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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       attccgaaGACATTATGACCGCGAAACAATGGGGGAGAAATATATTTTGTATTGATA--CATGTACTTCATTGCAC--AC--TGCATGC
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gi|7                          : agtagttggcctcaattacctcataataccatcgaatgaattagacatatcaaatgcagttgcagataagttcaaatagtggaaagtctaacatagtattgtataatttataaatgaatgtgactaaatcaaataactaaatcttttgtggatatgtaacaaaataaaaacacctatctttaattcagcgccggttatcttcaattcaattggaaatacatgtagatcatattattagaccttagaccaaagcaaaagttcgtgcatcacatcccgaaaaaaattaaaagggaaagagatgcagcataagaacagttcaattaagggcaaagatgtattacattaaagattgatgaatcgagataggatctcccaaacttccaagctggcaggacaaacaatataaaacccgaagtacatggaaaat-TTGTATTTATTGTGCATTCAG--TGTGAC--TGAG-ATGTA-GGTTTCCTATCATTAGTATGACAAAAACTGTGAATGTTATACAGTGATTAGAAA-TTGAAATGG-TAGGATATATATGATGTAATTATACATGT-------GC------------AGTA-CCGTAGAAA-TCAAGTGTTTTCAGAATATT-------------GAAGAAATGATTTTAAAAGATCATAAAATGATCAGAAGTGTTTGACA-AT-TACGCC-ATGGTAGTTTGTAAGATATGCAT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atgctTGTGCATATATACTGTAAT--TGAAGATGCA-GGTTTGCAGTCTAAAGTTTGACA-AAACTGTGAATGTTACAG--TGAC---AAA-TAACATCAT-------ACATGGAA---A-------ATTT-------GCC---G---ATGAAATG-GTTTATTAATACAGGT--TTTCATGATATTTTTAGGAATGAAGTAAGAGATCATCT-----GAT-----CGT-TTTAGACATG---------C-TAAACC-ATGGCAGCTCGCAAGATGCGCATTT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTATACATTTTCAATGTACCCACAAATTTAAAATGATTTTGGTAA-GCAGGT--TT---GAATATC-------------TAATGTATTATTCTA---AAA-----GATCTTCAGAAGTGTTCGAC--ATGTCAAACAATGACAGTTCACAAGATCTGCATTTTGATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GACATGTTTGACACGT-TAAACA-ATGACAATTCGTAAGATGTGCACTTTCATAAA---TGTGTT---CT---TTT-AAAAGAAGACGAGAATTAC------CATACAGTGTTGACTGCACATTTTTAAAAATTTTAT-------TCACTCTATGTGAATTAAAAATATACCTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -TAAACC-ATGGTAGTTTACAAAATTTG----CTGGTCATGGATGTGTTGAAATACATGTAATTTTAAGATAACAATCAACGTAA------AGTGGGGATAGCACACATAacccc
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|5 ): TTATATAATCTCACGTTGGTTCAATTAAATAGTATATGGATGTATGTCCAGATCAATTGGAGATAAGTTCATATACTAAATGGGAAATATTTAATTCATAAGTAGATGTTACTGAATTAAACCTTCAAATCTTTTGTGAATATGTTATAAAGTACAAGCACTTATCTTTAATCAATCCCTACTCATTAGAAATAAGTAAAATTATTAGACCTGAGGCAGAGCAGGCATTTGTGCCCATATCCCCAAAAGCTTTGAAAAAGGAAAGAGAGTAGCA
Unaligned ( gi|10 ): TGTGACTGAATCAGACCTTCAAATCTTGTGTAGACATTAAGGGCTCGTTATCTTTACCTTTTGAACAAACACTTATCTTGAATTAAGGTAGAGATAGGTTGCATCATTAGACCTAGGCACAGGAGGAGTTGTGCATGCATCCACAAACAATAGGAATAAAGGAAAGAGTAGCA
Unaligned ( gi|11 ): CTTCAAATCATTTGTGGATATGTTACAAAGTAAAAAGGCATGTATTTAACTTAATACCATATGTCTTGCATTCAATTAAAAGTTATGTCAAATCATTTGACATAAGGCGTGGCTGAGAGTTTTGCGCCTGGCTGCATCCTCAAAAACCGCTTCAAAAGCAAA
Unaligned ( gi|15 ): TTATATGATCTCAAGTTGATTAATGAAGTGGAATTGGGAATGCATCTAATTCATGAAGTAAATAGCTAATTAATATAATGAACTAAACCTTCAAATCTTTTGTGCATATGTTGCAAGGTAAAAACA
Unaligned ( gi|16 ): TAGAATATGAATTGGGATAGAGAGTCCAATTCCTAATTGGCATATGACTGAAATGTGCAGATTCCCAAACTCGAGATACAAAGGAGAAAAAAGAACACGTTTTGTATTTA
Unaligned ( gi|19 ): CAAGTGAACTAGATATGTCCAATTCAATTGCAGAAGCGTTCAAATAGTAGAAA






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Reference ( family-4136 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGGCAATATGA---CCGAGANACAATGGGAGA-GAAA----CATGTTTTGTATTCATAC--ATGCATTT--TTGTAT--ATTGTGCATACAG--TGTAAC--TGA-GATGTA-GGTTTGCAGTCAAAAGTACGACAAAAACTGTGAATGT--TANAGTGATT-G-AAA--TTG-A--AC--GTT--GATACATGN--GATGTAATTATACATTTGCC------G-TGAAATGNTTT-AGTAAN-CAG--GTTTTCAGAATATTT-------------AAGANATNATTTT---AGATNAT----T--TCAGACGTGTTCGACA-ATTAAACCATGGCAGTTCGCAAGATNTGCATTTTGATNANGGATGTGTTGAANTACATNTAANNNNAAGACGANAATCANCGT-AACATACAGTGNNGACNGCACACNTNTAAAAATTTTAT-------TCACTCTATGTGAATTAAAAATATACCTA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAATATAAAACCCGAAGTACA-TGGAA----AAT----CATGCTTTGTATT----------------------T--ATTGTGCATTCAG--TGTGAC--TGA-GATGTA-GGTTTCCTATCATTAGTATGACAAAAACTG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      agtagttggcctcaattacctcataataccatcgaatgaattagacatatcaaatgcagttgcagataagttcaaatagtggaaagtctaacatagtattgtataatttataaatgaatgtgactaaatcaaataactaaatcttttgtggatatgtaacaaaataaaaacacctatctttaattcagcgccggttatcttcaattcaattggaaatacatgtagatcatattattagaccttagaccaaagcaaaagttcgtgcatcacatcccgaaaaaaattaaaagggaaagagatgcagcataagaacagttcaattaagggcaaagatgtattacattaaagattgatgaatcgagataggatctcccaaacttccaagctggcaggacaaaGACATGTTTGACACGTTAAACAATGACAATTCGTAAGATGTGCACTTTCATAA---ATGTGTT------CTTTTAAAAG-AAGACGAGAAT-----T-ACCATACAGTGTTGACTGCACATTTTTAAAAATTTTAT-------TCACTCTATGTGAATTAAAAATATACCTA
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 attccgaaATACATTTTCAATGTACCCACAAATTTA------------AAATGATTTTGGTAAG-CAG--GTTT---GAATATCT-------------AATGTATTATTCT---AAAAGATC---T--TCAGAAGTGTTCGACATGTCAAACAATGACAGTTCACAAGATCTGCATTTTGAT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          attCGAGATACAA-AGGAGA-AAAAAGAACACGTTTTGTATTTAt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tagaatatgaattgggatagagagtccaattcctaattggcatatgactgaaatgtgcagattcccaaactTAAACCATGGTAGTTTACAAAATTTGC----TGGTCATGGATGTGTTGAAATACATGTAATTTTAAGATAACAATCAACGT-AA-----AGTGGGGATAGCACACAT
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgGACATTATGA---CCGCGAAACAATGGGGGA-GAAA----TATATTTTGTATTGATAC--ATGTACTTCATTGCAC--AC--TGCATGC
gi|3                          :                              aagatatctctaatcgaattgaacttggatataattaaacataaattttgttcaataaaagatgttggttcaagtgaatggaattttataaatgtccaattcaattgtggatgatagcttttgttaatttataagttgtcgtgggtatgttacaaaatataaatactgtatatatccgtaatttaactcaacttatgttcaattcaattagaaatgggttcgtgctcacattcccaaaaactttgaaaatggaaagagagtagccaaaactatatatccattcaaaatgcaaaggataacaaatattatggtatgaatcggcataggactctcaaaaccccaactgaaaagTTGGCAATATGA---CGGATATACAATGGGAGG-GAGA----CATGTTTTGCATTCACACGCATGCATTTC-TTGTAC--ATTGTGCATGCAG--TGTAAT--TGA-AATGTA-GGTTTGCAGTCAAAAGTATGAGATAAACTGTGAATGT--TATATTGATT-GAAAA--TTG-A--ATTATTT--GACACATAT--AA--CAATCATACATTTACCCAGGATA-TGAAATGCCAT-GGTAAG-CAG--ATTTTCAGAATATTT-------------AAGGGATCATTTT---AGATAATC---T--TCAGAAATGTTTGACG-ATTAAAACATGGCAGTTCGCAAGATGTGAATTTTGATTAT---TGTGTTGAACTACATGT-ATATCAAGATGAAAATTACGGTAAAAATACAGTGTGGATATCATATATATACATGTATTATCTTTTGCTCAATTCATGCAAATTATAAATATACCTAg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGACAATATGA---CCGAGATACAActct
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAATATAAAACCCGAAGTACA-TGGAA-------------AAT----CATGCTTTGTATT----------------------T--ATTGTGCATTCAG--TGTGAC--TGA-GATGTA-GGTTTCCTATCATTAGTATGACAAAAACTG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agtagttggcctcaattacctcataataccatcgaatgaattagacatatcaaatgcagttgcagataagttcaaatagtggaaagtctaacatagtattgtataatttataaatgaatgtgactaaatcaaataactaaatcttttgtggatatgtaacaaaataaaaacacctatctttaattcagcgccggttatcttcaattcaattggaaatacatgtagatcatattattagaccttagaccaaagcaaaagttcgtgcatcacatcccgaaaaaaattaaaagggaaagagatgcagcataagaacagttcaattaagggcaaagatgtattacattaaagattgatgaatcgagataggatctcccaaacttccaagctggcaggacaaaGACAT-GTTT--GACACGTTAAACAATGACAATTCGTAAGATGTGCACTTTCATAA---ATGTGTT------CTTTTAA-AAGAAGACGAGAAT--TA--CC----ATACAGTGTTGACTGCACATTTTTAAAAATTTTAT-------TCACTCTATGTGAATTAAAAATATACCTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGGCA-TATTA---CTGAGATGCAAAGG---A----------GAAA----AATGCGTTGTATTCATA---------------GTAT--AATATGCACACAG--TGTAAC--TCG-GATACAAGGTTTGCAGTCAAAAGTAC-----ATACTATGAATGT--TAACGTGATT-CAAAACTTG-AAGATG--TT--GATACAacccc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         attccgaaATACATTTTCAATGTACCCACAAATTTA------------AAATGATTTTGGTAAG-CAG--GTTT---GAATATCTA-ATGTATTATTCTAAAAGATC-T-------TCAGAAGT-GTTC--GACATGTCAAACAATGACAGTTCACAAGATCTGCATTTTGAT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          attCGAGATACAA-AGGAGA----------AAAAAGAACACGTTTTGTATTTAt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tagaatatgaattgggatagagagtccaattcctaattggcatatgactgaaatgtgcagattcccaaactTAAACCATGGTAGTTTACAAAATTTGC----TGGTCATGGATGTGTTGAAATACATGTAATTTTAAGATAACAAT--CAACGT--AA----AGTGGGGATAGCACACAT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATTC--ATG-ATTTA-TTGTTT--CTTTTAAATATAG--TATAAT--TGG-GATGTA--GTTTGCAGTCAAAAGTAa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgGACATTATGA---CCGCGAAACAATGGGGGA----------GAAA----TATATTTTGTATTGATAC--ATGTACTTCATTGCAC--AC--TGCATGC
gi|3                          :                              aagatatctctaatcgaattgaacttggatataattaaacataaattttgttcaataaaagatgttggttcaagtgaatggaattttataaatgtccaattcaattgtggatgatagcttttgttaatttataagttgtcgtgggtatgttacaaaatataaatactgtatatatccgtaatttaactcaacttatgttcaattcaattagaaatgggttcgtgctcacattcccaaaaactttgaaaatggaaagagagtagccaaaactatatatccattcaaaatgcaaaggataacaaatattatggtatgaatcggcataggactctcaaaaccccaactgaaaagTTGGCAATATGA---CGGATATACAATGGGAGG----------GAGA----CATGTTTTGCATTCACACGCATGCATTTC-TTGTAC--ATTGTGCATGCAG--TGTAAT--TGA-AATGTA-GGTTTGCAGTCAAAAGTATGAGATAAACTGTGAATGT--TATATTGATT-GAAAA-TTG-A--ATTATTT--GACACATAT--AAC--AATCATACATTTACCCAGGATA-TGAAATGCCAT-GGTAAG-CAG--ATTTTCAGAATATTTA-AGGGATCATTTTAGATAATC-T-------TCAGAAAT-GTTT--GACG-ATTAAAACATGGCAGTTCGCAAGATGTGAATTTTGATTAT---TGTGTTGAACTACATGT-ATATCAAGATGAAAATTACG--GTAAAAATACAGTGTGGATATCATATATATACATGTATTATCTTTTGCTCAATTCATGCAAATTATAAATATACCTAg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGACAATATGA---CCGAGATACAActct
gi|6                          : tttgttcaataaaagatagcttcaattgcataacgtcaaattggttgaattaaataagtgaattatataggccaatggaattgcagataagttcgaattgtagaaaattgaagatgagtttatttgatcgattcgttttgtaagtagatgcaatttgatttaaccttcagaacttgtatggatatgtcacaaagtataaacgctttaattcaactccaattattttcaagatgtgtcaatttcaataggcatgagacaccgcaggggttaatgtctgcatacctaaaaactttgaaaacggaaagagagctgcaaaaggaattaattaaaggcaaagtattgagaataaatctgaatagggattcctaaactcccaactggccgCAATATGA---CCGAAATACAATGG-AGA----------AAAA----CATATTTTGTATCCATA---ATTCATTG--TT---C--ATTATG--TGCAG--TGTAATATTGA-GATGTA-GGTTTGCAACCAAACGTACGACAAAAATTG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gcagggatttgtgtccgcatccgcgaaaactgagaatatataagagagcaaaaaaaaaaaaaaaagggggggggggggcaatgactgtattacgttatggagtatgactcggaatagggactaccaactggcaggaa--ATGC---T--TTGTATTTATTGTGCATTCAG--TGTGAC--TGA-GATGTA-GGTTTCCTATCATTAGTATGACAAAAACTGTGAATGTTATACAGTGATTAGAAA--TTGAA--ATG--GTAGGATATATAT--GATGTAATTATACAT-----------G-TGCAGTACCGT-AGAAAT-CAAGTGTTTTCAGAATATTGA-AGAAATGATTTTAAAAGATCATAAAATGATCAGAAGT-GTTT--GACA-ATTACGCCATGGTAGTTTGTAAGATATGCAT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGTGCATATATACTGTAAT--TGAAGATGCA-GGTTTGCAGTCTAAAGTTTGACAAAA-CTGTGAATGT--TACAGTGAC---AAA--T---A--ACA--TC---ATACATG---GA---AA------ATTTGCC------GATGAAATGGTTT-ATTAATACAG--GTTTTCATGATATTTTTAGGAATGAAGTAAGA-GATC-A-------TCTGA--TCGTTTTAGACATGCTAAACCATGGCAGCTCGCAAGATGCGCATTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GGCA-TGTG----CTGAGATATAA-AGGAGAAAAAAGAAACGAAA----CATGTTTTGTCTTCATA-------ATTA--T-GCAT--A----GCATACAG--TGTAAT--TGA-GATG
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TTATATAATCTCACGTTGGTTCAATTAAATAGTATATGGATGTATGTCCAGATCAATTGGAGATAAGTTCATATACTAAATGGGAAATATTTAATTCATAAGTAGATGTTACTGAATTAAACCTTCAAATCTTTTGTGAATATGTTATAAAGTACAAGCACTTATCTTTAATCAATCCCTACTCATTAGAAATAAGTAAAATTATTAGACCTGAGGCAGAGCAGGCATTTGTGCCCATATCCCCAAAAGCTTTGAAAAAGGAAAGAGAGTAGCA
Unaligned ( gi|10 ): TGTGACTGAATCAGACCTTCAAATCTTGTGTAGACATTAAGGGCTCGTTATCTTTACCTTTTGAACAAACACTTATCTTGAATTAAGGTAGAGATAGGTTGCATCATTAGACCTAGGCACAGGAGGAGTTGTGCATGCATCCACAAACAATAGGAATAAAGGAAAGAGTAGCA
Unaligned ( gi|11 ): CTTCAAATCATTTGTGGATATGTTACAAAGTAAAAAGGCATGTATTTAACTTAATACCATATGTCTTGCATTCAATTAAAAGTTATGTCAAATCATTTGACATAAGGCGTGGCTGAGAGTTTTGCGCCTGGCTGCATCCTCAAAAACCGCTTCAAAAGCAAA
Unaligned ( gi|15 ): TTATATGATCTCAAGTTGATTAATGAAGTGGAATTGGGAATGCATCTAATTCATGAAGTAAATAGCTAATTAATATAATGAACTAAACCTTCAAATCTTTTGTGCATATGTTGCAAGGTAAAAACA
Unaligned ( gi|19 ): CAAGTGAACTAGATATGTCCAATTCAATTGCAGAAGCGTTCAAATAGTAGAAA






Alignments
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Reference ( family-4136 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGGCAATATGA---CCGAGATACAATGGGAGA----------GAAA----CATGTTTTGTATTCATAC--ATGCATTT--TTGTAT--ATTGTGCATGCAG--TGTAAT--TGA-GATGTA-GGTTTGCAGTCAAAAGTACGACAAAAACTGTGAATGT--TACAGTGATTGAAAA-TTG-A--AC--GTT--GATACATAT--GACGTAATCATACATTTACC------G-TGAAATGNCGT-GGTAAN-CAG--GTTTTCAGAATATTTA-AGGAATNATTTTAGAAGATC-T-------TCAGA-AGTGTTTGACACGTTAAACCATGGCAGTTCGCAAGATGTGCATTTTGATNAT--ATGTGTTG-AA-TACATGTAATATNAAGACGANAAT--CG--GT--A-AATACAGTGTGGATAGCACATATNTANANGTNTTATCTTTTGCTCANTCCATGCGAATTANAAATATACCTA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tagaatatgaattgggatagagagtccaattcctaattggcatatgactgaaatgtgcagattcccaaactTAAACCATGGTAGTTTACAAAATTTGC----TGGTCATGGATGTGTTGAAA-TACATGTAATTTTAAGATAACAAT--CAACGT--A-A----AGTGGGGATAGCACACAT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATTC--ATG-ATTTA-TTGTTT--CTTTTAAATATAG--TATAAT--TGG-GATGTA--GTTTGCAGTCAAAAGTAa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgGACATTATGA---CCGCGAAACAATGGGGGA----------GAAA----TATATTTTGTATTGATAC--ATGTACTTCATTGCAC--AC--TGCATGC
gi|3                          :                              aagatatctctaatcgaattgaacttggatataattaaacataaattttgttcaataaaagatgttggttcaagtgaatggaattttataaatgtccaattcaattgtggatgatagcttttgttaatttataagttgtcgtgggtatgttacaaaatataaatactgtatatatccgtaatttaactcaacttatgttcaattcaattagaaatgggttcgtgctcacattcccaaaaactttgaaaatggaaagagagtagccaaaactatatatccattcaaaatgcaaaggataacaaatattatggtatgaatcggcataggactctcaaaaccccaactgaaaagTTGGCAATATGA---CGGATATACAATGGGAGG----------GAGA----CATGTTTTGCATTCACACGCATGCATTTC-TTGTAC--ATTGTGCATGCAG--TGTAAT--TGA-AATGTA-GGTTTGCAGTCAAAAGTATGAGATAAACTGTGAATGT--TATATTGATTGAAAA-TTG-A--ATTATTT--GACACATAT--AAC--AATCATACATTTACCCAGGATA-TGAAATGCCAT-GGTAAG-CAG--ATTTTCAGAATATTTA-AGGGATCATTTTAGATAATC-T-------TCAGA-AATGTTTGACG-ATTAAAACATGGCAGTTCGCAAGATGTGAATTTTGATTAT---TGTGTTG-AACTACATGT-ATATCAAGATGAAAATTACG--GTAAA-AATACAGTGTGGATATCATATATATACATGTATTATCTTTTGCTCAATTCATGCAAATTATAAATATACCTAg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGACAATATGA---CCGAGATACAActct
gi|6                          : tttgttcaataaaagatagcttcaattgcataacgtcaaattggttgaattaaataagtgaattatataggccaatggaattgcagataagttcgaattgtagaaaattgaagatgagtttatttgatcgattcgttttgtaagtagatgcaatttgatttaaccttcagaacttgtatggatatgtcacaaagtataaacgctttaattcaactccaattattttcaagatgtgtcaatttcaataggcatgagacaccgcaggggttaatgtctgcatacctaaaaactttgaaaacggaaagagagctgcaaaaggaattaattaaaggcaaagtattgagaataaatctgaatagggattcctaaactcccaactggccgCAATATGA---CCGAAATACAATGG-AGA----------AAAA----CATATTTTGTATCCATA---ATTCATTG--TT---C--ATTATG--TGCAG--TGTAATATTGA-GATGTA-GGTTTGCAACCAAACGTACGACAAAAATTG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gcagggatttgtgtccgcatccgcgaaaactgagaatatataagagagcaaaaaaaaaaaaaaaagggggggggggggcaatgactgtattacgttatggagtatgactcggaatagggactaccaactggcaggaa--ATGC---T--TTGTATTTATTGTGCATTCAG--TGTGAC--TGA-GATGTA-GGTTTCCTATCATTAGTATGACAAAAACTGTGAATGTTATACAGTGATTAGAAA-TTGAA--AT--GGTAGGATATATAT--GATGTAATTATACAT-----------G-TGCAGTACCGT-AGAAAT-CAAGTGTTTTCAGAATATTGA-AGAAATGATTTTAAAAGATCATAAAATGATCAGA-AGTGTTTGACA-ATTACGCCATGGTAGTTTGTAAGATATGCAT
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GGCA-TGTG----CTGAGATATAA-AGGAGAAAAAAGAAACGAAA----CATGTTTTGTCTTCATA-------ATTA--T-GCAT--A----GCATACAG--TGTAAT--TGA-GATG
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4136 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGGCAATATGA---CCGAGATACAATGGGAGA----------GAAA----CATGTTTTGTATTCATAC--ATGCATTT--TTGTAT--ATTGTGCATGCAG--TGTAAT--TGA-GATGTA-GGTTTGCAGTCAAAAGTACGACAAAAACTGTGAATGT--TACAGTGATTNAAAA-TTG-A--AC--GTT--GATACATAT--GACGTAATCATACATTTACC------G-TGAAATGNCGT-GGTAAN-CAG--GTTTTCAGAATATTTA-AGGAATNATTTTAGAAGATC-T-------TCAGA-AGTGTTTGACACGTTAAACCATGGCAGTTCGCAAGATGTGCATTTTGATNAT--ATGTGTTG-AA-TACATGTAATATNAAGACGANAAT--CG--GT--A-AATACAGTGTGGATAGCACATATNTANANGTNTTATCTTTTGCTCANTCCATGCGAATTANAAATATACCTA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAATATAAAACCCGAAGTACA-TGGAA-------------AAT----CATGCTTTGTATT----------------------T--ATTGTGCATTCAG--TGTGAC--TGA-GATGTA-GGTTTCCTATCATTAGTATGACAAAAACTG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      agtagttggcctcaattacctcataataccatcgaatgaattagacatatcaaatgcagttgcagataagttcaaatagtggaaagtctaacatagtattgtataatttataaatgaatgtgactaaatcaaataactaaatcttttgtggatatgtaacaaaataaaaacacctatctttaattcagcgccggttatcttcaattcaattggaaatacatgtagatcatattattagaccttagaccaaagcaaaagttcgtgcatcacatcccgaaaaaaattaaaagggaaagagatgcagcataagaacagttcaattaagggcaaagatgtattacattaaagattgatgaatcgagataggatctcccaaacttccaagctggcaggacaaaTGTTTGACACGTTAAACAATGACAATTCGTAAGATGTGCACTTTCATAA---ATGTGTT-------CTTTTAA-AAGAAGACGAGAAT-------T--ACCATACAGTGTTGACTGCACATTTTTAAAAATTTTAT-------TCACTCTATGTGAATTAAAAATATACCTA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          attCGAGATACAA-AGGAGA----------AAAAAGAACACGTTTTGTATTTAt
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATTC--ATG-ATTTA-TTGTTT--CTTTTAAATATAG--TATAAT--TGG-GATGTA--GTTTGCAGTCAAAAGTAa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgGACATTATGA---CCGCGAAACAATGGGGGA----------GAAA----TATATTTTGTATTGATAC--ATGTACTTCATTGCAC--AC--TGCATGC
gi|3                          :                              aagatatctctaatcgaattgaacttggatataattaaacataaattttgttcaataaaagatgttggttcaagtgaatggaattttataaatgtccaattcaattgtggatgatagcttttgttaatttataagttgtcgtgggtatgttacaaaatataaatactgtatatatccgtaatttaactcaacttatgttcaattcaattagaaatgggttcgtgctcacattcccaaaaactttgaaaatggaaagagagtagccaaaactatatatccattcaaaatgcaaaggataacaaatattatggtatgaatcggcataggactctcaaaaccccaactgaaaagTTGGCAATATGA---CGGATATACAATGGGAGG----------GAGA----CATGTTTTGCATTCACACGCATGCATTTC-TTGTAC--ATTGTGCATGCAG--TGTAAT--TGA-AATGTA-GGTTTGCAGTCAAAAGTATGAGATAAACTGTGAATGT--TATATTGATTGAAAA-TTG-A--ATTATTT--GACACATAT--AAC--AATCATACATTTACCCAGGATA-TGAAATGCCAT-GGTAAG-CAG--ATTTTCAGAATATTTA-AGGGATCATTTTAGATAATC-T-------TCAGA-AATGTTTGACG-ATTAAAACATGGCAGTTCGCAAGATGTGAATTTTGATTAT---TGTGTTG-AACTACATGT-ATATCAAGATGAAAATTACG--GTAAA-AATACAGTGTGGATATCATATATATACATGTATTATCTTTTGCTCAATTCATGCAAATTATAAATATACCTAg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGACAATATGA---CCGAGATACAActct
gi|6                          : tttgttcaataaaagatagcttcaattgcataacgtcaaattggttgaattaaataagtgaattatataggccaatggaattgcagataagttcgaattgtagaaaattgaagatgagtttatttgatcgattcgttttgtaagtagatgcaatttgatttaaccttcagaacttgtatggatatgtcacaaagtataaacgctttaattcaactccaattattttcaagatgtgtcaatttcaataggcatgagacaccgcaggggttaatgtctgcatacctaaaaactttgaaaacggaaagagagctgcaaaaggaattaattaaaggcaaagtattgagaataaatctgaatagggattcctaaactcccaactggccgCAATATGA---CCGAAATACAATGG-AGA----------AAAA----CATATTTTGTATCCATA---ATTCATTG--TT---C--ATTATG--TGCAG--TGTAATATTGA-GATGTA-GGTTTGCAACCAAACGTACGACAAAAATTG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gcagggatttgtgtccgcatccgcgaaaactgagaatatataagagagcaaaaaaaaaaaaaaaagggggggggggggcaatgactgtattacgttatggagtatgactcggaatagggactaccaactggcaggaa--ATGC---T--TTGTATTTATTGTGCATTCAG--TGTGAC--TGA-GATGTA-GGTTTCCTATCATTAGTATGACAAAAACTGTGAATGTTATACAGTGATTAGAAA-TTGAA--AT--GGTAGGATATATAT--GATGTAATTATACAT-----------G-TGCAGTACCGT-AGAAAT-CAAGTGTTTTCAGAATATTGA-AGAAATGATTTTAAAAGATCATAAAATGATCAGA-AGTGTTTGACA-ATTACGCCATGGTAGTTTGTAAGATATGCAT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGTGCATATATACTGTAAT--TGAAGATGCA-GGTTTGCAGTCTAAAGTTTGACAAAA-CTGTGAATGT--TACAGTGAC---AAA-T---A--AC--ATC---ATACATG---GA---AA------ATTTGCC------GATGAAATGGTTT-ATTAATACAG--GTTTTCATGATATTTTTAGGAATGAAGTAAGA-GATC-A-------TCTGATCGTTTTAGACATGCTAAACCATGGCAGCTCGCAAGATGCGCATTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GGCA-TGTG----CTGAGATATAA-AGGAGAAAAAAGAAACGAAA----CATGTTTTGTCTTCATA-------ATTA--T-GCAT--A----GCATACAG--TGTAAT--TGA-GATG


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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4136 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTGGCAATATGA---CCGAGATACAATGGGAGA----------GAAA----CATGTTTTGTATTCATAC--ATG-A-TTTATTGTAC--ATTGTGCATGCAG--TGTAAT--TGA-GATGTA-GGTTTGCAGTCAAAAGTACGACAAAAACTGTGAATGT--TACAGTGATTNAAAA-TTG-A--AC--GTT--GATACATAT--GACGTAATCATACATTTACC------G-TGAAATGNCGT-GGTAAN-CAG--GTTTTCAGAATATTTA-AGGAATNATTTTAGAAGATC-T-------TCAGA-AGTGTTTGACACGTTAAACCATGGCAGTTCGCAAGATGTGCATTTTGATNAT--ATGTGTTG-AA-TACATGTAATATNAAGACGANAAT--CG--GT--A-AATACAGTGTGGATAGCACATATNTANANGTNTTATCTTTTGCTCANTCCATGCGAATTANAAATATACCTA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          attCGAGATACAA-AGGAGA----------AAAAAGAACACGTTTTGTATTTAt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tagaatatgaattgggatagagagtccaattcctaattggcatatgactgaaatgtgcagattcccaaactTAAACCATGGTAGTTTACAAAATTTGC----TGGTCATGGATGTGTTGAAA-TACATGTAATTTTAAGATAACAAT--CAACGT--A-A----AGTGGGGATAGCACACAT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATTC--ATG-A-TTTATTGTTT--CTTTTAAATATAG--TATAAT--TGG-GATGTA--GTTTGCAGTCAAAAGTAa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgGACATTATGA---CCGCGAAACAATGGGGGA----------GAAA----TATATTTTGTATTGATAC--ATGTACTTCATTGCAC--AC--TGCATGC
gi|3                          :                              aagatatctctaatcgaattgaacttggatataattaaacataaattttgttcaataaaagatgttggttcaagtgaatggaattttataaatgtccaattcaattgtggatgatagcttttgttaatttataagttgtcgtgggtatgttacaaaatataaatactgtatatatccgtaatttaactcaacttatgttcaattcaattagaaatgggttcgtgctcacattcccaaaaactttgaaaatggaaagagagtagccaaaactatatatccattcaaaatgcaaaggataacaaatattatggtatgaatcggcataggactctcaaaaccccaactgaaaagTTGGCAATATGA---CGGATATACAATGGGAGG----------GAGA----CATGTTTTGCATTCACACGCATGCA-TTTCTTGTAC--ATTGTGCATGCAG--TGTAAT--TGA-AATGTA-GGTTTGCAGTCAAAAGTATGAGATAAACTGTGAATGT--TATATTGATTGAAAA-TTG-A--ATTATTT--GACACATAT--AAC--AATCATACATTTACCCAGGATA-TGAAATGCCAT-GGTAAG-CAG--ATTTTCAGAATATTTA-AGGGATCATTTTAGATAATC-T-------TCAGA-AATGTTTGACG-ATTAAAACATGGCAGTTCGCAAGATGTGAATTTTGATTAT---TGTGTTG-AACTACATGT-ATATCAAGATGAAAATTACG--GTAAA-AATACAGTGTGGATATCATATATATACATGTATTATCTTTTGCTCAATTCATGCAAATTATAAATATACCTAg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGACAATATGA---CCGAGATACAActct
gi|6                          : tttgttcaataaaagatagcttcaattgcataacgtcaaattggttgaattaaataagtgaattatataggccaatggaattgcagataagttcgaattgtagaaaattgaagatgagtttatttgatcgattcgttttgtaagtagatgcaatttgatttaaccttcagaacttgtatggatatgtcacaaagtataaacgctttaattcaactccaattattttcaagatgtgtcaatttcaataggcatgagacaccgcaggggttaatgtctgcatacctaaaaactttgaaaacggaaagagagctgcaaaaggaattaattaaaggcaaagtattgagaataaatctgaatagggattcctaaactcccaactggccgCAATATGA---CCGAAATACAATGG-AGA----------AAAA----CATATTTTGTATCCATA-------A-TTCATTGTTC--ATTATG--TGCAG--TGTAATATTGA-GATGTA-GGTTTGCAACCAAACGTACGACAAAAATTG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gcagggatttgtgtccgcatccgcgaaaactgagaatatataagagagcaaaaaaaaaaaaaaaagggggggggggggcaatgactgtattacgttatggagtatgactcggaatagggactaccaactggcaggaaTTGTATTTATTGTGCATTCAG--TGTGAC--TGA-GATGTA-GGTTTCCTATCATTAGTATGACAAAAACTGTGAATGTTATACAGTGATTAGAAA-TTGAA--AT--GGTAGGATATATAT--GATGTAATTATACAT-----------G-TGCAGTACCGT-AGAAAT-CAAGTGTTTTCAGAATATTGA-AGAAATGATTTTAAAAGATCATAAAATGATCAGA-AGTGTTTGACA-ATTACGCCATGGTAGTTTGTAAGATATGCAT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgctTGTGCATATATACTGTAAT--TGAAGATGCA-GGTTTGCAGTCTAAAGTTTGACAAAA-CTGTGAATGT--TACAGTGAC---AAA-T---A--AC--ATC---ATACATG---GA---AA------ATTTGCC------GATGAAATGGTTT-ATTAATACAG--GTTTTCATGATATTTTTAGGAATGAAGTAAGA-GATC-A-------TCTGATCGTTTTAGACATGCTAAACCATGGCAGCTCGCAAGATGCGCATTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GGCA-TGTG----CTGAGATATAA-AGGAGAAAAAAGAAACGAAA----CATGTTTTGTCTTCATA------------ATTATGC--ATAG--CATACAG--TGTAAT--TGA-GATG
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TTATATAATCTCACGTTGGTTCAATTAAATAGTATATGGATGTATGTCCAGATCAATTGGAGATAAGTTCATATACTAAATGGGAAATATTTAATTCATAAGTAGATGTTACTGAATTAAACCTTCAAATCTTTTGTGAATATGTTATAAAGTACAAGCACTTATCTTTAATCAATCCCTACTCATTAGAAATAAGTAAAATTATTAGACCTGAGGCAGAGCAGGCATTTGTGCCCATATCCCCAAAAGCTTTGAAAAAGGAAAGAGAGTAGCA
Unaligned ( gi|10 ): TGTGACTGAATCAGACCTTCAAATCTTGTGTAGACATTAAGGGCTCGTTATCTTTACCTTTTGAACAAACACTTATCTTGAATTAAGGTAGAGATAGGTTGCATCATTAGACCTAGGCACAGGAGGAGTTGTGCATGCATCCACAAACAATAGGAATAAAGGAAAGAGTAGCA
Unaligned ( gi|11 ): CTTCAAATCATTTGTGGATATGTTACAAAGTAAAAAGGCATGTATTTAACTTAATACCATATGTCTTGCATTCAATTAAAAGTTATGTCAAATCATTTGACATAAGGCGTGGCTGAGAGTTTTGCGCCTGGCTGCATCCTCAAAAACCGCTTCAAAAGCAAA
Unaligned ( gi|15 ): TTATATGATCTCAAGTTGATTAATGAAGTGGAATTGGGAATGCATCTAATTCATGAAGTAAATAGCTAATTAATATAATGAACTAAACCTTCAAATCTTTTGTGCATATGTTGCAAGGTAAAAACA
Unaligned ( gi|19 ): CAAGTGAACTAGATATGTCCAATTCAATTGCAGAAGCGTTCAAATAGTAGAAA