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Alignments
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Reference ( family-40 ) : GGCCGTAACTAGGGTGATA-TTTTTATGAGGCAAAAATAT--AATCG-CCGA--GCGAAGCGAGG--CG-AAAAATT---TTTGGGC-GAG--GGGT-CTGGG---G------------GCC--------GC-C-TAAGGCCCCC-----CG------------G---------AA-GCTCT-GGCCTT-AA-T----GGTGCGAAA-TCCTTG----A--T-TCT---AG-----CC--ATTT--CCTGGC-ATC-TTTT--TCCT---CG-TT------TAC-A----GCA-TAGC-TT--TTTT---ATC-TGTTTTTCTAC--TGAATC--AG-GTAT-TATAAG-AATG---T---A-----TT---TCA--GA-ATA--CATGTA-A-ACTAAAACA--TGGGAACAAA-------AACACGC-ACTTG--AAAAGCTACATAAAACTGATTC-C-TGTCTATGTAAAG--AAACAATACGAAGT------------ATGATTAAATGT---A----AT---GCAACA-CG---GAAAAGTAGA--TCTAG-CCGTCACCACC-GT--GTGGCATTCATTCGTCAGCAAAAGAAAA
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gi|12 : gtctggccgtactcccGGGC-GAG--GG-T-CTGGA---GCA----------ATC--------GC-C-T---------------G------------G---------AA-GCTCT-GGCCTT-AA-T-----GTGCAAAG-TCCTTA----A--TATCT---AGT----CC--ATTTC-CCTGGC-ATC--CTT--TCCT---CGATTTGTGTATGT-A----GCA-TAGA-TT--Taacgggcgagggtctggagcaatcgcctggaagctctggccttaatgtgcaaagtccttaatatctagtccatttccctggcatcctttcctcgatttgtgtatgtagcatagattt
gi|13 : gtctggccgtactcccgccgtactagggtgatattttttatgaaacGCCGTAACTAGGGTGATA-TTTTTATGA
gi|13 : GGGC-GAG--GGGT-CTGGG---C------------ATC--------GC-C-T----------------------------G---------AA-GCTCT-GGCCTT-AA-T----GGTGCAAAA-TCCTTA----A--T-TCT---AG-----TC--ATTT--CCTGGC-ATC-CTTT--TCCT---CG-TTTGTGTATGT-A----GCA-TAGT-TT--Taacgggcgaggggtctgggcatcgcctgaagctctggccttaatggtgcaaaatccttaattctagtcatttcctggcatccttttcctcgtttgtgtatgtagcatagttttatgcttatatct
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gi|7 : gttttatgcGTAACAAGGGTGATA-TTTTTAT-----------AT--AATTG-CCGA--GCGAAGCAAGG--CG-AAAAGTT---TTTGGCC-GAG--GGAT-CGGGG---G------------GCC--------GC-G-TAAAGCCCCC-----TGACCCGGCCCCCTG---------AA-GCTCT-GGCCTT-AA-T----GGTGCGAAA------------------------------------T--CCTGGC-ATC-TTTT--TCCT---CG-TT------CAC-A----GCA-TAAC-TT--ATTT---GTC-TCCTTTTCTAC--TGAATC--AG----T-TATAAG--CTG---TAA-A-----CTGCGTCA--GATATAAGCATA-A-A-ACTA
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blockSeqs : . A . . A T . . TTC . . . . G . . . CGCCCAG . . . . . . G . . AG A . . . . . . . . . . ACC . . GT . TA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . G . . . CCCCG . . . . . . C . . AG A . . . . . . . . . . TG . . GT . TA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . TTCCA . . . . . . G . . A C . . . . . . . . . . C . . TT . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . GG . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . .
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gi|7 : gttttatgcGTAACAAGGGTGATA-TTTTTAT-----------AT--AATTG-CCGA--GCGAAGCAAGG--CG-AAAAGTT---TTTGGCC-GAG--GGAT-CGGGG---G------------GCC--------GC-G-TAAAGCCCCC-----TGACCCGGCCCCCTG---------AA-GCTCT-GGCCTT-AA-T----GGTGCGAAA------------------------------------T--CCTGGC-ATC-TTTT--TCCT---CG-TT------CAC-A----GCA-TAAC-TT--ATTT---GTC-TCCTTTTCTAC--TGAATC--AG--T---T-ATA----AG--CTG---TAA-A-----CTGCGTCA--GATATAAGCATA-A-A-ACTA
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