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Reference ( gi|5 ) : CAAAAT-TACA-A-CATGGTC-----TAA----A-GTGAT--C-C-AC---A-----GTCAA--A---C---TA---CAC-----A-GC-AAGTTT-CAG--CTTGA----C-A-----T--G-T------GA-------------C--AC--------AG-----A--A-A-T--GA-AAAT--A-GA------A-A----C--AG--------AA----AACT-ATGAACAG--------A---CAGATG---GACA---GACGAAC-GG--ACA-T--AC-A--G-A-CATCA-C-TGTA-----C--CA--TA-------ATACA-------TCCTGTC--TAAAGATAGGTC
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7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-3965 ) : CAAAAT-TGCAA-CATGATC-----T-A-G----AG-TGACCCA-C--AA-A--G--AAG-C----T---A-----C---AC-----A-G-CAAGT-TT-CAG--CTTGAT----A-----T------------G-TGA-------------C--A-GAG-----AAAT-GA-AAAT-A-GAA----AC--AG---AAAA-CCC--C-GA---A----CGG--------ACG-----GAT-----G---GACGGAC---------GAAC----GGACGTACAGA-CATCG-C-TGTA-----C--CA--TAA--------------TACGTCCCGTCTAAAGACGGGT
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gi|41 : AAAAT-TGCAT-CGTGATC-----T-A-G----AG-TGACCCA-C--AA-A--G--GAG-C----T---A-----C---AT-----A-G-CAAGT-TT-CAA--CTTGAT----A-----TAA----------G-TGA-------------C--A-GAG-----AATT-G-----T--------------------AAG-CCC--C-GG---A----CGT--------AC--------------------------------------------------AGA-CATCG-C-TTTA-----C--CATGTAA--------------TGCGTCta
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus : CAAAAT-TGCAA-CATGATC-----T-A-G----AG-TGACCCA-C--AA-A--G--AAG-C----T---A-----C---AC-----A-G-CAAGT-TT-CAG--CTTGAT----A-----T------------G-TGA-------------C--A-GAG-----AAAT-GA-AAAT-A-GAA----AC--AG---AAAA-CCC--C-GA---A----CGG--------ACG-----GAT-----G---GACGGAC---------GAAC----GGACGTACAGA-CATCG-C-TGTA-----C--CA--TAA--------------TACGTCCCGTCTAAAGACGGGT
Reference ( family-3965 ) : CAAAAT-TGCAA-CATGATC-----T-A-G----AG-TGACCCA-C--AA-A--G--AAG-C----T---A-----C---AC-----A-G-CAAGT-TT-CAG--CTTGAT----A-----T------------G-TGA-------------C--A-GAG-----AAAT-GA-AAAT-A-GAA----AC--AG---AAAA-CCC--C-GA---A----CGG--------ACG-----GAT-----G---GACGGAC---------GAAC----GGACGTACAGA-CATCG-C-TGTA-----C--CA--TAA--------------TACGTCCCGTCTAAAGACGGGT
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gi|20 : ggataaaaattgcaaaatgatccagtactagtgacccaaaaagaaggtatacagcaagtttcagcttgaaaaaggacatacaggacattgctagacctcGCAC-CATGATT-----T-A-A----AG-AGACCCA-T--CA-A--G--AAG-C----T---G-----C---GT-----A-G-CAAGT-TT-CAT--CTTGAT----AATATGT------------G-TGATACTAATT-----C--A-GAG-----AAAT-GA-AAAT-A-GGA----TC--AG---AAAA-TCC--T-GA---A---------------------------------------------------GAAC----GGAAAT----A-TATCG-C-TATA-----C--CA--TAA--------------TACGTCCaaaaggacaaacaggacattgctagacctctgaccacaataagtcctgtataaagagtaagact
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gi|25 : aatC----GGACGTACAGATCATCG-C-TTTA-----C--CATGTAA--------------TGCG----GTCTAcatcgctttaccatgtaatgcggtctatgctaggcg
gi|26 : aatcaaaattgcattcgtatctagagtgacccacaaaaggactacatagaagttcaacttgaataaggtacgagaattggtaagcccATGATT-----T-A-C----AG-CAATTCA-T--TA-A--A--AAA-C----C---A-----C---AC-----T-G-AGAGT-TT-TAG--CTTGAT----A-----T------------G-CAA-------------C--A-GAT-----AAAT-GA-AAATAA-GAA----AT--AA---AAA---CC--C-GA---A----CGG--------ACC-----GAA-----G---GATGGA----------G-------GGATGTACAGG-TATTG-C-TGCA-----C--CA--tgctaggcg
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gi|30 : tgatttagagagacccacaaagaagctacataccaagtttcagcttaataagtgtaaatgaaaatatgtgtgatattaattttgatgcatcatatT-TGTAA-CCTGATC-----T-A-G----AG-TGACCCA-C--AA----G--AAG-C----T---A-----C---AT-----A-G-CAAGG-AT-TAG--CTTGAT----G-----T------------G-TGG-------------C--A-GAG-----AAAT-GA-AAAT-A-G------AT--AG---AAAT-CCC--C-AA---A----C--------------------T-----G---------------------AT----GGACATACAAA-CATCA-C-TGTA-----T--CA--TGA--------------TAacatgaataaa
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gi|32 : AT-TGCAA-CATGATC-----T-C-G----AG-TGACCTT-C--AA-A--C--AAG-C----C---A-----C---AT-----A-G-AAAGT-TT-CAG--CTTGAT----G-----T------------A-TGA-------------A--A-GAG-----AACT-GA-AATT-A-AAA----AC--AG---ATAA-CCT--T-GA---A----AAG--------ACA-----G-----------------------------------------ACAGA-CATCG-C-TGTA-----C--CA--TAA--------------TACatta
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gi|36 : gatAAAAT-TACAA-CATGATC-----T-A-C----AG-TGACCCA-T--A-----G--AAG-C----A---G-----C---AC-----A-G-CAAGA-TT-CAG--CATGAT----A-----T------------G-AGA-------------C--A-GAC-----AAAT-AA-AAAT-A-GAA----AG--AG---AAAA-CCC--C-CA---A----CAG--------c
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gi|38 : C-----T-A-G----TA-TGACCCA-A--AA-A--G--AAA-C----T---A-----C---AT-----GTA-CAAGT-TT-CAG--TTTGAT----A-----C------------A-TTA-------------C--A-GGG-----AAAT-GA-AAAT-A-GAA----AC--AAAACAAAA-ACC--C-GA---A----CAG--------ACA-----GAT---------------------------------GGACATACAGA-C-TCG-A-TGTA-----C--CA--AAA--------------
gi|39 : CAAAAT-TGCAA-GAAGACC-----G-A-G----AG-TGATCCA-T--TA-T--G--AGG-T----TTATA-----C---AC-----A-G-TAAGT-TTACAG--CTTGAT----A-----T------------G-TTA-------------A--A-GAG-----AGAT-AA-GAAT-A-GAC----AC--AG---AAAg
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gi|41 : AAAAT-TGCAT-CGTGATC-----T-A-G----AG-TGACCCA-C--AA-A--G--GAG-C----T---A-----C---AT-----A-G-CAAGT-TT-CAA--CTTGAT----A-----TAA----------G-TGA-------------C--A-GAG-----AATT-G-----T--------------------AAG-CCC--C-GG---A----CGT--------AC--------------------------------------------------AGA-CATCG-C-TTTA-----C--CATGTAA--------------TGCGTCta
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gi|48 : AAAT-TGCAA-CATGATC-----T-A-G----AG-TGAACCA-C--AA-A--G--AAG-C----T---A-----C---AC-----C-G-CAAGT-T---AG--CTTGAT----A-----T------------G-TAA-------------C--A-GAG-----AAACAGA-GAAG-A-AGA----AC--AG---
gi|49 : cA----AC--AG---AAAG-CCC--C-GA---A----CAG--------ACG-----GAC-----G---tcagacagacacatatcactgtatcacag
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-3965 ) : CAAAAT-TGCAA-CATGATC-----T-A-G----AG-TGACCCA-C--AA-A--G--AAG-C----T---A-----C---AC-----A-G-CAAGT-TT-CAG--CTTGAT----A-----T------------G-TGA-------------C--A-GAG-----AAAT-GA-AAAT-A-GAA----AC--AG---AAAA-CCC--C-GA---A----CGG--------ACG-----GAT-----G---GACGGAC---------GAAC----GGACGTACAGA-CATCG-C-TGTA-----C--CA--TAA--------------TACGTCCCGTCTAAAGACGGGT
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gi|20 : ggataaaaattgcaaaatgatccagtactagtgacccaaaaagaaggtatacagcaagtttcagcttgaaaaaggacatacaggacattgctagacctcGCAC-CATGATT-----T-A-A----AG-AGACCCA-T--CA-A--G--AAG-C----T---G-----C---GT-----A-G-CAAGT-TT-CAT--CTTGAT----AATATGT------------G-TGATACTAATT-----C--A-GAG-----AAAT-GA-AAAT-A-GGA----TC--AG---AAAA-TCC--T-GA---A---------------------------------------------------GAAC----GGAAAT----A-TATCG-C-TATA-----C--CA--TAA--------------TACGTCCaaaaggacaaacaggacattgctagacctctgaccacaataagtcctgtataaagagtaagact
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gi|22 : tAAAT-TGCAA-CATGATC---------A----AG-TGATCCA-C--AA-A--G--AAG-C----T---A-----T---AT-----A-G-CTAGT-TT-CAG--CTTGAT----G-----T------------G-CGA-------------C-------------------------A-GAA----AC---------CA-CCTAAT-GA---A----CAG--------ATG-----GAT-----G---GGCAGAC---------AGAA----GGACGTTTAGA-CATTG-C-TGTA-----C--TG--TAA--------------TACATCCCATCaa
gi|23 : T-TGCAA-CA-GATC-----TCA-G----TG-TGACCCA-C--AA-A--G--AAA-C----T---T-----C---AT-----A-G-CAAGT-TTCCAG--CTTGAT----G-----T------------G-TGA-------------C--C-GAG---------------------------GC--AG---GTCA-CCC--T-GA-------------------ATG-----GAT-----T---GACAGAC---------AGAT----GGAC--ACGGA---------TGTA-----C--T---TAA--------------TATGTCCCATCTAAAGA
gi|24 : ttAGAAA-TGCAA-CATAATC-----T-A-G----AG-TGACCCA-CT-AA-A--GAAAAG-C----T---A-----T---GC-----A-A-TAAGT-TT-CAG--TTT--T----A-----T------------G-ATA-------------C--T-GAG-----AAAT-GA-AAAT-A-GAA----AC--TG---AA----CC--C-GA---A----CG---------------------------------------------GAAC----GGACATAGAGA-TATCG-C-TG-A-----CAGCA--TTA--------------TA
gi|25 : CAAAAT-TGCATTCGT-ATC-----T-A-G----AG-TGACCCA-C--AA-A--A--GGA-C----T---A-----C---AT-----A-G--AAG--TT-CAA--CTTGA-----A-----T-----------------------------------AAG-----GTAC-GA-GAAT-T-G-----------G---TAAG-CCC--C-GG---A----CGT--------ACA-----GAT-----a
gi|25 : aatC----GGACGTACAGATCATCG-C-TTTA-----C--CATGTAA--------------TGCG----GTCTAcatcgctttaccatgtaatgcggtctatgctaggcg
gi|26 : aatcaaaattgcattcgtatctagagtgacccacaaaaggactacatagaagttcaacttgaataaggtacgagaattggtaagcccATGATT-----T-A-C----AG-CAATTCA-T--TA-A--A--AAA-C----C---A-----C---AC-----T-G-AGAGT-TT-TAG--CTTGAT----A-----T------------G-CAA-------------C--A-GAT-----AAAT-GA-AAATAA-GAA----AT--AA---AAA---CC--C-GA---A----CGG--------ACC-----GAA-----G---GATGGA----------G-------GGATGTACAGG-TATTG-C-TGCA-----C--CA--tgctaggcg
gi|27 : acattAAAAT-GGCAA-CATGATC-----T-A-G----AG-TGACCCA-A--AA-A--G--ATG-TTTAAT---A-----T---GC-----A-G-CATGT-TT-CAG--CTTGAT----A-----T------------GCTGA-------------C--A-AAA-----AAAT-AA-AAAT-A-GAA----AC--AG---AGAA-CTC--T-GA---A----TAG--------ACT-----G-T-----GAGTGACAGAC---------
gi|28 : tcaAC-TGCAA-CATGATT-----------------------A-C--GA-A--G--AAG-C----T---A-----C---AC-----A-G-CAAGT-TC-CAG--CTTGAT----A-----T------------G-TGA-------------C--A-AAG-----AAAT-GG-AAAT-A-GAA----A---AG---A-----TT--C-AG---A----TTG--------ACG-----AAA-----A---AATAGA-----------A------GGATGTAAAGA-TATTG-C-TGTA-----C--CA--TAA--------------CATGTCatata
gi|29 : AAAAT-TTCAA-CATGATC-----T-T-T----AG-GGACCCG-C--GA-A--A--AAG-C----T---G-----C---AT-----A-A-TTAAT-TT-CAG--CTTGAT-----------------------G-AGA-------------C--A-GAG-----AAAT-GA-AAAT-A-GAA----AT--AG---AAAA-CCG--C-GA---A----TGG--------ATG-----GA------------------------------------------AGT-CATCG-C-TGTA-----C--CA--CAA--------------t
gi|3 : tcaTGATT-----T-A-G----AG-AGACCCA-C--AA-A--G--AAG-C----T---A-----C---AT-----A-C-CAAGT-TT-CAG--CTTAAT----A-----A------------G-TG---------------------T-----AAAT-GA-AAAT-A-
gi|3 : -------------C--A-CAG-----AAAT-AA-AAAT-A-GAA----AC--A-----AAA-CCC--CTGA---A----CGA--------ACG-----GA-------------------------------------CGCACAGA-CATCG-T-TGTT-----C--CA--TAA--------------TACTTCCTGTCTGAAGACtgtgtgatattaattttgatgcatcatatcacagaaataaaaatagaaacaaaacccctgaacgaacggacgcacagacatcgttgttccataatacttcctgtctgaagacacatgaataaa
gi|30 : tgatttagagagacccacaaagaagctacataccaagtttcagcttaataagtgtaaatgaaaatatgtgtgatattaattttgatgcatcatatT-TGTAA-CCTGATC-----T-A-G----AG-TGACCCA-C--AA----G--AAG-C----T---A-----C---AT-----A-G-CAAGG-AT-TAG--CTTGAT----G-----T------------G-TGG-------------C--A-GAG-----AAAT-GA-AAAT-A-G------AT--AG---AAAT-CCC--C-AA---A----C--------------------T-----G---------------------AT----GGACATACAAA-CATCA-C-TGTA-----T--CA--TGA--------------TAacatgaataaa
gi|31 : AT-TTCAT-CATGATC-----T-A-G----AG-TGCCCCA-C--CA-A--G--AAG-C----T---A-----C---AC-----A-G-CAAGT-GT-CAG--CTTTAT----A-----C------------A-TGA-------------C--A-GAG-----AAAT-GA-AAGT-A-AAA----A---AG--------------------------------------G-----GAT-----G---GACTGAT---------AAA-------AC-CACA------------GTA-----C--CA--TAA--------------TACATCCTGa
gi|32 : AT-TGCAA-CATGATC-----T-C-G----AG-TGACCTT-C--AA-A--C--AAG-C----C---A-----C---AT-----A-G-AAAGT-TT-CAG--CTTGAT----G-----T------------A-TGA-------------A--A-GAG-----AACT-GA-AATT-A-AAA----AC--AG---ATAA-CCT--T-GA---A----AAG--------ACA-----G-----------------------------------------ACAGA-CATCG-C-TGTA-----C--CA--TAA--------------TACatta
gi|33 : AATATGCAA-CATGATC-----T-A-G----AG-TGACC-A-CTAAA-A--A--AAG-C----T---A-----C---AT-----A-G-CAAGT-TT-CAG--CTTAAT----A-----T------------G-TGA-------------C--A-GAG-----AAAT-GA-AAAT-A-G----------------AAA-CCC--T-GA---A----CGG--------ACA-----GA
gi|34 : CAAAAT-TAAAA-CATGATC-----C-A-G----AG-TGACCCA-C--GA-C--G--AAG-C----T---A-----C---AT-----A-G-CAAGT-TT-CAG--CTCAAT----A-----T------------G-CAA-------------C--A-GAG-----CAAT-GA-AAAT-T-AAA----CC--GG---AAA-------T-AA---A----TTG--------ACA-----GAT-----G---GAcctagccatatcatagttatgcctca
gi|35 : atCAAAAT-TGCAA-CTTGATC-----T-A-A----AA-TGACC-A-T--AT-G--A--GAG-C----T---A-----T---AC-----A-G-CAAGT-TT-CAG--TTTGGT----A-----T------------G-TCA-------------CATA-GAG-----GAAT--A-AAGT------------------------CCA--C-AA---A----CAG--------ACA-----G-------------------------------------ACGTTTAGA-CATAG-T-TGTA-----C--CA--TGA--------------agtggtacatgtacc
gi|36 : gatAAAAT-TACAA-CATGATC-----T-A-C----AG-TGACCCA-T--A-----G--AAG-C----A---G-----C---AC-----A-G-CAAGA-TT-CAG--CATGAT----A-----T------------G-AGA-------------C--A-GAC-----AAAT-AA-AAAT-A-GAA----AG--AG---AAAA-CCC--C-CA---A----CAG--------c
gi|37 : ---AC-----A-G-CTAGT-TT-CTG--CTGGAT----A-----TCCATGTATGCATG-TTA-------------C--A-GAT-----AA-T-AAGAAAT-A-AAA----GC--AG---AACA-CCC--A-AA---A----CAG--------ACATACAAAAT-----G---GCTGCAT---------GAAC----GGAC---------ATCA-C-T-----------------A--------------CACATCCTGTCTAAAGtatcacatactgtacatctaaagat
gi|38 : C-----T-A-G----TA-TGACCCA-A--AA-A--G--AAA-C----T---A-----C---AT-----GTA-CAAGT-TT-CAG--TTTGAT----A-----C------------A-TTA-------------C--A-GGG-----AAAT-GA-AAAT-A-GAA----AC--AAAACAAAA-ACC--C-GA---A----CAG--------ACA-----GAT---------------------------------GGACATACAGA-C-TCG-A-TGTA-----C--CA--AAA--------------
gi|39 : CAAAAT-TGCAA-GAAGACC-----G-A-G----AG-TGATCCA-T--TA-T--G--AGG-T----TTATA-----C---AC-----A-G-TAAGT-TTACAG--CTTGAT----A-----T------------G-TTA-------------A--A-GAG-----AGAT-AA-GAAT-A-GAC----AC--AG---AAAg
gi|4 : gatA-AAGT-A-GAA----AC--AG---AGAA-TCG--T-GA---A----CGG--------ACG-----GAC-----A---TACAGAC---------catacacattgctggaccacaat
gi|40 : ATC-----T-A-G----AG-TGACCCG-T--AA-A--G--AAG-C----T---A-----A---AC-----A-G-AAAAT-TT-TAGTCCTT-------------T------------G-TGA-------------C--A-TAA-----AAAT-GA-AAAT-T-TAA----A-----------G-CCT--T-GA---A----TGG--------A------------------------AC----------AAT----GGACGGACAGA-TATC--C-TGTA-----A--CA--TAA--------------TACATCCaggtgtgtaacaactgtgaacataaaactgcatgttaaatacgaaattgaaaataaccagcaaatcaaatgtaagttgtatatagtctaaaatgttccgttaccagctcagttttccttcgttcctcctgtaactgctctt
gi|41 : AAAAT-TGCAT-CGTGATC-----T-A-G----AG-TGACCCA-C--AA-A--G--GAG-C----T---A-----C---AT-----A-G-CAAGT-TT-CAA--CTTGAT----A-----TAA----------G-TGA-------------C--A-GAG-----AATT-G-----T--------------------AAG-CCC--C-GG---A----CGT--------AC--------------------------------------------------AGA-CATCG-C-TTTA-----C--CATGTAA--------------TGCGTCta
gi|42 : TGAA----A-----T------------G-GGG-------------C--A-CAGTAT--AAA--GA-GTAT-AAGAA----AC--AT---TAAC-TCC--C-AA---AAATACAG--------ATG-----GAT-----G---GAAGGAC---------AGACAGATGGACAAACAGA-CATTA-C-TA-A-----T--CA--CAA--------------TACATCCCACATAAAGAC
gi|43 : CAAAAT-TGCAA-CATAATC-----T-A-C----AG-TGACGCA-T--AA-A--G--AAG-C----T---A-----C---AT-----A-G-C-----------------GT----A-----T------------G-T---------------C--A-GAG-----AAAT-GA-AATT-A-TAA----AC--AG---AAAA-GAC--C-GA---A----CGG--------ACG-----G-----------------------------AC----GGACGTACAGA-CAT
gi|44 : atT-CAG--CTTGAT----A-----T------------GCTGA-------------C--A-AA------AAAT--A-AAAT-A-GAA----AC--AG---AGAA-CTC--T-GA---A----TAG--------ACtattatca
gi|45 : -CAAAT-TT-CAG--CTTGAT----A-----G------------A-TGA-------------C--A-GAG-----AAAT-GA-AAGT-G-GAA----TT--AG---AAAA-CCC--C-------------------------------AT-----T---------T---------GAAC----AGAC--ATAGA-TATTG-C-TGTG-----C--CA--TGA--------------TATGTCCCGtgtgagtgaagacatataaaattaatagaacaaatgtttcactagtctacatgatatagattatg
gi|46 : gaaaaacaatgatttggagtgatcT----A-----T------------G-TGA-------------C--A-GAG-----AAAT-GG-AAA--A-AAA----ACCCAT---AAAA-CCC--T-GA---G----CAA--------ATG-----GAC-----A---GATGGAA---------GGAC----TGACATACAGA-CATTG-C-TGTACAGTGC--CA--CAA--------------TATGT-CTACCTAAAGATGGG
gi|47 : -TT-CAG--CTTAAT--------------------------GA-------------T---------------T-GA-AAAT-A-AAG----AC--AA---AAAA-AAC--C-AA---AACC-CCA--------ACT-----GAT-----G---GACAGACATATGGAAAGAA-----GGATGTACAGACCATCA-C-TGTA-----C--CA--T-A--------------CATGTC---TATAAAGATGGATcaaa
gi|48 : AAAT-TGCAA-CATGATC-----T-A-G----AG-TGAACCA-C--AA-A--G--AAG-C----T---A-----C---AC-----C-G-CAAGT-T---AG--CTTGAT----A-----T------------G-TAA-------------C--A-GAG-----AAACAGA-GAAG-A-AGA----AC--AG---
gi|49 : cA----AC--AG---AAAG-CCC--C-GA---A----CAG--------ACG-----GAC-----G---tcagacagacacatatcactgtatcacag
gi|49 : AT-CA-AAAC-G-GGA----AC--AG---AAAA-CCC--C-GA---A----CG---------ACG-----G---------------GAC---------AAAC----A-AC--ACA-A-TATCG-C-TGTA-----C--CA--TAA--------------TAAACCTCGTCAAAAGACGGGaataaacatcaaaacgggaacagaaaaccccgaacgacgggacaaacaacacaatatcgctgtaccataataaacctcgtcaaaagacggg
gi|5 : aacagaaagccccgaacagacggacgaataaacCAAAAT-TACAA-CATGGTC-----T-A-A----AG-TGATCCA-C--AG-T--C--AAA-C----T---A-----C---AC-----A-G-CAAGT-TT-CAG--CTTGAC----A-----T------------G-TGA-------------C--A-CAG-----AAAT-GA-AAAT-A-GAA----AC--AG---AAAA-CTA--T-GA---A----CAG--------ACA-----GAT-----G---GACAGAC---------GAAC----GGACATACAGA-CATCA-C-TGTA-----C--CA--TAA--------------TACATCCTGTCTAAAGATAGGT
gi|50 : AAAAT-TGAAA-CGCCATC-----T-T-A----AG-TGACCCA-C--AA-G--G--AAG-C----T---AAAGAGCTAAAC-----A-G-CAAGT-TT-CAA--CTTAAC----C-----T------------G-TGA-------------C--A-GAG-----AAAT-GA-AAAT-C-GAA----AC--AG---AAAC-TCC--T-GA---A----CAG--------Ac
gi|51 : GGTC-----C-A-G----GG-TGACCCA-T--AA-A--G--AAG-C----T---A-----C---GC-----A-G-CCAGT-TT-CAG--CTTGAT-------------------------------------------------------AAT-GA-AATT-A-GAA----AC--AG---AAAA-CCC--T-GA---A----TGG--------AC--------T-----G---------------------AC----GGACATACAGA-CATTG-C-TATA-----gagc
gi|52 : taagggAAAC-TGCAAACAT-AT------T-A-A----GG-TGACCCA-C--AA-A--A--CA--C----T---A-----C---AC-----A-G-CAAGT-TT-AAG--CATGA-----A-----C------------T-TGA-------------C--A-GAG-----AAA---G-AACT-A-GAC----AG--AG---AAAC-CTC--C-AA---A----
gi|53 : CAAAAT--GCAA-CATGATC-----T-A-G----AT-TGATTAA-T--AA-------AAG-C----T---A-----C----C-----G-G-CAA-T-TT-CAG--CTT-----------------------------------------------A-AAG-----AAAT-AG-AA------AA----AT--GG---AA----CC--C-AAGTTA----CGG--------ACG-----GAagacaaagaca
gi|54 : t-TGACCCA-A--AA-A--G--ATG-T----T---T-----A---AT-----A-T-CAGATGTT-CAG--CTTGAT----A-----T------------GCTGA-------------C--A-AA------AAAT--A-AAAT-A-GAA----AC--AG---AGAA-CTC--T-GA---A----TAG--------Acatacaaa
gi|55 : aatcatagaaatgtG--CTAGAT----A-----T------------G---G-------------C--A-AAT-----AAAT-GA-AATT-A-GGA----AC--AG---AAAA-TTT--T-GA---A----ATC--------ACG-----GAT-----------C----------------C----GGACATATAAA-CATCG-C-TGTA-----T--GA--TAA--------------TACGT
gi|56 : A-AAAC-A-GAG----AC--AG---AAAT-CTC--C-GA---A----CGG--------AAG-----GGC-----G---GAC--------------------------TACAGA-TATCG-C-TCCA-----C--CA--TGA--------------TACGTCCCTTCTAAAGGCGG
gi|57 : A-------------C--A-AAG-----AAAT-GA-AAAT-T-GAA----AC--AG---AAAATCCC--C-AA---A----CGG--------ATG-----GActgtata
gi|58 : AAAT-TTTAC-CACAGCC-----A-A-G----AGATG-CCCT-C--AA-A--T--AAA-C----T---A-----C---AT-----A-G-CAAGT-TT-CAG--CTTGAT----A-----T------------catcactgaatacatgtacctgtaagtatagagattg
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gi|60 : aA-------------C--A-AAG-----AAAT-GA-AAAT-T-GAA----AC--AG---AAAT-CCC--C--A---A----C------------------GAT-----G---GAC
gi|61 : ---A----CAG--------ACA-----GAT-----G---GACAGAC---------AGAC----GGACAGACAGA-CAatcctgaatacatgtactgtaagtataagatt
gi|62 : AAC----AGATGTACAGA-CATCAAT-TGTA-----C--CA--TAA--------------TACGT-CCATCTAAAGAaactaatgcatataacctgatcccaaggtaaat
gi|63 : aT-TACAA-CGTCATC-----T-A-G----AA-TAACCTA-T--AA-A--G--AAT-C----T---A-----C---AC-----A-G-CAAGT-TT-CAG--tcagcatataaaaagt
gi|64 : ACGGACAGA-CAGAG-C-TATA-----C--CA--TAA--------------TACGTACTGTCTggaaatggaaaca
gi|65 : tAAA-CATCA-C-TGTA-----C--CA--TAA--------------TACATCCGGTCTActgataggcatattaaaac
gi|67 : gaaatggCAGA-CATCC-C-TGTA-----C--CA--TTG--------------TATGTCCTGTCTAAAGACTGGTttaaagtatcata
gi|68 : AAAT-TGCAA-CATGATC-----T-C-A----AG-TGACCCA-C--AA-A--G--AAG-C----
gi|7 : -TGCAG-CATGATG-----T-A-G----AG-TGACCCA-C--AA-A--G--A--------T---A-----C---AT-----A-G-TAGGT-TT-CAG--CTTGAC----A-----T------------G-TGA-------------A--A-GAG-----AAAT-GA-AAAT-A-G-A----AC--AG----AAA-CTC--C-CA---A----TGA--------ACA-----GAT------------GGAT---------AAAT----GGAATCAGGGA-CATCA-T-TATA-----C--CA--TAG--------------TATGTCCTATCTAAAGACAGG
gi|8 : AATAT-TTCAA-TATGATT-----T-A-C----AG-TAACCCA-T--AA-A--A--AA-------C---A-----C---AC-----T-G-AAAGT-TT-CAG--CATGAT----A-----T------------T-TAA-------------C--AAGAT-----AAAT-GA-AAAT-A-AGA----A---AA---AACA-CCC--C-GA---A----CGG--------GCA-----GAT---------------------------------GGATGTTCAGG-TATTG-C-TGCA-----C--CA--TAA--------------TACATc
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): ATGAAAATTAATCAAAATATAAGCTGTATTTTAATTCAGTTCTAACTTTCACTATCTTTGATTCCTTCCTCAATCACTACTTTTGGCTTCTCAAACCCTTTGTAATGTAGCACCATTGAGAAATCAGAACCATGCTCAAGCTTCTTTGATGATGTCATCTACAAAT
Unaligned ( gi|9 ): TAGTAAATCAAATCGGAATATGATTTTAGACTAACTTTTACTATCTTTTATGCCCCTTTCAAAAATTGTTCCTGGCTTCTCGAAACCTTTGTAGCGCAATACAATAGAAAAGTCGGAACCAGACTTCAGCTGTTTCGATATGCTCATCTGTAAACA
Unaligned ( gi|66 ): ATATATCTGAAAATTGGTGCTTTGGTTGATATATATTTTTGGGCTTAATTT
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