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Reference ( gi|5 )            :                                                                                                                                                               AGTGTTTGAAA-CTC-AC-TGT-AAA--ATTA--GCTGGACA-GT-CAGGGCT-----A------AC-TAC-TTG-TAAAA-----AT----------ATT-GTTAGTCCTGC-CAGAGAGCC-AC--TAGC-CCTG------CAACA-T---A-TTTTG---------TT--GG--TAT-----ACTG--------------A-----TGA-TCTT---------A-T-C----------AAA-C-GATAA-T-AGGA-TTAAAA---CGTAACCCACAACTTAG-A-TCCC-AA-TC-A---T-AAAAT--TGTC-GA------------C-G-T--TA--TTGC-----AACTTCA-----ATT-----CC-----------AG----T---TT-A-----AT-ACATCTGA-GTTTCTCTCAGCGG-AAA------TTTTAA-CACG-TCCGG-TCGG-GCGTC-TGC-GCAA-AGAAAT-TTG-TTCACCCGCGG-CAGAA-TTTAT-GC-GTCTCGGG-CGTTCGG-GCTTAC--GGTTAT-TTCAAACACT
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gi|1                          :                                                                                                                                                                 TGTTTTGAA-CTC-GC-TAT-AAG--ATTA--GCTGGAAC-G--CAGGGCT-----A------GT-TA--TTA-TAAAA-----AT------------T-GTTAGCCCTGC--AAAGAGCC-AC--TAGCACCTG------ATACT-T---T-TTTTT---------TT--AAAATATGTA--ACTG--------------------CAA-TTTTTTTTTGTATA-T-CCAATTCT---AAG-C-CATAA-T-TCGA-C-AAAC---CTTTATTCACAAATC-G-A-TCCCTAC-TC-A---T-AAAAAAATGTT-GA------------T---T--TA--T-GC-----AGCTTCATTACCATT-----ACGATAAGT----AGA---T---TT-A-----AT-GCATCTAA-ATTTTTCTCCGCG--AAA------TTTTAA-CACAATCCGG-TCGGCGCGTC-TGCTGCAA-A--AAT-GTGGTTCACCCGTGG-CAGAA-TTTAT-GCAATCTCGGG-CG-TCGG-GCGTAC--GGTTATGTTCAAACACT
gi|15                         :                                                                                                                                                                  GTTTGAAATCCC-AT-TTT-A-----TTAT-GCTAGACATGT--AGGGCT-----G------GC-TGC-TTGGCAAAA-----AA----------CCT-GTAAGCCTTGC-CAAAGACTCTCC--TAGC-CCTG------
gi|2                          :                                                                                                                                                                   TTTGAAA-CTC-GC-TAT-AAA--ATTA--GCTGGACA-CG-CAGGGCT-----A------GT-TAC-TTA-TAAAA-----------------ATT-GTTAGCCCTGC-CATAGACCC-AC--TAGC-CCTG-------AACG-T---T-TTTTT---------TTAAAA--TATGTA--ACTGCAATTTTTTTTTGTA-----T-A-TCCA---------ATT-C----------AAG-C-CATAA-T-TCGA-C--AAA---CTTTATTCACAACTTCG-A-TCCC-AA-TC-A---T-AAAAA--TGTT-GA------------T-G-T--TA--TTGC-----AGCTTCATTACCATT-----ACGATA-------AGTAGAT---TT-A-----AT-GCATCTAA-ATTTTTCTCCGCGG-AAA------TTTTAA-CACA-TCCGG-TCGG-GCGTC-TGT-GCAA-AAAAAT-GTG-TTCACCCGTGGCCAGAaggaaatcacgtgcaattttgaaaatcacctttatattactactaataccgatctttaataagtgattaattttcggctatggaactacattttcatagtttttatccaaacgaagaaaaacaaagaagcacgcttggcttgttacaactttgttactggaatgat
gi|14                         :                                                                                                                                                                   TTTGAAAACTC-GC-TGT-AAAGAATTA--GCTGGACA-TG-CAGGGCT-----C------AC-TAC-TTG-TAAA-------T-----------TT-GTTA-CCCTGCACAGA----C-ACC-TAGC-CCTG------CAATA-T---A-TTTTG---------TT--GG--TAT-----GCTA--------------T-----TAA-TCTT---------A-T-CTTATTCTTGAAAG-T-GATAA-T-ATGATTTAAAA---CATAATTCACATCTTTGAA-TCCC-AA-TCAA---T-AAAA---TGTC-GA------------C-G--------TTGC-----AACTTCA-----ATA-----CC-----------GA----T---TT-A-----AT-TCA---------TCTCTCAGCG---AA------TTTTAA-CCCG-TCCGG-TCGG-GCGTcacaggtcctacattacaatctgggtcagacacatgtctacattc
gi|19                         :                                                                                                                                                                        tt-CCC-GC-TAT-AAA--ATTA--GCTGGACATGT--AGGGCT-----A------AC-TACATTA-TAA-------------------ATT-GTGTGCCCTGC-CCGAGACTC-ACTATAGC-CATG------AATTATT---ATTTTTT---------TT--TT--TATAAATAACTGCAAATTTTGTTGT-A-----T-A-TCTA---------ATT-C----------AAG-C--ATAA-T-ATGA-CAAAAA---CTTAATTCACAACTTCA-ATTCTC-AA-TC-A---T-AAAAA--TGTC-GA------------T-G-T--CA--TTattt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                   GT-AAA--ATTA--TCTAAACA-CA-CAGG-CT-----G------TC-TGC-TTG-TAAAATTGGAATTCCCTGTAAAATT-GTCAGCCCTGC-CGAAGACCT-GC--TAGC-CCTGAGAAAGTAAC--TGCCA-TTTTGGAAACTACTTT--TA--T-T-----ACT-----------------------A-TCT----------A-T-C----------CAG-T-GAC---T-AGGA-CTCAA------T--TCCCTAATTTTG-A-TCCT-GA-AC-A---T-GAAAT--TGAC-AAAGTCTGTCCTTTC-GCT--TG--TTAC-----AACTTCA-----TGA-----CC-----------AG----T---AT-G-----AT-GCATCTAA-ATTTT------------A------TGTTAA-CATG-TCCAT-TTTA-GCAGC-TAC------ATGTAT-TTG-TTTACCCATGA-CA-AA-TTTATTGC-GTCTCTTG-CAGACAG-GC--ACTTGGCTAT-TTCAAACAC
gi|25                         :                                                                                                                                                                                               --GCTGGACA-TG-CAAGGCT-----ACATGTAAC-TAC-TGG-TAAAA------T-----------TT-GTTAACCCTGC-CAGAGAGCC-AC--TAGC-CC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                            -CAGGGCT-----A------AC-GAA-TTT-TACAA-----GT----------A---GTTGGCCCTGC-
gi|6                          :                                                                                                                                                                           tgtttgaaactcgctgtaaaatgagctggacat-CAGGGCT-----A------GC-AAC-TTT-TACAA-----GT----------A---GTTAGCCCTGC-ccagagagccactagccctgcaatatattttgttggtatactacattttcttatcttattcaagcgatatgattaaaacttaattcacatcttcgtcccaactcataaaaaatgtcgatttatgcaacttcattatcgattcatacatctaatcctctcagcgaaaattttaacccgtccgtcggcgtcttttgcaaagaa
gi|27                         :                                           gttgattatatatttttgagggtgtaattgtggttttaaaaacaaatataaaatgtcttgaaaataaagggcatagaaatattctacaaaaactgaaatatattgccatttcttatattactctatataattttcccctaaaattttaggctttatagcagtgtttgaaactcgctgtaaaattagctggacatAAA-----AT-----------TC-GTTAGTCCTGC-CAGAGAGCC-AC--TAGC-CCTG------AAAcagacccaatagctctgcttttttctttttataaataattgaaatttttttttcaaagtacattgcatttttatttcaaagcattcacgtcactgaaaagcttgacagt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gt---------TT--AG--TAT-----TATG--------------AAT---TGA-TTAT---------G-C-C----------AAAAC-GATAA-T-AG-A-TTAAAA---CTTA-TTCATATCTTCG-A-TCCC-AA-TC-A---T-AAAAAA-TGTC-GA------------TTG-T--TAGTTTGC-----AACTTCA-----ATA-----CG-----------AT----T---TT-ATTGAAAT-ACATCTAA-ATTTCTCTCAGCGGAAAA------TGTTAA-CCCG-TCCGG-TCGG-Gt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ctttccattttccgcttaaa-TCTT---------A-T-T----------TAA-TTGATAA-T-ATGA-CTAAAA---CTTGATTAACAACTTCG-A-TCCC-CA-TC-A---C-AAAAA--TGTA-GA------------T-G-T--TA--TATC-----AACTTCATTACCATT-----ACGATAACTATAAAG----TAGATTGA-----AT-ATATCTAA-TTTTTTCTCAGCGG-CAA------TTTTAG-CACG-TCCGG-TCGG-GCGTC-AGT-GCAA-GGAAAT-ATG-TTCGCCCGCTG-CAGAA-TCCAT-GC-GTCTCGGG-CGGTCGG-GCGTAC--GGTTAT-TTCAAACAgcatgtgttaatttatggcgtatcgcgcggttgattattcaaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --TA--CTGT-----AACTTCA-----ATT-----CC-----------AA----C---T--------AT-ATA----A-ACTTAT-------G-AAA------CTTTAG-CACA-TTCGG-TCAG-GAATT-TCC-ACAA-AGAGAT-T-A-TTCATCAATGC-CAAAA-TTTAT-CC-ATCTCAGat
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --TG--TTAC-----AATTTTA-----AG-------C-----------AGA---T---TT-G-----AT-ACATCTAT-ATCTTATTCAGTGC-AAACTTTAATTTTAA-CACG-TCTGG-atgggtacaagctaggttacccc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    C-----------AGA---T---TG-G-----AT-ACATCTAATATTTGT-TCAGTGG-AAA------TTCAAC-CACG-CCTGG-CCAG-GTATC------------------TG-TTCATCCGCAG-TAAAA-TTCAT-AT-GT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtgtttgaaattccattattagctagacatgtagggctggctgcttggaaaaaactgtaagccttgccaaagacctcctagccctgagaaaatcactgcaatttttgaaatcacctttatattaccactaataccgatcttctaattaaagtgattatttcgctatggaactacattttcatagttttgatcccaaacaaataaaacattataaagcaccttggcttgttacaactttgttactggaatgataag-----AT-ACATCTAAAGTTTGTTT---------A------TGT-AA-TAC---CCAG-TCAG-GTGTC-TAT-GCAA-CGAAAA-TTG-TTCACTCGTGA-CAAAA-TTTAT-GC-ATCT-GGG-C-----------AC--AGTTAT-TTTAAACt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cTCTCAGTGG-AAA------TTT-AA-CCTG-TCCAG-TCGG-GCGTC-TTT-GCAA-AGAAAT-GTG--TCGTCCGCGA-AGAAA-TTTAT-GC-GTCGC-GG-CGT-------ATAC--GGTTAT-TCAAAACACTt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GAA-TTTAT-GC-GTCTCGGA-CGGTCGG-GCGTAC--AGTTAT-TTTAAACACT
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-420 )      :                                                                                                                                             AGTGTTTGAAA-CTCGC-TGT-AAA--ATTA--GCTGGACAT-GC----AGGGCTA------ACTAC-TTG-T-AAAAT----------------AT-TGTTAGCCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---A--A-----T-----------T-----------A-TCTT---AT-----T-C----AAGCGATAA-T-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCG-A-TCCC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTC-GA------T-G--T---------TA--TTGC-----AACTT--C----A----AT-NCC--------------------GG-------------TTT------AAT-ACATCTAA-A-TTTCTCTCAGCGG-A------AA-TTTTAA-CC-CG-TCCGG-TCGG-GCGTC-T-TTGCAA-AGAAAT-GTG-TTCG----CCCGCGG-CAGAA-TTTAT-GC-GTCTCGGG-CGGTCGG-GCGTACGGTTAT-TTCAAACACT
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gi|12                         :                                                                                                                                              GTGTTTGAAA-CTCAC-TGT-AAA--ATTA--GCTAGACAT-GCTTATAAGAC--------A-TAC-TTA-T-AAAAT-----------------T-TGTTAGCCCTGC-CAGAGA--C--C-TA--GC-CCTG-------CAATAGT-A--TTT----T-----------------------------------A--A-----T-----------T---------------------T-----C-C------GCGATAA-T-ATGA-TTA--AAATAA-CTTAA--TTCAC--ATC-TCG-A-T-CC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTC-GA------T-G------------TA--TTGC-----ACTTC--C----A----TT-ATC--------------------GA-------------TTT------CATGACATC-AA-A-TTTCTCTCCGCGA-A------AT-TTTTAA-CC-CA-TCCAG-TCGG-GCGTC-T-TTGCCA-AGCAAT-GTG-TTCG----CCCGCGA-CAGAA-TTTAT-GC-GTCTCGGG-TGGT---------CGGTTAT-TTCAAACACT
gi|13                         :                                                                                                                                               TGTTTGAAA-CTCGC-TGT-AAA--ATGA--GCTGGACAT-GC----AGGGCCA------ACTAC-TTG-T-AAAAT-----------------T-CGTTAGCCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---AC-ATTTTCT-----------T-----------A-TCTT---AT-----T-C----AAGCG---A-T-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCG---TCCC-AACTC--A---TAAAAA-A--TGTC-GA------T----T---------TA---TGC-----AACTT--C----A----TT-ATC--------------------GA-------------TTC-------AT-ACATCTAA----TCCTCTCAGCGA-A------AA-TTTTAA-CC-CG-TCC-G-TC-G-GCGTCTT-TTGCAA-AGAA
gi|14                         :                                                                                                                                                 TTTGAAAACTCGC-TGT-AAAGAATTA--GCTGGACAT-GC----AGGGCTC------ACTAC-TTG-T-AAA-T-----------------T-TGTTA-CCCTGCACAGA----C-ACCTA--GC-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----G-----CT---ATTAATC--T-----------T-----------A-TCTT---AT-----T-CTTGAAAGTGATAA-T-ATGATTTA--A---AA-CATAA--TTCAC--ATCTTTGAA-TCCC-AA-TC--A---A-TAAA-A--TGTC-GA------C-G----------------TTGC-----AACTT--C----A----AT-ACC--------------------GA-------------TTT------AAT-TCA----------TCTCTCAGCG---------AA-TTTTAA-CC-CG-TCCGG-TCGG-GCGTA-T-TT
gi|15                         :                                                                                                                                              ttGTTTGAAATCCCAT-TTT-A-----TTAT-GCTAGACAT-GT----AGGGCTG------GCTGC-TTGGC-AAAAA----------------ACCTGTAAGCCTTGC-CAAAGACTCTCC-TA--GC-CCTG-------
gi|16                         :                                                                                                                                               TGTTTGAAA-CTCGC-TGT-AAA--ATTA--GCTGGACAT-GC----AGGGCTA------ACAAC-TTG-T-AAAAT-----------------T-CCTTAGCCCTGC-CAGAGAGCC-AC-AA--GC-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---A--A-----T-----------T-----------A-TCTT---ATCTTAAT-C----AAGGGATAA-T-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCG-A-TCTC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTC-GA------T-G--T---------TA--TTGC-----AATTT--C----A----AT-ACC--------------------GA-------------TTT------AAT-GCATCTAA-A-TTTCTCTCAGCGG-A------AA-TTTTAA-CC-aggaaatcacgtgcaattttgaaaatcacctttatattactactaataccgatctttaataagtgattaattttcggctatggaactacattttcatagtttttatccaaacgaagaaaaacaaagaagcacgcttggcttgttacaactttgttactggaatgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -TCTT---AT-----T-T----AATTGATAA-T-ATGA-CTA--A---AA-CTTGA--TTAAC--AACTTCG-A-TCCC-CA-TC--A---C-AAAA-A--TGTA-GA------T-G--T---------TA--TATC-----AACTT--C----A----TT-ACCATTACGATAACTATAAAGTAGA-------------TTG------AAT-ATATCTAA-T-TTTTTCTCAGCGG-C------AA-TTTTAG-CA-CG-TCCGG-TCGG-GCGTC-A-GTGCAA-GGAAAT-ATG-TTCG----CCCGCTG-CAGAA-TCCAT-GC-GTCTCGGG-CGGTCGG-GCGTACGGTTAT-TTCAAACAg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --------TT----AGTATT---A-----TG---A--A-----T-----------T-----------G--ATT---AT-----G-CCA--AAACGATAA-T-A-GA-TTA--A---AA-CTTA---TTCAT--ATCTTCG-A-TCCC-AA-TC--A---T-AAAA-AA-TGTC-GA------TTG--T---------TAGTTTGC-----AACTT--C----A----AT-AC---------------------GA-------------TTTTATTGAAAT-ACATCTAA-A-TTTCTCTCAGCGGAA------AA-TGTTAA-CC-CG-TCCGG-TCGG-G---------GC-------AT-GTG-TT-----------------AA-TTTATGGC-GTATCGCG-CGGTTGat
gi|19                         :                                                                                                                                    ctttccattttccgcttaaa-CCCGC-TAT-AAA--ATTA--GCTGGACAT-GT----AGGGCTA------ACTACATTA-T-AAA-------------------T-TGTGTGCCCTGC-CCGAGACTC-AC-TATAGC-CATG-------AATTA-TTA--TTTT---TT--------TT----TTTAT----AAATAACTGCAA--A-----T-----------TTTGTTGTAT--A-TCTA---AT-----T-C----AAGC-ATAA-T-ATGA-CAA--A---AA-CTTAA--TTCAC--AACTTCA-ATTCTC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTC-GA------T-G--T---------CA--TTattattcaaa
gi|2                          :                                                                                                                                                 TTTGAAA-CTCGC-TAT-AAA--ATTA--GCTGGACAC-GC----AGGGCTA------GTTAC-TTA-T-AAAA-----------------AT-TGTTAGCCCTGC-CATAGACCC-AC-TA--GC-CCTG--------AACG-T-T--TTT----TT--------TTAA--AATATGTA-A-----CTGC-A--A-----TTTTTTTTTGTAT-----------A-TCCA---AT-----T-C----AAGCCATAA-T-TCGA-C----A---AA-CTTTA--TTCAC--AACTTCG-A-TCCC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTT-GA------T-G--T---------TA--TTGC-----AGCTT--C----A----TT-ACCATTACGATAAGTA-------GA-------------TTT------AAT-GCATCTAA-A-TTTTTCTCCGCGG-A------AA-TTTTAA-CA-CA-TCCGG-TCGG-GCGTC-T-GTGCAA-AAAAAT-GTG-TTCA----CCCGTGGCCAGA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ---------TA--CTGT-----AACTT--C----A----AT-TCC--------------------AA-------------CT--------AT-A----TAA-A-CTTAT-------G-A------AA-CTTTAG-CA-CA-TTCGG-TCAG-GAATT-T-CCACAA-AGAGAT--TA-TTCA----TCAATGC-CAAAA-TTTAT-CC-ATCTCAGA-TGGcacaggtcctacattacaatctgggtcagacacatgtctacattc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AT-ACATCTAA-A-GTTTGTTTA----------------TGTAA-TA-C---CCAG-TCAG-GTGTC-T-ATGCAA-CGAAAA-TTG-TTCA----CTCGTGA-CAAAA-TTTAT-GC-ATCT-GGG-C-----------ACAGTTAT-TTTAAACgtacaagctaggttacccc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cTCTCAGTGG-A------AA-TTT-AA-CC-TG-TCCAG-TCGG-GCGTC-T-TTGCAA-AGAAAT-GTG--TCG----TCCGCGA-AGAAA-TTTAT-GC-GTC----G-CGGC----GTATACGGTTAT-TCAAAACACTt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GAA-TTTAT-GC-GTCTCGGA-CGGTCGG-GCGTACAGTTAT-TTTAAACACT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aagtagatataatccccccccccccc---------TG--TTAC-----AATTT--T----A----A--GCA--------------------GA-------------TTT------GAT-ACATCTAT-A-TCTTATTCAGTGC-AAACTTTAA-TTTTAA-CA-CG-TCTGG-gc
gi|25                         :                                                                                                                                                                            --GCTGGACAT-GC----AAGGCTACATGTAACTAC-TGG-T-AAAAT-----------------T-TGTTAACCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -TTTAT-GC-GTCTCGGGGCGGTCG---CGTATGGTTAT-TTCAAGCACT
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gi|3                          :                                                                                                                                              GTGTTTGAAAACTCGC-TGT-AAA---TTAAGGCTGAA-AT-GC----AGG-CTA------ACTAC-TTG-T-AAAAT-----------------T-TGTTACCCCTGT-CCGAGAGCC-AC-TA--CG-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----C-----TT---A--A-----T-----------T-----------A-TCTT---AT-----T-C----AAGAGATAATT-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCGTT-TCCC-AA-TC--AG--T-AGAA-A--TATC-GA------T-GT-T---------TA--TTGC-----AACTT--CATTTA----ATAGCT--------------------GA-------------TTT------AAT-ACATCTAA-CTTTTTTTTCAGCAG-A------AATTTTTAA-CC-CG-TCCGGTTCGG-GCGTC-T-TTGCAATAGAAATGGTG-TTCG----CCGCCAG-CAGAA-TTTAT-GT-GCTTC-------TCGGTGTGTACGGTTAT-TTCAAA
gi|4                          :                                                                                                                                              GTGTTTGAAA-TTC-----C-ATT--ATTA--GCTAGACAT-GT----AGGGCTG------GCTGC-TTG-G-AAAAA----------------AC-TGTAAGCCTTGC-CAAAGACCT-CC-TA--GC-CCTGAGAAAATCACTG-C-AATTTT----TGAAATCACCTT----TATATTACCA-----CT---A--A-----TACC--------G-----------A-TCTTCTAAT-----T-A----AAGTGATTA-T-TTCG-CTATGG---AA-CTACATTTTCAT--AGTTTTG-A-TCCC-AA-ACAAA---T-AAAACAT-TATA-AAGCACCTT-GGCT---------TG--TTAC-----AACTT--T----G----TT-ACT--------------------GGAATGATAAGCAGATTG------GAT-ACATCTAATA-TTTGT-TCAGTGG-A------AA--TTCAA-CCACG-CCTGG-CCAG-GTATC------------------TG-TTCA----TCCGCAG-TAAAA-TTCAT-AT-GTaca
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-420 )      :                                                                                                                                             AGTGTTTGAAA-CTCGC-TGT-AAA--ATTA--GCTGGACAT-GC----AGG------GCT-----------A------ACTAC-TTG-T---AAAA-T-TTGTTAGCCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---A--A-----T-----------T-----------A-TCTT---AT-----T-C----AAGCGATAA-T-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCG-A-TCCC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTC-GA------T-G---------T--TA--TTGC-----AACTT--CANT-----ACC--------------------GATTT------AAT-ACATCTAA-A-TTTCTCTCAGCGG-A------AA-TTTTAA-CC-CG-TCCGG-TCGG-GCGTC-T-TTGCAA-AGAAAT-G----TG-TTCGCCCGCGG-CAGAA-TTTA-T-GC-GTCTCGGG-CGGTCGG-GCGTACGGTTAT-TTCAAACACT
gi|1                          :                                                                                                                                               TGTTTTGAA-CTCGC-TAT-AAG--ATTA--GCTGGA-AC-GC----AGG------GCT-----------A------GTTA--TTA-T---AAAA-A-TTGTTAGCCCTGC--AAAGAGCC-AC-TA--GCACCTG---------ATA-C-T--TTT----TT--------TTTTAAAATATGTA-A-----CTGC-A--A-----T-----------TTTTTTTTGTATA-TCCA---AT-----T-CT---AAGCCATAA-T-TCGA-C-A--A---AC-CTTTA--TTCAC--AAAT-CG-A-TCCCTAC-TC--A---T-AAAA-AAATGTT-GA------T-----------T--TA--T-GC-----AGCTT--CATT-----ACCATTACGATAAGTA-------GATTT------AAT-GCATCTAA-A-TTTTTCTCCGCG--A------AA-TTTTAA-CA-CAATCCGG-TCGGCGCGTC-TGCTGCAA-A--AAT-G----TGGTTCACCCGTGG-CAGAA-TTTA-T-GCAATCTCGGG-C-GTCGG-GCGTACGGTTATGTTCAAACACT
gi|10                         :                                                                                                                                              GTGTTTGAAA-CGCAC-TGTTAAA--ATTA--GCTAGACATTGC----AGG------GCT-----------A------A-TAC-TTAAT---AAAA-T-TGGT-AGCCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----T-----------------------------------------------------------------------------AT-----T-C----AAGCGATAA-TGATGA-TTA--A---AAACTTAA--TTCA---ATCTTCG---TCCC-AA-TC--A---T-AAAA----TGTCAGA------T-G---------GGATA--TTGC-----A-CTTTCCATT-----ATCTC------------------GATTC------A-T-ACATCTAA-A-TTTCTCTCAGCGA-A------AA-TTTTAAACC-CA-TCCAG-TCGG-GCGTC-T-TTGCCA-AGCAAT-G----TG-TTCGCCCGCGA-CAGAATTTTA-T-GC-GTCTCGGG-TGGT---------CGGTTAT-TTCAAACACT
gi|11                         :                                                                                                                                              GTGTTTGAAA-CTCAC-TGT-AAA--ATGA--ACTGGACAT-GC----AGG------GCT-----------A------ACTAC-TTG-T---AATA-T-TTGTTAGCCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---A--A-----T-----------T-----------A-TCTT---AT-----T-C----AAATGATAA-T-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTTG-A-TCCC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TTTC-AG------T-G---------T--TA--TTGC-----AACTT--CATT-----A-------------------------------------------------TTCTCTCAGTAA-A------AA-TTTTAA-CC-TG-TCCGG-TCGG---GTC-T-TTGCAA-AGAAAT-G----TG-TTTGCCCACGG-CAGAA-TTTA-T-GC-ATTTTGGG-TGGTCGG-------GGTTAT-TTCAAACACT
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gi|15                         :                                                                                                                                              ttGTTTGAAATCCCAT-TTT-A-----TTAT-GCTAGACAT-GT----AGG------GCT-----------G------GCTGC-TTG-GCAAAAAA-C-CTGTAAGCCTTGC-CAAAGACTCTCC-TA--GC-CCTG-------
gi|16                         :                                                                                                                                               TGTTTGAAA-CTCGC-TGT-AAA--ATTA--GCTGGACAT-GC----AGG------GCT-----------A------ACAAC-TTG-T---AAAA-T-TCCTTAGCCCTGC-CAGAGAGCC-AC-AA--GC-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---A--A-----T-----------T-----------A-TCTT---ATCTTAAT-C----AAGGGATAA-T-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCG-A-TCTC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTC-GA------T-G---------T--TA--TTGC-----AATTT--CAAT-----ACC--------------------GATTT------AAT-GCATCTAA-A-TTTCTCTCAGCGG-A------AA-TTTTAA-CC-aggaaatcacgtgcaattttgaaaatcacctttatattactactaataccgatctttaataagtgattaattttcggctatggaactacattttcatagtttttatccaaacgaagaaaaacaaagaagcacgcttggcttgttacaactttgttactggaatgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TCTT---AT-----T-T----AATTGATAA-T-ATGA-CTA--A---AA-CTTGA--TTAAC--AACTTCG-A-TCCC-CA-TC--A---C-AAAA-A--TGTA-GA------T-G---------T--TA--TATC-----AACTT--CATT-----ACCATTACGATAACTATAAAGTAGATTG------AAT-ATATCTAA-T-TTTTTCTCAGCGG-C------AA-TTTTAG-CA-CG-TCCGG-TCGG-GCGTC-A-GTGCAA-GGAAAT-A----TG-TTCGCCCGCTG-CAGAA-TCCA-T-GC-GTCTCGGG-CGGTCGG-GCGTACGGTTAT-TTCAAACAg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --------TT----AGTATT---A-----TG---A--A-----T-----------T-----------G--ATT---AT-----G-CCA--AAACGATAA-T-A-GA-TTA--A---AA-CTTA---TTCAT--ATCTTCG-A-TCCC-AA-TC--A---T-AAAA-AA-TGTC-GA------TTG---------T--TAGTTTGC-----AACTT--CAAT-----AC---------------------GATTTTATTGAAAT-ACATCTAA-A-TTTCTCTCAGCGGAA------AA-TGTTAA-CC-CG-TCCGG-TCGG-G---------GC-------AT-G----TG-TT-------------AA-TTTA-TGGC-GTATCGCG-CGGTTGat
gi|19                         :                                                                                                                                    ctttccattttccgcttaaa-CCCGC-TAT-AAA--ATTA--GCTGGACAT-GT----AGG------GCT-----------A------ACTACATTA-T---AAAT-T-GTGT--GCCCTGC-CCGAGACTC-AC-TATAGC-CATG-------AATTA-TTA--TTTT---TT--------TT----TTTAT----AAATAACTGCAA--A-----T-----------TTTGTTGTAT--A-TCTA---AT-----T-C----AAGC-ATAA-T-ATGA-CAA--A---AA-CTTAA--TTCAC--AACTTCA-ATTCTC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTC-GA------T-G---------T--CA--TTattattcaaa
gi|2                          :                                                                                                                                                 TTTGAAA-CTCGC-TAT-AAA--ATTA--GCTGGACAC-GC----AGG------GCT-----------A------GTTAC-TTA-T---AAAA-A-TTGTTAGCCCTGC-CATAGACCC-AC-TA--GC-CCTG--------AACG-T-T--TTT----TT--------TTAA--AATATGTA-A-----CTGC-A--A-----TTTTTTTTTGTAT-----------A-TCCA---AT-----T-C----AAGCCATAA-T-TCGA-C----A---AA-CTTTA--TTCAC--AACTTCG-A-TCCC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTT-GA------T-G---------T--TA--TTGC-----AGCTT--CATT-----ACCATTACGATAAGTA-------GATTT------AAT-GCATCTAA-A-TTTTTCTCCGCGG-A------AA-TTTTAA-CA-CA-TCCGG-TCGG-GCGTC-T-GTGCAA-AAAAAT-G----TG-TTCACCCGTGGCCAGA
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AT-ACATCTAA-A-GTTTGTTTA----------------TGTAA-TA-C---CCAG-TCAG-GTGTC-T-ATGCAA-CGAAAA-T----TG-TTCACTCGTGA-CAAAA-TTTA-T-GC-ATCT-GGG-C-----------ACAGTTAT-TTTAAACgtacaagctaggttacccc
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-TTTA-T-GC-GTCTCGGA-CGGTCGG-GCGTACAGTTAT-TTTAAACACT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagtagatataatccccccccccccc--TG--TTAC-----AATTT--TAA------GCA--------------------GATTT------GAT-ACATCTAT-A-TCTTATTCAGTGC-AAACTTTAA-TTTTAA-CA-CG-TCTGG-gc
gi|25                         :                                                                                                                                                                            --GCTGGACAT-GC----AAG------GCT-----------ACATGTAACTAC-TGG-T---AAAA-T-TTGTTAACCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -TTTA-T-GC-GTCTCGGGGCGGTCG---CGTATGGTTAT-TTCAAGCACT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                    G-T---AAAA-T-TCGTTAGTCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CCTG-------AAAT
gi|3                          :                                                                                                                                              GTGTTTGAAAACTCGC-TGT-AAA---TTAAGGCTGAA-AT-GC----AGG-------CT-----------A------ACTAC-TTG-T---AAAA-T-TTGTTACCCCTGT-CCGAGAGCC-AC-TA--CG-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----C-----TT---A--A-----T-----------T-----------A-TCTT---AT-----T-C----AAGAGATAATT-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCGTT-TCCC-AA-TC--AG--T-AGAA-A--TATC-GA------T-GT--------T--TA--TTGC-----AACTT--CATTTAATAGCT--------------------GATTT------AAT-ACATCTAA-CTTTTTTTTCAGCAG-A------AATTTTTAA-CC-CG-TCCGGTTCGG-GCGTC-T-TTGCAATAGAAATGG----TG-TTCGCCGCCAG-CAGAA-TTTA-T-GT-GCTTC-------TCGGTGTGTACGGTTAT-TTCAAA
gi|4                          :                                                                                                                                              GTGTTTGAAA-TTC-----C-ATT--ATTA--GCTAGACAT-GT----AGG------GCT-----------G------GCTGC-TTG-GA--AAAA-A-CTGTAAGCCTTGC-CAAAGACCT-CC-TA--GC-CCTGAGAAAATCACTG-C-AATTTT----TGAAATCACCTT----TATATTACCA-----CT---A--A-----TACC--------G-----------A-TCTTCTAAT-----T-A----AAGTGATTA-T-TTCG-CTATGG---AA-CTACATTTTCAT--AGTTTTG-A-TCCC-AA-ACAAA---T-AAAACAT-TATA-AAGCACCTT-GGC-------T--TG--TTAC-----AACTT--TGTT-----ACTGGAATGATAAGCA-------GATTG------GAT-ACATCTAATA-TTTGT-TCAGTGG-A------AA--TTCAA-CCACG-CCTGG-CCAG-GTATC----------------------TG-TTCATCCGCAG-TAAAA-TTCA-T-AT-GTaca
gi|5                          :                                                                                                                                             AGTGTTTGAAA-CTCAC-TGT-AAA--ATTA--GCTGGACAG-TC----AGG------GCT-----------A------ACTAC-TTG-T---AAAAATATTGTTAGTCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CCTG-------CAACA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---G--A-----T-----------G-----------A-TCTT---AT-------C----AAACGATAA-T-AGGA-TTA--A---AA-CGTAA--CCCAC--AACTTAG-A-TCCC-AA-TC--A---T-AAAA-T--TGTC-GA------C-G---------T--TA--TTGC-----AACTT--CAAT-----TCC--------------------AGTTT------AAT-ACATCTGA-G-TTTCTCTCAGCGG-A------AA-TTTTAA-CA-CG-TCCGG-TCGG-GCGTC-T-GCGCAA-AGAAAT-T----TG-TTCACCCGCGG-CAGAA-TTTA-T-GC-GTCTCGGG-CGTTCGG-GCTTACGGTTAT-TTCAAACACTt
gi|6                          :                                                                                                                                             AGTGTTTGAAA-CTCGC-TGT-AAA--ATTA--GCTGGACAT-GC----AGG------GCT-----------A------ACTAC-TTG-T---AAAA-G-TTGCTAGCCCTGC----AGACCC-AA-TA--GC-TCTG-------C-----T-T--TTT----TC--------TT----TTTATA---A-----AT---A--A-----T-----------T-----------
gi|7                          : gttgattatatatttttgagggtgtaattgtggttttaaaaacaaatataaaatgtcttgaaaataaagggcatagaaatattctacaaaaactgaaatatattgccatttcttatattactctatataattttcccctaaaattttaggctttatagcGT-AAA--ATTA--TCTAAACAC-AC----AGGCTGTCTGCTTGTAAAATTGGA------ATTCC-CTG-T---AAAA-T-T-GTCAGCCCTGC-CGAAGACCT-GC-TA--GC-CCTGA------GAAAG-T-A--ACTGCCATT--------TT----GG-AA----A-----CT---A--C-----T-----------T---------------TT---AT-----TAC----TATCTATCC-A-GTGA-CTA--G---GA-CTCAA--TTCCCTAAT-TTTG-A-TCCT-GA-AC--A---T-GAAA-T--TGAC-AAAGTC--T-GTCCTTTCGCT--TG--TTAC-----AACTT--CATG-----ACC--------------------AGTAT------GAT-GCATCTAA-A-TTTT------------------A-TGTTAA-CA-TG-TC----------CATT-T-TAGCAG-CTACAT-GTATTTG-TTTACCCATGA-CA-AA-TTTATT-GC-GTCTCTTG-CAGACAG-GCACTTGGCTAT-TTCAAACACgaaatttttttttcaaagtacattgcatttttatttcaaagcattcacgtcactgaaaagcttgacagt
gi|8                          :                                                                                                                                               TGTTTGAAA-CTCGCCTGT-AAA---TTA--GCTGAA--T-GC----AGG------GCT-----------A------ACTAC-TTG-T---AAAA-T-TTGTTACCCCTGC-CCGAGAGCC-AC-TA--GT-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---A--A-----T-----------T-----------ACTCTT---AT-----T-C----AAGAGATAA-TTATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCC-G-TTCC-CA-TC--AGTTT-AGAA-A--TATC-GA------T-G---------T--TA--TTGC-----AACTT--CATTTAAT-ACT--------------------GATTT------AAT-ACATCTAA-T-TTTTTTTCAGCAG-A------AA-TTTTAA-CC-CG-TCCGG-TCGG-GCGTC-T-TTGCAA-AGAAAT-G----TG-TTCGCCCGCAG-CAGAA-TTTA-T-GC-TTC---------TCGG-GTGTACGGTTAT-TTCAAACACT
gi|9                          :                                                                                                                                              GTGTTTGAAA-CTCGC-TGT-AAA---TGA--GCTGGACTT-GC----AGG------GCT-----------A------GCTAC-TTG-T---AAAA-T-TTGCTAGCCCTGT-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CCTT-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---A--A-----T-----------T-----------A-TCTT---AT-----T-C----AAATGATAA-T-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCG-A-TCTT-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTC-GA------T-G---------T--TA--TTATACATAAAGTT--CATT-----ATC--------------------GATTT------CAT-ACA--CA------TCTCCCAACGA-A------AA-TTTTAA-CC-CA-TCCGG-TTGG-GCGTC-T-TTGCAA-AGAAAT-G----TA-TTCGCCCGCAG-CAGAA-TTTA-T-GC-ATCTCAGG-CGGTCAG-ACGTATGGTTAT-TTCAAATAC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-420 )      :                                                                                                                                             AGTGTTTGAAA-CTCGC-TGT-AAA--ATTA--GCTGGACAT-GC----AGG------GCT-----------A------ACTAC-TTG-T---AAAA-T-TTGTTAGCCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---A--A-----T-----------T-----------A-TCTT---AT-----T-C----AAGCGATAA-T-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCG-A-TCCC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTC-GA------T-G---------T--TA--TTGC-----AACTT--CATT-----ACC--------------------GATTT------AAT-ACATCTAA-A-TTTCTCTCAGCGG-A------AA-TTTTAA-CC-CG-TCCGG-TCGG-GCGTC-T-TTGCAA-AGAAAT-G----TG-TTCGCCCGCGG-CAGAA-TTTA-T-GC-GTCTCGGG-CGGTCGG-GCGTACGGTTAT-TTCAAACACT
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gi|19                         :                                                                                                                                    ctttccattttccgcttaaa-CCCGC-TAT-AAA--ATTA--GCTGGACAT-GT----AGG------GCT-----------A------ACTACATTA-T---AAAT-T-GTGT--GCCCTGC-CCGAGACTC-AC-TATAGC-CATG-------AATTA-TTA--TTTT---TT--------TT----TTTAT----AAATAACTGCAA--A-----T-----------TTTGTTGTAT--A-TCTA---AT-----T-C----AAGC-ATAA-T-ATGA-CAA--A---AA-CTTAA--TTCAC--AACTTCA-ATTCTC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTC-GA------T-G---------T--CA--TTattattcaaa
gi|2                          :                                                                                                                                                 TTTGAAA-CTCGC-TAT-AAA--ATTA--GCTGGACAC-GC----AGG------GCT-----------A------GTTAC-TTA-T---AAAA-A-TTGTTAGCCCTGC-CATAGACCC-AC-TA--GC-CCTG--------AACG-T-T--TTT----TT--------TTAA--AATATGTA-A-----CTGC-A--A-----TTTTTTTTTGTAT-----------A-TCCA---AT-----T-C----AAGCCATAA-T-TCGA-C----A---AA-CTTTA--TTCAC--AACTTCG-A-TCCC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTT-GA------T-G---------T--TA--TTGC-----AGCTT--CATT-----ACCATTACGATAAGTA-------GATTT------AAT-GCATCTAA-A-TTTTTCTCCGCGG-A------AA-TTTTAA-CA-CA-TCCGG-TCGG-GCGTC-T-GTGCAA-AAAAAT-G----TG-TTCACCCGTGGCCAGA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TA--CTGT-----AACTT--CAAT-----TCC--------------------AACT--------AT-A----TAA-A-CTTAT-------G-A------AA-CTTTAG-CA-CA-TTCGG-TCAG-GAATT-T-CCACAA-AGAGAT------TA-TTCATCAATGC-CAAAA-TTTA-T-CC-ATCTCAGA-TGGcacaggtcctacattacaatctgggtcagacacatgtctacattc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AT-ACATCTAA-A-GTTTGTTTA----------------TGTAA-TA-C---CCAG-TCAG-GTGTC-T-ATGCAA-CGAAAA-T----TG-TTCACTCGTGA-CAAAA-TTTA-T-GC-ATCT-GGG-C-----------ACAGTTAT-TTTAAACgtacaagctaggttacccc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cTCTCAGTGG-A------AA-TTT-AA-CC-TG-TCCAG-TCGG-GCGTC-T-TTGCAA-AGAAAT-G----TG--TCGTCCGCGA-AGAAA-TTTA-T-GC-GTC----G-CGGC----GTATACGGTTAT-TCAAAACACTt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-TTTA-T-GC-GTCTCGGA-CGGTCGG-GCGTACAGTTAT-TTTAAACACT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagtagatataatccccccccccccc--TG--TTAC-----AATTT--TA-------AGCA-------------------GATTT------GAT-ACATCTAT-A-TCTTATTCAGTGC-AAACTTTAA-TTTTAA-CA-CG-TCTGG-gc
gi|25                         :                                                                                                                                                                            --GCTGGACAT-GC----AAG------GCT-----------ACATGTAACTAC-TGG-T---AAAA-T-TTGTTAACCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -TTTA-T-GC-GTCTCGGGGCGGTCG---CGTATGGTTAT-TTCAAGCACT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                    G-T---AAAA-T-TCGTTAGTCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CCTG-------AAAT
gi|3                          :                                                                                                                                              GTGTTTGAAAACTCGC-TGT-AAA---TTAAGGCTGAA-AT-GC----AGG-------CT-----------A------ACTAC-TTG-T---AAAA-T-TTGTTACCCCTGT-CCGAGAGCC-AC-TA--CG-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----C-----TT---A--A-----T-----------T-----------A-TCTT---AT-----T-C----AAGAGATAATT-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCGTT-TCCC-AA-TC--AG--T-AGAA-A--TATC-GA------T-GT--------T--TA--TTGC-----AACTT--CATTTAATAGCT--------------------GATTT------AAT-ACATCTAA-CTTTTTTTTCAGCAG-A------AATTTTTAA-CC-CG-TCCGGTTCGG-GCGTC-T-TTGCAATAGAAATGG----TG-TTCGCCGCCAG-CAGAA-TTTA-T-GT-GCTTC-------TCGGTGTGTACGGTTAT-TTCAAA
gi|4                          :                                                                                                                                              GTGTTTGAAA-TTC-----C-ATT--ATTA--GCTAGACAT-GT----AGG------GCT-----------G------GCTGC-TTG-GA--AAAA-A-CTGTAAGCCTTGC-CAAAGACCT-CC-TA--GC-CCTGAGAAAATCACTG-C-AATTTT----TGAAATCACCTT----TATATTACCA-----CT---A--A-----TACC--------G-----------A-TCTTCTAAT-----T-A----AAGTGATTA-T-TTCG-CTATGG---AA-CTACATTTTCAT--AGTTTTG-A-TCCC-AA-ACAAA---T-AAAACAT-TATA-AAGCACCTT-GGC-------T--TG--TTAC-----AACTT--TGTT-----ACTGGAATGATAAGCA-------GATTG------GAT-ACATCTAATA-TTTGT-TCAGTGG-A------AA--TTCAA-CCACG-CCTGG-CCAG-GTATC----------------------TG-TTCATCCGCAG-TAAAA-TTCA-T-AT-GTaca
gi|5                          :                                                                                                                                             AGTGTTTGAAA-CTCAC-TGT-AAA--ATTA--GCTGGACAG-TC----AGG------GCT-----------A------ACTAC-TTG-T---AAAAATATTGTTAGTCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CCTG-------CAACA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---G--A-----T-----------G-----------A-TCTT---AT-------C----AAACGATAA-T-AGGA-TTA--A---AA-CGTAA--CCCAC--AACTTAG-A-TCCC-AA-TC--A---T-AAAA-T--TGTC-GA------C-G---------T--TA--TTGC-----AACTT--CAAT-----TCC--------------------AGTTT------AAT-ACATCTGA-G-TTTCTCTCAGCGG-A------AA-TTTTAA-CA-CG-TCCGG-TCGG-GCGTC-T-GCGCAA-AGAAAT-T----TG-TTCACCCGCGG-CAGAA-TTTA-T-GC-GTCTCGGG-CGTTCGG-GCTTACGGTTAT-TTCAAACACTt
gi|6                          :                                                                                                                                             AGTGTTTGAAA-CTCGC-TGT-AAA--ATTA--GCTGGACAT-GC----AGG------GCT-----------A------ACTAC-TTG-T---AAAA-G-TTGCTAGCCCTGC----AGACCC-AA-TA--GC-TCTG-------C-----T-T--TTT----TC--------TT----TTTATA---A-----AT---A--A-----T-----------T-----------
gi|7                          : gttgattatatatttttgagggtgtaattgtggttttaaaaacaaatataaaatgtcttgaaaataaagggcatagaaatattctacaaaaactgaaatatattgccatttcttatattactctatataattttcccctaaaattttaggctttatagcGT-AAA--ATTA--TCTAAACAC-AC----AGGCTGTCTGCTTGTAAAATTGGA------ATTCC-CTG-T---AAAA-T-T-GTCAGCCCTGC-CGAAGACCT-GC-TA--GC-CCTGA------GAAAG-T-A--ACTGCCATT--------TT----GG-AA----A-----CT---A--C-----T-----------T---------------TT---AT-----TAC----TATCTATCC-A-GTGA-CTA--G---GA-CTCAA--TTCCCTAAT-TTTG-A-TCCT-GA-AC--A---T-GAAA-T--TGAC-AAAGTC--T-GTCCTTTCGCT--TG--TTAC-----AACTT--CATG-----ACC--------------------AGTAT------GAT-GCATCTAA-A-TTTT------------------A-TGTTAA-CA-TG-TC----------CATT-T-TAGCAG-CTACAT-GTATTTG-TTTACCCATGA-CA-AA-TTTATT-GC-GTCTCTTG-CAGACAG-GCACTTGGCTAT-TTCAAACACgaaatttttttttcaaagtacattgcatttttatttcaaagcattcacgtcactgaaaagcttgacagt
gi|8                          :                                                                                                                                               TGTTTGAAA-CTCGCCTGT-AAA---TTA--GCTGAA--T-GC----AGG------GCT-----------A------ACTAC-TTG-T---AAAA-T-TTGTTACCCCTGC-CCGAGAGCC-AC-TA--GT-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---A--A-----T-----------T-----------ACTCTT---AT-----T-C----AAGAGATAA-TTATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCC-G-TTCC-CA-TC--AGTTT-AGAA-A--TATC-GA------T-G---------T--TA--TTGC-----AACTT--CATTTAAT-ACT--------------------GATTT------AAT-ACATCTAA-T-TTTTTTTCAGCAG-A------AA-TTTTAA-CC-CG-TCCGG-TCGG-GCGTC-T-TTGCAA-AGAAAT-G----TG-TTCGCCCGCAG-CAGAA-TTTA-T-GC-TTC---------TCGG-GTGTACGGTTAT-TTCAAACACT
gi|9                          :                                                                                                                                              GTGTTTGAAA-CTCGC-TGT-AAA---TGA--GCTGGACTT-GC----AGG------GCT-----------A------GCTAC-TTG-T---AAAA-T-TTGCTAGCCCTGT-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CCTT-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---A--A-----T-----------T-----------A-TCTT---AT-----T-C----AAATGATAA-T-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCG-A-TCTT-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTC-GA------T-G---------T--TA--TTATACATAAAGTT--CATT-----ATC--------------------GATTT------CAT-ACA--CA------TCTCCCAACGA-A------AA-TTTTAA-CC-CA-TCCGG-TTGG-GCGTC-T-TTGCAA-AGAAAT-G----TA-TTCGCCCGCAG-CAGAA-TTTA-T-GC-ATCTCAGG-CGGTCAG-ACGTATGGTTAT-TTCAAATAC


blockSeqs                     :                                                                                                                                                        A     C   T   GAA   AG         T  TTAT   CTGTCT   TGTAAAATTGGA           A   A CAA    A A             A      G  T  C  TA  .    AGAAAATC    G T AT   GCCA GAAATCACC  AAA      AAATAACTGCAAATTTTGTTGTATA                             CTA  CTTAA A TTGA         T G    T   TG AAT  A     TT     TA       AA     .  C  AA GTT A    C A     A  AGTCTGTCCTTTCGCT       GT    ACATA     TC    TAATA   ATTACGATAACTATAAAGTA     TATTGAA  G        CT             CAAACTTT   T      A  A  .     T    .     T T      T      GTATT   .           C     T    T G  .        G    CGGTGTG         .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                        T     .   .   A     T          .  .      .        ACATGTA                .   . A      . .             .      G  .  .  .   .    AG          . . .    T    G          G        GTAACTGCAATTTTTTTTTGTATA                              .    .     . CA           . T    .   .  .    .     .      .        AT     .  .  .  G   .    . T     .  GCACCTTGGCT            .     .         .     TAAT    ATTACGATAAGTA            A        .        TA             GAA        .      .  .  .     .    .     . T      .      GG      .           .     .    . .  .        .    CGGGCG          .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                        A     .   .   A     .          .  .      .        A                      .   . .      . .             .      G  .  .  .   .    C           . . .    .    G          G        TACCACTAATACCGA                                       .    .     . .            . .    .   .  .    .     .      .        TT     .  .  .  .   .    . .     .  TGGGA                  .     .         .     .       GGAATGATAAGCA            C        .        A              AA         .      .  .  .     .    .     . T      .      G       .           .     .    . .  .        .    CGGGCG          .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                        .     .   .   A     .          .  .      .        A                      .   . .      . .             .      G  .  .  .   .    C           . . .    .    G          G        GCTATTAATCTTA                                         .    .     . .            . .    .   .  .    .     .      .        A      .  .  .  .   .    . .     .  TGTT                   .     .         .     .       A                        A        .        A              AA         .      .  .  .     .    .     . T      .      G       .           .     .    . .  .        .    CAGGCA          .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                        .     .   .   A     .          .  .      .        C                      .   . .      . .             .      C  .  .  .   .    C           . . .    .    T          A        TATGAATTG                                             .    .     . .            . .    .   .  .    .     .      .        A      .  .  .  .   .    . .     .  TGT                    .     .         .     .       .                        A        .        T              AA         .      .  .  .     .    .     . G      .      A       .           .     .    . .  .        .    CGGGTG          .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                        .     .   .   A     .          .  .      .        G                      .   . .      . .             .      C  .  .  .   .    C           . . .    .    T          T        ACTAATTAC                                             .    .     . .            . .    .   .  .    .     .      .        A      .  .  .  .   .    . .     .  TGT                    .     .         .     .       .                        A        .        A              GA         .      .  .  .     .    .     . G      .      G       .           .     .    . .  .        .    CAGACG          .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                        .     .   .   A     .          .  .      .        A                      .   . .      . .             .      G  .  .  .   .    A           . . .    .    G          T        ACTAATTA                                              .    .     . .            . .    .   .  .    .     .      .        A      .  .  .  .   .    . .     .  TGT                    .     .         .     .       .                        A        .        A              GA         .      .  .  .     .    .     . A      .      T       .           .     .    . .  .        .    CGG             .
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Reference ( family-420 )      :                                                                                                                                             AGTGTTTGAAA-CTCGC-TGT-AAA--ATTA--GCTGGACAT-GC----AGG------GCT-----------A------ACTAC-TTG-T---AAAA-T-TTGTTAGCCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---A--A-----T-----------T-----------A-TCTT---AT-----T-C----AAGCGATAA-T-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCG-A-TCCC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTC-GA------T-G---------T--TA--TTGC-----AACTT--CATT-----ACC--------------------GATTT------AAT-ACATCTAA-A-TTTCTCTCAGCGG-A------AA-TTTTAA-CC-CG-TCCGG-TCGG-GCGTC-T-TTGCAA-AGAAAT-G----TG-TTCGCCCGCGG-CAGAA-TTTA-T-GC-GTCTCGGG-CGGTCGG-GCGTACGGTTAT-TTCAAACACT
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gi|15                         :                                                                                                                                              ttGTTTGAAATCCCAT-TTT-A-----TTAT-GCTAGACAT-GT----AGG------GCT-----------G------GCTGC-TTG-GCAAAAAA-C-CTGTAAGCCTTGC-CAAAGACTCTCC-TA--GC-CCTG-------
gi|16                         :                                                                                                                                               TGTTTGAAA-CTCGC-TGT-AAA--ATTA--GCTGGACAT-GC----AGG------GCT-----------A------ACAAC-TTG-T---AAAA-T-TCCTTAGCCCTGC-CAGAGAGCC-AC-AA--GC-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---A--A-----T-----------T-----------A-TCTT---ATCTTAAT-C----AAGGGATAA-T-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCG-A-TCTC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTC-GA------T-G---------T--TA--TTGC-----AATTT--CAAT-----ACC--------------------GATTT------AAT-GCATCTAA-A-TTTCTCTCAGCGG-A------AA-TTTTAA-CC-aggaaatcacgtgcaattttgaaaatcacctttatattactactaataccgatctttaataagtgattaattttcggctatggaactacattttcatagtttttatccaaacgaagaaaaacaaagaagcacgcttggcttgttacaactttgttactggaatgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TCTT---AT-----T-T----AATTGATAA-T-ATGA-CTA--A---AA-CTTGA--TTAAC--AACTTCG-A-TCCC-CA-TC--A---C-AAAA-A--TGTA-GA------T-G---------T--TA--TATC-----AACTT--CATT-----ACCATTACGATAACTATAAAGTAGATTG------AAT-ATATCTAA-T-TTTTTCTCAGCGG-C------AA-TTTTAG-CA-CG-TCCGG-TCGG-GCGTC-A-GTGCAA-GGAAAT-A----TG-TTCGCCCGCTG-CAGAA-TCCA-T-GC-GTCTCGGG-CGGTCGG-GCGTACGGTTAT-TTCAAACAg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --------TT----AGTATT---A-----TG---A--A-----T-----------T-----------G--ATT---AT-----G-CCA--AAACGATAA-T-A-GA-TTA--A---AA-CTTA---TTCAT--ATCTTCG-A-TCCC-AA-TC--A---T-AAAA-AA-TGTC-GA------TTG---------T--TAGTTTGC-----AACTT--CAAT-----AC---------------------GATTTTATTGAAAT-ACATCTAA-A-TTTCTCTCAGCGGAA------AA-TGTTAA-CC-CG-TCCGG-TCGG-G---------GC-------AT-G----TG-TT-------------AA-TTTA-TGGC-GTATCGCG-CGGTTGat
gi|19                         :                                                                                                                                    ctttccattttccgcttaaa-CCCGC-TAT-AAA--ATTA--GCTGGACAT-GT----AGG------GCT-----------A------ACTACATTA-T---AAAT-T-GTGT--GCCCTGC-CCGAGACTC-AC-TATAGC-CATG-------AATTA-TTA--TTTT---TT--------TT----TTTAT----AAATAACTGCAA--A-----T-----------TTTGTTGTAT--A-TCTA---AT-----T-C----AAGC-ATAA-T-ATGA-CAA--A---AA-CTTAA--TTCAC--AACTTCA-ATTCTC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTC-GA------T-G---------T--CA--TTattattcaaa
gi|2                          :                                                                                                                                                 TTTGAAA-CTCGC-TAT-AAA--ATTA--GCTGGACAC-GC----AGG------GCT-----------A------GTTAC-TTA-T---AAAA-A-TTGTTAGCCCTGC-CATAGACCC-AC-TA--GC-CCTG--------AACG-T-T--TTT----TT--------TTAA--AATATGTA-A-----CTGC-A--A-----TTTTTTTTTGTAT-----------A-TCCA---AT-----T-C----AAGCCATAA-T-TCGA-C----A---AA-CTTTA--TTCAC--AACTTCG-A-TCCC-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTT-GA------T-G---------T--TA--TTGC-----AGCTT--CATT-----ACCATTACGATAAGTA-------GATTT------AAT-GCATCTAA-A-TTTTTCTCCGCGG-A------AA-TTTTAA-CA-CA-TCCGG-TCGG-GCGTC-T-GTGCAA-AAAAAT-G----TG-TTCACCCGTGGCCAGA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TA--CTGT-----AACTT--CAAT-----TCC--------------------AACT--------AT-A----TAA-A-CTTAT-------G-A------AA-CTTTAG-CA-CA-TTCGG-TCAG-GAATT-T-CCACAA-AGAGAT------TA-TTCATCAATGC-CAAAA-TTTA-T-CC-ATCTCAGA-TGGcacaggtcctacattacaatctgggtcagacacatgtctacattc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AT-ACATCTAA-A-GTTTGTTTA----------------TGTAA-TA-C---CCAG-TCAG-GTGTC-T-ATGCAA-CGAAAA-T----TG-TTCACTCGTGA-CAAAA-TTTA-T-GC-ATCT-GGG-C-----------ACAGTTAT-TTTAAACgtacaagctaggttacccc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cTCTCAGTGG-A------AA-TTT-AA-CC-TG-TCCAG-TCGG-GCGTC-T-TTGCAA-AGAAAT-G----TG--TCGTCCGCGA-AGAAA-TTTA-T-GC-GTC----G-CGGC----GTATACGGTTAT-TCAAAACACTt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-TTTA-T-GC-GTCTCGGA-CGGTCGG-GCGTACAGTTAT-TTTAAACACT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagtagatataatccccccccccccc--TG--TTAC-----AATTT--TA-------AGCA-------------------GATTT------GAT-ACATCTAT-A-TCTTATTCAGTGC-AAACTTTAA-TTTTAA-CA-CG-TCTGG-gc
gi|25                         :                                                                                                                                                                            --GCTGGACAT-GC----AAG------GCT-----------ACATGTAACTAC-TGG-T---AAAA-T-TTGTTAACCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -TTTA-T-GC-GTCTCGGGGCGGTCG---CGTATGGTTAT-TTCAAGCACT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                    G-T---AAAA-T-TCGTTAGTCCTGC-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CCTG-------AAAT
gi|3                          :                                                                                                                                              GTGTTTGAAAACTCGC-TGT-AAA---TTAAGGCTGAA-AT-GC----AGG-------CT-----------A------ACTAC-TTG-T---AAAA-T-TTGTTACCCCTGT-CCGAGAGCC-AC-TA--CG-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----C-----TT---A--A-----T-----------T-----------A-TCTT---AT-----T-C----AAGAGATAATT-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCGTT-TCCC-AA-TC--AG--T-AGAA-A--TATC-GA------T-GT--------T--TA--TTGC-----AACTT--CATTTAATAGCT--------------------GATTT------AAT-ACATCTAA-CTTTTTTTTCAGCAG-A------AATTTTTAA-CC-CG-TCCGGTTCGG-GCGTC-T-TTGCAATAGAAATGG----TG-TTCGCCGCCAG-CAGAA-TTTA-T-GT-GCTTC-------TCGGTGTGTACGGTTAT-TTCAAA
gi|4                          :                                                                                                                                              GTGTTTGAAA-TTC-----C-ATT--ATTA--GCTAGACAT-GT----AGG------GCT-----------G------GCTGC-TTG-GA--AAAA-A-CTGTAAGCCTTGC-CAAAGACCT-CC-TA--GC-CCTGAGAAAATCACTG-C-AATTTT----TGAAATCACCTT----TATATTACCA-----CT---A--A-----TACC--------G-----------A-TCTTCTAAT-----T-A----AAGTGATTA-T-TTCG-CTATGG---AA-CTACATTTTCAT--AGTTTTG-A-TCCC-AA-ACAAA---T-AAAACAT-TATA-AAGCACCTT-GGC-------T--TG--TTAC-----AACTT--TGTT-----ACTGGAATGATAAGCA-------GATTG------GAT-ACATCTAATA-TTTGT-TCAGTGG-A------AA--TTCAA-CCACG-CCTGG-CCAG-GTATC----------------------TG-TTCATCCGCAG-TAAAA-TTCA-T-AT-GTaca
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gi|8                          :                                                                                                                                               TGTTTGAAA-CTCGCCTGT-AAA---TTA--GCTGAA--T-GC----AGG------GCT-----------A------ACTAC-TTG-T---AAAA-T-TTGTTACCCCTGC-CCGAGAGCC-AC-TA--GT-CCTG-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---A--A-----T-----------T-----------ACTCTT---AT-----T-C----AAGAGATAA-TTATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCC-G-TTCC-CA-TC--AGTTT-AGAA-A--TATC-GA------T-G---------T--TA--TTGC-----AACTT--CATTTAAT-ACT--------------------GATTT------AAT-ACATCTAA-T-TTTTTTTCAGCAG-A------AA-TTTTAA-CC-CG-TCCGG-TCGG-GCGTC-T-TTGCAA-AGAAAT-G----TG-TTCGCCCGCAG-CAGAA-TTTA-T-GC-TTC---------TCGG-GTGTACGGTTAT-TTCAAACACT
gi|9                          :                                                                                                                                              GTGTTTGAAA-CTCGC-TGT-AAA---TGA--GCTGGACTT-GC----AGG------GCT-----------A------GCTAC-TTG-T---AAAA-T-TTGCTAGCCCTGT-CAGAGAGCC-AC-TA--GC-CCTT-------CAATA-T-A--TTT----TG--------TT----GGTAT----A-----CT---A--A-----T-----------T-----------A-TCTT---AT-----T-C----AAATGATAA-T-ATGA-TTA--A---AA-CTTAA--TTCAC--ATCTTCG-A-TCTT-AA-TC--A---T-AAAA-A--TGTC-GA------T-G---------T--TA--TTATACATAAAGTT--CATT-----ATC--------------------GATTT------CAT-ACA--CA------TCTCCCAACGA-A------AA-TTTTAA-CC-CA-TCCGG-TTGG-GCGTC-T-TTGCAA-AGAAAT-G----TA-TTCGCCCGCAG-CAGAA-TTTA-T-GC-ATCTCAGG-CGGTCAG-ACGTATGGTTAT-TTCAAATAC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): CTTTCATTTTCTCTTAAATTAGTTATGAATGGATTATGCCA
Unaligned ( gi|29 ): TTCAATGCATTCACGTCACTGAAATGCTTGACAA