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Reference ( gi|13 ) : TTGTAAACT--GGC-GCT-T-G-A-A--T-ATT--T--GT-AGATTGTG---A-TA-G--CTTTA-----TTAAAATCT--TT-GA------C-----TTCCAC--T---------------T-TC----A------TAT--AAAATT--G--T--A-AAATTC-C---A-ATC-TT------A-C-A-TC-CATA-TCC----A-----T-GC--CA---TT-TC-T--A------GCAC-T---TG-TTGC-C--A-TG--TT----T-TG-----------------TT------T------------T-----------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-------A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-GG------A-----AT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-G--AAC--GCA--T-GC-A-GC--GAA---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TGAAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C-----G-AA----CC---GAGC-----G-------A-GAATT--TA--C-CGCG-GTT--AACCG-A---TTTTTCG-GTTAACCGTGAT-ATCC
gi|6 : TAAACT--CGC-GCT-T-G-A-A--T-ATT--T--GC-AGATTGCG---A-TA-G--CTTTA-----TTAAAATCT--CT-GA------C-----TTCCAA--T---------------T-TC----T------TAT--AAAATT--G--T--A-AAATCC-C---T-ATC-CT------G-C-G-TC-CATA-TCCTGTAA-----T-GC--AA---TT-TC-T--A------GCAC----------GC-C--A-TG--TT----T-TG-----------------TT------T------------T-----------A------C---------------CTACATATATACTGAT-G-TTAT-------A----T--GGA-A-T-T--GCAT--TGGT--T-GG------A-----AT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-A--AAC--GCT--T-GT-A-GC--GGA---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAGT-ATAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C-----G-AA----CC---AAAC-----G-------A-GAATT--TA--C-CGCG-GTT--AACCA-A---TTTTTCG-GTTAACCATGAC-AGCC
gi|18 : tattgtatactTAAACT--CGC-GGT-T-G-A-A--T-ATT--T--GC-AGATTGTG---A-TA-G--CTTTA-----TTATAATCT--TT-GA------C-----TTCCAC--T---------------T-TT--------------------TT--A--T--A-AAATTC-C---A-ATC-CT------G-C-A-TC-CATA-TCC----A-----T-GC--AA---TT-TC-T--AACACGTGCAC-G---TG-TCGC-C--A-TG--TT----T-TG-----------------TT------T------------T-----------A------T---------------C------------GAT-G-TTAT-------A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-GG------A-----AT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CAAA-C-C-A-A-TCA-G--AAC--GCG--T-GT-A-GC--G-A---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACT-GAA-----------CG-G-------AA--------------------------------------------------C-----G-------A-GAATT--TA--C-CGCG-GTT--AACCG-
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gi|31 : taatattcattgcaaggatgacatttatgtacatacaacaatcaaacaaaaggctttaaaaaagcagtcattatagactaataggctctgggtgaggtactgaaaattcagacctgattacatagcgcttattggtcgtagtagggtttttaatctttgccaacgctgcgttgatattgtggcctttgattttaaagtttcataacctaatgatccgcgctctcacgtctgaatgcctagcgtatttggggaagaacagttcatgagtctaaagttttgagtgggactagaacacaagtaaccttccggttcatgaagcgaacattcaacccactgagctactgcgatcgtgcttgcataaaataAAACT--CGC-GCT-T-G-A-A--T-ATT--T--GC-AGATTGTG---A-TA-T--CTTTG-----GTAAAATCT--TT-GA------C-----TTTCAC--TGNNNNNNNNNNGACTT-TC----ACTTTCTTAT--AAAATT--G--T--A-AAATTT-C---A-ATC------------------CATA-TCC----A-----T-GC--AA---TT-CC-T--A------GCA------TG-TCGCGC--A-TG--TT----T-TG-----------------TT------T------------T-----------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-------A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-GG------A-----AT-----CATCTGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-G--AAC--GCG--T-GT-AGGC--GAA---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-Tcc
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gi|10 : tgcatacttaaactcgtgcttgattt-GCT-T-G-A-C--T-ATT--TT-GC-AGATTGTG---A-TA-G--CTTTA-----TTAAAATCT--TT-GA------CTCCAGTCCCAC--G---------------T-TT----T------TAC--AAAATT--A--T--A-GAATTC-C---T-ATC-CT------A-C---------A-TCC----A-----T-GC--AA---TT-TCTT--T------GCAC-T---TG-TCGCAT--A-TG--TTTCAGT-TGGTTTTTAATTAATTTACCT------T------------T-----------A------C---------------C------------TAT-G-TTAT-------A----T--GGA-A-T-T--CTAT--TTGC--T-AG------A-----AT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCT-C--AAC--ACA--T----------GAA--------------G---T-A-GT-TTAAGAA--ATAAAC--AGA-ACT-GAA-CCGAAA--TCCG-C-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C-----G-AA----TC---GAACTGAATG-------A-GAATT--TA--C-CACA-TTT--AACCC-A---TTTTTT--GTTAATCGTGAC-AGCCtacagc
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gi|1 : tactgcatacttaaa--GC-AGAT-ATG---ACTATG--CGTTA-----TGAAAATCTCGTT-GT------T-----CTCCAC--------------------------A------TATCGGAAGTT--ACTT--ATAAATTCAC---A-ATCCTT------G-CTA-GT-CATA-TTC----ACC---T-GC--TAATTTT-TC-T--AAA----GCAT-GGAGTG-TCGC-CT-A-TG--TTATT-T-TG-----------------TT------T------------TT----------A------C---------------G------------GATTA-TTAT-------A----T--GGACA-TAT--CCAT--TGGTGGT-GGTAGAGAA-----ATTGG-TCAT-TGA--TTAAAAAT--AGGT-CGGA-T-C-A-T-TCACG--AACTTGCG----GCTA-GC--AAA---AGAGA-AAA-TG---T-taacaac
gi|35 : gctgtcacagttcatgaacatctttcggattcgttcgagttcatagtaaaggtgatacctcatgttcggtttttcggtttcagttttgttatataaataagcgattttaatttcgtattgaatcacataggatatcttttggaggaccctgacagtaaatgggggtacaaatgccaccacatttaaagagttataattataatatatagtaatcaacaaactataaaacactcaagttacacaagttccatttttgctaagagaagatttgttacacccttacaatgaatgcagtcaacattaaaagcctctaaaaagcagttgctttaatccgacgtagtaggctctcttgtagggcataatggtactgataatactttttaagtatctccgttacaacatgagcgcttaaaggtcgtaggtagaaaggggatttctaaacgtgcccggaattttcctgtatatgatagttctatagattagtgtccatggagactcgtactcccgtcatgtatgagtcatatacatacaatgtactctagccagcacgcaagagtctaatggccgagcgtttgggaagaaagcatcatgtgtcccactcgagggtttgtaattaggatatccatagaaaacacgacaagctttccggaacgagtcacgaagcgaacattgcaacaaccgagactactcgcccatctcctattgatatacttaaattatcacggctcgcaatctgcaacatataA-----TTAAAATCT--TT-GA------C-----TTCCAC--T---------------T-TC----T------TTT--AAATTT--G--T--A-AAATTC-C---T-ATG-CT------G-C-A-TC-AATA-TCC----A-----T-GC--AA---TT-TC-T--A------GCAC-G---TG-TCGC-C--A-TG--TG----T-TG-----------------TT------T------------T-----------A------C---------------CAACAGGTATACCGAT-G-TTAT-------A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-GG------A-----AT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-G--AAC--GCG--T-GT-A-GC--GAACCGAACGA-GAA-T
gi|42 : ATCT--TTTGA------C-----TTCCAC--T---------------T-TCTTATA------TAT--AAAGTT--G--T--A-AAATTC-C---A-ATC-CT------G-C-A-TC-TATA-TCC----A-----T-GC--AA---TT-TC-T--A------GCAC-G---TG-TCGC-C--A-TG--TT----T-TG-----------------TT------T------------T-----------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-------A----T--GGA-A-T-T--TCAT--TGGT--T-GG------A-----AT--A-TCAT-TAA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-G--AAC--GCG--T-GT-G-GC--GAA---AAAGttcccgcggttaactgatttttcggttaaccgtgacagcc
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gi|40 : ttgcataacattaaactcgcgcttcgaatcatttgccagactgcatatcttaatcaaaatctttgactaaattttgtaaattcctatatcctgcatccatatcctgcaatgtctagcacgtgtcgccatgttttgttttaccaacatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacgatgta-------A----T--GGG-A-T-T--CCAT--TGGC--T-AG------A-----AT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CAAA-C-C-A-A-TGA-T--AGC--ACG--T-GT-A-GC--GAA---CAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAG--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C-----G-AG----TC---GAACTGAATG-------A-GAATT--TA--C-CGCG-GTT--AACCG-A---TTTTTTG-GTTAATCGTAAC-AGCC
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gi|47 : ttgcataacattaaactcgcgcttcgaatcatttgccagactgcatatcttaatcaaaatctttgactaaattttgtaaattcctatatcctgcatccatatcctgcaatgtctagcacgtgtcgccatgttttgttttaccaacatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacgatgtataccgatgttatatggaattcc-GT-TTAAAAG--TTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCGCG-------AAAA-TG----CAAACCGA----AC-----C-----G-AA----CC---GAAC-----G-------A-GAA-C--TA----CGCG-GTT--AACCG-A---TTTTTCG-G-TAACC-TGAcagaacgcgtgtagcgaaaaagaaaatgtaatttaaaaagtaaacaaa
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gi|20 : attaaaatctttgacttccactttcttttaaatttgtaaaattcctatgctgcatcaatatccatgcaatttctagcacgtgtcgccatgtgttgttttaccaacaggtataccgatgttatatggaattccattggttggaatatcattgat-CACG-ATT--AACCG-A---AAAATCG-GTTAACCGTGGT-A
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gi|1 : CTC--GC-AATCT-GCA--------A--C-ATA--TA-GC-AGATATGACT---AT-G--CGTTA-----TGAAAATCTCGTT-GT---------------------T-----CTC-----CAC----------A--TATCGGAAG--TT-ACTT-ATAA-ATT--CAC--A--A-T-C--CTTGCTA-GT-CATA--TTC----ACC---T-GCTA-A-T--T-TT-TCTAAA------GCAT-GGAGT-G-T--CGC-CT-A-TG--TTATT-T-T-----G-----------------TT------T------------TT---------------A------C---------------G------------GATTA-TTAT-A----T--GGACA-TAT--CCAT--TGGTGGT-GGTAGAGAAATTGG-TCAT-TGA--TTAAAAAT--AGGT-CGGA-T-C-A-T-TCACGAACTTGCG--G-CTA-GC--AAA---AGAGA-AAA-TG---T-
gi|10 : gctgtcacagttcatgaacatctttcggattcgttcgagttcatagtaaaggtgatacctcatgttcggtttttcggtttcagttttgttatataaataagcgattttaatttcgtattgaatcacataggatatcttttggaggaccctgacagtaaatgggggtacaaatgccaccacatttaaagagttataattataatatatagtaatcaacaaactataaaacactcaagttacacaagttccatttttgctaagagaagatttgttacacccttacaatgaatgcagtcaacattaaaagcctctaaaaagcagttgctttaatccgacgtagtaggctctcttgtagggcataatggtactgataatactttttaagtatctccgttacaacatgagcgcttaaaggtcgtaggtagaaaggggatttctaaacgtgcccggaattttcctgtatatgatagttctatagattagtgtccatggagactcgtactcccgtcatgtatgagtcatatacatacaatgtactctagccagcacgcaagagtctaatggccgagcgtttgggaagaaagcatcatgtgtcccactcgagggtttgtaattaggatatccatagaaaacacgacaagctttccggaacgagtcacgaagcgaacattgcaacaaccgagactactcgcccatctcctattgatatacttaaattatcacggTAGAATC--AT-GCT-T-G-A--------C--T-ATT--TT-GC-AGAT-TG-TG---ATAG--CTTTA-----TTAAAATCT--TT-GA---------------------C-----TCCAGTCCCACGT---TTTT-A--CA----AAA--TT-A--T-A-GA-ATT--C-C--T--A-T-C--CT-AC-A-TC-CAT------------------GC-A-A-T--T-TC-T----TT-----GCAC-T---T-G-T--CGCAT--A-TG--TT----T-CAGTTGG-----------------TT------T------------TTAATTAATTTACCTTTA------C---------------C------------TAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--CTAT--TTGC--T-AG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCT-CAAC--ACA--T---------GAA--------------G---T-A-GT-TTAAGAA--ATAAAC--AGA-ACT-GAA-CCGAAA--TCCG-C-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AA----TCGAA---CTGAAT--G----A--G---AAT-T--TA--CCACA-TTT--AACCC---A---TTTTTT--GTTAATC-GT-GAC-AGCC
gi|11 : actTAGAATC--AT-GCT-T-G-A--------C--T-ATT--TT-GC-AGAT-TG-TG---ATAG--CTTTA-----TTAAAATCT--TT-GA---------------------CTCCAGTCC-----CACGT---TTTTAA--CA----AAA--TT-A--T-A-GA-ATT--C-C--T--A-T-C--CT-AC---------A--TCC----A-----T-GC-A-A-T--T-TCTT----T------GCAC-T---T-G-T--CGCAT--A-TG--TTTCAGT-T-----GGTTTTTAATTAATTTACCT------T------------T----------------A------C---------------C------------TAT-G-TTAT-A----T--GG--A-T-T--TTAT--TTGC--T-AG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCT-CAAC--ACA--T---------GAA--------------G---T-A-GT-TTAAGAA---TAAAC--AGA-ACT-GAA-CCGAAA--TCCG-C-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AA----TCGAA---CTGAAT--G----A--G---AAT-T--TA--CCACA-TTT--AACCC---A---TTTTTT--GTTAATC-GT-GAC-AGCC
gi|12 : actTGAACTC--GC-AGC-T-G-A--------A--T-ATT--TTCGC--GAT-TA-TGT--ATGG---TTTAAACCGTTAAAATCT-----AAACCCCC---------------C-----CCC-----CCCTT---CTTT-G--TC----AAA--T--A--T-A-GT-ATT--C-T--G--A-C-C--CT-GC-A-CC-CAT------------------GC-A-A-T--T-TC-TTC--A-------CAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----TCT-----A-----------------AT------T------------T----------------A------C---------------CTTTCTC------AAT-G-TTAC-A----T--GGA-A-T-TTCCCA---TAGT--T-AG------AA---A-TCAT-TAA--T-AAAGAT--A--T-CAAA-C-C-A-A-TCG-TAGC--ACA--T-GTA-GC--------AAACC-AAA-TGAGTT-A-GTGTTAAAAA--TTAA----------C-TAA-CCCAAA--CTT------------AA-TG----CA-----A----AC-----C--A-AA----TTAAA---CT------G----ATTG---AGTAT--TA--ACGCGCGAT--AACCG---A---CTTTTCA-GT--ATC-GT-GAC-
gi|13 : gccatactTAAACTG--GC-GCT-T-G-A--------A--T-ATT--T--GT-AGAT-TG-TG---ATAG--CTTTA-----TTAAAATCT--TT-GA---------------------C-----TTC-----CACTT---TCAT-A--TA----AAA--TT-G--T-A-AA-ATT--C-C--A--A-T-C--TT-AC-A-TC-CATA--TCC----A-----T-GC-C-A-T--T-TC-T----A------GCAC-T---T-G-T--TGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCA--T-GCA-GC--GAA---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TGAAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AA----CCGAG---C-------G----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTCG-GTTAACC-GT-GAT-ATCCatcc
gi|15 : ttgAAAT--AAA-ACC-GAA--CGAA----CTG-G-------AAAA-------AA-----A----AC-----C----------CCGAAAACC-------G----AT-GTTCATT-T--TC--CTGAA-CTG--AACCGAAAA---CTTTCTG----AACC-AT-GAC-AGCC
gi|16 : TAAACTC--GC-GCT-TCG-A--------A--TCATT--T--GCCAGAC-TG-C----ATAT--CTTAA-----TCAAAATCT--TT-GA---------------------C-----T-----------------------------AAATTTT-G--T---AA-ATT--C-CTAT--A-T-C--CT-GC-A-TC-CATA--TCC----------T-GC-A-A-T--G-TC-T----A------GCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------C------------AAC-A-TTtgagtaataaatcaaattcatttaatgaatccaggtatcttgaggaccctggaagtaaaatgggagtacaaatgcacacatcaaaatttaataaattctatacagcaatataacatatgtaattattgtaatattcatgcaagagtgacattatgtacaatacaacaaacagcgaaagctttagataatatagtcttaacgactt
gi|16 : ttgcataacat------------T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAA-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAA---AAAGA-AAA-TG---T-A-AT-TTAAAAA--GTAAAC--AAA-tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacgatgtataccgatgttatatggaattccattggttggaatatcaatgatataaatatcgaaccaatcagaacgcgtgtagcgaaaaagaaaatgtaatttaaaaagtaaacaaa
gi|18 : ttgcataacattaaactcgcgcttcgaatcatttgccagactgcatatcttaatcaaaatctttgactaaattttgtaaattcctatatcctgcatccatatcctgcaatgtctagcacgtgtcgccatgttttgttttaccaacatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacgatgtaTAAACTC--GC-GGT-T-G-A--------A--T-ATT--T--GC-AGAT-TG-TG---ATAG--CTTTA-----TTATAATCT--TT-GA---------------------C-----TTC-----CACTT---TTTT-A--TA----AAA--TT----------------C-C--A--A-T-C--CT-GC-A-TC-CATA--TCC----A-----T-GC-A-A-T--T-TC-T----AACACGTGCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------T---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CAAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--G-A---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACT-GAA-----------CG-G---------------------------------------------------AA---C-------G----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCG---
gi|2 : aactAAACTC--GC-GCT-TTG-A--------A--T-ATT--T--GC-AAAT-TG-CA---ATAA--CTTTGG----TTAAAATCT--T--GA---------------------C-----TTA-----CACTT---TCTT-A--TA----AAT--TT-G--T-T-AA-ATCACC-C--T--T-T-TTTCT-GC-AGTC-CAT---CCC----AATTATT-GC-A-A-T--T-TC-T----A------GCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TT--GT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------CCTACTGCTTTATTACC------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-CTT-T--CTAT--T-GT--T-GG-------AT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-CAA-A-TCA-GAAC--GCGTTT-GTA-GT--GAA---AA--G-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAT--GT-AAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TGC---CA-----A----AT-----T--G-AA----CCAAA---C-------T----A--G---AAT-T--TA--CCACG-GTT--A
gi|20 : taatattcattgcaaggatgacatttatgtacatacaacaatcaaacaaaaggctttaaaaaagcagtcattatagactaataggctctgggtgaggtactgaaaattcagacctgattacatagcgcttattggtcgtagtagggtttttaatctttgccaacgctgcgttgatattgtggcctttgattttaaagtttcataacctaatgatccgcgctctcacgtctgaatgcctagcgtatttggggaagaacagttcatgagtctaaagttttgagtgggactagaacacaagtaaccttccggttcatgaagcgaacattcaacccactgagctactgcgatcgtgcttgcataaaata--TT-A--T-A-AA-ATT--C-C--T--A-T-G--CT-GC-A-TC-CATA--TCC----A-----T-GC-A-A-T--T-TC-T----T------ACAC-G---T-G-G--CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TTCTACCTT------------T----------------A------C---------------C------------GAT-A-TTAT-AAATAT--GGA-A-T-T--CCAT--TGGC--T-AG------AAT--A-TTAT-TGA--T-GTAAAT--A--T-CAAA-C-C-A-A-TCA-TAGC--GCG--T-GTA-GC--AAT---CAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTTAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-AAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----ACCGAATC--G-AA----CCGAA---T-------G----A--G---AAT-T--TA--CCACG-GTT--AACCG---A---TTTTTCG-GTTAATC-GT-GAC-AGCCcc
gi|25 : t--CTTTT-----TTAAA-CCA--TT-GA---------------------A-----TTT-----TACTTGAATTTT-G--TG----CAA--T--A--T-A-AATATT--T----A--A-T-C--AT-A--------ATAATTAC----A-----A-GA-ATA-T--T-TT-A----A------GCA--G---T-A-TGACGC-C--A-TG--TT----T-T-----A-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------CTACATGTATACCGAT-G-TTAT-A----T--GGA-C-T-T--CTAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-AAAC--GCT--T-GTA-GC--GAA---AAAGA-AAG-TG---T-A-GT-TTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AA----Cc
gi|31 : AAACTC--GC-GCT-T-G-A--------A--T-ATT--T--GC-AGAT-TG-TG---ATAT--CTTTG-----GTAAAATCT--TT-GACTTTCACTGNNNNNNNNNNGAC-----TTT-----CACTT---TCTT-A--TA----AAA--TT-G--T-A-AA-ATT--T-C--A--A-T-C--C-----------ATA--TCC----A-----T-GC-A-A-T--T-CC-T----A------GCA------T-G-T--CGCGC--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-GG------A----A-TCATCTGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTAGGC--GAA---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-Ttaa
gi|35 : gcaaaacttaA-----TTAAAATCT--TT-GA---------------------C-----TTC-----CACTT---TCTT-T--TA----AAT--TT-G--T-A-AA-ATT--C-C--T--A-T-G--CT-GC-A-TC-AATA--TCC----A-----T-GC-A-A-T--T-TC-T----A------GCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TG----T-T-----G-----------------TT------TTACCAACAGGTAT----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAACCGAACGA-GAA-T
gi|35 : AT--AAATATC-GAA-CC--AA--TC-A-G-------AACG-CG----TG-----T----AG-----C--G-AA----CCGAA---C-------G----A--G---AAT-T--TC--CCGCG-GTT--AACTG---A---TTTTTCG-GTTAACC-GT-GAC-AGCCttcccgcggttaactgatttttcggttaaccgtgacagcc
gi|37 : attaaaatctttgacttccactttcttttaaatttgtaaaattcctatgctgcatcaatatccatgcaatttctagcacgtgtcgccatgtgttgttttaccaacaggtataccgatgttatatggaattccattggttggaatatcattgat-A-T--T-TC-T----A------GCACTG---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-------G-----------------TT------T------------TCCTACACGTAT-----A------C---------------C------------GAT-GGTTAT-A----T--G-A-C-T-T--CTAT---GGT--T-G--------AT--A-TCAT-GGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-CTC-AGA-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAG---AAAAATCAA-TG---T-A-CT-TTAAAAACAGTAAAC--AAA-AC--GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----A------T--G-AA----CCGAA---C-------GAACTA--G---AA-----TA--CCGC--GTTAAAACCG---A---TTT
gi|38 : -A-T--T-TC-T----A------GCACTG---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-------G-----------------TT------T------------TCCTACACGTAT-----A------C---------------C------------GAT-GGTTAT-A----T--G-A-C-T-T--CTAT---GGT--T-G--------AT--A-TCAT-GGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-CTC-AGA-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAG---AAAAATCAA-TG---T-A-CT-TTAAAAACAGTAAAC--AAA-AC--GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----A------T--G-AA----CCGAA---C-------GAACTA--G---AA-----TA--CCGC--GTTAAAACCG---A---TTTa
gi|39 : TAAACTC--GC-GGT-T-G-A--------A--T-ATT--T--GC-AGAT-TG-TG---ATAG--CTTTA-----TTATAATCT--TT-GA---------------------C-----TTC-----CACTT---TTTT-A-------------------T-A-AA-ATT--C-C--A--A-T-C--CT-GC-A-TC-CATA--TCC----A-----T-GC-A-A-T--T-TC-T----AACACGTGCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------T---------------C------------GAT-G-TTAT-a
gi|4 : attacataactAACTC--GCCGCT-T-G-A--------A--T-ATTATT--GC-AGAT-TG-CG---ATAAA-CTTTA-----TTAAAATCT--TTTGA---------------------C-----TTC-----CACTT----CTT-A--TT----AAA--TTTA--T-ATAA-ATC--C-C--T--A-T-C---T-GC-A-TTTCATA--TCC----A-----T-GC-A-A-T--T-TC-T----A------GCAC-G---T-GAT--CGC-CCCA-TG--TT----T-------G-----------------TT------TACCCTACATGTAT----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTATTA----TAGGGA-C-T-T--CTAT--TGGT--T-GG------AAT--A--AAT-TGGATT-ATAA-T--A--T-CGAG-A-C-A-A-TCA-GAAC--GCT--TTGTAAGC--GAA---AAAGA-AAGGTG---T-A-GT-T-AAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAAATTCCG-G-------AAAA-TGG---CA-----A----AC-----C--G-AA----CCGAA---CGCTGAACG----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTCGTGTTAACCGGTAGAC-AGnnnnnnnnnnnnnacataacttaaactcgcggttgaata
gi|40 : tgttgcataaactat-A----T--GGG-A-T-T--CCAT--TGGC--T-AG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CAAA-C-C-A-A-TGA-TAGC--ACG--T-GTA-GC--GAA---CAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAG--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AG----TCGAA---CTGAAT--G----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTTG-GTTAATC-GT-AAC-AGCC
gi|42 : ATCT--TTTGA---------------------C-----TTC-----CACTT---TCTT-A--TATATAAAG--TT-G--T-A-AA-ATT--C-C--A--A-T-C--CT-GC-A-TC-TATA--TCC----A-----T-GC-A-A-T--T-TC-T----A------GCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--TCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TAA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTG-GC--GAA---AAAGc
gi|43 : -GC-A-A-T--T-TC-T----A------GCAC-A---T-GGT--CGCAC--AATG--TT----T-T-----G-----------------TT------TACTACAGTA---T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--G-A-C-T-T--CTAT--TGGT----GG------AAT----TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--TTCGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAA---AAAGA-AAA-TG---TAA-GT-TTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAA----------------AGAA-TG----CA-----A----A
gi|44 : TAAACTTCGGC-GCTCT-G-A--------A--T-ATT--T--GC-A-AT-TG-TGGCAATAAAACTTTA-----TTAAAA-CT--TT-GA---------------------C-----TTC-----AACTT---TCTT-A--T-----GAA--TT-G------AA-ATC--C-C--T--A-T-T--CT--C-A-CC----A--TCC----A-----T--C-A-A-T--T-TC-C----A------aac
gi|45 : ctgtgcatacTAAACTTCGGC-GCTCT-G-A--------A--T-ATT--T--GC-A-AT-TG-TGGCAATAAAACTTTA-----TTAAAA-CT--TT-GA---------------------C-----TTC-----AACTT---TCTT-A--T-----GAA--TT-G------AA-ATC--C-C--T--A-T-T--CT--C-A-CC----A--TCC----A-----T--C-A-A-T--T-TC-C----A------
gi|46 : ctgtgcatacC-G---T-A-T--TGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------CTATTAC---------C------------AAT-G-TTGC-A----T--GGA-A-T-T--CCATATTGGT--T-AG------AAT--A-TCAT-TAA--C-AAACAT--A--T-CGAA-G-C-A-A-TGA-TAGC--TCA--T-GTA-AC--------AAACA-AAA-TG---
gi|47 : tc-GT-TTAAAAG--TTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCGCG-------AAAA-TG----CAAACCGA----AC-----C--G-AA----CCGAA---C-------G----A--G---AA--C--TA---CGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTCG-G-TAACC--T-GAC-GGCCgggt
gi|48 : T-CTAAAAA--ATGAAC--AAA-ACC-GAA-CTGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--A-AA----CCGAA---C-------A----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCT---A---TTTTTCA-GTTAACC-GT-GAC-AGCCc
gi|5 : TAAACTC--GC-GCT-T-G-AG-------A--T-ATT--T--GC-AGAT-GG-CG----TAA--CGTTA-----TTAAAATCT--TT-GA---------------------------TTC-----CACTT---TCTT-A--TA----AA---TT-A--T-C-A---TT--C-C--CTCACT-T--CT-GC-A-TC-CATA--CCC----A-----T-GC-A---T--T-TC-T----A------GCAA-A---TTG-T--CGC-C--A-TGGTTT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------CGCTACAATGTAT---C------------GAT-G-TTA--A----T--GGA-C-T-T--CTAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T--TACAT--A--T-TGAACC-C-A-A-CCA-GAAC--GT---T-GTA-GCGGGAA---AAAG--AAG-TG---TAA-G---TAAAAA--GTAACC--AAG-A--------CGAAA--TCCG-G--------AAA-TGC---CA-----AACCGAC-----C--G-AA----CCGAA---C-------T----A--G---AAT-TTCTACCCCGCGTGTT---ACCG---ATTTTTTTTCG-GTTAACC-GT-GAC-AGCCc
gi|50 : ttcataaactAAA--AAA-ATT-GAA-TCAAAA--TCCA-GTATTTACAAAC-TGAACACA-----A----AC-----T--G-AA----CTGAA---T-------G----T--G---TAT-T--TA--CCGTG-GTT--AGCTG---A---CTTTTAC-GTGCACC-AT-AAC-c
gi|52 : TAAACTC--G----------A--------A--T-AAT--TA-GC-AGAT-TG-TG---ATCG--CATTG-----TTAAAAACT--TCAGA---------------------C-----TCC-----CCTTT---TCTA-A--CA----A
gi|53 : tactgcatactTAAACTC--G----------A--------A--T-AAT--TA-GC-AGAT-TG-TG---ATCG--CATTG-----TTAAAAACT--TCAGA---------------------C-----TCC-----CCTTT---TCTc
gi|6 : ctactgcatactTAAACTC--GC-GCT-T-G-A--------A--T-ATT--T--GC-AGAT-TG-CG---ATAG--CTTTA-----TTAAAATCT--CT-GA---------------------C-----TTC-----CAATT---TCTT-A--TA----AAA--TT-G--T-A-AA-ATC--C-C--T--A-T-C--CT-GC-G-TC-CATA--TCCTGTAA-----T-GC-A-A-T--T-TC-T----A------GCA-------------CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------CTACATATATACTGAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--GCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-AAAC--GCT--T-GTA-GC--GGA---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAGT-ATAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AA----CCAAA---C-------G----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCA---A---TTTTTCG-GTTAACC-AT-GAC-AGCCaac
gi|7 : tattgtatactTAAGCTC--GC-GCT-T-GGA--------A--T-ATT--T--GC-AGAT--G-CG---ATAG--CTTTA-----TTAAAATCT--T--GA---------------------C-----TTC------A-TT---TCTT-A--TA----AA---TT-G--TTA-AA-AAT--C-C--T--A-TTC--CT-GC-G-TC--ATAG-TCCTGTAA-----T-GC-A-A-T--T-TC-T----A------GCAC-G------------C-C--A-TG--TG----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------CTATAGATACT--GAT-G-TTAT-A----T--GGA-AAT-T--GCAT--TGGT--T-G-------AAT--A-TCAT-TTA--T-ATAAATTAA--T-CGAAGC-C-A-AGTCA-AAAC--GCT--T-GTA-GC--GAA---AAGAA-AAA-T----T-A-GT-TTAAAA-----AAAC---AA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAATTG----CA-----A----AC-----C--GCAACC--CCAAAT--C-------G----AG-G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT---ACCA---A---CTTTTTC-GTTAACC-AT-GACAAGCC
gi|8 : ttgtatactAAACTC--G--GTT-T-G-A--------AATT-ATC--T--GC-AGAT-TG-CG---ATA----TTTA-----TTAAA-TCT--T--GA---------------------C-----TTC-------------TCTT-AATTA----TAA--TT-G--T-ATAA-AAT--C-C--T--A-T-T--C--GC-A-TC-C-CA--TCG----A-----TTGC-A-AGT--TGTC-T-----------GCAG-G---T-G-T--CGGAC--A-TGC-TT----T-T-----G-----------------TT------TACCTACATG---T----------------A------T---------------C------------GAT-G-TTAT------T--GAA-C-T-T--CTAT--TGGT--TTGG------AAT--AATCAT-TGA--T-ATAAAT--A----GGAA-G-A-C-A-TAA-GAA---GCT--T-GTA-GC--GAA---AAGAA-GAG-TG---T-ACGTCTTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACCGGAA-CCGAAA--TC---G-------GAAA-TG----CA-----A----AC-----CTTA-AA----CAGA------------G----A------AAT-T--TA--CCG-G-GTT--AACCGT--A---TTTTTCG-GTTAA-C-GTCGAC-AGC
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gi|16 : ttgcataacat------------T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAA-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAA---AAAGA-AAA-TG---T-A-AT-TTAAAAA--GTAAAC--AAA-tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacgatgtataccgatgttatatggaattccattggttggaatatcaatgatataaatatcgaaccaatcagaacgcgtgtagcgaaaaagaaaatgtaatttaaaaagtaaacaaa
gi|18 : ttgcataacattaaactcgcgcttcgaatcatttgccagactgcatatcttaatcaaaatctttgactaaattttgtaaattcctatatcctgcatccatatcctgcaatgtctagcacgtgtcgccatgttttgttttaccaacatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacgatgtaTAAACTC--GC-GGT-T-G-A--------A--T-ATT--T--GC-AGAT-TG-TG---ATAG--CTTTA-----TTATAATCT--TT-GA---------------------C-----TTC-----CACTTTTTT-A--TA----AAA--TT---------------C-C--A--A-T-C--CT-GC-A-TC-CATA-TCC----A-----T-GC-AA-T--T-TC-T----AACACGTGCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------T---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CAAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--G-A---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACT-GAA-----------CG-G---------------------------------------------------AA---C-------G----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCG---
gi|2 : aactAAACTC--GC-GCT-TTG-A--------A--T-ATT--T--GC-AAAT-TG-CA---ATAA--CTTTGG----TTAAAATCT--T--GA---------------------C-----TTA-----CACTTTCTT-A--TA----AAT--TT-G--T-T-AAATCACC-C--T--T-T-TTTCT-GC-AGTC-CAT--CCC----AATTATT-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TT--GT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------CCTACTGCTTTATTACC------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-CTT-T--CTAT--T-GT--T-GG-------AT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-CAA-A-TCA-GAAC--GCGTTT-GTA-GT--GAA---AA--G-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAT--GT-AAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TGC---CA-----A----AT-----T--G-AA----CCAAA---C-------T----A--G---AAT-T--TA--CCACG-GTT--A
gi|20 : taatattcattgcaaggatgacatttatgtacatacaacaatcaaacaaaaggctttaaaaaagcagtcattatagactaataggctctgggtgaggtactgaaaattcagacctgattacatagcgcttattggtcgtagtagggtttttaatctttgccaacgctgcgttgatattgtggcctttgattttaaagtttcataacctaatgatccgcgctctcacgtctgaatgcctagcgtatttggggaagaacagttcatgagtctaaagttttgagtgggactagaacacaagtaaccttccggttcatgaagcgaacattcaacccactgagctactgcgatcgtgcttgcataaaata--TT-A--T-A-AAATT--C-C--T--A-T-G--CT-GC-A-TC-CATA-TCC----A-----T-GC-AA-T--T-TC-T----T------ACAC-G---T-G-G--CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TTCTACCTT------------T----------------A------C---------------C------------GAT-A-TTAT-AAATAT--GGA-A-T-T--CCAT--TGGC--T-AG------AAT--A-TTAT-TGA--T-GTAAAT--A--T-CAAA-C-C-A-A-TCA-TAGC--GCG--T-GTA-GC--AAT---CAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTTAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-AAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----ACCGAATC--G-AA----CCGAA---T-------G----A--G---AAT-T--TA--CCACG-GTT--AACCG---A---TTTTTCG-GTTAATC-GT-GAC-AGCCcc
gi|25 : tA-T--T-TT-A----A------GCA--G---T-A-TGACGC-C--A-TG--TT----T-T-----A-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------CTACATGTATACCGAT-G-TTAT-A----T--GGA-C-T-T--CTAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-AAAC--GCT--T-GTA-GC--GAA---AAAGA-AAG-TG---T-A-GT-TTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AA----Cc
gi|31 : cttttttaaaccattgaattttacttgaattttgtgcaatataaatatttaatcataataattacaagaatAAACTC--GC-GCT-T-G-A--------A--T-ATT--T--GC-AGAT-TG-TG---ATAT--CTTTG-----GTAAAATCT--TT-GACTTTCACTGNNNNNNNNNNGAC-----TTT-----CACTTTCTT-A--TA----AAA--TT-G--T-A-AAATT--T-C-----A------------A-TC-CATA-TCC----A-----T-GC-AA-T--T-CC-T----A------GCA------T-G-T--CGCGC--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-GG------A----A-TCATCTGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTAGGC--GAA---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-Ttaa
gi|35 : gcaaaacttaA-----TTAAAATCT--TT-GA---------------------C-----TTC-----CACTTTCTT-T--TA----AAT--TT-G--T-A-AAATT--C-C--T--A-T-G--CT-GC-A-TC-AATA-TCC----A-----T-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TG----T-T-----G-----------------TT------TTACCAACAGGTAT----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAACCGAACGA-GAA-T
gi|35 : AT--AAATATC-GAA-CC--AA--TC-A-G-------AACG-CG----TG-----T----AG-----C--G-AA----CCGAA---C-------G----A--G---AAT-T--TC--CCGCG-GTT--AACTG---A---TTTTTCG-GTTAACC-GT-GAC-AGCCttcccgcggttaactgatttttcggttaaccgtgacagcc
gi|37 : attaaaatctttgacttccactttcttttaaatttgtaaaattcctatgctgcatcaatatccatgcaatttctagcacgtgtcgccatgtgttgttttaccaacaggtataccgatgttatatggaattccattggttggaatatcattgatA-T--T-TC-T----A------GCACTG---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-------G-----------------TT------T------------TCCTACACGTAT-----A------C---------------C------------GAT-GGTTAT-A----T--G-A-C-T-T--CTAT---GGT--T-G--------AT--A-TCAT-GGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-CTC-AGA-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAG---AAAAATCAA-TG---T-A-CT-TTAAAAACAGTAAAC--AAA-AC--GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----A------T--G-AA----CCGAA---C-------GAACTA--G---AA-----TA--CCGC--GTTAAAACCG---A---TTT
gi|38 : A-T--T-TC-T----A------GCACTG---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-------G-----------------TT------T------------TCCTACACGTAT-----A------C---------------C------------GAT-GGTTAT-A----T--G-A-C-T-T--CTAT---GGT--T-G--------AT--A-TCAT-GGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-CTC-AGA-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAG---AAAAATCAA-TG---T-A-CT-TTAAAAACAGTAAAC--AAA-AC--GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----A------T--G-AA----CCGAA---C-------GAACTA--G---AA-----TA--CCGC--GTTAAAACCG---A---TTTa
gi|39 : TAAACTC--GC-GGT-T-G-A--------A--T-ATT--T--GC-AGAT-TG-TG---ATAG--CTTTA-----TTATAATCT--TT-GA---------------------C-----TTC-----CACTTTTTT-A-------------------T-A-AAATT--C-C--A--A-T-C--CT-GC-A-TC-CATA-TCC----A-----T-GC-AA-T--T-TC-T----AACACGTGCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------T---------------C------------GAT-G-TTAT-a
gi|4 : attacataactAACTC--GCCGCT-T-G-A--------A--T-ATTATT--GC-AGAT-TG-CG---ATAAA-CTTTA-----TTAAAATCT--TTTGA---------------------C-----TTC-----CACTT-CTT-A--TT----AAA--TTTA--T-ATAAATC--C-C--T--A-T-C---T-GC-A-TTTCATA-TCC----A-----T-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-G---T-GAT--CGC-CCCA-TG--TT----T-------G-----------------TT------TACCCTACATGTAT----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTATTA----TAGGGA-C-T-T--CTAT--TGGT--T-GG------AAT--A--AAT-TGGATT-ATAA-T--A--T-CGAG-A-C-A-A-TCA-GAAC--GCT--TTGTAAGC--GAA---AAAGA-AAGGTG---T-A-GT-T-AAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAAATTCCG-G-------AAAA-TGG---CA-----A----AC-----C--G-AA----CCGAA---CGCTGAACG----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTCGTGTTAACCGGTAGAC-AGnnnnnnnnnnnnnacataacttaaactcgcggttgaata
gi|40 : tgttgcataaactat-A----T--GGG-A-T-T--CCAT--TGGC--T-AG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CAAA-C-C-A-A-TGA-TAGC--ACG--T-GTA-GC--GAA---CAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAG--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AG----TCGAA---CTGAAT--G----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTTG-GTTAATC-GT-AAC-AGCC
gi|42 : ATCT--TTTGA---------------------C-----TTC-----CACTTTCTT-A--TATATAAAG--TT-G--T-A-AAATT--C-C--A--A-T-C--CT-GC-A-TC-TATA-TCC----A-----T-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--TCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TAA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTG-GC--GAA---AAAGc
gi|43 : -GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-A---T-GGT--CGCAC--AATG--TT----T-T-----G-----------------TT------TACTACAGTA---T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--G-A-C-T-T--CTAT--TGGT----GG------AAT----TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--TTCGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAA---AAAGA-AAA-TG---TAA-GT-TTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAA----------------AGAA-TG----CA-----A----A
gi|44 : TAAACTTCGGC-GCTCT-G-A--------A--T-ATT--T--GC-A-AT-TG-TGGCAATAAAACTTTA-----TTAAAA-CT--TT-GA---------------------C-----TTC-----AACTTTCTT-A--T-----GAA--TT-G------AAATC--C-C--T--A-T-T--CT--C-A-CC----A-TCC----A-----T--C-AA-T--T-TC-C----A------aac
gi|45 : ctgtgcatacTAAACTTCGGC-GCTCT-G-A--------A--T-ATT--T--GC-A-AT-TG-TGGCAATAAAACTTTA-----TTAAAA-CT--TT-GA---------------------C-----TTC-----AACTTTCTT-A--T-----GAA--TT-G------AAATC--C-C--T--A-T-T--CT--C-A-CC----A-TCC----A-----T--C-AA-T--T-TC-C----A------
gi|46 : ctgtgcatacC-G---T-A-T--TGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------CTATTAC---------C------------AAT-G-TTGC-A----T--GGA-A-T-T--CCATATTGGT--T-AG------AAT--A-TCAT-TAA--C-AAACAT--A--T-CGAA-G-C-A-A-TGA-TAGC--TCA--T-GTA-AC--------AAACA-AAA-TG---
gi|47 : tc-GT-TTAAAAG--TTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCGCG-------AAAA-TG----CAAACCGA----AC-----C--G-AA----CCGAA---C-------G----A--G---AA--C--TA---CGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTCG-G-TAACC--T-GAC-GGCCgggt
gi|48 : T-CTAAAAA--ATGAAC--AAA-ACC-GAA-CTGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--A-AA----CCGAA---C-------A----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCT---A---TTTTTCA-GTTAACC-GT-GAC-AGCCc
gi|5 : TAAACTC--GC-GCT-T-G-AG-------A--T-ATT--T--GC-AGAT-GG-CG----TAA--CGTTA-----TTAAAATCT--TT-GA---------------------------TTC-----CACTTTCTT-A--TA----AA---TT-A--T-C-A--TT--C-C--CTCACT-T--CT-GC-A-TC-CATA-CCC----A-----T-GC-A--T--T-TC-T----A------GCAA-A---TTG-T--CGC-C--A-TGGTTT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------CGCTACAATGTAT---C------------GAT-G-TTA--A----T--GGA-C-T-T--CTAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T--TACAT--A--T-TGAACC-C-A-A-CCA-GAAC--GT---T-GTA-GCGGGAA---AAAG--AAG-TG---TAA-G---TAAAAA--GTAACC--AAG-A--------CGAAA--TCCG-G--------AAA-TGC---CA-----AACCGAC-----C--G-AA----CCGAA---C-------T----A--G---AAT-TTCTACCCCGCGTGTT---ACCG---ATTTTTTTTCG-GTTAACC-GT-GAC-AGCCc
gi|50 : ttcataaactAAA--AAA-ATT-GAA-TCAAAA--TCCA-GTATTTACAAAC-TGAACACA-----A----AC-----T--G-AA----CTGAA---T-------G----T--G---TAT-T--TA--CCGTG-GTT--AGCTG---A---CTTTTAC-GTGCACC-AT-AAC-c
gi|52 : TAAACTC--G----------A--------A--T-AAT--TA-GC-AGAT-TG-TG---ATCG--CATTG-----TTAAAAACT--TCAGA---------------------C-----TCC-----CCTTTTCTA-A--CA----A
gi|53 : tactgcatactTAAACTC--G----------A--------A--T-AAT--TA-GC-AGAT-TG-TG---ATCG--CATTG-----TTAAAAACT--TCAGA---------------------C-----TCC-----CCTTTTCTc
gi|6 : ctactgcatactTAAACTC--GC-GCT-T-G-A--------A--T-ATT--T--GC-AGAT-TG-CG---ATAG--CTTTA-----TTAAAATCT--CT-GA---------------------C-----TTC-----CAATTTCTT-A--TA----AAA--TT-G--T-A-AAATC--C-C--T--A-T-C--CT-GC-G-TC-CATA-TCCTGTAA-----T-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCA-------------CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------CTACATATATACTGAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--GCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-AAAC--GCT--T-GTA-GC--GGA---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAGT-ATAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AA----CCAAA---C-------G----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCA---A---TTTTTCG-GTTAACC-AT-GAC-AGCCaac
gi|7 : tattgtatactTAAGCTC--GC-GCT-T-GGA--------A--T-ATT--T--GC-AGAT--G-CG---ATAG--CTTTA-----TTAAAATCT--T--GA---------------------C-----TTC------A-TTTCTT-A--TA----AA---TT-G--TTA-AAAAT--C-C--T--A-TTC--CT-GC-G-TC--ATAGTCCTGTAA-----T-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-G------------C-C--A-TG--TG----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------CTATAGATACT--GAT-G-TTAT-A----T--GGA-AAT-T--GCAT--TGGT--T-G-------AAT--A-TCAT-TTA--T-ATAAATTAA--T-CGAAGC-C-A-AGTCA-AAAC--GCT--T-GTA-GC--GAA---AAGAA-AAA-T----T-A-GT-TTAAAA-----AAAC---AA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAATTG----CA-----A----AC-----C--GCAACC--CCAAAT--C-------G----AG-G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT---ACCA---A---CTTTTTC-GTTAACC-AT-GACAAGCC
gi|8 : ttgtatactAAACTC--G--GTT-T-G-A--------AATT-ATC--T--GC-AGAT-TG-CG---ATA----TTTA-----TTAAA-TCT--T--GA---------------------C-----TTC----------TCTT-AATTA----TAA--TT-G--T-ATAAAAT--C-C--T--A-T-T--C--GC-A-TC-C-CA-TCG----A-----TTGC-AAGT--TGTC-T-----------GCAG-G---T-G-T--CGGAC--A-TGC-TT----T-T-----G-----------------TT------TACCTACATG---T----------------A------T---------------C------------GAT-G-TTAT------T--GAA-C-T-T--CTAT--TGGT--TTGG------AAT--AATCAT-TGA--T-ATAAAT--A----GGAA-G-A-C-A-TAA-GAA---GCT--T-GTA-GC--GAA---AAGAA-GAG-TG---T-ACGTCTTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACCGGAA-CCGAAA--TC---G-------GAAA-TG----CA-----A----AC-----CTTA-AA----CAGA------------G----A------AAT-T--TA--CCG-G-GTT--AACCGT--A---TTTTTCG-GTTAA-C-GTCGAC-AGC
gi|9 : tttggcatactttaTAAACTC--GT-GCT-T-G-ATTTGCTTGA--TTATT--T--GC-AGAT-TG-TG---ATAG--CTTTA--------AAATCT--TT-GA---------------------C-----TTC-----CACTTTCTT-A--TA----AAA--TT---------------C-C--T--A-T-C--CT-GC-A-TC-CATA-TCC----A-----T-GC-AA-TATT-TC-C----A------GCAT-G---T-G-T--TAC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------ATCTATAC---------------C------------AAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-G-------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-C-AA-CAC-A-A-TTC-ATAC--GCGG-T-G-A-GC---AA---CAAGA-AAA-AG---G-A-GT-TTAAAAA--GTAAACGAAAA-ATC-GAAACCGAAA--TCCA-G-------AAA--TG----GA-----A----AC-----T--G-AATTGACCGAA---T-------G----A--G---AAT-T--TA--CCACG-GTT--AACTG---A---TTTTTCG-GTTAATC-GT-TAC-AGC
28 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|3 ): TTGTCAGGTTCGACATTGTTGGTTCGGCTTCAAGTGGAAATGAACCCTCGGTTTTCGGTTTCTGTTTTTGTGGTAATAAGTAAATAATTTCAATGTCCAGGTATCTTGAAGGACCCTTATAAATAAACATGGGTGTACAAAGGCACGACAGTGTCACCAATTTATTTCTACTTCTAATTCATTCGCAATTAACTACTGTATATTCATGCAAGGATGCATTATGTAAATCAACAATCAAAAAAAGCTTTAAAAGCAGTCTTAATAGACTATAAGGGCTCTGGTTGAGGTACTGAAATTTTTAATACTATACGCGAGTTGCGGTCGTAGTTAGGAGGTTTTCTTAAACTTGCCAACAGCTGTCGTGATATGTGACCTCGATTTTAGGTCACTAGGCTAATGATGCTGCGGCTCTCCGATCTGAAATGCGCGAGCGTTTGGAAAGAAGTCATGTGGTTCAAGTTTAGTGGGACTAGAACACATGTTACCTTCCCGCCAGTTCAGTCACGGGAGAGCGACATTCAACCACTGAGGGCTACCAGC
Unaligned ( gi|14 ): TGTCACGCGTTTCAGACATTTTTCGGTTTCGGTTTCAGGAAACTGAACCTCAGGGTTTTTCGGTTTTTCGGTATCGGTTTTTATTTTGTGTAAATTAGATAAAAGATTAATTTCGGATTGAACCCAGGTATTCTTGAGGACCCTATAAGTAAATGGGTGTTAACAAAAGTGCACACAGTCACCAAAGTTTATTAATACATTCTATCACAATATAACATAGTATATTCATGCAACGGATGGACATTATGTACAATAAAACAATCAAAAAAAGCTTTAAAAAGCAGTTCTTAAATAGACTAT
Unaligned ( gi|17 ): GGCTGTCATAATTCAGACATTTTACGGTTGGTTCAGATCGGTTCAAGGAACTAAACTTCGATTTTCCTTTGTTTTGGTTTGGTTTTATTTTGTGTAATAAATTACAATAATTTCATGAATCCAAGTATCTTGAGGATCCTGGAATATAAATGCAAACACCAAAGTTTAATAAATTTTATTCAACAATATAAGTAATATTCATGCAAAATGACATTTATATGTACAAAATACTACAATACAACAAGCAACAAAAGCTTTAAAAAGCAGTCTTAACCGACTAT
Unaligned ( gi|19 ): GGGCTTCATAATTCAGGACATTTTACGGTTGGTTCAGATCGGTTCAAGGAACTAAACTTCGATTTTCCTTTGTTTTGGTTTGGTTTTATTTTGTGTAATAAATTACAATAATTTCATGAATCCAAGTATCTTGAGGATCCTGGAATATAAATGCAAACACCAAAGTTAATAAATTTTATTCAACAATATAAGTAATATTCATGCAAAATGACATTTATATGTACAAATACTACAATACAACAAGCAACAAAAGCTTTAAAAAGCAGTCTTAACCGACTA
Unaligned ( gi|21 ): GGCTGTCACGGTTCAGACATTTTTCGGTTCGGTTCAGGAAACTAAACCTCGGTTTTTTCGGTTCGGTTTTAATATGTGTAATAAATGAAATTAATTTCATGAATCCAGGTATCTTGAGGACCTTGGAAGTAAAATGGGTGTACAAATGTACACATCAAAGTTTAATAACTTCTATTCAGCAATATAACATATGTAATATTCATACAAGGATTACATTATGTACAATACAACAGCCAACAAAATTAAGCTTTAAAAAGCAATCTTAACCGACT
Unaligned ( gi|22 ): GCTGTCACGGTTCAGACATTTTTCGGTTCGGTTCGGTTCAGGAAAATGATTCTCGGTTTTCGGTTTGGTTTTATTTTGTGTCATAAATAAAATTAATTTCATGAATCCAGGTATCTTGAGGACCCTGGAAGTAAAATGGGTGTACAAATGCACACATTAAAGTATAATAAATTATATTCAGCAATATAACATATGTAATATTCATGCAAGGATGACATTACGTACAATACAACAGTCAACAAAAGCTTTAAAAAGCGGTCTTAATCAACTA
Unaligned ( gi|23 ): GCTGTCACGGTTCAGACAGTTCGGGTTCGGTTCAGGAACTGAACCTCGGTTCGGTTTTTCTCGGTTGGTTTTAATTTGTGTAATAATAAATTAATTTCATGAATCCCAGGTATCTTGAGGACCTATAAGTAGGTGGTATCAAAGGCACACAGTCACCAATTTTTAATACCTTTTATCAGCATAAAACATATGTAATATTCCATGGCAAGAATGACAATGTTGTCAATACAACAACAAAACAAAGCTTTAAAAAGCAGTCTAA
Unaligned ( gi|24 ): TGTCACGGTCAGACATTTTCGGTTCGGTGCGGGTTTAGGAAACTGAACCTCGTTTTCGGTTTTTTCGGTTCGGTTTATTTGTGTTAATAAATAAAATTAATTTCATGAATCCTGGAAAGTAAAATGGGTGTACAAATGCACACATCAAAGTTAATAAATTCTATTCAGCAATATAACATATGTAATATTCATGCAAGATGACATTATGTACAATACAACAATCAACAAAAGCTTTAAAACGCAGTCTTAATCGACTATAT
Unaligned ( gi|26 ): TCAGGGAACTGAACCTCAGTTTTCATTTTTTTCGGTTCGGTTTTATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGGAAGTAATGCACACATTGAAGTATAATAAATTCTATTCAGCAATATAACATATGTAATATTCATGCAAGGATGACATTATGTACAATTCAACAGTCAACAAAAGCTTTAAAAAGCAGTCTTAACCGACTAC
Unaligned ( gi|27 ): GGCTGTCACGGTTCAGACATTTTTCGGTTCGGTTCAGGAAATTGAACCTCGGTTTTAGGTTTTATTTTGTATAATAAATAAAATTAATTTCATGAATCCAGGTATCTTGAGGACCCTGGAAGTAAATGGGTGAACAAATTCACACATTAAAGTACAATACATTTTATTCAGCAATATAACACATGTAATATTCATGCAAAGATGACATTATGTACAATACAACTGTCAACAATTTTAAGCTTTAAAACGCAGTCT
Unaligned ( gi|28 ): TTGTCACCGTTTCAGACATGTCGGACTCGTCGGTCAGGAAACTGAACCTCGGTTTTCGATTTCGTTATTTTGTGTAATAACTAAAATTAATTCATGAGATCCAATGTAGTCTTGAGACCTGGAAGTAAAATGGTGTACAAGGCACACATCAACAGTTTAATAAATTCTATCAGCATAACAATTAATATCATGCAAGGATGACTTTATGTACAAACAAACAATCAAACAAGCTTAAAAAGTAGTTTAATGAGAT
Unaligned ( gi|29 ): TTGTCACCGTTTCAGACATGTCGGACTCGTCGGTCAGGAAACTGAACCTCGGTTTTCGATTTCGTTATTTTGTGTAATAACTAAAATTAATTCATGAGATCCAATGTAGTCTTGAGACCTGGAAGTAAAATGGTGTACAAGGCACACATCAACAGTTTAATAAATTCTATCAGCATAACAATTAATATCATGCAAGGATGACTTTATGTACAAACAAACAATCAAACAAGCTTAAAAAGTAGTTTAATGAGAT
Unaligned ( gi|30 ): TTCGGTCGCGTTCAGGAAACTGAACCTCGATTTTCATTTTTTTCGGTTTCAGGTTTTTTCTTGATATGTAATAAATAAAATTAATCCATGAATGTCAGGTATCTTGAGGACCTGGAAGTAAAATGGGTGTACAAATGCACATCACACAAAGTTTAATAAATTGATTCAGCAATGTATAACGATGTAATATTTCATGAAGGATGACATTATGTTACAATTATCAACAATCAACAAAAAGCTAAATCAGTCTTA
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Reference ( family-434 ) : NNNTAAACTC--GC-GCT-T-G-A--------A--T-ATT--T--GC-AGAT-TG-CG---ATAG--CTTTA-----TTAAAATCT--TT-GA---------------------C-----TTC-----CACTTTCTT-A--TA----AAA--TT-G--T-A-AAATT--C-C--T--A-T-C--CT-GC-A-TC-CATA-TCC----A-----T-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAA---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AA----CCGAA---C-------G----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTCG-GTTAACC-GT-GAC-AGCC
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gi|4 : attacataactAACTC--GCCGCT-T-G-A--------A--T-ATTATT--GC-AGAT-TG-CG---ATAAA-CTTTA-----TTAAAATCT--TTTGA---------------------C-----TTC-----CACTT-CTT-A--TT----AAA--TTTA--T-ATAAATC--C-C--T--A-T-C---T-GC-A-TTTCATA-TCC----A-----T-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-G---T-GAT--CGC-CCCA-TG--TT----T-------G-----------------TT------TACCCTACATGTAT----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTATTA----TAGGGA-C-T-T--CTAT--TGGT--T-GG------AAT--A--AAT-TGGATT-ATAA-T--A--T-CGAG-A-C-A-A-TCA-GAAC--GCT--TTGTAAGC--GAA---AAAGA-AAGGTG---T-A-GT-T-AAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAAATTCCG-G-------AAAA-TGG---CA-----A----AC-----C--G-AA----CCGAA---CGCTGAACG----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTCGTGTTAACCGGTAGAC-AGnnnnnnnnnnnnnacataacttaaactcgcggttgaata
gi|40 : tgttgcataaactat-A----T--GGG-A-T-T--CCAT--TGGC--T-AG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CAAA-C-C-A-A-TGA-TAGC--ACG--T-GTA-GC--GAA---CAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAG--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AG----TCGAA---CTGAAT--G----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTTG-GTTAATC-GT-AAC-AGCC
gi|42 : ATCT--TTTGA---------------------C-----TTC-----CACTTTCTT-A--TATATAAAG--TT-G--T-A-AAATT--C-C--A--A-T-C--CT-GC-A-TC-TATA-TCC----A-----T-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--TCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TAA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTG-GC--GAA---AAAGc
gi|43 : -GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-A---T-GGT--CGCAC--AATG--TT----T-T-----G-----------------TT------TACTACAGTA---T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--G-A-C-T-T--CTAT--TGGT----GG------AAT----TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--TTCGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAA---AAAGA-AAA-TG---TAA-GT-TTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAA----------------AGAA-TG----CA-----A----A
gi|44 : TAAACTTCGGC-GCTCT-G-A--------A--T-ATT--T--GC-A-AT-TG-TGGCAATAAAACTTTA-----TTAAAA-CT--TT-GA---------------------C-----TTC-----AACTTTCTT-A--T-----GAA--TT-G------AAATC--C-C--T--A-T-T--CT--C-A-CC----A-TCC----A-----T--C-AA-T--T-TC-C----A------aac
gi|45 : ctgtgcatacTAAACTTCGGC-GCTCT-G-A--------A--T-ATT--T--GC-A-AT-TG-TGGCAATAAAACTTTA-----TTAAAA-CT--TT-GA---------------------C-----TTC-----AACTTTCTT-A--T-----GAA--TT-G------AAATC--C-C--T--A-T-T--CT--C-A-CC----A-TCC----A-----T--C-AA-T--T-TC-C----A------
gi|46 : ctgtgcatacC-G---T-A-T--TGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------CTATTAC---------C------------AAT-G-TTGC-A----T--GGA-A-T-T--CCATATTGGT--T-AG------AAT--A-TCAT-TAA--C-AAACAT--A--T-CGAA-G-C-A-A-TGA-TAGC--TCA--T-GTA-AC--------AAACA-AAA-TG---
gi|47 : tc-GT-TTAAAAG--TTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCGCG-------AAAA-TG----CAAACCGA----AC-----C--G-AA----CCGAA---C-------G----A--G---AA--C--TA---CGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTCG-G-TAACC--T-GAC-GGCCgggt
gi|48 : T-CTAAAAA--ATGAAC--AAA-ACC-GAA-CTGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--A-AA----CCGAA---C-------A----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCT---A---TTTTTCA-GTTAACC-GT-GAC-AGCCc
gi|5 : TAAACTC--GC-GCT-T-G-AG-------A--T-ATT--T--GC-AGAT-GG-CG----TAA--CGTTA-----TTAAAATCT--TT-GA---------------------------TTC-----CACTTTCTT-A--TA----AA---TT-A--T-C-A--TT--C-C--CTCACT-T--CT-GC-A-TC-CATA-CCC----A-----T-GC-A--T--T-TC-T----A------GCAA-A---TTG-T--CGC-C--A-TGGTTT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------CGCTACAATGTAT---C------------GAT-G-TTA--A----T--GGA-C-T-T--CTAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T--TACAT--A--T-TGAACC-C-A-A-CCA-GAAC--GT---T-GTA-GCGGGAA---AAAG--AAG-TG---TAA-G---TAAAAA--GTAACC--AAG-A--------CGAAA--TCCG-G--------AAA-TGC---CA-----AACCGAC-----C--G-AA----CCGAA---C-------T----A--G---AAT-TTCTACCCCGCGTGTT---ACCG---ATTTTTTTTCG-GTTAACC-GT-GAC-AGCCc
gi|50 : ttcataaactAAA--AAA-ATT-GAA-TCAAAA--TCCA-GTATTTACAAAC-TGAACACA-----A----AC-----T--G-AA----CTGAA---T-------G----T--G---TAT-T--TA--CCGTG-GTT--AGCTG---A---CTTTTAC-GTGCACC-AT-AAC-c
gi|52 : TAAACTC--G----------A--------A--T-AAT--TA-GC-AGAT-TG-TG---ATCG--CATTG-----TTAAAAACT--TCAGA---------------------C-----TCC-----CCTTTTCTA-A--CA----A
gi|53 : tactgcatactTAAACTC--G----------A--------A--T-AAT--TA-GC-AGAT-TG-TG---ATCG--CATTG-----TTAAAAACT--TCAGA---------------------C-----TCC-----CCTTTTCTc
gi|6 : ctactgcatactTAAACTC--GC-GCT-T-G-A--------A--T-ATT--T--GC-AGAT-TG-CG---ATAG--CTTTA-----TTAAAATCT--CT-GA---------------------C-----TTC-----CAATTTCTT-A--TA----AAA--TT-G--T-A-AAATC--C-C--T--A-T-C--CT-GC-G-TC-CATA-TCCTGTAA-----T-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCA-------------CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------CTACATATATACTGAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--GCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-AAAC--GCT--T-GTA-GC--GGA---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAGT-ATAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AA----CCAAA---C-------G----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCA---A---TTTTTCG-GTTAACC-AT-GAC-AGCCaac
gi|7 : tattgtatactTAAGCTC--GC-GCT-T-GGA--------A--T-ATT--T--GC-AGAT--G-CG---ATAG--CTTTA-----TTAAAATCT--T--GA---------------------C-----TTC------A-TTTCTT-A--TA----AA---TT-G--TTA-AAAAT--C-C--T--A-TTC--CT-GC-G-TC--ATAGTCCTGTAA-----T-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-G------------C-C--A-TG--TG----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------CTATAGATACT--GAT-G-TTAT-A----T--GGA-AAT-T--GCAT--TGGT--T-G-------AAT--A-TCAT-TTA--T-ATAAATTAA--T-CGAAGC-C-A-AGTCA-AAAC--GCT--T-GTA-GC--GAA---AAGAA-AAA-T----T-A-GT-TTAAAA-----AAAC---AA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAATTG----CA-----A----AC-----C--GCAACC--CCAAAT--C-------G----AG-G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT---ACCA---A---CTTTTTC-GTTAACC-AT-GACAAGCC
gi|8 : ttgtatactAAACTC--G--GTT-T-G-A--------AATT-ATC--T--GC-AGAT-TG-CG---ATA----TTTA-----TTAAA-TCT--T--GA---------------------C-----TTC----------TCTT-AATTA----TAA--TT-G--T-ATAAAAT--C-C--T--A-T-T--C--GC-A-TC-C-CA-TCG----A-----TTGC-AAGT--TGTC-T-----------GCAG-G---T-G-T--CGGAC--A-TGC-TT----T-T-----G-----------------TT------TACCTACATG---T----------------A------T---------------C------------GAT-G-TTAT------T--GAA-C-T-T--CTAT--TGGT--TTGG------AAT--AATCAT-TGA--T-ATAAAT--A----GGAA-G-A-C-A-TAA-GAA---GCT--T-GTA-GC--GAA---AAGAA-GAG-TG---T-ACGTCTTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACCGGAA-CCGAAA--TC---G-------GAAA-TG----CA-----A----AC-----CTTA-AA----CAGA------------G----A------AAT-T--TA--CCG-G-GTT--AACCGT--A---TTTTTCG-GTTAA-C-GTCGAC-AGC
gi|9 : tttggcatactttaTAAACTC--GT-GCT-T-G-ATTTGCTTGA--TTATT--T--GC-AGAT-TG-TG---ATAG--CTTTA--------AAATCT--TT-GA---------------------C-----TTC-----CACTTTCTT-A--TA----AAA--TT---------------C-C--T--A-T-C--CT-GC-A-TC-CATA-TCC----A-----T-GC-AA-TATT-TC-C----A------GCAT-G---T-G-T--TAC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------ATCTATAC---------------C------------AAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-G-------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-C-AA-CAC-A-A-TTC-ATAC--GCGG-T-G-A-GC---AA---CAAGA-AAA-AG---G-A-GT-TTAAAAA--GTAAACGAAAA-ATC-GAAACCGAAA--TCCA-G-------AAA--TG----GA-----A----AC-----T--G-AATTGACCGAA---T-------G----A--G---AAT-T--TA--CCACG-GTT--AACTG---A---TTTTTCG-GTTAATC-GT-TAC-AGC
blockSeqs : CG C C C G TTTGCTTG AT C AT TC C . . GCA AA AACCG . TT CTTTCACTGNNNNNNNNNNGA TCCAG AGTCC A AT ATATA ATT TATAT AC . TAT C T TT . . G TC G AATTAT T . G AT G T AACACGT T . T A GA A CC A GT TCAG C AGTTG GTTTTTAATTAATTTAC CTACCT TTAATTAATTTACCTTTACC . G T AATA AG CT . TC AT . T . . A C AT . TA . T C T A G G . . GTT T G GG CCG T G AGT A C G CA GA T G A AT C TATTTAC T AACA AACCG ACCG CGAAT TT C TTGA AAC GCTGAACG TT TTC A TC CC C AA AAA TTT GT G A A
blockSeqs : CG . C T . G . T . T . . . GCA AA G . TT ACCCCC . . . . A A GTTA . . CTC . . . . . . C . TGTAA . . . . . . AACACGT T . . G . A . . C . . . . . TACCTACTGCTTTATTACC . G . . . AA . . . . . . . . . . . . . . G T . G . . . GG . A . . T . . A . C CA . . . . . . . . C . . . . . CC T TGAATG T . . . . T AA T . A . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . T A . . CA . . . . . A A GTAT . . T . . . . . . C . TGTAA . . . . . . TCA . . . . . G . . . . . . . . TACCTACATGTATACC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . G . . . . . . . TGAATG G . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . CA . . . . . C A ATA . . T . . . . . . C . A . . . . . . TT . . . . . A . . . . . . . . TACCAACAGGTATACC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . GAACT . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . A A ATA . . G . . . . . . C . A . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . ACCCTACATGTATACC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAACT . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A A ATA . . A . . . . . . C . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TACGCTACAATGTATC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A T GTA . . A . . . . . . C . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TACCTACATATATACT . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A A GTT . . T . . . . . . C . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TCCTACACGTATACC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A T ATA . . T . . . . . . C . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TCCTACACGTATACC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T A GTA . . T . . . . . . A . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TACCTATAGATACT . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A G GTA . . A . . . . . . C . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . ACTACAGTATACC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A A GTA . . T . . . . . . T . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . ACCTACATGTATC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A A ATC . . A . . . . . . C . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TACCTTTCTC . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A A GTA . . T . . . . . . C . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TACTATTACC . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A A GT . . T . . . . . . C . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TATCTATACC . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A A TA . . T . . . . . . C . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TACC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . G . . T . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TACC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TACC . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TACC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TATC . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TACC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TACC . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TATC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TACC . . .
blockSeqCons : ** ** A**** GTA***** A********* A********** *** ** **** A** ** ****** ** ** ** G*********** G*
originalCons : NNNTAAACTC--GC-GCT-T-G-A--------A--T-ATT--T--GC-AGAT-TG-CG---ATAG--CTTTA-----TTAAAATCT--TT-GA---------------------C-----TTC-----CACTTTCTT-A--TA----AAA--TT-G--T-A-AAATT--C-C--T--A-T-C--CT-GC-A-TC-CATA-TCC----A-----T-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAA---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AA----CCGAA---C-------G----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTCG-GTTAACC-GT-GAC-AGCC
finalCons : NNNTAAACTC--GC-GCT-T-G-A--------A--T-ATT--T--GC-AGAT-TG-CG---ATAG--CTTTA-----TTAAAATCT--TT-GA---------------------C-----TTC-----CACTTTCTT-A--TA----AAA--TTGTA-----AAATT--C-C--T--A-T-C--CT-GC-A-TC-CATA-TCCA---------T-GC-AA-T--T-TC-TA----------GCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGAA--T-T--CCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAA---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AA----CCGAA---CG-----------A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTCG-GTTAACC-GT-GAC-AGCC
28 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|3 ): TTGTCAGGTTCGACATTGTTGGTTCGGCTTCAAGTGGAAATGAACCCTCGGTTTTCGGTTTCTGTTTTTGTGGTAATAAGTAAATAATTTCAATGTCCAGGTATCTTGAAGGACCCTTATAAATAAACATGGGTGTACAAAGGCACGACAGTGTCACCAATTTATTTCTACTTCTAATTCATTCGCAATTAACTACTGTATATTCATGCAAGGATGCATTATGTAAATCAACAATCAAAAAAAGCTTTAAAAGCAGTCTTAATAGACTATAAGGGCTCTGGTTGAGGTACTGAAATTTTTAATACTATACGCGAGTTGCGGTCGTAGTTAGGAGGTTTTCTTAAACTTGCCAACAGCTGTCGTGATATGTGACCTCGATTTTAGGTCACTAGGCTAATGATGCTGCGGCTCTCCGATCTGAAATGCGCGAGCGTTTGGAAAGAAGTCATGTGGTTCAAGTTTAGTGGGACTAGAACACATGTTACCTTCCCGCCAGTTCAGTCACGGGAGAGCGACATTCAACCACTGAGGGCTACCAGC
Unaligned ( gi|14 ): TGTCACGCGTTTCAGACATTTTTCGGTTTCGGTTTCAGGAAACTGAACCTCAGGGTTTTTCGGTTTTTCGGTATCGGTTTTTATTTTGTGTAAATTAGATAAAAGATTAATTTCGGATTGAACCCAGGTATTCTTGAGGACCCTATAAGTAAATGGGTGTTAACAAAAGTGCACACAGTCACCAAAGTTTATTAATACATTCTATCACAATATAACATAGTATATTCATGCAACGGATGGACATTATGTACAATAAAACAATCAAAAAAAGCTTTAAAAAGCAGTTCTTAAATAGACTAT
Unaligned ( gi|17 ): GGCTGTCATAATTCAGACATTTTACGGTTGGTTCAGATCGGTTCAAGGAACTAAACTTCGATTTTCCTTTGTTTTGGTTTGGTTTTATTTTGTGTAATAAATTACAATAATTTCATGAATCCAAGTATCTTGAGGATCCTGGAATATAAATGCAAACACCAAAGTTTAATAAATTTTATTCAACAATATAAGTAATATTCATGCAAAATGACATTTATATGTACAAAATACTACAATACAACAAGCAACAAAAGCTTTAAAAAGCAGTCTTAACCGACTAT
Unaligned ( gi|19 ): GGGCTTCATAATTCAGGACATTTTACGGTTGGTTCAGATCGGTTCAAGGAACTAAACTTCGATTTTCCTTTGTTTTGGTTTGGTTTTATTTTGTGTAATAAATTACAATAATTTCATGAATCCAAGTATCTTGAGGATCCTGGAATATAAATGCAAACACCAAAGTTAATAAATTTTATTCAACAATATAAGTAATATTCATGCAAAATGACATTTATATGTACAAATACTACAATACAACAAGCAACAAAAGCTTTAAAAAGCAGTCTTAACCGACTA
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gi|35 : AT--AAATATC-GAA-CC--AA--TC-A-G-------AACG-CG----TG-----T----AG-----C--G-AA----CCGAA---C-------G----A--G---AAT-T--TC--CCGCG-GTT--AACTG---A---TTTTTCG-GTTAACC-GT-GAC-AGCCttcccgcggttaactgatttttcggttaaccgtgacagcc
gi|37 : attaaaatctttgacttccactttcttttaaatttgtaaaattcctatgctgcatcaatatccatgcaatttctagcacgtgtcgccatgtgttgttttaccaacaggtataccgatgttatatggaattccattggttggaatatcattgatA-T--T-TC-T----A------GCACTG---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-------G-----------------TT------T------------TCCTACACGTAT-----A------C---------------C------------GAT-GGTTAT-A----T--G-A-C-T-T--CTAT---GGT--T-G--------AT--A-TCAT-GGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-CTC-AGA-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAG---AAAAATCAA-TG---T-A-CT-TTAAAAACAGTAAAC--AAA-AC--GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----A------T--G-AA----CCGAA---C-------GAACTA--G---AA-----TA--CCGC--GTTAAAACCG---A---TTT
gi|38 : A-T--T-TC-T----A------GCACTG---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-------G-----------------TT------T------------TCCTACACGTAT-----A------C---------------C------------GAT-GGTTAT-A----T--G-A-C-T-T--CTAT---GGT--T-G--------AT--A-TCAT-GGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-CTC-AGA-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAG---AAAAATCAA-TG---T-A-CT-TTAAAAACAGTAAAC--AAA-AC--GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----A------T--G-AA----CCGAA---C-------GAACTA--G---AA-----TA--CCGC--GTTAAAACCG---A---TTTa
gi|39 : TAAACTC--GC-GGT-T-G-A--------A--T-ATT--T--GC-AGAT-TG-TG---ATAG--CTTTA-----TTATAATCT--TT-GA---------------------C-----TTC-----CACTTTTTT-A-------------------T-A-AAATT--C-C--A--A-T-C--CT-GC-A-TC-CATA-TCC----A-----T-GC-AA-T--T-TC-T----AACACGTGCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------T---------------C------------GAT-G-TTAT-a
gi|4 : attacataactAACTC--GCCGCT-T-G-A--------A--T-ATTATT--GC-AGAT-TG-CG---ATAAA-CTTTA-----TTAAAATCT--TTTGA---------------------C-----TTC-----CACTT-CTT-A--TT----AAA--TTTA--T-ATAAATC--C-C--T--A-T-C---T-GC-A-TTTCATA-TCC----A-----T-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-G---T-GAT--CGC-CCCA-TG--TT----T-------G-----------------TT------TACCCTACATGTAT----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTATTA----TAGGGA-C-T-T--CTAT--TGGT--T-GG------AAT--A--AAT-TGGATT-ATAA-T--A--T-CGAG-A-C-A-A-TCA-GAAC--GCT--TTGTAAGC--GAA---AAAGA-AAGGTG---T-A-GT-T-AAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAAATTCCG-G-------AAAA-TGG---CA-----A----AC-----C--G-AA----CCGAA---CGCTGAACG----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTCGTGTTAACCGGTAGAC-AGnnnnnnnnnnnnnacataacttaaactcgcggttgaata
gi|40 : tgttgcataaactat-A----T--GGG-A-T-T--CCAT--TGGC--T-AG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CAAA-C-C-A-A-TGA-TAGC--ACG--T-GTA-GC--GAA---CAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAG--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AG----TCGAA---CTGAAT--G----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTTG-GTTAATC-GT-AAC-AGCC
gi|42 : ATCT--TTTGA---------------------C-----TTC-----CACTTTCTT-A--TATATAAAG--TT-G--T-A-AAATT--C-C--A--A-T-C--CT-GC-A-TC-TATA-TCC----A-----T-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-G---T-G-T--CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--TCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TAA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTG-GC--GAA---AAAGc
gi|43 : -GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-A---T-GGT--CGCAC--AATG--TT----T-T-----G-----------------TT------TACTACAGTA---T----------------A------C---------------C------------GAT-G-TTAT-A----T--G-A-C-T-T--CTAT--TGGT----GG------AAT----TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--TTCGAA-C-C-A-A-TCA-GAAC--GCG--T-GTA-GC--GAA---AAAGA-AAA-TG---TAA-GT-TTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAA----------------AGAA-TG----CA-----A----A
gi|44 : TAAACTTCGGC-GCTCT-G-A--------A--T-ATT--T--GC-A-AT-TG-TGGCAATAAAACTTTA-----TTAAAA-CT--TT-GA---------------------C-----TTC-----AACTTTCTT-A--T-----GAA--TT-G------AAATC--C-C--T--A-T-T--CT--C-A-CC----A-TCC----A-----T--C-AA-T--T-TC-C----A------aac
gi|45 : ctgtgcatacTAAACTTCGGC-GCTCT-G-A--------A--T-ATT--T--GC-A-AT-TG-TGGCAATAAAACTTTA-----TTAAAA-CT--TT-GA---------------------C-----TTC-----AACTTTCTT-A--T-----GAA--TT-G------AAATC--C-C--T--A-T-T--CT--C-A-CC----A-TCC----A-----T--C-AA-T--T-TC-C----A------
gi|46 : ctgtgcatacC-G---T-A-T--TGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------CTATTAC---------C------------AAT-G-TTGC-A----T--GGA-A-T-T--CCATATTGGT--T-AG------AAT--A-TCAT-TAA--C-AAACAT--A--T-CGAA-G-C-A-A-TGA-TAGC--TCA--T-GTA-AC--------AAACA-AAA-TG---
gi|47 : tc-GT-TTAAAAG--TTAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCGCG-------AAAA-TG----CAAACCGA----AC-----C--G-AA----CCGAA---C-------G----A--G---AA--C--TA---CGCG-GTT--AACCG---A---TTTTTCG-G-TAACC--T-GAC-GGCCgggt
gi|48 : T-CTAAAAA--ATGAAC--AAA-ACC-GAA-CTGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--A-AA----CCGAA---C-------A----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCT---A---TTTTTCA-GTTAACC-GT-GAC-AGCCc
gi|5 : TAAACTC--GC-GCT-T-G-AG-------A--T-ATT--T--GC-AGAT-GG-CG----TAA--CGTTA-----TTAAAATCT--TT-GA---------------------------TTC-----CACTTTCTT-A--TA----AA---TT-A--T-C-A--TT--C-C--CTCACT-T--CT-GC-A-TC-CATA-CCC----A-----T-GC-A--T--T-TC-T----A------GCAA-A---TTG-T--CGC-C--A-TGGTTT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------CGCTACAATGTAT---C------------GAT-G-TTA--A----T--GGA-C-T-T--CTAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T--TACAT--A--T-TGAACC-C-A-A-CCA-GAAC--GT---T-GTA-GCGGGAA---AAAG--AAG-TG---TAA-G---TAAAAA--GTAACC--AAG-A--------CGAAA--TCCG-G--------AAA-TGC---CA-----AACCGAC-----C--G-AA----CCGAA---C-------T----A--G---AAT-TTCTACCCCGCGTGTT---ACCG---ATTTTTTTTCG-GTTAACC-GT-GAC-AGCCc
gi|50 : ttcataaactAAA--AAA-ATT-GAA-TCAAAA--TCCA-GTATTTACAAAC-TGAACACA-----A----AC-----T--G-AA----CTGAA---T-------G----T--G---TAT-T--TA--CCGTG-GTT--AGCTG---A---CTTTTAC-GTGCACC-AT-AAC-c
gi|52 : TAAACTC--G----------A--------A--T-AAT--TA-GC-AGAT-TG-TG---ATCG--CATTG-----TTAAAAACT--TCAGA---------------------C-----TCC-----CCTTTTCTA-A--CA----A
gi|53 : tactgcatactTAAACTC--G----------A--------A--T-AAT--TA-GC-AGAT-TG-TG---ATCG--CATTG-----TTAAAAACT--TCAGA---------------------C-----TCC-----CCTTTTCTc
gi|6 : ctactgcatactTAAACTC--GC-GCT-T-G-A--------A--T-ATT--T--GC-AGAT-TG-CG---ATAG--CTTTA-----TTAAAATCT--CT-GA---------------------C-----TTC-----CAATTTCTT-A--TA----AAA--TT-G--T-A-AAATC--C-C--T--A-T-C--CT-GC-G-TC-CATA-TCCTGTAA-----T-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCA-------------CGC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------CTACATATATACTGAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--GCAT--TGGT--T-GG------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-CGAA-C-C-A-A-TCA-AAAC--GCT--T-GTA-GC--GGA---AAAGA-AAA-TG---T-A-GT-TTAAAAGT-ATAAAC--AAA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAA-TG----CA-----A----AC-----C--G-AA----CCAAA---C-------G----A--G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT--AACCA---A---TTTTTCG-GTTAACC-AT-GAC-AGCCaac
gi|7 : tattgtatactTAAGCTC--GC-GCT-T-GGA--------A--T-ATT--T--GC-AGAT--G-CG---ATAG--CTTTA-----TTAAAATCT--T--GA---------------------C-----TTC------A-TTTCTT-A--TA----AA---TT-G--TTA-AAAAT--C-C--T--A-TTC--CT-GC-G-TC--ATAGTCCTGTAA-----T-GC-AA-T--T-TC-T----A------GCAC-G------------C-C--A-TG--TG----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------A------C---------------CTATAGATACT--GAT-G-TTAT-A----T--GGA-AAT-T--GCAT--TGGT--T-G-------AAT--A-TCAT-TTA--T-ATAAATTAA--T-CGAAGC-C-A-AGTCA-AAAC--GCT--T-GTA-GC--GAA---AAGAA-AAA-T----T-A-GT-TTAAAA-----AAAC---AA-ACC-GAA-CCGAAA--TCCG-G-------AAAATTG----CA-----A----AC-----C--GCAACC--CCAAAT--C-------G----AG-G---AAT-T--TA--CCGCG-GTT---ACCA---A---CTTTTTC-GTTAACC-AT-GACAAGCC
gi|8 : ttgtatactAAACTC--G--GTT-T-G-A--------AATT-ATC--T--GC-AGAT-TG-CG---ATA----TTTA-----TTAAA-TCT--T--GA---------------------C-----TTC----------TCTT-AATTA----TAA--TT-G--T-ATAAAAT--C-C--T--A-T-T--C--GC-A-TC-C-CA-TCG----A-----TTGC-AAGT--TGTC-T-----------GCAG-G---T-G-T--CGGAC--A-TGC-TT----T-T-----G-----------------TT------TACCTACATG---T----------------A------T---------------C------------GAT-G-TTAT------T--GAA-C-T-T--CTAT--TGGT--TTGG------AAT--AATCAT-TGA--T-ATAAAT--A----GGAA-G-A-C-A-TAA-GAA---GCT--T-GTA-GC--GAA---AAGAA-GAG-TG---T-ACGTCTTAAAAA--GTAAAC--AAA-ACCGGAA-CCGAAA--TC---G-------GAAA-TG----CA-----A----AC-----CTTA-AA----CAGA------------G----A------AAT-T--TA--CCG-G-GTT--AACCGT--A---TTTTTCG-GTTAA-C-GTCGAC-AGC
gi|9 : tttggcatactttaTAAACTC--GT-GCT-T-G-ATTTGCTTGA--TTATT--T--GC-AGAT-TG-TG---ATAG--CTTTA--------AAATCT--TT-GA---------------------C-----TTC-----CACTTTCTT-A--TA----AAA--TT---------------C-C--T--A-T-C--CT-GC-A-TC-CATA-TCC----A-----T-GC-AA-TATT-TC-C----A------GCAT-G---T-G-T--TAC-C--A-TG--TT----T-T-----G-----------------TT------T------------T----------------ATCTATAC---------------C------------AAT-G-TTAT-A----T--GGA-A-T-T--CCAT--TGGT--T-G-------AAT--A-TCAT-TGA--T-ATAAAT--A--T-C-AA-CAC-A-A-TTC-ATAC--GCGG-T-G-A-GC---AA---CAAGA-AAA-AG---G-A-GT-TTAAAAA--GTAAACGAAAA-ATC-GAAACCGAAA--TCCA-G-------AAA--TG----GA-----A----AC-----T--G-AATTGACCGAA---T-------G----A--G---AAT-T--TA--CCACG-GTT--AACTG---A---TTTTTCG-GTTAATC-GT-TAC-AGC
28 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|3 ): TTGTCAGGTTCGACATTGTTGGTTCGGCTTCAAGTGGAAATGAACCCTCGGTTTTCGGTTTCTGTTTTTGTGGTAATAAGTAAATAATTTCAATGTCCAGGTATCTTGAAGGACCCTTATAAATAAACATGGGTGTACAAAGGCACGACAGTGTCACCAATTTATTTCTACTTCTAATTCATTCGCAATTAACTACTGTATATTCATGCAAGGATGCATTATGTAAATCAACAATCAAAAAAAGCTTTAAAAGCAGTCTTAATAGACTATAAGGGCTCTGGTTGAGGTACTGAAATTTTTAATACTATACGCGAGTTGCGGTCGTAGTTAGGAGGTTTTCTTAAACTTGCCAACAGCTGTCGTGATATGTGACCTCGATTTTAGGTCACTAGGCTAATGATGCTGCGGCTCTCCGATCTGAAATGCGCGAGCGTTTGGAAAGAAGTCATGTGGTTCAAGTTTAGTGGGACTAGAACACATGTTACCTTCCCGCCAGTTCAGTCACGGGAGAGCGACATTCAACCACTGAGGGCTACCAGC
Unaligned ( gi|14 ): TGTCACGCGTTTCAGACATTTTTCGGTTTCGGTTTCAGGAAACTGAACCTCAGGGTTTTTCGGTTTTTCGGTATCGGTTTTTATTTTGTGTAAATTAGATAAAAGATTAATTTCGGATTGAACCCAGGTATTCTTGAGGACCCTATAAGTAAATGGGTGTTAACAAAAGTGCACACAGTCACCAAAGTTTATTAATACATTCTATCACAATATAACATAGTATATTCATGCAACGGATGGACATTATGTACAATAAAACAATCAAAAAAAGCTTTAAAAAGCAGTTCTTAAATAGACTAT
Unaligned ( gi|17 ): GGCTGTCATAATTCAGACATTTTACGGTTGGTTCAGATCGGTTCAAGGAACTAAACTTCGATTTTCCTTTGTTTTGGTTTGGTTTTATTTTGTGTAATAAATTACAATAATTTCATGAATCCAAGTATCTTGAGGATCCTGGAATATAAATGCAAACACCAAAGTTTAATAAATTTTATTCAACAATATAAGTAATATTCATGCAAAATGACATTTATATGTACAAAATACTACAATACAACAAGCAACAAAAGCTTTAAAAAGCAGTCTTAACCGACTAT
Unaligned ( gi|19 ): GGGCTTCATAATTCAGGACATTTTACGGTTGGTTCAGATCGGTTCAAGGAACTAAACTTCGATTTTCCTTTGTTTTGGTTTGGTTTTATTTTGTGTAATAAATTACAATAATTTCATGAATCCAAGTATCTTGAGGATCCTGGAATATAAATGCAAACACCAAAGTTAATAAATTTTATTCAACAATATAAGTAATATTCATGCAAAATGACATTTATATGTACAAATACTACAATACAACAAGCAACAAAAGCTTTAAAAAGCAGTCTTAACCGACTA
Unaligned ( gi|21 ): GGCTGTCACGGTTCAGACATTTTTCGGTTCGGTTCAGGAAACTAAACCTCGGTTTTTTCGGTTCGGTTTTAATATGTGTAATAAATGAAATTAATTTCATGAATCCAGGTATCTTGAGGACCTTGGAAGTAAAATGGGTGTACAAATGTACACATCAAAGTTTAATAACTTCTATTCAGCAATATAACATATGTAATATTCATACAAGGATTACATTATGTACAATACAACAGCCAACAAAATTAAGCTTTAAAAAGCAATCTTAACCGACT
Unaligned ( gi|22 ): GCTGTCACGGTTCAGACATTTTTCGGTTCGGTTCGGTTCAGGAAAATGATTCTCGGTTTTCGGTTTGGTTTTATTTTGTGTCATAAATAAAATTAATTTCATGAATCCAGGTATCTTGAGGACCCTGGAAGTAAAATGGGTGTACAAATGCACACATTAAAGTATAATAAATTATATTCAGCAATATAACATATGTAATATTCATGCAAGGATGACATTACGTACAATACAACAGTCAACAAAAGCTTTAAAAAGCGGTCTTAATCAACTA
Unaligned ( gi|23 ): GCTGTCACGGTTCAGACAGTTCGGGTTCGGTTCAGGAACTGAACCTCGGTTCGGTTTTTCTCGGTTGGTTTTAATTTGTGTAATAATAAATTAATTTCATGAATCCCAGGTATCTTGAGGACCTATAAGTAGGTGGTATCAAAGGCACACAGTCACCAATTTTTAATACCTTTTATCAGCATAAAACATATGTAATATTCCATGGCAAGAATGACAATGTTGTCAATACAACAACAAAACAAAGCTTTAAAAAGCAGTCTAA
Unaligned ( gi|24 ): TGTCACGGTCAGACATTTTCGGTTCGGTGCGGGTTTAGGAAACTGAACCTCGTTTTCGGTTTTTTCGGTTCGGTTTATTTGTGTTAATAAATAAAATTAATTTCATGAATCCTGGAAAGTAAAATGGGTGTACAAATGCACACATCAAAGTTAATAAATTCTATTCAGCAATATAACATATGTAATATTCATGCAAGATGACATTATGTACAATACAACAATCAACAAAAGCTTTAAAACGCAGTCTTAATCGACTATAT
Unaligned ( gi|26 ): TCAGGGAACTGAACCTCAGTTTTCATTTTTTTCGGTTCGGTTTTATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGGAAGTAATGCACACATTGAAGTATAATAAATTCTATTCAGCAATATAACATATGTAATATTCATGCAAGGATGACATTATGTACAATTCAACAGTCAACAAAAGCTTTAAAAAGCAGTCTTAACCGACTAC
Unaligned ( gi|27 ): GGCTGTCACGGTTCAGACATTTTTCGGTTCGGTTCAGGAAATTGAACCTCGGTTTTAGGTTTTATTTTGTATAATAAATAAAATTAATTTCATGAATCCAGGTATCTTGAGGACCCTGGAAGTAAATGGGTGAACAAATTCACACATTAAAGTACAATACATTTTATTCAGCAATATAACACATGTAATATTCATGCAAAGATGACATTATGTACAATACAACTGTCAACAATTTTAAGCTTTAAAACGCAGTCT
Unaligned ( gi|28 ): TTGTCACCGTTTCAGACATGTCGGACTCGTCGGTCAGGAAACTGAACCTCGGTTTTCGATTTCGTTATTTTGTGTAATAACTAAAATTAATTCATGAGATCCAATGTAGTCTTGAGACCTGGAAGTAAAATGGTGTACAAGGCACACATCAACAGTTTAATAAATTCTATCAGCATAACAATTAATATCATGCAAGGATGACTTTATGTACAAACAAACAATCAAACAAGCTTAAAAAGTAGTTTAATGAGAT
Unaligned ( gi|29 ): TTGTCACCGTTTCAGACATGTCGGACTCGTCGGTCAGGAAACTGAACCTCGGTTTTCGATTTCGTTATTTTGTGTAATAACTAAAATTAATTCATGAGATCCAATGTAGTCTTGAGACCTGGAAGTAAAATGGTGTACAAGGCACACATCAACAGTTTAATAAATTCTATCAGCATAACAATTAATATCATGCAAGGATGACTTTATGTACAAACAAACAATCAAACAAGCTTAAAAAGTAGTTTAATGAGAT
Unaligned ( gi|30 ): TTCGGTCGCGTTCAGGAAACTGAACCTCGATTTTCATTTTTTTCGGTTTCAGGTTTTTTCTTGATATGTAATAAATAAAATTAATCCATGAATGTCAGGTATCTTGAGGACCTGGAAGTAAAATGGGTGTACAAATGCACATCACACAAAGTTTAATAAATTGATTCAGCAATGTATAACGATGTAATATTTCATGAAGGATGACATTATGTTACAATTATCAACAATCAACAAAAAGCTAAATCAGTCTTA
Unaligned ( gi|32 ): GGCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGTTATGTTGTGCTCAAGTGAGTGGGACTGAACAATGTAACTCTTCCGGTCTACGGAAGCGAACATCAAGCACTGAGCTCCGG
Unaligned ( gi|33 ): GGCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGTTATGTTGTGCTCAAGTGAGTGGGACTGAACAATGTAACTCTTCCGGTCTACGGAAGCGAACATCAAGCACTGAGCTCCGG
Unaligned ( gi|34 ): GCTGTCACGGTTCAGACATTTTTCGGTTCGGTTCAGGAAACTGAACCTCGGTTTTCGGTTTTTTCGGTTCGGTTTTATTTTGTGTAATAAATAAAATTAATTTCATGAATCCAGGTATCTTGAGGACCATGGAAGTAAAATGGGTGTTCAGAGGCAAACATCAAAGTTTCATCAATTTTATTCAGCAATATAACATATGTAATATTCATGCAAGGATGACATTATGTACAATACAACAATCAACAAAAGC
Unaligned ( gi|36 ): GTTTTTTATATGTTTTTATTTTTAGTGTATTAAATAAAATGAATTTCATGAATCAAGGTATCTTGAGGACCCTAGAAGTAAAATGGGTGTTCTTGAAAATGCACACATCAAAGTTTAATCAATTCTATTCAGCAATATAACACATGCAATATTCATGCAAGGATGACATTATCTACAATACAACAATTAACAAAAGCTTTAAAAAGCAGTAAGTAATCGACTATA
Unaligned ( gi|41 ): GCTTGTCACGGTTCAGACTTTTTTCGGTTCGTTCAGGAAACTGAACTCGGTTTTCGGTTCGGTTTTATTTGGGTAATAAATTTTCATGAATCCAGGTAGTCTTGAGGACCATGGAAGTAAAATGGGTGTACAAAGGCACACATCAAAGTTTTAATAATTCTTATTCAGCAATATTACATA
Unaligned ( gi|49 ): AGGACTCATGGTTCAGCCATTTTTCTGTTCGATTCAGGAAACAAAACCTCGGGTTTCCGGTTTCATTTTGATTAATAAAATAAAATAGCGTAATGAG
Unaligned ( gi|51 ): CTCTGGGGTTAGGTACTAAAAATTTAGGACCTATACATAGCGCTTACGGTTTCTTAAATTTGGCAACGCCTGTCTTGATATGTGACCTCC
Unaligned ( gi|54 ): AATTTAATTTAATACAATATAAATATTTAATCACAATAATTGTAAAAATATCATTAAGAAGTATGAC
Unaligned ( gi|55 ): AGGTAAGATACGGCCAACGTAATTCTATATAAGACGCTTAAGGT
Unaligned ( gi|56 ): TTCGGTACAAGAAGATAGCTTTCTTCCACGGAGCTACCGCAATC
Unaligned ( gi|57 ): CTGAAAATTTAGACCTATACATGACGGAGGTTGTGTGTTTCTT
Unaligned ( gi|58 ): TTTCGGTACAAGAAGATAGCTTTCTTCCACGGAGCTACCGCA
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