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gi|10 : ---CCCAGTCAGC-AT-CCATATG--T-T-GGCCCAACGT-TAC-GCCAA--------C---A---A-AG-TTC----A----T-TTA--GT----T-----------AGC---TCAATGTCG--CATT--CCAA-T----GTT-GGTCCAA---TG-T-ATAAGT-------------GC--------AA--A-G--T-GGCC--C-----------GA----TG-CGT---------G-GT-CA--AA-GCGT-T-GGCT--C-----------T------A-CATTGG-----C-------C-CAA--TGT----------TGTATAATGTT-G---G--C--AAtggattttacttgtcccacttatacactgtaagttt
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gi|8 : T-T-GGGCCAACGT-AGC-GCCAA--------C---A---C--G-TTG------------------------G---------GGC---CAAACGTTTGGCATA--CTAGTC----GTT-GGGCCAA---CC-T-A--AATT--T-------TTGC--T-----CA--T-----CG-----C-----------CC----TAACGT------T--G-GC-C----A-ACATGT--TTG--G-----------T---TCAA-TGTTGG-----C-------C-CAA--CAT-----------GT-------T-G---GTTC--AAT--G-T---TG-G------CCA-A-C-A------------GTTGGTTC-A-A-ATG-----T-T-G--G----C----------CA---A----C--------A---------TG----------TT-T--GG------GCCAACG----T------A--GAA---A-------C-AA-C------TGTTT-GGT---------G--CCCAA-ACG-------GGA-----------------GGG---CCGAA-T----GA-G--C----A----A-C-T-TACA-T---GGCCCA-GTG-------GT-A-C-GGC-CAA------C--GTA-G---G--C--C---------C-AA-C-----G----TATTCAACCGGTG----TTG-GC----C-AACAT----TGGCCCAA-CGT-
gi|6 : agatagcccttgactT-T-GGGTCAACGT-TGG---CAT-A------CTA-G---T-CG-TTG----GG---T-CAA-CGTAATTTTGATCATCATCGGC---CCTACGTTGGCC-CA--ACA--C----GTT-GATTCTA---CG-T------------------TGGC--TC----TA--T-G--TTGGCC--CAACACGTTGGTTC----TA-CGT------T--G-GC-CC--A--ACACGTTGGTT--C-----------T------A-CGTTGG----CT-------C-TA----------------TGT-------T-G---G--CCCAAC--A-CG--TT-GGT----TT----T-AT-----------GTTGG--C-T-GTATG-----T-T-G--G--C-C----------CA---A----C--------A---------CGTTGGTTTTATGT-T--GT------GCCAACG----T----------AG---AAC-----C-AA-CA----T-GTT--GG----------G--CC--A-AAG--------GA-----------------GGG---ACG-A-T----GA-G--C-A--A----A-C-C-TGCGTT---GGCCCA-ACG--TA---GT-A---CGG-CAA------C--GTT-G---G--T--C---------C-AA-C-----G---------------TA----TTGAATG---T-T--GT----TGGCCCAA-CGTAGTCATGCTATCTGcg
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gi|15 : tgttggcctaaaataataaccaacataagacagctgcacgtgttgt-CAA--CGT----------TG----------G---G--C--CA---A-T---GTAGAC----CCA-A-C-GC-----------GTTGG--C-C-ACGCA-----T-C-G--AG-C-CACTTTG----CACTTA----C--------A---------C-----------AT-T--GG------ACC-ACC----T-----------A---AAT-----G-AA-CT----TTG-TT-GGC---------G---T--A-ACG-----T-Tcccctgctaactgggatagacctagtac
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|14 : aAG---CC-AA------C------AG--------GTT-GGC------C-TG-A----T-TAAG-AGCC---GATGA-G----C-AAA-TTCC-C----GCT-GG---C--GCAATG--TT---GTA--T-A----CCAA------TAGT-G---GCCC-A-A-CAT
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gi|15 : -C-CA-ACG--T-TACG---CC---AA---------CAAAG-TTCA-TTTAGG-T-GG---T--CCAATG---T---GTAAGT-G----CAAAGTGGCTCGAT-GCGTGGCC-A-A-CGC--GTTGGGTC-TACATTGGCCCAACGTgacccaacgcgttggccacgcatcgagccactttgcacttacacattggaccacctaaatgaactttgttggcgtaacgttgg
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gi|22 : T-A---GCTC-A-A-TGTT---TGGCGC-TACGTTGGCCTAACATCTTcgttct
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Reference ( family-4356 ) : NTTTTTTGTGG---TG-TTCCATGTT-GGATAATTTCT-T-GTAACC-GGGT--CAAG------GGGGTC---CCCAGATAGC-A--TGACTACG--TT---GGGCCAAT--------------GTTGG-GCCAA---A---CA---C-CG-T-TGAA---TTTACGTTTGGGCCA-ACGTTGG-C-GT-------A--CNA-CGTT-GGGCCAACG---TA-AGTT--TTTG--CTT----C-A-T-G--TC--------GGCCC-----------CCNAC------GTT--GGC-CCA--A------AC--ATGTGT---TN--CT---T-ACGT-TGG--CC---------C----------CAA-C-----GT-TG----TTG---G--C-AA-CAT--T-TG-AGCCAACATA--GTTGG-CCA--ACGT--TG--GGCC----------CAACA-TGGT-------TGGGCCAACAT--------CG-A-AAG---CC-AA------C------AT--------GTT-GGC----G-C-CA-ACG--T-TAAG-GGCC---GATGA-G----CAAAA-TTCA-C----G-T-GG---C--CCAACG-ACT---GTA--T-G----CCAA------CGTT-G---GCCC-A-A-CGTT-GTTGGCGC-TACGTTGGCCCAACGTCTTGCGCTATGTGT-ATAGAAAAGAATTGCCACC-CGG----CACCAC--GTGTG----CCG--ACGGAAGAG---GACC-TGACACCTGAATCGG--TGTT--TTCGG-GCACATTTTGGAA--ATGTTCCAGGGTCTGCCAC-TCATCAAGAGN-TCCAACCC-CGGATTAA-GTTG-TAATTTGTAGATT-CAAAC-CATT--TGC-CC--AATCC-GAACAG-A--TC-GGCTTATTTGC--C-TGAAAAG-AAAAATG-AATTC-GTTT---AGG-GTACAAAAT--AAAG-GAC-ACCT-T---ACATT-GT-AAACAGGGGCGGA-C--TCNCCCCCCCCCCT-CTCTCTC-TCTCTCTGGTTGTG-T--TA-GC---AA--TTATC-GATCTGATC-TT--GTGTTAATAACTTT-AAACACAA--ATAATT-GAG-A-GG-GTG---CATATTTAAC-AA-GTA--TGCATCGTA--TACTTACATTTT---GA-A-ATG-TTCC-AGTTGTATT----CCTCCGTTTTT-CTT-TTATTTT----AAATTCCTTCAATAAAT-T--TTCACAATATTCA-ATTC-T-TTGCA-CGTGTTCGTTGG--TAT-CA-AGA--TT-CAA-ATGG-TGAAGACAA--AGCAGAA-TAAATTTT--TGACCATNCCTGGCAA-TATCCA-GATTA--CCG-ATTACT-AT--GGAAAAC-TGG-CCAG-T-CTC-ACGCT-G--TGAGA---A-CAC--ACGATCC-AGAT-ACTT--GGACAGT-AAAAAG-TG--TT-GTTATTCTCAGAATCCTGC-CTCTAAG-ATTT-CTA--CAGTTTTC-AG-AACCATTATG-TGATCCCTCGCC-A-CATTTTC-TTGGT-GCTTTTAGAAGTA-A-TTTG---ATA-ATATT-TACTTATT--A-AG-CACTA--TAAAAT-AAAAT-A-CA-GGT-ACTTTAATTAA-TTATT-ATTAAGATTTT-CTC-GGTAC-TTTTCA-ACATATAT-ATA-TAAGATA--TGA-TAAAATATTTAAT-CTTTAGCATATA--ATACGTGATA-T-TT-CGA-T--CCCTGT--TCGAAAACG-CA-CACA--ACTTT--AC-TTATGATATG--TGTGTCC-AATGTT-G-T--AAACCAACG---AAACAA-TA-GCCTTTTTATTTT-ATAAG-CAA-ATCTTA
gi|1 : TTTTTTGTGG---TG-TTCCATGTTTGGATAATTTTT-TTGTAAAC-GGGT--CAAG------GGGGTC---CCCAGATAGCGA--TGCTTACGGTTT---GGGCCAAT--------------GTTGG-GCCAA---A---CA---C-CG-T-TGAA---TTTACGTTTGGGCCTTACGTTGGGC-GT-------A--CCA-CGTT-GGGCCAATG---TA-AGTT--TTTG--CTT----C-A-T-G--TC--------GGCCC-----------CCTCC------GTT--GGC-CCA--G------AC--ATGTGT---TT--CT---T-ACGT-TGGGGCC---------C----------CAA-C-----AT-TG----TTG---G--C-AA-CAT--T-TG-AACCAACATA--GTTGG-CCA--ACAT--TG--AACC----------CAACA-TGGT-------TGGGCCAACAT--------TG-A-AAA---CC-AA------C------ATT-------GTTTGGC----G-C-CA-ACG--T-TAAG-GGCC---GATGA-G----CAAAA-TTTA-C----G-T-GG---C--CCAACGGACT---GTA--TTG----CCAA------CGTT-G---GCCC-A-A-CGTT-GTTGGCGC-TACGTTG-CCCAACGTGTTGCGCTATGTGT-TTAGGAAAAAATTGCCACCGCGGGGCCCACCAC--GTGTG----CCGGAACGGAAGAGTTGGACC-TGACACCTGAATCGG--TGTT--TTCGG-GACCATTTTGGAA--ATGTTCCAGGGTCTG-CACTTCATCAAGAGT-TCCAACCC-CGGATTAA-GTTG-TAATTTGTAGATT-TAAACGAATT--TGC-CC--AATCCGGAACAG-AATTCGGGCTTATTTGC--CTTGAAAAGAAAAAATGAAATTC-GTTTTTAGGG-GTACAAAATTAAAGG-GACAACCT-T---ACA-T-GT-AAACAGGGGCGGA-TCGTCCCCCCGCCCCCT-CTCTCTC-TCTCTCTGGTT-TG-TTGTA-GC---AA--TTATC-GATCTG-TC-TT--GTGTTAATAACTTT-AAACACCA--ATAATTGGAG-A-GGTTTG---CATATTTAAC-AAGGTA---GCAATGTATTTACTTACATTTTTGAAA-A-ATGTTTCC-AGTTGTATT----CCTCCGTTTTT-CTT-TTATTTTTTAGAATTTCCTTCAATAAAT-TTGTTCACAATATTCACATTC-TATTGCATCGTGTTCGTTGGTTTAT-CAGAGAATTT-CAAGATGG-TGAAGACAA--AGCAGAATTAAATTTT--TGACCATTCCTGGCAATTATCAA-GATTA--CCG-ATAACT-ATGGGGAAAACTTGGCCCAGTT-CTC-ACGCT-G--TGAGATAGG-CAC--ACGATCC-AGATAACTTTGGGACAGTAAAAAAG-TGTTTT-GTTATTC-AAGAATCTTGC-CTCTAAG-ATTTCCTA--CAA-TTTC-AGAAACCATTATG-TG-TCCTTCGCC-ACCATTTTC-TTGGTGGCTTTTAGAAGTA-A-TTTG---ATA-ATATT-TACTTAATAAA-AG-CACTATGTAAAAT-AAAAT-A-CAGGGT-ACTTTATTTAA-TTACT-ATTAAGATTTT-CTCGGGTAC-TTTTCA-A-ATATATAATATTAAGATATTTGATTAAAATATTTAAT-CTTTAG-ATATA--ATACGTGATA-T-TTGCGATT--CCCTGT--TC-AAAACG-CA-CACAAGACTTTTAAC-TTATGATCTGT-TGTGTCC-AATGTT-G-T--AAACCAACGGGAAAACAATTA-GCC-TTTTATTTTAATAAG-CAA-TTCTTA
gi|10 : a--------------GTTGG-GTCAAC--A---CAAGAC-CG-------------ACGTCTTTGCCA-ACATTA-----T-------A--CAA-CATT-GGGCCAATG---TAGAGCC--AACG--CTTTGACC-A-C-GCATC--------GGGCC--------------AC------TTT--G----------------C--AC---T---TA-------T-ACAT-TGG--AC---------C-----------AA-C-----AT-TG------GAATG--C-GA-CAT--T--G-AGCTAAC-TA--AATG----A--ACTT--TGTTGGCG----------TAAC----GT-------TGGGCCAACAT--------
gi|11 : agaattccattggcataggCCAGATAGC-A--ACGCTACA-------GGGCCTTT--------------GTTGG-ACCAA---T---CA---C-AC-T-C------TTTATA-TTGGTCCA-CCGTTTG-C-AT-------A--CAA-CTTT-GAGTCAGCG---GG-AA----TTTG--C-T----C-A-TCG--GG--------GGCCCTTAAT------CCGACTAACCTGCT--GGC-TCA--ATGTTGGACCAATGCTT---TA--C----T-ATAT-TGGA-CC---------CG---------CAT-CCGGCAGC-TG----TAT---G--C-AGTCATCAT-TG-GGCCAACAatggatgctgactgggtaaattgtac
gi|11 : tccattG--GGTC----------CAATA-TAGTAAAGCATTGGTCCAACAT--------TG-A---G---CC-AG------C------AG--------GTT-AGT------------CGGAT-TAAG-GGCCCCCGATGA-G----CAAA--TTCC-C----GCT-GA---C--TCAAAG--TT---GTA--T-G----CAAA------CGGT-G---GACC-A-A-
gi|12 : tccattccagatagcaacgctacagggcctttgttggaccaatcacactctttataA--T-G----CACA------CATT-G---GCCC-A-A-CGTT-Ggcatccggcagctgtatgcagtcatcattgggccaaca
gi|12 : agtcagaCAACATC--GTTGGCCCA--ACGT--T---TGTC----------CAACA-TTGT-------CAGACAAACGC--------CA-ACAAGTCTCC-AA------CCCACCAAT--------ACT---CT---G-C-CA-ACG--T-T--G-GGCC---AATGgcagagtattggtgggttggagacttgttggcgtttgtctgacaatgttggacaaacgttgggccaacgatgttgatatcgcattggtcgtaattttgataaaggtcagcatgcgattgttggtccgatgttgggccaac
gi|12 : agtcagaatgcacaGT-------TGGCCCAACAT--------CG-G-A-----CC-AACAATCGC------AT--------GCT-GACCTTTA-T-CA-AAA--T-T-AC-GACC---AATGC-GATATCAACA-T----C----GTT-GG---C--CCAACG-TTT---GT----------CCAA------CATT-G---atatcgcattggtcgtaattttgataaaggtcagcatgcgattgttggtccgatgttgggccaac
gi|13 : agtcagaatgcacacattggcccaacgttggcagagtattggtgggttggagacttgttggcgtttgtctgaGG----CATCAC--ATTTGATGACCT--GCGAAATAG---GACA-TGGCAGCTACATTGCCCTGCC--CTTGAAGC-CATCGTTGAATCATGTTCCAGGGTCTG---C-TC-------GC-TCCAACCCTC--ATTAAGGTTGCTAACAT-TA---T-CA----CATTGGTGC-AC--AGTCT-GAACAG-A--TC-GG
gi|14 : ---CCCAGATA------CGAGGAGG--TTATAGGGCCTAT--------------GTTAG-AC------A----A---C-CG-T----ACTCTTTATGTT-GGGCCA-CTATTGG-T-AT-------A--CAA-CATT-GCGCCAGCG---GG-AA----TTTG--C-T----C-A------TC--------GGCTCTTAATCAGG--CCAACCT----GTT--GGC-TCA--A------
gi|14 : aAG---CC-AA------C------AG--------GTT-GGC------C-TG-A----T-TAAG-AGCC---GATGA-G----C-AAA-TTCC-C----GCT-GG---C--GCAATG--TT---GTA--T-A----CCAA------TAGT-G---GCCC-A-A-CAT
gi|15 : acccagatacgaggaggttatagggcctatgttagacaaccgtactcttt-------A--CAA-CGTT-GGGCCAATG---TA-caa
gi|15 : -C-CA-ACG--T-TACG---CC---AA---------CAAAG-TTCA-TTTAGG-T-GG---T--CCAATG---T---GTAAGT-G----CAAAGTGGCTCGAT-GCGTGGCC-A-A-CGC--GTTGGGTC-TACATTGGCCCAACGTgacccaacgcgttggccacgcatcgagccactttgcacttacacattggaccacctaaatgaactttgttggcgtaacgttgg
gi|16 : acaGTGT-ATAGAA--GAATTGCCACC-CGG----CACCAC--GTGTG----CCG--ACGGAAGAG---GACC-TGACACTTGAATCGG--TG-T--TTCGG-GCACATTTTGGAA--
gi|18 : TTTTGTGGAAGTGGTTCCATGTT-G-ATAATTT---T-GTAACCTGGGTTTCAAG------GGGGTC---Cttc
gi|2 : AGAAGAATTGCCACC-CGG----CACCAC--GTGTG----CCG--ACGGAAGAG---GACC-TGACACCTGAATCGG--TG-T--TTCGG-GCACATTTTGGAA--ATGTTCAAGGGTCTGCCGC-TCATC-AGAGG-TCCAACCC-C-GATTAA-GTTA-TGA-TTGTGGATT-CAA---TATC--TGCACC--AATCC-GAACAG-A--TC-GGCTTATTTGCTGC-CGTAAAG-AAAAATG-AATT--GTTT---A-G-GTACAAAAT--AAAATGAC-ATCTGT---ACATTGGTGAAACAGGGGCGGC-A--TCTCCCCCCCCCCTGCTCTCTG-TCTCTCTGGTTTTGAT--TAGGC---AAATTTA-C-TATCTGATCTTT--GTGTTAATAACTTTAAAACACAGATATAGTT-GAGCACGG-GTG---CATATTTAACAAA-GTAGCTGAGCCATA--TGCTTACTTTTT---GATATATG-TTCC-AGTAGTGTCGGTATCTCCGTTTTT-CTT-TTATTT------AATTCCTC--ATAAAT-G--TTCACAATA-TCA-ATTCTT-TTGCA-CGTG-TCG-TGG--TAT-CA-AGA--TTGCAATATGGTTGAAGACAAAGAGCAGAG--AAAGTTTAATGACCATCC---GCAA-TAGTCATGATTAAGCAGAATTACTAAT--GG-AAAC-TGC-CTAG-TGCTCTACGCT-GGTTGAGA---ATCACCGACGACTC-ATAT--CTT--GGACAGT-AAGAAGCTG--TTGGTTATTCT-AGAATGCTGC-CTCGGAGAATTT-CTACTCCGTTTACAAG-AATCATTAT--TGATCC--CGCC-A--A-TTTC-TTGGTCGC-TTTAGAAGTATATTTTGATTATA-TTATT-CACTTATT--AGAGTCAC-A--TAAAAT-AAAATCACCA-GGTCATTTTAATTCT-TTATTAATTAAA--TTT-CTC-GGGATATTATCATAAATAGAT-ATA--GAGATA--T-A-TATATTATAGAAT-CTATAGCAAAC---ATA-GCGGCA-TATT-CGA-TTCTCCTGTAATTGAAAACG-CATCACA--ACTTT--TCGTTATTATATGGATGTGTCCTAATGTTGG-TTGAAACCAACG---AAACGA-GAGGCCTTTTTATTTTCATAAG-CAAGATCT
gi|20 : CAACA----GTTGGACCA--TCGT--TG--GGCC----------CAACA-Tatg
gi|21 : taT-A---GCTC-A-A-TGTT---TGGCGC-TACGTTGGCCTAACATCTTaaagaattcgaccgataaa
gi|22 : T-A---GCTC-A-A-TGTT---TGGCGC-TACGTTGGCCTAACATCTTcgttct
gi|23 : TT-A---GCTC-A-A-TGT--GTTGGCGC-TACGTTGGCCTAACATCTcgttct
gi|24 : ATGTGT-ATAGAAAA--ATTGCCACC-CGG----CACC
gi|3 : TGTGTTATAGAAAA----TGCCACC-CGG----CACCACCGATGTG----CCG--ACG-AAGAG---GACCCTGACACCTGA-TCGG--TGTCAATTTGG-GCACATTTTGGAA--A-GTTCCAGGGTCTGCCAC-TCATCAAGAGCGTCCAACCC--GTATTAA-GTTG-TAATTATTAGATTGTTAAC-CATT--TGC-CC--CATTC-CAACAG-A--TC-GGCTTATTTGC--C-TGAAA-G-AAAAATG-AATTCCGTTT---AAG-GTACAAAAT--ACAA-GAC-ACCT-T---ACAT--GT-AAACAGGG-CGGATC--TCGCCCCCCCCCCT-CTCTCTCATCTCT-TGTTTGTG-T--TA-GC---AA--TTATC-GATCTGA-C-TTAAGTGTAACTAACTTT-AA-CACAA--ATAAT--GAG-A-GC-GTGGGCCA-ATTTAAC-AA-GTA--TGCATTGTA--TACTGACATTTT---GA-A-ATG-TTCCCAGTTGTATT----CCTCCGTTTTTTCTT-TTATTTT----AAATTCCTTCAATAAATGT--TTCACAATATTCA-ATTC-T-TTGCA-CGTGT-CGTTGG--TATTCA-AGA--TT-CAA-ATGG-TGAAGACAA--AGCAGAA-TAAATTTT--TGAC-AT-CCTGGCA--TATCCA-GAT-A--CCG-ATTACG-AT--GGAAA---TGG-CCAG-T-CTC-ACGCT-G--TGAGA---A--GC--ACGATCCCAGAT-ACT----GACAGT-AAAAGT-TG--TT-GTTATTCTCAGAATCTGGCGCTCTAA--AGTT-CTA--CAGCTTTC-AG-AACCATTATGGTGATCC-TCGCCCA-CATT--C-TTG-T-GCTTTTAGAAGTA-A--TTG---ATATATGTA-TACTTA-T--A-AG-CACTA--TAAAATGAAGAT-A-CA-GGT-ACTTTAATTAACTTA-T-ATGAAGATTTT-CTC-GGTAC-TTTTCA-ACATATAT-ATA-TAAGATA--TGA-TAAAA-ATTTAATCCTTTAGCATATAC-ATACGTGATATT-TT-CGA-T--CCCTGC--TTAAAAACGCCA-CACA--ACTTT--AC-TTATGATATG--TGTGTCC-AATGTT-GTT--AAACCAACG---AAACAA-TA-GCCTTTTTATTTT-ATAAGCCAA-ATCTT
gi|4 : T-ATAGAAAAA---TGCCACC-CGG----CACCAC--GTGTG----CCG--ACGGAAAGA---GACC-T-ACACCTGAATCGG--TGTT--TC--G-GCACATTTTGGAA--ATGTTCCAGGGTCTGCCAC-TCATCAGGAGG-TCCAACC---GGATTAA-GTTG-TAATT-GTAGATT---AAC---TT--TGC-CCCAAATCC-GAACAGCA--TC-GGCTTATTTGC--C-TGAAAAG-AAAAATG-AATTC-GTTT---AGGTGTACAAAAT--AAAG--AC-ACCT-TGTTACATT-GT-AAACAGGGGCGGA-C--TC-CCCCCCGCCCT-CTCTCTC-TCTCTCTGGTTGTG-T--TA-GCCAAAA--TTATCCGATCTGATC-TT--GTGTTAA-AACTTTTAAACACAA--ATAATT-GAG-A-GG--TG---CATATT-AAC-AA-GTA--TGCATTGT---TACTTACATTT----GA-A-ATGGTTCC-AGTTGTATT----CCTCCGTTTTT-CTTATTATTGT----AAATTTCCTCAATAAAT-TGTTTCACAATATTCA-ATTC-T-TTGCA-C-TGTTCGTTGG--TAT-CA-AGA--TT-CAA-ATGG-TGAAGACAA---GCAGAA-TAAATTTT--TGACCATACCTGGCAA--ATTCA-GATTA--CCG-ATTACT-AT--GGAAAAC-TGG-CCAG-T-CTC-ACGCTTG--TGAGA---AGCAC---CGATCC-AGAT-ACTT--GGACAG---AAAAG-TG--TT-GTTATCTTCAGAAATCTGC-CTCTAA----TT-CTA--CACTTTTC-AG-AACCATTA-G-TGATTCCTCGCC-A-CATTTTCCTTGGT-GCTTTTAGAAGTA-A-TTTG---ATA--TATTATACTTATT--A-AG-CACTA--TAAA-T-AAAAT-A-CA-GGT-ACTTTA-TTAA-TT-TT-ATTAAGATTTTTCTC-GGTAC-TTTTCA-ACATATAT-ATA-TAAGATA--TGA-TAAAATA-TTAAT-CTTTAGCATATAACATACGTGATA-T-TT-CG--T--CCCTGT--AAAAAAACG-CA-CACA--ACTTT--AC-TTATGATATG--TGTGTCC-AATGTT-G-TA-AAACCAACG---AAACAA-TA-GCCTTTTTTATTT-ATAAG-CAA-ATCTTA
gi|5 : TTTTTTGTG----TG-TTC-ATGTT-AGATAATTTCTGT-ACAACC-GAGT--CAAAAAAACAGGGGTC---CC-AGATAGC-A--TGACTACGA-TT---GGGCCAAT--------------GT-GG-GCCAA---AAAACA---CACG-T-TGAA---T--ACTGTTGGGCTA--CGTTG--C-GT-------A--CCA-CGTTTGGGTCAATG---TA-AGTG--TT-G--CT-----C-A-T-----C--------GGCCC-----------TC-AC------GTT--GGC-CCC--A------AC--ATGTGC---TT--TC---T-ACGT-TGG--CC---------C----------CAAGC-----CA-TG----TTGA--G--C-CA-CAT--T-TG-AACCAACATC--GTTGG-CCA--ACAT--TG--AACC----------ATACAGTGCTA------TGGGCCAACAT---------G-A-------CCAAA------C------AT--------GTT-GG-----G-CACA-ACG----TAGA-GGCC---GATGA------CAAAA-TT-A-C----G-T-TG---C--CCAACG-ACTGTAGTA--T-G----CCAA------CGTT-G---GCCC-A-ATCGTA-GTTTGCGCTTACGTT-GCCCAACGTGTTGCGtgt
gi|6 : ---CCCAGATAGC-A--TGACTACG--TT---GGGCCAA-----------------------CAA--------------CA-T-TCAA---T--ACGTT-GGACCA-ACGTTGC-C-GT-------A--CTA-CGTT-GGGCCAACG---CA-GGTT--T--G--CT-----C-A-TCG--TCCCTCCTTTGGCCCAACATGTTGGTTCTAC------GTT--GGC-ACA--ACATAAAACCAACGTGT---TGGGCC---A-ACATACAG--CCAACATAAAAC----------CAA-C-----GT--G----TTG---GGCC-AA-CAT--A--G-AGCCAACGTA--G--AA-CCA--ACGTGTTG--GGCCAACGTAGAACCAACG-TG-T-------TGGGCCAACATAGAGCCAACGTA-GAA---TC-AA------C------GT--------GTT-GG-----G-C-CA-ACG--T---AG-GGCC---GATGATGAT--CAAAA-TT-A-C----G-TTGA---C--CCAACG-ACTA--GTA--T-G----CCAA------CGTT-G---ACCC-A-A-TGT--GTTGGCGC-TATGTTGGCCCAACATCTTG
gi|7 : a---CCCGAATAGC-A--TGACTACG--TT----GGCCAAC--------------GTTGG---CAA---A---AA------G-T-TG-------TACAGTTGGCAGA-ATGTTGG-C-GTTGGGCAGA--CTA-CGTT-GGGCCAACG---TA-GG-------G--C------CAA-C-G--TT--------AACAT-----------TGTGT------GTGGAGGA-CTAAAA------AG--ATGAGT---TG--CTAAATAACGT-TGG--CC---------CAGTGTTGGTTCAA-C-----GTATGTACATCGAT-G--C-AA--AT--TGGG-AGTCAAAATGACGTTGG-ACATTGCGC--TT--GGCC----------CAAT----GT-------T--GCCAACGT--------AG-ATCAA---CC-AA------C------ATAATATTACGTT-GGG----GAT-CATATG--T-T----GGCC---CATTG-G----C-------CA-C----G-T-AGAATCAACCAACA---T---ATA--T--------AA------CGTT-G---G---------G------GATCC-TACGTTGGCCCAACGT
gi|7 : -CA-GTG--TATAAGTGG-----GACAA-G----TAAAA-TCCAAC----G-TTGG---G--CCAACG--------TA--G-GATCCCCAA------CGTT-A------T-ATA-TGTTGGTTGATTC-TACG-TGGCCtggattttacttgtcccacttatacactgtaagttt
gi|8 : cccgaatagcatgactacgttggccaacgttggcaaaaagttgtacagttggcagaatgttggcgttgggcagactacgttgggccaacgtagggccaacgttaacattgtgtgtggaggactaaaaagatgagttgctaaataacgttggcccagtgttggttcaacgtatgtacatcgatgcaaattgggagtcaaaatgacgttggacattgcgcttggcccaatgttgccaacgtagatcaaccaacataatattacgttggggatcatatgttggcccattAGATAGC-CCTTGACTACG--TT---GGGCCAAT--------------GTTGG--CCAA-------CA---C-CGGT-TGAA---T--ACGTT-GGGCCT-ACGTTGG-CCGT-------A--CCA-C--T-GGGCCA-TG---TA-AGTT-----G--CT-----C-A-T----TC--------GGCCC-----------TCC-C------GTTTGGGCACCA--A------AC--AGTTGT---TT--CT-----ACGT-TGG--CC---------C----------AAA-C-----AT--G----TTG---G--CCAA-CAT--T-TG-AACCAAC-T---GTTGG-CCA--ACAT--TG--AACC-----------AACA-TG-T-------TGGGCCAACAT--------TG-A-A-----CC-AAA-----C------AT--------GTT-GGC--------CA-ACG--T-TAGG-G--C---GATGA-G----CAAAAATTTA-G----G-TTGG---C--CCAACG-ACTA--GTA--T-G----CCAAA-----CGTTTG---GCCCCA-A-CGT--GTTGGCGC-TACGTTGGCCCAACGtaagttt
gi|9 : ------GTT--GGC-CC---A------AC--ATTTATATACA--CT---T-A--T-TGG---C---------C----------CAA-C-----GT-------------A--C-AA-CAC--G-TGCAGCTGTCTTAT-GTTGG-TTATTATTT--TA--GG-C----------CAACA-
gi|9 : TACG--TT---GGGCCAATAAGTGTATATAAATGTTGG-GCC-A---A---CA---C-AA-TATG-----TTTGC-TGTGGAATA-AAGT-------T-------A--TAA-CGTA-GGGCCAGTGT--TG-AGCTAGTTTGCACTTAA--A-A-T-G--TT--------GA--A-----------CCAAC------GAT--GGC-------------GT--ATGTG---------------ACGT-AGG--GC---------CAACAAAGT--CAA-C-----AT-TG----TTGCA-C--C-AA-CA---T-TG-ACCCAACATA--acaatatgtttgctgtggaataaagttataacgtagggccagtgttgagctagtttgcacttaaaatgttgaaccaacgatggcgtatgtgacgtagggccaacaaagtcaacattgttgcaccaacattgacccaacatacccctgctaactgggatagacctagtac
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gi|9 : tgttggcctaaaataataaccaacataagacagctgcacgtgttgtacgttgggccaataagtgtatataaatgttgggccaacacaatatgtttgctgtggaataaagttataGGTCTATCCCAGTTAGC-A--GGGGTATG--TT---GGGTCAAT--------------GTTGGTGC--A---A---CA---A-TG-T-TGAC---TTTG---TTGGCCCT-ACGTC-A-C-AT-------ACGCCATCGTT-GGTTCAACATTTTA-AGTacccctgctaactgggatagacctagtac
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gi|22 : T-A---G--C--TC-A-A-TG-T--------TTGGCG---C-TACGTTGGCCTAACATCTTcgttct
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gi|5 : TTTTTTGTG----TG-TTC-ATGTT-AGATAATTTCTGT-ACAACC-GAGT--CAAAAAAACAGGGGTC---CC-AGATAGC-A--TGACTACGA-T----T---GGGCCAAT--------------GT-GGGCCA----AAAAACACA----CG--TT--GAAT--ACTGT-T------GGGCTA--CGTTG--C-GT-------A--CCA-CGTTTGGGTCAATG---T-A-AGTG--TT-GC--T-----C-A--T-----C--------GGCCC-----------TC-AC-------GTT--GGC-CCC--A------AC--ATGTGC---TT--TC---T-ACGT-T--GG-CC---------C----------CAAGC-----CA-TG----TTGA--G--C-CA-CAT--T-TG-AACCAACATC--GTTGG-CC-A--ACAT--TG--AACC----------ATA---CAGT-G--------CTATGGGC-----CAACAT---------G-A---------C-----CAAAC------A------T-G-TTGG-----GCACAACG--T--AGA-GG---CCGA---TG--A----CAAAA-TT-----AC---GTT---G-CCCAAC-GACT-GTAGTATG----CCAA------CGTT-G---G--C--CC-A-ATCG-TA------GTTTGCG---CTTACGTT-GCCCAACGTGTTGCGtgt
gi|6 : ---CCCAGATAGC-A--TGACTACG--T----T---GGGCCAA----------------------CA----A------CA--------TT--CAAT--AC-GT-T------GGACCA-ACGTTGC-C-GT-------A--CTA-CGTT-GGGCCAACG---C-A-GGTT--T--GC--T-----C-A--TCG--TCCCTCCTTTGGCCCAACATGTTGGTTCTAC-------GTT--GGC-ACA--ACATAAAACCAACGTGT---TGGGCC---A-ACATAC--AG-CCAACATAAAAC----------CAA-C-----GT--G----TTG---GGCC-AA-CAT--A--G-AGCCAACGTA--G--AA-CC-A--ACGTGTTG--GGCCAACGTAGAACCAA---CG-T-G--------TT--GGGC-----CAACATAGAGCCAACGTA--GA-A---T-----CAA-C------G------T-G-TTGG-----GC-CAACG--T---AG-GG---CCGA---TG--ATGATCAAAA-TT-----AC---GTT---GACCCAAC-GACTAGTA---TG----CCAA------CGTT-G---A--C--CC-A-A-TG-T-------GTTGGCG---C-TATGTTGGCCCAACATCTTG
gi|7 : a---CCCGAATAGC-A--TGACTACG--T----T----GGCCAAC--------------GTT-GGCAA----A------AA----G---TT--G--T--ACAGT-T------GGCAGA-ATGTTGG-C-GTTGGGCAGA--CTA-CGTT-GGGCCAACG---T-A-GG-------GC--------CAA--C-G--TT--------AACAT-----------TGTGT-------GTGGAGGA-CTAAAA------AG--ATGAGT---TG--CTAAATAACGT-T--GG-CC---------CAGTGTTGGTTCAA-C-----GTATGTACATCGAT-G--C-AA--AT--TGGG-AGTCAAAATGACGTTGG-AC-ATTGCGC--TT--GGCC----------CA-----A-T-G--------TT----GC-----CAACGT--------AG-AT-CA-A---C-----CAA-C------A------T----------------AATA--T-TA---------CGT---TG--G-G--GA-----TCAT--AT---GTT---GGCCC-----ATT-G------G----CC-A------CGTA-G---AATCAACC-A-A-CA-TATATAACGTTGGGGATCC-TACGTTGGCCCAACGT
gi|7 : -CAGTG--TATAAGTGG-----GA---CA--A-G--TAAAA-TCCA---AC---GTT---GGGCCAAC------GTA---GGATCCCCAA------CGTT-A----------T-ATA-TG-TTG-----GTTGATT---C-TACG-TGGCCtggattttacttgtcccacttatacactgtaagttt
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gi|9 : CTACG--TCACAT---ACGCCATC--------------GTTGGTTCA----A------CA----T---TT--TAA------GT----------GCAA-AC--TAG-C--T----------CAA-CACT-GGCCC-------T-A-CGTT--ATAAC--TT----T-A--T----TC--------CACAG-----------CAAACATATTGTGTT--GGC-CC---A------AC--ATTTATATACA--CT---T-A--T-T--GG--C---------C----------CAA-C-----GT-------------A--C-AA-CAC--G-TGCAGCTGTCTTAT-GTTGG-TT-ATTATTT--TA--GG-C----------CAA---CA-
gi|9 : TACG--T----T---GGGCCAATAAGTGTATATAAATGTTGGGCCA----A------CA----C--------AAT--AT-GT-TTGCTGTGGAATA-AAGTT--------------A--TAA-CGTA-GGGCCAGTG---TTG-AGCTAGTTTGCACTT----A-AAAT-G--TT--------GAACC-------------AAC-------GAT--GGC-------------GT--ATGTG---------------ACGT-A--GG-GC---------CAACAAAGT--CAA-C-----AT-TG----TTG---CACC-AA-CAT--T--G-ACCCAACATA--ggccaacaaagtcaacattgttgcaccaacattgacccaacatacccctgctaactgggatagacctagtac
gi|9 : tgttggcctaaaataataaccaacataagacagctgcacgtgttgACG--T----A---GGGCCAGT--------------GTTGAGCTA----GTTTG--CA----C---TT--AAA---AT-GT-T------GAACCA-ACGATGG-C-GT-------ATGTGA-CGTA-GGGCCAACA-----A-AGT-------C--AA----C-AT-T-G--TT--------G--CA-----------CCAAC-------ATT--GAC-CC---A------AC--ATcccctgctaactgggatagacctagtac
gi|9 : tgttggcctaaaataataaccaacataagacagctgcacgtgttgtacgttgggccaataagtgtatataaatgttgggccaacacaatatgtttgctgtggaataaagttataGGTCTATCCCAGTTAGC-A--GGGGTATG--T----T---GGGTCAAT--------------GTTGGTGCA----A------CAAT--G---TT--GACT--TT-GT-T------GGCCCT-ACGTC-A-C-AT-------ACGCCATCGTT-GGTTCAACATTTT-A-AGTacccctgctaactgggatagacctagtac
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): GAATTTCCATTGGTATTAGATTGGGTCAACATAAGTCCAATATGTCTTTGCCATCAT