lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 22222222222222222222222 222222222222 1111 1111111 11 1 1111111111111 11 22222 111111 111111 1111 333 2222222222222222 5555555555555 1 888888 1111111 11 444444444 1111 1 111111111 11111111 11 2 1111 111111 1 111 6666666666666666666666 11111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 11111 2222 5555555555555555555 1111 11 11111 11 22222222 11 11 1111 111 1111 11111111 1111111 1111 111
lowQualScore : 77 7777 6666666 22 77777777 55555555555555555555555 666 1 333 888888888888 1 8888 44 333 4444444 2 333 22 2 2 88 2 2 5555 2 888888888 2 6 2 99 2222222222222 2 11 444 2 444 33 2 33 2 44 99999 888888 44 888888 000000 9999 55 777 2 55 8888 55 4 4 555 4 4 4 4 5555555555555555 8888 4 4 4 777 4 4 9999999999999 2 888 999999 66 4 4 4444444 66 88 333333333 55 3333 2 6 77777 4 3 666666666 2 99 55555555 55 00 1 3 3 3 9999 3 7777 55 000000 0 3 000 3 44 777 4 777 4 777 4 0000000000000000000000 4 8 8 2 8888 55 4 4 11111 4 55 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5 66 22222 0000 5 66 66 6 6666666666666666666 6 3333 5 44 5 33333 33 55555555 5 5 66 4 11 55 4 9999 7777 555 1111 2 2 2 33 88888888 2 8 4444 555 2 3333333 88 44 44 99999 8888 222 3 66 5
lowQualScore : .. .... ....... .. ........ ....................... ... . ... ............ . .... .. ... ....... . ... .. . . .. . . .... . ......... . . . .. ............. . .. ... . ... .. . .. . .. ..... ...... .. ...... ...... .... .. ... . .. .... .. . . ... . . . . ................ .... . . . ... . . ............. . ... ...... .. . . ....... .. .. ......... .. .... . . ..... . . ......... . .. ........ .. .. . . . . .... . .... .. ...... . . ... . .. ... . ... . ... . ...................... . . . . .... .. . . ..... . .. ....................................................... . .. ..... .... . .. .. . ................... . .... . .. . ..... .. ........ . . .. . .. .. . .... .... ... .... . . . .. ........ . . .... ... . ....... .. .. .. ..... .... ... . .. .
lowQualScore : 00 1111 8888888 99 66666666 22222222222222222222222 777 9 333 444444444444 0 0000 55 555 2222222 0 666 99 5 5 00 5 5 3333 5 555555555 7 7 7 00 4444444444444 7 77 777 7 777 99 9 99 9 22 22222 888888 22 222222 555555 3333 55 000 5 55 5555 55 0 0 444 0 0 0 0 8888888888888888 5555 0 0 4 888 4 3 6666666666666 9 000 222222 11 0 0 4444444 11 33 444444444 55 9999 0 2 00000 0 2 000000000 3 22 11111111 55 00 8 6 6 6 1111 6 7777 00 555555 9 6 000 6 88 555 0 000 0 888 4 9999999999999999999999 0 0 0 8 5555 55 0 0 11111 4 99 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 99 55555 6666 0 99 99 7 3333333333333333333 0 5555 7 33 7 44444 88 00000000 0 0 66 4 00 55 0 8888 7777 000 5555 7 5 5 44 33333333 5 6 9999 000 9 7777777 55 22 22 44444 7777 777 6 77 0
consensus : GGTGCG-CGGT----AT-------T--ACC--------GGT--------A-----T--------TT---T-TCTT---GTA-C----C-G--GTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-------AAGCCAAATACC-GGTA--CA--TT-C-AA-GTCCAA-T-A----A-CT------C--TT-AGCAA-AAATGT--AAAATTT--AAA-CA----A-AGCAAAAA-TA---AT-T---AAATA--T-CAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAAC----A-GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TGA--T--AATTACATNTGT--AAAAACAATTA----TAA--TTTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAA--T----N-AAATTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTAT--T--AA-GAAA---------ACATTTAA-TATCATGT------AGA--TT-ATAAATAT-T-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AA-A---AC-T-A--TG---TG----TAG-A-CAAGA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAG-----T-ACC-GTA-TAAGA-TTA-------TTGTATAA-GATTTTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAATG-A--A--TTTAAATC-AAAT------A----CTT-----TCTCTTTTT--T-ATTTACATTG-GNGG-AATTAACAG--CTGATT--ATA--T--GC-AATA-AATCACAGCTAA-AAA-CGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-A---CT----AAAGATTAAAT---CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTAT-------GTAC-CGCGGTA---TTT---TT-CAAATATTACG------GT--ATA--C--C----GCG---GTA-CGTT-TTTTCTTCGCGGT-ACCCA
Reference ( gi|1 ) : GGTGCG-TGGT----AT-------T--ACC--------GGT--------A-----C--------TT---T-TCTT---GTG-C----C-A--GTATGTA-T-TGC--GGTACAC---A-------AAGCCAAATACC-GGTA--TA--TT-C-AA-TTCCAA-T-A----A-CT------C--TT-ACCAA-AAATGT--AAAATTT--AAA-CA----A-AGCAAAAA-CA---AT-T---AAATA--T-CAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTATC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAAC----A-GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACATA--TGA--TACAAGTACATTTGT--AAAAACAATTACCGGTAA--TTTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAA--T---AA-AAATTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTCAT--T--AA-GAAA---------ACATTTAA-TATCATGT------ATA--TC-AT-AATAT-T-TTATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AA-A---TC-T-A--TA---TG----TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACAC----T--G-CTGT-ATAG-----T-ATT-GTA-TAAAA-TTATCCTGGTTTATATAA-GATTATAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---CAAATG-A--A--TTTAAATC-AAAT------T----CTT-----TCCCTTTTT--T-ATTTACATTG-GAAG-AATTAATGG--CTGATT--ATA--T--GA-AATA-AATCACAACTAA-AAA-TGATAATAATGG-AATCA-TTT--T-A---AT----AAAGATTAAAT---CTG---TGG-T-ATA-CCGT--GGTAT-------ATAC-CGCAGTA---TTT---TT-CAAATATTACA------GT--ATA--C--C----ACG---TTA-AGTT-TTTTCTTTGCGGT-ACCCA
gi|7 : GGTGTG-CGGT----ATACCGGTAT--ACC--------GGT--------A-----C--------TT---T-TCTT---GTA-A------G--GTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-------AAGCCAAATACC-GGTA--CA--TTTC-AA-GTCCAA-T-A----A-CT------C--TTTAGCAA-AAA-GT--AAAATT---AAA-CA----A-AGCAAAA--TA---AT-T---AAATA--T-CAA--GAG-AAACA--C-----AAGATAACATTAAATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GGTGT-G-TCT---------------AATAACAACTA-GT-ACAATAGCCTCTGA-GGGT---A-AATGTA--TG------AATTACATATGT---AAAACAAT------TAA--TTTA-TTAT-TTATAATAAGAA-------AACACA--T--CAAAATTT---AATAAATTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTAT--T--AA-GAAA---------ACATTTAA-TATCATAT------AGA--TT-ATAAATAT-T-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-ATT--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGATAAACCCCGAGT---AA-A---ACTT-A--TA---TG----TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACAC----T--G-CTTT-ATAG-----T-ATT-GTA-TAAGA-TTAT------------------------ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTAAG-TTCT--GTC-----ACTAATTTC---CAAATG-A--A--TTTAAAT
gi|9 : aGGTGCG-CGGT----AT-------T--ACC--------GGT--------A-----T--------TT---T-TCTA---GTA-C----TTG--GTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-------AAGCCAAATACC-GGTA--CA--TT-CAAA-GTCCAA-T-A----A-CT------CTTTT-AGCAA-AAATGT---AAATTT-------A----A-AGCAAAAA-TA---AT-T---AAATA--T-CAA--GAG-AAACA--CCATT-AA------AT--GATAGG-CTAT------CTATAA------GTACCTATAT--G---TAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT---CT-TC-ATCCCATCGTAATGA-AATCTCAAAA-GGTAT-G-TC------------------TAAC----A-GT-ACAATAGCCTCT-A-GGGT---A-AACGTA--TG------AATTACATATGT--AAAAGCAAT------TAA--TTTA-TTA---TATGAT-AGAA-------AACACATTT--CAAAAC-T-------AATTATCAATGGA--ATA--ATATTCTACTTTTAT--T--AA-G-AA---------ACATTTAATTATCATGT------AGA--TT-ATAAATAT-T-TCATGGCCCTT-G-----A--T------GGATT-TA---CCCAGG-T--AAA--T
gi|8 : gGGTGCG-CTGT----AT-------T--ACC--------GGT--------A-----TACCTGTATTT---T-TCTT---GTA-C----C-G--GTACGTA-C-CGC--AGTACAC---A-------AAGCCAAATACC-GGTA--TA--TT-G-AA-GTCCAA-T-A----A-CTCTAAGAC--TT-AACAA-AATTGT--AAAATTT--AAA-CA----A-AGGAAGTA---------T---AAGTA--T-CAA--GAG-AATCA--C-----GA------AT--ACTAGGCCTAT------CTA----------------TAT--G---TACGCTGTCACTCACT--TTATT-------T--ACT-TC-AGCCCATCGTAATG---------AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAA---------------------TAA-GGGT---A-AACGTA--TG------AAGTATATGTGT--AAAAACAA-TA-----AA-----A-TCAT-TTATGATAAGAA-------AACATA--T--CAAAC--TAAAAA-AAAATATCAATGGA--ATG--ATATTATA-TTTCAT--T--AA-G-AA---------ACATTTAA-TATCAGGT------AGA--TT-ATAAATAT-T-TTATG----TT-GA----A--T------GG-AT-GA---CCCAGG-TC-GAA--TACCATTTCCACT-AA---TT-AGCCAAACCTCt
gi|18 : GATGCG-CGGT----AT-------T--TCC--------GGT--------A-----T--------TT---T-TTTTTTTATA-C----C-G--TTACATA-C-CGC--GGTACAC---A-------AAGCCAAATACC-AGTA--TA--TT-C-AA-GTCCAA-T-A----A-CT------C--TT-AACAA-AATTGCA-AAAATTT--AAA-CA----A-AGCAAAAA---------T---GAATA--TGTAA--GCG-Aacat
gi|19 : gaGGTGTA-TAAT----AT-------T--ATC--------GGTTTAATGGTA-----T--------TT---T-TCTT---GTA-C----C-A--GTACATA-C-TAA--AGTACAC---A-------AGATCAAATACC-GGAA--AA--TT-T-AA-GTCTGA-T-A----G-CT------C--GT-A-CAC-ACATGT--AAAATTG--AAA-CA----ATAGCAAAAATCATACAT-T---AAAgtagactcaa
gi|17 : GATGCGGCGGT----AT-------T---TC--------GGT--------AATTTTT--------TT---T-TTTT---ATA-C----C----GTTCATA-CGCGC--GGTA-AC---A-------AAGCCAAATACA-GTAA--TA--TT-C-AA-GTCCAAGT-A----A-CT------C--TT-AACAA-AATTGCA-AAAATTTTAAAA-CA----A-AGCAAAAT-GA---AT-------ATG--T-TAAGCGAGTAGACT--C------A------AT--AATaacaa
gi|14 : agaGGTGCG-CAGTTAATAT-------T--ACC--------GGTTA------A-----CCGGATT--TT---T-TCTT---GTA-C----T----GTACGTA-C--GCCTGGTACACCAAA-------AAGCCAA-TACCTGATA--TACATT-C-AA-GGCCAA-T-ATTAAG-CT---------TT-AGCAA-AAATGTTAAAAATTT--TTT-TT----A-AACTAAAA-CA---AA-T---AAAT-----CAA--GAG-AAA----------GA------AC--AATAct
gi|23 : aaGGGGCG-TGGC----AT-------TTGACC--------GGT--------A-----TAT------TT---T-TCTT---GTA-C----T-G--GTATGTA-C-AGC--Gtcttaagctattcctttatttaatctcaaatctatggcctgacatacgttaatcaatctttacatatcg
gi|10 : GCGCG-CGGT----AT-------T--ACC--------GGT--------A-----T--------TT---T-TCTA---GTA-C----T-G--GTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-------AAGCCAAATTAC-GGTA--CA--TT-C-AA-GTCCAA-T-A----ACCT------T--TT-AGCAA-AAATGT--AAAATTT-------A----A-AGCAAAAA-TA---AT-T---AAATA--T-CAA--GAG-AAACA--CAGT--AA------AT--GATA-GCATAT------CTATAA------GTACC--TAT--ATGTTAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GGTAT-G-TC------------------TAAC----A-GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TG------AATTACATATGT--AAAAGCAAT------TAA--TTTA-TTAT-a
gi|16 : agtTGCG-CGGT----AT-------T--ACCGGTATACCGGT--------A-----C--------TT---T-TCTT---GTA-C----T-G--GTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-------AAGCCAAATACC-GGTA--CA--TT-C-AA-GTCCAA-T-A----A-CT------C--TT-AGCAA-AAATTT--ACGATTT--AAA-CA----A-AGCAAAAA-TA---AT-T---AAATA--T-CAA--GAG-AAACA--CG----AG------AT--AATAGGTCCAT------CTATAA------ATAgcaatttacctgggtaaatccatcaagggccatgaaatatttataatctacatgataattaaatgtttcttaataaaagtagaatattattccattgataattagttttgaaatgtgttttc
gi|6 : gtGGT----AT-------T--ACC--------GGT--------A-----T--------TT---T-TCTA---GTA-C----T-G--GTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-------AAGCCAAATACT-GGTA--CA--TT-C-AA-GTCCAA-T-A----A-CT------C--TT-AGCAG-AAATGT--AAAATTC--AAA-CA----A-AGCAAAAA-TA---AT-TTAAAAATA--T-CAA--GAG-AAACAGTT-----AA------AT--AATAGGCATATCTAGGCCTATAA------GTACCTATAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTTAATGAT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTA-AAA-CTTAT-G-TCT---------------AATATC----ATGT-A
gi|4 : GT----AT-------T--ACC--------GGT--------A-----T--------TT---T-TCTA---GTA-C----TTG--GTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-------AAGCCAAATAC--GGTA--CA--TT-C-AA-GGCCAA-T-A----A-CT------T--TT-AGCAA-AAATGT--AAA-TTT--AAA----------GCAAAAA-TA---AT-T---AAATA--T-CAA--GAG-AAA-A--CCTGTTAA------AT--GATAGGCATAT------CTATAA------GTACC--TATATG---TAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TCCATCC--TCGTAATGA--AACTC-AAAAGGTAT-G-TCT---------------AA---C----A-GT-ACAATAGCTCCTA--GGGT---A-AACGTA--TGA------ATTACATATG---AAAAGCAATTA------A--TTTA-TTAT---ATGATAAGAA-------AACACA--TTTCAAAA--C---TC-AAATTATCAATGGA--TA---ATATTCTACTTTTAT--T--AA-GAAA---------ACATTTAT-TATCATGT------AGA--TT-TT-AATAT-TATCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CC-AGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACC--GAGT---AA-G---AC-T----TA---AGGT--TAG-A-CAAGACTGCAGAGAC-C----T--G-ATGG-CTAG-----T-AC----A-TA--------------TTGTATAAAGATTTTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCTT-GTC-----ACAGATTTC---AAAA-G-ATGA--TTTAA-TC-AAAT------A----CTTAATTTTCTCTTTTT--T-ATTTACATTG-GTGG-AATTAACAG--CTGATT--ACA--A--GGCAATA-AATCACAACTAA-AAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-A---CT----AAAGATTAAATG--CTGCACCGGCT-ATA-CCGT--GGTAT-------GTAC-CGC-GTA---TTT---TT-CAAATATTACG------GT--ATA--C--C-----CG---GTACA--T-TTTTCTTTGCGGTAACCCAgattataacatttgaatggtttacccaggtcaatgccatttacgccaataagacaaacccgagtaaaacttatgtgtagacaagatgcggagacacgtactgctgtgatagtaccatatgtatatgattttatacttatttaaactttagttctgtcacagatttcaaaatgaatttaaatcaaatactttctcttttttatttacattgtggaattaacagctgattacatatgcaataaatcacagctaaaaacgataataatggaatcgttttactaaagattaaatctgtggtccatggtatgtaccgcgtatttttcaaatattacgttataccgcgtacgtgacgttttttcttcgcggtaccca
gi|19 : atgcT-------T--TCC--------GGT--------A-----T--------TT---GATCTT---GTG-TACTTT-A--GTATGTA-C-T----GGTACAA---G-------AA---AAATACC--------A--TT-A-AA---CCGA-T-A----A-
gi|7 : ggtgtataata-------T--ACC--------GGT--------A-----T--------TT---G-GCTT------------------TGTGTA-C-CGC--GGTACGT---ACCTTAC-AAGAAAAGTACC-GGTA--TA--atttaagtctgatagctcgtacacacatgtaaaattgaaacaatagcaaaaatcatacattaaaaacaa
gi|2 : aggtgtgcggtataccgg-------T--ATC--------GGT--------A-----C--------TT---T-TCTA---GTA-C----T-G--GTACGTA-C-TGC--AGTACAC---A-------AAGTGAAATACC--TTA--CA--TT-C-AAGCTCCAA-T-A----A-CT------C--TT-AGCAA-AAATAT--AAAATT---------------------AA-TA---AT-T---AAATA--T-CAA--GTA-AAACA--CAGTT-AA------AT--AATAGGCATATCAGC--CTATAAAGTACGGTACCTATAT--G---TACGCTGTG-CTCACTTATTATTTT-----T--ACT-TC--TCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GGTATGG-TCT---------------AATAAC----A-GT-ACAATAGCCTCTAAGGGGT---AGAACGTA---GAATTACAGA-------GT--AAAAACAAT------TAA--TTTATTTATCTTATGATAAG-A-------AACACA--TTCCAAAA--T----T-AAATCATCAATGGAATAAA--ATA-TCTA-TTTTAA--T--GA-GAAA---------ACATTTAA-TATCATGT------AGA--TT-ATAAATAT-T-TCATAC---TT-GAATGCA--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TCAAAA--TGCAATTTACGCCGAA---TT-AGACAAA-CCCGAGT---AA-AAACTT-C-A--TAG--TA----TAG-ACCAAAA-TTGAGAGACAC----T--G-CTGT-TTAG-----T-ACC-ATA-----------------TTGTATAA-CATTTTATCATTTATT-------------TAAACTTTAA-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAATG-A--AACTTTAAA-A-GAAT------A----CTT-----TCTGGTTTTGGT-ATTTACATTG-GTGGAAATTAACAG--CTGATTACATA--T--GC-AATA-AATCAC----AA-AAA-CGATAATAATGG-AATTG-TTT--C-A---CT----AAAGATTAAAT---CTG---CAG-T-ATA-CCGT--GGTAT-------GTAC-CGCGGTA---TTT---TT-CAAATATTACG------GT--ATA--C--C----GCG---GTA-CATT-TTTTCTTCGCGGT-ACCCcatttcaagtccaataactctttagcaaaaagtaaaattaaacaaagcaaaataattaaatatcaagagaaacacaagataacattaaataggcctatctataagtacctatgtacgctgtgactcactttattttatacttcatcccatcgtaatgaaactcaaaggtgtgtctaataacaactagtacaatagcctctgagggtaaatgtatgaattacatatgtaaaacaattaatttattatttataataagaaaacacatcaaaatttaataaattatcaatggaaagatattctattttattaagaaaacatttaatatcatatagattataaatatttcatgttgaatggtttacccaggtcatttgccatttacgccaattagataaaccccgagtaaaacttatatgtagacaagatgcggagacactgctttatagtattgtataagattatacttatttttatgttcagaataaacttaagttctgtcactaatttccaaatgaatttaaat
gi|8 : agggtgcgcgtattacctgtataccggctg-------T--ACC--------GGT--------A-----T--------TT---G-GCTT------------------TGTGTA-C-TGC--GGTACGT---ACCGGTACAAGAAAAATACA-GGTA--TA--
gi|16 : ggtgcgctgtattaccgg-------T--ACC--------GGT--------A-----T--------TTGGCT-TTGT---GTA-C----C-GCGGTACGTA-C---C--AGTACAA---G-------AA---AAGTACC-GGTA--TA--tattgaagtccaataactctaagacttaacaaaattgtaaaatttaaacaaaggaagtataagtatcaagagaatcacgaatactaggcctatctatatgtacgctgtcactcactttatttacttcagcccatcgtaatgaaaggtatgtctaataataagggtaaacgtatgaagtatatgtgtaaaaacaataaaatcatttatgataagaaaacatatcaaactaaaaaaaaatatcaatggaatgatattatatttcattaagaaacatttaatatcaggtagattataaatattttatgttgaatggatgacccaggtcgaataccatttccactaattagccaaacctcacat
gi|11 : gttgcgcggtattaccgg-------T--ACC--------AAT--------A-----T--------TT---T-TCTT---GTA-C----G-G--GTACGTA-C-TGT--GGTACAC---A-------AAGCCAA-TACT-GGTA--TA--TT-C-AA-GTCCAA--------------------------CAA-AAATGT--AAAATTT--AAC-TAGTTGA-AGCAAAAA-TA---AT-T---AAGTC--T-GAA--GAG-AAAGA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------------------------------G---AACACTGTGACTT--T--TTTTTTT----ATTTCCA-TC-ATCCCATCATAATGA-AAGGT--ACA-TGTAT-G-TATATATATATATATATAAACAAC----A-GT-ACAATAGCCTCTAT-GATT---A-TATATG--CAA--TA-AATCAAAACTG----AAAACGATAA----TAA--TGAA-TCAT-TTcattcaagtccaataactcttagcaaaaatttacgatttaaacaaagcaaaaataattaaatatcaagagaaacacgagataataggtccatctataaata
gi|18 : g-------T--ACT--------GGT--------A-----T--------TTGGCT-TTGT---GTA-C----C-GCGGTATGTA----AC--GGTATAA---A-------AAAAAAAATACC-GGtactaattttaaaagattaaatctacagtataccctggtatataccacagtatttaaagtattacatgtatggtatactgtggtacgcttattcttcacgctgcc
gi|3 : gagatgcgcggtattt--------TT---T-CCTT---GTA-C----T-G--GTATGT--C-CGC--G-TACAC---A-------A-GCCAAATACC-TGTAAGCA--TT-C-AG-TCC--A-T-A----A-CT------C--TT-AGCAACAAATGT--AACATTTTTAAA-CAT---A-AGCAAAA--TA---ATAG---AAATA--T--AA--GAG-AA-CA--C-----AA------AT--CATATGCCTAA------TAATAA------GTACC--TAT--G---TAAGATGTGACTCACT--TTGTTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GATAT-GTTCT---------------AAT-AC----A-GTAACAATAGCCT-TAA-GGGTAAAA-AACGTAATTGA--T----TTACATCGTT--AAAAACA--TAT---TAATTTTTT-TTAT-TTATGATAAAAA-------AACACA--T--CAAAA--T----T-AAATAATCAATGGA--AAA--ATATTCTA-TTT-AT--TAAAA-GAAA---------ACA-TTAT-TATCTTAT------AGA--TTAAT-AAAATAT-TTAT-----TT-GA----A--T------GG-TTCTC---CCCAGG-TT-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TTAAGACAAACCCCGAGT---AA-A--------------------------A-CAATA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAG-----T--TT-GTA-TAAGA-TTA---------A-ATAA-TACTAT--------TTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCCTAGTC-----ACAGA-TTG---AAAATG-A--A--TTTAAATTAAAATATATAAT----TTT-----ACTCTCTTT--TAATTTACATTG-GAAG-AATTAACCA--GTGATT--ATA--T--GC-AATA-AATCACAGCTAA-AAA--GATAATAATGG-AATCGTTTT--T-A---CT----AAAAATTAAAT---CTG---CGG-TAATA-CC-T--GGTAC-------GTACACGCGGTA---TTT---TTCCAAATATTACG------GT--ATAAGC--C----GCG----TA-CGTT-TTATCTTCGCGGT-ACCCAtattcaagtccaataactcttaacaaaattgcaaaaatttaaacaaagcaaaaatgaatatgtaagcgagtagactcaa
gi|5 : ct---T-TCTT---GTAAC----T-G--GT-TGTAAC-CGCA-GGTACAC---AC------AAGCCAAATACC-TGTA--CA--TT-C-AAGTCCCAA-TTA----A-CT------C--TT-AGCAA-AAATGT--AAATTTT--AAAACA----A-A-CAAAAA-TA----T-T---AAATACTT-CAA--GAG-AAACA--C-----AA------AA--TATATGCCTA-------ATATAA------GTACC--TAT--G---TAAGCTGTGACTCACT--T-GTTTT----AT--ACTATC-ATCC-ATCGTAATGA--AACTC-AAA-GATAT-G-TCT---------------AATAAC----A-GT--CAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA---GA--TG-AATTACATCCGTTAAAAAACAATTA---ATTT--TTTT-TTAT-TTATGATAA-AA-------AACACA--T--CAAAA--T----T-AAATAATCAATGGA--AAAT-ATATTCTA-TTTTTT--A--AA-GAAA---------AC-TTTAT-TATCTTGT------AGA--TT-ATAAATAT-T-TTATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TC---CCCAGG-TT-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCGGAGT---AA-A----C-C-A--T--------------------A-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAG-----T-ATT-GTA-TAAGA-TTA-------TTA---------------ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TCCT--GTC-----ACAGATTT----GAAATGAA--A--TTTAAATT-AAATA-----TATTACTT-----TCTCTCTTT--T-ATTTACATTG-GAGG-AATTAACAGTTTTGA-T--ATA--T--GC-AATA-AATCACAGCTAA-AAA-AGATAATAATGG-AATCGTTTT--T-A---CT----AAAAATTAAAT---CTG---CGG-T-ATATCCGT--GGTAC-------GTAC-CGC-GTA----TT---TT-CAAATATTACG------GT--ATA--C--C----GCG---GTA-CGTT-TTATCTT--CGGT-a
gi|12 : TTA-TTTT-TTAT-ATAAAAACGAGAATAACATA--T--TGG----T---TA-AACTTATCA-TGCT--AAGGTATATTATA-TTCTA------------A---------AC-------TATTATGTGCTTTAATAGTTT-AT-GATAT-T-TTATG----TTTGA----AAGT------GGATT-TATCGCCGAGG-AT-AAAAATGGCATT-ACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGACT---AA-A---AC-T-C--TGCGTTG----TAG-ATCAAGA-TGGAGAAGCAC----TGAG-CTG--ATA
gi|10 : aaaagttatgaatgcGAA-------AACACA--TTTCAAAAC-T---AA----TTATCAATGGA--ATA--ATATTCTACTTTTAT--T--AA-GAAA----------CATTTAATTATCATGT------AGA--TT-ATAAATAT-T-TCATGGCCCTT-G-----A--T------GGATT-TA---CCCAGG-TA-AAT--TGCaacattcatgacaattgttattatgtaattttccactttagttaatgcccacttgtacttttgagattaatataattatgttcatattgtaaccaagtacatttagatttccattataaattggcaaaggatgatgataataacatcaaat
gi|6 : agtgcgcgcggtattaccggtatttttctagtactggtacgtaccgaggtacacaaagccaaattacggtacattcaagtccaataaccttttagcaaaaatgtaaaatttaaagcaaaaataattaaatatcaagagaaacacagtaaatgatagcatatctataagtacctatatgttaggctgtgactcactttattttatacttcatcccatcgtaatgaaactcaaaggtatgtctaacagtacaatagcctctaagggtaaacgtatgaattacatatgtaaaagcaattaatttattatA--ATG--ATACTTCA-TCCCATCGT--AATGAAACTAAAACTTATGTCTAA-TATCATGT------AGA--TT-AT-AACAT-T-T-----------GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AA---TGCCATTTACGCC-AA---TA-AGACAAACCC-GAGT---AA-A---AC-TTA--TG---TG----TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACACGTACT--G-CTGTGATAG-----T-ACC-ATA-TG---------------TATAT---GATTTTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAATG-A--A--TTTAAATC-AAAT------A----CTT-----TCTCTTTTT--T-ATTTACATTGTG--G-AATTAACAG--CTGATTACATA--T--GC-AATA-AATCACAGCTAA-AAA-CGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-A---CT----AAAGATTAAAT---CTG---TGG-T-----CCAT--GGTAT-------GTAC-CGC-GTA---TTT---TT-CAAATATTACG------TT--ATA--C--CGCGTACG---TGA-CGTT-TTTTCTTCGCGGT-ACCCA
gi|15 : ggtattaccggtatttttctagtactggtacgtaccgcggtacacaaagccaaatactggtacattcaagtccaataactcttagcagaaatgtaaaattcaaacaaagcaaaaataatttaaaaatatcaagagaaacagttaaataataggcatatctaggcctataagtacctatatgtacgctgtgactcactttatttt-AATAT-T-TCATG----GT-GA----A--TCGGAACGG-TT-TAC--CCCAGGTTC-ATT--TGCCA-TTACGCC-AAATTTC-AGA-ATACCACGAGTTAAAA-A---AC-T-ACCTA---TGATGATAGAA-CAAGA-TCCACACCCAC----T--GCCTTT-ATAG-----TCATTAGTACTAA---------CG----ATAACA-GGTT---T-ACTTATTATTA--TTTAGGATAAACTTAAGTTTCTA-GTCAAACAATAAATCTCATAAAAATG-A--A--CTT
gi|13 : aATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAGA---CT-T-A--AG---TG----TAG-A-CAAGACTGCAGAGACAC----T--G-ATGT-ATAG-----T-ACC-ATA-T----------------TGTATAA-GATTTTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAATG-A--A--TTTAAATC-AAAT------A----CTTAATTTTCTCTTTTT--TTATTTACATTG-GTGG-AATTAACAG--CTGATT--ACAAAG--GC-AATA-AATCACAACTAA-AAA-CGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-A---CT----AAAGATTAAAT---CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTAT-------GTAC-CGCGGTA---TTT---TT-CAAATATTACG------GT--ATA--C--C----GCG---GTA-CATT-TTTTCTTTGCGGT-ACCCA
gi|24 : -A-CAAGA-TGCAGAGACAT----T--G-CTGT-ATAGTATCAT-ATT-GTA-TAAGACTTATa
gi|20 : TTACATTG-GAGA-AATTAACAG--CTGATT--ATG--C---A-AGTATAATCTAAACTTATAAA-CGATAATAATGG-AATTG-TTT--TTA---CT----AAAGATTAAAT---CCG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTAT-------ATAC-CGCGGTACATTTT---TT-C
gi|11 : TGATT--ATA--TATGC-AATA-AATCAAAACTGA-AAA-CGATAATAATG--AATCA-TTT--T-ACTAATTTTAAAAGATTAAAT---CTA---CAG-T-ATA-CCCT--GGTAT-------ATAC-CACAGTA-----T---TT-AAAGTATTACATGTATGGT--ATA--C--T----GTG---GTA-CGCT-TATTCTTCACGCT-GCCttcgtagtacccaac
gi|21 : gtaccaatatttttcttgtacgggtacgtactgtggtacacaaagccaatactggtatattcaagtccaacaaaaatgtaaaatttaactagttgaagcaaaaataattaagtctgaagagaaagacaaataataggcctatgaacactgtgacttttttttttatttccatcatcccatcataatgaaaggtacatgtatgtatatatatatatatataaacaacagtacaatagcctctaTGGCAATCG-TTTGTT-A---TT----AAA--TTAACT---TTG---AGG---GTG-CCGT--GGTA--------ATAT-CGGA-------TTGGGTT-CAAATATCACG------AT--A-G--C--C----GCG----TA-CGTTGTTTTCGTT-CGG
gi|22 : CA-TTT--T-A---CT----AAAGATTAAAT---CTG---CAG-T-ATA-CCATATGGTAT-------ATAC-CACGTTA---TTT---TT-CAAATATTACG------GT--ATA--C--C----ACG---GTA-CGTT-ATTTCTTCATGGT--CCCAgtccaac
gi|13 : ----AAAGAAAAAATGTACCG---CGG-T-ATA-CCGT--AATATTTGAAAAATAC-CGCGGTA---C-----------ATACCACG------GT--ATA--C--C----GCAGATTTA-ATCT-TT
gi|2 : atttacgccaattagacaaaccccgagtaagacttaagtgtagacaagactgcagagacactgatgtatagtaccatattgtataagattttatacttatttaaactttagttctgtcacagatttcaaaatgaatttaaatcaaatacttaattttctctttttttatttacattggtggaattaacagctgattacaaaggcaataaatcacaactaaaaacgataataatggaatcgttttactAAGAAAAAATGTACCG---CGG-T-ATA-CCGT--AATATTTGAAAAATAC-CGCGGTA---C-----------ATACCACG------GT--ATA--CTGC----AGA---TTT-AATC-TTTgcggtacccaa
gi|2 : agggtgcgcgtattacctgtataccggctgtatcggtacttttctagtactggtacgtactgcagtacacaaagtgaaataccttacattcaagctccaataactcttagcaaaaatataaaattaataattaaatatcaagtaaaacacagttaaataataggcatatcagcctataaagtacggtacctatatgtacgctgtgctcacttattatttttacttctcccatcgtaatgaaactcaaaggtatggtctaataacagtacaatagcctctaaggggtagaacgtagaattacagagtaaaaacaattaatttatttatcttatgataagaaacacattccaaaattaaatcatcaatggaataaaatatctattttaatgagaaaacatttaatatcatgtagattataaatatttcatacttgaatgcatggtttacccaggtcaaaatgcaatttacgccgaattagacaaacccgagtaaaaacttcatagtatagaccaaaattgagagacactgctgtttagtaccatattgtataacattttatcatttatttaaactttaattctgtcacagatttcaaaatgaaactttaaaagaatactttctggttttggtatttacattggtggaaattaacagctgattacatatgcaataaatcacaaaaacgataataatggaattgtttcact-T-GTA-CCGC--GGTA---------TAC-CGTAATA---TTT---GA-AAAATACCGCG------GTACATA--C--C----ACG---GTA-cgcggtaccc
gi|13 : agggtgcgcgtattacctgtataccggctgtatcggtacttttctagtactggtacgtactgcagtacacaaagtgaaataccttacattcaagctccaataactcttagcaaaaatataaaattaataattaaatatcaagtaaaacacagttaaataataggcatatcagcctataaagtacggtacctatatgtacgctgtgctcacttattatttttacttctcccatcgtaatgaaactcaaaggtatggtctaataacagtacaatagcctctaaggggtagaacgtagaattacagagtaaaaacaattaatttatttatcttatgataagaaacacattccaaaattaaatcatcaatggaataaaatatctattttaatgagaaaacatttaatatcatgtagattataaatatttcatacttgaatgcatggtttacccaggtcaaaatgcaatttacgccgaattagacaaacccgagtaaaaacttcatagtatagaccaaaattgagagacactgctgtttagtaccatattgtataacattttatcatttatttaaactttaattctgtcacagatttcaaaatgaaactttaaaagaatactttctggttttggtatttacattggtggaaattaacagctgattacatatgcaataaatcacaaaaacgataataatggaattgtttcactaaagattaaatctgcagta-T-GTA-CCGC--GGTA---------TAC-CGTAATA---TTT---GA-AAAATACCGCG------GTACATA--C--C----ACG---GTA-ttttttcttcgcggtaccc
gi|20 : atttacgccaattagacaaaccccgagtaagacttaagtgtagacaagactgcagagacactgatgtatagtaccatattgtataagattttatacttatttaaactttagttctgtcacagatttcaaaatgaatttaaatcaaatacttaattttctctttttttatttacattggtggaattaacagctgattacaaaggcaataaatcacaactaaaaacgataataatggaatcgttttactaaagattaaatctgcggta-T-GTA-CCGC--GGTAT-------ATAC-CACGGTA---Tttttttctttgcggtacccaa
gi|11 : ttacattggagaaattaacagctgattatgcaagtataatctaaacttataaacgataataatggaattgtttttactaaagattaaatccgcggt-ATA-CTGT--GGTAT-------ATAC-CAGGGTA---Tttttttcttcgtagtacccaac
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 22222222222222 22222 111111 11 222 222222222222222 1111 33333 2222222222 1111111 11 2222222222222222 111 1111 11111111 11111 111 111 33333333333333333 6666666666666666666666666666 333333333333 11 11111 11111111111 22222 1 11 1111111 1111111 111111
lowQualScore : 3 6666 8888888 33 88888888888888888 8888888 11111111111111 2 444 2 88 2 2 55 444 2 444 33 2 2 2 2 2 7777 2 777777777 2 2 2 5 777777 66 333 7777 2 77777 33 33 2 33 77777 888888 33 666666 999999 55 55 666 1 55 7777 55 3 3 777 3 3 3 3 222222222222222 1111 3 4 777 4 777 55555 1 666 3 6666666666 55 3 99999 3 1 3333333 55 11 2222222222222222 111 55 4444 4 8 4 55 3 2 33 33333333 7 3 5 3 3 22222 3 3 7777 44 999999 3 6 3 000 3 3 555 3 666 3 111 4 77777777777777777 3 7 7 7777 55 3 3 9999999999999999999999999999 2 8888 3 2 4 888888888888 4 55 11111 777 66 4 66 99999999999 88888 77 77 1 1 5 5 66 22 2222222 4 4 4 2 4 0 4 7 55 3 1111111 3 666 3 3 3 55 3 8 666 55 3 111111 55 777 4 4 4 4
lowQualScore : . .... ....... .. ................. ....... .............. . ... . .. . . .. ... . ... .. . . . . . .... . ......... . . . . ...... .. ... .... . ..... .. .. . .. ..... ...... .. ...... ...... .. .. ... . .. .... .. . . ... . . . . ............... .... . . ... . ... ..... . ... . .......... .. . ..... . . ....... .. .. ................ ... .. .... . . . .. . . .. ........ . . . . . ..... . . .... .. ...... . . . ... . . ... . ... . ... . ................. . . . .... .. . . ............................ . .... . . . ............ . .. ..... ... .. . .. ........... ..... .. .. . . . . .. .. ....... . . . . . . . . .. . ....... . ... . . . .. . . ... .. . ...... .. ... . . . .
lowQualScore : 3 1111 7777777 77 77777777777777777 7777777 66666666666666 4 111 4 55 4 4 66 444 5 444 44 5 5 5 5 5 8888 5 333333333 5 5 5 0 222222 99 888 8888 5 00000 77 77 7 77 11111 222222 99 777777 666666 00 00 444 4 00 7777 00 6 6 444 6 6 6 6 777777777777777 4444 6 0 000 0 888 22222 0 333 6 1111111111 00 6 11111 6 6 0000000 55 00 8888888888888888 000 55 9999 0 0 0 55 2 3 99 22222222 3 3 4 3 7 22222 3 3 1111 66 666666 3 7 3 000 6 6 222 6 444 6 000 0 99999999999999999 6 3 3 7777 00 6 6 5555555555555555555555555555 1 6666 5 2 0 333333333333 4 00 11111 888 11 4 11 66666666666 66666 99 99 4 0 0 0 99 22 1111111 4 4 4 7 4 1 0 3 00 6 8888888 6 444 6 6 6 00 6 8 444 00 6 555555 55 000 0 0 0 4
consensus : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TGAT--AATTACATNTGT--AAAAACA-ATT-A----T-AAT--TTA-TT-----AT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAA----A-T----T----AAA---TTATCAATGGA--AA-G--AT-ATTCTA-T-TTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-G-A----A--T------G-G-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAAAC-TT-A--T-G---TG----TAG-A-CAAGA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTACCGT--ATAA-A----TTA-------TTGTATA--A-GATTTTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGNGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCA
Reference ( family-4091 ) : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TGAT--AATTACATNTGT--AAAAACA-ATT-A----T-AAT--TTA-TT-----AT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAA----A-T----N----AAA---TTATCAATGGA--AA-G--AT-ATTCTA-T-TTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-G-A----A--T------G-G-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAAAC-T--A--T-G---TG----TAG-A-CAAGA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTACCGT--ATAAGA----TTA-------TTGTATA--A-GATTTTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGNGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCA
gi|1 : GGTGCG-TGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----C--------TTTT-CTT---GTG-CC-AGTATGTA-T-TGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--TATT-C-AAT-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-ACCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAACAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTATC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACATA--TGATACAAGTACATTTGT--AAAAACA-ATT-ACCGGT-AAT--TTA-TT-----AT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAA----A-TA---A----AAA---TTATCAATGGA--AA-G--AT-ATTCTA-T-TTCATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------ATATC-AT--AATATT-TTATG----TT-G-A----A--T------G-G-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAATC-T--A--T-A---TG----TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTATTGT--ATAAAA----TTATCCTGGTTTATATA--A-GATTATAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---CAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TTCTT-----T--CCCTTTTT--T-ATTTACATTGGAAG-AATTAA-TGG--CTGATT--AT-A--T--GAAA-TA-AATC-ACAACT-AAAAATGATAATAATGG-AATCA-TTT--T-AATAA-------AGATTAAAT-CTG---TGG-T-ATA-CCGT--GGTATATAC-CGCAGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------AGTATA--CCACG---TT-AAGTT-TTTTC-TTTGCGGT-ACCCA
gi|10 : GCGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATTACGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AACCT------T--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--------A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CAGT--AA------AT--GATA-GCATAT------CTATAA------GTACC--TAT--ATGTTAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GGTAT-G-TC------------------TAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TG----AATTACATATGT--AAAAGCA-AT-------T-AAT--TTA-TTATGCAAT-TTAC-CTGGGTA-------AATCCA--T--CAAGGGCCA-T----G----AAATATTTAT-AATCTA--CATG--ATAATTAAA-TGTTTCTT--AATAAAA-GTAGAA-TATTAT-T--------CCATTGAT-AATTAGT-T--------TT-GAA----A--T------GTG-TT-T
gi|11 : agt-------T--AC-----------------CAAT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CG-GGTACGTA-C-TGT--GGTACAC---A-AAGCCAA-TACTGG---TA--TATT-C-AAG-TCC-AA-------------------------CAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAC-T-AGTTGA-AGCAAAAATAAT-T---AAGTC--TGAA--GAG-AAAGA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------------------------------G---AACACTGTGACTT--T--TTTTTTT----ATTTCCA-TC-ATCCCATCATAATGA-AAGGT--ACA-TGTAT-G-TATATATATATATATATAAACAACA----GT-ACAATAGCCTCTAT-GATT---A-TATATG--CAATA-AATCAAAACTG----AAAACG-ATA-A----T-AAT--GAA-TC-----AT-TTtc
gi|11 : gTGATT--AT-A--TATGCAA-TA-AATC-AAAACT-GAAAACGATAATAATG--AATCA-TTT--T-ACTAATTTTAAAAGATTAAAT-CTA---CAG-T-ATA-CCCT--GGTATATAC-CACAGTA-----T--TT-AAAGTATTACATGTATGGTATA--CTGTG---GT-ACGCT-TATTC-TTCACGCT-GCCtactaattttaaaagattaaatctacagtataccctggtatataccacagtatttaaagtattacatgtatggtatactgtggtacgcttattcttcacgctgcc
gi|12 : gtaccaatatttttcttgtacgggtacgtactgtggtacacaaagccaatactggtatattcaagtccaacaaaaatgtaaaatttaactagttgaagcaaaaataattaagtctgaagagaaagacaaataataggcctatgaacactgtgacttttttttttatttccatcatcccatcataatgaaaggtacatgtatgtatatatatatatatataaacaacagtacaatagcctctaAAAA-GTT-A----TGAATGCTTA-TT-----TT-TTAT-ATAAAAACGAGAATAACATA--T--TGG-------T----T----AAAC--TTATCA-TGCT--AA-GGTAT-ATTATA-T-TCTA---------AAC-------TATTATGTGCTTTAATAGTTT-AT-GA-TATT-TTATG----TTTG-A----AAGT------G-GATT-TATCGCCGAGG-AT-AAAAATGGCATT-ACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGACT---AAAAC-T--C--T-GCGTTG----TAG-ATCAAGA-TGGAGAAGCAC----TGAG-CTG--ATA--AACATTCATGACAATTGTTA-------TTATGTA-----ATTTTCC-ACTT
gi|13 : ATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAGAC-TT-A--A-G---TG----TAG-A-CAAGACTGCAGAGACAC----T--G-ATGT-ATAGTACCAT--AT-------------------TGTATA--A-GATTTTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTTAATTTT--CTCTTTTT--TTATTTACATTGGTGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AC-AAAG--GCAA-TA-AATC-ACAACT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACATT-TTTTC-TTTGCGGT-ACCCAtagttaatgcccacttgtacttttgagattaatataattatgttcatattgtaaccaagtacatttagatttccattataaattggcaaaggatgatgataataacatcaaat
gi|14 : GGTGCG-CAGTTAATAT-------T--AC-----------------CGGTTAACCGGA-----T--------TTTTTCTT---GTA-CT-G-TACGTA-C--GCCTGGTACACCAAA-AAGCCAA-TACCTGATATA--CATT-C-AAG-GCC-AA-TATTAAG-CT---------TT-AGCAA-AAATGTT-AAAAATTTTTTTT--AAA-CTA----A-AAC--AAATAA----------A--TCAA--GAG-AAA----------GA------AC--AATAa
gi|15 : aa-AAATATT-TCATG----GT-G-A----A--TCGGAACG-G-TT-TAC--CCCAGGTTC-ATT--TGCCA-TTACGCC-AAATTTC-AGA-ATACCACGAGTTAAAAAAC-T--ACCT-A---TGATGATAGAA-CAAGA-TCCACACCCAC----T--GCCTTT-ATAGT--CAT---TAGTA----CTA-------ACG-ATAACA-GGTT---T-ACTTATTATTA--TTTAGGATAAACTTAAGTTTCTA-GTCAAACAATAAATCTCATAAAAA--TG-AA--CTTtcttaagctattcctttatttaatctcaaatctatggcctgacatacgttaatcaatctttacatatcg
gi|16 : TGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----TACCGGTACTTTT-CTT---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATT-T-ACGA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CG----AG------AT--AATAGGTCCAT------CTATAA------ATA
gi|17 : gtGATGCGGCGGT----AT-------T---T-----------------CGGT-------AATTTTT--------TTTT-TTT---ATA-CC-GTT-CATA-CGCGC--GGTA-AC---A-AAGCCAAATACAGT---AA--TATT-C-AAG-TCC-AAGT----AA-CT------C--TT-AACAA-AATTG-CAAAAA------TTTTAAAA-C-A----A-AGCAAAATGAAT-------ATG--TTAAGCGAGTAGACT--C------A------AT--AAT
gi|18 : agaGATGCG-CGGT----AT-------T--TC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-TTTTTTATA-CC-GTTACATA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCAG---TA--TATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AACAA-AATTG-CAAAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATGAA-T---Act
gi|19 : ga-CGGT-----T-------T--AA-----------------TGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-AGTACATA-C-TAA--AGTACAC---A-AGATCAAATACCGG---AA--AATT-T-AAG-TCT-GA-T----AG-CT------C--GT-A-CAC-ACATG-T-AAAA------TTG--AAA-C-A----ATAGCAAAAATCAT-------ACA--TTAA------AAACA--tgtaagcgagtagactcaa
gi|2 : ggtgtataatattatGGTGCG-CG-T----AT-------T--ACCTGTATACCGGCTGTATCGGT-------A-----C--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-TGC--AGTACAC---A-AAGTGAAATACC-T---TA--CATT-C-AAGCTCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATA-T-AAAA------TT----------------------AATAAT-T---AAATA--TCAA--GTA-AAACA--CAGTT-AA------AT--AATAGGCATATCAGC--CTATAAAGTACGGTACCTATAT--G---TACGCTGTG-CTCACTTATTATTTT-----T--ACT-TC--TCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GGTATGG-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAAGGGGT---AGAACGTA---G----AATTACAGA-GT--AAAAACA-AT-------T-AAT--TTATTT-----ATCTTATGATAAG-A-------AACACA--TTCCAAA----A-T----T----AAA---TCATCAATGGAATAA-A--AT-A-TCTA-T-TTTAAT--GAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATAC---TT-G-AATGCA--T------G-G-TT-TA---CCCAGG-TCAAAA--TGCAATTTACGCCGAA---TT-AGACAAA-CCCGAGTA--AAAAC-TTCA--TAG---TA----TAG-ACCAAAA-TTGAGAGACAC----T--G-CTGT-TTAGTACCA--------------TA-------TTGTATA--A-CATTTTATCATTTATT-------------TAAACTTTAA-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AAACTTTAAA-AGA-----A-----TACTT-----T--CTGGTTTTGGT-ATTTACATTGGTGGAAATTAA-CAG--CTGATTACAT-A--T--GCAA-TA-AATC-AC-----AAAAACGATAATAATGG-AATTG-TTT--C-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CAG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACATT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCa
gi|20 : agTTACATTGGAGA-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-------GCAAGTATAATCTAAACTT-ATAAACGATAATAATGG-AATTG-TTT--TTACTAA-------AGATTAAAT-CCG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATATAC-CGCGGTACATTTT--TT-C
gi|21 : TGGCAATCG-TTTGTT-ATTAA-------A--TTAACT-TTG---AGG---GTG-CCGT--GGTA-ATAT-CG--G-A---TTGGGTT-CAAATATCAC------GATA-G--CCGC----GT-ACGTTGTTTTCGTTCG-GGT-ttcgtagtacccaac
gi|22 : CA-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CAG-T-ATA-CCATATGGTATATAC-CACGTTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCACG---GT-ACGTT-ATTTC-TTCATGGT--CCCAccaac
gi|23 : GGGGCG-TGGC----AT-------TTGAC-----------------CGGT-------A-----TAT------TTTT-CTT---GTA-CT-GGTATGTA-C-AGC--G
gi|24 : -A-CAAGA-TGCAGAGACAT----T--G-CTGT-ATAGTATCA--------------TA-------TTGTATA--A-GACTTa
gi|3 : -----T--------TTTC-CTT---GTA-CT-GGTATGT--C-CGC--G-TACAC---A-A-GCCAAATACCTG---TAAGCATT-C-A-G-TCC-A--T----AA-CT------C--TT-AGCAACAAATG-T-AACA------TTTTTAAA-C-AT---A-AGCAAAA-TAATAG---AAATA--T-AA--GAG-AA-CA--C-----AA------AT--CATATGCCTAA------TAATAA------GTACC--TAT--G---TAAGATGTGACTCACT--TTGTTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GATAT-GTTCT---------------AAT-ACA----GTAACAATAGCCT-TAA-GGGTAAAA-AACGTAATTGAT----TTACATCGTT--AAAAACATATT-A----A-TTT--TTT-TT-----AT-TTATGATAAAAA-------AACACA--T--CAAA----A-T----T----AAA---TAATCAATGGA--AA-A--AT-ATTCTA---TTTATTAAAAGAAAACA-TTAT-TATCTTAT--------AGATTAATAAAATATT-T-AT-----TT-G-A----A--T------G-G-TTCTC---CCCAGG-TT-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TTAAGACAAACCCCGAGT---AAA-------------------------A-CAATA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGT-TTGT--ATAAGA----TTA-------------A--A-TA----AT-ACTATTTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCCTAGTC-----ACAGA-TTG---AAAA--TG-AA--TTTAAATTAAAATATA-----TAATT-----TTACTCTCTTT--TAATTTACATTGGAAG-AATTAACCAG---TGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAA-GATAATAATGG-AATCGTTTT--T-ACTAA-------AAATTAAAT-CTG---CGG-TAATA-CC-T--GGTACGTACACGCGGTA---TTT--TTCCAAATATTAC------GGTATAAGCCGC----GT-ACGTT-TTATC-TTCGCGGT-ACCCAat
gi|4 : cGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CTTGGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATAC-GG---TA--CATT-C-AAG-GCC-AA-T----AA-CT------T--TT-AGCAA-AAATG-T-AAA-------TTT--AAA-----------GCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAA-A--CCTGTTAA------AT--GATAGGCATAT------CTATAA------GTACC--TATATG---TAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TCCATCC--TCGTAATGA--AACTC-AAAAGGTAT-G-TCT---------------AA---CA----GT-ACAATAGCTCCTA--GGGT---A-AACGTA--TGA----ATTACATATG---AAAAGCA-ATT-A-------AT--TTA-TT-----AT---ATGATAAGAA-------AACACA--TTTCAAA----ACT----C----AAA---TTATCAATGGA--TA----AT-ATTCTACT-TTTATT--AAGAAAACATTTAT-TATCATGT--------AGATT-TT-AA-TATTATCATG----TT-G-A----A--T------G-G-TT-TA---CC-AGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACC--GAGT---AAGAC-TTAA--G-G---T-----TAG-A-CAAGACTGCAGAGAC-C----T--G-ATGG-CTAGTAC----------A----T-A-------TTGTATA--AAGATTTTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCTT-GTC-----ACAGATTTC---AAAAGATG-A---TTTAA-TCAA-----A-----TACTTAATTTT--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGTGG-AATTAA-CAG--CTGATT--ACAA--G--GCAA-TA-AATC-ACAACTAAAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAATGCTGCACCGGCT-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGC-GTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CC-CG---GT-ACA-T-TTTTC-TTTGCGGTAACCCAa
gi|5 : atgcTT-CTT---GTAACT-GGT-TGTAAC-CGCA-GGTACAC---ACAAGCCAAATACCTG---TA--CATT-C-AAG-TCCCAA-TT---AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAT------TTT--AAAAC-A----A-A-CAAAAATA-T-T---AAATACTTCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AA--TATATGCCTA-------ATATAA------GTACC--TAT--G---TAAGCTGTGACTCACT--T-GTTTT----AT--ACTATC-ATCC-ATCGTAATGA--AACTC-AAA-GATAT-G-TCT---------------AATAACA----GT--CAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA---GATG-AATTACATCCGTTAAAAAACA-ATTAA----T-TTT--TTT-TT-----AT-TTATGATAA-AA-------AACACA--T--CAAA----A-T----T----AAA---TAATCAATGGA--AA-AT-AT-ATTCTA-T-TTTTTA--AAGAAAAC-TTTAT-TATCTTGT--------AGATT-AT-AAATATT-TTATG----TT-G-A----A--T------G-G-TT-TC---CCCAGG-TT-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCGGAGT----AAAC-C--A--T---------------------A-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTATTGT--ATAAGA----TTA-------TTA-----------------ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TCCT--GTC-----ACAGATTT----GAAA--TGAAA--TTTAAATTAA-----ATATATTACTT-----T--CTCTCTTT--T-ATTTACATTGGAGG-AATTAA-CAGTTTTGA-T--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAAAGATAATAATGG-AATCGTTTT--T-ACTAA-------AAATTAAAT-CTG---CGG-T-ATATCCGT--GGTACGTAC-CGC-GTA----TT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTATC-TTCG
gi|6 : GGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACTGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAG-AAATG-T-AAAA------TTC--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-TTAAAAATA--TCAA--GAG-AAACAGTT-----AA------AT--AATAGGCATATCTAGGCCTATAA------GTACCTATAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTTAATGAT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTA-AAA-CTTAT-G-TCT---------------AATATCAT---GT-Agta
gi|6 : TCTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AA-------CAT-----TT-G-A----A--T------G-G-TT-TA---CCCAGG-TC-AA---TGCCATTTACGCC-AA---TA-AGACAAACCC-GAGT---AAAAC-TT-A--T-G---TG----TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACACGTACT--G-CTGTGATAGTACCAT--AT--------------------GTATA--T-GATTTTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATT-GTGG-AATTAA-CAG--CTGATTACAT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---TGG-T-----CCAT--GGTATGTAC-CGC-GTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GTTATA--CCGCGTACGTGACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCAgattataacatttgaatggtttacccaggtcaatgccatttacgccaataagacaaacccgagtaaaacttatgtgtagacaagatgcggagacacgtactgctgtgatagtaccatatgtatatgattttatacttatttaaactttagttctgtcacagatttcaaaatgaatttaaatcaaatactttctcttttttatttacattgtggaattaacagctgattacatatgcaataaatcacagctaaaaacgataataatggaatcgttttactaaagattaaatctgtggtccatggtatgtaccgcgtatttttcaaatattacgttataccgcgtacgtgacgttttttcttcgcggtaccca
gi|7 : ggtattaccggtatttttctagtactggtacgtaccgcggtacacaaagccaaatactggtacattcaagtccaataactcttagcagaaatgtaaaattcaaacaaagcaaaaataatttaaaaatatcaagagaaacagttaaataataggcatatctaggcctataagtacctatatgtacgctgtgactcactttattttaatgatacttcatcccatcgtaatgaaactaaaacttatgGGTGTG-CGGT----ATACCGGTAT--AC-----------------CGGT-------A-----C--------TTTT-CTT---GTA-A--GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATTTC-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TTTAGCAA-AAA-G-T-AAAA------TT---AAA-C-A----A-AGCAAAA-TAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AAGATAACATTAAATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGA--AACTC-AAA-GGTGT-G-TCT---------------AATAACAACTAGT-ACAATAGCCTCTGA-GGGT---A-AATGTA--TGA----ATTACATATGT--AAAA-CA-ATT-A-------AT--TTA-TT-----AT-TTATAATAAGAA-------AACACA--T--CAAA----A-T----TTAATAAA---TTATCAATGGA--AA-G--AT-ATTCTA-T-TTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATAT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-G-A----A--T------G-G-TT-TA---CCCAGG-TC-ATT--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGATAAACCCCGAGT---AAAACTT--A--T-A---TG----TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACAC----T--G-CTTT-ATAG-------------------TA-------TTGTATA--A-GA--TTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTAAG-TTCT--GTC-----ACTAATTTC---CAAA--TG-AA--TTTAAAT
gi|8 : aGGTGCG-CTGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----TACCTGTATTTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--AGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--TATT-G-AAG-TCC-AA-T----AA-CTCTAAGAC--TT-AACAA-AATTG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AG--GAAGTA---T---AAGTA--TCAA--GAG-AATCA--C-----GA------AT--ACTAGGCCTAT------CTA----------------TAT--G---TACGCTGTCACTCACT--TTATT-------T--ACT-TC-AGCCCATCGTAATG---------AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAA--------------------TAA-GGGT---A-AACGTA--TG----AAGTATATGTGT--AAAAACA-A-T-A------AA-----A-TC-----AT-TTATGATAAGAA-------AACATA--T--CAAA----C-TAAAAA----AAA---ATATCAATGGA--AT-G--AT-ATTATA-T-TTCATT--AAG-AAACATTTAA-TATCAGGT--------AGATT-AT-AAATATT-TTATG----TT-G-A----A--T------G-G-AT-GA---CCCAGG-TC-GAA--TACCATTTCCACT-AA---TT-AGCCAAACCTC
gi|9 : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CTTGGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-CAAAG-TCC-AA-T----AA-CT------CTTTT-AGCAA-AAATG-T--AAA------TTT--------A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CCATT-AA------AT--GATAGG-CTAT------CTATAA------GTACCTATAT--G---TAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT---CT-TC-ATCCCATCGTAATGA-AATCTCAAAA-GGTAT-G-TC------------------TAACA----GT-ACAATAGCCTCT-A-GGGT---A-AACGTA--TG----AATTACATATGT--AAAAGCA-AT-------T-AAT--TTA-TT-----A---TATGAT-AGAA-------AACACATTT--CAAA----A-C----T-----AA---TTATCAATGGA--AT-A--AT-ATTCTACT-TTTATT--AAG-AAACATTTAATTATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATGGCCCTT-G------A--T------G-GATT-TA---CCCAGG-T--AAA--Tacat
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111111111111 22222222222222 22222 111111 11 222 222222222222222 1111 33333 2222222222 1111111 11 222222222 111 1 11111111 1111 1 111 22222222222222 1111111111111111111111111111 111 333333333333 11 11111 11111111111 22222 1 11 1111111 1111111 111111
lowQualScore : 3 6666 8888888 33 88888888888888888 8888888 11111111111111 2 444 2 88 2 2 55 444 2 444 33 2 2 2 2 2 7777 2 777777777 2 2 2 5 777777 66 333 7777 2 77777 33 33 2 33 77777 888888 33 666666 999999 55 55 666 1 55 7777 55 3 3 777 3 3 3 3 222222222222222 1111 3 4 777 4 777 55555 1 666 3 6666666666 55 3 3 3333333 55 66 111111111 4 55 222 2 55 8 0 77 33333333 3 3 3 3 7777 3 7777 44 999999 0 3 999 3 33 666 3 666 3 111 0 33333333333333 3 7 7 7777 55 3 3 5555555555555555555555555555 6666 000 4 888888888888 4 55 11111 777 66 4 66 99999999999 88888 77 77 1 1 5 5 66 22 2222222 4 4 4 2 4 0 4 7 55 3 1111111 3 666 3 3 3 55 3 8 666 55 3 111111 55 777 4 4 4 4
lowQualScore : . .... ....... .. ................. ....... .............. . ... . .. . . .. ... . ... .. . . . . . .... . ......... . . . . ...... .. ... .... . ..... .. .. . .. ..... ...... .. ...... ...... .. .. ... . .. .... .. . . ... . . . . ............... .... . . ... . ... ..... . ... . .......... .. . . ....... .. .. ......... . .. ... . .. . . .. ........ . . . . .... . .... .. ...... . . ... . .. ... . ... . ... . .............. . . . .... .. . . ............................ .... ... . ............ . .. ..... ... .. . .. ........... ..... .. .. . . . . .. .. ....... . . . . . . . . .. . ....... . ... . . . .. . . ... .. . ...... .. ... . . . .
lowQualScore : 3 1111 7777777 77 77777777777777777 7777777 66666666666666 4 111 4 55 4 4 66 444 5 444 44 5 5 5 5 5 8888 5 333333333 5 5 5 0 222222 99 888 8888 5 00000 77 77 7 77 11111 222222 99 777777 666666 00 00 444 4 00 7777 00 6 6 444 6 6 6 6 777777777777777 4444 6 0 000 0 888 22222 0 333 6 1111111111 00 6 6 0000000 55 55 222222222 0 55 555 0 55 1 8 55 22222222 6 3 2 3 5555 3 1111 66 666666 0 3 222 3 66 222 6 444 6 000 9 00000000000000 6 3 3 7777 00 6 6 6666666666666666666666666666 5555 000 0 333333333333 4 00 11111 888 11 4 11 66666666666 66666 99 99 4 0 0 0 99 22 1111111 4 4 4 7 4 1 0 3 00 6 8888888 6 444 6 6 6 00 6 8 444 00 6 555555 55 000 0 0 0 4
consensus : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TGAT--AATTACATNTGT--AAAAACA-ATT-A----T-AAT--TTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTAC---CAT--T-------TA-------TTGTATA--A-GATT---TTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGNGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCA
Reference ( family-4091 ) : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TGAT--AATTACATNTGT--AAAAACA-ATT-A----T-AAT--TTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTAC---CGT-AT-AA--ATTA-------TTGTATA--A-GATT---TTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGNGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCA
gi|1 : GGTGCG-TGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----C--------TTTT-CTT---GTG-CC-AGTATGTA-T-TGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--TATT-C-AAT-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-ACCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAACAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTATC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACATA--TGATACAAGTACATTTGT--AAAAACA-ATT-ACCGGT-AAT--TTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAATA---A----AAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTCATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------ATATC-AT--AATATT-TTATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAATC----T-AT-A-TG-TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTAT---TGT-ATAAA--ATTATCCTGGTTTATATA--A-GATT---ATAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---CAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TTCTT-----T--CCCTTTTT--T-ATTTACATTGGAAG-AATTAA-TGG--CTGATT--AT-A--T--GAAA-TA-AATC-ACAACT-AAAAATGATAATAATGG-AATCA-TTT--T-AATAA-------AGATTAAAT-CTG---TGG-T-ATA-CCGT--GGTATATAC-CGCAGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------AGTATA--CCACG---TT-AAGTT-TTTTC-TTTGCGGT-ACCCA
gi|10 : GCGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATTACGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AACCT------T--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--------A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CAGT--AA------AT--GATA-GCATAT------CTATAA------GTACC--TAT--ATGTTAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GGTAT-G-TC------------------TAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TG----AATTACATATGT--AAAAGCA-AT-------T-AAT--TTA-TTAT-
gi|10 : agtGAA-------AACACA--TTTCAAAAC----T----AA--TTATCAATGGA--ATA--ATATTCTACTTTTATT--AAG-AAACATTTAATTATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATGGCCCTT-G-----A--T------GGATT-TA---CCCAGG-TA-AAT--TGCgcaatttacctgggtaaatccatcaagggccatgaaatatttataatctacatgataattaaatgtttcttaataaaagtagaatattattccattgataattagttttgaaatgtgttttc
gi|11 : agtgcgcgcggtattaccggtatttttctagtactggtacgtaccgaggtacacaaagccaaattacggtacattcaagtccaataaccttttagcaaaaatgtaaaatttaaagcaaaaataattaaatatcaagagaaacacagtaaatgatagcatatctataagtacctatatgttaggctgtgactcactttattttatacttcatcccatcgtaatgaaactcaaaggtatgtctaacagtacaatagcctctaagggtaaacgtatgaattacatatgtaaaagcaattaatttattat-------T--AC-----------------CAAT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CG-GGTACGTA-C-TGT--GGTACAC---A-AAGCCAA-TACTGG---TA--TATT-C-AAG-TCC-AA-------------------------CAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAC-T-AGTTGA-AGCAAAAATAAT-T---AAGTC--TGAA--GAG-AAAGA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------------------------------G---AACACTGTGACTT--T--TTTTTTT----ATTTCCA-TC-ATCCCATCATAATGA-AAGGT--ACA-TGTAT-G-TATATATATATATATATAAACAACA----GT-ACAATAGCCTCTAT-GATT---A-TATATG--CAATA-AATCAAAACTG----AAAACG-ATA-A----T-AAT--GAA-TCAT-TT
gi|11 : gTGATT--AT-A--TATGCAA-TA-AATC-AAAACT-GAAAACGATAATAATG--AATCA-TTT--T-ACTAATTTTAAAAGATTAAAT-CTA---CAG-T-ATA-CCCT--GGTATATAC-CACAGTA-----T--TT-AAAGTATTACATGTATGGTATA--CTGTG---GT-ACGCT-TATTC-TTCACGCT-GCCtactaattttaaaagattaaatctacagtataccctggtatataccacagtatttaaagtattacatgtatggtatactgtggtacgcttattcttcacgctgcc
gi|12 : gtaccaatatttttcttgtacgggtacgtactgtggtacacaaagccaatactggtatattcaagtccaacaaaaatgtaaaatttaactagttgaagcaaaaataattaagtctgaagagaaagacaaataataggcctatgaacactgtgacttttttttttatttccatcatcccatcataatgaaaggtacatgtatgtatatatatatatatataaacaacagtacaatagcctctaAAAA-GTT-A----TGAATGCTTA-TTTT-TTAT-ATAAAAACGAGAATAACATA--T--TGG--T----T----AAACTTATCA-TGCT--AAGGTATATTATA-TTCTA---------AAC-------TATTATGTGCTTTAATAGTTT-AT-GA-TATT-TTATG----TTTGA----AAGT------GGATT-TATCGCCGAGG-AT-AAAAATGGCATT-ACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGACT---AAAACTC--T-GC-GTTG-TAG-ATCAAGA-TGGAGAAGCAC----TGAG-CTG--ATAA-ACATTCATGAC-AATTGTTA-------TTATGTA-----ATT---TTCC-ACTT
gi|13 : ATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAGACT---T-AA-G-TG-TAG-A-CAAGACTGCAGAGACAC----T--G-ATGT-ATAGTAC---CAT-AT-----------------TGTATA--A-GATT---TTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTTAATTTT--CTCTTTTT--TTATTTACATTGGTGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AC-AAAG--GCAA-TA-AATC-ACAACT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACATT-TTTTC-TTTGCGGT-ACCCAtagttaatgcccacttgtacttttgagattaatataattatgttcatattgtaaccaagtacatttagatttccattataaattggcaaaggatgatgataataacatcaaat
gi|14 : GGTGCG-CAGTTAATAT-------T--AC-----------------CGGTTAACCGGA-----T--------TTTTTCTT---GTA-CT-G-TACGTA-C--GCCTGGTACACCAAA-AAGCCAA-TACCTGATATA--CATT-C-AAG-GCC-AA-TATTAAG-CT---------TT-AGCAA-AAATGTT-AAAAATTTTTTTT--AAA-CTA----A-AAC--AAATAA----------A--TCAA--GAG-AAA----------GA------AC--AATAa
gi|15 : aa-AAATATT-TCATG----GT-GA----A--TCGGAACGG-TT-TAC--CCCAGGTTC-ATT--TGCCA-TTACGCC-AAATTTC-AGA-ATACCACGAGTTAAAAAACTACCT-AT-GATGATAGAA-CAAGA-TCCACACCCAC----T--GCCTTT-ATAGT-----CAT--T-AGT-ACTA-------ACG-ATAACA-GGTT------T-ACTTATTATTA--TTTAGGATAAACTTAAGTTTCTA-GTCAAACAATAAATCTCATAAAAA--TG-AA--CTTtcttaagctattcctttatttaatctcaaatctatggcctgacatacgttaatcaatctttacatatcg
gi|16 : TGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----TACCGGTACTTTT-CTT---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATT-T-ACGA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CG----AG------AT--AATAGGTCCAT------CTATAA------ATA
gi|17 : gtGATGCGGCGGT----AT-------T---T-----------------CGGT-------AATTTTT--------TTTT-TTT---ATA-CC-GTT-CATA-CGCGC--GGTA-AC---A-AAGCCAAATACAGT---AA--TATT-C-AAG-TCC-AAGT----AA-CT------C--TT-AACAA-AATTG-CAAAAA------TTTTAAAA-C-A----A-AGCAAAATGAAT-------ATG--TTAAGCGAGTAGACT--C------A------AT--AAT
gi|18 : agaGATGCG-CGGT----AT-------T--TC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-TTTTTTATA-CC-GTTACATA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCAG---TA--TATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AACAA-AATTG-CAAAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATGAA-T---Act
gi|19 : ga-CGGT-----T-------T--AA-----------------TGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-AGTACATA-C-TAA--AGTACAC---A-AGATCAAATACCGG---AA--AATT-T-AAG-TCT-GA-T----AG-CT------C--GT-A-CAC-ACATG-T-AAAA------TTG--AAA-C-A----ATAGCAAAAATCAT-------ACA--TTAA------AAACA--tgtaagcgagtagactcaa
gi|2 : ggtgtataatattatGGTGCG-CG-T----AT-------T--ACCTGTATACCGGCTGTATCGGT-------A-----C--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-TGC--AGTACAC---A-AAGTGAAATACC-T---TA--CATT-C-AAGCTCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATA-T-AAAA------TT----------------------AATAAT-T---AAATA--TCAA--GTA-AAACA--CAGTT-AA------AT--AATAGGCATATCAGC--CTATAAAGTACGGTACCTATAT--G---TACGCTGTG-CTCACTTATTATTTT-----T--ACT-TC--TCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GGTATGG-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAAGGGGT---AGAACGTA---G----AATTACAGA-GT--AAAAACA-AT-------T-AAT--TTATTTATCTTATGATAAG-A-------AACACA--TTCCAAAAT----T----AAA-TCATCAATGGAATAAA--ATA-TCTA-TTTTAAT--GAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATAC---TT-GAATGCA--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TCAAAA--TGCAATTTACGCCGAA---TT-AGACAAA-CCCGAGTA--AAAACT---TCATAG-TA-TAG-ACCAAAA-TTGAGAGACAC----T--G-CTGT-TTAGTAC---CA-----------TA-------TTGTATA--A-CATT---TTATCATTTATT-------------TAAACTTTAA-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AAACTTTAAA-AGA-----A-----TACTT-----T--CTGGTTTTGGT-ATTTACATTGGTGGAAATTAA-CAG--CTGATTACAT-A--T--GCAA-TA-AATC-AC-----AAAAACGATAATAATGG-AATTG-TTT--C-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CAG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACATT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCa
gi|20 : agTTACATTGGAGA-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-------GCAAGTATAATCTAAACTT-ATAAACGATAATAATGG-AATTG-TTT--TTACTAA-------AGATTAAAT-CCG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATATAC-CGCGGTACATTTT--TT-C
gi|21 : TGGCAATCG-TTTGTT-ATTAA-------A--TTAACT-TTG---AGG---GTG-CCGT--GGTA-ATAT-CG--G-A---TTGGGTT-CAAATATCAC------GATA-G--CCGC----GT-ACGTTGTTTTCGTTCG-GGT-ttcgtagtacccaac
gi|22 : CA-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CAG-T-ATA-CCATATGGTATATAC-CACGTTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCACG---GT-ACGTT-ATTTC-TTCATGGT--CCCAccaac
gi|23 : GGGGCG-TGGC----AT-------TTGAC-----------------CGGT-------A-----TAT------TTTT-CTT---GTA-CT-GGTATGTA-C-AGC--G
gi|24 : -A-CAAGA-TGCAGAGACAT----T--G-CTGT-ATAGTAT---CA-----------TA-------TTGTATA--A-GACT---Ta
gi|3 : -----T--------TTTC-CTT---GTA-CT-GGTATGT--C-CGC--G-TACAC---A-A-GCCAAATACCTG---TAAGCATT-C-A-G-TCC-A--T----AA-CT------C--TT-AGCAACAAATG-T-AACA------TTTTTAAA-C-AT---A-AGCAAAA-TAATAG---AAATA--T-AA--GAG-AA-CA--C-----AA------AT--CATATGCCTAA------TAATAA------GTACC--TAT--G---TAAGATGTGACTCACT--TTGTTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GATAT-GTTCT---------------AAT-ACA----GTAACAATAGCCT-TAA-GGGTAAAA-AACGTAATTGAT----TTACATCGTT--AAAAACATATT-A----A-TTT--TTT-TTAT-TTATGATAAAAA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TAATCAATGGA--AAA--ATATTCTA--TTTATTAAAAGAAAACA-TTAT-TATCTTAT--------AGATTAATAAAATATT-T-AT-----TT-GA----A--T------GG-TTCTC---CCCAGG-TT-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TTAAGACAAACCCCGAGT---AAA--------------------A-CAATA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGT---------------------------TTGTATA--A-GATTAAATAAT-ACTATTTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCCTAGTC-----ACAGA-TTG---AAAA--TG-AA--TTTAAATTAAAATATA-----TAATT-----TTACTCTCTTT--TAATTTACATTGGAAG-AATTAACCAG---TGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAA-GATAATAATGG-AATCGTTTT--T-ACTAA-------AAATTAAAT-CTG---CGG-TAATA-CC-T--GGTACGTACACGCGGTA---TTT--TTCCAAATATTAC------GGTATAAGCCGC----GT-ACGTT-TTATC-TTCGCGGT-ACCCAat
gi|4 : cGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CTTGGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATAC-GG---TA--CATT-C-AAG-GCC-AA-T----AA-CT------T--TT-AGCAA-AAATG-T-AAA-------TTT--AAA-----------GCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAA-A--CCTGTTAA------AT--GATAGGCATAT------CTATAA------GTACC--TATATG---TAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TCCATCC--TCGTAATGA--AACTC-AAAAGGTAT-G-TCT---------------AA---CA----GT-ACAATAGCTCCTA--GGGT---A-AACGTA--TGA----ATTACATATG---AAAAGCA-ATT-A-------AT--TTA-TTAT---ATGATAAGAA-------AACACA--TTTCAAAAC----TC---AAA-TTATCAATGGA--TA---ATATTCTACTTTTATT--AAGAAAACATTTAT-TATCATGT--------AGATT-TT-AA-TATTATCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CC-AGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACC--GAGT---AAGACT---T-AA-G-GT-TAG-A-CAAGACTGCAGAGAC-C----T--G-ATGG-CTAGTAC--------------AT-A-------TTGTATA--AAGATT---TTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCTT-GTC-----ACAGATTTC---AAAAGATG-A---TTTAA-TCAA-----A-----TACTTAATTTT--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGTGG-AATTAA-CAG--CTGATT--ACAA--G--GCAA-TA-AATC-ACAACTAAAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAATGCTGCACCGGCT-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGC-GTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CC-CG---GT-ACA-T-TTTTC-TTTGCGGTAACCCAa
gi|5 : atgcTT-CTT---GTAACT-GGT-TGTAAC-CGCA-GGTACAC---ACAAGCCAAATACCTG---TA--CATT-C-AAG-TCCCAA-TT---AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAT------TTT--AAAAC-A----A-A-CAAAAATA-T-T---AAATACTTCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AA--TATATGCCTA-------ATATAA------GTACC--TAT--G---TAAGCTGTGACTCACT--T-GTTTT----AT--ACTATC-ATCC-ATCGTAATGA--AACTC-AAA-GATAT-G-TCT---------------AATAACA----GT--CAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA---GATG-AATTACATCCGTTAAAAAACA-ATTAA----T-TTT--TTT-TTAT-TTATGATAA-AA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TAATCAATGGA--AAAT-ATATTCTA-TTTTTTA--AAGAAAAC-TTTAT-TATCTTGT--------AGATT-AT-AAATATT-TTATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TC---CCCAGG-TT-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCGGAGT---AAACC------AT----------------A-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAG-------------------TA-------TTGTATA--A-GATTA--TTA--ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TCCT--GTC-----ACAGATTT----GAAA--TGAAA--TTTAAATTAA-----ATATATTACTT-----T--CTCTCTTT--T-ATTTACATTGGAGG-AATTAA-CAGTTTTGA-T--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAAAGATAATAATGG-AATCGTTTT--T-ACTAA-------AAATTAAAT-CTG---CGG-T-ATATCCGT--GGTACGTAC-CGC-GTA----TT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTATC-TTCG
gi|6 : GGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACTGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAG-AAATG-T-AAAA------TTC--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-TTAAAAATA--TCAA--GAG-AAACAGTT-----AA------AT--AATAGGCATATCTAGGCCTATAA------GTACCTATAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTTAATGAT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTA-AAA-CTTAT-G-TCT---------------AATATCAT---GT-Agta
gi|6 : TCTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AA-------CAT-----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AA---TGCCATTTACGCC-AA---TA-AGACAAACCC-GAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACACGTACT--G-CTGTGATAGTAC---CAT-AT------------------GTATA--T-GATT---TTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATT-GTGG-AATTAA-CAG--CTGATTACAT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---TGG-T-----CCAT--GGTATGTAC-CGC-GTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GTTATA--CCGCGTACGTGACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCAgattataacatttgaatggtttacccaggtcaatgccatttacgccaataagacaaacccgagtaaaacttatgtgtagacaagatgcggagacacgtactgctgtgatagtaccatatgtatatgattttatacttatttaaactttagttctgtcacagatttcaaaatgaatttaaatcaaatactttctcttttttatttacattgtggaattaacagctgattacatatgcaataaatcacagctaaaaacgataataatggaatcgttttactaaagattaaatctgtggtccatggtatgtaccgcgtatttttcaaatattacgttataccgcgtacgtgacgttttttcttcgcggtaccca
gi|7 : ggtattaccggtatttttctagtactggtacgtaccgcggtacacaaagccaaatactggtacattcaagtccaataactcttagcagaaatgtaaaattcaaacaaagcaaaaataatttaaaaatatcaagagaaacagttaaataataggcatatctaggcctataagtacctatatgtacgctgtgactcactttattttaatgatacttcatcccatcgtaatgaaactaaaacttatgGGTGTG-CGGT----ATACCGGTAT--AC-----------------CGGT-------A-----C--------TTTT-CTT---GTA-A--GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATTTC-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TTTAGCAA-AAA-G-T-AAAA------TT---AAA-C-A----A-AGCAAAA-TAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AAGATAACATTAAATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGA--AACTC-AAA-GGTGT-G-TCT---------------AATAACAACTAGT-ACAATAGCCTCTGA-GGGT---A-AATGTA--TGA----ATTACATATGT--AAAA-CA-ATT-A-------AT--TTA-TTAT-TTATAATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----TTAATAAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATAT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-ATT--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGATAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-A-TG-TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACAC----T--G-CTTT-ATAG-------------------TA-------TTGTATA--A-GA-----TTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTAAG-TTCT--GTC-----ACTAATTTC---CAAA--TG-AA--TTTAAAT
gi|8 : aGGTGCG-CTGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----TACCTGTATTTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--AGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--TATT-G-AAG-TCC-AA-T----AA-CTCTAAGAC--TT-AACAA-AATTG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AG--GAAGTA---T---AAGTA--TCAA--GAG-AATCA--C-----GA------AT--ACTAGGCCTAT------CTA----------------TAT--G---TACGCTGTCACTCACT--TTATT-------T--ACT-TC-AGCCCATCGTAATG---------AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAA--------------------TAA-GGGT---A-AACGTA--TG----AAGTATATGTGT--AAAAACA-A-T-A------AA-----A-TCAT-TTATGATAAGAA-------AACATA--T--CAAACTAAAAA----AAA-ATATCAATGGA--ATG--ATATTATA-TTTCATT--AAG-AAACATTTAA-TATCAGGT--------AGATT-AT-AAATATT-TTATG----TT-GA----A--T------GG-AT-GA---CCCAGG-TC-GAA--TACCATTTCCACT-AA---TT-AGCCAAACCTC
gi|9 : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CTTGGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-CAAAG-TCC-AA-T----AA-CT------CTTTT-AGCAA-AAATG-T--AAA------TTT--------A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CCATT-AA------AT--GATAGG-CTAT------CTATAA------GTACCTATAT--G---TAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT---CT-TC-ATCCCATCGTAATGA-AATCTCAAAA-GGTAT-G-TC------------------TAACA----GT-ACAATAGCCTCT-A-GGGT---A-AACGTA--TG----AATTACATATGT--AAAAGCA-AT-------T-AAT--TTA-TTA---TATGAT-AGAA-------AACACATTT--CAAAAC----T-----AA-TTATCAATGGA--ATA--ATATTCTACTTTTATT--AAG-AAACATTTAATTATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATGGCCCTT-G-----A--T------GGATT-TA---CCCAGG-T--AAA--Tacat
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 22222222222222 22222 111111 11 222 222222222222222 1111 33333 2222222222 1111111 11 222222222 111 1 11111111 1111 1 111 22222222222222 555555555555555555555555 111 333333333333 11 11111 11111111111 22222 1 11 1111111 1111111 111111
lowQualScore : 3 6666 8888888 33 88888888888888888 8888888 11111111111111 2 444 2 88 2 2 55 444 2 444 33 2 2 2 2 2 7777 2 777777777 2 2 2 5 777777 66 333 7777 2 77777 33 33 2 33 77777 888888 33 666666 999999 55 55 666 1 55 7777 55 3 3 777 3 3 3 3 222222222222222 1111 3 4 777 4 777 55555 1 666 3 6666666666 55 3 3 3333333 55 66 111111111 4 55 222 2 55 8 0 77 33333333 3 3 3 3 7777 3 7777 44 999999 0 3 999 3 33 666 3 666 3 111 0 33333333333333 3 7 7 7777 55 3 3 555555555555555555555555 777 55 4 111 4 888888888888 4 55 11111 777 66 4 66 99999999999 88888 77 77 1 1 5 5 66 22 2222222 4 4 4 2 4 0 4 7 55 3 1111111 3 666 3 3 3 55 3 8 666 55 3 111111 55 777 4 4 4 4
lowQualScore : . .... ....... .. ................. ....... .............. . ... . .. . . .. ... . ... .. . . . . . .... . ......... . . . . ...... .. ... .... . ..... .. .. . .. ..... ...... .. ...... ...... .. .. ... . .. .... .. . . ... . . . . ............... .... . . ... . ... ..... . ... . .......... .. . . ....... .. .. ......... . .. ... . .. . . .. ........ . . . . .... . .... .. ...... . . ... . .. ... . ... . ... . .............. . . . .... .. . . ........................ ... .. . ... . ............ . .. ..... ... .. . .. ........... ..... .. .. . . . . .. .. ....... . . . . . . . . .. . ....... . ... . . . .. . . ... .. . ...... .. ... . . . .
lowQualScore : 3 1111 7777777 77 77777777777777777 7777777 66666666666666 4 111 4 55 4 4 66 444 5 444 44 5 5 5 5 5 8888 5 333333333 5 5 5 0 222222 99 888 8888 5 00000 77 77 7 77 11111 222222 99 777777 666666 00 00 444 4 00 7777 00 6 6 444 6 6 6 6 777777777777777 4444 6 0 000 0 888 22222 0 333 6 1111111111 00 6 6 0000000 55 55 222222222 0 55 555 0 55 1 8 55 22222222 6 3 2 3 5555 3 1111 66 666666 0 3 222 3 66 222 6 444 6 000 9 00000000000000 6 3 3 7777 00 6 6 666666666666666666666666 000 55 0 000 4 333333333333 4 00 11111 888 11 4 11 66666666666 66666 99 99 4 0 0 0 99 22 1111111 4 4 4 7 4 1 0 3 00 6 8888888 6 444 6 6 6 00 6 8 444 00 6 555555 55 000 0 0 0 4
consensus : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TGAT--AATTACATNTGT--AAAAACA-ATT-A----T-AAT--TTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTACCAT---------TA-------TT---GTATA--A-GATT---TTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGNGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCA
Reference ( family-4091 ) : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TGAT--AATTACATNTGT--AAAAACA-ATT-A----T-AAT--TTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTACCAT------T--TA-------TT---GTATA--A-GATT---TTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGNGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCA
gi|1 : GGTGCG-TGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----C--------TTTT-CTT---GTG-CC-AGTATGTA-T-TGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--TATT-C-AAT-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-ACCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAACAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTATC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACATA--TGATACAAGTACATTTGT--AAAAACA-ATT-ACCGGT-AAT--TTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAATA---A----AAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTCATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------ATATC-AT--AATATT-TTATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAATC----T-AT-A-TG-TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTATTGTATAAAAT--TATCCTGGTTT---ATATA--A-GATT---ATAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---CAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TTCTT-----T--CCCTTTTT--T-ATTTACATTGGAAG-AATTAA-TGG--CTGATT--AT-A--T--GAAA-TA-AATC-ACAACT-AAAAATGATAATAATGG-AATCA-TTT--T-AATAA-------AGATTAAAT-CTG---TGG-T-ATA-CCGT--GGTATATAC-CGCAGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------AGTATA--CCACG---TT-AAGTT-TTTTC-TTTGCGGT-ACCCA
gi|10 : GCGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATTACGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AACCT------T--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--------A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CAGT--AA------AT--GATA-GCATAT------CTATAA------GTACC--TAT--ATGTTAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GGTAT-G-TC------------------TAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TG----AATTACATATGT--AAAAGCA-AT-------T-AAT--TTA-TTAT-
gi|10 : agtGAA-------AACACA--TTTCAAAAC----T----AA--TTATCAATGGA--ATA--ATATTCTACTTTTATT--AAG-AAACATTTAATTATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATGGCCCTT-G-----A--T------GGATT-TA---CCCAGG-TA-AAT--TGCgcaatttacctgggtaaatccatcaagggccatgaaatatttataatctacatgataattaaatgtttcttaataaaagtagaatattattccattgataattagttttgaaatgtgttttc
gi|11 : agtgcgcgcggtattaccggtatttttctagtactggtacgtaccgaggtacacaaagccaaattacggtacattcaagtccaataaccttttagcaaaaatgtaaaatttaaagcaaaaataattaaatatcaagagaaacacagtaaatgatagcatatctataagtacctatatgttaggctgtgactcactttattttatacttcatcccatcgtaatgaaactcaaaggtatgtctaacagtacaatagcctctaagggtaaacgtatgaattacatatgtaaaagcaattaatttattat-------T--AC-----------------CAAT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CG-GGTACGTA-C-TGT--GGTACAC---A-AAGCCAA-TACTGG---TA--TATT-C-AAG-TCC-AA-------------------------CAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAC-T-AGTTGA-AGCAAAAATAAT-T---AAGTC--TGAA--GAG-AAAGA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------------------------------G---AACACTGTGACTT--T--TTTTTTT----ATTTCCA-TC-ATCCCATCATAATGA-AAGGT--ACA-TGTAT-G-TATATATATATATATATAAACAACA----GT-ACAATAGCCTCTAT-GATT---A-TATATG--CAATA-AATCAAAACTG----AAAACG-ATA-A----T-AAT--GAA-TCAT-TT
gi|11 : gTGATT--AT-A--TATGCAA-TA-AATC-AAAACT-GAAAACGATAATAATG--AATCA-TTT--T-ACTAATTTTAAAAGATTAAAT-CTA---CAG-T-ATA-CCCT--GGTATATAC-CACAGTA-----T--TT-AAAGTATTACATGTATGGTATA--CTGTG---GT-ACGCT-TATTC-TTCACGCT-GCCtactaattttaaaagattaaatctacagtataccctggtatataccacagtatttaaagtattacatgtatggtatactgtggtacgcttattcttcacgctgcc
gi|12 : gtaccaatatttttcttgtacgggtacgtactgtggtacacaaagccaatactggtatattcaagtccaacaaaaatgtaaaatttaactagttgaagcaaaaataattaagtctgaagagaaagacaaataataggcctatgaacactgtgacttttttttttatttccatcatcccatcataatgaaaggtacatgtatgtatatatatatatatataaacaacagtacaatagcctctaAAAA-GTT-A----TGAATGCTTA-TTTT-TTAT-ATAAAAACGAGAATAACATA--T--TGG--T----T----AAACTTATCA-TGCT--AAGGTATATTATA-TTCTA---------AAC-------TATTATGTGCTTTAATAGTTT-AT-GA-TATT-TTATG----TTTGA----AAGT------GGATT-TATCGCCGAGG-AT-AAAAATGGCATT-ACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGACT---AAAACTC--T-GC-GTTG-TAG-ATCAAGA-TGGAGAAGCAC----TGAG-CTG--ATA--AACAT------T--CA-------T
gi|13 : ATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAGACT---T-AA-G-TG-TAG-A-CAAGACTGCAGAGACAC----T--G-ATGT-ATAGTACCAT----------A-------TT---GTATA--A-GATT---TTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTTAATTTT--CTCTTTTT--TTATTTACATTGGTGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AC-AAAG--GCAA-TA-AATC-ACAACT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACATT-TTTTC-TTTGCGGT-ACCCAgacaattgttattatgtaattttccactttagttaatgcccacttgtacttttgagattaatataattatgttcatattgtaaccaagtacatttagatttccattataaattggcaaaggatgatgataataacatcaaat
gi|14 : GGTGCG-CAGTTAATAT-------T--AC-----------------CGGTTAACCGGA-----T--------TTTTTCTT---GTA-CT-G-TACGTA-C--GCCTGGTACACCAAA-AAGCCAA-TACCTGATATA--CATT-C-AAG-GCC-AA-TATTAAG-CT---------TT-AGCAA-AAATGTT-AAAAATTTTTTTT--AAA-CTA----A-AAC--AAATAA----------A--TCAA--GAG-AAA----------GA------AC--AATAa
gi|15 : aa-AAATATT-TCATG----GT-GA----A--TCGGAACGG-TT-TAC--CCCAGGTTC-ATT--TGCCA-TTACGCC-AAATTTC-AGA-ATACCACGAGTTAAAAAACTACCT-AT-GATGATAGAA-CAAGA-TCCACACCCAC----T--GCCTTT-ATAGT--CAT------TAGTA-------CTAACG-ATAACA-GGTT------T-ACTTATTATTA--TTTAGGATAAACTTAAGTTTCTA-GTCAAACAATAAATCTCATAAAAA--TG-AA--CTTtcttaagctattcctttatttaatctcaaatctatggcctgacatacgttaatcaatctttacatatcg
gi|16 : TGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----TACCGGTACTTTT-CTT---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATT-T-ACGA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CG----AG------AT--AATAGGTCCAT------CTATAA------ATA
gi|17 : gtGATGCGGCGGT----AT-------T---T-----------------CGGT-------AATTTTT--------TTTT-TTT---ATA-CC-GTT-CATA-CGCGC--GGTA-AC---A-AAGCCAAATACAGT---AA--TATT-C-AAG-TCC-AAGT----AA-CT------C--TT-AACAA-AATTG-CAAAAA------TTTTAAAA-C-A----A-AGCAAAATGAAT-------ATG--TTAAGCGAGTAGACT--C------A------AT--AAT
gi|18 : agaGATGCG-CGGT----AT-------T--TC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-TTTTTTATA-CC-GTTACATA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCAG---TA--TATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AACAA-AATTG-CAAAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATGAA-T---Act
gi|19 : ga-CGGT-----T-------T--AA-----------------TGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-AGTACATA-C-TAA--AGTACAC---A-AGATCAAATACCGG---AA--AATT-T-AAG-TCT-GA-T----AG-CT------C--GT-A-CAC-ACATG-T-AAAA------TTG--AAA-C-A----ATAGCAAAAATCAT-------ACA--TTAA------AAACA--tgtaagcgagtagactcaa
gi|2 : ggtgtataatattatGGTGCG-CG-T----AT-------T--ACCTGTATACCGGCTGTATCGGT-------A-----C--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-TGC--AGTACAC---A-AAGTGAAATACC-T---TA--CATT-C-AAGCTCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATA-T-AAAA------TT----------------------AATAAT-T---AAATA--TCAA--GTA-AAACA--CAGTT-AA------AT--AATAGGCATATCAGC--CTATAAAGTACGGTACCTATAT--G---TACGCTGTG-CTCACTTATTATTTT-----T--ACT-TC--TCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GGTATGG-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAAGGGGT---AGAACGTA---G----AATTACAGA-GT--AAAAACA-AT-------T-AAT--TTATTTATCTTATGATAAG-A-------AACACA--TTCCAAAAT----T----AAA-TCATCAATGGAATAAA--ATA-TCTA-TTTTAAT--GAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATAC---TT-GAATGCA--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TCAAAA--TGCAATTTACGCCGAA---TT-AGACAAA-CCCGAGTA--AAAACT---TCATAG-TA-TAG-ACCAAAA-TTGAGAGACAC----T--G-CTGT-TTAGTACCA----------TA-------TT---GTATA--A-CATT---TTATCATTTATT-------------TAAACTTTAA-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AAACTTTAAA-AGA-----A-----TACTT-----T--CTGGTTTTGGT-ATTTACATTGGTGGAAATTAA-CAG--CTGATTACAT-A--T--GCAA-TA-AATC-AC-----AAAAACGATAATAATGG-AATTG-TTT--C-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CAG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACATT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCa
gi|20 : agTTACATTGGAGA-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-------GCAAGTATAATCTAAACTT-ATAAACGATAATAATGG-AATTG-TTT--TTACTAA-------AGATTAAAT-CCG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATATAC-CGCGGTACATTTT--TT-C
gi|21 : TGGCAATCG-TTTGTT-ATTAA-------A--TTAACT-TTG---AGG---GTG-CCGT--GGTA-ATAT-CG--G-A---TTGGGTT-CAAATATCAC------GATA-G--CCGC----GT-ACGTTGTTTTCGTTCG-GGT-ttcgtagtacccaac
gi|22 : CA-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CAG-T-ATA-CCATATGGTATATAC-CACGTTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCACG---GT-ACGTT-ATTTC-TTCATGGT--CCCAccaac
gi|23 : GGGGCG-TGGC----AT-------TTGAC-----------------CGGT-------A-----TAT------TTTT-CTT---GTA-CT-GGTATGTA-C-AGC--G
gi|24 : -A-CAAGA-TGCAGAGACAT----T--G-CTGT-ATAGTATCA----------TA-------TT---GTATA--A-GACT---Ta
gi|3 : -----T--------TTTC-CTT---GTA-CT-GGTATGT--C-CGC--G-TACAC---A-A-GCCAAATACCTG---TAAGCATT-C-A-G-TCC-A--T----AA-CT------C--TT-AGCAACAAATG-T-AACA------TTTTTAAA-C-AT---A-AGCAAAA-TAATAG---AAATA--T-AA--GAG-AA-CA--C-----AA------AT--CATATGCCTAA------TAATAA------GTACC--TAT--G---TAAGATGTGACTCACT--TTGTTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GATAT-GTTCT---------------AAT-ACA----GTAACAATAGCCT-TAA-GGGTAAAA-AACGTAATTGAT----TTACATCGTT--AAAAACATATT-A----A-TTT--TTT-TTAT-TTATGATAAAAA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TAATCAATGGA--AAA--ATATTCTA--TTTATTAAAAGAAAACA-TTAT-TATCTTAT--------AGATTAATAAAATATT-T-AT-----TT-GA----A--T------GG-TTCTC---CCCAGG-TT-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TTAAGACAAACCCCGAGT---AAA--------------------A-CAATA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGT-----------------------TT---GTATA--A-GATTAAATAAT-ACTATTTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCCTAGTC-----ACAGA-TTG---AAAA--TG-AA--TTTAAATTAAAATATA-----TAATT-----TTACTCTCTTT--TAATTTACATTGGAAG-AATTAACCAG---TGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAA-GATAATAATGG-AATCGTTTT--T-ACTAA-------AAATTAAAT-CTG---CGG-TAATA-CC-T--GGTACGTACACGCGGTA---TTT--TTCCAAATATTAC------GGTATAAGCCGC----GT-ACGTT-TTATC-TTCGCGGT-ACCCAat
gi|4 : cGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CTTGGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATAC-GG---TA--CATT-C-AAG-GCC-AA-T----AA-CT------T--TT-AGCAA-AAATG-T-AAA-------TTT--AAA-----------GCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAA-A--CCTGTTAA------AT--GATAGGCATAT------CTATAA------GTACC--TATATG---TAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TCCATCC--TCGTAATGA--AACTC-AAAAGGTAT-G-TCT---------------AA---CA----GT-ACAATAGCTCCTA--GGGT---A-AACGTA--TGA----ATTACATATG---AAAAGCA-ATT-A-------AT--TTA-TTAT---ATGATAAGAA-------AACACA--TTTCAAAAC----TC---AAA-TTATCAATGGA--TA---ATATTCTACTTTTATT--AAGAAAACATTTAT-TATCATGT--------AGATT-TT-AA-TATTATCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CC-AGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACC--GAGT---AAGACT---T-AA-G-GT-TAG-A-CAAGACTGCAGAGAC-C----T--G-ATGG-CTAGTAC-AT----------A-------TT---GTATA--AAGATT---TTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCTT-GTC-----ACAGATTTC---AAAAGATG-A---TTTAA-TCAA-----A-----TACTTAATTTT--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGTGG-AATTAA-CAG--CTGATT--ACAA--G--GCAA-TA-AATC-ACAACTAAAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAATGCTGCACCGGCT-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGC-GTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CC-CG---GT-ACA-T-TTTTC-TTTGCGGTAACCCAa
gi|5 : atgcTT-CTT---GTAACT-GGT-TGTAAC-CGCA-GGTACAC---ACAAGCCAAATACCTG---TA--CATT-C-AAG-TCCCAA-TT---AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAT------TTT--AAAAC-A----A-A-CAAAAATA-T-T---AAATACTTCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AA--TATATGCCTA-------ATATAA------GTACC--TAT--G---TAAGCTGTGACTCACT--T-GTTTT----AT--ACTATC-ATCC-ATCGTAATGA--AACTC-AAA-GATAT-G-TCT---------------AATAACA----GT--CAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA---GATG-AATTACATCCGTTAAAAAACA-ATTAA----T-TTT--TTT-TTAT-TTATGATAA-AA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TAATCAATGGA--AAAT-ATATTCTA-TTTTTTA--AAGAAAAC-TTTAT-TATCTTGT--------AGATT-AT-AAATATT-TTATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TC---CCCAGG-TT-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCGGAGT---AAACC------AT----------------A-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAG---------------TA-------TT---GTATA--A-GATTA--TTA--ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TCCT--GTC-----ACAGATTT----GAAA--TGAAA--TTTAAATTAA-----ATATATTACTT-----T--CTCTCTTT--T-ATTTACATTGGAGG-AATTAA-CAGTTTTGA-T--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAAAGATAATAATGG-AATCGTTTT--T-ACTAA-------AAATTAAAT-CTG---CGG-T-ATATCCGT--GGTACGTAC-CGC-GTA----TT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTATC-TTCG
gi|6 : GGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACTGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAG-AAATG-T-AAAA------TTC--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-TTAAAAATA--TCAA--GAG-AAACAGTT-----AA------AT--AATAGGCATATCTAGGCCTATAA------GTACCTATAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTTAATGAT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTA-AAA-CTTAT-G-TCT---------------AATATCAT---GT-Agta
gi|6 : TCTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AA-------CAT-----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AA---TGCCATTTACGCC-AA---TA-AGACAAACCC-GAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACACGTACT--G-CTGTGATAGTACCAT----------A-------T----GTATA--T-GATT---TTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATT-GTGG-AATTAA-CAG--CTGATTACAT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---TGG-T-----CCAT--GGTATGTAC-CGC-GTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GTTATA--CCGCGTACGTGACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCAgattataacatttgaatggtttacccaggtcaatgccatttacgccaataagacaaacccgagtaaaacttatgtgtagacaagatgcggagacacgtactgctgtgatagtaccatatgtatatgattttatacttatttaaactttagttctgtcacagatttcaaaatgaatttaaatcaaatactttctcttttttatttacattgtggaattaacagctgattacatatgcaataaatcacagctaaaaacgataataatggaatcgttttactaaagattaaatctgtggtccatggtatgtaccgcgtatttttcaaatattacgttataccgcgtacgtgacgttttttcttcgcggtaccca
gi|7 : ggtattaccggtatttttctagtactggtacgtaccgcggtacacaaagccaaatactggtacattcaagtccaataactcttagcagaaatgtaaaattcaaacaaagcaaaaataatttaaaaatatcaagagaaacagttaaataataggcatatctaggcctataagtacctatatgtacgctgtgactcactttattttaatgatacttcatcccatcgtaatgaaactaaaacttatgGGTGTG-CGGT----ATACCGGTAT--AC-----------------CGGT-------A-----C--------TTTT-CTT---GTA-A--GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATTTC-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TTTAGCAA-AAA-G-T-AAAA------TT---AAA-C-A----A-AGCAAAA-TAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AAGATAACATTAAATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGA--AACTC-AAA-GGTGT-G-TCT---------------AATAACAACTAGT-ACAATAGCCTCTGA-GGGT---A-AATGTA--TGA----ATTACATATGT--AAAA-CA-ATT-A-------AT--TTA-TTAT-TTATAATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----TTAATAAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATAT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-ATT--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGATAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-A-TG-TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACAC----T--G-CTTT-ATAG---------------TA-------TT---GTATA--A-GA-----TTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTAAG-TTCT--GTC-----ACTAATTTC---CAAA--TG-AA--TTTAAAT
gi|8 : aGGTGCG-CTGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----TACCTGTATTTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--AGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--TATT-G-AAG-TCC-AA-T----AA-CTCTAAGAC--TT-AACAA-AATTG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AG--GAAGTA---T---AAGTA--TCAA--GAG-AATCA--C-----GA------AT--ACTAGGCCTAT------CTA----------------TAT--G---TACGCTGTCACTCACT--TTATT-------T--ACT-TC-AGCCCATCGTAATG---------AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAA--------------------TAA-GGGT---A-AACGTA--TG----AAGTATATGTGT--AAAAACA-A-T-A------AA-----A-TCAT-TTATGATAAGAA-------AACATA--T--CAAACTAAAAA----AAA-ATATCAATGGA--ATG--ATATTATA-TTTCATT--AAG-AAACATTTAA-TATCAGGT--------AGATT-AT-AAATATT-TTATG----TT-GA----A--T------GG-AT-GA---CCCAGG-TC-GAA--TACCATTTCCACT-AA---TT-AGCCAAACCTC
gi|9 : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CTTGGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-CAAAG-TCC-AA-T----AA-CT------CTTTT-AGCAA-AAATG-T--AAA------TTT--------A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CCATT-AA------AT--GATAGG-CTAT------CTATAA------GTACCTATAT--G---TAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT---CT-TC-ATCCCATCGTAATGA-AATCTCAAAA-GGTAT-G-TC------------------TAACA----GT-ACAATAGCCTCT-A-GGGT---A-AACGTA--TG----AATTACATATGT--AAAAGCA-AT-------T-AAT--TTA-TTA---TATGAT-AGAA-------AACACATTT--CAAAAC----T-----AA-TTATCAATGGA--ATA--ATATTCTACTTTTATT--AAG-AAACATTTAATTATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATGGCCCTT-G-----A--T------GGATT-TA---CCCAGG-T--AAA--Tacat
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 22222222222222 22222 111111 11 222 222222222222222 1111 333333 2222222222 1111111 11 111111111 111 1 11111111 1111 1 111 2222222222222 444444444444444444444444444444 1111111111 333333333333 11 11111 11111111111 22222 1 11 1111111 1111111 111111
lowQualScore : 3 6666 8888888 33 88888888888888888 8888888 11111111111111 2 444 2 88 2 2 55 444 2 444 33 2 2 2 2 2 7777 2 777777777 2 2 2 5 777777 66 333 7777 2 77777 33 33 2 33 77777 888888 33 666666 999999 55 55 666 1 55 7777 55 3 3 777 3 3 3 3 222222222222222 1111 3 4 777 4 777 555555 1 666 3 6666666666 55 3 3 3333333 55 66 777777777 8 55 222 2 55 8 0 77 33333333 3 3 7 3 7777 3 7777 44 999999 0 3 999 3 33 666 3 666 3 111 0 4444444444444 3 7 7 7777 55 3 3 888888888888888888888888888888 7777 3 7 3333333333 4 888888888888 4 55 11111 777 66 4 66 99999999999 88888 77 77 1 1 5 5 66 22 2222222 4 4 4 2 4 0 4 7 55 3 1111111 3 666 3 3 3 55 3 8 666 55 3 111111 55 777 4 4 4 4
lowQualScore : . .... ....... .. ................. ....... .............. . ... . .. . . .. ... . ... .. . . . . . .... . ......... . . . . ...... .. ... .... . ..... .. .. . .. ..... ...... .. ...... ...... .. .. ... . .. .... .. . . ... . . . . ............... .... . . ... . ... ...... . ... . .......... .. . . ....... .. .. ......... . .. ... . .. . . .. ........ . . . . .... . .... .. ...... . . ... . .. ... . ... . ... . ............. . . . .... .. . . .............................. .... . . .......... . ............ . .. ..... ... .. . .. ........... ..... .. .. . . . . .. .. ....... . . . . . . . . .. . ....... . ... . . . .. . . ... .. . ...... .. ... . . . .
lowQualScore : 3 1111 7777777 77 77777777777777777 7777777 66666666666666 4 111 4 55 4 4 66 444 5 444 44 5 5 5 5 5 8888 5 333333333 5 5 5 0 222222 99 888 8888 5 00000 77 77 7 77 11111 222222 99 777777 666666 00 00 444 4 00 7777 00 6 6 444 6 6 6 6 777777777777777 4444 6 0 000 0 888 222222 0 333 6 1111111111 00 6 6 0000000 55 55 222222222 0 55 555 0 55 1 8 55 22222222 6 3 3 3 5555 3 1111 66 666666 0 3 222 3 66 222 6 444 6 000 9 7777777777777 6 3 3 7777 00 6 6 111111111111111111111111111111 7777 6 3 6666666666 0 333333333333 4 00 11111 888 11 4 11 66666666666 66666 99 99 4 0 0 0 99 22 1111111 4 4 4 7 4 1 0 3 00 6 8888888 6 444 6 6 6 00 6 8 444 00 6 555555 55 000 0 0 0 4
consensus : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TGAT-A--ATTACATNTGT--AAAAACA-ATT-A----T-AAT--TTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTACC-------ATT-------AT-------TG----TA-TAA-GAT------T---TTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGNGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCA
Reference ( family-4091 ) : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TGAT-A--ATTACATNTGT--AAAAACA-ATT-A----T-AAT--TTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTACC-------ATT-------AT-------TG----TA-TAA-GAT------T---TTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGNGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCA
gi|1 : GGTGCG-TGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----C--------TTTT-CTT---GTG-CC-AGTATGTA-T-TGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--TATT-C-AAT-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-ACCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAACAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTATC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACATA--TGAT-ACAAGTACATTTGT--AAAAACA-ATT-ACCGGT-AAT--TTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----A----AAAATTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTCATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------ATATC-AT-AA-TATT-TTATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAATCT-----AT-A-TG-TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTATTGTATAAAATT-------ATCCTGGTTTA----TA-TAA-GAT------T---ATAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---CAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TTCTT-----T--CCCTTTTT--T-ATTTACATTGGAAG-AATTAA-TGG--CTGATT--AT-A--T--GAAA-TA-AATC-ACAACT-AAAAATGATAATAATGG-AATCA-TTT--T-AATAA-------AGATTAAAT-CTG---TGG-T-ATA-CCGT--GGTATATAC-CGCAGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------AGTATA--CCACG---TT-AAGTT-TTTTC-TTTGCGGT-ACCCA
gi|10 : GCGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATTACGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AACCT------T--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--------A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CAGT--AA------AT--GATA-GCATAT------CTATAA------GTACC--TAT--ATGTTAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GGTAT-G-TC------------------TAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TG---A--ATTACATATGT--AAAAGCA-AT-------T-AAT--TTA-TTAT-
gi|10 : agtGAA-------AACACA--TTTCAAAAC----T----AA--TTATCAATGGA--ATA--ATATTCTACTTTTATT--AAG-AAACATTTAATTATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATGGCCCTT-G-----A--T------GGATT-TA---CCCAGG-TA-AAT--TGCgcaatttacctgggtaaatccatcaagggccatgaaatatttataatctacatgataattaaatgtttcttaataaaagtagaatattattccattgataattagttttgaaatgtgttttc
gi|11 : agtgcgcgcggtattaccggtatttttctagtactggtacgtaccgaggtacacaaagccaaattacggtacattcaagtccaataaccttttagcaaaaatgtaaaatttaaagcaaaaataattaaatatcaagagaaacacagtaaatgatagcatatctataagtacctatatgttaggctgtgactcactttattttatacttcatcccatcgtaatgaaactcaaaggtatgtctaacagtacaatagcctctaagggtaaacgtatgaattacatatgtaaaagcaattaatttattat-------T--AC-----------------CAAT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CG-GGTACGTA-C-TGT--GGTACAC---A-AAGCCAA-TACTGG---TA--TATT-C-AAG-TCC-AA-------------------------CAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAC-T-AGTTGA-AGCAAAAATAAT-T---AAGTC--TGAA--GAG-AAAGA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------------------------------G---AACACTGTGACTT--T--TTTTTTT----ATTTCCA-TC-ATCCCATCATAATGA-AAGGT--ACA-TGTAT-G-TATATATATATATATATAAACAACA----GT-ACAATAGCCTCTAT-GATT---A-TATATG--CAATAA--ATCAAAACTG----AAAACG-ATA-A----T-AAT--GAA-TCAT-TT
gi|11 : gTGATT--AT-A--TATGCAA-TA-AATC-AAAACT-GAAAACGATAATAATG--AATCA-TTT--T-ACTAATTTTAAAAGATTAAAT-CTA---CAG-T-ATA-CCCT--GGTATATAC-CACAGTA-----T--TT-AAAGTATTACATGTATGGTATA--CTGTG---GT-ACGCT-TATTC-TTCACGCT-GCCtactaattttaaaagattaaatctacagtataccctggtatataccacagtatttaaagtattacatgtatggtatactgtggtacgcttattcttcacgctgcc
gi|12 : gtaccaatatttttcttgtacgggtacgtactgtggtacacaaagccaatactggtatattcaagtccaacaaaaatgtaaaatttaactagttgaagcaaaaataattaagtctgaagagaaagacaaataataggcctatgaacactgtgacttttttttttatttccatcatcccatcataatgaaaggtacatgtatgtatatatatatatatataaacaacagtacaatagcctctaAAAA-GTT-A----TGAATGCTTA-TTTT-TTAT-ATAAAAACGAGAATAACATA--T--TGG--T----T----AAACTTATCA-TGCT--AAGGTATATTATA-TTCTA---------AAC-------TATTATGTGCTTTAATAGTTT-AT-GA-TATT-TTATG----TTTGA----AAGT------GGATT-TATCGCCGAGG-AT-AAAAATGGCATT-ACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGACT---AAAACTC--T-GC-GTTG-TAG-ATCAAGA-TGGAGAAGCAC----TGAG-CTG--ATA--AAC-------ATTCATGACAAT-------TGTTATTA-TGT-AAT------T---TTCC-ACTT
gi|13 : ATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAGACT---T-AA-G-TG-TAG-A-CAAGACTGCAGAGACAC----T--G-ATGT-ATAGTACC-------AT--------AT-------TG----TA-TAA-GAT------T---TTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTTAATTTT--CTCTTTTT--TTATTTACATTGGTGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AC-AAAG--GCAA-TA-AATC-ACAACT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACATT-TTTTC-TTTGCGGT-ACCCAtagttaatgcccacttgtacttttgagattaatataattatgttcatattgtaaccaagtacatttagatttccattataaattggcaaaggatgatgataataacatcaaat
gi|14 : GGTGCG-CAGTTAATAT-------T--AC-----------------CGGTTAACCGGA-----T--------TTTTTCTT---GTA-CT-G-TACGTA-C--GCCTGGTACACCAAA-AAGCCAA-TACCTGATATA--CATT-C-AAG-GCC-AA-TATTAAG-CT---------TT-AGCAA-AAATGTT-AAAAATTTTTTTT--AAA-CTA----A-AAC--AAATAA----------A--TCAA--GAG-AAA----------GA------AC--AATAa
gi|15 : aa-AAATATT-TCATG----GT-GA----A--TCGGAACGG-TT-TAC--CCCAGGTTC-ATT--TGCCA-TTACGCC-AAATTTC-AGA-ATACCACGAGTTAAAAAACTACCT-AT-GATGATAGAA-CAAGA-TCCACACCCAC----T--GCCTTT-ATAGT--C-------ATT-------A---------G----TACTAACGATAACAGGT---T--T-ACTTATTATTA--TTTAGGATAAACTTAAGTTTCTA-GTCAAACAATAAATCTCATAAAAA--TG-AA--CTTtcttaagctattcctttatttaatctcaaatctatggcctgacatacgttaatcaatctttacatatcg
gi|16 : TGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----TACCGGTACTTTT-CTT---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATT-T-ACGA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CG----AG------AT--AATAGGTCCAT------CTATAA------ATA
gi|17 : gtGATGCGGCGGT----AT-------T---T-----------------CGGT-------AATTTTT--------TTTT-TTT---ATA-CC-GTT-CATA-CGCGC--GGTA-AC---A-AAGCCAAATACAGT---AA--TATT-C-AAG-TCC-AAGT----AA-CT------C--TT-AACAA-AATTG-CAAAAA------TTTTAAAA-C-A----A-AGCAAAATGAAT-------ATG--TTAAGCGAGTAGACT--C------A------AT--AAT
gi|18 : agaGATGCG-CGGT----AT-------T--TC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-TTTTTTATA-CC-GTTACATA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCAG---TA--TATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AACAA-AATTG-CAAAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATGAA-T---Act
gi|19 : ga-CGGT-----T-------T--AA-----------------TGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-AGTACATA-C-TAA--AGTACAC---A-AGATCAAATACCGG---AA--AATT-T-AAG-TCT-GA-T----AG-CT------C--GT-A-CAC-ACATG-T-AAAA------TTG--AAA-C-A----ATAGCAAAAATCAT-------ACA--TTAA------AAACA--tgtaagcgagtagactcaa
gi|2 : ggtgtataatattatGGTGCG-CG-T----AT-------T--ACCTGTATACCGGCTGTATCGGT-------A-----C--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-TGC--AGTACAC---A-AAGTGAAATACC-T---TA--CATT-C-AAGCTCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATA-T-AAAA------TT----------------------AATAAT-T---AAATA--TCAA--GTA-AAACA--CAGTT-AA------AT--AATAGGCATATCAGC--CTATAAAGTACGGTACCTATAT--G---TACGCTGTG-CTCACTTATTATTTT-----T--ACT-TC--TCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GGTATGG-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAAGGGGT---AGAACGTA---G---A--ATTACAGA-GT--AAAAACA-AT-------T-AAT--TTATTTATCTTATGATAAG-A-------AACACA--TTCCAAAAT----T----AAA-TCATCAATGGAATAAA--ATA-TCTA-TTTTAAT--GAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATAC---TT-GAATGCA--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TCAAAA--TGCAATTTACGCCGAA---TT-AGACAAA-CCCGAGTA--AAAACT---TCATAG-TA-TAG-ACCAAAA-TTGAGAGACAC----T--G-CTGT-TTAGTACC-------A-T-------AT-------TG----TA-TAA-CAT------T---TTATCATTTATT-------------TAAACTTTAA-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AAACTTTAAA-AGA-----A-----TACTT-----T--CTGGTTTTGGT-ATTTACATTGGTGGAAATTAA-CAG--CTGATTACAT-A--T--GCAA-TA-AATC-AC-----AAAAACGATAATAATGG-AATTG-TTT--C-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CAG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACATT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCa
gi|20 : agTTACATTGGAGA-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-------GCAAGTATAATCTAAACTT-ATAAACGATAATAATGG-AATTG-TTT--TTACTAA-------AGATTAAAT-CCG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATATAC-CGCGGTACATTTT--TT-C
gi|21 : TGGCAATCG-TTTGTT-ATTAA-------A--TTAACT-TTG---AGG---GTG-CCGT--GGTA-ATAT-CG--G-A---TTGGGTT-CAAATATCAC------GATA-G--CCGC----GT-ACGTTGTTTTCGTTCG-GGT-ttcgtagtacccaac
gi|22 : CA-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CAG-T-ATA-CCATATGGTATATAC-CACGTTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCACG---GT-ACGTT-ATTTC-TTCATGGT--CCCAccaac
gi|23 : GGGGCG-TGGC----AT-------TTGAC-----------------CGGT-------A-----TAT------TTTT-CTT---GTA-CT-GGTATGTA-C-AGC--G
gi|24 : -A-CAAGA-TGCAGAGACAT----T--G-CTGT-ATAGTATC-------A-T-------AT-------TG----TA-TAA-GAC------T---Ta
gi|3 : -----T--------TTTC-CTT---GTA-CT-GGTATGT--C-CGC--G-TACAC---A-A-GCCAAATACCTG---TAAGCATT-C-A-G-TCC-A--T----AA-CT------C--TT-AGCAACAAATG-T-AACA------TTTTTAAA-C-AT---A-AGCAAAA-TAATAG---AAATA--T-AA--GAG-AA-CA--C-----AA------AT--CATATGCCTAA------TAATAA------GTACC--TAT--G---TAAGATGTGACTCACT--TTGTTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GATAT-GTTCT---------------AAT-ACA----GTAACAATAGCCT-TAA-GGGTAAAA-AACGTAATTGAT-----TTACATCGTT--AAAAACATATT-A----A-TTT--TTT-TTAT-TTATGATAAAAA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TAATCAATGGA--AAA--ATATTCTA--TTTATTAAAAGAAAACA-TTAT-TATCTTAT--------AGATTAATAAAATATT-T-AT-----TT-GA----A--T------GG-TTCTC---CCCAGG-TT-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TTAAGACAAACCCCGAGT---AAA--------------------A-CAATA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGT---------------------T-------TG----TA-TAA-GAT------TAAATAAT-ACTATTTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCCTAGTC-----ACAGA-TTG---AAAA--TG-AA--TTTAAATTAAAATATA-----TAATT-----TTACTCTCTTT--TAATTTACATTGGAAG-AATTAACCAG---TGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAA-GATAATAATGG-AATCGTTTT--T-ACTAA-------AAATTAAAT-CTG---CGG-TAATA-CC-T--GGTACGTACACGCGGTA---TTT--TTCCAAATATTAC------GGTATAAGCCGC----GT-ACGTT-TTATC-TTCGCGGT-ACCCAat
gi|4 : cGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CTTGGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATAC-GG---TA--CATT-C-AAG-GCC-AA-T----AA-CT------T--TT-AGCAA-AAATG-T-AAA-------TTT--AAA-----------GCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAA-A--CCTGTTAA------AT--GATAGGCATAT------CTATAA------GTACC--TATATG---TAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TCCATCC--TCGTAATGA--AACTC-AAAAGGTAT-G-TCT---------------AA---CA----GT-ACAATAGCTCCTA--GGGT---A-AACGTA--TGA-----ATTACATATG---AAAAGCA-ATT-A-------AT--TTA-TTAT---ATGATAAGAA-------AACACA--TTTCAAAAC----TC---AAA-TTATCAATGGA--TA---ATATTCTACTTTTATT--AAGAAAACATTTAT-TATCATGT--------AGATT-TT-AA-TATTATCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CC-AGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACC--GAGT---AAGACT---T-AA-G-GT-TAG-A-CAAGACTGCAGAGAC-C----T--G-ATGG-CTAGTAC--------AT--------AT-------TG----TA-TAAAGAT------T---TTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCTT-GTC-----ACAGATTTC---AAAAGATG-A---TTTAA-TCAA-----A-----TACTTAATTTT--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGTGG-AATTAA-CAG--CTGATT--ACAA--G--GCAA-TA-AATC-ACAACTAAAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAATGCTGCACCGGCT-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGC-GTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CC-CG---GT-ACA-T-TTTTC-TTTGCGGTAACCCAa
gi|5 : atgcTT-CTT---GTAACT-GGT-TGTAAC-CGCA-GGTACAC---ACAAGCCAAATACCTG---TA--CATT-C-AAG-TCCCAA-TT---AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAT------TTT--AAAAC-A----A-A-CAAAAATA-T-T---AAATACTTCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AA--TATATGCCTA-------ATATAA------GTACC--TAT--G---TAAGCTGTGACTCACT--T-GTTTT----AT--ACTATC-ATCC-ATCGTAATGA--AACTC-AAA-GATAT-G-TCT---------------AATAACA----GT--CAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA---GATGA--ATTACATCCGTTAAAAAACA-ATTAA----T-TTT--TTT-TTAT-TTATGATAA-AA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TAATCAATGGA--AAAT-ATATTCTA-TTTTTTA--AAGAAAAC-TTTAT-TATCTTGT--------AGATT-AT-AAATATT-TTATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TC---CCCAGG-TT-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCGGAGT---AAACC------AT----------------A-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAG-------------T-------AT-------TG----TA-TAA-GAT------TA--TTA--ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TCCT--GTC-----ACAGATTT----GAAA--TGAAA--TTTAAATTAA-----ATATATTACTT-----T--CTCTCTTT--T-ATTTACATTGGAGG-AATTAA-CAGTTTTGA-T--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAAAGATAATAATGG-AATCGTTTT--T-ACTAA-------AAATTAAAT-CTG---CGG-T-ATATCCGT--GGTACGTAC-CGC-GTA----TT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTATC-TTCG
gi|6 : GGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACTGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAG-AAATG-T-AAAA------TTC--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-TTAAAAATA--TCAA--GAG-AAACAGTT-----AA------AT--AATAGGCATATCTAGGCCTATAA------GTACCTATAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTTAATGAT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTA-AAA-CTTAT-G-TCT---------------AATATCAT---GT-Agta
gi|6 : TCTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AA-------CAT-----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AA---TGCCATTTACGCC-AA---TA-AGACAAACCC-GAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACACGTACT--G-CTGTGATAGTACC-------AT--------AT--------G----TA-TAT-GAT------T---TTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATT-GTGG-AATTAA-CAG--CTGATTACAT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---TGG-T-----CCAT--GGTATGTAC-CGC-GTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GTTATA--CCGCGTACGTGACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCAgattataacatttgaatggtttacccaggtcaatgccatttacgccaataagacaaacccgagtaaaacttatgtgtagacaagatgcggagacacgtactgctgtgatagtaccatatgtatatgattttatacttatttaaactttagttctgtcacagatttcaaaatgaatttaaatcaaatactttctcttttttatttacattgtggaattaacagctgattacatatgcaataaatcacagctaaaaacgataataatggaatcgttttactaaagattaaatctgtggtccatggtatgtaccgcgtatttttcaaatattacgttataccgcgtacgtgacgttttttcttcgcggtaccca
gi|7 : ggtattaccggtatttttctagtactggtacgtaccgcggtacacaaagccaaatactggtacattcaagtccaataactcttagcagaaatgtaaaattcaaacaaagcaaaaataatttaaaaatatcaagagaaacagttaaataataggcatatctaggcctataagtacctatatgtacgctgtgactcactttattttaatgatacttcatcccatcgtaatgaaactaaaacttatgGGTGTG-CGGT----ATACCGGTAT--AC-----------------CGGT-------A-----C--------TTTT-CTT---GTA-A--GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATTTC-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TTTAGCAA-AAA-G-T-AAAA------TT---AAA-C-A----A-AGCAAAA-TAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AAGATAACATTAAATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGA--AACTC-AAA-GGTGT-G-TCT---------------AATAACAACTAGT-ACAATAGCCTCTGA-GGGT---A-AATGTA--TGA-----ATTACATATGT--AAAA-CA-ATT-A-------AT--TTA-TTAT-TTATAATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----TTAATAAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATAT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-ATT--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGATAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-A-TG-TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACAC----T--G-CTTT-ATAG-------------T-------AT-------TG----TA-TAA-GA-----------TTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTAAG-TTCT--GTC-----ACTAATTTC---CAAA--TG-AA--TTTAAAT
gi|8 : aGGTGCG-CTGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----TACCTGTATTTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--AGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--TATT-G-AAG-TCC-AA-T----AA-CTCTAAGAC--TT-AACAA-AATTG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AG--GAAGTA---T---AAGTA--TCAA--GAG-AATCA--C-----GA------AT--ACTAGGCCTAT------CTA----------------TAT--G---TACGCTGTCACTCACT--TTATT-------T--ACT-TC-AGCCCATCGTAATG---------AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAA--------------------TAA-GGGT---A-AACGTA--TG---A--AGTATATGTGT--AAAAACA-A-T-A------AA-----A-TCAT-TTATGATAAGAA-------AACATA--T--CAAACTAAAAA----AAA-ATATCAATGGA--ATG--ATATTATA-TTTCATT--AAG-AAACATTTAA-TATCAGGT--------AGATT-AT-AAATATT-TTATG----TT-GA----A--T------GG-AT-GA---CCCAGG-TC-GAA--TACCATTTCCACT-AA---TT-AGCCAAACCTC
gi|9 : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CTTGGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-CAAAG-TCC-AA-T----AA-CT------CTTTT-AGCAA-AAATG-T--AAA------TTT--------A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CCATT-AA------AT--GATAGG-CTAT------CTATAA------GTACCTATAT--G---TAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT---CT-TC-ATCCCATCGTAATGA-AATCTCAAAA-GGTAT-G-TC------------------TAACA----GT-ACAATAGCCTCT-A-GGGT---A-AACGTA--TG---A--ATTACATATGT--AAAAGCA-AT-------T-AAT--TTA-TTA---TATGAT-AGAA-------AACACATTT--CAAAAC----T-----AA-TTATCAATGGA--ATA--ATATTCTACTTTTATT--AAG-AAACATTTAATTATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATGGCCCTT-G-----A--T------GGATT-TA---CCCAGG-T--AAA--Tacat
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 22222222222222 22222 111111 11 222 222222222222222 1111 333333 2222222222 1111111 11 111111111 111 1 11111111 1111 1 111 2222222222222 444444444444444444444444444444 1111111111 333333333333 11 11111 11111111111 22222 1 11 1111111 1111111 111111
lowQualScore : 3 6666 8888888 33 88888888888888888 8888888 11111111111111 2 444 2 88 2 2 55 444 2 444 33 2 2 2 2 2 7777 2 777777777 2 2 2 5 777777 66 333 7777 2 77777 33 33 2 33 77777 888888 33 666666 999999 55 55 666 1 55 7777 55 3 3 777 3 3 3 3 222222222222222 1111 3 4 777 4 777 555555 1 666 3 6666666666 55 3 3 3333333 55 66 777777777 8 55 222 2 55 8 0 77 33333333 3 3 7 3 7777 3 7777 44 999999 0 3 999 3 33 666 3 666 3 111 0 4444444444444 3 7 7 7777 55 3 3 888888888888888888888888888888 7777 3 7 3333333333 4 888888888888 4 55 11111 777 66 4 66 99999999999 88888 77 77 1 1 5 5 66 22 2222222 4 4 4 2 4 0 4 7 55 3 1111111 3 666 3 3 3 55 3 8 666 55 3 111111 55 777 4 4 4 4
lowQualScore : . .... ....... .. ................. ....... .............. . ... . .. . . .. ... . ... .. . . . . . .... . ......... . . . . ...... .. ... .... . ..... .. .. . .. ..... ...... .. ...... ...... .. .. ... . .. .... .. . . ... . . . . ............... .... . . ... . ... ...... . ... . .......... .. . . ....... .. .. ......... . .. ... . .. . . .. ........ . . . . .... . .... .. ...... . . ... . .. ... . ... . ... . ............. . . . .... .. . . .............................. .... . . .......... . ............ . .. ..... ... .. . .. ........... ..... .. .. . . . . .. .. ....... . . . . . . . . .. . ....... . ... . . . .. . . ... .. . ...... .. ... . . . .
lowQualScore : 3 1111 7777777 77 77777777777777777 7777777 66666666666666 4 111 4 55 4 4 66 444 5 444 44 5 5 5 5 5 8888 5 333333333 5 5 5 0 222222 99 888 8888 5 00000 77 77 7 77 11111 222222 99 777777 666666 00 00 444 4 00 7777 00 6 6 444 6 6 6 6 777777777777777 4444 6 0 000 0 888 222222 0 333 6 1111111111 00 6 6 0000000 55 55 222222222 0 55 555 0 55 1 8 55 22222222 6 3 3 3 5555 3 1111 66 666666 0 3 222 3 66 222 6 444 6 000 9 7777777777777 6 3 3 7777 00 6 6 111111111111111111111111111111 7777 6 3 6666666666 0 333333333333 4 00 11111 888 11 4 11 66666666666 66666 99 99 4 0 0 0 99 22 1111111 4 4 4 7 4 1 0 3 00 6 8888888 6 444 6 6 6 00 6 8 444 00 6 555555 55 000 0 0 0 4
consensus : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TGAT-A--ATTACATNTGT--AAAAACA-ATT-A----T-AAT--TTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTACC-------ATT-------AT-------TG----TA-TAA-GAT------T---TTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGNGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCA
Reference ( family-4091 ) : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TGAT-A--ATTACATNTGT--AAAAACA-ATT-A----T-AAT--TTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTACC-------ATT-------AT-------TG----TA-TAA-GAT------T---TTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGNGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCA
gi|1 : GGTGCG-TGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----C--------TTTT-CTT---GTG-CC-AGTATGTA-T-TGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--TATT-C-AAT-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-ACCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAACAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTATC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACATA--TGAT-ACAAGTACATTTGT--AAAAACA-ATT-ACCGGT-AAT--TTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----A----AAAATTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTCATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------ATATC-AT-AA-TATT-TTATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAATCT-----AT-A-TG-TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTATTGTATAAAATT-------ATCCTGGTTTA----TA-TAA-GAT------T---ATAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---CAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TTCTT-----T--CCCTTTTT--T-ATTTACATTGGAAG-AATTAA-TGG--CTGATT--AT-A--T--GAAA-TA-AATC-ACAACT-AAAAATGATAATAATGG-AATCA-TTT--T-AATAA-------AGATTAAAT-CTG---TGG-T-ATA-CCGT--GGTATATAC-CGCAGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------AGTATA--CCACG---TT-AAGTT-TTTTC-TTTGCGGT-ACCCA
gi|10 : GCGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATTACGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AACCT------T--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--------A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CAGT--AA------AT--GATA-GCATAT------CTATAA------GTACC--TAT--ATGTTAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GGTAT-G-TC------------------TAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TG---A--ATTACATATGT--AAAAGCA-AT-------T-AAT--TTA-TTAT-
gi|10 : agtGAA-------AACACA--TTTCAAAAC----T----AA--TTATCAATGGA--ATA--ATATTCTACTTTTATT--AAG-AAACATTTAATTATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATGGCCCTT-G-----A--T------GGATT-TA---CCCAGG-TA-AAT--TGCgcaatttacctgggtaaatccatcaagggccatgaaatatttataatctacatgataattaaatgtttcttaataaaagtagaatattattccattgataattagttttgaaatgtgttttc
gi|11 : agtgcgcgcggtattaccggtatttttctagtactggtacgtaccgaggtacacaaagccaaattacggtacattcaagtccaataaccttttagcaaaaatgtaaaatttaaagcaaaaataattaaatatcaagagaaacacagtaaatgatagcatatctataagtacctatatgttaggctgtgactcactttattttatacttcatcccatcgtaatgaaactcaaaggtatgtctaacagtacaatagcctctaagggtaaacgtatgaattacatatgtaaaagcaattaatttattat-------T--AC-----------------CAAT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CG-GGTACGTA-C-TGT--GGTACAC---A-AAGCCAA-TACTGG---TA--TATT-C-AAG-TCC-AA-------------------------CAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAC-T-AGTTGA-AGCAAAAATAAT-T---AAGTC--TGAA--GAG-AAAGA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------------------------------G---AACACTGTGACTT--T--TTTTTTT----ATTTCCA-TC-ATCCCATCATAATGA-AAGGT--ACA-TGTAT-G-TATATATATATATATATAAACAACA----GT-ACAATAGCCTCTAT-GATT---A-TATATG--CAATAA--ATCAAAACTG----AAAACG-ATA-A----T-AAT--GAA-TCAT-TT
gi|11 : gTGATT--AT-A--TATGCAA-TA-AATC-AAAACT-GAAAACGATAATAATG--AATCA-TTT--T-ACTAATTTTAAAAGATTAAAT-CTA---CAG-T-ATA-CCCT--GGTATATAC-CACAGTA-----T--TT-AAAGTATTACATGTATGGTATA--CTGTG---GT-ACGCT-TATTC-TTCACGCT-GCCtactaattttaaaagattaaatctacagtataccctggtatataccacagtatttaaagtattacatgtatggtatactgtggtacgcttattcttcacgctgcc
gi|12 : gtaccaatatttttcttgtacgggtacgtactgtggtacacaaagccaatactggtatattcaagtccaacaaaaatgtaaaatttaactagttgaagcaaaaataattaagtctgaagagaaagacaaataataggcctatgaacactgtgacttttttttttatttccatcatcccatcataatgaaaggtacatgtatgtatatatatatatatataaacaacagtacaatagcctctaAAAA-GTT-A----TGAATGCTTA-TTTT-TTAT-ATAAAAACGAGAATAACATA--T--TGG--T----T----AAACTTATCA-TGCT--AAGGTATATTATA-TTCTA---------AAC-------TATTATGTGCTTTAATAGTTT-AT-GA-TATT-TTATG----TTTGA----AAGT------GGATT-TATCGCCGAGG-AT-AAAAATGGCATT-ACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGACT---AAAACTC--T-GC-GTTG-TAG-ATCAAGA-TGGAGAAGCAC----TGAG-CTG--ATA--AAC-------ATTCATGACAAT-------TGTTATTA-TGT-AAT------T---TTCC-ACTT
gi|13 : ATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAGACT---T-AA-G-TG-TAG-A-CAAGACTGCAGAGACAC----T--G-ATGT-ATAGTACC-------AT--------AT-------TG----TA-TAA-GAT------T---TTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTTAATTTT--CTCTTTTT--TTATTTACATTGGTGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AC-AAAG--GCAA-TA-AATC-ACAACT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACATT-TTTTC-TTTGCGGT-ACCCAtagttaatgcccacttgtacttttgagattaatataattatgttcatattgtaaccaagtacatttagatttccattataaattggcaaaggatgatgataataacatcaaat
gi|14 : GGTGCG-CAGTTAATAT-------T--AC-----------------CGGTTAACCGGA-----T--------TTTTTCTT---GTA-CT-G-TACGTA-C--GCCTGGTACACCAAA-AAGCCAA-TACCTGATATA--CATT-C-AAG-GCC-AA-TATTAAG-CT---------TT-AGCAA-AAATGTT-AAAAATTTTTTTT--AAA-CTA----A-AAC--AAATAA----------A--TCAA--GAG-AAA----------GA------AC--AATAa
gi|15 : aa-AAATATT-TCATG----GT-GA----A--TCGGAACGG-TT-TAC--CCCAGGTTC-ATT--TGCCA-TTACGCC-AAATTTC-AGA-ATACCACGAGTTAAAAAACTACCT-AT-GATGATAGAA-CAAGA-TCCACACCCAC----T--GCCTTT-ATAGT--C-------ATT-------A---------G----TACTAACGATAACAGGT---T--T-ACTTATTATTA--TTTAGGATAAACTTAAGTTTCTA-GTCAAACAATAAATCTCATAAAAA--TG-AA--CTTtcttaagctattcctttatttaatctcaaatctatggcctgacatacgttaatcaatctttacatatcg
gi|16 : TGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----TACCGGTACTTTT-CTT---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATT-T-ACGA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CG----AG------AT--AATAGGTCCAT------CTATAA------ATA
gi|17 : gtGATGCGGCGGT----AT-------T---T-----------------CGGT-------AATTTTT--------TTTT-TTT---ATA-CC-GTT-CATA-CGCGC--GGTA-AC---A-AAGCCAAATACAGT---AA--TATT-C-AAG-TCC-AAGT----AA-CT------C--TT-AACAA-AATTG-CAAAAA------TTTTAAAA-C-A----A-AGCAAAATGAAT-------ATG--TTAAGCGAGTAGACT--C------A------AT--AAT
gi|18 : agaGATGCG-CGGT----AT-------T--TC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-TTTTTTATA-CC-GTTACATA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCAG---TA--TATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AACAA-AATTG-CAAAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATGAA-T---Act
gi|19 : ga-CGGT-----T-------T--AA-----------------TGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-AGTACATA-C-TAA--AGTACAC---A-AGATCAAATACCGG---AA--AATT-T-AAG-TCT-GA-T----AG-CT------C--GT-A-CAC-ACATG-T-AAAA------TTG--AAA-C-A----ATAGCAAAAATCAT-------ACA--TTAA------AAACA--tgtaagcgagtagactcaa
gi|2 : ggtgtataatattatGGTGCG-CG-T----AT-------T--ACCTGTATACCGGCTGTATCGGT-------A-----C--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-TGC--AGTACAC---A-AAGTGAAATACC-T---TA--CATT-C-AAGCTCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATA-T-AAAA------TT----------------------AATAAT-T---AAATA--TCAA--GTA-AAACA--CAGTT-AA------AT--AATAGGCATATCAGC--CTATAAAGTACGGTACCTATAT--G---TACGCTGTG-CTCACTTATTATTTT-----T--ACT-TC--TCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GGTATGG-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAAGGGGT---AGAACGTA---G---A--ATTACAGA-GT--AAAAACA-AT-------T-AAT--TTATTTATCTTATGATAAG-A-------AACACA--TTCCAAAAT----T----AAA-TCATCAATGGAATAAA--ATA-TCTA-TTTTAAT--GAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATAC---TT-GAATGCA--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TCAAAA--TGCAATTTACGCCGAA---TT-AGACAAA-CCCGAGTA--AAAACT---TCATAG-TA-TAG-ACCAAAA-TTGAGAGACAC----T--G-CTGT-TTAGTACC-------A-T-------AT-------TG----TA-TAA-CAT------T---TTATCATTTATT-------------TAAACTTTAA-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AAACTTTAAA-AGA-----A-----TACTT-----T--CTGGTTTTGGT-ATTTACATTGGTGGAAATTAA-CAG--CTGATTACAT-A--T--GCAA-TA-AATC-AC-----AAAAACGATAATAATGG-AATTG-TTT--C-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CAG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACATT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCa
gi|20 : agTTACATTGGAGA-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-------GCAAGTATAATCTAAACTT-ATAAACGATAATAATGG-AATTG-TTT--TTACTAA-------AGATTAAAT-CCG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATATAC-CGCGGTACATTTT--TT-C
gi|21 : TGGCAATCG-TTTGTT-ATTAA-------A--TTAACT-TTG---AGG---GTG-CCGT--GGTA-ATAT-CG--G-A---TTGGGTT-CAAATATCAC------GATA-G--CCGC----GT-ACGTTGTTTTCGTTCG-GGT-ttcgtagtacccaac
gi|22 : CA-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CAG-T-ATA-CCATATGGTATATAC-CACGTTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCACG---GT-ACGTT-ATTTC-TTCATGGT--CCCAccaac
gi|23 : GGGGCG-TGGC----AT-------TTGAC-----------------CGGT-------A-----TAT------TTTT-CTT---GTA-CT-GGTATGTA-C-AGC--G
gi|24 : -A-CAAGA-TGCAGAGACAT----T--G-CTGT-ATAGTATC-------A-T-------AT-------TG----TA-TAA-GAC------T---Ta
gi|3 : -----T--------TTTC-CTT---GTA-CT-GGTATGT--C-CGC--G-TACAC---A-A-GCCAAATACCTG---TAAGCATT-C-A-G-TCC-A--T----AA-CT------C--TT-AGCAACAAATG-T-AACA------TTTTTAAA-C-AT---A-AGCAAAA-TAATAG---AAATA--T-AA--GAG-AA-CA--C-----AA------AT--CATATGCCTAA------TAATAA------GTACC--TAT--G---TAAGATGTGACTCACT--TTGTTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTC-AAA-GATAT-GTTCT---------------AAT-ACA----GTAACAATAGCCT-TAA-GGGTAAAA-AACGTAATTGAT-----TTACATCGTT--AAAAACATATT-A----A-TTT--TTT-TTAT-TTATGATAAAAA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TAATCAATGGA--AAA--ATATTCTA--TTTATTAAAAGAAAACA-TTAT-TATCTTAT--------AGATTAATAAAATATT-T-AT-----TT-GA----A--T------GG-TTCTC---CCCAGG-TT-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TTAAGACAAACCCCGAGT---AAA--------------------A-CAATA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGT---------------------T-------TG----TA-TAA-GAT------TAAATAAT-ACTATTTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCCTAGTC-----ACAGA-TTG---AAAA--TG-AA--TTTAAATTAAAATATA-----TAATT-----TTACTCTCTTT--TAATTTACATTGGAAG-AATTAACCAG---TGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAA-GATAATAATGG-AATCGTTTT--T-ACTAA-------AAATTAAAT-CTG---CGG-TAATA-CC-T--GGTACGTACACGCGGTA---TTT--TTCCAAATATTAC------GGTATAAGCCGC----GT-ACGTT-TTATC-TTCGCGGT-ACCCAat
gi|4 : cGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CTTGGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATAC-GG---TA--CATT-C-AAG-GCC-AA-T----AA-CT------T--TT-AGCAA-AAATG-T-AAA-------TTT--AAA-----------GCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAA-A--CCTGTTAA------AT--GATAGGCATAT------CTATAA------GTACC--TATATG---TAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TCCATCC--TCGTAATGA--AACTC-AAAAGGTAT-G-TCT---------------AA---CA----GT-ACAATAGCTCCTA--GGGT---A-AACGTA--TGA-----ATTACATATG---AAAAGCA-ATT-A-------AT--TTA-TTAT---ATGATAAGAA-------AACACA--TTTCAAAAC----TC---AAA-TTATCAATGGA--TA---ATATTCTACTTTTATT--AAGAAAACATTTAT-TATCATGT--------AGATT-TT-AA-TATTATCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CC-AGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACC--GAGT---AAGACT---T-AA-G-GT-TAG-A-CAAGACTGCAGAGAC-C----T--G-ATGG-CTAGTAC--------AT--------AT-------TG----TA-TAAAGAT------T---TTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCTT-GTC-----ACAGATTTC---AAAAGATG-A---TTTAA-TCAA-----A-----TACTTAATTTT--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGTGG-AATTAA-CAG--CTGATT--ACAA--G--GCAA-TA-AATC-ACAACTAAAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAATGCTGCACCGGCT-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGC-GTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CC-CG---GT-ACA-T-TTTTC-TTTGCGGTAACCCAa
gi|5 : atgcTT-CTT---GTAACT-GGT-TGTAAC-CGCA-GGTACAC---ACAAGCCAAATACCTG---TA--CATT-C-AAG-TCCCAA-TT---AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAT------TTT--AAAAC-A----A-A-CAAAAATA-T-T---AAATACTTCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AA--TATATGCCTA-------ATATAA------GTACC--TAT--G---TAAGCTGTGACTCACT--T-GTTTT----AT--ACTATC-ATCC-ATCGTAATGA--AACTC-AAA-GATAT-G-TCT---------------AATAACA----GT--CAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA---GATGA--ATTACATCCGTTAAAAAACA-ATTAA----T-TTT--TTT-TTAT-TTATGATAA-AA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TAATCAATGGA--AAAT-ATATTCTA-TTTTTTA--AAGAAAAC-TTTAT-TATCTTGT--------AGATT-AT-AAATATT-TTATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TC---CCCAGG-TT-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCGGAGT---AAACC------AT----------------A-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAG-------------T-------AT-------TG----TA-TAA-GAT------TA--TTA--ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TCCT--GTC-----ACAGATTT----GAAA--TGAAA--TTTAAATTAA-----ATATATTACTT-----T--CTCTCTTT--T-ATTTACATTGGAGG-AATTAA-CAGTTTTGA-T--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAAAGATAATAATGG-AATCGTTTT--T-ACTAA-------AAATTAAAT-CTG---CGG-T-ATATCCGT--GGTACGTAC-CGC-GTA----TT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTATC-TTCG
gi|6 : GGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACTGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAG-AAATG-T-AAAA------TTC--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-TTAAAAATA--TCAA--GAG-AAACAGTT-----AA------AT--AATAGGCATATCTAGGCCTATAA------GTACCTATAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTTAATGAT--ACT-TC-ATCCCATCGTAAT--GAAACTA-AAA-CTTAT-G-TCT---------------AATATCAT---GT-Agta
gi|6 : TCTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AA-------CAT-----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AA---TGCCATTTACGCC-AA---TA-AGACAAACCC-GAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACACGTACT--G-CTGTGATAGTACC-------AT--------AT--------G----TA-TAT-GAT------T---TTAT-ACTTATTT-------------AAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATT-GTGG-AATTAA-CAG--CTGATTACAT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---TGG-T-----CCAT--GGTATGTAC-CGC-GTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GTTATA--CCGCGTACGTGACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCAgattataacatttgaatggtttacccaggtcaatgccatttacgccaataagacaaacccgagtaaaacttatgtgtagacaagatgcggagacacgtactgctgtgatagtaccatatgtatatgattttatacttatttaaactttagttctgtcacagatttcaaaatgaatttaaatcaaatactttctcttttttatttacattgtggaattaacagctgattacatatgcaataaatcacagctaaaaacgataataatggaatcgttttactaaagattaaatctgtggtccatggtatgtaccgcgtatttttcaaatattacgttataccgcgtacgtgacgttttttcttcgcggtaccca
gi|7 : ggtattaccggtatttttctagtactggtacgtaccgcggtacacaaagccaaatactggtacattcaagtccaataactcttagcagaaatgtaaaattcaaacaaagcaaaaataatttaaaaatatcaagagaaacagttaaataataggcatatctaggcctataagtacctatatgtacgctgtgactcactttattttaatgatacttcatcccatcgtaatgaaactaaaacttatgGGTGTG-CGGT----ATACCGGTAT--AC-----------------CGGT-------A-----C--------TTTT-CTT---GTA-A--GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATTTC-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TTTAGCAA-AAA-G-T-AAAA------TT---AAA-C-A----A-AGCAAAA-TAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AAGATAACATTAAATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGA--AACTC-AAA-GGTGT-G-TCT---------------AATAACAACTAGT-ACAATAGCCTCTGA-GGGT---A-AATGTA--TGA-----ATTACATATGT--AAAA-CA-ATT-A-------AT--TTA-TTAT-TTATAATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----TTAATAAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATAT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-ATT--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGATAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-A-TG-TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACAC----T--G-CTTT-ATAG-------------T-------AT-------TG----TA-TAA-GA-----------TTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTAAG-TTCT--GTC-----ACTAATTTC---CAAA--TG-AA--TTTAAAT
gi|8 : aGGTGCG-CTGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----TACCTGTATTTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--AGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--TATT-G-AAG-TCC-AA-T----AA-CTCTAAGAC--TT-AACAA-AATTG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AG--GAAGTA---T---AAGTA--TCAA--GAG-AATCA--C-----GA------AT--ACTAGGCCTAT------CTA----------------TAT--G---TACGCTGTCACTCACT--TTATT-------T--ACT-TC-AGCCCATCGTAATG---------AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAA--------------------TAA-GGGT---A-AACGTA--TG---A--AGTATATGTGT--AAAAACA-A-T-A------AA-----A-TCAT-TTATGATAAGAA-------AACATA--T--CAAACTAAAAA----AAA-ATATCAATGGA--ATG--ATATTATA-TTTCATT--AAG-AAACATTTAA-TATCAGGT--------AGATT-AT-AAATATT-TTATG----TT-GA----A--T------GG-AT-GA---CCCAGG-TC-GAA--TACCATTTCCACT-AA---TT-AGCCAAACCTC
gi|9 : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CTTGGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-CAAAG-TCC-AA-T----AA-CT------CTTTT-AGCAA-AAATG-T--AAA------TTT--------A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CCATT-AA------AT--GATAGG-CTAT------CTATAA------GTACCTATAT--G---TAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT---CT-TC-ATCCCATCGTAATGA-AATCTCAAAA-GGTAT-G-TC------------------TAACA----GT-ACAATAGCCTCT-A-GGGT---A-AACGTA--TG---A--ATTACATATGT--AAAAGCA-AT-------T-AAT--TTA-TTA---TATGAT-AGAA-------AACACATTT--CAAAAC----T-----AA-TTATCAATGGA--ATA--ATATTCTACTTTTATT--AAG-AAACATTTAATTATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATGGCCCTT-G-----A--T------GGATT-TA---CCCAGG-T--AAA--Tacat
blockSeqs : G TAAT ACCGGTA TG CTGTATACCGGCTGTAT TAACCGG TACCGGTAC T TTT A TT A G CT CAA C ATA AG T A C C G ATTA C CTAAGAC T C T A ATTTTT TA CT GTTG T TTAA CT GC T GT CTGTT GATAAC TA CTAGGC AGTACG TA AT TGT G TA AATG TT A C GA A A G T ATATATATATATATA ACTA A G AAA G ATT ATAA A TTA T TATGA GC T C CGAGAAT TT TT TTAAT C AT GGT C AA A AT GCTTTAAT A A A A GCCC T ATGC AG CGGAAC A C TCG T CA AAA G ATT A TAA ACCTATGATGA A T C GTAC GA C G AACATTCATGACAAT TTAT C C AACAGGT C TTATGTTCAGAA T TA AAACA ATA GA A AC AATATA AATTT TA GG T T A C TT AC ATAT G T T A A C T GT T TTTTAAA G CAC C A T AT A A CAT GG C ATGTAT AG TAC G G G A
blockSeqs : . . . . . . TACCTGTAT . . . TT . . A . . . . . . . . . T . CTT . . . A . TT AC T . AG . . . . AGTT . . CAGC . TA . . C . . . . . GA . . . . . T . . . . T ATGA C T . TAATT . . . . . TC AAAAA . . AT C . A AT . . . A . GCCC . . . . A . C . A T . . . A CTGCGTTG . C C . . . . TACCATAT . . A TAAA . TTATGTTCAGAA . A . . . . . ATATAT AATTT . . A T . . . AC AAAG . . . A . . T . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . ATTTTT . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . T . . . . CATT . . . . TA . . C . . . . . GA . . . . . . . . . . C AT A T . AATA . . . . . TT TC . . A C . A A . . . A . C . . . . A . . . T T . . . . TCATAGTA . . . . . . . TACCATAT . . . TA . TTATGTTCAGAA . T . . . . . A . . . . A . . . . AAG . . . C . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TAT . . . G . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . T . . . . AGT . . . . . . . A . . . . . GA . . . . . . . . . . T A C T . TAAT . . . . . . T . . A . . A T . . . A . . . . . . . . . . C A . . . . TAAGTG . . . . . . . TATCATAT . . . T . TTATTTAGGA . . . . . . . A . . . . A . . . . AT . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . T . . . . G . . . . . . . G . . . . . GA . . . . . . . . . . T A A T . TAA . . . . . . T . . A . . A T . . . A . . . . . . . . . . T A . . . . TAAGGT . . . . . . . TACCATAT . . . T . . . . . . . . . A . . . . T . . . . AT . . . A . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . . . . . . . . T A C T . TA . . . . . . T . . G . . . T . . . A . . . . . . . . . . C A . . . . TATGTG . . . . . . . TACATAT . . . T . . . . . . . . . A . . . . A . . . . AT . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . . . C . . . . . G . . . . . . . . . . T A A T . TA . . . . . . T . . G . . . A . . . A . . . . . . . . . . T A . . . . TATATG . . . . . . . TCATTA . . . T . . . . . . . . . T . . . . AT . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . . . C . . . . . G . . . . . . . . . . . A G . . TA . . . . . . T . . A . . . A . . . A . . . . . . . . . . C T . . . . AT . . . . . . . TAT . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . . . C . . . . . G . . . . . . . . . . . A A . . TA . . . . . . T . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . TAT . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . G . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : GA* A***** TA******** TATGTG******* TACCATAT********************** TTATTAGA****
originalCons : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TGAT-A--ATTACATNTGT--AAAAACA-ATT-A----T-AAT--TTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTACC-------ATT-------AT-------TG----TA-TAA-GAT------T---TTAT-ACTTATTTTTATGTTCAGAATAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGNGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCA
finalCons : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-C-AAG-TCC-AA-T----AA-CT------C--TT-AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGA-AAACTC-AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGTA--TGA-----ATTACATNTGT--AAAAACA-ATTA--------AT--TTA-TTAT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAAT----T----AAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAAACTTATGTG-------TAG-A-CAAGA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTACCATAT----------------------TG----TA-TAA-GAT------T---TTAT-ACTTATTTTTATTAGA----TAAACTTTAG-TTCT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA--TG-AA--TTTAAATCAA-----A-----TACTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGNGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 22222222222222 22222 111111 11 11 11 1 222222222222222 1111 11 111111 1111111 11111 111111111 111 1 11111111 1111 1 111 2222222222222 22222222222222222222222 11111111111 7777777777777777777 111111 11 11111 11111111111 11111 11111 1 11 1111111 1111111 111111
lowQualScore : 3 6666 8888888 33 88888888888888888 8888888 11111111111111 2 444 2 88 2 2 55 444 2 444 33 2 2 2 2 2 7777 2 777777 55 2 2 5 777777 66 88888888 2 77777 33 33 2 33 77777 888888 33 2 666666 999999 00 00 666 1 55 7777 55 3 3 66 0 7 3 3 222222222222222 1 1111 3 77 777 4 777 11 8888 1 555 0 3 55 000000 55555 3 666 3 3333333 33333 4 444444444 8 55 222 2 55 8 0 77 33333333 3 3 3 3 7777 3 7777 44 999999 0 3 999 3 33 666 3 666 3 111 0 4444444444444 3 7 7 7777 55 3 3 55555555555555555555555 3 3 3 77777777777 0 4 6666666666666666666 111111 4 4 00 11111 777 4 66 66 99999999999 44444 44444 77 77 1 1 5 5 66 22 2222222 4 4 4 2 4 0 4 7 55 3 1111111 3 666 3 3 3 55 3 8 666 55 3 111111 55 777 4 4 4 4
lowQualScore : . .... ....... .. ................. ....... .............. . ... . .. . . .. ... . ... .. . . . . . .... . ...... .. . . . ...... .. ........ . ..... .. .. . .. ..... ...... .. . ...... ...... .. .. ... . .. .... .. . . .. . . . . ............... . .... . .. ... . ... .. .... . ... . . .. ...... ..... . ... . ....... ..... . ......... . .. ... . .. . . .. ........ . . . . .... . .... .. ...... . . ... . .. ... . ... . ... . ............. . . . .... .. . . ....................... . . . ........... . . ................... ...... . . .. ..... ... . .. .. ........... ..... ..... .. .. . . . . .. .. ....... . . . . . . . . .. . ....... . ... . . . .. . . ... .. . ...... .. ... . . . .
lowQualScore : 3 1111 7777777 77 77777777777777777 7777777 66666666666666 4 111 4 55 4 4 66 444 5 444 44 5 5 5 5 5 8888 5 222222 99 5 5 0 222222 99 77777777 5 00000 77 77 7 77 11111 222222 99 5 777777 666666 00 00 444 4 00 7777 00 6 6 99 3 3 6 6 777777777777777 3 4444 6 44 000 0 000 00 5555 0 888 9 6 00 555555 55555 6 444 6 0000000 00000 0 777777777 0 55 555 0 55 1 8 55 22222222 6 3 2 3 5555 3 1111 66 666666 0 3 222 3 66 222 6 444 6 000 9 7777777777777 6 3 3 7777 00 6 6 00000000000000000000000 6 6 6 11111111111 9 0 0000000000000000000 555555 0 4 66 11111 888 4 11 11 66666666666 33333 33333 99 99 4 0 0 0 99 22 1111111 4 4 4 7 4 1 0 3 00 6 8888888 6 444 6 6 6 00 6 8 444 00 6 555555 55 000 0 0 0 4
consensus : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-CAA-G-TCC-AA-T----AA-CT------CTT--AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGA-AAACTCAAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGT---A--TGA----ATTACATNTGT--AAAAACA-AT--TA------A--T--TTA-TT---AT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAA-T----T----AAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTA-CATAT---------------TGTA-T-AA-GAT------T---TTAT-ACTTATTTTTA---T---C--AG-A-TAA------ACTTTAG-TTC-T--GTC-----ACAGATTTC---AAAATG-A--A--TTTAAATCAA-----A-----TAC-----TT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGNGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCA
Reference ( family-4091 ) : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-CAA-G-TCC-AA-T----AA-CT------CTT--AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGA-AAACTCAAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGT---A--TGA----ATTACATNTGT--AAAAACA-AT--TA------A--T--TTA-TT---AT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAA-T----T----AAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTACCATAT---------------TGTA-T-AA-GAT------T---TTAT-ACTTATTTTTA---T---T--AG-A-TAA------ACTTTAG-TTC-T--GTC-----ACAGATTTC---AAAATG-A--A--TTTAAATCAA-----A-----TAC-----TT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGNGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCA
gi|1 : GGTGCG-TGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----C--------TTTT-CTT---GTG-CC-AGTATGTA-T-TGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--TATT-CAA-T-TCC-AA-T----AA-CT------CTT--ACCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAACAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------CTATAA------GTATC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGAGAAACTCAAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACAT---A--TGATACAAGTACATTTGT--AAAAACA-AT--TACCGGTAA--T--TTA-TT---AT-TTATGATAAGAA-------AACACA--T--CAAAA-T----A----AAAATTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTCATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------ATATC-AT-AA-TATT-TTATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAATCT-----AT-A-TG-TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGTATTGTATAAAATTATCCTGGTTTATA-T-AA-GAT------T---ATAT-ACTTATTTTTA---TGTTC--AG-AATAA------ACTTTAG-TTC-T--GTC-----ACAGATTTC---CAAATG-A--A--TTTAAATCAA-----A-----TTC-----TT-----T--CCCTTTTT--T-ATTTACATTGGAAG-AATTAA-TGG--CTGATT--AT-A--T--GAAA-TA-AATC-ACAACT-AAAAATGATAATAATGG-AATCA-TTT--T-AATAA-------AGATTAAAT-CTG---TGG-T-ATA-CCGT--GGTATATAC-CGCAGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------AGTATA--CCACG---TT-AAGTT-TTTTC-TTTGCGGT-ACCCA
gi|10 : GCGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATTACGG---TA--CATT-CAA-G-TCC-AA-T----AACCT------TTT--AGCAA-AAATG-T-AAAA------TTT--------A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CAGT--AA------AT--GATA-GCATAT------CTATAA------GTACC--TAT--ATGTTAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATG--AAACTCAAA-GGTAT-G-TC------------------TAACA----GT-ACAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGT---A--TGA----ATTACATATGT--AAAAGCA-AT--TA------A--T--TTA-TT---AT-
gi|10 : agtGAA-------AACACA--TTTCAAAA-C----T----AA--TTATCAATGGA--ATA--ATATTCTACTTTTATT--AAG-AAACATTTAATTATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATGGCCCTT-G-----A--T------GGATT-TA---CCCAGG-TA-AAT--TGCgcaatttacctgggtaaatccatcaagggccatgaaatatttataatctacatgataattaaatgtttcttaataaaagtagaatattattccattgataattagttttgaaatgtgttttc
gi|11 : agtgcgcgcggtattaccggtatttttctagtactggtacgtaccgaggtacacaaagccaaattacggtacattcaagtccaataaccttttagcaaaaatgtaaaatttaaagcaaaaataattaaatatcaagagaaacacagtaaatgatagcatatctataagtacctatatgttaggctgtgactcactttattttatacttcatcccatcgtaatgaaactcaaaggtatgtctaacagtacaatagcctctaagggtaaacgtatgaattacatatgtaaaagcaattaatttattat-------T--AC-----------------CAAT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CG-GGTACGTA-C-TGT--GGTACAC---A-AAGCCAA-TACTGG---TA--TATT-CAA-G-TCC-AA------------------------CAA-AAATG-T-AAAA------TTT--AAC-T-AGTTGA-AGCAAAAATAAT-T---AAGTC--TGAA--GAG-AAAGA--C-----AA------AT--AATAGGCCTAT------------------------------G---AACACTGTGACTT--T--TTTTTTT----ATTTCCA-TC-ATCCCATCATAATGA-AAGGT-ACA-TGTAT-G-TATATATATATATATATAAACAACA----GT-ACAATAGCCTCTAT-GATT---A-TATATGCAA--TAA----ATCAAAACTG----AAAACG-ATAATA------A--T--GAA-TC---AT-TT
gi|11 : gTGATT--AT-A--TATGCAA-TA-AATC-AAAACT-GAAAACGATAATAATG--AATCA-TTT--T-ACTAATTTTAAAAGATTAAAT-CTA---CAG-T-ATA-CCCT--GGTATATAC-CACAGTA-----T--TT-AAAGTATTACATGTATGGTATA--CTGTG---GT-ACGCT-TATTC-TTCACGCT-GCCtactaattttaaaagattaaatctacagtataccctggtatataccacagtatttaaagtattacatgtatggtatactgtggtacgcttattcttcacgctgcc
gi|12 : gtaccaatatttttcttgtacgggtacgtactgtggtacacaaagccaatactggtatattcaagtccaacaaaaatgtaaaatttaactagttgaagcaaaaataattaagtctgaagagaaagacaaataataggcctatgaacactgtgacttttttttttatttccatcatcccatcataatgaaaggtacatgtatgtatatatatatatatataaacaacagtacaatagcctcta--AAAAGTT-AT--GA------A--TGCTTA-TT---TT-TTAT-ATAAAAACGAGAATAACATA--T--TGG---T----T----AAACTTATCA-TGCT--AAGGTATATTATA-TTCTA---------AAC-------TATTATGTGCTTTAATAGTTT-AT-GA-TATT-TTATG----TTTGA----AAGT------GGATT-TATCGCCGAGG-AT-AAAAATGGCATT-ACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGACT---AAAACTC--T-GC-GTTG-TAG-ATCAAGA-TGGAGAAGCAC----TGAG-CTG--ATAA----ACAT---------------T-CA-T-GA-CA--------------------ATTGTTA---T---T--AT-G-TAATTTTCCACTTTAG-TT
gi|13 : ATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCCGAGT---AAGACT---T-AA-G-TG-TAG-A-CAAGACTGCAGAGACAC----T--G-ATGT-ATAGTACCATAT---------------TGTA-T-AA-GAT------T---TTAT-ACTTATTT-------------------AA------ACTTTAG-TTC-T--GTC-----ACAGATTTC---AAAATG-A--A--TTTAAATCAA-----A-----TAC-----TTAATTTT--CTCTTTTT--TTATTTACATTGGTGG-AATTAA-CAG--CTGATT--AC-AAAG--GCAA-TA-AATC-ACAACT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACATT-TTTTC-TTTGCGGT-ACCCAaatgcccacttgtacttttgagattaatataattatgttcatattgtaaccaagtacatttagatttccattataaattggcaaaggatgatgataataacatcaaat
gi|14 : GGTGCG-CAGTTAATAT-------T--AC-----------------CGGTTAACCGGA-----T--------TTTTTCTT---GTA-CT-G-TACGTA-C--GCCTGGTACACCAAA-AAGCCAA-TACCTGATATA--CATT-CAA-G-GCC-AA-TATTAAG-CT-------TT--AGCAA-AAATGTT-AAAAATTTTTTTT--AAA-CTA----A-AAC--AAATAA----------A--TCAA--GAG-AAA----------GA------AC--AATAa
gi|15 : aa-AAATATT-TCATG----GT-GA----A--TCGGAACGG-TT-TAC--CCCAGGTTC-ATT--TGCCA-TTACGCC-AAATTTC-AGA-ATACCACGAGTTAAAAAACTACCT-AT-GATGATAGAA-CAAGA-TCCACACCCAC----T--GCCTTT-ATAGT--CAT-T---------------AGTACT-AACGATAACAGGT---T--T-ACTTATTATTA---T---TTAGG-A-TAA------ACTTAAGTTTC-TA-GTCAAACAATAAATCTCATAAAAATG-A--A--CTTtcttaagctattcctttatttaatctcaaatctatggcctgacatacgttaatcaatctttacatatcg
gi|16 : TGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----TACCGGTACTTTT-CTT---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-CAA-G-TCC-AA-T----AA-CT------CTT--AGCAA-AAATT-T-ACGA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CG----AG------AT--AATAGGTCCAT------CTATAA------ATA
gi|17 : gtGATGCGGCGGT----AT-------T---T-----------------CGGT-------AATTTTT--------TTTT-TTT---ATA-CC-GTT-CATA-CGCGC--GGTA-AC---A-AAGCCAAATACAGT---AA--TATT-CAA-G-TCC-AAGT----AA-CT------CTT--AACAA-AATTG-CAAAAA------TTTTAAAA-C-A----A-AGCAAAATGAAT-------ATG--TTAAGCGAGTAGACT--C------A------AT--AAT
gi|18 : agaGATGCG-CGGT----AT-------T--TC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-TTTTTTATA-CC-GTTACATA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCAG---TA--TATT-CAA-G-TCC-AA-T----AA-CT------CTT--AACAA-AATTG-CAAAAA------TTT--AAA-C-A----A-AGCAAAAATGAA-T---Act
gi|19 : ga-CGGT-----T-------T--AA-----------------TGGT-------A-----T--------TTTT-CTT---GTA-CC-AGTACATA-C-TAA--AGTACAC---A-AGATCAAATACCGG---AA--AATT-TAA-G-TCT-GA-T----AG-CT------CGT--A-CAC-ACATG-T-AAAA------TTG--AAA-C-A----ATAGCAAAAATCAT-------ACA--TTAA------AAACA--tgtaagcgagtagactcaa
gi|2 : ggtgtataatattatGGTGCG-CG-T----AT-------T--ACCTGTATACCGGCTGTATCGGT-------A-----C--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-TGC--AGTACAC---A-AAGTGAAATACC-T---TA--CATT-CAA-GCTCC-AA-T----AA-CT------CTT--AGCAA-AAATA-T-AAAA------TT----------------------AATAAT-T---AAATA--TCAA--GTA-AAACA--CAGTT-AA------AT--AATAGGCATATCAGC--CTATAAAGTACGGTACCTATAT--G---TACGCTGTG-CTCACTTATTATTTT-----T--ACT-TC--TCCCATCGTAATG--AAACTCAAA-GGTATGG-TCT---------------AATAACA----GT-ACAATAGCCTCTAAGGGGT---AGAACGT---A---GA----ATTACAGA-GT--AAAAACA-AT--TA------A--T--TTATTT---ATCTTATGATAAG-A-------AACACA--TTCCAAAA-T----T----AAA-TCATCAATGGAATAAA--ATA-TCTA-TTTTAAT--GAGAAAACATTTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATAC---TT-GAATGCA--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TCAAAA--TGCAATTTACGCCGAA---TT-AGACAAA-CCCGAGTA--AAAACT---TCATAG-TA-TAG-ACCAAAA-TTGAGAGACAC----T--G-CTGT-TTAGTACCATAT---------------TGTA-T-AA-CAT------T---TTATCATTTATT-------------------TAA------ACTTTAA-TTC-T--GTC-----ACAGATTTC---AAAATG-A--AACTTTAAA-AGA-----A-----TAC-----TT-----T--CTGGTTTTGGT-ATTTACATTGGTGGAAATTAA-CAG--CTGATTACAT-A--T--GCAA-TA-AATC-AC-----AAAAACGATAATAATGG-AATTG-TTT--C-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CAG-T-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGCGGTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACATT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCa
gi|20 : agTTACATTGGAGA-AATTAA-CAG--CTGATT--AT-------GCAAGTATAATCTAAACTT-ATAAACGATAATAATGG-AATTG-TTT--TTACTAA-------AGATTAAAT-CCG---CGG-T-ATA-CCGT--GGTATATAC-CGCGGTACATTTT--TT-C
gi|21 : TGGCAATCG-TTTGTT-ATTAA-------A--TTAACT-TTG---AGG---GTG-CCGT--GGTA-ATAT-CG--G-A---TTGGGTT-CAAATATCAC------GATA-G--CCGC----GT-ACGTTGTTTTCGTTCG-GGT-ttcgtagtacccaac
gi|22 : CA-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---CAG-T-ATA-CCATATGGTATATAC-CACGTTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCACG---GT-ACGTT-ATTTC-TTCATGGT--CCCAccaac
gi|23 : GGGGCG-TGGC----AT-------TTGAC-----------------CGGT-------A-----TAT------TTTT-CTT---GTA-CT-GGTATGTA-C-AGC--G
gi|24 : -A-CAAGA-TGCAGAGACAT----T--G-CTGT-ATAGTATCATAT---------------TGTA-T-AA-GAC------T---Ta
gi|3 : -----T--------TTTC-CTT---GTA-CT-GGTATGT--C-CGC--G-TACAC---A-A-GCCAAATACCTG---TAAGCATT-CA--G-TCC-A--T----AA-CT------CTT--AGCAACAAATG-T-AACA------TTTTTAAA-C-AT---A-AGCAAAA-TAATAG---AAATA--T-AA--GAG-AA-CA--C-----AA------AT--CATATGCCTAA------TAATAA------GTACC--TAT--G---TAAGATGTGACTCACT--TTGTTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATG--AAACTCAAA-GATAT-GTTCT---------------AAT-ACA----GTAACAATAGCCT-TAA-GGGTAAAA-AACGT---AATTGA----TTTACATCGTT--AAAAACATAT--TA------ATTT--TTT-TT---AT-TTATGATAAAAA-------AACACA--T--CAAAA-T----T----AAA-TAATCAATGGA--AAA--ATATTCTA--TTTATTAAAAGAAAACA-TTAT-TATCTTAT--------AGATTAATAAAATATT-T-AT-----TT-GA----A--T------GG-TTCTC---CCCAGG-TT-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TTAAGACAAACCCCGAGT---AAA--------------------A-CAATA-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAGT------T---------------TGTA-T-AA-GAT------TAAATAAT-ACTATTTTTTATGTT---C--AGAA-TAA------ACTTTAG-TTC-CTAGTC-----ACAGA-TTG---AAAATG-A--A--TTTAAATTAAAATATA-----TAA-----TT-----TTACTCTCTTT--TAATTTACATTGGAAG-AATTAACCAG---TGATT--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAA-GATAATAATGG-AATCGTTTT--T-ACTAA-------AAATTAAAT-CTG---CGG-TAATA-CC-T--GGTACGTACACGCGGTA---TTT--TTCCAAATATTAC------GGTATAAGCCGC----GT-ACGTT-TTATC-TTCGCGGT-ACCCAat
gi|4 : cGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CTTGGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATAC-GG---TA--CATT-CAA-G-GCC-AA-T----AA-CT------TTT--AGCAA-AAATG-T-AAA-------TTT--AAA-----------GCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAA-A--CCTGTTAA------AT--GATAGGCATAT------CTATAA------GTACC--TATATG---TAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TCCATCC--TCGTAATGA-AA-CTCAAAAGGTAT-G-TCT---------------AA---CA----GT-ACAATAGCTCCTA--GGGT---A-AACGT---A--TGA----ATTACATATG---AAAAGCA-AT--TA------A--T--TTA-TT---A---TATGATAAGAA-------AACACATTT--CAAAACT----C----AAA-TTATCAATGGA--TA---ATATTCTACTTTTATT--AAGAAAACATTTAT-TATCATGT--------AGATT--T-TAATATTATCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA----CCAGG-TC-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAA--CCGAGT---AAGACT---T-AA-G-GT-TAG-A-CAAGACTGCAGAGAC-C----T--G-ATGG-CTAGTA-CATAT---------------TGTA-TAAA-GAT------T---TTAT-ACTTATT-------------------TAA------ACTTTAG-TTCTT--GTC-----ACAGATTTC---AAAA-G-ATGA--TTT-AATCAA-----A-----TACTTAATTT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATTGGTGG-AATTAA-CAG--CTGATT--ACAA--G--GCAA-TA-AATC-ACAACTAAAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAATGCTGCACCGGCT-ATA-CCGT--GGTATGTAC-CGC-GTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CC-CG---GT-ACA-T-TTTTC-TTTGCGGTAACCCAa
gi|5 : atgcTT-CTT---GTAACT-GGT-TGTAAC-CGCA-GGTACAC---ACAAGCCAAATACCTG---TA--CATT-CAA-G-TCCCAA-TT---AA-CT------CTT--AGCAA-AAATG-T-AAAT------TTT--AAAAC-A----A-A-CAAAAATA-T-T---AAATACTTCAA--GAG-AAACA--C-----AA------AA--TATATGCCTA-------ATATAA------GTACC--TAT--G---TAAGCTGTGACTCACT--T-GTTTT----AT--ACTATC-ATCC-ATCGTAATGA-AA-CTCAAA-GATAT-G-TCT---------------AATAACA----GT--CAATAGCCTCTAA-GGGT---A-AACGT---AGATGA----ATTACATCCGTTAAAAAACA-AT--TA------A--T--TTT-TTTTTAT-TTATGATAA-AA-------AACACA--T--CAAAA-T----T----AAA-TAATCAATGGA--AAAT-ATATTCTA-TTTTTTA--AAGAAAAC-TTTAT-TATCTTGT--------AGATT-AT-AAATATT-TTATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TC---CCCAGG-TT-AAA--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGACAAACCCGGAGT---AAACC------AT----------------A-TGCAGAGACAC----T--G-CTGT-ATAG-----TAT---------------TGTA-T-AA-GAT------TA--TTA--ACTTATTTTTATGTT---C--AGAA-TAA------ACTTTAG-TCC-T--GTC-----ACAGATTT----GAAATGAA--A--TTTAAATTAA-----ATATATTAC-----TT-----T--CTCTCTTT--T-ATTTACATTGGAGG-AATTAA-CAGTTTTGA-T--AT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAAAGATAATAATGG-AATCGTTTT--T-ACTAA-------AAATTAAAT-CTG---CGG-T-ATATCCGT--GGTACGTAC-CGC-GTA----TT--TT-CAAATATTAC------GGTATA--CCGCG---GT-ACGTT-TTATC-TTCG
gi|6 : GGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CT-GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACTGG---TA--CATT-CAA-G-TCC-AA-T----AA-CT------CTT--AGCAG-AAATG-T-AAAA------TTC--AAA-C-A----A-AGCAAAAATAAT-TTAAAAATA--TCAA--GAG-AAACAGTT-----AA------AT--AATAGGCATATCTAGGCCTATAA------GTACCTATAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTTAATGAT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATG--AAACTAAAA-CTTAT-G-TCT---------------AATATCAT---GT-Agta
gi|6 : TCTAA-TATCATGT--------AGATT-AT-AA-------CAT-----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-AA---TGCCATTTACGCC-AA---TA-AGACAAACCC-GAGT---AAAACT---T-AT-G-TG-TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACACGTACT--G-CTGTGATAGTACCATAT----------------GTA-T-AT-GAT------T---TTAT-ACTTATTT-------------------AA------ACTTTAG-TTC-T--GTC-----ACAGATTTC---AAAATG-A--A--TTTAAATCAA-----A-----TAC-----TT-----T--CTCTTTTT--T-ATTTACATT-GTGG-AATTAA-CAG--CTGATTACAT-A--T--GCAA-TA-AATC-ACAGCT-AAAAACGATAATAATGG-AATCG-TTT--T-ACTAA-------AGATTAAAT-CTG---TGG-T-----CCAT--GGTATGTAC-CGC-GTA---TTT--TT-CAAATATTAC------GTTATA--CCGCGTACGTGACGTT-TTTTC-TTCGCGGT-ACCCAgattataacatttgaatggtttacccaggtcaatgccatttacgccaataagacaaacccgagtaaaacttatgtgtagacaagatgcggagacacgtactgctgtgatagtaccatatgtatatgattttatacttatttaaactttagttctgtcacagatttcaaaatgaatttaaatcaaatactttctcttttttatttacattgtggaattaacagctgattacatatgcaataaatcacagctaaaaacgataataatggaatcgttttactaaagattaaatctgtggtccatggtatgtaccgcgtatttttcaaatattacgttataccgcgtacgtgacgttttttcttcgcggtaccca
gi|7 : ggtattaccggtatttttctagtactggtacgtaccgcggtacacaaagccaaatactggtacattcaagtccaataactcttagcagaaatgtaaaattcaaacaaagcaaaaataatttaaaaatatcaagagaaacagttaaataataggcatatctaggcctataagtacctatatgtacgctgtgactcactttattttaatgatacttcatcccatcgtaatgaaactaaaacttatgGGTGTG-CGGT----ATACCGGTAT--AC-----------------CGGT-------A-----C--------TTTT-CTT---GTA-A--GGTACGTA-C-CGC--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATTTCAA-G-TCC-AA-T----AA-CT------CTTT-AGCAA-AAA-G-T-AAAA------TT---AAA-C-A----A-AGCAAAA-TAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--C-----AAGATAACATTAAATAGGCCTAT------CTATAA------GTACC--TAT--G---TACGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT--ACT-TC-ATCCCATCGTAATGA-AA-CTCAAA-GGTGT-G-TCT---------------AATAACAACTAGT-ACAATAGCCTCTGA-GGGT---A-AATGT---A--TGA----ATTACATATGT--AAAA-CA-AT--TA------A--T--TTA-TT---AT-TTATAATAAGAA-------AACACA--T--CAAAA-T----TTAATAAA-TTATCAATGGA--AAG--ATATTCTA-TTTTATT--AAGAAAACATTTAA-TATCATAT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATG----TT-GA----A--T------GG-TT-TA---CCCAGG-TC-ATT--TGCCATTTACGCC-AA---TT-AGATAAACCCCGAGT---AAAACT---T-AT-A-TG-TAG-A-CAAGA-TGCGGAGACAC----T--G-CTTT-ATAG-----TAT---------------TGTA-T-AA-GA-----------TTAT-ACTTATTTTTATGTT---C--AGAA-TAA------ACTTAAG-TTC-T--GTC-----ACTAATTTC---CAAATG-A--A--TTTAAAT
gi|8 : aGGTGCG-CTGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----TACCTGTATTTTT-CTT---GTA-CC-GGTACGTA-C-CGC--AGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--TATT-GAA-G-TCC-AA-T----AA-CTCTAAGACTT--AACAA-AATTG-T-AAAA------TTT--AAA-C-A----A-AG--GAAGTA---T---AAGTA--TCAA--GAG-AATCA--C-----GA------AT--ACTAGGCCTAT------CTA----------------TAT--G---TACGCTGTCACTCACT--TTATT-------T--ACT-TC-AGCCCATCGTAATG--------AAA-GGTAT-G-TCT---------------AATAA--------------------TAA-GGGT---A-AACGT---A--TGA----AGTATATGTGT--AAAAACA-AT--AA------A-------A-TC---AT-TTATGATAAGAA-------AACATA--T--CAAAC-TAAAAA----AAA-ATATCAATGGA--ATG--ATATTATA-TTTCATT--AAG-AAACATTTAA-TATCAGGT--------AGATT-AT-AAATATT-TTATG----TT-GA----A--T------GG-AT-GA---CCCAGG-TC-GAA--TACCATTTCCACT-AA---TT-AGCCAAACCTC
gi|9 : GGTGCG-CGGT----AT-------T--AC-----------------CGGT-------A-----T--------TTTT-CTA---GTA-CTTGGTACGTA-C-CGA--GGTACAC---A-AAGCCAAATACCGG---TA--CATT-CAAAG-TCC-AA-T----AA-CT------CTTTTAGCAA-AAATG-T-AAA-------TTT--AAA-----------GCAAAAATAAT-T---AAATA--TCAA--GAG-AAACA--CCATT-AA------AT--GATAGGC-TAT------CTATAA------GTACC--TATATG---TAGGCTGTGACTCACT--TTATTTT----AT---CT-TC-ATCCCATCGTAATGA-AATCTCAAAAGGTAT-G-TCT---------------AA---CA----GT-ACAATAGCCTCTA--GGGT---A-AACGT---A--TGA----ATTACATATGT--AAAAGCA-AT--TA------A--T--TTA-TT---A---TATGAT-AGAA-------AACACATTT--CAAAA-C----T-----AA-TTATCAATGGA--ATA--ATATTCTACTTTTATT--AAG-AAACATTTAATTATCATGT--------AGATT-AT-AAATATT-TCATGGCCCTT-G-----A--T------GGATT-TA---CCCAGG-T--AAA--Tacat