lowQualScore                  :                         1111111                                     33333333333333333333333                          1                                        
lowQualScore                  :              2    33  2 5555555 2 22 2   77  7777 77777    2  88888 55555555555555555555555   33  33 2 33 2 2 666666 5  2      2 5   2 5555  0 2 2 2  2       
lowQualScore                  :              .    ..  . ....... . .. .   ..  .... .....    .  ..... .......................   ..  .. . .. . . ...... .  .      . .   . ....  . . . .  .       
lowQualScore                  :              2    11  2 9999999 1 22 1   44  4444 44444    1  22222 00000000000000000000000   44  22 4 22 4 4 888888 2  5      5 0   5 3333  8 7 7 7  7       
consensus                     :       CGATGTT-TTAA--AA-TA------C-T-CA-AAA-NTG----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-T------GGTG-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCA
Reference ( gi|9 )            :       CGATGTT-TTAA--AA-TG------C-T-CA-AAA-CTG----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-T------GTTG-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCA
gi|6                          :       CAATGTT-TTAA--AA-TA------C-T-CA-AAA-CCG----A-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-T------GGTG-TTTTT--A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTC
gi|5                          :   atgtCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-T-AA-AAA-CTG----G-----ACTT-CGTGAAAC--TAAAT------CTA------CTCA--AA--G-T--G-A-T------GATG-TTTTGA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCAgg
gi|10                         :     gtCGATGTT-TTAA--AA-TG------C-TTCA-AAA--TG----G-----ACTT-CG-----C--C-----------TC------ATCA--AA--G-C--G-G-T------GGTG-TTTTTA-A-TGC-A----CATC-A-T-GG-ACACTCA
gi|15                         :   ctgtCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-T-TA-AAA-CTG----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--GA--G-T--G-G-T------GGTG--TTTTA-A-TGC-A----
gi|4                          :   ctgtCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-T-CA-AA--CGT----G-----ACTT-CG-----C--GAAA-------CTAGATCTACTCA--A-----T--T-G-T------GGTG-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCA
gi|13                         :   ctgtCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-T-CA-AAA-ATG----G-----ACTT-CG-----C-------------CTC------ATCA--AA--G-T--G-G-T------GGTG-TTTGTA-A-TGC-A----CATT-A----G-ACACTg
gi|11                         :  cctgtCGATGTT-TTAA--A--CA------C-T-AA-AAA-ATG----G-----ACTT-CG-----C--C-----------TC------ATCA--AA--G-T--G-G-T------GGTG-TTTTTA-A-TGC-T----TATT-A-T-GG-ACACTCAt
gi|7                          :   ctgtCGATGTT-TTAA--A--T-------C-T-CA-AAAATTG----G-----ACTT-CG-----CTTCA-------------------TCA--AA--G-CACG-G-T------GGTG-TTTTTATA-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCA
gi|3                          :  ttgtcCGTTGTT-TTAA--AA-TA------C-T-CA-AAA-CTG----G-----ACTT-CGAT---C--GAAACTAGAATCTA------CTCA--AG--A-T--G-G-T------GGTG--TTTTA-A-TGC-A----CA---ACT-GG-ACA
gi|8                          :  cctgtCGATGTTCTTAA--AA-TA------CAT-CA-AAA-ATG----GG----ACTT-CG-----CT-CA--------------------CA--AA--G-T--G-G-T------GGTGTTTTTTA-ATTGC-A----CATTGA-T-GG--CACTCAt
gi|1                          :     ttCGATGTT-TTAA--AA-TT------C-T-CATAAA-ATGTATAGTCCTTACTT-CG-----C--C-----------TC------ATCA--AA--G-C--G-GGT------GGTG-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-TGGG-ACACGCAg
gi|12                         :  cttgtCGAT-TT-TTAA--AA-TT------A-C-CA-AAA-ATG----A-----ACTT-CG-----C-------------CTC------ATCA--AA--GAT--G-G-T------GGTG-TTTTTA-ATTGC------CA-T-A-T-GGAACACTC
gi|19                         :   ctgaCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-T-AA-AAA-ATG----G-----ACTTCCG-----T--CAAA-------
gi|17                         :     gcCGGTGTT-TTAC--AA-TAGTAGTAC-T-CA-AAA-CTG----G-----ACTT-GG-----C--CGAA-------CTA------Cag
gi|20                         :      tCGATGTT-TGAA--AAATA------C-T-CA-AAA-ATG----G-----ACTT-CG-----C--Cgtgcataatatggacaat
gi|18                         :  cctgtCGATGTT-TTAA--AA-T-------C-T--A-AAT-ATG----G-----ACTT-CG-----C--C--T-------CTA-------TCAACAG--G-T--G-G-T------Gtc
gi|2                          :    tgtCGATGTT-TT-A--AA-TA------C-T--A-AA---TGGA--G-----ACTT-C------C-----A-------CTC------ATCA--AAAGG-T--GCG-TGCAATAGTGG-TTTTTA-A-AAT-AAGGGCCTT-A-T-GG-ACACTgag
gi|14                         : gcctgtcGATGTT-TTACCCGT-TA------C-T-CA-AAA-CTG----G-----ACTT-GG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA----T--G-G----------TG-TTTTTA-A-TAC-A----TA-T-A-T-GG-ACAATCA
gi|16                         :                          ------C-T-CA-AAA-CTG----G-----ACTT-GG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AT--A-T--G-G-T------A--G-TTTTTA-A-TACAA----TATT-A-T-GG-ACAATCAg
gi|21                         :                                                                                                 aA--A-T--G-A-T------GGTG-TATTTA---TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCa





Alignments
lowQualScore                  :                                                                     22222222222222222222222                                                                   
lowQualScore                  :               2    22  4  555555 2 0 2   1 2 8888888888    2  77777 99999999999999999999999   33  33 2 33 2 2  55555  2 2      2 4   2 5555  0 2 2 2  2       
lowQualScore                  :               .    ..  .  ...... . . .   . . ..........    .  ..... .......................   ..  .. . .. . .  .....  . .      . .   . ....  . . . .  .       
lowQualScore                  :               1    99  2  888888 0 3 0   0 0 1111111111    0  88888 22222222222222222222222   22  11 2 11 2 2  66666  4 4      4 7   4 0000  2 5 5 5  5       
consensus                     :        CGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCA
Reference ( family-3978 )     :        CGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAANT-G----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCA
gi|1                          :        CGATGTT-TTAA--AA-TT------C-TCATAAAAT-GTATAGTCCTTACTT-CG-----C--C-----------TC------ATCA--AA--G-C--G-GGTG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-TGGG-ACACGCA
gi|10                         :   cttgtCGATGTT-TTAA--AA-TG------C-TTC-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C--C-----------TC------ATCA--AA--G-C--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATC-A-T-GG-ACACTCA
gi|11                         :    ctgtCGATGTT-TTAA--A--CA------C-TAA-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C--C-----------TC------ATCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-T----TATT-A-T-GG-ACACTCA
gi|12                         :    ctgtCGAT-TT-TTAA--AATTA------C--CA-AAAAT-G----A-----ACTT-CG-----C-------------CTC------ATCA--AA--GAT--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-ATTGC------CA-T-A-T-GGAACACTC
gi|13                         :    ctgaCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C-------------CTC------ATCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTGTA-A-TGC-A----CATT-A----G-ACACT
gi|14                         :    cctgtGATGTT-TTACCCGT-TA------C-TCA-AAACT-G----G-----ACTT-GG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA-----------TG-----GT-G-TTTTTA-A-TAC-A----TA-T-A-T-GG-ACAATCAt
gi|15                         :        CGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TTA-AAACT-G----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--GA--G-T--G-G-TG-----GT-G--TTTTA-A-TGC-A----g
gi|16                         :                      ctgtA------C-TCA-AAACT-G----G-----ACTT-GG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AT--A-T--G-G-TA--------G-TTTTTA-A-TACAA----TATT-A-T-GG-ACAATCA
gi|17                         :        CGGTGTT-TTAC--AA-TAGTAGTAC-TCA-AAACT-G----G-----ACTT-GG-----C--CGAA-------CTA------Ca
gi|18                         :       tCGATGTT-TTAA--AA-T-------C-T-A-AATAT-G----G-----ACTT-CG-----C--C--T-------CTA-------TCAACAG--G-T--G-G-TG-----Ggtgcataatatggacaat
gi|19                         :     tgtCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TAA-AAAAT-G----G-----ACTTCCG-----T--CAAA-------ag
gi|2                          :      gcCGATGTT-TT-A--AA-TA------C-T----AAAT-GGA--G-----ACTT-C------C-----A-------CTC------ATCA--AAAGG-T--GCG-TGCAATAGTGG-TTTTTA-A-AAT-AAGGGCCTT-A-T-GG-ACACTag
gi|20                         : gcctgtcCGATGTT-TGAA--AAATA------C-TCA-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C--C
gi|21                         :                                                                                             cctgtA--A-T--G-A-TG-----GT-G-TATTTA---TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCtc
gi|3                          :        CGTTGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAACT-G----G-----ACTT-CGAT---C--GAAACTAGAATCTA------CTCA--AG--A-T--G-G-TG-----GT-G--TTTTA-A-TGC-A----CA---ACT-GG-ACAcgc
gi|4                          :   cctgtCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AACGT-G----------ACTT-CG-----C--GAAA-------CTAGATCTACTCA--A-----T--T-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCAt
gi|5                          :    ctgtCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TAA-AAACT-G----G-----ACTT-CGTGAAAC--TAAAT------CTA------CTCA--AA--G-T--G-A-TG-----AT-G-TTTTGA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCAg
gi|6                          :      gtCAATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAACC-G----A-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTTT--A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTC
gi|7                          :    atgtCGATGTT-TTAA--A--T-------C-TCA-AAAATTG----G-----ACTT-CG-----CTTCA-------------------TCA--AA--G-CACG-G-TG-----GT-G-TTTTTATA-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCAgg
gi|8                          :   ttgtcCGATGTTCTTAA--AA-TA------CATCA-AAAAT-G----GG----ACTT-CG-----CT-CA--------------------CA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-GTTTTTTA-ATTGC-A----CATTGA-T-GG--CACTCA
gi|9                          :      ttCGATGTT-TTAA--AA-TG------C-TCA-AAACT-G----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-TG-----TT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCAg





Alignments
lowQualScore                  :                                                                     22222222222222222222222                                                                   
lowQualScore                  :               2    22  4  555555 2 0 2   1 2 8888888888    2  77777 99999999999999999999999   33  33 2 33 2 2  55555  2 2      2 4   2 5555  0 2 2 2  2       
lowQualScore                  :               .    ..  .  ...... . . .   . . ..........    .  ..... .......................   ..  .. . .. . .  .....  . .      . .   . ....  . . . .  .       
lowQualScore                  :               1    99  2  888888 0 3 0   3 0 1111111111    0  88888 22222222222222222222222   22  11 2 11 2 2  66666  4 4      4 7   4 0000  2 5 5 5  5       
consensus                     :        CGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCA
Reference ( family-3978 )     :        CGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCA
gi|1                          :        CGATGTT-TTAA--AA-TT------C-TCATAAAAT-GTATAGTCCTTACTT-CG-----C--C-----------TC------ATCA--AA--G-C--G-GGTG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-TGGG-ACACGCA
gi|10                         :   cttgtCGATGTT-TTAA--AA-TG------C-TTC-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C--C-----------TC------ATCA--AA--G-C--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATC-A-T-GG-ACACTCA
gi|11                         :    ctgtCGATGTT-TTAA--A--CA------C-TAA-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C--C-----------TC------ATCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-T----TATT-A-T-GG-ACACTCA
gi|12                         :    ctgtCGAT-TT-TTAA--AATTA------C--CA-AAAAT-G----A-----ACTT-CG-----C-------------CTC------ATCA--AA--GAT--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-ATTGC------CA-T-A-T-GGAACACTC
gi|13                         :    ctgaCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C-------------CTC------ATCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTGTA-A-TGC-A----CATT-A----G-ACACT
gi|14                         :    cctgtGATGTT-TTACCCGT-TA------C-TCA-AAACT-G----G-----ACTT-GG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA-----------TG-----GT-G-TTTTTA-A-TAC-A----TA-T-A-T-GG-ACAATCAt
gi|15                         :        CGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TTA-AAACT-G----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--GA--G-T--G-G-TG-----GT-G--TTTTA-A-TGC-A----g
gi|16                         :                      ctgtA------C-TCA-AAACT-G----G-----ACTT-GG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AT--A-T--G-G-TA--------G-TTTTTA-A-TACAA----TATT-A-T-GG-ACAATCA
gi|17                         :        CGGTGTT-TTAC--AA-TAGTAGTAC-TCA-AAACT-G----G-----ACTT-GG-----C--CGAA-------CTA------Ca
gi|18                         :       tCGATGTT-TTAA--AA-T-------C-T-A-AATAT-G----G-----ACTT-CG-----C--C--T-------CTA-------TCAACAG--G-T--G-G-TG-----Ggtgcataatatggacaat
gi|19                         :     tgtCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TAA-AAAAT-G----G-----ACTTCCG-----T--CAAA-------ag
gi|2                          :      gcCGATGTT-TT-A--AA-TA------C-T----AAAT-GGA--G-----ACTT-C------C-----A-------CTC------ATCA--AAAGG-T--GCG-TGCAATAGTGG-TTTTTA-A-AAT-AAGGGCCTT-A-T-GG-ACACTag
gi|20                         : gcctgtcCGATGTT-TGAA--AAATA------C-TCA-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C--C
gi|21                         :                                                                                             cctgtA--A-T--G-A-TG-----GT-G-TATTTA---TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCtc
gi|3                          :        CGTTGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAACT-G----G-----ACTT-CGAT---C--GAAACTAGAATCTA------CTCA--AG--A-T--G-G-TG-----GT-G--TTTTA-A-TGC-A----CA---ACT-GG-ACAcgc
gi|4                          :   cctgtCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AACGT-G----------ACTT-CG-----C--GAAA-------CTAGATCTACTCA--A-----T--T-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCAt
gi|5                          :    ctgtCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TAA-AAACT-G----G-----ACTT-CGTGAAAC--TAAAT------CTA------CTCA--AA--G-T--G-A-TG-----AT-G-TTTTGA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCAg
gi|6                          :      gtCAATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAACC-G----A-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTTT--A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTC
gi|7                          :    atgtCGATGTT-TTAA--A--T-------C-TCA-AAAATTG----G-----ACTT-CG-----CTTCA-------------------TCA--AA--G-CACG-G-TG-----GT-G-TTTTTATA-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCAgg
gi|8                          :   ttgtcCGATGTTCTTAA--AA-TA------CATCA-AAAAT-G----GG----ACTT-CG-----CT-CA--------------------CA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-GTTTTTTA-ATTGC-A----CATTGA-T-GG--CACTCA
gi|9                          :      ttCGATGTT-TTAA--AA-TG------C-TCA-AAACT-G----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-TG-----TT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCAg


blockSeqs                     :               C    CC  T  GTAGTA A   .   A T GAG           C  TGAAA GAAACTAGAATCTAC           AC  AG A AC C .  CAATA  G T      T T   A AGGG    G C .  A
blockSeqs                     :               .    .   A  .      .   .   A . GG            .  AT    GAAACTAGATCTAC            .   .  . .  . .  .      . .      . T   . .       . . .  .
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   A . G             .  .     TAAATCTAC                 .   .  . .  . .  .      . .      . .   . .       . . .  .
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   A . G             .  .     CAAACTAC                  .   .  . .  . .  .      . .      . .   . .       . . .  .
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   C . A             .  .     CAAACTAC                  .   .  . .  . .  .      . .      . .   . .       . . .  .
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   C . G             .  .     CAAACTAC                  .   .  . .  . .  .      . .      . .   . .       . . .  .
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   C . G             .  .     CGAACTAC                  .   .  . .  . .  .      . .      . .   . .       . . .  .
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   C . G             .  .     CAAACTAC                  .   .  . .  . .  .      . .      . .   . .       . . .  .
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   A . G             .  .     CAAACTAC                  .   .  . .  . .  .      . .      . .   . .       . . .  .
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   A . G             .  .     CTCTA                     .   .  . .  . .  .      . .      . .   . .       . . .  .
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   A . G             .  .     ACTCA                     .   .  . .  . .  .      . .      . .   . .       . . .  .
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   A . G             .  .     CTCA                      .   .  . .  . .  .      . .      . .   . .       . . .  .
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   C . G             .  .     CTCA                      .   .  . .  . .  .      . .      . .   . .       . . .  .
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   G . G             .  .     CTCA                      .   .  . .  . .  .      . .      . .   . .       . . .  .
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   C . G             .  .     CTCA                      .   .  . .  . .  .      . .      . .   . .       . . .  .
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   C . A             .  .     TTCA                      .   .  . .  . .  .      . .      . .   . .               
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   A . G             .  .     TCA                           .  . .  . .  .                                       
blockSeqs                     :               .    .   .  .      .   .   A . G             .  .                                                                                        
blockSeqs                     :                           .      .   .   C . .             .  .                                                                                        


blockSeqCons                  :                                              G*********             CAAACTAC***************
originalCons                  :        CGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCA
finalCons                     :        CGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAAAT-GG---------ACTT-CG-----CCAAACTAC---------------TCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                     22222222222222222222222                                                                   
lowQualScore                  :               2    22  4  555555 2 0 2   1 2 8888888888    2  77777 99999999999999999999999   33  33 2 33 2 2  55555  2 2      2 4   2 5555  0 2 2 2  2       
lowQualScore                  :               .    ..  .  ...... . . .   . . ..........    .  ..... .......................   ..  .. . .. . .  .....  . .      . .   . ....  . . . .  .       
lowQualScore                  :               1    99  2  888888 0 3 0   3 0 1111111111    0  88888 22222222222222222222222   22  11 2 11 2 2  66666  4 4      4 7   4 0000  2 5 5 5  5       
consensus                     :        CGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCA
Reference ( family-3978 )     :        CGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCA
gi|1                          :        CGATGTT-TTAA--AA-TT------C-TCATAAAAT-GTATAGTCCTTACTT-CG-----C--C-----------TC------ATCA--AA--G-C--G-GGTG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-TGGG-ACACGCA
gi|10                         :   cttgtCGATGTT-TTAA--AA-TG------C-TTC-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C--C-----------TC------ATCA--AA--G-C--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATC-A-T-GG-ACACTCA
gi|11                         :    ctgtCGATGTT-TTAA--A--CA------C-TAA-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C--C-----------TC------ATCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-T----TATT-A-T-GG-ACACTCA
gi|12                         :    ctgtCGAT-TT-TTAA--AATTA------C--CA-AAAAT-G----A-----ACTT-CG-----C-------------CTC------ATCA--AA--GAT--G-G-TG-----GT-G-TTTTTA-ATTGC------CA-T-A-T-GGAACACTC
gi|13                         :    ctgaCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C-------------CTC------ATCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTGTA-A-TGC-A----CATT-A----G-ACACT
gi|14                         :    cctgtGATGTT-TTACCCGT-TA------C-TCA-AAACT-G----G-----ACTT-GG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA-----------TG-----GT-G-TTTTTA-A-TAC-A----TA-T-A-T-GG-ACAATCAt
gi|15                         :        CGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TTA-AAACT-G----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--GA--G-T--G-G-TG-----GT-G--TTTTA-A-TGC-A----g
gi|16                         :                      ctgtA------C-TCA-AAACT-G----G-----ACTT-GG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AT--A-T--G-G-TA--------G-TTTTTA-A-TACAA----TATT-A-T-GG-ACAATCA
gi|17                         :        CGGTGTT-TTAC--AA-TAGTAGTAC-TCA-AAACT-G----G-----ACTT-GG-----C--CGAA-------CTA------Ca
gi|18                         :       tCGATGTT-TTAA--AA-T-------C-T-A-AATAT-G----G-----ACTT-CG-----C--C--T-------CTA-------TCAACAG--G-T--G-G-TG-----Ggtgcataatatggacaat
gi|19                         :     tgtCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TAA-AAAAT-G----G-----ACTTCCG-----T--CAAA-------ag
gi|2                          :      gcCGATGTT-TT-A--AA-TA------C-T----AAAT-GGA--G-----ACTT-C------C-----A-------CTC------ATCA--AAAGG-T--GCG-TGCAATAGTGG-TTTTTA-A-AAT-AAGGGCCTT-A-T-GG-ACACTag
gi|20                         : gcctgtcCGATGTT-TGAA--AAATA------C-TCA-AAAAT-G----G-----ACTT-CG-----C--C
gi|21                         :                                                                                             cctgtA--A-T--G-A-TG-----GT-G-TATTTA---TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCtc
gi|3                          :        CGTTGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAACT-G----G-----ACTT-CGAT---C--GAAACTAGAATCTA------CTCA--AG--A-T--G-G-TG-----GT-G--TTTTA-A-TGC-A----CA---ACT-GG-ACAcgc
gi|4                          :   cctgtCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AACGT-G----------ACTT-CG-----C--GAAA-------CTAGATCTACTCA--A-----T--T-G-TG-----GT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCAt
gi|5                          :    ctgtCGATGTT-TTAA--AA-TA------C-TAA-AAACT-G----G-----ACTT-CGTGAAAC--TAAAT------CTA------CTCA--AA--G-T--G-A-TG-----AT-G-TTTTGA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCAg
gi|6                          :      gtCAATGTT-TTAA--AA-TA------C-TCA-AAACC-G----A-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-G-TTTTT--A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTC
gi|7                          :    atgtCGATGTT-TTAA--A--T-------C-TCA-AAAATTG----G-----ACTT-CG-----CTTCA-------------------TCA--AA--G-CACG-G-TG-----GT-G-TTTTTATA-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCAgg
gi|8                          :   ttgtcCGATGTTCTTAA--AA-TA------CATCA-AAAAT-G----GG----ACTT-CG-----CT-CA--------------------CA--AA--G-T--G-G-TG-----GT-GTTTTTTA-ATTGC-A----CATTGA-T-GG--CACTCA
gi|9                          :      ttCGATGTT-TTAA--AA-TG------C-TCA-AAACT-G----G-----ACTT-CG-----C--CAAA-------CTA------CTCA--AA--G-T--G-G-TG-----TT-G-TTTTTA-A-TGC-A----CATT-A-T-GG-ACACTCAg