-A-TCTG---CTAC---AGGA-----AATAAAAAACTATGGT-G--GAC-ATGG------GTT--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TT-AGCAGA--------CAGAG-CAAATAAAGTCATC-AGTAG-G--ATTACGCAG-GATAAT---A-----CTATCACA-GAATTCA-TG-AAAACAGGG-GACT-GGG-AACCA-TA-CAGCATA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-GATG-GTG-Acttaccaccaaccacaacagtcaccaagtagccttgatcttgagtaatc
gi|14 : CTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGAAG---TT-CAG-TGTGCC-GGG-TGTT-A-AG--G-------A-GG---CATCCCATATTTCATTAGGT-AAA-C--AGG---GCAA-A-CTG--TGGG-TC-A-GT-GATATTAGTGG---TGA-CCT-TGTCC-AAACAG-A---T-CTA--CAGGGGA-A--CC--AGCTAC---AGAA-----GATACAAACCAGTGGT-G--GAT-ACGG------CTA--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATC--TT-TACAGA--------CAGAG-ACAATAAAGGCATC-AATAA-G--ATAACA-AG-GA
gi|15 : A--CGTCCGCGA-----CAC----GTACTGGTT-TG--TGAT-------GACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGA-TC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC-TCG-ACT-GC--TGGGACA-CGAAA--AACAAA-CATGGATA--ACACAG-------TC-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGAA-CGTA-CGG--CATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATATC---TACA-atactcatagcaaaacaatcat
gi|16 : A--CGTCCGCGA-----CAC----GTACTGGTT-TG--TGAT-------GACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGA-TC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC-TCG-ACT-GC--TGGGACA-CGAAA--AACAAA-CATGGATA--ACACAG-------TC-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGAA-CGTA-CGG--CATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATATC---TACA-
gi|17 : ACAAGTAAAC-AAAA-TA----GAAAAGTT-GTTGTTAGAAGAG--AC--CAA--T-AGCC-AGGA-T--GACTC--AT---TG--AAAGATTATAT---TGCC-TA--TCT-CCATGACT-TT--GTCAAACAGT-TCC-ATGGC------TTCCT-ATCCTCTCCAAC--GATCACTGCTC----------T-AATTCAAAAA-CTTTTTGAGAAGGA--CCTG-AAAA--TCCGA--TCCATAC-CC-GAG-AC
gi|18 : TCGG---T-CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------TTC-------G-G----TA---------------C-TG-------TT-CA--TATCCT-T---GA-TC------AG-GATGGTC-AGTTCTTG----TC-TCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AGA-AA-CAGAA-CA---TAC-AC---GATCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CAA--GA--AC-AATCTTTATGTTG-----GACAACGATA--------CACCA---ACACAGT--------GACAGTGT-ACAA-ATA
gi|19 : GTCCA-TC-AATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAAAC-TTAAAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CT-G--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TTAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACTAGTAAAC-GAAA-TA----GAAA
gi|2 : A-GGAGGTGTTTTT-CAAAGGTTCCA-TCAGATATG-TCTTGTTTC--A-AACATC-ACAAGATGTTATA-AAGGAAATGATATTCAAATGAAG-ATG-CTGG--CGG-A-AATGAA-----AGAATGA-TCATTGGATCG---------TCTTA----AGA-ACA-GCCAATGGAAGCTGATGGAGAGG-------TCTCTGCATAAATTAGGCA-TGGTGAATCAGCAGT-GGATGTCA-GAAA-TATTGAACAAGTAA-C-AGGAATATCAGGAAAAGTTGGTTGTGAGAAGAAG-AGAGCCAGCTGAGCC-AGGAAT--GAAACTCATG--TGGAAA-GATTGTATAATTGCGCTAAGTCT-CCATGACTGTTGTGTCAAACAGTGTCCGATGGTGGGCTTTCCCTCATCCTCTACAAACAGAT-GCAACTGGGGCGCTGCTC-AATTGCAAAAACTTTTTGAGAA-GGACCCTG-AAAGATTCCGGATCCCATACGCGCGAGTACAGTAATGAAAACCAAGTCCCCCCAAGTCAG-TATTACTTCGCTGGTCATTGGGTATCACGCAAAGGGAAGAATGTTGTCAAAGGATACTGAGGGTGAAAAGATAGAAAATTATAAGGAGACCAATTACCAATAGTAAAAGTA--AAGAATTAAAACGCTAAATGGAAAGTGGCTGCTCCTTTAGTGAGCAT--GCGGAAATGCTTACAAAGTAAGGTGCGAATGAAAACAA-ATTACAAGGAGATAAGATAAATCTGGATGTGGAAAACAAAACCA--TTGGTCTCTA-GTGTCCTCTAGTACAGTTT-ACTGAATTGGTGAGGGAGA--TTGCAG-GGTATTTGGG-TGTT-G-AATCG---TTTTATGGGCATAT----TATCTCCGTTCAT-AAA-TGCCGGACCGCAGGAACTT-CTGGC-TCGA-GTTAAC-TTAG--A---TAAACCTGTGTCC-AAACAGTA---TTCTAAGCAGGGGATAGTCTT-GCTTACAA-GGAATTATTAAGATAAGCTA-TGGTTG--GAC-TTGGGATTCTCTAATTCACA-AGTCACAGCAGGTATGGGGTTACTGTATC--TTTAGCAGAGCGAATCACAAATTAAGATATAGTCATCGAATTA-GGTATAACACAATGGTGAC--AAATACTCTATCACAAGAATTCA-TTAAAAACAGGACGACTGGGATACCAA-CTGCAGCATATTCATCTCTCTGCCCAC-ATCAACTGGGGACAGATATCTGGTGG-G----G-ATGTAATTGGAC--T-ATAG----GACTACAAGT--CAC-TTGCCGTATTATCAAGCAATTAGACAGGGAACATGAAGAACTACAGAATCAT-AC---AGTGGGATA--ACAAGTGTGATCG-GA-CTGTATG--AGTATGCCAATC-------CTACATGCACTAGAAAAAGATATAAAGCTGGAGGTGATATCTGATTAGCAATA-GATG--CTGCTGGTAA-AGAGG-CGAG-TAGT--GTTAGGTTAAAGTAAA-TCAGGACC-AATCACA--GTTTCTCC------T-----ACAAA--GGTCAG-AAGA-TCAG-GGTTGCTGATC-GCGTGTAAT----GGAATCCGTGGTAGCCTGA--TGTCCTCGG----TCACGAGTATCCTGGTGCTG--TGATAG-----ACC---AAT-T-GACGATT---------------GTTG-------TT-CATGCTGCTTAA---GA-TTCAAATGAA-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-ATTAACTGACG-T----CA-C--AAGGAAC--A-CAAGG--ATTGTA-GGCGTTG-TCC-GCTTGTGTAG---TTCTAGTGTGTTTCAAG-A-TG-AGTGA--GA--ACAAATCTCTAT-TAGTTAGTGA----GATA--------GG--G---ACACAGTTCAAGTGAGATAGTGTAATAG-GTACT--CTACATGTGAAGTTTCTCTTAATGGTCAATCAA
gi|20 : ctctgtgca--CA---CTCCTCCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CTTGTGG-G-G-------------AATGTT-ATTG----GG----GAGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAG----GT-ATTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG------AATC-CCAATG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|21 : --CA---CTCCTCCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CTTGTGG-G-G-------------AATGTT-ATTG----GG----GAGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAG----GT-ATTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG------AATC-CCAATG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|22 : -AAGGCC-CCAACCAACTAAAAAGGAATATTGACATGCACT-CTGGTA-ACAAATTG-CAGATAAGTTTCA--TTTTGTGTT-CA-AAAAATT-G-TGCAACAACTGG-AGAGTCATA-TTTGG--GC-AT--AAATTAATAGA-TTTAG--AGAGCAAT-TGATATTCAGGGGAAAAGT-TATC
gi|23 : gca-T-G--C-AAGGTC-C-ACCCCACTAAGGA----TATAGACATGC--C-TTG-TG-TAGATT-G-C---CAGCTTCCA--AT--ATGTT-CC-AAA---T-G-TTC-AACACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGC-AT--GAACTTGTTGA-TTTAG--AGA-TAAT-C--TATG---AAGAAAAGA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGA
gi|24 : CTAC---AGAA-----GATACCAACCAATGGT-GAAGATGAAGG------CTA--CCACACCGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATG--TT-TGCGGA--------TAGTG-ACAATAACGTCATA-AATAA-G--ACAACATCG-GATAAT--AA-----TG
gi|25 : ---GGTCAGGGAG---TT-CAG-GGTATT-GGG-TGTT-G-AA--G---TTTTATGG---CAT-----ATATCCCTTCAT-AAA-T--CCG---ACAG-A-CT--CTGGG-CC-A-GT-AAC-TTAG--A---TAA-CCT-TGTCC-AAACAG-A---T-CTA--CAGGGGtc
gi|26 : ctatTCACA-CAGG-ATGGGGTT-CTG-ATC--TT-AGCAGA--------AAAAG-CAAGTAAAGTCATC-AAGAG-G--ATAACACAC-GATAAT---A-----CTATCACA-GGATTCA-TG-AAAACAGGG-GACT-GGACACC
gi|27 : ACAT-CGC-AGAAA---ACATCAA-T----GGTGATGTCTGCGTGTC---C-GAC---TA--CAATAA-ACAAG-CT-G-TAG-TAGT--GGTAAA--TAAA-TCAAAT-C-AC-CACAG-G-TTCTCC-------TAC--A-GAG--GTa
gi|28 : GTTCTTG----TC-ATT-ACT-AC--T----CA-C--AC--TAC-AA-CACGG--A--GTACGGT---T-TCC-CT----ATAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-TGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GAAA--------TG--T---ACACca
gi|29 : gAATAAAGTCATC-AATAA-A--ATGGCACAG-AACAAT--AA------AATTAAA-AAGTTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGGCACCCA--T-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATTAA
gi|3 : TCAGATGGCACATTCCAAAACTGTAGCGTACCAAATATGGGTAC-AACCCCAGCACTTTT-TAGAATGT-GGCATC-GAA-GATTGC-GAG-AG-AAAATTGTCAA---CCTTACT--GCAATCCTT-GCCA-TC-GC-AGATGTTG-TCAAC-AATGCACAGCA-CG-AGCATCTG--AAGAATCC-AGATTACAAAGAAACCATGA-GG--TGGTCCCT-T-ACCAACAACGAAAA------CGACATCTTCCTG-TGG-AAAA--T-G--C-AAGATC-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGACATGC--T--TG-TG-TGGATT-G-C---CAGCTTCCA--TT--ATGCTACA-AAA---T-G-TTTCAACACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGC-AT--GAACTTGTTGA-TT-AG--AGA-CAAT-A--TAGAA--GAAAAAAAA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGAGAT----AT-CA-AAGGTCGA-CA-AGTATT-TTCT---TC--C-CACATC-ACA-GAT-TTACAGAAAGAAAT-------AAA-GG-G-ATG-CCCA--CAG-AGAAT-AA-----AGA-TGA-TCCA-AGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTG-TGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TATCA-GAAA-TATC-AACAAGTGGACTAATA--A----GAACAGTC-ATTGCT-GAGAAATTACAG-------AGTCGAAGA-T---ACAC--ATATTTG--AT-GAT-ACAT---T-TCATA--TCTTCCATGACC-T---GTCAAAATAT-TC--ATGG-------TAACT-ATCCTCCACAAA--ACTTACAATCA----------TTAATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-G-TTCCAG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACACCA-GT--GTT-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGG-----AAAAT-GAAGCG---GAAAAG---AA--ACAAGCGG-GGGTGCGGAAAAAAT-AAAACAC---ATGGACATTATAT-CTCCTTTAG----CATCAGTGGAC---TCTACAA-GTAAA---CGAAAGAAA-CAAGG--ACAAG--GATAAGG--ATCTTG-ATGT-GAAA-CAAA-CAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TTCACTGA---GGTCA-GGAA---TT-CAGTTGTATC-AGATTGTTAG-CA--G---TGC-ATTC---CA-----TATTTCACTAGGTAAAA-T--CAG---GCA-AA-CTT-ATGGATTC-A-GT-GAT-TTTG--ATGGTAA-CCT-TGTCC--AACAG-ACAGT-C-A--CTGAGGA----CTGCAACTAC---AAAA-----ATTACGAACCAGTGAT-G--GAT-ACGG------CT----CACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAC-CTG-ATCTTTT-A-CAGA--------C-GAGAAAAATAAAGTCATC-AATAA-A--ACAAT---G-GGTAATCAAA-----AGA--A-A-AAATTCATTT-CAAACAAAA-GACT-GGA-AACCA-AT-AAGC-TA--CA---CT-CTCAC-C-ATTAAC-GGGAAC--ATA-CTGGTGG-G-A-TG-AGG-AA---G--GAT-ATGGGTGAGGCTA-AA-TCACAC-TCG--GTAC-----AGCAA----ACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAA-G-GACAG-GACCTGTATTAGAG------GATC-C--ACACTA-AT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GG-GATATTTG-GTATC---ACGAC---AT--ATATAA-AAAGG-CA-GTTAGTGCGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C----TACAG-G-TTCTCC-------TACAAACG------TCAGAA--G-TTAA-GATT-TA--TC-CC----TTT----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG----TCAT----CTCCTGGTG-TG--TGAT-------------------GAAAACA---------------G-TGAAACAATTT-CA--ATTTCT-C---GA-T-------AGTGAGGGTC-A-TTCTTG----TC-TCT--CT-AC--T----CA-C--AA--AGA-AA-CAGAA-CAT-ATAC--T---A-TCCACC----G-AG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CGA--GA--AC-AATCTTTATGTAG-----
gi|30 : t-CA--CCTGCT-G---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCCCG----TC-TCT-ACT-GC--TGA--CACC--AG--AAC-AA-CATGG--A--ATACACC---A-TCC-Ca
gi|32 : AGGTTCA-CG-AATATT-TCCT---TC--C-AACTTC-ACAGGAT-TTACAAAAACAAGT------atg
gi|33 : -CT--TC-CC----TAT----GGTATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG----TCAC----ATCCTG
gi|34 : CTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G----A-ATG-AG---GA
gi|35 : --ACAAT-G-GACAG-GGACTGTAT---GG-----GTATC-C--ATGCTACAT-CAC-atga
gi|36 : aGTGT-ATAG-GTATC--T-ACA-GTGAG--TCCTCTTA
gi|4 : -AT----------------------TTT---------CTA--T-TTGTA-------G-A--GAGT----CC---T--ATTTATCAAATGGCAC-ATTCCAAACTAAGTGTACCAAGCCTG-GGTAC-A-CCCCAGCATTTTA-TAGAGTGT-GACATT-GAC-GAATGC-GAGAGG-AA--TTGTCAG---TTTTACT--GCAATTCTT-GCCA-TCTGC-AGATGT-G-TGAAC-AATGCAGAG-A-GG-AACATCTG--AAGAATAC-AGATTACCAG--AGCCATGA-GG--TGGT-CCT-TTACCAACAACGAAAAACGAAACGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-T-G--C-AAGACT-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGATATGC--T-TTG-TG-AGGAAT-G-T---CAAATTCCA--CT--ATGTT-CC-AAG---T-G-TGCAA-CACAGGCAGA-TCAT----CGG-GGC-AT--AAATTCATTGA-TCTGG--AGA-CAAT-C--T--T---GAGGAAAATATAGCACTT--------CGCCTCA-AGA-AGATAT----C--CAAAA--TCCA-AG-AATATT-TCCT---TC--C-GACATC-ACAAGAT-TTACAGAAAGAAAT------TAAA-GGTG-ATA-CCCA--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TAA-TCAT-GGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCTA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCCCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATGCATCAGGTGGAC-AAGA-TA----GAACAGTCC-TTGATGGAACAATTACAG-AA--T----C-AAGA-TTCAACAT---T---TG--AT-GATTACAT---T-TCATA--TCT-CAATGAC--CT-CGTCAAAGAGT-TTC-ATGGC------TACAT-GTTTTCCCCAAA--GCTTGCAAATA----------T-AATTTCCAAT-CTTTCTAAGAA--ATTCTCA-GAAA--TTCGA--CCCATAC-CA-GAA-ACAACAA----CAGTG-GTGACCCCA-AT--G-T-TTACT--GCTGGTCG----ATAT-A-GCAAAG---ATAATGTGGCCAAAT--TACTAGGG-----AAAATAAATGTG---AGGGATACCAA-----AGCAG-AGATGAG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCT-CTCCCTCAA----CATCAGTGGAA---TCTACAA-GTAAA---CAGAAGAAA-CGA-G--ATAAT--GATAAGA--AATCTT-ATGT-GAAA-CAAA-CAA--T--GCCCATA-TCTTCATATG-------TC-TCTGA---GTTTAGGGAGATATT-----TGTATT-----TGTT-A-AA--G----AA-ATGA---CCCA---TATCTCCCTTGAT-AAA-G--CAG---GCAAG---CT-ATGGG-TC-A-GT-GGC-AGTG--A---TAA-CCT-TGTAC-AAACAG-A---C-TTA--CA-AGGA-AAGC---AGCTGC---TGAG-----GATAAAGATCAGTAGT-G--GAT-CTGG------CTA--CCACACAGTCACA-CGGG-ACGGGGTG-CTC-ATC--TT-AACAGA--------CAGAT-ACAATAAAGTCATC-AACAA-G--ATAACACCG-GATCAT--AA------GATAAAA-AAGTTCT-TT-AGAACAGGA-AGCT-GGA-ACCCA-AT-CAGCATA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-GTA-TG-ATA---------GGTAAGGG----GGCCA-GAGT--CAC-ACG--GTAC-----AAC-G--AGAAAGGGA-----AAGAACTACATAT-CAT-AC---AAACAGATG--ATAAA-G-GACAG-AAACTATAT---AG-----cattgc
gi|5 : tcatttatTTCAAATCTCACTGCTCGAATTTCCAATAAATCCCCTCAAAGAGAATGTCA-TTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGT-AAGTACTTGTAAAAAAACAAAATCTCACATTTTACAGTCTAG--ACGTTGGTGAAT----GCGCTGTG---TCGGGTAAAATGATATTTTCAGGCATATTACTTTTT-GAAATGA----ATTCT--TGGAGTTTGGACATTGTCTACAT----------------------CTTCTACTGCAGTTAGTTGTTTCACGATGGCG-ATGGTGTATTTTTTAGT--ATTTATTAGA--GCAC-TTTCAAAAGTA-----------------TTACGA-CCC--GCACTTCC-TTAGGTGCGGGCATTCGAATGAGAG-CGAGCAGAAA--TTGTAGC---ATTTACTGCGCATTGCTTGGTCA-TCACCGAAATGT-GATAAACTAATGTCGAG-AGTA-AACA-CTG--AAGAGTCCAAGAATACAAAT-AGC--TGACAGTTTGGTT-CT-CTATT-ACAACATAAA------CAACAACTTCCTGCTGGAAAAAA-T-GC-C-AAGGCCAC-GGCCAACTAAGTA-----GTTGAGAGAC--TACTG-TAGATGAAT-G-C---CAGTCTCCAATTT--GT-TT-CACAAA---TCG-TAC-AACACTGGTAGAGTCACTGTCTG--GGCTACTAAAATTTATAGA-T------AGG-CAATAC--TATC-------AAAGT-TATT-CTAACAATTTTTG-TCCATCGACGGAGAG----TTACAGATGGTCCATTC-AATATTATCCT---TCAACAAACATCAACAAGAT-TTAAAGGAAGAGATCA----CAAA-GAAGAATGACGCGAACGGTA-AAT-AAATACTAGA-C-A-CTAT-GGCCAGGTTTCAGCTTCT-ATTTTAGATACATGCCATTGTAAGCCAACTGGGAGGATGTTTCTCTCT-CC-AAAT---ACA-TGGTGGA-CC-CAGTGGG-TGTCAGGAAAGTATAGAAC
gi|6 : A--TGTCCTCGG---T-CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------CCA---TATCGTGACAAAT---------------G-TG-------TT-CA--TCTTCT-A---GA-TC------AG-GACGGTC-GGTTCTTG----TC-ATT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CAAGG--A--GTAGAAT---A-TCC-CT----ATAG---T----GTATGTGT--AG-A-TG-A-TGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATT--------AT--G---ACACAGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC---TACA-GTGAG--TTCTCTTATT-GTCAATCAACACACTACCACACAGAGATTTCACAACTTGTGACCAATGAGATAATATTTTATGAAT-CT--ACAATTTAt
gi|7 : A---CTCCTCTCAC-ATTAAT-GGAGAC--ATA-CTAGTAGAG-G-TGGATA-AA---GATGGG-AAAC----GG--A-AAGT--GAT-CAG--ATAC-----AGCAA---GAGAGGAA-----AGAAGCTCCAAGA-AAT-TC---AGAAGGATG--ATAAA-G-GACAA-GATCTATAC---TG-----T-ATCAT--AGGGTGCAT-CAC-AGAAA---ACATTAA-C----GGTGACATCTGTGTATC---C-GACCCTCT--TCGTAA-GAAGG-TG-G-----TGGT--AGTGAC--CAGA-TTAGGA-C-AG-TATCG-G-TTCT-C------TTAC--TTTGGTCATCCATTACAA-CCTG-GATT-CTA-TC-CA----AAC----AGAATGTGTA-----CAGA--TG-CCTTGGGAATT-------ATCTTGGTC-TG--TAGT-------TGT---GGT-G-G-TAGTAAATGTGAGACCTGGGG-TA-------TC-CA--CATGTT-T---GA-CC------AG-GACGGTC-AGTTCCTGAATTTC-CTC-ATC-ACA-T----CA-C--AA--Aatgaatgaataaggctgatacaactatactagaaaatacacagtagagtgtatggaatccccataattaaccaaacaagttgctgattatatgtgcaagtttaactatgatttacagtcacttacattgttaagtatgcaaaacaacagtgtgtgacaatcaaaagatatctttaattatcctgtagctttcaatttacaatatctgaatatcacgatattactactaagagctagatttgaaaaaggtcttgtttatgaaataagattttagaaaataagattctccctttcagttttatataattcaattatttcttctttcattctacatttacaatagcatcctatggga
gi|8 : ct-TACAT--GTGAAT----G-GAT-TA---TCGGGTAATTTAATATTTTCAAGCA-ATGACTTTTT-G--ATAA----ATCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-GTATTGCCTACATTCTACTGTAAGTTT--------GCTAGTT-TTTCA-------GGATAGAATATTTTG---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCGTT-GAA-GATTGT-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACACCTG--AAGAGTCC-AGAAAACAAA--AACCATGA-AG--TGGTT-CT-CTATCTACAACGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAATG-T-G--C-AAGGCC-C-ACCCAACTAAAGA----TATTGACATCC--T-CTG-TA-ACAATT-G-C---AAAGTTTCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGC-AACACTGG-AGAtgcccagtgcggtctgcactgatgatcaacaaaacgtctgggttggaagttggaacag
gi|9 : GTCAAAATAT-TTC-ATGGT------CACCT-ATCCTCCAGAAA--CCTTACAATTA----------T-AATCCCCAAC-CTTTCTGAGAA-G-TTCCAG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-AAG-ACAACAA----AACCG-GTCACACCC-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGC-----AAAATAGAAAC------GGAAAACAA--ACCAGCAG-AGATGAG--AAAAAT-AAATCCC---ATGAAAATTGTCT-CCCCTTTAA----CATTAGTGGAC---TCTACAA-GTAAA---CAGAAGAAA-CAA-G--ACAAG--GATAAGG--AATCTG-ATGTGG-AA-CAAA-CAA--T--GCCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GATCAGGAAG---TT-CAG-TGTACC-GGG-TGTT-G-AA----------ACGG---TATTCCATATTTCACGAGAT-AAA-T--CAG---GCA-AA-CTT--TGGG-TC-A-AT-GA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): ATATAATTCAACTCTCTTTTCATTCATTCTACATTTAATATAGCATCTATGGG
Alignments
lowQualScore : 1 11 1 2222 11 1 1 2222 111 11 11 11 222222 222222 11 1 1 11 2222 11 1 1 888888888888888888888888888888888888 333333333333 111111 2 888888888888888888 1 111 11 11 111111 11 11 1111 11111 1 1 1 444444444 333333333333 3333333333333333 3333333 11111 111 2222222 1111 11111 222222222 1111 1 33333333 2222 1111 22 33333333333333 111 2222222 11111 22222222 11 222222 2222222 3333333333333 22222 1111 11 11 1111 111 11 22222 2222222 111 11 1 111 2 1111 1111 111 1111 22 11 1 11111 2222222 111 111 555555555555555555555555 222222222 111111 111 3333333333 2222 11111 111 11111111111 11 11111111 22222222222 11 11 1111 666666666666666666666666666666666666 111 11111 222 11111 111 111 11 111 3333333 1111 111111 11111 2222222 1 111 2222 1 444444444444444444444 222222 11 22222222222 111111 33333 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 111111 2222222 11 44444444444444444 1111 11111111 1 1 11 11111111111 6666666666666666 22222222 222 1 11 1 1 11 1 11
lowQualScore : 5 1 88 1 1 5 4444 88 5 5 4444 1 777 7 44 33 33 555555 222222 00 0 1 0 33 1111 33 0 0 2 333333333333333333333333333333333333 8 5 666666666666 1 0 666666 0 6 1 666666666666666666 6 6 5 0 77 5 5 0 8 0 5 77 1 1 000 77 1 5 5 1 5 5 5 5 0 5 5 5 0 77 1 5 1 33 1 4 66 99 66 6 7 1 999999 0 6 6 33 33 5 5 5 1 0 0000 0 1 00000 5 5 1 1 5 5 888 1 66 66 5 5 888 5 5 1 5 1 1 2 5 222222222 6 99 1 6 44 99 6 111111111111 6 1 6 4444444444444444 6 3333333 6 1 88888 5 000 77 5 5 2 5 1 5555555 6 3 6 6 1111 0 6 6 6 66666 6 1 6 6 666666666 6 4444 6 6 3 3 00000000 6 6 0000 6 6 6 6 6 6 9 33 6 1 6 4444 11 3 66666666666666 8 8 444 4444444 11111 0 22222222 11 8 666666 1 6 6 2222222 1 6 1 99 1 77 1 0000000000000 6 44444 6 6 99 99 6 88 6 7777 8 0 8 11 8 8 11 0 7777 8 8 444 1 11 1 00000 0 5555555 0 111 3 8 6 3 11 6 444 11 0 0 7777 3 4444 8 444 1 8 2222 55 11 8 5 999 8 33333 8 1111111 6 000 555 5 77 5 3 5 888 555555555555555555555555 1 1 1 5 7777 3 888 777777777 5 5 5 5 5 0 111111 5 5 5 5 555 77 2222222222 0000 44444 1 8 5 77 000 77777777777 4 5 5 0 5 5 11 0 88888888 666 4 4 66 0 4 22222222222 00 5 77 5 5 11 2222 6 66 777 7 4 0 55 4 4 555555555555555555555555555555555555 66 222 66 22222 000 22222 000 5 777 44 22 77 4 8 55 222 4444444 7777 2 5 88 4 888 3 333333 5 5 77777 6666666 1 6 1 6 6 3 111 99 1 99 6 6 6666 6 5 1 444444444444444444444 000000 8 6 55 6 99999999999 888888 66 44444 8888 44 66 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 8 55 1 0 99999 4 555555 4 5 8 8888 55 4 4 8888888 4 11 55 8 4 1 44444444444444444 4 0000 99999999 3 66 0 5 0 5 66 33 5 2 99999999999 7777777777777777 0 44444444 1 5 5 777 3 33 1 3 5 1 88 1 1 22 1 5 88
lowQualScore : . . .. . . . .... .. . . .... . ... . .. .. .. ...... ...... .. . . . .. .... .. . . . .................................... . . ............ . . ...... . . . .................. . . . . .. . . . . . . .. . . ... .. . . . . . . . . . . . . . .. . . . .. . . .. .. .. . . . ...... . . . .. .. . . . . . .... . . ..... . . . . . . ... . .. .. . . ... . . . . . . . . ......... . .. . . .. .. . ............ . . . ................ . ....... . . ..... . ... .. . . . . . ....... . . . . .... . . . . ..... . . . . ......... . .... . . . . ........ . . .... . . . . . . . .. . . . .... .. . .............. . . ... ....... ..... . ........ .. . ...... . . . ....... . . . .. . .. . ............. . ..... . . .. .. . .. . .... . . . .. . . .. . .... . . ... . .. . ..... . ....... . ... . . . . .. . ... .. . . .... . .... . ... . . .... .. .. . . ... . ..... . ....... . ... ... . .. . . . ... ........................ . . . . .... . ... ......... . . . . . . ...... . . . . ... .. .......... .... ..... . . . .. ... ........... . . . . . . .. . ........ ... . . .. . . ........... .. . .. . . .. .... . .. ... . . . .. . . .................................... .. ... .. ..... ... ..... ... . ... .. .. .. . . .. ... ....... .... . . .. . ... . ...... . . ..... ....... . . . . . . ... .. . .. . . .... . . . ..................... ...... . . .. . ........... ...... .. ..... .... .. .. .................................................... . .. . . ..... . ...... . . . .... .. . . ....... . .. .. . . . ................. . .... ........ . .. . . . . .. .. . . ........... ................ . ........ . . . ... . .. . . . . .. . . .. . . ..
lowQualScore : 0 0 55 0 0 5 0000 00 5 5 0000 0 777 3 00 22 88 222222 222222 22 0 0 0 88 2222 88 0 0 5 444444444444444444444444444444444444 0 6 888888888888 0 8 000000 4 7 7 777777777777777777 7 7 7 4 11 7 7 3 6 7 7 99 7 0 000 99 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 1 99 7 7 0 66 7 3 00 22 77 7 8 0 222222 7 7 7 11 66 0 0 0 0 1 6666 8 4 22222 0 0 0 0 0 0 888 0 99 99 0 0 888 0 0 7 4 4 0 1 0 333333333 7 22 0 7 88 22 7 777777777777 7 0 4 6666666666666666 7 0000000 4 0 33333 7 000 99 7 7 3 7 0 3333333 7 5 7 7 2222 7 7 7 7 77777 7 0 7 7 777777777 7 2222 7 7 3 7 88888888 7 7 8888 7 7 7 7 7 7 8 55 7 0 7 2222 44 8 22222222222222 0 0 222 8888888 44444 8 44444444 00 0 000000 0 7 7 8888888 0 7 0 22 0 00 0 3333333333333 7 55555 3 7 22 22 7 22 7 0000 0 6 0 00 0 0 00 8 0000 0 0 000 4 00 0 00000 8 6666666 8 888 2 0 0 8 00 0 000 44 6 0 0000 2 6666 0 000 4 0 2222 44 00 0 0 666 0 00000 0 7777777 7 000 777 7 00 7 0 7 333 666666666666666666666666 0 3 0 0 8888 1 888 444444444 0 0 0 0 7 6 000000 7 7 7 7 777 99 7777777777 6666 33333 0 9 7 99 333 99999999999 3 0 0 8 0 0 99 2 11111111 222 4 4 11 1 4 66666666666 00 7 00 0 0 66 7777 3 11 000 3 0 7 55 0 0 777777777777777777777777777777777777 99 444 99 55555 000 55555 444 0 555 44 22 11 4 9 44 222 4444444 0000 2 6 33 4 888 2 666666 9 2 33333 7777777 0 7 0 7 7 3 333 22 0 22 7 7 2222 7 5 0 000000000000000000000 444444 0 7 88 7 33333333333 333333 11 55555 5555 66 11 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 55 0 7 00000 0 555555 0 7 9 5555 00 0 0 5555555 0 00 55 9 4 0 00000000000000000 4 6666 11111111 2 99 0 0 0 0 99 88 0 5 66666666666 3333333333333333 7 22222222 0 7 7 222 3 88 0 3 0 0 00 0 0 00 0 5 00
consensus : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GCTAGTT-TTTCA-------G-ATGGAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTCCT-TTACCAACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATGC--T-CTG-TA-ANGANT-G-C---CAANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCCGGAGGC-AT--AAATTTATNGA-TTTAG--AGA-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGAT----TT-CAGAAGGTCCA-TC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CTCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TCAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGTCCGTTGTTAGAAGAANTACAGCAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTCATA--TCT-CCATGACT-TT-CGTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TNCCT-ATCCTCCNCAAA--GNTCGCAANTN----------T-AATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-GATTCCCG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACCCCA-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAACG---AGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTT----AGCATCAGCGGAA---TCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAGGAGATAAG--AAATCT-GATGTGG-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTA-TCGGG-TGTT-G-AA--G---TTT-ATGG---CAT----TATNTCACTNGAT-AAA-T--CGG---GCAGG-ACTT-CTGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-AATCTG-ANCTAC---GGAA-----GATANAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG------CTA--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGACACCCA-NT-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATG-AA---GACGGT-ATNG----GGCTA-AAGT--CAC-NCG--GTAC-----AGCAA--AGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-----CGATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-TAGTTGGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C-AA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACGAG--GTTCAGAAAGA-TCAG-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-NCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CANGG-CA--GTACGGC---G-TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--TTACA-GTGAG--TCCTCTTANT-GTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
Reference ( family-437 ) : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GCTAGTT-TTTCA-------G-ATGGAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTCCT-TTACCAACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATGC--T-CTG-TA-ANGANT-G-C---CAANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCCGGAGGC-AT--AAATTTATNGA-TTTAG--AGA-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGAT----TT-CAGAAGGTCCA-TC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CTCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TCAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGTCCGTTGTTAGAAGAANTACAGCAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTCATA--TCT-CCATGACT-TT-CGTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TNCCT-ATCCTCCNCAAA--GNTCGCAANTN----------T-AATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-GATTCCCG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACCCCA-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAACG---AGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTT----AGCATCAGCGGAA---TCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAGGAGATAAG--AAATCT-GATGTGG-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTA-TCGGG-TGTT-G-AA--G---TTT-ATGG---CAT----TATNTCACTNGAT-AAA-T--CGG---GCAGG-ACTT-CTGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-AATCTG-ANCTAC---GGAA-----GATANAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG------CTA--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGACACCCA-NT-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATG-AA---GACGGT-ATNG----GGCTA-AAGT--CAC-NCG--GTAC-----AGCAA--AGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-----CGATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-TAGTTGGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C-AA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACGAG--GTTCAGAAAGA-TCAG-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-NCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CANGG-CA--GTACGGC---G-TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--TTACA-GTGAG--TCCTCTTANT-GTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
gi|1 : TTTAAATCTCACTGCT-GCATTTCCAA--AGTCCCCTCAAATAGAAAGCCATTTGTCATTT----TG--GGTCAAACACAGAT-ATTGTAAAGTACT----GAAAAACAACATCTCA-A-TT-AC-GTCTAGATACAA--GTGAAT----A-GCTATAAAATCAGGTAAAG-AACATTTTCAAGCA-ATGACTTTTTTG--ATAATTAAGTCCT--TGGAATAT-GATA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GTTAGTT-TTTCA-------GTATGGAGTATTTTT---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TT-CAAAATTA----------------G-TAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--T-GTGAA---TTTTATT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGTCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-AG--T-GTTCTTCTTATTTGCAGCGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAAAAGTG--CGAAGGCC-C-ACCCAACGAAAGA----TATTGACCTTT--T-TTG-TA-ATGAGT-GCC---CAAGTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-GATACAAACACTGGAAGAGTCAT--TTCTGGGCC-AT--AAATTTATAGATTTTAGGAGGA-CAAT-C--TATT---CAGAAAAGT-TATCACTA--------T--TTCA-AGA-GGAGGTC---TT-CAGAAAGTCCATTC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAGGAT-TTAAAGAAAG--AT------CAAA-GAAG-ATG-CTGG--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TGATTCAT-GGACAG---------TCT-A----AAA-ACA-GCCA-TGAA-GCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCATTGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACAAGTAAAC-AATA-TA----GAAAAATCCATTGTTAGGAGGAG-ACAAAAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTC-TA--TCT-CCGTGACT-TT-TGTCAAAGAG---CC-ATGGC------TTCCT-ATCCTCTTCGAA--GATCACAGACT----------T-AATTCCCAAA-CTTTTTGAGAG-GAAACCTGAAAAA--TCCGA--TCCATAC-CC-AAG-ACAACAA----AACCA-GTACCCCCA-GT--G-T-TTACT--GC-GGTCA----TTAC-A-GCAAAG---ATGATGTTGTCAAAT--TACTAGGG-----AAGGTAGAAATT---AGAGAGACCAA--ACCAA-AG-AAA---G--AAAAATAAAAACCT---ATGGAG--TGGCTGCTCCTTC----AGTAGCACCGAAA---TCTAC-AAGCAG---GCAGATG-AAACAA-G--ACAGGGAGATAAG--AAATCT-GATGTTG-A----AAACAACTT--GTCTCTATTCTCCCTCTG-------TC-ACTGA---GGTCTGGGAG---TT-TAG-GGTA-TCTGG-TATT-ACAA--ACTTTTT-ATGG---CAT----TATATCACTTGAT-AAATT--CAG---GCAGG-ACTTCCTGGG-CC-ATG-TGAC-GTAG--A---T-AACCT-TGTCCAAAACAG-A---TTTA--CAGGGGG-AATCTG-ACCTACTTTGGAA-----AGTAAAAACTA-TGG-TG--GAT-TTGG------GTT--CCACA-AGTCACA-CAGG-ATGGGTTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAAA-G-CAAATAAAGTCATC-AATAGTG--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TG-AAAA-AGGG-GACT-GGACACCCACTT-CAGTATA--CA---CTGCCTCCAC-ATCGAA-TGAGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-AT--AA---AACGGTAAACA----GGCTA-AAGT--CAC-CCG--ATAC-----AGCAA--AGACA-GAA-----AAGAACTACAGAA-CATAAC---AG-CGGATA--ACAAT-G-GACAG-GGACTTTAT---AG-----CAATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGGAA---ATATGAA-T----GGAGATATCTGCACATC---A-GAC---CT--TAATAA-AGAGG-CA-GTTAGTTGGT--GTTGAA--TAAATTCAGGA-CAAA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACAAG--GTTCAGAAAGG-TCAA-GGTT-CT--TC-CC----CGG----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCTTCAG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------TAC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TT-CA--CTTCTT-A---GATTC------AG-GACGGTC-GGTTCTTG----TCAATT-ACT-ACCTC----CA-C--AA--AAC-AACCAAGC-CA--GTACAGC---G-TCC-CC----GTTG---T----CTGTGTGT--AG-ATTG-A-TGAAGAA--AC-AATCTCTAT-TA------GA----AATA--------TG--G---ACACAGT--------GACAGTGC-ATAGCGTATCTGTTACAGGTGAG--TCCTCTTACT-GTCAATCAA-ACATTGCCTCAC--AGATTTCACAGCTTGTGACCATTGAGATTATATTAAAAGAATACTAGACAATTTA
gi|10 : AAACAAAA-GACT-GG-CAACCA-AT-CAGCGTG--CA---TTCCTCTCAC-ATTAAC-GGCGAC--ATA-CTGGTGG-G-G----ATG-AA---G-------T--------CTA-AAGT--CAC-TCA--GTAC-----AGCAA---GACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAAGGACG--ACAAA-G-GACAG-GACCTGTAT---AG-----TGATC-C--ACACTACAT-AAC-AGAAA---ACACCAA-C----GAGGATATTTGCGTATC---A-GAT---TA--TAATAAGACAGGCCG-G-TAGGTGGT--GTTTAA--C-AA-TCAGAG-C----TACAGTGTTTTTTCGCCTAATTAC--A-GAG----TCAG--AGATTCAGAGAGT-CT--TTACC----TACAGCGGAAATATGT------CTGACCTGTTGTTGG----CCAC----ATAGTGATA-TGGTTGATTATTTAAGCC---TAT---TACAAT---------------------------TC-TA--CT--CT-T---GA-CCT-----AG-GATGGgcccacgcgaataa
gi|11 : tcATCTCA-A-TTTACA-TCTAG-TACGT--GTGAATTAATG-GCT-TA---TCGAGTAAATGAATATTTTCAAGCA-ATTACTTTTT-G--ATAT----GTCCTAATGGAATTT-GACA-TGT-----------------------------TT--------GCTAGTT-TT-CA-------G-A----GTATTTTT---TGTATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGC-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATT--GCAATTCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-gc
gi|12 : cCAACACTCTTATAGAGTGT-GCCA-------GGCTGCC-ACCA--AA--TACTCAAAAGTTCTATT--GCACGACTG-TTCAGCCAGC-AAATGT-G-TGAAC-AACACAAGG-A-TATCACATCCGGGAAGA---C-AAAAAACAAA--A-C--TGA-TG--TGGTT-CT-TTACCAAGAA-GAATA------CAAGAATTGCCAA-CAG-AGGAATTGTCC-AA--TC-C-ACCCCAA-AAGGA----CCTTAAAATTT--A-CTG-CA-AAGAAT-G-C---CTACTCCCA--AT--CTGTT-CC-AAA---T-G-tg
gi|13 : -AAA-T--CAG---GCAG--ACT--CTGGG-CC-A-G-TGAC-TGGC--A---T-AACCT-TGTCG-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-A-TCTG---CTAC---AGGA-----AATAAAAAACTATGG-TG--GAC-ATGG------GTT--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-CAAATAAAGTCATC-AGTAG-G--ATTACGCAG-GATAAT---A-----CTATCAC-AGAATTCA-TG-AAAACAGGG-GACT-GGG-AACCA-TA-CAGCATA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-GATG-GTG-Acttaccaccaaccacaacagtcaccaagtagccttgatcttgagtaatc
gi|14 : CTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGAAG---TT-CAG-TGTG-CCGGG-TGTT-A-AG--G-------A-GG---CATCCCATATTTCATTAGGT-AAA-C--AGG---GCAA--ACTG--TGGG-TC-A-G-TGATATTAGTGG---T-GACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-A--CC--AGCTAC---AGAA-----GATACAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG------CTA--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATC--TTTACAG--------ACAGA-G-ACAATAAAGGCATC-AATAA-G--ATAACA-AG-GA
gi|15 : A--CGTCCGCGA-----CAC----GTACTGGTT-TG--TGAT-------GACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGA-TC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC-TCG-ACT-GC--TGGGACA-CGAAA--AACAAA-CATGGATA--ACACAG-------TC-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGAA-CGTA-CGG--CATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATATC---TACA-atactcatagcaaaacaatcat
gi|16 : A--CGTCCGCGA-----CAC----GTACTGGTT-TG--TGAT-------GACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGA-TC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC-TCG-ACT-GC--TGGGACA-CGAAA--AACAAA-CATGGATA--ACACAG-------TC-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGAA-CGTA-CGG--CATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATATC---TACA-
gi|17 : ACAAGTAAAC-AAAA-TA----GAAAAGTT-GTTGTTAGAAGAG--AC--CAA--T-AGCC-AGGA-T--GACTC--AT---TG--AAAGATTATAT---TGCC-TA--TCT-CCATGACT-TT--GTCAAACAGT-TCC-ATGGC------TTCCT-ATCCTCTCCAAC--GATCACTGCTC----------T-AATTCAAAAA-CTTTTTGAGAAGGA--CCTG-AAAA--TCCGA--TCCATAC-CC-GAG-AC
gi|18 : TCGG---T-CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------TTC-------G-G----TA---------------C-TG-------TT-CA--TATCCT-T---GA-TC------AG-GATGGTC-AGTTCTTG----TC-TCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AGA-AA-CAGAA-CA---TAC-AC---GATCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CAA--GA--AC-AATCTTTATGTTG-----GACAACGATA--------CACCA---ACACAGT--------GACAGTGT-ACAA-ATA
gi|19 : GTCCA-TC-AATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAAAC-TTAAAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CT-G--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TTAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACTAGTAAAC-GAAA-TA----GAAA
gi|2 : A-GGAGGTGTTTTT-CAAAGGTTCCA-TCAGATATG-TCTTGTTTC--A-AACATC-ACAAGATGTTATA-AAGGAAATGATATTCAAATGAAG-ATG-CTGG--CGG-A-AATGAA-----AGAATGA-TCATTGGATCG---------TCTTA----AGA-ACA-GCCAATGGAAGCTGATGGAGAGG-------TCTCTGCATAAATTAGGCA-TGGTGAATCAGCAGT-GGATGTCA-GAAA-TATTGAACAAGTAA-C-AGGAATATCAGGAAAAGTTGGTTGTGAGAAGAAG-AGAGCCAGCTGAGCC-AGGAAT--GAAACTCATG--TGGAAA-GATTGTATAATTGCGCTAAGTCT-CCATGACTGTTGTGTCAAACAGTGTCCGATGGTGGGCTTTCCCTCATCCTCTACAAACAGAT-GCAACTGGGGCGCTGCTC-AATTGCAAAAACTTTTTGAGAA-GGACCCTG-AAAGATTCCGGATCCCATACGCGCGAGTACAGTAATGAAAACCAAGTCCCCCCAAGTCAG-TATTACTTCGCTGGTCATTGGGTATCACGCAAAGGGAAGAATGTTGTCAAAGGATACTGAGGGTGAAAAGATAGAAAATTATAAGGAGACCAATTACCAATAGTAAAAGTA--AAGAATTAAAACGCTAAATGGAAAGTGGCTGCTCCTTTAGTGAGCAT--GCGGAAATGCTTACAAAGTAAGGTGCGAATGAAAACAA-ATTACAAGGAGATAAGATAAATCTGGATGTGGAAAACAAAACCA--TTGGTCTCTA-GTGTCCTCTAGTACAGTTT-ACTGAATTGGTGAGGGAGA--TTGCAG-GGTATTTGGG-TGTT-G-AATCGT--TTT-ATGGGCATAT----TATCTCCGTTCAT-AAA-TGCCGGACCGCAGGAACTT-CTGGC-TCGA-GTTAAC-TTAG--A---TAAACCTGTGTCC-AAACAGTAT--TCTAAGCAGGGGATAGTCTT-GCTTACAA-GGAATTATTAAGATAAGCTA-TGGTTG--GAC-TTGGGATTCTCTAATTCACA-AGTCACAGCAGGTATGGGGTTACTGTATCT-TTAGCAGAGCGAATCACAAATT-AAGATATAGTCATCGAATTA-GGTATAACACAATGGTGAC--AAATACTCTATCACAAGAATTCA-TTAAAAACAGGACGACTGGGATACCAA-CTGCAGCATATTCATCTCTCTGCCCAC-ATCAACTGGGGACAGATATCTGGTGG-G----G-ATGTAATTGGAC--T-ATAG----GACTACAAGT--CAC-TTGCCGTATTATCAAGCAATTAGACAGGGAACATGAAGAACTACAGAATCAT-AC---AGTGGGATA--ACAAGTGTGATCG-GA-CTGTATG--AGTATGCCAATC-------CTACATGCACTAGAAAAAGATATAAAGCTGGAGGTGATATCTGATTAGCAATA-GATG--CTGCTGGTAA-AGAGG-CGAG-TAGT--GTTAGGTTAAAGTAAA-TCAGGACC-AATCACA--GTTTCTCC------T-----ACAAA--GGTCAG-AAGA-TCAG-GGTTGCTGATC-GCGTGTAAT----GGAATCCGTGGTAGCCTGA--TGTCCTCGG----TCACGAGTATCCTGGTGCTG--TGATAG-----ACC---AAT-T-GACGATT---------------GTTG-------TT-CATGCTGCTTAA---GA-TTCAAATGAA-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-ATTAACTGACG-T----CA-C--AAGGAAC--A-CAAGG--ATTGTA-GGCGTTG-TCC-GCTTGTGTAG---TTCTAGTGTGTTTCAAG-A-TG-AGTGA--GA--ACAAATCTCTAT-TAGTTAGTGA----GATA--------GG--G---ACACAGTTCAAGTGAGATAGTGTAATAG-GTACT--CTACATGTGAAGTTTCTCTTAATGGTCAATCAA
gi|20 : ctctgtgca--CA---CTCCTCCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CTTGTGG-G-G-------------AATGTT-ATTG----GG----GAGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAG----GT-ATTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG------AATC-CCAATG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|21 : --CA---CTCCTCCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CTTGTGG-G-G-------------AATGTT-ATTG----GG----GAGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAG----GT-ATTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG------AATC-CCAATG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|22 : -AAGGCC-CCAACCAACTAAAAAGGAATATTGACATGCACT-CTGGTA-ACAAATTG-CAGATAAGTTTCA--TTTTGTGTT-CA-AAAAATT-G-TGCAACAACTGG-AGAGTCATA-TTTGG--GC-AT--AAATTAATAGA-TTTAG--AGAGCAAT-TGATATTCAGGGGAAAAGT-TATC
gi|23 : gca-TG--C-AAGGTC-C-ACCCCACTAAGGA----TATAGACATGC--C-TTG-TG-TAGATT-G-C---CAGCTTCCA--AT--ATGTT-CC-AAA---T-G-TTC-AACACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGC-AT--GAACTTGTTGA-TTTAG--AGA-TAAT-C--TATG---AAGAAAAGA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGA
gi|24 : CTAC---AGAA-----GATACCAACCAATGG-TGAAGATGAAGG------CTA--CCACACCGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATG--TTTGCGG--------ATAGT-G-ACAATAACGTCATA-AATAA-G--ACAACATCG-GATAAT--AA-----TG
gi|25 : ---GGTCAGGGAG---TT-CAG-GGTA-TTGGG-TGTT-G-AA--G---TTTTATGG---CAT-----ATATCCCTTCAT-AAA-T--CCG---ACAG--ACT--CTGGG-CC-A-G-TAAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGtc
gi|26 : ctatTCACA-CAGG-ATGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------AAAAA-G-CAAGTAAAGTCATC-AAGAG-G--ATAACACAC-GATAAT---A-----CTATCAC-AGGATTCA-TG-AAAACAGGG-GACT-GGACACC
gi|27 : ACAT-CGC-AGAAA---ACATCAA-T----GGTGATGTCTGCGTGTC---C-GAC---TA--CAATAA-ACAAG-CT-G-TAG-TAGT--GGTAAA--TAAA-TCAAAT-C-AC-CACAG-G-TTCTCC-------TAC--A-GAG--GTa
gi|28 : GTTCTTG----TC-ATT-ACT-AC--T----CA-C--AC--TAC-AA-CACGG--A--GTACGGT---T-TCC-CT----ATAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-TGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GAAA--------TG--T---ACACca
gi|29 : gAATAAAGTCATC-AATAA-A--ATGGCACAG-AACAAT--AA------AATTAA-AAAGTTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGGCACCCA--T-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATTAA
gi|3 : TCAGATGGCACATTCCAAAACTGTAGCGTACCAAATATGGGTAC-AACCCCAGCACTTTT-TAGAATGT-GGCATC-GAA-GATTGC-GAG-AG-AAAATTGTCAA---CCTTACT--GCAATCCTT-GCCA-TC-GC-AGATGTTG-TCAAC-AATGCACAGCA-CG-AGCATCT--GAAGAATCC-AGATTACAAAGAAACCATGA-GG--TGGTCCCT-T-ACCAACAACGAAAA------CGACATCTTCCTG-TGG-AAAA--TG--C-AAGATC-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGACATGC--T--TG-TG-TGGATT-G-C---CAGCTTCCA--TT--ATGCTACA-AAA---T-G-TTTCAACACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGC-AT--GAACTTGTTGA-TT-AG--AGA-CAAT-A--TAGAA--GAAAAAAAA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGAGAT----AT-CA-AAGGTCGA-CA-AGTATT-TTCT---TC--C-CACATC-ACA-GAT-TTACAGAAAGAAAT-------AAA-GG-G-ATG-CCCA--CAG-AGAAT-AA-----AGA-TGA-TCCA-AGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTG-TGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TATCA-GAAA-TATC-AACAAGTGGACTAATA--A----GAACAGTC-ATTGCT-GAGAAATTACAG-------AGTCGAAGA-T---ACAC--ATATTTG--AT-GAT-ACAT---T-TCATA--TCTTCCATGACC-T---GTCAAAATAT-TC--ATGG-------TAACT-ATCCTCCACAAA--ACTTACAATCA----------TTAATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-G-TTCCAG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACACCA-GT--GTT-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGG-----AAAAT-GAAGCG---GAAAAG---AA--ACAAGCGG-GGGTGCGGAAAAAAT-AAAACAC---ATGGACATTATAT-CTCCTTT----AGCATCAGTGGAC---TCTAC-AAGTAA---ACGAAAG-AAACAAGG--ACAAG--GATAAG--GATCTT-GATGT-G-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TTCACTGA---GGTCA-GGAA---TT-CAGTTGTA-TCAGATTGTTAG-CA--G---TGC-ATTC---CA-----TATTTCACTAGGTAAAA-T--CAG---GCA-A-ACTT-ATGGATTC-A-G-TGAT-TTTG--ATGGT-AACCT-TGTCC--AACAG-ACAGTC-A--CTGAGGA----CTGCAACTAC---AAAA-----ATTACGAACCAGTGA-TG--GAT-ACGG------CT----CACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAC-CTG-ATCTTTTA-CAG--------AC-GA-GAAAAATAAAGTCATC-AATAA-A--ACAAT---G-GGTAATCAAA-----AGA--A--AAAATTCATTT-CAAACAAAA-GACT-GGA-AACCA-AT-AAGC-TA--CA---CT-CTCAC-C-ATTAAC-GGGAAC--ATA-CTGGTGG-G-A-TG-AGG-AA---G--GAT-ATGGGTGAGGCTA-AA-TCACAC-TCG--GTAC-----AGCAA----ACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAA-G-GACAG-GACCTGTATTAGAG------GATC-C--ACACTA-AT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GG-GATATTTG-GTATC---ACGAC---AT--ATATAA-AAAGG-CA-GTTAGTGCGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C----TACAG-G-TTCTCC-------TACAAACG------TCAGAA--G-TTAA-GATT-TA--TC-CC----TTT----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG----TCAT----CTCCTGGTG-TG--TGAT-------------------GAAAACA---------------G-TGAAACAATTT-CA--ATTTCT-C---GA-T-------AGTGAGGGTC-A-TTCTTG----TC-TCT--CT-AC--T----CA-C--AA--AGA-AA-CAGAA-CAT-ATAC--T---A-TCCACC----G-AG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CGA--GA--AC-AATCTTTATGTAG-----
gi|30 : t-CA--CCTGCT-G---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCCCG----TC-TCT-ACT-GC--TGA--CACC--AG--AAC-AA-CATGG--A--ATACACC---A-TCC-Ca
gi|32 : AGGTTCA-CG-AATATT-TCCT---TC--C-AACTTC-ACAGGAT-TTACAAAAACAAGT------atg
gi|33 : -CT--TC-CC----TAT----GGTATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG----TCAC----ATCCTG
gi|34 : CTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G----A-ATG-AG---GA
gi|35 : --ACAAT-G-GACAG-GGACTGTAT---GG-----GTATC-C--ATGCTACAT-CAC-atga
gi|36 : aGTGT-ATAG-GTATC--T-ACA-GTGAG--TCCTCTTA
gi|4 : -AT----------------------TTT---------CTA--T-TTGTA-------G-A--GAGT----CC---T--ATTTATCAAATGGCAC-ATTCCAAACTAAGTGTACCAAGCCTG-GGTAC-A-CCCCAGCATTTTA-TAGAGTGT-GACATT-GAC-GAATGC-GAGAGG-AA--TTGTCAG---TTTTACT--GCAATTCTT-GCCA-TCTGC-AGATGT-G-TGAAC-AATGCAGAG-A-GG-AACATCT--GAAGAATAC-AGATTACCAG--AGCCATGA-GG--TGGT-CCT-TTACCAACAACGAAAAACGAAACGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGACT-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGATATGC--T-TTG-TG-AGGAAT-G-T---CAAATTCCA--CT--ATGTT-CC-AAG---T-G-TGCAA-CACAGGCAGA-TCAT----CGG-GGC-AT--AAATTCATTGA-TCTGG--AGA-CAAT-C--T--T---GAGGAAAATATAGCACTT--------CGCCTCA-AGA-AGATAT----C--CAAAA--TCCA-AG-AATATT-TCCT---TC--C-GACATC-ACAAGAT-TTACAGAAAGAAAT------TAAA-GGTG-ATA-CCCA--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TAA-TCAT-GGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCTA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCCCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATGCATCAGGTGGAC-AAGA-TA----GAACAGTCC-TTGATGGAACAATTACAG-AA--T----C-AAGA-TTCAACAT---T---TG--AT-GATTACAT---T-TCATA--TCT-CAATGAC--CT-CGTCAAAGAGT-TTC-ATGGC------TACAT-GTTTTCCCCAAA--GCTTGCAAATA----------T-AATTTCCAAT-CTTTCTAAGAA--ATTCTCA-GAAA--TTCGA--CCCATAC-CA-GAA-ACAACAA----CAGTG-GTGACCCCA-AT--G-T-TTACT--GCTGGTCG----ATAT-A-GCAAAG---ATAATGTGGCCAAAT--TACTAGGG-----AAAATAAATGTG---AGGGATACCAA-----AGCAG-AGATGAG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCT-CTCCCTC----AACATCAGTGGAA---TCTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACGA-G--ATAAT--GATAAG--AAATCT-TATGT-G-AAAC-AAACAA--T--GCCCATA-TCTTCATATG-------TC-TCTGA---GTTTAGGGAGATATT-----TGTA-TT----TGTT-A-AA--G----AA-ATGA---CCCA---TATCTCCCTTGAT-AAA-G--CAG---GCAAG---CT-ATGGG-TC-A-G-TGGC-AGTG--A---T-AACCT-TGTAC-AAACAG-A---CTTA--CA-AGGA-AAGC---AGCTGC---TGAG-----GATAAAGATCAGTAG-TG--GAT-CTGG------CTA--CCACACAGTCACA-CGGG-ACGGGGTG-CTC-ATC--TTAACAG--------ACAGA-T-ACAATAAAGTCATC-AACAA-G--ATAACACCG-GATCAT--AA------GATAAA-AAAGTTCT-TT-AGAACAGGA-AGCT-GGA-ACCCA-AT-CAGCATA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-GTA-TG-ATA---------GGTAAGGG----GGCCA-GAGT--CAC-ACG--GTAC-----AAC-G--AGAAAGGGA-----AAGAACTACATAT-CAT-AC---AAACAGATG--ATAAA-G-GACAG-AAACTATAT---AG-----cattgc
gi|5 : tcatttatTTCAAATCTCACTGCTCGAATTTCCAATAAATCCCCTCAAAGAGAATGTCA-TTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGT-AAGTACTTGTAAAAAAACAAAATCTCACATTTTACAGTCTAG--ACGTTGGTGAAT----GCGCTGTG---TCGGGTAAAATGATATTTTCAGGCATATTACTTTTT-GAAATGA----ATTCT--TGGAGTTTGGACATTGTCTACAT----------------------CTTCTACTGCAGTTAGTTGTTTCACGATGGCG-ATGGTGTATTTTTTAGT--ATTTATTAGA--GCAC-TTTCAAAAGTA-----------------TTACGA-CCC--GCACTTCC-TTAGGTGCGGGCATTCGAATGAGAG-CGAGCAGAAA--TTGTAGC---ATTTACTGCGCATTGCTTGGTCA-TCACCGAAATGT-GATAAACTAATGTCGAG-AGTA-AACA-CT--GAAGAGTCCAAGAATACAAAT-AGC--TGACAGTTTGGTT-CT-CTATT-ACAACATAAA------CAACAACTTCCTGCTGGAAAAAA-TGC-C-AAGGCCAC-GGCCAACTAAGTA-----GTTGAGAGAC--TACTG-TAGATGAAT-G-C---CAGTCTCCAATTT--GT-TT-CACAAA---TCG-TAC-AACACTGGTAGAGTCACTGTCTG--GGCTACTAAAATTTATAGA-T------AGG-CAATAC--TATC-------AAAGT-TATT-CTAACAATTTTTG-TCCATCGACGGAGAG----TTACAGATGGTCCATTC-AATATTATCCT---TCAACAAACATCAACAAGAT-TTAAAGGAAGAGATCA----CAAA-GAAGAATGACGCGAACGGTA-AAT-AAATACTAGA-C-A-CTAT-GGCCAGGTTTCAGCTTCT-ATTTTAGATACATGCCATTGTAAGCCAACTGGGAGGATGTTTCTCTCT-CC-AAAT---ACA-TGGTGGA-CC-CAGTGGG-TGTCAGGAAAGTATAGAAC
gi|6 : A--TGTCCTCGG---T-CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------CCA---TATCGTGACAAAT---------------G-TG-------TT-CA--TCTTCT-A---GA-TC------AG-GACGGTC-GGTTCTTG----TC-ATT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CAAGG--A--GTAGAAT---A-TCC-CT----ATAG---T----GTATGTGT--AG-A-TG-A-TGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATT--------AT--G---ACACAGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC---TACA-GTGAG--TTCTCTTATT-GTCAATCAACACACTACCACACAGAGATTTCACAACTTGTGACCAATGAGATAATATTTTATGAAT-CT--ACAATTTAt
gi|7 : A---CTCCTCTCAC-ATTAAT-GGAGAC--ATA-CTAGTAGAG-G-TGGATA-AA---GATGGG-AAAC----GG--A-AAGT--GAT-CAG--ATAC-----AGCAA---GAGAGGAA-----AGAAGCTCCAAGA-AAT-TC---AGAAGGATG--ATAAA-G-GACAA-GATCTATAC---TG-----T-ATCAT--AGGGTGCAT-CAC-AGAAA---ACATTAA-C----GGTGACATCTGTGTATC---C-GACCCTCT--TCGTAA-GAAGG-TG-G-----TGGT--AGTGAC--CAGA-TTAGGA-C-AG-TATCG-G-TTCT-C------TTAC--TTTGGTCATCCATTACAA-CCTG-GATT-CTA-TC-CA----AAC----AGAATGTGTA-----CAGA--TG-CCTTGGGAATT-------ATCTTGGTC-TG--TAGT-------TGT---GGT-G-G-TAGTAAATGTGAGACCTGGGG-TA-------TC-CA--CATGTT-T---GA-CC------AG-GACGGTC-AGTTCCTGAATTTC-CTC-ATC-ACA-T----CA-C--AA--Aatgaatgaataaggctgatacaactatactagaaaatacacagtagagtgtatggaatccccataattaaccaaacaagttgctgattatatgtgcaagtttaactatgatttacagtcacttacattgttaagtatgcaaaacaacagtgtgtgacaatcaaaagatatctttaattatcctgtagctttcaatttacaatatctgaatatcacgatattactactaagagctagatttgaaaaaggtcttgtttatgaaataagattttagaaaataagattctccctttcagttttatataattcaattatttcttctttcattctacatttacaatagcatcctatggga
gi|8 : ct-TACAT--GTGAAT----G-GAT-TA---TCGGGTAATTTAATATTTTCAAGCA-ATGACTTTTT-G--ATAA----ATCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-GTATTGCCTACATTCTACTGTAAGTTT--------GCTAGTT-TTTCA-------GGATAGAATATTTTG---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCGTT-GAA-GATTGT-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACACCT--GAAGAGTCC-AGAAAACAAA--AACCATGA-AG--TGGTT-CT-CTATCTACAACGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAATG-TG--C-AAGGCC-C-ACCCAACTAAAGA----TATTGACATCC--T-CTG-TA-ACAATT-G-C---AAAGTTTCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGC-AACACTGG-AGAtgcccagtgcggtctgcactgatgatcaacaaaacgtctgggttggaagttggaacag
gi|9 : GTCAAAATAT-TTC-ATGGT------CACCT-ATCCTCCAGAAA--CCTTACAATTA----------T-AATCCCCAAC-CTTTCTGAGAA-G-TTCCAG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-AAG-ACAACAA----AACCG-GTCACACCC-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGC-----AAAATAGAAAC------GGAAAACAA--ACCAGCAG-AGATGAG--AAAAAT-AAATCCC---ATGAAAATTGTCT-CCCCTTT----AACATTAGTGGAC---TCTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACAA-G--ACAAG--GATAAG--GAATCT-GATGTGG--AAC-AAACAA--T--GCCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GATCAGGAAG---TT-CAG-TGTA-CCGGG-TGTT-G-AA----------ACGG---TATTCCATATTTCACGAGAT-AAA-T--CAG---GCA-A-ACTT--TGGG-TC-A-A-TGA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): ATATAATTCAACTCTCTTTTCATTCATTCTACATTTAATATAGCATCTATGGG
Alignments
lowQualScore : 1 11 1 2222 11 1 1 2222 111 11 11 11 222222 222222 11 1 1 11 2222 11 1 1 888888888888888888888888888888888888 333333333333 111111 2 888888888888888888 1 111 11 11 111111 11 11 1111 11111 1 1 1 444444444 333333333333 3333333333333333 3333333 11111 111 2222222 1111 11111 222222222 1111 1 33333333 2222 1111 22 33333333333333 111 2222222 11111 22222222 11 222222 2222222 3333333333333 22222 1111 11 11 1111 111 11 22222 2222222 111 11 1 111 2 1111 1111 111 1111 22 11 1 11111 2222222 111 111 555555555555555555555555 222222222 111111 111 3333333333 2222 11111 111 11111111111 11 11111111 22222222222 11 11 1111 666666666666666666666666666666666666 111 11111 222 11111 111 111 11 111 3333333 1111 111111 11111 2222222 1 111 2222 1 444444444444444444444 222222 11 22222222222 111111 33333 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 111111 2222222 11 44444444444444444 1111 11111111 1 1 11 11111111111 6666666666666666 22222222 222 1 11 1 1 11 1 11
lowQualScore : 5 1 88 1 1 5 4444 88 5 5 4444 1 777 7 44 33 33 555555 222222 00 0 1 0 33 1111 33 0 0 2 333333333333333333333333333333333333 8 5 666666666666 1 0 666666 0 6 1 666666666666666666 6 6 5 0 77 5 5 0 8 0 5 77 1 1 000 77 1 5 5 1 5 5 5 5 0 5 5 5 0 77 1 5 1 33 1 4 66 99 66 6 7 1 999999 0 6 6 33 33 5 5 5 1 0 0000 0 1 00000 5 5 1 1 5 5 888 1 66 66 5 5 888 5 5 1 5 1 1 2 5 222222222 6 99 1 6 44 99 6 111111111111 6 1 6 4444444444444444 6 3333333 6 1 88888 5 000 77 5 5 2 5 1 5555555 6 3 6 6 1111 0 6 6 6 66666 6 1 6 6 666666666 6 4444 6 6 3 3 00000000 6 6 0000 6 6 6 6 6 6 9 33 6 1 6 4444 11 3 66666666666666 8 8 444 4444444 11111 0 22222222 11 8 666666 1 6 6 2222222 1 6 1 99 1 77 1 0000000000000 6 44444 6 6 99 99 6 88 6 7777 8 0 8 11 8 8 11 0 7777 8 8 444 1 11 1 00000 0 5555555 0 111 3 8 6 3 11 6 444 11 0 0 7777 3 4444 8 444 1 8 2222 55 11 8 5 999 8 33333 8 1111111 6 000 555 5 77 5 3 5 888 555555555555555555555555 1 1 1 5 7777 3 888 777777777 5 5 5 5 5 0 111111 5 5 5 5 555 77 2222222222 0000 44444 1 8 5 77 000 77777777777 4 5 5 0 5 5 11 0 88888888 666 4 4 66 0 4 22222222222 00 5 77 5 5 11 2222 6 66 777 7 4 0 55 4 4 555555555555555555555555555555555555 66 222 66 22222 000 22222 000 5 777 44 22 77 4 8 55 222 4444444 7777 2 5 88 4 888 3 333333 5 5 77777 6666666 1 6 1 6 6 3 111 99 1 99 6 6 6666 6 5 1 444444444444444444444 000000 8 6 55 6 99999999999 888888 66 44444 8888 44 66 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 8 55 1 0 99999 4 555555 4 5 8 8888 55 4 4 8888888 4 11 55 8 4 1 44444444444444444 4 0000 99999999 3 66 0 5 0 5 66 33 5 2 99999999999 7777777777777777 0 44444444 1 5 5 777 3 33 1 3 5 1 88 1 1 22 1 5 88
lowQualScore : . . .. . . . .... .. . . .... . ... . .. .. .. ...... ...... .. . . . .. .... .. . . . .................................... . . ............ . . ...... . . . .................. . . . . .. . . . . . . .. . . ... .. . . . . . . . . . . . . . .. . . . .. . . .. .. .. . . . ...... . . . .. .. . . . . . .... . . ..... . . . . . . ... . .. .. . . ... . . . . . . . . ......... . .. . . .. .. . ............ . . . ................ . ....... . . ..... . ... .. . . . . . ....... . . . . .... . . . . ..... . . . . ......... . .... . . . . ........ . . .... . . . . . . . .. . . . .... .. . .............. . . ... ....... ..... . ........ .. . ...... . . . ....... . . . .. . .. . ............. . ..... . . .. .. . .. . .... . . . .. . . .. . .... . . ... . .. . ..... . ....... . ... . . . . .. . ... .. . . .... . .... . ... . . .... .. .. . . ... . ..... . ....... . ... ... . .. . . . ... ........................ . . . . .... . ... ......... . . . . . . ...... . . . . ... .. .......... .... ..... . . . .. ... ........... . . . . . . .. . ........ ... . . .. . . ........... .. . .. . . .. .... . .. ... . . . .. . . .................................... .. ... .. ..... ... ..... ... . ... .. .. .. . . .. ... ....... .... . . .. . ... . ...... . . ..... ....... . . . . . . ... .. . .. . . .... . . . ..................... ...... . . .. . ........... ...... .. ..... .... .. .. .................................................... . .. . . ..... . ...... . . . .... .. . . ....... . .. .. . . . ................. . .... ........ . .. . . . . .. .. . . ........... ................ . ........ . . . ... . .. . . . . .. . . .. . . ..
lowQualScore : 0 0 55 0 0 5 0000 00 5 5 0000 0 777 3 00 22 88 222222 222222 22 0 0 0 88 2222 88 0 0 5 444444444444444444444444444444444444 0 6 888888888888 0 8 000000 4 7 7 777777777777777777 7 7 7 4 11 7 7 3 6 7 7 99 7 0 000 99 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 7 1 99 7 7 0 66 7 3 00 22 77 7 8 0 222222 7 7 7 11 66 0 0 0 0 1 6666 8 4 22222 0 0 0 0 0 0 888 0 99 99 0 0 888 0 0 7 4 4 0 1 0 333333333 7 22 0 7 88 22 7 777777777777 7 0 4 6666666666666666 7 0000000 4 0 33333 7 000 99 7 7 3 7 0 3333333 7 5 7 7 2222 7 7 7 7 77777 7 0 7 7 777777777 7 2222 7 7 3 7 88888888 7 7 8888 7 7 7 7 7 7 8 55 7 0 7 2222 44 8 22222222222222 0 0 222 8888888 44444 8 44444444 00 0 000000 0 7 7 8888888 0 7 0 22 0 00 0 3333333333333 7 55555 3 7 22 22 7 22 7 0000 0 6 0 00 0 0 00 8 0000 0 0 000 4 00 0 00000 8 6666666 8 888 2 0 0 8 00 0 000 44 6 0 0000 2 6666 0 000 4 0 2222 44 00 0 0 666 0 00000 0 7777777 7 000 777 7 00 7 0 7 333 666666666666666666666666 0 3 0 0 8888 1 888 444444444 0 0 0 0 7 6 000000 7 7 7 7 777 99 7777777777 6666 33333 0 9 7 99 333 99999999999 3 0 0 8 0 0 99 2 11111111 222 4 4 11 1 4 66666666666 00 7 00 0 0 66 7777 3 11 000 3 0 7 55 0 0 777777777777777777777777777777777777 99 444 99 55555 000 55555 444 0 555 44 22 11 4 9 44 222 4444444 0000 2 6 33 4 888 2 666666 9 2 33333 7777777 0 7 0 7 7 3 333 22 0 22 7 7 2222 7 5 0 000000000000000000000 444444 0 7 88 7 33333333333 333333 11 55555 5555 66 11 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 55 0 7 00000 0 555555 0 7 9 5555 00 0 0 5555555 0 00 55 9 4 0 00000000000000000 4 6666 11111111 2 99 0 0 0 0 99 88 0 5 66666666666 3333333333333333 7 22222222 0 7 7 222 3 88 0 3 0 0 00 0 0 00 0 5 00
consensus : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GCTAGTT-TTTCA-------G-ATGGAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTCCT-TTACCAACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATGC--T-CTG-TA-ANGANT-G-C---CAANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCCGGAGGC-AT--AAATTTATNGA-TTTAG--AGA-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGAT----TT-CAGAAGGTCCA-TC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CTCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TCAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGTCCGTTGTTAGAAGAANTACAGCAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTCATA--TCT-CCATGACT-TT-CGTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TNCCT-ATCCTCCNCAAA--GNTCGCAANTN----------T-AATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-GATTCCCG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACCCCA-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAACG---AGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTT----AGCATCAGCGGAA---TCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAGGAGATAAG--AAATCT-GATGTGG-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTA-TCGGG-TGTT-G-AA--G---TTT-ATGG---CAT----TATNTCACTNGAT-AAA-T--CGG---GCAGG-ACTT-CTGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-AATCTG-ANCTAC---GGAA-----GATANAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG------CTA--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGACACCCA-NT-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATG-AA---GACGGT-ATNG----GGCTA-AAGT--CAC-NCG--GTAC-----AGCAA--AGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-----CGATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-TAGTTGGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C-AA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACGAG--GTTCAGAAAGA-TCAG-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-NCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CANGG-CA--GTACGGC---G-TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--TTACA-GTGAG--TCCTCTTANT-GTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
Reference ( family-437 ) : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GCTAGTT-TTTCA-------G-ATGGAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTCCT-TTACCAACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATGC--T-CTG-TA-ANGANT-G-C---CAANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCCGGAGGC-AT--AAATTTATNGA-TTTAG--AGA-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGAT----TT-CAGAAGGTCCA-TC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CTCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TCAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGTCCGTTGTTAGAAGAANTACAGCAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTCATA--TCT-CCATGACT-TT-CGTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TNCCT-ATCCTCCNCAAA--GNTCGCAANTN----------T-AATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-GATTCCCG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACCCCA-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAACG---AGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTT----AGCATCAGCGGAA---TCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAGGAGATAAG--AAATCT-GATGTGG-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTA-TCGGG-TGTT-G-AA--G---TTT-ATGG---CAT----TATNTCACTNGAT-AAA-T--CGG---GCAGG-ACTT-CTGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-AATCTG-ANCTAC---GGAA-----GATANAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG------CTA--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGACACCCA-NT-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATG-AA---GACGGT-ATNG----GGCTA-AAGT--CAC-NCG--GTAC-----AGCAA--AGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-----CGATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-TAGTTGGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C-AA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACGAG--GTTCAGAAAGA-TCAG-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-NCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CANGG-CA--GTACGGC---G-TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--TTACA-GTGAG--TCCTCTTANT-GTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
gi|1 : TTTAAATCTCACTGCT-GCATTTCCAA--AGTCCCCTCAAATAGAAAGCCATTTGTCATTT----TG--GGTCAAACACAGAT-ATTGTAAAGTACT----GAAAAACAACATCTCA-A-TT-AC-GTCTAGATACAA--GTGAAT----A-GCTATAAAATCAGGTAAAG-AACATTTTCAAGCA-ATGACTTTTTTG--ATAATTAAGTCCT--TGGAATAT-GATA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GTTAGTT-TTTCA-------GTATGGAGTATTTTT---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TT-CAAAATTA----------------G-TAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--T-GTGAA---TTTTATT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGTCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-AG--T-GTTCTTCTTATTTGCAGCGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAAAAGTG--CGAAGGCC-C-ACCCAACGAAAGA----TATTGACCTTT--T-TTG-TA-ATGAGT-GCC---CAAGTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-GATACAAACACTGGAAGAGTCAT--TTCTGGGCC-AT--AAATTTATAGATTTTAGGAGGA-CAAT-C--TATT---CAGAAAAGT-TATCACTA--------T--TTCA-AGA-GGAGGTC---TT-CAGAAAGTCCATTC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAGGAT-TTAAAGAAAG--AT------CAAA-GAAG-ATG-CTGG--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TGATTCAT-GGACAG---------TCT-A----AAA-ACA-GCCA-TGAA-GCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCATTGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACAAGTAAAC-AATA-TA----GAAAAATCCATTGTTAGGAGGAG-ACAAAAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTC-TA--TCT-CCGTGACT-TT-TGTCAAAGAG---CC-ATGGC------TTCCT-ATCCTCTTCGAA--GATCACAGACT----------T-AATTCCCAAA-CTTTTTGAGAG-GAAACCTGAAAAA--TCCGA--TCCATAC-CC-AAG-ACAACAA----AACCA-GTACCCCCA-GT--G-T-TTACT--GC-GGTCA----TTAC-A-GCAAAG---ATGATGTTGTCAAAT--TACTAGGG-----AAGGTAGAAATT---AGAGAGACCAA--ACCAA-AG-AAA---G--AAAAATAAAAACCT---ATGGAG--TGGCTGCTCCTTC----AGTAGCACCGAAA---TCTAC-AAGCAG---GCAGATG-AAACAA-G--ACAGGGAGATAAG--AAATCT-GATGTTG-A----AAACAACTT--GTCTCTATTCTCCCTCTG-------TC-ACTGA---GGTCTGGGAG---TT-TAG-GGTA-TCTGG-TATT-ACAA--ACTTTTT-ATGG---CAT----TATATCACTTGAT-AAATT--CAG---GCAGG-ACTTCCTGGG-CC-ATG-TGAC-GTAG--A---T-AACCT-TGTCCAAAACAG-A---TTTA--CAGGGGG-AATCTG-ACCTACTTTGGAA-----AGTAAAAACTA-TGG-TG--GAT-TTGG------GTT--CCACA-AGTCACA-CAGG-ATGGGTTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAAA-G-CAAATAAAGTCATC-AATAGTG--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TG-AAAA-AGGG-GACT-GGACACCCACTT-CAGTATA--CA---CTGCCTCCAC-ATCGAA-TGAGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-AT--AA---AACGGTAAACA----GGCTA-AAGT--CAC-CCG--ATAC-----AGCAA--AGACA-GAA-----AAGAACTACAGAA-CATAAC---AG-CGGATA--ACAAT-G-GACAG-GGACTTTAT---AG-----CAATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGGAA---ATATGAA-T----GGAGATATCTGCACATC---A-GAC---CT--TAATAA-AGAGG-CA-GTTAGTTGGT--GTTGAA--TAAATTCAGGA-CAAA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACAAG--GTTCAGAAAGG-TCAA-GGTT-CT--TC-CC----CGG----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCTTCAG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------TAC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TT-CA--CTTCTT-A---GATTC------AG-GACGGTC-GGTTCTTG----TCAATT-ACT-ACCTC----CA-C--AA--AAC-AACCAAGC-CA--GTACAGC---G-TCC-CC----GTTG---T----CTGTGTGT--AG-ATTG-A-TGAAGAA--AC-AATCTCTAT-TA------GA----AATA--------TG--G---ACACAGT--------GACAGTGC-ATAGCGTATCTGTTACAGGTGAG--TCCTCTTACT-GTCAATCAA-ACATTGCCTCAC--AGATTTCACAGCTTGTGACCATTGAGATTATATTAAAAGAATACTAGACAATTTA
gi|10 : AAACAAAA-GACT-GG-CAACCA-AT-CAGCGTG--CA---TTCCTCTCAC-ATTAAC-GGCGAC--ATA-CTGGTGG-G-G----ATG-AA---G-------T--------CTA-AAGT--CAC-TCA--GTAC-----AGCAA---GACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAAGGACG--ACAAA-G-GACAG-GACCTGTAT---AG-----TGATC-C--ACACTACAT-AAC-AGAAA---ACACCAA-C----GAGGATATTTGCGTATC---A-GAT---TA--TAATAAGACAGGCCG-G-TAGGTGGT--GTTTAA--C-AA-TCAGAG-C----TACAGTGTTTTTTCGCCTAATTAC--A-GAG----TCAG--AGATTCAGAGAGT-CT--TTACC----TACAGCGGAAATATGT------CTGACCTGTTGTTGG----CCAC----ATAGTGATA-TGGTTGATTATTTAAGCC---TAT---TACAAT---------------------------TC-TA--CT--CT-T---GA-CCT-----AG-GATGGgcccacgcgaataa
gi|11 : tcATCTCA-A-TTTACA-TCTAG-TACGT--GTGAATTAATG-GCT-TA---TCGAGTAAATGAATATTTTCAAGCA-ATTACTTTTT-G--ATAT----GTCCTAATGGAATTT-GACA-TGT-----------------------------TT--------GCTAGTT-TT-CA-------G-A----GTATTTTT---TGTATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGC-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATT--GCAATTCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-gc
gi|12 : cCAACACTCTTATAGAGTGT-GCCA-------GGCTGCC-ACCA--AA--TACTCAAAAGTTCTATT--GCACGACTG-TTCAGCCAGC-AAATGT-G-TGAAC-AACACAAGG-A-TATCACATCCGGGAAGA---C-AAAAAACAAA--A-C--TGA-TG--TGGTT-CT-TTACCAAGAA-GAATA------CAAGAATTGCCAA-CAG-AGGAATTGTCC-AA--TC-C-ACCCCAA-AAGGA----CCTTAAAATTT--A-CTG-CA-AAGAAT-G-C---CTACTCCCA--AT--CTGTT-CC-AAA---T-G-tg
gi|13 : -AAA-T--CAG---GCAG--ACT--CTGGG-CC-A-G-TGAC-TGGC--A---T-AACCT-TGTCG-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-A-TCTG---CTAC---AGGA-----AATAAAAAACTATGG-TG--GAC-ATGG------GTT--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-CAAATAAAGTCATC-AGTAG-G--ATTACGCAG-GATAAT---A-----CTATCAC-AGAATTCA-TG-AAAACAGGG-GACT-GGG-AACCA-TA-CAGCATA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-GATG-GTG-Acttaccaccaaccacaacagtcaccaagtagccttgatcttgagtaatc
gi|14 : CTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGAAG---TT-CAG-TGTG-CCGGG-TGTT-A-AG--G-------A-GG---CATCCCATATTTCATTAGGT-AAA-C--AGG---GCAA--ACTG--TGGG-TC-A-G-TGATATTAGTGG---T-GACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-A--CC--AGCTAC---AGAA-----GATACAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG------CTA--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATC--TTTACAG--------ACAGA-G-ACAATAAAGGCATC-AATAA-G--ATAACA-AG-GA
gi|15 : A--CGTCCGCGA-----CAC----GTACTGGTT-TG--TGAT-------GACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGA-TC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC-TCG-ACT-GC--TGGGACA-CGAAA--AACAAA-CATGGATA--ACACAG-------TC-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGAA-CGTA-CGG--CATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATATC---TACA-atactcatagcaaaacaatcat
gi|16 : A--CGTCCGCGA-----CAC----GTACTGGTT-TG--TGAT-------GACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGA-TC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC-TCG-ACT-GC--TGGGACA-CGAAA--AACAAA-CATGGATA--ACACAG-------TC-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGAA-CGTA-CGG--CATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATATC---TACA-
gi|17 : ACAAGTAAAC-AAAA-TA----GAAAAGTT-GTTGTTAGAAGAG--AC--CAA--T-AGCC-AGGA-T--GACTC--AT---TG--AAAGATTATAT---TGCC-TA--TCT-CCATGACT-TT--GTCAAACAGT-TCC-ATGGC------TTCCT-ATCCTCTCCAAC--GATCACTGCTC----------T-AATTCAAAAA-CTTTTTGAGAAGGA--CCTG-AAAA--TCCGA--TCCATAC-CC-GAG-AC
gi|18 : TCGG---T-CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------TTC-------G-G----TA---------------C-TG-------TT-CA--TATCCT-T---GA-TC------AG-GATGGTC-AGTTCTTG----TC-TCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AGA-AA-CAGAA-CA---TAC-AC---GATCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CAA--GA--AC-AATCTTTATGTTG-----GACAACGATA--------CACCA---ACACAGT--------GACAGTGT-ACAA-ATA
gi|19 : GTCCA-TC-AATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAAAC-TTAAAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CT-G--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TTAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACTAGTAAAC-GAAA-TA----GAAA
gi|2 : A-GGAGGTGTTTTT-CAAAGGTTCCA-TCAGATATG-TCTTGTTTC--A-AACATC-ACAAGATGTTATA-AAGGAAATGATATTCAAATGAAG-ATG-CTGG--CGG-A-AATGAA-----AGAATGA-TCATTGGATCG---------TCTTA----AGA-ACA-GCCAATGGAAGCTGATGGAGAGG-------TCTCTGCATAAATTAGGCA-TGGTGAATCAGCAGT-GGATGTCA-GAAA-TATTGAACAAGTAA-C-AGGAATATCAGGAAAAGTTGGTTGTGAGAAGAAG-AGAGCCAGCTGAGCC-AGGAAT--GAAACTCATG--TGGAAA-GATTGTATAATTGCGCTAAGTCT-CCATGACTGTTGTGTCAAACAGTGTCCGATGGTGGGCTTTCCCTCATCCTCTACAAACAGAT-GCAACTGGGGCGCTGCTC-AATTGCAAAAACTTTTTGAGAA-GGACCCTG-AAAGATTCCGGATCCCATACGCGCGAGTACAGTAATGAAAACCAAGTCCCCCCAAGTCAG-TATTACTTCGCTGGTCATTGGGTATCACGCAAAGGGAAGAATGTTGTCAAAGGATACTGAGGGTGAAAAGATAGAAAATTATAAGGAGACCAATTACCAATAGTAAAAGTA--AAGAATTAAAACGCTAAATGGAAAGTGGCTGCTCCTTTAGTGAGCAT--GCGGAAATGCTTACAAAGTAAGGTGCGAATGAAAACAA-ATTACAAGGAGATAAGATAAATCTGGATGTGGAAAACAAAACCA--TTGGTCTCTA-GTGTCCTCTAGTACAGTTT-ACTGAATTGGTGAGGGAGA--TTGCAG-GGTATTTGGG-TGTT-G-AATCGT--TTT-ATGGGCATAT----TATCTCCGTTCAT-AAA-TGCCGGACCGCAGGAACTT-CTGGC-TCGA-GTTAAC-TTAG--A---TAAACCTGTGTCC-AAACAGTAT--TCTAAGCAGGGGATAGTCTT-GCTTACAA-GGAATTATTAAGATAAGCTA-TGGTTG--GAC-TTGGGATTCTCTAATTCACA-AGTCACAGCAGGTATGGGGTTACTGTATCT-TTAGCAGAGCGAATCACAAATT-AAGATATAGTCATCGAATTA-GGTATAACACAATGGTGAC--AAATACTCTATCACAAGAATTCA-TTAAAAACAGGACGACTGGGATACCAA-CTGCAGCATATTCATCTCTCTGCCCAC-ATCAACTGGGGACAGATATCTGGTGG-G----G-ATGTAATTGGAC--T-ATAG----GACTACAAGT--CAC-TTGCCGTATTATCAAGCAATTAGACAGGGAACATGAAGAACTACAGAATCAT-AC---AGTGGGATA--ACAAGTGTGATCG-GA-CTGTATG--AGTATGCCAATC-------CTACATGCACTAGAAAAAGATATAAAGCTGGAGGTGATATCTGATTAGCAATA-GATG--CTGCTGGTAA-AGAGG-CGAG-TAGT--GTTAGGTTAAAGTAAA-TCAGGACC-AATCACA--GTTTCTCC------T-----ACAAA--GGTCAG-AAGA-TCAG-GGTTGCTGATC-GCGTGTAAT----GGAATCCGTGGTAGCCTGA--TGTCCTCGG----TCACGAGTATCCTGGTGCTG--TGATAG-----ACC---AAT-T-GACGATT---------------GTTG-------TT-CATGCTGCTTAA---GA-TTCAAATGAA-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-ATTAACTGACG-T----CA-C--AAGGAAC--A-CAAGG--ATTGTA-GGCGTTG-TCC-GCTTGTGTAG---TTCTAGTGTGTTTCAAG-A-TG-AGTGA--GA--ACAAATCTCTAT-TAGTTAGTGA----GATA--------GG--G---ACACAGTTCAAGTGAGATAGTGTAATAG-GTACT--CTACATGTGAAGTTTCTCTTAATGGTCAATCAA
gi|20 : ctctgtgca--CA---CTCCTCCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CTTGTGG-G-G-------------AATGTT-ATTG----GG----GAGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAG----GT-ATTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG------AATC-CCAATG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|21 : --CA---CTCCTCCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CTTGTGG-G-G-------------AATGTT-ATTG----GG----GAGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAG----GT-ATTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG------AATC-CCAATG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|22 : -AAGGCC-CCAACCAACTAAAAAGGAATATTGACATGCACT-CTGGTA-ACAAATTG-CAGATAAGTTTCA--TTTTGTGTT-CA-AAAAATT-G-TGCAACAACTGG-AGAGTCATA-TTTGG--GC-AT--AAATTAATAGA-TTTAG--AGAGCAAT-TGATATTCAGGGGAAAAGT-TATC
gi|23 : gca-TG--C-AAGGTC-C-ACCCCACTAAGGA----TATAGACATGC--C-TTG-TG-TAGATT-G-C---CAGCTTCCA--AT--ATGTT-CC-AAA---T-G-TTC-AACACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGC-AT--GAACTTGTTGA-TTTAG--AGA-TAAT-C--TATG---AAGAAAAGA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGA
gi|24 : CTAC---AGAA-----GATACCAACCAATGG-TGAAGATGAAGG------CTA--CCACACCGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATG--TTTGCGG--------ATAGT-G-ACAATAACGTCATA-AATAA-G--ACAACATCG-GATAAT--AA-----TG
gi|25 : ---GGTCAGGGAG---TT-CAG-GGTA-TTGGG-TGTT-G-AA--G---TTTTATGG---CAT-----ATATCCCTTCAT-AAA-T--CCG---ACAG--ACT--CTGGG-CC-A-G-TAAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGtc
gi|26 : ctatTCACA-CAGG-ATGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------AAAAA-G-CAAGTAAAGTCATC-AAGAG-G--ATAACACAC-GATAAT---A-----CTATCAC-AGGATTCA-TG-AAAACAGGG-GACT-GGACACC
gi|27 : ACAT-CGC-AGAAA---ACATCAA-T----GGTGATGTCTGCGTGTC---C-GAC---TA--CAATAA-ACAAG-CT-G-TAG-TAGT--GGTAAA--TAAA-TCAAAT-C-AC-CACAG-G-TTCTCC-------TAC--A-GAG--GTa
gi|28 : GTTCTTG----TC-ATT-ACT-AC--T----CA-C--AC--TAC-AA-CACGG--A--GTACGGT---T-TCC-CT----ATAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-TGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GAAA--------TG--T---ACACca
gi|29 : gAATAAAGTCATC-AATAA-A--ATGGCACAG-AACAAT--AA------AATTAA-AAAGTTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGGCACCCA--T-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATTAA
gi|3 : TCAGATGGCACATTCCAAAACTGTAGCGTACCAAATATGGGTAC-AACCCCAGCACTTTT-TAGAATGT-GGCATC-GAA-GATTGC-GAG-AG-AAAATTGTCAA---CCTTACT--GCAATCCTT-GCCA-TC-GC-AGATGTTG-TCAAC-AATGCACAGCA-CG-AGCATCT--GAAGAATCC-AGATTACAAAGAAACCATGA-GG--TGGTCCCT-T-ACCAACAACGAAAA------CGACATCTTCCTG-TGG-AAAA--TG--C-AAGATC-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGACATGC--T--TG-TG-TGGATT-G-C---CAGCTTCCA--TT--ATGCTACA-AAA---T-G-TTTCAACACAGGGAGA-TCA----CAGGAGGC-AT--GAACTTGTTGA-TT-AG--AGA-CAAT-A--TAGAA--GAAAAAAAA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGAGAT----AT-CA-AAGGTCGA-CA-AGTATT-TTCT---TC--C-CACATC-ACA-GAT-TTACAGAAAGAAAT-------AAA-GG-G-ATG-CCCA--CAG-AGAAT-AA-----AGA-TGA-TCCA-AGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTG-TGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TATCA-GAAA-TATC-AACAAGTGGACTAATA--A----GAACAGTC-ATTGCT-GAGAAATTACAG-------AGTCGAAGA-T---ACAC--ATATTTG--AT-GAT-ACAT---T-TCATA--TCTTCCATGACC-T---GTCAAAATAT-TC--ATGG-------TAACT-ATCCTCCACAAA--ACTTACAATCA----------TTAATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-G-TTCCAG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACACCA-GT--GTT-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGG-----AAAAT-GAAGCG---GAAAAG---AA--ACAAGCGG-GGGTGCGGAAAAAAT-AAAACAC---ATGGACATTATAT-CTCCTTT----AGCATCAGTGGAC---TCTAC-AAGTAA---ACGAAAG-AAACAAGG--ACAAG--GATAAG--GATCTT-GATGT-G-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TTCACTGA---GGTCA-GGAA---TT-CAGTTGTA-TCAGATTGTTAG-CA--G---TGC-ATTC---CA-----TATTTCACTAGGTAAAA-T--CAG---GCA-A-ACTT-ATGGATTC-A-G-TGAT-TTTG--ATGGT-AACCT-TGTCC--AACAG-ACAGTC-A--CTGAGGA----CTGCAACTAC---AAAA-----ATTACGAACCAGTGA-TG--GAT-ACGG------CT----CACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAC-CTG-ATCTTTTA-CAG--------AC-GA-GAAAAATAAAGTCATC-AATAA-A--ACAAT---G-GGTAATCAAA-----AGA--A--AAAATTCATTT-CAAACAAAA-GACT-GGA-AACCA-AT-AAGC-TA--CA---CT-CTCAC-C-ATTAAC-GGGAAC--ATA-CTGGTGG-G-A-TG-AGG-AA---G--GAT-ATGGGTGAGGCTA-AA-TCACAC-TCG--GTAC-----AGCAA----ACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAA-G-GACAG-GACCTGTATTAGAG------GATC-C--ACACTA-AT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GG-GATATTTG-GTATC---ACGAC---AT--ATATAA-AAAGG-CA-GTTAGTGCGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C----TACAG-G-TTCTCC-------TACAAACG------TCAGAA--G-TTAA-GATT-TA--TC-CC----TTT----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG----TCAT----CTCCTGGTG-TG--TGAT-------------------GAAAACA---------------G-TGAAACAATTT-CA--ATTTCT-C---GA-T-------AGTGAGGGTC-A-TTCTTG----TC-TCT--CT-AC--T----CA-C--AA--AGA-AA-CAGAA-CAT-ATAC--T---A-TCCACC----G-AG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CGA--GA--AC-AATCTTTATGTAG-----
gi|30 : t-CA--CCTGCT-G---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCCCG----TC-TCT-ACT-GC--TGA--CACC--AG--AAC-AA-CATGG--A--ATACACC---A-TCC-Ca
gi|32 : AGGTTCA-CG-AATATT-TCCT---TC--C-AACTTC-ACAGGAT-TTACAAAAACAAGT------atg
gi|33 : -CT--TC-CC----TAT----GGTATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG----TCAC----ATCCTG
gi|34 : CTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G----A-ATG-AG---GA
gi|35 : --ACAAT-G-GACAG-GGACTGTAT---GG-----GTATC-C--ATGCTACAT-CAC-atga
gi|36 : aGTGT-ATAG-GTATC--T-ACA-GTGAG--TCCTCTTA
gi|4 : -AT----------------------TTT---------CTA--T-TTGTA-------G-A--GAGT----CC---T--ATTTATCAAATGGCAC-ATTCCAAACTAAGTGTACCAAGCCTG-GGTAC-A-CCCCAGCATTTTA-TAGAGTGT-GACATT-GAC-GAATGC-GAGAGG-AA--TTGTCAG---TTTTACT--GCAATTCTT-GCCA-TCTGC-AGATGT-G-TGAAC-AATGCAGAG-A-GG-AACATCT--GAAGAATAC-AGATTACCAG--AGCCATGA-GG--TGGT-CCT-TTACCAACAACGAAAAACGAAACGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGACT-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGATATGC--T-TTG-TG-AGGAAT-G-T---CAAATTCCA--CT--ATGTT-CC-AAG---T-G-TGCAA-CACAGGCAGA-TCAT----CGG-GGC-AT--AAATTCATTGA-TCTGG--AGA-CAAT-C--T--T---GAGGAAAATATAGCACTT--------CGCCTCA-AGA-AGATAT----C--CAAAA--TCCA-AG-AATATT-TCCT---TC--C-GACATC-ACAAGAT-TTACAGAAAGAAAT------TAAA-GGTG-ATA-CCCA--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TAA-TCAT-GGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCTA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCCCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATGCATCAGGTGGAC-AAGA-TA----GAACAGTCC-TTGATGGAACAATTACAG-AA--T----C-AAGA-TTCAACAT---T---TG--AT-GATTACAT---T-TCATA--TCT-CAATGAC--CT-CGTCAAAGAGT-TTC-ATGGC------TACAT-GTTTTCCCCAAA--GCTTGCAAATA----------T-AATTTCCAAT-CTTTCTAAGAA--ATTCTCA-GAAA--TTCGA--CCCATAC-CA-GAA-ACAACAA----CAGTG-GTGACCCCA-AT--G-T-TTACT--GCTGGTCG----ATAT-A-GCAAAG---ATAATGTGGCCAAAT--TACTAGGG-----AAAATAAATGTG---AGGGATACCAA-----AGCAG-AGATGAG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCT-CTCCCTC----AACATCAGTGGAA---TCTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACGA-G--ATAAT--GATAAG--AAATCT-TATGT-G-AAAC-AAACAA--T--GCCCATA-TCTTCATATG-------TC-TCTGA---GTTTAGGGAGATATT-----TGTA-TT----TGTT-A-AA--G----AA-ATGA---CCCA---TATCTCCCTTGAT-AAA-G--CAG---GCAAG---CT-ATGGG-TC-A-G-TGGC-AGTG--A---T-AACCT-TGTAC-AAACAG-A---CTTA--CA-AGGA-AAGC---AGCTGC---TGAG-----GATAAAGATCAGTAG-TG--GAT-CTGG------CTA--CCACACAGTCACA-CGGG-ACGGGGTG-CTC-ATC--TTAACAG--------ACAGA-T-ACAATAAAGTCATC-AACAA-G--ATAACACCG-GATCAT--AA------GATAAA-AAAGTTCT-TT-AGAACAGGA-AGCT-GGA-ACCCA-AT-CAGCATA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-GTA-TG-ATA---------GGTAAGGG----GGCCA-GAGT--CAC-ACG--GTAC-----AAC-G--AGAAAGGGA-----AAGAACTACATAT-CAT-AC---AAACAGATG--ATAAA-G-GACAG-AAACTATAT---AG-----cattgc
gi|5 : tcatttatTTCAAATCTCACTGCTCGAATTTCCAATAAATCCCCTCAAAGAGAATGTCA-TTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGT-AAGTACTTGTAAAAAAACAAAATCTCACATTTTACAGTCTAG--ACGTTGGTGAAT----GCGCTGTG---TCGGGTAAAATGATATTTTCAGGCATATTACTTTTT-GAAATGA----ATTCT--TGGAGTTTGGACATTGTCTACAT----------------------CTTCTACTGCAGTTAGTTGTTTCACGATGGCG-ATGGTGTATTTTTTAGT--ATTTATTAGA--GCAC-TTTCAAAAGTA-----------------TTACGA-CCC--GCACTTCC-TTAGGTGCGGGCATTCGAATGAGAG-CGAGCAGAAA--TTGTAGC---ATTTACTGCGCATTGCTTGGTCA-TCACCGAAATGT-GATAAACTAATGTCGAG-AGTA-AACA-CT--GAAGAGTCCAAGAATACAAAT-AGC--TGACAGTTTGGTT-CT-CTATT-ACAACATAAA------CAACAACTTCCTGCTGGAAAAAA-TGC-C-AAGGCCAC-GGCCAACTAAGTA-----GTTGAGAGAC--TACTG-TAGATGAAT-G-C---CAGTCTCCAATTT--GT-TT-CACAAA---TCG-TAC-AACACTGGTAGAGTCACTGTCTG--GGCTACTAAAATTTATAGA-T------AGG-CAATAC--TATC-------AAAGT-TATT-CTAACAATTTTTG-TCCATCGACGGAGAG----TTACAGATGGTCCATTC-AATATTATCCT---TCAACAAACATCAACAAGAT-TTAAAGGAAGAGATCA----CAAA-GAAGAATGACGCGAACGGTA-AAT-AAATACTAGA-C-A-CTAT-GGCCAGGTTTCAGCTTCT-ATTTTAGATACATGCCATTGTAAGCCAACTGGGAGGATGTTTCTCTCT-CC-AAAT---ACA-TGGTGGA-CC-CAGTGGG-TGTCAGGAAAGTATAGAAC
gi|6 : A--TGTCCTCGG---T-CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------CCA---TATCGTGACAAAT---------------G-TG-------TT-CA--TCTTCT-A---GA-TC------AG-GACGGTC-GGTTCTTG----TC-ATT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CAAGG--A--GTAGAAT---A-TCC-CT----ATAG---T----GTATGTGT--AG-A-TG-A-TGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATT--------AT--G---ACACAGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC---TACA-GTGAG--TTCTCTTATT-GTCAATCAACACACTACCACACAGAGATTTCACAACTTGTGACCAATGAGATAATATTTTATGAAT-CT--ACAATTTAt
gi|7 : A---CTCCTCTCAC-ATTAAT-GGAGAC--ATA-CTAGTAGAG-G-TGGATA-AA---GATGGG-AAAC----GG--A-AAGT--GAT-CAG--ATAC-----AGCAA---GAGAGGAA-----AGAAGCTCCAAGA-AAT-TC---AGAAGGATG--ATAAA-G-GACAA-GATCTATAC---TG-----T-ATCAT--AGGGTGCAT-CAC-AGAAA---ACATTAA-C----GGTGACATCTGTGTATC---C-GACCCTCT--TCGTAA-GAAGG-TG-G-----TGGT--AGTGAC--CAGA-TTAGGA-C-AG-TATCG-G-TTCT-C------TTAC--TTTGGTCATCCATTACAA-CCTG-GATT-CTA-TC-CA----AAC----AGAATGTGTA-----CAGA--TG-CCTTGGGAATT-------ATCTTGGTC-TG--TAGT-------TGT---GGT-G-G-TAGTAAATGTGAGACCTGGGG-TA-------TC-CA--CATGTT-T---GA-CC------AG-GACGGTC-AGTTCCTGAATTTC-CTC-ATC-ACA-T----CA-C--AA--Aatgaatgaataaggctgatacaactatactagaaaatacacagtagagtgtatggaatccccataattaaccaaacaagttgctgattatatgtgcaagtttaactatgatttacagtcacttacattgttaagtatgcaaaacaacagtgtgtgacaatcaaaagatatctttaattatcctgtagctttcaatttacaatatctgaatatcacgatattactactaagagctagatttgaaaaaggtcttgtttatgaaataagattttagaaaataagattctccctttcagttttatataattcaattatttcttctttcattctacatttacaatagcatcctatggga
gi|8 : ct-TACAT--GTGAAT----G-GAT-TA---TCGGGTAATTTAATATTTTCAAGCA-ATGACTTTTT-G--ATAA----ATCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-GTATTGCCTACATTCTACTGTAAGTTT--------GCTAGTT-TTTCA-------GGATAGAATATTTTG---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCGTT-GAA-GATTGT-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACACCT--GAAGAGTCC-AGAAAACAAA--AACCATGA-AG--TGGTT-CT-CTATCTACAACGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAATG-TG--C-AAGGCC-C-ACCCAACTAAAGA----TATTGACATCC--T-CTG-TA-ACAATT-G-C---AAAGTTTCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGC-AACACTGG-AGAtgcccagtgcggtctgcactgatgatcaacaaaacgtctgggttggaagttggaacag
gi|9 : GTCAAAATAT-TTC-ATGGT------CACCT-ATCCTCCAGAAA--CCTTACAATTA----------T-AATCCCCAAC-CTTTCTGAGAA-G-TTCCAG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-AAG-ACAACAA----AACCG-GTCACACCC-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGC-----AAAATAGAAAC------GGAAAACAA--ACCAGCAG-AGATGAG--AAAAAT-AAATCCC---ATGAAAATTGTCT-CCCCTTT----AACATTAGTGGAC---TCTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACAA-G--ACAAG--GATAAG--GAATCT-GATGTGG--AAC-AAACAA--T--GCCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GATCAGGAAG---TT-CAG-TGTA-CCGGG-TGTT-G-AA----------ACGG---TATTCCATATTTCACGAGAT-AAA-T--CAG---GCA-A-ACTT--TGGG-TC-A-A-TGA
blockSeqs : C A TA G T . GTAT CA T . TGTA A CAT T AG T TG TAATG GTG TG T T . AA . AA G T C GTATTGCCTACATTCTACTGTAAGTTT G G CGATGGCGATG A TAGT A A T TAGCGTACCAAATATGGG G A A CG C T C A AA T G AAG GC T G G A G T A T C G T GG G A A GA G C CA TT CC . A A ACGAAA C A AT TC . A C C GGAA T ACTC G G A A T . AGA C AT TT A C AAT C . G A C T G G TATTTGG T TA A . TT . G TGATATTCAGG A T G ACAATTTTTGTCCAT C GTTTTT A G TCAG A GTT AA A A A G A GATATTC T A A A CGAA T G G ATACT A G . T GTTTCAGCT T TTTT T T A G GATGTTTC G T TTAG . T G G A G A AG T A A TCAG GG A GAGAGCCAGCTGA G A TCA TCATG GAAA AATTGCGC AG T TGTTGT C G G TGGGCTT T C C CA A CA C GGGGCGCTGCTC A GGAC T . AT AT G GC T TGAA A A CA T A TC TTGG C C GGA G GA G GTGAA ATTATAA TTA T T A T GA T TAA AG G AGTG C AATG A GGT T A ATT GA AT G G AAA A TTG . GTACAGT C ATT ATA G TT T G T AG TCGTTTTATGGGCATAT T A A A TGC A ACC GGAACTTC T G . T A ATGG A G . T CAG AG TAGTCTTGC AAG TTATT A A T AA GAA GATTCTCTAAT C G T A T TT AGCGAATC TT G . GT T AAATACTCT CA T TA C G AT CTG G TT TCT C T AG T A ATGAGGAAGGATATGGGTGAGGCTA CA GAA CC TATCA TTA ACATG AAT . TGA AA AA GT T C AC TAG TATGCCA CCA C C GC T AAG A GCTGGA G C AATA GCTGC A G C C A T GTG TA T AG . C AAT T T T GCCTAATTACAGAG TACAA A G GA A TACAGCG GGTAGC CC GAATT GAGT GC GT TGTGGTGGTAGTAAATGTGAGACCTGGGGTA G TG T GTTG . CAAATG T T A AATT T A G TGGGA C GA GG A . T ATTGTAGGCGTTG A TTGT TTCTA T CA A . T G . TT A G TTAGTGA GGTCATTCCAGTAC TCAAGTGA A A . C T GT A G C A AG A A TT T . .
blockSeqs : A T A T . GC TA AT . T . . . . . . C CATCTTCTACTGCA . T GGATA T TGT A . C AGTGTACCAAGCCTGGG . . . T . . C . . A C . . A . . A . . . . . . . . A . A T A C T . T . A A . . . A C . . . A . G TAC . . C A . . . G . . . . . . . T C A A G G CTGTCTG . . T . TT . . ATAGAAG . G G CGCCTCA . TTA A G TTCA . . . . . A . T CAC . A . . GG . . . . . G . . . . . . . T A G . . T . . . . . . A TG . A . . G A TTACAGAAT . . G ATATT AAA TGCC . . TTT C . . C C . A . A TA C ATT . GGA T . . . . C . . . . . . . . . . . . C . C . CGGA A C . T C . . . AT . . C C . . A . GG . . . G AA . T . . . . A . T . G . A GTTTTATGGCAT C C T . T G . AACTTA . . . . . TGG . . . . T . CTGCAA A . C G . . AT GTT C . . . . T . GA . . . . CAAAAG C . G . . AC AT A . . C . . . . GATGTAATTGGACTATAGGACTAC . GAA . . G . AA . TGA TG AA A . C TT G TG CCA T C A . . A C T A AC CCTCT G . G . . . TGC . T . . . AC . T C TTACTTTGGTCAT AGAT . . A . GTGTAAT A . C . A . AGACCAATTGACGATTGTTG G . G GTTG . T . T A . T . . TGGGA . GA . A . T ATAACACAG . . CTCT T . A . T . . TT . G GACAAC GGTCATTCCAGTAC . A . . T . . T .
blockSeqs : . . G TA TT . G . . . . . . . ATTTT . T GA A T . . T GG . . . T . . . . . T C . . C . . T . . . . . . . . A . T . G C G . C . A A . . . A . . . . C . G AC . . A T . . . C . . . . . . . T A A A C . CAGGA . . T . CT . . CTATGA . G A TGCTT . AT G G TCA . . . . . G . C C . T . . CA . . . . . G . . . . . . . . G . . . . . . . . . . G GC . G . . A G ACCAATA . . G AT AT TTCA . . CTC A . . C A . A . C TG T CT . GTT A . . . . A . . . . . . . . . . . . T . A . TGAG A C . T A . . . AT . . T A . . A . G . . . . AA . T . . . . . . G . G . G GAGGCATCCCA A C T . C G . GACTC . . . . . A . . . . . . AAGCAG A . T A . . AC CTA C . . . . . . G . . . . AATG C . G . . GC TA A . . . . . . . GTGGATAAAGATGGGAAACGGA . TC . . G . AA . . GG . G . . TT . GT AT T C C . . A T A C A TA A . C . . . TA . A . . . AG . . C TACAGAGGT AAGA . . . . TTT A . T . T . TATTTAAGCCTATTACAAT . . G AA . . . C . . T . . TGA . . . . . G ATAACACAG . . CTCT T . . . . . . . . G GA CACCA . C . . . . .
blockSeqs : TT . . GA . T . . T GG . . . T . . . . . T C . . T . . A . . . . . . . . G . T . G C G . T . T T . . . G . . . . C . G CT . . G T . . . C . . . . . . . G . A A T . CAGGA . . T . T . . ACTATC . G . TGCTT . C . G CAA . . . . . A . C T . A . . CA . . . . . A . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . AG . T . . C . TTACAGA . . . T AT TTCA . . CT G . . T A . C . C TA A AT . ATT C . . . . A . . . . . . . . . . . . C . C . C . C . T A . . . AT . . . C . . A . G . . . . A . T . . . . . . G . A . G GAAATGACCCA T A A . T C . AACTG . . . . . A . . . . . . ATCTG A . C G . . TT CTA C . . . . . . G . . . . ACT A . T . . C AT G . . . . . . . TATGATAGGTAAGGGGGCCA . TT . . A . AT . . GG . G . . AC . A C C C C . . A T A T C TA T . A . . . TG . G . . . . . . C TACAAAGG AAG . . . . TAT A . T . T . GACGTATATGTGACAGGTG . . A T . . . G . . A . . GT . . . . . A CATACACGA . . T T . . . . . . . . G GA GGG . T . . . .
blockSeqs : . T T . . . T . . . . . T A . . G . . A . . . . . . . . G . T . A . A . T . . C . . . . . . . . C . G TT . . G A . . . A . . . . . . . A . A T . . TCGG . . A . . . . CTTG . T . . CGA . . . . . A . C . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . C . G . . A . . . A . A . C G T AT . GTT A . . . . A . . . . . . T . G . A ACGGTATTCCA C C T . T A . GACTC . . . . . A . . . . . . ACCAG A . C G . . AC CTA C . . . . . . G . . . . ACT A . T . . G AT A . . . . . . . GAATGTTATTGGG . TC . . . . GA . . AG . A . . GA . A C T G C . . A T T . C AT C . A . . . T . G . . . . . . . TACAAACG . . . AAC . . T . G . GACGTATATGTGACAGGTG . . T T . . . C . . A . . AT . . . . . C AGTACGGTT . . T T . . . . . . . . G G TGT . C . . . .
blockSeqs : . C . . . . . T G . . C . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . A TC . . T A . . . T . . . . . . . G . . T . AGA . . . . . . . A . . . T . . . G GTGCATTCCA T A A . G A . AGCTA . . . . . A . . . . . . T . A . . . CT CT . . . . . . . G . . . . AAA . . T . . A T . . . . . . . . GAATGTTATTGGG . AC . . . . . . . AC . T . . AA . G C G . C . . . C T . T . G . CCATATCGTGACAAATGTG . . T C . . . C . . T . . T . . . . . G CATATACTA . . T . . . . . . . . . G G ATG . .
blockSeqs : . . . A . C T . . C T . . . G . . . . . . . . T A . AACTT . . . . . . . . . . T . . . . AAG . . A . . . . . . . GATGAAGTCTA . CA . . . . . . . AA . A . . AT . T . . . . . . . C . . T . G . GAAAACAGTGAAACAAT . . C G . . . C . . T . . T . . . . . T AATACACCA . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . C . TTCGGTACTG . . C A . . . . . . A . . T . . . . . A AGTAGAATA .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A T . . . . . C . . T . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : GTCTT******************************* GA********** GCAGCGG*********** T* A* CNGGG**** ** T****** CGA** N* CCACAGA******* T****** CTT*** GTT** AT ** AA* T**** G** GTTTTAGGCATTCCA********* T*** AACTN**** NNCGG***** A*** ANN******** A* AT** GAANGTTATTGGGC********************** G** AG A****** A*** TACAGAGGT************ ANA*** T**** T* TG***** ANTACACNA******** ** ***
originalCons : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GCTAGTT-TTTCA-------G-ATGGAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTA----------------GGTAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTCCT-TTACCAACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATGC--T-CTG-TA-ANGANT-G-C---CAANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCAT--TCCGGAGGC-AT--AAATTTATNGA-TTTAG--AGA-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGAT----TT-CAGAAGGTCCA-TC-GATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CTCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TCAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGTCCGTTGTTAGAAGAANTACAGCAA--T-AGCC-AGGA-T--GACAC--AT---TG--AA-GATTATAT---TGTCATA--TCT-CCATGACT-TT-CGTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TNCCT-ATCCTCCNCAAA--GNTCGCAANTN----------T-AATTCCCAAA-CTTTCTGAGAA-GATTCCCG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACCCCA-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAACG---AGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTT----AGCATCAGCGGAA---TCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAGGAGATAAG--AAATCT-GATGTGG-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTA-TCGGG-TGTT-G-AA--G---TTT-ATGG---CAT----TATNTCACTNGAT-AAA-T--CGG---GCAGG-ACTT-CTGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGA-AATCTG-ANCTAC---GGAA-----GATANAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG------CTA--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAAT--AA-----CGATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGACACCCA-NT-CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-G-G-TG-ATG-AA---GACGGT-ATNG----GGCTA-AAGT--CAC-NCG--GTAC-----AGCAA--AGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-----CGATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-TAGTTGGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C-AA-CACAG-GTTTCTCC------TTAC--ACGAG--GTTCAGAAAGA-TCAG-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG---TTCAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCTTG----TC-NCT-ACT-AC--T----CA-C--AA--AAC-AA-CANGG-CA--GTACGGC---G-TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC--TTACA-GTGAG--TCCTCTTANT-GTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
finalCons : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTAGTCTT-------------------------------GCTAGTT-TTTCAGA----------GAGTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTAGCAGCGG-----------TAC-A-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCA-TCAGC-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTT-CT-TTACCAACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATGC--T-CTG-TA-ANGANT-G-C---CAANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCACNGGG----GGC-AT--AAATTTATNGA-TTTAG--AGA-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGATT------CAGAAGGTCCACGA--ATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CTCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TCAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGTCN-TTGTTAGAAGAACCACAGA-------GCC-AGGA-T--GACACT------TG--AA-GATTATAT---TGTCATA--TCT-CCATGACCTT---GTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TNCCT-ATCCTCCNCAAA--GNTCGCAANTN----------T-AATTCCCAAA-CTTTCTGAGAAGTT--CCCG-GAAA--TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACCCCA-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAACG---AGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTT----AGCATCAGCGGAA---TCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAG--GATAAG--AAATCT-GATGTGGAA-AC-AAACAAT----GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTA-TCGGG-TGTTG--AAGTTTTAGGCATTCCA---------TATNTCACTNGAT-AAAT---CGG---GCAAACTN----TGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CAGGGGANNCGG-----CTACA---GAA-----GATANAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG------CTA--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GATAATANN--------ATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACT-GGA-ACCCAAT--CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CTGGTGG-GGAANGTTATTGGGC----------------------AAGT--CAC-NCG--GTAC-----AGCAAG--GACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AGA------ATC-C--ACGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-TAGTTGGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-CA---CACAG-GTTTCTCCTACAGAGGT------------TCAGANA---TCAG-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGGT----CAC----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCTTG----TCT-CT-ACT-ACTG-----CA-C--AA--AAC-AA-CANGGANTACACNA--------TCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTATC---TACA-GTGAG--TCCTCTTANT-GTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): ATATAATTCAACTCTCTTTTCATTCATTCTACATTTAATATAGCATCTATGGG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1 2222 11 1 1 2222 111 11 11 11 222222 222222 11 1 1 11 2222 11 1 1 111111111111111111111111111111111111 4444444444 1111 111111 2 1111111111111111111111111111 1 111 1111 11 111111 11 11 1111 11111 1 1 1 22222222222 333333333333 3333333333333333 222222 22222 111 2222222 1111 11111 222222222 1111 1 33333333 2222 1111 1111 3333333333333333 111 444444444 11111 22222222 11 2222222 2222222 3333333333333 111 1111 11 11 1111 111 11 22222 2222222 11 11 1 111 2 1111 1111 111 1111 22 11 11111 11111 2222222 111 111 555555555555 22222 11 1 111111 111 22222222222 111111 11111 111 11111111111 11 11111111 1111 1 1111 111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 11111 2222 11111 111 111 11 111 111 11111111 111111 11111 2222222 1 111 33333 1 2222222 1 11 22222222 11 22222222222 111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 111111 44444 11 1111 11111111 1 1 11 11111111111 6666666666666666 22222222 111 1 11 1 1 11 1 11
lowQualScore : 5 1 88 1 1 5 4444 88 5 5 4444 1 777 7 44 33 33 555555 222222 00 0 1 0 33 1111 33 0 0 2 555555555555555555555555555555555555 8 3 2222222222 7777 0 666666 0 6 1 3333333333333333333333333333 6 5 0 77 5 5 0 8 0 5 77 1 1 000 77 1 5 1 2222 5 5 5 5 0 5 5 5 0 77 1 5 1 33 1 4 66 99 99 7 1 999999 0 6 6 33 33 5 5 5 1 0 0000 0 1 00000 5 5 1 1 5 5 888 1 66 66 5 5 888 5 5 1 5 1 1 2 5 33333333333 6 99 1 6 44 99 6 111111111111 6 1 6 4444444444444444 8 000000 6 1 22222 5 000 77 5 5 2 5 1 5555555 6 3 6 6 1111 0 6 6 6 66666 6 1 6 6 666666666 6 4444 6 6 3 3 00000000 6 6 0000 6 6 6 6 6 6 9 33 6 1 6 4444 3333 3 8 8888888888888888 8 8 444 111111111 11111 0 22222222 11 8 1111111 1 6 6 2222222 1 6 1 99 1 77 1 0000000000000 6 77 22 99 111 99 6 88 6 7777 8 0 8 11 8 8 11 0 7777 8 8 444 1 11 1 00000 0 5555555 0 11 3 8 6 3 11 6 444 11 0 0 7777 3 4444 8 444 1 8 2222 22 11 8 44444 8 33333 8 1111111 6 000 555 5 77 5 3 5 888 555555555555 11111 1 1 1 5 7777 3 888 11 0 777 5 5 5 5 5 0 111111 5 5 5 5 555 77 5 66666666666 444444 44444 1 8 5 77 000 77777777777 4 5 5 0 5 5 11 0 88888888 666 4 4 66 0 4 9999 4 2222 66 5 77 5 5 66 0000 6 66 777 7 4 0 55 4 111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 66 222 66 22222 1111 22222 000 5 777 44 22 77 4 8 55 222 777 5 5 66666666 88 4 888 3 333333 5 5 77777 6666666 1 6 1 6 6 3 111 99 1 99 6 6 99999 6 5 8888888 88 9 8 1 99 77777777 6 55 6 99999999999 888888 66 88 4 8888 44 66 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 8 55 1 0 99999 4 555555 4 5 8 8888 7777 4 11111 4 11 55 8 1 999999999 111 1 4 0000 99999999 3 66 0 5 0 5 66 33 5 2 99999999999 7777777777777777 0 44444444 1 5 5 5 111 3 33 1 3 5 1 88 1 1 22 1 5 88
lowQualScore : . . .. . . . .... .. . . .... . ... . .. .. .. ...... ...... .. . . . .. .... .. . . . .................................... . . .......... .... . ...... . . . ............................ . . . .. . . . . . . .. . . ... .. . . . .... . . . . . . . . . .. . . . .. . . .. .. .. . . ...... . . . .. .. . . . . . .... . . ..... . . . . . . ... . .. .. . . ... . . . . . . . . ........... . .. . . .. .. . ............ . . . ................ . ...... . . ..... . ... .. . . . . . ....... . . . . .... . . . . ..... . . . . ......... . .... . . . . ........ . . .... . . . . . . . .. . . . .... .... . . ................ . . ... ......... ..... . ........ .. . ....... . . . ....... . . . .. . .. . ............. . .. .. .. ... .. . .. . .... . . . .. . . .. . .... . . ... . .. . ..... . ....... . .. . . . . .. . ... .. . . .... . .... . ... . . .... .. .. . ..... . ..... . ....... . ... ... . .. . . . ... ............ ..... . . . . .... . ... .. . ... . . . . . . ...... . . . . ... .. . ........... ...... ..... . . . .. ... ........... . . . . . . .. . ........ ... . . .. . . .... . .... .. . .. . . .. .... . .. ... . . . .. . ...... ...................................................... .. ... .. ..... .... ..... ... . ... .. .. .. . . .. ... ... . . ........ .. . ... . ...... . . ..... ....... . . . . . . ... .. . .. . . ..... . . ....... .. . . . .. ........ . .. . ........... ...... .. .. . .... .. .. .................................................... . .. . . ..... . ...... . . . .... .... . ..... . .. .. . . ......... ... . . .... ........ . .. . . . . .. .. . . ........... ................ . ........ . . . . ... . .. . . . . .. . . .. . . ..
lowQualScore : 0 0 55 0 0 5 0000 00 5 5 0000 0 777 3 00 22 88 222222 222222 22 0 0 0 88 2222 88 0 0 5 222222222222222222222222222222222222 0 2 0000000000 0000 8 000000 4 7 7 3333333333333333333333333333 7 7 4 11 7 7 3 6 7 7 99 7 0 000 99 7 7 7 1111 7 7 7 7 7 7 7 7 1 99 7 7 0 66 7 3 00 22 22 8 0 222222 7 7 7 11 66 0 0 0 0 1 6666 8 4 22222 0 0 0 0 0 0 888 0 99 99 0 0 888 0 0 7 4 4 0 1 0 00000000000 7 22 0 7 88 22 7 777777777777 7 0 4 6666666666666666 0 000000 4 0 77777 7 000 99 7 7 3 7 0 3333333 7 5 7 7 2222 7 7 7 7 77777 7 0 7 7 777777777 7 2222 7 7 3 7 88888888 7 7 8888 7 7 7 7 7 7 8 55 7 0 7 2222 4444 8 0 2222222222222222 0 0 222 000000000 44444 8 44444444 00 0 4444444 0 7 7 8888888 0 7 0 22 0 00 0 3333333333333 7 33 00 22 777 22 7 22 7 0000 0 6 0 00 0 0 00 8 0000 0 0 000 4 00 0 00000 8 6666666 8 00 2 0 0 8 00 0 000 44 6 0 0000 2 6666 0 000 4 0 2222 00 00 0 66666 0 00000 0 7777777 7 000 777 7 00 7 0 7 333 999999999999 33333 0 3 0 0 8888 1 888 99 0 999 0 0 0 0 7 6 000000 7 7 7 7 777 99 7 55555555555 777777 33333 0 9 7 99 333 99999999999 3 0 0 8 0 0 99 2 11111111 222 4 4 11 1 4 4444 4 4444 44 7 00 0 0 44 4444 3 11 000 3 0 7 55 0 555555 666666666666666666666666666666666666666666666666666666 99 444 99 55555 0000 55555 444 0 555 44 22 11 4 9 44 222 000 0 0 66666666 33 4 888 2 666666 9 2 33333 7777777 0 7 0 7 7 3 333 22 0 22 7 7 00000 7 5 3333333 88 5 0 0 00 44444444 7 88 7 33333333333 333333 11 77 0 5555 66 11 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 55 0 7 00000 0 555555 0 7 9 5555 2222 0 55555 0 00 55 9 0 777777777 777 1 4 6666 11111111 2 99 0 0 0 0 99 88 0 5 66666666666 3333333333333333 7 22222222 0 7 7 7 777 3 88 0 3 0 0 00 0 0 00 0 5 00
consensus : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GCTAGTT-TTTCA-G-ATA----GA----GTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTAG------TA--C---G------------GTACA-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCATCAG----C-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTCT--TTACCAACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATGC--T-CTG-TA-ANGANT-G-C---CAANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCA---CNG---G-GGGCAT--AAATTTATNGA-TTTAG--AGA-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGA--T-T-CAGAAGGTCCAT-CGAATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CTCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TCAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGT-CG-TTGTTAGAAGA-A-----CCA-CAG----AGCC-AGGA-T--GACACA---T----TG--AA-GATTATAT---TGTCATA--TCT-CCATGAC-T--T-TGTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TNCCT-ATCCTCCNCAAA--GNTCGCAANTN----------T-AATTCCCAAA-CTTTCTGAGAAGNNCCCGG--AAA---TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACCCCA-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAACG---AGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTT----AGCATCAGCGGAA---TCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAGGAGATAAG--AAATCT-GATGTGG-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTA-TCGGG-TGTT-G-AA--G--TTTTAT-GGCATCCCA-TATNTCACTNGAT-AAA-T--CGG---GCA--AAC-T--CTGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CA-GGGGA----ATCGG--CTAC---A--GAA-----GATANAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG------CTA--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GAT----AAT-A--CNATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACTGGGCAC-CCAA-T--CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CT------GGTGG-----G---G------A--ANGT-T-AT---TG-----G-----------GC--GAGT--CAC-NCG--GTAC-----AGCAA--GGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-G-AT-C-C--A--CGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-TAGTTGGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C--A--CACAG-GTTTCTCC-------TACA-AAGG-TCAG-AGA--TCA------G-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG-TCA-C----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCTTG----TC--TCTACTA-CTG----CA-C--AA--AAC-AACANGG--ANT----ACACCGTCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTA-TC---TACA-GTGAG--TCCTCTTANT-GTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
Reference ( family-437 ) : TTCAAATCTCACTGCTCGNATTTCCAATAAGTCCCCTCAAANAGAANGCCATTTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGTAAAGTACTTGTAGAAAAACAANATCTCA-A-TTTACAGTCTAG-TACGT--GTGAAT----G-GCTGTA---TCGGGTAAANTAATATTTTCAAGCA-ATNACTTTTT-G--ATAA----GTCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-GT----------------------CTT--------GCTAGTT-TTTCA-G---A----GA----GTATTTTT---T--ATTTATTAGATGGCAC-TTTCAAAATTAG------CA-GC---G------------GTACA-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--TTGTNAA---TTTTACT--GCAATCCTT-GTCATCAG----C-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAANACAAA--AGCCATGA-AG--TGGTTCT--TTACCAACAACGNAAA------CGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGGCC-C-ACCCNACTAAAGA----TATTGACATGC--T-CTG-TA-ANGANT-G-C---CAANTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGCAAACACNGGNAGAGTCA---CNG---G-GGGCAT--AAATTTATNGA-TTTAG--AGA-CAAT-C--TATC---GAGAAAAGT-TANCGCTA--------TGCTTCA-AGA-GGAGA--T-T-CAGAAGGTCCA--CGAATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAGAT-TTANAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CTCG--CGG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TCAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATNGAACAAGTAAAC-AANA-TA----GAAAAGT-CN-TTGTTAGAAGA-A-----CCA-CAG----AGCC-AGGA-T--GACAC----T----TG--AA-GATTATAT---TGTCATA--TCT-CCATGAC-C--T-TGTCAAANAGT-TCC-ATGGC------TNCCT-ATCCTCCNCAAA--GNTCGCAANTN----------T-AATTCCCAAA-CTTTCTGAGAAGTTCCCGG--AAA---TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACCCCA-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTNGGG-----AAAATAGAAACG---AGGGAGACCAA--ACCAGCAG-AGATGNG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCTGCTCCTTT----AGCATCAGCGGAA---TCTAC-AAGTAA---ACGGAAG-AAACAA-G--ACAAG--GATAAG--AAATCT-GATGTGG-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGGAG---TT-CAG-TGTA-TCGGG-TGTT-G-AA--G--TTTTA--GGCATTCCA-TATNTCACTNGAT-AAA-T--CGG---GCA--AAC-T--NTGGG-TC-A-G-TGAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CA-GGGGA----NNCGG--CTAC---A--GAA-----GATANAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG------CTA--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-AAAATAAAGTCATC-AATAA-G--ATAACACAG-GAT----AAT-A--NNATCAC-AGAATTCA-TT-AAAACAGGA-GACTGGA-AC-CCAA-T--CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CT------GGTGG-----G---G------A--ANGT-T-AT---TG-----G-----------GC--AAGT--CAC-NCG--GTAC-----AGCAA--GGACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAG-G-GACAG-GANCTGTAT---AG-A-AT-C-C--A--CGCTACAT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GGNGATATCTGCGTATC---A-GAC---CT--TNATAA-ANAGG-CG-G-TAGTTGGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C--A--CACAG-GTTTCTCC-------TACA-GAGGTTCAG-ANA--TCA------G-GATT-CT--TC-CC----NAC----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG-TCA-C----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------NNC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TC-CA--CNTCCT-N---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCTTG----TC--TCTACTA-CTG----CA-C--AA--AAC-AACANGG--ANT----ACACNATCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATA--------CG--G---ACACGGT--------GACAGTGT-ATAG-GTA-TC---TACA-GTGAG--TCCTCTTANT-GTCAATCAACACACTGCCNCACAGAGATTTCACAGCTTGTGACCANTGAGATNATATTNNANGAATACTAGACAATTTA
gi|1 : TTTAAATCTCACTGCT-GCATTTCCAA--AGTCCCCTCAAATAGAAAGCCATTTGTCATTT----TG--GGTCAAACACAGAT-ATTGTAAAGTACT----GAAAAACAACATCTCA-A-TT-AC-GTCTAGATACAA--GTGAAT----A-GCTATAAAATCAGGTAAAG-AACATTTTCAAGCA-ATGACTTTTTTG--ATAATTAAGTCCT--TGGAATAT-GATA-TGTCTA-AT----------------------TTT--------GTTAGTT-TTTCA-GTATG----GA----GTATTTTT---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TT-CAAAATTAG----------------------------TACA-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGCCGAGCAG-AA--T-GTGAA---TTTTATT--GCAATCCTT-GTCATCAG----C-AAATGT-G-TAAAC-AATGTCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-AG--T-GTTCTTCTTATTTGCAGCGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAAAAGTG--CGAAGGCC-C-ACCCAACGAAAGA----TATTGACCTTT--T-TTG-TA-ATGAGT-GCC---CAAGTTCCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-GATACAAACACTGGAAGAGTCATTTCT----G-GGCCAT--AAATTTATAGATTTTAGGAGGA-CAAT-C--TATT---CAGAAAAGT-TATCACTA--------T--TTCA-AGA-GGAGGTCT-T-CAGAAAGTCCATTCG-ATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAGGAT-TTAAAGAAAG--AT------CAAA-GAAG-ATG-CTGG--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TGATTCAT-GGACAG---------TCT-A----AAA-ACA-GCCA-TGAA-GCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCATTGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACAAGTAAAC-AATA-TA----GAAAAATCCA-TTGTTAGGAGG-A------GA-CAAAAATAGCC-AGGA-T--GACACA---T----TG--AA-GATTATAT---TGTC-TA--TCT-CCGTGACTT--T-TGTCAAAGAG---CC-ATGGC------TTCCT-ATCCTCTTCGAA--GATCACAGACT----------T-AATTCCCAAA-CTTTTTGAGAGGAAACCTGAAAAA---TCCGA--TCCATAC-CC-AAG-ACAACAA----AACCA-GTACCCCCA-GT--G-T-TTACT--GC-GGTCA----TTAC-A-GCAAAG---ATGATGTTGTCAAAT--TACTAGGG-----AAGGTAGAAATT---AGAGAGACCAA--ACCAA-AG-AAA---G--AAAAATAAAAACCT---ATGGAG--TGGCTGCTCCTTC----AGTAGCACCGAAA---TCTAC-AAGCAG---GCAGATG-AAACAA-G--ACAGGGAGATAAG--AAATCT-GATGTTG-A----AAACAACTT--GTCTCTATTCTCCCTCTG-------TC-ACTGA---GGTCTGGGAG---TT-TAG-GGTA-TCTGG-TATT-ACAA--ACTTTTTAT-GGCAT-----TATATCACTTGAT-AAATT--CAG---GCAG-GAC-TTCCTGGG-CC-ATG-TGAC-GTAG--A---T-AACCT-TGTCCAAAACAG-A---TTTA--CAGGGGGA----ATCTGACCTACTTTG--GAA-----AGTAAAAACTA-TGG-TG--GAT-TTGG------GTT--CCACA-AGTCACA-CAGG-ATGGGTTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAAA-G-CAAATAAAGTCATC-AATAGTG--ATAACACAG-GAT----AATAA--CGATCAC-AGAATTCA-TG-AAAA-AGGG-GACTGGACAC-CCACTT--CAGTATA--CA---CTGCCTCCAC-ATCGAA-TGAGAC--ATA-CT------GGTGG-----G---GTGATAAA--ACGG-TAAA---CA-----G-----------GCTAAAGT--CAC-CCG--ATAC-----AGCAA--AGACA-GAA-----AAGAACTACAGAA-CATAAC---AG-CGGATA--ACAAT-G-GACAG-GGACTTTAT---AGCA-AT-C-C--A--CGCTACAT-CAC-AGGAA---ATATGAA-T----GGAGATATCTGCACATC---A-GAC---CT--TAATAA-AGAGG-CA-GTTAGTTGGT--GTTGAA--TAAATTCAGGA-CAAA--CACAG-GTTTCTCCT------TACACAAGGTTCAG-AAAGGTCA------A-GGTT-CT--TC-CC----CGG----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCTTCAGTTCA-C----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------TAC---TAT-G-GACAATA---------------G-TG-------TT-CA--CTTCTT-A---GATTC------AG-GACGGTC-GGTTCTTG----TCAAT-TACTACCTC----CA-C--AA--AAC-AACCAAGCCAGT----ACAGCGTCC-CC----GTTG---T----CTGTGTGT--AG-ATTG-A-TGAAGAA--AC-AATCTCTAT-TA------GA----AATA--------TG--G---ACACAGT--------GACAGTGC-ATAGCGTA-TCTGTTACAGGTGAG--TCCTCTTACT-GTCAATCAA-ACATTGCCTCAC--AGATTTCACAGCTTGTGACCATTGAGATTATATTAAAAGAATACTAGACAATTTA
gi|10 : AAACAAAA-GACTGGC-AA-CCAA-T--CAGCGTG--CA---TTCCTCTCAC-ATTAAC-GGCGAC--ATA-CT------GGTGG-----G---G------ATGAAGTCT-A---------------------------AAGT--CAC-TCA--GTAC-----AGCAA--G-ACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAAGGACG--ACAAA-G-GACAG-GACCTGTAT---AGTG-AT-C-C--A--CACTACAT-AAC-AGAAA---ACACCAA-C----GAGGATATTTGCGTATC---A-GAT---TA--TAATAAGACAGGCCG-G-TAGGTGGT--GTTTAA--C-AA-TCAGAG-C-----TACAGTGTTTTTTCGCCTAATTACA-GAG--TCAG-AGAT-TCA------GAGAGT-CT--TTACC----TACAGCGGAAATATGT------CTGACCTGTTGTTGG-CCA-C----ATAGTGATA-TGGTTGATTATTTAAGCC---TAT---TACAAT---------------------------TC-TA--CT--CT-T---GA-CCT-----AG-GATGGgcccacgcgaataa
gi|11 : tcATCTCA-A-TTTACA-TCTAG-TACGT--GTGAATTAATG-GCT-TA---TCGAGTAAATGAATATTTTCAAGCA-ATTACTTTTT-G--ATAT----GTCCTAATGGAATTT-GACA-TGT-----------------------------TT--------GCTAGTT-TTC-------A----GA----GTATTTTT---TGTATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTAG---------------------------GTACA-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGT-GGCATT-GAA-GATTGC-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATT--GCAATTCTT-GTCATCAG----C-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACATCT--GAAGAGTCC-AGAAAACAAA--AGCCATGA-gc
gi|12 : cCAACACTCTTATAGAGTGT-GCCA-------GGCTGCC-ACCA--AA--TACTCAAAAGTTCTATT--GCACGACT--GT--TCAGCCAGC-AAATGT-G-TGAAC-AACACAAGG-A-TATCACATCCGGGAAGA---C-AAAAAACAAA--A-C--TGA-TG--TGGTTCT--TTACCAAGAA-GAATA------CAAGAATTGCCAA-CAG-AGGAATTGTCC-AA--TC-C-ACCCCAA-AAGGA----CCTTAAAATTT--A-CTG-CA-AAGAAT-G-C---CTACTCCCA--AT--CTGTT-CC-AAA---T-G-tg
gi|13 : -AAA-T--CAG---GCA--GAC-T--CTGGG-CC-A-G-TGAC-TGGC--A---T-AACCT-TGTCG-AAACAG-A---TCTA--CA-GGGGA----ATCTG--CTAC---A--GGA-----AATAAAAAACTATGG-TG--GAC-ATGG------GTT--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------ACAGA-G-CAAATAAAGTCATC-AGTAG-G--ATTACGCAG-GAT----AAT-A--CTATCAC-AGAATTCA-TG-AAAACAGGG-GACTGGG-AA-CCAT-A--CAGCATA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CT------GGTGG-----G---G------A--TGGT-cttaccaccaaccacaacagtcaccaagtagccttgatcttgagtaatc
gi|14 : CTG-------TT-ACTGA---GGTCAGGAAG---TT-CAG-TGTG-CCGGG-TGTT-A-AG--G------A--GGCATCCCA-TATTTCATTAGGT-AAA-C--AGG---GCA--AAC-T--GTGGG-TC-A-G-TGATATTAGTGG---T-GACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CA-GGGGA----ACCAG--CTAC---A--GAA-----GATACAAACCAGTGG-TG--GAT-ACGG------CTA--CCACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATC--TTTACAG--------ACAGA-G-ACAATAAAGGCATC-AATAA-G--ATAACA-AG-G------AAT-A--C--TCAT-AGga
gi|15 : A--CGTCCGCGA--CA-C----GTACTGGTT-TG--TGAT-------GACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGA-TC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC--TCGACTG-CTGGGA-CA-CGAAA--AACAAACATGG--ATA----ACACAGT-C-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGAA-CGTA-CGG--CATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATA-TC---TACA-caaaacaatcat
gi|16 : A--CGTCCGCGA--CA-C----GTACTGGTT-TG--TGAT-------GACGTATAT-GTGACAG-----------------G-TG-------TCGCA--CGTCCT-GTTGGA-TC------AG-GA-GGTCAAGTTCCTG----TC--TCGACTG-CTGGGA-CA-CGAAA--AACAAACATGG--ATA----ACACAGT-C-CC----ATGGCTCT----GTG-GTGT--GGAA-CGTA-CGG--CATTAC-AACCTCTATGTAG-----G-----GACAGGTCATTCCA--GTACACACGAT--------AAAAATGT-GTAC-ATA-TC---TACA-
gi|17 : ACAAGTAAAC-AAAA-TA----GAAAAGT-TG-TTGTTAGAAGAGA-----CCA--AT----AGCC-AGGA-T--GACTCA---T----TG--AAAGATTATAT---TGCC-TA--TCT-CCATGAC-T--T-TGTCAAACAGT-TCC-ATGGC------TTCCT-ATCCTCTCCAAC--GATCACTGCTC----------T-AATTCAAAAA-CTTTTTGAGAAGGACCTGA--AAA---TCCGA--TCCATAC-CC-GAG-AC
gi|18 : TCGG-TCA-C----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------TTC-------G-G----TA---------------C-TG-------TT-CA--TATCCT-T---GA-TC------AG-GATGGTC-AGTTCTTG----TC--TCTACTA-CT-----CA-C--AA--AGA-AACAGAA--CAT----ACACGATCC-CC----GTAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CAA--GA--AC-AATCTTTATGTTG-----GACAACGATA--------CACCA---ACACAGT--------GACAGTGT-ACAA-ATA-
gi|19 : GTCCA--TCAATATT-TCCT---TC--C-AACATC-ACAAAAC-TTAAAGAAAGAAAT------CAAA-GAAG-ATG-CT-G--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TGA-TTAT-GGACAG---------TCT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATAGAACTAGTAAAC-GAAA-TA----GAAA
gi|2 : --T-T-CAAAGGTTCCAT-CAGATATG-TCTTGTTTC--A-AACATC-ACAAGATGTTATA-AAGGAAATGATATTCAAATGAAG-ATG-CTGG--CGG-A-AATGAA-----AGAATGA-TCATTGGATCG---------TCTTA----AGA-ACA-GCCAATGGAAGCTGATGGAGAGG-------TCTCTGCATAAATTAGGCA-TGGTGAATCAGCAGT-GGATGTCA-GAAA-TATTGAACAAGTAA-C-AGGAATATCAGGAAAAGT-TGGTTGTGAGAAGA-AGAGAGCCAGCTG----AGCC-AGGAAT--GAAAC----TCATGTGGAAA-GATTGTATAATTGCGCTAAGTCT-CCATGAC-TGTTGTGTCAAACAGTGTCCGATGGTGGGCTTTCCCTCATCCTCTACAAACAGAT-GCAACTGGGGCGCTGCTC-AATTGCAAAAACTTTTTGAGAAGGACCCTG--AAAGATTCCGGATCCCATACGCGCGAGTACAGTAATGAAAACCAAGTCCCCCCAAGTCAG-TATTACTTCGCTGGTCATTGGGTATCACGCAAAGGGAAGAATGTTGTCAAAGGATACTGAGGGTGAAAAGATAGAAAATTATAAGGAGACCAATTACCAATAGTAAAAGTA--AAGAATTAAAACGCTAAATGGAAAGTGGCTGCTCCTTTAGTGAGCAT--GCGGAAATGCTTACAAAGTAAGGTGCGAATGAAAACAA-ATTACAAGGAGATAAGATAAATCTGGATGTGGAAAACAAAACCA--TTGGTCTCTA-GTGTCCTCTAGTACAGTTT-ACTGAATTGGTGAGGGAGA--TTGCAG-GGTATTTGGG-TGTT-G-AATCG--TTTTATGGGCAT---ATTATCTCCGTTCAT-AAA-TGCCGGACCGCAGGAACTT--CTGGC-TCGA-GTTAAC-TTAG--A---TAAACCTGTGTCC-AAACAGTAT--TCTAAGCA-GGGGATAGTCTTGC--TTAC---AAGGAATTATTAAGATAAGCTA-TGGTTG--GAC-TTGGGATTCTCTAATTCACA-AGTCACAGCAGGTATGGGGTTACTGTATCT-TTAGCAGAGCGAATCACAAATT-AAGATATAGTCATCGAATTA-GGTATAACACAATGGTGACAAAT-ACTCTATCACAAGAATTCA-TTAAAAACAGGACGACTGGG-ATACCAA-CTGCAGCATATTCATCTCTCTGCCCAC-ATCAACTGGGGACAGATATCT------GGTGG-----G---G---------ATGT-A-AT---TG-----GACTATAGGACTAC--AAGT--CAC-TTGCCGTATTATCAAGCAATTAGACAGGGAACATGAAGAACTACAGAATCAT-AC---AGTGGGATA--ACAAGTGTGATCG-GA-CTGTATG--AG-T-ATGC-C--AATC-CTACATGCACTAGAAAAAGATATAAAGCTGGAGGTGATATCTGATTAGCAATA-GATG--CTGCTGGTAA-AGAGG-CGAG-TAGT--GTTAGGTTAAAGTAAA-TCAGGACC--AATCACA--GTTTCTCC-------TACA-AAGG-TCAGAAGA--TCA------G-GGTTGCTGATC-GCGTGTAAT----GGAATCCGTGGTAGCCTGA--TGTCCTCGG-TCA-CGAGTATCCTGGTGCTG--TGATAG-----ACC---AAT-T-GACGATT---------------GTTG-------TT-CATGCTGCTTAA---GA-TTCAAATGAA-GACGGTC-AGTTCTTG----TC--ATTA--A-CTGACGTCA-C--AAGGAAC--ACAAGG--ATTGTAGGCGTTGTCC-GCTTGTGTAG---TTCTAGTGTGTTTCAAG-A-TG-AGTGA--GA--ACAAATCTCTAT-TAGTTAGTGA----GATA--------GG--G---ACACAGTTCAAGTGAGATAGTGTAATAG-GTACTC---TACATGTGAAGTTTCTCTTAATGGTCAATCAA
gi|20 : ctctgtgcaaggaggtgttt--CA---CTCCTCCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CT------TGTGG-----G---G------A--ATGT-T-AT---TG-----G-----------G---GAGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAG----GT-ATTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG-A-AT-C-CCAA--TG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|21 : --CA---CTCCTCCCGCCATTAAC-GGCGAC--ATA-CT------TGTGG-----G---G------A--ATGT-T-AT---TG-----G-----------G---GAGT--GACGAAG--GTAC-----GACAG--GTACAGGAC-----GGGAACTCCAG----GT-ATTGAAGGGAGACGAAATAAG-G-GACAGCGTTCTGTAT---AG-A-AT-C-CCAA--TG-TACAT--AC-GGAGA---AC--CGA-T----GGAGATATCT
gi|22 : -AAGGCC-CCAACCAACTAAAAAGGAATATTGACATGCACT-CTGGTA-ACAAATTG-CAGATAAGTTTCA--TTTTGTGTT-CA-AAAAATT-G-TGCAACAACTGG-AGAGTCA---TAT---TTGGGCAT--AAATTAATAGA-TTTAG--AGAGCAAT-TGATATTCAGGGGAAAAGT-TATC
gi|23 : gca-TG--C-AAGGTC-C-ACCCCACTAAGGA----TATAGACATGC--C-TTG-TG-TAGATT-G-C---CAGCTTCCA--AT--ATGTT-CC-AAA---T-G-TTC-AACACAGGGAGA-TCA---CAG---G-AGGCAT--GAACTTGTTGA-TTTAG--AGA-TAAT-C--TATG---AAGAAAAGA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGA
gi|24 : --CTAC---A--GAA-----GATACCAACCAATGG-TGAAGATGAAGG------CTA--CCACACCGTCACA-CAGG-ACGGGGAT-CTG-ATG--TTTGCGG--------ATAGT-G-ACAATAACGTCATA-AATAA-G--ACAACATCG-GAT----AAT-A--ATGTC
gi|25 : ---GGTCAGGGAG---TT-CAG-GGTA-TTGGG-TGTT-G-AA--G--TTTTAT-GGCAT------ATATCCCTTCAT-AAA-T--CCG---ACA--GAC-T--CTGGG-CC-A-G-TAAC-TTAG--A---T-AACCT-TGTCC-AAACAG-A---TCTA--CA-GGGG
gi|26 : ctatTCACA-CAGG-ATGGGGTT-CTG-ATC--TTAGCAG--------AAAAA-G-CAAGTAAAGTCATC-AAGAG-G--ATAACACAC-GAT----AAT-A--CTATCAC-AGGATTCA-TG-AAAACAGGG-GACTGGACAC-C
gi|27 : ACAT-CGC-AGAAA---ACATCAA-T----GGTGATGTCTGCGTGTC---C-GAC---TA--CAATAA-ACAAG-CT-G-TAG-TAGT--GGTAAA--TAAA-TCAAAT-C--AC-CACAG-G-TTCTCC-------TACA-GAGGTa
gi|28 : GTTCTTG----TC--ATTACTA-CT-----CA-C--AC--TAC-AACACGG--AGT----ACGGTTTCC-CT----ATAG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-TGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GAAA--------TG--T---ACACca
gi|29 : gAATAAAGTCATC-AATAA-A--ATGGCACAG-AAC----AAT-A--AAATTAA-AAAGTTCA-TT-AAAACAGGA-GACTGGGCAC-CC-A-T--CAGCGTA--CA---CTCCTCCCAC-ATTAA
gi|3 : TCAGATGGCACATTCCAAAACT-G------TA-GC---GTACCAAATATGGGTACAACCCCAGCACTTTT-TAGAATGT-GGCATC-GAA-GATTGC-GAG-AG-AAAATTGTCAA---CCTTACT--GCAATCCTT-GCCATC-G----C-AGATGTTG-TCAAC-AATGCACAGCA-CG-AGCATCT--GAAGAATCC-AGATTACAAAGAAACCATGA-GG--TGGTCCC--TTACCAACAACGAAAA------CGACATCTTCCTG-TGG-AAAA--TG--C-AAGATC-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGACATGC--T--TG-TG-TGGATT-G-C---CAGCTTCCA--TT--ATGCTACA-AAA---T-G-TTTCAACACAGGGAGA-TCA---CAG---G-AGGCAT--GAACTTGTTGA-TT-AG--AGA-CAAT-A--TAGAA--GAAAAAAAA-TGGCGCTA--------TGCTT---AGA-GGAGA--TAT-CA-AAGGTCGA--CAAGTATT-TTCT---TC--C-CACATC-ACA-GAT-TTACAGAAAGAAAT-------AAA-GG-G-ATG-CCCA--CAG-AGAAT-AA-----AGA-TGA-TCCA-AGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCCA-TGAAGGCTG-TGGAGAG--------TCTCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TATCA-GAAA-TATC-AACAAGTGGACTAATA--A----GAACAGT-CA-TTGCT-GAGAA-A-----TTA-CAG----AGTCGAAGA-T---ACACATATT----TG--AT-GAT-ACAT---T-TCATA--TCTTCCATGAC-C--T--GTCAAAATAT-TC--ATGG-------TAACT-ATCCTCCACAAA--ACTTACAATCA----------TTAATTCCCAAA-CTTTCTGAGAAGTTCCAGG--AAA---TCCGA--CCCATAC-CA-GAG-ACAACAA----AACCG-GTCACACCA-GT--GTT-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGG-----AAAAT-GAAGCG---GAAAAG---AA--ACAAGCGG-GGGTGCGGAAAAAAT-AAAACAC---ATGGACATTATAT-CTCCTTT----AGCATCAGTGGAC---TCTAC-AAGTAA---ACGAAAG-AAACAAGG--ACAAG--GATAAG--GATCTT-GATGT-G-AAAC-AAACAA--T--GTCCCTA-TCTTCCTCTG-------TTCACTGA---GGTCA-GGAA---TT-CAGTTGTA-TCAGATTGTTAG-CA--G--T-------GCATTCCA-TATTTCACTAGGTAAAA-T--CAG---GCA--AACTT--ATGGATTC-A-G-TGAT-TTTG--ATGGT-AACCT-TGTCC--AACAG-ACAGTC-A--CT-GAGGAC---TGCAA--CTAC---A--AAA-----ATTACGAACCAGTGA-TG--GAT-ACGG------CT----CACACAGTCACA-CAGG-ACGGGGAC-CTG-ATCTTTTA-CAG--------AC-GA-GAAAAATAAAGTCATC-AATAA-A--ACAAT---G-GGT----AAT-C--AAAAGAA-AAAATTCATTT-CAAACAAAA-GACTGGA-AA-CCAA-T--AAGC-TA--CA---CT-CTCAC-C-ATTAAC-GGGAAC--ATA-CT------GGTGGGATGAG---G------A--AGGA-T-ATGGGTGA----G-----------GCT-AAATCACAC-TCG--GTAC-----AGCAA----ACAGGAA-----AAGAACTACAGAA-CAT-AC---AGAGGGACG--ACAAA-G-GACAG-GACCTGTATTAGAG-G-AT-C-C--A--CACTA-AT-CAC-AGAAA---ACATCAA-C----GG-GATATTTG-GTATC---ACGAC---AT--ATATAA-AAAGG-CA-GTTAGTGCGT--GGTGAA--CAAA-TCAGGA-C-----TACAG-G-TTCTCC-------TACA-AACG-TCAG-AAG--TTA------A-GATT-TA--TC-CC----TTT----GGAATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG-TCA-T----CTCCTGGTG-TG--TGAT-------------------GAAAACA---------------G-TGAAACAATTT-CA--ATTTCT-C---GA-T-------AGTGAGGGTC-A-TTCTTG----TC--TCT-CTA-CT-----CA-C--AA--AGA-AACAGAA--CAT----ATACTATCCACC----G-AG---T----GTGTGTGT--AG-A-TG-A-CGA--GA--AC-AATCTTTATGTAG-----
gi|30 : t-CA--CCTGCT-G---GA-TC------AG-GACGGTC-AGTTCCCG----TC--TCTACTG-CTGA---CACC--AG--AAC-AACATGG--AAT----ACACCATCC-Ca
gi|32 : AGGTTCA--CGAATATT-TCCT---TC--C-AACTTC-ACAGGAT-TTACAAAAACAAGT------atg
gi|33 : -CT--TC-CC----TAT----GGTATCTGTA-----CTGA--TGTCCTCGG-TCA-C----ATCCTG
gi|34 : CTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CT------GGTGG-----G---A------A--
gi|35 : --ACAAT-G-GACAG-GGACTGTAT---GG-GTAT-C-C--A--TGCTACAT-CAC-tgaggaatga
gi|36 : aGTGT-ATAG-GTA-TC---TACA-GTGAG--TCCTCTTA
gi|4 : TT--------TCTA--T-TTGTA-G---A----GA----GT----CC---T--ATTTATCAAATGGCAC-ATTCCAAACTAAGTGTACCAAGCCTGG------------GTACA-CCCCAGCATTTTA-TAGAGTGT-GACATT-GAC-GAATGC-GAGAGG-AA--TTGTCAG---TTTTACT--GCAATTCTT-GCCATCTG----C-AGATGT-G-TGAAC-AATGCAGAG-A-GG-AACATCT--GAAGAATAC-AGATTACCAG--AGCCATGA-GG--TGGTCCT--TTACCAACAACGAAAAACGAAACGACAACTTCCTG-TGG-AAAAA-TG--C-AAGACT-C-ACCCCACTAAAGA----TATAGATATGC--T-TTG-TG-AGGAAT-G-T---CAAATTCCA--CT--ATGTT-CC-AAG---T-G-TGCAA-CACAGGCAGA-TCA---TCG---G-GG-CAT--AAATTCATTGA-TCTGG--AGA-CAAT-C--T--T---GAGGAAAATATAGCACTT--------CGCCTCA-AGA-AGATA--T-C-CAAAA--TCCA--AGAATATT-TCCT---TC--C-GACATC-ACAAGAT-TTACAGAAAGAAAT------TAAA-GGTG-ATA-CCCA--CAG-A-AAT-AA-----AGA-TAA-TCAT-GGACAG---------CTT-A----AGA-ACA-GCTA-TGAAGGCTGATGGAGAG--------TCCCT-CA-AAA----GCA-TGGTGGA-CA-CAGT-GG-TGTCA-GAAAATATGCATCAGGTGGAC-AAGA-TA----GAACAGT-CC-TTGATGGAACA-A-----TTA-CAG----AATC-AAGA-TTCAACAT----T----TG--AT-GATTACAT---T-TCATA--TCT-CAATGAC-C--T-CGTCAAAGAGT-TTC-ATGGC------TACAT-GTTTTCCCCAAA--GCTTGCAAATA----------T-AATTTCCAAT-CTTTCTAAGAAATTCTCAG--AAA---TTCGA--CCCATAC-CA-GAA-ACAACAA----CAGTG-GTGACCCCA-AT--G-T-TTACT--GCTGGTCG----ATAT-A-GCAAAG---ATAATGTGGCCAAAT--TACTAGGG-----AAAATAAATGTG---AGGGATACCAA--A---GCAG-AGATGAG--AAAAAT-AAAACCC---ATGGAAATTGTCT-CTCCCTC----AACATCAGTGGAA---TCTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACGA-G--ATAAT--GATAAG--AAATCT-TATGTG--AAAC-AAACAA--T--GCCCATA-TCTTCATATG-------TC-TCTGA---GTTTAGGGAGATATT-----TGTA-TT----TGTT-A-AA--G------A--AATGACCCA-TATCTCCCTTGAT-AAA-G--CAG---GCA--AGC-T--ATGGG-TC-A-G-TGGC-AGTG--A---T-AACCT-TGTAC-AAACAG-A---CTTA--CA-AGGAA----AGCAG--CTGC---T--GAG-----GATAAAGATCAGTAG-TG--GAT-CTGG------CTA--CCACACAGTCACA-CGGG-ACGGGGTG-CTC-ATC--TTAACAG--------ACAGA-T-ACAATAAAGTCATC-AACAA-G--ATAACACCG-GAT----CAT-A--AGATAAA-AAAGTTCT-TT-AGAACAGGA-AGCTGGA-AC-CCAA-T--CAGCATA--CA---CTCCTCCCAC-ATCAAC-GGGGAC--ATA-CT------GGTGG-----GTATG------AT-AGGT-A-AG---GG-----G-----------GCCAGAGT--CAC-ACG--GTAC-----AACGA--GAA-AGGGA-----AAGAACTACATAT-CAT-AC---AAACAGATG--ATAAA-G-GACAG-AAACTATAT---AG-cattgc
gi|5 : tcatttatatTTCAAATCTCACTGCTCGAATTTCCAATAAATCCCCTCAAAGAGAATGTCA-TTGTCATTTGTATTGCAGGTCAAACACAGATTATTGT-AAGTACTTGTAAAAAAACAAAATCTCACATTTTACAGTCTAG--ACGTTGGTGAAT----GCGCTGTG---TCGGGTAAAATGATATTTTCAGGCATATTACTTTTT-GAAATGA----ATTCT--TGGAGTTTGGACATTGTCTACAT----------------------CTTCTACTGCAGTTAGTTGTTTCACG---ATGGCGATGGTGTATTTTTTAGT--ATTTATTAGA--GCAC-TTTCAAAAGTAT------TA--C---G----------------A-CCC--GCACTTCC-TTAGGTGCGGGCATTCGAATGAGAG-CGAGCAGAAA--TTGTAGC---ATTTACTGCGCATTGCTTGGTCATCAC----CGAAATGT-GATAAACTAATGTCGAG-AGTA-AACA-CT--GAAGAGTCCAAGAATACAAAT-AGC--TGACAGTTTGGTTCT--CTATT-ACAACATAAA------CAACAACTTCCTGCTGGAAAAAA-TGC-C-AAGGCCAC-GGCCAACTAAGTA-----GTTGAGAGAC--TACTG-TAGATGAAT-G-C---CAGTCTCCAATTT--GT-TT-CACAAA---TCG-TAC-AACACTGGTAGAGTCA---CTGTCTG-GGCTACTAAAATTTATAGA-T------AGG-CAATAC--TATC-------AAAGT-TATT-CTAACAATTTTTG-TCCATCGACGGAGAG-T-TACAGATGGTCCATTC-AATATTATCCT---TCAACAAACATCAACAAGAT-TTAAAGGAAGAGATCA----CAAA-GAAGAATGACGCGAACGGTA-AAT-AAATACTAGA-C-A-CTAT-GGCCAGGTTTCAGCTTCT-ATTTTAGATACATGCCATTGTAAGCCAACTGGGAGGATGTTTCTCTCT-CC-AAAT---ACA-TGGTGGA-CC-CAGTGGG-TGTCAGGAAAGTATAGAAC
gi|6 : A--TGTCCTCGG-TCA-C----ATCCTGGTG-TG--TGAT-------CCA---TATCGTGACAAAT---------------G-TG-------TT-CA--TCTTCT-A---GA-TC------AG-GACGGTC-GGTTCTTG----TC--ATTACTA-CT-----CA-C--AA--AAC-AACAAGG--AGT----AGAATATCC-CT----ATAG---T----GTATGTGT--AG-A-TG-A-TGA--GA--AC-AATCTCTATGTAG-----GA----GATT--------AT--G---ACACAGT--------GACAGTGT-ATAG-GTA-TC---TACA-GTGAG--TTCTCTTATT-GTCAATCAACACACTACCACACAGAGATTTCACAACTTGTGACCAATGAGATAATATTTTATGAAT-CT--ACAATTTAt
gi|7 : A---CTCCTCTCAC-ATTAAT-GGAGAC--ATA-CTAGTAGAGGTGG-----A---T------A--AAG----AT---GGGAAACG-----------GA--AAGT--GAT-CAG--ATAC-----AGCAA---GAGAGGAA-----AGAAGCTCCAAGA-AAT-TC---AGAAGGATG--ATAAA-G-GACAA-GATCTATAC---TG-T-AT-CAT--A--GGGTGCAT-CAC-AGAAA---ACATTAA-C----GGTGACATCTGTGTATC---C-GACCCTCT--TCGTAA-GAAGG-TG-G-----TGGT--AGTGAC--CAGA-TTAGGA-C--AG-TATCG-G-TTCTCT-------TACT-TTGG-TCAT-CCA--TTACAACCTG-GATT-CTA-TC-CA----AAC----AGAATGTGTA-----CAGA--TG-CCTTGG-GAATT----ATCTTGGTC-TG--TAGT-------TGT---GGT-G-G-TAGTAAATGTGAGACCTGGGG-TA-------TC-CA--CATGTT-T---GA-CC------AG-GACGGTC-AGTTCCTGAATTTC--CTCATCA-CAT----CA-C--AA--Aatgaatgaataaggctgatacaactatactagaaaatacacagtagagtgtatggaatccccataattaaccaaacaagttgctgattatatgtgcaagtttaactatgatttacagtcacttacattgttaagtatgcaaaacaacagtgtgtgacaatcaaaagatatctttaattatcctgtagctttcaatttacaatatctgaatatcacgatattactactaagagctagatttgaaaaaggtcttgtttatgaaataagattttagaaaataagattctccctttcagttttatataattcaattatttcttctttcattctacatttacaatagcatcctatggga
gi|8 : ct-TACAT--GTGAAT----G-GAT-TA---TCGGGTAATTTAATATTTTCAAGCA-ATGACTTTTT-G--ATAA----ATCCT--TGGAATTT-GACA-TGTCTA-GTATTGCCTACATTCTACTGTAAGTTT--------GCTAGTT-TTTCA-GGATA----GA----ATATTTTG---T--ATTT-TTAGATGGCAC-TTTCAAAATTAG---------------------------GTACA-CCCCAGCACTTCT-TGGAGTGC-GGCGTT-GAA-GATTGT-GAGCAG-AA--TTGTGAA---TTTTATT--GCAATCCTT-GTCATCAG----C-AAATGT-G-TAAAC-AATGCCGAG-A-TA-AACACCT--GAAGAGTCC-AGAAAACAAA--AACCATGA-AG--TGGTTCT--CTATCTACAACGCAAA------CAACAACTTCCTG-TGG-AAATG-TG--C-AAGGCC-C-ACCCAACTAAAGA----TATTGACATCC--T-CTG-TA-ACAATT-G-C---AAAGTTTCA--TT--GTGTT-CA-AAA---T-G-TGC-AACACTGG-AGAtgcccagtgcggtctgcactgatgatcaacaaaacgtctgggttggaagttggaacag
gi|9 : GTCAAAATAT-TTC-ATGGT------CACCT-ATCCTCCAGAAA--CCTTACAATTA----------T-AATCCCCAAC-CTTTCTGAGAAGTTCCAGG--AAA---TCCGA--CCCATAC-CA-AAG-ACAACAA----AACCG-GTCACACCC-GT--G-T-TTACT--GCTGGTCA----ATAT-A-GCAAAG---ACGATGTTGCCAAAT--TACTCGGC-----AAAATAGAAAC------GGAAAACAA--ACCAGCAG-AGATGAG--AAAAAT-AAATCCC---ATGAAAATTGTCT-CCCCTTT----AACATTAGTGGAC---TCTAC-AAGTAA---ACAGAAG-AAACAA-G--ACAAG--GATAAG--GAATCT-GATGTGG--AAC-AAACAA--T--GCCCCTA-TCTTCCTCTG-------TT-ACTGA---GATCAGGAAG---TT-CAG-TGTA-CCGGG-TGTT-G-AA--A--C------GGTATTCCA-TATTTCACGAGAT-AAA-T--CAG---GCA--AAC-T--TTGGG-TC-A-A-TGA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): ATATAATTCAACTCTCTTTTCATTCATTCTACATTTAATATAGCATCTATGGG